CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_014760_1 | 587291-587397 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_014760_1
|
1 spacers
spacers of NC_014760_1
>1.1|587320|49|NC_014760|CRISPRCasFinder ATGGATGAATTAAAATTAAATGATGGGAATAAGATGATGGATGATAATC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014760_1
The CRISPR arrays of NC_014760_1 >merge|NC_014760|1|587291-587397|CRISPRCasFinder CATCGCCAATGAAGTCTGAGCCTGTAGATATGGATGAATTAAAATTAAATGATGGGAATAAGATGATGGATGATAATCCATCACCAATGAAGTCTGAGCCTGTAGAT >NC_014760|1|1|587291-587397|CRISPRCasFinder CATCGCCAATGAAGTCTGAGCCTGTAGAT ATGGATGAATTAAAATTAAATGATGGGAATAAGATGATGGATGATAATC CATCACCAATGAAGTCTGAGCCTGTAGAT
>NC_014760.1|WP_013456319.1|586339_587068_+|purine-nucleoside-phosphorylase MPTPHLSCNKGEIAKIVLMPGDPLRAEYMAKKFLTNPKLVSLVRNIYFYTGEYKGKLVTIGASGMGVASMGIYAYELFTEYDVDVIIRLGSTGSYVDNLDVKQPVLVKRAYADGLGFVSLMTGEKTHNAYPDKEIVKLLKRSAKKKKINVLDVSCHTTDVFYSIRSLEETINKTKCQVVDNECFGLFTTAKRCNKKAAALLSVSENIVTGKSMTSDERLLEFSQMFEVALNALDNIYKHIEN >NC_014760.1|WP_013455944.1|585045_586170_-|tRNA-2-thiouridine(34)-synthase-MnmA MSNKKKVILGMSGGVDSSVCAYLLLKQGYEVEGLFMRNWDSMLNNDFLGNENISQDICPQEQDYHDALEVANKLGIKLHRVDFVNEYWNDVFKTFISEYEAGRTPNPDILCNKYIKFKAFSDYAFNNLGADYIAMGHYAKVTDGRLYRAKDQNKDQTYFLAQLSHEQLKRVLMPLAEFNSKEEVRKIAQEQGLITASKKDSTGICFIGERKFTKFLQNYIPMQPGDIVDIRTNNKLGKHEGCFYYTIGQRKGLNLGGQAEPYYVCGHDVKKNILYVAPSSDLSYLTSDALLATGLTLNHNDFDHNNLSAKFRYRQENIPVTIELLPNNTIKVYYPSEAQAVTPGQQVVIYEGQKCLGGAVIEKIYYKGSEKTYL >NC_014760.1|WP_013456137.1|582392_585035_-|alanine--tRNA-ligase MKKLTSTEIRQKWLDFFESKNHLVIESKSLIPVNDPSLLWINSGVATLKNYFSGKKVPPAFRLTNSQKAIRTNDIENVGVTSRHHTFFEMLGNFSIGNYFKKEAIAYAKEFLVNVLEMDFEKLYFTYYEEDLEAKNYWLENGVDESHLISGTRDTNFWDLGSGPCGPCTEIFYDRGEKYDSRGIDLLKNDIENDRYIEIWNIVFSQFNNDGEGNYTELKQKNIDTGAGLERLASIMQDVPTNYDSDLFINIIREIEKYSRYKYIIENYFVKDEHQSEINTNFKIIADHIRTVVNAIADGAKVSNVGRGYIIRRLLRRSYYKGMQLGIKDLFLHKLVKVVKDSLPYEYDEKDVIDAIKEEELLFSKTIEKGKILLESFLDNENKVFDGAVAFNLLETYGFPIELTAEILHQKGIRVDMEAFELAKEKHALASKGGKATGMDKVINSLALIDKKMDNFVGYSELSASSKVLKLFDEENEVESFETGGYVLLETTPFYATSGGQRHDKGFIIQGENKIKIIDVFKDKFGNHIHFVEGKMNNYEPVSSFVDPNIRIGLERNHSGTHLLFCALRNVLGSHIEQLGSDNNEERLTFDFPADEKPSDEQIKAIEDLVRSYITKSIDREYITTTVDKAREMGAIMTLEEGEYMDPRAVRVVRFGDITSDLCGGTHLSNTSKLESFKITNVEKKQAGVFRIRAISSIKLVNEYLSEVNKKLNEELATIIKKIKELKNDYVAPVINENEPDIETLNLSINKRIDELREVYKQLLKESSNLEFDYETVKFDKINNYDVYINLDVDASSVKLIAASIRDKFQSGKTVAIIGSKNEKELLLAIATRAIDANKMFKKLSSELNGRGGGAPILAMGKMNYSENIESLIKDYLLNA >NC_014760.1|WP_013456187.1|581959_582400_-|Holliday-junction-resolvase-RuvX MRKLSFDLGTKTCGFAISDILEISANALETIRFDENDFNVVITKVKEIIKMYQNSIDAFVLGYPLRSNGSKSERTVMVDNFATLLANEFPGINIYLVDEYGSTIKAQRILKDAKLSNKKTKSKKDTVSAVIILNDFLQYGGQKYEL >NC_014760.1|WP_013456305.1|581241_581970_-|hypothetical-protein MSFKEKLVQNGSPTSLGWGLIASAIIASLIGIITSITVFVRAFKIRKQFNKTLEENAKNAIMKIKGSELDAKDEFINKAFSTNINEFDMLHIVKSVYLNYAQNVLIDGLNLENLYLTLKTMTLANIEIDLRAINSKTWNEAVIKFKDKITEKPCFIDSEDKKYNLIISANDNSSNTEIFNKLYPKLTLGGLLMVIQNPIIKSDLKDLKRDLKIKNIRFEASKNKALFLYIVKSESDSLPYLQ >NC_014760.1|WP_013456453.1|578786_580958_-|DUF31-family-protein MSYIKLEKKFKLLLGTITSAVPLSFVLSCTNNKESVLPKLDDDKMIDKNSDTEAKTPIKQADKHFLAIDQLIKLSPREIHSKTKTYIEKNKKFKNFLKTRNINFISEEYPRHENELDKEYWTYAKYLGEYGNHGDDSYQKTQFFNPSIPIGHYLNHQHLEKFSEEEVKGLEVKTIDLSSLIRNNPFGYLPSNLSQLLSYATYESIEKKFNLRNISNIKSSYDDIKGVIYLLIYTNNNKNKHYYLINKDNNKELKANIDFFTYIKDRSIELNVNAKQWVSTVDQQKNISGIFSFPKFLGTAWVIDRIKNNNKDYYELLLATNMHVFNLRSAFDKTYHYDKFKKYESGYKDKDYQWKEFPPGFYDGIKTDDSGDNRNIKPKPAFKVGRIKENSLDLDFGVFEKNKYKYELDHSDRIDAFEDAYAQYLDAPYYTPRYESNNTYLKAIEKIPETLKNNFSYFNTKNSGADFLTLRLKIKKDKLKNVLPKLASVIGTDEEKDFYVNFSNKEFSPIKTQFYAGYPKHWDPFSKKSQFRGIKSEGGIISTKRRIVDENWFRDVWLRYDEKLNKEYNSENNLWEKYQQPFIKKKDKDDKYQLIKEEHGMPLTTLDQFSTLYTNIPFGDLNLKEGASGSMAIDSSFNVIGILNTRVDNVIGDKKVIKFDKPYGKDGIIDGIVVRPQTNGIVLFKSLSDDYIGKEKQPFIIDGLKNKLINDKLETIKLNPNSK >NC_014760.1|WP_013456554.1|577889_578612_-|SDR-family-oxidoreductase MKKLIAITGANSGIGLASAKLFASKNYPMLLIDKNIDVLETIDFKNCLIKKIDVRDFNSLNQAIIEAQKEFGSVDLMLNNAGIMPLDKYYEQSLQDKYDIIDTNIKGVINGMDAVLPSMIKENSGTIINISSTAGRFTYDDHSVYNGSKFAVNAITQQARRELAHTNIRFSLIEPAIVNTNLLSTVKNQKIKDEYLQFQRSIDNGLKPETIAQTILYIYELPQDVTIKEILISHTNESEV >NC_014760.1|WP_013455952.1|577112_577565_-|SocA-family-protein MNKKYSYKDVSNWFLSKESMTPKKLQKLTYYAEAWANALLGEGILSDTAFQAWVHGPVSPELWHDYKEYGWNEIEQLKPNDEKFSKNILELLDAVWITYGDKSGYELEAISHSEEPWLKARNGLSEFEISTKVIDPADMKNFYKSIYSGD >NC_014760.1|WP_013456130.1|576720_577110_-|hypothetical-protein MNKKLTSELNLNKKTNLFHTNKEIVFKFAIVNKLDNGYDFKSLDLDGLKKFNNFVNDILEKKMTISQVEKTYMRKRFKPLVKRHIEEQDMDVREIHLGKDQQKFRLFGYFNENNYFVLTKIDSKHNFNE >NC_014760.1|WP_080551571.1|574922_576524_+|IS1634-like-element-ISMbov3-family-transposase MSIGVPRPDNKGFVYRLGYGYLHELKQYHDDPLTIIKAIIANFPLSWTKEQARTKLDEILKEKKETKKEVLERFKGYEVVEKLFDYLNIFNDCSPTKSTTLKDVVLQLIYQRIKNPISVFNTYMTAKKEKIDTYSKNSFYRSLDYIAKNKDEILRNLNAQICANTNRKIDVLWFDATTTYFETFSREGYKKPGYSKDGKFKEDQIVIGMATDENGIPLHYKIFPGNVTDSNTFIPFMLEIADIYEVNSVTIIADKGMSVNRNIRFLESKNWKYIISYRMKAGSKQFKEYVLDEKDYVNDGGLIYKTRDIASSYNKKRINEHFRRQIISFSQKRATKDKNDRDILIQNFTKKMNKDNLVSCDDLAGSKKYRFFKPINKGAFYELDIEKIQEDQKYDGYYVYETNRTDLSVKEVINLYSKQWQIESNFKTLKGKLSLRPMYLSTWNHIVGYICLCFISLVFLNYIIYILNSKLGLTGKSKITEHKVINVIKEVKEIEVFVNKQKIETIQVYNDELQESWQTYQILLELLTKEKVT >NC_014760.1|WP_041309256.1|591163_592204_-|zinc-dependent-alcohol-dehydrogenase MKAFVVKAPKEYSVELIDIPEPVDNEVLVKLETSGVCHTDLHIANFDWPRQPNYPMVPGHEGIGIVTKVGPNCTKIKVGDRVGVGYMYSACGQCEYCISGKEILCVSRVVTSLVKPGTFAEYTIGHEDYVLPIPKELDIVSGAPILCGGVTSYKALKQAELKVGDYVAIIGIGGLGHFAISYAKAMGLNIVAIDIDDKKLESAKYEGAHYIYNANDLSFVQEVKELTNGGVHAVINTSVSTSSASLAMYILRRAGRQVLVGVPPKDENGKIEFPLSILGTISGEQHVLGSVVGTRQDTKEALILGTKGIVSKIGRIISLDEVKDVFEQLAKGELIGRAVIDFRSYK >NC_014760.1|WP_013456567.1|592415_593000_-|variable-surface-lipoprotein MKKSKILILGSIASLGAIPFVAAKCGNENQNSIKEDKTDSQSKSEKSSGTVKKDSTSENSTIDKKENETAPKKQLESENSKSEKSDSVSNMNTEMPKVTESVANETDDGESISDILDDEAKKYFKKEIDAEYENIEKMINKVLKSDSDKKSEVLEYFKKLKTLLNSMFDNAKTFEDIDKIFDYLGKVVIVGKTK >NC_014760.1|WP_013456478.1|593316_594357_-|zinc-dependent-alcohol-dehydrogenase MKAFVVTEPKKWSVKEVDVPKPKYKEVLIEMETSGICHTDLHAANYDWLVEPKYPLIPGHEGIGKVVALGEGCTRLKIGDRVALAWLHDACGYCEFCLTGRETLCPNQNMSAYTKDGSYAEYAIGHEDYVGLVPEKLDIVTGAPVVCAGVTTYKSLKQTKAKAGNFVAVIGVGGLGQMAIQYAKAMGLRPIGVDLQDEKCELALKSGAEYAFNSAKDPKFIEKIIEVTGGGVHAVVNTSVHPSAAEQGMDMLRRGGRQVLVGLPAKDKHGKDDFKVSIFWSVLLERELAGSIVGTRQDLAEALEYAAEGKVKSEVTKVVKLEEVADIFEKLQKGEFLGRAVIDFRK >NC_014760.1|WP_013455921.1|594582_595314_+|DNA-processing-protein-DprA MNDLLIYFSILFKGNNFEIYKALKNGHKVDKYKVDETINELNEKGIKAITIFDSNYPQGLKELKYSPFVLFYKGNISLLDKNIVCATGDVVNEFVLQNVYQTCGELSKSSVLLTNNFKNIDQNIIEIFNKNKQGIIYLLANGISYNCPDVDFDKDLCITFIPPELHPKLRYFKERNVIAAALSNNLIIFSSKRNSGLINLANCFANLGKNVYCYPGLTYDDGNTYLIKSGASLITHLAEVNYF >NC_014760.1|WP_013456021.1|595300_596137_-|HAD-family-phosphatase MKRKIFSYDLDGTLLMRNNKVHPITKKAFHDVHLKGGINILNTGRGLLKVLPLLDEFDGIDYFICSNGALIYDVKNKNHIVVGQLEPEVFEQMFEYANQNDLIISLDTSNYTATYVNKDANGNFPEWINKQDIMDFSHIKFSDYETMSKVANDSKSIITQVALRNPNEIANETTKYFNNLYKDKYSVYLTNRIYTDVNPLGISKWNGLKEFMRIYNMQDCIIYAFGDSSNDVEMLQNAHFSFAMENATDDAKEAATEVIGHYNSGAIGIKLEEIIKSS >NC_014760.1|WP_041309141.1|596231_597584_+|YitT-family-protein MSSPVTNLKIIKRKKLLKKLHSENVNNLKLIELDKEDIDLRKYFGDDLMANLRMANYTYYTDSANKRKKNVRKRTAILYAKRIFFIFIAALIFNFGVIAFLNRGDTLPSGLSGFPMLAVLIAKDKGYRDWDKYFALMFILINLPLLIGFGFKVKKSFTILTTVFMVSQLITNAIFTSIPQVHNFIHNYINIAPGWHKLVEFRDKAGNIIGTYENSSSWPIIINGFLGSICAGTSIAIAWKNGGSTGGADIIAYYFSTKKQKSVAGMMFTVNIIATSFFLLVFGIAARHKEAVDLGVISSSSSVESVLEQPNSIIITLKDGFTINSIKKYVSHRTIFGLREFSTILYIIFNNIVLGLMYPKYKKVTLSIATKCPDTIINYFKHIKYWHAYTIFKGISGYSQEETYFIETTLLTLETKNLISDIKVIDPKAWISIKPVEQVKGAFNTQYVEQ >NC_014760.1|WP_013455962.1|597636_600615_-|AAA-family-ATPase MKLIKVEAHGFKSFAEPITLRFDGGVAGIVGPNGSGKSNINDAIKWVLGERSAKELRGDNMDDVIFAGSKTAKPMDKAVVTLTFDNKDGQSSINHEMITISRVLERGSGINQYYLNGEVCRQKDIKEIAMESGIGKSSLAIISQGTVSDIAEASAEERKGIFEEAAGVSKYKFRKKEALSKLTKTQEGLDQIGLVIAEIERKLNPLRKQAEKAKIFIAKTEELRTVEVGLLVDNIKKFGSRYEELSTELEGVQETKNDLNNRIKDLESKISQNIDFKSNLEASQREISMELDAVKDRLNNLSIAIARENERERLIVEGNIKVDKTEQINAYKTLIEKSMQRIAYFSREYDLISKRVADNNEILDKHDSELNLLNVKLNKKENDIFKIQTHLNLLKQQKEGNTLLYKGTKTILENKAIFGKGLKGTVADLIKVNKEYSRAIEAVLANALQHLVVEKSEVAVKAVEFLKQNNGGRATFIPLASIQPKSVRDDHLLAIQGQPGFIAVASEVVEVEPIYIILSQFLLGNVIVTETIHHANHISKILDNRYMIVTLDGDIIRAGGVIVGGAKSNTETLLTIDLKISELESLLPGIQIAINDDKAKQNEILNERRTCLELDSQLKNQLSNVVSQKSAEQKILDELNLKLKNISERELEIKSDSISIHSSEADLEVLSSRKSALEADFRAKHERINSLSQEINSAQVLKNDFESTLRKLLESFSEKLSEKEKSKLLLDQSRERLASQYKFTLESAEAQGYKLEMSYDQATEIVREIREEISKLGNVNLEALEQLVEEEERYNKFVKSEEELTQAKEVLESAIAQMDKIIITRLTNIIHDVNNEFNDVFATMFGGGSARLFFSDPKNILESGVEIEAMPPGKSIKNLKLFSGGEKSLIAISLLFGILKARPLPLCILDEVEAALDESNVVRYAEYLQKLKSKTQFLVITHRHGTMSRVDSLFGATMQNRGVTTFFSLELAEAKKLVDDIQEDYISARQTK >NC_014760.1|WP_013456004.1|600688_601363_-|ribonuclease-III MNSIENFLNQFNIKANSLLVYRQAFTHGSSAANAKNKNYQTLEFLGDAILQFYVSAILFNVFKDKNQGQLTLIRAKLVCTDSLNSIADRLKLKDFLLLSSNVVANEVLSSKKVGADIFESLVAAIFIDQGMPKVKEFLDKTLLPLVKQYKEGKIELKDSKTRLQEYMQSFSKKTVFYQTYQSDNNQFKSEAIYEGNVYGSGLGKSKHEAEENAANDALNKLIKS >NC_014760.1|WP_013456463.1|601355_602360_-|phosphate-acyltransferase-PlsX MYRIAFDVNGNDNGVSAAVSASVQFLKDNDDYEIILVGDESSINVELKKIEGIPDSLRIVNNPNLPSDVKNIHKSLRENTSMNTAIDLVVDGKADAVISSGDSGTYLACATFKLKRLQGVSRSAFMPLMPTVVGRKFLLLDVGANIECKSEYLVEWAKIANVYARTLLNIVNPRVSLINIGTEDYKGLEIVKEASQLLKDNKFINYIGYTEPRYLLDGATDVAVIDGYGGNLVLKSLEGAILSFKNLLKDKIMAKPIRKFGYLFLKGAFKDVAETLDYRNVGAAWLIGLNGLSIKCHGNSDTKAYLGALNQIKLVIKNNVLEAIKKELNDQPNE >NC_014760.1|WP_013456558.1|602366_604013_-|DAK2-domain-containing-protein MIKNAKVIDGTIYSNLIISGANNLINNKNRIDALNVFPVPDGDTGTNMSNTAEAAAKALKDLQENKNLAEVSAIVSKNMLLGARGNSGVILSQIFKGFANYFADKNEVTVLEFVQGFQSATKRAYESVLKPVEGTILTVIRETSEQLAKNVNDETTLEQFFEMAKNYSRVACDNTPNLLKVLREVGVVDSGGEGLVSFITGMHSYVIGNPVQIQQVEQSIDKFISSDEVYKGEFGYCTEFIIELSKPDEFDKTAFEKHISKFANSLVIVQDAELIKVHGHTLKPGDMLNYGQKYGEFIKIKSENMTLQAENSRSNRNNSVVINDVVAQGAKKCGIVSCNLGSGFINKMKELGVDAIIECGQTQNPSVTDILEAIKSVDAKDVFVLPNNPNIFLAAQQAASGIFDKNVHIVPTRTQIQGINAIIAFNSNSSSDENNELMKEVMKMVRTGEVTMAVRDTTLNGVKIKKDNFISILDGKIISCKSSYLEAAKHLIKKAANDETEIITIYYGNDASEPDAIELVDYINRYYDCEVELVNGNQPNYHFLIGFE |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
77413 : 88773
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_014760|77413:88773|DBSCAN-SWA TATGAAAATTTATATTGTTAAAAGTACTTCGCCATATGAAACATTGGCTTATGAGAATCTAATAATGGAAGATCCATCAATCACTGGCGATGTTTTAGTGCTTTATCAACATGCAAATGCAATAATCATTGGTAACAACCAAAATGCATATGAAGAAATCAACCGTGAATATGTTAGAGATCACAAAATTGTATTAGCAAGAAGAAAGTCAGGTGGTGGTGCTGTTTACCATGACTTAGGTAACCTAAACTTTAGTTTTATTTCAGATAAATCTGATGATAATAGCTATGTGAAGTTCCTTAGACCAATTATTAATTTCCTTAACTCATTAGGATTAGAATCTGAATTTCATGGCAGAAACGACATTCACGCCAATGGATGCAAAATAAGCGGTAATGCACAATATATTAGTGGCAAAAGAATAGTTTCACATGGAACATTACTTTTTGATGTTGATATGACAATATTATCTAAAGCGCTTAATCCAAACAAAATAAAATTTGAATCCAAAGGTATTAAATCAATTCGTTCTAGAGTTGCAAATATCAATGACCTATTGCCTAAAAAAATGACAGTTGATGAATTCAAAGATACTTTAGTTAAATACTTTGTTGAAAATGAAAACTGCACATTAGAAGAAATTCCATATGAAAAATATGCTGAAAGATTCGAAGAGCTAAGAAGTCTATTTAGCTCTGAAAAATGAATATACGATCGTTCAGCAAACTTTACATATTCAAAAACTGAAAAATTCCCAGGCGGACTTGTTACAGTTTATGGCACAATTGAAAACTCTATTATTAAAGACATAATTTTTGCTGGTGACTTTTTAAGTAAAAAAGATATTAGAGACGTTGAGCCTTTATTTAAAGGTATACGTTATGATGAAAAATCAGTTAGAGAAGTTTTAACAAAAATTGATATAGAAAACTACTTTGGTACTCTAACAGAGGATGAAATTGTCAAAATAATTTTAGGGTAAAAAGTGAATAGTACAGTTCTAATTAAAAACGAGAAAATTCATTACATCTACGAAGACACATCCAATGATATTCCAGTTCTTTTATTCGTTCATGGATTCAAAGATAGATCTAAAACAATTCAACCACTCATAAGCATAAAAAACAGAAATTATTCTATTTATGCATTAGATTTACCAGGTTGTGGTGAATCAAGCAGCAATTTAGGCGAATATTCGATTGAATTTTATGCTGAAGTGGTGAGAGAGTTCATAGCTAGAGTATTGCCAAATAAAAAAGTAATATTAATGGGACACTCAATGGGTGCTGCTGTGTCTTTAATGTGTTTTGACTTACTAAATGTTTTAGAGCTTATTTTAGTGGCACCATTTAATTACAATGCAAAACTTAATGCAGGTTTTAGTGATGGCAAAAAATGAATGCTACCCGAAAGCATTGAGGATGCAATCGAGTCATATAAAGCTTTAGTATACAATCCTAATCCATTCTACATAAAAGGCATACAAGCATTTGCAATGCAAGATGTACAAAACAGAGAAGCAACCAAAAAGATGTTTTCACACATTGTCGATAATCAATTTTTTAATACCTCTTACCTAGATAATGTTCTAAAACCACTATACCATAGTGCTAAAAAGCCATACACACTAATTTATGCTAAAAATGACCAATTTACTACTGAAGCAGAAATGCTTAAGCTAATTGATGATATACCAAGCATAACTCCATATGCTTTGGACGAATGCGGTCATGCTGTATTTTTCCAAAAAGCAAATAAAGTTAATGAAATAGTAACGAATATAGCAAGCACAATAAAACTCCAATAAGTCTATGAAAAAGCCAAATAAAGCAACGAATTAATTATGCTTTCTTGCTTTATTTTTTTACTATTATTTTTATAATATTTACTATGAATATAGATGCAATTTATAGTACCTTTTTTGTTAATGGATCAAACGTTATTTCGGCATGATTTGTGATAATATTTGGATTTTTAGGAATGTCAATGACTCTTATTTTAGGTCTTCCGCAAGCCATTCATCTATACAAGTGCAAGAAAACTGGAAATGTTAAGTATTATTCATACTGAATGTTTTTATTTGGAATACTTTCATGGATATTTTTAGGTGCTTTTGATCCGGTTCAAAAAATGTTTGCTATTGTAATATCTAATTGCATTTGCTCTTTAATTTATGTTATTACGTTGTGACTTACTTACAGATATTCAAGTGATCCTAAACGTAAAAGAAATCAATGAATCGTATTGTTTTCATCGCTTTTACTTTCAATTTTTGTAATTAGCTTGTCAATTTCAGCCTTAGTTTTAGAATGAAAACTACCCCAAATTGCACAAATGAGTATTGCTCAAATAGTGCCAATAATTACAACATTTGCATTCTTTCCTCAGGTTTTGAAGGCAATTGATTCTAAAGATTATTCAGGAATGTCAGCTTCAATGGTCTGAACATTCATCTTAGCTAATGTGTTTTGAACATTATATTGAGTGTTTTTTATAATTAATGCCGGAATTGCCCCACAATTAATAAGTGCACTAATATGGCAAGTTTTATCATTACTCCTATATTCACTTTTGTTAATAAAAATGATGCATCAAGCAAAGCTAAATAAAATAAACAATACCAATGAAAATGTAGCGGAGAACAAGTATGTATAAATCTAAACTGACTTTAAAAGAAACACAACAAGCTATTCAAGATCTTAAATTTGCCTTTACAAAAAAACTTAATCAAGAGTTAAAATTAACAAGAGTTTCTGCCCCTTTATTTGTTACTTCAAGCTCTAAAATTAATGATGGCTTAAATGGTGATATCCCAGTTATTTTCTCACCAAATAAATGAAAAGAAAATATCGAAATTGTGCACTCACTTGCTAAGTGAAAAAGATCTGCGCTATCAAGATACAAATTCTTACCTGGTGAAGGTTTATGGACAGATATGAATGCAATCCGCAAGGATGATGAAGTAGACTATAAGCATTCATTATATGTTGATCAATGAGACTGGGAATTAATTATTAACAAAGATGATCGAAACCTAGAATTTTTGAAGAGAATTGTCGAAACAATCTATAAATCAATCAGATATGTTGAAAACAAAATTAACTTTAAGTATCCTGTATTAGACCAAAAGTTGCCATCTGAAATAAAATTTATTAACTCCGAAGAGTTATACAGAGAGTTTCCAAATGTAAGTCCCGAGGAAAGGGAAAATATAGTTGCCAAAAAGTATAAAGCTGTTTTTATTTACAAAATAGGTCACACATTGCCTGATGGCTTGCCTCATTCAAAAAGAGCGTTTGACTATGATGATTGGGAATTAAATGGTGACATGGTTTTTTATGATAAAGTTAATGATGCAGCCTTAGAAATTTCATCAATGGGTATAAGGGTTGATAGTGATTCGCTAACTAAACAAGCTAAAATTTCTAGAAAAAAAGATAGTGATATGGGCGAGTACCATAAGTTAGTATTAAGTCAAAAATTACCTTACACAATCGGCGGCGGTATTGGGCAAAGCAGATTAAGTATGTTCTTATTAGAAAAGAAGCACATTGGCGAAGTTCAAGCAAGCGTTTGACCTGATGAGCATAGAGAATTTTTTGAGAAAGAAGGAGTTATTTTACTATAGGTGTATTTTCTAAAATATCTATAAAATAGTGTTTTTAGTAAATTAACTATCTAATAGTTAAATATTATTAGCAAAATTAAATAAATTAATTTATATATCGTATTAGTATTAATATAATATATGTATGAGTTCTGTAGGTTATAAAAGATTTCAAGCATTTTGCAAAGCTAATAACATAGAAATTAATAACGAGTTAGAAGGAACCGAACTGGTTCTTTTTAATCTTAATTATGATGAAAATTCAAATGATAAATTGAAGCTAGAATTCCGCTTTAAAAATTTTATTTCATATGATACAGTAAGAAAATTAAAATCCTTCATAAGATCTAACAGAGACAAATGAGATGTTTCATTTGTTTTTTCTAGCGATTCATATAGCAAAGAAAATATCTTATGTTTTGTTAATAAAATAATTGATAAAACACGTTTTATGCCTTTAAAACAGATTAATTGGGAAAATAAATTTGTTGTAAAAGACAATAATGCCTATTTTGAAAACATTGATAGGGATTTCGAGAATCAATATGGAATGCTGATTGATAAGTTACTAAACAAACTTAAAGAATATGGTTTTGCAACGCTTGATTTTTCATATAACTATGCAACAAACTTAACTTCTAATGATCAAAATTTATCATCAAATGCGGAAGAATCTGAAAAGATAAAAAGAGAACTTTTTAAAAAAATGATTGAATTAGACCAGTCATCTACATCATATGAAAGTAATAGTAACAGTCCACTAAGGATAAAGAGGAATCTTAACAAGAGTTATACAAGGTACTCTATCAAAGATTTAAATGATGCGCCAAGCAGAGTTAATGTAGAATTTGTTGGTATATTATTTGCTTCTAAAAAAACTTTTTCTAAAAACAAACGGTTAACTATCCAATTCAAAGTAAGTGACTTTGAGAGTGCTGTTAATTGTATGTGATTCTTAGACACTGACTGATTGAGTAATGAGCAAAAAAATCTAATTAACCCTGAAAATCAATCTTGAGTTAAGGTTAAAGGTTCAATTCCAAGTAGCGACAAGATTAAAGGAAACAACTTCTTTGTCTATGTTGATTCGCTTGAATTAACAGCTTGTCCACTAAATATAAATGAAGATAAAGCACCCGAAGATAGAAAAAGAGTTGAGTTCCATATTTCAACAAAAATGAACACAATGGATGGACTTTTTAATGCCGATGATTTTGTTGAAAGAGCCAAAAGATGAAAAATGCCAGCAATCGGCATTATGGACACCGATGGCGCACAGGGCTATCCCAAATTATTTAATAAAGCAAAAAAATCAGGAATTAAAGCCATATACGGAACTGCATTCACTACTATAAATAAGGCAAATGAGGCAATTTTAGGCGAAATTCCTGAG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_014760|77413:88773|85945_87169_+|WP_013456310.1|DBSCAN-SWA MNNLANELRPKTLDDIIGQKQVVDLLKKVAKDRIHSSFIFFGESGTGKTSSAVALANDLGLKYNYFNASVNSKAELTKMLSDNEVLIIDEIHRLNKDKQDILLSYLEFDKIIIYATTTENPYFRVNPALRSRMQILQFTKLSEDEMFEGVKLNLKKHFPNYEMDDSTIKVFVKLSNGDYRSCLNNLQMLVLMTKNKQISLDDIKKFVPNISFYSDENSSSHYNNLSAFHKSLRGSDVDASLYYGAIILKSGDLQGLFRRLIACSYEDVGFADPNLQLRVKNAIESAEMLGLPEAKLPIFYAIISVALAPKSNSMYIAMQNVENYIDAGNIYDVPKFLRDGHYASASKLGDSIGYKYPHDFPNHFVKQEYLPKEAKGKRFFLPMETDSKRITEYYKFIKQLKGEKDEL >NC_014760|77413:88773|87158_88124_+|WP_013456569.1|tRNA|DBSCAN-SWA MSSKINWDEIKTFEQYKQAKNLAFGPGSEIEELKSKIKSSNPEERKLIGIKISEIKSFYELKFKEIEEKLEKDKINKIIENEFIDVTKPLKQLGSLHPISIIEQRLRDWFTQNGYFEAVGGEITNEEYNFERLNIPNNHPARASHDSLYITNNILLRTHNTGITAYELEKNANKCANIFSIGKVYRNDEDDATHSHQFTQLDFVSVGQQVSFPNLIWTLKSLLSYVFEEELEIRLRPSYFPFTEPSVEVDIFYKNKWIEVLGAGMLHSNVMKKAGYDSKKFYGFAAGLGLERLTMIKYAISDIRYLYKNDLRTLLQFKNEK >NC_014760|77413:88773|78397_79219_+|WP_013456294.1|DBSCAN-SWA MNSTVLIKNEKIHYIYEDTSNDIPVLLFVHGFKDRSKTIQPLISIKNRNYSIYALDLPGCGESSSNLGEYSIEFYAEVVREFIARVLPNKKVILMGHSMGAAVSLMCFDLLNVLELILVAPFNYNAKLNAGFSDGKKWMLPESIEDAIESYKALVYNPNPFYIKGIQAFAMQDVQNREATKKMFSHIVDNQFFNTSYLDNVLKPLYHSAKKPYTLIYAKNDQFTTEAEMLKLIDDIPSITPYALDECGHAVFFQKANKVNEIVTNIASTIKLQ >NC_014760|77413:88773|77413_78394_+|WP_013456543.1|DBSCAN-SWA MKIYIVKSTSPYETLAYENLIMEDPSITGDVLVLYQHANAIIIGNNQNAYEEINREYVRDHKIVLARRKSGGGAVYHDLGNLNFSFISDKSDDNSYVKFLRPIINFLNSLGLESEFHGRNDIHANGCKISGNAQYISGKRIVSHGTLLFDVDMTILSKALNPNKIKFESKGIKSIRSRVANINDLLPKKMTVDEFKDTLVKYFVENENCTLEEIPYEKYAERFEELRSLFSSEKWIYDRSANFTYSKTEKFPGGLVTVYGTIENSIIKDIIFAGDFLSKKDIRDVEPLFKGIRYDEKSVREVLTKIDIENYFGTLTEDEIVKIILG >NC_014760|77413:88773|81164_85541_+|WP_013456297.1|DBSCAN-SWA MSSVGYKRFQAFCKANNIEINNELEGTELVLFNLNYDENSNDKLKLEFRFKNFISYDTVRKLKSFIRSNRDKWDVSFVFSSDSYSKENILCFVNKIIDKTRFMPLKQINWENKFVVKDNNAYFENIDRDFENQYGMLIDKLLNKLKEYGFATLDFSYNYATNLTSNDQNLSSNAEESEKIKRELFKKMIELDQSSTSYESNSNSPLRIKRNLNKSYTRYSIKDLNDAPSRVNVEFVGILFASKKTFSKNKRLTIQFKVSDFESAVNCMWFLDTDWLSNEQKNLINPENQSWVKVKGSIPSSDKIKGNNFFVYVDSLELTACPLNINEDKAPEDRKRVEFHISTKMNTMDGLFNADDFVERAKRWKMPAIGIMDTDGAQGYPKLFNKAKKSGIKAIYGTAFTTINKANEAILGEIPEGSFKDYSYVSFDIETTGLSPKFHEIIEFGAVDINQDLKVGKTTQFFIKPKDKIGSFTTELTGITQQMLDSKGLYIKEGLEKIYDCLDGKIAIAHNAKFDFNFLKEQFRLNNMQFPRVTVIDTLVASRIGFPGYKRHKLEDVASRLGVVYDPNVAHRGDYDAKVLANVWVNIISELNAKGIFTFDDLSKYSSNELYAKMHGYEVSTIALNNQGLKKQFELITDCLTKKYINGPITFKEDFASLNRTDILVGSGTLKGLLIDKYFYSSHDDFINELKLYDFIEIPAPQCFEHWIRYGFITTKQLQKGLSEIIYEAKKHSKIFIATADVKYLDPWDQEIFKSLVYAKGIKNARHYLFDYKKAEEGRLVIPNQRFLTTEEMLKQFAFLQDNQLIEELVIDNTQLIANMAENIEVIKSGLFTPEFDDSKKKLYDLVYKNAYAKYGEKLPEIIQKRIDSELNPIIKYGFDVIYWISYKLVKLSIDQGFIVGSRGSIGSSFVASLIGISEVNPLIPHYCCPNCKYFEVANAPGVTSGYDLPDKPCPECNTLIKGDGQSIPFETFLGFNADKVPDIDLNFTGEFQGVVHEEIRRLFGKSHTFRAGTISKVAEKTAFGYVKSYAEQTRQTIPQIFVEFLANRIKDVKRTTGQHPGGIIIIPKQFDIFDFTPINYPANDQSSSWLTTHFDYKAIHDNVLKFDILGHDNPTSIKLLEQYTGINIYDVPKNDQNVIKLFSSTEPMGISPEQISNEKTGAIGLPEFGTSFVRQMLNDIKPKTVADLISISGLSHGTNVWINNADELVLEKGRKLNEVVCCRDDIMPMLIAKGIEPLMSFTLMEKVRKGKGLSNDEVELLEKHNVPNWLIKSMQKIEYLFPKAHATAYVTMALWIAWFKLYEPLAFYASYFTAHSKADDIKNMIDKPNGIKVSKRLYELKKTEDRSNKENDLIGVFEVAEELYARGFYISNVDIDKSQAEKWLIDKEKGCLIPPFSTIESLGTVKANDIVNAREEKPFLSKEDFKTRTGVSKTVFDTMNQMKILDSLNDSDQLTLF >NC_014760|77413:88773|80059_81040_+|WP_013456612.1|DBSCAN-SWA MYKSKLTLKETQQAIQDLKFAFTKKLNQELKLTRVSAPLFVTSSSKINDGLNGDIPVIFSPNKWKENIEIVHSLAKWKRSALSRYKFLPGEGLWTDMNAIRKDDEVDYKHSLYVDQWDWELIINKDDRNLEFLKRIVETIYKSIRYVENKINFKYPVLDQKLPSEIKFINSEELYREFPNVSPEERENIVAKKYKAVFIYKIGHTLPDGLPHSKRAFDYDDWELNGDMVFYDKVNDAALEISSMGIRVDSDSLTKQAKISRKKDSDMGEYHKLVLSQKLPYTIGGGIGQSRLSMFLLEKKHIGEVQASVWPDEHREFFEKEGVILL >NC_014760|77413:88773|88113_88773_+|WP_013456493.1|DBSCAN-SWA MKNKFDEFIENESKKEYFIDLFALIENESKSNNIFPSKDKIFECLKYSNPEELKLIIIGQDPYYKKGYADGLAFSTENKHCPKSLENIITELKKDYPSALVETFSLKSWAKNHILLLNSVLTVSEDKPNSHSGFGWEIFISNLLDFILELNCNVIFGIWGKKAYSLIKDKVDDKRIIYTSHPSPLSYSKTNHSFKDSNFFKKVNAKLTNPIDFSIRKEN >NC_014760|77413:88773|79302_80067_+|WP_041309069.1|DBSCAN-SWA MNIDAIYSTFFVNGSNVISAWFVIIFGFLGMSMTLILGLPQAIHLYKCKKTGNVKYYSYWMFLFGILSWIFLGAFDPVQKMFAIVISNCICSLIYVITLWLTYRYSSDPKRKRNQWIVLFSSLLLSIFVISLSISALVLEWKLPQIAQMSIAQIVPIITTFAFFPQVLKAIDSKDYSGMSASMVWTFILANVFWTLYWVFFIINAGIAPQLISALIWQVLSLLLYSLLLIKMMHQAKLNKINNTNENVAENKYV |
8 | Bodo_saltans_virus(28.57%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
138791 : 231492
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_014760|138791:231492|DBSCAN-SWA 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54 | Mycoplasma_phage(26.67%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
635745 : 718739
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_014760|635745:718739|DBSCAN-SWA 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56 | Orpheovirus(15.38%) | transposase,tRNA,integrase | attL 662705:662764|attR 727676:727853 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
726299 : 803981
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_014760|726299:803981|DBSCAN-SWA 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60 | Tupanvirus(15.38%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
888845 : 949161
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_014760|888845:949161|DBSCAN-SWA 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53 | Faecalibacterium_phage(21.43%) | transposase,tRNA,integrase | attL 895037:895053|attR 952164:952180 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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