Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_017546 | Listeria monocytogenes FSL R2-561, complete sequence | 4 crisprs | DinG,cas3,WYL,casR,DEDDh,csa3 | 0 | 1 | 6 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_017546_1 | 210230-210381 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NC_017546_1
|
1 spacers
spacers of NC_017546_1
>1.1|210277|58|NC_017546|CRISPRCasFinder ATTCGAATTTCCACCACCACCTACGGATGAAGAGTTAAGACTTGCTTTGCCAGAGACG |
cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017546_1
The CRISPR arrays of NC_017546_1 >merge|NC_017546|1|210230-210381|CRISPRCasFinder CCAATGCTTCTTGGTTTTAATGCTCCTGCTACATCAGAACCGAGCTCATTCGAATTTCCACCACCACCTACGGATGAAGAGTTAAGACTTGCTTTGCCAGAGACGCCAATGCTTCTTGGTTTTAATGCTCCTGCTACATCGGAACCGAGCTC >NC_017546|1|1|210230-210381|CRISPRCasFinder CCAATGCTTCTTGGTTTTAATGCTCCTGCTACATCAGAACCGAGCTC ATTCGAATTTCCACCACCACCTACGGATGAAGAGTTAAGACTTGCTTTGCCAGAGACG CCAATGCTTCTTGGTTTTAATGCTCCTGCTACATCGGAACCGAGCTC
>NC_017546.1|WP_010989373.1|207655_209188_+|zinc-metalloproteinase-Mpl MKSKLICIIMVIAFQAHFTMTVKADSVGEEKLQNNTQAKKTPADLKALPDSCEAKDFYKNFKILDMTKDKLGVTHYTLALSSGGYLTDNDEIKVHVTPDNKITFINGDLQQGQLRITNQIKITEKNAIEKAFEAIGQSEAHVKSYVGNPVKEKEIILNSRTKRLVYNIKLIFAEPEVASWIVQVDVETGAILKKQNMLSEVERADTHKDFQALGKGANRLLQRPLHVMKINDLFYLVDRTHKGLIRTFDLKHNTDTSFGKVVSNKTNMFTDPEFSSAVDAHFYASEVYEYYKNVHQLESLDGKGGEIDSFVHYGLNCNNAFWDGQEILYGDGDKKNFKPFSCAKTIVGHELTHAVIQYSAGLEYEGQSGALNESFADVFGYFIAPNHWLIGEDVCVRGSRDGRIRSIKDPDKYNQAAHMKDYESLPLTEEGDWGGVHYNSGIPNKAAYNTITKLGKEKTEQLYFRALKYYLTKKSQFTDAKKALQQAAKDLYGEDASKKVAEAWEAVGVN >NC_017546.1|WP_003722731.1|205735_207325_+|cholesterol-dependent-cytolysin-listeriolysin-O MKKIMLVFITLILVSLPIAQQTEAKDASAFNKENSISSMAPPASPPASPKTPIEKKHADEIDKYIQGLDYNKNNVLVYHGDAVTNVPPRKGYKDGNEYIVVEKKKKSINQNNADIQVVNAISSLTYPGALVKANSELVENQPDVLPVKRDSLTLSIDLPGMTNQDNKIVVKNATKSNVNNAVNTLVERWNEKYAQAYPNVSAKIDYDDEMAYSESQLIAKFGTAFKAVNNSLNVNFGAISEGKMQEEVISFKQIYYNVNVNEPTRPSRFFGKAVTKEQLQALGVNAENPPAYISSVAYGRQVYLKLSTNSHSTKVKAAFDAAVSGKSVSGDVELTNIIKNSSFKAVIYGGSAKDEVQIIDGNLGDLRDILKKGATFNRETPGVPIAYTTNFLKDNELAVIKNNSEYIETTSKAYTDGKINIDHSGGYVAQFNISWDEVNYDPEGNEIVQHKNWSENNKSKLAHFTSSIYLPGNARNINVYAKECTGLAWEWWRTVIDDRNLPLVKNRNISIWGTTLYPKYSNKVDNPIE >NC_017546.1|WP_003733144.1|204540_205494_-|phosphatidylinositol-specific-phospholipase-C MYKNYLQRTLVLLLCFILYFFTFPLGGKAYSLNNWNKPIKNSVTTKQWMSALPDTTNLAALSIPGTHDTMSYNGDITWTLTKPLAQTQTMSLYQQLEAGIRYIDIRAKDNLNIYHGPIFLNASLSGVLETITQFLKKNPKETIIMRLKDEQNSNDSFDYRIQPLINIYKDYFYTTPRTDTSNKIPTLKDVRGKILLLSENHTKKPLVINSRKFGMQFGAPNQVIQDDYNGPSVKTKFKEIVQTAYQASKADNKLFLNHISATSLTFTPRQYAAALNNKVEQFVLNLTSEKVRGLGILIMDFPEKQTIKNIIKNNKFN >NC_017546.1|WP_003722729.1|203556_204270_-|listeriolysin-transcriptional-regulator-PrfA MNAQAEEFKKYLETNGIKPKQFHKKELIFNQWDPQEYCIFLYDGITKLTSISENGTIMNLQYYKGAFVIMSGFIDTETSVGYYNLEVISEQATAYVIKINELKELLSKNLTHFFYVFQTLQKQVSYSLAKFNDFSINGKLGSICGQLLILTYVYGKETPDGIKITLDNLTMQELGYSSGIAHSSAVSRIISKLKQEKVIVYKNSCFYVQNLDYLKRYAPKLDEWFYLACPATWGKLN >NC_017546.1|WP_003722728.1|202557_203514_+|ribose-phosphate-diphosphokinase MSNEYFDPKLKIFSLNSNRELAEEIAKEVGIELGKSSVTHFSDGEIQINIEESIRGCHVYVIQSTSNPVNQNLMELLIMIDALKRASAATINIVMPYYGYARQDRKARSREPITAKLVANLIETAGATRMITLDMHAPQIQGFFDIPIDHLNAVRLLSDYFSERHLGDDLVVVSPDHGGVTRARKMADRLKAPIAIIDKRRPRPNVAEVMNIVGNVEGKVCIIIDDIIDTAGTITLAAKALREAGATKVYACCSHPVLSGPAMKRIEESPIEKLVVTNSIALPEEKWIDKMEQLSVAALLGEAIVRVHENASVSSLFE >NC_017546.1|WP_009931068.1|201133_202507_+|bifunctional-UDP-N-acetylglucosamine-diphosphorylase/glucosamine-1-phosphate-N-acetyltransferase-GlmU MSKRYAVVLAAGQGTRMKSKLYKVLHPVCGKPMVEHVVDQISTLNVDKVVTIVGHGAEKVQEHLAGKSEFVKQDEQLGTAHAVLQAKAELAGKDGVTLVVCGDTPLIEASTMEALLKYHHEKRAKATILTTVIEDPTGYGRIIRDDLGIVEKIVEHKDATEKEQRISEINTGTYCFDNKALFEALENVSNDNVQGEYYLPDVIKILKDSDEVVAAYRMESFEESLGVNDRIALAEASKLMQRRINENHMRNGVTLVNPESTYIDIDVKIGQDTVIEPGVMLRGKTVIGDDCVVTSGSEIVNSVIGERVHVRTSSIFESKVGDDVQIGPYAHLRPESDIHDHVKIGNYVETKKAVVGEGTKLPHFIYMGDAEIGKNVNVGCGSIAVNYDGKNKAKTIIGDNVFVGCNSNLIAPVKVGDRAFIAAGSTITKDVPEDALGIARAKQDNKLGYAKHLNHSK >NC_017546.1|WP_003722726.1|200438_200747_+|septation-protein-SpoVG MQVTDVRLRRVETDGRMRAIASITLDEEFVVHDIRVIDGNNGLFVAMPSKRGVDGEFRDIAHPINSDTRAKIQEVVLAEYERVGEEEATAVTEEESESVSAE >NC_017546.1|WP_003722725.1|200010_200319_+|septation-protein-SpoVG MEITDVRLRRVETDGRMKAISSITIDGEFVIHDIRVIDGNEGLFVAMPSKRTPDGEFRDIAHPINSGTRAKIQEAVLAAYEVADEPAVNEESSADESIVEEN >NC_017546.1|WP_009931069.1|198117_199326_+|FtsX-like-permease-family-protein MNVLQSMKMAWKQLKASKLRSFLTMLGIIIGVASVILLVSLGNGVTQEVDDQMGDLGSNLITVVNSSVNPNDKYTYDEVMKYQNIDGVKSVSPELSGQVNATFDYKNSSNKVIGTNDQYKAARSLEMKEGRFLLPIDTEYGQKVAVIGSTVASDLFGFGDPIGETIRLNGMPYKVVGVLKEKGASMMGSSDDQIFIPISSAQRLLKDTNVRTIYVETKSAEDVDFVVNTLESRLAIKFGDEKEQEKNASSAQMGPSYQVINQQEILNAFNTISTTLTTALGAIAAISLVVGGIGIMNIMLVSVSERTREIGIRKALGAKKRAILLQFLIESIVISVCGGVIGIIIGVSGALIFGSVAGISSGITAGTIIFSFVFSLCIGVIFGIAPANKASKLRPIDALRSE >NC_017546.1|WP_003722723.1|197428_198121_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MPKPLIDMKNLTKTYTLGGETFKALDDVTFTVEQGEFLSIVGPSGSGKSTLMNMIGCLDVPDEGSYHLDDVDVFKLSDNKLSEIRNKKIGFIFQQFNLLPKLSAFENVELPLIYAGLSVSAREKAAIECLEKVGLLEKRRNLPTQLSGGQQQRVAIARALAGKPQILLADEPTGALDSKTGKEVMGILQELNRAGNTIVMITHDPTIASYGTRSIRIQDGKLFHEEATQA >NC_017546.1|WP_010989375.1|211341_212211_+|phosphatidylcholine-phospholipase-C MKFKKVVLGMCLIASVLVFPVTIKANACCDEYLQTPAAPHDIDSKLPHKLSWSADNPTNTDVNTHYWLFKQAEKILAKDVNHMRANLMNELKKFDKQIAQGIYDADHKNPYYDTSTFLSHFYNPDRDNTYLPGFANAKITGAKYFNQSVTDYREGKFDTAFYKLGLAIHYYTDISQPMHANNFTAISYPPGYHCAYENYVDTIKHNYQATEDMVAKRFCSDDVKDWLYENAKRAKADYPKIVNAKTKKSYLVGNSEWKKDTVEPTGARLRDSQQTLAGFLEFWSKKTNE >NC_017546.1|WP_009924872.1|212282_212606_+|DUF5502-family-protein MYIKGRLIFFFVVLVIALCSVLILLIIKISVWKDEPFHLSDAKEIECLGSCEIKNTNQKIHFFSIKENLFEEKGDIAGILNEDEQKVADKSIFIVILDDEKGIANEE >NC_017546.1|WP_003722736.1|212740_213202_+|YehR-family-lipoprotein MKMLKKGTAVLFVMIMAVMLVACGDKEETKTYTLSQNGVDSKLTYTYKGDKVTKQTAENTMSYASLGVASKEDAEKMLKATSDKFQGIDGLKEKIEYKDDKAIETLEVDYTKISSEDMNKIPGMSSNGDTSKGISMEESAKMLESQGYKEVSK >NC_017546.1|WP_003725735.1|213252_213585_-|putative-heavy-metal-binding-protein MIVTTSPNIEGKQIIEYKKIVFGEVITGVNFMKDIGAGLRNFFGGRSQGYEDELINAREEAIREMEQRAKDIGANAVIGVDIDYEVLGADNGMLMVTASGTAVVIEAQDY >NC_017546.1|WP_009930499.1|213651_214326_-|DNA-alkylation-repair-protein MITFDQLDTELQALENPNTIKIFRNHGCPDSLDLYGLKIGDLKKIIRREKLTKNHELAVKLIESNNSDLIYLGLLAINPNKITTEQIEKWNIAFRETWSQLTFGLASIVSKRDDALLFAKTWIESDYDLTKSMGWQIYSEHINNLPEAETLLQRAKETLQTETNRTRYSMNGFIITCGIYKDDLHEKAMEAAKSVGKVHVNLGNTACKVPDAISYIEKARNRTK >NC_017546.1|WP_003722739.1|214402_215344_-|L-lactate-dehydrogenase MKDHQKIILVGDGAVGSSYAFACVNLSIGQEFGIIDIDKDRTIGDAMDLSHAVPFSTPKKIYSANYSDCHDADLVVVTAGTAQKPGETRLDLVNRNIKIMKGIVDEVMASGFDGIFLIASNPVDILTYATWKFSGLPKERVIGSGTSLDTARFRMSIADYLKVDARNVHGYILGEHGDTEFPAWSHTTVGGLPITEWISEDEQGAMDTIFVSVRDAAYEIINKKGATFYGVAAALARITKAILNNENAILPLSVYLDGHYGMNDIYIGAPAVVNRQGVRHIVEMNLNDKEKEQMKNSADTLKKVLDDAMKQID >NC_017546.1|WP_003722740.1|215637_216261_+|50S-ribosomal-protein-L25/general-stress-protein-Ctc MATTLEVQKRETTQHSEVTRLRSEGKVPGIIYGYKSENVPVSVDSLELIKAVRDNGRNAVFSVTVDGKKLNVLLHEYQVDPLKDVLVHVDLLAVDMNEEVETDVRVVLVGDAPGVKAGGVLQQIIHDVKVSATPEKLPETIELDISSLEIGDVLTTNDLPENKDYVVQAEEEETVVTVSAPRAEEEPTTTEAPEPEAVHGKDEEPVE >NC_017546.1|WP_009930501.1|216350_216935_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MLDKSVPHISVIMVNHDATNYPEFHLPAGYSFCFYKDGLEEDWCRLQLETGQVLSMDSIRARFETEFGNEKEKLTKRCIFVKAPNGEIIGTAMLWDGNTFGKIESRIHWVAVLDSHGGKGIAKALLSKILGLNKSKFVYLTTQTGSYQAIYLYRKFGFEKYVGKTPENWKTVNFQEEKETAWQIIENKIAEHQA >NC_017546.1|WP_003722742.1|217041_217602_+|aminoacyl-tRNA-hydrolase MKLIAGLGNPGKKYERTRHNVGFMVVDELSFRHQTPWKKSKFNGMTSEIIVGGEKMILVKPLTFMNASGECIRPLMDYYNIPIEDVVIVYDDLDLPVGKIRLRQKGSAGGHNGMKSIIQHVKTQEFNRIRVGVSRPLKGEVINYVLGDFPKAEQPDIIAAIQKSADAIEDFAQTPFIEVMNKYNQK >NC_017546.1|WP_010989376.1|217716_221256_+|transcription-repair-coupling-factor MKGLQQLIYEQKDIRAVLNALDEKEKAQLVTGLTGSSRALFASVVEGASKRPVVFVTHNLYHAQKLYDDLLSLMDVDRLFLYPADELISSELSISSPELRGQRVEALDFLLSGKPGIVIVPVAGLRKMLPPVSLWKHFNISIVEGEEIDPDVLRQKLVTMGYTMSGMVNTPGEFSVRGGIIDIYPITEEFPIRIELFDTEVDSLRFFDVETQRSTTRVEEFRLLPATEIILDQSYYPDIVKRLEKKMMLTLNELKEQEDKQALIENLEEDLEMLRSGVKPDMFFKYIGLAYPDPASLFDYLPKNTAILLDEFGRILETEESLEREEAEWQTETLSRMETVRDVQVSHSFKKLLEGNHSPKIYLSLFQKQMASMRVSKTTNIVYKQMQQFHGQMNVLKTELESWHKNNYAVVILAPNLERAEKMQQTLTDYDMESTILKKESDVPKYGMVQFVIGTFQNGFELPLAKVAIISETELFNKKIKKVKKRQKLSNAERIQSYSELKVGDYVVHVNHGIARYVGMETLDINGVHKDYLLLVYQGEDKLFIPVDQLDLVQKYVGAEGKSPRLNKLGGAEWKRVKKKVQASVQDIADDLIKLYAEREAEKGYAFSADDEMQREFEEAFPYQETEDQLRSISEIKKDMERPRPMDRLLVGDVGYGKTEVALRAAFKAIMDGKQVAFLVPTTILAQQHFETMKERFQGFPIEIGLLSRFRTKKQQTETLKGMKNGTVDVVVGTHRLLSKDVEYQDLGLLIVDEEQRFGVTHKEKIKQMRSKIDVLTLTATPIPRTLHMSMLGVRDLSVIETPPANRFPVQTYVAEQNNVLVREAIERELARDGQVYYLYNRVESITQKADEISAMVPDARVATAHGQMGESELESVILSFLEGEFDVLVTTTIIETGVDIPNVNTLFVQDADRMGLSQLYQLRGRVGRWNRIAYAYFMYQKDKILREEAEKRLSAIKEFTELGSGFKIAMRDLSIRGAGNILGAQQHGFIDSVGFDLYSQMLKEAIEAKKPKEEQKQIVPVEIDIQADAYIPEYYITDGRQKIEMYKRFRNIETLSELEDLQSDMIDRFGEYPEEVEYLFTMTELKVRALEVGIESVKQEQNKITMLFSESGTAGIRGDIVMQIIGEFGRMVGVGMEGTQLKITINVQNKPLKEWLYQVKSLAEKLRGAMKEKASTEN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_017546_2 | 497506-498090 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_017546_2
|
7 spacers
spacers of NC_017546_2
>2.1|497545|39|NC_017546|CRT TGGGATATGTTTAACAGCTGTAGGGCACTTGAGGAACTG >2.2|497623|39|NC_017546|CRT TCTTACATGTTTTATGATAATAGAAATCTTGAGGTGCTG >2.3|497701|39|NC_017546|CRT TATGCCATGTTTGAAGATTGTACTAGTCTTGAAGAGCTG >2.4|497779|39|NC_017546|CRT TATAGAGTGTTTAATGGCTGTGAAAAACTGAAGAAACTA >2.5|497857|39|NC_017546|CRT GTTCAAATGTTTAGAAATTGTAGCGCCCTTGAGAAGTTG >2.6|497935|39|NC_017546|CRT CGTGCCATGTTTGCTGGTTGTACTAGTCTTGAAGCGTTA >2.7|498013|39|NC_017546|CRT GCTGCCATGTTTTCTGATAATGAAAAAGTGGAGAAGCTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017546_2
The CRISPR arrays of NC_017546_2 >merge|NC_017546|2|497506-498090|CRT GATTTGAGTGGTCTTGATACTAGTGCGGTAACTACTATGTGGGATATGTTTAACAGCTGTAGGGCACTTGAGGAACTGGATGTAAGTCATTTTGATACAAGTTCAGTAACTAATATGTCTTACATGTTTTATGATAATAGAAATCTTGAGGTGCTGGATGTAAGCAACCTTGATACCAGTTCAGTAACTAATATGTATGCCATGTTTGAAGATTGTACTAGTCTTGAAGAGCTGGATGTAAGTCATTTTGATACGAGTTCAGTAACTGATATGTATAGAGTGTTTAATGGCTGTGAAAAACTGAAGAAACTAGATGTAAGTAATTTCGATACCAGTTCCGCTACTGCAATGGTTCAAATGTTTAGAAATTGTAGCGCCCTTGAGAAGTTGGATGTAAGTAATTTTAATACGAGCTTAGTAACTGATATGCGTGCCATGTTTGCTGGTTGTACTAGTCTTGAAGCGTTAGATGTAAGTAATTTTGATACGAGTTCAGTAACTAATATGGCTGCCATGTTTTCTGATAATGAAAAAGTGGAGAAGCTTGATTTAAGTACCTTTGATACCAGTTCAGTGACTAACATG >NC_017546|2|1|497506-498090|CRT GATTTGAGTGGTCTTGATACTAGTGCGGTAACTACTATG TGGGATATGTTTAACAGCTGTAGGGCACTTGAGGAACTG GATGTAAGTCATTTTGATACAAGTTCAGTAACTAATATG TCTTACATGTTTTATGATAATAGAAATCTTGAGGTGCTG GATGTAAGCAACCTTGATACCAGTTCAGTAACTAATATG TATGCCATGTTTGAAGATTGTACTAGTCTTGAAGAGCTG GATGTAAGTCATTTTGATACGAGTTCAGTAACTGATATG TATAGAGTGTTTAATGGCTGTGAAAAACTGAAGAAACTA GATGTAAGTAATTTCGATACCAGTTCCGCTACTGCAATG GTTCAAATGTTTAGAAATTGTAGCGCCCTTGAGAAGTTG GATGTAAGTAATTTTAATACGAGCTTAGTAACTGATATG CGTGCCATGTTTGCTGGTTGTACTAGTCTTGAAGCGTTA GATGTAAGTAATTTTGATACGAGTTCAGTAACTAATATG GCTGCCATGTTTTCTGATAATGAAAAAGTGGAGAAGCTT GATTTAAGTACCTTTGATACCAGTTCAGTGACTAACATG
>NC_017546.1|WP_014601342.1|495058_496597_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MREYLDSKSQKKVALLEKIFYAENHTSTQEELLNDLNITYPTLISTIKTINFDIERFGYKAFSIVHSAPNLSYTLKISDNCSIQLIINAYIRESPKFQILETLLLASFPNLQALAKKVHVSYSGIKKEIKELNEELRERNLSISTGNQVEITGDEFSLRIFYAFLFLVTYSGDRWPFSFVQYDEITDLLESCPKEIYRANSIDKGMMIHYYVAMHLLRDRMNCQIDTTRQFKVALYKACTEESKKSESAFIKKVAKQLPNRNYKEITYTTQIILSTIVAFGSYSSIEKMPSFFYMDEQLEEMGFMKLVDFASERVNDNLSIPFSEKEMELLRYSFASINYRYFLLDNLINKFNNIVPGYTDLDRNIRKIHKVNHLEPLISQLVNLKEMRLLKPFEERLASDYLIILDKRIDFSIHTLPIKVTILSTISNETAVFDFMRYFSSYYNLEIINQVDPVVDLYISDFSVSPEVLTSLRINQPIVYVNTRWLESDYVKINDNLAKIARKKFIANKKD >NC_017546.1|WP_010989476.1|492688_494239_+|hydantoinase/oxoprolinase-family-protein MYKIGIDVGGTNTDAVILDENQQLIHSVKMPTSEDIETGITESLHRVLSETGIDRSKVTHAMLGTTQCTNAIVERKKLAKVGVLRLGYPATASVLPYTAWPEDMVGFLSGKYKLTGGGYEYDGQVLSEINEAEIRETLASWKGEVESVAVVGVFSSLKNDQELAVQKIIEEELGADIPVSISSSVGSVGLIERENATILNAALFKVIAATSDGFEKALEQEGIEHAEIYLCQNDGTLMSLNYARQFPILTIACGPTNSIRGASYLAGLKDAMVLDVGGTTSDIGVLTDGFPRESSLAVDVGGVRTNFRMPDIISIGLGGGSIVREKDGDITIGPDSVGYRISEEALVFGGKTMTTTDIAVRLGMAEIGNPELVAHIPTDFAEKAYKKIADMTEDAIDKMKTSSGSVSLVLVGGGSVIIPDEISGVAQIFRDKNGPVANAIGASISQISGQYEQIYIYSQIEREEALQDAEQKAREQATLAGAVTDSIEVVEVEEIPLAYHPGNATRLRVKVVGNLV >NC_017546.1|WP_003721245.1|491595_492696_+|DUF917-domain-containing-protein MRYLDEQAIENIAIGAAFLGTGGGGDPYIGKMMALTAIKKHGPIKLLSPEEIADDDYFIPAAMMGAPSVLIEKFPKGDEFVRVFEKLGRYVGKEVKGTFPMEAGGVNSMIPIVVAAQLGLPMVDCDGMGRAFPELQMVTFHLDGISATPMAITDEKGNIGIMETIDNKWTERLARVTTVEMGASSLVSLYPCNGAQIKQSSIKNIVTLSEEIGKVIRETSMDEAEKLQKLLDVTHGYHLFEGKITDVVRETRAGFNFGRVKIDGLNKDTNSEVIVHFQNENLVAEKNGEPIAITPDLICMVDLETLMPVTTEALKYGKRVRVMALPADDAWRTDKGIETVGPRYFGYDVDFEPLEELVKKEERRHV >NC_017546.1|WP_003721244.1|490311_491595_+|cytosine-permease MTEKKTVEQAQSWQSLAFVWTGAMICVPSLLVGGTLISGMPLWEAILIALLGYGVIVVFMIYQGMQSSDLGIPAVSVASQVFGEQGSKKIISILLAIACLGWFGIQANVCGAAFSQFLGIYGINLPVPVSSLIWGVIMLLSAIYGIRILSILNYIAVPILLFVCIYGLVVSLNNGGLAVVENYKPAGSMSFMTGLAITIGSFALGAVIAGDYSQYTKSRKDVVKAAIVGILPSGVLMIAVGAILALTAGTADISVVFTNLGLPVLGIIGLILAAWTTNAVNAFSGGIAIINVFNISEKYHKVAVAIAGGLGTVLAVIGILNHFVPIMSVLSAMVPPVAGVMIASYWIVQKGDKSKWAPVPGVNWLGVTSWLVGAVIAGIPVILTFFPALPQLPNQPLIGIILSLAVYLVGAKVLSGKTNNVENLEGK >NC_017546.1|WP_010989475.1|488582_490178_+|PucR-family-transcriptional-regulator MSVKLADLMKLPSLKEAKVVSGKSGLSKLVSSISVLEYTEVALLEDDLFDNDEFYGSEIVVSAFVNIRDDVEAQCRTIERLHKVGEVALILYYVGIFVPKMDQKLIDFANELDFTIIVMPENEMSLRYSEVIYEVVEAIVKQEMTDTNFVTESLEQISSVRPPQRNIDTTLKILSDRTHSSLVLTDNSFQVINSITWPRTRHWDFERVIETSKQIDEHELVQLHLDERDFYTARKPIFQDGMQAMHLFMMKEKGALTADVVMQITEVVQVFMNLWGRNYVEISTAELMKAILNDESVKMRRLGKILNVDVSSIKWMWLVKTEEIRNNEQVLAELKSFVASHFQVSLIDLFEDNIVVLLDNSVGQRDRTHTANEFAMMMKEHGIDLKITVCQGMEQTSDVQSAYSLVNEYKNAANAIYANKSIYSLQEIDFAAKCVEIVDRGELAIAEQMRPLKSLEDNDELIETLSVFLLEGESNYNQAAELLFLHKNTIKYRIQRINELLQYPATKIPESYNLYLAVAIRRLLGGNNNNK >NC_017546.1|WP_010989474.1|487479_488427_-|MoxR-family-ATPase MSIEPSIKINEIINEVEKVIVGKRHVVKLSLTALLAGGHVLLEDVPGVGKTMMVRTLSKTIGVSFKRIQFTPDLLPADVTGVSIFNPETRDFEFRPGPVMGNIVLADEINRTAPRTQAALLEGMAENSVTVDGITRKLANPFFVMATQNPIEYEGTYALPEAQLDRFLLKINIGYPTVEEEMQLLTLKQYQDPLDQTKQVVTLSELLDLKNKAKQVFIDDVLKNYIIRLVDATRKHPSVALGISPRGSLAFMQAAQAFALIEGRDYVIPDDIQYLAPYIFTHRLILKSEAYYNEETAESIIASILKNTSVPVEKR >NC_017546.1|WP_010989473.1|486326_487475_-|DUF58-domain-containing-protein MLKKRLLLASRWIIMLIIYAGLWTYTLFQGDTASWFLTYFFSFILLLLFLSSIYPLKAWKVNRSFVKNTYHDGDLIDMQVSFTRKSRYPVGYLLFQQKIPATFGKVRARQQVVYPLFKKQFTVTLAGFVGVRGIHSFPPVDVETSDAFGLLERSRQLSSEKSLTIYPTYFPNVLEKISEASPENERNAAYWTLKKNSNLHSLREFSSGDRISLIDWKSSAKSDQLMTREFENSATSRLSVIFYGASHPNFELSLRAAYSFIRKISEENGEIRVTLLGDQTSKFAPAKGTSRLQDISTAFAEIAPVDSLTLQESLDSNLHSGEKILLFTPCMDTMLMQKVTRLTDNKQLQIITFQSEHSKAMDAPAIFLEQASLLSRWERETK >NC_017546.1|WP_009930718.1|484170_486330_-|transglutaminase MKRYLTLVMLFILSVLLISEWIYPFAELTELSTATWIILFITLSLGSFFLRLKYYWTIPLHVVMIIIVSGIYYAKGGILAGNWLGSFFQITFNGFRDMVQFRSSDISMDFILIVFLIALWLLSYITTYSILRKQRIMSVLVLTVAYLAVINTFTDYNSNWAIVRTVLEGFLLLHLALASRIATPNRISADSLKRNGLFYHGFVILLLAVFVFSSLMLPKKAPIFPDPIPTIKNALGINTTRTVGYSEDDTTLGGALKKDNATVFTAQAEKGHYWRVESKTVYTGTGWANANSGDVISFSSGDNFPIQLTEQTTGATNTAEISFASSSDYMPYPYGTQAVNGAVDSFSANLTIERVGPVDTIKNYTVQLKTPVYNIEKMQNADFSTLSNAFVSQYTQTPKDLPDRVTKLANKVTKDADSIYDKTKAIESYLSTSGTFTYSTDDAKETPMGADYVDQFLFETQIGYCDNFSTSMVVMLRSLGIPARWAKGYTPGEGEKKENDAKTTYTITNNNAHSWPEVFFPGTGWVPFEPTATFSNPENFQEPTTETANKPETPNDSTSTPETPNTPDKTPEQDNGSSSTGETPKKEEPKTETATSNVEIPSWVWWIPAGLVVALLALAIVFRRRIRGYLLLRSLRNSPEFGKTYHRLMKLLASYGYVRESSETLRHFSARVDADLTTSEFSRLTKMYETQLYSKNLTEKVIAAEETQLVQQIIARLTK >NC_017546.1|WP_009930717.1|483297_484053_-|DUF4866-family-protein MTTIFPKEQNVTPLFEQILANPTACRRFKDVFLDNLESYQETRGFEKDDTLFAKIILSAYRQSDVSALLLGVCGRTLFELLRQAFLIPKKLTVDNPFFLTDKEGNFIAKKDDISNREQEKFQEIYQSDLHHSETTIFLVDDDDIVHSYEPDFSISTKRINKKRGILVLYSLPDTLKSGMTESEVYAFIWKTFLHIQEIIPSSRIFYGQETSENADELGVFLPIHHFEKKMLQNIEQVNELVDALREQMVNK >NC_017546.1|WP_010989471.1|482611_483277_-|DUF1275-domain-containing-protein MARTRQISESIGLGLLLALAGGFMDAYSYIERGQVFANAQTGNILLFGINISEGNWAIAIQYFWPVVSFTVGIALSEVIHRRDIRRLHWRQLSVLIEAVILIGVAFIPLDHNLIANSLISFVCGIQVESFRKMHGRGVATTMCIGNLRSATQNLCDYFEYKEKQYLHNSFLYFSVILSFIIGAVVGNFFIQLFAQYAILVCAFLQLIAFMMMFIDRESKII >NC_017546.1|WP_009931585.1|498983_499457_+|hypothetical-protein MKKKKVVVISLLLLLVSVIGISSYFLFKDKINLLDVDPSAVEWNGKKQKDTSGEENTIAIPGFEKVTLYANETKQAVNFHNPEINDCYFKISLIHPDGSVLWRSDLIEPGKGMYSIELEKTLAVGEYENAVLKYECFSLNDQSPLNGSEINLKLVVV >NC_017546.1|WP_009931584.1|499476_499962_+|hypothetical-protein MNKLVLSTLSVAAMGMVIFSGGTAYAADKEGNTVVEYSVEGDYTLVVPEKVNLSNDNATEMSVKTINRNLEPGKEVEVTLSSGLSADGEIELERVGATSDVITSSFKSNNSTVTMANPVIGSFSGYAIEETEVSKIQIGSPQGDKKAGAYQTTLTFTAAFK >NC_017546.1|WP_003733941.1|499989_500295_+|LPXTG-cell-wall-anchor-domain-containing-protein MKRKLVLAMVLISFCGMFLLSPERVQASQTVVEVFISEDDLDVSEENIQEIPKKELAASSDKDNKQHMLPKAGDTVTNYTLLGLVLVLIWLIMQRKRKKKE >NC_017546.1|WP_003721255.1|500370_500637_+|transposase MARIEYGEEIQKSLLVLYSRGSTIDSICKEYGIPRYEFHKWMKLHDADKLETKEVKTLLQIRELKQQKNKLEEEILFLNEAINLLESP >NC_017546.1|WP_014601344.1|500875_501040_+|hypothetical-protein MYVESKEELEKIIYQQLINNINVKPDPWKWEERNALIVEIEVKAVLEKYGSTPI >NC_017546.1|WP_010989479.1|501101_501338_-|hypothetical-protein MSLKKILESDESIEKKEQQIDSYYQSELITRVEACELLDVSTKSLDRYIKQNKLSFQLNSLLIPHFCLIVLLMPLAIL >NC_017546.1|WP_009932195.1|501576_503307_+|DUF4365-domain-containing-protein MVKYTNPKIEKLGVNAVSNYIVESDYLSDFLAQQSTEPATDGTIRIYNGPGERKRDLIGIVPVQVKGTTTKNIIKYNRHEIDIVDLTYYYKVGGVVYFVVYVTNKVPKIYYRDLLRIDIKEILKKNEKLRGKKEKGTITIDFREVPVNVEDFRTVLLNFHKDQDYQTKDYVELGSINEISRDLTFTIIAPNSNIVEALKYVSPVLYKNEGDLKIPVRRFKIGELSVFTKSEFSIGIKGANSYIATVMEGEEETEIQIGSLQQLIVKFKEGRFKVDFEAKGKIQETIELLEILLGIVTGVNLYIDNKPVTEFFIEEVNEDFISRVNHALESFKKTQEALNHCKVPSNFHYEELTENDIDVINSIMELYQTSIDNTWGKFEFNNRLVYLLKHKGTIYNLLDSNVALEINFWSKREDGIQYTTTPLILIDDFSKMNDTEICNIKGPIEKLIPIHEKACSDINLICVRLIDAYDQTNNNQFLLVAFELLELIIPFTTNNEIHLIYLNKYQIKKRWDNLVMEDINHLVSIQKEFEEDKRIHLATLILLSAKNDAAQLLSELKNNEGFSLEDMPILNLLEKN >NC_017546.1|WP_009932193.1|503351_503675_+|AP2-domain-containing-protein MYQKASEKMKETMKANIALVESIRISSISNKKLQSDNKSGHTVVTFKDNKWVARICVSGVEHQLGSFVTKEEAIDARIEGEKYFQPLINKYNNRLDVFYSERRPFWT >NC_017546.1|WP_010989480.1|503649_503955_+|hypothetical-protein MNVDPFGRKVELMIIGNGLDVKANLASTFVDYYKHRCKLMRLEYNEDDFYRLKSKNYFPMKVKMQQFPSIRRCNIEILSIDAETAINENITFWDLVLFFCL >NC_017546.1|WP_072217966.1|503983_504901_+|hypothetical-protein MESKIERVLNKLGGYLSDPINIILNNCGFGENLEDEQENDLYNLMEERLEEKDKYVLSVAFIHKLNSYSNCSLEEFLMLELNKYEKYFSDYIKTEVTNKYEEYHKTRNNILTKLSGGLGATHSISVMNFNFTPNQFSDSVKLNEKIGLAHVNVHGSYLANSIFGIDTKSLEDIDTIGSGYRFTKTYRKLTLKTKRSTEILYHDITDIIFYGHSLGQADYAYFQSIFDYLDIYNNTIVLTFYYSDYKENVREEQTIAVRNLIEEYGKTFDNKHKGKNLLHKLLLEERISVTDLEIYEEDYSSKDMK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_017546_3 | 543052-543340 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of NC_017546_3
|
4 spacers
spacers of NC_017546_3
>3.1|543081|36|NC_017546|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGATAAAAAAGATATTAGTAATTTATTTGCAATTTA >3.2|543146|36|NC_017546|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGCTCTCTTTTGTGTAAAGCACATCAAGCATGTAGC >3.3|543211|35|NC_017546|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCGATTTTTGTCAAAGGGACAGCGATGGGTTACAA >3.4|543275|37|NC_017546|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTACCACCAAAGTCCCTACACTCAATACCACCAAAGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017546_3
The CRISPR arrays of NC_017546_3 >merge|NC_017546|3|543052-543340|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAATCGATAAAAAAGATATTAGTAATTTATTTGCAATTTAGTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAATTGCTCTCTTTTGTGTAAAGCACATCAAGCATGTAGCGTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAATGCGATTTTTGTCAAAGGGACAGCGATGGGTTACAAGTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAATTTACCACCAAAGTCCCTACACTCAATACCACCAAAGCGTTTTAGTTACTTATTGTGAAATATAAAT >NC_017546|3|1|543052-543340|PILER-CR GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT CGATAAAAAAGATATTAGTAATTTATTTGCAATTTA GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT TGCTCTCTTTTGTGTAAAGCACATCAAGCATGTAGC GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT GCGATTTTTGTCAAAGGGACAGCGATGGGTTACAA GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT TTACCACCAAAGTCCCTACACTCAATACCACCAAAGC GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATATAAAT >NC_017546|3|2|543052-543340|CRISPRCasFinder GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT CGATAAAAAAGATATTAGTAATTTATTTGCAATTTA GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT TGCTCTCTTTTGTGTAAAGCACATCAAGCATGTAGC GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT GCGATTTTTGTCAAAGGGACAGCGATGGGTTACAA GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT TTACCACCAAAGTCCCTACACTCAATACCACCAAAGC GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATATAAAT >NC_017546|3|2|543052-543340|CRT GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT CGATAAAAAAGATATTAGTAATTTATTTGCAATTTA GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT TGCTCTCTTTTGTGTAAAGCACATCAAGCATGTAGC GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT GCGATTTTTGTCAAAGGGACAGCGATGGGTTACAA GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT TTACCACCAAAGTCCCTACACTCAATACCACCAAAGC GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATATAAAT
>NC_017546.1|WP_003733190.1|541878_542814_+|ribose-phosphate-pyrophosphokinase MAGKMKLFSVTSERPLATKIADYLDIPLCEVELQKFSDGEVKINIEESIRGTNAYVVQSMNSNVNERLMELLIMVDALKRASVHSINIIMPYYGYARQDRKARSREPITAKLMANLIQRAGANRLITVDLHAAQIQGFFNIPIDHLSAIPLIGDYLIENYGEKDVVVVAPDHSGVVRARRIADRLNAPIAILNRKPRPHEDEIMSVIGDVKGKVAIVVDDIIDTGVRATTSADILLEKGAVEVIACATHSVMAGNATERLQNSNIKEVITSDSIDLPEDKQFDKLTTISIGRILGRAIEGVQENRSLHPLF >NC_017546.1|WP_003721294.1|540467_541739_+|PTS-galactitol-transporter-subunit-IIC MDIILDFFKYIIGLGVTVMMPIIITILGVIFRKKISVAFKAGLTVGVGFVGLGVITSLMLTTITPVTKALVENYNFKLTATDIGWGVGSSLAWGTEVVPFVFVAIIATNILMIAFKWTKTMDVDIWNYWQPLFIASALYLTTGSMIIAVLSSIINMAIIFKIADWTQKDVEDVLGLEGISLPQIQTTGWALVGYPMNWLLGKIPGVRKINWSTEKVQSRLGIFGEPMLMGLIIGGGLAAIAQMPLSQVLQTGVTIAASLVLIPRMVSLLMDGLTVISEAAHEFMEKRFPGRELFIGLDSAVGIGHPFVLSLGLLMIPITLILAFILPGNKVLPLADLTALPFYMIFAIVPSKGNLFRGIFTGIVIVIITLYLSGAAAPLMTELAGQIGYNIPKDAVEVTSLAVGTQWYTWIVYYGLHWFGGIL >NC_017546.1|WP_003721293.1|540159_540453_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIB MKKKRIYVCCGTGIATSTVISKKVRAVLDEKRIPYEISQCTVQEVASKVSTSKPDIIVSSTTVTGDVGDVPVVIGRSFLTGLKKQETIDEILAILQD >NC_017546.1|WP_009930756.1|539097_540144_+|galactitol-1-phosphate-5-dehydrogenase MKALKLYGKRDLRYEEADMPTIEEPDDVILKVKTVGICGSDISRYSKLGPYVPGMVWGHEFSGEVIEVGSEVTDIEIGDRAAGCPALYCGECEYCKKGEFARCRKLTVIGARHPGAYAEYIKLPAENVVKIPNELDYEAAALVEPSAVVVHGFYHTKLQAGDDVVVVGSGNIGLLAIQWAKVFGARRVIAIDVDDKKLALAKEVGADVVINSLKEDPLEVVAAHTDGLNADLVVEAAGSPITSAQVFAYAKKGGGVVFLGIPYADVTIERFYFEKIVRSELTVWGSWNAISAPFPGKEWQTTIHFLANKQINIEPMITHRLSLAEGPEVFERIYERNEFFGKVLFFPE >NC_017546.1|WP_003721291.1|538450_539101_+|ribulose-phosphate-3-epimerase MAKIVPSVFGADIGRINEQLQVLEKNDIDLLHVDMMDGSFVPNIAFGPDQIKMMKKGTKLQFDVHMMVYEPDRYIPRLVEAGAHMITVHQEATTHLHRTIQLIKSYGVRAGVVLNPGTPPSTLEYVLDDIDCILLMTVNPGLGGQKFFQSSLEKIRKTKAYIGNRPIQIEVDGGVNDELAKECTLAGADLIVVGSYLFEGDIEANLEKLAKGVLTE >NC_017546.1|WP_003721290.1|538041_538440_+|hypothetical-protein MGSFFASFVDWLIGSPGRFVVNLIEDNMLIFMVVVMIYATTILYAKWTLAYYLPKKMSQLAEMKTWELDELYAAWQTEKKALPWYILVPSRNEFWVKSARNAPESTKLLHFSQQKLKLSDKEKLQKIIEIQS >NC_017546.1|WP_003733191.1|537557_538025_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA MDVLEYFKEEMVRFSNEQNKEKLLAEMAEQLCEVGAVKPSYKDAVIKREKVFPTGLLTAHAGVAIPHTDSEHVIRPVVAVRILKKPVSFIEMASDNEAIDVRIVFMMALRSADEQLDMLQTLIQLIQDEEVMTTLLKAQETGDVLSAIEHFSKNN >NC_017546.1|WP_003733192.1|536927_537530_+|SIS-domain-containing-protein MDKQAILNNIHQTWQEEANAISRLPEVTSEEALVKTVEKIAECTGKIVVAGCGTSGVAAKKLVHSFNCIERPAVFLTPSDAVHGTLGVLQKEDILILISKGGNTGELLNLIPACKTKGSTLIGVTENPDSVIAKEADIFFPVSVSKEPDPFNMLATASTMAVIASFDAVIVCLMTYMNYTKEQFSVIHPGGAVGNKLLNK >NC_017546.1|WP_010989498.1|534863_536924_+|BglG-family-transcription-antiterminator MYLDNRSKTLFQEVIKNPNITNKQLEVKYKLSRYQISYSFQKVNEWLKWKNYPEVKRSKNGRFILEPELTALFSEKETRDPSVEYLPSENERANLILLMLLTSKEELSLAHFTTKIQVSKNTILRDLKVAQKLLPKETTVTYSRASGYQLAGSEWELRKVLTQVVSSVKEMFRGEHYFLSYSGIEKVQLMEIRRTLEEAEAMMQIKFTYEQIELLPYLLSVMFLRIRDRRLIDTAFHIDEKSLSDTREYHITDILLEKTGPVPEQERLFITLQLLTTNIFSGEILTEKLTEDLEKVVLTCLDLFEKKALVSLKNKHILIEKLLLHLKPAYYRIKYQMNLEDTLYEKFNQEFEALNFIVKEAFDPLAKFIGREIPAGEIFFISLFIGSDMIPQNDIYHKQKRAIVLCPSGVTFSKIMENILVKLFPEIHFYPTISVREYAFFKAEVDIVFSSIPLKDGENVFVVQPFMNDIEKTQLRQHVLQNLFGMGNQLTSIDKIMEVVERNADIKDPNAIRDGIIDILSANIATDENKRVKKVYLHDLITEDNIMICEDVKNYQEAIRLASQPLLLQQAITANYVKTMIDNHKFHDPYIIIGEDIAIPHAMPNAGVNRLAMSLLVVKNGVYFSETEQVHFVIVIAPVDKEQHIEALYQIVHLAENHQILDDLLENVTKEKIMQTINQLVIREDE >NC_017546.1|WP_010989497.1|534104_534755_+|transaldolase MHLDSANLDDVKKIQASSIFKGITTNPTILVKEKCNRQTAINRILELTDKQVFVQTVGFTYEEILADARMLLTMFGKDKIAIKIPAHEAGTNVIDTLKKEDKTIQILGTAIYSADQAITAALAGADFVAPYVNRMSAANIDPFKEITQMRHFFDKKALKTQIMAASFKHSGQVMQAYESGADTVTIPYEIYSQMTNKVLAVEAIRVFNEDAVLYEK >NC_017546.1|WP_009930754.1|543599_544178_+|hypothetical-protein MKKILVPILLLATILASCSSPNEKITKDTKISKTITIRADYKVPKDIKELEDDSANIVKVKFLQNKTIGKDGSTISEIEILTSYKGNLEKGSKVDISEPWYLSDGKYVAVENYIALDKEQEYTIFLGEKDKDTYPLSSLGYGKFGGSLKEDQAVLADFNILGEVQKFDFISENTEEVKNYQLIKEQVAGKYK >NC_017546.1|WP_010989499.1|544285_544966_+|type-1-glutamine-amidotransferase MIIDVLQHVPHEGPGLIANWARENQHQLKIHSLFEENAHVPNDSDFLIVLGGPMGINDTAEFPWLKDERKLIKRLSEQHKPVFGVCLGAQQIAATFGSEITVNKEKEVGWFPVKRTSDKLLFFPKSLNVFHWHQDTFALPTGSTRLFASEGCLNQAFLYGENIIGLQFHFEMEKAGIETILRIDEAFITPGKYVQSVEVMREKDVPEDNKQMLEAILDYLINPKTI >NC_017546.1|WP_003721298.1|544990_545350_-|hypothetical-protein MEQILFIQTGFGVDVHGQNITKAAERAVRNAIFTNSMPGIQGLLPDGDLQNMVVNIKLALPCDADQLDEDTIRAIIPYGTVTIEKMAGGMMTTSGIFLEDKEDKNDLMYIVNASVETGY >NC_017546.1|WP_009932856.1|545356_545815_-|MarR-family-transcriptional-regulator MNNEQNMNQQIALFYFGYKAFTETADLIIAKHSLKRLHHRILFFTARMPGLTINELLTFLEISKQALHQPLAELKERELLTIEQGRRDKRQRCIFLTSAGKELENELGAAQRKQMSEIFTNSADTDGMHFTEVMEGYAKNRPGAAFIKDFKE >NC_017546.1|WP_010989500.1|546196_548014_+|lmo0514-family-class-1-internalin MKKALKLFLATICMFIMIYPSTAAHAEETNIVNIPDANLKTYLNGLLKQASDAPITKTQMNTIQTVTLSGSTYTDLTGLEEAGNLVTLSLNNTNIQTLEPIKNQTSLTYLTVGGDNVKDSLFVDLNGLVNLQSLSINGSEVTHNVFKTFNKLPKLTYLYAQNSMKITDISALASLPALTTLFLQFDGIDDFRPLNDFESFKNGNLKALAAFGQNTGRTNPRITLKSGKLDYNETNQTLYLPFSMMPKPLTSFDGTVAPFSKSTSASNTYLGFNDVALPSSRLSITDDGITVSGVTKEEFDNLDEIEYNARYDFPTGSYPTPPSMTSYTISSGTYDQYFDISHTLDLTADESFDYNQYDTTSEEQFLKDVHAETDDGTAVKSDFDQVVKLDVPGEYTVTLNAENAAGLKATPVTVKVTVHEKPVITSDSQISYKKETTKSVDEFLKEIHGSVTGNAVLTSDFDKVVDLNTPGEYTVTLNAINDRGQKADPVTVVVTVTTSDSGHVDPVPPTPQEETDQTIIPEPQSETTEDSVKEDQAKDGQAKSEEKADKTSLTTKENKVEKSEKTNQPKTKALPQTGDTNKTALPIAGVMLSLAALLIFRKSKS >NC_017546.1|WP_003721301.1|548114_548546_+|universal-stress-protein MEKYHRILVAVDGSEPAKLAFEKGLELALKLDGVLGIASIVDLRAFSPNVSYDGSLEEKAELELKTSVNEYAEKARTAGVKQVETFVAKGNPKILLSTDIPAEFQADLIICGATGMNRVEKLVLGSVSSYIMAHAICDTLIAR >NC_017546.1|WP_010989501.1|548592_550023_-|CapA-family-protein MKKLTYVIITGLVLVFIAGAFWITNSTNQSDQKATQTEPIKKISPANVKTISSEAKKTLNSLASSGADKASISDLKQLIKELKSYPTEKNDSGVYLQNLTACLEAVKSYTTGKADEKTLGKVYPAFLASEQKLSAIEKTNQYDWFYAAAATNQQGLKEKGVVTLTMVGDNSFGTYPETPEHLKFDNVFQKNNGNNTYVYKNCLPWFKSDDYTIINAESAFTNATKAENKMWRIKSDPAHVAFLPASGVDAANLANNHTMDYFQVGYDDTLKAFKENNIPVFNADAPLETTIKGMKTVLLGYDCRMSQQSPAYLERIVKDVKKYKKEDTLVIVNMHWGVEYRETPTDYQTQFGHAILDAGADIIMGSHPHRLESVEKYKDKYIVYSMGDFAFGADPTLLSRMTSMFQLRFTKEDNKIVLKDISIVPTYENSDGSTTENNYQPLPVFGDDAKKIVDELNRISKPIEGGVTEYTYFDPF >NC_017546.1|WP_003721303.1|550143_550959_-|histidine-phosphatase-family-protein MKKNIFKLLMALCAVLLIAGCGNSTSADKKETKETKEDGTVTFYVVRHGKTMLNTTDRVQGWSDAVLTPAGEEVVKSAGKGLKDVDFSAAYSSDSGRAIQTANLILKESDKSADKEVQTDPRFREFNFGSYEGDLNENMWTDIAKSQGKTLEEWQKAGLSPKDFANSVAALDKTRVKEGENWPAEDYATIQARLKEGLTDVAKKESKNGDSNVLLVSHGLSIGALLDTIEPGYKLPAEGIKNASVTKITYKDGKFTIGDVNDLSYVEKGSK >NC_017546.1|WP_003727296.1|551239_551608_-|DUF1304-domain-containing-protein MAILAFILTFIVMIEHIYIMILEMFFANTKLAAKTFGVEKELLANKKVQTLFANQGLYNGFLAAGLVWGLFFAGAGFAETVQIFFLSCVVVAALFGGATSSKGILVKQGLPAVLALVAVLLV >NC_017546.1|WP_009931218.1|551754_553170_+|multidrug-efflux-MFS-transporter MQQEATGGQKIRPIPIIASFLMAGFIGLFSETALNMALSDLIQVFDISSATVQWLTTGYLLTLGILVPISGLLLQWFTTRGLFFTAVSFSIAGTLIAALSPTFAMLMIGRVVQAVGTALLLPLMFNTILLIFPEHKRGSAMGMIGLVIMFAPAVGPTISGLILENLTWNWIFWISLPFLIIALLFGMKFMQNVSVVTKPKIDILSIILSTLGFGGVVFAFSSAGESGWGSATVLVSIIVGGIALGLFVWRQLTMEKPLMDLKVFKYPMFTLGLILVFISFMMILSTMILLPLYLQNSLALAAFSAGLVLLPGGVLNGLMSPFTGRLFDAYGPRALVIPGFIVAVVALFFLTRIEVGTSALTIIVLHSVLMIGISMVMMPAQTNGLNQLPPKLYPDGTAIMNTLQQVSGAIGTAVAITIMSAGQKAYMETAQGVGPEQMVASLTAGIQNAFVFGLIMACIGLLCSLFIRKAK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_017546_4 | 2808907-2809017 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_017546_4
|
1 spacers
spacers of NC_017546_4
>4.1|2808941|43|NC_017546|CRISPRCasFinder TGTACTTTATTTTGATTTAGTTCTTCAATATAAATCTGAGCAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017546_4
The CRISPR arrays of NC_017546_4 >merge|NC_017546|4|2808907-2809017|CRISPRCasFinder AGCGATGATTTAATCCTTCCCAGAACTTTCAAAATGTACTTTATTTTGATTTAGTTCTTCAATATAAATCTGAGCAAAGCGATGATTTAATCCTTCCCAGAACTTTCAAAA >NC_017546|4|3|2808907-2809017|CRISPRCasFinder AGCGATGATTTAATCCTTCCCAGAACTTTCAAAA TGTACTTTATTTTGATTTAGTTCTTCAATATAAATCTGAGCAA AGCGATGATTTAATCCTTCCCAGAACTTTCAAAA
>NC_017546.1|WP_003732084.1|2807053_2808793_-|DNA-polymerase-III-subunit-gamma/tau MAYQALYRVFRPQSFQDVVGQEHVTKTLKNAIVQNKTSHAYLFSGPRGTGKTSAAKIFAKAINCEHGHDGEPCNECEICKGTTDGSIPDVLEIDAASNNGVEEIRDIREKVKYAPTVAKYKVYIIDEVHMLSTGAFNALLKTLEEPPKHVIFILATTEPHKLPLTIISRVQRFDFKRITTQDIIGRLKFILEEEKIPYDEKALMIVARAAEGGMRDALSLLDQVISYGSEEVTVEDALEITGSVAQNLLTKLVSAAFDGDAAEAISTLTALLAEGKDPVRLVEDLLVFFRDVLLYQKAPNLEETMERALIDDDFVALAKRADSLKVYEFVKILNTAQQQMRFSNHPGIYVEVALVQLTQAGQSVAGGGNVPADAASGSDVSDLKRQMEQMHQEIQTLKKQIASGAGAAPADKPTQNRGGSKKAINNGKQFKAPIGKINHVLGEAKKENLQLIRGCWGELLSMLMASQAALLNDAEPVAASQDTFVLKFKHEIHCQMAMDNPNFVETITSSIARLTQVNYTFIGIPEDQWADVRENFLHSHGSDADAEDGANPEAKKPAEDPFVAEAAKLVGEDLLEIKD >NC_017546.1|WP_003722063.1|2806706_2807024_-|YbaB/EbfC-family-nucleoid-associated-protein MRGMGNMQGMMKQMQKMQKEMAKAQADLEAQEFTGTAGGGMVTVKATGKRVITDVVINEEVVDPEDIEMLQDLVLAATNDVLKQIEDTTSQTMGKFTQGLNIPGM >NC_017546.1|WP_003722062.1|2806001_2806598_-|recombination-protein-RecR MHYPEPITKLIDSFMKLPGIGPKSAARLAFYVLDMKEDDVLDFAKALVDAKRNLSFCSVCGHITDKDPCYICADTSRDRSVICVVQESKDVIAMEKMRDFHGLYHVLHGTISPMDGIGPEDINIPDLLKRLQDDTIEEVILATNPNVEGEATAMYISRLLKPSGIKVTRIAHGLPVGGDLEYADEVTLSKAMEGRREV >NC_017546.1|WP_003722061.1|2805741_2805987_-|YaaL-family-protein MESRSNKFGRKKNKKIGKLHKSYDAYLMELIEVTQENWHKQKVLMRKSFEYDPNLEYEEKKAEARYFYLFKEARTRQLKNK >NC_017546.1|WP_009931159.1|2804853_2805696_+|aldo/keto-reductase MTLSFSDTYRLNNGIEMPRHGFGVYKLTDEARMRTALETAVDVGYRLFDTASFYHNEKELGDFFASSGLKRDEFFVTTKMWNTEQGYDETLRAFEKSQKKLQLDQIDLYLVHWPKQDTFFDTWRAVEKLYDEGLVRAIGVSNFEAHHLDRLRTSANVLPVVDQLETHPHFPNHLLHRYLEELHIVHQAWSPLGRGGVLQEQILIDLAEKHGKSPAQIVLRWHLQNNISIIPKSETPSRIRENAAIYDFELSEADMRQVERLNTGERVSHAPDVMYVRSEI >NC_017546.1|WP_010990045.1|2803893_2804733_+|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MTTQAIILDIDGTLLNDDKQISPETKKALITAQENGVKLILASGRPTTGMHVYAEQLEMEKHHGLLVSYNGAKVVDCATNEELFNQALTVEEGKAVLEHMKQFEVKVMIDKEDYMYTNDVYDCYVPYRGEEINIIQYESRGGNFKLCEKDDLAAFLDYRLSKILTAGDPAYMQKNYQAMMAPFKDTLNCVFTADFYFEFTAQGIDKAKALDTVLTPMGIHAENVIAFGDGHNDITMVEYAGTGIAMQNAVPELKAAASSVTLSNNEDGIAHVLNSLIPS >NC_017546.1|WP_010990044.1|2802923_2803775_+|MurR/RpiR-family-transcriptional-regulator MNILIKIRELTNLTNSEKELANYILANPKKTLQFKPKELATAAFVSAATIYRLINKLGLNGIGELKIEIASSLRETSEEKDLNYDYPILESDTPYQIMTNLHQIYKGTIDETLNNADPEELVKIGEKLIQAKTIDVYAASANLFFAQNFKFQMQEIGVLVNVPEEDYIQSLSAANSDENHIAIVVSYGGRSRTLQRVVKILSENNVDIILITSMQDNPLVEFATHKIYMASAENHYNKVSSFSTRQSLLSIFDTLYSIYFNQNYEKNIQYKTTNYQKMNTELE >NC_017546.1|WP_009930438.1|2802443_2802818_+|PTS-dependent-dihydroxyacetone-kinase-phosphotransferase-subunit-DhaM MAKPYGVVIISHSKDVAKGVHDIIKEIAPDVSITHAGGTEDGRIGTSFDAVNEAIENNEANKVYTFYDLGSAKMNIETVEEISEKEIILFNAPILEGAYATAAQVQMDEKPEVIAANLKTIEIK >NC_017546.1|WP_003722056.1|2801843_2802440_+|dihydroxyacetone-kinase-subunit-L MTYDKDWALRWLNDFGERVQENKQLLSDLDQAIGDGDHGINMARGLGELKKAFTEKEPADLKDVFKTAGMTMVSKVGGASGPLYGTAFLNMSKAVDADTIDAVGLTKVIEAGLEGIEKRGKSHAGEKTMIDVWEPVVHALHQEDLTDDVVDAALQKTKDLKATKGRASYLGERSIGHLDPGAYSSALLFHAMLQTEVS >NC_017546.1|WP_009930437.1|2800832_2801822_+|dihydroxyacetone-kinase-subunit-DhaK MKKILNGTDQVVEQMVEGLVKSHADVVHRVEGTRVIARNDKRPGKVGLVSGGGSGHEPAHAGYVGRGMLSAAVCGDVFTSPTPDQIYEGIKAADQGAGVLLIVKNYTGDVMNFEMAADLADADDIKVEQIVVDDDIAVEDSTFTTGRRGVAGTVLVHKIIGAAAEAGASLDELKALGEKVIASVKTLGVALSPCTVPEVGHPGFELGDDEIELGIGIHGEPGFTREKIMPSASLAKQLYERISNESKLLAGDKVVVLVNGMGATPLMEQYVFANDVHELLKNAGVQVEKTLVGDYMTSLEMAGLSLTILKLEDEKWVDMLKLPVDTIAW >NC_017546.1|WP_003722065.1|2809119_2809584_-|DUF3284-domain-containing-protein MNVTQKLYISQKECFDTLVSSAIYDVKNATGKTLQVRKLEGYKYQRTMSNGALATTKIVKVQPNELYQFETSSRVNTHTTTYTIKSTSETTCEVTYNELIETEKALNKMNNIIVGFMFGFFRKKRVKNLLKSIELSVINESKQKQEKLAAKSEQ >NC_017546.1|WP_003727657.1|2809601_2809784_-|DUF3188-domain-containing-protein MKIVNALFLISIGLIIIMFSPSYGKDGMASVPLLVTGLAVVLIGCVFIVLKIRKDKKEKN >NC_017546.1|WP_003722067.1|2809786_2810008_-|hypothetical-protein MIILNCPMKRDYITELLETYDKDGVTFKKIDEKGMKLTFETNIEDEEKAAKIAKETIKATEIGSVLYFQVSVG >NC_017546.1|WP_003725004.1|2810142_2811507_-|PTS-sugar-transporter-subunit-IIC MNGLTAFLEKYFVPVAAKIGSQKHLVALRDAFISTMPITMAGSIAVLLNAFFRDFPTDWGWTGFVEAMQPLIGINGYVYNGTLAIVSIIFAFSLGYNLSKAYEVDRLAGGLVSLAAFVMNLTVTVSLDAVKAAIAASNANFDVATLPKEFAGIYGFFSLSQVNGTGLFTAMIFGFISTIIYAKLMRRNIIIKMPDSVPPAVSKAFAAIIPALVALYVVGIIDWAFFKITNMDVITWISKTIQEPLLSLSQGYGAVLLVTFLVQLLWFFGIHGPNVLAPVLESLWGTAQLQNISAAQEGAKLPFEWVRGSFDAYVWMGGSGGTLVLIIALLMFSKRADARTVAKLSLAPGIFNINEPIMFGLPIVLNTIYLIPFLIAPMVMVTIAYFATTLGIVGPVKIAVVWVMPPLLNSFLATGGDWMAPVISLINMVVAFLIWVPFVITANRVGVPEEEMKA >NC_017546.1|WP_009931588.1|2811948_2812104_+|hypothetical-protein MAVKRDMPEESKNSKVVKKEHFSIVFPDDIKEPATVEEKKKQDAEKKTDDN >NC_017546.1|WP_009925039.1|2812675_2813317_-|hypothetical-protein MQQLKSKKKWLPALIVAVFVGIIVILAIMFGFFQRQEVFDKYEVAYEIDGKLYEVFPISATDIGVDKKSKDKNLYFRVNSYYNIDYLFRLAYKQYEINEPSTNKYYSGLIDYSVADNAYVTQKDVYITNNESYATYDFFDKNGKKIYTYNPEETSNDDYIVRIKPTILQGYEKSDIGSYDDYLNITALFKDKLGMDVNVRIDEDKEMVIFSIK >NC_017546.1|WP_003732087.1|2814014_2815529_-|gluconokinase MTSKPYIMGVDIGTSSTKAVLFNQRGEVIFRQATHYELITDETGKAEESPTEIFDAVLTSIQAVMKNINTEELAGISFSSAMHSLIMVGSNGELLTECITWADGRSSETLEKVKRDNYLFQLYEATGTPIHPMSPFAKICWLKEEKPTLFKRTEKFVDIKSYILYRLFGVWVMDESLASGTGLYNIMEHDWEFEAMEIVKLTPDFLPKVVPETYQLAGVKKEYAELMGIPENLPFIIGGSDGALANIGIQATGQNDVTITVGTSGAVRKLTDQFQIDSRGRTFCYGAGDGYFIAGGAVNNGGKVVEWGLQQFGSEAEISRRDFASFIAKIEEVPPGAAGLLFQPYLLGERAPFWTNDIRGGFVGLTINHTKAHFIRAILEGVAFNLAEVYEAVSAPDDIIYVTGGISAHDAWCKLLADILNREIRVPHTIEGSSLGAAIIGMRSLGILKDLNLKHTLPIKAVYHPSENVLKYAELRLIFKQVTTQLMSSYSQLNSWQKKFDINS >NC_017546.1|WP_003732088.1|2815644_2816583_-|GW-domain-containing-glycosaminoglycan-binding-protein MKKLLSGLIVVLMVSLLGHSFNAEAASYEKIIYDKAVNLKGVVNQSKRNDGINSKMYKTSSSVKYLGSAKKYDKKTLIITREGKTARAKWYYCKLGNTTIGWIDSRAFTNIGKPTIADAVPALWNSKKAIITTKPKSTTATTYFFQKNSAGNWYEVRHFTSHIGKWGFDPKFSEKSSGTPVGVYRTGIAFGQKGNPGTKLTFRAITNRSYWISNSNDKAYNTWQERNSSSSADEKMKIPQYKYGMEVKYNAKRVKGKGSAVFYHVDSPKYNYTLGCVAQSEANTKEVLKFADKNTLIVLGEESRIKTFYGIN >NC_017546.1|WP_003722074.1|2816625_2817573_-|LPXTG-cell-wall-anchor-domain-containing-protein MKKFHGLILTALVTCLIIPFSLAASAETNENGNNSTPTEEKTTDTTENIITEEKTEPAEPTKDTTVTPPQKSKVQTTIDITDSQEVYSYEQNSKIDLKDFTATLTDYTDTKLTNYRLAANSKLSTAQTGIQEVTLLGDNEDGKTTAVKLNYLVKEKTAQLTITDMNFDLETKIFTGKTKPFASVYMSSPADENFGEGTTTADKDGYFYAEWATTPKQITAYAFDESGNYSEEVTYQVPAKKQNEAVVTAPDKVKKIETKNAVKSATTKPTDVTKVTKDDKTDLPSTGDKGTEWIFVVAGVIVILVAVLLLRKRKK >NC_017546.1|WP_014601547.1|2817713_2819453_-|thiol-reductant-ABC-exporter-subunit-CydC MRKSSWIIPYIKENRGLFLLVIFLGTLTFASAGALMFTSGHLISKSSLMPESIMAVYISTVGVRAFGIMRSVSRYVERLSSHSLVLRILEKMRVRLYRLLEPQALLLKSRYKTGDILGLLAGDIEHLQNFYLTTMLPAIVSLVLYAGVVIALGAFSIPFAALFVLLIGLLVLVLPWVSLLYARGKNAYLKQGRNSLYQKFTDAVFGISDWKFSGREKTFISNYEKDEADMLRTENKQFHFVNWRDFFSQLVVGFMVIVMVYWSTAESRDGAFSGTLIAAFVLAIMALAEAFVPVSSAISDKSLYQDSLARLDKIEDPALPTFEEETKEIERINTENVVLKAENLTFAYNEKSPEILNGFDFTLQQGEKVAIIGRSGTGKSTFLKLVQGALLPTAGKVTMNDVEVEKLRPQIPELTSMLNQKAHLFSTTVLNNIRLGNQDASDEEVYEAAKKVQLHDFIMSMPDGYHTQMSEMGERFSGGERGRIALARILLQNTPIVILDEPTVGLDPITERDLLATIFETLADKSLIWVTHHLVGAEKMDRVLFLEEGKTLMEGPHAELMAEEPRYKRLYQLDRPIEL |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_017546_3 | 3.3|543211|35|NC_017546|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 543211-543245 | 35 | MH341453 | Listeria phage PSU-VKH-LP041, complete genome | 10139-10173 | 1 | 0.971 |
NC_017546_3 | 3.3|543211|35|NC_017546|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 543211-543245 | 35 | NC_009813 | Listeria phage B054, complete genome | 10139-10173 | 2 | 0.943 |
1. spacer 3.3|543211|35|NC_017546|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH341453 (Listeria phage PSU-VKH-LP041, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
gcgatttttgtcaaagggacagcgatgggttacaa CRISPR spacer gcgatttttgtcaaaggaacagcgatgggttacaa Protospacer *****************.*****************
2. spacer 3.3|543211|35|NC_017546|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_009813 (Listeria phage B054, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
gcgatttttgtcaaagggacagcgatgggttacaa CRISPR spacer gcgatttttgtcaaaggaacggcgatgggttacaa Protospacer *****************.**.**************
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
120588 : 127113
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_017546|120588:127113|DBSCAN-SWA TTCAAAACTTCTTGTAAACATCAATGGAATTGCCAAAATTAATGAAATATCCACCATAATCATACATTGGACCATATTTTTCCGCGTAATGAGAAACTGTATGGCGCAAAAATTCTTCTGTTACCTCTAAAAACTCCGCTACTTCAAAATATTCTCGTAAGCCTAGATAAAAACAAGCAATGATGTCATCAAGCGGTATTAGTTCCTCATAACCTTTGCGACGAGCGAAAATTTCTTGTTTTTTATCCATGATTGTTTCCTGTTTGGTGATATTACCTACAGTGTATTTGTAATGCATCAATTCTTCTACTAAAACACAGCCTTTTTCAATGGAAGATTGATCCTTACTAATAAAAATCATCCCATTTAAATAAAGTCCCGGAAGTTTGTAAGGCATTTTCTCTTCTCTGATTGTTACCTCATCTTGGTATTTATTTACCAATTTTTCGTACAATAAAATCACATCCCGCGATGGAGTTTTTTCTTCATCTCTATATAAGCTAAAATATCCCGCATTTCTTCCTCGGTTACGTCATCATCAATATGGGCTGCAATTGTTACCAAGCGTTCATCAACAGGGGGTAAATTTCTTTCAGGAAAAAAGTCATCTAATCGTTTGTTGAAGATTTTTGCAAGTTCAAATAAAACATCTTGATTTGCTTTTCGATCGCCATTTTCATAACGGCTAATAGTTTGGCGAGTTGTATGAAGCTTTTCTGCTAATGCTTCTTGATTTAAGCCTCGTTCCTCGCGATATTGTTTTATTTTATTTCCTACAAATTTATTTAGCTCCATAATAATTGTCCTCCATATGTTTATGGCTTCAGTATAGCACTTTTAGCACCAAAACGGAACTTTTTCGAACATATTTGTCGGATAAAGTTTACCAGTAACCAAAATGGTGCTATAATATTTGTAGAGCTAGAAAATAAATGTGGCTGATTTTGTACCGATAGCACCAAATTGGTGACAAAACTACTATATTAATTTATGAGATGGAAGTGGGAATGGATGGATAGAAAACTTTTAAAAGAAAAGCAAATCCAACTAATTTTTCAACTAGAACAAGAAGAAAATCGATTTATTCGAAAGCGTTTGATAGAAGAGTTGGAGTTTTTTGAAGCACTTGGGGATAGGGAAAAAGGACTTCTAACGGCGGAGCAAAAGTTGCTTATTTTAACACCTAGTGAGTACCGAGAATACAAAAGAACCAAATCAGATGTGCAAATTAGTAGGATAATTGGAGTATCGAGATCGTCACTTGCAGAATGGAAACGAAAAAAAGGTTTAAATAGAAAAAAGTCGCAACCGGTTCAGCAGGAAATGATTGATGTATTAGCTTTTCATTTAGATAAAACAAAAGAAGAAATTGGCGCTTTACCTGCTTCGGCGATTGAATGTCAGTATGAGGCTTTTGTGATTAATGAAGCCAATAATTAAGGAGTGATAAAATGCAGGTTTTAGTTTTACCAGAAAATAAGGATATCAATTATATAAAAACGGTCCAAGAAGTAAAACGATTTTTTGCGGATTTTGAGCGGTTTCGGATGATTACGGGGTTATCAAAAAAGCCACATTTACTTAGAAATGGTTTTCTGGAAGAGCCGCAGTTTGAGCCGGTAGCATTTTCTGCTAGACATAATAAAGAAGTCATTTTGGAAGCGCGATGGTTGGTAGAGAAATATACTGAAATGTTGAATCAGATGGATGATTTATATCGAACTATTTTGATGGAATGTTACGTGGAACGAAAACAAGATGTGGCGGTAATGATGGATTTACCGTATGAAATTGCCCAGTTTAAACGGATAAAAAAACGGGCAGTGCTAGAACTTGCAACGCTAATGGGGATTTTAGTAAGGAAATGATGATACTTTCGTGATATTTTGAAACATCATTTTCCTATTAATATAGAAGTAAGCTAATTGTCCAGTAAGCGGATGACAATAAAAGCTGCATCAGAATGAAGGTGCACCGATTTTCTGATAATACATGATGTTTTACAAGGAATTTGTTTTTATGATTGGATTTAAATCCGTTGAGATAAACAAATATTCTATTTTGGAAAGTAAAGTTCGGAGGAATAAATTATTAAATGTGGTCTTGACCGAACTTTGCTTTCTGTTTTAAAGGAGTGAACGTTTGGTGAAGAGTTTGAGCTTCATGAGAGTTTTGGAAGCAGTGAGAACAATGCTCCAGGAAAAAGGCGGACTAGATATTTCTATTGTAATGCGTGACCAAGTGGAAATGCCTACAACGATGATCGAGATGATTGATCAAGAGGAAGAAGAAAGCCAAACTGCCTGGAAAGAAAAATACCGTTTTGCAATCCATCATTATACAAATGAAACGGACTTAGCGGGAGTCGAAAAGATAGATACGCTTATCCAAACAGGATTCACTTTGCCTGAAGGATACAAATTAATCGCTGTTCGACATTACGGAAAACAAAATTTAGTCAAAGAAAATACGTTAATTCACGCAAAAACCAGTTTTGAAGTAAGTATTTGTCGTGAATTAAAAGTAAAAATTTAGGGGGAAATATTAATGGCATTTGAAGAGAATTTATATTGTGATTATACACCGGGAGCTGCTAAAGCGGTCGCGGGGAAAGATGTAATTTTAGCAGTTTTTAACGCAGCGGGGGACAAACTATTAGCGGTTGCGGGCCAACAAGGTCTAACTGTAAACCGTTCTAAAGATAGCATTGAAATTACATCTAAAGATACAGTTGGCGGATGGAAATCCAAAATTGGCGGTATGAAAGAATGGTCAATTGAAAATGACGGATTATATGTCGCTGATGCAGAGTCTCACAAAGAATTGGCGAAATATTTCGAAAGTGATAGCCCGGTTTGTGTGAAAATCATTAATCAAGCATCTAAAAAAGGTCTTTTCGGTGGTTTGGCAATTGTAGCTGACTATAGTTTTGAAGCACCTTTTGACGAAGCGATGACTTACTCTGTAAAACTAGACGGAATGGGCGCGCTTGTTGATTTAACGATTACTGAGGGCGGCGACCAAATGCCCGGCGAAACACCTGTAGCACCAGCAGAATAAAATAGAAAGCCACTGAAATAAGTGGCTTTCCCTTAGGAGGAAAATAAATGTTTGAAGTGAATGATACAACTTATATTTTACGATTTAATAAACAAAAAGTTAAAACGGTGGAATTAACATCAGGGATTAGTTTAGTTGCAGCTTTGACTGCGAATAAAGGGATTTTGAGCTATCAAGTGATTGAAACGCTATTTGTTTCAGGACTTGTGGAAGAAAAAGGCTTAGTACCTGTAAAACAAAAAGAAGCTTTGGAGATTTTCGACAAATTAGTAGAAGAACAAGGCTTAATTTCGCTTAATGTAGCTGTTATTGAGAAATTGCAAGAGGATATGGGTTTTTTGTTCCGTTAAAACAGATTGAATTTGAGTATTTTGGTGCTGAGGACGAAGAAGTGGATAGTGAAATGAACCATGATTTTGATTTGGAAAAACAGTTCGCTTTTTTTGTAGTCAATTTTCGAATGTCCAAGCATGATTTTGAAGAACTTACTGAAGTGGAGAAAAATTTCATCATGAAAGAATGGGAAAACAAGGTGATTTTTGAATCTACTATGCTTCGAAATGCAGTTTTAAATGCGGAACAAAATCTCAATCGAAAACGAAATTCCCGTTTTATCGACTTGCATAAAAAACGTCAGAAGAAAGCCGATGTTAATTATACAGTAAATGCACTTCAAGCAATTTCCGAGAATGAAGCGAAGGAAGGTAAAGCGTGGATTGATCGGATTTATGGTGCAAATGGGTTGCGAAGACCTAAGAATAAAGAAGAAAGGAGGAACGTGAATGGCGGATTCTAAAAGTTTTACATTTGAACTCAACGAGAGCGTTTTAACAGCGCAAGTTGGCAGGCTAGATGAAATGGCGATGGTTGTAGAGCAACGATTTTCAGAGCTCAAAATGACTATTGAAGATGTTGGAAATGCTGATCCAGGTTCGAAAATTTCCGAGTCTTTAGGTGGGCTGCAGTCTGGGCTTGGCACGATTAGTTCGGCGTTTGGACAGCTGGGTTCTAGTAGTGAGGCGATTACATCTGGATTCGGTACTGCGGTTGGTTCTGTTGGTGGAATCACGGATGCGTTTAAAAATCTAGGTTCAAGTGTGCAAAATGGTACGTTATTTTCAAGCTTGGCGACTGGAATTGGTGGCATGAGTACGATGCTTGGTGGAGTATCTGGCGGCGTTCAAGGAATTACAAATCTAGCTAGTGGTTTTATGGAGTTGAAGAACCATTTAGGCGGATTAATGTCTTCTATTGGCGGCGTTGGTGGAATTATGGGTAAACTGACCTCTCCTATGGGGTTAGTTATTATCGGTATTGTAGCGTTAGTAGCTGCATTTGCGTATTTGATGACGACGAATGAATCATTCCGAAATACGGTGATGTCAGTCGTAACACAGGTTGCGCAACTGTTCGGTCAACTTGTCGCCAGTTTAATGCCGATTATCATGCAAATTGTTACTGCGGTTATGCAAATTGGTGCCGCGTTAATGCCAATGGTTATGCAATTTATTAGCTTTTTTGCGCAATTGTTAGCCCAATTAATGCCGTTTATTAATATGCTGATTTCCATGCTTATGCCTGTTATTATGCAGATTGTTCAAGTTGTTATGTCGCTTGTTTCGGCACTATTACCGAGCATCATGACAGTGATTCAAGGCATTATGAGCGTTATTCAATTTTTAATTCCAATAATCATGCAAATTGCGACGGTGGTTGTACAAATTGTTGTAACGATTATTTCTTATATAAGTAAAATTATGCCGATTGTAATGACGATTATTGGCGTTATTGTTTCGATTATCACAACGATTATTAGTTACGTCGTTATTATTGCGACGACGATTGCTAGTGTTATTGGGAAAATTATTAGCTTTATTGCGAGTGTTATTACGGCGGTTATCGGGATTGTGCAACCAATTATTGCCTTTATTACCAATATCTTTACGACTATCGTGACAATTATTGGTGCAGCTTTCCAAATGGTATTTACTGTTGCATCCAAAATTTGGAATTCCATTATGTCGACTATTTCCGGAATTATTGACGGAATCAAAGCAGTCATCACAGGTATTTCTACTACAGTTTCATCAGTGTTTAACGGAGTGAAGCGCATTATTACAGGTGTTTTTGACGGAATCAAAAGTGCTTGGGGTGGTTTAACTGATTTTGTAGGAAATATTTTCGATGGTGTTTCAAGTGCAATTCAAACAGTGGTAGACAATGTCAAAGGTTTTGTAAACGTGGTAATTCGAGGGATTAATGGAGCCATTGGTTTAATTAATAAGATTCCAGGAGTTGAAATCGGCAAAATACCGCAATTAATTTCCGGAACAACAAATTTCCAAGGTGGCTTTGCTCGAATGAATGAAGGCGGCCGAGGCGAAATGGTTGTTTTACCGTCGGGTTCGCAAGTAATTCCGCACGATGCAACGATGAAATACGCAAGAGAAAGTGCGCGCGGAAATAAATCAATGCTTTACACGAGTCAAGGCGCTGATTTGGCTAGAGTTGAAAATCTTCTCGAGCGCTTACTACAAAAAAATCCTGTAATCAAAATGGATGACAAAGTGGTAGCTGAGGTAGTTAGCCGTAATCAAGCTAACTCATTTGATCAGTACAACTACACAATGGGAGGTGCAGCTTATTCATGAGTGACTTGTTTTTAGAATTAAATGGAAAAGTGCATTCGCTTAGTGAGACATTTCCAGGTCTTTCTGTACAAGAAGTTTCGAGACAAAGTCCCCAGTTAAGCATGGAAACTGCTGAAATAGCTGGGACTGATGGGGTTATCCCAGGAATGACCCAATTTAAACCGTTTATCTTTTCAGCAAAATGTAATTTGCAAGCACTTGATATTCCAGATTATCATTTGGCAGTCAGAGAAATTTATGAATTTTTATTCCAGCGCGATAGTTATTATATTTGGAGCGATCAAATGCCAGGAATTCGGTATGAGGTGCATCCTAAACCAGTTGATTTTAGTCGAGAATCGGATCGTGTTGGTTTACTCACTATAGAATTTGATGTATTTAAAGGTTATGCGGAGTCACGTGGCACGAGCCTTGACCCTATGACTTTTGAAGTGGATTTATGGCAAATGGGAATGAATTTATCGAACCGTGATGATTTATTTTATATTTTTAAAGAAAATACATTTCGGGTCTATAATGCGGGGAGCGACCGTGTTAATCCACTGATGCGGCATGAACTAGATATTGCGATGACGGCGAATGGGACACCAACGATTCATAATCTTACAACGGGAGAATCCTTCGAGTATCAGAAAGAGCTCCGAAAAACAGATGTTTTACTGTTGAACAATATTTATCCACTTGTTAATAACCGCCGTGTTGGAAAAGATACCAATCATGGGATTATCACCCTTGAAAAAGGCTGGAACGATTTTGAAATCAAAGGTGTAACGGATGTAACGATTGCTTTTAATTTTCCGTTCATTTATCGGTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_017546|120588:127113|121046_121382_-|WP_003721740.1|DBSCAN-SWA MELNKFVGNKIKQYREERGLNQEALAEKLHTTRQTISRYENGDRKANQDVLFELAKIFNKRLDDFFPERNLPPVDERLVTIAAHIDDDVTEEEMRDILAYIEMKKKLHRGM >NC_017546|120588:127113|126294_127113_+|WP_009911828.1|tail|DBSCAN-SWA MSDLFLELNGKVHSLSETFPGLSVQEVSRQSPQLSMETAEIAGTDGVIPGMTQFKPFIFSAKCNLQALDIPDYHLAVREIYEFLFQRDSYYIWSDQMPGIRYEVHPKPVDFSRESDRVGLLTIEFDVFKGYAESRGTSLDPMTFEVDLWQMGMNLSNRDDLFYIFKENTFRVYNAGSDRVNPLMRHELDIAMTANGTPTIHNLTTGESFEYQKELRKTDVLLLNNIYPLVNNRRVGKDTNHGIITLEKGWNDFEIKGVTDVTIAFNFPFIYR >NC_017546|120588:127113|124429_126298_+|WP_010989347.1|DBSCAN-SWA MADSKSFTFELNESVLTAQVGRLDEMAMVVEQRFSELKMTIEDVGNADPGSKISESLGGLQSGLGTISSAFGQLGSSSEAITSGFGTAVGSVGGITDAFKNLGSSVQNGTLFSSLATGIGGMSTMLGGVSGGVQGITNLASGFMELKNHLGGLMSSIGGVGGIMGKLTSPMGLVIIGIVALVAAFAYLMTTNESFRNTVMSVVTQVAQLFGQLVASLMPIIMQIVTAVMQIGAALMPMVMQFISFFAQLLAQLMPFINMLISMLMPVIMQIVQVVMSLVSALLPSIMTVIQGIMSVIQFLIPIIMQIATVVVQIVVTIISYISKIMPIVMTIIGVIVSIITTIISYVVIIATTIASVIGKIISFIASVITAVIGIVQPIIAFITNIFTTIVTIIGAAFQMVFTVASKIWNSIMSTISGIIDGIKAVITGISTTVSSVFNGVKRIITGVFDGIKSAWGGLTDFVGNIFDGVSSAIQTVVDNVKGFVNVVIRGINGAIGLINKIPGVEIGKIPQLISGTTNFQGGFARMNEGGRGEMVVLPSGSQVIPHDATMKYARESARGNKSMLYTSQGADLARVENLLERLLQKNPVIKMDDKVVAEVVSRNQANSFDQYNYTMGGAAYS >NC_017546|120588:127113|121598_122027_+|WP_003732219.1|DBSCAN-SWA MDRKLLKEKQIQLIFQLEQEENRFIRKRLIEELEFFEALGDREKGLLTAEQKLLILTPSEYREYKRTKSDVQISRIIGVSRSSLAEWKRKKGLNRKKSQPVQQEMIDVLAFHLDKTKEEIGALPASAIECQYEAFVINEANN >NC_017546|120588:127113|120588_121041_-|WP_003721739.1|DBSCAN-SWA MYEKLVNKYQDEVTIREEKMPYKLPGLYLNGMIFISKDQSSIEKGCVLVEELMHYKYTVGNITKQETIMDKKQEIFARRKGYEELIPLDDIIACFYLGLREYFEVAEFLEVTEEFLRHTVSHYAEKYGPMYDYGGYFINFGNSIDVYKKF >NC_017546|120588:127113|122038_122455_+|WP_003721742.1|DBSCAN-SWA MQVLVLPENKDINYIKTVQEVKRFFADFERFRMITGLSKKPHLLRNGFLEEPQFEPVAFSARHNKEVILEARWLVEKYTEMLNQMDDLYRTILMECYVERKQDVAVMMDLPYEIAQFKRIKKRAVLELATLMGILVRK >NC_017546|120588:127113|123134_123647_+|WP_003721744.1|tail|DBSCAN-SWA MAFEENLYCDYTPGAAKAVAGKDVILAVFNAAGDKLLAVAGQQGLTVNRSKDSIEITSKDTVGGWKSKIGGMKEWSIENDGLYVADAESHKELAKYFESDSPVCVKIINQASKKGLFGGLAIVADYSFEAPFDEAMTYSVKLDGMGALVDLTITEGGDQMPGETPVAPAE >NC_017546|120588:127113|122732_123122_+|WP_009930418.1|DBSCAN-SWA MKSLSFMRVLEAVRTMLQEKGGLDISIVMRDQVEMPTTMIEMIDQEEEESQTAWKEKYRFAIHHYTNETDLAGVEKIDTLIQTGFTLPEGYKLIAVRHYGKQNLVKENTLIHAKTSFEVSICRELKVKI >NC_017546|120588:127113|123694_123997_+|WP_003721745.1|DBSCAN-SWA MFEVNDTTYILRFNKQKVKTVELTSGISLVAALTANKGILSYQVIETLFVSGLVEEKGLVPVKQKEALEIFDKLVEEQGLISLNVAVIEKLQEDMGFLFR >NC_017546|120588:127113|124038_124443_+|WP_009930419.1|DBSCAN-SWA MDSEMNHDFDLEKQFAFFVVNFRMSKHDFEELTEVEKNFIMKEWENKVIFESTMLRNAVLNAEQNLNRKRNSRFIDLHKKRQKKADVNYTVNALQAISENEAKEGKAWIDRIYGANGLRRPKNKEERRNVNGGF |
10 | Listeria_phage(33.33%) | tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1122790 : 1130213
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_017546|1122790:1130213|DBSCAN-SWA AATGAAAAAGGTTATTACATATGGAACATTTGACTTGCTTCATTGGGGGCATATTCACTTATTAAAGCGCGCTAAGGCTCTTGGTGATTATTTAATAGTAGCAATTTCTTCCGATGAATTTAATCGAATTAAACATAAAGAAGCTTATCATAGTTACGAACACCGTAAATTAATTATTGAAGCAATACGTTATGTGGATGAGGTGATCCCAGAGAATAACTGGGAACAAAAAAGAGATGATATAGAGAAATACGGAATTGATGTTTTTGTAATGGGTGATGACTGGGAAGGCGAATTTGATTTTCTAAAAGATGTGTGTGAAGTTGTTTATCTTCCTCGAACAGAAGGGATTTCTACGTCTCAAATAAAAGATGAACTAAAATAAAAATGTGAGAGGAGCATTCTTTTGGAACCTTTAGTAAGTGTAATTATTCCAGTTTATAATGTAGAAAAGTATGTTAAACGATGCTTGGATTCAGTTCTTGAGCAAACATATCATAACCTCGAAGTTATCGTAGTTAATGATGGAGCGACTGATAATTCAGCTAAAGTCATAAAAAGTATCTCAGATAATCGAATTCGTTATTTTGAAAAAGAAAATGGCGGACAAGCTACTGCCCGAAATTTTGGATTAGATGTGGCTACGGGAGATTACATCGTGATGGTAGATAGTGATGATTACATTAGCAAAAACCTAGTAGAAACTTGTTTGGATACTGTACAAAAAACGAATGCTGATTTAGTCTTGTTTACTTCATATAATGTGAATCAGGAAGGAAAAATGCAGTATATAAAGCGTGATAAAGGCATCAAAGTTTTAGATGCAGGTCCAACTCCATGGAACAAATTTTATCAAGCAGATCTATGGAAGGGTTCGCGTTTTCCAGTAGGTTATTGGTATGAAGATCTAGGAATTATTCCAGTCGTCACGCTAAAAGCAAAAAATCCAGTGAAAATCCAGGACGCACTTTATTACTACATAACTGATAGAGCGGATTCACAATCGAATATTCAACAAGTAGATCACTTTTTAGATGTGGTTATTATGTTGGAAAATGTTGAAACAGAATTAAAAAAACTAGGTATTTACGAAGAATCAAAAGATCAACTTGCGTACCTATATATAGAACATCTAATTTATCGTTTAGTTTTACGAAAAGCGATTTACATTACGAATAAGCAAGAACGAAAAAAACTTATTAAGAAAATTAGTACAATTATTCAAGAGAAGTTCCCTAATTGGGGTAGTTATCCTTATCAAGCGGGTGGCAAACTAACTGCAACATTAAAGAAAAAAGCATTATGGCTTTATTTACATCATTTGTACTTGTTGGGTGATTTAGTATGGAAATATCCATTTTCTATCAGAAGTAAGCAAACAGGGTTTTAAAGGAGGTTATCATTTTGCATAAATTAAGTGTGGTCATTGCCGTATACAATGTTTCTGAGTATATAGAAGCATGCTTAACATCAGTCTTAGAACAAAACTACAAGAATGTGGAATTAATTATTGTCAATGATGGTTCAACTGATGATACCTTTCAAAAAGTAGAAAAACTAGTAGACGGACATACGAATGTTATTTTGATTGATCAAGAAAACCAAGGTGTTTCTGCTGTCCGAAATAATGGTGTAAAAGCCGCTACAGGTGATTATCTAGGCTTTGTCGATGGAGACGATATCATTGCTAAAGATATGTTTCAAAAAATGATGGATTCTTTTGAAATGTCGGATGCAGATATGGTAACAATTGGTGTGGCAAGACTTTCAGGAGATAAAGTATACCCTTCTACATTACACGAAAGATATATGGTAGAAAAAAAAGAAGCCACAACAATTGAAGAAACACCGGCACTTTTATATGATACTACTTCGTGGAATAAAGTATTTAAAAAATCTTTTTGGGATAAACACCATTTGGAATTTCCAGAGGGCCAAATGTATGAAGATATCGCATTAATGATTCCAGCCTTTTTGTATGCAGAAAAGGTAAATATTATTCCTGATGTTGGCTATTATTGGCGCAGTCGCGAGGGTGGAGCAAAATCAATCACTCAAAGACGAAATGACATTGCCATGGTGAATGATCGTTTACTTGCTTTGAAAAAAGTAAATCAAGTACTTAATGAGAAAAATATTCAGGGTGATTTAAGATATCAAAATGAACGTAAAAACTTTGAAATTGATTTGTTTTCCATGATTGAATGGGCATTTTTAGCGCCGAAGGATTACTATTTGGCTCTTCAACCACTTATCAAAAATTATGTTGAGCAAGAAATGAAAACAACTGCTTTGAATGATATTCCAAAAGAAAAGAAACGACTTTTCAAAGCTTTGTTAGCAAATAATCGTCCGGCTTTTCTCCTAAATAGTTACATTTATTTTGGTAAGAAAGCTGTGAAAAAAATAACGAAATAAGAGACAAAGGACAAAATACTTCGGATCTTTAGTACACTTGTAAACAATTGATTCAAGTGTGCCATTGCATCATTAGAAGTACTATGTCTTAGGCTCTTTTTTTGTTAGTAACAGTTAATTTAATAGTGAATCTATCTTTTATATGCTATGATAATTGGTATATAATAAGTCAAATTAATGCTTATAAAAAATGATAGGAGCAGAAGAAATGACAAATTTATTTCAAGATGATAGTCTAACGCTGCATACAGACTTATATCAACTAAATATGATGAAAGCGTATTTTGACGATGGACTTCATGAGCGTAGATCGGTGTTTGAAGTGTTTTTCCGAGATATGCCATTTGATTCGGGTTTTGTTGTGTTTGCGGGGCTAGAACGAATTATTCATTATATGCAAAATTTACGTTTTACAGAAACGGATATTGCTTATTTACACGACGAACTTGGTTTTGATGGACCTTTTCTAGAATATTTACGTAACTTTAAATTTAAAGGAAATATTCTTGCTGCGAAAGAAGGGGAGTTTGTTTTTAAAACAGAGCCAATCCTTCAAGTAGAAGCAAGTCTAGCGGAAGCACAATTAATCGAAACAGCTTTGCTTAATATTGTGAATTTCCAAACGCTGATTGCAACAAAAGCGGCGCGAATCCGTTCTGTTATTGACGACGAAACGTTTGCAGAATTTGGTACAAGACGTGCACAAGAAATGGATGCGGCTATTTGGGGCACACGAGCGGCTTATATTGGTGGTTGTGATTCGACGAGTAATGTTCGCGCTGGAAAGATTTTCGGTATTCCTGTGTCTGGTACGATGGCACATGCGATGGTTCAAGCTTACCGCGACGAACTAGAAGCATTTAGAAGTTACGCAAAAACGCATTTTGATTCAATTTTCTTAGTAGATACATACGATACGCTAAAATCTGGCGTACCAAATGCGATTAAAGTGGCGAAAGAAATGGGCGATAAAATTAACTTTATCGGCATCCGCCTAGATAGTGGCGATATGGCTTTCTTATCTAAAAAAGCACGCCAAATGTTAGACGAAGCTGGCTTTACAGAAGCAAAAATCTTTGCTTCGAGTGACTTAGACGAACATACTATTTTATCGTTAAAAGCGCAAAAAGCAAAAATCGATTCTTGGGGCGTTGGCACAAAACTAATCACCGCTTACGACCAACCAGCATTAGGTGCCGTTTACAAAATGGCGGCGATTGCTGATGAAAATGATATTTTACAGGATTCGATTAAACTTTCAAGTAACACCGAAAAAGTGTCGACACCTGGTAAAAAGAAAGTTTACCGGATTATTACGAATGAAGATGGCTTGAAAGCGGAAGGCGATTATATTGCTTTGGCGGATGAATCACTTGAGAATGTCGACAAACTAACGATGTTCCACCCAGTTCATACGTATATTATGAAGACAGTCGAGAATTTCACCGCGCGTGAGCTACTTGTACCGATTTTCCAAAATGGGGAACTTGTGTATGATATGCCTTCACTCGATGAAATTAAAGCATATAAAGAAGAGAACTTGGCGCTACTTTGGGACGAGTACAAACGAACAGTTCGTCCGGAGCAATACCCAGTTGATTTAAGTGTAAAATGTTGGAAAAATAAGATGCGTAATATCGAAAAAGTACGTAAAAGTGTCCAACTTCATTCACCAGTTGAACTAGATATGCCGTTTTAGGAGGAATTATAATGGAAATCAGAGAAAGAATTTTAGCAGATATGCAAGTGGCAGAAACGATTGATGCACACGAAGAAATCCGAAAAAGTGTCGAGTTTTTAAAAGCATATTTAAAAAAGAATACGTTCTTAAAAAGCTTTGTTCTTGGGATTTCTGGGGGACAAGATTCGACTTTAACAGGAAAACTAGCACAGATGGCGATAAGCGAAATGCGAGCAGAAACGGGCGACGATGAGTACCGATTCTTCGCTGTGAGCTTGCCATACGGAACGCAACTAGATGAATCGGACCGTCAAGATGCACTGAACTTTATGGAACCAGATAATCGTTTAACCGTAAATATTAAAGCCTCAGTGGATGCGAGTGTTGCGGCGCTTGCGGAAGCGGGAGTGGAACTATCTGATTTCGCTAAAGGTAATGAAAAAGCGCGCGAACGGATGAAAGTGCAATACGCAATTGCAGCGATGCATAAAGGCGTAGTGGTTGGAACTGATCACTCCGCGGAAGCAGTTACTGGCTTTTATACGAAATACGGCGATGGTGGAACAGATATTAATCCACTGTTCCGCTTGAATAAAAGACAAGGCAAGGCGCTTCTTAAAGAGCTAGGCTGCCCAGAACATCTATATTTGAAAAAACCGACAGCAGATTTAGAAGATAATAAACCGGCACTTCCTGATGAGGTCGCGCTTGGTGTGACTTATGACCAAATTGACGATTACTTGGAAGGCAAAGAAGTCCCAGCAGATGCTGCGGCAAAAATTGAGAATTGGTTTATTAAAACCGAACATAAACGCCATATGGCAATTACCATATTTGATGATTTCTGGAAATAGGAGGTTGTTTAAATGAAAGTTGGTTACGGGTTATTAACTGCATTTTATACACATCCAGGAGAGCGAGATCATTTAGTGAAGATTTTGCTTGAAGCAGCAGAAAGTTTGGAAGAGTATAATACGTGCATCCAGTATATCGTCAGCGAATCCGAAAACGAAGCAGATACGGTCTTTGTTTCTGAAATTTGGGTCGACAAAGGGCACCACGAAGCTTCTCTTGATAACCCTGCTGTAAAAGCGACGATTGAACGTGCCAAACCATTAATAAAAGAAGTAAAACGAATACAAGAATTAGACATACTCGGCGGAAAAGGCGTATAAGCTTAACAACAAGAATGATTCTGGGACTTTCCTGGAATCATTTTTTTGGAGGGATGACAAATGCAAACGTTGATGATTGTTTGTGCTGGTGGTGCGACTTCCAGCTTAATGGCACAAAACGTAGTGAAAAGTGCTACGTCAGAAGGAATGGACGCGGTTTTACTATTTCCTGATGATGTGAAATATAAAGATAGTTTTCGCGAAAAATATAGCACGCGGGATTTAGTTGTCGTCATGGGACCGGTCGGCGCGATTACGGCCGGTAAGTTTCGCGATTACAAAGAACAAGTCGATGCAGTTTTAGTAGCACCGCAAGTAAAATATATGTATAAAACAGTAGAAGAAGTGCTAGGCGAACTGAATATTCCTTGCGCCAATATTAATTCACTCGATTTCGGTCGGATGCGCGGCGACAAGATTCTTACGCAAGGTCTAGCCTTGATGAACGCGAAAAATTCCAAATAAGGTGTTGCAACTTTAGAGGGGAAACGTTAAAATGAAAGAAGATGAAAAGGACAAGTGATTTGTCCTTTTCTTATATTATTGTGAAGTAACCGCGATTTTGCGGTTTCATTTTATAGATAAGGGTGGTTTTGTTTAAAATTATGAAAGACTTTACCGAGCAAGAGAAAATTATCGTTCTAGATTTTGGTAGTCAGTACAATCAACTAATTACGCGCCGCATTCGTGAATTCGGTGTGTACAGTGAATTACATCCGCATACTATTACAGTTGAAGAAATGAAAGCACTAAATCCAACGGGGATTATTTTTTCAGGAGGACCTAACAGTGTGTATGACGAAGATGCCTTCCGCGCTGACGAAAGAATCTTTGACATGGGAATTCCGATTTTGGGAATTTGTTACGGCATGCAATTAATGACAACGCACTTCGGTGGCAAAGTAGAACGTGCGAAAGACCGCGAATACGGGAAAGCGGACATTCACGTTGAGAAGCCAAACCGTTTATTTGCTGGACTACCAACCGATCAAGTTGTTTGGATGAGTCACGGCGATTTAGTCGTTGAGGAGCCTGCTGGTTTTGAAGTAACAGTTACTAGTAAATCTTGCCCAATTGCAGGTATTGCGGACGAAGAACGTTCACTTTACGGCGTGCAATTCCACCCAGAAGTACGTCACTCCGTTTATGGCAACGAATTACTGAAGAATTTTGCATTAAATGTTTGTGGCTGTAAAGGCGACTGGACAATGGAAAACTTTAGTGAAGTAGAAATCGCAAAAATCCAAGAAATCGTAGGCGACAAAAAAGTCTTGCTTGCCCTTTCTGGCGGTGTAGATTCCTCTGTTGTTGGCGTGTTAATTCATAAAGCAATAGGCGACCAACTAACATGTATTTTCGTTGACCACGGCCTTCTTCGTAAAGGGGAAGCTGACCAAGTAATGGAGACATTACAAGGCGAATTCAACATGAACATCATCAAAGTAGATGCGAAAAAACGCTTCATGGACAAACTTGCTGGCGTTTCTGACCCAGAACAAAAACGTAAAATCATCGGCAACGAATTCATTTACGTATTTGACGATGAAGCCAACAAATTAGATGGCGTAGAATTCCTTGCACAAGGAACACTCTACACAGACATCATCGAAAGTGGTACAGCAACTGCCCAAACAATCAAGTCTCACCACAACGTAGGCGGCTTACCAGAAGATATGCAATTTAAACTAATCGAACCATTAAATACACTTTTCAAAGATGAAGTTCGCGCACTAGGAACCGAACTTGGCATGCCTGACGCAATCGTTTGGCGCCAACCATTCCCAGGCCCAGGCTTAGGAATCCGTGTGCTTGGCGAAATTACGGAAGAGAAATTAGAGATTGTTCGTGATTCTGATTACATCTTGCGTGAAGAAATCAAAAACGCAGGTCTAGAACGCGAAATCTGGCAATACTTTACTGCTCTTCCAAATATCCGTAGCGTTGGTGTTATGGGTGATGGTAGAACGTATGACCATACTGTGGTTGTTCGTGCAGTGACGAGTATTGATGGTATGACAGCCGATTGGGCACGTATTCCGTGGGATGTACTGGAGAAAATTTCGGTACGGATTGTGAATGAAGTGGATCATGTGAATCGTGTTGTTTATGATATTACGAGTAAGCCACCAGCTACGGTTGAGTGGGAATAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_017546|1122790:1130213|1122790_1123174_+|WP_003721506.1|DBSCAN-SWA MKKVITYGTFDLLHWGHIHLLKRAKALGDYLIVAISSDEFNRIKHKEAYHSYEHRKLIIEAIRYVDEVIPENNWEQKRDDIEKYGIDVFVMGDDWEGEFDFLKDVCEVVYLPRTEGISTSQIKDELK >NC_017546|1122790:1130213|1127754_1128063_+|WP_009931485.1|DBSCAN-SWA MKVGYGLLTAFYTHPGERDHLVKILLEAAESLEEYNTCIQYIVSESENEADTVFVSEIWVDKGHHEASLDNPAVKATIERAKPLIKEVKRIQELDILGGKGV >NC_017546|1122790:1130213|1123195_1124179_+|WP_010989659.1|DBSCAN-SWA MEPLVSVIIPVYNVEKYVKRCLDSVLEQTYHNLEVIVVNDGATDNSAKVIKSISDNRIRYFEKENGGQATARNFGLDVATGDYIVMVDSDDYISKNLVETCLDTVQKTNADLVLFTSYNVNQEGKMQYIKRDKGIKVLDAGPTPWNKFYQADLWKGSRFPVGYWYEDLGIIPVVTLKAKNPVKIQDALYYYITDRADSQSNIQQVDHFLDVVIMLENVETELKKLGIYEESKDQLAYLYIEHLIYRLVLRKAIYITNKQERKKLIKKISTIIQEKFPNWGSYPYQAGGKLTATLKKKALWLYLHHLYLLGDLVWKYPFSIRSKQTGF >NC_017546|1122790:1130213|1126917_1127742_+|WP_009931487.1|DBSCAN-SWA MEIRERILADMQVAETIDAHEEIRKSVEFLKAYLKKNTFLKSFVLGISGGQDSTLTGKLAQMAISEMRAETGDDEYRFFAVSLPYGTQLDESDRQDALNFMEPDNRLTVNIKASVDASVAALAEAGVELSDFAKGNEKARERMKVQYAIAAMHKGVVVGTDHSAEAVTGFYTKYGDGGTDINPLFRLNKRQGKALLKELGCPEHLYLKKPTADLEDNKPALPDEVALGVTYDQIDDYLEGKEVPADAAAKIENWFIKTEHKRHMAITIFDDFWK >NC_017546|1122790:1130213|1128123_1128528_+|WP_009931483.1|DBSCAN-SWA MQTLMIVCAGGATSSLMAQNVVKSATSEGMDAVLLFPDDVKYKDSFREKYSTRDLVVVMGPVGAITAGKFRDYKEQVDAVLVAPQVKYMYKTVEEVLGELNIPCANINSLDFGRMRGDKILTQGLALMNAKNSK >NC_017546|1122790:1130213|1125415_1126906_+|WP_003721509.1|DBSCAN-SWA MTNLFQDDSLTLHTDLYQLNMMKAYFDDGLHERRSVFEVFFRDMPFDSGFVVFAGLERIIHYMQNLRFTETDIAYLHDELGFDGPFLEYLRNFKFKGNILAAKEGEFVFKTEPILQVEASLAEAQLIETALLNIVNFQTLIATKAARIRSVIDDETFAEFGTRRAQEMDAAIWGTRAAYIGGCDSTSNVRAGKIFGIPVSGTMAHAMVQAYRDELEAFRSYAKTHFDSIFLVDTYDTLKSGVPNAIKVAKEMGDKINFIGIRLDSGDMAFLSKKARQMLDEAGFTEAKIFASSDLDEHTILSLKAQKAKIDSWGVGTKLITAYDQPALGAVYKMAAIADENDILQDSIKLSSNTEKVSTPGKKKVYRIITNEDGLKAEGDYIALADESLENVDKLTMFHPVHTYIMKTVENFTARELLVPIFQNGELVYDMPSLDEIKAYKEENLALLWDEYKRTVRPEQYPVDLSVKCWKNKMRNIEKVRKSVQLHSPVELDMPF >NC_017546|1122790:1130213|1128656_1130213_+|WP_010989661.1|DBSCAN-SWA MFKIMKDFTEQEKIIVLDFGSQYNQLITRRIREFGVYSELHPHTITVEEMKALNPTGIIFSGGPNSVYDEDAFRADERIFDMGIPILGICYGMQLMTTHFGGKVERAKDREYGKADIHVEKPNRLFAGLPTDQVVWMSHGDLVVEEPAGFEVTVTSKSCPIAGIADEERSLYGVQFHPEVRHSVYGNELLKNFALNVCGCKGDWTMENFSEVEIAKIQEIVGDKKVLLALSGGVDSSVVGVLIHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEADQVMETLQGEFNMNIIKVDAKKRFMDKLAGVSDPEQKRKIIGNEFIYVFDDEANKLDGVEFLAQGTLYTDIIESGTATAQTIKSHHNVGGLPEDMQFKLIEPLNTLFKDEVRALGTELGMPDAIVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEEKLEIVRDSDYILREEIKNAGLEREIWQYFTALPNIRSVGVMGDGRTYDHTVVVRAVTSIDGMTADWARIPWDVLEKISVRIVNEVDHVNRVVYDITSKPPATVEWE >NC_017546|1122790:1130213|1124193_1125207_+|WP_010989660.1|DBSCAN-SWA MHKLSVVIAVYNVSEYIEACLTSVLEQNYKNVELIIVNDGSTDDTFQKVEKLVDGHTNVILIDQENQGVSAVRNNGVKAATGDYLGFVDGDDIIAKDMFQKMMDSFEMSDADMVTIGVARLSGDKVYPSTLHERYMVEKKEATTIEETPALLYDTTSWNKVFKKSFWDKHHLEFPEGQMYEDIALMIPAFLYAEKVNIIPDVGYYWRSREGGAKSITQRRNDIAMVNDRLLALKKVNQVLNEKNIQGDLRYQNERKNFEIDLFSMIEWAFLAPKDYYLALQPLIKNYVEQEMKTTALNDIPKEKKRLFKALLANNRPAFLLNSYIYFGKKAVKKITK |
8 | Hokovirus(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1244264 : 1324823
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_017546|1244264:1324823|DBSCAN-SWA 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97 | Listeria_phage(79.31%) | integrase,terminase,capsid,tRNA,tail,protease,portal,holin | attL 1244147:1244163|attR 1287121:1287137 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1858426 : 1866712
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_017546|1858426:1866712|DBSCAN-SWA 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ATCGCCAATATCAACAATCCCAGCACCTTCACCCGGTCCTTGCAAAACTTGTTTTCCTTCTGTAGGAAATTTCCGAAGTACTGGTTTAGAATTTTTATAGCTACAATGTTCGGACCACATAACGGAGAAAAGTCCAGTTTCTGTATAATTAGGCTCGCGTCCAAGAATCGAACAAACAAGCTCATATTCACTATCAGTTAAGCCCATTTCTTGATAAATCTTTTGTTCTTTAATTTCTTTTGTCGTTGGCTCCATGTTAGGCATTTACTTGTTCCTCCTTCCAAGCTTTTACAACGGACTCGAAAAGTCTTAAACCATCAGTACCGCCAATAATTTCTTCTACCGCGCGTTCTGGATGTGGCATCATTCCAAGCACATTACCGCGCTCATTTACGATACCCGCAATATCCGCACGACTACCATTCGGATTAACGCTATCATATGTAAAAACAATTTGGTTATTTTCTTTTAGTTTTAAAAGTGTTTCGTCGTCACAGTAATAATTACCTTCTCCGTGAGCAACGGGAACTTGGATAATTTCGCCTTCTTCATAAAGCTCCGTAAACATCGTACTTGCATTTGCCACACGAAGCGGCACTGTTTTACAAATAAAATGCAAATTATTATTTCTAATTAAAGCACCTGGCAGCAAACCAATTTCCGTTAGAATTTGAAATCCGTTACACACACCAAGCACTGGTTTTCCCATTTCAGCAAAGCGCAAAACTTCTGGCATAATACTTGAAAATTTTGCAATCGCACCAGTTCGCAAGTAGTCTCCGTAAGAAAATCCACCTGGAAGTAATACCGCGTCAAAGCCTGCAAGACTTGTTTCCGCATGCCATATATATTCCGCCTCCTCGCCAAGAGAATCGCGAATCGCATGTAGCATATCAAGATCACAATTAGAACCTGGGAACTGAATGACAGCAAATTTCATCGTTTAAGCCTCCTCAATTTCATATCGGTAATCTTCCATCACCGGATTTGTTAGCAGTTTGTCACACATTTCATTTAACACTTCATGAATATCTCTATCCGACTTCGCTACTTTAAGTTCCATAAATTTACCAATACGAACATCTTCTACTTCCTCGTAACCCATGCTTTTCGCTGCATCTTTTACTGCAACCCCTTGCGGATCTAATACGCTTTTCTTTAAAGTGACATAAACTTTGACATTATACATTTTGTGGCCTCCTAGTTTTGAACTTGCTTTAATCTATTCAATACTTCTGTATACACATCTGTTAAATTGCCAATATTCCGACGAAAGACATCCTTATCGAGCTTTTGATTTGTTTCCTTGTCCCAAAGTCTACATGTATCAGGCGAAATCTCATCTGCTAGCAAAATTTCTCCAGCCGCGTCCCGACCAAATTCTAATTTAAAATCGATCAGCGTAATATTCATTTGATTGAATAATTCTTGTAGCACCTTATTAATCGAACGAGCCGCCTGACGAATCGTATCCATCTCACTCGTTGTCGCAACCTCTAAATAAAGCACATGGTCATCATTAATAAACGGGTCATCTAGCGCATCATCTTTATAGTAAAATTCTACTATCGCATTCGGAATTTGCTCGCCTTCTTCTTTTCCAAGCCGTTTCGCAAGACTCCCAGCCATCACATTACGAACAACCACTTCAAGTGGAATAATTGATACCTCTTTCACCAATTGTTCCGTTTCCGAAATCGCCCGAATAAAATGACTCTCTATTCCCGCTTCCGCCAAATGAGAAAAAATAAGCGATGTAATTTGGTTATTAAGCTCACCCTTCCCAGCAAAAGATTCCTTTCGTACTCCATTTAGCGCTGTCGCATCGTCCTTATAAGCAACACGCAAGACACCTGCTTCTTCTGTTTTAAAAAGTCGTTTTGCCTTTCCTTCATAAACCAGTTCATTAGTCACAATAATTTATCTCCTTATAAATTACTTAACCTCTTTGAAAAAATAAATATCAAAGAGGTTAGGTTGTATTCTGCCCGTAATTATAATCCTAAACGATCAAAAATTAAGTCGACATTCTTCAGGTGATAGTTGTAATCAAAGCAATCTGCAATTTCTTCCGCAGATAGGTTTTCAGTAATGGTTGCATCTTGTTCTACTAATTCACGGAAAGGTACTTGTTTTTCCCAAGCTTCCATTGCTCTTGGTTGTACGACATCATAAGCCGCCTCACGAGCCAAACCTTTATCAATGAGCGCAAGTAACACACGCTGTGAATAAATAAGTCCAAGTGTTCTGTCCATATTGCGTTTCATATTTTCTGGGAACACCGTCAAGTTTTTCACGATATTTCCAAAACGATTCAAAATATAATCTAATAAAATAGTAGAATCTGGTAAAATAATTCGTTCCGCTGAACTATGAGAAATATCACGTTCATGCCAAAGTGGTACATTTTCATAAGCAGTAACCATATGACCGCGAATAACGCGCGCTAGTCCAGTAACATTTTCAGAACCAATTGGATTACGTTTATGTGGCATTGCGGACGAACCTTTTTGTCCTTTTGCAAAGAATTCTTCCACTTCGCGCACTTCGCTTTTTTGTAACGCACGTACTTCTACCGCAAATTTTTCTACAGAAGTTGCAATTAATGCAAGTGTTGCCAAATATTCAGCATGTCGATCACGTTGCAATGTTTGCGTAGAAATAGGTGCAGGTGTCGTTCCTAATTTTTCACATACGTAAGTTTCTACAAAAGGATCAATATTTGCATACGTCCCAACCGCCCCAGAGATCTTTCCGAATTCCACACCATCAGCCGCAAAATTAAAACGTTCTAAGTTACGTTTCATTTCCTCGTACCATAGAGCAAGCTTCAACCCAAAAGTAGTAGGTTCCGCGTGAACACCATGTGTACGTCCCATAGTTACAGTATATTTATGTTCTTTTGCTTTTTCGCCAATAATCGCAATGAAATTTTCCAAATCCTTGCGCAAAATCTCATTCGCTTGTTTAAGTAAATAAGAATTCGCTGTATCCACTACGTCTGTTGATGTTAAGCCATAATGAACCCATTTACGTTCCGCACCAAGCGACTCAGAAACCGAACGAGTAAATGCCACAACATCATGTCTAGTTTCTAGCTCAATCTCATGAATACGATCTACATCAAACTTCGCATTAGCACGAATCTTCGCAACGTCTTCTTTCGGAATATCACCAAGCTCTGCCCAAGCTTCACAAGCCAAAATCTCCACTTCTAGCCAAGCCTGATAACGATTTTGTTCTGTCCAAATGTTGCCCATTTCTTTACGAGTATAACGTTCTAACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_017546|1858426:1866712|1864625_1865339_-|WP_010989809.1|DBSCAN-SWA MTNELVYEGKAKRLFKTEEAGVLRVAYKDDATALNGVRKESFAGKGELNNQITSLIFSHLAEAGIESHFIRAISETEQLVKEVSIIPLEVVVRNVMAGSLAKRLGKEEGEQIPNAIVEFYYKDDALDDPFINDDHVLYLEVATTSEMDTIRQAARSINKVLQELFNQMNITLIDFKLEFGRDAAGEILLADEISPDTCRLWDKETNQKLDKDVFRRNIGNLTDVYTEVLNRLKQVQN >NC_017546|1858426:1866712|1858426_1858993_-|WP_003722243.1|DBSCAN-SWA MNIAIFASGSGSNFQALVDDEFIKPYVKLLVCDKPNAYVLERANKHDIPVFLFEAKNYPDKEAFETEILLELRRLEIDLLVLAGYMRLIGPTLLAEFPEQIVNLHPSLLPEFKGKDAIGQAIQANVSGTGVTAHFVDAGMDTGPIIDQVKVTIETAETTDTLAEKIHQVEHIFYPKVIRGLIQNGGND >NC_017546|1858426:1866712|1858989_1860039_-|WP_009933235.1|DBSCAN-SWA MAENAYSKAGVDVEAGYQVVERIKKHVARTERIGAMGALGSFGGMFDLSSLNLKEPVLVSGTDGVGTKLLLAIEADKHDTIGIDCVAMCVNDILAQGAEPLFFLDYIATGKTDPVKMEQIVKGVADGCEQAGAALIGGETAEMPDMYGADDYDLAGFTVGAVEKQKLITEGAVQAGDTLIGIPSSGIHSNGYSLVRKIFFKDNEFTLDAEISELDVPLVEELLKPTRIYVKPVLEVLKEVTVHGITHVTGGGFVENLPRMLTNDLAVKVELGSWPMLPIFDVVKKYGQLNEMEMYEIFNMGIGMVLAVAKSDVEKTLEVLVQNGEAAYVIGEVTTRESNAVIFAGGKKG >NC_017546|1858426:1866712|1863681_1864365_-|WP_003733240.1|DBSCAN-SWA MKFAVIQFPGSNCDLDMLHAIRDSLGEEAEYIWHAETSLAGFDAVLLPGGFSYGDYLRTGAIAKFSSIMPEVLRFAEMGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALIRNNNLHFICKTVPLRVANASTMFTELYEEGEIIQVPVAHGEGNYYCDDETLLKLKENNQIVFTYDSVNPNGSRADIAGIVNERGNVLGMMPHPERAVEEIIGGTDGLRLFESVVKAWKEEQVNA >NC_017546|1858426:1866712|1860057_1861485_-|WP_010989807.1|DBSCAN-SWA MLAEVKGLNEECGIFGIWDHPNAAEITYYGLHSLQHRGQEGAGIVSTDGEILKGHRNLGLLADVFKHGELDDLKGKAAIGHVRYATAGQKNLGNVQPFLFHFHSSSLALAHNGNLVNAKSLRRELEEEGAIFQTSSDTEVLAHLIKRSHTGDFVEDLKVALNKVKGGFAYMLLTEDTMYAALDPNGFRPLSIGRIGDSYVVASETCAFETVGAEFVRDVEPGELIIINDDGLRIEKFTENVKHSICSMEYIYFARPDSNIAGINVHSARKRSGKRLAKEAFIDADVVTGVPDSSISAAIGYAEEAGLPYELGLIKNRYVARTFIQPSQELREQGVRMKLSAVRGVVEGKRVVMIDDSIVRGTTSKRIVQLLREAGAAEVHVRIASPPLAYPCFYGIDIQTRNELIASNYSVDEICRIIGADSLEYLSEEGLVDSIGRPYPNEPYGGLCMAYFNGDYPTPLYDYEAEYLASLEAEK >NC_017546|1858426:1866712|1865419_1866712_-|WP_003733238.1|DBSCAN-SWA MLERYTRKEMGNIWTEQNRYQAWLEVEILACEAWAELGDIPKEDVAKIRANAKFDVDRIHEIELETRHDVVAFTRSVSESLGAERKWVHYGLTSTDVVDTANSYLLKQANEILRKDLENFIAIIGEKAKEHKYTVTMGRTHGVHAEPTTFGLKLALWYEEMKRNLERFNFAADGVEFGKISGAVGTYANIDPFVETYVCEKLGTTPAPISTQTLQRDRHAEYLATLALIATSVEKFAVEVRALQKSEVREVEEFFAKGQKGSSAMPHKRNPIGSENVTGLARVIRGHMVTAYENVPLWHERDISHSSAERIILPDSTILLDYILNRFGNIVKNLTVFPENMKRNMDRTLGLIYSQRVLLALIDKGLAREAAYDVVQPRAMEAWEKQVPFRELVEQDATITENLSAEEIADCFDYNYHLKNVDLIFDRLGL >NC_017546|1858426:1866712|1861469_1863689_-|WP_010989808.1|DBSCAN-SWA MPNMEPTTKEIKEQKIYQEMGLTDSEYELVCSILGREPNYTETGLFSVMWSEHCSYKNSKPVLRKFPTEGKQVLQGPGEGAGIVDIGDGLGVAFKVESHNHPSYVEPYQGAATGVGGIIRDVFSMGARPIAMLNSLRFGELDTPHAKYLVSEVVAGIAGYGNSIGIPTVGGEIQFDPCYTKNPLVNAMCVGLIEAKDIQKGQAKGIGNPVMYVGAKTGRDGIHGATFASVEFSEEGEQQRSAVQVGDPFMEKLLLEACLDVIRDHSDILVGIQDMGAAGLVSSSSEMASKAGAGLELIMDDVPQRELHMTPYEMLLSESQERMLLCVKKGHVEEIQALFERYGLEAVVIGQVTDDKMYKIIHHGEVVANVPVDALAEDAPVYHKPSKEPTRYQAFQEEEAFVPAMDDVVGVWKELLAQPTIASKRHIYEQYDYQVRTDTAVVPGSDAAIVRVRGTEKAIAMTTDCNSRYLYLDPEVGGAIAVAEAARNIVCSGGKPLAITDGLNFGNPEKPEIFWEIEKAADGISAACLELDTPVISGNVSLYNETDGTGIYPTPVIGMVGLVEDLAHITTQDFKNSGDVIFLIGETKAEYSGSELQKLQQGKISGRAPELDLVTEKKYQQLLLTAIQEGLVASSHDLAEGGFGVALAEATFKAGLGAEVEVPFALNQLFSESQSRFLVSVKPENEAAFAQLMELEKVYRLGVVTEDDTIRVKHKEDQVTAKTTELRSIWEGAIPCLLK >NC_017546|1858426:1866712|1864368_1864614_-|WP_003722248.1|DBSCAN-SWA MYNVKVYVTLKKSVLDPQGVAVKDAAKSMGYEEVEDVRIGKFMELKVAKSDRDIHEVLNEMCDKLLTNPVMEDYRYEIEEA |
8 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2381600 : 2420829
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_017546|2381600:2420829|DBSCAN-SWA AATGGCTGGATTTATCAAGCGATACTTAGAAACTAAAAACTGGACAATTTATCAATTAGGAAACGCAACGGGTCTTGCGCATCAAACAATACGAATAGCAGACAAAAAAACAGTTGATCAAATGTCTGCGAAAAATGTGCGATTGATAGCGGAAGTTTTCGGCTTTACAGCGGGCGAAATGCTAGACGAATTCTACGAAATTGAAAAAGAAATAAATAATGATGAGATTTTAAAAGAGTTAACAACAGTATTCGAAAAATATGGCTATAACACGGATGAAATCAGCTCCGAATTGCTTGACGGTGAAAAGATTAAACTGGATATGAACGATGACAATATAACTAAACTCGCTGAATCTGTAAATACTACAGAGCATTTTACTGCTTATTTAGATGATTCAACTGATTATATGATTGTTGAGGCAATACAATGAATAATCATATTACCGACTTAACTGGACAAGTTTTTGGGAGATTGACTGTGAAAGAGTTTATTCGTTCTAAAAACGGAAATGCGGTTTGGAAGTGCGTATGCGAGTGCGGTAATGAAAAAGAAGTATTAGTTCAGCAACTCAAAAGAGGTTATGTGAAATCATGCGGGTGCTTAGCGAAAGAAAATGGGAATAAATATGCAAAAAATAATCTGCACTCGGACGAAGTTAAGAAAAAAGCACTTGCGCGAAAACTCGAAGTTGATAGTGTTGATGGTACAATGAAATCAGCTTTAACACGTAAAATTTCTAGTAGAAACAAAAGTGGTATAAAAGGAGTTCGCTGGAATGAATCGCGAAAAAAATGGGAAGCTTCTATAACATTCCAACGAAAATATCATTTTATCGGACGTTTCGTAAAAAAAGAAGACGCAATAAAAGCACGTCTTGAAGCAGAAGAAAAGTATTTTAAACCTGTTATCGAAAAGAATAAGCGCTAAGCACATGCTTGGCGTTTTTTGCATAAAAAAAATCCCTAACGTGTAGTTAGGGTGTGTTAAAATTATATAGTTCTTTCAGTTTACACTTCAATTCATGTTTGTTATAATTGAAGTGTAAAAGATAACTTGTGATGGATAAAGCTGGGTTCCCGAATGGGAGTAAGATAATTTATTATCGAGAATTCCTTTGCTCCAGAGGTTATCTTTATTTTTTTGTCTTCTTTTTTAAATGTTCAATAGTTTTTTGAGGATTCTTTTTTATCTCTGTTAAGATAAAATCTATGATTGCTCTCGAATATGTATACTGTGAGTGCTCCCCTATAACATGACGATAAGAATATCTCTCTTGCGCCTTTAAAGAATAGAACTTCAAAAAAAGCTGAAAATCAGCAGTATTAAAGTTACTTCTAATTTCCTTAGTAAATACTGAAAAATGTTCAAAGTCAATTTTTTCTCTGCTCAATATTTTATTTATCTCTTTTACACAATTTTTTTGTGTATAAGGATGTGTTTTATTAGGGTCTTTTTGTTCCTTTATTATTTTAACAGGAATTTCTCCATCTTTTGCTATTCTCACTGTGCTATCTGCATCGTTAATTTTCTTGGTTATATAAAAATTATGTTGAATGTCTATGGAAAAAGCTGGATTATTCTCTAGCTCTATTTTCTCTATCGCTTTTTTCGTTGTTAAGATTTTATCAGCTGTTTCTTTTGAATATTTAGACCTTATAATAGCTGGGTCTAAGTCATCTTCTTTTATTACTAGAGATAAAAAACTTTGAGTAATATACTCTGTTACATCAATATTATGAAACATACTCATTTTCTCTATGTAATTAAAAACACATGATTGAAATAAAGGTGCATATATTACTTCATAATCTTCAGTAATAAAATGAGTACTCACGTTCCTTAACTCAACTATTTTTTCTAGATTCAAACGTAATGGATCATGTTTATTTGTAAATATCTCCTTAATGCTATATTCTAAAGAAACAGTTCTAGACGGGTTATCCTTGAAGTATATACTATTTTCACCTTTATCGTTTATTAATTTAGCTTTTAACATAAGCTACCATGAGTTGCAAATAAAAAAACTAAAACCTTCTACCCTATATCTTATTGTAGGTTTGTTATATATTTCCAAGCCTAACAAAAATGCTTCAATACTTTTCTTTACTAACATATCATATGTGCTATTCATTTAAGTACCTTCTCCGCTTTTTTACTATAATAATATCATAGCGAATGATTGAGTACAATAAACACATTACAAAAACACCCCCGCAAAAGCGAGGGCATCAAACTAGATTTTCTTAACAAACTTCTTGTTTGCAGTTAGAAAATAACCGCTTTTTGTTTTTAATCTTGGTGTACCTCCCTTTGTTTTCGCCATTCCGGCGATAGTGAAAATAGTCCCCGGAGGATATGTCCCGCCTGTTTTATTTTTTTCAGTGAAGTCTACAGAGTCATATAGATCACACTGAACAAGCGTTTTGATTTTTCCGGGGTTTTCGGTGTAGTAAGTGTTATTACTAGCAGGTGTGTGTGGTTTTCCTGCTTTCAATTTAGCTAATAAAGTTGTATTTTGCGAAGCTGTTCCGCTGTAATTTTTAATTCCGTAACTTGTCGCTAGTTTTTTACGATTCGCAAAGCTAGAATCTAGTTTATTCATATTCATGTAATCAACTAATCCCAGACTGTTCGTGTTTGTGTTTGCGCTTGGTTTAGAAGAATTACTAGTACTAGCTCCTTTTCCAAAAGTATCAGTTCCATAACCTTTATAATTAAATTGAAGGTGCGGATTGTCTACAAATCCAGACCAATCACCACCCCATTCAAGTCCAAGGGACTTCGCTTTTGCCACGAATTTTTTGCCTTTGTCTGAACGATAAGCACCCCAATCAACAGTTTTACCTTTCGCCATGACGAAATCTAGTGCCTGTCCTACTAAATGATAAGAGCGCATTGTTTGACTCGCTCCGTTCGCGACATTAGCGGATTGTTGCTCTTTTGTCCTAATCGTTTCATAAATTAATACTTCAATGCCGCTATTTTCAGCCCAGTCGAGAAGTTTTCTCGCCGCCGCTTTTGTGTTATCCGCTAATTTATTTACATTTTCTAAACTTCTACTATAATAATAACTTGTCATTATACTTCATCCTCTACGTTTTTATTTTTATTCAATACTAAATCGCTATCGCTCGCGGTAGGAGTCGTTGGGTCATTTACTACACCTAACACACCTAATAACAGGAATACACTGTTAATCATATCTAGCGCTTCTTTGTTGATTGTGTCGGCAGGAATTGTTACGCCGAACCACCCAAGTACTTGCTGTACTAGTACCAGAATTAGCGGGATAACTGACACCCAGAACACTTTCGATTTCATTCTCACTTTCCAGTTAATTTTCATTATTTTTCCTCCTTCTCATTTTTCGCTATATACTTCCAAATTGCTTTATCCTCCCGCTTCAATAAAGCGATTTCTTTATCATGATCGTTTTGCTTCTCTCTTAAGCTGATGCGGTCTTTTTTGCTTTCTGACATTTCTTCTCTCAGACTATTTAAAGTTATATCCAGAGAATCAATCATATTACGCAAAGGCGCGACTAATGCCCATCTAATCACAAAACCCACAATCGCAGCGATTAAGCTGATTAACCCTATTAACTCGCCTACACTCATCCCTGCTATTGAAATACTCCCCAGTGTCAATTTTCATCATCCCATCTGTTTTTGACATAAAAAATAAGCCTTATTTGGCTTCAATCTAAAATATAAAATAATTGATTTAACGCGAAATACGTAATACTAGTGTCCGCAGGTATAAATCCCATCGCGTTACTAGATGATGCATGCACTCGGCCGCCGCTAGACTTGTTTGTCGGTGCATAAGCCATCGCTGTTTTTGTTGTTTGAACTTCGAAAGGAACAGACGCAAAAGCGTTATTTGTAGAGGTCCATGCGGTTGATTTTTGCACTTGCCCCCTGAAAAAGGCAATTCTGATACCAAAGATGCAAATAATTCTAAATTGAGGAGTATTCCCTTCTGCTGTTGAATATCCAGAGTTTAATATTAAATCTTGCCACGGCATTGAGTAAAATAAATCAGCATTTACAGATAAAGTTGTTTGCCCATCTTTAGTGAAATCTAGTGAATCCCCTCTTAACATTGTTTCCTTGAGTTCACCAGAAATATTATGATCCATCAATTGCTGTGCTACTTTCACACCACCAAGTGTTGTAACATCACTTTTTAAAATAGTAGAGCCGGCACCAGTTGGCAGTACTGTAGCAGCATTAAAACCATTGTCATTCATCGTGACCGTCCCAGTGAACAAATTGCCTTCATCATCACGATAATTAATATTGTGAATAAATTCAGCGCCTGTGATACTTCCGCTCTCTACATCACCTAATTTCGCAGTAATCGCTGATAACTCCCCGACTTTTAAAGCGTTATAATCCAGAGGTATTTCTTTCCAAATTACCCCATCCCACTTAAAAACACCTGTTATAGTATTTTCCACTTCATCTATCTTGAACCACGTATCGTTTATCTTTGGAATAGCTGGCGGTAGCTCACCATAAAAAGGCTTATTGTTATCACCAGCTTTCATTAACGCGTCATTAGCTGTATCTATTGCTGTGACAGCGGAATCTTTAGCATCATTTGCTACTTGTTTTGCATCTGTTGCATTTGTATTTGCATCATTTGCTACACTTTCGGCACTACTAGCGATTTGTTGTGCTGTTTCAGCCTTATTACTTGCGATTGACGCAACTTTATTAGCATTTGTTGATACTTTCGCGTTTTCCCTCAATTGATTTATAATCGCAGGTGTAGCCGAATTAATATCAATATAATCACCAACTACACAAGTGCTTTTTGACATATCGCTATAACAAATATTTAACTCAATAACCCTTGCTTGTACTGTAATTGGAGGACTCATTTCTAAATCTACAATTCTTACAAAACTGCCTTTTCTTATTCGATGTGCTTCAAAACCATAGACTTGTTCTAACATTAAAATATTTGCTTCATATTGATATGATGGCGAT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52 | Listeria_phage(95.35%) | holin,terminase,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2564990 : 2572834
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_017546|2564990:2572834|DBSCAN-SWA 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TGATCCAGCCCCGCACCAACTAATTTTACTTGCTGGTCCTGACTTTGTGTAATCTCCGCTACTTCACGACCTGCACGCAAATCAAAGATAGTATTTTCCGCTAACCGCTTTTCCCCAATTGGGAGGAACTCTTCATCAATTGGTAGGAAGCTATCACTATTGACCCAAAGCTGATGTTGTAAAACCGTTGAACCAGCTTCTCCGCTCAGATTAAAATAAATATGATTGCTCGGGTTATATATAGTCGGCTGATTGCTTCTCGCTTCATAATCAACCAGCCATTCATTTTTATTATTTAACGTATATGTCATTTTTGCATCAATTTTTCCTGGATAGCCATTTTCTCCATCCGCCCAGCAGTATTCAAAAGTCATCACAATTTGATCAAGACTTTTTTCTACTGAAACATCCCAAAGCTTCTTACTAAAATTGAATTTCCCACCGTGACGATGGTTAGAGCCTTCATTTTGAATCAGTTGAAATTGTTTGCCATCCAAACTAAATTGCCCATTTGTAATACGTCCAGCAACAGGGCCAAGTGTCGCGCCGAAGTAAGGAGAGTGTGCCAAATAATCATCTAAATTTGTAAAACCAAGACTAATATTCGCAAAATCACCAAATTTATCTTTTGTTTCAAGTGAAGTAACAATCGCTCCGTAATTTAAAACACTCATGCGCATATCATGATCATTTATCATCGTCCACTTCCAAACAGTTTCTCCTTCAAACTCCCCAAATCGCTCCTTCATTACTTCGATAAAAATCACATTCCTTCATAAGTTATTAATAGCCATTTGGATGAGATACGTGCCATTTCCAAGCAGTGGCGATAATATCTTTTACATCTGTATAAGTTGGCTCCCAACCAAGAATTTCGCGCGCTTTATCACTAGAAGCAATTAACGTTCCTGGGTCTCCTGCACGACGTGGTACTACTTCAGCAGGGATTTCTTTTCCTGTTACAGTACGAGCTGCTTCAAGCATTTCTTTCACAGAAAAACCGTTACTGCTACCAAGATTGAAAATATTACTTTCTCCCCCATTTTTCAAGTATTCTAGCGCTCTAATATGTGCGTCTATTAAATCTTCTACTTGTACATAGTCACGAATACAAGTACCATCTGGTGTATTATAGTCATCACCGTAGATCGCTAATTTTTCTCGTTGACCAAGCGCAACTTGTAAAATAATTGGCACTAGATGCGATTCTGGTTTGTGATCTTCCCCAATCGAACCATCTGCTTTTGCACCAGCGACATTAAAATAACGGAGTGCAACAAATTTCATGCCGTATGCTTTATCGCACCATTTCATCATTTTTTCCATGATTAGCTTTGTTTCGCCATAAGTACTTTCCGGATTTGTTGGCATATCTTCCGTAATTGGCACGCGTTCTGGTTCACCGTATGTAGCCGCACTGGAAGAAAAGACGATATGCTTCACATCAAATTCCTCCATCACTTCTAAAACGATTTGCGTACCATAGACATTATTATTTAAATAATCCAGCGGTACTTCCATCGATTCTCCTACAAGTGAACTAGCAGCAAAATGAATCACACCATCTACTTTTTCTTTTTCAAAAACTGAACTTAAAAATGCTTTATCACGAATATCTCCTTCATAAAATTTTGCCTTTTTATGAATGGATTCCCTATGCCCTGTTCTTAAATTATCAATAACTACTACTTCATATCCGCGAGTAATTAACTCATCTACTGCATGTGAACCGATATAGCCAGCGCCACCAAGTACAGCAATACCCATTACTTATCTCTCCTAACGCTTGTCTTTGTATTTCATTTTACACTACTCTGGTCTATATAGTCACGCAAAAATGGGTCTAAGATAAATAATCTCAGACCCATTCGAGTTTTCTTTACTATTATTTAGCCGCCTCAGCTTCTAGCGACTCTTTTAATTCTTCTACATATTTTTGAGCATTTTGTCCAGCAAGTCCGCCGTCGCCTGTAGCTGTTACAATTTGGCGTAAGCTTTTCGCACGAACATCACCTGCTGCAAAAATACCAGGAAGATTTGTACGCATTTCTTCGTCCGTTACGATGTATCCTTCATCATCTGTAATACCTAAATTTAAGAATGCTTTCGTAAGTGGAACAAGTCCAACATAGATGAAAACGCCATCTACTGGCATAATCGATTCGGAGCCATCCACAGTAGAAACAAGTTTTGCTCCTGTTACTTTTTTACCATCGCCAACAATTTCTTCTACTGTACTATTCCAAATGAAATCAACTTTTTCATCTTTAAAAGCACGATCTTGTAAAATTTGTTGTGCTCGCAATTTATCACGACGGTGTACAATGGTTACTTTATCTGCATAACGAGTCAAGTAGGTTCCTTCTTCCACTGCAGAGTCTCCGCCGCCAACCACAATTAATTCGCGATTTTTGAAGAATGCTCCGTCACAGACTGCGCAGTAAGAAACACCACGTCCACTAAGTTCTTCTTCACCAGCCGCGCCAAGTTTACGGTGTTCAGCTCCAGTCGCAATAATAATTGCCCGAGCCTTGTAGGTTTTCGACCCAGCTGTTACTGTTTTAAATTCTTTACCGTCAACAACTTCTTTAATATCACCATAAGCATACTCAGCTCCAAATTGTTTCGCACCACTAAGCATCTTGTCGGACAAATCTGGTCCTAAAATGCTATCAAATCCTGGGTAATTTTCTACCTCAGCTGTGTTAACCATTTGTCCACCGGGTACACCGCGTTCAATCATTAACGTATCTAAATCTGCACGGGAAGTATATAAAGCTGCTGTCATTCCAGCAGGCCCCGCCCCAATAATAATCACATCATAAATTTTTTCTTCACTAGCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_017546|2564990:2572834|2564990_2565962_-|WP_003722604.1|DBSCAN-SWA MSFASETKKELTHMDVSDSDAKVELAAFIRMNGAISFSSQLVIMDVQTENAAIARRMYQLLKDLYEVPIELLVRRKMKLKKNNVYIVRLKSGTRGILEDLRILEPPMTFTKSIDRGFVKKRSAKRAYLRGAFLASGSVNNPETSSYHLEIFSVYEEHNEAICALMNQFDLNARTLERKNGFITYLKEAEKITEFLSIIGATSALLHFEDVRIMRDMRNSVNRLVNCETANLNKTINAAVRQIDNIKYIQSTVGLEALPERLREIAALRIANEDVTLKELGEMLTTGQVSKSGINHRLRKLDQIAERLRSGETPAQVGLKISNS >NC_017546|2564990:2572834|2567922_2569653_-|WP_014601525.1|DBSCAN-SWA MNWQEEYQKWVANDKLDSTLRKQLTNMETNEKELEDSFYRNMEFGTAGMRGVLGAGTNRMNIYTIRKASLGLAQFVAENGEEAKKRGIVIAYDPRHMSREFAFESAAVLGHHGVKSYVFDALRPTPELSFAVRHLNAFGGIVITASHNPPEYNGYKIYGEDGGQMPPTGASAVIEYINAVEDIFSVEVANQELLIENGLLEVISEKVDRPYLEKLKEVIVNKELVQERGEDLKIVFTPLHGTGGILGVPALESVGFTNIVKVDEQFVNDPDFGTVKSPNPENREAFLLAIEYGKKFGGDILVGTDPDADRLGVAVRNADGEYEVLSGNQIGAIILHYLLKQKKAQSELPANAAVLKSIVTSNLGTEIAKHYGAEMIEVLTGFKFIAEQIKHFEETGKHTFEFGYEESNGYMVKPFTRDKDAIQAVLAIAEVALVSKVAGRTLLEDLDQIYDEFGYYNEDLVSLTLSGKDGSERIKEITSSFREQLPTSMGGFVVERVEDYLRSETTWIATGKTEAIHLPTADVIKCYFEDGSWFCLRPSGTEPKIKFYFSIRGESKEESTAKLEKVKADLMQHIEA >NC_017546|2564990:2572834|2565969_2566938_-|WP_003722605.1|DBSCAN-SWA MKKETKPRVVVIGGGTGLPVILKGLKKKDIHLTAIVTVADDGGSSGKIREQMDVLPPGDIRNVMLALSNVDPRVVDLFQYRFAVDGDLSGHVIGNLILTALSQLNDSYVDAINVLATVLKIRGKVIPATDQPLILNAEMEDGSIVHGESLIPLQGKHINRVYIEPENVKPYPTAVEAVKEADLIVIGPGSLYTSILPNLLLTELADEITASKAPKVYITNILTQIGETDFFSDADHIKVIHEHVGKSFIDKTLINTTTVPKELLFPEDVAQVEHNAKGMEELGVEAIYQDFLSTEDGLVRHAAEKVADALLAMLPNQTNEKE >NC_017546|2564990:2572834|2569694_2570756_-|WP_009930954.1|DBSCAN-SWA MIFIEVMKERFGEFEGETVWKWTMINDHDMRMSVLNYGAIVTSLETKDKFGDFANISLGFTNLDDYLAHSPYFGATLGPVAGRITNGQFSLDGKQFQLIQNEGSNHRHGGKFNFSKKLWDVSVEKSLDQIVMTFEYCWADGENGYPGKIDAKMTYTLNNKNEWLVDYEARSNQPTIYNPSNHIYFNLSGEAGSTVLQHQLWVNSDSFLPIDEEFLPIGEKRLAENTIFDLRAGREVAEITQSQDQQVKLVGAGLDHTFILKHENGRPDAVLFDPKSGRRLEMETKADSVLIYTANSLDGSFEIDERAVPKYAGITMETQGLVDAINHEGFGDIVLRPEKPFTSRTAFRFTVES >NC_017546|2564990:2572834|2570772_2571756_-|WP_009924988.1|DBSCAN-SWA MGIAVLGGAGYIGSHAVDELITRGYEVVVIDNLRTGHRESIHKKAKFYEGDIRDKAFLSSVFEKEKVDGVIHFAASSLVGESMEVPLDYLNNNVYGTQIVLEVMEEFDVKHIVFSSSAATYGEPERVPITEDMPTNPESTYGETKLIMEKMMKWCDKAYGMKFVALRYFNVAGAKADGSIGEDHKPESHLVPIILQVALGQREKLAIYGDDYNTPDGTCIRDYVQVEDLIDAHIRALEYLKNGGESNIFNLGSSNGFSVKEMLEAARTVTGKEIPAEVVPRRAGDPGTLIASSDKAREILGWEPTYTDVKDIIATAWKWHVSHPNGY >NC_017546|2564990:2572834|2571874_2572834_-|WP_003722610.1|DBSCAN-SWA MASEEKIYDVIIIGAGPAGMTAALYTSRADLDTLMIERGVPGGQMVNTAEVENYPGFDSILGPDLSDKMLSGAKQFGAEYAYGDIKEVVDGKEFKTVTAGSKTYKARAIIIATGAEHRKLGAAGEEELSGRGVSYCAVCDGAFFKNRELIVVGGGDSAVEEGTYLTRYADKVTIVHRRDKLRAQQILQDRAFKDEKVDFIWNSTVEEIVGDGKKVTGAKLVSTVDGSESIMPVDGVFIYVGLVPLTKAFLNLGITDDEGYIVTDEEMRTNLPGIFAAGDVRAKSLRQIVTATGDGGLAGQNAQKYVEELKESLEAEAAK >NC_017546|2564990:2572834|2566939_2567815_-|WP_010990001.1|DBSCAN-SWA MASKQLKLVIITGMSGAGKTVAMQSLEDLGYFCVDNLPPSLLPKFWELMKESDKMDKIALVMDLRGREFFDSIEPALDELDNTNFITTKILFLEADDKVLVSRYKETRRHHPLEPNGSVLDGINAERELLSDLKGRSQLVINTSNMAPRELRERINNEFQTEDKDIFNVQLMSFGFKYGIPIDADLVFDVRFLPNPHYIDKMRPLTGLDEDVYEYVMKWPETQTFLDKLVDLLMFTLPFYKREGKTQLVIAIGCTGGQHRSVALTEFVGKTIQQKYETTISHRDMKRRKGR |
7 | Streptococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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