Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
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NC_015275 | Cellulosilyticum lentocellum DSM 5427, complete sequence | 1 crisprs | cas3,DEDDh,RT,csa3,cas4,WYL,DinG | 0 | 0 | 10 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_015275_1 | 3710193-3710331 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_015275_1
|
1 spacers
spacers of NC_015275_1
>1.1|3710224|77|NC_015275|CRISPRCasFinder TTGGTTTCCATTACCCCCATTATTTCCATTGCCATTACTCTGGCCTCCGCTATTCCCATTGTTATTACCTTGGTTTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_015275_1
The CRISPR arrays of NC_015275_1 >merge|NC_015275|1|3710193-3710331|CRISPRCasFinder CACTGTTCCCACTATTTCCGTTGTTATTACCTTGGTTTCCATTACCCCCATTATTTCCATTGCCATTACTCTGGCCTCCGCTATTCCCATTGTTATTACCTTGGTTTCCACTCCCCCCACTATTTCCGTTGTTATTACC >NC_015275|1|1|3710193-3710331|CRISPRCasFinder CACTGTTCCCACTATTTCCGTTGTTATTACC TTGGTTTCCATTACCCCCATTATTTCCATTGCCATTACTCTGGCCTCCGCTATTCCCATTGTTATTACCTTGGTTTC CACTCCCCCCACTATTTCCGTTGTTATTACC
>NC_015275.1|WP_013658362.1|3707345_3709718_-|fibronectin-type-III-domain-containing-protein MKMQKRVICIMLTIILLLQYTYGEKTIDITNNDIGIKATQGDVTTTTASALQINQLSEYIPKLGIQVNFNAPGWNVFDDDNKNIWYENMDDWHNGDHGNFLNGGTHNSRTGKEGRARFNFIGSQFILAVQSHYGRNQGVQVIIDGELVDTIPYVGNYGWGHTIYYICPQLFSGEHSVELNMPASNTYMMLDIIQVNENGTIKPYELINKDKYYYESSDESNENVYNAIVNKKEQIDALGIEEINITWSTNYYKYEEPWSILTEDSQGAFFTTFASIDYVKDGSPRHENFAVWNEGYWKKGNSVEGENGDFISAWAGGDVISRAISRPNSYFIPKETDEFSIYSILPEIINIKFNSEGIINYKRGTKVNEPLPVTTLLIKEQKDYSIKLQWYKPYTNLPIESYKIYRNGVEIEETQENTFKDTNIDYQTLYNYTVAAIYEGEIQSENGNQVNTIIMEPYISQVTPTNQSTIGGDSVNFKINYMTNNSLEECNLKVEYTNESEYYSIPEENIKGSQIEGGISYSAIWDLEDIISGNYVVRISMEDERGIHILKELNYVVDTTKPSQVISLKAEPGEKQIEISWQEIDDDSIAYYEIHRSEVRDGVYTKLATIETGKANSYLDKAIEAEKEYYYKLYTKTRFGIIGEASESIMAIALKDTTPPEVIGIVPSNKSKIGKEVVVTVRTQDNIGIKSTTLQYLNEEGKWIEIDTVSNQSEAIFSFTNPKKEGTLTIKAIATDTSDNTNIEEVIRTYTIVAPNCQTITFNTVETSSTQMMLKWDKLDIEDFEKFIVY >NC_015275.1|WP_013658361.1|3699569_3707270_-|PKD-domain-containing-protein 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MGPTITQVRVVAVDNTEVTFEWDKSEDNYAFGGYTIYRNGEQLIDVTATRYTDTKLEANKAYTYQIIAYDKAGNTAEASNLLEVYTSLDIQPPSKPDHLGLKSKTIFNWEPSVDNISVAYYQIYRDGELVGRSDTALYIDNAIKADTNYTYQIEAIDSSGNKSELSEQLAVTASTIQLVQVTPDQGATIGGEKGQKLEIVCINDKNIEDGYAKFEVSLDGVNWEVLATDVQVSRFNEDYKWFTYEWQIKELLSNNYQIRYTVYNNVGHNAEMIARYSVDRTAPQSPHNLVGKADETSVVLSFDNNIEKDVIAYQIYRSEDNQTFQVIGKIPASSTLQFRDTSVLNSKPYYYKVTAIDQFEQQSEYSEVITAGINLEGKPQINVISPMENTISSETVFEVEGIDNDGIKTLAMYYWDVAGEEWKSFANNSSLTRLSGHLEMPNKQTAIKIKYEVEDILGNKNELISSYQIVHNTLVLKNITIGDGTAKIDWEGTNTSRLGHYIVEIIDRETGAAVCNEELDLTQRSFTKTNLEPEKNYQVTIYKYNNNNEVQLTSISQIFFMNKVDAIGGVSVFGPYQGAYNEAIPIQFSLYHNKGLKAVILEKSRDKINWSEIITYSILGAPKAYTGSYSMTLEDEAEGTIYIRARVVGADLVAMGDDKCPILINEIDKTPPPALEKLEVKEENGTLVLNWLKPQSMNDIVGYKIERRAKNEASYTNIATRPPNEESLIDYLVDPGETYEYRIYTIDKAGNLSKEAIYATHQVMADVTPPTIVSTSWDNKIDLKKALSIYAKDDFYLAQINIEVKDEGRENFILLTSQSFNKVASASTYFNIDTRTLRQGIATFRITAIDIRGNKSVERLYDIYIDRTPPSDVAFKATTVENGVEVWFDCEEEGATYKVYRYTGNKRQLLYYGENNTYIDNALTPQKQYTYGVVAIDAQGNEGKEKQILTTYDVPDTQAPKAELVNLNQAIVGETYYLDASTSTDNCGIKSYRWYINDKLIGEKSTVSYLFDKKAIYEVKLEVEDYAGNVTKKVIEVEPLPKEAVAKLIIDVRNSYDSSVCDANIYIASNTVNTENLFYKTSFGKLEVNLIPDNYSIAAFAGEKGEAGESVYLEAGETKTIVLDVKKEGITKGDVIITPLDIKEIKDLGIDTKDPDNLQIFEVAINFEFEQKEHEGVVEKETHTVFVNSSGQMYTGSGGKGAYYAFSGGGSNYYVYGTPPSGGGSSGEVPTIYVLKVPMEIQCLKEFFEVRLEIINQSVPEISLDEITAKLNLPDGLSLAPTKEEQSFEKELEDLAGGQQSEAVWYVRGDKEGDYTLDVIVNGILEPFGLPQHLTFKNASPLKVWGSSALYMYVEAPEKAISGEDYVIDIELTNVSDKPVYDMMLTPGDIESYKQVGEEIVATYDSPVYEITYENAEELNVLELGEQVKIKEFYPNQTLKFQYTTQITFPEENDEGFEAEYLLKKLFVTGLNTTINKKVTLLPVKQSNSRLRDASCQEAVTDEGIDIVTGAQLLNQTLLAVNGSNSLNFGIEYNSKQTKKSALGQGWSHTFDSYVQKKSATEVIIYWRPGQGTIYTYDETEKAYLADDWQTTRDKLTINKEGDYVLERSDFQVHTYNKQGRLVEMKNKIGQVLSLDYNEDGQVCLITDQSIGESIILDYSNKKLTTVSDTKGRHVSLRYNNEGLLEAITNAIGNTTTFTYNNKGLIESGINAEGYTFVKIGYDKSKRVISQTYPEGYTEKYAYEKKKEGDLTYIILKTTDDVGNTSYRTVDQDGQLVKEVDALGNTYYFTYNENHRKIGATDGNGHTSRFEYNDYGDTTKVIDALGNTTIYTYDDRRNLLTTTDAKGNVTANTYRADNQLMTTTLPTGAITSYVYDGNGFLQAMTKEDYYEGKAVNAVYDREAGLIKSTRDYKGNTTTVTYDSYGYPRTTTDREGKVTTYIYNAVGQLLSTIDQAGNKVSYEYDKRGLLLKQKDSKGIISYEYDKWGNKVKEIDPRGNVTEYFYTIKGQPKYTKYADGTTEQMTYNANNQVKTILDRNNGMTSYRYDAAGNVSEVTTPQTGTTSYTYDDANHVRTQTDGNNHTYTYYYDALGQLEKTVDPKRYVTSQNYDVLGNVLTATNGALETTSYTYDKWGRQRTITDAKGNVTSYTYDTLDNLETVTDALGGITRYTYDNENRVLTVTNPLGYVKKMKYNDIGKIELATDEEGRTTRTLYDERGNVKSVYDGFNVLVQQNVYDEASNLKTTTNGLGYTTTYEYDNMNRLFKSIDAMNQIKQRECDNRGNLIKVVDPPTADRLLPVTTSATYNPKGQVESITDPENNVQSYKYDVVGNLIQETTPIRTMYTYTYNDVNLLETVTNPRGQLATYKYDGAGRVVYLQDEVDTTNYIYDKNGNLEKVIAAKAGTITRTFDALNRVKTYMDVNGNIIKYDYDAVGNLKQITYPGGQVLTYYYDHSGLLTDVIDFNGGKTHYQYDLNGKLRTITRPNGTTREMTYDDAYQVKSIIEKASSGKIIINYSFDYDAGGKIKEEEGVNVATTQITNGETVMTYGKGNKLLTYNGIEVKYDASGNMIYGPLDGKMVDFKYDARNRLIEAGGTTYQYDAENNRIGQITNGKQTTYVVDTTSSQLSRVIEEKKGDTVRQYIYGLGLIMQVEGGEYATYHFDNRGSTVAITNKSGSTIASYTYGPYGELLNKTGKVTTSFLYNGKYGVETDANGLYYMRARYYNPEIKRFINQDVVQGSLDNAITLNRFAYANGNPISGIDPFGLYTGIPDEAKTMMRKAGVPPEEYLAEQLTPRYVYTQEQYELDMQAYKLDNWLTQTTLYLMTPFIAAESICRGIGESAGFAMAYPDEVIPTLWRGITNSDPSQNIITAPVYGVYTQTGPLLSGELSPEDFVKYQVNLFSTAAGAYGTARTVSNIGSKLGRLKKGVVSRGAGNSANLQSGQKLAKVNTTRINLANGRTRFTPLRANGNPVSAGMQHVIDGHFNRPLGNSRSIFSIEINYLKEILQSNRVVSSTVIDMGGGQYKRIVDTGEIIGNTALKFGGNTTSYIEVITDVKGNLITTYPVPAP 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
909280 : 936509
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_015275|909280:936509|DBSCAN-SWA 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MSMDLHGNVWRFRIMKDGIPYTKLFEGTEKKAKEAHEAFKVDVKRGNVGTNENMKFNELCQLVTDQYVKVNCKYSTVEFYKNTYNTHLLPFFGDKKLSSIKPLHIQQFVTHLSELDLAPSTVSNNLSCLKKTFEMAVKWELIIKNPCMYVDRPQKRKYQNRGQLMTVDEMKKLLEIYENLSTKPSHMHKCAFYIALGCGLRNSEIRALTLDDIDFENNIIRVNKQFGKYTEKGKVVEGYITTKSESSIRDIYAPDFVIAAIKNYISTLDCIPLSKQLFWSARTNKPVGRQCLSTFFTNILKNNNLPVIDFHDLRHLHATLLASKGVNMKSLSNRMGHSKLETTNIYMQPINEVDKQVAKVLDNTIVDIKNNNFLSS >NC_015275|909280:936509|927978_928527_+|WP_013655772.1|DBSCAN-SWA MGEDAAALINKRLDEMEKKIIAVVKQELTKEKIEVKRYNKKLHNSKLLLRNYKRFQTHCTESQFTATQLIDSELIEMIKDADNIDDNNIYIESILRTKERTAIMLNHIKRVLDFYMYTAESSDQEPYRRRAKVIKYKYIDGKGNEEIAARLNIHTRTVDKDIDKAIAEISPLLFGIDGIKLE >NC_015275|909280:936509|929100_929496_+|WP_013655774.1|terminase|DBSCAN-SWA MAMTEDEKKIKKIVKKTIADLEEIAIYKPQFNSTIQLYAETKYQYDILMKQFYESGCKVTEEYTNKAGFTNVRKTAIYLALETLRRDIINHENILGLTPAGLRKINEAELKGKKKKSRLIEALKSIEQNTS >NC_015275|909280:936509|921657_922443_+|WP_013655763.1|DBSCAN-SWA 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>NC_015275|909280:936509|934519_934795_+|WP_013655779.1|DBSCAN-SWA METVLQLLKYDLGISSEARDIYLKALIEANQKEIEKKGFDLNLTDVEDQMLLADYSAWKYRKRNEDVQLANNLRQRIQDRIVKARGENYVG >NC_015275|909280:936509|910113_910431_+|WP_013655746.1|DBSCAN-SWA MAYKFTDDNFKTDALESSIPVVVDFYADWCGPCKMMAPVIDELAGDYEGKVRIGKVNTDENRGTASKYNVMSIPTILFIKNGEVVDQVVGAVPKTVLEQKINSML >NC_015275|909280:936509|918780_918987_+|WP_013655755.1|DBSCAN-SWA MALKKVKGYKRLTKGQQELLERVYEKHMRAVEDESKWEIKSVIWERSYLRVSFKNGEWLHYSINGNWY >NC_015275|909280:936509|919406_919607_+|WP_157864033.1|DBSCAN-SWA MQRMTIANPNSSTYRIPIEKVDLFRVESTGLNTAFMGTMIDRLGKYEDLGLTPEEIKGMLKDGRRK >NC_015275|909280:936509|916821_917739_-|WP_013655751.1|DBSCAN-SWA MNYVVIDFETANSSRSSACSLGMVKVHEGNIVDSFYSLINPEDDFDLFNTSLTGITQDMVCNSPTFNELWPDILSFISDHMIVAHYASFDLSVLRNVLLKYNIPIPTLSYCCTRNLSKKTFPNLINYRLDTVASYLDIEFNHHHAFEDAHATAVLLNHIFIQNTTSSFEDLHSKLGLTIGKITSSSYTPSGYIKCVKKSSNLSSKDIVPTTSSFDDSHPLYDMTVIFTGTLSSMLRRDAMQKVVDVGGHCKDTVGKSANYLVIGIQDYSRFVDGEKSSKLKKAELLISEGYDLEIIDESTFLQML >NC_015275|909280:936509|935510_935891_+|WP_013655782.1|DBSCAN-SWA MSILGKFSRTEQLKISVKSILKPFCEKVYHKKAPPKCACPYVTYYLKHAKEYHQYDYKLEAHVWSKDVKEAETIADHIEELDNCVFSNEYHNFDIELQDRGNVEDEDKELTHIVVLFNLTYFDVRG >NC_015275|909280:936509|935897_936509_+|WP_013655783.1|DBSCAN-SWA MGLKQRITGYTKKTMENRQTGAGAYFKGYNVETDTFEKAVAAGKLLGATQGGGSFSAKPTITPVEVDGVPSSAMGMEEVDGWEVDMTANILEVTADNIKYALGAANIANTTDGKYQKITGKNTLDPEDYLDNVTFLGTVSGFDEPIIIQIYNALAVDGLNINPQDKKSTILTTKFKAHSAVDNLDEAPFAIFVPIKQESESEA >NC_015275|909280:936509|921293_921653_+|WP_041713340.1|DBSCAN-SWA MGTEAEEQMCIFRWAAYEQARRPELALMYHVPNGGKRDIGTAKKFKLEGVKAGVPDIVLPVSRGGYHGLYIELKVGKNKPSKEQQEWLHRLEAEGYYTTWCIGSKQAIEEIQNYLQMMR >NC_015275|909280:936509|927306_927591_+|WP_013655770.1|DBSCAN-SWA MTNEQLEQANEIKKEIITLEAEVEQMIVHKESFILRQLRKVIDLPSKKTHYNLYCTNNLDCIGSTVVLREDEVEMLTNYKKQRIEQLSKQLESI >NC_015275|909280:936509|916198_916744_+|WP_013655750.1|DBSCAN-SWA MENRPRYYFAHQLMKSLVFQGKDKLGFMILDDENKFKEMVQEGWKHSNETFNKKYRPYKIELYYKGINEDKLLVLFSSPSPKKMLDTYFCGFVLGGKVPRYFTVEKGMMYTILGEWTTDGHINYGEVSNEIEGIISRIEDIYTDVNPADAMRKIIEEGKPKKALIGGESIENNIIGNDLRN >NC_015275|909280:936509|926237_926522_-|WP_013655767.1|DBSCAN-SWA MLYTKEQINQAIYEILNNFHLSPTGIPFINVDFNQELFQIAIGLVIGKGYIGNIAFLNNFPVIGNPQYHLDIMGVEPVPSISESGQAFIDTYQK >NC_015275|909280:936509|924662_926183_+|WP_013655766.1|DBSCAN-SWA MGLIVDNFAGGGGASTGIELATGRSPDIAINHDEAAILMHKTNHPSTKHYQESVWDIDIKKVTAGQQVDLAWFSPDCKHFSKAKGGKPLEKKIRGLAWIVLKWAGTVKPRVIILENVEEFQTWGPLKKGRPVKSKKGDTFNKWKKQLEDLGYQVQHRELKACDYGAPTSRKRFFLIARCDGQPIKWPEPTHSNKDSIEVQFGLKEPYKTAADIIDWSIPCNSIFERSKPLAENTLKRIAKGLEKFVFNNPEPFILSIGQTGFSSDRTRNIHEPINTIVSKAEACLVAPTLIQYHTETTKNGVRGQSLNEPINTLDASNRYGLVSAFISKAYAGESRSVASSIDDCVHTITARPCFSLVEVALGDVKDHSEEVQAFLDKYYGKAVFGDRKAHDEAFLIKYYGQGTGQDIKASLDTITSKDRFGLVTIKGEEYKIIDIGLRMLEPHELFAAQGFPSNYIIDHDYKGNVYPKTKQVARCGNAVPPPFSKALVEANCGWLCKSKDGKEAI >NC_015275|909280:936509|918459_918768_+|WP_013655754.1|DBSCAN-SWA MELMKPILEAIREIIREEIQAVPQTKTERWVNSEELCEYLGVSRSWLAHRVKEIPHLKSPVRFKISEVEKWILENEMEETKQQIAATVIKKGKKPNKTFKVV >NC_015275|909280:936509|918292_918457_+|WP_013655753.1|DBSCAN-SWA MEKLNEVEKEKLKKRFESTTRMLEELPELEQRYVAGIIAGLYFRSTSKTEVKGA |
38 | Clostridium_phage(16.67%) | portal,integrase,terminase,head,protease,capsid,tRNA | attL 901636:901651|attR 927765:927780 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
944712 : 996397
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_015275|944712:996397|DBSCAN-SWA 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61 | Clostridium_phage(21.74%) | integrase,holin,portal,capsid | attL 941080:941094|attR 988038:988052 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1035407 : 1046425
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_015275|1035407:1046425|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_015275|1035407:1046425|1042798_1046425_+|WP_013655907.1|tail|DBSCAN-SWA MADGSIIIDTQLNNKGFKDGLNGLKGLADKGLGGLKDLAGGVAKALAAVGAALATAAGFAIKAGIEFESAFAGVKKTVNGTEEQLASLEGAIRNMAKEMPQSAAEIAGVAEAAGQLGISIDKIDSFTKTMVQLGDATNLSSEEAATSLARLANITGMSQDDFDKLGSTIVALGNNLATTESEITAMSLRLAGAGKQVGMSEAQILSLAGGLSSVGIEAEAGGSAFSKVMSDMALAVETGNSSLGQFAAVAGMSSEQFKKAFKDDAAGAIMSFIQGLGTAEDRGISAIKVLDDMGITEIRLKDALLRASSASDVFAKSMDIGNTAWKENTALAKEASARYATMESQIGILKNKLTDLGITFYKDVRNPMVEVVKTANDMLDKLASAFEKNGLEGLVVALGDVFSEIVVKVAEAAPKMIEAASDLIQSFIQGLSDNLETISGAAIEMGMSLVRGIGEITPKLLTLGVDIIKALGKGIQENIAEIVGIAKNIIMSLVDSFVQIMPTLLQTGLAIILELGKGIAEALPKLIPTAVETILNFIDYILEEDNIEKLLKCAEDIIIGLADGIVKALPKLADKAPEIIGKLVNALISAAIALVQCADEVMNKFKDGIMAIDWAGVGKDIIDEIGEGILGAGQDLPGILAKGIRLNLKQFGLIGLLADKGLDALGIGKDTIDSTLHKSSSGRYHGGSGTSFDDPKYKTLDDGVDNGMKMPGDIIDLTEYDKNAQGYLKHIQDIMDKGAKEYQKKVEEKAKENQEATDQAANDAALKLTDASEEYARLEQDLEVKRSEEYLALKEKLSAEELKQLEKELAEKETIGVAGVQKAYNKYIAIEKSKVVEKEKAITDLEAKLDKQNKAMSIASESKDLEGAYKVLAKLELDLMEDLDEETKAQKLKDIEAKAKSVTEKELNALAESNQSKLELTKQGLEDEKALQEQYIKNYESTYSGMISAYESAYQTIMSKQTSLEEKFKAFGDLFDKFTEDDIEYMKLGDLQNDINQLTLFGKSIEALKQKGVSQTFLDELISKNSMEDAIDFTELLLNQPEENLTSYLALWEEKQRLAGELAGNFYKDEFDNLKTEFTDKVRNDLSILPEEANQIGQDTTTALAEGLLNGVGTVRNAVGELVAQMQAAVAGETASIGANLSTSSTVTQNVNTKDNSVISALGAIYGALTEEAGAPIIVNMNADKVGEGSVDGMLRELRRRGVTFDVD >NC_015275|1035407:1046425|1037490_1037658_+|WP_013655898.1|DBSCAN-SWA MKRDTLIWKIVNRLHDERALELDNYMNYIEQANDIYKIIERELKDFTLIQGEVME >NC_015275|1035407:1046425|1039508_1040324_+|WP_013655902.1|DBSCAN-SWA MIRRDTDKHLLYVKMYESAKESNDKDHFLKGVFNGVRAVDTLLYENTYTKEQLETGCKLSDEVQELLKQATPRQIMQLFPIHKEYDGEKWSQKDYFSTMKYLKGLELDKSIGDNLEEFLWHYYHWDIMQFYIIYDTYHREREYQEYQNKAERFHKEIKAKAKEINHIGELVMNGLEIIKDSDRRIAAIKEKIQSKSSIVNFIERIKLKKMEHRRYVDWVYCKFLSDYKEDLLVEYASIEGWDEYIEELAKADRGKANEAIGVRNRLLNKCY >NC_015275|1035407:1046425|1037654_1037891_+|WP_013655899.1|DBSCAN-SWA MSETVRDLTEMVKEHRRKVEEKTIGVKEFAEIMGVGESTAREMLRSSNPPPYIKVGNRYRIIISRIDEWLNKLIGQEF >NC_015275|1035407:1046425|1038617_1039493_+|WP_083801215.1|DBSCAN-SWA MVESQNQQLTQASSIVMNMSTTCHTDVKLTDDEGNPYYYYMKNEPIETPFNIHNVQEGKTYHIRRKDGGINEYAVLKENYDRTALSTGIPQAYRYARTKEFDYERYTNLLVAKEARQKSINFIQHFNKFKDKGVGLYIHSPSTGSGKTLLACIIANGLIRQYKEQPRFIDASSLFCESRKANRYSNNEDIRSEDRLRSIENANILIIDDLGADKATDYTSSILYGLINKRTCLRKITIITSRKTLDELKYNTSTVNQIRNSTRVIELPNENVGAKVADEANKDLDNLLNQV >NC_015275|1035407:1046425|1035407_1036631_-|WP_013655895.1|integrase|DBSCAN-SWA MATDQPKKRKPRSKANGEGTIYATTKNGKTYYKATLTVGTNEDGKLIRKSFCSYKKQEVIDRMAEYRTQSNSGLTSSNDKITLNQWFYTWLFEFRINELKDTSFERYEGIYRNYIKGSALGKRKLVDIRTAHIQSYYNALAEQGKTTNTIKVLNKTLKTCLNDAVKQGYIVRNYCSLVTMPKCEGAAGTDKDNDITFFTPEEQKTFIGSLEKNKNRMLFILALGSGLRLGELMALKWDNVDMVNNTLSVTHAISRLSKVGKDGSRTWSVLEHDPKTKSSTRIIPLPTKIIKELKKHKAEQDKLILKYGDLYQKNNLVFCTDLGGYLDTRNLTRSYARALANAGIEHKKFHSMRHTYATRLFENDVPIKTVQSLMGHNDITTTMNIYTHVTPQQMTDEVQKLNKIFNL >NC_015275|1035407:1046425|1040341_1040743_+|WP_013655903.1|DBSCAN-SWA MKLLNIKSIEKALTPWEYLRDLKHLRKLAECDECTEAIYAFNYGRIIGIQQERARRRGEKYEKAFLVGDLFLDLYEVVSKGSENIPTEDLDDYFEYLNDYVNAEMRESVQDKVRGLLKGIKELEFLKRKEANR >NC_015275|1035407:1046425|1040841_1040982_+|WP_013655904.1|DBSCAN-SWA MIKIRISYTDTEDMPRVLEALKGFKIVHISKPYDKKNRKNMYLELE >NC_015275|1035407:1046425|1036633_1037089_-|WP_013655896.1|DBSCAN-SWA MNNVLLKTKRKEMKLSQSALGSLVGVSGAYIQQLEAGTKNPSIETLKKIADALNIRVNELFVDTLENILRKEIDKPQKCDDELIDMIRNSDEIENVIGALLLFNKTFKYNSIICNLSDNDLSFLVTLLSGTFNSIYESYINMIAESKKEGE >NC_015275|1035407:1046425|1038034_1038694_+|WP_162145065.1|DBSCAN-SWA MQRIPCGQTKVKATINELKQMNIIKVFRGKSQNNTWDTNSYEIDLKYLLEYISVGRDTTNSTSLYDQPIGHDTPKGYVLYDRGVGCNTTKKNTNKNTKENTNKNIYAQQAEQLWSSYPNKKGKDKAIKKLPKLIHQYGYEQLERCIDRYVQDIEAKQTSKEYIKHGSTFFNGGFIDYLDENYQEAHKEELKEVINGGEPKPTIDPSKFYSDEYVNNLPY >NC_015275|1035407:1046425|1041910_1042747_+|WP_013655906.1|DBSCAN-SWA MSVDYATKYAKEVDERFKAMSRSSECVNDDYDFTGSKTVKVYTVNTASMNDYNRAKVDGTSRYGNVENLSATTQELTMSKDRSFTFAIDKADLDETQLALEAGKALDRQLREVVKPEVDLYRFTKMCANAGTVATAEEITAANVYTLITTGTEVLDDKEVPEDNRFIIVTPETYKFMKLNDDLVLDTNVGQEMRLKGVVAYVDGMKVIKVPSNRLPLNSGFLIGHTIATTAPIKLAEYKIHENPPGISGYLVEGRIYYDAFVLDNKKNALYLQPIAAQ >NC_015275|1035407:1046425|1037246_1037450_+|WP_013655897.1|DBSCAN-SWA MNVNVEKLKSLIYNNGFTYTDLSNVSGVSRTSINRIVNNGFIPRPSTVGKLCKALNCKVEDLLKEDR >NC_015275|1035407:1046425|1041438_1041894_+|WP_013655905.1|DBSCAN-SWA MKKQFLPLNLQFFADDPAGDPTPKSGDKTFSQDDVNRIVGERLSREKAKYDDEYKAKYETKEVELKTRETELNKRELRYKAADLLSEKNLPNELLEVLNYSSEEEMCKNIEVLQKAFSNTTSEKKVPTITIPSNTNPKPEKSDAFLKGLKH |
13 | uncultured_Caudovirales_phage(33.33%) | tail,integrase | attL 1035230:1035269|attR 1050778:1050817 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1113175 : 1120474
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_015275|1113175:1120474|DBSCAN-SWA ATTGGATAAATACATGAGTATTATTACTAACTTTGGATGCCATGGAAAGTGTCCGTACTGCATAGTTAGAGAAAATGGCATAGATGTGCCAGAAACAACATTAGAAGGACTCGATTCTTTACTAACAAGATATGTAGAAAACGATTGTAATTTTATTTCTCTATCTGGTGGTGGTGATCCATTGCATGAATTTAGACAACACATGGACTATTACATGAAGTTATTTAAGCTTACAAGAGCGTTAGACATACCGCTAGAAATGCACACTAGTTACCTGGATGCTGGATTTGCCTTCCCAGTAGAAGAATTTAGTAGGGTTGTATATCATCTTAGAGATATAAATAAACTCAATAATGTTGATAAGTTCGGGATGGAGATTGTAAGAGTTGTTTTTGTAGTTACAGAAGAAATGACAGTTAAAGATATTGATTACATTCAAATGTTTGTAGAGGAATCAGATAAGATTAGTGAGTTGAGTTTTAGACAAATGGTCGGTCCAAACTTTGAAACTCAATACTGGTTACATGATTACCTTAAACAAGGACATGAAGAGGGGAAATGGCATTACATAGAGCAGAATGATTATAACTTATACTACGTGAATGGACAGGTGTACGAGAAGTTTTCGGATATACACAAGTAATCAAATTCGACTTTTAGGAGTGAAAAGTATGATAAACGAAGAAAACGTTATTTTCTTTAAAACAGGACAGAATGAAGAAATAATCAGAAAGGGTAATATTGTAGAAATAATTACACCTGTAGGACAAGATAATATTACTGGTAGGGTCACAAGTTTCAGTAATGGTCAAATTTATCTTGACTGTAGCGAGCTATATAATGCAGATTTGAAAGTTCTAAATTTTAACGAGGTTAGGAGCATTGAAGTTGTAAAATAATTAATTTATAACAGCTAGTGGTAAACAACTTGGGGAAGTTAAATATTACTAGTTAGGAGATTTAAAATGAGTAGAATATTTATTTATATTTACTTATAATTATTCATTTAAATAGCTACTAAAATGCTGTAAAAATGGTTAAAAAATAGAACAGGTTTTTGAACAACAAAACTGTTAGTTTTATAACAGCAAAAGTAACAGCAAAGCAGTGTGAAAAGTAACAAGCTTTACACTATGGCTATCATACAGTTTTAGGCTACTACATAACAGCAGAATGACAGCAAGTTAACAGCAATTATAACAACAAAGTAACAGCAAAACTACACAGAACTTGACAGAAAGTTGACACAAACAAGAATGTAAAGAATAAATAATAAAATAATATGTGCATTTCATGCACGCTTTTTATAAAAATTGTGAGGTGACTTATATTTGACTATTAAACAAAAATTGCAAAGATATGCAAACTTACTAGACCAAGCAAGAGAATTAGAATATAGAATAGCAGAAATAAAAGAGCACATGACTAGCGTAAGCAGTACTAACTTTGATAACATGCCTATATGCCATGGGAATAATGATAAGCTTACAGAAGCATTATGTAAGTTAAAAGACCTAAGAGATAAGTATATTGAATTATGGGGGAAAGTAGCCGAGGAGGAGTTAGAAGTAATAGACATGATTAGCAAGCTAGACTATCAAGAACAGAAGCTAATAAGATTGCATTACATTGATTGTAAGCCATTAGAAGAGATATCCTGTATACTAGGATATACATACAGGCATACATCTAGGATATACAAGAGAATCTATGAAAAGCTAGAAAAGATGTCCTAGCATGTCCTATGCATATATGCTAGTATTATATTATAAAGAATCTAGCAAGAGCTAGTGAAGATCTATTTAATAAATATCTAACTAAACAATAGAGGTACTCAATCGCAGAGTATCTCTTTTTTATTTCAAGAAAGGATGTGAGCAAATGGCAAGAGAATACAAGCGAGGTTATAAACAAGATAAGCCACGTAATGCAGACGGTACGTTTGCTTACTGTGAAGAGTTAGAGCAAAGACAAATAGACATGATCCATGAACTTATAAGCAACGGAGGACACAAGACTAAAGCATGTGAGACATTAGGTATTCCTAGAAGTACTTTGTACAAGTGGCTAGATAATGAGAAGTTTAAGAAAGCTTATCAAACAGCATGTGAAAGATTGTACGAGGAAGGATTGTCGGATGCTATTAAAACTACGTTAAAGCTGATGAAGTGTCAAGATAGCAGAACAGCATTAAAGGCTTGTGAGAACATTATGAAGCTAAATGGATACTTAGACACGAAAGTAGACGTAACGCAAAACCCTAGCGAAATTGTTATCACACTGGCGGACAGTAACGATTAGATGTTACGTAACTCTTCGCGATAGCTTTCTTTAGCGAATAGTAACATAAAGAATATGAAAGAGTGTAGCCTTTGATAGTCATTGGTTGCGCTCTTTTATTATGTTTAGCACACTATGAATTAGTTTTCGTTTTTATCGTTTTAATATAAAAGTAACACTGCTACTAAACAAAATAGCATATTGGCGAAGATGGTGTGTGCGTAGATGGGGTACACCACCCTTGACATATGACTGGGGCGGGCGAATAGTTGCTCAAAATATTTTTACACAAAAATAACCCTAGCTATCACGCTCGTACAAGTGCCTTAGTATTTACCCTAACATCTGAACATTGAACACTATAAAACGTCTATACGACGCTCACAATTAGCGAGAGACACGAAAGAAGGTGATACATTATGATAACAGCAATTATACGAGATGATGGCTTTAGAATATATGGCCATGCTTGTTATGCTCCTAGTGGCCAAGATGTGGTGTGTGCTGGGGTGAGTGCTTTAATTGGTGCAGCCTTGCAGATGCTTGATTGGATGATTAACGAGCAGGACAAAACTAAAGGATTAATAGATGTTACAGTGAGCAATAGTAATTATGGTGACAGGTTAGACGCTGTTATTTTAATGCTATATTACGGACTATTAAACATACAACAACAGTACTCGAACTATCTAAGCGTGGTGATTGACACATGGAATTAAAACTAGACCCACAAATATTCAATGATGCTTATTTGCCTTACTTGTTCGACTACTCTCACCGTTATGAGTGCTACTATGGTGGTGCCGGTTCCGGTAAGTCGCACTTTGTTTGGCAAAAGCTAGTTCTTAAAGCTCTTAAGAGTAAGAGAAAAATACTTGTAGTGAGAAAAGTAGGCAATACTCATAGAGATAGTACTTTTCAAATGTTAAAAGATACCCTTAGTTTTTTTAAGATTTACGATCAATGCAAAGTGAATAAAACAGATATGACTATAGAGCTGATGAACGGCTCTATTTTTATTTTCAAGGGTATGGATGATGACCAAAAAATAAAGTCTATTGCTAACATAACTGATATTTTCTATGAAGAGGTTACAGAGGGTGCACTTGATGAGGTATCTCAACTTGATTTACGTCTAAGAGCAAAAGTTGATAATTTACAAATGTACTTTGCCTTTAACCCTGTAAGTAAAGATAACTTTGTGTACAAGTACTTTCACAGAGATGACCCTGATACTACTCCGAGTAATATGTTCGTGCTTAAGACTACATTTAAGGACAATAAATTCTTACCACAGTCTTACATTGACTCATTAATGGCTATGAAAGATAGCAATCCAATCTATTACAAAATCTATGTAGAAGGTGACTTTGCTACACTTGATAAGCTTATATTTGCCTATGAGATTAAAGACTTTGATTGGCGTGAGAAGCTTAAAACTGGAATCGCTTGTTTTGGCATGGACTTTGGATATACTAATGACCCCGCTGCATTCAGTGCCTTTGTAGTAAATGAAGATCAGCGTGAGATATGGATATTTGATGAAATATACAAAAAGGGACTATTGAATAATCAATTAGCTGCTGAAATCATATATCATGGTTTTCAAAAAGAAGTTATTACAGCAGATTGTCAAGACCAACAAAGTATAGATGAACTTAGAACACAGTATGGTATAAGTCGAATTAAAAGAAGTTGGAAAGGTAAAGGGTCAGTACTTCAAGGTATACAGTACATTCAACAATTCAAGATATATGTGCTTCCTAGCTGTGAAAATCACATTATGGAGTTTAGCAATTACAGTTGGAAGAAGAATAAACAAACAGGTGAGTATACTAATGAACCGATTGATAAATTTAATCACTTAATGGACGCTATGAGATATGGTATTCAGAAGGTGAGAAAAGGTAAAGTTAAAACGCTTAATAAAGCAGTATTAGGATTGTAAAGGAGGTGACAAATGTTTACTTGTAGAGGTGAATTAACGCTAGATTTAATTAGAAAATATATAGAATTATTCAGGGCACAAGAATTACCACGCTTGAAAAAGCTAGAGCGCTACTATAAAGCCAAGAATGATACAATCATTAATCGTACATTCGAGGACGCTAGTAAGCCTAACAACAAATTAGCTCATGCTTATGCTGCTTATATCACAGATACACTATCGGCGTACATGGTAGGTAAGCCGGTATCTTATTCAGCGCAAGACGATATTCTAAATAGTGAAATTGCTAATATCATGAATTATAATGACTCCGCTGACAATGACCTATCCATCGCTGAAAGTCAAAGTATTTACGGTAGAGCCTATGAAGTCATGTATGTTGATGAAGATGGTCATACAAGGTTTAAATGCCTAAATACTTTAGAGAGTGTTCCGGTTTACGATGGCACTGTAGAGAATAACATGAAATACTTTATCCGCTACTGTGAGGAACAGGATCCAGTAACTTTTGTTACTACTGTTACAGCATGGGTATATGATGATGTTGGATGTAGTGAGTATAGAGGTTTAAGCGTAGGAGATTTAAAACTTATTGATACTGTAGAGAATGTATTTGGATATATTCAAATCAACGAATATATTAACAATAACTTTTACGAGGGTGACTTTGAAAAGGTTATTAGCTTAATAGACGCTTACGATTTGATGTGTAGTGATACGCTTAATGAGTTGGATTATTTTAGTGATGCTTATTTACTATTTGCTAACTGTG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_015275|1113175:1120474|1119832_1120474_+|WP_013656003.1|DBSCAN-SWA MKLRNRYFNTFRTVTQAAWFNLQFFAGEDDNNNEDDKPAEDKTLTQDQVNDIIAKRLAKEKAKWEKDYNAKLEAEKAEAARLANLDATQRAEEEAKKRIAALEEREAKLKQAEDKLECENVLKERGLSTSFANFLLGADAEVTLANINSFETAFKDAVKAEVETRIKGKTPPAGGGDNKDDVVSKEDFKKLPLFEQNKLYLSNPELYKTYYGA >NC_015275|1113175:1120474|1113845_1114073_+|WP_013655995.1|DBSCAN-SWA MINEENVIFFKTGQNEEIIRKGNIVEIITPVGQDNITGRVTSFSNGQIYLDCSELYNADLKVLNFNEVRSIEVVK >NC_015275|1113175:1120474|1117414_1118749_+|WP_013656000.1|portal|DBSCAN-SWA MFTCRGELTLDLIRKYIELFRAQELPRLKKLERYYKAKNDTIINRTFEDASKPNNKLAHAYAAYITDTLSAYMVGKPVSYSAQDDILNSEIANIMNYNDSADNDLSIAESQSIYGRAYEVMYVDEDGHTRFKCLNTLESVPVYDGTVENNMKYFIRYCEEQDPVTFVTTVTAWVYDDVGCSEYRGLSVGDLKLIDTVENVFGYIQINEYINNNFYEGDFEKVISLIDAYDLMCSDTLNELDYFSDAYLLFANCEIDTNSVQDMKNNRIIQATSGDSGQAAVVQWLTKNANDVQCENTKKRTVDEIHKLSKVPNLDPSAFVSHTTASHVFYSLLATEDLVSKKEKKFKKGLQQRLEKIVHLLNVKGIDTNYDYRDIEITFNRNIPQGLESIADPISKLRDLISDETLISLIPGITNPLEELKKRDAQRERERIDTSGMLGDDLEN >NC_015275|1113175:1120474|1113175_1113817_+|WP_013655994.1|DBSCAN-SWA MDKYMSIITNFGCHGKCPYCIVRENGIDVPETTLEGLDSLLTRYVENDCNFISLSGGGDPLHEFRQHMDYYMKLFKLTRALDIPLEMHTSYLDAGFAFPVEEFSRVVYHLRDINKLNNVDKFGMEIVRVVFVVTEEMTVKDIDYIQMFVEESDKISELSFRQMVGPNFETQYWLHDYLKQGHEEGKWHYIEQNDYNLYYVNGQVYEKFSDIHK >NC_015275|1113175:1120474|1115873_1116173_+|WP_013655998.1|protease|DBSCAN-SWA MITAIIRDDGFRIYGHACYAPSGQDVVCAGVSALIGAALQMLDWMINEQDKTKGLIDVTVSNSNYGDRLDAVILMLYYGLLNIQQQYSNYLSVVIDTWN >NC_015275|1113175:1120474|1116163_1117402_+|WP_013655999.1|terminase|DBSCAN-SWA MELKLDPQIFNDAYLPYLFDYSHRYECYYGGAGSGKSHFVWQKLVLKALKSKRKILVVRKVGNTHRDSTFQMLKDTLSFFKIYDQCKVNKTDMTIELMNGSIFIFKGMDDDQKIKSIANITDIFYEEVTEGALDEVSQLDLRLRAKVDNLQMYFAFNPVSKDNFVYKYFHRDDPDTTPSNMFVLKTTFKDNKFLPQSYIDSLMAMKDSNPIYYKIYVEGDFATLDKLIFAYEIKDFDWREKLKTGIACFGMDFGYTNDPAAFSAFVVNEDQREIWIFDEIYKKGLLNNQLAAEIIYHGFQKEVITADCQDQQSIDELRTQYGISRIKRSWKGKGSVLQGIQYIQQFKIYVLPSCENHIMEFSNYSWKKNKQTGEYTNEPIDKFNHLMDAMRYGIQKVRKGKVKTLNKAVLGL >NC_015275|1113175:1120474|1118738_1119527_+|WP_041712913.1|DBSCAN-SWA MRTNYWEERLIGNQYRKGTKRMDKEILKIYKSTTKELQALVNDLWLKMLQNGSVSQWQLYQYGRYIVLQDQINKILTGLGQQEISIINSQLQALYETTFTESARYLGGEGLSGSFSLLNPQTAYEVANANFKGAAFSDRVWKRQDLLKEQLTRVITNSAVLGKDWKSVSRDLASRLEVGLSDSRRLVRTETMRVLNSAAINKAIERGYEYYRVLLEVDACDECYSEYEGKLFSLKGGSPPPLHPHCRCCIIVEMNEGERVDD >NC_015275|1113175:1120474|1115055_1115475_+|WP_013655997.1|DBSCAN-SWA MAREYKRGYKQDKPRNADGTFAYCEELEQRQIDMIHELISNGGHKTKACETLGIPRSTLYKWLDNEKFKKAYQTACERLYEEGLSDAIKTTLKLMKCQDSRTALKACENIMKLNGYLDTKVDVTQNPSEIVITLADSND >NC_015275|1113175:1120474|1114505_1114910_+|WP_013655996.1|DBSCAN-SWA MTIKQKLQRYANLLDQARELEYRIAEIKEHMTSVSSTNFDNMPICHGNNDKLTEALCKLKDLRDKYIELWGKVAEEELEVIDMISKLDYQEQKLIRLHYIDCKPLEEISCILGYTYRHTSRIYKRIYEKLEKMS >NC_015275|1113175:1120474|1119516_1119699_+|WP_013656002.1|DBSCAN-SWA MTIRIYFKGKCVEVVTDYDFKEYVSNIYEEEADNEYLIAKKVDGKEIAIRLRDIDYVEQI |
10 | Clostridium_phage(33.33%) | portal,protease,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1656614 : 1667971
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_015275|1656614:1667971|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_015275|1656614:1667971|1664933_1666187_+|WP_013656495.1|DBSCAN-SWA MKILIIGNGGRESAIAHTVRRFHPEAEIFVAPGNGGTEEAFTNIPIKVEELEALANFAEEKQVDLTIVGPEVPLVLGIVDVFEKRGLNIFGPNKECAQFEGSKHFTKQFLIRNDIPTAAYASFKRDAVEACVAEAKNFSLPVVVKADGLAAGKGVLICETYEDAEAAIREIFSGKFAEAGSTIVLEEFLTGTEASLLCFVDGDSIVPMETARDYKRALDNDKGLNTGGMGGFSPNPIITAEVKANIDTQILEPIISGFKKENLKFKGVLFIGLMIENNIPKVLEFNVRFGDPETQSVLPRLKTDLIEIMQACIDGNLASTPIKWDERQSVTLVLASKGYPETSHKGDVITGLDDLNEDTYLFHAGTKKVNGTIQTDGGRVLAITSLGASLREARATIYEEVKKIEFDGMQYRSDIAK >NC_015275|1656614:1667971|1667401_1667971_-|WP_013656497.1|DBSCAN-SWA MGINDFIQIGTRIKEIRKSKGFSQAYMAEKIGVNRTTYSNYENNNREPNLKTIEKICEILDVTISDIVSDTQKNITVDYWRGMMDTDLNSIKEIEENTRGYSGLEVPISSLVGSIYISLNKNEKDFVTRYSYHTERLLESLSELLTYSNLPIKHENVDKNKYLDAINAINEFIKYKLHELTTLNSKEGE >NC_015275|1656614:1667971|1664348_1664930_+|WP_013656494.1|DBSCAN-SWA MSRLRIGVLVSGGGTNLQSIIDAVENGTLASKVVCVISNKASAYGLERARKHNIPAFHVDPKNGHYDEELLALLLEQKVDLVVCAGYLKIMDEKLVNTFKGRIINIHPSLLPKYGGMGYFGIHVHEAVIAAGEKESGATVHYIDTGVDTGEIILQRQLEVLEDDTPESLQQRILAEIEHKILVEAIKQIEGSN >NC_015275|1656614:1667971|1656614_1660331_+|WP_013656489.1|DBSCAN-SWA MSVFRVYVEKKNGFDVEAKRMESELKEFLHIKAVKGVRILNRYDIEHITNKVYEKALNTIFSEPQSDTLVEKLALTSGKAFAVSYLRGQYDQRADSCEQCIRIIDSTLKPTVRTARVYIVDGELTNEELLKIKKHVINPVEAEEVSLEPVASLDMTYPVPEDVKVLVDFINMDEVALENFRKEQGLAMNLDDLIYFQGYFKGINRNPSFTELKVVDTYWSDHCRHTTFMTELTKIEVEEGEYAAPIKAALDEYYGMREELGRNHKKVSLMDMATIIVKHLKAQGGLKELFETAEINACTIVDNIKVDGKDEEYLILFKNETHNHPTEIEPFGGAATCLGGAIRDPLSGRSYVYQAMRVTGAADPNESLENTMAGKLPQRVITKTAANGYSAYGNQIGLATGEVKEYYHPGYKAKRLEVGAVVGAVKRSNVKHEEPVPGNVILLLGGATGRDGCGGATGSSKEHTEESLHTCGSEVQKGNPVEERKLQRLFRNPEFSKRIIRCNDFGAGGVCVAIGEIAEGLRINLDLVPVKYMGLDATELAISESQERMAIAIDKNDLDLMINLANKENLNAVCVAEVTKEKRLVMTWRNKEVVNIDRSFLDSAGVTQQREAKVTAPEIEIEVKKLSKDNVLATLKDLNVGLQKGLGMQFDGTIGAGSVLMPYGGKNQLTKENGMVAKVPLVKGETTAATFMTHGFDPYLSEKSPFHGALYAVVESIAKIVALGADYKKTYLSFQEYFERLNGETSWGKPVAALLGALKAQKELGLAAIGGKDSMSGTFENISVPPTLISFTCNLGDAKECVSGSLKAAGNRLVYVAIPKDNVYMPDFSIMHEAYSKIYELVKADKVQSAYAIGAGGVVAALSQMAIGNEIGVKVELPPEIAPFVASYGDIVLEVAPEVATSLKEDYVTVIGETVTEKVVTIDEVTLEISEIIKAMLAPTANVFTQKVDSPLAATDATFTGERKIYVAKQKIAQPEVLIPVFPGTNCEVDTRRAFERAGAKVNEVLFINRTNSDIEDSIERLYQGIKSAQIIAFPGGFSAGDEPDGSGKFIASTFRNERLKEAIHEHLYTQDGLMLGICNGFQVLVKLGLLPYGEIREMDGECPTLTFNTIGKHISLMARTKITSVQSPWLNGVSLGDLHEIPLSHGEGRFVAPEAMLKELIAKGQVFSQYVDENGFASQDGNVNVNGSMHNIEGIISADGRIIGKMGHSERVGKFVHKNIPGNKEQNLFTSGVNYFK >NC_015275|1656614:1667971|1660451_1660940_+|WP_013656490.1|DBSCAN-SWA MKVAFVMGSDSDLPVVEKGVKTVKDFGVEVEVRVISAHRTPYAAEEFARDAEKNGIGVIIAAAGKAAHLGGVIAAFTTLPVIGLPIKSSTMDGLDSLLSMVQMPPGIPVATVAIDGAENAGILAVQMLALSSPELKEKLALHKKNMAEKVAEKDAAVSARFQ >NC_015275|1656614:1667971|1661065_1661770_+|WP_013656491.1|DBSCAN-SWA MEKREQLYEGKAKKVFKTDDERYYIVSYKDDATAFNGEKKGTIVGKGVVNNRMSNIMCRMLEQNGIETHLVEELNDRETVVKAVEIVPLEVIVRNVAAGSFSKRFGVEEGTVLKNPTLEFCLKDDALGDPMINDYQILALDIATEEELKVMSEMTFKINELLKAYFLKIGVKLIDFKIELGRVDGKIILADEISPDTCRFWDAETNKKLDKDRFRRDLGGVEEVYAEMLARVTK >NC_015275|1656614:1667971|1666279_1667401_-|WP_013656496.1|integrase|DBSCAN-SWA MALTKRTNLEDKSGRKPAKWRIRVTRNGHKYETTFFGNKKEAEQAEKDFIYQIDKGMMGSSENMLFKDLYKKVQREYIDKLKANSRITYRNSYDNHIGPAFDDMKLCDIKPIDIQEFATDLLEEYKYNTVRVIMSKLNTCLSLAEKWGIISNSPYKHIELGQAESKSLDELMSLDNIQTLIKLYENDKWPLHRAAFFLAVGCGLRNSEIRALTLKDIDFNLNTITVDKQIGLYDDEKDLFTSTKTSGSKRKIYAPEFVMKAIKEHIDSMPAIPINALIFTISKNKPINSHTLSNHLREVLIANDLPLIRFHDLRHIHATLMINNNMDIATVSKRLGHKSIATTLKFYTHTVEERDKRVATEFDDIYSKIKKKG >NC_015275|1656614:1667971|1661785_1663183_+|WP_013656492.1|DBSCAN-SWA MKFLQDDSLHEECGVIGVYREEKSASRLAYYGLFALQHRGQECAGIAVNCEGDIEVRKGMGLVADVFDETALNELQGNIAIGHVRYSTAGDKDVRNAQPLVAKYKKGDIGLAHNGNLVNAENIREILEDSGVIFHSTTDTESILNLIARYSNKGIETGIKNTMSLLKGAYALVLTTGEDLIGIRDPHGLRPLCIGKLKDGYVFASESCALDVLDAEFIRDVEPGEIVVINKEGLRSIEPSNMCQKHLCVFELIYFARPDSVIDGDSVYDFRVNAGRMLAKQKKIEADMVMPVPDSGVPSAIGYAKESGIPYGEGLVKNRYIGRTFIQPTQEMRENAVKIKLSPLKQNLEGKRVVMIDDSIVRGTTCKRIVEQVRKAGAKEIHVCITSPPVQYSCYFGIDTPYREFLIGAQKSVDEICEYLGADSLTYLSEDGLREVCNHKSQFCKACFNGKYPMEVPIGTPPSQC >NC_015275|1656614:1667971|1663332_1664361_+|WP_041713536.1|DBSCAN-SWA MTYKDAGVDVHRGYEAVAQMKEHVKSTFIPGVLTDIGSFGGAFSLGAFAGMKEPVLVSGTDGVGTKLKLAFDMDKHDTIGIDAVAMCVNDIICGGAEPLFFLDYIATGRIAPEHIASIVKGIADGCKESLCALVGGETAEMPGFYPDGEYDVAGFAVGIVDRQEMIDGSTIKVGDVIIGLPSTGVHSNGYSLVRKLVETAGVDLKAYSEELGETYGEALLKPTKLYVKAVKAAKAAARIKGIAHITGGGFIENVPRMLPKGVDAKININVIEKPPIYKFLEETSNLDVNELYNTFNMGIGMMLVVDVADSEKVLAALHGADEKALVIGEIVAGNKGVILCQD |
9 | Microbacterium_phage(12.5%) | integrase | attL 1665781:1665794|attR 1667416:1667429 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1894803 : 1903922
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_015275|1894803:1903922|DBSCAN-SWA AATGAAACAACTAGTAAAAGAATATATAGGAATTATTATAGGAGCATTACTTATAGCCATAGGACTTTATTTTTTCTGGGCACCATCAAATTTAGCAGCTGGAGGCGTAAGTGGTCTAGCAATTGTTCTAAAGGCGCTCTTCCCGATTGTACCCATTGGTATTCTTATTTTTATTTTAGATTGCTTGATGTTTATGATTGGGTTTATCATGTTAGGAAAAAGCTTTGGATTAAGAAGCTTAATGTGTAGTTTGTCTGTATCAGTATTAATGACAGAGTTAGAATTCATTTGGCCTAATTGGCAGCCTATTAGTGACGATTTACTAATCTTACTTATTTTTGGAGCGTTATTTATTGCTATAGGTCAAGCATTAGTGTTTAATTTAGAAGCATCTTCTGGTGGAACAGATATTATAGCAAAAATGATTACCCAATATACGCACCTTAATATTGGAACCTCCTTAATGATAGCTGATATGATTGTTGTTCTTTTAGCTACGGGCATATTTGGGCTTGAAAAAGGACTTTATGCGGCATTAGGGGTTTTAATTACGACTAACTTAATAGATTATTTAATTTCTGGGTTTAATGTTCAGCGCTATGTCATGATTATTCCCTCATCTTCAGATAAAGTGCAACCGATTAATACGTATATTTTAGAAACACTAGAGCGGGGTGCAACTATCTATACAGCAGAAGGAGCGTATAGTAAAAACCCTAAGCAAGTCATTACAACTGTTATCGACCGTAAGGAATTTATTGATTTAAAAAGGAAATTAATTAGAATTGACCCTTTAGCTTTTATGACAGTACAAAATTTACATGAGGTTGTTGGAGAAGGTTTTAAAGTGAAATAAAAAATGGTTAGAAATTAAAATAGAGATAGAAATTAAGCGGATAGCTTTCTTTCTATCTCTATTTTAATTTAATATTTTAATTTTATAAATAAGATTCTTAGAATTTAGTATAAAATTAATCGAAAAGGGTTGACAATTCTAGATATAAAGCATATACTACAAAACATAGAGAAATAGTAGGAATAAAGGAGGGGCTATGAAAATATCAACAAAAGCAAGATATGGTTTACGTGCTTTAGTAGATTTGGCAGTTCATTCATCAGGGGATCAAGTACCACTTATTAGTATAGCCCAGAGACAAGAGTTATCCGCCAATTATATGGAGCAAGTTTTTTCATCTTTAAAAAAAGCAGGAATTGTAAAAAGTATCAAGGGGTCACAAGGTGGCTACATTTTAGCAAAGCGTAGCTGTGACATCACTGTAGGAGAAGTCATTAGGGCTATAGAAGGAGAAATTCTTATCGTAGAAGAAGAGGAAGCTAGAGATGATGCTTCTTTAATTTATAATAGCATGAAACAGTGTTTACAAGAACAAGTTTGGAGTAAAATTACAGAAAGTATTTGTCAGGTGATTGATCATATTACCTTGGAAGATTTAATGAAGGATTATGAGAAGCTTAATCAAAAAGAAGTATTAATGTATTATATATAAAAATGGGAGGAATTAAAATGGCTAAGATATCAAAAAATATTACAGAGTTAATTGGAAATACCCCTTTATTAGAAATAGGGCAGTATGCAAAGAGTGAGGGAGTAGAAGCAACGCTTATTGTTAAACTAGAGTCTTTTAATCCAGGTAGCAGTGTAAAAGATCGTATTGGTTATTACATGATTCAGGATGCTGAAAAGCAAGGGCTTATAACAAATGAAACAACTATTATTGAGCCAACTAGTGGGAATACAGGTATTGCTTTAGCTTATATATGTGCAGCAAAAGGTTATAAGTTGATTTTAACTATGCCTGATACAATGAGTGTAGAGCGTCGTAATATATTAAAGGCATTAGGAGCAGAGCTTGTGCTTACAGAAGGAGCAAAAGGTATGAAAGGTGCTATTCAAAAGGCTGAAGAGCTTGCTAAAGAAAAAGTACCAAGCTTTATACCACAGCAATTTAATAATCCAGCTAATCCTTTAGCACATCGTTCAACAACTGCACTTGAAATATGGAATGATACAGATGGTAGTGTAGACCTTTTTGTAGCAGGTGTAGGAACAGGTGGAACAGTATCTGGTGTGGGAGAGGTACTTAAAGAAAAGAAACCACAAGTGAAAATCGTAGCTGTGGAACCAGCAGATTCTCCAGTACTTTCAGGTGGTAAACCAGGACCACATAAGATTCAAGGTATTGGTGCTGGTTTTGTACCAGCAGTGTTTGATTCTGAGGTGATTGACGAAATTATTCAGGTAAGTAATGAAGACGCTTTTGAAACAGCTAGAAAGCTTGCTAAGACAGAAGGTGTATTAGTAGGAATTTCATCAGGAGCTGCTTTATATGCAGCCACTCAATTAGCTAAAAGACCGGAAAATAAAGGTAAAAATATCATAGCACTTTTACCAGATACTGGAGAAAGATATTTATCTACACCTTTATTTGCTTAGTAATCTTTGCTCAAGTATCAGTTGAGGGTAACTTGTACAATCAATCAAAGATAAAAAATGAGAGCAGAATAAATCAAATTTTATAAGATTACCAAATAACTGCCAGTAAGCCTTAAAAGGTGAAAACTGGCAGTTATTTGTTTGCCTAAATTAAAAGTAAGTTAGCAAGTACTGCAAGAGCATAAAGGAAGAGGAATAAAAAGTTGATGAAAATAACATCCTAAGTTGTAGCCGGTAGAGAAATAAGTATGGTATATTTGAGAGGATGATATAAAAGAGGAGCGATGAAATGGTAACATTTAATAACAGCTGGGACGAACAACTAAAGGATGAATTTGAGAAACCTTATTATAAAGCTTTACATGAATTTTTAAAAGATGAATATAAGACTCAAACGATTTATCCGAATATGTATGATATCTTTAATGCTTTAAAGACAACAAGTTATGATGACGTAAAAGTCGTTATTTTAGGACAAGATCCGTATCATGGAGAAGGACAAGCACACGGAATGGCTTTTTCTGTAAAGCCAGGTGTAAAAGTACCACCTTCACTAGTTAATATTTATAAAGAACTTCAAGCTACTTTGGGGTGTTATATACCGAATAATGGTTATCTTATGAAATGGGCTGAGCAAGGCGTATTATTACTTAACACGGTTCTTACGGTAAGAGCTGGTAAGCCTCAATCTCATAAGGGAAAAGGTTGGGAAGTATTTACAGATCGTATTATTAGTTTGCTAAATGAAAGAAAAGATCCTGTTATTTTTATTTTATGGGGAGCGCCAGCTAAGAAAAAAGCAGAGCTTATTACTGCACCTTGGCATAAGATATTAACAGCTGCTCATCCTAGTCCTTTATCTGCATACAATGGCTTTTTTGGATGTAATCATTTTCAAAAGGTAAATGAGTATTTAATAGCTATGGGTAAGACACCTATTGATTTTCAAATAGAAAATATCTAGCCTTTTAAAACAAGAATGCTAAAATTGACTTGACAAAATATTTGACTGTAATTAAAATACTTATATAAATCTAAAAAATAAAGACGATGAAAAGACGAGTAAATCTTTACTAAGGTTTAAAGAGAGCCGAGGGAGCTGAAAATCGGTAACAAGGTAAGGATGGAAGAACAGCTTGGAGTTGCTAATCGAACGGCTATTGGCTTAGTAGACTTAGACGGGATAGACCGTTATATCTAAAACGTATCGAGTAATCTGTACGTTAGTGAGAGGATTTTAGTTTACTAAAGTCAATTAGGGTGGCAAACGCGAATCAACCTTCGTCCCTTACGTTTAAGGGAAGGAGGTTTTTTATATTTTAAAAGGAGGAATATGTGATGCAATTAAGAATTCCAGAAGGTTACAAAGCCAAATTAGACTTAAGAGAAACAGAAGTGGCAATTAAAAAGTTAAAGGATTATTTTGAAAATGCTTTAGCTTATGAGTTGTATTTAACTCGTGTGTCTGCTCCACTTTTTGTTAAACCAGAAACGGGTTTAAATGATAACTTAAATGGGACAGAAAGAGCAGTTGCTTTTGATATTGCAGATGATAATCATGCTATTGTAGAGGTGATTCATTCTTTAGCTAAGTGGAAAAGAATGGCGCTTGGTAGATATGAATTTGGTATTAATGAAGGACTTTATACAGATATGAATGCGATTCGTCGTGATGAAGAATTAGATAACTTACATTCCATTTATGTCGATCAATGGGATTGGGAAAAAGTTATTACTAAGGATATGCGTAATACAGAGTTTCTTGAGAAAACAGTAAAGCAGATTTACAGGGCGTTTATTAGAACACAAAACTATATTACAGAAGAGTATCCTGTACTTGAAAAATGGTTGCCAGATGAAATTTATTTTGTAACTTCACAGGAGTTATTAGACAGCTATCCAGAACTTACTGCTAAAGAAAGAGAAAATAAAATTTGTGAAGAAAAGAAAGCTGTATTTGTAATGCAAATTGGTGGGGCTTTAAGTAATGGAGAAAGACATGATGGTAGAGCGCCAGATTATGATGATTGGTCTCTTAATGGAGATATTTTATTCTGGAATCCACTTTTAGGTAGCGCATTTGAACTTTCTTCTATGGGAATCCGTGTAGATGAAGAAGTACTAGAAAAACAATTAGAAATAGCAGGGTGCCCAGAACGCCGTGAATTAGCTTTCCATAAAGGTGTTTTAGAAAGACAATTACCTTATACAATTGGTGGTGGGATTGGTCAATCTAGAATTTGCATGTATTTCTTACAAAAAGCACATATTGGAGAAGTTCAAGCATCCATTTGGCCACAAGAGATGATTGATGCTTGCGAAGCAGTACATGTTCATTTGCTATAACGCTCTTGATTAAACAATAGAGCATGTACAATCGGAGTATATGGTTTAATACTGTGTTCATATACATAGGATTAAGATAATAAGTAAATTTAGAATAAGCGATTAAAATCTGTGAAGAGAATTTTAATTGCTTATTTTTTCGTTTATTTAAGTACTTAGGAGAAATAAGCAGTAGAGGCAAGCAATCTTTAGAAAAGGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_015275|1894803:1903922|1894803_1895658_+|WP_013656705.1|DBSCAN-SWA MKQLVKEYIGIIIGALLIAIGLYFFWAPSNLAAGGVSGLAIVLKALFPIVPIGILIFILDCLMFMIGFIMLGKSFGLRSLMCSLSVSVLMTELEFIWPNWQPISDDLLILLIFGALFIAIGQALVFNLEASSGGTDIIAKMITQYTHLNIGTSLMIADMIVVLLATGIFGLEKGLYAALGVLITTNLIDYLISGFNVQRYVMIIPSSSDKVQPINTYILETLERGATIYTAEGAYSKNPKQVITTVIDRKEFIDLKRKLIRIDPLAFMTVQNLHEVVGEGFKVK >NC_015275|1894803:1903922|1896327_1897257_+|WP_013656707.1|DBSCAN-SWA MAKISKNITELIGNTPLLEIGQYAKSEGVEATLIVKLESFNPGSSVKDRIGYYMIQDAEKQGLITNETTIIEPTSGNTGIALAYICAAKGYKLILTMPDTMSVERRNILKALGAELVLTEGAKGMKGAIQKAEELAKEKVPSFIPQQFNNPANPLAHRSTTALEIWNDTDGSVDLFVAGVGTGGTVSGVGEVLKEKKPQVKIVAVEPADSPVLSGGKPGPHKIQGIGAGFVPAVFDSEVIDEIIQVSNEDAFETARKLAKTEGVLVGISSGAALYAATQLAKRPENKGKNIIALLPDTGERYLSTPLFA >NC_015275|1894803:1903922|1899857_1900292_+|WP_013656710.1|DBSCAN-SWA MFISIITALISGILMSVQGVFNTRVTEKSGVWFTSSIVHFIAFICCLGVLLFVRDANVEGFKTINKWYLLGGVLGAGITYTVVVSMAKLGPSYAVMLILIAQMTAAYLIELLGWFGTEKVNFMWTKLVGVLIMVGGIIVFQWKK >NC_015275|1894803:1903922|1898595_1899603_+|WP_013656709.1|DBSCAN-SWA MQLRIPEGYKAKLDLRETEVAIKKLKDYFENALAYELYLTRVSAPLFVKPETGLNDNLNGTERAVAFDIADDNHAIVEVIHSLAKWKRMALGRYEFGINEGLYTDMNAIRRDEELDNLHSIYVDQWDWEKVITKDMRNTEFLEKTVKQIYRAFIRTQNYITEEYPVLEKWLPDEIYFVTSQELLDSYPELTAKERENKICEEKKAVFVMQIGGALSNGERHDGRAPDYDDWSLNGDILFWNPLLGSAFELSSMGIRVDEEVLEKQLEIAGCPERRELAFHKGVLERQLPYTIGGGIGQSRICMYFLQKAHIGEVQASIWPQEMIDACEAVHVHLL >NC_015275|1894803:1903922|1900315_1901260_+|WP_013656711.1|DBSCAN-SWA MIKNKVCIIGAGMVGSATMMSILNSGLVAEIVMIDQNEKKAAGEALDAFHTTSFTYVPNVLIRQGNYEDCKDAQIIVMSAGPSVKPGEKLDRRILTKTNAEVTRSVMKEIIRYTQEAIIIFVSNPVDVVTYIAQNEFNYPRNKIIGSGTLLDTARMRRIIGEHFMVDTKNVHGYILGEHGATAMATWSLCNLGGIPLSDCSKKFNKPAVNQEQVLKEVIDAGMNILMAKGYTNYGIAEAVARMVKAIVLNELSVLPVSTTLEGEYGIKDVAISVPCIIGQEGIQSILDIPLTKEEHDKLLASANSLKEIIRTIE >NC_015275|1894803:1903922|1901328_1901808_-|WP_013656712.1|DBSCAN-SWA MSTLQVAGFLDHSTVNGEGFRSVLFLSGCLHACPGCHNPEMQAFHYGDSVEASDILQRILKNKPLIDGITFSGGEPFEQTEALIDLAASIKATGLTLWCYTGYTYEQLITNPSRRKLLNFIDVLIDGPFILAEKDEHLLYRGSRNQRILYLSQGKIIES >NC_015275|1894803:1903922|1901804_1903922_-|WP_013656713.1|DBSCAN-SWA MQYYVIKRDGRKVTFNTTKIENAILRSAKNVEVDIPISDITSKVTGRIQDLYSYEITVEQIQDVIEDTLMDLQLEALKNSYANYRKERTRIRDLKSELMDTVHNIGIETDRDNANVGNNFSSKLLRIASETNKWHNLSKMPKHLAKLHEQGDLYYHDLDSYNLTTNCLHIDTGKVFENGFNTGYGTIRKPKRIESAAELSCILLQSSQNDMFGGQSHVNFDNDMAPYVGLTREEINQEFAPLKSSLSEEDFTTFVENKLVSRVRQSMQGIVYNLNTMHSRAGSQVPFSSLNIGLPQSNDAALVCQIFLEEYEKGLGKNEQPIFPNIIFRVKKGVNRGEDAPYEYLFKLACRVASTRMNPTFMNIDADFNLKYYAKGILPATMGCRTYVCSNINGPEGPNRRGNNAPTTINLPRVALEAKGNLEAFWVLLDSRLQLAKESLLHRYEVLKRLKVKDLPFVVGEGLMLGSEGLGPNDSIDPVLKNGTWSIGFIGLAETLVALTGKHHGESETARELGYQIVQCIRNFTDKATQDTHMNWSCYATPAEGLSGKFVIQDRDRFGSIAGVTDKDYYTNSFHVPVGYQISIIDKIQIEAPFHRMCNAGHISYIEVDGYPSEETIEKIITYAYDSSNISYIGINFHLRYCKDCGTSVTDCGKTCPECGSSHIQGISRVTGYLSLDERFGSGKSAERQDRLSHDEAHKNTYTNV >NC_015275|1894803:1903922|1897546_1898221_+|WP_013656708.1|DBSCAN-SWA MVTFNNSWDEQLKDEFEKPYYKALHEFLKDEYKTQTIYPNMYDIFNALKTTSYDDVKVVILGQDPYHGEGQAHGMAFSVKPGVKVPPSLVNIYKELQATLGCYIPNNGYLMKWAEQGVLLLNTVLTVRAGKPQSHKGKGWEVFTDRIISLLNERKDPVIFILWGAPAKKKAELITAPWHKILTAAHPSPLSAYNGFFGCNHFQKVNEYLIAMGKTPIDFQIENI >NC_015275|1894803:1903922|1895854_1896310_+|WP_013656706.1|DBSCAN-SWA MKISTKARYGLRALVDLAVHSSGDQVPLISIAQRQELSANYMEQVFSSLKKAGIVKSIKGSQGGYILAKRSCDITVGEVIRAIEGEILIVEEEEARDDASLIYNSMKQCLQEQVWSKITESICQVIDHITLEDLMKDYEKLNQKEVLMYYI |
9 | Streptococcus_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2052164 : 2071538
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_015275|2052164:2071538|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_015275|2052164:2071538|2055986_2056229_+|WP_013656850.1|DBSCAN-SWA MKNLLKEILAAIALIVAFTLVLFPPSLSSDEVKIILGLPSVIFLSFYMGVYITKRERYKREFEKKKSMAKAATFNHAHRK >NC_015275|2052164:2071538|2062319_2062556_+|WP_013656866.1|DBSCAN-SWA MFEIKCKLYKLAVWYIGKCNKKWDKPTQQIKEFDRLTYRNIDKAYLKCGADCEWQNFSRYDVLDNAIQKLASYEDNKI >NC_015275|2052164:2071538|2061854_2062136_+|WP_013656865.1|DBSCAN-SWA MKVILYKRRYGVHRFVKECEVPVSFNKVYIKEDVINEDLLLDLLPKNWLPVEPREILLTISDKEGCGTGQRGLNRFLPWAKYFDSYVIELQED >NC_015275|2052164:2071538|2063691_2064657_+|WP_013656868.1|integrase|DBSCAN-SWA MSRVLYSQERWEKVNAVNKELMQLYLRSTRADRRRPNTCSEYTYDLRFFLIWNLLYNNNMNVLEFKKRNFEDFKFFMTDERNVSNARANRLLCVVRRMMDYAEDDDDLYEFYVRNVAAKVKSLEKKPVKENTFLKQEQIDLLRGYLINKKMYQHLCLLDVFYDTGARINEVLQVKNTDTLKHGYIKVECKGGEKQYILIHEHSQESIKLHLSVKESGDAFWQSKYGEVKKTSTLRGWVKDMYEILKEIDPSTPYFTPHSFRHTVIENLCNGTHYLCKKIGRKLTIEEAQIIVHHKSIDMTKSYMKPKDGEIVFKLFGISLG >NC_015275|2052164:2071538|2066749_2067508_+|WP_157864050.1|DBSCAN-SWA 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35 | Clostridium_phage(25.0%) | portal,integrase,terminase,head,protease | attL 2042710:2042725|attR 2067878:2067893 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2498411 : 2505948
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_015275|2498411:2505948|DBSCAN-SWA 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GCTACCTTTGCTCCTGCAGCTGCTACAAGAGGTGCCAATACTATCGTTGTTTTATCACCTACACCACCTGTACTATGTTTATCTACCTTAATGCCCTGAATAGGAGATAAATCTATTTGATCTCCACTACTAGCCATAGCCATAGTTAAATACGCTGTTTCTTCTAAAGACATGCCTTGAAAATAAATAGCCATTAATAAAGCTGATACCTGGTAATCTGGAATATCACCTTTTGTATAACCTTGTACTACAAAATCTATTTCTTCTTTTGTTAAAGCCAGCCCTCTTTTTTTGCAATCAATAATGTCATACATTCTCATTTTCTTACTTTCCTCCCGTTCTATTACTTATAAACTTCTTTCAAGAAACTTTCACCTATCTTAAGTTGTGGAAGATTAAATAACTCACATAAAGTTTGCCCAATATCCGCAAAACTCTTTCTTGTTCCTAAATTAATACCTTCTTTTATTTGTTTACCAATTACTAAAAGTGGGACATATTCTCTTGTATGGTCAGTTCCTGGTGCCGTCGGGTCACAACCATGATCTGCTGTAATAATAAGTATATCCTCTTCCTTTAAAGCTTCCACTATTTGTGGTAATGCTTTATCAAAGGCTTCTAAACCTTTACCATAACTTGCTGGATCATTACGATGTCCCCATTTCATATCAAAATCAACCAAATTAGTAAAAATAAGGCCTTCTTGATGTTTTGTCATGCATTCTAATGTAACAGCAATACCATCATTATTATCCTTTGTATGAATAGCTTCGGTGATGCCTTGACTATTAAAAATATCTTCGATCTTTCCAACTGCTACCACTGGCACACCACCTTCTTCACAGTAAGATAAAAGGTTGGGTTTTGGTGGACAAATAGCATAGTCTCGTCTGTTAGCTGTACGTGTAAAATGGCCCTCTTCTCCTGTAAATGGTCTTGCAATAACACGCGCAACTTCATGCTTACCTTTTAATAAATTACGTGCAATTTCACACATTTCATATAGCTTTTCTAATGAAATAACAGATTCATGAGCTGCAATTTGAAAAACACTATCTGCTGATGTATAAACAATAGGATATCCTGTTTTTACATGCTCTTCACCCAATTCTTCAATAATAGCTGTACCTGATGCTGTACAATTCCCCAAGGTTCTTCTACCGATTTTTTCTTCAAAGGCTTTCATAATTTCTTCCGGAAAGCCATTTGGATAAGTTGGAAATGGTACTTCTGTATAAATACCCACCATTTCCCAATGACCTGTCGTTGTATCTTTTCCTTTAGATAATTCACTCATTCTTGCAAAACTGCCTTTTGGTGATTCATATCTAGGGAGTGCTTTCATCCCTTCTATATTCCCTAATCCATAACTTATCATATGATTTAATTCTAGTCCATTACAGTGCTCATACACATGTGCAATTGTATTTACATCTCCATCACCATATTGTTTTGAATCAGGCATTGCTCCCATTCCTACGCTGTCTAAGACTATCCATATTGCTCTTTTCATCTCTTACCCTCCTAATTCTTAAGTGATTACTTAAACTTTCTACTATTATCACTTAGCTTCATATTGATTAACCTTTATTGTACCACATTCTGCAAAAAAATTGCACAAAAAAACTAGGAGATTACCTCCTAGTTTCATGCTCTTGGATGTGTTTTATTATACACATCCATTAACTCCTCTGTTTCTTTATTCAGATGCATATAAACTTGTGTAGTTGAAATATCTGAGTGCCCTAGCATTTGCTGCACGGATTTTAAATTAGCACCATTTTGCACTAAATGTGCTGCAAAAGAATGTCTTAACATATGGGGAGTAATCTCACCTTGAATATGTGCAGCATTAGCATAGGTCTTTAAAATCTTCCAAAAACCTTGTCTTGTCATAGGATAGCCATTGCAATTAACAAATAACGTTTTATCATTTGCACTACGGATTAAAATGTGTCTTACTTCTCCCAAATACATATTTAACGCTGAAATGGCAGATTTACCAATAGGAATGGTTCGTTCTTTTTGAGCATCCCTACATATAATATACCCTTGTTGCAAATTAATATCTGTTGTTTTAAGTGAAATGAGCTCTGATACACGGATCCCTGTAGCATATAGCAGTTCAAGCATGGCTCGATCACGTATTCCTTTAGTATCTTTTTTATTAGGTTGTTCTAATAAAGAGCTAATTTGCTCCTGCGATAAAATACGAGGCGCTTTTTTCTCTATCTTAGGTAAAGCTATTAATCTAGCTGGATTCTCATTTAGCACTTGTTCTTTTACAAGATATTGGCAAAAGGCACGAATAGATGCAAGAGTACGGGAAATAGTTGCAGTTGATTTCTCTTCATCTTTCATATGCTCTAAATAGACTTTAATTTGCTGATCTGTCAAAGACTGAATCTCTATTTTCCCCTGTTCTTCAACATAACGTTCAAAATATCTCAAATCTCTTTCATAAGATTGCACCGTATTATCTGAAGCACGCTTAATATGCTTTAAATAATACAAAAATGATGTAATATACTCCTCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_015275|2498411:2505948|2500248_2501019_-|WP_013657277.1|DBSCAN-SWA MAVLFKLQDFEGPLDLLLYLIDKNKMNIYDIEISSITDQYMTYLDEAEEVELDQMSDFIVMAATLLYIKSRMLLPKHPKPGEEVEEDPREELVRKLLEYKKVKYVSEKLNACQGESSQYCFRNKPAEIDIPESAIDYDAILENVSLKLLYDTFEQLMKQKEWEQHTKEERKIDHNILKKDTYTIEQKSIYIRNLIALEGKTTFFTICKKEMPKIELIVTFMALLELIHKKEVTVLQEEPTGDIVIKGGIVDEEDRA >NC_015275|2498411:2505948|2502425_2503730_-|WP_013657279.1|DBSCAN-SWA MRMYDIIDCKKRGLALTKEEIDFVVQGYTKGDIPDYQVSALLMAIYFQGMSLEETAYLTMAMASSGDQIDLSPIQGIKVDKHSTGGVGDKTTIVLAPLVAAAGAKVAKMSGRGLGHTGGTIDKLESFEGFKVELTEEQFFDNVNAHHIAVVGQSGDLAPADKKLYALRDVTATVDNMSLIASSIMSKKIASGADAICLDVKCGTGAFMKKLEDAKALGKAMVDIGNHVGRQTMAVVSDMNQPLGYAVGNALEVMEAINTLRGKGPEDLTLLTITLASHMLMLAGLAKDVEAAKNQIQDLLSTGAAIDKLKEWIKLQGGDERAVDDFSYLPQAPYHRDFCLNQIGYVEAINAEAVGKAALVLGAGRETKESSIDLAVGIVIHKKIGDKINVDEPVATIYYNNEQKYNLATSILEKAYKISDQQIEKPDLIYDIIH >NC_015275|2498411:2505948|2498411_2499560_-|WP_013657275.1|DBSCAN-SWA MKKKIILSFILIGSMLVSSLCYANSELPKVRAKGAVLIEQESGRVLYEKNGYEPLAMASTTKIMTCILAIEKGNLLDVVTISKRASSAPPVKLHLKVGEKQRLGDLLYALMLQSDNDAAVAVAEHIAGSVEAFCEQMTEKAKEIGAEHTSFKTPNGLDAEGHYASAYDMTLIGAYALKNPEFVKIITTATIQIPTIPTEGSHTYGLQNKNRFFYSYEGANGIKTGFTNKAGHCFVGAAYKNDMQLIGAALGSGWGKAGKTQKYTDVINMMNYGFKYYKKYTLVEPQRNIAKVAIEKALIESLSLDCDETIILPLTEVEKANVYIKKVVPTQLVAPVHKRDIIGEVQVICEGVTLAKVPLLASEEVPKATLLDYIKKWIKGND >NC_015275|2498411:2505948|2503753_2504923_-|WP_013657280.1|DBSCAN-SWA MKRAIWIVLDSVGMGAMPDSKQYGDGDVNTIAHVYEHCNGLELNHMISYGLGNIEGMKALPRYESPKGSFARMSELSKGKDTTTGHWEMVGIYTEVPFPTYPNGFPEEIMKAFEEKIGRRTLGNCTASGTAIIEELGEEHVKTGYPIVYTSADSVFQIAAHESVISLEKLYEMCEIARNLLKGKHEVARVIARPFTGEEGHFTRTANRRDYAICPPKPNLLSYCEEGGVPVVAVGKIEDIFNSQGITEAIHTKDNNDGIAVTLECMTKHQEGLIFTNLVDFDMKWGHRNDPASYGKGLEAFDKALPQIVEALKEEDILIITADHGCDPTAPGTDHTREYVPLLVIGKQIKEGINLGTRKSFADIGQTLCELFNLPQLKIGESFLKEVYK >NC_015275|2498411:2505948|2505057_2505948_-|WP_013657281.1|DBSCAN-SWA MEEYITSFLYYLKHIKRASDNTVQSYERDLRYFERYVEEQGKIEIQSLTDQQIKVYLEHMKDEEKSTATISRTLASIRAFCQYLVKEQVLNENPARLIALPKIEKKAPRILSQEQISSLLEQPNKKDTKGIRDRAMLELLYATGIRVSELISLKTTDINLQQGYIICRDAQKERTIPIGKSAISALNMYLGEVRHILIRSANDKTLFVNCNGYPMTRQGFWKILKTYANAAHIQGEITPHMLRHSFAAHLVQNGANLKSVQQMLGHSDISTTQVYMHLNKETEELMDVYNKTHPRA >NC_015275|2498411:2505948|2499653_2500268_-|WP_013657276.1|DBSCAN-SWA MKKTELESSIEALLFYAGDIISQKRLCEICNTEAFSVHMAINHLNDYYGQTNSGIEIIEVDDGYQMCTSPKHTEIIQLYRQKPVKNLLTQALIETLAIIAYSQPITRTQIEDIRGVRCEHAMSKLMEYGLIEEVGRLNVIGRPILFGTTNEFLRHFGFRNLEELPKIKEELLEKFKEEVREEMSYYEDHEAMKEEVNLALDVEE >NC_015275|2498411:2505948|2501142_2502333_-|WP_013657278.1|DBSCAN-SWA MKSKRVGVIFLLLIIMCCSQVFAAATPKKNTNQTLAATARSYILMEESSGKILLERNADEPLPPASITKVMTLLLINEAVDTGKINWEDKVTISEHAAHMGGSQVFMEPGEEQTVRDLVKCICIASANDAAVAMSEYIAGSEEQFVELMNKRAAELGMTHTVFKNACGLHTEGHVSTARDIALMSRALVNGHPEITKTLTTWMDTITHRTRRGESEFGLSNTNKMLKWYKGITGLKTGYTPEAKHCVSATATRDNMGLIAVIMGAADGKTRFQEAGQLLDYGFANYKVKVGPTIGTIIGEAPIKKGDVSKINVATKETKAFVVPKSNTNSELTYEAHYREPLIAPISKGAIVGEMTYYLDGNEVGKGQLISATDVKKATLKQMVPYMCKRFFKLSK |
7 | Stx2-converting_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2949648 : 3037442
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_015275|2949648:3037442|DBSCAN-SWA 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104 | Clostridium_phage(36.59%) | tail,plate,portal,integrase,terminase,head,transposase,capsid,coat,tRNA | attL 3008955:3008970|attR 3022771:3022786 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
4169476 : 4176564
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_015275|4169476:4176564|DBSCAN-SWA TTTACCTCCTCTCAAGATATAGATTGATTGTATCAACATTCATAAGTTCATCCTGACTTACCTCTAATAATTCACCAGAAATATCACTAATCTGTTTATATCTTAAATCATACTCACTAAACAAATCTAACATAGTCTGTATTTCTATACCTGCTCGTTTCATATGTTTTGGTGCAAATTCCATGATGATTTTTATTCCAGCATTATTTGCTATAATATTCTTCATACCTTCTAAAATGAAATACTCTGAGCCCTCTGCATCTAACTTAACAATATCTATTTGTTCTATATCCTTTAAGTGTTCATCTAGGACAACCATTTCAACTTGAATTTTCTGTGAATTTGAGGTTTGTTCAAAAATCGAGTTTTGTCCACACATTTTTTCCTCAATAAAAAACTCCGTAAATTCATGTTTATTAAATGCTCCTAAATTAAAGGTATTCCATCTACCACTTTCCCAATACCCATTTGCTTTAATATTCTGATTTAATATGCTATAAGTAGATGGAGTTGGTTCATAGGCATAAACTTTACATCCACCTCTAAGTGCTCTTAATGTAAATATCCCTAAATTTGCTCCTATGTCTACTACAGACATTCCTGGTTTAATAATACTTTCGAAGAATTTTTCTGTCCCTGGTTCAAAATGACCATTAAGAGATAGGAACATGGCAAGCCCCCATTCTTCAGAAGGGATTCCCATGATAAAGTCATCAACAATGACTGCTGTAATTCCACCTGCTATACTTGTTACTACCGATTTATTTTTAGCTCCAACTTGAGAAATATATGTCGGAAGTACATCTAACTTTTGTGAAATAGAAGTATCTATTTTCTGTACCAATTCCATACTATCCCCAATATTTGTTATGCTACTAGAAATAATATTAGCATTAGCATTAATGTTTTCTTTGAGTTCAACTGTACTCTCCTCAAAGCATGCTTTAATATCGCTTGTATTCTTACTAAATTTATTTTCTAAGTTATCGACTTGATCCTGTATCATATTATTTATAACCTTAATGTTATTTTCATTAGATGATTGCATGCTACTTAATAGTTGATTATATGTAGAAAGCACTCTCTGTGCATTTATCTCCGCTATTACTTCGGTTCTTTCTATTCTATCATAAAGCTCACTAATCTGAGATTTAAGTGTAAATACAGAAGATACTTTTCCTAGGACAGGTAATTTTGTAACTCTTTGTTTAAAAATAAATCTTTTATATTCCTTTTTATATTGTTTCAGATAAGTAATTTCTCCTTTTGCTCCAAATTCATCTGAAATAGCTATTAAATATACAATTGCGCCCTTACTTGCGCCTTGCCTCATTAGATTCAAGTAAGAATTCAGTCCATTTTCATCTACTTCTCTCCCTAAAAGGAGCTCATAAATAGCACTAATAAAGTCTGTCTTATACCATTCTAAATAAGGGGATACATCAAAAGTACATGTATTTAATTTAACTATGGATTTTTTAAGCATATTATTCTTTAAACTAAGCATCTTTCCTCCAATGAAAGGAATTCTTTTAATAAAGTCTTTGTTCCTAAATGCTAGTCTTATAAATTTAGCCTTTAACCCTTGCTCTGATTCTAAAATATAATTTTCTGCATCTTGGGAAGATAGTCCTCTAATATTAATATATCTTTGAGTTATAGAATCACTTCTATTCTGTTCTTCCCTACAACTTACCCTAAGTCTTCTTCTAATATATGTTTTATCTAAGTTTAAATCCTCTCCCGTATCTGGCATTCTTTTACCCTCACATTATCCTAAATTTAAATACTCATCACCTTTAGATATTCACTAATAACATAATCTGGATCTCCATCCATTCTTACAGTTCCATGATCAAGCCAAATAACTCGGTCACATAATTCTTTAATTGCTGCAAAATCATGAGATACAAATACTAGAATTTTTGCATTTTCAATAAGCCCCATAATACGTTGTTTAGCTTTATTCATAAAACGAGCATCTCCTGCTCCAAATATTTCATCTAAAAGTAAAATGTCTCCATCAATCATAGTAGAAATAGCAAAAGCAAGTCTTACAATCATCCCAGATGAATAGGACTTGATGGGATAATCAATAAATTCTCCTAGTTCTGCAAACTCAATAATTGATTCTGTCTTTTCTTTAATACTCCTAGGTGTTTCTCCTAATAATAGTCCTCTATATAAGATATTTTCTCTCCCTGTTGCATCAATTTCAAATCCTACTGCTAGATCAAATAAACTTCGTATCTTCCCCTCTATCTCTATTTCTCCCCCTGTAGTAGGATAAATTCCTGCAATAGCTTTAAGTAATGTACTTTTACCTGCACCATTGTGTCCTATTATCCCTACCTTTTCACCTTCATTTATTTCAATAGATACTCCTCTCAATGCATGTACATCATTAAGTAGTTTAGCTGGTTTTTGAAGCCTAGCCATTTCAAATATAGCTTGCTTGAGTGTTTTTCTATTATAAATAGTAGATGGATAATCTAAGTAGACTTCTTTAATAGATATATGGCATTTTTTCATTTTTTACCTTCCTTACACTATAAATAATATATAACTGTTTTCTCAAGTTTTTTATTTACATACCATGCTATTATTAATAATAATGATGCAATTGCAAAAGTATATACATAGCTTACAATGGGAGCGAAGCTACCACTTAAGAATGGCTCTCTAATCACCATCAGCACATGGGTAATTGGATTTACTAAGAAAAAAGAATGAAGTAGTGCATTACTTTCAAACATTTCTTCTTTAAAAAATACTGGGGACATATACCACAAAAATTGCATAACAAGTTGCATAACATATGGATAATCCCTATACCTTACATTGATATGGCTAGAGATAATAGAAAGCGCCCATGCCATCAAAAAGTAAATCATACCTGTAAGAGGCAAAGAAATAAGTGCAATAGGAATATTTTCTGGATATATAAAGCCTATCCAAGCAAATAAACCAATTGTTGCAATTATAAAAGTAATCACTGATACCATTGCAGCTCTCAGAGGATATAAAGTTACTGGATGTGCGAACTGTCTAATATAAGTTTCGGCAGCTAGAAATGAACTTCCATTTCCTATAATTGCTGCTGAAATTATATCCCATACAAGAACACCTGATAAAATATATGGTGCATAAGTCGTCATTTCTTGATCAAAAACATAACCAAATACTAGAGCTATAATCAGAGTCAATAAAAAAGGCTGTAGTACTGTCCATATAATCCCTAGTTTCGATCTTCTAAATTTATATTTTATATCCCAATTTACTAAGTGTAAAAGAAAGTATCGTGCCTCATATATTTTCTTTACATATGTATTTAATGTCTCCATTTATAACTCCTATCTTGCTATAAAATAATGCTTTTTAATGTATCACAAATATATTTTATGTCTTCTCTTGTTAAAAGTGCATGTGTTGGAAGATTCATTCCCGAAGCTGCTACCTTCTCACTGATAGGGCATTCTGCCTTTACGTCATAATAGACGGGCATAATATGCATCGGATAAAATAATGGTCTTGTCTCAATCCCTCTTGCTCTCATCATTTCCATAACCTTGTCTCTAGATACTTTCACAGAATCTCTAAGTAGTACAGAGAACATCCACCATACACTTGTACTTCCCTCCGTTACTTTCTGGAATTGAAGATAATCATTCATATCCTTTAATTCTTCCATATACCATGAAGCCACTTTCTTTCTGTCTGCAATATGCTCATCAATTTTTTCTAATTGTCCAAGCCCAATTGCTGCCTCTACATTTGTCATTCTGTAATTATAACCCATCTCTGTAAACCAATAACGTTTATTAGGATCTTGTCCTTGTCCTTTAAGTTGTCTCATCTTTGCATCTAACTCTTTATTATTAGTAACAATCATACCACCCTCACCTGTTGTAATAATCTTGTTACCAAAGAAACTAAAGGTACCTACCTCACCCATTGTACCTGCTTTCTTCCCTTTATACTCTGCACCATGACATTCTGCAGCATCTTCTAATACAAACAAATTATGTTCTCTAGCAATTTCCATAATTGCATCCATATCGCAAGGATTTCCATAAAGGTGTACTGGAATAATACCTCTTGTTTTAGATGTAATTTTTCTCTTTATATCCTCTGGATCAATATTCCAAGTATCTAATAAACAATCTGCAAATACAGGTGTTGCTCCACAATATTTAACTGCATTAGCTGTCGCTATATACGTAAAAGAAGGAATTATAACTTCATCTCCTGGCTTAAGCCCTAACGCTATAAGCGGTACGTGAAGTGCTACTGTTCCATTACAACAAGAGATTGCATACTCTGCATCAATAAACTTTGAAAATTGTTTTTCAAATTCACTAACATACTTTCCATTGGAAGAAATCCATGTTGTATCCATACAATCCATTACATATTTCTTTTCATTTCCTGATAAATGTGGTACTGCCACTGGTATAAACTTATCCATCTTCATTCACCTTTCAACTTTTTTATCATTCTTGCTGGTACCCCTACAGCTAGCGCATATTCTTCGATATCCATCACTACAGCAGCCCCAGCACCTATAAATGCATCGTTACCCACATTTATTCCATCTATAATACTTGCACCTGTTCCAACCTGTGTTCTATCGCCTATTGACACTGTTCCTGAAATCGCAACTCCCGGGGCTATATGAACGCTCCTTCCAATTTTGCAATCATGATCGATAGAACAATTGGTATTAATAATACAATTATCTTCAATAACGGCATTTACATTAATGACGGCTCCAGGCATTACACAAATCCCATTGCCCAACTTAGCTCTGGGTGAAATATATGCACTAGAACTAATAACATTTATAAGTTCAAATCCAAGTAAACTAACATAATCATACAATTCATCTCTGAGCTTATTTGAACCTATTGCAATAAATATCTTTTTTATGCCTTTATTTCTAAACTCTTCTAAAGCATTATCATTCCCAACAATAGGTATTTCTTCCATACCTTCAACTA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_015275|4169476:4176564|4172836_4173943_-|WP_013658767.1|DBSCAN-SWA MDKFIPVAVPHLSGNEKKYVMDCMDTTWISSNGKYVSEFEKQFSKFIDAEYAISCCNGTVALHVPLIALGLKPGDEVIIPSFTYIATANAVKYCGATPVFADCLLDTWNIDPEDIKRKITSKTRGIIPVHLYGNPCDMDAIMEIAREHNLFVLEDAAECHGAEYKGKKAGTMGEVGTFSFFGNKIITTGEGGMIVTNNKELDAKMRQLKGQGQDPNKRYWFTEMGYNYRMTNVEAAIGLGQLEKIDEHIADRKKVASWYMEELKDMNDYLQFQKVTEGSTSVWWMFSVLLRDSVKVSRDKVMEMMRARGIETRPLFYPMHIMPVYYDVKAECPISEKVAASGMNLPTHALLTREDIKYICDTLKSIIL >NC_015275|4169476:4176564|4172024_4172819_-|WP_013658766.1|DBSCAN-SWA METLNTYVKKIYEARYFLLHLVNWDIKYKFRRSKLGIIWTVLQPFLLTLIIALVFGYVFDQEMTTYAPYILSGVLVWDIISAAIIGNGSSFLAAETYIRQFAHPVTLYPLRAAMVSVITFIIATIGLFAWIGFIYPENIPIALISLPLTGMIYFLMAWALSIISSHINVRYRDYPYVMQLVMQFLWYMSPVFFKEEMFESNALLHSFFLVNPITHVLMVIREPFLSGSFAPIVSYVYTFAIASLLLIIAWYVNKKLEKTVIYYL >NC_015275|4169476:4176564|4174588_4175518_-|WP_013658769.1|DBSCAN-SWA MKALITGITGFVGKHLANELHRNNYEVYGADIIAKDENTLECDILDRVSIQNVLEQVKPNVIFHMAGQSSVAKSWSNPNLTFDLNVKGTINLLETIKMFDNEIQVLLIGSSDQYGKITVQDGIVNEEVPLCPATPYAVSKCAQEELGKLYHSAYGMNIYLTRSFNHIGIGQSKGFVIPDVASGIAEIEKHKSDTLKIGNLAVKRDFCDVKDIVRAYRLIVEKGRSGVVYNVGSGESYCIQELVDKLIAMSKCTIKIERDPSRMRPSDVPCIQCDHSRLTQEIGWQPEIEIEKTLKDILDYFRTVIEDEE >NC_015275|4169476:4176564|4175532_4176564_-|WP_013658770.1|DBSCAN-SWA MKRALITGINGQDGSYLAELLLEKGYEVYGIMRRKSVVDYGNVEHIKDKIKFIYADMTDAISLINAMRISQADEVYNLAAQSFVATSWEQPIATAEIDGVGVTNMLEAIRTVKPEARFYQASTSEMFGLVQEIPQKETTPFYPRSPYGVAKLYGHWITKNYRESYNLYACSGILFNHESERRGKEFVTRKITDAVARIKHGIQDHLELGNMDAKRDWGHSKDYVEAMWLMLQQEQADDYVIATNETRTVREFVEIAFKTVDIDVEWQGGGVDEIGIDKATGKTIVKINPVFFRPAEVEILLGDATKAEKALGWERKISFAELVERMVKNDMEFVAKEIRMINI >NC_015275|4169476:4176564|4169476_4171231_-|WP_013658764.1|DBSCAN-SWA MPDTGEDLNLDKTYIRRRLRVSCREEQNRSDSITQRYINIRGLSSQDAENYILESEQGLKAKFIRLAFRNKDFIKRIPFIGGKMLSLKNNMLKKSIVKLNTCTFDVSPYLEWYKTDFISAIYELLLGREVDENGLNSYLNLMRQGASKGAIVYLIAISDEFGAKGEITYLKQYKKEYKRFIFKQRVTKLPVLGKVSSVFTLKSQISELYDRIERTEVIAEINAQRVLSTYNQLLSSMQSSNENNIKVINNMIQDQVDNLENKFSKNTSDIKACFEESTVELKENINANANIISSSITNIGDSMELVQKIDTSISQKLDVLPTYISQVGAKNKSVVTSIAGGITAVIVDDFIMGIPSEEWGLAMFLSLNGHFEPGTEKFFESIIKPGMSVVDIGANLGIFTLRALRGGCKVYAYEPTPSTYSILNQNIKANGYWESGRWNTFNLGAFNKHEFTEFFIEEKMCGQNSIFEQTSNSQKIQVEMVVLDEHLKDIEQIDIVKLDAEGSEYFILEGMKNIIANNAGIKIIMEFAPKHMKRAGIEIQTMLDLFSEYDLRYKQISDISGELLEVSQDELMNVDTINLYLERR >NC_015275|4169476:4176564|4173945_4174599_-|WP_013658768.1|DBSCAN-SWA MKNKVLIIGAGGHARSVLDILLQNDEYEIVGCIDNAFGKREVVEGMEEIPIVGNDNALEEFRNKGIKKIFIAIGSNKLRDELYDYVSLLGFELINVISSSAYISPRAKLGNGICVMPGAVINVNAVIEDNCIINTNCSIDHDCKIGRSVHIAPGVAISGTVSIGDRTQVGTGASIIDGINVGNDAFIGAGAAVVMDIEEYALAVGVPARMIKKLKGE >NC_015275|4169476:4176564|4171257_4172007_-|WP_013658765.1|DBSCAN-SWA MKKCHISIKEVYLDYPSTIYNRKTLKQAIFEMARLQKPAKLLNDVHALRGVSIEINEGEKVGIIGHNGAGKSTLLKAIAGIYPTTGGEIEIEGKIRSLFDLAVGFEIDATGRENILYRGLLLGETPRSIKEKTESIIEFAELGEFIDYPIKSYSSGMIVRLAFAISTMIDGDILLLDEIFGAGDARFMNKAKQRIMGLIENAKILVFVSHDFAAIKELCDRVIWLDHGTVRMDGDPDYVISEYLKVMSI |
7 | Streptomyces_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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