Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_017252 | Buchnera aphidicola str. TLW03 (Acyrthosiphon pisum), complete sequence | 0 crisprs | DEDDh,cas3 | 0 | 0 | 3 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
58956 : 67537
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_017252|58956:67537|DBSCAN-SWA TTTAATCGTCTAAAAAACTGCGCAAAACTTCTGATCTGCTGGGATGACGTAGTTTTCTAAGTGCTTTTGCTTCTATTTGACGAATTCTCTCTCGAGTAACATCAAATTGTTTTCCAACTTCTTCTAAAGTGTGATCAGTATTCATATCTATTCCAAAGCGCATACGGAGTACTTTTGCTTCACGAGCTGTTAAACCTGATAGAACATCATGTGTTGCAGAACGTAAACTTTCAGAGGTAGCAGAGTCTAATGGTAATTCCAAAGTAGTATCTTCAATAAAATCACCTAAATGTGAATCATCATCATCTCCAATAGGTGTTTCCATTGAGATCGGTTCTTTGGCTATTTTCAATACTTTTCTAATTTTATCTTCAGGAATAAGCATTTTTTCAGAAAGTTCTTCTGGAGTCGGTTCTCGACCTATTTCTTGTAACATTTGTCTAGAAATACGATTGAGTTTATTAATAGTTTCAATCATATGTACTGGAATACGAATTGTACGAGCTTGATCAGCAATAGATCGAGTAATAGCTTGTCGAATCCACCAAGTAGCATAAGTTGAAAACTTATAACCACGACGGTATTCAAATTTATCTACAGCTTTCATTAAACCAATATTTCCTTCTTGAATTAAGTCTAAAAACTGTAGTCCTCTATTCGTATATTTTTTTGCGATAGAAATAACTAATCGTAAATTAGCTTCGACCATTTCTTTTTTCGCTCGTCTAGCTTTTGCTTCTCCAATAGACATTCTTTTATTAATATCTTTTACTTGTTCAATTGTTAAGCCAGTTTCTTCTTCTATTTTAATTAATTTTTTCACACTAATAAACACATCTTCTTTAACTTTTTTTAAGTTTTCAGACCATGGTTGATTTGTATTTTGTTCTCTTATAAACCAAAGATAGTTAATTTTTTTTATTGGAAAAATTTTAATAAAATTTTTTTTTGGCATTTTACATATTTCAACACATAATTTTATAATAATTCTTTCTTGTTTTCGTACTCTTTCCATCATATGTCTCATATTATTAACTAAATGATCAAATTGTTTTGGAACTAGTCGAAATTGTTTAAAAACTTCTGAAAGATTGTAAATTTCTAATAATGAATCTTTATGTGTTCGATTTTTATTTTTAATTGTATTATTTGTATTATTATATTGTATACGTAATTCAGAAAATTTTTCATTAGCTAATTCTGGATCAATACTATGATCATCTTCATGATCTTCTTGATTGTTTTCTTCGTCTTCTTCATTATTTTGTTGTTCATCAAGAAGTTCAGAACCTATATGAATAGCTGTAGGGAGGAAAATTTCTTCTGCATTGGGATCTACAAAACCTGTTATTATATCTGATAATCGTATTTGTCCAGTTTTAACACGATCATATTGTTCAAGAAGATATGTAATGGCTTCTGGATACTCTGATACTGAGCATTGAACCTGATTAATGCCTTCTTCAATACGTTTAGCAATATCAATTTCTCCTTCTCGTGTGAGTAATTCAACAGTACCCATTTCTCTCATATACATGCGTACAGGATCAGTAGTTCGTCCTAATTCAGATTCTACACTAGATAGTACCTGAGTTGCTGCTTCAACTGCATCTTCATCTGTATCTGTATTGATTTCATTTAATATTAGATCGTCAGCATCAGGTGCTTCTTCAACTACTGGAATGCCCATGTCATTAATCATCTGAATAATATCATCGATTTGTTCAGAATCAATAATGTCTTCTGGTAGATGATCATTCACTTCAGAATAGGTTAAATACCCTTGCTCCTTACCATGTGTGACAAGTAGCTTAAGTTGCGACTGTGGGTTTTGATCCATAATGTGGTATCCGGAATTCTATTAATTGAATGAATATTAATTGACTTTTTTGTCAATGATGAATAATAATAAAATTATTTTTAATATTTAAATAAATTAAAGAGTTTTTTAATTCATTAAACTTTTAGTATATTTAATTTTTATTATATTTTTTAATAAGTATAATTTTATCTTTTCGATAACTTTTTATTAATAGACCAAATCTCTTTTTTTTCATTCATTTGCAATCCTTTTTTTCTCTCTTTTGCAATAAGATATTCTCGTCTTTTTTCAAGGATTTTATCATGTATATTCATCAATAAATCTAAAAACATGTTTTGAGTTTCTTTTTGAATTATCATGTGATCCCATCGTGCTAAAATTTTTAAAACATTAATTATTGTAGTATTTCTGTATAGTTCTAATAATTGACCCGTATGAATATTAGGATTATCACGACATGTCTGTAATATTTCTAAAAAAATAGATAATCCTTTTATTTGTAAATTTTTAAATTTCATTGTCACAGGCGCTAGTTTTGCTAAACTAGGATTTTGTACTAATAATCCTATTAAAGTACGCATGGGAGTACGTTTTATTTGGAAATATGTTTTTTGAGTATTTTTAGTTTCTTTTTCATATAAAAATTTTTCAAATTGATTATCATCTAAAATTCCTATCATTCTAGCTAATATTTGACGCAAATAAATTCTTATAGTATCACTAGAAATCGTATTTATTAAAGGTAAAGCATGTACGCTTAAATGAAATTTGTCATCATCAGATGATAAATTGATATTTTTTAGTATATTTTTAAAAAAAAATTTTGACATGGTAATTGCGTTATCAATTCGTTTTTGAAATTTTTCTCTACCTTCTTTTCTAATAATTGTATCAGGATCTTCCTGGTTAGGTAATAAAATAAATTTTAATGTTTTTTTGTCTGATATATACGGCAAGGCTTTTTTTAAAGTTTTCCAAGCTGCATTTTTTCCTGCATCATCACCATCATAGCAACATATAATGATATCAGTATTTTTAAAGAGAAGTTGAATGTGTTCAGTTGTTGTTGAAGTTCCTAATATAGAAACAGCATAATCGATATTATATTGTGTTAATGTTATAACATCAATATACCCCTCAACAACCAATAAATATACAGGTTTTGAACATTTTTTTATAACTTGATATAATCCATATATTTGTTTTCTTTTATAAAAAATATCTGTTTCAGGTGAGTTAAGATATTTTGGTGACATATCATTTAATGAGCGGCCCCCAAAACCTATGATTCTGCCATGATTATCTTGTATAGGAAATATTATACGTCCTTGAAATCGATCATATATATATCCGTTTTTGTCAGTAGCAATAATATTGTTTATTAATAATTCTTGTTCAAATTCTTTACTTATATTTATTTTTTTATAAAATTCGTTCCATTTTAAACTAGAAAATCCAATTAAAAAAAAATCAATCATATTTTGATTGATACCTCTTCTAGCTAGATATTTATTAGCTAAATGAGTAACATTAATATTTTTTTTGTATAATTTACATATTTTTTCCATTAATAAATATAACTTTTGTTTTTTAACATAAATAGAATTTTGTACTGTATTTTCAAATGGTATTTTAACACCATGTATTAACGCTAGTTCTTCGATGCTTTCTATAAAACTTAAATGTTCATACTGTATTAAAAAATCAATTGCGTTTCCATGTGCATTACATCCGAAACAATAATAAAATTGTTTTTCATTACTGACGGTAAAAGATGGAGTTTTATCATGATGAAAAGGACAATTTGTTTGATAATTTTTACCATATTTTTTTAATTCTAGACGTGTATTAATTAATTCTATGATATTAGTTCGAGACAGTAGTTCAGTAATAAAGTATTTAGGTATTTTTCCAGACATATAATTTTATAATTATAGAATTCGTTTCCGTTCTTGAACAAGAACGGCTTTTTTTATTTATTTTATGTTTTAAAACATATTTAGTACATACGAATACGTCTTGCATTTTCTCTTGTAAGTTTTTTTGCAAGACGTTTGACAGCCGAAGCTTTAGCTCGTTTGCGTTCGGTTGTAGGTTTTTCATAAAATTCTCTTCGACGAATTTCAGCTAAAATGCCAGCTTTTTCACAAGACCGTTTAAAACGGCGGAGTGCTACATCAAATGGTTCATTTTCGCGTACTTTTATTATTGGCATTCAAAATTTACCTTAATTATTTAATTTATGTGATAAAAAATTATCGAAATTTTTAGGATAATAGATCCTATATCAATTAGTGTGATATTGTAAAGTATCATTTTTTTATGTTTTAATGCAGTTTTAATTAAATATTTAGATTAGTTCATTTAAAATGAATGTTCATTTTAAAATTTATATCAAATATATTTTTTCTTATTGTAAAAATTTATAATATATAGAGGTTTAAATTTATGAGAATATTAGGTATTGAGACTTCTTGTGATGATACAGGAATAGCTATTTATGATACTAACAAAGGTTTGTTAATTAATGAGATATATAATCAAAGAAAGTTAAACAATATATATGGAGGTATTATTCCAGAATTAGCATCTCGAGAACATATGGAAGCAATGATTGTTTTATTAAATAAAATATTTAAGAAAAAAAATATTTATAAATATGTTGATATGATTGCTTATACTGCAGGACCTGGTTTAATTGGTTCATTATTAGTTGGAGCTACATTTGCTTGTTCATTAGGGTTATCATTAAATATACCAGTTCTACCTGTACATCATATGGAAGCGCATTTATTATCACCGATGTTAGACTATAAAACAATTCAATTTCCATTTATTGGATTATTGGTATCGGGAAAACATACACAAATTATAGGTGCACATAAATTTGGTGAGTATGAAATACTTGGAAATTGTTTAGATGATGCAGCAGGTGAAGCATTTGATAAGACAGCAAAATTATTAGGATTAAAATATCCAGGTGGTTTAGAATTATCTAAATTAGCTTCTAAGGGAATAAAAGATTATTTTTATTTTCCCAGACCGATGATACATCATTCTGATTTAAATTTTAGCTTTTCAGGTTTGAAAACTTTTGCAGCTCAAACGATTAAGAAATCCAGTAAAAGTATGCAAGAAAAAGCTAATATTGCAAAAGCTTTTGAAGATGCAGTAATTGATATATTATTAATTAAAACTAAAAAAGCATTAAAAAAACAAAAATGGAAACGTTTAGTTATAGCTGGTGGTGTTAGTGCAAATCAAAAATTACGTAAAAAATCCGAGATCATGGTTAAAAAAAATTTTAATGGAACAGTTTTTTATTCAAGTTTAGAATTTTGTACAGATAATGCCGCGATGATTGCCTATCTTGGTTCATTGCGTCAAAAAGAAGCGCGGAATTCTCAATTAGAAATATTGGTTAAACCAAAATGGTCTATAGATGATTTATGTTTTTAATATAAAAAATTAAGTCTTGTATGGTTAATACTTGCATTTTTTTATTTTCAGAAAATTTTATTATTTCAGGGGTACGAGCCATGGTACCATCTTTATTTGTTAATTCACAAATAACCCCGGCCGGTTTGAAACCTGCTAGAGAAACAATTTCTATAGCAGCTTCTGTGTGTCCTGGTCTTGATAAAACTCCGCCTTTATGAGCTCGCAGAGGAAATACATGACCTGGTCTATTTAAATCACTTGGTTTAGCGTCATCAGCAATAGCGGTTTTTATAGTAGTGAGTCTATCTTTAGCTGATACGCCAGTAGATATACCTTTAGAAGCTTCTATTGTGACTGTAAATCCGGTGCGATATGCGCTAGTATTTTTCTTAACCATCATAGGTAAATTAAGTTGTTTCCGTTTAGATTCGGTTATACAAAGACATACTATTCCACTACCGTACCGAATACTTAGAGCCATTTGTTCTACTGTCATATTTTCACATGCAAAAACAAGATCTCCTTCGTTTTCACGTTCTTCATCATCTAATATAATAACACCTTGTCCGGACTTCAAAGCAAGTATTGCATTTTTAATTCTTTCTATAGGTTTTCCAAATTTAGATAATAGTGTTTGATTCATTATAAAAATCTTAATAGAGTTAAATTATTTAAAAAAAGTTTTATTTATAGAAAAATTAGTTAAATTTTATGTTTGTATAGTTAACATATTATATATTGAATTAAATTTAAGAGCAATGTAGAAATTATTATATTGAATAATATTTTTTCAATTTTTTATCTATTAGGATTCTAAACAACATATTGATATAAAATTTTACTTCGATTTTTTTTAAAAGCTTACTTGAAAAAATAGACCAAATAAAAATACAAAAATTAAATAACAGTACTTTTATTGATGGTTTAAAACAGAATTTAACTCATTAATATTCAATGTTTCAGTTCCAATTTTCTGTATAACAATACTGGCTCCAATATTGGCATAAAAACAAGCTTCTTCTAAAGAATATCCAGTTGCTAAAGATGCTGCAATTATAGCGATCACTGTATCTCCTGCACCAGTTACATCTGAAGCTATTTTAGATGCAGCAGGAAAATGTATTGGTTTTTTTTCTTTTTGAAATAGAGTCATTCCATTCTTAGAACGAGTAACTAATAAAGCTGATAACTGTAGTTCAGATAATAATTTTATCCCTCTTTGTAGTATTTCATTTTCTCTATAACATTTGCCAACTATCTTTTCAAATTCAAAAAGATTTGGTGTTAATAAACTAGCTCCCGAATATTTTTTAAAATCTATTCCTTTAGGATCTATAAGTATAGGGATAGACATTTTTTTTGCAAGATCAATAATATTTTGTATATTTGCCAAAGTGCCTTTTGCATAATCTGAAAGTACTAAAATTTTAAAAGACGATATTGAATCAATAATTTTTTGATGTAATAGATTGTTTTTATTAGAAATATATTTTTCTTGAAAATCCACTCGAATTAATTGTTTTTTCTCTGATAAGATTCTAATCTTAGTAATAGTTTTATTGTTTTTTATAGAGATTAAATCAGAATCAATTCGAATATGATCCATAAGTTTTTTTAATATTAATCCTTCATTATCCATTCCAATAAAACCAACAATTTTAGTATACCCCCCAATCTCTGCAATATTTTTAGCTACATTTGCAGCACCTCCAGGTTGTTCTTTGATTTTATTAATTGGTACAATTGGTGTTAATTGTTCAGATAGCATATAGTGATTTTTGCTATACCAATAACAATCTAGTATTAGATCTCCGACAACTAAAACTAGTGAGTTATTGAAATTTATTAATTTTTTCTTCATAGTGTTATCTCTGTATATTTTAAAGAATATAATGAAAATTAAAAATTCAATTTTTTTATAAATATAAACATTTGAAAGTTTAATAGATATTTTTTATTTAATATATAAATATTATTATATTATTGAATTGTGGAAAAATAATAAATAATTATATAAAAAATTCTATTTTTCTATTATAGAATAGAATTTTGTTTTTAGTATGAGAAAATTATTATGAAAATATATTTAGTAGGAGGAGCTGTGCGTGACTCCTTACTTAATTTACCCGTTAAAGATAAAGATTGGGTAGTAGTTGGTGGTACAGAAAAAATACTGCTAGAAAGAAATTTTCAGCAAGTCGGAAAAGATTTTCCAGTTTTCTTACATCCAGAAACACATGAAGAGTACGCTTTGGCAAGGAAAGAAAGAAAATCTGGAAAAGGATATACTGGATTTGATACTGATTGTAATTCAGATGTTACTTTAGAAGAAGATTTAATAAGACGAGATTTAACAATCAATGCTATTGCTCAAGATGAGTACGGTAATTATATTGACCCGTTTCAAGGTAAAAAAGATATAGAATGTGGTTTAATAAGACATGTATCAGAATCTTTTATAGAAGATCCATTGCGTGTATTACGTGTAGCAAGATTTGCTGCAACTTTAGTACATTTAGGATTTAAAATTGCAGAAGAAACTATGCTATTAATGTGCATTATAGTTAAAAAACAGGAATTGTCATATTTAACGTCAAACAGAATATGGAATGAAACTGAAAAAGCTTTGAAAACCCTTAACCCTCATGTATATTTTCAAGTTTTGTATGAATGCAATGCATTGCATTTTTTTTTCCCTGAAATGTATTTTTTATATGAAAAAAAAAATTTTTTAAACCGTTCTTTTTTCAAAAAATTCTGTAATAAGAATATTATATTAATGGGTTTGGCTGAAATATCACTTTTGAATAAAGATATCGATGTTCGTTTTTCTTATTTATGTCAATTTTTATCAGTTAATCAAATAGATAGAAATTATTCAAAAATATTTTTTGACTCATATGCAGCTTCTATTATTCATAGTGTATGTAAACGCTTTAAGATCCCATCTTATATTCGAGACATAGCAGTATTAAATACTGGTTTTTATTTTTTTTTAAATACGATTCATTATCAATCATCTAAAAATATTATAAATCTATTTTCAAAAGTTGATGCTTGGAGAAAACCTGATCGTGTAAAAAAATTAGCATTTTTAAGTAATTTTAATTTTTTAAGAAACTTTAAATCTGAATTTTTTTGTATAAAGTCTGGTTGTTTTTTAGAAAAATGTTTTTCTGTTGTAAAAAATGTTTCTATTAAGTTAATTTTAAAAAAAGGTTTTAAGGGATATGAAATAAAACAAGAAATAACGCGTCTAAGAATTAAAAAATTAGAATTTTGGCGTATAAAAAATATTAAACATCGTTTCTATCTATGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_017252|58956:67537|60962_62696_-|WP_012619413.1|DBSCAN-SWA MSGKIPKYFITELLSRTNIIELINTRLELKKYGKNYQTNCPFHHDKTPSFTVSNEKQFYYCFGCNAHGNAIDFLIQYEHLSFIESIEELALIHGVKIPFENTVQNSIYVKKQKLYLLMEKICKLYKKNINVTHLANKYLARRGINQNMIDFFLIGFSSLKWNEFYKKINISKEFEQELLINNIIATDKNGYIYDRFQGRIIFPIQDNHGRIIGFGGRSLNDMSPKYLNSPETDIFYKRKQIYGLYQVIKKCSKPVYLLVVEGYIDVITLTQYNIDYAVSILGTSTTTEHIQLLFKNTDIIICCYDGDDAGKNAAWKTLKKALPYISDKKTLKFILLPNQEDPDTIIRKEGREKFQKRIDNAITMSKFFFKNILKNINLSSDDDKFHLSVHALPLINTISSDTIRIYLRQILARMIGILDDNQFEKFLYEKETKNTQKTYFQIKRTPMRTLIGLLVQNPSLAKLAPVTMKFKNLQIKGLSIFLEILQTCRDNPNIHTGQLLELYRNTTIINVLKILARWDHMIIQKETQNMFLDLLMNIHDKILEKRREYLIAKERKKGLQMNEKKEIWSINKKLSKR >NC_017252|58956:67537|63225_64236_+|WP_009874015.1|tRNA|DBSCAN-SWA MRILGIETSCDDTGIAIYDTNKGLLINEIYNQRKLNNIYGGIIPELASREHMEAMIVLLNKIFKKKNIYKYVDMIAYTAGPGLIGSLLVGATFACSLGLSLNIPVLPVHHMEAHLLSPMLDYKTIQFPFIGLLVSGKHTQIIGAHKFGEYEILGNCLDDAAGEAFDKTAKLLGLKYPGGLELSKLASKGIKDYFYFPRPMIHHSDLNFSFSGLKTFAAQTIKKSSKSMQEKANIAKAFEDAVIDILLIKTKKALKKQKWKRLVIAGGVSANQKLRKKSEIMVKKNFNGTVFYSSLEFCTDNAAMIAYLGSLRQKEARNSQLEILVKPKWSIDDLCF >NC_017252|58956:67537|58956_60795_-|WP_014498672.1|DBSCAN-SWA MDQNPQSQLKLLVTHGKEQGYLTYSEVNDHLPEDIIDSEQIDDIIQMINDMGIPVVEEAPDADDLILNEINTDTDEDAVEAATQVLSSVESELGRTTDPVRMYMREMGTVELLTREGEIDIAKRIEEGINQVQCSVSEYPEAITYLLEQYDRVKTGQIRLSDIITGFVDPNAEEIFLPTAIHIGSELLDEQQNNEEDEENNQEDHEDDHSIDPELANEKFSELRIQYNNTNNTIKNKNRTHKDSLLEIYNLSEVFKQFRLVPKQFDHLVNNMRHMMERVRKQERIIIKLCVEICKMPKKNFIKIFPIKKINYLWFIREQNTNQPWSENLKKVKEDVFISVKKLIKIEEETGLTIEQVKDINKRMSIGEAKARRAKKEMVEANLRLVISIAKKYTNRGLQFLDLIQEGNIGLMKAVDKFEYRRGYKFSTYATWWIRQAITRSIADQARTIRIPVHMIETINKLNRISRQMLQEIGREPTPEELSEKMLIPEDKIRKVLKIAKEPISMETPIGDDDDSHLGDFIEDTTLELPLDSATSESLRSATHDVLSGLTAREAKVLRMRFGIDMNTDHTLEEVGKQFDVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSEVLRSFLDD >NC_017252|58956:67537|62776_62992_-|WP_009874014.1|DBSCAN-SWA MPIIKVRENEPFDVALRRFKRSCEKAGILAEIRRREFYEKPTTERKRAKASAVKRLAKKLTRENARRIRMY >NC_017252|58956:67537|64213_64861_-|WP_009874016.1|DBSCAN-SWA MNQTLLSKFGKPIERIKNAILALKSGQGVIILDDEERENEGDLVFACENMTVEQMALSIRYGSGIVCLCITESKRKQLNLPMMVKKNTSAYRTGFTVTIEASKGISTGVSAKDRLTTIKTAIADDAKPSDLNRPGHVFPLRAHKGGVLSRPGHTEAAIEIVSLAGFKPAGVICELTNKDGTMARTPEIIKFSENKKMQVLTIQDLIFYIKNINHL >NC_017252|58956:67537|66292_67537_+|WP_009874018.1|tRNA|DBSCAN-SWA MKIYLVGGAVRDSLLNLPVKDKDWVVVGGTEKILLERNFQQVGKDFPVFLHPETHEEYALARKERKSGKGYTGFDTDCNSDVTLEEDLIRRDLTINAIAQDEYGNYIDPFQGKKDIECGLIRHVSESFIEDPLRVLRVARFAATLVHLGFKIAEETMLLMCIIVKKQELSYLTSNRIWNETEKALKTLNPHVYFQVLYECNALHFFFPEMYFLYEKKNFLNRSFFKKFCNKNIILMGLAEISLLNKDIDVRFSYLCQFLSVNQIDRNYSKIFFDSYAASIIHSVCKRFKIPSYIRDIAVLNTGFYFFLNTIHYQSSKNIINLFSKVDAWRKPDRVKKLAFLSNFNFLRNFKSEFFCIKSGCFLEKCFSVVKNVSIKLILKKGFKGYEIKQEITRLRIKKLEFWRIKNIKHRFYL >NC_017252|58956:67537|65131_66079_-|WP_009874017.1|DBSCAN-SWA MKKKLINFNNSLVLVVGDLILDCYWYSKNHYMLSEQLTPIVPINKIKEQPGGAANVAKNIAEIGGYTKIVGFIGMDNEGLILKKLMDHIRIDSDLISIKNNKTITKIRILSEKKQLIRVDFQEKYISNKNNLLHQKIIDSISSFKILVLSDYAKGTLANIQNIIDLAKKMSIPILIDPKGIDFKKYSGASLLTPNLFEFEKIVGKCYRENEILQRGIKLLSELQLSALLVTRSKNGMTLFQKEKKPIHFPAASKIASDVTGAGDTVIAIIAASLATGYSLEEACFYANIGASIVIQKIGTETLNINELNSVLNHQ |
7 | Vibrio_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_2 |
385825 : 394810
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_017252|385825:394810|DBSCAN-SWA AATGAATATCAATAGACAAACCGCATTTATAACAGGGGCCAATCAAGGTATAGGAAAAGCAATTGCAAAAAAATTAATAAAAAAAGGAATTCAAGTAATTGGCACGTCTACTACTGAAGATGGAGTAAAAAGAATTAATGACTATTTGGAGGGGAATGGATTTGGTTTTGTTTTAAATTTAAAAAACATAGATTCTATTACAGAAAAAATTCAAGAAATTTATAAAAAAAAACACTCTATTGATATACTAATTAATAATGCTGGAATAAAAGAAGATAATTTATTAGTTAATATGAAAAGCACTGAATGGGATGATGTAATCAAAACTAATTTATCATCAGTATTTCATCTTGTAAAATCTGTTATTCGATCAATGATCAAAAAAAGGCAAGGCAGAATTATTACCATTGGTTCAGTTATAGCTTATACAGGTAACAAAGGACAAGTCAATTATAGTGCTTCAAAATCAGGACTAATTGGATTTCATAAATCATTAGCACTAGAAGTAGCATCAAAAGGTATTACTGTTAATATTGTCTCACCCGGTTTGATTAAAACAAATTTCACTGAAAAATTAAATTCAATACAATATCAAAAATATTTATCTAATATTCCAATGAAAAGATTCGGACAAAAAGAAGAAGTAGCAGATGCTGTTATTTTTTTAGCTTCAAAAAAAGCATCATATATTACCGGACATACATTACATGTAAATGGCGGCATGTATATGATATAATCCAAAAAATTATGTTAATATTAAAATATACTTTTAAAATAAAAATAAATTTTAAACACTTAATGGAAATGACAATATGAAAAATATTGAAGAACGTATAAAAAAAATAATTTTTGAAAAACTAGATATAAAACAAGAAAAGATTTTTAATGATGCATCTTTCATAGATGATCTTGGCGCAGATTCTCTTGATACCGTGGAACTTATTATGGCTTTAGAAGAAGAATTTGATATTGAAATATCGGATGAAGAAGCAGAAAAAATTAATACAGTGCAAAAATCTATTGATTTTATACAAAAGAAAAATTTAAAAAAATAAATAATTATCAAAATTTTTTAATTTTTTATAAACAGAAATTTAATATAAATTGCATATAATTAAAAAAATAATGATAAAAAGTAAATTTATTGTAATTGAAGGTTTAGAGGGTGCGGGTAAAACAAACGCATGTATATGTATTAAAAATCTATTAAAAAAAAATAGTATTAAAAATGTACTATTAGTTCGTCAACCTGGTAGCACACCTATTGCTGAAGATATAAGAAGATTAATAAAAAAAAAATTTAATGATGATAATCTTATCAAAGAAACTGAGTTATTATTAATGTATGCAGCAAGAATACAATTAGTTGAAAAAAAAATAAAACCTGCATTAAAAAATGGAATATGGGTTATTTCAGATCGTCATGATTTATCTTCTTTAGCTTATCAAGGTGGAGGTTTAGGTATTCCAAAAAAAATAATCTATCAATTGCAATCTTTATTTTTAAATAACTTCATTCCAGATTTAACTATTTATTTAGACGTGTCTCCAGAAATTGGTTTGGCAAGAGCATTAAAAAGAAATCCATTGGATTTAATTGAAAGTAGATCTTTGTTTTTTTTTAAAAAAACTAGACGATGTTATCTAGAAAAGTCAAAATTAGATAAAAAAACTATAATAATCAATGCTAATTTAAATATTAAAAAAGTAACTCAAAATATTACAAAAAAAATGTTAAATTGGCTAAATAAACAAGTTATATGAAACTATATCCTTGGTTAATAAAACCATACAATAATATTGTACAACAATATCAAAAAAAGAAAGCTCATCATGCGATATTAATAAAAACTCCAAGAGGCATAGGGGTATCATTATTAATTTGGTTTATTAGTAAGTGGCTTTTGTGCTTAAAACCTATAGGATTAAATTCTTGTGATAAATGTCATGGATGCAAATTAATGTCAGCAAATAATCATCCAGATTGGCACAATTTTACGCTGGAAAAAAACAACCTATTTAGTATTGAAAGCGTACGAATAATTAATGAAAAAATATTTACATGCTCTCGACAGGGCGGATCCAAAATTATTTTTTTATCAGATACTGGAAAATTAACAGAATCTGCAATTAATGCTTTTTTAAAAACATTAGAAGAACCACCTAGAAAAACTTGGTTTTTTCTTGTAAATTACAAAAATTTAAATTCACACTCTACACTCAATAGTCGCTGCCTTATATATAAATTATTTATCCCAGAAGAAAAAAAAAGTTTGTACTGGTTAAAAAAAGAAACTGTTAAAAAAAATAGATCATGCTTAACAGCACTGCGTATTAATCAAGGCTCTCCTCTATATGCAAAAAAATTTATTAATAGCAACTTATGGATAGATAGGATAAATTTTTATGAATGTTTGCATGATTCTTTCAAAAAAAATAATTTATTAAAAATATTACCGTTAATAACAGAAAAAGATAGCCAAGTAAAAATCGATTGGATATGTTTTTTACTATTTGATTCTATTAAATTTTATTTTAATGAAAATGACAATTTAACTAATTCTGATCAAATAGAACTCATCCAATTTTTTTCTTATAATTATAAGAACACTATTTTAGATACAAGTATTCGTACTTGGTTACATTGTAAATATAGATTGTCTAACATATCTGGTATCAATTGTGAATTACTATTATCAGAACAATTGCTTATATGGGAAAAAATATTAAATTTTTCATAAAAATTTAATATTTATAAAAAAAGAGATAAAATTATGTTTTTAATTGATTCACATTGTCATCTTGATAGATTAAATTATAATTTACCGCTAGAAAATATAGAAGATGTACTAAAAAAATCTTATCAGAATCATGTAAAAAACTTTTTAACAGTTTCAACCTGTATCAGCAATTTTTACAATATAAAAAAATTGTTTAAAAAATATAATACAATTTTTTATTCTTGTGGTGTACATCCCTTAAATTGCAAAAAAGAGCTTAATCTTTTTCATACAATAGAAAATTTATCTAATGAAATAAAAAAATTATCTTGTATTAAAGATGTAATAGCATTAGGTGAAACTGGTTTAGATTATTATTATTCATCTGCTACTAAAAAAATACAACAAGATTTTTTCAGAGAACATATCAGAGTCGCCATTAAGTTAAAAAAACCAATTATCGTACATTCACGCAATGCTTCAGAGGATACTATTAAAATACTGCAAGAAGAAAATGCGGAAAAATGCAAAGGAGTACTACATTCTTTTACTGGTGATTATAATACTGCATGTAAATTATTAGATCTAGGTTTTTATATTTCCTGTTCTGGAATTATTACTTTTAAGAATTCTTTAGAACTTTGCAAAACCATAAGAAAAATACCACTAAACCGTTTATTAATAGAAACAGATTCACCATATTTATCACCAGCTCCCTACCGAGGAAAAGGAAATCAACCTGCATATTTATTTTATATAGCAGAATATCTTTCGATATTAAAAGAAATAGATATACATGCACTTGGGCACATTACAACAAGTAATTTTCGTACATTATTTAATATTTAGCTCATTTAGTCTTTCATCCTATATCAAATGAAAAAATAATATATATTACATACCATTCATTTAAAATTTTTATATATACTTAGGAGTGTTTTTTGTATGTTTAAAAACGTATTTGCAAACCTTCAAAAAGTTGGTAAATCACTCATGTTGCCCGTTTCAGTATTACCTATTGCAGGTATACTGTTAGGAATAGGATCTGCTCATTTTAATTTTTTACCAGATATTCTTTCTCAAATTATGGCTCAAACAGGAGGTTCTGTTTTTAGTAATATGCCATTAATTTTTGCAATTGGTGTAGCTCTTGGCTTTACTAATAATGATGGAGTGGCCGCATTAGCAGCAGTTGTATCTTATGGGATTTTAATTCAAACATTAACTGCAGTAGAACCGATTGTTTTACATACAACTATTGAAGTCATAAAAAATAAACATCTTTCTGATACCGGTATATTAGGAGGAATTATTGCCGGCGCAATTTCAGCGTATATGTTTAATAAATTTTATCGTATTCAATTACCTGAATACCTAGGTTTTTTTGCTGGGAAAAGATTTGTACCTATTATTTCAGGATTATCTGCAATATTAATAGGTGTGATATTATCTTTAATTTGGCCTCCAATTGGTCATGGAATTCAAATTTTTTCAAAATGGGCTGCTTATCAAAATCCTATTCTTGCTTTTGCTCTATATGGACTAGTCGAAAGAGCACTGGTTCCATTTGGATTACATCATATATGGAATGTTCCATTTCAAATGCAAATTGGAGAATATACTAACTCTATAGGACAAGTATTTCATGGAGATATTGCAAGATATATGGCAGGTGATTCTACTGCTGGGAATCTATCAGGAGGTTTTATTTTTAAAATGTATGGTCTTCCGGGTGCTGCGCTAGCAATTTGGCATACGTCTAAAAAAGAAAATAAAACTAAAATAGGTAGTATTATGATTTCAGCGGCATTAACAGCTTTTTTAACAGGAATAACAGAGCCAATCGAGTTTTCATTTATCATTGTTGCACCAGTATTATATGTTATTCATGCTATTTTAGCAGGATTATCTTTCCCATTATGTATTTTTTTGGATATGCGCGCAGGAACTAGTTTTTCTCATGGTTTTATAGATTTTATAGTATTAAGTGGAAACAGTCATCATATATTACTTTTTCCAATTGTTGGTATACTTTATGGATTATTATATTATATTTTATTTTATTTATTCATTATTAATTTTAATTTAGATACACCAGGACGAGAAAATATAAAAAACAATATATTGGAAAAAGATAATAATGAAATCGCACCATATATTATTACAGCATTAGGTGGAAAAAATAATATTAAGAATCTAGATGCATGTATTACTAGATTGCGTATTACAGTTTCAGATATTTCAAAAGTTAAACAAAAGGATTTAAAAAATATCGGGGCTGCAGGAATAATAATTTCAGGATCAGGAATACAAGTAGTTTTTGGAACACGATCTGAAAATATTAAAACCGCAATGGATGAGTGTATAAAAAATATATGAAAAAACAGGAATTTAAATTATGCAAGATAATTCAATTTTTAAAAATATTATTCAAAGAAAAATACCAGCAAATATTGTTTATCAAGATAAAAAAATCACTGCTTTTGAAGATATAAAACCAAAAGCACCTGTACATATATTAATTATACCTAATTTTTTTATTTCATCATCAAATGATATCAATAAAAAAAACAAATGGATTATGTCACATATGTTTTATATTGCCGTGAAAATTGCAAAACAAAAAAAATAAATCAAGAAGGATATAGAATTATTATTAATTGTAATGAATATGGAGGTCAGGAAATCAATTATCTACACATGCATTTATTAGGCGGCAAAAAATTAAAATCTTTCTCCTAATTTTTTTATAGAAAAAATTTTTATGAAAATTTCTTTTTTTACATTATAAGGATAAGATTTGAGAAGAAATTTGTTATTGATATTATTTATTATATTTTTTTATAAATAGTTGTTCTTATTCTAAAAATATAGAGAATACTTTTTCGAAGGTAAAAAAAACAAATTTTATTCTTTTAAAATTTGATTCTGCTATAGAAAAGATCATTTCGGAAATGTTAAAACCTAATCATATATTAATCTTTAATAAAAAATTATTTTTTATTGATTTACTAGAAAATCAAACTAATATTTTTATAGACAGGGAAAAAATTACAGATTTAATAAAACACAAAATTTCCATAAAAAATAATGACATTCATTTTCTTGAAAAAAATATGATTAAAAAAAATAAAAAAAAAATAGGCATTTTAGAAATAAAAAAAACACTAGATACCAGTACTGCAATTTTTTTCTCTCGCAATAACAATGTAGAATATTATATACACAGCTGTATTTCTGGTAAAAATGAACCTTTTTTATTAAAAATTGAATTGATACTTGTTAAAACAGGAGAAATAGTATTTATGAAAGAAGAGAGATGCTATTGATAAAAACGGTATGTAAAAAAATTATATTTTATATATAAAAAATATTAAGACTAATTTTGAAAATAAAAAAAGACTTTTTGATGTGTCTAAGAGTAGTTCTTTCTACCGACGTTCGTATAATTAAATAATTAATTATTCTGAAATATAATAAATAGATTTCTCTATTATATGTCAGTAGAAAGTTCTAACTCTTAGTTGTTTTAGAAAAAAAGTTAAATTAATTTTAAAAAATATATATTTTCATGAAATTAGAAATGATAAACTATTCCAGCACCAATGGTGTTATCTGTAGGAATGTTTTGCTCTTTAATAACATTATCACTCTTTAATAAATTAATTGTATAATTCATATATGTAGAAATATTTTTGTTAAATTCATAACGAGTAGAAATATTAATTTGTTTTGCTAATTCTAAATTTTTAGGAACAGTAGTAGCATCTTTTATATTTAAATTTTGCCCCTTAGAATCTAAATAACTCAAGGAAGGATGAAATCCAGAATGAAAATTATATTCTGCAATCGCTTCAATATTTTGAGTTTTATTGATATATGGTTGATCCTTAGAAGCATTATTATCGCTAAGAATATTTAATGATGGTGTTAAATTACGTCCTTCACCATAAAATGCTGCTATATATATATCATTAGCATCATATTTAAAACCTAAACCATATGCACCTACAGAAGGAGTTAGCTTGTTGTCTTGATTACTTTTGTCAGATTGAAATCTTTGAGAAGAAAAACAAGAACCAATGGCAGTAAGTCCCACATCAGTTTCATATTTTATAGAAATACCCCAACCAGGACCATTTGTCTGATTTTGCGCTCTATTTTCAGATTGATCTTGATACTGTAATATAAAACTCATTCCGTCAATTAAACCAAAAATATCATCATTTTTATAAGTAAGTAAACTATTGCTTCTACCCGTCATATAGTTATCGTTATACGAAAATATACTATCTTTATTAATATATGGAGAACGATTAGTCAACGCTTGCACGTCATGTAAAACACCATAATTACGACCATAATCTATTGATCCCCAATTGCCATACTTGAAACCAGCATATCCTAGACGTAAATTGTTAGGTTGCTGTTTATCTAACAATTGTTCTGGTACAGAAAGATCAATTCCATATTCAATAGTCGCATAACTAAATAGTTCATCAGTAATATTTACCTCCCCCGACAAACCTAAAATAGCATTTGTATCGTCTTTATGAGATGTAATTTTATTTGCTAAAAAACTATGATTTAATTTATGATTAGGATTAATGCTACCATATAACTCAAGTTTATTACCATGTTTGTGAAAAACTTCTAAAGCATTAACTCCATTACTAGCAGCTAATAACATTGGGATTACCATTGCTAAAGATTTACGATTTGTCATAATTTTTTATACTACCTTTTAGTAAAAATAATTTAAATTAATATCAGTTTATTAAAATAAATATTATTTTTTTATATTTTGTATTTATATCTAAATACGAAAATACAAATAATTATTTAGTAAATATTAAATTTTTTCATTAAAAATAAGCGTTATTAACGGTACGTGGAAATGGAATGAGATCTCGTATATTTGTTATACCAGTAAAATAAGAAATCAGTCGTTCAAAACCCATTCCAAAACCTGAGTGTGGAACTGTTCCGTATCGACGCAAATCGCGATACCACCAATAATCCTCTTTTTTTAGCCCTAATTCTAATAAACGTTCATCTAAAATTGCAATACGTTCCTCTCTCTGAGAACCACCAATTAGTTCTCCGACATTAGGCACTAATATATCTATTGCTGCAACAGTTTTTTTATCGTTATTCAGTCTCATATAAAATGCTTTTAATTCTTTTGGATAGTTTTTTACTATTACCGGAATTTTAAAATAATTTTCTACAAGAAAACGTTCATGTTCAGAAGATAGATCTATACCTAAAAAAACAGAGTTATTAAATTTAATCTTGGAATCAAGTAAAATATTTATGACTTCTACATAATCTATACGTACAAAATCTACTAATAAAAATTTTTCTAAACGATCAACTATATTACTATTAGTATAGTTTTCAAGAAAATTAATATCTGTTATACATTTTTTTAAAAGAGATTTGCAAACATATTTTAACATACACTCAGCAAAATCTGATATATCATTTAAGTCTGTAAAAGCTGATTCTACTTCTAGCATCCAAAATTCCGCTAAATGACGACCCGTATTAGAATTTTCAGCACGAAATGTAGGGCCAAAAGTATATACTTTAGATAAAGAACAGGCATATGTTTCTAAATTTAACTGTCCCGAAACAGTTAAAAAAGATTCTTTTCCAAAAAAATCTTTTTTAAAATCAACGGAACTATCTAAATTTTTAGGAATGTTTTCCATATCTAATGTTGAAACACGAAACATTTCTCCAGCACCTTCAGTATTCAAACTAGTTATAATAGGAGTTGGAACCCAGTAATATTTTTCTTTATAAAAAAAATGATGTAATGAGTGTAATATATAATTTCTTATTCGAGCTATTGCGCCTATTAAATTTGTTCGAGATCGTAAATGTGCTACTTCTCTCAGATATTCTGTGCTATGTTTTTTAGAAGATATTGGATAAGTCTCTGGGTTTTCAACCCAACCCAAAACTTTAATCTTTTTCAATTGAATTTCATATTTTTGTTTATCTCCAATTGATAGTATTAATTTTCCACTAAGCATCACAGAACACCCAGTTGTTAGGTGTAGTATTTCTTTATAATAATTAGGCAAAGTATTATTTGCAATCACTTGTATAGAATTAAAACATGAACCATCATAAATTGTAATAAAAGAAAAACCAGATTTTGAACTTCTACGGTTCCGAACCCATCCACATACAGTAATTAAACTATTTACTATTATATCATCTTTATATATATCTGATATTGATACTGTATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_017252|385825:394810|387584_388565_+|WP_009874310.1|DBSCAN-SWA MKLYPWLIKPYNNIVQQYQKKKAHHAILIKTPRGIGVSLLIWFISKWLLCLKPIGLNSCDKCHGCKLMSANNHPDWHNFTLEKNNLFSIESVRIINEKIFTCSRQGGSKIIFLSDTGKLTESAINAFLKTLEEPPRKTWFFLVNYKNLNSHSTLNSRCLIYKLFIPEEKKSLYWLKKETVKKNRSCLTALRINQGSPLYAKKFINSNLWIDRINFYECLHDSFKKNNLLKILPLITEKDSQVKIDWICFLLFDSIKFYFNENDNLTNSDQIELIQFFSYNYKNTILDTSIRTWLHCKYRLSNISGINCELLLSEQLLIWEKILNFS >NC_017252|385825:394810|389489_390923_+|WP_012619518.1|DBSCAN-SWA MFKNVFANLQKVGKSLMLPVSVLPIAGILLGIGSAHFNFLPDILSQIMAQTGGSVFSNMPLIFAIGVALGFTNNDGVAALAAVVSYGILIQTLTAVEPIVLHTTIEVIKNKHLSDTGILGGIIAGAISAYMFNKFYRIQLPEYLGFFAGKRFVPIISGLSAILIGVILSLIWPPIGHGIQIFSKWAAYQNPILAFALYGLVERALVPFGLHHIWNVPFQMQIGEYTNSIGQVFHGDIARYMAGDSTAGNLSGGFIFKMYGLPGAALAIWHTSKKENKTKIGSIMISAALTAFLTGITEPIEFSFIIVAPVLYVIHAILAGLSFPLCIFLDMRAGTSFSHGFIDFIVLSGNSHHILLFPIVGILYGLLYYILFYLFIINFNLDTPGRENIKNNILEKDNNEIAPYIITALGGKNNIKNLDACITRLRITVSDISKVKQKDLKNIGAAGIIISGSGIQVVFGTRSENIKTAMDECIKNI >NC_017252|385825:394810|392121_393270_-|WP_012619519.1|DBSCAN-SWA MTNRKSLAMVIPMLLAASNGVNALEVFHKHGNKLELYGSINPNHKLNHSFLANKITSHKDDTNAILGLSGEVNITDELFSYATIEYGIDLSVPEQLLDKQQPNNLRLGYAGFKYGNWGSIDYGRNYGVLHDVQALTNRSPYINKDSIFSYNDNYMTGRSNSLLTYKNDDIFGLIDGMSFILQYQDQSENRAQNQTNGPGWGISIKYETDVGLTAIGSCFSSQRFQSDKSNQDNKLTPSVGAYGLGFKYDANDIYIAAFYGEGRNLTPSLNILSDNNASKDQPYINKTQNIEAIAEYNFHSGFHPSLSYLDSKGQNLNIKDATTVPKNLELAKQINISTRYEFNKNISTYMNYTINLLKSDNVIKEQNIPTDNTIGAGIVYHF >NC_017252|385825:394810|385825_386560_+|WP_009874307.1|DBSCAN-SWA MNINRQTAFITGANQGIGKAIAKKLIKKGIQVIGTSTTEDGVKRINDYLEGNGFGFVLNLKNIDSITEKIQEIYKKKHSIDILINNAGIKEDNLLVNMKSTEWDDVIKTNLSSVFHLVKSVIRSMIKKRQGRIITIGSVIAYTGNKGQVNYSASKSGLIGFHKSLALEVASKGITVNIVSPGLIKTNFTEKLNSIQYQKYLSNIPMKRFGQKEEVADAVIFLASKKASYITGHTLHVNGGMYMI >NC_017252|385825:394810|393409_394810_-|WP_009874316.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNTVSISDIYKDDIIVNSLITVCGWVRNRRSSKSGFSFITIYDGSCFNSIQVIANNTLPNYYKEILHLTTGCSVMLSGKLILSIGDKQKYEIQLKKIKVLGWVENPETYPISSKKHSTEYLREVAHLRSRTNLIGAIARIRNYILHSLHHFFYKEKYYWVPTPIITSLNTEGAGEMFRVSTLDMENIPKNLDSSVDFKKDFFGKESFLTVSGQLNLETYACSLSKVYTFGPTFRAENSNTGRHLAEFWMLEVESAFTDLNDISDFAECMLKYVCKSLLKKCITDINFLENYTNSNIVDRLEKFLLVDFVRIDYVEVINILLDSKIKFNNSVFLGIDLSSEHERFLVENYFKIPVIVKNYPKELKAFYMRLNNDKKTVAAIDILVPNVGELIGGSQREERIAILDERLLELGLKKEDYWWYRDLRRYGTVPHSGFGMGFERLISYFTGITNIRDLIPFPRTVNNAYF >NC_017252|385825:394810|388598_389393_+|WP_012619517.1|DBSCAN-SWA MFLIDSHCHLDRLNYNLPLENIEDVLKKSYQNHVKNFLTVSTCISNFYNIKKLFKKYNTIFYSCGVHPLNCKKELNLFHTIENLSNEIKKLSCIKDVIALGETGLDYYYSSATKKIQQDFFREHIRVAIKLKKPIIVHSRNASEDTIKILQEENAEKCKGVLHSFTGDYNTACKLLDLGFYISCSGIITFKNSLELCKTIRKIPLNRLLIETDSPYLSPAPYRGKGNQPAYLFYIAEYLSILKEIDIHALGHITTSNFRTLFNI >NC_017252|385825:394810|386949_387588_+|WP_010896081.1|DBSCAN-SWA MIKSKFIVIEGLEGAGKTNACICIKNLLKKNSIKNVLLVRQPGSTPIAEDIRRLIKKKFNDDNLIKETELLLMYAARIQLVEKKIKPALKNGIWVISDRHDLSSLAYQGGGLGIPKKIIYQLQSLFLNNFIPDLTIYLDVSPEIGLARALKRNPLDLIESRSLFFFKKTRRCYLEKSKLDKKTIIINANLNIKKVTQNITKKMLNWLNKQVI >NC_017252|385825:394810|391498_391873_+|WP_014498746.1|DBSCAN-SWA MLKPNHILIFNKKLFFIDLLENQTNIFIDREKITDLIKHKISIKNNDIHFLEKNMIKKNKKKIGILEIKKTLDTSTAIFFSRNNNVEYYIHSCISGKNEPFLLKIELILVKTGEIVFMKEERCY >NC_017252|385825:394810|386636_386879_+|WP_010896080.1|DBSCAN-SWA MKNIEERIKKIIFEKLDIKQEKIFNDASFIDDLGADSLDTVELIMALEEEFDIEISDEEAEKINTVQKSIDFIQKKNLKK |
9 | Vibrio_phage(33.33%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
530122 : 539143
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_017252|530122:539143|DBSCAN-SWA AATGAAAAAACAGGTGAAAAAAATTTATAACATGAATCATTTAATTGCGTTCTGGCCAATTTTAAAACGTCTACTAATTTATGTAAAACCTCATAAAAAAAAATTAATTTTAGCGTTTATTTTTCTTTTAAGTGGATCAACTTCAGAAGTTTTAGGCCCAATCTTGATCAGTTATTTTATTAATAATATTTTATCTAAACATCAACTACATTTATTAATAATTTTAACTATAATTACATTATTTATAATATTACAAATATTATCAGTATTTTTGAATTATTTTCAAAGTATTTTATTTAATAAAATAGCAGTAGAAAGCATTAATAAATTACGTCAAGATGTTATGTATGCTGCATTGCAACAACCTATTAGCGAATTTGATTCTCAACCTATTGGACAGATGATTTCAAAAGTAACGAATGATACTGAAGCAGTTAAAGAACTATATGACACAGTTGGACCTACATTGTTCCGAAGTATAATATTAATTTTTATTATATTATTTGCAATGTTTACTCTTGAATGGCATATGGCCCTTGTTGCTTTATTTATTTTACCATTAGTCATTACAATTATGCTGGTTTATCAATATTATAGTACGCCACTTTTACGGAAAGTAAGATATTACTTAGCCGAAATTAATAATAAATTTAATGAAACGATTAATGGAATGAATGTAATTCAGCAATTCTGTCAGCAACGTAGATTTCAAGAAAAAATAAAAAAAAGTAGTGATTTACATTACATGTCACGTATGAAAATATTAAGACTAGACGGTTTTTTATTAAGACCACTTCTGAGTTTATTATCTGCTATGATATTATGTAACTTCATGTTCTTATTTAGTTTTTTTCCAGTTGGAGCTTTTGAAGTAGGTGTACTATATGCGTTTATTACTTATCTTGGACGACTAAATGAACCTTTAATTGCTATTACAATCCAACAGTCAGTATTACAACAATCTATTGTTGCAGGAGAAAGAATATTTTCACTAATAGATTCGCCAAAACAAAAATATGGAAAAAATAAAGATTTATTAAAAAGTGGAAAAATAAATATTCAAAATGTTAGTTTTTATCATAAAAACTGCAATAAAAATATACTAGAAAATATTAATATTAAAATTTCCTCTAAAAGTTTTGTTGCATTTGTAGGACATACTGGTAGTGGAAAAAGCACTTTAGCAAATTTAATCATGGGATATTATCCTCTAAAAAATGGAAAAATATATTTAGATGACAAGTCTATTGATTCAATAAGTCATAGTGTTTTAAGAAGAAATGTATTAATGGTACAACAAGATCCAATAGTTCTCTCTGATACTTTTTTTTATAATATTACATTGGGAAGAAAGATACCTGAAGAAAAAATTTGGAATATATTAGATACGGTTCATCTTTCAGATTTAGTCAAATCGATGCCTAAAGGTATTTATTCCCTTCTAGGAGAAGAAGGTAATAATTTATCTGTTGGTCAAAAACAATTATTAGCGATTGCTAGAGTATTGGTTGCATATCCTAAAGTACTTATATTAGATGAAGCTACTGCTAATATTGATTCTGGAACAGAGCAATTAATTCAAAAAACACTATTATCGATACGAAAAAACTGTACTTTAATAATAATAGCTCATAGACTTTCGACTATTATCGAAGCAGATTCAATTATAGTTTTAAAAAAGGGGAAAATTGTTGAATTTGGTACTCATGAACAATTATTAACTAAAAAAAGTTGTTATTATAAAATGTATAAATTTCAATCATGTAAATTTTAGGAGTTTCTGTTAGCTTTATCAGAACACCTGTATCAATTGATTTGGCTGCTTCCTTCCGAATCTGACCAACTATTCAATATTGCAGTGTTTGGAGCTAACAGATAACTCTTTATTTATATTTTCATAATAAAAAATTAGATTTTTTATTATATAGATGAAATTTAAAATTTACAACCAATATTTATTTTTAAAAACTATATTTCAAAAATATTTGAAAAATCAAGAAGAGTACTTTCACAATACAATTAATATTGATAGCATAATAGTTTTTTAATAAAACATTATGAAATTTATATGAACTATCAAATATTAGCACGAAAATGGCGTCCACAATATTTTAGAGATATAATCGGTCAAAAACATATTGTTACTGCTATATCTAACGGATTATCTCTTGGTCGTATTCATCATGCATGGTTATTATCTGGTACTAGAGGAATCGGAAAGACTACTATCGCTCGCTTACTTGCTAAAAGTCTAAATTGTCAAAATGGAATCACATCAGATCCTTGTAGACAATGTATTATTTGTAAAGAAATAGAAAAAGGGTTATGTTTAGACGTAATTGAAATAGATGGAGCTTCTCGAACTAAAGTTGAAGAAATGCGAGAAATTTTAGATAGTATTTATTATTCTCCTATTAAAAGTCGTTTTAAAGTATATTTAATTGATGAAGTACACATGCTTTCTCGTCATAGTTTTAATGCACTTCTTAAAACTCTTGAAGAACCACCTGAACATGTTAAGTTTGTTTTAGCAACTACAGATGTAGACAGAATCCCTAAAACTATTATCTCTCGTTGTTTGTATTTTAAATTGCAAATAATATCTGAAGAAAAAATTTTCAAATTTTTAAAGTATATTTTAATTAAAGAATCTATTGATACAGATGAATATTCTTTAAAAAAAATAGCTTATCATGCTCATGGAAGTATACGCGATGCACTTAATTTACTAGAACATGCTATAAATCTAGGAAATGGACATGTTAATATAAAAAATGTAACAGATATGCTAGGACTTCTACCAGAAAAATATTCTTTTTTGTTAACTGATGCGGTTTTAAAAAAAGATTCAAAAAAAACAATGTTGTTGTTAAATAAAATTAGTAGTATAGGAGTAGAATGGGAAGAAATTTTGATAGAAATGTTACGTTTTTTATATCATATTTCTACATCGCAATCTTTTCCATTAGTTTGGGAAAAAATTTTTACCGAAAAATACAAAAATCAAATTCAAAAAATAGCTCAAAATAATAAAAAAACTAATATTCAATTATGTTATCAAATACTATTAAATGGAAGAAAAGAACTAAAGTTTGCTCCAAGTCAAAAAATAGGAGTAGAAATGTCTTTATTACGTGTTATTTCTGCAATATAAAAAATATAATATTAATATAAAAACATATAAATTTAACAAGATCATAAAAGATATGAAATAATTAATATTTCATATAAAAACATATTGAAAGTATTTGATATGTATATTTAACTGATAAAAAAATATCCAATACAGTATAATAAATTGATAATATAAAAAAATGCACATGATAAAAAATAATATATGTAGTAATTTTAACAAATCATTAAATAAAACATATAGATAAAAAAAATAGAAAATTATTTATTTTTAAAATAAAATTTTCGGCGTAAAAAATAAAAAATATGACTTTCACATTACAAAAAAGAGATCAATATATATGTTTACTAAAGGTGGTTTAGGTAATTTGATGAAACAAGCACAACAAATGCAAGAAAAAATGGCAAAAATACAAGAGGAAATAGCTCAAATGGAAGTGACAGGAGAAGCTGGCGCTGGATTAGTTAAAGTGACAATTAATGGTGCACATAATTGTAGACGTGTGGAAGTAGATCCTAGTTTACTTCAAGACGATAAAGATATGCTAGAAGATTTAGCAGCAGCCGCATTTAATGATGCGACAAGAAGAATATCTGAAGTACAAAAAAAGAAAATGTCTGCTATATCTACAGGCATGCAGCTTCCAAATGGATTTAATATGCCCGTTTAAATAAAATAAAGTAAAAAAATTATATATGCTAAATAAGTATAAATTTATTGAATAAATTTATTTTTACTATGATAATTTTATTCAAAAGTACTTTTTATACTTTTAAAATTACTTTTATTGTTAATTTAAAAAGAGGTCTTTCTGCATGAAAACACAAAAAAAAGAAGTTTATAATTTTCAATCAGAAACAAAAAAATTATTACATTTAATGATTCATTCACTATATTCTAACAAGGAAATTTTTTTAAGAGAATTGATATCTAATTCATCAGATGCAATAGATAAATTACGATTTGAATCTATATCATCACCAGAATTATATGAAAATGATAGTGATGTAAAAATTCAAATATCTATAAATAAAGCACAAAGAACATTGATCATTAGTGATAATGGCATTGGAATGACAAAAGAAGACACCATTGAAAATCTTGGAACAATTGCTAAATCAGGAACAAAATCATTTCTCCAATCTCTAGAACAAAAACAAAATAAAAAAAATGAATTAATTGGAGAATTTGGCGTTGGTTTCTATTCATCTTTTATTGTATCAGAAAAAGTCTCAGTTAGAACTAGATTTGCTGGTTTAGAATCTAATAAAGGAATATTATGGGAATCTTCAGGAGAAGGAGAGTACAATATTACAAATATTGTAAAAAAAACTAGAGGTACTGAAATCACTCTATTTTTAAAAAAAGAAGAAGAAGAATTTTTAGAAACTTGGCGTATAAAAAATATAATTAGTAAATACTCTGATCATATTACTATTCCAATACATATACAAGATTATGATGAAAAAAATAAAACATATTTTTGGGAACAAATTAATAAAGCTAAAGCATTATGGACATTGAATAAATCCTCTATTACAGAAGAAGAATATAAAGATTTTTATAAACATCTCACCAATGATCAAAATGATCCTCTTATATGGAGTCATAATCACGTAGAAGGCAATCAAGAGTATATTAGTTTATTATATATTCCTGAAAAAGCTGCTTGGGATATATGGAATAGAGATAATAAACACGGTTTAAAATTATATGTAAAACGTGTTTATATTATGGATAATTCTCAAGCCTTTCTTCCTAATTACTTACGTTTTATAAAAGGTTTAATAGATTCTAGCGATTTACCATTAAATATTTCTCGTGAAATATTACAAGATAATTCTATTACAGAAAAATTAAGAAAATC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_017252|530122:539143|537748_539143_-|WP_010896141.1|tRNA|DBSCAN-SWA MLKIFNTLTSTKEIFTPIKKNRVNLYVCGVTVYDFCHIGHGRTFVVFDMIVRYLRFSGFQVKYVRNITDIDDKIISKSTKEKKKINTFTASMIKEMHKDFDLLGISVPDEEPRVTDYIDNIIRIITTLIKKKHAYIHKNGDVIFSIDSDPNYGTLSRQSLTSLESGSRIPLNNMKKNPLDFILWKSSNKEEYSWDSPWGKGRPGWHIECSAITNVFFNNSIDIHGGGSDLLFPHHENERSQSICFNNKSMINFWMHTGMVILNNKKMSKSLGNVYFLRNILKDCDAEVLRYFFLSTHYRHPIYYCEKNLDQAYTSLKYLYTALYDTNPFFNNEEGLNFELEFYNAMNDDFNTPAVFSIFFKIARKINFLKNKDILKTNKFAFRLKYLANNLGFLFQDPKEFLQKKTTLNLLTLKEIQLLIEKRNIARQSKLWQEADNIRKKLMSLDIILEDLPDKTIWRKNKKS >NC_017252|530122:539143|536016_536664_+|WP_009874438.1|DBSCAN-SWA MRIILLGAPGTGKGTQGKFITEKYKIPQISTGDMLRESVVLKNKIGMIIKNIIEEGKLVSDEIVCHLIKNRIKKHDCINGFILDGFPRTIQQALYLSKKNIKIDYVLEFIIPHEYILERISGRRIHIQSGRIYHVKFKPPKIKDKDDLTGQTLITRKDDTKEGIKKRLEEYKKVHDPLVQYYIHEKKRGNIKFFQIDAMLSFSSIRKKLETILKK >NC_017252|530122:539143|530122_531895_+|WP_009874433.1|DBSCAN-SWA MKKQVKKIYNMNHLIAFWPILKRLLIYVKPHKKKLILAFIFLLSGSTSEVLGPILISYFINNILSKHQLHLLIILTIITLFIILQILSVFLNYFQSILFNKIAVESINKLRQDVMYAALQQPISEFDSQPIGQMISKVTNDTEAVKELYDTVGPTLFRSIILIFIILFAMFTLEWHMALVALFILPLVITIMLVYQYYSTPLLRKVRYYLAEINNKFNETINGMNVIQQFCQQRRFQEKIKKSSDLHYMSRMKILRLDGFLLRPLLSLLSAMILCNFMFLFSFFPVGAFEVGVLYAFITYLGRLNEPLIAITIQQSVLQQSIVAGERIFSLIDSPKQKYGKNKDLLKSGKINIQNVSFYHKNCNKNILENINIKISSKSFVAFVGHTGSGKSTLANLIMGYYPLKNGKIYLDDKSIDSISHSVLRRNVLMVQQDPIVLSDTFFYNITLGRKIPEEKIWNILDTVHLSDLVKSMPKGIYSLLGEEGNNLSVGQKQLLAIARVLVAYPKVLILDEATANIDSGTEQLIQKTLLSIRKNCTLIIIAHRLSTIIEADSIIVLKKGKIVEFGTHEQLLTKKSCYYKMYKFQSCKF >NC_017252|530122:539143|534069_535944_+|WP_012619568.1|DBSCAN-SWA MKTQKKEVYNFQSETKKLLHLMIHSLYSNKEIFLRELISNSSDAIDKLRFESISSPELYENDSDVKIQISINKAQRTLIISDNGIGMTKEDTIENLGTIAKSGTKSFLQSLEQKQNKKNELIGEFGVGFYSSFIVSEKVSVRTRFAGLESNKGILWESSGEGEYNITNIVKKTRGTEITLFLKKEEEEFLETWRIKNIISKYSDHITIPIHIQDYDEKNKTYFWEQINKAKALWTLNKSSITEEEYKDFYKHLTNDQNDPLIWSHNHVEGNQEYISLLYIPEKAAWDIWNRDNKHGLKLYVKRVYIMDNSQAFLPNYLRFIKGLIDSSDLPLNISREILQDNSITEKLRKSLIKKSLSMLEKLAQKNNEKYQIFWNQFGLVLKEGPAEDHENLNKIANLLRFTSMKSNNSEQKMSLKEYISNMNEQQEKIYYITADSYSSANNSPHLELFKKNNIDVLLLSDRIDEWMMNYLSEFEGKKFQSISKEDISLNKLTKEKKIKNKDVSTEMIEFLKKVKNILGNQVKDVRLTHRLTETPCVLLSDSTEMTTQMAKLFSAAGQSVPELKYIFEINPDHILIKKICTINNENELHQWIKLLLDQALLAEKGNLENPHKFISRMNKLLIK >NC_017252|530122:539143|536894_537752_+|WP_009874439.1|DBSCAN-SWA MPAIIIDGNKIAKKIELKILKKVKQRKKNGERIPGLAMILVGNHIPSQIYVNKKKIACKNVGFFSECWNLPSNINEKEILNIISKLNENKNIDGILIQLPLPPQINHMKILSSIVPDKDVDGFHPYNTGSLCQRTPKLRACTPKGIITMLKYNKIKTHGLHAVMVGASNIVGRPMSLELLLAGCTTTVTHRFTKNLKDHVQNADLLIVAVGKANFLKGSWIKTGSIVIDVGINRLKNGKVVGDVEFKTAYLRASYITPVPGGVGPMTVATLLQNTLEACENHDDI >NC_017252|530122:539143|533594_533924_+|WP_009874435.1|DBSCAN-SWA MFTKGGLGNLMKQAQQMQEKMAKIQEEIAQMEVTGEAGAGLVKVTINGAHNCRRVEVDPSLLQDDKDMLEDLAAAAFNDATRRISEVQKKKMSAISTGMQLPNGFNMPV >NC_017252|530122:539143|532189_533275_+|WP_009874434.1|DBSCAN-SWA MNYQILARKWRPQYFRDIIGQKHIVTAISNGLSLGRIHHAWLLSGTRGIGKTTIARLLAKSLNCQNGITSDPCRQCIICKEIEKGLCLDVIEIDGASRTKVEEMREILDSIYYSPIKSRFKVYLIDEVHMLSRHSFNALLKTLEEPPEHVKFVLATTDVDRIPKTIISRCLYFKLQIISEEKIFKFLKYILIKESIDTDEYSLKKIAYHAHGSIRDALNLLEHAINLGNGHVNIKNVTDMLGLLPEKYSFLLTDAVLKKDSKKTMLLLNKISSIGVEWEEILIEMLRFLYHISTSQSFPLVWEKIFTEKYKNQIQKIAQNNKKTNIQLCYQILLNGRKELKFAPSQKIGVEMSLLRVISAI |
7 | Organic_Lake_phycodnavirus(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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