Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_014109 | Candidatus Riesia pediculicola USDA, complete genome | 0 crisprs | DEDDh | 0 | 0 | 2 | 0 |
NC_013962 | Candidatus Riesia pediculicola USDA plasmid pPAN, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
55971 : 66588
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_014109|55971:66588|DBSCAN-SWA ATCATTGAATATCACATAAGTTTTTCCCAATTTTTACATTCACTTTTAAAGGAACAGATAACTTTATTACGTTTTCCATCATTTCTTTTATGGATCTTGAGTATTTCGAAGAAAGCGTATCTTTTATTTCGAAAATTAGTTCATCATGAATTTGAAGCAACATTCTGACATGTTTTGAATGATTCTCAATCCAATCATCTATTTTAATCATTGCCATCTTAACAATATCTGCGGAAGTTCCTTGAATAAAAGCGTTTACTGCTTCTTTTAAAATGTTTCTTTTCGAGAAAGATTTATCTTTTCTCTGAAAGTAAATTTTTCTCCCATTTAATGTATCAATGTATCCATATAACTTTACAAATTGTTTGATTTTTTTGATAAGAAGGAGTGCAGAAGGATATTTTTTAAAATAAAGGTTCATATAATCTTTAGCTTTTTCCAAACTAATTCCTAATCTATTTGATAGACCCATTGGGGTTATTCCATAAATTAGTCCAAAATTAACCATTTTTGCAATTCTTCTATGAACAGTTGAGATTTTATCTTTTTTTATTTCAAAAATTTCCTGAGCTGTTATTATATGAACATCTTGATCTTTTTTAAAAAGTCGAATTAAATTTTCATCTTTAGAACAGTGAGCTAATACTCTTAATTCAATTTGAGAATAGTCCAAAGAAACAATCTGAAAACCATCACTAGCTGTAAAAAATCTTCTAATTTCGCGTCCTTCTTTATTTTTGATGGGAATATTTTGCAAATTAGGATTTCTTGAAGATAATCTTCCTGTACTAACGACAGATTGAAAATAAGAAGTATGCACCCGATTGGTTTTCTTGTTGATCATTTTAAAGATTTTTTCACAATAATTTTTCCTCAATTTATATAAACTACGATACTTTAAAATTAAAGATGGTAATGAATGAAAACAAGACAATTTCTTTAAAATTTCTTCATTAATACAAGCAGAATGATCCTTATTTCTTTTGAGTATTGGAAGTTCCATCTCTTCGAATAATAATTTTCTAATTTGAAAGATAGACGTTAAGTCCATATTTTTTTTAGTTATTTGAAAAACTTGATCTTTTATTTTCGATAATTTTCTTTTCGAACGAAAAGAAAATTTCAGCAATCTTTCTAAATCTATCAGAACTCCATTTTTTTCCATTTTCGCTAAAATTGGAGCTAATGGAATCTCGATTTCTTGAAAAATATTTAAAAGTTTTTGATCTCTTTTTAGATTGCTCCAGAAAATATCGTATAGAGATAGCATGACTTTTGCTATCACTGAAGAGTAAATAGATGCCTCTTCTATTTTCATTTTCTTAAGATCAATTTGATTTTTATTTGTATCAATTTTATCTAGGATGGAATCGTTTTGTATAACATCGTATCTCTTTGTAAGACTCTTCAAATCGTGTTTATATGAACCTGATATATTGTCAGAAACATATGACGCTAATTCAATATCAAAAAAATTATTTTTCAGATCTATGCCGTAATTTGACATGATTAAATAGTCCAATTTCAGATTTTTAGTAATTTTTCGAATATTTTTGTCTAAAAAAATCAGTTGAATTTTAGAAAGTACATCTTTCATACATAATTGATTGGGAACATCTGGATAATTATGACCTAATGGAAAATAAATTGATTCGGATCCGTTGAAAAGATTGATTCCTACTATCTCAAAAGGTATTTCTTCGAAGTTTGTAATAATTACAAATGATACTCTTTTATTTAATTGAAACCTTTTAATCCATTCGATTAATTTTTCTTTATCCAAAATGATTTTTCTTAAGAAATTAAACTGTTTCATACTTTGTAAAGAAATGATTTTAATTTTCAATTGAATGATTTTTTTTCTCAAAAAATAAATTTAATACAGATCTTGTTTTCGTTTCGTATAGAAACCAATTTCTCTCTCTCTCATGAGAGAGCCATTTTTTGAATCCATAATCAAGAAATAAACTCTTTAAAAAAACTGAATTTGGAGTATTTACAGATAAACATTTGTAATAAGGATCTAAATCTAAGTTAGTAACGATAGTTGCTAATTGATAAGAGAGTTCGGCGATATCTTGATTTTTTTTTATAATTTCTTTAATTTTTTCCGGATTTCTCGTAATCAAACAATTGATTTTCGATAAATTTCGATATATATCCTTCACAGATCCTAGTCTGTTTAATAGATTTATGGCTATCTTTTTTCCAATTCCAGGAATTCCTGGAATATTATCAGATCGATCTCCTGCAAGAGCAAAAAAGTCCGCTATCAAGTTTGGATGAACTCCATATTTATCAAATATTTCTCTCGGTCCAAGAATATTTTGAAACGGATCTATTAAAAAAACGTTCTTTTTTACAAGTTGTGCTAAATCTTTATCTCCAGTGCTTATCAGAACTGTCAGATTTTCTCTATGAAGAATAGAACGACAAACCAAAGATCCTATCGTATCATCTCCTTCTACTGTAGGAATGGTTAATGTAGGAATACCCATGAACTGAATTATCAGTTTTAATGGGTCAATTTGTACAACCAAATCGCTAGGTATCTTTGGTCTATTTCCTTTATACAAATTAAACAATTTTTTTCTAAAATTTCTTTTCTTAGAATCAAATACTACTATTACATAAGCTGGTTGATGACGAAATATCAGCATTCTTAATGTTTTTATAAATCCATATATAGCATTGGATCTAAATGAATTCTTCTTAATTAAAAAAGAAAAAGCATAATACGAACGATATAGATGAAAAGATCCATCAACTATTAATAGAGACTCTCTTTTAAAGTTTTTCATTTTTCAAGAATCTACAAAAAGATTTATAAGAAAAATTTTCGATGATTATTTTTTAAAAAATACAATTTCTTATGAACTGCGCTGAAATTAAAAACAAATCCATAAAACTCTATACCCTTCCATTTATAAAAGTGATAGATTCTAGCAACCATTGTCTAAAGAATTCAAAATTATAACACTGATGTATAACTGATTCGATAATGACGGATTTGTTTAAGTATTTTAGATGTAAATAATTTAAAATATCATCTATTTAATTTTTATAAAAAATTTACTTTTCAACATCTCTTGATTTGAATGTTGGAAAACTTTTAACTTTCTCAACGGAAAGTCAAAAGAAAAGTCTCTCCTATAAACATTCTCATTTTTAATTAGTTCAAATTAAAACTGAGTATAATCATAAATTAATGATGAATGCTCTTTCATTTAAGAATTTACTTTTAACAGATTTCTATAACAATATTATTCACTGGGCGACAAATGCAAGTTAATATTTCTTTAGACTTCAATAAAGCGATAGGACGATAAAAATAGGAAATATCTCCTTTTTTTAGATAGACTTTACATAATCCACAAAATCCTAATTGACATTGATACCCAATGGGAATCTGGTTGTTTTGTAAAACTTCCAAAATATTTCTATGAAATTTACGATCGAAAAATATCTCTCTTTTTTTGAGAAAAATTTTAAAAGATTTCATAACTAAAGCTCAAAATTACTCAATTTATTCAAATCTACCTTTGTATCTACTTGTCCTACTAGATAAGAACTAACTTCAGTTTCTTGAGGAGCGGATTGTATATTATCTGAAGATAACCATGCATTAATCCATGGAATTGGATTGATTTTCTTGATTAAATCTTTTTTTAAACCTATAGCTCTCATTCTAACTTCAGTAATATAATCTATATATTCTTTCAAAATTTTTTTGTTTAATCCAATTAAATTTCCGTTTGAAAAGAGATAATCTGCCCATCTTTTTTCTTGATCCGAAACATTTAGAAATATTTTTTGACAAATCATAAGACATTCTTTTGAAATTTCAATCATCTCTTTATCTTCTTTTGAAGATTGCATGATGTTGATCATATGTTGAGTACCAGTAACATGAAGTGCTTCATCTCTGGCAATCAATTTGATAATTTTTGCATTTCCTTCCATTAATTCTTTTTCTGCAAAAGCGAAAGAACATGCAAAACTTACGTAAAATCGAATCGATTCTAATGCATTTACGCTGATCAAACATAAATATAAAGATTTCTTCAATTCTCTTAAAGAAACAGTGACTTTTTTTTCATGTATTTTATGTATACCTTCTCCAAAAGTTTGATATAAACGAATTAATTGAATCAAATGATCATAATAAAAAGAAATATCTTTTGCTCTATCGATAATTTCTTGATTAGATACAATTTTATCAAAGATTAAAGATGGATCATCTATAATATTACGAATAATATATGTGTATGATCTAGAATGGATAGTTTCTGAAAATGACCAAGTTTCTATCCAGTTTTCCACTTCTGGCAAGGAAACGATCGGTAAAAAAGCACAATTAGGACTTCTTGATTGAATTGAATCTAAGAGAATTTGATACTGTAAGTTTCTAATGAATATCTTTTTTTCATAAAGTTTTAAAGATTGATAATCGATTCTATCTTTGGATATATCGATTTCTTCTGGTCTCCAAAAAAATGATAATTGCTTTTCTGTTAAAGTTTCAAAAATCGAATATTTTTGTTGATCGAACCTAGAAATATTAACATGATTACCAAAAAACATAGGTTCCTTCAGTGGATCATTACTTATTTTTGAAAAAACTGTATACATTTTTTACCTCTTTAAACTTTACAGGCATGACTACTACAACTTTCATCCATACTATTTTCTATAATACTCTCAGATTTTTCTTGTATTTTATCCGATCCATCCCGAGTATTGTGATAGTAAAGTGTTTTGATTCCATATTTATATGCCAATAATAAATCCTTTAAAAGATGATTCATTGGAATCTGATTTCTATCAAATTTAGAAGGATCGTAATTTGTATTAGCTGAAATGGATTGATCAACAAACTTTTGTATGATTCCAACTAATTGCAAATATCCTATATTATTTGGCATTTCCCATAAAAGCTCGTATTTTTTCTTAAGTCGATCATACTCAGGTACTATTTGACGAAGAATTCCATCTTTTGACACTTTTATGCTCATAAATCCTCTAGGAGGTTCTATTCCATTAGTAGCATTAGAAATTTGTGAGGATGTTTCAGAAGGCATAACAGCTGATAAAGTAGAGTTCCTTAAACCATACTTTTTAATTCTTTCTCTTAAAGATTTCCAGTCATAATGTAAAGGTTCAGAAGTTAGATGATCTAGAGATTTTTTGTAATTATCTATCGGCAAAATGCCTTTTGAATAATTGGTATGATGAAACCAAGAGCAAGCACCTTTCTCTTTTGCTAATTGATTCGAAGCTTTTAAAAGATAATATTGAATAGCTTCAAATGTTTTATGAGTTAAGTTGTTTGCACTGCTATCTGAATATTTTACGTGATTTTTAGCTAGATAATAAGCATAATTTATAACACCAATTCCTAGCGTTCGACGACTAATAGAACTTTTTTTGGCAGCCAATATTGGGTAATCTTGGTAATCTAATAATGCGTCTAGTGCTCTAACAATTAGATCAGAAAGGTCTTCTAATTCCTCTAGAGAACGAATTTCACCTAAATTGAAAGCAGAAAGAGTACATAATGCAATTTCTCCTTCCTGATCGTTAATATTATATAAAGGATGAGTTGGAAGAAGAACTTCTAGACATAAATTTGATTGTCGAATCGGAGCAATCTTTGAGTCAAATGGACTATGCGTGTTGCAATGATCAACATTTTGAATATATGTTCTTCCGGTAGAAGACCGTTCTTGCATCATTTTAGAAAACAGATCTACCGCTTTTACTCTCTTTTTACGAATATTCTGATCTAATTCATATTTTTTATAAAGGTTCTCAAATTTATCTTGATCTGAAAAAAAACAAGAATACAGGTCTGGAACGTCAGAAGGACTAAATAAAGTGATTTCTTCTCCTCTAATCAATCTCTCATACATTAGTTTATTAATTTGTACAGCATAATCTAGATGACGAACTCGATTACTCTCAACTCCTCTATTGTTCTTTAAGACCAATAGACTTTCAACTTCTAGATGCCAAATTGGATAGAATATGGTTGCTGCACCTCCACGAATTCCTCCTTGAGAACATGATTTTACAGCTGCTTGAAAATATTTATAAAATGGTATACATCCTGTGTGAAATGCTTCTCCTTGTCGAATAGGACTTCCAATTGCACGAATACGACCAGCATTGATTCCTATTCCTGCTCTTTGTGAAACATATTTCACAATAGAACTAGCCGTGGCATTTATTGAATCCAAACTATCATCACATTCTATTAAAACACAAGAACTAAATTGACGAGTTGGAGTTCTGATTCCTGCCATGATAGGTGTAGGAAGCGATATTTTAAATGTAGAGATTGCATCATAAAAACGTTTCACATAAATCAACCTAACGTCCTTAGGGTATATTGAAAAAAGACAAGCAGATACTAAAATATAAAGAAATTGAGCACTTTCATAAATTTTTCCTGTGACTCGATCTTTAACTAGATATTTTCCTTCCAATTGTTTAACTGCTGCATAACAAAAATTCATATCTCTTAAATGATTAATAAACTGATCCATTTTTTGAAATTCTTCTACGGAATAATCTTCTAGTAATCTATAATCATATTTTCCAATACTAACCATATTTTTTACATGTTGATATAATTTTGGAGGATTGAATTCTCCATATGCATCTTTTCTCAAATAAGAAATCGCTAACCTAGCAGAAAGATATTGATAATCTGGTATTTTGGTAGATATCAAATCTGCAGATGTTTTAATGATAATTTGATGAATTAGTTTAGTTTGAATTTTATTATAAAATTGAATACAAGAAAGATCTTGTATTTTAGAAATAGAAATTCCTTGTAACCCATCCGCAGATAAAGTGATTAACCTTTTTATTTTTTTAAGATCTATCTTTTCTAAATCTCCATTTCTTTTAGTAACCAAAAAATTATATTTCATGAGTTAAATCGATATTTCATAAATATTAGAACTATAAAAAGCTGATATTTTTATAGAAACAATAATGATTTAGCAAGAAATCGTCAGAAATGTAGTGCGAAAGAATATAACTGAGTTTTTTCATTGGAATTTTCGGAAATTTAATTTTTTAGAAAAAAACCAAATAAACTTATCTAGATAAATATAAAAAATTTAAAATCGAGAAAAGGATTAAAGAACCAATCGATGAATAATAAAAACTAATTTTGATACTTCTTATAAAGAAATTATTAAAACTAGGAAGAAACAGCATGAATCATATAATTGATGTCTAAATTATCTCTGAAATAAAATTTATTCAAAAAAAAATTATAGTTCAGACCAATTATGTGTTTCTCTTTCATTTTAGTTTGATCGATCCAGTCTAGTAATTCACAAGGTGAAATGAATTTTTGTACATTGTGGGTGTTTTTTGGGAAAATTTTTAGAATTTTCTCAGCAAAAAAAATCAAAAAAAACCAAGACTTTATGCTTCTATTAATCGTAGAAAATAATACATGTCCTCCTTTTTTTATTAACTTATTACAAGATAAAACTATACTTTTAGGATTTGGAACATGTTCTAACATTTCCATGCAAGTTATTATATCATATTTATTTCTATTCTTTTTTACATGTTGTTCTATAGTCTCTAATAGATAACTAATTTTCATTTTTTTTTTAGATGCTTGAAACTTGGCAATTTCCAACATTTTTTTTGACATATCGATTCCTGTTACAATTCCCCCTTTTTTGGTCATACTTTCTGATAAAATTCCTCCACCACATCCAACATCAAGTATTTTTTTGCCAAATAACCCATTACAACAATCCAAAATAAACTCTAGACGTAATGTGTTCATCTTATATAAAAAAAAATACATACCAGACTTTTTATAAAAGTCGAAATAAGATTTATCGAACTTTTTAATTTCATCGAAATCTACATTTTTTTTTTCAAAGCTCATTTCATTTTTTTTCAATATAAAATACTTTTCGCACTACAATTAAGTTAATTAATATTATAATATATTAACTACCTTATTTATATTTTATTCTGATAAAATAAAGAGAAGTTTATATAATTTCATTTTTAACGCAATAATTAACATAAGGCTATTTCTGTGAAAAATGTATCTAAAGAAGTATCATCAATCAGCATTGAAGAAGAATTGAAACGTTCTTACTTAGATTACGCTATGTCTGTGATTGTTGGAAGAGCTCTTCCTGACGTACGAGATGGGTTGAAACCAGTTCATAGAAGAGTTTTATATGCTATGAAGAAACTTGGAAATGATTATAACAGCCCATATAAAAAATCAGCGAGAATAGTTGGAGATGTTATTGGGAAGTATCATCCTCACGGAGATGGATCAGTTTATGATGCAATAGTTCGTTTAGCACAACCATTTTCTATGAGATATGCATTAATAGATGGACAGGGAAATTTTGGATCGATTGATGGAGATTCAGCTGCTGCAATGCGATATACAGAAATCAGAATGTCAAAAATAGCTCAAGAGATTCTAGAAGATCTTGAAAAAAATACGGTAGATTTTGTTCCAAATTACGACGGAAACGAAAAAATTCCGGATGTAATGCCTACTAAAATTCCGAATCTATTAATTAATGGATCATCTGGAATTGCAGTTGGAATGACTACAAACATTCCACCACATAACATTGTCGAAGTTATTGACGCTTGTCTTGCCTATATTAATGATAACGACATACAAACAGAAGAACTGGTAAAATATATTCGAGGACCAGACTTTCCAACGGCAGCAATTATATATGAAAAAAAAGAACAAATAGTACATGCGTATCGAACAGGAAAAGGGACAATTCAAGTTCGTGCACTTACTGAGATAGAAAACGATAAAAAAAATAATCGAACTTCTATAATAATAAGAGAAATTCCTTATCAAATTAACAAAATTAGATTAATTGAAAAAATTGTAGAACTGGTTAAAGAAAGAAAAATAGATGGAATTCATGAAGTCAGAGATGAGTCAGACAAAGATGGAATGAGGGTTGTTATAGAATTAAAGAGAGAATCAGAAGCAAATTTCGTATTAAACAGCTTATATGCTCTAACTCGACTGCAAACTTCGATTAATATAAATATGATAGCCCTTCTAAAGGGAAAGCCAACTCTTTTAAATTTAAAAAAAATTATTTCTTCTTTTATAGATTACAGAAAAGAAATAGTTATTAAAAGAACGATATTCGAACTAAACCAAGCCAAGAAAAGAGTTCTTTCGTTAGAAGCAATGATCATTTCATTAAAAAATATTGATTTTATCATCTCGTTAATCAAAGGAGCAAGTACTCCAAAAGAAGCCAGATTGCGTTTAACATCCTTCTGTTGGAAATTAGAAGAAACTTTAATTGAGCTTGATCGATTTTATTCAAAAAAGAAAGATTGGAAAAATTGTTTTGAAAATCATTTAGATCGTTTTCAAAAGAGTAACTATCGATTTAATGAAGAACAAGCACAAACGATACTAGATTTGAAACTTCAGAAATTAACTAATTTAGAGAAAGAAAAAGTATTTGAAGAGTATATTTCTCTAACAAAAGAAATAACGTCCTTAGTTCAAATACTTCAAAACTCGAATCGATTAATGGAAATTATTAAGAACGAGTTGATATACATCAAGAATCAATATCGAGATAAAAGAAGAACAAAAATTATTGAAGATAATAGTAAATTCAATCAAGAAGATCTTATTAAGAAAAAGAAAGTAATTGTAATTTTATCGAACCAAGGATATATTAAGTTTCAGTCAATTTCTGATTATGATATACAAAAAAGAGGAGGAAAAGGAAAATCTTCAACTCGATTGAAAGAAAAAGATTTTGTAAAATCTGTATTAGTAACTGATACTCACGAAAATATACTATGTGTTTCCAATTTTGGAAGAATTTTTTCAATCAAGGTTTATCAACTACCTGAATCTAGTAGATTTTCTTTAGGAAAACCGATTGTCAACTTCTTATCTCTAAAAGATGGAGAAAAAATTACTTCTATATTTTCATTGAAAAATTTCAAAAAAGGAAATTATATATTGATAGCTACTTTGATGGGACTAATTAAAAAAATTTCAATGGACTTTTTGACAAAAGCTCGAAAAAGCGGAATTATCATAATTAACTTAAATAAAAGGGATGAAGTAATTGCTATGGACTCAGTAAAAAAAAGAAGTGAAATTATTCTCTTTACTTCTTCTGCTAAAGCAATTCGATTCTCAGAAAACTCTGTTCGTCTTACAGGAAGAAAATCCATGGGCGTGATGGGTGTCAAGATTCAAAAAGATGAAAAATTAGTTTCCATGATAATTGTAGAAAAAGACAAAGATATCTTGACGATTACTGAAAATGGATATGGAAATCGAACTAAAGAATCTGAATATCTAAAAAAATCTCGTTTTATTCGTGGTGTTTCGGTTATTAAAAATGATGAAAGAAATGGAAAAATAGTAGGTGCCATACAAGTCGAAAGAAAAGATCAAGTTGTAATATTTACTAATTATGGAATCTTAATTAGAATTTTAGTAAAAGATATTAGTGTGTTTAAAAGAAATACTAAAGGAATTATTTTAATTCGAAAAATAAACGATCAAGTGGTTTCTGGAATTTATCGTGTGTCATCGATTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_014109|55971:66588|64044_66588_+|WP_155760503.1|DBSCAN-SWA MSVKNVSKEVSSISIEEELKRSYLDYAMSVIVGRALPDVRDGLKPVHRRVLYAMKKLGNDYNSPYKKSARIVGDVIGKYHPHGDGSVYDAIVRLAQPFSMRYALIDGQGNFGSIDGDSAAAMRYTEIRMSKIAQEILEDLEKNTVDFVPNYDGNEKIPDVMPTKIPNLLINGSSGIAVGMTTNIPPHNIVEVIDACLAYINDNDIQTEELVKYIRGPDFPTAAIIYEKKEQIVHAYRTGKGTIQVRALTEIENDKKNNRTSIIIREIPYQINKIRLIEKIVELVKERKIDGIHEVRDESDKDGMRVVIELKRESEANFVLNSLYALTRLQTSININMIALLKGKPTLLNLKKIISSFIDYRKEIVIKRTIFELNQAKKRVLSLEAMIISLKNIDFIISLIKGASTPKEARLRLTSFCWKLEETLIELDRFYSKKKDWKNCFENHLDRFQKSNYRFNEEQAQTILDLKLQKLTNLEKEKVFEEYISLTKEITSLVQILQNSNRLMEIIKNELIYIKNQYRDKRRTKIIEDNSKFNQEDLIKKKKVIVILSNQGYIKFQSISDYDIQKRGGKGKSSTRLKEKDFVKSVLVTDTHENILCVSNFGRIFSIKVYQLPESSRFSLGKPIVNFLSLKDGEKITSIFSLKNFKKGNYILIATLMGLIKKISMDFLTKARKSGIIIINLNKRDEVIAMDSVKKRSEIILFTSSAKAIRFSENSVRLTGRKSMGVMGVKIQKDEKLVSMIIVEKDKDILTITENGYGNRTKESEYLKKSRFIRGVSVIKNDERNGKIVGAIQVERKDQVVIFTNYGILIRILVKDISVFKRNTKGIILIRKINDQVVSGIYRVSSI >NC_014109|55971:66588|60613_62908_-|WP_013087455.1|DBSCAN-SWA MKYNFLVTKRNGDLEKIDLKKIKRLITLSADGLQGISISKIQDLSCIQFYNKIQTKLIHQIIIKTSADLISTKIPDYQYLSARLAISYLRKDAYGEFNPPKLYQHVKNMVSIGKYDYRLLEDYSVEEFQKMDQFINHLRDMNFCYAAVKQLEGKYLVKDRVTGKIYESAQFLYILVSACLFSIYPKDVRLIYVKRFYDAISTFKISLPTPIMAGIRTPTRQFSSCVLIECDDSLDSINATASSIVKYVSQRAGIGINAGRIRAIGSPIRQGEAFHTGCIPFYKYFQAAVKSCSQGGIRGGAATIFYPIWHLEVESLLVLKNNRGVESNRVRHLDYAVQINKLMYERLIRGEEITLFSPSDVPDLYSCFFSDQDKFENLYKKYELDQNIRKKRVKAVDLFSKMMQERSSTGRTYIQNVDHCNTHSPFDSKIAPIRQSNLCLEVLLPTHPLYNINDQEGEIALCTLSAFNLGEIRSLEELEDLSDLIVRALDALLDYQDYPILAAKKSSISRRTLGIGVINYAYYLAKNHVKYSDSSANNLTHKTFEAIQYYLLKASNQLAKEKGACSWFHHTNYSKGILPIDNYKKSLDHLTSEPLHYDWKSLRERIKKYGLRNSTLSAVMPSETSSQISNATNGIEPPRGFMSIKVSKDGILRQIVPEYDRLKKKYELLWEMPNNIGYLQLVGIIQKFVDQSISANTNYDPSKFDRNQIPMNHLLKDLLLAYKYGIKTLYYHNTRDGSDKIQEKSESIIENSMDESCSSHACKV >NC_014109|55971:66588|59474_60602_-|WP_013087408.1|DBSCAN-SWA MYTVFSKISNDPLKEPMFFGNHVNISRFDQQKYSIFETLTEKQLSFFWRPEEIDISKDRIDYQSLKLYEKKIFIRNLQYQILLDSIQSRSPNCAFLPIVSLPEVENWIETWSFSETIHSRSYTYIIRNIIDDPSLIFDKIVSNQEIIDRAKDISFYYDHLIQLIRLYQTFGEGIHKIHEKKVTVSLRELKKSLYLCLISVNALESIRFYVSFACSFAFAEKELMEGNAKIIKLIARDEALHVTGTQHMINIMQSSKEDKEMIEISKECLMICQKIFLNVSDQEKRWADYLFSNGNLIGLNKKILKEYIDYITEVRMRAIGLKKDLIKKINPIPWINAWLSSDNIQSAPQETEVSSYLVGQVDTKVDLNKLSNFEL >NC_014109|55971:66588|59211_59472_-|WP_013087559.1|DBSCAN-SWA MKSFKIFLKKREIFFDRKFHRNILEVLQNNQIPIGYQCQLGFCGLCKVYLKKGDISYFYRPIALLKSKEILTCICRPVNNIVIEIC >NC_014109|55971:66588|55971_57786_-|WP_155799151.1|DBSCAN-SWA MKQFNFLRKIILDKEKLIEWIKRFQLNKRVSFVIITNFEEIPFEIVGINLFNGSESIYFPLGHNYPDVPNQLCMKDVLSKIQLIFLDKNIRKITKNLKLDYLIMSNYGIDLKNNFFDIELASYVSDNISGSYKHDLKSLTKRYDVIQNDSILDKIDTNKNQIDLKKMKIEEASIYSSVIAKVMLSLYDIFWSNLKRDQKLLNIFQEIEIPLAPILAKMEKNGVLIDLERLLKFSFRSKRKLSKIKDQVFQITKKNMDLTSIFQIRKLLFEEMELPILKRNKDHSACINEEILKKLSCFHSLPSLILKYRSLYKLRKNYCEKIFKMINKKTNRVHTSYFQSVVSTGRLSSRNPNLQNIPIKNKEGREIRRFFTASDGFQIVSLDYSQIELRVLAHCSKDENLIRLFKKDQDVHIITAQEIFEIKKDKISTVHRRIAKMVNFGLIYGITPMGLSNRLGISLEKAKDYMNLYFKKYPSALLLIKKIKQFVKLYGYIDTLNGRKIYFQRKDKSFSKRNILKEAVNAFIQGTSADIVKMAMIKIDDWIENHSKHVRMLLQIHDELIFEIKDTLSSKYSRSIKEMMENVIKLSVPLKVNVKIGKNLCDIQ >NC_014109|55971:66588|63183_63894_-|WP_041855164.1|DBSCAN-SWA MSFEKKNVDFDEIKKFDKSYFDFYKKSGMYFFLYKMNTLRLEFILDCCNGLFGKKILDVGCGGGILSESMTKKGGIVTGIDMSKKMLEIAKFQASKKKMKISYLLETIEQHVKKNRNKYDIITCMEMLEHVPNPKSIVLSCNKLIKKGGHVLFSTINRSIKSWFFLIFFAEKILKIFPKNTHNVQKFISPCELLDWIDQTKMKEKHIIGLNYNFFLNKFYFRDNLDINYMIHAVSS >NC_014109|55971:66588|57805_58771_-|WP_049821628.1|DBSCAN-SWA MKNFKRESLLIVDGSFHLYRSYYAFSFLIKKNSFRSNAIYGFIKTLRMLIFRHQPAYVIVVFDSKKRNFRKKLFNLYKGNRPKIPSDLVVQIDPLKLIIQFMGIPTLTIPTVEGDDTIGSLVCRSILHRENLTVLISTGDKDLAQLVKKNVFLIDPFQNILGPREIFDKYGVHPNLIADFFALAGDRSDNIPGIPGIGKKIAINLLNRLGSVKDIYRNLSKINCLITRNPEKIKEIIKKNQDIAELSYQLATIVTNLDLDPYYKCLSVNTPNSVFLKSLFLDYGFKKWLSHERERNWFLYETKTRSVLNLFFEKKNHSIEN |
7 | Bacillus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_2 |
557232 : 572466
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_014109|557232:572466|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_014109|557232:572466|562661_564074_+|WP_013087404.1|DBSCAN-SWA MKFSIPNFEKNRILVIGDIILDNYWYGITEKISKEAPIPTVNIKSRLSKLGGAANVAVNASRLGARVFLIGLVGNDESSEIVRSELVRLKILFDLIVLPNYLTVTKFRIFSKNQQIARMDFEEKIKEKCSEYVSYILEKVKKRISFAQVIVLSDYGKGALYETSKIIDLARNYKIPVLVDPYGKNFEKYKESTMLTPNLDEFELVVGKCSNNSEMEKKGFEMIRSLSLESILITLSEKGILLLSNKEHKLYLPSFVRNVKNVTGAGDTMIATLAVAFSSSELSLDQSCFLSNIAASIVVEKENTSDVSIEELKRRFYERSCRFFGILREDQIKNTVNICKFLKEKIVMVVGYLDEIHLTYVRYLNRARNFGDRLIVAINIDTSIERLKLKNTFYSTENTMEILLQLKSVDWIIPFKEKSPENIVRKIKPDVFISTKICSSWIENIFRYVGEVKILNFKDNRFYDENVKIV >NC_014109|557232:572466|570426_570672_+|WP_013087413.1|DBSCAN-SWA MPIIKVKENEPFDLAFRRFKRSCEKAGVLAEVRRREFYEKPTTVRKREKASSIKRHAKKIARENSRRFRTFLNPNLLKKKR >NC_014109|557232:572466|565624_567037_-|WP_013087404.1|DBSCAN-SWA 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14 | Caulobacter_phage(20.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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