Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_006832 | Ehrlichia ruminantium str. Welgevonden, complete genome | 1 crisprs | DEDDh | 0 | 0 | 1 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_006832_1 | 1124826-1124921 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_006832_1
|
1 spacers
spacers of NC_006832_1
>1.1|1124849|50|NC_006832|CRISPRCasFinder TGTAATACAATCTACAATATGCACACACGATATACTTTAAAGCCGTTAAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_006832_1
The CRISPR arrays of NC_006832_1 >merge|NC_006832|1|1124826-1124921|CRISPRCasFinder ATGACTTATAATATCAAAATTAATGTAATACAATCTACAATATGCACACACGATATACTTTAAAGCCGTTAAGATGATTTATAATATCAAAATTAA >NC_006832|1|1|1124826-1124921|CRISPRCasFinder ATGACTTATAATATCAAAATTAA TGTAATACAATCTACAATATGCACACACGATATACTTTAAAGCCGTTAAG ATGATTTATAATATCAAAATTAA
>NC_006832.1|WP_011155355.1|1123436_1124012_+|Holliday-junction-branch-migration-protein-RuvA MIGSITGNVEEIRDSYIILNVGNIGYIIYVSHKVLQTCKVGDNIKLYIETYVNRDNITQLYGFLNRQEQDYLKMLVTINGINYKTALSILSKLSPEQIFSAVVNNDKIAFKGNGIGEKLAGRIITELQYKINKMPIEETFSIIENDDSLAALISLGYEKLKAFNVIQEIKSKTPDASTQEVIRKALQKLSQ >NC_006832.1|WP_011155354.1|1122721_1123426_+|heme-ABC-transporter-permease MTRFIRYTKLILPYIIFSFTICLAYSLYMIFIASPADYKQGEFVRIMYIHVPSAWISLGSYTLIAILSFAILIWQNTVATIISHAIAPLGLVFTAICLITGSIWGKCTWGTWWVWDARLTSMLILFFLYLGYLSLWSFFDNEARSAKASSIFAIFSAINIPIIKFSVNIWATLHQPASILRKDGIAIDISMLIPLLSMFITLGLLFCILLILRSHTLINLRKINCRLAVLNNIL >NC_006832.1|WP_011155353.1|1120323_1120953_-|guanylate-kinase MNNNLKSRGIMLVMSSPSGGGKTTISQLLVNELQGEIIRSVSVTTREPRNEEVEGKDYFFVTEDEFHHLCNTNQMLEYAKVFGNYYGIPRRFVMDNINNGISILFSIDWQGAFKLIDIMSEHVVSVFILPPSMEELKRRLYNRSGESDMINQRLKEAAFEISHCYRYNYIIVNHNIEESVQQIKSIFIAEKLKTHRKMFLEQVVKSYYI >NC_006832.1|WP_011155352.1|1117962_1118865_-|bifunctional-methylenetetrahydrofolate-dehydrogenase/methenyltetrahydrofolate-cyclohydrolase-FolD MEGNIVSGKAVADNITNILATCISDLKAQHNLTPCLIVVLVGDDPASQLYVRNKQRKAEMLGLRSETMLLPSTISESSLIEKIHQLNNDDSVHGILVQLPVPRHIDKNLIINTIDPKKDVDGFHNENVGRLFTGQKKNCLVPCTPQGCLYLIKTITRNLSGSDAVVIGRSNIVGKPMACLLLGENCTVTTVHSATRDLPDYCRRADILVAAVGIPRFVKYSWVKHGAIVIDVGINSIEEDGVKKFVGDVDFAEVNKIASAITPVPGGVGPMTIAFLMVNTIIAACNQSGIDGFLEKYLDL >NC_006832.1|WP_011155351.1|1115101_1115626_-|cytochrome-c-family-protein MDGFQLNKIFTAILFACFIVLFVSNVTDLLYNPEPHTEPVRGYKVDVEQQGLIEESAAVPDVQVDIQALVAQANITKGKEISKKCVSCHTFEKGGANKVGPNLWHIIGNKKAHLGDAFNYSKAMLNIGGTWEYHDLFQFLTKPQAYVKGTRMAFAGISKPQDIADLIAYMKSLE >NC_006832.1|WP_011256149.1|1114301_1115099_-|alpha/beta-hydrolase MSLWRIHMLNQGRLKLSYAPDLHISYKQLISDSNVSIVFLSGFQANMQGAKATALYNYCKAHNFNLILFEYLGHGESDGQLIDYSISDWYKNSIDVIDQLTPPNSSHIIIGSSLGVWMMFLLAMSHPHRVSNLISLAGAPDITESLFKSLTTVQQDELLKYGHVTFLSSNEDSRSRVITRYMFEDGRKNLILNREFINIECPVTLIHGMNDTIVPYNVSLTLAEKIRSSYLTLRLIRSSDHSLSDDISLTIIFKAIEEAIEQQNL >NC_006832.1|WP_011155349.1|1111115_1112594_+|cation:proton-antiporter MHFFKNSLSDFSIIWLVFLPYISSVLILLLKKVRYSQETISFIASCMLFYAAFNIYTQTTDNISALHVVLCEFTPKIQLTLKTEYIGIIFSILASFLWIVTTIYTISYMRHNDKNNKKQSIFYACFAASIGCTMGIAFSGNLLTLFIFYELLTISTYPLVTYYANHESQISGRYYMGILLGTSMLLFLPAIIITYNISGTLDFTKGGILPSSISSVFLMSLLFLFIYSIGKTALMPIHSWLPRAMVAPTPVSALLHAVAVVKSGVFALIKVLLYIIGLERLQALVQTHNNILMYASAITILLASFIAIKQTNLKKLLAYSTISQLSYITIAVSLYTERAVDISIFQMISHAFAKITLFFTAGAIYTKTGKKYLNELQGIGKSMPITMTAFSIGAAAMIGIPPAVTFWGKFFIISESLNQNIMSVVLVLIASTILNTIYFIPIIYNAFYVPCNTNKYAEAPIPMLIAISITTICTILLFLYPDVIFNIINHLK >NC_006832.1|WP_011155348.1|1107485_1110107_+|pyruvate,-phosphate-dikinase MSERLIYYFSKNKCDGNLKLNHILGSKGANLAEMCNIGISVPPGFTISTAVCSHYNDNKLPDQISYLIQNAIEFLNNEVNLKFGDENNPLLLSVRSGSVSSMPGMLDTILNVGLNDKTVIGLAKKSGDLFAYDSYRRLIQMYAHTVLQVENSFFEEAIYKKKSVSTSKNEKISDPNIFKELIDEFKRIVKLHTNKDFPQDVNEQLYTAIYAVFRSWMNKRAITYRKIHNIPDNLGTAVNVQSMVFGNMSENSATGVVFTRNPSTGTKEIFGEFLISAQGEDVVSGTHSPLPLNKMKDLMPITHNELEQVCKKLELYYRDMQDIEFTIENGKLWILQTRSGKRSIQSAVKIATDMVKEKLISKEEAITRIDHKSFSKLFHPTLESSTNTDIIAYGLPASPGAATGQVVFTPSDAEQLKKEGKNVILIRQETNPEDINGMNSAVGIITLRGGMTSHAAVVARGMGKPCICSVNNIFIDKSEQFFYTNTGIKVYKGDNITINGCNGEVILGVIKTTLPKLDESFYDLMEWVDEIRTLKVMANADTPEDAEISMNFKADGIGLCRTEHMFFSDKRISIVQEMIVSDKKEERAVALEKLEIMQKEDFKKIFTHTLDKQVTIRLLDPPLHEFLPDNDDAIQEISSRTGKSLEKLKNRILYLLEKNPMLGHRGCRLAISYPEIYEMQVKAIFLAIKELQEETGIKEIIPEIMIPLIMSEEEIIVIKELVNNIAKQFDNPKYLLGTMIELPKAALIADKIAKHVQFFSFGTNDLTQTTLGVSRDDSASFIGTYRDLGIIKHDPFETLDIDGVGKLISIAVSLGKKESPDIKIGVCGEHGGNFESIQFFSRLNINYISCSPYRIPIARLIAAQCTIFNKDIN >NC_006832.1|WP_011155347.1|1105995_1106508_+|RDD-family-protein MPIIKSMKTKTAKTTILLKRISANIIDQIILSLINYQISWFIGEITFLSFIINIVSHCCYYMYFLSSEAQASIGQKILKIHTIRCNDKKIDAKLAFDRTLSEFLCPTIFMINIQIVNMHINNSLITIIVFIVTIFTLILSVYWYFIALFSESNQTIHDIIFDTIVVENKQ >NC_006832.1|WP_011155346.1|1105384_1106017_+|HAD-IA-family-hydrolase MKQPIAVIFDWYNTLIDTKVNIDRPTFYQVLNRMGYKDVNLNTVSDSTILKYLAMLLGDRWEEGVALYENSLEKSQKLDNFVLNDGAIELLDTLKGNNITMAIVSNKNGKSLRSEIHNKNLSHYFNSIIGSGDTASTKPSPEPVLTALAYLNIQPSKNVFFIGDSISDIQSATDAGCLPIRYGNCSTKDNVLSFKNFNEINKFICQLLSL >NC_006832.1|WP_044148681.1|1125172_1126162_+|Holliday-junction-branch-migration-DNA-helicase-RuvB MKDILQSSECIEDQQNISMRPNLLDEFIGQSSVVSNLKIFIDAAYERKEPIDHILLYGPPGLGKTTLAHIIAKELKVNFRSTAGPLLSKAGDLAAILTNLQARDVLFIDEIHRLNRNIEEILYSAMEDFSLDIIVGEGCGARTLRVDIPPFTLIGATTRIGLLSNPLRDRFGIPMHLEFYSTEELTKVIKRAAKVIHTNISNNGAEEISLRSRGTPRIALRLLRRIRDFISVTKQDTITHEFADQALLRLGIDKLGLDRQDIKYLQFIYEANNPIGIDTISSALSEDTGNIEETIEPYLIKINFIQRTPRGRVITQKAISYLNEQTYNM >NC_006832.1|WP_011256150.1|1126139_1126373_+|hypothetical-protein MNKHTICSKVLHIIHNFYITHNYTSFERDNDYTLTTSNRNIIDILTSEARQFLNPELFKQHLLNFIVPLVLLIMKIY >NC_006832.1|WP_011155357.1|1129103_1130300_-|multidrug-effflux-MFS-transporter MKVFKRNILILIITVIVMTEMSSDIYLPSLPKISDFFHVDYSIAQLTISLNLAGISISGLLYGPLSDYYGRRPVMLLGIVIFTIASVACYFANNVMMLIIMRFIQGFGTGVAGVVGYAIIKDMYSGDECAKNISIVNIAVAFSPVLGPILGSTVISYEYNWNVLFMIISVISVIVLICLFSFLRETLVIDRSKNNISFRSVMYKYKELICNYRFFGFALIHSLTIMWIWSCITNLPFVFVNDMGVPVAYYGYFVAINVAAYIIGAIINQKFVEKFGMSNMLILGLILTTLSDASVFILYQVIEITPLLAEIMWIPSGMGIAFILGNNMTCAFSEIKETGIGSAFILFLQTIFGAIGIYILSCFYDGTLIPVIIFPVVCSILCIIIYLVLKVTEKKTNM >NC_006832.1|WP_011155358.1|1131629_1132487_-|FAD-dependent-thymidylate-synthase MESEITKRIVVPELEDILYKEHKVLDKGFVRLVDYMGSDESVVQAARISYGRGTKSVSQDAALINYLMRHSHTTPFEMCEIKFHIKLPIFVARQWVRHRTANVNEYSARYSVLDHEFYIPELDHVATQSEDNAQGRGNSLSNEDAQYVTDLLKRDSDMVYETYNKFLIKGVSREISRISLTLNYYTEWYWKIDLHNLLHFLRLRSDVHAQYEIRVYAETMLEIVKKWVPLTYAAFVEYCLESQSFSKSALSVVKKLIAGEDVAREDTGIGKREWRELMDVLADNK >NC_006832.1|WP_011155359.1|1134248_1135025_-|succinate-dehydrogenase-iron-sulfur-subunit MVQFFLPKNSKINKNGEVYNAPENAKNVKCFKIYRWSPDDDSNPRIDTFFIDLDQCGQMVLDALIKIKNEIDSTLTFRRSCREGICGSCAMNIDGTNTLACTKAISDIKSDVEIYPLPHMNVIKDLVPDLSNFYKQYESITPWMQAEEPSHNKERLQSIEDRSKLDGVYDCILCACCSTSCPSYWWNPDKYLGPAALLQVYRWLIDSRDEASDKRLDMLDDAFKLYRCHTIMNCTNTCPKGLNPAKAIADIKQMMVRR >NC_006832.1|WP_011155360.1|1135058_1136855_-|succinate-dehydrogenase-flavoprotein-subunit MSSSTYSIIDHEYDVVIIGAGGAGLRATFGMTSVGLSVACISKVFPTRSHTVAAQGGISAALGNVTEDDWRWHMFDTVKGSDWLGDQDAIEYMCKNAAEAVIELERYGVPFSRTSDGKIYQRPFGGMTTEFGKGKPAIRTCAASDKTGHAILHTLYQQSLKHNAEFFVEYFAIDLIMNEVGQCQGVIAWSLCDGTLHRFRSHAVVLATGGYGRIYFSATSAHTCTGDGGGMVSRINLPLEDMEFVQFHPTGIYGSGCLMTEGCRGEGGYLINSEGERFMERYAPKAKDLASRDVVSRAMTLEIREGRGVGPNKDHVYLSISHLGAEVIHDKLPGISETARTFAGVDVTKEPIPVLPTVHYNMGGIPTNYYGQVITLTDSEEKIVPGLFAIGEAACVSVHGANRLGSNSLLDLVVFGRAAAIKAKELIKPGMLHAPINKASEEKIIARFDGIRFSKGSLRVAEVRGKMQHVMQNHAAVFRTAEVLDEGKVKIKDVAKLMPEIVVQDKSMIWNSDLVEALELTNMMPQAVVTMECAANRQESRGAHAREDFPERDDENWMKHTLAWYDAANCSVEIKYKDVAKTTLTNDVQYFPPQRRVY >NC_006832.1|WP_011155361.1|1138494_1140246_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MKILFQFVKPYLLYFIFAYLVVAVSSVTILAFGYGLHNLVDSWVTTSSVTSINNALLFLLIVVLIVGVTSFLRMWLTGYGSERVITGIRLNLYNRIIHFSPRFFENNSISSLVTRLMADTSALQVILSASMSTILRNATTLLGSIVMLVHTNFKLTTYTVVVIPVILVILTSLGKKVKLLSQKVRLKTDEITSFVEETYRGISVIQSFSKENTTKQKFSNLLGVSLNITNKYIILRALLVTLIITSAMTSIGLVLSLGIKEVLNNNITVGSLFSFIFYAAIAAGSVNNMGDNLHDIQKAVRISEDISKVLLMPLDIHEIENPKIVDELKDAILINNVTFSYPSKPNDPALKGVSFSIDKGQVVALVGPSGSGKSTITNILLRFYDITAGDVTIDGINIKDLSLSSLRSLFSVVPQNPVMFSGTILENITYGVSDATYEDVKNAAKTACILDFIESLPNKFSTFVGERGLCLSEGQKQRIAIARAVLKKDSGVLILDEATSSLDSKNEQLIHDALDNLKNNKTMLIIAHRLSTIVKADKIVVFNNGCIDDIGTHKSLIAKQDGLYSKLAKLQLSNENFSDGSSN >NC_006832.1|WP_011155362.1|1140249_1140579_-|iron-donor-protein-CyaY MPHFLCVSDFQSLSYNVLDTLVNMIDAADLDGILECENCNGIVSISDGKGNVYIVSKHEPSLQIWVASPISGSVRFSYNKSLNIWVNNNNDELFHFLKSEINMLFNVMI >NC_006832.1|WP_011155363.1|1140776_1142042_-|serine-hydroxymethyltransferase MVRYISDYDLQDVDTEVFKCITDESNRQNSQLQLIASENFVSKAVLQAQGSIFTNKYAEGYPGKRYYCGCHFADIIENIAIERLCKLFGCKFANVQPHSGSQANQGVFAALLKPGDTVIGMSLDCGGHLTHGSAPSISGKWFNAVQYQVDRDTGMIDMDAIEKLALSHNPSLIIAGSSSYPRTIDFKRFREIADKVGAYLLADIAHYAGLVAAGEFPSPIEYAHVITSTTHKTLRGPRGAVIMTNHEDIYKKIQSSIFPGMQGGPLMHVIAARAVAFGEALKPEFKDYAKQIIKNSKTLVKVFQERGLNVVTGGTDSHMVVVDLRPKSVTGKDAVLALERLGIICNKNAIPFDPEKPFVTSGLRFGSAAETSRGLQEPEFEKIGHMVCDVIDSLKTTDDVRLSIEQDVIRRVKELTDTFKV >NC_006832.1|WP_011155364.1|1142110_1142734_-|50S-ribosomal-protein-L9 MLSVILKESVRNLGKAGVVTKVKPGYARYLLAQKKAVRATKENLKILEEQHISIQQENLEKLEAAKALQVSLKDEFLIIIRQAADDGKLFGSVTPKCISKLLSDKGYNIHYHNIFFHSVIKYIGEYVVNLELHHDLVVPMMLYVVKNDLGAMQAQKLHLDKQKKEEKAKDEVSATEKDEELMLSSVTNDNDGDGAKEIVVEGTEESQ |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
696497 : 705918
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_006832|696497:705918|DBSCAN-SWA TATGAACAGCACAGTTAATCAGAATGAACTATTGAAATTTTCAAAAATATCTGACAAGTGGTGGAATGAAAATGGACCATTAAAGCCTATGCATATGATGCATCCTGTAAGAATGCAATATATTATTAATTATATTAATAAAGTCATGCCAAATGTTGATTTCAAGTCATTGTCGGTACTTGATGTAGGTTGTGGAGGTGGTTTATTGTCAGAATCTATGGCACGCTTAAATATGAGAGTTTGTGGTATAGATGCTAGTAAAGAAACTATTAATGTTGCTCAAAAGCATGCTTTAGTACATGGTATACATAATATAAGTTATCATTGTATGAATATAGAAGATTTAGTTAATATTCAAGAGAAGTATGATATTATCACTGTAATGGAGGTAGTTGAGCATGTCGATAACTTGCCATTGTTTATAAATAGCATCAGCAGTTTATTAAATGACAATGGTATAATATTCTTATCTACTTTAAATAGGAATATTAAGTCTTTATTGTGTGGAGTAATATGTGCTGAATATATACTCAACTTAGTTCCCTATGGTACACATCAATGGAGCAGGTTTGTAAAACCTTCAGAAATTGCAAACTTATTTTTACCTAATGGAGTAGTTTTACAAGAAATTGTTGGAGTAAGTTTTAATTTAATAAAAAACTGTTTACAATTATCTAAAGATATTTCTGTAAATTATATTTTGGCTGCACAAAAATATGTAAATTAGATACTAAGTACTGACTTTTATAATCAATGACTTCTATCGCGGGAATTACGCAAGGAGCTGCAGGGTTTAGGTGGTCCACCAGAAATTTCCGCTAGACGCATTCTGCAATTACCTGCTATAGCAATTCTCTTATGATAGCAAACCTTGGTATTTGTATACCAGCAAGCTCACAAGCTTGTAATACAGTTATACCATCTTCAAAGCTGCAGTTTATAAAAGAGTTGATTAGGTGAGTTGTTGGATTGTATTTATATAACTTTATTGTTGTATTCATATTTTATTATATGTTAACTGTACATAATCTATTTGTAGGATTGTATAGTTTACATTCCTAATGATGCTACAGTATAGTTATTTTCTCATTATGGAAATATGTAACATTTTTCTGTTTTTCTAATATTGATAAGGAACTAATTTTGAAGTATTTAGAAATTCATTTATTATATGTATAGCTAATATATGGTGAAATGAGCTTTCCTTAAGATATTTTGTAATAAAAAGCTGGGAATCATGAATAATATGATTAATTGCTGTAGTGATTAGTTTGCTTATTATGTAATAGGCTTATTACTATATAACATAAAAAACATTCATTGTAACAAGATAAAAAAGACAACTTAACTACAAAGAGCAAATATTCAGCATAAATTTCTTATTAATTAAAAACTTGGAAACCACTAAATTTATTACTGGAAATCTTCTTATCTATAATAAACAGCACAGAGTATATTCAGATCAATACAACAGATAGTTATTTCTTTTTAACAAAATCATCTTTATGTAGTGCTATATTTGACTTAAAATTATTATTTACTATATCCTCTAGTGAAATATTATTTAAATAATCTTTTATATAATTTCCTATATCATCCCATAATTTGTGAGTTACACATCTATTGTTATTCGATAGACAACCTGGACTGTTATTTTCGCATCTTGTAATTTTAATATTTTCGCCTATTGATTCAAGTATAAGACTAAGTGTAATTAAATGAGGAGCAATACTTAGTGAATAACCACCACCTGGACCTTTTGTAGCATTAATAAGCCCTTTTTTCTTTAATTGAACAATTACCTGTTCAAGATATCCTTCAGATAAAGATTGATTACTTGCAATATATGACATTCTTACTGGTTGCAACTTATTTTGTTGCGTGCAAAGACCATGAGCTAATTTTACCATAAACATTATAGCATAACGTAGCCTAGCTGTGGTCAACATATAAATATCCACACGTTAATTATGGGCCTTTTAAAGTATTTTTAATTGAATAGATCACTTTGATATTATCAACAACCTGATAATGTATCATTAATATACCTTGTGTCAAATTTAACGCCCTAGCATGATACTATAGCACAATAAATACCTAATTTTACCATTAATCAAGGTAGAAACATATGTGAAATACTATTTTATCTGCTATATACAACCTAATTGTATACCAATTACACATTATCATTATATCAACATATTATTACTAGTGACTTGATAAATAATTATTAGAAGACTTTTAATTATAGCTTTCATAGCGTACAACAATATATTGAGAAATCAATGTGTTATAGGCTACTACATTATACTGGTTCATCTTGCATAACAATTCTGCGGTATTTTACTTTTTTATTTGTAATATCTTTTTTACGATTACCAGCAGATTCAGATAAACAAAATTTAATGTAATTATCGACAATTTCATTAAATTTATCCATGTGATCGCGGAAAAAATGGTCTGCTTTTTCTATAACATAATACTGCATGTATTTACTTTTTATCGAGTTACTTAATCTAGCAGCAAGTTGAGATACTGCAGCTTCATCAGAAATACTATCTTGATCACCTTGAATAATTAAACCAGGTACAGGACAAGGAGACAAAAATGAGAAATCATACTTATTTGCAGGAGGTGCTACAGCTATAAAACCTTCAACTTCTGGACGTCTCATCATTAATTGCATAGCAACCCATGCACCAAAAGAAAAACCAGCCACCCAAAAAGGAGATGATGCCATGTTATTATTTTGTAACCAATCTGCTGCTGCTGCTCCATCACTTAGTTCACCAATACCCTTTTCAAAATTGCCAGATGATTTACCTACTCCACGAAAATTAATTCTTAAAACAGAAAATCCGTTATTTGCAAATATATTATACAAATTATATACGATCTTATTATCCATGTTCCCACCGTACTGAGGATGAGGATGAAAAATTAAAGCAATTGGAGCTCCTACCGTTTTATTATGGTGATACTTTCCTTCAATTTTTCCTACTGCACCATTAAAAAATATCTCTCTCATGAATTAACTTCCTTAAAAATTGAGTAAACCTTCACCTCATCAATAATACAAAAAAGTTTAACTTAATAAAGTATTTTTAACAAGTATATTATTAATTACAGCTTCAAAAGCACTATAGTTTTGCTTTCATTTTTGTAAAAAAAATTAAAGTTGCAATTAAAGACATATTTAACAATAAATATTTTTACTTATCTCATTTAAGAAAAAACCTACTTGACACAAGGTATATTAATGATACATTATCAGGTTATTGATAATATCAAAATGATCTATTCAATTAAAAATACTTAAAAAGGCCCATAATTAACGTGTGGATATTTATATGTTGATCACAGCTAGGCTACGTTATGCTATAATGTTTATGGTAAAATTGGCTCATGGTCTTTGTACGCAACAAAATAAGTTGCAACCAGTAAGAATGTCATATATTGCAAGTAATCAATCTTTATCTGAAGGATATCTTGAACAGGTAATTGTTCAATTAAAGAAAAAAGGGCTTATTAATGCTACAAAAGGTCCAGGTGGTGGTTATTCACTAAGTATTGCTCCTCATTTAATTACACTTAGTCTTATACTTGAATCAATAGGCGAAAATATTAAAATTACAAGATGCGAAAATAACAGTCCAGGTTGTCTATCGAATAATAATAGATGTGTAACTCACAAATTATGGGATGATATAGGAAATTATATAAAAGATTATTTAAATAATATTTCACTAGAGGATATAGTAAATAATAATTTTAAGTCAAATATAGCACTACATAAAGATGATAAACCATATATATATGCTGATTACAATTCAACATCTACGATACTACCTGAAGTAAAATATCAATTAAATAATTTATCCTATATAAAATTATATAATCCATCTTCAATACATAAACTAGGTCAAAAAACAAGAAGTATAATAGAAGAGGCAAGAAACATAGCTATTAAGCAACTAAATGCACAATATTATGATGTAGTTTTTACATCCTCTGGTACAGAAGCAAACAATTTAGTCATCAATAGTACATCAGACTACAAACATTTAATCTCTTCTACAGAACATCTATCTATTATAAAATGTGCTACTAATGCAGAATTAATACCTGTTGATTCTAATGGAATAATATGTCTAAATGCATTGAGTAGTCTTTTACATAAGTTTAAAGATGACAAAATACTAGTGTCAGTAATGACAGCAAACAATGAAACTGGTGCTATTCAACCAATAAAAAAAATTGTAGAACTATCACATAAATTTGGAGCATTAGTACACACAGATGCCATACAAGCGTGTGGAAAAATCCATATAGATATTGAAGATTTAGGAGTTGATTTGTTAACAATATCATCACATAAACTTGGCAGCATTGCTGGAGCAGGAGTGTTATTCTTTAATAGCAAAAAGATAAAGATAAAACCTATGATAATTGGTGGACATCAAGAGAAAGGATTAAGAGCAGGGACTGAAAATGTTTTAGCGATATACTTATTATCTATATCACTTAGTAATTTATATAAATCTATAACAAAGATGCTTCTTGTTGAAAAATTAAGAAATAAATTGGAAAATGAAATATTATCTTTAGTTCCTGACGCTCAAATATTTAGTAGAAATGTCGAGAGACTACCAAATACTAGTTGTATTTCAATGCCAAATGTAAATAGTGAGATTCAAGTAATAAGCTTTGACATAAAAAATATTGCAGTAGGTAATGGGTCTGCATGTTCCACAGGAGTAGTAGAACCATCTCATGTGTTATCTGCAATGGGAGTAAATCAGGAGATTGCAAATAATTCAATAAGGATTAGCTTAAGTCCTGACACTACAGATGAGCATATAAGAACTATAGTAAACTGTTGGTACGAAATATATACACATAATCAAGTGCATAAATGAAATTAGGTGTAAAATGATGCAAAAATTAGAAGATTACTATATCATTAACGATATCAAAGACAGGTTATAACATGGAAAAAATAAAAGATATACAACGACATATTAATCTACCTATATTTCTTGATTATCAATCCACAACTAAAACGGATAGTAGAGTCTTAGATGCTATGATTCCATATTTTCAAGAGTTTTCTAATCCTCATTCACGTAGTCATTGTTTTGGATGGAAAGCTGAGTCGGCTGTTGAATTAGCACGAGAAAGAATTGCATCTTTAATAAATGCTGAAAGTAAAGAAGTAATATTCACTTCTGGTGCTACAGAATCAAATAATTTGGCAATCAAAGGTGTAGCAAACTTTTATAAAAGTAAAGGAAATCACATTATTACAGTACGTACAGAGCATAAATGTGTTTTAGATTCATGTCGCCATTTAGAAACAGAAGGATTTGATGTTACTTACTTAGATGTACAAAAAAATGGTATTTTAGATCTTAATTTATTAAAATCAGCTATAACTGATAAGACTATATTGGTATCGGTTATGATGGTGAACAATGAAATTGGTGTCATTCAACCAATAGAGGAAATAGGAAAAATTTGTCATAATCATGGAGTATTCTTTCATACTGATGCAGCTCAAGCATTTGGTAAAATACCAATAGATGTAAACAAAATGAATATAGATTTGCTTAGTATATCAGGACATAAAATATATGCTCCAATGGGAATAGGGGCATTATATGTACGTAAACGTCAACCAAGAATACGACTTACTCCTATAATAAATGGTGGTGGACAAGAACGTGGTATGAGATCTGGAACCATACCTACTCCATTAGCAGTAGGTTTAGGTGAAGCAGCATATATAGCTCAGGAAGTAATGGAAGATGAAGCCATTAGGATAAAAGAATTACGTGATATTTTATATAGTGAAATAAAAAAACATTTACCCTATGTAATACTGAATGGTGATTATGAACAACGTATAGCAGGAAATTTAAATTTAAGTTTTCCATATGTAGAAGGAGAATCTATTATTATGGCGATTAACAACTTAGCAGTAAGTTCAGGATCTGCTTGTACATCTGCTTCACTAGAACCATCTTATGTTTTACGTGCGTTAAATATAGATAAGGATTTAGAACACTCATCTATTAGATTTGGAATAGGTAGGTTTACTACAAAAGCAGAAATTTTATATGCAGCGGATCTTATTGTAAATAGCATAAAGAGGTTGCGTGAGATGAGTCCTTTATGGGAAATGGTACAAGAAGGTATAAATCTTAATGAAATTAAGTGGGATGTGCATTAATTTTTATTGTATTTGATAATTATGAGGTATTTATATGAGTTACAGTGAATCTCTTCTAGAACATTATAAGAATCCTAAAAATGTTGGTACTTTACCTAAAGAGGATTACAATGTAGGTACTGGCTTAGTGGGAGCTCCTAGCTGTGGTGATGTAATGAAGTTACAGATTAAAGTAGATGATAATGGAAAAATTATAGATGCAAAGTTTAAAACTTTTGGATGTGGTGCTGCAATTGCAGCTAGTTCACTAGCTACTGAGTTAATTAAAGGTAAAACAGTAGATGAGGCACATGAGTTGAAAAATACAGTATTGGCAAAAGAATTAAGTTTACCCCCAGTGAAAATACATTGTTCATTACTTGCAGAAGATGCTGTAAAAGCAGCTATAAATGACTATCATATGAAACAAGCAAACAAAAAAAATGCTACTAAAAATCCTAATGAATAATACAGCAATAATATGCAATCAGGTTTATCTATGGATAAAGAAGTGTTGATACCACATAATAATCAAGAGAATACATGTGATTCACAGATAAAGTATTTTATAAACAGTAGTTTCACAGATAAGTCTCCTATTATCATAACGGAAAATGCTATTAAAAAAATTAAGGAACTCATTGATAAGAAAAAAGATTCTGTCATTGGGATTAGAATAATGGTAGCGCAAAAAGGATGTTTTGGTTTTAAGTATAATATAGAATATGCATATGATATCAAAATGTTAGATGTACAAATTCAAGTAAAATATCAAAATCAAAATTTTATAATTTTGATTGATCCAAAAGCTATGATGTTTATTAATGGAACAGAAATGGATCATGTAGAAAATAAAATATCTTCTGGCTTTGTATTCAAAAATCCAAATGAAAAAGGAAGATGTGGTTGTGGAGAAAGTTTTTATGTATAAGGACTATTTTTCATTATTCAAGTTAAACCAGAGTTTTTTTATTAATATACAAACATTAGAGAAGAATTATATAGCATTACAAAGTAAACATCACCCTGATTTGTTTTTTTTAAAATCTGAAAAAAAATTAGCATTAGACAATATAGCAGAAATAAACAAAGCATATCAAACTCTAAAATCGTCAATAACGAGAGCAGAATACTTATTAGAAATAAAAAGAGTTATTGCTAATACAGATGATGTAAACAACATAATAAAAGAAGTATTTACACTTAGTGAGCTAGATGATGCTGATATTCAATATCATATACTATTGTGTACAAAAGCTATGGAAAATGCTTTTCTTATGGAAGATTTTAAAGAAGCTGCTAAGCAACTTACGAAATTGAAATATATAAAGAAAATACAAGAAGATAGGGGTATTAGTTAATGAAATTAATTAATATAACAGAACCACAAGAAAAACGCATATCCATAGCATTTGGAATAGATCTAGGTACTACTAATTCTTTGATATCTATGGTAGATGATAATGGTCAGATTATTATATTTAAAGATCAGAATGGTAATTCTCTTATTCCATCAATTGTTAGCTATCTTGATGATCATAGAGTAGAAGTTGGTAAAAATCACAATGATGATAAAAGTTGTACTATTTCTTCAGTAAAACGCCTAATGGGAAAATCTATTGAAGATATTAAACAATCAGACCTATTATTTAATATAGCTAATACAAAAGACAATATATACATTAGAAAACAAGATAATACATATGTTACTCCAGTTGAAGTGTCAGCGGAAATTCTGAAAAAATTATGCCAAATTGTAAAAAATAGCAGTAACTTGGATGTAAAAAAAGTTGTCATAACAGTACCTGCGTATTTTGATGAAGTAGCAAGAAAAGCTACAAAAAATGCTGCAAAACTTGCTAATCTTGAAGTACTACGTTTATTAAATGAACCAACTGCTGCAGCATTAGCATATGGAATCGAGAAATCAGAACATGATACTATATGTATGATATATGATTTAGGAGGAGGAACATTTGATGTCTCAATATTAAAGTTACACGATGGAGTATTTCAAGTTTTAGCAACTGGTGGTAATACAAATCTAGGTGGAGATGATATAGATTACTTATTTGCAAAATTTATATACCAAAAATATCAGACAAAATCACATATTAAACTTACAGATTTCAATAAAGAAATACTTAAGGAGTTAATTGATGATGTAAGATATGCTAAAGAATATCTAAGTGATCATCATAGTGGAACTTTCATTTTTAAAATCAGAGGTAAGGATTTTTTGTGCAAAGTTACTAGAAATGAATTAAATAATATAGTATTAGGGTTAGTAAAAGAAACATTAGATATTGTACATTCAACAATTAGTAGTATTAGCCTCCTTCACAAGGATATTAAAAAAGTAATACTAGTGGGTGGTGCTACTAAAATGCCTATAATAAAAGACATGTTAAACAATCTATTCCATAACAGAGTATTTTGTGATGTAGATCCAGAAAAAATAGTCGCTGTTGGAGCAGCTTTACAAGCACATTATTTATTGAATCCAGATATAAAAAACAATCTACTTATAGATACTTTACCATTATCATTAGGGATTGAAACAATAGGCGGCATTGTAGAAAAAATTATACCAAGAAATACACCTATACCTGCATTTGCTACACAAGAATTTACCACATATGTAGATGGACAGAATGCAATACAAATTCATGTATGTCAAGGAGAACGGGAAATTATAGAACACAATAAATCTTTGGCTAAATTTGATTTAAAAGGGATACCTCCATTACCTGCAGGTTCTGCAAAAATTCAAGTAGAATTTCAGGTAGATATGGATGGATTATTAACTGTTTCAGCACAAGAAAAATTGACAGGAATAAAACAATCTGTAAGTATTAATAATACATTAAAGTTAGATCAAAAAGAAATAGAAGAAAACGTTATGGAATCTGTTAAAAATTTTAACAGTGATATGGATGCACGTTTGTTAGCTGAACAAAAAATTGAGGGACAAAGGATTATATCCATAATAAAGAAAGCACTTATTGAGGATAAAGATTTGATATCAACATCAGAATTAATGATACTTAATAAAACACTAGAAGATGCAGAAAAAGTATTATTAACTGGTCAGAGTGATCAAATTAAAGATGCTATTAATCATGTTGAATTACAAGCATCTAATTTTATAAAAAAACGGATGGATTTTTACTTAAAAAAATCTATTGATAACTATAATATTAGCAGTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_006832|696497:705918|704067_705918_+|WP_011155101.1|DBSCAN-SWA MKLINITEPQEKRISIAFGIDLGTTNSLISMVDDNGQIIIFKDQNGNSLIPSIVSYLDDHRVEVGKNHNDDKSCTISSVKRLMGKSIEDIKQSDLLFNIANTKDNIYIRKQDNTYVTPVEVSAEILKKLCQIVKNSSNLDVKKVVITVPAYFDEVARKATKNAAKLANLEVLRLLNEPTAAALAYGIEKSEHDTICMIYDLGGGTFDVSILKLHDGVFQVLATGGNTNLGGDDIDYLFAKFIYQKYQTKSHIKLTDFNKEILKELIDDVRYAKEYLSDHHSGTFIFKIRGKDFLCKVTRNELNNIVLGLVKETLDIVHSTISSISLLHKDIKKVILVGGATKMPIIKDMLNNLFHNRVFCDVDPEKIVAVGAALQAHYLLNPDIKNNLLIDTLPLSLGIETIGGIVEKIIPRNTPIPAFATQEFTTYVDGQNAIQIHVCQGEREIIEHNKSLAKFDLKGIPPLPAGSAKIQVEFQVDMDGLLTVSAQEKLTGIKQSVSINNTLKLDQKEIEENVMESVKNFNSDMDARLLAEQKIEGQRIISIIKKALIEDKDLISTSELMILNKTLEDAEKVLLTGQSDQIKDAINHVELQASNFIKKRMDFYLKKSIDNYNISS >NC_006832|696497:705918|703188_703638_+|WP_011155099.1|DBSCAN-SWA MQSGLSMDKEVLIPHNNQENTCDSQIKYFINSSFTDKSPIIITENAIKKIKELIDKKKDSVIGIRIMVAQKGCFGFKYNIEYAYDIKMLDVQIQVKYQNQNFIILIDPKAMMFINGTEMDHVENKISSGFVFKNPNEKGRCGCGESFYV >NC_006832|696497:705918|698801_699524_-|WP_011155095.1|DBSCAN-SWA MREIFFNGAVGKIEGKYHHNKTVGAPIALIFHPHPQYGGNMDNKIVYNLYNIFANNGFSVLRINFRGVGKSSGNFEKGIGELSDGAAAADWLQNNNMASSPFWVAGFSFGAWVAMQLMMRRPEVEGFIAVAPPANKYDFSFLSPCPVPGLIIQGDQDSISDEAAVSQLAARLSNSIKSKYMQYYVIEKADHFFRDHMDKFNEIVDNYIKFCLSESAGNRKKDITNKKVKYRRIVMQDEPV >NC_006832|696497:705918|699846_701415_+|WP_011155096.1|DBSCAN-SWA MLITARLRYAIMFMVKLAHGLCTQQNKLQPVRMSYIASNQSLSEGYLEQVIVQLKKKGLINATKGPGGGYSLSIAPHLITLSLILESIGENIKITRCENNSPGCLSNNNRCVTHKLWDDIGNYIKDYLNNISLEDIVNNNFKSNIALHKDDKPYIYADYNSTSTILPEVKYQLNNLSYIKLYNPSSIHKLGQKTRSIIEEARNIAIKQLNAQYYDVVFTSSGTEANNLVINSTSDYKHLISSTEHLSIIKCATNAELIPVDSNGIICLNALSSLLHKFKDDKILVSVMTANNETGAIQPIKKIVELSHKFGALVHTDAIQACGKIHIDIEDLGVDLLTISSHKLGSIAGAGVLFFNSKKIKIKPMIIGGHQEKGLRAGTENVLAIYLLSISLSNLYKSITKMLLVEKLRNKLENEILSLVPDAQIFSRNVERLPNTSCISMPNVNSEIQVISFDIKNIAVGNGSACSTGVVEPSHVLSAMGVNQEIANNSIRISLSPDTTDEHIRTIVNCWYEIYTHNQVHK >NC_006832|696497:705918|697338_697497_-|WP_162009505.1|DBSCAN-SWA MNTTIKLYKYNPTTHLINSFINCSFEDGITVLQACELAGIQIPRFAIIRELL >NC_006832|696497:705918|697974_698445_-|WP_011155094.1|DBSCAN-SWA MLTTARLRYAIMFMVKLAHGLCTQQNKLQPVRMSYIASNQSLSEGYLEQVIVQLKKKGLINATKGPGGGYSLSIAPHLITLSLILESIGENIKITRCENNSPGCLSNNNRCVTHKLWDDIGNYIKDYLNNISLEDIVNNNFKSNIALHKDDFVKKK >NC_006832|696497:705918|703576_704068_+|WP_011256078.1|DBSCAN-SWA MYSKIQMKKEDVVVEKVFMYKDYFSLFKLNQSFFINIQTLEKNYIALQSKHHPDLFFLKSEKKLALDNIAEINKAYQTLKSSITRAEYLLEIKRVIANTDDVNNIIKEVFTLSELDDADIQYHILLCTKAMENAFLMEDFKEAAKQLTKLKYIKKIQEDRGIS >NC_006832|696497:705918|701495_702728_+|WP_173358441.1|DBSCAN-SWA MKDIQRHINLPIFLDYQSTTKTDSRVLDAMIPYFQEFSNPHSRSHCFGWKAESAVELARERIASLINAESKEVIFTSGATESNNLAIKGVANFYKSKGNHIITVRTEHKCVLDSCRHLETEGFDVTYLDVQKNGILDLNLLKSAITDKTILVSVMMVNNEIGVIQPIEEIGKICHNHGVFFHTDAAQAFGKIPIDVNKMNIDLLSISGHKIYAPMGIGALYVRKRQPRIRLTPIINGGGQERGMRSGTIPTPLAVGLGEAAYIAQEVMEDEAIRIKELRDILYSEIKKHLPYVILNGDYEQRIAGNLNLSFPYVEGESIIMAINNLAVSSGSACTSASLEPSYVLRALNIDKDLEHSSIRFGIGRFTTKAEILYAADLIVNSIKRLREMSPLWEMVQEGINLNEIKWDVH >NC_006832|696497:705918|702762_703176_+|WP_011155098.1|DBSCAN-SWA MSYSESLLEHYKNPKNVGTLPKEDYNVGTGLVGAPSCGDVMKLQIKVDDNGKIIDAKFKTFGCGAAIAASSLATELIKGKTVDEAHELKNTVLAKELSLPPVKIHCSLLAEDAVKAAINDYHMKQANKKNATKNPNE >NC_006832|696497:705918|696497_697223_+|WP_011155093.1|DBSCAN-SWA MNSTVNQNELLKFSKISDKWWNENGPLKPMHMMHPVRMQYIINYINKVMPNVDFKSLSVLDVGCGGGLLSESMARLNMRVCGIDASKETINVAQKHALVHGIHNISYHCMNIEDLVNIQEKYDIITVMEVVEHVDNLPLFINSISSLLNDNGIIFLSTLNRNIKSLLCGVICAEYILNLVPYGTHQWSRFVKPSEIANLFLPNGVVLQEIVGVSFNLIKNCLQLSKDISVNYILAAQKYVN |
10 | unidentified_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|