Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_017298 | Clostridium botulinum F str. 230613 plasmid pCBF, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NC_017297 | Clostridium botulinum F str. 230613, complete genome | 15 crisprs | csa3,DinG,c2c9_V-U4,WYL,DEDDh,cas3,cmr6gr7,cmr5gr11,cmr4gr7,csx1,cmr3gr5,cas10,cmr1gr7,cas6,casR,cas3HD | 3 | 17 | 6 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_017297_1 | 1046093-1046380 | Orphan |
III-B
Consensus repeat of NC_017297_1
|
4 spacers
spacers of NC_017297_1
>1.1|1046121|38|NC_017297|CRISPRCasFinder TCTTGAGTAAAAAATAAAACCTCATGTCCTTCTAGGGC >1.2|1046187|37|NC_017297|CRISPRCasFinder GATACCTGTTGTGTAAGTTTAGCTATCTCTGGATTGT >1.3|1046252|37|NC_017297|CRISPRCasFinder ATATATGCACTACGGTGTTTTACATTATTCGGACTAT >1.4|1046317|36|NC_017297|CRISPRCasFinder AAGGTAGATATGGCCATATCTACTTGCGGAGCCTAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017297_1
The CRISPR arrays of NC_017297_1 >merge|NC_017297|1|1046093-1046380|CRISPRCasFinder TGAACATTAACATGAGATGTATTTAAATTCTTGAGTAAAAAATAAAACCTCATGTCCTTCTAGGGCTGAACATTAACATGAGATGTATTTAAATGATACCTGTTGTGTAAGTTTAGCTATCTCTGGATTGTTGAACAATAACATGATATGTATTTAAATATATATGCACTACGGTGTTTTACATTATTCGGACTATTGAACATTAACATAGGATGTATTTAAACAAGGTAGATATGGCCATATCTACTTGCGGAGCCTATTGAACAATAACATAAGATGTATTTAAAT >NC_017297|1|1|1046093-1046380|CRISPRCasFinder TGAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT TCTTGAGTAAAAAATAAAACCTCATGTCCTTCTAGGGC TGAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT GATACCTGTTGTGTAAGTTTAGCTATCTCTGGATTGT TGAACAATAACATGATATGTATTTAAAT ATATATGCACTACGGTGTTTTACATTATTCGGACTAT TGAACATTAACATAGGATGTATTTAAAC AAGGTAGATATGGCCATATCTACTTGCGGAGCCTAT TGAACAATAACATAAGATGTATTTAAAT
>NC_017297.1|WP_134865364.1|1045878_1046031_-|hypothetical-protein MLKNFFQPFAIFYKDRDKAYLKAYISMPRIYFKIKCGLKILLLIIRLISY >NC_017297.1|WP_003401789.1|1045312_1045870_+|bifunctional-adenosylcobinamide-kinase/adenosylcobinamide-phosphate-guanylyltransferase MSDKNKVALITGGVRSGKSEFAESLLQNEKSVLYIATAKITDKEMEHRVEKHKERRNSTWKTYEGYKDLGKIIKYYDEKNILLDCVTVMTTNLMFHKKIDYENIKEEQLDEILEGIKKEFYDLIISVKEENKNIILVTNEVGYSIVPAYKLGRIFRDFQGIINKFIASLSDEVYLVTCGIPLKIK >NC_017297.1|WP_011987836.1|1043438_1045034_+|LexA-family-transcriptional-regulator MKLESGQNRIVKSKHLGYGLLRGSLGTGKTTAAIYRGIYLKNQYCMYDKDKVLILSKHEENLNYIKNIYDEAEKTGVQYITLFSYIEDKLYFSVIYKIINKYFWEYIENNNLQCKIASEEEKRAIIEECINDIKNEYKKLKYIDIKYSKFFLEEIQWMKDCMYYELEEYKKADRIGRKTKKGEGPQRIIKNSKIREAVFKIMLLYNEKLKDKNLLDYSDVVSMALKEASKNKENKFNHIIVDEAQNFTKLELKFIEALGRKNIYSSILFIADKEKNSNPKGWITKGRKLNNLQLGFEFKRFNLNKKVSINLKKNIDDCNLKRKVSNIDTKNEAVSNIDNANLEDKVLDKNIKNEWHKDRVNYDMDKFEYVDMKHRRSYEFSRGLGSNEEFIVEDQGSKEEYKEDELTKLPVFNDIAAGEPILMNPCVEGEFNIPKYWVRGMKNCFILKVKGDSMIGANIEDGDHVVIKRQQMAENKDIVAVNLEGSATLKRLLIKKSGAVLMPENKKYKPIEIREEGASIIGIAVGIIKGK >NC_017297.1|WP_011987835.1|1042813_1043359_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MGKIKQAKYNINGKTIIIRHAEVQDAEQLINVTKKVNQETDFLLKDPEEVCLTIKEEKEFIQSQIDSQVDLLIVPEIDGRIVGICSLNGNTNKRIRHCAQFGLAVEKEYCGMGIGKNLMKSGIEWAKENGIFRITLEVDINNYRAISLYLKLGFEIEGTLRNDKMLLDGSYTSGYAMALLL >NC_017297.1|WP_011987834.1|1040764_1042471_+|hypothetical-protein MDRFSFLKIEWPEIYQIICNVEEKSKEDSNTTLIKLAQIAELITKYILKENHIEKNTELLDEINLLRDCYNLNDNIADFFYKIIIVSNKAIYENYSDSIIAKSFLDKMFEILVWFAIEYGKTDYRKVDLSNMIPEDKDIFNKYIKSKSYNDTEKNIENETMIQPFTIDNEEFFKEENNDDINRYEQDIFETKEEFHKRIKDHEIFTLGRIFIKKSNINGTDEIVAFPFSVYKSIQIKIPIIDMLYIERAEFENLSIEEEEYTVFSKLDIINDKICIDINNIYIGVNNNKCKVHAVVLDVSYYESYEKYRNIIYSKKSIPIGMIKLNKNKYDINKNEMPVTINYYDWIQKYILNTKAYIEIDRYEAKTLCKENLYYILNGKLDIFDKKLLIREYYIQSKSLDKNFRINLHSSDTMNKLRCLVDKEEILAMNIIGEMYYKEQNYKEAMYWYKKASEKGNSTSMNKIGVMYYEGKGVEQDYKKAMYWYKKSSQEGNFTAMSNIGFMYYSGQGVTQDYKKAMYWYKKSYKEGNSGVMRDIGSMYYEGKGVIKDYKKAMQCYKKASQIDNFIK >NC_017297.1|WP_041173203.1|1039811_1040360_+|biotin-transporter-BioY MDKKLKVRDMIYSALFATIIGVSSYIIIPLPISPVPITAQSLAVMLAGCVLTPIQVVLSMITFLLMGIIGIPVFSGGTAGFGIIVGKTGGYLIGFLVGAIIISLLVRKNKSLVNMMIACFIGGIVVVHILGSAWLGQVTSIGIKKAFLLGSAPFIPGDLIKAVVAVLIGRKLSKEMKRIGTQ >NC_017297.1|WP_079992165.1|1038428_1039460_+|HAMP-domain-containing-histidine-kinase MMNNKISVKMVVAFSLIVFFIVTSAVVISALVVVFLSRFNVFTQPNPLILLGWLGIISIMVSTAIAQIIGKKVLSPISDLNKATKEVAKGNFNTRLSENSWTDEIREMAHSFNIMTHELGNIETLRDDFISNVSHEFKTPISAIEGYATLLQDDELSDEERKEYIHKILISTKRLSSLSGNILQITELENQKILPLKQKYYLDEQIRQTILLFEYQWTKKNITLDINLDNITYIGSKELLAQVWQNILGNAIKFSHQNGTIQVTLTQTNEEVLITIKDNGIGMSEEVKDRVFEKFYQGDSSHYSDGNGLGLALVKRIIDICEGTIKISSHEEVGTEFTVKLPK >NC_017297.1|WP_011987831.1|1037760_1038432_+|response-regulator-transcription-factor MFRVLVVEDDPALRKLFCTVLNKNGYKSIEAKDGDSALDILYREYIDLIISDIMMPNMDGYTLTKLIRESNNNVPILMITAKETFSDKQEGFRVGTDDYMVKPIDVNEMILRVGALLRRSQIINERKIVIGETTFLYDFLSVKYNNKELVLPQKEFYLIYKLVSTPNKIFTRQQLMDEIWGIESETDPRTVDVHINRLRDRFKDNKDFNIITIRGLGYKVVKQ >NC_017297.1|WP_014519207.1|1035240_1037601_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein/permease MLQIKDLKKVYTTGEFKQTALDGVSIDFRQSEFVAILGPSGSGKTTLLNMLGGLDQYDSGDMIINGLSTKKFGESDWDTYRNNSVGFIFQSYNLIPHLSIVDNVEMGMTLSGVPKSEKRQKATYVLEKVGLGNHIHKKPNQLSGGQMQRVAIARALANDPEIILADEPTGALDTQTSQQIMDLIKEIAKDKLVIMVTHNPELAEEYADRIVSFSDGKIVSDTNPFVSENNSNDYKPKKTSMNFLTALKLSGNNIVTKKWRTALTAFASSIGIIGVALVLSLSNGFNKQINEFEKDSLSNYPISIEQNSMSLGMSPSSKSKDKEKTEFPNKSMIYPYDSSKNATVHANAISTEYVDYIKKIDSSLINGISYTRNVNMNILKKQDGKVVSMNTSAAAFSTYPSKGDSFETDYLKSYYDVLAGSYPKNEKELVLVVDKYNQVDTNILEALGFSANSKNINFDSMIGTEYKLIYNDDYYTQSGKYFTVNGDTTNLENLYNNKNAVTLKISGIIRIKEDANVSNLSTGIVYSDQLAQDFIENAKNSKIVLAQKEAKYNVMNGNLLTEKTSTTTAAVHGAPNMTTNITSNVETKDDVLASLGATSSPTSISIYPVNFEAKDNITNYLDDWNKKLKEEDQIVYTDMASMITSLTGNIMDGITIVLVAFAGISLVVSMIMIGIIIYISVLERTKEIGVLRALGARKKDITRVFNAETFIIGFCSGGLGIAITYLLTIPVNSILYKFTDLNNVAQLNPLHAIALVITSIVLTMIGGAIPSKMAAKKDPVIALRSE >NC_017297.1|WP_011987829.1|1033269_1034877_+|hypothetical-protein MKKKIYSSFIVLSLIISMALIYFLMPVFSVKFYSFYIVFIIIALLLSINVSLNKGKESSKIYGIPVILIGLFIVMFIISLPIFRASSYKKLLPTPKYEEFSKNITPIDIKEIPTVNQKYAELLADKKLGEETSLGSKVELGTLTLQNVNGKLYYVAPLVHSGFMKWLLNDSTPGYITVSATDDKDVKLVTKLNGKDIKIRYQPKGFLNDDLKRHIYLKGTMNKGITDLTFELDDKGNPYYTATIYENKVGMSGQKAVGTAIVNPETGEVKKYTVENTPKWVDRIQPQSFVENNLKKWGKYIKGFFNFSGQDKLKATEGTGVIYNNDRCYYYTGLTSVGKDESSIGFALVDTRTQQTRIFKIAGATETASMKSAEGKVQNLGYTSTFPILINVDNIPTYFTTLNDKNDLTKMFAMISVTDYNIIGTGENITECKSNYIKNLASKGNLINVGSTGKEENITDTIERINSYVVGNSTIYTFILKDHKDKIFNAGISISNELPITKEGDKVNIRYVDTKQDTINITSFDNIEFKQQSIK >NC_017297.1|WP_011987837.1|1046491_1047256_-|MerR-family-transcriptional-regulator MHYKIKEVADMAGISVRMLHHYDKIGLLHPESVSAAGYRLYSDENLDRLQQILFFKELNFPLQEIKIILDSPNFDKKEALKVHRQLLLEKKIRLEKIIQSVDKTISNMEGEFKMDKKETLNVFSMTEIEEHQRKYSEEIKEKYGNTSAYKESNKKTSKYTKEDWSNIMKGWDEIFKKLANLMDKNPDDKEVQESVHQFREHISKNFYDCTPEIFRGLGELYVNDERFTTNIDKYKTGLSKFLKEAINVYCDNIK >NC_017297.1|WP_011987839.1|1049445_1050408_+|cobalamin-biosynthesis-protein MYLNVTGNFIDIIIAIFIDWIIGDPYWFPHPVIYIGKLINFLEKKFRARVKNEENLKIYGEVIVMIVCFASFLIPFMILQAFKFNFYIYHGLNILIIWTTLAAKCLHEEAIKIYYALYKENIEEARLKLSYIVGRETKDLIGNEIMRADIETVAENASDGVIAPLFYAIIGGAPLAMMYKGINTMDSMLGYLNDKYRYIGFFPAKVDDIFNFIPARLTGILMCISAPIVGGNPFKSFKIMIRDRKNHKSPNCAYPEGATAAALKIQLGGTNVYFGQVVEKPTIGDKIKELAPIHIKESIKLMYASEALMIVMCAIIFKLF >NC_017297.1|WP_011987840.1|1050626_1051715_+|aminotransferase-class-I/II-fold-pyridoxal-phosphate-dependent-enzyme MHGGDIYTEGILKGKELIDFSSNINPLGLSDSFKDNLEEALSWVQVYPDIQYRNLKRNLIDYLSFSLGYFYKEKVEKPNIKEENLVLGNGAVEIIDLAISNLKSISILVPSFVEYELCAKKWNVQIDYCNLNEDMTYNYENIKKSLEKTEGIILGNPNNPNGSVIDKESFIYILDYCEKNNKIVILDEAFIEFTGKNSFSFLNLYKRYKCIFIIRALTKFFSMPGIRFGYGISFNNEFLNKIREKQNPWNINCFAEIAVKYVLKDEEFIEKSINYIEKERTFMYENLKKSHLFHDVYSTYSNFILCKLKRITGEELKEKLLDKGFVLRICKDFKTLNDDYVRFAIKTRELNKNLIHVLKEIN >NC_017297.1|WP_011987841.1|1051898_1052618_+|energy-coupling-factor-ABC-transporter-permease MKKKYLFLLTTALVLALSQSAYAMHIAEGFLPPKWAALYFVLSAPFIVIGIKHIRQKTKKNKDLKMLLAVVAAYAFILSAMKIPSVTGSCSHPTGTGLAAIIFGPFVASVVGVIVLLFQAILLAHGGITTLGANTFSMGIVGPIVSYLIYKGLKNKNQKLAVFLAASLGDLATYTVTSLQLALSFPAKTGGAMAAFAKFATIFSLTQIPLAIIEGLITIMIFDFMMKYSKEELKTLSEV >NC_017297.1|WP_011987842.1|1052621_1052921_+|energy-coupling-factor-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKQNIIITIVSVVVILASLFIGGARGGEFAGADDQAEGIIEEMNKNYEPWFESIWEPPSGEIESLLFASQAALGAGVIGYYIGKKKNAKNNNASIKNQ >NC_017297.1|WP_011987843.1|1052883_1053582_+|cobalt-ECF-transporter-T-component-CbiQ MLRTIMLLSKTSKLSNIHPLEKAILSIIPIVILGFTQNYIIVFCNILFFLFMNFISKNNKKIFTKITLEVTAFAAISSITFVFDYGIVYTLTLIFKSVSAGLCLSFFSLTTPIDDMLYCLGKKEYLKDMCDIAKGMERFLVVINDEYNILYSSIKSRGGFDSFKLKIRNTGKMAALLFINTLSRWKIIKEGLDSRGYVGYVPYLDRDFDFSYIRFFSILSYIILMLLLVIFF >NC_017297.1|WP_079992166.1|1054014_1054677_+|NAD(P)-dependent-oxidoreductase MEWINLQEKYNFIALKSKRIRILIVGGGRAAFIKGKSFLDRGCSLYMLAPKFSKGVLDLKNYDNVEFIKNNYDEKYILDKHLVVIATEDEEVNNEIRNNCDALSKLYIDCSDKDKSLCFNSFQRESKTMVLALNNKIGCPKATSFIGEKIKRDLEKYDNYIEYVTYIRSITKNNTMKDEIIDFICSNDFHFFFEKGYGNLILSMFYGGMDFEFYNSHKKK >NC_017297.1|WP_011987845.1|1054645_1055518_+|hydroxymethylbilane-synthase MNFIIATRRSKLAQVQTEIIIDLLNKKHDIECEKLLIETVGDKILEVSLDKIGGKGLFVKDIEVAMLEQRADAAVHSMKDVPYEMPKGFEIIAIPKREDVRDAFISLDNIKFKDLRKGAKIGTSSRRRAAQLKLLRPDLDIVPIRGNVQTRIEKIKKENLDGIILAVAGLKRVNLEHLITDYFDTKEMVPAIGQGALGIEVMEEHPKKELFKDLDHYNSKICVLAERAFMRELDGDCHSTIGAYASIKDNIMHIIGIFERKNKIIKKEITGTKDQYEKLGIALAEHILKD >NC_017297.1|WP_011987847.1|1057261_1057444_+|hypothetical-protein MENNKKCPICGCEEIGEGKLESYMAPTDGSWLSSKVIADICTKCGHILAMRVKNPEKFKD >NC_017297.1|WP_003404069.1|1057705_1058680_+|porphobilinogen-synthase MFRRHRRLRENEAIRAMVRETVIREEDFIYPMFVVEGENIKEEISSLPGNYHYSIDRLEELVEEVKKSGIKGIMIFGVPDHKDECGSAAFDDNGIVQKGIRRLRELMPELYIVADVCMCQYTSHGHCGIIHGHNVDNDESLKYLAKISLSYAKAGADMIAPSDMMDGRVYAIRKILDENNFKHVGIMAYSAKYCSAFYGPFREAANSAPQFGDRKTYQMDPANGREAMLEIEDDINEGADIVMVKPALPYLDVIRMAKDRFEFPLAAYNVSGEYAMVKAAAKQGLIDERRVALEMLTSIKRAGADIIITYYAFEASAWLKEDRK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_017297_2 | 1109484-1109576 | Orphan |
III-B
Consensus repeat of NC_017297_2
|
1 spacers
spacers of NC_017297_2
>2.1|1109510|41|NC_017297|CRISPRCasFinder AAATTCTATTTTACGAATTATTTTATTTGTCATCTTAAAAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017297_2
The CRISPR arrays of NC_017297_2 >merge|NC_017297|2|1109484-1109576|CRISPRCasFinder GTTGAACATTAACATGAGATGTATTTAAATTCTATTTTACGAATTATTTTATTTGTCATCTTAAAAGGTTGAACATTAACATGAGATGTATTT >NC_017297|2|2|1109484-1109576|CRISPRCasFinder GTTGAACATTAACATGAGATGTATTT AAATTCTATTTTACGAATTATTTTATTTGTCATCTTAAAAG GTTGAACATTAACATGAGATGTATTT
>NC_017297.1|WP_011987904.1|1107687_1108542_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MFIYDTLENIGIETLHETFLNAFSDYQVKMDLPLFKFQHMLQRRGYVSKVSIGAFNNETLVGFVLNGVRNWDGKLTAYDTGTGIIEAYRKQGITSNMLLNVRRLFQQMGVEQYLLEVIQSNTSALQLYKKQGFKILRDFECFHLDKNKYNPITTYKVEHVDMINPNDWRELTEFWDFVPSWQNSIDSINAVSDSFIYSIVRFDDNIVGYGVIDKKTGDIPQIAVNKNYRRKGIARSILTDLIKNTESYNINVINVDGRSKSMKDFLLKLGFECGVSQYEMILKL >NC_017297.1|WP_011987903.1|1107318_1107642_+|TfoX/Sxy-family-protein MASNIEFVEYVCDQISGAGDITYKKMFGDYGVYCNEKIIGLICDNQFFLKITKAGKDLLHEAIEAPAYKGAKPSFLIESLDNREYLAKIVSATYKELPMPKSKKTKK >NC_017297.1|WP_011987902.1|1106372_1107218_+|aldo/keto-reductase MQDIKSYTILNNGVKMPWLGFGTYKVENGDTVIQSVKEALKIGYGHIDTASYYGNEEGVGTAIKESRIPREDIFLVSKVWNSEQGYDKTLKSFEDSIKRLGTDYLDLYLIHWPQPLSKETWKALEKLYKEGRVKAIGVSNFLVNHLKWLLEDAEIMPMVNQVEFHPQLIQKDLIEFCSKNNIQLEAWSPLMRGKVFQIELLQELAQKYGKTISQIVLRWDLQMGVVTIPKSINPSRIKENADIFDFEISKEDMDKIQQLDKGLRVGSDPNKVYPCQSISNK >NC_017297.1|WP_011987901.1|1106050_1106251_+|DUF3788-family-protein MYGKKEIEQFESRIDEFSDYMKQIFNETKHYHDGKWLLIRIQDDKYINELIEMIKIKKKPKKKHIA >NC_017297.1|WP_011987900.1|1105393_1105987_+|DUF1349-domain-containing-protein MFRFNTKECEWFFEPKNYLIEEDKVEIITEPNTDFWQRTYYGFRNDNAHVLYVTTDEKYFSFTVKTDFNSTALFDQCGLAIYQNSENWAKACIEFHDNNTSWLGSVVTNHGYSDWATMDIGSSVKSMWYRLSRRGSDYCFENSFDGVNFKQMRIFHLFEGAKEINFGLLACSPSKNSFKATFTEMKITDCLWEEHKA >NC_017297.1|WP_011948662.1|1104797_1105241_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MEIKIIEENKRSFLDLLLLADEQESMIDKYLNRGEMFALYDGDLKSICVVTNEEEGIYEIKNLATYEKYQGQGYGSRLIKFIFEYYKDNCKTMLVGTGDSPLTIPFYKHCGFKISHRIKNFFIDNYDHPIYESGVQLIDMVYLKKDF >NC_017297.1|WP_011987899.1|1104231_1104696_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MNIRMYQLEDCREIVELFYNTVHSINSRDYNSAQLDVWAPKEIDIDSWYKSFSQHYSIVAEESDVIIGFGDLDETGYLDKLYVHKDYQGIGVATTIASELENYAQENHISIVTTNASITAKPFFKKRGYEVVKEQFVERNGQFLKNFIMKKVLG >NC_017297.1|WP_011987898.1|1102852_1103890_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MIKENLNLDKVIDFKKWIKLQESLALVTKAAIIVVDYKGNPVTEHSRCNRFCKAVRSNPDLVKYCHKCDSRGGLEAVRLNKPYIYLCHYNIVDIAIPIIIDGKYIGAIMAGQIKLSDNKDSDFLEQIVITPKNSTARHALKEFKEYYDEIPVLSLKEVQEIANMLFSLCNYLVEEALDKNLISEIYKKTVTPKSEIDSNTLTGYTMKNIENAKKEMSNVLLNSYVKENLSSDSLDISVSNTLKPAIEYIYNHKSENITAKKLAEVCHISPSYFSRLFAKETGKSFSSFISNLKVDWAKSLLEETDMPINEISDELGFNETGYFIKIFKKYESVTPFVYRKYCKKN >NC_017297.1|WP_011987897.1|1101405_1102536_-|glycerol-dehydrogenase MRKAFICPTKYVQGEDELLNLGYFVKSFGESALLIAHKDDIKRVKDKLDSTAKKFGITFVESSFCGECSREEVARLQEIAKNNKCACTIGLGGGKAIDTAKCVAKGNSLIIVPTIAATDAPTSHSAVLYTPDGSFDDYAYFWQSPTVILIDTTVIANAPTRFLVSGMGDALSTYFEARATSNSFSNVNAGLPCGVREGLCAPAKGTNTALTLAKACYKTLLEDGVKAKIASDCNLVTQALENIIETNILLSGLGFESAGLAAAHAIHDGLTILEGTHKYFHGEKVAFGTIAQLVLENAPKEEIDEVINFCLEIGLPVCLEDIGVDSITDEELMEVAKKSCIEEESIHSMPFKVTPEAVAAAIITADTLGKKYKSNK >NC_017297.1|WP_011987896.1|1099634_1101395_-|dihydroxyacetone-kinase-subunit-DhaK MKKIINRPETVVMEMCNGIAMAHPELEFVRKYKVMKKKNINKNKVSLISGGGSGHEPAHAGFIGKGMLDAAVCGDIFASPSQIQIYKAIKATASEKGTLLIIKNYSGDMMNFKNAAHLASEDGIKVDYVKVDDDIAVEDSLYTVGRRGVAGTVLVHKIAGAAAELGFSLEKVKSIAQKAVSNVRSLGFAFSSCTVPAKRTPTFQLAEDEMEFGVGIHGEPGIVREKVATADELAKKIVDSILKDMKIDGSNNEEVALLINGFGATPLQELYLFNNSVTAELAKKNIKINRTFVGNYMTSIDMEGASVSIMKLDDELKELLSKESDTPAFKVSGPVESVEYISLEDNNDIENEVSFDVETCDCHSKIKDKKITLDNMIYIIDKMSEVIIANEVHFCELDSHAGDGDFGMSVAKGFKQLKRDWKHILKEDNMNIGKFLNECSLIIMEHCGGASGPIWGSAFRSAGKQVGDKKELSVSDFAEMMQAAVKGIQSTGERSFGRGAVVGDKTLIDALVPCADLWSESANNNTSIHETFQKGAAAAVKGAKMTEKIVARMGRAGTVGERSIGYPDAGAYGLGVIFTEISNSLK >NC_017297.1|WP_011987907.1|1111843_1114012_+|YhgE/Pip-domain-containing-protein MNRFKNIIKVYKRDIKSLNKNFIAIIIILGVCVLPSLYAWVNIKACWDPYENTSTVPIAVINNDKGTDFGGKELNVGNEMVKKLKSNDKIGWKFTNKKEADMGVVDGTYYASIEIPADFSADIVSVLSDNPKHPEIIYKVDTKENPVAAKITGMAKNTLINEITTTFITTVNKTVFSSINEIGRNLEKNKNEIIKLKESIISMNRNMDLILAGLESVNTNSKNLNGYLSVVRTTFPEITKGLENINSKSSNTNETINQTNNIFNNSLNNINVILKQAISTNNRVQSVLDNLIVLNNESSSNEANSSIANLIMDIDSANKNIDSMIEFLEKINNTKPNTEVSKFIVSLNNVKGALNEEKQKLIKIQEIASNSSKVNENSINELKRNISNTNKQIESVMNVFNSNTRQELSTIINNFKNSIQDASKLIKAGNGLNTQIENLLATSTKGADLSAKLSKELIDKLTEYKGIIGQLSKKLELVSNDDLIQIISILQNNPMLMSQTAAYPFNIKEEAVYDIPNYGSAMTPVYSVLALWVGTLILVSLLKTEVVDFEGSENITIRQKYFGKMLTFTTLAAMQGLVVAVGNKAILGVYTVSFPLMIAFSVVSSITFAIITYTLVAIFGKFGNALAIVFMIIQLAGSGGTYPIQVDPLIFRILQPFFPFTYSIGGFREAIGGPLVSSVILDFIMLILMGSIFVLIGFFLKSPLHHKVSKFDEDFKASGISE >NC_017297.1|WP_011987908.1|1114038_1116198_+|YhgE/Pip-domain-containing-protein MKKAFRIFSRDLKNIVKHPAAIIVVLGLSFIPSLYAWINIKACWDPYANTGNLPIAIVNRDEGMMLRGKYTNVGNGIVENLKGNKNMGWVFVDEWQANYGLNEGKYYALIEIPSNFTRGLASLKTTDPQKPNIIYRANEKSNAIATKITNAAKGSLAKQIQTNFVYTVNKEAFKLLNNTGGQLEKNKSKILGIKSTLELGNKSIGEVKNIIDDASKDSESLKQYFNDTKDKLPLITDQINNLQKATEASKNLVNETERDLNGIAKNINNDMIYRESTNSKINSILTNLKEYNNVSNNSEMIKLVDEASKLCDSINSNIDGTIKSLEVVNILKPNKIIEELISSLKNLQEKVNGEKNKLAELKNKISTSNNNKQNINQVVESILLLNDEINKNMRNTSNIFYNQTTMIIENTAKGLNNRLDTANDILDTTKLVIPQLKALGDFGVGTSDAALKDGKKINNKLAEFKKTINKLEEKTSSLTEDNLDKIINLTQKNPEQMASFISSPINIKEEEIYNTGIFGVGLTPFYTVLAIWVGVLLMSSLISVEAEEFEGEKKLTHLQVYFGKLLLFLSIAIIQGIIVTLGDVFILGIEPASMGLLMVFTIVTAITFTFIIYTLVSIFGNLGKAIAVVIMVFQIAGAGGIYPIQTNPKIFGVLQPLWPFTYAIAGFREAIAGPVRAAVIKNLGALFIFSIGSLLLVVLKKPLHKVTEYMNDKFIETGL >NC_017297.1|WP_011987909.1|1116671_1116974_-|hypothetical-protein MEKKPSVKSSANLLAIVSLIMSIIVILPILNWLFKITPWQKLEGLPLFFGLLISPFGFLLGILSIKIQSNKLGKIGVIINTLLFLLPFIYMTLGVLIFGP >NC_017297.1|WP_011987910.1|1117179_1117935_+|DUF4184-family-protein MPFTFSHPAIVLPLEKKWNKYFSFTALILGSMSPDFEYFIRFKPMATIGHGLIGFFLYNLPLCFILAYLFHKIIKKPLIAHMPKPIDSWYYNTALKPWRINSLTQVLVFSYSAIIGMITHVLWDSFTHKGGKFVILFEGLRKNIEILNYDIPVYKTLQHGSTLLGVIFIILYIYSKRNKHINWKRINRIPAINNKEKVSYFTTIFCTGLIVLFVYIFLLNVSFSIKNVGSFVVTFINGLFIGTIITSIKCR >NC_017297.1|WP_011987911.1|1118202_1120332_+|DNA-helicase-RecQ MLESAKNLLKKHFGYNEFRKAQEKVIESILKKEDTVAIMPTGAGKSICYQIPALIFEGVTVVISPLISLMKDQVDSLKEVGIEATYINSSLNNLEIEERIFNAREGLYKLIYIAPERLESDNFVRSLNNLNIALVAVDEAHCVSQWGHDFRPSYTKISNFIRKLSKRPIVTAFTATATETVRRDILKSLELQNPKVFVTGFDRENLSFSVIKGEDKEKFIFDYLENNIGKVGIIYTSTRKEAESLYNKINKKGYTVGVYHAGLSDEERKKTQEDFSFDNIEIIVATNAFGMGIDKSNVRFVIHHNIPKNMEAYYQEAGRAGRDGEESECILLFSPNDIRLQKYFIDESFLSPERKNNEYNKLRAMVDYCYTSKCLRSYILEYFGEDALEEKCNNCSTCNDNREEKDITLEAQKIFSCVYRMKERFGVNMVADVLRGSKNKKLLSLDLDGLSTYGIMEEFTQKDIVALMNKLIADDYMVTTDDKFPVVRLRSKSHDVLKGKEIVSIKVSKIEKKVKADNELFEILKQLRKAISQEESVPPFMIFPDATLKELSEYMPTKEEDLLKIKGIGERKAEVYGERFIEAITEYMNEKGIDINNMDNYESTKSNKESKIKTHVLSYNLYKEGKTIKEISEERNLKAITIQEHLFKCLSEGMEVDLDNFIKKDYEKLILDTIKKVGGTKLKPVKDELPLEVDYMCIKSVWYKYKDII >NC_017297.1|WP_011948678.1|1120503_1120935_+|ferritin MDELDIINENQLGIAANNEKIKTDLEGQFRAETGEVGLYIAMARVAQRQGFPEIAEVLKVIATEEAEHAARYAELNGKVSDCTKENLQKMLQGEIGSNKMKKSLAVKAKEENIDEVHDFIDEASRDEARHAKMLKGLLDRYFG >NC_017297.1|WP_011987912.1|1121216_1121762_-|phosphodiesterase MKLFFMSDIHGSAYYLEKALHIFEKEKADYLIILGDELYHGARNPLPKGYDPKKVTEILNSYKDKIIAVRGNCESEVDQMVLNYPIMSDYSIVLYNGKRLFLTHGHIFNKDNMPNISDGDALIYGHTHIPLAEKINNIFVINPGSITFPKENTPHCYGILSDNLFKIKTLEGNTFKEISLI >NC_017297.1|WP_003355968.1|1122398_1122782_+|response-regulator MSSSQKNILVIDDSASIRSFVRNILEKANYKVYEACDGEEGIEVYKKCGNIDLVMTDIYMPKKSGLEVVVELQNKYKGTQIIVFSDGGKENFTNDSGVCEALGAAYFIRKDLIKDKLLDLVNIIFSK >NC_017297.1|WP_011987913.1|1122896_1125371_+|DUF3298-domain-containing-protein MIERNLFNIINKYLPMGSQIIVEEDNNNEPLIIKADLNGYGLGEIIIAYRWQEENYIMVLERYCNQWSVIDNIRGKGYDISYLKVAPITDNAMDNLIIGWRRGAIWSELDILQWTPYGFKRVIDEGIYYSKIEVENMKSVKAMNDKNEIALWLHDTAEAYKVEIYRWSLGKLVKAEDVYPYYFKKVIDFYKTKLQEEPDLPVYWYYLADAQIKGEMYEDALKSIDKALELPKAYPSKKELIKLRDYILSHKKCKNINLYLAPMNTIKGVRWGYINEKGEFLIKPLYNLALEFQCNGLAVVEIDNLYGIIDENQDYIVKHKYGFISDFSEGRAIVIDNERFNIINEEGEELIAKTENYSYIGNFKEGRAQYGVIDSNKGYLYGYLDREGKVIIPAQYEYGNDFYKGKAVVRIKENEYALININGEILNKYEYASVGNLREGLLSFKKDMGEKYGFIDEDGNVVIKLQFTYAQDFSEGRSVVNVSGNIMNNYGVIDKEGNYIITPKYNDIILLGENRVAVGVAIDKTSPFIGSKYAIADTEGNILTDFIYYEVSNYKSGIASAYDDKNTFFIDKEGNKIENLPIVEGSGTLTVENELIKAYVDYKISYFDKEGNLIWEENSVISLNNQYKVIEGKYKPNKDYLVYYPKVQGMVDKALEDGVNNRLKILSEVKPIEENVQLEYNYLGDFKIEFFNKNLLELELDGYNFHFGAAHGMPSKIYTKIDLTTGEFYELKDLFKEDSDYVKALSDIIGEQIKNNPEYSYIFPDTYNGIKEDQPFYVSQDTLYIYFYPYEIAPYAAGFPTFKIPYKDIIDIINEAGAFWISFN >NC_017297.1|WP_011987914.1|1125818_1126034_+|DUF2997-domain-containing-protein MTKQIKLRIYPDGIVQAEVEGVKGKKCTNYISIIENLLEAKVADSEYTPEYYEEEIVESYEEENITLKEGR |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_017297_3 | 1903423-1903640 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NC_017297_3
|
3 spacers
spacers of NC_017297_3
>3.1|1903446|43|NC_017297|CRISPRCasFinder CCTATTAATAATATGGAAAAACTAAAGGATATAAATTTATCTA >3.2|1903512|40|NC_017297|CRISPRCasFinder TATTTAAAGGATTTAAACTTACATCATTTAGATTTAAGAG >3.3|1903575|43|NC_017297|CRISPRCasFinder GTCTTAAAAGATAAAACATCCTTGCAACATTTGTATTTAGCTA |
cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017297_3
The CRISPR arrays of NC_017297_3 >merge|NC_017297|3|1903423-1903640|CRISPRCasFinder ATAATAATATAGAAGATATATCTCCTATTAATAATATGGAAAAACTAAAGGATATAAATTTATCTAAAAATAAAGTAAAAGACATATCTTATTTAAAGGATTTAAACTTACATCATTTAGATTTAAGAGATAATAAAATAGAAAATATAGAAGTCTTAAAAGATAAAACATCCTTGCAACATTTGTATTTAGCTAATAATAGTATTAAGGATTTTTTA >NC_017297|3|3|1903423-1903640|CRISPRCasFinder ATAATAATATAGAAGATATATCT CCTATTAATAATATGGAAAAACTAAAGGATATAAATTTATCTA AAAATAAAGTAAAAGACATATCT TATTTAAAGGATTTAAACTTACATCATTTAGATTTAAGAG ATAATAAAATAGAAAATATAGAA GTCTTAAAAGATAAAACATCCTTGCAACATTTGTATTTAGCTA ATAATAGTATTAAGGATTTTTTA
>NC_017297.1|WP_012099780.1|1897933_1902391_+|DUF5050-domain-containing-protein MIRGVFAIFSKKFVAKLLLYSSIAIIPMFNHNYVQAASSKQYETKYNVSLDKVWKIRFSREVDKATLNPENIKILDNQGKEMPINLSLDVDKHYVKIALKSGTYNGVHYSGKYEKDKKYSLIVKEGLMSEPSKNKKSKNLAYETMMDFNTIGDNEYPGLPIEDGLIVIGDKAYSVGYLSKHSSIANEITSNGNYYIAYISKEYGEKIKQVLGNNTTKGNQERANKILYYAPNGNQYEYEWNEAFGEYKIVLPKAYVDVTPGVINGVVNLAVKQVKAVPGAKYFKLAHSNTIKPIGESISYSMTYPTEKLTILSADETPLATALVDVYLPKTGYVSLSSVNETLGNTAGNISNNGSAAMDLDFYVYYVNSADKNSLYRKTLTGRMDTQISLDKAQYINVIGDWIYYSNYNDNGKIYKMKKDGTKKQILCDDTATYITVSGGVVYYANQSDKGRLYKINTDGTIDGGTSNRDPAGKVHGMPVMDDYGNYNKATDQANFINVVGDWIYYSNFSDGHKIYTVNKDGNIRRKVNDEWADGIQIVGAWAYYCSGSGAISKVRVDGTGSVIPLRGTTRKVDKGYHLNIVDGWLYYSNAEDGGKLYRIKEDGSGEKKKLADLATDYINIVGDTMYLISAGKTYTLPLNTDGTIKPTLVTKDNNGNTVVDVKDLNITVAYEDANKTIGELEAKYLPQKVAVFMKDDTVQQLPVDWDIKNRKYNGQGIYTYTGTVLGHGKQIKCTLTIPSEMLNATSIIEVYNNGPKNGSIMIKERSFGPSKQDQELKEKLKLAKRVEIGDVIKVYDNPNSEKPLGNIKVDANNANGPLVKSLDLDMYGRSFWITITRKNKAESKPTEVRQLGAAVLSGDVLDEDGEALGVDGRDFTVKGWNNPSIRDDGFISDTTEIAAQGTKSIYVIPGTGKLNMENQGVIPAGITSANYWNGGNARALLTNYDLLTNDSLKNKLKEGNYSIYVVVGYDGKAEEDVNGFGSPLVIGKTASIPKAMKATEEKIPKAPSVTKQYVKAGDTVKISGVTKEDEIYLAPEGASYIAKDITNKPYKSHDNLFFEDQSKSKEEREKEYEKSGKPSIEDGYQCKLVDGKIPQGVRSGKYKVYMVNAIGSSSPASGEIVIDNEDPVVRLDSAKQEDVIKTVTQNGTTTQETTGQKFKVNFAAFDNSFDNSIKEGITVSMARLDSPKSAIKAQEIKDKGNKTFEVIINDPHANLNDYAIYAEDKAGNIGQVNLKVQDPPVNINNISLAIRTSNEGVDLVKSRLVGRTKYMTKDLTRVSDNYEVTVDGVKYVLQEEALRNLGASPSIDAFMNALMQAKQWDIANNKPMEDKPKLSSKVSIYKVNDIIYIEGNDNTPIQIEDRTKIDADTAIVSNMIGLNSNENSTGENSKNQQYIINVTGTAQKNGKLKVCLAGKCFDIDILSTDDATKIARKIKDVINDNTILDSYQYPGTNVESSGSEVKLTRKSPGAVVPTFTVEYFNYDN >NC_017297.1|WP_012099779.1|1896331_1897777_+|DEAD/DEAH-box-helicase MNKLTFENYKLSDEILKSLGKLGYKNPSEVQKQVIPLILKDKDIIVKSETGSGKTAAFSIPVCEKLELEEKDPQVLVLTPTRELALQIKEEISSIALYKRLRCTAIFGKQPMSLQKRELKQRVHLVVGTPGRTLDHIERENLDLKKIKYFVLDEADEMLNMGFIDQVEAVIKRLPKNRVTMLFSATIPEKIENLCKKYMNNPQNININPENITTDTINQCYYEVEDKDKFSLLQKIIYKEVVDNSIIFCNTREKVDEVLKNMKKKGLNAVGLHGGMEQKDRLETMKKFKEGEFQFLVCTDVAARGIHIENISHVINYEMPYEKESYVHRIGRTGRAGKEGVAITFIEPNKVRFLRDIEDYIEKEIPKRKEPSLEEVDKGKKIFEENIKNRIKTKVPKNNKKQKDITKIYISAGRKKKIRPGDIVGAITSIEGINVDNIGIIDIQDNHSYVDILEGKGDIVLKASEDMKIKGKKVRIQRAVK >NC_017297.1|WP_012099777.1|1895316_1896153_+|S1-RNA-binding-domain-containing-protein MIKLGEIQKLEIIREAPMGVYLNSKEDKSENDILLPGKQVPKDAKIGDEVEVFVYRDSEDRMIATINRPKITIGEIAPLKVIEKTKMGAFLDWGLERDLFLPFKEQTYGIQEGMECLVYLYIDKSDRLCASMNVYRVLSTESPYKEDDEVKGFIYDIKREIGAFVAVDNEYHGLIPKNELYGKFRYGDIVEARVTKVKEDGKLDLSIRKKAYKQMDEDVDTILEKLNSNGGKLYLNDNSDPRAIKELLSMSKNAFKRAVGRLLKEGKIEFIEKGIKLK >NC_017297.1|WP_012099776.1|1893728_1894994_+|DEAD/DEAH-box-helicase MNNSFDTLNLNPKLVQGLKKLNINIPTEIQAEAIPLAMENKDIIGQSETGTGKTLAYLLPIFEKITTEKREMQAIILAPTHELAMQINNEIKNISSNSNMDVKSMAIIGEANIKRQIEKLKEKPHIIVGSPGRILELIKKKKITAHTVKTIVIDEGDKLLDKNNLKVVKEVIKTTLRERQLMLFSATITESTLNIAKDLMKDSEVVKVKEKNTVNENIKHLYITGEHRERIEILRKLIAATNPKRAIVFINRNEEIELTTLKLQYHKIKAYGIYGAAEKEQRKKALEDFRSGKVQILVSSDLSARGLDVKDVTHIFNLDLPENPKEYLHRVGRTGRASKEGIAISIITEKEKALIRKYEKEFNINIEEKKIYKGTLISSKGERSSQPKSKNKSTSAHKDNNKKKRSSSINKSKNNHKKKKY >NC_017297.1|WP_012099775.1|1892466_1893360_-|chemotaxis-protein-CheV METNILLESGTGEVEIIEFLVNNKHYAINVIKVKEVIEVDNVTKVPQSDPAIEGLILCREKIFPLIDLSYILGQKNTSKKRFKTIICEFNRVSVAFKIDEIVAVHRIGWDKILKPDDIAANPLVIGNILLKDKIILLLDFEKIVTDINPSTGISEERIVNVDYKDRSHIKVFLADDSSLIRKLLKDTLTKAGFKKLTIFDDGKQVLDKLLELVEKKGEDFTEDVQILITDIEMPQMDGHTLTRKVKEHPILKRLPVIIFSSLITKDLKHKGTSVGADEQLSKPDIGELVNIIDNYIE >NC_017297.1|WP_012099774.1|1891411_1892266_+|4Fe-4S-dicluster-domain-containing-protein MKMISKNEIAKLKGEGFLAQKQEGYFSVRILSRAGNFTSKQIIKLAEIADNYGKGYLGVTTRLATEIPWIRYEDIEAVKKEIVSSGMAHGGTGKRVRPLVSCKGTVCVHGLYDTQKLCGELHDKYFGYELPSKFKITLVGCPNNCAKASINDIGIMGQAYVEFDEEKCKTCGICTKSCRQKAVTVENKKIVYKKDLCVNCGKCATVCPFEAMTIKEQGLQVYLGGRFGREYRIGNRLKGLYKEEEIPALVQKIFDVYSEMGNPGERLAKMIERVGFDKVEEAIL >NC_017297.1|WP_041173147.1|1890382_1890841_+|YbaK/EbsC-family-protein MSLEGVKKQFTDENLNLKILEFDKSTATVELAAKALGVEPGQIAKTLAFHVKGENMLIVAKGDARIDNKKFKAYFNGKGKMMAPEVVLEVTGHAIGGVCPFGLENPINIYLDQSLKEFEKVYPAAGNANTAVEVTLDELEGITKGLWIDVCK >NC_017297.1|WP_012099772.1|1888480_1890061_-|ABC-F-family-ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MITVTNLSLRYGDKKLFEDVNLKFTPGNCYGVIGANGAGKSTFLKILSGEIEANTGDVSIQPGVRMSILKQDHFKYDEFPVLETVIMGNERLYQIMKEKDAIYAKTPFTDEDGIKASELEGEFADLNGWEAEAEASSLLQGLGIGTELHEKNMKDLSGSEKVKVLLAQALFGNPGVLILDEPTNHLDIKSVNWLEEFLINFEGTVIVVSHDRHFLNKVCTHMADVDFGKIKLYVGNYDFWYESSQLALQMAKDQNKKKEEKIKELQEFIARFSANASKSKQATSRKKLLDKIDLDNIQPSSRKYPYIAFKPEREVGNDILRVEGLTKTIDGTKVLDNISFIIGKDDKIAFVGDELSITTLFKIISGELKPDSGEYKWGITITNAYFPKDNSEYFNDVDLNLVDWLRQYSEEKSESYLRGFLGRMLFSGEEALKEVKVLSGGEKVRCMLSKMMLNNANVIILDQPTNHLDLESITALNNGLMDYKSNILFTSHDHQFIQTIANRIIEVSEAKFVDKKVTYDEYLESK >NC_017297.1|WP_012099771.1|1886196_1888200_+|methyl-accepting-chemotaxis-protein MKFKTMKGKMLTYFLSLFLIICIAISFMAYFMSKRMIERKASSLMSEVSRQAVQNIEARLNGTLDSIETVANMPTIKDPKLGWDKKKTILDEEIKLHGHVKMGIVGKDGQSIQTDGTTVNIKDRNYFKETMEGKRTISEPIVSKVDGKVVIIYTVPIKNGNTIMGALTAVREGNDISNISNSIKVGESGGAYLIDSTGTVIAHKNKESVIKRENSIKDAQSNEELKPIAAIEKSMIEGKEGIGQYKYKGAEKYISYSPMKSTGWSLAIYAPKNEILKEVSEITRNIIIVSILGIGIALVCIWFISTQISNNLISMRDSLNIVATGDLTTNVDSKIEKEKDEIGHMARALSKTVLSIGNMINSLKGSSFNIDDKANNLAAISEEFTATTENVSTAIQEVATGATNQAQALTEIVSMLNDFSDKINSTVNNIEEIDGMSKEIDEKANVSNKDMKELLNSIENLTKVFENFETKIWTMESNVQKINEITNLINDIAEKTNLLALNAAIEAARAGESGKGFAVVAEEIRKLAEMSRKSSEDIYTIVNGVLEDTKDMVKSSNEVNEKLNGQRSTADEAMNSFMEISKSVTNMIPKIRNINNSANIIEKNKNEILNKSETIASISQEISASAEEISASSEEMSASSEEVANTAQSLNDMTQDMLNEMNKFKTE >NC_017297.1|WP_012099770.1|1885618_1885828_+|cold-shock-domain-containing-protein MSMHTGTVKWFDNERGYGFIAGNNGKDVYVHYMQIKEKTHNKDLHEGEEVLFDIVEKEKGPIAINVQKL >NC_017297.1|WP_011986372.1|1908998_1909181_+|hypothetical-protein MYSIKYYLRYIKSKVLWETIYDKFFIQETIKKFFINLKKLIILMKKIHINCLNFKKNILK >NC_017297.1|WP_012099784.1|1909241_1910096_+|response-regulator MKDTKVVIVDDSPFSISIIKDILEENGLTVVGEAGNLEEVINVVKDKKPDIVTMDMTLPGTDGIECIKAINKINKNVKVIVISSMMDEEIVKKANKNKVCGYIQKPIDPEELIETIEKVVMKEELFLQLENDYFQIFKESFKDALNKFTKTTAEFSEDTKCTISETSRGMVVVIGIIGNFSGRMILDLSQETANSMVNFMLKREPKDMNEVLNVIGEFSNIVAGNACSMLNRKSKVFGLRIAPPSIFYGKSLNISQSLIESLSVESNTEFGQIYMNVGFKRGES >NC_017297.1|WP_012099785.1|1910095_1910557_+|chemotaxis-protein-CheX MDAKYINPFIDSFYNVLPQIGFSNVTREDVAIKNNVESLGILINLGIVGDIKGNIVYNIQGENGKKIASKMMMGLPVEELNEMAQSALSELSNMLTANASINFSNIGVNVNISTPTLMYGQDIKIKLNTDKILNIKIVADDIPIDVNIAFEKI >NC_017297.1|WP_012099786.1|1910739_1912098_-|YjiH-family-protein METQKNNKYSFSELFKFICPSLIGFILFIIPISYDGEITIPIAVLSKIVLAGLGSILPQLMGIIICITFICTAITKIFKPKAILENKFFNNLFNVSPVWVLARVLGFIFIISTFFKIGPEWIWSENTGGLLLYDLLPILFSVFIFAGMLLPLLLDFGLLEFVGALLTKVMRPIFNLPGRSSIDCMASWLGDGTIGVLLTSKQYEEGYYSEREAAIIGTTFSAVSITFSLVVISQVKLAHMFVPFYLTVCLSGIIAAILIPRIPPLSRKPDTYLNGGESKNSEALPEGYTPFTWGLEKAVAKAGSNDDPLNFIRQGLQNVLDMLLGVTPVVMAMGTSALILAEYTPLFKWLGLPFIPLLNLLKIPEAALASQTIVVGFADMFLPSVIAATIQSEMTRFIIACLSVTQLIYMSEVGGLLLGSKIPVSLKDLVIIFLERTLVTLPIITLVAHILF >NC_017297.1|WP_003403080.1|1912836_1913040_+|alpha/beta-type-small-acid-soluble-spore-protein MPSNKNSNNLVVPEAQQGLNQLKMEVANEVGIANYDSMDKGNLTSRQNGYVGGNMVKKMVEAYERNL >NC_017297.1|WP_003363259.1|1913100_1913301_+|alpha/beta-type-small-acid-soluble-spore-protein MANRNSNNLVVPEAKHGLNQLKMEVANEVGIANYDAVDKGNLTSRQNGYVGGNMVRKMVEAYERNL >NC_017297.1|WP_012099787.1|1913500_1913830_-|HesB-like-protein MTPVNMSDLAYKEFKNFIKENNVNSNIFRIFLAGNGUGGPVFNIVLDEQTSEDLLSPIGELSFLVHKDLFSEFGGFIIKCAEENGKGSFTIDPIIQSENISCSTCSSCS >NC_017297.1|WP_077272268.1|1914347_1914560_-|hypothetical-protein MKHAKLLIIVYLRRYSLASDLYYGRNRILKLPSLSSLIAYQLIMNINYLAMHNSIFIHSNLSTACVKKWY >NC_017297.1|WP_012099789.1|1916047_1916521_-|hypothetical-protein MNRETCIFNYTKKCTDCGECEICDLDQNKKCDNCGECLQREGIDTQAIKIDEIKEDKNFVDKEDLKKVLKEDEKELESLKEFEEDLENEILQETELLKDYDENFKEQGLYAIENVEGVEIEYIEDVDGLSELMEDESRLKKVAYEEFPGLIKIRENK >NC_017297.1|WP_003358834.1|1916818_1917424_+|transcriptional-repressor-LexA MNKSRIDKQNEVYNFIKLQIKEKGYPPSVREICKAVGLSSTSSVHFHLKRLEKEGLIKRDSSKTRAIEIVDPTSKKEVINVPIVGTITAGNPILAIENIEDVFPLPIDYVKNTKDLFMLKVSGESMIEAGILDGDLAIIEKTDSANNGDIVVALIDNEATLKRFFKESSYIRLQPENKSMKPIILENCKVLGRLVGIYRKY |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_017297_4 | 2351786-2351882 | TypeIII-C |
III-B
Consensus repeat of NC_017297_4
|
1 spacers
spacers of NC_017297_4
>4.1|2351816|36|NC_017297|CRISPRCasFinder ATTGATTTACGAAGGAGTAAAAGGAACTAATCACGC |
cmr6gr7,cmr5gr11 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017297_4
The CRISPR arrays of NC_017297_4 >merge|NC_017297|4|2351786-2351882|CRISPRCasFinder GCTTAAATACATCCTATGTTAATGTTGAATATTGATTTACGAAGGAGTAAAAGGAACTAATCACGCATTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAATC >NC_017297|4|4|2351786-2351882|CRISPRCasFinder GCTTAAATACATCCTATGTTAATGTTGAAT ATTGATTTACGAAGGAGTAAAAGGAACTAATCACGC ATTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAATC
>NC_017297.1|WP_012100137.1|2350567_2351302_-|hypothetical-protein MDKFRNMKKSHIALLAVMYIVLMGSLPRFTGWATIFSAIVVGGYFLKNKKDLKELTRKKKNFIFTGIIILAIIGSLNVAVGNNIQNEKLMAEKAKQEQEIKQEEQKKIEEKKLAEEQKRIQEEEAKKKAAEEKRKQEEEAKKKAAEEQKKQEELKRKQEEENKVKAENEQAQAAFAQSTGKGNSNSQSNESQNADDNQNYTVYKTRTGSKYHSSGCRYLKKSCYETTVSQARNEDLTPCSVCNP >NC_017297.1|WP_012100136.1|2349825_2350230_-|membrane-protein MNILISTCNIGIPVLMIFIGILYKCNSYKKIDKTLDLIVPIAMFFTGFSERDREHLYKNTNNLASVNRKCSLIWSISGVCTLLLTIISLILNKSDIYNTSVILLEPELLILVIVFITVEYILKRNFNKKISEQY >NC_017297.1|WP_012100135.1|2348874_2349591_-|transaldolase MKYNDLKIKIFADGADLNGMLDAYDKGIVKGFTTNPSLMKKAGITDYKEFAKEVLAKIKDMPVSFEVFSDDLETMEKEAEVLGNLGENVYIKIPVTNTKGESTAPLIKKLSEKGYHLNVTAIFTIDQVKEVVGALKSGVDSIVSVFAGRIADTGEDPVTIMKEASKICKTKEGVELLWASCREFYSIVEADKCGCEIITVTNDILKKMPNMGKDLKEYSIETVRGFYKDASSLGFSIL >NC_017297.1|WP_012100134.1|2348413_2348851_-|PTS-maltose-transporter-subunit-IIBC MLKNYINDQVVEVNVEVKNWEEAVRLGGKLLEEDGAVEHSYIDAMVDTVKNMGPYIVIAPGIAMPHARPEAGAKNIRIGLLKLKNPINFGNEEHDPVDIVIFLCAVDNKAHIEVLGELVQLIEDDDFLKIVRNASTKKEILDYIK >NC_017297.1|WP_014519318.1|2348094_2348385_-|PTS-sugar-transporter-subunit-IIB MNILTVCGNGIGSSLMLAMKIEEICKENGIAANVESTDFNSAQGKKADLIVTVKELAEQFEGRDVAVVRSYINKKKITEDVLEIIKQKDEELKNRS >NC_017297.1|WP_003358211.1|2346724_2348089_-|PTS-ascorbate-transporter-subunit-IIC MLGLLQFLRDVLKQPALLMGIMALVGLVALKKPGHKVLTGTLKPILGYLMLGAGADFIVANLEPLGGMIQTGFNITGVVPNNEAIVAVAQKVLGVETMSILVVGLLINLVIARFTKYKYVFLTGHHSFFMACLLSAVLGTSGMKGTELILFGGFLLGAWSAISPAIGQKYTLKVTDGDEIAMGHFGSLAYYVSAWVGSKVGKPEESTENIEIPEKWGFLRDTTISTAITMMVFYIVAAVAAGPEYVSKLSDGMSPILFAIMSSLKFAVGVTIVYNGVRMILGDLIPAFQGIATKIIPDAIPAVDCAVFFPYAPTAVIIGFVSSFIGGIIGMVLLGVAGGVLIIPGLVPHFFCGSTAGIFGNATGGKKGAVIGSFVNGLLITFAPALLLPVLSTLGFKNTTFGDFDFGVLGIIIGKTSNLAGKTGIIIIAMLMLVALIVPNFIKTKSKALNNIEE >NC_017297.1|WP_003358205.1|2343740_2344094_-|zinc-ribbon-domain-containing-protein MIIWGWGKVTKKIIGAVFERTCNYCNTDEVWNLCVVRTWFTLFFIPIIPYKKQYCIACPKCWSYIELTQEEFEKIKIDITSSSNNINEKVVTDNIKYAGKTETQINYLKQMEEYANK >NC_017297.1|WP_012100132.1|2342185_2342953_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MQNILSVEKIEKYYGNKDNVTKAIDNISFKVDEGEFVGIMGPSGSGKTTLLNCISTIDNVTTGKIMINNNDITRLKSKSLDKFRQNELGFIFQDFNLLDTLTAYENIALALTIQGEKTSKIDEKVKSVAKYLEIEKVLDKYPYQMSGGQKQRVASARAIVTNPSLILADEPTGALDSKSARLLLERFEKLNKELKATILMVTHDAFAASYAHRILFIKDGKIFNELVRGKDTRKEFFNKIIEVTSLLGGDDNNVF >NC_017297.1|WP_079992183.1|2340204_2342205_-|ABC-transporter-permease MIIMYSKIALKNIKKSYKDYTIYFLTLILAVCIFYSFNSIDSQKALTDIKSSGGSYVSRLMEFMSAVSVFVSIILGSLILYANNFLIKKRKKELGIYMILGMGKRKISKILVTETSIVGVISLIAGLIIGMGVSQGLSVFALKLFEVSINEYRFAVSTRAISKTILYFGIMFLLVMIFNIFVISKYKIIDLLISGRKNENIKFKNTFIYLLSFVLCVVLLGFAYKSILKTGLKLREPMFKPSIAFVIVGTVLFFFSLAGVILYVVNKNKKIYFKGLNMFVVKQINSKVNTNFLSMSLICLMLFITILVLSTGISFKNGLEEGVRIRAPFDASIIISNNSKKDNLEDVLDKINFKKSKNEKYATCNEYISGVKLESLLSITDKDYKDAEVFFVKISDYNKILKLKGKKEINLNKDEILVMSTNNAVVKQANEKLKNSKKFNIKGKEYLVKNDTIIEENLATYLLADNVFTIVISDEFLYDYNKIVYSILNVTYSDKNREENNKKYSEINKNFVGGKYKSLNISYMGAFSKDDIYSGSKGGTTSILFVGIYLGLVFLITSMAVLALQQLSEASDSIERYKALKRIGASSKMIEKTIFLQTLIYFALPMILALVHSMIGIKVISDYIEVFTKIDISFSALITSLIFIVVYAGYFYTTYIGYKNIVESNI >NC_017297.1|WP_012100129.1|2337558_2338416_-|sugar-phosphate-isomerase/epimerase 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_017297_6 | 2352681-2352908 | TypeIII |
III-B
Consensus repeat of NC_017297_6
|
3 spacers
spacers of NC_017297_6
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cmr6gr7,cmr5gr11 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017297_6
The CRISPR arrays of NC_017297_6 >merge|NC_017297|6|2352681-2352908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCTTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAACACATAATCAGATGTTAGAAGTACTTCACGAATTAAGATTTAAATACATCTTATGTTACTGTTCAACTAGATAAAGATAGGACAATAGAATATTTTACATTAGAATTTAAATACATCTTATGTTACTGTTCAACGCGGCTATGGGAAACATAGAAGCTGAATCCGAATTATTTAAATACATCTTATGTTACTGTTCAAC >NC_017297|6|6|2352681-2352908|CRISPRCasFinder GCTTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAAC ACATAATCAGATGTTAGAAGTACTTCACGAATTAAG ATTTAAATACATCTTATGTTACTGTTCAAC TAGATAAAGATAGGACAATAGAATATTTTACATTAGA ATTTAAATACATCTTATGTTACTGTTCAAC GCGGCTATGGGAAACATAGAAGCTGAATCCGAATT ATTTAAATACATCTTATGTTACTGTTCAAC >NC_017297|6|1|2352681-2352908|CRT GCTTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAAC ACATAATCAGATGTTAGAAGTACTTCACGAATTAAG ATTTAAATACATCTTATGTTACTGTTCAAC TAGATAAAGATAGGACAATAGAATATTTTACATTAGA ATTTAAATACATCTTATGTTACTGTTCAAC GCGGCTATGGGAAACATAGAAGCTGAATCCGAATT ATTTAAATACATCTTATGTTACTGTTCAAC >NC_017297|6|1|2352683-2352908|PILER-CR TTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAACAC ATAATCAGATGTTAGAAGTACTTCACGAATTAAGAT TTAAATACATCTTATGTTACTGTTCAACTA GATAAAGATAGGACAATAGAATATTTTACATTAGAAT TTAAATACATCTTATGTTACTGTTCAACGC GGCTATGGGAAACATAGAAGCTGAATCCGAATTAT TTAAATACATCTTATGTTACTGTTCAAC
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NC_017297_5 | 2352134-2352426 | TypeIII |
III-B
Consensus repeat of NC_017297_5
|
4 spacers
spacers of NC_017297_5
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cmr6gr7,cmr5gr11 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017297_5
The CRISPR arrays of NC_017297_5 >merge|NC_017297|5|2352134-2352426|CRISPRCasFinder GCTTAAATACATCTCATGTTATTGCTCAATGTATCTTCTAAGTTTTCTGTATTAGATATTTATGGATTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAACGAGAATGTATTTAAGAATACAATAAATGAATACAAATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAACTAAAAAAGATCTACGGACAATTAGTAAAGCAATAAAATTTAAATACATCTCATGTTAAAGTTCAACTCTTACTTTATTTATAGATAAAACAAAAGAAAGGACATTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAATA >NC_017297|5|5|2352134-2352426|CRISPRCasFinder GCTTAAATACATCTCATGTTATTGCTCAAT GTATCTTCTAAGTTTTCTGTATTAGATATTTATGG ATTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAAC GAGAATGTATTTAAGAATACAATAAATGAATACAA ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC TAAAAAAGATCTACGGACAATTAGTAAAGCAATAAA ATTTAAATACATCTCATGTTAAAGTTCAAC TCTTACTTTATTTATAGATAAAACAAAAGAAAGGAC ATTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAATA
>NC_017297.1|WP_012100137.1|2350567_2351302_-|hypothetical-protein MDKFRNMKKSHIALLAVMYIVLMGSLPRFTGWATIFSAIVVGGYFLKNKKDLKELTRKKKNFIFTGIIILAIIGSLNVAVGNNIQNEKLMAEKAKQEQEIKQEEQKKIEEKKLAEEQKRIQEEEAKKKAAEEKRKQEEEAKKKAAEEQKKQEELKRKQEEENKVKAENEQAQAAFAQSTGKGNSNSQSNESQNADDNQNYTVYKTRTGSKYHSSGCRYLKKSCYETTVSQARNEDLTPCSVCNP >NC_017297.1|WP_012100136.1|2349825_2350230_-|membrane-protein MNILISTCNIGIPVLMIFIGILYKCNSYKKIDKTLDLIVPIAMFFTGFSERDREHLYKNTNNLASVNRKCSLIWSISGVCTLLLTIISLILNKSDIYNTSVILLEPELLILVIVFITVEYILKRNFNKKISEQY >NC_017297.1|WP_012100135.1|2348874_2349591_-|transaldolase MKYNDLKIKIFADGADLNGMLDAYDKGIVKGFTTNPSLMKKAGITDYKEFAKEVLAKIKDMPVSFEVFSDDLETMEKEAEVLGNLGENVYIKIPVTNTKGESTAPLIKKLSEKGYHLNVTAIFTIDQVKEVVGALKSGVDSIVSVFAGRIADTGEDPVTIMKEASKICKTKEGVELLWASCREFYSIVEADKCGCEIITVTNDILKKMPNMGKDLKEYSIETVRGFYKDASSLGFSIL >NC_017297.1|WP_012100134.1|2348413_2348851_-|PTS-maltose-transporter-subunit-IIBC 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spacers of NC_017297_7
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cmr6gr7,cmr5gr11,cmr4gr7,csx1,cmr3gr5,cas10,cmr1gr7 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017297_7
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>NC_017297.1|WP_012100137.1|2350567_2351302_-|hypothetical-protein MDKFRNMKKSHIALLAVMYIVLMGSLPRFTGWATIFSAIVVGGYFLKNKKDLKELTRKKKNFIFTGIIILAIIGSLNVAVGNNIQNEKLMAEKAKQEQEIKQEEQKKIEEKKLAEEQKRIQEEEAKKKAAEEKRKQEEEAKKKAAEEQKKQEELKRKQEEENKVKAENEQAQAAFAQSTGKGNSNSQSNESQNADDNQNYTVYKTRTGSKYHSSGCRYLKKSCYETTVSQARNEDLTPCSVCNP >NC_017297.1|WP_012100136.1|2349825_2350230_-|membrane-protein MNILISTCNIGIPVLMIFIGILYKCNSYKKIDKTLDLIVPIAMFFTGFSERDREHLYKNTNNLASVNRKCSLIWSISGVCTLLLTIISLILNKSDIYNTSVILLEPELLILVIVFITVEYILKRNFNKKISEQY >NC_017297.1|WP_012100135.1|2348874_2349591_-|transaldolase MKYNDLKIKIFADGADLNGMLDAYDKGIVKGFTTNPSLMKKAGITDYKEFAKEVLAKIKDMPVSFEVFSDDLETMEKEAEVLGNLGENVYIKIPVTNTKGESTAPLIKKLSEKGYHLNVTAIFTIDQVKEVVGALKSGVDSIVSVFAGRIADTGEDPVTIMKEASKICKTKEGVELLWASCREFYSIVEADKCGCEIITVTNDILKKMPNMGKDLKEYSIETVRGFYKDASSLGFSIL >NC_017297.1|WP_012100134.1|2348413_2348851_-|PTS-maltose-transporter-subunit-IIBC MLKNYINDQVVEVNVEVKNWEEAVRLGGKLLEEDGAVEHSYIDAMVDTVKNMGPYIVIAPGIAMPHARPEAGAKNIRIGLLKLKNPINFGNEEHDPVDIVIFLCAVDNKAHIEVLGELVQLIEDDDFLKIVRNASTKKEILDYIK >NC_017297.1|WP_014519318.1|2348094_2348385_-|PTS-sugar-transporter-subunit-IIB MNILTVCGNGIGSSLMLAMKIEEICKENGIAANVESTDFNSAQGKKADLIVTVKELAEQFEGRDVAVVRSYINKKKITEDVLEIIKQKDEELKNRS >NC_017297.1|WP_154018626.1|2360525_2360675_+|hypothetical-protein MIYINLNTSYVKVQRTPVTIDGKEYTNLNTSYVNVQPYRYHKLYHHHNI >NC_017297.1|WP_012100148.1|2363571_2364369_-|MerR-family-transcriptional-regulator MRYSITDLAEILGCTTSAIHYFEKEHLIEVEKGKNGHRYYNVVDVFRLLSYTKYRSMEIPMKTIIAQFGGEENNYKLIEEREAMYQLEALKRAQYYMNLADAIGEHLVSVRRIEELLDKYEFAKSPEVTIMCDDECGWLSKKRSSQRIIHEWVKAMPTVQLGVFDSRMGISNFGYLVKTKKREELELPLGLHTKQLKSTSCIHTIVMADEDFTQHPQKVFKKASEFAIKKGLEIGEIAWGKILLVEVEKGAKLHPYIELWISIKI >NC_017297.1|WP_012100149.1|2364417_2364711_-|hypothetical-protein MNFFTLNILIGAMAFIINKINNMSQDIDPFEAFNDIEENLDEIDNEKVTNFVNGLINASMSNPSIGYFFMFLVYMTPVLNLLLLIKGIINYFNRAVG >NC_017297.1|WP_012100150.1|2365144_2366443_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr6 MIKLLKVKSFSTKRGAEFENKETFNKLKQEFYKNPKIGDYVFCSIEEDKLRGLEWRLYQDIDNTNVYEQWQKWKKDSCHYGLKLDKFTNVFNGREESVNKKIDQSIHLNIDDYLKEDKNLYENIDFNVKVFDKLVVGLGEHSVFETDIKLHHTYGVPYIPASAVKGCFRSHIIQKYFQSKEKKAEEDKNFIEIFGGEYKDKTYSGNVIFIDLFPKNSFEIKKDVMTPHYQNGYTDDGNITPIEFLTVENTLFRFILRISNKCLLQDNNSKIKLKENQDVRDLIVEELVEMIATHGIGAKTSVGYGYFEEVTKEECLEQTENNEKRREEEILEAKEKKKLMKMNDSEKKLYLVEKISDCEKRKEGLRKLFTNRKQEELEQTEIEKLAKLIKRDLEDSGKWRYKIGKKGKKNKELERIEKICEILNIDLPKNSN >NC_017297.1|WP_012100151.1|2366435_2366915_-|type-III-B-CRISPR-module-associated-protein-Cmr5 MGDLKNVNLQVAQFALEKVKEVLNYYEKEILKCKEEEREQIEKKQKMLSSKYKTLSKKMTVLIQKNGLIGTLVFILSKVKKEKANELVLQHIINWCEEDCKLDFLRVDKENTNPNEAFIENITKLSNQEYRLVTKEIMNLFGWIKRFTDGMIEGEVQND >NC_017297.1|WP_012100152.1|2366914_2367778_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr4 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MKFLKIKPYDNTFFRLGNNFEFKISNVIQTKNVAYPSTFFGAIFTAILANNDEFRESFLNIPGNTDHLEILNIKQIYLYAEKQGMIYIKAPKDIFVNNNEVKFGNFKEIKDGESSIKYDYYLEEPDGNELERADNYFVSIKEFYDKYRYKVLDNIDLKQEDEIFAKNIKTGIALDKSTGIVKESLLYTIEQTEFKNITEDYYSNDWSFVVEYAIDNDFLKKQGYPKVKNLDKGELKLGGETKVCTYEIIENSDINEFKSKTSQGFLKPGEKLKVILTSDSYFTKSFAELFNDEMKILALVNDKPIYIGGFDVAKNEEKAMYKGYSAGTVLLLQNESGKDINLQKYLDMKLRNKLKNGFNEYICVKGE >NC_017297.1|WP_012100155.1|2370149_2371895_-|type-III-B-CRISPR-associated-protein-Cas10/Cmr2 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MERVKVTLGVVTDMFSEGVNSNKEAEFRITELKALLRSTFREFFYYTSLDDLKEKEELLFGSTNRKSPVIIKFGRNNKIRFKDKKKLVLHKNMFKEAIPSGTTINIIFQSRYEKYLKTYVYTLKLASIMGALGKRSRKGMGAFKIIKIDDNEIIDINKSVEDLLCGYEEQFKINEKIYLIKTRKLLKEKQYKDNCTKYKIECDANMPKNVNYVKNIYKIYLGNLTEEKSRNKIDCTLRNFSWLNHYRLSDLNKIFSNETIKKIEKETGKRIDNEISLENLFNKEILGNYNYKYKEKEVTKKNILTRFACPVYVTIYQKSRGELIENYLIIKELNYDYVYKKILDKKVSNKKVTEQKKEEIRTDIKSELKEMKPIDKYYVEEFVKKIIECCEVK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_017297_8 | 2360034-2360193 | TypeIII |
III-B
Consensus repeat of NC_017297_8
|
2 spacers
spacers of NC_017297_8
>8.1|2360062|38|NC_017297|CRISPRCasFinder AAATAGTATAGAGCTACAAATAGAAAAGGCAAGAATAT >8.2|2360128|37|NC_017297|CRISPRCasFinder AGAGGAGCCAATAGACATTGCAAGATATTAGATACAT |
cmr6gr7,cmr5gr11,cmr4gr7,csx1,cmr3gr5,cas10,cmr1gr7 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017297_8
The CRISPR arrays of NC_017297_8 >merge|NC_017297|8|2360034-2360193|CRISPRCasFinder TTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACAAATAGTATAGAGCTACAAATAGAAAAGGCAAGAATATTTAAATACATCCCATGTTAATGTTCAAGAGAGGAGCCAATAGACATTGCAAGATATTAGATACATTTAAATACATCTCATGTTACTGCTCAACC >NC_017297|8|8|2360034-2360193|CRISPRCasFinder TTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC AAATAGTATAGAGCTACAAATAGAAAAGGCAAGAATAT TTAAATACATCCCATGTTAATGTTCAAG AGAGGAGCCAATAGACATTGCAAGATATTAGATACAT TTAAATACATCTCATGTTACTGCTCAACC
>NC_017297.1|WP_012100144.1|2358746_2359268_+|DUF4825-domain-containing-protein MKNKLKILIPLIIILSLNLVGCGMNSEKKSKENIKNSSKVETYDLIKYKGTYVGDNSSVGSIIKNLPANKYSAGFSLQTSKEPYEITVNYKANENLGEENYNKFWSDKKADKLLEKNAVVLLSLIPNAEIIKFNVDNIGEESYKYDRKNLEQKYGNLKDLSKDNDSLKKFLNN >NC_017297.1|WP_012100142.1|2356807_2357548_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MINYYGSLCTVMYELLHPHAPEDELQFYLQYAKKEMKILEPLCGSGRFLVPFLERGFNITGFDMSEEMLKELYKKAPKAKVFQSSIEKFSPKEKYDYIFITSGSFSLFLDEDIAFNVLVKMKEALAPKGKFVFAAETTANIIHDREKYLKNCAVKTKEGYDIIFKSKSFYDKHKKILSTPSLYELYDGDKLLGKEEMDFRIKLYDFGELDKLILKAGFKGSHVFSDFNRRESIDKNTETFLYECYI >NC_017297.1|WP_012100141.1|2355312_2356704_+|peptide-MFS-transporter MSEKKQKHPIGLWLVNISIALQSYAAYAVVSILILFLTADVSKNGLGLSVPKAAAIIGLYQGINYMGSLVGGYITDKWLGIQKSLILGCFLTACGYLALFFAKPNIGSVWLGLIILIVAGAFFKAQISSLVGELYGKNELSKKDAAYSIFYMFINIGAFFGPIIAGLISDKWFAKVAADGEIAAYGYKYIFLMCTLIMIFIGIFIWIVSPKWLGEIGKYPVSKDKKTSTKSIEKAKAQPLTQLEKNRIKAMIVMFVFVIIFWSAWDQTATSFSLLANKLVNRTIGEFTMPVPWLTSINAIFCVVLSPIIANIWLKLGNSKKGDLSVPTKMGLGMILTGIAFLTLILGISTLGGVLDGSKQMNILFIIVAYFLLTVGELCLSPIGMAMFNKLAPAKYGSLAMGAWYLSFFFSSIISGKLAGFTDTLGYTQIFGLISGIVIVFGVILILLRNGLLKLMSLDELDK >NC_017297.1|WP_012100140.1|2353707_2354322_-|sugar-O-acetyltransferase MNQKDRMLAGLPYKACLDGLPEERMENKKKIYEYNHCFPDEHEKIHKLIRDILRKAGADVHIEAPFYCDYGKNIQVGDNFFANYNCTILDVGKVIIGNNVQFAPNVSLYTAGHPIHPDSRNSGYEYGIGITIGDNVWLGGNVVVNPGVHIGNNVVIGSGSVVTKDIPDNVIAIGNPCKIIREITEKDRKYYYKNYEFDIDDYKE >NC_017297.1|WP_012100139.1|2353170_2353665_-|hypothetical-protein MILAIECFIACVLFTLMILPSLYKEPIKHIMSYPTDIRKRVENLPQYKDVIQKKEKKHLTVKIIAVFMFAIIFAVVAYFSGAKSFSKAYIHVFTLFFVVNIYDMIVLDIGLFCHSKKTRIPGTEDMDKEYRNPWHHIKGAGIGTIIGAVVALLSRGMVHFISII 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MLKNYINDQVVEVNVEVKNWEEAVRLGGKLLEEDGAVEHSYIDAMVDTVKNMGPYIVIAPGIAMPHARPEAGAKNIRIGLLKLKNPINFGNEEHDPVDIVIFLCAVDNKAHIEVLGELVQLIEDDDFLKIVRNASTKKEILDYIK >NC_017297.1|WP_014519318.1|2348094_2348385_-|PTS-sugar-transporter-subunit-IIB MNILTVCGNGIGSSLMLAMKIEEICKENGIAANVESTDFNSAQGKKADLIVTVKELAEQFEGRDVAVVRSYINKKKITEDVLEIIKQKDEELKNRS >NC_017297.1|WP_154018626.1|2360525_2360675_+|hypothetical-protein MIYINLNTSYVKVQRTPVTIDGKEYTNLNTSYVNVQPYRYHKLYHHHNI >NC_017297.1|WP_012100148.1|2363571_2364369_-|MerR-family-transcriptional-regulator MRYSITDLAEILGCTTSAIHYFEKEHLIEVEKGKNGHRYYNVVDVFRLLSYTKYRSMEIPMKTIIAQFGGEENNYKLIEEREAMYQLEALKRAQYYMNLADAIGEHLVSVRRIEELLDKYEFAKSPEVTIMCDDECGWLSKKRSSQRIIHEWVKAMPTVQLGVFDSRMGISNFGYLVKTKKREELELPLGLHTKQLKSTSCIHTIVMADEDFTQHPQKVFKKASEFAIKKGLEIGEIAWGKILLVEVEKGAKLHPYIELWISIKI >NC_017297.1|WP_012100149.1|2364417_2364711_-|hypothetical-protein MNFFTLNILIGAMAFIINKINNMSQDIDPFEAFNDIEENLDEIDNEKVTNFVNGLINASMSNPSIGYFFMFLVYMTPVLNLLLLIKGIINYFNRAVG >NC_017297.1|WP_012100150.1|2365144_2366443_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr6 MIKLLKVKSFSTKRGAEFENKETFNKLKQEFYKNPKIGDYVFCSIEEDKLRGLEWRLYQDIDNTNVYEQWQKWKKDSCHYGLKLDKFTNVFNGREESVNKKIDQSIHLNIDDYLKEDKNLYENIDFNVKVFDKLVVGLGEHSVFETDIKLHHTYGVPYIPASAVKGCFRSHIIQKYFQSKEKKAEEDKNFIEIFGGEYKDKTYSGNVIFIDLFPKNSFEIKKDVMTPHYQNGYTDDGNITPIEFLTVENTLFRFILRISNKCLLQDNNSKIKLKENQDVRDLIVEELVEMIATHGIGAKTSVGYGYFEEVTKEECLEQTENNEKRREEEILEAKEKKKLMKMNDSEKKLYLVEKISDCEKRKEGLRKLFTNRKQEELEQTEIEKLAKLIKRDLEDSGKWRYKIGKKGKKNKELERIEKICEILNIDLPKNSN >NC_017297.1|WP_012100151.1|2366435_2366915_-|type-III-B-CRISPR-module-associated-protein-Cmr5 MGDLKNVNLQVAQFALEKVKEVLNYYEKEILKCKEEEREQIEKKQKMLSSKYKTLSKKMTVLIQKNGLIGTLVFILSKVKKEKANELVLQHIINWCEEDCKLDFLRVDKENTNPNEAFIENITKLSNQEYRLVTKEIMNLFGWIKRFTDGMIEGEVQND >NC_017297.1|WP_012100152.1|2366914_2367778_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr4 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_017297_10 | 2361041-2361200 | TypeIII |
III-B
Consensus repeat of NC_017297_10
|
2 spacers
spacers of NC_017297_10
>10.1|2361069|38|NC_017297|CRISPRCasFinder ATCCTTCCTTATTTCTACATATGGTCGTCAAATGAATT >10.2|2361135|38|NC_017297|CRISPRCasFinder AAAAATATCCTTCTTGATTTACCCTCCTTATCTTTTAT |
cmr6gr7,cmr5gr11,cmr4gr7,csx1,cmr3gr5,cas10,cmr1gr7,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017297_10
The CRISPR arrays of NC_017297_10 >merge|NC_017297|10|2361041-2361200|CRISPRCasFinder TTAAATACCTCATATGTTATTGTTCAACATCCTTCCTTATTTCTACATATGGTCGTCAAATGAATTTTAAATACATCTTATGTTATTGTTCAATAAAAATATCCTTCTTGATTTACCCTCCTTATCTTTTATTTAAATACATCTTATGTTATTGTTCAAT >NC_017297|10|10|2361041-2361200|CRISPRCasFinder TTAAATACCTCATATGTTATTGTTCAAC ATCCTTCCTTATTTCTACATATGGTCGTCAAATGAATT TTAAATACATCTTATGTTATTGTTCAAT AAAAATATCCTTCTTGATTTACCCTCCTTATCTTTTAT TTAAATACATCTTATGTTATTGTTCAAT
>NC_017297.1|WP_154018626.1|2360525_2360675_+|hypothetical-protein MIYINLNTSYVKVQRTPVTIDGKEYTNLNTSYVNVQPYRYHKLYHHHNI >NC_017297.1|WP_012100144.1|2358746_2359268_+|DUF4825-domain-containing-protein MKNKLKILIPLIIILSLNLVGCGMNSEKKSKENIKNSSKVETYDLIKYKGTYVGDNSSVGSIIKNLPANKYSAGFSLQTSKEPYEITVNYKANENLGEENYNKFWSDKKADKLLEKNAVVLLSLIPNAEIIKFNVDNIGEESYKYDRKNLEQKYGNLKDLSKDNDSLKKFLNN >NC_017297.1|WP_012100142.1|2356807_2357548_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MINYYGSLCTVMYELLHPHAPEDELQFYLQYAKKEMKILEPLCGSGRFLVPFLERGFNITGFDMSEEMLKELYKKAPKAKVFQSSIEKFSPKEKYDYIFITSGSFSLFLDEDIAFNVLVKMKEALAPKGKFVFAAETTANIIHDREKYLKNCAVKTKEGYDIIFKSKSFYDKHKKILSTPSLYELYDGDKLLGKEEMDFRIKLYDFGELDKLILKAGFKGSHVFSDFNRRESIDKNTETFLYECYI >NC_017297.1|WP_012100141.1|2355312_2356704_+|peptide-MFS-transporter MSEKKQKHPIGLWLVNISIALQSYAAYAVVSILILFLTADVSKNGLGLSVPKAAAIIGLYQGINYMGSLVGGYITDKWLGIQKSLILGCFLTACGYLALFFAKPNIGSVWLGLIILIVAGAFFKAQISSLVGELYGKNELSKKDAAYSIFYMFINIGAFFGPIIAGLISDKWFAKVAADGEIAAYGYKYIFLMCTLIMIFIGIFIWIVSPKWLGEIGKYPVSKDKKTSTKSIEKAKAQPLTQLEKNRIKAMIVMFVFVIIFWSAWDQTATSFSLLANKLVNRTIGEFTMPVPWLTSINAIFCVVLSPIIANIWLKLGNSKKGDLSVPTKMGLGMILTGIAFLTLILGISTLGGVLDGSKQMNILFIIVAYFLLTVGELCLSPIGMAMFNKLAPAKYGSLAMGAWYLSFFFSSIISGKLAGFTDTLGYTQIFGLISGIVIVFGVILILLRNGLLKLMSLDELDK >NC_017297.1|WP_012100140.1|2353707_2354322_-|sugar-O-acetyltransferase MNQKDRMLAGLPYKACLDGLPEERMENKKKIYEYNHCFPDEHEKIHKLIRDILRKAGADVHIEAPFYCDYGKNIQVGDNFFANYNCTILDVGKVIIGNNVQFAPNVSLYTAGHPIHPDSRNSGYEYGIGITIGDNVWLGGNVVVNPGVHIGNNVVIGSGSVVTKDIPDNVIAIGNPCKIIREITEKDRKYYYKNYEFDIDDYKE >NC_017297.1|WP_012100139.1|2353170_2353665_-|hypothetical-protein MILAIECFIACVLFTLMILPSLYKEPIKHIMSYPTDIRKRVENLPQYKDVIQKKEKKHLTVKIIAVFMFAIIFAVVAYFSGAKSFSKAYIHVFTLFFVVNIYDMIVLDIGLFCHSKKTRIPGTEDMDKEYRNPWHHIKGAGIGTIIGAVVALLSRGMVHFISII >NC_017297.1|WP_012100137.1|2350567_2351302_-|hypothetical-protein MDKFRNMKKSHIALLAVMYIVLMGSLPRFTGWATIFSAIVVGGYFLKNKKDLKELTRKKKNFIFTGIIILAIIGSLNVAVGNNIQNEKLMAEKAKQEQEIKQEEQKKIEEKKLAEEQKRIQEEEAKKKAAEEKRKQEEEAKKKAAEEQKKQEELKRKQEEENKVKAENEQAQAAFAQSTGKGNSNSQSNESQNADDNQNYTVYKTRTGSKYHSSGCRYLKKSCYETTVSQARNEDLTPCSVCNP >NC_017297.1|WP_012100136.1|2349825_2350230_-|membrane-protein MNILISTCNIGIPVLMIFIGILYKCNSYKKIDKTLDLIVPIAMFFTGFSERDREHLYKNTNNLASVNRKCSLIWSISGVCTLLLTIISLILNKSDIYNTSVILLEPELLILVIVFITVEYILKRNFNKKISEQY >NC_017297.1|WP_012100135.1|2348874_2349591_-|transaldolase MKYNDLKIKIFADGADLNGMLDAYDKGIVKGFTTNPSLMKKAGITDYKEFAKEVLAKIKDMPVSFEVFSDDLETMEKEAEVLGNLGENVYIKIPVTNTKGESTAPLIKKLSEKGYHLNVTAIFTIDQVKEVVGALKSGVDSIVSVFAGRIADTGEDPVTIMKEASKICKTKEGVELLWASCREFYSIVEADKCGCEIITVTNDILKKMPNMGKDLKEYSIETVRGFYKDASSLGFSIL >NC_017297.1|WP_012100134.1|2348413_2348851_-|PTS-maltose-transporter-subunit-IIBC 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_017297_9 | 2360473-2360766 | TypeIII |
III-B
Consensus repeat of NC_017297_9
|
4 spacers
spacers of NC_017297_9
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cmr6gr7,cmr5gr11,cmr4gr7,csx1,cmr3gr5,cas10,cmr1gr7,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017297_9
The CRISPR arrays of NC_017297_9 >merge|NC_017297|9|2360473-2360766|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GCTTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAACTTTAGAAAAAAATAACGCTTTTGATGATTTATATAAATTTAAATACATCTTATGTTAAGGTTCAACGAACACCAGTTACAATAGATGGAAAAGAATATACAAATTTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAACCTTATCGCTATCATAAACTATATCACCATCATAATATTTAAATACATCTTATGTTAATATTCAACAGGTGAAGAAATTGGAGATACTTTAGAAGCAGTTTGATTTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAACC >NC_017297|9|3|2360473-2360765|CRT GCTTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAAC TTTAGAAAAAAATAACGCTTTTGATGATTTATATAA ATTTAAATACATCTTATGTTAAGGTTCAAC GAACACCAGTTACAATAGATGGAAAAGAATATACAA ATTTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAAC CTTATCGCTATCATAAACTATATCACCATCATAAT ATTTAAATACATCTTATGTTAATATTCAAC AGGTGAAGAAATTGGAGATACTTTAGAAGCAGTTTG ATTTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAAC >NC_017297|9|3|2360475-2360699|PILER-CR TTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAACTT TAGAAAAAAATAACGCTTTTGATGATTTATATAAAT TTAAATACATCTTATGTTAAGGTTCAACGA ACACCAGTTACAATAGATGGAAAAGAATATACAAAT TTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAACCT TATCGCTATCATAAACTATATCACCATCATAATAT TTAAATACATCTTATGTTAATATTCAAC >NC_017297|9|9|2360475-2360766|CRISPRCasFinder TTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAAC TTTAGAAAAAAATAACGCTTTTGATGATTTATATAAAT TTAAATACATCTTATGTTAAGGTTCAAC GAACACCAGTTACAATAGATGGAAAAGAATATACAAAT TTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAAC CTTATCGCTATCATAAACTATATCACCATCATAATAT TTAAATACATCTTATGTTAATATTCAAC AGGTGAAGAAATTGGAGATACTTTAGAAGCAGTTTGAT TTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAACC
>NC_017297.1|WP_012100144.1|2358746_2359268_+|DUF4825-domain-containing-protein MKNKLKILIPLIIILSLNLVGCGMNSEKKSKENIKNSSKVETYDLIKYKGTYVGDNSSVGSIIKNLPANKYSAGFSLQTSKEPYEITVNYKANENLGEENYNKFWSDKKADKLLEKNAVVLLSLIPNAEIIKFNVDNIGEESYKYDRKNLEQKYGNLKDLSKDNDSLKKFLNN >NC_017297.1|WP_012100142.1|2356807_2357548_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MINYYGSLCTVMYELLHPHAPEDELQFYLQYAKKEMKILEPLCGSGRFLVPFLERGFNITGFDMSEEMLKELYKKAPKAKVFQSSIEKFSPKEKYDYIFITSGSFSLFLDEDIAFNVLVKMKEALAPKGKFVFAAETTANIIHDREKYLKNCAVKTKEGYDIIFKSKSFYDKHKKILSTPSLYELYDGDKLLGKEEMDFRIKLYDFGELDKLILKAGFKGSHVFSDFNRRESIDKNTETFLYECYI >NC_017297.1|WP_012100141.1|2355312_2356704_+|peptide-MFS-transporter 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MLKNYINDQVVEVNVEVKNWEEAVRLGGKLLEEDGAVEHSYIDAMVDTVKNMGPYIVIAPGIAMPHARPEAGAKNIRIGLLKLKNPINFGNEEHDPVDIVIFLCAVDNKAHIEVLGELVQLIEDDDFLKIVRNASTKKEILDYIK >NC_017297.1|WP_014519318.1|2348094_2348385_-|PTS-sugar-transporter-subunit-IIB MNILTVCGNGIGSSLMLAMKIEEICKENGIAANVESTDFNSAQGKKADLIVTVKELAEQFEGRDVAVVRSYINKKKITEDVLEIIKQKDEELKNRS >NC_017297.1|WP_012100148.1|2363571_2364369_-|MerR-family-transcriptional-regulator MRYSITDLAEILGCTTSAIHYFEKEHLIEVEKGKNGHRYYNVVDVFRLLSYTKYRSMEIPMKTIIAQFGGEENNYKLIEEREAMYQLEALKRAQYYMNLADAIGEHLVSVRRIEELLDKYEFAKSPEVTIMCDDECGWLSKKRSSQRIIHEWVKAMPTVQLGVFDSRMGISNFGYLVKTKKREELELPLGLHTKQLKSTSCIHTIVMADEDFTQHPQKVFKKASEFAIKKGLEIGEIAWGKILLVEVEKGAKLHPYIELWISIKI >NC_017297.1|WP_012100149.1|2364417_2364711_-|hypothetical-protein MNFFTLNILIGAMAFIINKINNMSQDIDPFEAFNDIEENLDEIDNEKVTNFVNGLINASMSNPSIGYFFMFLVYMTPVLNLLLLIKGIINYFNRAVG >NC_017297.1|WP_012100150.1|2365144_2366443_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr6 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MYKDKETIYIKAISPIHAGSGQSLTSVDMPIQRESHSNIPKIEGSSLKGSVKHNVYHKLRVNKDNKKEEHKLFEKMFGSEDGNDCASAISITDAKLLLFPMRSAIDIYKLITCPYVLKRWKEETNQSFEDSILENIEDGHCVINQNSPLLSNDKVMLEEYIFEARKEDLSILFNGSFENLQINKVVILSDSDFIDMVTMYTEVITRNKINVETGTAQGTGLFSEEYLPAETVMYFSVLESAFYKGEEEVLKYFNENIGGIFQVGGNETIGKGIVKVINHDLLKGVTE >NC_017297.1|WP_012100153.1|2367791_2369063_-|hypothetical-protein MEHKNVEHLVIFSTLNQITNYIAIKNLKPKNIYNITFDQGFADTLKQGIDPKKWDDNLKNVLNDENIKPKRKNIEIKQCMYIDLEKFKEELEKNIEYVDEDTPIYWHITGGQRIFAIAIHDIVKKRPNDIIFYLEGNSEKIIYIGKEKTKFEYELKDLDFSTAFKLMGYNTEDLDSTRILKGKIKKNDKNEKLKYDKNEMKFYHRLYDWIINNDGEKTKSHIAFSIGDKKFEGTFKKLLLESNSINRTIRQEFLKKLFEELEKKSPSLKKIEYNFINSDEMKMEFPAGYIFEKLTGYQIYKVVEDNTRILGMAMSLKVYNEEGGHSTDELDIALLTNTGRIINFECKSGSLKGDNAKSHKFTTYSLSGVFGAPIFLTPLTYKGEKLEKELDKKLHSACKAADRANLEKIYLKDIKEKVKKLIG >NC_017297.1|WP_012100154.1|2369065_2370169_-|CRISPR-associated-protein-Cmr3 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_017297_11 | 2374002-2374313 | TypeIII |
III-B
Consensus repeat of NC_017297_11
|
4 spacers
spacers of NC_017297_11
>11.1|2374028|62|NC_017297|CRISPRCasFinder TAATATATTATGTTATTGCATTCAACAACAGTTTGATATCAGTCCCCTTATGGGACGTGCAA >11.2|2374116|41|NC_017297|CRISPRCasFinder CAACGACTTAGTGAATTTGAAGGATCTGGCAGAGAATTTGG >11.3|2374183|40|NC_017297|CRISPRCasFinder CAACCCCGGGGGTGTATAAGATATTCTTTTTCCTTATTTG >11.4|2374249|39|NC_017297|CRISPRCasFinder CAACGGTATTTCTTGATTAGTTGCAAGTATATTTTCCCA |
cas6,cmr1gr7,cas10,cmr3gr5,csx1,cmr4gr7,cmr5gr11,cmr6gr7 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017297_11
The CRISPR arrays of NC_017297_11 >merge|NC_017297|11|2374002-2374313|CRISPRCasFinder TTCTTATTATATATCATATTAATTTTTAATATATTATGTTATTGCATTCAACAACAGTTTGATATCAGTCCCCTTATGGGACGTGCAAATTTAAATATATCTTATATTAATGTTCAACGACTTAGTGAATTTGAAGGATCTGGCAGAGAATTTGGATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACCCCGGGGGTGTATAAGATATTCTTTTTCCTTATTTGATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACGGTATTTCTTGATTAGTTGCAAGTATATTTTCCCAATTTAAATACATATCATGTTAATGTT >NC_017297|11|11|2374002-2374313|CRISPRCasFinder TTCTTATTATATATCATATTAATTTT TAATATATTATGTTATTGCATTCAACAACAGTTTGATATCAGTCCCCTTATGGGACGTGCAA ATTTAAATATATCTTATATTAATGTT CAACGACTTAGTGAATTTGAAGGATCTGGCAGAGAATTTGG ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTT CAACCCCGGGGGTGTATAAGATATTCTTTTTCCTTATTTG ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTT CAACGGTATTTCTTGATTAGTTGCAAGTATATTTTCCCA ATTTAAATACATATCATGTTAATGTT
>NC_017297.1|WP_012100157.1|2373124_2373814_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MEFWELIVTAMLKKDIYFEDCGYIIGKNINKSMLWDKDLKEVHPKKQYKNYVFNSFYPIERDKFYKKDRLYIFNIRGLSKEFIDKIETCLCNLESNDFNVISTSKKEIKQRYIKELYTQTPLIITVDDKPWLQNDGDLDLFKQRLEDNLEKKYKSFFNEDIDVKGKFIKSIEFKNRKPMHYNYKNGKKLLANKVSIQIEDNEEAQKVAFLARAIGLGEKNPSIGAGFCK >NC_017297.1|WP_012100156.1|2371897_2373079_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr1 MERVKVTLGVVTDMFSEGVNSNKEAEFRITELKALLRSTFREFFYYTSLDDLKEKEELLFGSTNRKSPVIIKFGRNNKIRFKDKKKLVLHKNMFKEAIPSGTTINIIFQSRYEKYLKTYVYTLKLASIMGALGKRSRKGMGAFKIIKIDDNEIIDINKSVEDLLCGYEEQFKINEKIYLIKTRKLLKEKQYKDNCTKYKIECDANMPKNVNYVKNIYKIYLGNLTEEKSRNKIDCTLRNFSWLNHYRLSDLNKIFSNETIKKIEKETGKRIDNEISLENLFNKEILGNYNYKYKEKEVTKKNILTRFACPVYVTIYQKSRGELIENYLIIKELNYDYVYKKILDKKVSNKKVTEQKKEEIRTDIKSELKEMKPIDKYYVEEFVKKIIECCEVK >NC_017297.1|WP_012100155.1|2370149_2371895_-|type-III-B-CRISPR-associated-protein-Cas10/Cmr2 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MKFLKIKPYDNTFFRLGNNFEFKISNVIQTKNVAYPSTFFGAIFTAILANNDEFRESFLNIPGNTDHLEILNIKQIYLYAEKQGMIYIKAPKDIFVNNNEVKFGNFKEIKDGESSIKYDYYLEEPDGNELERADNYFVSIKEFYDKYRYKVLDNIDLKQEDEIFAKNIKTGIALDKSTGIVKESLLYTIEQTEFKNITEDYYSNDWSFVVEYAIDNDFLKKQGYPKVKNLDKGELKLGGETKVCTYEIIENSDINEFKSKTSQGFLKPGEKLKVILTSDSYFTKSFAELFNDEMKILALVNDKPIYIGGFDVAKNEEKAMYKGYSAGTVLLLQNESGKDINLQKYLDMKLRNKLKNGFNEYICVKGE >NC_017297.1|WP_012100153.1|2367791_2369063_-|hypothetical-protein MEHKNVEHLVIFSTLNQITNYIAIKNLKPKNIYNITFDQGFADTLKQGIDPKKWDDNLKNVLNDENIKPKRKNIEIKQCMYIDLEKFKEELEKNIEYVDEDTPIYWHITGGQRIFAIAIHDIVKKRPNDIIFYLEGNSEKIIYIGKEKTKFEYELKDLDFSTAFKLMGYNTEDLDSTRILKGKIKKNDKNEKLKYDKNEMKFYHRLYDWIINNDGEKTKSHIAFSIGDKKFEGTFKKLLLESNSINRTIRQEFLKKLFEELEKKSPSLKKIEYNFINSDEMKMEFPAGYIFEKLTGYQIYKVVEDNTRILGMAMSLKVYNEEGGHSTDELDIALLTNTGRIINFECKSGSLKGDNAKSHKFTTYSLSGVFGAPIFLTPLTYKGEKLEKELDKKLHSACKAADRANLEKIYLKDIKEKVKKLIG >NC_017297.1|WP_012100152.1|2366914_2367778_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr4 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MIKLLKVKSFSTKRGAEFENKETFNKLKQEFYKNPKIGDYVFCSIEEDKLRGLEWRLYQDIDNTNVYEQWQKWKKDSCHYGLKLDKFTNVFNGREESVNKKIDQSIHLNIDDYLKEDKNLYENIDFNVKVFDKLVVGLGEHSVFETDIKLHHTYGVPYIPASAVKGCFRSHIIQKYFQSKEKKAEEDKNFIEIFGGEYKDKTYSGNVIFIDLFPKNSFEIKKDVMTPHYQNGYTDDGNITPIEFLTVENTLFRFILRISNKCLLQDNNSKIKLKENQDVRDLIVEELVEMIATHGIGAKTSVGYGYFEEVTKEECLEQTENNEKRREEEILEAKEKKKLMKMNDSEKKLYLVEKISDCEKRKEGLRKLFTNRKQEELEQTEIEKLAKLIKRDLEDSGKWRYKIGKKGKKNKELERIEKICEILNIDLPKNSN >NC_017297.1|WP_012100149.1|2364417_2364711_-|hypothetical-protein MNFFTLNILIGAMAFIINKINNMSQDIDPFEAFNDIEENLDEIDNEKVTNFVNGLINASMSNPSIGYFFMFLVYMTPVLNLLLLIKGIINYFNRAVG >NC_017297.1|WP_012100148.1|2363571_2364369_-|MerR-family-transcriptional-regulator MRYSITDLAEILGCTTSAIHYFEKEHLIEVEKGKNGHRYYNVVDVFRLLSYTKYRSMEIPMKTIIAQFGGEENNYKLIEEREAMYQLEALKRAQYYMNLADAIGEHLVSVRRIEELLDKYEFAKSPEVTIMCDDECGWLSKKRSSQRIIHEWVKAMPTVQLGVFDSRMGISNFGYLVKTKKREELELPLGLHTKQLKSTSCIHTIVMADEDFTQHPQKVFKKASEFAIKKGLEIGEIAWGKILLVEVEKGAKLHPYIELWISIKI >NC_017297.1|WP_004451526.1|2376882_2377731_-|PhzF-family-phenazine-biosynthesis-protein MEYFHVDVFSNEILYGNGLTVVFCNEELEDNLMLKLTQEFKQFETIFVRRIDNSIFNARIFTVDEELDFAGHPILGAAATIHSNIFRNEEDIAITFQLNQKTIIVNSKKIEEYYEVQMNQGKAEFLCEVSKEKRNKYVHALNLSEENLSEEFPMEVVSTGLPYLLVPLTSGIENAKIISSKFEEMLKEVGAKFAYIFDVNYIEGRTWDNQGNVEDVATGSAAGPLGAYLYKHNIFNVGHEIIINQGRFVGRPSKIKVSMSISEKEILVSGEVAILAKGTILL >NC_017297.1|WP_012100160.1|2378021_2378942_-|PhzF-family-phenazine-biosynthesis-protein MRKFEYTLVDVFTNQVFGGNQLAVFKDAEKLSSEEMQSIARELNFSETTFVTDIGPNHKKLRIFTPKTELPMAGHPTIGTAFVLADEGAVETREGINKLIFEEGVGEIAVSIHVEGGRIRSIEMEQPMPVFGQVFGDIRTAAELLSLDIDDIDTTSPIQTVSTGVPFLYIPLKSLDVISKIKLRLDTWEKFFSASEDTKHIFAFTRETLHAGSTIHSRMFAPAMGIAEDPATGGASGPLGAYLVEHGLVAHGYDGKYMIINEQGIEMGRPSFINITVSKTYNNFSEIKIGGTCVKFGAGLIELPTL >NC_017297.1|WP_012100161.1|2379266_2380760_+|PLP-dependent-aminotransferase-family-protein 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_017297_12 | 2376525-2376617 | TypeIII |
III-B
Consensus repeat of NC_017297_12
|
1 spacers
spacers of NC_017297_12
>12.1|2376552|39|NC_017297|CRISPRCasFinder TTATTGCCTATATGATAGACGAAGATTATAGATTCTTAT |
cas6,cmr1gr7,cas10,cmr3gr5,csx1,cmr4gr7,cmr5gr11,cmr6gr7 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017297_12
The CRISPR arrays of NC_017297_12 >merge|NC_017297|12|2376525-2376617|CRISPRCasFinder TTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAATTATTGCCTATATGATAGACGAAGATTATAGATTCTTATTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAA >NC_017297|12|12|2376525-2376617|CRISPRCasFinder TTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAA TTATTGCCTATATGATAGACGAAGATTATAGATTCTTAT TTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAA
>NC_017297.1|WP_012100157.1|2373124_2373814_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MEFWELIVTAMLKKDIYFEDCGYIIGKNINKSMLWDKDLKEVHPKKQYKNYVFNSFYPIERDKFYKKDRLYIFNIRGLSKEFIDKIETCLCNLESNDFNVISTSKKEIKQRYIKELYTQTPLIITVDDKPWLQNDGDLDLFKQRLEDNLEKKYKSFFNEDIDVKGKFIKSIEFKNRKPMHYNYKNGKKLLANKVSIQIEDNEEAQKVAFLARAIGLGEKNPSIGAGFCK >NC_017297.1|WP_012100156.1|2371897_2373079_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr1 MERVKVTLGVVTDMFSEGVNSNKEAEFRITELKALLRSTFREFFYYTSLDDLKEKEELLFGSTNRKSPVIIKFGRNNKIRFKDKKKLVLHKNMFKEAIPSGTTINIIFQSRYEKYLKTYVYTLKLASIMGALGKRSRKGMGAFKIIKIDDNEIIDINKSVEDLLCGYEEQFKINEKIYLIKTRKLLKEKQYKDNCTKYKIECDANMPKNVNYVKNIYKIYLGNLTEEKSRNKIDCTLRNFSWLNHYRLSDLNKIFSNETIKKIEKETGKRIDNEISLENLFNKEILGNYNYKYKEKEVTKKNILTRFACPVYVTIYQKSRGELIENYLIIKELNYDYVYKKILDKKVSNKKVTEQKKEEIRTDIKSELKEMKPIDKYYVEEFVKKIIECCEVK >NC_017297.1|WP_012100155.1|2370149_2371895_-|type-III-B-CRISPR-associated-protein-Cas10/Cmr2 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MYKDKETIYIKAISPIHAGSGQSLTSVDMPIQRESHSNIPKIEGSSLKGSVKHNVYHKLRVNKDNKKEEHKLFEKMFGSEDGNDCASAISITDAKLLLFPMRSAIDIYKLITCPYVLKRWKEETNQSFEDSILENIEDGHCVINQNSPLLSNDKVMLEEYIFEARKEDLSILFNGSFENLQINKVVILSDSDFIDMVTMYTEVITRNKINVETGTAQGTGLFSEEYLPAETVMYFSVLESAFYKGEEEVLKYFNENIGGIFQVGGNETIGKGIVKVINHDLLKGVTE >NC_017297.1|WP_012100151.1|2366435_2366915_-|type-III-B-CRISPR-module-associated-protein-Cmr5 MGDLKNVNLQVAQFALEKVKEVLNYYEKEILKCKEEEREQIEKKQKMLSSKYKTLSKKMTVLIQKNGLIGTLVFILSKVKKEKANELVLQHIINWCEEDCKLDFLRVDKENTNPNEAFIENITKLSNQEYRLVTKEIMNLFGWIKRFTDGMIEGEVQND >NC_017297.1|WP_012100150.1|2365144_2366443_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr6 MIKLLKVKSFSTKRGAEFENKETFNKLKQEFYKNPKIGDYVFCSIEEDKLRGLEWRLYQDIDNTNVYEQWQKWKKDSCHYGLKLDKFTNVFNGREESVNKKIDQSIHLNIDDYLKEDKNLYENIDFNVKVFDKLVVGLGEHSVFETDIKLHHTYGVPYIPASAVKGCFRSHIIQKYFQSKEKKAEEDKNFIEIFGGEYKDKTYSGNVIFIDLFPKNSFEIKKDVMTPHYQNGYTDDGNITPIEFLTVENTLFRFILRISNKCLLQDNNSKIKLKENQDVRDLIVEELVEMIATHGIGAKTSVGYGYFEEVTKEECLEQTENNEKRREEEILEAKEKKKLMKMNDSEKKLYLVEKISDCEKRKEGLRKLFTNRKQEELEQTEIEKLAKLIKRDLEDSGKWRYKIGKKGKKNKELERIEKICEILNIDLPKNSN >NC_017297.1|WP_012100149.1|2364417_2364711_-|hypothetical-protein MNFFTLNILIGAMAFIINKINNMSQDIDPFEAFNDIEENLDEIDNEKVTNFVNGLINASMSNPSIGYFFMFLVYMTPVLNLLLLIKGIINYFNRAVG >NC_017297.1|WP_012100148.1|2363571_2364369_-|MerR-family-transcriptional-regulator MRYSITDLAEILGCTTSAIHYFEKEHLIEVEKGKNGHRYYNVVDVFRLLSYTKYRSMEIPMKTIIAQFGGEENNYKLIEEREAMYQLEALKRAQYYMNLADAIGEHLVSVRRIEELLDKYEFAKSPEVTIMCDDECGWLSKKRSSQRIIHEWVKAMPTVQLGVFDSRMGISNFGYLVKTKKREELELPLGLHTKQLKSTSCIHTIVMADEDFTQHPQKVFKKASEFAIKKGLEIGEIAWGKILLVEVEKGAKLHPYIELWISIKI >NC_017297.1|WP_004451526.1|2376882_2377731_-|PhzF-family-phenazine-biosynthesis-protein MEYFHVDVFSNEILYGNGLTVVFCNEELEDNLMLKLTQEFKQFETIFVRRIDNSIFNARIFTVDEELDFAGHPILGAAATIHSNIFRNEEDIAITFQLNQKTIIVNSKKIEEYYEVQMNQGKAEFLCEVSKEKRNKYVHALNLSEENLSEEFPMEVVSTGLPYLLVPLTSGIENAKIISSKFEEMLKEVGAKFAYIFDVNYIEGRTWDNQGNVEDVATGSAAGPLGAYLYKHNIFNVGHEIIINQGRFVGRPSKIKVSMSISEKEILVSGEVAILAKGTILL >NC_017297.1|WP_012100160.1|2378021_2378942_-|PhzF-family-phenazine-biosynthesis-protein MRKFEYTLVDVFTNQVFGGNQLAVFKDAEKLSSEEMQSIARELNFSETTFVTDIGPNHKKLRIFTPKTELPMAGHPTIGTAFVLADEGAVETREGINKLIFEEGVGEIAVSIHVEGGRIRSIEMEQPMPVFGQVFGDIRTAAELLSLDIDDIDTTSPIQTVSTGVPFLYIPLKSLDVISKIKLRLDTWEKFFSASEDTKHIFAFTRETLHAGSTIHSRMFAPAMGIAEDPATGGASGPLGAYLVEHGLVAHGYDGKYMIINEQGIEMGRPSFINITVSKTYNNFSEIKIGGTCVKFGAGLIELPTL >NC_017297.1|WP_012100161.1|2379266_2380760_+|PLP-dependent-aminotransferase-family-protein 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MSNKRNLQSLRSFYICILIFNMVSNSIFHLNNNGFNIKLFKNFTIRSVILLDLNILLFLIIVIAFEKKINIDEEANTQLNTRIRPLYLVNIFFIAYILVCIFLLKDIDVILSSFIMEIIYIGIIILSKKIITLELTNRQLQWQKACGYIDEDCEESSFLWRFKLWWSPHVNVPFKNRWKGSSRLLYDLALVYGIIISKGNLFSLILLILLLPDVISWLEGLLGLQTSLTGICTGITEHHSKNSHVLYHKVYVTDYKNKREITFYVDGPLFIHENSHMTVVHGTFSKRVLYVEGLNLDIR >NC_017297.1|WP_012100167.1|2386588_2387911_+|APC-family-permease MLEKKYGLWTTVSMVIGIVIGSGVFFKADNILMASGGNVKTALLAWLVGAISMIFGALVFAECANRFERSNGIVDYAEGMLSEKFAYLIGWFNGIIYYPAIAAVLAWAAGNYTAILFNKDGNFVWIMAAIYMIGIYILNYISPILSGKFQIASTAIKLVPLMIIAIFGIFQGVNNGILIENFSKVSIISDSGSGFAAAVLGAAFAYEGWIIATTINGEIKDAKNTLPKALVFGSLVIVIIYILYFLGIVGMIPTETILKQGDNTVNVAARTVFGNFGASILTIFIIVSCLGTLNGLILGGSRSFYSLAIRGQGIKPDAFSKLNSKTNIPTNSTIANFILICIYLVVWYMNFKGLFPNKMFVDISELPIALIYGIYIIIYIAYMMKMKDLSFIKRFVIPSLALMGALIVVYGGLSKPSVIIDLGISVFVFLSGLLFYNKKK >NC_017297.1|WP_012100169.1|2387978_2388713_-|protein-kinase-family-protein MVIKFLKRDTKYLPEQKIHEYTVLKVLGEGRFGICYLVQSNNKQYILKQLKTKMLKKVGSKVIYEQEILKNINHNCIPKFVKTLQFEKIFGYVLKYKEGKTFEEIICEDEYVFKREEIYDICIQIIEILKYLHKNGIVHRDIRIPNTIYYKKKVNLVDFGLARWINNKRYTENVDFSYLGDFLLHLYYTSFQCKTFKGKPWYEELDLFSEEMNFLKRLLGIEKKYKNIEEVERDFLLLKSNYNK >NC_017297.1|WP_012100170.1|2389215_2389989_-|2-hydroxyglutaryl-CoA-dehydratase MYTMGLDIGSTTSKGVIMKDGKEIVASVLVPVGTGTSGPLKLIKELKEKSNLTEKDIEKTVVTGYGRIQYKDADKQISELSCHAKGVAFLIPGARTIIDIGGQDAKAMKLNDKGKLINFIMNDKCAAGTGRFLDVMAGVLETDVSKLGEISEKSTKEVSISSTCTVFAESEVISHLSANAKKEDIIAGIHTSVVRRVSTLAMRVGIEDQVVMVGGVARNKGIVKAMEKELGHDIKVPELAQLTGALGAAIYAFEETK >NC_017297.1|WP_012100171.1|2390082_2391648_-|membrane-protein 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_017297_13 | 2382754-2382851 | TypeIII |
III-B
Consensus repeat of NC_017297_13
|
1 spacers
spacers of NC_017297_13
>13.1|2382787|32|NC_017297|CRISPRCasFinder TAATTATCATTATAAAAACCCTCATCCATATG |
cas6,cmr1gr7,cas10,cmr3gr5,csx1 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017297_13
The CRISPR arrays of NC_017297_13 >merge|NC_017297|13|2382754-2382851|CRISPRCasFinder CAAATTTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAACTAATTATCATTATAAAAACCCTCATCCATATGCAAATTTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAAC >NC_017297|13|13|2382754-2382851|CRISPRCasFinder CAAATTTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAAC TAATTATCATTATAAAAACCCTCATCCATATG CAAATTTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAAC
>NC_017297.1|WP_012100163.1|2382320_2382542_-|hypothetical-protein MNQGQEKFLGFILERVEEDKVEEAKALLADNFKKQAEGNFTTQFIPKMAMLLKPDKIEEVQTVMKQFAENFSH >NC_017297.1|WP_012100162.1|2381831_2382197_-|glyoxalase/bleomycin-resistance/dioxygenase-family-protein MNFCWITLNVSNMEESLNFYHKIIGLKISERFNVGEDIEIAMLGETDGTKVELIYNKKQSVLSRSEGLSIGFEVKLLDEAMELLKNKNIPIKRGPISPLPSSRFFFIDDPNGIEIQIVQHN >NC_017297.1|WP_012100161.1|2379266_2380760_+|PLP-dependent-aminotransferase-family-protein MNIKIDKNSIITITQQLVHYFSDRIMSGFIKAGQKLPSIRSLAKELGISPMTIIKAYNNLKQNGLVTTIQGKGTYVNERNSTVKSNNITEKDSFQWQMSVPDYLSRSQFRYNPNLSYSNDYYNLSVASLNHKLLPTKTILKDSLGLIQNDIKLLSEYPPAQGDYEFRNIMSQYLRSKEIATSPENILVTSGSQQGISLIASTFIGPGDIVVMETPTYPGAIDLFKCRGAVILTVPVDSEGMRTDILMNLCDKHSPKLIYTIPNFHNPTGYSMSSKRKAELLDIAIYNDILIVEDDPWNEISYKREKIKTIKSMDTDGHVVYIKSLSKILGPSYRLAVIISESSILSRLIAAKANHDLGTSVLIQKTIINFIQSNKITYYIESLNKQLVKRRDKVISLLKSHSPSGMKWAIPEGGINIWVTLPKNFNVEKLLSYSITTKNISFLPGTICYPNEVEFNNLRICFTYLDEEFIEDTIIELCNLIKLLYTTKNITDYRPII 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MSNKRNLQSLRSFYICILIFNMVSNSIFHLNNNGFNIKLFKNFTIRSVILLDLNILLFLIIVIAFEKKINIDEEANTQLNTRIRPLYLVNIFFIAYILVCIFLLKDIDVILSSFIMEIIYIGIIILSKKIITLELTNRQLQWQKACGYIDEDCEESSFLWRFKLWWSPHVNVPFKNRWKGSSRLLYDLALVYGIIISKGNLFSLILLILLLPDVISWLEGLLGLQTSLTGICTGITEHHSKNSHVLYHKVYVTDYKNKREITFYVDGPLFIHENSHMTVVHGTFSKRVLYVEGLNLDIR >NC_017297.1|WP_012100167.1|2386588_2387911_+|APC-family-permease MLEKKYGLWTTVSMVIGIVIGSGVFFKADNILMASGGNVKTALLAWLVGAISMIFGALVFAECANRFERSNGIVDYAEGMLSEKFAYLIGWFNGIIYYPAIAAVLAWAAGNYTAILFNKDGNFVWIMAAIYMIGIYILNYISPILSGKFQIASTAIKLVPLMIIAIFGIFQGVNNGILIENFSKVSIISDSGSGFAAAVLGAAFAYEGWIIATTINGEIKDAKNTLPKALVFGSLVIVIIYILYFLGIVGMIPTETILKQGDNTVNVAARTVFGNFGASILTIFIIVSCLGTLNGLILGGSRSFYSLAIRGQGIKPDAFSKLNSKTNIPTNSTIANFILICIYLVVWYMNFKGLFPNKMFVDISELPIALIYGIYIIIYIAYMMKMKDLSFIKRFVIPSLALMGALIVVYGGLSKPSVIIDLGISVFVFLSGLLFYNKKK >NC_017297.1|WP_012100169.1|2387978_2388713_-|protein-kinase-family-protein 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MSENSKSKVGFLTAFQVAAVWFGAHVGGGFATGNQTMNFFVKHGWHSIWLPAVIIIIIGLTYKESLILAKNYGTYDYKSWSKKMYEPYDKVFSFIFEIGYLMIVLLGTGGSIAGSASLMETYGVNYLVGVLITGGIFYILTIYGSELIRKASTIITVLILIFLTIIVIVGIVNNSGNLSHLVSTKYSPSSFGTVLYSGLRYAGYQAFVVAIVLSASDTLKSDKAINKSILLGVILNGAMITLSCIMLLAWMPGAQKETIPILYICKRLNDGFLLFSYSVVLFLAFVSTGIGCVFGAVARFEHVFKKPENIKKRRGLISLVCMILSMAISLFGLTKIVVIGYGYVGIIGIFVVVIPCIVVGRIKNNKFKKEQQSILIENKDDTSSKEDNDNVLIGDQDDMLEENKDSILQDQDDISKEDEENMPVEEQDDASKENKESVSVEDQVDVLKGEQDSVPEGEDDTLKEDGENAPVEGQDDASKGNKKSVLVEGQDDMPKEDKESASIEEQKSTSTQEDGNASKEE >NC_017297.1|WP_004451547.1|2391947_2392997_-|electron-transfer-flavoprotein-subunit-alpha/FixB-family-protein MDIKKDLSSYKNVWVIAEQRQGKITPVVIELLGEGRKIANDIGVELCAVLLGYNVDNLADELIKFGADKVYYANDPLLEKYTTDGYAKVIVDAVNDIKPEIVLIGATHIGRDLAPRIASNLDTGLTADCTKLEVDPEDKKLKQTRPAFGGNIMATIICPDNRPQMSTVRPGVMDKAVKDESRKGQILKLSADLIKDDIRTEVIEIVKSKKELVSLTDANFIVSGGLGLGNPDGFKLLKQLADRLGGVVGSSRAAVDAGWIENSHQVGQTGTTVKPTVYIACGISGAIQHLAGMQESDIIIAINKNESAPIFEVADYGIVGDLYDVVPKLLELLDDDDRINRLFEESKIV >NC_017297.1|WP_012100172.1|2393015_2393801_-|electron-transfer-flavoprotein-subunit-beta/FixA-family-protein MRIIVCVKQVPDTTEVKIDPKTGTLIREGVPSILNPDDANALEEALKMKDKDENVTVSVVSMGPPQADVMLRECLAMGADEAYLVSDRAFAGSDTWATSKVIASAIRKIGNYDIIFAGRQAIDGDTAQVGPQISEKLGIPQVTYVQDFRMEDDKITVQRQLEDGYEIIRVKKPALLTAVSSLNEPRYMAVDKIFDAYKKEIKVLTIDDLDIEKEGVGLKASPTKVFRSFTPAPKGKGVMLEGSTEEMVEKLVVSLKQKHII >NC_017297.1|WP_012100173.1|2393839_2394973_-|acyl-CoA-dehydrogenase MLFKKEHELLRKSVRDFVDRELKDIPEEVDTEGKLPKELLQKLAKYKFISPVIPKEYGGAGADYVSYCIIMEEISKRCASTGTFITAGASLVALPLLNFGTDKQKEKYLKPLAKGEYIGSFGLTEPGAGSDAGAGETTAVLEGDYYILNGRKTFITNAPICDFAIVTAMTEKGKGSRGISAFIVESKWDGFSTGAHENKMGIRGTETADLIFENVKVPKENLIGKEGKGFKIALNTLDVGRIGVAAQALGIAQGALDEAIKYVKERVQFGRPLAKFQNTQFTIADMETKVQAARWLVYDAAEKKDNGINPGVESAMAKYYAAEIANEVAYKALQLHGGYGFMKDYPIERMYRDARITSIYEGTSQVQQMVIAAKALK >NC_017297.1|WP_004451550.1|2395470_2396598_-|2-hydroxyacyl-CoA-dehydratase MDNIKNILSKLEVIVKNPKKVVSDYKERTGNKVIGCFPVYTPEEIVYAADMLPIGIWGGDVEANLAKQYYPAFCCSIMQSCMEFGLKGVYEGLSAVIIPGMCDTLNCMGQNWKFAIKDIPYIALVHPQNRKLEAGVEYLVEEYKHVKAKIEEIRGKEITEEELQNSIEIYNEHRKVMRSFVDEAAKHPNTINNYQRNLVIKSGFFMRKDEHTKIVKELNELLSVLPEEKYDGKKVLVTGILLDSKEMLDVFEENKLRIVADDLAQESRQFRTDVPEGKDALDRLARQWSNIEGCSLAYDPKKIRGSMIAKEAKAKGIDGVVFAMMKFCDPEEYDYPIVKKDIEKGDIPTTMIEVDQQNKSVEQIRTRIQTFSEIL >NC_017297.1|WP_003358160.1|2396597_2397830_-|2-hydroxyacyl-CoA-dehydratase MADKKEVKKNAAKVINGILAKSYADAWKAKEEGRPVGWSTSVFPQELVEVFGLDVLYPENQAAGVAAKKESLSLCEAAESAGYSIDLCAYARTNFGLLEKGGSENLNMPKPDFICCCNNICNQVIKWYENIAKELDIPLIMIDTTFNNENEVTENRIKYLRAQFEEAIKQLEKISGKKFDPKKFEEVMKISAENGKLWKYSMSLPSGSFPSPMNGFDLFTYMAVIVCYRGKIETTEAFKLLISELEDNIKNKATSFRGEEKYRIMMEGIPCWPYIGYKMRTLAGYGVNMTGSVYPHAWALQYEVNDLDGMAKAYSTMFNNVNLERMCKYRVDSLIDGNCDGAFYHMNRSCKLMSFIQYEMERQVFEKTGIPYAGFDGDQADPRNFSKAQFETRLQGLVEVMEERKKGGNK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_017297_14 | 2476163-2476408 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NC_017297_14
|
5 spacers
spacers of NC_017297_14
>14.1|2476181|30|NC_017297|CRT TCTGCATCTTCTTTCACATTCTCTTCTGCA >14.2|2476229|30|NC_017297|CRT TCTACATCTTCTTTCACATTCTCTTCTGCA >14.3|2476277|18|NC_017297|CRT ATCGCGATCTCTTTCGCA >14.4|2476313|18|NC_017297|CRT TCTACATCTTCTTCTGCA >14.5|2476349|42|NC_017297|CRT TTCGCACTCTCTTTCACACTCTCTTCTGCATCTTCTTCTGCA |
casR |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017297_14
The CRISPR arrays of NC_017297_14 >merge|NC_017297|14|2476163-2476408|CRT TCTTCTTTCACATTCTCTTCTGCATCTTCTTTCACATTCTCTTCTGCATCTTCTTTCGCATTCTCTTCTACATCTTCTTTCACATTCTCTTCTGCATCTTCTTTCGCACTCTCTATCGCGATCTCTTTCGCACTCTCTTTCGCACTCTCTTCTACATCTTCTTCTGCATCTTCTTTCGCACTCTCTTTCGCACTCTCTTTCACACTCTCTTCTGCATCTTCTTCTGCATCTTCTTTCGCACTCTCT >NC_017297|14|4|2476163-2476408|CRT TCTTCTTTCACATTCTCT TCTGCATCTTCTTTCACATTCTCTTCTGCA TCTTCTTTCGCATTCTCT TCTACATCTTCTTTCACATTCTCTTCTGCA TCTTCTTTCGCACTCTCT ATCGCGATCTCTTTCGCA CTCTCTTTCGCACTCTCT TCTACATCTTCTTCTGCA TCTTCTTTCGCACTCTCT TTCGCACTCTCTTTCACACTCTCTTCTGCATCTTCTTCTGCA TCTTCTTTCGCACTCTCT
>NC_017297.1|WP_012100240.1|2475093_2475675_-|flavodoxin-family-protein MKYCILMGSPRKNGNTFKLLKPFIEELELQQVQYDLIWLYDKHIEPCTACRNCQKDWTIFGCRYSDDVQEIFDKVYDSDVIILATPIYSWYCTPPMKSLLDRLVYGMNKYYGDEKGPSLWSGKKLAIITTCGYRPENGADLFEEGIKRYCKHSKLKYIGMLAERDFGYKSVFITDDKIEHSRSFARKLISDKV >NC_017297.1|WP_101502759.1|2474972_2475080_-|hypothetical-protein MIYNFLVTCNNYIITLDRIIQYEYAVFLFTNLNSC >NC_017297.1|WP_012100239.1|2473894_2474896_-|linear-amide-C-N-hydrolase MYHSRWKGSHYEAGLHYGNILHKNGVNPMSSIPISDERKEFSVKCLPIYEKFYPEIVEEIKGMANGLKIGYMDIASFIFTMYCFVFDNKCSCLAISNKGKTLFARNSDFVVSIEKLCDSAYYKLNNVYSFVGNTTAWTEMEDGINEHKLAVGLTFIYPIKIKPGFNAGMLVRYILEKCKTTDEAILALKKLPIASPQTITLADKSGNIAVVECNCDKVVVLNPQQGKNYVFTTNHFISEEMQEYQFNGVDDVHSHERYETLVNAFGNSKDYSLDFIKNLLSGKMGFMCQYDRKQGLDTVWSSIYDLTEGTIFRVEGNPSRKVFKKDKRLIFAK >NC_017297.1|WP_012100238.1|2473391_2473730_+|hypothetical-protein MCNCEKRERQTHVHEFLGSTRLAEIQTEPHNHRFAGVSGQAIRSGNSHVHRITTNTDFFDHFHMINVLSGPAIPVGNGRHVHFVSGVTSVNDGHRHEFIFATLIEAPIFEED >NC_017297.1|WP_012100237.1|2472926_2473196_-|DUF1599-domain-containing-protein MMDKANKHKIICEELNKIYKVKNHDYGDSFGETYKKLGIISAVTRITDKVNRLQSLCIKDALVDESIKDTLIDLANYSIMTLIELEEEE >NC_017297.1|WP_012100236.1|2472357_2472606_-|hypothetical-protein MAEQIKTNSTPIRIQRNANDVAMELLDIYLKDQYETDKPMQADYLRNLYLKFYATAEMAERIHFKYLKEYLPEGLKEMAEKF >NC_017297.1|WP_012100233.1|2468644_2470438_+|M24-family-metallopeptidase MKVSERLIKLRNLMTEKNIDMYIVPTADFHQSEYVGEHFKARKYITGFSGSAGTAVITKGNAGLWTDGRYFLQAGNQLKGTTVELFKMGEPGVPTIEEYIMNTLSDKGTLGFDGRVVSMVDGQTYEKILSSKNANINYDCDLINDIWEDRPSLSEEPAFELDIKYTGESTASKLKRVRKAMTDAGTNVHVITSLDDIAWILNIRGNDIEFFPLVLSYLIITMDEAHLFINEDKLSDEIKSNLKKNGVSFIHPYNEIYKAVKKFNTSDIVLVDPARMNYALYNNIPKDVKKVENRNPSVLFKAMKNPIEIENIKKAQIKDGVAHTKFMYWLKHNIGKETITEISASNKLDEFRAEQGGFIRPSFEPISSFAEHAAIVHYAPTPETDVELKEGSLFLTDTGAGFYEGSTDITRTYALGEVPQIMKDHFTLTVNSNMHLAHARFLYGCNGMNLDILARAPFWNRGLNFNHGTGHGVGYLMNIHEAPTGFRWQYRANETHPFEEGMVITDEPGIYIAGSYGVRIENELLVCKGEQNEYGQFMYFEPISYVPIDLDAINPDLMTAEEKAWLDEYHESVYNKISPYLTEEEKNWLKEYTRKIS >NC_017297.1|WP_004451638.1|2467870_2468467_-|DUF3862-domain-containing-protein MLEKKEEPFYKKIWFWIIAIVIVCGVASYGDSKKINITDTKNSAKTETKKDDTRKVTYEKFCKIKIGSTYEEVKSILGEYKESKESEINGMKVVIYSWYNDDNSNMEVIVKNNKVIGKAQAGLSMGKADVNLIKYAKITTGMDYSKVEEILGDGKLMSISKTNGSTKSIYLWANPNGTNMNVTFQNGKVTAKNRLGLN >NC_017297.1|WP_012100232.1|2467300_2467729_-|MarR-family-transcriptional-regulator MMKLENRIRIINEEWTDIYYLLHYIDKENLTHQAIRLLQYIDKNKETTIGDLAKHISTSSNTASEHIKRLIKKGLVTKQRSEVDERKVIVKITEEGKHTLHRHINLDEAKLKKVLGSLTDSELEVIQKGFLILSEGAKKCLP >NC_017297.1|WP_004451635.1|2466983_2467313_-|DUF3147-family-protein MFTVVKVFISAIIIGVVTEIARKSPTYGGIIAALPIVSLLSLTWIYIQGEQTQNLSKFVFGVLKGFPATIILLLVIGLSLRANRSLVLSIFLGACGWGVILAVQNFIFN >NC_017297.1|WP_134865116.1|2476663_2476762_-|hypothetical-protein MKLTQKQKVFDDYYIETGNVKKQLLKLDIVKK >NC_017297.1|WP_003400697.1|2476819_2477023_-|hypothetical-protein MGVENPTCHVKILNNETKESVYHWRKEINIVEIEAIKISKKVYCNNQYYDIKTLVFNYDNLTLEIII >NC_017297.1|WP_012100242.1|2477834_2478167_+|hypothetical-protein MSYCEEMQTHVHEFLGSTRLAEIQTEPHNHRFAGVSGQAIRRGNSHVHRITTNTDFFDHFHMINVITGPAIPVGDGRHVHFVSGVTSVNDGHRHEFIFATLIDSPIFQEA >NC_017297.1|WP_014519337.1|2478505_2478733_+|hypothetical-protein MEYEIKDCIDAGSEYCPCHLAETGDCILCSQLSGKKFCDCINWKGVCIYQEFIWNRKKAKEERETYLGKIIKKIT >NC_017297.1|WP_079996738.1|2478729_2479488_+|sulfide/dihydroorotate-dehydrogenase-like-FAD/NAD-binding-protein MEDKTIVLTISLSHKLCQQLVYPGSFVFLRNKNDSGFYDAPISIMDVDTEENFIKVAIEIRGVKTKTIASLNKNDDIWVRGPFWNGVLGLKNVYMTKDGTSLLISRGIGQAPLVPVMKKLYSNGNKIIAIIDNSGYENILIKNYLELYNAEVIELNTLKAGELTEELKNKLKEILDKEDINIIHCSTQDIIIYKLVEFLDGKVPISSSNNAKMCCGEGVCGTCTVRYKGHIVKRLCKVQTEPKYVFRERRLI >NC_017297.1|WP_003392410.1|2479582_2479750_-|aspartyl-phosphate-phosphatase-Spo0E-family-protein MSKEQLLLEKIEEARTLMNQLISEKSQLIDEELVLLSQKLDDLLNEYNKFLRQNH >NC_017297.1|WP_012100244.1|2480050_2480458_-|hypothetical-protein MQIITGAVVNILGVVIIYLSTVVVQYFKQKRQASINQMGNEQYNMHYNIAKSIFYAIEQEYRLVSKSGEQKAEKFNKMLMEKIPSLKQEDLDHFREAIVGEINTQIKQSKLLEPADSITNEKKQLLDSKENKIEN >NC_017297.1|WP_012100245.1|2480538_2481132_-|hypothetical-protein MKSIFKKLMPIIFIAILSISLTGCSSKPDETVKGFFGALKQQDIKKASTFINANSFYKELKVDEFDSKEQEKIVKAVLSKFDYSLGDVEKNGNTATAKVSVTSIDLGKITIKTIDKVLPNLIDEAFSKGKIDEKKQQAVIIQHMLNSINDPNAPKIKTNINVKLVKGDKGWLIEPDEELANALSGNLYSVAKKFQSK >NC_017297.1|WP_012100246.1|2481304_2481754_-|peptide-methionine-(R)-S-oxide-reductase-MsrB MNKNYSKKSKEELKKILTPEEYYVTQENGTEAPYKNEYWDLNEEGIYVDITNGEPLFTSKDKFNSSCGWAAFSKPIDRKIIKESIDKSHGMTRTEVRSKNADSHLGHVFCDGPEKLGGLRYCINSASLKFIPKNELEEEGYGEYLKLFK >NC_017297.1|WP_012100247.1|2481985_2482582_-|superoxide-dismutase MAHTLPNLNYDYNALEPHYDEQTLKIHHDIHHKVYVDGLNKAEQKLQEARESGDFALIKHWEKEIAFHGSGHILHTLFWENMVPNGNLNPEGSAIERIKQDFGDYEKFKKQFTEAAIAVEGSGWTILAWNPMFQKLVILQAEKHQNLTQWGVVPLLILDLWEHAYYLKYQNRRAEFINAWWNIVNWDIVNTRYDNAIK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_017297_15 | 3875654-3875767 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NC_017297_15
|
1 spacers
spacers of NC_017297_15
>15.1|3875681|60|NC_017297|CRISPRCasFinder ATGAACCGAATGCTCTAGCCAGCTGAGCTATTCCGCCAAAAAATAATTGGTTGCGGAGGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017297_15
The CRISPR arrays of NC_017297_15 >merge|NC_017297|15|3875654-3875767|CRISPRCasFinder AGGACTTGAACCTACGACACTTCGGGTATGAACCGAATGCTCTAGCCAGCTGAGCTATTCCGCCAAAAAATAATTGGTTGCGGAGGCAGGACTTGAACCTACGACCTTCGGGTT >NC_017297|15|14|3875654-3875767|CRISPRCasFinder AGGACTTGAACCTACGACACTTCGGGT ATGAACCGAATGCTCTAGCCAGCTGAGCTATTCCGCCAAAAAATAATTGGTTGCGGAGGC AGGACTTGAACCTACGACCTTCGGGTT
>NC_017297.1|WP_012101155.1|3872923_3875311_-|stage-II-sporulation-protein-E MQYGAELLPYQRLKKIDKQKYKKSINFSSIVNMIIFFISSFLVSRVIFINNMAPFGIAFLLSISRQKEYNKYLFISAIGSIIGYISLINNIGYTSLNMLEVVTITLLSYVFKNVEDKKNTIIICMIIYLEIFTYKIFVTKISTTMAMLGATFEIGCIFPIYYIINYSILCFKNMNTSHLYSNEEIVSMAITLSLVVSGTWGANIAGINLMNLISITMILIIGYVKGSTSASAIGVAMGAISGLSSNNMMIYISIYGLCGLISGVFKETGKLMTGISYLISFLILKFYSNINYDFKIIEVLISLTLFYIIPNKIYMKMEYELDYQKKQKNLQENYMDKIKGIITDKLGNFSDVLYNMGNILEKLVDNEKLAMKNKSGALIENLADRVCSSCNMNHICWKREGYYTYNALGELIQNYQENKKELPYEIERKCVKRTQLINNTEDIANNYIINEMWKKRLSECREVLANQINTMAYSVEEITKEFGQSIRFSNLTEKDIRRMLNKNNIKYKDIFCYNNENGRLIINLKIDACTGKQKCIKEILPLINKVTGKLMCVANESCNLDLKNNDCNIIFEETPKYHVASYVNKMAKDGEQCNGDSYSFGKLQSGSYMTIISDGMGSGPQAVQESSAVVELIERFAQSGFSKITAINTINSIMSIKFSQDEKFSTVDLSNIDLYEGKIDFMKVGAVASFIKRGTEVYTIKSKTLPIGVLDKVDIDIETRDLKNGDIIVMVSDGVLDYESSSAGKVEWVVEFLKNTTLNNPKEISEELIENAKKLSKGKVKDDMTAIVQKVYSLY >NC_017297.1|WP_012101154.1|3871368_3872775_-|tRNA-lysidine(34)-synthetase-TilS MKDVVINTIKKYNMIEANDKIIVGVSGGPDSMCLLHMLCLLKNQLRIKDIYVAHINHGVRGAESDADEKYVENFCYMNNLGFFSKTINMDKIAKEKGISSESAGREARYDFFNYLRKELGAQKIATAHNANDQAETVLMRIMRGTGLQGLIGINPIRDDLYIRPLINVLREDIENYCDKYELNPRIDKTNLQSIYTRNRIRLELIPYIKDNFNEDIVNTLCRFSNIVSKDNNYLEEVSKDKFERYCTKKLQRVIIDKRAFLEHESISTRILREAILYINQNLYNLEMRNIYDVLELSLNATGKFVNLPSNIKAENIYGDIHLYKEDNCIKKVNNIQCELKIGFNQVEDLNINLKIYSIKDHNYNINDNKYIQYFDYDKVSNEKIYLRNRKNGDKFTPLGMKGSKKLKDFFIDLKIPREQRDKLKLVCFGEEIAWIIGCRTGNNFKIDKNTKNVLEITVERGEANGFDK >NC_017297.1|WP_003359412.1|3870839_3871385_-|hypoxanthine-phosphoribosyltransferase MDLISRDIEKILISEEQIQSKINELGDQISKDYDGKNLMLVGILKGSVPFMADLLKRITIPCTMDFMAVSSYGNSTTSSGVVRILKDLDFEIEGKDILIVEDIIDSGITLKYLLENLRARKPASINIACLLNKEERRKAEIDVHYLGFNVPDYFLVGYGLDFAEKYRNLPYIGILKEEVYK >NC_017297.1|WP_012101153.1|3868952_3870758_-|ATP-dependent-metallopeptidase-FtsH/Yme1/Tma-family-protein MKKFSSATAWIVVLILVIFSSLMLVRTGTNSTAINFSEFQKSWIQNEIKSFQVKDDKMTVVGTLKDGKQYETIVPSERLFQFINEHPKNGEVKEVYVKPASVPIWVQYLPMILIVLMLLGFWFMFMQQAQGGGGNRNVMNFGKSKAKMATPDKKKVTFDDVAGADEEKEELAEIVDFLKSPKRYIDMGARIPKGVLLVGPPGTGKTLLAKAIAGEAGVPFFSISGSDFVEMFVGVGASRVRDLFEQAKKNSPCIIFIDEIDAVGRQRGAGLGGGHDEREQTLNQLLVEMDGFGANEGIIMIAATNRPDILDPALLRPGRFDRQIVVGAPDVKGREAILKVHSKNKHLAEEIKLEVLAKRTPGFTGADLENLMNESALLAVRKKKELIDMEDLEEAVTRVIAGPEKKSRVIDEEDRKLTAYHEAGHAVVMKLLPHADPVHQISIVPRGMAGGYTMHLPEKDSSYMSKSKLEDEIVGLLGGRVAEKLIIGDISTGAKNDIDRATTIARKMVMDYGMSNTLGPIAFGSGHDEVFLGRDLGKGRNFSEDVAYKIDQEIKKLIDTGYNEAERLLNENISKLHAVAQELLKKEKLEANEFEEIFKNS >NC_017297.1|WP_003399652.1|3867076_3868750_-|formate--tetrahydrofolate-ligase MFKSDIEIAQESKMKNIKNIAEKIGLTEEDIDLYGKYKCKISLDVLESNKDKKDGKLILVTAINPTPAGEGKSTVTVGLGQALWKKNKKAVIALREPSLGPVFGIKGGAAGGGYSQVVPMEDINLHFTGDMHAITSANNLLAAAIDNHIHQGNILKIDQRRILFKRVMDMNDRALRNVIVALGGKINGFPREDGFMITVASEIMAILCLAEDLMDLKNKMGEILVAYSTEGKPIYCKDLEVQGAMALLMKDAIKPNLVQTLENTPAIIHGGPFANIAHGCNSILGTKMALKLGDYVITEAGFGADLGAEKFFDIKCRKANLKPNCVVIVATVRALKYNGGIPKENLKEQNMEALSKGIKNLGKHIENVNKFGVPAVVAINKFISDTEEEIEFIKKYCKELGAEVSIAEVWEKGGNGGLELADKVLDTIENKESKFNPIYEETLNIKQKIETIAQEIYGAEGVDYSKEAEKQISEIEKLDLDKKPVCMAKTQYSLSDDAKLLGRPCGFRINVKEVRISNGAGFIVVLTGNVMTMPGLPKKPAANNMDVLSDGNIVGLF >NC_017297.1|WP_003359441.1|3866145_3866922_-|type-III-pantothenate-kinase MILVLDVGNTNIVLGIYKNKELIANWRLATDNKRTADEYGIQVIELFSHNNLSFSDIEGVIISSVVPNIMYSLEHMISKYFNIKPIIVGPGVKTGINIKYDNPKEVGADRIVNAVAAHEIYKKPLIIIDFGTATTFCAVTKEANYLGGTICPGIKISSDALFDKAAKLPRVELVKTPGVICKNTVASIQSGIIYGYAGQVDYIVSKMKKEMMDLGEEEPFVVATGGFAKLISEESKSIDEINAILTLEGLRVIYEKNK >NC_017297.1|WP_003399651.1|3865164_3866136_-|tRNA-dihydrouridine-synthase-DusB MNIGNLIFHNNVFLAPMAGFTDIAFREICKELGCGLVYTEMVSAKALYYESNNTKELCVISNKEKPVALQLFGHEPEIMANAVEFFNNNDDVCILDVNMGCPAPKIVKNGDGSALMKDPKLASEIIKAMKKVAKKPITVKFRKGFDKNNINAVEFAKIMEQSGVDAITIHGRTREQMYEGKADWAIISKVKSSVSIPVIGNGDVFSSEDALEMINKTDCDGIMIGRGAQGNPWIFKQINEKIKGEHVYYPTPQERIDICINHYKKSLEYFEEHKAVREMRKHVAVYVKGLKNCTDIKDKVNMEKDPDKVLEELIKYRETLREF >NC_017297.1|WP_003399650.1|3864287_3865115_-|hypothetical-protein MKPIIDIRSNIIKDYNKNNFIFKIKDEFLTHFRGNCFIEELNLVISKVRISPNFNEKAYHKNIKRSIKYSRHKDFVLAPKTFRFLDYYLLNSFQKELFALSVCESIKTVLRLKGKTIRNSCIVIFDAKEEYVFNIINCVSKEAKYIILVSEDLNKLANLNDYIIANYGITPIITKDIKTSFSKADFIITTKDVEIIKSIPVWYINNSKIYENKGNCNINNIIYKVPWKTNLNFNPELLGAILCQMDKKNVEEAIRYNGIVLDKIMFNKDIVKIIR >NC_017297.1|WP_003361709.1|3863674_3864157_-|transcription-elongation-factor-GreA MSEAKKYVMTYEGVKKLEEELEYLKTVKRKEITEKIKVALSFGDLSENSEYDEAKNEQAFVEGRIIQLENMLKNASIVDENEVPKDIVSVGSIVKVKDYEFDEEVEYIIVGSAEADPMNNKISNESPVGHGLIGKKVGDIIEVTVPDGVSKYEILEVNRA >NC_017297.1|WP_003359337.1|3862141_3863656_-|lysine--tRNA-ligase MSKEDNVINSFEEQANELMKERFQKLKELQSNGKDPFDVYKVERTHTSKEVKDNYEDLEGKTVTVAGRLMSKRVHGKAGFSDIHDRYGKIQLYIKINDVGEEKLKEYKTFDIGDIISVTGTVFKTKTGETSIHITDFQLVCKSLRPLPEKWHGLKDPDLRYRQRYVDLIINQDVRDTFIKRTAIIKSMREFLDNRGFLEVETPILSPIAGGAAAKPFITHHNALDIDMYLRIATELYLKRLIVGGFEKVYEIGKNFRNEGIDIRHNPEFTAIELYEAYADYNDMMEITENMIAYICEKVLGTTKVEYEGAEIDFTPPWRRLTMVDAVKEYAGVDFNIIKNDIEARTIAKEKHIEFKKELKDCTKGDVLIGLFEEFCEDKLMQPTFICDYPVENSPLTKKKRGNEAFTERFEGFVFGREVCNAYSELNDSIVQKERFMQQLKERELGDDEAYMMDDDFITSLEVGMPPTGGLGIGIDRLIMFLTDTHSIRDVILFPTMKPQPNNQ >NC_017297.1|WP_003359471.1|3876166_3876571_-|RNA-binding-protein-S1 MTLNAGSILEGTVVNITNFGAFVEIEGKTGLVHISEVSDSYVKDIREYLKEQDKVKVKVISIDDKGKISLSIKQAMQQKKSCKPAEIDWSREKPKKNEANFEDRLSKFLKDSEERFQDLKKHQDSRGRGSKKSY >NC_017297.1|WP_003359350.1|3876632_3876902_-|septum-formation-initiator-family-protein MKKINVKKLIFFLAIVYSTVIFINQQITMHKIRDQISEKKIELKEVKEKNQKLQDEVKLSKSKDYIEKLARERLRLIKKGETPVINNTQ >NC_017297.1|WP_003359440.1|3876996_3877395_-|spore-cortex-biosynthesis-protein-YabQ MVISISKQLGLLIFSFLSGLITGVFFDIYRSIRMDKNLSPIIKIIEDILFWCLAAIVIFIFLLYNDCAFIGVYVYLWIAIGLYIYIFFISKYLNPIFIYVVQNINKFFRISINIIVYPFKILIYKIKSNKMH >NC_017297.1|WP_012101156.1|3877410_3877701_-|sporulation-protein-YabP MEKKEFKNDDKISNLNLESRKRLILSGINEVISFNEQEIMLKTTLGDLDIKGSNLKMNKLDVQNGDVVIVGTINSCAYLNNESKANRSNIFSKLFK >NC_017297.1|WP_012048379.1|3877820_3878060_-|RNA-binding-S4-domain-containing-protein MRLDKFLKVSRIIKRRTVAKEACENERVFVNSKIAKPGTEVKEGDILEIQYANKTMKYEIISVLEHVKKEDAENMYKII >NC_017297.1|WP_003359333.1|3878133_3878412_-|HU-family-DNA-binding-protein MNKSELITSMAEKSKLTKKDAETALKAFIESVEEALEGGEKVQLVGFGTFETRERAERVGRNPRTKEEITIPASIAPVFKAGKELKEKVNKK >NC_017297.1|WP_012101157.1|3878539_3879985_-|nucleoside-triphosphate-pyrophosphohydrolase MINIIGLGPGSKESITLGTIDSLKTVDKVFLRTEKHPTVEYINKLGITYETFDGEYEVGESFDDVYNSIAKSLIEASKNYSDIIYAVPGHPLVAEKSVDILIKLCRQNDIKFKILPAVSFVDALMESLLLDPVEGLKIIDAFDIKKQAMDKRIGTIITQVYDKFIASEVKLNLMNYYKDDTEIFFVRAAGIEGLEEIRKIPLYELDRQHNIDHLTSVYIPKVPNNNYDFMDLLDIMDKLRGEDGCPWDREQTHVSLKKYLIEESYEVIEAIDNKDVDMLIEELGDVLLQVVFHSQIGKEDGFFEIKDVIQSICDKMINRHPHVFSDLEINNSSEVLENWDKIKSKEQGTETYTDSIRHIAKTLPALMRADKVQKKASKVGFDWDNIEDAMKKIIEEYKEIEDVYKSKNKVKILEEIGDLLFSVVNVARFLDIDPENALNYSIDKFINRFQYIEDEAISMGRQLDNMSLEEMDKLWKEAKNK >NC_017297.1|WP_012101158.1|3879999_3881535_-|polysaccharide-biosynthesis-protein MKKQSLIKGTFILGVAGIIAKFLGLFFRWPLQMLIGDEGIGYYQMSYPLYMFFIAAASGIPVAVSKLVSERNAVRDEGGIISVLKEAMIFMFIMGMGFTIILLLFSKDIIRFLKWDTRSYYSLIGISLAPLFISIMSVFRGFFQGMQNMNYTAISQLIEQLGRVIFGVGLAYILLPRGIEYSAGGAAIGAAAGGLLGGIYLFLKYLGVKKEFRVKKVKRNFKIMNTILYTAIPISIGSAVGTIMSLIDSALVPQKLLEAGFTYKQSTILYGQLTGKAFTLVNVPLTLSVSLCAALVPIIAEDYILNRRMAVLKKVELAIKISMVIAIPSCLGLNFMAKPILNLIFPGQEAGYEILKHLALSIPFIVLCQTSTAILQGIGRYIRPIINLCIGCILKIVITLILVPMNNINIYGAVIGTIAGYVISAILNMMALKKSLNISINYYEIMIKPLIASTIMIIAVVFIYFYAYNYTISSKIACLIAVFLGMIIYFIIIGLIGILDYNYIKRKIIKR >NC_017297.1|WP_003495805.1|3881667_3882219_-|stage-V-sporulation-protein-T MKATGIVRRIDDLGRVVIPKEIRRTLRIREGDPLEIFTDREGGVILKKYSPIGDLSEFSKGYTDSLQQTIGNIVMICDKDTIISISGAPKKEYLEKKISYDLEKIIEERKTVYFGDDNKAVSIYDDEDVDEKYSAQVISPIIAEGDTVGAVIIVSKEGGKKFNELEMKLAETASSFLGKQMEE >NC_017297.1|WP_012101159.1|3882417_3883428_-|peptidylprolyl-isomerase MKSAKKLLSVLCLGIFILTFTACDMVEKTPEAKAKSTIAKVNGEKIQRKDLDESPNMQQVLSQIKTQYGEEFEKTEQGKEVIKEQKKQILENLITEKVLLQKGKELKVIPKDEELNKEADKKVNEIKAVYNNDEKKFEETLKSTGFTKETLKEYLKDQIVIEKVINEVTKDVKVEDKDAQKYYNENQSMFTEKPNTMNVSHILVKTEDEAKKVKKRLDAKEDFAKVAKEVSQDTGSKEKGGLLGDISYSDSNYDPTFMKAAIALKSGEISNPVHTQWGYHIIKINSKKEYPVKKFDSVKEDIKKQLKQEKQQEAYTKKIEEWKKASKIKTYEKNLL |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
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NC_017297_14 | 14.4|2476313|18|NC_017297|CRT | 2476313-2476330 | 18 | NC_017297.1 | 2198240-2198257 | 1 | 0.944 |
1. spacer 14.1|2476181|30|NC_017297|CRT matches to position: 2476157-2476186, mismatch: 0, identity: 1.0
tctgcatcttctttcacattctcttctgca CRISPR spacer tctgcatcttctttcacattctcttctgca Protospacer ******************************
2. spacer 14.2|2476229|30|NC_017297|CRT matches to position: 2476157-2476186, mismatch: 1, identity: 0.967
tctacatcttctttcacattctcttctgca CRISPR spacer tctgcatcttctttcacattctcttctgca Protospacer ***.**************************
3. spacer 14.4|2476313|18|NC_017297|CRT matches to position: 2198240-2198257, mismatch: 1, identity: 0.944
tctacatcttcttctgca CRISPR spacer tctacttcttcttctgca Protospacer ***** ************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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NC_017297_6 | 6.4|2352713|36|NC_017297|PILER-CR | 2352713-2352748 | 36 | NZ_CP013848 | Clostridium botulinum strain Af650 plasmid pRSJ14_1, complete sequence | 37322-37357 | 1 | 0.972 |
NC_017297_13 | 13.1|2382787|32|NC_017297|CRISPRCasFinder | 2382787-2382818 | 32 | NZ_CP013709 | Clostridium botulinum strain F634 plasmid pRSJ2_2, complete sequence | 64680-64711 | 1 | 0.969 |
NC_017297_13 | 13.1|2382787|32|NC_017297|CRISPRCasFinder | 2382787-2382818 | 32 | NZ_CP013682 | Clostridium botulinum strain 1169 plasmid pRSJ8_1, complete sequence | 66917-66948 | 1 | 0.969 |
NC_017297_13 | 13.1|2382787|32|NC_017297|CRISPRCasFinder | 2382787-2382818 | 32 | NZ_CP013295 | Clostridium botulinum strain CDC_54064 plasmid pNPD1_1, complete sequence | 77633-77664 | 1 | 0.969 |
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NC_017297_7 | 7.1|2359520|35|NC_017297|CRT | 2359520-2359554 | 35 | NZ_CP013682 | Clostridium botulinum strain 1169 plasmid pRSJ8_1, complete sequence | 165473-165507 | 2 | 0.943 |
NC_017297_7 | 7.1|2359520|35|NC_017297|CRT | 2359520-2359554 | 35 | NZ_CP013295 | Clostridium botulinum strain CDC_54064 plasmid pNPD1_1, complete sequence | 176189-176223 | 2 | 0.943 |
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NC_017297_12 | 12.1|2376552|39|NC_017297|CRISPRCasFinder | 2376552-2376590 | 39 | NZ_CP031095 | Clostridium botulinum strain CFSAN034200 plasmid p1_CDC51232, complete sequence | 264936-264974 | 3 | 0.923 |
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NC_017297_9 | 9.4|2360700|36|NC_017297|CRT | 2360700-2360735 | 36 | NZ_CP013295 | Clostridium botulinum strain CDC_54064 plasmid pNPD1_1, complete sequence | 77357-77392 | 4 | 0.889 |
NC_017297_9 | 9.4|2360700|36|NC_017297|CRT | 2360700-2360735 | 36 | NZ_CP013844 | Clostridium botulinum strain A634 plasmid pRSJ19_2, complete sequence | 109842-109877 | 4 | 0.889 |
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NC_017297_9 | 9.11|2360700|38|NC_017297|CRISPRCasFinder | 2360700-2360737 | 38 | NZ_CP013295 | Clostridium botulinum strain CDC_54064 plasmid pNPD1_1, complete sequence | 77357-77394 | 6 | 0.842 |
NC_017297_9 | 9.11|2360700|38|NC_017297|CRISPRCasFinder | 2360700-2360737 | 38 | NZ_CP013844 | Clostridium botulinum strain A634 plasmid pRSJ19_2, complete sequence | 109842-109879 | 6 | 0.842 |
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NC_017297_7 | 7.11|2359717|32|NC_017297|PILER-CR | 2359717-2359748 | 32 | NZ_CP035776 | Klebsiella pneumoniae strain R46 plasmid pR46-270, complete sequence | 48808-48839 | 8 | 0.75 |
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NC_017297_7 | 7.4|2359716|34|NC_017297|CRT | 2359716-2359749 | 34 | NZ_CP041094 | Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae strain KPCTRSRTH01 plasmid unnamed2, complete sequence | 21221-21254 | 9 | 0.735 |
NC_017297_7 | 7.4|2359716|34|NC_017297|CRT | 2359716-2359749 | 34 | NZ_CP024459 | Klebsiella pneumoniae strain QS17-0161 plasmid pMR0617aac, complete sequence | 204868-204901 | 9 | 0.735 |
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NC_017297_7 | 7.4|2359716|34|NC_017297|CRT | 2359716-2359749 | 34 | NZ_CP047635 | Klebsiella pneumoniae strain K2606 plasmid unnamed2, complete sequence | 22415-22448 | 9 | 0.735 |
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NC_017297_7 | 7.9|2359586|34|NC_017297|PILER-CR | 2359586-2359619 | 34 | GU943017 | Uncultured phage MedDCM-OCT-S04-C1227 genomic sequence | 7844-7877 | 9 | 0.735 |
NC_017297_7 | 7.9|2359586|34|NC_017297|PILER-CR | 2359586-2359619 | 34 | GU943022 | Uncultured phage MedDCM-OCT-S04-C890 genomic sequence | 7790-7823 | 9 | 0.735 |
NC_017297_7 | 7.9|2359586|34|NC_017297|PILER-CR | 2359586-2359619 | 34 | CP013001 | Bacillus thuringiensis strain XL6 plasmid, complete sequence | 131053-131086 | 9 | 0.735 |
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NC_017297_14 | 14.1|2476181|30|NC_017297|CRT | 2476181-2476210 | 30 | NZ_KX982169 | Staphylococcus sciuri strain wo27-9 plasmid pWo27-9, complete sequence | 34158-34187 | 9 | 0.7 |
NC_017297_14 | 14.1|2476181|30|NC_017297|CRT | 2476181-2476210 | 30 | NZ_KX982171 | Staphylococcus sciuri strain wo28-1 plasmid pWo28-1, complete sequence | 38466-38495 | 9 | 0.7 |
NC_017297_3 | 3.2|1903512|40|NC_017297|CRISPRCasFinder | 1903512-1903551 | 40 | NC_018689 | Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC429, complete sequence | 417214-417253 | 10 | 0.75 |
NC_017297_5 | 5.1|2352164|35|NC_017297|CRISPRCasFinder | 2352164-2352198 | 35 | NC_008259 | Enterococcus faecium plasmid pCIZ2, complete sequence | 1636-1670 | 10 | 0.714 |
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NC_017297_7 | 7.2|2359585|36|NC_017297|CRT | 2359585-2359620 | 36 | GU943014 | Uncultured phage MedDCM-OCT-S04-C1161 genomic sequence | 18218-18253 | 10 | 0.722 |
NC_017297_7 | 7.2|2359585|36|NC_017297|CRT | 2359585-2359620 | 36 | GU943013 | Uncultured phage MedDCM-OCT-S04-C1035 genomic sequence | 11891-11926 | 10 | 0.722 |
NC_017297_7 | 7.2|2359585|36|NC_017297|CRT | 2359585-2359620 | 36 | GU943017 | Uncultured phage MedDCM-OCT-S04-C1227 genomic sequence | 7842-7877 | 10 | 0.722 |
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NC_017297_7 | 7.4|2359716|34|NC_017297|CRT | 2359716-2359749 | 34 | NZ_CP038334 | Escherichia coli O157:H7 strain N8B7-2 plasmid pN8B7-2 | 39352-39385 | 10 | 0.706 |
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NC_017297_7 | 7.9|2359586|34|NC_017297|PILER-CR | 2359586-2359619 | 34 | KC821626 | Cellulophaga phage phi39:1, complete genome | 23600-23633 | 10 | 0.706 |
NC_017297_7 | 7.9|2359586|34|NC_017297|PILER-CR | 2359586-2359619 | 34 | MG543995 | Staphylococcus phage UPMK_1, partial genome | 138793-138826 | 10 | 0.706 |
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1. spacer 6.1|2352711|36|NC_017297|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013848 (Clostridium botulinum strain Af650 plasmid pRSJ14_1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
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2. spacer 6.4|2352713|36|NC_017297|PILER-CR matches to NZ_CP013848 (Clostridium botulinum strain Af650 plasmid pRSJ14_1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
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15. spacer 12.1|2376552|39|NC_017297|CRISPRCasFinder matches to NC_010379 (Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.923
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17. spacer 12.1|2376552|39|NC_017297|CRISPRCasFinder matches to NC_012654 (Clostridium botulinum Ba4 str. 657 plasmid pCLJ, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.923
ttattgcctatatgatagacgaagattatagattcttat CRISPR spacer atattgcctatatgatagacgaagattatagattctttg Protospacer ************************************
18. spacer 12.1|2376552|39|NC_017297|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP006909 (Clostridium botulinum CDC_1436 plasmid pCBG, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.923
ttattgcctatatgatagacgaagattatagattcttat CRISPR spacer atattgcctatatgatagacgaagattatagattctttg Protospacer ************************************
19. spacer 12.1|2376552|39|NC_017297|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP031095 (Clostridium botulinum strain CFSAN034200 plasmid p1_CDC51232, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.923
ttattgcctatatgatagacgaagattatagattcttat CRISPR spacer atattgcctatatgatagacgaagattatagattctttg Protospacer ************************************
20. spacer 9.4|2360700|36|NC_017297|CRT matches to NZ_CP013709 (Clostridium botulinum strain F634 plasmid pRSJ2_2, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.889
aggtgaagaaattggagatactttagaagcagtttg CRISPR spacer tagcgaagaaattggagatactttagaagcagcttg Protospacer .*.****************************.***
21. spacer 9.4|2360700|36|NC_017297|CRT matches to NZ_CP013682 (Clostridium botulinum strain 1169 plasmid pRSJ8_1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.889
aggtgaagaaattggagatactttagaagcagtttg CRISPR spacer tagcgaagaaattggagatactttagaagcagcttg Protospacer .*.****************************.***
22. spacer 9.4|2360700|36|NC_017297|CRT matches to NZ_CP013295 (Clostridium botulinum strain CDC_54064 plasmid pNPD1_1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.889
aggtgaagaaattggagatactttagaagcagtttg CRISPR spacer tagcgaagaaattggagatactttagaagcagcttg Protospacer .*.****************************.***
23. spacer 9.4|2360700|36|NC_017297|CRT matches to NZ_CP013844 (Clostridium botulinum strain A634 plasmid pRSJ19_2, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.889
aggtgaagaaattggagatactttagaagcagtttg CRISPR spacer tagcgaagaaattggagatactttagaagcagcttg Protospacer .*.****************************.***
24. spacer 12.1|2376552|39|NC_017297|CRISPRCasFinder matches to NC_025146 (Clostridium botulinum plasmid pCB111 DNA, complete sequence, strain: 111) position: , mismatch: 4, identity: 0.897
ttattgcctatatgatagacgaagattatagattcttat CRISPR spacer atattgcttatatgatagacgaagattatagattctttg Protospacer ******.*****************************
25. spacer 14.1|2476181|30|NC_017297|CRT matches to NZ_CP010418 (Azotobacter chroococcum NCIMB 8003 plasmid pAcX50c, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.867
tctgcatcttctttcacattctctt-ctgca CRISPR spacer acggcatcttctttcatattctcttgctgc- Protospacer * *************.******** ****
26. spacer 14.2|2476229|30|NC_017297|CRT matches to NZ_CP010418 (Azotobacter chroococcum NCIMB 8003 plasmid pAcX50c, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tctacatcttctttcacattctctt-ctgca CRISPR spacer acggcatcttctttcatattctcttgctgc- Protospacer * .************.******** ****
27. spacer 9.11|2360700|38|NC_017297|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013709 (Clostridium botulinum strain F634 plasmid pRSJ2_2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.842
aggtgaagaaattggagatactttagaagcagtttgat CRISPR spacer tagcgaagaaattggagatactttagaagcagcttgtg Protospacer .*.****************************.***
28. spacer 9.11|2360700|38|NC_017297|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013682 (Clostridium botulinum strain 1169 plasmid pRSJ8_1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.842
aggtgaagaaattggagatactttagaagcagtttgat CRISPR spacer tagcgaagaaattggagatactttagaagcagcttgtg Protospacer .*.****************************.***
29. spacer 9.11|2360700|38|NC_017297|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013295 (Clostridium botulinum strain CDC_54064 plasmid pNPD1_1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.842
aggtgaagaaattggagatactttagaagcagtttgat CRISPR spacer tagcgaagaaattggagatactttagaagcagcttgtg Protospacer .*.****************************.***
30. spacer 9.11|2360700|38|NC_017297|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013844 (Clostridium botulinum strain A634 plasmid pRSJ19_2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.842
aggtgaagaaattggagatactttagaagcagtttgat CRISPR spacer tagcgaagaaattggagatactttagaagcagcttgtg Protospacer .*.****************************.***
31. spacer 5.2|2352229|35|NC_017297|CRISPRCasFinder matches to NZ_MK275623 (Clostridium perfringens strain JXJA17 plasmid p5, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
gagaatgtatttaagaatacaataaatgaatacaa CRISPR spacer atggaagaagttaataatacaataaataaatacaa Protospacer . *.* * * **** ************.*******
32. spacer 7.11|2359717|32|NC_017297|PILER-CR matches to NZ_CP050860 (Klebsiella pneumoniae strain SCH6109 plasmid pSCH6109-Vir, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagc CRISPR spacer atactaaatatgcatgtgaagatggaaaaaca Protospacer *** **************** *** * *
33. spacer 7.11|2359717|32|NC_017297|PILER-CR matches to NZ_KY565557 (Escherichia coli strain Mcp0221 plasmid pMcp0221, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagc CRISPR spacer atgataaatatgaatgtgaatatgaatatgat Protospacer **.********* *********** *. *...
34. spacer 7.11|2359717|32|NC_017297|PILER-CR matches to CP043017 (Escherichia coli strain 388808_gen plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagc CRISPR spacer atgataaatatgaatgtgaatatgaatatgat Protospacer **.********* *********** *. *...
35. spacer 7.11|2359717|32|NC_017297|PILER-CR matches to NZ_CP035776 (Klebsiella pneumoniae strain R46 plasmid pR46-270, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagc CRISPR spacer atactaaatatgcatgtgaagatggaaaaaca Protospacer *** **************** *** * *
36. spacer 7.11|2359717|32|NC_017297|PILER-CR matches to NZ_CP038334 (Escherichia coli O157:H7 strain N8B7-2 plasmid pN8B7-2) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagc CRISPR spacer atgataaatatgaatgtgaatatgaatatgat Protospacer **.********* *********** *. *...
37. spacer 7.11|2359717|32|NC_017297|PILER-CR matches to CP019690 (Shigella sonnei strain 75/02 plasmid p75-02_2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagc CRISPR spacer atgataaatatgaatgtgaatatgaatatgat Protospacer **.********* *********** *. *...
38. spacer 7.11|2359717|32|NC_017297|PILER-CR matches to NZ_CP041094 (Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae strain KPCTRSRTH01 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagc CRISPR spacer atactaaatatgcatgtgaagatggaaaaaca Protospacer *** **************** *** * *
39. spacer 7.11|2359717|32|NC_017297|PILER-CR matches to NZ_CP024459 (Klebsiella pneumoniae strain QS17-0161 plasmid pMR0617aac, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagc CRISPR spacer atactaaatatgcatgtgaagatggaaaaaca Protospacer *** **************** *** * *
40. spacer 7.11|2359717|32|NC_017297|PILER-CR matches to MN824002 (Klebsiella pneumoniae strain N201205880 plasmid p205880-2FIIK, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagc CRISPR spacer atactaaatatgcatgtgaagatggaaaaaca Protospacer *** **************** *** * *
41. spacer 7.11|2359717|32|NC_017297|PILER-CR matches to MK649826 (Klebsiella pneumoniae strain 130411-38618 plasmid p130411-38618_1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagc CRISPR spacer atactaaatatgcatgtgaagatggaaaaaca Protospacer *** **************** *** * *
42. spacer 7.11|2359717|32|NC_017297|PILER-CR matches to MK649827 (Klebsiella pneumoniae strain 1675474 plasmid p1675474_1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagc CRISPR spacer atactaaatatgcatgtgaagatggaaaaaca Protospacer *** **************** *** * *
43. spacer 7.11|2359717|32|NC_017297|PILER-CR matches to MK649828 (Klebsiella pneumoniae strain 1675479 plasmid p1675479_1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagc CRISPR spacer atactaaatatgcatgtgaagatggaaaaaca Protospacer *** **************** *** * *
44. spacer 7.11|2359717|32|NC_017297|PILER-CR matches to MK649829 (Klebsiella pneumoniae strain 16114547 plasmid p16114547_1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagc CRISPR spacer atactaaatatgcatgtgaagatggaaaaaca Protospacer *** **************** *** * *
45. spacer 7.11|2359717|32|NC_017297|PILER-CR matches to NZ_CP047635 (Klebsiella pneumoniae strain K2606 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagc CRISPR spacer atactaaatatgcatgtgaagatggaaaaaca Protospacer *** **************** *** * *
46. spacer 7.11|2359717|32|NC_017297|PILER-CR matches to NZ_KY853650 (Escherichia coli strain 347-43491A plasmid p977565, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagc CRISPR spacer atgataaatatgaatgtgaatatgaatatgat Protospacer **.********* *********** *. *...
47. spacer 14.1|2476181|30|NC_017297|CRT matches to NC_021536 (Synechococcus phage S-IOM18 genomic sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tctgcatcttctttcacattctcttctgca CRISPR spacer actgcatcttctttcacaatttctaccagt Protospacer ***************** *.*** *..
48. spacer 14.2|2476229|30|NC_017297|CRT matches to NZ_KT601170 (Staphylococcus sciuri strain wo28-3 plasmid pwo28-3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tctacatcttctttcacattctcttctgca CRISPR spacer gtaacatcttctttcacattttctttatta Protospacer . *****************.****. .*
49. spacer 14.2|2476229|30|NC_017297|CRT matches to NZ_KX982169 (Staphylococcus sciuri strain wo27-9 plasmid pWo27-9, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tctacatcttctttcacattctcttctgca CRISPR spacer gtaacatcttctttcacattttctttatta Protospacer . *****************.****. .*
50. spacer 14.2|2476229|30|NC_017297|CRT matches to NZ_KX982171 (Staphylococcus sciuri strain wo28-1 plasmid pWo28-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tctacatcttctttcacattctcttctgca CRISPR spacer gtaacatcttctttcacattttctttatta Protospacer . *****************.****. .*
51. spacer 7.4|2359716|34|NC_017297|CRT matches to NZ_CP050860 (Klebsiella pneumoniae strain SCH6109 plasmid pSCH6109-Vir, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagctt CRISPR spacer atactaaatatgcatgtgaagatggaaaaacact Protospacer *** **************** *** * * .*
52. spacer 7.4|2359716|34|NC_017297|CRT matches to NZ_CP035776 (Klebsiella pneumoniae strain R46 plasmid pR46-270, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagctt CRISPR spacer atactaaatatgcatgtgaagatggaaaaacact Protospacer *** **************** *** * * .*
53. spacer 7.4|2359716|34|NC_017297|CRT matches to NZ_CP041094 (Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae strain KPCTRSRTH01 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagctt CRISPR spacer atactaaatatgcatgtgaagatggaaaaacact Protospacer *** **************** *** * * .*
54. spacer 7.4|2359716|34|NC_017297|CRT matches to NZ_CP024459 (Klebsiella pneumoniae strain QS17-0161 plasmid pMR0617aac, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagctt CRISPR spacer atactaaatatgcatgtgaagatggaaaaacact Protospacer *** **************** *** * * .*
55. spacer 7.4|2359716|34|NC_017297|CRT matches to MN824002 (Klebsiella pneumoniae strain N201205880 plasmid p205880-2FIIK, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagctt CRISPR spacer atactaaatatgcatgtgaagatggaaaaacact Protospacer *** **************** *** * * .*
56. spacer 7.4|2359716|34|NC_017297|CRT matches to MK649826 (Klebsiella pneumoniae strain 130411-38618 plasmid p130411-38618_1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagctt CRISPR spacer atactaaatatgcatgtgaagatggaaaaacact Protospacer *** **************** *** * * .*
57. spacer 7.4|2359716|34|NC_017297|CRT matches to MK649827 (Klebsiella pneumoniae strain 1675474 plasmid p1675474_1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagctt CRISPR spacer atactaaatatgcatgtgaagatggaaaaacact Protospacer *** **************** *** * * .*
58. spacer 7.4|2359716|34|NC_017297|CRT matches to MK649828 (Klebsiella pneumoniae strain 1675479 plasmid p1675479_1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagctt CRISPR spacer atactaaatatgcatgtgaagatggaaaaacact Protospacer *** **************** *** * * .*
59. spacer 7.4|2359716|34|NC_017297|CRT matches to MK649829 (Klebsiella pneumoniae strain 16114547 plasmid p16114547_1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagctt CRISPR spacer atactaaatatgcatgtgaagatggaaaaacact Protospacer *** **************** *** * * .*
60. spacer 7.4|2359716|34|NC_017297|CRT matches to NZ_CP047635 (Klebsiella pneumoniae strain K2606 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagctt CRISPR spacer atactaaatatgcatgtgaagatggaaaaacact Protospacer *** **************** *** * * .*
61. spacer 7.9|2359586|34|NC_017297|PILER-CR matches to AP013386 (Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G15, isolate: uvMED-CGR-C23-MedDCM-OCT-S37-C51) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gttaaagaagatgaaaaaagtaaataggtgatat CRISPR spacer aaaaaagaagttgaaaaaagtaaataagtatgac Protospacer . ******* ***************.**. *.
62. spacer 7.9|2359586|34|NC_017297|PILER-CR matches to GU943014 (Uncultured phage MedDCM-OCT-S04-C1161 genomic sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gttaaagaagatgaaaaaagtaaataggtgatat CRISPR spacer aaaaaagaagttgaaaaaagtaaataagtatgac Protospacer . ******* ***************.**. *.
63. spacer 7.9|2359586|34|NC_017297|PILER-CR matches to GU943013 (Uncultured phage MedDCM-OCT-S04-C1035 genomic sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gttaaagaagatgaaaaaagtaaataggtgatat CRISPR spacer aaaaaagaagttgaaaaaagtaaataagtatgac Protospacer . ******* ***************.**. *.
64. spacer 7.9|2359586|34|NC_017297|PILER-CR matches to GU943017 (Uncultured phage MedDCM-OCT-S04-C1227 genomic sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gttaaagaagatgaaaaaagtaaataggtgatat CRISPR spacer aaaaaagaagttgaaaaaagtaaataagtatgac Protospacer . ******* ***************.**. *.
65. spacer 7.9|2359586|34|NC_017297|PILER-CR matches to GU943022 (Uncultured phage MedDCM-OCT-S04-C890 genomic sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gttaaagaagatgaaaaaagtaaataggtgatat CRISPR spacer aaaaaagaagttgaaaaaagtaaataagtatgac Protospacer . ******* ***************.**. *.
66. spacer 7.9|2359586|34|NC_017297|PILER-CR matches to CP013001 (Bacillus thuringiensis strain XL6 plasmid, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gttaaagaagatgaaaaaagtaaataggtgatat CRISPR spacer tttaaagtagatgaaaaaggtaaattaattaaaa Protospacer ****** **********.****** ..* * *
67. spacer 14.1|2476181|30|NC_017297|CRT matches to NZ_KT601170 (Staphylococcus sciuri strain wo28-3 plasmid pwo28-3, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tctgcatcttctttcacattctcttctgca CRISPR spacer gtaacatcttctttcacattttctttatta Protospacer . .****************.****. .*
68. spacer 14.1|2476181|30|NC_017297|CRT matches to NZ_KX982169 (Staphylococcus sciuri strain wo27-9 plasmid pWo27-9, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tctgcatcttctttcacattctcttctgca CRISPR spacer gtaacatcttctttcacattttctttatta Protospacer . .****************.****. .*
69. spacer 14.1|2476181|30|NC_017297|CRT matches to NZ_KX982171 (Staphylococcus sciuri strain wo28-1 plasmid pWo28-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tctgcatcttctttcacattctcttctgca CRISPR spacer gtaacatcttctttcacattttctttatta Protospacer . .****************.****. .*
70. spacer 3.2|1903512|40|NC_017297|CRISPRCasFinder matches to NC_018689 (Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC429, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.75
tatttaaaggatttaaactta---catcatttagatttaagag CRISPR spacer tatttaaaggatttaaacttagttcattacataggttatc--- Protospacer ********************* ***.*. ***.**
71. spacer 5.1|2352164|35|NC_017297|CRISPRCasFinder matches to NC_008259 (Enterococcus faecium plasmid pCIZ2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
gtatcttctaagttttctgtattagatatttatgg CRISPR spacer attgcttccaagatttctgtattagatatgctttc Protospacer .* ****.*** **************** . *
72. spacer 7.2|2359585|36|NC_017297|CRT matches to AP013386 (Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G15, isolate: uvMED-CGR-C23-MedDCM-OCT-S37-C51) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
gttaaagaagatgaaaaaagtaaataggtgatatta CRISPR spacer aaaaaagaagttgaaaaaagtaaataagtatgacaa Protospacer . ******* ***************.**. *. *
73. spacer 7.2|2359585|36|NC_017297|CRT matches to GU943014 (Uncultured phage MedDCM-OCT-S04-C1161 genomic sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
gttaaagaagatgaaaaaagtaaataggtgatatta CRISPR spacer aaaaaagaagttgaaaaaagtaaataagtatgacaa Protospacer . ******* ***************.**. *. *
74. spacer 7.2|2359585|36|NC_017297|CRT matches to GU943013 (Uncultured phage MedDCM-OCT-S04-C1035 genomic sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
gttaaagaagatgaaaaaagtaaataggtgatatta CRISPR spacer aaaaaagaagttgaaaaaagtaaataagtatgacaa Protospacer . ******* ***************.**. *. *
75. spacer 7.2|2359585|36|NC_017297|CRT matches to GU943017 (Uncultured phage MedDCM-OCT-S04-C1227 genomic sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
gttaaagaagatgaaaaaagtaaataggtgatatta CRISPR spacer aaaaaagaagttgaaaaaagtaaataagtatgacaa Protospacer . ******* ***************.**. *. *
76. spacer 7.2|2359585|36|NC_017297|CRT matches to GU943022 (Uncultured phage MedDCM-OCT-S04-C890 genomic sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
gttaaagaagatgaaaaaagtaaataggtgatatta CRISPR spacer aaaaaagaagttgaaaaaagtaaataagtatgacaa Protospacer . ******* ***************.**. *. *
77. spacer 7.4|2359716|34|NC_017297|CRT matches to NZ_KY565557 (Escherichia coli strain Mcp0221 plasmid pMcp0221, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagctt CRISPR spacer atgataaatatgaatgtgaatatgaatatgatga Protospacer **.********* *********** *. *...
78. spacer 7.4|2359716|34|NC_017297|CRT matches to CP043017 (Escherichia coli strain 388808_gen plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagctt CRISPR spacer atgataaatatgaatgtgaatatgaatatgatga Protospacer **.********* *********** *. *...
79. spacer 7.4|2359716|34|NC_017297|CRT matches to NZ_CP038334 (Escherichia coli O157:H7 strain N8B7-2 plasmid pN8B7-2) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagctt CRISPR spacer atgataaatatgaatgtgaatatgaatatgatga Protospacer **.********* *********** *. *...
80. spacer 7.4|2359716|34|NC_017297|CRT matches to CP019690 (Shigella sonnei strain 75/02 plasmid p75-02_2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagctt CRISPR spacer atgataaatatgaatgtgaatatgaatatgatga Protospacer **.********* *********** *. *...
81. spacer 7.4|2359716|34|NC_017297|CRT matches to NZ_KY853650 (Escherichia coli strain 347-43491A plasmid p977565, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagctt CRISPR spacer atgataaatatgaatgtgaatatgaatatgatga Protospacer **.********* *********** *. *...
82. spacer 7.9|2359586|34|NC_017297|PILER-CR matches to KC821626 (Cellulophaga phage phi39:1, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
gttaaagaagatgaaaaaagtaaataggtgatat CRISPR spacer attaaacaagatggaaaaagtaaatttaagttta Protospacer .***** ******.*********** . * *
83. spacer 7.9|2359586|34|NC_017297|PILER-CR matches to MG543995 (Staphylococcus phage UPMK_1, partial genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
gttaaagaagatgaaaaaagtaaataggtgatat CRISPR spacer gacaaagaagatgaaaaaaataaagagaaaaatg Protospacer * .****************.**** **. .*
84. spacer 13.1|2382787|32|NC_017297|CRISPRCasFinder matches to MF979562 (Pectobacterium phage DU_PP_III, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
taattatcattataaaaaccctcatccatatg CRISPR spacer gcgaggtcattataataacccgcatccatttt Protospacer . .********* ***** ******* *
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1733058 : 1741270
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_017297|1733058:1741270|DBSCAN-SWA ACTATGTCATATTTGAATATATATCATTAATTTTTTTACATTTATTTTTTATAATTTCTCTAATATGATTGGGTTCAAGTACTTCCACATATTCTCCGTAACTTAATATCATGGAATATACCCAGTCATCTTCTAATAAATATGTATCTACAATTACACTACCATCTTCTTGAAACTTCATTTCATCTTTATCAAAAGAATCGTCTATTCTATATCTAACTCTTTCAGAAAACTTTAGTACAACTCTTGTAGGTACTTGTTCACTCTCACTAATATTTATATATTCTTTATAGGAAATTCTATTTTCATTAATTTTTTCATGTAAAACAGTTAAACTTTCCATTCTTGATAATTTGAAAAATCGGTAATCATTTTTTAATTTGCAAAAGGAAAATAAATACCATGAAAAACCTTTAAAAACAAGAGTTAATGGTTCTACCTGTCTCCAATTATATTCACCTTTTGAGTTTCTATAATCAAAGGCTATACAGTTTTTGTTATCTACAGCATCATATATAATTTTGTATTTTAAGTTTTCTTCTTCACATTTTTTAAAGCCCCAAGGTAATGTATCTATACACATTTGCTCAAAATGCAAATCAAATACTTCTTTTTTTTCTTTAGGAACAATATTTTTTACCTTTTCAATGGCCATTTCAACATTTTTATTATCTAAAAATTTATTCATATTTTTTAGAGCTTCTATAATTGAAATCATATCTTCTAATGTTAAAAGTTGATGATTGATTTTATAGTTATCTATAATATAAAATCCTCCATTATTTCCAATTTGAGAAACTATAGGAATTCCAGCAAGATTAATTGCTTCAATATCTCTATAAATTGTTCTTACAGAAACCTCAAATTTTTCAGCTAATTCTGATGCAGATATTTTTTCTTTATTTAAAAGCATTACAATAATTGCCAATAATCTATTAATTTTCATGAATCTATAAACCTCCCATAATTTGAAATGACTATTTTATTATATCAAATTAATAACTTGTAAAATTGGTTAGAGAGAAATTGCTGGGAGAACTGTATAAGAAAGTTTTAAAAAAATAAATTCCGGCATGGTAATTTTTGGGCTGTTTATGGGTATGAACTTGACTTAACAAATGTACTATAGTAAACTTATATCGTAAAAAAGAATAAAGACAGTTCGTAACCATCCTGTCTATAAATAAAACTAGGACGTAGCTACCGCCTTAGGTAGTTTTTTTGTTGATGGGCATTTAATGCCCTTTTTTATTTGCAAAAAATTTACAAATAGGATTTTTGTTTTAGGTGAAATTTTTAATTTATATAAAGTTTAGAAATTGTTATTCAAGGACGCAGAGGTCTTATCCAATGAATTTTTTAACTTAAATATAACAGTAACAATATAAGGCTGTTTTTTATAAAGATTGTCCAAATATAACTTAAAAACCTTACAAGGTAGGAAACTTTAAATAGTTGTAAAATATCCTAATAAATAATAATTTATCATAACCATTATAACTATTTGATGTTTTCAAGTCTAAGTGAGTGTAATAGATTGAAAAATCTATAGCACAAGGAGGAATGAAAATGAAAAAAATAGGACTAACAACTACAGTGCCAGTGGAAGTTATTGTTGCAGCAGGATATACACCAGTAGATTTAAATAATATGTTTATAACTTCAGAGAATTATTTAAAATATATAGACATAGCTGAAAGAGATGGTTTCCCCAAAAGCTTATGTGCTTGGATAAAGGGGATTTATGGAGCATGTCTAGAAAATAATATTAAAGAAATAGTTGGAGTTATGGAGGGGGATTGTTCTAATACTAAAGCTCTTATTGAGGTTTTTAAACTAAGAGGAATAAAAATTTATCCATTTTCATTTCCCCATAGCCATAGTTTAAAGGATGTAGAAATTGAAATAAGAAAGTTCATGGATATCTTCAATGTTAACGAGGATAAGGTAGAACAGGTTAGAAAAATATTAAATAGAGTTAGAAAGCTAGCAAAAAAAATAGATGAAATGACTTATATAGATAATAAGGTTAATGGTTTTGAAAACCATCTATATCAGGTGAGCTTAAGTGACTTTAATGGAAACATAGATGAATTTGAAGAACACCTTAAAAAAGTCATTGATGGTATGGAGAAAAGAGAGCCAATAAATAAAAAGTTAAGATTAGGCTATATAGGAGTTCCTCCAATGACTGGAGATATATATGAGTTTAGTGAAAAATTAAATGCTCATTTTGTATATAACGAAGTTCAAAGAGAATTTGCTTTTCCTAGGGGGATAGAAGCTGCAAATATATTTGAACAGTATTATAATTACACTTATCCTTATGATAATGAGTTTAGAATTAAGGAATTGAAAAAGCAAATAGAAAAGAGAAAGATAGATGCTATAATTCACTACACTCAGGCTTTTTGCCATAGAGCTGTTGAAGATATAGTATTAAAAGAAGAATTAAATATTCCTATGTTAAATATTGAAGGTGATAAGTTAAATACATTAGATGCAAGAACTAAACTAAGATTAGAAGCCTTTCTGGATATGTTGCTGGACTTAAAGCAGAAGTAATAGGTGATCTAGTAAGAATTTTTATCTTAATATATTGTTGGATTTAAAGCAAAAGTAATAGACGGTATATAAAAGAAGTTCATGTTTTCTTTATATTTAATGAAGGAGGGGAATTAATGAGATTGTTAGGAATAGACCTTGGAAGTAGAGAAGTTAAGATTGTTTTAATGGAAAACAATCTTATAGTTAAAAAGAAAAAAGTAAGTACCATGAAATTTTATAGAGATTACTGTAGCTTTCATGGCAAGATTGTAGTAGGTTTAGAAAAACTTAATATAGAAGGAATAGATAAAGCGATATCAACGGGTTATGGGAAAAATAATACGGATTTAGAATTTTTTACACCTATAAATGAGATAAAAGCCCATGTTTATGGTGGGATCTATCAAAGTAATTTAAAGGATTTTATTACTTTTAGATGTAGGTGGTCAGGACGTTAAGGTGGTAAAGGTAGAAAAGGGCGTTGCAACAGATTTGGAGCTTAATGAAAAATGTGCTGCTTCCTGTGGAAGATACTTGGAGAATATGGCAAATGTACTTGAAATATCCCTAGATGAAATGAGTCAGTACTCGGAAAATCCTGTGGATTTAAATTCCACCTGTGCAGTATTTTCTGAATCAGAATTAATTGGAAAAATAGCCGAAGGGGTACACATAGAAAGGTTATGTGCTGGGGTTAATTACTCTTTGTATAAAAGGCTACAACCTCTTTTAAGTAAGTTTAGGGGGAAGAAATTAGTTATAACCGGTGGTGTTGCAAATAACCATTCAATAAAAAAATATTTAAATAATGATTATGAAGAAATAGTATCCGTAAAAGATCCTCAGTTTAATGGGGCTATTGGATGTTGTTATTACGGAAGCAAATTTTTAAAATAAACTTAGGAGGAAAAAACATGTATACTTTAAAAGTAGAACATAATTTTGATAGCGCTCATTTTCTTGCAGGTTATGAAGGTAAATGTGGAAATATTCATGGACACAGATGGAAGGTTGAAATTCAGGTTCAGGCAGAATCATTAGTACAAGGCGGTCAACTTGACGGGATGATAATAGACTTTGGAGACTTAAAAAAAGATGTTAAATCTATGGTAGATTATTATGATCATGCACTTATAATAGAGAAAGGAACTATGAGGGGGCAATCATTAAGCTCATTAAAGGAGGATGGATTTCGTATAATAGAAGTTAATTTTAGACCAACAGCGGAAAATTTTGCAGCTTTTTTCTATAAAATTATGAAGGATAGAGGATATAATGTAAAAAGTACTACAGTTTATGAAACACCTAATAATAGTGCTACCTATGAAGAAAGTGGGGTAATTTAAAATGGATTTTAAGGTGGTTGAAAGTTTTATAAGCATAAATGGAGAAGGAAGGCGTTGTGGACAACTGGCTATATTCATAAGATTCGCGGGTTGTAATTTAAACTGTAGCTATTGTGATACACTTTGGGCAAATGAAAAGGATGTACCCTATGAAGTATTAAGTTCCAAAGATATATATGAATATATTAAGTCCAAAGAGGTTAAAAATGTAACTTTAACAGGAGGAGAACCTCTTTTGCAAAAGGGAATAATGGAGTTATTAAAACTTTTGTCTAAGGATAAAGAGCTTTATGTGGAAATTGAGACAAATGGCAGCATATTATTAGATGAATTTTTGAATATAGAAAATTCACCAAGCTTTACTATGGATTATAAACTTCCTTTAAGTAATATGGAAAATAAAATGGCATTAGATAACTTTAAATATTTAACTAAGAAGGATACAGTAAAATTTGTATCAGGTAGTATAGAGGATTTAGAAAAAGCTAGAGAAATAATAAATAAGTATAACTTAGTAGATAAAACTAATGTGTATATAAGTCCTGTTTTTGGAAAAATTAATTTAGATACTATTGTAGAATTTATGAAAAATAATAGAATGAATGGAGTTAATTTACAACTGCAGCTTCACAAGATTATATGGGAGCCTAGTAAGAGAGGAGTATAGTATATGGCAATTGATGTTAAAGCAATTGAAGAACACATAAGGGGGATTTTGATAGCTTTAGGAGACAACCCAGAAAGAGAAGGTCTAAAGAACACACCAAAACGTGTAGCTAAAATGTATGAAGAAGTATTCAAAGGTATGTGTTATAGCAATGATGAAATTGCAGAAATGTTTAATGTAACCTTTGAAGATGATTTATGTATAAATGATAATGAAAATGACATGGTTTTTATGAAGGAAATAGAGATATTTAGTCATTGTGAACATCATTTAGCACTTATGTACAATATGAAAGTAGCCATAGCATATATACCTAAGAAAAAAATTATTGGTTTAAGCAAAATAGCACGAATAGCAGATATGGTAGGACGTAGACTACAGCTTCAAGAGAGGATTGGAAGTGATATAGCAGAAATACTTCAGAAGGTAACTGACTCAGAAGATGTAGCTGTTATTATAGAAGGAGAACATGGCTGTATGACCACTAGAGGAATAAAGAAGCCAGGTACTAAAACTATAACAACTACATTAAGGGGAAAGTTTAACACAGATCCTATTGTAAGCAATAAATTAATGATGCTTTATACGAAATAAAGAAATTTTTAGTTCTAGTTAGAGTTTTATTAAAATAAATATATTAAATTCGTACAAGATTAAAAAATCTTACACATGAGTAGAACAGTTTATATAAAGAGAGTGTATTAAAGAAGCATAACTATAACAAAGATTTTTGTAGATTGTAGGATGATAATAAAATAATAAAGGGATGTGTAGTAGATGAATAAGGAAAAAGCAATAGTAGTATTTAGTGGTGGACAAGATAGTACAACCTGTTTGTTTTGGGCAAAGAAAAAATATAAAGAAGTTATAGCAGTATCCTTTGATTATAATCAAAAACATAAATTAGAGTTAGACTGTGCAAAGGATATATGTAAAAAATATAATATTGAACATCATATTTTAGATTTAAATTTGTTAAATCAATTAGCACCAAATTCACTAACTAGGCAGGATATAACTGTTGATAAAAGCGCACCTAAAGAAGGAGTGCCTAATTCCTTTGTAGATGGAAGAAATTTATTGTTTTTAAGCTTTGTCGCAGTATTTGCAAAACAAAAAGGAATAAACACTATTATAACTGGTGTGTCACAGAGTGATTTTAGTGGATATCCAGATTGTAGAGATGTATTTATAAAATCTTTAAATGTTACATTAAATTTAGCTATGGATTATGAATTTGAAATAATTACACCACTAATGTGGATTAATAAAGCAGAAACGTGGAAAATGGCTTATGATTTAGGAGTTCTTGATATAGTTAAAGAAGAAACCTTAACATGCTACAATGGAATAAAAGCGGATGGATGTGGGGAATGTCCAGCTTGTAAATTAAGAAAAAAGGGATATTTGGAGTTTGAGAAATATTTAATGAATTAGAGTTAATTTAGGAGGACTAGTATGCTAAGTACTAGTTTTTTTATTGTGAAATTATGGGGAATTATGGTATAATTAGTTCAGGATTAAGCAAGTTATTGTAAAGTTATGAAATTTTTACAGGGATTATAGCGATAATAATTATAGAGGGTTCTTTATTGTAAAGTTATAGTTATTTAAGAATAATAAAAAAAATCTACGCAAAGAGGAAATATCTTATAAAGAATCAAGTATATTAATTCTGCTTATATGGCAAAAAGTAACATGTTTTTATAAAGGACAGGAAGGTGAAGACTATGGAAAAATTTAATGAAAATAGGGGTATATCTATAAAAGAGAGTATTAAATTATTTTTTGAAATTAATATATGGTTAATTATATATGGAATTCCATTTACTATTTTGGCCATATATTTTAAAGAACATGGATTAGAAGTGACTTATGAATCTATTGAACAATTAGGAGAAATAGTAGCCTATATATTTATTATAAAAAAATATATAAAAGGTTTAAATTACAAGAAAATTTTAGATTTAAAATTAAATATAAACCTACATTAAAAGAAGGTATTTTTATAATCATAGCAACAATAGCATATATTTTTGTATATGATAATACTTTGGGGATATTGCTACAAAAAATCCCTGAAGCTGATTGGGTTAAGAATGCTTTTATTGAGATTGAAAGTGAACCTCTATTATTACAGTTTAGCTCATTGTGTTTAATTGCACCAATTTTTGAGGAAATAATATGTAGAGGAATAATATTAGAACAGTTAAATAAAAGATGTGGAGCTACAAAAGCTATATTAATTTCTTCATTATTTTTTGGCATAATGCACTTTAATTTGCATCAAGGAGTAAACGCGTTCTTCATAGGGGTAGTTATGGGAGTTATTTATGTTAAGACAGATTCATTGTTACTTACTATACTTTTGCATTTTGTAAATAATTTATATTGTTTAATAGCACAGTATATACCATATTTAGACCAGATTGAATCTAATTTTAGTGTAGTTAGATTAATATGTGGATCTATATTGCTTTTTATATCCTATAGATTTTTTAATGGTATAAAAATACATTTAAATAGAGAGCTTAATTTGAGATCTTAAAGTATATTTAAAAGATAAAAATAATTTAAAATAATAATTTTATATGTATTGCTTGAGCAATACTTCCTTTTTATATTTCGTATTTAGTTTTTGTAAATTTTGTCGATAATTTAATATTATAAGTATGAAATATTAGGAGGATTATATTATGATAAATATTTTTAGTAAAAAAGATAGTAAAAAGGATAATAAAAATGATACTATTGAGCAGGAAGTTATTGTTGAAGAAAAACATGAAGTTGAAACTATAGATACTATGAAATTTCTAAAAGAAATGACTATACAGATAGAGGGTATAATACAGCAGCATAATAAAGTTAATGGTGAACATGAAGTGCTTGAAAAATTAGCAAAACAGATTGAAAATCATATGGTAACAGTATCAAATTTAACTGAAAGGACTAATGAATCAACAGATAAGCTTTTTAGTCAAGGAGAAAGTCTGTTAGAGATTACAAAAGATACTGTAAATAAATCCTTAGAAGGTAAAAAGTCAATTGAGGGTATGGTTAAAGTGATTGAAAATCTTGACATAGAAACAAAGGATACATACGAGAATATTAATGCTTTGGGCGAAAAACTAAAGGAGATTGGAGAAATAGCTCAATTGATAAGTGGAATAGCCTCAAAAACAAATCTTCTTGCTCTTAATGCTGCCATAGAAGCAGCCCGTGCAGGAGAACAAGGCAAAGGCTTTGCAGTAGTTGCTGATGAAGTTAGAAAATTGGCAGAAATGACCGGTGAAAGCAGTAGTAATATAACTAATTTAATTAGTGGCATAGACTCACAAACTAAAAATGTTTTAAATAGTGTTGAAAAGAGTACATTAGTAGTTACAGAAGGAGTAAAATCCTCTAAAGGAGCCCTTGAAAAAATAGAAGAAGTTCTAGATTCATTTAACAGAGTTGAAGATGACACTGATAGCCTAATAAAAACAATTAATACTCAAAAAGAGGATATAAGTAAAATTTTTAACGGAATAAATGGAGTAGATAAAATTCTTACTGAAACCAATGAGCAAATTATAAAGCATATAGATGAGGCACACAAAGTAGATGAGAAATTAGAAAAAAGTGTATATCATATAGCTCAATATGTAAAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_017297|1733058:1741270|1736951_1737617_+|WP_012099659.1|DBSCAN-SWA MDFKVVESFISINGEGRRCGQLAIFIRFAGCNLNCSYCDTLWANEKDVPYEVLSSKDIYEYIKSKEVKNVTLTGGEPLLQKGIMELLKLLSKDKELYVEIETNGSILLDEFLNIENSPSFTMDYKLPLSNMENKMALDNFKYLTKKDTVKFVSGSIEDLEKAREIINKYNLVDKTNVYISPVFGKINLDTIVEFMKNNRMNGVNLQLQLHKIIWEPSKRGV >NC_017297|1733058:1741270|1734626_1735622_+|WP_012099657.1|DBSCAN-SWA MKKIGLTTTVPVEVIVAAGYTPVDLNNMFITSENYLKYIDIAERDGFPKSLCAWIKGIYGACLENNIKEIVGVMEGDCSNTKALIEVFKLRGIKIYPFSFPHSHSLKDVEIEIRKFMDIFNVNEDKVEQVRKILNRVRKLAKKIDEMTYIDNKVNGFENHLYQVSLSDFNGNIDEFEEHLKKVIDGMEKREPINKKLRLGYIGVPPMTGDIYEFSEKLNAHFVYNEVQREFAFPRGIEAANIFEQYYNYTYPYDNEFRIKELKKQIEKRKIDAIIHYTQAFCHRAVEDIVLKEELNIPMLNIEGDKLNTLDARTKLRLEAFLDMLLDLKQK >NC_017297|1733058:1741270|1736518_1736950_+|WP_011949100.1|DBSCAN-SWA MYTLKVEHNFDSAHFLAGYEGKCGNIHGHRWKVEIQVQAESLVQGGQLDGMIIDFGDLKKDVKSMVDYYDHALIIEKGTMRGQSLSSLKEDGFRIIEVNFRPTAENFAAFFYKIMKDRGYNVKSTTVYETPNNSATYEESGVI >NC_017297|1733058:1741270|1738394_1739054_+|WP_012099661.1|DBSCAN-SWA MNKEKAIVVFSGGQDSTTCLFWAKKKYKEVIAVSFDYNQKHKLELDCAKDICKKYNIEHHILDLNLLNQLAPNSLTRQDITVDKSAPKEGVPNSFVDGRNLLFLSFVAVFAKQKGINTIITGVSQSDFSGYPDCRDVFIKSLNVTLNLAMDYEFEIITPLMWINKAETWKMAYDLGVLDIVKEETLTCYNGIKADGCGECPACKLRKKGYLEFEKYLMN >NC_017297|1733058:1741270|1740313_1741270_+|WP_012099663.1|DBSCAN-SWA MINIFSKKDSKKDNKNDTIEQEVIVEEKHEVETIDTMKFLKEMTIQIEGIIQQHNKVNGEHEVLEKLAKQIENHMVTVSNLTERTNESTDKLFSQGESLLEITKDTVNKSLEGKKSIEGMVKVIENLDIETKDTYENINALGEKLKEIGEIAQLISGIASKTNLLALNAAIEAARAGEQGKGFAVVADEVRKLAEMTGESSSNITNLISGIDSQTKNVLNSVEKSTLVVTEGVKSSKGALEKIEEVLDSFNRVEDDTDSLIKTINTQKEDISKIFNGINGVDKILTETNEQIIKHIDEAHKVDEKLEKSVYHIAQYVK >NC_017297|1733058:1741270|1733058_1734003_-|WP_012099656.1|DBSCAN-SWA MKINRLLAIIVMLLNKEKISASELAEKFEVSVRTIYRDIEAINLAGIPIVSQIGNNGGFYIIDNYKINHQLLTLEDMISIIEALKNMNKFLDNKNVEMAIEKVKNIVPKEKKEVFDLHFEQMCIDTLPWGFKKCEEENLKYKIIYDAVDNKNCIAFDYRNSKGEYNWRQVEPLTLVFKGFSWYLFSFCKLKNDYRFFKLSRMESLTVLHEKINENRISYKEYINISESEQVPTRVVLKFSERVRYRIDDSFDKDEMKFQEDGSVIVDTYLLEDDWVYSMILSYGEYVEVLEPNHIREIIKNKCKKINDIYSNMT >NC_017297|1733058:1741270|1737620_1738211_+|WP_012099660.1|DBSCAN-SWA MAIDVKAIEEHIRGILIALGDNPEREGLKNTPKRVAKMYEEVFKGMCYSNDEIAEMFNVTFEDDLCINDNENDMVFMKEIEIFSHCEHHLALMYNMKVAIAYIPKKKIIGLSKIARIADMVGRRLQLQERIGSDIAEILQKVTDSEDVAVIIEGEHGCMTTRGIKKPGTKTITTTLRGKFNTDPIVSNKLMMLYTK |
7 | uncultured_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_2 |
1966595 : 2055534
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_017297|1966595:2055534|DBSCAN-SWA ATTATTTAAAATATTTTCCTTTCTTTCTAATTATAGATATTAGTTCATCAGAAATTTTATTCATATTAACTTTAAGCTCTTTACTGATTTCCAAAGTGTAATCTATATTAGAAACTTCAATAGCTAGAATGTATCCTTTTATTTCATTATAATAAAGTTTAACTAAGTCTATAAAACTATAGCTATGTTGGGTATATCCATTTTTATGTGATGTATAAGTATCTAGAGGTAATATTGTTATATCTCCTATTTTTTTACCATAGTATCCCGCATCTAATATAAATAAGAAATCCTCCTTTTTTATTCTTGAAAGGCAATATTCAAAATCAGTTTCTCCTATTATAAGATCTATATAATTTTCTTTTAAAAATCCCTCAATATTTTTAGCTATTTTTATGGCTATACCATCATCACCCATTAAAATATTTCCTATAGCAATAACTTTAATAGCTATACTAATACTTCAACTTTAACTGGTTCATTATTATTACTTATTAAATGGGTGGCACAGGAAATGCAAGGATCAAAAGAACGAATTATTCTTCCTATTTCTACGGGTTTTTCTATATTATCTATTTTTGAGCCTATTAAGGATTTTTCTCCTACACCTCTTATACCATTTGAATCCTTAGGAGATATATTCCAAGCTGTAGGAGTTATAATATTATAGTACTTTATAGTTTTATTCTCTATTTTTATAAAGTGTGATAAGGCTCCCCTAGTAGTATCTATAAGGCCTTCTCCAAAGGCGCTTTCTGGAATATTATATGCAGATTGATTATTAGATAGTAATTGAATTTTTTCTGATATATTATATAATATATTTATTATTTTTTTAGTTTCTAGAACACGGGCTATATTTCTATCCATAGAGGAATTGCCTCCGGTATATTCTCCTGCAATTTTTAATCGAGCTAAAGGACCTACTTCCATAGGTAAATCAGCATATCTAGGTGCTTTTACGAAACTATAAGCTCCTTCTTTTTTTAAATCTACAGTATATTCATTGTTCACAATGGGATTTTCTATTATAGTATCGCTTACATACCAAGCATAGCGAATGTTTTCTGTTATTTTATCTCTATCAAAATTTTCTACTTTATTATTTATTATTACTCCCGGTTTTACATAGCTTATATTTTTATCCTTATATTTATCAAATACACCAAAACTCATAAAATTCCCATAAGTGTTTCCAAGATTAAAATATTCAGGGTAATACTGAGCAATTATATTCATATCCTCTAACATATAGATATTTACAAATTTTTTTTATTGCCTTTAATATGGATTGTATTTTTGTCAATTTGTAAGAATCTATATTTACGGTAACCCCTCCTACGAAAATACCATGACTATGAGGTGCTTTACCTCCCAATACAGCTAAGGCTTCATGGGCTAACCTACTATATTTTATGCCCTCTTCATAATGGGAACTTATTCTTTCATTTAACTTTTTAGGCAATCTAAAGTCACTATATTCTTGAGGGTATATAGGTCTTATATTAGGTAGATTTACATAGCTTGGCACAGTAAAACAATAAAACTGCCTTAGGTGGTTTTGTATAAATTCAAATCCATGCATCATATCTCTTATATATATATCATTTATACTTGGAGTTATATTTAATGCATTTTCTAAAGCTAAAGTAGATGCTGTAGCATGGGCAGTAGAACATATGCCACATATTCTTTCAGTAAAATATATAGAATCTAAAGGAGGTCTTCCTTCTAACATTTTTTCAAAGCCTCTAAATAATAATCCGCTGGTTTCACCATCTATAATAATGTTATCTTCTACTTTTACCTTTATTTCTAAAAATCCACTAATCCTAGTTATAGGATCAATAGTAATAATCTTTCCCATAATGACCTCCCATTTTTATAATTCAAAATTTACTTAGTTATCTTAAGCATAAATAATTTAAACTAAAAAATTAATATACTTTATTCTTTTAACTATAGAAATTAATACCTAACAAAGGGTTCCATACCATCTGGAAATCTTTCTTGGGCACAGCCTATACAATTTGTGTTGTCTCCAATAGGCCAATTTACATAGCCATTCCATTTTCTTCTGGGGCAATCTGTTTTTGTAACAGGTCCTCTACAGCCTAACTTAAACATACATCCTTCTTCTCCAAATTTTTTTGCAAATATTCTTTTATCAAAAAAGCCTCTTCTTGTACAACTATCATGAATAGTTATTCCATAAAATAATATAGGTCTCCCTTTATTATCTAATTCTGGTTTACCATAAGTAACTAGATGAGCTAAAGTACCTACCACCCAGTCAGGATGACAAGGACACCCTGGTAATTTTATTACTTCTTTATTTATAACAGCTTCTACGCTTTTGCTACCAGAAGGATTAGGTCTAGCCGCAGAAATACCACCATAAGAAGAACAGGTTCCTACAGTTACCACATATCTTGCTTTTTCACCTGCCATTTTTATTGCTTCTAATGCGGTAACAGGTTTTCCTTTATAATTAGCAATAATGTTATAATAGCCATTTTCTCTAGTGGACACAGCTCCATCCACTAATAATATAAATTCTGTGTCTAAAGTATTTAAAAACTGTTCATAGGCAAATTCTCCTTCAGCTCCCATTAAAGAATTATTAAAAGTTAAATTAACTATATTTCTAAGTATATAAATAAGCCCTGGATTTTCTGCGTTCAAAAGAGAAATTATATTTCCAGAACAGCCTGTTACTTCTAACCATATAGCATTTATTTTTTTTGTTTTTTTATGATTAATTGATTCCATAGCTTCTCTGCAAAGGATTTTTGAAGTTGTATCTTTCCTTTCAATTAATGGGCAAAAGCTATTATTCATTACTCCTCCTAAAAATTTATTAATTACCATATAAAAAATATGCTCCAATAAATTATATAAATAAAAATTATTTATTATGCTATTGAAAAATGAATAAAGTTTGTACGGCTATATTAATAGTACTTAAAATTATTAATGATTATTAGAATTAATTAAGTTTTTTATTACATTATTGTAATGTTTCTGTAATATAAATAAATTTCTCTATGTCTTGTGAACATATATAATTCTATTCATAAAAGAAACGCTTAAAGGAGGTTTTATATTATGAATTTAGATGGTTTTAAATTAAAAATTATAGCAATGATACTTATGGTGTTAGATCATTTGCCTAAAGCTTTTAATAACACTCCAATATGGTTTGGATGGCTTGGTAGGTTGGTAGCTCCTATATTTTTCTTTTTTGTGGCAGAAGGATTTTTTCACACAAGGAGTAAGAGTAAATATTTAATAAGGTTATTTGGATGGGGCGCAATCATGTTTGCAGGATCATCAATATTAAATTATGCTCTACCAGGAAAGGAGCCTTTACAAAATAATATATTTTTATCCTTAGGATTATCAGTACTTTTGATGTGTATTATTGATTATACTAGAAAAAGTAAAAATTATAAATTTGGTATTCCGTTAGCTATTATAGTGAGTATAGTATCTTTGTTTACAGAAGCATCTTTTGATGGAGTATTAATGACTTTAGTTCTCTACTTTTTTAGAGAGGATAAAATTAAATTATCTATTGGATATATTTTAATTTCTTTATTTGAATTTATTATGGTTAGTGGTGAAGGGCTAACTTATTTGAATTTATTCGTATTAAATTACCAATGGTTAATGATTTTTGCTCTTCCTCTTATTCTTATGTATAACGGTGAAAGAGGACTAAACAATAAATTTATAAAATATATGTTTTATGCTTTTTATCCTATACATTTATGGATAATTACTATAATATCTCACTTTCTAAAATAATATAAAAAGGTTAGTACTTATACTGTATAATTGTAGATTTTACCCGTGGTGGTTATTTAATATCTACAATTATATTTTTATTTCTGATATAAAAATTAGGTAGGGTTAATATTTTTTTACTTAAAATATTAACCCTACTACATATAATAAATAAATAAAAATAAGTATTTAATATATATTAATATTATATTAGAAAAAACTTTAAAAAGCATTGTAGTTATATGAGTTTTTTTTGCATATAATGATAGTATAGGGATATAACAAAACCTAATTAGTGTTTACTTATGACTATACTAGGTGGTAAAATTATGGTATACTATAAAAAAATTCAAATTTCGTAGAAGTGGATGGCTACGGTGGTTGTACGTTTTCCACCTTGGGCTATAGATGATTTTTCATTATAGCTTAAGGGGGTGGTATTGGATATGCTAGAACTTTTAATAAAAGGAGTTTTTGTGATTTGTATTATTAGTTTAATATTGAAACACAATCCTTTTTATTTCCAATATAAAAATCAAGGTTAGATTTCTTGGTTTAGATATAGAAGTTGATAGCAAAGAGAAAAAGCACCCATCCTCCAAAGATTAGTGCTTTTTTCCTTGTTTAACATATTTATAAGTTAAAAATCCAATAGCCCTAAAACAACACCACTAAAGTGGGAAGCAGTTATACCAAATGATAATTCGGATTTCTGCTTAAAAACGTTCTAGGATCGGCTTAGTGTTCTCAGCACTGAGCCTTTTCTAATTAGAATTTTTAAAAACTTGGTTTTAAAGTTCTGTACTTCTCAGTTTGCCTGTGAATTTTACCTAATATATATTATAACAAAAATTATATAAAAATAAACATAATAACTTAATTAATATAAATATTTTATAACCATAAATATTATATTCATATACAGTACTTTCAGTACTATAAAAATTAAAAAATATATTTAGTACTTTTTATTAATGACCCTAAACTTTATTTATTATAAATCCAAAGAAATTATTACATAAATTCAAAAAATATAATAAAATTTTTGAACTGTATTCCATTGCTCTAGACATATATACTTGTAAATTTTTTTATTCAGTATATATTTATATTAATTATTTTCTATGAAACATAGATTTTATATTATCATTATATGTTATTAAGGGTACTTTTTCAATGATTTTATTGTAAATATAGTTAAATCATACATT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_017297|1966595:2055534|1981209_1981794_-|WP_014519279.1|DBSCAN-SWA MNLYERDYEKPSTKELEVIREQDEFNKIGIVSPEHVDPINKYSKEIRNFVYHYRTKFPNNVIWSRELNHEESKKESEAFKKVLDNSKSENDIQTYIKSNKKWFIPASIIKEYNFGHKENYLFPEMMLGSKYKVDYVICGRNSDGYHLLLIEFENANTPFINQDGNCESKSVNSGYGQIKNWKNWMDDNRQLFFK >NC_017297|1966595:2055534|2004397_2005213_-|WP_012099844.1|DBSCAN-SWA MNLKKIKESADFVKNNISIMPEIGVILGSGLGDLAEEIENKEIIKYSNIPNMPASTIKGHKGQFVVGTLKGKKVIMMQGRVHYYEGNKMSDVVLPVYIMKELGVKNIIVTNAAGGVNEIYNPGDLMIIKDHINFAFSNPLIGSNDEEIGPRFPDMSEAYNKSLIVLAEKEAEKLGFSLQKGVYAMMTGPSYETPAEIKMLRMLGADAVGMSTVPEVIAANHCGIKVLGISCITNMAAGILEQPLNHQEVIETSNKVRSKFISLLKSILEVM >NC_017297|1966595:2055534|2037353_2037551_-|WP_012099883.1|DBSCAN-SWA MDNFTNTFNIISGVCSIISLFIGIFVANKVTKIYNSNKIGDIKDIEQNSEGSNSPNIISGRDTHK >NC_017297|1966595:2055534|1987870_1989766_-|WP_012099833.1|DBSCAN-SWA 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80 | Clostridium_phage(51.43%) | portal,tail,terminase,capsid,integrase,head,protease | attL 2010013:2010030|attR 2067214:2067231 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
2528453 : 2588159
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_017297|2528453:2588159|DBSCAN-SWA 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68 | Clostridium_phage(63.04%) | tail,terminase,protease,portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
3093288 : 3102891
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_017297|3093288:3102891|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_017297|3093288:3102891|3095001_3095619_-|WP_012100666.1|DBSCAN-SWA MFKIAVLVSGGGSNLQSIIDKIEEGYIKNCRIEMVIGDRSNIYGIERAEKKGIKTLTLDRKIYKSNLSNKICECLYGNVDLIVLAGWLSILNGDLVNKFENRIINIHPSLIPSFCGDGMYGIKVHRKALEYGVKVSGCTVHFVDEGTDSGPIIIQKSVPVFAEDTAEILQKRVLEKEHEALPEAIKLISEGKVKLQGRKVFIKTY >NC_017297|3093288:3102891|3099158_3099638_-|WP_012100670.1|DBSCAN-SWA MKVAIIFGSKSDTDKMKGAAKALKEFSIEYKAYILSAHRVPEKLMETIEDLEKEGYECIIAGAGLAAHLPGVIASHTILPVIGVPIEAAVGGMDSLLSIVQMPKSIPVATVGINNSYNAGMLAVQILSLKYEKLREKLIEYRKDMKEKFINDNKEGVEL >NC_017297|3093288:3102891|3100165_3100300_+|WP_041173178.1|DBSCAN-SWA MAKPHIAFPSGKKFLMKKFDTPSQVSYLSIRVFFIFAWLKLSLF >NC_017297|3093288:3102891|3098454_3099159_-|WP_012100669.1|DBSCAN-SWA MEKKDMLYEGKAKKIFRTDDKDTVVVYYKDDATAFNGEKKGTIEDKGVMNNSITAMLFELLEKKGVKTHFIEKINEREQLCKKVEIVPLEVIVRNIAAGSMAKILGLSEGRKLDTTVFEISYKNDDLNDPLINDYHAVAIGLTNFEELKEMYSIAEKVNNTLKEFFDEQGINLVDFKIEIGRFNGELLLADEISPDTCRLWDKKTGEKLDKDRFRRDMGNVKEAYMEILKRVNK >NC_017297|3093288:3102891|3095765_3096743_-|WP_014519379.1|DBSCAN-SWA MVSYKEAGVNIEEGYKSVDLIKKYASKTFTKGVLNNLGSFAGMFELPKYKNPVLVSGTDGVGTKLDIAFRMKKYNTVGIDCVAMCINDILCHGAKPLFFLDYIACGKLESEIAAQLVEGVSNGCIQSECALIGGETAEMPGFYRDGEYDIAGFAVGIAEKDEIIDGSKIEDGDILIGIASSGPHSNGYSLIRKLVEDLHKDFEGNKIGNTLLTPTKIYVKPVMKLLEKYNIKGMAHVTGGGFYENIPRMFKEDFTAVINKKSYPLPNIFSHLMSLGIEEDHMYNTFNMGIGFVLCVNEKDGENIIKDLIEMGEKGYKIGYVKKRK >NC_017297|3093288:3102891|3093288_3094788_-|WP_012100665.1|DBSCAN-SWA MIKRALISVFDKTGILDLAKFLESRDVEIISTGGTYKHLKENGVKVIDIEEVTGFPEMLDGRVKTLNPLIHGGILAIRDNEEHMKVIEEKGINPIDMVVVNLYPFFNKVEENLSFDEKVEFIDIGGPTMIRAAAKNFKDVVVLTDTKDYENVIDEIKENDQVNIKTRKKLAGKVFNLMSAYDAAISNFLLEEEYPEYLTLSYKKNIDLRYGENPHQTAAYYTSTVGKYPMKNFEKLNGKELSYNNIKDMDIAWKTVCEFEEVACCALKHNTPCGVAIGDTVQEVYTKAYECDLISIFGGIVAFNRKVDKETAENLAKIFLEIVVAPDFDEDALEVLKNKKNLRVIKCEEKSTEGKDMAKVDGGILVQKSDNKLLEDTKVVTEKSPTEQEMKDLIFGMKVVKYVKSNAIVVVKDGMAKGIGGGQVNRIWAAKEALDRAGDGVVLASDAFFPFGDVAEEAAKWGIKAIIQPGGSIRDEESIKVCNEKGISMVFTGIRHFKH >NC_017297|3093288:3102891|3096914_3098363_-|WP_012100668.1|DBSCAN-SWA MSMCYMLDDLNENMPFDLEGDKFKEECGVFGVFSKDNESKSAEITYYGLYALQHRGQESAGIVVSDGEKFKYHKGMGLVSDVFSKETIEGLIGNSAIGHVRYSTTGASKSDNAQPIVGTYKLGSIAIAHNGNLVNAAVIRELLEDGGCIFQTSIDTEVLLNLIARSAKKGIDKAVVDAIQAIKGSYAIVILTEDKLIGARDPHGIRPMCLGKIGDDYLLSSESCAFDCVGGEFIRDIEPGEIVIIDESGINSIKFTEKTKCHTCAFEYIYFARPDSTMDGINVYESRVRAGRKLYEEYPVEADIVIGVPDSGIPAAVGYAEASGIPYGIGFIKNKYVGRTFIAPSQELREKAVSVKLNPLKINVEGKRVVIIDDSIVRGTTSKRLVQILRKAGAKEVHFRVSSPVVKYPCYFGIDTPYRKDLIGAHSEVEEIREKIGADSLAYISMEGLVETLNKDKGFCLGCFNGIYPISAPIEMPKDSLE >NC_017297|3093288:3102891|3100320_3102891_-|WP_079992192.1|DBSCAN-SWA MGVINVYEFILNERNVSVSEDINLLEYLRDNEDLTSVKNGCAEGACGACMILVNGKALRACICTTAKVNGKDVKTVEGLTEFEKDVFTWAFSKAGAVQCGYCIPGMIISAKSLLDKNLNPNKKEIKTAIRGNVCRCTGYVKIIKAIEMAAEAFRNGKLPFAKEYKGKIGENIPRIDAKDKILGIGKYVDDMKIEGMVYGSALRSKYPRALVKSIDISVALKHPEVEAILTAEDVPGNRLIGHIVKDWPAMIAVGEETRYVGDAVALVAAKSKKALKEILNLIKVEYEELEPISNPNIAIAEDAPKIHPKGNILTVEKVNRGDVDEAIANSKYVVTNHYSTPFTEHAFLEPESALAMPDGDGVIIYTGSQGIYDEQREISELLGLPKEKVRTISKYVGGGFGGKEDMSVQHHAALLAWTIKKPVKITLSRKESIKIHPKRHAMEMTITTACDEKGNLTAFKADIISDTGAYASLGGPVLQRACTHAAGPYKCPNVKIKGTAVYTNNPPGGAFRGFGVTQSVFGSECNLNLLAEKVGISPWEIRFKNAVEPGDALPNGQIADKGTAIKETILAVKDVYKKSKCAGIACCMKNSGVGVGIPDIGRCNLIVIDGKVHIRTSAACIGQGLGTILTQIICETIGLLPEQIILDLPDTKFAPDSGTTTASRQTVFTGEATRMASLKLKEKLLTTSLEECEGEEFYGEYQSITDPINSDKKNPVSHVAYGYATQVVILDDDGKIERVVAAHDVGKAINLTNVEGQIEGGIVMGLGYAFTEDYPLNKSIPTAKFGTLGLFRATDIPEIETTIIEKNTNDLAYGAKGIGEITTIPTAPASQGAYYKFDGEFRKKLPLEDTAYRRKK |
8 | Synechococcus_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
3253962 : 3275563
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_017297|3253962:3275563|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_017297|3253962:3275563|3267868_3268153_-|WP_012100779.1|DBSCAN-SWA MRTPLEILKFNLQEKQYPYFEDKELELLLEINNNDVEKSSYKGCILKAIADDGIEVADIKLQSNRAYWLTLAEHFKEEQKILKNQTSMERVDEH >NC_017297|3253962:3275563|3269668_3270517_-|WP_046665300.1|DBSCAN-SWA MKQVGEALEKTLKSRELDYNIAGENERVEICSVCGEAIEKITYIPGLNRCIKGPVMCKCKREALMAKEKEKINKEKQLRLKKIIKNSLIDEKFRNSKFKNWDFTKGNDKMYKIANKYTKKFENMKKESVGLLLYGSPGNGKTYTVACIANFLIGKMLPVICVNADSLLNRIKDTYKKSGKEVEEDVLRGLDNADLLIIDDLGTEQDTEWTRTKIYNILDSRYRNGLPLIITTNLSLIELKNRYEKRTYYRILEMCTPILNDGKNIREEKAKEKTEILKELLK >NC_017297|3253962:3275563|3271731_3271941_-|WP_012100783.1|DBSCAN-SWA MTTAKKLKAYRCLKGAKQEDIARLIGVSLNTYNFKENGKKSFTLNEAKIISDFFDTTIDELFFRRNSKL >NC_017297|3253962:3275563|3265403_3265820_-|WP_012100775.1|DBSCAN-SWA MDLKVTNIEDLKNVAQGEVIQLPQFGQGIPFNARVKRVSLLNLVRKGVVPNKLLSAAEELFYGKQSSKENIDLAQMTDVMYIMAENALVEPSIEDLKSVGLELTDEQIIALFNYTQEGVSELDSFREESENTECNINK >NC_017297|3253962:3275563|3259515_3260484_-|WP_012100768.1|DBSCAN-SWA 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MSEFEVNIDSVIDGLSEFEMQSKTAISGYADIAAKKLEEDAKKNAPWKEQSGKDIETIKGGEQWKGDKCNIYISGNKDYYSSLELCNDKKYAILKPTIDKLSPQILKGMSNLFGK |
27 | Clostridium_phage(85.71%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
3378914 : 3462532
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_017297|3378914:3462532|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_017297|3378914:3462532|3442706_3443036_-|WP_012100895.1|head,tail|DBSCAN-SWA MDLNELKEYIKLEEDEGEKITIPSLLLAAKAYIKGATGLTEDMIKDNEILELYKLCIKILVSHWNENRAIETTGPNFHKLSFGVDSILLQLEAEYLKIKRGATDGSGQT >NC_017297|3378914:3462532|3415060_3415258_-|WP_003405999.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA MKKLVKNKKSELVSLEAYSCNCGYCYANCTCSCGYDPQSSVNRSRGSNADNARYVSRGNSYDSHD >NC_017297|3378914:3462532|3442399_3442726_-|WP_012100894.1|head|DBSCAN-SWA MDPGKLNKRIKFIIIENGTDDEGYPIKGEKTIRECWASVRGLRGREFYNAAAVQSEQDKIFNCRYFKGLDTSLQIKYKNKFYDITSINDLNERHVEYEIHAKEVKASG >NC_017297|3378914:3462532|3387094_3387835_-|WP_003405923.1|DBSCAN-SWA MECYREFAHIYDELINEDIDYEKWAKTITNICDEFNLCKIDYLDLACGTGNLTLQVSPYFKNVWAVDLSYDMLTEAENKFRENNIKGKLVCQNICDLKLNKTFNLITCCLDGINYILDKKSLNNLFKNVYNHLKEDGLFIFDINSYYKLNNILGNNLFSYDDDEITYIWRNSTENNITNMDITFFIREDENNYIRFDEEHKERAYKEEEIEEIILNNGFKILRTLDNYENKKIQEKTERIVYILTK >NC_017297|3378914:3462532|3381169_3382069_-|WP_012100842.1|DBSCAN-SWA 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85 | Clostridium_phage(54.05%) | bacteriocin,holin,tail,terminase,capsid,tRNA,integrase,head,protease | attL 3416520:3416539|attR 3451774:3451793 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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