Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_014410 | Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum DSM 571, complete genome | 5 crisprs | cas3,cas14j,cas4,csa3,WYL,DinG,csx1,cmr1gr7,cas10,cmr3gr5,csm6,cmr4gr7,cmr5gr11,cmr6gr7,DEDDh,cas2,cas1,cas5,cas7,cas8b1,cas6,csm2gr11,csm3gr7,csx10gr5,csx20,cas8a4 | 0 | 13 | 8 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_014410_1 | 309414-312133 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_014410_1
|
40 spacers
spacers of NC_014410_1
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CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014410_1
The CRISPR arrays of NC_014410_1 >merge|NC_014410|1|309414-312133|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT 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>NC_014410|1|1|309414-312133|PILER-CR GTTTTTAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC TTTTACAAATACAGTATCCAGTACAGGTGCTACAAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC TGACTAAAATTAAAGCAGTAGCAAGAAGAGCAGGTT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC CCTCCTTCTGATATATTCTTGTCTTGATTTCTTGAAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC TTAGATCCAGTTATATTATTAAATCTTATTTTTATCCAAAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC GGTGTAAAGATTTATAAAAAGCTTTCAGGTAGTAGA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC TTAGTCTTAACAACAATACCTTGACGCAAAATACAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC CTGTCAACATAGCCATTATTGAAATACTTTGGCGGAAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC CCGCTTGCGATAGCGTCTTCGACAGGACTTTCAAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC TCATAACGAATAAATTCAACCTTCCCGCCCCTTTTG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC GCTAATACAAACGCCCAGGCAGGAAGACAAACGGCCCAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC TCAGATGCAAAAGCTAAGGATTTAATATACGCTGCTA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC CTTCGTCCCTGGACATTGGAGCGGCCATGTTTTCGTC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC GCGTCCAAGATCGCCATAAGAATGTCCTTCTGGTGG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC 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>NC_014410.1|WP_013296868.1|308182_309052_-|copper-amine-oxidase MFKKIITAMLILSLVVIPFMAFADDTTSSTSDNTTTSTQAVTSNDNTTVSDSVYDQTSGDSTTIQNSQIDAINSQIQELEQELETAINNNQFAKALEISNKIKALEQKLKTLSQNDQLEAQIADLKTEAINDFQNGQIDNAINVIKQIISLKHSQDNYALLGKIYHMVKKDNTPHVFANGKEVLSDVNPMIYNNRTYIPLRAVANAIGVDNNAISWDNNNRTVNIKTGNINIYMPVNTTNIKVNGNAKAIDAPAIIYKNRVMVPLRAISQLFNKSVNWYQEGQIATVGD >NC_014410.1|WP_013296617.1|306555_307128_-|hypothetical-protein MIIIAFPVKNIHEYIENESYLYIDTPSGCPNCNYNGKLYRHGYYCRGVFIDNNCIDITIARVICPVCHKTHALIPDFLVPYFIYPLSVILTSLKKIFIDGHGTTYVADEIIKEFNLSFVKEQNISYFKMRFLSILNYVHSFFANFREYIETMNSLSPRTLISNICKYTKEKLKFNLHYFDLMKVHFFKKV >NC_014410.1|WP_155812181.1|305084_306194_-|DDE-type-integrase/transposase/recombinase MPSLGKREFSPNTIKTWLYCYRKYGFEGLYPKSRCDKGASRVLTDDVKAYIKNLKLDNPRRSAKSIYQELLVKKFIELDKVSLSTVQRYLRKTKISTSALNTKDRRSFEMEYPNDCWQSDISMGPYLIINDKKIKTYLIAFLDDSSRLITHAEFYDTDNVISLIDAFKKAVSKRGVPKKLFVDNGKVFQSEQLHLICASLGTSLCYAEPYSPESKGKIERFFRTLKDQWMYGFDWQKISSIDELNENLNKYIEGIYHQTVHSSTNMKPIEKFIKYTDTMKFINSKEDLDNIFLYRVKRRVIKDATVSIEKIKFEVPMQYIGDYVNIRYYPKSLDKAYIFSEDGKLLQTIHPVNKIDNSKIRRKEIDFSL >NC_014410.1|WP_013296615.1|304259_305063_-|AAA-family-ATPase MFNVYYGLTFNPFSKDCDVKYHYKSQDYIQAMSRLEFLKDKKGFGLITGDPGSGKSYTLKCFVTSLNPNMYKVVYIPISTLTVMDFYRYLSDGLGLIPKHRKCDMFRQIQDVILSYHSKNITPVIIVDEAQFISNSILDDLRIIFNFDMDTKNYALLILSGQTQLIIQLNRQAHEALRQRIVLNYSFKGLNKDETKEYITSRLKCAGCNETIFTDDAIELIYSSTNGYLRKINLLAEMSMILGAKESQKTINGELVFRAQSDINITE >NC_014410.1|WP_013296865.1|298582_299578_+|copper-amine-oxidase MRKTVSMVIAFLLIFLSIPVFALASSQSDELPYQDWIDKGWIKAISPDENGHDKLGWYSIMPGKEKEIAYSDKLKNTDRLIVVVGSFLANNNLEYYQSEGGSAVALCDVTKLRENYKELYGEIKYNNPDTLKYDFWKGLVTINLVSINGTPWQETKYKDVLLQNFYDRWEGLKDPAYNRYLIDPKWNGYTDECIYNWDGVDVWIGKDDITVRYELKENKGKLPTEVISDNGVSMIPLRGVMEELGATVDYDSKTQEITIKDKGKTVVLKVGSDNAVVDGNTVKMPRKVYVKSGYTMLPLRFVAENLDHAVQYLNDGTIMIWRAKYTTPPSI >NC_014410.1|WP_013296864.1|297986_298559_+|Uma2-family-endonuclease MSLPKESKKYTYADYLTWPEGERWEIINGVPYNMSPSLERKHQKVVGELFAYIHNYLKGKTCEVYNAPFDVRLLDENVSDDVTNVVQPDIVIVCDPRKLDDKGCKGSPDMIVEVVSPSTLKRDLKEKFYLYEKAGVKVYWIVFPDEKTVLSYHLGEDGKYKRPEVYSEEDNIKVGIFESLEIDLKDVFDY >NC_014410.1|WP_013296863.1|297694_297943_+|DUF2442-domain-containing-protein MYKIIDVKAADDYKLIVTFENGVIKEYDIKQKLNEWPFELLKNKAYFRAVKVDVGGYGISWNSDIDLSEYELWNNGKSISLA >NC_014410.1|WP_013296862.1|297439_297688_+|DUF4160-domain-containing-protein MPEITRFYGIVIKMYFGDHLPPHFHAIYGEYVGMFNINTLEMIEGDLPKRAREMIIEWASKYQNELLDIWESQKFIRLPGLE >NC_014410.1|WP_013296861.1|297110_297338_+|DUF5348-domain-containing-protein MEVINGFVKWNYETDRYNIGGYDLHSGDFVDLWDNWSLRWICGRVEFRDGRYVLLTIDKEIKEFSLNQKAKFYNI >NC_014410.1|WP_013296860.1|296431_296647_+|hypothetical-protein MILRKQLKNSKLGYHFIFAGALLISFTEIIRRYIVVGDFVDGLCIGIGIGLEILGIIALRKYYNSQRVSNQ >NC_014410.1|WP_041587406.1|312327_312696_+|hypothetical-protein MGWIYAPYRLYFAKCSPLWENKGVAFLSGKKEKNHEYYSVIRLWKITEEQFYEIQKQEGKCWYNLILELGEKDGVKIKTITGCWIDEIQAPSEEYLKVIEKGLKETTNWDDERIRAYLKKFM >NC_014410.1|WP_013296869.1|313144_313978_+|chemotaxis-protein MITISKNEMLDFFHKLTAFLPILFEDSVSFAIVDNEKYLEIQNCDELPINAEVGDAIPEGGAAFEALRTGNYIIKDVPKEVYGVPFKSYAIPIKDYDNAVIGVFLMGKSLEKRHKVLSLSENLAASLEQISSAIQEVSSGVEIVVNSNTKILEEVDKAIENAKGTDDILNFVQNISKQTNLLGLNAAIEAARAGEMGKGFSVVAEEIRKLSNTSSESIRRIDSVLEKIQESIKSISNKINESSSFFETQAAAFEEITSSIEELSDTSQLLEELARNL >NC_014410.1|WP_013296870.1|314603_315179_+|Uma2-family-endonuclease MPLPKENKKYTYADYLTWPEGERYEIIDGVPYMQAAPTWQHQAVLLELSRQFANYLRNKTCMVFTSPFDLRLPEDNNQNDDDVTNVLQPDIVVVCDRSGLRKTGYYGTPDLIVEIVSSSSMRRDKLEKFNIYEKSGVKEYWIVEPEGKIVSVFVLQDSKRYGRPEIYADEDKVKVTIFDDLIIDLKPVFDY >NC_014410.1|WP_041587408.1|315256_315439_+|hypothetical-protein MKYDGIVIGRLFVNQHIEKDCLYHEINKYSKSTKILGIGRKPNIVEKIQEKVFEVAHSLC >NC_014410.1|WP_013296871.1|316634_317918_-|IS110-family-transposase MKYNQNTKIMQITEKTLIVGVDIAKEIHHARAFDFRGIEYGKRIEFSNDIDGMKRFLKWAADIMNKSNKEHLMVGMEPTGHYWLCFAQFLRDKNHKVVLVNPFHVKRSKEFDDNSPTKNDRKDPKTIAMLVKDGRYVEPNIPEGIYSELRIAVDIREMLTKDLNKIKNRVARWLDIYFPEFNKVFADWEGKAALITLKEFPTPAKILGIGAEEILAAWKKEINRAVGAKRALKLIEAASQSVGKRDGIEMAEIEIKIILEQYEMLVKQLKKIESKIEELFMQVPGANEMLSIKGVGVITAAIFIAEVGDITRYEHPKQIQKLAGYNLVENSSGQHKGQTTISKRGRRRLRSALYKMIMPILANNKEFQELHKYYTTRKENPLKKKQSMIVLCCKLIRVFFVILKKGVKYNGNKMLRDIKRPEIRNAA >NC_014410.1|WP_041587409.1|319103_319301_+|hypothetical-protein MSEIIYYGAYGSNLLRERFLIYIKGGEYRGKEYRGCRDKTEPIDMGWIYVPLQALFCKMFSTMGK >NC_014410.1|WP_013296873.1|319248_319602_+|hypothetical-protein MFLYRLYFARCSPRWENKGVAFLFDEKEENPEYYSVIRLWKITEEQFYEIQRQEGGWYNLILELVEKDGIEIKTITGRWRDKKQAPSEEYLEVIKKGLKETTNWDDERIEAYVKKFM >NC_014410.1|WP_013296874.1|319715_321008_-|SEC-C-domain-containing-protein MKIFDISRNDDCICGSGKKYKKCCMNNIEEIKKTLTNSLSNEVNLFSDDVEFIKIVSILYGANLSEKNKSFKADKIVKLILETFETEDNYTNDDYIQFLRKMTRNIAEDKRLKKVRVPGDLLKDIEIGNELDVDNLLKEIVEENLVEEILLSIAFELQNFNFNEKEIKDLFLLIRISILDEYNTLVKVAIGATMIEIAKALEEIHAINGTKTMDKIYDIASKYPSFNEYLSSKMFDTITNDLAYVLDERIDIPFFIVYLFLLKFYHRILSSFLFDFKTPTEFYDSLFDEVLQNLLYKELIIYEKALKTILTSLELKSESINDEKVKMSFENVLSLLSLPINHWNMEIFEQIMKVNILRTLNNLPAKVEGIDKEVKLQDLISDEILDEYIVYLKKNGLEQIVDLFKKIYGDLKNTMSKISSDILANLDIKF >NC_014410.1|WP_013296875.1|321423_322524_+|NADP-transhydrogenase-subunit-alpha MNLPSFSVIGAGNGGQAMAAHLSLMGFTVNLYNRTREKLIPILNNGGIYLEGAVSGFAKLNMITDSIEDAIRDTDIIMVTIPASGHSDVAYEMLPYLKSGQIIVLNPGRTFGAIEFYNIIRARSDLNVVISETDTFIYACRSNDGRGKIFRIKDVVSLASIPSWKTNYVVDLLKLAYTQIVPAENVLETSLNNIGSIFHPAPILLNSARIETTEGSFQYYLEGISPSVAKILERMDRERVAVAHALGVNAITALDWLKDTYGVVSDNLYEAIQNTDAYKGLLAPRTLDCRYIFEDVPMSLVPISSIGRQLGVSTHTIDSIIHLASCMHEKNYWKIGRTVVKLGLDGKSAAEIKEIVEGVKEESTVA >NC_014410.1|WP_013296876.1|322520_324173_+|cobalamin-B12-binding-domain-containing-protein MKRLIIAASIENDVHVAGVYKFLRLAESEGFDIQFLGPATPIDKLVEIIRLRKPDIVGISYRLTPDSLKSILDVLKSRIKEYNLNGIRWIFGGTEPNCIVAKESGIFEEVFDGTSGDEFTISYLKGQKVLADEVEYGQDIVDRIERNYPYPVIRHHFGLPSYKDTLAGIKKIASEKVLDVISIAPDQNTQEHFFDKKYNTALDGAGGVPIRSEEEFKKLYDESRRGNYPLLRCYSGTNDVFKMAKMLKDTINNAWAAIPLCWYNVLDSRGPRQVEESIRENQKLMKWHADRNIPVEVNEAHHWGLRDAHDAIYVAASYLAAYNAKKMGVKNYIAQFMFNVPPATSPKMDLAKMLASIELVESLQDDNFRVFRQARAGLASMPQDLFEAKGQLASSAYLSMAIKPHIYHVVGFCEAHHAATPDDIIESVKIVKAVIKNTLSGMFDFTQDLDVLKRKEELINDAKVILNGIRELNTLCSDPLSDPHTLSLAIKLGILDAPHLKGNKSASGALQTKVINGACYAFDYENNRVIEEEERVFNIIQNYQKMIIVA |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_014410_2 | 315799-316092 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_014410_2
|
4 spacers
spacers of NC_014410_2
>2.1|315829|36|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATGCAATTGATAATAAAGTAAACAATATGCAGATT >2.2|315895|35|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTAAGTAAGTTGATGAAGAGCCAGTAACATCTGA >2.3|315960|37|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTGCATTTATATTTGCTCTCGATTTCTCTTATATA >2.4|316027|36|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATAAATGACTTAGAAAAGACATCTTATGCAAGCAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014410_2
The CRISPR arrays of NC_014410_2 >merge|NC_014410|2|315799-316092|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACAATGCAATTGATAATAAAGTAAACAATATGCAGATTGTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACTGTAAGTAAGTTGATGAAGAGCCAGTAACATCTGAGTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACTTTTGCATTTATATTTGCTCTCGATTTCTCTTATATAGTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACAATAAATGACTTAGAAAAGACATCTTATGCAAGCACGTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC >NC_014410|2|2|315799-316092|PILER-CR GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC AATGCAATTGATAATAAAGTAAACAATATGCAGATT GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC TGTAAGTAAGTTGATGAAGAGCCAGTAACATCTGA GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC TTTTGCATTTATATTTGCTCTCGATTTCTCTTATATA GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC AATAAATGACTTAGAAAAGACATCTTATGCAAGCAC GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC >NC_014410|2|2|315799-316092|CRISPRCasFinder GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC AATGCAATTGATAATAAAGTAAACAATATGCAGATT GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC TGTAAGTAAGTTGATGAAGAGCCAGTAACATCTGA GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC TTTTGCATTTATATTTGCTCTCGATTTCTCTTATATA GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC AATAAATGACTTAGAAAAGACATCTTATGCAAGCAC GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC >NC_014410|2|2|315799-316092|CRT GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC AATGCAATTGATAATAAAGTAAACAATATGCAGATT GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC TGTAAGTAAGTTGATGAAGAGCCAGTAACATCTGA GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC TTTTGCATTTATATTTGCTCTCGATTTCTCTTATATA GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC AATAAATGACTTAGAAAAGACATCTTATGCAAGCAC GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
>NC_014410.1|WP_041587408.1|315256_315439_+|hypothetical-protein MKYDGIVIGRLFVNQHIEKDCLYHEINKYSKSTKILGIGRKPNIVEKIQEKVFEVAHSLC >NC_014410.1|WP_013296870.1|314603_315179_+|Uma2-family-endonuclease MPLPKENKKYTYADYLTWPEGERYEIIDGVPYMQAAPTWQHQAVLLELSRQFANYLRNKTCMVFTSPFDLRLPEDNNQNDDDVTNVLQPDIVVVCDRSGLRKTGYYGTPDLIVEIVSSSSMRRDKLEKFNIYEKSGVKEYWIVEPEGKIVSVFVLQDSKRYGRPEIYADEDKVKVTIFDDLIIDLKPVFDY >NC_014410.1|WP_013296869.1|313144_313978_+|chemotaxis-protein MITISKNEMLDFFHKLTAFLPILFEDSVSFAIVDNEKYLEIQNCDELPINAEVGDAIPEGGAAFEALRTGNYIIKDVPKEVYGVPFKSYAIPIKDYDNAVIGVFLMGKSLEKRHKVLSLSENLAASLEQISSAIQEVSSGVEIVVNSNTKILEEVDKAIENAKGTDDILNFVQNISKQTNLLGLNAAIEAARAGEMGKGFSVVAEEIRKLSNTSSESIRRIDSVLEKIQESIKSISNKINESSSFFETQAAAFEEITSSIEELSDTSQLLEELARNL >NC_014410.1|WP_041587406.1|312327_312696_+|hypothetical-protein MGWIYAPYRLYFAKCSPLWENKGVAFLSGKKEKNHEYYSVIRLWKITEEQFYEIQKQEGKCWYNLILELGEKDGVKIKTITGCWIDEIQAPSEEYLKVIEKGLKETTNWDDERIRAYLKKFM >NC_014410.1|WP_013296868.1|308182_309052_-|copper-amine-oxidase MFKKIITAMLILSLVVIPFMAFADDTTSSTSDNTTTSTQAVTSNDNTTVSDSVYDQTSGDSTTIQNSQIDAINSQIQELEQELETAINNNQFAKALEISNKIKALEQKLKTLSQNDQLEAQIADLKTEAINDFQNGQIDNAINVIKQIISLKHSQDNYALLGKIYHMVKKDNTPHVFANGKEVLSDVNPMIYNNRTYIPLRAVANAIGVDNNAISWDNNNRTVNIKTGNINIYMPVNTTNIKVNGNAKAIDAPAIIYKNRVMVPLRAISQLFNKSVNWYQEGQIATVGD >NC_014410.1|WP_013296617.1|306555_307128_-|hypothetical-protein MIIIAFPVKNIHEYIENESYLYIDTPSGCPNCNYNGKLYRHGYYCRGVFIDNNCIDITIARVICPVCHKTHALIPDFLVPYFIYPLSVILTSLKKIFIDGHGTTYVADEIIKEFNLSFVKEQNISYFKMRFLSILNYVHSFFANFREYIETMNSLSPRTLISNICKYTKEKLKFNLHYFDLMKVHFFKKV >NC_014410.1|WP_155812181.1|305084_306194_-|DDE-type-integrase/transposase/recombinase MPSLGKREFSPNTIKTWLYCYRKYGFEGLYPKSRCDKGASRVLTDDVKAYIKNLKLDNPRRSAKSIYQELLVKKFIELDKVSLSTVQRYLRKTKISTSALNTKDRRSFEMEYPNDCWQSDISMGPYLIINDKKIKTYLIAFLDDSSRLITHAEFYDTDNVISLIDAFKKAVSKRGVPKKLFVDNGKVFQSEQLHLICASLGTSLCYAEPYSPESKGKIERFFRTLKDQWMYGFDWQKISSIDELNENLNKYIEGIYHQTVHSSTNMKPIEKFIKYTDTMKFINSKEDLDNIFLYRVKRRVIKDATVSIEKIKFEVPMQYIGDYVNIRYYPKSLDKAYIFSEDGKLLQTIHPVNKIDNSKIRRKEIDFSL >NC_014410.1|WP_013296615.1|304259_305063_-|AAA-family-ATPase MFNVYYGLTFNPFSKDCDVKYHYKSQDYIQAMSRLEFLKDKKGFGLITGDPGSGKSYTLKCFVTSLNPNMYKVVYIPISTLTVMDFYRYLSDGLGLIPKHRKCDMFRQIQDVILSYHSKNITPVIIVDEAQFISNSILDDLRIIFNFDMDTKNYALLILSGQTQLIIQLNRQAHEALRQRIVLNYSFKGLNKDETKEYITSRLKCAGCNETIFTDDAIELIYSSTNGYLRKINLLAEMSMILGAKESQKTINGELVFRAQSDINITE >NC_014410.1|WP_013296865.1|298582_299578_+|copper-amine-oxidase MRKTVSMVIAFLLIFLSIPVFALASSQSDELPYQDWIDKGWIKAISPDENGHDKLGWYSIMPGKEKEIAYSDKLKNTDRLIVVVGSFLANNNLEYYQSEGGSAVALCDVTKLRENYKELYGEIKYNNPDTLKYDFWKGLVTINLVSINGTPWQETKYKDVLLQNFYDRWEGLKDPAYNRYLIDPKWNGYTDECIYNWDGVDVWIGKDDITVRYELKENKGKLPTEVISDNGVSMIPLRGVMEELGATVDYDSKTQEITIKDKGKTVVLKVGSDNAVVDGNTVKMPRKVYVKSGYTMLPLRFVAENLDHAVQYLNDGTIMIWRAKYTTPPSI >NC_014410.1|WP_013296864.1|297986_298559_+|Uma2-family-endonuclease MSLPKESKKYTYADYLTWPEGERWEIINGVPYNMSPSLERKHQKVVGELFAYIHNYLKGKTCEVYNAPFDVRLLDENVSDDVTNVVQPDIVIVCDPRKLDDKGCKGSPDMIVEVVSPSTLKRDLKEKFYLYEKAGVKVYWIVFPDEKTVLSYHLGEDGKYKRPEVYSEEDNIKVGIFESLEIDLKDVFDY >NC_014410.1|WP_013296871.1|316634_317918_-|IS110-family-transposase MKYNQNTKIMQITEKTLIVGVDIAKEIHHARAFDFRGIEYGKRIEFSNDIDGMKRFLKWAADIMNKSNKEHLMVGMEPTGHYWLCFAQFLRDKNHKVVLVNPFHVKRSKEFDDNSPTKNDRKDPKTIAMLVKDGRYVEPNIPEGIYSELRIAVDIREMLTKDLNKIKNRVARWLDIYFPEFNKVFADWEGKAALITLKEFPTPAKILGIGAEEILAAWKKEINRAVGAKRALKLIEAASQSVGKRDGIEMAEIEIKIILEQYEMLVKQLKKIESKIEELFMQVPGANEMLSIKGVGVITAAIFIAEVGDITRYEHPKQIQKLAGYNLVENSSGQHKGQTTISKRGRRRLRSALYKMIMPILANNKEFQELHKYYTTRKENPLKKKQSMIVLCCKLIRVFFVILKKGVKYNGNKMLRDIKRPEIRNAA >NC_014410.1|WP_041587409.1|319103_319301_+|hypothetical-protein MSEIIYYGAYGSNLLRERFLIYIKGGEYRGKEYRGCRDKTEPIDMGWIYVPLQALFCKMFSTMGK >NC_014410.1|WP_013296873.1|319248_319602_+|hypothetical-protein MFLYRLYFARCSPRWENKGVAFLFDEKEENPEYYSVIRLWKITEEQFYEIQRQEGGWYNLILELVEKDGIEIKTITGRWRDKKQAPSEEYLEVIKKGLKETTNWDDERIEAYVKKFM >NC_014410.1|WP_013296874.1|319715_321008_-|SEC-C-domain-containing-protein MKIFDISRNDDCICGSGKKYKKCCMNNIEEIKKTLTNSLSNEVNLFSDDVEFIKIVSILYGANLSEKNKSFKADKIVKLILETFETEDNYTNDDYIQFLRKMTRNIAEDKRLKKVRVPGDLLKDIEIGNELDVDNLLKEIVEENLVEEILLSIAFELQNFNFNEKEIKDLFLLIRISILDEYNTLVKVAIGATMIEIAKALEEIHAINGTKTMDKIYDIASKYPSFNEYLSSKMFDTITNDLAYVLDERIDIPFFIVYLFLLKFYHRILSSFLFDFKTPTEFYDSLFDEVLQNLLYKELIIYEKALKTILTSLELKSESINDEKVKMSFENVLSLLSLPINHWNMEIFEQIMKVNILRTLNNLPAKVEGIDKEVKLQDLISDEILDEYIVYLKKNGLEQIVDLFKKIYGDLKNTMSKISSDILANLDIKF >NC_014410.1|WP_013296875.1|321423_322524_+|NADP-transhydrogenase-subunit-alpha MNLPSFSVIGAGNGGQAMAAHLSLMGFTVNLYNRTREKLIPILNNGGIYLEGAVSGFAKLNMITDSIEDAIRDTDIIMVTIPASGHSDVAYEMLPYLKSGQIIVLNPGRTFGAIEFYNIIRARSDLNVVISETDTFIYACRSNDGRGKIFRIKDVVSLASIPSWKTNYVVDLLKLAYTQIVPAENVLETSLNNIGSIFHPAPILLNSARIETTEGSFQYYLEGISPSVAKILERMDRERVAVAHALGVNAITALDWLKDTYGVVSDNLYEAIQNTDAYKGLLAPRTLDCRYIFEDVPMSLVPISSIGRQLGVSTHTIDSIIHLASCMHEKNYWKIGRTVVKLGLDGKSAAEIKEIVEGVKEESTVA >NC_014410.1|WP_013296876.1|322520_324173_+|cobalamin-B12-binding-domain-containing-protein MKRLIIAASIENDVHVAGVYKFLRLAESEGFDIQFLGPATPIDKLVEIIRLRKPDIVGISYRLTPDSLKSILDVLKSRIKEYNLNGIRWIFGGTEPNCIVAKESGIFEEVFDGTSGDEFTISYLKGQKVLADEVEYGQDIVDRIERNYPYPVIRHHFGLPSYKDTLAGIKKIASEKVLDVISIAPDQNTQEHFFDKKYNTALDGAGGVPIRSEEEFKKLYDESRRGNYPLLRCYSGTNDVFKMAKMLKDTINNAWAAIPLCWYNVLDSRGPRQVEESIRENQKLMKWHADRNIPVEVNEAHHWGLRDAHDAIYVAASYLAAYNAKKMGVKNYIAQFMFNVPPATSPKMDLAKMLASIELVESLQDDNFRVFRQARAGLASMPQDLFEAKGQLASSAYLSMAIKPHIYHVVGFCEAHHAATPDDIIESVKIVKAVIKNTLSGMFDFTQDLDVLKRKEELINDAKVILNGIRELNTLCSDPLSDPHTLSLAIKLGILDAPHLKGNKSASGALQTKVINGACYAFDYENNRVIEEEERVFNIIQNYQKMIIVA >NC_014410.1|WP_013296877.1|324313_324967_+|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase MLIVVDPGHGGLDSGAVGNGFFEKDINLSVSLKLRDILEANNVDIILTRDKDITLGLSERCDIANKNKADYFISIHCNSFKDSTAKGTETYSYPGSISGGKLAKSIQQAIVTNLNTVDRGVKTANFYVLHHTNMTAVLVELGFITNKEDLDLILNKRNLFAISISNGILNNIGLKQISKSDSIEKLHQMGFISDYYDPESYVKWKDIADALLKIIGG >NC_014410.1|WP_013296878.1|324971_325307_+|phage-holin MRDLIMTILTAGLQLVILATLGYVINFLYSKIGTEKTKRYFEIAKMIVRGVEQEFGAGNGADKKAEAVNLIKKIVGNKLTEEEIDKLIEAAVFEMNYVLNLKGLSTTSKKT >NC_014410.1|WP_013296879.1|325369_326647_-|uracil-transporter MKNKFYGIQDVPPINEAVPLSFQHVFAMFGATILVPLLTGLDPAVTLFTSGLGTLIFHLMTKGKVPAYLGSSFAFIAPIIAATKAYGVRGAFTGMIAAGLVYVAVFIIISLTGIDWIERILPSVVVGPVVMIIGLSLAPTAIQEAQKDLPTALVTAALVIIFSMFGKGFMKVIPILLGTIGGYIFAIFRGLVDFSPVLKASWIAVPKFSFLVGHSPVLAWGAVTLIAPLALVAIIEDLGHVLVIGNIVDKDLIKDPGFHRVMLGNGLATSIAALFGGPPSTTYGENIGVLAMTKVYSSRVIEGAAVIAILLSFIQKIGALIQVIPQAVMGGVTIILFGMIAAAGIRTLVENKVDFSDSRNLIIASVILTLGVGGIKIGLGNFVFEGVGPATLAGIILNLVLPKIKLTKPKGEKSKVKDDSVITQA >NC_014410.1|WP_013296880.1|326953_327511_+|hypothetical-protein MIVKLKNRKLLYLFISINILIIILLSIIISKYFIYKHELVYLYHYANLMDENRAILESVKFKDFHDEQLIEDSYKNLEQFVQYNNLYILKGKLNNKNVGYFEYGFLHNVKEATDKVISDIYNNKVNIRDESYIKDMSSKYDILFNEYIKFIKESNFINLKYSKLENASRIYEIMNNISSEFINAR |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_014410_3 | 318047-319079 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_014410_3
|
15 spacers
spacers of NC_014410_3
>3.1|318077|36|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTCAAATTCGACTTTTTGCACTTCTTATAACCTCT >3.2|318143|37|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGTCCCAAGCGTTGCAGATCCATACATAATACAGCGT >3.3|318210|40|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTGGCATGTTCAAGGATAAAGTTGATGTAAACGTGGATG >3.4|318280|39|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTGCTTCTATAAGTTTAAACTGGACCATCTCGGCTTTT >3.5|318349|37|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTTCTCCTGACTGATGCCATACTTCTTCCTAAATC >3.6|318416|37|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAATTATATGTTATGTTTAGTTACAAGTCAATTTTAA >3.7|318483|36|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTCAAACAGTTAATTGAACTTATAGAAAAACTTTA >3.8|318549|36|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTAGTACAATTGCCGACACACAAAACCTATATAAA >3.9|318615|36|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAGATCACACGGCCCCAGGGGATATAAATGTGACA >3.10|318681|36|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTGTTTCGGCAGACATACCGTAAATGATACCAAATG >3.11|318747|36|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTAGCCAATATGTGTGTATACCATTACCGCTATTA >3.12|318813|37|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGGATTCCGCATATGGCCAACACATAGGAAACTCAA >3.13|318880|38|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAACTAACAGGCATAGAAGAATATTTAAAAAAGATACA >3.14|318948|35|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTCAGCAGGTAATTTCCATTCTAGAATCCATCTG >3.15|319013|37|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT GCAAAATAGACGTATTTGCCGATACGTCTATTTTGTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014410_3
The CRISPR arrays of NC_014410_3 >merge|NC_014410|3|318047-319079|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACTTTCAAATTCGACTTTTTGCACTTCTTATAACCTCTGTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACCGTCCCAAGCGTTGCAGATCCATACATAATACAGCGTGTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACCTTGGCATGTTCAAGGATAAAGTTGATGTAAACGTGGATGGTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACATTGCTTCTATAAGTTTAAACTGGACCATCTCGGCTTTTGTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACTTTTTCTCCTGACTGATGCCATACTTCTTCCTAAATCGTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACCAATTATATGTTATGTTTAGTTACAAGTCAATTTTAAGTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACATTCAAACAGTTAATTGAACTTATAGAAAAACTTTAGTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACCTTAGTACAATTGCCGACACACAAAACCTATATAAAGTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACATAGATCACACGGCCCCAGGGGATATAAATGTGACAGTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACGTGTTTCGGCAGACATACCGTAAATGATACCAAATGGTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACAGTAGCCAATATGTGTGTATACCATTACCGCTATTAATTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACTTGGATTCCGCATATGGCCAACACATAGGAAACTCAAGTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACAAACTAACAGGCATAGAAGAATATTTAAAAAAGATACAGTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACTGTCAGCAGGTAATTTCCATTCTAGAATCCATCTGGTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAATGCAAAATAGACGTATTTGCCGATACGTCTATTTTGTTGTTTTTAGCCTACCTATGAGGGATTTATTT >NC_014410|3|3|318047-319012|PILER-CR GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC TTTCAAATTCGACTTTTTGCACTTCTTATAACCTCT GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC CGTCCCAAGCGTTGCAGATCCATACATAATACAGCGT GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC CTTGGCATGTTCAAGGATAAAGTTGATGTAAACGTGGATG GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC ATTGCTTCTATAAGTTTAAACTGGACCATCTCGGCTTTT GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC TTTTTCTCCTGACTGATGCCATACTTCTTCCTAAATC GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC CAATTATATGTTATGTTTAGTTACAAGTCAATTTTAA GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC ATTCAAACAGTTAATTGAACTTATAGAAAAACTTTA GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC CTTAGTACAATTGCCGACACACAAAACCTATATAAA GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC ATAGATCACACGGCCCCAGGGGATATAAATGTGACA GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC GTGTTTCGGCAGACATACCGTAAATGATACCAAATG GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC AGTAGCCAATATGTGTGTATACCATTACCGCTATTA ATTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC TTGGATTCCGCATATGGCCAACACATAGGAAACTCAA GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC AAACTAACAGGCATAGAAGAATATTTAAAAAAGATACA GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC TGTCAGCAGGTAATTTCCATTCTAGAATCCATCTG GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAT >NC_014410|3|3|318047-319079|CRISPRCasFinder GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC TTTCAAATTCGACTTTTTGCACTTCTTATAACCTCT GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC CGTCCCAAGCGTTGCAGATCCATACATAATACAGCGT GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC CTTGGCATGTTCAAGGATAAAGTTGATGTAAACGTGGATG GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC ATTGCTTCTATAAGTTTAAACTGGACCATCTCGGCTTTT GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC TTTTTCTCCTGACTGATGCCATACTTCTTCCTAAATC GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC CAATTATATGTTATGTTTAGTTACAAGTCAATTTTAA GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC ATTCAAACAGTTAATTGAACTTATAGAAAAACTTTA GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC CTTAGTACAATTGCCGACACACAAAACCTATATAAA GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC ATAGATCACACGGCCCCAGGGGATATAAATGTGACA GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC GTGTTTCGGCAGACATACCGTAAATGATACCAAATG GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC AGTAGCCAATATGTGTGTATACCATTACCGCTATTA ATTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC TTGGATTCCGCATATGGCCAACACATAGGAAACTCAA GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC AAACTAACAGGCATAGAAGAATATTTAAAAAAGATACA GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC TGTCAGCAGGTAATTTCCATTCTAGAATCCATCTG GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAT GCAAAATAGACGTATTTGCCGATACGTCTATTTTGTT GTTTTTAGCCTACCTATGAGGGATTTATTT >NC_014410|3|3|318047-319079|CRT GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC TTTCAAATTCGACTTTTTGCACTTCTTATAACCTCT GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC CGTCCCAAGCGTTGCAGATCCATACATAATACAGCGT GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC CTTGGCATGTTCAAGGATAAAGTTGATGTAAACGTGGATG GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC ATTGCTTCTATAAGTTTAAACTGGACCATCTCGGCTTTT GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC TTTTTCTCCTGACTGATGCCATACTTCTTCCTAAATC GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC CAATTATATGTTATGTTTAGTTACAAGTCAATTTTAA GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC ATTCAAACAGTTAATTGAACTTATAGAAAAACTTTA GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC CTTAGTACAATTGCCGACACACAAAACCTATATAAA GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC ATAGATCACACGGCCCCAGGGGATATAAATGTGACA GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC GTGTTTCGGCAGACATACCGTAAATGATACCAAATG GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC AGTAGCCAATATGTGTGTATACCATTACCGCTATTA ATTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC TTGGATTCCGCATATGGCCAACACATAGGAAACTCAA GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC AAACTAACAGGCATAGAAGAATATTTAAAAAAGATACA GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC TGTCAGCAGGTAATTTCCATTCTAGAATCCATCTG GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAT GCAAAATAGACGTATTTGCCGATACGTCTATTTTGTT GTTTTTAGCCTACCTATGAGGGATTTATTT
>NC_014410.1|WP_013296871.1|316634_317918_-|IS110-family-transposase MKYNQNTKIMQITEKTLIVGVDIAKEIHHARAFDFRGIEYGKRIEFSNDIDGMKRFLKWAADIMNKSNKEHLMVGMEPTGHYWLCFAQFLRDKNHKVVLVNPFHVKRSKEFDDNSPTKNDRKDPKTIAMLVKDGRYVEPNIPEGIYSELRIAVDIREMLTKDLNKIKNRVARWLDIYFPEFNKVFADWEGKAALITLKEFPTPAKILGIGAEEILAAWKKEINRAVGAKRALKLIEAASQSVGKRDGIEMAEIEIKIILEQYEMLVKQLKKIESKIEELFMQVPGANEMLSIKGVGVITAAIFIAEVGDITRYEHPKQIQKLAGYNLVENSSGQHKGQTTISKRGRRRLRSALYKMIMPILANNKEFQELHKYYTTRKENPLKKKQSMIVLCCKLIRVFFVILKKGVKYNGNKMLRDIKRPEIRNAA >NC_014410.1|WP_041587408.1|315256_315439_+|hypothetical-protein MKYDGIVIGRLFVNQHIEKDCLYHEINKYSKSTKILGIGRKPNIVEKIQEKVFEVAHSLC >NC_014410.1|WP_013296870.1|314603_315179_+|Uma2-family-endonuclease MPLPKENKKYTYADYLTWPEGERYEIIDGVPYMQAAPTWQHQAVLLELSRQFANYLRNKTCMVFTSPFDLRLPEDNNQNDDDVTNVLQPDIVVVCDRSGLRKTGYYGTPDLIVEIVSSSSMRRDKLEKFNIYEKSGVKEYWIVEPEGKIVSVFVLQDSKRYGRPEIYADEDKVKVTIFDDLIIDLKPVFDY >NC_014410.1|WP_013296869.1|313144_313978_+|chemotaxis-protein MITISKNEMLDFFHKLTAFLPILFEDSVSFAIVDNEKYLEIQNCDELPINAEVGDAIPEGGAAFEALRTGNYIIKDVPKEVYGVPFKSYAIPIKDYDNAVIGVFLMGKSLEKRHKVLSLSENLAASLEQISSAIQEVSSGVEIVVNSNTKILEEVDKAIENAKGTDDILNFVQNISKQTNLLGLNAAIEAARAGEMGKGFSVVAEEIRKLSNTSSESIRRIDSVLEKIQESIKSISNKINESSSFFETQAAAFEEITSSIEELSDTSQLLEELARNL >NC_014410.1|WP_041587406.1|312327_312696_+|hypothetical-protein MGWIYAPYRLYFAKCSPLWENKGVAFLSGKKEKNHEYYSVIRLWKITEEQFYEIQKQEGKCWYNLILELGEKDGVKIKTITGCWIDEIQAPSEEYLKVIEKGLKETTNWDDERIRAYLKKFM >NC_014410.1|WP_013296868.1|308182_309052_-|copper-amine-oxidase MFKKIITAMLILSLVVIPFMAFADDTTSSTSDNTTTSTQAVTSNDNTTVSDSVYDQTSGDSTTIQNSQIDAINSQIQELEQELETAINNNQFAKALEISNKIKALEQKLKTLSQNDQLEAQIADLKTEAINDFQNGQIDNAINVIKQIISLKHSQDNYALLGKIYHMVKKDNTPHVFANGKEVLSDVNPMIYNNRTYIPLRAVANAIGVDNNAISWDNNNRTVNIKTGNINIYMPVNTTNIKVNGNAKAIDAPAIIYKNRVMVPLRAISQLFNKSVNWYQEGQIATVGD >NC_014410.1|WP_013296617.1|306555_307128_-|hypothetical-protein MIIIAFPVKNIHEYIENESYLYIDTPSGCPNCNYNGKLYRHGYYCRGVFIDNNCIDITIARVICPVCHKTHALIPDFLVPYFIYPLSVILTSLKKIFIDGHGTTYVADEIIKEFNLSFVKEQNISYFKMRFLSILNYVHSFFANFREYIETMNSLSPRTLISNICKYTKEKLKFNLHYFDLMKVHFFKKV >NC_014410.1|WP_155812181.1|305084_306194_-|DDE-type-integrase/transposase/recombinase MPSLGKREFSPNTIKTWLYCYRKYGFEGLYPKSRCDKGASRVLTDDVKAYIKNLKLDNPRRSAKSIYQELLVKKFIELDKVSLSTVQRYLRKTKISTSALNTKDRRSFEMEYPNDCWQSDISMGPYLIINDKKIKTYLIAFLDDSSRLITHAEFYDTDNVISLIDAFKKAVSKRGVPKKLFVDNGKVFQSEQLHLICASLGTSLCYAEPYSPESKGKIERFFRTLKDQWMYGFDWQKISSIDELNENLNKYIEGIYHQTVHSSTNMKPIEKFIKYTDTMKFINSKEDLDNIFLYRVKRRVIKDATVSIEKIKFEVPMQYIGDYVNIRYYPKSLDKAYIFSEDGKLLQTIHPVNKIDNSKIRRKEIDFSL >NC_014410.1|WP_013296615.1|304259_305063_-|AAA-family-ATPase MFNVYYGLTFNPFSKDCDVKYHYKSQDYIQAMSRLEFLKDKKGFGLITGDPGSGKSYTLKCFVTSLNPNMYKVVYIPISTLTVMDFYRYLSDGLGLIPKHRKCDMFRQIQDVILSYHSKNITPVIIVDEAQFISNSILDDLRIIFNFDMDTKNYALLILSGQTQLIIQLNRQAHEALRQRIVLNYSFKGLNKDETKEYITSRLKCAGCNETIFTDDAIELIYSSTNGYLRKINLLAEMSMILGAKESQKTINGELVFRAQSDINITE >NC_014410.1|WP_013296865.1|298582_299578_+|copper-amine-oxidase MRKTVSMVIAFLLIFLSIPVFALASSQSDELPYQDWIDKGWIKAISPDENGHDKLGWYSIMPGKEKEIAYSDKLKNTDRLIVVVGSFLANNNLEYYQSEGGSAVALCDVTKLRENYKELYGEIKYNNPDTLKYDFWKGLVTINLVSINGTPWQETKYKDVLLQNFYDRWEGLKDPAYNRYLIDPKWNGYTDECIYNWDGVDVWIGKDDITVRYELKENKGKLPTEVISDNGVSMIPLRGVMEELGATVDYDSKTQEITIKDKGKTVVLKVGSDNAVVDGNTVKMPRKVYVKSGYTMLPLRFVAENLDHAVQYLNDGTIMIWRAKYTTPPSI >NC_014410.1|WP_041587409.1|319103_319301_+|hypothetical-protein MSEIIYYGAYGSNLLRERFLIYIKGGEYRGKEYRGCRDKTEPIDMGWIYVPLQALFCKMFSTMGK >NC_014410.1|WP_013296873.1|319248_319602_+|hypothetical-protein MFLYRLYFARCSPRWENKGVAFLFDEKEENPEYYSVIRLWKITEEQFYEIQRQEGGWYNLILELVEKDGIEIKTITGRWRDKKQAPSEEYLEVIKKGLKETTNWDDERIEAYVKKFM >NC_014410.1|WP_013296874.1|319715_321008_-|SEC-C-domain-containing-protein MKIFDISRNDDCICGSGKKYKKCCMNNIEEIKKTLTNSLSNEVNLFSDDVEFIKIVSILYGANLSEKNKSFKADKIVKLILETFETEDNYTNDDYIQFLRKMTRNIAEDKRLKKVRVPGDLLKDIEIGNELDVDNLLKEIVEENLVEEILLSIAFELQNFNFNEKEIKDLFLLIRISILDEYNTLVKVAIGATMIEIAKALEEIHAINGTKTMDKIYDIASKYPSFNEYLSSKMFDTITNDLAYVLDERIDIPFFIVYLFLLKFYHRILSSFLFDFKTPTEFYDSLFDEVLQNLLYKELIIYEKALKTILTSLELKSESINDEKVKMSFENVLSLLSLPINHWNMEIFEQIMKVNILRTLNNLPAKVEGIDKEVKLQDLISDEILDEYIVYLKKNGLEQIVDLFKKIYGDLKNTMSKISSDILANLDIKF >NC_014410.1|WP_013296875.1|321423_322524_+|NADP-transhydrogenase-subunit-alpha MNLPSFSVIGAGNGGQAMAAHLSLMGFTVNLYNRTREKLIPILNNGGIYLEGAVSGFAKLNMITDSIEDAIRDTDIIMVTIPASGHSDVAYEMLPYLKSGQIIVLNPGRTFGAIEFYNIIRARSDLNVVISETDTFIYACRSNDGRGKIFRIKDVVSLASIPSWKTNYVVDLLKLAYTQIVPAENVLETSLNNIGSIFHPAPILLNSARIETTEGSFQYYLEGISPSVAKILERMDRERVAVAHALGVNAITALDWLKDTYGVVSDNLYEAIQNTDAYKGLLAPRTLDCRYIFEDVPMSLVPISSIGRQLGVSTHTIDSIIHLASCMHEKNYWKIGRTVVKLGLDGKSAAEIKEIVEGVKEESTVA >NC_014410.1|WP_013296876.1|322520_324173_+|cobalamin-B12-binding-domain-containing-protein MKRLIIAASIENDVHVAGVYKFLRLAESEGFDIQFLGPATPIDKLVEIIRLRKPDIVGISYRLTPDSLKSILDVLKSRIKEYNLNGIRWIFGGTEPNCIVAKESGIFEEVFDGTSGDEFTISYLKGQKVLADEVEYGQDIVDRIERNYPYPVIRHHFGLPSYKDTLAGIKKIASEKVLDVISIAPDQNTQEHFFDKKYNTALDGAGGVPIRSEEEFKKLYDESRRGNYPLLRCYSGTNDVFKMAKMLKDTINNAWAAIPLCWYNVLDSRGPRQVEESIRENQKLMKWHADRNIPVEVNEAHHWGLRDAHDAIYVAASYLAAYNAKKMGVKNYIAQFMFNVPPATSPKMDLAKMLASIELVESLQDDNFRVFRQARAGLASMPQDLFEAKGQLASSAYLSMAIKPHIYHVVGFCEAHHAATPDDIIESVKIVKAVIKNTLSGMFDFTQDLDVLKRKEELINDAKVILNGIRELNTLCSDPLSDPHTLSLAIKLGILDAPHLKGNKSASGALQTKVINGACYAFDYENNRVIEEEERVFNIIQNYQKMIIVA >NC_014410.1|WP_013296877.1|324313_324967_+|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase MLIVVDPGHGGLDSGAVGNGFFEKDINLSVSLKLRDILEANNVDIILTRDKDITLGLSERCDIANKNKADYFISIHCNSFKDSTAKGTETYSYPGSISGGKLAKSIQQAIVTNLNTVDRGVKTANFYVLHHTNMTAVLVELGFITNKEDLDLILNKRNLFAISISNGILNNIGLKQISKSDSIEKLHQMGFISDYYDPESYVKWKDIADALLKIIGG >NC_014410.1|WP_013296878.1|324971_325307_+|phage-holin MRDLIMTILTAGLQLVILATLGYVINFLYSKIGTEKTKRYFEIAKMIVRGVEQEFGAGNGADKKAEAVNLIKKIVGNKLTEEEIDKLIEAAVFEMNYVLNLKGLSTTSKKT >NC_014410.1|WP_013296879.1|325369_326647_-|uracil-transporter MKNKFYGIQDVPPINEAVPLSFQHVFAMFGATILVPLLTGLDPAVTLFTSGLGTLIFHLMTKGKVPAYLGSSFAFIAPIIAATKAYGVRGAFTGMIAAGLVYVAVFIIISLTGIDWIERILPSVVVGPVVMIIGLSLAPTAIQEAQKDLPTALVTAALVIIFSMFGKGFMKVIPILLGTIGGYIFAIFRGLVDFSPVLKASWIAVPKFSFLVGHSPVLAWGAVTLIAPLALVAIIEDLGHVLVIGNIVDKDLIKDPGFHRVMLGNGLATSIAALFGGPPSTTYGENIGVLAMTKVYSSRVIEGAAVIAILLSFIQKIGALIQVIPQAVMGGVTIILFGMIAAAGIRTLVENKVDFSDSRNLIIASVILTLGVGGIKIGLGNFVFEGVGPATLAGIILNLVLPKIKLTKPKGEKSKVKDDSVITQA >NC_014410.1|WP_013296880.1|326953_327511_+|hypothetical-protein MIVKLKNRKLLYLFISINILIIILLSIIISKYFIYKHELVYLYHYANLMDENRAILESVKFKDFHDEQLIEDSYKNLEQFVQYNNLYILKGKLNNKNVGYFEYGFLHNVKEATDKVISDIYNNKVNIRDESYIKDMSSKYDILFNEYIKFIKESNFINLKYSKLENASRIYEIMNNISSEFINAR >NC_014410.1|WP_013296881.1|328666_329410_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MDYVIELKDLTKRFGSITAVDKLSIKVPSGKIFGLLGPNGSGKSTTIRMICGIIKPTSGHGTVLGFDIVKESEKIKKSIGYMSQKFSLYEDLTVKENMDFYSSIYGLDKKERIEREKIIIDMMELHDRENQIVGTLSGGWKQRLALGCALLHNPKFVILDEPTSGVDPVSRRLFWNTIKKLTSEGLSVLVTTHYMEEAQESDFVAFMFNGHLLTFGTPSEIIRENNSNNLEDVFIKYVNEHGGMDKL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_014410_4 | 2643518-2647416 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NC_014410_4
|
58 spacers
spacers of NC_014410_4
>4.1|2643548|37|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT CTTTATAAAAATCATGTGCATCTGAACCTATTAATTT >4.2|2643615|37|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT AGGTTAAGAAGAGGTATCCAAAGGTAACATTTTATCG >4.3|2643682|35|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT TTACTTTGCCTACAAATGTAAACATTCTGTATGGA >4.4|2643747|37|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT CTTATACTATACCAAAACTGAGTACAAGTAAAAACAG >4.5|2643814|38|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT ATTATTGATAGTGATATTGTAGGTGACGAAATATGTTT >4.6|2643882|36|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT CAGACAAAGTTTGTACATTAGTATCAACCAAACTAG >4.7|2643948|36|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT CAAGGACGTAGTTATCTGATCACACAATAAAGGAAG >4.8|2644014|37|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT TGAGTGTATATAACAAAATAGGGAAAAATTCAAGTTA >4.9|2644081|36|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT TTCATACTACCAAAAGAAACAATGCAGGGAAATTGG >4.10|2644147|36|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT TTTTAGCATATCTACTCTTAACTTCATCATATCCCA >4.11|2644213|36|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT TTTTGCTCCCTGATTTTTTCCAGCCCTTCAATGTTT >4.12|2644279|37|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT CAAGGTCTAACACAGCAACAATTATCACAATTAGGAG >4.13|2644346|38|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT AACGGATCGTCAATACTGTCTACAGGCTCAAAGTCTGG >4.14|2644414|35|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT GGGAATCAGTAGAAGTATAAGAAACAAGATTACCT >4.15|2644479|36|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT ATATTTGCTACAAGAAAACTTCTTGGGGGTGCAGAA >4.16|2644545|36|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT GGTTATGCATAAGTCTCTTAAAAAATATTTTTGGCT >4.17|2644611|37|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT TAAAAGAGTAGTGAGAATTTATTAGGAGGTAATTTTA >4.18|2644678|36|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT AACCTACTAACGAGCCATCATTTTTTGGTGCAGTAT >4.19|2644744|37|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT TAGAAGAAAACATAAAAGAAAAATTTAATAAATTCTA >4.20|2644811|35|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT AGGAAATTTATCACCAATATTAATATTGTTATGAA >4.21|2644876|36|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT GGGATTTGAATATGAATTTACGTGCACCTTTTTGCT >4.22|2644942|36|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT AAAGAAAGGTTTTAATTATACAAGGAGGAATAAGTA >4.23|2645008|37|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT TTCAAAAAGTTTTAAAATACACTTGGACGAATAAAAT >4.24|2645075|37|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT CTTTTTCACGAAATGGTACATTCAACAGGACATGAAA >4.25|2645142|38|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT TTTGATTTTATTTTTAATTATAAAGCAAAAAAGTACGT >4.26|2645210|37|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT CTCTCTATTGTATTACAAAGAATATTATACAAATCAT >4.27|2645277|38|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT ATTGGTCTAAAGTGTTTGGATCTGGTACAAGATTAGGG >4.28|2645345|36|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT TAAAAAAAGAAGGTGTACCGGTTAAGCTTGTAAGAG >4.29|2645411|38|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGTGCAAGAGCAAACATTCTTTTTGCTTGTTTTTGTG >4.30|2645479|38|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGGGGATATAGAGGGGAAGCCAGCCAGCTTCACGCCAA >4.31|2645547|38|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAGACATTGAACTTGTGAAAAAGTATGAGGGAATGGAA >4.32|2645615|36|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTGGATCCAGATAGAACGATACTTGGCACATATGG >4.33|2645681|39|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACCAAACCCAAAAACCTGGCTGAACGAGGGAAGATGGGA >4.34|2645750|37|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCTTGTATGTTTCGACAATTCCCTCTTCGACGTATGT 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cas4,cas1,cas2,csx1,cas3,cas5,cas7,cas8b1,cas6,csm2gr11,csm3gr7 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014410_4
The CRISPR arrays of NC_014410_4 >merge|NC_014410|4|2643518-2647416|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR 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>NC_014410.1|WP_013299024.1|2640420_2641860_-|S-layer-domain-containing-protein MNIQNKFTKRFIVLFLSVLLLMTSTISTSFAATNTSFKDISGHWAEKEINDWTSKGLIAGYEDSTFKPDNPITRAEFIALVNRSFNIKNTAQINFSDVKPSDWYYSDIQKAKAAGFISGYEDNTMRPNKSITRQEAASIISRLLNLKNTDSSGISNFKDAGKISDWAKGAISSVVKQGYMGGYPDNTFKPENFITRAETVVVLNRVKINSTNTNTNTGINNENNQPTVKAIAAGAYHTVALKNDGTVWAWGWNDCGQLGDGTTTNRTIPVQVKGISDVVAIAAGMYHTVALKNDGTVWAWGDNEHDQLGNETTKEEYHSTPVQVKGISDVKAIAAGASYTVVLKNDGTVWAWGVNEYGKLGDGTTNNSFTPVQVNGISNVKAIAAGAYHTVVLKNDGTVWTWGYNHYGELGNGTTVDSSTPVQVKGISDVKAIAAGACHTVALKNDGTVWAWGCNYYGELGNGTAVDSSTPVQVKWQNN >NC_014410.1|WP_013299021.1|2639292_2639790_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MDFEVTGSLMQSYNICKRQVWLMAHQIIPNQEHPYIEMGRLIDDISYDRDRKKLNFENVVIDLVRNDNGNLLVGEVKKSSKAEKSAKMQLLFYLYKLKQNGIVAKGQLFFPEERKKVDVYLTSESEAEVTNAIKDIIDIIHRDKAPSFKKIPYCKNCGYKEFCLS >NC_014410.1|WP_013299020.1|2638303_2639296_-|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKKPVYIFSDGELKRKDNTLYFEGENGRKFIPVENTSEIMIFGEVSLNKRFIEFISQSEIILHFFNHYGYYIGSFYPREHLNSGYMILKQAENYIDEKKRLYIAQKFVEGAYRNIRQVLKYYQNRGKNLDDTIYAIERLGNLIDGTSDINELMAIEGNIREYYYKSFDEILGNSDFEFDVRSKRPPKNSLNVLISFGNSLMYTTVLSEVYKTHLDPRIGYLHSTNFRRFSLNLDVSEIFKPIVVDRVIFTVVGKNIIKKDDFDGDAEGLLLKDKAKMAFIEEYEDKLKTTIKHRTLGNNVSYRRLIRLELYKLEKHLMEEQEYTPFVAQW >NC_014410.1|WP_013299019.1|2638027_2638291_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFVILVYDVNEKRVNKVLKTCRKYLNWVQNSVLEGDISDANFRKLKSEISRIINKDEDSVIVYILRTTKYSDREILGLEKGGESLFI >NC_014410.1|WP_013299018.1|2636802_2638005_-|TIGR02221-family-CRISPR-associated-protein MKTVLISFIGKGKKSQGESGYAKTCYGFLDGYTYETAFFGSALYNYLKEKGNTVDKWLIFGTLQSSWSEIIDTIDYDKQKEVEDLYLKMIYYEEHNGLTQECLKNLENSLRHYISEVSLIAVETTEREKYVDKLMEMIPDEDVHIVFDLTHALRHMPVIMAFSLMYVRCFKKIDNIDVYYGAFDLTKDGITPVYRIDFINELFSLTTSYELYKNSGYFPQLLNNLGIKGSEKTYFKLEMNRSPRKEINDLIGKLQKVKDDNKDKIYIKSVADEIISEFSSMNNQKTTLDERMLNKAKFFYDKKQYLIALTLIFEAILDKANRVYKLNIKEGSNYSSSLIKSKIREKLNDEEALKTFADLEHSRNSAVHGDPAIGTQNYLENQRDFEKLFAEAIKLYDMIN >NC_014410.1|WP_013299017.1|2635097_2636663_-|ClC-family-H(+)/Cl(-)-exchange-transporter MSGNSHIYEIFKNRENFKDRLIIEGIVVGIFIGVVVSILRLILEKAGMYLLILYKALETKIYLLPIWLVFLVALGIFTNYILKLEPMISGSGIPQVEGTIIGYFKLNWLKIFVLKFVGTILMIGAGLSLGREGPCVQLGASLGQGVSRSLKRMRFEEKYLITCGAGAGLAAAFNAPLAGVIFSLEELHKNFSPIVLVSSMVSSLTATYITDTFLGLKTVFDITNLPIVPFSKYIYLLVLGVVIGLGGILFNKSLLKSQDLYNKYVKIPQLKIFIPLLVSVIVGLSIPMVLGGGESLVDKISSVNLGFAFVILLLISKFLFTMVSYGSGVPGGIFMPLLAIGALIGNLYGIIIIHIFNIDQLYLKDFIVLAMAGYFAAIVRAPITGSLLVTEMTGSFSHLLALSTVSITAYIVSGLYRNMPIYESLLDRIIKNTNSTKVDDNDDTGKILFEMPVAVGSFVDGKKLKDIEWPHNCLVVGIKRGGKEIIPKGNTKILSGDYIVLIGDENNVVDIKNNIRKMTEI >NC_014410.1|WP_013299015.1|2634520_2634964_-|MarR-family-transcriptional-regulator MEINERLDILSTLKSIMNLIHKNIEDQFRKLNITGPQGMIIGILMHHGEMKISDLSQKMGLTNSTVSGIIDRLEKQGMVKRVRSSDDRRVVYVKIADDFKRNAKEVFSDIDKKFEAMMNKATDEEHEAIVKGLNTLKKLIESMDDKS >NC_014410.1|WP_013299014.1|2632262_2634488_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLKLRKYFKPYIFITIVAILFIFIQAMSDLALPDYMSNIVNQGIQQGGIVNAVPSAVRQSMMDKLTLFMNDDDKKEVLSDYTLIDKNSSDYDKYVKQYPTLKKEPIYVLKNIDKSEVDKINPVMGKAFLAVSAVDKMKSSAKGGFITFNNTKIPANMDLFALFAKLPESERQKITNDMDKKFTALGDNMVTQAAAAEVKSEYKALGVNTDKIQMNYILTTGLIMLLITILSAACAILVGFLGSRVAAGFSRDIRKNLFTRVESFSNTEFDKFSTASLITRTTNDITQIQMLIVFMIRMIFYAPMIGIGGVIRAVGKSASMSWIIALAVIILLGLVSIIFSIALPKFKSVQKLVDRLNLVARENLAGMMVIRAFNTQEFEENRFDKANSDITNTMLFINRVMITMFPVMMLIMNGITLLIVWVGAHEIANSSMQVGDMMAFMQYAIQIIFAFLMMSMMFIMIPRASVSASRIAEVLETEPTVVDPKESKKFDESQKGVVEFRNVSYRYPGAEEDAIKDITFKAEPGKITAIIGSTGSGKSTLVNLIPRFYDATEGQVLVDGVDVRDVKQHDLREKIGYVPQKISLFKGTVMSNIKFGNENATDEEVKKAAEVAQASEFIERLPDGYQSEISQDATNISGGQKQRLSIARALVKKPEIYIFDDSFSALDFKTDRALRRALKEYTRDSTVIIVAQRISTIMNADQIIVLDDGKIAGIGTHEELMKNCETYREIAYSQLSKEELA >NC_014410.1|WP_013299013.1|2630391_2632263_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein 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MNTAFETYETAWCPGCGNFGILNALKDALTELGLKPHQVVIASGIGQAAKMPHYINVNGFNGLHGRALPPATAISIANKDLKVIIDSGDGDTYGEGGNHFIHAIRRNANIAHFVHDNQIYGLTKGQASPTTAKGQKTSLQFDGVILDPVKPIKLALTMGAGFVARSFSGNYEHLKKMMKEAIMYDGYALLDIFQPCVTFNRVNTFKWYNDRVYELPNDYDYTDLDNAFKVADEWGDRIPIGIIYKVEKPMYIDNISFLKDGPPLVDAKYDPMMAEKYLDDFR >NC_014410.1|WP_041587489.1|2647584_2649948_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MNTSCFSSLYSHPNKYLEDHLSGSAHLIEKFSDESSTNLLDDKLISRLTKVIALCHDLGKSTRYFQDYLSADDSEKKNMKSMKETHHSLISAVIAFFVIKEEINKHAAYNDVKTLLPFIAYIVIKKHHGNLNDVVTEASLDDSDIDTMKSQLQSIDEEKFSILSDNLVKAGLDVKLDKNTINHYIENIKNELRNVKRYIRRINEKSDLSYYILINYIFSLLIDSDKSEVVIGRNFSRSYVELPSDLVDKYKSQMSYKENKINSLREDAYREVNSSEINFDDRILSINLPTGLGKTLASISFALRLREKLYKTFNKNYRIIYSLPFLSIIEQNFQEFEKILKGNNINTSTNVLLKHHHLSEMKYTDDDTEFDTDSSKIMIEGWNSEIIVTTFIQLFHTLLSNKNKSLRKFHRIANSIIILDEIQSIPFYYWKLVKEILQAVAFKLNSYVIFVTATQPMIFGNDEIRQLTDKRKYFNQMDRVVIKPVLDRNIHLSELVDMFDLKDGRSYLFILNTIASAKQFYELLKQKLPDEEIVYMSTHIVPFERLERIELIKSKKVKYAVTTQLVEAGVDIDFDVVVRDIAPLDSINQSAGRCNRNWQKSGEVYVVSLIDENDKKYSSRIYDKVMINITEKILSQYDEIGEKDFLNIIDRYYTAISENLSSDAAINILNAVYKLKYDSDDGTPSISKFKLIDDGYYKVDAYIEYNDEAIELWQRYLELKNVKNLFKRRNIFNEFKADFYKYVISIPEKTENMPADVEGFKYVNSDSINEYYDKETGFITKGVLSIW >NC_014410.1|WP_013299028.1|2649925_2650639_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKSLIFDIYGDFGHFKKYYTTSSPLTFSFPPPPTIKGMLGAIGGISKTEYLKTFRSDKCKIAVRILRPVKKIRMGLNLINTKDNFWIPFKKKNHEARTQVKMELLKDPMYRIYFSHEDDELFNDIVEKVRNHHNVYTLSLGLSEMIADYRFVDVKDAFETGDVETEISSVLPYKYILDNKIVFEDGKKYFKEKIPFDMDEDRVVLDYSDVVYEANGKSIRSYVSKSWVIDDEYVMFF >NC_014410.1|WP_013299029.1|2650714_2651626_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csh2 MNSTIKNRSEILFLYDVSFANPNGDPVDENKPRIDEETGINIVTDVRLKRTIRDYLAEYKGKDVFILETRDKDGKLRTKDDRISDFGSNEDIIEKCIDVRLFGATTAVKDKTMTLTGPVQFGYGRSLHKVNMTYIKGTTVMPSQSGNNQGTFTEKYILPYSLISFYGIVNENAAKNQNIPLTDEDIDLMLEAMWNGTKNLMSNSKMGHMPRFLLQVVMKEKNYQIGELNKRIKFVHDVEDEELRDIKDGKIEIKELVESLNANKDKISAVRYVADERVVFSLNGDVCDIDDVLKGFSVEKLSF >NC_014410.1|WP_013299030.1|2651622_2653383_-|TIGR02556-family-CRISPR-associated-protein MLDAVKEIGEMAIKAENKSLLDVLIEDPNQNGAYKNIIAINFMIDGNDVTFRDVTIEQTDSSKVARYLYSSSGGNGPGYMPVAKITEPEKTFNGKILSWFKILSKKGLKIDNDEKKFLENLNKSLQENKDRILDDIIKFRGEFPKKEGLVLMIKFIENNVNKYIGDIPVFRKLLIDSDNDKYNKLSATDKVCSICGEKKDLVFGKVDTYAFYTIDKIGYIVGGFDEKKSWRNYPVCPDCRLKLEEGKKYIENNLTFRFYGLRYQLIPKFLIGEDFIREDIINIFKDTTKLVTLKDSTEKRVIGDEDDITYFLKDADDSLSLNYLFIQKQNSAERILLLIEDVFPSHLREIFSAKDSVEKMFGDNFTFRNIRNFLSKSDINKRDSDLDGYFLDITDRIFRGRKVDLNLLLKFIMKRVRDEFIEDRYYANATKDGIMAVTFLEKLGLIEMEVYEMEERQLSDFFKKYDKNFETPIKRGLVLLGALTELLLRKQYKDRGAKPFMKNLKSLKMDEKDIKGLLPKVQNKLEEYDSFDKGKRLLAKEVSNYLLLAGDNWHMPVDEINFYFACGINLTDEIAAIIYNKEEELQ >NC_014410.1|WP_013299031.1|2653398_2654139_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRVMLEFIGDKDLHLPIQYNHIVQGFIYNNMTDGDFSAFMHDEGFKHGKRKFKLFTYSRLEGEFRLLKKEEKIVLKPPFKLTISSPIDEFIFDISQNMFKKDFCTFNNQTFQLSSINIENPPVFRDRARIKFLSPVVMYSTIEDKGIKYTYYYSPWNDNFSDLLLNNLIKKYEVIYGEGVRDPYFKLYPIGRENMKYQKVMKYKNTVIKGWMGIYDVECNPDLLKVAYYSGLGAKNSQGFGCFEIL >NC_014410.1|WP_013299032.1|2654359_2654725_-|hypothetical-protein MKDGLYDMAVKIGKYFVKNRMTNVLDTVINFCESAKEVSNHEKEAKMKFFNMLYLANKNPFMLAGGNSYKIAFKKFVEGYLSIVFRFKNAECHNREFASLTPDEMLYVLGLANRYIKCNLT >NC_014410.1|WP_013299033.1|2654738_2655593_-|hypothetical-protein MKPYNFVPILGAKTYIKSPDVKSGKLRISIEVVTPVHIFSGYYNENGNMVYKEFAKYNGKYIIPGSSLKGCVRTIAESVSRSCISTNQNLYKIGKNVRDRNDCIICDMFGSLGKKSRLRFADLELVKNNGVDIINIPTFYGPRPENKNYYAADGKFKGIKFYSHGDENIIEKGTMPCEFVMPGSIFEGNVFYEDLDDNQLDLLCFSLGLGGDIYLKLGYGKPAYYGSVKMKSIDDKIDASKRASRYGMKDNDVAKNVKRLKELLSWDKRHTKSVWRTVNNQRGY >NC_014410.1|WP_013299034.1|2655579_2656359_-|CRISPR-associated-protein MFKELHNEGYLKFYLKTMSPLSIKAADNNDFDPTVPDNKFLRSYKDGKLTVVMPGSSIKGVFRSRAEKKLKGCDIFGSEYCGKKLSSSMDGKERYKESCPACKMFGNTALKSRILFKDAYPIGEIKMGKRKNVAIDRITGASKRNALFEPEVVEDGTFECEIKMENVFNWQIKVLTEILDEIDDGYVVFGGITSRGFGRMAVQNVQFTMRYYDRKNISGYEDYGFYIERKFDRETLREKLSRLALDDECFGKVEFDETL >NC_014410.1|WP_013299035.1|2656351_2657101_-|CRISPR-associated-RAMP-protein MFDKFENRYIVKGTIVALKPIHIGKGQESMDPTEVDSPVIKDENGRPLIPGSSLKGVLRSFVERVLSSGAFEGYRSCLIVNDEPCVNGDYVKKLKDKYDKDYKKIAEEIYERSCNVCRLFGSNNLAAKLTIKDLNSIDEKTFFDMRDGVGIDRDTGTAKDGKKYNYEITPSGTKFELYMTGDNLDDDDLELLKLCLNVLKNGQISVGGMTSRGLGTIKLIDEKIYKVDKSNLKEYVSNGLSEEMRWNDV >NC_014410.1|WP_013299036.1|2657128_2657578_-|hypothetical-protein MNISKELKQKLIKYSEEIASKSDFVSIHTNDEKGREKDKIGISQYRTLAEIASNIDSYDEFELYIKYKESRRNGWDNIFDGMKYGDKIIEYMRKIKNDATEDILPKALSLFFGYLYWQSSYRVKLIRSDASQKNNGFGKQNKNSKNGNK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_014410_5 | 2723692-2726373 | Unclear |
I-A,II-B,III-A
Consensus repeat of NC_014410_5
|
40 spacers
spacers of NC_014410_5
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cas6,cas2,cas1,cas4,cas5,cas7,cas8a4,cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014410_5
The CRISPR arrays of NC_014410_5 >merge|NC_014410|5|2723692-2726373|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT 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>NC_014410.1|WP_081441857.1|2719486_2720245_-|copper-amine-oxidase-N-terminal-domain-containing-protein MYMFRNRYKLIVSIIIIILLLLGNVYAVPYIRLIINGQQVYTDVPPQIVNGTTLVPIRVISETLGAKVNWDGNTQTVTVDMPQYTPEAKMVEHYWETTNDNTGNITPPAIDSSVSGTLNSYLKDAYTLLKQKAPEAYKLVCAYISKVSEAETTTDSNVFATTYSNTHTIVFNTPALKMFNNNPYFYNVECIAITLAHEAYHGQQMASGSFEPNNVNCNEATAYTYEYFVAKQLGVPQDLLNWIKTQITNNLN >NC_014410.1|WP_013299096.1|2718576_2719188_+|sporulation-membrane-protein-YtaF MHFIYSLFIALANNIDNISVRIAYSVRGIKITAVKNLWISLITFIISSIAAMSGNIISGVLSKHISSILSMILFISIGLWIAIEPYLKKNTDNPNDINDKAKNIYDILKKPEEADVDDSKDIDFKEATFLGIALSINNIGGGLSAGMIGLNSFFIGFLSALISFIALWIGNYVTNFLNRWNFKRKATIIAGLILILIGIKQVI >NC_014410.1|WP_013299095.1|2716993_2718436_-|M1-family-metallopeptidase 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MSRCNFSNDFDDLGSTPVSNFFINHYMLEAPGEYVKVYLLGLKYSYYNQSFSIEEMAEKLFMSEIDIDKALKFWEKSGVIRLRYSDSEYYIEYLPLVKKVDDKHTLSIDDTEVRQMFETVEKMIGRPLSPTEMNTYLGWVDEYGFSLEILTMLISYCASKNKTSLKYMEKVAIAWHDAGLKTALDVEAYLKAESEKWIRYKKILRALGLKDDDVMEAHKAMMDRWMDDLGFDIDVILKACNECVLKINEPSFPYINQILINWYNDGIRTINDFDKVKKKPYTKKTAPNYKVPKNYFNGYSQRTYDVDELEKKLLAHSRGEFGE >NC_014410.1|WP_013299092.1|2713600_2714866_-|peptidoglycan-DD-metalloendopeptidase-family-protein MDNEGKSNPFSCGIMKNTAIKRRCIFVVALGILFAIAFKYIDNDKSAYSYVCVENDYNTSYITNAKSEKENLITYLNTVNNKNLRIEKPTAITVDGLYVVALKSKKDALEALKITLDKYKRGSIKAYFKNDVRLMEVDTPTANLKTIEEAVKDLEGKSRSVTYVVKDNDTLWSISRKFNVTLNDIYNLNPGISQRIYPGELLKIKESKPLLTVVTEKKSVYMEDIPYETVTQKDDKMFINDSKVLVRGKTGSKIVTAILKYYNGEIVNKNVINENVVSEPVNEVIAVGDEPLPVTYATGNFIYPVRGHITITSRYGQRWGRLHAGIDIAASIGDPIYAADGGTVIFSGWESGYGYLVKIDHGNGYVTYYGHASKLIVKKGDKVYKGQEIALVGMTGNTTGPHVHFEVRKNGVPVNPQIYLK >NC_014410.1|WP_013299091.1|2712625_2713441_-|hypothetical-protein MRKNKNLVAIVFIVFVLAILLNGSILTKAYPVYKVIGKDKIENSIKNFKTKEGKHFIIRYTEPDSKYVDLIINTAEKHYYDIIKDLGYTPKGKSTIIVYNNPDEMNKDFSLAKGENAMGIYLNGVISIESPSLWISPGQDVTKVFQYEGPVVHEFTHLVVDDIANGNYPIWFTEGIALLEEYRQDGYEWGKDLNYNGAPYTYEQLKNDFNSLDEMLAYKRAFQVTKAISDKYGMGTIREMLRDLGSGMSIESSFYKETGLRLDVFVNNAKE >NC_014410.1|WP_013299090.1|2711920_2712619_-|response-regulator-transcription-factor MSSRILIIDDEKPIVEILKYNLEKNGYSTIEAYDGEEGLKLAQEKNPDLILLDVMLPKMDGFTVLRILRQTMTTPILMLTAKEEEVDKVLGLELGADDYVTKPFSMRELIARVKANLRRSGINNGEGMSNVIIVNNLSIDLSKYKVEKNGRPIELTSREFDLLKFLVANRGLIFSREMLLEKVWGYEYFGDVRTVDVTIRRLREKIEDDPANPRYIHTKRGVGYYFSEESEL >NC_014410.1|WP_013299100.1|2726614_2727370_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRIKITLLPEEYKSLNINYNYFLSGWVYNTLKKANREFAEHLHEKGYRYGKKVFKLFTFSQLRSKKLKIIDDEIMFLDETYLYITSPKKEFMLNFVTEVLNNEFLKLQDYQFRIKSVEMLKEPEFSNKEDKFICLSPIVMSTAIEIDGKRKSINLPLHDSRFIENIKNNLIEKYYVLYNTLPDNLNINIDFDVNYYMKNPNGKRIKFKNVYVKGYMVPFTMSGNPDLIKVAYECGLGEKNSAGFGMIQKIK >NC_014410.1|WP_041587492.1|2727380_2727644_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MYVLIVYDVDEKKVAKVNKYLKTYLNWVQNSVFEGELTEAQLDRIIFWFKGHLDLKSDSVLIYTASSQKWLSKRIIGIEKNSTDNIL >NC_014410.1|WP_013299102.1|2727645_2728638_-|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKKSIYINISGRLSRKDNTIFFESETFGKKFIPVNNVEEIFLFGEIDFNTKAINFLAQNNITVHVFNYYGYYSGSFYPREHLPSGFLLVKQVEKYKDENERLKIAKELINGASHNILKNIKYYANRKEGLDEYVERIENERKNLKDVKTINELMGVEGRIRNIYYCAFETIIDGKFAFKNRTMNPPDNPINALISFGNSMMYSIVLTEIYNTQLNPTVSYLHEPGERRFSLSLDISEIFKPIIIDRIIFSLINQKMIREEHFDQDLEMCYLNDKGRIIFQREFEEKLGTIIKHPKLNRSVSYRRLIRLECYKIIKHLLDEEEYESLKMWW >NC_014410.1|WP_013299103.1|2728649_2729141_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MDLATGTEVNYYFVCKHKLWLFTHGINMEHNSDYVDIGNAIHERSFQREDKEILLDGRIKIDFIKNQMEIHETKKSKAMEEATKYQVLYYIYYLKTKGIENVTGILHYMDNHSKEEINLSEESEDEIKVIIEEINKIKSADKPPAIVKSRVCTKCSYYELCFS >NC_014410.1|WP_013299104.1|2729215_2729932_-|hypothetical-protein MLLEVVYKPTSLFSLRRSDATNPAAKSLIAPSPYSIKMALINAAITFKSFDDDIFEMIKNLEIHYNLPDFICVNNCFVKNQSKYEIKTKKENVNLEDIEGYAFKTTIGFREYVYYNNLVKILIKTEIKEKKDIDFLKSLFMRVNYFGKRGSFFQFIEAKEYNDNKRPPGYSYIFDEIVSNNYGKNMIIFKMDDVDKEAKFANMNSYSGEKAKRVSKIYCFEYEQYRANKNFTLLRKIK >NC_014410.1|WP_013299105.1|2729953_2730919_-|DevR-family-CRISPR-associated-autoregulator MDKNFISSLSICGELGLNMHSLNNEGGEGNQVLTREVTIVNEDGKIFTVNAVSGDMLKHIQAEHLYHISIEKGLPLCEKCKVFDANRISGDKTFTEETKDKKDEEILDMLVNKCVIDDLEGILITNNNKNLPRKSAAEFGWLIGIPEKVKTDTFFHVKLVANAGNKSNDESANQGQNIFHRPANSGIYALVSNYDIYRIGYNEISRTYAIDAIQRCERYKAFLQSIMYTFIKPNGAMRNTQDPHIISFKGVIAISNSTVPAPTISPLNDTYTNEIKAIAENINKLEKSSIRVIEFNTLSEFTEIMTDLIQNYEPYELGANN >NC_014410.1|WP_013299106.1|2730938_2732744_-|hypothetical-protein MTDKKYYVLKESGTYSNALEAYGLAELILGLTHEKAKISIIDKGIYYELDVKDMELSEIRYFDLFPYLKKKDDKEVIEKGIKNYIDLEEEKERKNRYNDYLKKINEEKKKAKSLPDAKSILAELDKKIKNYEDKPIKELDVITGINQFKALDMYKKAYFNLYDNKDSFQNIIDVVLRLYSDTTNNIEEAKAIISDLKKKRKIKNIEKVNSLQLYNPSMVKGAHPQKSNDITPKSVDGFWLQECLKIAGSFTSMVIKPVQIAKQKWDNKVYVFDVNNLDWDISKKIFNEFKKLLKGNTSIRLDINSVLLMAKELIQHREEYKSNRKFLNGYRPHDEIKGFYTVYFKNMGNANSPTNISFIELPLFIEINSDKEVKDWIEIIDEHLKIINNIRNSISDQDESGNIISLLKTYRQFLTTSDMDYFYNFIGQYSIFLMEQIAKKNYFTKPFSEKLMEVFLLKTDSKISEILQNQGFRNIAKAIRKSTISEQYAKSKGQQKYDIRYGLAQELLRKSAYKEDLIEFLSEFIVSYNQETAKMAEKDKGKVRATIKQQDLEDLVKLIDEYDNPSLIGKLLCAFGYSLDRKEKEDELAEDENNELDEING >NC_014410.1|WP_013299107.1|2732733_2735145_-|CRISPR-associated-helicase-Cas3' MVLNEFEYVKFFKDVTGFEPYDFQIDLAKKVFAGKNVIMQAPTGSGKTWASIMPFLFAYYEGINFPRKLIYSLPLRVLTNSLYNDVREKVDKKFNGNIQVTIQTGENSNDPYFLDGDIIFTTIDQSLSSLLSIPFSLSNKQSNINTGAIISSYLIFDEFHLLDVKRSLSTLLNIISKLDGITPFCFMSATLSSKLLDNYCKKLNGSQISIKESEVAKIKSQRDKVKRVFVKETTISAEEIIKNHVKKTIAICNTVETCQNLFLELKNKIDREKSLNNVRLLCIHSRFSSNDRKDKEELIKKFFNKYSDENVILISTQVIEVGLDITCDVMHLEISPINSFLQRIGRCARYEGENGKIFVYDVNKDDKTKPYLPYDEELCVRTLNKLKSIGNGVNIDYQKSEVLINDILTDKELRDFERIEEGKHTRFTEIVDCWINNEKGNASRLIRDIDTINVLVVQNVSLLKNPYTYDAIPVNRYTLISRLKKVVKEDEEDWLVRAIEESFLDDEDLFGKFNYPQIALDDIRLKVENRVILNSKYVFYDDDIGLNFLNAGQREILKIDKLQQKQDYIITKDTYEEHIRYMMVAFDDLFKGKYKYIFLKLKERLDLKYDVEELIRFIIIMHDYGKLNAVWQASASKYQNKKGNYNKEELLAHTDYNPNVDENNRPKLPNHAGIGGVVAASLAGDILDYGVCIAILNAIAKHHSVKTESSAKYRIMKEGKEKTLKLIKIYCPNLYKDIDKSKEFLSEGDEQSFNDYAVNFNKFGIDFDVLLYFLFVRILRICDQKSFAYKQIMMEGGEYRDDR >NC_014410.1|WP_013299108.1|2735494_2736547_+|DUF1646-domain-containing-protein MINAILFAILLIILTVPFFVKAIEDNIEYFLFAMGIIAVTVSGAMSLDLLSHILKNHLLYIITAAVFISGLLFEIFKIKIKEFVKSILNHISLKIFVFMLIVVLGLTSSIITAIVASLVLVEIVHILPIHHKDKVVITVIACLSIGLGAALTPVGEPLSTLVISALKKDFFYLLRTIGIYIVPAIFVMGILGAFYVNRFADNAKPKQEEEYFKEEEMEIRQIENIKFIVIRSIKIFIFLLALELLSAGFKPLVDNYIMHMNVRLLYWVNMISAVLDNATLAAAEISPAMDPEHIRAILMGLLISGGMLIPGNIPNIISAGKLEIKSREWAKIGIPLSMITLIVCYFIVFI >NC_014410.1|WP_041587625.1|2736648_2737320_-|hypothetical-protein MDKVYLERYESLGYARYICTSCYHCISKMGVSYCSINMRGCCSYFPKFELIDIHRMVKSAEGLQVLKRIIDNPGTVVYNYYIHAKGYFDKDGYEEYLKNAPEEDDIRDKTIFFRACPFVKSGYGCTLPPVYRNYVCNFFICDEVINNVDDEEVKNQYIRERSRFVRWAEWENMSLESILAEHHLNLRDDFEGSIKLLQEIPLDIFEFPQLKELNVINIGEKDA |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_014410_5 | 5.35|2725976|35|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2725976-2726010 | 35 | CP003186 | Thermoanaerobacterium phage THSA-485A, complete genome | 35350-35384 | 1 | 0.971 |
NC_014410_1 | 1.18|310582|39|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 310582-310620 | 39 | CP003186 | Thermoanaerobacterium phage THSA-485A, complete genome | 30773-30811 | 2 | 0.949 |
NC_014410_4 | 4.3|2643682|35|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT | 2643682-2643716 | 35 | CP003186 | Thermoanaerobacterium phage THSA-485A, complete genome | 38266-38300 | 2 | 0.943 |
NC_014410_4 | 4.24|2645075|37|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT | 2645075-2645111 | 37 | NZ_CP006906 | Clostridium baratii str. Sullivan plasmid pCBJ, complete sequence | 114997-115033 | 5 | 0.865 |
NC_014410_4 | 4.20|2644811|35|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT | 2644811-2644845 | 35 | FN667788 | Campylobacter phage CP220, complete genome | 166761-166795 | 8 | 0.771 |
NC_014410_5 | 5.16|2724715|37|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2724715-2724751 | 37 | NZ_LR135375 | Enterococcus faecium isolate E8172 plasmid 4 | 15892-15928 | 8 | 0.784 |
NC_014410_5 | 5.31|2725710|35|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2725710-2725744 | 35 | MN694578 | Marine virus AFVG_250M492, complete genome | 13942-13976 | 8 | 0.771 |
NC_014410_5 | 5.31|2725710|35|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2725710-2725744 | 35 | MN693901 | Marine virus AFVG_250M491, complete genome | 27732-27766 | 8 | 0.771 |
NC_014410_5 | 5.31|2725710|35|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2725710-2725744 | 35 | MN694641 | Marine virus AFVG_250M490, complete genome | 27736-27770 | 8 | 0.771 |
NC_014410_3 | 3.6|318416|37|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 318416-318452 | 37 | NZ_CP040783 | Bacillus thuringiensis strain HM-311 plasmid p1, complete sequence | 244117-244153 | 9 | 0.757 |
NC_014410_4 | 4.19|2644744|37|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT | 2644744-2644780 | 37 | NZ_CP050184 | Bacillus thuringiensis strain HER1410 plasmid pLUSID1, complete sequence | 272540-272576 | 9 | 0.757 |
NC_014410_4 | 4.19|2644744|37|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT | 2644744-2644780 | 37 | NZ_CP007513 | Bacillus bombysepticus plasmid pBb, complete genome | 150658-150694 | 9 | 0.757 |
NC_014410_4 | 4.20|2644811|35|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT | 2644811-2644845 | 35 | NZ_CP010112 | Bacillus thuringiensis serovar indiana strain HD521 plasmid pBTHD521-6, complete sequence | 304027-304061 | 9 | 0.743 |
NC_014410_4 | 4.20|2644811|35|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT | 2644811-2644845 | 35 | NZ_CP009636 | Bacillus cereus 03BB108 plasmid pBFI_2, complete sequence | 218353-218387 | 9 | 0.743 |
NC_014410_4 | 4.20|2644811|35|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT | 2644811-2644845 | 35 | NZ_CP053962 | Bacillus cereus strain FDAARGOS_802 plasmid unnamed2, complete sequence | 43796-43830 | 9 | 0.743 |
NC_014410_4 | 4.20|2644811|35|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT | 2644811-2644845 | 35 | NZ_CP016596 | Bacillus cereus strain K8 plasmid pBCM301, complete sequence | 138974-139008 | 9 | 0.743 |
NC_014410_4 | 4.20|2644811|35|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT | 2644811-2644845 | 35 | NC_019507 | Campylobacter phage CP21, complete genome | 80834-80868 | 9 | 0.743 |
NC_014410_4 | 4.20|2644811|35|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT | 2644811-2644845 | 35 | HE815464 | Campylobacter phage CP21 complete sequence | 80834-80868 | 9 | 0.743 |
NC_014410_4 | 4.36|2645885|36|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2645885-2645920 | 36 | NZ_CP009047 | Staphylococcus epidermidis strain SEI plasmid unnamed, complete sequence | 34194-34229 | 9 | 0.75 |
NC_014410_5 | 5.16|2724715|37|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2724715-2724751 | 37 | NC_002137 | Lactococcus lactis cremoris NIZO B40 plasmid pNZ4000, complete sequence | 10539-10575 | 9 | 0.757 |
NC_014410_5 | 5.16|2724715|37|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2724715-2724751 | 37 | NZ_CP014901 | Lactobacillus backii strain TMW 1.2002 plasmid pL12002-2, complete sequence | 4136-4172 | 9 | 0.757 |
NC_014410_5 | 5.16|2724715|37|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2724715-2724751 | 37 | NZ_CP016751 | Lactococcus lactis subsp. cremoris strain JM1 plasmid pJM1E, complete sequence | 10693-10729 | 9 | 0.757 |
NC_014410_5 | 5.16|2724715|37|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2724715-2724751 | 37 | NC_015864 | Lactococcus lactis subsp. lactis plasmid pIL7, complete sequence | 28257-28293 | 9 | 0.757 |
NC_014410_5 | 5.16|2724715|37|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2724715-2724751 | 37 | NZ_CP014875 | Lactobacillus backii strain TMW 1.1989 plasmid pL11989-2, complete sequence | 7466-7502 | 9 | 0.757 |
NC_014410_5 | 5.16|2724715|37|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2724715-2724751 | 37 | NZ_CP016710 | Lactococcus lactis subsp. cremoris strain UC109 plasmid pUC109D, complete sequence | 11020-11056 | 9 | 0.757 |
NC_014410_4 | 4.14|2644414|35|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT | 2644414-2644448 | 35 | KF669662 | Bacillus phage Spock, complete genome | 83390-83424 | 10 | 0.714 |
NC_014410_4 | 4.20|2644811|35|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT | 2644811-2644845 | 35 | NC_041831 | Campylobacter phage vB_CcoM-IBB_35 clone Contig3, complete sequence | 4186-4220 | 10 | 0.714 |
NC_014410_5 | 5.16|2724715|37|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2724715-2724751 | 37 | NZ_CP031543 | Lactococcus lactis subsp. cremoris strain 3107 plasmid p3107E, complete sequence | 13262-13298 | 10 | 0.73 |
NC_014410_5 | 5.16|2724715|37|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2724715-2724751 | 37 | NC_016042 | Lactococcus lactis subsp. lactis plasmid pKP1, complete sequence | 284-320 | 10 | 0.73 |
NC_014410_5 | 5.16|2724715|37|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2724715-2724751 | 37 | NC_004959 | Lactococcus lactis W-37 plasmid pSRQ900, complete sequence | 10791-10827 | 10 | 0.73 |
NC_014410_5 | 5.16|2724715|37|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2724715-2724751 | 37 | NC_004960 | Lactococcus lactis W-1 plasmid pSRQ800, complete sequence | 7814-7850 | 10 | 0.73 |
NC_014410_5 | 5.16|2724715|37|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2724715-2724751 | 37 | NC_016971 | Lactococcus garvieae 21881 plasmid pGL4 complete sequence | 458-494 | 10 | 0.73 |
NC_014410_5 | 5.16|2724715|37|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2724715-2724751 | 37 | NZ_CP032127 | Acinetobacter chinensis strain WCHAc010005 plasmid p1_010005, complete sequence | 12085-12121 | 10 | 0.73 |
NC_014410_5 | 5.16|2724715|37|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2724715-2724751 | 37 | NZ_AP017399 | Lactococcus garvieae plasmid pNALG-1 DNA, complete sequence, strain: 122061 | 1321-1357 | 10 | 0.73 |
NC_014410_3 | 3.6|318416|37|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 318416-318452 | 37 | NC_008387 | Roseobacter denitrificans OCh 114 plasmid pTB2, complete sequence | 56273-56309 | 11 | 0.703 |
NC_014410_3 | 3.6|318416|37|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 318416-318452 | 37 | NZ_CP027408 | Roseobacter denitrificans strain FDAARGOS_309 plasmid unnamed2, complete sequence | 36132-36168 | 11 | 0.703 |
NC_014410_4 | 4.20|2644811|35|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT | 2644811-2644845 | 35 | MT774383 | CrAssphage cr11_1, complete genome | 44315-44349 | 11 | 0.686 |
NC_014410_4 | 4.47|2646622|36|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2646622-2646657 | 36 | NC_010895 | Bacillus thuringiensis serovar tenebrionis plasmid pBMB175, complete sequence | 4141-4176 | 11 | 0.694 |
NC_014410_5 | 5.10|2724318|35|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2724318-2724352 | 35 | AP014086 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C3-MedDCM-OCT-S45-C97, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 9100-9134 | 11 | 0.686 |
NC_014410_5 | 5.10|2724318|35|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2724318-2724352 | 35 | AP014087 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C3-MedDCM-OCT-S46-C100, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 7494-7528 | 11 | 0.686 |
NC_014410_5 | 5.16|2724715|37|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2724715-2724751 | 37 | NZ_CP015179 | Bacillus thuringiensis serovar alesti strain BGSC 4C1 plasmid pBMB57, complete sequence | 31000-31036 | 12 | 0.676 |
1. spacer 5.35|2725976|35|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP003186 (Thermoanaerobacterium phage THSA-485A, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
tcaatagattcagtgataaatttagtaagagcaaa CRISPR spacer tcaatagattcagtgataaatttagtaagaacaaa Protospacer ******************************.****
2. spacer 1.18|310582|39|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP003186 (Thermoanaerobacterium phage THSA-485A, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.949
aatgttctaattgtttaattttgtcattcataacattaa CRISPR spacer gatattctaattgtttaattttgtcattcataacattaa Protospacer .**.***********************************
3. spacer 4.3|2643682|35|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT matches to CP003186 (Thermoanaerobacterium phage THSA-485A, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
ttactttgcctacaaatgtaaacattctgtatgga CRISPR spacer ttactttgcctacaaatgtaaacattctatatggg Protospacer ****************************.*****.
4. spacer 4.24|2645075|37|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP006906 (Clostridium baratii str. Sullivan plasmid pCBJ, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.865
ctttttcacgaaatggtacattcaacaggacatgaaa CRISPR spacer gcttttcacgaaatggtacattcaacaggtcataaag Protospacer .*************************** ***.**.
5. spacer 4.20|2644811|35|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT matches to FN667788 (Campylobacter phage CP220, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
aggaaatttatcaccaatattaatattgttatgaa CRISPR spacer tttccatttatcaccaatattaattttgttattga Protospacer ******************* ******* .*
6. spacer 5.16|2724715|37|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR135375 (Enterococcus faecium isolate E8172 plasmid 4) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
tcttttttattgttttgaaaaatgtaaagatatatat CRISPR spacer tattttttatttttttcaaaaatgtaaaagtaacgat Protospacer * ********* **** ***********..** **
7. spacer 5.31|2725710|35|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694578 (Marine virus AFVG_250M492, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
----gaacctgtagtagaagataacacaagtacaaaaga CRISPR spacer tggggaa----tagtagaagataatacaattacaaaact Protospacer *** *************.**** *******
8. spacer 5.31|2725710|35|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693901 (Marine virus AFVG_250M491, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
----gaacctgtagtagaagataacacaagtacaaaaga CRISPR spacer tggggaa----tagtagaagataatacaattacaaaact Protospacer *** *************.**** *******
9. spacer 5.31|2725710|35|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694641 (Marine virus AFVG_250M490, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
----gaacctgtagtagaagataacacaagtacaaaaga CRISPR spacer tggggaa----tagtagaagataatacaattacaaaact Protospacer *** *************.**** *******
10. spacer 3.6|318416|37|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP040783 (Bacillus thuringiensis strain HM-311 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
caattatatgttatgtttagttacaagtcaattttaa CRISPR spacer taattatatgtaatctttagttacaagatctttctat Protospacer .********** ** ************ . **.**
11. spacer 4.19|2644744|37|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP050184 (Bacillus thuringiensis strain HER1410 plasmid pLUSID1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
tagaagaaaacataaaagaaaaatttaataaattcta CRISPR spacer aagaaaaaaacataaaagaaaaagttagaattttaca Protospacer ****.***************** ***. * ** .*
12. spacer 4.19|2644744|37|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP007513 (Bacillus bombysepticus plasmid pBb, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
tagaagaaaacataaaagaaaaatttaataaattcta CRISPR spacer aagaaaaaaacataaaagaaaaagttagaattttaca Protospacer ****.***************** ***. * ** .*
13. spacer 4.20|2644811|35|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP010112 (Bacillus thuringiensis serovar indiana strain HD521 plasmid pBTHD521-6, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
aggaaatttatcaccaatattaatattgttatgaa CRISPR spacer cataattttttcaccaatattaatattgttcatat Protospacer . ** *** ******************** *
14. spacer 4.20|2644811|35|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP009636 (Bacillus cereus 03BB108 plasmid pBFI_2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
aggaaatttatcaccaatattaatattgttatgaa CRISPR spacer cataattttttcaccaatattaatattgttcatat Protospacer . ** *** ******************** *
15. spacer 4.20|2644811|35|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP053962 (Bacillus cereus strain FDAARGOS_802 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
aggaaatttatcaccaatattaatattgttatgaa CRISPR spacer cataattttttcaccaatattaatattgttcatat Protospacer . ** *** ******************** *
16. spacer 4.20|2644811|35|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP016596 (Bacillus cereus strain K8 plasmid pBCM301, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
aggaaatttatcaccaatattaatattgttatgaa CRISPR spacer cataattttttcaccaatattaatattgttcatat Protospacer . ** *** ******************** *
17. spacer 4.20|2644811|35|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019507 (Campylobacter phage CP21, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
aggaaatttatcaccaatattaatattgttatgaa CRISPR spacer tttccatttatcaccaatattaatttttttattga Protospacer ******************* ** **** .*
18. spacer 4.20|2644811|35|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT matches to HE815464 (Campylobacter phage CP21 complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
aggaaatttatcaccaatattaatattgttatgaa CRISPR spacer tttccatttatcaccaatattaatttttttattga Protospacer ******************* ** **** .*
19. spacer 4.36|2645885|36|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP009047 (Staphylococcus epidermidis strain SEI plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
agttaatcccaccaattctttatatatttttttaaa CRISPR spacer aattctattaaccaattctttatatactttattaaa Protospacer *.** .. ****************.*** *****
20. spacer 5.16|2724715|37|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_002137 (Lactococcus lactis cremoris NIZO B40 plasmid pNZ4000, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
tcttttttattgttttgaaaaatgtaaagatatatat CRISPR spacer ttttttttatttttttcaaaaatgtaaaaccaaaggt Protospacer *.********* **** ***********. .* * .*
21. spacer 5.16|2724715|37|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014901 (Lactobacillus backii strain TMW 1.2002 plasmid pL12002-2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
tcttttttattgttttgaaaaatgtaaagatatatat CRISPR spacer ttttttttatttttttcaaaaatgtaaaaccaaaggt Protospacer *.********* **** ***********. .* * .*
22. spacer 5.16|2724715|37|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP016751 (Lactococcus lactis subsp. cremoris strain JM1 plasmid pJM1E, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
tcttttttattgttttgaaaaatgtaaagatatatat CRISPR spacer ttttttttatttttttcaaaaatgtaaaaccaaaggt Protospacer *.********* **** ***********. .* * .*
23. spacer 5.16|2724715|37|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_015864 (Lactococcus lactis subsp. lactis plasmid pIL7, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
tcttttttattgttttgaaaaatgtaaagatatatat CRISPR spacer ctttttttatttttttcaaaaatgtaaaactaaaggt Protospacer ..********* **** ***********. ** * .*
24. spacer 5.16|2724715|37|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014875 (Lactobacillus backii strain TMW 1.1989 plasmid pL11989-2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
tcttttttattgttttgaaaaatgtaaagatatatat CRISPR spacer ttttttttatttttttcaaaaatgtaaaaccaaaggt Protospacer *.********* **** ***********. .* * .*
25. spacer 5.16|2724715|37|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP016710 (Lactococcus lactis subsp. cremoris strain UC109 plasmid pUC109D, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
tcttttttattgttttgaaaaatgtaaagatatatat CRISPR spacer ttttttttatttttttcaaaaatgtaaaaccaaaggt Protospacer *.********* **** ***********. .* * .*
26. spacer 4.14|2644414|35|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT matches to KF669662 (Bacillus phage Spock, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
gggaatcagtagaagtataagaaacaagattacct CRISPR spacer gggaataagtataagtataagaaacctgcggaatc Protospacer ****** **** ************* * * ..
27. spacer 4.20|2644811|35|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_041831 (Campylobacter phage vB_CcoM-IBB_35 clone Contig3, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
aggaaatttatcaccaatattaatattgttatgaa CRISPR spacer tttccacttatcaccaatattaatttttttattga Protospacer *.***************** ** **** .*
28. spacer 5.16|2724715|37|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP031543 (Lactococcus lactis subsp. cremoris strain 3107 plasmid p3107E, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
tcttttttattgttttgaaaaatgtaaagatatatat CRISPR spacer ctttttttatttttttcaaaaatgtaaaaccaaaggt Protospacer ..********* **** ***********. .* * .*
29. spacer 5.16|2724715|37|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_016042 (Lactococcus lactis subsp. lactis plasmid pKP1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
tcttttttattgttttgaaaaatgtaaagatatatat CRISPR spacer tattttttatttttttcaaaaatgtaaaatccaaagt Protospacer * ********* **** ***********. . * .*
30. spacer 5.16|2724715|37|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_004959 (Lactococcus lactis W-37 plasmid pSRQ900, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
tcttttttattgttttgaaaaatgtaaagatatatat CRISPR spacer tattttttatttttttcaaaaatgtaaaatccaaagt Protospacer * ********* **** ***********. . * .*
31. spacer 5.16|2724715|37|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_004960 (Lactococcus lactis W-1 plasmid pSRQ800, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
tcttttttattgttttgaaaaatgtaaagatatatat CRISPR spacer ctttttttatttttttcaaaaatgtaaaaccaaaggt Protospacer ..********* **** ***********. .* * .*
32. spacer 5.16|2724715|37|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_016971 (Lactococcus garvieae 21881 plasmid pGL4 complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
tcttttttattgttttgaaaaatgtaaagatatatat CRISPR spacer tattttttatttttttcaaaaatgtaaaatccaaagt Protospacer * ********* **** ***********. . * .*
33. spacer 5.16|2724715|37|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032127 (Acinetobacter chinensis strain WCHAc010005 plasmid p1_010005, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
tcttttttattgttttgaaaaatgtaaagatatatat CRISPR spacer ctttacttattgttttgaaaaatttgaagataaaagc Protospacer ..** .***************** *.****** * ..
34. spacer 5.16|2724715|37|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP017399 (Lactococcus garvieae plasmid pNALG-1 DNA, complete sequence, strain: 122061) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
tcttttttattgttttgaaaaatgtaaagatatatat CRISPR spacer tattttttatttttttcaaaaatgtaaaatccaaagt Protospacer * ********* **** ***********. . * .*
35. spacer 3.6|318416|37|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_008387 (Roseobacter denitrificans OCh 114 plasmid pTB2, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
caattatatgttatgtttagttacaagtcaattttaa CRISPR spacer taattatatgttattattagttacaagaactatgtgg Protospacer .************* *********** * *..
36. spacer 3.6|318416|37|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP027408 (Roseobacter denitrificans strain FDAARGOS_309 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
caattatatgttatgtttagttacaagtcaattttaa CRISPR spacer taattatatgttattattagttacaagaactatgtgg Protospacer .************* *********** * *..
37. spacer 4.20|2644811|35|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT774383 (CrAssphage cr11_1, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
aggaaatttatcaccaatattaatattgttatgaa CRISPR spacer atttgtcttattactaatattaatattgttattcc Protospacer * . .****.**.*****************
38. spacer 4.47|2646622|36|NC_014410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_010895 (Bacillus thuringiensis serovar tenebrionis plasmid pBMB175, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.694
gcctttctttaattcctaattcctttgctgtatctc CRISPR spacer tatccttactaattcctaattcctttgctacatcta Protospacer ...*. .********************..****
39. spacer 5.10|2724318|35|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AP014086 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C3-MedDCM-OCT-S45-C97, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
agaacgttaaaaacttgttatcaattaatggcgga CRISPR spacer caattcttaaaaacttattatcaatttatggaatc Protospacer .* . **********.********* **** .
40. spacer 5.10|2724318|35|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AP014087 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C3-MedDCM-OCT-S46-C100, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
agaacgttaaaaacttgttatcaattaatggcgga CRISPR spacer caattcttaaaaacttattatcaatttatggaatc Protospacer .* . **********.********* **** .
41. spacer 5.16|2724715|37|NC_014410|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP015179 (Bacillus thuringiensis serovar alesti strain BGSC 4C1 plasmid pBMB57, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.676
tcttttttattgttttgaaaaatgtaaagatatatat CRISPR spacer ctgtaacgattgttttgaaaaacgtaaagacatagta Protospacer .. * . **************.*******.***
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
19857 : 28775
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_014410|19857:28775|DBSCAN-SWA CATGATATTGAAAGGATCGCAGGTTATAATAGAAGTTTTAAAAGAACAGGATGTAGATACTATATTTGGCATACCCGGTGGTTCTGTTATACCACTTTATGATGCTTTGTATGATTCTGATTTAAAGCATATTCTTGCAACACATGAGCAGATGGCTGCTCATATGGCAGATGGATATGCAAGAGTAACGGGAAAAGTTGGTGTATGTATAGCTACATCTGGACCAGGTGCTACCAATTTAGTAACAGGCATTGCAAATGCATATATGGATTCTGTGCCTATTGTTGCAATAACAGGTCAAGTAGCCACAAACTTGATAGGTAAAGATTCTTTTCAGGAAGTCGATATTGCCGGGATTACTATGCCTGTAACAAAGCATAATTTCATAGTAAAATCACCTGATAAATTAGCTGATACTTTAAGAGAAGCATTTTTTATAGCAAAGGAAGGAAGGCCTGGACCTGTACTGGTAGATATACCAAAAGATATTCAGACATCAAATGTAAATTTTATTAAGCGGAAAGATTTTTACATTGAAGTTAAGAAGCATCCTGTAAATGAATCGGATTTGACAAAGGCTACGGAATTAATAAATTCAAGCAAAAAGCCTGTGATATTTGCAGGTGGCGGAGTTATATGGGGTGAGGCGTCCAAGAGCTTATATGATTTTGCAAAAGAAAATATGATTCCTGTAGCGACTTCTCTTATGGGATTAGGATGTTTCCCAGAAGATGATGAATTGTCACTAGGACTTATAGGAATGCATGGAAGCAGATATGCCAATACAGCCATTTATAAGTCTGACTTAGTAATTGCCATAGGTACTAGGTTCAGCGATAGAGTTGCCGGTAAAGCAGGTGGGCTGGCACCTTATGCAAAGGTCATCCATATCGATATAGATCCTGCAGAAATTGGTAAAAATATAGATGTAGATGTTCCAATTATTGGGGAAATTAACGAGGTTCTTAAACTTTTAAATAACATGATAAAAGAAAAAGAACACAATGAATGGATTCATGAGCTTTTATCTATAAAAGAAAAAACATCGTTTAAGTATAAAGACGATGGAAAATTAAAGCCTCAGTGGATAATCGAAAAAGTGCAGGAAATGGGGAAAGACGACCTTATCATGGCAACGGAGGTAGGGCAAAATCAAATGTGGACTGCCCAATATTTTAAATTTAAAGAGCCTAGGACATTTGTGACATCTGGTGGTCTTGGCACAATGGGATTTGGACTTCCAGCTTCAATAGGGGCACAGGTAGGGAGAAATGATAAGCGTGTTGTAAATATAGCTGGAGATGGAAGCATAAGGATGAACATCCATGCTTTTGAAACAATGGCTATATACAATATACCTGTTATAACTATTATTCTCAATAATCAGACATTAGGAATGGTAAGACAATGGCAGAATCTCCTTTTCAATAAAAGATATTCTCAGACGGATTTAAATCCAAACCTTGATTTTTCAAAAGTAGCAGAAGCGTTTGGGGTCTTTAGCAAAAGGATTTACACAAAAGAAAAGTTTGAAGAATCATTTAAAGAGGCATTATCTAATAATAAGCCATGCGTGTTGGAATGCATGATAGACAAAGATGAGATGGTTCTTCCTTTTATTCCTGCTGGAGGAACTATTGAAGAAATGATAGACTAGTATTTTTATTAAGAGTATGATATAATATAAAAAATTGAATAAATTTAAAAACCTTCAGGGATTGGTGAAATTCCATACCGGCGGTAAAGCCCGCGAGCCTTATGGCAGATCTGGTTAGATTCCAGAGCCGACAGTAAAGTCTGGATGAAAGAAGGTAAATAGGCAATTTTGTCGAAATGCCCTGAAGTATTACATACTTCAGGGCTAAGTTTATTTTTGGGGTGTTTTTATGGAGAAATACATGAAAAGGGCATTACAGCTTGCAAAATTAGGCTTAGGGCACACAAATCCAAATCCTTTAGTAGGTGCAGTAATTGTTAAAAATGGCAGGATAATAGGTGAAGGGTACCATGAATACTATGGAGGACCACATGCAGAAATAAATGCACTAAAAAGTGTTAAAGAAGATGTAATAGGAGCTCAGCTTTATGTCACATTAGAACCGTGCTGTCATTATGGAAAAACTCCGCCTTGTGTAGATGCTATTGTAAAATCAGGTATAAAAGATGTTTTTATTGCTATGGAGGATCCAAATAAACTTGTTTCAGGAAAGGGAATAAAACATCTTAAAGAAGCAGGCTTAAATGTGTATACAGGTTTATTAAAAGAGGAGGCAGAGAAAATAAATGAAATATTTATAAAGTACATTACGACTAAAAAGCCGTATGTAATATTAAAGTCTGCCATGACGATTGATGGAAAGATTGCAACTTATACAGGCGATTCTAAATGGATAACAAATGAAAAATCGAGAGAACATGTCCATATAATGAGAGGCTGTGTTATGGCAATAATGGTAGGTGTCAACACAGTTATAAAAGATAATCCATATCTTACGGCGAGAATAGATGGATTTAAGAATCCTTTAAGGGTGGTTGTTGATAGCCGTGGCAGGATTCCTCTAGAAGCAAATGTTGTAATTGACAAATCTGCCAAGACAATAGTAGCAACAACGGATATGATGCCCTATAAAAAAGTAAAAGCATTAAGGGATTTAGGAGTAGATGTATTTGTGCTTGACAAGTTAAACGGTGAAGTAGATTTAAAAAAATTGATGGATATGTTAGGAGAGAGAGGGATAGACAGTGTAATCATAGAAGGTGGAGGAACACTAAATTATTCTGCTTTAAAAGAAGGAATAGTAGACAAAGTGATGTTCTATATAGCTCCAAAAATAATAGGTGGAAGCAATTCTTTGACGCCTGTAGAAGGAAAAGGCATTGATTTGATTAAAGATGCCATAATGATTGAAAAATTAGACGTAAAAAGATTTGATGATGACATACTTATAGAAGGTTATATTAAAAAGTAGGTGTTACTATGTTTACAGGAATAATAGAAGAGATTGGCAAAGTTAAGATGATACAACGTGGAGATATTACAAAAATAGCAATTGAATGTGATAAGGTGTTAAATGGCACAAGAATTGGGGATAGTATAGCTGTAAATGGAGTATGTTTGACGGTTACAAATGTAGGAAAAAATCTATTTACAGCGGATCTGATGAGGGAAACACTAAAATCCAGCAATTTAGGAAACTTGAAAATAGGAAGTATGGTCAATTTAGAAAGAGCTTTAAGCATATCTGGCAGGTTAAATGGCCATATTGTGACAGGACACGTAGATACTGTCGGTACAATAGTTAATAAAAATCGAATTATGAATTCAAATGTATTTAAAATTAAAATCGATGAAAGATATTCAAAATACGTTGTAAGCAAGGGAAGCATCGCTGTCGACGGAATAAGTTTGACAGTCGTGGAGGCGTTAGCTTCATATTTTACGGTTTCTGTCATACCGCATACGGAGTTAAATACAACACTAAACTTTAAGAGAATCGGAGATAGTGTCAATATAGAAGTAGACATACTATCGAAGTATGCTGAAAAACTGTTGTTAAAAAAAGGAATGAAGGAGCTTGTATTAGAAAATGGCTTTTGATTATTTAACATATTTTTATTAAATTTTAAGGAGATGTGTATAAATGCTTGATACGATAGAAAGTGCAATAGAAGACATCAAAAATGGTAAAATGGTCATTGTAGTCGATGACGAAGACAGGGAAAATGAAGGGGATTTAGTGATGGCAGCAGAAAAAGTTAGAGGCGAAGATATAAATTTTATGATAAAGTATGGACGTGGATTAGTATGTGTTCCCATGAGTGATAAAAGGCTTAAAGAATTAAATATAGGTAAGATGGTATCTGAAAATACAGATAATAGAGAAACTGCCTTTACTGTATCTGTAGATCACAAAAGTTGTAAGACTGGTATTTCGGCGTACGAAAGGGCATTTACAATAAAAATGCTTCTAGATGATAATTCTAGGCCGGATGATTTTACAAAACCAGGACATGTATTTCCTCTGAAAGCAAAAGAAGGAGGTGTTTTGGTAAGGGCAGGACACACAGAAGCAGCGTATGATTTGTCGAGACTTGCTGACTTTAAAGGTGCTGGCGTAATCTGTGAAATCATAAAAGATGACGGCAGGATGGCTAGACTTCCAGAGCTTGTGGAGTTTTCAAAGAGGTTTAACCTAAAGATAATATCTATAGCCGATCTAATTGAATACAGAAGGAAGAAAGAAAAACTAATAAGGAGAGTAGCTGAAGCCCATCTTCCTACAAAATACGGCGATTTCAATATAATAGGGTATGAAGAAATTTTGACCGGTAAAGAACATGTGGCGTTAGTAAGAGGAGAATTGACAGAGGAGCCTACGCTTGTTAGAGTTCATTCAGAATGCTTAACAGGTGATATAATGGGTTCTTTAAGATGTGATTGTGGTGATCAGCTTCATGCAGCAATGGAGAGAATAGGAAAAGAAGGAGGTGTCCTTTTATACTTAAGACAAGAAGGCAGAGGAATCGGACTTTTAAACAAGATTAAAGCATATCACTTACAGGACGCAGGCCTTGATACGGTTGATGCTAATCTTAGATTAGGTTTTCCTGCTGATATGAGAGAATACGGAATAGGAGCTCAGATTTTAAAAGATTTAGGACTTAGAAGGCTTAGGATAATGACCAACAACCCTAAAAAATTAGCTGGTTTATCTGGCTATGGGCTTGAAATAGTGGAGAGAGTCCCGATAGAAGTATCTTTAAACAAGCACAATGAAAAATATCTTAAAACAAAAAAAGAAAAGTTTGGCCATATATTTCATACATTTCAATAATTAGTAAAGGGGAGATTATTTTGAGGACATATGAAGGAAAACTTATAGGTGATGGCTTAAAGTTAGGCATCGTAGTAAGCAGGTTTAATGAATTCATAACAAGTAAACTTCTAGATGGTGCTTTGGATGCTTTAAGGAGGCATGGTGTAGATGATGACAGCATTG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_014410|19857:28775|25230_26295_-|WP_013296601.1|DBSCAN-SWA MKDFLSRYQSTIKNVIIILAVIISFYLFVFKLIPFLMPFAVALFLAILIDPAVEFLEKKLKVPRGLSSAFLILLLIAIIGLLISLLITQLVFELNTLAEHAPNYTKNFDVVISDLIDRIRIYYISLPTNISTFLENNLQSILNNISVLAKNFAAWILGLATKLPNFFFMSIITIVSTFFLSKDKWLILNFIKRQFPSNWALHAENIKGDLFQTLIGFIRAEITIMFITFMEVSIGLTIIGFDYAFLLGLLVSFIDILPVLGSGSVLVPWAVYNIFTKNYLIGIYLLILYGIVTVVRQMIEPKIVGQSIGLHPLVTLLSMFIGAKLFGGFGLIMGPVFVVVFKTFQKSGIIPSWK >NC_014410|19857:28775|23497_24691_+|WP_013296599.1|DBSCAN-SWA MLDTIESAIEDIKNGKMVIVVDDEDRENEGDLVMAAEKVRGEDINFMIKYGRGLVCVPMSDKRLKELNIGKMVSENTDNRETAFTVSVDHKSCKTGISAYERAFTIKMLLDDNSRPDDFTKPGHVFPLKAKEGGVLVRAGHTEAAYDLSRLADFKGAGVICEIIKDDGRMARLPELVEFSKRFNLKIISIADLIEYRRKKEKLIRRVAEAHLPTKYGDFNIIGYEEILTGKEHVALVRGELTEEPTLVRVHSECLTGDIMGSLRCDCGDQLHAAMERIGKEGGVLLYLRQEGRGIGLLNKIKAYHLQDAGLDTVDANLRLGFPADMREYGIGAQILKDLGLRRLRIMTNNPKKLAGLSGYGLEIVERVPIEVSLNKHNEKYLKTKKEKFGHIFHTFQ >NC_014410|19857:28775|19857_21513_+|WP_013296596.1|DBSCAN-SWA MILKGSQVIIEVLKEQDVDTIFGIPGGSVIPLYDALYDSDLKHILATHEQMAAHMADGYARVTGKVGVCIATSGPGATNLVTGIANAYMDSVPIVAITGQVATNLIGKDSFQEVDIAGITMPVTKHNFIVKSPDKLADTLREAFFIAKEGRPGPVLVDIPKDIQTSNVNFIKRKDFYIEVKKHPVNESDLTKATELINSSKKPVIFAGGGVIWGEASKSLYDFAKENMIPVATSLMGLGCFPEDDELSLGLIGMHGSRYANTAIYKSDLVIAIGTRFSDRVAGKAGGLAPYAKVIHIDIDPAEIGKNIDVDVPIIGEINEVLKLLNNMIKEKEHNEWIHELLSIKEKTSFKYKDDGKLKPQWIIEKVQEMGKDDLIMATEVGQNQMWTAQYFKFKEPRTFVTSGGLGTMGFGLPASIGAQVGRNDKRVVNIAGDGSIRMNIHAFETMAIYNIPVITIILNNQTLGMVRQWQNLLFNKRYSQTDLNPNLDFSKVAEAFGVFSKRIYTKEKFEESFKEALSNNKPCVLECMIDKDEMVLPFIPAGGTIEEMID >NC_014410|19857:28775|27503_28775_+|WP_013296604.1|tRNA|DBSCAN-SWA MLDIKRIRNNPDEVKKAIELKKENSNIDEFLEIDEKRRGILKELESLKNTRNKESENIAKLKREGKDAEELIKEMKEISDKIKAMESDVKQYDERLEELLWTIPNIPHESVPVGDSDADNVEIRRWGDVRKFDFEIKPHWDIGVELGILDFEAASRVTGSRFTFYKGLGCRLERSLISFMMDLHTEKHGYTEVFPPFMVHRRSMYGTGQLPKFEEDAFKVAGTDYFLIPTAEVPVTNMYRETIIDAEELPIYNCAYSACFRQEAGSAGRDTRGLIRQHQFNKVELVKITEPERSYEELEKMVNDAEDVLKTLGIPYRVVSICTGDLGFTAAKKYDLEVWMPSYGRYVEISSCSNCEDFQARRANIKYRPKGGGKAQYVHTLNGSGVAVGRTFAAILENYQQEDGSVVIPEALRPYMKCDVIRK >NC_014410|19857:28775|22833_23454_+|WP_013296598.1|DBSCAN-SWA MFTGIIEEIGKVKMIQRGDITKIAIECDKVLNGTRIGDSIAVNGVCLTVTNVGKNLFTADLMRETLKSSNLGNLKIGSMVNLERALSISGRLNGHIVTGHVDTVGTIVNKNRIMNSNVFKIKIDERYSKYVVSKGSIAVDGISLTVVEALASYFTVSVIPHTELNTTLNFKRIGDSVNIEVDILSKYAEKLLLKKGMKELVLENGF >NC_014410|19857:28775|24711_25179_+|WP_013296600.1|DBSCAN-SWA MRTYEGKLIGDGLKLGIVVSRFNEFITSKLLDGALDALRRHGVDDDSIEIAWAPGAFEIPLISKRMVMSKKYDAVIALGAVIRGDTPHFDYVANEVSKGIAKLSLDFDIPVIFGVLTTDTVEQAIMRSGTKSGNKGFDAAVTALEMVNLIKEIDG >NC_014410|19857:28775|26700_27237_+|WP_013296603.1|DBSCAN-SWA MKSNTKKEILSWVLTIGLAFIIAMLIRTYIFELVDVPTGSMLDTIQLNDKFVELKFIYRFEPIKRGDIVVFKYPDDPSVSFVKRVIGIGGDTIEIKNGILYRNGVPVKEPYLKEPMNKNETFGPYKVPPNHYFMLGDNRNQSLDSRYWKNKYVSRDAIMGKIVFRIWPLSRFGTMVGK >NC_014410|19857:28775|21754_22825_+|WP_013296597.1|DBSCAN-SWA MKRALQLAKLGLGHTNPNPLVGAVIVKNGRIIGEGYHEYYGGPHAEINALKSVKEDVIGAQLYVTLEPCCHYGKTPPCVDAIVKSGIKDVFIAMEDPNKLVSGKGIKHLKEAGLNVYTGLLKEEAEKINEIFIKYITTKKPYVILKSAMTIDGKIATYTGDSKWITNEKSREHVHIMRGCVMAIMVGVNTVIKDNPYLTARIDGFKNPLRVVVDSRGRIPLEANVVIDKSAKTIVATTDMMPYKKVKALRDLGVDVFVLDKLNGEVDLKKLMDMLGERGIDSVIIEGGGTLNYSALKEGIVDKVMFYIAPKIIGGSNSLTPVEGKGIDLIKDAIMIEKLDVKRFDDDILIEGYIKK |
8 | Staphylococcus_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
187275 : 194829
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_014410|187275:194829|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_014410|187275:194829|193470_194829_+|WP_013296752.1|DBSCAN-SWA MDFGNEQNKNIDENEIDNFKMDSNSMNTENISSDNLNNTQEIPATYNQQNSEINHEMPRVEFRSNKKSLGKMVKRFRRRMLVSFVAVALIAALIGGGAVAGIMKYTNIGQQTQVINRYLPLSSDNNNFNLITNIAKIVSPSVVGIDTSVSYSNGYRSALVPEGSGSGIIINSQGYIVTNNHVVDGASKITVNLSDGRKFPAQLIGKDAKTDLAVLKINATNLIPAKLGDSSKLEVGELAVAIGNPLGESFAGTVTAGIISGLNRNLQSDYGPVNLIQTDAAINPGNSGGPLVNSNGEVIGITSVKLTSTGGSDTQDPFGMFQSQSTPVEGMGFAIPINEAKPIIDELIKHGYVERPVMGVSVQEVTSQDAAQYNIPVGLYIAQVQQGSGADAAGLQAGDVITAVDGTKVDTFDSLQSIITKHKIGDTITVTFWRNGRTLTAKVKLMSSSNAQ >NC_014410|187275:194829|190052_191003_+|WP_013296749.1|DBSCAN-SWA MVRHGGAIKIFSGNSNPALAKEIAENLGLTLGDSEVGTFSDGEISVRIKESIRGANVFVVQSTCSPVNDNLMELLIMIDAFKRASAGEITAVIPYYGYARQDRKSKPRDPITAKLVADLITVAGADRVLTMDLHAAQIQGYFNIPVDHLLGGPILAKYFMEKDLGGDVVVVSPDHGSVVRARNFAEKLNAPIAIIDKRRPKANVAEIMNLIGDVRGKIAILVDDLIDTAGTLQQGAQALIDNGAKEVYACATHGVLSGPAIERLIDSPIKELVITDTIPLPEEKKISKIKIRTVAPLLAEAIMRIYEGMSVSKLFV >NC_014410|187275:194829|188676_190050_+|WP_013296748.1|DBSCAN-SWA MDNFYTLILAAGLGKRMKSKHPKVLHKVCERPMVEWVVRSAKEAGAKDVVVVLGHGAEEVKSALGDSVKYAYQEKQLGTGHAVMASKDLLPDTGNIMILTGDTPLIMPETLKKFYNFHLKEQNSITVLSSFFDVPDGYGRIVRDVNGNVLKIIEDKDADEAIKGIHEINSGMYIFNSDYLKKSLQYINNNNAQGEYYLTDAVEIVIRLGGKVGAYSAPNEEIMGVNTRVQLQEAEKAMRRRINKRLMLDGVTIIDPDNTYIGPDVVIGMDTIIYPGTRIEGKTSIGEDCEIGPNSYIIDSEIGNGCRIIFSMITESKLYNNIKLGPFAQIRPESVIHNNAKLGNFIEIKKSVIGEGTKVPHLTYIGDAEVGKRVNMGCGSIVVNYDGKKKHKTIIGDDVFVGCNVNLVSPVKINNNAFIAAGSTITDEVPDGALAIARCRQTNKEGWVEERRKKGGL >NC_014410|187275:194829|187275_188124_+|WP_013296746.1|DBSCAN-SWA MNAYKRYERISVILKILTENPNKLFNLNYFMDLFNVAKSTASEDIDILKSILEKFGLGDIKTVAGAGGGIKYIPINNIDNFHEFMIDICRKLEDPKRIIPGGFLYTADIIYSPQYANKIGEILSYPFQEKDVDAVVTVETKGIPIAMMCARALNVPLVIIRQDNRVTEGSSVSINYVSGSQKQIKAMSLSRRSLERNSKVVLIDDFMKAGGTIKGMIELMNEFDAEVLGAGVMIATKEPEVKVVKNYFSIFTLVEMNEDKETIKMEISDWLMYNMHKNGNNS >NC_014410|187275:194829|188286_188568_+|WP_013296747.1|DBSCAN-SWA MEITDVRVRKINEEGKMRAVVSVTFDNEFVVHDIKVIEGQNGLFIAMPSRKTPEGEFKDIAHPINSETRAKIQTAILSEYEKAKEQDKPQGQE >NC_014410|187275:194829|191790_193212_+|WP_013296751.1|DBSCAN-SWA MSRNRLFRRLLFTNITIIVLTMVILSALFYIMFENYYFRDKEKIMVEEGKQINTILNDYLIGDIDIDRLNQNLNVVDRLINASIWVVSTDGHIYIQSRDFEKNWTGVTLSKDDIKNILRGETIVRRGYFGGRFTQPVLTVGLPLILGGKIQGAIFMHAPIVEMQKTLMDIFFIMLLAISISIFIAFILISYTSKRISNPLKEMSIATEKMAKGDFSTKINVVDDDEIGDLSKSFNAMSSELGRMDNARREFVANVSHELRSPLSTIQGYIDGVVDGTIPMEKSKFYLEIAQKETRRMSRLISELLDITKMESGAFPLNLVEFDINELIRLTIIKMESRINKKDLMVKVDFDSDKDIVEADKDKIEQVLTNLIDNAIKFSNPGGYIHIVTEKSKDKLFIKVHNKGKTIPPDEIDHIWDRFYKVDKSRSGSPGVGLGLYIVRSIINLHNEDIWVTSSDEEGTTFTFTLKLKKVKQ >NC_014410|187275:194829|191105_191789_+|WP_013296750.1|DBSCAN-SWA MGENKKIYIVDDDRNICEIISLYLEKEGFATVRIGDGVTALNKIKEELPLLIILDLMLPGIDGMTLCKEVRKFTDVPIIMLTAKGDTFDKVLGLEIGADDYIVKPFDGKELVARVKAVLRRYEHEENDGDSVTYPDLSISLSEYKVKYKGENVDLTPKELELFYFLCTHPNKVFTRDQLLENVWGYEYMGDSRTVDVHIKRLREKIGDGPNWKLTTVWGVGYKFEVK |
7 | Hokovirus(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
294583 : 347929
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_014410|294583:347929|DBSCAN-SWA TATGAGTACATACCAAGCAATTCAGATAATGATTGCATTTGGGATGTTTACAATATCACTAATCTCCTTGATTGTTAGCCTGATAAAGGATAACAACAAAGGAAAAAAATAATCACCCTGCCCGCCACGCAGAGTGATTAGATAAATTTTTCGCTGTGTGGCGACCGCACTTTGCGGTGCCGATTACCTATGTTTATTATAACACAAAAAAGTGCAAAAGTAAACAATCATTCTATTATTAACACGTTTATGAATTGAACATGCAAAAATTGTATTAAAAGCAGTACGGATTTTTCATTTTCGTTTTACTCAAAACAAAAATCCGAATTTATAACGCACCTCTGCTTATATTTGCAGAAGTGCTTTTAATTTTATGGAGGTGAAAATTTGCTTCTATCAATTATTGTTACTAAACAGATGTCAGAGAAGATAAAAGATATTTTGGAAAGTGGAGAAGATATTGTTTTTAAGCATATTGGTAAACTGGACTCTGAAAGCGTGAAAGATGTATTCTACTCAGCTTCAAGAATTTCTTCTGAGGCTATACTGGTAGATATAGATGTTTTTCCAGGAAAGGAGATTGTTTCTGCACTTCAAAGTTTTAGAATATCAAGGCCAAATACAAGAGTGATCATTATTGCTCCTGAAAGAAAACCAGGCGATGAGATAATTTCTTCTATAGTTGGCCTTGGTATATACGATATAGTTGCAGAGGTAAAAGATTTAGATTGGAATGAGATAATTAATAATGTTTTGCTGTCTACTCCTGCAACATATTCACAGGCTGCAAGATGGCATACAGGGCAGTTTGTAAGTGATGGTGGACGAAATAGAGAAAGAGTAGTAATAGAAGAGAGACCTTCTGGTGTTATTGTTATAGCAGTTGCTGGTGCCGCACATGGTTTGGGATGTACTCATACAGCTTTTTCTTTAGCTTCTTTTCTTTCACGTTCAGGCTATTCGGTAGCTGTTATAGAGGATAACCAAAGACCTGCGTTCTCATATTTCATAAATGTTTTGAAAGCAAAAGAAGGGAAAGTAAAAGATTCGCATGTGATTCATGGAATAGATATTTTTGCATTAAATGAGAGTAAAGACAGAGGTGATTGGAATTTTGATACGTTGGTCAAAGAGATTAAGGCAGGACAATATGAATATGTCATTAGAGATCTTGGTGTTTTGGATTCGTCAAGGATTAGAGAGATGTATAGAGCAGATGAGGCTTTTATTGTTGCATCGGCTGCAAAATGGAGATGGAATGAGTGTATGGATAAGCTTGACAATGAATTTAGTATTATCTTTCCTTTAGCATCAAACAGTGATGTAGATGAATTTTCTTTTTATACATATATTAAAGGAACGGCTTTTCCTTACTGTCCCAACCCTTTCAGTAAAGACAATGATTCGGTCATTTTAAAGCTACTTGATCCGGTATTACCAAATAGACGGAAAAAGAGAGCTTTATTTGAAAAGTTACTGATTTAGAAACAGATTTTGCATTCTTATGTTGTAGATATCTACGTTATTGTGGTATTATATGGATAGAGTAATCGGATATAGCAGGGTGTGGTTGCCACTTTCCCGCGAAGGGAGGTGGTTGCTTATGATGAATACATATGAAACATTGTCTTTAATGATAATGTTTGGAATGTTCGTCATAGCAATTCTTAGTTTTAACAGAAAAAAATAACCACCCTGCTGCAACCAGAGTGGTTATAACTTTATAACTTACGCTGGGCGACCGCACTTTGCGGTGCCGATTACTCTCACTTATATTATAACACGATGAACATAAAAGTAAACAGTATTTTAGTGTTTTGTTCTTAGTTTAATAAAGGGAGATTTATACATGATTTTGAGAAAGCAGCTAAAAAATAGCAAACTTGGGTATCACTTTATTTTTGCAGGTGCTTTACTGATTTCTTTTACGGAAATTATTAGAAGATACATTGTAGTTGGAGATTTCGTAGATGGACTTTGCATAGGAATAGGTATTGGGCTAGAAATCCTTGGAATCATAGCTTTAAGGAAATACTATAATAGTCAAAGAGTGTCTAATCAGTAAATTGAGATAAAATGATTTTCACTACATTTTGTTTGAAAATTATATTGTATAAAATTCTATTATAGAAGTACGGATTTTTCATTTTCGCTTTGCTAATCAAAAATCCGAATTTATAACGCACCTCTGCTTATATTTGCAGAAGTGCTTTTATTTTTTGTATATTTTTTGGGTCTAAATAATGGAAAGTACTCTTGCGAGTACTTTTTTAAAATTTGCCTCCCGCTTTTTGGATTATACGCCTGCTCGGTTTACGGTCAAGAGGTTCGCTTTTGCCGTGTGAGCATATCCTCCTTTCGCTGCGCTTCAGTCCGGTATCCCTCCCACGCCTCTTGACCTTCAATTCGCAGGCTCTGTTTTTATTCCCTGCCGGGAGGCAAATTTAATTTTGATTTGAGCTTAATGTTTTGGGTCTTAGTAGAGTAGCATGTTTCAATATTATGATTTCTTAAAGGGGGATATCGAGATGGAAGTGATTAATGGTTTTGTTAAATGGAATTATGAGACAGACAGATATAACATAGGAGGGTATGATCTGCATTCTGGTGATTTCGTAGATTTATGGGATAATTGGAGTCTTAGATGGATATGTGGCAGGGTCGAGTTTAGAGATGGTAGATATGTATTATTAACAATAGATAAGGAGATCAAAGAGTTTTCTCTGAATCAAAAAGCAAAATTTTATAATATTTAGAAAAAATAACATGAATATGGATGTTTATGATATAATATAAGTGTAATGTTTCAAGAAAATTCGGATATATTAATGTTTTAAAAATAAGGAGTGATATTAAAATGCCAGAAATAACGAGGTTTTATGGGATAGTAATAAAAATGTATTTTGGAGATCATTTACCACCGCATTTTCATGCTATATATGGTGAATATGTAGGTATGTTTAACATAAATACTTTAGAAATGATTGAGGGAGATCTTCCTAAAAGGGCAAGAGAAATGATTATTGAGTGGGCAAGTAAATATCAAAACGAGCTATTAGATATTTGGGAAAGTCAAAAATTCATAAGGTTACCCGGATTGGAGTGATGAGATATGTATAAAATTATTGATGTAAAGGCTGCAGATGATTACAAATTGATTGTTACTTTTGAAAATGGAGTAATAAAAGAATATGATATCAAACAAAAACTTAATGAATGGCCATTTGAACTATTAAAAAATAAAGCATATTTTAGAGCAGTAAAAGTTGACGTTGGAGGGTATGGCATAAGTTGGAACAGTGATATAGACTTAAGTGAATATGAACTTTGGAATAACGGAAAGAGCATAAGTTTGGCTTGATAAAAATGTCAAATAGGACAGCTTTATACAGGAGGGAATATATATGTCATTACCAAAAGAAAGTAAAAAATATACGTATGCTGATTATTTGACGTGGCCGGAAGGAGAAAGATGGGAGATAATAAATGGAGTTCCATATAATATGAGTCCATCACTGGAGCGGAAACATCAGAAAGTTGTAGGAGAATTATTTGCTTATATCCATAATTATTTAAAAGGAAAGACTTGTGAGGTCTATAATGCTCCATTTGATGTAAGATTGCTTGATGAGAATGTTAGTGATGATGTGACAAATGTAGTACAGCCTGACATAGTGATAGTGTGTGATCCGAGAAAACTGGATGATAAAGGCTGTAAAGGAAGTCCTGATATGATTGTAGAAGTAGTTTCTCCTTCAACATTAAAGAGGGATTTAAAAGAAAAATTTTATTTATATGAAAAGGCTGGAGTAAAAGTATATTGGATCGTATTTCCTGATGAAAAAACTGTGCTGTCGTACCATTTAGGCGAAGATGGTAAATACAAAAGACCAGAAGTATATTCAGAAGAAGACAATATAAAGGTAGGGATTTTTGAATCATTGGAAATCGATTTGAAAGATGTATTTGATTATTAAAATGAAAGAAAGGAGCTTTTAAAATGAGAAAAACTGTTTCTATGGTCATTGCGTTTTTACTAATCTTTTTATCCATTCCTGTTTTTGCTTTAGCTTCAAGTCAGAGTGATGAATTACCTTATCAAGACTGGATAGACAAAGGCTGGATAAAAGCAATATCACCTGATGAAAATGGTCATGACAAATTAGGATGGTATAGTATTATGCCGGGTAAAGAAAAAGAAATAGCATATAGCGATAAGCTTAAAAATACGGACAGATTAATTGTTGTAGTTGGAAGCTTTTTAGCAAATAATAATTTAGAATATTATCAAAGTGAAGGTGGTAGTGCGGTTGCGTTATGCGATGTTACTAAACTGAGAGAAAATTATAAAGAATTATATGGCGAAATCAAGTATAATAATCCTGACACATTAAAATACGATTTTTGGAAAGGACTTGTTACAATAAATCTTGTCAGCATTAATGGTACTCCGTGGCAAGAGACGAAATACAAAGATGTATTGCTTCAAAATTTTTATGATAGATGGGAAGGTTTAAAAGATCCTGCATACAATAGATATTTGATTGATCCTAAGTGGAATGGATATACTGATGAATGTATCTATAATTGGGATGGGGTAGATGTTTGGATTGGAAAAGACGACATTACTGTAAGATATGAGCTTAAAGAAAATAAAGGGAAACTGCCGACGGAAGTCATATCCGATAATGGAGTCTCAATGATACCGCTTAGAGGCGTAATGGAAGAATTGGGTGCGACAGTTGATTACGACTCTAAAACACAAGAAATAACCATAAAAGATAAAGGAAAAACAGTTGTATTAAAAGTAGGTTCTGATAATGCAGTAGTAGATGGAAACACTGTTAAAATGCCAAGAAAAGTATATGTCAAAAGTGGATATACAATGCTTCCTCTAAGATTTGTAGCTGAGAATTTAGACCATGCAGTACAGTATTTAAATGATGGGACAATAATGATATGGAGAGCTAAATATACTACGCCTCCGAGTATATAATGCT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46 | Staphylococcus_phage(33.33%) | holin,integrase,transposase | attL 286221:286236|attR 308736:308751 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
803933 : 870786
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_014410|803933:870786|DBSCAN-SWA 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69 | Erysipelothrix_phage(75.86%) | transposase,coat,holin,terminase,portal,protease,tail,capsid,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1374756 : 1384501
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_014410|1374756:1384501|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_014410|1374756:1384501|1383199_1384501_-|WP_013297859.1|tRNA|DBSCAN-SWA MKMNIIRISEMKDFVGEEVTIKGWLYNKRSSGKIKFLIIRDGSGFVQGVVVKNEVAEDVFELCDKLTQESSITVTGVVRKDDRSPYGYELTISSIKLIQMAFNDYPISLKEHGVDFLLDNRHLWIRTPKQHAILSIRHEVIKAIQEFLNNNGFVRIDSPIITPSTCEGTSDLFQIDYFGENAYLSQTGQLYQEAAAMALGKVYSFGPTFRAEKSKTRRHLNEFWMVEPEMSFVDHYENMEIQEKLVEYIVQSVLENRSKELKELGRDLSKLEKIKTPFPRLTYDEAIEILKKNGYEIEWGNDLGSPDETFLSNQFDKPVFITEYPAKCKAFYMQPKEDRPEVVMCADLLAPEGYGEIIGGSQRIHDYDLLIKRLKEENLPLEMYDWYIDLRKYGSVPHSGFGLGIERTVAWITNTEHVRECIPFPRTLSRIRP >NC_014410|1374756:1384501|1377586_1377841_+|WP_013297852.1|DBSCAN-SWA MNQKAAINLQDIFLNQVRKEHIAVTVYLINGFQLKGIVKGFDNFTVVLETDNKQQQLIYKHAVSTITPLKPVIFTTTEKDEKQQ >NC_014410|1374756:1384501|1377913_1378705_+|WP_013297853.1|DBSCAN-SWA MKIGFIGTGNMGTALIKGLINSKYVPSNSICAFDISKDKLMKLKEELGINIGNSNKEIAKECDVIILAIKPNVYNDILLEIKDDIDENKIIIIIAPGITIESVKNILRRGKVVRTIPNTPALIGEGVTAISYPENISSNDKEIVEKIFRSCGEVVEVKENLIDAAMAISSCSPAFVYMFIESLADAGVSLGLPRDVSYKLASKAVSGSGSMVLETGMHPGYLKDMVTSPGGTTIQGVRTLERLGLRSALFEAVISSYEKVKGN >NC_014410|1374756:1384501|1374756_1376583_+|WP_013297850.1|DBSCAN-SWA MNKINLLDDELINKISAGEVVERPASIVKELVENSIDAGSNNITVEIMDGGIPYIKVSDDGCGMDEIDAVLAFGRHATSKIKSINDLFNIETLGFRGEALASIASISKVLLKTKEENSLYGTLINVEGGKIIKKVKCGCPKGCSIEVRDIFYNTPARRKFLKRPSTEAMYITDMVAKIALSRPDISFKYIKDKKIELQTSGNNSVSDVILRLYGDELYSSLVQSEYTNEYLNVKVFLCKPSYTKGNRNMQILFVNGRFVKNKVYNVAIEEVYKTLIPINRYPVVITYINIDPRKIDVNVHPTKLEVKFSDEKEIFDSIYNTIKNALNKSNLIPVVKYEKKFTFSDVDKDYKHEQTQINQFERTTKEITNHSGDVPFIKDETISSSNGSNKNIYFDNDKISETVQDKYISNFNSLPDNNDDKYKLIGVLFSTFIIVEKDDMVYLIDQHAAHERILYERFMSKYNNVQGKQTTIPILVNIEPGDEEIINENIELFNKLGYKFESFGNNSIILREVPVILGQPESRQLFIDIIDKLRNGDFNKDIKLKEENIIMMACKKAVKAMDKLSKEEIKSLFDELKITENPYTCPHGRPVIISIKKYEIEKMFKRIM >NC_014410|1374756:1384501|1379240_1380224_+|WP_013297855.1|DBSCAN-SWA MRISTNNNIELPPILEEFLNYFSTIKARSPNTVKAYEYDLVLFFRFIKVRKNLSSDSDFDQIDISDVDISLIESIDLNDLYAYLSFVTHERSNTPPARARKVASLRSFYNYLYAKRKVITKNPALELESPKLGIRQPVYLTLDESMKLLDSIDGPFKERDYAIITLFLNCGLRLSELANINISDIKDDKLTVIGKGNKQRTVYLNDACISAINEYLKVRPHDGVKDKKALFLSKRLQRISIKTIQYIVKKHLKDANLDGKKYSTHKLRHTAATLMYRYGKVDIRTLQRLLGHSNVSTTQIYTHVDDSQLRDAVSKNPLSELNSNNKN >NC_014410|1374756:1384501|1378706_1379156_+|WP_013297854.1|DBSCAN-SWA MANIPEIDIYTDGACSGNPGPGGWGAVLIYNGIKKEISGYEENTTNNRMELTAVIKALSLLKRSCKINIYSDSSYLINAFNQKWIENWQKRGWLKSDKTPVENKDLWLKLLDLSSCHDIKWIKVKGHSDNEYNNRCDKLATDEIRKHSI >NC_014410|1374756:1384501|1380933_1382226_-|WP_013297857.1|DBSCAN-SWA MMSSENILIEKFNIPKDVIFLLEKAEEDVREEFKKVERLVEKNQYKILYAMQKNHLSDIHFNGTSGYGYGDIGRDTIEKIYSDIFSAEDALVRPQIVSGTHAISLCLYAVLRPNDELISACGTPYDTLADVIGKERDNNTGSLIDFGVTYKEIPLLESGKIDIDKLLGAISDKTKMVMIQRSKGYDFRNSLSINDIKNTIEKIKNKKKDLIVFVDNCYGEFTEELEPTDVGADLVAGSLIKNPGGGLSPTGGYVIGKKELVKNAAYRLYAPGIGKKVGPSLNINRLILEGLFLSPLIVGNALKGAIILSRIMEMLGYDVLPKFNESRTDIVQAVRFKTKEELITFIQSIQKGSPVDSHVVPEPWNMPGYNDQVIMAAGGFIQGASIELSADAPIRKPYTAYIQGGLSYYQVKLSLMIAINNMIEKGFIKI >NC_014410|1374756:1384501|1380282_1380906_+|WP_013297856.1|DBSCAN-SWA MKDKSKISLKQQEIIEFIKSEINRKGYPPSVREIGKAVGLKSTSTVHGHLSRLEKKGYIRRDPTKPRAIEVLNNDKRDLSDVIKLPVIGKVTAGSPILAVENIDEYYSIPRDLIVGYEGESFILKVRGESMINAGILDGDYIIVRKQSYADNGDIIVALIEDEATVKRFYKESDHIRLQPENPSMDPIIVDNVMVLGKVVGVIRKLK >NC_014410|1374756:1384501|1382230_1383121_-|WP_013297858.1|DBSCAN-SWA MSIWPVNFDNYKIERKAKSEENKNIDKDKNLEIEALKELNSLIGLNKVKQIINELYALEQVQIKRKNAGLATDPIVLHMVFKGNPGTGKTTVARILGKLLKGIGVLSKGHVVEVERADLVGEYIGHTAHRVQENVKKSLGGILFVDEAYSLARGGDKDFGKEAIDTLVKAMEDYKDEFILILAGYRDEMEYFLNTNPGLRSRFPIQIDFPDYTIDELLQIAELMVKNRQYILTDSAKRKIMKVLINDNTTREIGNARLVRNIIERAIRKHAVRIMNKKTITKDDLMIIDSIDIRED >NC_014410|1374756:1384501|1376593_1377520_+|WP_013297851.1|tRNA|DBSCAN-SWA MAIPLLIIVGPTASGKSKLSVELAKFYDGEIISADSMQIYKYMDIGTAKITDEEKQGIPHYMIDIVEPNVKFSVAEFEKMAKPIIDDIYKRGRLPIVVGGTGLYIDSLIYIMNFSDYIGNDDFRSALKNIAEVLGNDYLFNRLKVVDPKMFDKLHPNDLRRIIRALEVYQFTGKPISVYQELSSKRMNPEYDVIMIGLNFRDRNKLYKRIDDRVDIMLKNNLVNEVVNLLKIGYNKYDTSMQALGYKEIAEYLDGNVTFDEAISNLKKRTRRYAKRQITWFKSYKIINWFYVDDYIDFEELKKILSVF |
10 | Wolbachia_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1944730 : 1953161
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_014410|1944730:1953161|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_014410|1944730:1953161|1949075_1950296_-|WP_013298407.1|DBSCAN-SWA MEFNHDFENYSMPEDGLKNNRKSLGKMVKRYRRKMFLSFVVVALVAALIGGAAGAGIMRYVSTGQTQVVNRYLPLSSDNNNFDLITNIVKAVSPSVVGIDTYTNGYGAYGNSYVQEGSGSGIIIDSQGHIVTNNHVVDGASKITVNLSDGRKFPAQLVGKDAKTDLAVLKINATNLTPAKLGDSSKLEVGELAVAIGNPLGDSFAGTATAGIISGLNRNLQSDYGPVNLIQTDAAINPGNSGGPLVNSIGEVIGITSIKLTSTGSSSTQDPFGLFQSQSVTLEGMGFAIPINEAKPIIDDLIKNGYVERPVMGVSVQQITKQLARQYNIPVGLYIAQVQQGSGADAAGLQAGDIITAVDGTNVTTFNQLENILNKHNVGDIISVTIWRNSKTITVNVKLMSSSSVQ >NC_014410|1944730:1953161|1952492_1953161_-|WP_013298410.1|DBSCAN-SWA MAKVLVIEDEEGMRDILKTYLEKNNFDAFFAEDGNTGIDMFKNNSFDIVLLDVMLPDMSGWNVLKTIRESSKIPVMMITARSEEYDRLLGFELGADDYVVKPFSPREVVARIKAILSRSKWAESDNLISFSGITIDTDSRVVKVDGKKIDLTPKEFDLLSLLAQNMGKALSREKCLNVVWGYEFFGDLRTVDTHIKQLREKLGDKRDIIKTVWGYGYKLGGD >NC_014410|1944730:1953161|1951141_1952491_-|WP_013298409.1|DBSCAN-SWA MRGIRKKLFITYLIITGIIFLLFYLSQVVFIGKIYTYYKINQLKNYSLKIANALAKNDDKTANELMEESNSKVIVVTDTGNLIFGTHGNGQGYGIGLPKTYLNTDEKLSVVEFTHPSIGVKSLAVIRAFLYNKQNAKLVLTIPLSTITDTTVIFKSEFLLMLLICIVVIIIMSIVMSKKLTKPIDDLKYAAQNIASGNLDVKLDVNTNDELEDLAMSMNSMAENLSKAEKFKRDLIANITHDLKTPLGLIKGYCEMLLDFYGEDKEKRNKYLNAALNEVDRMSKMIDDVLSLSKFQSGLVKLKISSFNLKSLVDDVVLSFEPLLHGKNINIVMENLDVIVNGDAELIRRVIMNLLSNSIKSISKSGLITISAILENNHVKVIVSDTGKGIKREELPNVFKKFYKGDKSGIGLGLAIVKEILDLHGSEYYIESEINKGTLFYFTLNKADI >NC_014410|1944730:1953161|1947927_1948908_-|WP_013298406.1|DBSCAN-SWA MIYIYNRITDPYFNLASEEYILKEFKDDCFMLWRNEPSIIVGKNQNALAEINLDYVKEHNIPVVRRLSGGGAVFHDLGNVNFTFIVNDDLNRFNDFRRFTQPIIDVLRKLSLNAEFSGRNDITIDGKKISGNAQYYYKNRILHHGTLLVSSNMADLSAALKVRPIKFEDKGVKSVSKRVTNINEHLKEPIGIEEFINLIMNDIRERTGGSGLYEFTGEDIKNIEKLKNEKYSTWEWNFGMSPDYSLKNEKKFLGGTLEVVLNVENGIIKDMKIYGDFFGKKDVKDIEEILKGVKHSESGVRDALSSVDINEYFANISLENLIDVLF >NC_014410|1944730:1953161|1946439_1947894_-|WP_013298405.1|DBSCAN-SWA MNIEVKVPTEEVSQESTLNNTGVYNNEAKEYDLAVIGGGPGGYVAAIKAAKKGAKVALFEKDRLGGTCLNRGCIPTKAYARVAEVYDIIKRADEFGFDVDVKLFDYKKVVERKDNIVNELVSGINTLLKANGVDLYSEEAKIDKDKNILFGENKIKAKNIIIATGSEPAELPIEGVKSENVINSNDILEITALPESMCVIGGGVIGMEFAFIMNQFGVEVSVVEMMPNILPSLDREVSNVIKSEARKKGIKVYTSSKVEKIFDEENGGSIVTISKNNETKCIYADKVFISIGRKLNTDVGPISELLEFDGKAIKVDEYLRTNVDNVYAIGDVTNKMMLAHVASAQGEAAVDNIFGDNVALDYMKIPAAVFTEPEIGYFGYTEEEAKSKFENVKVGKFYFAANGRAKTYGETKGFAKIISSEDGDVLGAWVVGSDASEIAQIISTSRQSGANAEELKKAIYTHPTRSETIMEAVKDIFKESIHKV >NC_014410|1944730:1953161|1950473_1951067_-|WP_013298408.1|DBSCAN-SWA MNSIFSCAVCPNKPCAKGDDNFPKNCPTVMEKEIIEKSIERYNVDENINKIMKIANKLPVTEDGELRSRAEEIIDLVKQMNIKKIGVAFCYSLEKEAKKFVKMLENYDITVVPVCCKVGSVDVKEIGIEKKRDKFIATCNPLTQAEIMNKENTELNVVVGLCVGHDMIFNKNSETYVTTLIAKDRKYAHCPAKAFEE >NC_014410|1944730:1953161|1944730_1946182_+|WP_013298404.1|DBSCAN-SWA MNYDKLIFEVSKPGHTSYSLPPLDVEDIQLEEAIPDKLLRHTELNLPEVSEVELIRHYTNLSYKNYSVDKGFYPLGSCTMKYNPKVNEDIANFKEFTNIHPLQSENTVQGALKLMYDLQEMLKEITGMDGISLQPAAGAHGELTGMMIIKAYFEDIGEYNRKKMIVPDSAHGTNPASAATAGFDVVEIKSGNDGLIDIDALKSVLDDDVAGLMLTNPNTLGLFEKNILEISKLIHDAGGLLYYDGANMNANMGITRPGDMGFDVVHINLHKTFATPHGGGGPGSGPVGVKGKLADFLPVPIVEKNDDMYYLKHDLPHTIGKVRSFYGNFNVMVKAYAYILSMGADGLKAASSLAVLNANYVKEKLKEYYELPFDTICKHEFVFSGLKSKANDITTLDVAKRLIDYGFHPPTIYFPLIIDSALMIEPTETESKETLDEFIEAMKAIAKEADENPEILKTAPHNTPVRRLDEVKAARNPIVKANV |
7 | Bacillus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2103171 : 2112671
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_014410|2103171:2112671|DBSCAN-SWA 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AGCATAATTTCTTATCAAAACTTCAATAGGATAGATTTCTACTTTTTTCACAAGCATTTCTCTATCATTTAACCTCTTTACAAAATGCGTAGGAACGCCTTCTTTTTCAAGTAATTCAAATAGTATTGTAGATATTTCATTATTTAATATCCCTTTATTTTGAATAGTGCCTTTTTTTATGCCGTTAAATGCTGTAGCATCATCTTTATATTCAATAATGTAAAAATCTTCATCACTTGTCCTAAAGACCTTTTTTGCTTTTCCTTCATACAACATGCTTAACTTTTCCATTTAAACAATCTCCCCCTGTAATTTTTTATCTTTTTCAATAACTTCTTCTGCTAATTTCTTTTTGTACGCAATAACTTTTTTCATCAGCTCTGGATACTTTATGCCCAGTATCTCTATTGCCAACAACGCTGCATTGTAAGAACCATCTATAGCAACTGTCGCGACAGGTATGCCCTGAGGCATTTGAACAGTAGACAATAAAGAGTCTAAACCATCCAGAGTCGATGATTTTATAGGAATCCCAATCACTGGAAGTGGCGTCATTGATGCTATAACACCTGCTAAATGAGCTGCCTTTCCAGCTGCAGCTATGATTACTTCATATCCATTTTCTACTGCTTTTTTTGCAAAATCATGTGCTATATCTGGTGTCCTGTGAGCTGAAATAACTCTGGCATCATACTCAATATTAAATCCCTTAAAAAGCTCTAAAGCCTTTTTAACCAATGGAAAATCCGAATCACTTCCCATTACAACCGCAACCTTCGGCATAATAACTTCCCCCTATTTTTATTTATTTTTATTTACAAAATGCAGAAAGGAAATCTTTCCTTTCTGCATTTTATCCGCTATTACCCCATAAAGAATGCAAATCTCAATAGGAACAATAGTCCTATAATATACATCAATGGATGAACTTCTTTAGCTTTCCCTACGACAATTTTCGTTATCGGGTAGAAAATAAAGCCAGCAGCTATACCATTTGATATGCTGTAAGTGAAAGGCATAAAAGCTATTGTCATAAACGCAGGAAATGCCTCACTAAAGTCTTCAAAATTCACCTTTGTAACTGAACCTATCATCAATGCTCCAACGATTATAAGGGCTGGTGCTGTAGCTTGTGAAGGTACTATGCCAATTATTGGAGCAAAGAATAGAGATATCAAGAAAAGTATTGCAACAACGGTAGATGTCAAACCTGTCTTTCCACCTTCACTTATGCCTGATGCACTTTCAACGTATGTGGTAATTGTACTTGTCCCCAAAAAAGACCCTATCGTAGTACCAATGGCGTCTGCAAACAGAGCCCTTTCAAATCTAGTCTTAAAACCGCCATTTGATTTTTCGAAGTCATCTTCTTTAAAAATACCTGTCTTTGTTCCTGTACCAATTAATGTTCCAATGGCATCAAACATATCCGCCAAACTAAAGGCCAAAATAACCGTTATGAGCCCTGTAAGGATTGAAATGATATTGCCATCTGTCCCTGGTTTCAAAAGACCAGCAAAATCCAACTTCATAAATGTAGGTGCCAAACTCGGTGGCATCTGCACAATAGTTTTCAGATTTGAAACATTAGTTATTCCCATAGGTATACCTATTAAAGTAGAAGCAATGATTCCTATAAGTATTGCACCTTTAACACCTCTGCTCATAAGTACAGCTATTATAGCAATGCCGATTACAGTAAGTATTACACCAGGATCTTTGAAATTGCCAAGTGTAACTAAAGTGTCACTGCTTTTCGTTATTATACCACCGTTTTCCATGCCTATTATGGCGATAAAAAGTCCAATTCCGGCTCCTATTGCGCTTCTCAACGATTGTGGTATCGCCTTAATTAGTGAACCTACTCCATCCTATAGAGGATGAAGCTTCCTACTTCATAGACCGTTGCCTACTGTTATTCACAGCAGGTCTTACACAATCTCCATAGGCGTAATTTCGGGAGGAACCTTCCCTACAAAAATATTACTCTTAGGCTGTTATGCCTAATTGTCTTTACTTTTTACTCCTGATAATATTATAGCATATAATGTTATGGAAAACAATAGAAATTCATCTCCCACCTATAGAGGATGGGAGACTTCTTTCAAGCCTTCGTTAAAATTCTCAATTTCGTTGCCGTAATGATTATATTTATAATACCGCTTATCAGCGCAAGTGACAATGCTGCCTGCCATGAATAGTGCAGTGTCAATACGACATAAAAAGTAAAGAATGCATTCATACCCATTCCAGCAGATAGGGCAAACGGAACATTTGCAAACAATCCCATGACCAATGTCGCAACAACAGATGACAAAATTGTCGCAACAAATACCGCTCCGATTACAGGATCATTGGCAATTGACAAACCAGAATTTACTGCTTGAGTTCCTAAAAGTCCTTTTGAATTCATTCCGGCTTGCATGAGTATTGATGGGTTTACAAAAATGATATAAGCCATCGTTATAAAAGTTGTTATGCCAGCTATTACTTCTGTCTTTACTGTTGTGCCATTTTCTTTAAGTTTAAAGAAACTGTCTAAAAAGCCTCTCTTGTCATTGTTTTTTACCATTATAATCCTCCTTATAATTGTAATAAAAGCACTATTAAAATAAAATATGCCCGAGATGATAGATTCCAACACAAAGAGTGAAACCTATCCTCCCGGGCTTTTATCCCACAGGTGTGGCAACAGCATGCCTGTACCGCTCGGTCCGAACACCTTTAAAAAAACTATCCATGCTTTTAAAAATGCTAAAAGCATACAAGGCTGGAACCCTCAGGTACACTTTCACTCATAGTCAGACAATTTACGGTTGTCTGGTAGAAACTTCTGAGCCATATTCTCAGAATTATATGAGTAGTATTTACTTGTCCTGACACAATTATAATATCAACTTTTTTAATCCAAGTCAATGATTTTACGAATATTTTTTTGATATTTATAATTAATGTTCGTAATTTATTCCCATTCAATGGTGGCAGGCGGTTTTGACGTGATATCATACAGCACTCTATTTACGCCATACACTTCATTTATGATACTTGTGGAGATGTCCTCAAGAATATCATACGGAATCTTAACCCAATCTGCTGTCATTCCGTCATTACTTTCAACTATCCTTAAGATAATAGGATATGCATATGTCCTGTCATCCCCCATTATTCCTACACTTTTTATGTCAGGCAGTACAGCAAATGATTGCCATACGTTGTTATACCAGCCATTTTTCTTCATCTCTCTTAAAACTATACTGTCAGCTTCTCTTAATATATTTAATTTTTCTTCAGTGACTTCCCCAAGTATCCTTACTGCAAGCCCCGGTCCCGGGAACGGCTGCCTATTTAGAATTTCATCAGGCATGCCAAGTTCTCGCCCAACCTGTCTTACTTCGTCTTTAAAAAGCATCCTTAAAGGCTCTATAAGCTCAAAACCAACATTTTCAGGAAGACCGCCAACATTGTGATGGCTCTTTATTGTTGAAGCAACGGGGCTTCCGCTTTCGATAACATCTGGATAAAGTGTCCCTTGCACAAGATATTTTACATCGCCAATTTTCTTAGCTTCTTCTTTAAAGACTTCAATAAATTCATTTCCTATTATTTTCCTCTTTTGCTCAGGATCTTTTACTCCTTTCAACTTTTCCAGAAATCTATCTTTTGCATCAACTTTTATTATCTCCATATCAAAATTATTCTTGAAGGTTTCAACTACTTTTTCTCCTTCATTTTTCCTTAAAAGACCATTATCAACAAAAATACATACTAGCTGATCGTGTATTGCCCTGTTAACTAAAACTGCAGCAACAGATGAATCAACACCACCGCTTAATGCACAAACTACATTGTCCTTTCCTACCTTTTGCCTTATTTCTTTGACAGTCTGCTCTATCAGTGAATCCATCGTCCAATCTGCAGAGCAGTCACAAATCTCAAACAAGAAATTTCTGATGATTTCAGTACCCCTTGGAGTATGAATGACTTCAGGATGGAATTGTACGGCATATTGCCTTCCTTCTACATTTGCAATTGCCGCAATCGGACAGTTTGCAGTTGATGCAACGACTTTAAAATTTTTGGGAGGCAGTTCTATTTGATCTGTATGGCTCATCCAACAGCTTGTCTCTTTTTCAATTCCTTTAAACAAAGGTATATTGTTATTTATGACAACATCCGTCTTTCCATACTCTCTTACAGGAGCCTCCGCAACTTTACCGCCTTGCATCATAGTCATAAGTTGTGCGCCATAACATATACCAAGAATTGGATAATTTAATTTAAAAATTCCCTCATCGCATATTGGCGCATTCTCTGCGTATACGCTAGCAGGTCCGCCTGACAAGACCAATCCTTTTGGCTGTTTCTTTATAATTTCTTCTGGTTTTATGTTGTATGGAACAATTTCACAAAAAACATTTGCTTCCCTTATTCTCCTTGCAATCAATTGTGTATATTGTCCGCCGAAGTCAAGAATTAATATAACTTCTCTATTAATCCCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_014410|2103171:2112671|2103171_2104698_-|WP_013298552.1|DBSCAN-SWA MSKRALISVSKKDGILDLAKSLDELGVEILSTGGTYKLLCDNSIKAIKVSDITGFPEILDGRVKTLHPKIHGGLLAIRDDENHMKQLNENGIEPIDIVAVNLYPFKETILKDDVMLEDAIENIDIGGPSMIRAAAKNYKYVTVLVDPSDYTKVIEEIKEYGNTKEETRFYLAMKAFGHTASYDSLIYNYLLDKNGVEFPDTITLSYEKSQDMRYGENPHQKAAFYKNSLKSFGISECIKLHGKELSFNNINDANAAIELLKEFDVPAAVAIKHTNPCGVAVADNIYDAFKKAYECDPVSIFGGIVAFNRTLDKRTAEELSKIFLEIIIAPDFEEDALNILEKKKNVRILKLKDGYVKEYDVKKVEGGILVQEKDEVDLYEDKLKVVTKNAPDEKEFKDLRFAWKVVKHVKSNAIVLAKDGATVGIGAGQVNRIWPTQQSIKQAGEKAKGSVLASDAFFPFSDVVEAAAKAGVASIIQPGGSKNDEASIDAADKAGISMVFTGIRHFKH >NC_014410|2103171:2112671|2108461_2108953_-|WP_013298557.1|DBSCAN-SWA MPKVAVVMGSDSDFPLVKKALELFKGFNIEYDARVISAHRTPDIAHDFAKKAVENGYEVIIAAAGKAAHLAGVIASMTPLPVIGIPIKSSTLDGLDSLLSTVQMPQGIPVATVAIDGSYNAALLAIEILGIKYPELMKKVIAYKKKLAEEVIEKDKKLQGEIV >NC_014410|2103171:2112671|2106346_2107744_-|WP_013298555.1|DBSCAN-SWA MNKTIKLKEECGVFGAFSLNNVVHHHIYYGLQALQHRGQESAGIAVLKGSYVNCIKGMGLLLEVFSKEELDELEGNVAIGHVRYSTTGNSDVCNAQPFVANFSNGYMALAHNGNLINALELRRELEDEGRILQTTSDSEIILHLIAKYYRYGLVESLKKTMNKIKGSYALVIIMEDKLIGIRDKNGIRPLCIGKKGDDYYLSSESCALDVIGAELVRDVEPGEIVIIDKNGLNTVKVDSDAAKMPCVFEYIYFSRPDSVLEGISVYKARYEMGKRLAIESHVDADLVVPVPDSGVPASRGYSFQSGIPIGEGLIKNKYIGRTFICPKQTDREIGVRVKLNVLKELVRDKRIVLIDDSIVRGTTMKRLVSLLKKGGAKEVHVRISSPPVKYSCYFGIDTPTKKELVGATMEVKEICDYIGADSLSFLSIEGLKESVGMSSICAACFDGKYPMEVPKEGSKYLFEKK >NC_014410|2103171:2112671|2111132_2112671_-|WP_013298558.1|DBSCAN-SWA MGINREVILILDFGGQYTQLIARRIREANVFCEIVPYNIKPEEIIKKQPKGLVLSGGPASVYAENAPICDEGIFKLNYPILGICYGAQLMTMMQGGKVAEAPVREYGKTDVVINNNIPLFKGIEKETSCWMSHTDQIELPPKNFKVVASTANCPIAAIANVEGRQYAVQFHPEVIHTPRGTEIIRNFLFEICDCSADWTMDSLIEQTVKEIRQKVGKDNVVCALSGGVDSSVAAVLVNRAIHDQLVCIFVDNGLLRKNEGEKVVETFKNNFDMEIIKVDAKDRFLEKLKGVKDPEQKRKIIGNEFIEVFKEEAKKIGDVKYLVQGTLYPDVIESGSPVASTIKSHHNVGGLPENVGFELIEPLRMLFKDEVRQVGRELGMPDEILNRQPFPGPGLAVRILGEVTEEKLNILREADSIVLREMKKNGWYNNVWQSFAVLPDIKSVGIMGDDRTYAYPIILRIVESNDGMTADWVKIPYDILEDISTSIINEVYGVNRVLYDITSKPPATIEWE >NC_014410|2103171:2112671|2105319_2106330_-|WP_013298554.1|DBSCAN-SWA MNYKDAGVNIDEGNKFVEMIKPIAKTTMIDGVLNGIGGFGALYEIKNNKNPVLVSGTDGVGTKLKVAFMMEKYDTIGIDLVAMCVNDIIVSGAKPLFFLDYFATGKLDGSVGLEVIKGIAEGCREAQCALIGGETAELPGMYNKGEFDLAGFAVGVVEKDEIIDGSNIKPGDVIIGLASSGIHSNGYSLVRKVLFEEGNMNIDDYLDEYGLSLGEVILKPTKIYVKALDSLKGLTIKGIAHITGGGFIDNIPRTLKDGVSAKINKGTWDVPYIFTVLKEMGNIDENEMYRTFNMGIGMIIIVSREQCDDAVKRLKAIGEKPYIIGEIVNGKKEVLI >NC_014410|2103171:2112671|2104714_2105323_-|WP_013298553.1|DBSCAN-SWA MRLLVMASGNGTDFQSIIDGIKSGYINAEIAALISDKEGAYALKRAADNNIPSICVPKKKLKGRFYEELMKVVDKINPDGIILAGFITILNEEIVNKYQNKIINIHPSLIPSFCGKGFYGINVHKAVIEYGVKYTGCTVHFVDAGADTGPIILQEVVKVEDNDTPETVADKVLKLEHRLLPYAVKLFAEGRLKVEGRKVIII >NC_014410|2103171:2112671|2107753_2108461_-|WP_013298556.1|DBSCAN-SWA MEKLSMLYEGKAKKVFRTSDEDFYIIEYKDDATAFNGIKKGTIQNKGILNNEISTILFELLEKEGVPTHFVKRLNDREMLVKKVEIYPIEVLIRNYAAGSISKRLGIEEGAKLKRTVLEFCYKNDELGDPFINEYHIEAMELATKDEVETIKNYSFKINDILSKYFISKNIILVDFKLEFGKSKDGIVLADEISPDTCRFWDSVTMEKLDKDRFRRDLGNVEGAYVEVLNRLEKQ |
7 | Synechococcus_phage(42.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2705012 : 2757478
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_014410|2705012:2757478|DBSCAN-SWA 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39 | Bacillus_phage(33.33%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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