Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
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NC_012552 | Lactobacillus johnsonii FI9785 plasmid p9785S, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_013504_1 | 973657-973745 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_013504_1
|
1 spacers
spacers of NC_013504_1
>1.1|973680|43|NC_013504|CRISPRCasFinder CTTGTTCAACTGAATGTAAGATATGGAAGAAATTAGTTACATT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_013504_1
The CRISPR arrays of NC_013504_1 >merge|NC_013504|1|973657-973745|CRISPRCasFinder TTCAACTTCATCGGTACCTTTTGCTTGTTCAACTGAATGTAAGATATGGAAGAAATTAGTTACATTTTCAACTTCATCGGTACCTTTTG >NC_013504|1|1|973657-973745|CRISPRCasFinder TTCAACTTCATCGGTACCTTTTG CTTGTTCAACTGAATGTAAGATATGGAAGAAATTAGTTACATT TTCAACTTCATCGGTACCTTTTG
>NC_013504.1|WP_080513811.1|971680_972781_+|ATP-binding-protein MENPFNPSFGKMPSVFLNRDSLTQRIVTELNRVGSPFQTSLLYGQRGSGKTTSMTEVSNLISKDKNWLVINLVLDNDLLVSLINQLQRHLLNLKIIKNIDLKMNFFGLDMSASFHQQTESNFQLLFQDALEKLTKKGFHVLINIDEVHLTPLLKKFASCYQIMIRNNLNVSLLMAGLPENVSEIQNDDVLTFLLRANRIVLNPLDIESIKNSYQHIFSKAGYTFSTEALLYMTKQTQGFAYAFQLLGYHLWEEIIHSSNKTISISDINNILDTYISELNRNVYFKVYSDMSEREKEFVQAMVKSKQHKVKSQVIGNLMKKGPNYIAVYRRKLIDDQIIKPNGYGYVSFLLPYFDKFVEQEMILDGF >NC_013504.1|WP_012846206.1|968923_971446_-|excinuclease-ABC-subunit-UvrA MAVPKKIEVRGGRVHNLKNINVDIPLHKFVAISGLSGSGKSSLAMGILYEEGSRRYLDALSTYMRRRIKQGAQADVTSVKHIPSALALRQRPSIPNERATVGTTTETYNVLRLIFSRLGSPVCPNGHRVAPSLDIAEAMSKSGDEMGQVTCPTCGVKFHVPSAEDFSFNSDGACERCGGTGKVRQLDESKLITDPNLSIKDGAVASWNLPGRNFMPNVAEHAGVRIDIPYKDLTEKEKDFVLNGPEKKYKMDLLSGTGRVFHNFNALYENAHQAVLKSAESSKSERAQKRLAEFFTYSTCPVCHGTRLRPELLNQLVNGKNIDQVQHMQLGDLPKWSKEVLASLSENMHPMAKALLNEFINNLQPLLDLGLDYLTMARAGNTLSTGELQRIQLARTLRTETTGVLYVLDEPSIGLHPANVDGLIKVLRNLVAQGNSLVVVDHNVDIIKAADEIIEIGPGSGEAGGEILDQGTPLEIEKDPQSLIAPYLDGKADLMARKVSDKVNSEQVTFEVDHYFNLHDIKAGIPVNQISAVTGFSGAGKTSLILDSIVPAIKAQDKGQPLPKQVKEFNSPIHHIVSVDASPIGKSTRSTVATYTSIMDNLRKLFAQQPLAKEKHYTPSYFSYNNKEGACPTCGGTGIVTLDIQFLPDMQQTCPTCHGDRYNQRIQKVKWHDLSIVDVLNLDINEAIPIFKEIPKIERDLLLLKEVGLDYLHLGESTPTLSGGEAQRLKLVTHLSQRQDDILFVFDEPTIGLHPLDVKVLVHVMQKLIDQGATIVTITHDLNLIVNTDYMLDLGPRGGENGGKLVAKGRPLELIKNPQSLTVKYLADYVDRFKLNKINS >NC_013504.1|WP_012846205.1|967635_968718_-|LLM-class-flavin-dependent-oxidoreductase MSIELGISSFGETTPLKTTGKAISHDERIRDLLDEIILADELKIDAFAIGEHHRKDFAVSAPEIVLTAAAAKTKHIHLSSATTNLPTIDPIRVYEQYATIDAFAPGRVEIMAGRGSFTEAFDLFGYNIENYDDLFIEKLLMLLEIDKHEILDWKGGKFTPKVDHKGIYPRTQKPIPISVASGGSINSTIRTAELGLPIVYAIIGGNPLDFKPMITLYREVAKKAGHDLSKMPVSAHSWGWLNQDKDRAIKEYFYPTKLLVDQISKERPHWTGMTYDQYLESVGENGAIFVGDSKTVANKIIKVMEELGLNRFYLHLPIASMPHEEVMNAIKIYGEEVVPKVKEHFKKKEDKKRLNVKWKD >NC_013504.1|WP_012846204.1|966965_967418_-|hypothetical-protein MEKLKAIQFNFENCESEQIPIEYISYFNFKNVYTNLSHRWDHEEEDSDVLETGLECDGFTMIADWDRVNTIETWEEYNLADRIAKFHDLVDVDLIFKSGKTKNIYMPWEDTNCGESNALMIVLKSDSSFYVTNSKFNNSTFLEVYIEKKA >NC_013504.1|WP_012846203.1|966565_966898_+|antibiotic-biosynthesis-monooxygenase MSLTVNLYYTGKNGSARKFAEEMESSGVADRIRKEPGNEKYKYFIPLDDPETILLIDSWKNQESLDAHHASPMMQELADLRNKYDLHMRVERYISDKNGVPSSDKKFIRK >NC_013504.1|WP_012846202.1|965937_966432_+|thiol-peroxidase MKITFKGKEVKLIGTPPAVGEEMPNFTVLNKNNQEFTKSDLLGKFSLISVVPDINTSVCSIQTKTFNKTMDKFPEINFLTISTNTVEDQQTWCAAEDVKNMQLTSDKSLSFGKATGLLIPESGILARSVWVLDPNGKILYRELVDEITHEPNYDAVLNELKQLH >NC_013504.1|WP_012846197.1|959732_961829_-|DUF262-domain-containing-protein MQASIFNATERFFAPFQMILKIPVYQRNYDWNKNNVKRLLDDLHTVIKTKEHHFLGAVVYLESTNSDIGLPEYLIIDGQQRLTTITLMLQALKDATVDGDAFTTGTIESFLINTQSPSQEYKIKLKPIKSDNIQYSALLKHDNSKLDENSHIVENYRLAKQTFDNWLRQGIASREILWAIRQLQVVGISLKEGEDDPQIIFESINSTGVALTNSDLIRNFLLMSDHDQERLFEDYWLPIENKLRRDNSNHAMDAFFRQFIIMKKNSVVAERKVYQTFVDTFKNENLSHEQALKEIKDYAELYASFMYPAESSYNDDIKTDLASLNRINQSTSYPFFLHVFHDYENNEIDEETLTKVIHLITIYLIRRTICDVPSNSLLGFFASYYARTFKLAKNKKKYYEAINKYLFVQQNQNEVPDDNQLKNALIHSKLYLNKGLCDLIMLDIENGNSKEKLNSEDLTIEHIMPQTMSKSWRKNISDEEHDEFVHTLGNLSITGYNSEMSNKSFAEKKHILEENSKAIILNKDVVDKNEWTIADIKARAERLADILLNRYELNPIEDSRIEFEAVDKIELDNLDATTGRKLVSFTLEGSKYPVKYFKDVPLQVIQILDQDNPDLLESLVGLTWKGTLNDANQNNSFIICQKKDIDDKLKWSYSKVRDGIYVMTGGSAHRNMHVLKQIIEAYKVPKDEFYLSVKVKEN >NC_013504.1|WP_012846193.1|954190_954682_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MIIRTVTMEDLNDIVELESDAFKMTKKQTEQDMIARIENYPDTFLVAQEDGKVIGHIFGPAFNKRYIEDELYFKNHPNRKTDHYQMVLSLAVLPEYRKQGVATKLIEALAQEAIKQNRQAISLTCLPKLIKFYEKRGFHNEGETNDDIPDPTGVTSVNMVRTL >NC_013504.1|WP_012846192.1|953532_954189_-|hypothetical-protein MTELTEEMYAIFDRNEFSFKKLKQQYSEDELAQVKTDFKEVWQTWKEVNSNVYQKLPQDKFAKVHVESWTNGWNLRDHYWASFRLNTMADKSPCIGVMLDKKQLQVYLMFQHYKSEKRGDNPEQYNELLADIPTWAKNRKINNWYLWDKNEMEFADHLSLSEYLADTKKQTLFNEEAAKTSFLLGKFAFRNQDQVKDMEEFILNGIEQLLSLYGKLEC >NC_013504.1|WP_012846191.1|953314_953458_-|hypothetical-protein MPIRKPLADLIRPKDLSHFVGQKDLIKEGQPLYQIIKINIEILLHEV >NC_013504.1|WP_012846212.1|975315_976056_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MIYQTFAQLYDQLFDSDMYKSWEKFTLANINKKNCKLLDLAGGSGRLAVLLAKDGINVTVADFSDEMLSLADQHSTENNVSLQLVQVDMRDLADLEKFDVITCYADSFCYLDDEADLFQVFSEIANHLKADGVFLFDVITPHQTDDIYPGYMYNYQDDDHRRAFMWQSYANDDVEHGVIHDLTFFNRLPNGEYDRLSETHYERAYDLDTIKQLLKHAGFNSIEVGSDFSLEMKDKKATRWFFKCQK >NC_013504.1|WP_012846215.1|977410_978469_-|aspartate-semialdehyde-dehydrogenase MSKEYNVAILGATGAVGRRMIDQLAKSTIPIKSVKLLASSRSAGTHLKFRDQDLVVEETTPDSFNGIDLMLSSAGGSVSKKFLPEAVKRGAVCVDNTSAFRMDEDVPLVVPEVNPEALKNHHGIIANPNCSTIQMVMALEPVRRKFGLKQIIVSTYQAASGAGQAAIDELKKESQDYLDGKDMHEDAQILPTKGDKKHYPLAFNLLPQIDVLEDSGYSHEEWKMIHETKKIMLNDMNSKDIKVTATCVRVPVPIAHGESVYFTVEDESATAKDIMDVIADFPGDVLQDDIKNQIYPQPINAEGSRDTFVGRIRPDYENKGAFNMWVVSDNLLKGAAWNTVENAEYLVKMGLI >NC_013504.1|WP_012846216.1|978465_979647_-|aminotransferase-class-I/II-fold-pyridoxal-phosphate-dependent-enzyme MPELADNLHFSEKVEKLKPSGIRIFDNKVSEIPNIIKLTLGEPDLNTPEHVKKAAIKSIEENDSHYAPQKGKKELLEAISRFLDKTIHVKYDPKSEIVATVGATEAINAAIFALFNPEDKILVPTPIFSLYWPVANLAGVQYSLVNTASDDFKLTAEKLEEVVKNDPTIKGVILNYPTNPTGVEYTNEEIKQLAKIVEKYNLYVITDEIYSSLTYGAEHYSIATEIPERTLYISGLSKSHAMTGYRLGYIAGPKKVMYQISKVHGLMVTTTTDSSQAAAIEALTNGINDSEEYKKIYQKRRDFVVNELSKMGVEFVKPQGAFYIFAKIPEKYGTDDMQFALDLAFKKKVGVTPGSAFGPGGEGYIRLSYASSDEALQVALKRIGEFLKEGNEE >NC_013504.1|WP_012846217.1|979662_980442_-|4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate-reductase MTKKVLIAGFAGAMGQKVVNLVNNMADFEIVAGLSPHANHDPEEYHLPESAQIFNQLSDIPENISDIWIDFTTPNAVYENVKYAILHHISPIVGTTGLNDKQVTELKNLAKKEKVGGLIASNFGMSAVLLMKFAKEAAKYFPDAEIIEMHHADKKDAPSGTALSTAKLIVENRPKHESAPNEVESLAHVRGGDYEGIKIHSVRLPGYIAHEQVLFGGNGEALTIRQDSFDRESFMSGVKVVLEKIDSLHELMVGLENIL >NC_013504.1|WP_012846218.1|980434_981373_-|4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate-synthase MTRLIDTDLLTALVTPFDENEEIDYDSLKKLTNYLISQGTNGFVIGGTTGETPTLSHDEKIELYTKFGEIVNGRVPVIAGTGSNNTAETIAFTNEVAKIKGIDYALVVVPPYNKPNQRSMVAHFTAVAENIDLPILIYNIPGRVGVKMNKETVVQLSHIENIKGIKQCASLEELEYIIDHKDNDFQVFTGEDSQALTARLLGANGVVSVASHIYSKQMREMYDDLYAGNYPEAARLQRWLTPRMAALFMYPSPSPVKAVLNAQGFKTGGCRLPLVSLNEEEKVTLAQHLGLKDDALMHELPLDLGKEVEEND >NC_013504.1|WP_012846219.1|981375_982524_-|N-acetyldiaminopimelate-deacetylase MILTEEELIQIRRHLHQIPELALKEFKTHDYLLNTIRGFNQDYLKIEVPQSLPTAILVLVKGKNPQRTIGYRADIDALPVNEKTNLPYASKNHNVMHACGHDIHMTVALGLLNYFSENQPQDNLLFFFQPAEESESGGRQAYEKGIFHDEFKPDEFYGLHDNPALPAGAIGCRMGTLFAGTTEVNIDITGKSGHAAFPQNANDTVVAAASLIMQIQTIISRSIDPIQSGVVTLGKIEAGTIRNVIAGRARIEGTIRGLTQKMIVQIDQRLKDICEGVARSYNMNIGLQLNQGGYWPVENNPELTKQFILYMKNNPQVNYVETAPAMTGEDFGFLLAKFPGVMFWLGVDDNSELHSATLTPNESSIMRGIEAIKGFLIYRMEK >NC_013504.1|WP_012846220.1|982526_983237_-|2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-dicarboxylate-N-acetyltransferase MSKLDAQSIINYIGNAPKKTPVKVYLKGDLENLDFPEEIQDFVNAKSGVIFGEWQVVKEFLANHSQEIEDYHVENDARNSAVPLLDLKEINARIEPGALIRDQVVIGNNAVIMMGAVINIGAEIGDDSMIDMGAVLGGRAIVGKDCHVGANAVLAGVIEPASAEPVRIDDNVLIGANAVVIEGVHVGEGAVIAAGAIVTHDVAPYTVVAGVPAKVIKKVDQKTESKTGLEDNLRKI >NC_013504.1|WP_012846221.1|983255_984560_-|diaminopimelate-decarboxylase MNSQITNQINQAGHLTIGGVDSLKLAKEYGTPLVVYDVSQIRNQIRAFKKVFEEEQVNYVVSYASKAFASIAMYQVANEEGAYTDVVSAGELYTAMKANFPMERISFHGNNKSKEELEMGVKNHVGKIIIDNFYEIDLLRQVLEEQDSKINVMLRITPGISAHTHEYDQTGQVDSKFGFDLKSGQADKALQEVLKNKRMHMLGIHAHIGSQIFELNGFEMAAAKLVDVAASWKEKYDYTAQIINVGGGFGIKYVQEDHPLKPEEFVKAIVKAIKDEATKHNFPIPEIDIEPGRSIVGPAGYNLYKVGSMKEIPGLVPYVAVDGGMGDNIRPALYQAKYETVLANNPQRRASQEFHVAGKYCESGDILADAKLPSLKAGDILAMLDTGAYGYSMASNYNRNPRPAVVFAENGKAQVVIKRESLEDLIHLDQDYNI >NC_013504.1|WP_012846222.1|984988_986341_+|aspartate-kinase MRVVKFGGSSLATGTSVNQALEIILADPSRHVMVVSAPGKRNSSDIKVTDLLIKYAKTVLNHQNYSKIVDEIYSRYQEIGHFFGLEETQLNIIKDILLSLPESSYPTDDYLIAAFKAHGERLNARLIAMILNQKGIKTKFLDPHEAGLTVTGEPNDAIVSPETYLNLDKIKIDSDEHIIFPGFFGITPSGHIATFSRGGSDITGAILAKGLHADLYENFTDVNGIFAANPAIIDHPQSIKTMTYREMRELSYAGFSVFHDEALIPAIEGEVPINVKNTHDPQNPGTMIVPDKRFKPLNPITGVASQKHFSALYLHKYLLNKEAGFTLRILQILYKHNIPYEHMPSGIDDITIIFNRQFLNDQLIDLICNEIQSLINPDQLEWIDDYAIIMIVGEGMKYEHGISSQILSSLNKEDISPQMINQGASQISIMIGTKKEEADQVVKTIYKQFF >NC_013504.1|WP_012846223.1|986355_987357_+|diaminopimelate-epimerase MSTLYKVHGSQNHFFILDQTELSTPLTDTELVEFTKKITNPSSGILNGADGVLAINSPTRPQALAQMRVINADGSEASMCGNGLRTVARYLSEKYNQDNFLVDTMNANLRVRKHDNLAKEVKAFAVEISPVSFNKSSLPFQNLGYNRIIDQYLPEIYPGLRFTSIAVPNPHLISFMDQNQIESNILKEVGEYLNGDNPYFPDGVNVNFAQIIDKNKLFVRTYERGVGFTNACGTGMSATSLAFCLTYPEKGIFNQSIDVYNPGGKVQTIVHHENHTYWIELIGNATFTDQIEISEADLHNCDFSSINITSTEEESDYQNFIQNLPHFNNFSAD |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
427365 : 490413
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_013504|427365:490413|DBSCAN-SWA TATGAAACAATTGACTAGTTCACAAGTACGTCAAATGTTCTTGGACTTTTTTAAAGAGCATGGCCACATGGTTATGCAAAGTGCATCATTAATTCCACAAGATGATCCAACCTTGTTATGGATTAACTCTGGTGTTGCTACAATGAAGAAATACTTTGATGGTTCCGTTGTGCCTAAGAATCACCGAATTACTTCTTCTCAAAAATCAATTAGAACTAACGATATTGAAAACGTTGGTAAAACCGCTCGTCACCAAACTTTCTTTGAAATGCTTGGTAACTTCTCAGTTGGGGATTACTTTAAAAAAGAAGTTATTCCTTGGGCTTGGGAATTTTTGACTAGTCCAAAATGGTTAGGTCTTGATCCAGATAAGCTTTACGTAACTGTTTATCCTAAGGATACTGAAGCATACCACATGTGGCACGATGTTGTTGGTTTACCTGAAGACCATATTGTTAAGCTAGAAGATAACTTCTGGGATATTGGTGAAGGTCCATGTGGTCCTGACTCAGAAATTTTCTATGATCGTGGTCAAGAAAATAACGATGTGGCTGAAGACGATCCAGAAAACTTCCCAGGTGGAGAAAATGCTCGCTACCTTGAAATTTGGAACATCGTATTTTCACAATTTAACCACTTACCAAATGGTAAATATGTTGACCAACCACATAAAAATATTGATACCGGTATGGGATTAGAACGTGTAGTATCAATTATTCAAGATGCTCCAACTAACTTCGAAACTGATTTATTTATGCCAATCATTAAGGAAACTGAAAAGTTAAGTGATGGCAAGAAGTATGCCGCAAATAAAGAAGATGATGTTGCATTTAAGATTATTGCTGACCATGTTCGTGCAGTAAGCTTTGCGATTGCTGACGGTGCACTTCCTTCAAACTCAGGACGTGGATATGTTTTACGTCGTTTAATTAGACGTGCTGACTTAAACGGTCAATGTTTAGGTATTAAAGGTGCATTCTTGTACAAATTAGTACCTGTAGTTGGCGAAATTATGAAGAGCCACTATCCAGAAGTTGTTGACCAACAAGCATTCATTCAAAAAGTAATTAAGAACGAAGAAGAAAGATTCCAAGTAACTCTTTCATCTGGTCTAAACTTACTTGATAATATCATTGCTGAAGCTAAGAAGAGCGATGATAAGACTATTTCTGGTAAAGATGCCTTCAAGTTATTCGATACTTACGGCTTCCCATATGAATTAACTTTTGAAGCTGCTCAAGATGCAGGTCTTAAGATTGATAAAAAGGGCTTTGATGAAGAAATGAAAGCTCAAAAGGAACGTGCTCGTAAAGCTCGTGGTAACTTGCAATCAATGGGTTCACAAGATGTTACTTTGATGAATATCAAAGATAAGAGTGAATTTGAATATGGTACTTTAGAAGAAAAGCATGCCAAATTAATTGATATTGTTGTTGATGACAAGTTAGTTGATAAGGCAGATGGTGAACATGCAACTTTAATCTTTGATAAAACTCCATTTTACGCAGAGCGTGGTGGACAAGTTGCTGATCATGGTGAAATTTTGAACCAAAATGGTGAATTAGTTGCTCGTGTAACTGATGTACAACATGCACCAAATGATCAAAACTTGCACTTTGTAGATGTTATTTTGCCACTTGAAAAGGGACAAGAGTATGTCTTGAAAGTTGATCAAAAACGTCGTCGCGGCTTAAAGCATAACCATACTGCTACTCACTTATTGCATGCAGCTTTACGTGAAGTTTTAGGTACTCATACTCACCAAGCTGGATCTTTAGTTGAACCAGATTACTTACGTTTTGACTTTACAAGCTTAGAGCCAATGACTAAGAAAGAAATTGCCAGTGTTGAAAAGTTAGTTAACGAAAAGATTTGGGAAGAAATTCCAGTCAAGACCACTGTTACCGACCCAGATACTGGTTTAAAGATGGGCGCCTTAGCATTATTTGGTGAAAAATATGGTGACACAGTTCGTGTTGTTCAAATCGATGACTTCTCCACTGAATTTTGTGGTGGTACACACTGTGAAAATACTGATCAAATCGGTATGCTAAAGATTGTTTCTGAGTCTGCTGTTGGTGCTGGCACTCGTAGAATTATCGCTGTTACCGGCCCAGAAGCTTACAAGTATGTAACAGACCGTGACGAAATCTTGAAAGAAGTTCAAGATGAAGTTAAGGCAACTAAGGCTGAAGACGTAGTTAATAAGATTTCTTCTATCGAAGATGATTTACGTGCAAGCCAAAAAGAAGCTGAACAATTAAAGGCTCAAATTAATAAGGCAAAAGCTGGCGATCTCTTTAATGACATTAAGCAAGTTAAAGATTTAACTGTAATTGCTGCGCAAGCTGATGTTGAAGGCATGAATGATTTACGTGAACTTGCTGACAACTGGAAGAGCAGCAATAAATCTGATGTTTTAGTCTTAGCTGCTGAAGTGAATGGTAAAGCTAATATGGTAATTAGCTTAGATGATAAGGCTATTAAAGCAGGCCTTAAGGCTGGCGATTTGATTAAAACTGCTGCTCCAATCTTTGGTGGTGGCGGTGGTGGCCGTCCAAATATGGCACAAGCCGGTGGTAAGAATCCAGCAGGATTAAAAGATGCTATCGCTAAAGTGTTACAAGAAGTTGAAGAAAAACAAAATTAATTGAGTTCGTTCGATATTTCAAGTAAAATTAAGAAGAATAGGAGGAATTTTATTATGAGTTCGCTAGATAAAACAATGCATTTTGACTTTAACCAAAATAAGGGTAAGAATGTATACGATACTCTACAAGACGTATACAATGCACTTGAGGAAAAGGGCTATAGCCCAATTAATCAAATTGTTGGTTATTTACTTTCAGGCGACCCTGCATATATTCCTCGGCATAATGATGCACGTAATTTGATCTTGAAACATGAGCGTGATGAAATTATTGAGGAATTGGTTAAGAGTTATTTAGGTAAAAATAAATAATGCGATTACTTGGACTTGATGTTGGCTCTAAGACTGTCGGTGTTGCAATCAGTGACCCTTTGGGAATTACCGCTCAAGAGCTTGAAACAATTAAGATTGACGAAAGCAAGTTTAGCTTTGGTATGCGTCAAATTAGAAAAATTGTACGTAAATATGATGTTGAGGGCTTTGTTTTAGGTTTGCCTAAAAACATGGATGGTAGTAGTGGACATTCAGTAGAGAGAAGTAAACAGTATGGTGGGCGCTTAAAAGAAAAGTTTGACCTACCTGTTTATTACGTAGATGAACGTCTTACAACAGTGCAAGCTGATCGAATTTTAGTTGAAGAAGCTGGCGTCCATGATCGTGTTGAACGAAAAAAGGTTATTGACCAAATGGCTGCTGTTTTAATCTTGCAAAACTATTTAGAGGCAACCAGAAAGGATAATTAAAATGAGTGAAAAAATTAACGCTAACCAAGATAATGATCGTCAAATTACTTTAGTTGACGAACAAGGTAATGAAGAATTATTTGAAATCTTATTTACTTTTACATCTGAAGATTATGGTAAATCTTACGTTTTACTATATCCAGCAGCTGTTAGTGACGATGATGATGTTGAAGTACAAGCTTTCAGCTATGATGCAGATGCAGATGGCGATGTAACTAGTTCTGACTTACATGAAATCACAGATGATGATGAGTGGAACATGGTACAAGGAGTTTTAAATACATTTTTGTCAGACGATCGCTTAAGCGGCGAATAATCTTCAAAAAAGACTGGCGATTGAAGCTAGTCTTTTTTGCTTAATCAAGGATGAGCAATGATTTCTTTTTTCATTTTATTAATTTTTATCTATTGTTGTTATGTAGGCTATCGGCGTGGTGTAGTATATGAAGGCTTAGCAGCTGGTGGATATGTAAGCGGGCTAATTTTAGCCACTTTATTGTATAAACCATTTAGTAACTTTTTAAATTTGTGGGTTCCATATCCATCCGCAAATGATCGAAGCAGCTTTGCTTTCTTTGATAAAACTACGGGATTAACCTTAGATAAATCATTTTATGCAGCAATTGCTTTTTCAATTATTTTGTTGATTGTTTGTTGCTTATGGCGTTTTGTGATGCTAGGGTTTAATCAATTAAGATATGTTACGGTAAACTCTAACCTAAATCTCTGGGGAAGTTTAATTATTTCTTTTATTGTGACACAGATTAGTGTTTATTTGCTTTTGTTTATTTTAGCCACAATTCCTAATGATGGTTTGCAAAATATGCTGGGGCATTCTATTTTAGCAAGTGGTATCTTGCATTTTTCTCCTGGAATTTCCCAAGTTTTTATAAATTTATTTATTACAACAATATAAAAAATGGTCCCAACTCTGGGGCCTTTTTGCTAGGTGGAATATATGAACTCTAAAATTATTGAAAAATTAGAATATAATCGCATAATTAAACAATTAAGTGATTTGGCTATTACAGCACCTGCAAAAGAGCAGGCTTTAACGTTAATGCCAAGTAGTAATTTTGATGAAGTAAAAAAATCAATTGATCAAACTAGGGTCCTTTCTAATATTTTACGAGTTAAAGGACCAATGCCGATAACTGACTTTAAAGATGTTAGAGCTAGTTTGAAGCGTTTGAAGGTCAAGGCAAATTTAAATGGGGAAGAATTAGGTAATATTTTTCTAATTCTTAGCTTAGCTAAAGATGTTTCTCAGTTTACTGCTGACTTAGAAGAGCGTGAAATTGATACCCGACCGATTGAAAAAACTCTTAAAAATTTAGCAATTTCAGAAGACTTATTTAAGAAACTGAATCAAGCAATTGAATATGACGGAACTGTTAAGGATACAGCTTCTTCCAAGTTAATGCAGCTGCGACATGATATTCAAAGCAATGAAACTGATATTAAAAATCACATGAATGATTACATCAGTGGTAAACATACACAATATTTGTCAGAAAATATCGTAACTATCAGAGATGGTCGCTATGTATTACCGGTAAAGCAAGAATATAAGAATAAATTCGGTGGAGTTGTTCATGATCAAAGTG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50 | Staphylococcus_phage(18.75%) | tRNA,bacteriocin,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
678683 : 685915
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_013504|678683:685915|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_013504|678683:685915|680843_681065_+|WP_003649044.1|DBSCAN-SWA MNLGLAIFLIIIALLIGLVGGFYGARAYMKKYFQDNPPISEDMIAAMMAQMGQKPSAKKLNQVMNMMKHQQQK >NC_013504|678683:685915|681140_682907_+|WP_012845951.1|DBSCAN-SWA MNIFSKLGWFFKQEKKRYIIGISFLALTSIANLVPPRILGLMADQLDKGSISWGEYGALILAVIAAAIVLYLLRYFWRKQIWGGAAELERQMRSRLFKHFMIMDKTFYQRHRTGDLMAHATNDINSIQNVAGDGVLTLVDSLVTGGTTMIAMIIFTDFRLTIIALLPLPFLALGAWKLGAKLHYSFDKSQAAFSRLNNKTQESVSGIKVLKAFGESEQDSAAFNKMVDDTIQINKKVFKWDSMFDPLGTLIIGATYVITIIYGGLLVSNRTLSVGQLVSFIAYISNMVWPMFAIGYLFNILERGSASYDRVERLLYEKPQITDENADQSLTTTDIQGDLKYEIKSFAYPDEKEIPVLQNINFTLKPGQTLGLVGKVGSGKTTIIELLLREFDQYQGRISLGGHDIRNIPLKLLLSEISYVPQNNFLFSTSIEKNIAFSDENVEKDKIESAAQKSDLHDDILQMPAGYKTLVGENGVSLSGGQKQRLSIARALLKESPILILDDALSAVDAKTETSILDSLKSERKGKKTLIAAHRLTSVMDADLILVLKEGKIVERGKHADLLAQNGWYAEMWRKQELQAKVGEVDGQ >NC_013504|678683:685915|679761_680385_-|WP_012845950.1|DBSCAN-SWA MTEPHANKQLEILRFIYDTVEERAFPPTVREICSAVDLSSTSTVHGHLARLEKKGYILKDATKPRAIEVTEKGREALGIKPKDIPVVGVVTAGQPILAVQDIDEYFPLPPDLENDAGELFMLRVHGESMINAGILNGDYVIVRKQSSANNGEIVVAMTEDNEATVKRFFKEDGYYRLQPENDTMDPIILPVVQILGKVVGLYRNNID >NC_013504|678683:685915|678683_679103_+|WP_012845948.1|DBSCAN-SWA MHEYSAGSIVYRIKNNKIEFLLVQSRLNRTWGFPKGHLEKDENNVQAAQREVYEEVGLKPDYDYDFEESITYKIARDRLKTVTLFLSRFNPDQKIELQKSEIGDYKWATLAEANYCLNYKELKELLKKAQEYIENEISR >NC_013504|678683:685915|679086_679725_+|WP_012845949.1|DBSCAN-SWA MKYPDKLLAEVKERSKGMKLEGINFGAGPVHPKLMIVGEAPGREEIESLIPFHGASGKELMKSLASIDLKREDVYITSAVRSRPYSIKHTFSKKENKEVIKYPNRKPTKKEILAHAPFLDYEIKCVKPKIIVTVGTTALTRLLDDKYEISNVHGKIIENTPILELNDKKDGYIWSKEKYIVVPQYHPAAVFYNRKLAEVIAQDWLNVKPLIK >NC_013504|678683:685915|682896_684690_+|WP_012845952.1|DBSCAN-SWA MDNNEESKSVWSKAIPFKEQVQIFKRVLKYVKPFKVEMGIAIFGAFLVSVINMLLPRGLQFFLDNYLIKQKATVQIIIWAGLLYGLGTIIKAILQFVYQYLYALGAEKTLESVRKDLYRKLHSLGMRYFDQTPAGSIVSRVTNDTMTLSDFLGVLCQVVIGVFSLVTAFIAMYVTNKFAALIVLLFLPILGFIFWIYTQKSSRLYRAFRERLSRINTNLNESIEGVSLIQQFKQEKRMTNHFENENGTLMRTRFNLIRVNSLLLSPMTSLLYSLALALVLMYFGFPLQKTFVPAGIVYAFSQYVQQFFNPISTMMDRMTSFQDGIVAGKRIFRIMDEKEYEPRQENDERAVISKGKIEFKNVSFSYDGENEILHDVSFVVNPGETLGIVGHTGSGKSSIINVMMRFYEFGSGEVLIDGIDIRKFPKKELRKKLGLVLQEPFMFYGDISSNIRLYNDKITDQQIKDAAKTVQADSFIEKMPGKYHAKVIEGGSELSQGQRQLISFARTLVTDPKILVLDEATANVDTETENLIQEGLKKLRQGRTTLAIAHRLSTIADADQIIVLDKGRIVERGTHEELLKKKGYYYNLYKLQQNSDK >NC_013504|678683:685915|680522_680771_+|WP_004895283.1|DBSCAN-SWA MDKKEEEKLIKRINELTKISRERELTPDELEERKKLRSAFLENFRAGFRQQLEDTVVIDKDGKEVTSEKAKEAQRRKGLRKD >NC_013504|678683:685915|684733_685915_-|WP_012845953.1|DBSCAN-SWA MLEKPLYKMMLSHSFNIPVKVTYWDGKSEIYGNGTPEVEVIFNKKIPFKEITSNASLALGEAYMDKDLEIKGSIQKLIEAAYESSESFMRASKFRKFLPKQKHTEKKSQEDVQSHYDIGNDFYKLWLDPTMTYSCAYFTNGNKEDLEVAQIAKVHHILQKLDPKPGKTLLDIGCGWGTLMLTAAKEYGLKVTGVTLSQEQFDLVNQKIKDMGLENQAEVLLEDYRELGNRDFDYVTSVGMFEHVGSENLGEYFKDVAKYLKPHGVALIHGITRQQGGATNAWINKYIFPGGYIPGLVEIVSRIEEANLQIADMEMLRRHYQRTLEIWDKNFNEHRSEVEGMMGERFVRMWDMYLQACAASFESGNIDVIQYLLTKGPSGKTLPMTRQYMLNDK |
8 | Pacmanvirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
692649 : 812407
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_013504|692649:812407|DBSCAN-SWA AATGAAAGGTATTTTAATCTTTCTAGTTGTTTTTGGGATACTTGTTTTTGTTCATGAATTTGGACATTTTATTGTTGCAAAAAAGTGCGGTATTTTAGTTCGTGAATTTTCAATTGGTATGGGGCCAAAATTGTTTCAAAAGATGCGTGCTAAAACCACATATACTATTAGATGGCTTCCTTTAGGGGGATATGTGCGCTTAGCGGGACCTGATGATGCCGCAAAGATTGATCCTGGTACTACAGTAGTATTGCAGTTAGATGATCAAAATAAAGTTAAACGAATTGATGCATCAGGATCTCAAATGCCAATTGAAGGAATTCCAGTACAAGTCAATGCCGCTGATTTAGTAGATGCATTAACTATTCAAGGATATGAAAATGGTGATGAAGATCAACTAAAAATTTATTCTGTTGATCATGATGCCACGATCATTGAACAAAATGGAACTGAATTGTTAATTGCACCCCGGGATACACAATTTCAAGAGGCCAGTGTTGGTAAAAAACTAGCTACTAATTTTGCTGGTCCATTCATGAATATTGTCTTAGGATTTGTTGTATTTATTATTTGGTCATTAGCAGCTCCTGGTGCACCGACTACAACGGTAGGTAGCACTATTGCTCATCAACCTGCTCAAGTAGCTGGGATCAAAGCTAATGATAAAATTATCGCGATTAATAATAAAAAAATTAGTAATTTCAATCAAATTGCTGCTGAACTGGCTGAAAGTAAAGGTAAGACTGTTGAAGTAAAGGTAAAAAGAGATAATAAGGTTAAAAATTTCTCCATAAAGCCTAAAGTTAATAGGATAGATGGTCAAAAAGTCTATCAACTTGGTTTTTATGGAAAGCCTGATAATAGTCTTGGTGCAAAAATTAGCCGTGGATGGAATACAAGTATTAGTACAACTGGTTTAATCTTTAGTGCCGTAGGCAATTTGTTTAGACATTTTAGTTTGAACAAACTTTCTGGACCGGTAGGGATTTATTCGCAAACCGTTCAAGTTTCAAACATGGGCTTTACATACTTGCTAGCATTTTTAGCAATGATTTCTATTAATTTGGGAATTGTAAATTTGATTCCAATCCCTGGATTAGATGGTGGAAAATTATTACTTAACCTGATTCAGCTCATTATTCGAAAACCAATTCCTGAAGATAAGGAAGCAATTGTAGATGTAATCGGTTTTGTCATTCTCTTACTGTTAATCGTTGCAGTAACTGGAAATGATATTTATCGCTATTTTATTAAGTAAATTTTTGGAGGAATAAATGCGTCAATCAAAATTTTTTATGCCAACGTTAAAAGAGGCACCTTCTGATGCTGTAGCAAAAAGTCACCAATTAATGCTTAGAGGTGGCTATATCCGTCAAGTAACTGCCGGGGTTTATGCATACTTACCTTTGGGTTACCGCGTCCTACGCAAGGCGGAAAATATTATTGAAGAAGAAATGGATAATATTAATGTACCTGAAATGATCATGCCTCATCTCTTGCCTGCAACCCTTTGGCAAGAATCTGGTCGTTATAAAAAATATGGCGCAGAAATGTTTAAGCTTCAAGACCGACATGGACGTGAAAGTTTGCTTGGACCAACACATGAGGAAACCTTCACTGAAATTGTTGCTAAGAACTTAAAGAGTTACAAGCAAATGCCACTTGCTCTATATCAAATTCAAACTAAATTCCGTGATGAAAATCGTCCACGTTTCGGTTTGCTTCGTGGTAGAGAATTTGTCATGTTAGATGGCTACAGCTTTGCAGCAACTCGTGAACAATTAGATGAACAATTCGATGATCAAAAATCCGCATATTTAAAGATCTTTAATCGTGCTGGTGTTACTGTTCACCCGGTTATTGCAGATTCAGGTACAATGGGTGGAAAGAACTCAACTGAATTTCAAGCTCCTGCTGCAATTGGTGAAGATACAATTGCTACTAATGAAAAAGGCACTTACGCTGCTAATCTTGAAATGGCTAAAAGTATTGATACTTTTAAACAAGAACCAGAAGAAGCAAAAGACTTGGCTAAAGTAGCTACTCCAGGAATGGATACAATTGAAAAGTTAGCTGATTTTCTTAAAGTTCCTTCAACTAGAATTGTTAAGAGTATCTTATACATTGCAGATGACCAAAGGGTCTTAGTTCTTATCCGTGGTGATAAGGAAATTAACGAAGTTAAATTAGGTCATATCTTAGATGCAGATGAAGTTAGAACTGCAAATGCTGATGAATTAGTAGAAATTACCGGTTCAGAAAAGGGCGGCGTTGGACCAATCAATGCTGACTGGGCGGATAAGATTATTGCGGATGAAACAGTTAAAGATTTGTACAATGTAGTTGTAGGTGCAAATGAAACCGACTATCAATATCAAAATGCTAATTTAGATCGCGACTTTAAAGTTGATGAATTTGCGGATATTCGTACGGCAAACGAAGGAGAACCAGATCCAGTTGATCATTTACCATTGAAATTTACTACTAGTATTGAAGTTGGTCATATCTTTAAATTAGGTACTTACTATACTGATACTATGGGTGCTGATTTCTTAGATAATAATGGTAAAGCTAAGCCAGTAATCATGGGCTCCTATGGAATTGGGGTAACCAGAATGCTGTCAGCTGCAGTTGAACAACACTTAACTGAAAATGGAATCGCATGGCCAAAAGAAATTGCTCCATTTGCTATTCATTTAATTCAAATGAAAATGAAGGATGAAACTCAAACTGAATTAGCTGAAAAACTTGAAAAGGAACTTTCAGCCAAGTATGATGTTTTATACGATGATAGAAATGAACGACCAGGTGTTAAATTTAATGATGCTGATTTAGTCGGAGCACCATTAAGAATTACAATCGGTCGAAAAGCAAAAGATGGTATTGTAGAAGTAAAGCGTCCAATGGATGAAAAGGCTACTGAAGTTAATATTTCTGATTTGGATGCTGTGATTACAAAAGAGTTAGGATAATTTTTGTGACAAAAAAGAACGAACTTTTCAAAAAACTATTAGATCAAATCAAGTTTCCTGATAAGTTTGAAGATAACGATATTGTCCAAAATGGTGAAATTGAAAACGTGGATGTATACGCTAATGAAAGAAAGTGGAAAATCCACGTTTTTTTTGATACACCATTAGATTTTGAAACTTATCGCTCTCTTAATGAACTTATTTATGAGACTTTTGAACCATTTGTGAATGTTGAATTATTAGTTCAAACACGCGATGGAAGTAGTAAAAAACTACCGGCCTACTGGACTTATGCCATTCAGAATTCAACTAACCTAAAACCAGCTGTTCGGGAATTTTTACAAGGACAAGCTCCTCATTTAGAAAAAGAAAAATGGCTAATTCCAACTCAAAACCAAGTAGTAAATGGCTTGCTTTCAGAACAAGTTTTAGCAGAACTAAATAAAGAATTCAGACGCTATGGTTTCTTCAATATTAAGTTTACAACGAAAGTTGATGAAACTAATATTGATGAAAATTTAAGAAGTCTAGAACAAGAGCAGGCTCAGCATGAGTCTGCTATGCAAGAATTCTATGAAAAACAACCGGCAGAACCTAAGAAAAAAATGCCTGTTAAGAGCACAAGAATGGGCAACAAAAAGGTCGATAAAAAAGCTAAATTTATTCAAATTAAAGACTTGGAAGATGGCAGTGGAAACGTAGCTATTGAAGGCCATATTTTTAATACTGATATTCATGAATTAAAATCTGGAAGTATAATTTTTACTGGTGAGATTACTGACTATACAGATTCAATTAGCTTTAAAAAATTTGTTTCTGACAAAGATCAAATTGATTATCTAAAGGGAATTAAACCTGGTGTTTGGGCTAGAATGCAAGGTTATGCAGCTGATGATCAATATCAACATGACGTTGTTTTTAATATTCGAAACCTAGAATTAATTGAACATAAGGGTCGAGAAGAAAAGTATGAAGGAGAGAAAAAGCGTGTAGAATTGCATCTTCATACAAATATGAGTCAATTGGACGCAACTAGTACGGCTAGTGACTTTATCAAAACTGCCAAAAAATTTGGTCAAAAGGCAATTGCAATTACGGATCATGCAGATGTGCAATCTTTCCCAGAAGCTTATCATACTGGTGCAAGCGAAAAAATGAAAATTTTATATGGCTATGAGGCCAATATGATTGATGATCATGCTTTGCTTGTCCTTAATCCTACTGAAATGGATTATCGAGATCGTGAATATGTGATTTTCGACGTTGAAACAACAGGACTATCTTCTGTTTACGACACCATTATTGAAATCGGTGCGGTAAAAATGAAAAATGGAGAAGTACTGGAAAGATTCGATGAGTTTATCAATCCCCACCATCCCTTAAGTGATACAACGATTAACTTAACATCAATTACTGATGAAATGGTTGGTGCAGCTGATGATGAAAAAGATGTAATTAAGAAATTTAAAGAATTTTATGGTGATCGTCCTCTCTGTGGACATAATGTTCAATTTGATGTTGGGTTTGTAAATGCGGCTTTACGCCGTGCAGGTCTAGAAGAAATTACGCAACCTGTTGTTGACACGCTTGAAGTTTCAAGACTTTTGCATCCTGAACAAACTCGCCACACTCTTGATTCTTTAGCTAAGAAATACAATGTTGTTCTTGAACATCACCACCGCGCTAATCAAGATGCCGAAGCTACAGGATATTTAATGTTTAAATTGCTAGATGCTTTTAATGAACGTTTTCATGAAGCAGATTTAGGCAAAATGAATGACTATGCTAAATATGGGCAAGTTTATAAGCGAGCTAAGCCAAGTCATATGAGTGTTCTTGCTCTAAATCAAGAAGGGCTAAAAAATATGTACAAGCTTGTATCGCTTGCAAGTACTAAATATTTCTATCGTATTCCACGTACCCCAAAGTCGGAATTAAGAAAATATCATAAAGGTTTATTATTTGGTAGTGGGTGCTGGCAAGGCGATGTATTCATTTCAATGATGCAAAAAGGATATGATGAAGCTC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114 | Lactobacillus_phage(32.76%) | integrase,holin,protease,terminase,portal,head,capsid,tail,tRNA | attL 690322:690340|attR 750915:750933 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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