Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_014964 | Thermoanaerobacter brockii subsp. finnii Ako-1, complete sequence | 6 crisprs | RT,cas6,cas8b1,cas7,cas5,cas3,cas4,cas1,cas2,csa3,Cas14b_CAS-V-F,csx20,csx1,cas10,csm3gr7,csx19,DEDDh,cmr1gr7,cas14k,cas14j,casR | 0 | 11 | 7 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_014964_1 | 121660-124897 | TypeI-B |
NA
Consensus repeat of NC_014964_1
|
48 spacers
spacers of NC_014964_1
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cas3,cas5,cas7,cas8b1,cas6,cas4,cas1,cas2,RT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014964_1
The CRISPR arrays of NC_014964_1 >merge|NC_014964|1|121660-124897|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT 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AATCCTGGCCCCGGGCAAAGACCACTTCTTCATGCTCC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGTAAACGAGGGAAAGGATGAAAAAAAAATGATAAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGATATTTAAGCGCGCGATGTGGAGGGGTCTCGTGG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CGTGCCTGCAGACTGCAATGCCTACGACGTCATGGA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGTACTAAAGATTGAGGAGGTATAAACATGGAAGAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CAGCCTGTTGCTTATAATTAAGGTAACAGCAGGTTAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGCTGTTCCTGCAAGGATGCGATGGTTGCAGTTTTTT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CCACCTTTTTTACCTCAATTAGTTCTATAGTATTAAAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AAACTAGTGATGGATATGTTGATTGGCTAAGTATTGA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTGCTTTAGCAAGATTGTTATTTTTTAACATATTAC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GAAAAGCAGTTGGAGGAGGCAAAAGAACATGAAAAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CAGTATTGAAACATTAAAAAATAATGCAGAGCTGAAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CCTGTAGCACCTTTGTAGTTATCTAAAACCTCAATGG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TAATATCCTGAAACAAAGAAAAAACGCTGAATCTCAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TAGAGCCTTTTAATATTGCAAAGGAAAAGGTGCTTTCG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATCGCTTAAATTGTTCTTCTGTTAATTCATTCTCTG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGTATTAAAAATTAAGGAGGTTTAAAAAATGGAAAA GTTTTTAGCCTACCTATCCTGAAAATAGTG
>NC_014964.1|WP_012268883.1|119122_121477_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MSSFSELYSHPDKFLEDHLINTSKIIRSYFNEKKVAIIDKETFLKTATIISLCHDFGKATNYFQKYLFTENEKERNKLKTMEEMHHSLLSAVVAFYLVKNEINAQDRKGILFPFIAFLIVKNHHGDLKNVFNEVILDDKELEVLKKQLNSIDDEKLQVLNGKLRNAGLNENLTKSAINDYIDSINSELRKIKRELRRLKEEQDVSIYLLLNFLFSLLVDADKTEVVVGIDNIKRPEIKFEEQLVKEYKASFPDKESKINLLREEAYKEVLEKDIDIKQKIMSINLPTGLGKTLTTIAFAMKLWAKLYKETGVKYRIIYSLPFLSIIEQNSNVLEDLLRYNGIQPDTEIILKHHHLSDIRYTKNNTEFEDEQAKILIEGWNSEIIITTFVQFFHTLVSEKNKTLRKFHRLANSIIILDEVQSIPFKYWLLTKELLKAVANELNSYIIFVTATQPLIFREEEIYPLVAKTKYFTQMDRVEIIPKLSRDITLEELSEMFDLNDGKSYLFILNTIKSAQQFYNILRAKIPNDEIIYMSTHVVPMERMERIEKIKEGKIRFAVTTQLVEAGVDIDFDVVVRDIAPLDSINQSAGRCNRNWRGKGEVYVVSLIDEKGQKYSKYVYDKILLGITREILSKYDTIKEQELLKIIEKYYQEVSERMSSNEGRELLDAIYTLRYDSEDGNMCISKFELIEDDYYKVDAFIELNDEAKELWHKYVELKDIKNLFERRNIFNRFKADFYKYVISIPATVENMPPDIWGFKYVNYDSLNDYYDKETGFITKGVTSIW >NC_014964.1|WP_003871404.1|118425_119139_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKTLVFDVFGDYGHFRKYYTTSSPLTFSFPPPPTVKGMLGAIAGIDKKEYLKVFSEENCKVAIRILNPIKKIRLGLNLINTKGNYWIPYKAKNHEARTQVKTEFVKDAAYRIYFMHKDNDLFEDIVEKIKNRRNVYTLSLGLSEMIADYKFIGVYEAEEIENAEVDILSVLPFQSIVEDKIYFENGKKYFKEKIPAGMNEDRVVLSYEDVLYEVNGQSIKCHVKKCWEVKGEHVIFF >NC_014964.1|WP_012268882.1|117501_118413_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csh2 MENVIKNRAEILFLYDVSFANPNGDPVDENKPRIDEETGINIVTDVRLKRTIRDYLAYYKGKEVFIIETRKDNGELRTKKDRIEDFGTNEDIIAKCIDVRLFGATTAVKDKMMILTGPVQFKYGKSLHRVNLMYVKGTTVMPSGEGREQGTFTEKYILPYSLIAFYGIVNENAAINQNIPLTDEDVDLMLEGMWNGTKNLMSGSKIGHMPRLLIEVVYQENNYQIGELEKRIKFVHEMEDEEIRDIQDGKLDITELVAVLKQNQEKIKLIKYIYDDRVTFTCNGEECTLEKALKGLNIQKLQY >NC_014964.1|WP_012268881.1|115737_117501_+|TIGR02556-family-CRISPR-associated-protein MITAIKELGEMVLKSQNKTLLDVLIENPNQDGRYSKIIAINFIVKEDEIEYEGIRLEEYDDSKISRYLFTDTGGNAPGYTPAAKITEVPKTFNGKIKNWFNKVLKDKSIKIDEKDRAFLERIKDILEEKSDEIIKEAEKIRGDFPKKEGLSLILKFNVDGEYKYIGDFNVFRDLMLQLDSQKYQKIYAEDKVCSICGQKKDIVFGTVDTYKFYTIDKPGYIAGGFNEKESWKNYPVCAECRLALEEGKRYLENELTFRFYGLEYQLIPNFIIGKEFVRKEVREIFESSERLLSLKREVKKRFIGDEDEILDYLADAEDSMTVNLLFLRKSNSAERILLLIEDVFPSHLREIFNAKEQVDKIFGNSFTFKNIRSFMSKSDSNKRDNDLDGYFLDITDRIFRGRPVDLGFLYNLIMKKIREEFVKDGYYKAATADGLMTIAFLEKMKLIKMEVIPMEERIFDSFFAKYGPTFEMPLKRGLVLLGALTELLLRKQYSDREAKPFMKNLKGLKMDEKDIKGLLPKVQNKLEEYDSFEKGKRLLAKEASNYLLLAGDNWNMSVDEINFYFACGINLADELTSIIYKKEGEEK >NC_014964.1|WP_004399630.1|114962_115718_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRITLEFVGEKNLVLPIHYNYIVQGFLYDLMGDSEFAAFLHDEGFQYEKRKFKLFTFSRIEGEFKILTDSKGQKKISIKPPFKFTVASPLDEFIFDISKNALKKEYCHFNGQKFILNSLNIDNPPVFKNKARIKFISPVVMYTTLKDGDIKYTYYYSPWDEKFSPLLLNNLLKKYELVYKIKAEDPYFKLYPLSEKEDRRYSKMIKYKNVYVKGWMGIYDVESSPELLELAYYTGLGAKNSQGFGCFEIIG >NC_014964.1|WP_003868738.1|114360_114774_+|SUF-system-NifU-family-Fe-S-cluster-assembly-protein MSDLNQLYSEVIMEHYENSPHRRELKDATHKERGHNPLCGDDITLYLKMNGDIIEDASFTGHGCAISQASTSMMIDLIKGKDKKEALRLVQEFIDMIHKKDVNLDELGDAQVLHGVSDFPARVKCALLAWKTLQEIL >NC_014964.1|WP_012268880.1|113134_114364_+|cysteine-desulfurase MKNIDIERIKKDFPILSVKPHGKRLVYLDNAATTQKPIEVIKAMDKYYEELNANVYRSPHYLSVLSTQAYEEARERVKKFINAKKEESIVFTRNTTESINFIAYTWGMKHINEGDEILLTIAEHHSNILPWQMVAEAKGAKLKYVYLDENFRLSMKDFKEKMSEKVKLVAVQHMSNVLGIINPVEEITHIAHKYGAKVLIDGAQSVPHMPVDVQKIDCDFFAFSGHKMLGPMGIGVLYIKEDLLKEVPPFLRGGEMIDEVYEDHSTFAPSPLKFEAGTPNIEGAYVLISAIDYIEKIGLTNIYKHEGELLEYGLQKMRELDFVKLYGPKDAKERGGIISFNVEGVHPHDVATILDEEGVAVRSGHHCCQPLMRYLGVPATVRASFYLYNDFEDIDALVEGLKKVRKWFK >NC_014964.1|WP_012268879.1|112088_113138_+|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufD MWKRVSMEEIQQPSYKEYTSAVIKNLSHDTVKIKETKKLAGLPTEILALRDKAFGIEGKFINMVRDFYNAGFHIEISQNSNVEKPIVIDYITNEQNDTLIDYNIIEAEANSQVTIVFDYNSGTKGFHNGITQVIAKEGSTVNIVKIQRLGDEFNDFDNNLVIVGKNAMVNWSNVVIGSKVSAFDVAVYLDEVGGTFTSKSIFLGVDSQKYDMAYKVYHQAPKTTSSVDLKGALKGSAKATFIGNIDIKKGAKKAKAEENETVLLLDKTVKSVAIPALYCGEDDVQANHSASAGQIDEDKLYYVMSRGFSLEEARLLMVQAILNPVIDLIPYDPVREIIIKGHIGRRIIK >NC_014964.1|WP_012268878.1|110674_112078_+|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufB MKKPDIKEIDFSIYDVKDNVKYEYQTGKGLSKEVVLEISEQKNEPSWMRDFRLKALEIYQKMPMPTWGVDLSQLDIDSIIAYIRPSAKMQRSWDEVPEEIRRTFERLGIPEAERKALAGVGAQYDSEVVYHNIKESLTQQGVIFEDMDTAVKKYPDIIKEYFMTKNVTPYDHKFVALHAAIWSGGTFVYVPEGVKVEVPLQAYFRMNAPGSGQFEHTLIIADKGSEVHFIEGCSAPQYTVSNLHAGCVELFVNEGARIIYSTIENWSKNTYNLNTKRAIVEKDGIIEWISGSFGSHKTMLYPASILKGEGAKAEYTGVTFAAKGQHLDTGSKMIHLAPHTSSKVLAKSISKDGGISSYRGLLKIGPNAEGAKASVQCEGLMLDDISRSDTMPVIEIENDNVDIGHEAKVGRISDEQIFYLMSRGLSEDDARAMIVRGFVEPIAKALPLEYAVEMNRLIKLELEGAIG >NC_014964.1|WP_012268877.1|109908_110655_+|Fe-S-cluster-assembly-ATPase-SufC MRETLLEIKDLHIEVEGKYILKGLNLTIKKGEIHAIMGPNGGGKSTLCNSIMGNPKYKVTSGQILFEGEDITNLKVNERAKKGIFLSFQYPEEIPGITVDNFIRTSVNIVTGQNVSMLQFAKEMKNTLELLDMNSEYRSRYLNVGFSGGEKKKAEILQMAFLKPKLVMLDEIDSGLDIDALKVVAEAVKKLKSEDMSILIVTHYNRILDYLEPDVISVLMDGKIVKSGDKDLAKILEEKGYDFVRNGV >NC_014964.1|WP_003869923.1|129773_130994_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKNVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_014964.1|WP_003869923.1|133640_134861_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKNVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_014964.1|WP_012268884.1|136967_138188_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKSVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_014964.1|WP_009052111.1|138326_139055_+|peptidase-E MKKVVAIGGGEISKFETFKIDEEIVKLTDKAKPKALFVPTASGEPEAYCDNFDFVYGKMLGCETDILFLIKDDPDSSQIEKKISWADLIYVGGGNTKRMMEIWRSKGVDKMLIDAYQRGTVLSGLSAGAICWFKYGFSDSQRFENQENWHYTKVEGLGLFDAILCPHLNEENRRELFEKFMIDFEGVGIGLENGCAIEIVDDTFKIINSFENAHAYVFRRSENKLFVDEIRHRDYIPFNLLI >NC_014964.1|WP_003867574.1|139383_139881_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MEFEVTGALMQSYTICKRQVWLMAHQIVPDQEHPYIEIGRLIDENSYQRDRKKIHFENVVLDLVRMEKDNILIGEVKKSSKAEDSAKMQLLFYLYKLKQSGITAKGQLFFPEERKREVVELTPEFEREVIKAIEEIKDIVYKEKPPAFIKIPYCKNCGYKEFCMS >NC_014964.1|WP_004399636.1|139877_140870_+|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKKTIYIFSDGELKRKDNTLFFEGENGRKFIPVENTSEIMVFGEVSLNKRLLEFLTQSEIILHFFNHYGYYVGSYYPREHLNSGYMILRQAEHYNDESKRLYLAQKFVEGAYKNIRQVLKYYSNRGKDLEDVIYSIEKLGESVDSTSTINELMAIEGNIREYYYKAFDEIIQNPDFKFDFRSKRPPQNFLNTLISFGNSLMYTTTLSEIYKTHLDPRIGFLHATNFRRFSLNLDVSEIFKPIIVDRTIFTLLSKKMVTKEDFEEDAEGLLLKEKGKKVFVQEFEDKLATTIKHRNLSNNVSYRRLIRLELYKLEKHLIEEEQYKPFIAQW >NC_014964.1|WP_003871087.1|140886_141150_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFLILVYDVNEKRVNKVLKTCRKYLHWVQNSVLEGEISEANLKKLKIELSRIIDKDEDSVIFYILRTTKYSEREILGLRKGGEDIII >NC_014964.1|WP_012268885.1|141270_143196_+|FAD-dependent-oxidoreductase MELTKPIKIGNLSLKNRVVMAPVKTGYATPEGQVTEELIQYYVNRAKGGVGLIVLESAYVDLSGKEIPRQLGIYDDSMVEGLRRLITPLQEAGSKVAVYINHAGRIANPMVTKLPLIAPSSIACPTIGVEPQGIPHEDIKKWQNTYVKAAVRAYEAGADALEIQFGHGYLIHQFLSPHTNKREDEYGGSFENRIRFGMEILDEIKKEIGADFPIIVRISADEFVPGGWALEDAIRLAKILEDKGVAAIDVSLGSSCESGAITLQTLGTQKGLAWEFASKIKKQVNIPVIAVGRINTPELAEEILVSGKADLVALGRPLVADPLFVEKATSGRSKEIRRCAACHQGCLDELRAGRRFGCNFNPSVGKEEEIEIQKAPQPGKKVFIIGAGLAGLEAAYTAAARGHKVYIYEEKGEIGGQVLPGSVPPHKEELKGIVEYYKEVLPKVGVTLNLNHKVTAEEIAKWEADEVVFATGGQPIVPPIPGLKEYGFLTAVEVLRGEKQAGDKVAIIGGGLIGMETADYLSEQGKKVMVIELLEEVARDMGVFEKILIMKRLKERGVEIYVKTRLKEVGKALLVETPEGEKELPLPDTIVLAVGLKPDPSLYEEVSKILPQEKLHVIGDAKEVRKIVHAISEGRNLGLSL >NC_014964.1|WP_003871085.1|143456_144236_+|MBL-fold-metallo-hydrolase MKFCSLRSGSSGNAIYINHKDVHILVDAGLSGRTIEKALLNIGINPKSLSAILITHEHKDHIIGAGVLSRRYNIPIYANKATWEVMEKDIKEISEKNKLYFTTGEEFEIGDVKIMPFKKSHDAVEPVGFSFKCGDKKISIATDLGYMTRGVANHLIGSDIVLLEANHDIEMLINGSYPWPLKKRILSNLGHLSNDAAADTLMKLFKMKAIGIAFLGHLSQNNNRPELAFATVTNVLKKSGVKFEVRMALRNIESDLVEI >NC_014964.1|WP_012268886.1|144690_146103_+|group-II-intron-reverse-transcriptase/maturase MDSKDMQRLQTTQQRGYPLNREMEFQKTTEVHSISSASEDGRNEVQRYTSKMLEMIVERGNMEAAYKRVVANKGSHGVDGMEVDELLPYLKENWATIKQQLLEGKYKPQPVRRVEISKPDGGVRLLGIPTALDRLIQQAIAQILNRVYNHTFSDSSYGFRPGRSAKDAIKAAEAYINEGYTWVVDMDLEKFFDRVNHDIIMSKLEKRIGDKRVLKLIRRYLESGVMINGIKVSTEEGTPQGGPLSPLLANIMLDELDKELEKRGHKFCRYADDCNIYVKSRSAGNRVMKSIKKFIESKLKLKINEAKSAVDRPWRRKFLGFSFYTKENEVRIRIHEKSIKRFKEKVREITNRNKGISMENRIKRLNQITTGWVNYFGLADAKSIMKTLDEWIRRRLRACIWKQWKKIKTKHDNLVKLGVEEQKAWEYANTRKGYWRISNSPILNKTLTNKYFESIGYKSLSQRYLIVHNS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_014964_2 | 126460-128029 | TypeI-B |
NA
Consensus repeat of NC_014964_2
|
23 spacers
spacers of NC_014964_2
>2.1|126490|39|NC_014964|CRT CTAATTTGCTTTAAGCTTGTTGCTACAAGATAGACCTTG >2.2|126559|38|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CGCCGAGGTCTTCTCCTGTCGCGATATAATGCGACAGG >2.3|126627|36|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GGCAATAGTTTTATTACGTCCAAAACAAACTAAAAG >2.4|126693|37|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AAAGGGCGGTTAAACTGCCTGAAAACGGCATAGTGGG >2.5|126760|38|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CATGGAAGCAGCAGCCGAGGCCACAGGTGGAGTTTATG >2.6|126828|38|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATGCACCTTGCTTTAGGAGTGCATAAGCCTCTCTCCCG >2.7|126896|37|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TAAAGCAAAAAACCAGTGGCTTTGCTGCAAGGGTTGA >2.8|126963|36|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AGCTGTTGTTTTGACATATTCATCATCCTTTCTGAA >2.9|127029|39|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGACATTGTCTTCTTTAATTACCTTTCTTATGAAATCCG >2.10|127098|35|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GCAGGCAACCCAAAGCGGATGCATTTATGGATTGG >2.11|127163|36|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATTAAGTTGTTGGGCCATGATATCAGGGGCAATAAC >2.12|127229|36|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TAAGAACCTGTCATAATCTTTTCATTCTTATTTCTA >2.13|127295|36|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AAGGAATTTTGGCTAATAAGCTTGAAAACTTCCATC >2.14|127361|37|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CAAAAATTCTGTACTTTATACCGTTGATTTTTTTATG >2.15|127428|37|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TACGCAGTACATACAGCAAAGAAGCAGATATTACAGG >2.16|127495|38|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TAGCACCGGCATCCAGTAATCATCATGGAAATTATGAG >2.17|127563|38|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CCATGACGTGGCGGCATCATTACAATAAGACGATTAAG >2.18|127631|38|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TCTACCGTGACGGGTCGGTGGTCCAGCCGACCGAATAG >2.19|127699|38|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GTCCATCTTTTTATATTAGCCATCATTATCACCTCAAC >2.20|127767|36|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGGATTACGTGGGCATAGAGAACAAGGTTGACGCCA >2.21|127833|35|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CATAGGCCGTGGCTGGGCCGGTATCGGGTATAACG >2.22|127898|36|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GGTATATAAACGTCTACGACAATGATGAAGATGTAT >2.23|127964|36|NC_014964|CRT,CRISPRCasFinder AGAGGAACAATTGGAATGTATGAAATAGGACAAAGA |
cas3,cas5,cas7,cas8b1,cas6,cas4,cas1,cas2,RT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014964_2
The CRISPR arrays of NC_014964_2 >merge|NC_014964|2|126460-128029|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GCGGCATGGGAGTCTATAAGGAATTGAAACCTAATTTGCTTTAAGCTTGTTGCTACAAGATAGACCTTGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCGCCGAGGTCTTCTCCTGTCGCGATATAATGCGACAGGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGGCAATAGTTTTATTACGTCCAAAACAAACTAAAAGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAAAGGGCGGTTAAACTGCCTGAAAACGGCATAGTGGGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCATGGAAGCAGCAGCCGAGGCCACAGGTGGAGTTTATGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATGCACCTTGCTTTAGGAGTGCATAAGCCTCTCTCCCGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTAAAGCAAAAAACCAGTGGCTTTGCTGCAAGGGTTGAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAGCTGTTGTTTTGACATATTCATCATCCTTTCTGAAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTGACATTGTCTTCTTTAATTACCTTTCTTATGAAATCCGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGCAGGCAACCCAAAGCGGATGCATTTATGGATTGGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATTAAGTTGTTGGGCCATGATATCAGGGGCAATAACGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTAAGAACCTGTCATAATCTTTTCATTCTTATTTCTAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAAGGAATTTTGGCTAATAAGCTTGAAAACTTCCATCGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCAAAAATTCTGTACTTTATACCGTTGATTTTTTTATGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTACGCAGTACATACAGCAAAGAAGCAGATATTACAGGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTAGCACCGGCATCCAGTAATCATCATGGAAATTATGAGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCCATGACGTGGCGGCATCATTACAATAAGACGATTAAGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTCTACCGTGACGGGTCGGTGGTCCAGCCGACCGAATAGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGTCCATCTTTTTATATTAGCCATCATTATCACCTCAACGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTGGATTACGTGGGCATAGAGAACAAGGTTGACGCCAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCATAGGCCGTGGCTGGGCCGGTATCGGGTATAACGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGGTATATAAACGTCTACGACAATGATGAAGATGTATGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAGAGGAACAATTGGAATGTATGAAATAGGACAAAGAGTTTTTAGCCTACCTATCCTGAAAATAGTG >NC_014964|2|2|126460-128029|CRT GCGGCATGGGAGTCTATAAGGAATTGAAAC CTAATTTGCTTTAAGCTTGTTGCTACAAGATAGACCTTG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CGCCGAGGTCTTCTCCTGTCGCGATATAATGCGACAGG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GGCAATAGTTTTATTACGTCCAAAACAAACTAAAAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AAAGGGCGGTTAAACTGCCTGAAAACGGCATAGTGGG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CATGGAAGCAGCAGCCGAGGCCACAGGTGGAGTTTATG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATGCACCTTGCTTTAGGAGTGCATAAGCCTCTCTCCCG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TAAAGCAAAAAACCAGTGGCTTTGCTGCAAGGGTTGA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGCTGTTGTTTTGACATATTCATCATCCTTTCTGAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGACATTGTCTTCTTTAATTACCTTTCTTATGAAATCCG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GCAGGCAACCCAAAGCGGATGCATTTATGGATTGG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATTAAGTTGTTGGGCCATGATATCAGGGGCAATAAC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TAAGAACCTGTCATAATCTTTTCATTCTTATTTCTA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AAGGAATTTTGGCTAATAAGCTTGAAAACTTCCATC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CAAAAATTCTGTACTTTATACCGTTGATTTTTTTATG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TACGCAGTACATACAGCAAAGAAGCAGATATTACAGG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TAGCACCGGCATCCAGTAATCATCATGGAAATTATGAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CCATGACGTGGCGGCATCATTACAATAAGACGATTAAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TCTACCGTGACGGGTCGGTGGTCCAGCCGACCGAATAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GTCCATCTTTTTATATTAGCCATCATTATCACCTCAAC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGGATTACGTGGGCATAGAGAACAAGGTTGACGCCA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CATAGGCCGTGGCTGGGCCGGTATCGGGTATAACG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GGTATATAAACGTCTACGACAATGATGAAGATGTAT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGAGGAACAATTGGAATGTATGAAATAGGACAAAGA GTTTTTAGCCTACCTATCCTGAAAATAGTG >NC_014964|2|2|126529-127963|PILER-CR GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CGCCGAGGTCTTCTCCTGTCGCGATATAATGCGACAGG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GGCAATAGTTTTATTACGTCCAAAACAAACTAAAAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AAAGGGCGGTTAAACTGCCTGAAAACGGCATAGTGGG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CATGGAAGCAGCAGCCGAGGCCACAGGTGGAGTTTATG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATGCACCTTGCTTTAGGAGTGCATAAGCCTCTCTCCCG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TAAAGCAAAAAACCAGTGGCTTTGCTGCAAGGGTTGA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGCTGTTGTTTTGACATATTCATCATCCTTTCTGAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGACATTGTCTTCTTTAATTACCTTTCTTATGAAATCCG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GCAGGCAACCCAAAGCGGATGCATTTATGGATTGG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATTAAGTTGTTGGGCCATGATATCAGGGGCAATAAC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TAAGAACCTGTCATAATCTTTTCATTCTTATTTCTA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AAGGAATTTTGGCTAATAAGCTTGAAAACTTCCATC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CAAAAATTCTGTACTTTATACCGTTGATTTTTTTATG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TACGCAGTACATACAGCAAAGAAGCAGATATTACAGG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TAGCACCGGCATCCAGTAATCATCATGGAAATTATGAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CCATGACGTGGCGGCATCATTACAATAAGACGATTAAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TCTACCGTGACGGGTCGGTGGTCCAGCCGACCGAATAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GTCCATCTTTTTATATTAGCCATCATTATCACCTCAAC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGGATTACGTGGGCATAGAGAACAAGGTTGACGCCA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CATAGGCCGTGGCTGGGCCGGTATCGGGTATAACG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GGTATATAAACGTCTACGACAATGATGAAGATGTAT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC >NC_014964|2|2|126529-128029|CRISPRCasFinder GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CGCCGAGGTCTTCTCCTGTCGCGATATAATGCGACAGG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GGCAATAGTTTTATTACGTCCAAAACAAACTAAAAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AAAGGGCGGTTAAACTGCCTGAAAACGGCATAGTGGG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CATGGAAGCAGCAGCCGAGGCCACAGGTGGAGTTTATG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATGCACCTTGCTTTAGGAGTGCATAAGCCTCTCTCCCG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TAAAGCAAAAAACCAGTGGCTTTGCTGCAAGGGTTGA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGCTGTTGTTTTGACATATTCATCATCCTTTCTGAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGACATTGTCTTCTTTAATTACCTTTCTTATGAAATCCG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GCAGGCAACCCAAAGCGGATGCATTTATGGATTGG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATTAAGTTGTTGGGCCATGATATCAGGGGCAATAAC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TAAGAACCTGTCATAATCTTTTCATTCTTATTTCTA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AAGGAATTTTGGCTAATAAGCTTGAAAACTTCCATC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CAAAAATTCTGTACTTTATACCGTTGATTTTTTTATG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TACGCAGTACATACAGCAAAGAAGCAGATATTACAGG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TAGCACCGGCATCCAGTAATCATCATGGAAATTATGAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CCATGACGTGGCGGCATCATTACAATAAGACGATTAAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TCTACCGTGACGGGTCGGTGGTCCAGCCGACCGAATAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GTCCATCTTTTTATATTAGCCATCATTATCACCTCAAC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGGATTACGTGGGCATAGAGAACAAGGTTGACGCCA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CATAGGCCGTGGCTGGGCCGGTATCGGGTATAACG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GGTATATAAACGTCTACGACAATGATGAAGATGTAT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGAGGAACAATTGGAATGTATGAAATAGGACAAAGA GTTTTTAGCCTACCTATCCTGAAAATAGTG
>NC_014964.1|WP_012268883.1|119122_121477_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MSSFSELYSHPDKFLEDHLINTSKIIRSYFNEKKVAIIDKETFLKTATIISLCHDFGKATNYFQKYLFTENEKERNKLKTMEEMHHSLLSAVVAFYLVKNEINAQDRKGILFPFIAFLIVKNHHGDLKNVFNEVILDDKELEVLKKQLNSIDDEKLQVLNGKLRNAGLNENLTKSAINDYIDSINSELRKIKRELRRLKEEQDVSIYLLLNFLFSLLVDADKTEVVVGIDNIKRPEIKFEEQLVKEYKASFPDKESKINLLREEAYKEVLEKDIDIKQKIMSINLPTGLGKTLTTIAFAMKLWAKLYKETGVKYRIIYSLPFLSIIEQNSNVLEDLLRYNGIQPDTEIILKHHHLSDIRYTKNNTEFEDEQAKILIEGWNSEIIITTFVQFFHTLVSEKNKTLRKFHRLANSIIILDEVQSIPFKYWLLTKELLKAVANELNSYIIFVTATQPLIFREEEIYPLVAKTKYFTQMDRVEIIPKLSRDITLEELSEMFDLNDGKSYLFILNTIKSAQQFYNILRAKIPNDEIIYMSTHVVPMERMERIEKIKEGKIRFAVTTQLVEAGVDIDFDVVVRDIAPLDSINQSAGRCNRNWRGKGEVYVVSLIDEKGQKYSKYVYDKILLGITREILSKYDTIKEQELLKIIEKYYQEVSERMSSNEGRELLDAIYTLRYDSEDGNMCISKFELIEDDYYKVDAFIELNDEAKELWHKYVELKDIKNLFERRNIFNRFKADFYKYVISIPATVENMPPDIWGFKYVNYDSLNDYYDKETGFITKGVTSIW >NC_014964.1|WP_003871404.1|118425_119139_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKTLVFDVFGDYGHFRKYYTTSSPLTFSFPPPPTVKGMLGAIAGIDKKEYLKVFSEENCKVAIRILNPIKKIRLGLNLINTKGNYWIPYKAKNHEARTQVKTEFVKDAAYRIYFMHKDNDLFEDIVEKIKNRRNVYTLSLGLSEMIADYKFIGVYEAEEIENAEVDILSVLPFQSIVEDKIYFENGKKYFKEKIPAGMNEDRVVLSYEDVLYEVNGQSIKCHVKKCWEVKGEHVIFF >NC_014964.1|WP_012268882.1|117501_118413_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csh2 MENVIKNRAEILFLYDVSFANPNGDPVDENKPRIDEETGINIVTDVRLKRTIRDYLAYYKGKEVFIIETRKDNGELRTKKDRIEDFGTNEDIIAKCIDVRLFGATTAVKDKMMILTGPVQFKYGKSLHRVNLMYVKGTTVMPSGEGREQGTFTEKYILPYSLIAFYGIVNENAAINQNIPLTDEDVDLMLEGMWNGTKNLMSGSKIGHMPRLLIEVVYQENNYQIGELEKRIKFVHEMEDEEIRDIQDGKLDITELVAVLKQNQEKIKLIKYIYDDRVTFTCNGEECTLEKALKGLNIQKLQY >NC_014964.1|WP_012268881.1|115737_117501_+|TIGR02556-family-CRISPR-associated-protein MITAIKELGEMVLKSQNKTLLDVLIENPNQDGRYSKIIAINFIVKEDEIEYEGIRLEEYDDSKISRYLFTDTGGNAPGYTPAAKITEVPKTFNGKIKNWFNKVLKDKSIKIDEKDRAFLERIKDILEEKSDEIIKEAEKIRGDFPKKEGLSLILKFNVDGEYKYIGDFNVFRDLMLQLDSQKYQKIYAEDKVCSICGQKKDIVFGTVDTYKFYTIDKPGYIAGGFNEKESWKNYPVCAECRLALEEGKRYLENELTFRFYGLEYQLIPNFIIGKEFVRKEVREIFESSERLLSLKREVKKRFIGDEDEILDYLADAEDSMTVNLLFLRKSNSAERILLLIEDVFPSHLREIFNAKEQVDKIFGNSFTFKNIRSFMSKSDSNKRDNDLDGYFLDITDRIFRGRPVDLGFLYNLIMKKIREEFVKDGYYKAATADGLMTIAFLEKMKLIKMEVIPMEERIFDSFFAKYGPTFEMPLKRGLVLLGALTELLLRKQYSDREAKPFMKNLKGLKMDEKDIKGLLPKVQNKLEEYDSFEKGKRLLAKEASNYLLLAGDNWNMSVDEINFYFACGINLADELTSIIYKKEGEEK >NC_014964.1|WP_004399630.1|114962_115718_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRITLEFVGEKNLVLPIHYNYIVQGFLYDLMGDSEFAAFLHDEGFQYEKRKFKLFTFSRIEGEFKILTDSKGQKKISIKPPFKFTVASPLDEFIFDISKNALKKEYCHFNGQKFILNSLNIDNPPVFKNKARIKFISPVVMYTTLKDGDIKYTYYYSPWDEKFSPLLLNNLLKKYELVYKIKAEDPYFKLYPLSEKEDRRYSKMIKYKNVYVKGWMGIYDVESSPELLELAYYTGLGAKNSQGFGCFEIIG >NC_014964.1|WP_003868738.1|114360_114774_+|SUF-system-NifU-family-Fe-S-cluster-assembly-protein MSDLNQLYSEVIMEHYENSPHRRELKDATHKERGHNPLCGDDITLYLKMNGDIIEDASFTGHGCAISQASTSMMIDLIKGKDKKEALRLVQEFIDMIHKKDVNLDELGDAQVLHGVSDFPARVKCALLAWKTLQEIL >NC_014964.1|WP_012268880.1|113134_114364_+|cysteine-desulfurase MKNIDIERIKKDFPILSVKPHGKRLVYLDNAATTQKPIEVIKAMDKYYEELNANVYRSPHYLSVLSTQAYEEARERVKKFINAKKEESIVFTRNTTESINFIAYTWGMKHINEGDEILLTIAEHHSNILPWQMVAEAKGAKLKYVYLDENFRLSMKDFKEKMSEKVKLVAVQHMSNVLGIINPVEEITHIAHKYGAKVLIDGAQSVPHMPVDVQKIDCDFFAFSGHKMLGPMGIGVLYIKEDLLKEVPPFLRGGEMIDEVYEDHSTFAPSPLKFEAGTPNIEGAYVLISAIDYIEKIGLTNIYKHEGELLEYGLQKMRELDFVKLYGPKDAKERGGIISFNVEGVHPHDVATILDEEGVAVRSGHHCCQPLMRYLGVPATVRASFYLYNDFEDIDALVEGLKKVRKWFK >NC_014964.1|WP_012268879.1|112088_113138_+|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufD MWKRVSMEEIQQPSYKEYTSAVIKNLSHDTVKIKETKKLAGLPTEILALRDKAFGIEGKFINMVRDFYNAGFHIEISQNSNVEKPIVIDYITNEQNDTLIDYNIIEAEANSQVTIVFDYNSGTKGFHNGITQVIAKEGSTVNIVKIQRLGDEFNDFDNNLVIVGKNAMVNWSNVVIGSKVSAFDVAVYLDEVGGTFTSKSIFLGVDSQKYDMAYKVYHQAPKTTSSVDLKGALKGSAKATFIGNIDIKKGAKKAKAEENETVLLLDKTVKSVAIPALYCGEDDVQANHSASAGQIDEDKLYYVMSRGFSLEEARLLMVQAILNPVIDLIPYDPVREIIIKGHIGRRIIK >NC_014964.1|WP_012268878.1|110674_112078_+|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufB MKKPDIKEIDFSIYDVKDNVKYEYQTGKGLSKEVVLEISEQKNEPSWMRDFRLKALEIYQKMPMPTWGVDLSQLDIDSIIAYIRPSAKMQRSWDEVPEEIRRTFERLGIPEAERKALAGVGAQYDSEVVYHNIKESLTQQGVIFEDMDTAVKKYPDIIKEYFMTKNVTPYDHKFVALHAAIWSGGTFVYVPEGVKVEVPLQAYFRMNAPGSGQFEHTLIIADKGSEVHFIEGCSAPQYTVSNLHAGCVELFVNEGARIIYSTIENWSKNTYNLNTKRAIVEKDGIIEWISGSFGSHKTMLYPASILKGEGAKAEYTGVTFAAKGQHLDTGSKMIHLAPHTSSKVLAKSISKDGGISSYRGLLKIGPNAEGAKASVQCEGLMLDDISRSDTMPVIEIENDNVDIGHEAKVGRISDEQIFYLMSRGLSEDDARAMIVRGFVEPIAKALPLEYAVEMNRLIKLELEGAIG >NC_014964.1|WP_012268877.1|109908_110655_+|Fe-S-cluster-assembly-ATPase-SufC MRETLLEIKDLHIEVEGKYILKGLNLTIKKGEIHAIMGPNGGGKSTLCNSIMGNPKYKVTSGQILFEGEDITNLKVNERAKKGIFLSFQYPEEIPGITVDNFIRTSVNIVTGQNVSMLQFAKEMKNTLELLDMNSEYRSRYLNVGFSGGEKKKAEILQMAFLKPKLVMLDEIDSGLDIDALKVVAEAVKKLKSEDMSILIVTHYNRILDYLEPDVISVLMDGKIVKSGDKDLAKILEEKGYDFVRNGV >NC_014964.1|WP_003869923.1|129773_130994_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKNVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_014964.1|WP_003869923.1|133640_134861_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKNVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_014964.1|WP_012268884.1|136967_138188_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKSVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_014964.1|WP_009052111.1|138326_139055_+|peptidase-E MKKVVAIGGGEISKFETFKIDEEIVKLTDKAKPKALFVPTASGEPEAYCDNFDFVYGKMLGCETDILFLIKDDPDSSQIEKKISWADLIYVGGGNTKRMMEIWRSKGVDKMLIDAYQRGTVLSGLSAGAICWFKYGFSDSQRFENQENWHYTKVEGLGLFDAILCPHLNEENRRELFEKFMIDFEGVGIGLENGCAIEIVDDTFKIINSFENAHAYVFRRSENKLFVDEIRHRDYIPFNLLI >NC_014964.1|WP_003867574.1|139383_139881_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MEFEVTGALMQSYTICKRQVWLMAHQIVPDQEHPYIEIGRLIDENSYQRDRKKIHFENVVLDLVRMEKDNILIGEVKKSSKAEDSAKMQLLFYLYKLKQSGITAKGQLFFPEERKREVVELTPEFEREVIKAIEEIKDIVYKEKPPAFIKIPYCKNCGYKEFCMS >NC_014964.1|WP_004399636.1|139877_140870_+|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKKTIYIFSDGELKRKDNTLFFEGENGRKFIPVENTSEIMVFGEVSLNKRLLEFLTQSEIILHFFNHYGYYVGSYYPREHLNSGYMILRQAEHYNDESKRLYLAQKFVEGAYKNIRQVLKYYSNRGKDLEDVIYSIEKLGESVDSTSTINELMAIEGNIREYYYKAFDEIIQNPDFKFDFRSKRPPQNFLNTLISFGNSLMYTTTLSEIYKTHLDPRIGFLHATNFRRFSLNLDVSEIFKPIIVDRTIFTLLSKKMVTKEDFEEDAEGLLLKEKGKKVFVQEFEDKLATTIKHRNLSNNVSYRRLIRLELYKLEKHLIEEEQYKPFIAQW >NC_014964.1|WP_003871087.1|140886_141150_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFLILVYDVNEKRVNKVLKTCRKYLHWVQNSVLEGEISEANLKKLKIELSRIIDKDEDSVIFYILRTTKYSEREILGLRKGGEDIII >NC_014964.1|WP_012268885.1|141270_143196_+|FAD-dependent-oxidoreductase MELTKPIKIGNLSLKNRVVMAPVKTGYATPEGQVTEELIQYYVNRAKGGVGLIVLESAYVDLSGKEIPRQLGIYDDSMVEGLRRLITPLQEAGSKVAVYINHAGRIANPMVTKLPLIAPSSIACPTIGVEPQGIPHEDIKKWQNTYVKAAVRAYEAGADALEIQFGHGYLIHQFLSPHTNKREDEYGGSFENRIRFGMEILDEIKKEIGADFPIIVRISADEFVPGGWALEDAIRLAKILEDKGVAAIDVSLGSSCESGAITLQTLGTQKGLAWEFASKIKKQVNIPVIAVGRINTPELAEEILVSGKADLVALGRPLVADPLFVEKATSGRSKEIRRCAACHQGCLDELRAGRRFGCNFNPSVGKEEEIEIQKAPQPGKKVFIIGAGLAGLEAAYTAAARGHKVYIYEEKGEIGGQVLPGSVPPHKEELKGIVEYYKEVLPKVGVTLNLNHKVTAEEIAKWEADEVVFATGGQPIVPPIPGLKEYGFLTAVEVLRGEKQAGDKVAIIGGGLIGMETADYLSEQGKKVMVIELLEEVARDMGVFEKILIMKRLKERGVEIYVKTRLKEVGKALLVETPEGEKELPLPDTIVLAVGLKPDPSLYEEVSKILPQEKLHVIGDAKEVRKIVHAISEGRNLGLSL >NC_014964.1|WP_003871085.1|143456_144236_+|MBL-fold-metallo-hydrolase MKFCSLRSGSSGNAIYINHKDVHILVDAGLSGRTIEKALLNIGINPKSLSAILITHEHKDHIIGAGVLSRRYNIPIYANKATWEVMEKDIKEISEKNKLYFTTGEEFEIGDVKIMPFKKSHDAVEPVGFSFKCGDKKISIATDLGYMTRGVANHLIGSDIVLLEANHDIEMLINGSYPWPLKKRILSNLGHLSNDAAADTLMKLFKMKAIGIAFLGHLSQNNNRPELAFATVTNVLKKSGVKFEVRMALRNIESDLVEI >NC_014964.1|WP_012268886.1|144690_146103_+|group-II-intron-reverse-transcriptase/maturase MDSKDMQRLQTTQQRGYPLNREMEFQKTTEVHSISSASEDGRNEVQRYTSKMLEMIVERGNMEAAYKRVVANKGSHGVDGMEVDELLPYLKENWATIKQQLLEGKYKPQPVRRVEISKPDGGVRLLGIPTALDRLIQQAIAQILNRVYNHTFSDSSYGFRPGRSAKDAIKAAEAYINEGYTWVVDMDLEKFFDRVNHDIIMSKLEKRIGDKRVLKLIRRYLESGVMINGIKVSTEEGTPQGGPLSPLLANIMLDELDKELEKRGHKFCRYADDCNIYVKSRSAGNRVMKSIKKFIESKLKLKINEAKSAVDRPWRRKFLGFSFYTKENEVRIRIHEKSIKRFKEKVREITNRNKGISMENRIKRLNQITTGWVNYFGLADAKSIMKTLDEWIRRRLRACIWKQWKKIKTKHDNLVKLGVEEQKAWEYANTRKGYWRISNSPILNKTLTNKYFESIGYKSLSQRYLIVHNS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_014964_3 | 131252-133555 | TypeI-B |
NA
Consensus repeat of NC_014964_3
|
34 spacers
spacers of NC_014964_3
>3.1|131282|35|NC_014964|CRT AGGTCAAACCTGGGGCAAAGACTTACGACGGGAAA >3.2|131347|36|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGCCATCACCTATCATACTATCTCCATCCACTCTTA >3.3|131413|37|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CCATCTCAGACCGTGCAGAAAGCAACTTGTCTAATTG >3.4|131480|36|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AACTATGACATATAAAATTTAATGTGCCTTGTGGAG >3.5|131546|37|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CCAGTACCGTAGCTTCCTACAAATATGATGCCTACTC >3.6|131613|38|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTTCCCTCTATATATTCAACAGGTTCAGGATATTTACG >3.7|131681|37|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTGAAAGTAAATTAGGAGAAAGATTTCGTGCAAGAAG >3.8|131748|37|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CGTGTTCCCAAAAAAGTGGACATGGTTCTTGTTCTTC >3.9|131815|39|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATTATTTGCTCAATAGCCGAGCAGAGAACGGATTTGCCT >3.10|131884|36|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTTCCTCTCGGACCGCCCCATCCATTACAGCAGCCG >3.11|131950|38|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CATGCTCTCTCTGTAGTTGTGCGGCTGTTCCCGGTGGG >3.12|132018|35|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TCTACCAATGCATGGACGATATGCAGGACACCTGG >3.13|132083|36|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GCGAACCCATACTGCAAAGCCTCTTCTGCTGTCATC >3.14|132149|37|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATGCTTCCATCTTTTTTCGCCTCCTCAGTATCTTTCC >3.15|132216|37|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ACAATAAGGCGATCCCGGCGCTGATTGATTTAAACGG >3.16|132283|36|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GTTAATACGGCCGGCATGTTTGTCTTGCGAAGCACG >3.17|132349|37|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CCTCGGACGATGCTAAAGCAACTCTTTCACCTTGCAG >3.18|132416|40|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CAGAAAAGTGTATCATTGTGTATCATGTTTCTTGAGTTTG >3.19|132486|37|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CACATTTCAGCAATTCTCGATACTATTGCATCGCCTG >3.20|132553|37|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GAAGAAGAGGAATAGAGAGGGTTTACTCCCTCTCTTC >3.21|132620|37|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTTTGTCCGAGGGACTTGGTCTAAACGTGGACAGCGA >3.22|132687|36|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AGATCTTTTTGAGGACAATTACCTTTCCGTCTATAT >3.23|132753|38|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGTGTATTACATTGCCTTGTTTATCAAGTGGTTGTATA >3.24|132821|38|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTACGTGCGCAAAGATGGCAGCATCTTCCGAGGCAGAG >3.25|132889|37|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATTATCTCTTGAAGCGCCTTTGCAGTGTCGAATTTTT >3.26|132956|37|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTTGGAATTCCTTTAGGCGCTCGAACTCACCCATCTG >3.27|133023|38|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AAATACTCGCCGGCGCGAACCTTAATCTTCACCGGCCA >3.28|133091|37|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CCCATAACCTTGGGAACACAAATTATATGGTGAACAT >3.29|133158|37|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AGAAACTCGCAGAACCCGGCCAACCTGCTGGCTATAG >3.30|133225|36|NC_014964|CRT,CRISPRCasFinder ATAAAAAAGTTCCCCGTTGTTACCTCATGTTGCTGT >3.31|133291|37|NC_014964|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR CAAGATAAATGGGATAGCCTTGTTGAGGCAGCAAAAA >3.32|133358|36|NC_014964|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR CCAACGCTCCCGGTGGTCTTGCGCTGTTCTGGAGTA >3.33|133424|35|NC_014964|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR ATGTCTAACCTATCAAGTACGTCTTTTATTGCTTG >3.34|133489|37|NC_014964|CRT,CRISPRCasFinder TGGATAGCAAAGGCAAGTGCAGAACTGGATAAAAAGA |
cas3,cas5,cas7,cas8b1,cas6,cas4,cas1,cas2,RT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014964_3
The CRISPR arrays of NC_014964_3 >merge|NC_014964|3|131252-133555|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder,PILER-CR 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>NC_014964.1|WP_003869923.1|129773_130994_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKNVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_014964.1|WP_012268883.1|119122_121477_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 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MITAIKELGEMVLKSQNKTLLDVLIENPNQDGRYSKIIAINFIVKEDEIEYEGIRLEEYDDSKISRYLFTDTGGNAPGYTPAAKITEVPKTFNGKIKNWFNKVLKDKSIKIDEKDRAFLERIKDILEEKSDEIIKEAEKIRGDFPKKEGLSLILKFNVDGEYKYIGDFNVFRDLMLQLDSQKYQKIYAEDKVCSICGQKKDIVFGTVDTYKFYTIDKPGYIAGGFNEKESWKNYPVCAECRLALEEGKRYLENELTFRFYGLEYQLIPNFIIGKEFVRKEVREIFESSERLLSLKREVKKRFIGDEDEILDYLADAEDSMTVNLLFLRKSNSAERILLLIEDVFPSHLREIFNAKEQVDKIFGNSFTFKNIRSFMSKSDSNKRDNDLDGYFLDITDRIFRGRPVDLGFLYNLIMKKIREEFVKDGYYKAATADGLMTIAFLEKMKLIKMEVIPMEERIFDSFFAKYGPTFEMPLKRGLVLLGALTELLLRKQYSDREAKPFMKNLKGLKMDEKDIKGLLPKVQNKLEEYDSFEKGKRLLAKEASNYLLLAGDNWNMSVDEINFYFACGINLADELTSIIYKKEGEEK >NC_014964.1|WP_004399630.1|114962_115718_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRITLEFVGEKNLVLPIHYNYIVQGFLYDLMGDSEFAAFLHDEGFQYEKRKFKLFTFSRIEGEFKILTDSKGQKKISIKPPFKFTVASPLDEFIFDISKNALKKEYCHFNGQKFILNSLNIDNPPVFKNKARIKFISPVVMYTTLKDGDIKYTYYYSPWDEKFSPLLLNNLLKKYELVYKIKAEDPYFKLYPLSEKEDRRYSKMIKYKNVYVKGWMGIYDVESSPELLELAYYTGLGAKNSQGFGCFEIIG >NC_014964.1|WP_003868738.1|114360_114774_+|SUF-system-NifU-family-Fe-S-cluster-assembly-protein MSDLNQLYSEVIMEHYENSPHRRELKDATHKERGHNPLCGDDITLYLKMNGDIIEDASFTGHGCAISQASTSMMIDLIKGKDKKEALRLVQEFIDMIHKKDVNLDELGDAQVLHGVSDFPARVKCALLAWKTLQEIL >NC_014964.1|WP_012268880.1|113134_114364_+|cysteine-desulfurase MKNIDIERIKKDFPILSVKPHGKRLVYLDNAATTQKPIEVIKAMDKYYEELNANVYRSPHYLSVLSTQAYEEARERVKKFINAKKEESIVFTRNTTESINFIAYTWGMKHINEGDEILLTIAEHHSNILPWQMVAEAKGAKLKYVYLDENFRLSMKDFKEKMSEKVKLVAVQHMSNVLGIINPVEEITHIAHKYGAKVLIDGAQSVPHMPVDVQKIDCDFFAFSGHKMLGPMGIGVLYIKEDLLKEVPPFLRGGEMIDEVYEDHSTFAPSPLKFEAGTPNIEGAYVLISAIDYIEKIGLTNIYKHEGELLEYGLQKMRELDFVKLYGPKDAKERGGIISFNVEGVHPHDVATILDEEGVAVRSGHHCCQPLMRYLGVPATVRASFYLYNDFEDIDALVEGLKKVRKWFK >NC_014964.1|WP_012268879.1|112088_113138_+|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufD MWKRVSMEEIQQPSYKEYTSAVIKNLSHDTVKIKETKKLAGLPTEILALRDKAFGIEGKFINMVRDFYNAGFHIEISQNSNVEKPIVIDYITNEQNDTLIDYNIIEAEANSQVTIVFDYNSGTKGFHNGITQVIAKEGSTVNIVKIQRLGDEFNDFDNNLVIVGKNAMVNWSNVVIGSKVSAFDVAVYLDEVGGTFTSKSIFLGVDSQKYDMAYKVYHQAPKTTSSVDLKGALKGSAKATFIGNIDIKKGAKKAKAEENETVLLLDKTVKSVAIPALYCGEDDVQANHSASAGQIDEDKLYYVMSRGFSLEEARLLMVQAILNPVIDLIPYDPVREIIIKGHIGRRIIK >NC_014964.1|WP_012268878.1|110674_112078_+|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufB MKKPDIKEIDFSIYDVKDNVKYEYQTGKGLSKEVVLEISEQKNEPSWMRDFRLKALEIYQKMPMPTWGVDLSQLDIDSIIAYIRPSAKMQRSWDEVPEEIRRTFERLGIPEAERKALAGVGAQYDSEVVYHNIKESLTQQGVIFEDMDTAVKKYPDIIKEYFMTKNVTPYDHKFVALHAAIWSGGTFVYVPEGVKVEVPLQAYFRMNAPGSGQFEHTLIIADKGSEVHFIEGCSAPQYTVSNLHAGCVELFVNEGARIIYSTIENWSKNTYNLNTKRAIVEKDGIIEWISGSFGSHKTMLYPASILKGEGAKAEYTGVTFAAKGQHLDTGSKMIHLAPHTSSKVLAKSISKDGGISSYRGLLKIGPNAEGAKASVQCEGLMLDDISRSDTMPVIEIENDNVDIGHEAKVGRISDEQIFYLMSRGLSEDDARAMIVRGFVEPIAKALPLEYAVEMNRLIKLELEGAIG >NC_014964.1|WP_003869923.1|133640_134861_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKNVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_014964.1|WP_012268884.1|136967_138188_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKSVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_014964.1|WP_009052111.1|138326_139055_+|peptidase-E MKKVVAIGGGEISKFETFKIDEEIVKLTDKAKPKALFVPTASGEPEAYCDNFDFVYGKMLGCETDILFLIKDDPDSSQIEKKISWADLIYVGGGNTKRMMEIWRSKGVDKMLIDAYQRGTVLSGLSAGAICWFKYGFSDSQRFENQENWHYTKVEGLGLFDAILCPHLNEENRRELFEKFMIDFEGVGIGLENGCAIEIVDDTFKIINSFENAHAYVFRRSENKLFVDEIRHRDYIPFNLLI >NC_014964.1|WP_003867574.1|139383_139881_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MEFEVTGALMQSYTICKRQVWLMAHQIVPDQEHPYIEIGRLIDENSYQRDRKKIHFENVVLDLVRMEKDNILIGEVKKSSKAEDSAKMQLLFYLYKLKQSGITAKGQLFFPEERKREVVELTPEFEREVIKAIEEIKDIVYKEKPPAFIKIPYCKNCGYKEFCMS >NC_014964.1|WP_004399636.1|139877_140870_+|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKKTIYIFSDGELKRKDNTLFFEGENGRKFIPVENTSEIMVFGEVSLNKRLLEFLTQSEIILHFFNHYGYYVGSYYPREHLNSGYMILRQAEHYNDESKRLYLAQKFVEGAYKNIRQVLKYYSNRGKDLEDVIYSIEKLGESVDSTSTINELMAIEGNIREYYYKAFDEIIQNPDFKFDFRSKRPPQNFLNTLISFGNSLMYTTTLSEIYKTHLDPRIGFLHATNFRRFSLNLDVSEIFKPIIVDRTIFTLLSKKMVTKEDFEEDAEGLLLKEKGKKVFVQEFEDKLATTIKHRNLSNNVSYRRLIRLELYKLEKHLIEEEQYKPFIAQW >NC_014964.1|WP_003871087.1|140886_141150_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFLILVYDVNEKRVNKVLKTCRKYLHWVQNSVLEGEISEANLKKLKIELSRIIDKDEDSVIFYILRTTKYSEREILGLRKGGEDIII >NC_014964.1|WP_012268885.1|141270_143196_+|FAD-dependent-oxidoreductase MELTKPIKIGNLSLKNRVVMAPVKTGYATPEGQVTEELIQYYVNRAKGGVGLIVLESAYVDLSGKEIPRQLGIYDDSMVEGLRRLITPLQEAGSKVAVYINHAGRIANPMVTKLPLIAPSSIACPTIGVEPQGIPHEDIKKWQNTYVKAAVRAYEAGADALEIQFGHGYLIHQFLSPHTNKREDEYGGSFENRIRFGMEILDEIKKEIGADFPIIVRISADEFVPGGWALEDAIRLAKILEDKGVAAIDVSLGSSCESGAITLQTLGTQKGLAWEFASKIKKQVNIPVIAVGRINTPELAEEILVSGKADLVALGRPLVADPLFVEKATSGRSKEIRRCAACHQGCLDELRAGRRFGCNFNPSVGKEEEIEIQKAPQPGKKVFIIGAGLAGLEAAYTAAARGHKVYIYEEKGEIGGQVLPGSVPPHKEELKGIVEYYKEVLPKVGVTLNLNHKVTAEEIAKWEADEVVFATGGQPIVPPIPGLKEYGFLTAVEVLRGEKQAGDKVAIIGGGLIGMETADYLSEQGKKVMVIELLEEVARDMGVFEKILIMKRLKERGVEIYVKTRLKEVGKALLVETPEGEKELPLPDTIVLAVGLKPDPSLYEEVSKILPQEKLHVIGDAKEVRKIVHAISEGRNLGLSL >NC_014964.1|WP_003871085.1|143456_144236_+|MBL-fold-metallo-hydrolase MKFCSLRSGSSGNAIYINHKDVHILVDAGLSGRTIEKALLNIGINPKSLSAILITHEHKDHIIGAGVLSRRYNIPIYANKATWEVMEKDIKEISEKNKLYFTTGEEFEIGDVKIMPFKKSHDAVEPVGFSFKCGDKKISIATDLGYMTRGVANHLIGSDIVLLEANHDIEMLINGSYPWPLKKRILSNLGHLSNDAAADTLMKLFKMKAIGIAFLGHLSQNNNRPELAFATVTNVLKKSGVKFEVRMALRNIESDLVEI >NC_014964.1|WP_012268886.1|144690_146103_+|group-II-intron-reverse-transcriptase/maturase MDSKDMQRLQTTQQRGYPLNREMEFQKTTEVHSISSASEDGRNEVQRYTSKMLEMIVERGNMEAAYKRVVANKGSHGVDGMEVDELLPYLKENWATIKQQLLEGKYKPQPVRRVEISKPDGGVRLLGIPTALDRLIQQAIAQILNRVYNHTFSDSSYGFRPGRSAKDAIKAAEAYINEGYTWVVDMDLEKFFDRVNHDIIMSKLEKRIGDKRVLKLIRRYLESGVMINGIKVSTEEGTPQGGPLSPLLANIMLDELDKELEKRGHKFCRYADDCNIYVKSRSAGNRVMKSIKKFIESKLKLKINEAKSAVDRPWRRKFLGFSFYTKENEVRIRIHEKSIKRFKEKVREITNRNKGISMENRIKRLNQITTGWVNYFGLADAKSIMKTLDEWIRRRLRACIWKQWKKIKTKHDNLVKLGVEEQKAWEYANTRKGYWRISNSPILNKTLTNKYFESIGYKSLSQRYLIVHNS >NC_014964.1|WP_003867580.1|146342_146783_+|ACT-domain-containing-protein MGEDGKLYIIREEILSDSLKKTLKVKELLESGKVKTINEAVKQVGISRSAFYKYRDYVFPFSKFSKGKIITLSMVLDHMPGVLSSILDVVANARGNVVTINQSMPSMGVASVTISIDTQYMEMSLENFLEKLSSQNGVRKIEILGE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_014964_4 | 135119-136882 | TypeI-B |
NA
Consensus repeat of NC_014964_4
|
26 spacers
spacers of NC_014964_4
>4.1|135149|35|NC_014964|CRT CCTATCAGCTCCGGTGGCACCCCAAACGCAATAGC >4.2|135214|37|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GATAGCCTTCAGCTATTAACTTTGCCGCTTCCAATTG >4.3|135281|36|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GCTGGTGCTTATTATTGGAAAGGATATAAACAAGCA >4.4|135347|35|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CGCTGTCGTCTTTGTTAAAGGACCTGTACCCTGCA >4.5|135412|38|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AGATATTGTTCAATATTGCATTTATCTCCGCTTCGCTT >4.6|135480|37|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGTAGAAAATGTCAAAAAACATCAAAAAGGAGGTGTG >4.7|135547|35|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AGTAAATACGGGAACAGAAGCAGCACCCGTGTGGA >4.8|135612|36|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CATTGCCACTACTTGCAGCAGCAGGAGCATCTATAA >4.9|135678|37|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CGTAGAAATAGACCCACCATTTCATCCAGACACACAC >4.10|135745|35|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CTGATTGAGTACTAGGGAGGGAGAGAGATGTATCC >4.11|135810|37|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AGCGCTTGAGGATGCATACATGAATAATACAATTTTA >4.12|135877|37|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CGCCCAAAATGGCGCTTAAAACGGCTGCAAATTTGTC >4.13|135944|37|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CCAGCCTGTAATGCAGGGTCGCCTACAAATCCGACGT >4.14|136011|38|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTCTTTAGATATACTTAAAAGCAATGTAGAGAAAGGTG >4.15|136079|37|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CGAGTGAAAAGATGATACCATGTCGCTTTGAAATGAG >4.16|136146|35|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TCCCTAGTAGTTTAGCCATATCAGCTTGTTTTAAA >4.17|136211|36|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AGCTCTTTCATTAATTTTGCAGCTTTGTCTGTCGGA >4.18|136277|36|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTGCCAAGCTGTTTTGCTAATTTGCTCATTTTTGCC >4.19|136343|37|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TCGATATAATAGCTCTAAACGTTTGGCTTTGCTTTGT >4.20|136410|40|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATATCCTCGCCAGATACACATTGCTCGCTAACATACAGGC >4.21|136480|36|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TAACGCAGACGTGGGAGGTTGCCGTGGATTCGGTTG >4.22|136546|37|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TCATAATCTATCAAACCGCTTGCTATTGCAAGCATGA >4.23|136613|36|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ACATTGTTTGTAGTTTTGGTATGTTCTGTTGTATAC >4.24|136679|39|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TATCATTCCAACTACCAACTTTTGTTAAATAATATTCTC >4.25|136748|37|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TATGCTGCATACGTCGAATACGGCACAAAAAAGATGG >4.26|136815|38|NC_014964|CRT,CRISPRCasFinder CCATGTTGGTTTTACGCTCAATCTCGGTTACGTAGAAA |
cas3,cas5,cas7,cas8b1,cas6,cas4,cas1,cas2,RT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014964_4
The CRISPR arrays of NC_014964_4 >merge|NC_014964|4|135119-136882|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GCGGCATGGGAGTCTATAAGGAATTGAAACCCTATCAGCTCCGGTGGCACCCCAAACGCAATAGCGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGATAGCCTTCAGCTATTAACTTTGCCGCTTCCAATTGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGCTGGTGCTTATTATTGGAAAGGATATAAACAAGCAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCGCTGTCGTCTTTGTTAAAGGACCTGTACCCTGCAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAGATATTGTTCAATATTGCATTTATCTCCGCTTCGCTTGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTGTAGAAAATGTCAAAAAACATCAAAAAGGAGGTGTGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAGTAAATACGGGAACAGAAGCAGCACCCGTGTGGAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCATTGCCACTACTTGCAGCAGCAGGAGCATCTATAAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCGTAGAAATAGACCCACCATTTCATCCAGACACACACGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCTGATTGAGTACTAGGGAGGGAGAGAGATGTATCCGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAGCGCTTGAGGATGCATACATGAATAATACAATTTTAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCGCCCAAAATGGCGCTTAAAACGGCTGCAAATTTGTCGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCCAGCCTGTAATGCAGGGTCGCCTACAAATCCGACGTGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTCTTTAGATATACTTAAAAGCAATGTAGAGAAAGGTGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCGAGTGAAAAGATGATACCATGTCGCTTTGAAATGAGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTCCCTAGTAGTTTAGCCATATCAGCTTGTTTTAAAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAGCTCTTTCATTAATTTTGCAGCTTTGTCTGTCGGAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTGCCAAGCTGTTTTGCTAATTTGCTCATTTTTGCCGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTCGATATAATAGCTCTAAACGTTTGGCTTTGCTTTGTGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATATCCTCGCCAGATACACATTGCTCGCTAACATACAGGCGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTAACGCAGACGTGGGAGGTTGCCGTGGATTCGGTTGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTCATAATCTATCAAACCGCTTGCTATTGCAAGCATGAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACACATTGTTTGTAGTTTTGGTATGTTCTGTTGTATACGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTATCATTCCAACTACCAACTTTTGTTAAATAATATTCTCGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTATGCTGCATACGTCGAATACGGCACAAAAAAGATGGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCCATGTTGGTTTTACGCTCAATCTCGGTTACGTAGAAAGTTTTTAGCCTACCTATCCTGAAAATAGTG >NC_014964|4|4|135119-136882|CRT GCGGCATGGGAGTCTATAAGGAATTGAAAC CCTATCAGCTCCGGTGGCACCCCAAACGCAATAGC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GATAGCCTTCAGCTATTAACTTTGCCGCTTCCAATTG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GCTGGTGCTTATTATTGGAAAGGATATAAACAAGCA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CGCTGTCGTCTTTGTTAAAGGACCTGTACCCTGCA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGATATTGTTCAATATTGCATTTATCTCCGCTTCGCTT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGTAGAAAATGTCAAAAAACATCAAAAAGGAGGTGTG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGTAAATACGGGAACAGAAGCAGCACCCGTGTGGA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CATTGCCACTACTTGCAGCAGCAGGAGCATCTATAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CGTAGAAATAGACCCACCATTTCATCCAGACACACAC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CTGATTGAGTACTAGGGAGGGAGAGAGATGTATCC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGCGCTTGAGGATGCATACATGAATAATACAATTTTA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CGCCCAAAATGGCGCTTAAAACGGCTGCAAATTTGTC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CCAGCCTGTAATGCAGGGTCGCCTACAAATCCGACGT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTCTTTAGATATACTTAAAAGCAATGTAGAGAAAGGTG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CGAGTGAAAAGATGATACCATGTCGCTTTGAAATGAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TCCCTAGTAGTTTAGCCATATCAGCTTGTTTTAAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGCTCTTTCATTAATTTTGCAGCTTTGTCTGTCGGA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTGCCAAGCTGTTTTGCTAATTTGCTCATTTTTGCC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TCGATATAATAGCTCTAAACGTTTGGCTTTGCTTTGT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATATCCTCGCCAGATACACATTGCTCGCTAACATACAGGC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TAACGCAGACGTGGGAGGTTGCCGTGGATTCGGTTG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TCATAATCTATCAAACCGCTTGCTATTGCAAGCATGA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ACATTGTTTGTAGTTTTGGTATGTTCTGTTGTATAC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TATCATTCCAACTACCAACTTTTGTTAAATAATATTCTC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TATGCTGCATACGTCGAATACGGCACAAAAAAGATGG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CCATGTTGGTTTTACGCTCAATCTCGGTTACGTAGAAA GTTTTTAGCCTACCTATCCTGAAAATAGTG >NC_014964|4|5|135184-136814|PILER-CR GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GATAGCCTTCAGCTATTAACTTTGCCGCTTCCAATTG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GCTGGTGCTTATTATTGGAAAGGATATAAACAAGCA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CGCTGTCGTCTTTGTTAAAGGACCTGTACCCTGCA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGATATTGTTCAATATTGCATTTATCTCCGCTTCGCTT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGTAGAAAATGTCAAAAAACATCAAAAAGGAGGTGTG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGTAAATACGGGAACAGAAGCAGCACCCGTGTGGA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CATTGCCACTACTTGCAGCAGCAGGAGCATCTATAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CGTAGAAATAGACCCACCATTTCATCCAGACACACAC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CTGATTGAGTACTAGGGAGGGAGAGAGATGTATCC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGCGCTTGAGGATGCATACATGAATAATACAATTTTA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CGCCCAAAATGGCGCTTAAAACGGCTGCAAATTTGTC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CCAGCCTGTAATGCAGGGTCGCCTACAAATCCGACGT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTCTTTAGATATACTTAAAAGCAATGTAGAGAAAGGTG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CGAGTGAAAAGATGATACCATGTCGCTTTGAAATGAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TCCCTAGTAGTTTAGCCATATCAGCTTGTTTTAAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGCTCTTTCATTAATTTTGCAGCTTTGTCTGTCGGA 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TAACGCAGACGTGGGAGGTTGCCGTGGATTCGGTTG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TCATAATCTATCAAACCGCTTGCTATTGCAAGCATGA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ACATTGTTTGTAGTTTTGGTATGTTCTGTTGTATAC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TATCATTCCAACTACCAACTTTTGTTAAATAATATTCTC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TATGCTGCATACGTCGAATACGGCACAAAAAAGATGG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CCATGTTGGTTTTACGCTCAATCTCGGTTACGTAGAAA GTTTTTAGCCTACCTATCCTGAAAATAGTG
>NC_014964.1|WP_003869923.1|133640_134861_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKNVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_014964.1|WP_003869923.1|129773_130994_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKNVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_014964.1|WP_012268883.1|119122_121477_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MSSFSELYSHPDKFLEDHLINTSKIIRSYFNEKKVAIIDKETFLKTATIISLCHDFGKATNYFQKYLFTENEKERNKLKTMEEMHHSLLSAVVAFYLVKNEINAQDRKGILFPFIAFLIVKNHHGDLKNVFNEVILDDKELEVLKKQLNSIDDEKLQVLNGKLRNAGLNENLTKSAINDYIDSINSELRKIKRELRRLKEEQDVSIYLLLNFLFSLLVDADKTEVVVGIDNIKRPEIKFEEQLVKEYKASFPDKESKINLLREEAYKEVLEKDIDIKQKIMSINLPTGLGKTLTTIAFAMKLWAKLYKETGVKYRIIYSLPFLSIIEQNSNVLEDLLRYNGIQPDTEIILKHHHLSDIRYTKNNTEFEDEQAKILIEGWNSEIIITTFVQFFHTLVSEKNKTLRKFHRLANSIIILDEVQSIPFKYWLLTKELLKAVANELNSYIIFVTATQPLIFREEEIYPLVAKTKYFTQMDRVEIIPKLSRDITLEELSEMFDLNDGKSYLFILNTIKSAQQFYNILRAKIPNDEIIYMSTHVVPMERMERIEKIKEGKIRFAVTTQLVEAGVDIDFDVVVRDIAPLDSINQSAGRCNRNWRGKGEVYVVSLIDEKGQKYSKYVYDKILLGITREILSKYDTIKEQELLKIIEKYYQEVSERMSSNEGRELLDAIYTLRYDSEDGNMCISKFELIEDDYYKVDAFIELNDEAKELWHKYVELKDIKNLFERRNIFNRFKADFYKYVISIPATVENMPPDIWGFKYVNYDSLNDYYDKETGFITKGVTSIW >NC_014964.1|WP_003871404.1|118425_119139_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKTLVFDVFGDYGHFRKYYTTSSPLTFSFPPPPTVKGMLGAIAGIDKKEYLKVFSEENCKVAIRILNPIKKIRLGLNLINTKGNYWIPYKAKNHEARTQVKTEFVKDAAYRIYFMHKDNDLFEDIVEKIKNRRNVYTLSLGLSEMIADYKFIGVYEAEEIENAEVDILSVLPFQSIVEDKIYFENGKKYFKEKIPAGMNEDRVVLSYEDVLYEVNGQSIKCHVKKCWEVKGEHVIFF >NC_014964.1|WP_012268882.1|117501_118413_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csh2 MENVIKNRAEILFLYDVSFANPNGDPVDENKPRIDEETGINIVTDVRLKRTIRDYLAYYKGKEVFIIETRKDNGELRTKKDRIEDFGTNEDIIAKCIDVRLFGATTAVKDKMMILTGPVQFKYGKSLHRVNLMYVKGTTVMPSGEGREQGTFTEKYILPYSLIAFYGIVNENAAINQNIPLTDEDVDLMLEGMWNGTKNLMSGSKIGHMPRLLIEVVYQENNYQIGELEKRIKFVHEMEDEEIRDIQDGKLDITELVAVLKQNQEKIKLIKYIYDDRVTFTCNGEECTLEKALKGLNIQKLQY >NC_014964.1|WP_012268881.1|115737_117501_+|TIGR02556-family-CRISPR-associated-protein MITAIKELGEMVLKSQNKTLLDVLIENPNQDGRYSKIIAINFIVKEDEIEYEGIRLEEYDDSKISRYLFTDTGGNAPGYTPAAKITEVPKTFNGKIKNWFNKVLKDKSIKIDEKDRAFLERIKDILEEKSDEIIKEAEKIRGDFPKKEGLSLILKFNVDGEYKYIGDFNVFRDLMLQLDSQKYQKIYAEDKVCSICGQKKDIVFGTVDTYKFYTIDKPGYIAGGFNEKESWKNYPVCAECRLALEEGKRYLENELTFRFYGLEYQLIPNFIIGKEFVRKEVREIFESSERLLSLKREVKKRFIGDEDEILDYLADAEDSMTVNLLFLRKSNSAERILLLIEDVFPSHLREIFNAKEQVDKIFGNSFTFKNIRSFMSKSDSNKRDNDLDGYFLDITDRIFRGRPVDLGFLYNLIMKKIREEFVKDGYYKAATADGLMTIAFLEKMKLIKMEVIPMEERIFDSFFAKYGPTFEMPLKRGLVLLGALTELLLRKQYSDREAKPFMKNLKGLKMDEKDIKGLLPKVQNKLEEYDSFEKGKRLLAKEASNYLLLAGDNWNMSVDEINFYFACGINLADELTSIIYKKEGEEK >NC_014964.1|WP_004399630.1|114962_115718_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRITLEFVGEKNLVLPIHYNYIVQGFLYDLMGDSEFAAFLHDEGFQYEKRKFKLFTFSRIEGEFKILTDSKGQKKISIKPPFKFTVASPLDEFIFDISKNALKKEYCHFNGQKFILNSLNIDNPPVFKNKARIKFISPVVMYTTLKDGDIKYTYYYSPWDEKFSPLLLNNLLKKYELVYKIKAEDPYFKLYPLSEKEDRRYSKMIKYKNVYVKGWMGIYDVESSPELLELAYYTGLGAKNSQGFGCFEIIG >NC_014964.1|WP_003868738.1|114360_114774_+|SUF-system-NifU-family-Fe-S-cluster-assembly-protein MSDLNQLYSEVIMEHYENSPHRRELKDATHKERGHNPLCGDDITLYLKMNGDIIEDASFTGHGCAISQASTSMMIDLIKGKDKKEALRLVQEFIDMIHKKDVNLDELGDAQVLHGVSDFPARVKCALLAWKTLQEIL >NC_014964.1|WP_012268880.1|113134_114364_+|cysteine-desulfurase MKNIDIERIKKDFPILSVKPHGKRLVYLDNAATTQKPIEVIKAMDKYYEELNANVYRSPHYLSVLSTQAYEEARERVKKFINAKKEESIVFTRNTTESINFIAYTWGMKHINEGDEILLTIAEHHSNILPWQMVAEAKGAKLKYVYLDENFRLSMKDFKEKMSEKVKLVAVQHMSNVLGIINPVEEITHIAHKYGAKVLIDGAQSVPHMPVDVQKIDCDFFAFSGHKMLGPMGIGVLYIKEDLLKEVPPFLRGGEMIDEVYEDHSTFAPSPLKFEAGTPNIEGAYVLISAIDYIEKIGLTNIYKHEGELLEYGLQKMRELDFVKLYGPKDAKERGGIISFNVEGVHPHDVATILDEEGVAVRSGHHCCQPLMRYLGVPATVRASFYLYNDFEDIDALVEGLKKVRKWFK >NC_014964.1|WP_012268879.1|112088_113138_+|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufD MWKRVSMEEIQQPSYKEYTSAVIKNLSHDTVKIKETKKLAGLPTEILALRDKAFGIEGKFINMVRDFYNAGFHIEISQNSNVEKPIVIDYITNEQNDTLIDYNIIEAEANSQVTIVFDYNSGTKGFHNGITQVIAKEGSTVNIVKIQRLGDEFNDFDNNLVIVGKNAMVNWSNVVIGSKVSAFDVAVYLDEVGGTFTSKSIFLGVDSQKYDMAYKVYHQAPKTTSSVDLKGALKGSAKATFIGNIDIKKGAKKAKAEENETVLLLDKTVKSVAIPALYCGEDDVQANHSASAGQIDEDKLYYVMSRGFSLEEARLLMVQAILNPVIDLIPYDPVREIIIKGHIGRRIIK >NC_014964.1|WP_012268884.1|136967_138188_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKSVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_014964.1|WP_009052111.1|138326_139055_+|peptidase-E MKKVVAIGGGEISKFETFKIDEEIVKLTDKAKPKALFVPTASGEPEAYCDNFDFVYGKMLGCETDILFLIKDDPDSSQIEKKISWADLIYVGGGNTKRMMEIWRSKGVDKMLIDAYQRGTVLSGLSAGAICWFKYGFSDSQRFENQENWHYTKVEGLGLFDAILCPHLNEENRRELFEKFMIDFEGVGIGLENGCAIEIVDDTFKIINSFENAHAYVFRRSENKLFVDEIRHRDYIPFNLLI >NC_014964.1|WP_003867574.1|139383_139881_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MEFEVTGALMQSYTICKRQVWLMAHQIVPDQEHPYIEIGRLIDENSYQRDRKKIHFENVVLDLVRMEKDNILIGEVKKSSKAEDSAKMQLLFYLYKLKQSGITAKGQLFFPEERKREVVELTPEFEREVIKAIEEIKDIVYKEKPPAFIKIPYCKNCGYKEFCMS >NC_014964.1|WP_004399636.1|139877_140870_+|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKKTIYIFSDGELKRKDNTLFFEGENGRKFIPVENTSEIMVFGEVSLNKRLLEFLTQSEIILHFFNHYGYYVGSYYPREHLNSGYMILRQAEHYNDESKRLYLAQKFVEGAYKNIRQVLKYYSNRGKDLEDVIYSIEKLGESVDSTSTINELMAIEGNIREYYYKAFDEIIQNPDFKFDFRSKRPPQNFLNTLISFGNSLMYTTTLSEIYKTHLDPRIGFLHATNFRRFSLNLDVSEIFKPIIVDRTIFTLLSKKMVTKEDFEEDAEGLLLKEKGKKVFVQEFEDKLATTIKHRNLSNNVSYRRLIRLELYKLEKHLIEEEQYKPFIAQW >NC_014964.1|WP_003871087.1|140886_141150_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFLILVYDVNEKRVNKVLKTCRKYLHWVQNSVLEGEISEANLKKLKIELSRIIDKDEDSVIFYILRTTKYSEREILGLRKGGEDIII >NC_014964.1|WP_012268885.1|141270_143196_+|FAD-dependent-oxidoreductase MELTKPIKIGNLSLKNRVVMAPVKTGYATPEGQVTEELIQYYVNRAKGGVGLIVLESAYVDLSGKEIPRQLGIYDDSMVEGLRRLITPLQEAGSKVAVYINHAGRIANPMVTKLPLIAPSSIACPTIGVEPQGIPHEDIKKWQNTYVKAAVRAYEAGADALEIQFGHGYLIHQFLSPHTNKREDEYGGSFENRIRFGMEILDEIKKEIGADFPIIVRISADEFVPGGWALEDAIRLAKILEDKGVAAIDVSLGSSCESGAITLQTLGTQKGLAWEFASKIKKQVNIPVIAVGRINTPELAEEILVSGKADLVALGRPLVADPLFVEKATSGRSKEIRRCAACHQGCLDELRAGRRFGCNFNPSVGKEEEIEIQKAPQPGKKVFIIGAGLAGLEAAYTAAARGHKVYIYEEKGEIGGQVLPGSVPPHKEELKGIVEYYKEVLPKVGVTLNLNHKVTAEEIAKWEADEVVFATGGQPIVPPIPGLKEYGFLTAVEVLRGEKQAGDKVAIIGGGLIGMETADYLSEQGKKVMVIELLEEVARDMGVFEKILIMKRLKERGVEIYVKTRLKEVGKALLVETPEGEKELPLPDTIVLAVGLKPDPSLYEEVSKILPQEKLHVIGDAKEVRKIVHAISEGRNLGLSL >NC_014964.1|WP_003871085.1|143456_144236_+|MBL-fold-metallo-hydrolase MKFCSLRSGSSGNAIYINHKDVHILVDAGLSGRTIEKALLNIGINPKSLSAILITHEHKDHIIGAGVLSRRYNIPIYANKATWEVMEKDIKEISEKNKLYFTTGEEFEIGDVKIMPFKKSHDAVEPVGFSFKCGDKKISIATDLGYMTRGVANHLIGSDIVLLEANHDIEMLINGSYPWPLKKRILSNLGHLSNDAAADTLMKLFKMKAIGIAFLGHLSQNNNRPELAFATVTNVLKKSGVKFEVRMALRNIESDLVEI >NC_014964.1|WP_012268886.1|144690_146103_+|group-II-intron-reverse-transcriptase/maturase MDSKDMQRLQTTQQRGYPLNREMEFQKTTEVHSISSASEDGRNEVQRYTSKMLEMIVERGNMEAAYKRVVANKGSHGVDGMEVDELLPYLKENWATIKQQLLEGKYKPQPVRRVEISKPDGGVRLLGIPTALDRLIQQAIAQILNRVYNHTFSDSSYGFRPGRSAKDAIKAAEAYINEGYTWVVDMDLEKFFDRVNHDIIMSKLEKRIGDKRVLKLIRRYLESGVMINGIKVSTEEGTPQGGPLSPLLANIMLDELDKELEKRGHKFCRYADDCNIYVKSRSAGNRVMKSIKKFIESKLKLKINEAKSAVDRPWRRKFLGFSFYTKENEVRIRIHEKSIKRFKEKVREITNRNKGISMENRIKRLNQITTGWVNYFGLADAKSIMKTLDEWIRRRLRACIWKQWKKIKTKHDNLVKLGVEEQKAWEYANTRKGYWRISNSPILNKTLTNKYFESIGYKSLSQRYLIVHNS >NC_014964.1|WP_003867580.1|146342_146783_+|ACT-domain-containing-protein 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_014964_5 | 801340-801538 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_014964_5
|
2 spacers
spacers of NC_014964_5
>5.1|801377|45|NC_014964|PILER-CR GAGGTCGAGGGTTCAAGTCCCTTTTGGGTCGCCAGTTATGCCTCG >5.2|801459|60|NC_014964|PILER-CR GGGACTGAAAATCCCTGTGTCAGTGGTTCGATTCCACTTCGAGGCACCATTTGTGCGGAC |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014964_5
The CRISPR arrays of NC_014964_5 >merge|NC_014964|5|801340-801538|PILER-CR ATAGCTCAGTTGGTTAGAGCGCCAGCCTGTCACGCTGGAGGTCGAGGGTTCAAGTCCCTTTTGGGTCGCCAGTTATGCCTCGATAGCTCAGTAGGTAGAGCAAGGGACTGAAAATCCCTGTGTCAGTGGTTCGATTCCACTTCGAGGCACCATTTGTGCGGACATAGCTCAGTTGGTAGAGCATCACCTTGCCAAGGTG >NC_014964|5|6|801340-801538|PILER-CR ATAGCTCAGTTGGTTAGAGCGCCAGCCTGTCACGCTG GAGGTCGAGGGTTCAAGTCCCTTTTGGGTCGCCAGTTATGCCTCG ATAGCTCAGTAGGTAGAGCAAGGGACTGAAAATCCCT GTGTCAGTGGTTCGATTCCACTTCGAGGCACCATTTGTGCGGACATAGCTCAGTTGGTAG AGCATCACCTTGCCAAGGTG
>NC_014964.1|WP_009052585.1|800246_801131_+|Hsp33-family-molecular-chaperone-HslO MRDYIVRATAYNNKILAIAAFSTQTAQKAKEIHNLTPTTCAALGRALTAVAMMRVMMKGEKDKVTLVIKGDGPIGNIVVVSNYPGIVKGYVGNPTVDLPLSEKGKLDVGKAVGKNGYVTVIKDIGLKEPYVGTVELQTGEIGEDIAYYFYTSEQVPSAVGVGVLVGKEGNVLASGGFIIQLLPNIEEEVVAKVEEALKNISSVTELLRKGYLPEDILNHILGEMGLNILERVDLKYECDCSQERFETAIIALGKEEIKKLIAEGQSVEAVCHFCGKKYLIEESRLKELLRIAEE >NC_014964.1|WP_009052586.1|799982_800186_+|cold-shock-protein MVRGKVKWFNAEKGYGFIEREDGTDVFVHYSAIEGDGFKTLEEGQKVEFEVVEATKGPQASKVRKVN >NC_014964.1|WP_009052587.1|799160_799907_+|NAD-dependent-protein-deacylase MGDKNLFEKAARLIKQSRKTIVLTGAGISTESGIPDFRSPGRGLWENLDPMEVLSTGVLYNFPEEFYKVGFKILSSMRNAEPNEAHYILSEMEKEGIIFGVITQNIDNLHQKAGSKNVFEVHGNTREGSCLRCGKKVSFEVLEEKVSKKQIPPRCDDCNGVLRPDVVLFGDPMPYAFDLAVKEVKSSDLLIVIGSSLAVSPVNFLPDTVRHLIIINATETPYDYKADVVIREKASYALRNIWDIIKFQ >NC_014964.1|WP_003867226.1|798964_799135_+|small,-acid-soluble-spore-protein,-alpha/beta-type MDNEILKLEAAEELGLLEKVKKVGWSKLSAQETGKIGSIVKKKMKLQQEVGKKEKL >NC_014964.1|WP_157748019.1|798480_798624_+|transposase MYVCQNCGIVVNGDVNGAVNILRRVSPNLKKDRGRGFLDNPVRIKVS >NC_014964.1|WP_003867225.1|798153_798375_+|NifU-family-protein MRERVEEVLELLRPSLQADGGDVELIDVTEDGIVKVRLTGACGGCPFATLTLKEGIERAIKEEIPEVKEVIAV >NC_014964.1|WP_012269161.1|797635_798100_+|GAF-domain-containing-protein MEKRKVFDDLLVRIDQMAREIDDMDEFYGEVVKILADNVPYYNWTGFYFMKDGELVIGPYIGRPTEHVRIKVGQGVCGRAVAEKNTIIVDDVTKEDNYLACSLETKSEIVVPIWANGDIIGEIDIDSDDLAAFDEEDKRFLEKVAEIISRKLKK >NC_014964.1|WP_003867223.1|796432_797206_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MYIPTISPYAFKIGPIDVHWYGIFMAISIAIGGYYLYRQAMKLNYDEDFLLNLLMIVVISGVVGARLMFVLANYPEWFIKDPVQVLKIYEGGLSWHGAVLGGFLAGLYYCRKKGVRINPLEDFAVLGLSIGNILVRIGNIFNQEVLGRPTEFAFGRWPAQLVGVAMGIILLIRYFYIQKKHMPDGYQFWSFIFYYQLMRGLIEETVRDNPLIWPVYLNEKWGIGFFTLTQLVTPFILILAYWMIRRVLNDPNKQFYN >NC_014964.1|WP_003867222.1|794465_795860_+|dipeptidase-PepV MDLNSYIDNMRDDIIKSVQELVRIKSVQDEPKPGMPYGEGIAKALDKALEIAQSLGLKTKNVDGYVGYAEYGEGEEMIGVLGHLDVVPEGDGWTYPPYGAEIHDGKIYGRGTVDDKGPIIAALYGLKAIKDAGLELSRRVRILFGTNEETGSHEIPYYLKHDEAPTMGFTPDAQYPIIYAEKGITMFNVVKDFNKKPSNIVIKYIKGGERPNVVPGFCEAGLKVKEANKKKEIQDKLEAFVKETGYNLKAEEKDEMLVIKSVGVSAHGSLPHLGKNAIMQLFLFLDRIDLEDSDVKDFIHFFATNIGIETNGKTFGIYLKDETGELTFNVGTIQLDESKGVLGLNIRYPVKYKYEDWMNIFENKIKTNGMRIEDMLHQPPLYFPPAHPLIKTLSKVYEEQTGQKAELLAIGGGTYAKEMPNTVAFGPVFPGKPELAHQADEYIEIEDLILNAKIYAHAIYELAK >NC_014964.1|WP_003867221.1|793789_794125_-|winged-helix-turn-helix-transcriptional-regulator MAENIYELRAEFFKALSHPTRLKILDVILNEKEICVCEIVNKIGVDQSTISKHLNILKKAGILESKKEGLSVFYKVRFPCMKDYFICIDKTIKCDLVTKVSFIDSSKEKVE >NC_014964.1|WP_003867230.1|801762_802098_+|thioredoxin-family-protein MEKIIDIENIEQIIKENDMVFLYFSTQDCGICTSLLPKLEGMLVNYPKIKSFHIPIDEIPLASGKFSVFTVPTVIVYVDGKEAIREARFISMDTLEEKISKYYSLFFEETA >NC_014964.1|WP_003867231.1|802220_803153_+|response-regulator MKGRNILIVDDNKLTRKILKDILENAGYGVLEAKDGEEALQIYRNKLPDMVILDIVMPGMNGFDLLRILRKEEENLMLPIILLTSQDNFEEKIKGLELGADDYLVKPFNDKELLFKVNNLFQRIEHNRMANPLTGLRGNIDIKEEIKRRIKENKPYAILYIDLDNFKSYNDYYGFLRGDNVIKLTAKILSDAVNLIGNERDFLGHIGGDDFVIITTPDKAEEMCKYIISRFDEEIKYLYDDEDRKRGYIETIGRTGEKMMFPLVSISIAIVTNEFRDFKNDLEISAVAAELKKKLKTMDGSCYLKDRRKG >NC_014964.1|WP_003867232.1|803211_803946_+|hypothetical-protein MSNPFVPHGNFKWVVIDGREREIGDSLSKLGIKVLYTEKCADLYDAISFHPDILLHPLGDREIIVAPNVTPEFIRKLKLIGLKVKIGQTFLKRNYPYDIAYNVARLGNTAFHNFKYTDPVLRESLEKKGVKFLNVKQGYTKCNMAIIDDNSFITSDKGIFEVAVSNGFEALLIEPGGVFLKGFEYGFIGGAMGLIGEKKLAVTGVFNSHKNYEKIIEFLNKKGIEIVYLTFKQIKDIGSIIPLI >NC_014964.1|WP_012269163.1|804001_804880_+|putative-sporulation-protein-YtxC MQLFSIGVSKDLKLDAENLKHGLKNLAENGIKIAINSNVCGSVTYYSLKVEDKQGFSNVARIRNYIAEAISDIIVNQIDKRIIKKLINKYYHYFSEDEKEEIEKIAYNILEDDVNKETFKLAKKEQIFVLVRDFLKESDYIDLEGFVNFRLRDFIGELSEVTDKAVDEFLMKKEYNEFIGLLKYFVELQDSKVEILNIIVDKNGKFKLYDENDKPISNDFINEIVAELKDGVISDEDALISTLITIAPKKIFFHSINNMRDNEILETVKKVFNDKVEICYGCELCSKIKCEK >NC_014964.1|WP_012269164.1|804962_805562_+|DUF445-family-protein MQFLTRMLFLAFVGAAIGWLTNFVAVKMLFKPLKPVKIFGITLQGLIPKRKYEIAKSIGEIVERELLSFNDLWDRLLTEENRKFLLSNLDLKVKEVTENKLPSFLPKAIKEMISNYIGDIINREVEVFLNSPSNEVVEIISTKLKISEIVEEKIKSFKLEKLEDVVIKIAHSELYMIEIMGGVLGFLIGVLQAIVIQFL >NC_014964.1|WP_012269165.1|805859_807764_+|threonine--tRNA-ligase MIIILKDGTQREFEKGMTVYEIAKSISERLAKEAVGGKFNGKVVELNTKIEEDGKLEILTFDDEEGKKIYWHTSSHILAQAVKRLFKDVKLAIGPAIDNGFYYDFDTDRPFTTEDFEAIEQEMNKIIKEDYKLERFVLPKDKAIKLMEGKGEPYKVELIKEIPEGEEISFYKQGEFTDLCAGPHLMSTGMVKTIKLLSVAGAYWKGDEKNKMLQRIYGISFPKKSMLDEYLHMLEEAKKRDHRKLGKELDLFSIHPEGPGFPFFHPKGMIIRNILEDFWRKEHMKHGYQEIKTPIILNEELWRRSGHWDHYKENMYFTEIDGETYAIKPMNCPGAMLVYKSTMHSYRDLPLRLCELGLVHRHELSGVLHGLMRVRSFTQDDAHLFMTPEQVEDEILGVINLVDYFYKIFGFEYFVELSTRPENSMGSDEDWELATNALISALNRVNLPYKVNEGDGAFYGPKIDFHLKDSIGRTWQCGTIQLDFQMPERFELEYIGPDGEKHRPIMLHRVIYGSIERFIGILTEHFAGAFPTWLAPVQVRVLPISDKHYAYAQNVYGRLLENDIRAELDDRNEKVGYKIREAQLQKIPYMLIVGDKEVEQGTVSLRSRKEGDLGAISLSEFIEKILKEIATKAL >NC_014964.1|WP_012269166.1|807866_809111_+|MFS-transporter MKKNLEVYKHLKYNIKMNMINGLAWAIGFNMVNPFIGIYAIKLGADDFQVSLLNSLPALMVVIGVIPVTYLINSLKNVHKFAYIVLYIARAFYFLLALAPFFDKEFQPWIVVILVGVMNLPSMAVGMCWQSFMSELIPPEYRSKVFADRNFWTTIVATITVLVTGWLLDKIVFPINYQVIFTVAFIFGLIESYYFSRFHVVKRDLDEAKPGSFYEAFRNMFESKKFIYFNVTSFIYYFAWMMAWPIFTIYKVNFLHANNAWMSIFTIVSSIGSILAFYKWADLSNKRGNGFAVALSALLLGFIPLMWATAKNLYVGAIFDFLGGIAVGGYNMLLLNWLLELLPPTSEKMNYIAVFTLITQISAFIAPMFGMWLYTQMGYVAFMILTGIARIVVSILYFLVANYEDEIKEIEAKQ >NC_014964.1|WP_012269167.1|809122_810175_+|chorismate-synthase MRYITAGESHGEALIAVIEGLPSNLLIDEEFINKELKRRQGGYGRGGRMAIEEDKVHVLSGIRNGKTIGSPLTLEIINKDYENWKNKKTPEVTRPRPGHADLAGAIKYNQRDLRNILERSSARETAARVAVGSVAKLLLKELDIYVKSKVLEIGGVKAEEKWRRTIDEAKSKGDTLGGIIEIVIEGVPVGLGSHVQWDRKLDALLAYHVMSVQAIKAVEIGLGFEAARKPGSLVHDEIYYDEERGFYRKTNNAGGIEGGISNGSPIVIKAAMKPIPTLLKPLTSIDINTKEEVKAAYERSDVTAVEAAACVLEAVCAWVIADECLKKFGGDSIEELKKNYDAYLVYVKNF >NC_014964.1|WP_004401900.1|810371_810923_+|translation-initiation-factor-IF-3 MRFYFFIIFRRCVFINKELQVNEEIRDKEVRLIDQDGKQIGIMSAKEAYKIAQERHLDLVKIAPQANPPVCKLMDFGKYRYELSKREKEAKKKQKIINVKEIRMSPTIEDHDFGVKLKSAIKFLKEGNKVKVTIRFRGREAAHTSLAEDLLKRFANELSEYGVIEKAPNIEGRNLMMVLTPKS >NC_014964.1|WP_004401892.1|810950_811148_+|50S-ribosomal-protein-L35 MPKMKTHRGAAKRFKVLKSGKVKRSRAYKSHLLTHKNAKRKRRLRKATYLVGADAKNIKRLLPYS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_014964_6 | 955169-956468 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NC_014964_6
|
19 spacers
spacers of NC_014964_6
>6.1|955199|36|NC_014964|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATAAAGATTGGCAAATAACTGTGATGTAAGGTTAC >6.2|955265|37|NC_014964|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCACAAGAAAAACCTGTACAAGCAGGTAACTGGATTG >6.3|955332|36|NC_014964|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTGACGTTGTTTCTTGCTCCACTTCTTCTTTTTGC >6.4|955398|39|NC_014964|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGGCTGAACTTGAACAATCTGAAGTGAAGTTGGTACAA >6.5|955467|39|NC_014964|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTATATTGAAATTGACTGGAATTTTAGAGAATTTTACCT >6.6|955536|37|NC_014964|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAATATGCTTGTACAACTTTATTGATGAGTTCTTGAC >6.7|955603|36|NC_014964|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAAATTGGACAGCACAAGGACTAAAAACGAGAGAA >6.8|955669|36|NC_014964|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAAACTTTTTTACGTCTTGCAGTTTCATTTTTACC >6.9|955735|36|NC_014964|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGCAATTGTACAGAGCACACTCAAAGAAAAAAAAGA >6.10|955801|39|NC_014964|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTCCGCTTCTCTTAAAAAACTTTTGTGCGGAAAAATGT >6.11|955870|37|NC_014964|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCGGCATCCGGGCCACCTCCCTGTTACTGTTACTCTC >6.12|955937|36|NC_014964|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGGACCACTACTATGAGCTGATAGAATACGACAAA >6.13|956003|36|NC_014964|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGGGAAGCATTCGTATATTTCGTAGGTTTTGCAAT >6.14|956069|35|NC_014964|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGGTGGGAGAAAGACAACAAAAGCAATGCACTTGC >6.15|956134|36|NC_014964|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCATTAAAAATTGCCAAACTGTTGAATGAATATGAG >6.16|956200|37|NC_014964|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACACGCCACCCAAAACACAGTAACCACAATTGCAAAC >6.17|956267|38|NC_014964|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGTACTTAGGCTAACAAAAATGCCGGCCGTATTAACA >6.18|956335|36|NC_014964|CRISPRCasFinder,CRT AATTATTGCAGAGGCAATGGCAAAAGGCTTAAGCAA >6.19|956401|38|NC_014964|CRISPRCasFinder,CRT ATGCGGTGATGGCTTATGAGGATACGTATATTGCGTAG |
csx20,csx1,cas10,csm3gr7,csx19 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014964_6
The CRISPR arrays of NC_014964_6 >merge|NC_014964|6|955169-956468|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGATAAAGATTGGCAAATAACTGTGATGTAAGGTTACGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGCACAAGAAAAACCTGTACAAGCAGGTAACTGGATTGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTTGACGTTGTTTCTTGCTCCACTTCTTCTTTTTGCGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAAGGCTGAACTTGAACAATCTGAAGTGAAGTTGGTACAAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTATATTGAAATTGACTGGAATTTTAGAGAATTTTACCTGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAAATATGCTTGTACAACTTTATTGATGAGTTCTTGACGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAAAAATTGGACAGCACAAGGACTAAAAACGAGAGAAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATAAACTTTTTTACGTCTTGCAGTTTCATTTTTACCGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAGCAATTGTACAGAGCACACTCAAAGAAAAAAAAGAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATTCCGCTTCTCTTAAAAAACTTTTGTGCGGAAAAATGTGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCCGGCATCCGGGCCACCTCCCTGTTACTGTTACTCTCGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTGGGACCACTACTATGAGCTGATAGAATACGACAAAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATGGGAAGCATTCGTATATTTCGTAGGTTTTGCAATGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAGGTGGGAGAAAGACAACAAAAGCAATGCACTTGCGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGCATTAAAAATTGCCAAACTGTTGAATGAATATGAGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACACACGCCACCCAAAACACAGTAACCACAATTGCAAACGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTGGTACTTAGGCTAACAAAAATGCCGGCCGTATTAACAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAATTATTGCAGAGGCAATGGCAAAAGGCTTAAGCAAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATGCGGTGATGGCTTATGAGGATACGTATATTGCGTAGGTTTTTAGCCTACCTATCCTGAAAATAGTG >NC_014964|6|7|955169-956334|PILER-CR GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GATAAAGATTGGCAAATAACTGTGATGTAAGGTTAC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GCACAAGAAAAACCTGTACAAGCAGGTAACTGGATTG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTTGACGTTGTTTCTTGCTCCACTTCTTCTTTTTGC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AAGGCTGAACTTGAACAATCTGAAGTGAAGTTGGTACAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTATATTGAAATTGACTGGAATTTTAGAGAATTTTACCT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AAATATGCTTGTACAACTTTATTGATGAGTTCTTGAC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AAAAATTGGACAGCACAAGGACTAAAAACGAGAGAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATAAACTTTTTTACGTCTTGCAGTTTCATTTTTACC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGCAATTGTACAGAGCACACTCAAAGAAAAAAAAGA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATTCCGCTTCTCTTAAAAAACTTTTGTGCGGAAAAATGT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CCGGCATCCGGGCCACCTCCCTGTTACTGTTACTCTC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGGGACCACTACTATGAGCTGATAGAATACGACAAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATGGGAAGCATTCGTATATTTCGTAGGTTTTGCAAT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGGTGGGAGAAAGACAACAAAAGCAATGCACTTGC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GCATTAAAAATTGCCAAACTGTTGAATGAATATGAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ACACGCCACCCAAAACACAGTAACCACAATTGCAAAC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGGTACTTAGGCTAACAAAAATGCCGGCCGTATTAACA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC >NC_014964|6|5|955169-956468|CRISPRCasFinder GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GATAAAGATTGGCAAATAACTGTGATGTAAGGTTAC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GCACAAGAAAAACCTGTACAAGCAGGTAACTGGATTG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTTGACGTTGTTTCTTGCTCCACTTCTTCTTTTTGC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AAGGCTGAACTTGAACAATCTGAAGTGAAGTTGGTACAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTATATTGAAATTGACTGGAATTTTAGAGAATTTTACCT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AAATATGCTTGTACAACTTTATTGATGAGTTCTTGAC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AAAAATTGGACAGCACAAGGACTAAAAACGAGAGAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATAAACTTTTTTACGTCTTGCAGTTTCATTTTTACC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGCAATTGTACAGAGCACACTCAAAGAAAAAAAAGA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATTCCGCTTCTCTTAAAAAACTTTTGTGCGGAAAAATGT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CCGGCATCCGGGCCACCTCCCTGTTACTGTTACTCTC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGGGACCACTACTATGAGCTGATAGAATACGACAAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATGGGAAGCATTCGTATATTTCGTAGGTTTTGCAAT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGGTGGGAGAAAGACAACAAAAGCAATGCACTTGC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GCATTAAAAATTGCCAAACTGTTGAATGAATATGAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ACACGCCACCCAAAACACAGTAACCACAATTGCAAAC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGGTACTTAGGCTAACAAAAATGCCGGCCGTATTAACA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AATTATTGCAGAGGCAATGGCAAAAGGCTTAAGCAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATGCGGTGATGGCTTATGAGGATACGTATATTGCGTAG GTTTTTAGCCTACCTATCCTGAAAATAGTG >NC_014964|6|5|955169-956468|CRT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GATAAAGATTGGCAAATAACTGTGATGTAAGGTTAC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GCACAAGAAAAACCTGTACAAGCAGGTAACTGGATTG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTTGACGTTGTTTCTTGCTCCACTTCTTCTTTTTGC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AAGGCTGAACTTGAACAATCTGAAGTGAAGTTGGTACAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTATATTGAAATTGACTGGAATTTTAGAGAATTTTACCT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AAATATGCTTGTACAACTTTATTGATGAGTTCTTGAC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AAAAATTGGACAGCACAAGGACTAAAAACGAGAGAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATAAACTTTTTTACGTCTTGCAGTTTCATTTTTACC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGCAATTGTACAGAGCACACTCAAAGAAAAAAAAGA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATTCCGCTTCTCTTAAAAAACTTTTGTGCGGAAAAATGT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CCGGCATCCGGGCCACCTCCCTGTTACTGTTACTCTC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGGGACCACTACTATGAGCTGATAGAATACGACAAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATGGGAAGCATTCGTATATTTCGTAGGTTTTGCAAT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGGTGGGAGAAAGACAACAAAAGCAATGCACTTGC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GCATTAAAAATTGCCAAACTGTTGAATGAATATGAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ACACGCCACCCAAAACACAGTAACCACAATTGCAAAC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGGTACTTAGGCTAACAAAAATGCCGGCCGTATTAACA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AATTATTGCAGAGGCAATGGCAAAAGGCTTAAGCAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATGCGGTGATGGCTTATGAGGATACGTATATTGCGTAG GTTTTTAGCCTACCTATCCTGAAAATAGTG
>NC_014964.1|WP_012269222.1|954602_954971_+|large-conductance-mechanosensitive-channel-protein-MscL MLKGFKEFIMRGNVLDLAVAVIIGSTFNKVVNSLVVDVLTPLIGAIFGAPDFSAIKLGPIAIGNFLNAVVNFVIVAAAIYFFIVAPMNAIKRRKPKEKEQTPPEPSEEVKILREILEVLKEK >NC_014964.1|WP_012269221.1|953720_954476_+|sulfite-exporter-TauE/SafE-family-protein MKNYILILMASILAGATNSIAGGGTLITFPALVWVGINPLAANMTNTVALWTGSVTGAWGFKERLSQTKELLKFLTLPSLLGGILGAYLLMITPHKVFNFVVPFLVLFATVILALNDRINKFNLDSEEGREKKSLVFVFILQFLTSLYGGYFAAGIGILMLATLGIAGITDIHTANGIKNVLSLFINITSGLVLLFSGKVVWPFAIILMIGFALGGYLGAKISQKFDSKKVKSFVILWGIILAIVFWIRGV >NC_014964.1|WP_012269220.1|953100_953721_+|nitroreductase-family-protein MKECQKLITERRSITFFDPTKEISDDFIKEVLEVAATAPSANNLQPWEVIVVKDKEKKKILKEICFNQQKVEDASAVIVLIANPKAAFEHIDRVLDSSIELGYIPKERRESAKERVLEVWKDMEQAKRKSIRDTALFAMNIMIVARVYGLETHPMDGFNEEKMKEFLGIDAEKIVPMIIAIGYKDPSKELLPRAYRFKFEEFGEIV >NC_014964.1|WP_012269219.1|952374_952839_-|sigma-70-family-RNA-polymerase-sigma-factor MWQDLYKAAFYYLLKLGVPQADAEDIAQEALLSTYLNLDGIQEGKLKAYVLTAARNKYTDYLRKTKKDMTVSIIDVFPQSTFSEFQQIENKEVIKKAVNRLTLNEQKLFYLKFILEMSNEEISSYLKTNSNTEKTMVWRLRKKLKEYLKEEEKS >NC_014964.1|WP_012269218.1|951414_952374_-|hypothetical-protein MGSDLNKPISDISFDEKAFLRKARFKSILRIIIISLIIAIGVFVLTFIIPEMMLQNQENRIDSFYPDIVKFTEPNTFAISGESYNVRLFGRQKEYYLLRLIGNKPYPAGIVTVDFDIWGGEQFQGNKSFCVVETDHIIPYSEISTVIPEGTKEYLAPYAVPKLKFYNPVVKYDKVIREFDVLKNIPNDNLVEMALSFYRPLTFIEIKTIIPEDLKLMWGAVLVFEENDYKEKNYLAERLVGNPYIDSHDGEKEFLKQLEQLSNLQSYSSTNLKRTVNFLKEKGIKYYGVVVVGHPESLQKLSSNSIIRGAVLGIVTTPY >NC_014964.1|WP_012268741.1|951089_951311_+|hypothetical-protein MKRGYIHATDRLGNESDFPIMGISIAVVNNSNRKFSDIDEISRIASQIKMECKKYEKSHYIIESLEKGKQAVI >NC_014964.1|WP_003867703.1|949788_950904_+|sodium-ion-translocating-decarboxylase-subunit-beta MFEAIINFLKTTGYFNVTLSQLIMIIIAFVLMYLAIVKKYEPLLLVPISFGMLLANIPEAGLMEEGGFLYWIYQGVKLGIYPPLIFMGVGAMTDFGPLISNPKSLLLGAAAQLGIFITFLGARLLGFDAKEASSIGIIGGADGPTAIFVTSKLAPHLLGAVAVAAYSYMALVPIIQPSIMRLLTTKKERTVVMEQLRPVSKTEKIIFPIIITVLASFLVPPATPLIGSLMLGNLFRESGVVDRLSKAVQNELMNILTIFIGLSVGATASGDNFLRLETIEIIILGLIAFAGGTAGGVLFGKLMYLLSGGKVNPLIGSAGVSAVPMAARVSQKVAQEEMPGNFVLMHAMGPNVAGVIGSAIAAGVLLSLYGG >NC_014964.1|WP_003867702.1|949382_949742_+|sodium-pump-decarboxylase-subunit-gamma MIEALSTTVLGFGITLIFLYLLSLILDLMRVVFYKKDKKEPKILPSREQEKTKFQEDETEEDEGELIAVITSAILACSQKPADEIKIRLIRRINQRTPIWAMESRLNLMKHQQHLRSLR >NC_014964.1|WP_003867701.1|948944_949346_+|methylmalonyl-CoA-epimerase MNILKIDHIGIAVNSIEEASKIYTELLGLEMHGVEEVAEQKVKVAFIPVGESEVELLESTDPEGPIARFIEKNGEGVQHIAFRVEDIEKALEELKQKGVRLIDEKPRYGAGGAKIAFIHPKATKGVLIELCER >NC_014964.1|WP_003867700.1|948001_948931_+|methylmalonyl-Co-A-mutase-associated-GTPase-MeaB 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>NC_014964.1|WP_012269224.1|959377_959788_+|hypothetical-protein MKQIDLKKMFLVFSHQLTDFQKEDARLNLGVNEFIYLPDNLKIQWLDISPYDDSLTFHLQDLINWLKINARKGDYVLVQGDFGATFLIVDFCLKNDLIPVYSTTKREIISEIKNGENIKVSRLFTHVRFRKYERWI >NC_014964.1|WP_012269225.1|959790_961080_+|TIGR02221-family-CRISPR-associated-protein MAIKFFSFLGTGAYTKCKYKFDNIESDSSCYVQEALIDNLLKKGVNLESVFIFKTEEATIANWSKNKKYPSDPGLKQVLDKYNGKPSINYVDIPSGQNENELWEIFDKVLEQIDKGDEIIFDITHSFRSIPMLALIILNYAKFIKKCEIRGIYYGAIEAVGKEIKDIEESDIAPIFDLTPFVRLLDWTVGIDRFIETGDARYINYLMKLGTKELHLKGMKDERNILSNFAQKLENYTRNVATCRGKEISKGGLELKNILGDAVSIADKTYIKPMKPVIDRLNDRFINFSNDENKNMIEIVKWCSEHNLIQQGFTILEEGIVNFFCEKFGFDKNNIKEREIIENATYIKHYSLPKDRWKKTAFENEAVIYNLLSKLNEENYKNLIKVLYEEIKPLRNDINHAGYKENDMKAEKFEDKLNELIDKVEKYIV >NC_014964.1|WP_012269226.1|961133_962447_+|DUF1887-family-protein 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_014964_1 | 1.18|122825|38|NC_014964|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 122825-122862 | 38 | CP003186 | Thermoanaerobacterium phage THSA-485A, complete genome | 27908-27945 | 1 | 0.974 |
NC_014964_1 | 1.39|124230|38|NC_014964|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 124230-124267 | 38 | NC_004979 | Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum plasmid pNB2, complete sequence | 252-289 | 1 | 0.974 |
NC_014964_6 | 6.3|955332|36|NC_014964|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 955332-955367 | 36 | NZ_KT897276 | Clostridium botulinum strain INGR16-02E1 plasmid pINGR16-02E1, complete sequence | 11053-11088 | 6 | 0.833 |
NC_014964_6 | 6.3|955332|36|NC_014964|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 955332-955367 | 36 | NZ_KT897280 | Clostridium botulinum strain FI1111E1 plasmid pFI1111E1, complete sequence | 10971-11006 | 6 | 0.833 |
NC_014964_6 | 6.3|955332|36|NC_014964|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 955332-955367 | 36 | NZ_KT897275 | Clostridium botulinum strain IFR 12/29 plasmid p12/29, complete sequence | 11042-11077 | 6 | 0.833 |
NC_014964_6 | 6.3|955332|36|NC_014964|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 955332-955367 | 36 | NZ_KT897277 | Clostridium botulinum strain ST0210E1 plasmid pST0210E1, complete sequence | 11053-11088 | 6 | 0.833 |
NC_014964_6 | 6.3|955332|36|NC_014964|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 955332-955367 | 36 | NZ_KT897278 | Clostridium botulinum strain FWSKR40E1 plasmid pFWSKR40E1, complete sequence | 10971-11006 | 6 | 0.833 |
NC_014964_6 | 6.3|955332|36|NC_014964|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 955332-955367 | 36 | NZ_KT897279 | Clostridium botulinum strain SWKR38E2 plasmid pSWKR38E2, complete sequence | 10971-11006 | 6 | 0.833 |
NC_014964_4 | 4.3|135281|36|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 135281-135316 | 36 | NZ_CP015333 | Borrelia hermsii HS1 isolate Browne Mountain plasmid lpV47, complete sequence | 19023-19058 | 7 | 0.806 |
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NC_014964_1 | 1.20|122960|36|NC_014964|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 122960-122995 | 36 | MN694760 | Marine virus AFVG_250M661, complete genome | 46244-46279 | 8 | 0.778 |
NC_014964_2 | 2.8|126963|36|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 126963-126998 | 36 | NZ_CP021437 | Bacillus thuringiensis strain C15 plasmid pBMB240, complete sequence | 123645-123680 | 8 | 0.778 |
NC_014964_2 | 2.8|126963|36|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 126963-126998 | 36 | NZ_CP021437 | Bacillus thuringiensis strain C15 plasmid pBMB240, complete sequence | 33833-33868 | 8 | 0.778 |
NC_014964_2 | 2.8|126963|36|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 126963-126998 | 36 | NZ_CP015351 | Bacillus thuringiensis strain MYBT18246 plasmid p150790, complete sequence | 7249-7284 | 8 | 0.778 |
NC_014964_2 | 2.8|126963|36|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 126963-126998 | 36 | NZ_CP015352 | Bacillus thuringiensis strain MYBT18246 plasmid p142098, complete sequence | 106305-106340 | 8 | 0.778 |
NC_014964_6 | 6.18|956335|36|NC_014964|CRISPRCasFinder,CRT | 956335-956370 | 36 | NZ_LR699117 | Aquicella lusitana strain SGT-39 plasmid 4 | 49039-49074 | 8 | 0.778 |
NC_014964_1 | 1.20|122960|36|NC_014964|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 122960-122995 | 36 | NZ_CP011133 | Citrobacter amalonaticus Y19 plasmid unnamed, complete sequence | 61910-61945 | 9 | 0.75 |
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NC_014964_1 | 1.48|124832|36|NC_014964|CRISPRCasFinder,CRT | 124832-124867 | 36 | NZ_CP014147 | Clostridium botulinum strain CDC_67190 plasmid pNPD12_2, complete sequence | 6019-6054 | 9 | 0.75 |
NC_014964_1 | 1.36|124030|36|NC_014964|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 124030-124065 | 36 | NC_019924 | Clostridium phage phi8074-B1, complete genome | 44692-44727 | 11 | 0.694 |
NC_014964_3 | 3.27|133023|38|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 133023-133060 | 38 | NC_010507 | Methylobacterium radiotolerans JCM 2831 plasmid pMRAD08, complete sequence | 1319-1356 | 11 | 0.711 |
1. spacer 1.18|122825|38|NC_014964|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP003186 (Thermoanaerobacterium phage THSA-485A, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
tgcaaaatttcagaaaatttcaggaaaggaggtatgcg CRISPR spacer tgcaaaatttcagaaaatttcaggaaaggaggtatgct Protospacer *************************************
2. spacer 1.39|124230|38|NC_014964|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_004979 (Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum plasmid pNB2, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
ccaccttttttacctcaattagttctatagtattaaag CRISPR spacer ccaccttttttacctcaattagttctatagtattaaaa Protospacer *************************************.
3. spacer 6.3|955332|36|NC_014964|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KT897276 (Clostridium botulinum strain INGR16-02E1 plasmid pINGR16-02E1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
-tttgacgttgtttcttgctccacttcttctttttgc CRISPR spacer atttcatgat-tttgtttctccacttcttctttttgc Protospacer *** *.* * *** ** *******************
4. spacer 6.3|955332|36|NC_014964|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KT897280 (Clostridium botulinum strain FI1111E1 plasmid pFI1111E1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
-tttgacgttgtttcttgctccacttcttctttttgc CRISPR spacer atttcatgat-tttgtttctccacttcttctttttgc Protospacer *** *.* * *** ** *******************
5. spacer 6.3|955332|36|NC_014964|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KT897275 (Clostridium botulinum strain IFR 12/29 plasmid p12/29, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
-tttgacgttgtttcttgctccacttcttctttttgc CRISPR spacer atttcatgat-tttgtttctccacttcttctttttgc Protospacer *** *.* * *** ** *******************
6. spacer 6.3|955332|36|NC_014964|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KT897277 (Clostridium botulinum strain ST0210E1 plasmid pST0210E1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
-tttgacgttgtttcttgctccacttcttctttttgc CRISPR spacer atttcatgat-tttgtttctccacttcttctttttgc Protospacer *** *.* * *** ** *******************
7. spacer 6.3|955332|36|NC_014964|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KT897278 (Clostridium botulinum strain FWSKR40E1 plasmid pFWSKR40E1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
-tttgacgttgtttcttgctccacttcttctttttgc CRISPR spacer atttcatgat-tttgtttctccacttcttctttttgc Protospacer *** *.* * *** ** *******************
8. spacer 6.3|955332|36|NC_014964|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KT897279 (Clostridium botulinum strain SWKR38E2 plasmid pSWKR38E2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
-tttgacgttgtttcttgctccacttcttctttttgc CRISPR spacer atttcatgat-tttgtttctccacttcttctttttgc Protospacer *** *.* * *** ** *******************
9. spacer 4.3|135281|36|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP015333 (Borrelia hermsii HS1 isolate Browne Mountain plasmid lpV47, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
gctggtgct--tattattggaaaggatataaacaagca CRISPR spacer --ttattcttgtattattgcaaaggatataaataagca Protospacer * .* ** ******** ************.*****
10. spacer 1.7|122089|37|NC_014964|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP019190 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Poona str. ATCC BAA-1673 plasmid pATCCBAA1673_01, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
tgcatttccccaccttcgcggtaaagctccacgaacg CRISPR spacer tacctctccccaccttcgcgataaagatccacatccg Protospacer *.* *.**************.***** *****. **
11. spacer 1.20|122960|36|NC_014964|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694760 (Marine virus AFVG_250M661, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
agatactttttaacttctttatatatttaataaaaa CRISPR spacer aaaaactttttaaattctttatatattaaaaagtta Protospacer *.* ********* ************* ** *. *
12. spacer 2.8|126963|36|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021437 (Bacillus thuringiensis strain C15 plasmid pBMB240, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
agctgttgt------tttgacatattcatcatcctttctgaa CRISPR spacer ------tgtaaagcgtttgacatatttgtcatcctttctgaa Protospacer *** ***********..**************
13. spacer 2.8|126963|36|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021437 (Bacillus thuringiensis strain C15 plasmid pBMB240, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
agctgttgt------tttgacatattcatcatcctttctgaa CRISPR spacer ------tgtaaagcgtttgacatatttgtcatcctttctgaa Protospacer *** ***********..**************
14. spacer 2.8|126963|36|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP015351 (Bacillus thuringiensis strain MYBT18246 plasmid p150790, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
agctgttgt------tttgacatattcatcatcctttctgaa CRISPR spacer ------tgtaaagcgtttgacatatttgtcatcctttctgaa Protospacer *** ***********..**************
15. spacer 2.8|126963|36|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP015352 (Bacillus thuringiensis strain MYBT18246 plasmid p142098, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
agctgttgt------tttgacatattcatcatcctttctgaa CRISPR spacer ------tgtaaagcgtttgacatatttgtcatcctttctgaa Protospacer *** ***********..**************
16. spacer 6.18|956335|36|NC_014964|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR699117 (Aquicella lusitana strain SGT-39 plasmid 4) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
aattattgcagaggcaatggcaaaaggcttaagcaa--- CRISPR spacer aattattgcagatgcaatggccaaag---tgggtaaaga Protospacer ************ ******** **** *..*.**
17. spacer 1.20|122960|36|NC_014964|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP011133 (Citrobacter amalonaticus Y19 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
agatactttttaacttctttatatatttaataaaaa CRISPR spacer ttcttctttttaactttttaatatatttaatttaat Protospacer * ***********.** *********** **
18. spacer 1.48|124832|36|NC_014964|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP031100 (Clostridium botulinum strain CFSAN034202 plasmid p1_CFSAN034202, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
agtattaaaaattaaggaggtttaaaaaatggaaaa CRISPR spacer tttattaaaaatttaggaggtataaaaatgaataaa Protospacer *********** ******* ****** .. ***
19. spacer 1.48|124832|36|NC_014964|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014147 (Clostridium botulinum strain CDC_67190 plasmid pNPD12_2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
agtattaaaaattaaggaggtttaaaaaatggaaaa CRISPR spacer tttattaaaaatttaggaggtataaaaatgaataaa Protospacer *********** ******* ****** .. ***
20. spacer 1.36|124030|36|NC_014964|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019924 (Clostridium phage phi8074-B1, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.694
agtactaaagattgaggaggtataaacatggaagag CRISPR spacer aacactaaagttttaggaggtataaacatatggata Protospacer *..******* ** ***************. ... .
21. spacer 3.27|133023|38|NC_014964|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NC_010507 (Methylobacterium radiotolerans JCM 2831 plasmid pMRAD08, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.711
aaatactcgccggcgcgaaccttaatcttcaccggcca CRISPR spacer tcatactcgccggcgcggaccttgatcttcgagaggtc Protospacer ***************.*****.******. .* .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
86989 : 138188
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_014964|86989:138188|DBSCAN-SWA TATGGCAAGACAAAGAGGGTCAGTGAAAGAAATAATTAAGGGAAAGAAGTATAAGATAAGCTTTTATATTGGTACTGATGGTAATGGAAAAAGGAAATACTATATTGAAACAATCGAATGTAAAAACAAAGCAGAAGCACAAAAATATTTAGCCAAAAAAATAGTAGAGTATGATACAGGGACATTGCCAATAGATGAAACTAATATTACGGTTAAGGATTATCTTAAAAAATGGCTTGAGACAAAAAAATCCTCTTTAGCACTCAAAACTTACAACGATTATGAACAAAAGATAAGATTGTATATCAATCCTGCTATTGGGAACTATAAGCTTTTAAAATTAACACCTTTAATAATACAAAATATGTACAATAATATGTTAGAGCAGGGCCTATCAGCAAGAACTATAAGATATACACATACAGTTTTAAATGAAGCATTAAAGCAAGCTATTAAGTGGCAGATGTTAAGATATAACCCGTGTGATGGAACTACATTGCCGAAGCAGGCAAAAAAAGAGATGAAAGTTTTAACGCCAGAACAGGCTAAAAAGTTTTTAGAAGCTTGTGTTTATAACAGATGGGGGATATTATTTGAATTGCTACTTATAAGTGGTATGAGACCAAGTGAAGCCTTAGGCCTTAAATGGGAAGATATAGACTGGAAAAATAATCGTATTGCAGTACAAAGGACTTTGACCAGAGTAAAAAACAATTGGCAATTAAAAGAACCAAAGACACCACAAAGCAGAAGAACAATTCCTTTACCAAGAGAAGTTATGAATGACTTAAAGGAGCATAGGAAACAACAGTCAAAGGAAAAGCTTAAGGCAAAAGAATATATCAATTATGATAAGGATAAGAATAAATTTAAACCAGAAGAATGGGAAGAAAAATTGAAAGACCCAAAGGTATATGTCGATTATGGACTTGTATTTGCTACTGAAACAGGAAGACCTCTTGACCTTGCAAATATTAATTATCAATATTTTAAACCTCTTCTAAAAAACGCAGGATTACCAAATATAAGACTTTATGATTTAAGGCATACATGCGCTACACTTCTTTTATTAGCAGGTGAAAATCCTAAAGTAGTAAGTGAAAGATTGGGACATGCGAATATAACATTAACACTTGATACTTATAGCCATGTTTTACCTACTATGCAGGAAGAGGCTACACAAAAGTTAAAACAAATGCTATTTGGAAGTTAATTTTTTTTGATTGCGAGTTGATTGCGAACTGAAAAAAACTTAATGAATCTCAAGCAATTTAACATAATATTACAAATGGCTGAAATCCTTAATACATGCAGGTTGTAAGGACTTGTAACACCTAAAAGAACATCAACAAAAGTAGCTGTTATGGGACTTGTAATCAGCAGGTTGAAGGTTCAAGTCCTTTCGCCAGCTCCATTTTTTTGTCAAAAGTCAAGGTTTTTAAGTACCTTGCTTTTTTATTTTAGTGTTGGTGACAACAAAATGACAACATCTGATCTTTTCGATCTGTGAAGAGCTTATTTGGTTTTTCAGCTGCTTCTCTTTGTATTTGATTTAGTATCATTTTCGGTGTTTTGGTATCTGGTGCTTCAAATATAGCTCTTACCTTCCATGTATTTTATCTTGACACTATCGGTTTGATGCTTAATAATACTAAAGGTAAATCAATTGTGGTAAGTCTTGTCACCCATAGGCACTAAAATAATTGATAGTACCAATGCTAGTGATAGGAACAGACTAAGTATTCGCTTGTTTCTAAAATTCATTCGATGGAGTAGTAACCGATGGCCTTAAACCTTAACTGGAAATTTTATATACAATGATATTATACGAGAGGTGATAATAATGCCTAAAAAAAATGAAATTTGTGTTATAGATAGATTTGAAGGAGATTGGGCGGTCATAGAATGGAAAGATAAGATTTTTAATTTCCCCCGGGAATTACTTCCTAAGAAGGTAAATGAAGGAGACGTACTGATATTTAATGTGGATGTAGATAAAAGCGAAACAGAAAAGCGCAAAAAGGCTATTGAAGATTTGGCGAAGGACCTATTTAAAGATGAATAAAGATGGATAAATGTTAAAAAGGTGCATAATTTGAAGGAGAGGTTTTAGCTATGTACAAGAAGAGATTACTGTTGCCCTTTATATTAATACTATTTGCATTTATATTGACAAATTATACAATATTTGACAATACCCTTACTCATGAAGTTCAACAGGTTTTACAGGATGAAGGAATAAAAAAACAGCACGAAGCAGTTAAAAAATCCGCAACAGACAGTTTAACAGTAAATTATATAGACGTAGGACAAGGAGACAGTATATTTATACAAACTCCATCAGGCAAGACGATGTTAATAGATGCAGGAACACCTGAAATGGGTAGCAAAGTTATAAAGTACATAAAAAGCCAGGGAATTAATAAAATTGACGTACTTATAGGTACCCACCCTCATAATGACCACATAGGAGGTATAGTGGAGATTATAAAAACCTTCAAAATAGGAAAGTTTTATATGCCTAAAGTAACCACTACAACGAGGACATTTGAAGAAGTTCTAAAGGCAGCAAAATCAAAAGGACTTTCGATAAACGTTGCAAAAACAGGAGTAGTAATTGACCTTGGAGATGGTATAATTGCAAAAATGCTTGCGCCAAATAGTTCCCATTACGAGGACTTAAATAATTATAGTGCGGTAATAAAAATTACGTATGGTAATACCTCTTTTTTGTTTACAGGAGATGCTAGTGAACAATCTGAAAAGGAAATGCTAAGTAAAGGATATAATTTAAAAGCCGACGTCTTAAAAATTGGACATCATGGCAGTTCTTCATCTTCTACTTGGGCATTTTTAAAGGCAGTACATCCTAAATATGCTGTTATATCTTGCGGTAAATACAATGACTATGGTCATCCCCACAAAGAAACAATGAAAAAGCTTAGGTCATTAGGAATAATAGTATATAGAACAGATGAATGTGGGACTGTAATTGCAGTAAGTGATGGCAAAACTATAAATTTTAATGTAGAACCAGGTGATAATTTGTCGGGAAGTGAGATTAAAAGATAATTTACTTTAATACATTGCATTTATAAAGTGATATGATATAATAAAAGCATTGAAACCAGTTGAAATAAATTTTTAGGAGGATTATTATGGCTACAGTAAAACCCTTTAAGGCAATAAGGCCTGTACCAGGATTGGCAGATAAAATAGCGTCCTTGCCTTATGACGTCGTAAATACCGAAGAAGCGAGGAATTTGGCGAAAGATAATCCTTATTCATTTCTTCATGTGGATAGAGCAGAAATAGATTTAGCTCCATCTATAAATCCTTACGATGAAATAGTTTATGAAAAAGCGAGAGAAAATTTTGACAGAATGCTTAAAAAAGGACTGTTAATAAAAGATAATGAGGAGAACTGTTACATCTATAGAGAAATAATGAACGGCAGGAGTCAAGTGGGATTGGTAGCGACTGTTTCGATTGATGAGTATTTAGAAGGAATAATTAAAAAGCATGAGCTTACTCTGCCGGAGAAAGAACAGGATAGAATAAATCACATGGATTACTGTGATGCTCACACGAGTCCAGTTTTTTTAACGTACAAAGCCAATCAAGAGCTTAAAAAGTTGTTAAATAGCTGGATGGAGAGCAAAAATCCTATATATGATTTTACATCAGAGGATGAAATAAGACATACAGTATGGATTATAGATGACAAATCCTTAATAAATAAAATTACTTCTGTTTTTAAGGCAATAGACTATCTTTACATTGCAGATGGACATCATCGGGCTGCTGCTTCTGTAAAAGTAGGCTTAAAGAGGCGAGAACAAAATCCTGATTATAAAGGAGATGAGGAGTTTAACTATTTTTTAGCAGTGTTAGTGCCCCATGATGAAGTTTATATCATGCCTTATAATAGGGTGGTAAAAGATTTAAACGGCTATTCTGAAAGTGAATTTATTGAGAAGATAAAAGAGAAATTTGAAGTAGAGAAATGTAATGAAGGCCAGCCTTTCAATCCTTCGCAAAAGCACACTTTTGGCATGTATCTATCAGGGAAGTGGTACAAACTTACTGCCAAAGGAGGTACTTTTAACCCATCGGATCCGATAGAAAGTTTGGATGTGTCCATCTTACAAAAAAATCTGTTAGATCCTATTTTGGGGATAAAAGATCCGAGAACTGATAAAAGGATTGATTTTGTAGGAGGAATTAGAGGCTTAGAAGAATTAGAAAGAAGAGTTAAGGAAGACATGAAAGTGGCTTTTTCTATGCATCCGACAACAGTTGAAGATTTAATTGCTGTTGCCGATGCGAGAATGATAATGCCTCCTAAGTCTACCTGGTTTGAGCCTAAACTAAGAAGCGGATTATTTATTCATGAATTGAGATAAAAGCACCTTTTCTTTTTTAAGGTGCTTTTTATGTGCGCCCGGCATGGGCGATAGCTAGGCGGTGAAAGTCCGCTGTGGGCTTGGTAGTGGGAACCACTAGCCAAAAGCAAGGGTGTCCATCGTGAGGTGGAATCTGAAGGAAGCTTAAGGCAAAATCTCGGTCTGATGAACAAGAACCAGATAAGAGGCTGAATTGGGATGGATGAGTTTGCGTAACAAAACGAAGTCCAACACTACCCGAATCCCATACAGTAAATCTGGCAGATATATGAGATGAAAGTTATCGTTCTTACCCGGGGAGGTCTCAAGGACAAGTCACTAAAGTGAACTCTGAAGTGACAACCCATACAGTGATGTATGGTTGAACCTTGAGAAGTCAGCAGAGGTCATAGTACTTATCTAGTCATGAATAGATAAGGAAGGGCCGAACGTTAGGAGGTTTTGGAAATCTTATGGACTCGAAAGATATGCAGAGACTGCAGACAACTCAACAAAGAGGCTATCCGTTGAATAGAGAAATGGAATTTCAAAAGACAACGGAAGTGCATAGTATATCATCGGCGTCAAAAGATAGAAGAAACGATGTACAAAGAT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34 | Wolbachia_phage(17.65%) | protease,integrase,transposase,tRNA | attL 80562:80607|attR 88357:88402 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
174529 : 182580
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_014964|174529:182580|DBSCAN-SWA 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AGGTGAACTAAATTTGAGCAAAAATAGACTTTTTAAAAAACTTTTTATAAGCAATATGATTATCATCCTTATTACTTTGTCTATTCTTTCAGGGATGTTTTATCTGATGTTTCAAAACTATTACTTTGCTGACAAAGAAAAAATAATGTTAGAAGAGGCTCAAGAAATAAATGCAATTTTAAATGAATTTGCGGTAGGAGACATAAACATAGATAAATGGAATCAAGAACTAAACGTTGTTACTAGATTGATTAATGCTACTGTATGGATCGTAGATAAAGAAGGGCTAATTTACAGTCAATCACAACAGCAGGGCAAAGCATGGACAGGAGTAAGCCTCAGTAAAGAAGAAATAAAAAGCATTTTAGATGGACAATCTGTTGTAAAAAAAGGATATTTTGGTGGCAAATTCAATCAGCCTGTTTTGACAGTAGGAGTGCCTCTTGTTATAAATGGCCGAATTGAAGGTGCTATATTTATGCATGCTCCTTTGACAGAAATGAATAAAACTATTATTAACATCTTTATTTTAATGCTTTTATCTGGAGGAGTAGCTCTTATAATAGGTTTTGTGCTCATTTCTTATACTTCCAGTAAAATATCTCAGCCTCTTAAAGAGATGAGCTTAGCTGTTCAGCAGGTAGCGAAGGGGAATTTTTCTGCAAGGGTACAACATAAGGAAGAAGATGAAATAGGGGATTTGGCTAAATCCTTTAATATTATGGCAAAAGAATTAGAACAATTAGAAAACATGAGAAAAGATTTTGTGGCAAATGTTTCTCACGAATTGAGGTCTCCATTGACCTCTATACAAGGATATATAGATGGGATATTAGACGGTACTATTCCAAAGGAAAAAGCTTGCGATTATCTTAAAATAGTACAAAAAGAAACACGGAGGATGTCTCGGCTCATAGACGATTTTCTTGAAATGACTAAACTTGAGTCAGGTCAATTTCCACTGCATAAGACGGAATTTGATATAAATGAACTTATAAGACTGGCCGTTATAAAGTTTGAAAAAAGAATAGTGGAAAAAGATCTAACCGTTAAAGTTGATTTTGAAGAAGACAGACGAATAGTTATAGGTGATAAGGACAAGATAGAACAAGTTTTGACAAATCTTATAGACAATGCAATAAAATTTTCTAAAGAAAAGGGTATAATTCATATTTTTACTGAAATAAAAGATGACAAAGTATTCATTACTATAAAAGATAATGGAATAGGTATTTCTCCAGAAGACCAAGAGCATATATGGGATAGATTTTATAAAGCGGACAAATCGAGAGGAAAAGATGGAGCAGGCCTTGGGCTTTATATAGTAAAGCGTATTATAAATGCTCATAACGAGGAAATATGGGTAGAAAGTGAAGTTGGTAAAGGTACAGCATTTACTTTTACTTTGTCGGTGAAAAAATTTTAAAAAATCACAATAAAATATTTACACTTTGTTAACACTTTATTCATAAATAAGGGATACAATAATATTTGAGAGCGACAAATGCCTCTCCTTGACCTCCCTTATCATAGCGGTCCAAGTGAATACTTGGGCCGCACATTTATTTATAAAAAACAACGCGGAAATTTTTTAATAAAAACTACTTAAAATCTTTACATCATGTTCATAATTTGTTAATAAAAAGGGGTTATAATTAAAAGCAAGAAAGAACAAAAGGAGTGAGTGATTATGGATTACGAAAAAGACTTTGAAGATAAAATTGAAAAGAATGATCCGGAGAATGTAGTTCTTCCAGAAGAAAATGAAAAAGAAGAGCTATATCAAACAGAAGAATTAAATAGCGAAATATTAAAAGCAGAGGAACAAAAGCAAGAGGAGTTGGAAACTACTGCGCCAATTCCTAAAGTGGTATTTAGAAACAACAAAAAGAGTTTGGGGAAGATGGTAAAAAGATTCAGAAAGAGAATGTTAGCTTCTTTTATCGCAGTAGCGTTGGTGGCAGCTTTAATCGGCGGAGGAATTACAGGAACTGTAATGAAATACTATGGAACCCAAAATGATGCGTCAGCACAAGTTGTTACAAGATATTTACCTCTAGATGCTACTTCGTCAGACGAAAGCGGTATTTTAAATTTGATACCCAACATTTACAAAATAGTGAGCCCAGCAGTTGTAGAAATTAGTACAAGTGTTGCTTACAACTACGGTTATAGAACTAGAGGTAGCGGTTCTGGATTTATCATAAGCTCTGATGGATACATTGTCACAAATAACCATGTAATTGACGGAGCATCAAAAATCACAGTAAAACTTTCAGATGGAAGAAGTGCTGATGCAAAACTTGTAGGAAAAGATGATAGAACAGACCTCGCAGTACTTAAAATAAACCTTCCTAATTTACCCATTGTAAAACTAGGAGATTCTTCCAAACTCCAACCTGGGGAATTGGCAATTGCTATAGGCAATCCTCTTGGAGAATCCTTTGCAGGTACAGTCACAGCAGGTATAATAAGCGGACTCAACAGGAATCTCCAAAGTGATTATGGGCCTGTCAAACTCATACAAACAGATGCAGCTATAAATCCTGGTAACAGCGGCGGACCTCTTGTGAACAGTAAAGCAGAAGTTATAGGTATAACAAGTGTTAAGCTCACTTCAATAGGACCAAGTATACAAGACCCTTTTGGAATGTTCCAGAGCCAAGGAACCCCTGTTGAAGGTATGGGTTTTGCAATTCCAATAAACGAAGCAAAACCTATAATTGACCAGATAATAAAACACGGCTATGTAGAAAGGCCTATGATGGGAATAGGTGCTCAAACTATTACACAACAAGATGCTGCCCAATATAATTTGCCTGTAGGAGTGTATGTAGTACAAGTTCAGCCAAATAGTGGAGCAGAAAAAGCTGGTATCCAACCAGGAGATGTGATAATAAAGGCTGATGGCAAAACCATTACTTCCTTTGAGGATTTGCAAAGCATAATAAATAACCACAAAGTTGGAGATGTAATAAGTGTAACAGTTTGGAGAAATGGCAAAACATTTACAGTTCCTGTAAAATTGCAAAGCAGTGCAAACTTTCAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_014964|174529:182580|175908_176859_+|WP_012268902.1|DBSCAN-SWA MARYTNSLKIFSGNSNPKLASEIAEHLGLKLCDSEVGTFSDGEISVRIGESVRGASVFVIQSTCAPVNNNLMELLIMIDAFKRASAAEINAVIPYYGYARQDRKAKARDPITAKLVADLITAAGAHRVVTMDLHAPQIQGYFNIPVDHLLGGPILAKYFLDKELGNDVVVVSPDHGSVTRARYFAEKLNAPLAIIDKRRPKANVAEIMNIIGDVRGKKAILVDDLIDTAGTLVQGAEALLDSGATEVYACATHGVLSGPAIERLKESPIKELVITDTIPLPEEKKIDKIKVRSVAPLFAEAILRIHEGMSVSKLFV >NC_014964|174529:182580|177303_178716_+|WP_012268903.1|DBSCAN-SWA MDSKDMQRLQTTQQRGYPLDREMEFQKTTEVHSISSASRDGRNEVQRYTSKMLEMIVERGNMRAAYKRVVANKGSHGVDGMEVDELLPYLKENWPTIKQQLLEGKYKPQPVRRVEIPKPDGGVRLLGIPTALDRLIQQAIAQILNRVYNHTFSDSSYGFRPGRSAKDAIKAAEAYINEGYTWVVDMDLEKFFDRVNHDIIMSKLEKRIGDKRVLKLIRRYLESGVMINGVKVSTEEGTPQGGPLSPLLANIMLDELDKELEKRGHKFCRYADDCNIYVKSRSAGNRVMKSIKKFIESKLKLKVNEAKSAVDRPWRRKFLGFSFYTKENEVRIRIHEKSIKRFKEKVREITNRNKGISMENRIKRLNQITTGWVNYFGLADAKSIMKTLDEWIRRRLRACIWKQWKKIKTKHDNLVKLGVEEQKAWEYANTRKGYWRISNSPILNKTLTNKYFESIGYKSLSQRYLIVHNS >NC_014964|174529:182580|178855_179539_+|WP_003867604.1|DBSCAN-SWA MGDNRKIYVVDDDKNICEIVSLYLEKEGFDVEQIYDGQTALKKIQEKPPKLVILDIMLPGIDGIALCREVRKFSKVPIIMLTAKGDTLDKVLALEIGADDYIVKPFDGKELVARVKAVLRRYEPESEEKQAVSYPELYVSLSEYKVVYKGQNVDLTPKELELLYFLCTHPNRVFTRDQLLENVWGYDYMGDSRTVDVHIKRLREKMGDGPNWKLTTVWGVGYKFEVN >NC_014964|174529:182580|174529_175903_+|WP_004399028.1|DBSCAN-SWA MEGLVTLILAAGLGKRMKSKHPKVVHKVCGKPMIEWVVDAVEEIGSKEVIVVVGHKAEEVKEVLKERVKYAYQEVQLGTGHAVMMAEDLLPEEGNVLILTGDTPLITSNTLKELINFHIKEGNSVTILSSVLEDPTGYGRIIRDKSGNVIRIVEDKDATEEEKSIHEINSAMYVMDIAKLKKALRMITNNNAQGEYYLTDAVEIIRDMDGKIGAFTVPSEEITGVNSRVQLFEAEKIMRKRINYRHMENGVTIVDPDTTYIGAEVEIGADTVVLPGCVIEGKTKIGSDCEIGPNCRIVDSEIGDGCSVTYSVILSSKIKNNVKIGPFAHIRPETVIQSNVKIGDFVEIKKSIIDEGSKVPHLTYVGDAEVGKNVNMGCGSITVNYDGKQKHKTVIGDNVFVGCNVNLVAPVKIGNNAYIAAGSTITEDVPEGALAIARSRQTNKEGWVQERIKKGRL >NC_014964|174529:182580|179541_180954_+|WP_003867605.1|DBSCAN-SWA MSKNRLFKKLFISNMIIILITLSILSGMFYLMFQNYYFADKEKIMLEEAQEINAILNEFAVGDINIDKWNQELNVVTRLINATVWIVDKEGLIYSQSQQQGKAWTGVSLSKEEIKSILDGQSVVKKGYFGGKFNQPVLTVGVPLVINGRIEGAIFMHAPLTEMNKTIINIFILMLLSGGVALIIGFVLISYTSSKISQPLKEMSLAVQQVAKGNFSARVQHKEEDEIGDLAKSFNIMAKELEQLENMRKDFVANVSHELRSPLTSIQGYIDGILDGTIPKEKACDYLKIVQKETRRMSRLIDDFLEMTKLESGQFPLHKTEFDINELIRLAVIKFEKRIVEKDLTVKVDFEEDRRIVIGDKDKIEQVLTNLIDNAIKFSKEKGIIHIFTEIKDDKVFITIKDNGIGISPEDQEHIWDRFYKADKSRGKDGAGLGLYIVKRIINAHNEEIWVESEVGKGTAFTFTLSVKKF >NC_014964|174529:182580|181218_182580_+|WP_012268904.1|DBSCAN-SWA MDYEKDFEDKIEKNDPENVVLPEENEKEELYQTEELNSEILKAEEQKQEELETTAPIPKVVFRNNKKSLGKMVKRFRKRMLASFIAVALVAALIGGGITGTVMKYYGTQNDASAQVVTRYLPLDATSSDESGILNLIPNIYKIVSPAVVEISTSVAYNYGYRTRGSGSGFIISSDGYIVTNNHVIDGASKITVKLSDGRSADAKLVGKDDRTDLAVLKINLPNLPIVKLGDSSKLQPGELAIAIGNPLGESFAGTVTAGIISGLNRNLQSDYGPVKLIQTDAAINPGNSGGPLVNSKAEVIGITSVKLTSIGPSIQDPFGMFQSQGTPVEGMGFAIPINEAKPIIDQIIKHGYVERPMMGIGAQTITQQDAAQYNLPVGVYVVQVQPNSGAEKAGIQPGDVIIKADGKTITSFEDLQSIINNHKVGDVISVTVWRNGKTFTVPVKLQSSANFQ |
6 | Tupanvirus(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
303919 : 311856
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_014964|303919:311856|DBSCAN-SWA AATGGGTAAAAAGATATTTGTTGTTGATGACGAAATAAAAATACTGGAAGTTGTAAAGTCATATCTTGAACATGAGGGATTTAGCGTTATTACCGAAACCAATGGCAATAACGTTTTAAATACATTCAAAAAAGAAAAACCGGATCTTGTTATACTTGATCTTATGTTGCCAGGTATTTCAGGAGAGGAACTGTGCAAGAGGATACGGCAGTTTTCCAATGTTCCGATATTGATGCTTACAGCAAAAGTTCAAGAAAGTGATAAAATTAATGGATTTTCTATAGGTGCTGATGACTATCTTACAAAACCATTCAGCCCACGTGAATTGGTTATGAGAGTAAAGGCAATATTAAGGAGGACAAGTGATGATGTACCTCTTGCTGAAGTAATGTCTTTTAATAATGATGACCTTGTGGTCGATTTTAAAGCACACACGGTGAAGAAAAAAGGAGTAGTTGTAAATCTCACTCCAAACGAATTTAAAATTTTAAAGTTTTTAATTCGCAATCCTAACAGAGTCTTTACAAGAGAAGAATTAATTGAAAAAGTTATGGGATTTGACTATGAAGGCTATGACAGGACGATTGATGCACATATTAAAAATTTAAGACAAAAAATTGAAGACGATACGAAAAATCCAGTGTATATTAAAACGGTGTATGGTGTTGGATATAAATTTGGTGATGGAAATGTTTAGAAATAATTTAAGAACAAGGACGGCTATTGTATTTATTTCAATAGCTCTTATATCGATTGTTATTGTAAGTATTACAACAAACATCTTAATAATAAATAGCTTTGGAAATTATGTTACAAAGTCAACAGATAAAGAATTTAGCAATATAGCTAACACTCTTGCTGCAGTGTATAAATCTGAGGGGGGGTGGAAAAGTACAACAGGGCGTGAAATTGGTCATGCAGCTATGATGGAAGGATATGGATTAAGACTTAGAGATAAAGATGGCAAGATTATATGGGATTTTTCTTCAATGTCATATATGATGAATATGATGGGAAAATGGAATAAGAAAAATATTTCTGAAAAAACTCTTCCCATCATTGTAGATGAAAAAACAGTGGGATATGTGGATATAATTTATTATGGGCCGATAATGATGAGTGACTTGGATTTTAAGTTTTTATATGACATTAGTAGATATAATGTTATAGCAACGGTGATAGCTATTTTTATAGCATTGATTATAAGTATTTATGTGTCAAATTATATTACAAGACCGTTAATTAATATTACGGAAGTTGCTAAAAAGCTTGAAAAAGGTGATTTTACTGCAAAGGTTTATGATATACCTAAAGAAGAAGAGCTATTTAAGCTCACAGCTGCAATAAACCACCTTGGAGAATCTTTAAAATATCAAGAAATACTAAGAAAACAAATGACCTCTGACATTGCACATGAGCTTAGAACACCATTGACAACATTGCACAGTCATATTGAAGCAATGCTTGATGGGGTTTGGGAGCCTACGTATGAAAGACTGAAGAGTTTAAATGAAGAGGTCTTAAGACTTATAAATATTGTAAAAGACCTTGAAACATTGAATAAATTTGAATCTGACATGTTAAAGCTTAATAAAATCAAATTTGACGCAAGCGAATTAGTAAAGAGCATTTTAACAAATTTTGAAGCATCTTTTGCTGAAAAAGAACAAGAAGTTGTAAAGAACATCGAAGATAACATTATGTTGTTTGGCGATAAGGACAGGATAGCACAGGTCTTTGTTAACCTAATATCAAATTCAAATAAATATACTCCTGTAGGTGGCAAAATAAAAATAGACTTTTATAAAGATGGCGATTATGCAGTATTTATTGTAGAAGATAATGGAATGGGTATATCAAAAGATGATATTCCTTTTATTTTTGAAAGGTTTTACAGAGGAGAAAAATCAAGAAATCGTGAAACAGGTGGAAGTGGAATAGGGCTTTCGATTGCAAAAGCCATAGTACTAGCCCATGGAGGCAAAATAAACGTTGAAAGCGAGATAAATAAAGGGAGTAAGTTTATTGTTAAAATTCCCCTATAAAAACTGGTTCATAAGTTTTTCATAATGGCGGTGTATAATTATTTTTGAAAGGAAGAAGGGATGGTGAAAACATTATGATGAGAATGATGTATGGCTGGGGCTGGGGATATGGAATAGGTGGATTTATTTGGAGCATTGTCTGGATGGCAATAGAGATAGGTTTAATAGTTGCTGCAATATATCTTATTATATCATTATTTCGAGGCACAAAAAATAGAAACAAAGAGAGGGATGCGATAGAAATTTTAAAAGAAAGATATGCAAGAGGGGAAATAAGCGAAGAAGAATATCTTGAACGAAAAAAACGACTTGAAGAAAAATGATTATATCATTGCATGCAGGCATCTTTAAATTGATTTGTATTATATATTAATAGGGAAAGGGTCTTCTATATGAATCTGCAAATAGTGAGAGACCACTTTGGATTGGTAACAATTGCGATAATTGTAATATCAGTAATACCTGCATTGTAAGCTTTGTAAATGCGGAGACTTTTCTGTTATGTCTAAAGTCTGAAACGTTGAATACTTATCAATGGTTTTCTTTAGTTATTTTTATCTTGGTTTAAATGTTGTGCATTCTGTTTCTGCACTAGTTTTTGCAGGCATTACTTTTGAACTTACTTCAATTGATGGAGCGTGGCATTTCATTAAAAACTATTCACCGAAAATGTCATTGTTATCGTAATAATTAACCCAAAAATAGAATTTATTACCATAAGACAGCTTTAACAATAGGAAAGTAGTTTACATTAGTAGTATACAAATACAATTATTCCCTGTAAAATAACAAAAAAAGACAATACCACTTTATGGCTTACAATGCAGCTTCCCTCACTGTTAGTGTTCTTGCATTTGTTTTTTTGAATGATGATTAATTTTTGTAATTCCCTCTTTGCCATATTATTTCTCCCCTTTTCATACTGACATTATCGCAGAATACTTTTAATATGGCAATATCACAGAATAATAACATTCATCAGATTTCTGATATTGACATGAGGGAAAAATAATTATATACTAATATATGAACAATTATTCATATGTTCAAGTATTGAGGTGCTTTTTATGAAGGAGAAAGGAAATAAAGCAGAGGCTTGTGAAGTTACTATAATACATGAAGATATTGTAAACAAAGTAAAAGAAATTATGCCCGAAGAAACAAAATTATATGACCTTGCAGAATTATTCAAAGTATTTGGGGATACTACAAGGATAAAAATACTCTGTGCGTTATTTGAATCAGAGATGTGTGTTTGTGACATTGCGGCACTTCTTGGCATGAGCCAGTCTGCTGTTTCCCACCAACTTCGAGTATTAAAGCAAAATAAATTAGTGAAATTTAAAAAAGAAGGAAAAGTAGTGTATTATTCTTTAGCGGATGACCATGTAAAGAAAATATTTGAGCAGGGATTTAATCATATTAATGAGTGAATGAATAGAGGGTGAGTAATGTGCAAAATAATAACAAGTCATTTATTTTAAAAGGGCTTGATTGCGCAAGCTGTGCTGCCAAAATAGAAGAGGGTGTGAAAAGGATAGAGGGTGTGACTTATGCTAATTGTGATTTTGTCAACAGCAAGCTTTCCGTTGAAATAGATGATTCATATGAGCTGGAAAAAACGATAAAAGAATTGAAAAAACTCGTAAAAAATATAGAACCAAATGTTGAAATTATTGAATATGAAAATGAAAAGATTAAAGATGATAATGAGCTATTGAGAAGGGGCATTCGATATGGAATTTCTGCTATCTTGTTTACTGTTGCATTGATATTTAATTTATCTGTTTATGTTAAATTTACTTTATTTTTCATAAGCTATATAATCGTAGGTGGAGAAGTCATCTTAACAGCTGGTAAAAAGATTTTAAAAGGGCAGGTTTTTGATGAACATTTTCTTATGAGCATAGCGACAATTGGTGCTTTTGTTATTGGAGAGTATCCGGAAAGTGTAGCTGTAATGCTTTTTTACCAAATTGGGGAACTTCTGCAGGATATTGCTGTTGACCGTTCGAAAAGGTCTATTAAAGAGTTAATGAATATTCGTCCCGATTATGCTAACTTAAAAATTGGATATGAAATAAAGAGGGTTTCACCACAAGAAGTAAGACCGGGAGACGTCATCATAGTAAAGCCTGGTGAAAAAATACCACTTGATGGGAAGGTAATCGAAGGGGAATCGATGGTGGATACTTCTGCATTAACAGGAGAATCTGTTTTAAAAGAGGTTTATAAAGGCGCGGACGTTTTAAGTGGCTTTATAAATAAAAATGGACTTCTCACAATAGAAGTAACCAGAGAGTTTGCAGAATCAACTGTTTCAAAAATACTAGGACTTATTGAAGAGGCTAGCAGTAAGAAAGCTCCTACAGAAAAATTTATGACAAAGTTTGCCAAATATTACACTCCTATTGTTGTTTTTTTGGCATTGATTATTGCAGTAATTCCTCCTTTAATTATACCAGCAGCAACCTTCAAGGAATTTATATATAGAGCACTTATTTTTCTTGTAATATCGTGCCCCTGTGCACTGGTGTTATCGATTCCTTTAACCTTTTTTGCTGGTATAGGTGCTGCCTCAAAAAATGGCATCCTTGTAAAAGGAAGTAACTATTTGGAAGCGTTAAGCAATGTAGAAACTGTTGTATTTGATAAAACAGGTACCCTTACAAAAGGGGTATTTAAGGTGACGAAAATTAAATCTGTAAATGGCATGAGCAGGGATGCGCTTTTGGAATATGCGGCATATGCCGAAAGTTTTTCAAATCATCCTATAGCAGAATCCATTTTAAAAGCCTATGGGAAAGAAGTAGACAGATCTAAAATAAAAAAGTATGAAGAAATTTCAGGAAATGGCGTAAGAGCAAATATAGAAGGAAAAGAAGTCCTTGTGGGCAATGCTAAATTAATGAAGATGGGAAATATTGATTGTGTTACCGGTGACTCAACAGGCAC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_014964|303919:311856|303919_304615_+|WP_012268958.1|DBSCAN-SWA MGKKIFVVDDEIKILEVVKSYLEHEGFSVITETNGNNVLNTFKKEKPDLVILDLMLPGISGEELCKRIRQFSNVPILMLTAKVQESDKINGFSIGADDYLTKPFSPRELVMRVKAILRRTSDDVPLAEVMSFNNDDLVVDFKAHTVKKKGVVVNLTPNEFKILKFLIRNPNRVFTREELIEKVMGFDYEGYDRTIDAHIKNLRQKIEDDTKNPVYIKTVYGVGYKFGDGNV >NC_014964|303919:311856|306037_306286_+|WP_009053008.1|DBSCAN-SWA MMRMMYGWGWGYGIGGFIWSIVWMAIEIGLIVAAIYLIISLFRGTKNRNKERDAIEILKERYARGEISEEEYLERKKRLEEK >NC_014964|303919:311856|307416_309516_+|WP_012268960.1|DBSCAN-SWA MQNNNKSFILKGLDCASCAAKIEEGVKRIEGVTYANCDFVNSKLSVEIDDSYELEKTIKELKKLVKNIEPNVEIIEYENEKIKDDNELLRRGIRYGISAILFTVALIFNLSVYVKFTLFFISYIIVGGEVILTAGKKILKGQVFDEHFLMSIATIGAFVIGEYPESVAVMLFYQIGELLQDIAVDRSKRSIKELMNIRPDYANLKIGYEIKRVSPQEVRPGDVIIVKPGEKIPLDGKVIEGESMVDTSALTGESVLKEVYKGADVLSGFINKNGLLTIEVTREFAESTVSKILGLIEEASSKKAPTEKFMTKFAKYYTPIVVFLALIIAVIPPLIIPAATFKEFIYRALIFLVISCPCALVLSIPLTFFAGIGAASKNGILVKGSNYLEALSNVETVVFDKTGTLTKGVFKVTKIKSVNGMSRDALLEYAAYAESFSNHPIAESILKAYGKEVDRSKIKKYEEISGNGVRANIEGKEVLVGNAKLMKMGNIDCVTGDSTGTIIHVAIDNKYCGYILISDEVKEDSPKAIESLRKMGIKRIVMLTGDNKAISDKIAASLRIDEVYSELFPNEKVGILEKLYANNKKGKLIFVGDGINDAPVLARADVGVAMGGIGSDVAIEAADVVLMTDEPSKLVTAIKISKKTKLIVWENILLALGVKIVVLALGALGVPTMWEAVFADVGVALLAVLNALRVLTGAV >NC_014964|303919:311856|306517_306613_-|WP_081448161.1|DBSCAN-SWA MKCHAPSIEVSSKVMPAKTSAETECTTFKPR >NC_014964|303919:311856|307030_307396_+|WP_009053006.1|DBSCAN-SWA MKEKGNKAEACEVTIIHEDIVNKVKEIMPEETKLYDLAELFKVFGDTTRIKILCALFESEMCVCDIAALLGMSQSAVSHQLRVLKQNKLVKFKKEGKVVYYSLADDHVKKIFEQGFNHINE >NC_014964|303919:311856|309686_310625_+|WP_009053004.1|DBSCAN-SWA MSEREDKIYEDITQLIGNTPMIRLNKIVPENAAEVIVKLESFNPGGSVKDRIALNMIKRAEEEGRLKPGGTIVEATSGNTGIGLAMVSAVKGYKLILVMPDTMSIERRNLLLSYGAELVLTPGAEGMKGAIKKAQEILELNPDYIILDQFKNSANPEIHELTTAKEILKDTNGIVDAFVAGVGTGGTISGVGKVLKQYNKDIKIFAVEPEESPVLSGGKPGPHKIQGIGAGFIPDTLNLDVIDEIIKVKERDAFEMSMKLAKQEGILCGISSGANVFAAIEVANRIGKGKRVVTVLPDTGERYLSMHKFFEY >NC_014964|303919:311856|304607_305963_+|WP_012268959.1|DBSCAN-SWA MFRNNLRTRTAIVFISIALISIVIVSITTNILIINSFGNYVTKSTDKEFSNIANTLAAVYKSEGGWKSTTGREIGHAAMMEGYGLRLRDKDGKIIWDFSSMSYMMNMMGKWNKKNISEKTLPIIVDEKTVGYVDIIYYGPIMMSDLDFKFLYDISRYNVIATVIAIFIALIISIYVSNYITRPLINITEVAKKLEKGDFTAKVYDIPKEEELFKLTAAINHLGESLKYQEILRKQMTSDIAHELRTPLTTLHSHIEAMLDGVWEPTYERLKSLNEEVLRLINIVKDLETLNKFESDMLKLNKIKFDASELVKSILTNFEASFAEKEQEVVKNIEDNIMLFGDKDRIAQVFVNLISNSNKYTPVGGKIKIDFYKDGDYAVFIVEDNGMGISKDDIPFIFERFYRGEKSRNRETGGSGIGLSIAKAIVLAHGGKINVESEINKGSKFIVKIPL >NC_014964|303919:311856|310701_311856_+|WP_009053003.1|DBSCAN-SWA MSTIYLDNAATTPVDKRVLEAMLPYYSDVFGNPSSLHSHGQEAKKAIEEAREKVAKALGADSEEIYFTSGGSESDNWALKGVAYALKEKGNHIITTEIEHHAVLHTCRYLEKEGFKVTYLPVDEYGLVKPEDLKKAITDKTILVSIMFANNEIGTIEPIEELVKIAHEKNIYFHTDAVQAVGNVPIDVKKLDVDLLSLSAHKIYGPKGVGALYIKKGVKIHSLIQGGTQEKNRRAGTENVPGIVGLGEAIELITKNLDSHINKLTFLRDKLINGILEKIPYTRLNGHPTKRLPGNVNVSFEFIDGESLILNLDMAGICASSGSACTSGSLEPSHVLLAIGLSKELARGSLRLTIGKDNTEEDIDKVLEALPQIVKRLRSISQIV |
8 | Streptococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
431877 : 480209
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_014964|431877:480209|DBSCAN-SWA AATGAGAAACGTAATGATTGTAGTAGAATATGACGGGACCAATTATCACGGTTGGCAATACCAAAAGAATGCAGTGACAGTTCAGGAGGTATTGCAAAAAGCAATAAAGAAGGTAACAGGGGAAGAAGTTAATTTAATAGGTGCGAGTAGAACTGATACAGGTGTCCATGCTCTATATCAAGTAGCTAACTTTAAAACTAATACTAAAATACCTGCAGAAAAGCTGCCCTATGCTCTAAACAGTGTATTACCCGATGATATAGTAGTTGTCCAAGCAAAGGATGTGGAAGACTCTTTTCACGCTCGATATAGTGCAAAAAGGAAAAGATACAAATACATTATTCTTAATAGGAAATTTCAAATGCCCACAATGAGAAATTATTGTTGGCATATAAGTTATCCTTTAAATATAGAAGAAATGAAAAAAGCTGCTTCTTACTTAATTGGGACTCACGATTTTTCTGCTTTTAAAGCTTCAGGAAGTAGTAAAACAAGTACTATAAGGACAGTGTATGATTTAACTATTGAAAAAAATGAAGATTTTATCAACATTGAAATAGAAGCCAATGGTTTTTTGTATAACATGGTGCGAATAATTGTAGGTACACTGTCTTATGTAGGTCTTGGCAAAATAAAAGAAGACGAAGTTTATGATATTTTAAAATCAAAAGACAGAACAAAAGCGGGCATAACTGCCCCGCCACAAGGATTGTATTTAATAAAAATTATCTATTGACAGTTGCAGTACTGTGAATTAAAATAATATTATGCGAAATTGTGCCCTGTGCTGGAAATTTACCACGGATAAGGAGGTTATATAGAAGATGAAGTCATATATGGCTAAACCTGAAGAGGTCAAAAGAAAATGGTTTGTTATAGATGCTGAAGGTAAAGTCTTAGGAAGACTAGCAAGCCAAATTGCTAAAATACTAATGGGTAAGCATAAACCAACCTATACACCTCATGTAGATACAGGAGATTTTGTAATAGTTTTGAATGCTGAAAAAATTGTGTTGACAGGCAACAAATTAGAAGATAAGTATTACAAATATTATACAGGGTATCCTGGAGGATTAAAAGAGGTTCAGTATAAAAAATTAATGCAGACGAAACCAGAGTTTGTAATATACCACGCTGTAAAAGGCATGTTGCCTAAAAACAGACTCGGCCGCAGAATGATTAAAAGATTGAAAGTATATAGAGGCTCTGAGCATAAGCATCAAGCTCAAAAGCCTGAAAAATTAGACATAGAATGAAAGGAGGATATCTTATGGCAACAGTACAATATTACGGAACAGGAAGAAGAAAAGAAGCTGTAGCGAGAGTAAGGCTTATGCCTGGAAAGGGAAATATAATAATTAATAATAGACCTCTGGAGGAGTATTTTACATTAGATACTTTAAAGTATACTGTTAAACAACCTTTAATTTTAACAGAAACAATAGACAAATTCGATGTATACGCAAAAGTATCCGGAGGAGGACTTACAGGTCAAGCGGGAGCAGTAAGACTTGGTATTGCTCGTGCATTAGTAAAAGTTGATAGTGAATTAAGACCTATTTTGAAGAAAGCCGGATTCTTGACAAGAGATCCAAGAATGAAAGAAAGAAGAAAATACGGACTCAAAAAAGCAAGAAAAGCTCCACAATTTTCAAAGAGATAAAAGAGCCTTTGGCTCTTTTTTTTGTTATGTAAAAACAACAAGAACAATCGTAATATAGAGAATTACTTAGTATTTTAAAGATATTAAAAGAAAAGAGCTGATATTTCAATAAAAAACGATAAAATAGCATTATATACTACTTGAGTCTATTAAAGAATCATGGTATATTATATTTCGTCGCTACTAAAGCGACAAAATCAAAGCGACAAAAGGACTTGACAGGAAGCTGAAGATTTGATAATATAGAGGAGCTGTGGTGAGGCAGAGAGGGACCTTGAAAAATGGACAGTGAGGCGGAAAAGGTGTAGAGAAGAGTAAGGAAATGAACCTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGGTCCGGCACTCAACTAAGTGCTTACTTAAGGGGAAGGAAGTATAGTAGAAGAAGAAAGTAATAAAAGTGGTGCAAAGTAAGGTAAGCACGGAGTTGAGTGCCGGATAGCGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTGGGCAACCTACCCTTAAGACCGGGATAACACCTCGAAAGGGGTGCTAATACTGGATAAGCTCCTTGTAGGGCATCCTATGAGGAGGGAAGGTAGCGGGAGCTACCGCTTAAGGATGGGCCCGCGTCCCATCAGCTAGTTGGTAGGGTAACGGCCTACCAAGGCGACGACGGGTAGCCGGCCTGAGAGGGTGGTCGGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATCTTGCGCAATGGGCGAAAGCCTGACGCAGCGACGCCGCGTGAGCGAGGAAGGCCTTCGGGTCGTAAAGCTCGATAGTGTGGGAAGAAGGGATGACGGTACCACACGAAAGCCCCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAAGACGTAGGGGGCGAGCGTTGTCCGGAATTACTGGGCGTAAAGGGCGCGTAGGCGGCCGTTCAAGTCAGGTGTAAAATACCCGGGCTCAACCCGGGGATAGCACTTGAAACTGGGCGGCTAGAGGGCAGGAGAGGGGAGTGGAATTCCCGGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATCGGGAGGAATACCAGTGGCGAAGGCGACTCTCTGGACTGACCCTGACGCTGAGGCGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGGGTACTAGGTGTGGGATGCGGAAGCATTCCGTGCCGTAGTTAACGCAATAAGTACCCCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGGCTTGACATGCAGGTAGTAGCGAGCCGAAAGGTGAGCGACCTTACCTTAAAGGTGAGGAGCCTGCACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCTGCCTCTAGTTGCCAGCGGGTGAAGCCGGGCACTCTAGAGGGACTGCCGTGGACAACACGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCATGCCCTATATGCCCTGGGCCACACACGTGCTACAATGGCCGGTACAGAGGGAAGCGAAGCCGCGAGGTGGAGCGAAACCCAAAAAGCCGGTCCAAGTTCGGATTGCAGGCTGCAACTCGCCTGCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCATGCCGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCACGAGAGTCTGCAACACCCGAAGCCGGTGACCCAACCGGGAAGGAGGGAGCCGTCGAAGGTGGGGCAGATGATTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTATCGGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCTAAGGAGAGAGGCCTCACTGTTCATTTTTGAGGGTAAAGCCCTCGAGATAACATGGTTCATGGGGGTGTAGCTCAGTTGGGAGAGCACCTGCCTTGCAAGCAGGGGGTCAGGAGTTCGAATCTCCTCATCTCCACCATGGGCTTATAGCTCAGATGGTCAGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAGGTCGATGGTTCGAATCCATCTAAGCCCACCATGTTATCTATTTATTATAAAATGTAAGCAAAATTAAGGACCTTGAAAACTGCACAAAGCCGGAAAGGTCAAGTGAGGTAAGGGCATATGGTGGATGCCTCGGCACTTGGAGCCGAAGAAGGACGCGGCAAGCGGCGAAACGCTCCGGGGAGCCGCAAGCGGGCGAAGATCCGGAGGTCTCCGAATGGGGGAACCCACTCGAGGTAATACTCGAGTATCCACTGATGAACACATAGTCAGTGGAGGGGAACCGCGCGAACTGAAACATCTAAGTAGCGCGAGGAAAAGAAAGAAAGGAATCGATTCCCTAAGTAGCGGCGAGCGAAAGGGGAGGAGCCCAAACCCGGCACTCAAGTGGACATGGAATTATAGGCAAAAAAGATGATATAATACGTGTCCACTTGAGTGCCGGGGGTTAGGACCCACCGTAAAAGTGAGTGAGTACTCTAGGCGAACGGATCTGGAAAGGCCGGCCGAAGAAGGTGAAAGCCCTGTAGTCGAAAGGGGAAAGCTTGCTGGTGGGGACCAGAGTACCACGGGATAGGCGACCCTGTGGGAAGGCGGGAGGACCACCTCCCAAGGCTAAATACTACCAAGTGACCGATAGCGGATAGTACCGTGAGGGAAAGGTGAAAAGAACCCCGGGAGGGGAGTGAAAGAGAACCTGAAACCATATGCCTACAAGCAGTCAGAGTCTGCCGTAAGGCAGATGATGGCGTACTTTTTGTAGAACGGGCCGGCGAGTTACGGTAGCAAGCGAGGTTAAGCGGTAAGCGGAGCCGAAGCGAAAGCGAGTCCGAAAAGGGCGAAAGTTTGCTGCTGTAGACCCGAAACCGTGCGACCTACCCATGGCCAGGGTGAAGCCGGAGTAAGATCTGGTGGAGGCCCGAACCACGTTGGCGTTGAAAAGCCATGGGATGAGCTGTGGGTAGAGGTGAAATGCCAATCGAGCACGGAGATAGCTGGTTCTCCCCGAAATAGCTTTAGGGCTAGCCTCAGGGTAGGACCTATGGAGGTAGAGCACTGAATGGGCTAGGGGCCAAGGAGGTTACCGAACCCTATCAAACTCCGAATGCCATAGGTTAATACCTGGGAGTCAGACTACGAGTGATAAGATCCGTAGTCGAGAGGGGAACAGCCCAGACCTCCAGCTAAGGTCCCAAAGGGCATGTTAAGTGGTAAAGG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41 | Bacillus_phage(25.0%) | coat,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
865495 : 873783
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_014964|865495:873783|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_014964|865495:873783|867129_867375_+|WP_003867938.1|DBSCAN-SWA MIKASELRDKDVIDINTGEKLGNIIDIEVNLEEGRVEGIVIPKETSFFRFFNKDIEIYLPWESIKKIGTDVILVDFKDREA >NC_014964|865495:873783|867971_868676_+|WP_003867940.1|DBSCAN-SWA MAHTVLVIEDEIHILELLRYNLEAAGYKVITSENGKEGLDKAFEGKPDLVILDLMLPDVDGLEICKILKKNDETKNIPIIMLTAKSEEFDKVLGLELGADDYITKPFSVRELLARIKAVLRRTQQPEEEKEEIIKFGDIVIDTGKHLVYKKGKVLELTLKEFELLKLLSQNMGKVLTRDYLLDKVWGYEYAGETRTVDVHIRHLRKKIEDDDKSPVYIETVRGIGYKLNDKGEA >NC_014964|865495:873783|873033_873783_+|WP_012269192.1|DBSCAN-SWA MKKIQVKDLDLFYGDVQALKKINLDVEANSVLALIGPSGCGKSTFIRTLNRMNDLIEGVKISGTVLLDGQDVYKEVDVIELRKRVGMVFQKPNPFPMTVYDNVAYGPRIHGIKDKKKLNEIVEKSLKAAALWDEVKDRLDKSALSLSGGQQQRLCIARTLAVEPEVILMDEPTSALDPISTMKIEELINELKNKYTIIIVTHNMQQAGRVSDYTAFFLNGELIESGPTDRVFYNPKDKRTEDYITGRFG >NC_014964|865495:873783|872104_872992_+|WP_003867944.1|DBSCAN-SWA MKSKLYDKIANIYFYVVAVFLILLLVSLISYILYQGRTKLNIDFLTSPPKFMEAGGGIGPQLFNSLQLLIITLIISVPIGLGAGIYMAEYAKPGLLTEIIRLSAETLSSMPSIVVGLFGLLVFVTMTGWGYSLVAGALTLTVLNLPVMTRVSEDSIRSVPNSLREASYALGATKWQTIVKVVVPAAMPGIITGIILTAGRIFGEAAALLYTAGMSSPALNFSNLNPSSPTSPLNIFRPAETLAVYIWKVNSEGLAPDARQIADGAAAVLLLMVLIFNILARWLGNTLYKRMTGEK >NC_014964|865495:873783|866290_867061_+|WP_004402381.1|DBSCAN-SWA MNNKVEICGVNTSKLPVLKPSKQKELLQRMKNGDKKAREEFINGNLRLVLSVIQRFNNRGEYVDDLFQVGCIGLIKAIDNFDLNQNVKFSTYAVPMIIGEIRRYLRDNTPIRVSRSLRDIAYKALQVRDKLVSENSKEPTVGEIAKELDLPREEVVMALDAIQEPVSLFEPIYHDGGDAIYVMDQVSDDKNMDEVWLEKIALKEAIQKLSEREKMILTMRFFEGKTQMEVAKEIGISQAQVSRLEKAALNHMRKYI >NC_014964|865495:873783|867442_867919_+|WP_003867939.1|DBSCAN-SWA MKCPYCGYPDSKVIDSRPTDDNTSIRRRRECLKCGKRFTTYEKVEQLPILVIKKDNRREVYDRDKILKGMIKACEKRPVPIKVLEEITDEIDKRIINSMEREITSTEIGEMVMEKLKNVDEVAYVRFASVYRQFKDINTFMDELKKLLKENETKKEKT >NC_014964|865495:873783|871208_872108_+|WP_003867943.1|DBSCAN-SWA MTVDKNYERKRKLVNSFGKAIVFISALLLIIITVSLFLFVASKGLSTFIKDGISIKEFLFSTTWKPDREVPAVGALQFILGSIYVSVFAIMISAPIGVSSAIFMVEIAKKLGQKILQPAIEIFVGIPSVVYGWVGLTVLVPFISKHFGGLGFSLLAGILVLTIMTLPTITSVSTDAIKSLPTEIREASYALGATRWQTIRHVILPAAKPGILTAIVLGLARAFGEALAVQMVIGNRPVIPKSFLEPMSTITSIITMDMGNTVMGTVWNDALWSLALLLLMISFTFIIVIKLVGRRGMYK >NC_014964|865495:873783|870127_871012_+|WP_012269191.1|DBSCAN-SWA MLKSRFAKVVIAVLLIASFFTFAACGSKQPQSNNSTTTTDNLSGKITIAGSTALQPLAEQAAKMFMEKYPNVVITVQGGGSGTGLTQVVQGAIDIGNSDIFAEEKLDANTAKSLVDHKVAIVGFAVVVNKDVTVDNLTQQQLIDIFTGKITNWKDVGGSDEKITVILRPASSGTRATFKKIVLKGQEEAEGLALTEDSNGAVKKAVADTKGAISYIGLAYIDDTVKVLKYDGVEPTAQNIIDGKYPIWSYEHMYTKGEPTGAVKAFLDFMMSDEVQKELVPKVGFIPVSEMKTK >NC_014964|865495:873783|865495_866221_+|WP_003871580.1|DBSCAN-SWA MQLKTKVKIEMLLLWKKILDFLDLSEGIFYIGGSEALPPPLSVEEEIYLISKMEKGDNEAKTVLIERNLRLVVYIAKKFENTGVGIEDLISIGTIGLIKAINTFNPKKKIKLATYASRCIENEILMYLRRNSKTKLEVSFDEPLNVDWDGNELLLSDILGTDNETVYKYIEDEVEKELLTSALKKLPDREKKIIGLRFGLEGGVEKTQKEVADMLGISQSYISRLEKKILKRLKKEMNRLV >NC_014964|865495:873783|868675_870046_+|WP_012269190.1|DBSCAN-SWA MLKKSYCKLFFINLLGILIVAIFFLGYVPMTKFIFAILLGILVTFFLSYRFIKNIVEPIKEITEITKDIAKGIYSHRLESDSIDEIKELSLAVDSMSYKLKETIEELNDRNAKLEAILKSIVNGVIAFDNNEKILLINDAARKILNIKEKDLIGRHILEIVRNSKLHDFFEDVKKNKNSPSKSLELNVFNKHLKVYTSPILHPISHQNLGFVLIIDDITEMRRLEKIRSEFVANVSHELRTPLTSIRGFIETLRNGAIDNPQARDKFLDIIDFESERLTRLINDILTLSEIENVKEGYPKEEIELDNEIEDILYIMDKVARNKNITLKKDLNCTDLVIKTNKDRFHQMMINLIDNGIKYTPEGGFVKVSTREEGDKIIVTVEDNGIGISKENIPRLFERFYRVDKSRSRKLGGTGLGLAIVKHIVESMKGEIFVESEVGRGTKFIIKFNKTDLTKT |
10 | Bacillus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1367188 : 1421749
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_014964|1367188:1421749|DBSCAN-SWA 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MEKEEVLEIFSKLGVINKGHFLLTSGKHSDTYLQCAKIFQYPKYSEIFSKELALKFKGHEIDVVIGPAIGGIILAYEVARQVGAKALFAEREEGVMKLRRGFEIKEGENVLVVEDVVTTGGSVKEVINLVNSLKGNVIGVGSIVDRSDGKVNFEVPFKSVVSLYVETYEKEECPLCKEGIPLVKPGSRKF |
53 | Pseudomonas_phage(13.33%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1740426 : 1749204
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_014964|1740426:1749204|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_014964|1740426:1749204|1746322_1746571_-|WP_003866810.1|DBSCAN-SWA MLIAKVYITLKKGILDPQGKAVKGALYSLGYEEVKEVRVGKYIELTFEDGDLSLLKDKVDEMCKRILTNPIIEDYTFEIVEG >NC_014964|1740426:1749204|1746572_1747280_-|WP_003866811.1|DBSCAN-SWA MEKRELLYEGKAKKVYKTDEENLYIIEYKDDATAFNGLKKGTIAEKGIVNNKVSAILFALLDKNNVPTHYVKRLSDREMLVKKVEIFPLEVIVRNYAAGSICKRLGLEEGLKFKTPVLEFSYKNDELKDPMINEYHIQALELATKEEIEIMTGMTFKVNEILSEYFLSKDIILVDFKLEFGKSSEGILLADEISPDTCRFWDKNTMEKLDKDRFRKDLGKVEEAYLEILKRLGGM >NC_014964|1740426:1749204|1743441_1745643_-|WP_012269567.1|DBSCAN-SWA MDKIWRELGLTDEEYEKIISILGREPNITEIGMYSVMWSEHCAYKNSKPLLKYLPTKGERVIQGPGENAGVLDIGDNLAVVMKIESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIFTMGARPIALLDSLRFGIPDDKRTKYLIENVVAGIADYGNCIGIPTVGGDTYFEESYKGNPLVNAMCVGIVEKDKIKKGIAKGIGNPVMIVGATTGRDGIGGASFASQELSEESEEKRPSVQVGDPFMEKLLLEACLELFETDAVVAIQDMGAAGLTSSSCEMASRGGVGMELDLDKVPLREKGMTPYEIMLSESQERMLVVVEKGKEEDVQKVFKKWGLNAATIGKITDDGMIRVIKEGKIVAEVPAKSLAEDAPQYIREEEVPKWQEDVNKLNINEVKPPEDMNKALKDVISSLNIASKEWIYSQYDYMVRTDTAITPGMDAAVVRIKGTKKAIALTTDCNGRYCYLDPYIGSQIAVAEAARNLCMVGAKPIGVTDCLNFGNPEKKEIYWQLKNSIFGIAKACETLQIPVVSGNVSLYNENEEGAIYPTPVIGMAGLIEDVSKICTMDFKKERDVIIILGENKGEIGGSEYLKVCFGMVKGQPPQIDLEEEKRLQELVLKLIDKGLINSSHDISEGGFAAALVESAISGKKGAKISLQTSLREDIELFSESPPRALITVSPEKVEEVLKIAYEYQVPAQKVGVVEGKKIAIEVNGKKIIDLPLEVLEESWRGRIKWEMERN >NC_014964|1740426:1749204|1745645_1746320_-|WP_003866809.1|DBSCAN-SWA MKFAVIVFPGSNCDVDCYYAVKDGLGEEVEYVWHQEKNLSKYDVIMLPGGFSYGDYLRAGAIARFSPVMEAVREEAEKGKFIIGICNGFQILTEAGLLPGALRKNEGLKFICNTVSIIVENDKTPFTTRLKKGQEILLPIAHGEGNYYVDDKTLKELKENNQIVFRYKENINGSVERIAGVINKKGNVLGMMPHPERAYAPLLGNTDGLYILGSIMDNFVKGGV >NC_014964|1740426:1749204|1740426_1741041_-|WP_003866805.1|DBSCAN-SWA MNLVVMASGNGTDLQSIIDAIEEGYINARIIAVISDKKGAYALERAKKHGIATYCLPKKELKENFQRELLKLLEKLNPDGIILAGFLTILSGEIVERFENKIINIHPSLIPAFCGKGFYGMKVHQAVYEYGVKYTGCTVHFVDSGADTGPIILQEVVKIDEEDTPEAIAKKVLEVEHKVLPYAVKLFTEGKLKVEGRKVKILKF >NC_014964|1740426:1749204|1742065_1743463_-|WP_012269566.1|DBSCAN-SWA MGNGEKLKEECGVFGAFSLSTSVTSYIYYGLQALQHRGQESSGIAIYDGEKINCIKGLGLVSEVFNKENLKTLEGKMGIGHVRYSTTGSNDIINAQPLVANFKNEYMALAHNGNLINAEELRGQLEEDGRIFQTTTDSEIILHLIAKNFQKGLIEALLETIKQIKGSYALVILTDNKLIGIRDVNSIRPLCIGKKDDTYFLSSESCAFDVIGAELIRDVEAGEIVIIDGKGIDSVKLEVEEKKKPCVFEYIYFARPDSVIDGKSVYFTRLEMGKRLAEEAPVDADLVVPVPDSGIAAARGYSLKTGIPMGEGLIKNKYIGRTFIAPDQRDRETGVRIKLNVLKELVQGKRIVLIDDSIVRGTTMKRLVSLLKSGGAKEVHVRISSPPVKYSCYFGIDTPTKKELIATRMSVEEICKLIGADSLQFLSIEGLIKSVGLKSICTGCFDGNYPMYVLKEGSKYLFEKK >NC_014964|1740426:1749204|1741037_1742048_-|WP_003866806.1|DBSCAN-SWA MNYKDAGVNIDEGNKLVEMIKPIAKKTLTDNVLEGIGGFAALFEIKNYKNPVIVSSTDGVGTKLKIAFMMDKHDTVGIDLVAMCVNDIIVTGAKPLFFLDYFATGKLKSEVAVEVIKGIAEGCKIAGCALIGGETAELPGFYKEGEYDLAGFCVGIVEKEELIDTKSIKEGDAIIGLASSGIHSNGYSLVRKVFFEKNNFSVKDFIPELGMNLGDALLTPTKIYVKSIEALKELKIKGMAHITGGGFIDNIPRILRKSIAAKINKGSWKIPTIFNLIQRLGDIEEREMYRTFNMGIGMVVIVDPSDVDKALEKLNGIGEKAYVIGEIVESEGGVIL >NC_014964|1740426:1749204|1747299_1747761_-|WP_003866812.1|DBSCAN-SWA MPKVAIVVGSKSDLPVVERCTKILEELEIPYDVKVLSAHRTPFETQEFAVNADKYYDIIIAGAGKAAHLPGVIASYTLLPVIGLPIKSSILDGLDSLLSIVQMPKGVPVATVAIDGAENAALLACHILSLKYTYLKKTLADYREKMAEEVLNN >NC_014964|1740426:1749204|1747821_1749204_-|WP_003866813.1|DBSCAN-SWA MEKVSKVRNKNSLENLANRIWRLENYNTNVKTEILAGITTFITMAYIMFVNPIILKEAGMDAGAVFVATCLSAAIGTFMMAFYANYPFAQAPGMGLNAFFTYTVVLTMGYTWQQALAAVFFSGIIFILITLFGIREMIVDAIPMSLKYAVSGGIGLFIAFIGLKNAGIIVANQATYIGFGDLTNPGTLLAIAGLFITAILMSRNIKGSILLGILITTVLGLFTGIVKLPSDFSVIKMPPSLAPTFLKLDIKGLLGIGENIGFISLVTSVLYVVLSFAFVDLFDTIGTFIGTGSKAGMLDENGKMPNMKKGLMSDAIATTIGSLLGTSTVTTYVESAAGIAEGGRTGLTAFVTGILFLVALFFSPIALLVPTEATAPALIIVGVLMMGSIKKINFEDFTEAMPAFLTIIAMPFTFSIANGIAAGLIAYPIVKIASGKAKEIHPMVYFLAILFILRFITLSE |
9 | Synechococcus_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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