Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_014393 | Clostridium cellulovorans 743B, complete genome | 5 crisprs | csa3,DinG,DEDDh,cas3,cas5,cas7,cas8a2,RT,WYL,PD-DExK | 1 | 1 | 9 | 0 |
1. NC_014393
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_014393_1 | 1128578-1128666 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_014393_1
|
1 spacers
spacers of NC_014393_1
>1.1|1128601|43|NC_014393|CRISPRCasFinder TAATGATGCAGATATATAGGGATTATTGATGAGAACTGTGTGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014393_1
The CRISPR arrays of NC_014393_1 >merge|NC_014393|1|1128578-1128666|CRISPRCasFinder TTTAAATTAATATAAATATATATTAATGATGCAGATATATAGGGATTATTGATGAGAACTGTGTGTTTTAAATTAATATAGATATATAT >NC_014393|1|1|1128578-1128666|CRISPRCasFinder TTTAAATTAATATAAATATATAT TAATGATGCAGATATATAGGGATTATTGATGAGAACTGTGTGT TTTAAATTAATATAGATATATAT
>NC_014393.1|WP_010076463.1|1127235_1128309_-|galactose-ABC-transporter-substrate-binding-protein MNLLKRTLTLTITLIFIIVTLTSCGLKTIKVSSNVSTKNPIKVGILLYSFEEMYLSLLKKSLEDIEKENTDKVEFTFFDGKANSAIQYQLMDEMINKNFDLIFLNIFESKQEILEDIIYRAKQKNIALILFLSTIPNLDIMKSYSKIAIIAAALKDPPVLEGQIIVDEWKTNKKIMDKNGDNILQYVMLKGKKDSTLSDTRTKYSLETIKNAGIQTDELSTVVCNWNRETAKDAITSLFLRYGPKIEAIIANNDTLAIGAIEGLQKYGYNKGNKSKTIPVVGIDALPEAQELIKKGFMLGSVFHNPRILADTIYTVGMNLVNEKKITEGTNYKLDSSGIIISAPFEEYTLKSIPKTD >NC_014393.1|WP_010076465.1|1125570_1126152_+|DJ-1/PfpI-family-protein MKILLLCAKAFETLEFSAFIDVMGWAREDYKCNISIDICGFEKIVTSTFGVSVMMDVLIDDINVEEYDALAIPGGFREFGFNEEALDVRTLDLIKKFDYYEKPIASVCVAAFALAESGVLKGRNATTYHLDNGKTQGELAKYGINIINKPVVIDKNIITSYCPETAPEVAFKLLEMLTNTEKMQQVKGAMGYN >NC_014393.1|WP_010076466.1|1125175_1125523_+|CatB-related-O-acetyltransferase MGGNGNWKSASDECEIGNDVWIGAGANILRGVTIGNGAVIGASSVVTKDVPPYAIVVGNPAKIVRLRCKEEWIERLQKLKWWELPEEVIRNNLDLFKEALTNDVIEKIENIKANL >NC_014393.1|WP_010076467.1|1124877_1125210_+|hypothetical-protein MCEEAEVIESTLNSRVFVDKYTRIEHSELGEKLRIERNNQIVYSYRGRYCYTGANTVIKNARLESFVSIAWNVSIGGNTHDLNHITTHSFLVYPKWEMGDGRKRKLEIGI >NC_014393.1|WP_010076468.1|1123698_1124511_+|hypothetical-protein MSSKKVMAVLLAVGVVASTSAMVSKINIKEVFAESIKQNVVYTKEDTTTASQDDGTGKVTGAEEEVYKERTLDILKNYFNISVEENENFKFSACILNEKTLDVIQLKEQEWVQEAYDKKEISKEEYDKRMADIERNYNGLKERVKKLKHGLVQATWFGENKCYMFDFNENTKEVDFVMVNEGNPAESDVPLTISEEQLKNTAEDFIKQNKLADIEKPKCIFVKGKHIFYEDENDSAKKAEISINPFTGKVWSFAVKGYADLEYNTAINKK >NC_014393.1|WP_010076469.1|1122159_1123587_+|HAMP-domain-containing-histidine-kinase MKLWLKIYLFSLLLLIFTLNITGFGLIQKLHNNLLEKEVEKCISEQKFASRELRGNSRSLQKNYTDVSPDINNLISTLISEYTSSIDYEAGQHGEIQILDKQNKILYSDVEFPVSSEKKELENLSLGTFNYIIRTLNDKQYLYISSLVKVYNIPVKIHYAKDISNIYIEKINYYTLFVKLDILICSIFAVFMFFISRLITKPINTLIDSTQKISLGQYSERLRIKSKDEFNVLSGHFNLMAQTVEDKINELEVSNIEKETFINNLTHELKTPLTSIIGYANLIRTSKYNEELFFQATDYIYKEGKRLEQMSFKLMDLIYAKTQDVKLTPEKIMPIIVEAEKALLVKLKDKNIDLIIEGEDCILDMDKDLLKMALCNLVENAIKASTNNSKIYLKVSDSHNKTSISIVDWGSGMDKEHLDKIWQPFYVVDKARCRKNNGAGIGLSICKKIAEVHSADIIINSQLGRGTEVTIIFSR >NC_014393.1|WP_010076470.1|1121497_1122154_+|response-regulator-transcription-factor MKINILIIEDEEAISNLIKINLTMAGYESRQVFDGLEALNLLKEESFDLILMDIMLPGMDGFELMKRIKDLNIPVIFLTAKNGLADKVNGLKAGAEDYIVKPFETVELLARIEVVLRRYSKNSNCIEFKSLQIYEDKRIIKKDEETIELTLKEFELMLLLVKNKNIALSREYLLEKIWGYEYMGETRTIDTHIQKVRKKLNIADNIKTVYKIGYRLEE >NC_014393.1|WP_010076471.1|1119189_1121259_+|glycoside-hydrolase-family-31-protein MRFTQDGNRLIAKSGSETIWIEPWGANSLRVRMTKEAIMDANDWALIDKPEATTAKIAIEDIELIEPWIKEEDRASRAQKTQTASIQNGEIIAVFNGEGWLTFKNSDGKILTEEYWRDRNRIDRYCVPLRVEARELKPITGTSDYSLTLRFEAYEDEKIFGLGQYQEKVLNKKGATLELAHRNCQASVPFMMSSRGYGFLWNNPAIGTVTFGTNRTEWSAKSTKKLDYFITAGKTPAQIEEQYANAVGKAPMMPEYGLGFWQCKLRYRNQEELINVAREYKRRGIPVDVIVIDFFHWTRQGDFKFEPRDWPNPDAMIAELKEMGTELMVSVWPTIDSRSENYGKMASEGYLISADRGLNINMNWMGETVFFDATHPGARDFVWQVSKKNYYDKGVRIFWLDEAEPEYGPYDFDNYRYYQGPALQCTNIYPAMYAKGYYDGMVAEGQENVCNLVRSAWVGSQRYGALIWSGDVSSTFRAMREQLQIGLNMGIAGIPWWTTDIGGFLGGYVEDKNFHELLLRWFAFGVFSPVFRLHGERVPHIEPEQAVIDGVAQMMTGSANEIWSYGEQNYEVMKNYIDMRERLRPYVRECMKEAHEKGTPVMRTMFYEFPEDSACWTADTQYMFGPDILVAPILELGERSREVYLPKNQLWKNPKTNEVFEGGQTITVDAPINEIPLFMRAEKEHPIYL >NC_014393.1|WP_010076472.1|1117847_1118726_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MKSKILLKEKATHGTALIPIAIRHLNYAEGLENFFYLHWHSEFEFVYILSGAILYSIEDKEYCVKAGEGLFIHSNQLHAARSFNGMPCEACVVLFHPNLFGHNKQSSTYSKFIYPILEGDLVFENYFKCEEEWQRLVMKLLSELDDLKYENVSENELLLKSKIFEIWHLCYKNSVALAPQGRKNRNYKLERMQPVLNYIHENYKEEITLMALAKILPMSEGQFCHAFKEVMNISPIAYVIRHRILQSCTLLTETDWKIADIARNVGFNNISYFNREFIKAIGCSPSKYRLEG >NC_014393.1|WP_010076473.1|1116762_1117593_-|peptidase MRLLKTLKTNGFFRKLTLSTLLIATTLCTSLPVYAGTSLLPGYTGPIGGPRPLPDLRPDVYPTPISCQQQQTVGQVMLFDSGVKNWGYLPTSGFNVKWFVNDIQVAYGPHNGIGSHTTVMDGNSQLLYTFNSPGTYKITFQVDADNQLAEQNEANNSVTTYIFIYPVDLEPTQITSSLAYPKVWQKITFNTSVKNTGYQNSGDFAIAWYVNDTPVGFGGHNSIPGHSTVDNGNSALDYTFGTPGTYKITVEVDAGYGINEAFEENNKTSMYITVTN >NC_014393.1|WP_010076462.1|1128695_1129910_+|sensor-histidine-kinase MKNRFKSVFIEDFDEMISPKFPVVFGVVLIYLATVFVQSSGKLSFHETIGFTIVMLIQILVFLFSNKIFKHKYWIYFIVQGIITFDYAIIAHEGYKTIVLGLVPLLIIQSMIVYNDAIKVILTSMFFYSIFGGTIIIINGFHELIQSLPLIIIITIAMRAYAIFYFKQVKLRIQTQKVLKELELAYEKVEELTLANERQRMARDLHDTLSQGLAGLIMQLEAINANLSKENVKRANEIVEKSMEHARRTLADSRLVINDLRSYEKRKMDLNKSLENEIDTFKNVSNAFISKDINIEAQISSRIIKQMVYIVREALNNIAKHAKAENVVVKIIEINNKININISDDGVGFDIRILDKLFGHYGIVGITERVKAINGEIKIESKRKVGTNINIIIPIEKGIDEENG >NC_014393.1|WP_010076461.1|1129893_1130556_+|response-regulator-transcription-factor MRKMDKRKILVVDDHLVVREGLKLIFETEEEYEVIGEAENGEKALVLIEQLKPDVVLMDLNMPRRSGLEAIRALKEKKNPVPIIILTTFNDENLIREGLALGARGYLLKDSTREELIRTVEAAIRGELLLQPEISGIIFGAKKESKESNNTFNAGITERELFVLQAVARGCTSKEIAVDMGIAERTVKAHLTNIYSKLKVESRPQAVAVAIEQGIIHIEK >NC_014393.1|WP_010076460.1|1130637_1131468_+|SDR-family-oxidoreductase MRKVCVITGGGSGMGLATAKIIGKDNYIIIVGRTIKKLEKALEELRAEGIEAEAFACDISDEASVNKLAAHAKEIGTISSVIHAAGMSPHMGEAVTIMEANALGTININEVFYKVMEKGSCIIDVSSMSAYLTPKFIMPKGSYKYSRTNKEIFMKKMMARVNLFPKKVRSGVAYGISKNFVTWYAKTDAAKFGQKGIRVLSISPGSFETPMGEVEKDEVENLIKFCAIKRLGHVEEIANLMAFCASDKAGYLTGVDILCDGGCVASGCNPLKMKQS >NC_014393.1|WP_010076459.1|1131775_1132576_+|SDR-family-oxidoreductase MKVENKNIVVTGGGNGVGREVVLKLLSKGARVIAIDINKSALEETYKISGGSDKLLTRVVNITDKKAVLDFAEEIIGTLGYIDGVINNAGIIQPFVQLKDLTFEQIDKVMDVNFYGTLYMTKAFLNHLLTRPEAHIVNIASMGGFFPVPGQSAYGASKAAVKIMTEGLYSELSDTNVHVSVVFPGGIATDIKKNSQLTNESASEKEKNSKLILSPSAAAEKIISGMEKNKYKFCIGKDSNLMDFMYRINPGFATKVIKRALGSKIH >NC_014393.1|WP_010076458.1|1132731_1133496_-|DUF975-family-protein MWSRKELKNRAKDILRKTYWRALVVSIVIAITGGNDAWSGGGNGRSNYKDFKNHTYSNFHYSDFIDWHFILVFASIFLIVSVLILAFRIFVGYSLEVGGKRFFTQASQYGDDRICLGFGFNGENYKGIVKTMLVTNIFIFLWTLLLIIPGIIKAYAYRMVPYILSDNPNIGTEEAIALSNKMTMGHKWDMFVLDLSFIGWYILGSLLCGIGVFFVMPYSNATNAELYLVLRRNALENNWCSRRDLLLDDANNTW >NC_014393.1|WP_010076457.1|1133974_1136269_+|glycosyl-hydrolase MKVKQLVKKTTVSVATLAIFSTMLGVQAHSETVSKTYNYAEAFQKSMYFYDAEKCGAGITGGKLEWRGDCHTDDAKIPLVPAGKGADGAMAEKGVSLTQEFIDANRKYLDPDGDGTVDLSGGFHDAGDHVKFGLPGSYAAATLGWGFYEFKDAYARIGEEAHMRDLLKWYSDYFLRCTFMNENGEVVAFCYQVGEGSSDHSYWGAPELQPTLRPAYFATPQTPASDQVAGAAAALAIMYLNTKDTDAAYAEKCLSTSKALYNFAVKYRGLGYSGGFYGSSYDEDELSWAAVWLNIATGEKSYINDIVEVSPDGRYLGYLGKIIKSTQDDWQNIWCHSWDVVWGGVFAKLAPITNTERDWYIFRWNIEYWSGVPHEDPSDKTFMAATPGGFKVVNTWGSARYNSAEQLCALVYKKETGSSDFDAWVKSQMNYILGDNPLNRCYEVGYAENSAKHPHHRAAHGSITNNMGVPNEHRHTLWGALVGGPDQTDSHKDDTTDFVGNEVAVDYNAGFVGALAGITKYFGQDQMPLENFPLKEAPVDEFFVESKLEQENGERTQVTIRANNLTVHPPHTEDTIKVRYFFNISELMQYNQGIDAITCPVMYDQSNTVDVKGATISAPVEWDKEKGIYYVEIDWSGNAIYGSREFHFGLVTGQDSNWKAHWDPTNDWSRQGVTEEYAQNPHISMYVNGKKVFGEEPTTKVLVIKGDADGNGKVTAIDLAYIKKYILGQGSIIFPGGIEVVDMNGDGVINAIDLALLKKALLGL >NC_014393.1|WP_010076456.1|1136580_1137015_+|chromosome-partitioning-protein-ParB MKDMKFTVEEAISFSKEGKIEEWVHLFLNSVGNNVPFSEGLKLQKRYWTGPLLISIDKLRRCCGPEPGMEYYNPPEHWEPRIFNLQELIRKGWGMPPLIVQHEGDDFRINDGNHRVEAMTREGIEKCWVIIWNSHYQDDINDFY >NC_014393.1|WP_010076455.1|1137608_1139600_+|class-I-tRNA-ligase-family-protein MKDKKIERPIFPKKAIITAGMPYGNKDLHFGHVGGVFVHADTFARFLRDRIGNENVIFVSGTDCYGSPISASYLKLVEEGKYEGSIEEYVREYHEKQKEVLEKYEMSMNLYAASALDRAGEIHKGVSEEIFNKLYDNGYLAKASSPQFYDPDFKVFLNGRQVVGKCPIEGCSSDKGYADECDLGHQYMPDELIDPKSILSGKTPELRKVTNWYFKLEEYNNTLAERVDYLRANSNLRKNLLNTIEESLKPPVIFVKRKQLEGITDLEEKLPKHRTIDEPKKPSITFVFESLEDRDIARGVFDEVGVRFRTGKTLVPFRLSGNVEWGIPVPDKEELKALTFWVWPESLWAPISFTKTYLETIGKNPDQWTEWWHSEDSKVYQFIGEDNVYFYGIAEMAMFMALEGIKAGDKIDWDKINLPHLIANSHLLFMNKKASSSGAVKPPMARELLEYYTPEQLRMHFLSLGLSKGSVSFMPQVFMEEKDKQGPDTVLKDGNLLTNVFNRLVRSCFYTAQKHFNGTIPVGEISDSIMEESKEAILTYERHMYNHEFHSLIYVLDSYIRNMNKYWVNNMRVADTSDDNALRKQVLIDAFHAVRTVTTLIHPIAPKSCEKVREYLNVNENLWNWEYIFEPVYKFIVDQTMHKLKFLEPRVDFFEKHQSQISF >NC_014393.1|WP_013291570.1|1139995_1140469_+|IS200/IS605-family-transposase MDNSSLAHSKWNCKYHIVFAPKYRRQIIYGKIKADIGVILRKLCEHKGVEIIEANACKDHIHMLVSIPPKLSVSQFMGYLKGKSSLMIFDRHANLKYKYGNRQFWCKGYYVDTVGRNKKIIEEYIKNQIQEDLAYEQMSLKEFIDPFTGESVNKGKK >NC_014393.1|WP_010076454.1|1140718_1141066_+|PadR-family-transcriptional-regulator MPRKDSIDIGELTDSAFYILSSVIEEKHGYLIMKTIEKFTNNEVTIGPASLYTTLKKLLSAELVELSPSAEENKKVYKITGKGREMLIKEIERKKQMVKFAENCFELEKGDIHGQ |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_014393_2 | 1581437-1581528 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_014393_2
|
1 spacers
spacers of NC_014393_2
>2.1|1581464|38|NC_014393|CRISPRCasFinder CTGGTATAGTATCATACAACTGCTCACTAGTTACATTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014393_2
The CRISPR arrays of NC_014393_2 >merge|NC_014393|2|1581437-1581528|CRISPRCasFinder TTAAATAATTATCTCTAATATAAAAGTCTGGTATAGTATCATACAACTGCTCACTAGTTACATTATTAAATAATTATCTGTAATATAAAAGT >NC_014393|2|2|1581437-1581528|CRISPRCasFinder TTAAATAATTATCTCTAATATAAAAGT CTGGTATAGTATCATACAACTGCTCACTAGTTACATTA TTAAATAATTATCTGTAATATAAAAGT
>NC_014393.1|WP_010076093.1|1578572_1580306_+|AAA-family-ATPase MGIMSETILKSVNYYIYIYQNALIVIGVIGSIWAIVSNFKKYSYRREFAIFVKTTILMFLSSLILEGIGIASITAIEEKIFHDISAMMIIGFFILFVVEKLFFYRIDNKGYHIEQDFIGYLIYLVYFLMVIAMGYGLKYLLFALSWQIVLISLRFNMNTKKVEVKKKDRLYPSRKEQLKTVEKIINESEYKNFAIAISGKWGTGKSLFLEALMARTEENSNYCIYIKPMITDTRETLISEFQKRLSNIMIKNGIYCGRYSALESYFKEVLGLLTVSGKASIVSLIKGVEESKSYRDFKEEVQRDIDALLSESNKLVVVIDDFDRIDEKKQLDVLTFIKEVIDFKGCIVIFAFDYNNITDTKFITAEYLEKFIATKINLINVSFDELINYHRDEGLSVDNIKSKYVKDILTNIYDNSIDYFNEQYEYFVQAINKNHEVYLINDDYETQLVEFKIRLRDSIDNSVRVIHFLKEILTSLITIEATNNQDKSIENFFLAEEVAKLVFTVNFIKVFQRKIYDEKIEVQGMKTYLESNTSKFKSIDEAYVRILLSQVLICNDDNKDMNAKKRCVSLATKFMKI >NC_014393.1|WP_013291660.1|1577750_1578206_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MAIDFNFIESFTTSKYYQEVINCRSRLLFNSHTNSPYSYLEDLEEDLQSYHYGAFEGENLIGYVRLYINGDTAKLSRIFVKDQYRGTGIGYKTIKSLLEECREKSLDKLVLFSRLDAVDFYKKLGFVNTDEIIVSPTSGLELNKMVFYINS >NC_014393.1|WP_010076095.1|1577130_1577583_+|hypothetical-protein MKRDVKKSLEKVVDTVETTAKKTAENLETVAKEVGSAAKKTAQEVMANDTVKKAVNTTKATASKVAKEGEAAVKNTVQKVAKKKVLSDGEFYIQSCNNEISYNDIMKSISKELEEIVDFAKVKEFKVYYKVEEKTAYCVVNGTDTYKVAF >NC_014393.1|WP_010076096.1|1576450_1576861_-|hypothetical-protein MDFMNFIQGINPVILIGLAILIAFIILKNILKKVVKIILLILGIAAITGGSISTLNLKNYASSVVPNVQDVINSYAQQNGIDLSTLNENDLNSLNEYIKTNYPKVEVKNDNGNLVLEVSKDDFFNFKTSVTLKKSS >NC_014393.1|WP_010076097.1|1575172_1576216_-|hypothetical-protein MSRKHQPVKKRHPIRNGILSILYIGIFIGVTSPLILFYGPYSTLKQLVVSTVMATRHQYLITTFLSQADIDALLGKKEQTVVASSTPENATKSPATSSTPTTDIEIKHKNSTEINQYKIEHDRYIAHILEIKDPTKIKAVMTKYVGKNGQKTSEMALDYDAIAAINGGAFADVSASGQKWAGNGAIPGGFVITNGAIVYPKENVNKYDVQNVVAFTKEGKLVVGDYCINDLMAMGVTEAMCFRPPSIIIDGVAQITDKLQDGTNPRTAIGQKADGTVVLLVIDGRTLSMPGATLYDVQQIFKDLNVVNAGNLDGGYSSTMYFNGEIINSPNAWSGERTVATAFIVER >NC_014393.1|WP_010076098.1|1574077_1575163_-|hypothetical-protein MKLFKRILILTAIALILENGALYYLNKNYFKPTEEINIVKIESPKIAETDNSNKTTLSGKTEKINASFDGNYISYMEDSTLKIMNLSTKEIQNVVPNDDMKFDYYEWLPDDNRLIITERPSNMSNSYSIYLFSYDVKKKSKQQLIDFDNVYCHIALDNIEEHVSNISFSSSNTYMCVQIAKPNGKSNLYSFDVMSKKNIMKENASVTGNIDVIPGDTAIVYQADNSVYQIESFTDKNETTKYNGSYLSINGANSLLLLDVDDKSNIYIGSVVNGLVTSVYYGQKNTDANSWTLINLSKPVKAEDISIGLKGEIYVIDSQANTVNELNSKATYEFKGKLISICSKGIISLDGNTLIDKPFSK >NC_014393.1|WP_010076099.1|1573074_1573917_+|DegV-family-protein MAIKIITDSTSYIPKEIRESLDIKILSLEVNFEDMSFKETDIENFEFYKLLETKEIPRSSQPPIGEIYNEMKRIIEEGNEIVGVFLSSDMSGTYSTANLAKEMVLDEYPEAKIEIIDSRSNCMQLGYAAIVAARKAKEGQSIGEVRQAVEENIKRSRFLFIPENLVYLKKGGRIGGAGALIGNILKIIPILTVENGVTSVRAKVRTKNKAISAMVDMMQKDNETFKIKEVMIHHINCPEEAQKLSLQVGELLQMKVEICDIGPVIGLHVGPGAIGIVYYN >NC_014393.1|WP_010076100.1|1572633_1572891_+|hypothetical-protein MSKKNIFISIIAIVVILFLAIYILPWIIVIAALVYVFFKVKAYIFGRKEKDISAEDSKVYVGDKNASEKMKTREEVIDVDYKPID >NC_014393.1|WP_010076101.1|1569947_1572374_-|glycogen/starch/alpha-glucan-phosphorylase MNITRERFKQDYEQKLMSLFTEEIDKASTLDKYLALGSLVKEYSAKNWSKTKKQYSKDGDKQVYYFSMEFLIGRLLQSNLINLGIRDTVKEALAELNVSLDELEETEVDAGLGNGGLGRLAACFIDSIASIGIPGHGNGMRYQYGFFEQKIVNGYQVEIPDNWLKEGNVWETKREDKSVIVKFYGTPKAVQNNGRLNFELENYEAIKAVPYDTPVIGYENNTVNTLRLWSAEPVTNAFNFQIFSKGEYSKAVEYRTSVEAISSVLYPDDSAETGKILRLKQQYFFTSAGIYSILRTFKNSGHSLYDLDKYVAIQINDTHPAVAVAELMRILVDEEEMGWDDAWSVTTGTLAYTNHTILSEALEKWPVQVFNKLLPRIYMIIEEINRRFVGEIYQKHPNDHDRVRRMSIIEGGMVKMAHLAIVGSHSVNGVATLHTEILVNKELRDFSEFYPRKFNNKTNGITHRRWLIQSNEELTSYITKCIGDSWKKRPKDLAQFAELSKDPLVRKRVGEIKLHNKQMLADMVKKDYDIDVDPNSIFDIQVKRLHAYKRQVLNILHIMDLYNRLKDNPDLDISPRTYFFGAKSSPSYHLAKETIKLINTVADKINNDPSIKGKLKVVFLENYRVSLAEKIIKCADISEQISTTTFEASGTGNMKFMMNGALTLGTLDGANVEIHDEVGDENMFVFGMSKDEVLNYLKYGGYSPRHFYNTNSRIKRVLDQLVDGSLGVATTEFRNIHSSLLGRDEYFVLKDFDSYCEAQERIDKVFRDKDKWNEMCIVNIGKSGRFSSDNTITEYSREIWNTSPKEIH >NC_014393.1|WP_010076102.1|1568421_1569765_+|NADP-specific-glutamate-dehydrogenase MDCKKYINDIIEKLERENPGETEFQAAAKEVLISLVPALEKNPKFIEEGVVERIIEPERVVMFRVPWVDDNGKVQVNKGYRVQFNSAIGPYKGGLRLHPSVNLSIIKFLGFEQIFKNSLTGLPIGGGKGGSNFDPKGKSDREIMRFCQSFMSELARHIGPDTDVPAGDIGVGGREIGYMFGQYKKIRNANEAGVLTGKGLTYGGSLGRTEATGYGLVYFVDEMLKDNGLSFQGKTVVVSGSGNVAIYATEKATELGAKVVACSDSNGYIYDKNGLDLELIKRLKEVERKRIKEYVAVHPEAEYHEGGNIWSVPCDIALPCATQNEIDEASAELLVKNGCIAVGEGANMPSTLDAIEVYRRNKTLFAPGKAANAGGVATSALEMSQNSMRLSWTKEEVDAKLKNIMKNIYVSSKACAVDYADGRDLVIGSNIAGFLKVAEAMVAQGIV >NC_014393.1|WP_010076091.1|1581611_1582976_-|L,D-transpeptidase-family-protein MKHKKALLSVIAAASLILIGIYIRNVVYFNNKLLPNTTIYGINCSSKTPEEANSLLRDKLSNTTYSVKENDVENFSFSASEIGLNRDFTDQLKNILDNQNSLGWFINSLGRKDKYDKLSNVIFNDEAFNTYLSKINLNQGTRTTSQDAYIDKTNDSFTIIEEIYGNTIDVKSATDKIKESILNDTTNIDIADCYIKPSILKNNANLIASLTKANKMKDIKVDYLFGTRVETVSTADKMSWLTFNGTNVDFDKEKIRTYIVALGNKYNTCGSTRSFQSTTNGVINVSGGLYGFYILTDSETEELYNLLSQGNPISRAPLIEGTGITNSSNDIGNTYVEVNKAAQHMWFYKNGSLVVDTDVVTGTTDGVHDTPVGVHYVLYKESPAILRGPGYAAPVSYWMPLTWDGVGIHDATWRSAFGGNIYTYDGSHGCINTPYGAVQTIFENIDAGTPVVIY >NC_014393.1|WP_010076090.1|1583086_1584457_-|L,D-transpeptidase-family-protein MNRKKIIIGSAASVALILFGIYLANALYLRDKLLPGTNIEGIDCSYKTIDEVNQLLMDKHKNTKFSILEGTSESLSFTGSNIGLDRDLTNELSQVREKQNSLTWPLGLISKKALDEETSNLLFNEDAFNTYFSSVNLNKGNRLQSNDAFLNRNNTNFIITEEVYGNTLNVETAINKIKENIKNGADTIDISDCYEKPKVTKNDEKLISLAAKANDLKKINIEYKFGTRREVASDVNKMDMITYDGNDVYFDKSKVNNYVVSLAQKYDTYGSTRSFKSTRRGVVNVTGGVYGWYILTESETEELYNQLLEGNDISRVPNYDGTIIKNEDNDIGSTYIEVDILNQHLWFYKNGALLVEGDVVTGNASNGHDTPKGVHYVWSKESPSILKGQDYETRVEYWMPIEWTGVGIHDAIWRNPAEFGKNTYLTNGSHGCINSPLILAKTIYENVEIGTPVIVF >NC_014393.1|WP_010076089.1|1585002_1585689_-|CpsD/CapB-family-tyrosine-protein-kinase MFKSLITYRDPDSITSEIYRTLKTKLQFVNIDNDIRTLLVTSASKAEGKSTTTANLAITVAQSGRKVLIIDSDIRKPYIHKLFSLPNKTGLTTVLTNQCDLMDAIQETEVDNLHILCGGKIETNSHQLIGSKKMSKLIDLVENNFDMVIIDGPPILLVTDSQLLANQVDGVLLVTCYGKTEKKALVKAKKTLDSVNANTLGVVITKVPKPPKIEENYSYYYSEEDDDE >NC_014393.1|WP_010076088.1|1585698_1586379_-|LPS-biosynthesis-protein MDLHELLYIIKKRMVLMVSITLVIGASGWIFSTLFINKLYTSDISVIIGKNYRNPAEGESSIATYSDILMYQKAVKTYGKIATSRTVASDVIDKLSLNYSPSALLGSVAVVTPSETEFMTIRVTLRNPEEAALIANQWALSLKEISKEIQGTDNVKILDTAQVPKSPSSPNLKLNIIFSFGAGFSLSVVLCFLLEIFDTTIKSENDVLKLVSLPVLSSIPNFEIDE >NC_014393.1|WP_010076087.1|1586980_1587718_+|tRNA-pseudouridine(38-40)-synthase-TruA MRNLKLTIEFDGSRYKGWQNQKDKEQTVQGKIETVLSKMTGEEIEVIGCERIDTGAHADGYIANFKTNCELSCTAISIYLYEFLPEDILVKFIEEVDERFHARYNAKAKVYEYVINNNNLRNVFNRKYSYHIDIDLNIEEMLKAAEAFKGKHDFKAFTNLKSSAKSTVRTVEDILIKKDNGLIKIELIADDFLLNMERIIVGTLIEVGKGNVKATNVFKMLKDGKKIETIPMAQAKALFLKKVIY >NC_014393.1|WP_010076086.1|1588090_1589119_+|3-deoxy-7-phosphoheptulonate-synthase MSFEYLNKMPSGEEIKELYPLSSKLVEIKRQRDEEIRKVFEGKSDKFVLVIGPCSADKEDSVCEYVSRLSKIQDEVKDKVILVPRVYTNKPRTNGDGYKGIMHQPDPQREPNMAEGVVALRKMHIRVMEESGLTAADEMLYPENYAYLDDILSYVAIGARSVENQQHRLTVSGLDIPVGMKNPTGGDLNVMFNSVYAGQHAHTFEYQKWEVKTQGNPLTHAILRGSVDKNGGNHVNYHYEDLLQVTEMYAQKKLINPAIIVDTNHANSNKKYDQQPRIAMEILNSCNSNSDIKKIVKGLMIESYLVGGTQPVTGDVFGQSITDGCIGWEETRSLILNIAERV >NC_014393.1|WP_010076085.1|1589640_1590264_+|hypothetical-protein MSRVLGKIHYWLFNKIQWFEGLEEEIADISKEKGIITEQWQLELYNKYGEPTPKIPLEEIIDTDNIHGWLQERIHSAEGRQAEYITKILKEEPKNIEFLMDIYKKQGLKAGALEVVDNAIAIYKELNNYILEGMPCDRVIELIENSEEIVSWRIVEDLHGHFYDSIGGDVNNFHNLRKMWIKSFVEGTNSGYTYMTTENGDHVIERV >NC_014393.1|WP_010076084.1|1590275_1590830_+|hemerythrin MNAIEIMVDEHRYIKRMLVVVRKLCIKIMNGEDVNFSDFYRVMDFVKNYADIHHHGKEEQLLFNRMLDETGKVAEKLIKSGMLVEHDLGRLYMADLRSALEKYEKGDEESKLDIISNAMGYTYLLKRHIEKEDEVVYKFAERSLSKETLAEIEVQCIEFEKKQSAEGIQTKYIALLEELEKKLK >NC_014393.1|WP_010076083.1|1590892_1591915_-|LCP-family-protein MESRTSRIKKRKKKKALKITIIAIVSILIFIIGIVVSFAYTKLNQVNRVAISNNDLDLGITDDVKSLLDNKFVDENTGKEVPYHSVQNILLTGIDHVENATDTMIVVSIDKTANKIKMTSIYRDTYIENTPEGQVPKLNYAHKYGGIQNTVKVINENFKLDIRDYVNVDVQGFFNVVDSIGGVTLNVPTEDVWAINKKIDFICENDYPSADPSSNYLSQGGPQELNTIQTIAYVRYRTSSGDYARTDRNRAFMEAVLNKIISMPISQYLSLYDSISQYFETTLSSMDLINLVKSAISYAPNGIAQSAFPYDAETIFVNGWNYFGWDQPSNIEKIHEFIYK >NC_014393.1|WP_010076082.1|1591928_1593134_-|hypothetical-protein MNKLYYENQYKKDFTAEIINILEKDNEFHVELDKTYFYPEGGGQPSDTGFIETSKVTYVYEDQGIIYHVVDKKPIKLKKTKCSLDWNRRFDHMQQHLGQHILSAAFLELFNVNTIAFHLGSENCTIDLDKPLTDAEIREAESLANKTILENINVEFLFPSKAELKKFHIKKTIPKTNDAIRIVKIDDFDINPCCGLHPNSTLEVQIIKIKKYEKHKTGIRLEFLCGNRGIKDSFIIEDFVTKLCRTLKCNHEEALENITKQSTNIKNLLAENKELKSIIADYEVKTMIDNGEKVKDITIIKTIHDTDDFKYVNLLASKLTTFDNVVVLFAVKTSDMAKLLFMCSRNILNLNMGTLLKDAITLIDGNGGGSNISAQGGGKNIGNLQSCMDYAFMNIKNTLTI |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_014393_3 | 2598493-2598666 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_014393_3
|
2 spacers
spacers of NC_014393_3
>3.1|2598515|64|NC_014393|PILER-CR TCCCAAAATGCTCCAATCTGTAAAGCCTTGAAATCACTAGCCTCCTTTGTTCTGAATTTTCTTG >3.2|2598601|44|NC_014393|PILER-CR AATATTATTTCTATTCTTTTTCTATTCAAAATTCCATTTAAAAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014393_3
The CRISPR arrays of NC_014393_3 >merge|NC_014393|3|2598493-2598666|PILER-CR AATAACAATAAAGTTTAGTCATTCCCAAAATGCTCCAATCTGTAAAGCCTTGAAATCACTAGCCTCCTTTGTTCTGAATTTTCTTGAATTATAATAAAGTTTGGTCAAAATATTATTTCTATTCTTTTTCTATTCAAAATTCCATTTAAAAAAATCATAATAAAGTTTGGTCAT >NC_014393|3|1|2598493-2598666|PILER-CR AATAACAATAAAGTTTAGTCAT TCCCAAAATGCTCCAATCTGTAAAGCCTTGAAATCACTAGCCTCCTTTGTTCTGAATTTTCTTG AATTATAATAAAGTTTGGTCAA AATATTATTTCTATTCTTTTTCTATTCAAAATTCCATTTAAAAA AATCATAATAAAGTTTGGTCAT
>NC_014393.1|WP_157629736.1|2598135_2598294_-|hypothetical-protein MAKFRDGFEYEKLVKSTRSARELTRDISLFCRKLKNLAKLLSNIRVNALICI >NC_014393.1|WP_010076852.1|2597321_2598065_-|hypothetical-protein MIIEKNNINFKFNDSVNHEEAVNIITKFFKYLDIVLNDRKYGEFLKYVDYTVEAKLGANYSTDDKTMTIPMFDFGNLDEVIYNELVHVKVIIDNYDMLKKAMNEKINNALAFLSEYYAIYETKLYFYNKNPDILKLKGEIDSMWREKKLYFEKGNELISKYEKILKSNNKKLISEVEISFGNEVKEFKKNINYFNAQWLGNVSVYNQYSENKFTTSYDEVVDKIANYIDSINYPITIEDLKYIEGLL >NC_014393.1|WP_010076854.1|2596292_2596631_-|protein-tyrosine-phosphatase MINIKLLFICSRNKWRSLTAEKIFNKLNGYSVRSAGTETNARIKITEGHIGWADMIFVMEKKHSQKIKNRFNHMLYAKRIICLDIPDDYGFMDEELIELLKARGSEHIEIDF >NC_014393.1|WP_010076855.1|2595886_2596225_-|DUF2500-domain-containing-protein MFSFQIIFFIFFAFVAFMGIATYIKNENSPVISTKAQLIKKKRDMHSHTDGNGMMSTNEALILIFQLDTGSEIKFNVGRRVFRNITEHEWGTLTFKGTRFLKFQSVSGSVER >NC_014393.1|WP_010076856.1|2595021_2595879_-|aminoglycoside-6-adenylyltransferase MRNTQEMMDLILNIAKEDARIRAVYLSGSRVDPDATQDKYSDFDIVYIVNEIQSFTKDDHWLDQFGDRLIMQKSVDWYSHQYDYNSNEDFIYLMQFLDGNRIDLTLVDIENVKRRINDKEPRIILLDKDGIDGLHNIEVKDYYYIQKPSKEEFRDCCNEFWWLNTNIAKGLCREELMYVKFFMEHYQMDMFLKMLNWKIGIEYDFSVSTGKCYKYFKRYLSDSDMDRFTNLFPNGEYKEIWDKLLKICEFFHELAITVSTHFNFEYSKEEAENVIEYLKRMQMMA >NC_014393.1|WP_010076857.1|2594417_2594912_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MEFRKGNLAEIQEIMRIIRDSIKNMEQNGIYQWDDIYPNEIVIQEDIQGENLYVCISDNKITGFAVLNNYQDREYESISWNTTSDNNLIIHRVCVDPKYQGMGIATKLIQYAEKRGKEEAYDSIRLDSFTKNSIACRLYENNGYEKRGIVKFRKGEFFCFEKKL >NC_014393.1|WP_010076858.1|2593340_2594276_-|hypothetical-protein MKKTAYLLIIMMLMISLLSGCKSNSLIQLNVKEGDSYKVTQQIEQNISIKLGQQGINMSGNTTIVYIYNIIDVAEDGITTINVKYDSLIEKQNAVGATLDFDSTKDMDNSTPQNLALKSIIGKEFSFKISREGKILNIDGVNEILEAIVSNIKDIDENQKGVLTHFLNQTVGNDAIKDSLNQSMDIYPGKEVKVGDSWTKETVLNAAVPMKINSAMTLKEIKDDLVTIDVNSELSANDIIKSLQTVGINMNYNGTGKETKTLKVSKSNGFLQSGDIIQTLSGTGDVTMQGKGISIPMDIESKTNYTSQKLN >NC_014393.1|WP_010076859.1|2592517_2593318_-|TIGR00266-family-protein MNSHEIDYKITGDDIQYVEIELDPKETVVAEAGAMMMMDPSIQMETIFGDGSNQNPSSTFKDKLFYAGKRVLTGESLFMTAFTNLGNIKEKVYFAAPYPGKIIPMDLSLLGGRIICQKDAFLCAAKGVSIGIDFRKKLSVGFFGGEGFILEKLEGDGVAFIHACGAIIKKDLMPGETLRVDTGCLVAMTQEVHYDIQFVGGVKNTLFGGEGVFFATLTGPGTVWIQSLPFSRLAERVFAAAPHLGGHRKDEGSALGILGNILGGDR >NC_014393.1|WP_010076860.1|2591940_2592243_-|Dabb-family-protein MIKHIVMWKLKDTYEGKNKQEIATKIKEDLESLKNVINKIKTIEVGINFNDSAQASDVVLYSEFENEDDLNTYQNHPEHIRVAGYVRNVNIERVVVDYTA >NC_014393.1|WP_010076861.1|2591486_2591903_-|DUF2809-domain-containing-protein MIYKRNRYIYFIFLVSIIALGLFTRKFPELFPNILNIYLGDALWALMIFIGLGFLFPSKNMWIIAIFAILFCYGIELSQLYQGVFIDSIRKTSIGRLVLGVGFLWSDLIAYILGISLGFLLESIFFIVLRKSKKINRF >NC_014393.1|WP_010076851.1|2599031_2600030_-|hypothetical-protein MALFESYERRINQITPVLEKYGIASLEEARQISLDKGIDVYNIVKSTQPIAFENAMWAYIVGAAIAIKKECKVAADAAAAIGEGLQAFCIPGSVADDRKVGIGHGNLGAMLLREETKCFAFLAGHESFAAAEGAIKIAEKANKVRKEPLKVILNGLGKDAAMIISRINGFTYVQTKFDYYTGKLEIVKETPYSTGLRAQVKCYGSDDVREGVAIMHHEGVDVSITGNSTNPTRFQHPVAGTYKKECVEQGKKYFSVASGGGTGRTLHPDNMAAGPASYGMTDTMGRMHSDAQFAGSSSVPAHVEMMGLIGMGNNPMVGATVAVAVAIEEAAK >NC_014393.1|WP_010076850.1|2600050_2600743_-|nitrogen-fixing-protein-NifU MIYSTEVQHMCTVAKGPNHGPAPIPVEGKWVQAKEVSDISGLTHGIGWCAPQQGACKLTLNVKDGIIQEALVETIGCSGMTHSAAMASEILPGKTILEALNTDLVCDAINTAMRELFLQIVYGRTQTAFSEGGLPIGAGLEDLGKGLRSQVGTMYGTLDKGPRYLEMAEGYVTRLALDADDQIIGYEFISLGKMMDAITKGTDANEAKEAATSSYGRFADAAKYINPRHE >NC_014393.1|WP_010076847.1|2602080_2602488_-|aegerolysin MAYAQWVTITILPDNCDVVLKNFQLDWGKFYAPNNKDAEIDKNTLENYQVKKEIPYSISSCGREDASSGTEGSFNVCDDQGQQICNIYWDCPWGSSTNTFKVSSINTGYMVDYSGDNLDGGALGTVTVEIFKKYA >NC_014393.1|WP_010076846.1|2602890_2603316_+|hypothetical-protein MNNCSFNLNNCNEETEETLGYVVSSNNKSFIHVGKSSKYDGCFEKGLLVPGAPLIVNKKEYVPDTIPGIETITLECNNDPVTKYSIIVKGANPYEKKGIKLLFTDCNDEVYILRIYSRINKEHIFNYQSSAGYIKKISWYS >NC_014393.1|WP_010076845.1|2603378_2604338_-|hypothetical-protein MKRIFNFAFILFVFLLVLRSTSVQASDASIEIKTLGEVKKGNFIDIQIDLNNITNMYAASVDFNYDSKIILVKNISVNRSITGENIYEYNYPNNENNKAKYGFTFLGDTKGYTGTNNFLSIKAEVLSDGKLNINSDNFKIELVEKVNTSLVDIDYQLIVTEQMKKVKEPNNDESRKTESSASNNIGSNKNIEQNNITENSSFIDKTEINTTKTPLQQETTKIEKNNNSSGLLNKVQNVDSSNDAVPKDNTINDILDFNDKEGINVATETLPKDEANNPIDIDEKSSNSFFLPVIIIAILLILGSIMFYKKVSRRNIKRI >NC_014393.1|WP_010076844.1|2604415_2605849_-|hypothetical-protein MNKLNKLLAITLVLNSMLFNVDIRGTELPNTQVKTASLQLNDFDNSTTKTLDYSANTYATSTADGLAITEAIYNGLVNFQQTIDLSAFASVIDTPQIPLDLYCLVYKQAPDLFYISNNVRCSYTTDQNGKIVSYKLYISYLYDIPTCKIMKQKLDAKVNYIKENYLDLVDSEVQKEYVIHDYLIENCTYDSQSVSSGNVPLISHTSYAALINGKAVCDGYSKAASLLFEKCGIESGIIESAPMNHAWNIVKIEGVYYHLDVTWDDPVPESNKNRYAYFNCSDNEMNKDHSWVPVDSIAAPSNKFSFLRSYSYIARTEDTLNYKVGNSLTYTNLYGANSTNELLSFVTNDFVGDRKNIYYINGSDVDGRTANCVMKYNVVKNTNDILFKTSGTITDIYKNDSGIVVKYTENNILLTTVLSTKLDEDINRDGIIDIKDLATIASKYNVSLKDTSYKSLIDFNRDGLIDIFDIVKITHKL >NC_014393.1|WP_013291728.1|2606304_2608722_+|cellulosome-anchoring-protein-cohesin-subunit MKILFNKKIKKSFSTIFVLSFFMQMSLFGIPVLAAYSPAQISYVVTGEATVGNTIIITANISSVSNLYALSWDFIYDSNMLQIQSIESGSILGTSVQKNIINNLGQASIWISKTGNVESTNGSGTVAIIKAKVLKAGVIDLKTTNDKATLNLTGSTSCIKLSDNNGNMLMYNFTDTSITSKIVSPLSPGKYENTNSNLTYSGSWTKVSDGSQQYSNITNSVLTFTFEGAGLNIYALMASNRGIAKVYIDDVAYDFDEYNASAQSKIVFTKDGLKAGIHTAKVVVSGTKNPASSGYYISIHAIEILGAPTNLVAGKYENTDSKLNYTGSWTKVSDGSQHYSNVTNSVLTFTFEGSGLNIYALMASNRGVAKVYIDDVAYDVDEYNASTQSKIVFTKDGLATGKHTAKIVVSGTKNPASSGYYISIDAIEILSAPVNLIAGKYENTDPKLTYTGSWSKTSDGTQSYSNVTNSVLAFTFEGVGLNIYALKASNRGIAKVYIDDVAYDVDEYNASPQSKVVFTKAGLSVGKHTAKIVVSGTKNVDSSGYYISIDAIEILSAPTNLVAGKYENTDSRLVYSGSWTKSFDGSQHYSNVTNSVLNFTFEGSGLNIYALMASNRGMAKVYIDDVAYDVDEYNASSQNKVVFTKDGLSAGKHTAKIVVSGTKNADSSGYYISIDAIEILSAPTSLVAGKYENTDSRLIYSGAWTKSFDGSQHYSNITNSVLTFNFQGSGLNIYALMASNRGIAKVYIDDVAYDVDEYSALSQGKVILAKDGLTPGNHTAKIVVSGNKNIDSSGYYISIDAVEIK >NC_014393.1|WP_010076841.1|2609160_2609928_-|acylneuraminate-cytidylyltransferase-family-protein MKILFTVCGRAGSKGLRNKNLKTFLGDPLMYYTLSCIDLFKKRNSNRFHIDIAINSDSQDLLKLAGETNLDILQIRRVEELGKDDTPKVSVIRNSLEMAEKEKGYGYDIIVDLDITSPLRTIIDLENAVNKKIENTSTDVVFSVVEARRNPYFNMVKNENGVVSKVISSNFVARQQAPEVYDMNASIYVYAKAFLINNDVRTVFDGKIDIVKMTDTAILDIDSENDFELMEIMAEYLYKTYPKFKDIKDNIKSIV >NC_014393.1|WP_010076840.1|2609924_2610545_-|GFO/IDH/MOCA-family-oxidoreductase MCKKTNDNGIYYVAAPLRYTKVLESIKRVVNENKVYSVRSICSSYLPDWRPNVDYRNIYSAHKDQGGGVSIDCIHELDYLFHLFGFPSNAYNVRGKYSHLEIDSDDLSIYIFKYDDKLIELHLDYFGKNKERTVEIYTEKGRFIGDFYRNEIRYPNGKIESFDTSPNYMYIKELETFLDMIDGNSINENSIEHSIEVLRFAEGEIK >NC_014393.1|WP_010076839.1|2610573_2610843_-|hypothetical-protein MKVCFVGLGSIGCRHINNLKSVSMDRQIDLEIHAFRESNRILSEEIKQFIDREIFEASDLDDNYDIVFITNPTNMHYDTINKFILKTSF |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_014393_4 | 2748102-2750748 | TypeI-A |
NA
Consensus repeat of NC_014393_4
|
40 spacers
spacers of NC_014393_4
>4.1|2748131|36|NC_014393|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTATTTTCTGTGATAGTAACTAAACTTAATGCGTA >4.2|2748196|36|NC_014393|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGCATGGTAAAGTTTTCAGTCCTCTTTTCTTCACT >4.3|2748261|36|NC_014393|CRISPRCasFinder,CRT TTTTTGTGCTCTATCTTCTGCCTGCGAATGAACTGC >4.4|2748326|36|NC_014393|CRISPRCasFinder,CRT ATATCGATATAACTTGACTACTGTTAAAAATCCAAT >4.5|2748391|35|NC_014393|CRISPRCasFinder,CRT TATAACCTCTGTATAAGTATATACATCATATTCAT >4.6|2748455|36|NC_014393|CRISPRCasFinder,CRT ATATATGATCTGCTCCATACTCTCTAGTAGTAGCTG >4.7|2748520|36|NC_014393|CRISPRCasFinder,CRT TTCCAATCTTGGCGCATCTTCATACACACTAAAATT >4.8|2748585|36|NC_014393|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CATATTTGCATTTGGCTTTGTTCTTGGGGCAGTCAC >4.9|2748650|37|NC_014393|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTGTAGTAAAATGTACTACTGACATACTTACAACTAC >4.10|2748716|37|NC_014393|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGTTTCAAAATAAGGTTAATCACAGAAAAACACTGTG >4.11|2748782|37|NC_014393|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTATAATGTTTACATTGGGATGGAGAAATGATGATCA >4.12|2748848|35|NC_014393|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTCATGCAATTAATGAAACCGAGGATATTGTCAT >4.13|2748912|35|NC_014393|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAGTTATACGATCAATCGATAAATGGATTGTCATT >4.14|2748976|36|NC_014393|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGAATTTATACGTCAACTTCGTCAACATCGTCATGA >4.15|2749041|38|NC_014393|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCATTAGGACACAGCGTAGAAATGACAATGAATGTCTA >4.16|2749108|37|NC_014393|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAAGCCAATACGATGATTGTTGTGGTGATGCTCCTTA >4.17|2749174|37|NC_014393|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCGATTCACTAGGCGTAACTATAGATGACATTATAAA >4.18|2749240|37|NC_014393|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAACAAAGCTAATTAAATCTACTTCAAATTCTATATT >4.19|2749306|37|NC_014393|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTGCATGGGATGGTACAAGTGATATAACAGCTACTAC >4.20|2749372|37|NC_014393|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAATCAAAGAGCATAAAGACAATATTGTTTTCTTAGA >4.21|2749438|36|NC_014393|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGTGACAAAGGTAAAAAATATAATTTTATTTTTAAT >4.22|2749503|37|NC_014393|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTACATACTTCAGAATTTATCCTTCTAACTAAATCAC >4.23|2749569|36|NC_014393|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAAAAAGAAGGAGTAGGGAATGAAAGATTTTGCTTT >4.24|2749634|36|NC_014393|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTGATAAAGCAGCCACATGTTCCTATCTTTATCACT >4.25|2749699|36|NC_014393|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCCAATTTTAACAACTCTTCTGCCTTTTTCAGTTTT >4.26|2749764|37|NC_014393|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGATAGAAAAGTTGATTTTCGTACTTTGGCTGTTAC >4.27|2749830|38|NC_014393|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTTTCCGTAGATACAATAAACAGTTATTCGCTAGTTG >4.28|2749897|37|NC_014393|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCAGAATCGTCTTGATAATCATCTAAGACTATAAGGT >4.29|2749963|37|NC_014393|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATAGTATCGCGTCCGCTACTTCGATCTGATAATCAAA >4.30|2750029|37|NC_014393|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CATCTAACTCATCTAAAGGTATATCCTTAACTTGTAG >4.31|2750095|37|NC_014393|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATATACCAAATGAAAACCGTGGGCATACAACTATCTT >4.32|2750161|37|NC_014393|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGACCTTTTATTAGTTCTAATAATATTATTATTTCAT >4.33|2750227|37|NC_014393|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGATCATAAGTGAAAGACCGTCCGCCATAGCGTTATT >4.34|2750293|36|NC_014393|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAGAGATTTGGCTAATAAGAAAGCTGTAGCAATTTT >4.35|2750358|36|NC_014393|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGATAACCTTGGTACTCACACGTTGCGTAAAACGTT >4.36|2750423|37|NC_014393|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GATTAAAAGCTTTAACAACTGAACCATTGTTTAGTAT >4.37|2750489|35|NC_014393|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACTACCAGTGGGACGATGCCAGGAGGAATTGCTTC >4.38|2750553|37|NC_014393|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTGAACTTATGTATAGCTCTTTTGCTTTATCTCTATT >4.39|2750619|35|NC_014393|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCAGTAATAACTGCTGCAGTCCCTAGTCCAATTAA >4.40|2750683|37|NC_014393|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATGGTGTTTTTACACCTAATGCAACAATATGTTCTTT |
cas3,cas5,cas7,cas8a2 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014393_4
The CRISPR arrays of NC_014393_4 >merge|NC_014393|4|2748102-2750748|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR 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>NC_014393.1|WP_010075380.1|2746583_2747744_-|hypothetical-protein MIIARNITNSVPTAVWIATLIKTYQNFILDKNDNYWINQKDIQEIAKLLCPKNIDNARISQWCNGDHPNNTYNYLRSKGSLRRLTKIGEFSNQKEQPRELPINELIFDNNVELLNIIEWYKNVYCKIEFEDPKEIVHNNQNRNSDVNNKVPNKYEQDSYRTSEMQSYKNSFYEELYENQNINIRTISLIKVAWEIFSKKVGNGLILINKEASMQLQYAYILKSMLPLIIFRDDEFIEIELETTISDGKSTREVDIMVIVSKGVSVYKIALELKCYKTKASSGGNRGATDIFMKDVYQDVHLLERYCENNEADIGIALVMNDYKNFVFPKKKSYKCWDYDISQGAKIGRIHLNTPIGGKQVDILLNNEYDIKWNNVGEFWFLLLMTK >NC_014393.1|WP_010075379.1|2746283_2746550_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MNKTATFIEVFETIETGSSAVYEDLPENTFAEKIFKLRMLHGLTQRQFAARCGIGYSSVCKYELGYTPSSYNLEKIIDALNLDINYFD >NC_014393.1|WP_010075378.1|2745779_2746265_-|glucose-inhibited-division-protein-A MSTYYPLEKLRKIPGLEFAKYADPYAGGIGNSIRYLAVSPRTNDMRVRGLDNLFVAGEKSGLFVGHIEAMATGSLAGYNAVRYGIGMPLLTLPISTAIGDIISYENYRESTIDGRKNRYTFSGAEYFNRMKSLGLYSLDNEEIKRRIEKNNLTDIFKIKLI >NC_014393.1|WP_010075377.1|2745108_2745294_-|hypothetical-protein MDYMKSGKGPLKNPSKDWAWHHPADASGKIRLVPKNQHQSPTLQEILYPGPNGQGGFGLFK >NC_014393.1|WP_010075376.1|2744541_2745087_-|DUF4272-domain-containing-protein MKKAKEIIARSVILLCVSDRCALEKSTIGGRAYSKKQREEQRIAIYKWQQNNRYTDFMTKNEKLLFEQEVGSGNKNEILSIQVQYETIEPCLWTIGLVKKLSSYNQFVLDDFHPVLQIGMNHTLERLLDTRSLQANEDIQLQNEISMLWHWRAVECNNSIFKLSLLKTLLNQCLGINMKKF >NC_014393.1|WP_010075375.1|2744365_2744572_-|hypothetical-protein MFGHQYEKVLEDIQQFDIEQNDFMVNNKSVSNLNIEEKKRINCIAKWRHHAFEWIVGDEAWDEIEINT >NC_014393.1|WP_010075374.1|2743556_2743820_-|hypothetical-protein MNDLYRERFKKIVNIINSNTVREYAHLNDEKSFTRKRKMPLEEIILCTLSKKGLTTEMELHKYFIEKGATSMNISKQGFLQQRKKLN >NC_014393.1|WP_010075373.1|2743184_2743478_-|hypothetical-protein MVFAIDGSRAEVPNSDENKANFGECGNKNNKGEIRALVSTMFDVFNHFFLDLQIGSVKTSESELAKQNIMAVKALLKDKPFIIAIGEKTNPQRLMLL >NC_014393.1|WP_010075372.1|2742698_2743118_-|hypothetical-protein MDIIGTMIIIAGGFFLIVFSFWLIFSIIIEHQMRRRERIKRKKGQSFKEHLLYTRFKMQIPKVLLYFYYSLIFLHLMLGLFAVLIYILGINGSIIHKIDVITIFFGIADMVIIAAFAFIFSSPKRSQFIIGRWVKKNKI >NC_014393.1|WP_010075370.1|2741074_2741578_-|hypothetical-protein MIDKIKKKVLAMLDLEHDKVDKGLYIVLPIIGMLIARCMGQKGAIAFMIGIVVLLAVATIIQLVRKNRNIKNFLTYLGATIFGIFMIAVIWLIRYYGDMGDGRMAFNIVKVFLIVFSMLMDVLLIPILKNKRTPKSKKIISTISAIVITIIALLGIVFLPPKDLPLK >NC_014393.1|WP_013291735.1|2750939_2753057_-|CRISPR-associated-helicase-Cas3' MFENYYDIIGFKKPREIQKEIKNVLKNKKENVLVISGCGSGKTEVGHYALLNWNGIRSIFVEPMKTLATSIQERLNEYNKILNINEKWTIQHSGIEEDKYLENKFCVTTIDQVLSGWLGIGRQSFIRGKNIVQSNFVFDEVQLFQPDKALLTTINFLDSINSQGNKFLIMTATMPKYLIDFLLERYNMKLIEAYEETIADREIYVNYSSKVDYLQINSRTESQIVICNTQAQQEEVYNNIEDKSRCIILNSKLLKYDRSKIESKNLLEDDVSEKSLYKYFGKYAKKNNKILIATSIVEAGVDISANYLYSYACPIDNFIQRCGRCARWGGIGQVVIINSNDIVYDSKIVKKTIEFFADRPSLKFTWEIQKAVVTNILNPFYMDVINEINVRKNKYNLIDGSRGKLIRDIQNVNIIVDKDISFNSFKKQSISINISVLEKLSKNNALYVIDYGKNRNSPVQKKINDDIIGQTIVIQGNDCIYDELGFRYKEGSVCNTFQYDSNATDKYDKFNFDYKEESWINHATSVRALVKQKMLNDRFSSYVLENIDDISNVCGLHDIGKLDEQWQGPKWAGAKSILLAHFPFKKANTLIFKNRNHRAIGYIVLKNNLEDRILLNVVLQHHGRIISNNHDIIIDKFGLHKNSMLCLYEYGFYGGVVKEGNDNISYEEILTPKDTEWNNFLYIVGTLMESDIESINLFHNTKFLG >NC_014393.1|WP_010075383.1|2753065_2753704_-|hypothetical-protein MNKITYKTANLFTLKKYENSNLNCQSYEYPTLYAIRSAILGAIIQVDGVMKAEELFHKVKNAVIYIQYPKVFHINGCKIKRYANSYYGINNEQKLDRENLIKNNFYTTMGFREYIDVEDIVFYIDMSIPNINLYLKNIDWIGTAESLVYLHSIEEVQTLNNVMVPVPSNEVRGRYNQFDWDSKARFEHIYLYSDKYTHKHRNLSCSIKDLVL >NC_014393.1|WP_010075384.1|2753717_2754638_-|DevR-family-CRISPR-associated-autoregulator MNKLAIMMLLIVEGEALNNEGNIGNTMQPRQIELSDGSIRNAIAGEMLKHFHTKNVRLLADEDELCDTCKIFSPMKNGTVKEKDKNLSDSGNRVKQCIVDDIEGFMNAGKGNNEKRVSCIKFSWAISTDDNDYQSVLHNRVDPINNKGKNEKNLNEQGKPDTTSEANTNKDQNTQMLFYRPIRSNEYALTIQIDLDRIGLDDEKLIDAVDNNTKIMRQRKCLKAVKNMFLDLEGALCSTRLPHLTDIQGIIVQKKNKDEVLSKYSALKEDFIQVNKRLSNNSFEFNNIEEFAAVIDDIGVKLEENL >NC_014393.1|WP_010075385.1|2754637_2755975_-|hypothetical-protein MNSIKYSLNKTGEYYLIIHEEFNYDDALFLDIEEENCETCNSSLNKTERNNSMNSANKFISQNVSLIFKYFSTHDDKLLKSLKKEGSLGIGTYFNTKSIRASTSPGTFGTTPVERTMAFLGWINATNYITNDDVEINAILIPSKTNRILKPYEYVFQDKEENKLKSIHYFGKRSKKSDIILQAEIYVNTIAEYLAYKETNSKDVELESVLFMVLTKAGQKPIPNKFFEMPVYEWTKELYVKLGQMISYSSSDLDIKDMTARFIVKPSLANFHKLIQIYSKKNCKIDSIYREEILRMYENKVQEIHNNEAIKKLGRGLNRLLYSKKGFEILTKLYTVRTVESLSYRIRELEDSYLRYGKHSILSDKEHIEVINLINTKKDAVICANAIISFGRVFHESSKKGSNNSDGMVSNTKEIDEFEIDINTEDAVEKIVLESSVSLNNEEEI >NC_014393.1|WP_010075387.1|2756073_2756553_-|prepilin-peptidase MNGDEKIVLQRFLEVAFDNPLVIIKGFLYAVILLYVSLSDIKIRIIPDKVHIMILLVSLININLKDSLLGLFLVSIPFIITALISENGIGGGDIKLMGASGFLLGVKGGFLASIIGLATAIVTKKVSYKIKSTNKDEAFPLAPYLSIGCFLSYLISGGF >NC_014393.1|WP_010075388.1|2756539_2756863_-|hypothetical-protein MELEEKETLYIPLGLKTKTEIFDGFGKEELFKAIISTLISAAIDVVIYIIFRNVAITIVFILSAMAGSVMMLTKDTSNLSVVDQIKFMVRFAKSQKKYKYKYLDEWR >NC_014393.1|WP_010075389.1|2756962_2757460_-|hypothetical-protein MVNSIQNNYLINTNKQSSDEKKTKYTAEEESKISAEENAILYEKYKKAGYSKEEFDYVLKNGTTFPPFSAPGSVRRAWRQAKENASPEERAEMKAFTIMFDGFRRDYPNYMSTMNNDTNGYLKMVKDMKSYAEQYNVNGDSQLQLQYKWYTKTLQIFDTELKKFA >NC_014393.1|WP_010075390.1|2757566_2758091_-|hypothetical-protein MVNSIKNDYSKSIYQTQKNTEIRKLFVGEKKPKLSVEEESKISAEEDAILYEKLKSYGYTKEMFDNLIKTGYTFPPHNAPGSVRRAWRQIWDSASPEMKDKMRSFTSMFYGFERDYPNYMSNIQNDIKGYFNLIEDLYSHIQQYNADGDLQAQKQYRWYNEVLELFTTELEKFT >NC_014393.1|WP_010075391.1|2758296_2758812_-|hypothetical-protein MVNSIKNNYPNQNNYSINTNKQTSDKNQVKYTAEEEAKISAEEDAIYCEHLRKNGYTEDQIDYAKKHMHGFPPDNAPGSVRRAWRQAVENATPEMRDQLCLFICVSDAFMRVNPDYTSSIQNDTNGYFKVIEDLQTYIKQYDEQSDSQSKNQYKWYNEILKAFETELKKFA >NC_014393.1|WP_010075392.1|2758837_2759257_-|hypothetical-protein MRKIFKTIIVTAMALMMFAVPTFAEVTNATVCKVDGVTDSGNYPLQWYSNTMTNVPLVGTTAYIRVRSNGYGSPNVYMLSSNASCTELSNTRDFTFGQEIGWVTIYKITNLPAGITGIKFWKMSGTNTISDTVYLKMLQ |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_014393_5 | 4819249-4819389 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_014393_5
|
1 spacers
spacers of NC_014393_5
>5.1|4819303|33|NC_014393|CRISPRCasFinder GTCAAAAAAAAAATCCGTTCAAAACCGGATTTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014393_5
The CRISPR arrays of NC_014393_5 >merge|NC_014393|5|4819249-4819389|CRISPRCasFinder CTGACCCAAGGATAGTGAGAGGCAATGAAGCCACAAAAAACTTCCTGAAAAAAAGTCAAAAAAAAAATCCGTTCAAAACCGGATTTACTGACCCAAGGATAGTGAAAGGCAATGAAGCCACAAAAAACTTCCTGAAAAAAA >NC_014393|5|4|4819249-4819389|CRISPRCasFinder CTGACCCAAGGATAGTGAGAGGCAATGAAGCCACAAAAAACTTCCTGAAAAAAA GTCAAAAAAAAAATCCGTTCAAAACCGGATTTA CTGACCCAAGGATAGTGAAAGGCAATGAAGCCACAAAAAACTTCCTGAAAAAAA
>NC_014393.1|WP_010074004.1|4818652_4819078_-|DUF4406-domain-containing-protein MSPDGITYTNAEGYSDPVPFRAIANMEKAEKKFRPIVYICSPYSGDIEGNTLKARKYSRFAVDQGAIPIAPHLLLPQYMDEKTERDLAMQMDMILLAHCLEIWVFGSFISEGMEAEIARAKQKRMTIRYFTEDLKEEEKCS >NC_014393.1|WP_010074003.1|4816394_4818662_-|hypothetical-protein MQLTIFNAACVGNAKNCTYPQKCVVTSAEGLIDAVKFDHVCAEYQKNYRNVSNFIQSDVVVMDLDNDHSDNPADWVTADMLDEMMPDISYALAPSRHHMLAKDGQAPRPKYHVYFPIAVCTHADDYAALKRAIHKAFPVFDGNALDAARFIYGADCTEVVWHEGWVTIDEEVQIEEDEEDTSTGGVIQAGTRNNTLSRFAGRVVKRYGATDKAHEIFLEEAEKCDPPLSDEELKTIWYSAVKFAKKIQGQDGYVPPDDYNDDFGGGEGDSLKPDDYSDVGQARVLCREYGDELKFTAATDFIRFDGEVWVEDKQMAVGACVEFLDLQLADANDELERVRKQLIDAGIAESTVKAGSKAVAKEVEGDQLGLFYALLAAEKYMAFTMKRRDYKYITSALNVAKSMVTIKVSDLDKNPVLLNTPFATYNLEKGMAGVQPHDPFDLITKITEVSPGDEGMDIWLEALETFFCGDQELIEYVQMVIGLAAIGKVYEEFIIIAYGDGANGKSTFWNTIARVLGTYSGKISSDILTMGNKVNAQPEMAELKGKRLIIASEMQEGVRLNTAMVKQLCSTDEIQACKKYKDPFHFMPAHQVVLYTNHLPRVGANDDGIWRRLKVIPFNAKIKGNSDIKNYADYLFENAGPAIMKWIIEGAEKVSKANHKVADPKVVRDAVEAYREDNDWLGHFIAECCEVDDSFEEKSGEFYQQYRAYCIQNGEYIRSTTDFYSAIDKAGFYRHKTNKGVMVHGVKLKMGNDFI >NC_014393.1|WP_010074002.1|4815899_4816178_-|VRR-NUC-domain-containing-protein MREKQIEKKLITEVKKRGGICPKWVSPGFDGVPDRIVLLPGGKFAFVEVKAPGEKPRPLQVSRHKLLRRLGFRVYVLDDMSQIGGILDEIML >NC_014393.1|WP_010074001.1|4814545_4815916_-|DEAD/DEAH-box-helicase MRLCYKPHAYQEYAIEFIKKNPIAAILLDMGMGKSSITLTAIMELMYDSFEVSKVLIIAPLRVAKHTWSGEIEKWEHLKGLRYSIVVGTVAQRKKALQKDADIYIINRENVPWLIEQSGQPFDYDMVVIDELSSFKNWQSKRFRSLMKVRPMVKRMVGLTGTPSSNGMMDLFAEYKVLDMGARLGRFIGQYRLNYFKPDRVNGPIVYSYKLLPGAEQQIYEKIDDITISMKATDYLEMPSLLSTEYPVYLSASELDTYEEMKKDLVLSLPGGEITASNAASLSGKLSQMANGAVYTDDKSYIEFHDKKLDALEDIIEAANGQPLMVAYWYKHDLIRIEERLKSLGVQYQRLDSDASIEKWNRGELPVALVHPASAGHGLNLQSGGSTLVWFGITWSLELYQQTNARLYRQGQTASCVKIIHLISKGTIDERIVKALSDKDNTQAALIDAVKADLNQ >NC_014393.1|WP_010074000.1|4814235_4814466_-|hypothetical-protein MQGSNTEDPYTGLANAIILQAVKDYRDALKKLSRGRANKDAEIKKQEILNFFRSDWFGVLTEIDPEMLIRKLDEEV >NC_014393.1|WP_010073999.1|4813825_4814233_-|DUF1492-domain-containing-protein MTVREYLSQAYRLEQRIALLKEEIDTLRELASSVGSPGLEEHYNATKNTDAPYIKTLLKIDEYEREYMEKLESLLVTKKEIMEVIGTLENHDEQIVLTYRYIKNYTWSQIGDVLHADERTIRRWHDRAINKISCP >NC_014393.1|WP_010073998.1|4813315_4813684_-|HNH-endonuclease MPKKPKRPCSKPGCPNLTYGRFCEQHQKEENKRYETYDRDKAAVNRRYGRVWKRIRDSYVKSHPMCEKCLEKGLYVPVEEVHHIKPLAEGGTHDRSNLISLCKSCHSRIHAERGDRWHKNSG >NC_014393.1|WP_010073997.1|4812660_4813200_-|terminase MAKDGTNRGGARVGAGRKSKALVDKMNDGQSATVISLPDPPTFTGEDVPPIKDYLTSKQKAGKDLCAAEVYKETWNWLKERGCERLVNIQLIEQYAMSVSRWIQCEECISEFGFLAKHPTTGNAIASPYVAMSQQYMKQVNQIWYQIFQVVKENCSVEFSGATPQDDVMERLLRTRKGI >NC_014393.1|WP_010073996.1|4811876_4812659_-|S-adenosylmethionine-synthetase MIEKVNPSHPDKVADRIAGAIVDLAYETEENPKIAVEVLIGHDVCHAIIETSAHIVEEVVKQAIKRIAGEMKTDIVIVPQDVHLSHNQSVEVRCGDNGIFKGMPLTKEQRTLSEIAREIYEEYPTDGKYILDGSRLIICQSNADRTKLEEKYSFAEVNPIGDWTGGTDVDTGATNRKLGSDMADAVTGGGLHGKDLSKADVSLNIHAFLKAQKTGKPVEICCAIGDVMIGGIPYAEIVEEARAFIRSIGGFEKFAEWGLY >NC_014393.1|WP_010073995.1|4810610_4811867_-|site-specific-DNA-methyltransferase MQTTTEMKLVSIDKLIPYVNNARTHNAEQINKLRASLREFGFINPVIIDGDYNIIAGHGRVMAAKEEHIEEVPCVLADHLTPAQKKAYIIADNRMAQDAGWDEELLRIEIEALQAEAFDIGLTGFEEQEIADLFGTEDDKVEDDDFDLNDALEKAAFVKRGDVWQVGRHRLMCGDATSEEDVATLMDGKKANLIVSDPPYGVSFQSSDGLTIQNDSIKGEEFYNFLLQAFKNMAAHLEKGGAAYIFHADTEGLNFRRAFQDAGFHLAGCCIWVKNSLVLGRSDYQWQHEPVLYGFLQNGKHPWYSDRSQTTIWNFDKPKRNKNHPTSKPLDLLAYPIGNSSQANGIVVDTFGGSGSTLMACEQTNRICHTMELDEKYASVILRRYVEDTGDADNVYVIRDGEQIPYSALVVEVEGSNE >NC_014393.1|WP_010074006.1|4819615_4819864_+|hypothetical-protein MHENNGLTGKTINVKHKHGHTDAYPWNGIAVPVLITEEHTNFYVGTVLPHHAPGGFGISQPYNVTLDKHDLKVGNLIIVGGK >NC_014393.1|WP_010074007.1|4819866_4820271_+|hypothetical-protein MGKMKELSAILDSMVECGNALVTSANALKDLCENIVSCGNTLQNAANALKDFYSSVTEEEPKAALPKKETTPKKETEKTYTLEEVRAILSAKSKAGFREQVKEMITKRGVDNLTKLDSSEYPSLVKEVEGLTNG >NC_014393.1|WP_010074008.1|4820263_4821406_+|DUF2800-domain-containing-protein MAKHALLSASASHRWINCPPSAKLCAVEENKSSPYAQQGTDAHELCQYKVEHALGKNVSDPTANLEFFDTEMDYCSDQYCSYVMEQLAAAKELCNDPEILIEQRLDFSKWVPEGFGTGDCVIVADREIHVIDYKHGLGVLVSANNNSQMLCYALGALELFDGIYDIQTVKMTIFQPRRDNVSTYEISKEELLKWADEVLAPTAQLAFNGEGEFSAGEHCQFCRVKATCRKRAEENLKLAQYDFEMPINLNDTEIAAILSQVDELVSWANDIKEYALQQALSGTEYEGFKVVEGRSIRKYTDEDAVAFIVKDHGFDPYEKKLLGITAMTSLLGKKKFEELLSGLIAKPPGKPTLVPISDKRQAMSTAKEDFKENEGGQDNG >NC_014393.1|WP_010074009.1|4821398_4821962_+|DUF2815-family-protein MANMSIPTKVITGVNTRWSFVNAWEPKSINGGAPKYSVSLIIPKDDIATINKIKAAIQAAYEEGESKLKGNGKTVPALSVLKTPLRDGDLERPDDAAYANAYFVNANSATAPGIVDADRQPIIERSEVYSGVYGRASINFYAFNSNGNKGIACGLNNLQKIRDGEPLGGKSRAEDDFATSDEDDFLS >NC_014393.1|WP_010074010.1|4822058_4824050_+|DNA-polymerase MRKIGTLSIDIETYSSIDLAKCGVYKYSESSDSEVLLFAYSVDGGSVIVIDVANGESIPDEILQALVDDSVIKWAFNAAFERVFLSIWLKRNYPELFCSYSIPEDSVGNYLDPSAWRCSMIWSAYMGLPLSLEGVGAVLGLEEQKLKEGKDLIRYFCKPCAATKVNGGRTRNLPEHAPDKWELFKAYNKRDVEVEMNIQKKLSHYPVPEFVWEEYHLDQEINDRGIALDMDVVENAIRIDAISKATLMATMQDLTDLENPNSVAQMKGWLAAKGVDTDSLDKKAVIELLKTVPTDVADVLTLRQQLAKSSVKKYQAMQNAVCDDGRARGMFQFYGANRSGRWAGRIIQLQNLPQNHMEDLDVARDIVKSGDYEILNMFYDNVPGVLSELIRTAFIPREGYKFAVADFSAIEARVIAHLAKERWRMKVFADNGDIYCASASAMFGVPVEKHGQNAHLRQKGKIAELALGYGGSVGALTSMGALDMGLAEEELQPLVDAWRAANPNIVQFWWDVDNAVKRAIKERTATKTHGIRFIYKSAMLFIVLPSGRRLAYVKPRIGENKFGGESVTYEGVGTNKKWERIESYGPKFVENIVQAISRDILCYALRTLSHCFIVGHVHDEVIIECRQDASLEAICEQMGRVPEWIEGLLLRADGYETQFYKKD >NC_014393.1|WP_010074011.1|4824083_4824599_-|hypothetical-protein MTKKANLVTINNPIYIPILEEDYGTIQYYENLGIPVRWIVMHGVGRYYAIMEGDSAVEAKRMTDGLCAMVRKDIRAMQRQNENETSYDALVEEGYDAATDENDPANVVSDLMLVKDLLAECEKLTDEKKRICKGIAEEKTEREMAAEFGIPQTTLHGRKDKLLKELKKKLD >NC_014393.1|WP_010074013.1|4824922_4825549_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MSNLNIDILNQNIQTLMEQEGLTQQQLAEKIDMSQPNFSRAFNNKGGQRFTLEQICKIADHFQVSVDFLLGFEKPTNKLSEKEICTLFTSLLEQRKLVKFDISREEEIYTPYKTFDGYPDCNTEKKHIQYNGFLFPSYFDIGPTDRYTEDQLDDFQSDILYGGNSDESNKRINAFFDRYFQIYDMYLHNQITKEFFHEIVDKFLADLS >NC_014393.1|WP_010074014.1|4825717_4827625_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MAKYESFKAYLEDNFIDDMMARLSSFVVTQPKDSFENDVISYVTWVSLQDIHVSGVTFKDMGNDELEIRATVDADIEVAGKTRYGQETFEDCKCYNIFFRALLQNGLHNVRITNVSEYDVSRYERDRSLSQNLVPYMYEEDVERHAEDFLRRHYPKALMQPMALPVEEIVASMGMKLYFAPLEEGVFGKTYFGSEKVIVYTNILRKETCEIVTEPGTMLINPNVYFMYNIGTANNTIIHECVHWDRHRKPFELQKILQGDCNHISCEIVEVYEGIPQDAPALKWMEWQANQLAPRILMPAEMTKRKLDECLHRLHAEYPMMRNAELMELAVGELATFFMVSAIAAKIRVIELGYDEAHGVQVFSDGKYLPPFSFAKGTLGKNQTFVIDEKNAIFVIFMDPVLRELFIDGKIIYANSMVCLNTAKYIELNENDMPILTRYALEHVDECCFVFDRNISASTSYSDTFYRRCFLCRDVTSDTFIEANYNPNHKDNQGKITRRDELSKVVVSSGKIAEIMEELPQGFGKTLKYHMERLDVNESELSYRSNISTQTISKYINQGSCEKKYANVVAICKALYMNPVFMEDLLAKAGFDKKYDQVAYFVKFLIWNHPDDSVEEWQSKIDDAHVNLKLPERKE >NC_014393.1|WP_010074015.1|4827662_4829135_-|LlaJI-family-restriction-endonuclease MKIVSSYVREQKRYTKNELKNIFSFDEAGVEKFIKNLKAYGVLKSVKNNTAQLEMTDLLDEDIEITDETAESGDCLYVFTYVGVITSGSRVIKVYPKYLLSQKEPLTEMKQVIKVLERYSNSEEQIINIFNGDGDNRSFNILAVILFLLNDYYEYGIYTNSEDIIEINGEGEILWGKTIDESFAMIEDKRPYYMELYTGKTVEDDKDYFKRLHECVLTECSKQLHDAQLDELFGIDELVLSEEILLDFGDKDYILERLHKELNIQFNTRRQILLKTIYTYISQERRMLEENDGISMFGTTAYHAVWEKVCADVFDNKLNTTLGQLKMSVPLADEFKSRSSEALINIIEKPKWKGIDMEEVDAADTLIPDLISIPQINGTDHFIIFDAKYYNIQLEKGKSLRGNPGVGDVTKQYLYQLAYKDFIKAHNISVVKNCFLMPTEKNEIIKKGTARMPMLEALGLENIQIRLIPASMLYERYLAKGKIDIGLLEL >NC_014393.1|WP_010074016.1|4829137_4831711_-|AAA-domain-containing-protein 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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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1. spacer 4.4|2748326|36|NC_014393|CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 2748066-2748101, mismatch: 2, identity: 0.944
atatcgatataacttgactactgttaaaaatccaat CRISPR spacer atatcgatataacttgactaatgttaagaatccaat Protospacer ******************** ******.********
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_014393_4 | 4.21|2749438|36|NC_014393|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2749438-2749473 | 36 | NC_010180 | Bacillus mycoides KBAB4 plasmid pBWB401, complete sequence | 357371-357406 | 10 | 0.722 |
1. spacer 4.21|2749438|36|NC_014393|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_010180 (Bacillus mycoides KBAB4 plasmid pBWB401, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
agtgacaaaggtaaaaaatataattttatttttaat CRISPR spacer attatcaaaggtaaaaaatacaatgttatttgcgcg Protospacer * *. ***************.*** ****** ..
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
302784 : 310060
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_014393|302784:310060|DBSCAN-SWA GATGATTATTAAGGCAATAAAGGATTATATAAGTACTTGCTCTTATCTGCAAGAATTTGAAGCTGCTATATGTGCTGTAGTTGGGTCTGGAACTAGTAATTCAGAACTGTATGCTATTGAAGTAGTTAAAGCAGAGCCAATTTTAAAGAAATATATGAATGGCGATTCCCTAAGGCAATGCCACTTTACTTTTTGCAGTAAAGAAAGCTATGGGATCGATGTATTACGAAGCATAGAAAGTAGCAGCTTTTATGATGATTTTGAAAATTGGATTGAGGAAGAAAACAGAAAAGGAAATTTACCAAGCCTAACGGGAAATTACATACCCGTTGAAATAAAGGTTATATCTAGCGGATATGCTTTCCCAGTGTCACAGGACAAGTCGAGATACCAAATAGAACTAATATTAAATTATTACAAGAAACAAGGAGGAAATTAATTATGGGAATTAAACAAAGAAAGAGTTATGCAAATTATTTAAAGGTGGCAAATGCATTTGAATTTATGGGAGCAGGTTTTAGTGATCTTAATGAAGCACCAACTGCAGTAAGTGCATCAAAACGTTATATAAGTGAGTCAAGCACTACAAAAACAATTACAGGTTACGAATGGTCAACTGCTTATGTTACAGATATGATCAGAAGCGAAAAGGCTGTTGATTTTATCTGCAATATCGGAGAAATGCAATTAACAGGAGCAGAGGCAGAAACAGAATATGTTATCGTGGACTTAGATGTTCCAGCAGCTACTGCTAATGAATTTAAAGCTAGAAAAGTTAAAGTTGCAGTAGAAGTTGCTACTTTTGATAACACTGATGGTGTAATGGGGGCAACTGGTAACCTTTTAGGCAAAGGTGATATGGTTCTAGGAACTTTCAATACTGAAACAAAAACCTTCAAAGAAGGCTTTACTGCTGCTGTATAGTGAAAGCTATTCAATAGGAATTCACAAGAGGAAATATGAAAGCAGATTTTACTGCAAAGAGATAACTAAAATGGAGGTAGGCTTTACTGCAAAAGTATAGTTAAAGTTAGAGCTACCTTCATTAACAAGTCAACATTCTGTAGCAAAAGTTGCAGAATGTTAACTTAGAAAAATAATTAAGTTAATATAAGGAGGCAAAGTTATGATAATAAATAATGTTGAACTAATTGATATAGACATATTTGATGTTGAGGTAGCAGAAAAATATGAGAATGCCTTAAAAGAAGTTGAGACAGTGGCTAGCAAAGTAAAGGATATGAAACTTTCTGAAAGTGTGAGAACTCAATGTGAAAGCATATTTAAGGTTTTCAACATTTTATTTGGAGAAGGCGCTGATAAGAAGATATTTGGAGATAAAATGAACCTACTAACTTGTATTAAAGCTTTTGAAGAACTTGTTGTACAAGTTAATGATCAGAAGTCAGCAATTGAAGAAATAGCTAGTAAATATTCTCCTAATAGAGCACAAAGGCGTAAAAAATAATGAACCTCTTAATTGACTTACTACCAAATACAGTAGATATAAATGGGGTAAAGTACGAAATTAATTCAGATTTCCGTACTTCTATCCTTTTTGAAATAATGATGCAGGATACATCCTTGAGTGATGAGGATAAGATTATTCAGGCTCTTCAGTTATACTATCCTAGAGTTCCAGAGGATATTGATACTGCTATTGACAAGATGCTATGGCTTTATAGGTGTGGAAAAGATGAAACATCATTAAAGGGAACTGGTAGTAATAAAACTAATCAAATTTATTCTTATGAATATGATGAGGATTATATTTATAGCGCTTTTTTAGATCAATATGGAGTTGATCTTCAAGATATTGAGTTTCTTCATTGGTGGAAGTTTAAGGCTATGTTTAAGAGTCTAAAGGAAGATAATGAGATAGTTAAAATTATGGGTTACAGGGCTATGGATCTTTCGAAAATTAAGGATAAGAGTCAAAGAGATTTTTATAAGAAAGCGAAAGAAATATATAAAATCCCTACTATGCTTAATAAAGATGAGAAGCAAAAAATAAGTGATATAGAAGAAACGCTTATGGGAAGCGGGGATTTGGCTAGTGTTTTAAAACAGGATAAATGATAAGGGTTTTATCCAAGGAGTGTTATAATAGCTATTTTTAAAGAATAGAAGGATTTAACTAAAAAAGCTTAAGTTAAAACCTTAGTGGAGTATCAGACTAAAAATGAGGTGATTATTATAGATGAAGTAAGATGCCCCAAGTGTAATCAGCTGCTTTTGAAAGCTGAATATATAAAGGGTGAAATTAAATGCACAAGATGCAAGAAGATAATAGAATTAAGTATGGAATCAAAAGACAGAGCTTAAGGCCACACCATAGAGTAGTGAGCAAGCCTGCTTTTTTTATTTTAATGAGAAAAGGCAGGTGAAAAAATGGCAGATGAGAAAAAATGCAATTGTGGAAATGATGCAAGCGAAGAGCAAACTGACCTACAGAAATATACTGAGGAAGTTAAAGCCTTAGCTAAAGGTGGTTTTGATGTACTTTCTAATAGTGCCATCAATGTGGTATCTAAGTTAAAAGAAATTGGGCTTGAAGGAATTAAGTTAGCTGGTAACCTTGAAAAAGTCCAAGGAAGTTTCCCAAATAATATTGATAGTTTCTCTAGTCAAATGGATATAGCTAATTCAAACATTGAAGGGTTAATCACAGATTTAGGTCAAATTCTATTACCTATAGCAACAGAGGTGGTTAAGAAATTTAATGAAGTTGCTGATAAAGTAAAGAATGCTTTAGCTAATCCAGAAGTCCAAGCTAGCATTCAGGGATTAGCTAAAGATATAGGAGATTTAGTAAATGGAGCTTTGAGCTTTTTCGCAGATAATCTTGATATCATAACTGAGGGTCTTACTTGGGTGATGGACAATTCAGAGGTTATACTTGCTGGGATTGTAGCTATTGGAGCTGCATTAGCTACAATAGCAATTATTGGGGCAATAAGTTCTATTGTAGGTTTGTTTGTAGCATTATATGAAGAAATAGCCACAGGAACTCCAATAATGGAGGCCTTTAATATAGTTGTAGGAATGAATCCTTTTGTTCTTATTGCTGCTGCAGTAATAGGATTAATTGCTGCTTTTATTTTTCTATGGAACACAAGTGATGGATTTAGAAACTTTTGGATTGGACTTTGGGATAATATAAAAACTATCTTTTCTGATGTTTGGAATGGCATAATGACCTTCTTTACAGAAGTAATACCAGGATGGATAGACAGCCTTATTCAATGGTTAAGTGGTATTCCACAATGGTTTTCTGAGCTTCCTGGAAAGATTGGTTACTTTTTAGGATATCTTTTGGCACAGTTACTTTTGTTTGGAATTAATGCTTGGACGTGGGTAACCACAGAGGTTCCTAATATAATAAATACTATAATCAATTGGTTTGCGCAATTACCAAGCAATATTTATAACTGGTTGATGAATGTAGTTTCAAATTTAGAACAATGGGCTTCAAATATGATTTCAAAAGCTGAGCAAGCGGCAAAAGATATAGTTGGGGGAATAATTAACTTTTTTAAGAATTTACCTGGCGAAATGGAGAACATAGGTAAAAATATAGTTACTGGAATTTATAATGGGATAATCAATGCAAAAGATTGGATTCTTGGCAAAATTGACGAATTTGTTAGTGGAGTAGTTCAAGGATTTAAGGATGCCTTAGGAATACATTCGCCTTCTAGGGTACTGCGAGATGAAGTTGGTAAGTTTATAGCTAAAGGTATTGCAGTTGGATTTGTAGCTGAAGTACCTAAGATGCAAGGAGACATTGATTCCAGTATGTCCGATATGGTCGCTAGAATGCAGGGTGCAGTAGGCTGTGAAATTGCAGCAACAACAGCTAATGTAGCTTCTAACAATAGTGCAATCACAAAAGACAACGCAATAAATGATACTCTTATGAATAGCAATGGCAAGGTAATAGAAAACCATATCCATGTGGATATCGAAGGAAGAGAAGTCGCCAAGGCTGTAGCTCCATACCAAGGAGTATTTGATACATATCAGATAGGAAGGTGATAGGAAGTGTTAAAGAATGGAGAAATATATTTCAATGGAAATACAAGCATAGGGTTAAATCTATTTTTAGAAGAATATCCCTCTGTTCCTATTGCCAATGAAGACTTTGAGGAGATAACTGTTGAAGGAAGAAGCGGTAGTTTGTACATTAACAAAGGAACTTATCCAGATAAGAAAATACCTTTTAATTTTACGATACTATCGCCGCAGATAGAAATAGATTTTGATAAAGTATATCAATGGTTAACAGAAATCCAAGATAAAAGACTTATATTTGGCAGAGAAGATAGATGCTATATAGTAAAAAAAGTATTATTTGAAAATCTACAAAAGCAGTTCAAAACGATAGGGCAGTTCAAGGTTACTTTTATATGCGAACCCTTTAGCAGTGATTTAAATTATACAACTTACGAAATCACATCAGATAATTACAGCTTTTATTATCAAGGAAATGCACCAGCAGAATCTTTGATAAAGGTATATGGCATTGGAAATATTCAACTTACTATAAACGGTGAGACTATGGTGATATATGATGTAACTGATTATGTTGAAATAGACAGTAAATTTATGCAAGTAAGAAACAAGGATAAGACCTCAAAGGATTCAGCTGCCTATGGGGTTTTTCCTTTGTTTAGTGCAGGGGCAAATACTATAAAATACACGGGGAATGTAACAAAAATAATAGTAGAATATACTACTAGATATAAATAGGAGGAACTATGAAGAAGGATATTAAAATAGCATATTTCTCTTATAATACTAAAAAAGAAGATGTATTAGCTTATAACGGCATGGCTCTTGATAACTATTGTATTAAATGTGAAACGGAAGAAAACTTAAATACTGGCGGCTATACTCTAGACGCCACTTTTCTTTTAGATGTCCAGAATACTATAAAAAACAGCAGTGGTTTAGTGGATGGTATTAGAGAGGAAGGAATTTTAAAGGTAAAGCTTGAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_014393|302784:310060|304250_304862_+|WP_010075235.1|DBSCAN-SWA MNLLIDLLPNTVDINGVKYEINSDFRTSILFEIMMQDTSLSDEDKIIQALQLYYPRVPEDIDTAIDKMLWLYRCGKDETSLKGTGSNKTNQIYSYEYDEDYIYSAFLDQYGVDLQDIEFLHWWKFKAMFKSLKEDNEIVKIMGYRAMDLSKIKDKSQRDFYKKAKEIYKIPTMLNKDEKQKISDIEETLMGSGDLASVLKQDK >NC_014393|302784:310060|302784_303222_+|WP_010075238.1|DBSCAN-SWA MIIKAIKDYISTCSYLQEFEAAICAVVGSGTSNSELYAIEVVKAEPILKKYMNGDSLRQCHFTFCSKESYGIDVLRSIESSSFYDDFENWIEEENRKGNLPSLTGNYIPVEIKVISSGYAFPVSQDKSRYQIELILNYYKKQGGN >NC_014393|302784:310060|303224_303707_+|WP_010075237.1|DBSCAN-SWA MGIKQRKSYANYLKVANAFEFMGAGFSDLNEAPTAVSASKRYISESSTTKTITGYEWSTAYVTDMIRSEKAVDFICNIGEMQLTGAEAETEYVIVDLDVPAATANEFKARKVKVAVEVATFDNTDGVMGATGNLLGKGDMVLGTFNTETKTFKEGFTAAV >NC_014393|302784:310060|305174_306821_+|WP_010075232.1|DBSCAN-SWA MADEKKCNCGNDASEEQTDLQKYTEEVKALAKGGFDVLSNSAINVVSKLKEIGLEGIKLAGNLEKVQGSFPNNIDSFSSQMDIANSNIEGLITDLGQILLPIATEVVKKFNEVADKVKNALANPEVQASIQGLAKDIGDLVNGALSFFADNLDIITEGLTWVMDNSEVILAGIVAIGAALATIAIIGAISSIVGLFVALYEEIATGTPIMEAFNIVVGMNPFVLIAAAVIGLIAAFIFLWNTSDGFRNFWIGLWDNIKTIFSDVWNGIMTFFTEVIPGWIDSLIQWLSGIPQWFSELPGKIGYFLGYLLAQLLLFGINAWTWVTTEVPNIINTIINWFAQLPSNIYNWLMNVVSNLEQWASNMISKAEQAAKDIVGGIINFFKNLPGEMENIGKNIVTGIYNGIINAKDWILGKIDEFVSGVVQGFKDALGIHSPSRVLRDEVGKFIAKGIAVGFVAEVPKMQGDIDSSMSDMVARMQGAVGCEIAATTANVASNNSAITKDNAINDTLMNSNGKVIENHIHVDIEGREVAKAVAPYQGVFDTYQIGR >NC_014393|302784:310060|306827_307535_+|WP_010075231.1|tail|DBSCAN-SWA MLKNGEIYFNGNTSIGLNLFLEEYPSVPIANEDFEEITVEGRSGSLYINKGTYPDKKIPFNFTILSPQIEIDFDKVYQWLTEIQDKRLIFGREDRCYIVKKVLFENLQKQFKTIGQFKVTFICEPFSSDLNYTTYEITSDNYSFYYQGNAPAESLIKVYGIGNIQLTINGETMVIYDVTDYVEIDSKFMQVRNKDKTSKDSAAYGVFPLFSAGANTIKYTGNVTKIIVEYTTRYK >NC_014393|302784:310060|307543_310060_+|WP_010075230.1|DBSCAN-SWA MKKDIKIAYFSYNTKKEDVLAYNGMALDNYCIKCETEENLNTGGYTLDATFLLDVQNTIKNSSGLVDGIREEGILKVKLDYGDEIFRISKVTKGTKHIDVVARQITISEVLNLYLDNIDIKAANIAQALGYLYDGAYGNKNLELTTNLIGTVSGSYKDMSLYKAIQGDQDSIINKVNGEIQRRKYKLSVLDQVGKNGTIVTIREGKNLTGFNGTSDFESVVTRARGTGANGIKGNWIESSNISKYAMVYSKTVSYDDVKVRTQEEIQKNQATDGYDTRESAIAELDRRVKKLFDQQQIDIPKVSYEINFVQLEKTEEYKNYAIAERVDIGNTVRVYVPKLDTDIMVRAVVKKYDVLAQRTKELTLSNEVETKAMGMNISSIVADLKKQYASSGSSSINEYMTSVIKSGMKDSYVVVRDNELLIMDKPDIDAATKVCRYNQNGLAFSRDGYYGTYTTGVSIDGIINADLIQTGIINADLIRTGKLSSKDGSISIDLNSNVFSIKNPNEDVKDGLSADTDGNLTITGAFRQFDDKGKKSIDIYDNKINIYDYKRNEDFIGALMSETTGGDTYGRLVLCAHTGNPLDLGIFNNDGTYSKYITLRDNADELATITMQQWCDFKNDITISAGDVAYGFMKLDANKDLWLCSNADDSQSLKLGNRRFDGELRNVIEISAAGGGVNSAVTINGALNIAQGKNRIVETNGYGVVALGAYETTEPYFGDIGEGIIAEDGLCYISIDPIFMKTVNTSCSYQVFLQRYGEGDIYILERAEDYFIVKGTPGLNFGWEIKAKQREYENNRLEVSDKFEPVVENFDDQLLDQNIINDKELDGILEGEEIIYE >NC_014393|302784:310060|304946_305108_+|WP_010075234.1|DBSCAN-SWA MEYQTKNEVIIIDEVRCPKCNQLLLKAEYIKGEIKCTRCKKIIELSMESKDRA >NC_014393|302784:310060|303909_304251_+|WP_010075236.1|DBSCAN-SWA MIINNVELIDIDIFDVEVAEKYENALKEVETVASKVKDMKLSESVRTQCESIFKVFNILFGEGADKKIFGDKMNLLTCIKAFEELVVQVNDQKSAIEEIASKYSPNRAQRRKK |
8 | Clostridium_phage(83.33%) | tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
922758 : 989314
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_014393|922758:989314|DBSCAN-SWA 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67 | Streptococcus_phage(20.59%) | transposase,portal,head,holin,tail,terminase,capsid,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
1027659 : 1037245
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_014393|1027659:1037245|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_014393|1027659:1037245|1035655_1037245_+|WP_013291622.1|DBSCAN-SWA MAIARAVTVIPAIVGRFTPTTSGVVTMKKVAAYARVSTDNDEQLSSFEAQMDYYARYIKSNTEWSFVEVYTDEGISATSTKKRDGFNRMITDALNGKIDLIITKSVSRFARNTVDTLTTVRQLKEKGVEVYFEKENIYTLDSKGELLITIMSSLAQEESRSISENVTWGQRKRFADGKVSLPYKQFLGYEKGEDGLPKIVEKEATIIRTIYKLFLEGKTPSAIAKHLTLSKIPTPGGKEIWQASTVSSILKNEKYKGDAILQKSFTIDFLTKKKKINEGEIPQYYVENSHPAIITPEVFDLVQHEIKKRKDAKGYKTSSGCFSGKIVCGKCGNFYGSKVWHSTSKYRRIIWQCNSKFKNNEKCGTPHLYEDKIKQAFVEVFNSVIENKEEILAGYEGILQALTDTTKLDKESFKLQSELEVVSEMLKKCVEENAHSALNQDEYEERYKALAERYENIKKGLEEIDEKRLERSAKHESITAFIKELEQREGLITEFDENLWAGTIEKIIVNTEEQITFVFKDGMEIEWNI >NC_014393|1027659:1037245|1030762_1031248_+|WP_010076551.1|DBSCAN-SWA MDRDYFDRPERYKDLNEKDKVVLDNWIKSKFEVASSNYTIRSSYGLKHDLNRDTGIYVYNGQFKGAMLAAGFTAVDERMLNWHFKMKERIPNSFYGFCLRRYKYNNSHLGDFTRDMEKAPEFPRESIDKVEIKDYLYKKHACVEAIKAFEKAWMNFEKSRK >NC_014393|1027659:1037245|1027659_1030341_+|WP_010076552.1|DBSCAN-SWA MTDRGNLAVSYAKKGFKIVMLHGINEAGNCTCGKGVKCNSSGKHPIYSNWGKKATTSEEEIIAEFKKYPKANIGFATGDNYFVLDVDIGHGGYESLKEYGELKKTLSVRTGSGGSHHYYLMPDGVTVPNRVGVLNGVDIRSNGGLVVAPGSVHKSGKHYEWLEHCSIDDVEITTPDKWLIDLIFSKKSSVKEVPESIEEGSRNAVMASIAGSLRRKGLSFEAILAALLVENNNRCNPPLNDSEVETIAKSICRYNPEAPITGEEWGEDKKENLLSSISNLEDFSKIYEKDMLSKLSMAKDNDPVTFAIIKSKLKGKINLKDLERAIKHIKHSEKEVEFKQALELDGLGTNGYMIPFGWSVDFNEGISKYEQNGEGIFKEVPVSFTPVVISRRFHNLDTEQEKVELSFYRDGYWKKVLAPRSVIFNRNSILRLADSSFPVSSNNAGELISYLSDFERENDKAIPVIKSVARLGWLKESEFFPYSTREYLEFENDSKEASNIMAGLKTYGDFDKWLEVARKARENLAARFIMASSFASVLLEPLHKRVFFIHLWHNSRSGKTATIKLSMSAFGNPNKLIGSFNSTIVGLERMAAALRNLPFAIDELQVLNTKKMSTDSIIYMLSQGQGRTRGSKDGGIQETLTWRNIIITTGEEAMLGTNMQDGANTRTFELYAKPVEDIALASLMHEVSEAHYGFAGKVFINKLCEELKMDKTFLQAIYDELRTSLKEKHIECIHLDEVAVVCLGDYLSSIYVFEEEEKVARDNALLTATAMIENNRQLTQNDNIERAWEMFTGWLIANNEKFQFDAKAPRYGRIDINDNYYVIPSFAHKALEDAGFSPKKVFRGFAERGYIESQVDKDGVLRLQITKSIGGKNCRVYVVRIPDDESVDMEFLR >NC_014393|1027659:1037245|1032144_1032456_+|WP_010076549.1|DBSCAN-SWA MRALFGRKVLNLKELKELTKEAKADGVQGTAYEVTKEIELTDDEFKEFTKDFGKDQPWITEEDGGCNEKGELKCIRVKNSKTKKCILVDSEGYTYPRYTAIEK >NC_014393|1027659:1037245|1034348_1035653_+|WP_013291621.1|DBSCAN-SWA MTRNIRKIEPLTQKMPRKKRVAAYARVSSGKDAMLHSLSAQVSYYSDLIQKHVGWEYAGVFADEALTGTKEIRPEFQRLLNECRNGKIDMVITKSISRLARNTVTMLETVRELKSLNIDVYFEKENIHSLSGDGELMLTILVSFAQEESRSVSENCKWRIRKGFEAGELINLRFMYGYHIKKGKIEINESEAEIVRMIFNDYIDGIGCTLIAKKLREMNVPKIKGGIWNSERVVNIIKNEKYAGNALLQKKYVKDHLTKTLVINKGNLPMYYAEGTHPAIINIETFQMAQEIMSKNVEKYIRDNTRVKYPFTSKIICGICGKNYRHKNTRGRISWNCSTHLKYGKDSCPSKQIPEEILIAVTTAVLGLKEFDEDIFQEKIKEIQVPEQNTLVFVFMDGTTLKKEWNYKSRSEGWSIEAREKARERSLKNIEGRN >NC_014393|1027659:1037245|1033711_1034128_+|WP_010076547.1|DBSCAN-SWA MTSNQKEEIKKMRQDGNSYSKIALILGISENTIKSYCRRNNLGINKVVKPDKEEELYTVCKNCSKPLEQGTKGHRKKFCSDICRRSWWRDNEALYNKKAFYKLKCLACGKEFESYGNKDRKFCGHSCYINYRFGKLEG >NC_014393|1027659:1037245|1032559_1033333_+|WP_010076548.1|DBSCAN-SWA MKENQYKLILKVKGLERKATSKVIGDFFGVEPRYLGAPSFNFEIQTQKGETFIVDRNGAIITPTYEIEETSEVIELYSKIAEAGAESIEIEIKLSMNGHRGISLKNLINIISSKQSLIKKALGIERNIVEQDFIEGINNVRLIEIEDFKRSALEIGVDKCEGISFDFEEEAIGFKFFKEKAEPQDLFAYLQLTQALNDNAKTLRHSSPKTTETNNEKYTFRTWLLRLGFIGNRYKESRSQLLRHLSGNSAFRSPTNA >NC_014393|1027659:1037245|1031588_1032035_+|WP_010076550.1|DBSCAN-SWA MLNEKQKDEILEFRKKGYGYKSISGILKINRDVVRDLCKRNGLGGFLGYGKSVPMESKKEIPIRQTSCESCGEPINILERRGRKARFCSDCCRRKWWYENQDKKDRRESAWYSFVCLYCRKDFKAYGNRARKYCSRKCYVEHRYGINI |
8 | Erysipelothrix_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
1264725 : 1274153
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_014393|1264725:1274153|DBSCAN-SWA 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ATCAGAAATAAGGTTGAAAGTATATTAGAAGCTTATCCTAAGGTAAAACTTATTGATATTGATGGTGAAGAACAAATAGAATTAGCAGCACTAAATAATGTTTTTTCCTTTCCATTATTGATACTTTATGTTGATGGTAAGGAAGTAATCAGAGTTGGAAGGAACGTTAACTTGCTAGAACTAGAGAATACTATTAAGAGATATTATGATTTGGTGTTTTACAATATTAAAAAAGAGAAGAGTTTTTAAAAGCCCCAGGGTGTGTGGAAGTCAGAAATAGCTTTTTAGGATAATCAATTAGACTTTAAGATTCAAAGTATTTACAGTAAAAAAAATACTTGACAGGAAGACTGTTTTAAATTTAATATATTATTGTTATTATTGTCAAAATTTTAAATAATAATAATATTTATACTTTTTATAAGGGGAAATTATTATGAAACTAAGTGTACCTTTTAATGGTGATATTTCTTTGATTGACAATTTGAGAGATAAAGAGATCTGCATGTTTTATGGGCAGATTTCAGAAGAGGCTTTTGGTGGAGGACGATCTAATATTGGTAAATATGACCAGGAAAATTTAAAAAAATTTGTCGAGGAAATCAAACGCAATTCCATTAAGTTTAATTATATATTGAATGGAAATTGTTTTTCTAATTTGGAATTTACAGATGATGTGAAAAGGAAGTTGTATAACAAATTGCAGTGGCTGGAAGAAATTGGAGTGCATATGGTAACATTCAGCAATCCATTTTTTATAAAATTCTGTAAAAAATATTTTCCAAATTTAAAAATTAGCCTATCTGTTATTGCTCGTGTCAACGATTTAAAGCAGTTACTATTATGGGAGCAAGAAGGTGTTGACCATATTACTTTATCGAAAGATATAAATAGAGATTTTGAGACATTAATGAAAATGAAAAAGTACTCAAATATGGAGCTTCAACTATTGGTCAATGATCCTTGCTTACCTTCTTGTCATCTAAATAATTACCATAATCAGATTACTTCATATGCAAGTCAAAGTATTCTTTCAGACGCAAAGATGAATCATGTAAGTTTTTGCACTTCCCAATGTAGGAAAAGTATGCTTGAAGACCCTACAAATATTATTAGGGCTATGTGGATAAGGCCAGAGGATATAAAGGTTTACGAGGAAATTGGCATTAGTTCTTTTAAATTGGTTGACAGAAAAGAATCTGTCAATTGGATTGAAAGAGCAGCGAAAGCATATATAAACAGAAAATATTCAGGAAATCTAGCTGATTTAATGAGTTTTTTCTCTTTGAATAAAGGCAATGGAGAGTTAGAACCTGAGCGCAATTCTGAAAAAATTGATATTGAAAAAATGGATTGGATAACAATTCCAAAGGAACATAAAATAGATTTTAGATTCAAACCTTTTATTGACAATTCAAAATTAGATGGATTTATTGATCGTTTTGTTAAAATGAGTTGTAGAAATCAACCTTGTTCTGTTTGTGGATATTGCTCAAAATTTTCAGAAGCGGTTAGTATAGATTACAATGACCAAGAAGTGGTTTTACACAACCAAGACCATTATATTGATAAGTTACTAGAAAAAAAGAGGTGAATCTAGGTGAAGCAGGATATTTCATCACTTAAAGACAAATTCGAATTAAAGGTTTCATCTAGTGAAAACCTTAATTTCATTTTAAATAATTCTTTAGATCTAGTTATAACATCTCCTCCATATAATATTGGAACAGATTATACAGGTTCATCAGATGATAAAAGCCTCTATGGATATGAAACATTTATAAAAAATGTATTCAAAGAATGCTATGAAAAGTTAAAAATGGATGCATATTGTATAGTGAATATTCCAGAAAATATAAAAACTAAAAACGAAGTCTGGTACTATCCGAAAATTTACAGTTCAATTTTAAAAAATATAGGATTTTCACTTATTTCAGTACATCCATGGTTTAAATTATCTTTAGATGGTGAATTATTTACAAGCAAAAAATGGGAAGAAGGTAAAGTGTGCAAAGATTCTCATGTTCACTCTGTTACGGAATGGTTTATGATTTTTAAAAAATCTAATCAAAAGGAGGAATTTAAAATAGGAGAAGGTTTTACATTTACTCCATATAAGACACCATTGCATCCAGCTGCATGGCCTGTAGCATTAATAGAAGAATTGATCAAAAATTACTGTCAAGTTGAAGGTAAAGTTCTGGACCCTTTTGCTGGCATTTGCACTACTGGATTAGCTTGTGTTAGAAATAATAGATGTTTTATTGGTGTTGACATCTCTAAAGATTATATAAGTATCGGTAGTAAGCTTTTAAATGAAGAAATGTTAAAATTAAAAAAATAAATATTCATAAATTAGAAAAACTATAATAATTGTAGAAAAGGTACTGTTGATATGAAAAACAAAGAGTTATTTTCCAAAATAAATGAATTAATTGCTTCTTATGATCCGATGGTGGCAGAAATTATTTCTGCAGAGAGCTATCGGCAAAGGAATACTATTTCTCTTATTCCTTCTGAAAATTATGTGTCTGCTCAGGTAGCATTGGCATTAGCCTCATCTTTTACAAACAAGTATTCCGAAGGATATCCACATGTTTGGAAAGAAGGTGTCTTAATTGATAAAAATGGAAGGTACTATCAAGGTCAGAAAAATACTAATAAAATTGAAAAACTAGCTATCCAAAGAGCACTTGAATTATTTACAGATATTCCCTCAGATTATCATGCTAATGTACAGGCTACCAGCGGTGCACCTGCCAATCTTGCAGTGATAGGAGCTTTTTTAAAGCCTGGTGACACGTTGATGGGACTTGCCCTTGATTTTGGTGGGCACTTGACTCATGGACACAAAGTAAGTGTTACCAGTCATTATTACAATGCTGTTCATTATAAATTAAATGAAGATGGAAAACTAGATTATGATGAAATTGAAAAATTGGCTGAAAAGTACAAACCAAAGCTTATAATTTCTGGAGCTACTGCATACACGGGAAAGATTGATTTTGAGCGATTTGGAAAAATTGCAAAAAAAGTAGGTGCTATTTTATTAGCAGATATTTCGCATATTGCTGGTCTATGTGTAACTGGCGAGCATCCACATCCGTTTCCACATGCAGATGTAATTACTTCTACTACACACAAAATTCTTAGGGGACCTCGAGCAGGTATTATTGTATGCAAAAAAGAATATGGTCCCCAAGTAGATAAAGCTCTTTTTCCAGCATTGCAAGGCGGACCACATATGAATACAATTGCAGCTATGGCTGTTGCATTTAAAGAAGCTTTATCTGATGAATATAAGGCATATACACAGCAGGTTGTTAAAAATGCAAAGGTATTGTCAGAAAAATTAAAAGAATACAATTTTAAACTGATTTCAGATGGAACAGAAAATCATCTAATTCTTTTAGATGTTATAAACAATAAAAATGGTATTTCTGTAAAGAATGCAAGTTGGTTTGCTGAACGATTAGAATTTGCTGGAATTGTGACTAATAAAAATACAGTTCCTGGAGATGCTAAACCATGGAATCCTTCCGGAATAAGAATTGGAACACCAGCAGTTACTACTTTAGGTATGAAAGAGAACGAAATGGTCAAAATAGCTGAATTGATAAGGTTAACTGCATTACATGCAGAAGATGATTCGAAACTGACTGAAGTAAAAGCTGATGTAGAATTATTAGTTAGCAAATTTGCACAAAATAGTAATTTCATTATTTAAAAAAAATTTTTATTTTCGAGCTAAAATTTCTAAATTCTGATGGTGGAGAATTATTTCACGAATATCAAATAATTCTTTCTACTATTAGAATACTGTTTATTTATAAATAATTGCAACAACATGTATGTTGAAAGTTTATGATTATAAATGAAATAAGATACGAGGATGTTATTAATGCCGAATAATTATTTGAAAAAGTCAGAAATATTTACTTTCCCCACAGAATATGCTCTTTTCAAAGCACAGGTATTTATTTTAAAAGATGGAACAATGCCAGTAGTTGTATCTTTAAATCAAGATCATTTAAGTTTGAATGATATACTAGTACGAATTCATTCTGAGTGCTTTATGAGTGAAGTATTATCATCAATACGTTGTGATTGTGCAAGTCAATTAAAAGAGTCTTTAAAAAGAATTGCTTCAGAGGGGCAAGGAGTGCTTTTTTACCTTAGACAAGAAGGAAAAGGAATGGGGTTATTTAATAAAGCCAAAGCATATTATTTGCAGGAAAAATATCAATTGAGCAATTATGAAGCCGACAAGATGGCAGGTTTTCCTGAAGATACTAGAGATTATGCATTTGTGGTTGAAGTATTGAACGAGATGAATATTCATTCAATTCGTTTACTAACCAATAATGATGAAAAAATCAGATATTTGAAGGAAAATGGTATCAATGTTCAAAAGACTTCTTTGGCGTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_014393|1264725:1274153|1269622_1269973_+|WP_010076352.1|DBSCAN-SWA MLKINSNEDIKKLISDNEIIIIYFSNKVCGACDVIRNKVESILEAYPKVKLIDIDGEEQIELAALNNVFSFPLLILYVDGKEVIRVGRNVNLLELENTIKRYYDLVFYNIKKEKSF >NC_014393|1264725:1274153|1264725_1267176_+|WP_010076356.1|DBSCAN-SWA MGKVVNNPSKSNIKLVPKNITPSQSNIKATVKREFILEGLGCANCAAKMEHKLSTLERISSASVNFVTKTLTVELDGTNKTDGLVDTITEVVQSIEGHVKVIEKQSNKVLKKEIKLQGLCCGNCAAKIERESNNIKGVKSAVVDFVNTKLILEIDNLSKQNVIIEKVKEIVKRIEPDVKVIELENNNRGAKDKTHEHNHDESNKSDMIKFGASALIFVVASVLNLSSYIELTLFLISYILVGGEVVLRAIKNIRRGQVFDENFLMSIATIGAFAIGQYPEGVAVMLFYQLGEMFQGFAVNRSRKSITALMDIRPDFANLKIGDELKKVSPEEVGVGDIIVVKPGEKVPLDGKVIEGNSMVDTSALTGESVPREVGAGDSILGGVINRNGLLTIEVEKEFGDSTIAKILDLVQNASSKKAPTENFITKFARYYTPIVVFSAVALAIIPPLVIDGATFSQWLYRALAFLVVSCPCALVVSIPLGFFGGIGGASRNGILIKGGNYLEALNNVEIIVFDKTGTLTKGVFKVTEVKAQNNFTSDELINYAAYAESYSNHPIATSILKAYGTEIAKDSIENYEEISGYGVKAMVSGREVLAGNFKLMNNEKIIYQQIETIGTVVHVAVDKRYAGYIVISDEIKEDSAKAIKDLKAIGVKKTVMLTGDNKIVGNKVAKQLGLDKVYAELLPDQKVEKVELLDKEKSPKGKLIFVGDGINDAPVLARADIGIAMGGVGSDAAIEAADVVIMTDEPSKITAAIKIAKKTRRIVMQNIIFALGIKIILLVLVAMGLGTMWEAVFGDVGVTLLAVLNSMRAMKVEKM >NC_014393|1264725:1274153|1273625_1274153_+|WP_010076348.1|DBSCAN-SWA MPNNYLKKSEIFTFPTEYALFKAQVFILKDGTMPVVVSLNQDHLSLNDILVRIHSECFMSEVLSSIRCDCASQLKESLKRIASEGQGVLFYLRQEGKGMGLFNKAKAYYLQEKYQLSNYEADKMAGFPEDTRDYAFVVEVLNEMNIHSIRLLTNNDEKIRYLKENGINVQKTSLA >NC_014393|1264725:1274153|1268972_1269467_+|WP_010076354.1|DBSCAN-SWA MRKLLLVLIGVMLSCLIGGTGKAVGDEKIAEDFVKAQGYDIITPKGEINKYVLEKSKLHGGTETIPYQQSWGVQTVGPDSYFGKEIIIYGFIVKNHPLEKKDKNVQNGVAVNIMLSDSKVIGGYSYPNEDIVGAYSSLDGKTLEEVTGLSFQQWQDNWNKKYRN >NC_014393|1264725:1274153|1270160_1271318_+|WP_010076351.1|DBSCAN-SWA MKLSVPFNGDISLIDNLRDKEICMFYGQISEEAFGGGRSNIGKYDQENLKKFVEEIKRNSIKFNYILNGNCFSNLEFTDDVKRKLYNKLQWLEEIGVHMVTFSNPFFIKFCKKYFPNLKISLSVIARVNDLKQLLLWEQEGVDHITLSKDINRDFETLMKMKKYSNMELQLLVNDPCLPSCHLNNYHNQITSYASQSILSDAKMNHVSFCTSQCRKSMLEDPTNIIRAMWIRPEDIKVYEEIGISSFKLVDRKESVNWIERAAKAYINRKYSGNLADLMSFFSLNKGNGELEPERNSEKIDIEKMDWITIPKEHKIDFRFKPFIDNSKLDGFIDRFVKMSCRNQPCSVCGYCSKFSEAVSIDYNDQEVVLHNQDHYIDKLLEKKR >NC_014393|1264725:1274153|1271324_1272068_+|WP_010076350.1|DBSCAN-SWA MKQDISSLKDKFELKVSSSENLNFILNNSLDLVITSPPYNIGTDYTGSSDDKSLYGYETFIKNVFKECYEKLKMDAYCIVNIPENIKTKNEVWYYPKIYSSILKNIGFSLISVHPWFKLSLDGELFTSKKWEEGKVCKDSHVHSVTEWFMIFKKSNQKEEFKIGEGFTFTPYKTPLHPAAWPVALIEELIKNYCQVEGKVLDPFAGICTTGLACVRNNRCFIGVDISKDYISIGSKLLNEEMLKLKK >NC_014393|1264725:1274153|1267607_1268831_+|WP_010076355.1|DBSCAN-SWA MAIFRVNKDDKNPFMMINKEFVNDNRLSLKAKGLMCYFLSKPDSWEFYIEEIKKHTKDKEAAISSAIKELIEGGYIKRSRKRENGKFLGGYAYDIFEAAKGDISKVDVSIGAMTIGQQSYGKLIVNDNVGQAPCNDFTIYEEIQLRSCIAAAVEEEIKVTDKKENKVEEDYNSRKTYSSEKEYISTNEYASEREYNVAKKYTDEEQYTSENADILGTLHKVKNIKMGKSHTGENTEMGKNHTGENTEMEFYQNGELPNWKNPVLLNNDFNNNNDFKSNNDIYTSDFKESEELTLAKYLFKHIKNNNPKAKEPNLEKWAKTFKLILKKDQRNFEEVKIIIDLSQKHHFWYKNILSPEALRKQYDRLILEMEEKKKPKKNQESYAGTFGDYTQRTYDFDKLERQLLGWS >NC_014393|1264725:1274153|1272119_1273451_+|WP_010076349.1|DBSCAN-SWA MKNKELFSKINELIASYDPMVAEIISAESYRQRNTISLIPSENYVSAQVALALASSFTNKYSEGYPHVWKEGVLIDKNGRYYQGQKNTNKIEKLAIQRALELFTDIPSDYHANVQATSGAPANLAVIGAFLKPGDTLMGLALDFGGHLTHGHKVSVTSHYYNAVHYKLNEDGKLDYDEIEKLAEKYKPKLIISGATAYTGKIDFERFGKIAKKVGAILLADISHIAGLCVTGEHPHPFPHADVITSTTHKILRGPRAGIIVCKKEYGPQVDKALFPALQGGPHMNTIAAMAVAFKEALSDEYKAYTQQVVKNAKVLSEKLKEYNFKLISDGTENHLILLDVINNKNGISVKNASWFAERLEFAGIVTNKNTVPGDAKPWNPSGIRIGTPAVTTLGMKENEMVKIAELIRLTALHAEDDSKLTEVKADVELLVSKFAQNSNFII |
8 | Streptococcus_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
1977979 : 1987498
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_014393|1977979:1987498|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_014393|1977979:1987498|1981762_1982242_+|WP_010077434.1|DBSCAN-SWA MKVAIIFGSKSDTDKMRGAANALKEFGIEYKAYVLSAHRVPEKLREVLKELEADGFECIIAGAGLAAHLPGVIASETVLPVIGVPINGALDGADALYSIVQMPKSIPVATVGIDNSYNAGMLAVEILGVKYPEIREKLLAFRKTMKENFIKENGEGVEL >NC_014393|1977979:1987498|1985992_1987498_+|WP_010077429.1|DBSCAN-SWA MIKRALISVFYKDGLLEMAKFLESKGVEIVSTGGTFKFLKDNGIKVIDVTEVTGFEEMLDGRVKTLNPYIHGGILAIRDNEEHMTKIEEKGITPIDMVIVNLYPFFEKVTADITFEEKVEFIDIGGPTMLRSAAKNFQDVIVISDTKDYAEVMSQIEEKGDVDYEFKKRLAGKVFNLTSAYDAAISNFMLGDGNEEYLSVSYKKLMDLRYGENSHQSAAYYVSTTEKGAMKNFTQLNGKELSYNNIKDMDIAWKVVCEFDEIAACGVKHNTPCGVAIGETVYESYMKAYECDPTSIFGGIVAINRPVDKATAEELVKIFLEIVIAPDFDEDALEILKTKKNLRVIKCDEKPQLSKELVKVDGGILVQSADDKLIEETKVVTKKAPTDKEMKDLIFGMKVVKYVKSNAIVIAKDQVTLGIGGGQVNRIWPTQESLKRSNNPEGAILASDAFFPFGDIVEEAAKYGISSIIQPGGSVRDSESIENCDKNDISMVFTGLRHFKH >NC_014393|1977979:1987498|1984377_1985370_+|WP_010077431.1|DBSCAN-SWA MSLYKESGVDIEEGYRSVSMIKEHAKRTQIPGVLNSIGSFAGMFELGQYKNPVIVSGTDGVGTKLEIAIRMKKYDTVGIDCVAMCVNDILCHGAKPIFFLDYIGCGKLEAEVAADLVKGVSEGCLQSNCALLGGETAEMPGFYKHGDYDIAGFAVGVVEKDEIIDGSDIENGDILIGIESSGVHSNGYSLVRKLIPDINIDFNGAPIGETLLTPTRIYVKPVLDILQKVKVRGMAHITGGGFIENIPRMFKKNQRAVINKASYKVPAIFKYLMECGVKEEEMYNTYNMGIGYIMCVAKEDAAKVMSLLKEYDLNSYEIGYVEEGEGVCLK >NC_014393|1977979:1987498|1985357_1985969_+|WP_010077430.1|DBSCAN-SWA MFKIAVLASGGGTNLQAIIDAVNNKEINAEISYIITDNEKAYALERGRLNNIPVMSFDRKQYKEGLSDKILEVLKGKADIIVLAGYLSILQGDIIKEFKNRIINIHPSLIPSFCGMGAYGIKVHEMAIEYGVKVSGCTVHFVDEGTDTGAIILQKVVEVMEGDDAKKLQERILVKEHEAIVEAVKLFSEERVQIDGRKVSIKG >NC_014393|1977979:1987498|1977979_1981741_+|WP_010077435.1|DBSCAN-SWA MNSIRSIFVEKKKQFQGESKELLKDLRENLHLTSLEAVRIINRYDIEGLNDETYQKAKNLILSEVNVDDIYEENIILNEGEVAFAVQYLPGQYDQRADSAIQCIQIIAGYSSFNLTSSKIIILKGNLEKENIEKVKNYYINNVDSREINIEKPKTLELKVEEPEAVEVLEGFNDYSEEALKAFLEERGLAMTIEDLKFCRDYFKNTEKRNPTITEIKVIDTYWSDHCRHTTFSTVIDEVEFEDGPYNEEIKRIYESYKASRDFVYGDKPKAQTLMDLATIGMKELKRTGYLDDLDESEEINACSINITVEIDGKEEPWLLMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCIGGAIRDPLSGRSYVYQAMRVSGSGDPRTPIEETIKGKLPQRKITIGAAHGYSSYGNQIGLATGQVTEIYHPGYVAKRMELGAVIAAAPKENVIRETPVSGNKVVLVGGRTGRDGCGGATGSSKEHTEKSIDTCSSEVQKGNALTERKIQRLFRNPEVAKMILRCNDFGAGGVSVAIGEVSEGIKINLDLVPKKYMGLDGTEIAISESQERMAVVIEEKDVPRFLEHCDEENLEATVVAEVTGNRRVEMLYKGDNIVSISRDFLDTNGVTAHIKAKVSKISEEGNFFVTSEAVSESATLEELLVNRVSELNVASQKGLSERFDSTIGAGTVLMPFGGKKQATPTDAMVAKIPVLKGETNTCSIMSFGYNPYLTSWNPFLGGIYSVIEALSKVVVVGGDYRKARLSLQEFFERLGKDEEKWGKPFSALLGAYYAQKSFGTAAIGGKDSMSGTFKDLTVPPTIVTFAVATEKSENIISQEFKSANSKVILLSHSMLENNMPDIDGLKRIWKKVYSLACEGKILSSMAIKFGGVIEAIAKMSFGNAIGIKINENVSLKELAASNYGSIVLELKEEDVKLLEGFDFLELGTTTEEYKITYKCEEISLSNIENKWETVLEGIFPSTKKAEGPVIDKLSAVEKKASPVIKLAKPKVLIPVFPGSNCEYDTSRIFERAGAEAEILVFRNRNNEDINASIDAMVEQIKASQIIMFPGGFSAGDEPDGSGKFITAVLRNPKIKDAIMNHLNNKDGLILGICNGFQALIKVGLVPYGEIRDLDEKDPTLTYNTIGRHISTMVNTKVVSKLSPWLNSVELGDIHSIAVSHGEGRFVGDEALIRKLFENGQIATQYVDMSGNATMESPFNPNGSMFAVEGITSPDGRVFGKMGHSERIGSNIAKNISGNKDQKIFLSGVNYFK >NC_014393|1977979:1987498|1982241_1982955_+|WP_010077433.1|DBSCAN-SWA MEKLEMMYEGKAKQIYRCADEDKVIVHYKDSATAFNGEKKGEIEDKGVLNNAITSAIFKLLEENGVKTHFIKKLNDRDQLCKKVEIIPLEVIVRNVAAGSMAKRLGLEEGYKLKTTVFELSYKDDSLGDPLINDHHAVGIGATTFEELDEIYKMTAKVNEVLKDFFAKQNISLIDFKIEFGKTADGEVLLADEISPDTCRFWDSITGEKLDKDRFRRDLGDVKAAYVEILNRISEEK >NC_014393|1977979:1987498|1982957_1984352_+|WP_010077432.1|DBSCAN-SWA MWIDDEDKLKEECGVFGIFSKTQIQASHLAYYGLYALQHRGQESAGIVVSDGEKLSIHKEMGLVSDIFDEELLNTLSGNSAIGHVRYSTSGESTSRNAQPLMSEFKLGPIAIAHNGTLINADVIRGLLEDSGSIFQTSIDTEVIINLIARQNKKGLEYALVDAIQAIKGSFAIVMLTEKQLIGVRDPYGIRPLCLGKLGESYILASESCAIESIGGEIIRDVEPGEVVIVDENGIKSIKYAENTPRKSCSFEHIYFARPDSVIDGINVYEARVKAGMELYEKYPVEADVVIGVPDSGLASAVGFSKASGIPNEMGIIKNKYIGRTFIAPTQEMRERAVSVKLNVLKSIVNGKRVVLIDDSIVRGTTGKRLIEILRRAGATEVHFRVASPMVGYPCYFGIDTPYRKDLMGSEASTEQMREMIGADSLGFLTIEDLVKSLGGSNDFCLGCFNGIYPMATPVEQFQK |
7 | Cyanophage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
2441182 : 2450704
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_014393|2441182:2450704|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_014393|2441182:2450704|2442624_2443242_+|WP_010076997.1|DBSCAN-SWA MGIKKFDAYINNHIKENKWLYLLSLLCICTGIVLGIYSVNYMDDILKKQLCAYISNFSSANDKISNMNVFVESLKNNIPFILLIWFTGLTIIGVPFILIIQLIKGFTLGFTFSFFVNAFRSKGILFSLFGILPQNLIFVGLMIFTSVVAMNFSLALLKEKNAWRVNVIKKINKYTRNLIVILLLMCVGAFIESFVSSYLLKLIKL >NC_014393|2441182:2450704|2443558_2444374_+|WP_010076996.1|DBSCAN-SWA MKYNVVMESASYIKDIVNEELEIGIILGSGLGSLASEVINAKVVSYSDIPNFPVSTVQGHAGQFVIGELCGKKVIMMQGRFHYYEGNPMAVTALPVYVMKELGIKTLIVTNAAGGVNTEFKPGNLMIIKDHINFSGVNPLIGENDDEIGPRFPDMSVAYSKELIEIVKKAAKETNIDMVEGTYVMMSGPSYETPAEIRMLRIVGGDAVGMSTVPEAIAASHCGIKTIGISCITNMAAGILDVPLNHQEVMETSAMVKEQFISLIKKTLELL >NC_014393|2441182:2450704|2447921_2448527_+|WP_010076992.1|DBSCAN-SWA MRDNMNQIEFIDNEEESRLFSIIESLLFVSGEPLNIKQISEIIECSYSKTLALLESYGEELSNSKRGIKLMMLEDNYQLVTKEENAEFIQRLLKTNSRQSLSQAALETLAIIAYKQPITRVDVDEIRGVKSDRAIYTLVEKKLIKESGRMDIPGRPILYATTDEFLRYFQLENLKQLPNLEELEELIAIDADVDIDNGEEE >NC_014393|2441182:2450704|2449654_2450704_+|WP_010076989.1|DBSCAN-SWA MFKKKFRNSFLIAVMILISISNNITAYGKVLSIDARAAIAMDVKSKRVLYEKNSVSLIPMASTTKIMTSLVALTYGNLDQEITISKKAAAIRGSTVNYMAGEKVTLRELLYGLMLRSGNDAAIAIAEGIAGDVDSFLVLMNEYANLIGATNSHFESPHGLDSNQHYTTTYDLAIITSKAMENRTFREIVGCRSIEKGASGFTRGYSNINKILFLHGDATGVKTGYTGQAGKCLVSSFNYDGNDIVVIVLNCNPRWGETLKIYNHVKDNYEYKKLCSKEDDIAIINTKKSKYKLFLEEDMILPIKRNANFALNVVKPKYVKKDTGYYGRIEVIEEGKMIFNKELLKEKID >NC_014393|2441182:2450704|2441182_2441785_-|WP_010076999.1|DBSCAN-SWA MVEKNNKQMEIYNYIKSVSAERGYPPSVREICTAVGLSSTSTVHGHLERLEKRGYIRRDPSKPRAIELLKENKVEMLSIPIIGKVTAGNPILAFEDIEDTFTIPSQFIKSNKELFMLKVSGESMVEAGIRDGDLAIIEKQNTANNGDIVVAMIEGEATIKTFYREENHIRLQPENKLLSPIIVNSCTILGKLAGIFRNYK >NC_014393|2441182:2450704|2445812_2447024_+|WP_010076994.1|DBSCAN-SWA MKVKKKRLISLFLVLISIFQLFVPKAAIVVFAEEAAVETSAAKDTTAINVEANSALLMEPNTGKVLYEKNIHDKYAPASVTKIMTMLLAMEAIDSGRIKLTDTITVSENAKKMGGSSMILETGEVRTVEEIIKGIAIASGNDAAVAMAEYIGGSEENFVVMMNKKCEELGMKNTTFKNCTGLSADGHLSTAYDISLMSRELLKHPTILKYSSIYMETISEGRKTPIELVNHNKLVRFFKGCDGLKTGFTSEAKYCISATATRDGVRMLSVIMGAPTFKVRNRDASMLMNYGFSKFESKVIVKKDDEVDKVSFDKKGDKFLMAKSCDEVRVVVEKGGNIETTKKIILNDNLKEIKQGQMIGKCEFYNGDVLVGTVNIYSDRDIKGNNLINNIKEFFTGIFEHAV >NC_014393|2441182:2450704|2448543_2448969_-|WP_010076991.1|DBSCAN-SWA MEDHPINDLLKCTIENLREMMDVSTVIGDPIVTGDGSTILPISKVSLGFGSGGGEYSTKHCPEYKEKVHSMPFGGGSGAGVSIKPVGFLIVRGDKFRLMPLEFNDSVEKLIDTVPDILDFIKKTFNKDKSATESTKNTKEE >NC_014393|2441182:2450704|2448937_2449573_-|WP_010076990.1|DBSCAN-SWA MILKIFLYLLLFLIILFLLPIPVIIKGNFSKDAIEIHVYGKKISLNKKLKKANKDENLKETIETKKKKEKKNASKKKKAIMDRINENLSIPTVLKLHGKFKKVFTIRKLHMNFNYGLQDPYNTAMAYWSICSMHCIIYKFFEFLVHIKDYSFKIIPNFNKEEISFNFSCIFIINFAKITYIAFYAYKILISNSKINSRRDYYGRSSNKRFT >NC_014393|2441182:2450704|2444411_2445716_+|WP_010076995.1|DBSCAN-SWA MRMYDLIAKKQAGFELSKEEINYFIEGYTKGTIPDYQVSALLMAIYFKKMNERETADLTMAMVNSGDVLDLSMIEGVKVDKHSTGGVGDTTTLVLTPMVAALGIPVAKMSGRGLGHTGGTIDKLETFKGFSVEMSKEKFIEDVNNIKIAVVGQTADLVPADKKLYALRDVTSTVENISLIASSIMSKKIASGADAIVLDVKVGDGAFMKSYEDAKNLGEAMVSIGDNVGRRTIAVISDMDQPLGLAVGNALEVKEAIETLKGNGPKDLFELCLTLGSNMVMLANESLTEAKAREMLLETITSGAAIAKLKEFIAAQGGDVSCIDDINLLPKAQHIIEVKSDKEGYVSKIHAQEIGVVAMKLGAGRETKESVIDLAVGVVLNKKRNDYVEVGDTLAYIHANSLELGSKLKEELASCYEISKEYEEKIPLIYDIIK >NC_014393|2441182:2450704|2447169_2447925_+|WP_010076993.1|DBSCAN-SWA MALNIKLENFEGPFDLLLHLIKKNKMNIYDIKILDITNQYLEIIRTMSEMDLELTSEFIVTAATLIEIKSSMLLPKDKEEEEEEEENSTDNLIKKLIQYRKFKSAAGYLKERATSFGQVYTKKPEIIEEKKGEVKLEDLLKEVTMISLYNLFHQLMIDYSEKMNLHIIDKEIKIDVYKVEDKMDMFKEFFKVNKTMNFSYIVKGYKDKIEVVVAFLAALELAKLKEVKILQEENFKEIYLERITTGEEIEI >NC_014393|2441182:2450704|2442042_2442567_+|WP_010076998.1|DBSCAN-SWA MDLAEKTISEETIYEGKIIKLRKQKVVLPNGNTADREIVNHPGGVAILAFKDENTVIFVEQYRKPIDKVTLELPAGKIEKGEDIKLTALRELEEETGYKSNDITYLGKVLASPGFCDEYIHIFKAENLYNGKAGCLDEDEFVNVHYHSLEEVQKMIKEGIIEDAKTICAFGYIR |
11 | Stx2-converting_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
2801554 : 2930566
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_014393|2801554:2930566|DBSCAN-SWA 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105 | Clostridium_phage(30.23%) | transposase,head,holin,portal,tail,terminase,capsid,tRNA,integrase,protease | attL 2865319:2865378|attR 2900824:2900960 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
4302645 : 4346248
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_014393|4302645:4346248|DBSCAN-SWA 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55 | Clostridium_phage(36.67%) | integrase,capsid,portal,tail | attL 4328873:4328888|attR 4349628:4349643 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_9 |
4712370 : 4824050
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_014393|4712370:4824050|DBSCAN-SWA 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86 | Erysipelothrix_phage(50.98%) | head,holin,portal,tail,terminase,capsid,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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