Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_005295 | Ehrlichia ruminantium str. Welgevonden, complete genome | 1 crisprs | DEDDh | 0 | 0 | 1 | 0 |
1. NC_005295
Click the left colored region to show detailed information
0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_005295_1 | 1146227-1146322 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_005295_1
|
1 spacers
spacers of NC_005295_1
>1.1|1146250|50|NC_005295|CRISPRCasFinder TGTAATACAATCTACAATATGCACACACGATATACTTTAAAGCCGTTAAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_005295_1
The CRISPR arrays of NC_005295_1 >merge|NC_005295|1|1146227-1146322|CRISPRCasFinder ATGACTTATAATATCAAAATTAATGTAATACAATCTACAATATGCACACACGATATACTTTAAAGCCGTTAAGATGATTTATAATATCAAAATTAA >NC_005295|1|1|1146227-1146322|CRISPRCasFinder ATGACTTATAATATCAAAATTAA TGTAATACAATCTACAATATGCACACACGATATACTTTAAAGCCGTTAAG ATGATTTATAATATCAAAATTAA
>NC_005295.2|WP_011155355.1|1144837_1145413_+|Holliday-junction-branch-migration-protein-RuvA MIGSITGNVEEIRDSYIILNVGNIGYIIYVSHKVLQTCKVGDNIKLYIETYVNRDNITQLYGFLNRQEQDYLKMLVTINGINYKTALSILSKLSPEQIFSAVVNNDKIAFKGNGIGEKLAGRIITELQYKINKMPIEETFSIIENDDSLAALISLGYEKLKAFNVIQEIKSKTPDASTQEVIRKALQKLSQ >NC_005295.2|WP_011155354.1|1144122_1144827_+|heme-ABC-transporter-permease MTRFIRYTKLILPYIIFSFTICLAYSLYMIFIASPADYKQGEFVRIMYIHVPSAWISLGSYTLIAILSFAILIWQNTVATIISHAIAPLGLVFTAICLITGSIWGKCTWGTWWVWDARLTSMLILFFLYLGYLSLWSFFDNEARSAKASSIFAIFSAINIPIIKFSVNIWATLHQPASILRKDGIAIDISMLIPLLSMFITLGLLFCILLILRSHTLINLRKINCRLAVLNNIL >NC_005295.2|WP_011155353.1|1141724_1142354_-|guanylate-kinase MNNNLKSRGIMLVMSSPSGGGKTTISQLLVNELQGEIIRSVSVTTREPRNEEVEGKDYFFVTEDEFHHLCNTNQMLEYAKVFGNYYGIPRRFVMDNINNGISILFSIDWQGAFKLIDIMSEHVVSVFILPPSMEELKRRLYNRSGESDMINQRLKEAAFEISHCYRYNYIIVNHNIEESVQQIKSIFIAEKLKTHRKMFLEQVVKSYYI >NC_005295.2|WP_011155352.1|1139364_1140267_-|bifunctional-methylenetetrahydrofolate-dehydrogenase/methenyltetrahydrofolate-cyclohydrolase-FolD MEGNIVSGKAVADNITNILATCISDLKAQHNLTPCLIVVLVGDDPASQLYVRNKQRKAEMLGLRSETMLLPSTISESSLIEKIHQLNNDDSVHGILVQLPVPRHIDKNLIINTIDPKKDVDGFHNENVGRLFTGQKKNCLVPCTPQGCLYLIKTITRNLSGSDAVVIGRSNIVGKPMACLLLGENCTVTTVHSATRDLPDYCRRADILVAAVGIPRFVKYSWVKHGAIVIDVGINSIEEDGVKKFVGDVDFAEVNKIASAITPVPGGVGPMTIAFLMVNTIIAACNQSGIDGFLEKYLDL >NC_005295.2|WP_011155351.1|1136503_1137028_-|cytochrome-c-family-protein MDGFQLNKIFTAILFACFIVLFVSNVTDLLYNPEPHTEPVRGYKVDVEQQGLIEESAAVPDVQVDIQALVAQANITKGKEISKKCVSCHTFEKGGANKVGPNLWHIIGNKKAHLGDAFNYSKAMLNIGGTWEYHDLFQFLTKPQAYVKGTRMAFAGISKPQDIADLIAYMKSLE >NC_005295.2|WP_011256149.1|1135703_1136501_-|alpha/beta-hydrolase MSLWRIHMLNQGRLKLSYAPDLHISYKQLISDSNVSIVFLSGFQANMQGAKATALYNYCKAHNFNLILFEYLGHGESDGQLIDYSISDWYKNSIDVIDQLTPPNSSHIIIGSSLGVWMMFLLAMSHPHRVSNLISLAGAPDITESLFKSLTTVQQDELLKYGHVTFLSSNEDSRSRVITRYMFEDGRKNLILNREFINIECPVTLIHGMNDTIVPYNVSLTLAEKIRSSYLTLRLIRSSDHSLSDDISLTIIFKAIEEAIEQQNL >NC_005295.2|WP_011155349.1|1132517_1133996_+|cation:proton-antiporter MHFFKNSLSDFSIIWLVFLPYISSVLILLLKKVRYSQETISFIASCMLFYAAFNIYTQTTDNISALHVVLCEFTPKIQLTLKTEYIGIIFSILASFLWIVTTIYTISYMRHNDKNNKKQSIFYACFAASIGCTMGIAFSGNLLTLFIFYELLTISTYPLVTYYANHESQISGRYYMGILLGTSMLLFLPAIIITYNISGTLDFTKGGILPSSISSVFLMSLLFLFIYSIGKTALMPIHSWLPRAMVAPTPVSALLHAVAVVKSGVFALIKVLLYIIGLERLQALVQTHNNILMYASAITILLASFIAIKQTNLKKLLAYSTISQLSYITIAVSLYTERAVDISIFQMISHAFAKITLFFTAGAIYTKTGKKYLNELQGIGKSMPITMTAFSIGAAAMIGIPPAVTFWGKFFIISESLNQNIMSVVLVLIASTILNTIYFIPIIYNAFYVPCNTNKYAEAPIPMLIAISITTICTILLFLYPDVIFNIINHLK >NC_005295.2|WP_011155348.1|1128887_1131509_+|pyruvate,-phosphate-dikinase MSERLIYYFSKNKCDGNLKLNHILGSKGANLAEMCNIGISVPPGFTISTAVCSHYNDNKLPDQISYLIQNAIEFLNNEVNLKFGDENNPLLLSVRSGSVSSMPGMLDTILNVGLNDKTVIGLAKKSGDLFAYDSYRRLIQMYAHTVLQVENSFFEEAIYKKKSVSTSKNEKISDPNIFKELIDEFKRIVKLHTNKDFPQDVNEQLYTAIYAVFRSWMNKRAITYRKIHNIPDNLGTAVNVQSMVFGNMSENSATGVVFTRNPSTGTKEIFGEFLISAQGEDVVSGTHSPLPLNKMKDLMPITHNELEQVCKKLELYYRDMQDIEFTIENGKLWILQTRSGKRSIQSAVKIATDMVKEKLISKEEAITRIDHKSFSKLFHPTLESSTNTDIIAYGLPASPGAATGQVVFTPSDAEQLKKEGKNVILIRQETNPEDINGMNSAVGIITLRGGMTSHAAVVARGMGKPCICSVNNIFIDKSEQFFYTNTGIKVYKGDNITINGCNGEVILGVIKTTLPKLDESFYDLMEWVDEIRTLKVMANADTPEDAEISMNFKADGIGLCRTEHMFFSDKRISIVQEMIVSDKKEERAVALEKLEIMQKEDFKKIFTHTLDKQVTIRLLDPPLHEFLPDNDDAIQEISSRTGKSLEKLKNRILYLLEKNPMLGHRGCRLAISYPEIYEMQVKAIFLAIKELQEETGIKEIIPEIMIPLIMSEEEIIVIKELVNNIAKQFDNPKYLLGTMIELPKAALIADKIAKHVQFFSFGTNDLTQTTLGVSRDDSASFIGTYRDLGIIKHDPFETLDIDGVGKLISIAVSLGKKESPDIKIGVCGEHGGNFESIQFFSRLNINYISCSPYRIPIARLIAAQCTIFNKDIN >NC_005295.2|WP_011155347.1|1127397_1127910_+|RDD-family-protein MPIIKSMKTKTAKTTILLKRISANIIDQIILSLINYQISWFIGEITFLSFIINIVSHCCYYMYFLSSEAQASIGQKILKIHTIRCNDKKIDAKLAFDRTLSEFLCPTIFMINIQIVNMHINNSLITIIVFIVTIFTLILSVYWYFIALFSESNQTIHDIIFDTIVVENKQ >NC_005295.2|WP_011155346.1|1126786_1127419_+|HAD-IA-family-hydrolase MKQPIAVIFDWYNTLIDTKVNIDRPTFYQVLNRMGYKDVNLNTVSDSTILKYLAMLLGDRWEEGVALYENSLEKSQKLDNFVLNDGAIELLDTLKGNNITMAIVSNKNGKSLRSEIHNKNLSHYFNSIIGSGDTASTKPSPEPVLTALAYLNIQPSKNVFFIGDSISDIQSATDAGCLPIRYGNCSTKDNVLSFKNFNEINKFICQLLSL >NC_005295.2|WP_044148681.1|1146573_1147563_+|Holliday-junction-branch-migration-DNA-helicase-RuvB MKDILQSSECIEDQQNISMRPNLLDEFIGQSSVVSNLKIFIDAAYERKEPIDHILLYGPPGLGKTTLAHIIAKELKVNFRSTAGPLLSKAGDLAAILTNLQARDVLFIDEIHRLNRNIEEILYSAMEDFSLDIIVGEGCGARTLRVDIPPFTLIGATTRIGLLSNPLRDRFGIPMHLEFYSTEELTKVIKRAAKVIHTNISNNGAEEISLRSRGTPRIALRLLRRIRDFISVTKQDTITHEFADQALLRLGIDKLGLDRQDIKYLQFIYEANNPIGIDTISSALSEDTGNIEETIEPYLIKINFIQRTPRGRVITQKAISYLNEQTYNM >NC_005295.2|WP_011256150.1|1147540_1147774_+|hypothetical-protein MNKHTICSKVLHIIHNFYITHNYTSFERDNDYTLTTSNRNIIDILTSEARQFLNPELFKQHLLNFIVPLVLLIMKIY >NC_005295.2|WP_011155357.1|1150504_1151701_-|multidrug-effflux-MFS-transporter MKVFKRNILILIITVIVMTEMSSDIYLPSLPKISDFFHVDYSIAQLTISLNLAGISISGLLYGPLSDYYGRRPVMLLGIVIFTIASVACYFANNVMMLIIMRFIQGFGTGVAGVVGYAIIKDMYSGDECAKNISIVNIAVAFSPVLGPILGSTVISYEYNWNVLFMIISVISVIVLICLFSFLRETLVIDRSKNNISFRSVMYKYKELICNYRFFGFALIHSLTIMWIWSCITNLPFVFVNDMGVPVAYYGYFVAINVAAYIIGAIINQKFVEKFGMSNMLILGLILTTLSDASVFILYQVIEITPLLAEIMWIPSGMGIAFILGNNMTCAFSEIKETGIGSAFILFLQTIFGAIGIYILSCFYDGTLIPVIIFPVVCSILCIIIYLVLKVTEKKTNM >NC_005295.2|WP_011155358.1|1153030_1153888_-|FAD-dependent-thymidylate-synthase MESEITKRIVVPELEDILYKEHKVLDKGFVRLVDYMGSDESVVQAARISYGRGTKSVSQDAALINYLMRHSHTTPFEMCEIKFHIKLPIFVARQWVRHRTANVNEYSARYSVLDHEFYIPELDHVATQSEDNAQGRGNSLSNEDAQYVTDLLKRDSDMVYETYNKFLIKGVSREISRISLTLNYYTEWYWKIDLHNLLHFLRLRSDVHAQYEIRVYAETMLEIVKKWVPLTYAAFVEYCLESQSFSKSALSVVKKLIAGEDVAREDTGIGKREWRELMDVLADNK >NC_005295.2|WP_011155359.1|1155649_1156426_-|succinate-dehydrogenase-iron-sulfur-subunit MVQFFLPKNSKINKNGEVYNAPENAKNVKCFKIYRWSPDDDSNPRIDTFFIDLDQCGQMVLDALIKIKNEIDSTLTFRRSCREGICGSCAMNIDGTNTLACTKAISDIKSDVEIYPLPHMNVIKDLVPDLSNFYKQYESITPWMQAEEPSHNKERLQSIEDRSKLDGVYDCILCACCSTSCPSYWWNPDKYLGPAALLQVYRWLIDSRDEASDKRLDMLDDAFKLYRCHTIMNCTNTCPKGLNPAKAIADIKQMMVRR >NC_005295.2|WP_011155360.1|1156459_1158256_-|succinate-dehydrogenase-flavoprotein-subunit MSSSTYSIIDHEYDVVIIGAGGAGLRATFGMTSVGLSVACISKVFPTRSHTVAAQGGISAALGNVTEDDWRWHMFDTVKGSDWLGDQDAIEYMCKNAAEAVIELERYGVPFSRTSDGKIYQRPFGGMTTEFGKGKPAIRTCAASDKTGHAILHTLYQQSLKHNAEFFVEYFAIDLIMNEVGQCQGVIAWSLCDGTLHRFRSHAVVLATGGYGRIYFSATSAHTCTGDGGGMVSRINLPLEDMEFVQFHPTGIYGSGCLMTEGCRGEGGYLINSEGERFMERYAPKAKDLASRDVVSRAMTLEIREGRGVGPNKDHVYLSISHLGAEVIHDKLPGISETARTFAGVDVTKEPIPVLPTVHYNMGGIPTNYYGQVITLTDSEEKIVPGLFAIGEAACVSVHGANRLGSNSLLDLVVFGRAAAIKAKELIKPGMLHAPINKASEEKIIARFDGIRFSKGSLRVAEVRGKMQHVMQNHAAVFRTAEVLDEGKVKIKDVAKLMPEIVVQDKSMIWNSDLVEALELTNMMPQAVVTMECAANRQESRGAHAREDFPERDDENWMKHTLAWYDAANCSVEIKYKDVAKTTLTNDVQYFPPQRRVY >NC_005295.2|WP_011155361.1|1159895_1161647_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MKILFQFVKPYLLYFIFAYLVVAVSSVTILAFGYGLHNLVDSWVTTSSVTSINNALLFLLIVVLIVGVTSFLRMWLTGYGSERVITGIRLNLYNRIIHFSPRFFENNSISSLVTRLMADTSALQVILSASMSTILRNATTLLGSIVMLVHTNFKLTTYTVVVIPVILVILTSLGKKVKLLSQKVRLKTDEITSFVEETYRGISVIQSFSKENTTKQKFSNLLGVSLNITNKYIILRALLVTLIITSAMTSIGLVLSLGIKEVLNNNITVGSLFSFIFYAAIAAGSVNNMGDNLHDIQKAVRISEDISKVLLMPLDIHEIENPKIVDELKDAILINNVTFSYPSKPNDPALKGVSFSIDKGQVVALVGPSGSGKSTITNILLRFYDITAGDVTIDGINIKDLSLSSLRSLFSVVPQNPVMFSGTILENITYGVSDATYEDVKNAAKTACILDFIESLPNKFSTFVGERGLCLSEGQKQRIAIARAVLKKDSGVLILDEATSSLDSKNEQLIHDALDNLKNNKTMLIIAHRLSTIVKADKIVVFNNGCIDDIGTHKSLIAKQDGLYSKLAKLQLSNENFSDGSSN >NC_005295.2|WP_011155362.1|1161650_1161980_-|iron-donor-protein-CyaY MPHFLCVSDFQSLSYNVLDTLVNMIDAADLDGILECENCNGIVSISDGKGNVYIVSKHEPSLQIWVASPISGSVRFSYNKSLNIWVNNNNDELFHFLKSEINMLFNVMI >NC_005295.2|WP_011155363.1|1162177_1163443_-|serine-hydroxymethyltransferase MVRYISDYDLQDVDTEVFKCITDESNRQNSQLQLIASENFVSKAVLQAQGSIFTNKYAEGYPGKRYYCGCHFADIIENIAIERLCKLFGCKFANVQPHSGSQANQGVFAALLKPGDTVIGMSLDCGGHLTHGSAPSISGKWFNAVQYQVDRDTGMIDMDAIEKLALSHNPSLIIAGSSSYPRTIDFKRFREIADKVGAYLLADIAHYAGLVAAGEFPSPIEYAHVITSTTHKTLRGPRGAVIMTNHEDIYKKIQSSIFPGMQGGPLMHVIAARAVAFGEALKPEFKDYAKQIIKNSKTLVKVFQERGLNVVTGGTDSHMVVVDLRPKSVTGKDAVLALERLGIICNKNAIPFDPEKPFVTSGLRFGSAAETSRGLQEPEFEKIGHMVCDVIDSLKTTDDVRLSIEQDVIRRVKELTDTFKV >NC_005295.2|WP_011155364.1|1163511_1164135_-|50S-ribosomal-protein-L9 MLSVILKESVRNLGKAGVVTKVKPGYARYLLAQKKAVRATKENLKILEEQHISIQQENLEKLEAAKALQVSLKDEFLIIIRQAADDGKLFGSVTPKCISKLLSDKGYNIHYHNIFFHSVIKYIGEYVVNLELHHDLVVPMMLYVVKNDLGAMQAQKLHLDKQKKEEKAKDEVSATEKDEELMLSSVTNDNDGDGAKEIVVEGTEESQ |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
716650 : 726071
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_005295|716650:726071|DBSCAN-SWA TATGAACAGCACAGTTAATCAGAATGAACTATTGAAATTTTCAAAAATATCTGACAAGTGGTGGAATGAAAATGGACCATTAAAGCCTATGCATATGATGCATCCTGTAAGAATGCAATATATTATTAATTATATTAATAAAGTCATGCCAAATGTTGATTTCAAGTCATTGTCGGTACTTGATGTAGGTTGTGGAGGTGGTTTATTGTCAGAATCTATGGCACGCTTAAATATGAGAGTTTGTGGTATAGATGCTAGTAAAGAAACTATTAATGTTGCTCAAAAGCATGCTTTAGTACATGGTATACATAATATAAGTTATCATTGTATGAATATAGAAGATTTAGTTAATATTCAAGAGAAGTATGATATTATCACTGTAATGGAGGTAGTTGAGCATGTCGATAACTTGCCATTGTTTATAAATAGCATCAGCAGTTTATTAAATGACAATGGTATAATATTCTTATCTACTTTAAATAGGAATATTAAGTCTTTATTGTGTGGAGTAATATGTGCTGAATATATACTCAACTTAGTTCCCTATGGTACACATCAATGGAGCAGGTTTGTAAAACCTTCAGAAATTGCAAACTTATTTTTACCTAATGGAGTAGTTTTACAAGAAATTGTTGGAGTAAGTTTTAATTTAATAAAAAACTGTTTACAATTATCTAAAGATATTTCTGTAAATTATATTTTGGCTGCACAAAAATATGTAAATTAGATACTAAGTACTGACTTTTATAATCAATGACTTCTATCGCGGGAATTACGCAAGGAGCTGCAGGGTTTAGGTGGTCCACCAGAAATTTCCGCTAGACGCATTCTGCAATTACCTGCTATAGCAATTCTCTTATGATAGCAAACCTTGGTATTTGTATACCAGCAAGCTCACAAGCTTGTAATACAGTTATACCATCTTCAAAGCTGCAGTTTATAAAAGAGTTGATTAGGTGAGTTGTTGGATTGTATTTATATAACTTTATTGTTGTATTCATATTTTATTATATGTTAACTGTACATAATCTATTTGTAGGATTGTATAGTTTACATTCCTAATGATGCTACAGTATAGTTATTTTCTCATTATGGAAATATGTAACATTTTTCTGTTTTTCTAATATTGATAAGGAACTAATTTTGAAGTATTTAGAAATTCATTTATTATATGTATAGCTAATATATGGTGAAATGAGCTTTCCTTAAGATATTTTGTAATAAAAAGCTGGGAATCATGAATAATATGATTAATTGCTGTAGTGATTAGTTTGCTTATTATGTAATAGGCTTATTACTATATAACATAAAAAACATTCATTGTAACAAGATAAAAAAGACAACTTAACTACAAAGAGCAAATATTCAGCATAAATTTCTTATTAATTAAAAACTTGGAAACCACTAAATTTATTACTGGAAATCTTCTTATCTATAATAAACAGCACAGAGTATATTCAGATCAATACAACAGATAGTTATTTCTTTTTAACAAAATCATCTTTATGTAGTGCTATATTTGACTTAAAATTATTATTTACTATATCCTCTAGTGAAATATTATTTAAATAATCTTTTATATAATTTCCTATATCATCCCATAATTTGTGAGTTACACATCTATTGTTATTCGATAGACAACCTGGACTGTTATTTTCGCATCTTGTAATTTTAATATTTTCGCCTATTGATTCAAGTATAAGACTAAGTGTAATTAAATGAGGAGCAATACTTAGTGAATAACCACCACCTGGACCTTTTGTAGCATTAATAAGCCCTTTTTTCTTTAATTGAACAATTACCTGTTCAAGATATCCTTCAGATAAAGATTGATTACTTGCAATATATGACATTCTTACTGGTTGCAACTTATTTTGTTGCGTGCAAAGACCATGAGCTAATTTTACCATAAACATTATAGCATAACGTAGCCTAGCTGTGGTCAACATATAAATATCCACACGTTAATTATGGGCCTTTTAAAGTATTTTTAATTGAATAGATCACTTTGATATTATCAACAACCTGATAATGTATCATTAATATACCTTGTGTCAAATTTAACGCCCTAGCATGATACTATAGCACAATAAATACCTAATTTTACCATTAATCAAGGTAGAAACATATGTGAAATACTATTTTATCTGCTATATACAACCTAATTGTATACCAATTACACATTATCATTATATCAACATATTATTACTAGTGACTTGATAAATAATTATTAGAAGACTTTTAATTATAGCTTTCATAGCGTACAACAATATATTGAGAAATCAATGTGTTATAGGCTACTACATTATACTGGTTCATCTTGCATAACAATTCTGCGGTATTTTACTTTTTTATTTGTAATATCTTTTTTACGATTACCAGCAGATTCAGATAAACAAAATTTAATGTAATTATCGACAATTTCATTAAATTTATCCATGTGATCGCGGAAAAAATGGTCTGCTTTTTCTATAACATAATACTGCATGTATTTACTTTTTATCGAGTTACTTAATCTAGCAGCAAGTTGAGATACTGCAGCTTCATCAGAAATACTATCTTGATCACCTTGAATAATTAAACCAGGTACAGGACAAGGAGACAAAAATGAGAAATCATACTTATTTGCAGGAGGTGCTACAGCTATAAAACCTTCAACTTCTGGACGTCTCATCATTAATTGCATAGCAACCCATGCACCAAAAGAAAAACCAGCCACCCAAAAAGGAGATGATGCCATGTTATTATTTTGTAACCAATCTGCTGCTGCTGCTCCATCACTTAGTTCACCAATACCCTTTTCAAAATTGCCAGATGATTTACCTACTCCACGAAAATTAATTCTTAAAACAGAAAATCCGTTATTTGCAAATATATTATACAAATTATATACGATCTTATTATCCATGTTCCCACCGTACTGAGGATGAGGATGAAAAATTAAAGCAATTGGAGCTCCTACCGTTTTATTATGGTGATACTTTCCTTCAATTTTTCCTACTGCACCATTAAAAAATATCTCTCTCATGAATTAACTTCCTTAAAAATTGAGTAAACCTTCACCTCATCAATAATACAAAAAAGTTTAACTTAATAAAGTATTTTTAACAAGTATATTATTAATTACAGCTTCAAAAGCACTATAGTTTTGCTTTCATTTTTGTAAAAAAAATTAAAGTTGCAATTAAAGACATATTTAACAATAAATATTTTTACTTATCTCATTTAAGAAAAAACCTACTTGACACAAGGTATATTAATGATACATTATCAGGTTATTGATAATATCAAAATGATCTATTCAATTAAAAATACTTAAAAAGGCCCATAATTAACGTGTGGATATTTATATGTTGATCACAGCTAGGCTACGTTATGCTATAATGTTTATGGTAAAATTGGCTCATGGTCTTTGTACGCAACAAAATAAGTTGCAACCAGTAAGAATGTCATATATTGCAAGTAATCAATCTTTATCTGAAGGATATCTTGAACAGGTAATTGTTCAATTAAAGAAAAAAGGGCTTATTAATGCTACAAAAGGTCCAGGTGGTGGTTATTCACTAAGTATTGCTCCTCATTTAATTACACTTAGTCTTATACTTGAATCAATAGGCGAAAATATTAAAATTACAAGATGCGAAAATAACAGTCCAGGTTGTCTATCGAATAATAATAGATGTGTAACTCACAAATTATGGGATGATATAGGAAATTATATAAAAGATTATTTAAATAATATTTCACTAGAGGATATAGTAAATAATAATTTTAAGTCAAATATAGCACTACATAAAGATGATAAACCATATATATATGCTGATTACAATTCAACATCTACGATACTACCTGAAGTAAAATATCAATTAAATAATTTATCCTATATAAAATTATATAATCCATCTTCAATACATAAACTAGGTCAAAAAACAAGAAGTATAATAGAAGAGGCAAGAAACATAGCTATTAAGCAACTAAATGCACAATATTATGATGTAGTTTTTACATCCTCTGGTACAGAAGCAAACAATTTAGTCATCAATAGTACATCAGACTACAAACATTTAATCTCTTCTACAGAACATCTATCTATTATAAAATGTGCTACTAATGCAGAATTAATACCTGTTGATTCTAATGGAATAATATGTCTAAATGCATTGAGTAGTCTTTTACATAAGTTTAAAGATGACAAAATACTAGTGTCAGTAATGACAGCAAACAATGAAACTGGTGCTATTCAACCAATAAAAAAAATTGTAGAACTATCACATAAATTTGGAGCATTAGTACACACAGATGCCATACAAGCGTGTGGAAAAATCCATATAGATATTGAAGATTTAGGAGTTGATTTGTTAACAATATCATCACATAAACTTGGCAGCATTGCTGGAGCAGGAGTGTTATTCTTTAATAGCAAAAAGATAAAGATAAAACCTATGATAATTGGTGGACATCAAGAGAAAGGATTAAGAGCAGGGACTGAAAATGTTTTAGCGATATACTTATTATCTATATCACTTAGTAATTTATATAAATCTATAACAAAGATGCTTCTTGTTGAAAAATTAAGAAATAAATTGGAAAATGAAATATTATCTTTAGTTCCTGACGCTCAAATATTTAGTAGAAATGTCGAGAGACTACCAAATACTAGTTGTATTTCAATGCCAAATGTAAATAGTGAGATTCAAGTAATAAGCTTTGACATAAAAAATATTGCAGTAGGTAATGGGTCTGCATGTTCCACAGGAGTAGTAGAACCATCTCATGTGTTATCTGCAATGGGAGTAAATCAGGAGATTGCAAATAATTCAATAAGGATTAGCTTAAGTCCTGACACTACAGATGAGCATATAAGAACTATAGTAAACTGTTGGTACGAAATATATACACATAATCAAGTGCATAAATGAAATTAGGTGTAAAATGATGCAAAAATTAGAAGATTACTATATCATTAACGATATCAAAGACAGGTTATAACATGGAAAAAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_005295|716650:726071|716650_717376_+|WP_011155093.1|DBSCAN-SWA MNSTVNQNELLKFSKISDKWWNENGPLKPMHMMHPVRMQYIINYINKVMPNVDFKSLSVLDVGCGGGLLSESMARLNMRVCGIDASKETINVAQKHALVHGIHNISYHCMNIEDLVNIQEKYDIITVMEVVEHVDNLPLFINSISSLLNDNGIIFLSTLNRNIKSLLCGVICAEYILNLVPYGTHQWSRFVKPSEIANLFLPNGVVLQEIVGVSFNLIKNCLQLSKDISVNYILAAQKYVN >NC_005295|716650:726071|719999_721568_+|WP_011155096.1|DBSCAN-SWA MLITARLRYAIMFMVKLAHGLCTQQNKLQPVRMSYIASNQSLSEGYLEQVIVQLKKKGLINATKGPGGGYSLSIAPHLITLSLILESIGENIKITRCENNSPGCLSNNNRCVTHKLWDDIGNYIKDYLNNISLEDIVNNNFKSNIALHKDDKPYIYADYNSTSTILPEVKYQLNNLSYIKLYNPSSIHKLGQKTRSIIEEARNIAIKQLNAQYYDVVFTSSGTEANNLVINSTSDYKHLISSTEHLSIIKCATNAELIPVDSNGIICLNALSSLLHKFKDDKILVSVMTANNETGAIQPIKKIVELSHKFGALVHTDAIQACGKIHIDIEDLGVDLLTISSHKLGSIAGAGVLFFNSKKIKIKPMIIGGHQEKGLRAGTENVLAIYLLSISLSNLYKSITKMLLVEKLRNKLENEILSLVPDAQIFSRNVERLPNTSCISMPNVNSEIQVISFDIKNIAVGNGSACSTGVVEPSHVLSAMGVNQEIANNSIRISLSPDTTDEHIRTIVNCWYEIYTHNQVHK >NC_005295|716650:726071|723341_723791_+|WP_011155099.1|DBSCAN-SWA MQSGLSMDKEVLIPHNNQENTCDSQIKYFINSSFTDKSPIIITENAIKKIKELIDKKKDSVIGIRIMVAQKGCFGFKYNIEYAYDIKMLDVQIQVKYQNQNFIILIDPKAMMFINGTEMDHVENKISSGFVFKNPNEKGRCGCGESFYV >NC_005295|716650:726071|724220_726071_+|WP_011155101.1|DBSCAN-SWA MKLINITEPQEKRISIAFGIDLGTTNSLISMVDDNGQIIIFKDQNGNSLIPSIVSYLDDHRVEVGKNHNDDKSCTISSVKRLMGKSIEDIKQSDLLFNIANTKDNIYIRKQDNTYVTPVEVSAEILKKLCQIVKNSSNLDVKKVVITVPAYFDEVARKATKNAAKLANLEVLRLLNEPTAAALAYGIEKSEHDTICMIYDLGGGTFDVSILKLHDGVFQVLATGGNTNLGGDDIDYLFAKFIYQKYQTKSHIKLTDFNKEILKELIDDVRYAKEYLSDHHSGTFIFKIRGKDFLCKVTRNELNNIVLGLVKETLDIVHSTISSISLLHKDIKKVILVGGATKMPIIKDMLNNLFHNRVFCDVDPEKIVAVGAALQAHYLLNPDIKNNLLIDTLPLSLGIETIGGIVEKIIPRNTPIPAFATQEFTTYVDGQNAIQIHVCQGEREIIEHNKSLAKFDLKGIPPLPAGSAKIQVEFQVDMDGLLTVSAQEKLTGIKQSVSINNTLKLDQKEIEENVMESVKNFNSDMDARLLAEQKIEGQRIISIIKKALIEDKDLISTSELMILNKTLEDAEKVLLTGQSDQIKDAINHVELQASNFIKKRMDFYLKKSIDNYNISS >NC_005295|716650:726071|721648_722881_+|WP_173358441.1|DBSCAN-SWA MKDIQRHINLPIFLDYQSTTKTDSRVLDAMIPYFQEFSNPHSRSHCFGWKAESAVELARERIASLINAESKEVIFTSGATESNNLAIKGVANFYKSKGNHIITVRTEHKCVLDSCRHLETEGFDVTYLDVQKNGILDLNLLKSAITDKTILVSVMMVNNEIGVIQPIEEIGKICHNHGVFFHTDAAQAFGKIPIDVNKMNIDLLSISGHKIYAPMGIGALYVRKRQPRIRLTPIINGGGQERGMRSGTIPTPLAVGLGEAAYIAQEVMEDEAIRIKELRDILYSEIKKHLPYVILNGDYEQRIAGNLNLSFPYVEGESIIMAINNLAVSSGSACTSASLEPSYVLRALNIDKDLEHSSIRFGIGRFTTKAEILYAADLIVNSIKRLREMSPLWEMVQEGINLNEIKWDVH >NC_005295|716650:726071|718127_718598_-|WP_011155094.1|DBSCAN-SWA MLTTARLRYAIMFMVKLAHGLCTQQNKLQPVRMSYIASNQSLSEGYLEQVIVQLKKKGLINATKGPGGGYSLSIAPHLITLSLILESIGENIKITRCENNSPGCLSNNNRCVTHKLWDDIGNYIKDYLNNISLEDIVNNNFKSNIALHKDDFVKKK >NC_005295|716650:726071|723729_724221_+|WP_011256078.1|DBSCAN-SWA MYSKIQMKKEDVVVEKVFMYKDYFSLFKLNQSFFINIQTLEKNYIALQSKHHPDLFFLKSEKKLALDNIAEINKAYQTLKSSITRAEYLLEIKRVIANTDDVNNIIKEVFTLSELDDADIQYHILLCTKAMENAFLMEDFKEAAKQLTKLKYIKKIQEDRGIS >NC_005295|716650:726071|717491_717650_-|WP_162009505.1|DBSCAN-SWA MNTTIKLYKYNPTTHLINSFINCSFEDGITVLQACELAGIQIPRFAIIRELL >NC_005295|716650:726071|722915_723329_+|WP_011155098.1|DBSCAN-SWA MSYSESLLEHYKNPKNVGTLPKEDYNVGTGLVGAPSCGDVMKLQIKVDDNGKIIDAKFKTFGCGAAIAASSLATELIKGKTVDEAHELKNTVLAKELSLPPVKIHCSLLAEDAVKAAINDYHMKQANKKNATKNPNE >NC_005295|716650:726071|718954_719677_-|WP_011155095.1|DBSCAN-SWA MREIFFNGAVGKIEGKYHHNKTVGAPIALIFHPHPQYGGNMDNKIVYNLYNIFANNGFSVLRINFRGVGKSSGNFEKGIGELSDGAAAADWLQNNNMASSPFWVAGFSFGAWVAMQLMMRRPEVEGFIAVAPPANKYDFSFLSPCPVPGLIIQGDQDSISDEAAVSQLAARLSNSIKSKYMQYYVIEKADHFFRDHMDKFNEIVDNYIKFCLSESAGNRKKDITNKKVKYRRIVMQDEPV |
10 | unidentified_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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