Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_017452 | Haemophilus influenzae R2846, complete genome | 1 crisprs | DinG,DEDDh,csa3,cas3,WYL | 0 | 0 | 4 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_017452_1 | 1397625-1397749 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_017452_1
|
1 spacers
spacers of NC_017452_1
>1.1|1397660|55|NC_017452|CRISPRCasFinder GCCAAATCGTAGACATAGAAGAAGTGTTAGCCAGCCTCAAGAGACTTCTACTGAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017452_1
The CRISPR arrays of NC_017452_1 >merge|NC_017452|1|1397625-1397749|CRISPRCasFinder AAAACAACAGTAGCTGATAATTCAAAAAGCAGTAAGCCAAATCGTAGACATAGAAGAAGTGTTAGCCAGCCTCAAGAGACTTCTACTGAAAAAACAACAGTAGCTGATAATTCAAAACGCAGTAA >NC_017452|1|1|1397625-1397749|CRISPRCasFinder AAAACAACAGTAGCTGATAATTCAAAAAGCAGTAA GCCAAATCGTAGACATAGAAGAAGTGTTAGCCAGCCTCAAGAGACTTCTACTGAA AAAACAACAGTAGCTGATAATTCAAAACGCAGTAA
>NC_017452.1|WP_014550978.1|1391933_1393013_+|DNA-replication/repair-protein-RecF MAISRLLVEKFRNLTAVDLDFDPCFNFLIGNNGSGKTSLLEAIFYLGHGRSFKSAVTNRIISYDEPHFTLFGQIQESQHQWSVGLQKLRQGNTLVKINGEDGNKISDLAHLLPMQLITPEGLTLLNGGPSYRRAFLDWGLFHHQTSFYSAWSNLNRLLKQRNAALAQNQPYSAIKIWDVELAKLAHQVSQWRAEYAEALRPEIEQTCQLFLPELEINVSFHQGWEKNADYYEILQQNFERDRALNYTFSGPQKADFRFKAQGLPVEDVLSRGQLKLLMCVLRLAQGEHLMKEKQRHCIFLIDDFASELDQYKRALLAERLQQSGSQVFVTAITQRQLKEIQVENKKMFSVHNGIINALN >NC_017452.1|WP_014550977.1|1390831_1391932_+|DNA-polymerase-III-subunit-beta MQFSISRENLLKPLQQVCGVLSNRPNIPVLNNVLLQIEDNRLTITGTDLEVELSSQTQLSSSSENGTFTIPAKKFLDICRTLSDDSEITVTFEQDRALVQSGRSRFTLTTQPAEEYPNLTDWQSEVDFQLPQNTLRRLIESTQFSMANQDARYFLNGMKFETEGNLLRTVATDGHRLAVCTISLEQELQNHSVILPRKGVLELVRLLETNDEPARLQIGTNNLRVHLKNTVFTSKLIDGRFPDYRRVLPRNATKIVEGSWEMLKQAFVRASILSNERARSVRLSLKENQLKITASNTEHEEAEEIVDVNYNGEELEVGFNVTYILDVLNALKCNQVRMRLTDAFSSCLIENCEDSSSEYVIMPMRL >NC_017452.1|WP_014550976.1|1389454_1390819_+|chromosomal-replication-initiator-protein-DnaA 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MTKKPYFRLSIISCLLISCYVKAETQSIKDTKEAISSEVDTQSTEDSELETISVTAEKVRDRKDNEVTGLGKIIKTSESISREQVLNIRDLTRYDPGISVVEQGRGASSGYSIRGMDRNRVALLVDGLPQTQSYVVQSPLVARSGYSGTGAINEIEYENVKAVEISKGGSSSEYGNGALAGSVTFQSKSAADILEGDKSWGIQTKNAYSSKNKGFTHSLAVAGKQGGFEGLAIYTQRNSIETQVHKDALKGVQSYDRLIATTDGSAGYFVMQDECPKGDDTCVAKPPAKLSSQSETVSVSDYTGANRIKPNPMKYESQSWFLRGGYHFSEQHYIGGIFEFTQQKFDIRDMTFPAYLSPTERRDDSSRSFYPMQDHGAYQHIEDGRGVKYASGLYFDEHHRKQRVGIEYIYENKNKAGIIDKAVLSANQQNIILDSYMRHTHCSLYPNPSKNCRPTLDKPYSYYRSDRNVYKEKHNMLQLNLEKKIQQNWLTHQIAFNLGFDDFTSALQHKDYLTRRVIATANSISGTVAGKRRNGYEKQPYLYSTPKVDFVGQDHCNYKGSSSNYSDCKVRLIKGKNYYFAARNNMALGKYIDLGLGIRYDVSRTKANESTISVGKFKNFSWNTGIVIKPTEWLDLSYRLSTGFRNPSFAEMYGWRYGGKDTDVYIGKFKPETSRNQEFGLALKGDFGNIEISHFSNAYRNLIAFAEELSKNGTTGKGNYGYHNAQNAKLVGVNITAQLDFNGLWKRIPYGWYATFAYNRVKVKDQKINAGLASVSSYLFDAIQPSRYIIGLGYDHPSNTWGINTMFTQSKAKSQNELLGKRALGNNSRNVKSTRKLTRAWHILDVSGYYMVNRSILFRLGVYNLLNYRYVTWEAVRQTAQGAVNQHQNIGNYTRYAASGRNYTLTLEMKF >NC_017452.1|WP_014550974.1|1384567_1386514_+|transferrin-binding-protein-like-solute-binding-protein MKSVPLITGGLSFLLSACSGGGGSFDVDDVSNPSSSKPRYQDDTSSSRTKSKLENLSIPSLGGGMKLVAQNLRDRTKPSLLNEDDYMIFSSLSTIKADVEKENKHYTSPVGSIDEPSTTNPKENDHGQRYVYSGLYYIPSWNLNDLKNNKYYYSGYYGYAYYFGKQTATTLPVNGKVTYKGTWSFITAAENGKRYPLLSNGSQAYFRRSAIPEDIDLEVKNDENREKGLVSEFSADFGTKKLTGGLFYTKRQTHIQNHEKKKLYDIDAHIYSNRFRGKVNPTQKDSKEHPFTSEGTLEGGFYGPEGQELGGKFLAGDKKVFGVFSAKGTEENKKLPKETLIDGKLTTFSTKTTDAKTNATANATTSTAANTTTDTTANTITDAENFKTKDISSFGEADYLLIDNYPVPLLPESGDFISSKHHTVGKKTYQVKACCSNLSYVKFGMYYEVPPKEEEKDKEKKEKEKEKQATNLSNTYYQFLLGLRTPSSEIPKGGSAKYLGSWFGYLSDGSTSYSPSGDKKRENNALAEFNVNFADKTLKGQLKRHDNQNTVFTIDATFKSGKNNFTGTATANNVAIDPQSTQGTSNVNFTATVNGAFYGPNATELGGYFTYNGNPTDKSSSTVPSSSNSKNARAAVVFGARQQVETTK >NC_017452.1|WP_014550973.1|1383024_1384470_-|DUF560-domain-containing-protein MKNGVKQLSLLSLIGLSLTNVAWAEVARPKNDTLTNTIQSAELKTSSFSSMPKKEIPNRHIISLSKSQLAHHPRLVLRGLIPALYQNNTQAVQLLLPLYKQFPQQDNFLLTWAKAIEAREQGDLTQSIAYYRELFARNASLLPLRYQLAQALFFNYENEAAKIQFEKLRTEVDDEKFLGVIDQYLLTLNQRNQWIWQVGLNFLNDDNLNNAPKSGTKIGSWTAWEKESGQGVGYSLSVEKKWPWADHFFSKTMFNGNGKYYWDNKKYNEATVRIGGGLGYQTASVEVSLFPFQEKRWYAGGSSGTNTMKQYADKLGIRLENVDWLSKTWQISTALEYGESRYKIRKHLDGNYYFISSTLFYLPKSTQFWFVGMDFHRENTQALDNAYQQKTLRLGWGQDWSHGISSRLTFSYANRVYREKDLIGIQQKNREYTTTITLWHRNIHFMGLTPKLSWDYQKSTSNHAFYRYDKNRIYLEIGKIF >NC_017452.1|WP_005539760.1|1382714_1382849_-|50S-ribosomal-protein-L34 MKRTFQPSVLKRSRTHGFRARMATKNGRQVLARRRAKGRKSLSA >NC_017452.1|WP_005647913.1|1382342_1382702_-|ribonuclease-P-protein-component MVKLNFSRELRLLTPIQFKNVFEQPFRASTPEITILARKNNLEHPRLGLTVAKKHLKRAHERNRIKRLVRESFRLSQHRLPAYDFVFVAKNGIGKLDNNTFAQILEKLWQRHIRLAQKS >NC_017452.1|WP_005647910.1|1382118_1382379_-|membrane-protein-insertion-efficiency-factor-YidD MAETHSLGTKILIKIIRLYQIMISPFIGARCRFVPTCSCYGIEALKTHGLLKGGWLTLKRVLKCHPLNAGGFDPVPPKTNNNDEKK >NC_017452.1|WP_014550972.1|1380493_1382119_-|membrane-protein-insertase-YidC MDSRRSLLVLALIFISFLVYQQWQLDKNPPVQTEQTTSITATSDVPASSPSNSQAIADSQTRGRIITLENDVFRLKIDTLGGDVISSELLKYDAELDSKTPFELLKDTKEHIYIAQSGLIGKNGIDTRSGRAQYQIEGDNFKLAEGQESLSVPLLFEKDGVTYQKIFVLKRGSYDLGVDYKIDNQSGQAIEVEPYGQLKHSIVESSGNVAMPTYTGGAYSSSDTNYKKYSFADMQDNNLSIDTKAGWVAVLQHYFVSAWIPNQDVNNQLYTITDSKNNVASIGYRGPVVTIPSGSQETITSSLWTGPKLQNQMATVANNLDLTVDYGWAWFIAKPLFWLLTFIQGIVSNWGLAIICVTIVVKAILYPLTKAQYTSMAKMRILQPKMQEMRERFGDDRQRMSQEMMKLYKEEKVNPLGGCLPILLQMPIFIALYWTFLEAVELRHAPFFGWIQDLSAQDPYYILPILMGISMFLLQKMSPTPVTDPTQQKVMNFMPLVFMFFFLWFPSGLVLYWLVSNLITIAQQQLIYRGLEKKGLHSRKK >NC_017452.1|WP_005669693.1|1398799_1399402_-|3-isopropylmalate-dehydratase-small-subunit MAGFKQLSGLVVPLDAANVDTDAIIPKQFLQAITRVGFGKHLFHEWRYLDVDGTKPNPEFVLNYPQYQGATILLARKNLGCGSSREHAPWALADYGFKVMIAPSFADIFYNNSLNNHMLPIRLSEEEVEEIFQWVWANDGKQIHVDLEAMTVTVGDKVYHFELDEFRRHCLLNGLDNIGLTLQHEDKISAYEKNIPAFLR >NC_017452.1|WP_014550980.1|1399426_1400836_-|3-isopropylmalate-dehydratase-large-subunit MVKTLYEKLFDSHIVYEAEGETPILYINRHLIHEVTSPQAFDGLRVANRQVRQVNKTFGTMDHSISTQVRDVNKLEGQAKIQVLELDKNTKATGIKLFDITTKEQGIVHVMGPEQGLTLPGMTIVCGDSHTATHGAFGALAFGIGTSEVEHVLATQTLKQARAKSMKIEVRGKVASGITAKDIILAIIGKTTMAGGTGHVVEFCGEAIQDLSMEGRMTVCNMAIEMGAKAGLIAPDETTFAYLKDRPHAPKGKDWDDAVAYWKTLKSDDDAQFDTVVTLEAKDIAPQVTWGTNPGQVISVNETIPNPQEMADPVQRASAEKALHYIGLEAGTNLKEVKVDQVFIGSCTNSRIEDLRAAAAVMKGRKKADNVKRILVVPGSGLVKEQAEKEGLDKIFIAAGAEWRNPGCSMCLGMNDDRLGEWERCASTSNRNFEGRQGRNGRTHLVSPAMAAAAGMFGKFVDIREVALN >NC_017452.1|WP_014550981.1|1401011_1402088_-|3-isopropylmalate-dehydrogenase MQSYNIAVLAGDGIGPEVMAEAIKVLNKVQEKFGFKLNFNEFFVGGAAIDHCGYPLPAETLKGCDEADAILFGSVGGPKWTNLPPDQQPERGALLPLRKHFKLFCNLRLATLYKGLEKFCPLRADIAAKGFDMVVVRELTGGIYFGQPKGREGESSQTKAFDTEVYYKYEIERIARAAFEAAMKRNKKVTSVDKANVLQSSILWRETVTEIAKDYPEVTLEHIYIDNATMQLIKAPESFDVLLCSNIFGDIISDEAAMITGSMGMLPSASLNEEGFGLYEPAGGSAPDIAGKGIANPIAQILSAAMMLRYSFNLNEAADAIESAVQKVLANGHRTADLADDSTPVSTSEMGTLIAQAI >NC_017452.1|WP_014550982.1|1402173_1403721_-|2-isopropylmalate-synthase MTDRVIIFDTTLRDGEQALKASLTVKEKLQIALALERLGVDVMEVGFPVSSQGDFESVQTIARHIKNARVAALSRAVDKDIDAAYQALKVAEAFRIHTFIASSALHVEAKLKRSFDDVVGMAVAAVKRARNYTDDVEFSCEDAGRTGIDNICRIVEAAINAGATTVNIPDTVGFCLPNEYGNIIAQVRNRVPNIDKAVISVHCHNDLGMATANSLTAVQNGARQIECTINGIGERAGNTSLEEVVMAMKVRQDFMGVDTRINTQEIHRVSQMVSQLCNMPIQPNKAIVGSNAFAHSSGIHQDGMLKNKNTYEIMSPETIGLKKEKLNLTARSGRAAVKGHMTDMGYNEQDYDLDKLYDTFLKLADKKGQVFDYDLEALAFIDMQQGDEDRLVLDKLSAHSTKEYPATAFVQLKLDGEKLSTSSIGGNGPVDAVYNAILNLTGLEIKMSHYNLTAKGEGAEALGQVDIVVEHKGRKFHGVGLATDIVESSALALVHAINAIYRAHKVADIKNHKQH >NC_017452.1|WP_014550983.1|1404264_1405386_+|DNA-protecting-protein-DprA MNDITYTLLRLMQVPKLGGIGIDKILSNITLNELLNYDDVAFRQMGWGAIQIRRWFKPEAKFIEPALVWSQKEGNHLVNYFSPFYPFLLKQTANFPPLLFVKGNLTALSQRQMAMVGSRYCTTYGEYWAKHFATELSLAGFTITSGLALGIDGHCHQAVVNIQGQTIAVLGSGLEQIYPSKHQRLSAQIIENNGALVSEFLPNQAPIAANFPRRNRIISGLSVGTLVVEATEKSGSLITARYALEQNREVFAVPGNIQNESSQGCHRLIKQGAMLVENAKDILETLYQHSIHSQTEIDFDQIAVPNYTPPPDPRRLVEAPSHPKLYSRIGYTPVSIDDLAEEFNLSVDVLLVQLLDLELQDLIMSENGLYKRV >NC_017452.1|WP_005651588.1|1405438_1406215_+|peroxide-stress-protein-YaaA MLAIISPAKTLDFESAVKNFPVSQPHFTDYSEQLIEVCRKLSPQDLSSLMSISDKLAGLNAARFAEWTKIHNENNSRPALFAFKGDVYTGLDADSLSEDDVIFAQSHLRMLSGLYGLLKPLDLMQPYRLEMGTKLANPKGKDLYAFWGNVITQAVQQAIDAQGDNVLVNLASDEYYKSVKESQINAKIIKPVFLDNKNGKYKVISFYAKKARGLMCRYIIQHHLTEIEQLKEFDLGGYWFDSASSTETEFVFKRDINE >NC_017452.1|WP_005686250.1|1406207_1406789_+|hypothetical-protein MNKIFVILTALILSGCATKLTQLNVPTQLEHNGKHYVLTSSQDLGTIARYVYIAKPDTLENWQSEIEILFDRNQSERSIKERIALRERIYRNTGVKDFHFDAILENSTNPNELNGYVIYSPTKENPSWQVNVMKGRQLSQCGFVQFQYSQKIQQPTHSKHLSVNKVQRHLQKYIVDIERKHLQNLKWQLFCEK >NC_017452.1|WP_014550984.1|1406884_1407850_+|6-phosphofructokinase MIKKIAVLTSGGDAPGMNAAIRGVVRSALAEGLEVFGIYDGYQGLYNNKIKQLNRYSVSDVINRGGTFLGSARFPEFKDPNIRAKCAEILRSHGIDALVVIGGDGSYMGAKLLTEEHSFPCVGLPGTIDNDVAGTDYTIGYQTALQTAVDAIDRLRDTSSSHQRISIVEIMGRHCSDLTISAGIAGGCEYIVASEIEFNREELIQQIERSIIRSKRHAIIAITELLTDVHSLAKEIEARVGHETRATVLGHIQRGGSPCAFDRILASRMGAYAVDLLLQGKGGYCVGIQNEQLVHHDIIDAINNMQRVFKADWLKVAKRLE >NC_017452.1|WP_005647965.1|1408093_1408579_+|SsrA-binding-protein-SmpB MTKKKVKPNSNTIALNKRARHDYFIEDEIEAGLELQGWEVKSMRAGKANISDSYVIFKNGEAFLFGASIQPLNVASTHIVCDPTRTRKLLLNKRELASLFGKANRDGFTIVALSLYWKSAWAKVKIGLAKGKKQQDKRDDIKEREWKVTKDRIMKNAHRRS >NC_017452.1|WP_005651583.1|1408673_1408973_-|DNA-binding-transcriptional-regulator-Fis MLEQQRNSADALTVSVLNAQSQVTSKPLRDSVKQALRNYLAQLDGQDVNDLYELVLAEVEHPMLDMIMQYTRGNQTRAANMLGINRGTLRKKLKKYGMG |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
926213 : 938257
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_017452|926213:938257|DBSCAN-SWA 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GATTGAATCCAACGATCGGCTAATGAAAACTCGATCTCGCCTTCACTTAAATCTAATTTGTCATTCGTTAATACGAAACGGCTTGCATTCCATAATTTATTACAGAAGTTGCGGTAGCCTTCTAAACGTTTCATATCCCAGTTGATATCACGACCATTTGAAGCCAACGCAGCTAATGTAAAACGCAATGCGTCTGTACCGTGAGCAGCAATTCCGTCCGCAAATTCTTTGCGAGTTGCTTTGGCGATTTTCTCTGCTAATTGCGGCTGCATCATGTTGCCAGTGCGTTTTTCAAGTAAATCGTCAAGGCTGATACCGTCAATCATATCGATTGGATCAAGTACGTTACCTTTTGATTTCGACATTTTTTGACCTTGCTCATCACGGATTAATCCCGTTACGTACACGGTTTTGAATGGTACTTGTGGTTTGCCATTTTCATCTTTCACAAAGTGCATCGTAAACATAATCATACGCGCAACCCAGAAGAAGATGATATCAAAACCAGTGATTAACACATCCGTTGGGTGGAACATTTTGAGCTCTTTAGTTTGCTCTGGCCAACCTAAAGTGGAGAACGTCCACAAGCCTGAGGAGAACCACGTATCCAGCACGTCTTCATCTTGTTTAAGTTCAACCGCAAAATCTAAGTTGTATTTTGACCGCACTTCTGTTTCGTTACGCGCAACATAAACGTTGCCTTCCGTGTCATACCACGCTGGAATACGGTGTCCCCACCAAAGTTGGCGAGAAATACACCAATCTTGAATATCACGCATCCAAGAGAAATAAAGGTTTTCATATTGTTTTGGCACGAATTGGATTTCGCAGTCTTCCACCGCTTTAATTGCTACATCGGCAAGCGGTTTCACGCTAACATACCATTGGTCAGTTAGCATCGGCTCAATCGGCACGCCACCACGGTCGCCATAAGGCACTTTCAAATCGTGTGGTTTAATTTCGTCTAATAAACCTAGCGATTCAAAATCTGCCACGATTTTTTTACGTGCAGCAAAACGCTCTAAGCCTCGGTAATCCGCAGGAATAGTCGCCTCATAACCCGCAAGTGGTTTGCCGTCAGTACCGATAATTTCCGCTTCATCACGAATATCTGCATTTAAAGTTAATACATTAACCATTGGCAAGCCGTGACGTTTACCCACTTCGTAGTCATTGAAGTCATGAGCTGGGGTAATTTTCACTACACCAGTACCGAATTCACGATCCACATATTCATCGGCAATAATCGGAATTTCGCGATTAGCCAATGGCAGAACCACGGTTTTACCGATTAAAGATTGATAACGTTCATCTTCAGGATGCACCGCCACCGCTGTATCGCCCAACATAGTTTCTGGACGTGTAGTTGCCACCACTAAATAATCTTTACCATCTGCCGTTTTTGCACCATTTGCTAATGGATAACGGAAATGCCAAAGAGAACCTTTGCTCTCTTTATTTTCCACTTCTAAATCAGAAATCGCGGTGTGAAGTTTTGGATCCCAGTTTACTAAGCGTTTACCACGGTAAATCAAGCCCTCTTCGTGCAAACGAACAAATACTTCTTTTACTGCATTCGATAAACCATCGTCCATAGTGAAACGCTCACGTTCCCAGTCGATAGAGTTTCCTAAACGACGCATTTGTTGGCTGATTGTGCCGCCTGAATAAGCTTTCCAATCCCAAATTTTGTTGATGAACGCTTCACGTCCATAATCGTGGCGTGTTTTACCTTCTTCAGCCCCGATTTTACGCTCCACCACCATTTGGGTTGCGATACCGGCGTGGTCTGTCCCCGCTTGCCATAAGGTGTTATGCCCTTCCATACGGTTAAAACGGATTAAGGTATCCATTAAGGTTTGTTGGAAAGCATGTCCCATGTGTAGAGAACCTGTTACATTCGGTGGAGGAATCGCAATGCAATAGCTCGGCGCATTTTCATTTCCAGACGGTTTAAAATAACCGCTCTCTTCCCAATGTTGATAAAGGGCTTGTTCTACCGCAGACGGATTAAAACGATCTGCCATTTCGAATTTTTGTGTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_017452|926213:938257|929862_931419_+|WP_014550748.1|DBSCAN-SWA MNIQTQAFIAVTAQSIPYYADTTAIFNTLCQPNSNSLLLDSAEIGSKNSLQSLILVNAAVKITCLGHNVTFKALNKNGKQVLKEIHPKLTALGKISAVNFEDEFSVQFSPLDNQLDEDSKLQSATIFDGLRVISSLYQHSQTPIFLGGLFAYDLVANFIPMDGITLKNDGINCPDYSFYLAEHLITIDHQNQQATLKSFCFAQEEQVNIAKTSLSIAQKLKNIDHVLSIKAASDEVKTNFDDPEFTGIVKALKHHINIGDVFQIVPSRRFSLACPNTLASYAQLKQNNPSPYMFYMNDEDFILFGASPESALKYAPENRQLEIYPIAGSRPRGFDAHGNIDPELDARLELELRLDHKEQAEHLMLVDLARNDIARVCQSGTRKVAELMQVDRYSHIMHLVSRVVGKLRPELDALHAYQACMNMGTLTGAPKIKAMQLIYQFEQQKRHSYGGAVGYLTSDGHFDTCIVIRSAFVQNGIAHVQAGCGEVLDSDPQMEADETRHKAAAVLKAIRQVNTQAK >NC_017452|926213:938257|928992_929757_+|WP_041174663.1|DBSCAN-SWA MAIKSVQNQTYPCKHYVFVDGNIFWDKAKSILEQFPDVIPIYLPMNTGKNGILNGAINAAATFLVEEDIICYLDDDNQLREDHVESLVNVIEQGADFAYSLRSFYDSNHQFICNDDFDSLGNWNTKSDIFVDVKIEDIQKQIHFTFNEVNGHIDTNCYAVPREIAQKTSYSWNTPLIGDRSFLSALKSLGLIGQTSGKYTVKYRADFNKLIAVRRVFPQLSLSDEDNNNLSAQILEVINQQNIEYYGGRPWAKE >NC_017452|926213:938257|935088_935361_+|WP_005650573.1|DBSCAN-SWA MFRRSGQIVKIDENSLQLATVDVCGVQREVNISLICTRNPADLLGKWVLVHVGFAMSVIDEDEAKKTQEALITMSQLEHEVGDFLGLNQK >NC_017452|926213:938257|931431_932013_+|WP_005688458.1|DBSCAN-SWA MANILFLDNFDSFTYNLVDQFRVLGHNVTIYRNDCDLEKLVETALNTPDTILALSPGPGTPSEAGILLPLIERLKNQVPIIGICLGHQALIQAFGGKVVHAGEVLHGKVSRISHDNEAMFKDLANPMPVARYHSLMGQDLPKEFIVNAEYNGIIMAIRHRDLPICAFQFHPESILTVQGSQLLQQSIEWLLNR >NC_017452|926213:938257|932500_933502_+|WP_014550749.1|DBSCAN-SWA MQHNQLLEQLYSGHSLSTSESTALFNAVIQGELSNEQIAAMLIALKVRGANTEEISGAVAASLQNAKAFPRPDYPFADIVGTGGDGQNTINISTTSAIVAASMGAKVAKHGNRSVSSKSGASDVLTALGVNVNVTPEQARQALDEIGVCFLFAQQYHSSFRHVAPVRTALKTHTIFNILGPLINPARPTYHLLGVYVPELVKTYAETAVALEHQHSFVVHGSGLDEVALHGETQVAEIKNGKIEYFTLTPEDFGLKTQSLESLRGGEPQENTQYLTALLQGKGKAEHANAVAANTALLLKLFGHDDLKQNVQNVLAHLVSGNAFKTLQKLTTY >NC_017452|926213:938257|933539_934973_+|WP_014550750.1|DBSCAN-SWA MMITQDFTKPIDSATVLQKIVLDKAQWVKAKEKEFPLSQFKQNIQNSDRSFYDALAKGTHQKPAYILECKKASPSKGLIRAEFNLEEIANVYKHYASAVSVLTDEKYFQGNFEFLPLVRGIVSQPVLCKDFMISEYQVYLARYYQADAILLMLSVVNDETYRVLAELAHSLGMGVLTETSNEEEFERALALGAKIIGVNNRNLHDLTVDLNRVVELTEKYADCIPADIRIISESGIYNHKQIRQLQKVAHGFLIGSSLMGNQDLNNAVRSVIFGENKVCGLTRAQDVKIVYENGALYGGLIFAEHSKRCVSLRQAQELVTAAPLRFVGVFQNQEIDFIVKIANQLQLYAVQLHGAETEAFITALRQQLPKNTQIWKAISVNTEAQSAVDFTDNLNVERYIFDSQTSNQQGGTGKTFDWSLIPENLKHKIILAGGISPNNVEQAIQQNCLGLDINSGVESSAGVKDQEKVRLVFNNIY >NC_017452|926213:938257|935392_938257_-|WP_014550751.1|tRNA|DBSCAN-SWA MTQKFEMADRFNPSAVEQALYQHWEESGYFKPSGNENAPSYCIAIPPPNVTGSLHMGHAFQQTLMDTLIRFNRMEGHNTLWQAGTDHAGIATQMVVERKIGAEEGKTRHDYGREAFINKIWDWKAYSGGTISQQMRRLGNSIDWERERFTMDDGLSNAVKEVFVRLHEEGLIYRGKRLVNWDPKLHTAISDLEVENKESKGSLWHFRYPLANGAKTADGKDYLVVATTRPETMLGDTAVAVHPEDERYQSLIGKTVVLPLANREIPIIADEYVDREFGTGVVKITPAHDFNDYEVGKRHGLPMVNVLTLNADIRDEAEIIGTDGKPLAGYEATIPADYRGLERFAARKKIVADFESLGLLDEIKPHDLKVPYGDRGGVPIEPMLTDQWYVSVKPLADVAIKAVEDCEIQFVPKQYENLYFSWMRDIQDWCISRQLWWGHRIPAWYDTEGNVYVARNETEVRSKYNLDFAVELKQDEDVLDTWFSSGLWTFSTLGWPEQTKELKMFHPTDVLITGFDIIFFWVARMIMFTMHFVKDENGKPQVPFKTVYVTGLIRDEQGQKMSKSKGNVLDPIDMIDGISLDDLLEKRTGNMMQPQLAEKIAKATRKEFADGIAAHGTDALRFTLAALASNGRDINWDMKRLEGYRNFCNKLWNASRFVLTNDKLDLSEGEIEFSLADRWIQSEFNRTVETFRNSLSQYRFDLCANAIYEFTWNQFCDWYLELTKPVFANGNAAQIRAASQTLVHVLEKLLRLAHPLIPFITEEIWQKVKGFVGITADSIMLQPFPQVEENGFDPEAEAEIEWLKEVIVAVRNIRAESNIAPSKGLDLLFRNLSTENAKILEKQTALLKAMAKLDNVQVLAANETAPLAVAKLVGNAELLVPMAGFINKEAELARLTKEIEKYQNEVKRIENKLSNEAFVAKAPEAVIAKEREKQAEYQSGLEKIQEQYKAIEAL >NC_017452|926213:938257|932061_932448_+|WP_005662273.1|DBSCAN-SWA MITVFGLKSKLAPRREQLAEVIYNSLHLGLDIPKGKHAIRFLCLEKEDFYYPFDRSDDYTVIEINLMAGRMEGTKKRLIKMLFSELEYKLGIRAHDVEITIKEQPAHCWGFRGMTGDEARDLDYDIYV >NC_017452|926213:938257|928885_928960_+|WP_080001612.1|DBSCAN-SWA MNQPTNQPTNQPTNQPTKIIKPLR >NC_017452|926213:938257|928246_928744_+|WP_005650592.1|DBSCAN-SWA MLSENVVKLLNDQMNLEFYSSNLYLQMSAWCDQQGFEGTAKFLSVHAAEEMQHMRKLFTYLNETGSLAVISAIEAPAHEYKSLKEIIETTYEHEKLITSKINELVGKTFEEKDYSAFNFLQWYVEEQHEEEKLFSSILDKLNFLGEDGKGLFLIDKDLGNLSTKA >NC_017452|926213:938257|926213_927218_-|WP_014550746.1|DBSCAN-SWA MKKNLIIVLTLGTLPFAQANSITGAGASFPYPIYAKWASLYEKETGNKVNYQSIGSGGGQQQIIAKTVDFGASDDPMKSELLQQHQLVQFPAVIGGIVPVVNLPEIKPGKLKLSGKLLAEIFLGKIKKWNDPDLVALNPTLPLPNKNIIVIHRSDGSGTTFGFTNYLSKVSNDWKNQVGEGKSVKWLTGQGGKGNEGIASYVRQMKYTIGYVEYAYAKQNQLAWISLQNQAGQFVQPSNESFMAAASHAKWHEKAGMGVILTNETGEKSWPITAASFILLNKYSDNPETTKNVLAFFDWAFSRGQDAATELDYVPIPADVVSTIKSQWKTELKQ >NC_017452|926213:938257|927738_928227_+|WP_005650594.1|DBSCAN-SWA MLNQIIINKLNDQINLEFYSSNVYLQMSAWCSKHGYEGAATFLLRHADEELEHMQKLFNYVSETSGMPILGKIDAPKHDYSSLREVFEITLEHEKLVTSKINELVEVTFESKDYSTFNFLQWYVAEQHEEEKLFSGIIDRFNLVGEDGKGLFFIDRELATLE |
12 | Acinetobacter_phage(42.86%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1013233 : 1019912
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_017452|1013233:1019912|DBSCAN-SWA ATTATTCAACCGCTTGTTGAGAAGGATTTAGAAGGCGATCAATCGCTTTTAGCGCATCTAACGCTTTCATTTCTAGACTTAAAAAGTGCATTTTCGGCACACCAGCATCTTGTGGGTTAATACGGATAAATCCACCCTTTTTTGCTTTCGCCGTACGTTCAGAAAAGCAACGCACAGTAGGAATAACTTTCCCCGCTCCCAGTTCGATGACGATAAGATTTTGCACTTCTTTTAACCACGATTCTAACCGCACTTTTTTAAAATCCTGATATTGACTTACATAACTCCAATCATTAAACATTAGTACATTTTGACGAGCAAAGCCACCACAATAAGGACAATGTGGTTTTTCACTGGTTAAACATAAATTTTTATTATCCACGACAGGTTGAAAACTTGATGCAGACCAACTTAATCCTCGACAATTATTGACACATTGAAGACGCTCCAAAGTACCGTGTACTTCATAAACATGGCTATCATCAAAACCAGCCTTTTGAAAATGCCCATCCACATTACTGGTAAAAACGAAATATCCATGAGATTTATCTCCCGCCCAGCGTTTTAAAATCTGATACCCTTCGTGAGGAATAGTATTTCGGTATTGAATTAATCGATGTCCATAAAACCAATAGGCAAGTTCCTGATTATGCTTATAAGCTAATGGCGTCGCGATGTCTTCAAAAGATATATTATGTTCTTTAAACATAGGATAAGCATTCCAAAATCCGCCAACGCTGCGAAAATCGGGCAGCCCAGAATCCACGCTCATACCCGCACCAGCTGTAATTAAAATGCCATCCGCTTTGCGGATAAGTTCCACAGCATAATTCAAATCATTTTTCATAATACTTTTCTCTGTCCATTTTTCATTGATGAAATAATACCCGCTTGTTCCAACTGTTCTAAAATTTGCCCAGCTCGATTAAAACCCAACATAAATCTGCGTTGAATCATTGAGCAAGATGCAACTTTTTGTTGTTGCACATATTTTTTTACATCCTCAAAAAGTGGATCTCTTGCCATAATTACTTTCATTGCCATTATTTGCTCCTTTTTATTAATTAAAGGCTTGATAGATATGTAAGAAGTAAAAAATCTCCCTTTATGGAAAAATTATATGAAAGGAAGCGACAACTTGTGTCGTTTGCGAATATTGAAAGCGGTTATTTTTAGAAGATTTTTTGCAAATAAGATGATCTGTATTGCAATATGCATATTTATCTGGTTATATATACATGTAAGTTATTAAGGAAAATAATATGAATAACCAAAACCCGATTGAAATTTACCAAGCTCAAGATGGCACAACGCAAGTGGAAGTGAGATTTGAAAATGGCACCGTTTGGCTTTCCCAGGCACAAATGGCAAATATTTTTGATACTAGCTCAGATAACATAGGCCTACACTTAAAAAATATTTTTAATGAAGAAGAACTTGATGAAAATTTAACTACCGAGGATTTCTCGGTAGTTCGACAAGAAGGAAAAAGGCAAGTTACTCGTAAGGTTAAACATTATAATCTGGATGCTATTATTTCTGTAGGCTATCGAGTGAAGTCTAAGTCTGCAACAAATTTTAGAATTTGGGCAACTGCACGTTTAAAAGAATATCTGACTCAAGGCTATACTATTAACCAAAAACGTTTACAGCAAAATGCTCACGAATTAGAACAAGCACTTGCGCTTATTCAAAAAACGGCAAATTCATCAGAATTAACGCTAGAAAGCGGTCGCGGATTAGTGGATATTGTCAGCCGTTATACGCATACGTTTTTATGGCTACAACAATATGATGAAGGTTTACTTGCCGAACCACAAACACAGCAAGGCGGTACATTACCGACTTATGCAGAAACCTGTTCTGCACTAGCAGAGTTAAAATCACAGCTGATGGCAAAAGGTGAAGCAAGTGATCTATTTGGACGTGAACGAGATAACGGCTTATCTGCGATTCTAGGCAATTTAGATCAAAGTGTATTTGGTGAACCTGCTTATCCAAGCATTGAAGCAAAAGCGGCACATTTACTTTATTTTGTCGTCAAGAATCATCCTTTTTCAGATGGTAATAAACGTAGTGGCGCATTTTTATTTGTAGATTTCTTACATAGAAATGGGCGTTTGTTTGATCATAATGGGCATCCAGTTATCAATGATACTGGGCTTGCAGCACTCACTTTATTAGTTGCTGAATCTGATCCGAAACAAAAAGAAACGCTTATTAGGCTTATTATGCACATGCTTAAGCAAAAACAAGAGAAGTAATGATAAATAGCGACCGAAGTCGCTATTTATCTATCAATGTTAAACTTAATAAAAAATTTATTTACATAATTCTTTTACTGACTCTACTAATGCTTCCATTTTGTCGTAAGAATTAATGCCACTTGGACCACCAAAAAACGGACAAACACAAATTAAAGTATCATTGTACTTGCGATAGAAGATATTAAATTCTTTCAACGCTTTAGTTTCATATACGGCTTCTCCAGTAAAAAACTTAAAGAAGTTATCTTTTTCAGTGACTCCCGTACAAATAATAACTTTAGGATTACATTCATCTATAAGTTGACGATAAAAAGCACCACGATTTTCAACACACCATTCTCTATATTGATCGAATGTTTCAAATCCTGTCATCTTAATGAATTGTTCATTCCATTGAATTGATGCTCTATTTTTGAAATTGATTGGTAGCATATTTAGTTTAAAACCAATACCCTGTGGATAAAGCACATTATAAGTACTAACAAAATACTCATAGCTTTCACCACTTTTCCAATCTAAATTATAGTAGTACCACAAAAACCAACATAATTTTTGATTATATTGCGTAGTCCAACTACCATCAAAATCGTCCTCTAACCAAGAGTGCGGTATTAATTTAGGGCTTAAACTAAATTTCTTATAAAAATCATCAGGAGAAGCTTCATCACCAATCCCCCATTCTAACCCACAAAACCAAACATCTGAGTTAGGATTTCCGCCATCTCCTCCAGCGAAGGATACTGCCACTTTTTTAAACTCTTCTGTTACCATTATTTTATCCTCATTATTTAAGTAGATTTGTCCAAATCCCTATGGTTTCTTCTTGAATTACGCCTTTTTCTTGACCTAATTTTATTGCCAGTTGCTGTAAACTTTTAGCCAACTCAGTATGACCGCAATAATTTAAACTACGAATGATGCGGGAAATCTTCTTACTTTCATGCCCAATATTGCGTAGCCAAACTTTACGTTCAGTTAATTCAGGTTTAGGGAATATTTTATTATCTTCACGATATAAACAGAAGTAATCCAGAATAATATCAATAGAATGTAAATATTTATTTTGAATTGCTTCATCTCCAATAAAAATAGCCAGGTCTTCTTCGTTAAAAACCGGTACTGAACGATTCCATTTGGAACTTTCAGTAACAGGTAAAAGCCAAGGAATATAAAAATAAGCATCGCCAATCATTCTTTTTGGCATTGCCCGCATATCTTGCAAAGATAAATTATGTTGGCTTTTTCTTTGTTCTAAATAAAATTCAATTACTGGATGCATACGTTTCTCATTAATTCATCAGTCATACAGTATAGTGATATAAAACTCGCTATTTATGTGAAAAGTGCGGTCATTTTTCTATGAGTTTTTGGTGTTCTCTAATAACTCTGCCACCACTTTCGGCACACCCTCGCCTGCTTTCTCTTTTATTGCAATAACTTGCTTACGAACAAAGCCTGTATTTGGGTTAGGATCAATCAGATAAATTGGCGCTTTTCTTGGAGCTTCATTGACTAAGCCGTTGGCTGGATAAACTTGTAATGAAGTACCAATCACTAACACAACATCTGCTTGTTCCACAATATCAACCGCTCGTTCTAACATCGGCACCATTTCACCAAAAAAGACGATGTAAGGGCGCATTGGGTGTCCATTTGGATCTTTATCTTCTAATTTCTGATCACCAAAACAATCCACAATATAACTTTCATCAAAGCTACTGCGAGCTTTATTTAATTCACCGTGTAAATGCAACACCTTCGAGCTGCCGGCACGTTCATGTAAATCATCCACATTTTGCGTGATGATTCTTACATCATAGGCTTTTTCTAGTTCAACTAAGGCGAGATGCGCAGCGTTTGGCTTAGCTGCTGCCGCATTTTTACGGCGTTGGTTATAGAAATCAAGCACTTTCGCACGGTTCTTTTGCAAGGCTTCGGGCGTGCAAACTTCTTCTACTTTATGCCCTGCCCACAATCCATCTTCAGCTCTAAAAGTAGGAATACCACTTTCGGCACTAATTCCAGCTCCCGTTAATACCACGCAAATTGGTTTATTTTTCTCTGTCATTTTTCAGGCTCCTTTTATTAGCAAACTGTTCTGTACCAAAATGAACATGTTCACCTTGAAATTTACCAGCTCCATTTTTAGTGCGATCATCAATTAAATAATTGCCTTGGTTGAGATTTTTATGATGGGATAAAATCAATCGTTTGTATAAGGCTGAACCTTTTTCTTCACCGAAATAATGTTGAATCCATTTTACTTTATCACTCCAAACGGATGGATTATGCCAAGGCGCAGTAGAAAGCACATAAATATGATATTTTTTCATCAATTTATGCACAGCAGAAATCGCATTAGGCATTGGCTCCATTAAGCTAAAAATACCCTCTACTTCATCATATCGACCTTCGTACTCTTGCTTGGTTTTCTCATCTAATTTTGCAATACCAGACGGAAAATCAACCATCACATTATCCATATCAATATAAACAATTTTCTTCATTTTAATGTCCTCTCTGTTGATGGCTTAATGATAAAAGATGAAGCGACAATTTATGTCGTTAGGCATTTTCGTCTAAATAAGTGCGGTCAATTTCTTGGTAATCTTCACCAAAATGGGCTATCCACCATTCCAGCATAGCACTCTTAATCACGGTAGCGGAAATTTCATATTCAGTGCCACAATCTTTTACTGTTTGATCCATTGATAATGGTGTTTCTGTTAAAAAGCCACCAATATCTTTATTAATGCGGAAAGTTAATCGAATTTTTCGACCATAGGTAAAACCAAACTTTTGGCTTTCTACATAAGATTTCAAATTAAAATCAGGGCGTTCAAATATCATTGTACTCACTGTTACCTTAAGCAAGCGATGCAAAGCAAGGTGTAAAATATCGCCATTCTCATATTGTGCGACTAAATAGCTACTTGGTCCTTGTTGAACCAAAGCCAATGGCTTGACCTGTGCCTTATGTTCTTTACCGTGAATACTCCGATAATGCACCTGCAAAAATCGATTTTGATAAAGTGCGGTACTAATTTGAGAAAAAATTTCTGGATTGATTTTGGCAGGTAATAACGGCTGACTAGTTGGGGCAATAGCAACTTTATTAAGCCATTCTGCCCCTGATTTTTTATGGCTGTCATAAACCAAATTATATTCGGCCTGTTGAAAGAACGCCTCCATTGAGTTCATAATGCTAGAAGGCAAAATGCCATTGAGATATTGTTTAGCAAGCATAAGCACAAGTGATTGCTGTTCATTTAAAATCGGTAAATCCAAGCCTTTAGCATTTGATTTCCATCGATATCCATAAGGTTTATCACGCATATCTCGCTCAATTTCAAACTGTTGAGACAAACTTTCTAGCTGGCGTTGGATTGAACGAATATCACGTTGAACGCCAATATCAGCAAGTTTTTGTAAGATTTCTTCTGCGGTAATAAAACGAGTTTTTGGAATAAGGCGTAAAATTTCAAGTTGAATTTGAAGTGCGGTTAAGTTTGAGGGCATTTTTATCTCCCAAATTTGAAAAAAATCATTATAAAAAATGCTGGAAAATTCCAGCATTATATTTTCTAAATCCGTCTGACTTGCCAGAAGGCTTTTGACCAATAAGGGTTATTCATTGAAGAATAGACGACTCCCCCTCTGGTGGAAGCATGAAGGAATTTATCTTCTTTTACATAAATCCCCACATGATAACCATTAGGGCCTCGGCCAGTTTTAAAGAAAATTAAATCGCCAGTTTGAATATCTTCTTTGCGTACATGTTTACCATAATTAGCTTGTTCAACAGTGCTTCTAGGCAAACGAAGATTAAAACGATCGAAGAAAGTTTTCTGCACAAAACCAGAACAATCTACCCCACGGCGTGAAACACCGCCGAGCACATAAGGTGTACCTGCCCATTCATGTTGTTGTTCGCTCAACATGGCTATAGCCATAATAGGATCGCCGATTTGACCTTTATAGTTCATCGCATAATCATCGTTTTGAAAACTGGAACAAGCGAATAAAAACAGCGAGGCAGTAGCGATTAAAAATAATTTATATACTTTCATACCTTTTCATATGAAAAGTGCGGTAGAAATTCACCGCACTTTTTGTTGCTTACTATTTAGTTTTTTCTACACGGGCACGTAACTTTTGCCCAGGTTTAAATGTCACTACTCGGCGAGCAGAAACTGGCACAACATCACCTGTTTTTGGGTTACGCCCTGGGCGAGATGACTTATCACGTAGTTCAAAATTACCAAATCCTGATAATTTCACATCTTGACCAGATTCTAGCGATAAGCGGATCTCTTCCAAAAAGTTCTCCACTACATTTTTCGTATCTTGTTTAGATAAGTGATATTTATCGCTTAAATATTCAATAATATCAAGTTTAGTTATCGTAGCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_017452|1013233:1019912|1019621_1019912_-|WP_005652847.1|DBSCAN-SWA MATITKLDIIEYLSDKYHLSKQDTKNVVENFLEEIRLSLESGQDVKLSGFGNFELRDKSSRPGRNPKTGDVVPVSARRVVTFKPGQKLRARVEKTK >NC_017452|1013233:1019912|1014494_1015496_+|WP_014550799.1|DBSCAN-SWA MNNQNPIEIYQAQDGTTQVEVRFENGTVWLSQAQMANIFDTSSDNIGLHLKNIFNEEELDENLTTEDFSVVRQEGKRQVTRKVKHYNLDAIISVGYRVKSKSATNFRIWATARLKEYLTQGYTINQKRLQQNAHELEQALALIQKTANSSELTLESGRGLVDIVSRYTHTFLWLQQYDEGLLAEPQTQQGGTLPTYAETCSALAELKSQLMAKGEASDLFGRERDNGLSAILGNLDQSVFGEPAYPSIEAKAAHLLYFVVKNHPFSDGNKRSGAFLFVDFLHRNGRLFDHNGHPVINDTGLAALTLLVAESDPKQKETLIRLIMHMLKQKQEK >NC_017452|1013233:1019912|1019083_1019569_-|WP_005688175.1|DBSCAN-SWA MKVYKLFLIATASLFLFACSSFQNDDYAMNYKGQIGDPIMAIAMLSEQQHEWAGTPYVLGGVSRRGVDCSGFVQKTFFDRFNLRLPRSTVEQANYGKHVRKEDIQTGDLIFFKTGRGPNGYHVGIYVKEDKFLHASTRGGVVYSSMNNPYWSKAFWQVRRI >NC_017452|1013233:1019912|1014075_1014276_-|WP_005688188.1|DBSCAN-SWA MAMKVIMARDPLFEDVKKYVQQQKVASCSMIQRRFMLGFNRAGQILEQLEQAGIISSMKNGQRKVL >NC_017452|1013233:1019912|1016283_1016778_-|WP_005688182.1|DBSCAN-SWA MHPVIEFYLEQRKSQHNLSLQDMRAMPKRMIGDAYFYIPWLLPVTESSKWNRSVPVFNEEDLAIFIGDEAIQNKYLHSIDIILDYFCLYREDNKIFPKPELTERKVWLRNIGHESKKISRIIRSLNYCGHTELAKSLQQLAIKLGQEKGVIQEETIGIWTNLLK >NC_017452|1013233:1019912|1018064_1019018_-|WP_012054395.1|DBSCAN-SWA MPSNLTALQIQLEILRLIPKTRFITAEEILQKLADIGVQRDIRSIQRQLESLSQQFEIERDMRDKPYGYRWKSNAKGLDLPILNEQQSLVLMLAKQYLNGILPSSIMNSMEAFFQQAEYNLVYDSHKKSGAEWLNKVAIAPTSQPLLPAKINPEIFSQISTALYQNRFLQVHYRSIHGKEHKAQVKPLALVQQGPSSYLVAQYENGDILHLALHRLLKVTVSTMIFERPDFNLKSYVESQKFGFTYGRKIRLTFRINKDIGGFLTETPLSMDQTVKDCGTEYEISATVIKSAMLEWWIAHFGEDYQEIDRTYLDENA >NC_017452|1013233:1019912|1016856_1017567_-|WP_005671438.1|DBSCAN-SWA MTEKNKPICVVLTGAGISAESGIPTFRAEDGLWAGHKVEEVCTPEALQKNRAKVLDFYNQRRKNAAAAKPNAAHLALVELEKAYDVRIITQNVDDLHERAGSSKVLHLHGELNKARSSFDESYIVDCFGDQKLEDKDPNGHPMRPYIVFFGEMVPMLERAVDIVEQADVVLVIGTSLQVYPANGLVNEAPRKAPIYLIDPNPNTGFVRKQVIAIKEKAGEGVPKVVAELLENTKNS >NC_017452|1013233:1019912|1013233_1014079_-|WP_005688189.1|DBSCAN-SWA MKNDLNYAVELIRKADGILITAGAGMSVDSGLPDFRSVGGFWNAYPMFKEHNISFEDIATPLAYKHNQELAYWFYGHRLIQYRNTIPHEGYQILKRWAGDKSHGYFVFTSNVDGHFQKAGFDDSHVYEVHGTLERLQCVNNCRGLSWSASSFQPVVDNKNLCLTSEKPHCPYCGGFARQNVLMFNDWSYVSQYQDFKKVRLESWLKEVQNLIVIELGAGKVIPTVRCFSERTAKAKKGGFIRINPQDAGVPKMHFLSLEMKALDALKAIDRLLNPSQQAVE >NC_017452|1013233:1019912|1015553_1016270_-|WP_005688183.1|DBSCAN-SWA MVTEEFKKVAVSFAGGDGGNPNSDVWFCGLEWGIGDEASPDDFYKKFSLSPKLIPHSWLEDDFDGSWTTQYNQKLCWFLWYYYNLDWKSGESYEYFVSTYNVLYPQGIGFKLNMLPINFKNRASIQWNEQFIKMTGFETFDQYREWCVENRGAFYRQLIDECNPKVIICTGVTEKDNFFKFFTGEAVYETKALKEFNIFYRKYNDTLICVCPFFGGPSGINSYDKMEALVESVKELCK >NC_017452|1013233:1019912|1017550_1018006_-|WP_005688179.1|DBSCAN-SWA MKKIVYIDMDNVMVDFPSGIAKLDEKTKQEYEGRYDEVEGIFSLMEPMPNAISAVHKLMKKYHIYVLSTAPWHNPSVWSDKVKWIQHYFGEEKGSALYKRLILSHHKNLNQGNYLIDDRTKNGAGKFQGEHVHFGTEQFANKRSLKNDREK |
10 | Escherichia_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1212090 : 1220604
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_017452|1212090:1220604|DBSCAN-SWA TATGAATATTTTCAATCCAAACCACGATCGTAAAGCGATTGTCATCTTTTCAGGTGGACAAGACTCCACGACTTGTTTATTCCAAGCTATTGCTGAATACGGCAAAGAAAACGTAGAAGCCATTACCTTTCAATATGGGCAGCGTCATGCTATTGAGTTAGAAAAGGCACGCGCCATTACGCAAGATCTCGGCATTAAACAAACCTTGATTGATACATCTGTTATAAAAGCTATCACGCATAATGCATTAATGGATGAACAGGCGCATATTGAGCAAAAAGAGAATGAATTGCCAAACACTTTTGTTGATGGTCGCAATGCCCTATTTTTACTTTATGCTGCGATTTATGCGAAAGGCCAAGGCATTCAAGATATTATCACTGGCGTATGTGAAACAGATTTCAGCGGTTATCCCGATTGCCGAGATGTGTTTATCAAGTCAATGAATGTCACATTAAATTTAGCTATGGATTATCAATTCAATATCAAAACACCATTAATGTATCTCACTAAAGCCCAAACTTGGCAACTTGCTGATGAATTAGGCGTATTAGATTATATACAAAAACATACTCACACTTGCTATGAAGGCATCGAAGGTGGATGCGGAAAATGCCCAAGCTGTATTTTACGCAATAAAGGTCTAAAGAAATATTTGACTCAAAAAGGTAGAAAAAATGTTTAAAATTTCCAAAGAATTTAGCTTTGACATGGCACATTTATTAGATGGACATGATGGGAAATGTCAAAATTTACATGGACACACATATAAATTACAAGTTGAAATTTCGGGTGACTTATATGAATCAGGTGCAAAAAAAGCAATGGTCATTGATTTTTCAGATCTAAAGTCTATTGTGAAAAAAGTTATTTTAGATCCGATGGATCACGCCTTTATTTATGATCAAACCAATGAGCGAGAAAGCCAAATTGCCACTCTATTGCAAAAGTTAAACTCAAAAACTTTTGGTGTTCCCTTTAGAACTACGGCAGAAGAAATAGCTCGTTTTATTTTTAATCGTTTAAAACATGATGAACAACTGTCCATATCATCCATTCGTTTATGGGAAACCCCAACTTCATTTTGCGAGTATCAGGAGTAAATGTTGATGGAAAAATATCATGATTTTGAACCGAACTTTAACATAGTCGAAATTTTTGAAAGTCTGCAAGGGGAGGGCTTCAATACGGGAATGCCAAGTGTTTTTGTACGATTTGGTAAATGCAATCTAGACTGTCCTTGGTGTGATACACCTTATAATAATTTTAAACGCTGGTCTGTATCACAAATTCTAGAAAAAGTGCGGTCATTTTCGTCAAAGAATATTATCATCACAGGTGGTGAGCCAACAATTGTACCAAAAATTGAATACTTACTTGAGCAATTTAAATCAGATGGCTATTTTCTTGCAATTGAAACCAATGGTCTAAAAGCAATTCCTGCACAAATAGATTATATTGCGACGAGTCCTAAGAGCCTTTATGCTCATAAGTATGAAAAGCGTTGCATTCCATTTGCAAATGAAGTACGTATTGTAATGGACAGTAATATGCCATCATTTTGTGAATTGATCGAGCAAAAAATAAAAGCAAAGAATTACTATCTTTCACCTTGTGAAATTGATGGGAAAATGAATTTACTTGAGACTATCACTTTACTTGGTCAATTGAATCAACGTTCAAATAAACCTAAATGGCAGCTAAGTTTACAAACACATAAATTGATTGGTATTGAGTAATAGAAGGAAATATTATTTTTTGATCAATATATAATTTAGTATATGACGTTTTCTACTTTAGAGAGTGATCATAATGAAACTTGGATAGCACACTTCTCCCATTCCTTTGTGCTAACCATTTTTTGGAATTTTGTACCATATCTCACTCTTTCTCATTTGTATTAATTATGAATAACATTGAATTTGAGTAACTTTTTAACCTAAAACTTAATTCGGACAAAATCACCGACTATGCGTAAAATGGCGTGCAAGTAGAAGGAAAAGCAAATGTTTATAAAATCATTACAGGAATCCTAGCAAATCAAGTATTGATTAAGTCATTAAACAACATTCCTATGCTATTATTGTTCATCATGGGTATTTTTGGAAAAATGAGAAACCTTGCATTTTAGGAATGAGAGGTAAACGAATTAAAAGTTTGTTTATAAATAGTATAAAAATAGCTTTCAAAGCATATAATTTTGATGTTGAGTTTAAGGATATAGGAGAATCCCGCTTAATATTATTCTGAAAATGTTCTACCCTACTTTTGATATACTCACAAATCTTATTGTTTCACAAGATAGATGGGACTATAATAACTGTAAATTTAAACAGATTAAAGATAGTTTATGATGGATATTTCTGAATTACTTGACGGACTCAACGATAAACAACGCGAAGCCGTAGCTGCTCCTCTTGGTAATCACTTAGTGCTAGCTGGTGCAGGCTCGGGCAAAACGCGTGTATTGACGCACCGTATTGCTTGGTTAATTGCGGTCGAAAATATTTCTGAAGGCAGCATTATGGCGGTGACCTTTACCAATAAAGCCGCAGCAGAAATGCGTCATCGTATTCAATCTACCCTTGCCAAACACGCACAACATCAATTATTTGGTATGTGGATTGGCACCTTCCATAGCATTGCTCATCGTTTGTTGCGAGCTCATCATTTAGATGTGGGATTGCCACAAGATTTCCAAATTTTAGATTCAGAAGATCAACTTCGTTTAATTAAACGATTATTAAAATTACATAATTTTGATGAAAAAGCTTTTCCGCCTAAACAGGCTTGTTGGTACATCAATAACAAAAAAGATGAAGGCTTGCGACCAAATGATATTGAAGATTTTAATGATCGCCAAGAACGTGAATGGATTAAAATTTATCAGATCTATCAAGACACTTGCGATCGCGCAGGGTTGGTCGATTTTGCTGAATTATTAATTCGGGTCTATGAATTATTTGAGAAAAAACCATTAATTTTGCAACGTTATCAACAACGTTTTCAGCATATTTTGGTGGATGAGTTTCAAGACACCAATAAAATTCAATATAAGTGGATTAAAATTCTTGCTGGAAAAACAGGCAAAGTCATGATCGTAGGCGATGATGATCAATCTATATACGGTTGGCGTGGTGCACAAATTGAAAATATCCAAAAATTCTTGAAAGATTTCAAAGCCGAAACAATTCGCCTTGAACAAAACTATCGTTCTACCGCCAATATCCTAAACAGCGCAAATGAATTAATTGCAAACAATAGTGATCGTCTTGGTAAAAATTTATGGACAGAGGGTGAGAAAGGCGATCCTGTGGGCATCTATTCTGCCTTTAATGAATTGGATGAAGCAAAATTTGTCGCTTCACAAATTCAGGATTGGGTAGAACATGGCGGAAAACTTGATGATTGTGCTGTACTTTATCGTAGTAATAGCCAATCACGGGTTATTGAAGAAGCTTTAATTCGTTGTCAAATTCCATACCGTATTTATGGCGGTATGCGTTTCTTCGAACGTCAAGAAATTAAAGATGCGTTAGCCTATCTTCGTTTGATTAATAATCGTCAAGATGATGCGGCTTTTGAGCGTGTAATTAATACGCCAACCCGTGGCATTGGCGACCGCACTTTAGATATATTGCGTAACTTAACACGCGAACGCCAAATTACCTTATGGCAAGCAGTACAAGTCGCAACACAAGAAAATATGTTAGCAGGGCGAGCCTCAACAGCCTTATTACGTTTCCAAGAATTAATTAATTCACTACAACTTGATACCGCAGAAATGCCACTTTTCGCACAAACTGATTTTGTGATTAAACATTCGGGCTTATATGAAATGTATCAACAAGAAAAAGGCGAAAAAGGCGAAGTGCGTATTGAAAACTTGGAAGAATTAGTTACCGCAACCCGTGAATTTATCAAACCTAATGATGCGGAAGAAATGACCGAACTCACTGCCTTTTTAACGCACGCTTCCTTAGAAGCTGGCGAAGAACAAGCCTCGCCACATCAATCTTGTGTAGAAATGATGACGTTGCACTCTGCGAAAGGCTTAGAATTTCCTCGTGTATTTATGGTGGGCGTAGAAGAAGGATTATTCCCAAGTTTTCGTTCTTTTGAAGAACCCGGACGTTTAGAAGAAGAGCGTCGTTTAGCTTATGTCGGTATTACTCGCGCACAGAAAAAACTGACCATCTCTTATGCGGAAAGCCGTCGATTATATGCCAAAGAAGAACGCCATTTGCCATCACGGTTTATCGCAGAATTACCGAGAGAATGTATCCAAGAAATTCGTTTACGAGGGACAGTCACGCGTGCGATGAACCTAGCAAAAGTCGGTTCATTGTCGAATACCAGTGCGGTCGAAAATGAATGGAAAATGGGTCAAAAAGTTAAACACGAAAAATTTGGTTTCGGCACAGTGATTAATGTGGAAGGATCTGAAAATAACACACGTTTACAAATAGCGTTCCAAGCTCAAGGCATTAAATGGTTGATTGCGCATTTGGAAACATTGGAAAAAGTGCGGTAGAATTCAAGAGTATTATATTTTTTACCGATTAATTTCTTTGAAAAGTGCGGTGAATTTTTACCGCACTTTTATTATCTACGAGTGATGGAATGTTTAAATTTGTATTCAAACGAATCTTAATGGTGATCCCTACTTTTATTGCCATTACTTTTATTACCTTTGCCCTTGTGCATTTTATTCCTGGTGATCCTGTGGAAATAATGATGGGTGAACGTGGCTTAACGGCAGAAGTACATCAACAAATGATGCACCAATTGGGTTTAGATTTACCTCTTTATCAGCAATATTTCCGCTATATTGGCAATGTAATTCAAGGGGATTTCGGTGCATCGTTCCGCACTCAACAACCTGTTCTTACTGAATTTTTTACACTTTTCCCTGCCACCGCTGAATTAGCATTTTTTGCGTTATTTTGGTCATTATTAGGTGGAATAATTTTAGGCACGATTGCCGCAGTAAAAAAAGACAGTTGGATTTCTCACACCGTTACAGCTGCATCGCTCACAGGTTATTCTATGCCGATTTTCTGGTGGGGATTGATTTTAATTTTATACGTTTCACCACAACTCGGTTTACCGCAAGGTGGACGTTTAGATAATGAATTTTGGATCGATACACCAACAGGATTTATGCTTATTGATAGCTGGCTTTCAGGTGTTTCTGGTGCCTTCGAAAATGCGGTGAAATCATTAATTCTTCCTGCCATCGTCTTAGGCACAGTTCCTCTCGCCATTATTACGCGTATGACACGATCTGCAATGCTGGAAGTATTAGGCGAAGATTACATTCGCACGGCTAAAGCAAAAGGCCTAAATTATACTCGAATCGTCATTGTGCATGCATTGCGTAATGCGTTAATTCCTGTTGTCACTGTGGTGGGATTAATTGTAGGTCAATTGCTTTCTGGTGCAGTTCTCACAGAAACTATTTTCTCTTGGCCGGGAATTGGAAAATGGATCATTGATGCCATTCAAGCCCGTGATTATCCTGTGTTGCAAGGTTCTGTACTGATTATTGCGACGATTATTATTGTGGTAAATTTAACCGTCGATTTACTTTACGGCGTGGTCAATCCGCGTATCCGTCATTAATTGTAGGAGAAATTATGTCTGACACGCCTTTAACTTTCGCGCCAAAAACACCTTTACAAGAATTTTGCTTTTACTTCAAACAAAATCGTGGTGCGCTAATTGGTTTAATTTTTATTTTGATTGTTGCCTTAATCAGCATTCTCGCGCCTTATATTGCGCCTTTTGATCCAACAGTGCAAAATCGTACCGCACTTTTACTTCCCCCTGCTTGGTATGAAGGCGGCAATCCAGCCTATTTACTCGGCACAGACGATATTGGACGAGATATTCTTTCGCGCATTATTTACGGAACGCGAATTTCCGTTTTTGCAGGATTTGTCATTGTATTGCTGTCTTGTGCCTTTGGTACTAGTCTTGGCTTGATTTCTGGCTATTATGGCGGCGTGCTAGATACAATTATCATTCGCCTAATTGATATTATGCTTGCGATTCCAAACTTACTTTTGACGATTGTAGTCGTCTCTATTTTAGAGCCATCACTCGCCAATGCCACTTTAGCGATCGCCGTGGTATCGATTCCTAGCTATGTGCGTTTAACCAGAGCGGCAGTAATAAATGAAAAAAATCGTGATTATGTGACTTCATCTAAAGTGGCAGGGGCAGGTATTTTACGCCTCATGTTTATTGTGATTTTACCAAACTGTTTAGCCCCTTTAATTGTGCAAATGACAATGGGCATTTCCAATGCCATCTTAGAACTCGCGACACTTGGTTTCTTAGGCATTGGTGCAAAACCACCAACACCTGAACTTGGCACAATGCTTTCAGAAGCACGCAGTTTTATGCAAGCGGCAAACTGGTTAGTTACAATTCCTGGCTTAGTGATTTTATCTTTGGTGCTTGCTTTCAACTTAATGGGCGATGGCTTGCGTGATGCCCTTGATCCAAAACTCAAACAATAGGAAAACAGAATGGCATTATTAGACGTAAAAGAACTTTCTGTTCACTTTGGCGATAAAAAAACGCCATTTAAAGCAGTGGATCGCATTAGCTATCAAGTCGCACAAGGCGAAGTGCTTGGCATTGTAGGAGAATCAGGCTCAGGTAAATCTGTGAGTTCTCTCGCAATTATGGGATTAATTGATCATCCTGGACGTGTATCGGCTGAATCCTTGCAATTTGAAAATACTGATTTACTCACTTTAGAGAGTAAAGCTAAACGCCAGCTTATTGGTGCTGATGTAGCAATGATTTTCCAAGATCCGATGACAAGTTTGAATCCTGCTTATACTGTGGGTTTCCAAATTATGGAAGCGTTAAAAACTCACGAGGGCGGCACAAAAAAGGCGAGAAAAGACCGCACTTTAGAGCTTTTAAAATTGGTCGGTATTCCTGATCCTGAATCTCGGATTGATGTTTATCCCCATCAGCTGTCTGGTGGAATGAGCCAGCGCGTGATGATTGCGATGGCAATTGCTTGCAGACCTAAATTATTGATTGCTGATGAGCCAACCACGGCATTGGACGTGACTATTCAAGCACAAATTATGGAACTCTTACTCGAATTGCAGAAAAAAGAATGCATGTCGCTGATTTTGATTACCCATGATCTTGCGCTTGTTGCTGAAGCGGCAGATCGAATTATCGTGATGTATGCTGGACAAATCGTTGAAGAAGGCACCGCAAAAGATATTTTCCGCGAACCAAAACACCCTTACACACAAGCCTTGTTACGTTCATTACCTGAATTTGCAGAGGGAAAATCTCGCTTAGAATCATTACAAGGGGTCGTCCCTGGAAAATACGATCGCCCAACAGGCTGTTTATTAAATCCTCGCTGCCCTTATGCCACCGAATATTGTCGCCAAGTTGAACCTCTATTGCATCATATCGGTTCGCATAAAGTAAAATGCCATACTCCACTGAACGAGCAAGGCAATCCAGTTGAATATCAAGGAGCTTAATAATGACGAATGAAGTAAAAGAAAATCCGCCATTATTAAATGCCATTGGCTTAAAAAAATATTACCCTGTAAAAAAAGGCTTGTTTGCAAAACCACAGCAAGTAAAAGCGTTGGATGGTGTCTCTTTTCAGCTTGAACGAGGTAAAACTTTAGCAGTCGTGGGTGAATCAGGTTGTGGAAAATCAACGCTAGGTCGTTTATTGACAATGATTGAAGAACCAACCAAAGGCGAACTTTATTACAAAGGGCATAATTTTTTAGAAAATGATTCTGAAACAAAAGCACTACGTCGTAAAAAAATTCAAATAGTTTTTCAAAATCCTTACGCATCGTTAAATCCACGCAAAAAGATTGGTTCAATTTTGGAAGAACCATTAATCATCAATACAAAACTTTCCGCCAAAGAACGGCGAGAAAAAGTTTTATCGATGATGGAAAAAGTGGGCTTGCGCGCTGAATTTTATGATCGTTATCCCCACATGTTCTCAGGCGGACAACGCCAACGTATTGCCATCGCTCGTGGTTTAATGTTAGATCCCGATGTCGTTGTTGCCGATGAGCCTGTTTCTGCATTGGATGTTTCCGTGCGTGCACAAGTACTGAATTTAATGATGGATTTACAAGATGAATTAGGCTTGTCTTACGTATTCATTTCACACGATCTTTCTGTGGTAGAACATATCGCTGATGAAGTGATGGTGATGTATTTAGGTCGTTGTGTTGAAAAAGGGACGACAGAGCAGATTTTTTCTAATCCTCAGCATCCTTATACCAAAGCGTTACTTTCAGCGACACCACGTTTGTCGCCAAACTTGCGCCGTGAACGCATAAAACTGACAGGCGAATTGCCAAGCCCAATTAATCCGCCAAAAGGCTGTGCATTTAATCCTCGTTGTTGGAAAGCGACAGAAAAATGTCGTGAAAATCAACCGCACTTGGAACAATATACTGATGGAAAATTAATCGCTTGTTTCCATATTGATTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_017452|1212090:1220604|1217728_1218616_+|WP_014550903.1|DBSCAN-SWA MSDTPLTFAPKTPLQEFCFYFKQNRGALIGLIFILIVALISILAPYIAPFDPTVQNRTALLLPPAWYEGGNPAYLLGTDDIGRDILSRIIYGTRISVFAGFVIVLLSCAFGTSLGLISGYYGGVLDTIIIRLIDIMLAIPNLLLTIVVVSILEPSLANATLAIAVVSIPSYVRLTRAAVINEKNRDYVTSSKVAGAGILRLMFIVILPNCLAPLIVQMTMGISNAILELATLGFLGIGAKPPTPELGTMLSEARSFMQAANWLVTIPGLVILSLVLAFNLMGDGLRDALDPKLKQ >NC_017452|1212090:1220604|1219620_1220604_+|WP_005657163.1|DBSCAN-SWA MTNEVKENPPLLNAIGLKKYYPVKKGLFAKPQQVKALDGVSFQLERGKTLAVVGESGCGKSTLGRLLTMIEEPTKGELYYKGHNFLENDSETKALRRKKIQIVFQNPYASLNPRKKIGSILEEPLIINTKLSAKERREKVLSMMEKVGLRAEFYDRYPHMFSGGQRQRIAIARGLMLDPDVVVADEPVSALDVSVRAQVLNLMMDLQDELGLSYVFISHDLSVVEHIADEVMVMYLGRCVEKGTTEQIFSNPQHPYTKALLSATPRLSPNLRRERIKLTGELPSPINPPKGCAFNPRCWKATEKCRENQPHLEQYTDGKLIACFHID >NC_017452|1212090:1220604|1213192_1213828_+|WP_005686506.1|DBSCAN-SWA MLMEKYHDFEPNFNIVEIFESLQGEGFNTGMPSVFVRFGKCNLDCPWCDTPYNNFKRWSVSQILEKVRSFSSKNIIITGGEPTIVPKIEYLLEQFKSDGYFLAIETNGLKAIPAQIDYIATSPKSLYAHKYEKRCIPFANEVRIVMDSNMPSFCELIEQKIKAKNYYLSPCEIDGKMNLLETITLLGQLNQRSNKPKWQLSLQTHKLIGIE >NC_017452|1212090:1220604|1214439_1216623_+|WP_014550901.1|DBSCAN-SWA MMDISELLDGLNDKQREAVAAPLGNHLVLAGAGSGKTRVLTHRIAWLIAVENISEGSIMAVTFTNKAAAEMRHRIQSTLAKHAQHQLFGMWIGTFHSIAHRLLRAHHLDVGLPQDFQILDSEDQLRLIKRLLKLHNFDEKAFPPKQACWYINNKKDEGLRPNDIEDFNDRQEREWIKIYQIYQDTCDRAGLVDFAELLIRVYELFEKKPLILQRYQQRFQHILVDEFQDTNKIQYKWIKILAGKTGKVMIVGDDDQSIYGWRGAQIENIQKFLKDFKAETIRLEQNYRSTANILNSANELIANNSDRLGKNLWTEGEKGDPVGIYSAFNELDEAKFVASQIQDWVEHGGKLDDCAVLYRSNSQSRVIEEALIRCQIPYRIYGGMRFFERQEIKDALAYLRLINNRQDDAAFERVINTPTRGIGDRTLDILRNLTRERQITLWQAVQVATQENMLAGRASTALLRFQELINSLQLDTAEMPLFAQTDFVIKHSGLYEMYQQEKGEKGEVRIENLEELVTATREFIKPNDAEEMTELTAFLTHASLEAGEEQASPHQSCVEMMTLHSAKGLEFPRVFMVGVEEGLFPSFRSFEEPGRLEEERRLAYVGITRAQKKLTISYAESRRLYAKEERHLPSRFIAELPRECIQEIRLRGTVTRAMNLAKVGSLSNTSAVENEWKMGQKVKHEKFGFGTVINVEGSENNTRLQIAFQAQGIKWLIAHLETLEKVR >NC_017452|1212090:1220604|1218625_1219618_+|WP_005660423.1|DBSCAN-SWA MALLDVKELSVHFGDKKTPFKAVDRISYQVAQGEVLGIVGESGSGKSVSSLAIMGLIDHPGRVSAESLQFENTDLLTLESKAKRQLIGADVAMIFQDPMTSLNPAYTVGFQIMEALKTHEGGTKKARKDRTLELLKLVGIPDPESRIDVYPHQLSGGMSQRVMIAMAIACRPKLLIADEPTTALDVTIQAQIMELLLELQKKECMSLILITHDLALVAEAADRIIVMYAGQIVEEGTAKDIFREPKHPYTQALLRSLPEFAEGKSRLESLQGVVPGKYDRPTGCLLNPRCPYATEYCRQVEPLLHHIGSHKVKCHTPLNEQGNPVEYQGA >NC_017452|1212090:1220604|1216742_1217714_+|WP_014550902.1|DBSCAN-SWA MVIPTFIAITFITFALVHFIPGDPVEIMMGERGLTAEVHQQMMHQLGLDLPLYQQYFRYIGNVIQGDFGASFRTQQPVLTEFFTLFPATAELAFFALFWSLLGGIILGTIAAVKKDSWISHTVTAASLTGYSMPIFWWGLILILYVSPQLGLPQGGRLDNEFWIDTPTGFMLIDSWLSGVSGAFENAVKSLILPAIVLGTVPLAIITRMTRSAMLEVLGEDYIRTAKAKGLNYTRIVIVHALRNALIPVVTVVGLIVGQLLSGAVLTETIFSWPGIGKWIIDAIQARDYPVLQGSVLIIATIIIVVNLTVDLLYGVVNPRIRH >NC_017452|1212090:1220604|1212766_1213192_+|WP_005647466.1|DBSCAN-SWA MFKISKEFSFDMAHLLDGHDGKCQNLHGHTYKLQVEISGDLYESGAKKAMVIDFSDLKSIVKKVILDPMDHAFIYDQTNERESQIATLLQKLNSKTFGVPFRTTAEEIARFIFNRLKHDEQLSISSIRLWETPTSFCEYQE >NC_017452|1212090:1220604|1212090_1212774_+|WP_005660434.1|DBSCAN-SWA MNIFNPNHDRKAIVIFSGGQDSTTCLFQAIAEYGKENVEAITFQYGQRHAIELEKARAITQDLGIKQTLIDTSVIKAITHNALMDEQAHIEQKENELPNTFVDGRNALFLLYAAIYAKGQGIQDIITGVCETDFSGYPDCRDVFIKSMNVTLNLAMDYQFNIKTPLMYLTKAQTWQLADELGVLDYIQKHTHTCYEGIEGGCGKCPSCILRNKGLKKYLTQKGRKNV |
8 | uncultured_Caudovirales_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1347294 : 1356363
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_017452|1347294:1356363|DBSCAN-SWA TATGTTTAACAAAATTTTTTCGTGGTTTGAAAATCGTTTAAATCCCTATCCAGAAAGCAATCCAACAACACCTAAAAAAGGTTTGTTCCGTTTTATTTGGTCTAGTATTACAGGAATGAAAGGCTGGATTTTTTTGCTCGCAATTTTAACCGTAGGTACAGGTGTAATGGAAGCTGTATTATTCCAATTTATGGGAACGCTTGTAGATTGGTTAGGCACATTTACACCTGAAAGATTATGGCAAGAAAAAGGTCATTTATTAATTGGAATGGCTGCTCTATTACTCATTAGTATTGTATGGGGATTTTTAGCTTCGGCCGTGCATTTACAAACCTTACAAGGCGTATTTCCAATGCGATTACGTTGGAATTTCCATCGTTTAATGCTTGGACAAAGTTTAAGTTTTTATCAAGACGAATTTGCAGGTAGAGTATCCGCAAAAGTAATGCAAACCGCCCTTGCAGTACGTGACACAGTACTTACACTTGCAAATATGTTCGTTTATGTATTGGTATATTTTATTACCTCTGGCGTAGTGCTAGTGGCATTAGATTCTTGGTTCTTATTACCATTTATTACTTGGATTATACTCTTCGGTTTGATCCTACGAACCCTAATTCCTAAACTATCAAAAACCGCACAACGACAAGCTGATGCTCGTTCTTTAATGACAGGATGCATTACAGATGCTTATTCTAATATTGCTACAGTAAAATTATTTTCTCACGGCTCACGCGAAGCTACTTATGCCAAGCGTTCTATGCAAGATTTTATGGTAACAGTACACGCCCAAATGCGCTTAGCAACATCACTAGATACACTCACTTACGCTACAAATATTCTACTTACGTTAAGTACTGCAATACTTGGTATTATTTTATGGAAAAATGGTCAAGTTGGCGTGGGTGCAATAGCAACGGCAACGGCAATGGCATTACGCGTAAATGGGCTTTCTCGCTGGATTATGTGGGAATCTGCCCGTTTGTTTGAGAATATCGGCACTGTAAACGACGGAATGAATACTTTAACCAAACCTCACACCATTGTGGATAAACCACAAGCATCACCGTTACAAGTGAAACAAGGGGAAATTAAGTTTAACAATATTACCTTTGCTTACGATCCGACAAAACCATTACTCAATCATTTCAATCTCACTATCAAACCAGGGGAAAAGGTTGGGTTAATCGGTCGTTCTGGTGCAGGAAAATCTACGATTGTGAACTTATTACTTCGCTTTTATGAAGCACAACAAGGCGAAATTACCATTGATGGACAAAATGTACTCAATGTGCAACAAGAAAGCTTACGTCGCCAAATCGGTTTAGTCACTCAAGACACTTCGTTGCTACATCGTTCTGTACGTGACAATATTATTTATGGTCGCCCGAATGCTACTGATGAAGAAATGGTTTTAGCTGCTGAACGAGCGAAAGCCGCTGATTTCATCCCATTTCTCAGTGATTCTCAAGGTAGAAAAGGCTATGATGCCCATGTGGGAGAACGCGGGGTAAAACTTTCTGGTGGTCAGCGTCAGAGAATTGCCATTGCTCGTGTAATGTTAAAAGACGCACCAATTCTATTGTTAGATGAAGCCACAAGTGCATTGGATTCAGAAGTGGAAGTGGCAATACAAGAAAGTCTAGATAAGATGATGGAAAATAAAACTGTGATTGCCATTGCCCATCGTTTATCCACCATCGCAGCGATGGATCGCCTGATTGTGCTTGATAAAGGACAAATTGTCGAACAAGGTACGCACGCCGAATTACTAGAGCTCAATGGTCTGTACGCTAAACTTTGGAATCATCAAAGTGGCGGATTTTTAAGCGAAAGTGCTGAATGATATTGCGTTTATCATATTTAATTAATTGTACTGTAATCAAGCTAATTAAAAAATTAGTCTAATTTAATAGCTAAAGAAAAGTGCGGTGAATTTTTACCGCACTTTTTTGCTAGATATTTAGCGTTTAATTCACGACTTCAGCAGTATATTTCAGCTTGTGAATTGCATCGAATAATTGTTGGTTTGTGACTTTTGGATCTTCCACAACCGTCACTAAACCATCTTTAATAGATGCTTTTGTTAAAATAACGCCATTGATATTACGCAGTTCTTTATTGACTAAGTAAGCACAAAGCTGGCAATTCATTTCCTTTACTTTTAGCACAATTTGTTTGGTTTCATTCGCATGAGCGAAAGAAATTGCAAACAGCGAAAGCAAAAGTGCGGTACATAATTTCTTCATTTTTATTCCTAATTAGCTAATTCTAAAATCCAAGGTAAAATTGTTGGATAGGTTAAGAAAAAAATCATCACGATAAATACAATCCAATATAAAACGATAAGTTTTTTACGGGAAATATATTTGCTACAAATGATTTTTTTGGAAAACATCAACAGCCAAAATCCATAGGCAAAGGCGCATAATGAAATGATAAGCATAGGAATACGCAAATAATCATATTCGCCTAAGCCAATCAACCAAGTGGACGACACACCAAATACTAAATAAATTAATGGTGCGATGCAGCACAAGGTTGATGCCACCGCAGCACTTAGTGCGGCGGCTATGGCAACCCAAAAGGATTTATTAGAGTTTTTTAGATACGTAGTCATATTTAAATTCTTTTGGGTCAAAGGAATTTAACGGATCGCCACCTACTTCTGCATATGGATAGCCGAAGTTATTGATTGGAGCCAGTTCTGGTTGTGGATATAAATCGAAGTCACGGGCATGATTAAATCCCACCCAGTTTGCTTCCCAGTTACCAAACAAATATTTTGCTACGGCTTGTGTATCTTTATCTTCAACAGATTTTTTCTCTGCTAAACGCATTTTGGCAACGTCTGCGGAATCAACTGGTACCCATCCAAATCCTGCAAGGTAGAATTCAGCGCGGCAGTGCTGACCGCCACTTACGTTTGCGATGCCTTGTTCATTTGCACTACCGAAGGCACCTTTTGAATATTTGCCCATTTTCTCTGCCGTACCTAAGCGAATACCAAAAATTTCACGAGCAGGGATGCCTGCAGCACGAGCAAGTGCCACAAATACAGAGTTAATATCGGTACATTTACCTTTTAACACGCCAGTGGTAAGAATTTTTTCTACATCGCCGTCACCACAACCTAATACAGAATTATCACGTTCCATATTTTTTACGATCCAGTGGTGAATAAGTTCTGCTTTCTTCAATGGATTAGTTTCTTTACCTAGGATTTTGTCAGCAAATTCTTTCACAATGCCATCAGTTTTAATATGTGGAGTAGCTTTTAAGTATTCTTGTACATCCACGGAATACTGAATATCTTTTGGCGGAGTATAATTCTCTAAAGCACCTTTCACCATCGGTTCACGGTCTTTTGTTTCAATGACCATCGTGACTTTTAAATCACGTTTTTGTGCATCTTTATCCCAAGTGGCAAATAAGGTTTTCGCTCCGTATTTATTGTTTTCTGTTACATAGGCATTCATGTAATTACCTTCAAAGTGAATCGATTTCACTTGTTGGTATTCCCCATTAAATGGTAATGGAACCCATAAATTGGTTTGTCCTTGCGAGCCTTTTGGCACAACTAAATCATAGGTTTGCGTGAATTCGTAAAGATGGGCGTCTGTATTGTAGTTTGGAATATTAGTGTTTGCATGAGCTAACGAGCCACATGCAGAAAGCACCGCAACTGCGATAAGTTTCTTCATGAAGAGATCCTCTAGTTAATAATAGTTAAACTTAACATATTAGATAAACTAATACGCCACTATGCTAACGGGTTTTTAAATCCATAGTCAATTTGTTATTCCAAAATTTATTAAAACATCAATCTACTAAAATACCCTATAAATAATATACCTATTAATGATTAATTGATTTGGCTCAAGTAAAACTTCTATACAAAGATTATAATTAACTTGTTTTAGTTATTTTTCAATCTGACTGTGGGGGAACGATATAATGAGTAACTTTAATCAAATAAGTCGCCGAGATTTTGTCAAGGCGTCATCTGCGGGAGCTGCACTGGCAGTTTCAAATCTTACTTTACCTTTCAATGTAATGGCTAAAGAGACACAACGCCTCAATGAAAATAATCAAGAACGTATTGTTTGGAGTGCTTGTACAGTAAACTGTGGTAGCCGTTGTCCATTACGAATGCACGTAAAAGATAACCGAATCACTTATGTGGAAACCGATAATACGGGGACAGAAACATATAATCTTGATCATCAGGTTCGCGCTTGTCTACGTGGACGTTCTATGCGTCGTCGAGTATATAACCCAGACCGTTTAAAATATCCAATGAAACGTATAGGTAAACGCGGAGAAGGCAAATTCAAACGAATCAGTTGGGATGAGGCTTTAACTGAAATTGCAGACGCATTGAAACGCAATATCAAAAAATATGGCAATGAATCAATTTATTTAAACTATGGTACGGGAACACTCGGTGGCACAATGGCTAAATCTTGGCCACCTGCATCCACTATGATCGCTCGTTTTATGAATTGTATTGGTGGATATTTAAACCATTATGGTGATTACAGCACCGCACAAATTGCTGTCGGTTTAGATTATACCTATGGTGGTGGTTGGGCATTGGGAAATGGAATGGCTGACATTGAAAACACCAAATTAATAGTGTTATTCGGTAATAATCCTGCAGAAACTCGTATGAGTGGAGGTGGTTTAACTTATTGTATTGAACAAGCCAAAGCTCGTTCCAATGCCAAAATGATTATTATCGATCCTCGTTATAATGATACTGGTGCAGGGCGTGAAGATGAGTGGATCCCAATTCGTCCAGGCACTGATGCAGCCCTCGTTTCTGCCCTTGCTTATGTAATGATTCAAGAAAATCTCGTGGATCAACCTTTCTTAGATAAATATTGTGTTGGTTATGATGAAAAAACATTACCTGCGGATGCCCCTAAAAATGGTCATTATAAAGCCTATATTTTAGGTTATGGTAATGATGGTATCGCTAAAACCCCAGAATGGGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_017452|1347294:1356363|1353681_1354299_+|WP_005647791.1|DBSCAN-SWA MEQYGFYFDSERCTGCKTCELACKDYKDLGTEVNFRRIYEYTGGQWNQQADGCWHQNIFAYYMSISCNHCADPACTKVCPTGAMHKNADGFVIVNEEICIGCRYCHMACPYDAPQYDAQKGHMTKCDGCYSRVKSGQKPICVDACPLRALDFAPIDELRTKYGTQASIAPLPPADITQPNLVVKPNKYARLSGDTSGFLGNPREV >NC_017452|1347294:1356363|1349550_1349868_-|WP_074030688.1|DBSCAN-SWA MAAALSAAVASTLCCIAPLIYLVFGVSSTWLIGLGEYDYLRIPMLIISLCAFAYGFWLLMFSKKIICSKYISRKKLIVLYWIVFIVMIFFLTYPTILPWILELAN >NC_017452|1347294:1356363|1354300_1355140_+|WP_014550952.1|DBSCAN-SWA MNTGLYELPLVFFTVLAQSAVGAWLVFTFVLLNEKNTKSRTYIHKVMFVILALLGIGFIASIMHLGLPIRAFNSLNRVGSSMMSNEIAAGAIFFTLAGFYWLIAILGKMPVSLGNVWRIVTALIGILFMYVMNQVYHITSIPTWNNALTSWSFYLTVVLGGLTLSYALLIPNKQREYQLQHLPSLFAIGVSLVAIVAIYQGFNLHNIHSAIQNAADLVPNYAIMTVTRLCLLSIVAFLLFRVKNIGLLGISVLLTLVAEGIGCVLFYGLHMTYGMAIGG >NC_017452|1347294:1356363|1349263_1349542_-|WP_014550949.1|DBSCAN-SWA MKKLCTALLLSLFAISFAHANETKQIVLKVKEMNCQLCAYLVNKELRNINGVILTKASIKDGLVTVVEDPKVTNQQLFDAIHKLKYTAEVVN >NC_017452|1347294:1356363|1355251_1355863_+|WP_014550953.1|DBSCAN-SWA MQNTLQQISIYGRLLGAVFYYEPNDARLTDILTFFRQPNWMQEWEISFDVKTHKKITALIEKGLQQNITEQYQYLFIGPNELPTPPWGSVYLDPECVIFGNSLLALRDFLQQHQITFQTQQDEPEDHIGLMLMLAAYLAENRPHLLIEFLREHFLTWAYHFLEQLSKIENSDFYQALALLTIKTLQQWQVDLHINVPTVRFYR >NC_017452|1347294:1356363|1349887_1350997_-|WP_014550950.1|DBSCAN-SWA MKKLIAVAVLSACGSLAHANTNIPNYNTDAHLYEFTQTYDLVVPKGSQGQTNLWVPLPFNGEYQQVKSIHFEGNYMNAYVTENNKYGAKTLFATWDKDAQKRDLKVTMVIETKDREPMVKGALENYTPPKDIQYSVDVQEYLKATPHIKTDGIVKEFADKILGKETNPLKKAELIHHWIVKNMERDNSVLGCGDGDVEKILTTGVLKGKCTDINSVFVALARAAGIPAREIFGIRLGTAEKMGKYSKGAFGSANEQGIANVSGGQHCRAEFYLAGFGWVPVDSADVAKMRLAEKKSVEDKDTQAVAKYLFGNWEANWVGFNHARDFDLYPQPELAPINNFGYPYAEVGGDPLNSFDPKEFKYDYVSKKL >NC_017452|1347294:1356363|1355862_1356363_+|WP_014550954.1|DBSCAN-SWA MKNEAYYQAYLSHHHISRRGLLRHVFPATKSTIEKTQSRPPFSAREDLFSAVCNGCGECASVCPNGLIQLKQQQATLEIDYAPCDLCGKCAEVCPTNALHPNFPADTLLRPQFSSACLILQNQTCPDCQTACPQQAISSTLEIDNERCNGCGECKITCFVAAITLK >NC_017452|1347294:1356363|1347294_1349139_+|WP_014550948.1|DBSCAN-SWA MFNKIFSWFENRLNPYPESNPTTPKKGLFRFIWSSITGMKGWIFLLAILTVGTGVMEAVLFQFMGTLVDWLGTFTPERLWQEKGHLLIGMAALLLISIVWGFLASAVHLQTLQGVFPMRLRWNFHRLMLGQSLSFYQDEFAGRVSAKVMQTALAVRDTVLTLANMFVYVLVYFITSGVVLVALDSWFLLPFITWIILFGLILRTLIPKLSKTAQRQADARSLMTGCITDAYSNIATVKLFSHGSREATYAKRSMQDFMVTVHAQMRLATSLDTLTYATNILLTLSTAILGIILWKNGQVGVGAIATATAMALRVNGLSRWIMWESARLFENIGTVNDGMNTLTKPHTIVDKPQASPLQVKQGEIKFNNITFAYDPTKPLLNHFNLTIKPGEKVGLIGRSGAGKSTIVNLLLRFYEAQQGEITIDGQNVLNVQQESLRRQIGLVTQDTSLLHRSVRDNIIYGRPNATDEEMVLAAERAKAADFIPFLSDSQGRKGYDAHVGERGVKLSGGQRQRIAIARVMLKDAPILLLDEATSALDSEVEVAIQESLDKMMENKTVIAIAHRLSTIAAMDRLIVLDKGQIVEQGTHAELLELNGLYAKLWNHQSGGFLSESAE >NC_017452|1347294:1356363|1351250_1353671_+|WP_014550951.1|DBSCAN-SWA MSNFNQISRRDFVKASSAGAALAVSNLTLPFNVMAKETQRLNENNQERIVWSACTVNCGSRCPLRMHVKDNRITYVETDNTGTETYNLDHQVRACLRGRSMRRRVYNPDRLKYPMKRIGKRGEGKFKRISWDEALTEIADALKRNIKKYGNESIYLNYGTGTLGGTMAKSWPPASTMIARFMNCIGGYLNHYGDYSTAQIAVGLDYTYGGGWALGNGMADIENTKLIVLFGNNPAETRMSGGGLTYCIEQAKARSNAKMIIIDPRYNDTGAGREDEWIPIRPGTDAALVSALAYVMIQENLVDQPFLDKYCVGYDEKTLPADAPKNGHYKAYILGYGNDGIAKTPEWAAKITSIPAERIIKLAREIGSTKPAFISQGWGPQRRSNGELISRAIAMLPILTGNVGIHGGNTGARESAYSIPFVRMPTLKNPVKASIPMFLWTDAIIRGTEMTALTDGIRGVDKLSSPIKVIWNYASNCLINQHAQINRTHDILQDDTQCEMIITIDNHMTSTAKYSDILLPDCTTSEQMDFALDAFVSNMAYVIFADQVIKPSFECRPIYDMLSDLAEKMGVKEKFTEGRTQEEWLRHIYKQSREKLPELPTFEEFRQQGIFKKVDPNGFKVAYKDFRDNPEAHPLKTPSGKIEIYSSRLAEIAKTWKLAEDDVIHPLPIHAQSFEHYGDPLMEKYPLQLSGFHYKARTHSTYGNVDVLKAANPQEVWMNPIDAEPRNIKNGDMIRIFNDRGEVRINVKITPRIIPGVVALSEGAWYAPDKDRIDHSGCINVLTTQRPSPLAKGNPQHSNLVQVERL |
9 | Escherichia_phage(83.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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