Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_014378 | Acetohalobium arabaticum DSM 5501, complete sequence | 1 crisprs | cas14k,csa3,WYL,cas10d,csc2gr7,csc1gr5,cas3,cas4,cas1,cas2,cas6,Cas9_archaeal,RT,cas14j,DinG,DEDDh | 0 | 2 | 4 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_014378_1 | 892812-893359 | TypeV,TypeI-D |
NA
Consensus repeat of NC_014378_1
|
7 spacers
spacers of NC_014378_1
>1.1|892849|37|NC_014378|PILER-CR,CRT TTTATTTTTTTAAATTAATACCATTTTAGTGTTGACA >1.2|892923|37|NC_014378|PILER-CR,CRT TGCTTGAACATCATCTTTAGATCATCTCTTTTCTTAA >1.3|892997|36|NC_014378|PILER-CR,CRT GGAAGATTTTGGAGATGTCACATTCGAGGAACTGGT >1.4|893070|36|NC_014378|PILER-CR,CRT GCTGCTAATAACTCACTCACATTATTCATCTCCTTC >1.5|893143|34|NC_014378|PILER-CR,CRT GTACTGCTTTCTGCTGTGCAGCTTGGGCTTGTGC >1.6|893214|36|NC_014378|PILER-CR,CRT CATCATTTGGAGATTCATGTGAATTAATTGTTAAAG >1.7|893287|35|NC_014378|PILER-CR,CRT AGGATAATATGCTTTCACTCGTTGCTTCGGGAGAG >1.8|892850|36|NC_014378|CRISPRCasFinder TTATTTTTTTAAATTAATACCATTTTAGTGTTGACA >1.9|892924|36|NC_014378|CRISPRCasFinder GCTTGAACATCATCTTTAGATCATCTCTTTTCTTAA >1.10|892998|35|NC_014378|CRISPRCasFinder GAAGATTTTGGAGATGTCACATTCGAGGAACTGGT >1.11|893071|35|NC_014378|CRISPRCasFinder CTGCTAATAACTCACTCACATTATTCATCTCCTTC >1.12|893144|33|NC_014378|CRISPRCasFinder TACTGCTTTCTGCTGTGCAGCTTGGGCTTGTGC >1.13|893215|35|NC_014378|CRISPRCasFinder ATCATTTGGAGATTCATGTGAATTAATTGTTAAAG >1.14|893288|34|NC_014378|CRISPRCasFinder GGATAATATGCTTTCACTCGTTGCTTCGGGAGAG |
cas6,cas2,cas1,cas4,cas3,csc1gr5,csc2gr7,cas10d,WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014378_1
The CRISPR arrays of NC_014378_1 >merge|NC_014378|1|892812-893359|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTTAAAGAACTATAATTTCGTTTAAGGAATTGAAACTTTATTTTTTTAAATTAATACCATTTTAGTGTTGACACTTTAAAGAACTATAATTTCGTTTAAGGAATTGAAACTGCTTGAACATCATCTTTAGATCATCTCTTTTCTTAACTTTAAAGAACTATAATTTCGTTTAAGGAATTGAAACGGAAGATTTTGGAGATGTCACATTCGAGGAACTGGTCTTTAAAGAACTATAATTTCGTTTAAGGAATTGAAACGCTGCTAATAACTCACTCACATTATTCATCTCCTTCCTTTAAAGAACTATAATTTCGTTTAAGGAATTGAAACGTACTGCTTTCTGCTGTGCAGCTTGGGCTTGTGCCTTTAAAGAACTATAATTTCGTTTAAGGAATTGAAACCATCATTTGGAGATTCATGTGAATTAATTGTTAAAGCTTTAAAGAACTATAATTTCGTTTAAGGAATTGAAACAGGATAATATGCTTTCACTCGTTGCTTCGGGAGAGCTTTAAAGAACTATAATTTCGTTTAAGGAATTGAAGCT >NC_014378|1|1|892812-893358|PILER-CR CTTTAAAGAACTATAATTTCGTTTAAGGAATTGAAAC TTTATTTTTTTAAATTAATACCATTTTAGTGTTGACA CTTTAAAGAACTATAATTTCGTTTAAGGAATTGAAAC TGCTTGAACATCATCTTTAGATCATCTCTTTTCTTAA CTTTAAAGAACTATAATTTCGTTTAAGGAATTGAAAC GGAAGATTTTGGAGATGTCACATTCGAGGAACTGGT CTTTAAAGAACTATAATTTCGTTTAAGGAATTGAAAC GCTGCTAATAACTCACTCACATTATTCATCTCCTTC CTTTAAAGAACTATAATTTCGTTTAAGGAATTGAAAC GTACTGCTTTCTGCTGTGCAGCTTGGGCTTGTGC CTTTAAAGAACTATAATTTCGTTTAAGGAATTGAAAC CATCATTTGGAGATTCATGTGAATTAATTGTTAAAG CTTTAAAGAACTATAATTTCGTTTAAGGAATTGAAAC AGGATAATATGCTTTCACTCGTTGCTTCGGGAGAG CTTTAAAGAACTATAATTTCGTTTAAGGAATTGAAGC >NC_014378|1|1|892812-893359|CRISPRCasFinder CTTTAAAGAACTATAATTTCGTTTAAGGAATTGAAACT TTATTTTTTTAAATTAATACCATTTTAGTGTTGACA CTTTAAAGAACTATAATTTCGTTTAAGGAATTGAAACT GCTTGAACATCATCTTTAGATCATCTCTTTTCTTAA CTTTAAAGAACTATAATTTCGTTTAAGGAATTGAAACG GAAGATTTTGGAGATGTCACATTCGAGGAACTGGT CTTTAAAGAACTATAATTTCGTTTAAGGAATTGAAACG CTGCTAATAACTCACTCACATTATTCATCTCCTTC CTTTAAAGAACTATAATTTCGTTTAAGGAATTGAAACG TACTGCTTTCTGCTGTGCAGCTTGGGCTTGTGC CTTTAAAGAACTATAATTTCGTTTAAGGAATTGAAACC ATCATTTGGAGATTCATGTGAATTAATTGTTAAAG CTTTAAAGAACTATAATTTCGTTTAAGGAATTGAAACA GGATAATATGCTTTCACTCGTTGCTTCGGGAGAG CTTTAAAGAACTATAATTTCGTTTAAGGAATTGAAGCT >NC_014378|1|1|892812-893358|CRT CTTTAAAGAACTATAATTTCGTTTAAGGAATTGAAAC TTTATTTTTTTAAATTAATACCATTTTAGTGTTGACA CTTTAAAGAACTATAATTTCGTTTAAGGAATTGAAAC TGCTTGAACATCATCTTTAGATCATCTCTTTTCTTAA CTTTAAAGAACTATAATTTCGTTTAAGGAATTGAAAC GGAAGATTTTGGAGATGTCACATTCGAGGAACTGGT CTTTAAAGAACTATAATTTCGTTTAAGGAATTGAAAC GCTGCTAATAACTCACTCACATTATTCATCTCCTTC CTTTAAAGAACTATAATTTCGTTTAAGGAATTGAAAC GTACTGCTTTCTGCTGTGCAGCTTGGGCTTGTGC CTTTAAAGAACTATAATTTCGTTTAAGGAATTGAAAC CATCATTTGGAGATTCATGTGAATTAATTGTTAAAG CTTTAAAGAACTATAATTTCGTTTAAGGAATTGAAAC AGGATAATATGCTTTCACTCGTTGCTTCGGGAGAG CTTTAAAGAACTATAATTTCGTTTAAGGAATTGAAGC
>NC_014378.1|WP_013277805.1|891731_892526_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MFYSVIVRFRAKKDIYFNYYPGESLHGMLFHMINKRDEEKVTVLHDRYNSKPFTISPILPYLKWRKGKRYLKKGKKYFFRITFLEEEWYKLFMEYFLYHPEGLKLNGVKIEVIEALTNSKQDNRCDCIEPSQLRQNSGDDRKIKFKFHSTTTFSIEDRHIIFPRADYLFNSLFSKWQEFGSEKLTVEREDFDNIYLSRYDLESTMEWFNDYPIKGFEGKCKYELSSKISSKKVKDINLLAGFAFYGGVGYKTTMGLGQVARMQN >NC_014378.1|WP_013277804.1|891419_891692_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFVVISYDISEDKRRNRIFKILKDFGTWIQYSVFECELEKKDYLKLRDRLQKVLDEDEDNIRFYFLCSKCEDEIERIGSESSPAQQSIII >NC_014378.1|WP_013277803.1|890423_891419_+|type-I-D-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MPTVYVTQEDTALRKKGERLIVKQGKEKIADVPLVKVDQVVVFGNASISGSLISLLLKAEVPIAYLSYYGKYKGRLVPEYSKNSLLRLKQFEAHKDMKVKLELTRKIVKGKLTNMRTLLMRDTRETRSEEVKQLCQKMKNIINKIERTESIDKLRGFEGMGSRYYFSQFNEVLNDSFNFNGRNRRPPKDPVNCLLSFGYSLLLNDVLAALYLVGFDPYIGFFHSSQYGKPALALDLMEEFRPVIVDSVVKSVINKKMIVSDNFNKTCGTVKMKDKARNKFLEQYEKRLREEFTHPVFEYKVTWRRCIELQARLISKTINEEIEEYPPLVVK >NC_014378.1|WP_049772653.1|889773_890424_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MQPRTRKKSRKLLSKEGDNLDQKLYVPLSAINAYNYCPYRVYLEYVLGEWKDNTHTIEGILKHDRAHSGERRYDSNRIQTTQVFVKSEQYRLVGKIDVVEEKEGEVYPVEYKKGRSGEWINDHLQLCAQALCLEEQLGVKITKGYLWYFSSRDREEVEFDLKLRDKTIETGESVLKIMEGEVIPENEYSRRCRACSIEEICLPKEVSILKKGGIDY >NC_014378.1|WP_013277801.1|887567_889817_+|type-I-D-CRISPR-associated-helicase-Cas3' MIEISLSEDYEPVSKENPFNLEYTPLKHQYQTYRALQDNQIVMNLHNTGTGKTLASLLYLFDLQEIGGNVLFIAPTNELIHQHARDIKGFITENDLKFNVINVDAGLLEQLTSQARRNGDKLHRLLSNPLEFAKELDLEFTDRSYPFVFVTNPDIFYYALYFQYNRIDRRNLCQDFAALFSYIVIDEFHYYNSKQFANFLFFFALSKGFGYFAEDRRICLLSATPAQYVINYLEELDLKMEIIDLEGDQEKKLQTLTKAKAEIVAGDLDEEIDLVEDKITDYLHQGLEGVIIGNSLSRINRAFAQIEWPDKERITGPQSRRARQEANKKQLILATPTVDIGYNFDKENKNRQNIDFAVVEAKSVDELLQRIGRAGRVLGKEIQNQPSKLLILVDDNSYSVLADELEKNKEYGRKEFAKLLVKLNTPPQKKEFVQYINSYALLESFYPLYEMYCAMPDEIKDYIEELFNLLQEIFSGTKSFRKLLAIMSKFKHHERVCEGEEELSLQDCQDFSYWFDNRTYPDDVIEEYAENSGFQKSVMDFIRQEYAVKKSLFNFRDSFNGPRAVVYDPQDILASDEVTSYDLLHVIRNYKYDLYSSRQQFKEATGSDLKGDFYLQVRDFRSEKMRLSYRLKSPYGLDKQSFEEKLCNRPLALSGLELVSDSALKSEITNYFKEEYIPMLIMTNNLTSNLYGAVKNSAIYPVKIEMIFPDYDSEEYYVILGTAAFLVYPELRGAIYAAENQKEEPEIII >NC_014378.1|WP_013277800.1|886859_887564_+|type-I-D-CRISPR-associated-protein-Cas5/Csc1 MEQERKVYHVELELLENTFFASREIYNYYETEPLLGHFALAYALGLCQGTYSQPKKPLYQEHFTDLNDKGIYLTPATVIGRPKFIIQNFNTLSDSYWYSFENNAVESDRSKDRTSASNFPQQGRAKMLATGNQFSFYLFSRDELELPRYIRLGKFMSKAKVKQKKVNYELQEVEQKKIRRVLSPLDFGEKVEMHSYDTINIRPTPLIKNSILSGKMLYIKQSDEYLPADMSYGV >NC_014378.1|WP_013277799.1|885834_886782_+|type-I-D-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csc2 MDLLDEYSDFLVDEYQNFPQSNYVNILLVRKTESETIFRTESEGGLSKEFVRITGQEEPTQRVVMTKRKQVAVERRTGRELLRRHDQLFENDGDICAMNRNTPCGECVDCMLYGFAVGSGGAQKARVITNDAYSLLPAKKVTAKRTFNALYDNGTMRDPETGETSTSLGEVEYIKPETHFIDVQTLKDVTAEELIYVLGNILRSTRYGAISSKIGKMENYLVGIYFSDCELTSNLELTQQVNQELEEVEFPLETDKIKGLAKEKMDQSLESIFGQVKVLADEKLDQLLNEIREIYQSDEQIEELLETIVKKYPGN >NC_014378.1|WP_013277798.1|883055_885812_+|type-I-D-CRISPR-associated-protein-Cas10d/Csc3 MSSILELVASEEDSFWNDYLQEVAFNGLTPYYKIQQWGNREGTTLGEHVLTGCMLIQELKDICNLTELEEKICLAAYTVHDMNKIERFANKNIPLKKATLEDILIELERVNLVKIFPEAKEYIDDITFLVRNHAGKFHAMEGLLAPNKRDFQLGQDRLEELVELIKGVDVADLSDEFSEEYQKDKFLSKVNIIADKQYQLVNHRLSEHRGILTNLIHNAVNQYLQEEYNYTPVFVYPKGIYYLTDDPVKLTRNEFEKLAKQVEKEVNKIVRGKFADFISSTSTGIKIDGKCLDLNVPFIDMLEVVDNRIHSKGYGSDRHTKVWKKVLENVDGLDQDTTEDYKEFFAALTDTPFVEEEFHTAELIRAYYNFLRLDHFNLNSAQAWNRTYELLDVDEEVQSYFELLSGLAAIYYRPYPLAKYLMDNEDLSYDKLYQLVKERGTEVVDELQDDETDSLFKRYIYRVLSIDQQNFVDQEEFQANFDYYLDKPHKQCSTCGLDYEVDDWMAGDVPDNINVQFFSNRLAGGGGEPKRNICKICNKQFVLEKLNFVAHSQTDTFYLHFYPKGFHSAVFLNAFRHTLDKLRGEDNRAIMLKNDQIIIDQLDEKVDRDLQLKFSETNSNGNPLPRYSQVVGNIITLPLNCPGDNDTQRFIFALQQILIWMRYFNFRAILSRTPIPPLAHNEFDQLYLDNLPFNLKGVIGKQNLDHEEVEELWGDIKDFYNISSQVDEGTDRRKVYAKLFRTASDNLMELFFVLDRLIIQKADSEREELAISRRVLEKLESLISTKGGEEMESAEVIAKLGELAGKSYIKGKTFKRNSLLKPIDIIFDLLERKSEYLDLETVFATATQQIFDHIKRISPDDRQPGETKYQKIEEFVATFKKDLLEGVYQGKINNLIADQKIIKSAYLFYYRKATKTEE >NC_014378.1|WP_013277797.1|882093_883044_+|YafY-family-transcriptional-regulator MKYDRLLRLTSLIDHIASAPGKNFQFYADKFGVAARTIRRDVDTLAEAGLPVETSAGIRFINDIELPNINFTYNEAFALMIALSELKRYTQFDGELEQVKVKLEEVFPDKLAEIAKEIEKRVGIYPSRTEIATEISDKMMPIISSLIDNRRLEIKYYSFSSDEVKWRKVDPYGVFFRRRSWYLAAYCHLADEVRTFRFSRVREWNHLREYFELPDDFNLDEYVTESWELMKGEPAEIEVKFASDVAQLILETEFNKDEEKELLKDGSVIYRVKVEGWREIFYWILSFGGDAEIIKPDWLRSKAEDEAKRMLKLYSS >NC_014378.1|WP_148217670.1|881668_881905_+|hypothetical-protein MKMQKNKTHIEVIEQRTGRNKKQIINPQLREDIDSYIQGMKVSEYLFQSRKGDNKPISRVQAYRVLRKAVDKIGIEMT >NC_014378.1|WP_013277806.1|894157_894538_-|PH-domain-containing-protein MGLFSGLMGNASEMDMEKLEKELAEILIKGEEIEQGYQLIRDYFVFTNKRLILVDKQGLTGAKKELHSIPYSSIRHFSIETARSFDRDSELKIWIASLQQPVIKEFSKKSSDILEVQKTLSKHALK >NC_014378.1|WP_013277807.1|894750_894939_+|hypothetical-protein MKWIIGFLAVLGISVWAFVSFLKSNLKEKKEVEVISDNQTDQSDDNMEVVREKMMNGIEEDK >NC_014378.1|WP_013277808.1|894976_895903_-|AEC-family-transporter MQFSIIINQILVLFIIIFIGYIIRKKEIINQEVSDGLTDLLMEVTLPALIISSMIIEINPRLVNNLQISFWVWGGLYLFIIGMISLLSHYLPFSQNQKSVFKFATIFGNVGYMGYPVIDAIYPEYGMLYAIIGNIFFNVLAWTYGIYLFTKKEDGDNKIQFEKLLNNGLIAIIIGFGFLLTGYQLPNPLTGALDRLGNMTFPLSMIVIGSSLTNIDFKTILYNKYLYLISGLKLIIIPLIIFLLLQPFTIPTKINNIVVILFAMPSAATTVVFAEKFGADYTLASEGVFVTTLFSLVTIPFFIYLITL >NC_014378.1|WP_013277809.1|896197_898438_+|alpha-amylase-N-terminal-ig-like-domain-containing-protein MAESFEVTFTYKPVISVDSVNLIGDFNDWDLDRTPMADENGDGTYEVTLELEAGEYQYKFVVDDDKWQKPPEADYYVDDGFGEKNGVIIVGDEVPLRVSVKGNGVIDFETLRHNNSDVKFANPLSRDRISIRFQTRRNDVEEVTLCYNDGQKQRIQLENFATYEEFDFYKAIIDLENPYFEYYFEVKDGDKIIWYDKEGIKEADNGKLTDLTSFQYNLSEVDIFRTPGWVKDAIFYQIFPDRFYNGCKENDPEKIEVYKDEDTRCDAVIPDWEKGVPPNPPVLTEETEFYDNKNEIHPEAGYYVFYGGDLQGVEQKIPYLKRLGVNAVYLNPIFKGTANHRYNTAGYELVDDTLAIKGDLEASEEYVIKLIEKLHRYGFKVIFDAVFNHTGYEHWAFQDIIEHGKDSKYVDWYNIHSFPIVPLYKQNKENPPNYDCWWGFGHLPELNVKNPEVRDYIFQVTEKWMDPKGNGDLSAGIDGWRLDVPNEVKEVVPNFWQDWRESVMEINPEAYIVGEIWDNASDYLQGDEFDGVMNYRFRDAALRFLGLNEIKGDEFAAELSKMYFQYPEQANYSMLNLIDSHDTSRYLTVIDEDKERMKLTVLFQMTYLGAPMVYYGDEIGMKGEDGPDCRRTMIWKDRGYTKPDYDLFNHYQRLIKIRKQQPALRRGNIRGIDIAYDQVDGFKRSYGDQQLLVLLNAGKEMIDLEVEVDAADGKYRELYQNRIVSVDNGRLHLKLEGITGAIIKLS >NC_014378.1|WP_013277810.1|898452_899940_+|4-alpha-glucanotransferase MEFKRQSGILLHPTSLPGDYGIGSLGEEAYEFIDFLVAADQKLWQILPLGPTGYGDSPYQSFSAFAGNPLLISLERLKEDGLLAADDLKTEKEFALDYVDYDQVTEFKYPLFEKAFQTFKRDAAKSIEDKFQRFCCENSDWLDDYALFKTLKECFEGQPWYEWDEDIKLRRSEAINHYQETLQDRIKFHKFIQYIFFKQWNRLKAYANENYIKIVGDIPIFVAYDSADVWANPELFSLDEDKKPINVAGVPPDYFSETGQLWGNPLYDWQKLKETDYDWWIDRFETTLELVDIVRLDHFRGFAAYWAVPYGEKTAVRGKWKEGPGRDFFRKVKDELKKLPIIAEDLGVITDEVEELRDYFKLPGMNVLQFGFNSQDDNNHLPHNYTKNSVVYTGTHDNNTVLGWYNNADDEAREYAIEYLKASEDNICWDFLQAAWASVSKIAIAPLQDILSLNSEARMNTPGTTKGNWKWRYRKEMLDVNLSKKLKRLTGIYHR >NC_014378.1|WP_049772688.1|900394_900970_+|precorrin-8X-methylmutase MNIIEEEVADLECSDQEKKIVKRVIHATADFDFKDLIIISEDAVEAGLQALESGSNIVTDVNMLRAGINDRKLGSFGGELKCFISNDDVAKEAKEKGITRSMMSMRRAAKNPDNKIFAIGNAPTALFELMKLIKAGKADPELIIGTPVGFVGAKESKAELEKMDLPFITVRGRKGGSSVAASITNALLYMK >NC_014378.1|WP_013277812.1|900995_902126_+|cobalamin-biosynthesis-protein-CbiD MFESYVKRNGEKLRRGYTTGTAAAGAAKAAAETLYSGQTLDVVKVDTPAEIVVDLEISGTEIKEESVSCTVLKDGGDDADITDGTEIVAEVTKLDSGIELKGGKGVGEVTKPGLAVEVGKPAINPVPREMIIDSVKEVLPPESGAKITIKVPEGEELAANTLNPRLGVEGGISILGTTGIVEPMSKKAYRESLVVTLDQALAEDNYELVFIFGNYGKQMAQSMGVSDNQWVKMSNFVGYMLERAAEREIERIILLGHVGKLIKVGAGIFDTHSSVADARLEIVAAYTASLGGSQQLIQKILAANTAEETIQILREVELAEDVFNLLAKRVVARAAEKVEYEIDFGAILFSMDQEVVGSYGVELKKGAEEWRIKSMC >NC_014378.1|WP_013277813.1|902101_902728_+|precorrin-6y-C5,15-methyltransferase-(decarboxylating)-subunit-CbiE MENQIYVLGIGPGSKEYMLPVVERLASESDVLIGGRRALELFSQLDKEELVIKADLERILNYIQDNYQQKQIAVLVSGDPGLYSMLNYLSKHFSKDQLKVIPGISSLQLGFAEAKLVWQDAEITSLHGRERSELLELVQKEDKVGFFTDHKFPPDEIAQYLLDNGVQDRKAFVGERLSYEDERIIDGDLEEIADSDNFDMSVMVVYSE >NC_014378.1|WP_049772689.1|902786_903311_+|precorrin-6Y-C5,15-methyltransferase-(decarboxylating)-subunit-CbiT MTKEEVRAVTISKLRLKRDSVVWDIGAGTGSLSIEAGLIADQGSVWAVERESEGIELINQNCEEFGVENIEPINGEAPAALADLPAADRIIIGGSGGQLEEILAMVDKKMTAEGRVVLNAITLETLLAAKESLSKMDYSFNIVTVSITRTREIGNYHMLDAQNPIYIIAGERRR >NC_014378.1|WP_013277815.1|903312_904026_+|precorrin-2-C(20)-methyltransferase MAGKFYGVGVGPGDPELMTLKAKRILDQADIICTPKSKAGKDSIALSIVKEVVSTEGKIKDLVFPMTHDQERLDKFWNEAVDEIQAELESGQNVAFITLGDPLLYSTYIYVLERLQNRPMEVEIETVPGINSFSACAAAMNQPLAEKNETLSIIPAAYDYDDLEEILATFDNTVLMKVARNFDEVVAKLEKLEMKESSFYASKCGRSEELLTRDLDSLLGDELDYLSLVIAKQRGEE |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_014378_1 | 1.1|892849|37|NC_014378|PILER-CR,CRT | 892849-892885 | 37 | NZ_LR134418 | Legionella adelaidensis strain NCTC12735 genome assembly, plasmid: 9 | 9711-9747 | 6 | 0.838 |
NC_014378_1 | 1.8|892850|36|NC_014378|CRISPRCasFinder | 892850-892885 | 36 | NZ_LR134418 | Legionella adelaidensis strain NCTC12735 genome assembly, plasmid: 9 | 9712-9747 | 6 | 0.833 |
NC_014378_1 | 1.1|892849|37|NC_014378|PILER-CR,CRT | 892849-892885 | 37 | MN693725 | Marine virus AFVG_250M494, complete genome | 63002-63038 | 8 | 0.784 |
1. spacer 1.1|892849|37|NC_014378|PILER-CR,CRT matches to NZ_LR134418 (Legionella adelaidensis strain NCTC12735 genome assembly, plasmid: 9) position: , mismatch: 6, identity: 0.838
tttatttttttaaattaataccattttagtgttgaca CRISPR spacer tttatttctttaaattaataccattttaagatagaaa Protospacer *******.********************. .* ** *
2. spacer 1.8|892850|36|NC_014378|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR134418 (Legionella adelaidensis strain NCTC12735 genome assembly, plasmid: 9) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
ttatttttttaaattaataccattttagtgttgaca CRISPR spacer ttatttctttaaattaataccattttaagatagaaa Protospacer ******.********************. .* ** *
3. spacer 1.1|892849|37|NC_014378|PILER-CR,CRT matches to MN693725 (Marine virus AFVG_250M494, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
tttatttttttaaattaataccattttagtgttgaca-- CRISPR spacer tttatttttttaaattaattcc--ttttgtattcccttc Protospacer ******************* ** *** **.** *
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
466883 : 474701
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_014378|466883:474701|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_014378|466883:474701|468066_468987_+|WP_013277419.1|DBSCAN-SWA MDGIFLAREIRNRERELNSLYKRLDQQVTDGNLQNLVNQLRQHQSQQLSQLDELIKGLEGPRPFPPTVRLARHVVQQGETLSQIASQYNTTVANLLRVNPDIDDPDMIQAGKTIRLPIILPPSPECYFEYEVKRGDTLFKLTQQFNTTVNELVYYNSIKDPDLIYPGQILIIPCPEDETSDDDKEISEELTFNTLDRSNANNYSGSIEEKLFAASTRAQLRRALNNFNIRVPTRVNFNTDIVIGAIEYDIENLYLEDRRIRVVVDRKARGYHLVTVPRDQFREQGSYRVYFVTRDNRTLDRDRVNI >NC_014378|466883:474701|469344_469755_+|WP_013277420.1|transposase|DBSCAN-SWA MSNQNNLIHARTCVYNVGYHIVFTVKCRKKVLTGKVATRLKEVLHQVAQDKEFIIETMELMPDYVDLFVTAHPKIAPSYIVKMSKGISGRLLLKEFPKLKEELYKGHLWNKSYYLETVGSISKDTVKQYIENQKSK >NC_014378|466883:474701|467719_467887_+|WP_013277418.1|DBSCAN-SWA MPRGDGTGPRGEGSQTGRNAGYCSGFDQPGYANDEVPRQRLAHRRGKRGGRNRRR >NC_014378|466883:474701|469888_470410_+|WP_013277421.1|DBSCAN-SWA MELKDAIIDLCRPDFYYKSIYDINLQQLKELGINGLICDLDNTLLAWNHHQVEPQIKEWIAHIKELGISVCILSNSLQVRVDKISNILQLPAVSQALKPRKRAFKTAINKLNVNSNRIAVIGDQLFTDVFGGNRLDLLTILVDPIADKEFVTTKLIRLLEKNFKKELELIQKE >NC_014378|466883:474701|466883_467591_+|WP_013277417.1|DBSCAN-SWA MIPGFLAGIGSSLADGILVLISYIANNNIFPQPLDDEEEKKYLTRYLEGDEEAKEVLIEHNMRLVAHIVKKYNNSNVDKEDLISIGSIGLIKAIETYDPSKKVKLATYASRCIENEILMHFRQNKKTNREVKLHDPLSSDKEGNEMTLMDVYETDEEAVLEKVEMALAEERLYDKIEGLSEREQKVVKMRYGLNNVEELTQREIANKLGISRSYVSRIEKRALQKLNQLFCTNGG >NC_014378|466883:474701|470416_471121_+|WP_013277422.1|DBSCAN-SWA MKKVSKYHTILLILVFIFFISIFIDKPVAQASSSYNFEFGARDLKYGDEGVDVVFLQVQLKVLGFYEGEIDGLFGRGTLEAVEKFQNKNDLKVNGIVDKNVYKYLELGNYAEQNEFVQHKIMTLARAINGEARGESFRGQVGVGAVILNRVRNDEFANSIKEVIYEDGQFTSVVDGQVNLPPTELSIKAAKAALIGYDPTGNARFFYNPKIATKLEWISSRPKIVKIDNHIFAD >NC_014378|466883:474701|471259_471676_+|WP_013277423.1|DBSCAN-SWA MFQKLRGILTTYDKILIISILLFTIVGIGWSVFNLAEDNQSAKYVVIEHKNQVLNKFRLTSDFQKRITIDLDHGTAEIMVENGEVRMMEMPREICPLGICSDTGWVSNVGETIVCIPNQIVIAVEAQDSEDKIDGISY >NC_014378|466883:474701|472885_473146_-|WP_013277425.1|DBSCAN-SWA MKSTGIVRKVDDLGRIVIPIELRRTLGLETKDSLEIYVDNDKIIFKKYEPACIFCGNAENTIDFKNKIICSECLDKMVEKSEEKPA >NC_014378|466883:474701|473516_474701_+|WP_013277426.1|DBSCAN-SWA MKEIEVNNLSKIFGNNPQEGIELLKEGYSKDEILEKTGLTVGVNDVSFKVNTEEIFVIMGLSGSGKSTLLRCLNRLIEPTAGELKLKDQNLMDLDQQSLRQMRRDKFGMVFQNFALFPNRTVLENAEFGLEIQDVPKEEREVQAKEALKRVGLDGWEDQYPEQLSGGMQQRVGLARALAVDPEILLMDEPFSALDPLIKKEMQDELLDIYQDLDKTILFITHDLDEALKLGDRIAIMNDGKIVQIGTPEEILTDAENDYVKEFVQDVNRSRILTAEDIMTKPLALLYDQDGPHTAMHKMRQNEISSIFVVDKERKLKGIVEIEDAVEGVNKGQKDLEGIMKETPTTNPDENLDELFSEIADLDIPLPVINDEGKLLGLIIKSNVLANLASEERV >NC_014378|466883:474701|471700_472825_+|WP_013277424.1|DBSCAN-SWA MKYDILIVGAGPAGAYTAYRLAQADLDVLLLEKEELPRYKPCGGGLTSKVFGIIPEFNLDHVIEDKISTVVFTHNVEAPIKLDFIEPFTYMTMRDKFDYFLVQQAKEVGVKVIDNTPVVDIRCMSDRVRVCTTGSEYTAKYIIGADGARSLVAQQLGLMDGVESAIAYEKEIKVSSQLLEAQRGIMNLDYGIIHGGYSWIFPKVDHFSVGVGTFAEGVSLKKSLEDYLAKGKIDDYKELKAKGHPLPVGGSKRELTYKRAVLIGDAAGLVDPLSGEGIFYALKSADLASRILLDVIRRGKSLSRYTTLINQEILPEFRKAELIKKIFFKFSDLLHKLFMKENWILKKLIQVIYGDDTYSNLYDNIQNQIPLLKF |
10 | uncultured_Caudovirales_phage(16.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1192809 : 1204070
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_014378|1192809:1204070|DBSCAN-SWA AATGGCTAATACTTATAAGGCTGTAGCTGGATTAAAAAAGGAATTCCTTTTACAGGGGCTTGGCTGTGCTAATTGTGCCAGTAAGATGGAGCATCGTATAAATGAACTGGATAATGTTAAAACAGCTGAACTTAATTTTACGGTCCAAAAGTTAATTATTACAGTAGAGGATGAGAGTGAACTTGATGAAACTATTGAGGCTGCCGAAGAAATCATTCATGATTTAGAACCAGAGGTTGAAGTAAAGGAAGCTGAAGAAGAGAAGGACTCAGAAAGTATTATGGATAATGCAGAAATTAAACGGAAAGGACTGCGAATAACTGTTGGAAGTTTCTTCTTTATAGCTGCTCTTATAGCTCCAGTTTCATTTAATTTTAAGTTAGTTTTATTTATAACTGCTTACCTGACTATAGGTGGAGGTGTTCTCAAGCGGGCGGTAAGAAATATTAGCAAGGGCCAATTCTTTGATGAGAATTTTTTGATGGCACTGGCTACTACTGGTGCTTTTGCTATTCAGGAATTTCCAGAAGCAGTTTCAGTAATGTTATTTTATCAATTAGGCGAGTTACTCCAGAATATTGCTGTTGATAGATCGCGGCGTTCAATTAAGGATTTGATGGATATTAAAGCAGAGTATGCCAATCTAAAGACGGAGACTGGAGTTAAAGAAGTTGACCCGGCTGAAGTGAATATTGGAGATAGAATAATTATTAAACCTGGTGAAAGGGTTCCACTGGATGGTAAAGTTATTTCAGGAGAAGCCCAGATGGATACTTCGGCTTTAACCGGTGAGTCAGCACCTCGGAAAGTAGAATCTGGCGAAGATATTTTAAGCGGTTTTATCAATAAAACAGGGGTATTGACAGTTGAAGTAAAAAAAGAATTACAGGAGTCTATGATAACTAGAATTCTGGATTTAGTTGAGAATGCCAGTGCTAAAAAAGCACCGACTGAGAAGTTTATTACTAAGTTTGCTCGCTACTATACACCTGCTGTTGTCTTTGTAGCTTTGGCCTTGGCTACTCTACCACCGCTATTATTAACAGATGCTCTTTTTGCTGATTGGATTTATCGGGCCTTAGTCTTTTTAGTTATTTCCTGTCCCTGTGCATTATTAATCTCAATTCCGTTAGGATTTTTCGGCGGGATAGGAGCTGCTTCTAAAAGAGGGATTTTGGTTAAAGGAGGAAATTATCTTGAGGCTTTGAATAATCTTGATAGAGTTATCTTTGATAAGACCGGTACTTTAACTGAAGGTAACTTTGAAGTTGATGAAGTTATAGCGGCTAAAGGTTATACAAAGCAGGAAGTTTTAGATTTAGCGGCTAAAGTAGAAGTCCATTCTAACCATCCTATTGCTCAATCAATTCTTGCTGCTTCTTCGAAAGATATCAATGCTGAGGATATAGAAGGATATGAAGAGCTCTCTGGACAGGGGATTAAGGCTAAGATAGCAGGTGAAGAAGTATTAGTAGGAAATGAAAAGTTGTTGTCCAAGTTAGCTTTAGAAAGTAACAGATATAAGTCAGAAGATAAGACAGTAGTTAATGTAGTAGTTGAAGAAGATTATATCGGATCTATTTTAATTGCTGATCAGATTAAGTCTGATGCTAAAGAAGCTATTGCTGAATTAAAAGAGTTGGGAATTAAAGAAGTAGTAATGTTGACTGGAGATAATAAAATCGTAGCTGAGAGGATAGTCGATAAATTAGGGCTGGATAGCTATCAGGCGGAGTTATTACCGAATGAAAAAGTGAAAAAAACAGAAAGACTCCTTGCTCAAAGCAGTAATGATGGTAAGTTAGCTTTTGTGGGAGATGGAATCAATGATGCTCCTGTATTGGCAAGAGCAGATGTAGGAGTGGCTATGGGAGGCCTAGGATCTGATGCTGCTATTGAAGCTGCTGATATAGTGTTAATGACTGATGAACCTGCTAAATTAGGAGAAGCTCTAGAAGTGGCTAGTGATACTAAAAGAATAGTCTGGCAGAATATTATCTTAACTTTAGGTATTAAAGGAATTGTAATGGCTTTAGGAGCTGTAGGGATGGCTACAATGTGGGAAGCGGTCTTTGCTGATGTAGGTGTTGCTTTATTAGCGGTATTGAATTCCCTTCGAATTATTAAAAGTAAGAAGTAAACGGAAATTAGGATTATTTTAGATAATTTATTCTTGACAGAGGCTTTAAATTATGGTATTATACTAGGTGGAAATTAGAAATATGAAGAAATATTGTTAAGGAGGTATGAAATATGGTATCATTAAGTGAAATAGTTGGTGAAGAAGCTGAAGAAGATATTTCTAAGTCAGTTGATGAAGGTGATGCTGCAGAGGAAGAGTCTATTACTGTAGATGAATCTGTTGCTGTAGATTCTGATACTGGATCTAGAACTGGAAAGGTAAAGTGGTTCGATACTAAAAAAGGTTATGGTTTTATTGAACAAGAAGATGGAGATGACATCTTCGTTCACTATACTGCTATCCAGGAAGAAGGTTTTAAGGACTTAGAGGAAGAACAGCAGGTAAGCTTTGAAGTTGTAGAAAGTGATAAAGGTTTACAAGCTGAAAATGTAACTAAAGTATAATTAGTTCTCTGCTAAGTACTTAACAGACCTAGGTGGGATTTTTCCATCTAGGTCTTTTCTAGTTTAGAGCAGGAAAAAGATTATTCAGTTAGAATATTTAATAATATAATATATTTAAATCTTGTGACAGGAGGTAGTAAAATGTGGAATAACATAGCAGTTTCTCGGAAAAGTTTAATTAAGTATCTTGCTGTTATTATGATTGGGATCGTAGTAAGTGGAGGTTTATTTATAGGTTTAAGTACTGGTCAGGCTTTTGCTCAAAATGAAGCCGATTCAACTCAGAATGTTTATAAAAGTAATTTCTTTGCTGATATAGCTTCTAAGGTTGATGCAGCAGTGGTTAGGATTAATGTTAAAGTTGAAATAGATTCAGAAAAATTAAAAGAAAATTATCCATTCTTCAATGATCCTTACTTTAAGAAGTTTTTTGAACAGCAGATTCCTTTTGAAGGGGAGGGAAATCCTAAATTTAGACAGGGATTTGGGACCGGATTTATTATTAGCCAAGATGGATACATATTAACCAATGAACATGTTATTCATGGTGCCGAGGAAGTAACAGTTAAGCTGTCAGATAGAAAGGAACCAATTAAGGCAGAGGTAGTTGGAACTGATTTTAGTCTTGATCTGGCTGTATTAAAGATTAATGTTAATGACAAACTGCCGGCAGTCAAGTTAGGCAACTCAGATAATATTAAACCAGGAGACTGGACTGTAGCTATTGGTAATCCTTATGGGTTGAATCATACAGTTACTGTAGGGGTGATCAGTGCTCTGGGCCGTCCACTTCGCATTAGACAGGGAAAGAAGCCTAGAGTCTATAAGAATATGATTCAGACAGATGCGGCGATAAATCCTGGTAATAGTGGCGGACCTTTATTAAATAGAGAAGGCCAAGTTATTGGAATTAATACTGCTATTAATGCTCAGGCACAGGGGATTGGGTTTGCTATTCCAATCAATGAAGCTAAAAGAGTTTTAAGTGATCTAAAACAACACGGTAAGGTGATCCGCCCCTGGATGGGGGTCTATATGCAGCCGATAACTGAAGAGATGACTGAATACTTCAATTTAGAAAGTACTGAAGGGGCTTTAATTGCTGATATAATTTCGGATAGTCCAGCCGATAAAGCCGGTTTGAAGGCTGGAGATGTTATTGTGGAAATAAATGAAATAGCAGTAGAAAATCCTGAAGATGTAGTTAAATTAGTAGAAAAAGCTGAAGTAGGAGATAAGATGGTACTTAGGGTTTTAAGGGAAGGATATAAGCGATTCGTAAGTGTAACTTTAGATGAAAGACCTAAAGAGTATTAAGTGAAATTGTTAAATATTAAGTAGTATGTTATAATCTAAATGATAGTGATAAAAAAAGGAGGATCATTATTATGATTGAAGAAGAAAAGATTGGTAAGTTTCTTGATGATTTTGCATCTGACAAGCATACACCTGGCGGGGGAAGTGCTGCTGCTTTGAGCGGTGCTTTAGGTGCTGCTTCTACTTGTATGGTAGCTTCTTTGACAGTAGGAAAAGATGATTATGCTGATGTTAAAGAGAAAATGGAAGAGTTGATTGCTGATACTACAGAACTGAAAGATGACTATCTTGAGTTAGTGGACAAAGATATGGAAGTATTCAATGATTTTATGGAAGCTTTGAAGCTGCCCAAGGAAACAGAAGAAGAGAAAGAAAAGAGAGCAGAAGCCTTAAAAGAAGCCTCAATCGAAGCCACGGAAGTTCCCTTTGCTATGGCCAAGAAGAGTTTAGAAGTTTTAAAACAGGCTTTAATTGCTGCCAAGAAAGGAAATATACAGGCAGTCAGTGATGCTGGAGTAGGGGCTATTGAAGCCTGGGCTGCTCTAGAAGCTGCTGAACTGAATGTCAATATCAATTTAGCTTCAATGAATAATGAGGAGTATGTAGCTAAGAAGCGTCAAGAGATGAAGGAATTAAAGGAAGAAGCTAAGGAATTAAAAGAGGAAGTATTAGAAATTACAAATGAAAAGATAGGTTAATTATGTAAGCCAGAGGATATATCCTCTGGCTATTTTAGTCTTTATAAAGCAAAGACGTGATTATCTATTCTTGTTGTTATAGATCGGCTCCAGATCCAGTTATAAGGTGAGTAAACTTTTGCTGGATTGTAGAAGTAAAGTGAATTATTTGTTGGATCCCAGCCGTTTAGTGCAGCTTCAACTGCTTTAATCGATTCATTATTGGCTGGATGATAGATTCTGCCATTCATAACCGGTTCAAATGCTAATGGTTGATAGATTACTTTGGAAATAGTGTTAGGAAATTTGGAATCTTCAACTCGGTTTAATACTACTGCTGCTACAGCTACCTTACCTTCGAAGCTTTCACCTAATGCTTCAGCCTGTACTAGACGGGATAATAAGTCGAATTCTTTATCT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_014378|1192809:1204070|1200695_1201142_+|WP_013278083.1|DBSCAN-SWA MTQTFFFIFAVIAGTAMAIQGSLNSVLGKVIGFWEATFVVHIIATSLVAVIIFIFSLNKGDFGNLMETPWYTYIGGILNVIILYGVVVTIPKLGVANATTLIIVGQVTTAVIIDHFGFWGLEAVPFQWTKLIGVGLLALGARILLNTG >NC_014378|1192809:1204070|1195061_1195394_+|WP_013278076.1|DBSCAN-SWA MVSLSEIVGEEAEEDISKSVDEGDAAEEESITVDESVAVDSDTGSRTGKVKWFDTKKGYGFIEQEDGDDIFVHYTAIQEEGFKDLEEEQQVSFEVVESDKGLQAENVTKV >NC_014378|1192809:1204070|1192809_1194948_+|WP_013278075.1|DBSCAN-SWA MANTYKAVAGLKKEFLLQGLGCANCASKMEHRINELDNVKTAELNFTVQKLIITVEDESELDETIEAAEEIIHDLEPEVEVKEAEEEKDSESIMDNAEIKRKGLRITVGSFFFIAALIAPVSFNFKLVLFITAYLTIGGGVLKRAVRNISKGQFFDENFLMALATTGAFAIQEFPEAVSVMLFYQLGELLQNIAVDRSRRSIKDLMDIKAEYANLKTETGVKEVDPAEVNIGDRIIIKPGERVPLDGKVISGEAQMDTSALTGESAPRKVESGEDILSGFINKTGVLTVEVKKELQESMITRILDLVENASAKKAPTEKFITKFARYYTPAVVFVALALATLPPLLLTDALFADWIYRALVFLVISCPCALLISIPLGFFGGIGAASKRGILVKGGNYLEALNNLDRVIFDKTGTLTEGNFEVDEVIAAKGYTKQEVLDLAAKVEVHSNHPIAQSILAASSKDINAEDIEGYEELSGQGIKAKIAGEEVLVGNEKLLSKLALESNRYKSEDKTVVNVVVEEDYIGSILIADQIKSDAKEAIAELKELGIKEVVMLTGDNKIVAERIVDKLGLDSYQAELLPNEKVKKTERLLAQSSNDGKLAFVGDGINDAPVLARADVGVAMGGLGSDAAIEAADIVLMTDEPAKLGEALEVASDTKRIVWQNIILTLGIKGIVMALGAVGMATMWEAVFADVGVALLAVLNSLRIIKSKK >NC_014378|1192809:1204070|1201285_1201603_+|WP_013278084.1|DBSCAN-SWA MVEESTVKLTEENFKNEVMKSDKKVLVDFWAPWCGPCKQVSPIVEELGEEHEEVKIGKVNVDENQNLAAEYGIMSIPTLIVFEDGEILNKQVGAASKERLESLIK >NC_014378|1192809:1204070|1197450_1198230_-|WP_013278079.1|DBSCAN-SWA MHKFKFKLPLIIGLIGILIFSSVGIALGSVVHRVSPGENLWTIARWYNTTVNQIKTANNYWSNRITVGQQLVIPGNFKTHRVKPGDSLHKIAHRFSVSINQLRIHNGIWHNIIRSGDILTIPSSTEAKNSYAANTVPNYISDKEFDLLSRLVQAEALGESFEGKVAVAAVVLNRVEDSKFPNTISKVIYQPLAFEPVMNGRIYHPANNESIKAVEAALNGWDPTNNSLYFYNPAKVYSPYNWIWSRSITTRIDNHVFAL >NC_014378|1192809:1204070|1199072_1199612_+|WP_013278081.1|DBSCAN-SWA MRATGIVRKIDNLGRVVIPKEIRKEMKINNGNTLEIFVDQDDSVILKKYSPVDELDQVQDYVNTLVETTECDVMITDTDKVIAGSEELERYERRPVGAVIKETMENRNTEIIEEGTKGDICEDYEHNEEKVGSILIAPVMKQGDVLGAVILSSQDQSLGDYEVKIAETTAKILSKQLGL >NC_014378|1192809:1204070|1201826_1204070_+|WP_187286649.1|DBSCAN-SWA MDLLENTKNLLEDRYLKRNEKREIVETPEELFIRVAENIAAAEEDEEKQEYYEEEFYNLMTDFKFLPNSPTLMNAGTELQQLAACFVLPVEDSMEGIFTAVRNAALIHKSGGGTGFAFSRLRPKDDVVKSTGGVSSGPLSFMKVFNSATNTVKQGGKRRGANMGMLRVDHPDILDFIHAKGELNDKNQELYDEFKESLEDTYLAPEVIDKKLKQYKQKLLDDQFSNFNLSVGVTDEFMEAVKNDENYELINPRTGQVVGELDARKVFNLIVKYAWKNGEPGLVFLDEINHKNPVPNLGEIEATNPCGEQPLLPNEACNLGSINLSKFVDDGTVDWEELKETIDLAVRFLDNVIDMNNYPLDKIEEQVMKARKIGLGVMGFHEMLIKLGIAYNSDEAVEMAKKVMKFINEHAHQYSQKLAEEKGAFPAWEESKYKTPKRNATLTTIAPTGSISFLAGTSGGIEPFFDFSYTHTDGDGNTSRFEYDFTSEAEEEVLVTTMDIAPEWHIKIQAAFQNYVDNAVSKTINLPNTATKEDIREAYILAYELNCKGLTVYRDGSRESQVLKSSDDKKEETLRTDKIYPRTRPLIADGKTVRYDTGCGKLYLTINVDDNGEPIETFLTTGSDGGCQVMTEAVSRLTSMALRAGIAPEEIIDQLSSTSTCPSFMYQRGKGAELTGRSCSDVVGKALKKILETSNGLEKISKEEITETEEENEIDSSLTPKCPECGNKLIFEEGCSTCKNCGYSNCS >NC_014378|1192809:1204070|1198400_1198646_+|WP_013278080.1|DBSCAN-SWA MEFKDKLIQRLKEDPDVFNEIRSEIIASDFNREKKEKIGFIDKPEESNFLEERSDEKLIEAIAANLEYFIEYSKENEERWV >NC_014378|1192809:1204070|1199769_1200153_+|WP_013278082.1|DBSCAN-SWA MPENDKCLSCEVYKIHEENIKLLQDEELPEDIILKLAETFKVLGDPTRIKIINALSNVELCVCDISEHLEMSSSAVSHQLRVLRNLNLVKYRKEGRTVYYSLDDDHILQLFSQCLEHVLEKEDIDKS >NC_014378|1192809:1204070|1195535_1196711_+|WP_013278077.1|DBSCAN-SWA MWNNIAVSRKSLIKYLAVIMIGIVVSGGLFIGLSTGQAFAQNEADSTQNVYKSNFFADIASKVDAAVVRINVKVEIDSEKLKENYPFFNDPYFKKFFEQQIPFEGEGNPKFRQGFGTGFIISQDGYILTNEHVIHGAEEVTVKLSDRKEPIKAEVVGTDFSLDLAVLKINVNDKLPAVKLGNSDNIKPGDWTVAIGNPYGLNHTVTVGVISALGRPLRIRQGKKPRVYKNMIQTDAAINPGNSGGPLLNREGQVIGINTAINAQAQGIGFAIPINEAKRVLSDLKQHGKVIRPWMGVYMQPITEEMTEYFNLESTEGALIADIISDSPADKAGLKAGDVIVEINEIAVENPEDVVKLVEKAEVGDKMVLRVLREGYKRFVSVTLDERPKEY >NC_014378|1192809:1204070|1196782_1197409_+|WP_013278078.1|DBSCAN-SWA MIEEEKIGKFLDDFASDKHTPGGGSAAALSGALGAASTCMVASLTVGKDDYADVKEKMEELIADTTELKDDYLELVDKDMEVFNDFMEALKLPKETEEEKEKRAEALKEASIEATEVPFAMAKKSLEVLKQALIAAKKGNIQAVSDAGVGAIEAWAALEAAELNVNINLASMNNEEYVAKKRQEMKELKEEAKELKEEVLEITNEKIG |
11 | Streptococcus_phage(25.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1656206 : 1665151
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_014378|1656206:1665151|DBSCAN-SWA TTTAAAAAATATCCAAATCCTTCTGACTTAATTCCTCAATCGCTTCAAAATCAGTCAAGTTAAGTCTAATCGGAGTAATCGAAATCCGCTGTTGATTAACAGCTGCTACATCAGTCTCTTCATCATTGCCCTCTTCTACAATATCGCCGCCCATCCAGTAATAGTCTTCCCCCCGTGGATCTGTACGCTGATCAAAAGTGTTAATGTAACTTCTATTACCCAGCTTAGTAATCTGAACTCCTTCCAATTCTTCTCTATTACAGGGAGGAATATTAACATTTAATAATACTTCCTTATCCAATCCTTTTTCTGCTAAATCCTCTACTAATTCGGAAATAAATTCAGCAGCATAAGTAAAGTTTAAATCATCATAAGCTGCCAGTGAAACTGCAACAGCTGGTACTCCTAATAATATTCCCTCAAATGCTGCCGATACAGTACCAGAATAGAGAACATCACAGCCTAAATTAGGTCCCCGGTTAATACCGGAAATAACTATATCAGGCTTTTCTTCTAGAATTGCTTCAATTCCTAATTTTACACAGTCGGCCGGTGTACCATTAACAGCTAAACTCTCAGCATCAGCACTATCATAATTAACTTCTTTTACCCGCAGCGGGCGATGCAGAGTAATAGCATGTCCTGTTGCACTCTGTTCTCTATCAGGTGCTACTACCAATACTTCATTATCCGGATTCTTCGCTAAGGCTCTAGCCAGCTGCTGAATTCCATCAGCATAAATTCCATCATCATTAGTAACTAAAATTTTCATCATTTCTCTCCCCTTCCATTACCAAATAAATCACTGTCTTAATTGGAGCATTAGTTAGTTCTACTTAGTTTAATTAATTTAATCTCATTTAAAACTTGCTAGCTACAATTGACAGCATAAGCAATATAAGTTATACTACATATTGTTCGCTACGAAATAATATTCCTTACGGAGCATGGCGCAGCTTGGCTAGCGCACCTGGTTTGGGACCAGGGGGTCGCAGGTTCAAATCCTGCTGCTCCGACCATTGTGGACCCATAGCTCAGTTGGTCAGAGCCATCGGCTCATAACCGATTAGTCGTAGGTTCGAATCCTACTGGGTCCACCATTTCTTATACTACCCCATTCACCTGCCAAAGTACATATATAATAGTAACTATAATAAAATTCCAGGTAGCATGAGCAATAATACTGGTATATAATGACTGGCTTACTTCATAAAGAATAATTAATCCTAGTCCACCTAAAAAGGTAGCTAAAAAAGACCATAAACTAAAATGTAAAGCCCCAAAAATCACTGCTGCTAGAAGCCCACCTTTAAATAATCCAAATCTATCCTTAAAATACTGATACATTAAACCACGAAAGAATACTTCTTCTGTAATCGGAGCTACAATAACAATCAAAGAAGCATATAGAATAAAGGTCAATTGATTCTGGCTCTCCATTAACTCCGTTATTATCGGTTGAGAAGGAATCACAATTCCCCACCATTCCATAATCAGTTTCTGAACTCCCAGATTAACCAGCATTGCCATAGAACAGATACCAAAACCGCCTATAATCCCTAAAGTAACCATTTTTTTAAGATCAATCATCTGAAAACCTAAAATTTTTAATGATAGACCATACTTAGTAAAAATTATATACATACTTACTATTAACATAGTAGCAAACTGTAAAAAATTAACTATAATCTGTTTATAAGACAGCACCCCCGGTATAATATAGGATAAATGCTCCAGCAAAGAAGCTACCAAAAAATTAAATAACAACGTCATACTTATAGTAATTAAAATTATAAGTAAGATATCAGTTCCGGTCCAGACAACTTTTTGGTTCTGATATCGGCTTTTAAACATACCTGCCCCTCCTTTGGTACAATTAATTGTATTATAAACTACTTTAGAATATGTTGCAAAATTAAAGAGATATACTTACATCTGGTGAATGCAAATATATCCCTACTTAATCCATATTTAATTCATTCACTTTTGAGTGTAAATTTCCTCTCTATAACTTCACCCTGTCTGCCAAAAGGTCCAAACGCCTCACCATTAAGGACAACTTTGACTCCAGCCGCATTGGCTGAAAGAAATTCTACACTCCGGTCAGCATGCCAGCTTCTTTCTGTACCTGAACTCAGCATTTCCTCTAAAACTATCTTTCCATCCACTACTACCTTTATCCAGGATGTTTCGAGCACCTTAATCGTAATATTTCTTTTCGAAGGTTCAGTATTTCTATCCTTGACCTTAATTTCTTGTTTATTCGTATCAGCCTCTATTCCTGTACTGACAGACTCTTGAGAAGTATTATCCTTCTTTTCCTCTGATAAAATCATATTACTCTGCTCCGTTTGGGTTAAATTGCCTATAATTCCCTGCTTATAAAGAATAGTCCCGCCCAAAAAAACCATGAGTAAAATAACTACTGCCGCTACAATCTTCATTAGGTGATTGCTGATAAAACATAATACTTTCTCTGCTGTTGATTCATCTTCTTCTATCTCCGTTTTACCTTTTTTAACCTCTTGACGTAGATCTATTAATTCATTATACTCATTTAATATTTCTTGGCCGTCAAGCCCAACATAATTAGCATATACCCGCAAAAACCCTTTCAAAAAGACTTCTTGAGAGATTACTTCAAAATCCCCTGCTTCGATTGCTTTTAGATACTTTTTTCTAATTTTAGTCGACTTCTGTACTTTATCAATCGTAATTCCACGGTCTAAACGGGCCTGCCTAATCTTTTGACCCAATTCTTCCATATCTCCCATTCTAGTAGCCCCTTTCCACTCTCCTTTCAGTTTTCCTAAATTAAGCTAATAAAATTAAATACTAAAATCAAACTTCCGATTCCCCAGACATAATAAGCAAAGTATTCGAATTGATCCTTTTCTAGCGCCTTTAATAAGAATTTGATAGCTGCATAGCCAACCACCGCTGCAGTAACCGTTCCTATAAGAAGGGATAAGTAATTAACCTCTATACCGCCTACTTCAAATAAATCAATAACTTCCAATAAAGTAGCACCTAAAACCGCTGGAATAAAGATCAAAAATGAAAATCTAGCCGCCGCCTTTCGCTTCAATCCTATAAATAATCCAGCTATAATAGTAATTCCCGACCTAGATATTCCAGGCGTAATTGCTATTCCTTGAGCAATACCAATTATTATAGCCTGTAACAAACTTAAATTTCTAACTTTTTTATCAAATCTAATATTCATATTCTCCACCCACCATAACAGACCACCAGTTACCAGTAAAGCAATACCCACAGCTGAAACTGAACCAAATAAGCTTTCAAAAGTATCTTTCAGAACAAATCCCATAACTGCTGTAGGAAAAGTAGCTGTTATTATCAGTAGTCTTTCTTTATTATATTTAAAATCAAGACTTAATAAATCCCTAATATCATCCCAATAAAAGACAGTTACTGCAATCAAGGTTCCAAAATGAAGAAAGACATCATAGATTAAGTGTGGTTCTGTAAAGCCCAATAAATTCTTAAAGATCACTAAATGGCCTGAACTGCTAATCGGTAAGAACTCTGTTATTCCCTGTACTATTCCCAAAATAATACTATCCAATATTGACACCAATTATCCACTTCCTTTATTTTCATAAATTTAAACTTCTATTATTTATCATTATATGATTATTCTATATAATAACTGCTATTCCCTTTATCAAGTATAATATTAATAGAAAAATCTATACCATTTTGTAAAATGGTATAGATCCACTATGACAATATCCACAATTAAACTATTTTTCTTCTCTATTAGCTATAACCTTATCAACTACACTGAGATAATCCAGTAAAACCAATCCGTTAGCCTCTAACTTATATTTATCTATGGCTATCTCCTCATAGGGAATACTCTTTCTGCCGCCCTGCTGTTTTTTAATCATATATTCATCCAATAATTTAAAGGGAAGATAATAAGATTCATCCAACTTTTTGAATCTAACTAATAAAAAAGCTACTGCTCCACATTGATTCTGGTCTTTTAAATACTGGTACTGATGCTGTTTGATATTCTTAAGATCAAATCTTGTCTCTACATTAGTCTCTTTAGCATCAAATACAATAGTTCGTCCTTGATAAGTACCGATATAATCAACAGTTGATTTCTGCTGATAAAAAGCTTTAGTAATCTTACCAGTCTGCGGATTAAAGTTAAGAACTTTAACCGGAATCGGAATTTTTTGTATCTTGGCTATTCCCTGTGAATTATAATATTGATTAGTAGTCTCTAATTCAGTCTCCAACTGCCGTCCACGATTAGCATAACCCTGGCGATACTTAGTCATCTAATCACTCCAGATATCCTTTAAGCTGCTTAATTCTTGTCGGATGCTTCAAGCGGTTTAAAGCCTTAAGCTGTATCTGTCTAATCCGCTCTCTAGTTACTCCCAATTCTTCTCCAACTTCCTTTAGAGTACGGGGCCGACTGTCACGCAGACCAAAACGCAGCCTGATTACTTCTGCTTCTCTATCCGATAATTCTGTTAACAGCTCCTCTAAATCCTCCTTTAGAAGCTGTTGGCTTGTCCCTTCCACCGGATCATCAGCACTACCGCTTGGTACTAGCTGACCTAATTCAGTATCCCTATCATCACCAACAAACTGATTTAAAGAAGCAAGATTCTGATCTGTTATTACCCGCATTACTTCCTTTATTTTCTCTAATGAAATATCTGTCTCCTCAGCTATCTCCTCAGCAGTAGGTTCTCGGCCTAACTCAGTCTGGAGATCATCCTTAACTTTAAATATCTTATTTGTCTTCTGCCAGACATGAACCGGAATTCTAATTGTCTTTCCCTGGTTAGCAATAGCTCTAGTTACTCTCTGTTTAATCCACCAGGATGCATAAGTACTAAACCGATATCCTTTATCAGGATCAAACTTCTCTACTGCTGTAATTAAACCAATATTACCTTCTTGGACGAGGTCCTGTAGATCCAGCCCCTTCCCCTGATGTTTATTAGCAATACTAACTACTAAACGTAAATTATGGCGTATTAATTTATCTTTCGCTTCAGAATCTCCAGCCTGAGCCTTTCTAGCTAAAGAAATTTCCTCTTCTTTTGTCAATAAGTCATGTGAAATATCTTGATAATATTGATTAATAGAATTAATCATACTTCCCTCCTGTTATATATAAATTATTTAAAAAATATTGGATTCAAATTAATACACTACTCTAAACTCTTCTTTAAAACAATCAAACATTCCTGCTTAAATTACAAATCTAAAAAATCTTTAATTTTTTTACCATAAATTATTTTTATAAAAACTGTATATCATTACTTCTAGTCTTACACAATAAATGCCAAAGGAGTGATTTTAAATGGATACTCTTGATAGATTAGCACTTATTCTAGTAATTATTGGTGCTCTAAACTGGGGATTAATTGGATTATTTGAATTTGACTTAGTAGCTAATCTCTTCGGCGGACAGAATGCTGCACTTAGTAGATTAATTTATTCTTTAGTTGGACTAGCCGGCCTATACTCAATCACTTTCTTATTTAGAGAAGAAACCGTTCCAACTGATGAAAGCTAAAAATACAAGGAGTAAAAAGCGACTACCGCTCGGTAGTCGCTTTTTAGTTTAAAAAGAAATATTAATTCTCTTCTGATCCAAACTGCTATCTTCAGCTGTCACAAAATCTATTCTGTGTGATCCTTCAACTGAAAACTCTTCTTTAGTTACTTTAATTAGATGGTAGCCTTTAGGTTTATCAGTTACTACCACTTTAAGAGTTCTATCTTCTAAATCTAATGCTTCAATATCATATCCGACCGCTCCAATAACAATGTTTTCTTCAAAATCAATTCTTTCCGGAGCTTGAATCCCGAAATTTTCGAGAATTCTTTCCAATCTAAATTTAGTATCAGCAGTAAATAAATTATCCTTGACAGTTCCATTGAAATTATTTTCATTATCTCTAGCTAAAGTATCAAAATATATCCCATTTTCATTATTACTTTCGTTAGCCACCTCTATATCTCCTTCATATTCTTCTAAACTTTTTTTCTGATTATCTTGATTATCCGGACAAGGAATCAGCAATATTCGCCCAGGATAGATTAAATCAGAATCACTGATGCTGTTATAGTAAACTAACTGATTTACTGTTGTATCAAATCGCTGTGCTAATCTAAACAGCGTATCTCCCGGTTTCACTGTATATTCAAAGTAACATTCCGGTCTTTGAGGTAGAATAATCGGAAGATTAATTACCATTCCGGTCTGAATCACATCTGGGTCTTCTATATCAGGGTTTACACGAAGTATGCGAGCTACAGTGGTATTATATTTACGAGCCAATAAAAATAACGTCTCTCCCTGCTGAACTATATGCTGGGCTAATTTAACTGACGGTGAAGGTGGTGTTGGTTCTTCCAGTCCAGAAATTAGATCATCCAGTAGATTCAATTGTTGATTTTGAATCCGGCGCAGCTGACGGATTATCTGTTCTGGATCAGAATCTGTTACCTGTTGGTCTAACTGTCTATAATTTTGCTGTAATAACCTTTCCCGGCTACGGACCACGCGCGATAATGAAATTCCATTCATTCTATTCCTCCTTTCTACACTTTACAGTATATTTATGTATTAATCATTAGTTTGTGAGTCCAATTAAGTTATTTACCACCTTCATTCAATAATTCTTCTAATTCTTCTTCATCAATCAACACTTCGCGCGCCTTACTACCTCGATGTTCACCAACAATCCCTTCTTCTTCCATAGTATCAATTAATCTAGCTGCTCTGGTATAACCGATTCGCAATTTACGCTGCAGAAGTGAAATAGAAGCCCGCTCTGTAACGGCTATCCGTACAGCTTTCTCATATAATTCATCTTTATCATCAGTTTCTATAGTAATATCTTTATCCTTAATTTCAGCTAATTTCTCAGCATACTCCGGATTATCCTGGCGTTTAATATACTTAACTAAGTTCTTTACTTCCTTTTCCGAAATAAATGCCCCTTGAATTCTTGTCCCCTGCTGTGAACCTACTGGCGAGAATAACATATCCCCCTTACCCAATAGTTTCTCCGCTCCTCCAGTATCTAAAATTGTCCGTGAATCGGCCTGAGAAGAGACAGCAAAAGAGATTCGGCTTGGAATATTAGCCTTAATCACTCCGGTAATTACATCTACTGACGGCCGCTGAGTAGCAATAATTAGATGTATTCCGGCTGCTCTTGCCATCTGAGCCAGCCGACAAATAGCATCTTCTACTGCATCGGCTGCTACCATCATTAAATCTGATAATTCATCTATAATCACTACTACATAAGGCAATTTCTGGTCAGCCTCATCTTCAGATAACTGGCGATTATAACTAGCAATATCCTTAGCTCCGCTGTCAGCAAATAATTCATAGCGATTCTCCATCTCCTGGACAACCCATTTTAGGGCTGAAGCTGCTTTTTTAGGATCAGTCACTACTGGTGCTATCAAATGGGGTATCTTATCATAAATATTAAGTTCTACCTTTTTAGGATCAATTAACATTAATTTAAGCTCGTCCGGACTTCCGCGATAAAGAAGGCTACTGATAATACTATTAATACAGACACTCTTTCCCGAACCAGTAGCTCCTGCCACCAACAGATGAGGCATTCCGGATAAATCTGCTACTACTGACTTGCCGGTTATATCCTTGCCTAGAGCAATCCCCAGTTTAGAATCAAAGTTTTGAAATGCATCAGACTCTAGAATTTCTCTGAGTGAAACCATGATCTGTTCTTGATTAGGCACTTCAATCCCCACTGCTGCTTTACCCGGAATCGGTGCTTCAATTCTGACATCTGAAGCAGCTAAGGCGAGAGCAATATCATTCGAAAGGCTCGATATACGGCTGACTTTCACTCCCGGAGCCGGATGAACCTCGTAACGAGTAACTGTTGGTCCATAACTTACATCTCCAACTTTAGCATCAACACCAAAGTTATCCAGAGTTTTCTCTAATAAGTCGCCGTCAGCCTGATTTACTCCAGCACTACTTCCTACCTGAACCTTTTGTAGTAGTGATAGGGGGGGGAGAATATATTCATTATCCTTTACTTCTAATTCTTCAGCAAAAAGCTCCGGTTGTTTAATCTCCTGTTCAGTACCAACCTGCAGCTTATTCTGTTTTTCAGTATTTGACCGGTCTGCTTTTTCTTGTTTTGGCAGCTGTTTTTCTTTATTATCTTTGCTGTTTTTATTAACTTTAACCTGACTACTTTCTTTTTCTTGAACAGTTTCCGAATTTTTTGTAGCCTTCTTCTCCGGAATTAACTTCTTTTTGAACTGATTTAATTTATTTTTGAACTTAACAGATAATTCCATAAAATATTCAGTTATCTGTTTTACAAGTGTGGATAAAAATAGATCAGTCGCCAGTAACATTCCGATTAAGCTAACAGCTCCTAATACAATATAGGCTCCTAAATCCTCTAAGCTTCTCCGTAATATATATAGGATTACTGCGCCAACTAGGCCACCGCCTCTTCCCTGCAGAGCAAATTTAAATTCTAATTTAGTCCCAGACTCAAAATGAAACAGAGTCAAAATAACTAAAAAGAGCAGACATAAACCTATTGATCGTCCAGTAATCTTGAATTCTTTATCTCTAACTAAATTAATCCCCCACATTAAGAAAACAAAAGGTACTATATAGGCTCCATTTCCCAAAATCACTTTAAATCCCTGGGTTAAAATCCTACCTACCAATCCTGTAGCTTTAAAATAAAAACTAATTCCTAATAGAATAGCCAGTACGATAAGAAATATTCCCAATAATTCATTATTCCGTTCCTGATATATTTTAACTAGCGTTGACTTCAACTTAAACCACCTCACCACCTTATTCGAGACCGGAATTAAATAATCCTGCAATTTATAATTAACCAAAAAAGAATGTATCCTGGCAGGATACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_014378|1656206:1665151|1661561_1661777_+|WP_013278514.1|DBSCAN-SWA MDTLDRLALILVIIGALNWGLIGLFEFDLVANLFGGQNAALSRLIYSLVGLAGLYSITFLFREETVPTDES >NC_014378|1656206:1665151|1659972_1660521_-|WP_013278512.1|DBSCAN-SWA MTKYRQGYANRGRQLETELETTNQYYNSQGIAKIQKIPIPVKVLNFNPQTGKITKAFYQQKSTVDYIGTYQGRTIVFDAKETNVETRFDLKNIKQHQYQYLKDQNQCGAVAFLLVRFKKLDESYYLPFKLLDEYMIKKQQGGRKSIPYEEIAIDKYKLEANGLVLLDYLSVVDKVIANREEK >NC_014378|1656206:1665151|1658181_1658979_-|WP_013278510.1|DBSCAN-SWA MGDMEELGQKIRQARLDRGITIDKVQKSTKIRKKYLKAIEAGDFEVISQEVFLKGFLRVYANYVGLDGQEILNEYNELIDLRQEVKKGKTEIEEDESTAEKVLCFISNHLMKIVAAVVILLMVFLGGTILYKQGIIGNLTQTEQSNMILSEEKKDNTSQESVSTGIEADTNKQEIKVKDRNTEPSKRNITIKVLETSWIKVVVDGKIVLEEMLSSGTERSWHADRSVEFLSANAAGVKVVLNGEAFGPFGRQGEVIERKFTLKSE >NC_014378|1656206:1665151|1659014_1659803_-|WP_013278511.1|DBSCAN-SWA MSILDSIILGIVQGITEFLPISSSGHLVIFKNLLGFTEPHLIYDVFLHFGTLIAVTVFYWDDIRDLLSLDFKYNKERLLIITATFPTAVMGFVLKDTFESLFGSVSAVGIALLVTGGLLWWVENMNIRFDKKVRNLSLLQAIIIGIAQGIAITPGISRSGITIIAGLFIGLKRKAAARFSFLIFIPAVLGATLLEVIDLFEVGGIEVNYLSLLIGTVTAAVVGYAAIKFLLKALEKDQFEYFAYYVWGIGSLILVFNFISLI >NC_014378|1656206:1665151|1657309_1658059_-|WP_013278509.1|protease|DBSCAN-SWA MFKSRYQNQKVVWTGTDILLIILITISMTLLFNFLVASLLEHLSYIIPGVLSYKQIIVNFLQFATMLIVSMYIIFTKYGLSLKILGFQMIDLKKMVTLGIIGGFGICSMAMLVNLGVQKLIMEWWGIVIPSQPIITELMESQNQLTFILYASLIVIVAPITEEVFFRGLMYQYFKDRFGLFKGGLLAAVIFGALHFSLWSFLATFLGGLGLIILYEVSQSLYTSIIAHATWNFIIVTIIYVLWQVNGVV >NC_014378|1656206:1665151|1656206_1656977_-|WP_013278508.1|DBSCAN-SWA MKILVTNDDGIYADGIQQLARALAKNPDNEVLVVAPDREQSATGHAITLHRPLRVKEVNYDSADAESLAVNGTPADCVKLGIEAILEEKPDIVISGINRGPNLGCDVLYSGTVSAAFEGILLGVPAVAVSLAAYDDLNFTYAAEFISELVEDLAEKGLDKEVLLNVNIPPCNREELEGVQITKLGNRSYINTFDQRTDPRGEDYYWMGGDIVEEGNDEETDVAAVNQQRISITPIRLNLTDFEAIEELSQKDLDIF >NC_014378|1656206:1665151|1662862_1665151_-|WP_148217699.1|DBSCAN-SWA MYPARIHSFLVNYKLQDYLIPVSNKVVRWFKLKSTLVKIYQERNNELLGIFLIVLAILLGISFYFKATGLVGRILTQGFKVILGNGAYIVPFVFLMWGINLVRDKEFKITGRSIGLCLLFLVILTLFHFESGTKLEFKFALQGRGGGLVGAVILYILRRSLEDLGAYIVLGAVSLIGMLLATDLFLSTLVKQITEYFMELSVKFKNKLNQFKKKLIPEKKATKNSETVQEKESSQVKVNKNSKDNKEKQLPKQEKADRSNTEKQNKLQVGTEQEIKQPELFAEELEVKDNEYILPPLSLLQKVQVGSSAGVNQADGDLLEKTLDNFGVDAKVGDVSYGPTVTRYEVHPAPGVKVSRISSLSNDIALALAASDVRIEAPIPGKAAVGIEVPNQEQIMVSLREILESDAFQNFDSKLGIALGKDITGKSVVADLSGMPHLLVAGATGSGKSVCINSIISSLLYRGSPDELKLMLIDPKKVELNIYDKIPHLIAPVVTDPKKAASALKWVVQEMENRYELFADSGAKDIASYNRQLSEDEADQKLPYVVVIIDELSDLMMVAADAVEDAICRLAQMARAAGIHLIIATQRPSVDVITGVIKANIPSRISFAVSSQADSRTILDTGGAEKLLGKGDMLFSPVGSQQGTRIQGAFISEKEVKNLVKYIKRQDNPEYAEKLAEIKDKDITIETDDKDELYEKAVRIAVTERASISLLQRKLRIGYTRAARLIDTMEEEGIVGEHRGSKAREVLIDEEELEELLNEGGK >NC_014378|1656206:1665151|1660525_1661353_-|WP_013278513.1|DBSCAN-SWA MINSINQYYQDISHDLLTKEEEISLARKAQAGDSEAKDKLIRHNLRLVVSIANKHQGKGLDLQDLVQEGNIGLITAVEKFDPDKGYRFSTYASWWIKQRVTRAIANQGKTIRIPVHVWQKTNKIFKVKDDLQTELGREPTAEEIAEETDISLEKIKEVMRVITDQNLASLNQFVGDDRDTELGQLVPSGSADDPVEGTSQQLLKEDLEELLTELSDREAEVIRLRFGLRDSRPRTLKEVGEELGVTRERIRQIQLKALNRLKHPTRIKQLKGYLE >NC_014378|1656206:1665151|1661825_1662794_-|WP_013278515.1|DBSCAN-SWA MNGISLSRVVRSRERLLQQNYRQLDQQVTDSDPEQIIRQLRRIQNQQLNLLDDLISGLEEPTPPSPSVKLAQHIVQQGETLFLLARKYNTTVARILRVNPDIEDPDVIQTGMVINLPIILPQRPECYFEYTVKPGDTLFRLAQRFDTTVNQLVYYNSISDSDLIYPGRILLIPCPDNQDNQKKSLEEYEGDIEVANESNNENGIYFDTLARDNENNFNGTVKDNLFTADTKFRLERILENFGIQAPERIDFEENIVIGAVGYDIEALDLEDRTLKVVVTDKPKGYHLIKVTKEEFSVEGSHRIDFVTAEDSSLDQKRINISF |
9 | uncultured_Mediterranean_phage(16.67%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2424790 : 2438512
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_014378|2424790:2438512|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_014378|2424790:2438512|2437987_2438512_-|WP_013279242.1|DBSCAN-SWA MQPKVGIIMGSDSDLPVMQEAAKVLDDFDISYELTVVSAHRTPKRVQEYAEKATDKGIEVIIAGAGGAAHLPGMTAAHTSLPVIGVPIKTSKLSGLDSLYSIVQMPGGAPVATVGINGAQNAGLLAVQMLGIADKDIRAEFEAYKDRLNERVKDTASELEELGYEEYLKENPQN >NC_014378|2424790:2438512|2433862_2434561_-|WP_013279237.1|DBSCAN-SWA MKFAVVTFPGSNCDQDCYHVAHEVLGESTDMLWHDDTADLSEYDCIILPGGFSYGDYLRTGAIARFSPMMESVIEYAENGGLVIGICNGFQILLEAGLLPGAMKINNSLKFACKYIDLEVINAETPFTNQCSEGEVLNVPVAHGEGNYHIDEAGLQKLIDNDQIVIKYSNENPNGSVADIAGICNQKKNVFGLMPHPERCSESILGNGSEDGYKIFSSIVEYVIKRGEKNGR >NC_014378|2424790:2438512|2434562_2434823_-|WP_013279238.1|DBSCAN-SWA MDWKVEIKILLKESILDPQGQAVEGGLEKLDYNNVSEVQVGKHIELELEDLPSKEEASKQVDEMCQRLLANPVIEDYTFEIEELEG >NC_014378|2424790:2438512|2430292_2431720_-|WP_013279235.1|DBSCAN-SWA 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13 | Synechococcus_phage(25.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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