Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_014657 | Caldicellulosiruptor owensensis OL, complete sequence | 3 crisprs | cas7,cas5,cas3,cas4,cas1,cas2,csa3,cas6,DEDDh,csm5gr7,csm4gr5,csm3gr7,cas10,csx1,csx20 | 0 | 6 | 3 | 0 |
1. NC_014657
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| NC_014657_1 | 91068-95458 | Unclear |
I-A
Consensus repeat of NC_014657_1
|
66 spacers
spacers of NC_014657_1
>1.1|91097|36|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TACCCAGAAGCGCATAAAAAGCCAAATCGCTCTTGT >1.2|91162|35|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCGATGAAGCTGGTGGCGTAGGGCTTGGCTTCGAG >1.3|91226|39|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATACGTCAAAGAAATCACGCTGGAAGTTGATGCCTATT >1.4|91294|38|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCGCTAAAGATTGACAATACTCTTCTATTAGCCCACGG >1.5|91361|36|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TACTCTTGTATTTTGAATCTAAACCTTACAACACCA >1.6|91426|37|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGTAATTACAGTGGCATTGCATATTGCAATGCTTCG >1.7|91492|37|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTGTTTAGCTCATCCCTTATCCAATCCATGAGTGGC >1.8|91558|37|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTGAATTGATTGAAAAGAGAGAACAAGAAGATAAAA >1.9|91624|40|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTAACATGTGTTGTTGTCGTTCGCCTCGACAGAATTGTTT >1.10|91693|36|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTATAAGTCCCTAACCCATCGCACTTGTAAATCGTG >1.11|91758|37|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGCACAATGCAGGGGGCTGTTTTGGTATATACAAACA >1.12|91824|37|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAATGGTCTTATAAGCAGAGAGACAGCACTAAAGAGG >1.13|91890|38|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTCATTGACTATAAAACAGACTACGGTCTGGTAGCAG >1.14|91957|38|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCAAAGGTGACTAAAAACGGTGCAACAAATTGATTTAA >1.15|92024|37|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TACAGTCAGTTCAATTTGTCCTTTTCTAATTTGGTCT >1.16|92090|39|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGCAGTGAAATTCAAAAAATCATAGCCGAAAAGGGATT >1.17|92158|36|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAAATAAACAAACGTATAGATTATGTAATGATGACA >1.18|92223|37|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATGTACATGTTGACCCTGCAACATGGACCCCTGCTG >1.19|92289|37|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGCTCTCTGCGTCGGGCCTGTTCTTGCAGATCCTGT >1.20|92355|38|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGGGAATGATTACATTTTGCTCTAGCGGCTCTTTGAG >1.21|92422|36|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGCTATTATTGGTATGAAGTCCGCATCGTAGATTCC 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AAAAGCTTTTAGTATCGTCGATGCAAAACTTGTAGA >1.33|93209|37|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACAGCTTGTAGTGTCGGCAAAATCTTATCTGCTGTAA >1.34|93275|38|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTGAACTTTGTGCTATTGTAGAGGAGATAAAGAAGCAG >1.35|93342|37|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTTCACTGTGAATTTGAATAATCAGCCACAAACACA >1.36|93408|36|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATCACTGGAGGATTTGTAACAACAGACGATGGAAC >1.37|93473|37|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGTTGAGATAGAAATTAATCTTACCCAGAATGATAG >1.38|93539|36|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCCCACTCGCTTTATAAAGTCCTAACAGGTCAAAGC >1.39|93604|37|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGATTGGCAGCTCATAAATACCGCACTGTGTCGTTTT >1.40|93670|36|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGGAGAGATGAAATTATTGTTTACATAGCAAATTT >1.41|93735|39|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GACGCTGTTCGTTCTGCTTTTGTCAAACGAAAAACCCCG >1.42|93803|38|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCGGTCAAATTGAATGAAATACTGCAGGAATACCTGAA 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cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014657_1
The CRISPR arrays of NC_014657_1 >merge|NC_014657|1|91068-95458|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACTACCCAGAAGCGCATAAAAAGCCAAATCGCTCTTGTGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACTCGATGAAGCTGGTGGCGTAGGGCTTGGCTTCGAGGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACGATACGTCAAAGAAATCACGCTGGAAGTTGATGCCTATTGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACGCGCTAAAGATTGACAATACTCTTCTATTAGCCCACGGGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACTACTCTTGTATTTTGAATCTAAACCTTACAACACCAGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACATGTAATTACAGTGGCATTGCATATTGCAATGCTTCGGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACGTTGTTTAGCTCATCCCTTATCCAATCCATGAGTGGCGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACAGTGAATTGATTGAAAAGAGAGAACAAGAAGATAAAAGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACGTAACATGTGTTGTTGTCGTTCGCCTCGACAGAATTGTTTGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACTTATAAGTCCCTAACCCATCGCACTTGTAAATCGTGGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACTGCACAATGCAGGGGGCTGTTTTGGTATATACAAACAGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACAAATGGTCTTATAAGCAGAGAGACAGCACTAAAGAGGGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACGCTCATTGACTATAAAACAGACTACGGTCTGGTAGCAGGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACTCAAAGGTGACTAAAAACGGTGCAACAAATTGATTTAAGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACTACAGTCAGTTCAATTTGTCCTTTTCTAATTTGGTCTGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACTAGCAGTGAAATTCAAAAAATCATAGCCGAAAAGGGATTGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACGAAATAAACAAACGTATAGATTATGTAATGATGACAGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACGATGTACATGTTGACCCTGCAACATGGACCCCTGCTGGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACTTGCTCTCTGCGTCGGGCCTGTTCTTGCAGATCCTGTGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACATGGGAATGATTACATTTTGCTCTAGCGGCTCTTTGAGGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACAGCTATTATTGGTATGAAGTCCGCATCGTAGATTCCGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACAACTGCCGTAGCTCTTCGAAATTTCCCGGGGTCACCTGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACGCACACCCTACGACGGAGATTCCGAGCTGCTCCAAGCGGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACGCGAAATATTGTTCTGCTTCGTCAAGGGTGACATAGGGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACTGAGGATATAGGTTTGGAAGATGAACAAATACAAACGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACTTCTGGCAGACCGGCCATTTCTCTCACATAATCTTCCGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACGAGAGTGAGCAGTACAAAGTAATACAGGAAAGTGCAGAGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACAAAGGCTGGTAATTAGGCGAAACTTCAGCGTTATGTGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACTTTTCAAAACTGTATTGTCAAGAGTATAAGGGTCCTGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACTTTTCAAAACTGTATTGTCAAGAGTATAAGGGTCCTGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACTGATTATGGTATCGTACCTGGCACCAGCAAACCTACGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACAAAAGCTTTTAGTATCGTCGATGCAAAACTTGTAGAGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACACAGCTTGTAGTGTCGGCAAAATCTTATCTGCTGTAAGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACGTGAACTTTGTGCTATTGTAGAGGAGATAAAGAAGCAGGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACTGTTCACTGTGAATTTGAATAATCAGCCACAAACACAGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACAATCACTGGAGGATTTGTAACAACAGACGATGGAACGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACTAGTTGAGATAGAAATTAATCTTACCCAGAATGATAGGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACGCCCACTCGCTTTATAAAGTCCTAACAGGTCAAAGCGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACTGATTGGCAGCTCATAAATACCGCACTGTGTCGTTTTGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACCTGGAGAGATGAAATTATTGTTTACATAGCAAATTTGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACGACGCTGTTCGTTCTGCTTTTGTCAAACGAAAAACCCCGGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACGCGGTCAAATTGAATGAAATACTGCAGGAATACCTGAAGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACGGTTCTTTCACTGAATACCAGTACAAATTCACTGAGGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACGGCTTTAAATGCGGCGTGGGTGTTATCATACTACAAGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACGTAAATTGCCGGTTGCCCTGCTGTGGGCTGCCAGATAGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACCGAATCCACCGAAAACAGACAGATAAGCGGAGAAGCAAGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACGTGTATTTTACCCTTTCGACTATGTCAGGATGGTTCTGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACTGAAGTTATGGCTTCTGACAATGAGAGTAGAGCGCAGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACACTTTGATCGCATACGGTCTTGGTTTCCAGCTTAACCGGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACGTCTTTTAAATTTGTGGCTATCTGGGCTGGGTCATAAGGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACGATCGCTCTCGACAATTCATCAACGGTCACATCCTCTAAGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACAAGGATCGGAGCGATAGTTCATCTCCAAATACCAACTCGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACGCGTATAAGCAATGGCATTTGTTCTTTAACACTTGCGTGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACGTGATTATAACAACAAATTTGACGCTTGAAGAAATTGAGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACAAGCGAGGCTTCAAGGAGCTTGTTAAACAAGACTTAAGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACCTTCTGGCTTTACGGCAAAAATATGTGCAGCTGAAGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACCGAGCTTTACAAAGAATTGTCGATGAGGTAATGTCAAAGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACGATGCTGTACTCAACTTCATGGGTGTTTTAAAACCCAAGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACTCGTTGTAAATGACGAAAGCGAAAAACCTATTGAAGAGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACGTGAATCCTGAAAGAATTACAGTAGAAGCAGGGAACAAGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACTCTACTTATCCCCCTTCCAAAACTGCGGGAGGAGCAGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACGGAAGTTGAACGCCGCGTGAGTGTCAGGTATCACGCAGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACAAGGGGAAAATAAGCGATGTTATAGATGGCGGCCCAGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACAATTCATCGAATTTGATTATCAGCACAAAAATAAACCTGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACTCTATTAAAACAAAATACATTTCAAACACTCCTTATCAAGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACTTTCGATTTTTTGCTATGTTAACTTCTGCAATGTTGTTTTATCTGAACTATGAGCATTCCTGTA >NC_014657|1|1|91068-95128|PILER-CR GTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC TACCCAGAAGCGCATAAAAAGCCAAATCGCTCTTGT GTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC TCGATGAAGCTGGTGGCGTAGGGCTTGGCTTCGAG GTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC GATACGTCAAAGAAATCACGCTGGAAGTTGATGCCTATT GTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC GCGCTAAAGATTGACAATACTCTTCTATTAGCCCACGG GTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC TACTCTTGTATTTTGAATCTAAACCTTACAACACCA GTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC ATGTAATTACAGTGGCATTGCATATTGCAATGCTTCG GTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC GTTGTTTAGCTCATCCCTTATCCAATCCATGAGTGGC GTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC AGTGAATTGATTGAAAAGAGAGAACAAGAAGATAAAA GTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC GTAACATGTGTTGTTGTCGTTCGCCTCGACAGAATTGTTT GTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC TTATAAGTCCCTAACCCATCGCACTTGTAAATCGTG GTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC TGCACAATGCAGGGGGCTGTTTTGGTATATACAAACA GTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC AAATGGTCTTATAAGCAGAGAGACAGCACTAAAGAGG GTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC GCTCATTGACTATAAAACAGACTACGGTCTGGTAGCAG GTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC TCAAAGGTGACTAAAAACGGTGCAACAAATTGATTTAA 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MKMTIETIKALKIKIYQPQAHYRVPFSYQRRHTYPLPPYSTVIGLVANVLGIKNLPGQEEPCVKENCDCFYHKLQQIKIGVCGNFRYKSTEYTWLRNLGKDSHLKRFRTVDNRVVAGHIEHIGGQIPCWIDVLNDVRILIYLHHHDDTFLDEIKQNFKNPINKSSILHMGRAEDWIVIEDLKEVFLKSDEINGNYKHFFWIPERIFGIENGKEFEKINGLVYNLTTFYKIKDGARSFEYIKAKLNDGNLGDIHTYFDFEEEIPVFFSDLEGDKNE >NC_014657.1|WP_013411095.1|84316_85420_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MGYTNRVHVRHVAATIIFEGSALNRDEKIGGNILSIKKLKQGDRTVSYIGKPGIRHYLFETLKKSCNWKESSVTGQGEVIQFDITKDDILTSPELDAFGYMYTISDQASITRKAPIGITKAVGLVPYEGDMAFYANHDLVNRRIKQGSNATPNPYSKEEHISFYKVSFTIDIDVLGKDEWIVDQQPEFNNGVIKIVLSSDNVKEVSNVESLEKEENKYKVEKGIIKWEKILNDKKEKYKITFELNEKEKKERIRQILEAIKNGLYAQSSGEANTIVPLFLIAGYVKVPSPVFHPYIELEQLCNSKTYKVLGVIDALKNGWIVDKVFLMDCERVQVERKEELINRINKEERIKITENWDDFIGELEKY >NC_014657.1|WP_013411094.1|83775_84282_+|hypothetical-protein MSENFNFEEKKKSLVEAIQKNQIEFTQFKKVIDSYKELGFELEKILEYAANNAKDEDKIKLWALFNEVSLQNISELCDRLRRYGDSLKNSELHGRFYDEDKKVPRAIAFRLLELTRLGKRDEVFHMILREFANAKEKVNLDLVKAFNPKYSLESFKILVYSFLSGLLG >NC_014657.1|WP_013411093.1|82663_83779_+|hypothetical-protein MSNNVLVLYPGNWLYNASVIGFLRSLEDVEKLSGSFNLKGDGTIVIDKNIFFQLNVEERYYVKKISSIIGKSSSYKNYLQYYDEYKSAFVFFVKNLGRIKEIYDCVPCGFCGRKFEFSDLDILSIKRQIKNEKIEKAFENFLKGVKKYDVRHNALLGPSAGEFPNSFWNKNVSFKICPLCAYLIIHHHKALTRLEDNSEIFINAPSFKVMWYLNKYLQTVYEKEKIATTKELLGMSIIEMALKVNVQLGKWNMMNIEIVTKSNGKVDFFSMPYEITVLLSNHEVASLLNDIGELKVLNLILNSDFIKVLELAERIFKIALKPEKERSEQDKKFISENIKLQKNIENLTSLSYKLFKLYAVIEEKAKKEAFV >NC_014657.1|WP_013411092.1|81873_82659_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRAKFIFEAVENQSELHNLPVYYRTVFMSFLKTALSLYNKDYFDRIYWWGEKKNKWQKPFVYAINLPNMNFQDDTVYFRGDILLNLSTSDYEFFVNMYNSLLNSNLYPYPLTDNCKIALKRMYLVREPEKFDSKMVFKTFSPILIEKKEGNKKVPVLPFDEGFEDVFNDVVDFEIRNVRLLRGQNKGLQKRLTFRPINVQKTVVKHRISEFVQNTGKDIMFLTGFSGIFELSGDPEDLKELYQNGIGFRRGQGFGFVEVAR >NC_014657.1|WP_013411091.1|80631_81357_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MVELIELTKDFGKVLAVNRLSFKIERGEIFGILGENGAGKTTTLRMLATMLKPTSGTAIISGLDIAKEPEKVRRKIGILFGSESGLYSRLTARENIEYFGLLHDMDKNELKKRIDELSERFGMQDYINRPAGTFSKGMKQKVCFVRSIIHNPEVMLFDEPTNSLDVSSAKEVHDFIKLCKQEGRTIIFSSHSMNEVEKLCDRVAIIHKGKLVALGTIDEIKQRFTGASFEEVFLRLVGDER >NC_014657.1|WP_013411101.1|96708_99867_+|hypothetical-protein MRRIKIKSRVVVTAVFIIIAVLLVVPVIVWFLKPAILLNVWIVDKTVPQSDFREHGGLFWIFNFEKIKDKNQNPYNLKKDYFGFHPDSKNYKIRDIGFKDIQQKYYPDIIYLTDAYGVYKDNLNKNSKLDIKSELIYGGITKNDLLYINASLKDNILIGEFNIFQYPTEKTVSERLQDIFGVKWTGWYGRYYSDLSKGIEVPDFIVELFENRYKTKWNFKGAGIVILSESGDIVVLEKGKDFSKRPITIEFCKNYRDYYNASNNVTFYYWFEIVKPNTAQKIADFKLNLTEQGKKRLKNLSIPMIFPAILKNESKEYTSYYFAGDFADFQAKNGLYFYNIADKLHQIFTFEKSGFQDVFYWKVYVPVMKKVIAEASKKENIQKDMVEELTTEDGLALKSKIQNKELVIYNENKWEKFFVKGVNLGLALPGKYFTQMPDDPNIYYQWFKMITDMNANTVRLYTLAPPEFYQALKVFNLTSSKKVYLIQEIWPDENVPDKNYFNKSYTEEFKKEIEYAIDALHGNAEIPKRMGRAYGKYSFDVSMYTIAILIGRELEPDEVLETDRKNNINEYNGKYVKVKGSPSEVWLGMCCDYTLEYETRKYSMQHPVGIVSWPTLDPINHPSEFNAQGRKDLEYNDKAQIQIDNFDLGEKNKAGLFVAYHIYPNYPDFMNNEEKYKSYKDEKGQFLYGGYLRELRTVHKKFPILVAEFGLSTSVGVAHKNPDGYHHGGIDEKTQGEGIIRMMKAIKKEGYMGGIIFEWMDEWAKKTWITEPFMIPYDRRVLWHNKLDPEQNYGILANEALPPDKKVKVSGSQKVKNIEISSNPEYLYLKINLNNEFSSDTSLLVGIDTYDRQRGEFVVQSDRKINLPTGIEFLLKISSNETKLQVIPSYNWAKGKYSSTKSYSGSFEDIIFQTNKERVTQDGKRIPAMYHNFSVLPEGKFDDSKSTWYIDKNTVFVRIPWGLLNVTDPSSNTVLDDSRTIYQPERDMLKTSKTDSFVFYFILLQNDKTEDVLLKQNEKLISFPLSKWEDVNFSWRLKKSYYMIQKFFATIK >NC_014657.1|WP_041737390.1|100217_100397_+|hypothetical-protein MFLKIRENKDQMQRNFFAHCGLEENFVIVNEENEGIYVKYIEDLPELRKMVGKMLLEQI >NC_014657.1|WP_013411103.1|100666_102691_+|hypothetical-protein MIELLFMLGILLILVYLLLKLIGLRVIPNDKVGIVEKWWSFKGSLDEQIIALRGEAGFQPEVLRGGIHFRTPLMYKVHIVPLVTIPQGQIGYVFARDGKPLEPTQTLGKVIPECNNFQDVRAFLENGGQRGPQRAILREGTYAFNLAQFIVITEDKIYYLPMGNKEEKEMIEKMVQTLKSRNAFRPIVITEDKVGIVTVHDGPSLPSGDIVAPTVGDDPSNPETYHNNFQDPEKFLKAGGFRGRQLQVLVEGTYFINRLFATVELIDKTVIEVGYVGVVVSYVGPKGQDTSGEDYKHGELVERGFRGVWKDPLMPGKYAFNTYAGKIVKVPTTNIILKWISNQTGTHRYDENLKEVSLITKDAFEPSLPLAVVLHIDYRKAPLVVQRFGDLKMLVEQTLDPMVSAYFKNIGQKKTLIELIQQRDEIQKMASEEMKERFAHYNLELEEVLIGTPMSSPNDNKIDAILEQLRDRQIALEQIETYSRQQKAAEKERELREAEARAAQQKLLTESEINIQIQTNQGKAEYQRSIQEAQKIKALAEAEAEKEARIGIGRAIAIEEQVKAYGGPQYQVIQDVMGKFTQALEKTGIDIVPETVVAMGEKASSASFNAFEVLLSLLLTKELGVEFKAKETEDENINKIKQEILNSILLAKENQKEIEAEVTSQDLQQQENVS >NC_014657.1|WP_013411104.1|102897_104985_+|alpha-amylase MSTLSRLFEILKEKSKKWNKKNDFRIPKLWDSFGYDGHEKKENKDGTISVNPYSFVARALEKAVLPYMKEGIDYHQPLSKILSEDTTASEKLSGNWIEKSNVYGMQIRTFSAWDHDCDRKLELENAFGLKDTGTFIKTIALLPLIKKMGFDAIYTLPITKNSTKYKKGEMGSPYAVKNFFELDPVLYDPMADQLSIDEQFKALIEACHILGIRFIIDIIPRTSARDSDFILEHPDWFYWIKIEDLEDYGPPKLTLIKEFTKANEENIELIYKDPAVLKHIRKFVQSPEKYAPEKWQSIIERCKKDRNLDFFELIEKEIGLTTAPAFSDCLNDPQPPWTDVTYLRLYLDHPVQSAKYVDSNQPPYILFDIIRGNIFKGRKPNSELWEKISNIIVHYQKNFGIDGARIDMGHALPKELEDMIISNARKEDPQFCFIAEELSMDAHKKAKKSGYDMIIGDLWAREPRYYQGTMKKVFDILLQLEVPVFAACEIPDSPRAASRLGGRDFSRFATVLNFFLPNSVPFVTCGQEVYELQPMNLGLDPQPDGRFLLPKSDPLYGKLAFFDKYALHWTNQGADEMINLIQTAADLKKRFSQFIAKENFFKIPYNGKMILSFGYKLISESENEYFIIVANSDNLKKKTAKLNLFKSGIFNAQRAENIDCLFSLKGEVDYHYSYPNLIVNLNPLDIKIFYFEIEK >NC_014657.1|WP_013411105.1|105061_105859_+|polysaccharide-deacetylase-family-protein MKKIYFCFPGGRFKALTMSYDDGKKQDRKLVEIFNKYGIKATFNINAGLLGKDDRITAEEIANLYQGHEVATHTFNHPTIARCPHDQVVQQIIEDRKILEDIVGYPVRGLAYPNGSYSPDIKSFLPYCGIEYARIVGNSNDFSIPVDFYEWKATCHHNYNLLKLAEQFLSFTKKQYLYLMYVWGHSYEFDNDNNWDLIEEFCRMVGNQPDIWYATNIEIVDYIKALQNLKFSANGDFVYNPSSIDVWISVDDKIVKVDGGKITKL >NC_014657.1|WP_013411106.1|105922_106555_-|flavodoxin-family-protein MKVVAFNGSPRKEGNTYHAIKIVAQELEKEGIEVEIVHVGDKLIRGCLACGMCAKNKNERCVIDDEVNDWISIMKTADGIILASPVHYSSISATMKAFLDRAFYVSGANGNLLRHKVGAALVAVRRSGGTQAFLQLMQYLNYAEMLIASSNYWNIIHGTLPGEVLQDEEGVQIMRVLGKNMAWLLKLVENGKGSILEPAKEPKVVTNFIR >NC_014657.1|WP_013411107.1|106824_107577_+|DeoR/GlpR-transcriptional-regulator MFAEERKSKIAQMIKSGQSVKVSELAKLFGVSESTIRRDLAELETLGIIKRTHGGAVNNFLTSFEPSFAEKEDKFAKEKEYIGKLAASFIHDGDTIILDSGTTTQYIARNITAKNVVIITNSVNIAYELSNNENVEVIITGGVIRTKTKALVGDIAQNVLKQFRVDKAFVAANGVSIEFGVTTPSHVEAAIKRAMIENAKEVFLVADSSKFGQVTFSLICPVQRLDYIITDKMDERQKSEYEKLGVKVIT >NC_014657.1|WP_013411108.1|107604_108552_+|1-phosphofructokinase MIYTVTLNPAIDMTVYIDTLKKGQVNRSRYCLMDAGGKGINVSKVIKALGGQSIVLGFLGNDNKDWFLKYLKEMQLDFDFIFVDGLTRTNIKIVETSQKIYTDLNQNGFEVKKKDINHLFEKIDKIAKADDIFVVSGSLPPGADEEVYAELIRILKQKGAKVIFDADGKALKSGVLEKPDVMKPNIHEFKCLFDVDENDLNSIVNSAKKLIESGIKKVLISMGAKGAVFVTENMELFAKAAEAKIKSTTGAGDSMVAAISYGLSQNMDDVSIFKLALACAAAKVSKEGVKPPEKKEIKKFLEKISLEKLGEVKWI >NC_014657.1|WP_013411109.1|108542_108992_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA MDIKTLFSPSRMSFDLQAKTKEAVIEELIELLYKDGKISDKEKFKKAVMKREEEFSTGIGMGIAIPHGKDSSVLEPCVAFGVSKKGIDFDSMDGEPAYIFFLIAVPENADDTHLHVLSFISRKLMHEDVRKKLYNAESFEDVISAFEEK >NC_014657.1|WP_013411110.1|109014_110382_+|PTS-transporter-subunit-EIIC MKKIVAVTSCPTGIAHTYMAAEALQMAAKELGVEIKVETRGSVGAENEITADDLKQAHAVILACDTKIDEDRFQGLPIVRASVKDAIKDPKGLITKAMNMEKKDYVDKVFEAKKEAKERATGVYKHLMTGVSYMIPFVVAGGILIAISFAFGIKAFEQKGTIAAALMDIGGGSAFYLMVPILAGFIAFSIADRPGLVPGMIGGLLANKLGAGFLGGIVAGFAAGYLVAWLKKTIKLPKTMEGLMPVLILPVLSTLIIGLGMIYVVGEPVAALNKAMTEWLKSMSSGSAVLLGIILGLMMAFDMGGPVNKAAYTFAVSTLAAGQPSTIMAAVMAAGMTPPLGLALATLIAKDKFTTEEREAGKAAFFLGISFITEGAIPFAAADPLRVIPSIMIGSAATSVLSILFKCTLAVPHGGIFVLPIPNAVGNLLLYAVAIAIGTVVTALIVSILKPKKVQ |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_014657_2 | 2367884-2369174 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NC_014657_2
|
19 spacers
spacers of NC_014657_2
>2.1|2367915|35|NC_014657|CRISPRCasFinder AGGTATAACGGCACAAATTTTATCTTACAGGGTAG >2.2|2367981|35|NC_014657|CRISPRCasFinder ATTGTCGTCTAAATGGTTTAGATACGCTGTTACAT >2.3|2368047|36|NC_014657|CRISPRCasFinder TATCAAAAGAAGCGTTGTGGGCTATCAAAGGATATT >2.4|2368114|33|NC_014657|CRISPRCasFinder TCCGACGTGCGCAAAAGAGTGGACTTTGCAATG >2.5|2368178|36|NC_014657|CRISPRCasFinder TCCAGAGAGGGCCGTCCCTCTCTGGTTTTCATAACA >2.6|2368245|36|NC_014657|CRISPRCasFinder CTGAAGCTGCTTTTATCAAAGACAGAGTATATCATG >2.7|2368312|36|NC_014657|CRISPRCasFinder TTGCAACTGTTTGGAATGCAATCAAGAATGTTATTT >2.8|2368379|34|NC_014657|CRISPRCasFinder TCGGCTTGCCACTTATCCTAAAACTCTCAATAAC >2.9|2368444|35|NC_014657|CRISPRCasFinder TGTATATCACACTTAGGACAATAAACGTTCAACTC >2.10|2368510|37|NC_014657|CRISPRCasFinder ATCTGCAAGTTGTGAATGAAGACCCGCAATCTTCTAC >2.11|2368578|36|NC_014657|CRISPRCasFinder AGTTGTTGCGCAGGATGTTGCTGGCTGGAGAATACA >2.12|2368645|35|NC_014657|CRISPRCasFinder AAAGCCAGCAGGCAATAACATAGTCCTGCGCTTCA >2.13|2368711|36|NC_014657|CRISPRCasFinder GTAGGATTAATAATATTATTATTCTTTTCTTTACTT >2.14|2368778|37|NC_014657|CRISPRCasFinder CCACCTCAAACTTGTGTTCTGTTCTGATTATACCACC >2.15|2368846|36|NC_014657|CRISPRCasFinder GCCCTTATCTTCAGCCCTTGCTCATCTTTGATAAGC >2.16|2368913|34|NC_014657|CRISPRCasFinder CGCAATGTGAGTTTAAACCATCTAAGCTGTTTGA >2.17|2368978|35|NC_014657|CRISPRCasFinder CACCGAAACCGTAACGGGAAATACACAGGTAAACT >2.18|2369044|34|NC_014657|CRISPRCasFinder AGTCGGCGGCGGATGTATTCTACCGCTAATGCTG >2.19|2369109|35|NC_014657|CRISPRCasFinder AGGAGGTCGCGCTTGTTTTTTTCGTACCACTCCTT >2.20|2367914|37|NC_014657|PILER-CR,CRT TAGGTATAACGGCACAAATTTTATCTTACAGGGTAGC >2.21|2367980|37|NC_014657|PILER-CR,CRT TATTGTCGTCTAAATGGTTTAGATACGCTGTTACATA >2.22|2368046|38|NC_014657|PILER-CR,CRT TTATCAAAAGAAGCGTTGTGGGCTATCAAAGGATATTT >2.23|2368113|35|NC_014657|PILER-CR,CRT TTCCGACGTGCGCAAAAGAGTGGACTTTGCAATGG >2.24|2368177|38|NC_014657|PILER-CR,CRT TTCCAGAGAGGGCCGTCCCTCTCTGGTTTTCATAACAA >2.25|2368244|38|NC_014657|PILER-CR,CRT TCTGAAGCTGCTTTTATCAAAGACAGAGTATATCATGA >2.26|2368311|38|NC_014657|PILER-CR,CRT TTTGCAACTGTTTGGAATGCAATCAAGAATGTTATTTG >2.27|2368378|36|NC_014657|PILER-CR,CRT TTCGGCTTGCCACTTATCCTAAAACTCTCAATAACC >2.28|2368443|37|NC_014657|PILER-CR,CRT TTGTATATCACACTTAGGACAATAAACGTTCAACTCG >2.29|2368509|39|NC_014657|PILER-CR,CRT CATCTGCAAGTTGTGAATGAAGACCCGCAATCTTCTACG >2.30|2368577|38|NC_014657|PILER-CR,CRT CAGTTGTTGCGCAGGATGTTGCTGGCTGGAGAATACAG >2.31|2368644|37|NC_014657|PILER-CR,CRT CAAAGCCAGCAGGCAATAACATAGTCCTGCGCTTCAG >2.32|2368710|38|NC_014657|PILER-CR,CRT CGTAGGATTAATAATATTATTATTCTTTTCTTTACTTG >2.33|2368777|39|NC_014657|PILER-CR,CRT CCCACCTCAAACTTGTGTTCTGTTCTGATTATACCACCG >2.34|2368845|38|NC_014657|PILER-CR,CRT CGCCCTTATCTTCAGCCCTTGCTCATCTTTGATAAGCG >2.35|2368912|36|NC_014657|PILER-CR,CRT CCGCAATGTGAGTTTAAACCATCTAAGCTGTTTGAG >2.36|2368977|37|NC_014657|PILER-CR,CRT CCACCGAAACCGTAACGGGAAATACACAGGTAAACTG >2.37|2369043|36|NC_014657|PILER-CR,CRT CAGTCGGCGGCGGATGTATTCTACCGCTAATGCTGC >2.38|2369108|37|NC_014657|CRT CAGGAGGTCGCGCTTGTTTTTTTCGTACCACTCCTTG |
csa3,cas6,csm5gr7,csm4gr5,csm3gr7,cas10,csx1 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014657_2
The CRISPR arrays of NC_014657_2 >merge|NC_014657|2|2367884-2369174|CRISPRCasFinder,PILER-CR,CRT TGTTCGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAATAGGTATAACGGCACAAATTTTATCTTACAGGGTAGCGTTCGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAATATTGTCGTCTAAATGGTTTAGATACGCTGTTACATAGTTCGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAATTATCAAAAGAAGCGTTGTGGGCTATCAAAGGATATTTGTTCGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAATTCCGACGTGCGCAAAAGAGTGGACTTTGCAATGGGTTCGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAATTCCAGAGAGGGCCGTCCCTCTCTGGTTTTCATAACAAGTTCGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAATCTGAAGCTGCTTTTATCAAAGACAGAGTATATCATGAGTTCGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAATTTGCAACTGTTTGGAATGCAATCAAGAATGTTATTTGGTTCGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAATTCGGCTTGCCACTTATCCTAAAACTCTCAATAACCGTTCGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAATTGTATATCACACTTAGGACAATAAACGTTCAACTCGGTTCGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACATCTGCAAGTTGTGAATGAAGACCCGCAATCTTCTACGGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACAGTTGTTGCGCAGGATGTTGCTGGCTGGAGAATACAGGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACAAAGCCAGCAGGCAATAACATAGTCCTGCGCTTCAGGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACGTAGGATTAATAATATTATTATTCTTTTCTTTACTTGGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACCCACCTCAAACTTGTGTTCTGTTCTGATTATACCACCGGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACGCCCTTATCTTCAGCCCTTGCTCATCTTTGATAAGCGGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACCGCAATGTGAGTTTAAACCATCTAAGCTGTTTGAGGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACCACCGAAACCGTAACGGGAAATACACAGGTAAACTGGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACAGTCGGCGGCGGATGTATTCTACCGCTAATGCTGCGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACAGGAGGTCGCGCTTGTTTTTTTCGTACCACTCCTTGGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTTAATT >NC_014657|2|2|2367884-2369174|CRISPRCasFinder TGTTCGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAT AGGTATAACGGCACAAATTTTATCTTACAGGGTAG CGTTCGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAT ATTGTCGTCTAAATGGTTTAGATACGCTGTTACAT AGTTCGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAT TATCAAAAGAAGCGTTGTGGGCTATCAAAGGATATT TGTTCGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAT TCCGACGTGCGCAAAAGAGTGGACTTTGCAATG GGTTCGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAT TCCAGAGAGGGCCGTCCCTCTCTGGTTTTCATAACA AGTTCGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAT CTGAAGCTGCTTTTATCAAAGACAGAGTATATCATG AGTTCGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAT TTGCAACTGTTTGGAATGCAATCAAGAATGTTATTT GGTTCGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAT TCGGCTTGCCACTTATCCTAAAACTCTCAATAAC CGTTCGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAT TGTATATCACACTTAGGACAATAAACGTTCAACTC GGTTCGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC ATCTGCAAGTTGTGAATGAAGACCCGCAATCTTCTAC GGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC AGTTGTTGCGCAGGATGTTGCTGGCTGGAGAATACA GGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC AAAGCCAGCAGGCAATAACATAGTCCTGCGCTTCA GGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC GTAGGATTAATAATATTATTATTCTTTTCTTTACTT GGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC CCACCTCAAACTTGTGTTCTGTTCTGATTATACCACC GGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC GCCCTTATCTTCAGCCCTTGCTCATCTTTGATAAGC GGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC CGCAATGTGAGTTTAAACCATCTAAGCTGTTTGA GGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC CACCGAAACCGTAACGGGAAATACACAGGTAAACT GGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC AGTCGGCGGCGGATGTATTCTACCGCTAATGCTG CGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC AGGAGGTCGCGCTTGTTTTTTTCGTACCACTCCTT GGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTTAATT >NC_014657|2|3|2367885-2369107|PILER-CR GTTCGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAA TAGGTATAACGGCACAAATTTTATCTTACAGGGTAGC GTTCGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAA TATTGTCGTCTAAATGGTTTAGATACGCTGTTACATA GTTCGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAA TTATCAAAAGAAGCGTTGTGGGCTATCAAAGGATATTT GTTCGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAA TTCCGACGTGCGCAAAAGAGTGGACTTTGCAATGG GTTCGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAA TTCCAGAGAGGGCCGTCCCTCTCTGGTTTTCATAACAA GTTCGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAA TCTGAAGCTGCTTTTATCAAAGACAGAGTATATCATGA GTTCGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAA TTTGCAACTGTTTGGAATGCAATCAAGAATGTTATTTG GTTCGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAA TTCGGCTTGCCACTTATCCTAAAACTCTCAATAACC GTTCGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAA TTGTATATCACACTTAGGACAATAAACGTTCAACTCG GTTCGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAA CATCTGCAAGTTGTGAATGAAGACCCGCAATCTTCTACG GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAA CAGTTGTTGCGCAGGATGTTGCTGGCTGGAGAATACAG GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAA CAAAGCCAGCAGGCAATAACATAGTCCTGCGCTTCAG GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAA CGTAGGATTAATAATATTATTATTCTTTTCTTTACTTG GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAA CCCACCTCAAACTTGTGTTCTGTTCTGATTATACCACCG GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAA CGCCCTTATCTTCAGCCCTTGCTCATCTTTGATAAGCG GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAA CCGCAATGTGAGTTTAAACCATCTAAGCTGTTTGAG GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAA CCACCGAAACCGTAACGGGAAATACACAGGTAAACTG GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAA CAGTCGGCGGCGGATGTATTCTACCGCTAATGCTGC GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAA >NC_014657|2|2|2367885-2369173|CRT GTTCGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAA TAGGTATAACGGCACAAATTTTATCTTACAGGGTAGC GTTCGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAA TATTGTCGTCTAAATGGTTTAGATACGCTGTTACATA GTTCGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAA TTATCAAAAGAAGCGTTGTGGGCTATCAAAGGATATTT GTTCGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAA TTCCGACGTGCGCAAAAGAGTGGACTTTGCAATGG GTTCGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAA TTCCAGAGAGGGCCGTCCCTCTCTGGTTTTCATAACAA GTTCGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAA TCTGAAGCTGCTTTTATCAAAGACAGAGTATATCATGA GTTCGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAA TTTGCAACTGTTTGGAATGCAATCAAGAATGTTATTTG GTTCGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAA TTCGGCTTGCCACTTATCCTAAAACTCTCAATAACC GTTCGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAA TTGTATATCACACTTAGGACAATAAACGTTCAACTCG GTTCGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAA CATCTGCAAGTTGTGAATGAAGACCCGCAATCTTCTACG GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAA CAGTTGTTGCGCAGGATGTTGCTGGCTGGAGAATACAG GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAA CAAAGCCAGCAGGCAATAACATAGTCCTGCGCTTCAG GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAA CGTAGGATTAATAATATTATTATTCTTTTCTTTACTTG GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAA CCCACCTCAAACTTGTGTTCTGTTCTGATTATACCACCG GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAA CGCCCTTATCTTCAGCCCTTGCTCATCTTTGATAAGCG GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAA CCGCAATGTGAGTTTAAACCATCTAAGCTGTTTGAG GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAA CCACCGAAACCGTAACGGGAAATACACAGGTAAACTG GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAA CAGTCGGCGGCGGATGTATTCTACCGCTAATGCTGC GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAA CAGGAGGTCGCGCTTGTTTTTTTCGTACCACTCCTTG GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTTAAT
>NC_014657.1|WP_049778110.1|2364897_2367351_+|PBP1A-family-penicillin-binding-protein MQNKSKKKSKKESPLSLFLKGFLKTMLILIIASMAVLIGAGIGMYTGYIKAIPANALDIITASSDSQTTIVYDQSGNEISRLHGNENRIRVPYSKIPKNLINAFVAIEDERFWQHNGIDIKRIIGAIFRNIKSGNLSEGASTITQQLVRNKLLTFEKSFKRKIQEQYLAIQLEKRWTKEQILEEYLNTINLGSGAYGVGAAAYTYFGKDVSQLTLAECALIAGITQNPSYYNPYVFPDHAKKKQEIVLKKMFELGYITEQEYLEAKNQPLVYVKKDISAENAYKHPYFVDSVIDEAIEILSEKKRISEDEAENLIYGGGLRIYTTMDETIQSIMEEVFSDPSVMPKIKHYDKSGIPQPQAAAVLIDFSTGAVKGIMGGRGNLKGVRLLNRATMSVRQPGSAIKPIADYALALENGYTAATVIDDVPFSVGGYTPRNWYKSNTVSGKRGYKGLMTLRESLQWSANIPAVKIAYNLGIQNVYRNLKRFGFTTLAAQDMNSLSIAIGGFTYGVKPIELTAAFAAVANSGVYIKPYFITKIEDKNGITIFERIPYKRKVMDEKNAYILTNMLQSVVTARITVGVKFSYPVAGKTGTTDDSKDRWFVGYTPNYALGVWVGEDKPVALSYLTGTNPALKIFKGIMDKVVSKKGVSSEFLRPAGIVERYICKESGKLATSLCRQDPRGSQVIKEIFAEGTEPTEYCDRHVKLKVCTESNKLATQYCPTKIEKVFIKRDNPVWPGQNSGIVPPDDYMYQAPTSYCDIHKSPQEVVVPQEGNTSQQEQSSSQSQQSSSSDQSNQQSSQENLPLDGGTTQSRTYSSQ >NC_014657.1|WP_013413027.1|2363660_2364716_-|[FeFe]-hydrogenase-H-cluster-radical-SAM-maturase-HydE MKIKNILEKACAKNNLTKDEIKVLLEAEDEDKDLLFKTADRVRKEHVGDEVFLRGLIEFSSYCKNDCFYCGLRRSNNQAQRYRMQEDEIVEVAKRAYQMGYHTVVLQSGEDMFYTKDRMCSIIKKIKENVDVAITLSIGERSYDEYKAFKDAGADRFLMRFETSNEKLYRQYHPGMSFEKRIECLKWFKNLGYELGTGFLIGLPGQTIDDLAQDIILVKELDADMIGIGPFIPHPQTPLKDAKEGSVDLTLKSIAILRLLIPDANIPATTALGTLDPLGRQKGLMCGANIVMPNVNNLKYKLKYELYPGKICINEDATKCRGCIESIIVSLGRKVGQGKGQSRHYKRAAAS >NC_014657.1|WP_013413026.1|2362866_2363568_-|hypothetical-protein MSMKRGKATTKKVWVVVLIVAVCALGILAGYYMAGYLAKKPAAIDQTLQTSRPSQQLQGENEQNSSSQAQQEQATNLQVSEQQQQETTISSEVYKAFARFDGGVDAHTVQLSLLNTEFDYKEFEIDEKLTQGLNLSEGEIVEIEFEKPQDGGNPRIVSIKKPDEVTLKGKFVGLADNNFAEFVFDQKHVVLQISNVADKVSYLDENTNVEVTFKTNPKNPQSNPVVEDIKVLK >NC_014657.1|WP_013413025.1|2361384_2362803_+|MFS-transporter MHREEDTKINKKILIATTLSSFLVPFMSSAVNIAAPDIAKSFKLNAEELNLVISIFLIFSAAFILPMGKLSDTFDRTKIFKTGLLLFTLSTLMCALSNTVEILFVFRALQGFFSAFTFVTSMATLIENHSPQIRGRLLGINTAVVYLGTSLGPFLGGVLVKLWGYRSVFLFGFAIGLVGSFVSLFFLQKEVKNTKQAKLLDSLKSLDKIGTILSMTGLFLLMYGASTFELGNTSKILFFAGLILMVIFVIVEAKLQNPVLDVKLFVKIPQFGFSNLAALINYSCTFSVSYLLSLYLQLVKALPSQLAGSVLIVQPLSQVITSLISGRASEKIEPRKLATAGMVLTTIGLFVFSLFSSKTSLVLAVANLLVMGIGFGLFSSPNTNVVMSCVPKSLYGTASSTISVMRVVGQAFSMAIVSFVSIMFLKGVRLSHENYFLILKSMKTSFLVFASLSILGIVASYKRGNIYSSRNS >NC_014657.1|WP_013413024.1|2360457_2361108_-|hypothetical-protein MRVAWSATHQEFLLTDGYYFSGLYKELCNRRIEIEEVDDFDRLFEYDVIVFNYPENPFSSEEKEKIREALEQKGKKIIFTAHFKNKDGVSEICNSITRDYGIDILPEGIKDEMHHLEDDLFIITTDEVKLYREGVKEVVFPYSAPLEVENGAEIVLRARKTSLTDSGKKSPVLIAQKRFESGGKLIVCGSCIFWDNFSLFRLDNLQFVVNMFEGAE >NC_014657.1|WP_013291477.1|2360039_2360435_+|NADPH-dependent-7-cyano-7-deazaguanine-reductase-QueF MSDKYQQRRFDIYGYEKIDTEVLEAIPYEYPEKNTVVEYITEEFSSVCPWTGLPDTAKLTIRYIPHQKLVELKSLKYYLTSYRNVGILQEHAVNRILDDLVKLLEPKFMEVIGEFHERGGISTKVVARYEK >NC_014657.1|WP_013413023.1|2358949_2359873_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MPEKEPLYIEEIFDYVSQRPQKFVLNFWEDPRYFKLHRHNFVEFMYVVKGEGTEHINSISYSLKPGTFSIVMPYQIHRIDYSEQNPLSIYVVAISFEELLAPSSIFYRIGELLLSYNENVLPYYYFEGKEKEVMDRLFKEAWTYFNQEDVWAEIILKAKILEIVAYFDRCRNLASAKNSQRPASSVVQNRAQKDSIPVPTDYWQLVYYVHKNYNQNIDLKVLSKEFHLSPSYISQLFKKLVGSNFHNFLNEVRLQHACSLLLSTDKPVTDIALEVGFDSYSTFARVFHKHKGMSAQEFRKRGYLRQV >NC_014657.1|WP_013413022.1|2358544_2358790_+|TM0996/MTH895-family-glutaredoxin-like-protein MVIKVLGGGCANCKKLMENAKKAAEELEIQASFEEVKDIEKIMSYGVMRTPALVVDEKLIFSGRVAGVEEIKEVLKKEAGK >NC_014657.1|WP_013413021.1|2357541_2358513_+|permease MFLPVQKFADFLTYSIFKIPQGSKLSSAVNFFIFDTIKIFILLFVIVFIITFIRTFFSPEKTRDILSHRKQNIYIAHILAALLGIVTPFCSCSAVPLFIGFVEAGIPLGVTFSYLIAAPMVNEVALGLLYANFGLKIAIIYVFSGEIIAIVSGILIGKLNLERYVEDYVFKIKVANVQYQEEKKTLKKRMSETLEFTVQLIKKVWIFVVVGIGIGAFLHGYIPTGALAKIAGKNNPFAVIFATVLGIPLYSNAAGIIPLVSEFKRLGVSMGTSLSFMMSVTALSLPEMILLRRVLKPRLLAIFAAIVGCGIIITGYLFNLILE >NC_014657.1|WP_013413020.1|2357238_2357535_+|winged-helix-turn-helix-transcriptional-regulator MQMEERLAKIFKALAHPIRVKIVEKLSEGEKCVCELLEFVEYSQPNLSQHLKILKEAGIIEHRKIGQNIHYRIKNDIIKNILFGAKDLILQIHEFERM >NC_014657.1|WP_013413030.1|2370571_2371306_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRYKLRFYTEQDVLLRFDYNLELSMVIKNFLNPKYVEFLENGGFKCDNKIFKPYTFSRLLPEQYQINSYGIEIKKGYVELIISSIDENFWFSFLEGLLKEKKISLSGREFYLESISVKRLGKKKKIIAQTYSPFIVKTIFKNWSFIEVERNLKKNLMCKVYVFKRKKYNEEDFNLKLFEKTLKKTIIVINNTPSEAYSGLLLIEGDEDIIETAYDAGLGLKNALGFGCIEDIKSKEEKTIYRVY >NC_014657.1|WP_013413031.1|2371302_2372502_-|hypothetical-protein MEKEISYKTYKVLVEAISDFCVSANQDFNIKSSEYLINGKFAYIIENSSVVKMLEDGVISENELEDIKAFLQAHPEYLEKYFGDYKLELASEYDNNIGIIRFWRFSELADNSYRERYAIPASTVKGILKTGFLSFFLNSADYKYGRVGNKKRLQLMLLKPNNLKDKAKNTQQLYEILINQNDVKKGVHLYKLVGENTWKEINEIDNIILSTENMLFRNIICSDLVVKDGRFVVKKVNRISRVNKKSATLQYIELAQKGSLFEGEIKEVNHLKDLPVNMLSFLYYKDLNYPENLNLIDICREGLKKFSKKIIEAERKHFAQRIKDLNPQNSEFYDTLLSEVENEEIIIKLGRGGIHAKSFMSFDSNNLSKQDFFPYTINVDDADKLPIGWVKLRIEEEKR >NC_014657.1|WP_013413032.1|2372519_2373431_-|hypothetical-protein MIYRVDFTAVSTSSQFISPVIFGVIVDKIFELVDEKKARKIVDEIISSDILISDAYPIIRTDNGIERLFTKIGLSSFDEFENGDLSLKDRRKLSREMKKKAGQQLLIAIDHSGNMKETNRNIVSAVEVYRIGIQVNRHTDTSQEGILFYHQEFIFPQNQPFSIYIKCDNEKLIEIIEKCFSIIELTGFGPDVSIGKGKIRFFKHENKILIRDEQVERYFPQNIDGKEEFVNISSTIFSPQITEICKFKTYLTFRYDSKGYFTFKPPYFCAAKGAVVVPISSKLNLVKEYQGKLLYTCIFPLKL >NC_014657.1|WP_013413033.1|2373462_2374164_-|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm3 MENSMLLRKIVVMTTLMKLETGLRIGGTKEEVRIGDIDHPVIRDPITKRPYIPGSSLKGKMRSVLEIALNGVQEPCFCGECVVCKLFGAGSKAGAEKKEVSRLIVRDCYMTEESQELLLNFVGDYVEIKTENVVNRVTGVAEHPRTLDRIPAGTEFKCEFVLRLYEKDLEHEENFIKNIKMALKLIEFTYLGGCGTRGYGKVKFSDVEFKRYDIKVTDDFVEISESKVDKIKL >NC_014657.1|WP_013413034.1|2374191_2374806_-|hypothetical-protein MSNGMHHKGSRNSNQQRNNQQNQNQQPSFFSDPTYQQLDSSKTELFEKIREEQGFCDENGTRFDVMQKIEDFAKYLNCVYLQNTGETGVTSSSIRNIFENYISIRRKFQTYELEMLNNRIKDSKQKAFEKIRPQLISAKAKVNYLVERKLKEGSNRKDDSYYAKQIAYINFREFIKLSTDKITTSYKQFEAFMELLETLIAFMK >NC_014657.1|WP_013413035.1|2374814_2377262_-|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Cas10/Csm1 MQKREIINTIAFAALMHDIGKFVRRSGLGKSSHEDESKEFLNRYKGIIQQSSLFSSEQLELVEKLVVNHHNNLSSSNDSKFSDDEKNLLKILIYSDWDSASERSTETEATGSQEYLPIHSILSFINEAFEIDEVWRQGKEEEAGEYLLQIKAFLPQDALLYRKPELDSNTSVVKENEKMFNKFEKEFNSLIKSSSSQDEFIMRLNYILKRYSTYITSSGKERVRDISLYHHSATTAAFAVNRYIDFVAGEKIDRYKKMGVIYGRLFKIQDYIFSGINSKIEKPLRRIITRSQLVSILNMLIPYDIIKTLKLYPFNIIFYGGGAFLIFIPCSYIQDAERKISEIKQKVADIFESKIYFEAICDQISIVDENGKYTIGNELKRLGAKLSDKKLSRSFDTIPSLFQEGYFDRKYFKCNNCSINSSNVIQEGEDYICKACYIENKWMNIDISKIKINVENLKVENIESPEHLEGDLRKNESVVNFSNQGIDEFKCIDTFLQGRKFIYNIHVCKKCPVFDKCNEPYKFDTSEPKDNDAKKIISTNCLEKLSNSDNIIATAKMDIDDLGFILYQVYPVRASQKEEYPFSVSRLSYASWLLNLFFTEGVKSVIDEKFKNEVMILYSGGDDLLITGVWEKVIEAIDEIEKEFSMFITGKIVSQRNVTVTSSIVFHRANENFDAVIKSVSEGLEKAKAVKNSVYIFDAVLSYPKLRESKEIAAKIVEYVEKKILTKSMVAKLLDILENRKKSRKIPYLEIKAVSQYCYLKRRLIEENRKLSKEQKEEVIEFLDSFMLIPSTCRDVDMQIVAVKIALRKLIKNKE >NC_014657.1|WP_013413036.1|2377621_2378425_+|tryptophan-rich-sensory-protein MERKRKAIISGVLLVITLIVNALGSMGIINGNSQKAVSDKYQTLITPSPSTFSIWGLIYLLLIISVALMIFKHNDDYFAKLIDSITYLFWLSCVLNIIWIVFFSYEMLGLATIVISGMLITLTLIVKNISKMQTQRKRLLPLTFGLYSGWLLIATVVNISAWLVKLRWNGLGISPEIRATVVLIISIALSTIIARNIKNEVFILPVAWAYFGIYNNLISASGFNNKFIVLPKIAIIGAAVLIAIFAIEFYKNKYCITPTVESEKKVK >NC_014657.1|WP_013413037.1|2378570_2379989_-|TIGR01897-family-CRISPR-associated-protein MKVIYQVGRLDNPAIATKKFYIKNFNGEIVEESGESELSSTVLRDFLRKRGCEAKTVVIYPVSIVLNSRLPEYIQPANLKEELSTIFKEPSEYLKNPDEFIDRIDLERCRDEKLIVHSLGEYLGTSLDASYDDIVLEILFDMIERYLKGELEDLYLDISSGHNIYISAILEAARHFAVFSNLMNWLDESKVPKIYLTFSDPIIGSSAKVFEIHIQQQRFTAFFSSPIKRKEAAEYNFSFLRNIFPDPDNGAKGSEAAKLKQQVREKRKKLREKIEMFCLLFSAIKNNVPLYLYYQHYHSVDEIKEEIFKLIEHAKGQLCSDYQKSPNLNKRAYIDAILSLGFYIGIVNVLEKHNITMFCQDTGIDLELLKRNYFEIYSTFRVPTNYVMLSNEISNTQKVLEQMDDIGSWTGLYKIIDPGKPAGEPIDRNYFAHSGFERNITEIRTEGSTIFIRYAFNTNFNVINCWLKDRIE >NC_014657.1|WP_041738146.1|2380121_2381219_-|DUF1848-domain-containing-protein MIISVSRRTDIPAFYGDWFINRIKEGFAMYRNPMRLTQVFAVSLHPKDVDAIVFWTKNPKNFLDKLKYLEEYTYYFQFTITPYGKDIEPGIPSKDEVIETFIELSNMIGKKRVIWRYDPIIITDKMDLKYHKEKFEELCEKLSPYTQKCIISYVDFYSKAVDELNRINAKDLAAEELYNLFGAIGSIGKKYNLSVETCAEDVPVEELGLKKAHCVDGELIKELRKEKGFHDNKEYKKDNNQRKACGCVQSIDLGIFNTCKHFCTYCYANFSRNSILKNAKKYDVNSPLLCSRLDLEKDEIRIREKDGSIKLDKEAILKAEANQKELMAQLDFYEYEKISLEENSNNWLIEKIIDYLRKTKQETLL >NC_014657.1|WP_158304031.1|2381555_2381693_+|hypothetical-protein MLKRISSAIIVYHILAIIITNITIVLPFKVNPVETCCTGAFSGIE |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_014657_3 | 2382387-2383146 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NC_014657_3
|
11 spacers
spacers of NC_014657_3
>3.1|2382417|36|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAAATCAAATTGTCTCAAATATTTTTGCCTTTCTAA >3.2|2382483|37|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAAAAGTCATTCCTCCACCCCTTAGTATCCCCAATC >3.3|2382550|37|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAAAATCCAAATGCGAAGGAAACTCTCATGCAGGTTA >3.4|2382617|35|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATATTATTCTGTTCCTGTTTCTGTTCCGGCGATGG >3.5|2382682|37|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCTTTGGATGAGGTTTCAAAAGCGTCGTCTTCACCA >3.6|2382749|36|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGATGATTTCGTAGCTGAAATATCCTGCACCTGCAA >3.7|2382815|36|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCCTTGAAACACCAGAATACAGGAGCGCATTTTTCG >3.8|2382881|35|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAATATTTTGCTTGGTCAATCACAAGTGTTCTTTG >3.9|2382946|38|NC_014657|CRISPRCasFinder,CRT ACAAACCACCGATTTTTTTTGAATTTTTTTCACTGTAA >3.10|2383014|34|NC_014657|CRISPRCasFinder GAGGGGAGAGCCTCCCCTTTGGGGATTGATGAGA >3.11|2383078|39|NC_014657|CRISPRCasFinder TAATCGTGGATCAAACGTGCAAACGACCAACTGAGGATG |
csx1,cas10,csm3gr7,csm4gr5,csm5gr7,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014657_3
The CRISPR arrays of NC_014657_3 >merge|NC_014657|3|2382387-2383146|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAACCAAATCAAATTGTCTCAAATATTTTTGCCTTTCTAAGTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAACTAAAAAGTCATTCCTCCACCCCTTAGTATCCCCAATCGTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAACGAAAATCCAAATGCGAAGGAAACTCTCATGCAGGTTAGTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAACATATTATTCTGTTCCTGTTTCTGTTCCGGCGATGGGTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAACTTCTTTGGATGAGGTTTCAAAAGCGTCGTCTTCACCAGTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAACTGATGATTTCGTAGCTGAAATATCCTGCACCTGCAAGTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAACTCCTTGAAACACCAGAATACAGGAGCGCATTTTTCGGTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAACAAATATTTTGCTTGGTCAATCACAAGTGTTCTTTGGTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAACACAAACCACCGATTTTTTTTGAATTTTTTTCACTGTAAGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAGGAGAGGGGAGAGCCTCCCCTTTGGGGATTGATGAGAGGGGAGGGCCTCCCCTCTGGGGATTGAAACTAATCGTGGATCAAACGTGCAAACGACCAACTGAGGATGGTTTGTAGCCTTCCCTCTGGGAATTGAGGT >NC_014657|3|4|2382387-2382945|PILER-CR GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC CAAATCAAATTGTCTCAAATATTTTTGCCTTTCTAA GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC TAAAAAGTCATTCCTCCACCCCTTAGTATCCCCAATC GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC GAAAATCCAAATGCGAAGGAAACTCTCATGCAGGTTA GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC ATATTATTCTGTTCCTGTTTCTGTTCCGGCGATGG GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC TTCTTTGGATGAGGTTTCAAAAGCGTCGTCTTCACCA GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC TGATGATTTCGTAGCTGAAATATCCTGCACCTGCAA GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC TCCTTGAAACACCAGAATACAGGAGCGCATTTTTCG GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC AAATATTTTGCTTGGTCAATCACAAGTGTTCTTTG GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC >NC_014657|3|3|2382387-2383146|CRISPRCasFinder GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC CAAATCAAATTGTCTCAAATATTTTTGCCTTTCTAA GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC TAAAAAGTCATTCCTCCACCCCTTAGTATCCCCAATC GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC GAAAATCCAAATGCGAAGGAAACTCTCATGCAGGTTA GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC ATATTATTCTGTTCCTGTTTCTGTTCCGGCGATGG GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC TTCTTTGGATGAGGTTTCAAAAGCGTCGTCTTCACCA GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC TGATGATTTCGTAGCTGAAATATCCTGCACCTGCAA GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC TCCTTGAAACACCAGAATACAGGAGCGCATTTTTCG GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC AAATATTTTGCTTGGTCAATCACAAGTGTTCTTTG GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC ACAAACCACCGATTTTTTTTGAATTTTTTTCACTGTAA GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAGGA GAGGGGAGAGCCTCCCCTTTGGGGATTGATGAGA GGGGAGGGCCTCCCCTCTGGGGATTGAAAC TAATCGTGGATCAAACGTGCAAACGACCAACTGAGGATG GTTTGTAGCCTTCCCTCTGGGAATTGAGGT >NC_014657|3|3|2382387-2383013|CRT GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC CAAATCAAATTGTCTCAAATATTTTTGCCTTTCTAA GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC TAAAAAGTCATTCCTCCACCCCTTAGTATCCCCAATC GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC GAAAATCCAAATGCGAAGGAAACTCTCATGCAGGTTA GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC ATATTATTCTGTTCCTGTTTCTGTTCCGGCGATGG GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC TTCTTTGGATGAGGTTTCAAAAGCGTCGTCTTCACCA GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC TGATGATTTCGTAGCTGAAATATCCTGCACCTGCAA GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC TCCTTGAAACACCAGAATACAGGAGCGCATTTTTCG GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC AAATATTTTGCTTGGTCAATCACAAGTGTTCTTTG GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC ACAAACCACCGATTTTTTTTGAATTTTTTTCACTGTAA GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAGGA
>NC_014657.1|WP_158304031.1|2381555_2381693_+|hypothetical-protein MLKRISSAIIVYHILAIIITNITIVLPFKVNPVETCCTGAFSGIE >NC_014657.1|WP_041738146.1|2380121_2381219_-|DUF1848-domain-containing-protein MIISVSRRTDIPAFYGDWFINRIKEGFAMYRNPMRLTQVFAVSLHPKDVDAIVFWTKNPKNFLDKLKYLEEYTYYFQFTITPYGKDIEPGIPSKDEVIETFIELSNMIGKKRVIWRYDPIIITDKMDLKYHKEKFEELCEKLSPYTQKCIISYVDFYSKAVDELNRINAKDLAAEELYNLFGAIGSIGKKYNLSVETCAEDVPVEELGLKKAHCVDGELIKELRKEKGFHDNKEYKKDNNQRKACGCVQSIDLGIFNTCKHFCTYCYANFSRNSILKNAKKYDVNSPLLCSRLDLEKDEIRIREKDGSIKLDKEAILKAEANQKELMAQLDFYEYEKISLEENSNNWLIEKIIDYLRKTKQETLL >NC_014657.1|WP_013413037.1|2378570_2379989_-|TIGR01897-family-CRISPR-associated-protein MKVIYQVGRLDNPAIATKKFYIKNFNGEIVEESGESELSSTVLRDFLRKRGCEAKTVVIYPVSIVLNSRLPEYIQPANLKEELSTIFKEPSEYLKNPDEFIDRIDLERCRDEKLIVHSLGEYLGTSLDASYDDIVLEILFDMIERYLKGELEDLYLDISSGHNIYISAILEAARHFAVFSNLMNWLDESKVPKIYLTFSDPIIGSSAKVFEIHIQQQRFTAFFSSPIKRKEAAEYNFSFLRNIFPDPDNGAKGSEAAKLKQQVREKRKKLREKIEMFCLLFSAIKNNVPLYLYYQHYHSVDEIKEEIFKLIEHAKGQLCSDYQKSPNLNKRAYIDAILSLGFYIGIVNVLEKHNITMFCQDTGIDLELLKRNYFEIYSTFRVPTNYVMLSNEISNTQKVLEQMDDIGSWTGLYKIIDPGKPAGEPIDRNYFAHSGFERNITEIRTEGSTIFIRYAFNTNFNVINCWLKDRIE >NC_014657.1|WP_013413036.1|2377621_2378425_+|tryptophan-rich-sensory-protein MERKRKAIISGVLLVITLIVNALGSMGIINGNSQKAVSDKYQTLITPSPSTFSIWGLIYLLLIISVALMIFKHNDDYFAKLIDSITYLFWLSCVLNIIWIVFFSYEMLGLATIVISGMLITLTLIVKNISKMQTQRKRLLPLTFGLYSGWLLIATVVNISAWLVKLRWNGLGISPEIRATVVLIISIALSTIIARNIKNEVFILPVAWAYFGIYNNLISASGFNNKFIVLPKIAIIGAAVLIAIFAIEFYKNKYCITPTVESEKKVK >NC_014657.1|WP_013413035.1|2374814_2377262_-|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Cas10/Csm1 MQKREIINTIAFAALMHDIGKFVRRSGLGKSSHEDESKEFLNRYKGIIQQSSLFSSEQLELVEKLVVNHHNNLSSSNDSKFSDDEKNLLKILIYSDWDSASERSTETEATGSQEYLPIHSILSFINEAFEIDEVWRQGKEEEAGEYLLQIKAFLPQDALLYRKPELDSNTSVVKENEKMFNKFEKEFNSLIKSSSSQDEFIMRLNYILKRYSTYITSSGKERVRDISLYHHSATTAAFAVNRYIDFVAGEKIDRYKKMGVIYGRLFKIQDYIFSGINSKIEKPLRRIITRSQLVSILNMLIPYDIIKTLKLYPFNIIFYGGGAFLIFIPCSYIQDAERKISEIKQKVADIFESKIYFEAICDQISIVDENGKYTIGNELKRLGAKLSDKKLSRSFDTIPSLFQEGYFDRKYFKCNNCSINSSNVIQEGEDYICKACYIENKWMNIDISKIKINVENLKVENIESPEHLEGDLRKNESVVNFSNQGIDEFKCIDTFLQGRKFIYNIHVCKKCPVFDKCNEPYKFDTSEPKDNDAKKIISTNCLEKLSNSDNIIATAKMDIDDLGFILYQVYPVRASQKEEYPFSVSRLSYASWLLNLFFTEGVKSVIDEKFKNEVMILYSGGDDLLITGVWEKVIEAIDEIEKEFSMFITGKIVSQRNVTVTSSIVFHRANENFDAVIKSVSEGLEKAKAVKNSVYIFDAVLSYPKLRESKEIAAKIVEYVEKKILTKSMVAKLLDILENRKKSRKIPYLEIKAVSQYCYLKRRLIEENRKLSKEQKEEVIEFLDSFMLIPSTCRDVDMQIVAVKIALRKLIKNKE >NC_014657.1|WP_013413034.1|2374191_2374806_-|hypothetical-protein MSNGMHHKGSRNSNQQRNNQQNQNQQPSFFSDPTYQQLDSSKTELFEKIREEQGFCDENGTRFDVMQKIEDFAKYLNCVYLQNTGETGVTSSSIRNIFENYISIRRKFQTYELEMLNNRIKDSKQKAFEKIRPQLISAKAKVNYLVERKLKEGSNRKDDSYYAKQIAYINFREFIKLSTDKITTSYKQFEAFMELLETLIAFMK >NC_014657.1|WP_013413033.1|2373462_2374164_-|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm3 MENSMLLRKIVVMTTLMKLETGLRIGGTKEEVRIGDIDHPVIRDPITKRPYIPGSSLKGKMRSVLEIALNGVQEPCFCGECVVCKLFGAGSKAGAEKKEVSRLIVRDCYMTEESQELLLNFVGDYVEIKTENVVNRVTGVAEHPRTLDRIPAGTEFKCEFVLRLYEKDLEHEENFIKNIKMALKLIEFTYLGGCGTRGYGKVKFSDVEFKRYDIKVTDDFVEISESKVDKIKL >NC_014657.1|WP_013413032.1|2372519_2373431_-|hypothetical-protein MIYRVDFTAVSTSSQFISPVIFGVIVDKIFELVDEKKARKIVDEIISSDILISDAYPIIRTDNGIERLFTKIGLSSFDEFENGDLSLKDRRKLSREMKKKAGQQLLIAIDHSGNMKETNRNIVSAVEVYRIGIQVNRHTDTSQEGILFYHQEFIFPQNQPFSIYIKCDNEKLIEIIEKCFSIIELTGFGPDVSIGKGKIRFFKHENKILIRDEQVERYFPQNIDGKEEFVNISSTIFSPQITEICKFKTYLTFRYDSKGYFTFKPPYFCAAKGAVVVPISSKLNLVKEYQGKLLYTCIFPLKL >NC_014657.1|WP_013413031.1|2371302_2372502_-|hypothetical-protein MEKEISYKTYKVLVEAISDFCVSANQDFNIKSSEYLINGKFAYIIENSSVVKMLEDGVISENELEDIKAFLQAHPEYLEKYFGDYKLELASEYDNNIGIIRFWRFSELADNSYRERYAIPASTVKGILKTGFLSFFLNSADYKYGRVGNKKRLQLMLLKPNNLKDKAKNTQQLYEILINQNDVKKGVHLYKLVGENTWKEINEIDNIILSTENMLFRNIICSDLVVKDGRFVVKKVNRISRVNKKSATLQYIELAQKGSLFEGEIKEVNHLKDLPVNMLSFLYYKDLNYPENLNLIDICREGLKKFSKKIIEAERKHFAQRIKDLNPQNSEFYDTLLSEVENEEIIIKLGRGGIHAKSFMSFDSNNLSKQDFFPYTINVDDADKLPIGWVKLRIEEEKR >NC_014657.1|WP_013413030.1|2370571_2371306_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRYKLRFYTEQDVLLRFDYNLELSMVIKNFLNPKYVEFLENGGFKCDNKIFKPYTFSRLLPEQYQINSYGIEIKKGYVELIISSIDENFWFSFLEGLLKEKKISLSGREFYLESISVKRLGKKKKIIAQTYSPFIVKTIFKNWSFIEVERNLKKNLMCKVYVFKRKKYNEEDFNLKLFEKTLKKTIIVINNTPSEAYSGLLLIEGDEDIIETAYDAGLGLKNALGFGCIEDIKSKEEKTIYRVY >NC_014657.1|WP_013413040.1|2383294_2384179_+|Rpn-family-recombination-promoting-nuclease/putative-transposase MCKKLPPKEHDTTFKFLFSDKDEILLLVKDILCYTWADRIEEDSIELVKTNYVTHEFSQVEADVVATVKKEMQQKILKYMISIWADEIRKDVQILPAIIPIVVYNGIGERWSVSTNLIEAFDIFKDDVFRYRVVDIIELDVKELLETKEDVLLPVVFYLEQVREDRSELIRRLLEVEENLKNLSKKNVDRFLEWSYRIIRPRLSEEQKSEYDTVARRLSEVGVNAMGEFISNVARLLDEAKIKDFMAGKLEGKLEATIEIAKRLIQKGFSDEEVAELTELQIEKVKELRKSMLN >NC_014657.1|WP_013413041.1|2384411_2385395_-|hypothetical-protein MKRVISTLLIVFLILSVSNAMAFAAKKKQVAGPKKSQSHEISEPGQTPVSQEETKQSSQTAISSNNTGFGTWLWNPWLIVSSKDDILNYLRANGYSELYLQIDSTLDSRYYRDFVSSAASYGISVYALSGDSIWIWQDRREGFYNFVRWVENYNLNVSESEKFCGIHLDVEPYQNTEWNTARDVVILNYQSFVEEAILQASRLNLPAVFDIPFWFDEIYYSNSYGSGNLAQWVISKASWTNIMAYRDSSQEIITISENEAGYAKNFGKKLVISVETQPSTEGENVTFFEEGLATMYSELSSVKSYFESKGYTNIGFAVHHLASVMKM >NC_014657.1|WP_013413042.1|2385660_2386470_-|ATP-dependent-Clp-protease-proteolytic-subunit MSFWDLLIFFIIASSLQPVMKQRMLESARQKLIAKIEKKRGSRVILLVHRQETMSFLGFPVYRYIDINDSEEVIRAINMTDPSIPLDIILHTPGGLVLASLQIARAIKRHKSKVTVHIPHYAMSGGTLIALAADEIVMCEDAVLGPVDPQIGEFPAVSILEVVKQKTLNEIDDKTLILADIARKALKQTKDAVLELLSDNYPENIAQNIAKELVEGKYTHDFPITYEKAKELGLRVRCDMDKEIKQLMCLYPQPVNKKSSVDYLWIPKK >NC_014657.1|WP_013413043.1|2386494_2387223_-|rhomboid-family-intramembrane-serine-protease MIPLKDTIPSREKPFMTWFLIVVNVFVFLYQVSLPPETAQEFVLRYAFIPEEFSKALSYGIITGIIYSIWPVICSMFMHGSWMHLISNMWSLWLFGDNVEDRVGHFRFLIFYLLSGFFAAYTHWFFYAGSDIPVVGASGAISGVMGAYFLMFPLSKIVTLIPIGFIPLFINIPAVFYLGLWFLSQVSSGILELFGPVFGSGIAWWAHIGGFVFGALTVNFFRKKYRRYNNFFDDEIFYYRYY >NC_014657.1|WP_013413044.1|2387502_2388057_+|biotin-transporter-BioY MQNTLSKYTTKNLVLSALFTAIVAVCAQISIQIGPVPFTLQVLAIFLASLILPPKYAFLSLLVYDLLGAVGVPVFAGFTGGLSKFVGPTGGYLIAFPIAAFVTSYINTKKPIKNEAANASAALILGLVIIYTFGFLYLSWAANMTLKKAFAAGVAPFIIPDIIKLAIAYFLARAIKSRKVLNIA >NC_014657.1|WP_013413045.1|2387986_2390212_-|ATP-dependent-RecD-like-DNA-helicase MQQNIQGMVSDIIYRNLENSYTVFEIICDDEVFTAVGIVPDIAIGEKVSVYGEFYFHPVYGQQLKVSYLEKLLPQTKDEIYLYLSSGVIKGIGQKTAKKIVDTFGDDTARILQEEPEKLLSIRGMTPEKVERIKNMFAFQKFLKDIMSIFSRYGFSQNHAMRLFKLYGFSALSLLQENPYFLLDVFPELDFKKVDRLALDMGVMLDDRRRISAKILNLLTLAANSEGHTCLPENRLKQICSKTLDLPVEKIEEALESLAQERRVVKDEVESQTMIFLYGYYECERYIADKILSMLKEYDDIADIDEKISLFEAKNGIAFSPNQKKAIKMALTQGVSIITGGPGTGKTTIIKCIIEIFEGAGKKVFLCAPTGRAAKRMQTACEKEAKTIHRLLEMTVLDTHVIFQRGPNNPLKCDVVVVDEMSMVDSFLMNYLLSAIKPTTRIVLVGDKDQLPSVGAGNVLKDLIKSQIVPCTILSDVYRQSENSFIVLNAHRINKGEFPYLQKESDFYFIQKNSQEEILKTVVELVTKKLPNYLSCDPMTDIQVLCPSKKGLVGMYNLNRVLQQYLNPPSSHKREYVFKENLFRVGDRVMQVKNNYSLEYEVIQGEEKGRSSTGIFNGDIGVVKDIDRVQGVLEILFDDEKLVYYDFSLLDDLELAYAMTVHKSQGSEFRCVVMPIVETYPILMTRNLLYTAVTRAKELVVLVGKKSALEYMIANQKEAMRYSALCDFLLRGQENMQLRAL >NC_014657.1|WP_013413046.1|2390261_2390774_-|hypothetical-protein MNSIPKDIIYFVPYYTEDGDSVLILFLSGEKKIVPMSIRSFSKKLYSLYAIDCQAIKKLISQRIGQKNLLPIVLPDATFIPVKTRKAIVKTDPIFGYVNMSQIFKIDDKNDHFEMLFRCGAVLNCLGSAKYFKKRITLASVITDYLQSIWLQGALKIKEECELENVFGLE >NC_014657.1|WP_013291523.1|2390859_2391009_-|YvrJ-family-protein MQDLIANIANIGFPIVLCIYLLTRFESKIDKLSDSIDKLSEKILQMKNN >NC_014657.1|WP_013413047.1|2391124_2391334_-|DUF2922-domain-containing-protein MLTLVLTFKLQNGKTFRLSIPDPKPNLTAAEVDSVMNLIVQKNIFVTSDPIVEKVSARIVDREVNTLIG >NC_014657.1|WP_013413048.1|2391392_2391605_-|DUF1659-domain-containing-protein MPAKPLTGSLQLKLENGTTSTGRIRFKTLSYDIKPNAQDVDVYQVGQAIASLQSKPLYTIIRSNNFELLY |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_014657_2 | 2.16|2368913|34|NC_014657|CRISPRCasFinder | 2368913-2368946 | 34 | KF620435 | Shigella phage pSb-1, complete genome | 4644-4677 | 7 | 0.794 |
| NC_014657_3 | 3.8|2382881|35|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2382881-2382915 | 35 | NC_048651 | Aeribacillus phage AP45, complete genome | 30236-30270 | 7 | 0.8 |
| NC_014657_2 | 2.16|2368913|34|NC_014657|CRISPRCasFinder | 2368913-2368946 | 34 | MH733496 | Escherichia phage PGN829.1, complete genome | 41556-41589 | 8 | 0.765 |
| NC_014657_1 | 1.24|92620|37|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 92620-92656 | 37 | NC_007410 | Trichormus variabilis ATCC 29413 plasmid A, complete sequence | 39506-39542 | 9 | 0.757 |
| NC_014657_1 | 1.24|92620|37|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 92620-92656 | 37 | NZ_CP047243 | Trichormus variabilis 0441 plasmid unnamed1, complete sequence | 49553-49589 | 9 | 0.757 |
| NC_014657_3 | 3.4|2382617|35|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2382617-2382651 | 35 | NZ_CP004365 | Komagataeibacter xylinus E25 plasmid pGX5, complete sequence | 263022-263056 | 9 | 0.743 |
| NC_014657_3 | 3.4|2382617|35|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2382617-2382651 | 35 | NC_016037 | Komagataeibacter medellinensis NBRC 3288 plasmid pGXY010, complete sequence | 113194-113228 | 9 | 0.743 |
| NC_014657_2 | 2.7|2368312|36|NC_014657|CRISPRCasFinder | 2368312-2368347 | 36 | NZ_CP031279 | Staphylococcus hominis strain 19A plasmid unnamed2, complete sequence | 39434-39469 | 10 | 0.722 |
| NC_014657_2 | 2.3|2368047|36|NC_014657|CRISPRCasFinder | 2368047-2368082 | 36 | NZ_CP050442 | Tolypothrix sp. PCC 7910 plasmid unnamed2, complete sequence | 27612-27647 | 11 | 0.694 |
1. spacer 2.16|2368913|34|NC_014657|CRISPRCasFinder matches to KF620435 (Shigella phage pSb-1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
cgcaatgt-gagtttaaaccatctaagctgtttga CRISPR spacer -gcgatgcagaggttaaagcatctaagctgtttac Protospacer **.***. *** ***** **************.
2. spacer 3.8|2382881|35|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048651 (Aeribacillus phage AP45, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
aaatattttgcttggtcaatcacaagtgttctttg CRISPR spacer aaatattttgcttggtcaataacaagggtgcgcgt Protospacer ******************** ***** ** * .
3. spacer 2.16|2368913|34|NC_014657|CRISPRCasFinder matches to MH733496 (Escherichia phage PGN829.1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
cgcaatgt-gagtttaaaccatctaagctgtttga CRISPR spacer -gtgatgcagaggttaaagcatctaagctgtttac Protospacer *..***. *** ***** **************.
4. spacer 1.24|92620|37|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_007410 (Trichormus variabilis ATCC 29413 plasmid A, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
gcgaaatattgttctgcttcgtcaagggtgacatagg CRISPR spacer ccaatgttttgttctgattcatcaagggtgacatttg Protospacer *.* .* ******** ***.************* *
5. spacer 1.24|92620|37|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP047243 (Trichormus variabilis 0441 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
gcgaaatattgttctgcttcgtcaagggtgacatagg CRISPR spacer ccaatgttttgttctgattcatcaagggtgacatttg Protospacer *.* .* ******** ***.************* *
6. spacer 3.4|2382617|35|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP004365 (Komagataeibacter xylinus E25 plasmid pGX5, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
atattattctgttcctgtttctgttccggcgatgg CRISPR spacer ttctgtttctgtttctgtttctgtttcggcgcgcg Protospacer * * *******.***********.***** *
7. spacer 3.4|2382617|35|NC_014657|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_016037 (Komagataeibacter medellinensis NBRC 3288 plasmid pGXY010, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
atattattctgttcctgtttctgttccggcgatgg CRISPR spacer ttctgtttctgtttctgtttctgtttcggcgcgcg Protospacer * * *******.***********.***** *
8. spacer 2.7|2368312|36|NC_014657|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP031279 (Staphylococcus hominis strain 19A plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
ttgcaactgtttggaatgcaatcaagaatgttattt CRISPR spacer tctcaacagtttggaatgcaattaagaatacgacaa Protospacer *. **** **************.******.. *.
9. spacer 2.3|2368047|36|NC_014657|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050442 (Tolypothrix sp. PCC 7910 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.694
tatcaaaagaagcgttgtgggctatcaaaggatatt-------- CRISPR spacer tatcaaaggaagcgttgtcggctatc--------tcccctggca Protospacer *******.********** ******* *.
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
891917 : 922848
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_014657|891917:922848|DBSCAN-SWA 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37 | Paenibacillus_phage(15.38%) | transposase,portal,terminase,integrase,capsid | attL 885392:885407|attR 917418:917433 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
1311257 : 1323405
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_014657|1311257:1323405|DBSCAN-SWA 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TCTCTTGTTTTTGAAAAAATTATTAACGAACTGTTAACAATTAATAAAAATTATTTTAAATCAAGTGTAAATATAAATTTAGACCCAATACCTTCTTCACTTTCAACCCAGATATTCTGTTTGTGAAGTTTTATAATTTCTTTTACAATTGAAAGTCCTAATCCAACACCATTTTCAAGGCTTCTGGACTCATCAACTTTATAAAACCTCTCCCAAATAAGTTTTTGTAGCTTCTCTGGAATACCCACCCCTGTATCTTGTATGGTTATATATGCTTTGCCATTTGCTACTTCACTATATATATATATCTTCCCTCCAACTTTGTTGTATTTTATAGCATTGTCAAGAAGATTGTGAATAACCCTGCTTATCAAATCTCTATCAGCCTTAACAACAAGTTCTTCATCCACCTGAACATCTATATCTATATTTTTTTCTTCTATCCGTTTCTCAAACTTAATAAGCTCTTCAGCAATCACAGAATAAATCTTAAATTCGCTCAAATTAAGATTTATTTTTCCCCATTCAAGTCGAGACAATTCTAAAAGCTGGTTAATCAAGTTGTTAAGCTTTATAACTTCCTCTTTTACAAGAGTTAGATAAAAATCTCTTTTCTCATCTGGAATAGTTTTATCTAATATACCTTCCACAAAACCTCTTATCGAAGTAAGAGGAGACCTAAGTTCATGGGAAACATTAGAAATAAAACTCTTTCGCATTGTTTCTAAATTTTCTAATTTTTCAGTCATATAATTAAAAGATGAGACAAGTTCACTAATTTCGTCATCACTATTGTTCGAAATAGGAATTTTTTGCGAAAAATCACCTTCAGCTATCTTTCTTGAAGCCTGTGCAAGCTTTTTAATGGGAGTAATAATCCTTTGAGTCAGTGCATATGTTATTATCAAAACAACTAATACCTCAAACAATGTAATTAACCAAATTATTCTATTATACATCTTTAATGTCTGCCTTATTTCATCGGTCGAGGTGATAAGAAGCAGTCCTGACACAACATGATTGTTTATCACTACCGGATACCCTATAACCAAATACTCTCTTTTTATTATATCACCTATAAGAAGCTTTTTTACAGCAATTTCTCCTCCGAATACCTTATCTCTTATCTTTCTTAAATTTAAATCATCTATATACACCTGTTCATCTGAGTTTAATATTACATTTGCATTTTTGTTTATCAGTAGAATTGAAGCATTCAGATAATCACGCAAAAATCTAATTTCAAACCGCAGTCTATCTTGCTCTAGAAACCCTGTTATATACCAAAGTGCAAGTCCTGTTGCTATCTTTTCAGCTTCCCTGACAAGCTGGGTTTGTTTTTGAGAAATAAAATAGTTTTCAGTCAGGTTATTGAGTACTGTGCCAAAAATTAAAAAACCAACTGCAATGATTATGGCATATATTATCACAAACTTAAAATATATAGATTTCAATTTTTTCACTTCCTTGGTGGCAATTAAATTTCAAACTTATAACCTACACCCCATACAGTCTTTATTTTCCAAGGATATTTATCTTTTTCAATCTTTTCTCTTATCCTTTTAATGTGTACATCAACTGTTCGAGTGTCACCAACAAAGTTGTAACCCCATATATGGTCAAGAAGTTGTTCACGGGTGAATACCTTGTTAGGATGTGACGCTAAAAAATACAAAAGCTCTATCTCTTTCGGTGGCATATCTATTACTTTATCTTCAAGTTTCACTTCATATGTAGTGAGATTTACTGTCAGATTTGGATATACCACAACCTTTTCATCATTGACTTCACCCTGTGTTCTTCTCAGCACTGCTTTTATACGTGCAATTAGCTCTTTAGGATCAAACGGTTTTACAATATAGTCATCTGCTCCTAACTCTAATCCAAGTACCTTATCAAACGTCTCTCCTTTAGCAGTGAGCATTATAATTGGAATGTTACTAATCTTTCTGAGTTCTCTACAAACATCATATCCATCTTTTTTGGGTAACATAATGTCCAGTATTACAAGGTCGGGCATTTCATTTTTGAAAACAGAAATTCCATCCATACCATTGTGAGCAACTACCACTTCAAACCCTTCTTTTTCTAAGTAGAGTTTTATTACTTCACATATCTTTACATCATCATCAATGACAAGAATTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_014657|1311257:1323405|1312939_1314364_-|WP_013412156.1|DBSCAN-SWA MCFKELEEGFKDHCGIFGIYCPDGKLDVAKITYFGLFALQHRGQESSGIAVNDSGNIIYHKDNGLVNEVFNEVVLNHLKGYSAIGHVRYSTTGKSDRENAQPLVIKYRRGHMALAHNGNLVNAHIIREKLEQEGAIFQTTIDSEVIASLISRNRIKSENIEEAILKTMDEIKGAYSLLILTPNKLIAVRDPYGLRPLVMGKINNSICFASETCALDTIGAEYIRDVEPGEIISVTKSGIKSVKYNNNTKHLCVFEFIYFARADSYLEGISVYEIRKRLGKQLCKESYVDCDIVIGVPDSGTTAAIGFAEEANIPFSEGFIKNRYIGRTFIKPEQTQREIAVKIKLNVLKSNVADKRVVLIDDSIVRGTTSRKIIKMLRDAGASEVHLRISSPPVLFPCYYGIDTPDRKELIAANYSTEEIARILGADSLEYLSLNGLNEVFDGKIHQFCTACFSGEYVTEIPGNFNKYILEEGV >NC_014657|1311257:1323405|1317246_1317495_-|WP_013412159.1|DBSCAN-SWA MLKAEIYVYLKKSISDPPGIAVLNSLKSLGFDSVEKVRMGKYIVVYLNENDIEKAKEQVKLMCEKLLCNPVMEEYKFKISEE >NC_014657|1311257:1323405|1321306_1322710_-|WP_013412163.1|DBSCAN-SWA MKSIYFKFVIIYAIIIAVGFLIFGTVLNNLTENYFISQKQTQLVREAEKIATGLALWYITGFLEQDRLRFEIRFLRDYLNASILLINKNANVILNSDEQVYIDDLNLRKIRDKVFGGEIAVKKLLIGDIIKREYLVIGYPVVINNHVVSGLLLITSTDEIRQTLKMYNRIIWLITLFEVLVVLIITYALTQRIITPIKKLAQASRKIAEGDFSQKIPISNNSDDEISELVSSFNYMTEKLENLETMRKSFISNVSHELRSPLTSIRGFVEGILDKTIPDEKRDFYLTLVKEEVIKLNNLINQLLELSRLEWGKINLNLSEFKIYSVIAEELIKFEKRIEEKNIDIDVQVDEELVVKADRDLISRVIHNLLDNAIKYNKVGGKIYIYSEVANGKAYITIQDTGVGIPEKLQKLIWERFYKVDESRSLENGVGLGLSIVKEIIKLHKQNIWVESEEGIGSKFIFTLDLK >NC_014657|1311257:1323405|1311910_1312936_-|WP_013412155.1|DBSCAN-SWA MTTYKDAGVNIEEGYKAVNLIKGLARETFDSNVITDIGSFGSMYLLNIGSSEYILVSGTDGVGTKLKIAFCLDKHDTVGIDCVAMCVNDILCHGARPLFFLDYVACGKLSSSKVASIVKGVAEGCKMAGCSLVGGETAEMPGFYKEDEYDLAGFAVGIVEKQKAVYGKDVNTGDVLIGLASSGVHSNGYSLVRKVFEIDENPKVLEKTYEELEMSLGEELLKPTRIYVKPVLKVLEKVRVKGIAHITGGGFFENIPRAFPKGYSAVIEKGSWEVPAIFKLIQEHGKVEEKEMFSTFNMGIGMVLIVSKDDVDLTLEMLEQERVKAWVIGTIQKGEDGVVLR >NC_014657|1311257:1323405|1319983_1321213_-|WP_013412162.1|DBSCAN-SWA MMDKFDFESPNYQPSYSPINFEIPKTIRKKKSIKEYLVAGLIGGIIGALLVSMFFIGYFEINFNNFKNDANSTLNSLNLNSSSNAEPLTKTVVLNSGNSSFVTDVAQKVGPAVVGIKNKGTAYNWWTDEEQEITIGEGSGVIISKDGYIVTNNHVVSGAKSVSVILSGEKEVPATIVGTDALSDIALLKIDPKYVKAVAPLGDSSKVKVGEFVIAIGNPLGQEFAGTVTFGVVSAVNRKLDMGNGIQIPLIQTDAAINPGNSGGALVDSSGQVIGINTAKISQTGVEGMGFAIPINYVKPIINDLMKYKKVLRPTIGISVMEYYDRTGNVMGMYISRVYPGTGAAKAGLKEGDIILQIDGKKVTTFSDIQSILSNHKIGDVITIRVLRDGQTKDFKVTLGTPIDTTNKD >NC_014657|1311257:1323405|1316544_1317243_-|WP_013412158.1|DBSCAN-SWA MKFGVVVFPGSNCDSDCFHVIKDVINEDVEYIWHDYDEKLTGFDCIILPGGFSYGDYLRAGAIARFSKVMPRIEEFAHNGGLVIGICNGFQILTESHLLPGALIRNKNLKFICSDQYVKVVNTNTPFTNLYTKGEVINLPIAHGEGNYVVDEETLKQMIQNQQIVLQYCDKYGNVNDETNPNGSILSIAGVCNKEKNIFGLMPHPERSSEKILGCEDGKRVFLSIVNYLKSR >NC_014657|1311257:1323405|1318375_1319764_-|WP_013412161.1|DBSCAN-SWA MLENIFKLKERNTDVKTEVLAGFTTFITMAYIIFVNPSILSTTGLDKHVVFFATCIGAAIGTLIMALYANLPFALAPGMGLNAFFTYTVCLQMKYTPQQALAAVFISGIIFVIITAVGLRQAIVRSIPQSLKHAMTAGIGLFIAFIGFINSGIVVIDPGSKLPKFGDFTSAFKSLTNDPNINSAIISSRGAIVALIGLLIIGILIAKRVKGAIIIGIIITTVISFPLKIVDLSKFKFSVEAFKISAFNFDFAGLFAAHGQGGSLGAILLSLFAVILTFTLIDMFDSIGTFVGLADKAGMLDEKGDIPNMNRALMSDAVATIVGAIFGTSTVTTYIESAAGIEEGGRTGLTSLVTGILFILALVIAPFIGLVPSQATAPALIAVGVMMISSIKKIDFNNFEEALPAFLTIVIMPFTYSIANGISAGIIFYVLSKLLRGKAKEVHPITYILAILFILRFMIIAH >NC_014657|1311257:1323405|1317498_1318251_-|WP_013412160.1|DBSCAN-SWA MNYVITKLLYEGKAKKVYETNCQDVVVIEYKDDATAFDGTKRGIINNKGIVNNLVSNYFFKILESNKIPTHFIEQIDERKTAVKKVQIIPVEVIVRNIAAGSLCKRLGLEEGAILKRPILEFCYKNDALRDPQVNQYHILALELATEDEIKKIEEYSFKINDVLRNYLKQVNIDLIDFKLEFGRYKGEIILADEISPDTCRFWDVATKEKLDKDRFRRDLGNVEEAYMEILRRLGLDKKVNKFNSELKGE >NC_014657|1311257:1323405|1311257_1311914_-|WP_013412154.1|DBSCAN-SWA MKKLAVFVSGSGSNLQAIIDQIKVGEIPATISCVISNKKDAYALERARKNGIQAIYISKKDFPSSLEYEKYLVNFLKSQKIDYVILAGFLYIFSEYFVEEFKNRIVNIHPSLLPAFGGKGMYGINVHRSVLEYGMKVTGATVHFVDAVPDGGPIILQKAIYVKDDDTPETLQKRVLEEVEWKIYPLAIKLLCEDKIEVVGRKVIIKDREILKKVGIEI >NC_014657|1311257:1323405|1314345_1316538_-|WP_013412157.1|DBSCAN-SWA MNKHLYEEVGLSYDEYKMIVEILGREPNELELNLFGVMWSEHCGYKNSKAFLKNLPTKGEHILQGPGENAGIVDIGDGYAVCFKVESHNHPSAVEPYEGAATGVGGIIRDIFTMGARPIALLDSLKFGKLDDSRTKYLFEGVVSGIAGYGNCVGIPTVGGETTFDPVYKNNILVNVMCVGIMKKNKIFKGVAQGVDNSVFYVGHTTGRDGMGGATFASTDLTAESEEKRSAVQVGDPFMEKLLLEACLELFQTDAVVGIQDMGAAGLTSSTCETAARAGTGIEIDVALVPKREEGMNPIEVMLSESQERMLIIVKKEREEEVYRIFEKWGLHAVKIGRVTDDGMLRVLDNGKVLAEVPAKALAHAPVYVREVKEPAIIKEAEKFDIYSIPQPNDLNEVICKMISNPNLASKEYIYRQYDHMVRTDTVIRPGHDASLLRIKGTKKGIAVTIDSNGRYCYLNPYEGVQLVLAESYRNIVAVGAKPLAITDGLNFGNPHYPEIYYQFVKTIEGMKVACEHFETPVTGGNVSFYNQSEEGAIYPTPVIGMIGRIDDIEKAVDISFKNEGDLVAVIGKTSDDIGASEYLSFYHGIVSGRVPKLDLKLHKKVCDKVLECINKGLFNSVHDISDGGFAIALIESAIRGSKGAELQIKTELREDFYLFSETPGRFVVTFKEGNLKEIQDILEDIEFTVVGRVTGEFVINGKINDKDIHLDLKEVERIYQEAIPCALKS >NC_014657|1311257:1323405|1322733_1323405_-|WP_013412164.1|DBSCAN-SWA MKILVIDDDVKICEVIKLYLEKEGFEVVVAHNGMDGISVFKNEMPDLVILDIMLPKKDGYDVCRELRKISNIPIIMLTAKGETFDKVLGLELGADDYIVKPFDPKELIARIKAVLRRTQGEVNDEKVVVYPNLTVNLTTYEVKLEDKVIDMPPKEIELLYFLASHPNKVFTREQLLDHIWGYNFVGDTRTVDVHIKRIREKIEKDKYPWKIKTVWGVGYKFEI |
11 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
2077851 : 2138220
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_014657|2077851:2138220|DBSCAN-SWA 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MEYTTLGQRFILGLEVTVIGMLIVFAVLALLCGIISLLSKFLQRFEKPMKAQDSHFSSIEIDETQEDSLLEKTGFTSGEAYILDAEDEEIAAILAAVAFDSDIPLSELKIKSIKPVKE |
41 | uncultured_Caudovirales_phage(33.33%) | integrase,tRNA,transposase | attL 2079700:2079715|attR 2140699:2140714 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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