Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_009494 | Legionella pneumophila str. Corby, complete sequence | 2 crisprs | DEDDh,DinG,cas3,WYL,RT,csa3 | 0 | 1 | 6 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_009494_1 | 1253558-1253705 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_009494_1
|
1 spacers
spacers of NC_009494_1
>1.1|1253604|56|NC_009494|CRISPRCasFinder TCAATGAACAAGAGCATGGCCATGCCGGGCATGAATCATAGCGCAATGGGCCAGAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009494_1
The CRISPR arrays of NC_009494_1 >merge|NC_009494|1|1253558-1253705|CRISPRCasFinder TAAGACGTCTCACTCTGCTCAAATGAAATCTGACTCCTCGTCGACCTCAATGAACAAGAGCATGGCCATGCCGGGCATGAATCATAGCGCAATGGGCCAGAATAAGACGTCTCACTCTGCTCAAATGAAATCTGACTCCTCATCGACC >NC_009494|1|1|1253558-1253705|CRISPRCasFinder TAAGACGTCTCACTCTGCTCAAATGAAATCTGACTCCTCGTCGACC TCAATGAACAAGAGCATGGCCATGCCGGGCATGAATCATAGCGCAATGGGCCAGAA TAAGACGTCTCACTCTGCTCAAATGAAATCTGACTCCTCATCGACC
>NC_009494.2|WP_011946135.1|1251498_1251987_+|DUF2231-domain-containing-protein MIEIIPNWHPIFVHFTVALFTVSVILYAVTYLSSYIHWNTKPLIGELEIVARWCLWLAALSTMTTVSTGFYAFYTVKHGAMVHAVKVIHRNWALTTSSAIVLVAFWMVWRYIKHQKPTLVFLMALLFVQVLLLTTAWYGAELVYRHGYGVLPVTAEKTVSSH >NC_009494.2|WP_011946133.1|1251117_1251273_-|hypothetical-protein MNAKDCFAENDHEEKTRETKPLFDEKEVHKAHDLENEMELDEEFDAIRSMN >NC_009494.2|WP_011946132.1|1249425_1251105_+|DUF3141-domain-containing-protein MGKENTDSPYQMGHDFFSYQLDCWQRSILFWDTLRERANNMMEHEQQGLPPLLNFKYELVLDGKSLEPKTNYALVKILEVGDVCFEECFDPQAHPVIIVDPRSGHGSGIGGFKRDSEVGIALHSGHPVYFVIFYPNPVPHQTLADVLMTLRHFVEQVQAWHEGKAPILYGNCQAGWMLALLASDCVGSVGLTVMNGSPVSYWSNSEEEANPMQLLGGLLGGSWSARFLSDLKEGIFDGAWLVSNFELLNPTTAIWDKYYGLFDDIDGERERFLEFERWWNGFYQFSQEEIMATVNNLFIGNQLERGEMRIHKGCVYDLKRIQSPIVLFASQGDQITPPRQALHWIRTIYPTTQALKKAKQRVVYLLHPSVGHLGIFVSAKVVRLHHRAILEHSNAIEQLQPGLYEMIIVNPTGDPDCSKEQYHVRFEARELTELCATSSTQPFDKVRQTSEANDSIYQKVFQPSVQSLSNPFLSWWLEKTHPMRLSRYVFSEKVNLLMKAIELLSPPIQANRRMATQNNCFKKIEHGVAQMMRDSLESSRIMRNDVMTNWFEALYKDPD >NC_009494.2|WP_011946131.1|1248877_1249189_-|hypothetical-protein MKKINFILYLLTMLAISFVTLGHGTTEATDTTNQTKHMYRGSSISLEELAKVADLSSARNQKGNPVTLEEESYQVGSFTKGTVTIIPKSGKADDVITLDLKPN >NC_009494.2|WP_011946130.1|1247181_1248453_-|TolC-family-protein MKTACFLQGIMTMICLCWGGLAFAIANAPLTLTEAEHLALATSPELKRFEANSQALQQQAVADSQLSDPQLLAGTINVPTDTFSFTQDMMTMVEVGLQQQFPRGRSLKMKSQQTQALAKVELKKAFDQVITLLRNVRETWLDLYYWTKALQVLHANRLLYKDLLKVTQSQYSNGKINQSDVIQVELELSRLNDQEIQIQQQLAVLRAQLARWIGVKEINRSLVLSMPRWPRPSPLNQLQARLPKHPLLQADAANVKASYYEVAYAKEQYKPGWLLGVSYGFRQGRMPGEMPRSDMLTAQVTMDLPFFTANRQDRQLSASFNRLNASHFERQTHYRDLLQVLSAQYATWQRLSEREVIYEKQLLPEAKQNAKAALLAYQSATTELTTVLRAYSSQLTIQLEQVQIQVERLKSRATLLYLEGVAL >NC_009494.2|WP_011946129.1|1245928_1247185_-|efflux-RND-transporter-periplasmic-adaptor-subunit MNKKLLLIIVISIILGVFLGRWTTNIITGKASQEATNKKPLYWIDPMEPMIHYPGPGKSRMGMELVPVYPDDNQEKGEKATVQISPSVVNNLGVRTVPVIQTTLARHIDTVGFVEPNENQISHIHTYADGWVKNLVVKAVGDSVKKGQLLLQYYSPQLVTAQEEYLIALEGNNQSLITASYKRLQALHISEQQIEDIKKGHQSNQLVAVYAPQDGIVAALNIREGMRVTPDVEIMSLVDLANVWMIAQIFEEQANWVKIGDQAEARISAFPQKQWKGRVEYIYPRLEPMTRTVKVRFRFDNPDNQLKPNMYASISILVNPKSNVLSIPLEALIRSPQGDRVIVALGKGRFQVRQVKAGMESGDRVEILSGLKVGENVVVSGQFLLDSESNLKAGLERLETPEENEKRIQSTNPKGQKP >NC_009494.2|WP_011946128.1|1242797_1245932_-|efflux-RND-transporter-permease-subunit MIASIIRWSINNRFLVILVTVMMIVGGLYTINNTVVDAIPDLSDVQVIIKTEFPGQAPQVVEDQVTYPLTTAMLAVPGAVTVRGESGFGVSYVYIIFKDGVDLYWARSRVLEYLSQIANQLPPGAQVALGPDATGVGWVYEYALVDRTGQHDLAQLTSLQNWVLKFELQKVPGVAEVATAGGMVKQYQITLDPNRLRAYGLTLDQVKQAVQRGNREAGGATIEMGEAEYMIRAKGYLQSIRDIEQIPVGLGKNGIPILLKEIAHIQLGPQIRRGMTELNGEGEVVGGIIVMRSGQNAMQTIAGVRAKLNQLQASLPKGVEIITTYDRSSLIQRAINTLRDKLIEEFIVVSLICVVFLFHFRSSLIIVISLPIAILLALIVMHVQGINANIMSLGGIAIAIGAMVDAAIVMIENAHKHLEHNAITSENRWPMMQQAALEMGPPLFFSLLIITVSFLPVFTLQAQEGRLFAPLAYTKTYAMAAAAALSITLVPVLMGYLIRGKIKAEQENPINRALMAVYRPILQASLKTPKTTLTIAAFIMLIGFWPVSYLGGEFMPELDEGDLLYMPTTFPGISAGKAQQLLQQTDKLIASIPEIKTVFGKIGRAETATDPAPLSMIETTIQFKPKNEWRPGMTMNKLRDELESRLKLPGLSNAWVMPIKTRIDMLATGIKTPVGIKVAGPDLKTIQSIGQQIETVLKKVPGTTSVFAERVASSRYVTVDINRVKAARYGLNIEDIQQIIETAVGGMNVTQTIEGRERYPVNLRYPREIRDSLENLRSLPIVTPTGATIPLSEVANVTITEGPDMIRSENARLNGWVYVDITGRDLGSYVKEAQNIIRQQVKLPAGYSLTWSGQYEYLERAKERLSLVVPFTIAIIAFLLYLNFRRFAEVIIILATLPLALIGGIWLLYLLGYHLSVAVGVGFIALAGVAAETGVIMLVFLNQALEKQQQQAKQEQRALTKDNVYTAVVEGALLRLRPKIMTVTAIIGGLLPIMLLSGTGSEVMRRIAAPMVGGMASATILTLIVIPVIYLLWQQKKILIKNLS >NC_009494.2|WP_011946127.1|1242373_1242595_-|hypothetical-protein MPTKNPRINITFEESTAGLLAYLAELEHKSISGLAKELIMEALERREDKVLSAIAEFRDHATVKRVKHDDAWK >NC_009494.2|WP_013101331.1|1242105_1242390_-|type-II-toxin-antitoxin-system-RelE/ParE-family-toxin MTPGSKLYQIEYIEDVVKNDMPSLSTSAKKLIKKAIEERLMADPIGFGKPLRYSLKGHRRLRVSDYRIVYRIEAETNTVVIIAIKHRKEVYDDF >NC_009494.2|WP_011946125.1|1241183_1241639_-|hypothetical-protein MTTPIDKLLEYKNTQVLNRYKKDYPNNKLKAEEAFPELLKYLWISQKHKEDLCHFPENDELKFSCGIYPDMLDIDDMWHTFLLFTKDYMAFCDQFFGKYVHHTPTSDNEPIPNNEFEVDFSRYLFYIYDHLGEETVKKWFGELLEEEVDMA >NC_009494.2|WP_027264484.1|1255280_1256579_+|glutamate-dehydrogenase MEECMYLDALSRLDKAASFCRIDSEALEKLKHPKSCLEVSLPVRMDNGELKIFTAYRVHHNDSRGPMKGGIRFHPKLDLDEIKTLALWMTIKCAVVDIPFGGAKGGVIVDPKQLSRMELERLSRSYIELIADFIGPDKDIPAPDMYTNEMIMGWMMDEYATIVRQNSPAVITGKPISLGGCLGREGATGLGAYYCIKILEKKKKWQSSELRVAVQGFGNAGQSIAKLLYDNGYKIVAISDSKGGIYNTKGIDIPRMIEIKNSSKEVQSIYCKESVCKLAKDATITNEELLELDVDLLIPAAAQNQITQENAARIKAPIIIEIANGPITLEADALLQKKGVLIVPDILANTGGVIVSYFEWVQNKSGYYWSMEKVQEELQTIISREFKNIWQLMEQYQTDMRQAAYIHALSRYDKAVTAQGTRGYFSNLSLSL >NC_009494.2|WP_011946138.1|1256808_1257132_-|hypothetical-protein MWTLKTLKRFVVVAALIGSTAVAAAFDTSVKNDSQLGSMILAASVHHPPHWTPHGGHGKWHWDGHRWHWIQYHYKWHHNWHQNWHQQNWHHGGQGGHGWQGGHGSGH >NC_009494.2|WP_027264485.1|1257238_1257481_+|DUF2933-domain-containing-protein MRFWSSPSGMVAIIIIGIIGYFLIVEHGAHIASFLGASPFLLLVLLCPLMHLFMHRGHGGHEEEHHHKSDNEDDSSEDKD >NC_009494.2|WP_011946140.1|1257487_1258153_+|isoprenylcysteine-carboxylmethyltransferase-family-protein MEHTSYAYGLWLLVIVNSAIFILFAYSFTTTFKTRRDWRAFGAFSAFVIAYFTEMYGFPLTIYFLSGWLSKYYPGVDLYGHDSGHLLHTLLGLKGDPHFDVFHILSFVFIIGGLWMIASAWGTLYRAQKAHQLATSGLYAKIRHPQYDGFILVMIGFLLQWPTILTLIMFPILVYMYVRLARREEKEVLAEFGEEYQRYAAVTPGFIPRFGKQQDSKGGAP >NC_009494.2|WP_011946141.1|1258149_1258650_+|hypothetical-protein MMFMFHSAEMLGLIAIALGIMLVVWALRNEGNSTGLSKVFGWLIVIIGILGELCSSYYAIKYWYAGYFQMPMMSGEAFLFHVAQMLSLIAIAFGIILVVWTSRHEGFGISLAKVFGWLIVLFAILGMICSAYYATVYWHKGYIQTPTGMPLLMQHQMPMQKQSPNQ >NC_009494.2|WP_011946142.1|1258716_1259538_-|hypothetical-protein MKLRWATLAALTVIAALSFMAYYLPSHGDEVSRLTNVAEWQRMASPGELSKAHSFLSHNCTACHTPVKGVEAANCIVCHANNEFLLKRQPTSFHANIGSCVECHREHQGRTARITQMDHNALVSLGLQQLRAFSNANDEEEQLIINQVMLFLAQNESNKSTLRVNPHLSPQELTLRCASCHQNKDKHFKLFGDDCSACHETAHWSLSEFRHPSPSSMDCAQCHQAPPSHYMEHFNMISKKVAHEHEARVDQCFLCHQTTLWTDIKGVGFYKHH >NC_009494.2|WP_011946143.1|1259534_1260296_-|hypothetical-protein MNAQGRMMVLGLVLLMLITWLGFAVHTSYRFAGSFWGGVFGVSGSILMLIPLLYLFIKRISFLKNWVTHYVSMSTLLSWHIYTGIIGSILVLIHTGHKFNSALGIALTAMTLIVTLSGFIGRYLMGFMTQEIDEKKTILLGLQKQYQIVAQELQASAHPKQNIGKLHLMTARFLSWLLEDTALNGQLIKSAEVRALCLADAISELEYAIRFHEHFKRLFQKWLTCHIITALVLYVLLGLHVWSGIYFGLRWFQ >NC_009494.2|WP_011946144.1|1260295_1262179_-|2Fe-2S-iron-sulfur-cluster-binding-domain-containing-protein MLFQYIKKFFLFLWVQAVSISFLLAMASVSFAQLTAQDHAAHHQGEKEGEGMSGMMKNIGTPSKELYPSLMSLPTLSPEKRLEIQQRAHQRITSGMALMKGGLNELLLASSNNNYAKMQEALEKLREGITQYESALAALRALSEGKNPSDIALQWFKREMNLLPSSPQAESVLGGPFFHLTIIALFGLFFLVMIWMYFFKMRRAAALLDRLTKQNAAVSSQTPPQFSKAPEPTPSLTSAEPIKSSQVSKVPSETAPTMPPTCPAHKCPVPQFPVMRSLTEPEEKWEGQLRVCRIFQEAPGIKTYHLASTHEVALPFTYYPGQFITLTALINGKTVRRSYTMASTPTQLHYCAITVKREEQGVFSRYLHDEIKEGDLLEVMGPNGKFTFTGEEAKSIVLICGGVGITPMMSIIRYLTDIGWHNDIYLLYCCRTTSEFLFREELEQLQERYLNLHVYASMLRSEGTIWMGLQGLFTKNIISHLVPDIASHRIHVCGPPAMMEAILGILKELKVPADLILTEAFGPEKKPEIAQEELEAIKADTRAMVSFRKSEKMVPILPDRTLLEIAEANGVTIDNACRTGQCGLCKVKLLSGEVTMACEDALSKEDKQQGLILACQAKATKNIEVDA >NC_009494.2|WP_011946145.1|1262392_1263262_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-gamma MTKRTKLKEHLHTLEEIGHIMTAMRNLSLIETGKITQCLALQDQVIKTIHEVSHDFLSFYSMPPMNQQENPLLVSILIGSERGFCGSFNDNVFHQLDAHKEHHSELEPALILVGHKLALKMPNDSRVMATIDGPNAIEEIPAVISNVLHTLEKALLQKNKTWHSWQWTVLFNEEEHNQIQAKTWQPFRELDTNPALHFSVPPVLNGSKDQFFADLVEHYLLAMCYSIFYQSFFAENHQRLFHLNQALDRLENKKNALNHRLNLLRQEEITEEIQNILQSAEAIIGHELT >NC_009494.2|WP_011946146.1|1263318_1264791_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-alpha MNWSNTPSFLEKQRQRLKRYQFQIKVSEQGRVVSVGDGIIWIKGLPGAAIDEILISEDECCIAMVFHLTEELVGAVMLVQTKKLKAGTPIFPLKRVLSIPVGDKLLGRVIDPLGHPLDGGEIPPHEEQGLLDRLSPHILHRDFVNRPLYTGNKMLDNLIPIGKGQRELLIGDNGLGKSALALDIVMNQKDKKVYCVYVLIGQKRSTVSSTIQLLKKANALDYTTVVVAQATALPGLLYLAPFAGCAIAEHWMKKGLDTLVVYDDLSAHANSYRELSLLLRRPPGREAFPADIFYLHSRLLERSTCLSPAMGGGSMTALPIIETKEGEMATYIPTNLISITDGQIFFDESLFSSGFLPAIDITKSVSRVGAKAQHPQIKKESGRMKLDYLQFLDLELFTRFGAKLDAKMQKQIQKGRVLREILKQERFSPLPIEFQLAWLIAYNEGFFDESNLEDIPQILKKIEKEIKQSNLSLGSPREQWKKAIKEWLMA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_009494_2 | 1661585-1661673 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_009494_2
|
1 spacers
spacers of NC_009494_2
>2.1|1661614|31|NC_009494|CRISPRCasFinder CCAGCAGTACCAGCAGCATTTGACGGCTTAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009494_2
The CRISPR arrays of NC_009494_2 >merge|NC_009494|2|1661585-1661673|CRISPRCasFinder CAGGTTAATGATGCTGGTGGTGTGTTGGGCCAGCAGTACCAGCAGCATTTGACGGCTTATCAGGTTAATGATGCTGGTGGTGTGTTGGG >NC_009494|2|2|1661585-1661673|CRISPRCasFinder CAGGTTAATGATGCTGGTGGTGTGTTGGG CCAGCAGTACCAGCAGCATTTGACGGCTTAT CAGGTTAATGATGCTGGTGGTGTGTTGGG
>NC_009494.2|WP_011946455.1|1660269_1661016_+|ribosomal-large-subunit-pseudouridine-synthase-B MSSERLQKILSQAGLGSRREMERWIDNGWVQVNGKPAKLGDSAGPSDKISVKGKLIPNPLKGKQNIRVLLYHKPVGEVSSRHDPKFEKTVFDNLPHLRQGRWVQVGRLDLNTSGLLIFTNNGELANQLMHPKYGLEREYAVRVHGQVSQESLNNLLKGVMLDDGLAKFTKIQFRGGEGTNSWYHVTLNEGRNREVRRLWESQGVEVSRLIRIRYGMLTMPRFLSRGQFYELTPKEVTEFLDSLPNELS >NC_009494.2|WP_011946454.1|1659698_1660280_+|SMC-Scp-complex-subunit-ScpB MIDNELKNIVEALILSSNEPVTLEKIQETFDEWQRPTLEDLQAIIESLKVDYSSRAFELIQVASGFKVQTKSKYATWVARLQIEKPAKYSRALLETLAIIAYKQPVTRADIEDIRGVAVNSQIIKTLMEREWIRIAGYKDVVGKPAVYTTTKEFLNYFNLNYLSELPPLPEIMDTLTLHEATQPIKECTQNEQ >NC_009494.2|WP_011946453.1|1658905_1659697_+|segregation/condensation-protein-A MNIDLQPAPVVKAVVDGKEITQFPEDLYIPPDALEVLLDSFTGPLDLLLYLIRKQNIDILDIPMTSITNQYLQYIQLMENRRMELAAEYLLMAAMLAEIKSRLLLPVTPDSEEEEEDPRMTLVRQLQAYEQIKQAAELLDGLPRQDRDNFTIQVSPDEVEAIKVYPEVELSELVEAMKVLLKREEHYSKHQVSRELMSVRERMSRILFQLQHQKTLEFSQLYTLEEGRMGLVVSFLAILELAKQSLLIITQTQPFSPIHLQAA >NC_009494.2|WP_011946452.1|1657691_1658906_+|tryptophan--tRNA-ligase MSALFTSNKRVVSGMRVSGRLHLGHYHGVLKNWIKLQHQYDCFFFAADWHGLTTQYESPNFIEKHLWDMIIDWLACGVNPGLCKIFIQSWVPEHAELHLLLSMITPLGWLERVPTYKDQQEKLKEKDLSTYGFLGYPLLQSADVLLYHADYVPVGEDQVAHIELTREIARRFNYLYGREANFEELAAAAIKKMGKKNGKIYTELRRQFQEHGIHESIKTAQALLEDQPNLSIGDKERLLGYLEGSGKIILSEPQPLLTETAKMPGLDGQKMSKSYHNTIMLRDEPALVEKKILTMPTDPARIKRTDPGEPEKCPVWQFHKVYSNEEVKDWVQKGCRTAGIGCVDCKRPVIDAIHQELKPIQEAISDYEADLGSVKRIVAEGSEAAREEGNKTLNTVREVMGLDY >NC_009494.2|WP_011946451.1|1656836_1657457_+|threonylcarbamoyl-AMP-synthase MSQFFALHPDNPQARLLRKAVSIIEEGGLIVYPTDSGYALGCSLGNKSALERIRRLRQLDKHHNMTLVCRDLSQLGTYAKVSNPIFRLLKAFTPGSYTFILNATHEVPRLMLHPKRRTLGLRVPDNTITLSLLECLEAPLMSTTLILPGAEAPLSEPEAIKDLLGNQIDLIIDGGNCGHEPTTVVDLTGDYPVIIREGKGDPEPFR >NC_009494.2|WP_011946450.1|1656000_1656840_+|PHP-domain-containing-protein MIDLHCHSSFSDGALTPEELIKRASTLQVQCLSLTDHDTIAGYDALYDAAIHTNIEIVKGIELSTRWKKYDIHILGYQINHTAELQELIAHQNKSRIERAEKIGESLHSIGIDKAYEKACLLAGHKRVGRPHFAQVLINEGKAKDMKSAFKNYLGRGKCAYIPTLWISMHDAVKGISHSGGQAVIAHPLKYGLTRSKLRELITEFKEAGGVGMEVVSGEMTTAQIQEMAGMCERFHLLASSGSDYHSDAQSCINLGRQRQLPIICTPIWQEWNMKQGTL >NC_009494.2|WP_032829183.1|1654771_1655722_-|PhoH-family-protein MSSTLNSEIIKLPPLNTRELANLCGVLHSNLKILEQHFKVSIKIKNHNMIICGQSGDHFEEIKKVLKLLYPLTGEPIDTKTLRVLINEDYQTAMTHHIRLSRKSISARNSKQAAYLDSINTHDITFAVGPAGTGKTYLAVSKAIECFEKGEVQRLIFVRPAVEAGEKLGFLPGDLVEKVLPYLRPIYDALYEMIGFKETQKLIQTDIIEILPLAFMRGRTLNESFIILDEAQNTTIMQMKMFLTRMGFGSKTVITGDITQVDLPKGIDSGLAHAIQLFRHFPDISIHTFTSREVVRHPLVSKIVDCYDNEMERIKK >NC_009494.2|WP_010947169.1|1654298_1654775_-|rRNA-maturation-RNase-YbeY MTYHIDIQNATGKLLPLSEDEITKLASLALRDHKQDAELTVRLVDVEEMTYLNHTYRKKNKPTNVLAFPCSLPANIELECPLLGDVVICPEVLLAESAQFNKSLHAHWSLILIHGVLHLLGYDHIKDEEASIMQMLEAKLLAELGYANPYEVEENELE >NC_009494.2|WP_029345972.1|1653448_1654339_-|CBS-domain-containing-protein MLIHMKSRKMNLNKLEDGGSWFSRLKQFLQGEPQNQEELVSLLRDAQIRSLINSETLAMIEGAILFSKMRVRDIMLPKNQMVCINKDDDFKHIISIVTQTGHSRFPVTSENSDEVVGILHAKDLLKYQPENMESFDLLDICRQVTFVPESRRLDSLLSEFRSNRNHMAIVVDEYGEVSGFVTIEDIIEQIIGDIEDEFDIDEDAYIKAHEGHCYIIKAHTPIEEFNEQLNADFSDETYDTIGGIVLNKFGYLPQRGEVIIIDDFEFKVLNADSRRIKLLECLDKRSPEKLNSTVEG >NC_009494.2|WP_011213724.1|1652760_1653441_-|response-regulator-transcription-factor MSSSILIIDDDTELTDLLTQYLEPEGFNVVCVHDGENGVKKALNQVFDAIILDVMLPKLNGFEVLKAIREHLETPVLMLTARGDDIDRIVGLEIGADDYLPKPCNPRELVARLRAILRRTQKIPTPKPIIEQHNIIVDCSKRHVTMGGKFLELTNAEFNILEMLIKSPGQAFSKEELTEYALGRKYTAYDRSIDVHISNLRNKLGDNPQGEPLVKTVRGFGYMFNA >NC_009494.2|WP_011946457.1|1664709_1665159_-|YbhB/YbcL-family-Raf-kinase-inhibitor-like-protein MSLLLTSPAFEHNDFIPDEFTCHGLDRPPPLAWENAPPNTKSFVIIMDDPDALGGLWVHWVLFNIPANYNELDAAIDLPDSAVSVKNSWGKTGYGGPCPPRGTHRYFFRLYALDIFLSLDEKATKKDVEYAMQGHILETSELICKYTKL >NC_009494.2|WP_011213737.1|1665376_1665742_+|hypothetical-protein MKDLLVYVLFFIFSSLINVAWADNNLCIAINNFGTVPINVSGANSLEDHIVKPRETLILPEKEVAASCFPDWGCDVIIIPIEQNAKGLYLKQLPKGSRIIYSQPDLYYVNRTANVPCIPDL >NC_009494.2|WP_011946458.1|1665780_1666632_+|alpha/beta-hydrolase MTSYEEKKVKIPGFTIALKIWNPNNPNPVLCLHGKMDNAASFDLLAPLLSDRQLVAVDYPGTGLSSHYPEGVVPHWKNDAFLMCHVIKALGWKRFDIIAHSLGSFLATVISIAQPKQVNKLVFLDILGPTVHIIENSMAYLPLNIESYLISGKQPRTVFSSLDAAIKDRMNIGNISYQAAQALVQRGTKQDNEGWVWTFDPRLRCISATIPHEDEIRAMFRAIDVPVCLILANQGVSYPESVFKGRSQSIKNLTIHRVQGGHHVHMDDPAPVAEIISQYLSSK >NC_009494.2|WP_011213739.1|1666758_1667277_+|lpg1453-family-Dot/Icm-T4SS-effector MPRWFRRIVDEGERLLVEVTDELRDESEVHKAASQLHLRIEQVLNANRARLEKPVIEAAEGFLHDLGVILEEDSMLRFPHAPVNQYLLAEKCTDIIYNYKPSLESAPGIWNQIKAHINNFIEIIFGLENVLPTTQTMFAKDVSFTRCKRNLSRLKESLESDAPDLLSVLVNC >NC_009494.2|WP_013101456.1|1667398_1668784_-|MFS-transporter MKKNIIMFIVSCAMFMEAIDTTILNTAIPVMAHSLEVNPIDLKLVLISYLLSLAIFIPISGWIADKYGVKKVFIAAIGVFTLSSLWCGFTQSLWELVLARIIQGLGGSLTVPVGRLIILRTCKRHELITKMSIVVMVASLGMLLGPLLGGIITDYFSWRWIFWVNIPVGIIAMLLSHKLLPTILPRSVPPLDKSGFIMFGAGLAFLTLGLSLFSETKTDIVYSASITLLSALLLIGYTKHSRNKKNPIIKVTLLNIRTFRIAVLGNLLTRLSFGGIPFLLPLLFQIILEYSPQLSGMLLTPVALGVFLVKPLSFSILRRLGYKKLLLLNTVLVCFSLWSFATINQSTSVIYIGFLTFLYGFFIALQYTGMNSLAYANIDDNDMSYATSIMSTVQQLSQSFGVAISALLVSLFTSQVSQHFVLTVKIFHLTFFALGMLTILSGLIFTSLKKEDGKELIESPT >NC_009494.2|WP_011213741.1|1668812_1670069_-|hypothetical-protein MLKNITRALSLSLLISHNICANEASSIETISQPTTIQFLEKFGAGFANLEHKNLGDRVQLYLPGHNSKTGIVKLKLPNGSKLSYGEIVMYGGDMFGNPAKPISNCSEKNRLACFQAQFDALGTLGNKQDKRCSNPLNQITHLDRFFANLAEEIEKSKQNGTNDWDYYKQHDSAISKELNKLTCGGSIISGFIPFGNYIKLAEVNYDHFVPDSLVAYKTGHRFALETALKAYEKKQQGLIDEAHKLLELAYAQNAFANHYLTDSFSAGHMRTPRRAIGHDILLPSVLNLLIANLMHNEDNQHGLNVVNHEGISWLAYGDGYLYKPEAELQRVIILDAMQRSADSIHSTFMNGVIPEHYPEMDVFPDYSKIEQINDTAPLFKVENGVLLKRVNNKDHYDHHWTKYWSGLVTLIEFQVNKI >NC_009494.2|WP_011946460.1|1670189_1671524_+|23S-rRNA-(uracil(1939)-C(5))-methyltransferase-RlmD MRKVKPKLNLTSQTARIVNLSHDGRGIARVNGKATFIQGALPGEVVEFQYTRIKKDFDEGKLLSIVEPSTLRVEPKCPHYQMCGGCSLQHMSAEEQIRFKQSHLLDLLSRYGHTEPQSVLSPLTSHHWNYRNKARLSTRFVEKKQSTMVGFRERNNPRFITEINQCPILNSKIDTDIVHLRKLIDTMEDKHCIAQIEVAAGDNEVALIFRNLSPLTEQDELKIREFAQQFQYKVFLQPGGLDSVFCFYPSDAHAYLSYELPDYQITFQFHPNDFTQVNAELNRKMVTQAIQLMELKNSDIVLDLFCGLGNFSLPMAKHCSRVIGVEGNKNMVERAYMNAKSNHITNVDFYAANLDDVMEVRNLVNTSFSKVLIDPPRSGALEIVKQIDSIDPERIVYVSCNPITLARDTDILVNQKGYVLITAGVMDMFPHTAHVESIALFQKG >NC_009494.2|WP_011946461.1|1671529_1673734_+|GTP-diphosphokinase MVRVKDTTPLMPDGSIDVEMWLHHLGSKGYLDNLELVRAACTLSQLAGQDHATETGQTCLQQGLSMADLLADLEVDQETLAAAIIFENVHYADLSIDDVEEQLGHNIAKLVKGIEKMSAMNNFQALNKYPQNKNQIDNIRKMLLAMVDDVRVVLIKLAECLCILRTAGHLSETVRKQLATEAMEIYAPLANRLGIGAIKWEMEDLAFRHLHPEEYKAIAKGLKAKRLERDSFVNRIVEQLEHQIRATGARHFAVYGRSKHIHSIYKKMKRKNVSLDEIYDATAVRILVDTEAQCYEVLGMVHTLWKQIPAEFDDYIINPKSNGYQSLHTAVEGPEGRVFEVQIRTFHMHDLAEMGVAAHWKYKEGAVSQKESHERKIEWLRDVLAWHQEMAANKGVAENVTTEFLEDRVYVFTPDGDVLDLPHGVTPLDFAYHVHSNLGHRCRGAKVNGHIVPLTYQLKTGDRVEVLTGKEIKPSRDWINPHLNYLKTARAKAKVLHWFKMQDYEDNVRDGRELLEKELKSLGIKSDKLNEVITALNYKKADDLYASLGRGDIKIGQIVNRLAPPDTSEQNLQKFVRQQQKPEVTGSDLRIEGVGNLLTFMARCCQPVPGDEIVGYITIGRGVSVHRKDCPNIIHASEKQKRRFIQVNWGTATRENYVVDVLIKAFDRSELLKDVTSLLSNEKAHVYALQTQSNKHENMAYITLTVEIDGLNSLSRLLTKLEQIPNVLEARRQL >NC_009494.2|WP_011213744.1|1673774_1674140_-|Mth938-like-domain-containing-protein MNINLETAEQHAVQAYSDKKIQINSIIYESSLIVSKKEIITDFVIKDIQDINDSYIDLLLRSKPELIIIGHLQTGKTLPVTLISQLSQKRIGIECMSIGAACRTYNVLLSEHRAVVAGFIF >NC_009494.2|WP_011213745.1|1674198_1675392_+|alanine-transaminase MSQFPRIKRLPPYVFNTINQLKMEARARGEDIIDFGMGNPDQPTPPHIVNKLIEVAQRPDTHRYSMSKGIPRLRRAMATWYLRHYDVHLDSETQILATIGSKEGLAHLALAISGPGDTVLVPDPAYPIHTYGFIIAGANVKQIPLIDEVQFLAAVEDAINRTWPKPKALVLNFPANPSTHCVEYEFFEKVVDLAKRNNIWIIHDLAYADIVFDGYKAPSILQVPGAIDIAIETYSMSKSYNMPGWRVGFACGNEELVAALTRIKSYLDYGTFTPIQVAAITALEGPDDCVLEIRNLYEKRRNLLCDGLNDIGWEVSKPKGTMFVWAPIPLNYRAMGSLEFSKYLLKEAQVAVSPGIGFGQQGDGYVRFGLIENKDRIRQALRNLKALFKRDGLLKAI |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_009494_2 | 2.1|1661614|31|NC_009494|CRISPRCasFinder | 1661614-1661644 | 31 | NZ_CP021285 | Legionella pneumophila subsp. pneumophila strain Allentown 1 (D-7475) plasmid unnamed2, complete sequence | 33893-33923 | 4 | 0.871 |
NC_009494_2 | 2.1|1661614|31|NC_009494|CRISPRCasFinder | 1661614-1661644 | 31 | NZ_CP021285 | Legionella pneumophila subsp. pneumophila strain Allentown 1 (D-7475) plasmid unnamed2, complete sequence | 35384-35414 | 4 | 0.871 |
NC_009494_2 | 2.1|1661614|31|NC_009494|CRISPRCasFinder | 1661614-1661644 | 31 | NC_006366 | Legionella pneumophila str. Lens plasmid pLPL, complete sequence | 43967-43997 | 4 | 0.871 |
NC_009494_2 | 2.1|1661614|31|NC_009494|CRISPRCasFinder | 1661614-1661644 | 31 | MH319723 | Marine virus AG-345-D19 Ga0172267_104 genomic sequence | 8623-8653 | 9 | 0.71 |
1. spacer 2.1|1661614|31|NC_009494|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021285 (Legionella pneumophila subsp. pneumophila strain Allentown 1 (D-7475) plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.871
ccagcagtaccagcagcatttgacggcttat CRISPR spacer aaagcagttccagcagcatttgatggcttat Protospacer ****** **************.*******
2. spacer 2.1|1661614|31|NC_009494|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021285 (Legionella pneumophila subsp. pneumophila strain Allentown 1 (D-7475) plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.871
ccagcagtaccagcagcatttgacggcttat CRISPR spacer ccagcagtaccagcagcatttgatggttcac Protospacer ***********************.**.*.*.
3. spacer 2.1|1661614|31|NC_009494|CRISPRCasFinder matches to NC_006366 (Legionella pneumophila str. Lens plasmid pLPL, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.871
ccagcagtaccagcagcatttgacggcttat CRISPR spacer aaagcagttccagcagcatttgatggcttat Protospacer ****** **************.*******
4. spacer 2.1|1661614|31|NC_009494|CRISPRCasFinder matches to MH319723 (Marine virus AG-345-D19 Ga0172267_104 genomic sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
ccagcagtaccagcagcatttgacggcttat CRISPR spacer ccagcagttccagcagcagttgatacttggc Protospacer ******** ********* ****.. .* ..
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1018596 : 1025435
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_009494|1018596:1025435|DBSCAN-SWA TTTAGTCAGTCATTAGTTTCTGTAATGCTTTCCCGATGTTATCTGCCCTCATTAAACTCTCTCCAATCAAAAAGGCATTAATGCCATGGGATTGCATTAATTTTATGTCTTCACGGGTGTTGATTCCGCTTTCAGTAATAATAATTTTATCTTTAGGAACAAATTGTTTTAATTGGATACTCAGTTGAATGTCTGTTTTAAAGTTGTGTAGGCTGCGGTTATTAATGCCTATAAGAGGGGTGGGTAAGCGTAATGCTCTTTCTAATTCATCTTGCGTGTGGCTTTCAACCAAAACAGACATTTTAAGTTCTTGAGCCAGTTGGCAAAAATCCATTAATTGAACATCATCTAATAATGCGACAATCAGTAAAATGCAATCAGCACCCAAGACAAGGCTTTCATAGATTTGATAAGAATCAATAATAAAGTCTTTACGCAATACGGGCAAAGTAGTTTTTGATTTTGCTAAAGCCAAATAATCAGGATGACCTTGAAAAAACTCAATATCCGTTAAAACGGATAAGCATCTTGCGCCATTTTGGGTATAAATCTTGGCAATTTCTGCAACATTAAAATCTTTTCGAATTAGACCTTTGCTTGGAGAAGCCTTTTTTATCTCGGCTATGACTGCAGGTGAGGTATTGGATTTTAAAGCAGTTATGAAGTCACGTATTTCCCCCGGTTGTTGTTTTGACAGAACATGTAAAGGCTTATTTTTTTTCGCAACTGCAACTTCTTCTAGTTTATGTTTGGCTATTCGTTCCAGGATACTATTCATGATTTGATTCTTTATTTAAAGTTTGGGTCAATAATCGGAGTTTGTTAAAACAATGATTTGCTTTACCACTATCAATCGCAATTCTTGCTTCCTCTATGGATGCATCAAACGATATGCCATCTTTGGCACAATAAATGGCTGCGGCAGAATTGAGAAGGACTATATCTCGAGCTGGCCCAGAATCACCTGAAAGTACGGATTGAATCAAATGCAGGCTTTGCTCTGGTGAGTCGACTATGATTGCATCTAAAGAAGAATGCTTTAGACCATAATCTTCAGGAGAAATAAACCATTGCTTAAAATTTCCATCTCGGTATTCAACTACTTCACTTTTCGCTGCAATACTAATCTCATCCAGTCCATCTTGAGAGCTTATTACTAATGATCTTTCACTACCTAAGTTGGCCAGGACAGTAGCTATTGTTTTGAGCCAATTCGTTGAAAATACACCAACGACTTGTCGTTTTACCTGAGCCGGGTTAATCAGTGGGCCAAGTAAATTAAATAAAGTTCTTATTCCTAATTGTTGCCTTGCAGCTCTCGCATGCTGCATGGCGGGGTGATAATGTGGCGCAAACAAGAAAGCCAATTGACATTGGTTGATGCAGTTTTGTACCTGTGAGTCAGAAAGATTAAGTATAAATCCGGCTTGTTCTAATAGATCAGCGCTACCGCTACGACTCGAAACAGAACGGTTACCATGCTTTGCAACTTTTATTCCTGCTGCAGCTACAACAAAACTACAGGCTGTTGATACGTTAAAAGTATTTCTTCCATCACCGCCAGTGCCAACTATATCAATCAGGGGATTTCCCAAATCTATTTTGTGGGCTAATTGCCTCATGACTTTAGCTGCTGCAGTAAGTTCATTGACTGTCTCACTTTTCATGCGCATTAATGCCAGAAAGGTTGCAATTTGCACATCACTAAATTCACCTGTCATACAAGCATGGATGACCTCTTGCATCTGGTCTGAGCTTAAATCCTGTCGGGATAGAAGTTGTTCAAATAGAAGTTTGGGTTTCATAGCGTAAAAAATTCTCGAGTATTTGCAAGCCAAATTGACTTAATATGGCTTCAGGATGAAATTGTAGACCAAAAAGAGGAAATTGACGATGTGATATTGCCATTATTGTATCGTCTGCCCACGCATCTATCGAAAAGCAATTGGGCAAGCTCATGATATCCACGGCTAAAGAATGATATCTCGTCGCTTGAAAGTGATTTGGTATTCCTGTAAATAAGCCCTGGTAATGATGGGTGATTTCTGAGGTTTTACCATGCATGATTTCTGGTGCTGGGATGATTTTGCCTCCAAATGCCTGAGCTATACACTGATGGCCAAGGCAAATACCCAATATCGGAATATGCTTGTGAAACTCTTTAATGACTTCTATAGAGATTCCTGATTCATCAGGAGAGTTGGGTCCCGGTGAAATGACCAGGTATTGCGGCGCTGATTGCCTGATAGCATCGATTTGAATTTCGTCATTTTTAAAAACTGCAACTTTTTGATTTAAGCTCTGGAAGTACTGTACCAGGTTGTATGTAAATGAATCGTAGTTATCAATAATTAGTAACATAAGTATAATTAAAATGTATTCTTTTAAATGAGGCTACAAAGCAAATTCTTCACCCAAATAAACTTGCCTTACTTGTTGATTGGCAAGTATTGCTTTGGGGGTTCCTTCGCAAAGAATTTTTCCCTGACTTACAATATAAGCGCGTTCGCAAATGTCTAAAGTCTCTCTCACGTTATGATCTGTAATTAAAACCCCTATACCTTTATCACACAAATGCAGGATAATTTTTTTGATATCGATTACAGAAATTGGATCAACCCCGGCAAAAGGCTCATCAAGCAAGATAAAGGATGGTTCTATTGCCAGGGCTCTTGCAATCTCAACGCGTCTTCTTTCGCCGCCCGATAAGGCCATGCCCAAGCTGTTTTCTATGTGAGAAATATGAAACTCTTGTAAGAGAAGATCCAGCTTTTCTTCACGTTTTTGATCATCTAAATCTTTTCTTAGTTCCAGAATCGCCATGATATTTTCAGCGACAGTAAGCTTTCTAAAAACGGAGGCTTCTTGCGGAAGGTAACTAATACCATGCCTTGCTCTTAGGTGCATTGCGTCTTGAGTTATGTCTGTTCCGTTAAGAATAATATGGCCTTCATCACAGGATTGCAGACCTACAATCATATAAAAACAAGTGGTTTTACCCGCCCCGTTAGGACCTAATAAACCGACACATTCACCTTGCTTAATGTGAATGCTAACACCATTCACAACCGTCCGGCCCTTAAATGATTTTTTTAATTGTTTAGCCTCTAGTAAACTCATGATTTCTTTTCAGGATAAATAATGATTGTCGTTCTTGTTTTTTCGTCACTATGTGATAAAACATGTTGTTCCTGAGTATCATAACTAATTTTTGCCGCTGAAAGAGAGTTGGGTCCTTGCTCTATGCGAGCATTCCCAATTAATTCGATTAAATGTTTTAGCGGATAATATTTTATAGTGTCAGCATAGGCATGGAATGGGGGTTTATCAGGGGCTGTTGTAGTCCAATAATGAGCTTGCTTGTCTTTAGAGCCTTCAGCAATGGCTAAAGTGAGTTGATTTTTGGCATCTCCTTGCGTAATGGCTTTTTCTGCACGCAAATTGGTTGACCCTTGAACGAACTCAACATTTCCTATATAGACTCCCTGATGATTTTTCTGATTTAAGTCGGCTGAATCAGAAACTACTTGCACCATTTTTTCCTTATCAAACGGAAGAGCATTTCCTGAAATGGAGCACAACATCAACAATAGCAGTATAATGTATTTAACCTTTAGCTGGGTCATAACTACCTCTGGCTTTATGGAGTAATTCTACTCTTTTTTCATCCAAATAGGCATTCATTCCAGTAGACTGTATGATATTGCCTGGTTGTTCAAAGGTTACAAAAAGACTTGTTGTTGCTTTTTTTTCCTTGGGATAATAAGTAATCTCTTCAGTTTTTAAAGTGCTTTCCCTGGTGTTTTCTCCCGGATTTTGATGAACTACTACTTGCTCTATAAAAGTAATTTGTTTACCACCATCAAACGATTTTGCCCGTAATGAATTGATTTCCCACGCGGGTTGATTGTCTTGCTTAATAATAATATGGGGGTTTTTAAGCAAATGGAGATTGTTGTTAGGAATATATTCTACCTGTGGAGTGGTTAATAAGTTAATTAACACACCTTCTGAATTAAATTGCTTTACGGTAAGCTGCGAAATCGTTGTGTCAACTTCATTTGACAACGTTTTCTTATTGATAATAGCCTGATTAAAATGAGCATAATACCAACCAGATCCTGCTAAAATAAGCAAGGTCAAGAATAGCCAAATTGCTTGCTTGGTAATATTCATTGTTTTAAATAGCCTGTGATCGCCAATTCTGCTTTATTTTGTGCGTTAAGAATTAAGTCACATAATTCGCGAACCGCGCCTCTACCACCAGTCCGCTCTGTTCTCCAATCAGCAAATTCCAGAACTTGCGGTACAGCATTACTGACTGCAACTCCTAATCCCACTTGTTGTATCAAGGGTAAATCTGGCAAATCATCGCCAATATAGGCAAACTCCTCATCATTGAGTCCCAATGTTTTTTTTAGATGTTGGTAAGCGCTACGCTTATCAACTTGACCTTTATAGTAATGAGTTATCCCTAATTGCTCCATTCGATGGTCAACTACAGCATTTTGTGCTGTGGTAATGATTGCAACTTGTATCCCGGCGGCCATTAATAATTTTAATCCCATTCCATCTTGTACATGGAATGATTTCAGCTCATTGCCGTGATTATCAATGTGAAGTAAGCCATCACTGAGCACCCCGTCTACATCACAAATAAGACATTTAATTTTTTTCGCTTTTTCCAATAGTTCGTTCATTTCTATCTCTGTATTAAAAAACACCCGCTTTTAGCAAGTCATGTAAATGGAGTACCGCATAAGGTCTATTATCATTTTCAACTACTACCAAGGATGTGATGCTATATTTTTGCATGATTGCTAAAGCTTCGGCAGCCAACATGCCTTTAGAAATAGTTCTGCAGTTTTTAGTCATGACGTCCTTGATTAGAGTAGTGTTGATATTAAATTGACGTGTCAATGTTCGACGGATATCTCCATCAGTATATACACCCACTAAATAGCCATGGTTGTCTACAACACAAGTCATTCCCAGCTTTTTATTTGTGACTTCAATTAAAGCGTCACTCACTGTTGCGTTTTCATTCGCTAAGGGAAGTTGCTCTCCTGTATGACATAAATCGTCTATTTTTAGCAACAATTTTTTGCCAAGTGCGCCTCCAGGATGGGAAAGAGCGAAGTCCTCTGCACTAAATCCCCGTGCTTGTAAAAGAGATATAGCCAATGCATCCCCCATAACCAGCGATACCGTAGTACTGGTTGTTGGAGCAAGACCCAGAGGGCAAGCCTCTTGTTTAATACTGACATCCAGATTGACATCTGCAGATTTAGCCAGAGTTGATTGTTTATTGCCGGTCAATGTAATTAAGGGGACTTCAAGCCTTTTTAATAATGGAAGCAAAGTAACTATTTCGTGGGTATTGCCTGAATTGGAAATGGCAACAACTATATCCTGGCGAGTTATCATACCCAAGTCTCCATGACTTGCTTCTCCAGGATGCATAAAAAAAGCGGGGCTGCCAGTGCTGGAAAAAGTAGAGGCCAGTTTATTAGCTATATGGCCAGATTTTCCCATGCCTGTGACGACGATACGCCCTTTGCATGATAAGAGTAATTCACAAGCTTTTTCAAAATGTTCATCAATTCGTTGAGTTAGCTCAAATACAGCTTGTGCTTCAGTTTCAATAACTGCTAGTCCAAGTGTGCAAAAGTTCATAGGTCATTGAGTCGTAATTTTGTTTGGTTTTCATTCTAACATAATGTATTTAAATGATGTACCCTATATTTCAGTAACTGATACCAACTAATGGCTTATAGCATTATTATTTGTTAAAATAACACTCAAATTGAACTTAAATAATAAAAAACGTCTTTTATTTAAATTTTCCGATTAATTTTTGAAAAATTGGTATTGTAAAAAAACTTTTAAAAAGTTTTTTTTTAATGGAAACGCAATTATTAAACACATTTTTATTTATCCAGTATATACTTCTTAATTAAAGATATAATAAAGCATTACCTGTCTTTGATAGATATCAAACTGACATCATTACCCGTTAAAATAATAAGTGGATAATAAAGCATGCCTGATAATTGGGTTGAAATAAAAAATCTATTCTTTAGCCTTGATGATCGCTGCATTTTTGATGGCATTGATATGGTGGTTAAGCAAGGCAAGATTACCGCTATTATGGGACCCAGTGGTTCTGGAAAGACTACTTTACTGCGGTTAATTGGTGCGCAATTGAGGCCTGATAGTGGCCAAATTTATGTTAATGGTCAGAATATTCATCAATTATCCCGCAAATCACTTTATGAAACCAGGCGAAACATGGGATTGCTTTTTCAAAGTAGTGCCTTATTTACACACCTTTCAGTATTTGAAAATGTTGCCTTTCCATTAAGAGAACATACTGAATTAAACGCGTCCATGATAAGAAACATTGTATTAATGAAGCTCGAAGCGGTTGGTTTGCGTGGAGCCGCCCATCTAATGCCCGCTCAATTATCAGGGGGAATGTGCAGGAGAGTTGCATTAGCCAGAACCATTGCTCTTGATCCTGTATTAATGATGTATGATGAGCCTTTTACCGGTCAAGATCCAATTTCCATGGGGGTATTGGTCAGATTAATACAACGATTGAATCAATTATTGCATACCACCACTATTATCGTATCTCATGATGTTGAAGAAACTTGTTCAATTGCAGATTATATCTACTTAATATCAGGGGGTAAAATTATAGGTCAAGGTACTCCGGATGAATTAAAGCGATCTATTGAGCCTCAGATAAGACAGTTTATGCATGGAGAAGCGGATGGGGTAGTGCCTTTCCATTATCCGGCAAAACCGTATACAGAGGAGTTATTAAATGCTTGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_009494|1018596:1025435|1022767_1023295_-|WP_011945955.1|DBSCAN-SWA MNELLEKAKKIKCLICDVDGVLSDGLLHIDNHGNELKSFHVQDGMGLKLLMAAGIQVAIITTAQNAVVDHRMEQLGITHYYKGQVDKRSAYQHLKKTLGLNDEEFAYIGDDLPDLPLIQQVGLGVAVSNAVPQVLEFADWRTERTGGRGAVRELCDLILNAQNKAELAITGYLKQ >NC_009494|1018596:1025435|1020989_1021715_-|WP_010946572.1|DBSCAN-SWA MSLLEAKQLKKSFKGRTVVNGVSIHIKQGECVGLLGPNGAGKTTCFYMIVGLQSCDEGHIILNGTDITQDAMHLRARHGISYLPQEASVFRKLTVAENIMAILELRKDLDDQKREEKLDLLLQEFHISHIENSLGMALSGGERRRVEIARALAIEPSFILLDEPFAGVDPISVIDIKKIILHLCDKGIGVLITDHNVRETLDICERAYIVSQGKILCEGTPKAILANQQVRQVYLGEEFAL >NC_009494|1018596:1025435|1020377_1020956_-|WP_011945952.1|DBSCAN-SWA MLLIIDNYDSFTYNLVQYFQSLNQKVAVFKNDEIQIDAIRQSAPQYLVISPGPNSPDESGISIEVIKEFHKHIPILGICLGHQCIAQAFGGKIIPAPEIMHGKTSEITHHYQGLFTGIPNHFQATRYHSLAVDIMSLPNCFSIDAWADDTIMAISHRQFPLFGLQFHPEAILSQFGLQILENFLRYETQTSI >NC_009494|1018596:1025435|1022201_1022771_-|WP_011945954.1|DBSCAN-SWA MNITKQAIWLFLTLLILAGSGWYYAHFNQAIINKKTLSNEVDTTISQLTVKQFNSEGVLINLLTTPQVEYIPNNNLHLLKNPHIIIKQDNQPAWEINSLRAKSFDGGKQITFIEQVVVHQNPGENTRESTLKTEEITYYPKEKKATTSLFVTFEQPGNIIQSTGMNAYLDEKRVELLHKARGSYDPAKG >NC_009494|1018596:1025435|1024637_1025435_+|WP_010946577.1|DBSCAN-SWA MPDNWVEIKNLFFSLDDRCIFDGIDMVVKQGKITAIMGPSGSGKTTLLRLIGAQLRPDSGQIYVNGQNIHQLSRKSLYETRRNMGLLFQSSALFTHLSVFENVAFPLREHTELNASMIRNIVLMKLEAVGLRGAAHLMPAQLSGGMCRRVALARTIALDPVLMMYDEPFTGQDPISMGVLVRLIQRLNQLLHTTTIIVSHDVEETCSIADYIYLISGGKIIGQGTPDELKRSIEPQIRQFMHGEADGVVPFHYPAKPYTEELLNA >NC_009494|1018596:1025435|1018596_1019373_-|WP_011945950.1|DBSCAN-SWA MNSILERIAKHKLEEVAVAKKNKPLHVLSKQQPGEIRDFITALKSNTSPAVIAEIKKASPSKGLIRKDFNVAEIAKIYTQNGARCLSVLTDIEFFQGHPDYLALAKSKTTLPVLRKDFIIDSYQIYESLVLGADCILLIVALLDDVQLMDFCQLAQELKMSVLVESHTQDELERALRLPTPLIGINNRSLHNFKTDIQLSIQLKQFVPKDKIIITESGINTREDIKLMQSHGINAFLIGESLMRADNIGKALQKLMTD >NC_009494|1018596:1025435|1021711_1022221_-|WP_011215024.1|DBSCAN-SWA MTQLKVKYIILLLLMLCSISGNALPFDKEKMVQVVSDSADLNQKNHQGVYIGNVEFVQGSTNLRAEKAITQGDAKNQLTLAIAEGSKDKQAHYWTTTAPDKPPFHAYADTIKYYPLKHLIELIGNARIEQGPNSLSAAKISYDTQEQHVLSHSDEKTRTTIIIYPEKKS >NC_009494|1018596:1025435|1019365_1020400_-|WP_011945951.1|DBSCAN-SWA MKPKLLFEQLLSRQDLSSDQMQEVIHACMTGEFSDVQIATFLALMRMKSETVNELTAAAKVMRQLAHKIDLGNPLIDIVGTGGDGRNTFNVSTACSFVVAAAGIKVAKHGNRSVSSRSGSADLLEQAGFILNLSDSQVQNCINQCQLAFLFAPHYHPAMQHARAARQQLGIRTLFNLLGPLINPAQVKRQVVGVFSTNWLKTIATVLANLGSERSLVISSQDGLDEISIAAKSEVVEYRDGNFKQWFISPEDYGLKHSSLDAIIVDSPEQSLHLIQSVLSGDSGPARDIVLLNSAAAIYCAKDGISFDASIEEARIAIDSGKANHCFNKLRLLTQTLNKESNHE >NC_009494|1018596:1025435|1023308_1024271_-|WP_010946576.1|DBSCAN-SWA MNFCTLGLAVIETEAQAVFELTQRIDEHFEKACELLLSCKGRIVVTGMGKSGHIANKLASTFSSTGSPAFFMHPGEASHGDLGMITRQDIVVAISNSGNTHEIVTLLPLLKRLEVPLITLTGNKQSTLAKSADVNLDVSIKQEACPLGLAPTTSTTVSLVMGDALAISLLQARGFSAEDFALSHPGGALGKKLLLKIDDLCHTGEQLPLANENATVSDALIEVTNKKLGMTCVVDNHGYLVGVYTDGDIRRTLTRQFNINTTLIKDVMTKNCRTISKGMLAAEALAIMQKYSITSLVVVENDNRPYAVLHLHDLLKAGVF |
9 | Acinetobacter_phage(42.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_2 |
1279687 : 1302783
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_009494|1279687:1302783|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_009494|1279687:1302783|1300888_1301155_+|WP_011946187.1|DBSCAN-SWA MSTKTVQARVDSHLKEVGEGILKMLGVTPSQAINAFYAQIVLCKGLPFEVKLPNNLTLEAIEELESGGGKKFSSFKSMIDDLEEDENA >NC_009494|1279687:1302783|1281588_1281774_+|WP_011946164.1|DBSCAN-SWA MAYDDDLKKKKKESPTSLNIGADEETGNYYCPVDNNHNPIHEKRKYIKVGEQIPSGWVQCD >NC_009494|1279687:1302783|1297064_1297472_-|WP_148220206.1|DBSCAN-SWA MFLDKKIILMVLSIIIKPTYSAGIYTGKDFIFACTDQNYTKNQDVCNTAITQAFATYMVSLELFSGEKLAKCYRNHYPFLEKKSVKDGVQFLTEQYKENPELTPHLLGFGFSVVMYSKYPTPRKCIKFKQSGVSI >NC_009494|1279687:1302783|1301147_1301429_+|WP_011946188.1|DBSCAN-SWA MLEIVRSSQFKKDLKKIIKLKQGKDLELLEEIVNKLQHSEKLPLKNCDHLLSGDWRGFRECHISPDWLLIYKNENELKLLRLVRTGSHSDLFR >NC_009494|1279687:1302783|1286799_1287423_-|WP_011946168.1|DBSCAN-SWA MTDNLNANLNFLEDDFRRKPIAEKLIELLQSDIDISPIIIDGEWGTGKTYFCKKTKSLIENDHQENISCAYIDAFSADHANEPLITIIAAISKLIKKGTNKRKYLRAAKAIASYGIKATGKAGIAWILRTQAQHMDKEIEEAIQSASNDSIDYAIDNLIQQHEAIEENIITLKKVLSEIAQTKNLVIFIDELDRCRPDFAVCVFRRT 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26 | Acidithiobacillus_phage(44.44%) | transposase,integrase | attL 1287730:1287752|attR 1302785:1302807 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1315248 : 1367903
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_009494|1315248:1367903|DBSCAN-SWA 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41 | Acidithiobacillus_phage(25.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1421352 : 1431087
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_009494|1421352:1431087|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_009494|1421352:1431087|1425150_1426224_+|WP_011946290.1|DBSCAN-SWA MHEQFLLAALEQAKLGRGFCAPNPSVGAVAVQNGNIIAQAWHRGAGTPHAEQLLLSQIPPQTPEVTLYITLEPCNHWGKTPPCVDAIINHGIEEVVFAYFDPNPIVAKSNSSEKLREHGIQVRHIPIKAIDAFYKSYAYWTMTHKPRVTVKIAQTFDGKIGKSEGDRVVLSNVLCEQFTHQMRAASDVILTSAKTVQMDNPRMNARLDSGVVAKPVAIVDRNLSLSDDTIIFSTAKHCHIYHQPQANQAKTYPNSTHYAMPLQNGLMDLDAIITHLGQLGYHDVWVEAGGAIFSALHSKGLVHRTYLYLVPGSLGHQAISAYQQQGIFEKAHTVSWQAMGDNMIACLDWQEDECLPD >NC_009494|1421352:1431087|1428628_1430266_+|WP_010946915.1|DBSCAN-SWA MTKYIFITGGVVSSLGKGIAAASLAAILEARGLRVTLIKLDPYINVDPGTMSPFQHGEVFVTNDGAETDLDLGHYERFVKTTMTKRNNFTSGKIYENVIKKERRGDYLGGTVQVIPHITNEIKRCIKLGADAFDVAMVEIGGTVGDIESLPFLEAIRQMRIELGSQRAIFIHLTLVPYIATSGETKTKPTQHSVKELRSIGIQPDVLICRSEKPLSMADRAKIALFTNVEKEAVISLEDANSIYQIPMILHAQHLDEIVVKKLSLEAKQADLSEWQRVVDMQAVQTMTVKIAMVGKYTELNDAYKSINEALLHAGIHTETKVEIIYFDAEMIEKHGALLLESIDAILVPGGFGERGVEGKIKAIQYAREHKVPFLGICLGMQTAVIEFARNVVGLTGANSTEFNKETLYPVLGLISEWMDADGSKQIRDENTDLGGTMRLGGQYCHLAEGTLARKVYGKPQIIERHRHRYEVNNKYVDSLVKHGLIISGRSADNSLVEMIELADHPWFLACQFHPEFTSNPRDSHPLFKEFVLAARIHHQEKDKK >NC_009494|1421352:1431087|1426819_1428028_+|WP_011946292.1|DBSCAN-SWA MKHSLATIEEAVATLKAGKMIILMDDEDRENEGDLVIAAEHATPEAINFMSRLGCGLICLPMAEELIDKLQLPMMARHNKSPYGTAFTVSIEAANGVSTGISARDRARTIQVAIDPKSGPSDIISPGHVFPLRARKRGVLERPGQTEGSVDLVRLAGLTPAAVICEIINEDGTMSRRDELALFSKKHQIPLVTIKDLINYRIRHENLINPVATTQIPLEENGVFTMTVFENQIDSGEHFVLVKPPLYGNQVPLVRIHSECITGDVFGSRKCDCGKQLELSLSQIGAEGGILIYLRQEGRGIGLANKLKAYALQEQGFDTVDANLELGLPADDRDYAVAYQILKYLGVDALRLLTNNPLKIASLERYGIKITQRIPLEIKPSRENHSYLKTKKIKLGHLLAID >NC_009494|1421352:1431087|1423651_1425088_-|WP_011946289.1|DBSCAN-SWA MIKLNLNYKLITKKTLPKLFYWGLGIVFFFLAPTTNAGSLSPYTTKELEQLEREFIQLINQSDSVERNPLASQYINSIGKKLAHYGRIKTPYFFIVKSKEINAFAGPGGYIGINTQLILTSSNESELAAVMAHEIAHVRLHHLYSIIEHQKQMRVPLLASILASAALGVLNPTVGMGAMMASVSGFSQDNINFTRSKEKEADRIGIDMLIKAGFNPQGMAAFFNKMQENSRYYYTANIPAILRTHPLDADRIAEAENRTSRLPKKHYTDSLDYALFKELIRVSVASNNKQILDYYEHHCHKKNPATACQYGYVLALLNNNNFQKAAEKLNPLLLQDNSNLNFQIAMAQAELGLSQYQSALSRLAELQNNFPDNYAALMAYAQGLLTANQPEKATAILLKGSRQYKEDLPLCRELARAQAESHQKSYAYFTQAQCLLLEGQKRGAIAQLKVAQKMAKKDAYLSARISAKIDEIKFMVEN >NC_009494|1421352:1431087|1428035_1428503_+|WP_010946914.1|DBSCAN-SWA MREIKTIVSDGVTFPIALVVSTFNELITSALKKGALDRLTELGFKSEDITLVEVPGAVEIPFVAQLLAKKQKVEVIVALGAVIRGETSHYDYVCDQVSQGCQRVMLDYNIPVIFGVLTTENDEQALARVGGTHGHKGRDAIDCAVSMRSIKQQLQ >NC_009494|1421352:1431087|1423109_1423355_+|WP_011213531.1|DBSCAN-SWA MNSWNSVVFLKTKNAWSDSAAIAKMNGVQSLWSTSGDWDWCIKLDSKHSSPEETALFVKNLRNADWVAETKTSWWKEVAVK >NC_009494|1421352:1431087|1430262_1431087_+|WP_010946916.1|DBSCAN-SWA MRLCGFEAGLDKPLFLIAGPCVIESEELALETAGYLKEMCSQLNIPFIYKSSFDKANRSSISSYRGPGFEKGLSILEKVKSQIGVPVLTDVHEDTPLFEVSSVVDVLQTPAFLCRQTNFIQKVAAMNKPVNIKKGQFLAPWEMKHVIAKAKAQGNEQIMACERGVSFGYNNLVSDMRSLVIMRETGCPVVYDATHSVQLPGGNNGVSGGQREFIPALARAAVAVGISGLFMETHPDPDKALSDGPNSWPLDKMKQLLESLKAADEVYKKYSTDF >NC_009494|1421352:1431087|1421352_1422681_+|WP_011946288.1|DBSCAN-SWA MTKSKVLVIDDEPDIRELLTLTLSRMGLACDAASDFKQGVEHIKQNYYSLVLTDMRLPDGDGIEIVKFIQKYKPQVPVAVITAYGNVEGAVNTLKAGAFDYVSKPIDLKMLRDLVKTALSMQNPSTERPDESLLVGESLVMQQLRESIHKLARSQAPVFIQGDSGVGKELVAQLIHANGPRKDKPFIPVNCGAIPGELMESEFFGHKKGSFTGAISDKTGLFVAAHGGTLFLDEIAELPLAMQVKLLRAIQEKAIKPIGELYEVPVDVRILSASHKNLIEEVNAGMFRQDLYYRINVIELRVPTLMERLSDIPCLTEAILRKLSKNQNRNLVKINPSCFEILSRYHFPGNVRELENILERAMAMCEGEVIEPSDLHLPRTTITPVVAVSPASTNLNGYLQDQEKELILDALEKTKWNRTAAAQLLGVSFRTLRYRLKKLGLD >NC_009494|1421352:1431087|1426208_1426823_+|WP_011946291.1|DBSCAN-SWA MFTGLIENTGKVLVNRQGENSSRLVISSSYQDLKPGESIAVNGVCLTLLPADLPDLCFDISPETLHVTTLSKLSSGDMVNLERAMLASTRFGGHYVSGHVDTRAKVKSIRAVNEFIAMDLEGFIPEHNHYLIPKGSITVDGVSLTINTVSEQTVGLMLVPHTLLMTNLGSLRVGQQVNIEFDYLTRIVAHQLQIIGKLNHEEVP |
9 | Staphylococcus_phage(42.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2201208 : 2256068
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_009494|2201208:2256068|DBSCAN-SWA 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49 | Escherichia_phage(22.22%) | transposase,tRNA,integrase | attL 2237733:2237750|attR 2264124:2264141 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2372669 : 2382792
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_009494|2372669:2382792|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_009494|2372669:2382792|2375620_2376946_-|WP_011946923.1|DBSCAN-SWA MELVEEGVQKINTLQDYKVADISLADWGRKEIAIAETEMPGLMALREEFSARKPLQGARIAGCLHMTIQTAVLIETLVALGAEVRWSSCNIFSTQDHAASAIAAKGIPVFAWKGETEEEYWWCVEQTLSGPNGWTPNLLLDDGGDLTQVVHQKHPKLLTAIKGVSEETTTGVARLYEMAKHGQLKIPAINVNNAVTKSKFDNLYGCRESLLDGLKRATDVMIAGKVALILGYGDVGKGCAQALRGQGATVLVAEIDPICALQAAMEGYRVVTLDDVAEQVDIVVTATGNYHVVTHDHMKRMRNQAILCNIGHFDSEIDIQSLKQYQWENIKPQVDHVIFPDGKRIIILAEGRLVNLGCATGHPSFVMSASFTNQVLAQIELFQNSSQYQNQVYVLPKVLDEKVARLHLGRIGAKLTQLSKEQADYIGVDKNGPYKPDHYRY >NC_009494|2372669:2382792|2380857_2382792_-|WP_011946925.1|DBSCAN-SWA MAKIIGIDLGTTNSCVAVMEGDKPKVIENSEGHRTTPSIVAFTDDNEILVGQSAKRQSVTNPEKTLFAIKRLIGRRFDDPIVQKDIKMVPYKIMKADNGDAWVRVKDQDKAPPQISAEVLRKMKKTAEDYLGEEVKEAVITVPAYFNDSQRQATKDAGRIAGLEVKRIINEPTAAALAYGMDKKRGDSVIAVYDLGGGTFDISIIEIAEVDGEHQFEVLATNGDTFLGGEDFDLALIEYLASEFKKDTGIDLHNDPLALQRLKEAAEKAKIELSSAQQTDVNLPYITADASGPKHLNIKLTRAKLESLVEKLVERTIEPCKTALKDAGLTVSQINEVILVGGQTRMPLVQKTVEEFFGKEPRKDVNPDEAVAVGAAIQAAVLSGEVKDILLLDVTPLSLGIETMGGVMTKLIEKNTTIPTKATQVFSTADDNQTAVTVHVLQGEREQASANKSLGRFDLRDIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAKDKATGKAQSIVIKASSGLSEEEVAAMVKDAQSHAEEDKKFKEMAELRNQADSLIHSCEKSMKDLADELSEDEKKGIETAISELKEAVQGTDKARIEDKLKVLTDASAKMAERIYAKKSSEGQAAQGQTQSQESTKPAEEGVVDAEFEEVKEEDKK >NC_009494|2372669:2382792|2374489_2375497_-|WP_011946922.1|DBSCAN-SWA MDLVIAANYLSTLEKCLEQFGINHFLEKIGFDLVRVHDPDAYLTQDEFNQVILEAYKLSNCPELGLVFGQNLSIVNHGFLGYAAMSSPTFGTAIQTVLSYLNTRTNLLSLELRQFNNENSAYIKLLPHTKEMVLSRFITELAVTHLIKMRNFLISCNDPLLKIELNYDEPPYAKYYQTIFQTKIVFNTEATRVWFKAEELNYPIHFADDVSYQLAKRQLQELEKKMSLKEDMASKIKSILINQNLNHASMDEIASRLCMTSRTLRRHLQRLDVTYQELLDEVREQKAKTFLLNNNISMTEISFLLGFQDTSNFSKAFKRWTGVTPTEYREKHEVQ >NC_009494|2372669:2382792|2376964_2378113_-|WP_011214269.1|DBSCAN-SWA MNEVYVFTSESVSEGHPDKIADQISDAILDAILAQDPKARVACEVLVKTGMVLVGGEITTKAWVDVEEITRHVIKDIGYNSSQMGFDWESCAVLSAIGKQSPDIAQGVDNQQTKILGAGDQGLMFGYASRETDVFMPAPIAYAHRLMEKLAKARKSGQLPWLRPDAKCQLTLKYEQGMPVEVDTVVFSTQHSPDIEHKDLVEAIREEIIKSVLPAEWLNDKTRYFINPTGRFVIGGPLGDCGLTGRKIIVDTYGGMARHGGGCFSGKDPSKVDRSAAYAARHVAKNIVAAGLADKCELQISYAIGVAEPTSIFVDTFGTGRLKNSEIIDLIHTHFDLTPQGIIDQHDLLRPIYRQTATYGHYGRENFPWERLDKVAELSKAL >NC_009494|2372669:2382792|2372669_2374358_-|WP_011946921.1|DBSCAN-SWA MGLKSGILGLSLLSLACGSFAMTETETIRVIIKYKQQPATMASLKSQVIKSVQIPVKEMKPMANGAYSLIFDTSNSHAIVKAKEEDVTAKVLERLRKNPNVLYAVKDRIGHFKPLPDPVINQELSQLLSHESQWDEFERPAGIRLESKPGLRDGAWAYTTGKSRKPIVVAVLDTGIALNDSLVNNLVKDNEGNVFGWNFAGNNNDLSDETRSYHGTHVAGTIAGYGDVMNGVGEDLKILTVKIPAENGMFYESAVVNSIYWAVGGDVPGVPKNIHPAKVLNMSFGVDLEPGKEIDYCDEALQEALFFARKKGAVVAVAAGNDNVWEHYNAPAVCNGTIKVASTGPEGLRSYFSNYGPSITLAAPGGDKRYGTSGGILSTVNPGGGYNSSGFDFYQGTSMASPHVAGVAGLIFAVSNKALKPEQVEQILYVTTHEFGQSNDTNKSCVGKKPCGHGILDADNAVQAALNGYDVLFSAPKMIALATHECGENRLKPGKNIINDSTATWIQIKSSCETGVSYQKPRIEKAKDGKIYAYYGSVSYELDQSAYKECRVVGYDGVGCYL >NC_009494|2372669:2382792|2378321_2379434_-|WP_011946924.1|DBSCAN-SWA MINKSAILALADGTVYEGLSVGATGDSVGELVFNTSMTGYQEMLTDPSYARQIITLTTAHVGNTGCNMEDMESTKVWAAGLVMRNCTAIPSNYRAEQSFPDWLSKNGVVAISGIDTRALTLKLREKGSIGACISTNVEKPEIAVEKAKSFAGLQGADLALEVTRQTIERWHEGRGMWSLDKQPQQLHVVAYDFGVKHNILRILHDKGCHITIVPAKTSAEEVLAMNPNGVFLSNGPGDPQACDYAIKATQVFLDNNIPLFGICLGFQILALACGGITKKMKFGHHGSNHPVVETTGKKRVFITSQNHGFAVDEDSLPNCLEVTHRSLFDNSLQGIRHKTKPAFGFQGHPEASPGPHDIDILFNEFVKLMK >NC_009494|2372669:2382792|2379529_2380669_-|WP_010947740.1|DBSCAN-SWA MEQRDYYELLEVSRNASDAEIKKAYRRLAMKYHPDRNPGDTSAEEKFKEIQKAYNILSDKQKRAAYDQFGHAGVDPSMGGGPGGFGGFGGFGDVFEDIFENIFSGGRGHGRQSRGQRGADLQFNVQLTLEEAAIGKEVEITVPRHGTCTVCEGSGAKKGTSPKTCETCQGMGQVRIQQGFFSIQQTCPTCHGEGKIISDPCASCHGQGRVRESKKINVKIPAGVDNGDRVRLSGEGEAGVHGGGSGDLYVQISLKKHAIFERHENDLHCEVPISFATAALGGSIEVPTLEGRVTLKIPAETQTGKVFRLRSKGMKSVRGYGQGDLLCKVVVETPVNLSREQKELLNKLQDSLENAKGTHSPKTSSWFAGVKKFFEDMKF |
7 | Bacillus_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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