Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_014209 | Thermoanaerobacter mathranii subsp. mathranii str. A3, complete genome | 3 crisprs | cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b2,cas6,cmr1gr7,cmr4gr7,cmr5gr11,cmr6gr7,cas10,cmr3gr5,csa3,DEDDh,cas2,cas8b1 | 0 | 5 | 1 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_014209_1 | 21980-25625 | Unclear |
I-A
Consensus repeat of NC_014209_1
|
55 spacers
spacers of NC_014209_1
>1.1|22009|39|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGCTATTGCTAATGAGCTTATTCTGAGGCTTTATGCAG >1.2|22077|36|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CATTTAACACCTCCTCAACAATCAAACCATAATTTC >1.3|22142|36|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAAATCTATTCTATCAGAAGGTATAAGATCCTCAGT >1.4|22207|36|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTAGATAATGTGTATAACTTTTATCCAATTTATGAT >1.5|22272|37|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATGATTATTAATGTTCTTCCTAACAGTCCTTTTGAT >1.6|22338|36|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAACTGGTACTGCCCCAACTGAAAGCACGATGACAC >1.7|22403|37|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGTTTTAAAAAGGATTTTGATTTTTTAAAAAATAGA >1.8|22469|39|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCATAATCTACCTTCATTTGCACCGCTTGCTCGTCTTCT >1.9|22537|37|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCAATAACGATAGACATAAAAGGAGTTAGAGAAACGT >1.10|22603|36|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACATCAAAAAAACTTGCTAATCTTTGTAATATTTC >1.11|22668|35|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGCCATCACCGCTGGAGCTTCTGCCTCCCACGTA 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cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b2,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014209_1
The CRISPR arrays of NC_014209_1 >merge|NC_014209|1|21980-25625|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT 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>NC_014209.1|WP_013149493.1|20069_21110_+|IS21-family-transposase MEIKPNFSELAREYGVDRRTVKKYYEGYEGKPKTRNKQSKLDKYYDEIKASGHPRFETPAGKQAQVDWKEDIKLVSRYGEEFVVNVNVFNYKLGYSRYCYFEYRKAKTQQDVVECLINAFKATGGVPEEILFDNMKTVVDITNEGRKINNKIKAFANDFGFKIRLCKPRHSYTKGKVESSNKFIDWLLPYNGEFENEEDLIKIIDEINKKVNQSTNQSTGIQTIILFQKEKEYLSPLPSNDIIESYMNFEQKATVHKDSMIYYKGSRYSVPPKYINKTVTLKTVENELHIYFNTDLISVHILSVIKKVNYHESHYRELMENLIKNREDIEQICTNNLNELDKLLHR >NC_014209.1|WP_041591618.1|19693_19879_+|hypothetical-protein MKVRGLLRVEFYDAWDEFPYVDIKLVPTTINAEKEKAEEKEIKFCINGQSIAQCSTEALDK >NC_014209.1|WP_013149491.1|19232_19580_+|hypothetical-protein MSEKVSNKPWSNFSESDYDKEQWWEACLIHLVPKSEYTSKEQCKLPVREPDGTLNRNGIHAAAAALAGARGGVDAPMEEKRKAAKKLVSLYRNVLNEEPPESILKLAGMKPNQSE >NC_014209.1|WP_013149490.1|18890_19169_+|hypothetical-protein MGILEQAKMEAESLDIFEEEEPDYFAVSYLLNILDILQEKQLIETPEGKELQKKVLKYADKLAPFVKGPPNGETGWWWHMDKVAKGELKPQI >NC_014209.1|WP_157629574.1|18401_18881_+|hypothetical-protein MYDEQARVIIENEKDYSVLIKKLAELRQIEWDNTHWLIKKELILEARKEKELYREKYHVAKHGYTFDETIPRNQKEITEEHITKYKKFLLQTKKNADEIYTFRDPQRGDICWAFVKYEKRKVNLALFNEHMNRDASGWAFEDKEDWAKYLEKQPYIRIL >NC_014209.1|WP_041591617.1|16900_18304_+|ISLre2-family-transposase MNKHIFEDIILQNALNFTREVIEIFSDLLNKGMNITELAARIKELTDKLGREAIEAIIEELDKIIKEDKRRKEKWVVERKDKKRLTTILGDIEYERTYYKSREDGRYTYLVDDALEIGRHDRIEKGVKIKLVENAIEESYERSSKKACPEELSKQTVLNAIREIGEVEVKREIKEKKEVRVLYIEADEDHVPLQDGSNETPRLIYIHEGKEERNGRDVLRNVHYKAYVGEKAEDIWIDVANYIEENYKEEKIEKIYIAGDGAPWIKEGLEWIAKSRFVLDRYHLNKYVLKATSKEPKYREKIWRAINEGDKEGVKKIFDELIKAAEEEREKEKIKEARKYILNNWEGIEIYNKDKDVIGCSAEGHISHVFSVRLSRNPLGWSREGLKLMAKLRVFSKNGGDLREVEWGKRKNINEGSYKLTKKQIKEAVRRIKTSTNEKINNITVLNIGKVTPIYRILRAIKYAQVI >NC_014209.1|WP_013149487.1|15851_16802_+|phage-capsid-protein MPNFDEEKLIQSLVELYRQGFLNILKVILEKEAKKQDTIYFKDILKQIMQILEQLDNNAAKWIEENVPKIYQQNYIAVMAFIQQLKGEAIQNPSFSQLHQRAVDVLAQNLYDNLRDATQFVGRKFDDYFRKASLEAAGKKYVSGETWQQMKKDLMERLLSKGLTGFKDRLGREWRLDSYAEMVARTLTREAATVATINACKEFDIDLVRISTHYPTCHLCAPIQGKVYSLSGKDGRYPKYGEDGVVIPRHPNCRHVLMPYVRELDPNAEETEKYSNTSLTEDPRSEKEKEAYKEAQEKRKQQFYNKVKREYLKNIV >NC_014209.1|WP_013149486.1|14408_15845_+|phage-portal-protein MITDLSFFDIGAKWPPDSEMERLQRYDQNRKLFEGRHELVFKDWIRLLRDDKKATLEIILNWPKRLSTLWADLLLGEPPRITAGETGSKEQEQLDKIIKNNNFLNTAYEVAIDLSRYGDGIFKTRYDKRAIIEAVPPSLWFLVVTADNIKDVQAHVIAWTFDIATPTLLSKDKKTTYLRLEIHERGKITNKLFELQDEIIKNEIDIKTFYPDLEPEIYTGIDDFLVVPVHNMQTSDRIYGLDDYSDLDSIIQEIEVRIAQISRILDKHADPNMYGPATALEQNELGEWVVRGGGKYFPVEQGEQPPGYVVWDGKLDAAFREIDLLMEQFYALSETSAAAFGQLKQGLAESGSALRRLMMAPLAKVNRIRMRFDPAIKKILRLASKLDALYGNGIELETINIAWNDGLPDDEKEQAEIYSMLVQNGLISRETALKHLFEFDAETLKQELAKIAVETAQEAPALFTTTLQTQQNQQQQSE >NC_014209.1|WP_049766004.1|14010_14367_+|hypothetical-protein 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>NC_014209.1|WP_041591677.1|25832_26096_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFVIVTYDINEKRVNKVRKILKKYFTWVQNSVFEGEITFGKLEKCKRELLSVIKRDEDSVYFYEMEFKIVCNKKVLGQEKNYDSIIL >NC_014209.1|WP_013149495.1|26286_27267_-|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MQKSLYLTSNGRLRRHENTLYFETEVEKRSIDIENVEQIHIFGEVDLNTKALNYISQYGIVLHFYNYYGFYAGSFLPRKKNVSGDVVVRQALHYLDREKRLFLAYCFVESAVYHMMRNLRERKEAEAFLIAIEDEWEKGRFNISSIAELMGLEGRIRNIYYQSFNWFLPEDFVMEKREKRPPTNPINALISFGNSLIYSHTLSQIYQTQLDPTISFLHEPSEKRFSLSLDISEIFKPLIVDTVIFKLLNNSKLTLEHFDEDLNYCYLNHEGRKIFLKELQNKLETTVRHRQLNRNVSYKSFIRLECYKLIKHFIGDQVYSPLKAWW >NC_014209.1|WP_013149496.1|27272_27785_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MEDIQEISDVRFQGIKINYLYVCKRKLWLFSKNITFENTSDKVLLGKVLHEYSYPKENAKEVLIDNLIMIDILSDGSIREVKYSSKMKEADIMQVMYYLYYLKQKGIQKQGIINYPKEKRKEVLELTPEYEEKVKQALKEIEEITTKPIPPPVQKQKICKSCAYYEFCWG >NC_014209.1|WP_013149497.1|27804_30138_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 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MKERVYLGDWAYNAGIIGFIDIMLDGKDITSQNIITIGPNYIEFDRNSLQGFSDKFFKKAYQRYPRTDELIDLGNKLLQRLENNDFDKNLKQEVSNFKKRVEGFSKLKQLVDSRKLTLPRNFNKTDAEQYVSQITDLLNANKQGLIEDNVKTYLKNASSICGDRSFLNRNFKGELKKKFFDDFEGPIVNQTNRQDKNHDCIFCGLRPAKKDALLDTGLVSFLGANKDNKNFFWNFKPQLPICEICELIYFCIFAGLTEFRIGQTKKFYFVDRNTSVLELYQTNKLFMEMMSREENILKEKGILNFINDYLLLKLKEESKFRLANIMFIEIDLTSSVTPKLYGFSITKQKAEFINSNFDIFKKIAGSFIKFKDNNIYPFSEFMQKFMNNTLSFQFLSFLEGEYLSSQKPNSKINTNLSPYRLQMYNILTYKYLKSIKRGGELMDEKWLWKMYFFGQELKKKFLSSKAENKITSLAYRLISALRIGDVNTFMNLIIRTYMSYNMEVPALFVSCINDRDNFCALGYSFVNGLLGSEKDEKVENSEEVVGNE >NC_014209.1|WP_013149501.1|33473_34259_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRAKFIFEIANPKTEIFELPIYYRTLFMSFLKNALSEYNQEYFKKLYWWKDKKNKWQKPFVFAVNLPNMNFADDKVMFRGDIVLNLSTSDYEFLVNMYNSLINNHLYPYNLTDNCKIKLKRMYLVKEPEQFNRVMAFKTFSPILIEKKGESKKIPVLPYEDGFEDVFNEVIDFEIRNIRSLRGQNRGLQKKIIFKPINVQKTVIKHRISEFVENTNKNYMYLTGFIGLFELSGTPEDLKEIYQNGIGFRRGQGFGFIEVAK >NC_014209.1|WP_013149502.1|34429_35455_-|NADPH-dehydrogenase-NamA 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_014209_2 | 791663-793751 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NC_014209_2
|
31 spacers
spacers of NC_014209_2
>2.1|791693|36|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGCGCTTCTTTTCTGAAAAGTTTACGACTGCCACAA >2.2|791759|36|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGTTTGAGGTGATAAGCCACCTTTTTTGCCGTCTA >2.3|791825|38|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATATATACGCCCAAGTACCCAGATGTTACCTGATTAGC >2.4|791893|36|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTCAAGTGCTTTGATGAGTTTTCTAACTTCTTCT >2.5|791959|35|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTATGATGGACAATTACAACCATTCTCCCTGGATG >2.6|792024|36|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAAGATACAGTATGTTGATTTCTATTCTGTTGAAA >2.7|792090|36|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAACATCATAATTTTATGATGTCAAGTAGTTTTTTA >2.8|792156|37|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGTCAATGGCGGGATTGCAGAAACATGCGAGCCAATG >2.9|792223|37|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGAAAAAGTAGCTACGACCATTGCCAATGCGATTTGC >2.10|792290|37|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTCGCCAGCGCTAGCATTTGCACTGTTAGCTAATAA >2.11|792357|35|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAGCAAAGAACAGTTAATCCTTCTCCTTGTTTAGA >2.12|792422|37|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCCCCCCCCTTTATCATTCATTGCTTTCTTCTTCCTC >2.13|792489|35|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGTAGCAAGGTTTTTCTAGAAATTATTGCTTTTCC >2.14|792554|36|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAGTGAAGAAGAACAAGAGAAAGAAACGCAGCAAGA >2.15|792620|36|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATATACTTTATGGTGCACAATATCTCCAGGTTTCC >2.16|792686|39|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAAATATTCTTGACCCTAAACGGACATGAGGGATTTTC >2.17|792755|36|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATATCACACCGTATCTGGATATGGCGAACGCAAAAA >2.18|792821|36|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCAAGCCTTTTGCGCTAAGCAATGCTAACGCATTTG >2.19|792887|35|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTATTGATTGTCGTAAAGTACAGCACTAAAAAGTC >2.20|792952|36|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACACCAGTTACTGCTGGCATATTAATCAACCTCCTA >2.21|793018|37|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGATTGGCTTGATTCCGGTGGACGTGACAAAATCGT >2.22|793085|38|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGCAGACTGCTTCCCTGTTGCACAGTTTCAGGAGGCCC >2.23|793153|36|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAATAAACATTTTTATCCCTCCATACTCATTATTT >2.24|793219|37|NC_014209|CRISPRCasFinder,CRT AACCATTTATCTGGTGTGTCTGGATGCATAGGAAGAC >2.25|793286|36|NC_014209|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAAGAAAAGAAGTATGCAACTAGCTACATGGCAACG >2.26|793352|35|NC_014209|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAGACAGGGACACCAGCAACATTCGCAGGATATCC >2.27|793417|38|NC_014209|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTGTTGAAGATTTGAATTTCATTCATATTAACTAACCT >2.28|793485|37|NC_014209|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCAAAAAGGACATTGGTCCTTTTTGGTAAATTTCATA >2.29|793552|39|NC_014209|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACTCTAAAATGAATGTACTTCCTCATCTTTTCTTCAAAG >2.30|793621|38|NC_014209|CRT,PILER-CR AGCTCCTCGCGGGTATACTGGGATTTCATGCCCAGAGC >2.31|793689|33|NC_014209|CRT GAATGCTATTTACAGCAACTTAGCAAAACATGA |
cmr3gr5,cas10,cmr6gr7,cmr5gr11,cmr4gr7,cmr1gr7 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014209_2
The CRISPR arrays of NC_014209_2 >merge|NC_014209|2|791663-793751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR 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>NC_014209.1|WP_012994798.1|790258_791329_+|type-III-B-CRISPR-module-associated-protein-Cmr3 MLFEVSPLDNVYFGKGHPFSAGFEGIGSGIFPPAPSVFYGAFATYYLSLNGINPQNLEFVQKNLKIKGIYYKNGEAWYTLVPMDLVKNKEDKEENKLEFLRVGKPLVETDLGDGQINLLYSPNKVENVKGLIDDLAMSNYLKGIKENIFFKPFNDFVTKENKIGIKIDYDKRSSKKGYLYKTDYIKMAKDIKNSLEFVVDVECKDFSFPDTGLVKLGGEGKAAKVSRVNDIPKFLEEKFTEEVKEIITKTGKFKLILVTPSIFQNGWKPDFSKLNIKVKLIAAAIGKPISIGGWDMKNKRPKVMSKAVPAGSVYYYEILEGPIDSLIEKIYECGISDARANEGFGRCLMGEYDWLN >NC_014209.1|WP_013150031.1|787534_790255_+|type-III-B-CRISPR-associated-protein-Cas10/Cmr2 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>NC_014209.1|WP_013150023.1|774960_776112_+|TIGR02678-family-protein MEELQMLLENFWILRDDRENFNKIRDAENKIKPFVEEKLGYRLIINPYIIKLEKVPSDVEEWMGIDAFQMPMDYAFLCLLLAFLEDKGPEDQFVLSNITEYIEAQYDGPDKVDWTLFQHRKSLVRVLNFAVDIGIIKIDDGDHERFSESEDTEVLYENTGISRYFLRSFNREITEDMKIEDFLQEDLNLSNSKDAVIQRRHRVYRKLILSPAVYSEGPDDQDFMYIKNYRNTIAKDLEEYLDAKLHLHKTSAFVLFNDNKYLKSYFPDKNKNISDIMLQVSKIIREMIEEGKLAYNPDDTIDITEAEFINIILKVKERFSDGWYKSYREMSEKQLIEEVIENMESFKMIKRVEELHSIKILPMAAKLIGEYPPDFEKGEDVDE >NC_014209.1|WP_013150032.1|795103_796099_+|aldo/keto-reductase MVKRKLGKSGLEVSGIGLGCMRMSFGQNPLPDREEMIALIRKAVELGVTFFDTAEVYGPYTNEELVGEALEPFKGEVVIATKFGFDLYPDGRPGWRGLNSRPEHIKKAVEGSLRRLKVDAIDLYYQHRVDPNVPIEDVAGAVKDLIQEGKVRYFGLSEASAETIRRAHAVCPVAAVQSEYSLWWRKPEEEVLPTCEELGIGFVPYSPLGKGFLTGTIDEKTQFDSTDIRSSIPRFQPEAIRANLALVDFIKEVARRKQATPAQIALAWLLAQKPWIVPIPGTTKLERLKENIGAVSITFTEEELREINEALSKIPIHGGRYPEEVEKMTYR >NC_014209.1|WP_041591636.1|796559_797429_+|aldo/keto-reductase 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>NC_014209.1|WP_013150035.1|799367_799856_+|small-multi-drug-export-protein MESFVKEILNFLPRELAVLFIAALPVVELRGAIPIGISLGLSPFYTTIISLIGSMIPVPFILFTIKPIFVRLKKTRLFKKLVDKLTDRSLKYNGEKIQKYGVWGLVLVVAIPLPGTGVWSGSLAAALLNMQFKQALLAIFMGNIIAAILVMILSYGVGSLFF >NC_014209.1|WP_013150036.1|800274_802281_+|sodium-translocating-pyrophosphatase MEKLIWLAPISGVVALLFAFMRTMMIIKSPVGNEKMREISDAIHEGAMAFLLREYKTLAIFVAVMFFVIGTFINWQTAVSYITGSIASVLAGFIGMSVATRANVRTANAAREGMNKALSIAFSGGTVMGMSVVGLGLLGLGILYFLFGDPADVKSFDVINGFALGASSIALFARAGGGIYTKAADVGADLVGKVEAGIPEDDPRNPAVIADNVGDNVGDVAGMGADLFESFVGSIISGIAIGAVAISPVTNQPYGIKGVIFPMLVAAAGIISSIVGTLFVRTGEGANPQKALSKGSFASAIFVILITFFFSRYFLQEINAFYAAVSGIVVGVLIGILTEYYTSSNYNPVREIAKASQTGPATNIITGLAVGMKSTALPVLFIALAIIISYKFAGLYGIALAAIGMLSTTGMTVAVDAYGPIADNAGGIAEMAELDPSVRKITDKLDAVGNTTAAMGKGFAIGSAALTALALFSAYTTAAGLKEGIDLLRADVIVGLLIGAMLPFLFSAMTMEAVGKAASQMIEEVRRQFREIPGIMEGKAKPDYARCVDISTRAALREMIIPGLIAVIAPLAIGFIFGREALGGLLAGALVTGVMLAIQMANSGGAWDNAKKYIEEGNYGGKGTPTHAAAVVGDTVGDPFKDTSGPSLNILIKLMTIVALVFAPLFMK >NC_014209.1|WP_013150037.1|802424_802865_+|SoxR-reducing-system-RseC-family-protein MKEKAIVVSKKGNKAEVAVIRTSACDKCRACSGGVKGQPLKVWAENETKAEVGQIVEIEMESKALLSATFILYVIPLAGFILGVILGLKLADILNIMWKELFSFLIGFLFIILVFAGIYVNNRFFDKSRMFTARIVNVLDDQYQKR >NC_014209.1|WP_013150038.1|803010_804519_+|RtcB-family-protein MLDDMFLFVNFRKIRDRKGVNFHGVEVIQGYTVVKDGINKWCIPKFGKMRVDAVIYVNDTLKELLHEDQSLRQITNAATLPGVVKPVIGMPDIHEGFGLPIGGVMAIEEKGVISAGAVGYDINCGVRLLRTNLEAEYFNKELLYKLIERIEYYVPTGIGKKGRHKGITRLIFDDVVHNGVEAVIKAGFGKKSDLNFIEEGGKLSGADISAVSKEAQGRGEEQLGTLGGGNHFIEIQQVDSILDEKLAERFGLFKGQIAVMIHTGSRGFGHQIATDYTKILWEAAKKYGVDVPEKGLAAAPIDSKEGKAYYKAMAAAVNFAFSNRQIIMFDVIKAFEDVLKKSSESMGFQLVYDVAHNIAKWEEHGGKKLLVHRKGATRALPAGHPQNPSFYKESGHPALIPGSMGTGSYVVVGTEKAAETFYSVNHGAGRRLSRNKAKKITKEEFEKAMGDVIYNVRSFKDIVDESPLAYKDVEEVISVLSERGITTPVARLIPLAVVKGAD >NC_014209.1|WP_012994810.1|804756_805296_+|antiterminator-LoaP 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_014209_3 | 2216141-2217710 | TypeI-B |
NA
Consensus repeat of NC_014209_3
|
23 spacers
spacers of NC_014209_3
>3.1|2216171|37|NC_014209|CRISPRCasFinder,CRT GTTTTTTTAAATAGTATGTAAAGCAGCTGCTTTTACA >3.2|2216238|36|NC_014209|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAATACTATCTACTATGGCTTGGACTTTGGTTACAA >3.3|2216304|38|NC_014209|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAGGAATGGATTGGACCTTTCTCTAGAGAGCGGTTCAA >3.4|2216372|37|NC_014209|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTTCTATGTCCTCGTCTCTATCACTTTCAAGCGCTG >3.5|2216439|36|NC_014209|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATGAGTTGCCATCGTACGGCATGTTTAAAAGCTAA >3.6|2216505|36|NC_014209|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CATTTTGCAAACGAAAAAGATAAAAATCTTTAAAAA >3.7|2216571|39|NC_014209|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTGATGTATCCTGTTCTACATCTACAACAGGCTGAGGCA >3.8|2216640|37|NC_014209|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGGATGCGGGATAAGGGTGCGAGTAAACTTTTCTTTG >3.9|2216707|37|NC_014209|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAGGTTCATCCTCAATAACTTCGGACAGCAAGTGCT >3.10|2216774|36|NC_014209|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CGAGAATGGCAAGCGAAACAATCATAAATCAAAACC >3.11|2216840|38|NC_014209|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCGCTTCTGCTTCACTTTCTCACCACCTTTCTTTCAAA >3.12|2216908|35|NC_014209|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGTTTCTAAGGCTAGTAGAATGAATGTCTTATATT >3.13|2216973|36|NC_014209|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCCAACTGGTGTCGGGGTCGTCACTGATGTCAACTC >3.14|2217039|38|NC_014209|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTACACCGTGTTATCACCATTCAAGTGGGGAATATTG >3.15|2217107|36|NC_014209|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTTACGCTTATTCCTGTCTGATTTGAAAGATCCAA >3.16|2217173|39|NC_014209|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCAGATACTTGTATAGACTGATCCAAAAAAGGATTTGTA >3.17|2217242|37|NC_014209|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAGAAACAAATGACTATTTTGTTGTCAGACAAGAACT >3.18|2217309|36|NC_014209|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGAGTTACAGCAATACACAATCCCATACGCATACTT >3.19|2217375|38|NC_014209|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCTGGCTTTCATTTCTAATCCTGAAGAGGAAAAAATGT >3.20|2217443|38|NC_014209|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAAGGCAATTTATTTGTAGAGCCTTCTAAACTAACTTT >3.21|2217511|39|NC_014209|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGGCATAAAGAAAAAAGAAGTAGAGAAAGGAGATAATAA >3.22|2217580|36|NC_014209|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATCATGGCACGGCGTAAAGAGATCAACAGTGAGCT >3.23|2217646|35|NC_014209|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGGGTTTTATAAGTTTGGAATTAAGTTACATTAGG |
cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b1,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014209_3
The CRISPR arrays of NC_014209_3 >merge|NC_014209|3|2216141-2217710|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CACTATTTTCAGGATAGGTAGGCTAAAAACGTTTTTTTAAATAGTATGTAAAGCAGCTGCTTTTACAGTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACCAATACTATCTACTATGGCTTGGACTTTGGTTACAAGTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACGAGGAATGGATTGGACCTTTCTCTAGAGAGCGGTTCAAGTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAAAAACGTTTCTATGTCCTCGTCTCTATCACTTTCAAGCGCTGGTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAAAAACAATGAGTTGCCATCGTACGGCATGTTTAAAAGCTAAGTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAAAAACCATTTTGCAAACGAAAAAGATAAAAATCTTTAAAAAGTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAAAAACCTGATGTATCCTGTTCTACATCTACAACAGGCTGAGGCAGTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAAAAACTGGATGCGGGATAAGGGTGCGAGTAAACTTTTCTTTGGTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACAAAGGTTCATCCTCAATAACTTCGGACAGCAAGTGCTGTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACCGAGAATGGCAAGCGAAACAATCATAAATCAAAACCGTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACTCGCTTCTGCTTCACTTTCTCACCACCTTTCTTTCAAAGTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACTGTTTCTAAGGCTAGTAGAATGAATGTCTTATATTGTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACCCCAACTGGTGTCGGGGTCGTCACTGATGTCAACTCGTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACTTTACACCGTGTTATCACCATTCAAGTGGGGAATATTGGTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACGTTTACGCTTATTCCTGTCTGATTTGAAAGATCCAAGTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACGCAGATACTTGTATAGACTGATCCAAAAAAGGATTTGTAGTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACTAGAAACAAATGACTATTTTGTTGTCAGACAAGAACTGTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACGGAGTTACAGCAATACACAATCCCATACGCATACTTGTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACGCTGGCTTTCATTTCTAATCCTGAAGAGGAAAAAATGTGTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACGAAGGCAATTTATTTGTAGAGCCTTCTAAACTAACTTTGTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACAGGCATAAAGAAAAAAGAAGTAGAGAAAGGAGATAATAAGTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACAATCATGGCACGGCGTAAAGAGATCAACAGTGAGCTGTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACAGGGTTTTATAAGTTTGGAATTAAGTTACATTAGGGTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC >NC_014209|3|3|2216141-2217710|CRISPRCasFinder CACTATTTTCAGGATAGGTAGGCTAAAAAC GTTTTTTTAAATAGTATGTAAAGCAGCTGCTTTTACA GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC CAATACTATCTACTATGGCTTGGACTTTGGTTACAA GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC GAGGAATGGATTGGACCTTTCTCTAGAGAGCGGTTCAA GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAAAAAC GTTTCTATGTCCTCGTCTCTATCACTTTCAAGCGCTG GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAAAAAC AATGAGTTGCCATCGTACGGCATGTTTAAAAGCTAA GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAAAAAC CATTTTGCAAACGAAAAAGATAAAAATCTTTAAAAA GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAAAAAC CTGATGTATCCTGTTCTACATCTACAACAGGCTGAGGCA GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAAAAAC TGGATGCGGGATAAGGGTGCGAGTAAACTTTTCTTTG GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC AAAGGTTCATCCTCAATAACTTCGGACAGCAAGTGCT GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC CGAGAATGGCAAGCGAAACAATCATAAATCAAAACC GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC TCGCTTCTGCTTCACTTTCTCACCACCTTTCTTTCAAA GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC TGTTTCTAAGGCTAGTAGAATGAATGTCTTATATT GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC CCCAACTGGTGTCGGGGTCGTCACTGATGTCAACTC GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC TTTACACCGTGTTATCACCATTCAAGTGGGGAATATTG GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC GTTTACGCTTATTCCTGTCTGATTTGAAAGATCCAA GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC GCAGATACTTGTATAGACTGATCCAAAAAAGGATTTGTA GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC TAGAAACAAATGACTATTTTGTTGTCAGACAAGAACT GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC GGAGTTACAGCAATACACAATCCCATACGCATACTT GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC GCTGGCTTTCATTTCTAATCCTGAAGAGGAAAAAATGT GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC GAAGGCAATTTATTTGTAGAGCCTTCTAAACTAACTTT GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC AGGCATAAAGAAAAAAGAAGTAGAGAAAGGAGATAATAA GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC AATCATGGCACGGCGTAAAGAGATCAACAGTGAGCT GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC AGGGTTTTATAAGTTTGGAATTAAGTTACATTAGG GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC >NC_014209|3|3|2216141-2217710|CRT CACTATTTTCAGGATAGGTAGGCTAAAAAC GTTTTTTTAAATAGTATGTAAAGCAGCTGCTTTTACA GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC CAATACTATCTACTATGGCTTGGACTTTGGTTACAA GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC GAGGAATGGATTGGACCTTTCTCTAGAGAGCGGTTCAA GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAAAAAC GTTTCTATGTCCTCGTCTCTATCACTTTCAAGCGCTG GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAAAAAC AATGAGTTGCCATCGTACGGCATGTTTAAAAGCTAA GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAAAAAC CATTTTGCAAACGAAAAAGATAAAAATCTTTAAAAA GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAAAAAC CTGATGTATCCTGTTCTACATCTACAACAGGCTGAGGCA GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAAAAAC TGGATGCGGGATAAGGGTGCGAGTAAACTTTTCTTTG GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC AAAGGTTCATCCTCAATAACTTCGGACAGCAAGTGCT GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC CGAGAATGGCAAGCGAAACAATCATAAATCAAAACC GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC TCGCTTCTGCTTCACTTTCTCACCACCTTTCTTTCAAA GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC TGTTTCTAAGGCTAGTAGAATGAATGTCTTATATT GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC CCCAACTGGTGTCGGGGTCGTCACTGATGTCAACTC GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC TTTACACCGTGTTATCACCATTCAAGTGGGGAATATTG GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC GTTTACGCTTATTCCTGTCTGATTTGAAAGATCCAA GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC GCAGATACTTGTATAGACTGATCCAAAAAAGGATTTGTA GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC TAGAAACAAATGACTATTTTGTTGTCAGACAAGAACT GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC GGAGTTACAGCAATACACAATCCCATACGCATACTT GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC GCTGGCTTTCATTTCTAATCCTGAAGAGGAAAAAATGT GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC GAAGGCAATTTATTTGTAGAGCCTTCTAAACTAACTTT GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC AGGCATAAAGAAAAAAGAAGTAGAGAAAGGAGATAATAA GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC AATCATGGCACGGCGTAAAGAGATCAACAGTGAGCT GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC AGGGTTTTATAAGTTTGGAATTAAGTTACATTAGG GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC >NC_014209|3|4|2216208-2217710|PILER-CR GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC CAATACTATCTACTATGGCTTGGACTTTGGTTACAA GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC GAGGAATGGATTGGACCTTTCTCTAGAGAGCGGTTCAA GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAAAAAC GTTTCTATGTCCTCGTCTCTATCACTTTCAAGCGCTG GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAAAAAC AATGAGTTGCCATCGTACGGCATGTTTAAAAGCTAA GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAAAAAC CATTTTGCAAACGAAAAAGATAAAAATCTTTAAAAA GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAAAAAC CTGATGTATCCTGTTCTACATCTACAACAGGCTGAGGCA GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAAAAAC TGGATGCGGGATAAGGGTGCGAGTAAACTTTTCTTTG GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC 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>NC_014209.1|WP_157629589.1|2215405_2215678_+|hypothetical-protein MGILPPSAVRGVRVGVRGKRGQKGEYVKNWSNATVRQILTHQAYIALYAVTMAPSKDENTIPFTGSTQDRITPYGCCTSSSILQSLSFKF >NC_014209.1|WP_083768296.1|2214958_2215363_+|hypothetical-protein MTRRHSLWKVRCGSCLETFDRLSRNLKDTFYLLDDAFEKNGIGFTSIQEQFDTTTPIGKAVMQIIAVFAQLEREMITEKMKMGKYQKTRLGQFPSGHILYGYRKKPVTGEFEINEEEARIVRLIYHWYVYGDET >NC_014209.1|WP_049766026.1|2214776_2215025_+|recombinase-family-protein MTKAVGYIRVSTEEQTQHGYSLEAQAQAIKKYCELQGCELVRIYRNDGYSGASMERPDLQQLLEDIHFGKFDVVVVWKLLTD >NC_014209.1|WP_049766025.1|2213820_2214072_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MQRKPKLRELIALAKSGNEEAMTQVVKRFIPIVKKYSRQLGYEEACFDLMTWIIEAVYRYQPNTTWGRDELNRYFSRKSDYQK >NC_014209.1|WP_049766024.1|2213287_2213671_-|sigma-70-family-RNA-polymerase-sigma-factor MAWFLTGLRHEAIRLAKKHKRLREHELLILNNLLSQEAEDEMTEMLDTVAGTDDILAEVEDSVFLQEALTVLTPQQQKVITATVLEGRTEREVAEQLGISQPVVHRLKERALNRLRKHFVLDEPTAK >NC_014209.1|WP_013150993.1|2212413_2212968_-|rare-lipoprotein-A MVASAHVRRGDGQVTFKSYPNTIYEDLYDTNLNSICTVTAADATAYGMTPAALALSWARNIRGALQSSDLNCLGEPVKSSRQLVVPSQSYSGNKNVTATYYGAGEQLLNPYTSNGEIFHTCDLTIASGLSDLPRNCWVKVTYSGKSVIARVNDTAPANTIDLTYGGVAKALGFPGSGTVNISAP >NC_014209.1|WP_083768306.1|2211689_2212349_+|copper-amine-oxidase-N-terminal-domain-containing-protein MIVGAVLLVGIFTTIAFADNPIKLFVNGQEIKPDVPPQLINGRTMVPIRWVAEALGADVQWSNNRVIKLTSVVERPILFTRIAFSKDWRKTTKPPYQELPELRDLYNQNFYVITGNSEGSKIFDTLGIDKLERVSSNIAAPEGSLGILTVYSSIIGITVKGQNVIVYVQPQDAGYDFVAVEPAVTDLPQEDSGYGEKMSTFFFTDTKGKELTRVVKMWP >NC_014209.1|WP_013150991.1|2210634_2211180_+|hypothetical-protein MRKRVKLSILLFLIAATLSLILFGCSQEPFNSNVEESKAEEQPTSKDGLQNAETILESLKSASPEEVIQAFFWGHSNHCKEVVNATLYHEYAKTNSDYPEIKQWEVLQITKLLNPPDWLRDSEKEFTEVEYFKVKHRLTLNSGYDLSNTQLAEIAERGEIEWYFVLAKERESRWFIVSYGN >NC_014209.1|WP_013150990.1|2209618_2210530_+|copper-amine-oxidase MKRLLFITIISVVMMAGTLVLPAFAQEQQKIPVLIDGLPVVFDVLPIIQNGRTLVPFRAIAEALNVKVDWDGTTQTISATDGKTSIRLQIGNKTAHRNDSPILLDVPPQILGVRTLIPLRSSEAFDCQVNWDNSINGVRITSPPKEMTVIGFYALGDSKTSSWTNIFGKPYPETDRGNTDVVGELALGRYSLDKEGNLLTKSRTGWQRPDGELADRIIIMAYDYGSKPEPVSLVTQAMEIARASVPPEKLVLGISASSETPESILIKVGIAKRYGLDGIAIWRLGLVTGEMWDTLRSTVIPRR >NC_014209.1|WP_012996176.1|2208337_2208835_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MEFEVTGALMQSYTICKRQVWLMAHQIVPDQEHPYIEIGRLIDENSYQRDRKKIHFENVVLDLVRIEKDNILIGEVKKSSKAAESAKMQLLFYLYKLKQSGISAKGQLFFPEERKREIVELTPELEDKIIEAINEIKEIALHELPPAFLKIPYCKNCGYKEFCMS >NC_014209.1|WP_013150995.1|2217892_2220247_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MSSFSELYSHPDKFLEDHLINTSKIIRNYVYEKNVEIIDKDTFLKTVTIISLCHDFGKATNYFQKYLFTENEIERNKLKTMEETHHSLLSAVVAFYLIKNEINTQDRKGILLPFIAFLIVKNHHGDLKDIFNEVILDEKELKILKRQLNSIDDEKLQILNKNLKNAGLNKDLTKSLINEYIDNINSELRKVKRELRKLKEEQDISIYLLLNFLFSLLIDADKTEVVVGIDNIKRPEIKFEDQFVKAYKASFCGEENKINLLREEAYKEAVEREINIGQRIMSINLPTGLGKTLTTIAFSMKLWDILYKHTGVKYRIIYSLPFLSILDQNSSVIEELLKYNGIYPSTEIILKHHHLSDVKYTKSNSEFEDEQAKILIEGWNSEIIITTFVQFFHTLVSEKNRTLRKFHRLSNSIIILDEVQSIPFKYWLLIKELLKAVAEELNSYIIFVTATQPLIFKEEEIYPLVDKNKYFAQMERVEIIPKLDCDITLEKLSEMFDLSDGRSYLFILNTIKSAQQFYSILKTKVLNDEIIYISTHITPLERMERIEKIKKGKIKFAVTTQLVEAGVDIDFDVVVRDIAPLDSINQSAGRCNRNWNGKGKVYIVSLIDEKGQRYSRYIYDRILLDITREILSKYDIVREQELLKIIEKYYHEVSERMSSSEAKKLLDAIYALKYDSDDGDMCISKFKLIEDDYYKVDAFIELNEEAKELWQKYVGLKDIKNLFERRNIFNRFKADFYKYVISIPATAENMPPDIWGFKYVNYDSLNEYYDKETGFIAKGVIGIW >NC_014209.1|WP_013150996.1|2220230_2220944_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKTLVFDIFGDYGHFRKYYTTSSPLTFSFPPPSTVKGMLGAIAGIDKKEYLKVFSSSNCNIAVRILNPVKKIRMGLNLINTKGNFWIPYKMKNHEARTQVRAEFVKDAAYRIYFAHKDNDLFEDVIDKIKNHKNVYTLSLGLSEMLADYKFVGIYDSHEVKYVEVDILSVLPFEFIVEDKIYFEKGKKYFKEKIPMDMNEDRVVLSYQDVLYEANGQSIKCHVMKCWEVNGEHVIFF >NC_014209.1|WP_013150997.1|2220956_2221871_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csh2 MGNIVKNRAEILFLYDVNFANPNGDPVDENKPRIDEETGINIVTDVRLKRTIRDYLAYYKGKEVFILETREEEGGKLRTKEERMRDFGTNKDIIEKCIDVRLFGATTAVKDKVMTLTGPVQFKYGKSLHKVDLMYIKGTTVIPSGEGRGQGTFTEKYILPYSLIAFYGVVNENAAITQNIPLTDEDVDLMLEGMWNGTKNLMSGSKMGHEPRLLVEVIYQENNYQIGELEKRIKFVHDMEDEKIRDIQDGKLDITELVTVLKENKDKIKLIKYVYDDRVIFTCNGEVCTLEKALEGLNIQKLQY >NC_014209.1|WP_013150998.1|2221854_2223633_-|TIGR02556-family-CRISPR-associated-protein MITAIKELGEMVLKSQNKTLLDVFIENPNQEGRYSKIATIDFTIKEDDIEYEKVRLEEYDDSKINRYLFTDTSGNAPGYTPAAKITEVTKTFNGKIKSWFKVLDDRTIKIDQKNKIFLQNIRNILEEKSDEIIAEVEKIRKDIPKREGLSLILKFNVDGDSKYIGDLDIFKSILLQLHNKKYQKIHSKDKVCSICGQKKKMIFGTVDTYKFYTIDKPGYIAGGFNEKESWRNYPVCKECMLALEEGKRYLENELTFKFYGLEYQLIPNFIIGNEFAKKEVREIFENASKLISLKKETKKRFIGDEDEILDYLAKAEDTMTVNFLFLKKANSAERILLLIEDVFPSHLREIFNAKDKVDETFNENFTFKNIRSFMSKSDSNKKDNDLDTYFLDITDGIFTGRPVDLGFLYGLIMKKVREEFVNDRNYKNAIKDGLMTVAFLEKLKLIKMEVVPMEERIFDSFFAKYGPSFETPLKKGLVLLGALTELLLRKQYSDREAKPFMKNLKGLKMDEKDIKGLLPKVQNKLEEYDSFDKGKRLLAKEVSNYLLLAGDNWNMSVDEINFYFVCGINLADELTNIIYKKEEEEKTNGKHC >NC_014209.1|WP_041591676.1|2223651_2224407_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRITMEFMGEKNLVLPIHYNYIVQGFLYDLMGDSNFAVFLHDKGFQYEKRKFKLFTFSRIEGEFKILVDSKGQKKISITPPFKFTVASPLDEFIFDISKNVLKKEYCHFNGQKFILNSLNIDNPPVFKNKARIKFISPVVTYSTLKEGDIKYTYYYSPWDEKFSPLLLNNLLKKYELVYNVKAKDPYFKLYPLSKQEDRRYSKMIKYKNVYVKGWMGIYDVETTPELLELAYYTGLGAKNSQGFGCFEIIK >NC_014209.1|WP_013151001.1|2225707_2226979_+|copper-amine-oxidase METCKKKLVLSFIFIFLIVTIFNLRVANAQEKQEITVLLDGYPVTFDVPPVLKDGTTLVPFRAIAEALNISVNWEVSTQTVTATDNKTKVKLQIGNKTAIKDNMPLTLRVSPQMINQRTLIPLRFFSEAFDCDVDWDKNTYTVKITSPPKEMFVTGFYALGDSQTSSWTNLFGKSYPEYTSGNTGYFSSIAFGWYSLDNNGNLLTKSRTGWQRPDGWEKVLEVISQYKLKSEMVIHVTDGDKTISNLLSSSESIEKAISSIVEEAKIYDSVNLDFEGLGLNEDKEQLLQTQQKFTEFVKLLKNRLDVSKSITLTLHAPNSVYKGYDYKTLGEIADKIIIMAYDYGTKPEPEELVIQAIEQATEKVPKEKLLLGISIPNETPESFAVKIGLAKRFGLGGIAIWRLGLVQDEMWDVLKNSITPRR >NC_014209.1|WP_012996185.1|2227019_2227433_-|SUF-system-NifU-family-Fe-S-cluster-assembly-protein MSDLNQLYSEVIMEHYENSPHRKELKDATRKERGHNPLCGDDITLYLKMNGDIIEDASFTGHGCAISQASTSMMIDLIKGKDKKEALRLVQEFIDMIHKKDVNLDELGDAQVLQGVSDFPARVKCALLAWKTLQEIL >NC_014209.1|WP_013151002.1|2227429_2228659_-|cysteine-desulfurase MKNIDIEKIKKDFPILNVKPHGKKLIYLDNAATTQKPISVIKAMDKYYEELNANVYRSPHYLSALSTQAYEEARERVKKFINAKSVESIIFTRNTTESINFIAYTWGMKYINEGDEIILTIAEHHSNMLPWQMVAEAKKARLKYVYLDEDFRLSMKDFKEKMSDKVKLVAVQHMSNVLGIINPVEEITHIAHKYGAKVLIDGAQSVPHMPVDVQKIDCDFFAFSGHKMLGPMGIGVLYIKEDLLSDVPPFLRGGEMIDEVFEDRATFAPPPLKFEAGTPNVKGACVLVSAIDYIEKIGLSNIYHHESELLEYGLQKMKELDFVKLYGPKDAKERGGIISFNVEGVHPHDVATILDEEGIAVRSGHHCCQPLMRYLGVPATVRASFYLYNDFDDIDALVEGLKKVRKWFK >NC_014209.1|WP_013151003.1|2228655_2229705_-|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufD MWKRVNIEKIKVPSYKEYTLAVVKDSSQDTVKIKKIKDLHHLPIETLISANKTFGIDDKFVNMVKTLYNTGFYIKTFQNTSVEKPIVVDYITDEQNDTLIDYNIVEIEANSSATVVFDYNSGAHGFHNGITEVIAKEGATVNIVKIQRLGNEFNDFDNNLVIVGKDATVNWSNVVIGAKMSTFDVTVYLDEIGATFISKSIFLGVDSQKYDMAYKVYHQAPKSTSSVDLKGALKGSAEATFIGNIDIKKGAKKAKAEENETVLLLDKTVKSVTIPALYCGEDDVVAKHSASAGQIDEDKLYYVMSRGFSFEEARLLMVQAILNPVIDLIPYDPVKEIIIRGHIGRKIIK >NC_014209.1|WP_012996188.1|2229715_2231119_-|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufB MKKPDIKEIDFSIYDVKDNVKYEYQTGKGLSKEVVLEISEQKNEPSWMRDFRLKALEIYQKMPMPTWGVDLSQLDIDSIIAYIRPKAKMQRSWEEVPEEIRRTFERLGIPEAERKVLAGVGAQYDSEVVYHNIKENLTRQGVIFEDMDTAVKKYPDIIKEYFMTKNVTPSDHKFVALHAAIWSGGTFVYVPEGVKVEVPLQAYFRMNAPGSGQFEHTLIIADKGSEVRFIEGCSAPQYSVSNLHAGCVELFVKEGARIIYSTIENWSKNTYNLNTKRAIVEKDGIIEWVSGSFGSHKTMLYPTSVLKGKGAKAEYTGVTFAAKGQHLDTGSKMIHLAPYTSSKVVAKSISKDGGISTYRGFLKIGSTAEGAKASVQCEGLMLDDISRSDTIPVIEIENDNVDIGHEAKVGRISDEQIFYLMSRGLSEDDARAMIVRGFVEPIAKALPLEYAVEMNRLIKLELEGAIG |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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NC_014209_1 | 1.37|24377|37|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 24377-24413 | 37 | KX961630 | Bacillus phage QCM8, complete genome | 10642-10678 | 9 | 0.757 |
NC_014209_1 | 1.53|25431|36|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 25431-25466 | 36 | NZ_CP039703 | Clostridium butyricum strain 29-1 plasmid p-butyl_plas_29-1, complete sequence | 300525-300560 | 9 | 0.75 |
NC_014209_1 | 1.53|25431|36|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 25431-25466 | 36 | NZ_CP013238 | Clostridium butyricum strain CDC_51208 plasmid pNPD4_2, complete sequence | 418876-418911 | 9 | 0.75 |
NC_014209_1 | 1.53|25431|36|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 25431-25466 | 36 | NZ_CP039706 | Clostridium butyricum strain 4-1 plasmid p-butyl_plas_4-1, complete sequence | 376245-376280 | 9 | 0.75 |
NC_014209_1 | 1.53|25431|36|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 25431-25466 | 36 | NZ_CP033246 | Clostridium butyricum strain CFSA3987 plasmid pCFSA3987, complete sequence | 78560-78595 | 9 | 0.75 |
NC_014209_1 | 1.53|25431|36|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 25431-25466 | 36 | NZ_CP033248 | Clostridium butyricum strain CFSA3989 plasmid pCFSA3989, complete sequence | 78601-78636 | 9 | 0.75 |
NC_014209_1 | 1.53|25431|36|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 25431-25466 | 36 | NZ_AP019717 | Clostridium butyricum strain NBRC 13949 plasmid pCBU1, complete sequence | 408389-408424 | 9 | 0.75 |
NC_014209_3 | 3.6|2216505|36|NC_014209|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2216505-2216540 | 36 | NC_022111 | Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 plasmid, complete sequence | 1551014-1551049 | 9 | 0.75 |
NC_014209_3 | 3.6|2216505|36|NC_014209|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2216505-2216540 | 36 | NZ_CP040741 | Enterococcus faecium strain VRE1 plasmid pVRE1-1, complete sequence | 142131-142166 | 9 | 0.75 |
NC_014209_1 | 1.37|24377|37|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 24377-24413 | 37 | MK779875 | Lactococcus phage CHPC971, complete genome | 26488-26524 | 10 | 0.73 |
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NC_014209_2 | 2.10|792290|37|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 792290-792326 | 37 | KU686199 | Synechococcus phage S-CAM3 isolate 1010CC42, complete genome | 32811-32847 | 10 | 0.73 |
NC_014209_2 | 2.10|792290|37|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 792290-792326 | 37 | KU686198 | Synechococcus phage S-CAM3 isolate 0910TB04, complete genome | 32830-32866 | 10 | 0.73 |
NC_014209_3 | 3.6|2216505|36|NC_014209|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2216505-2216540 | 36 | NZ_CP009636 | Bacillus cereus 03BB108 plasmid pBFI_2, complete sequence | 196876-196911 | 10 | 0.722 |
NC_014209_3 | 3.6|2216505|36|NC_014209|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2216505-2216540 | 36 | NZ_CP053962 | Bacillus cereus strain FDAARGOS_802 plasmid unnamed2, complete sequence | 22319-22354 | 10 | 0.722 |
NC_014209_3 | 3.6|2216505|36|NC_014209|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2216505-2216540 | 36 | MN693201 | Marine virus AFVG_25M427, complete genome | 46686-46721 | 10 | 0.722 |
NC_014209_1 | 1.50|25236|36|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 25236-25271 | 36 | KF114877 | Leptospira phage LnoZ_CZ214, complete genome | 74132-74167 | 11 | 0.694 |
1. spacer 1.37|24377|37|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN150686 (Bacillus phage BC-T25, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
ttaaaacctcttcttttcttttttgttgataatattc CRISPR spacer tttggaactcttcttttctttttcgttcataatttat Protospacer ** ..* ****************.*** ***** * .
2. spacer 1.37|24377|37|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KX961630 (Bacillus phage QCM8, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
ttaaaacctcttcttttcttttttgttgataatattc CRISPR spacer tttggaactcttcttttctttttcgttcataatttat Protospacer ** ..* ****************.*** ***** * .
3. spacer 1.53|25431|36|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP039703 (Clostridium butyricum strain 29-1 plasmid p-butyl_plas_29-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
taaaacatctatagatacattaaaaagagccgtatc CRISPR spacer tccaacatttatagatacattaaaaacagtattaat Protospacer * *****.***************** **. ** .
4. spacer 1.53|25431|36|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013238 (Clostridium butyricum strain CDC_51208 plasmid pNPD4_2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
taaaacatctatagatacattaaaaagagccgtatc CRISPR spacer tccaacatttatagatacattaaaaacagtattaat Protospacer * *****.***************** **. ** .
5. spacer 1.53|25431|36|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP039706 (Clostridium butyricum strain 4-1 plasmid p-butyl_plas_4-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
taaaacatctatagatacattaaaaagagccgtatc CRISPR spacer tccaacatttatagatacattaaaaacagtattaat Protospacer * *****.***************** **. ** .
6. spacer 1.53|25431|36|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP033246 (Clostridium butyricum strain CFSA3987 plasmid pCFSA3987, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
taaaacatctatagatacattaaaaagagccgtatc CRISPR spacer tccaacatttatagatacattaaaaacagtattaat Protospacer * *****.***************** **. ** .
7. spacer 1.53|25431|36|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP033248 (Clostridium butyricum strain CFSA3989 plasmid pCFSA3989, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
taaaacatctatagatacattaaaaagagccgtatc CRISPR spacer tccaacatttatagatacattaaaaacagtattaat Protospacer * *****.***************** **. ** .
8. spacer 1.53|25431|36|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP019717 (Clostridium butyricum strain NBRC 13949 plasmid pCBU1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
taaaacatctatagatacattaaaaagagccgtatc CRISPR spacer tccaacatttatagatacattaaaaacagtattaat Protospacer * *****.***************** **. ** .
9. spacer 3.6|2216505|36|NC_014209|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_022111 (Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 plasmid, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
cattttgcaaacgaaaaagataaaaatctttaaaaa----- CRISPR spacer cattttgcaaacgaaaaagacacaaat-----ggaatcgtc Protospacer ********************.* **** ..**
10. spacer 3.6|2216505|36|NC_014209|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP040741 (Enterococcus faecium strain VRE1 plasmid pVRE1-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
cattttgcaaacgaaaaagataaaaatctttaaaaa CRISPR spacer aatttgacaaacgaaaaagataaaaatgggaaatat Protospacer **** .******************** ** *
11. spacer 1.37|24377|37|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK779875 (Lactococcus phage CHPC971, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
ttaaaacctcttcttttcttttttgttgataatattc CRISPR spacer ttacaacctcttctttttttttttgtctttaaggagg Protospacer *** *************.********. *** .
12. spacer 2.10|792290|37|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KU686197 (Synechococcus phage S-CAM3 isolate 0808SB25, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
tttcgccagcgctagcatttgcactgttagctaataa CRISPR spacer tatttcctgcggtagcatttgcactgttagctctcgg Protospacer * *. ** *** ******************** ...
13. spacer 2.10|792290|37|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KU686199 (Synechococcus phage S-CAM3 isolate 1010CC42, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
tttcgccagcgctagcatttgcactgttagctaataa CRISPR spacer tatttcctgcggtagcatttgcactgttagctctcgg Protospacer * *. ** *** ******************** ...
14. spacer 2.10|792290|37|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KU686198 (Synechococcus phage S-CAM3 isolate 0910TB04, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
tttcgccagcgctagcatttgcactgttagctaataa CRISPR spacer tatttcctgcggtagcatttgcactgttagctctcgg Protospacer * *. ** *** ******************** ...
15. spacer 3.6|2216505|36|NC_014209|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP009636 (Bacillus cereus 03BB108 plasmid pBFI_2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
cattttgcaaacgaaaaagataaaaatctttaaaaa CRISPR spacer gcttttgcagatgaaaaagataaaaatcagattaga Protospacer *******.*.**************** *.*
16. spacer 3.6|2216505|36|NC_014209|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP053962 (Bacillus cereus strain FDAARGOS_802 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
cattttgcaaacgaaaaagataaaaatctttaaaaa CRISPR spacer gcttttgcagatgaaaaagataaaaatcagattaga Protospacer *******.*.**************** *.*
17. spacer 3.6|2216505|36|NC_014209|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN693201 (Marine virus AFVG_25M427, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
------cattttgcaaacgaaaaagataaaaatctttaaaaa CRISPR spacer gaagagca------aaacgaaaaagagaaaaagctttaaatc Protospacer ** ************ ***** *******
18. spacer 1.50|25236|36|NC_014209|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KF114877 (Leptospira phage LnoZ_CZ214, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.694
ttaagcaattttacaaaaatgtaaaattcttgcttg CRISPR spacer actttcaattttacaaaaatataagattcttcgata Protospacer . ***************.***.****** *.
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
14408 : 60988
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_014209|14408:60988|DBSCAN-SWA TATGATAACGGATTTGAGTTTTTTTGATATTGGTGCAAAATGGCCTCCAGATAGCGAAATGGAAAGACTACAGCGTTATGACCAAAACAGAAAGCTCTTTGAAGGTAGGCATGAACTTGTATTTAAAGATTGGATTAGGTTGCTTAGAGATGACAAAAAAGCAACGCTAGAGATTATTTTAAATTGGCCTAAACGTTTATCGACGTTATGGGCAGATTTGTTATTAGGAGAACCACCTAGAATAACAGCAGGAGAAACAGGAAGTAAAGAGCAAGAACAGTTAGATAAAATTATCAAAAATAATAACTTTTTAAACACGGCTTACGAAGTAGCAATAGATTTAAGTAGATATGGCGATGGCATATTTAAAACAAGATATGATAAAAGAGCAATTATAGAAGCAGTTCCACCATCGCTTTGGTTTCTTGTTGTGACTGCAGACAACATCAAAGATGTGCAAGCTCATGTAATAGCATGGACGTTTGATATTGCGACACCAACGTTATTGAGCAAAGACAAAAAGACAACTTATCTTAGACTTGAAATACACGAAAGAGGTAAAATCACAAATAAACTTTTTGAATTGCAAGATGAAATTATAAAAAACGAAATTGATATAAAAACTTTTTACCCGGATTTAGAACCGGAAATATATACGGGAATTGATGATTTCTTAGTGGTACCAGTGCATAATATGCAGACAAGCGACAGAATATACGGCTTGGATGACTACAGCGACCTTGATAGTATAATTCAAGAGATAGAAGTCAGAATTGCACAGATAAGTAGAATCCTTGATAAGCACGCTGACCCTAACATGTATGGGCCTGCTACAGCACTTGAACAAAACGAGCTCGGTGAGTGGGTTGTCAGAGGAGGAGGAAAATATTTTCCTGTAGAACAAGGCGAACAACCACCGGGTTATGTGGTGTGGGATGGGAAGCTTGATGCTGCATTTAGAGAAATAGACCTGTTAATGGAGCAATTTTATGCGCTATCAGAGACATCAGCAGCAGCTTTTGGGCAACTTAAACAGGGTTTAGCAGAAAGCGGAAGTGCATTGAGAAGGTTAATGATGGCACCTTTAGCAAAAGTAAACCGAATACGCATGAGGTTTGACCCTGCTATAAAGAAAATTTTACGGCTTGCAAGTAAATTAGATGCTTTATATGGCAATGGGATAGAACTAGAGACAATTAATATAGCTTGGAACGACGGATTACCAGATGATGAAAAAGAGCAGGCAGAAATCTATTCAATGCTTGTTCAAAACGGGCTTATAAGCAGAGAAACAGCTTTAAAACATTTATTTGAATTTGATGCAGAGACTTTAAAACAAGAACTAGCGAAGATAGCGGTTGAGACAGCACAAGAGGCTCCAGCATTATTTACAACAACATTACAAACACAACAGAATCAGCAACAACAAAGTGAGTGATAGATAATGCCTAACTTTGACGAAGAAAAACTCATACAAAGCCTTGTCGAACTCTATCGGCAGGGTTTCTTGAATATTCTTAAAGTAATATTGGAAAAAGAAGCAAAGAAACAAGATACAATTTATTTCAAAGATATTCTCAAACAAATAATGCAGATATTAGAACAGTTAGATAATAATGCTGCAAAATGGATAGAGGAAAATGTTCCAAAGATATATCAGCAGAACTATATTGCAGTGATGGCTTTTATTCAACAGTTAAAAGGTGAGGCAATACAAAATCCGAGTTTTAGCCAGTTGCATCAGAGAGCAGTGGATGTGTTAGCGCAAAATCTTTATGATAATCTTAGAGATGCAACTCAGTTTGTGGGACGTAAATTTGATGATTATTTTAGAAAAGCAAGTTTAGAAGCAGCAGGTAAAAAGTATGTCAGTGGTGAAACATGGCAGCAGATGAAAAAAGATTTGATGGAGAGGCTATTGAGCAAGGGTTTAACAGGCTTTAAAGACAGACTAGGTAGAGAATGGAGGCTTGATAGTTATGCTGAAATGGTTGCAAGGACATTGACAAGAGAAGCGGCGACAGTAGCGACAATCAACGCTTGCAAGGAATTCGATATTGATTTAGTGAGGATTTCTACGCATTATCCAACATGTCATTTATGTGCACCAATTCAGGGTAAAGTATACAGCCTTTCAGGTAAAGATGGGAGATATCCAAAGTACGGAGAAGATGGTGTAGTTATTCCCCGTCATCCAAACTGTAGACATGTACTAATGCCATATGTGCGAGAACTTGACCCTAATGCTGAAGAAACAGAAAAGTATAGTAATACATCGTTAACTGAGGATCCAAGAAGTGAGAAAGAAAAGGAAGCATATAAAGAAGCACAGGAAAAACGGAAACAGCAATTTTACAATAAAGTGAAAAGAGAATATCTTAAAAACATAGTGTAAAATTATCGTAGGATTTTTTGAGTAAAAAAAAACAAGAGACAACCCCTGTGATAAAATAGATTATGGAAAACAAAACAACACAGAAAGGGGTGTCTCTTGTGAACAAACATATCTTTGAAGATATTATACTACAAAATGCTCTAAATTTCACTAGAGAAGTGATAGAAATTTTTAGTGATTTATTAAACAAAGGAATGAATATTACAGAGCTTGCAGCAAGGATAAAGGAACTAACGGACAAACTAGGTAGAGAGGCAATAGAAGCAATTATTGAAGAGTTAGATAAGATAATAAAAGAAGACAAGAGAAGGAAAGAAAAATGGGTAGTAGAGAGGAAAGATAAAAAGAGATTAACCACAATCCTTGGGGATATAGAATATGAGAGGACATATTACAAATCCAGAGAGGATGGAAGATATACATATTTGGTGGATGATGCATTAGAGATAGGGCGGCACGATAGGATAGAAAAAGGTGTAAAAATAAAGTTAGTAGAGAACGCAATAGAAGAATCATATGAAAGAAGCAGTAAAAAAGCATGTCCAGAGGAGTTAAGTAAACAGACAGTATTAAACGCAATAAGGGAAATAGGAGAAGTAGAAGTAAAGAGAGAAATAAAAGAGAAGAAAGAAGTAAGGGTATTATACATAGAAGCAGATGAAGACCATGTGCCTTTGCAAGATGGCAGCAATGAAACACCGCGATTGATATACATACATGAAGGTAAAGAAGAGAGAAATGGTAGAGATGTACTGAGAAATGTGCATTACAAGGCATACGTAGGAGAGAAAGCAGAAGACATATGGATAGATGTAGCAAATTACATAGAAGAAAACTACAAAGAAGAGAAGATAGAGAAGATATACATAGCAGGAGATGGAGCACCGTGGATAAAAGAGGGATTAGAGTGGATAGCAAAATCAAGGTTTGTGTTAGACAGATATCATTTAAACAAATACGTATTAAAAGCCACATCAAAAGAGCCAAAATACAGGGAAAAGATATGGAGAGCAATAAATGAAGGAGATAAAGAAGGAGTGAAGAAGATATTTGATGAACTAATAAAGGCAGCAGAGGAAGAGAGGGAGAAAGAGAAGATAAAAGAAGCAAGGAAATACATACTAAACAATTGGGAAGGGATAGAGATATACAACAAAGACAAAGATGTAATAGGGTGCAGTGCAGAAGGGCATATAAGCCATGTATTTTCAGTAAGACTAAGCAGGAATCCATTGGGATGGAGTAGAGAAGGATTAAAGTTAATGGCGAAATTAAGGGTATTCAGCAAGAATGGAGGAGACTTAAGAGAAGTAGAATGGGGTAAGAGAAAGAATATAAATGAAGGAAGTTACAAATTAACGAAGAAGCAAATAAAAGAGGCGGTAAGAAGAATTAAAACGTCTACAAATGAAAAGATAAATAATATTACGGTTTTGAATATAGGGAAAGTAACGCCAATATACAGGATTTTAAGAGCAATAAAATATGCACAAGTCATATAAAAAACATGATAAGACGAAGCCCTGAATTAAGTAAGTTACAGGGGTTGTCTTAAAAAAATCCTACAGTATCTTGACACTATCTCTTAAAAATAAAAAGTTGTATGATGAGCAAGCAAGAGTTATAATAGAAAATGAAAAAGATTATTCAGTTTTAATTAAAAAGTTGGCTGAGCTAAGGCAAATTGAGTGGGATAACACGCATTGGCTTATTAAAAAGGAGCTAATATTAGAGGCAAGAAAAGAAAAGGAGTTGTATCGTGAAAAATATCACGTTGCAAAACATGGGTATACATTTGATGAGACGATACCAAGAAATCAAAAAGAAATTACAGAAGAACATATAACAAAATATAAAAAATTCTTGTTGCAAACCAAGAAAAATGCTGATGAGATATACACATTTAGAGACCCACAGCGTGGAGATATTTGCTGGGCATTTGTAAAATATGAAAAACGCAAGGTGAATTTAGCTTTGTTTAATGAGCATATGAATAGGGATGCAAGTGGTTGGGCATTCGAGGATAAAGAAGATTGGGCAAAGTATTTGGAAAAACAGCCATATATCCGAATTTTGTGAGGTGAGAATATGGGAATACTTGAACAAGCTAAAATGGAAGCTGAAAGTCTTGATATTTTTGAAGAGGAAGAACCTGATTATTTTGCGGTAAGTTATTTATTGAACATCCTTGATATTCTTCAAGAAAAACAGCTAATCGAGACACCCGAAGGCAAAGAATTACAAAAAAAAGTTTTAAAATATGCTGATAAACTTGCGCCTTTTGTAAAAGGCCCACCAAATGGTGAAACAGGTTGGTGGTGGCATATGGATAAAGTTGCAAAAGGCGAGTTAAAACCCCAAATTTAACCACCTAACCGAGCAAGGTTGAGGTGGTATTTTTATGCCTTCTTGTAAGGAGGTGAGTACCAAGTGTCTGAGAAGGTTTCTAATAAGCCATGGAGCAATTTTAGTGAGAGTGACTATGATAAAGAACAATGGTGGGAAGCATGTCTAATACACCTTGTGCCAAAAAGCGAATATACAAGCAAGGAACAGTGCAAACTGCCAGTCCGTGAACCAGATGGTACTTTAAATAGAAATGGCA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41 | Staphylococcus_phage(25.0%) | terminase,portal,tRNA,transposase,capsid,integrase | attL 25929:25944|attR 60991:61006 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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