Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_014207 | Methylotenera versatilis 301, complete sequence | 0 crisprs | csa3,DinG,DEDDh,RT | 0 | 0 | 3 | 0 |
1. NC_014207
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0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
1752146 : 1760063
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_014207|1752146:1760063|DBSCAN-SWA TTTATTTAGAAATAGTCAGCTTTTCTAAACCGTTCATGTATGGTCTTAATACCTCTGGCACGGTCACGCTACCATCTGCATTTTGATAATTTTCTAGCACTGCCACCAAGGTACGCCCTACTGCCAAACCAGAACCATTCAGCGTATGCACTAACTCGGGTTTGCCGTTTTCGTTTCTAAAACGTGCTTGTAAACGCCGTGCTTGAAATGCTTCGCAGTTTGAAACAGATGAAATCTCACGATAAGTATTTTGTGCAGGCAGCCACACTTCTAAATCGTAAGTTTTAGCTGCGCCAAAACCCATATCACCTGTGCAGAGTGAAACCACACGATATGGTAAGCCTAGCGCTTTCAAGATATTTTCCGCATGCCCTACCATCTCTTCAAGCGCTGCATAACTGGTATCAGGATGTACGATTTGCACCATCTCGACTTTATCAAACTGATGCTGACGTATCATGCCTTTAGTATCGCGACCATAAGAACCTGCTTCAGAACGGAAGCAAGGCGTGTGCGCTGTTAGCTTGATTGGCAATGATTCTAAAGGTACGATTTCATCGCGTACTGTATTGGTGAGTGTAACTTCTGATGTTGGGATTAGATAAAGCTTACTGTCATTGTGCTGTAAGCTGAATAAATCTTCTTCAAACTTTGGCAACTGACCAGTACCCGTTAGCGTTTCTGCGTTCACCAAATACGGCGTATAGCATTCCTCATAGCCATGTTGTTCAGTTTGAGTATTCAACATAAACTGCGCTAAAGCACGATGCATTTTTGCGATTTGTCCACGCATTAAGGTAAAACGCGTGCCTGAAAGCTTAGTACCAGTATCGAAATCCAAACCTAATGGCGTGCCGACATCGGCATGATCTTTCACTTCAAAATCAAATGTACGCGGCGTTCCAACTTTACGCACTTCTATGTTATCAGCCTCTGATTTTCCTGATGGCACGCTTGAATGCGGTAGATTTGGTACATTTAGCAGTAAGTTCTGTAAGCTAGCTTGCAACTCAATCAATCGTGCTTCATCGGCTTTTAATTGGTCACCGAAGCCCGCAACTTCTGCCATGATGGCGCTCACGTCTTCACCTTTAGATTTAGCGATGCCGATTTGTTTAGAGGTGTTATTACGTTTAGCTTGTAGCTCTTGCGTGCGAGTTTGTACGGTTTTACGCTCGTTTTCTAAGGTTGTAAAACTGGCTGAATCAAACTCAAATCCACGCGCTTTTAATTGGCTAACAACGCCGTCCAAATCAGTTCTTAACGCTTGTATATCTAACATATTTATTCTCTATTTTCTAAATTTCTATTTTTTAGCTTTTTTTGCAAGTTCGCGCTTATCCAAATCCCTTAAGTGCGCCAATTTTTCCGTAATTTTACCTTCTAAGCCACGCGGTGTGGGCATATAAAATTGCGGAACGGTATTTTTATCATGCAAATCATCTGGAAAATAATCCACGCCTGCAGCATAGGCTTCTGGTTCATGATGTGCATAGCGGTATTCTTTGCCGTAATCTAAGGCTTTCATCAGCTTGGTTGGCGCATTTCTTAAGTGCAATGGTACTGGGCGTGATTTATCTTGTGCGACAAAGGCTTTAGCTTGATTGTAGGCGTTATATGCGGCATTACTTTTAGGTGCAACAGCCAAATAAATCACCACATTAGATAACGCCAGCTCACCTTCTGGCGAACCTAGTCGCTCGTAAATCTGGCAAGCTTCAATTGCCATGCCTTGCGCGCGCGGATCCGCTAAGCCAATATCTTCAATGGCCATACGAACGATGCGTCGACCTAAGTATAAGGGATCTGCACCGCCATCTATCATGCGTAAGAACCAGTACAAAGCTGCATCTGGGTTTGAGCCACGTACAGATTTATGTAACGCGGAAATCTGGTCGTAAAACGCTTCGCCGCCTTTATCGAATCTGCGTAACTTGCTCGCCATGGTGGTCTGCAAAAAGGCTTCATCAATCTCGGTGACGCCAGCACCTTCAGCAGCATTAAATAAGCCTTCAACAAAGTTCAGTAAGCGTCTTGCATCGCCATCGGCATAAGCCAACACTTGTTCGCGAACGTCGTCAGCAAGTTTGACATTTTCAGCAACTAATTGCTGAGCGCGATCTAGTAACAACGATAACTCAGCCTCAGATAAGGCATTGAGTACAAAAACCTGCGCACGGCTTAATAAAGCGCTGTTTACTTCAAATGAGGGATTTTCAGTGGTTGCACCAATAAAAGTGATTAAGCCACTTTCTACAAACGGCAAGAATGCATCTTGCTGTCCTTTGTTAAAGCGATGCACTTCATCCACAAACAATATAGTTTTACGACCATGTTGCTGCAAGATAAGCTCAGCGCGCTCTACAGCCTCACGAATGTCTTTAATGCCCGATAATACGGCAGAAATAGGGATGAAATCAGCCTCTGCGGTATTGGCAATTAATCGGGCTAAAGTTGTTTTGCCTACACCAGGTGGTCCCCACAAAATCATGGAGGGCAACTTGCCCGATTGAAATGCCAGCCTCAGTGGTTTGTTAGCGGCCAATAAGTGCGACTGCCCAACCACTTCATCAAGAGTTTTAGGGCGCAAGCGCTCGGCTAGCGGCGCTTCTGGCTGATTTGGTGTGAATAAGTTAGTCAAAATGCAATGAGCCTATTACGAGACTCAATCAAATGAAGACAAGGCGAAGAGTGCAAATGGCACGGCAAGAACCATACAACGCAGTATTCATTTGTTTGCGGCACGGGATTATTACTCACCAACAACATCAACGCCAGGTGGTGGCTTGAATAAAAAGCTCTTTGGCTCAATCACAGGATTATGCACGACGTTGCTAAATAAGATTTTGGTTTGATGGCCAAAGCTGTCTATCATGTCCATTTCTTGCAACACATCATTTTTAAAAGCTAATGATATTTTATTAAAGCCAGTATCAGAATCTTTAGGATTCGTACTTACCCAATCAAGACCATCTTTACGAAATGCATTTACTAACTTAAAGTTTTTATCTAGGCTATCGTCACCTGCTAAGAGTGCTGCAGGGCTTGAGCCTAGCGCTTTACTTAACTCACGCACTGAAACTTGCGCCAACTCTGTATCGTACAGCCACACTTGCTTGCCGTCACTGATGATTTGCTGTTCAAACGGCTTATGATAATCCCACCTAAATTTATTCGGACGTTTTAACTGCATTTCACCATAGACTTCTTGAATTTTCTGCCCTTGTTTATCCGTGACGATTTGATGAAAATCCGCTTTAACCGCGTGTGTTTCATCATAAAACTTTTTAAGGCTAGACACGCCATCGGCATTAGCGGCTAACGGCAGTATTAACAGACAGCTCAATAATGCAGCTTTTAATTTATTCATTTAATTCCTTATTTGCTTTTTTGGATGTATTTAGGAATCGTGATGCGGCACTAATACTTCACGATTACCATTGCTCTGCATGGCTGATACTAGGCCTGCACGTTCCATGTCTTCTATGAGTCGCGCAGCACGGTTATAACCGATGCGCAATTGACGCTGCACGCCTGAAATGCTGGCGCGGCGAGTTTTAAGTACAATGCCAACAGCTTCATCATAGAGCGGATCAACCTCTGAACCACCGCTCGAGCTGGAGCCGCTATCAGCAAAGTCTGCACCGCCCTCTTCAGCCTCATTACTTAGGATACCCTCAATATAGTTTGGTTCACCTTGCGCTTTGAGGTAGTTCACCACCTTGTGCACTTCTTGATCAGACACAAATGCGCCGTGGATACGCACAGGGTAACCTGTGCCAGGTGGCATATACAACATATCACCCTGCCCCAATAAGGCTTCCGCGCCCATTTGATCTAATATGGTACGCGAGTCAATTTTGCTGGAAACTTGAAAAGAAATTCGCGTAGGCACGTTGGCTTTAATCAAGCCTGTAATCACGTCCACAGATGGACGCTGCGTCGCAAGCACCAAATGAATACCAGATGCGCGTGCTTTTTGTGCTAAACGGGCAATCAACTCCTCCACCTTCTTGCCTACCACCATCATTAAATCTGCCAACTCATCAATCACCACCACAATCAACGGCATTTCCATTAATGGTTCAGGATCATCTGGCGTTAAGCTAAATGGATGCGGTATTTTTTCACCTGTTTTTTCCGCATCTCTAATTTTTTGATTGTAACCCGCTAGATTACGTACACCTAAACTAGACATCAATTTATAACGGCGCTCCATCTCAGCCACACACCAATTAAGCGCATTTGCAGCTTGACGCATATCGGTCACCACAGGGGCTAGTAAATGCGGAATACCTTCATAGACGGAGAGCTCAAGCATTTTTGGGTCGATTAAAATCATACGCACTTGACTAGCATCAGCCTTATACAACCAGCTTAAAATAAGCGCATTAATCGCCACAGACTTACCTGAACCCGTAGTACCCGCAACCAGCACGTGCGGCATCTTTGCCAAATCGGCCACCACAGGTTTGCCCGAAATATCTTTACCAAGTGAAATTGCCAGTGGTGACTTCACATCGGCATAAGCTTGGCTGCCCATAATTTCAGATAAATAGACAATTTGGCGTTTAGGGTTAGGGATCTCTAAACCCATACAGGTTTTGCCCGGAATCGTTTCAACTAAACGCACACTCACAACAGAAAGTGCGCGCGCTAAATCTTTAATTAAATTAGTGACTTGGCTACCTTTTACGCCAGCGGCAGGTTCTAACTCAAATCGAGTAATCACAGGGCCAGGCTGTGCCGTGAGCACTTTAACTTCAATGCCGAAGTCCATTAATTTGCGTTCAATTAAGCGCGATGTAAAGTCTAGAGTTTCAGCTGACGGAAGCTCGACCATGCCAGAAGGATCATCAAGCAAATGCAAAGGTGGCAGCGCTGAGTCTGGCATAGAGTCAAATAACGGCGCCTGCTTCTCTTTTTGTACACGCTCACTTTTTGCGACTTCTAAAACTGGTGGCTCAATAAATACTGGCTCACGTGCTTCAACACGTTTACGCTCGGTTTGTACAAACTCAGTACGTTCTTGCTCAACTACTTTGCCAGCTTGCCTATCTTGTCTATCTTGCCATTTGAATTTTAGGTATTCATAGCTTGAAATGATTGCGCCGCCCAATTTCTCAGTGATCATAATCCACGACCAGCCAGTAAATAAGCTAAAGCCCACTACAAACATTACTAACAGCAACATACTAGAACCCGTGTAGCCAAACAGGCTACGTAAACCAGTATCCAAGGCTGTGCCTAGCATGCCGCCACGCGCATCTGGCAACATTGCTGGCAAGTTAACAATATGTCCAGCCTCCAATGCACATGAAGCTACAAGTAATAAAGCAAATCCAATAAAATTAAACAGCAAAAATGGTCTTTCACTTTGGTTAACCGCTTCTAATTTTAGGTAAACAAGCCACATGGCATAGAACGCCAGAATCGCCCACCACCAAGCTGAAAGACCAAATAAAAACAGTAATAATGCAGAAATCTTTGCACCTACATAGCCACCAGCATTATGTATTAGCGTATTGTTCGTAGATAAGTTAAACCAAGATGGATCTTCACGATGATAAGTAAATAGAATCACCGTAATAAAAAGCCCTGCTAATACTAAAATTAGCCACCAAGCTTCTTTAATCAGCGTTGTGCCTATCACATGCGACTGGCTCACTTCTGCCTCACGGCGAGCATTGACAGGAGTTGATTTTTTGAAAAACAAGATAGTCGAACCTTACAAATTTTTAACGTCAAATTTAATTATAGCAGTATCAAAGTCGCTTGGTAGCTAATACAATACTAATCTAATTCTAAACCTATCTACACTTACATTTCTACTAAGGAAACCATCATGGATATCGGCATCAAAGAGAAAGATAGAAAAGCGATTGCTAAAGGTTTATCACACCTTTTGGCGGATACATATACCTTGTATCTAAAGACGCATTATTTCCACTGGAATGTGACAGGGCCAATGTTTAACACCCTGCATTTGATGTTTGAAGCACAATATACCGAGCTTGCATTAGCTGTAGATTTAGTGGCAGAACGTATACGCGCATTAGACGTTTACGCGCCTGGTACGTACCGTGATTTTGCAAAACTATCGTCTATTAAAGAGTCTGAATCAGTGCCGAAAGCGCAAGACATGATTGCAGAATTGGTAGCAGGTCATGAAGCAGTTTGTCGCACAGCACGCAGTGTGTTTCCTGCAGCAGATGCAGCTTCAGACGAAGCAACCAAAGATTTGTTAACGCAACGTCTGCAGTTGCATGAAAAAACAGGTTGGATGCTACGCAGCTTGCTTGAAAAATAAGCCAATAAACCCAATATAGCTCAAACAACACTTATTAAAGAAAGCAATACAACATGGCAACACGTCACGTCAAACTACTCATTTTAGGCTCTGGCCCTGCAGGTTACTCTGCTGCGGTATATGCCGCCCGCGCGAATCTTAAACCTGTACTCATCACAGGCATTGCACAAGGTGGTCAATTGATGACGACCACTGAGGTCGACAACTGGCCTGCTGATGCCGATGGCGTGCAAGGCCCAGAGTTGATGGAGCGCTTTCAAAAGCATGCTGAGCGCTTTAATACCGAAATGATTTTTGACCATATCCACACGACGCATTTGACTGAAAAGCCTATCCGTTTAGTAGGCGATAGTGGCGAATATACTTGTGATGCCTTGATTATTGCTACAGGCGCCTCAGCTAAGTATTTAGGTTTGCCAAGTGAAGAAGCTTTCTCAGGCAAAGGTGTTTCAGCATGTGCGACTTGCGATGGCTTCTTCTACCGCAATCAAGAAGTTGCAGTGATTGGTGGCGGAAATACGGCTGTTGAAGAAGCTTTGTATTTGGCTAACATCGCAAGCAAAGTCACCTTGGTACACCGTCGTGATAAGTTTAAAGCTGAAGCGATTTTGGTTGATAAATTAATGGCGCGTGTGGCTGAAGGCAAAATCGTCTTAGAAACATTCAACACGCTAGATGAAGTGCTAGGCGACAACACTGGCGTGACTGGCATGCGCATCAAAAACGTGAATGACGGCACCACTAAAGATATAGCGCTACAAGGCGTATTTATTGCGATTGGTCACAAACCAAATACTGACATTTTCGAAGGCCAACTCGATATGGAAGGTGGTTACATCATCACGCAAATGGGTCGTGGCGGCAATGCTACTGCAACTAGCGTTCCCGGTGTGTTTGCCGCAGGTGATGTGCAAGATCATATTTATCGCCAAGCGGTTACCAGCGCTGGTTCAGGTTGCATGGCTGCGCTAGATGCTGAACGATACCTCGACAAATAAGCTTTTAAGCGCAAAAAAGCGTTTAAAACAAGCAGAGGCAGCACAGAAACTAGCTGAACAAAATGCTGCAAAAGAAATCAGAGAAAAAATAGCTGATGAAGCCTCAGTTTTTCGTGACGCGGTAAAAGACGTCAAACCTTTTACCGCGCCACCAAAAGATGAATACAAACTAAAACCAAAGCCCATCCCACTGCAATTTATCCGCGATGAACAACAAGCCCTTGTTGACTCATTATCTGACCATTACATTCCAGCCCATGAAATTGAAACAGGTGAAGAGCTACTTTACCTGCGTGATGGCCACTCGCCTGACATTCTAAGCAAACTACGCCGCGGACATTGGGTAATTCAAGCCAAAATTGACTTACATGGCTTAATTAGCGATGAAGCAAGGCTCTATGTTTCTACCTTTATCAGCGATTGCAAAAAACGCGGCATCCGCTGCGTGCGCATCGTGCATGGCAAAGGCTTAGGCTCTCGCAACCGCGAACCTGTGCTAAAACACAAACTGCGCGGCTGGCTAATGCAAAAAGATGAAGTCATTGCCTACGCCGAAGCTAAAAAACAAGATGGCGGCAGCGGCGCAGTGATTGTGCTTCTAAAAGCTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_014207|1752146:1760063|1752146_1753427_-|WP_013148260.1|tRNA|DBSCAN-SWA MLDIQALRTDLDGVVSQLKARGFEFDSASFTTLENERKTVQTRTQELQAKRNNTSKQIGIAKSKGEDVSAIMAEVAGFGDQLKADEARLIELQASLQNLLLNVPNLPHSSVPSGKSEADNIEVRKVGTPRTFDFEVKDHADVGTPLGLDFDTGTKLSGTRFTLMRGQIAKMHRALAQFMLNTQTEQHGYEECYTPYLVNAETLTGTGQLPKFEEDLFSLQHNDSKLYLIPTSEVTLTNTVRDEIVPLESLPIKLTAHTPCFRSEAGSYGRDTKGMIRQHQFDKVEMVQIVHPDTSYAALEEMVGHAENILKALGLPYRVVSLCTGDMGFGAAKTYDLEVWLPAQNTYREISSVSNCEAFQARRLQARFRNENGKPELVHTLNGSGLAVGRTLVAVLENYQNADGSVTVPEVLRPYMNGLEKLTISK >NC_014207|1752146:1760063|1757990_1758455_+|WP_013148264.1|DBSCAN-SWA MDIGIKEKDRKAIAKGLSHLLADTYTLYLKTHYFHWNVTGPMFNTLHLMFEAQYTELALAVDLVAERIRALDVYAPGTYRDFAKLSSIKESESVPKAQDMIAELVAGHEAVCRTARSVFPAADAASDEATKDLLTQRLQLHEKTGWMLRSLLEK >NC_014207|1752146:1760063|1753451_1754786_-|WP_013148261.1|DBSCAN-SWA MTNLFTPNQPEAPLAERLRPKTLDEVVGQSHLLAANKPLRLAFQSGKLPSMILWGPPGVGKTTLARLIANTAEADFIPISAVLSGIKDIREAVERAELILQQHGRKTILFVDEVHRFNKGQQDAFLPFVESGLITFIGATTENPSFEVNSALLSRAQVFVLNALSEAELSLLLDRAQQLVAENVKLADDVREQVLAYADGDARRLLNFVEGLFNAAEGAGVTEIDEAFLQTTMASKLRRFDKGGEAFYDQISALHKSVRGSNPDAALYWFLRMIDGGADPLYLGRRIVRMAIEDIGLADPRAQGMAIEACQIYERLGSPEGELALSNVVIYLAVAPKSNAAYNAYNQAKAFVAQDKSRPVPLHLRNAPTKLMKALDYGKEYRYAHHEPEAYAAGVDYFPDDLHDKNTVPQFYMPTPRGLEGKITEKLAHLRDLDKRELAKKAKK >NC_014207|1752146:1760063|1758508_1759453_+|WP_013148265.1|DBSCAN-SWA MATRHVKLLILGSGPAGYSAAVYAARANLKPVLITGIAQGGQLMTTTEVDNWPADADGVQGPELMERFQKHAERFNTEMIFDHIHTTHLTEKPIRLVGDSGEYTCDALIIATGASAKYLGLPSEEAFSGKGVSACATCDGFFYRNQEVAVIGGGNTAVEEALYLANIASKVTLVHRRDKFKAEAILVDKLMARVAEGKIVLETFNTLDEVLGDNTGVTGMRIKNVNDGTTKDIALQGVFIAIGHKPNTDIFEGQLDMEGGYIITQMGRGGNATATSVPGVFAAGDVQDHIYRQAVTSAGSGCMAALDAERYLDK >NC_014207|1752146:1760063|1754897_1755515_-|WP_013148262.1|DBSCAN-SWA MNKLKAALLSCLLILPLAANADGVSSLKKFYDETHAVKADFHQIVTDKQGQKIQEVYGEMQLKRPNKFRWDYHKPFEQQIISDGKQVWLYDTELAQVSVRELSKALGSSPAALLAGDDSLDKNFKLVNAFRKDGLDWVSTNPKDSDTGFNKISLAFKNDVLQEMDMIDSFGHQTKILFSNVVHNPVIEPKSFLFKPPPGVDVVGE >NC_014207|1752146:1760063|1755545_1757861_-|WP_013148263.1|DBSCAN-SWA MFFKKSTPVNARREAEVSQSHVIGTTLIKEAWWLILVLAGLFITVILFTYHREDPSWFNLSTNNTLIHNAGGYVGAKISALLLFLFGLSAWWWAILAFYAMWLVYLKLEAVNQSERPFLLFNFIGFALLLVASCALEAGHIVNLPAMLPDARGGMLGTALDTGLRSLFGYTGSSMLLLVMFVVGFSLFTGWSWIMITEKLGGAIISSYEYLKFKWQDRQDRQAGKVVEQERTEFVQTERKRVEAREPVFIEPPVLEVAKSERVQKEKQAPLFDSMPDSALPPLHLLDDPSGMVELPSAETLDFTSRLIERKLMDFGIEVKVLTAQPGPVITRFELEPAAGVKGSQVTNLIKDLARALSVVSVRLVETIPGKTCMGLEIPNPKRQIVYLSEIMGSQAYADVKSPLAISLGKDISGKPVVADLAKMPHVLVAGTTGSGKSVAINALILSWLYKADASQVRMILIDPKMLELSVYEGIPHLLAPVVTDMRQAANALNWCVAEMERRYKLMSSLGVRNLAGYNQKIRDAEKTGEKIPHPFSLTPDDPEPLMEMPLIVVVIDELADLMMVVGKKVEELIARLAQKARASGIHLVLATQRPSVDVITGLIKANVPTRISFQVSSKIDSRTILDQMGAEALLGQGDMLYMPPGTGYPVRIHGAFVSDQEVHKVVNYLKAQGEPNYIEGILSNEAEEGGADFADSGSSSSGGSEVDPLYDEAVGIVLKTRRASISGVQRQLRIGYNRAARLIEDMERAGLVSAMQSNGNREVLVPHHDS >NC_014207|1752146:1760063|1759427_1760063_+|WP_013148266.1|DBSCAN-SWA MLNDTSTNKLLSAKKRLKQAEAAQKLAEQNAAKEIREKIADEASVFRDAVKDVKPFTAPPKDEYKLKPKPIPLQFIRDEQQALVDSLSDHYIPAHEIETGEELLYLRDGHSPDILSKLRRGHWVIQAKIDLHGLISDEARLYVSTFISDCKKRGIRCVRIVHGKGLGSRNREPVLKHKLRGWLMQKDEVIAYAEAKKQDGGSGAVIVLLKA |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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| DBSCAN-SWA_2 |
2031876 : 2085395
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_014207|2031876:2085395|DBSCAN-SWA ACTATTGCAATTCTGATGTAACAAATTTAACTTCATCACGCATAATGTCTAACTGATCACTCCACCATTGCGCCAATTGTCTGCGCTCTTTATCGTAGGTAGCTTCATTGTAAATTTCCCTTATTTTGTCTTTATCACTATGTGATAGAAATGACTCAATTACATCATTCCTAAACAATCCGCTTTCATTTGCCTGCGTACTAAAAAAATGTCGGCATCCATGGGGGACTGTATGATAATCAGTAAAAGTTAACCTAAAAGCTTTACGAATTGATGCCTCAGAAACAGGCCTATCGACAAATCTAGCTGCAAATAAATATTCGCTATGCCCAGTGTATGCCTGCAATTCTTTTATTGCCAATATAGCCTGTTTTGATAGCATGATGGTATGAGGCTTCTTCATGTACTTACGACTTTTAGATTTTTCTAACGGTAGTGTCCATATTGCTTTATCTAAATCGAACTCTACCCATTTTGAACATCTTAGTTCACTTGGTCTTTGTGCAAAATGCAATTGCAAGTAAACACATGTTGCAACTTCAAAGCTCCCACCATATTCAAAAAGGTTACGTAAAAACTTGCCAGCATCCTGCTTACTTTCTAGATGCGGATATTTTTCACTGACATGCTTTTCTAATCGTTCGTCTTTTAATGGAATTGGATTCTCTGCAATAAGCTTGTCACTCAAAGCAAAGTCAAACACTGACTTAATCCAGCCACGTGTTTTTTCCATAAATTCTAATGCTCCTCGATTTTGCATTATCAGTAAGCATTTGCGTACTAGCAAATTGTCAATATCTTTAATTGGGTATTTACCGATAACGCCATAAACATTAGCGTTGAACGTTTGCTTAATTTTTAGGAGTGTAGAAGGTGCAAGCGTGCGTTGCTTGATGACTAGCCAGTCCTCAGCTACTTTTTGAAATGTATTATCAGCATCTTTAGATTTTCGCTGCTTAGCTAGCTTACCCTCAAGTATTGGATCAATATGCTCAACTTTTACTTGTTTACGTTTATCGCGTGATTGGTCTCGTGCTTCACTTAATGATAACGCAGGATAGGTACCCAATTGGATTAACTTACGTTTATTGTGTAACGTAGTACGCAATTGAAAATATTTACTACCATTAGGGTGCACTAATAAAAATAAGCCGTTGCCATCACGAAGTGTATATTGTTTCGCCTTGGGCTTTGCCGCTTTAATTGTTAGATCATCTAGTAAATCAGAATTCAACTTTGCCATGAAAGGTATAAATAATTATTACGATTAGTTTTTATACCTTCTTTTATACCAATTGTAAAGCGACATTGTGAGACACAGAGATGCATTGTGAGGTGAATGAGAAATATAACTTATTGAATTTATTGCTATTTAATACGAAGTGATACATCCTGAAACTATCTGCTGGTGCCGACGGAGAGACTCGAACTCTCACGACTATTCGTCACAACCACCTCAAGGTTGCGTGTCTACCAATTCCACCACGACGGCAATTTTCTGAGACCAAGCTCAGAACGTTTAACTATTTCGGTATATCTTGTGCTGGCGCTACAGGCGGCGTAACAGCATCAGCCTTTGCTGCCGGGGCAGTTGTATTCACAACGGCACTTTTCTCAGCCAAAGCTTTAACCACACTACCGTCACCCTCTTTATGGCTAGACATATAGGCTAGCGTTAAGCTTGTAGTGAAGAATATCAACACAAAAACAGCAGTTGCGCGACTCATAAAGTTAGCTGAGCCAGATACACCAAATAAGCTGCCAGATGCGCCGCTACCAAATGAAGCGCCCATATCTGCACCTTTGCCGTGCTGCAAAAGGACTAAGGCAATTACGCCAAGTGCTGCAATTACATGAATTACTAATACTAATTTTTCCATTTTCCACCTAATACTATTTAATTTTTACGACCAGTACCGAAGAACATCCTGCAGCAATCTACTCTGCCTTTTTCAGGCCGCAGCGCAACATATTCGTTCAAATTCTTGTGCATTTAATGAGCACTTACCGATAAGACCACCGTCTATATCTTGCATAGCGAATAATTGTACCGCATTTTGCGGGTTTACGCTGCCCCCATAGAGGATTTTCATGCTTGTTGCGGCCGTTTTATCCAGCACAGCAACCTTACCGCGAATAAATTCGTGCATGCTTTGCGCTTGGTCAGAGCTTGCGGCTAAACCTGTGCCAATCGCCCAAATTGGTTCATATGAAACCACCGAATTAGCAAATACGGCTGCGCCATATGTATTGATAATGGTATCTAATTGTTTGCCTACCACCATTTGCATGACGCCTGCTTCGCGCTCAATCAAGGTTTCACCTACACACAGAATAGGAATTAAACCATGTGCTTGCGCTTGCACGAATTTAGTGGCGATATTTTCATCTGATTCACAATAGGCTGTTGCACGTTCCGAATGACCAATAATCACATAACTTGCACCAAAGTCTTTAATCATTGCGGCACTCACTTCACCTGTGTGCGCACCTACTGCATCTTTACTTAGGTTTTGCGCACCCCAAGCGATATTGGTATTTTGCAGCATGGATTGCGCTTGAGCTAAATAAGGATATGGCACACAAACGACAACATCGGTATTTTTTAGGGAGGATAGCTGATCAATATAAGCTTGAAATAACAGCTTATTTTCTGCCAGATTGCCATGCATTTTCCAATTGGCAACGACTAATTTTTTACCCATGCTAACCTTAGTTGATATTGACAGGCGTGATTTTACATTTTTAATTGTGGATAGTCATCGTTTAACGACAATAGGTTTAACTAGGTAGTATATGAACTTAGCTGATTAATGATATTGCGCGCCTCAATCGCCACCTCTGATGCAGAAAGCCCTGCAGGGCCCATACCTTTTGCAACCAGAGCATCAGCTGCCGCACCGTGTACAAAAACACCAAGTTTAGCGGCGTCTAGACCGCTTAAACCCTGCGCTAAAAGACTACCAATAATGCCACTAAGTACATCACCGGTACCTCCACTAGCCAGGCCAACATTACCTGTAGTATTAATAAAATAATTGCCATCATCGTGCGCAACCAAGGTTTTGGCGCCTTTAAGCACACAAGTGACATGCAAGTTATGAGCTAAGGTAAGTGCGCTTTCAGTTCGGTTTTGCTGAATGTCTTCAGTAGTGATTTTTAGCAATCTAGCGGCCTCTCCTGCGTGAGGTGTAATGACGGTGTCAGCGCAACGATTTTTGCAAATTGCAGTTAAGTGTGGGTGCTTGGCAATTAAATTAAGTGCATCTGCATCTATCAACATCTTTAAATCTTGACTCAACCAGAATTCCAGCAACTCAATTGCTGCTTGCGATTGACCAAGACCGGGGCCAATCACAACACAGTCCAATTGCGCTAAATTGGTTAAGTCAGTAGGTTTACGAAACATGATTTCTGGGTGCAATATATCCACACTAGGCGTGTTGTTTGATAAACAAGCTGCATACACACGCCCCGCACCGCTCAATAAGGCAGCTCTTGCTGACAAAAGCACAGCGCCGACCATGCCAGTGTCACCACCAACAATCGCCAGACTGCCAAATGTGCCTTTATGCGCATCAGCATGACGTGCTGGCAAAGCGCTTACAAGCATACTTTGTATTAACAAATGCGGGTTAGATTGTATTGTTTTGATAATATGAATTCCTACAGTTTACGATAAATCCATAACTCTACTTGGTGGCCAAAAGTAAAACTAACTAACTTATTGAGCTTTCATTAGCAGTAAGCTTGTAAATGCGTAAGCTATTATAGTCATAAACTTAGCCATAAAATTTACTCAATCTGTATTGAAGATATTTTATACGACTACAAGTACCTAAGACAAAACTAGAGCCGTATAACTTAAGAGGCAGGAGTATTTTATGATGAATGTACTTTATATTGTTTGGAAACCAGATGATGATATAGGAGTTCCCATTATTGATGAACAACATCACGCGATTGTTGCCACCATTAACTCACTCTACTATTTCATCCAAGAGGGCTGGGGGCTTTCTGCACTTGCGCCGACTCTTAATATTATTAAAAGTTACTCTAGCTTTCACTTTAAAACTGAAGAAGGAATATTGGCCAAAGCTGGATATCCAGAGCTACATAAGCACATTATGGCTCAAAAGCAATTCATAAAAGATGTAGATGCTGCCGCCCAAGAAGCTATCGATTATAAAGATCCTTTTATACTGCTTAAGTTTTTAAAAAATTGGTGGGTCTCTCATTTGAAGAAAGAGCATCTCGAATATGCCGTTAATCTTGATAAGTTAAAAGAAAAAAGCGACGATTAATTAGTCTCGCACTACTACATAACGCAAATTCAACTGCACTTTTTGTGTACCGTTATAACTATTGGTTTGCAACTGATAGGCGGCTTGAATCTCGTCTGGTAAAAACTCGGCGTGATTAAAGTAAATCGCATCGATGACGCTTGCATCTTTTTTCAGGCTAAGTTTAAGGTGTTTTTCTCCCAATAAGCGCTGATTCAGCACTTCAAATTCATCATAAAACAACGGTGGAGCAAACCCCTGTCCCCACACTTGGTTTTCCAGCGCTTGTGCGGTTGCGAAGGTCATTTCGCTTTTACTCAAATTACCATCCACCTCTAGCACTGATTCCAAATCGGCTTCAGTAATCAAGCTTTTCACTACAGCTTCAAAGCTTTGGTTGAACAATTCAAAATCAGCCTGTTTAATAGTGAGGCCTGCCGCCATGGCATGGCCGCCAAACTTTAAAATTAAATCCGGTTGATGTTTGCTGAGCAAATCAAGCGCATCGCGTAAATGCAAACTAGCAATAGATCGACCCGACCCTTTAAGCAAGCCATCGCCAGCATTAGCGAAGGCAATCACAGGGCGATGATAGCGCTCTTTAATGCGCGATGCCAAAATACCAATGACACCTTGGTGCCAATCTTCCTGATAAATGCTGATGGCAAATTGATTATCGATATTAATCTCTTCCAACGATAGGCTTGCGCCATCTTG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_014207|2031876:2085395|2072857_2073787_-|WP_041360032.1|DBSCAN-SWA MKHASKFVSKIFLCLTATIFLIDEAFASSCAGHGIELQVLGSGGPEMQDKRASSSYLIWQDGMARVLIDSGGGSALRFGESGANMTDLYVVLFTHLHVDHTADFPALIKSSYFEDRSKPLPVYGPTGNTLFPSTTEFIQDLFGTKGAYRYLNDFLTTSQSSYVIQAHNVEFKNQRIKEVFNQSGVIATATDVVHGSVPALAWRVDIGGKSIVFSGDTNGGNGNLQLLAKDADILVAHNAVPEGASGVERKLHMPPSVIGQIAVEANIKQLVLSHRMLRTLGKEPQTLEVISHSFNGKTMFANDLDCFTP >NC_014207|2031876:2085395|2034660_2035488_-|WP_049769966.1|DBSCAN-SWA MLVSALPARHADAHKGTFGSLAIVGGDTGMVGAVLLSARAALLSGAGRVYAACLSNNTPSVDILHPEIMFRKPTDLTNLAQLDCVVIGPGLGQSQAAIELLEFWLSQDLKMLIDADALNLIAKHPHLTAICKNRCADTVITPHAGEAARLLKITTEDIQQNRTESALTLAHNLHVTCVLKGAKTLVAHDDGNYFINTTGNVGLASGGTGDVLSGIIGSLLAQGLSGLDAAKLGVFVHGAAADALVAKGMGPAGLSASEVAIEARNIINQLSSYTT >NC_014207|2031876:2085395|2054694_2055366_-|WP_013148512.1|DBSCAN-SWA 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54 | Enterobacteria_phage(25.0%) | transposase,integrase | attL 2063522:2063537|attR 2089734:2089749 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
2738202 : 2745749
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_014207|2738202:2745749|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_014207|2738202:2745749|2738202_2738928_+|WP_013146724.1|DBSCAN-SWA MQRHECIALLAELKLGAMAEAWDEIVTDGIARKRSTPDIIGRLLQTELTDRQRRSVQYRITQAKFPQHKSLTTFKFEQSPVHQPSIELLLDGDYIKQKRNIIFVGGPGTGKTHLASAIGVDAATKGARVRFYNVLDLVNQLELDKDQQKHKLAQQLAKYDLVILDELGYLPFSQKGGALLFHLISQLHEQTSIIITTNLAFSEWGKLFADEKMTSALLDRLVHHCDIVETGNDSYRFKNRS >NC_014207|2738202:2745749|2743531_2743975_-|WP_013149158.1|DBSCAN-SWA MSLKLQITEDMKTAMRAKDSARLGAIRLLQAAIKQREVDERIELSDADVITAIEKMLKQRRDSIAAYESANRTDLADVEKYEVSVLQEYLPQQLTEAEILSILDQVVSDTGAAGVKDMGKVMAAIKPLVAGKADMGKISGLIKTRLA >NC_014207|2738202:2745749|2738924_2739311_-|WP_013149155.1|DBSCAN-SWA MATIVKTESGTWKALVRKTGWPTTSKTFRTKRDAEDWSRRTEDEMVRGLFIKRTPSEKMSVKEALERYEREVIPTKSTATQEREQSRLKLLKSQFGNYSLAALTADIVAECQCLFRSAPQFACKSAPV >NC_014207|2738202:2745749|2741648_2743385_-|WP_013149157.1|DBSCAN-SWA MIPESFIQELLNRVDIVDVIDKSTPLKKAGANYSACCPFHNEKSPSFTVSPTKQFYHCFGCGAHGTAVGFLMEYQGLSFVEAINDLARMVGMIVPQEARDANKPEHKVVLGLQESLQQAAQYYKAELKKSPRAIEYLKARGLSGQVAAKFQVGYAPAGWQNLQSVFPNYDNEALSVAGLVVENDQGRRYDRFRDRIMFPIHDQKGQVIGFGGRVINPEDTPKYYNSPETPLFQKGHELYGLFLARRAIRDAGRALVVEGYMDVVALAQYGIEYAVAALGTATTPFHITKLMRQTDEVVFCFDGDNAGLTAAWRAAMNALPALTDGLKLSFLFLPKAHDPDSYVREFGKEQFEAEIKTAMPLSQYILKHLSEDNPLQSQEDKVRFLNEAEPIMQQINAPRSAMYLRKKVAELAQLSIDEMQSLLKLPNLNKAPAQARPKLTRTTNSLHHHFCLTMIMQPALVDKDDLLWIAGSSDDELLLRQTIETCLMHPHSKPVVIMRELESKVDANIITELKKELNVLDETLDLAQAMSGARQQLKQLYLQKNETALLAQVSEKPLSALTDDERNLLKSLGSKVKK >NC_014207|2738202:2745749|2739549_2741487_-|WP_013149156.1|DBSCAN-SWA MARPKKSDQLAEKNKMEFVSPELQEASAEERRSRLKSLIVLGKERGYLTYAEINDHLPDDVQNSEQIDGIIGMINDMGIQVYEEAPDAEVLLMSDAPPAVTDEDAVEEAEQALATVDSDFGRTTDPVRMYMREMGTVDLLTRESEIEIARRIEDGLKHMVQAIAACPTTIAALLALVDKVENDELSVDDLVDGLIDSDVGAVADVVIEAAEDEDEVDEDIDEGEDEDGAKAAAISAEALAKLKEEVVNRFTVVRAANKKMTEILPLRGSQDPQYQALLSEILVELTAFRFSPKQVEGLCDQVRDLVETIRSHERKVLDFCVEKSGMPRLHFIKSFPGNESNLGWLAEELKADKPYIEKLIRYNHSILDQQQRLIDLEKNVGIPIKELKEINKQMTTGEARARRAKREMIEANLRLVISIAKKYTNRGLQFLDLIQEGNIGLMKAVDKFEYRRGFKFSTYATWWIRQAITRSIADQARTIRIPVHMIETINKMNRISRQILQETGVEPDPALLAEKMEMPEDKIRKILKISKEPISMETPIGDDEDSHLGDFIEDGQTLAPVDAAIYASLRDATSEVLESLTPREAKVLRMRFGIEMNTDHTLEEVGKQFDVTRERIRQIEAKALRKLRHPTRSERLRSFLETGQD >NC_014207|2738202:2745749|2744295_2744508_-|WP_013149160.1|DBSCAN-SWA MSSVRVKENEPFDVALRRFKRLIEKTGLLNDLRAREFYEKPTWERKRKAAAAVKRQYRRLLKQTLPAKLY >NC_014207|2738202:2745749|2743982_2744288_-|WP_013149159.1|DBSCAN-SWA MADTNNAPAAPDEAFWSLTDKFIGFANEQAASNDVGVVNASFLFASARFNTFLIATQCGTKESFEAEKAAALEYFVNQYKIALTEHMADYQAKFDTYIKSA >NC_014207|2738202:2745749|2744720_2745749_+|WP_013149161.1|tRNA|DBSCAN-SWA MIVLGVESSCDETGLALYDTEQGLLAHALHSQVEMHAEYGGVVPELASRDHIRRVLPLTENVLKTANKTLQDIDAIAYTQGPGLSGALLVGTSFAESLAFSLQVPTINVHHLEGHLLAPLLEANPPAFPFVALLVSGGHSQLMRVDGIGEYELLGDTLDDAAGEAFDKTAKLLGLGYPGGPALSKLAQSGKARFKLPRPLLNSGDLNFSFSGLKTAVLTLVNQHQPLDATTTADIAWEFQEAVTEILTLKCMTALRETGLDNLVVSGGVGANSKLREKLNAATKRKLCKVSYPRLEFCTDNGAMIAFAGAMRLKAMHGNGNRNYGFSVRPRWDLAELQKPAI |
8 | Enterobacteria_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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