CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_014014_1 | 767337-767441 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_014014_1
|
1 spacers
spacers of NC_014014_1
>1.1|767364|51|NC_014014|CRISPRCasFinder ATCTATATTTTTATCGTTCTCATTAGTATCTTTATTAACATTTTCACGCGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014014_1
The CRISPR arrays of NC_014014_1 >merge|NC_014014|1|767337-767441|CRISPRCasFinder TGAAGTTTCTATTTTATTATCTAGATTATCTATATTTTTATCGTTCTCATTAGTATCTTTATTAACATTTTCACGCGATGAAGTTTCTATTTTATTATCTAGATT >NC_014014|1|1|767337-767441|CRISPRCasFinder TGAAGTTTCTATTTTATTATCTAGATT ATCTATATTTTTATCGTTCTCATTAGTATCTTTATTAACATTTTCACGCGA TGAAGTTTCTATTTTATTATCTAGATT
>NC_014014.1|WP_013054136.1|762685_763672_+|lactate-dehydrogenase MKIITFRVREVEAPIFEKINNKFGYELTYYSEGLSKENIHLVKGFDCLIVRANDTLDSSLLKTIWDYGVRYLLTRTVATNHIDLNAAHELGFMMARVPSYSPTAIAELAFSLAHMLSRKSLHFAEKGRNKNFVVDPFGFSKELKNSTIGVVSVGKIGLAAAKMFKAFSPNVLGYDPYPSNEAKEVVDFVSLDELLKRSDIISVHTPYINGVNEKMIGKDFISKMKDGAILVNTSRGQIQDEKEILNALKSGKLSAVATDVLNEEGKYFFKELKKYEDPVIEELMSLYPRFVLTPHVGSYTDEAALNMIETSYENLKEYIETKNCKNKI >NC_014014.1|WP_049757065.1|761451_762663_+|AEC-family-transporter MLFSSATSTTGSKSSVSEQLIKVLTNQTLWGAILASILIIALGYILVKMKWFKLEWKGAITAVVMKVGLPALALKGFMAKNSLVDLQQQAIVLGIAFAFYIVLLAVAILWVKYMPRLLPKTVVNATGDSLMGQVSGMSQEDVDKKYRPLVLWMLIIFGSTTFFGMPIINQLYKNGGLLAANMWNIPYRIFLYSVCFMQIKGLKLDKANIKQSMKTTFLNPIIIATLLGLVLWLTQLIPGASWKQGPAGKEVMVGWFQLGTTAPWIYKTVDVLSALCSPLIWIVIGMTLAGTKLKDAFTDKWAWIYSAMKLILLPAFIFAIFAILLKTNALPTDVKSPEMPKNIAIAMVIFAATPPATVAVAFCLGENKCSNLAARCSAISTLCAVVMIPVWVILCEVVFGLLI >NC_014014.1|WP_013054189.1|760373_761303_+|FAD-dependent-oxidoreductase MNNIYDLLIVGSGPAGLNAALYASRANLNVAFIEKSAPGGKLSATSKIENWIGLGNMEGWQMATKFFEHAQEYGAKYIYGEVKNIINKGDFLKEIELADGSKVLSKTVLIASGMKNKIPTFIKNIDKFIDKGVSFCAICDGPIYGKTPTLVLGGGNSAVEESVYLSKIASEVNLVIKDTDFTAEKRLVDDLLKLDNVKIFRESQITQIEGDQRLQKATIKDKNGKLTTIEVSSFFPYIGLEPAASFAAGLGVLEENGFILTNEEMQTKVPGIYAAGDIRVKNIRQIVTAASDGAIAAKNISDYLSSEKQ >NC_014014.1|WP_013054589.1|759376_760363_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MQQPSWVPEYAFKGGDTTILFKIGSFNFYLYSLMIMLGIIASILTITFFWTRQKYKSEVLMALILITVPTAIFGARLGYVVEALIYEEKPFANSHWYAAWDGGLSIQGGIILAATCDLIYVYFKRDIIDIRKTMSIIIPTILIGQVIGRWGNYGNHELYGKIDWTGKSSLVFGKSFAQNMFIVDSVSESILGKNQGAYRYPLFLYEGLANLAGYLLIVWVFNLFGIFKPGSTSGFYLIWYGIVRLVMEPMRQESFALYSITSLIFIILGTLMFVYFEFLSRIQYVKVWKKYYFEYEYAREEDYLRWVERTDIIKIIKKKINEKQTRII >NC_014014.1|WP_013054699.1|758450_759377_+|HPr-kinase/phosphorylase MIKKAISIKLIIERFGLEIANPECDPNYLDVLSPAIKRVGJELTQQIQNDRIGHNVICWGTTESKWFTSIGKQKSIEAIESVFQYKPPFVILSRGLTTLPTKWIIEVANKYRIPVCILPNSSTAVISTTIGAYLNNFYLEEVQVHGCLVLIGGVGVLIVGPSGSGKSEATLDLIQRGHVFIXDDAVLIKDTGGHFVGTCPKITRNFLEVRGIGIIDIKYTYGITSVARSCEINLVVELVQKQHQDDLDRIGIEFLKYPINNTYIKKIQIPVKDGGSTASLIEAAVSTYLARHDGVDVLKEIAERGGEK >NC_014014.1|WP_013054396.1|755545_758401_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrA MEKDLQNKLIVKGARENNLKDVSLTIPKNKLVVFTGLSGSGKSSLAFNTIYEEGRRRYVDSLSSYARMFLGGTSKPDVDSIEGLSPAISIEQKTVHNNPRSTVGTVTEIYDYFRLLFARIGKPFCPKHNIQVSGQTTKDIIDSIYQNKPNSKLILYAPLVDGEKGTHQNLLSKLKQEGYIRVKIDDKIYTLDDQIDLDKNQRHSIDLMIIRAALTEEKYSEIAEAVDICIEKSGGNVKVENIDTNEIKMYSKNYSCIYKDFEMPKIETKLFSFNSPYGMCENCKGLGVEFKPDFNTLVPNKQLSIKEGAIIYFKNMINTLNIEWQEFELLLNKFSIPIDVPINELTKSQIDILKHGSEEEIDFAIKTSSGNTLRRTKKLDGILTKIERQYYDTSSERVRDYIKQYMGTFDCSVCKGSRLNKYALAVKIDEKNIFDFSNLSVSDALLILEKSKLSEQEKNISHLIIDELVNRLNFLKNVGLEYLTLSRNAETLSGGEAQRIRLATQIGSKLTGVLYVLDEPSIGLHQKDNLKLIDTLRKMVDLGNTLIVVEHDEETIFSADHIVDIGPEAGLHGGQIIAQGTVDDICKSSESITGKYLSKEWEIPIPSFRRSGNGKKLIIKGARENNLKDIDVTIPLGKLVGVTGVSGSGKSTLVNTILVNELNGSENNPFSISFKSSVKKADYDSVSGLFDVDKVIQINQSPIGRTPRSNPATYTGVFDEIRDIFAAANESRTRGYSKGRFSFNVPGGRCEKCQGDGLIKIEMHFLPDVYINCDQCDGKRYNRETLEIKYHNKNIYDVLNLSVEEALDVFKNKAKIMVKLQTLFDVGLGYIKLGQNSTTLSGGEAQRVKLAAHLQKKPTGKTLFVLDEPTTGLHTHDVKKLIKILNRIVDNGDSVLVIEHNLDIIKCCDHIIDLGPDGGINGGRVVASGTPEQVAQNPNSYTGQFLAKILP >NC_014014.1|WP_013054491.1|755019_755535_+|hypothetical-protein MYYTLSEIKENKDIINDLTLDIYDIFADLKKMLSFFKYEEGALEEEIKNFKLDNNSSMVRENLERFSVLLSYLLFKYGKTNKTFSQELNKYVELVKSTTNLKEFYEEVYLQYGARDVMKLMSQIFNLFKLDGTSKDLLVLLEFNLFDDQIIKKLDNTTFQFHPFNGCDAPL >NC_014014.1|WP_013054472.1|752972_754946_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrB MSIYQLRANYKPSGDQPRAIQELSEGVAEGLKHQVLEGVTGSGKTFTIANVIQNFDRPVLVLSHNKTLASQLYSELKSFFPHNAVEYFVSYFDYYRPEAYIPTSDTYIEKTSKTNQDIELLRMSTINSLLRRRDTIVVASVSSIYGALNPQEYQKGIFEIFKGMDFNFKEFLRTLIKIKYDRNDIDNPPATFAVRGDTVFISPADSDEFLLRIDFFGDTIEAIYKVDKVTKNIIKEFKVYAIYPGEAYTVENSIFDKILPMIQEELNQRIKYFNENNKLLEAQRISERVKNDMDEMAEYGFCGGIENYTMYLDGRDFNQRPFTLFDYLPNDTIIFLDESHMMIPQLHGMYKGDRARKETLVNYGFRLPSALENRPLKFHEFEQAFDFQKIYISATPNEYEIDQSQGLVTKLYVRPTGLLDPILEMRPTKNQIEDIFDEIKIQNDKNQRTIVLTTTKRSAEELSSYMQKRNIKSAYIHSEYDTFKRNEILRKLRKGIYDVVIGINLLREGIDLPEVSLVVVLDADKEGFMRNRSSLIQIAGRAARNKDGRVIFYADVETKSLKATFEDNKEKRELQIAYNKKHNITPQTIYKEIAEPIQGHDIDNALEAVLAKDKKITKQDKEELIKKIKVQMKQAAKDLDYERAIELRDLIIEIEKS >NC_014014.1|WP_013054782.1|751971_752856_+|hypothetical-protein MIKLLQKNKKIINIFTLVLLIVGIIVFFGSRNFYNSNLYQDPITNKLLHRSYYSEYFEIKKNSIEIFLISSLIISTAIILFTIFSKWKIVNIALLGITIIINLIWIFLTIIWTSGPSFYVHVVIIVTFIFLNIYLIIWELLRGTQREDHIIYVNKITNLIIYFVFGYLFYVIVNNDIYLVSYKNLKESSDDVFKPLFNSQNSGRYNFISTLIIFMLFVPISLLYSQITKSENIKKAISFITFGVVSFILLLIVLSLIKQPYTFELTVIINSIIIIWFLLLINLYQFTMLRKDTN >NC_014014.1|WP_013054313.1|751302_751968_+|hypothetical-protein MKNNKLINYFFLNTLLITTSLMTSMALQNESNIEKNHKKYLSNELSVDISNIRIKKIKSNHNTFELIYNCMGNGFCIYNNKSKRYVETILDAKNPFVSNENYYFGPFEYYKKIDSKHFKHLLSNKIITINEGYQLSEKLNEKINIVKENESSFYNYTLLDNTHGSRPKDYITEQISSSSSKIGDVISDKFLDNNGNLKVEGNKGIIVLWLQSSSRLWYYRW >NC_014014.1|WP_013054373.1|767982_768174_-|50S-ribosomal-protein-L28 MSRVDVLTGRGPQTGNKRSHALNATKRKFNVNLQKIKLNLDGQRVTVRVSAKTIKTLKTKGLV >NC_014014.1|WP_013054152.1|768331_769087_+|class-I-mannose-6-phosphate-isomerase MKKVIPVKHEKIWGYEIWLYSPLKEAPTQYEDKSGYVSRGPLIKIIKANDPLSIQVHPDNELAKELENQDNGKSESWLVLDCNEKSELVVGLNNHDQKVIEQALQNKTIDKYLKVIKPKIGQFIDIPAGLVHGIGRPNASGITVLEVQQPSDVTYRFWDYNRKDKNGNFRDLHVNKALKSIKDLNYKVKPSIENETLIYKTEYYKLHLLSDVKVAPSDGVAIINSNDEYFAEEILKDEKLNKDTVFFVEEI >NC_014014.1|WP_013054194.1|769270_771211_-|type-IIA-DNA-topoisomerase-subunit-B MEKNNNYEASNIKFLEGLEHVRRRPGMYIGTTSKDGLHHMIWEIVDNSVDEAMAGFANIIQITITDDDRIIVEDNGRGIPVGIHERFGISALEVVLTKLNAGGKFESNAYKVSGGLHGVGASVVNALSDSMKAWVKREGKIHFAEFANGGVTIKSTEVIGTYEGDSSGTKIEFHPDFTIMEKVPFDKELVVDHAKQIAHLNKGLFVSVKDLRDNTYEEFKFDNGIIDYVNELNEGYTPINQEVIFAEGTYLSVHNGNERSIGVEIAAQYLSDFPRSNIISYANNIATHEGGTHVSGFYDSVMRIVNNYAIENGIIKNEAEKFSREDLTEGLTAIISVKHPDPQFEGQTKGKLGSKDARMAVNKVFSEVFERLLNENPVLSKKIIENAVYARKGRLAANAARDNAKRKSAFDNGGLPGKLADCASKNAEVSELYLVEGNSAGGSAKMGRDRNTQAILPLRGKVLNVERARQDRVVNNEEIMSLVTALGTSLGDTFNINKLRYHKIVIMTDADVDGAHIRTLLLTFFYRYFKPLIEYGFIYIAQPPLYKIQQNKTVEYAYNDAQKDEIITKLNPTQKINIQRYKGLGEMDPEQLWETTMDPKNRKMLQVQIEDAYKADWAFSTLMGENVEPRREFIEKNAKYVKNIDL >NC_014014.1|WP_013054477.1|771392_774947_-|DNA-repair-ATPase MKKILLIGSSLLATSALIASISATDATATNTDATPTNEAQKVSSFANNGKFEILKRSELRKTYIDKLKVELSKLITTLSNVEGANNIIARASELEKSETATLTELLKFYFENTINISNGFLDDSGKVKIFSNLSTDEQKKERWLNYFSFSSYYINNSNKTNDDQITSVDENFNFSILNEFVKFNLELEKLNLTNKKINGENYAQTLISELNGYRDFDKNWSNFITSLNTYDKNKKELYYLNIYSSFLYKQLFSGKIIYNDPELSIVSSSKIPSMYLVANNKQTINNLWNVAFYSYNLDEIKEKIKSLITLFESGEKQTWFFYEVLKSRLIKYVTLMGGLFNDRFNQDLEFKYMDFYFNKLLEESGKNDVHTKVHQLNMEFFFDKNNLDVFENLYTNEMLNNTNGIKEELSKVGQKFSENIVEGGDSGRNDELKRLLTRKIRNVVHQAEGKNALDQGYFKFYKDLSERLFSEWTINSFEVYTSEKYVTISNFFTNMGENDVYYFVKPILMDIFLPMANKREELIKLINSTEIEINVLDEKINELNVFYEKIMKYDNKFNGINPYTYLAADLLKKYTEIHINEIPVLKKIAKSIHNDEQFDKNDQDVIKYVNSWFKDGEKKLAEQGINEIEEVLKIWSKSKSDITSLTLEEINKLDNNKNDLASNKHVSHIIKPLLVKSSNKKQPKIDSFKKVAEILATSNSNNEDLSKLKNFNTSVEAEIASVLTNTGNLYSEEEKVKIQELLNKKATESKEKIDTVTTKLAEDFKAKFNTVTTENGNSINKDALDKLTEAKTEYDNLDPLVKEKLKEVSTTIEKNLETAKADKENFETNKLSNEEQIKSFKEKYQTLVDKTNDVLSINDLETVEAALKEFESKTQEVKTALAEQKQKLDAQKQYLLDKKDAEAKKVQNDEQIKLFKQTHDQLLNKADNTLDYNDLTSIEAALKDLDSKNPEVQTALSSEKQKLESKKQYLIDKKAIEEGDAKDKELKKQAYDKAQTDIDSIYASIKDSIGKNNKDNEALLTDLKESYKTFIDNKGGVETHDKYLADKAEVNKKLINSIVNDHAINHKNIDMNTFDFLKANMSDEEYQELSKVVDNYNNFNDKVNSLDKENKKLTLKDSKELDPSLKVLNESPSSNEQLKNLISDRLSKLKPDSKLKTAMLILGIVLSGLAMLLIVALITKKARA >NC_014014.1|WP_013054377.1|775141_775375_-|hypothetical-protein MENRKSIESIEKYTKLYEKYSSFLTQSQSQVFQLFYFEDLSYGEIAQILATSRTNAYDTLAKTIKKLEKIDEKMNVE >NC_014014.1|WP_013054632.1|775364_776417_-|signal-recognition-particle-docking-protein-FtsY MGIFKRLKDKLFGKNNKDIEELTQLNEEKEVKKLLKSKEMEKYETGLSRSSSFGKKLLELQNKYKKIDDEYFDELEEVLIMSDINTDLVFKIIEKIKKEVKTNNIDDPKMIGEIVADQMFLIYTNKTIVNTNLNFKNERLNVFVMVGVNGSGKTTSIAKLAHRYKMQGKKVVIAAADTFRAGAVDQLSVWANKIGVDIVKPDKEGADPSSVVFKGLEYAKNNYYDLLIIDTAGRLQNKINLMKELEKMFGVIRKFVPDAPHEALLVLDGTTGQNGLSQAKVFKEVCQLSGIILTKMDGTSKGGIVISIKDEFDLNVKLLGLGEKLDDLQEFDLDLFIYQMTKDLIENNGK >NC_014014.1|WP_041594080.1|776460_776859_+|hypothetical-protein MDNKNITLDELIDFNISNSKIINKEYAWIKNVFKDFDYKRTSSLPKKIKYKNNIINRDTLVVSNLTTIKSILHEMKLLNSKHVFFMDNYSYRNHDIDDVILTLKGNNNLAENGNELIDLTKTTRVVINKIKI >NC_014014.1|WP_013054541.1|776895_777579_+|(d)CMP-kinase MNKVNIAIDGPAGAGKSTVSKEIARRLNYTFINSGSMYRAIAYNAIMNNVDLNIEEEVNKTLKKGMIELKLDESVWLNGKDVSNLIRAEHISRSSAIVAKYQQVRNFVVDYIHNMTKTSKGFIMDGRDTTFKLMPHAEVKIFLWADAKERAKRRYLQNESLGFQTSLEEVLLDVKHRDEQDMNRKVDPLHKTEDATLIDCTFMNFEEVVNKIIELVNTTATKVNNEK >NC_014014.1|WP_013054295.1|777568_778873_+|ribosome-biogenesis-GTPase-Der MKNKIAIIGKPNVGKSTFFNRLIGKKISIVYDQPGVTRDRLYENIEWCGRVIKMIDTGGIEIENKPFQEQIQIQAKIAIDEADVIIFIFDGTSEITNDDLFIMNILRKSNKQIIAVANKLESNQDFDYSWYKLGVEKIYAISALHGEGVGEVLDECVKHLDFTDKQEDEEFKLSIIGKPNAGKSSLLNNLAKENRSIVSEIAGTTRDSVKSTVQINGQKYNIIDTAGIMRKSRLVESVDHYALMRAMNSLNEADLSLIIVDATSDISHFDSRIIGYALENQKPIIVVINKWDLVEKETNTMAEYEKNLRFKFHFVPWVPFVFISAKFNQRIEKLIKTIEQVRTNLNRDIKPALLSKFIMETQMIQPAAPYNGGRLNIYFVRKTLDKIPTFVFYVNNKKFIHFSYERHLENQIRSTFDFTGCPIRLQFKNKSGLE >NC_014014.1|WP_013054653.1|779812_782155_+|putative-immunoglobulin-blocking-virulence-protein MIKARKKKIIIISSTVAGALVLPQVVAAPFYISKNNDKVNLNVMFRVLPDNNIIENGKVDPTNSLSNIDNHLEIIPPEKEVPVVVPKIEPKDPEKEEIVTSVEPEKVEEKTKEDENVAIIPKEEVKPEEEVKPVEEPKVEKPVEEKKEEVNKEPVEEKALDKSRPDPKPKDVVIDYDGLKLNANITEQPERTKYKSDVDNRIANRVDYINNTVPDINHVDLTKEYVGNNRGKVIEKTTREAKNLSNILNVGDSPMFNTEKWFNDNPSARNKFAAFEPFLKRPDIKNWIKDSAQNDFDKKKEEFKDKKYQWYGWLLDNIEWSKIKDSKTMHDYLEKGMTTDPNNVYIDANGEFNSYAFSPLPGYNAVTSRMERDNTTKRTFGYKSWYTRSPKSIRDGKYEGWEKTNVTSTEEFKTFGLDGIDGIEIFKMTNNDGTFAKNNNGFVVEIDVSKRDAYNKTLSLINQLKSAGKKITSYRLFNMGLNDHNQKFKEILSALPDKLPQLELFFEHENTEALIALEDKEIDELSMYTSRNSLTDEWSINPFALRGVAYINTLDYNVSSSYSKFDKIDTRITFDKIAFDPVNYTHGSQDAYREINLGLRMVYLVRNNEPFFQGSFGPGTRPDHSEGGNSYPTGLDLSRIHELKSLRGLQFSFIKEGKRFDRKVRRLVLWSDTKDFKISADEMNESQFTKVMHLDGPPNPGEIRLKFNGYKNVNAIHLTGKNALNGEGLSNLETFYRELGRGMFSKVIVDPGNQALYNQLQRAGYTVAWRTADDDLGDFN |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
337994 : 347052
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_014014|337994:347052|DBSCAN-SWA TTTAGTCTTCATTTTTAATTATTTCTTTTAGTAAAGGCTCCATTCTAGAAATTACACCCGTAACTAAAGCATTCCCCATCATAAAATATCTTTTTTTATCAGGCATAGTATTGGTTCAATTTGCAGGAAACATTTGAATTAATTCGCATTCTAATGGTGTTAGAATTCTATAATTATTTATTTTTTTATCAAATATTATATGTGATGTTCTATTGATTGAACCTTCACTTGTTAGCATTGTTCTTGCTGGTTCATCGAGATTATCAGGAAAAGACATTGCACCTTCACTATATATATAATTATGACCTTCTTTTGAAGTTCTATTAATTTTTTTAGAACCTTTTAGAAATTTTCATTTTTCAAGATTTTGCTCATTGATTATTAAATTATCATAATGGTCATTAAAAGATGATGCTTTTTCTAATATTGAACTTAATGTATGTTTTACTTCATTTATAGGTTTTATTTTAGAGTGATAAATATTATTATCGATCATAATTCCACATTCATGGAATGAACCACTTTTGTAGTTTAGAGATATATCTAAAACGTCCTCATATTTATTTAAATCTATATGTTTAAGTTCTGTTATTGTTTCTATTGGAAATACTTTATTAAAAATATTTAATTCATTTAAATTAAGATTATTACACTTTATTGACTTTGATCATTTTAAATCTTTTCTATAAGCAAAAATAAATACTCTTTTCCTTTTTTGAGGCATAGAATAATCACCAGCATTTAAGACTCTTCATTGTGCATCATATCCTAAATCATTTAGAGTTTTTAACATAATTGCAAAATCTCTACCACGATTGCTTGATGGAGATTTAAGTAACCTGTCAACATTTTCTAATAAAACAAACGGTGTTTTTTTTGTTTCTAAAATATCACTTATTTCTCAAAATAAAACACCTTTTTTGCCTTCTATGCCTTTGTTATTTGAAAGAGATCTAGCAACTGAATAATCTTGACAAGGAAAACCACCTACCAATAAATTATGATCAGGAATTACTTTTTTATCTACTTTTGATATGTCATCATTTGAATGATTCTTGTCACCAAATCTTGTTATATAACATTCAAAAGCATGTTGCTTGTTAGATGAAGGTTCATATTGATTTGCTCAGACAAAATTTCAGTTATTATTTTCAATTGCTCTTCCATTTTCATCAAAAGAATTTATATGATTAAGCCCAACTCTAAAACCACCTACACCTGCAAATAATTCAACTACTGATAATTTCATATTAGCATTTCTCCTTTTTGATTATGTCTTCGACTATTTTTTTAATATATTCACTATTTAATCAAAAACATTGATTTGTCATTTTATCGCCATTTATTAATTCATCCATATCTGTTTTTGAACCTTCACCATATTTTATACCATTAATGATATAAGAACTTTTTAATGAATGTGGTCTTAGATGGAAAATTTTTGTTTCTGATTTTTTAGGTAAGTCATTTTTTACAATTAATTTTCCTAAGTTGTTATATTCTATTTTGAAATTTACACCTTTTAAGAATTTTTTCTTATTTAATTCTCACTCTTTTTTTCCAATAGTTTCAAGTTCATTAATTGGCATATTTCAAAATTTTGAACCAGCTAATTTATAATTACCTTCTTCATTCTCTTTGAAAACTACAAATAAGAACCTAGTTTTTTCAAAATAATTATATTCATTTGAGTTTTCAAAAATTTTATTAACAAAATCTTTTATTACAATTTTAGGAAAAGACACACTCTCATTAGGTGTTCCATTTTTTCTTACTCTTATTGTTTTAATATCAATATTAGCTTTTTGAAATTCTTCAGACTTATCTGAATTTACACCTAAAATTTTATTTACTAAAATTCTATTTATATTTTTACTTTTTATGATTTTATTTAAATCAAAAGCATGATACAATTCAGCTTCTGTTTTACCTATAAAAAAATTTAATTTATCTAATATTTTACTTTCAAAATTGCCATCAATTATTTCTTCATCTTTAAAAATTGAATCAAATTTTTCCTTATCGTTATTCATAATGTAATTATTTAATATATAGGTCATATATGATTGTTTTAAAGAAAAAGCTCTTCTTTTTGCTAAAACTTTATTATTGTAATATTGTGGTTTTAATATTTGTGATGCACTAGATCCTTTTGTGCATGCACCAAGATATTTAGTGTCACTTTCTGATAAATTATGAGCATTTCCTGAAGTAATTTTATTAACAATAATATTATAGTCATCTAAAATTATTGTTAAATCTTTAGATAATAATTTACTATACAATTGATAAAGATAAATATAATCTATACTATATTCAATTCTCTTTTTATTTCTATTTCTAAGATATCATATCATTAAAACATTCTTCAACTTCTTTTCTAAATGAGAATTTTTAAATTCTTTTTCAATAGGATTAGTGTTTGGTATCATAGAAATAACTAGTCTTTCTCCTGCTATAAATTTATTTTTATTAATTTCATAAGGAGTGGTTTTTAATTCTAGTTCTGCTTTTTGAAAATCTGGTAATTCACTATTATTTGGTTTATAATAAAAAAAGTATTCTTCTAACAAATTACCTAATGAACCTTTATTACTAGGATTATTGTAATAATCATTTATGTCTTCTAAATCTTCATTTTCATAATTTAGTGATAAAACATCAAGAAAAGTTTTTCCTAATAACTTTTGAGAGTAATTATATATGTCTTTTATGTTTGTTTCATCGTAAGGTAGTTTATTGCTATATTTAGTTAAATCCTTCATTTTTATAAATAACTTTTCTTAATTGGGAAGGAGTTAGTAAATTCATTAACTTTTTTCTTTAGACTATCTTTAAGAGTTTTGGCTTCAGGACTACTAGTTTTTAACATGTCGTGATTTCTTAGTATTGTATGCATTATCTGTGCTAACTCTTCTCATTTTGTAAAATCTCTTGAAGTCATTGCGGCTGTTCCTAATCTTAAGCCACTACCTAAAGTAGGACTTAATGTATCATTTGGAATAGTATTTTTATTTGTTGTGATATTAAATTGCTCAAGAATTTTTTCAGCATCTTTCCCTGTAATTCCATAACTTGTTTTAACATCTATCATAAATAAATGATTATCGGTTCCGCCCGAAACTAATGTTGCCCCAAGATTAATAAATGATTCTGAAAAAATCTTAGCATTTCTAACAATGTTAGCTCCATATTTTTGAAACATAGATGTTAATGCTTCATAGAAACAAATAGCTTTACCAGCAATTGCATGAAATAGTGGTCCGCCTTGGTAACCTGGAAAAACCCATCTATCTACTTTCTTAGCTATTTCAGGATCGTTTGTCATGATGATTCCACCTCTTGCACCTCTTAATGTTTTATGAGTTGTAGAAGTGATAATGTGAGCATAATTAACTGGACTAGGATGAACGTTTGCGGCTATAAGTCCTGCTATATGTGCAATATCAGCCATAAGTTTTGCACCACACTTATCAGCTATTTCTCTAAATCTTTTAAAATCGATAATTCTAGGATATGCAGAATAACCACAAATTATCAAATCAGGCTTTTCTTTCATAGCAATTCTTTCAATATCATCATAATCTAAATAACCATTTTTATCAACTTCATATGAAACTGAATTATAGAAAATTCCACTAAAACTAATTTTATAACCATGTGTTAAGTGACCTCCACTATTTAAAGAAAGACCCATGATTTTTCCGCCGTGTGGTGCAACCGATGCTATTGCAGCAGCATTTGCTACTGATCCAGAATATGGTTGAACATTTGCATATTCAACTCCAAAGATTTTCTTTAATCTTTCTATAGCTAGTGTTTCAACAACATCAACATTTTCACAGGAACCATAATATCTTTTATTTGGATATCCTTCACCATATTTATTAGTTAAAACACTACCTTGAGCTTTAAGAACATCCTCAGATGTGTAGTTTTCAGAAGCTATTAGTTCTATATGTTCTTCTTGCCTCTTCAATTCAGCATTAATTGCATTTTGCACTTCTTTATCATTAAGTTCTATATTTTTGTACATGTTTATTTCCTTCCTATCATTATTATTTATTGTATTTTTTGTTAATCAATTCTATTGTTTTTGAATCTGAAGTTATTCTTAAAGTGGTATTAATTAAGTTGTTTTTTTCGAATGTGTCTTTCAATTCGATATCATAGACATTAAAGTTATTATTAATGTCTTTGACATATGATTTTATAGATTCACCATGTTTAAGTCCAAATGTTAAATCTATAGATTTTAATGGTTCATTGTCTATGATTTTGTATTTTTTATTACTATTAAATTGAGGAACTAGCACTTCAGCAACATAAGCATTTGTTAAATCGTATTTAGGATTAACTTTTCCTATTCAACCTATGAGCAAGTTATTTTGGTATATTTTTGCTGAAACATTAGGATGTATTTTTTCGTTATTATCTAATTTTTCGAAAACTAATTTATTATCTCTATATAGTTTTATAATATCTTCTTTTATTTCTTCAAAACTTTTGGTTGTACTTGCTAATCCAACTACACTTATATTATTGTTTATCATTCCTACTTCAAAAAAGTTAATTTTATTGATTTTTCTTTTTTGATTGTATTCAACCGCTTCAAGCATAGAAGGTATAATTGAGTTTCTGATTACTTCTCTTTCTTTTGAAACAAATGTTTCAAGTGCTAATTCTTCTTGAAAATCAAACACATTTAAGAAATTTTTTTGTTTTGATAAAAGCGAATATGTTAATATCTCATTATAACCATTTGCTTGCAATTCATGTTTAATTGTAGATCTTTTATGTATTTTAAAACTTGTGTTTGAGAGCTGTACTGGTTCAAAATTATCATATGAGTAAAATCTGAATATCTCTTCTATAATGTCTTCAAAGTAATTTATATCGTATCTATAAATCGGCACATAAACTTCATTTACTTCTAAATCAAAACTAAAACCAAGCTTCTTTAATTTTTCAATTGCTGGTATGAATTTTTTTAATGATGAGGTATTTTGATCAGAATAAACTGATAATTTTTCTTTATCAAATTTAATCATTTTTTTAGGGCCTATTTTAGGAATTCCAAGTAAATTTGAAATTGAAATTTTATTATCGTTTAAGTATTTTCTTAAAAATAAAATTCCTAATTCTAAAATTTCATTTGTAATTGTTCTACTTGCTTGATTAGCAGAATTACTAAGTAATTTAATTTGTTTTACTGAGTGTCTTATTAAAGTCGGATCAAAAACACCTATTTCGAAAATAAATTCTTTTGTCTTTTCATCAACTTTAGTGGTTTCAAGACCCATAACTGATGCTACTGAAATAGGTTTATTTTCATCCCTAATAATAAGTACGTTTTCAACATCAACATCTTTGTTTCCTAATAATTTTAATTTTCCACTATAAAGCTCTGAAGTTATTTTTAGCCCAATTTTATTTTTATCATATACATGACAAGGAGCACCTGTTATTATAAGAACTAGGTTTGTAAGATTAACAGCTCAACCTAATGAAGTGTCGATATTATGTTTTGCTAAAAGCATTTTATCAAATATATTTAAGTCAAATTCTTTATCACAATAGGCTTGAAACATTGTAATTTCATTACTCATTCCTCTATCTATTGCGATATCTGAAAATAGACTACCTTTGTGATTTTTTTCATTAAAAACAAATTCAGTTTCATAGTATGCTGCCAATTCTTTTGCCATTACATAATATGAATTAGCATCATTTCTATTGGCTGTTGTAGAAACATCAAGAATATAGTCATCTAGTTGCAATACTTGCATAGGATCATCGTTAATTGAGGCAAAATTCTTATCTAGTCTTAAAATGTGTTCGCCTAAATCACCGAATAATTTACCATCAAAACCTAACTCTTCATATGAAGCAAACATACCTTGTGAAGGAATATTTTTTAAGTTTTTGGTTTTGAAAACAATGTCACCCATTTTAGAACCTTCAATAAAGCAAACAACTAAATCATCTACTTTTAGAACATTATCTGTTGTTTGAATTGTTAAATTTCCGTGTTTAGTTTCAACGGTGGCAACAGTTAATAAATCAGAATTTGGATTTTTATAAAGTTCCTTAATTAGACCAAAAACAACACCTTCAATTGTGCTAAATTTTTTAATGCTTTCAACTTCGAAACCAAGTTTATTTATAACTTGCTCAACGTCCTTATTTAGCTTTATTCCAGGCAAATAAGTATTTAATTTTTTTAGTGAGAATATCATTTTACTCCTTTATTGACCAATCAATTTTTTCTTGATTTGTCTTTTCTAGTAAATTATTAATCTTTTTGAAAAACTCTCCATCTTTAAAGCTTTTATGATAGCCTAAAGGACTTGGGTGAGATAAAAATACAACATTTTTTGGTTTAATATCTAACTTATCAATAATCTTTTTTGATGAGTTTCCAAGAAGTCCAAAAACAACATTTTCGTTATTTTTTATAACTTCTTCCAATATTACTTTATTAAATTTTTCTCAACCAATATCAGCATGAGAATTAGGTTGTGATTCATTAACTGTAAGTATTGTATTAAGAAGTAAAACTCCTTGCTTAGCCCAATTACTAAGATCGTTTGATTTAATTATAATACCTTGGTAATCTTTTTTTAATTCTTTAAAAATATTTTTTAAACTACTTGGAGTTTTATCTGATTTTGTGCTAAATGCTAAACCATCTGCTACTCCTAAAGTAGGATAAGGATCTTGACCTAGAATTACAACTTTTGTTTCATTGACTTGAAAGAAATCAAAAGCTCTAAACATATTTTGGCTTTCAGGAAAAATTTTATAGCCTTCCTTTTCGAATTTTTCTAATTTAGAAAGTATATTTTGGAAATATTGTTTTTTACCCTCGTTTTGTAAAATGTCCAATCAACTATATTTCATGATTAAATTGTTCCAATATTCTTAAGTCATTTTTATAAAGATCTCTTATGTCTTCAATTCCATATTTTATCATTGTAATTCTTTCGATTCCAACTCCTGCAGCTAAGCCATTCATACTGTTGGTATATCCAGCAAGTTCTAATACATTTGGATGTAACATACCAGCACCAAGAATTTCAATTCATCTGTTTTTATAAAACATATCAACTTCAACACTCGGTTCAGTAAAAGGGAAATATGATGGTCTTAGTCTAATTTCAAGTTCTGTTTCAAAAACATAACTAAGCATTGATTTAAGAGTTCAAATCAAATTTGGGAATGATACTTTACCGACACTAACAAAATCAAGTTGTTTAAATTGATGAGAGTGAGTAGCATCATCTTCATCATTCCTATATACTTTTCCGATTGTAAATGTAGAAAAAGCTTTATTACAGTTTTTTTCGAGTTCGTGTGCACTTGCTCCTGTATTATGTGTTCTTAATAAAGTTGTTGCATTTAAGTAGAGAGAATCGTGCATAGCTCTTGCTGGGTGATCTTGAGGAATGTTTAAACGTTCAAAGTTATATAAGTCGCTAACTATTTCTCCTACTTCTTGTTCGTAATATCCATTATTTAAAAATCAATCTCTTAGTCTGTTTTCAACAAGAGTAATGGGGTGCAACGAACCAGGTTTGGAATTCGGTTTCGATACATCAACATATTGACTTTTTATTTTGTTATTAATTTCTTCTGCTTCAATTTTTTCTTCAACTTTTTTAAATTCTGTTTCATAAAAATCGAGCATCTTTTTAATTTTAAGCCCTATTTCTTTTTTTTCTTCTGACTTAGCAATTTTAAGTTGTGATTTTAAGTTAATTAGTTCTTCATCCTTAGCATAGACCTGATTTTTAGCAATCTTTAATTCTTCTAAGTTTTTAATTTTTTTAAAATTAATCATACTATTTCTCCCCTTTTTTAATTTCATTTCAGTAATCATTATATTTTATTTCATTTATATTTTTACCAGGATTATAATAAATTATATCCTTTAATTCTTTAGGTAAGTAATCTTGTTTTATTCAATTATTGTAGTAATCATGTGGATATTTATAAGTTAGACCGTATCCTAATTTTACCGATGATTTATAATGAGCATCTTTTAAGTGATCTGGAACTTCATAAATTTTTCCTGATTCTATATCGCTTTTAACTGCACTCATTGCTTTATAAATACTGTTGCTTTTTGGACTTAGTGCTACATCAATTATTGCAAATGCAACTGCTAAATCAGCTTCTGGGAATCCTAGACGTTCAATAGTATTAAACGCAGCTTCCATTCTTAAAATTATATTTGGGTTAGCTAAGCCAATATCTTCATAAACTACACAATTTAACCTTCTGATTAACCCTTGATAATCGCCACTTTTAACTATAACAAAGCCATAATAAAGAGCTGCATTTACATCACTTCCTCTTAGAGATTTGTGAAAAGCAGATAAATTGTTATAATGTGCTGATGAATCTCTATCACTATAAAAATTTATATTAGGAATGACTTTTTTAAGATCATCTTTATGTATTTTTTCATTATTTGAGTATAAAATTCCAAGCATTTGAAGATTATTAATACATGCTCTAAAATCTCCTGCGCTGTATCTTACTAATTCTAATATTATTTCGTCATCTAAATTTAATGAATTAAAATATTTATTCTTTATTTTAGATAATCCACTAAATAAATCATGTTCTTTAAGCTTTTCAAAAGATAGTATTTGCATTCTACTTCTAAGAGCAGGATTAACTCGAAAATAAGGATTTTCAGTAGTTGTAGCATAAACAATTATTTTGTCAAATTCAAGAAATGAAAGTAAAATATCTTGCTTATCTTTGTTTAATCTGTGAATTTCATCAATTATGATAATTTCATTATTTTCAAGTTTTTTTACAAGGTCTGATTTACTATCGATTGAAGCATTAAAATAATCATATTTTAATTTCATTTCATTTGCTAATGCAAAAGAGCAAGAAGTTTTACCGGTCCCACTTTCACCAAAAAAAATAAAGCTAGTTTTAACTTTGTTTAATACAATTTTTTTTAGTAAGTCAAGAATATGACTTTGACCAATAATATCGTCAAGAATTTTTGGTCTTAATTCATTAGCTAAATTTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_014014|337994:347052|344233_344896_-|WP_013054460.1|DBSCAN-SWA MKYSWLDILQNEGKKQYFQNILSKLEKFEKEGYKIFPESQNMFRAFDFFQVNETKVVILGQDPYPTLGVADGLAFSTKSDKTPSSLKNIFKELKKDYQGIIIKSNDLSNWAKQGVLLLNTILTVNESQPNSHADIGWEKFNKVILEEVIKNNENVVFGLLGNSSKKIIDKLDIKPKNVVFLSHPSPLGYHKSFKDGEFFKKINNLLEKTNQEKIDWSIKE >NC_014014|337994:347052|340760_342029_-|WP_013054504.1|DBSCAN-SWA MYKNIELNDKEVQNAINAELKRQEEHIELIASENYTSEDVLKAQGSVLTNKYGEGYPNKRYYGSCENVDVVETLAIERLKKIFGVEYANVQPYSGSVANAAAIASVAPHGGKIMGLSLNSGGHLTHGYKISFSGIFYNSVSYEVDKNGYLDYDDIERIAMKEKPDLIICGYSAYPRIIDFKRFREIADKCGAKLMADIAHIAGLIAANVHPSPVNYAHIITSTTHKTLRGARGGIIMTNDPEIAKKVDRWVFPGYQGGPLFHAIAGKAICFYEALTSMFQKYGANIVRNAKIFSESFINLGATLVSGGTDNHLFMIDVKTSYGITGKDAEKILEQFNITTNKNTIPNDTLSPTLGSGLRLGTAAMTSRDFTKWEELAQIMHTILRNHDMLKTSSPEAKTLKDSLKKKVNEFTNSFPIKKSYL >NC_014014|337994:347052|345837_347052_-|WP_013054582.1|DBSCAN-SWA MKNLANELRPKILDDIIGQSHILDLLKKIVLNKVKTSFIFFGESGTGKTSCSFALANEMKLKYDYFNASIDSKSDLVKKLENNEIIIIDEIHRLNKDKQDILLSFLEFDKIIVYATTTENPYFRVNPALRSRMQILSFEKLKEHDLFSGLSKIKNKYFNSLNLDDEIILELVRYSAGDFRACINNLQMLGILYSNNEKIHKDDLKKVIPNINFYSDRDSSAHYNNLSAFHKSLRGSDVNAALYYGFVIVKSGDYQGLIRRLNCVVYEDIGLANPNIILRMEAAFNTIERLGFPEADLAVAFAIIDVALSPKSNSIYKAMSAVKSDIESGKIYEVPDHLKDAHYKSSVKLGYGLTYKYPHDYYNNWIKQDYLPKELKDIIYYNPGKNINEIKYNDYWNEIKKGEK >NC_014014|337994:347052|344885_345836_-|WP_193333239.1|tRNA|DBSCAN-SWA MINFKKIKNLEELKIAKNQVYAKDEELINLKSQLKIAKSEEKKEIGLKIKKMLDFYETEFKKVEEKIEAEEINNKIKSQYVDVSKPNSKPGSLHPITLVENRLRDWFLNNGYYEQEVGEIVSDLYNFERLNIPQDHPARAMHDSLYLNATTLLRTHNTGASAHELEKNCNKAFSTFTIGKVYRNDEDDATHSHQFKQLDFVSVGKVSFPNLIWTLKSMLSYVFETELEIRLRPSYFPFTEPSVEVDMFYKNRWIEILGAGMLHPNVLELAGYTNSMNGLAAGVGIERITMIKYGIEDIRDLYKNDLRILEQFNHEI >NC_014014|337994:347052|337994_339242_-|WP_013054149.1|DBSCAN-SWA MKLSVVELFAGVGGFRVGLNHINSFDENGRAIENNNWNFVWANQYEPSSNKQHAFECYITRFGDKNHSNDDISKVDKKVIPDHNLLVGGFPCQDYSVARSLSNNKGIEGKKGVLFWEISDILETKKTPFVLLENVDRLLKSPSSNRGRDFAIMLKTLNDLGYDAQWRVLNAGDYSMPQKRKRVFIFAYRKDLKWSKSIKCNNLNLNELNIFNKVFPIETITELKHIDLNKYEDVLDISLNYKSGSFHECGIMIDNNIYHSKIKPINEVKHTLSSILEKASSFNDHYDNLIINEQNLEKWKFLKGSKKINRTSKEGHNYIYSEGAMSFPDNLDEPARTMLTSEGSINRTSHIIFDKKINNYRILTPLECELIQMFPANWTNTMPDKKRYFMMGNALVTGVISRMEPLLKEIIKNED >NC_014014|337994:347052|342051_344232_-|WP_013054594.1|tRNA|DBSCAN-SWA MIFSLKKLNTYLPGIKLNKDVEQVINKLGFEVESIKKFSTIEGVVFGLIKELYKNPNSDLLTVATVETKHGNLTIQTTDNVLKVDDLVVCFIEGSKMGDIVFKTKNLKNIPSQGMFASYEELGFDGKLFGDLGEHILRLDKNFASINDDPMQVLQLDDYILDVSTTANRNDANSYYVMAKELAAYYETEFVFNEKNHKGSLFSDIAIDRGMSNEITMFQAYCDKEFDLNIFDKMLLAKHNIDTSLGWAVNLTNLVLIITGAPCHVYDKNKIGLKITSELYSGKLKLLGNKDVDVENVLIIRDENKPISVASVMGLETTKVDEKTKEFIFEIGVFDPTLIRHSVKQIKLLSNSANQASRTITNEILELGILFLRKYLNDNKISISNLLGIPKIGPKKMIKFDKEKLSVYSDQNTSSLKKFIPAIEKLKKLGFSFDLEVNEVYVPIYRYDINYFEDIIEEIFRFYSYDNFEPVQLSNTSFKIHKRSTIKHELQANGYNEILTYSLLSKQKNFLNVFDFQEELALETFVSKEREVIRNSIIPSMLEAVEYNQKRKINKINFFEVGMINNNISVVGLASTTKSFEEIKEDIIKLYRDNKLVFEKLDNNEKIHPNVSAKIYQNNLLIGWIGKVNPKYDLTNAYVAEVLVPQFNSNKKYKIIDNEPLKSIDLTFGLKHGESIKSYVKDINNNFNVYDIELKDTFEKNNLINTTLRITSDSKTIELINKKYNK >NC_014014|337994:347052|339243_340758_-|WP_013054236.1|DBSCAN-SWA MKDLTKYSNKLPYDETNIKDIYNYSQKLLGKTFLDVLSLNYENEDLEDINDYYNNPSNKGSLGNLLEEYFFYYKPNNSELPDFQKAELELKTTPYEINKNKFIAGERLVISMIPNTNPIEKEFKNSHLEKKLKNVLMIWYLRNRNKKRIEYSIDYIYLYQLYSKLLSKDLTIILDDYNIIVNKITSGNAHNLSESDTKYLGACTKGSSASQILKPQYYNNKVLAKRRAFSLKQSYMTYILNNYIMNNDKEKFDSIFKDEEIIDGNFESKILDKLNFFIGKTEAELYHAFDLNKIIKSKNINRILVNKILGVNSDKSEEFQKANIDIKTIRVRKNGTPNESVSFPKIVIKDFVNKIFENSNEYNYFEKTRFLFVVFKENEEGNYKLAGSKFWNMPINELETIGKKEWELNKKKFLKGVNFKIEYNNLGKLIVKNDLPKKSETKIFHLRPHSLKSSYIINGIKYGEGSKTDMDELINGDKMTNQCFWLNSEYIKKIVEDIIKKEKC |
7 | Mycobacterium_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
889109 : 896843
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_014014|889109:896843|DBSCAN-SWA AATGAGTAGAAATAATAATAAATATTATAAAGAATCTGTCTCGCCATTGGAATATGAACGTAATGGTTTCAACGGAAAAATGAGAGCAGTAAATTGAAATATCATCAATGATGATAAAGATTTAGAAGTTTGAAACAGAGTAACACAAAACTTCTGATTACCAGAAAAAATTCCTGTATCAAACGATATCCCTTCATGAAGAACGCTTAGTGATGAATGACAAACATTAATTACAAGAACTTTCACAGGATTAACAATGCTTGATACAATCCAAGCTACAGTTTGTGATATAGCACAAATTCCTAATGCACTTACTGATCACGAACAAGTTATTTATGCAAACTTTGCTTTTATGGTTGCAGTACATGCAAGATCATATGGAACGATTTTCTCGACACTTTGTTCAAGTGATCAAATTGAAGAGGCACATGAATGAGTAATTGCTAATGAAGAATTACAAGAAAGAGCAAGAATCTTAATTCCTTATTATCATTGTGAAGACCCTCTTAAATCAAAAGTAGCAGCCGCATTAATGCCTGGTTTCTTATTATATGGAGGATTTTACTTGCCATTTTATCTATCAGCAAGATCGAAATTACCAAATACTTCAGATATTATTAGATTAATATTAAGAGATAAGGTTATCCACAACTACTACAGTGGATATAAATACCAAAAGAAAGTTGCTAAATTATCTGACAAGAGAAAAGCAGAACTTAAAGAATTTGTTTTTGAATTACTATATAGATTAATAGATGCTGAAAAGAAATTCTTAACAAAATTATATGAAGGATTTGATCTAGCTGAAGATGCTATTAGATTTAGTGTTTATAATGCTGGTAAATTCTTACAAAACCTTGGTTATGATTCACCTTTTACAGATGAAGAAACAAGAATCGAACCAGAAATATTTGCTCAACTTTCAGCAAGAGCAGATGAAAACCATGATTTCTTCTCAGGAAACGGATCATCTTATGTAATGGGTGTTACCGAAGAAACAGAAGATGAAGATTGAGAATTTTAGGAGGAAGAATGCACGAAGATGTAATTAAAGTAACAGATAAAGATATTAAAAGACCGAAAGGTGATGTACTTGTTGTTTATTATTCATCAATTTCAAATAACACACACCGTTTTATACTTAAATTAAATAAACCTTCAGTAAGAATTCCATATGAATTATCTGAAGAAATTGATGTTAATAAGGACTTTGTTCTTATTACTCCAACCTACAGTGGTGGTGGAGAATTTAAAGAAGGAGCAGTTCCAAAACAAGTTATTAAATTCTTAAATAAAGAATCTAATAGAAAACATTGTCGTGGAGTTATAGCAAGTGGAAACACGAACTTTGGCGATACATTTGCTTTAGCTGGTCCAATCTTATCTAAGAAATTAAATGTTCCATTGTTATATCAATTTGAATTGCTAGGAACTGCAGATGATGTTAAAAACGTTGCTAAAATGTTAGACGAATTCTGAGGAAAATAGGGGATACATGACTAAGAAAACAAAACTTGCAGACATAAATAACTATGATGAATATATTGCTCTAAACGCAAAAAGTAAATTATTGGCTTGTGGAAAAAGTGATTTTTTTCAAGATCACGAAGCTGCCAGATTATACATGAAGCACCATGCTCTACCTAATACAAAAGTCTTTAATTCTATAAAAGAAAGATTTGATTATTTAGTTAAACATGGCTATTATGAAGATGAATTGGTAAAAAAATATAATATTAAAGATATTGAAAAACTAAGACAATATGCTATTGATTATCATTTTAAATTTACTTCATTTATGGGGGCTTTAAAATTCTATAATGCTTATTGTTTAAAAAGCTTTGATGATACTGAATATTTAGAACAATATGAAGATAGAGCTTTAATGAATGCGCTTTTCATTGGAGATGGAAATGTTGAAGTTGCACAAGCTACACTTGAAGAAATAATGAGTGGAAGATATCAACCGGCTACACCAACTTTTTTAAACGCTGGTAAAAAACAACGTGGAGAATATATTTCATGTTATTTATTAAGAGTTGAAGATAACATGGAATCAATTGCAAGAGGAATTTCAACCTCTTTACAATTATCAAAACGTGGTGGCGGAGTTGCTCTTTGTTTAACGAACCTTCGTGAATTAGGTGCTCCAATTAAAAATATACAAAACCAAGCAACAGGAATAGTGCCTGTTATGAAAATTCTTGAAGATTCATTTTCATATGCAAATCAACTTGGACAACGTCAAGGTGCTGGAGTAGTTTATTTAAGTGCTCATCACCCCGATGTAATGACTTTCCTTGATACAAAAAGAGAAAATGCTGATGAAAAAATCCGTATTAAATCACTTTCATTAGGATTAGTTTTACCAGATATTACATTCGAATTAGCTAAAAATAATGAAGACATGGCTCTATTTTCTCCTTATGATGTTCAAAGAGAATATGGAAAAGCATTTAGTGATATTTCAATAACTAAAGAATATTACAATATGTTAAATAATAAAAACATTAAAAAAACATTTATAAGTGCTAGAAAATTATTTCAAACCATTGCTGAATTACACTTTGAATCTGGTTATCCTTATTTACTTTTTGATGATACAGTTAATGACAGAAGTGCTCACCCTGGTAGAATTATTATGTCAAACCTTTGTTCTGAAATTGCGCAACCAAGTTCTGAAACAACATATAATCCTGACCTTTCATTTGTAAAATTAGGTGAAGACATCGCATGTAACTTAGGTTCAATGAATATTGATAAATTAATGCAAGCAGGAAACAAATTCTCTGATTCAATATATCGTGCAATTTATGCTCTTAATCACATAGCTACAAACTCTGATTTAAGTGCTGCACCAAGCATTCAAAACGGAAACAAAAGAAATAGAGCTATTGGGTTGGGAGCGATGAACTTACATGGTTTCTTATCGACAAATAGCATTTACTATAATACTAAAGAAGCTGTTGAATTTACAGATTTATTCTTCTACACATTTGCATATCACTCATTTAAAGCTTCAAATAAATTAGCTAAAGAAGGATTTGGAAAATTTGCTAATTTCGAAAATACAAAATTTGCAACTGGTGAATATTTTGATAAATATACAAAAGCAAAAGATGATGAATATAAACCAAAAAGTCAAATTGTTGCTGAATTATTCAAAAAGTTTGATGTTCATATTCCAACCAAACAAGAGTGAAAAGAACTTTCAAAAGAAATTCAAAAAACTGGACTTGCAAACTCTCACTTAATGGCTATTGCGCCTACCGGTTCAATAAGTTACTTGTCAGGATGTACACCAAGTTTACAACCTGTTGTAGCGGATGTTGAAGTTAGAAAAGAAGGAAAACTAGGACGTGTTTATGTTCCTGCATACAAAATAAGTGAAGAAAACAAAAAGTACTACCAAATGGGTGCTTATGAAGTTGGACCATTACCAATTATTGATGTTGTCGCTGCCGCTCAAAAACACATTGATCAAGCAATTTCTCTAACCCTTTTTGTTAAAGATACAGTAACAACGCGTGATTTAAATAAAGCTTATATTTATGCTTTTAAACAAAAATGTGCTTCTATTTATTATGTTCGAATAAGACAAGATGTTCTTGAAGGTAGCGAAAATCTTGAATGTACTTCTTGTGTAATATAATTCATATTTAACTATTACAAAGTCAAATACAAAAAAACGCCTAGTGCGTTTTTTGAATTCTTTTGTATGTTTCTACAACAAATTTTTCAAATTTTTGTTTTTTTATAACTTCATAATTTGATAAGTTAAGGTTTAAATAAACATTACCTTGATAATCGCCATCAACTCTTGAAATTAATAATTCATCAGCATATTCAAAATACTTTTCATAAATAGATTTACCACCTGCAATGAATAAAACTTCATTATTAGTTTTAAATTTAGCAAACAAGTTTTTAAGTTCTGTTTCGTTGTGAATTGTAATGCAATTATCGAGTGTTTGTTCTGATAATACATAAATTGTTCTCTTGTCTAATTTTCCAGGTAAACCTAAAAAAGTAGTTCTACCAAACAATAAAGAATGGCTGATTGTTGTATTTCTGAAGTGTTCGAATTCTTCTTTAATTCTTCACGGCATTTTATCAACATTACCAATTAAATTGTTTTTATCAGTTGCAACTATCAGCTTTATCATTAAACAGAAACCTCTGCTTTAATTCTAGAGTGTGACTTGTAATCTTTAAGTTCTATGTCTTCGAATTCGAAATCAAAAATTTCCTTAACTTTTTTATTCAAAATAATTGTTGGGAGTTTAAAAGGTCTTCTTGTTAATTGCTCAGTTACTTGATCAACGTGATTTGAATAAATATGAGCATCTCCGATTGTATGGATAAATTCGCCCACTCTTAAGTTTGTTACTTGTGCAACCATGTGCAATAATAATGCATAAGAAGCAATATTAAATGGAACCCCAAGAAATAAGTCACCACTTCTTTGATAAAGTTGTAGCGATAATTCATCATTAGATGAAACATAAAATTGAAATAAAGCATGACATGGTGGAAGAGCCATTTTATCTACTTCTTCAGGATTTCAAGCACTTACTAAAATTCTTCTAGAAAAAGGTTTTGTTCTAAGTTCGTTTATTACATACTTAATTTGGTCAACACCATTAAAATCTCTTCATTGTCTACCATAAACAGGTCCTAGATTTCCATGTTTGATTGCAAATTCATTATCATTCTTAATTTTATTAATGAATTCCTCTATGGTTTCCCCTTGAAAATCCGTTGATCTTTTGTAAATTTCATAAGGTCATTCATTTCAAATATTAACATTTCTATCTACCAAGTATTTTATATTGGTTTCGCCTTTCAAGAATCATAGAAGTTCAACAACTATAGATTTCCAAGCCATTTTCTTAGTTGTTAAAAGAGGGAATCCTTTCCTTAAATCATATCTTGTTTGAGTACCAAAAACACCAATAGTACCGGTACCTGTTCTATCTCTTCTTACCATTCCGGTATTTAATACAGTTTTTAGAAGTTTTAGATATTGCGTCATTTTTGCTCCTTTATATATATGAATAGTGAAAATAATTATAGATTAATAAAATGAATTAAAAAATAAAAAACATTTTTTATTAATCTAGAAATTTAATAATTTATATCTCTTTTTTTGTGTCAAAAATACTTTAATATTTTTTATGTTTATAAAATCATATTAAAGTATTTTTACTAATTATAATTAAATAAAATAAACACTATATAATAAGTAATATCTTTAATTAATAAAGATAAAGAAAGCAGTATATGAGAGAGTTCAATAAAGACAAAAAAGGTTTCGATTCAAAAAGATCAAGTAGACCAAACAACAACATCAGATCATGAAATAAAGATGATAGAAGAAGAGATGACAGGGGTTTTGACAATAAACCAAAATTCGATAGAAGTGAAAAACCAAGAGAGGAAATTGACTTTTTCAAAGAATGATCAAGCATTAAAAGTTTAGAAGAAAACATTAATGAATATTCAACAATTTTAAAAAATTTAAAAGGAATCAGCAATACAGATTGATTTAAAAATAAATTCAATGCATTAACAGAAATACAAGTTGAATACATTAATCATTTAGAAATTTACGTAGCAAGATTAACATCAATATCAGAAAACAAAAAAGAAAGATTTAATAAAAATGTTTCATCAAGCAACCAAAATATTATGGATATTGTTTCTAGATTTAAAGAACTAGATAAAGAACAAAAAGAAAGCTATAAAACTCTTTTTGATGAATATTTAGAATCAACCAAAAAGAATAAATAATAATTAATCTTTTAAGATATATAAAACCACTTTTGCCTGTAAATAAGGTGAACGTGGTTTTTAAATTCAAACTTCATGAAAAAAGTTTAGTTGTTCAATAAAAAAACGTCTTTAATTATTGTTTCAAGATAACCATCATTTGACATATTATAATTCATTAAGGTTATGTATTTGAATGCTTTTTCTAATTGATTTTTTGAATTATTATCTCAGCATAAGCCATCGGTAATCAGTAAAAATTTTATACCTCTTAAATTTAATTCATTATTTCTGTTGATATAACTATCTATAATTTCCTCTGGTTTTGAACCGCCAGCAAAAAAGTAATTAACCTCAATATTAAGTGCTTTTCTATTTTTGATTAAGATAAAATCTGCTTTTCTATTTCGAAAATCATCATTAATTGGAATGCCGAAATTTGCTAATTCTCCAAGTTTCTTTTGTTGAAGTAAAGTTATATCATATTTCTTACAAATCTCAGCAATTAATGGTTGGCAAATATCTTCAAAAGCTCTACCACTTCTATTTTTTCTTCCATTAGAATCAAGACCAACTAATACACCGGATACATAATCTTTTATACTTTTCTCAAGTAAATTTGTAAATAAATTCTCTAAACCCATATCTTTAAAGAGAGCATAATAAAGCTCTTTTTCATCGCTTGACAAAAATGAATTTGACTTATATTCAATAAATGAATATTTATAGTAAAAACTTTTTGCTAAATTTAATATTTTCAACTTTGATTTACCTTTTTCAAGAACTTTTCTTTCATTTCTGCTTAATGCAAACAGTAGTGGAAAAGTAGCAATAACACTTGGAACTTTTGTTAATAATTCTATAAAACGCTCCTTAAAGTTTTTCACTCTAATCAAAGAATTTAATGCATTTAATTCAACATCGTATTTTTCTATTTCAATTAAATTATTTCAGTCTACAAAAAAATTGAAACTTCTATTAGTTTCTAATAATGTATTAACAAATTTATCAATAAGTTTGTTTTTATGATTTTCGCTCATATATTTTCTTCCAATCATCTTTTATTTATTTGGTTGTATTAATAATTATTTCAATTCAATATTACTACAATCTAATATTTAATATGGTTTTTGAATTATTGGTATTCATAATTCGTAATTATAACTTCTTCACCAACTCTATTTTTTGCATCACTATTAATCATCCTTTTTACTGAAACAGTTTTTATATTAAAATCTTTATAAAGAAAATTTATTAATTCTGTATTATGGTTTGTTAACATAACATAACATCCTCTTTTATCAAGTTCTTTAAATAAGTTAGCCAATCTAATATGATCGTTTAATGTAAAACCTTCTTTTGAATATTCATGAAAACTTGTCTCGGTTAGAGGTACATAAGGGCTATCCAAAAAAATAAAATCTCCTTTTTTAGCATTATTTACACTTTTTTCAAAATCTACACTTAGTATTTCAACGTTTTTTAAATACTTGCTAATTGCTAAAATATTTTCTTTCGAGAAGGAACTTCCTCTCTGTTTGTTGTTGAACGGAACATTAAAAAGACCTTTTGAATTTACTCTATAAAGGCCATTGAAACATTTTTTATTTAGAAAAATAAATAACGCTGATTGCTCAACATCAAACTCTTGATTAATAATTTTTTTATTAAATTTATTTCTTAAATTATTGTATTTTTCTTTATCAATATTAGAGGAATCGAATTTGCTTAATAAATTTATAAGTTCATCTGGATTGTTTTTTATGATTTTGTAAGTGTTTATTAATACATTATTTATATCGTTAATGAATGCTTTTTTTGGTTTAAGAAAAAGTAATAAAGCACCGCCACCTACAAACGGTTCATAATAATCATTATAGAATTTAGGTAGTGAATTACTAATTACATTTAATAATTGTCTTTTACCACCTACTCATTTTACAAAGGGTGTTAAACGTTCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_014014|889109:896843|889109_890132_+|WP_013054480.1|DBSCAN-SWA MSRNNNKYYKESVSPLEYERNGFNGKMRAVNWNIINDDKDLEVWNRVTQNFWLPEKIPVSNDIPSWRTLSDEWQTLITRTFTGLTMLDTIQATVCDIAQIPNALTDHEQVIYANFAFMVAVHARSYGTIFSTLCSSDQIEEAHEWVIANEELQERARILIPYYHCEDPLKSKVAAALMPGFLLYGGFYLPFYLSARSKLPNTSDIIRLILRDKVIHNYYSGYKYQKKVAKLSDKRKAELKEFVFELLYRLIDAEKKFLTKLYEGFDLAEDAIRFSVYNAGKFLQNLGYDSPFTDEETRIEPEIFAQLSARADENHDFFSGNGSSYVMGVTEETEDEDWEF >NC_014014|889109:896843|890603_892760_+|WP_013054617.1|DBSCAN-SWA MTKKTKLADINNYDEYIALNAKSKLLACGKSDFFQDHEAARLYMKHHALPNTKVFNSIKERFDYLVKHGYYEDELVKKYNIKDIEKLRQYAIDYHFKFTSFMGALKFYNAYCLKSFDDTEYLEQYEDRALMNALFIGDGNVEVAQATLEEIMSGRYQPATPTFLNAGKKQRGEYISCYLLRVEDNMESIARGISTSLQLSKRGGGVALCLTNLRELGAPIKNIQNQATGIVPVMKILEDSFSYANQLGQRQGAGVVYLSAHHPDVMTFLDTKRENADEKIRIKSLSLGLVLPDITFELAKNNEDMALFSPYDVQREYGKAFSDISITKEYYNMLNNKNIKKTFISARKLFQTIAELHFESGYPYLLFDDTVNDRSAHPGRIIMSNLCSEIAQPSSETTYNPDLSFVKLGEDIACNLGSMNIDKLMQAGNKFSDSIYRAIYALNHIATNSDLSAAPSIQNGNKRNRAIGLGAMNLHGFLSTNSIYYNTKEAVEFTDLFFYTFAYHSFKASNKLAKEGFGKFANFENTKFATGEYFDKYTKAKDDEYKPKSQIVAELFKKFDVHIPTKQEWKELSKEIQKTGLANSHLMAIAPTGSISYLSGCTPSLQPVVADVEVRKEGKLGRVYVPAYKISEENKKYYQMGAYEVGPLPIIDVVAAAQKHIDQAISLTLFVKDTVTTRDLNKAYIYAFKQKCASIYYVRIRQDVLEGSENLECTSCVI >NC_014014|889109:896843|894987_895920_-|WP_013054507.1|DBSCAN-SWA MSENHKNKLIDKFVNTLLETNRSFNFFVDWNNLIEIEKYDVELNALNSLIRVKNFKERFIELLTKVPSVIATFPLLFALSRNERKVLEKGKSKLKILNLAKSFYYKYSFIEYKSNSFLSSDEKELYYALFKDMGLENLFTNLLEKSIKDYVSGVLVGLDSNGRKNRSGRAFEDICQPLIAEICKKYDITLLQQKKLGELANFGIPINDDFRNRKADFILIKNRKALNIEVNYFFAGGSKPEEIIDSYINRNNELNLRGIKFLLITDGLCWDNNSKNQLEKAFKYITLMNYNMSNDGYLETIIKDVFLLNN >NC_014014|889109:896843|894391_894901_+|WP_041594089.1|DBSCAN-SWA MREFNKDKKGFDSKRSSRPNNNIRSWNKDDRRRDDRGFDNKPKFDRSEKPREEIDFFKEWSSIKSLEENINEYSTILKNLKGISNTDWFKNKFNALTEIQVEYINHLEIYVARLTSISENKKERFNKNVSSSNQNIMDIVSRFKELDKEQKESYKTLFDEYLESTKKNK >NC_014014|889109:896843|890140_890596_+|WP_013054725.1|DBSCAN-SWA MHEDVIKVTDKDIKRPKGDVLVVYYSSISNNTHRFILKLNKPSVRIPYELSEEIDVNKDFVLITPTYSGGGEFKEGAVPKQVIKFLNKESNRKHCRGVIASGNTNFGDTFALAGPILSKKLNVPLLYQFELLGTADDVKNVAKMLDEFWGK >NC_014014|889109:896843|896015_896843_-|WP_013054605.1|DBSCAN-SWA MERLTPFVKWVGGKRQLLNVISNSLPKFYNDYYEPFVGGGALLLFLKPKKAFINDINNVLINTYKIIKNNPDELINLLSKFDSSNIDKEKYNNLRNKFNKKIINQEFDVEQSALFIFLNKKCFNGLYRVNSKGLFNVPFNNKQRGSSFSKENILAISKYLKNVEILSVDFEKSVNNAKKGDFIFLDSPYVPLTETSFHEYSKEGFTLNDHIRLANLFKELDKRGCYVMLTNHNTELINFLYKDFNIKTVSVKRMINSDAKNRVGEEVIITNYEYQ >NC_014014|889109:896843|893273_894143_-|WP_013054133.1|DBSCAN-SWA MTQYLKLLKTVLNTGMVRRDRTGTGTIGVFGTQTRYDLRKGFPLLTTKKMAWKSIVVELLWFLKGETNIKYLVDRNVNIWNEWPYEIYKRSTDFQGETIEEFINKIKNDNEFAIKHGNLGPVYGRQWRDFNGVDQIKYVINELRTKPFSRRILVSAWNPEEVDKMALPPCHALFQFYVSSNDELSLQLYQRSGDLFLGVPFNIASYALLLHMVAQVTNLRVGEFIHTIGDAHIYSNHVDQVTEQLTRRPFKLPTIILNKKVKEIFDFEFEDIELKDYKSHSRIKAEVSV >NC_014014|889109:896843|892800_893274_-|WP_013054223.1|DBSCAN-SWA MIKLIVATDKNNLIGNVDKMPWRIKEEFEHFRNTTISHSLLFGRTTFLGLPGKLDKRTIYVLSEQTLDNCITIHNETELKNLFAKFKTNNEVLFIAGGKSIYEKYFEYADELLISRVDGDYQGNVYLNLNLSNYEVIKKQKFEKFVVETYKRIQKTH |
8 | Staphylococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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