Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_014166 | Arcobacter nitrofigilis DSM 7299, complete sequence | 1 crisprs | csa3,PrimPol,cas3,DEDDh,cas6,cas8b1,cas7,cas5,cas4,cas1,cas2 | 0 | 5 | 3 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_014166_1 | 2825927-2827069 | TypeI-B |
NA
Consensus repeat of NC_014166_1
|
17 spacers
spacers of NC_014166_1
>1.1|2825957|36|NC_014166|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATTATCACAAAGAAAATAGTGATATTTCAGTTTAT >1.2|2826023|36|NC_014166|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAAAAAGTTTGGAACAACAATTATTACTAAAGCTC >1.3|2826089|35|NC_014166|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTTATTAGATTGGATTGAAGAGTTTCCAGAAAC >1.4|2826154|34|NC_014166|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCGTATAATCAAAAAATTCAAATTCTTTATTTG >1.5|2826218|35|NC_014166|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACACTTTCACCTGTCACTCTACTCGTGGCACAGAG >1.6|2826283|38|NC_014166|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAAGAAGTTAAAGACTATTTTGAAAAACTTTGTGATG >1.7|2826351|36|NC_014166|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAACAAGACCTATACAAATAGAGCCTTGGTTTTTT >1.8|2826417|36|NC_014166|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGATAAACCACAAGAAGATATTAATATTGTCAATAC >1.9|2826483|36|NC_014166|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATATCTCATTTGGCAATTCAATATAAATCTTATTAT >1.10|2826549|34|NC_014166|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAGTTACTCAATTTGGTTGGGTTGTTAGCCCTA >1.11|2826613|36|NC_014166|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAGATGATAAGACTATATTAGATAGAATTCAAATT >1.12|2826679|34|NC_014166|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAATAACAGTTTCTGCAAATTCTTTAGCATTTT >1.13|2826743|36|NC_014166|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGAGGAAAAAGAAAAATACAAAAGTGAATCATGGAA >1.14|2826809|35|NC_014166|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAATATATAAGATTAATAAGCCCACAATCAAAAG >1.15|2826874|35|NC_014166|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAAAACAGAAAGAGAAATGAGAAAAATCTTAGGA >1.16|2826939|36|NC_014166|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAATTTTTATACTTGCAATAATTGCGGAATGACACT >1.17|2827005|35|NC_014166|CRT TAAGATAATCAAGTTTTCCAAAACGAGGAAACTCT |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b1,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014166_1
The CRISPR arrays of NC_014166_1 >merge|NC_014166|1|2825927-2827069|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAATGATTATCACAAAGAAAATAGTGATATTTCAGTTTATCTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAATATAAAAAGTTTGGAACAACAATTATTACTAAAGCTCCTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAATATTTTATTAGATTGGATTGAAGAGTTTCCAGAAACCTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAATTTCGTATAATCAAAAAATTCAAATTCTTTATTTGCTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAATACACTTTCACCTGTCACTCTACTCGTGGCACAGAGCTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAATTAAAGAAGTTAAAGACTATTTTGAAAAACTTTGTGATGCTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAATAAAACAAGACCTATACAAATAGAGCCTTGGTTTTTTCTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAATGGATAAACCACAAGAAGATATTAATATTGTCAATACCTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAATATATCTCATTTGGCAATTCAATATAAATCTTATTATCTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAATAAAGTTACTCAATTTGGTTGGGTTGTTAGCCCTACTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAATAAAGATGATAAGACTATATTAGATAGAATTCAAATTCTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAATTTAATAACAGTTTCTGCAAATTCTTTAGCATTTTCTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAATTGAGGAAAAAGAAAAATACAAAAGTGAATCATGGAACTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAATAAAATATATAAGATTAATAAGCCCACAATCAAAAGCTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAATATAAAACAGAAAGAGAAATGAGAAAAATCTTAGGACTTGAACCAAAACATATGATGTATTGAAATTAATTTTTATACTTGCAATAATTGCGGAATGACACTCTTGAACCAAGACATATGATATATTGAAATTAAGATAATCAAGTTTTCCAAAACGAGGAAACTCTCTTGAACCAAGACATAATGTATTGAAACTC >NC_014166|1|1|2825927-2827004|PILER-CR CTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAAT GATTATCACAAAGAAAATAGTGATATTTCAGTTTAT CTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAAT ATAAAAAGTTTGGAACAACAATTATTACTAAAGCTC CTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAAT ATTTTATTAGATTGGATTGAAGAGTTTCCAGAAAC CTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAAT TTCGTATAATCAAAAAATTCAAATTCTTTATTTG CTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAAT ACACTTTCACCTGTCACTCTACTCGTGGCACAGAG CTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAAT TAAAGAAGTTAAAGACTATTTTGAAAAACTTTGTGATG CTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAAT AAAACAAGACCTATACAAATAGAGCCTTGGTTTTTT CTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAAT GGATAAACCACAAGAAGATATTAATATTGTCAATAC CTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAAT ATATCTCATTTGGCAATTCAATATAAATCTTATTAT CTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAAT AAAGTTACTCAATTTGGTTGGGTTGTTAGCCCTA CTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAAT AAAGATGATAAGACTATATTAGATAGAATTCAAATT CTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAAT TTAATAACAGTTTCTGCAAATTCTTTAGCATTTT CTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAAT TGAGGAAAAAGAAAAATACAAAAGTGAATCATGGAA CTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAAT AAAATATATAAGATTAATAAGCCCACAATCAAAAG CTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAAT ATAAAACAGAAAGAGAAATGAGAAAAATCTTAGGA CTTGAACCAAAACATATGATGTATTGAAAT TAATTTTTATACTTGCAATAATTGCGGAATGACACT CTTGAACCAAGACATATGATATATTGAAAT >NC_014166|1|1|2825927-2827004|CRISPRCasFinder CTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAAT GATTATCACAAAGAAAATAGTGATATTTCAGTTTAT CTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAAT ATAAAAAGTTTGGAACAACAATTATTACTAAAGCTC CTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAAT ATTTTATTAGATTGGATTGAAGAGTTTCCAGAAAC CTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAAT TTCGTATAATCAAAAAATTCAAATTCTTTATTTG CTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAAT ACACTTTCACCTGTCACTCTACTCGTGGCACAGAG CTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAAT TAAAGAAGTTAAAGACTATTTTGAAAAACTTTGTGATG CTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAAT AAAACAAGACCTATACAAATAGAGCCTTGGTTTTTT CTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAAT GGATAAACCACAAGAAGATATTAATATTGTCAATAC CTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAAT ATATCTCATTTGGCAATTCAATATAAATCTTATTAT CTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAAT AAAGTTACTCAATTTGGTTGGGTTGTTAGCCCTA CTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAAT AAAGATGATAAGACTATATTAGATAGAATTCAAATT CTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAAT TTAATAACAGTTTCTGCAAATTCTTTAGCATTTT CTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAAT TGAGGAAAAAGAAAAATACAAAAGTGAATCATGGAA CTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAAT AAAATATATAAGATTAATAAGCCCACAATCAAAAG CTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAAT ATAAAACAGAAAGAGAAATGAGAAAAATCTTAGGA CTTGAACCAAAACATATGATGTATTGAAAT TAATTTTTATACTTGCAATAATTGCGGAATGACACT CTTGAACCAAGACATATGATATATTGAAAT >NC_014166|1|1|2825927-2827069|CRT CTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAAT GATTATCACAAAGAAAATAGTGATATTTCAGTTTAT CTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAAT ATAAAAAGTTTGGAACAACAATTATTACTAAAGCTC CTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAAT ATTTTATTAGATTGGATTGAAGAGTTTCCAGAAAC CTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAAT TTCGTATAATCAAAAAATTCAAATTCTTTATTTG CTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAAT ACACTTTCACCTGTCACTCTACTCGTGGCACAGAG CTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAAT TAAAGAAGTTAAAGACTATTTTGAAAAACTTTGTGATG CTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAAT AAAACAAGACCTATACAAATAGAGCCTTGGTTTTTT CTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAAT GGATAAACCACAAGAAGATATTAATATTGTCAATAC CTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAAT ATATCTCATTTGGCAATTCAATATAAATCTTATTAT CTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAAT AAAGTTACTCAATTTGGTTGGGTTGTTAGCCCTA CTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAAT AAAGATGATAAGACTATATTAGATAGAATTCAAATT CTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAAT TTAATAACAGTTTCTGCAAATTCTTTAGCATTTT CTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAAT TGAGGAAAAAGAAAAATACAAAAGTGAATCATGGAA CTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAAT AAAATATATAAGATTAATAAGCCCACAATCAAAAG CTTGAACCAAGACATATGATGTATTGAAAT ATAAAACAGAAAGAGAAATGAGAAAAATCTTAGGA CTTGAACCAAAACATATGATGTATTGAAAT TAATTTTTATACTTGCAATAATTGCGGAATGACACT CTTGAACCAAGACATATGATATATTGAAAT TAAGATAATCAAGTTTTCCAAAACGAGGAAACTCT CTTGAACCAAGACATAATGTATTGAAACTC
>NC_014166.1|WP_013136592.1|2825448_2825763_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MAKKQNINYNYVFLFYDIADEFSDIGKYRVAKVFKICKQYLKHHQKSIFRGNITPSDQIMLETKLKKVIDKDLDFISIIKVQNSGSFAEVIIGNDKKESESIFI >NC_014166.1|WP_013136591.1|2824442_2825447_+|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MAKNHTRYIFSMGELKRKDNSIAFRNEKGNFYIPIQDTRELYCMNEVSFNTKFLDFISKSGITLHLFNYHGNYSGSFYPKEQLVSGDLTIKQSLCFIERRLHIAKAIVRAIALNIHESLYHYFRHGKKDLKQVLDWLKNDLEKLLNKELTIEQILFVEGQVWNRFYDSFKYFLPEDFIMNKRVKRPPDNPINALVSFGNTLLYTKTISSIYETHLNQTISFLHSPREGRFSLSLDISEAFKPIIVFKTIFDLVGKKRIQVTKHFDKSLNYALLNEEGKKIFIDAFETRINETFMHKKLKRKTSFKNCIKLDGYKLIKYIVEEKEFSPFLLKEKM >NC_014166.1|WP_013136590.1|2823935_2824430_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MKINGTLISYFFICKTKLWLHANRINLEDNSEDVRIGKILHEINESKSKKAEISIDNIKIDKLTRDYLVEVKKSDSDIESVKWQVLLYLYKLKQKGVERKGKIEFIEKNKQDKKIHYIDLDEVNEKELLKICDKIEALINAPVPPTAKFENKCKKCAYYEYCFI >NC_014166.1|WP_013136589.1|2823126_2823939_+|Bro-N-domain-containing-protein MDKIQLFESKQIRSHWDENSELWYFSIVDVVTILTQSASPRKYWNKLKQRLKEEGNETVTNCHQLKMKASDGKMRLTDVATTEQLLRLIQSIPSPQAEPFKMWLAKVGYERIEAIQDPEKSIDAALRDYMKLGYSEKWINQRLKSIEVRKELTDEWKQRGVEEGKEFALLTDIISKAWSGNTTKEYKKLKNLKKENLRDNMTNLELVLNMLAEATTTEISKEKKPDGLDESKKIAKEGGTIAGDTRKAIEEKTGKRVVTNQNAKDLLENK >NC_014166.1|WP_013136588.1|2820898_2823115_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MKILAKKIVEDEQIKTQTLQEHTNWVMEEALKLIDDKSLSKVSIVSGWKKEKILDLIFFSCYFHDIGKATIEFQNTINNGTNSYHSLYSVSVLNQINEFNISGEEDSTINLLLTLCLTHHTLLPYNSNNAYFTFLDSVENIFFNYKDSYKNYLNKECLYDFDFEIEEDIEDILFDIEDDLKYIKENHKLRTLYTYCSGILNFADWLASARFNKSLPKTYFEKIPTKEIFLEQLSENNPSFKKLRDFQDDLSILGKSVLVEIPTGEGKTEGSLLWAIKNLYDKNSKVIYTLPTQVTSNKLYERVTSLFDKNECGLIHSSSKLYLEKEYEKEHGLVDDFFKSEITFNKNFSKPVTVSTIDSLLKFFINIGRFNIATKNYLNSVVIIDEVHCYDFKLMGFLKKFLELCNEFDVKVCLMSASIPKKIKELLGIENYPIITEKKLFKKKANEIIKIDEELDENFDLIIKKFKENKNILIIRNSVKSATDTYKKLRDDYGIDEDDLILYHSTFKKRDKNQKEKDIFDKLDGNKPFILIATQIVEISLDIDFDIMFTDNAPIDSLIQRFGRVNRKKDEIKKGVIYIFKYEKEFPYKSKYLIQITFDTIENGYFELGEYVKWLNIVYDKVFKNDIKINNEIDILFKQGYKKYDDVLKELDGIKKSEDNYDLRHIEQSKVDYLLVDDFLDDNIDSKKFHEYTISLPNYYGKKYLYMSQKESFYKVLDLKYNYRQGLLIDDDKSCEFM >NC_014166.1|WP_013136587.1|2820179_2820899_+|CRISPR-associated-protein-Cas5 MKVIRFEIQGLMNSYRIPFFRTYHKSFLAPPKTTIIGMLCNISLKSQKEFFEILDKEVFEVSVVINEIKGRAKDLWSYKTLEKKNMGKSVVRRDKLFSPKYTIYLKIKDKKLYNEILENLRLPKNTPSLGMDDELIEIKNIKTLEMEEHDTNKINSIFLDKNISYKAYVKDLSKSIELPTINLASTKFIAFDKKNKRIPKESNKDFEFSQVEYLNCEIEFAKDIESFVDVELNNKVVFY >NC_014166.1|WP_013136586.1|2819256_2820180_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MFLNIAYITKVNLASLNGSEGTGGNITEMKKIASANGEEYAYVSGQALRRYFKETLLQLGQRITEVSENGNPTFRDENGKYIDLDKKLKDVKELAYKKFIDLDLFGYMFPNGGRRWSPVKVTPLISILPYKGEYDYLTRKQKPKKENEKSGNIVQIEIDTLNFMRGNIMVNTSHIGNEIDEYTYDVNEILDNEEKNSRLNIFLDAIKNFNGGAKQSRNLEDISPKFIVIAKQKTGNPFLLNSLDVDIEGNINIENIKESIEDTDVESLTIGISKGIFKNEEEIKNSFENVVSVAKAIEEYKDILKSK >NC_014166.1|WP_013136585.1|2817510_2819247_+|hypothetical-protein MEVVQENLFNVTQKDKIVSKKFTVKDVFFNNGLVNLYQFLQEYNFDINIKLEKSFLELKYQDEEIFFKILNKFLEEKEIVTFNKKNTRIFFDTNTNEFTQAAKVNIKNGGSNDSKNALIRVHIDDLSISKEELLKKEEKYIQENENHTKDEYKIEKCYYDKSKQEIYVLSSLQEHIEKFSSYLVKDDFLALNSSIHNFEDGQKSFHDMIKISKNYNIDKWEALIYWFGTKIQHYFNFAFFIYPNSSNIEALNIFKRDLKIKDEKNSFRDENDTLITTNTNVNFYDQLRKDKIFGKKFKNFYISKSDVEFELKFFMYLFSKISHIESSYEKALDKDKMTKRKEKIFNALQEISFVIYVEDGTFKKSLNEYTKAYQFIQFLEELKKTKINVQKEYESNLFIYLADMIVTFGLSQNPKEININFQKWCKAFLEFKSLRKYYYTTSFNILKNESKSFGRGLYEFEKIYLKNIMKGKNMSTHEKSKVLGESIGYFCAELGDKDLLFKLRNVKNYKQLLSYFKDLKFASLKNEDKARFSKEFNESLEEIIEILESDWEIIRDYISIYAIDKFKVTNYAKLQQNK >NC_014166.1|WP_013136584.1|2816782_2817520_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MKYFELKCLAYIKKEIELNESFDALSSYINYCFTKDEVLKKLHEEKDFKNYCFGNFYPIEKNKVYKKGNTYEFVIRSLDEEFIYKLQKLLRENVNNSFFQVLQATKKVVKQFFISELYTVTPTITTVKDENNKSIFWTIDKDGDILKLQEQLQKNLLKKYENFYNEKLEPTQNFIQLLEIKNQKPQSIYFMKKINDDKSIRVRLFGNKFKIVPNEDEVSQKLAFVALACGLGEKQSYGGGFCLWK >NC_014166.1|WP_013136583.1|2816225_2816684_+|hypothetical-protein MKAFFLFSLLFCFLNADYKIIENKNLFLVEVTNSSFEKDLVDLKDEISYEGFTIVYELNLAKATNELATFLKEKGVLKKGINLGICKSSFTLQMVKENFNNINYCPLAISIYKKDKNKTYISYKFYKTFKDNDKIANKINETLKKLILDSLE >NC_014166.1|WP_013136593.1|2827302_2828151_+|hypothetical-protein MKKSLGILIFVILAFIACVNTTNLQKQNKQITKKEKVVELLNSIETGDTIPVSYINQNKYIQHNLALKDGVKGFAEILSKLPKGNAKVEVKRAFEDGNYVFTHTKYNFFGEKVGFDVFRFENGKIVEHWDNLQPISKTTANGRSQIDGATKVEDIEKTIQNKLLIKNFVNDILMGKNPNKITNYISTKKYLQHNPDVKDGLSGLGEALSALSKAGMPMTYEKNHMILGEGNFVLAISEGIFMNKKASFYDLFRIENGKIVEHWDTIEEILPKSKWQNSNGKF >NC_014166.1|WP_013136594.1|2828226_2828664_+|MarR-family-transcriptional-regulator MKKELIALASKVTDLSNKLIISQLEKNNINGIVPSHGSIFILLYENEQVTMKDIADFVHKTKPTVTILVDKLVKMGYVKKEKSKTDSRVTFVELTQKGKDLKPVFEEISNNINNIIYKNLTTNEAVQTEKTLRKVIANLNFEDIV >NC_014166.1|WP_013136595.1|2828660_2829059_-|hypothetical-protein MKKLIFISVFASFLSAQNSMMQIYKPVTGTCPQDWIKEMTKEVKEVNVVSLMNVKNLKKEIGIPKEIQSCNTSIIDDYVFEGNVPARAIKDFFKRKPKNAIGLSLPAYENEKSPKTVFVLFEDKTYKIFGKY >NC_014166.1|WP_013136596.1|2829055_2829754_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLNINILEKKFGKTIILKDINIFIEEGELISIIGPSGCGKTTILNIVSGLDTNYIGSLSGDFSKLSFMFQDDRLLPWLNIKDNLLLVSKTKDIEEIEELLSLIGLNHILNEYPNRLSGGMKRRIALIRAFINRPKIIVLDEPFISLDYPTSMALKKDFLIFCKKFNPTVILVTHDLSEAVHLSSRIIFLSSTYATKILDYKNDNNQESDIKKIDEKKNIILDLYPKILEGKI >NC_014166.1|WP_013136597.1|2829755_2830493_-|ABC-transporter-permease-subunit MQKNQTKIFSFMLFLILWQALSLLINSDLFPSIIDIVKSLEEHIKNKDLFWNLFITLYRVFVAFFITMSIGIIFGLLMGFYKKVDDFFDFLLILGLNIPALVTIIICYIWFGLTDFSAILAVVINKVPIVIVNIREGTKAFDKKYMDFAKIYKLSRKEIFLNIYLPQLYPYLLATTRLSLSLIWKIVLVVELLGRSDGIGFQISMFYQYFDISSILAYSFAFISVILLIEHKILKPIDIKLKAWK >NC_014166.1|WP_013136598.1|2830492_2831446_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKCKIFLVFIFFLINLNAQQKLRVGVLAYGTVNWGLEILKQNGLDKKNGFDLEIVKLASKNAQLISLQANKVDLIVNDWIWVNKQKSKGKNFLFYPYSKALGTLMVNKQSGINNLSDLKNGELGISGGIYDKTWLLFRAFYKKENGKKFEEIVKPVFASPPILYKKMMDNSLNAAINFWHFNAKLPKEKFEPLVQISDILKSLGVNSDISFVGWVFNKDFASKNKALVNTFLNTSLQSKELLASDDKQWDKIKKLVKTKDNKIFESLKQEYIKGIIKEFTKEDISELRKVYKILSKEAGANYISKNVPFDESIFWLK >NC_014166.1|WP_013136599.1|2831593_2832007_+|cytochrome-c-550-PedF MNKIQKLGLTVLLSTVFAYGHGDVVPQPVDTKGLKPLGKEWLETNPYVGNKKAIEIGKHGYEENCARCHGLEVVSGGIAPDLRYLDTGADGDEWFMERIRGGAVRNGNVYMPPFEGILSQEAMWAIRSFIVSKHTEE >NC_014166.1|WP_013136600.1|2832010_2832877_+|transporter-substrate-binding-domain-containing-protein MSILKSALIILILALSIHARSIEDIKKSGEIIIAVYKDFPPYSFKEKGVAKGIDVDLGKKVAKALGVKPVWYFTGFDEDLAADLRNTISRGNKVHKNRADVMFRIPYDYTYMRLTDKQTGELQNDMVTIKGPYQSEKWVIATHKKIIPKITTLGIFAYQTIGVEVDMLPDLHLSGFARGLIRKNVKHYRNFNDAIRDFKLGKIDAIAGLKTQLEYLLDYKNNKDKYYISDNIPMMKSKWDLATAVRSNYRALSYFIDGVIEKAYKNGEIKNIFNKYGVDYLPPIARTQ >NC_014166.1|WP_013136601.1|2832887_2833628_+|quinoprotein-dehydrogenase-associated-SoxYZ-like-carrier MKNIFFALFLIITSQNLFANNPISSPTFKDIINDVIKGEKYIFDDKNIIVDVPKFADNPIQVPIFIDGKNIKNAKRMIVFADLNPIPVIVDMKLIDLLPLISVNIKVAQETPLRALIQDDKGVWHIGSANIKSFGGGCSVSSVSSSDTNFDKYLGKAKGEIFKKGDITRIKASIFHPMETGLVFGNSAFYINKISIFAKNKKLSDITSYSAISENPRFIFETKNKSEDYKINFYDTDANEFSLDIK >NC_014166.1|WP_013136602.1|2833624_2834542_+|quinoprotein-relay-system-zinc-metallohydrolase-1 MKTLLLLLSIFSFCFSFDFKLKPIKLAKNSYYFYGKEEYFSVKNGGDISNTAFIITKNSVILIDTGSSYEYAEQVKKKIKQITNKPIKYVINTHHHPDHFLGNNAFSNSEIFSTEFTKNEIAQNGDLYIANLNNLVQGAMNGTKIKVPNEILKSNELNLDGYKLKLFYLDGHTKSDLVIYDENTKILYAADLVFNKRTLATPHANIPDWIKSLEKLKKINYKILVPGHGKIDRTKNAINEDIAYLHYLDNTLKNSARHGFDIFEILARPIPKEFKSFTMFKEEFERSIINLYPKYEKRRMKNYQE |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_014166_1 | 1.4|2826154|34|NC_014166|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2826154-2826187 | 34 | MH617456 | Microviridae sp. isolate ctdc47, complete genome | 2357-2390 | 8 | 0.765 |
NC_014166_1 | 1.4|2826154|34|NC_014166|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2826154-2826187 | 34 | NC_010937 | Clostridium perfringens plasmid pCW3, complete sequence | 28281-28314 | 8 | 0.765 |
NC_014166_1 | 1.4|2826154|34|NC_014166|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2826154-2826187 | 34 | NC_019687 | Clostridium perfringens plasmid pCpb2-CP1, complete sequence | 18050-18083 | 8 | 0.765 |
NC_014166_1 | 1.4|2826154|34|NC_014166|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2826154-2826187 | 34 | NZ_CP025503 | Clostridium perfringens strain EHE-NE18 plasmid pJIR3844, complete sequence | 9441-9474 | 8 | 0.765 |
NC_014166_1 | 1.4|2826154|34|NC_014166|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2826154-2826187 | 34 | NC_019257 | Clostridium perfringens plasmid pJIR3844, complete sequence | 18598-18631 | 8 | 0.765 |
NC_014166_1 | 1.12|2826679|34|NC_014166|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2826679-2826712 | 34 | NC_017139 | Bacillus megaterium WSH-002 plasmid WSH-002_p1, complete sequence | 52405-52438 | 8 | 0.765 |
NC_014166_1 | 1.12|2826679|34|NC_014166|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2826679-2826712 | 34 | NZ_CP046125 | Enterococcus casseliflavus strain EC291 plasmid unnamed2, complete sequence | 84798-84831 | 8 | 0.765 |
NC_014166_1 | 1.12|2826679|34|NC_014166|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2826679-2826712 | 34 | NZ_CP023514 | Enterococcus sp. FDAARGOS_375 plasmid unnamed1, complete sequence | 66608-66641 | 8 | 0.765 |
NC_014166_1 | 1.12|2826679|34|NC_014166|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2826679-2826712 | 34 | MN693255 | Marine virus AFVG_25M362, complete genome | 31353-31386 | 8 | 0.765 |
NC_014166_1 | 1.8|2826417|36|NC_014166|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2826417-2826452 | 36 | NZ_MF150536 | Lactococcus lactis subsp. lactis bv. diacetylactis strain FM03P plasmid pLd8, complete sequence | 6455-6490 | 9 | 0.75 |
NC_014166_1 | 1.13|2826743|36|NC_014166|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2826743-2826778 | 36 | NC_017543 | Paenibacillus polymyxa M1 plasmid pPPM1a, complete sequence | 250439-250474 | 10 | 0.722 |
NC_014166_1 | 1.13|2826743|36|NC_014166|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2826743-2826778 | 36 | X96987 | Bacteriophage GA-1 complete genome sequence | 9311-9346 | 10 | 0.722 |
NC_014166_1 | 1.13|2826743|36|NC_014166|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2826743-2826778 | 36 | NC_002649 | Bacillus phage GA-1, complete genome | 9311-9346 | 10 | 0.722 |
NC_014166_1 | 1.17|2827005|35|NC_014166|CRT | 2827005-2827039 | 35 | NZ_CP015439 | Anoxybacillus amylolyticus strain DSM 15939 plasmid pDSM15939_1, complete sequence | 244765-244799 | 10 | 0.714 |
1. spacer 1.4|2826154|34|NC_014166|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH617456 (Microviridae sp. isolate ctdc47, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
ttcgtataatcaaaaaattcaaattctttatttg CRISPR spacer atcatataatcaaaaaattcaaattgtcaaataa Protospacer **.********************* *. * * .
2. spacer 1.4|2826154|34|NC_014166|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_010937 (Clostridium perfringens plasmid pCW3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
ttcgtataa---tcaaaaaattcaaattctttatttg CRISPR spacer ---cgataagcttcaaaaaattcaatttcattattta Protospacer **** ************* *** ******.
3. spacer 1.4|2826154|34|NC_014166|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019687 (Clostridium perfringens plasmid pCpb2-CP1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
ttcgtataa---tcaaaaaattcaaattctttatttg CRISPR spacer ---cgataagcttcaaaaaattcaatttcattattta Protospacer **** ************* *** ******.
4. spacer 1.4|2826154|34|NC_014166|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP025503 (Clostridium perfringens strain EHE-NE18 plasmid pJIR3844, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
ttcgtataa---tcaaaaaattcaaattctttatttg CRISPR spacer ---cgataagcttcaaaaaattcaatttcattattta Protospacer **** ************* *** ******.
5. spacer 1.4|2826154|34|NC_014166|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019257 (Clostridium perfringens plasmid pJIR3844, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
ttcgtataa---tcaaaaaattcaaattctttatttg CRISPR spacer ---cgataagcttcaaaaaattcaatttcattattta Protospacer **** ************* *** ******.
6. spacer 1.12|2826679|34|NC_014166|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_017139 (Bacillus megaterium WSH-002 plasmid WSH-002_p1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
ttaataacagtttctgcaaattctttagcatttt----- CRISPR spacer ataataacaatttttgcaaattctt-----ttttacaaa Protospacer ********.***.*********** ****
7. spacer 1.12|2826679|34|NC_014166|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP046125 (Enterococcus casseliflavus strain EC291 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
ttaataacagtttctgcaaattctttagcatttt CRISPR spacer ttagggattgtttctgcataatctttagcatttg Protospacer ***. .*. ********* * ************
8. spacer 1.12|2826679|34|NC_014166|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP023514 (Enterococcus sp. FDAARGOS_375 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
ttaataacagtttctgcaaattctttagcatttt CRISPR spacer ttagggattgtttctgcataatctttagcatttg Protospacer ***. .*. ********* * ************
9. spacer 1.12|2826679|34|NC_014166|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693255 (Marine virus AFVG_25M362, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
ttaataacagtttctgcaaattctttagcatttt CRISPR spacer tcatttaatttttctgcaaaatctttagcttttt Protospacer *.* * * ********** ******** ****
10. spacer 1.8|2826417|36|NC_014166|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MF150536 (Lactococcus lactis subsp. lactis bv. diacetylactis strain FM03P plasmid pLd8, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
ggataaaccacaagaagatattaatattgtcaatac CRISPR spacer agcaaagaaacaagaagatattaaaattatcaatag Protospacer .* **. *************** ***.******
11. spacer 1.13|2826743|36|NC_014166|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_017543 (Paenibacillus polymyxa M1 plasmid pPPM1a, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
tgaggaaaaagaaaaatacaaaagtgaatcatggaa CRISPR spacer acacagaaaagaaaaaaagaaaagtgaatcatatag Protospacer * ..********** * *************. *.
12. spacer 1.13|2826743|36|NC_014166|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to X96987 (Bacteriophage GA-1 complete genome sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
tgaggaaaaagaaaaatacaaaagtgaatcatggaa CRISPR spacer tgtattaaaagaaatatacaaaaatgaatcatctgt Protospacer ** . ******** ********.******** .
13. spacer 1.13|2826743|36|NC_014166|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_002649 (Bacillus phage GA-1, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
tgaggaaaaagaaaaatacaaaagtgaatcatggaa CRISPR spacer tgtattaaaagaaatatacaaaaatgaatcatctgt Protospacer ** . ******** ********.******** .
14. spacer 1.17|2827005|35|NC_014166|CRT matches to NZ_CP015439 (Anoxybacillus amylolyticus strain DSM 15939 plasmid pDSM15939_1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
taagataatcaagttttccaaaacgaggaaactct CRISPR spacer cgtcaaaatcaaattttccaaaaggaggaaacaac Protospacer .. * ******.********** ******** .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
479314 : 489352
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_014166|479314:489352|DBSCAN-SWA ATCATTTGAACTGTCCTAATAATCTTAAATCACTCTCAAATAGAGATCTTAAATCTCCTATGTTGTGTATTAGCATAGCAACTCTTTCTATACCCATTCCAAAGGCATAACCAGACATATCTTCATATCCAACTGCTTTAAATACATTTTGATCTACTATTCCACAACCAAGAATCTCTATCCAACCAGTATGTGAACAAACACGACAACCATCACCTTTACAAAATACACATGAAATGTCAACTTCAGCAGATGGTTCTGTAAAAGGGAAGAATGAAGGTCTAAATCTAACTTCAACATTTCCAAACATATGTTTTAAAAACTCTTCCATTACATGTTTTAAATTAGAAAATGAGATTTTATCAGAATCATCTACTACTAATCCTTCTATTTGATGGAACATAGGTGTATGTGTAATATCATAATCTCTTCTAAATACCGTTCCTGGTGCTATCATTCTAATAGGGGGTTTTTGAGCTAACATAGTTCTAATTTGTACAGGAGAAGTGTGCGTTCTTAAAAGTGAATAATCTTTATTGTAAAAAGTATCTTGCATATCTCTTGCTGGATGGTATTTTGGAAGATTTAAAGCTTCAAAGTTATGGAAGTCATCTTCTACTAAAGGTCCTTCTTCAACTGCAAAATTTAAATTTTGAAAATAAGAGATAATTTTATCCATAGTATCAACAACTGGGTGAACAGCACCACAAGTTAGTTTATTATTAAATCTTGATACATCAATTCTTTCTGCTTCAAGTTTTTTATTTAATTCAATTTTTTCTAAAATCTCTTTTTTTGACTCTAAGGCATTTGTTATTTCAATCTTTTTTGTATTTAAATCTTGTGCAAATGCTTTTTTCTCTTCATTTGGAATATCTTTTAATCTTGCAAACTCTTTAGTTAAAAAACCTTTTTTCCCAAGTATCTCAATTCTTAGGTTTTCTAAGGCTTCTATAGAATCAGCAGATTCAATTTTTTCGATCCACTCTTTCACTTATTTCCCCTGTTTTCATTTATATAAAAGGTGATTATTGTACTTAAGTTTTTATTAGAGTTTGGTTATAATAAAAATTAATACTATTAAAAGGAACTATAGATGTGCATTTTTTGTAAAATTGTGAATGGGGAAATTCCAAATAAAACTATATTAGAAGATGAAAAATTTTTAGCTTTTGAAGATATAAATCCAGCTTGTAAAGTTCATGCTTTAATTATACCAAAAGAGCATTATACTTCATTTGATGTTGTACCTCCAAAAGTAATGGCAGGAATGACTGAATTTATTCAAAAAGTTGCTTCAAAGTTAAATTTAAGAGATGATGGATATAGGCTTATTACAAATATCGGAGAGCAGGGTGGTCAAGTTGTTCATCACTTGCATTTTCATGTTTTAGGTGGGGAATATGTGGGAAGTTTAGTTGGAAATAAAAACAAAGAGTAAAAAAGAGGGAAACCTCTTTTTTATTATTTTTGAGAAAAACTACCTAGGGACATAAGTTTTTCATATCTTTTTTCATATCTCTCTTCTTGCGACATATTTCTTAATTCTTTTACAGACTCAAGAAAATAATCAGCTAAAGCTTTTATAGCTTCATCTTTTGATCTATGTGCACCAATTAATGGTTCATTTATTACATCATCAATCAAATTAAGGCTTTTTAATGATTCAGCAGTAATTTTTAAAGAATTAGCCGCAGTTTCAGCTTGAGCAGGGTCATTCCATAAAATTGCAGCACAACCTTCAGGGGATATTACAGCGTAAACAGAGTATCTCATCATTGCTAATTTATCAGCAATAGAAATAGCTAAGGCTCCACCTGAACCACCTTCACCAATTACAACAGAGATTGTAATAGTCTTTAAATCAGAAAATTCATATAAATTTTTAGCAATAGCTTCAGATTGATTTCTCTCTTCAGCTCCAATTCCTGGATATGCACCTGGGGTGTCTACTAACATAAGAATAGGCAGATTAAATTTTTCAGCTAATTTAGCAGCTCTTAAAGCTTTTCTATAACCTTCAGGGCTTGGCATACCAAAATTTCTTTTTAATTTATTTTTAGTACCTCTACCTTTTTGTTCACCAATTACTACAACTTTTTCATCACCGATTTTACCTAAATAACAAACTATCGCATTATCATCAGTGAAGTGTCTATCACCATGAATTTCATAAGCATCTGTCAAAAGACCTCTAATATAATCTAAGGCATAAGGTCTATCTGGATGACGTGCTAGTTGAAGTTTTTGATAATCAGTTAAATTCTTAAAAGTTTTTTCAACTTCTTTTTCTAACTTTTTATCTAATATTTCAACTGCATGTTCATCTGACTTTGATTTTGCTACTATTATATCTTCTTCGATAGCTTTTATTTTTTCTTCAAATGTTAAATAAGTTGACAATTTATTCCTTTATTAAAAAGATTTTTATCTTTTAATATAAATTATTTTATAAATTTTTTAAATATGATTGAACCGTTAGTTCCACCAAAACCAAAGTTATTACTCATAACAGTAGTTAATTCTGCTTTTCTTGCAACATTTGGAACATAATCTAAATCACACTCTTCATCAGGATTAATCATATTAATTGTTGGAGGAATAATCCCTTCATTTAATGATTTAATTGTGAAAATTGCTTCAATTGCTCCCGCAGCTCCTAAACAATGTCCAATTTGACCTTTTGTTGAAGTTACAGGAGGACAATTTTCTTTTCCACCAAATAATTCTTTTATAGCTTTAGTTTCATTTCCATCTCCCACAGGAGTAGAAGTACCATGGGTATTTATATAATCAATTTTTGGATATTCTCCTGTATTTGATTTTACCATTTCAAATGCTGCTCTCATAGCTCTTAATGGACCATCCATAACTGGTGCTGTGATATGATTTGCATCAGCACTTTCTCCAAATGCAATTATCTCTGCATAAATTTTAGCACCTCTTGCAAGAGCAGAATCTAAAGTTTCTACGACTAAAGCACCAGCTCCTTCACCCATAACAAAACCATCTCTATCTTTATCAAAAGGTCTTGATGCAGTTTGAGGGTCATCATTTCTAGTAGATAGTGCTTTCATTGCAGCAAATCCACCAATTCCAGCTCCACAAATTGCAGCTTCAGCACCAACTACTAAAACGCTATCAGCACCACCTAAAGCGATTGTTTTAACAGCATCTGATAAAGCATGAGTTGAAGCAGAACAAGCAGTAACATGAGATAAATTAGGTCCTCTTAATCCATGCTCAATAGAAATAAACCCACCTAACATATTTACCAATGATGATGGAATAAAAAATGGAGATATTCTTCTAGGTCCCTTTGTATCACAAACAACAGAGTTTTTTTCAATTGTTGATAAACCACCTATTCCAGAAGCAGAAATTACTCCAAATCTTGGAGAAAGTTCGTCACTTACTTTATTATTTTCTTCACTTGTAAAGCCAGAGTCAAGCATAGCTTCTTTTGCAGCTTTAATACCTAATTGGATGAATCTATCAGCTTTTTTTACTTCTTTTTTATCCATAACTGTTGTTGGGTCAAAATCTTTTACCTCTCCTGCAAACTTTACTGAATATTCACTTGCATCAAAAAGAGTAATATCTCTAATCCCACATTTACCTGCAACTACTGCATCGAATGATTCATTTACATTATGTCCTAAAGAATTTATAGTACCTAGACCAGTTATTACAACTCTTTTCATCTATTTAAGCTCCATTTGTGATTATAATTTAATTATTTAAATTCTTCAATTTTTAAAAAAAATTCAAAAATTTAAATAAAGAGTTAAAAGTTAACTCTCTATTTGAGTCAAGAATAATGTCTTATTACTTGATTATTTATTATCTTCGATGTATTTGATAGCATCTGAAACAGTTAAGATTTTTTCCGCATCTTCATCAGGTATTTCGATGTCAAATTTTTCTTCTAAAGCCATAACTAGCTCAACAACGTCTAACGAATCTGCCCCTAAGTCTTCAATGAATTTTGAATCTTCTTTAACTTCAGCTGGATCGCAATCTAATTGCTCAACTACTACTTCTTTCACATCATCTAATAATGCCATTTTCTTTCCTTTTTTAAAATTGTCCTAGAATTATACCTAAAAGCCTTTAAATATTCTTTTAAATAAAATTTTTTAGCTTAAACGTATAAGCCACCATTAACTTTTAAGATCTCTCCTGTTATATAAGAAGAGTGATCACTTAACAAAAATGCAACCGCATCAGCGATTTCACTTGGCTTCCCAAATCTACTTAGTGGGATATTTTTTTCATATTCTGCTTTTACTTCATCTTTTAACTCATCAGTCATGTCTGTTTGAATAAAACCAGGAGTTACGGCATTGTATCTTATACTTCTAGATGCTGCTTCTTTTGCAAATGACTTAGTCATAGCATTTAATCCACCCTTAGAAGCTGAGTAATTTGTTTGACCAGGATTACCCATTTCTCCAACTATTGAAGAGATATTAACAATTGAGCCAAATCTTTTTTTACCCATTACTTTTAATGCAGCTTTACAACCAATAAATGCTGATGTTAAGTTTGCACTTATAACATCATTGAAATCTTGAACAGACATTCTAAGAGCTAATTTATCTTTTGTAATACCAGCATTGTTAACTAAGTATGATAACTCACCATCTGAGTCAATAATTGTATTAATTGCACTTACAAACTCATCTTCATTTGTTACATCTGCTTTTATAATTGCAGCTTTTCCACCAGCAGCTTCAATTTCTTCTTGAATTTTAGAAGCAGCATCTGCTCCACTTCTATAATTAATCCATACTTTAAGTCCATGACTTGCAAGAGTTTTGGCAATTTGGGCACCTATACCTCTGCTAGCACCAGTAACTAGTACATTTGAACCTGTAAATTTCATCTTTATCCTTATGTTTATTTTATAAAAATAGCTTTAATAATATCAAAATTTTAATTTAATTTCTATTTATACGCCTCTTTTATTATCCCAAACCCTTATATGTAGTCTATCACAATATTTATATCCTGAATTAATTGCCATGTTTATAACGCTTTCAGAATGTTTATTTATCTCATAAGCACTATCTCCCATTGGCATAAGGTAAATGTCACAATTTGGTATTATTGAAGAGATTAATTCAATCTCTTCTTTTGCTTTTGTAATAAATTCTTTGCTAATAACAAATTTTAAATATGACTCTTTTGTATTTGTGATAATCTTTTTTAGAGTCTCTTCGTTGACCCTTTTTTTAAGTGGTTCGAGTGAATTAGAAAGTTTAACGCTCATGGAAAATATTAACTCTTTTTGATACTCTTTTGTAAAATCTATATTTAATGAGCCATTTGTCTCTATTGTTACTTTATAACCATTTGATATATAATATTTCAAAATTTCTTGGAACTCTTCATCTTTCCAATATAAGAGTGGCTCACCACCTGTAATTACTATATCTACTTTATATGAAGGTTCTAACTTTTTAACTTGATTTATTATTTCATTTTTATTCATCTTATGCCATTGGTCTTTAAAGGCAGGATCAACTGCATAAAATGAATCGCAAGAACATTTTTTTACACCACTTGGAGTCTCATATTCAACGGCAAAGCCTTCACATCTAAAATTACATTTGCCAAATCTTATAAAAATAGATGGATTCCCAACATATTTACCTTCACCTTGAATTGTGGGTCCAAATATCTCATTTACTTCAAGCATAAACTGTACTTTTACTTTTTGGAGTCTCTAAAAATTCTACATGTGATACTTCTATTGGTAGTTCATTCATCTTAGTTTGAATAATTTCTAAAAGCCAAGCAGAAAGGTTTTCACTTGTTGGTACAAAATCAACAAGTACATATCCTTCATACAATTCACGAATATGTATTGGTTCATCTTTTATGCTATTTAAATCAAAAGTATAAAATCCTTCTTCATGGAAAAACAACTCTTCTTTATTTTTGAAATGAGGTAGTAAAGTTTCAAATAATGGATCATTTAAGTCTAAAACAAATTTATGATCTAAAGTATCATCTAAAAATTTCTTGAACCAATTTAAGTGCTTAAAATCAGTTACCATTCCATTTTTTAAACTTGAACTTTCTAAATGAACTATTACTTTTCCTTGATGTCCATGTAGATGTCTACACATCAAACAAGTATCTAGTGAAAAGTCTGGGTTTAATTCTTGTGACCAAACTCTATGACCATAACAAAAATCGAACTCTTTTGAAATATTCCATTTCATCAAGAACCTTTATAGGGTATTGGATCTTTTGAATTTGCTTGTGCAAATCCATTTAATCGTAATCTGCATGAATCACAAACTCCACAAGCTTCTTTTTCTTCTTTATAGCAAGACCAAGTTAGTTCAAGTGGAACATTTAGTTCAAGGGCTTTTTTTACAATTTCACTTTTGTGAAGTTTTACTAAAGGAGTTTTAATACTAATGTGAGTTGCTTCTTTTGTTCCTTCATTGATTGCATTTTTAATTTGGTTTATAAAGGCATCTGTACAATCAGGATATCCACTACTATCTTCTTCAACAACTCCAATAAACATTGCTTCTGCATTCTCTTTTTCAGCAACTGCTGCTGCAATTGAAAGAAAAATACCATTTCTAAATGGCACATAAGTAACGGGAACACCAGGTTTAACTCCATCAATTGGAACATCAATATTGGCATCAGTTAAAGCACTTGCCCCAATTTGTGTAAAAAATGGAATATCAATTTCATATTTATTTTTAACATTCAAATTTTCGCAAACATCTCTAAATGCTTTTAATTCTCTTTTTTCAGTTCTTTGTCCATAGTTAAAATGGATAGCAATTATCTCATATCCTTCATTTTTAGCAATATATGAAGAAAGAGTGGAATCCATACCTCCACTTAAAATACAAATAGCTTTTTTACTCATAAGTTATATAGTCCTTTTTTTTATCGCAAAAGAATTTCCAGTTAATTGGAATAACTTTTACTTCTTGATTTTCATTTAATTTTGATACATTTTCATCTAAAGCAATAAATGAATTACATTTGCATAAAACAGATACCATCCCTGGGCTTTTTTTATCAGAAGGAGTGAATTTTTCTCCATCAAAAAAACCTGGAAGTAAGGTAAGTCTTCCTTTTTTATTTAAAAGTGTTTGGTCAAGTTTTGCCATTATAAAGTTATGATAAAAATCTTTAGAACCAATCATCTTTTGAATAATTATTTGACCTAACATCTCAAAAACCATAGCTGAAGCTAAAGGATTACCTGGAAGATTTAAAATAAAAGTATCTTTTATTTTCCCAAAGATTGTTGGTTTTCCTGGTTTTACATTTACTCCATCAAATAAAGTTTCTAAGCCAACTTGTGTAAATGATTCCCTTGTAAAATCTGCTTCTCCCACTGATACCCCACCAGAGGTAATTATTAAGTCTGCACCTAAAGAGTTAAGTACATGCTCTTTTATTGATTCAATTGAATCTTTTGCTTGTCCTATAAAACTAACATCACAGCCCAACTCTTTAGTTCTTGCTATGAAAGTTGGAGTATTAGAGTTATATATTTGGTACTCTTTTATTCCTTGGTAGTGAAGTTTCAACTCTTCACCCGAAGCAAAAACTACAACTTTTGGTTTTTTATAAACTTTTACATGGGAAATACCTTGAGATGCAAGAAGAGTAATTTTTGAAAAATTTAATTCTTCACCTTTTTTAACTAGAATTTCATCTTTTTGAATATCTTCACCAATAAATCTAATATGTTGCATTTTTCTAATATCAGAGGTGATTTTAATTCTACTTCCAATAGTTTGTGTATTTTCTTGTGGAACAACAGCTTCACAGTTTTGTGGAACTCTAGCCCCTGTCATGATTTTAATTGTTGTACCTGTTTCTAAAATATCTTGATTATTATCACCTGCAAATATTTTATTTGTAAGAGTTAATTCTTTATCTTTATCTTCAAAAAGTATTGCATAACCATCCATTGCAGAGTTGTTAAACTTTGGTAAAGAGATTGTTGCATGTAAATTTTCGGCACTTATTCTTGATGTCGCATTTTCAATTGGAACTATTTCAAACTTGTTTATTTGAATAGAATTTACAATTATATTTAAAGCTTCTTCAATTGACACACTCATATAAAATCCTTTTACTTCAACCTATGCTTAAGTTTGATATAATAGCAAAATTTCTTAAAAGTGAGATAAACATGGATTTTAGTAGTTCGACAATTGATACACATGTATTTTTCGTATACCTTTTTATATCGGTTATGATAATTAATTTTTATAGTGTGTATAATATAAATAATTTTATAAAATTAGCAAAAAGATTAAAATTTTTTACCCCTTTGTATCATACTTTAAATGCAATTATTATCTATACAGGAACAATAGTTGCTTTTTATCAAAGAACATTTAGTTTTACTATATTTATAATGATAGCAGCAGCAATTGCTGTAATGGTATTAGAGATAAAAAGATTTAAAAAGATGAGAGTTATAAAAAGTGATGATACACAACTACAAGAAGAATTTTTTAGATTTTCTAGGAAAATTTATCTTATTGAAATTATTATAATAGTTTTCACATATATTATAAGTAAGATTTTTTAGTGCAGTTTGTTTATTCATCTGAGGCATCACTTGAAACAATTAAAGTTGAAGGTGATATATATAAATATCTTTTTAAAGCAAGAAGAGAAAAAATTGGTTCAACTGTTTTTTTTAGGAATTTAAAGAATAATTTTATTTATTCCTATGAAATATTTGATATTAGCAAAAAAGATGCAAATTTAAGACTTATAAAAAAAGAAGAAAAAATAGTTGAGGCTAATAATAAACTTCACATTATTTGGGCAATAGTTGATCCAAAAACAATTGAGAAACAACTTCCTTATTTAAATGAAATAGGAGTTGATAAAATTACCTTCTTTTATGCTGATTATTCACAGAAAAACTTTAAACTAAATATAGAAAAGTTTGAAAAAATATTGATAAATTCATCACAACAATGTGGAAGAAGTTCAATTATAAAATTAGAAATAATAGCTTCTTTAGATGAGGTTTTAACTTCATACAAAGATAGTTTTGTTTTTAATTTTTCTAATAATCACATAAATGATAAAAAAGATATAAAAAGTATAATTGTGGGGTGTGAAGGTGGTTTTTCTCCTAAAGAATTGGAAAAATTCACAGAAGAAAAAACTGTTGGGATTAATTCTAATTTGATTTTAAGAAGTGAAACAGCAGTTACAACTATTGCTGCAAAATTGATAGTTTAAAACTAACACTTAATTAACACTAATACTTTATAATTACAATGTTTAAACAAAAAGAATAAGATAAACTCCTACTAATTTTTATCTATTCACAAGAACGCTAAAGCCTTTAAACACCAATTGGCTTTAGCCTATATCCTCTATTTTTTTGTGATTCTATAATATCAACTCCCAATATTTTTCTTAAATGCCAAATATGATATCGAATAACATCTGCTTTTGAATTACTATTGCTTGGATAAACATTTTTTTCCAAGCTTTCTTTGCTTACAAAATTTCCTCTATTTTTAATCAAGTAATTTAATACTAATAGGGTTTGTGGTTCCATTTCTAAGGGTTCTTGATTGTAAAAAAGTTCTTTTGAAAAGATATTGTATGAAAGATTTTCACTTATAATTATATCTTGGTGATATGTTCGATATGATCTTTTGATTAGAGATTGTATTCTTAAAATTAGTTCTTGATTATTTCCTGTTTTATTTAAAAAACCATCACATCCACTTTTAAATGATCTAATTATACTATTTGAAATAGAAGTTAGTACTAATCTTAAAGTCTCATCTTCATATTCATTTAAAATTCTCATGATTTCATAACCATCAATTTGTGGGACATTTATATCAAGAATATATAAGTCATATATATTGTCATATATTTTGTTTAAAAATTTTTCACCATTTGAGCAAGTATCAATTATAAAATTTTCTTCTTCAAGTAGATCTTTTATAGTTTCTTGATAGAGTTTATCATCTTCCAAAAATAGTATTTTAGTGCCAAGCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_014166|479314:489352|487905_488574_+|WP_013134313.1|DBSCAN-SWA MQFVYSSEASLETIKVEGDIYKYLFKARREKIGSTVFFRNLKNNFIYSYEIFDISKKDANLRLIKKEEKIVEANNKLHIIWAIVDPKTIEKQLPYLNEIGVDKITFFYADYSQKNFKLNIEKFEKILINSSQQCGRSSIIKLEIIASLDEVLTSYKDSFVFNFSNNHINDKKDIKSIIVGCEGGFSPKELEKFTEEKTVGINSNLILRSETAVTTIAAKLIV >NC_014166|479314:489352|487501_487906_+|WP_013134312.1|DBSCAN-SWA MDFSSSTIDTHVFFVYLFISVMIINFYSVYNINNFIKLAKRLKFFTPLYHTLNAIIIYTGTIVAFYQRTFSFTIFIMIAAAIAVMVLEIKRFKKMRVIKSDDTQLQEEFFRFSRKIYLIEIIIIVFTYIISKIF >NC_014166|479314:489352|486209_487430_-|WP_013134311.1|DBSCAN-SWA MSVSIEEALNIIVNSIQINKFEIVPIENATSRISAENLHATISLPKFNNSAMDGYAILFEDKDKELTLTNKIFAGDNNQDILETGTTIKIMTGARVPQNCEAVVPQENTQTIGSRIKITSDIRKMQHIRFIGEDIQKDEILVKKGEELNFSKITLLASQGISHVKVYKKPKVVVFASGEELKLHYQGIKEYQIYNSNTPTFIARTKELGCDVSFIGQAKDSIESIKEHVLNSLGADLIITSGGVSVGEADFTRESFTQVGLETLFDGVNVKPGKPTIFGKIKDTFILNLPGNPLASAMVFEMLGQIIIQKMIGSKDFYHNFIMAKLDQTLLNKKGRLTLLPGFFDGEKFTPSDKKSPGMVSVLCKCNSFIALDENVSKLNENQEVKVIPINWKFFCDKKKDYITYE >NC_014166|479314:489352|485545_486217_-|WP_013134310.1|DBSCAN-SWA MSKKAICILSGGMDSTLSSYIAKNEGYEIIAIHFNYGQRTEKRELKAFRDVCENLNVKNKYEIDIPFFTQIGASALTDANIDVPIDGVKPGVPVTYVPFRNGIFLSIAAAVAEKENAEAMFIGVVEEDSSGYPDCTDAFINQIKNAINEGTKEATHISIKTPLVKLHKSEIVKKALELNVPLELTWSCYKEEKEACGVCDSCRLRLNGFAQANSKDPIPYKGS >NC_014166|479314:489352|480409_480754_+|WP_013134303.1|DBSCAN-SWA MCIFCKIVNGEIPNKTILEDEKFLAFEDINPACKVHALIIPKEHYTSFDVVPPKVMAGMTEFIQKVASKLNLRDDGYRLITNIGEQGGQVVHHLHFHVLGGEYVGSLVGNKNKE >NC_014166|479314:489352|484267_485017_-|WP_013134308.1|DBSCAN-SWA MLEVNEIFGPTIQGEGKYVGNPSIFIRFGKCNFRCEGFAVEYETPSGVKKCSCDSFYAVDPAFKDQWHKMNKNEIINQVKKLEPSYKVDIVITGGEPLLYWKDEEFQEILKYYISNGYKVTIETNGSLNIDFTKEYQKELIFSMSVKLSNSLEPLKKRVNEETLKKIITNTKESYLKFVISKEFITKAKEEIELISSIIPNCDIYLMPMGDSAYEINKHSESVINMAINSGYKYCDRLHIRVWDNKRGV >NC_014166|479314:489352|480777_481716_-|WP_013134304.1|DBSCAN-SWA MSTYLTFEEKIKAIEEDIIVAKSKSDEHAVEILDKKLEKEVEKTFKNLTDYQKLQLARHPDRPYALDYIRGLLTDAYEIHGDRHFTDDNAIVCYLGKIGDEKVVVIGEQKGRGTKNKLKRNFGMPSPEGYRKALRAAKLAEKFNLPILMLVDTPGAYPGIGAEERNQSEAIAKNLYEFSDLKTITISVVIGEGGSGGALAISIADKLAMMRYSVYAVISPEGCAAILWNDPAQAETAANSLKITAESLKSLNLIDDVINEPLIGAHRSKDEAIKALADYFLESVKELRNMSQEERYEKRYEKLMSLGSFSQK >NC_014166|479314:489352|479314_480307_-|WP_013134302.1|tRNA|DBSCAN-SWA MKEWIEKIESADSIEALENLRIEILGKKGFLTKEFARLKDIPNEEKKAFAQDLNTKKIEITNALESKKEILEKIELNKKLEAERIDVSRFNNKLTCGAVHPVVDTMDKIISYFQNLNFAVEEGPLVEDDFHNFEALNLPKYHPARDMQDTFYNKDYSLLRTHTSPVQIRTMLAQKPPIRMIAPGTVFRRDYDITHTPMFHQIEGLVVDDSDKISFSNLKHVMEEFLKHMFGNVEVRFRPSFFPFTEPSAEVDISCVFCKGDGCRVCSHTGWIEILGCGIVDQNVFKAVGYEDMSGYAFGMGIERVAMLIHNIGDLRSLFESDLRLLGQFK >NC_014166|479314:489352|483457_484201_-|WP_013134307.1|DBSCAN-SWA MKFTGSNVLVTGASRGIGAQIAKTLASHGLKVWINYRSGADAASKIQEEIEAAGGKAAIIKADVTNEDEFVSAINTIIDSDGELSYLVNNAGITKDKLALRMSVQDFNDVISANLTSAFIGCKAALKVMGKKRFGSIVNISSIVGEMGNPGQTNYSASKGGLNAMTKSFAKEAASRSIRYNAVTPGFIQTDMTDELKDEVKAEYEKNIPLSRFGKPSEIADAVAFLLSDHSSYITGEILKVNGGLYV >NC_014166|479314:489352|483149_483380_-|WP_013134306.1|DBSCAN-SWA MALLDDVKEVVVEQLDCDPAEVKEDSKFIEDLGADSLDVVELVMALEEKFDIEIPDEDAEKILTVSDAIKYIEDNK >NC_014166|479314:489352|481757_483017_-|WP_013134305.1|DBSCAN-SWA MKRVVITGLGTINSLGHNVNESFDAVVAGKCGIRDITLFDASEYSVKFAGEVKDFDPTTVMDKKEVKKADRFIQLGIKAAKEAMLDSGFTSEENNKVSDELSPRFGVISASGIGGLSTIEKNSVVCDTKGPRRISPFFIPSSLVNMLGGFISIEHGLRGPNLSHVTACSASTHALSDAVKTIALGGADSVLVVGAEAAICGAGIGGFAAMKALSTRNDDPQTASRPFDKDRDGFVMGEGAGALVVETLDSALARGAKIYAEIIAFGESADANHITAPVMDGPLRAMRAAFEMVKSNTGEYPKIDYINTHGTSTPVGDGNETKAIKELFGGKENCPPVTSTKGQIGHCLGAAGAIEAIFTIKSLNEGIIPPTINMINPDEECDLDYVPNVARKAELTTVMSNNFGFGGTNGSIIFKKFIK >NC_014166|479314:489352|488680_489352_-|WP_013134314.1|DBSCAN-SWA MLGTKILFLEDDKLYQETIKDLLEEENFIIDTCSNGEKFLNKIYDNIYDLYILDINVPQIDGYEIMRILNEYEDETLRLVLTSISNSIIRSFKSGCDGFLNKTGNNQELILRIQSLIKRSYRTYHQDIIISENLSYNIFSKELFYNQEPLEMEPQTLLVLNYLIKNRGNFVSKESLEKNVYPSNSNSKADVIRYHIWHLRKILGVDIIESQKNRGYRLKPIGV >NC_014166|479314:489352|485009_485546_-|WP_013134309.1|DBSCAN-SWA MKWNISKEFDFCYGHRVWSQELNPDFSLDTCLMCRHLHGHQGKVIVHLESSSLKNGMVTDFKHLNWFKKFLDDTLDHKFVLDLNDPLFETLLPHFKNKEELFFHEEGFYTFDLNSIKDEPIHIRELYEGYVLVDFVPTSENLSAWLLEIIQTKMNELPIEVSHVEFLETPKSKSTVYA |
13 | Campylobacter_virus(28.57%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
932132 : 939913
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_014166|932132:939913|DBSCAN-SWA ATTATTCCTTCTTTCTGATCCTTAAAAATGAGGCAAATTTTGGTTTACCGTTTTTTGTTAAATCATAATATTTAAATGTAATTTGTTCTCCTACTTTTGGTGGATTTAATCTCTCTTTATCGCTAAATCCATTGCCAAGATTAAAAATAATTCCATTATTTAATTTTATAGTTAAACTTTTCATTTTTTTATTATTGTAGTTTATTTTTTGAACAATTCCCTCTTCATCATAAAATTTTTTAACTTTTAGAGAATTTGCACTTCTTTTGTTTATATATTCAAGATTTGGATTTTTTATTATGACTCCTTCACCTTTTAATAAAACAATCTTTTCTAAAAAAGCATCTAACTCTTTCTTATTTCTGCATTTTATTTGTTTGATTATGTGTACTTTTACATTTGGATTTTTATCAAACCAATTTTTAACTTTCTCTAGGCGATTGTAAAAATTACCTTTGGCATTTGGGGCTTCAAAAATATTGTATGTTATTTCACTCCATTTTGAACTTGGAGTTTTATCTAAAACTATGCTTTGAATATTTTCAAAATCATCTCTTTTACTCCAAAGTTCACCATCAAGTTCAAAGGGTGGAAAATTGTGTGTAAAAGAGCTTGGTACAAATATCTTATTTCCATTTTTAGTGTATAAAAACTTTCCATCCCAATAGGCTCTTATTCCATCTAGTTTTTCACTCATAAGCCAGTTTTTTATATCTTGATTTTTATAAATTTTTGGCTTTTCTAAATTTAAACAAAAGATATTTGAGACGATAAATAATAATATTAATATAATTTTCATACAAACTCCAAATATAATATTAAAAATTATATTTTAAATTATCTGATTTTATTATAAAACCGTAACTTAATTTTCGATAGAATAAAGCCCATTTATGTAAAGTAGGTAAATATGAAATATACAGAATATGATTTTAATGAAAAAACAATTTTAATTACAGGGGCTGCAGGATTTATTGGCTCAAACCTATGTTTTTATTTTCAAAATAATTATCCAATGGCAAAGATTATTGCTTTAGATTCATTTAGAAGTGGTGAAACCCTAAGTAATGGTAACTTAAAGTCTTTTGGACACTATAAAAACTTGTTAGGATTTAAAGGAACAGTTATTAGTGGGGATATCAATGATAAAGAACTATTAAATCAAATTGACGAAGATTATGACTTTGATTTTATTTTCCATGAAGCTGCTATTTCAGATACGACAGCAAGTGAGCAAGACTTGATGGTAAAAACAAATGTTAATGCCTATGAAGATTTATTAAAAATGGCAATAAATCATAATGCAAATATGATTTATGCAAGTAGTGCAGCAACATATGGAGATGCAGCATCTCCCCAAACAGTTGGAAATGAAAATCCAGGAAATGTTTATGGCTTTTCAAAACTTATGATGGATAATATTACTTATGATTATTTGAAAAAAGATTTAGATATCTCTATTGTAGGTCTTAGATACTTTAATGTGTATGGTCCAAGAGAGTATTATAAAAATAAAACAGCTTCAACTGTAATACAATTTGGACACCAAATATTAGCTGGAAATACACCAAAATTATTTGAAGGTAGTGATAAAATACTTAGAGATTTTATTTATATAGAAGATGTAATTCAAGCAAATATAAAAGCAGCAACTCCTAAAAAAAGTGGAATTTATAATGTGGGAACTGGAAAAGCTAGATCTTTTCAAGATATAGCAGATATCTTACAAAAAGAGTTAGGTACAAATTTAGGAACAAACTATATTCCAAATCCATATATCGGACAATACCAATTTCATACAGAAGCAAATATAGAAGATACAAAAACTTATTTAGAGTATGCTCCAAAATATGAGATGGAAGATGGAATAAAAGATTATATCTCAGAGATAAAAAGAATTTATGAGGTGGAGGTTAAATAATGGAAAGAATTTTACAAAATGAAAAAAAGCCAAATATATTAGTTATTGGTGATTTAATGGTTGACCACTACCTATGGGGAACTTGTGATCGAATCTCACCTGAAGCTCCTGTTCAAATTATTGATATACAAAATGAGACAAAAGTATTAGGTGGAGCTGGTAATGTTATTAGCAATCTTTTAAGCCTTGGAGCTGATGTTGGTGTTTTATCTGTTGTTGGAGATGACAGTGTTGCAGAAGAGGTGAAATACCTTATTGATGCAACAGATGCTAAAAGTTTTTTAATACTTCAAAAGGGAAGAAAAACTTCTAAAAAATCTAGAATTATGGCATCAAAATCTCAAGTTGTAAGATATGACCATGAGAGTAAAAACAATATCTCTTTTGAATCAACTGATAAAGTATATGCAAAACTACAACAAATAGTTAATGGCTATGATTTAATTTTATTATCAGATTATGGGAAAGGTGTTTTAACAAACGATTTAACACAAAGAATCATTAAAATAGCAAAACTAAATAATAAAAAAGTAATAGTAGATCCAAAAGGTACAAACTATGCAAAATACTCAGGGGCATATTTTTTAACTCCAAATAAAAAAGAAGCAGAAGTAGCAACTGGTATTAAAATTGATTCAAGTGATAGTTTACGTGATGCCTTAAAAGAGTTACAAAAAATAGCTAATTTAGAGATGTCTGTAATTACTTTAAGTGAAGATGGAATAGCTGTTTTAAAAGATAAAGAGGTTACTGTTAAACCAACTGTTGCAAAAGAAGTATTTGATGTAACAGGTGCTGGTGATACTGTTTTAGCCTCACTTGGTTATGCTTTATCTATGACTGATGATATTTATGCTGCCTTAGAGTTCGCAAACTTAGCAGCAGGGGTAGTTGTTGGGAAACTTGGAAGTGCGACAGTAACTCTTGATGAGATAGAGGATTATAAAGCAACACTGCATAAAAGCTCTATAGACTTACATATTAAAACAGTTAAAGAGATAAAAAAAGTAGCAAAAAGATTAAGAAAACAAAATAAAAAAATAATCTTTACAAACGGTTGTTTTGATATTTTACACAAAGGACATGTTTCATATTTAAATAATGCGAAAGCCTTAGGTGACATATTAATAGTTGGTTTAAATTCAGATGATAGTGTAAGAAGATTAAAAGGTGAAAATAGACCAATAAATAACCATGATGATAGAGCTTATATTTTATCAGCTTTAGAGTGTGTGGATTATGTAGTGATTTTTGATGAAGATACACCATATGAATTAATACAAAGGGTAAAACCTGATGTTTTAGTAAAAGGTGCTGATTATGAAGGTAAAGAAGTAATTGGATCAGATATTGCAAAAGAGACAGTTTTGATTGACTTTGTAGAAGGCAAAAGTACAACTTCAACAATAGAAAAGATTTTAGGTAAATAATATGAAAAAAACAATAGAAAAAGAGTTTCAATCACATTTAGAAACGATTCAAAAAGTAATCGAAACTATGAGTGAACCTTTAGAAAAAGCTTCAAAATTAGCAGTTGATACATTAAAAGCTGGAAATAAAATATTAATTTTTGGAAATGGTGGAAGTGCTGCTGATGCACAACATATAGCAGCTGAACTAACAGGTAGATATAAAACTGAAAGAAGAGGTTTACCAGGTATTGCTCTTACGACAGATACAAGTGCATTAACAGCCATTGGAAATGACTATGGTTATGATAGAGTTTTTGATAGACAAGTTGAGAGTTTAGCAAATGAGGGTGATTTACTTATAGGTATTTCAACTTCTGGTAATTCAAAAAATGTAATAAATGCTTTTGAAGTAGGTAAAGATTTAGGTTGTAAGATTATTGGACTTACAGGAAGAGATGGAGGGAAAATGGATTCTTATTGTGATGTTAATTTAATAGTACCATCAAATGATACACCAAGAATACAAGAGATGCATATACTTTTTGGACATACTATTTGTCAACTAATTGATGATGCATACGAAGGGAACTAGATGAGTTTAACGCAAGAGCAAAAAGATTTAATTTTTAATTCAATAAGAGATATAAAAGACTTCCCCAAAGAGGGAATAATATTTAAAGATATTACAACTTTATTAAACAACAAAGAGGCTTTTAAAACTTTGATGGATCACTTTGAAGAGAGATATAAATCTTATAATTTAGATTATATTGCTGGTATTGATTCAAGAGGTTTTATCTTTGGAGCTGCACTTGCTGATAGACTTGGTATTGGTTTTGTTCCTGTTAGAAAAAAAGGAAAACTACCAGGTACTACTGTTTGTGAAAAATATGAATTAGAGTATGGCTTTGATGAGGTAGAGATTCATCTAGATGCCTTTCCTATAAAAGATGCAAGAGTTTTATTAATAGATGATTTAATAGCAACAGGAGGTACTGCTACTGCTGCTGCAAAACTTATCAAACATGTTAATGCACAATTAGTTGAAGTATGCTTTTTATTAAATCTTAAATTTTTATCTGGGGACAAAAAAGTAGCTGAACATGCCCCTGTTTATTCAGTATTGGAGATATAATGCAAGAAATATATATACCTAAAAAAAGTAATTTTGATCCAGATGAAAATGGTCATTTTGGTAAATTTGGTGGAAGATATGTTCCTGAAACATTGATGCCAATTCTACTTGAACTAGAAGCTGAATACAAAAAATATAGATTTGACAAAGAATTTTGGGGCGAAGTAAATGAACTATTAAGAGAGTATGTGGGAAGAGAAAATCCTTTATATCATGCAAAAAATATCTCTGAAGAAATTGGTGCAAAAGTTTATCTAAAAAGAGAAGATTTAAACCATACAGGTGCCCATAAGATAAACAATGTAATTGCACAAGGATTATTGGCTAAAAAACTTGGGAAAACAAAAGTTATAGCTGAAACTGGTGCTGGACAACATGGAGTTGCAAGTGCAACTATTGCTGCACTTTTAGGCTTAGAGTGTACAGTATTTATGGGTGCAAAAGATGTAGAAAGACAAGAACTTAATGTATTTAGAATGAAACTTCTAGGTGCTAAAGTTGTAGCCGTTCAATCTGGAAGTAAAACTTTAAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_014166|932132:939913|938494_939913_+|WP_013134753.1|DBSCAN-SWA MKITLSNDSIKKLDTAVEISIVLDLENVNKYDKEILDDLNFKAKDEEVVFLVESKKIYVGCEEESYDAIAIAISAAMKKFNSTKYKDAKVEIFGEEKDTLKALVEGAILGSYTFEKYKSKKEKELKKELIVCCKVSKELEEILEQSTHIANSVNKVRNFVNTTPQDFYPEIMAKEAKKVAKENDIICKIQGEEFLEKNGMNAMLSVARASVHEPKLIHMAYKPKDPVRKVVLVGKGLTYDSGGLSLKPADFMVTMKSDKSGGCAVIGILNAVAKLNLPIEVHGIIGAVENMIGGDAYKPDDVLVAKNGKTIEVRNTDAEGRLVLADCLCYAQDKIKDFDYIFDYATLTGACVVGVGEYTTGIMGNNTVLKRDAVCNALSSGEYATTLPFNRFLRKTIKSEIADICNIANTRYGGAITAGLFLDNFIYDENKDKWLHFDIAGPAFVEKAWGYNPHGASGAGVRMTVEFLKNLL >NC_014166|932132:939913|936607_937810_+|WP_041660335.1|DBSCAN-SWA MYIPKKSNFDPDENGHFGKFGGRYVPETLMPILLELEAEYKKYRFDKEFWGEVNELLREYVGRENPLYHAKNISEEIGAKVYLKREDLNHTGAHKINNVIAQGLLAKKLGKTKVIAETGAGQHGVASATIAALLGLECTVFMGAKDVERQELNVFRMKLLGAKVVAVQSGSKTLKDAMNDAIRYWVTNARDTFYIIGTVAGPHPYPMMVRDFQAVIGWEARRQALQKDGRLPDYVLACIGGGSNAIGIFSHFLEDKEVTCIGIEAGGLGTSTDKHGCSLEKGSPGILHGQCSYLLQDEDGQVLEAHSFSAGLDYPGIGPEHSFHKDNKTVQYDSITDEEALDAFVWLSRREGIIPAFESAHAIAYLKKAKEKFQGKTVIVNLSGRGDKDMVQAKDLLNFE >NC_014166|932132:939913|932132_932930_-|WP_013134746.1|DBSCAN-SWA MKIILILLFIVSNIFCLNLEKPKIYKNQDIKNWLMSEKLDGIRAYWDGKFLYTKNGNKIFVPSSFTHNFPPFELDGELWSKRDDFENIQSIVLDKTPSSKWSEITYNIFEAPNAKGNFYNRLEKVKNWFDKNPNVKVHIIKQIKCRNKKELDAFLEKIVLLKGEGVIIKNPNLEYINKRSANSLKVKKFYDEEGIVQKINYNNKKMKSLTIKLNNGIIFNLGNGFSDKERLNPPKVGEQITFKYYDLTKNGKPKFASFLRIRKKE >NC_014166|932132:939913|934051_935482_+|WP_013134748.1|DBSCAN-SWA MERILQNEKKPNILVIGDLMVDHYLWGTCDRISPEAPVQIIDIQNETKVLGGAGNVISNLLSLGADVGVLSVVGDDSVAEEVKYLIDATDAKSFLILQKGRKTSKKSRIMASKSQVVRYDHESKNNISFESTDKVYAKLQQIVNGYDLILLSDYGKGVLTNDLTQRIIKIAKLNNKKVIVDPKGTNYAKYSGAYFLTPNKKEAEVATGIKIDSSDSLRDALKELQKIANLEMSVITLSEDGIAVLKDKEVTVKPTVAKEVFDVTGAGDTVLASLGYALSMTDDIYAALEFANLAAGVVVGKLGSATVTLDEIEDYKATLHKSSIDLHIKTVKEIKKVAKRLRKQNKKIIFTNGCFDILHKGHVSYLNNAKALGDILIVGLNSDDSVRRLKGENRPINNHDDRAYILSALECVDYVVIFDEDTPYELIQRVKPDVLVKGADYEGKEVIGSDIAKETVLIDFVEGKSTTSTIEKILGK >NC_014166|932132:939913|937818_938514_+|WP_013134752.1|DBSCAN-SWA MRDRLKNNSGKILFLVVVIFFSFIAYELYKAPVSGLEDKFLYLLKVYGYIILFAWSILEGELGLIMAGLMAHDGSMHLYLAIFVAGLGGFVGDQIYFYIGRFNKAYVHKKFSGQRRKFALAHLLLQKYGWPIIFAQRYMYGMRTVIPVSIGLTRYSAKMFAFINILSAWCWASITIIPVWYFGEEILIVIKFAKEHWYFAAPFAVLIGGGIIYYFNQASKRKEKVNENNPK >NC_014166|932132:939913|936056_936599_+|WP_013134750.1|DBSCAN-SWA MSLTQEQKDLIFNSIRDIKDFPKEGIIFKDITTLLNNKEAFKTLMDHFEERYKSYNLDYIAGIDSRGFIFGAALADRLGIGFVPVRKKGKLPGTTVCEKYELEYGFDEVEIHLDAFPIKDARVLLIDDLIATGGTATAAAKLIKHVNAQLVEVCFLLNLKFLSGDKKVAEHAPVYSVLEI >NC_014166|932132:939913|933041_934052_+|WP_013134747.1|DBSCAN-SWA MKYTEYDFNEKTILITGAAGFIGSNLCFYFQNNYPMAKIIALDSFRSGETLSNGNLKSFGHYKNLLGFKGTVISGDINDKELLNQIDEDYDFDFIFHEAAISDTTASEQDLMVKTNVNAYEDLLKMAINHNANMIYASSAATYGDAASPQTVGNENPGNVYGFSKLMMDNITYDYLKKDLDISIVGLRYFNVYGPREYYKNKTASTVIQFGHQILAGNTPKLFEGSDKILRDFIYIEDVIQANIKAATPKKSGIYNVGTGKARSFQDIADILQKELGTNLGTNYIPNPYIGQYQFHTEANIEDTKTYLEYAPKYEMEDGIKDYISEIKRIYEVEVK >NC_014166|932132:939913|935483_936056_+|WP_013134749.1|DBSCAN-SWA MKKTIEKEFQSHLETIQKVIETMSEPLEKASKLAVDTLKAGNKILIFGNGGSAADAQHIAAELTGRYKTERRGLPGIALTTDTSALTAIGNDYGYDRVFDRQVESLANEGDLLIGISTSGNSKNVINAFEVGKDLGCKIIGLTGRDGGKMDSYCDVNLIVPSNDTPRIQEMHILFGHTICQLIDDAYEGN |
8 | Mimivirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1691888 : 1747558
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_014166|1691888:1747558|DBSCAN-SWA 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60 | Klosneuvirus(25.0%) | plate,tRNA,integrase | attL 1686986:1687003|attR 1744052:1744069 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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