Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_010555 | Proteus mirabilis HI4320 plasmid pHI4320, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NC_010554 | Proteus mirabilis HI4320, complete genome | 1 crisprs | DEDDh,DinG,c2c9_V-U4,PD-DExK,cas3,csa3,RT,WYL,c2c10_CAS-V-U3 | 0 | 0 | 8 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_010554_1 | 2186565-2186707 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_010554_1
|
2 spacers
spacers of NC_010554_1
>1.1|2186588|37|NC_010554|CRISPRCasFinder TGGCGCTGGTAATGTCATTAAATCTGATGTTACACAA >1.2|2186648|37|NC_010554|CRISPRCasFinder CGGCATAGCAAATGTAATAAAACATAACTCTAATTAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_010554_1
The CRISPR arrays of NC_010554_1 >merge|NC_010554|1|2186565-2186707|CRISPRCasFinder GGTGATATCAATTTCACAGGTGGTGGCGCTGGTAATGTCATTAAATCTGATGTTACACAAGGTGATATCAATTTTACAGGTGGCGGCATAGCAAATGTAATAAAACATAACTCTAATTATGGTAATACCAACTTTACTGGTGG >NC_010554|1|1|2186565-2186707|CRISPRCasFinder GGTGATATCAATTTCACAGGTGG TGGCGCTGGTAATGTCATTAAATCTGATGTTACACAA GGTGATATCAATTTTACAGGTGG CGGCATAGCAAATGTAATAAAACATAACTCTAATTAT GGTAATACCAACTTTACTGGTGG
>NC_010554.1|WP_004244072.1|2184649_2184853_+|hypothetical-protein MIHIPASGFIYMASIIKSMLENPCINKEFEKLIAADLLPILQNETNMTENFTALHLIKKTNNRRIIL >NC_010554.1|WP_004248541.1|2184502_2184649_+|hypothetical-protein MAINEKFVQEISSINYNNSIFSLYFVGQDPHKIAQGIMPEKDEELALK >NC_010554.1|WP_004244067.1|2181231_2183829_-|bifunctional-aconitate-hydratase-2/2-methylisocitrate-dehydratase MLEEYRKHVAERAAEGVVPKPLDATQTAALVELLKSPPKGEEEFLLDLIVNRVPPGVDEAAYVKAGFLTALAKGETTSPLITPEKAVELLGTMQGGYNIHALIEALDNDKLAPIAAKALSHTLLMFDSFYDVEEKAKAGNVYAKQIMQSWADGEWFTERPELAEKITVTVFKVTGETNTDDLSPAPDAWSRPDIPLHALAMLKNAREGIEPDQPGSVGPIKQIEALNKKGFPLAYVGDVVGTGSSRKSATNSVLWFMGDDIPYVPNKRGGGVVLGGKIAPIFFNTMEDAGALPIEVDVSKLNMGDVIDIYPYKGEIRNHETNELLETFALKTEVLIDEVRAGGRIPLIIGRGLTSKARSALGLPPSTLFRHAKAVEQSDRGFSLAQKMVGRACGRDGIRPGEYCEPKMTSVGSQDTTGPMTRDELKDLACLGFSADLVMQSFCHTAAYPKPVDVTTHHTLPDFIMNRGGVSLRPGDGIIHSWLNRMLLPDTVGTGGDSHTRFPIGISFPAGSGLVAFAAATGVMPLDMPESVLVRFKGKMQPGVTLRDLVHAIPLYAIKEGLLTVEKKGKKNIFSGRILEIEGLPELKVEQAFELADASAERSAAGCTIKLDKAPIIEYLQSNIVLLKWMIAEGYGDRRTLERRITAMENWLADPQLLEADADAEYAAVIEIDLNEIKEPILCAPNDPDDARLLSEVANSKIDEVFIGSCMTNIGHFRAAGKLLDQHKGQLPTRLWVAPPTKMDAAQLTEEGYYSVFGKSGARIEVPGCSLCMGNQARVADGATVVSTSTRNFPNRLGTGANVYLASAELAAVASLLGRLPEPQEYLDFINKVDETAEDTYRYLNFDQLEQYTDKATQVIFQTTV >NC_010554.1|WP_004244066.1|2180689_2181061_-|YacL-family-protein MDYEFQRDLTGGILARFSMDHEAIGYWLNDEIQGDISLIDQILTEMDEVKGSEKQWQLIGKEYSLSIDDEEIMVRANTLHFETDDLEEGMSYYDNESIAFCGLDDFATMLQKYRLFILENRRS >NC_010554.1|WP_012368224.1|2179737_2180598_-|small-conductance-mechanosensitive-channel-MscS MNELPASLDEATGWFVANQELFIQYAVNIVAAFLILFIGLFVAKMVSKGVARILTLRHIDATVVTFLSVLVRYTVIAFTLIAVLGRLGVQTASVIAVLGAAGLAVGLALQGSLSNFAAGVLIVIFRPIRAGEYVMIGAVEGTVRDVQIFSTTLRSADDRIIVIPNSKIISSEVINLSREPNRRTQIIVGVAYDADIDKVKQVLGDVVAQDKRIQHNQGVTIRLHEMAPSSLNFVVRVWTTNDDAWPVYWDLMENFKRALDANNIGIPFPQMDVYMHQAQNTVMKAE >NC_010554.1|WP_004244063.1|2178945_2179569_-|arginine-exporter-ArgO MLTTFFQGFLLSAAMILPIGAQNAFVLQQGSKKQYHLMSAFLCALSDVILISGGVFGGSALLSQSEYLLLLITWGGVAFLLWYGWNAFKTAFTKEIELSQHKNQVKSRWRVIVTLVAVTWLNPHVYLDTFVVLGSIGGQLSAELRPWFTFGAVFASISWFFALSLLAAWFSPILSQVTAQRIINLFVGCVMWFIALQLAAQGWKNLF >NC_010554.1|WP_004248538.1|2178120_2178855_-|oxidative-stress-defense-protein MKVKAMVLASMLALGAPSIALAGAVPEGPHITTSGNATIKATPDMATLNIQVSEKAKDAAQAKKQVDERVAKYFAFLKENGVTKEDIDAANIRTQPNYEYDKKAERSVINGYTATRTVDVKIKKLDQLNTLLDGALAAGLNEINNVEFGVNDPEQYKAKAREVAIKNAIQQASSVAKGFGADLGAVYSVSYRAPEATPYPIARMKMDAMALSAPSPEAVKETYQQQSIEFKDYVDVVFELKTAK >NC_010554.1|WP_041707096.1|2177524_2177953_+|hypothetical-protein MADIATLIAKWRNGLEVEIYTENYEFRYGRIKSSRFNASGEESVYYATYFHTRAKPKDNDPLLIITFDPVVGQDDFMFIETIIDHRTYFGSPGADKTKSHIERRSSDLKRRIENGKKISSEPSSSVQNVNKNNNDSPDQENK >NC_010554.1|WP_004244060.1|2177235_2177457_+|hypothetical-protein MSTFIRRSRNVALAIDAGRKSGSANIEGNTPADIQASLLKSLGEFTASIPTTKQQPYVKGSHGANHKKTYFGR >NC_010554.1|WP_004244059.1|2176133_2177033_+|LysR-family-transcriptional-regulator-ArgP MKRPDYRALQALDAVIRERGFERAAQKLCITQSAVSQRIKQLENLFGQPLLVRTVPPQPTEQGQKLLALLHQVEMLEEQWLGDENSGSTPLLLSLAVNADSLATWLLPALHPVLTQLPIRLNIQVEDETRTQERLRRGEVVGAISIQPQALPSCLVDQLGALDYLFVASPDFAQRYFANGVTKSSLLKAPAVAFDHLDDMHQAFLQQNFGLSPGSVPCHIVNSSEAFVQLAKQGSTCCMIPHLQIADELKSGELIDLTPGLCQRRMLYWHRFAPESRTMRKVTDALLDYGRKVLKQDEE >NC_010554.1|WP_004244077.1|2199157_2200585_-|dihydrolipoyl-dehydrogenase MSTEIKAQVVVLGAGPAGYSAAFRCADLGLDTVLVERHSTLGGVCLNVGCIPSKALLHVAKVIEEAKALSEHGVVFDAPKTDIDKIRIWKDKVISQLTGGLAGMAKGRKVNVVNGEARFTGSHTLSVEGSEGTTTITFENAIVAAGSRPIELPFIPHEDPRVWDSTDALQLKTVPERLLVMGGGIIGLEMGTVYHALGSQIDVVEMFDQVIPAADKDVVKVFTKRISKKFNLMLETKVTAVEAKEDGIYVTMEGKKAPAEPQRYDAVLVAIGRVPNGKLLDAGKAGIEVDDRGFIHVDKQMRTNVPHIFAIGDIVGQPMLAHKGVHEGHVAAEVISGKKHYFDPKVIPSIAYTEPEVAWVGMTEKEAKEKGVSYEVATFPWAASGRAIASDCADGMTKLIFDKETNRVIGGAIVGSNGGELLGEIGLAIEMGCDAEDIALTIHAHPTLYESIGMAAEVFEGSITDLPNPKAKKKK >NC_010554.1|WP_012368226.1|2200786_2202652_-|pyruvate-dehydrogenase-complex-dihydrolipoyllysine-residue-acetyltransferase MSIEIKVPDIGADEVEVTEVMVKVGDRIEEEQSLITVEGDKASMEVPSPQAGIVKEIKIAVGDKVETGSLIMIFDTEEGAQAPAQEAAPAPSAAAPAASELKEVHVPDIGGDEVEVTEVMVNVGDTISEEQSLITVEGDKASMEVPAPFAGVVKEIKIAVGDKVSTGSLIMVFEVAGSAPAPSASAPAPAASAPAASAIKDVNVPDIGGDEVEVTEVMVKVGDTIAEEQSLITVEGDKASMEVPAPFAGVVKEIKIAVGDKVKTGSLIMTFEVAGAAPAAQAPVAPAASTSAAPSAPAKAPASAPAAKEEFVENEAYVHATPVIRRLAREFGVNLAKVKGTGRKGRILREDVQSYVKELIKRAESAPANAGGGLPGMLPWPKVDFSKFGEIEEVELSRIQKISGANLSRNWVMIPHVNLFDEADITEVEEFRKQQNKEAEKKKLDVKITPLVFVMKAAAKALADMPRFNSSISEDGQKLILKKYINIGIAVDTPNGLVVPVFKDVNKKGILELSYELAEVSKKARAGKLTASDMQGGCFTISSLGGIGTTGFAPIVNAPEVAIMGLSRSSMKPVWNGKEFVPRLMLPMSLSFDHRVIDGADGARFITLINQYMSDLRRLVM >NC_010554.1|WP_004244080.1|2202664_2205331_-|pyruvate-dehydrogenase-(acetyl-transferring),-homodimeric-type MSDMLKNDVDPIETRDWLQAIDSVIREEGVERAQFLIDQVLKQARNGGLDIALGGSVHSDYINTIPVEDEPAYPGNLELERRIRSAIRWNAVMMVLRASKKDLELGGHMASYQSSATLYEVCFNHFFRAHNDNDGGDLVYFQGHISPGIYARAFLEGRLTEEQLNNFRQEIGGKGLSSYPHPKLMPEFWQFPTVSMGLGPLSAIYQAKFLKYLDHRGLKDTTKQRVYAFLGDGEMDEPESKGAITIAVREKLDNLCFVVNCNLQRLDGPVTGNGKIVNELEGIFAGAGWNVIKVMWGDRWDALLRKDTSGKLIQLMNETLDGDYQTFKSRDGAYVREHFFNRYPETAALVKDMTDDEIWALNRGGHDPKKVFAAFQKAKETKDKPTVILAQTIKGYGMGETAEGKNIAHQVKKMNMDGVKHFRDRFNIPVSDEKVAELPYITFDKDSEEYKYLHARRQELEGYLPARRTRFDEKLEIPTLEDFSQLLEEQSKEISTTIAFVRALNVMLKNKSIKDRLVPIIADEARTFGMEGLFRQIGIYSPNGQQYTPQDREQVAYYKEDVKGQILQEGINELGAGASWLAAATSYSTNNLPMIPFYIYYSMFGFQRIGDLCWAAGDQQARGFLIGGTSGRTTLNGEGLQHEDGHSHIQSLTIPNCISYDPAFAYEVAVIMQDGLERMYGDKQENVYYYITTLNENYHMPAMPAGAEEGIRKGIYKLESLEGAKGKVQLLGSGSILRHVREAAQILSTEYGIGSDVYSVTSFTELARDGQDCERWNMLHPSEEPRVPYIAQIMNDAPAVASTDYMKLFAEQVRTYVPADDYRVLGTDGFGRSDSRENLRHHFEVDTSYVIVAALGELAKRGEIDVKVVEEAIKKYNINPEKVNPRLA >NC_010554.1|WP_004244081.1|2205494_2206280_-|pyruvate-dehydrogenase-complex-transcriptional-repressor-PdhR MASSNMAYTKIRQPKLSDVIEQQLEHLILEGTLRPGEKLLPERELAKQFDVSRPSLREAIQKLEAKGFLLRRQGGGTFVQDNLWQSFSDPLAQLLSGHPESQFDLLETRHALEGIAAYYAALRGTDDDLERIKASHARIIDAHDKGDIAAESDAVLQYQLIVTEAAHNVVLLHLLRCMVPMLEQNIRQNFEFLYTRKEMLTAVSEHRTQIYQAIINREPEAAREASHRHLAFIEDVLLDMSREHTRRERSLRRLQQHPDLF >NC_010554.1|WP_004250361.1|2206591_2207134_-|1,6-anhydro-N-acetylmuramyl-L-alanine-amidase-AmpD MEIKQGWLTGVKHVPSPNYDNRPEGEIPSLLIIHNISLPPGQFGGPYIDQLFTNTLAVDDHPFFNEIAHLRVSAHCLIRRDGEIVQYVPFTARAWHAGVSFYKGREKCNDFSIGIELEGTDECDFTPQQYQQLSTLTQQLIEHYPGIKENITGHSDVAPGRKTDPGPHFNWSYYRALLAK >NC_010554.1|WP_012368228.1|2207344_2207788_+|prepilin-peptidase-dependent-pilin MNTLNYHSTENGFTLMELMIVIAIISILSSVAIPAYHGYIQKAALTDVLQTLSPYRSAVELCHYEHQYNQCHADASFMPQQFRSRYLTDIHVANGVISAKGKAQLEGLTIVMTPAANSKETLPQWQINCTSTNTALQTLCHKVFKSH >NC_010554.1|WP_004250359.1|2207886_2208990_+|Flp-pilus-assembly-complex-ATPase-component-TadA MNNTIHTATEFIEQLLRHSLAQRVSDLHLEPQQNSLRIRARIDNHLVLFSPPDNQLANEILTRLKILANINIAEKRLPQDGQFNWSYQKNNYSIRVATLPTLYGEKIVLRLMNNLQQPQLAQLGFQTIHLTLLKKYLTQPQGMILVTGPTGSGKTLTLYSCLQYLNKDNRNINSIEDPIELPLHGINQTQITEKAGITFATILRALLRQDPDVIMIGEIRDQQTAEIAIKAAQTGHLVLSTLHTNSTQATLARLANLGIAKDLIDSCVKLIISQRLVRCLCSNCKYPSPEQKNFIINNQQIILPNWQATGCQFCYSGYKGRTAIYDCFELAKQSLPSPYALFNSGIELIKKGITSLDEVYQVVGDIE >NC_010554.1|WP_012368229.1|2208986_2210186_+|type-II-secretion-system-F-family-protein MKLHFIYRYNALTYQGKWLSGNVVAQSKHEVIDQLIQQQKLPVKIRLYRVIIFQNSDKQYRIQLLEQLALLLHSGLALLPALTLLKEECRYLHWQCVLNDIIFHLNQGGALSKQLSRYPLYFPANLTHFIYIGEESGKLDEVLLLQTTQLKNQRDLIKKIIKAFQYPLFLLLTLIVITISMLIYVLPEYQSLYSAFNTELPMLTLTLIRCSQWFSQYSLIILLFILIISYSYYTIKHHSAKFRDIEQRCWLNLPYLGVLLRYHQLHIIFQIMTITQQAGLPLLQGLKIITEQLTHSLYQRALTDMIAHITQGKSLSSFMRHNPLFPPICYQLISSAENSGQLQFFCQQLTHWFYHQLEERLDSVKTWLEPILMTLIALITGTLIIAMYLPVLQLGDTIH >NC_010554.1|WP_004244087.1|2210463_2211078_+|dephospho-CoA-kinase MTYTVALTGGIGSGKTTIANGFASLGVPLVDADVIARLVVEPDSPGLKALQQHFGDTILLPDGKLNRAQLRHIIFQNQQEKAWVNQLLHPLIQQETQKQIQQIRAPYFIWVVPLLVENKLTHLADRILVVDVTEEEQITRTMQRDGVSRDHVLKILQAQAKREQRLAVADDIIENHDNSLNQDEQIKQLHQHYLELAQKSNTGQ >NC_010554.1|WP_004244089.1|2211080_2211833_+|cell-division-protein-ZapD MSEETSTIIFEHPLNEKMRSWLRIENSLIQLNSFQSINSLSSALSFFRAVSEFIEVLDRGEIRAELLKELEKRQKKLQQWLSFPNVDKEIVSHIINELSESACALSKAPRIGQHLKQDKIISLVKQRLSIPGGCCSFDVPTLHLWLNLPQTVRTEKLTCWQEGLYPLQNALNALLTLIRQSDTFKPVLSHNGFYQDSTEEGELLRIKLLASQQIYPQVSGHKNRYAIRFLPLDSEHGTIPSELPFEISCC |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
479796 : 491140
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_010554|479796:491140|DBSCAN-SWA CTTACTCATTTGGTGTCTCCTTATCCAGTGCTTGTAACAACATTCCTTTCGAAATTAAACCGATATAACGGTTTTTTTCATCAATAACAGGGATCGCACAGGGAGATTGCGCAACAGTAGAAATCAGTTCATTTAATGGTGTATCACCATTAATCGCACAAGGTTCAGTTAAAATAGCGGATCCAATAGGTTGCTTCGCTTTTAATGCTTCTTCAAGAGAAGTGACAGAAACAATACCTGCAAATTTCCGTCCTCGCTCAATTAAATAACCAAAGTTTCTATCTTCATCTTCCAGTACTTTTAATGCTGAACGGGGACCAAAACCTGGCGCAATATGCAGTAGTGTTTCTGGGCGACGTTTAGCAATATCTTTAGCGCTAAATACATGACTGATATCAACGCCACGGAAGAAGGTACGTACATAATCATTGGCTGGGTTATTAAGAATTTCATCAGGGGTACCGATTTGTACCACCACACCGCCTTGCATAATCGCGATACGATCACCAATACGCATGGCTTCATCCAGATCATGAGAAATAAACACAATGGTGCGTTGTTTATCACCTTGTAAGCTCAATAACTCATCTTGCATTTCTGTTCGGATTAATGGGTCAAGTGCGGAGAATGCCTCATCCATTAATAAGATATCAGGATCATTGGCCAGTGCACGAGCAAGCCCAATACGTTGTCGCATCCCACCGGATAACTCATCCGGCCAAGATTGAGCATGAGAGCTTAAGTTAACTTGCTCTAATGCTGCCATGGCTTTTTCATAGCGCTCTTCTTTGCTAATGCCTGCAAGCTCCATACCAAATGCTGTATTATCGAGTACATTCATATGAGGCATTAAAGCGAATGATTGAAACACCATACTGATTTTTTTACGTCGAACTTGTCGTAAATCTTTATCAGACATGGTGGTGATGTTTTCACCATCAATAAGGACTTCGCCTTTAGTGGGATCTATCAGACGATTGAGAAGGCGCACTAATGTAGATTTACCAGAGCCTGATAATCCCATGATGACAAATATTTCGCCTTCTTCAATGGCCAGATTGGCATTTTGCACACCAACGGTTAACCCTGTTTTATCAAAGATTTGGTCTTTGTTCATACCAGATCCTAATAATTCAAAGGCCCGTTTAGGGTGCTCACCAAATATTTTATATAGGTTTTTTACTTCGAGTTTAATTGCCATGCAATATCTATTTTCCTATTTAAATATGAAAGGAATAAATTAAATGTTAATAAATTAGTTTGTTGTTTTTCCTAAATTGAGATTTTTAGTAGGGGAATTACCCTATCATAATGAACAAGCCTGACAACCCTATGTTAATTATAATTAAACAAATAATTTTGTGATTTTTTTAGGTTTTTTTTGATAATTAATATTTAAATAAAGTAAAATTATAGAAAAGAAAGAAGTCAAAAAAACCATACTAACTGTATGAAATAACATTATTTTTATTCAGATGTTAATTTTAATTATCATCACAATAGAAATAACAACAAAATAAAAAAATGTAAAAAGATACTGATAAAATAAAAATAGAAAAAAATGCATTAACATTAAAAAATCTTATGTTTTTTGAGGGGTGATCTTAAGTTATCGATAACTAGTCATAAAAATCATTCGTAAAAAATTGATAATTCTGGTTAATGGAACGGTAAAAATTACACAATCAGGTTGTTTTTCAAGCAAATAAAAAGGCACTAAAAAATAAGTTTTATTTTTCAGTGCATTATATTAATTGATTAATTCATAATTAATATGAATGTATTCTGTTTTTTGCTGTAGAGGGTTAGCTAGAAATCCCAGTCATCATCTTCGGTATTGATCGTTTTACCAATAACATAAGAAGAGCCTGAGCCAGAAAAGAAATCATGATTTTCATTTGCATCTGGCGATAGTGATGAAAGTATTGCTGGACTAACATTAGTTATTTCATCTGGAAATAGTGCTTCATAACCTAAATTCATCAGCGCTTTATTCGCATTATAATGAAGGAATTTTTTTACATCTTCTGTCCAACCGACAGAGTCGTAGAGATCTTCTGTATATTTAACTTCATTATCATATAAATCTAATAATAATGAGAAAGCAAAGTCTTTAATATTTTGTTTCTCTAATGATGATTTATTTAATAACTGATTTTGGAATTTATAGCCAATATAATAACCATGCACAGCTTCGTCACGAATAATTAAACGAATTAAGTCGGCTGTATTGGTTAATTTCCCTCGACTTGACCAATACATTGGTAAATAAAATCCAGAATAGAATAAAAAAGACTCTAAAAATACACTGGCAATTTTTTTCTTTAATGGATCACTATCTTGATAATAACGCAGAATAATATCTGATTTCTTTTGCAAATAGGTATTTTCTTCACTCCAACGATAAGCATCATCAACATCTGTTGTTAAGCAGAGTGTCGAAAATATCGAGCTATAAGAGCGAGCATGTACCGCTTCCATAAAACAGATATTCGATAATACCGCCTCTTCATGAGGAGTCTGAGCATCAGGCATTAAGGTTGGTGCCCCGACCGTATTTTGTATCGTATCGAGCAGTGTAAGCCCTGTAAATACACGGATAGTCAACTGTTTTTCAGCTTGGGTTAAGGTATTCCATGAAGGTATATCATTAGAAAGTGGAATTTTTTCGGGTAACCAAAAATTCATGGTTAAACGGTTCCAAACTTCTAAATCTTTTTCGTCTTCAATACGATTCCAATTTATCGCATTAACACGACTTAAATAAGATGCAGACATAGTAACACTTTCCTTATCATTATTATTAAAGGGCGCATGAAACACAGCCTTTTATTTCTGTGCCGGCTAATGCTGTTTGTCTAATACGAATGTAATACAAGGTCTTTATACCTTTACGCCATGCATAAATTTGTGCTTTATTAACATCCCTTGTGGTTGCTTCATCAGAAAAGAATAATGTTAGCGACAATCCTTGGTCGATATGTTGTGATGCTTGGGCATAGGTATCGATAATTTTTTCTGCGCCAATTTCATAAGCATCTTGATAAAAATGACGGTTTTCATTGGTCATAAAAGGGGCGGGGTAATAAACCCGACCGATTTTACCTTCTTTTCTTATTTCAATCGGTGCCACAATGGGGTGAATACTCGATGTAGAGTGATTGATATAAGAGATTGATCCTGTTGGTGGTATTGCTTGTAAGTTTTGATTATAAATACCGTGAGTCATAATCGAGAGCTTAAGTTTTTGCCAATCTTCTTGGGTTGGAATATGAATATTGGATTGGCTAAATAGCTGGTGGACTTTTTGGGTTTTAGGTAACCACTGTTTTGATAAATATTTATCAAAATACTCCCCAGTGGCATATTTTGACTGTTCAAACCCTTTAAAGCGCTGTTTAGTCTCTATCGCTAATTGGTTAGAGGCTAAAAGGGCATAGTATGTTACGGTATAGAAATAGATATTGGTAAAATCAAGTCCTTCTTCTGAACCATAATAAATCCCTTCACGGGCTAAATAACCATGTAAGTTCATTTGCCCTAAGCCAATGGCATGAGATGCTTGGTTGCCTTTTTCAATAGAAGGTACTGATTCTATTTTAGTCATTTGTGCCACACTCGTCAGTGCTCTGATGGCAACATTTACGGTATGCGCAAAATCTGGTGAGTCCATCGCCATGGCGATATTCATTGATCCGAGATTACAGCTAATATCATGACCAATTTGTCGATAACTTAAATCAGGATTGTATTCACTGGCACTATTTACTTGTAAGATTTCTGAGCATAAATTGCTCATATTAATTCGGCCCGCAATCGGATTTGCGCGATTGACGGTATCTTCAAACATAATATAGGGATAACCTGATTCAAATTGAATTTCAGCTAAAGTTTGAAAAAATGCCCGTGCTTTAATTTTTTTCTTACGTATCTCTGCATTGTTGACCATTTCAGTATATTTTTCGCTAATACTGATTTCTGACATAGGAACGCCATATACTCGTTCTACATCATAAGGTGAAAATAGATACATATCTTCGTTGCGTTTAGCTAATTCAAAGGTAATGTCGGGAATAACGACACCTAATGAAAGCGTCTTAATACGTATTTTTTCATCAGCATTTTCTCGTTTTGTATCTAGAAAATGATAGATATCAGGATGATGAGCATGGAGATAAACCGCTCCAGCACCTTGTCTTGCGCCTAATTGATTGGCATATGAGAAGGCATCTTCAAGCATTTTCATCACCGGTACTACGCCAGACGATTGGTTTTCAATGCGTTTTATGGGGGCTCCTGCTTCTCGTAAATTAGTCAGTAAGAAAGCAACACCTCCGCCACGTTTCGACAATTGCAACGCAGAATTGACTGCTCGGCCAATGGACTCCATGTTGTCTTCGATACGTAATAAAAAACAAGAGACCAATTCGCCACGCTGTTTTTTTCCACAATTTAAGAAAGTAGGGGTTGCAGGCTGGAAACGGCCACTAATTATCTCATCGACAAGGTGAGTGGCGAGTTTGGTATTCCCCTGTGCTAGGGTTAAGGCAACCATACAAACACGATCTTCATAGCGTTCGAGATAACGCTCACCATCAAAGGTTTTTAAGGTGTAACTGGTGTAGTATTTAAATGCACCTAGGAACGATTGAAAGCGAAATTTTTTGCTATAGGCATGCTTAAAAAGCTGTTTGATAAACGGGAAATCGTACTGCTCTAATACTTGTGCTTCGTAGTAGTGTTGTTGCACCAGAAAATCGAGCTTTTCTTTTAGATCATGAAAAAACACCGTATTTTGATTAACGTGTTGACGAAAAAAATGGTGGGTGGCTAATTTGTCTTTATCAAACTGGATATTGCCTTGCTCATCATAGAGATTGAGCATGGCATTTAAGGCGTGATAATCGAGTTGTTCTATAGAGTGGGTCATATTTTTTATCTCATTCACTTTTTAGTCATTATTTGCTAGCTGACCAAAATGTGCTTAATCCGGTTTTTACACGTTTAACATCTTCAGGCGTACCAAGTAACTCAAAACGATAGAGAAAAGGGACTTGGCATTTTTGTGCAATAATGTCACCTGCTAAGCCGTAAGCAGAGCCAAAATTGGTATTTCCTGAAGCAATAACACCGCGTATTAATTGGCGATTTTCAGGAATATTTAAAAACTGGATCACCGCTTTAGGCACTGCGCCTTTAACGCCACCGCCACCATAAGTTGGGCAGAGCAACACAAAAGGTTGTGTGGCTTGTAGTGGTTCATCCTCTTTTATCCTTGTCGCTTGTAGATTAAGTTTTTGTACGAAGCGGTGACAATTTTCTGAGCGACTAGAGAAATAAATTAAAGGGGCAGTCGATTGCATAAGTTGCTCCTTTAGCGCGCTATTTGACGAATTTTATCTGGGCAGAAGCCAGACCAATGTTCGTCACCATTAACGACAACTGGTACTTGGCGATATCCCATAGAAACTATTTTTGCTAATGCTTGAGTGTCTTGGGTGAGATCAACCGCAGTGAAAGGAATTTTTTGTTGTTGTAATGCGCGCTCGGTTGCACTGCATTGAACACAATTTGGTTTGGTATAGAGGATCACAGACATAGAATAACCCTTATAAAAATGTGAATGTGTCTGCTCACAGTCACAATGAAAAGTACTTAAATACTATATATAGGTTTATTCTTTTTCAACCACACTAGATATGGTGTTTTTTATTTTTGATAATGATTATTATTAAAATTAAGCAGTTAGCAGATTTATTTTATTTTCTTATCGCTCATTTGAGCAATTTTTATTAGGTATAGTAGAAAATTAGATGATTGATTTACTTACAAAGCATGTTTTAATCTTGATGATACAGACAAATCAATAGAGAACACATTATGTACCAAGATTATCTCAATACGCCGAAAGGTTTTCCAAAGCCTTATATATCCATTACTGCAGATGATGATGGCATCACCAGCCTTAACTTTGTTAGTGAAAAAGAGGCGTTAGTTAATTCAAATGCCATAATTGACCTGTGTATAAAACAGTTAAAAGAGTATTTTTCGGGTAAACGCACCCTATTTTCAGTGCCACTAGCGCCTAAAGGAACCGAATTTCAAATACGCGTTTGGCAGACTTTACAGTCTATTCCTTATGGTGAAATTTGGAGTTATAAAAAGTTGGCACTTACATTAGGTTCCGTCAACTATTGCAGAGCGGTAGGAATGGCAAATTCACGTAACCCAATCTCGTTAATTATTCCTTGCCATCGCGTCATTGGTCATAATGGTAAGTTAGTAGGCTATACTGGGGGACTTGATATCAAACGTTGGCTATTACACTATGAAAAAGTGGATATTGACGAATAGTTCATATTGTAAGTATTAAGCACTATTTCTTAAGTGATTAATGGCTTAAGTTATGGGATTTGTCTGAATAATAATCGTTTAACAGAAAAAAAATACGCGTTTCGTGATCTAGACTGTGGACAGCGAATCATCATTTTTGTTTTACTATAGCCAACGCAAAACGCTTGCGTTTATTTTCTATTTTAAAGGTAAACTTGATGTCTAAATTAAAAGGTAACGTTAAGTGGTTTAACGAAACTAAAGGTTTTGGTTTTATCACTCCAGAAGATGGCAGTAAAGATGTGTTCGTCCACTTTTCCGCTATTGTTTCAGAAGGTTTTAAAACACTTGCTGAAGGTCAAAAGGTAGAGTTTGAAGTTACTGACGGCGCGAAAGGGCCATCTGCTGCAAACGTTGTCGCTATCTAATTAACGACTTCTCCAAAAGTAAAAAACGTTTTTGAAATGACCCCCAATAGTTGGACAACCAATTATTGGGGGTCTTTTTATGTCAAATACAGGGGGGATTTAAACATCATCATTGCTACTTAGGGTGACTATGCTTGCCACACTGCATAACTCTCGCTCGTTTTGATGATGAAAAAAGACTTGAGAAATTTAAAGAGGAGCTTGCGTATCTAGCTGCGGGATAAATACCGTGGTTGAAAGTTTTTTAAATTATTAAAATCAAGAATACATCATAGCTATCATTTTAAAATATCAATGAATGTATTGATAAAATTGGCTAATTTATTGAGTAATACCACCGGGAACAAAATCAAATTAAAAGGCCTGACATTGGTTGAATATTAAGTTCAGGCCTTATAAATCGCTTAACTAAAAGAGTACAACTTTATGATTAACGGTTTTTATCTTGTTAAAGAGACTACATTTCACGGAGTAGCCAGAATGCGAATGCCGTCATCAGAAACGAGCCCGCTAAGTTTGCCCCCATGGTGCCTAATGCCCAGCCTATTCGTCCTTCATTAAATAAGGCGACCACCTCAACGGAAAAAGTAGAAAAGGTGGTTAAGCCACCACAAAAACCTGTGGTAAGCATGATTTTCCAAATAGGATCAATATTGGGAGCCTTACTAAACCAAGCAATGCCAAAGGCGATAATAAAGGCACCAATACAGTTAGCGACCAAGGTCCCCGTTGCAAAATGGGGAAAAAGAGAATTGAGGCGGTAGCTAATTAGCCAGCGTAGTACGCTACCTAAACCACCGCCGATAAATACAGCTATTGCAATGTTAAGCATAAGAGAGATTAATCGTTATTTAACCTCAATCCCTTGAGCTTGAAGATCAGCATGATAAGACGAACGAACAAATGGTCCACAAGCGGCGTGGGTAAAGCCCATTGCTAATGCTTGCTCTTTCATATATTCAAACTCGTCAGGACTGACGTAGCGTTGAACAGGAAGATGGTGACGACTGGGTTGTAAATATTGCCCTAATGTCAGCATCGTTACACCATGTTTACGCAGATCGCGCATCACGTCAATAATTTCTTCATTTGTTTCACCTAAACCGACCATTAACCCCGATTTAGTTGGAATATTTGGGTGGGCTTGTTTAAAGCGTTCTAGTAACGTTAGAGACCATTGATAGTTCGCACCAGGACGCACTTGACGATAAACACGAGGTACGTTTTCTAAATTGTGGTTAAAGACGTCTGGTGGTGTGTCAGTGAGGATCTCTAATGCTTTATCCATACGACCACGGAAATCAGGGACTAAAGTTTCGATGCGAATATTAGGATTTTTTTCACGGATAGCGGTAATACAATCGGCAAAATGTTGTGCACCACCATCGCGTAGGTCATCGCGATCTACTGAGGTGATAACAACATAACGTAATCCCATATCTTTTATCGTTTGGGCTAATTTAATTGGCTCTTGGGGATCGGGTGCGTTAGGACGACCATGAGCAACGTCGCAAAATGGGCAACGACGCGTACAGATTGCCCCTAAGATCATAAAGGTTGCGGTACCGTGGTTAAAACATTCTGCAAGATTAGGGCATGAAGCCTCTTCACAAACAGAATGCAGGCCATTTTTACGCATGGCCGCTTTAATACCTTGAATTTTACTTGAATCTGCGGGCAACTTTATTTTCATCCACTCAGGTTTGCGTAGCAGTTCTTCACGTTCTGTAACGATTGTTTTAACAGGAATAAGTGCCATTTTATCGGCGTCACGATATTTTACGCCGCGTTCCATCTGAATAGGTTTACTCATAATTGTGCCAGTTCCAGTTATCTAGGGTGATTAACACGATGTGACTGAGGTAATCAGGGTTTTAAAAAAAAATGATAAATGTTAAAAAAATTATAGCATTTTTATTGCTGTGGTTGGAATCCCAGTTGTGTACAAAAATGGTTGATTAATAATGATGCCACTTGTTCCGATGTTGCATTAGGCGCCAAATCAACCAGTTGTGTCATTTTTAGATCAGGATAACCACAAGGATTTATTCGCGTAAAAGGAGATAAGTCCATATCAACATTAAGTGCTAGACCGTGAAAAGAGCAACCTTTGCGTATACGTAATCCCAAAGAGCAAATTTTATCACCATTAACATACACGCCCGGTGCATCTGCACGAGCATATGCGTCTACATTAAATTCTGCGAGTGTGTTGATCACAGTATTCTCTAAAACAGTGACTAATTGGCGAACGCCAATATGGTTACGTTTTAGATCAAGCAAAACATACATCACTTGTTGGCCAGGGCCGTGGTAGGTCACTTGTCCACCGCGGTCAGATTGGATCACCGGTATAGAGCCTGTGTTTAAAAGGTGTTCTGCTTTACCCGCTTGACCTTGGGTAAAAACCTGTTCATGTTGAACCAGCCAAATTTCATCAGGTGTATGACTTTCCCGTTTTTCCGTAAACTGATGCATAGAATCAGAAACCGGTAAATAGGGTTTCATACCCAATTGGCGAATAATGATTGTTTTATCTTGCACCGTGAAAATCTTCATTTGTAGCGTAATTGTGAAAGGCAGTATAACGCTCCAACAAATGAACTACCAGAATGAGATGAGATTATTGCTTCAGTTTGTGTTTGATAAAGGAATATTGATAAAAAAACGACGTAGTGAGAAGGGGGATAGATGTGATTAACCAAGCAGTGCTTAATTGGCGATTAACCCCAATTAGGCTTTTATTTAAGTGAGACTTACTAAATCTAGGTGACAAATCAATAACGAAATAATAAGAATTAATATAAGAAGTAAGGTGAAAGAGAAAGATAAAGAGAAGATACTGCGTAATATTGCTTCTTAAGTACGTCTAATGCCCCCTAATAGGGTAAGGGGGCAAATAGAAAAAAATTATAACACCATGCGAACAAGCTCTAATTCACCTAACTCTTTATAGAGGGTTTCTACTTGTTCAATATGCGTTGCGTTGATAGTCACCGAGACTGAGTGATAGTTACCTTTGCTACTTGGTTTTACTGAAGGTGTATAATCACCGGGTGCATGACGCTGGATCACTTCAACGACTTGGTCAACTAATTCGGGTTTAGCATGACCCATGACTTTGTAAGTAAATGAGCAAGGGAACTCTAATAGTTCGTTTAATTTTGTTTTCATCATAATGTAATCCTTAAGACAACAGGCGATGTTGTTTTAATAATCTCTTTTACACCTCATCAGCA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_010554|479796:491140|484753_485158_-|WP_004246072.1|DBSCAN-SWA MQSTAPLIYFSSRSENCHRFVQKLNLQATRIKEDEPLQATQPFVLLCPTYGGGGVKGAVPKAVIQFLNIPENRQLIRGVIASGNTNFGSAYGLAGDIIAQKCQVPFLYRFELLGTPEDVKRVKTGLSTFWSASK >NC_010554|479796:491140|479796_480996_-|WP_004246075.1|DBSCAN-SWA MAIKLEVKNLYKIFGEHPKRAFELLGSGMNKDQIFDKTGLTVGVQNANLAIEEGEIFVIMGLSGSGKSTLVRLLNRLIDPTKGEVLIDGENITTMSDKDLRQVRRKKISMVFQSFALMPHMNVLDNTAFGMELAGISKEERYEKAMAALEQVNLSSHAQSWPDELSGGMRQRIGLARALANDPDILLMDEAFSALDPLIRTEMQDELLSLQGDKQRTIVFISHDLDEAMRIGDRIAIMQGGVVVQIGTPDEILNNPANDYVRTFFRGVDISHVFSAKDIAKRRPETLLHIAPGFGPRSALKVLEDEDRNFGYLIERGRKFAGIVSVTSLEEALKAKQPIGSAILTEPCAINGDTPLNELISTVAQSPCAIPVIDEKNRYIGLISKGMLLQALDKETPNE >NC_010554|479796:491140|487013_487388_-|WP_004246058.1|DBSCAN-SWA MLNIAIAVFIGGGLGSVLRWLISYRLNSLFPHFATGTLVANCIGAFIIAFGIAWFSKAPNIDPIWKIMLTTGFCGGLTTFSTFSVEVVALFNEGRIGWALGTMGANLAGSFLMTAFAFWLLREM >NC_010554|479796:491140|485675_486149_+|WP_004246069.1|DBSCAN-SWA MYQDYLNTPKGFPKPYISITADDDGITSLNFVSEKEALVNSNAIIDLCIKQLKEYFSGKRTLFSVPLAPKGTEFQIRVWQTLQSIPYGEIWSYKKLALTLGSVNYCRAVGMANSRNPISLIIPCHRVIGHNGKLVGYTGGLDIKRWLLHYEKVDIDE >NC_010554|479796:491140|488470_489115_-|WP_004246056.1|DBSCAN-SWA MKIFTVQDKTIIIRQLGMKPYLPVSDSMHQFTEKRESHTPDEIWLVQHEQVFTQGQAGKAEHLLNTGSIPVIQSDRGGQVTYHGPGQQVMYVLLDLKRNHIGVRQLVTVLENTVINTLAEFNVDAYARADAPGVYVNGDKICSLGLRIRKGCSFHGLALNVDMDLSPFTRINPCGYPDLKMTQLVDLAPNATSEQVASLLINHFCTQLGFQPQQ >NC_010554|479796:491140|481604_482573_-|WP_012367584.1|DBSCAN-SWA MSASYLSRVNAINWNRIEDEKDLEVWNRLTMNFWLPEKIPLSNDIPSWNTLTQAEKQLTIRVFTGLTLLDTIQNTVGAPTLMPDAQTPHEEAVLSNICFMEAVHARSYSSIFSTLCLTTDVDDAYRWSEENTYLQKKSDIILRYYQDSDPLKKKIASVFLESFLFYSGFYLPMYWSSRGKLTNTADLIRLIIRDEAVHGYYIGYKFQNQLLNKSSLEKQNIKDFAFSLLLDLYDNEVKYTEDLYDSVGWTEDVKKFLHYNANKALMNLGYEALFPDEITNVSPAILSSLSPDANENHDFFSGSGSSYVIGKTINTEDDDWDF >NC_010554|479796:491140|489928_491140_-|WP_004246054.1|DBSCAN-SWA MKQTRPVKLLRTRLFSATFILLAISHHAIADDTLKTMIPAVPNIEAESYILIDYNSGKVLAEKNADVRRDPASLTKMMTSYVIGQAIRAGKISNNDIVPIGEEAWATGNPVFRGSSLMFLKPGDKVTVSQLTRGINLQSGNDACVAMASYVAGSQDTFVTMMNDYVKRLGLQNTQFQTVHGLDAPGQYSSARDMALIGAALIRDVPEEYAIYKEKEFTYNNIRQTNRNGLLWDTSLNVDGIKTGHTEAAGYNLVASATEGNMRLISAVMGGHSSKGRDAESKKLLTWGFRFFETVKPLQVGKEFAAEPIWYGDTDKVQLGVDKDVYLTIPRGRLKDLKASYVLDNVELHAPVSKNQVVGTINFQLDGQVIEQRPLVVMNEVKEGGIFSRLIDYIKLLFSRWFG >NC_010554|479796:491140|486346_486556_+|WP_004246068.1|DBSCAN-SWA MSKLKGNVKWFNETKGFGFITPEDGSKDVFVHFSAIVSEGFKTLAEGQKVEFEVTDGAKGPSAANVVAI >NC_010554|479796:491140|482598_484725_-|WP_004252248.1|DBSCAN-SWA MTHSIEQLDYHALNAMLNLYDEQGNIQFDKDKLATHHFFRQHVNQNTVFFHDLKEKLDFLVQQHYYEAQVLEQYDFPFIKQLFKHAYSKKFRFQSFLGAFKYYTSYTLKTFDGERYLERYEDRVCMVALTLAQGNTKLATHLVDEIISGRFQPATPTFLNCGKKQRGELVSCFLLRIEDNMESIGRAVNSALQLSKRGGGVAFLLTNLREAGAPIKRIENQSSGVVPVMKMLEDAFSYANQLGARQGAGAVYLHAHHPDIYHFLDTKRENADEKIRIKTLSLGVVIPDITFELAKRNEDMYLFSPYDVERVYGVPMSEISISEKYTEMVNNAEIRKKKIKARAFFQTLAEIQFESGYPYIMFEDTVNRANPIAGRINMSNLCSEILQVNSASEYNPDLSYRQIGHDISCNLGSMNIAMAMDSPDFAHTVNVAIRALTSVAQMTKIESVPSIEKGNQASHAIGLGQMNLHGYLAREGIYYGSEEGLDFTNIYFYTVTYYALLASNQLAIETKQRFKGFEQSKYATGEYFDKYLSKQWLPKTQKVHQLFSQSNIHIPTQEDWQKLKLSIMTHGIYNQNLQAIPPTGSISYINHSTSSIHPIVAPIEIRKEGKIGRVYYPAPFMTNENRHFYQDAYEIGAEKIIDTYAQASQHIDQGLSLTLFFSDEATTRDVNKAQIYAWRKGIKTLYYIRIRQTALAGTEIKGCVSCAL >NC_010554|479796:491140|487403_488369_-|WP_004246057.1|DBSCAN-SWA MSKPIQMERGVKYRDADKMALIPVKTIVTEREELLRKPEWMKIKLPADSSKIQGIKAAMRKNGLHSVCEEASCPNLAECFNHGTATFMILGAICTRRCPFCDVAHGRPNAPDPQEPIKLAQTIKDMGLRYVVITSVDRDDLRDGGAQHFADCITAIREKNPNIRIETLVPDFRGRMDKALEILTDTPPDVFNHNLENVPRVYRQVRPGANYQWSLTLLERFKQAHPNIPTKSGLMVGLGETNEEIIDVMRDLRKHGVTMLTLGQYLQPSRHHLPVQRYVSPDEFEYMKEQALAMGFTHAACGPFVRSSYHADLQAQGIEVK >NC_010554|479796:491140|485169_485394_-|WP_004246071.1|DBSCAN-SWA MSVILYTKPNCVQCSATERALQQQKIPFTAVDLTQDTQALAKIVSMGYRQVPVVVNGDEHWSGFCPDKIRQIAR >NC_010554|479796:491140|489466_489730_-|WP_026090527.1|DBSCAN-SWA MKTKLNELLEFPCSFTYKVMGHAKPELVDQVVEVIQRHAPGDYTPSVKPSSKGNYHSVSVTINATHIEQVETLYKELGELELVRMVL |
12 | Mycobacterium_phage(25.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
527076 : 573949
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_010554|527076:573949|DBSCAN-SWA 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73 | Proteus_phage(19.05%) | lysis,tail,integrase | attL 526990:527008|attR 580859:580877 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
748837 : 827369
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_010554|748837:827369|DBSCAN-SWA 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57 | Bacillus_phage(23.53%) | protease,tRNA,plate | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
980552 : 1041227
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_010554|980552:1041227|DBSCAN-SWA 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75 | Morganella_phage(17.07%) | protease,terminase,tRNA,capsid,lysis,tail,integrase,portal,transposase,head | attL 1028741:1028756|attR 1046926:1046941 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1822786 : 1841793
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_010554|1822786:1841793|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_010554|1822786:1841793|1839889_1840294_-|WP_012368092.1|DBSCAN-SWA MAKIARGERNNNPGNIRHGAKWQGLASTQTDKDFCQFISPEYGIRAIYKLIQTYQKKYGLNTIKTIIYRYAPPNENNTLGYIERVSKEIGIESNKPIDTQIKNVCISLSIAIINIELGYQPYAKKVFEDAWLLL >NC_010554|1822786:1841793|1833540_1834029_-|WP_004250719.1|DBSCAN-SWA MITEVRIFDLASFTTLFDSVNPTQVTIDDSHQAITFTVENGESRSDHVVINPISISISLLLTGDIANAYATIKQLYDENTLVGIQTRVSTYQPMLLESLSHDEDPSKVDAIELKLKFIEWKSIEPEYNKKSAKSTKKPKQSSTINRGNVKSKKSMPIGKKQG >NC_010554|1822786:1841793|1831390_1831735_-|WP_004243617.1|DBSCAN-SWA MRTFAINQHNDLVIDAKGDLQICDNDEAVKNLCQHFIKAVRGEMLHKKDKGIPYWSATFSRQVDIPLFEMAFRQRLAEIEEVVAISHFNAFLDNGVLKYQADIRTIYGGFTLHG >NC_010554|1822786:1841793|1838894_1839407_-|WP_012368090.1|DBSCAN-SWA MNDNDINKAIREQLIKQLIKTDINAEVITGYQPEEITDNNIIMFFPIKEVSQGWQKRSYDVQGNNANHTEQQLVELTYQVQSFTKKQSDFTAGDLIRTTRMIIHSLPFIESMRKKGIGIQRATEIRRAPIINEGNSYEHNPSFDFNVTFPCSLSLNTAATHLLISNLSRI >NC_010554|1822786:1841793|1825857_1826634_+|WP_012368082.1|DBSCAN-SWA 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21 | Escherichia_phage(28.57%) | lysis,holin,plate | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_6 |
2104939 : 2156333
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_010554|2104939:2156333|DBSCAN-SWA 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62 | Salmonella_phage(29.73%) | protease,terminase,integrase,tRNA,capsid,lysis,holin,tail,plate,portal,head | attL 2117082:2117106|attR 2147092:2147116 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2605001 : 2613851
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_010554|2605001:2613851|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_010554|2605001:2613851|2606970_2607651_+|WP_012368337.1|DBSCAN-SWA MQPQFENAKNTVKTLSVFDFDGTLTYHDSFIPFLKFAFGRRKFARRIIKMVFPTLRCFRRKLTRDELKEVLIKTFLTDIKEEWLKEKAEAFCKAYWSKLMRPAGLLAVAEEINRHAEVTICSASPAMVLQPFADRLGIKLIGTTLEVVDGVLTGKIIGNNCRCGEKIKRLERVYGDLTQYHLRAWGDSRGDHELLYAAQDPHWRYFHTGSNKSKKSPIKITLKKDS >NC_010554|2605001:2613851|2608399_2608978_-|WP_004249446.1|DBSCAN-SWA MSVSLSKGGNVSLSKAAPTMKNVLVGLGWDARSTDGQDFDLDASAFLLAANGKVRSDADFIFYNNLRSADGSVVHTGDNRTGEGDGDDEALKIKLDTIPSDVEKIIFVVTIHEAQARRQSFGQVSGAFIRLVNDDNQIEVARYDLTEDASTETAMLFGELYRHNGEWKFRAVGQGYAGGLGSVCAQYGINAS >NC_010554|2605001:2613851|2612705_2613851_+|WP_012368339.1|DBSCAN-SWA MNSLIGSSVYRRQLTCGTLSVTPNCSLEHLDELFDIAERRNPKRAFLFVSKVLGRHIPVSPKKMRETYQQMAKQFPQSLEGPILFIGMAETAVGLGAGIFDEVRDRYPQALYLTSTRHPIADGELFCKFKENHSHATDHLLYLPHNLEQRQWIQQAKTIVLIDDEATTGNTFLNLLSALREEGKLTQIKQIIAVTLTDWSGDALQKRSPLPITTFSLVQGKWQWQANPDAPLPVMPNVNITASGQVAITGKQSWGRLGMTTPANDLGLFIHVSEGEKILVLGSGEFVWEPFLLAERLEKQGAIVKYSSTTRSPIATNFAIQSAITFTDNYGLGIPNFVYNVAHQQFDRILLCCETPAESIDSQLIKALYKVAPIVEVISYD >NC_010554|2605001:2613851|2610585_2611728_-|WP_012368338.1|DBSCAN-SWA MTLTPGGNISVPDQTLMVRIHSGSPVDVSAFRLYASGKVNGDADMVFYGQTTNDDRTIIYATAGNSTSFTVDLTRLRPDVDRIAFTATCEGQQTIAHLQHLSIQVDANNNVVANGHVDIDGRTEAALILGELYRRNGSWKFRFIAQGFNGGLKPLAEYFGVDIADPEPAPAPAPSSVNLSKVSLTKEKPAISLTKKDDFGKIRINLDWHRESKSSGSGLLGGLFGGNKGIDLDIGAFVELQDGYKSVIQALGNGFGDFNRMPYVELQGDDRTGDVAGGEWIFINGREWKNIKQVLIFTFIYEGVPNWSKTDGVVTIHVPEQPPIETRLTDGNNGRAMCAIARLVNENGSIKVERLNEFFKGHRDMDNAYGWGFRWTAGSK >NC_010554|2605001:2613851|2611728_2612313_-|WP_004250201.1|DBSCAN-SWA MVSLRKDQTVSLSKQAPALSHLMFGLGWDPIKKKGFLGGLFGGNNSIDLDASCVLLDVNGKQIDTIWFRKLKSTCQSVIHSGDNLTGEGDGDDETIFVDLNRLPSLVEYLVFTVNSFRGQTFNEVENAFCRVVDKTTNKELAHYKLTEQGAHTGIVIAALQRNQGQWDFTAFGSPCKGLVIDEMMPDILATVVR >NC_010554|2605001:2613851|2610105_2610561_-|WP_004245607.1|DBSCAN-SWA MSFFNKLKEGFNSGRAELTKQVSRFKNKKFMQGTVAVCARIAIASDGVSSEEKQKMLGFLKASEELKVFDTSEVIEFFNKLISSFEFDTEVGKGETMKYILAMKDQPEAAQLAIRVGIAVAKSDGDFDNDEKEAVRAIAVALGFEPAEFDL >NC_010554|2605001:2613851|2609045_2610071_-|WP_004245605.1|DBSCAN-SWA MVSTHIGFPTETVIVFVVLAIGAIFIDLFMHRADKPITLKNAVFWSIFWVVVAMAFAGFLYVHHGAEVASLFVTGYALEKVLSVDNLFVMMAIFSWFAVPDRFRHRILYWGIIGAIVFRAIFVAIGTGLLSLGPYVEIVFALIVAWTAVMMLRSGNDSEEIEDYSQHLAYRLVKRFFPIWPKITGHAFLLTQKEVDVELAKPENKDITIGRGTKAALYATPLMLCVAVVELSDVMFAFDSVPAIIAVSREPLIVYSAMMFAILGLRTLYFVLEALKQYLIHLEKAVIALLFFIAVKLGLNATDHIWQHGYSISATTSLFVVLGVLALGILASFVFPEKKNK >NC_010554|2605001:2613851|2605001_2606570_-|WP_004245601.1|DBSCAN-SWA MSIKRTVKLGSSLLLLIFILSSALSSFFIYKMQNNFTQVDVLSARYDDVLMARYQLAIMRSNVNYLLQDKDSRVADRNKIIQQNKKLAIMAKNTMETWVKEKKMTVAAQKNADDISTLFYNLIDKLVLDPNKLATIKIKANQFDQDFEHLDQLFEKYIQTRNKNSLYLTHKQDSMVEFSIYSTIISLIILLIVLYFVLHWINKTFVSNLNTLSEILNKVGNADLVFSVPQVKNDEFGKLFSRVSDMQKALTSTIFSVKKEAMDIKGGAFKIASGNQELSSRTEEQSSALQQTAASMEQIKIAVANNTDNTIEANNIINQSTDIVMDGANVMKEAVLSMKKIEQGAVKVGEINDVINKLANQTNILALNAAVEAARAGEQGRGFTVVAAEVRNLAAKSAEAAKEISQVLKASINDVTYGTNLVNKSGECMQEIVSSISKVNKIMQGISLASEEQRLGVEQIAVAINQMDTVVQQNASLVDLAASSTMMLNDKAQVLMDNVAVFNIDDLEKEPEQKQELINEQE >NC_010554|2605001:2613851|2607747_2608323_-|WP_004245603.1|DBSCAN-SWA MAVSLVKGGNVSLTKEAPTMTVAMVGLGWDARVTDGAEFDLDASVFMVGEDGKVLSDASFIFFNNKVSQCGSVEHQGDNRTGEGEGDDEQVKITLSKVPAEVKKLVFAVTIYDAENRKQNFGMVSNSFMRVYNNDNNTEIARFDLSEDASTETAMIFGELYRHGSDWKFKAVGQGFAGGLGALAAQHGVNI |
9 | Caulobacter_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
3276462 : 3340274
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_010554|3276462:3340274|DBSCAN-SWA 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54 | Salmonella_phage(23.08%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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