Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_017358 | Helicobacter pylori Cuz20, complete genome | 1 crisprs | cas14j,cas2,c2c9_V-U4,DEDDh | 0 | 0 | 2 | 0 |
1. NC_017358
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_017358_1 | 399565-399684 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_017358_1
|
1 spacers
spacers of NC_017358_1
>1.1|399595|60|NC_017358|CRISPRCasFinder TATCGCCAAAAAGCAAGAAGAAACCCAACGCCAAGAAACCCCAGAGGGCAAGCATGATGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017358_1
The CRISPR arrays of NC_017358_1 >merge|NC_017358|1|399565-399684|CRISPRCasFinder AGAGAGGCTCTCTAGCGTTACTGAAGAAATTATCGCCAAAAAGCAAGAAGAAACCCAACGCCAAGAAACCCCAGAGGGCAAGCATGATGGAGAGAGGCTCTCTAGCGTTACTGAAGAAAT >NC_017358|1|1|399565-399684|CRISPRCasFinder AGAGAGGCTCTCTAGCGTTACTGAAGAAAT TATCGCCAAAAAGCAAGAAGAAACCCAACGCCAAGAAACCCCAGAGGGCAAGCATGATGG AGAGAGGCTCTCTAGCGTTACTGAAGAAAT
>NC_017358.1|WP_000699928.1|398847_399186_+|hypothetical-protein MKIMHQVRDFLDSCKQTIQKNSNEALQKTKRALFKEKSQKIREQAVKIVEKRLKKEGMKLSDFNEEELKIMFEAEEKRLLEQIHAKESEENQEKSVKHFKEVWEKGDNEQER >NC_017358.1|WP_000599165.1|397210_397615_+|Holliday-junction-resolvase-RuvX MILACDVGLKRIGIAALLNGVILPLEAILRHNRNQASRDLSDLLREKNIQVLVVGKPNESYADTNARIEHFIKLLDFKGEIVFINEDRSSIEAYENLGHLGKKNKRLAIKDGRLDSLSACRILERYCQQVLKKC >NC_017358.1|WP_000841120.1|396413_397214_+|DNA-protecting-protein-DprA MKSNFQYSALENIPKAFGILKDPPKKLYCVGDTKLLDAPLKVAIIGTRRPTPYSKQHTITLARELAKNGAVIVSGGALGVDIIAQENALPKTIMLSPCSLDFIYPTNNHQVIQEIAQNGLILSEYEKDFMPVKGSFLARNRLVIALSDAVIIPQADLKSGSMSSARLAQKYQKPLFVLPQRLNESDGTNELLEKGQAQGIFNIQNFINTLLKDHHLKEMPEIKDEFLEYCAKNPSYEEAYLKFGDKLLEYELLGKIKRINHIVVLA >NC_017358.1|WP_000051412.1|396168_396402_+|cell-division-topological-specificity-factor-MinE MSLFDFFKNKGSAATATDRLKLILAKERTLNLPYMEEMRKEIIAVIQKYTKSSDIHFKTLDGNQSVETIEVEIILPK >NC_017358.1|WP_001019023.1|395365_396172_+|septum-site-determining-protein-MinD MAIVVTITSGKGGVGKSTTAANLAIGLAESGKKVVAVDFDIGLRNLDMILGLENRIVYDVVDVMEKNCNLSQALITDKKTKNLSFLAASQSKDKNVLDKEKVAILINALRADFDYILIDSPAGIESGFEHAILHADMALVVVTPEVSSLRDSDRVIGIIDAKSNRAKKGMEVHKHLIINRLKPELVANGEMISIEEVLKILCLPLIGIIPEDSHIISATNKGEPVIRTDCESAKAYQRITRRILGEEVEYVEFKAKKGFFSALKGIFS >NC_017358.1|WP_001207784.1|394349_395342_+|ketol-acid-reductoisomerase MALPVYYDKDIDLGVIQSLQVGIIGYGAQGEAQALNLRDSKVRVRIGLYQGSLSVPKVKAEGFEVLEVKELVQQSDVIMALLPDELHKEVLEKEVIPFLKEGQIVGFAHGFSVHFNQVVLPKGVGAILVAPKGPGSALREEYLKNKGLYHLIAIEQESSKNNAKAVALSYAKAMGGGRMGVLETSFKEECESDLFGEQAVLCGGLEAIVRMGFETLIKAGYPEELAYFECVHEVKLVADLLHYKGVEGLRKHISNTAEFGAIKAREPMGNLLEKRMQKILKKIQNGSFAKDFLLEKSLNYPRLNTERKALKETKIEQIGEILRAPFNHKK >NC_017358.1|WP_001168223.1|393320_394103_-|NAD+-synthase MQKDYQKLIAYLCDFLEKEAQKRGFKKVVYGLSGGLDSAVVGVLCQKVFKENAHALLMPSSVSMPESKTDALNLCETFSIPYTEYSIAPYDAIFDSHFKDASLTRKGNFCARLRMAFLYDYSLKSDSLVIGTSNKSERMLGYGTLFGDLACAINPIGELFKTEVYELACHLNIPKKILNKPPSADLFVGQSDEKDLGYPYSVIDPLLKDIEALFKNKPIDAETLIQLGYDEILVKNITSRIQKNAFKLELPTIAKRFNPK >NC_017358.1|WP_000833955.1|392385_393324_-|tetraacyldisaccharide-4'-kinase MKSDKPFLERYFYDPTLLQKGLIFALYPFSLIYQGIATLKRKTAKKHDFKIPLISVGNLIAGGSGKTPFILETAPRYQEVAVISRGYQRDSKGLVVVSVKGNILVSQQTAGDEAYLLALNLKQASVIVSEKRELGVLKALELGSKIVFLDDGFRFNFNQFNLLLKPKVPPYYPFCLPSGLYRESIKSYKEAHLVITEDKDYKRITSISHPTKRMLLATAIANPSRLDAFLPKEVVKKLYFRDHAPFDLKLLEKEFYQNNATSLLVTSKDFVKLQDCNLPLSVLDLKLEICPKILEQIDRYILSYPCNTKEHL >NC_017358.1|WP_000742580.1|391910_392453_+|UDP-4-amino-4,-6-dideoxy-N-acetyl-beta-L-altrosamine-N-acetyltransferase MKKNYCYKNIQAIDFAHLNDEEKLLVLEFRNHPNTALWMYSAFISLKTHLQFIEDLKNSPNHRYFLFKEEGVYLGVGSITKINFFHKHGYLGIYKNPFLKNRGETILKALERIAFEEFQLNSLHLEVMENNFKAIAFYEKNHYELEGRLKGFISKEKEFIDVLLYYKDKKGYNDRSVLKF >NC_017358.1|WP_079991976.1|391020_391914_+|CMP-N-acetylneuraminic-acid-synthetase MQPFEKRMPVKILCDCFLTSGLGHVRRCEKILSFIEKLGVKADLYLYKHNNISAFLEGVGNDDFLIIDSYCLNSKDFYLLKEKAKSLMVIEDKEHVKGFYPKNTKIMNFTLNALKHYHYLSKDYQYYLGVGFYPVDIRFVYERPINTENKEVLITLGGSEQKTLKEIVKILENKGMHLHIISSHIPKNPPKNTHYYSPLNPLEFSSLMKFCACAISAAGQTLYELALSQTPSLIIPIASNQIIQSQEFESLGIFKQTSLKTLAKDFENLQIQKKQIWAKNLAFGSELEGALREFLEI >NC_017358.1|WP_014534202.1|399747_399966_+|lysozyme MLCLSKLILVASFLIVDSEGFSPSVYTDKTEHPTIGYGYNLSVYSYEGKRITNKGREILKEYLNESCILLGE >NC_017358.1|WP_041199234.1|399977_400046_+|hypothetical-protein MLKSFKKAFFRALCLGMLGLLG >NC_017358.1|WP_014534204.1|400195_400561_+|DUF1294-domain-containing-protein MGLRINLKILPSLFLSLKPSGRAVKTLLKGMEFVFIVWLLIVNILIFILMLVGKNSAEQKMWRIPEKALWVLSLLGGSVGFLLAMVVSHHKILKLKFKYGVSLICLIERAILYFANKDLFG >NC_017358.1|WP_000426613.1|401447_402536_+|hypothetical-protein MENDVKEDLEQAKQKLEPEKQKQELEKLTQEKEQEIKKKEGRKYIYIFSGIIIVLFMLYPILSIITYNEPSQAIKTAHTKTILEILPDPISDLIKNNLDSHQQEISDLLSSSKDKMYSKVDAQIDNLFDPIENNVDKFLDWHYSLKGNYSELALLAAKTIGSSAEDALFNKLQEKLLGADYKQRLKTMTDNISDAYISLLRQHKKDTEKIATQGVAGIPQVAESLKNIDDRIERDLKLKMGFAAAIGATAGVGAGKLMERLAPKLVKKLGTKLGAKFLAKFGIAVGGVLPTLGADVAFNYIDEWLHRDDFKKEILNNINEAKKNLKESYKTDFDNSITKFSEKIQENFIETISVQAHMKKLK >NC_017358.1|WP_001117111.1|402579_403461_-|RluA-family-pseudouridine-synthase MPFVEEEFEILKPTKALFFVHDILKCSLKEAQRHLDKQRLKQNQQAVRKSQMIQGVVSLIHFKPNEKTQALVFETKDFGVFDKPPQVYTHPKGYFYHESLLDCIQSHFGKNAHPAHRLDYETSGLVLAGKTLQSAKDLKTLFMQKKVKKTYLALAHGLVDKNIVIDKPILTPQNIQKDLRIRSKISPLGKPSTTLVEPLSYNAFFDISLLKITPLTGRTHQIRLHLSSVGHRIVGEGLYGVIDENAREYLQLKRENNAPLLMLHASSLAFEFKGAIHEITSPMPKRFMPFLKD >NC_017358.1|WP_000810778.1|403460_405011_-|single-stranded-DNA-specific-exonuclease-RecJ MKQKLKAQIKERVASIAYNEKGFPSPFLFKDLKKAALKIIEAMRANTEILVVGDYDADGVISSTIMAKFFESLNYKHVRIVIPNRFIDGYGISKKFLEKHHAPLIITVDNGISAFEAARFCKEKNYTLIITDHHCLHHDEVPDAYAVINPKQPDCDFIQKEVCGALVAFYLCYGIHQLLGKEKSHSSELLCLAGVATIADMMPLTFFNRFLVSKALYFLQKESLGAMGFLRQREVFRKRSLKASDISFSIAPLINSAGRMQDAKMALDFLSANNFQDGYFLYERLKACNIKRKMIQQQVFEEAFKHAMVGEKIIVAFKDDWHEGVLGIVASKLVKATQKPSLVFTFKEGVYKGSGRSSSNIDLIDALNGVSSLLLGYGGHRQACGLSVGKNNILSLFETLENFDFKILPFCEKEPPLTLTLKDIDRELLEIIEAGEPYGQENPEPLFQAQNLEVIEEKIIKESHQVLRFKDKECVKEAIYFNTERFLKAGEKVSAIFSVELDEYSNEPKMFVKSLL >NC_017358.1|WP_000373227.1|405020_406637_-|CTP-synthase-(glutamine-hydrolyzing) MDRAKFIFVTGGVLSSLGKGISSSSIATLLQHCNYQVSILKIDPYINIDPGTMSPLEHGEVFVTSDGAETDLDIGHYERFLNRNLTRLNNFTTGQIFSSVIENERKGEYLGKTIQIVPHVTDEIKRRIKSAAKGLDFLIVEVGGTVGDMEGMFYLEAIRQLKLELGNEKVINVHVTLIPYIQTTNELKTKPTQHSVQELRRLGVTPQIILARSPKPLDKELKNKIALSCDVEQDSVIVATDTKSIYACPILFLQEGILTPIARRFNLNKLHPKMAAWNTLVEKIIAPKHKVKIGFVGKYLSLKESYKSLIEALIHAGAHLDTQVNIEWLDSENFNEKTDLEGVDAVLVPGGFGERGIEGKICAIQRARLEKLPFLGICLGMQLAIIEFCRNVLGLKGANSTEFNQRCEYPVVYLIEDFIDQNHQKQVRTYNSPLGGTMRLGEYECEIVPNSLLEKAYKKPSIKERHRHRYEINPKYRQEWENKGLKVVGFGANHLIEAIELDDHPFFVGVQFHPEFTSRLQSPNPIILDFIKSALHKS >NC_017358.1|WP_000829954.1|406894_407557_+|membrane-protein MAENSFKNVTIQSKPFFLSQVKTLFLLGGVFSAFFILMVGLVFFDYANSMDNAIFSLMRSNSSNPILDQTLQRIVFLGSSQFVLPLSLLVGVFLSLYRRNLALGVWFVLSVILFEALLESLKYLLAHSIQWFSHSANFPNATALSLALFYGLLVLLIPHLITHQTLKNILSYSLFGLILLIGLALIVLGVSFSSVLGGFCLGALGACFSIGIYLSVFQKI >NC_017358.1|WP_000364763.1|407600_409304_+|flagellar-basal-body-M-ring-protein-FliF MDLKVLLQRIVDFFIKLNKKQKIALIAAGVLITALLVFLLLYPFKEKDYTQGGYGVLFERLDSSDNALILQHLQQNQIPYKILKDDTILIPKDKVYEERITLASQGIPKTSKVGFEIFDTKDFGATDFDQNIKLIRAIEGELSRTIESLNPILKANVHIAIPKDSVFVAKEVPPSASVMLKLKPDMKLSPTQILGIKNLIAAAVPKLTTENVKIVNENGESIGEGDILENSKELALEQLRYKQNFENILENKIVNILAPIVGGKNKVVARVNAEFDFSQRKSTKETFDPNNVVRSEQNLEEKKEGAPKKQVGGVPGVVSNIGPVQGLKDNKEPEKYEKSQNTTNYEVGKTISEIKGEFGTLVRLNAAVVVDGKYKIVLKDGANTLEYEPLSDESLKKINALVKQAIGYNQNRGDDVAVSNFEFNPMAPMLDNATLSEKIMHKTQKILGSFTPLIKYILVFIVLFIFYKKVIVPFSERMLEVVPDEDKEVKSMFEEMDEEEDELNKLGDLRKKVEDQLGLNATFSEEEVRYEIVLEKIRGTLKERPDEIAMLFKLLIKDEISSDSAKG >NC_017358.1|WP_000201851.1|409322_410354_+|flagellar-motor-switch-protein-FliG MATKLTPKQKAQLDELSMSEKIAILLIQVGEDTTGEILRHLDIDSITEISKQIVQLNGTDKQIGAAVLEEFFAIFQSNQYINTGGLEYARELLTRTLGSEEAKKVMDKLTKSLQTQKNFAYLGKIKPQQLADFIINEHPQTIALILAHMEAPNAAETLSYFPDEMKAEISIRMANLGEISPQVVKRVSTVLENKLESLTSYKIEVGGLRAVAEIFNRLGQKSAKTTLARIESVDNKLAGAIKEMMFTFEDISKLDNFAIREILKVADKKDLSLALKTSTQDLTDKFLNNMSSRAAEQFIEEMQYLGAVKIKDVDVAQRKIIEIVQSLQEKGVIQTGEEEDVIE |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
186973 : 217197
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_017358|186973:217197|DBSCAN-SWA TTCACTCGCTAACACCGCTCACGCTTTCATTATAACCGCTTTCGTTATTACTATCATTCGCTAACGCTAATAAATCGCTCATGCTCATCTGCGCTACATTGTTTTCATTACTTCCTTCTATTACTTGGATTTGTTCTTTTCCAAACAAGCTAACTCCAGCATCAATAAAAAGTTTAGACACTTTCTCAGCCGCTACGATAATATTAGCGCTATCCTTTTCGTTATTGGTCAAGCTCGCTCGCTTAATCATCTTGATCAGTTCGCCTCTAGCCACTACCGCACAAAATAAGATCTGTTTTTTAATATAAGCGGTATTCATCGCTTTCAATAATAGTTCGTCGCTTGTACTTTCTGTTATCGCTTCTAAAACGATCGGATCTAGGTTCAAATGCTCTAAACTTTGTTTTATCGTTTCCTTGACTTCTTCTTTTTTCGTGTCTAAAAACAAATCCATGTTTTTTTCAGTCAGCTTATCGCCTAAAATCTCTTTTATTTCTTTTTCTTCTAAATCTTTCGTGATTCTGCGTTTTATCCAGTTTTGGCGTGTTTTGATATACCTAAGATAATGTTCATTCATCTTATACTTTTTCGCAAGTTCTCTAATGCTCATTCCTAGCGTTTCATACATCGCTCTTATTTCATTGAAAATTTTCCTACTTGTCCATTCGCCTTGCTTTGACCATTGGTTAAGAGTCTGTCGGCTTATATTGAATTTAGCGGCGATCTCGCCTTGCGTGGCTAAAGTGTCTTCATACGCTTCTCTAACCGCTCTTTTAAGATCAATTTTTGAAATCAATTCGTTTTCTTTGTTTTCTTCTTCCATTACAAGCCTTTAGCGCTCAAGCTTTGGTATTGTTTAAGATCAATTTTTCCGGCTCTCTCGTTAATATAATTTAATTTGTCCTGGTGTTCTTTGATCTTTGCTAACACTAACGGAGATACATTACCGCCCAAGCTTTCTAACATTTGCGCGTTCTTTTTTAAAGAATTGAGTAGCACTTCTTGCGTTTGCGCGGTTCTTGCGGTGTTTTCTTCCTTGCTTCTTGCCAGCCACTCTGTCATCGTTTTAGCTTCATCTCTTAATTTCTGCGTTACTTGTCCGCCTTGCGCCATCGTCTTTGCAACTCGGTTAGCATAACTAACTCTAGCGTTGTCGGTTTGAGCTAAATCATAATCAACGCCTTTTAAACCTTTTGTCTTGTGGTTAATCCATAGCTTAATCTGGTTAAAAAGTCCGCTGTGTTCTTGCGCTTTTTGTATTAAATCATTTCCCAAATCTAAAGCCTTAATATCATCAAAAATATCCTGTGTAGCTTTATTAATGCTCGCTAACCTTGTTTTATTATCGCTTTTAATATTCAAGTTACCATTTAGATTAATGCTTAAATCAAGACCTAAAAACTTTTTAGCCATGTAATAATCAAACGCCGTTATACTTCTATTTTTGATTTTTTTATCCAAATAATCAATTCCGGTAGAGAGATAAGACGGCACATTTTCTAAATTTTGATTAGCTAAATTTTGGTTAGCTAAATTTTGATTAGCTAAATTTTGGTTAGCTAAACTTTGATTATTTTCATTACCGCTTTCTGGCGTTGCTTTCTGTTGTTTTAGCGGTTTGTAGAGGCTGTTTAGTTGTTCTTCAAAAATTTCACTTTCTGTTCTTTCGTCCATAGCGTTATCCTTTCTGTCAAATTACCTTAAAAATGTTTTTTTTAAATAATTCATCTTCTAGCTTGCCTTGCTCAATCAATTCTTTACGCTTAAGATTATAAGCGATCTCATTTTCTATTTTCATCTTATTGTTTAAATTAGCGGCTTCAATCATTAAAGCGTCTTGTAATAATTTCACCTTATTGCTTTCTATCGTTACCTGCAAATAGGATAACGCTTTAAGTTCGGCTAACCTTAAAGTTTTGAGTTGCTCGGCTTCATTTAAGGCATTATTAACGGCTTCTTTAATATATTTCTTTAAAAACTCGCTTTCAAGCTCTTTAAAAAACATTCCTTTCAAATTTTTGTTAATCACGCTATAGAATGCTTTCGGTTGAGCGCTTAAAAAACTAAAATCTAAATTCTTAATCACGCTTTCTATAATAGCGTTTAGTTTGCTTTCTAAAATACCTAAAACCTTGCTTGCTAGCGCGTTTATAGTCTTGCTTGTGGTTTCGCTTACAATTTCGCTTTTAGCCTGTTTTAGTTCGTTTTGTAATTCTCTATTGCTTAAAAGGTTATTAAAATTGCTTTTAATCTCGTTTTTTAGTTCTTGCTTTAAATTGTTAGTTATCGCTTGCTTGTCAAATTGGTTTAAAAGCTCGTTGTGTATTTCTTTAGTCAGCGCTTCGTTATTGATAAGTTCTTTTACATTTTCTTTTACGATTAAAGGCATCTCTACTAATTGTCCGTCTAAATAGCCTTGAAATTCGTTTTTTAAGCTTTCTAGATTTTGGTTAGCTTTAGTATTGACTAGATCGCTTAATTCGTTTTTCGCTAATCCTAACACTTCATTATTTTTTTGTTTGAGCGATTCGCTTTCGTTAATGAGTTCTTGTATCTTGTTATAGAGTTTCATTTTTCATTCCTTTCTATATGTTACAAAAATTATAAAAAATATAAAAAACTATTTCAAGGGTTATATTTTTTAAATGCGTTTATTAGTGATTCGTAGCTTTCTAACTTCGCTTCGCATGTGTGGTCTTTAACGATGATTTTATGGTATTTGTCTTTAATCTTTGGTGTTTCTAAAAGCTTGTTAGCCTTGTATTGTTGGCTTTCTAATTCTAGCGTTTGGATCGCTTCATTTTGCTTAATCAAATGCACTTCGTTAATTGTTAGTCTTTCATTCGCTAACGCTAATTTAGTTTTTAAGTTAGAGTTCATTATTAGCAATATAACGATGATAATATAAGGCACTATCCTCCTTAATGCCCTAAAGATCAAATCATAAGGCATTAAAATCTAAACATAGGATTAGCGTAAAGCGCTCTGAATTCTTCTTTAGATAGTGTTTTATTGTTTGGCGTTATTGGCGCGCTTTGTGTTGTTAGTGGCACCTTTGTTAAATTCGTAGCGTTATCACTAACTAACGCTACCGCTGTTGTCTTTGGCGTTGCTTTCATTAGCCATGCTTGCTGTTTTTCGTTTAGCTTGTTTTCTAGCGCTATTCCTTGCGCTTGGAGTTTTTTTATCGCTTGATCTTGCTTGTGTTGTTCTTCACGCATGCGCTGTTGGCTTTTAGCAAAATCCATGCTTTGCTCGGCTTGTCTTTTTTGCAAGTCAAACGCTTCCGCTTGTCTTTTGTCGTTAGCTAAATCTCGCATTCTTTGATACTTTAGCGCTTCTTCTCTTATTTTAGCGTTATCAAAAAGGCTTCCTGCATTAGCGATCGTGGCTGCGAAATTACCCATGCTTTCATTCAGCACTAAATTAGCGTATCGTTGGTTATTCAACGCTTGATTAAAACTATCTAATCCACCTCTGCCTGCTGTAATACTTTCAAAATAAGCCATTAGTTAGTCCTTTCTTTGAGTTTGTTTGAAACCACGCTTATAGTAATATTCTTTTCTAATTTAATAGCTTCCTTGCTAGCTTTAAAAGTTATTATATGCTTACCCACTTTATCACTTCTAAATAAACACACGCTACCGCGCGCTATCTCTTCATTCTCTTCATTGTAAAAGCCTTCGTTAGCATTAGACAAAGTGCTAAATCCCCATAACCTCGTCGGTGCGTCTTTTAACACTTCTAATTTATCGCTAAAAACCTGTATAGAATTAACTTCGCTTTGTTCGTTCAACTTGTCTAATTCCTGGCTTAACTTGTTTAATATTGTTTTTAATTCGTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTCATTGTCGCACCTGCGTTATTTTTTTTAAAATTGCTAGAATTGGTTTCATCGTATTCAGATCCGATCTGGCTTATAATTTTAAACGCTGTTTCAAAATTATGAAATGTAAGCGCATTAGAGGCGTTCGCTTGCACCTGTAACAAGCTCACAAATGCGTTTGCGCGGTTGATTATAGCGTTATCTCTTAGGCTTTTTATCATCGCTTCGCATTGAATAAGCTTATTTAATGTTTCGGCTTTGGCGTTTTGTAAATTCGCTTGCATTCCTAAAAAGTCTATTTGCATTTTCGCTCTAACTTGTTCGCTTTGTAGGTATTGCGCTTCTTCATTTAAAGCTAACTGCTCGCTTTGTAAGGCTGCTTGCATGCTCGTGGTGTTCAAATCTTTATTATTGAAATTTTGCTTTTGTAGAACTTCTTTAAATAAAATAAAGTTCCTTATAAATCGTGTTGTATCCATTCTTTAAGCCTTGTCAATCACTTTAAACAAAAAATTATTAACGCCCTTATCTTTGACTAAATCAAAAAACTTTTTTATCGCTTCGTTGCTTTTATAAATCATTTCTTCATCGTGTTGCATACCTAACAAAACACATCCTAAAGTATCATGCGCGCTGTTTCCTACATGGATTAAAATTTTTCGGTTTTTGAAATCCTTGTTATTAGGATCTATAAGCTGTAACACTTCATGGCGCTCTTTATTGCACTTTTTGTTTTGGTATTCTTTAGGCACCGTGCAACTCGTATCGCTCCATTCTAATATATAATCTCTAGCCACGATCGGCTTATCTAAATTCGGCGTATCCGTTGGCTCTCCGCTGTTTTCTAATGAAAAGCAACTAAATAGAGCGTTTTGTTTTTCGTAGTGTTTCAGTATCGCTTTATCGCTTATACCTTGATTGTGCGTAGCTTCAAATACTCTAAACTCGCCTAACATGCCGCTTTCTTTCTTGTCTTTTCTTAAAATCGGGTTTAAATCGTGTTTTCTTTCTAGTAGCGCTATATACATTAACTTCCTTTCATTTCTTTGGTATTTAATCCTAATCAAGCGTGATTTTTAAGGGTTATTGTTTTTTTGTGCAAAACTTCAAATCGTTTTCTAGCGTTTCAGTATAAATTAGTAATTCTCTTAAGTATTC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32 | Helicobacter_phage(84.38%) | integrase | attL 211684:211700|attR 223357:223373 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
1487040 : 1497919
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_017358|1487040:1497919|DBSCAN-SWA 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GAAGCGTTTTTTTGTGGCGGTGTTGGTTATGGCTAATAAGGGAGTTAGCGCACGCTAAAATTTCAGCACTGGAGCGGTAGTTGGTTTCTAATTTCACCACCTTAGCCCCTTTAAAATGCTTGGAAAAATTTAAAATATTAGAAATATCAGCCCCCCTAAAACCATAAATGCTCTGATCGTCATCGCCCACCACGCACAAATTATGGTGCGTGAAACTCAATTTTTTTAAAAATTCTAATTGCAAGGCGTTCGTGTCTTGATACTCATCTACCATAATGTAATGGTAGCGCTCGCTAGTTTCTTTAGCAATGGTTTCATTATCTTGCAAAATCTTAAGGCTTAAAAAAAGCAAATCGTCAAAATCCACTAAATTGTCTTTTTTGAGCGCGTTTTGATAAAGCTCATACGCTTTATGACATTCGCTATCTTGCATGCTTAAATCAATCATGCCGTTTTTGATTTGAGAAATACTGGCTCTAAAGCTTGAAATTTTGAGCTGTTTGCACAGCGTTTTTACTTCATCGCTGTCTAACACCGAAAAATCGCACGCTCTTTTTAAAAGGCTCATGTGTTGCCTTAGAAACAGCAAACCAAAACGATGGAAAGTGCAAAGCAAGGGGGGGATAAGGGTTTGGTTTTTCAACAATTTCAAAGCCCTTTCTTGCATTTCTTTGCTCGCTTTATTGGTGAAAGTGAGCGTTAAAGTGTTCTCGCTAGGCACGCCACAAGCGCCAATCAAATACGCTAAGCGGCTCGTTAAAGTCTTAGTTTTACCGCTCCCAGCTCCCGCTAAAATCAGCAAAGGCCCTTGAATGTGGCTTGCAGCGATTTTTTGCGCTTCGTTCAAATTGTCTAAAATGCTTTTTTCAAAATCCATTAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_017358|1487040:1497919|1493594_1494170_-|WP_000289750.1|DBSCAN-SWA MYVVLEGVDGAGKSTQVGLLKDRFKNALVTKEPGGTRMGEHLRHIALNESISELARAFLFLSDRAEHIESVIKPALKEKKLIISDRSLISGMAYSQFSSLELNLLATQSVLPEKIILLLIDKEGLKQRLSLKSLDKIENQGTEKLLTIQQKLKTHAHALKEKFGCEVLELDAQKSVEDLHRQIVAFIECVV >NC_017358|1487040:1497919|1495217_1495874_-|WP_000670254.1|DBSCAN-SWA MKFLIFFLICLNALFALDSNALKTEIKEAYLKEYKDLKLEIETINLEIPERFSNASILSYELNASNKLKKDGVVFLRLENEPNLRLPVRYSVIGSMQAFKSVGAIKKDENITANNTQKERVLFGTLSNPLLEGAINKVSAKNFIPPNTLLSADKTQALIIVRKNDIITGVYEEGQISIEISLKALENGALNQIIQAKNLESNKILKAKVLSSSKAQIL >NC_017358|1487040:1497919|1487040_1489722_-|WP_000392405.1|DBSCAN-SWA MEEPVIKEGTLALIDTFAYLFRSYYMSAKNKPLTNDKGFPTGLLTGLVGMVKKFYKDRKNMPFIVFALESQTKTKRAEKLGEYKQNRKDAPKEMLLQIPIALEWLQKMGFTCVEVSGFEADDVIASLATLSPYKTRIYSKDKDFNQLLSDKIALFDGKTEFLAKDCVEKYGILPSQFTDYQGIVGDSSDNYKGVKGIGSKNAKELLQRLGSLEKIYENLDLAKNLLSPKMYQALIQDKESAFLSKELATLERGCIKEFDFLSCAFPSENPLLKIKDELKEYGFISTLRDLENSPTPLILDNTPLLENAPLSDNAPKKSRLIVLENTEPLSAFLEKLENSNARIFMRLVLDKEKKVLALAFLYEDQGYFLPLEEALFSPFSLEFLQNAFFKMLQHVQIIGHDLKPLLSFLKAKYQVSLENIRIQDTQILAFLKNPEKVGFDEVLKEYLKEELIPHETIKDFKTKNKVEKLEQLDMELNALKRLCEYFEKGGLEEGLLALARGVETPLMKVLMGMEFQGFKIDAPYFKRLEQEFKNELHVLERQILDLIGVDFNLNSPKQLSEILYEKLELPQNKSRSTDEKSLLKILDKHPSIALILEYRELNKLFNTYTTPLLRLKDKDDKIHTTFIQTGTATGRLSSHSPNLQNIPVRSPKGLLIRKGFIASSKEYCLLGVDYSQIELRLLAHFSQDKDLMDAFLKGRDIHLETSKALFGEDLAKEKRSIAKSINFGLVYGMGSKKLSETLNIPLNEAKSYIEAYFKRFPSIKDYLNRMKEEILKTSKAFTLLGRYRVFDFTGANDHIKGNYLREGVNAIFQGSASDLLKLGMLKVSERFKNNPSVRLLLQVHDELIFEIEEKNALKLQQEIQRILNDEVYPLKVPLETSAFVAKRWNELKG >NC_017358|1487040:1497919|1495870_1497919_-|WP_079992014.1|DBSCAN-SWA MMDFEKSILDNLNEAQKIAASHIQGPLLILAGAGSGKTKTLTSRLAYLIGACGVPSENTLTLTFTNKASKEMQERALKLLKNQTLIPPLLCTFHRFGLLFLRQHMSLLKRACDFSVLDSDEVKTLCKQLKISSFRASISQIKNGMIDLSMQDSECHKAYELYQNALKKDNLVDFDDLLFLSLKILQDNETIAKETSERYHYIMVDEYQDTNALQLEFLKKLSFTHHNLCVVGDDDQSIYGFRGADISNILNFSKHFKGAKVVKLETNYRSSAEILACANSLISHNQHRHKKTLQSFKGSHKSVVCKEYLTQKEESLDVAYQIKALLKKGENLENIAILYRLNGLSRSIEESLNALNIPYRLIGAVSFYERAEVKDALAFMHLVAKKDDRFFIRRVLNKPSRGLGKITQEWIFSLLDDEGLNLEEALKLGVFKGKLNPKNEHALNKFIAMIGRLREAFEISVEEFCARFLEETNLLKSYEKEDNYEEREGFVKELLALVKEHFKTNPTHSLLDFLNESVLDTHNTENAQKVSCMSVHMSKGLEFKHVFVIGLEEGFFPHRGFNQESDLEEERRLAYVAITRAKEGLQLSYVQERSYFGRKISCSPSVFLEEAKLLKQDNPPKQDHKKDTPIKVGDLIRHKIFGTGRVLGVEKGLSGLCLKINCGGNVYDKISVKFVEKVDNGF >NC_017358|1487040:1497919|1494644_1495208_-|WP_000780116.1|DBSCAN-SWA MKLVLGISGASGIPLALRFLEKLPKEIEVFVVASKNAHVVALEESNINLKNAMKDLRPSATFFNEQDIHASIASGSYGIHKMAIIPASMDMVAKIAHGFGGDLISRSASVMLKEKRPLLIAPREMPLSAIMLENLLKLARSNAIIAPPMMTYYTQSKTLEAMQDFLVGKWFDSLGIENDLYPRWGMN >NC_017358|1487040:1497919|1490959_1492999_-|WP_001147679.1|DBSCAN-SWA MQAFRLEDDVDDYVKKELAKLGLVKNKDFNVKSQMSSSLKNALLNASKTKDKTSYGEPDFSLEKYTHPKNKESVIPIIIENKLYAKNLKKLKNSTLQNDDHSISKYAVNGALHYAQNILKNKEKYKECIAIGIAGDDEENLFIEVYYVFASGINSHKLTNAKNLHFLENQESFNAFYKECTLTEEEKHSILIKTKAELNETAKKLNRLMHNHNITAPQRVLYVSGMLLSMQEIKGKKEGLKPSDLKGELTDTSRDGVLVFNQISEFLKTKNLSEEKRDLMLASFKEISKDPQRDKETSLDKAISMLLEKDSSITKQIFTFLYEFVHKPINESDNTGHLDIMGELYSEFLKYALGDGKELGIVLTPPYVTKMMSELLGVNAKSFVMDLATGSAGFLISSMVLMIEDIEKTYGKNTTKANEEIKNAKTTQLLGVELNAEMFSLATTNMILRGDGSSLIIKGNTFETNKKIYEDFKPNILLLNPPFSYEENGMPFIKFGLEYMQKGALGAIIIQDSAGSGQALKSNVEILKKHSLLASVKMPTDLFMPQAGVQTSVYIFKAHEPHDYEKPVKFIDFRNDGFKRTKRGLNETSDPTKRYEEIIKIYKAGLNAEVSKELWGDLKTIYIEDFIAKPHESKHAKDFNFEAHQKNDTKPELEDFKRTIADYLSYEVGLILKNQTPPK >NC_017358|1487040:1497919|1493031_1493607_-|WP_001203650.1|DBSCAN-SWA MRCLTCLKLSFKPLCSNCLNDLPLSLKVRVLEGVSVYSFYAYSEIEELIKSKYALIGSRILPLLSQKAGAEFVKILQEKGLTTPLYGIAIDDKIKSFYSHSAALLKGFCQGNLKATYGRLRAINAVSYAGKSLEFRANNPRNFTFKGDKNLDYFLLDDIITTGTTLKEALKYLKTLNIKAHFAIALCSADE >NC_017358|1487040:1497919|1489787_1490963_-|WP_000580073.1|DBSCAN-SWA MIGPLSSQLNAIKWGEFKLGDLFEASNGDFDIQKRHINHKGEFVITAGLSNNGVLGQSDIKAKVFESHSITIDMFGCAFYRSFPYKMVTHARVFSLKPKFEINHKIGLFLSTLFFDYPKKFGYENMCSWAKIKNDKVILPLKPTANTQTLDDIDFHFMEKFIAELEQCRLAELEAYLKATGLSNTTLSNDEENALNLFKCGLTWQSFKLGDLFEIRPTKAYKLTNSHLFDNSAKNPVVTNSSLNNGISGYSSLEPTEKGNQITYSDTTTSEGIFYQKRPFIGYSHVQGLYSLKYHEFWNEKTLLYIVTAFKKVACGRFNYGNKFNRKIASGMPIILPTNQHGKIDFHFMRTFINALMKQTIQGVVQYSSAKIQATKEAISQETPTQKDSLF >NC_017358|1487040:1497919|1494171_1494645_-|WP_001169287.1|DBSCAN-SWA MQKIGIYPGTFDPVTNGHIDIIHRSSELFEKLIVAVAYSCAKNPMFSLKERLEMIQLATKNFKNVECVAFEGLLANLAKEYHCKVLVRGLRVVSDFEYELQMGYANKSLNHELETLYFMPTLQNAFISSSIVRSIIAHKGDASHLVPKEIHPFISKV |
9 | Bacillus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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