Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_014829 | Bacillus cellulosilyticus DSM 2522, complete genome | 6 crisprs | csa3,DinG,WYL,RT,cas3,DEDDh | 0 | 8 | 5 | 0 |
1. NC_014829
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_014829_1 | 472384-472571 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_014829_1
|
3 spacers
spacers of NC_014829_1
>1.1|472409|26|NC_014829|CRISPRCasFinder TAATAAATAGCACTGAAAATAGTCTG >1.2|472460|36|NC_014829|CRISPRCasFinder GACTCGAAACTCTTGAAAAAGGGGGGATTTCCTTTG >1.3|472521|26|NC_014829|CRISPRCasFinder TGCCACGAAATTAGGTCAATTTTGAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014829_1
The CRISPR arrays of NC_014829_1 >merge|NC_014829|1|472384-472571|CRISPRCasFinder AATAAACGGAGAAATTCCGCTTATTTAATAAATAGCACTGAAAATAGTCTGAATAAACGGAGAAATTCCCCTTATTGACTCGAAACTCTTGAAAAAGGGGGGATTTCCTTTGCATAAGCGGAAAAACTACCCTTATTTGCCACGAAATTAGGTCAATTTTGATTTTAAACGGAAATTCTCCGCTTATT >NC_014829|1|1|472384-472571|CRISPRCasFinder AATAAACGGAGAAATTCCGCTTATT TAATAAATAGCACTGAAAATAGTCTG AATAAACGGAGAAATTCCCCTTATT GACTCGAAACTCTTGAAAAAGGGGGGATTTCCTTTG CATAAGCGGAAAAACTACCCTTATT TGCCACGAAATTAGGTCAATTTTGAT TTTAAACGGAAATTCTCCGCTTATT
>NC_014829.1|WP_013487056.1|470884_472063_+|CamS-family-sex-pheromone-protein MKRKLSIVCISFLLLLTGCIPTLDRGEEEIIVVEQTEETEEQHFVITPTIDTPENYYRNLLPDGIYHRSEARGTVAHTMNNRIDMNQFELGLMEIATARYSQEDFYFQEGELLTGNTINSWLRRYNPNEDRYRFGLNPPLGEGDDLEEQMRKSPIVLSHVMEHNYVQRNDDGEIMLGGIVIGLSLNSVYYFRTEDEEGRYYFHEEPIEPEDAEAAGKEMAEQVVERIRARDGLENVPITIALYQEERRGAIVPGTFISMAHISGEDAFINDWEEINEQFFFFPSSNARTVHPNLSNSFGQFKDEVEEFFGRSMGIVGKGRYKNDALDELTIEFNLQSHGKAEIIALTQFVSGKVSSLFTFDAPINVYINSVNGPEAIIIQYPGEDPYIHVYK >NC_014829.1|WP_013487055.1|468831_470844_+|NAD-dependent-DNA-ligase-LigA MAKDDIKQEIDRLTNILNDYAYHYYVLDQPKVSDAEYDQLLHELTKLEEAYPEWKRDDSPSERVGGQPLEHFSKVQHDVPMLSLSNAFNEEELRDFDRRVRQGLGHEPTYSCELKIDGLAVTLKYEQGRFVQGATRGDGTVGEDITSNLKTVPSIPLRLKEAVTIEVRGEAFMPKRSFIRLNEAKEKNGEQLFANPRNAAAGSLRQLDPKIAAKRSLDIFIYSVGKVEGEDIPSHHGALNYVKELGFKTNEHQKHCKTIDEVIDYCESWLSKRADLPYEIDGIVIKVDALADQEQLGFTAKSPRWATAYKFPAEEVVTTLLDIELSVGRTGVITPTAILEPVSVAGTTVQRASLHNEDLIRELDLKLGDKVTIKKAGDIIPEVVNVLVEQRTGEERDFSMPTQCPECHSELIRIEGEVALRCVNPKCPAQIREGLIHFVSRNAMNIDGLGERVITQLFNHKLIEDVADLYKLERQLLLNLERMGEKSVDNLLRAIEASKENSLEKLLFGLGIRHVGAKAAKTLAQHFNTIDQIQNATREDLEAINEVGEKMADAVVTYFETPEVKELISELEALDINLEYKGPNINVSDDANNAYFSGKTVVLTGTMEQMARGDAKKEIEARGGNVTGSVSSKTDLLIAGEKSGSKLKKAQDLNIEIWDEARFLEELTKE >NC_014829.1|WP_013487054.1|466536_468819_+|DNA-helicase-PcrA MERIKQQLLDGLNKEQGEAVKHGDGPLLIMAGAGSGKTRVLTHRIAYLIGEKGVPPWSILAITFTNKAAREMKERVARIASTAEEIWISTFHSMCVRILRRDIDRIGTSRNFTILDSGDQLTVIKRILKELNIDVKRYEPRSILGTISSAKNELKTPKDYEKTASGPYELTVLKVYEAYTKELKKNQALDFDDLIMTTIKLFKQVPEVLEYYQRRFRYVMVDEYQDTNRAQYVLVKMMADRHQNICVVGDSDQSIYRWRGADIQNILSFENDYPNVNVIMLEQNYRSTKKILQAANEVIENNSNRKPKKLWTQNDDGEKIKFYEADSEHDEAQYVVGKIKEATDSGRYRASDISILYRTNAQSRVMEEMLVKSNIPYTIVGGTKFYDRKEIKDLLAYLRLVANPDDDISFRRIINVPRRGIGATTLAKIDDYAARNDLSIFQALQEVRHIGLSPRFEKTLTEFIEQINGWVQMQDYLPVTELVDELLDKTGYREMLKNEKNLEAEARLENINEFLTVTQEFEKTSEDKTLVAFLTDLALIADIDKVDDDGNQEDQVLLMTLHSAKGLEFPLVFLIGLEEGVFPHSRSLMEEAEMEEERRLAYVGITRAEQELCISRARMRTLYGRTNMNPPSRFLNEIPDDCVEHVNPKEDNSMPDWMKTTRSHTSSGTGAHFSSSNRRGAARPTNTAAPRGTVTQRSKTTVTGGQSFDWAVGDKASHNKWGVGTVVSMKGDGENIELDIAFPAVGVKRLFAKFAPITKQ >NC_014829.1|WP_013487053.1|465780_466467_+|heptaprenylglyceryl-phosphate-synthase MKQYKEWKHAFKLDPNKEISDEDLELLCESGTDGIIVGGSDGVTEENTIDLLMRIRRYSVACALEVSNLYSIVPGYDYYFIPSVVNTTNATWINGLHHRALKEYGHLMNWDEVVTEGYCVLNQSSKVAQLTDANTELDSEDVIAYARMADKLFHMPVFYLEYSGKYGDPDIVAEVKYVLEHCRLFYGGGIESFEQAKEMAQHADTIIVGNVIYTDIKEALKTVNAVQE >NC_014829.1|WP_013487052.1|464710_465016_+|hypothetical-protein MQINKLRGKELDQLFEAILSLKDLEECYQFFDDLCTMNEIQSLAQRLEVARMLMEGYTYQRIEKDTGASTATISRVKRCINYGNDGYKFTLERVHGELKEK >NC_014829.1|WP_013487051.1|463568_464651_+|DUF3048-domain-containing-protein MKRLILTVFVISLFFLVACKSEEETAKEEPREEEKVEIIESEEPEEEPLPPFPLTGLGSEEGEFEYRAFGVMIENSMSARPQSGLYQADVVYEVLSEGSITRLLAIYHSQQPERIGPVRSARSYYVHLNKGFDAIYASAGGSPGGLQLAESDYVDNISGLVYDGRFFSRSTDRVAPHNMYTTYDDLKAATDHLGYEWERQPPSLYFVDELEENAGEKVDYFEVKYGSTNNDVQYEYDEQLKKYVRYNGGQPTEDLETGEAVAPKNVFIVEMSHRVIPKEENHIDAGSNRREIDVESGGRAYLMQEGTLQEVEWKNVDGIILPFKDDQQVPFLPGQTWVNIVPTNGGGLESYVSLSNNTVD >NC_014829.1|WP_013487050.1|461782_463531_+|adenine-deaminase MVKGFSHYWTKREIRQQLEVIRGNLAPTKVITNAKWLNSVRKCWNKGNIWIYNDRIVYVGDQLPKLMPHETEIFDASSKYAVPGYIEHHAHPFQLYNPLSLAQYASERGTTTLINDNLLFFLHLSKKKALTLLDNLQKTPATLLWWARYDSQTELHNEEEVFAYSNMRTWINHPYVVQGGELTGWPSVLNGDDSILHWMQETKDVKKPIEGHFPGASEKTLTQMALLGVDGDHESMTGEDVIRRLDMGMTASLRYSSIRPDLPNLLSELHEAGLDQYESLLMTTDGSTPSFMKNGMMEHLIKIALDNGVPFMDAIAMCTYNVAKHYHMDDMLGMIAPGRIANINFLSSTEDPLPTDVLAKGQWVRKQDTPCFPNIDMSWNEYDLSPLNIDWDLQESDFHFSLPVGVEMANDVILKPYRIISDLTRETLSEENDECFFILVDRSGKWILSTAIKGFGKSLYGFASTFNHTGDIILIGKSKQGLLKAFDQLKKQQGGIVLLDEDKMVFSMNLPLNGMMSEETMEKVMEQEATLKEALKGRGYRFNDPIYSLLFFASTHLPYVRVTQKGIFDVKKKKVLFPSIMR >NC_014829.1|WP_013487049.1|461391_461673_-|DUF2892-domain-containing-protein MKQNIGTLNALIRITCGFSILAWATAKLVRRSNETMPLLLAMMGAMKVAEGFTRFCPLTYIAEQSMDKNNDNTSYRSTHHTESANGSEPINPT >NC_014829.1|WP_013487048.1|460978_461302_+|hypothetical-protein MSIKKLLWKLFFIIISLGAQFGITFLVYEQLNTHHFFDVMFFTAILFVVITIFFSSSGGFNMAHYKAERIYSQKSFKMERFSMNVNSFVISSVLFLIIYILLEVFVR >NC_014829.1|WP_013487047.1|458957_460232_+|phosphoribosylamine--glycine-ligase MKVLVVGSGGREHALCWKLKQSSKVTEVYAAPGSAGIAEDGIFNVDINENDHEGLIAFAKEQSIALTVVGPEAPLVSGIVDFFQAEGLTVFGPTKAAATLEGSKQFAKEIMKKYDIPTAAYEVFTDVEEAKAYVRKQGAPIVVKADGLAAGKGVIVAETEEQALVALDDIMGARTFGDAGASVVIEDCLRGEELSLMAFVHGETVLPMVPAQDHKRAFDGDAGPNTGGMGAYSPVPHIDANLVAEAEATILRPMAKAMVAEGVPFTGILYAGLMMTEDGPKVIEFNARFGDPETQVVLPRLETDLVDVIESTLSSKEIELEWTDKACAGVVLASEGYPGSYPKGTPMSVPSDVVEGQKWFHAGTKKTADGWATNGGRVILLSSLGEDLHAALEKTYEVLNAHEWEGLFYRSDIGSRAVNLSNKK >NC_014829.1|WP_013487057.1|473079_473370_+|Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln)-amidotransferase-subunit-GatC MARISKEQVEHVANLARLEFTNEEIDMFQQQLDDIIGYAEQLNELDTSNVKPTSHVLDIKNVLREDEVKPSLEREKVLKNAPDHEDGQFKVPSVLE >NC_014829.1|WP_013487058.1|473384_474842_+|Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln)-amidotransferase-subunit-GatA MSLFDHKIADIHELLHKKELSVTDLVNESYNRINQVESKVDAFLHLTEELARAKAKELDEQLGAIQTLEGTLFGLPIGIKDNIVTKGIRTTCASKLLENFEPQHNATVVNKLADARAITIGKLNMDEFAMGSSNENSGYKLTRNPWDLNRVPGGSSGGSAASVAAGEVLFSLGSDTGGSIREPASFCGVVGMKPTYGRVSRFGLVAFASSLDQIGPITRNVEDNAYVLQAISGHDKMDSTSANVDVPSFTNGLNGDIKGLKVAVPSEYIGEGVSSEVREQVMQALKTLESLGATWEEVSLPHSKYATAAYYLLASSEASANLARFDGIRYGVRVEEENLIETYRKSRSEGFGDEVKRRIMLGTFALSSGYYDAYYKKAQQVRTLIKQDFENVFEKYDVIIGPTAPTTAFKIGEKTDDPLTMYATDILTIPVNLAGVPAISVPSGLAGGLPVGLQIIGKHFDEATVYRVAYAFEQATNFNEQKPKL >NC_014829.1|WP_013487059.1|474855_476289_+|Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln)-amidotransferase-subunit-GatB MKYETIVGLEVHVELKTKSKIFCGCSTEFGAPPNTHTCPICLGHPGVLPVLNKQAVEFAMRAAMALNCEVAEVTKFDRKNYFYPDNPKAYQISQFDKPVGEHGWIDIEVNGETKRIGITRLHLEEDAGKLTHVDGMGHSLVDFNRVGTPLIEIVSEPDIRTPEEAYAYLEKLKAIMQYIEVSDCKMEEGSLRCDANISLRPVGQEEFGTKTELKNLNSFAFVQKGLAYEQERQAEVLSSGGEILQETRRWDEKANKTLLMRVKEGSDDYRYFPDPDLVEFHIDAAWREKVEKQIPELPDARRKRYINELDLPAYDASVLTQQKSVSDFFEACLAEGGPAKPVSNWVMGEVSRYLNAEEKEIEDIPMTPKSLVNMISLIEKGTISSKIAKQVFSELMENGGDPEEIVKDKGLVQISDEGEILKMVNDVLDQNPQSVDDFKAGKKKAVGFLVGQIMKASKGKANPQLVNKMLVEEMNKR >NC_014829.1|WP_013487060.1|477021_478251_+|cellulase-family-glycosylhydrolase MKKITTIFVVLLMTLALFIIGNTTAADDYSVVEEHGQLSISNGELVNDRGEPVQLKGMSSHGLQWYGQFVNYESMKWLRDDWGITVFRAAMYTSSGGYIEDPSVKEKVKEAVEAAIDLGIYVIIDWHILSDNDPNIYKEEAKDFFDEMSELYGDYPNVIYEIANEPNGSDVTWDNQIKPYAEEVIPVIRNNDPNNIIIVGTGTWSQDVHHAADNQLTDPNVMYAFHFYAGTHGQNLRDQVDYALDQGAAIFVSEWGTSAATGDGGVFLDEAQVWIDFMDERNLSWANWSLTHKDESSAALMPGASPTGGWTEAELSPSGTFVREKIRESATTPPSDPTPPSDPDPGEPEPDPGEPDPTPPSDPGDYPAWDPNTIYTDEIVYHNGQLWQAKWWTQNQEPGDPYGPWEPLN >NC_014829.1|WP_013487061.1|478805_480272_+|endoglucanase MKKLTTIFIVFTLALLFVGNSTSANNGSVVEQNGQLSIQNGQLVNEHGDPVQLKGMSSHGLQWYGQFVNYDSIKWLRDDWGITVFRAAMYTSSGGYIEDPSVKEKVKEAVEAAIDLGIYVIIDWHILSDNDPNIYKEEAKEFFDEMSALYGDYPNVIYEIANEPNGHNVRWDSHIKPYAEEVIPVIRANDPNNIVIVGTATWSQDVHEAADNQLDDPNVMYAFHFYAGTHGQQLRNQVDYALSRGAAIFVSEWGTSAATGDGGVFLDEAQVWIDFMDERNLSWANWSLTHKDESSAALMPGANPTGGWTAAELSPSGAFVREKIRESASIPPSDPTPPSDPDPGEPDPTPPSDPGEYPAWDPNQIYTNEIVYHNGQLWQAKWWTQNQEPGANQYGPWEPLGDAPPSEPSDPPPPSEPEPDPGEPDPGEPDPGEPDPTPPSDPGEYPAWDPTQIYTNEIVYHNGQLWQAKWWTQNQEPGYPYGPWEPLN >NC_014829.1|WP_013487062.1|480331_481192_-|hypothetical-protein MSILSKQTDKTYCRTEYDTLKRVVLCEPKHMHIREQINDTQKHFANEGLHIELAMEQHQHFVKALEKHGVEVILLPPNSKYPEQVFTRDIGFTLGQTTFVAEMAHGARIGEENILKEWLESKEIPYYNLLGDMVEGGDVIINGHQIFIGLSNRTNQNAINHIQKLLHEYEVITVPFTEKYLHLDCVFNIISENEALYFPRAFDKKEEKILAKHFDLIEVNEEEQFTLGTNVLSIGKKRIVSLPINREVNQQLRIRGYEVIEVDITEIIKSGGSFRCCTMPLVRAKD >NC_014829.1|WP_013487063.1|481414_481897_-|hypothetical-protein MSKFIHRFFISVLSVVIFSAILAGYTYLFSSGEQLGFGLLLGIYSFYTAPVFILGGIPATYIVDFFVKNRNTEVRTKLEAYCRNFALYALAGIAVAMVYSAITSLANGNFFFTLGDSLLSIVIGLAAAAVYYNISLLLQINWEKMKEQYEKEQQANESNF >NC_014829.1|WP_013487064.1|482148_483063_+|diacylglycerol-kinase MKRCRLIYNPSSGREQVKKQLPYILEQLEITGYETSTHATTGKDCAKKAARLAAERGFDLVIAAGGDGTINEVVNGLAEQPNRPMLGVIPAGTTNDFARALHIPRDIREATDVLCNGTEQYVDVGKVGGQFFINIAGAGTLTELTYEVPSKLKTMIGQVAYYVKGFEKLPRIRPTEVTIEYDGKWFEGEIMLFLVSNTNSVGGFEKLAPKAYLNDGLFDLLILKKTNLADVVRVVSAALRGEHIHDDCVIYVQASRIKIHSKTEMHLNLDGEYGGDLPGEFTNLHNHIKMIVPNKKLAVFQDLY >NC_014829.1|WP_013487065.1|483279_484182_-|hypothetical-protein MIKLSQEKYALAVHYIHHYARPIDRALFEYHFNSGSSLEVMQQLQFYQNEDGGVGHGLEPDIRSKFSSPIVSTVALQYAREVKASWEHPFIQSVMKYFTDTYYSFETWPLKLSHMNEFPHADWWKHSEDVTSFQANPGVEIVGYYHAYPQAIPEQLFHIFQESVFQHLDNQHKTPEYHEVLCYLRLVEEMPDPGKTMIVEYLRDSIRDIATLDHTQWGGYCAKPLSLAPSPNAAMFNALEDVIQKNLDYEINNQKEDGSWEPFWEWGQYKDEWETRVKQEWKGYLTVQMLKTLKNYERIE >NC_014829.1|WP_013487066.1|484430_485366_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MSSYALEVEGLTKIVGGNKRIVDEATFQMDKGEILGLLGPNGAGKTTTIRMIVGLISKSEGKVIINGRDLDSEGQRCKEEIGAIIENPAFYDHMSGFKNLKQYARMARQEITDERIMDVVKLVKMDHAIHDKVKKYSLGMKQRLGVAQAILHKPAVLILDEPTNGLDPQGIRDLRDYLKILAQQGTSTLVSSHLLSEMQLMCDRVAIMEHGKIIDVSSISALNDNGDEDELIVSFKVKQLDEASALVEKSELEVTNVADENNSLQLKMKSEMIPKINKLLVENNIDVYAIESAKTSLEEKFLKLTTVSEKG |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_014829_2 | 568335-568522 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_014829_2
|
3 spacers
spacers of NC_014829_2
>2.1|568360|26|NC_014829|CRISPRCasFinder TAATAAATAGCACTGAAAATAGTCTG >2.2|568411|36|NC_014829|CRISPRCasFinder GACTCGAAACTATTGAAAAAGGGGGGATTTCCTTTG >2.3|568472|26|NC_014829|CRISPRCasFinder TGCCACGAAATTAGGTCAAGTTTGAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014829_2
The CRISPR arrays of NC_014829_2 >merge|NC_014829|2|568335-568522|CRISPRCasFinder AATAAACGGAGAAATTCCGCTTATTTAATAAATAGCACTGAAAATAGTCTGAATAAACGGAGAAATTCCCCTTATTGACTCGAAACTATTGAAAAAGGGGGGATTTCCTTTGCATAAGCGGAAAAACTACCCTTATTTGCCACGAAATTAGGTCAAGTTTGATTTTAAACGGAAATTCTCCGCTTATT >NC_014829|2|2|568335-568522|CRISPRCasFinder AATAAACGGAGAAATTCCGCTTATT TAATAAATAGCACTGAAAATAGTCTG AATAAACGGAGAAATTCCCCTTATT GACTCGAAACTATTGAAAAAGGGGGGATTTCCTTTG CATAAGCGGAAAAACTACCCTTATT TGCCACGAAATTAGGTCAAGTTTGAT TTTAAACGGAAATTCTCCGCTTATT
>NC_014829.1|WP_041808552.1|567483_567984_-|L,D-transpeptidase-family-protein MPFFHTVLPGETLNQIAIDYRTPLTTIINANPNLDPNVIYPGQSIVIPGFPPLNTIPYVIDVSIRGRSLILLKDGVQQKQYSIAVGRILHETPTGKFIIINKAPNPGGAFGTMWMSLSKQHYGIHGTNDPSSIGNAVSKGCIRMHNQDVEELASIVPIGTPVVIRP >NC_014829.1|WP_013487133.1|566448_567189_-|MerR-family-transcriptional-regulator MGMKVKEVANLVGISIRTLHHYDEINLLTPDEITNSGYRLYSDKDLEKLQQILFFKELGFPLKKVKEIIDCPTFDRERALELQRKSLLEKRSRLDKMIKTIDKTMRHAKGEINMSNKEKFEGFDFHNNRYEQEARERWGDQAVDESKAKIANMPGDPEAIVTEIYSKLAALRHQSPQSAEAQSAIKEWFDCLNKNFGNYSLEAFKGLGQMYVDDERFTQNIDKMGEGLAQFMCDAMVHFADTTKNK >NC_014829.1|WP_013487132.1|564538_566119_+|peptidase-M3 MAVEQFLQTQNEKIRELYRGITNASWKAQTTGDKEWAQKVGEAQTQFRTYFSDKELYETVTSYLKMDNLSALQKRQLEALQKTLRENQLPKDILKELSQLSAELNHMFNTYAPEVDGKKLSANDIRNILLNSDDVQERENAWKASKEVGQVVEGKLLTLVRKRNEAAKAVGFDNYHQMSFKNQELDREEIFSIFQKLIDDSDKAFRALKAELDEEIASKFNITVEEIRPWHYVDPFFQEAPASEETNLDPYFKNEDLNKLTADTFSAMGIPIDDLYAKSDLLPREGKNPTAFCTDMDREGDTRVLCNNEPNAYWMGTMLHEFGHAAYFKYLDRELPFILRSPAHTLTTEAIAMLFGKMTQNKEWLKTFLKLEDSKLDELAPALEKHEQLMMLIAGRWIITFVFFEKELYENPEQDLNGLWWKLVSEIQLVNPPEGRDLPDWAAKIHFTLAPVYYQNYLLGELTSAQLHHYINKQVSDQFFTPEVGQVLNEQFFKLGSKYHWNEKIERVTGEKLNPEYFSEAYCKIK >NC_014829.1|WP_013487131.1|563887_564370_+|hypothetical-protein MKKVLLFCLVSVLIVLSTGCFGTGEESSTKEIDDPVEAAVYYYYDSLQKENYDEALSYLASDYLTYLNISERDYVNIFKDMRTLEDWRIEEISVRSIDEIDDDITVPFALEPLLVTSGDNYIVIVDISISIHGETSGVVDNVLVAEDNNGEWKIFGIVSF >NC_014829.1|WP_013487130.1|563028_563703_-|response-regulator-transcription-factor MKILLVEDDKTIASGLEYSLQQDHFDTVLCYDIQSAQKIINHEISSIDLCLFDLSLPDGSGYELCKLVKQKSDTPVIFLTAYDDEVNVVMGLDMGADDYITKPFRIRELLSRIKSVLRRYNKQTTIIKLHNIQINTLEGKVYKNGEEIIITALEYRLLLIFANHVGQVLTREQLLERIWDVAGDYVNDNTLTVYIKRLREKLEDNPQKPTLIKTVRGLGYKVGD >NC_014829.1|WP_041808550.1|562025_563003_-|HAMP-domain-containing-histidine-kinase MLLVIMIFISIAATAATLYFSVEAAIIVAITTILLIVSTIAFTIWRYREIRKLSSYLRKISSGDYSLDVRDNKEGELSILKNDIYKVTLMLSEQRAVLMTDKSKLTDAISDISHQLKTPITSMMVMSDLLSDSKLTAEKKKEFTRNIRVQLERIEWLVSSLLKLSKIDARTIQFKRDTVQVKQLIDKAVDPIRIPMDIQEQTLSIVGEETVSFIGDLNWSAEALLNILKNCVEHTKSGGNIHITFSENALFTEIIIRDNGVGIAKEDVPYIFKRFYKGKNASDESVGIGLAMAHSIITSQNGTIEVQSECNSGTTFNVKFYKQVI >NC_014829.1|WP_013487128.1|561242_561926_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MEIVKVENLSKVYGKGDTAVKALDNVSLTINKGEFVAIIGPSGSGKSTLLHLLGGVDRPSSGKVFIDNTDIYSLNETQLAIFRRRQIGLIYQFYNLIPILTVEENITLPILLDEHKVDKDHFSKIVDVLSLNDRLNHLPNQLSGGQQQRVSIGRALISNPAIMLADEPTGNLDSKNSSEIIDLLKLFNKTYYQTLVVITHDERIALQADRVISIEDGRIAKDEVIRK >NC_014829.1|WP_013487127.1|558639_561246_-|FtsX-like-permease-family-protein MNIVNKLTLRHLKENKRRTLVTIIGTIISVAMITAVSTLSVSFLDLMQRHQIANNGEWHVQYENVNPEQVETMKNDDNTKDVFLTRDKGYAYLESSENEFKPYLFISEFNREGFEYFPISLVEGVLPSSNNEIIISEHIESNANVRFSIGDELILEVGKRVNEADNLTDMGQTQSFVKMDDESLEKIVNTTKETYTVVGIMERPMWEPLWAPGYTVISYLNEDTLTANDRVNASVLLKDVNQSLYENAELFAEENNISLDSIDYNRHLLRYLGVTTFDTFRATLFSLSAIIIAIIIIGSVALIYNAFSISVSERSRHLGMLSSVGATKKQKRNAVFFEGAVIGLISIPLGLLAGIGGIGITFIFINSFIEDALSIQAKLTVTVTPLSILTACIVSIITIFISAYIPAQRASKVTPIEAIRQTSDIKVTRKKVKTSNIVRKLFGIEGEIGLKNLKRNKRKYQVTVFSLIISIMLFLTVSFFTESIERSVELSNQGVNYDIELYTGEELTSEVGTIFEELKRLDGVTDYTHTTEIQSLRTWINERNLSDSLLEMVTDHPDILTDGKYQYFINIYGLHEDSFHKYTEEIGVSAEQIIWSQGLSAIVVDTHTYQDWETGAFIETKAVKTSVGETIPLFYEDWETNEELHVFDIEVAALTDTLPMGIRSSNMGGLNIIVHASILEQYMTEDFPYYPIHNLYLTSDHPMETQQQIEEIKTDSMSVYNYYQTRQQDKQAMLIISIFIYGFIVLITAISIANILNTISTSISLRKREFAMLKSVGMTPKSFNKMIRYESIFYGIKSLLYGLPISIGFMYLIHLAITQSFVYSFQLPWGSIMIVIVAVFIIVSATMLYSTSKVRKENIIETLKQENI >NC_014829.1|WP_157184251.1|557955_558366_+|hypothetical-protein MLIKKVKNKKVLLLVPFILVFTFALTYIPHSVVSMNPSGVSKITIFDGNTGSETVITEKDHIEYIITDLSDVTFQKGKSSFGYMGYSFNTKIYNEKGKVVKELIINSEDTIRYKGFFYTAKDELIDYDYIKNLVDN >NC_014829.1|WP_013487125.1|557375_557735_+|DUF4870-domain-containing-protein MTEVENKGEVELQPTSDEKTMATLIHVLGIFFGVFSTLIIWLIQKDKSKYVDHHGKQNMNWQLTLIIGYFASFILMFVLIGFLTIIAIGVLDLVFSILAAVAANKGERYKFPVAIPFIR >NC_014829.1|WP_013487135.1|568778_570953_-|RNA-degradosome-polyphosphate-kinase MKISTLVNTTHYNNRELSWLAFNYRVLEEAIDERNLLMERFKFLSIFSSNLDEFFMVRVAGLTDQVKAGFTKPENKAGLTPKEQLTLIAEKTQPLVKKQYETYEMLLSLLSKQGISLTQINSLSREELFFLEQYFDEQIYPVLTPRAIDAYRPFPMLLNKSLNLAIVIDGQDNEHEQITDLSGKLAIVQVPSVLDRYVLIPSFTNERKYILLEDLITTFIHKLFFGRSIKSVTSFRITRNADLTIHEDEAIDLLIEIEKELKKRKWGAAVRLEIKENEYDHNVLKYLKQRLGIHEKDTYIVNGPLDLTFLFTFYEEIGRFNPSLIDLPMVSQQPVDLEDNKKIFDVALKKDILLHHPYDSFQTVVDFISLAANDPNVQAIKQTLYRVSGNSPIIHALKRAAINGKQVTVLIELKARFDEENNVSWAKELEKEGCHVIYGMTRLKTHSKITLIVRRMEGKIERFVHLGTGNYNDKTAKLYTDIGLITSEEEIANDATRFFNYISGYCDKPEYHHFSLAPLDIRDDFIRLIEKEIRNHEGYGNGRIIAKMNSLSDKKIIDKFYEASSKGVKIDLIIRGICCLRPGIKGVSENITVRSIVGQYLEHSRIYYFYHNGEEKTFISSADLMTRNMENRIEILFPLLSTEIKDRVVSWLLLYLSDNTKARTQDRNGNYHYVTPLEGEPLINSQLAVSNRGFTPPIQKGFTHYFYTFKENIIKKFIKTNKHH >NC_014829.1|WP_013487136.1|571313_575771_-|bifunctional-metallophosphatase/5'-nucleotidase MFLKKTWSKGIIYWMILALVFSIVTPIQTVSASSNDDIVTLESTTEDNVTTGNEDLLDLTILHTNDIHSRIDELGKAAAFINAEREAAENSLYLDAGDIFGGSPVNDINLGEPIIEILNEMNLDALTIGNHEFDYGQDAFADRVIQSDFPWISANMTVSPEIPIEQPDPYTIFEFDDFDVAVFGLTQNPPATAPSGIVGIEFHNYVETALQYQDEMEAQADIIIALTHIGNSADRRLAESVDYFDVIIGGHSHSVINSPQVVNGTPITQAGGYASHVGKLNLSIDPETKEVVDVTGHLQSIDQLTETEENIQSIIDSWNIQMEDILQITIGESDTGLTRDGRNSRDIALGNFWTDAMVWATEADMAFTNNGGVRDSIEPGAITIGDIYRVEPFDNQVMLYEMTGQAIKDVIQYSYSRFRNVDLQTSGLHYTILTDENRYYSDAILELNGEPLNMEQTYIVALPDFIGTGGSGYHFVGEVIYPEVMPVTTAMIQYAEFLTEQGKRLNYESEGRISIILHSELEPTNPEPNDPPNSEVLDLTILHTNDIHSRIDELGKAAAFINAEREAAENSLYLDAGDIFSGSPVNDINLGEPIIEILNEMNLDALVIGNHEFDYGQDVFAERVIQSDFPWISANMTVSPEIPIEQPDPYTIFEFDDFDVAVFGLTQNPPATAPSGIVGIEFHDYVETALQYQDEMEAQADIIIALTHIGYGADRSLAEEVDYFDAIIGGHTHTTLSTPQVVNGTPITQAGGYASHVGKLNLSIDPETKQVIEVSGGLQEISSLSEVDEDVQAIVDHWNEQMDEILSIVIGETETGLSRNERYETDAPLGNFWTDAMAFAASADIAFTNNGGIRDSISPGDVTIGDIYRIEPFDNQVMLLEMTGEAIKNVIEYSYTRDGRNQIDLQSSGLHYTILTNSSGQYIDAILEINNEPINMNASYLVAVPDYIGTGGSGYHFEGEVLYNEVTPMTTAMIDYAEYLGLQGQKLNYHIEGRINIKIDPNADTPDGNTIGATTNGLYSDNKSAMDVGLGNLYADAVRSIANADIGLLNGSSVSGNIPAGDITIEQIEQLDRFGNEIVLVETTGAQLKEMILSQSNFHRNVDLQASGIHYILVKGDGPQTFSDVSIYLEDGTPIIEDAVYTVAYNDFMHNGGHYTLSNETIEIEPITVWEAVVEYVKAQEGPIDYVEGSRIYVEILAHPRVEEETIFISDDIVDKITKNSVLAINLHSDEFSSISKITFSQSQIDALRENNVNVYITTDFFTISFPAAMFSSGEVEFSFENVNEEEIDLTKIDEIGHLLSKVYNFTFLHNGQPFTQFGEYDVTLKLPLVHEFDNEENVSVYFYDKSEEQWTSIGGTLDNGVIQAQTNHFSMFAAFEFFEGTEQEPIDPVDPVDPIDPVDPIDPIDPIDHVDSTDSVDQNPEQDGSKESDKEDDIEKKIVEDEKKGSNKTLPDTATDVYQWLLAGLLLIFLGISLTLIRNRHKTV >NC_014829.1|WP_013487137.1|576111_577095_+|Gfo/Idh/MocA-family-oxidoreductase MVRFAVIGTNWITESFIQAGAQVDDFQLVAVYSRTKERAEEFAEKYNLKHTYTDIQALAKSPEVDAVYIASPNAFHAEQAITCMEHGKHVLCEKALASNSKEAKEMVKVAKQNQVLLMEAVKSTLLPNFFTVKEHLHKIGKIRRYVASYNQYSSRYDAYLNGTVLNAFNPKFSNGSLMDIGIYCIYPMVVLFGKPLHVKASAVLLESGVDGEGSIVMSYVDMEAVVMYSKITNSSQPSEMQGEKGNIILNNIHTPTKVEINYKDGTTEDVSLPQKETEMYYEVKEFVELIKAGKTESAVNSHENSIIVSEVVEEARKQTGVIYPADE >NC_014829.1|WP_013487138.1|577237_577969_-|aspartate/glutamate-racemase-family-protein MIFQAQKGQVYYGHKIGILMLDTFIPLIPGDVGNATTYDYPVLYRTLHKITAHKMVNKAPGVLEEIISKGKELVDNGAEAITGGCGFLLLYQDELRKALNVPVFLSSLLQIPFMLLMLNTNEKVGLITADSSLLKASLLREIGIAEIDRVEIVGLEKTEHFRECCMNESGTLNSDVLEAEVVTTAEKMVHTNPNIKSILLECSLLPPYAKAVQEAVHLPVFDYVTMINYVQASLNKTNFSGFL >NC_014829.1|WP_013487139.1|578158_579325_+|tryptophan-synthase-subunit-beta MSMREDEKRGYFGEFGGSFIPEELQKVMDILEENFENYRNDPEFIEEYKYYLKEFVGRENPLTYAKNISEKFGGAKIYLKREDLNHTGAHKINNVIGQILLAKRMGAKRIIAETGAGQHGVATATACAMFNMDCTVYMGKLDTERQALNVFRMELLGAKVISVDAGQGRLKDAVDAALGDLVENYENTFYLLGSAVGPHPFPSMVKHFQSIISEESKQQILEKEGKLPTAVVACAGGGSNAIGAFAHYIDEKDVRLIGVEPAEAPTLTEGVPAVIHGFKCLTLLDEDGNPRPTYSISAGLDYPGIGPEHSYLKESGRAEYVAVTGDEALEAFQLLSKEEGIIPALESSHAIAHAVKLAKELSKDDILIVNLSGRGDKDVEQVFKMINQ >NC_014829.1|WP_013487140.1|579506_579914_+|gamma-glutamylcyclotransferase MKKKHFVFCYGTLRKNESNHHLLKDANCICEHSLTEGKMFDTGYGYPVIIQDAISKVHGELYEITDEELDMLDRLEGYESRSAQHNLYERIRQKVITHKGEYEAFVYIEGVNQNLCTTYIEHGDWKVYRKNREDD >NC_014829.1|WP_013487141.1|580188_580893_-|DsbA-family-oxidoreductase MKIEIWSDFVCPFCYIGKRRLEIALDHFSNKHAVDVSFRSFELDRNAAPYSGKSIHEMLAEKYGMSIEDAIKANQGVAEQADSIGLTFQFENMKPTNTFDAHRLAKYAKSQEKEGELTEKLLSAYFTESKNVGDVETLTNIATSVGLDKGTVVEILDNKSSFADDVRADEELAKEYGVSGVPFFLIDEKYAINGAQPLENFIGALEKIWEEEHNKPKIRDLSLTKGNACSDDSC >NC_014829.1|WP_013487142.1|581255_581954_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MKPIVSVENVERSFGKGNKKVQVLNGINLTIDPYSVTALRGRSGSGKTTLLNLIGGLDKPTNGEIYFQEAPISEYSDTQSAEFRRKNLGIIFQSFGLVPLMTVEENVEFGLRIAGVPRKEWSERIKETIALVGLTKRAKHRQYELSGGEQQRVAIARALAPRPKLILADEPTAELDSKMAFHIIRVFQELTKNKETTIMMTTHDPGILEILDHVYTLEDGKIESAKQEQETK >NC_014829.1|WP_013487143.1|581919_582966_+|efflux-RND-transporter-periplasmic-adaptor-subunit MNLQNKSKKLNNTRILLSCLIALPLLLSGCSLLPQEEEMIAPPLVEPASVDYDLVEVQRGDITKKVTGTAYFVPVHSKNLFYEQSGGRLQHVEVKEGDIVEEGQLLAEIDTGNLVHDIEQLEIELAKADIRLKQVKGSGADSYSIELAELDKEGIELRLSQLRRQLATAQITSPIDGIITFVTAHKPGDYVDAYESIIQVADLSNLQLIYIASAANNISDVKVGMQVALQMNGEDMRGEVVQTPETVPEDVLENNSTQYSRSLLIDFPDGAPEDVQVGDSVSIEIVTERKEDTLVIPTNALREGFGRTYVHVLVDNRRRELDVEIGIESSTEVEILQGIEEGDEVILR >NC_014829.1|WP_013487144.1|582980_585842_+|FtsX-like-permease-family-protein MTIFKIIARKMLNNRWLTFSLFLGLLITVSLVSSIPTYTTAVMDKMLVSGFEEFYEKEETFPSTFSYSINLARDESIDRTEMLEEMEVLQESLIESTNIPTARDVTILSTSRLRVILAGDTEEEILTSGRVIALTDIEDHITITDGTLPSNRMEDGVIEAIVPERALTTRQMVLGNTFTIGEGEDAFKIKPVGTFTADSPRDPYWIVSAERYNSDFIILEDVYREEIVHNRELVETVRFVSAFDYTAIQSEHIPTLLSLDPIVKREVNRMMDTILLIDFEVEEILKTYNTQSAQLETVLWSLIAPVLIMLAIYLFMVSRLIINRQLNEIAVFASRGAKRIQILFIYFIEITILGTIAFFVGPYLGLLYANILGATNGFLEFVQRTALPTQVLPESFLYGFYAILASIMMVMIPVFVASKKSIVNHKQNLAASVNQYKWYSIFIDLSLIGVSIYGLYTFQRGQAVSGSSGEIYIDPTLFFLPAIFIIGFGLLLLRIYPLILKAIYKLGEKIWSISLYSTFLQVSRSSKQYQFFMMFLIMTIAIGVFSASAARTINTNLEEQILYETGADVALEVLWDYEVRDPDPMNVNARAPVSESNDEEEEGFEREGTTGVREVMYTEPPFEPFENLIGVEQATRVFQKEDVRAEGNGQRMPSVQLMGIEPKQFGETAWFKGNILPHHWYEYLNLLSAEPSSVLISSSVARSLGVQEGDYITLSWSESDTGQFVVYGIIDYWPSFNPNAQGGDNTPALVVANLPYVQNVMALEPYHVWLSVDENTSRSDLYQNIRDERLRVFRMHDVQPQIVELKNSGFLLGLNGTLSLGFIISIVITFIGFLLYWIVTIKSRTMQYGIYRAMGIPMRDLIGIIIWEQVMTSGVACFLGIIIGGITSQLFVPLLQYSFDSHTLAPPFRVVFDSSDEMKIYAFVGFMFIVGLSILVALLRKIKVHQAIKLGED |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_014829_3 | 1890531-1890717 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_014829_3
|
3 spacers
spacers of NC_014829_3
>3.1|1890555|27|NC_014829|CRISPRCasFinder CTAATAAATAGCACTGAAAATAGTCTG >3.2|1890606|37|NC_014829|CRISPRCasFinder TGACTCGAAACTATTGAAAAAGGGGGAATTTCCTTTG >3.3|1890667|27|NC_014829|CRISPRCasFinder TTGCCACGAAATTAAGTCAATTTTGAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014829_3
The CRISPR arrays of NC_014829_3 >merge|NC_014829|3|1890531-1890717|CRISPRCasFinder AATAAACGGAGAAATTCCGCTTATCTAATAAATAGCACTGAAAATAGTCTGAATAAACGGAGAAATTCCCCTTATTGACTCGAAACTATTGAAAAAGGGGGAATTTCCTTTGCATAAGCGGAAAAACTACCCTTATTTGCCACGAAATTAAGTCAATTTTGATTCTAAACGGAAATTCTACGCTTAT >NC_014829|3|3|1890531-1890717|CRISPRCasFinder AATAAACGGAGAAATTCCGCTTAT CTAATAAATAGCACTGAAAATAGTCTG AATAAACGGAGAAATTCCCCTTAT TGACTCGAAACTATTGAAAAAGGGGGAATTTCCTTTG CATAAGCGGAAAAACTACCCTTAT TTGCCACGAAATTAAGTCAATTTTGAT TCTAAACGGAAATTCTACGCTTAT
>NC_014829.1|WP_013488300.1|1890016_1890190_+|hypothetical-protein MIEQRRDTSKLYRRGVARSCGKGSYAERRSKRLADFYTESEFAQVSSTSTFKWPYIY >NC_014829.1|WP_013488299.1|1889273_1889681_+|hypothetical-protein MKTSTYAFSDDLHVNAYFFSEFIVCIDVTKSGQHVGSFCSDAKEFEDLDEEEFKSIIQQHVNGFDNSVSHRDYEKRELKHFDLYYYPFSDFMYCMDVYRLGEKVSSLCVDRDSFEEWMEDENHLLNVVEKLAFNG >NC_014829.1|WP_013488298.1|1888379_1888937_+|elongation-factor-P MISVNEFKTGLTIEVDGSIWQVVEFQHVKPGKGAAFVRSKLRNLRNGSIQEKTFRAGEKVAKAHLENRRMQYLYASGESHTFMDTESYEQLELPASQLTEQLKYLKENMEVQILTYQGETLGIEVPNTVELKVTETEPGIKGDTASGGTKAAVVETGLSVQVPFFINEGDVLVIDTRNGSYVSRA >NC_014829.1|WP_013488297.1|1887280_1888348_+|aminopeptidase-P-family-protein MERIEKLKAQFAEYNIDGLLITSTYNRRYMTGFTGTAGVAIVSESHAVFITDFRYVEQAQSQAVGYEIVQHSGPIHEEIATQLKRLGIKKLGFEKDHVSYSTYDTYEKVLETTLVPVSGLMERLRLVKDEKEIAIIQEAVDIADAAFEHIQTYIRAGVKEIDVSNELEFFMRKQGAVSSSFDIIVASGYRSALPHGVASDKVIEKGELVTLDFGAYYKGYCSDITRTVAVGEPSKELVNIYKTVLEAQLKGVQGIKPGMTGIEADALTRDHIKSKGYGEYFGHSTGHGLGMEVHEGPGLSFRSNTKLEAGMVVTVEPGIYIAGLGGTRIEDDIVITENGNKILSKSPKELIILGE >NC_014829.1|WP_013488296.1|1886682_1887189_+|hypothetical-protein MLSNTETNERQSEPALSFNGTVALIGFFGGLFWSIIGYVAFYFNFASVGPALALMPWALGDWKHGWMGHLVGIGFIAIVSIAVAFLYRLVFAKINQPWPGILYGVALWVVILGLFNPMFPELDPLFQLDVNTIITTLCLYLVYGLFIGYSVSYEYHERTQHEGQTIQN >NC_014829.1|WP_013488295.1|1886019_1886394_-|hypothetical-protein MLRNSFHPLTLTIIGLAIIGIGYRLVENPSAFFTMVLVAVGTATILIFVMKRFILPKLSGYQTAMRPQSAPSHKSQHGQKPISFKSMKKEKKKRISRPLVKRQSNVKLTVIEGKKNKKKNRALF >NC_014829.1|WP_013488294.1|1885212_1885980_-|hypothetical-protein MGVATIIFPSIFPLFVLLILICTSLVYWTKGRRIGFQLLYLTFLSICISYIILLNIPLFYTHQAYVPFTDPIVQTVVTIFLFFIPLCQSKKQITICLLLPIFFCIYSIVILQAPPISVVSGIIIGGFLVYTFYRTLDWIEGMPERLLLLFSIIFPLFLAIIIFPNIEHLFYPGILLGSAIGITVETLKVKVNNIPRSTTRMLFSVSLGTIGLIILYLMYMYTSSFIPMQEWISGLVIGIWVTLIVPYILSFLKNL >NC_014829.1|WP_013488293.1|1884289_1885183_+|patatin-like-phospholipase-family-protein MLKVDGVFAGGGIKSFSFVGALRVMKNENIEFERLAGTSAGAIVAAFIKAGFTVDEIESILDGLDLEELLEPKRTGVIFQFYKWIRLYRNMGIYKGALLEKWLEEVLMEKGVKTFNDLPPGSLKMVASDITTGQLLVLPDDLKRYGIIPETFSVARAIRMSCSLPFFFEPVKLQNSNGKHSVIVDGGVLSNFPIWLFSNSENKKPERPVVGFRLTPSMEMVSQREVSNAFSMLHSMVETMWKAHDLRHISKLHEKNIVFIPVDKIAATQFSISEEEKKELIELGEKSTEKFLKGWSY >NC_014829.1|WP_013488292.1|1883595_1884027_+|transcriptional-regulator-MntR MPTPSMEDYLERIYLLIEEKGYARVSDIAEALEVHPSSVTKMVQKLDKSQYLVYEKYRGLVLTAKGKKIGKRLVYRHDLLEEFMKIIGVDKDNIYEDVEGIEHHLSWDAIDRIGDLVQYFDENPEQVEQLRLVQKKNDELEGS >NC_014829.1|WP_013488291.1|1880692_1883260_+|vitamin-B12-dependent-ribonucleotide-reductase MTTYMSEKTINVEALNRDIEQFPQVFPITPDMKMKQSGVSRLVMLDRYTFKDTEKKTLKIGDFVVLTVKADPKFPARGYGFVVDINWPENRVKIAVEDEFLGVLDDPEEKETGIVDRSLDTIDKPLEVYYEQIAKRNARGLAEVEVDPQKQVESFEKFYHELVNMNFVPAGRVLYGAGAETDVTYFNCYVMPFVADSREGISEHRKQVMEIMSRGGGVGTNGSTLRPRNALARGVNGKSSGSVSWLDDIAKLTHLVEQGGSRRGAQMIMLADWHPDILEFIISKMQNPRILRYLLENTEDAQIQRLIKEKLSFTPLSELDEAMYQSIVNYKHIPGTGGFDPKIIREAEEKLSTGGTYSVNNSEFLTGANISVCITKEFMEAVDNDEDYALRFPDVENYNEKEMEAYNREWHEYGDVREWEALGFGVRTYRNIKAKELWNLINICATYSAEPGIFFIDNANEMTNAKAYGQKVVATNPCGEQPLAPYSVCNLAAVNLAEMADKDNKVVDFKKLEQTVATGVRMQDNVIDATPYFLEDNTKQAKGERRVGLGVMGLHDLLIYTETVYGSEEGNALVDKIFETIATTAYRTSIELAKEKGSFPYLVGNNEQETNHLRMKYINTGYMKKMPEDVRQGILQYGIRNSHLLTVAPTGSTGTMVGVSTGLEPYFSFSYFRSGRLGKFIEVKAEILQSYLERHPEADPNELPEWFVSSMELSPEAHADVQCVIQRWVDSSLSKTVNAPRGYTVDQVKKVYERLYKGGAKGGTVYVDGSRDSQVLTLKAEENDMYAVELAGEPEQDTEKKPVVLVDTIADVRSTSVTYGSEVGDTCPVCRKGTVEDIGGCNTCTNCSAQLKCGL >NC_014829.1|WP_013488301.1|1891098_1892031_+|stage-III-sporulation-protein-AA MKEVLNVLPESIRSLALQLPNEILNKTEEIRLRVNRPVEIRTHNKTYMLPNEKNPFIFKESEAGLMMSLLSQHSVYRLEEELKRGYLTISGGHRVGLAGRVVMEKGEVKGIRDISSFNIRIARQKQGVAYAYLPYIQRRGNWCHTLIIGPPKSGKTTLLRDLAREISIGSKSRKIEPKNVGIIDERSEIAGSVKGVPQHDFGVKIDILDACPKAEGLMMMIRSMSPEVLIVDEIGRKEDCEAIMEAVHAGVTIFASVHGENLNDVKSRPTIARLINEGFFQRVIELKVTTKEGLVRKLDVDRPRTGVGTP >NC_014829.1|WP_013488302.1|1892027_1892540_+|stage-III-sporulation-protein-AB MKLLGALLIIATTTMFGWEFSRRLTRRTKQIRYLKIAFEALETEMTFSMTPLPDACEKVAHQLIAPLNIFFEDVAERLKKEEKSATSIWNSSLKKWKGKTDLNTAELNILNQFGQTLGQQDLESQRKQIRLAISYFNQEEKQALEDQQKFESMYKSLGFLGGVLLVLIML >NC_014829.1|WP_013488303.1|1892560_1892767_+|stage-III-sporulation-protein-AC MNYDVSLIFQIAGVGIVVAMIHTVLKQMGKEEIANWVTLIAFVVVLYMVATVVDDLFQKIRSVFLFQS >NC_014829.1|WP_081457268.1|1892782_1893172_+|stage-III-sporulation-protein-AD MEIIQIVGLGMIATFLALVVKEHKPIFAFLLTVFVGVIIFIFLIDQIAMIIHMLEELAAEANINLAYVQTVLQIVGIAYIAEFGAQIAKDAGQGAMASKIELAGKVLIMVMAIPIISVIIETIVRLIPS >NC_014829.1|WP_013488305.1|1893184_1894366_+|stage-III-sporulation-protein-AE MMIKKSVFALIFLVTLFLLPFPVLAEESVQQEDELIERQLERLGIDEIRQFWDDVRHEYEGFLPESQRGSFMDFVTGDKQFSVGEWVNGFIRFLFHEIFANGVLLGTLVLLAVFSMILSQLQQAFEQHTISKVAYAITYMVLLIIALNSFRVTMEFAERTIEVMSNFMVSIVPILLVLMASSGSVTSVALFHPIVMFLVHTSGIFVQYVVLPLLFLSTLLYIISTMTDHYKVTKLAQFLRNIAVGSLGIFLTVFLGVLSVQGATAAIADGIAIRTAKFVTGNFVPVVGRMFTDAADTVMGASVLLKNTVGVVGLVILLLICSFPALKVLSVAIIYTFTAAILQPLGGGPIIKCLSIIGKQMLFVFGALAAVSLMFFLSITIIVISGNLSLMMR >NC_014829.1|WP_013488306.1|1894393_1895047_+|stage-III-sporulation-protein-AF MGIITSWITNIILLILFATILELLLPNSKMQRYVKLVVGLMLLMVMLNPILSIFQNDPEAWLDDISSWTNEPSEQTMSSMDAMQSEIEKENLARISEQVAVQLKNVAAKELEQQYEVVIRNIYLEFETFQEDEDLLDHLSDVDVFIQSLDEFEKEENEIKVVTIDPVEIMKEEKSIEEKEGIGNVPVDDIAELLSSTWAIPNEKIHVHVKSGADRDE >NC_014829.1|WP_013488307.1|1895221_1895878_+|stage-III-sporulation-protein-AG MGEKKGDNQLFRSLNLKTSGKKLNVKYLFILLLIGVLFMMIGTFMQSNEEPASSLPVVQDEIEEEESSEVFMSNDEPQELVTMSDYERFYERQLEDILEKVVGVSDVSVMVNLAESEKIVYEKDRNTMEQFTEESDREGGTREVQDKTQDEQTVIIRTGDQEEPLIVKTQKPDIRGVLVVANGAENIQIKTWIIEAVSRGLDVPSHRVSVLPKNSKEE >NC_014829.1|WP_013488308.1|1895881_1896475_+|SpoIIIAH-like-family-protein MVLKRQTVWLLTMLSLIVVLSAYYLTMPNMQDQEALGEEEEPGNDLEMNMDDIDEEDVTFIEIEEVEDVLAEGDFFSDASSVNEMFDTIRLRRADSRARLMTEFMEVFHSDGAASEVQLEALDRREALETLGQKEENLEELLRAKGYDDALVIAEENMVQIYVKADELTNVETVEILNLSRDHLGIEEIRVGYQSEN >NC_014829.1|WP_013488309.1|1897149_1897467_+|hypothetical-protein MEWSDLTDGAKAVLEQTRNIKNDKIQIVEFEVGFKQEVEDSDEEPISIQEEDYQSLKRFTQENEYGDKYHMARNKNIVKIILLEKGKIPDNLSEIPIFREYKNQN >NC_014829.1|WP_013488310.1|1897919_1898411_+|acetyl-CoA-carboxylase-biotin-carboxyl-carrier-protein MLKIQEIRELIKLIDESSIEEFKFEQEGSKVTLRKQIKRQESVQAPIETKAIPNPTVAVEPATITQQLKDEETKSEKKEVAKENVVTITSPMVGTFYEAPSPESSAYVKVGDKVNKDTVVCIVEAMKLMNEIEAEINGEIVEVLVENGQLVEYGQELFVVKPE |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_014829_4 | 3586778-3586852 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_014829_4
|
1 spacers
spacers of NC_014829_4
>4.1|3586801|29|NC_014829|CRISPRCasFinder TCTATTTTTTATGCTCAGGGGCAGATGGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014829_4
The CRISPR arrays of NC_014829_4 >merge|NC_014829|4|3586778-3586852|CRISPRCasFinder GCTGCTCCATCTTACCTTCTGCTTCTATTTTTTATGCTCAGGGGCAGATGGCGCTGCTCCATCTTACCTTCGGCT >NC_014829|4|4|3586778-3586852|CRISPRCasFinder GCTGCTCCATCTTACCTTCTGCT TCTATTTTTTATGCTCAGGGGCAGATGGC GCTGCTCCATCTTACCTTCGGCT
>NC_014829.1|WP_013489934.1|3584731_3586411_-|PucR-family-transcriptional-regulator MSLSVKDIVQLPIMKTSKVRTGKEWLKSRMVEWISVIEVPVENFVRKNEFVLSTGIGCEGDNLLLEKFVNDIIDSGASVLAFATGRYINDIPDRVIELANKHHLVLIEIPWEVRFGEILQIVLEEIHKEKQGERQQAEDVRQELINCVLHEKGLEDISSILYKHINMPIAIIDHSGQLRANKKFNEELLAVFNGEKKGTVQQIPSSDVLYSEHPLFHQMKEYLVHNHIFFLLPIVNNHHNQGSLLFHPVDREKLTTFVMNVLDHSLTACALYFVKENAVELTEVRLKDNFILELAQKYSEVTTQLISKAQLLGYDLARPYLCLVGEMTHNDRKKTLKVQGESLGSSSLQSRNYYLQKEITRAGKNLRRRTMTTFDEDEVIIFLEADNQPYMETANQFLDNIEERLYELLSHITFSWGIATHKDGHYAFHNSYEEAKTALKIGKQQKGLGERTFFSDTRINRLLMAISQEDAIATIVKDTLQPLLDYDEKRQTDLIYTFIIYNKYKGNVSQTARALNLHRQSLLHRLRNIESLTGLSLVDSDDLFLLELSVRLWMLKKFS >NC_014829.1|WP_081457326.1|3583307_3584567_-|M24-family-metallopeptidase MVIVTKDISLIKGGGASLLPFEMAEYQDRLRKTKERMVKSGVEVLLVTDPANINYLSGYDAWSFYVHQMLVVSLEDLQPVWIGRYQDANGARATTWIHDDNVISYPDYYVQSSFYHPMEYIAHKLEQMGHRKKYIGVEMDNYYFSAKAYDVLKTNLPDATFKDAGLLVNYVRLVKSDQEIEYMKKAGKIAEETMYKAVQSVKPGVRECDTAAQIYSQLISGTDEYGGDYPAIVPLLPSGRNTSIPHLTWSDRAYQEGDTVIIELAGCYKRYHVPIARTISVGSTSEQLKNISPVVVEGVNEVLNAVKPGVTCGELENVWRNSISKRGYEKEARLGYSIGLNYPPDWGEHTASIRKGDNTVLEPNMTFHLIPALWFNNYGIEISESFRVTENGCETFTNFPRDMIIHPPFMMNQHDGKIS >NC_014829.1|WP_013489932.1|3582034_3583222_-|cystathionine-gamma-synthase-family-protein MRDSKMGTRSIWAGERDYLAFGATQVPVVHSVSYGYEDMDEWYEVAIGNKKGHIYGRNTNPTVEAFEEKIRNLEDADAVTSFSTGMAAISNTLDTLLFPGDRIVSIKDTYGGTNKIFTEFLPKKKVEVVLCDTGDHEALEKEVEKGCKVLYLETPTNPTVKITDIERMAKAGKKVGATVIVDNTFATPINQNPLALGADLVIHSATKFLGGHADALGGAVCGSKDLVEAIYHYREINGATMDPMAAYLLLRGMKTLKLRIDKQNENALAIAKYLKTVDVVEDVFYPGLEEHIGHDIAKKQMRGFGGMLSFSVKGGMDTVRHFLPKLQFANRAANLGAVETIVGPARTTSHVECTPEERAAMGIPEGLIRYSAGIEDIEDLIGDLDQAFQSLPSKL >NC_014829.1|WP_157184322.1|3580800_3582012_-|amidohydrolase MLKTIAKCAENLKQELIEWRRYFHQYPELSFEESNTSDYIVRVLKSFGITDIETNIAEHGIVATISNGPGRVIALRADMDALPIQEKTNLKYASKNLNVMHACGHDAHMSMLLGASKLLNEEMKDDNLKGTIKFIFQPAEESANDEGLTGAPYFIKNGILDEVDAIISVHVCPWRKVGEIQVNEGPSMANIDNFELTISGKGGHGGYPHQTVDPIWISSFVLQGIYSLISRKIDPLHVGTISVGELKAEGSKNVIPEKVTIGGTIRSYKSTIRSQLIKELEAVAKICEAFGGTFDLTIQRGEPALYNDAAITRLMKKNAKRLYPDMKIIEEPFGMGGEDFGHMTAVVPGSMFFLGSAFEEKEFQLHTPQFQLNEKALPIGVAVLTACACDLINTEVRREADDN >NC_014829.1|WP_013489930.1|3579773_3580811_-|homoserine-dehydrogenase MTTKIAFIGFGGVGQTLAKLLYEKKDEFFKKYDLDFEVVAVSDVMKGSLYNPNGLNVSRLIETINKTGNLKAYSDESGLVRGMDSLETIKKSNADVIVEVTFTDVETGQPAIDHCKAAFKEGKSVVTTNKGPVALAYRELSKLAKENNAYWGFEGTVMSGTPALRLPLVTLAGNKIKEIRGILNGTTNYMITEMEKGCSYEEALKKAQNLGYAEADPTSDVDGFDARYKATILANYVMNTELKANDIPCVGIRNITNEKVSEALRENKVWRLIAKIKGDENGQVKASVQPELIEINDPLAGVSGATNAIVYECDLAGSIMLTGPGAGLTETAYSLLIDLLHFKNQ >NC_014829.1|WP_013489929.1|3578295_3579741_-|aldehyde-dehydrogenase-family-protein MHTDVLVEKMLIAGDWVDAEEFFHVYNPENNEIIAKVPLASNKQMLLAIDKGHSVLKNHAAWPTHERIRILNNVANYIEENKEKYARTIATEGSKTIKEARGEVKRTIQTIKISAEEARRVNGETINFDQMEGSENRVGYHYRFPIGVIGAITPFNDPLNLVAHKIGPAIAAGNPIVVKPASVTPLSALLLAEAFVKSGLPKGYLSVLTGSGKDIGETLITHPNVKMISFTGGLETGEKIAKQAGLKKVNMELGSNSPVIVLNDANQSEAVAACVSGAFSAVGQNCIGVQRIYVEKESYNQFLTALVEETTKLKVGDKLLESTDMGPLINEREAKRVEAWVNDALYRGAKLHTGGKRTGAFYEPTILTDVPEGAKIAKEEIFGPVVLVFPVNNVEEAVARSNSVNYGLQAGVFTNNIDNAYYTIQNMAVGGIMVNDSSDYRIDAMPFGGIKGSGLGREGVRSAIEAMTEPKVVCFQLQKWL >NC_014829.1|WP_013489928.1|3576780_3577863_-|inorganic-phosphate-transporter MFLTYVAIIIALFFAMNIGASGAAATMGPAYGAGAIKKKRLALLLVGLGAFLGAVIGSGQVVKTVGEGIIPANILSVEVVLIILFSATLTLFIANMIGIPLSTSEVTIGSIVGVGVAFQSLFVNNVLFIVSFWLIVPIAAFVIAYCIQKMISYFEKKYPGRLKGAKWKKILSILLILTGFVEAFSAGMNNVANAIGPLIGAGIMEETLGIWLGALFVALGALLLGGAVLETNGKKITKLSKLQGIAVSGTGGALVIVASIFGIPVPLTQATTSAIVGVGTAETGFQLWQKSVIQKIIKVWIVSPVMSLVVSFSLIHTLLMPNPYMMIIVISIFVTTFGSISLYRSTKEEKRSVHNEGGGI >NC_014829.1|WP_041809132.1|3576061_3576778_-|phosphoadenylyl-sulfate-reductase MSNQVLLYENLKDQDYADLNAKMKNDALHVIKWAYEQFNDDLVYACSFGAEGIVLIDLISKVKKDAKVVFLDTNVHFDETYELIEQMKKKYPSLRIELKQPEITLEEQADQYGNELWIKNPDLCCKLRKNTPLKSVLSGSKAWLSGLRREQSPTRANTQFVNKDDKFQSIKICPLIHWTWDEIWEYIHLFNLPYNKLHDQGYPSIGCSKCTFPVEEGEDLRAGRWSGSNKTECGLHTK >NC_014829.1|WP_013489926.1|3574902_3576042_-|sulfate-adenylyltransferase MTLSQPHGGTLIHRINEQYDYSDVFQTIEIDRTALSDLELIANGAYSPLKGFMSEADYTSVVQNMRLADGTVWSIPITLPISEETANSLKVGQKTKLSYEGTIYGIIELSELFTPNKLEEADHVYKTTETAHPGVKKLYDRGNVYAAGQITLVKVPKKESFATYYLTPIETRKTFENRGWKTVVGFQTRNPVHRAHEYIQKTALEIVDGLFLNPLVGETKADDIPADVRMESYEVLLENYYPADRVFLAVFPASMRYAGPREAIFHSLVRKNYGCTHFIVGRDHAGVGDYYGTYDAQLIFNHFTQEELGITPLFFEHSFFCKKCGNMTSTKTCPHSKEDRVILSGTKVREMLKNGETPPPEFSRHEVVQVLIRGMKVTV >NC_014829.1|WP_013489925.1|3574297_3574906_-|adenylyl-sulfate-kinase MSQQEKVENIHWHNTTVSKEDRQSLNNHKGSVVWFTGLSGSGKSTLANAVEKKLHDQGIRTYVLDGDNIRHGLNKGLGFQPDDRKENIRRIGEVSKLFVDAGIVVLTAFISPYREDRQLVRSLLESGEFHEVYTKCALDECERRDPKGLYKKARDGEIPAFTGISAPYEEPENAEVVIETDKELIDDSVNKVVAHLKELKVI >NC_014829.1|WP_013489935.1|3587281_3587896_-|SGNH/GDSL-hydrolase-family-protein MKLKQGDRIVFIGDSITHAGRNEDPNGLGFGYVKMISDELIKAGMHIKIVNKGENGDRVIDLADRWQEDVIDIQPDWVSVSIGINDVWRQLDQPSISQIYPEAFTNIYEDLLDQVKNKTAAKIILMEPTIIEEDVMSKGNELLKPYVHAVHRLVEKYDCIIVPTHYVFIEALRTKSHGALTTDGVHMTPEGDKLIAHTWLKSIR >NC_014829.1|WP_013489936.1|3587918_3588815_-|AEC-family-transporter MNIFTSVVLPVLLVFLLGFVVQKWKKVEIKPISTVAIYLMVPALVFRTFYTAELNIQYVYMIIFALVLLFSLILINKVYCRLMKYPVELESGLILSTAFKNAGNYGAPIILFAYGEVGFAFAVSYMVLQSIIMNVFGVYYASKGSAGMKSSVMAVLHMPATYAVLLALLLRYVPFQLPGNLFLTIDIIAEATIPTVMIILGMQLAKIKLGQFQWGHISYAVTVRLFISPLIAFFITLVLPMDPLLAKVLIVSAAMPSAATIVMYAIEFNAKPKLVSSVTLISTLLSILTITILLLLLQ >NC_014829.1|WP_013489937.1|3588973_3590224_-|glycosyltransferase MKVLYITEKVPYTPGTADQIRAVQQIEGLVQAGIEVDCLFCHEQHLYKLTSDKVLAKLFNTSTGNVWSTSLNKKRIRQKIMSLFNGTPFRFSAFHIPELKTVIKELIDEANYDLIQIQGRLAHNIIDLQIDIPVLVDYIDVDSTYYKQHIEKTQNKLKLLYYKEQFRRVCNIENSVYSNFKAGMVHSNKDKEQILKKVDYGKIKVIPTYLEETECEEHTSNRKVIVFSCMMNNQAEMEAANRLVKNIFTPLKRNIEDLECWIVGTHLPKKIETLEKIEGVKINNNVKDSHQFYSDAFAYVNPADFGSGYQYAALHAAVHKCPIVTTHVVNESIGLTDEKDAFICETDDQFIKSIIELLENQSLGKRFAQRTERYVKNIYKKDYSMMQLIATYKELVEESDDTVIHPKKDDSEKILN >NC_014829.1|WP_013489939.1|3590588_3591221_-|nitrate/sulfite-reductase MSEEKTIPLAVNGGIGFGAKLTPQQLVALGSYLDSNSEVEMTTFQQLIIHVKESHVDEVTHSLEKEGFSVYKVGSYVKSLRTCNFCKGAEEEGMPVAIELNRRIAGQEVPFTLRPAYTGCPNACGEPLINDIGVIKRNEHYELYIGGQAKGEDARTAVLLQDNLEPTQLYSLTDAVLELYRQNGRKRERMSKFIDRYGLENIKKHLKLGS >NC_014829.1|WP_013489940.1|3591345_3592371_-|LacI-family-transcriptional-regulator MSRRKVTMQQIAHTAGVSKYVVSKTLNGKPGVSDKTRQKILFVAKQLGYFKNNENVPMQPDSEPNDHTSFVLGVIPNRHYENQSSYWGKIIEGLSDGVHDKNWGLVIVTEEQPFKDMINTKGVKGIICVGHISTEMMLDLQQLHVPMVLVDHEDPLIAADSVFIDNYDGTYKLTKHLVTIGHENVLFVGDIGFASSFYDRFLGYRTALEQAGLQSSVQEPLKIAYTDQFAEQFSNWIEEEKGNQDFPTAFVCANDDIAQRVLETLHQHHIRVPEECSVTGFDNLDISLYTEPPLSTVQVLKEAIGKRAVEKLFWRFNHADFPIEKILIRGEIIIRRSVASK >NC_014829.1|WP_013489941.1|3592854_3594450_-|aspartate:alanine-antiporter MDVLSFLEDPLVLIFVILLLGSVLGQLSIKGLNLGASGVLLAAMVFGHFGYIIPSTVQNLGLSLFIVAVGLQAGPRFFKMIKSTGIVFGILGFLIVLIASITTIIVAQVFQLSAPLSIGLMTGALTSTPGLAAALEATNDPIASVGYGIAYPFGVIAVVLFIQLLPRMLKTDLKKDLKRTTGPVKHKGSPKSKMFKVENEQLHKKTLKELKLNQNSSVVISKVIRGDRSFLGRNDTVILKGDELIAVGFSEDLDTLKEKVGSEVRTRIEYKDNLKIKKIPVESEELIGKNLREIKLRANYGVNVTRMERGGFEFNQNPSWRFERGDILTVVGSERRLKLVENLFGKRQHSETNVHILSLSLILLLGIFVGMIPITIPGIGSMTLGVAGGPLFVAILIGHFGKLGPIHARFYQPSNRVIRDLGLVLFLAGAGTNAGSGLVEVVINEGFRLIIGGAIITIVPIFLGYFIAKKLFKLSIIHSLGALCGGMTSTPGLGACNNLIDTDDPAIAYAAAYPFALFFVALAAQVLALIL >NC_014829.1|WP_013489942.1|3594634_3595357_-|MBL-fold-metallo-hydrolase MKMTVVGFWHGYPEAGEATSGYLLEADEYNVLIDCGSGVISNVQKFCNLNDLKAIILSHYHHDHMADIGVFHYSQILTQSKEKKIIYGHTEDEEKFQKLHFQDLVVAKAFSEKHVLTLGPFNINFHKTVHPASCYAMRIERNGKIMTYTADTSYQEELADFAKNSDVLIAECSAYEENDVSQFGHMNSRDAGRLAQKAGVKQLLLSHLPHHGDHQQLKNEASKYFDGEILIASSGLSISL >NC_014829.1|WP_087942446.1|3595655_3598445_-|cellulase-family-glycosylhydrolase MVSAEEGDNGDDDDLVTPIEIEERPHESNYEKYPALLDGGLDERRPSEAGALQLVEVDGQVTLADQDGVPIQLRGMSTHGLQWFGEIVNENAFAALANDWGSNVIRLALYIGENGYAYNPDLIEKVYAGIELAKENDMYVIIDWHVHAPGDPNADIYQGGVNEDGEEYLGAKDFFLHIAEKYPNDPHLIYELANEPSSNSSGGPGITNDEDGWEAVREYAQPIVDALRDSGNAEDNIIIVGSPNWSQRMDLAADNPIDDHHTMYTLHFYTGTHEGTNESYPEGISSEDRSNVMANAKYALDKGKAIFATEWGVSEADGNNGPYLNEADVWLNFLNENNISWTNWSLTNKNETSGAFTPFILNESDATDLDPGEDQVWSMEELSVSGEYVRSRILGEEYQPIDRTPREEFSEVIWDFNDGTTQGFVQNSDSPVDVTIENVNDALQITGLDESNAIAGEEEDYWSNVRISADEWEETFDILGAEELSMDVVVDDPTTVAIAAIPQSSAHEWANASNSVLITEDDFEEQEDGTYKALLTITGEDAPNLTNIAEDPEGSELNNIILFVGTENADVISLDNITVTGDRESVPEPVEHDTKGDSALPSDFEDGTRQGWEWDSESAVRTALTIEEANGSNALSWEYAYPEVKPSDDWATAPRLTLYKDDLVRGDYEFVAFDFYIDPIEDRATEGAIDINLIFQPPAAGYWAQASETFEIDLEELDSATVTDDGLYHYEVEINIEDIENDIELRNLMLIFADDESDFAGRVFLDNVRMDMSLETKVEVLERNINELQEQLVEVEASNEEQIAQLETQIADLEAQLSDLADESVVADLLEVIASLEAQLNDLEAQVNELKSETGESTQSDSSAEESAEDEGSEASEADEEKQAAEEEKEGDRLPDTATNTFNFLIIGALLLMSGVAFFVIQRRKVATN >NC_014829.1|WP_013489944.1|3598983_3601890_-|cellulase-family-glycosylhydrolase MKKKLRKFLAVMMTFLLVATLFAPMVSAEENGNGEEEAPLVNPLPISQDPHVSNYEKYPALLDNGVPKASEGGALSLKEVNGQMTLVDKNNNPIQLRGMSTHGLQWFGEIVNENAFAALADDWGSNMIRLALYVGENGYATRPELINKVYDGIDLAIENDMYVIVDWHVHAPGDPRADVYSGAEEFFLTIAEKYPNNPNILYELANEPSSNNNGGPGITNDEAGWEAVKEYADPIVEALRNSGNADDNIIIVGSPNWSQRPDLAADNPIDDHHTMYTVHFYTGTHNGTNDSYPEETPSDKRSNVMANAKYALDNGVAVFATEWGVSEANGDNGPYLNEADIWLNFLNKNNISWANWSLTNKNETSGSFTPFQLNVSEATPLDPGDGQVWTKEQLSLSGEYVRSRIIGEEYEPIDRTPRETFTEVIWDFNDGTTQGFGVNAGSTLEGFTVTNENNALQIAGISEANSVWDVRISADNWDETVDIAGAQELSMEIIVDEPTMVEIGAIPQSASAGWANPVEVAVSPEDFDLQEDGNYMAVLTLTAEDAPNLSNIANSSEDSLLNNIILLINTEDADAISLDNISVSGDRESIPEPVVHDEKGTATLPSTFEDGTRQGWDWHSESGVKTSLTIEEANGSNALSWEYAYPEVKPSDGWATAPRLDFWKDNLVRGDNEFVAFDFYIDPVEERATEGEISINLTFQPPSMGFWAQAPSTFDIDLEALDEATLTEDGLYHFEVEIDITNITNLQDDTELRNMMLIFADGESDFAGRVYVDNVRFDMSLEKKVEVLSRTIAELLEQIETIEADNAERIAELEDQIAELEEQLNELVDSSVVEELQRIIEDLLAQIAALEQQVQELKDAANGVTPQPGNGDGSSDDVDNGTTDGGDNGSTDGENNGSEEGESGSTEDEDSDSSDGAEETGSSSKEGKDGEKLPNTATNMFNFLMVGLMLLAIGIVTFVIKRKNVAIK >NC_014829.1|WP_013489947.1|3603068_3604082_+|potassium-channel-family-protein MFVFRFDFIVESYSRFYSLIKMTFIVFLFALFIGNLMHIIEPDNFPSIFDGIWWSVVTISTVGYGDFVPESIFGRILGIILILGGIALFSFFITNLASSTVLAKQEKDAGGAKVKEKGHYIIVGWNERSHQLIKELMNLYSNIHIVLIDETLEKKPIDTKALSFVKGSPTKDETYERANIKKAHTIIITSNQHVDEKTSDANTVLTLLTSKGMQSNIYAIVELISPQQAKNAERAGADEVILSSKHLSLLMVNGVLFHGMTDVIAEMLKHGKDDQLQFKIVPPELINETFQKAITDYQTSDMFLIGIRRGSDTLLHPKNGSQLLSGDKLIFFKRVSS |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_014829_5 | 3835035-3835157 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_014829_5
|
1 spacers
spacers of NC_014829_5
>5.1|3835067|59|NC_014829|CRISPRCasFinder GTTTTGAACCCGGGTTACCTTGAACCCGGGTTCGTTTCCCTCACCTTCAGGCTCGCTTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014829_5
The CRISPR arrays of NC_014829_5 >merge|NC_014829|5|3835035-3835157|CRISPRCasFinder TTCTCTTGTTTTCTCTCGGTTTGAAGGTGAGAGTTTTGAACCCGGGTTACCTTGAACCCGGGTTCGTTTCCCTCACCTTCAGGCTCGCTTATTCTCTTGTTTTCTCTCGTTTTGAAGGTGAGA >NC_014829|5|5|3835035-3835157|CRISPRCasFinder TTCTCTTGTTTTCTCTCGGTTTGAAGGTGAGA GTTTTGAACCCGGGTTACCTTGAACCCGGGTTCGTTTCCCTCACCTTCAGGCTCGCTTA TTCTCTTGTTTTCTCTCGTTTTGAAGGTGAGA
>NC_014829.1|WP_013490152.1|3832859_3834686_-|hypothetical-protein MDVIGIELLKAFGRMWLHPLPYLFVLLALWFGYSRVKRERKNFHTRIYDVVHELFFPIAIGLSFGLILSIIFPIVGLEIPIGMMVLLLSLWIIVLPFRSFKYLSMTFVASIALLISFFLPEGGTGISLLNDWLSEIKAMDMVGFAWFIAVLFLAESLLIFVHGWKKTYARLTLSKRGKTIGNHEAKRLWPVPILFLFPVGNLAFEGWWPLFDSISTTGQGLMFLPFILGFQMSVQSSYSKDAVKHVGKRLILLSILLLALAGVATFIPLFVYAVAIVGILGREIIYIMHHTRDKHRTGLFTSREKGLTVLGVLPHSTAEKMGIEVGEVILKVNGWEVYSQRDLYEALQENSAFCKIQVVDRSGELRFAQSSLYEGDHHHIGLLFIPDGEMVNLSRRALRSSVVIHHDRNGGKNLKQQVNDDEDIFEYDTSASEEASASTIQAHPDVLEENSQEDVIEKSAVQAYEDAEQDEATVTNDLEREGHEMENNVDVESDIEDTTVTIEEDHDYAGEAAATSDEIIEESNTIEDPNDRNEATQAIEGSAEEDAHNSEETTEEDEQEVKSNDEEKLNKEDNDVLPYGQAAGLSAFYEEFRTASKEKKKWGKNFKK >NC_014829.1|WP_041809160.1|3830444_3832433_-|excinuclease-ABC-subunit-UvrB MTTGFELVSKYEPQGDQPQAIKELVEGINEGKKFQTLLGATGTGKTFTISNVIKEVKKPTLVIAHNKTLAGQLYSEFKEFFPNNAVEYFVSYYDYYQPEAYIPHSDTYIEKDASINDEIDKLRHSATSSLFERKDVIIVASVSCIYGLGSPTEYSELVVSLRVGMEKERNQLLRNLVDIQYERNDINFTRGTFRVRGDVVEIFPASRDEHCLRIEFFGDEIDRITEVDALTGEILGERNHAAIFPASHFVTREEKLKKAMVRIEQELEETLKEMNEKGKLLEAQRLEQRTRYDLEMMQEMGYCSGIENYSRHLTFREAGATPYTLLDYFPEDFLIVVDESHVTLPQVRGMYNGDQARKGVLVDHGFRLPSAKDNRPLKFEEFEKHIHQTIFVSATPGPYELDICPKMVEQIIRPTGLLDPTVDVRPIEGQIDDLIEEIRLRKERNERVLVTTLTKKMSEDLTDYLKEVGISVRYLHSDIKTLERIQIIRELRLGHFDVLVGINLLREGLDIPEVSLVAILDADKEGFLRAERSLIQTMGRAARNANGHVIMYADKITKSMDIAIGETKRRREIQKEFNEKHGITPQTIQKAVPQLIQATYAAEADEAYEVKEVAAPKQKLSKKEREKVIERMEMEMKDAAKNLNFERAAELRDVIIELKAEG >NC_014829.1|WP_013490150.1|3827559_3830439_-|excinuclease-ABC-subunit-UvrA MALENIVVKGARSHNLKNIDVTIPRNKLVVLTGLSGSGKSSLAFDTIYAEGQRRYVESLSAYARQFLGQMDKPDVDAIEGLSPAISIDQKTTSRNPRSTVGTVTEIYDYLRLLFARVGRPICPTHGVEITSQTIQHMVDRMMNYPERTKMQILAPIVSGRKGTHVKVLEDMKKQGFVRIRVNGEMREVAEDIELEKNKKHNIEVVIDRIVIKAGIESRLADSLETALALADGRVIVDVIGEEELLFSQKHSCPHCGFSIGELEPRMFSFNSPFGACQSCDGLGSKLEVDLDLVIPDWARSLNEHAVAAWEPTSSQYYPQLLSSVCDHFGIDMDAPLEQLPKHQVDKILFGSGNEKVYFRYENEFGNVREKEIYFEGVVQNIERRYHETSSDYIREQMEGYMAQKPCPTCKGNRLRKETLAVKVSDKHIGEITHLSIKDAKDFFSSLELSEKEMTIAKMILREIDERLGFLINVGLDYLSLSRSAGTLSGGEAQRIRLATQIGSSLMGVLYILDEPSIGLHQRDNTRLIHTLEKMRDLGNTLIVVEHDEDTMLAADHLIDIGPGAGVHGGMVTAEGTPEEICNNEGSLTGQFLSGKRFIPLPVERRKPDGRKLSIKGAKENNLKGTNVDIPLGVMVAVTGVSGSGKSTLINDILYKSLAQKLTTAKDKPGDHKKIEGIELLEKVVDIDQSPIGRTPRSNPATYTGVFDQIRDVYAMTNEAKVRGYKKGRFSFNVKGGRCEACRGDGIIKIEMHFLPDVYVPCEECHGKRYNRETLEVKYKGKTIADVLDMTVEDALQFFENIPRIQRRIETLYDVGLGYMKLGQPATTLSGGEAQRVKLASQLHRRSTGKTLYILDEPTTGLHVADIERLLKVLQRLVENGDTVLVIEHNLDVIKTVDHIIDLGPEGGDKGGQLVAQGTPEKVAEVKGSYTGEYLKPILERERKRMEELLKEKEKVATMK >NC_014829.1|WP_013490149.1|3826072_3827176_-|DUF4097-domain-containing-protein MQEERKMILKMIEDGKITAEEGLQLLNALKEGKENSTTAAEEKTTEQLSKDVDWENSQNNYYEKTSKKSSFANRFSEFIEEAVQKIKEFDLDFNFGSSVEIQHIFQHKGENVRNVDVHLENGSITFRPWEEEDIRVECNVKVYKVHDNDEARKFFLDEVNFDVSNERLRFESNRKTMKINTVIYVPKENLEKVKLYTFNGKVDGETVQSEKFEAQTVNGRINFDEVDAKDVRFETVNGTISISKLNMEHTDAKTVNGTMSLNVVKGKLDAETLNGTVHYTLLEPTNSRAYIKTTTGSVNVIVPEEVKTEGELKTTVGGIHCDLDHLSIIEEKKEFASKKMSFLANKEGENAFYVEVEATTGSITVKH >NC_014829.1|WP_013490148.1|3825795_3825993_-|PspC-domain-containing-protein MKRLYRTVSDRRIAGVCGGIGHYFNIDPTMVRIIALVLMIPFAIFPVVLAYFIATIIIPNETDVI >NC_014829.1|WP_013490147.1|3825439_3825796_-|phage-holin-family-protein MGWIIQLMVNAIVLLIIAHFFNGIEIAGFAFAILASFILALINITVKPILILFTLPITILTLGLFMIVINAIGLMLTSFIMGNSFIIESFSIAIITAVLFGLLNSMIHSFLVDPVTKR >NC_014829.1|WP_013490146.1|3824170_3825109_-|HPr-kinase/phosphorylase MVKVTVQDLVKEFKLELLNNEEDVAFRPITTSDLSRPGMEMAGFFTYYPAKRIQLLGKTEMTFFSQLTPEEQEDRVERLCTYDTPGIVLSRGMEAPEKLVEAANKMGVPVLRSEMTTTRLSSQLTNYLESQLAPMTAMHGVLVDIYGIGVMITGSSGVGKSETALDLVRRGHRLVADDSVEIRQEHEGALVGRAPELIRHLLEIRGLGIINVMTLFGAGSVRNFKRIGLAIHLELWDQKKQYDRLGLDEDTIKIFDTDLPKMTVPVRPGRNLAVIIEVAAMNFRLKRMGINAAQQFSDQLTNVIEEGDKDDF >NC_014829.1|WP_013490145.1|3823177_3824056_-|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MLATIQPLNPVAFELGPLTVYWYGLLIGVGAALAYLLANHEAKKRGFPKDMFADLLIFAVPAAIVGARLYYVIFRWEHYAHDPIKAFAIWEGGLAIHGALIGAVVVAVIFAKKRGYSFWKIADIAAPSILLGQAIGRWGNFMNQEVYGGEVSRAFLENLMLPEFIINQMYINGAYYHPTFLYESLWNLLGVAFLLYLRRVNLRRGEMFITYAIWYSVGRGVIEMIRTDNLLFFGIRTAVVVSIITIIGGIILAIYRRQKGLADKRYLDDDDQLPPKSSNSSGKKTNKKKKKK >NC_014829.1|WP_013490144.1|3822124_3823084_-|membrane-protein MNTLKKGLMVGLQTTWTLGKIIFPITLIVTILGHTPVMGWLTTLLSPLMGYIGLTGEAAIPLVLGNVLNLYAAIGAMLTMDLTVKQVFILAVMLSFSHNLFVESAVAKQVGVKIWIVLLVRIGLALFSAWLINLVWHGGSERAQYGFVPSGEREAVDGFLPIVYQGVESALLGILQLALIVIPIMVFIQIMKDLKWLDVFSRWMSPFTRVLGIRENTSTTLAAGLVFGLAYGAGVMIQAVKEDGVSKKDVYLVMIFLVACHAVIEDTLLFAPLGIPLWPLLLIRLIVAILLTITVAIIWKRLEKREEKDAETGDSNAIP >NC_014829.1|WP_041809159.1|3820653_3821289_-|pyrophosphatase-PpaX MDTILFDLDGTLINTIELIVASFLHTMEHYYPGKYTREDVITFIGPPLSETFTNLDPSKVEEMTKTYRTYNHAKHDELVKEYEGVYETLEKLEEKGYKMAIVTTKSRGTAVRGLELMKLDKFFDVVVSLDEVENYKPHPEPLEKAMAALQADRSKTLMVGDSKHDILGGKNAGTKTAGVAWSIQGKESLQTYEPDIMLDTMPELLHYLGVE >NC_014829.1|WP_013490153.1|3835267_3836737_-|S41-family-peptidase MEVKKSLIAVMIGLSLVLGSGITFAGMQIAEVRSSESVDSMDEEAVAVNGELEDGLKELEYIEKFSKAFDIILNSYYEEVEGNDLLEGAISGMLDSLGDPYSVYMDQETAQEFMESLDSSFEGIGAEVSMSDGRVTIMVPFRDSPAERAGLRTNDQILKVDGESVEGLALYDAVLKIRGEKGTTVTLTIERPGVSEPFDVDIIRDTIPIETVYSDIIEENGQTIGVIEITSFSQNTAVRFGEELSNLESQGIDGLIIDVRDNPGGLLQVVESIGSMVIPGGEPVLQIEDRAGEKGRRLSSLDETKPYPIVGLINEGSASASEILAAALNEAGNYELVGQTTFGKGTVQQTLDVGDGSEIKLTLFKWLTSAGNFINEEGVAPTIEVEQPEFFYVSPINTDEDLQLDMNNSHIATAQVILKGLGYDPQRSDGYFSKEMEEAVRQFQADMGIEVTGVIDSETADQLQQEVINAIQSREHDNQFKKAVEILTQ >NC_014829.1|WP_013490154.1|3837023_3838403_-|peptidoglycan-DD-metalloendopeptidase-family-protein MDRRLLYVSLAILLTFSTFLGTNLLTTAEANTGNELRDEINSYQEQQSDIEREAEEAEEELKQVQAEIDQAAADIRKLDEEMAITNSAIDSKQEEIDETNDRITDLVEEIEILEERIAQRDEILKDRARSMYQSGGSLSYIQVILGAQSFGDLIERVTALNTIAQQDRNILEQHVADKEAVEAAKLDLENELMNLEDQMSQLESLKAELKGQLAEKDEILDWLREEEISLEDQMVSLEEEQAILLAQEEAAKQELERWEEEQRRLEEERKRQEEEERKRKEEEERQRQLELERQQQQEQEQPSSPPPSQDNNSNTNNNASPPPDNSSSTLMRPATGTITSGYGHRWGRMHHGIDIGQGGRSNVPIVAAEAGTVTYAGWMNGYGNTILITHVIEGRTVTTLYAHLASFSISNGQRVSRGQQIGIMGNTGESTGPHLHFEVHEGGWNAAKSNSRNPMNYIN >NC_014829.1|WP_013490155.1|3838642_3839536_-|ABC-transporter-permease MKSRTLLRHLKEGCKNLVRNGWMTFASVSAVTVMLLVVGAFLLVIMNVNHFASALEGDVEVQVFIDLTASEDDHDELLDELEGIDGVESVTFVSKDEGLDALIDSLGEQGGLYEMLRDENPLNDKFVVQAENPEETDVIASDIEDLSHVENVEYGKDIFEQLFSATDFVRMVGFAIIIALMFTAMFLIANTIKLTIIARKREIQIMKLVGATNGFIRWPFFVEGLLLGTLGAVIPIAILSYGYSNFYSSMGQQTGLDFFSFLAPNPLLSQMALLLTAIGAFVGIWGSMMSVRKFLRI >NC_014829.1|WP_013490156.1|3839525_3840212_-|cell-division-ATP-binding-protein-FtsE MITMNEVWKTYPNGVMAINGIDINIDKGEFVYVVGPSGAGKSTFIKMMYREEKPTRGDIIIDGKNLAKVKERQIPYIRRNMGVIFQDFKLLPSLSVYENVAFAMEVIEESKSNIRRRVMNVLEIVHLKNKARFYPDELSGGEQQRVAIARAIVNSPSVLIADEPTGNLDPETSWEIMDILEDINNRGTTIVMATHNKEIVNTIRKRVIAIEGGRIARDEMKGEYGYEK >NC_014829.1|WP_013490157.1|3840672_3841038_-|cytochrome-c MKKLLMTLIGTIILTSACGTTEDEVDEPQTGEDIEQNEEEIANTSDEEVLYDASSAEAVYIGRCSGCHGQDLGGRSGGPGIIGLSKEEVLSAIEEGPGIMPKNVITGEEAENVAAWVADQQ >NC_014829.1|WP_041809163.1|3841101_3841986_-|YitT-family-protein MQRKLELEPIKPLHRTILEFAHVLIGSAIVAISFNIFLLPNQIASGGVSGISILFQSLFAFEPAYTQWAINIPLFVAGVLLLGGSLVGSIMYGVKTLVGTIFLPFVVFMTRDFEAATSDPLLAALFGGIGVGLGLGIVFRSNSSTGGTDLAAQIVNKYTGLSLGACIFIMDGLVVAASGVIFGFEFALYALIGLFTTGKTIDLVQIGFGYSKMAIIISGYEEEVKQGLLTKVDRGVTKLDGYGGYTNDKRPVLMCVVGRNEVTKLKQVVKTIDPNAFVIVTNASEVLGKGFKNK >NC_014829.1|WP_013490159.1|3842251_3843353_-|peptide-chain-release-factor-2 MELVEIKQELAAMAKRLNDFRGSLDLEEKETRIAELEELMSDPSFWDNQDNAQKIISENNALKEMVDTYRELEAEQEDLDVSYELVKEEGDEELAADLHAGIKELGKKFNDFELQLLLSEPYDKNNAILELHPGAGGTESQDWASMLLRMYQRWADDKGFKVETLDYLPGDEAGVKSVTLMISGHNAYGYLKAEKGVHRLVRISPFDSSGRRHTSFVSCEVMPELDDNVEIEISPDQLKIDTYRASGAGGQHINTTDSAVRITHLPTNTVVTCQSERSQIKNREQAMKMLKAKLFQLEIERQQQELDEIRGEQSDIGWGSQIRSYVFHPYNMVKDHRTNYETGNTQSVMDGELDPFIDAYLRSKIN >NC_014829.1|WP_013490160.1|3843524_3846044_-|preprotein-translocase-subunit-SecA MLGLLKKVIGDSDARHIKKLQKTVDQIEALADDIKKLSDDGLRQKTEEFKERYRNGEKLESMIPEAFAVVREGATRALGLRHYSVQLIGGIILHHGDIAEMKTGEGKTLVATLAVYLNAITEKGVHVVTVNEYLAKRDAEEMGKLYTFLGLTVGLNLSGMSKDEKRAAYNCDVTYATNNELGFDYLRDNMVIYKKQMVQRPLHYAIVDEVDSILIDEARTPLIISGSAEKSTQLYTAANSFVRMLKEDEDFTYDEKTKNVQITDEGVSKAERTFGIENLFDSEHSQLNHHINQALKAHKVMIRDEDYVVDDGEVAIVDQFTGRLMKGRRYSDGLHQAIEAKEGLEIKRESMTMASITFQNYFRMYEKLAGMTGTAKTEEEEFRNIYGMNVYFVPTNEPIARLDQPDLIYKTMEAKFRAIVEQIDELYQKGQPVLVGTVNVDTSELISSLLKKKRIPHNVLNAKNHEREAEIIENAGQRKAVTIATNMAGRGTDIKLGEGVKELGGLFVLGTERHESRRIDNQLRGRSGRQGDPGESRFYLSLEDTLMRRFGSENMSKMMERLGMTEDQPIESKMVSRAVEQAQKRVEGNNFDARKQLLQYDDVMREQRDIIYEQRMEVLESENLREVVEKMIESMVERNVSLYTPESEVPEDWNLQGIVDYVNATVLNDKEIELKDIDGLDPEEMVELIMDRVIEEYDRREEEFTSEHMREFEKVILLRIVDSKWTAHIDQMEQLRQGIHLRAYGQNDPLREYKFEGFQMFEEMIASIEEDVSRYVMNAQIQTNLERKQVAEGKAVHRSATEAQQEKKRKTPFRKESTVGRNDACPCGSGKKYKNCHGK >NC_014829.1|WP_013490161.1|3846343_3847177_+|transcription-antiterminator MITVKKVLNNNVIIAEHSQYDEIVLIGKGLGFGKKTGDEVAGQKAEKFFVLKDAQEQQQYINLLEYVDESFIEMMNDFIGKIEERFQTSLNEHIHVGLTDHLYFAIKRIKQGMDVKNPFGRETELAYPKEYAMATEIVEALNDKLNMKIPTGEIGFIALHIHSALSNRALNEINKHTMLVTELVNMIEDNLKITIDKQDMNYLRLVRHLHHTIDRVTSGNYMEEQDALKKVLQEEYPICYTLSWKLMRVMQQKLQKPVPDAESVYLTLHIQRLYNKI >NC_014829.1|WP_013490162.1|3847356_3849462_+|PTS-transporter-subunit-EIIC MFKKLFGQLQRIGKSLMLPVAILPAAGLLLAIGNAMKNPNMTSLMPFLENDFFASLATMMESAGGIIFDNLAIIFALGVAVGLANGAGVAALAAIVGFLVMNVTMSVMGGLTVEGVLTEGNPAHALVLGIPTLQTGVFGGIIIGALAAWAYNRYYTIELPAFLGFFAGKRFVPIVTAFTAFFVGVAMFFVWPPIQTGLNTASEFLMNEAMTLAVFAFGFIKRLLIPFGLHHIFHAPFWFEFGSYTTAAGDVVRGDMNIFFAQLRDGAELTAGHFMAGEFPIMMFGLPAAALAMYHQARPENKKIVGGLLGSAALTSFLTGITEPIEFSFLFLSPLLFFIHAVLDGLSFVILYWLNINMGYTFSGGAIDFFLFGVVPGREPWWLVILVGLVFAVIYYVLFTFMIKKFNLMTPGREKNVGMVDEDQNNRKGGGNTELPYNILKALGGKENLTHLDACITRLRVSVSDNTKVDKNRLKELGASGVMQVDQNFQAIFGPRSETIKSQIEDIISGKTPTPEEEIETPSNENCDAPMEGDDNAEANAVGVPATQVSIAVPMAGVIKPISEVPDQMFAEKMMGDGFAVDPTDSNGAVVSPVSGTIVNLFHTKHAIGIETEGGTEVLVHVGIDTVKLGGKGFEAAVAQGDKVEQGQKLLQVDLASVKNEAPSVMTPIVFTNLKEDEYVVIDRPGPTKAGETGRIRIAKK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_014829_6 | 4017754-4017941 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_014829_6
|
3 spacers
spacers of NC_014829_6
>6.1|4017779|26|NC_014829|CRISPRCasFinder ATCAAAATTGACCTAATTTCGTGGCA >6.2|4017830|36|NC_014829|CRISPRCasFinder CAAAGGAAATCCCCCCTTTTTCAATAGTTTCTAGTC >6.3|4017891|26|NC_014829|CRISPRCasFinder CAGACTATTTTCAGTGCTATTTATTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014829_6
The CRISPR arrays of NC_014829_6 >merge|NC_014829|6|4017754-4017941|CRISPRCasFinder AATAAGCGAAGAATTTCCGTTTAAAATCAAAATTGACCTAATTTCGTGGCAAATAAGGGTAGTTTTTCCGCTTATGCAAAGGAAATCCCCCCTTTTTCAATAGTTTCTAGTCAATAAGGGGAATTTCTCCGTTTATTCAGACTATTTTCAGTGCTATTTATTAAATAAGCGGAATTTCTCCGTTTATT >NC_014829|6|6|4017754-4017941|CRISPRCasFinder AATAAGCGAAGAATTTCCGTTTAAA ATCAAAATTGACCTAATTTCGTGGCA AATAAGGGTAGTTTTTCCGCTTATG CAAAGGAAATCCCCCCTTTTTCAATAGTTTCTAGTC AATAAGGGGAATTTCTCCGTTTATT CAGACTATTTTCAGTGCTATTTATTA AATAAGCGGAATTTCTCCGTTTATT
>NC_014829.1|WP_013490298.1|4016011_4017154_+|trypsin-like-serine-protease MKLHWIISLIFTVLILGVGAYGFYFIYDHVPKQLDAPSSILAYDDEESDQFVEGETRELTEIIHDTQKLVVKIETEDGSIGSGFLYNDMGDIVTNAHVVAGVNNVTVTTADSRQLYGTVIGISDTIDIALVRVDDLAGTDPLPISNTKAEIGEEVLALGSPFGLDNTVTTGIISGLDRDLDLPPYYYEGLYQISAPIAPGNSGGPLVYSATGEVIGINSAAADQGSIGFSIPIIDVLGMIQGWSQSPMTALPTFDTYTTDYGYYETDYYYTDEDYALYLVEYYYDNLIYQDFLTAYSLLGSNLQTNMSYESLRNEYIHTDWISIDDIVVTNTNPLQVFSIITKEQYSNNTTSYEKYKVTHTIGYENDHLKILTEQKERIN >NC_014829.1|WP_013490297.1|4014548_4015997_+|zinc-ribbon-domain-containing-protein MYCHNCGEQLPEDSQFCANCGTKLAHDEHPVDDQTSEQNNEVELKEEGETSSSQNVDETPDTPNDTPSGVLSSVPAATDASKDTVDSQSKEVVPAEEQQNEVASTSEQQSVQETEPIPQESKTRSKPASRKTFSFWLSILVPIFSFFLIVGGLILYYFYESNVNERVLNLKESAEESALDGDFTAAIEDINKAIDLRPNYIVLRQNLQEINQANDFSNRLVEISTLIDEQSYDEADELLLTFISSLDREEGILFDYFKDQIPSLQSAIAVGKIMLELDELTTIHALSDRLNTISSLSSDEAEEVRERIISKIIELSTEQATASLNNNQYSEALSLVNQGLEYASNNDSLLSLRSQIESEQAEFERAEQERLTAALEAAAQDDLFNRTEAVQVTYFDSYIDSWGDIFLEGEIVNNASVPIYDITIYYTVYDDYGYYMDESYTFVFPYYLYPGDIGYFDDWYINYSWYDEIGSVEVDYITWNLD >NC_014829.1|WP_041808406.1|4014100_4014388_+|hypothetical-protein MNKKAIQFFNTLVSLFIIGLSWFYTWAYIGYTLQFYLWIFLIPLVVVIIYIMSYIVIERFEESRLLFSIIGIQCVLFFLIIFFAYNNLWNTILAK >NC_014829.1|WP_013490296.1|4012621_4013734_-|thioredoxin-family-protein MIKYGYFFAILIVLIGCGSYEQEMLAEEAVVKAEGLAEQLTETLFINENVEPLSSLENIDEQLKNETKLAYEEAMASLEEIRNESKREPYLVRLEKVLFAVEEAENFQLAINKYNEVIQKWLDFESFVMKNPLDASLNAKLDEMNELFSSKHWEDFDDEIKLAFVNLLQYASTEEVETILTFQQQFDGLEEWLFSNPSIGEVNDMHDEMTELVALLDNPIITEAYEKFENEMLSSFYDWKEYEAEVKAFMDIVKEEQIISLDAETEPLLWVILENSEYVSLLFYTDGCFVNTQSSHFSLKQQSDLAKKYPEMIFINVRFHDHQELAKFFSITETPFKIIFKDGDSKVGFSGFMEMTEVEQLYHDVYNDKY >NC_014829.1|WP_157184221.1|4012137_4012296_-|DUF2292-domain-containing-protein MSVGEKELQYLEEIKKLIEKIDFGSITITLHNGEVTQIDATEKKRFDVKKKK >NC_014829.1|WP_013490294.1|4010711_4012058_-|putative-sulfate-exporter-family-transporter MAEEKDVNLSEAKPPVKKHPLNTEDWWAVWLGFGLISLIIFISFPGATLPSRWGTEGSESIFNAIPGENLFGIILTGVIALIVFLIAVSFLKGKFQKQFLIGFPILFLLTLVAYVIGQYAPFRHYGFNDVIWALVIGLVISNVFKTPAILKSVLKTELYIKTGLVLLGASILFDRMLALGMLGIGVAWVVTPIVIIVMYIFSQRVLKMNDQRELAVTISSATAVCGVSAAIASGTAAKAKKEEITLAISITLIFTILMMLGMPALVSLLGIDPIVGGAWLGGTIDATGAVVAAGSMLGDNAMEVASVIKMVQNILIGFVAVAIAIFFVSRQNAANGQGTEKKKVKAKEIWTRMPKFIIGFIAASLIFSFLLPQQTVDASGSVVDSYRNLFFTLAFVSIGLESNFKELAKGVRGGKPIVLYIVGQLLNIILTLIAAYVFFSGVFFTLPF >NC_014829.1|WP_013490293.1|4010529_4010694_-|hypothetical-protein MKKKIIFLVAILGIISLVLLLPNPDTNEPGAGDIWWMNVPEINESYYKINGKND >NC_014829.1|WP_013490292.1|4009292_4010285_-|HNH-endonuclease MSFQDRVKKETKKLGEKVIDGAKKLHEKDRVLKETTGKGLVHTTGESVGNAAGFLLGKPLEKVGQRFHNKFFMELGEGIHKSSRFTGGVAGQLGQGAWKTTEGLIRWDGSVVWEGFGEIGHATGRTVVGIGKTAIYTLQNSAQIVKGLYSKDYERVKIGASGVAKVVIIGGIAFTVIDLVDGGNIAMAEEGTFINTHNSSLAGQLHPETGVPFEAQAIALEDGTEVVGVFPVFDAVAEVVLPEELYGSSDYLHFSYANGELIDMVSENETIAAQFSIDQLEQIYAGETPDGYTWHHHEDLGKLELVDEEIHAKTGHSGGRSVWGGGTDGR >NC_014829.1|WP_013490291.1|4008868_4009303_-|SMI1/KNR4-family-protein MEGNTKLEWRFVKNPATEKSLNNLENEFDILLPSTYRILMKLYNGGRPKPNKYYIQQEERVVKSFLNVYPVKGGVKDVVSWLELPQKVIPFANDPFGNYLCFDYRNISYMEPTIVLWEHEKNRLVIVEQSFEAFLRMLKKGVNN >NC_014829.1|WP_013490290.1|4007452_4008619_-|nucleotide-sugar-dehydrogenase MKIAVAGTGYVGLSNAVLLAQHNEVVAVDIVEEKVDMVNRKQSPIADKEIEEFLATKELNLVATTDKYKAYENADFVIIATPTDYDPETNYFNTKSVESVIETVLEVNPNTVMVIKSTIPVGYTKDVKEKYNTDNIMFSPEFLREGKALYDNLYPSRIIVGEQSDRAKTFANLLLQGAIKKDVRMLFTDSTEAEAVKLFSNTYLALRVAYFNELDTYAEMKGLNAKQIIEGVGLDPRIGDHYNNPSFGYGGYCLPKDTKQLRANYEGIPNNIINGIVDANSTRMDHIAAQIIASNPKVVGIYRLTMKTGSDNFRASAIQGIMERLKAKNIELVIYEPGLHEETFNDYKVIKSLEEFKQVSDIIVSNRLDAEIADVKEKVYTRDLYQRD >NC_014829.1|WP_013490299.1|4018251_4019547_-|zinc-ribbon-domain-containing-protein MLKCTSCGADLREDAKFCVKCGAKAEVKTATESPVTEEEKLDSYFNHQEEQESPSNEVVTTSIEQSDEKSPSFFRKFRLWIIAGSSALAVIALLIVLSTQFIFGQEKTWFVTVNHNEQAGFINAAGEEQIAHQYEVPFLLHFYYWDRYWDIDEIRAFYFTEDYHVVRISDKFGYINRDGRYAINPQFDTATSFVDGLALVSKDGMYGFIDEDGNTVINFEFDYAEPFSDGLALVGIQSNYGFIDKNGEMVINPRYDDAYSFSEGLARVEVNGEYGYIDKNGEMVISPQFDFAMDFSDERARVYIGDNLGFIDKNGQMVINPQFQFALPFSEGLAPVAKDDKIGYIDVDGVYVIDPQFDFAGPFHEGLAAVSIGGKVGFINKEGRIVINPQYDQALPFYNGVALVVTDNHDTRTFKYINEDNEEIYSFNLDY >NC_014829.1|WP_013490300.1|4019767_4024147_-|LPXTG-cell-wall-anchor-domain-containing-protein MTKRGLPLMMIFIMLFSLLQPGIITDANSDVTNVGNGSYSNVFPNIDHGSFDDPGYAGQQGEPPSTIYRTENVTGPMQTNTWWSSLAADPFSMTQFPHPFSIKHGADGFNVFYNSPNQTVVHGDAGSGLWHIVGAMGTDFKIGHSGTSTFQQALVDDYNDWYVRGVLENGNNKMYTTYGVGSPYIFVEYEGGSAEINFPNTPNIWENRGNVLGFSTHDNKHYAAFAPDGYDWSGVGTQKLENSSNAITVAKLPDANSSTLDKFEEYAFSFVRDAQANYSYNEDTGIVTTTFEVTTEPIEEGAPDGTIFALLPHQHRHLAEASRDQLLTGYSFYLLQGDMLALEGKSFQTELTYTGVLPSLPDAGDYDREVLKGYLQDAREHTPTGQDTYELGKYLGKIATLAPIADQMGEVELAEEFRDELKSILEDWLVATDSEGNIKTENVLYYNDNWGTMLGYHAAHGSATRISDHHFHYGYFVKAAAEIARTDSEWASESEWGGMIDILIRDYAGGRDDEMFPYIRMFDPYSGHSWADGLSTFDAGNNQESSSEAMHAWTNTILWAEATGDTELRDRAIYLYTTEMSAINEYFFDVHQENFPDAYTPEIVTIKWGGKMDHATWWNSGIVEKYGINWLPFHGGSLYLGHHPEYVERAYAELLNRNGSTDWNWWSNMVWMYRALTNPTDALNQMNASIDDYTSFNPGDETIIERGSTKAQTYHWIHNLNVLGRVNPNVTADHTTYAVFDKDGVRSYVVYNFTDTEVEVSFSDGMTMTAGANDFTIDYGEGLSFPEDPVDPVDPGEPGDGDDGNGDDNGVAPPQPGDGHVHEDYEAGARKTGDNEAQIWFTPETDAQYVDVHYSINSGNKAGYRMTKDNMTWTQNITGLSEGDVIEYHFIYEKNGPQYQSESYQFTFTENEIDPDPVDPGEPGDGDDNGESPSQPGDDHVHEDYEAGARKTGDSQAQIWFTPETDAQYVDVHYSINAGNKSGYRMTKDNNTWTQNITGLSEGDVINYHFIYEKNGPQYESEHYQFTFKEASEQPDPVDPIVPDAPTSLEAYEKTTSTVTLTWEAVNGADGYEVLRDGIVVHTTPETTFTDIGLDENTTYEYTVRAYNEAGSSEESVPLVATTDKKAETPGDGEPGDGQDPEAIEVESGVETSVSANQVVKLQGGKATIKMSENLPDGATISIESVEEPAPNVNHTKAGQVIKVNLQGAEGAEGFDLELSYDEGYEEVAIFYYNETTEEWERIGGVMNQETNTISVTVDHFSTYGVFASESGDGQDPDPVDPGEPGDGEDPDPSDPSDPGDSEELQQRINELQALIEQLNTRISELENNNEILELEMRVAQLEGQLNALKAQFSDIEEYVSNLETLINNLKEEIAALKAQFSDFETPEAPKTDDDSSEEDENGTDGDVDSEEASKDSSKDGDELPNTATNLFNYLVIGMLLLIIGAVTFFTRKKQVFNN >NC_014829.1|WP_013490301.1|4024500_4025040_-|hypothetical-protein MSKRKKKTIAEKGKNKRNTIILSCLGLVLAASLLSYVVNADSSQTIVEEYEVPEKLQKYELSGTVDEVRAELIKLMANEMGEFIYIYEPGCDECDRMDAIVFPIAESEGITVNRLNIKKYEELAPLVDLDNIPTPVTVYYSGGWREGWITGNEDEKYYHDFIDHFYLHHEKHPDGNTVH >NC_014829.1|WP_013490302.1|4025152_4029697_-|carbohydrate-binding-protein MNSRRQKFNVFLMLLLLLSTLITPVLQPNTVTAHNGDHSSDSSHRLLVVTHTEGYFHGSINDIRDVMPQWGQENGFEVVFADSSSSARGSDVPIEEAFTPEFLADFDAMMFANTTGNFGTTEERQAIMDFIESGGGFVGAHAAIDTGYDWPEYGEMVGTYFQSHPWVQQVNYLVEDSDHPATRHLQSGEWTKLEEVYIFPEDLNPRDAGKHILLSLDTDSVSGNRGGQFDDHPAAWCSPQEEGRVFITALGHHSQTWSSEPDFKQHILGGLEYAFGIENDTDCHLPSPKPGLVKEQLTNAVPRPTALEVTDDSRVFSISINGGVYETQPNGSTNRILNIPTTTEGEHGVMGIALDPEFDENGHVFIYYSEPEHTSEGEIINNLSRFTYENGEIDPATEELLLEVPSDPQCCHQGGYLKFGPDGKLYLSTGDNKPATNGPNALAIETAQNLGDLRGSILRINKDGSIPEDNPFVDVDGARGEIYAYGFRNPYRFTFDEETGFIYVGDVGPDSSSDYDEYNVITEPGQNFGWPYIIGDTPYVNYLSRFESFANNFDFSTVRGNFTADDVLTTAEEILHFHENEAVDPIAFYPYGHKDPWGSGGRTSNVGPVYDPGNGENAFPATHHGKLLFYDFVRGWMKLVDTDENGEIIAVEDFIDGLLLPMDVDIGPDGSIYIAEFGSSWWEVNDQSGITKISWGVLERAPVIQVNVSKNYAFIGDEISFDSSGTYDPDGNDITFDWDFGDGTTSTEASPTHAYSENGEYTVRLSVTDATGKVASWNTTIVIGNTPPVVEILQPSNNTFFRNGDTFTFVGRAYDAEDGEIACENLEWRLDLLHDDHGHPQEYKRGCEVTYTLQDDGHNYTDNIWWQMSLVARDSGGDGAPVLEGIDTIEFIKNRIEAEHYDDKSPAINTEGTSDVGGGQNIGWTGPGEWLKFEDLNLEQMDTVYLRTASLSNYHIELRLDSPDGESIASIEGNATGGWQNWNTVSAELSDVEGNHDIYVYYVSGEANINWIQFGGEGFPGPGEEGDPYEPVDPGDPGDPSDPGEDCGGNYCFEPIADLENSLDRSNWIPSASHSHEEEANDAPSGLHYAIDDDLGTRWSSGEDMTDGMYYQVDFGEVHTINAVYVDSGSHWEERGLKDSHRDWFLGYRIEISVDGENWTTVAEQEENDQYIIHVQFDDVDARFVKVTNTKDITVPGWLSIHDLQVIEAVGDSEPGVDVTELENLISTAKSYTNDEGEYTEESFEALQIAIAEAEAALETIETIQDLNNAFAALQEKINALQPSLSDPVLDVSELENLIESAKAISNEDEVYTDESYETLQAAIAEAEAQLEVIETEEELMNAISALLAAVEGLVERQPDPVLDVSELENLIESAKAISNEDEVYTDESYETLQAAIAEAEAQLEVIQTEAELVNALVALQAAIDGLVEKQVDPDPKPDRDKDKDSDKDKDKDTDIDKDTDHKDIEEKNGDSDDELPSTATSMYNYLFIGFFILIIGCSLYFLSKKGKRQEVNR >NC_014829.1|WP_013490303.1|4030417_4031002_-|hypothetical-protein MIKINYVQPEYFPTTLLVGVGDLGVSVLDTFRGNIESVGVCFSPEQKEFCEAPINNSFHTFTNESKFQMLPYVTELLNMVDKNVVNKVFITGDCDNELDAAVIKLIVNRGKLLGIDFSLVLAKPYAKQETILPTLLEDLQTDCEAIVTIEKNQYCNNKKMVEPVNEADVCLRLVRALKQLEKLLNSRQMPEAIE >NC_014829.1|WP_013490304.1|4031230_4031617_-|VOC-family-protein MNINAVHHIAIICSNYEVSKDFYVRILGLEILQEVYRAERESYKLDLAVNGYYQIELFSFPSPPKRQSYPEATGLRHLAFEVNNVEEAVEHLKSENIKVERVRIDGITKKKYTFFNDPDGLPIELYEK >NC_014829.1|WP_013490305.1|4031761_4032544_+|hypothetical-protein MFSRQYNLLSWMLIVIVVLLMTACNNGDEPVEENEDSDIASLEADIEALESIIDQLQDELAKRDETISELESELGIEDSDSTGEGESNNESPSSSENSTLRERANLVVGSLENKNFNTLANYVHPEKGVRFSPYGYVDTDEHLIFQSEEVKGFTYDTEEYEWGTEDGTGYAITLTPSEYYEEYIYIRDFSRMSSDIVENEIESYGNIIVNVEEKYPEAEFVSYYVTPSDNELNWANLILAFEEYEGEWYLVGIAVDRWTI >NC_014829.1|WP_013490306.1|4032795_4033755_+|peptide-methionine-(R)-S-oxide-reductase-MsrB MSNLEKATFAGGCFWCMVKPFDEFPGIHQVVSGYSGGHTENPTYEEVSTDTTGHREVVQITFNPEVFPYEKLLEIFWRNIDPTDAGGQFHDRGEHYKTAIYYHSEEQRELAEVSKRNLEESGKFDKQIVTDILPAKTFYPAESGHQDYYKKNPFHYNRYYEGSGRKDFTESKWKVSKNEDELREKLTAIQYEVTQNNGTERPFQNEFYSNEDEGIYVDIVSGEPLFSSKDQYDAGCGWPSFTRPISHYHITDKLDQSHGMIRTEVRSKYGDSHLGHVFNDGPKEEGGLRYCINSAALKFIRKDDLEKEGYGEYKVMFEE >NC_014829.1|WP_013490307.1|4034899_4035820_-|NERD-domain-containing-protein MSVIKNRKEPLKLVILRLLASRMKLQEEYEQQLYSTEKGYEGELEFDQWIATINDDYLVINDLLIESNGTTFQIDSVIICYDSIFLVDVKNYTGDFYFDGNKFCKRNKNREYKNPLLQLERAESLFRQLLNELGLSFSVKPQLLFINPEFTLYNAKMDQPIIFRSQLKSFITKLQYPSQKLQKRHMHLANQLISYHQEESRYTQLPSYTYGDLKKGIMCKECRGEMVRHNKFKLLCKQCGKKEDSVRAILRSVEEFELLFPTQDIKVSTIYDWCGGIVTEKAIWSAISKKYTLIGKGRNFKYKKKE >NC_014829.1|WP_013490308.1|4035996_4036968_+|ferrochelatase MEKTAVLLVNLGTPDAPDTKSVRKYLKIFLSDKRVIDLPRWRWLPILHGIVLRFRPKKSAKLYKSIWTKDGSPLLVYSQKQQQLLANRFEGNGNVKVTLAMNYGAPSITTELEKLHHWGVRHLIVLPLFPQYSSTTTASVWDHVQKVISKWRDIPELSFIRDFPDHPQFIELLQKRVDESIEVNGTPDAIVASYHGIPNRYAESGDDYVNRCTRTTDALRRRFPSVPILQCFQSKFGKEPWVEPATSDKLIELAKTDKKHVQIIAPAFTADCLETLEELEVENRDIFLSSGGKAYHYLPAANDDSLFIDCLESLIVERLKDSL |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_014829_1 | 1.3|472521|26|NC_014829|CRISPRCasFinder | 472521-472546 | 26 | NZ_CP045339 | Vibrio sp. THAF190c plasmid pTHAF190c_a, complete sequence | 1158486-1158511 | 5 | 0.808 |
| NC_014829_6 | 6.1|4017779|26|NC_014829|CRISPRCasFinder | 4017779-4017804 | 26 | NZ_CP045339 | Vibrio sp. THAF190c plasmid pTHAF190c_a, complete sequence | 1158486-1158511 | 5 | 0.808 |
| NC_014829_1 | 1.1|472409|26|NC_014829|CRISPRCasFinder | 472409-472434 | 26 | NC_015704 | Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL02, complete sequence | 69375-69400 | 6 | 0.769 |
| NC_014829_2 | 2.1|568360|26|NC_014829|CRISPRCasFinder | 568360-568385 | 26 | NC_015704 | Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL02, complete sequence | 69375-69400 | 6 | 0.769 |
| NC_014829_3 | 3.3|1890667|27|NC_014829|CRISPRCasFinder | 1890667-1890693 | 27 | NC_019728 | Calothrix sp. PCC 6303 plasmid pCAL6303.02, complete sequence | 23283-23309 | 6 | 0.778 |
| NC_014829_6 | 6.3|4017891|26|NC_014829|CRISPRCasFinder | 4017891-4017916 | 26 | NC_015704 | Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL02, complete sequence | 69375-69400 | 6 | 0.769 |
| NC_014829_3 | 3.1|1890555|27|NC_014829|CRISPRCasFinder | 1890555-1890581 | 27 | NC_015704 | Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL02, complete sequence | 69374-69400 | 7 | 0.741 |
| NC_014829_4 | 4.1|3586801|29|NC_014829|CRISPRCasFinder | 3586801-3586829 | 29 | NZ_CP028488 | Yersinia massiliensis strain GTA plasmid unnamed1, complete sequence | 73384-73412 | 7 | 0.759 |
1. spacer 1.3|472521|26|NC_014829|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP045339 (Vibrio sp. THAF190c plasmid pTHAF190c_a, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
tgccacgaaattaggtcaattttgat CRISPR spacer tatttctaaattaggtcaattttgat Protospacer *... * *******************
2. spacer 6.1|4017779|26|NC_014829|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP045339 (Vibrio sp. THAF190c plasmid pTHAF190c_a, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
atcaaaattgacctaatttcgtggca CRISPR spacer atcaaaattgacctaatttagaaata Protospacer ******************* * ...*
3. spacer 1.1|472409|26|NC_014829|CRISPRCasFinder matches to NC_015704 (Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL02, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.769
taataaatagcactgaaaatagtctg CRISPR spacer gaataaataggactgaaaatagagac Protospacer ********* ***********
4. spacer 2.1|568360|26|NC_014829|CRISPRCasFinder matches to NC_015704 (Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL02, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.769
taataaatagcactgaaaatagtctg CRISPR spacer gaataaataggactgaaaatagagac Protospacer ********* ***********
5. spacer 3.3|1890667|27|NC_014829|CRISPRCasFinder matches to NC_019728 (Calothrix sp. PCC 6303 plasmid pCAL6303.02, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
ttgccacgaaattaagtcaattttgat CRISPR spacer ctatgacgaaattaagtcatttttgaa Protospacer .*.. ************** ******
6. spacer 6.3|4017891|26|NC_014829|CRISPRCasFinder matches to NC_015704 (Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL02, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.769
cagactattttcagtgctatttatta CRISPR spacer
gtctctattttcagtcctatttattc Protospacer
*********** *********
7. spacer 3.1|1890555|27|NC_014829|CRISPRCasFinder matches to NC_015704 (Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL02, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.741
ctaataaatagcactgaaaatagtctg CRISPR spacer ggaataaataggactgaaaatagagac Protospacer ********* ***********
8. spacer 4.1|3586801|29|NC_014829|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028488 (Yersinia massiliensis strain GTA plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
tctattttttatgctcaggggcagatggc CRISPR spacer gcgctaacttatgctcagggtcagatggc Protospacer * * .************ ********
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
448926 : 457214
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_014829|448926:457214|DBSCAN-SWA GATGATTGAACGTTATACACGACCTGAAATGGGTGCTATTTGGACAGAGGAAAATCGTTTTCAAGCGTGGTTAGAGGTTGAGATTCAAGCTTGTGAGGCGTGGGCGGAGCTTGGTGATATACCGAAAGAGGACGTAAAGAAAATTAGAGAAAATGCAGGCTTTAACGTTGATAGAATTAAAGAGATTGAAGAAGAAACAAGACACGATGTAGTTGCTTTTACACGTGCTGTATCTGAAACGTTAGGGGAAGAACGTAAATGGGTGCATTACGGTTTAACATCAACAGACGTTGTTGATACGGCATTATCATATTTACTTCGACAAGCAAATGAGATTATTGAAAAGGATTTAATTAATTTTATCAACATATTGAAGGATAAAGCAAAAGAGCACAAAATGACAGTCATGATGGGGCGCACACATGGTGTACATGCAGAGCCTACAACTTTTGGTTTAAAACTAGCACTATGGTATGAAGAAATGAAGCGAAACTTAGAACGTTTCCGAGCGGCTGCTGAGACCGTGCGAGTAGGTAAAATTTCTGGGGCGGTTGGAACGTATGCAAACATTGATCCGTTCGTAGAGAAATATGTATGTGAAGGTCTTGGTTTAGAAGCATCACCGATTTCTACACAAACTTTACAACGCGATCGCCATGCGCATTACGTGGCAACACTTTCATTAATTGCTTCCTCTATTGAGAAAATGGCAGTGGAAGTACGTGCATTACAAAAAAGTGAAACACGTGAAGTGGAAGAGTTTTTTGCAAAAGGTCAGAAAGGTTCTTCGGCAATGCCGCATAAGCGAAACCCAATTGGTTCAGAAAATATGACAGGTCTTGCTCGTGTATTGAGAGGTCATGTTGTAACAGCATATGAGAACGTTGCTTTATGGCATGAGAGAGATATTTCTCACTCTTCAGCAGAGCGTGTCATCTTACCAGATGCGACTATTATGATTAACTACATGCTTAATCGTTTTGGTAACATCGTCAAAAATTTAACGGTATTCCCTGACAATATGAAGCGCAACATGGATAGAACGTACGGTTTAATTTACTCCCAACGAGTTCTTTTAACGCTTATAGATAAAGGGATGGCTAGAGAAGAAGCATACGATTTAGTGCAACCGAAGGCGATGGAAGCGTGGGAAAAGGCTGTACCATTCCGTTCATTAGTGGAAGCGAATGAGCAAATTATGAGCCACTTATCTAAGGAAGAGCTAGATGATTGCTTTGATTATCACCATCATTTAAAACACGTCGATACAATCTTTGATCGTCTAGGATTAAATTAGTTGACTCACGATTATTAATAATTAGCGTTTGACTATTAGTAGCCAGAGGGCACTGAAAAAGGCCTCCGATATTGACCTTTTTCAGTCCCTCAAAATGAATAGGAGGGAGCATCTTGCAAAAAGGAGCTTGTCTTTACGAAGGAAAAGCAAAAAGAATCTATAAAACCGAAACCCCAGGTGTACTATGGGTGGAATATAAGGATGATGCTACAGCCTTTAACGGAGAGAAAAAAGATGTACTTACTGGCAAAGGGCGATTAAATAACGAAATCAGTTCTCTCATTTTTACACAGTTGAAGCAAGAAGGGATTGATAGTCACTTTATTGAGAGATTATCAAGTAATGAGCAATTAATAAAAGAAGTAGAAATCGTTCCTATTGAAGTAGTTGTTCGCAATGTGGCAGCTGGTAGTCTAGTAAAAAGGCTCGGAATTGAACGCGCAACGGCTTTTAACCCTCCAATAGTAGAGTTTTATTATAAAGATGATGCGCTAGGTGATCCTATCATTACAGATGAACATGTACGGGTCATGAATTTAGCTAGTAAAGAAGAGGTAGACCAGCTAAAAGATATGGCACTACAAGTCAATGAACACCTTAAACAGATGTTTAAAAAGGTCGGCATTCAATTAGTAGACTTTAAGCTGGAATTCGGTAGAGACCAAACAGGTGCGATTTTACTAGCAGATGAGATTTCTCCGGATACGTGCCGTTTATGGGATGAGGAAACAGGGGAATCATTCGATAAAGATTTATTTAGATTTCAGCTAGGAAACTTGCAAGACGGCTATGAAACAATCTTAACTCGACTAGGAGGACTTAAATAATGTATGAAGTAAAAGTATTTGTCTCATTAAAAGAAGCGGTATTAGATCCACAAGGAGCAGCGGTGAAAGGTTCTTTACATCACTTAGGTTTTGAAGGAGTAGAGGAAGTTAGAATCGGAAAAGTAATGACGCTTCGCATCGAAAGCACAGCGGATAAAATTGAAGCGGAAGTAAAGGAAATGTGTGAAAAGCTATTAGCGAATCCAGTTATTGAAGATTATCGTTTTGAAATTGAGGAGGTAGTTTCTCAATGAAGTTTGCAGTAATCGTCTTTCCAGGCTCCAACTGTGACTTAGACATGTATCATGCAGTAAAGGATGAACTTGGTGTTGAAGCAGAGTATGTATGGCATGACGAAACGAGCTTAGAAGGCTTTGATGGTGTGTTGTTACCAGGAGGATTCTCATATGGGGATTATCTTCGTTGTGGAGCAATTGCTCGTTTTTCACCAATAATGGATGCTGTCATTCAAGCAGCAAACGAAGGAAAGCCAGTACTTGGCGTATGTAATGGATTCCAAATTCTTTTAGAAGCAGGTCTTTTACCAGGGGCGATGCGTCGAAATAAAAACTTGAAATTCATTTGTCGTCCTGTTCAGTTAGTAGTAGAGAACAACGAAACGCTTTTTACAAATGGTTATGCAAAAGGGCAAGAGATTACAATCCCAGTTGCTCATGGTGAAGGAAATTACTATTGCGACGATGACTTGCTACAGAAACTAGTTGCTAATAAACAAATCGTTTTTTCATATCAATCAGATGTAAATGGATCTGTAAATGACATTGCAGGTATTACGAACGAGGCAGGAAATGTACTTGGCATGATGCCTCACCCTGAAAGAGCAGTCGATTCATTACTAGGATCAGATGACGGATTAACTTTATTTAAATCGATTTTAAGCCATTGGAGGGAACGAAATGCAATTACTTCATGAGCCATCTCCACAGATGATTAAAGATGAGCGCATTTACGCAGAAATGGGAGTAACAGATGAAGAGTTTCGCATGGTAGAAAATATTTTAGGGCGTCTACCTAACTATACAGAAATTGGTCTTTTCTCTGTTATGTGGTCGGAGCACTGCAGCTACAAAAACTCTAAAGTCGTATTGAAAAAATTCCCGACAACAGGTGAAAAAGTGTTACAGGGACCTGGTGAAGGTGCTGGAATCATTGATATTGGAGACGAGCAAGCAGTCGTTTTCAAAATCGAAAGTCATAATCATCCATCCGCAATTGAGCCGTATCAAGGGGCTGCAACTGGTGTAGGTGGTATCATTCGTGACATCTTTTCCATGGGTGCTCGTCCAGTAGGTCTATTAAACTCGTTACGTTTCGGAGAATTAGAGACGCCTAGAGTGAAGTATTTATTTGAAGAGGTAGTTGCAGGTATCGCTGGGTACGGTAACTGTATCGGTATTCCAACAGTCGGTGGAGAGATCCAATTTGACCCTTGTTACGACGGTAATCCATTAGTGAATGCGATGTGCGTAGGGTTAATTGACCATAAAGATATCCAAAAGGGGCAAGCAAAAGGGGTAGGCAACTCTGTCATTTATGTTGGTGCAAGCACTGGACGCGATGGTATTCACGGAGCAACGTTTGCATCCGAGGAGTTAAGTGAAGCTTCTGAAGCGAAGCGCCCTGCTGTTCAAGTAGGAGATCCATTTATGGAGAAGCTTCTTCTTGAAGCATGTCTTGAAGCGATCCAAAACGATGCGCTTGTTGGTATTCAGGACATGGGTGCTGCTGGTCTTACTTCTTCCTCCGCAGAAATGGCTAGTAAAGCTGGCTCTGGAATTGAAATGGATTTAGATAAAGTACCACAACGTGAAAAAGGGATGACGGCATATGAAATGATGCTTTCAGAGTCACAAGAAAGAATGCTCCTTGTTGTGGAAGCGGGTCGTGAGCAAGAAATGATCGATATTTTTGAGCGTTGGGGCTTAGAAGCGGTTGTTGTAGGGAAAGTGACGGATGATAAAAAGCTTCGTCTCCTTCATAAAGGGGAAGTTGTAGCGGACGTTCCTGTTGATTCTTTAGCAGAGGATGCGCCTGTATATCATAAGCCTTCTAAAGAGCCTGCTTACTATAGTCAATTCCAAAATGAAGCGCCTTTCAAACCTGCAGTAGCAGATATGAAGGAAACGTTAGCACAATTATTAGCACAACCAACCATTGCTAGTAAAGAGTGGGTTTATGACCAATACGATTACATGGTTAGAACGAATACAGTAGTCGCACCTGGTTCGGATGCTGCTGTTCTTCGTATTCGTGATACGGAAAAAGCAATTGCAATGACAACAGATTGTAATTCTCGTTATATATATTTAGATCCATACGTAGGTGGACAAATTGCTATTGCCGAGGCAGCTAGAAATCTCGTCTGTTCAGGAGCAAAGCCACTTGGCGTTACGGATTGTTTAAACTATGGTAGCCCTGAAAAACCAGAAATTTTCTGGCAGCTAGAAAAGTCTACAGACGGATTAAGCAATGCTTGTGAAGTGCTCGAAACACCAGTAATTGGTGGGAACGTATCTTTATATAACGAAACAAATGGAGTTGCAGTATATCCAACACCTGTTATTGGGATGGTAGGTCTTGTAGAAAACGTAGATCACATTACGAAGCAGCAATTCCAACAAGCTGGAGATTTAATTTATGTCATTGGTGAGGCTGGAGATGACTTCGGTGGAAGTGAGCTACAAAAGCTTCAAAAAGGTGCTATTTCTGGAAAAGCGCCAGCTATTGACCTGTCTGTTGAAAAAGCGCGTCAAGATCAAGTTTTAGCTGCTATTCAAGCTGGAACAGTATCTTCTGCCCACGATTTAGCAGAAGGTGGTTTTTTAGTCGCATTAGCAGAATGTACTTTCGGTACT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_014829|448926:457214|456632_457214_+|WP_041808106.1|DBSCAN-SWA MMNLGVFASGSGSNFEAIMEAVKSGAVAGKVQLLVCDKEDAYAIKRAENHGVPVFTYQPKVFASKEAYETEILRQLQAYNVELIVLAGYMRLIGSTLLSAFEHRIVNIHPSLLPAFPGLDAIGQAFDAKVKVSGVTVHYVDAGMDTGPIIAQEAIHIEDGDTKEDVQRKIQQVEHQLYPKTIQGVIEQITRGV >NC_014829|448926:457214|450335_451049_+|WP_013487039.1|DBSCAN-SWA MQKGACLYEGKAKRIYKTETPGVLWVEYKDDATAFNGEKKDVLTGKGRLNNEISSLIFTQLKQEGIDSHFIERLSSNEQLIKEVEIVPIEVVVRNVAAGSLVKRLGIERATAFNPPIVEFYYKDDALGDPIITDEHVRVMNLASKEEVDQLKDMALQVNEHLKQMFKKVGIQLVDFKLEFGRDQTGAILLADEISPDTCRLWDEETGESFDKDLFRFQLGNLQDGYETILTRLGGLK >NC_014829|448926:457214|448926_450222_+|WP_013487038.1|DBSCAN-SWA MIERYTRPEMGAIWTEENRFQAWLEVEIQACEAWAELGDIPKEDVKKIRENAGFNVDRIKEIEEETRHDVVAFTRAVSETLGEERKWVHYGLTSTDVVDTALSYLLRQANEIIEKDLINFINILKDKAKEHKMTVMMGRTHGVHAEPTTFGLKLALWYEEMKRNLERFRAAAETVRVGKISGAVGTYANIDPFVEKYVCEGLGLEASPISTQTLQRDRHAHYVATLSLIASSIEKMAVEVRALQKSETREVEEFFAKGQKGSSAMPHKRNPIGSENMTGLARVLRGHVVTAYENVALWHERDISHSSAERVILPDATIMINYMLNRFGNIVKNLTVFPDNMKRNMDRTYGLIYSQRVLLTLIDKGMAREEAYDLVQPKAMEAWEKAVPFRSLVEANEQIMSHLSKEELDDCFDYHHHLKHVDTIFDRLGLN >NC_014829|448926:457214|451966_454189_+|WP_013487042.1|DBSCAN-SWA MQLLHEPSPQMIKDERIYAEMGVTDEEFRMVENILGRLPNYTEIGLFSVMWSEHCSYKNSKVVLKKFPTTGEKVLQGPGEGAGIIDIGDEQAVVFKIESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIFSMGARPVGLLNSLRFGELETPRVKYLFEEVVAGIAGYGNCIGIPTVGGEIQFDPCYDGNPLVNAMCVGLIDHKDIQKGQAKGVGNSVIYVGASTGRDGIHGATFASEELSEASEAKRPAVQVGDPFMEKLLLEACLEAIQNDALVGIQDMGAAGLTSSSAEMASKAGSGIEMDLDKVPQREKGMTAYEMMLSESQERMLLVVEAGREQEMIDIFERWGLEAVVVGKVTDDKKLRLLHKGEVVADVPVDSLAEDAPVYHKPSKEPAYYSQFQNEAPFKPAVADMKETLAQLLAQPTIASKEWVYDQYDYMVRTNTVVAPGSDAAVLRIRDTEKAIAMTTDCNSRYIYLDPYVGGQIAIAEAARNLVCSGAKPLGVTDCLNYGSPEKPEIFWQLEKSTDGLSNACEVLETPVIGGNVSLYNETNGVAVYPTPVIGMVGLVENVDHITKQQFQQAGDLIYVIGEAGDDFGGSELQKLQKGAISGKAPAIDLSVEKARQDQVLAAIQAGTVSSAHDLAEGGFLVALAECTFGTQLGAKVTLQGEDVVKESFAETPSRYIITVAKDNQSAFEALIPDATLVGEVTKEATLTVQDQAGKSVLTEEVSKLEDTWRGAISCLLK >NC_014829|448926:457214|451048_451303_+|WP_013487040.1|DBSCAN-SWA MYEVKVFVSLKEAVLDPQGAAVKGSLHHLGFEGVEEVRIGKVMTLRIESTADKIEAEVKEMCEKLLANPVIEDYRFEIEEVVSQ >NC_014829|448926:457214|451299_451983_+|WP_013487041.1|DBSCAN-SWA MKFAVIVFPGSNCDLDMYHAVKDELGVEAEYVWHDETSLEGFDGVLLPGGFSYGDYLRCGAIARFSPIMDAVIQAANEGKPVLGVCNGFQILLEAGLLPGAMRRNKNLKFICRPVQLVVENNETLFTNGYAKGQEITIPVAHGEGNYYCDDDLLQKLVANKQIVFSYQSDVNGSVNDIAGITNEAGNVLGMMPHPERAVDSLLGSDDGLTLFKSILSHWRERNAITS >NC_014829|448926:457214|454173_455586_+|WP_013487043.1|DBSCAN-SWA MFAEIKGLNEECGVFGVWGHKDPAPIAYYGLHSLQHRGQEGAGIVVSDGEKLKAHKGMGLVNDVFGKGEINDMHGKGAIGHVRYTTAGDSNLLNVQPFVFNSQTGSLALAHNGNLVNANALKHQLERQGSIFQTTSDTEVVAHLIKRSGYDTIEERIKNALTMIKGAYAFIFMIEGKMMAALDPNGLRPLSIARLGDGYAISSETCAFDIIGAEYLREVEPGELVIIDDDGLRSERFSSSPKRAICSMEYVYFARPDSNVDEINVHQARKNLGKQLAEEQPVEADVVTGVPDSSISAAIGYAEQAGIPYELGLIKNRYVGRTFIQPSQELREQGVKMKLSAVRGVVEGKRVVMIDDSIVRGTTSRRIVKLLREAGALEVHVRISAPPITNPCFYGIDTSTKGELIASVKTVEEIREEIGADSLSFLSVEGLQKGIGRSPEMENHGQCLACFTGSYPTEIYPETDHPQEKC >NC_014829|448926:457214|455601_456639_+|WP_013487044.1|DBSCAN-SWA MSKAYESAGVNIEAGYEGVRRIKKHVESTKRPEVLGSLGSFGGLFDLSSFTYKEPVLVSGTDGVGTKLLIAQEMGKHDTIGIDAVAMCVNDIIVQGASPLFFLDYLALGVNDPEVVEQVVSGIAEGCRQSGAALIGGETAEMPGLYKPEEYDVAGFVVGIAEKSQLFDPTNVAAGDVLIGITSSGVHSNGFSLVRKIVAEQGLSWSDPFGDSGKSIGEVFIEPTRIYVKTLKPFLSNGLVKAAAHITGGGLIENVPRMLPEGLGAEINVDAWELPQVFQWLKEKGNLTAIDLYETFNAGIGLVLTVKASDADEVIKTLTENGESPKVIGEVVTGTGVTFKGEGVS |
8 | Synechococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
1991506 : 2000610
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_014829|1991506:2000610|DBSCAN-SWA TATGGACAATAAGTATATGAAGATGGCAATTGAGCTTGCAAAAGTGACAGAAGGGCACACTACCCCTAACCCTGTGGTAGGTGCAGTTATTGTAAATAATAATCAAATTGTTGGCTTTGGAGCACATTTAAAGGCTGGTGAGCATCATGCAGAAAAGCATGCGATTGAAATGGCAAAAGATAAAACAGAGGGGGCAACGATTTATGTAACACTTGAGCCCTGTTCCCACTACGGTCGTACACCGCCATGTGCTGATGCAGTAATTGAGGCCGGAATCAAGAAAGTTATTATTGGCTCTGTTGACCCAAATCCGAAAGTGTCTGGAAGAGGTATAAAGAAGCTTGAGGATGCAGGTATTGAAGTAGAGGTAGGGTGTATGAAGGAGGAAACGGACAAATTAAATGATGTTTTCTTCCATTTTGTTAATACAAAAAAACCTTTTGTTACCTTGAAATCTGCTACTAGTTTAGATGGGAAAATTGCTACTCGTACTGGGGAGAGTCAGTGGATCACGAGTGAAGAGTCTAGAAAAGATGTCCATCAATTACGCCATAAGAACGATGCTATTCTAGTAGGTATTAATACGGTAATTAAAGATGACCCTGCTTTAACAACTAGATTACCAGACGGTGGAAAGAATCCAATTAGAGTCATCTTAGATCGAGAACTTAGGATACCGATGACAGCGAAACTTATTAATGATCATGCGTCTTTGACATGGGTCATAACGACACGGTTAGCTAATAAGGAAAAAATTGATTTGTTGCGAGACAAAGGGACTAAAGTATTGATACTTGATGATGATAAGATTGAAATTTCTTCTTTACTATATTTACTTGGGGAACATAACATTACTTCTCTTTTAGTAGAAGGTGGAGGTACCGTAAACGATTCATTCTTAAAATCGGGGGAATTTCAACAAGTGATTGTGTATATAGCCCCTTTATTAATCGGTGGAGAAGATGCTCTTTCTTCCTTCTCTGGTTCTGGAATAGAAAAATTAGCAGATGCAAAAAAATTAAAAGTCCAATCATTAGAGCAAATTGGTAATGATATAAAGTTAGTTTTGACGAAAGGAGAGGAAGACTAAATGTTCACAGGAATTATTGAAGAGAAAGGACATGTAAAAACGATTTCACAATCTGGCGATTCCATAGTAATGGAAATTAAAGCCAAAAAAATATTACAGGATGTCCATTTAGGAGATAGTATAGCAGTTAATGGCGTATGTCTTACAGTTACAACATTTAATGATCATTACTTTACGGTTGACATGATGCCAGAAACGGTTAGAAATACTAGCTTAAAGAATTTGACAGTTGGTTCGAAAGTGAATCTAGAAAGAGCAATGGCTGCTAATGGTCGATTCGGGGGTCACTTTGTTTCTGGACATGTTGATGGAGTGGGTACCATTCGCAAAAAGCGGCCTGAACATAATGCTGTATACTACGAGATCGAAGTTTCATCAAAATTGCGAAAGTATATGATGATGAAGGGAAGTATCACTGTGGATGGTACTAGCTTAACAATCTTTGGCTTGTCTGACGATACTTTTACAATATCGATCATTCCTCACACGATCCAAGAAACAATTATTGGTGACAAAGGACCCGGAGATATTGTGAATGTAGAATGCGATATGTTAGCAAAATATATAGAGGAACTAATTATACAACGAACTAATTCAAATAAAACTGGAAATATAACAGAAAGCTTTTTGAAAGACAATGGTTTTTAATTGAAAGAGGGGGGATTAAGATGTCTATATTTGATCCAATTGAAGAAGCGATATATGAGCTTATGCAAGGAAAAGTAGTCATTGTGTGCGATGATGAAGATCGTGAAAATGAAGGTGACTTTATAGCATTAGCTGAAAAAGCAACACCAGAGGTCATTAACTTTATGGCTACACATGGTAGGGGTCTCATTTGTGCTCCAATTACGAGAAATCTAGCAGAAAAATTAGAACTAGTCCCAATGGTTGATCATAATACCGATCCTCATGGGACAGCTTTTACGATTAGTATAGACCACAAAAATTCAACTACTGGTATTTCAGCCCATGAGCGATCTGAAACAGTAATGAGCTTGATCGAAGAAAGTACGAAGCCATCTGACTACAAAAAACCAGGTCATATATTCCCTTTAGTTGCTAAAGACGGGGGGGTACTTCGAAGAGCAGGACATACTGAGGCAGCTGTTGACCTTGCACGTATGTGTGGAGCGAAACCAGCAGGTGTTATTTGTGAAATTATGAATGATGATGGTTCAATGGCAAGAGTTCCGAACTTGCGAAAAATTGCTGACGAGCATGAATTGAAAATGATAACGATAAAAGATTTAATACAATATCGTAATAGAAAAGATAAATTAGTTCAACGTGAAATTGAGACATCACTCCCTACTGACTTTGGGGATTTTAAAGCAATAGGTTATAGTAACATTGTAGATGGAAAAGAGCATGTTGCTTTTGTCAAGGGTGAAATTAATGGAGATCAACCGACTCTCGTTCGCGTTCATTCTGAATGTTTAACAGGTGATGTATTTGGTTCGCAACGATGTGATTGTGGACCTCAGCTTCATGCTGCTTTAGCTCAAATTGAGACAGCAGGATCAGGAGTGTTACTATATTTGAGGCAAGAAGGAAGAGGGATTGGGCTATTAAATAAATTAAGGGCTTATAAACTACAAGAAGAAGGCTATGATACAGTAGAGGCAAATGAAAAGCTTGGATTTGCTCCAGATTTACGAGAGTATGGTATTGGCGCACAAATTCTTCGAGATCTTGGTGTTAGAAAGATGAAGCTACTAACAAATAACCCAAGGAAAATTACTGGATTGAAAGGTTATGACCTTGAAGTGGTAGACAGAGTTCCAATTCAGCTACCATCAAAAAAAGATAACGAAAGATATTTAAAAGTAAAAAAAGATAAACTAGGACATTTATTACATTTTTAATAACATTGGAGGAATTTATGATGGGGAAAGTATTTGAAGGAAATTTAGTAGGTACTGGATTAAAAGTAGGTATTGTAACAGCAAGGTTTAATGAATTTATTACGAGCAAACTACTTGGTGGAGCTGAAGATGCATTGAAACGCCACGGTGTAGAAGAAAATGACATTGAAGTAGCGTGGGTTCCTGGTGCGTTTGAGATACCATTAATCGCAAAGAAAATGGCGGAATCAGGTAAATATGACGCAGTTCTTACATTAGGGACGGTTATTCGTGGATCTACACCTCACTTTGATTATGTATGTAATGAAGTAGCAAAAGGAGTAGGATCATTGTCTTTAACAACTGGTATTCCAGTTATTTTCGGTGTACTAACAACAGATACAATTGAACAAGCGATAGAAAGAGCAGGAACAAAAGCAGGCAATAAAGGATATGAAACAGCTGTTGGTGCGATAGAAATGGCAAACCTATGTAAAGGTATTTCATAAGGTAAAAAAAGAAAGGGTGGATTTAATCCATCCTTTCTTTCGTGCGCTTGGCAGCGCATCGAACTAATGGGTGGAAGTCCCTAACACGCCGAAGTGGCGGAAGTGTATAGCTGACAGGTAGTGCATGTCCGCGAGGAAATGTGTGGAGGACCTGAAGGCGAATCTCGGAACAGACGACTAACCACCATGTTGGCTGACAGAATCGGATAACCTTGCGAAAGATGGGGAAGTCCAGTGCCACAAGAGGGTTCTGTAAGTTATGAGGACTGGGTTCGAGGGAAAGTTTGATGACGTGACCCAAGGAGATCTCATCATCTCCGCTATGCAGTGGTAACTCTCAAACAAGTCCGTGAGGGGCGAGTTGGGATTATGGGTGGTGAGAAGTCAGAGCAGGGGATATTAGTGAATAAGCTCGTCGGAAAAGTCGTAATGGCGAGTGACTTAGCATGGCGTTGCTAAGGCGAGCCCTTACCCAAAAGGAAGGGACTTGATGCGAAGCCCGTCTGTCCATGGAAGAAAAGCAATTCAATTTAGAAAGCCGTCATGTGCCAAGCAGAAGCCAGTGAGGTGGAGCCTAAGAACTGGGGTCGAATAGTAAGTAGACCGTTTGGGACGGAGTACTTTAGGTAAAACTCGGAAAATGCCGTGTGCTAGTCATCCGAGAGAGCCAAGGGAAGGATACGAACATGAGCGAGAGATTAAATCAGAAGAGTTTTCGTGATGGAGTAAAGTCTACACAAAAGAGAAAATGGTATAGCTTAATGGATAAGGTATGGGCTATGTCCAACATGGAGGAAGCATTCAAAGAGGTAAAACGAAATCGAGGGTCTGCAGGAGTAGATGGAGTTTCTATCCGTACTTTTGAACACGGGGTGGAGGACAATGTACAAGTTCTTCAACGTGAATTAAAAGAAAAGGCCTATAGACCGAGACCCGTGAAGCGTGTATTTATTCCAAAAACGGATGGGACGAAAAGACCTTTAGGAATTCCTACTGTGAGAGACCGTGTTGTTCAAGCGGCTGTACGTCGCATTATAGAGCCAATTTTCGAAGACAAATTTTTGGATTGTAGTTTCGGATTCAGACCGAATAAAAGTGCACATATGGCATTAGAGAAAATCCGAAAGGATTTAATGGATGGGTATGTGTACGTAATTGACGCTGATCTAAAAGCCTACTTTGATACAATCCCACAGGATAAACTCATTCAAGCTGTAAGGGAAGAAGTAGTAGACGGTAGTGTTATTCGGTTGATTCAGAGTTTTTTACAAGCAGGGGTTATGGATGGAGGAAGCTTCCACCTTACTGAAAAAGGAACACCTCAAGGTGGGGTTATTAGTCCATTACTTGCAAATATCTATTTACACCCACTCGATGAACTGATGACAAAACGGGGGCATCGAATCACAAGGTACGCTGATGACTTTGTTATATGTTGTAAATCACAAAAAGGGGCTGAAAGAGTCCTTAAATCAGTAACTCGCTTCTTAAACGAGGAACTAGGTTTAACGGTTCACCCTGAAAAGACTAAGGTTGTTAATAACCTAGAAGAACCATTTCTATTTTTGGGTCACGAATTCAAGGGTGGTTATTATGTTTCTGCATCTCCTAAAGCTTTAAAGAAATTTAAAGAAAAGGTTAAGGAGATCACTAGGCGAAACCAAACCGTAAACATCGAGACATTGATTAAAGAAAAACTTAATCCATACCTAAGAGGTTGGGGTAACTACTTTGGTCACTTTTATGGGAAGACTATATTCACTATATTTGATGGATGGATACGTAGAAGATTAAGATCAGTTCAATTAAGAAGTTGGAGAAATATTAGGAAATTGCACAGGGAACTGAGGAAAAGAAAATGGAAAGGAGATCTCCCTAGATTGCGTATGAATAGATGGAGAAGCTCTTTGTCTACCCCAGTACATACTGCTTTACCTAAAGAATGGTTCGTAGAAATCGGTCTTGTCTCACTTGTAAAACTTTACAATGATCATCATCCCCAACGGGGATAATCATGGAGGAGCCGTATGCGATGACCCGCACGTACGGATCTGTGAGAGGCGCATGAATAATTTCATGCGCCTACTCTATTTCTTTTTGTCTAGAGATTTTAAACGTTCTTCTATAACGTCAGACCGATCGCGTAGTTTATGACGATAAACTAATGACTCATCAGATTGGTTGTCGTTATCACACCAAGTGAGCTGGATTTGTGCACACTTTTCTTTACATAACGCGACGAGTTGATTGTCGCTAATAGGAAGGTTCATTGTTTTGTAACCTCCACCATTTTTTATGTTAAGTATCCGTTGTCTCGTCATGTCACTAAGCGTTTTTACATCTAGACCTAATTGTCGAAAAGCAGTTTCACTCTCTTTTAAGTGATTAAGGGACTTTTCATATAAACGTAAGCTACCACTATAATTTTTCTGTCGTTCGTGGTATATAGCTACGGCTAATTGGATAAGACCAAGCCAATGATTTTCGTTGTGTTCTTTCCAATATTCCTCCATAATTTCATGACATTCAAAAAAATCTCTAGTGCAATGAAATTCAATTAAAAAGTCAATGTAGGCTTTGGGATAGTTTTTCATTAAAAGCCTCCTCATAAAATGGATAAAATTTTTACTTACTAAAAATAAGCGTATCATATGTTAGGAAAAAATGCTTGTGATAAATTACATAGGAAAGTCCGTTCAAATGCATATGTTTATGATATAATTTTATCAGATAAAGGAAAAATGGTGACGCATATGCAATATAGTGTAAAACTGCAATCTTTCGAAGGGCCGTTAGATTTATTGTTACATCTTATTCAAAAAAATGATCTGGACATCTATGATATACCTGTAAAACAGATAACAGATCAGTATATGACCTATATTCATACGATGCAAGTGCTACAATTAGATGTTGCTAGCGAATATTTAGTCATGGCTTCTACTTTGTTACATATGAAAAGCCAAATGCTTCTCCCAGCAACAGAAGATGAAATTGATGAAGACTTTGAATATGATGAAAATGAAGACCCTAGAGAAGAACTTATGTTTCGATTAATTGAATATAAAAAATATAAAGAGGCAGCAAGTGGCTTAAAGGAGAGAGAACGTGCAAGAAGTGACTTATTTTCAAAGCCTATGACTGATTTAACACCACTTTTGGATGAGGAAGAGCCTTCAAGTATGAATGTATCCATTTATGATATGCTCCAAGCATTTCAAAAGCTGCAAAAAAGAAAGAAGTGGAAGGAACCAGTAACTTCAAGAATTCAACGGGATGAAATCCCAATTGATGAAAAAATGGCCCAGATTATGGAAACATTACAAAGATATCAAGGAAAAAGGTTATTTTCCGAGCTTTTTGCAGAAGAAAAAGAGAAACACCATATTGTTACATCTTTTTTAGCGTTGTTAGAGTTGATGAAAGCGAATGTCATTATATGTACGCAACATAAAAACTTCGAAGACATCTTGATTTCACAGAAGGGGGAGGATAAACTTGAAGAGTTATCAAATTAAAGCAATCATCGAGGGTCTCCTTTTTGTATCCGGTGAGGAAGGGATAGACGAGAAACAACTAATGGATGTTCTTCAAATGGATAGAAAAACAATTAAATTTTATATGAATGAATTAATAGAGGCATACTCATCTGATTCAAGGGGTATACAAATAGTGGAAATAGCTGGAGGGTATCAATTTACAACAAAAGCTGAGCACGCCCCGTATTTTAAAAGACTAGTGCAATCTCCTTCAACGACGACATTATCACAAGCTGCTTTGGAGACACTAGCAATTGTTGCATATAAACAACCGATATCTAGAATTGAAATTGAAGATATACGTGGAGTGAAATCAGAAAGGCCAGTGCGTACTTTAGTAGCAAAGTCCTTAATTAAAGAGGTTGCTCGTTCAGAAAAAACAGGACGCGCTATTTTGTATGGTACAACGAAAGAATTCTTAGAACAATTTGGATTACGATCAACAAAAGAATTACCACCTCTTCCAGAATCAGTACCTGAAGAAGAAGTTGAGGAAGAAGTGGATTTATTCTTAACAAGATTTCAAGACTTTTCCTTGAAAGAGGATCAAGCTAAATAAGAACACTGAATAAAGAAGGGAAGAAATGCTAAATGGGTAATGATTTAGTACAACAACAACTTACATTTACTATGGAAAAATTAGAAAAAACAGCTGAGGAAATTAGAGGGTATTTAAATTCAACGACAATAGATAGTCTCGTTCAAGAAGGAGAAGGGGGCTCTGCGTCTGATTATATTGATATTTTGGATCAAATAAGACGTATTTTAGTTTTTTTTGATGAAGGGCGCGAATCAGGCTATTTGTTATTAAGAAGTGAAAAATTCCGTAAAGGTGCAGCAGAAAAAACGTTGTATTGGATTTTTCATCAATGTATTGAGGAGTTCTTCCAACCTAAACTAGACGTATGGTATGAAGATAGTAGAGCTGCTTATACTGGGAAAAATGCTATTCGTTTTAGAGTGGCTGTTCCACAACAACTAAAGGATTTAGTGCAAAAAATTGAAGGGCCTTTACAAGAGGTAAGGGAAGAATTGGAATATTACGAAACAGACTTTCGAACAAAGATGCGTCAGCGTGAAGGAGAATAATATATTATTTAAGTCTCGTCACTAGCCCACGATAAGAAACGTGGGCTTTTTTTATATTCATGACAGGTGAAGATATTTCCAAAAAAATGTAATTTTACATGAACGAACCTAGCTCATTCATGCATATGATGCTATTGCATGTATTGAGGAGGGTGAATATGTTGGATGTAAATGACTATATTGAAAAGTTAAAGGAATGGCTAAATGACTTTGAAGAGCAATTGCATCAATCAGATGGCTTAAGTGAGAATTTTGTGGATGAGGTGAAAGGTCTCCAAAATAAGTTAAGTCGTGAAGAAGACCATGGAAAGCTTGGTAAAATTCAATATGAAGCAGAACAACTTTATGACAGGTATATTAATAGCAGAGCCGTTGAATCGCGTAATGAAAACGATGGTGAGAGTAAGAGAGTAGCCATTGGAGAACATACTTTGCCAAGATTAAACTATCAATATCATGATTTGGAGCCATACATTGCCAGAAGAATTATGGAGCTACACCATAAAAAACATCACCAATCATATGTAGATGGATTGAATAAGGCAGAAAAAGAGTTGCAAAGGCAAAGGGAAAGGAATCATTTTGAACTCGTAAAACATTGGGAACGCGAACTAGCCTTTCACGGAGCAGGACACTATTTACACACTCTTTTTTGGAAAGTGATGACACCAAAGGGCGGTGGACAACCTAATGGTGCTTTGCTAAAGCAGTTTGTTCTTGATTTTGGTAGCTTTGAAGCATTCAAAGCTCACTTCTCAGAAGCAGCAAAAAATGTTGAAGGAAGTGGATGGGCAATTTTGGTCTGGTCACCACGGCCAGGTCGGCTAGAAGTTTTAACAGCTGAAAAGCATCAAAATTTAACGCAATGGGACGTTATTCCTTTGTTACCTTTAGATGTATGGGAGCACGCATATTATTTACAATATGAAAATAAGAGAGAAGACTATATTAGTAATTGGTGGAAAGTGATAAATTGGCCTTATGTGCAACAAAGGTTTAATGAGGTGAGAAACAACGTATCGATTGTCTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_014829|1991506:2000610|1999081_1999579_+|WP_013488409.1|DBSCAN-SWA MGNDLVQQQLTFTMEKLEKTAEEIRGYLNSTTIDSLVQEGEGGSASDYIDILDQIRRILVFFDEGRESGYLLLRSEKFRKGAAEKTLYWIFHQCIEEFFQPKLDVWYEDSRAAYTGKNAIRFRVAVPQQLKDLVQKIEGPLQEVREELEYYETDFRTKMRQREGE >NC_014829|1991506:2000610|1998449_1999049_+|WP_013488408.1|DBSCAN-SWA MKSYQIKAIIEGLLFVSGEEGIDEKQLMDVLQMDRKTIKFYMNELIEAYSSDSRGIQIVEIAGGYQFTTKAEHAPYFKRLVQSPSTTTLSQAALETLAIVAYKQPISRIEIEDIRGVKSERPVRTLVAKSLIKEVARSEKTGRAILYGTTKEFLEQFGLRSTKELPPLPESVPEEEVEEEVDLFLTRFQDFSLKEDQAK >NC_014829|1991506:2000610|1997038_1997545_-|WP_013488406.1|DBSCAN-SWA MKNYPKAYIDFLIEFHCTRDFFECHEIMEEYWKEHNENHWLGLIQLAVAIYHERQKNYSGSLRLYEKSLNHLKESETAFRQLGLDVKTLSDMTRQRILNIKNGGGYKTMNLPISDNQLVALCKEKCAQIQLTWCDNDNQSDESLVYRHKLRDRSDVIEERLKSLDKKK >NC_014829|1991506:2000610|1992595_1993243_+|WP_013488403.1|DBSCAN-SWA MFTGIIEEKGHVKTISQSGDSIVMEIKAKKILQDVHLGDSIAVNGVCLTVTTFNDHYFTVDMMPETVRNTSLKNLTVGSKVNLERAMAANGRFGGHFVSGHVDGVGTIRKKRPEHNAVYYEIEVSSKLRKYMMMKGSITVDGTSLTIFGLSDDTFTISIIPHTIQETIIGDKGPGDIVNVECDMLAKYIEELIIQRTNSNKTGNITESFLKDNGF >NC_014829|1991506:2000610|1997704_1998469_+|WP_013488407.1|DBSCAN-SWA MQYSVKLQSFEGPLDLLLHLIQKNDLDIYDIPVKQITDQYMTYIHTMQVLQLDVASEYLVMASTLLHMKSQMLLPATEDEIDEDFEYDENEDPREELMFRLIEYKKYKEAASGLKERERARSDLFSKPMTDLTPLLDEEEPSSMNVSIYDMLQAFQKLQKRKKWKEPVTSRIQRDEIPIDEKMAQIMETLQRYQGKRLFSELFAEEKEKHHIVTSFLALLELMKANVIICTQHKNFEDILISQKGEDKLEELSN >NC_014829|1991506:2000610|1999677_2000610_+|WP_157184187.1|DBSCAN-SWA MNEPSSFMHMMLLHVLRRVNMLDVNDYIEKLKEWLNDFEEQLHQSDGLSENFVDEVKGLQNKLSREEDHGKLGKIQYEAEQLYDRYINSRAVESRNENDGESKRVAIGEHTLPRLNYQYHDLEPYIARRIMELHHKKHHQSYVDGLNKAEKELQRQRERNHFELVKHWERELAFHGAGHYLHTLFWKVMTPKGGGQPNGALLKQFVLDFGSFEAFKAHFSEAAKNVEGSGWAILVWSPRPGRLEVLTAEKHQNLTQWDVIPLLPLDVWEHAYYLQYENKREDYISNWWKVINWPYVQQRFNEVRNNVSIV >NC_014829|1991506:2000610|1995637_1996963_+|WP_013488213.1|DBSCAN-SWA MSERLNQKSFRDGVKSTQKRKWYSLMDKVWAMSNMEEAFKEVKRNRGSAGVDGVSIRTFEHGVEDNVQVLQRELKEKAYRPRPVKRVFIPKTDGTKRPLGIPTVRDRVVQAAVRRIIEPIFEDKFLDCSFGFRPNKSAHMALEKIRKDLMDGYVYVIDADLKAYFDTIPQDKLIQAVREEVVDGSVIRLIQSFLQAGVMDGGSFHLTEKGTPQGGVISPLLANIYLHPLDELMTKRGHRITRYADDFVICCKSQKGAERVLKSVTRFLNEELGLTVHPEKTKVVNNLEEPFLFLGHEFKGGYYVSASPKALKKFKEKVKEITRRNQTVNIETLIKEKLNPYLRGWGNYFGHFYGKTIFTIFDGWIRRRLRSVQLRSWRNIRKLHRELRKRKWKGDLPRLRMNRWRSSLSTPVHTALPKEWFVEIGLVSLVKLYNDHHPQRG >NC_014829|1991506:2000610|1991506_1992595_+|WP_013488402.1|DBSCAN-SWA MDNKYMKMAIELAKVTEGHTTPNPVVGAVIVNNNQIVGFGAHLKAGEHHAEKHAIEMAKDKTEGATIYVTLEPCSHYGRTPPCADAVIEAGIKKVIIGSVDPNPKVSGRGIKKLEDAGIEVEVGCMKEETDKLNDVFFHFVNTKKPFVTLKSATSLDGKIATRTGESQWITSEESRKDVHQLRHKNDAILVGINTVIKDDPALTTRLPDGGKNPIRVILDRELRIPMTAKLINDHASLTWVITTRLANKEKIDLLRDKGTKVLILDDDKIEISSLLYLLGEHNITSLLVEGGGTVNDSFLKSGEFQQVIVYIAPLLIGGEDALSSFSGSGIEKLADAKKLKVQSLEQIGNDIKLVLTKGEED >NC_014829|1991506:2000610|1994483_1994951_+|WP_041808193.1|DBSCAN-SWA MGKVFEGNLVGTGLKVGIVTARFNEFITSKLLGGAEDALKRHGVEENDIEVAWVPGAFEIPLIAKKMAESGKYDAVLTLGTVIRGSTPHFDYVCNEVAKGVGSLSLTTGIPVIFGVLTTDTIEQAIERAGTKAGNKGYETAVGAIEMANLCKGIS >NC_014829|1991506:2000610|1993269_1994463_+|WP_041808789.1|DBSCAN-SWA MFDPIEEAIYELMQGKVVIVCDDEDRENEGDFIALAEKATPEVINFMATHGRGLICAPITRNLAEKLELVPMVDHNTDPHGTAFTISIDHKNSTTGISAHERSETVMSLIEESTKPSDYKKPGHIFPLVAKDGGVLRRAGHTEAAVDLARMCGAKPAGVICEIMNDDGSMARVPNLRKIADEHELKMITIKDLIQYRNRKDKLVQREIETSLPTDFGDFKAIGYSNIVDGKEHVAFVKGEINGDQPTLVRVHSECLTGDVFGSQRCDCGPQLHAALAQIETAGSGVLLYLRQEGRGIGLLNKLRAYKLQEEGYDTVEANEKLGFAPDLREYGIGAQILRDLGVRKMKLLTNNPRKITGLKGYDLEVVDRVPIQLPSKKDNERYLKVKKDKLGHLLHF |
10 | Staphylococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
2264279 : 2325666
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_014829|2264279:2325666|DBSCAN-SWA AATGGTTGAGTATGTAATTGGCGAAGCTCTCATTTTAGTGCCAGTCCTACTTATTATTGGAAAAATAATAAAAGAAGCTCAATATGTCCCGAATAAATATATTCCATCAATACTTTTATGTATTGCATTGCTTTGTTCAGGATTTTTAATTGGATGGCATATTGAAGCTTTTATTCAAGGTGTATTAGTTACTGGAGTTGCTGTTTTCAGCCACCAAATTTATAAACAATCTACAAAATAGTTTTATCAAAGTAGAAAAATAAATATAACGTAATAGAGGGAGTCTCATAGACTATAAAGCATCTTGACTACACTATCCACATACCACAATAAAGACTCAAAGTATGCAAGTGATAGCGTCAAGGCTACGTATATTCATTCATTAAATGGTGGATCAGAAGGGAAAATACCCTGTTGATTCACCATTTTATTTTTTATATAAAAGCAAGATAAGATCGAATCTTATGTAAAAAATAGGTATTTATTACATAATAGGAGTATTGACCTATGCAATACCTATTTTTTATTATATATTTATATTAAAAAGGAGGGGTTGGATGTCTTCCTTCACATACGTTGGTGTAAGTACTGCAGATTCATGGGAAGTTGCTGGTAGAGAAGCGACTATTGAAGCAATGTCTTATATTACAAATGCAAATAAACCAAAAATGTTAAAGATCATGTATACCGAGGACGCAGAGCCTGATGATTATAAAGCGATCTACAAAGGTTTAAGATCTGTTTCTAATGATGTGATCGTAATTGGTGGTAGAGTTAAGTATTTGTATACCTCAAAAGGTGTTTTACATAAAGGGGTGGTAGTCGTTGCTTTAAATTGGGATGGAGAATTAATAGAACCGATTCTTTTTCACCGAGATTATGATTTAAATAAAATAGATGAGCAGTTTAACCAATCTATTAAATCGTATCAACATGACTATGAGGTTACAATATATACGTTGTGGTCTGGTTTTAATTATATGATGAATGTTGGAGAACAGTGGTACAATACATTTGGTCCATCAATTAATATATTTGGTGGTGGTTGTGTAGAGATTGCTATTGAAGATCAAGTATACTTTGATTATGGGGTTGCCGTTGCTTTTTTATCTAAGAAAAGGTTTGAATATGTACTTGGGCATGGTTGTCAGCCAGAAGGTCGTCCTTTAATGATAACACGTGCAGATAAACATAACATTTATGAGATAGATGGTATGAGTGCGACAGAAGTGTATGATCAGCTTTGTGATGACGTTACTGCGAAGCTTGGTAAAAAGAGGGATGAAGGTGTTGAATGGTCTTTTTCATTCGGTTATCCTACAGTAAATGGGGAGTATGTTCTTCAGGAGCCTGTAGCTATTAATAGAGAGAATGATAGTATTCAAATGTTTTTAGAAATTCCAGATAATAGTGTTGTTAGAATTTTAGTTGCGAGGTCAGATACTATTTTTAACAAGTCTGTACAATTAGTAGATGAGTATATGAATAAATTCGATAACACACCTAATTTTAATTTAGTGATAAACTGTGTTAGCCGAATGGACGCCTTAGACTACCAATTTCGTGAAAAAGAATTAGCGTTGTTTAAAGAGCATTTAGGCGATAATCATTTTGTCGGTTTCTCATCTATTGGAGAATTAGGAATTCCTAAAGGTATGCCTATATATAGTCATCAAAAGACGCTAATTATTTTTGGTGTTTCGTAATAAAGGGGGTATAAATTTGAATGAAGTCCCTAGTAATTTACTTCAAGCGTTAGAAAATGATATAACTCAAATCGCAATATTATATGATATATCTATGATCGTTGGTATTAATGATCGTGATCACTTAATGTCTTTAATATTAGATAAAGCAACGAGAACATTAAGTAGTGATATGGCTGTTGTTATTTTAAAGAATAATCATGTCTTGGAAGCCGTTTGTTCGAGAGGAGTTTTAATTAGCGAAGTAGATCGTTTACTTGGAGATGATTCTCTTCAATCAGACATTATTAACTTATGTGATAATGTACAAAACTCTCATTTCGTAAAGGAATCAACGGACGGTATTGACTTTGCTGGAACGAAGTATGCGACTTTATTGTTTCAGCCTATTAAATCCCAAGGTCATGTTTTAGGAGTCATTATTATTGGACGCCTCTTGAAATCAGGCTTCAATAGAGAAGAGCTTAAACTTTTCTCCTTATTAGCACAAAAGGCTTATGTTTCATTAGAAAATATTAAGTTAAGAGAAGAAGTATATTTACAAAGCATTACAGATGCTTTAACAGGATTATATAATTTTCGATATATAGAAAGTAAAATGAGTAAGACTCTACAAGATGCTGAAGAACGACAGCAAAATTTAACGCTTGTTCTTATGGACTTTTTACACTTTAAGGATGTAAACGACAGGCTTGGTCACAAAATGGGGAATCATGTTTTAGCGCAGTTTGGCAGCTTTTTAAGAGAGCAATTTCCAGAAAATGATTGCTGTAGGATAGGTGGGGATGAATTTTTAATCGTATTTGTAGATAAAACTCTCGAGGAAGTAAAGAGAGAGTGTGAGAAGATTAAATCATTTGTTCACCGTAAAAGTGTGAAAGATATAATATCAAGAGGTATAAATTTTGGTGTTGATGTTGGTTTTTCTCGTTATCGAGAAGATGGATATAATTACGGAGAGCTGTACAAAGTTGCTGATGCACGCATGTATGAAGATAAAGCGAAAAATAAGCGTGAGCAATAATGGTTGTTAATATGTTTACTAGAAAAAATGCTTCAACTCGCTCTTATATAGGGGCGAGTTTTTTTAATTGGATTTCTTATAACGGATAATAGGCATAGCAGCAACAAGCACTGAGACGGCTGCACCCATACGAGTTACGAACTTATTAGGTTATAAATAATCATATAGTTTTTTAATAAAAAATAAAATATAGTTGTTAGAAAATTAACACATTTGTTATGCTAAATATAATAAACATATTATTACTTTTATTTTAAATTCCATTAGCTGCTTAGAACTGTATTAAAGGAGAGAGCGATATGCTAAATGTATTTCGAATCGATTCTAGATTAGGGATTTCCATACCGAAATTAGGTAAACCGTGGACTGATTATTCATTGAAGGAACAATCTCAAATCTTATCTATTTGGGAAAAAGAAAGAGCAATCATTCCAGAAAAAATAAAGGAGATTGAAAAGATTGTTACTGTGAAAACGAAAGAATTGTTAGAGGAAAATGATGTTGATAAAATGAACGAATTAAATCATGTAATTATGAACTACGCAAGTATTATTAACGATCTCAATATTTGGTTTCGTATAGAGCCACAATTAACAGAAGAACGTGAAGAGGATATAGCAACTTAAATCATGTTGATTAATAATGTCTGTTTAGTACCGATTTAGTGGTTTTGTTGAGAAAAACTAAACTGGTAAAGTAACATCGTGACGTTCCTTACCAGTTAGTTTGTTTACTGTTAAAATAAATTATTCATGAGTCTGGCCATCTAATGCTTCTGGAATCATTGTGAAGCCTTCAATGACTGTATCCTCTTCTACTTCTATCATTAAGTAACGTTTTCCACTAAAGTGTATTTGTCTTACATAGCTTAAATCTTGTGGACTAATAGCAATTTTGGCAACCTTTGTATCTATCTTAATTGATTTTGATTTATACTTTGAGACGATACTACTTGCTTTTATTTCATACTTTTCATCATCTACGACTCTCTGGAACGCTGATTCTACTTTTTCCGTATTCACGTCTTTTACACCACTATTAATTAATACTCGCTCCACATCTTTATAGTCTAATTTTGGTGATTCTTCATCCTCATTTTCTTCTACAACACGGTTAATTTCTTCATATACATTAGATAGGGTAGAAGTATTTAATTTATCTTCCGATACACTTTTTACAATTTCTTCAAACACAATTTTATCATCTTGTGCTGTCATCGCATCTTCACAGTTTAAGATCTCTTCAATGAATTGATAATCTAGTTCATATGCTTTTGCAGCGGAATAAAGTACGTGATTGACATCTGCAACATTATCAGTGAAACATGGGAATAAAAAGCCACCGATAGGCGCGTTTAAATTTATAATGGGATCTACTACAATGTTATATTTGAATTCTTTCTCGACATAATCAAAAAGTAATTCCTTTTTGGGGTCTTGAGTTTTATTCATGCTACACAATATAAAAGAATGGGAATAAACAGCATCTCGATCACTTTCTTCAGTCTCTTCATTACTTCGCTTCACAGGTTTTAAATATTCTCCTCGAATAAACGAGACGACAATATCCATTTCATATTGTTTGTTTTTCAACATTTTTTCAACGATTTTAAGCATTTGTACTTTCCAATCGTCTACTTCACTGCTAAGTAATCCTTGGTGCAAAATTAACTGGCTACTATTTTCTGCATCACGTTTAAATTTTAATTCAAATAATTTCTCATCTAATTGACCAGCTAATAATTTTTTAAAGTTATTCATAAATAACTCTTGTTGGTCTTGATCAAGCATTTCAAATGGCTGACTTTGATGATGATAAATTTCACTTGATTCTTTCATAATATATACATTGAAAATATCCTTAATTTTAAGCAAGTCGTTTTCAACCTTAAATTGTTTACGAATATTGGCGATATCTTTTTTATTCATGTTCTTAGCACTCCTTAGAAGTAGTTGATTTGTAGGGGAATCTTATATTTACAAATCGATAATTGATGCATAGAAAGAGGAGAGTAAATACATAGATTTACCCTTTATTTTTATTAGGCATTCTATTATTTTAACATAGAGTTTGTAATAATATGAACGTTAATATTACGAAATATATTAGATAGTACGGCATTGGTGTTATTTTAACCGACCAGTAACTTCAACATCAATGTGGATTTCTGGACATTGTTCATTTTGTTGAGATACGATAGTCTTAAGGCTAAAAGAAATATGGGTATCTTATGATATGTATTCTTATTTGAAACTCATAGAAAGGGTGTA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73 | Paenibacillus_phage(22.22%) | holin,portal,integrase,head,terminase,tRNA,protease,capsid,tail | attL 2280199:2280258|attR 2317081:2317164 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
2917805 : 2926505
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_014829|2917805:2926505|DBSCAN-SWA CCTACAAATAATAAAAACGAGTATCAAATATTATTTCGATTTGACCACTCGTCCCACTAATTGTTATTTCGTTTCCCCCTGGCTCTAACGTTAATACCCTTTTGCATGTATTGCTGAAAATTGATATACCGTTCTTTCTGGCTCTAACACCTTCGATTACTATTTCTTGCTGTGATGTAGTTGATCCAAAATATTGCCATTCATCACCATTACGTTCATTACGTATTTTTAAATTATTTGAGATACCTTTAAAAGTGATTTTATACTGTTGATACCACTCGCGAGGATCTAGCGCAACGTCACCTATATTATTAAATACAAAGGAAGTGCTATTAAACGTATAGTCATTTTGGTCTACGCTAAGACCTTGACCGATCCCCCATAACTCAACATCAAAAGTAAAGGGACTAAGTGAAGTTCCTATGCTCTCTGCAAAAGCTGATTCACTTTCAAATGTTAGGTTGATTCGCCCATAACGATCTATTTGTTGCGGTTCTATAGGAGATTCCAATTTCACTTTATATCTCTTCCAAGGTTGCCTAAAATGTCTAACATAAAAAGCTTCTCTACTATCGAATATTCTATTTAACTCATTTATCAAGAGATAATAGTCGTCTACATTTTCTCCCTTCAGCAAAAAGGTTGCATAGATTCTCCTACCCTCATAAACTGTACCAAGGTCTACATAACCGTTCTTTCCTTCAGGATATTCTTTGGCTGTTCTTGGTATAGGCAATGGAGCTGAAAAGGTTAGGCATGTGATTCCATAATCTAAAACATTTATCTCTGTATCTTTTCTTATAACAGATAGATCATATTTTCTCATGTTTGCTTAACCCCCATAACCAGCAGCTGATTTTCAACCTCGTTTTGTTGTTCTGAATTTATTTGATCGTAAAGATCTCTGTCTATATTTCCTTCAACAGTGATGTGATTAGTGATGTGAATAGGTCTTTCTTGATCTGATGAAGTGCTTCTAATTCTTGCAGAAACTGCATCAGCAAATGGCTGCATATATTGACCAGCTAAAGGCATTGCAACTTCTGGGCCAGCTTCCCCAAACCCTTTAATGCCCCCAGGAGTGTTTAGAACTGTTGGTTGCGTAAAGACAGCACCTCTTGCATACCAATCAATACCGATTCTTGGAACACTTGGCGGATTTATGCTAAACGATCCTTCCAAACTAAATCTAGGTAGTTTAGGAACATCTATGCTTGGGAGAGCGAGTTTTGTGTTATCAAAAACTGCCTTTATAGCATTAATGGCTCCAATAACAGAGTCTTTAGCGCTGTTTATAGGACTCAAAATATCGTCTTTTGCTTGATTAAATCGACTTTTTACTATGATTCCCATAGCGGTCAACGTACCTGAGACATTCGATTTAAGTTCTTCCATCTTTTCTGTTGGATAATCTCTAATCTTTCTAGCTGTCTCTCTTACCTCGTCCCACTGCTCGTTCCATTTTTTCTTGATGAACGTAGTAAGTATCGTAGTCATTGCTTCTTTTTGCTTTTTATACTGCTCATATTTAGTTAAGATCTCACCCGTTTCCCAATCGATCAAAAAGATATGTTCTTCTGCCTGCTTTCTCGCTTCTTCTACAACTAAATGATGCATTTCTTCAGCACGACTAACTACTTCATCTCGCTGTCTTTCAGCTTCTCGAATCATTGCACTAGCTTGTTCTTCGGTTATATCGCCAGCTTCATCACGTAGCCTTATAAATTCACCAATAGATCTGTTATACTGCTCCTCTGCCTCAGCCACTACTGCATCTTTTTGTTCAACTGAATTCTTCACCACTTCAGCTGCTTGTCTTGCTGTAATTAAACTAGCATTCTCATGCATTCTTTCAAGTATTATTTTTTGCTCCAACTCGTTTTCAGACATTGCCTGTATGCCATTTTCAACCATTTCGCGTTGTAGTTGATTAATTTTTCTATGTTCATAGGCTGTAAGTTCTCTGTTCTCTGCTTCTGCAGTTTCAATTATTTTTTGAATTTGTTCAAACGCTCTTTCCGTTTCAGCAATTCTATTGTCATAGCCTTCTTCGATTGCGGATAAAATGTCCATCTGATTATCTTCAGTGAGCCTAACCGTATCTTCATAATTAAACTCATAAATTCCATTCGCGTTAGCGAAAAACTCTTGCATACTTCTTATAGATTTATCTTTTTGTTCATCAAGTGCTTCAGCTACTCGCTCTGACATTTCTCTAAAGTTACCGACTATTGCATCCCTAGTTTCTTCAGAGACTTCTTTACCGGTCATCGCTAATTCACGTAAAGCAAATGTTGCATCATCATTAAGGTCTAAAAATGCACCAACAGCCTCCTGAGTAGACTCGGAGACTTCATCACTAAATCTATTTACTTCTGGTATAGCATCTTGTTTTAGGTGATTATATAAAGCGATACCGCCAGCAGTTAATGCTCCTAATGTTAAAATTGTGAGTCCTACAGGACCTGTTGCAAATGTAGTTAGTGCCGCTCCGAGGCCACCAGCTCCTGCAATTGCTCCTGTTAAACCAGATACACCAGCCATGACACCACCAACAGTAGTTGTCAAACCACCTAATGTAACTAAAACAGGACCTGCAGCTGCTGCAGCTCCCGCTAAACCAATTATAAATTTTTGTGTTTCTGGATCTGCTTCAGCAAATTTTGTTATTAAATCACTAAGCCAAATCACTACTGGTTCGATAGAGTCGGCTAAAGTAAGGAGTGATGGTATAAGAGTATCACCAAGGTTTTGAGCCATTACTGCCATTCTTTGTTTAAATTGCTCCCATGTAAAACCTGCTTTGTTTATACCTTCAGTTTGCTCCTGGAATGCTTTATCAGTTGCTCCCGATACCTCTTGCATTTCAGCTAATTTTTCATTAAAAGTATCGGCTTGAGCTCCACTTAGTGCTAATGCAAGTGTCTGACCTTCTATAGACCCTATATATTTTTGTAGAGGTATACCGCTTGATTCTGCAGCTGACACAATAGCTTCTAAGGATCCTTGCAGACCCAATGATTCATACATTGCTTCTCCATTTGCATATCCTAATTCTTCAAACAACTTTGTCATTTCTCCAGTAGGTGCCATAAGGGATTGTAATATACCTCTAAACTGAGTAACGACCTCTGAAGCAGATCCAGTAACACCCGTTCCAGTAGCCATTACGCCGAACAGTTCTTCCTGAGATACACCTAACTCTGACGCGAGGGGAATAACCCGGCCCATAGAACTTGCGAGTTCAGGAAAGCTTGTTTGTCCTAGCCTAACAGTTGTAAACGCTAAATCTGAAGCGTGTTGAACAGCTTCGGCTGATGTGTCACCATAACCTTTTGTAACTGCGGATGTTAAATCAATTGCATTAGATGTAGTTGCTAATCCTGCTGCAGCTGCCTTTGCATTTATTTCTAATATTTCAACTGTATCAGCCGTGTCACCAAAAGCTGATATAGTTTGATAAAGACCATCTGTCAAATCGCCTGTAGACTTACCGACTTCAATTGCCATTTCTTGTACTGAAGTCTTCAAATCGTTGACTCTTGTGATATTACCTGGAATTAATGTGGCTACGTTAGCCATGCCGGCATTAAAATCCGTTGCCATCTTTACTGCCGCACCGCCAAGTCCAACTATAGGTGCAGTGACACGTAGAGATAAATCTTTACCTATGTCTGACATCTTTCCGCCAATTTCCTTAAATCGCTCTCCCGTATCCTTTAGGTTGGTCTCGAGCCTTCTCCAGGGGTTTGTTTGCCGTTCTATAGCGTCTGTAACATCATTGAGCTGTTGCTCTGTCCTATTCATTGCAGCAACTGCATTGTTATGTTGAGTTAAGAGTTTTTGAGTTTCTACATGGTCCTCACCTTTAACTCTTACAGACTCTTCGTATCTTCGTCTTAACTCATCTACTTTAGCTCTCTGAGTCTCAAATGTACGGGTGAGGATGTCCGATCTCGTACGAAGACCTTCTAAACTTCTTCCGAAATCATTTCCTCCAGATCTTGTAACATTCATTTCAGATCTTAGACCACGAAGCCCAGCATTAACATTAGATAGTGATTGTGTAAATTCCGCATTATCTAGATTTAACCTGACCCGGAGAGCCCCAACTTCTGCCTGTGACATTTCCCTCACCCCTTACCATACTGAATCGATTGGTACCTCTTGTCCAAAACCTTTGTTCATATTCTGATTCCCCTGTCCCCCAACTTCTGTTTCGTTGTAGAGGCTAAAATAAAAATCTATATCCATTTGATCTATTTCGTGTAATTTATAACCGAGTTTCATGAGTTCTCTATAGTGGTTTTTTATTGTGGTGTAATATTCAGCGTAGAGTTGCTTTAACTTTTCTCTTCGCTGTTCTTTAGTGAGTTTGGGTCCTCCACCGCTTCTTCTGTATTTTGTTTAGCGAGTTTTCTTTGCTCTTCTGGATTGATCCCATAAAGCATTTCAAATAGCTTTTCAAAAATATAAGTTTGATCAGCACCTTTATAAAGGTCCTCCAATGTAAATTGGTTATGGAATACGATGTTCGGTAAAAGTGAATACACTTCATCCATTTGCTCAGGTTTTAAATTATTCATGTCAAACCCTTTATCTACTTCCATCTCTAAATACTTTCTGCGTGCCAACATCGACACAAATGGTGTTGTATATGTTTTAGTGACAAACTCCCCCTCTTTACCGTCCTTACCTGGTACATAAAACTTCAGATCAATTTTCACTTTAAATACCTCCAATAAGTTTTTTTCATAACAAAAAAAGGGACGAAATTCGCCCCTTTTATCCTTGTGGTGTCGGTTGATATACACTATCAAACCAATCATCAATTACTTCTTGTGCTACATTTTCTTGATCTTCTTCAACTTCAAACTTCCACTTTCCATCTTTCTTTCTCCCTAAAAACGTTGCATTGTGTGTAGGAGTTTGAAAAGCAGGAGTTGCTTCTTTTGTTTGATAGTTTCGTGATGCTGGTCTAAATCTACCTTTTAAAAGCCAAACAAAACGGTACTTACCGTTAGCTTTTTGAGCCTTGAACCCTAAAGCAACATATGGAGCCTGATCATTAATTGCACTTTCAATTACTCCATCACTATTTACTTTTGCTCCTAGCAAATCTTCCTGTACTTCAGGAGGTAAATCATCAGAATTTAAGGCAACGTTGATACTATCCAAAGCGTCAATTGTTTCTAACAATGCATCGTCACCATGGAAATTTGCATTGTTTACTTGTGGTTCGATATTGGCAGATATAGCCGGCGCTATATATTTTGGCTGATCATATTCAAAACTGTCCCCATCATCTTTTGTGATTTTTGCATAATGTAAGTCTTTTAAACCAACTGTAGGCATTCTTCATCCCTCATTTTCCGTAGAATAAGAAAAACGAATCACTTTTTGATAGAGATTCGTTTGTTCACTGTACTCCTCAGCTTCAAATGTTCTGGTTAGTCCCGCGTTAATCAATAACCCTTTTACTTGATTAACCAAATCATCGGCTTTATAAGGAGCGTAAATATTTATTTGATAAGAGAAAGCTGTTTGTTTTTCTTTATCGTCAGCAAAAGCAGCACCTTGCTGGTTGTATTCCAAATAGGTTACATAAGTTTTTTCATTTCCTGTGTAATAAATAGGAACTACTGGAGCATTTATAGGGGATAAGATATCTTCAATGTTCATAATCCTAATCCCCTTCTAGCTTCAACTGCCATTGCATTTATCATGCCTGACTTATTACGTTCAAACACTGGTGTTAATATTGGACGAGGTGCCATGTACCTTCCAGGAGCTCTTCTTTTTCGCCTTTTGGCTGTACCAACATGATAAAAGCCCATTTCCCAAAAATACAGATAAAAGGCATCACTTGTAGTTCCCACAATGTACTCACCAGTTTTTATTCTTTCTTTAGTGATCTCTCGTTGAGCTGTTCCAGTTCGTCTATTTAGTCCAAAAGAATAAACAGATTGCTCAAATTTCCTTTCGATGAACTCAGCACCTTTTTCTACTGCGTCATCAGATATCTTTTCTCCCTTAACACCAAGCTCGTTTAATGCATTTTGTAAGCTTTCAAGACCTTCTAAAGATATATTGGTCATTTATTTCACCGCCTGTAAAACGACTAGCAGATCAATATTCATTCCATCAACATTAGAAATTGGTTCAACTAACTCATATGGCTTACCTTTATACATAACCCTCATAGACTCATTATCTTCCAAATCTTTTCGGTACCTAATCTTAAAAACTTTCATGCTTTGTAAGAAATTGCGATCAGATCCTGAGAAAAATCGTCCCGGTTTCGTCTCCAGTTCAGCCCAAACTGTTGTATACTCTGGCCAATTTCCCAAGTCGTTATGAGAAGAAAAATCACCTTTTTCAGGAGGAGATAAAAAAGTGATTCGGTGTCTAGCTCGCCCCGGGTTCATTACCTTCACCTTTAACCAAAGACTCGATATGTTTTAAGACAGTTGAACGATTTTTTCCTTCTGATTCTTTAGTAAACAGAGCTTGCAGTTCCTCTTTACTTAAATCTGAATTAATTGCTGCAACTACATCAGAAGCATTCTGATCTAATACGGATTTATTATCTTGTTGTTCAGGTTCATATTCCTCTTCACTTATTAGATCTCTATTTTGCAGATCTTCAATTCTTTCTGGATCTTCCGATTCAAAAACAGAATCCTTTTTGTGGTACTTTTTTGGATCATATTTATCTTTAAAAAGTTTCTTTACTTTACGTCTATATTTCATTTCAACACTCCTCCTCATTTCGCTCCCCATCGTTTGTAAGGGGCAATTAATGCTTTTAATGTAAAATCTATATCCGTAACGTTTCTACCTACTTGGACAACAGATCGGTTATCATACCAATGACCGACTAACATTAAAATAGATTGCCAAATAGGTTTTGGTATCTCTTCATAGCCGCATATATAACTAATTTCAACCGTTGCATTAGATTGATTCACAAACCAACATTCACCCTCATAATTAGCCATGTGATCATACTGGTTAGTTATATCTCCATTCACTTTTACAGACTCAATTTCAATAAATGGTTCGAGTGGCAACTTAATCTTGTTATTACCAGTTGTCAAAGTCACATTCTTTTTAATTAGGGTCATTCTCCCAATTGTTTCTATGTGATCCCTTGCAGCTGTGATTAAGCTATGAATATATGCATCGTCTTCACTTATATCAACTCGACAGTAATTTTTTGCCTCGGGTAATGTAACCGGCTCCTCACCGATAACCTCAATATTTTTTATAAACAAGTAAACCACCTAACTTTCATAAAGCAAGGTGACCATACAAATGGCCACCTTTACTATTATTAGCCTTGTGGCACATCAAGGACAACGTAAGGAGAGACTTTAGTACTTTTATCTTCCAATGTTAACGGCTCAACAACCCAAGGTTTCCCATCTACATTCCAGAACGCTTTGATAACTGTTTTGTTTTGGCGGAATAACACATGCTCAGATGCTGCAACATAAGGTCCAGAACCGTCTTTGATGAGATAGTAACCAAAGTCTATTAATTGTATATCACCTTTTGTACCAAGAGGTTTTGTTTTGCCAGTGAATCGAACAGGGATACCTGAAAGTGTTGCGGGGATCCCACGTGATGCATCACCTTGAATATAAATGTAATTTCCCGCTTCATCTTTCAATGTAACAATTTGTGGCAAGGCACTTTGGTTTATTACCCATAGAGCATTGCTTACCGAATCTGGATGCAATTTGGCAATCATAGAAACTACATCTAAGTAGCTGATTTTATTTGATTCACCTCTGTTAATAGACAATGCTCCATTTCCATTTGTTACGCCAAGTGGCTTCGCTGTACCATTTCCAGTTAAGAATGCAACATCTTCAGCCGAATCCATTGCCCCTCTTAATAACCCTCCAAGGAATGTATTTGAAGCTTTCCAGTTACGTAGTAATTTGTCAGTTACGACAGTAGTTGCAGCAACTTCCTTCGGTTCAAGTGACACTTCTTTTAAATTCGCATCAGTCTCCGGTTTATCATCACCCTCACCAATCCATTGAACTTCAACACCACCAAAAACCCCATTCGAACCTTGATCTAATGCTGGCATTGTGATTTTAGAATCTGGTGGATCTCCTGCTGGAATAACACTTGCACGAGGTCGAACAATCATACTTTCAGGGTTCATTCGAAGTACTTCAGAACGGAACTGTTCTGGAATTGCAAATCCTCCTTTTTCTCCAACTCCCATTGACATCCCTTTGTCTTCATTTCTGAGTAGTAGTTGTCTAAAGGCTTCAGGTACCTCATATCCTCCACCTTCACCTTCATTAATTGGCACCTCACTCAATCTGCCTTTTGGATCACCAAAACGTACTGCGGATATGAATTCACCGAAATTTTGGAAGCCTTTATCATCTTTAGGGCTTGGTTGAGTTTCGTGATTTGATGGCATAGATGGACGGAAAGGTTTTACTTGGTTGTTAATCTCTCTTTCACGAGCAGCTAAATTCTTTTCTCTTTCCTCTTGTTTATGCTTATCCTCAATATCTTTTTCAAGTCCGTCAATTTCAGCTTGAAGATCATCGAAATCCTTTGCTTCTACTTCAGTTAAATCACGGTTTTCTGCTTTCGCTGCATCAATCAGAGTACGTTGATTTTGAATTTTTTCAGCGCGTTCATTTAACAATTCTTGTAGTGTTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_014829|2917805:2926505|2924212_2924557_-|WP_013489316.1|DBSCAN-SWA MKYRRKVKKLFKDKYDPKKYHKKDSVFESEDPERIEDLQNRDLISEEEYEPEQQDNKSVLDQNASDVVAAINSDLSKEELQALFTKESEGKNRSTVLKHIESLVKGEGNEPGAS >NC_014829|2917805:2926505|2921944_2922094_-|WP_013489310.1|DBSCAN-SWA MKLGYKLHEIDQMDIDFYFSLYNETEVGGQGNQNMNKGFGQEVPIDSVW >NC_014829|2917805:2926505|2923482_2923902_-|WP_013489314.1|DBSCAN-SWA MTNISLEGLESLQNALNELGVKGEKISDDAVEKGAEFIERKFEQSVYSFGLNRRTGTAQREITKERIKTGEYIVGTTSDAFYLYFWEMGFYHVGTAKRRKRRAPGRYMAPRPILTPVFERNKSGMINAMAVEARRGLGL >NC_014829|2917805:2926505|2923162_2923486_-|WP_013489313.1|DBSCAN-SWA MNIEDILSPINAPVVPIYYTGNEKTYVTYLEYNQQGAAFADDKEKQTAFSYQINIYAPYKADDLVNQVKGLLINAGLTRTFEAEEYSEQTNLYQKVIRFSYSTENEG >NC_014829|2917805:2926505|2925140_2926505_-|WP_013489318.1|capsid|DBSCAN-SWA MKTLQELLNERAEKIQNQRTLIDAAKAENRDLTEVEAKDFDDLQAEIDGLEKDIEDKHKQEEREKNLAAREREINNQVKPFRPSMPSNHETQPSPKDDKGFQNFGEFISAVRFGDPKGRLSEVPINEGEGGGYEVPEAFRQLLLRNEDKGMSMGVGEKGGFAIPEQFRSEVLRMNPESMIVRPRASVIPAGDPPDSKITMPALDQGSNGVFGGVEVQWIGEGDDKPETDANLKEVSLEPKEVAATTVVTDKLLRNWKASNTFLGGLLRGAMDSAEDVAFLTGNGTAKPLGVTNGNGALSINRGESNKISYLDVVSMIAKLHPDSVSNALWVINQSALPQIVTLKDEAGNYIYIQGDASRGIPATLSGIPVRFTGKTKPLGTKGDIQLIDFGYYLIKDGSGPYVAASEHVLFRQNKTVIKAFWNVDGKPWVVEPLTLEDKSTKVSPYVVLDVPQG >NC_014829|2917805:2926505|2918626_2921932_-|WP_013489309.1|tail|DBSCAN-SWA MSQAEVGALRVRLNLDNAEFTQSLSNVNAGLRGLRSEMNVTRSGGNDFGRSLEGLRTRSDILTRTFETQRAKVDELRRRYEESVRVKGEDHVETQKLLTQHNNAVAAMNRTEQQLNDVTDAIERQTNPWRRLETNLKDTGERFKEIGGKMSDIGKDLSLRVTAPIVGLGGAAVKMATDFNAGMANVATLIPGNITRVNDLKTSVQEMAIEVGKSTGDLTDGLYQTISAFGDTADTVEILEINAKAAAAGLATTSNAIDLTSAVTKGYGDTSAEAVQHASDLAFTTVRLGQTSFPELASSMGRVIPLASELGVSQEELFGVMATGTGVTGSASEVVTQFRGILQSLMAPTGEMTKLFEELGYANGEAMYESLGLQGSLEAIVSAAESSGIPLQKYIGSIEGQTLALALSGAQADTFNEKLAEMQEVSGATDKAFQEQTEGINKAGFTWEQFKQRMAVMAQNLGDTLIPSLLTLADSIEPVVIWLSDLITKFAEADPETQKFIIGLAGAAAAAGPVLVTLGGLTTTVGGVMAGVSGLTGAIAGAGGLGAALTTFATGPVGLTILTLGALTAGGIALYNHLKQDAIPEVNRFSDEVSESTQEAVGAFLDLNDDATFALRELAMTGKEVSEETRDAIVGNFREMSERVAEALDEQKDKSIRSMQEFFANANGIYEFNYEDTVRLTEDNQMDILSAIEEGYDNRIAETERAFEQIQKIIETAEAENRELTAYEHRKINQLQREMVENGIQAMSENELEQKIILERMHENASLITARQAAEVVKNSVEQKDAVVAEAEEQYNRSIGEFIRLRDEAGDITEEQASAMIREAERQRDEVVSRAEEMHHLVVEEARKQAEEHIFLIDWETGEILTKYEQYKKQKEAMTTILTTFIKKKWNEQWDEVRETARKIRDYPTEKMEELKSNVSGTLTAMGIIVKSRFNQAKDDILSPINSAKDSVIGAINAIKAVFDNTKLALPSIDVPKLPRFSLEGSFSINPPSVPRIGIDWYARGAVFTQPTVLNTPGGIKGFGEAGPEVAMPLAGQYMQPFADAVSARIRSTSSDQERPIHITNHITVEGNIDRDLYDQINSEQQNEVENQLLVMGVKQT >NC_014829|2917805:2926505|2923902_2924232_-|WP_013489315.1|head|DBSCAN-SWA MNPGRARHRITFLSPPEKGDFSSHNDLGNWPEYTTVWAELETKPGRFFSGSDRNFLQSMKVFKIRYRKDLEDNESMRVMYKGKPYELVEPISNVDGMNIDLLVVLQAVK >NC_014829|2917805:2926505|2922589_2923159_-|WP_013489312.1|tail|DBSCAN-SWA MPTVGLKDLHYAKITKDDGDSFEYDQPKYIAPAISANIEPQVNNANFHGDDALLETIDALDSINVALNSDDLPPEVQEDLLGAKVNSDGVIESAINDQAPYVALGFKAQKANGKYRFVWLLKGRFRPASRNYQTKEATPAFQTPTHNATFLGRKKDGKWKFEVEEDQENVAQEVIDDWFDSVYQPTPQG >NC_014829|2917805:2926505|2924571_2925081_-|WP_013489317.1|head,tail|DBSCAN-SWA MFIKNIEVIGEEPVTLPEAKNYCRVDISEDDAYIHSLITAARDHIETIGRMTLIKKNVTLTTGNNKIKLPLEPFIEIESVKVNGDITNQYDHMANYEGECWFVNQSNATVEISYICGYEEIPKPIWQSILMLVGHWYDNRSVVQVGRNVTDIDFTLKALIAPYKRWGAK >NC_014829|2917805:2926505|2922147_2922531_-|WP_013489311.1|DBSCAN-SWA MKIDLKFYVPGKDGKEGEFVTKTYTTPFVSMLARRKYLEMEVDKGFDMNNLKPEQMDEVYSLLPNIVFHNQFTLEDLYKGADQTYIFEKLFEMLYGINPEEQRKLAKQNTEEAVEDPNSLKNSEEKS >NC_014829|2917805:2926505|2917805_2918630_-|WP_013489308.1|tail|DBSCAN-SWA MRKYDLSVIRKDTEINVLDYGITCLTFSAPLPIPRTAKEYPEGKNGYVDLGTVYEGRRIYATFLLKGENVDDYYLLINELNRIFDSREAFYVRHFRQPWKRYKVKLESPIEPQQIDRYGRINLTFESESAFAESIGTSLSPFTFDVELWGIGQGLSVDQNDYTFNSTSFVFNNIGDVALDPREWYQQYKITFKGISNNLKIRNERNGDEWQYFGSTTSQQEIVIEGVRARKNGISIFSNTCKRVLTLEPGGNEITISGTSGQIEIIFDTRFYYL |
11 | Bacillus_phage(66.67%) | capsid,head,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
3272091 : 3337653
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_014829|3272091:3337653|DBSCAN-SWA 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55 | Streptococcus_phage(22.22%) | coat,tRNA,protease,transposase,integrase | attL 3261074:3261089|attR 3275282:3275297 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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