Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_014655 | Leadbetterella byssophila DSM 17132, complete sequence | 7 crisprs | DEDDh,csa3,c2c10_CAS-V-U3,cas3,PrimPol,RT,WYL,DinG,Cas9_archaeal | 4 | 15 | 12 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_014655_1 | 578987-579060 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_014655_1
|
1 spacers
spacers of NC_014655_1
>1.1|579011|26|NC_014655|CRISPRCasFinder AATCCCACAAGTTTTGTTGTTGATCC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014655_1
The CRISPR arrays of NC_014655_1 >merge|NC_014655|1|578987-579060|CRISPRCasFinder CTTAGATCTTAGAAAAATACAATGAATCCCACAAGTTTTGTTGTTGATCCCTTAGTTCTTAGAAAAATACAATG >NC_014655|1|1|578987-579060|CRISPRCasFinder CTTAGATCTTAGAAAAATACAATG AATCCCACAAGTTTTGTTGTTGATCC CTTAGTTCTTAGAAAAATACAATG
>NC_014655.1|WP_083794533.1|578469_578922_-|DDE-type-integrase/transposase/recombinase MSTVLDDYCRYIIHWELCDSMNAEDVKRTVNTAIEKAKLKSKAKPKLLSDNGPCYISSELKTYLKEDMKMKQVHGRPMHPQTQGKIERYHRTMKNVVKLNHFYHPEELIEALGKFVDNYNNRRYHESLQNLTPADVYCGRSERILKKENR >NC_014655.1|WP_013407105.1|577928_578237_-|transposase MSKHRKTWSLEEKEKIVLHSIQHGVSYSSREFGVSTVSIYNWKEKFEKLGKSGLEAGAMTDAERELKQLRRENEALKRIVAEKELAIQIKDSLLKKSQSLKK >NC_014655.1|WP_083794525.1|577032_577926_-|DDE-type-integrase/transposase/recombinase MQVVDEFLEQGRPKYLVLKHVDLPRSSYYYISTGTKPGKRASGYVYDMENNRFDMDYILQETKTLLEGEFVDYGYYKTYRYLNQEKGLRIGAYRTYKLMKENNLLKFQRSNTKRISRNWVKELVPIVQREFAFLEFDIKYVYIQGKRTNAQVLTILDVFSRWQLGQYIANSIKSEDVINLFEQILQTYPMPKQFIVRNDNGSQFEALIVQEYLKQKGITQEFTKPATPQQNGHIEAYHSILESAVCQRFEFESLQEFKQVMIRWKKFYNFERIHGGLHYKSPRKFLESIGVKIDPNW >NC_014655.1|WP_013407358.1|576646_576913_-|transposase MKTSKFNPTQIAKILKEFESGKDVDSIIREHGISKATFYKWRQRYGGMEASELKRVKQLEEENAKLKRMYADLAIELDMAKYIIEKKL >NC_014655.1|WP_083794532.1|576077_576545_-|IS3-family-transposase MYQSIKNDTALMASLEKLAVDHPREGFWKSYYRLRNAGQKVNHKRLHRVYKQMGLPLRRKVKKRLPARVKETIAVPAHFTHTWSIDFMHDVLQNGRKFRSFNVIDDYNREVLFIETDYSLKSSRVIWILNHLINKHGKPQKIRMDNGPGARSQSL >NC_014655.1|WP_187287917.1|575886_576051_-|transposase MIGIEFKYIQPGKPTQNALIERFNKTYRTNVLDAYLFESIDEVREISQKMGSGL >NC_014655.1|WP_083794530.1|575765_575930_-|transposase MKCEKLAKKWVQDYNHYRPHDSLGGISPVAFKNKKSVVGLRSATLHCAQQQTEI >NC_014655.1|WP_013407357.1|575162_575648_-|hypothetical-protein MKLLFYLSLLAILSLSSCKEQSFNQEIPYTSLADLSKEAEFRFSIKSSSLGNYPILDDGEVRTSDYLVVINDENAYLNEVVTKYEHPFINFSTHTLLVLGIEYRGTVTLKPRKEGNKTILTVIKKIPELGPQGTVFNTFSAIVPKVDSTNVIKELIEVNVK >NC_014655.1|WP_013407356.1|572797_575161_-|S8-family-serine-peptidase MRKYILLLLLAIGVLPGFSQKFYRYVDNEKDILTISGDKFFVSLKDSTYAENLSRVNFISKLDRIDNKGTYLISSTRKIDFSEVFEHLKNDSYVEFLSPVISSNGKEMGGYTSKIIIKTKNEMSLEDIENIVDKYGLRVFEYSKFDKTTVFLQSKEKDASKNQEIANALHSSGIFEYADPNYLLFVNPASDPLYSSQWHLNNTGQVGGTTGEDIKAPGAWTVTTGSSSIKIAILDSGVDLDHEDLTDNMGAGYDATGGSSNGDDWYFHGTAVAGVAAARGDNSKGVRGVAYYSTIIPVRFYNSASGWSTTESGYLQSAIQWIRTGNRADIINMSFTITQTTSLNSEINTAASSGRGGKGIVMVASSGNNNSTSIGYPSSNSNVISVGASNQFRQRVSPTSSDGTSDSDFLGSNYGSGLDIVAPGLNIRSTNIAGTIPANFYLYYKGTSYSAPQVSGAAALVLSVNSNLTREQVKNILESTADKIGTYTYSSGAGENPSLTWNSEMGYGRLNACRAVTIAKAGKINGSDLVCSNSTFTLDAIPAGATISWSSSNTGILTINSSTGVATRVGSGSGSVTITSTLNASCGSVQLTKVVWVGNPDLTKRINGTIAGTTPVNPGNLYNLTAESQSPSTSFNYNNYTGSGDMVIDIYYPNSANTQMYVYGTSTNGSRHVRVTATNSCGSYYQDFVFYIPSFFKSVYPNPAKDYLTLDFNDLTEKATLPDAIELYNEASMKKELVLNIDDVLKDTKNQQGNKYILDIKDLKRGVWYLHAVKKGYKTEVIRLLFE >NC_014655.1|WP_013407353.1|570491_570854_+|peptidase-M10 MEKFFTIALLLFCYGTTFGQEKGKPVYYDNWPTEIAANRDILKIKYSTTAKYVPIGSIWSKRILTYFFANGTTDMSGNTERDAVTLGFTYWSNVYVFKLNRTFWDKSLRSILVYKFNNFS >NC_014655.1|WP_013407361.1|579913_582187_-|multicopper-oxidase-domain-containing-protein MNRYNKIPIRILQTVLILLCTQTLFAQRVVHYELYVKDTLVNYAGKQKRAIAVNGQIPMPTLTFTEGDTAEIVVHNQLKESTSLHWHGVFLPNKEDGVPWLTQKPIAPGTTYTYRFPIIQHGTHWYHSHSGLQEQIGMYGSFIMKKRSDDKTFRKGIDDLPTVPIILSEWTNLNPDNINRMLHNANDWAAIKKGATQSYVEAIKEGKFGVKVTNEWKRMLAMDVSDVYYDKILINGSNAPELKTVDGKTLKAGDKVRLRISNGGASSYFWLRYAGGKITVVANDGNDVEPVEVDRLIIAVSETYDIVVTIPQDGLAYEFLATTEDRTQSASYFIGDGVKQLISPLPRLKYFEGMKMMNDMMKMNGDLDDMGMKMSLNQMDMNVVMYPEITGDATKKADHSKHEGMDMDNDANRYNANALGEIKTLNYAMLQSPHNTTLPKDAPVKELKFTLTGNMNRYVWSMDNKILSETDKIPVKKGEVLRITIYNNSMMRHPMHLHGFDFRVINGKGEKSPLKNVLDIMPMETDIIEFLANEEGDWFFHCHILYHMMAGMNRVFEVGDYKNPYLPDKAKAYKELQRESNMPHFMAQNDFATNGNDGEAMLMNARYQLGTEWRLGYNSMHGYEVETHLGRYIGKMQWFMPFVGFDWRYRKMGEDEHEKNIFGQINKKDTRRAFSVGFMYTLPMLVNFQAEVYHDGIVRLQLMREDIPISKRLRGGFMVNTDLEYMGELRYIINKNIGIRTHYDSDMGFGVGLALTY >NC_014655.1|WP_013407362.1|582200_582656_-|heme-binding-domain-containing-protein MTIKKKIILGLAVVLIAIQFSQPLRNQAVEVPATHIERVYAVPQNVKAILVQSCYDCHSNNTHYPWYSRIQPGAWYMAEHIKKGKEELNFSEFGDYSVRRQRNKFRAMAGQVKDGEMPLSSYTLIHRNAVLSPEDKQVLIAWFSTMEDSIK >NC_014655.1|WP_013407363.1|582688_583108_-|hypothetical-protein MSKIIIGFISLLALLFTACGQAGSNKDEAAQHHSQATPESHGHSTQIGELVPSDEVCMVNDAYMGKKQFDVKFDGKIYYGCCEMCKERIPKDATVRMAIDPYSHKQVDKANAMIAVTGNNGEVSYFENKENYAKYVKKQ >NC_014655.1|WP_013407364.1|583668_584334_-|DUF3347-domain-containing-protein MKNLTLSIIAVIMAFVTVSCNQASNKNEQSSNDTAVVSQEQPASQPKEDDTVSAPAVSETPSGQEAKATGKEEAKNFSIAPIVTDYLSLKNALVSDDDKAAASSGKKLLATLNKVDMKAVPADKHKKYMDIADDAKEHAEHIGENVGNIHHQREHLASLGEDLKDLIDLFGTSQTLYQDHCPMFNDGKGAVWFSENKEIKNPYYGSKMLTCGKVEKTINSK >NC_014655.1|WP_013407365.1|584340_586461_-|heavy-metal-translocating-P-type-ATPase MKKYTCPMHPQVLKDEPGKCPLCGMALVPVGDASVSLEHTSEHGHSGHSQHGHADENFNKHEGHHTGDFLTRFWISLVITIPILLLSHMIQQWLGFSLAFNGDKYVLLALGTVIYCYGGLPFLKGMIGEVKAKAIGMMTLVAIAISVAYVYSVAVVFGLQGMDFFWELATLIDIMLLGHWLEMRSQMAASRALQSLVALLPNDVTVERGGEAVKIKLEDLQSGETAIIKPGEKIPADGLVLEGLSYINESMLTGESIPVKKEKDGKVIAGSINGDGALKVKVTAVGKDSYLNRVINLVQEAQATKSNTQNLADKVAKWLTFIAIAVGIGTFVYWYASSGDIAFALERMVTVMVTACPHALGVAIPLVVAISTTLSATNGLLIRNRTAFETTRKLSTVIFDKTGTLTKGSHAVEKVIPLTDEYNDDEVIQYAAAVQQNSEHHIAKGIMATLKEKSLTLWKSENFSYMQGIGVKGVVNGKNVVAGGPNYFTENHLSLPEIPNEINQEAETVNFVLIDDRVIGIITLADSIREGSAQAIEELKKMGIKSFLLTGDNDRIAAAVAGKLGMDGYLANVLPHNKQEKVKEFQAKGEIVAMTGDGVNDAPALAQADVGIAVGSGTDVAAETADIILVDSDPRDVVKLIDFGKLTYKKMVQNLIWAVGYNVVAIPLAAGVLYPNFILSPAMGAVLMSVSTIVVAINASFLKIKK >NC_014655.1|WP_013407366.1|586479_586785_-|hypothetical-protein MVQYNDMVQALKDLRQRGYSMDFSLLPDCLYCTSRSLKLKPEDFTVTETHRFESLDSSPDNNAVIYAISSNDSKNKGVLVDAYGTYAEEMTHEMAKKLSAT >NC_014655.1|WP_041823398.1|586799_587675_-|DUF3347-domain-containing-protein MKSLSKIVMVIAVLLSSINGFAQIKNAKTETVKIYGNCGMCKTTIEKAGNVKKVASVDWNKDTKMATLTYDGDKTNQDEILKRIALAGYDSEKFRAPDDVYAKLAGCCQYDRPVKTVAKNKEAGMDMNAGQGNHDHSQMAANKDAAQNQSQLKAVFDNYFSVKDALIKTDAATASANAAELAASLKAVDMNKLSAEEHTAWMKVMQDLTANAESISKSKDVAKQRSAFAALSESIYTLAKVSKQDTPIYYQHCPMYNGGKGANWLSKENAVINPYYGSQMLTCGSTVETIK >NC_014655.1|WP_013407368.1|588387_589182_-|cation-transporter MNKTIFNITKMDCPSEEQLIRMKLQDFDTVKSLEFDIPNRELNVYHSGNPEPILSALETLNLNTTLISTEETDGVIETDTSNRQRRLLWTVLVINFVFFGVEMLFGIFSNSMGLVADSLDMLADSIVYALALFAVGGTVARKNNIAKFAGYFQILLAVIGFVEVIRRFLGFEKMPDFQTMIIVSVLALMANVLCLYLLQKNKSKEAHMQASMIFTSNDVIINSGVIVAGLLVHWLNSSYPDLIIGAIVFVIVARGAYRILKLVE >NC_014655.1|WP_013407369.1|589185_591357_-|TonB-dependent-receptor MKKILIVSFFMALNLCVYAQNTLTAVVKSSGTKEPLIGVTASIKGTSIGATSNENGQITLFNIPNGLQEIHFNYIGFNERIDTLEFPLKDTSVIEILLKESSEELDEIVISSTRSTRSIQNIPTRIEFIGGEELDEKGNMKAGDIRMLLSESTGIHVQTTSPTSANASIRIQGLDGRYTQILKDGFPIYSGASSGLGLLQIPPLDLKQVEVIKGSTSTLYGGGAIAGLVNLISKTPTEERDLRFHLNGTSGRGLDINGFYGQKFNKIGTTIFASHNRNVAYDPAQIGLSAIPQFERYVLNPKLFVYFNDKTKMNFGINATIENRLGGDMLYIKGKADNTHQFFEENKTQRYSTQFVFDHTVNENSFVQVKNSVSYFNRNTAIPNYEFEGTQTATFTEASYTHSKEKSEWITGVNIWTDNFKEKQITSFPLRDYNQTTFGAFVQNSFRATDWFQLETGLRTDYVVDYGAVFLPRVSALFHIANGLTSRIGGGFGYKTPTIFTEESERIQYQNVMPIYDNTNKLEKSYGANADFNYRTNMGDDWTFSINHLFFYTYLDNPLLLQNMATNTYQFINSSGYIHTKGTETNVKIGYDDLKLFLGYTFTDTRLLENGTSTENPLTPKHRVNSVLMYEIEDKWKIGLEAYYFSPQKLNDGTTGKDYWMCGFMAEKIWERFSLYINFENFLDTRQTRFDNIYTGTITNPVFRDIYAPLDGFVINGGIKFKL >NC_014655.1|WP_013407370.1|591442_591754_-|hypothetical-protein MKYLSFILALMVLVLSTAPCFMEDKCLDLAQQTTDSQEQDNDDCGMDWCSPFSKCNTCTGFVITSFYFSIANSFQLPEKKLGVITTSPISDFPYSIWHPPQIA |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_014655_2 | 774055-774137 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NC_014655_2
|
1 spacers
spacers of NC_014655_2
>2.1|774079|35|NC_014655|CRISPRCasFinder AATGACCTAGTCGAAGCCCCGGTGGCTATATTTCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014655_2
The CRISPR arrays of NC_014655_2 >merge|NC_014655|2|774055-774137|CRISPRCasFinder TCCCTTCGACTTCGCTCAGGGACCAATGACCTAGTCGAAGCCCCGGTGGCTATATTTCGTCCCTTCGACTTCGCTCAGGGACC >NC_014655|2|2|774055-774137|CRISPRCasFinder TCCCTTCGACTTCGCTCAGGGACC AATGACCTAGTCGAAGCCCCGGTGGCTATATTTCG TCCCTTCGACTTCGCTCAGGGACC
>NC_014655.1|WP_148225757.1|772633_772942_+|NADH-quinone-oxidoreductase-subunit-NuoK MIDNLMPYLCVSAVLFALGFAVVVTKKNLVLMLMGVEMMLNAVNINFAIFSKFDKSAEQGQIFSIFIMIVAAAEIAVGLAIALKVRKYYQEIDPLKLNSLRD >NC_014655.1|WP_013407517.1|772164_772644_+|NADH-quinone-oxidoreductase-subunit-J MIDLVFWLFCLLTIGGGVYVLLSKNVLYAAYGLLSTFLGVAGMFVFAGAEFMAAAQIMIYVGGIMILLIFGIMLSTRRKYLVVEDAAQNRGILVAVLLAAVWIVLIIKLRLLSGEPVELISIKKVGLALMTSHVLILELVGVILLMALVGATYIARDDR >NC_014655.1|WP_083794535.1|770471_772172_+|4Fe-4S-dicluster-domain-containing-protein MENVLAYFRNILRGIRTTSKGLGLTLKHLWAARHSKGHMELRSTEFFQVDEGNVTLQYPHARLEVPDTGRYQLDCEIDDCIVCDKCAKVCPVDCIEIEAIKSPELIRYASDGSPVRLHAAKFNIDMAKCCFCGLCTTVCPTECLTMTSEYDFSVEEVDLLNFAFSNLSAKEAEEKRELYQQFVAEKEASKALDKPKGNDSPSVAKPVFTPKAKPEASEGVAKSAFVPKAKPQVGEENAKPGFLPKGKPQEADEGSKPAFVPKSKPEQAEGEKKPAFVPKAKPQVADEVSKPAFIPKAKPEQAEGENKPAFVPKAKPQVEDEVSKPAFIPKAKPEQAEGENKPAFVPKAKPQISDEGSKSAFIPKVKPEQAEGENKPAFVPKAKPQVADEVSKPAFMPKAKPEQVEGENKAAFVPKAKPQVADEVSRPAFVPKSKPEQAEGENKPAFVPKAKLQGADEGSKPAFIPKAKPVQEEGEKKPAFVPKAKPQVADEGSKPAFVPKAKPEVAEGENKPAFVPKAKPQIADEGSKSAFIPKGNPEQAEGENNSSSEGSKAKFVPKRKPPMAND >NC_014655.1|WP_013407515.1|768823_770404_-|pyridine-nucleotide-disulfide-oxidoreductase MQKILKYVVGPEIAFDQDALESFLKKKTGLDQFHFRKYRQSIDARGKAVKVNLEVEISTDGPFQPLDFPEYQYKSGPFKKKLIIIGAGPAGLFAALRCLELQIQPIILERGKDVRARRRDLAAINKEHIVNPDSNYCFGEGGAGTYSDGKLYTRSKKRGDIRRILEIFVKHGATERILVETHPHIGTNKLPVVIENIRNTILQNSGEIHFDTKVTDFLFENGQIKGVISQGDKTWQADGVILATGHSARDIFELLHQKGLALENKPFALGVRVEHAQKFVDSCQYHTPQRGLLPAAAYSLVEQTNFEGVQRGVFSFCMCPGGFIVPASTAPGELVVNGMSPSRRDSYFANSGVVVAIDERDWAPYLEKYGPLSALQYQKVIEQRAHQLVIEKSGAEYSQAAPAQKIKDFYSGKVSKDLNETSYQPGLIPLDFHHILPKPIAGALKQGLKGFNRKMKNYELGQMIGIESRTSSPVRIPRTEEDLEHPEVQRFYPCGEGAGYAGGIVSAAVDGERCVNAFAKKYLEKY >NC_014655.1|WP_013407514.1|768189_768789_-|CoA-pyrophosphatase MDSTITFLEKRLKDPLPGIASHKRFMHPGRSMDIPADLRSSAVLILLYPHENEIYFPLILRPKYDGKHGGQMALPGGKTEPSDENVIRTALREAQEEIGIRAMDVQILGQLTEVYIPISNYVVYPVIGFMDYTPQFYPDAREVDKIYTPKLTDLKGETVHRTITIGNQEVDVPGFEIQDTWVWGATALMLGELSDILWP >NC_014655.1|WP_013407513.1|767855_768161_+|DNA-directed-RNA-polymerase-subunit-omega MAINPSIITRDTDVLASKTTNLYESVYVVSKRAQQIAIKSKEELSHKLSEFASSVDNLEEIFENREQIEISKYYERQPKPTSVALEEFLSDQIVVKYKDAE >NC_014655.1|WP_013407512.1|766924_767815_+|outer-membrane-protein-assembly-factor-BamD MNLRLYPLLVLSVLIFSCSREFSRVQKKGTTEEKYAAAVKYYKKADYYKASVLFEEIAPLLKGDSTAERTQFYNAYANYYLGNYQMSSYLFNTFYATYNNSPFAEEAYYMYAYSMYKDTPPYNLDQTNTLTAIDALQTFINSYPDSKYADDCAKNLQDLRERLERKSYEKAKQYFKTRDPSWGGLSNYLASVVTIDNFKKDFPDSKYNEELSAMQITAQYELADLSLFNKQKERYNQAIEYYNKFIDKYPNSKYLKDLEKLYDKSLKGLQKVAEIEKQIEEMKKQAEAAKAEEVDK >NC_014655.1|WP_013407511.1|766340_766871_+|T9SS-type-A-sorting-domain-containing-protein MKWFSKIALLVIMASMTSVTLLAQNAQSRLNVGKDGKKPIVKEPAPVFGKTPEKINFNSRTEFTQYYRNLLLKKEGDTKSEPHKGTEIVSDKIKFGNMFPNPAVDFVEIPYDALDQFKEARVTVMSMVGSPLLEYPVTANGNKVKLNTSNLESGIYMVQFVVDGKKIGTKKLLVEK >NC_014655.1|WP_013407510.1|765769_766213_+|ribose-5-phosphate-isomerase-B MALRIAIGSDHAGFQYKQKILAWLQEQNFKTADYGTYSEESMDYPDAAHPVANAVEKGEYDFGILLCGSANGVCMTANKHQGVRAGLAWNLEVVKLIRQHNNANVICLPARFISEHQALEYVKEFLNTPFEGGRHATRVNKMGIPTC >NC_014655.1|WP_013407508.1|764468_765041_-|Crp/Fnr-family-transcriptional-regulator MHNELFNFIAKYITLDQEEKAALESLNLIRSFKKGSILLKEGQKSTESYFVLKGCIRTYYILEGEEKTTAFYTESEALTPPCVLQNTASEFYVSSVEDSILCVSNAQMEEEINQKFPKFDAMCRVFSAELLARKNIDFDQFKTSSPEKRYLNLVENRPDLIQRIPQHQIASYLGIKPQSLSRLRRRIMKK >NC_014655.1|WP_013407519.1|774434_774749_+|GIY-YIG-nuclease-family-protein MKGYMYILKCSDDSYYTGSTTNLELRLAQHQNGEGANYTKKRLPVTLVYYEEFNRIDKAFYREKQVQGWSKKKKEALIKGRENELRSLAQCLNESSHKNWNKEG >NC_014655.1|WP_013407520.1|774935_775415_+|VOC-family-protein MTITQKITPCLWVDTDAKGVVDYYLSIFKDGKLKEFQRFQNPPEAIEQGGQEFFETALFEIAGMELQILAAGPYFKFNEAISLVINCKDQEEVDYYWDALTSNGGEEGPCGWCKDKFGLSWQVVPVEYYQLVTSSDPSVRDKAMQATMSMKKLILADLK >NC_014655.1|WP_013407521.1|775411_775972_+|Crp/Fnr-family-transcriptional-regulator MIREYLLGLRTFDNEELNFFVSKFSQKKIIRGELFIKEGETCKEVAFIETGIFHSYYIDGNENTFCFRFPNTFLAPYASFITGKPSYESQQALTDASLWVASKDEIEGFSSPNFLRFLKSIAENEYLDLEDRFFQLQRDSAQARYLSLFHKEPELIRDIPLHYIASYLGITQRHLSRIRNDIRQMS >NC_014655.1|WP_013407522.1|776017_776584_+|NAD(P)H-dependent-oxidoreductase MKILVINGHPYKGSYVSALFQNYLQNIEISSHEVRTLVLGDEKFDPILRFGYSLRMEADDFIERSQKDILWADHLVFFYPVWWGSMPALLQGWIDRVLMPGFAYNMKGLKTQKHLKGKTAELFITADAPEWYIRCIPNSPIRLMRTHILGLCGIRVRRSHVLGMTTLKGNSKARIHFLTLVGKPAARL >NC_014655.1|WP_013407523.1|776731_776950_-|PLDc-N-terminal-domain-containing-protein MTTLFLGALSGLQLTIFTVIYFLLLIYIIYSIFKREKGIDLVSWVLFVILAPIIGPILYLLKVSFSVKNISE >NC_014655.1|WP_013407524.1|777100_777922_+|pyridoxal-kinase MKVLIIHSQVSYGFVGSNTTSLVLQLAGIETITVPTVLYSNHLGHSIYGGGVIPEDLFSDVLRGIKDFGLLKEVDLIITGFFGSARQIEIAAEFIREAKLQYPHISYLCDPVMGDVDKGQYVQDDVPEAIISSLFPLADYLTPNHFEAEKIVGSSCLTQGDFRKQFKKMIKQQIVMVTGANVPKVLPENMGTYLVNDDLLVQAPKIDLHPPGTGELFAAQLLISLAKKVDLMNAITLSVEIVYRTMYHMKEAGRNEFALDDILFSMELRSGIE >NC_014655.1|WP_013407525.1|777921_778638_+|YggS-family-pyridoxal-phosphate-dependent-enzyme MADILHNLQIIQNRIDLACAKANRSREEVRLLLATKTVTADRILTAMQAGYTLIAENKVQEVKEKFDALKDFSHISHFIGHLQTNKIKDLLKCNVSCIQSLDRLDLAEKLQSRLEKENKDIDVFIQVNTSEEESKFGIHPDQAEDLVRRVAELDRINIKGLMTIGLFSADLDKVRLCYQLLNRLRKEIQVPGVELKELSMGMSGDLEIAIEEGATIVRVGTAIFGQRIYPDSYYWNEG >NC_014655.1|WP_013407526.1|778639_779647_-|FUSC-family-protein MTSLFKLNPTQRKWHLPLVAGVSVGLPLLLCYFTGEQEGGRLGALAGLSILYLQSNKLVERMMILMTCCFGILLSYCVGIWASANPLVAPLALGLHAFAVHLALHHLRLTRPPGNFFFIMIASMAIYTPFDLAHIPEKIGYVAMGTISTCIIGFIYSLLTIHQEPSTPLPEKEKHINITESIIFGIFMAISMTVAQLSQFENPYWILISCIAVMQGSNTKHVWLRGTQRIIGTLIGLGIVALISLLNPSYLFMIICIIVMQVIVEYFVVRNYAIAVVFITVLTIFLSEAGGDFEIQKILIARMVDILIGSIIGIVGGWALYHEKVHYYSTKRWKK >NC_014655.1|WP_013407527.1|779727_780162_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MIRPITEDDIPQLFELILDLAEDHHQQMWVTSCPENLISAYRNGKFGAIIAIEEGVPIGYLSYTWNFSIWSGEEFMNLDDLYVVPDYRSKGIGEQLMKEAQRQCQLRNVKRMRWEVQTDNYKAIQFYQRLGATMYNKGIFRWTW >NC_014655.1|WP_013407528.1|780240_781035_+|hypothetical-protein MKKLQLLTLLLCFQAQAQKNRIELELGASLLGRQDLIFSPFVHQSFSPIHVGLQWENQNYQRLGLRANLHSSALLSRFRYLEEDHSKVAAQHFFTLVELDYSKGWSILSKDKFSLVAGVTSQNHFQMMNYQYGRIGSFGYYLQLGVGPYLQAQLRPTSKTRFEIRASQPAFAWISRSPYLVNDDEFIENISSHSSLRTLGAFIVDGDFVSALDFKDVKSELKWVRSLGKHLEGSLSYRFDYLHVENPRPLKSYQNGLFFHIAVK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_014655_3 | 1936655-1937494 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_014655_3
|
10 spacers
spacers of NC_014655_3
>3.1|1936704|30|NC_014655|CRISPRCasFinder CTTTCCCTCTTGCAGTTCCTGAAGCAACAC >3.2|1936783|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR GCAACAGGTTCAGGAAAATCCGTTCAGATT >3.3|1936862|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR TTTGCCGGCCCTCCCTAATTTTGGAAATGT >3.4|1936941|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR TTTTTGCGTAGTTCTTCTACTGCCAGCTGG >3.5|1937020|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR ATTTCCGGCGAGTGTAGCAAGCGCGGTAGA >3.6|1937099|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR TTACAAACCAAAATATGCCTCTTTCCTACC >3.7|1937178|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR GAAGTGCTTTTGAGCAGTAATTTGCGCGTC >3.8|1937257|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR CTGCTTCCGTGACCGCTTCTGCAATAATCC >3.9|1937336|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR AAAAGGAGAATAAAGAAGCTCTTTCCAGGC >3.10|1937415|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR AATAGATGCTTATTTTAAGAATGAGTACAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014655_3
The CRISPR arrays of NC_014655_3 >merge|NC_014655|3|1936655-1937494|CRISPRCasFinder,PILER-CR GTAGAGAATAGATCACATTTTTTAGAAACTTTATGAATACTGGCGCAACCTTTCCCTCTTGCAGTTCCTGAAGCAACACGTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAACGCAACAGGTTCAGGAAAATCCGTTCAGATTGTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAACTTTGCCGGCCCTCCCTAATTTTGGAAATGTGTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGGTTACTGTCGCAACTTTTTGCGTAGTTCTTCTACTGCCAGCTGGGTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAACATTTCCGGCGAGTGTAGCAAGCGCGGTAGAGTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAACTTACAAACCAAAATATGCCTCTTTCCTACCGTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAACGAAGTGCTTTTGAGCAGTAATTTGCGCGTCGTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAACCTGCTTCCGTGACCGCTTCTGCAATAATCCGTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGGTTACTGTCGCAACAAAAGGAGAATAAAGAAGCTCTTTCCAGGCGTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAACAATAGATGCTTATTTTAAGAATGAGTACAAGTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAACA >NC_014655|3|3|1936655-1937494|CRISPRCasFinder GTAGAGAATAGATCACATTTTTTAGAAACTTTATGAATACTGGCGCAAC CTTTCCCTCTTGCAGTTCCTGAAGCAACAC GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC GCAACAGGTTCAGGAAAATCCGTTCAGATT GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC TTTGCCGGCCCTCCCTAATTTTGGAAATGT GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGGTTACTGTCGCAAC TTTTTGCGTAGTTCTTCTACTGCCAGCTGG GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC ATTTCCGGCGAGTGTAGCAAGCGCGGTAGA GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC TTACAAACCAAAATATGCCTCTTTCCTACC GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC GAAGTGCTTTTGAGCAGTAATTTGCGCGTC GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC CTGCTTCCGTGACCGCTTCTGCAATAATCC GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGGTTACTGTCGCAAC AAAAGGAGAATAAAGAAGCTCTTTCCAGGC GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC AATAGATGCTTATTTTAAGAATGAGTACAA GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAACA >NC_014655|3|1|1936734-1937493|PILER-CR GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC GCAACAGGTTCAGGAAAATCCGTTCAGATT GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC TTTGCCGGCCCTCCCTAATTTTGGAAATGT GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGGTTACTGTCGCAAC TTTTTGCGTAGTTCTTCTACTGCCAGCTGG GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC ATTTCCGGCGAGTGTAGCAAGCGCGGTAGA GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC TTACAAACCAAAATATGCCTCTTTCCTACC GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC GAAGTGCTTTTGAGCAGTAATTTGCGCGTC GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC CTGCTTCCGTGACCGCTTCTGCAATAATCC GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGGTTACTGTCGCAAC AAAAGGAGAATAAAGAAGCTCTTTCCAGGC GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC AATAGATGCTTATTTTAAGAATGAGTACAA GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC
>NC_014655.1|WP_049781351.1|1935709_1936156_+|Crp/Fnr-family-transcriptional-regulator MKHELKRILDKLEVFTPEEVTELCELLKVIRVEKDALLLKEGQIYNSCFFVLKGCMRKYVTVDGDEKNLAFYTEEQAINFFTSYSKKTPSDSYLSAVGDTILLEGNPDMDAEIFAKFPKLQHLTRKRILVRPKMPLPSTSLLHRKNDI >NC_014655.1|WP_041823554.1|1934298_1935645_+|tRNA-uridine-5-carboxymethylaminomethyl(34)-synthesis-GTPase-MnmE MSTALNFQDTICAVATPPGVGALAIIRVSGPEAISLVDAVFKGKSLKHAEGNTIVYGHIVDGEKVVDEVLVSVFRNPRSFTGEDSLEISTHGSPFIIRYVMKLLVQKGCRPAGPGEFTQRAFLNGRLDLVQAEAVADLIAADSEAAHKTALNQLRGGFSRKLAILREDLIHFASLVELELDFGEEDVEFADRDDLKALILNLQDQIRPLIQSFESGNAIKEGFPVAIIGAPNAGKSTLLNALLNEDRAIVTDIAGTTRDIIEDTLIIDGIKFRFIDTAGIRETEDLIEAMGIERSKKALQDARLVLFLYDSTQGYEFLQDLQGLIREDQTLFWVRNKTDIDESSIREGEIRISARAQVGIEALKKQISQSVADLKTTDTTITNVRHFDHLTKAYSALDDVLTGLHSGITGDFLAQDIRLALHHLGEITGTISTDDLLKNIFGKFCIGK >NC_014655.1|WP_013408604.1|1932785_1934171_-|MBOAT-family-protein MLFDSLQFILFYIVVTILYFSIRHRGRVWLLLLASCYFYLVFKPIYILILLVTIIVDYFAGIWIAQSEGKKRKLFLVLSLIANIGFLAFFKYWNFFNGNLTILLDLMGMVNPLPDYQLELPIGLSFHTFQAMSYTIEVYRRKQEPEKDFIIYSLYVMFYPQLVAGPIERPQNMLPQFHTYFKYSFENLKSGLMLMLWGLFKKVVISNRLAEMVDYCFDNPTEHGGLTLLVAAVFYSFQIYCDFSGYSDIAIGAGRTMGFTLMRNFDVPYLSKSIGEFWRRWHISLSTWFKDYLYIPLGGSREGEWKLYRNLAIVFLVSGLWHGAAWTFIIWGGLHAAFQILARMRDRLVKLPKNDFLSIVFTFILVTLAWVFFRAKGFYNAKVILTKILTFDFFSGYSMPYNGTEFMFCWLLIVVLFLKDIFVKEISVKNTPAFYAKFVGLAFLCYFFGVFSGDQFIYFQF >NC_014655.1|WP_013408603.1|1931789_1932782_-|hypothetical-protein MGKVLKYTVLVLASFLWFLGCSRATVVYLVDNDYIEDDFRYGDLYRLSNLGEYREEVKKCGQVYEGQKVPLSLYLAGDSFTELGRIGGEAYAASHFERSAVNTPAHNLVLKEGKKILVIESVERHFRERFATQPWNEWSLPPTTVPKVQSQHWYDWLVELQVPYREEMHESVLFSSDFILKIKEWKAGFNKQFFGKVDPKVGVLDEHLVYELDLAEGVSSVFDPVSEEELDRIVLHINQTRENYKKLGFDEVYLSIIPNKSSLLLTNDSRYNRLVERIEAHPDLETPIISVWREFQQGEYYLKGDSHWTCEGQKIWVDKVNGAILLEAVK >NC_014655.1|WP_013408602.1|1931101_1931737_-|methyltransferase-domain-containing-protein MNKKYVQYGCGLSAPEQWINYDASPTLQIQKTPVLGNLLQNQLNTRFPSNVRYGDIIKGLPEDVNSVDGLYCSHTLEHLALADMRKALANSYAILKKGGIFRCVVPDLEYAAREYLRRLDNGDENASHFFMENTLLGVPSRARGAKGMVSSYFGNSHHLWMWDRKSLSAELRNAGFIEVRECSFNDSEDPMFKHVEDPSRFEFAVALEARK >NC_014655.1|WP_013408601.1|1929949_1931101_+|glycosyltransferase-family-4-protein MKFLITDLQIQLDGHRLGFMQNLMSYIENHHTTDEFLFLTNRSRAFELKSPAKHIRTLQLTQEEQDLVHAETKPLSIARAEWSIITKYALEFSADRVILMFMDSYQIEIGRTQVPFKISGIWFSPYPRIESESNNLGSKIQTWLTKMRKRIVMRTALRNAQLDKIFILNDEEMPKWLNKGVTRFFTLADPYFAYEPLEDYKLREVYGIPEDHLIFLQFGYMDERKNLENIVNAFNQLPEIYALKSTLLLIGKFKAGFKEQVERLKSGPFQLIIRDEFVPNAEMESAFAQSDVILRMNVGFFGSSGIIGVAAQHNKPVIASNTGVMAEIVEKYHLGMLVDPYNTKEIADAISRFHTIPDSLRIDGTKYRNNHDLATFAETLLQK >NC_014655.1|WP_013408600.1|1928651_1929953_+|MFS-transporter MNIKRVWNAWCMYDWANSVHNLVIITVIFPIYYQATVPVQEVIDQKELVRFFGFMFDKNALYSFTISAASLLLVFLNPILTGIADYSGRKKLFMKIFCYLGALSCTYFYFFTPDNVESTMIAFALSIVGWGGSLVFYNAFIPQIATEEHYDRLSARGFAFGYVGSVILLIFNLLMIMKPEIFGLENAPSGMTTRIAFVTVGIWWAGFAQIPFFVLPKDEKRAFRSRFLKNGFIQLKNTFFRVQKNKNLKRFLLAYLIYDMGVMTVIYVATLFANEEIKVPREGLIVTLLLIQLIAIPGSYLASFLSEKFGNTKALRIEILLWTIVPIAAYFTTTAMQFYFIAALVGLVMGGIQSLSRSTFAKFLPENITDTSAYFAFFDITEKVAITLGTFIFGFILDQTGSMRNSILFLIVLFILGFLLLSRIRSQHVYHEE >NC_014655.1|WP_013408599.1|1927022_1928486_-|MFS-transporter MTEKRSSMFAVIGASSVGTMIEWYDFYIFGSLATLISTKFFPSGNETLAFLSTLATFAAGFIVRPFGALFFGRLGDLIGRKYTFMVTLLLMGGATFLIGCIPSYESIGIISPLLVLLLRLLQGLALGGEYGGAATYVAEHAEPKKRGFMTSWIQTTATAGLIVSLLVITITRSSMSKEAFEDYGWRIPFLASAVMIYVSYIIRKNMHESPLFAKAKSEGKTSKNPLKESFGNRYNLKYVLLALLGVAMGQGVIWYTGQFYAMSFIERVMHVPKEQVDQILIWALCLGTPFFILFGWLSDKVGRKWIMMAGMLVAICSYRYIYDQMYQKADVSRKELVSEEEIELGHIQRTYEDGTVEKWEEGANGEKLHRTVALSGADQRSLIFWVFVQVIFVTMVYGPIAAFLVEMFPVRIRYTSMSLPYHVGNGIFGGLLPAIATFLVTRGEEINAKAGKVLVQKPYLEGLWYPIVIAGICLVIGVIYLDENESN >NC_014655.1|WP_013408598.1|1926820_1927036_-|hypothetical-protein MNQIKRILGLVWMLLGVLAVYYLIYNQAIPLWKSGGANLIPAVIYIFVLCPIVAGSLGCFGWFCWKGDFDR >NC_014655.1|WP_041824459.1|1925402_1926776_-|L-serine-ammonia-lyase MNKGVITTSVFDLFKIGPGPSSSHTIGPMKAGYDFLQRIQSIFLEEGTELRIEIHLYGSLSATGKGHGTDRAVIAGILGWQPDTVDPQAFTSLLQHPDSSYTVYIGNRTVQVDASSILFQKGRYDSPHPNTVIFKLLADGFRVHEEEYYSVGGGFVVRKGDKSDRQNPVVPPYPYSTMKELKAHLDANKISLIELMMANEVAISGLDRKTINRKIDDIIETMHKAVKRGLKSKGELPGSIRLRRKAPVLYAQAKNSASTSDSFMVFLNAYCMAASEENAAGNMVVTAPTSGASGVIPGVTYLLKHHYHYDKQKIREGMLAAAAVGFLIKHNASISGAEMGCMGEIGSASAMAAAMLAHCAGKNINTIEVAAEIAIEHHLGMTCDPIGGYVQIPCIERNAMGAIKAYNAYLIASSGNPNDQKISLDSVIKVMRATGRDMSKKYKETSEAGLALSATEC >NC_014655.1|WP_013408606.1|1937610_1937877_+|transposase MKKSKHSEHQIVKVLGEYENGRKVEDICRELNIHKATFHTWKKKYSGMSGTDLAELKSLQQENARLKKMYADLALDHAVLKDVLSKKF >NC_014655.1|WP_148225797.1|1937900_1938515_+|DDE-type-integrase/transposase/recombinase MNYIVNEYGMSIQKACKIMDLSRSVYYYSSVKDDTEVRGKLLGLAENHPKEGQDKMYQRIRNQGLKWNYKRVRRIYLLLGLNLRQKTRKRLPARVKVPLIQPEGINHTWSMDFMHDVLGNGRKIRILNIIDDYNREALTVEAHFSIQSNMVVQSLEDLIAYRGKPTQIRVDNGPEFVANVLADWCRENDIRLLYIQPGKPFQNG >NC_014655.1|WP_187287913.1|1938557_1938761_+|transposase MFENIHQVRILAEEFMKDYHTQRPHESLGGFTPEKFKNLSTSFPAGGASSPCWKNNKSISLFNYTMS >NC_014655.1|WP_041823557.1|1940274_1940814_+|DUF3987-domain-containing-protein MANPEILFCLTAEQQEHFKAFFEQIQNTYLSLQGLEYMATIRRLGLIAFRIAMILSALRIMEHGDLPEHIICEERDFQTTLKVVGVLVKHASKVFSELPQDAPMPKRKNQKERYLDALPASFNRQEYLRIAASMSIPNKTAEGYITDFCKRGLIHREKQDHYLNPNAKETKNLREIKKG >NC_014655.1|WP_013408607.1|1941010_1941832_+|type-IV-toxin-antitoxin-system-AbiEi-family-antitoxin MEDSRQYKSAEDWVNHLLAKGKYAFALHQFRADFPEQSDTANKFALKRLVDKEQIISIHKGYYLIIPPQYRSKGILPPTLFLDAFMKELDRPYYLALLNAAAYHGASHQQPQEFFVVTGFPVLRPTQKKGLKVNYISKKEIPATLLDTRKTEAGYLKISNPALTATDLIQYAKRVGGINRVATVLAELAESIQPNAFDANLLQHVPVTALQRLGYLLDKVFDNQPLANALYMALQNNNAPLFRIPLKASAPAKGFASDERWKVILNTTIELDE >NC_014655.1|WP_013408610.1|1942907_1944857_+|AAA-family-ATPase MLAYKDYEKAVFDWLYSKYKATGFTFSIRRKISKGAEGDYFTGTENSNYFGTTFWFIPVGYPGSNGELIQLNFTYSKDRSPYVYYFEFIQTSAPDDLQNKAALKLIENLLPILEAKFGLISTIKPGAKIFNYKLKPIKASYDTVEEMFRDIDSQLNTLLPLVDENIKMVKAAYPNFKAERISKENFEVLIQKGFDRIKKYKNEQTSHITPDPVNQMKPRSSKSLPLNLILFGPPGTGKTYKLKRDYFEQFTVKQSAQTREQFLADFVSNLTWWQIITLALLELGKAKVQDIYEHELVRSKASISSSKTVRATLWGQLQSHTVRSNEFVNTKERSEPLYFEKDGDSYWSISHPDLQEKYPEAQELYEQYKNYQVSPDKEIKNYEFITFHQSFSYEDFIEGIKPAIEEDSEGSLRFRIQDGVFKRIAERARRDPENKYALFIDEINRGNVSAIFGELITLIEDSKRAGQAEALEVTLPYSKEKFSVPANLHLIGTMNTADRSVEALDTALRRRFTFEEMLPNPDINELDYTIYGYSASEVLKTINLRIEKLLDREHCIGHAYFIGKDESSIISSFYKNIIPLLQEYFFGDYGKIGLVLGKGFVRLKHNEQALFADFPYDYVEDLAAKPVYEIIQNTEESFAYALAALMNND >NC_014655.1|WP_013408611.1|1944849_1946103_+|5-methylcytosine-restriction-system-component-like-protein MTKVENKHITVYEHQKLLVGKDLSQDQYEALLRFYGNYSPFFTLIRNGVKFCSYVGVLQVGNTLIEILPKADISSGNGQETLWQKVLIQMLRTVWGFSVRDAGSSHLKIKHHSVLDLYFELYVFELEKLIHYGLIKKYRREERNTVALKGKLAFTKHIQNNLVHQERFYIQTFNYTLHHLLHQVLYTALKVVQNLNRNTLLHARIGNLLLHFPEQKPIKVTPSTFERLPQDRKSLLYRPALEIAELLLLNYHPDISQGHKHVLALMFDMNALWEQFVLRLLQRNLKSYTVSGQVNKKFWKSTTGSLSSSLRPDILIHGRSSTVVLDTKWKYLNGEGPSADDLRQMYVYQEYFQANTAALIYPGTDRKLSGAYFQKEENKHLDTKECHILQISVEENTFLWQKKIVAAVEELFQNNQN >NC_014655.1|WP_013408612.1|1946110_1947190_-|histidine-kinase MKEFFSKYYDKRLSLILVGFYLITVALNLFKVFMVAYLKDAPLALGKDFHYQIYVIDIVLVMLIMQVIAMHTKRLILRKTPWKKILLFHFVLAIFIGVIIQGVTDFYRIQFGIIPHYDFKVSLRNFLSVIDVNFLVYFAMIFIIYTYFYFNIIRANEIKQSQLESQLVTTKLNTLKTQMEPHFLFNTLNAIIGLIDIDKKRAQNTLIDLSSLLRMLTKKTMEHEHRLDQELEMVNHYIDILKVRFEDELEIDVEVADHLLDKKVPTMLFQPLIENAINHGFAQCSGQFQIGVRGFEQGGKMVFVVENNGNPLQENAPSRQTGVGVSNLQQRLKNLYGSRATYVLRNKEQGVENVIEIPL >NC_014655.1|WP_013408613.1|1947186_1947870_-|response-regulator-transcription-factor MRVIIVDDEHIARTRISNLIKKLDGVEVLAECGNGQLAIKAINDLQPDLVFLDINIRDMDGFQVLEQIQTKPYIVFITAHEDFALKAFEYEAFDYLVKPFSEERFYKTVNKVLKLEESEHLKKIAIKQGHKTFLIPTEEINYILASGVYVEIYTDKGKYVHRETLNHLEQQLNPQYFVRVHRSAIVNITAVKELVHSEYSGVDARMKDGVLVSVSKTQKKIFLSKIK >NC_014655.1|WP_013408614.1|1947996_1949142_+|peptidase-C45 MKKLIFLLFITQTISAQIIHLSGTPYERGVQHGKQLKPQIAEVFTKWKASLQQDSGKDASEVIKTFLESTRFLNSIQTWTPDIYEEIKGIADGSGQSLEDVFAFNLIDEYWAHLDRVKNENQEKNKCTAVGVAKSSDQPTIVAQNVDIDNYMQGYQVLLHIQGDKQTPEQYIMSCAGFLGFAGMNKNLSLVINALTDVNSSVEGLPVTFVFRGILSKKTAQEALDFVHYVQHATGQNYLIGTNKEVYTFEASANRVEEFNPHKRKLVYHTNHSLVNEDIKPWRVETRKKMLDGSRKANSNTRLAGVHKFLEKFENKLTAENIKDILRSKEDPIFPICVPYREGGGAFTFSSVVFTLGKDPSAEVTYGEPDKNDYQKHYFKK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_014655_4 | 1938761-1940149 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_014655_4
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16 spacers
spacers of NC_014655_4
>4.1|1938810|30|NC_014655|CRISPRCasFinder GCTTGCAGAAGAATATTATGCGCAAAACAG >4.2|1938889|108|NC_014655|CRISPRCasFinder CTTTCAAATAATACAAACCGTCATCGTAAGTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAACTTAGAGATTACTTATTGGAAAGGCCAAAAC >4.3|1939046|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR CGCGCTATCGTTGGTGGATAAAATCAGATT >4.4|1939125|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR TTTGTGATGAAATTCCCAAATTGCAACATG >4.5|1939204|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR TGCTTTCCAGGTCACCTTCAAGAATGTAAA >4.6|1939283|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR TATGCTGTTCCGTTGGAATGGCAGCGAATA >4.7|1939362|108|NC_014655|CRISPRCasFinder ATTGCTAAATCTTCTATTTCAGACATAGAGTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAACACAGTGCAAGGGTATATATACAAAGCGGTT >4.8|1939519|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR ATTCTCCTCCGGATTAATTTTTCTTGTGAT >4.9|1939598|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR GAATGCTGACGGCTCAATCTACTTTGACAC >4.10|1939677|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR TTCTCTATCAAATTCCAGCTTTTCGGCGAG >4.11|1939756|108|NC_014655|CRISPRCasFinder GGAGTTATTAAAGGTGCCGTCTTTAATTGGTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAACGGGGCAGACGGTAAGGACGTCGAGCATTTT >4.12|1939913|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR GCAAGAATTACTTGCAGTTGCAAAGTTAGC >4.13|1939992|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR CTTTGGACTCAGGATAATTAGAAATAATAC >4.14|1940071|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR TTATCCAGTCGATGTACCCTTCTGGAGTTA >4.15|1938889|29|NC_014655|PILER-CR CTTTCAAATAATACAAACCGTCATCGTAA >4.16|1938967|30|NC_014655|PILER-CR TTAGAGATTACTTATTGGAAAGGCCAAAAC >4.17|1939362|29|NC_014655|PILER-CR ATTGCTAAATCTTCTATTTCAGACATAGA >4.18|1939440|30|NC_014655|PILER-CR ACAGTGCAAGGGTATATATACAAAGCGGTT >4.19|1939756|29|NC_014655|PILER-CR GGAGTTATTAAAGGTGCCGTCTTTAATTG >4.20|1939834|30|NC_014655|PILER-CR GGGGCAGACGGTAAGGACGTCGAGCATTTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014655_4
The CRISPR arrays of NC_014655_4 >merge|NC_014655|4|1938761-1940149|CRISPRCasFinder,PILER-CR AAAAGGGGAGGGTTACAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAACGCTTGCAGAAGAATATTATGCGCAAAACAGGTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAACCTTTCAAATAATACAAACCGTCATCGTAAGTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAACTTAGAGATTACTTATTGGAAAGGCCAAAACGTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAACCGCGCTATCGTTGGTGGATAAAATCAGATTGTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAACTTTGTGATGAAATTCCCAAATTGCAACATGGTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAACTGCTTTCCAGGTCACCTTCAAGAATGTAAAGTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAACTATGCTGTTCCGTTGGAATGGCAGCGAATAGTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAACATTGCTAAATCTTCTATTTCAGACATAGAGTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAACACAGTGCAAGGGTATATATACAAAGCGGTTGTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAACATTCTCCTCCGGATTAATTTTTCTTGTGATGTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAACGAATGCTGACGGCTCAATCTACTTTGACACGTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAACTTCTCTATCAAATTCCAGCTTTTCGGCGAGGTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAACGGAGTTATTAAAGGTGCCGTCTTTAATTGGTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAACGGGGCAGACGGTAAGGACGTCGAGCATTTTGTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAACGCAAGAATTACTTGCAGTTGCAAAGTTAGCGTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAACCTTTGGACTCAGGATAATTAGAAATAATACGTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAACTTATCCAGTCGATGTACCCTTCTGGAGTTAGTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC >NC_014655|4|4|1938761-1940149|CRISPRCasFinder AAAAGGGGAGGGTTACAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC GCTTGCAGAAGAATATTATGCGCAAAACAG GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC CTTTCAAATAATACAAACCGTCATCGTAAGTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAACTTAGAGATTACTTATTGGAAAGGCCAAAAC GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC CGCGCTATCGTTGGTGGATAAAATCAGATT GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC TTTGTGATGAAATTCCCAAATTGCAACATG GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC TGCTTTCCAGGTCACCTTCAAGAATGTAAA GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC TATGCTGTTCCGTTGGAATGGCAGCGAATA GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC ATTGCTAAATCTTCTATTTCAGACATAGAGTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAACACAGTGCAAGGGTATATATACAAAGCGGTT GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC ATTCTCCTCCGGATTAATTTTTCTTGTGAT GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC GAATGCTGACGGCTCAATCTACTTTGACAC GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC TTCTCTATCAAATTCCAGCTTTTCGGCGAG GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC GGAGTTATTAAAGGTGCCGTCTTTAATTGGTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAACGGGGCAGACGGTAAGGACGTCGAGCATTTT GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC GCAAGAATTACTTGCAGTTGCAAAGTTAGC GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC CTTTGGACTCAGGATAATTAGAAATAATAC GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC TTATCCAGTCGATGTACCCTTCTGGAGTTA GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC >NC_014655|4|2|1938840-1940149|PILER-CR GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC CTTTCAAATAATACAAACCGTCATCGTAA GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC TTAGAGATTACTTATTGGAAAGGCCAAAAC GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC CGCGCTATCGTTGGTGGATAAAATCAGATT GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC TTTGTGATGAAATTCCCAAATTGCAACATG GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC TGCTTTCCAGGTCACCTTCAAGAATGTAAA GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC TATGCTGTTCCGTTGGAATGGCAGCGAATA GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC ATTGCTAAATCTTCTATTTCAGACATAGA GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC ACAGTGCAAGGGTATATATACAAAGCGGTT GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC ATTCTCCTCCGGATTAATTTTTCTTGTGAT GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC GAATGCTGACGGCTCAATCTACTTTGACAC GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC TTCTCTATCAAATTCCAGCTTTTCGGCGAG GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC GGAGTTATTAAAGGTGCCGTCTTTAATTG GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC GGGGCAGACGGTAAGGACGTCGAGCATTTT GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC GCAAGAATTACTTGCAGTTGCAAAGTTAGC GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC CTTTGGACTCAGGATAATTAGAAATAATAC GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC TTATCCAGTCGATGTACCCTTCTGGAGTTA GTTGTGAATTCCTTTCAATTTTTAGTAACTTTATGATTACTGTCGCAAC
>NC_014655.1|WP_148225797.1|1937900_1938515_+|DDE-type-integrase/transposase/recombinase MNYIVNEYGMSIQKACKIMDLSRSVYYYSSVKDDTEVRGKLLGLAENHPKEGQDKMYQRIRNQGLKWNYKRVRRIYLLLGLNLRQKTRKRLPARVKVPLIQPEGINHTWSMDFMHDVLGNGRKIRILNIIDDYNREALTVEAHFSIQSNMVVQSLEDLIAYRGKPTQIRVDNGPEFVANVLADWCRENDIRLLYIQPGKPFQNG >NC_014655.1|WP_013408606.1|1937610_1937877_+|transposase MKKSKHSEHQIVKVLGEYENGRKVEDICRELNIHKATFHTWKKKYSGMSGTDLAELKSLQQENARLKKMYADLALDHAVLKDVLSKKF >NC_014655.1|WP_049781351.1|1935709_1936156_+|Crp/Fnr-family-transcriptional-regulator MKHELKRILDKLEVFTPEEVTELCELLKVIRVEKDALLLKEGQIYNSCFFVLKGCMRKYVTVDGDEKNLAFYTEEQAINFFTSYSKKTPSDSYLSAVGDTILLEGNPDMDAEIFAKFPKLQHLTRKRILVRPKMPLPSTSLLHRKNDI >NC_014655.1|WP_041823554.1|1934298_1935645_+|tRNA-uridine-5-carboxymethylaminomethyl(34)-synthesis-GTPase-MnmE MSTALNFQDTICAVATPPGVGALAIIRVSGPEAISLVDAVFKGKSLKHAEGNTIVYGHIVDGEKVVDEVLVSVFRNPRSFTGEDSLEISTHGSPFIIRYVMKLLVQKGCRPAGPGEFTQRAFLNGRLDLVQAEAVADLIAADSEAAHKTALNQLRGGFSRKLAILREDLIHFASLVELELDFGEEDVEFADRDDLKALILNLQDQIRPLIQSFESGNAIKEGFPVAIIGAPNAGKSTLLNALLNEDRAIVTDIAGTTRDIIEDTLIIDGIKFRFIDTAGIRETEDLIEAMGIERSKKALQDARLVLFLYDSTQGYEFLQDLQGLIREDQTLFWVRNKTDIDESSIREGEIRISARAQVGIEALKKQISQSVADLKTTDTTITNVRHFDHLTKAYSALDDVLTGLHSGITGDFLAQDIRLALHHLGEITGTISTDDLLKNIFGKFCIGK >NC_014655.1|WP_013408604.1|1932785_1934171_-|MBOAT-family-protein MLFDSLQFILFYIVVTILYFSIRHRGRVWLLLLASCYFYLVFKPIYILILLVTIIVDYFAGIWIAQSEGKKRKLFLVLSLIANIGFLAFFKYWNFFNGNLTILLDLMGMVNPLPDYQLELPIGLSFHTFQAMSYTIEVYRRKQEPEKDFIIYSLYVMFYPQLVAGPIERPQNMLPQFHTYFKYSFENLKSGLMLMLWGLFKKVVISNRLAEMVDYCFDNPTEHGGLTLLVAAVFYSFQIYCDFSGYSDIAIGAGRTMGFTLMRNFDVPYLSKSIGEFWRRWHISLSTWFKDYLYIPLGGSREGEWKLYRNLAIVFLVSGLWHGAAWTFIIWGGLHAAFQILARMRDRLVKLPKNDFLSIVFTFILVTLAWVFFRAKGFYNAKVILTKILTFDFFSGYSMPYNGTEFMFCWLLIVVLFLKDIFVKEISVKNTPAFYAKFVGLAFLCYFFGVFSGDQFIYFQF >NC_014655.1|WP_013408603.1|1931789_1932782_-|hypothetical-protein MGKVLKYTVLVLASFLWFLGCSRATVVYLVDNDYIEDDFRYGDLYRLSNLGEYREEVKKCGQVYEGQKVPLSLYLAGDSFTELGRIGGEAYAASHFERSAVNTPAHNLVLKEGKKILVIESVERHFRERFATQPWNEWSLPPTTVPKVQSQHWYDWLVELQVPYREEMHESVLFSSDFILKIKEWKAGFNKQFFGKVDPKVGVLDEHLVYELDLAEGVSSVFDPVSEEELDRIVLHINQTRENYKKLGFDEVYLSIIPNKSSLLLTNDSRYNRLVERIEAHPDLETPIISVWREFQQGEYYLKGDSHWTCEGQKIWVDKVNGAILLEAVK >NC_014655.1|WP_013408602.1|1931101_1931737_-|methyltransferase-domain-containing-protein MNKKYVQYGCGLSAPEQWINYDASPTLQIQKTPVLGNLLQNQLNTRFPSNVRYGDIIKGLPEDVNSVDGLYCSHTLEHLALADMRKALANSYAILKKGGIFRCVVPDLEYAAREYLRRLDNGDENASHFFMENTLLGVPSRARGAKGMVSSYFGNSHHLWMWDRKSLSAELRNAGFIEVRECSFNDSEDPMFKHVEDPSRFEFAVALEARK >NC_014655.1|WP_013408601.1|1929949_1931101_+|glycosyltransferase-family-4-protein MKFLITDLQIQLDGHRLGFMQNLMSYIENHHTTDEFLFLTNRSRAFELKSPAKHIRTLQLTQEEQDLVHAETKPLSIARAEWSIITKYALEFSADRVILMFMDSYQIEIGRTQVPFKISGIWFSPYPRIESESNNLGSKIQTWLTKMRKRIVMRTALRNAQLDKIFILNDEEMPKWLNKGVTRFFTLADPYFAYEPLEDYKLREVYGIPEDHLIFLQFGYMDERKNLENIVNAFNQLPEIYALKSTLLLIGKFKAGFKEQVERLKSGPFQLIIRDEFVPNAEMESAFAQSDVILRMNVGFFGSSGIIGVAAQHNKPVIASNTGVMAEIVEKYHLGMLVDPYNTKEIADAISRFHTIPDSLRIDGTKYRNNHDLATFAETLLQK >NC_014655.1|WP_013408600.1|1928651_1929953_+|MFS-transporter MNIKRVWNAWCMYDWANSVHNLVIITVIFPIYYQATVPVQEVIDQKELVRFFGFMFDKNALYSFTISAASLLLVFLNPILTGIADYSGRKKLFMKIFCYLGALSCTYFYFFTPDNVESTMIAFALSIVGWGGSLVFYNAFIPQIATEEHYDRLSARGFAFGYVGSVILLIFNLLMIMKPEIFGLENAPSGMTTRIAFVTVGIWWAGFAQIPFFVLPKDEKRAFRSRFLKNGFIQLKNTFFRVQKNKNLKRFLLAYLIYDMGVMTVIYVATLFANEEIKVPREGLIVTLLLIQLIAIPGSYLASFLSEKFGNTKALRIEILLWTIVPIAAYFTTTAMQFYFIAALVGLVMGGIQSLSRSTFAKFLPENITDTSAYFAFFDITEKVAITLGTFIFGFILDQTGSMRNSILFLIVLFILGFLLLSRIRSQHVYHEE >NC_014655.1|WP_013408599.1|1927022_1928486_-|MFS-transporter MTEKRSSMFAVIGASSVGTMIEWYDFYIFGSLATLISTKFFPSGNETLAFLSTLATFAAGFIVRPFGALFFGRLGDLIGRKYTFMVTLLLMGGATFLIGCIPSYESIGIISPLLVLLLRLLQGLALGGEYGGAATYVAEHAEPKKRGFMTSWIQTTATAGLIVSLLVITITRSSMSKEAFEDYGWRIPFLASAVMIYVSYIIRKNMHESPLFAKAKSEGKTSKNPLKESFGNRYNLKYVLLALLGVAMGQGVIWYTGQFYAMSFIERVMHVPKEQVDQILIWALCLGTPFFILFGWLSDKVGRKWIMMAGMLVAICSYRYIYDQMYQKADVSRKELVSEEEIELGHIQRTYEDGTVEKWEEGANGEKLHRTVALSGADQRSLIFWVFVQVIFVTMVYGPIAAFLVEMFPVRIRYTSMSLPYHVGNGIFGGLLPAIATFLVTRGEEINAKAGKVLVQKPYLEGLWYPIVIAGICLVIGVIYLDENESN >NC_014655.1|WP_041823557.1|1940274_1940814_+|DUF3987-domain-containing-protein MANPEILFCLTAEQQEHFKAFFEQIQNTYLSLQGLEYMATIRRLGLIAFRIAMILSALRIMEHGDLPEHIICEERDFQTTLKVVGVLVKHASKVFSELPQDAPMPKRKNQKERYLDALPASFNRQEYLRIAASMSIPNKTAEGYITDFCKRGLIHREKQDHYLNPNAKETKNLREIKKG >NC_014655.1|WP_013408607.1|1941010_1941832_+|type-IV-toxin-antitoxin-system-AbiEi-family-antitoxin MEDSRQYKSAEDWVNHLLAKGKYAFALHQFRADFPEQSDTANKFALKRLVDKEQIISIHKGYYLIIPPQYRSKGILPPTLFLDAFMKELDRPYYLALLNAAAYHGASHQQPQEFFVVTGFPVLRPTQKKGLKVNYISKKEIPATLLDTRKTEAGYLKISNPALTATDLIQYAKRVGGINRVATVLAELAESIQPNAFDANLLQHVPVTALQRLGYLLDKVFDNQPLANALYMALQNNNAPLFRIPLKASAPAKGFASDERWKVILNTTIELDE >NC_014655.1|WP_013408610.1|1942907_1944857_+|AAA-family-ATPase MLAYKDYEKAVFDWLYSKYKATGFTFSIRRKISKGAEGDYFTGTENSNYFGTTFWFIPVGYPGSNGELIQLNFTYSKDRSPYVYYFEFIQTSAPDDLQNKAALKLIENLLPILEAKFGLISTIKPGAKIFNYKLKPIKASYDTVEEMFRDIDSQLNTLLPLVDENIKMVKAAYPNFKAERISKENFEVLIQKGFDRIKKYKNEQTSHITPDPVNQMKPRSSKSLPLNLILFGPPGTGKTYKLKRDYFEQFTVKQSAQTREQFLADFVSNLTWWQIITLALLELGKAKVQDIYEHELVRSKASISSSKTVRATLWGQLQSHTVRSNEFVNTKERSEPLYFEKDGDSYWSISHPDLQEKYPEAQELYEQYKNYQVSPDKEIKNYEFITFHQSFSYEDFIEGIKPAIEEDSEGSLRFRIQDGVFKRIAERARRDPENKYALFIDEINRGNVSAIFGELITLIEDSKRAGQAEALEVTLPYSKEKFSVPANLHLIGTMNTADRSVEALDTALRRRFTFEEMLPNPDINELDYTIYGYSASEVLKTINLRIEKLLDREHCIGHAYFIGKDESSIISSFYKNIIPLLQEYFFGDYGKIGLVLGKGFVRLKHNEQALFADFPYDYVEDLAAKPVYEIIQNTEESFAYALAALMNND >NC_014655.1|WP_013408611.1|1944849_1946103_+|5-methylcytosine-restriction-system-component-like-protein MTKVENKHITVYEHQKLLVGKDLSQDQYEALLRFYGNYSPFFTLIRNGVKFCSYVGVLQVGNTLIEILPKADISSGNGQETLWQKVLIQMLRTVWGFSVRDAGSSHLKIKHHSVLDLYFELYVFELEKLIHYGLIKKYRREERNTVALKGKLAFTKHIQNNLVHQERFYIQTFNYTLHHLLHQVLYTALKVVQNLNRNTLLHARIGNLLLHFPEQKPIKVTPSTFERLPQDRKSLLYRPALEIAELLLLNYHPDISQGHKHVLALMFDMNALWEQFVLRLLQRNLKSYTVSGQVNKKFWKSTTGSLSSSLRPDILIHGRSSTVVLDTKWKYLNGEGPSADDLRQMYVYQEYFQANTAALIYPGTDRKLSGAYFQKEENKHLDTKECHILQISVEENTFLWQKKIVAAVEELFQNNQN >NC_014655.1|WP_013408612.1|1946110_1947190_-|histidine-kinase MKEFFSKYYDKRLSLILVGFYLITVALNLFKVFMVAYLKDAPLALGKDFHYQIYVIDIVLVMLIMQVIAMHTKRLILRKTPWKKILLFHFVLAIFIGVIIQGVTDFYRIQFGIIPHYDFKVSLRNFLSVIDVNFLVYFAMIFIIYTYFYFNIIRANEIKQSQLESQLVTTKLNTLKTQMEPHFLFNTLNAIIGLIDIDKKRAQNTLIDLSSLLRMLTKKTMEHEHRLDQELEMVNHYIDILKVRFEDELEIDVEVADHLLDKKVPTMLFQPLIENAINHGFAQCSGQFQIGVRGFEQGGKMVFVVENNGNPLQENAPSRQTGVGVSNLQQRLKNLYGSRATYVLRNKEQGVENVIEIPL >NC_014655.1|WP_013408613.1|1947186_1947870_-|response-regulator-transcription-factor MRVIIVDDEHIARTRISNLIKKLDGVEVLAECGNGQLAIKAINDLQPDLVFLDINIRDMDGFQVLEQIQTKPYIVFITAHEDFALKAFEYEAFDYLVKPFSEERFYKTVNKVLKLEESEHLKKIAIKQGHKTFLIPTEEINYILASGVYVEIYTDKGKYVHRETLNHLEQQLNPQYFVRVHRSAIVNITAVKELVHSEYSGVDARMKDGVLVSVSKTQKKIFLSKIK >NC_014655.1|WP_013408614.1|1947996_1949142_+|peptidase-C45 MKKLIFLLFITQTISAQIIHLSGTPYERGVQHGKQLKPQIAEVFTKWKASLQQDSGKDASEVIKTFLESTRFLNSIQTWTPDIYEEIKGIADGSGQSLEDVFAFNLIDEYWAHLDRVKNENQEKNKCTAVGVAKSSDQPTIVAQNVDIDNYMQGYQVLLHIQGDKQTPEQYIMSCAGFLGFAGMNKNLSLVINALTDVNSSVEGLPVTFVFRGILSKKTAQEALDFVHYVQHATGQNYLIGTNKEVYTFEASANRVEEFNPHKRKLVYHTNHSLVNEDIKPWRVETRKKMLDGSRKANSNTRLAGVHKFLEKFENKLTAENIKDILRSKEDPIFPICVPYREGGGAFTFSSVVFTLGKDPSAEVTYGEPDKNDYQKHYFKK >NC_014655.1|WP_013408615.1|1949138_1950257_+|serine-hydrolase MKRLGFIYLCLFAFAVQAQDFQKRIQHKLDSLQNQNGFPGITFCAILPNNEKIIVASGWADSLSKTPMSTESRMLSGSNGKTLFIAAALKLASEGVFSLDDKISKYLGDEPWFSRLPNAHSVTMRMLMNHTSGIEEYYTLGNFMELVKADPERSFKPYDTFKYIFDRKPLFEAGSQWGYSDTNFILLGYILEKISGRPMYEWVQEAFIQPYGLSRTEPSLRMSFEHLATGYGRANSPFPFHGAMVKEGQLVFNPQFEWMGGGFVSQVQDLAYWAKALYNLKEISPEIRAEMKKKVPAKTGKNHGYGLGIQIRPSGTLGESYGHSGWFPGYLTDAAYFPDKDISVAIQLNTDDIAKIKSSPYDLLQFIANILL >NC_014655.1|WP_013408616.1|1950425_1950863_-|hypothetical-protein MLHFISVKYLTFKSEGIAQQYLILLGKYRKEMKKVLGIGLIALTMMGCEDKDPYLKTLQKCNLTGWAVAGTLTNVQGFIVKDADSNYYIEPISITTGSDLYPCNLPEEYKKDQSLIRFSGNIMTQPNNDASFELTSIELVTYGNQ >NC_014655.1|WP_013408617.1|1951072_1952269_-|alginate-lyase-family-protein MKKISALVLFLMFFCLESKAQWLWDVKKMQEIKRQIKNYTPAYKKLISDADQELKKEPYSVTYKKGIAPSGVKNDYVSLSRYWWPNPETTDKLPYIYKDGQSNPELNEYDRNTLGKMCASVNTLALAYFYSGNEKYAKKASEFLQVWFMDPATKMNPHLEYAQFIPGRDGSKGRPEGLIDSYSFVDMLNSLQLMKGSKYYTKELHSGLQQWFSALAQWFQTSSQGIREEAAKNNHATSYDSQMMVFYLFAGEEAKAKAIAEAFPKKRIDTQIEPDGKQPHELRRTLSYHYSLYNLAHMFDAGVMSKALGVDFLNYVSADGKSFYKALDYLVGYVGKELQDWPYQQISGWEEKQQETCLNLLKIVSFFPEKQQYQEVIKKHFKFEGNERFVLYYGKPIE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_014655_5 | 2168780-2168853 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_014655_5
|
1 spacers
spacers of NC_014655_5
>5.1|2168804|26|NC_014655|CRISPRCasFinder TTTGCGCCAAAAAAGTAACAAGAAGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014655_5
The CRISPR arrays of NC_014655_5 >merge|NC_014655|5|2168780-2168853|CRISPRCasFinder AAATTCATGTTTTTTGGTTACTTTTTTGCGCCAAAAAAGTAACAAGAAGAATATTCATGTTTTTTGGTTACTTT >NC_014655|5|5|2168780-2168853|CRISPRCasFinder AAATTCATGTTTTTTGGTTACTTT TTTGCGCCAAAAAAGTAACAAGAAGA ATATTCATGTTTTTTGGTTACTTT
>NC_014655.1|WP_013408770.1|2165994_2167452_+|pyruvate-kinase MIKKTKIVATVGPASESEEMLVALAKAGVNVFRLNFSHGTHEEHQVRIDRIKKINREHGFNCAILQDLQGPKIRVGLMEGGNAGVPLETGRRFIFTNDDIVGNSERASTPYDGMYKDVKVGDRILMDDGKLEVKVIEIDEEKHEVITEVVYGGLLKQKKGVNLPNTNISQPSVTDKDYRDLDFGLKNDVDWIALSFVRTAEEIIKIKEYIRSKGSEAKVIAKMEKPEAIQNMDAIIDAADGVMVARGDLGVEMPSEEVPIIQKTLVAKCHLAVKPVIVATQMLESMIDSPTPTRAEVGDVANAVLDGADAVMLSAESASGKYPLLAVQTMTRTIQHIEEFGNPSVLYYRHHTRVTEPTYVSKEKDNDNVIMMGCRLARDLKVKAIVGVTTSGYTAFRLSHHRPKSQIYIVTGNEKLLTQLSLYWGVNAFSIKELDQPENELQLIDEANKLMVKKGLLQPGDKFINMSSYPLGKQHRTNNLTLMTV >NC_014655.1|WP_013408769.1|2164635_2165784_-|2-isopropylmalate-synthase MSEKIYVFDTTLRDGEQVPGCQLNIDEKIMIAKELDKLGVDIIEAGFPVSSPGDFRAVEAIAKAVENATVCGLTRAVKKDIEVAAEALKPARRPRIHTGIGSSDTHIKYKFNSTREDILQRAIDAVKYAKTFVEDVEFYAEDAGRADLEFLARLTEAVISAGATVVNLPDTTGYLLPHQMHSRISYLMNHVPNVDKAILSMHNHNDLGLATANTIAGITAGARQVEVTINGIGERAGNTSLEEVAMILKLHKDLGLHTDIKSEMLAPLSKLVSSTMRMPVQANKAIVGRNAFAHSSGIHQDGFLKHAETYEIMTPQEVGVDKSDIILTARSGRHALKHRLSLLGFELEKEELDSTYQRFLVLADEIKEVNDGHLVDLMKLAV >NC_014655.1|WP_013408768.1|2163996_2164569_-|glycerol-3-phosphate-1-O-acyltransferase-PlsY MFLEFALAFLIGSIPTGFWYAKFFHNLDIRQHGSGNIGATNSYRVIGKKAAIIVLFIDLLKGLIPVLLAKYLDFSSENVLLAGVFAVLGHLFSPFLNFRGGKGIATAFGVILGFSPLAALCAVLVFGAVLYFSKMVSLGSIFGVLTFWIYILITKEMGPLWWISTVLAILLIVSHRKNISRIIQGKESKI >NC_014655.1|WP_013408767.1|2163313_2164000_+|DNA-repair-protein-RecO MLHKTRGIVLNYIKYRETSIIAKIYTEEFGLQSYVENGVRSPKSKGRIALFQPLNLVDLVVYFKPQADIQRISEIKCTHPFFNIPTDIRKTTLGIFVGEILVLTLKENAGNPLLFSFLQEALIHLEHQDEGVENFHLYFLMTLSAYLGFGPHTAQDIRMALAENGIPLTRSALQTLQRILENPFGNPLNISKTQRMEALDHLLAFYSYNLDSFHGVRSLQILKDVLEA >NC_014655.1|WP_148225803.1|2162763_2163324_+|hypothetical-protein MIGMGDEKKIKRYEPWGFLLVLGILSMSLSFIYAIFKIHIHSRMGGVSVAPMDLLRMLRTLFLTLSFVSLGGARQYILKQEFPKVKPLLTLSFFLLLLFILIPLAYRITPDISQFIILLHLLYSLLALVALGGLIAQIFRKTNYVDTYIFSVNPPNVLKLKLLWYYFLFICLSWWIILILLSSYAA >NC_014655.1|WP_013408765.1|2160716_2162726_-|gliding-motility-associated-C-terminal-domain-containing-protein MRKLVAIAFLLFCVLPSLTAQNLCEDPRAYATGSFELSSYDICHNENIRITGDEKVQDARYYFNYKGETYEMAYSQGETRLDFSEYMEKLKKPSVFTVIQVGKVDGKESVACKKIKVRYMDVPVYSYTYCPGPTIKLEITIPQHELNDFQDYSIKVNGQNYYTDALTYRDAFTVPNQPIKLHVTANGSPKTCPATSSEIEVPIFGGGRDWDYYPEITTLTLGDDLIPRMEITGQYDQTHTLYRYAAGANYNVAQAVKTGIKTGDLVSDIPPSLDKSYCYFIKADRVACVQMQFRSAEICTIPLKEGNSANIKENVLTWQRYSGPVDYRAFTPSGALSTSSWMEIARSEENLETKRLLDQDVQYVDKNVDCSKKYCYRIRLDHTGHISGANFQSRSYSNTVCLDHRLDLQDPPLGLLVSAEEQDNIISFNPPGDIQYKPVTWELYKKEGTTFTLSQTEEDVTKFTDEGVTKAETYKVRFFDACKNESPYSGEVTSVFLSEDGDNILDWTSGNPFDGSTISHYEVMYVNSGETFKESAQVNTHPVSTAEVVTEGTFIVRAVASDGRVSDSNPVRFFVRGALFLPNAFTPNSDGHNDTFGAKGSLTSIEKFQMDIFAPNGQKIAEVTDPMSGWDGKLPNGLLAPTGSYFYQIKAEMKSGQVLSKNGSFVVIH >NC_014655.1|WP_013408764.1|2159356_2160667_-|30S-ribosomal-protein-S12-methylthiotransferase-RimO MKTKGNRKSKINIVTLGCSKNLVDSEMLYTQLRGNGMDVSHESPEDDSQIVVINTCGFIDNAKQESIDTILRYVDAKESGIVEKVYVTGCLSHRYKDELEVEIPQVDSWFGTNELPRLLKTLKADYKHELIGERLLTTPSHYAYMKIAEGCDRPCSFCAIPLMRGSHVSRPMDELVLSAKNMVAKGTKELILIAQDLTYYGLDLYKKRNLSELLARLSDVEGLDWIRLQYAYPAGFPMDILEVMAERTNICKYLDMPLQHGSSEMLKKMRRGIDRPKTEKLLETIREKVPGIHLRTTLIVGHPGETEDMFEEMYRFVESQKFDRLGVFQYSHEEQTHSYSFVDDVPAEVKQERADIIMELQQGISEERNKAKVGQVFKVLVDKKESGHFVGRTEFDSPEVDNEVLIPAEHYVRIGDFTQVRIDSATEFDLYGTPIV >NC_014655.1|WP_041823588.1|2158452_2159367_+|outer-membrane-beta-barrel-protein MVFRLLVIFLFFSFSAFGQRDLIITQAGEQIRCKITGETSMRFSYSYTNEKGKTVHSEIFKTLVSSYKYNFFQDDKAATPKTLVQKPTKTYNSPLKEKTEFSNYLKYRVGFKGGLSNLLDGSTDKSDYGLFTEKLKRGWHYGADATIFFNDHIGLGVQYNSYQASNKNRKLDFPHRLNGGEVRNGSLETKINHKFVGPMLVGRIPLDYKTFVMASAGPGYYFYTDKGLENEKAYSFKGKDWGAAASLGLEFLLGNNDSGRDVMLSIECGYQYGKVLVETQSIDLSRLDFSVGLRFNRFPRHLRQ >NC_014655.1|WP_013408762.1|2157620_2158226_-|RNA-polymerase-sigma-factor MDKNKVNESELISAYIRGDENAFTILVNRYKSKVYTTIYLVVKDSYVAEDLTQDTFIKAIRTLKEGRYNEEGKFLPWILRIAHNLAIDYFRRAKRYPNVVFEDGSSVFNSLNFAEDSVESAQIKKESHEHLRSLIKKLPQQQREVLVMRHYEDLSFQEIAEATGVSINTALGRMRYALINLRKLMSKTKYAYDTNLYIDSE >NC_014655.1|WP_013408761.1|2157415_2157652_-|hypothetical-protein MIQTFTSTQNEIIRYVYHETSPSENEWIEEQIAGDTDNLDFYLDCLQIKEEMDQIRLVPQDQTLERIFSYSRNYKPAV >NC_014655.1|WP_013408771.1|2169185_2169494_-|SCP2-sterol-binding-domain-containing-protein MTLTDYFNSLKEKVSPADLQGIDTKINFDLKGKNMFVTVKDNHIDVSEGVADGAEVNITVKEDDLLSIIQGNTNPMMAMMMGKLKISNPGAMMKYAKILGLM >NC_014655.1|WP_013408772.1|2169700_2170300_+|RNA-polymerase-sigma-factor MKSSKYTSYKDEELVSLYITSQKNEYFEEIYERYANKVYRKCYSFVYNQEKAEDLTHDIFLKLIVKIGTYKETSKFSTWLYSITYNYCMDQIRTRKKKTEVPLPDQIDISDEDDADFLDFQSAELEKSLKQMPSEERAILQMKYQEDFSIKEIAETMKISESAVKMRLLRSKEKLKKYYLENITVFVLIVMKILSLFEK >NC_014655.1|WP_013408773.1|2170296_2170473_+|hypothetical-protein MTTIDEDNLEVSPNLKKLLMSEVDLIRDALAVLEVFTEGAVNTTLKFIEELEHEKTDE >NC_014655.1|WP_013408774.1|2170465_2171302_+|mechanosensitive-ion-channel MNEFPDIRQILVDTFSKLIEQSSTFISNLISAILILSIGWLVAKICSYILRSFLSRVGIDQLGEKIQNMELLRKYQLDFKLSKVLATIVYILIMLFLSVSAADTLGVPAISNMFMMLVDFIPKLGVAILMTLLGLFVSDLARKFVETLCKSFKISSGKLISMGVFFFLSFISVILALGQAGINTTLLESSFNILIAGLVLAFSIGYGIASKEILLNILSSIYSRKRVREGDWLEIQGVKGQVISIDNTTIVLRSEGQDVSFPLRVMQMEKITLFHKND >NC_014655.1|WP_013408775.1|2171305_2172325_+|DUF3078-domain-containing-protein MKKTTFLILLLAAFSAHAQEVPKSDEAQKKVADALTTKDLKGDFKEGWNKNSSFGTTVNITGFSDSWRQVNTGVVGNTNLHFILKHQNALVKGKNIWINDFEGQLGFQSTGKDEVTRKKVFNRNIDKLFINSLYGRKISDKVSAFAEGNFISQFLAVKDKNAETRRNIASAFMTPGYLTISTGIEYRPADYFTVKFAPIANKWTFVSHKNVQIDTTSGLAYGVNIADGKKSLSEFGSQLTLGFNKEVMKNVNLGFRYNFFKAWKDTEGNKNKPLDHRLDLLATAKINKYLNVNFTYIGILDKDIFNHKAYNNATPKPIDPIRSSWQSASGFGIGFLATF >NC_014655.1|WP_013408776.1|2172341_2172740_+|large-conductance-mechanosensitive-channel-protein-MscL MFKEFKEFIMTGNVIDLAVAVILGAATGGVVNGFVQDIAMPIVGFFTGGADFSDLKYVLSPASVGADGTAIPENAIRYGSWINSIINLVTVGLVLFLIVRAYNKVRKPAAPEAPAGPTEVELLTEIRDALKK >NC_014655.1|WP_013408777.1|2172897_2174064_+|FtsW/RodA/SpoVE-family-cell-cycle-protein MTEKLKNHLQGDKQIWWILGLLSLISIVTVYSSISSLAYRQAGGNTEAVILRHALFLFLGFVVTYFVHLLDISKYAHIAKILLYISPFLLIYTLIFGVSIGNAKRWINVMGMSFQTADLVKLVLIVNLAAMLASKIHIEYKKKDLFEIITWCGIIILLISISSFSSAIILGFTCFTIMWIGKVPGRYLRALTAVIVGVISFVLISGYLIRLTTGKEVGRISTVIDRTEVFINKDLDRDGYVGGYLGGKSSQKNYAHVAIARGGIFGVGPGNSSQKNVLPEAYSDYIYSIVIEEYGLVGGLFVLALYLWLLARGIKNIDFTERAFGGLLCVGLTLLLVFQAFAHMAINVGLGPVTGQTLPLISRGGTSALFSFIALGIVLSVSKHSKAT >NC_014655.1|WP_013408778.1|2174060_2175137_+|undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide-beta-N-acetylglucosaminyltransferase MKVIISGGGTGGHIYPAVAIANELKRQKPEVDILFVGALGKMEMEKVPREGYEIVGLPIAGFNRSNLLANVGFPFKLIKSLWKSYSIIKNFKPDVAVGVGGFASGPTLKMSNYLGVKTLIQEQNSYAGVTNKILAQKAQKVCVAYPNMENFFPKEKIVFTGNPVRNDLLLSGVSKEASRSHFGLDPHKPTLLVIGGSLGALSINKAMSQGLNTLRGAGIQVIWQTGKSYFPEAQALQQEGVFISDFIYEMDKAYAAANLVVSRAGALAVSELALVGKATILVPFPFAAEDHQTKNAKSLSDQNAAILIPDNKVSDQLISEVLTLAKDQTKIAALETAIKTFARPKAAEDIVHEILKLI >NC_014655.1|WP_013408779.1|2175133_2175910_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MKIFLSENNVDYNTYTFSYALYALKESQDEISELYDKGFLPYTGNPDMEKEVYYFARSLRVNLEKFDDTSENRRVNRMVEPLGIEVSVTPKASFPTESPEFLNFCENYINERIGEDHMSMERWKYILSRETGSHLFEFRTPEKVVGYVLAALNEDMVHYWFAFFDTEYMRTHSLGKWMMWRVIRWAKDNGLKHAYLGTAYKPAALYKIRDHKGLEFWDGTKWNEDVKILKEWCQTDLEPKSADRFKLIENPDEYLEKL >NC_014655.1|WP_013408780.1|2175906_2176665_+|hypothetical-protein MKNWKSILYTIGGGCLAALAVFLMFSSAKADEKRMCEGVIVRIKDEDKQLLVKQADVLQWATREGTFPLKGMPLSRIKLKTVEQRVESSGIIKECQAYVNLNGYIILDVVVYKPMARILGNARFPDRYMDETGHFFPVSKNYTPTVLLLSGPYFEQIKGLKSEENKDLLELIQTVANDEFWSAQITRMHVDKHKEIQLEPLLGEHLIEFGKPQKIRTKLEKLMVFYTKILPQDAWSKFTEVSVKYDGQIVCR |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_014655_6 | 2568308-2568396 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_014655_6
|
1 spacers
spacers of NC_014655_6
>6.1|2568332|41|NC_014655|CRISPRCasFinder GCTCCAAAAAAGTAACAAGAAGAATATTCCTGTTTTTTTGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014655_6
The CRISPR arrays of NC_014655_6 >merge|NC_014655|6|2568308-2568396|CRISPRCasFinder TACTTTCCGTAAGGACGGACCCTTGCTCCAAAAAAGTAACAAGAAGAATATTCCTGTTTTTTTGCTACTTTCCGTAAGGACGGACCCTT >NC_014655|6|6|2568308-2568396|CRISPRCasFinder TACTTTCCGTAAGGACGGACCCTT GCTCCAAAAAAGTAACAAGAAGAATATTCCTGTTTTTTTGC TACTTTCCGTAAGGACGGACCCTT
>NC_014655.1|WP_013409055.1|2567203_2567836_+|response-regulator-transcription-factor MIKVGIVDDHDLILHGLSHMLSHQNLCTVVFQASSGEDTYNKLQEIPIDVLLLDIELPDTNGVELCGKLLKSYPTLKIIALTNHDETMWVRKMLRAGALGYLLKGTDKGNLLQAISTVFEGQQFLDPQVQNAILQQTLSGRKNSIEVKLTKRETEILALIANEYSNQEIADKLFLSIRTVEAHRNSLNQKLDIKNTAGLVKEALLRGLIS >NC_014655.1|WP_013409054.1|2565353_2567207_+|tetratricopeptide-repeat-protein MNWTLKGSLTLFVLLTIPPLKAQTSLQDSSKVYWYIELGDQKNAKNAIDSAEYYYQMAGDLAEKIGFDKGYLEFTGHYTGFLYRQARYQDALKVAERQLVVGQRSKDLTRTANAYNNMALQYQAMGNMQEAAKSLMKALDISHRSKDQVNQQKYYTNLGSLFIDLKDYKKAVRYAGKGHELAVSLKDTFKIGRSLINLMVAEILDEQLDQAEKHAKEAVLIGEKYQSNDLIMSAYCNLGDIYLRKKDYKTGLETLLRALPLLPNSPPDYQAYVYQGIANAYKYLGQYHEANQYFSKALNPGNEYLPRAEYSALLLSGSEIKEALGDYKDALNLRKQYELLNDSLLNENTQKNLHDLEIQYQTAEKELKLAQQQLEIDRRNKWIIYASSLVAVLIGLLIFSQKINRQKRKTMETLHRSNLLEAQLAGEEEERSRTARELHDGVASILSAAKLHLQPSTPIYSLVDHALQEVRNISHNMAAEVVGSEGLSYAVREFCQRVSHPLLNIEYIQVGELPKMNKGDELLLYRSIQEAVTNIVKHAQASEALVQIASDGTRMTVSIEDNGVGFDPDQLKKPGIGLKSLASRIHLLDGTYEVVSAPGNSTSVYIECSFEKDNIPA >NC_014655.1|WP_013409053.1|2564740_2565199_+|hypothetical-protein MFKLFLKLTIALAICTSLQASQYSSPFGNKYWIIESSTIQPALDLDLDGKPDTDILKITPACEKDDALLFRADGTILTHRGKVKCEDDEETEEETGEWTYDASSKKFTLHYFDSRKPVVATLTEISANRIVAVETHKSAKGQHTIKTVLKVK >NC_014655.1|WP_013409052.1|2563709_2564426_-|carboxypeptidase-regulatory-like-domain-containing-protein MSVFALGLLLLLSCSKDGEVQPGEVNYQQGYASGVAKDASGKPLKGVKIIVDHTIFYNSNISTFTSEKGTYKVKVPTGSWFAFAQHTVNYNGKSYSFYLHPDNPAGFGGEGAVRNFEWKLTGKRPEPLSGEYGGLVTFDSYPGVYIDDKQIEFTFTPLTPLIDGSTGTTLQLKSPDGYHLKDIPMGRYEVTARYQGKSVKLRKWNTDDTFQEKFILDFEPEIYAQCDNCAMLEYNYEN >NC_014655.1|WP_013409051.1|2561677_2563576_+|hypothetical-protein MKKFIFFFLILGSLQAQIRLPKLISDGMILQRDAPLTLWGWASPGESIALTLAGKTYKTKTSPQGDWKIQIPAHAADGKAHEISIKGKNQIILKDVYFGDVWLCSGQSNMVHQLDIHDVTYARDIEEANFPLIRQFLVPTIGRLQGPAKDLSGGSWQKAIGENVRPFSAVAYFFAREIHLKYGIPVGIINSSYGGTPIEAWTSEEGLKDFPDFTTTLNKNKDSIYVAETQKAAFTPPRASKDLGMAEKWFSTEYTPKAWRSIQVPGYWEDQGIRNLDGVVWYRKEIQISADASLDAPKLWLGRIVDADEVFINGQKIGGFTYQYPQRRYKVPQNLLKPGKNLIVVKVSNFFGKGGFVPDKPHALILGKDTIDLRGEWKYKVGEVFEPQAPRPMGISVQNQPSSLFNSMIHPFVNFSIKGVLWYQGESNAGRPQIYEKQIRALVADWRRHWPEVPFIHAQLPGFMEYTYLPTESNWAQLREASRRTLDIPRTAMTVNIDLGEWNDIHPDNKLDVGRRMALAARKIAYGDELVYSGPIIQKAQKQGQKIILSFEHIGSALSTADGEEPQEFAVAGSDKKFKWVKATLQGKQILLDISELPEAKYVRYAWADNPVNPNVINSEGLPASPFEIEVN >NC_014655.1|WP_013409050.1|2560709_2561681_+|glycoside-hydrolase-family-43-protein MLKPLSPPLVTHMYTADPSAHVFEGRLYFYPSHDIDAGIPFDDLGSHFGMEDYHVFSVEGDEVIDHGLALHIKDVPWAEKQMWAPDAAHKDGKYYFFFPAKAKDGLFRIGVAVGDRPEGPFKAQPEAIPGSYSIDPAVFEDEDGAYYMYFGGLWGGQLQHYRNNAYSPDYLEPEAHENALGPRVAKMSDDLLSFAEEVREIKILDENGNELKAGDHDRRFFEAAWVHKYKGKYYFSYSTGNTHYLCYAIADSPYGPFTYRGRILNPVIGWTTHHSIVEHEGKWYLFYHDSTLSEGVTHLRCVKKAEITYDENGDIQTLNPYLE >NC_014655.1|WP_013409049.1|2559320_2560709_+|MFS-transporter MKLSVTEKIGYSLGDLSANLVFQTLMTYLAYFYTDVYGLSPDVATPIIFTVGMVAAFAFNPLIGALADRTQTRWGKFRPWILITAIPLSLSALLAFSTPDFEGKAKVIYAIVTYSLLLFLYAANNLPYAALSGVITGDMGERNSLSSYRFIAVMVAQFSVQSLMYPLINKLGNGNQAEGFSKVMVYLAIVGAVLMLITFFTTKERIVPKPEQKSTLSQDLADVKNNKPWWIMLFTTILVFITLAMKGGTYLYYFENYVSAESLAEFLNRYTWLSSEAPVATGFSLFNGLGIIMMIIGIGFSKKFADKYGKRDTFMASLFLCTIPIVAFYFIPAEAVGTIFLAQIIHGFFYGISTPILWAMIADVADYSEWKNNRRATAMIFSAMMVGLKAGLTLGQSLITGILNHYNYVPNTVPAENTIHGIVMTVSIFAAVPFLLSVALLFFYEIDKKMEVQIESDLKQRR >NC_014655.1|WP_013409048.1|2558239_2559319_+|endo-1,4-beta-xylanase MKSKLIPILLLGLGACAQKQEVGLKDVFDYQIGTALSIQQIQEKDRKADSLVKRQFNVLTPENIMKSMFLQPERGKFDFAAGDQLIQYAEKNGMKVVGHTLVWHSQLPPYAQQIKDKEEFKAFMEDHIKEVASHYDGKVQGWDVINEALEEDGSLRKSIFLNLLGEDYITDAFKLAAKYTPSSELYYNDYNIEQPAKRAGAIRLIKKVQDAGLRIDGVGIQGHWMVGKVPFEEIEKSIIEYAALGLKVMITELDIEVLPRNFTGAEVSKRIEGGENLNPYKDGLPDSVQQQLASDYERLFQIFEKHKDKITRVTFWGVHDGQSWLNGWPVPGRTNYPLLFDRNYQPKPAYHKVMSLKNK >NC_014655.1|WP_013409047.1|2555756_2558231_+|glycosyl-hydrolase-115-family-protein MKKWTIFFSLICSLTVKAQIFSSKPTNWDLVGKPIYVSDSEPTVVKKAAELLSEDIERVSGKKSPVVHQKPEKDFVWIGTVSENLHSILGKDFPKKWEEYLIKFDAQKRVLVISGADRRGTAYGALTLSREMGVSPWYWWADVPVKKKSNLYINANLQIQDAPVVQYRGIFINDEAPALSSWSKEKFGGFNHQYYSKVFELMLRLKSNYIWPAMWGNAFYDDDPKNIQIADDYAIVIGTSHHEPLHRAHDEWRRYGKGPWNFVQNPDALKEFWKTGMKRSWNENITTIGMRGDGDEPMTRETATELLEKIVDQQRQIIEEVTGKPASETPQLWALYKEVQDYYDKGMRVPDDVTLLLCDDNWGNLRKLPTLNASPRKGGYGIYYHFDYVGGPRNYKWLNTTQIMRVWEQMNLAYEHGVEKIWIVNVGDIKPMEFPISFWCDMAWNPEKMSLENAVKYPILWAEEQFGKSYAAEIGDILQRYTQYNHRRTPELLDAKTYSLENYQEWEKVHADYQKLKYRAEKIKLPAEAYSAYFQLVLHPVKAMANLYDLYYQVALNHQAHSKSYSTTADYAEKAKKAFEKDSLITLEYHQLNGGKWNHMMSQTHIGYRIWQQPPYNIMPMVYTQNGTVKPEPISKHTPQKAVIHKREKYHQFIEVDGYISIQASNFSKSNGNQWKIIPELGKHGAGVSTYPTTLPASTPGGDSPYLEYEIHTYSSGPVTLTCSFAPSLNYHFTEDGLQYAISVDEEAPQVISLNKEDKDSISGIWNKWVAEAEIKKTSTHQIDKPGKHVIKFWRVNAGVVLQKITADFGGLKPSYLGPPETKP >NC_014655.1|WP_013409046.1|2555001_2555754_+|glucose-1-dehydrogenase MIFSLKNKLALITGGGAGIGLEIARCMIAAGARVVITGRTESKLITAVKDLGPSALYRIHDVTAHSTHEALIRELEENVGDIDILVNNAGINMKKNALEVSNEEFASIINTNLNSVFALTRVTAKSMVKRGKGVILMISSMAAYYGIDRVVAYAASKSGIEGMVKVLASDLSPNGIRINAIAPGFIETSMMKTAFGSDPDRMHKAMDRTPLGRFGKPEDVGWAAVYLASDEANFITGVSLRVDGGNAIGF >NC_014655.1|WP_013409056.1|2569165_2570308_-|alpha-hydroxy-acid-oxidizing-protein MYNVKYPGIDDLIRKAKKRMPKFAFEYLDGGCNEDVNLFKNTADIREIELIPYYLREYKVPEMKTELFGHTYDAPFGISPVGLQGLMWPNSPQILAKAAVEHNIPFILSTVSTASIEDIGQITDGKFWFQLYHPAKDELRDDMFLRLEDAGCKTLVVLSDVPSFGYRPRDIRNGLAMPPQMTLKNILEICTHPVWALSTLYYGTPNFATMKKYMPKGLDMKQLGQYMNKTFSGRITPERLQTIRDRWKGNLVMKGVASTEDVEKAIKYGIDGVIVSNHGGRQLDAGQSAIKSLEPIVEEFKGKIKIMMDSGVRTGPDIARTLASGAEFAFLGRTFMYSVAALGAEGGDHAITILKMQLQQVLDQVCCAKPEALNEHLFKK >NC_014655.1|WP_013409057.1|2570344_2571655_-|carbohydrate-kinase MSFILIYDIGKTNKKAFVFDQEYRIKWQKSTHFEEALDEDGDPCEDLHALEQWVKSTYEDARTLYPLKAVNFCTYGASLVFLDGNHKVLTPLYNYLKSYPQDLQERFYAQYGNEVAASTASPVLGSLNSGLLAYRLKYEKPKVFAFVRKILHLPNYMSFLFTQKACTDITSVGCHTKLWDFKKGDYHKWVEEEGIRHLLPALHPASEVKKGVDGLAIGIGLHDSSSALLPYLRTFKDPFVLISTGTWNITFNPFTTSILTEEELENDCLCYLRIDQKPIKAARLLAGIFHDEEVDKISMLYEVSREEVLATGFDPDWEGEELDLNDFVVRNPIQGKGRNWLEFMSYKEAYHQLISDLVALQVKSSSWVIEDIPKIFVDGGFGKNHLFMQMLRKALPDREVWTVEVPQASAIGAAMVIHEHWNEGGIPAKLITLTEG >NC_014655.1|WP_013409058.1|2571651_2572923_-|sugar-isomerase MRLDKKHIDNHNTDQSALHNKRLRFAKDEIADADQIIEKLKAFQVAIPSWALGTGGTRFGRFPGGGEPGTIEQKLEDVGLLHALNQSSGAVSLHIPWDIPQDHQALKNLAAELGLSFDAVNSNTFQDQKDQEYSYKFGSLQNVDKQVRDQAIAHNLEVIRHGEALGSKSITVWLSDGSCFPGQINFRRAYENTLESLREIYAGLPADWKLFLEYKAFEPNFYSTTVGDWGQSYSYVNKLGEKAYTLVDLGHHLPNANIEQIVSLLLMEGKLGGFHFNDSKYGDDDLTTGSIKPYQLFLIFNELVEGMDARGMNHANDLGWMIDASHNVKDPLEDLLQSVEALMIAYAQALSVDKQALKQAQMESDVVRAQEILQHAFRTDVRALVAEARLQTGGALQPLGLFRDLQVRKQLVAERGFQQSTGL >NC_014655.1|WP_013409059.1|2572938_2575035_-|bifunctional-rhamnulose-1-phosphate-aldolase/short-chain-dehydrogenase MEFKHVSYLWDEEKASKIDNEVDLFLYRSNLLGADLRLTNYGGGNTSVKITDVDPLTGEAVPVMWIKGSGGDIGTLTRGGCAALYLDRLRALERVYRGVDFEDEMVALFNHCIFDLNSKAPSIDTPLHGFLPYKHIDHLHPDAAIAIAAAKDGKAITEDLFQGEIGWVDWKRPGFELGLSLRACVQEAEQRGVTLKGIMLGSHGLFTWGETSYESYVNTLEVIEKCAEYIESKVTVPFGGAILASLGEEGRRDRAAEIAPVLRGFCSSERSMVGHFTDDERVLEFINSADLARLAPMGTSCPDHFLRTKISPLVLPLAPTEDLSEVKEKLTPVFEEYREGYKAYYETCKHPDSPAMRDPNPVVILYPGIGMFTFAKDKTTARLASEYYVNAINVMRGAEAISSYTSLPRQEAFDIEYWLLEEAKLQRMPKPKALAGRVALVTGSGGGIGKAIAKKFAQEGACVVLSDIDGQRLESTRQEFVSTFGKDAVAATFLNVTDEDSAAVAFKAAAVAFGGVDIVVNNAGISISKSIEEHSLEEWDRLYDILVKGQFIVSKAGIALMKKQGIGGDILNIVSKNAVVAGPNNPGYGSAKAAQAHLSRLMAAELGAAKIRVNTVNPDAVIADSNIWAGGWAEGRAKAYGISVEELPAYYAKRTLLNEVILPEDIANACFAFVSGLLNKSTGNALNVDGGVAMAFYR >NC_014655.1|WP_013409060.1|2575053_2576106_-|L-rhamnose/proton-symporter-RhaT MQTILGILFHTLGGISSGSFYMPFKRVKQWSWESYWIVGGLFSWLIVPPLAAWLTVDDFGSIIAGTDSSIKFLIYGLGVLWGIGGLTYGLGVRYLGMSLGNSVILGVSSALGSLGPAIYYNFSPVEGKASLSDMLQHTGGQLVLLGILVCLIGIYVSGKAGMLKENELSTEAKQESTSEFNFGLGIVIAVISGLLSAFFNFGIEAGKPMADVAVQQGNNPLFQNNVTYVVLLWGGLTTNLLWCLYLNFKNGSYKDYTNGQTPIVRNILFSALAGTMWYIQFFFYGMGESKLGNGASSWILHMATIILTANFWGLYLKEWSAVSKGTFRTFVLGITLILLSIFLVGIGNSI >NC_014655.1|WP_013409061.1|2576213_2578562_-|family-78-glycoside-hydrolase-catalytic-domain MKIISLILLTCALAWGQVDYKKQAWTAHWISVPGYSSTEYGIYQFRKEVALSVVPKSYVVYVSADNRYELYVNGEWIGFGPARGDISHWNYEEYDLSPYLKPGKNWIAAKVWNEGEYRPEAQFSVRTGFLLQGVTDPSISTGTSWLGRRDESFAPLPLKVPFYYVAGPGEVRDLNKYTPDWETGKGEGWKPAQNIVRALPNTIVGPYGTTNIWMLQASILPPLERKIERLGKVVKAEGVSLNNFPKVKEPIHLPARKKVSLLLDQGYLTNAYPILQFSGGKGAKISLSYAEALYDDRMKKGNRNEVEGKKFIGRKDSLISAGRRGEVFRTYSYRTYRYLLMEVETQEEALEIEDLQSLFVGFPFQMKARMDSELGEMQDMLEVGWRTARLCAVDTYMDCPYYEQLQYIGDARIQALVSLYNSGDDRLLKNALNLMDQSRQPEGITLSRHPSYTPQYIPTFSLWYIGMLYDYLRYGSDIGFVKQKLSGVHQVLQYFQRYENEEGSLRDLPQWRFTDWVSAKDWKSGEGPFGADGGSAILDFQLLWAYQVAANLEKDLGVNVYREMYLKKAEKLKQMLKKRYWVAERGLFADRSEKDLYSQHANTLAILTETVTPEEAKTIARKLLEEKDLAPASIYFKYYLHLALVKAGRGEEYLSFLDDWRENLRLGLTTWAEMSDVSGSRSDCHAWGSSPNIEFYRILLGIDSDSPGFAKVKIQPHLGDLKQLSGEIPHPNGKISASYTLVDSQWKVQIALPNGVDGTFEWKGQKKALKPGLNDFMIKNSN >NC_014655.1|WP_013409062.1|2578568_2579369_-|LysR-family-transcriptional-regulator MRTLTYFIALAEELNYAKAALRLGVTQPAVTRQIQALEEELQVKLIDETQKKAHKRVVLTEEGVYFYHEALKLVEQQKESLEGLARLRDKKKTLQIGFMAYTPGEELKRLLKVFATALEEYDFKWKLFHEASSLIDALKRDEIHLAVHCTWAKVPDGWVEATIQKGNLRVLFPPSDPRFCSCEVSTLRGEKGIVVGGLGIKELQTVHEVGNFDQLEALVQAGAGIGIIPSFFSRQRGAVWMPEVPCRWAIWMSRAGHVFERINFNL >NC_014655.1|WP_013409063.1|2579365_2580382_-|GntR-family-transcriptional-regulator MSRFLVTVDELSATPKYRQLMDAVIQAVKSGVLQQGDSMPSINELSFQTDISRLTVEKSYKELRKLGILEAFQGKGYFVKSTEIKQEYRVLLLFNKLSAHKKIVYDAFVRELGDKASVDFYIYNNDARMFCRLLEEKSKNNYTHYVVIPHFIEGEKLAVKALEKIPTSSLILVDKILPELKGSYGAVYENFSRDLYQALVQLLDALQKYKVLKLVFPENSYYPKEILEGFLSFCESFVFEHKIVHEVKGEEVQAGDVFINLMEDDLFELLEQMQDLKVGKDIGIISYNETKAKKYIMNGLTTISTDFEAMGIKAAELVLKHSKQQWQNPFHVTLRDSL >NC_014655.1|WP_013409064.1|2580444_2580777_+|alkylphosphonate-utilization-protein MSEFPPCPNCKSEYVYPSDDLLICPECFHEWNPADEDDGTLKVLDSNGNLLQDGDSVVIIKDLPVKGAPKPIKAGTKVKNIRLTEGDHNIDCKVEGFGAMALKSEFVRKA >NC_014655.1|WP_013409065.1|2580845_2581979_+|DUF418-domain-containing-protein MQTRPTEAKDRIPFLDALRGFALLGVLVANMYSHGGYFFYTPLSTIPKVPFDQPLEWCLHFLVDGKFYSLFSLLFGIGFALQLERKGQDISSFFLKRLSILFLFGILHALFLFVGDILMVYAFTGVFLLFFKKDHLKWAIFFLAFPVVEYAIFNFTLELPPPPPKELIQNVIETQRYGSLHQLILDHWAGLTEDRIPHLLFTGRFFKVLAMFLMGVYVAQKGLFKPGNREVLKRLFRICLPLGLLLNFGMAMLMETEYYYSLHPLGILESILYVIGVPVLSLAYASGFYLLHPSPLTKVFIPVGRMALTNYLTQSLICKIIFTQTHSWAGVPLTYLVILGLLIFLVQILWSHLWFKYFKYGPMEWLWRRLTYGRSFA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_014655_7 | 2725307-2725416 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_014655_7
|
1 spacers
spacers of NC_014655_7
>7.1|2725336|52|NC_014655|CRISPRCasFinder GAGTTAGGCGCGAATCCGGTCAAAGAAGAGTAAACTAAATCGTCTATAGTTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014655_7
The CRISPR arrays of NC_014655_7 >merge|NC_014655|7|2725307-2725416|CRISPRCasFinder CCGTGCAGGCTAGGAAAGGGTTCTGCTATGAGTTAGGCGCGAATCCGGTCAAAGAAGAGTAAACTAAATCGTCTATAGTTACCGTGCAGGCTAGGAAAGGGTTCTTCTAT >NC_014655|7|7|2725307-2725416|CRISPRCasFinder CCGTGCAGGCTAGGAAAGGGTTCTGCTAT GAGTTAGGCGCGAATCCGGTCAAAGAAGAGTAAACTAAATCGTCTATAGTTA CCGTGCAGGCTAGGAAAGGGTTCTTCTAT
>NC_014655.1|WP_041823686.1|2724450_2725197_+|hypothetical-protein MKKAIFFLSLALLGCDDSKEETSAPAVNTYSLVFIDKTQSVNPNDPFVKAKYSAALQMLVEDNIKNAGDQIDLYYIHENTSKAKVLSIISRTEKEDQTNMSPTDKEASDNAYHLSIKKERQIITQALMQKFLETNTSSSNAETHVTGSVPVISEALKSKPSVQVYYFSDMVESKKGGRDFHIKPPASANEAVVWAREDMGDYEPIGGAKIHIILPFSPNSSSKINNPNVSAYWKRFFDELGANPIKEE >NC_014655.1|WP_013409183.1|2723849_2724383_+|Crp/Fnr-family-transcriptional-regulator MKNFALDTYAQCFIISATNLHKTMYAPIIQHVPKGMILSKPGQIYLVKKGVVREFITLNSGDEVTTQMIPEKEYFFCSSKSSRQKYQVLEASILQRMENPGPRELTSILEETLSRIELRAELLKLKRPGERLETFEKQYPNLCNRVPHYHVASLLNITPQTLSRIRRIRALRKRPPS >NC_014655.1|WP_013409182.1|2722541_2723735_-|phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide--transferase MLYYFFEYLDKVFDLPGAGVWRFISFRASAAIIVSLSIAAIFGKRIIHKLQMLQIGESIRDLGLHGQMEKKGTPTMGGFIILASLLIPVLLFARLDNVYIILLIVATVWTSLIGFADDYIKVFRKNKEGLKGRFKVIGQIGLGLIVGLTLYYNKNVTIRQFTGGGQYIDTTSLHTTVPFTKNNLLDYHIFSQYLPDSLGWLPYVLICIFIITAVSNAANITDGIDGLAAGTSAIIGVTLAIFAFLSGNKIFAEYLNIMLIPNAGELAIFSAAFVGACVGFLWYNSYPASVFMGDTGSLMLGSVIATMALILRKELLIPVFCGIFLVENLSVMAQVFYFKYQRRRHGLEYAQKHRLFLMAPLHHHYQKKGQHEAKIVTRFWIIGILLAIVSIVTLKLR >NC_014655.1|WP_013409181.1|2719951_2722231_-|SLBB-domain-containing-protein MKLIKLLFFFVFLGTSLHAQTLPPVESVSDKQLETFLQEVEKRGLTEEQVEIIAKSRGYTNSDIIKLRERLARIKTGTSKSNETTNAVVREQIEEVADRAEVQVKSETPIMSDALYGTSLFRNKSLTFEPNLRIPTPPNYVLGTGDELRASITGYAAKDYTLLVSEEGTVKLEHFAPIYVNGLTVNEAKAKLRQRLGTLYAGLNNGSLNLDLTLAKVKSIKVTVIGEVTHPGTYTVSSLATLFNVLYQSGGPTNIGSFRNIQLIRNNKVIHRLDLYEFLQKGLLTGDVGLKDQDVVMIPTSEIIVKITGEVKRPMRYELKSGEGMKDLLAYSGGFTETAYKASLTLKRKTDKELEIRNIAIDNDVSLKNGDELHAGAILDRYTNRVEISGAVFRPGQYALDQNLQTVAQLIKKADGLREDAFKGRAILKRERENLDPEFIALDLNKILNEGEDFKLKREDVLIIRSVAELREARKVTISGEVNQTGEYDFTENLTVSDLVFMAGGFKQGAAAGRIEVARRLYNDQNAEATVQIFDLSINQDLSIVEKSFVLQPFDQVYIRALANYQPQQTVTIEGEVNYPSRYVIKSKTERISDLIERAGGLRNEAYVRGAKFYREGKLVALDLEKALNQKNAAINLFLEEGDRLVIPKEEQVVKLHGQVQNPTSVAFVPGFSFRDYIEQAGGFTDSAHVKKTYVRYANGMTDRTKSFLGIRFYPKADKGMEVFVPVKHREKMSRAEVVTMATAVTSMMAVIVTLIRVL >NC_014655.1|WP_013409180.1|2718924_2719950_-|LPS-biosynthesis-protein MEKEINIDFKAFFRIIWNEKWRIIIVTLFISILGLTYSLMATEEFKTQGKILPELQSRGANSLSQFAGLASLAGLDLNSIASSGIDAVRPDLYPDVLSSTPFYLELFKLKVKTKDNVELTFEEFLHKSIEKGKSIDDKLVEKYKVDNDDILILNKLVERRIKILRNRLYSSIDKKSGIITITVEMPDPVVAAAVARFSMEYLMNYVKDYRTKKLTNDVEYLERQLSFSRNKYYSNQEAKARYSDQFQDMALQSADIKRERIESEYRISSTFYNELLKKYEEAKFKLHQETPVFKILEPPIAPSVKSSPKRTVICLISIFLGSFLSLIYVILKDKNYHLIFN >NC_014655.1|WP_013409179.1|2716737_2717859_-|polysaccharide-pyruvyl-transferase-family-protein MRIGILTLPLHTNYGGILQAYALQETLKLLGNEVWILDPSPLLKIPAYKKPFSYLKRAIRRIFLNTDDEIFFDVKYNREFKIISEHTEVFLKRKINRLEINDLYSVPKEFFDVLVVGSDQIWRPKYYPKIENAFLKFAKKWEVKRIAYAPSFGVDKWEYNTNDTLKCKELITLFHSVSVREDSGVKLVEEYFGRSAVHVADPTLLLPKEKYIELFKEADIPLSKGNFLTYILDLNSDIENLISEIECQCGLKAFKCNSEVENPKAKLNARIQPPVEQWIRGFYDAEFVLTDSFHACIFAIIFNKPFVVIGNRNRGLARFLSVLKKFGLEERLIYDPKDFDITMVSTPLNGQIEQRLEQFKEFSLNFLTNSLKS >NC_014655.1|WP_148225820.1|2715744_2716734_-|glycosyltransferase MMKFSVIVPVYNCENSLFKCIESILGQEFNDFEVIIVNDGSSDSSEEICKRFIAKDSRVKYFYQKNSGVSSARNLGIENAVGEWIVFCDSDDYVGPYFLRDFFCNISEDTEIICQGFYCFNWQNIQDQYVGSKIKRKISGIDLLGEEIVQQLKDGYLGYVWCKAFKREIIIKNCIRFPIDIHFMEDLLFVSNYLKNVKSILVLYSSNYFYNFTPVGKEFLTSNPYDLLIVVYKNVLAINSDSNFKYEIRLYYAEAIIELFLSGRYNLTNEMLIDYYRQFSDVVFNIVPRSFKVRVFKYFAIKDNRSYNFKLIKIIRCAVVLGKLARIWK >NC_014655.1|WP_187287896.1|2714645_2715602_-|EpsG-family-protein MGGLRDTSIGIDLRVYGVEYFYYALFSNSFSDLIRNSPTSEYGYIILNYICSLLSTEINFFLFISEFIKISLVCIVAVYFKDSLNGAILISGYLLFFYFGGYSLLRQQLALCICLVSLIPLINGNWIKFLLLVFLAWTFHHSAFIMFFLPIVLKLSRKWYSIPLITLFLFLVYQYKVQLLVFLSGSGIVQEVMADRYVDSGVATAKANILIGATFLLYSIFVGDENKARKRLILINSIFCLFFLFMASFFEVAFRVSYYQMIILIAVILMSINRIRSAWFRAFCQFVYLLLFIFYFVVESNHGLSGTIPYTSSILGIR >NC_014655.1|WP_013409176.1|2714016_2714607_-|serine-acetyltransferase MIKTRSDLKIYLTKDAQLYPKLSGSWIKRIKNILVTNPINSQYVIYKYLCTLRNSEFHFNNSYFTKKRGISAALHKLAVVLKFYRLRRLSYKTGFQIPPNTCGPGLQIWHYGYIIINPNAIIGENATIYPGVEIGEKKGGVPIIGNNVFIGAGAIVFGNLRIGNNSVIAPNAVVISDVPENAIVGGVPAKILKYNK >NC_014655.1|WP_013409175.1|2712805_2714020_-|glycosyltransferase MKVLQINHSYKYGGSTGRIVYELQELSENLKIDSYVAFGYDFNNVKGKNLFKICSIPQMQISKLQTRFFGEHGFYNTKETYELIKHIKRIKPDVIHLHNLHNHYLNSQILFDYIKEEDIPIVWTLHDCWSFTGWCAYFDYANCSKWESECNECPSLKDYPFTWFFDKSKPNFYRKKKAFTEVKNLIIVTPSIWLSEVVKRSFLSDYPVKVINNGIDLNIFSPKLNNSLRQRHNLIGKKVILSVASEFDRRKGLDFLVKLPEFLEEDEVLLLVGLKSNQKKLFSNRKCICIERTESVKELAEYYSLADVFLNTTLEDNFPTTNLEALACGTPVITFDSGGSIEAVDNYTGKIVAKGDLTGLLDAKSQILEKGKEAYINNCRERAEIFFNKDIQYSKYIDLYRSLV >NC_014655.1|WP_013409185.1|2725728_2726058_+|winged-helix-turn-helix-transcriptional-regulator MGVTKTEIYKDEQNKLASLLKVLGHPARIAILQYIINQRACICNDLVEELGLAQATISQHLKELKTIGIIQGSIEGKSVCYCIDELVWKQFQEEINGFFNQDVNVKQCC >NC_014655.1|WP_041823688.1|2726134_2726599_+|hypothetical-protein MKLSEIKEILPALENVEFQLENGTFVPEHFHVTEVGQIIKNFIDCGGVIRKEKVVNFQLWSADDYEHRLKPGKLLSIIKLSEDKLGIEDAEIEVEYQSDTIGKYDLDFNGNTFVLKNKATACLAQDACGIPSEKQNKSFSELTSNSCTPNSGCC >NC_014655.1|WP_013409187.1|2726617_2727232_+|protein-tyrosine-phosphatase MYPALSETIQQLEWEKINNDERKSTLQPLIDFIQLKINSKQQININFICTHNSRRSHLSQVWAQVAASHFGIENVICYSGGTEETALFPKVAETLSDQGFNIFKINDGSNPVYAIKYSDNSPPIIGFSKKYDNPFNPVSAFVAIMTCSQADGGCPFIAGAEKRIPITFEDPKISDNTSEQTKIYSKRSLQIASEMFYVFSKITK >NC_014655.1|WP_013409188.1|2727235_2728267_+|ACR3-family-arsenite-efflux-transporter MQPKLKFLDRYLTLWIFLAMVLGLGLGYFFPGISNITNTLSVGTTNIPLAIGLVLMMYPPLAKVDYSLLPIVLKDKKVVSISLLLNWIIGPILMFGLAILFLRNEPDYMIGLILIGLARCIAMVIVWNDLAKGNREYAALLIALNSIFQVLSYSFLVWLFINVLPNRLGLASFNVSVSIKDVTESVMIYLGIPFLTGFLSRYLLVKSKGIEWYNRKFVPKISPITLYALLFTIVLMFSLKGDKIIELPMDVITVAIPLVIYFVLMFFVSFFINKSLNVPYHKNAAIAFTAAGNNFELAIAVSIAVFGIHSPQAFVGVIGPLVEVPVLILLVKISLWLKKKYYQ >NC_014655.1|WP_013409189.1|2729811_2731026_-|D-alanyl-D-alanine-carboxypeptidase MKKILLFFVLGLLFTACKIQKLEKSLPKHAFSGVLIKEGKSGKVLFAKNAHKPFVPASNTKILSMYAALEMLPDTLPAFRYWIKGDTTFLMGTGDPTLLHPDFPKNPAWEILEQAKVIVYSDKNLHQERYGAGWSWDDYNDYYQAEINALPLYGNVVRVKGEDWLPSYFKGGVVKAERSNVKRAEHENVFYAPQVLNRTQEVPFRTSSHLVVDLLKDTLKREVIYRRVDLDPNYKTAWGLPKDTVIRRMMQPSDNHLAEQLLLMAGGADTLSSSKSIEKVKAKLFEEFPKPYVWKDGSGLSRYNLFTPAFMVHLLEEMYKKYPTDQLFSYMSVGGKAGTLRNKYKGELPYVFAKTGSMSGVYNESGYFINRKGKILVYSVLKNNFTESVSENGAATMEWMNRWR >NC_014655.1|WP_041824655.1|2731063_2732299_+|DUF5009-domain-containing-protein MAKQRIVSLDVFRGLTMILMITVNNPGDWSNVYAPLLHAEWHGWTPTDLVFPFFVFAMGMALPFSMKPGSGLSKDDFLKILARSARLIALGLFLNFFSKIEFGNAQGITLLLFRLMITGFVGFLLMGNFPTKIKLYTALALLGLMLALAYSGLPHFAQVRIPGVLQRLGTVYFFAAILYLAFSLRVQWGIGLSVLVIYWLLLAYIPVPGSGVTGFEKGENLPAWIDSIVLGDHVWSSSKPWDPEGVLSTLPAIISCLLGAWAGVFLREDKKKLLLTGVILLICGLAWSTFFPINKALWTSSFVLLTAGLGSIIVSLLGFVVDGKPLNALTSFLVMWGVNPIIVFFGAGILPRALNMIKVNDQALLSAFYKNGIVPLFEDPRNSSLLFALVHVSFWSLVLLYLRKEKMIIKV >NC_014655.1|WP_013409191.1|2732350_2733967_+|S41-family-peptidase MEYKNSKQNIASPLVICLSLAVGIFLGAKFFGSKATPGAGSLGNRYREVLMNIKKSYVDEVNIDSLEMYALDKMLEKLDPHTVLLPPQDAQLASADLGTGFDGIGVEFNIFNDSLYVVTPLSGGPSEAIGIKAGDIILKADTVSLTGKTLNTNLVYQTLRGPRGSTVKIVVKRKGVSSPMTFQVKRDKIPTFSIDAAYMIAPQTGYIKVNRFSESTYEEFVTHLKNLKGQGMDKLLLDLRGNPGGYMDRATNMVDELVPGNGVIVYTKGKDASNNYEIKAGKDGIFEKGKIVVLVDEGSASAAEIVSGALQDYDRATVVGRRTFGKGLVQVPIQLSDGSELRLTISRYYIPSGRSIQRPYELGNQQGYYEDFLERYNHQEMFVADSIKNNEKLKYKTKAGRTVYGGGGITPDVFVPQDTSFYTDYLLELFSRNVFKEFAMTYAEKHGAELQKKGFEHFLKNFQVNEAILSDFNALASKSKARYKEASFQKSKKYIQETLKALIARHIWNGNALNNEYYQVINPTDPMIQAGLKAFSSR >NC_014655.1|WP_013409192.1|2733953_2735384_-|alpha-L-fucosidase MRINILWFFLILAVSCRPSLISTPSPVGPTPSTKQLEWHELETYAFIHFTTNTFTGKEWGYGDESPSIFNPTNTNVDQWVRTLKNTGFKAVILTAKHHDGFCLWPSKYTKHSIAASPYKKGKGDLVKEVAQACKKHGLKFGLYLSPWDRNREDYGSPSYVTYYRNQLKELFENYGPVFEMWFDGANGGDGYYGGAKEKRRIDGKTYYDWPGTISMVRNMEPNILFFSDAGPDIRWVGNERGIAGETNWNTISPDTLYAGKAGIESLLNTGHENGTSWIPAEVDVSIRPGWFYHAEEDGKVKTPEELFDIYLTSVGRGSNLLLNIPPDRRGLLHEKDVEHLEGFHALLKERLGHNYLRKARVKADKSLDKTQRPLYLVDGKKDTFWAAEDKQAEIEISLNKPQELKYITLQEHIALGQRVKSFEVEVNDGNRWVTVGRGTTIGYKRILKIQPITAKKIRIRILDAKGPAVLNEISAS >NC_014655.1|WP_013409193.1|2735482_2737249_+|DUF1080-domain-containing-protein MKKILLSLLWWVPLAAQSQIPLNDLSFFNSQSSNWSIVGDVNAPLNQKNTLTTQSGTGVLVCKHDSKEYGDKFDLFTKESYGDIDLSLDFMLGVGSNSGIYLMGRYEVQLFDSWGVKTPKYSDCGGIYQRRDVKTGNQYEGFAPRFNAYKAPGLWNNIQISFQAPRFDANGKKISNAKFIYVKLNGLLIHENVELSGPTGGPIEENEVASSPLRFQGDHGAVAFRNLNITNFNKKPGTISNLSYKTYYGSYMHDADLSKVKMDAQGKTDDITWEVTKNPNDYVFFINGTYTAPEDGEYTFVTQLGGHSYLKIDGQMVQPNVWMRGGTRSVTLNLKKGDHSFEIFNNKRDNWIKPALGFWSAGPGFRLTPHHASSSVIASKPDDPILVKAETPIILRSFMDFDQKKRIVHAVNVGSPDGIHYTYDLDKGAVIQAWKGDFLDTTPMWHDRGDGSSKPLGSLTKFNYDLLLTNGNSWSDTVGTGYKPLGYQLDQNDLPTFRYKIAGTEVEDQVRIVEGKYLDRKIKLSKDAALLARLATGEKIVEIEKNLFSVDDKKYFIKVDKGLDAKIKDGKEIVVRPQSQLIQYSIIF >NC_014655.1|WP_013409194.1|2737251_2739174_+|membrane-protein MKKILIASLLLFSASSFAQESPKEEDFYKIITLPVPEGILLEVGGVEMLPNGSVALSTRRGDIWIVDNPTSTKPYFRKFASGLHEILGLLYKDGSLYCAQRGELTKLTDSNGDGKADKYETIHAWDISGHYHEYSFGPKLASDGKFFVSGNVAFGDIEWWRGESRAKTRGTIFKVSEDGQLELYAAGVRSPAGLGMIDGELFYTDNQGDWIGSGGLWHVQKGKFYGNPASLRWKEVQDLVGFTEDEFYKERDVRRERDASGNILKPENKVEEVPQTFYELKSKFPNVQPPAVWLPHGILGISNSEILVDHTGGDFGPFSGQVFVGDQGQSKIMRVFLEKVNGEYQGAAWDFRSGFQSGVLRMTFAPDGSMFVGETNRGWGSAGDAAQGFQRLIWNGKIPFEMLTCKAMPDGFEIEFTMPIDQKSAENLNSYSVRSFIYKHHPVYGSPQIHDKNLKVKGVKLSADRKKLRIVIDGLRPYFIHELNLEGIRAEQNAWSLVHPTVYYTLNHIPDGQKLSATEIKGTAVASKTPAPAKTTPTTVSPDGKNQPAVAKQPAAPTFASVKPLLQKHTCLSCHDPEKKMIGPSFKEIAKRKYTNAKMISLIKSPKAENWPDYPAPMPPMSHVPQGDLEKIATYINSLK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
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1. spacer 1.1|579011|26|NC_014655|CRISPRCasFinder matches to position: 569445-569470, mismatch: 0, identity: 1.0
aatcccacaagttttgttgttgatcc CRISPR spacer aatcccacaagttttgttgttgatcc Protospacer **************************
2. spacer 5.1|2168804|26|NC_014655|CRISPRCasFinder matches to position: 2167929-2167954, mismatch: 0, identity: 1.0
tttgcgccaaaaaagtaacaagaaga CRISPR spacer tttgcgccaaaaaagtaacaagaaga Protospacer **************************
3. spacer 5.1|2168804|26|NC_014655|CRISPRCasFinder matches to position: 2168214-2168239, mismatch: 0, identity: 1.0
tttgcgccaaaaaagtaacaagaaga CRISPR spacer tttgcgccaaaaaagtaacaagaaga Protospacer **************************
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tttgcgccaaaaaagtaacaagaaga CRISPR spacer tttgcgccaaaaaagtaacaagaaga Protospacer **************************
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tttgcgccaaaaaagtaacaagaaga CRISPR spacer tttgcgtcaaaaaagtaacaagaaga Protospacer ******.*******************
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14. spacer 6.1|2568332|41|NC_014655|CRISPRCasFinder matches to position: 2812447-2812487, mismatch: 1, identity: 0.976
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15. spacer 7.1|2725336|52|NC_014655|CRISPRCasFinder matches to position: 2729607-2729658, mismatch: 1, identity: 0.981
gagttaggcgcgaatccggtcaaagaagagtaaactaaatcgtctatagtta CRISPR spacer gagctaggcgcgaatccggtcaaagaagagtaaactaaatcgtctatagtta Protospacer ***.************************************************
16. spacer 6.1|2568332|41|NC_014655|CRISPRCasFinder matches to position: 2621158-2621198, mismatch: 2, identity: 0.951
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17. spacer 6.1|2568332|41|NC_014655|CRISPRCasFinder matches to position: 2811850-2811890, mismatch: 2, identity: 0.951
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18. spacer 6.1|2568332|41|NC_014655|CRISPRCasFinder matches to position: 2812730-2812770, mismatch: 2, identity: 0.951
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19. spacer 6.1|2568332|41|NC_014655|CRISPRCasFinder matches to position: 3831589-3831629, mismatch: 2, identity: 0.951
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20. spacer 6.1|2568332|41|NC_014655|CRISPRCasFinder matches to position: 4017337-4017377, mismatch: 2, identity: 0.951
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_014655_5 | 5.1|2168804|26|NC_014655|CRISPRCasFinder | 2168804-2168829 | 26 | JQ680351 | Unidentified phage clone 1013_scaffold1563 genomic sequence | 5251-5276 | 4 | 0.846 |
NC_014655_3 | 3.5|1937020|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1937020-1937049 | 30 | NZ_CP045339 | Vibrio sp. THAF190c plasmid pTHAF190c_a, complete sequence | 112382-112411 | 6 | 0.8 |
NC_014655_3 | 3.9|1937336|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1937336-1937365 | 30 | NC_010180 | Bacillus mycoides KBAB4 plasmid pBWB401, complete sequence | 234993-235022 | 6 | 0.8 |
NC_014655_3 | 3.9|1937336|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1937336-1937365 | 30 | NZ_CP031072 | Bacillus mycoides strain BPN401 plasmid pl395, complete sequence | 136181-136210 | 6 | 0.8 |
NC_014655_3 | 3.9|1937336|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1937336-1937365 | 30 | CP037991 | Bacillus mycoides strain TH26 plasmid unnamed1, complete sequence | 440573-440602 | 6 | 0.8 |
NC_014655_4 | 4.12|1939913|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1939913-1939942 | 30 | AP013817 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C15-MedDCM-OCT-S44-C148, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 7462-7491 | 6 | 0.8 |
NC_014655_4 | 4.13|1939992|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1939992-1940021 | 30 | NZ_CP041677 | Lactobacillus reuteri strain LL7 plasmid unnamed, complete sequence | 65962-65991 | 6 | 0.8 |
NC_014655_4 | 4.14|1940071|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1940071-1940100 | 30 | NZ_CP026318 | Vibrio campbellii strain BoB-90 plasmid unnamed 2, complete sequence | 65547-65576 | 6 | 0.8 |
NC_014655_4 | 4.14|1940071|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1940071-1940100 | 30 | NZ_CP046830 | Vibrio parahaemolyticus strain 2012AW-0224 plasmid unnamed1, complete sequence | 54401-54430 | 6 | 0.8 |
NC_014655_4 | 4.17|1939362|29|NC_014655|PILER-CR | 1939362-1939390 | 29 | CP015514 | Vibrio vulnificus strain FORC_036 plasmid unnamed, complete sequence | 650089-650117 | 6 | 0.793 |
NC_014655_4 | 4.17|1939362|29|NC_014655|PILER-CR | 1939362-1939390 | 29 | NC_010889 | Actinobacillus pleuropneumoniae isolate 12494 plasmid p12494, complete sequence | 11884-11912 | 6 | 0.793 |
NC_014655_3 | 3.1|1936704|30|NC_014655|CRISPRCasFinder | 1936704-1936733 | 30 | NZ_CP016453 | Sphingobium sp. RAC03 plasmid pBSY17_1, complete sequence | 182464-182493 | 7 | 0.767 |
NC_014655_3 | 3.2|1936783|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1936783-1936812 | 30 | NC_003267 | Nostoc sp. PCC 7120 = FACHB-418 plasmid pCC7120gamma, complete sequence | 49756-49785 | 7 | 0.767 |
NC_014655_3 | 3.6|1937099|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1937099-1937128 | 30 | KJ019069 | Synechococcus phage ACG-2014j isolate Syn7803US103, complete genome | 59874-59903 | 7 | 0.767 |
NC_014655_3 | 3.6|1937099|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1937099-1937128 | 30 | NC_031900 | Synechococcus phage S-CAM4 isolate 0809SB33, complete genome | 59893-59922 | 7 | 0.767 |
NC_014655_3 | 3.6|1937099|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1937099-1937128 | 30 | KU686202 | Synechococcus phage S-CAM4 isolate 1010NB23, complete genome | 59951-59980 | 7 | 0.767 |
NC_014655_3 | 3.6|1937099|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1937099-1937128 | 30 | KU686200 | Synechococcus phage S-CAM4 isolate 0309CC44, complete genome | 59868-59897 | 7 | 0.767 |
NC_014655_3 | 3.9|1937336|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1937336-1937365 | 30 | NZ_CP040345 | Bacillus albus strain DLOU-Yingkou plasmid unnamed1, complete sequence | 385394-385423 | 7 | 0.767 |
NC_014655_3 | 3.9|1937336|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1937336-1937365 | 30 | NZ_CP009368 | Bacillus cereus strain FM1 plasmid unnamed, complete sequence | 62780-62809 | 7 | 0.767 |
NC_014655_3 | 3.9|1937336|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1937336-1937365 | 30 | NZ_CP053657 | Bacillus cereus strain CTMA_1571 plasmid p.1, complete sequence | 460207-460236 | 7 | 0.767 |
NC_014655_3 | 3.9|1937336|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1937336-1937365 | 30 | NZ_CP009691 | Bacillus mycoides strain ATCC 6462 plasmid pBMX_1, complete sequence | 142101-142130 | 7 | 0.767 |
NC_014655_3 | 3.9|1937336|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1937336-1937365 | 30 | NZ_CP034868 | Buchnera aphidicola (Macrosiphum gaurae) strain Mga plasmid pLeu, complete sequence | 5756-5785 | 7 | 0.767 |
NC_014655_4 | 4.5|1939204|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1939204-1939233 | 30 | MF417906 | Uncultured Caudovirales phage clone 7F_8, partial genome | 37033-37062 | 7 | 0.767 |
NC_014655_4 | 4.5|1939204|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1939204-1939233 | 30 | MF417894 | Uncultured Caudovirales phage clone 7AX_4, partial genome | 3699-3728 | 7 | 0.767 |
NC_014655_4 | 4.5|1939204|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1939204-1939233 | 30 | MF417905 | Uncultured Caudovirales phage clone 8AX_11, partial genome | 37055-37084 | 7 | 0.767 |
NC_014655_4 | 4.16|1938967|30|NC_014655|PILER-CR | 1938967-1938996 | 30 | NZ_CP020864 | Paenibacillus sp. Cedars plasmid unnamed1, complete sequence | 184861-184890 | 7 | 0.767 |
NC_014655_4 | 4.16|1938967|30|NC_014655|PILER-CR | 1938967-1938996 | 30 | NZ_CP032413 | Paenibacillus lautus strain E7593-69 plasmid pAZOPL1, complete sequence | 30881-30910 | 7 | 0.767 |
NC_014655_4 | 4.20|1939834|30|NC_014655|PILER-CR | 1939834-1939863 | 30 | NZ_CP013104 | Paraburkholderia caribensis strain MWAP64 plasmid 1, complete sequence | 47760-47789 | 7 | 0.767 |
NC_014655_3 | 3.1|1936704|30|NC_014655|CRISPRCasFinder | 1936704-1936733 | 30 | NZ_CP035512 | Haematobacter massiliensis strain OT1 plasmid pOT1-2, complete sequence | 112900-112929 | 8 | 0.733 |
NC_014655_3 | 3.1|1936704|30|NC_014655|CRISPRCasFinder | 1936704-1936733 | 30 | NC_048709 | Vibrio phage YC, complete genome | 83052-83081 | 8 | 0.733 |
NC_014655_3 | 3.7|1937178|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1937178-1937207 | 30 | MG945638 | UNVERIFIED: Microviridae sp. isolate 7092-1602, complete genome | 1163-1192 | 8 | 0.733 |
NC_014655_4 | 4.4|1939125|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1939125-1939154 | 30 | NZ_CP023514 | Enterococcus sp. FDAARGOS_375 plasmid unnamed1, complete sequence | 93825-93854 | 8 | 0.733 |
NC_014655_4 | 4.5|1939204|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1939204-1939233 | 30 | NZ_CP024321 | Borrelia miyamotoi strain Yekat-6 plasmid pYkt6-2 | 17949-17978 | 8 | 0.733 |
NC_014655_4 | 4.5|1939204|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1939204-1939233 | 30 | NZ_CP024395 | Borrelia miyamotoi strain Izh-4 plasmid pIzh4-cp30-1, complete sequence | 18008-18037 | 8 | 0.733 |
NC_014655_4 | 4.5|1939204|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1939204-1939233 | 30 | NZ_CP024209 | Borrelia miyamotoi strain Izh-5 plasmid pIzh5-2 | 29170-29199 | 8 | 0.733 |
NC_014655_4 | 4.5|1939204|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1939204-1939233 | 30 | NZ_CP024211 | Borrelia miyamotoi strain Izh-5 plasmid pIzh5-4 | 14449-14478 | 8 | 0.733 |
NC_014655_4 | 4.5|1939204|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1939204-1939233 | 30 | NZ_CP024217 | Borrelia miyamotoi strain Izh-5 plasmid pIzh5-9 | 21216-21245 | 8 | 0.733 |
NC_014655_4 | 4.5|1939204|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1939204-1939233 | 30 | NZ_CP024338 | Borrelia miyamotoi strain Yekat-1 plasmid pYkt1-3 | 20973-21002 | 8 | 0.733 |
NC_014655_4 | 4.5|1939204|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1939204-1939233 | 30 | NZ_CP040828 | Borrelia miyamotoi strain Izh-4 plasmid pIzh4-cp30-2, complete sequence | 13791-13820 | 8 | 0.733 |
NC_014655_4 | 4.5|1939204|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1939204-1939233 | 30 | NZ_CP024357 | Borrelia miyamotoi strain Izh-16 plasmid pIzh16-3, complete sequence | 17300-17329 | 8 | 0.733 |
NC_014655_4 | 4.5|1939204|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1939204-1939233 | 30 | NZ_CP024358 | Borrelia miyamotoi strain Izh-16 plasmid pIzh16-4, complete sequence | 14883-14912 | 8 | 0.733 |
NC_014655_4 | 4.5|1939204|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1939204-1939233 | 30 | NZ_CP024378 | Borrelia miyamotoi strain Izh-14 plasmid pIzh14-3, complete sequence | 8488-8517 | 8 | 0.733 |
NC_014655_4 | 4.16|1938967|30|NC_014655|PILER-CR | 1938967-1938996 | 30 | NZ_CP029455 | Bacillus cereus strain FORC087 plasmid pFORC087.1, complete sequence | 257154-257183 | 8 | 0.733 |
NC_014655_3 | 3.1|1936704|30|NC_014655|CRISPRCasFinder | 1936704-1936733 | 30 | NZ_CP048608 | Pseudomonas fluorescens strain DR133 plasmid unnamed, complete sequence | 27061-27090 | 9 | 0.7 |
NC_014655_4 | 4.5|1939204|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1939204-1939233 | 30 | NC_002759 | Pseudomonas syringae pv. maculicola str. M6 plasmid pFKN, complete sequence | 6832-6861 | 9 | 0.7 |
NC_014655_4 | 4.5|1939204|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1939204-1939233 | 30 | NC_004633 | Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 plasmid pDC3000A, complete sequence | 5590-5619 | 9 | 0.7 |
NC_014655_4 | 4.5|1939204|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1939204-1939233 | 30 | NZ_CP034079 | Pseudomonas syringae pv. pisi str. PP1 plasmid pPP1-1, complete sequence | 5240-5269 | 9 | 0.7 |
1. spacer 5.1|2168804|26|NC_014655|CRISPRCasFinder matches to JQ680351 (Unidentified phage clone 1013_scaffold1563 genomic sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.846
tttgcgccaaaaaagtaacaagaaga CRISPR spacer tttgcaccaaaaacgtaacaagaaat Protospacer *****.******* **********.
2. spacer 3.5|1937020|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP045339 (Vibrio sp. THAF190c plasmid pTHAF190c_a, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
atttccggcgagtgtagcaagcgcggtaga CRISPR spacer aggtgcagcgagtgtagcaagcgcggtatc Protospacer * * *.*********************
3. spacer 3.9|1937336|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_010180 (Bacillus mycoides KBAB4 plasmid pBWB401, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
aaaaggagaataaagaagctctttccaggc CRISPR spacer aaaaggagaataaagaagcacttccgttgt Protospacer ******************* ***.* *.
4. spacer 3.9|1937336|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP031072 (Bacillus mycoides strain BPN401 plasmid pl395, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
aaaaggagaataaagaagctctttccaggc CRISPR spacer aaaaggagaataaagaagcacttccgttgt Protospacer ******************* ***.* *.
5. spacer 3.9|1937336|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to CP037991 (Bacillus mycoides strain TH26 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
aaaaggagaataaagaagctctttccaggc CRISPR spacer aaaaggagaataaagaagcacttccgttgt Protospacer ******************* ***.* *.
6. spacer 4.12|1939913|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to AP013817 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C15-MedDCM-OCT-S44-C148, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
gcaagaattacttgcagttgcaaagttagc CRISPR spacer tcaagaattaccttcagttgcaaatgaagc Protospacer **********.* ********** ***
7. spacer 4.13|1939992|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP041677 (Lactobacillus reuteri strain LL7 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
ctttggactcaggataattagaaataatac CRISPR spacer cctttagctcaggatcattagaaacaatac Protospacer *.** ..******** ********.*****
8. spacer 4.14|1940071|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP026318 (Vibrio campbellii strain BoB-90 plasmid unnamed 2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
ttatccagtcgatgtacccttctggagtta CRISPR spacer ttatccagtcgatgtagcctttggtggtca Protospacer **************** ****. * .**.*
9. spacer 4.14|1940071|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP046830 (Vibrio parahaemolyticus strain 2012AW-0224 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
ttatccagtcgatgtacccttctggagtta CRISPR spacer ttatccagtcgatgtagcctttggtggtca Protospacer **************** ****. * .**.*
10. spacer 4.17|1939362|29|NC_014655|PILER-CR matches to CP015514 (Vibrio vulnificus strain FORC_036 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
attgctaaatcttctatttcagacataga CRISPR spacer gtcgctaaatcgactatttcagacatatt Protospacer .*.******** **************
11. spacer 4.17|1939362|29|NC_014655|PILER-CR matches to NC_010889 (Actinobacillus pleuropneumoniae isolate 12494 plasmid p12494, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
attgctaaatcttctatttcagacataga CRISPR spacer aaacctaaatcttctattccggacataaa Protospacer * **************.*.******.*
12. spacer 3.1|1936704|30|NC_014655|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016453 (Sphingobium sp. RAC03 plasmid pBSY17_1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ctttccctcttgcagttcctgaagcaacac CRISPR spacer gactcccgcttgcagttcctgcagcaagcc Protospacer .**** ************* ***** *
13. spacer 3.2|1936783|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_003267 (Nostoc sp. PCC 7120 = FACHB-418 plasmid pCC7120gamma, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
gcaacaggttcaggaaaatccgttcagatt CRISPR spacer acaacaggctcaggaaaatcagttttggta Protospacer .*******.*********** ***. *.*
14. spacer 3.6|1937099|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KJ019069 (Synechococcus phage ACG-2014j isolate Syn7803US103, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ttacaaaccaaaatatgcctctttcctacc CRISPR spacer attaaaaccaaaagatgcatctttccttac Protospacer * ********* **** ******** *
15. spacer 3.6|1937099|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_031900 (Synechococcus phage S-CAM4 isolate 0809SB33, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ttacaaaccaaaatatgcctctttcctacc CRISPR spacer attaaaaccaaaagatgcatctttccttac Protospacer * ********* **** ******** *
16. spacer 3.6|1937099|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KU686202 (Synechococcus phage S-CAM4 isolate 1010NB23, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ttacaaaccaaaatatgcctctttcctacc CRISPR spacer attaaaaccaaaagatgcatctttccttac Protospacer * ********* **** ******** *
17. spacer 3.6|1937099|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KU686200 (Synechococcus phage S-CAM4 isolate 0309CC44, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ttacaaaccaaaatatgcctctttcctacc CRISPR spacer attaaaaccaaaagatgcatctttccttac Protospacer * ********* **** ******** *
18. spacer 3.9|1937336|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP040345 (Bacillus albus strain DLOU-Yingkou plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
aaaaggagaataaagaagctctttccaggc CRISPR spacer aaaaggagaataaagaagcactcccgttgt Protospacer ******************* **..* *.
19. spacer 3.9|1937336|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP009368 (Bacillus cereus strain FM1 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
aaaaggagaataaagaagctctttccaggc CRISPR spacer aaaaggagaataaagaagcactcccgttgt Protospacer ******************* **..* *.
20. spacer 3.9|1937336|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP053657 (Bacillus cereus strain CTMA_1571 plasmid p.1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
aaaaggagaataaagaagctctttccaggc CRISPR spacer aaaaggagaataaagaagcactcccgttgt Protospacer ******************* **..* *.
21. spacer 3.9|1937336|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP009691 (Bacillus mycoides strain ATCC 6462 plasmid pBMX_1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
aaaaggagaataaagaagctctttccaggc CRISPR spacer aaaaggagaataaagaggcacttccgttgt Protospacer ****************.** ***.* *.
22. spacer 3.9|1937336|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP034868 (Buchnera aphidicola (Macrosiphum gaurae) strain Mga plasmid pLeu, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
aaaaggagaataaagaagctctttccaggc CRISPR spacer ttaagggcaataaagaagctctttcaggac Protospacer ****. ***************** .*.*
23. spacer 4.5|1939204|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MF417906 (Uncultured Caudovirales phage clone 7F_8, partial genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tgctttccaggtcaccttcaagaatgtaaa CRISPR spacer gagttttcaggtcacctacaagaatgttat Protospacer . ***.********** ********* *
24. spacer 4.5|1939204|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MF417894 (Uncultured Caudovirales phage clone 7AX_4, partial genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tgctttccaggtcaccttcaagaatgtaaa CRISPR spacer gagttttcaggtcacctacaagaatgttat Protospacer . ***.********** ********* *
25. spacer 4.5|1939204|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MF417905 (Uncultured Caudovirales phage clone 8AX_11, partial genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tgctttccaggtcaccttcaagaatgtaaa CRISPR spacer gagttttcaggtcacctacaagaatgttat Protospacer . ***.********** ********* *
26. spacer 4.16|1938967|30|NC_014655|PILER-CR matches to NZ_CP020864 (Paenibacillus sp. Cedars plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ttagagattacttattggaaaggccaaaac CRISPR spacer ttagagattacttatttgaaaatcaagagt Protospacer **************** ****. * *.*..
27. spacer 4.16|1938967|30|NC_014655|PILER-CR matches to NZ_CP032413 (Paenibacillus lautus strain E7593-69 plasmid pAZOPL1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ttagagattacttattggaaaggccaaaac CRISPR spacer ttagagattacttatttgaaaatcaagagt Protospacer **************** ****. * *.*..
28. spacer 4.20|1939834|30|NC_014655|PILER-CR matches to NZ_CP013104 (Paraburkholderia caribensis strain MWAP64 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ggggca----gacggtaaggacgtcgagcatttt CRISPR spacer ----caccgcgacggtaaggaggtcgagcatgtc Protospacer ** *********** ********* *.
29. spacer 3.1|1936704|30|NC_014655|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035512 (Haematobacter massiliensis strain OT1 plasmid pOT1-2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ctttccctcttgcagttcctgaagcaacac CRISPR spacer gcccgcctgttgcagatcctgaagcaacgc Protospacer ... *** ****** ************.*
30. spacer 3.1|1936704|30|NC_014655|CRISPRCasFinder matches to NC_048709 (Vibrio phage YC, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ctttccctcttgcagttcctgaagcaacac CRISPR spacer gaaatcctcatgcagttcctgaagcagctc Protospacer .**** ****************.* *
31. spacer 3.7|1937178|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MG945638 (UNVERIFIED: Microviridae sp. isolate 7092-1602, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
gaagtgcttttgagcagtaatttgcgcgtc CRISPR spacer aattaatgtttgagcaggaatttgcgcgtc Protospacer .* .. ********* ************
32. spacer 4.4|1939125|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP023514 (Enterococcus sp. FDAARGOS_375 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tttgtgatgaaattcccaaattgcaacatg CRISPR spacer aggcgggtgaatttcccaaattgcaacaag Protospacer *.**** **************** *
33. spacer 4.5|1939204|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP024321 (Borrelia miyamotoi strain Yekat-6 plasmid pYkt6-2) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tgctttccaggtcaccttcaagaatgtaaa CRISPR spacer caatttcaagctcaccttcaagaatggtac Protospacer .. **** ** *************** *
34. spacer 4.5|1939204|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP024395 (Borrelia miyamotoi strain Izh-4 plasmid pIzh4-cp30-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tgctttccaggtcaccttcaagaatgtaaa CRISPR spacer caatttcaagctcaccttcaagaatggtac Protospacer .. **** ** *************** *
35. spacer 4.5|1939204|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP024209 (Borrelia miyamotoi strain Izh-5 plasmid pIzh5-2) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tgctttccaggtcaccttcaagaatgtaaa CRISPR spacer caatttcaagctcaccttcaagaatggtac Protospacer .. **** ** *************** *
36. spacer 4.5|1939204|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP024211 (Borrelia miyamotoi strain Izh-5 plasmid pIzh5-4) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tgctttccaggtcaccttcaagaatgtaaa CRISPR spacer caatttcaagctcaccttcaagaatggtac Protospacer .. **** ** *************** *
37. spacer 4.5|1939204|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP024217 (Borrelia miyamotoi strain Izh-5 plasmid pIzh5-9) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tgctttccaggtcaccttcaagaatgtaaa CRISPR spacer caatttcaagctcaccttcaagaatggtac Protospacer .. **** ** *************** *
38. spacer 4.5|1939204|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP024338 (Borrelia miyamotoi strain Yekat-1 plasmid pYkt1-3) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tgctttccaggtcaccttcaagaatgtaaa CRISPR spacer caatttcaagctcaccttcaagaatggtac Protospacer .. **** ** *************** *
39. spacer 4.5|1939204|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP040828 (Borrelia miyamotoi strain Izh-4 plasmid pIzh4-cp30-2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tgctttccaggtcaccttcaagaatgtaaa CRISPR spacer caatttcaagctcaccttcaagaatggtac Protospacer .. **** ** *************** *
40. spacer 4.5|1939204|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP024357 (Borrelia miyamotoi strain Izh-16 plasmid pIzh16-3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tgctttccaggtcaccttcaagaatgtaaa CRISPR spacer caatttcaagctcaccttcaagaatggtac Protospacer .. **** ** *************** *
41. spacer 4.5|1939204|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP024358 (Borrelia miyamotoi strain Izh-16 plasmid pIzh16-4, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tgctttccaggtcaccttcaagaatgtaaa CRISPR spacer caatttcaagctcaccttcaagaatggtac Protospacer .. **** ** *************** *
42. spacer 4.5|1939204|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP024378 (Borrelia miyamotoi strain Izh-14 plasmid pIzh14-3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tgctttccaggtcaccttcaagaatgtaaa CRISPR spacer caatttcaagctcaccttcaagaatggtac Protospacer .. **** ** *************** *
43. spacer 4.16|1938967|30|NC_014655|PILER-CR matches to NZ_CP029455 (Bacillus cereus strain FORC087 plasmid pFORC087.1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ttagagattacttattggaaaggccaaaac CRISPR spacer acgaactttagttattggaaaggcaaaaac Protospacer ...* *** ************* *****
44. spacer 3.1|1936704|30|NC_014655|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048608 (Pseudomonas fluorescens strain DR133 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ctttccctcttgcagttcctgaagcaacac CRISPR spacer gctgccctcttgcagctcctgaagccggcg Protospacer .* ***********.********* .
45. spacer 4.5|1939204|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_002759 (Pseudomonas syringae pv. maculicola str. M6 plasmid pFKN, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tgctttccaggtcaccttcaagaatgtaaa CRISPR spacer atttttccaggtcaccttcaacaatagccc Protospacer .****************** ***.
46. spacer 4.5|1939204|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_004633 (Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 plasmid pDC3000A, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tgctttccaggtcaccttcaagaatgtaaa CRISPR spacer atttttccaggtcaccttcaacaatagccc Protospacer .****************** ***.
47. spacer 4.5|1939204|30|NC_014655|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP034079 (Pseudomonas syringae pv. pisi str. PP1 plasmid pPP1-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tgctttccaggtcaccttcaagaatgtaaa CRISPR spacer atttttccaggtcaccttcaacaatagccc Protospacer .****************** ***.
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
274014 : 303071
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_014655|274014:303071|DBSCAN-SWA 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20 | Feldmannia_irregularis_virus(50.0%) | transposase,integrase | attL 267130:267145|attR 303741:303756 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
331328 : 360759
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_014655|331328:360759|DBSCAN-SWA 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MPCFHRFYDELIPNQNLVEYLFIGTFNPSWNAENENNAEYFYGRETNFFWCICPHAFNRNCLIDKGKPEWLSFCEQNLIGLTDLIKNIENADQENDQHVQLLTNGFQDKNLDLRENGQYIFNIDFNTDDIIKYITSRRNSLKGVFFTRRTDNGIRRIWEQWCQISNHCNELSIYNAVLPTPSLRGGGTLKSTISTWRTEIEKCSQD |
31 | Acinetobacter_phage(50.0%) | transposase,protease,integrase,tRNA | attL 341270:341284|attR 350122:350136 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
512630 : 577926
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_014655|512630:577926|DBSCAN-SWA 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54 | Bacillus_phage(25.0%) | transposase,integrase,tRNA | attL 569613:569631|attR 578994:579012 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
805575 : 863404
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_014655|805575:863404|DBSCAN-SWA ATTAAGTTTCTGAGAAATGAGTTCGATATTGAATCGGGCTCATTTTTTTTAGGTTTGACTTTATTCTTTCATGATTGTAATAGTAAATATAGTTTTTGATTTCCTTTTTTAGTTCTTCAATTGAATTGATTTTTTGGATGTAAAACATTTCAGCTTTTAGTGTTCCAAAGAAATTTTCAATAATGGCATTGTCTAGGCAATTTCCTTTTCTTGACATGCTTTGTACAATTCCCTTTTTCTTAAGCAGAGCTTGGAATTGTTTCATTTGATATTGCCATCCCTGGTCAGAGTGGAACAGTAGTTCGGTACTAGTAGGGATCTTTTTGAATGCCTTTTTGAGCATATCTACCACTTGGTCAAAACTAGGACGTTCACTTAACTGATAACTGATAATTTCTTGATTATAAAGATCCATTATCGGCGACAGATAAAGTTTTTTGTCTCGAACTTTAAATTCTGTGATGTCTGTTACCCATTTCTGATTTGGCCGATCCGCTTTAAAGTTACGTTGTAAAATATGAGGTGCTATTTTACCTTGATCTCCCCGATACGACTGGTATTTCTTCCTTCGAATCAAGCTCTTCAATCCCAATAAACTCATCAACTTTAAAACCGTTTTATGGTTGATGATCCGGCCTAGCTTTCGCAGCTCATCTGTAATCCTTCTGTAGCCATAACGCCCTTTATGCTTATGATAAATGCATTTAATGAGCTCCTTTAGCTCACCGTACTTGTCGCTTTTACTGCAGAGTTGATGATAATAAAAGCTACTTCTAGCCATATGAGAGCAATCTAACAATAACTGTAGATTAAACTCCGGCCTTAATTCTTGTATGGCTTTTGCGATTGTCCGCGGCGTTGTTCCTCCTCGGCTTGAATTAAGGCTCTCAACTTTTTTAGAAAAGCATTCTCACAACGTAAACGTTCGTTTTCTAATTCTAGCTCTTCTAATCTCGTTAAAGGTGCTTTGGGTTTGCGATTCATAGTTATGGGACGGCCTTTGGGTTTGCTTTCTAAACCGTTGACTCCAAAGGTAGCAAAATTCCTTTGCCAAGTGATTATGGTTGAGTCACTTGGAATACGAAATCTCAATCGCGCATCCTTTAAACTTAAATTCTCATTTTCGATAGCCTTTAAAACATTGAGTTTAAAAGATGAACTATAAGTCCGATTGCTCACCTTAGGTTCCAGGCCTTTTAAACCACCTATTTCATACTCTTGTAACCACTTCCGTAAAAGAACTTCCTTAATCCCCACGCTGTCACTTACTCTTACTATTGATTGATGTTTTTCTAAAACATCTTTTACACATCTTAGCTTAAACGCTAGATCATACTTTACTTTCCTGCTCATAAAAATGCCCCCAATTAGTGTCTAACTTTTTGGGGGCACTCTATTCTGACTCTCTTTTCTTATTTTAATTGGGAAGCTAAGATGCCAATTCCTTCTGTAAATGATCTAGGTGAATAACCTAAGTCCTTTATGGGTTTATCTAAAATAAAACCGGTCTTCGGTGGTCGTCTAGCCGTCTGAGTAAATTGGGTGCCATTCACCTCCTGAATCAGGTTTTTGTCCAATCCAAAGTAATCTGCAGTCATGACTGCCATCTGATAAGGATTCAATAGATCTTTTCCAGAGATATTATATATCCCCTGAGCTTTCTTCTCTACCATTAGGATACATCCTGCTGCGAGATCTTCTGCAAGGGTAGGAGTGCGCCATTGATCATTAACCACCTTGATCGTTTTTCCCGCTTCTAGAGAACCTTTAACCCATAGGATGATGTTCGAGCGACTCATATCATGGGCAATCCCATACACCAATACTGTTCTGGCTATGGACCAGTTGAGCGAGCTACTTTGCACCACCTTTTCTGCTGCAAACTTACTCCATCCGTAGAAACTTATAGGATTAGGTTCTGCATCTTCTGCATAAGGGCCTTCTTTTCCGTCAAAGATGAAGTCCGTGGAAACATGCAGGAAATAAGATCCAGTTTTTTCAGCTGCTTTTACTAAGTATTCAGTGGCATGGACATTGAGTTTCCAGCATTCTTCTTTATCTGTTTCACACTGATCAACGTTCGTCATTGCAGCTGTATGTATAATGGCATCCGGTGTTTCTTCTATAATGACGGCATTCACAGCTTCCGGATCAGTGATATCTAAACTTCTATATCTGTATCCATCTGATAGGGGCAAACGGTTTTCCCCTCTTGCTGTAGCAATTATATCTCCTTTACCTGCCAACTGTTGCACTAATTTCTGTCCCAAAAGACCATTGGAACCTGTAATTAATATTTTCATAAGTAAGTGTAGCCGTATTTTTTAGTTATCTTTTTTCTACTCATTTTCTTAGCAGTGATCTTCATCTTCTGATCTTCTACTGGTCGGTTAAATTCATCCGTCTTCACCGCTGCAATTTTATCTAACAGACTAAGGTCACCCACTACCTCCCCAAAAACGGTGTAATTCTTATCCAAGTGAGGAGTACCTCCAATGGTTTTGTAGGTTTCTCTCTGGGATGGAGTGTATTTCAATTGATTTCTTGTTTCAAATTTGTCCAGATCTTCGTCATTGAATTTCTTCCCTTGCACTATGTAAAACTGGCAAGCGCTGGATTTCTTTTCGGGATTATTGTCTCTGGCAGCCGCAATGACTCCTTTTTTGTGGAATCTTTCCGGATGATATTCAAAAGGTATCCTTTCCAGGTGATCTCCACCATTTCCTAATCTATCTCCGGGTTTAGCTTTTTTTGAATTGGGATCTCCTCCCTGAATCATAAAGTCCTTGATGACTCTATGAAAGAGTAGTCCATGGTAGAATTTTTTAGATACTAATGATGCAAAATTCTTCTTATGCAAAGGAGTTTCATCATAGAGGACGAAGCGTATCTTATCCTTACCTGAGGTTAGGGTATAAACCTTATCCCTTTTTTGAGCAAAGGCCGATATAGGAAGGATGGCTAATAGGAAGAGTATCTTTTTCATGCTCTGATTTGTTTCAATATTTCTGCACCTCCATTTTGTAGGACTTGTTCGGCGGCATGCTGACCTAAAAGAATAGGATCTGTTCCTCTGAATTCCATAGATACTTCTTCAGTTCCTTCTAGGTTAGTGATTCCTCCTTTGAAGAGGATTTCTTCCCCCTCCAAAGTAGCGTGTCCGAACACTGGAATAGAACAACCTCCATTCATTTCTTTTAAGAATGCTCGCTCGGCTTGTAAACATTTATACGTATTTTCATCGTTACAAGTGTTTTTTACGAAGGTCTTAATGTTCTCATCTAAGTTTTTTGCGATCTCTACTGTAACGGTGCCCTGTCCTACCGGAGGGATAAATTGATCCAAGGGAAACCTATGGACAATCAGTTCATCATATTCCATACGATGTACTCCGGCATAAGCTAGGGCCAAACCATCGCATTGACCGGAACGCATTTTTTGAATGCGGGTTTGCAGGTTTCCTCTCATATTCACTAATTTGATATGAGGATAATGCTTCTTAAAGAAAGCAATTCTACGTACAGATGAGGTCCCTATGGTGATAGGTGCGCTTAAATCCAAAGCCCGGTCAGCCACAAGTACATCTCCAGGGTATTCCCTTTCTGTAAATGCAATCAATTCAAAATCTTCTGCCAAACTACTCTGCATGTCTTTAGCGGAGTGTACAGCTATATGAATCTCACCATTCAGGAGTTTTTCTTCCAATTCTTCTGTGAATACACCTTTACTGCCAATTTTGGATAGGGCTACATCCAATACTTTGTCGCCTTTGGTTTCCATCCCCACTATCTCTGTTTCTGCTCCTGCAGCTTCCAGCCGACTTTTAATATAATTAGCCTGCCACATGGCTAATAGACTTACCCTCGTACCTATCCTTATTTTCATAATTTCATAAAATAATACGATCCAATAAATCCGGTAACGAATCCCCATATTGCACCTAGGAAGATTTGTCTACGGTTATGTGCACCTAAATATAGTCGGGCGCTTCCTAAAACCCCAACCAGAATTAGTGCACTTAAAATAACAGGAATCAGATTAGGATCCCCATATCTATAGTAAATGCCAAAGAAAATGCCCACAATGCCTCCTAATCCCGAGGTATGGGCTGATATTTTATCAAAGAAGTTAAATAGAAACAGTCCCAAAATATTCACACCCATGGCGGTGAATAGGACCGCAGTAGGCATAAAGACGCTGCCTTTTTCATTCAAAAAATAGGCCGTAGCGAAGTAAAATCCGGAGGTGAAGAGGTAAACTCTGGGTCTTTCTCTTCTATTATTCAAGGTATAATCTGAAATGAATTTCAGTTTATACTGGAGAAATACAAACAAGAGTGGGATAATGACGGTATACGTAAAGATCAGGAGAAATAAGGCCAGGAAGAGTCGATCTCCCATAAAAAGGTAAAACACGGGAAGAGGGGCCCATACCTTCAAGGCTATAACCAAATAGCAAGGTATAAATACCGGATGTAGGATATAGGAGAGGGCTTTTGATATTCTTTCTGACACTTTCAAATTTGTTTTCTTAATCGGGCTACCGGGATGCCCAGTTGTTCTCTGTATTTAGCTACGGTTCTTCGGGCTATGTTATAGCCTTTTGCTTTTAGTAATTTCTCTAATTTATCATCAGAGTGTGGAGCACTTTTTTCCTCTTCATCTATAAGTGCTTTCAGGGTGTTTTTAACCTCTCTGCTTGAGGCATCTTCCCCTGATTCTGTAGAAATACCTTCGGAAAAGAAATATTTTAGGGGATAAATCCCGAAATCTGTTTGTACAGATTTGCTATTGGCTACTCTTGAGACGGTTGAAATGTCCATGTCTATTTTGTCAGCAATATCCTTCAAGATCATGGGTTTTAGTTTACTTTCATCACCTTCTACGAAGAAGTTGAATTGGAAATCCACTATAGCCTCCATGGTTTTCAGTAGGGTTTGCTGTCTTTGCTTTATGGCATCTATAAACCATTTGGCAGCATCTAATTTTTGCTTGACAAAG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77 | Leptospira_phage(26.67%) | transposase,integrase,tRNA | attL 845309:845328|attR 860936:860955 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
981472 : 1037567
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_014655|981472:1037567|DBSCAN-SWA 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60 | Leptospira_phage(33.33%) | transposase,integrase,tRNA | attL 1002896:1002921|attR 1025696:1025721 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1056714 : 1106366
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_014655|1056714:1106366|DBSCAN-SWA 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53 | uncultured_marine_virus(16.67%) | transposase,protease,integrase,tRNA | attL 1078113:1078128|attR 1094605:1094620 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1124996 : 1160741
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_014655|1124996:1160741|DBSCAN-SWA 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32 | Leptospira_phage(22.22%) | transposase,integrase,tRNA | attL 1121559:1121573|attR 1144245:1144259 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2213964 : 2223938
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_014655|2213964:2223938|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_014655|2213964:2223938|2215998_2216817_+|WP_013408814.1|DBSCAN-SWA MGKIISIVNQKGGVGKTTTAINLSASLAVLDYKILLIDTDPQANAGSGIGVDSKEQKHNIYTALVGQSPIKDCIVKTQIPNLDLISSHIDLAGFELEIVNQVAREYILKEIIGEVKDDYDFIFIDCSPSLGLMVINSIVASDSVLIPVQCEYFALEGIAKLQNTIEIIRKRLNPELAMEGYVLTMYDGRTNLSKMVVDDVRKHFGTLCFSTLVPRNVKLAEAPSYGVPALLMFSEDGEFDISYLENKGAKSYIDLAKELLRRNSLPEIKNGE >NC_014655|2213964:2223938|2213964_2215848_-|WP_013408813.1|DBSCAN-SWA MIPQDTVNQILQAADIGEVVGEFVTLKRRGANLIACCPFHNEKTPSFSVSPAKGIYKCFGCGKGGDSVRFVMDLEGLSYPDALKWLAKKYNIEIKEKEFTDSELAAQNERESLFIVSEFANNFFRDYLLNSSEGQSVGASYFIERGFSKPVMERFHLGFAPDGRDLFYKTATQAGFSQEVLEKAGLVSKKDDNTYLDRFRGRVVFPIHNVAGKTIAFGARILKTDAKAPKYINSPETEIYHKSKIVYGIYQAKNAIRQKENCFLVEGYTDVISLHQAGIENVVASSGTSLTVEQIRLIGRFTDNITVLYDGDSAGIKASLRGIDLILEEGLNVKAVVFPEGDDPDSYIRKVGGEAFTRYVEQNQKDFIRFKTEISLEDVGQDAVKKAELVESLVLSITKVPNPVKRQIFYQEVAKLLNIDEAILINEGNKKTVTNLKPVAKQDGGQVAPKRNIEMEILSQEDHPEEEALVRDLVLYGQVQISEAHVLADYIFSETEADIVQDPVLNAIYRQYYEFYSRGEAPTTRYFISHPDHRIQEKVIQWETPKHELSQHWKKYEIFIPEYQDNLGENITRINFRIALLKIKKEINQVIEELNFVDEEKEVILLEHLKEKLAERKEIAEFLGSVL >NC_014655|2213964:2223938|2220009_2220984_+|WP_013408817.1|DBSCAN-SWA MSIFDKRINYKPFEYPEILTFTSAINKAYWVHSEVDFTADTQDFHSHLSPAERSAVKNSLLAIAQIEVAVKTFWGNLYDHFPKPEFNGLGTTFAECEFRHSEAYSRLLEVLGYNNEFQKLLEIPVIKQRVEYLGGVLKDTRSEDRKKYVISLILFTILIENVSLFSQFAIILSFTRFKGYMKNVSNIIAWTSVDEQIHANGGIYIVNTIRDEFPDFFDPETITQIEDTVRESIEVEERILDWIFSEGEIEIIKKKDLLNFMKFRIDDSMKKIGFSPLFHVSSADYQPIAWFEEEVFANSLDDFFAKRPVDYTKHDKSITADDLF >NC_014655|2213964:2223938|2220989_2222663_+|WP_013408818.1|DBSCAN-SWA MELFIAEGEAQRLWWKNSESEQILNRGYLLNGETVEGAIHRICSAAAKRLYKPELTEAFKEMIERGWMSLSSPIWANMGTERGLPISCFNVHVPDSIESITHKLGEVIMQTKTGGGTSGYFGDLRGRGSAVTDNGKSSGAVSFMKLFDTAMDTISQGGVRRGAFAAYLDIDHPDCEEFLQIKNIGNPIQNLFFAVCVPDYWMQEMIDGDMEKRQLWAKVLESRQQKGLPYIFFTDNVNRNKPQVYKDHNMRINASNLCSEIMLPSSADESFICCLSSMNLELYDEWKDTKAVKLAIFFLDAVLQEFIAKTEDNYYLAAANRFAKRHRALGLGVLGWHSLLQKRMLPFEGMEAKQLTSEIFRHMKTEADKATEELAMIYGEPELLKGYGRRNTTTMAIAPTTSSSAILGQTSPGIEPFSSNYFKAGLAKGNFMRKNKYLKALLEEKGIDNEETWRSIMLNNGSVQHLKELNEYEKSVFKTFKEISQLEIIQQASIRQKYVDQGQSLNINIPAELPIKDVNRLIIEAWKLGIKSLYYQRSQSVSKELVTNLVSCSSCES >NC_014655|2213964:2223938|2216806_2217661_+|WP_013408815.1|DBSCAN-SWA MENKGKGLNSLLGDSDLVVKRKVAAFVGVKEVEVDRIVVGSSQPRKSFDESALRELADSIKLQGLIQPITVRETSEGKLEIISGERRFRASKLAGLTRIPAYIREVDDQRSLEMALIENIQRENLNPIEIALSYRRMMEELGFRQEDLGQRVGKSRSNITNFLRLLQLPTEIQTGLVLGVVTVGQVRPLIPVNDPSLQMDIYQKILEDNLSAREVEALVKRGNAFEAQANELEMHREDMRIEEMTLKGKTKVPIKIKVQDINKGQVTIRFSNADDLEKILQKLK >NC_014655|2213964:2223938|2217780_2219730_+|WP_013408816.1|DBSCAN-SWA MSENNKQDYSASNIQVLEGLEAVRKRPAMYIGDIGIKGLHHLIWEVVDNSIDEAMAGYCNRIETTINTDNSITVKDNGRGIPTGWHEKEQKSALEVVLTVLHAGGKFDKDTYKVSGGLHGVGVSCVNALSTHLRAEVHRDGKITEQEFSIGKPLYPAREIGTTDYRGTIIHFKPDDSIFQVTEYKYETVANRLRELSFLNKGITLTLTDLRELDEEGKPKYEEFHSEGGLIEFVEYLDKSRERLITTPMYMEGQRDGVPVEVSMTYNTSYSENVSSFVNNINTPEGGTHVSGFRMALTRTLKSYAEKSGLLAKEKIEISGDDFREGLTAVISVKVAEPQFEGQTKSKLGNSEVTAAVSGCVQEMLENYLEENPKDAKIIVDKVILAARARIAAKKAREMVQRKNVLVGSGLPGKLADCSEHDPALCEVYLVEGDSAGGSAKQGRDRNFQAILPLRGKILNVEKAQEYKIYENEEIKNIFTALGVQIGKEGDERALNLEKLRYHKIIIMTDADIDGSHIRTLILTFFYRFMREIIENGYLYIAQPPLYLVKKGKDEIYAWTEEQRYAAVKKLAGGGKEENVGVQRYKGLGEMNPEQLWETTMNPQHRTLKQVTIESAAEADMLFSMLMGDDVPPRRDFIEKNARYANVDA >NC_014655|2213964:2223938|2222675_2223938_-|WP_013408819.1|DBSCAN-SWA MKKIFTVLFLLWGQLAIAQVDTNRYEVPGRKNIDPDKPYVILISLDGFRPDYIERHGAENLKRLAEKGVFSKGMVPSYPTNTFPNHFSIVTGMYPSNHGLVDNFFYDAKRDQSYSMYTASTVRDSSWYGGLPLWSLAERNGVVSMSLFWVASESRTNGIPPTYYYHYHNEFSNDRKIEIVKEMLSLPDDVRPHLITMYFPEVDSQGHYYGPFSKETKEAVKNVDGAIQKLCEEVDKLGLKNVNYVLVSDHGMAEADVDHLIPIPEMVRNRKYVVMNSFSMARIHVLNKDQIKSTYKALKKEKNPNYKVVLTKRMPKRLHFRTNEDGRLGDIILLPYPPKAFASNPPSPRKYPGIHGYDVKWAPEMHATFMAWGPAFKQNYSIGSFENVHVYPLIADILGLKYDHKIDGKKKVLEKIKAGN |
7 | uncultured_virus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2397992 : 2430914
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_014655|2397992:2430914|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_014655|2397992:2430914|2403042_2405109_-|WP_013408943.1|DBSCAN-SWA MASSITGQGIAAPVAKKVPFPIETHGHTRVDEYYWLNQREDEEVLSYLRAENEYLEQVMSPLKELREELFEEMKGRIKEDDESVPYKEGSYMYFTKFVKGGEYPVYCRKKVGTEVEEILLDGNALAEGHSYFHVGGMEISDDEQLLLFAVDTVGRRNYTAKVKNLVTGEILSDEIPETEGGNYAWAADSKTFYYVKKDQQTLLGNRVYRHQLGNQEDELVYEEKDNQYYMGIFRMKSKKYIAIGSEHIGVASEFQLLRADDPQAKPVTFLPRGNRHEYSIEHFEDKFYIRTNLNGAENFALMQVKEEKHADIAAWEMVIPSREEVFFEGLELFKEFMVVQERKEGLIQMRIIHHRTGEEHYVDFGEPAYTAFISINPEFDTTVLRYGYTSMTTPRSTYDYHMDTREKVLLKEQEVLGGFDKEDYVSERIFVTARDGAKVPVSIVYKKDTPLNGTSPLLQYAYGSYGATMDASFSPSRLSLLNRGFVYAIAHIRGGLEMGRQWYEQGRMMQKKNTFYDFIDCSKALVALGYAAKDKVFAMGGSAGGLLMGAVMNLAPEVYKGVVAAVPFVDVVTTMLDESIPLTTGEFEEWGNPKNEDSYWYMLSYSPYDNVEEKAYPNTLVTTGLHDSQVQYWEPAKWVAKLRDKKTDDNLLLLFTDMSAGHGGASGRFEALKTLALEYAFVVDLAKK >NC_014655|2397992:2430914|2400545_2400995_-|WP_041823627.1|DBSCAN-SWA 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33 | Cafeteria_roenbergensis_virus(16.67%) | transposase,integrase,tail | attL 2415221:2415235|attR 2429748:2429762 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
2636663 : 2646913
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_014655|2636663:2646913|DBSCAN-SWA ATTAATCCTGGAAACTCCCAACGATACCGTTGGCTATAGACAATAAAAAACTAAAAATTAAAGCCGTAAAGAAGCCATGAATCTCAAATCCATCCACCAGGTAGCTACAGATATACACTACGGCTACAGAGAGTACCAATGAGAATAATCCCAAGGTTAGGATAGTGATGGGAAAAGAAATGATGTGCAGGATAGGCTTTACAAAAGTGTTCAGGATGCTCATCACCAGTGCCACGATCACACCGGTAGTAAGTGTATCTACACTCATTCCCGAAAGTAATTTAGGCATAAGGTAAATAAGGGCTCCTGTGAGTACGAGGCGTATGGCGTAATTGATCATTTTTTATGTCTTTTAATGAGTACGTCTATTACTTCGTCTAAGTTGATCTCCTTTGCTTCTAGCAATACCAGGTAATGGAAAAGGAGGTCTGCAGCTTCACCAAGGAAAAGGTCCTTGTTGTCATCTTTCGCTTCAATGACTAGCTCTACCGCTTCCTCTCCTACCTTTTGGGCAACCTTATTGATGCCTTTGGCAAAGAGGGAGGCCGTATAGGAAGAATCACTTGGATGCTGCTTGCGATCATGTATGATTTCACGAAGGTAACGAATAAATGCTACCTTTCCTGTATTGTGCTCTCCCCAGCAGGTATCGTCTCCGGTATGGCATACAGGACCTACGGGTTCAGCTTGGATGAGGATAGTATCTCCATCACAATCCACGGCGTGGCTAATGTAGTTCAAATAGTTTTGGGAGCTCTCTCCCTTTGTCCACAGTCGATTCTTAGAACGGCTGAAAAAAGTTACCTTACCTGAGCTTAAAGTATGCTGGAGGGCTTCTTCATTCATATAGCCTACCATAAGTACCTTAGCTGTAAGGTGATCCTGTATCACGGCCGGGATCAGCCCTTTCGAAAAATCCACTTCTCTTTCCATAATTGAATACAATATTAGGGATTCGAGTGAAGATTTTTACAAAATTTTTGCTCAAAATTTTGACATTAAAAAATCTGCTTATATCTTTGCACCCACATTCGACGAGGGAGTTTTCCTAAAGAGAATAAGCGGAAGTAGCTCAGTTGGTAGAGCGTAACCTTGCCAAGGTTAAGGTCGCGGGTTCGAGACCCGTCTTCCGCTCGACAGACAGAAGTTCCTATGCATATGGGAGCTTTTTTTGTCTCAAGGGCCGGGGTGGTGGAACTGGTAGACACGCAGGACTTAAAATCCTGTGAGGCTTATCCCTCGTACGGGTTCGATTCCCGTCCCCGGTACTGAAAATCAAAGAGTTACAAAGCGATTTGTAGCTCTTTTTTTATGGGAGAAATGCTGTGTCGTGCATATGTCGTGCATTTTTCAAAGATCTATCATTCCAAATTATCATCATCTGAAACAATCAGGTAGTATCGGGTGTGCCTTAGCTTGCCGACCTTTTTCAACGCCCCCAAATCCACCATTTCTGACAAATCTCTGCTGGCCGTTGCCCTCGATGTTTTTGTGATGCGGATGTAGTTATCCGCACTCAGGCCGCCTTTGAATCCGTCTACTCCTTCCCTGAATATCCGCAACGCCACTTTTGCCTGACGCTCATTTAACCGTTCGCTGTATTTCTCAAAGAAGCGCGCCTTATCGATAATAAAATCTATCGTTTTTTGAACATATTGCTGAGCTTCAAGAATCTTTTCAGAAAAATAGAGAAGCCACTCCGTTATATCCGATACTGTATTTGCTCTTTCCAAGGCCTGATAATAAGCTTTCTTGTCCCGCTCTATTGTACCGGACAAAGACGTAATTAGCGATTGCCTTGCCCCTATGGCCAATGCTTTTTCTGCGATACTCCGTCCAATACGTCCATTACCATCTTCAAAAGGGTGTATTAACTCAAAATACAGGTGAGCCATACCCGCATGAATAATCGTCGGCATACCATCGTCTATCGCTTTATTGAACCATGCTATATACCGTTTCATCTCATCGGGTACGCGGGAAGATGGCGGTGCCTCATAGAAGACTTTCGGCGTGTCCAGCCTGCCGGAAACAATCTGCATCGGGTCTGTAAGGATACGATAGCCTCCTGTCACCTCCAAATCCGTCCGCCCATTCATAATCATTTTATGCCATGAAAAAAGACGTTCTTCCGTAAGAGGCTCATTATAGCTCTTGTACAAGTCAACCATCATTTGGGAAACACCTGTTTCCTGCGGCTTTGCTCTTCTGCCGTCCGTTTGCAACCCCAAATGCTTTCGCACCGATGACTGAACGGAATCTCTGTCTAAAATTTCACCCTCAATTTTTGAGGTATCGACGGCCTCATTGCTCAGCAATGTCACCCGTAACTCATCCCTTTCACCAAGAGATACACCTCTTAGCGACCCGATAATCAGGCCTGCATTTCGATGAAATTCTCTTTCAAAATTGGTGAATCTGGCCGCGTCAAACCTGAATTCCGGCCAGCTCTCTTGTTCCCAAATCCACTTCATGAGGTATAGCTCCGTTTTCTATAGCTCAATAATACAACAAAATATGAGTTATAGGAAGTGTTTTTATAACTCATATCTATTTTAATGATTCATACCGAAAAAATACCCATTGCAAAAATGCTTTGTTCATTATGATTAATTTCCTAATTATTGGTAATAAACCCCTATAAATTATGCAAGTCATCTGCCTTGAAGAAGACGCCTTCACAAGCGGATGGCCGACAGGCTGGTCCGTCCGACACACGAAGTCGTCGTTTGAGGTGGTCGGGGTTCCGCATGAGGTGATTGACCATTTTACCAAGCGGACAAATGAAATCGGACAGATTGCCGAGGAAAAAGGCATTACCGATGCCAAGGCCTTAGATACTTTGGGTGCGCGTACCCGCACCAGCAAGGAAAAGGGCTTGGGCATGGAAGAATTGTGCCAAGACTGGAAACGGCAGATACGGGAATTGGAAAAGAGCGGTGGCATTGCAGACCGGCTGGAATACAACGCGCCATTACGTGACAAGGGGCGACACAAAGGCATCACGAAAACCGGTATGACAGCAGAGCATTGCATTGACCACGGATCAAGTGAAATTCTTGGGGGGAGATGAATTTTATAGTTTCTTTGCAAGAAAAAACTAGAAGAAATTGAGTGCGCAGGAGGATTTATTGAAGTTATAGTTACCCAAAGAAATGGTTGAATATTTTGACTTGACCAAAGTTGAGGAAGTAGAGGGGACGCTCAATTTTCATTTGAAAGAGCTCAATCTAGCTCCTACTGGATATTTGGCAGAGCAATTAGAATCTAAAGGTTTTCTTCCTGAAATACGGGTTCAAGATTTCCCCATTCGCGGCAAAAAAGTCTATTATCATACACTTAGACAAAGATGGCGCGTAATATCGAGTGGTGAGATGATTAGCAGAGATTGGGCTTTGGTTGCAAAGGGATCGGGGACGCCTAGTTACGAATGACACAAGAATTTGGGTTGTTCTTAAAAAAAATATTTGGACCACAATCCGGTAAGTAGTCATCAATTAGGCCATTTCTTTCCTGTTGATGGAAAACAATTGGGCCAGCAATACAAAGATCATTTTAGCGATTACCACGATTGGGATCAGAAGGAACACGCTCAAGAGTGGATGTTGTTTGTAGACCATATTGGCGAGCGCTTAAGTATTGATGAAACCGCGCTATCCCATGGTGAACTCTATACCATCGTTACCAATAAGGCTGCAGCGGCGCGAAAAGGGGCTTTAGTAGCCATGATTAAAGGTACCCGAGCAGAAGATATTATTACGGTAATGCAAAAGATTCCGTGGCATCTTCGCAAAAAGGTAAAGGAGGTAACTTTAGACATGGCGGCTAACATGATAAAGGCCGTCAAACTCAGTTTCCCCCATGCATCTAGGGTAATAGACCGCTTCCACGTGCAAAAACTAGCTTTCGATGCAGTTCAAGAATTACGCATAAATTACCGATCGGAGCCTATAGATCAGGAGAATGAAGCCATTGCAAAAGCGAAACTGAACAAGGAAACATACGAGCCGGAGATTTTTTCAAATGGAGATACATTAAAGCAAGTATTAGCACGTAGCAGATTTTTACTATTTAAACACCAGAGTAAATGGACATTATCCCAACTTGAACGAGCGACTTTCCTGTTTGAACGGTACCCAAAACTAGATCAAGCCTATAAATTATCTGTTCAATTGGCTAATATTTTTACCTACAGCCGTGCAAAAGAAGATGCTTTTAAGAAACTAGGCATATGGTATCAGCAAGTAGAAAAAAGTGGCATAGAAGCATTTAACACAGTCTGCAAATCTGTACAAAACCACTATTTACACATATTAAACTACTTCAATAACAGAAGTACAAATGCATCGGCCGAGTCTTTTAATCGCAGCGGCGAACCGTGCAAAGATTAAGGCCTTCCGAGCCTCATCCAGGGGCGTAAGAGACATCACATTCTTTTTCTACAGACTCAAAAATATCTATGCTTAGACAAATCTCCCCCCACGTTTTCGGCTTGATCCGGATTGTCCGATTAATAAGAGATACATCAACATAATATATCTTGCCTCTTTTTAGAAGGTACTAAGATGGGGGAGCTTACAACAGCACTATTAATGTTATGTACATTTACAACGTATGCAAATAAGTTTTGGGGTTCTGAAGAAACCTACCTCTTTACTGCCCAAGGTGCATCAAATATTGAAAATAATTCATACGGATCTAATGGTAAGTGTGTGGCATATTATCGAGTTGTAAAATATGTATTTTGGATTGAAGTCGATAGTTATAATATTGAAAAAGAAGTTGACTGCTACGTAATAACTTCCTAATTTTAATTTTGGAATTTATTATAATATTGGTCGCAATAAAATGATCAAAATTTATATATTTTTATTCACACATCTTAGTGCGATGGCATTTTGTCAGCGCACTAATAATTTTATTGGAAAAGTTGTTGATGAGGACAACTACGGTATTCCGTTTGTTACTATTTTCATAAATTCGAAATATATTAATAGCGA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AAAAAGGTATAACTCAGGAATTTACAAAACCGGCAACACCTCAACAGAATGGACATATAGAAGCCTACCATTCAATTCTGGAAAGTGCTGTATGTCAACGATTTGAATTTGAAAGCCTACAAGAATTTAAACAAGTAATGATAAGATGGAAAAAATTCTATAATTTCGAAAGAATACATGGCGGTCTTCACTATAAGTCCCCTAGAAAATTCCTCGAATCAATTGGTGTAAAAATTGATCCGAATTGGTGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_014655|2636663:2646913|2636663_2637002_-|WP_013409109.1|holin|DBSCAN-SWA MINYAIRLVLTGALIYLMPKLLSGMSVDTLTTGVIVALVMSILNTFVKPILHIISFPITILTLGLFSLVLSVAVVYICSYLVDGFEIHGFFTALIFSFLLSIANGIVGSFQD >NC_014655|2636663:2646913|2643528_2644143_+|WP_148225816.1|integrase,transposase|DBSCAN-SWA MNYIVNEYGMSIQKACKIMDLSRSVYYYSSVKDDTEVRGKLLGLAENHPKEGQDKMYQRIRNQGLKWNYKRVRRVYLLWGLNLRQKTRKRLPARVKVPLIQPEGINHTWSMDFMHDVLGNGRKIRILNIIDDYNREALAVEAHFSIQSNRVVQSLEDLIAYRGKPTQIRVDNGPEFIANVLADWCRENDIRLLYIQPGKPFQNG >NC_014655|2636663:2646913|2646019_2646913_+|WP_083794525.1|integrase,transposase|DBSCAN-SWA MQVVDEFLEQGRPKYLVLKHVDLPRSSYYYISTGTKPGKRASGYVYDMENNRFDMDYILQETKTLLEGEFVDYGYYKTYRYLNQEKGLRIGAYRTYKLMKENNLLKFQRSNTKRISRNWVKELVPIVQREFAFLEFDIKYVYIQGKRTNAQVLTILDVFSRWQLGQYIANSIKSEDVINLFEQILQTYPMPKQFIVRNDNGSQFEALIVQEYLKQKGITQEFTKPATPQQNGHIEAYHSILESAVCQRFEFESLQEFKQVMIRWKKFYNFERIHGGLHYKSPRKFLESIGVKIDPNW >NC_014655|2636663:2646913|2645160_2645574_+|WP_013409118.1|DBSCAN-SWA MSIEKFSLTRISGVLTLFLLFSACDRDIPIHDTEECISRVIVGEKCGVLGFKPDKKGALGARVWEKKINDQQDLIRIENVIGVIGLPIEYKENERFFLKLRNATEEEQLSIACYLDLPGPPTPIYIVINQNSFNCPN >NC_014655|2636663:2646913|2644185_2644389_+|WP_187287890.1|transposase|DBSCAN-SWA MFENIHQVRILAEEFMKDYNTQRPHESLGGFTLEKFKNLSTSFPAGGASSPCWKNNKSISLFNYTMS >NC_014655|2636663:2646913|2636998_2637595_-|WP_013409110.1|DBSCAN-SWA MEREVDFSKGLIPAVIQDHLTAKVLMVGYMNEEALQHTLSSGKVTFFSRSKNRLWTKGESSQNYLNYISHAVDCDGDTILIQAEPVGPVCHTGDDTCWGEHNTGKVAFIRYLREIIHDRKQHPSDSSYTASLFAKGINKVAQKVGEEAVELVIEAKDDNKDLFLGEAADLLFHYLVLLEAKEINLDEVIDVLIKRHKK >NC_014655|2636663:2646913|2638023_2639136_-|WP_013409111.1|DBSCAN-SWA MKWIWEQESWPEFRFDAARFTNFEREFHRNAGLIIGSLRGVSLGERDELRVTLLSNEAVDTSKIEGEILDRDSVQSSVRKHLGLQTDGRRAKPQETGVSQMMVDLYKSYNEPLTEERLFSWHKMIMNGRTDLEVTGGYRILTDPMQIVSGRLDTPKVFYEAPPSSRVPDEMKRYIAWFNKAIDDGMPTIIHAGMAHLYFELIHPFEDGNGRIGRSIAEKALAIGARQSLITSLSGTIERDKKAYYQALERANTVSDITEWLLYFSEKILEAQQYVQKTIDFIIDKARFFEKYSERLNERQAKVALRIFREGVDGFKGGLSADNYIRITKTSRATASRDLSEMVDLGALKKVGKLRHTRYYLIVSDDDNLE >NC_014655|2636663:2646913|2644636_2645086_+|WP_013409117.1|DBSCAN-SWA MKKLNILDHYLKGILIISISAVFIKCDSTDLVEPISGDKCYEGEAIHAFCPSFLVVNVRNGNIGQKWTFNGKRYNNALLIKNAGRSDASTDTNSITPSSKVYFQVDVDATNNNENCQIIAPCLQWAEERSSPAKSVCVKFISNQKCNSI >NC_014655|2636663:2646913|2642337_2643138_+|WP_041823661.1|DBSCAN-SWA MKKLISLVLFSFSIASAQQIAYTVKDQEGKPLPYVSIQVNDRYGILTDNAGKFTLYNYEKPQHLLFEKVGFSSLNITHDKLNQVVVLEKLPEKALTPLIQGTKVLNLGYSKKQKLIKDIRFRANYNYEAGITLPYETRYKSMLLAKVRLMVYFPEKTSFPLRLNVYSLDSKGAPARNLLHKEIIFQAPNTKQWTEISLEEQGIPFPESGVALTVELLNPQMSRVRNSRPIFAGFEHPFVFRYELVEGWIAGKGETYAMELEVKGKL >NC_014655|2636663:2646913|2643238_2643505_+|WP_013409116.1|transposase|DBSCAN-SWA MKKSKHSEHQIVKVLGEYENGPKVEDICRELNIHKATFHNWKKKYSGMSGTDLAELKSLQQENARLKKMYADLALDHAVLKDVLSKKF >NC_014655|2636663:2646913|2641227_2641470_+|WP_013409113.1|DBSCAN-SWA MGELTTALLMLCTFTTYANKFWGSEETYLFTAQGASNIENNSYGSNGKCVAYYRVVKYVFWIEVDSYNIEKEVDCYVITS >NC_014655|2636663:2646913|2641510_2642341_+|WP_013409114.1|DBSCAN-SWA MIKIYIFLFTHLSAMAFCQRTNNFIGKVVDEDNYGIPFVTIFINSKYINSDENGIFKISDLLESDSLTFNSTGFQQIKISATDFLKTNKIVLKRKLIHLAELKIINKSSKWIGYTNELDQITTYNFLTLQSSETGIIIGNKEKNRGIIKSIKVKVGFIGKPKLPYRIHLYSLQKNGIPENELLQREIVFKPRSKKLKWYTFNIEEQNIELPETGLAATIEFINPSTKNYILSKNFTPIRQGFFSRDFQVISRHSNSNGWYLENSSLPMISLEVLLQ >NC_014655|2636663:2646913|2645708_2646017_+|WP_013409119.1|transposase|DBSCAN-SWA MSKHRKTWSLEEKEKIVLHSIQHGVSSSSREFGVSTVSIYNWKEKFEKLGKSGLEAGAMTDAERELKQLRRENEALKRIVAEKELAIQIKDSLLKKSQSLKK |
13 | Brochothrix_phage(50.0%) | transposase,integrase,holin | attL 2637876:2637931|attR 2655437:2655492 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
2658581 : 2686930
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NC_014655|2658581:2686930|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >NC_014655|2658581:2686930|2662645_2669344_+|WP_013409136.1|DBSCAN-SWA 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MVYKKNLYGLNGGESNFDPWGVRLNGTEVVNGFQNRWELQGKEKEMTFGLNRVNFGARVYNPTIGRFDRVDPLAEKFYPHSPFNFSLNNPVNFIDPDGREAISINGSWKYTGEDAVAAFQQLQMMGNGGGDDKDKNKNKHQTQSLPIGDIGTGLGVVGEGLWFLGENKSANLYKEGFRRGIDGNYQLTGHNFSLFGNQAMTEATKPVTELDKVAKFGKFASSLGTVLSVTSSLVDIAAYSKGTLSGTRLSYRAVGTGGSIAAAAYLGGPYGATLGLGFTGLEKAYDWTEPARKEIVNSYGQFKRTLTSSWLKFK |
24 | Bacillus_phage(100.0%) | transposase,integrase | attL 2657988:2658047|attR 2686968:2687495 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
3001644 : 3054160
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NC_014655|3001644:3054160|DBSCAN-SWA 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42 | Leptospira_phage(16.67%) | transposase,integrase,holin,protease,tRNA | attL 3023867:3023883|attR 3058812:3058828 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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