Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_017304 | Hungateiclostridium thermocellum DSM 1313, complete sequence | 5 crisprs | WYL,cas8b1,cas6,csx1,cas10,csm3gr7,csx10gr5,csx19,cas2,cas4,cas3,csa3,DEDDh,DinG,csm2gr11,cas1,cas5,cas7 | 0 | 8 | 5 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_017304_1 | 879396-879663 | TypeIII |
?
Consensus repeat of NC_017304_1
|
3 spacers
spacers of NC_017304_1
>1.1|879436|38|NC_017304|PILER-CR CCAAAATCAGGCCGTGCATGGGTGAACCAGGAAGCAAA >1.2|879514|35|NC_017304|PILER-CR CATAACAGAATTCGCCTCCCAATTTATCATTATAG >1.3|879433|38|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT CCAAAATCAGGCCGTGCATGGGTGAACCAGGAAGCAAA >1.4|879508|38|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT ATACATAACAGAATTCGCCTCCCAATTTATCATTATAG >1.5|879583|44|NC_017304|CRT ATATGAGACTCTATTTCAAGCCTTACAGAATCAGAACTTCCACC |
csx1,csm3gr7,csx19,csx10gr5,cas10,cas2,cas4 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017304_1
The CRISPR arrays of NC_017304_1 >merge|NC_017304|1|879396-879663|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACCCAAAATCAGGCCGTGCATGGGTGAACCAGGAAGCAAAGTTGAAGAGGTACTTTCAGTAAAACAAGGATTGAAACATACATAACAGAATTCGCCTCCCAATTTATCATTATAGGTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTAAAACATATGAGACTCTATTTCAAGCCTTACAGAATCAGAACTTCCACCAATCCATTTTCTGTGCCGTTAAAACAAACCTTGTAAG >NC_017304|1|1|879396-879585|PILER-CR GTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACCCA AAATCAGGCCGTGCATGGGTGAACCAGGAAGCAAAGTT GAAGAGGTACTTTCAGTAAAACAAGGATTGAAACATACAT AACAGAATTCGCCTCCCAATTTATCATTATAGGTT GAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTAAAACATA >NC_017304|1|1|879396-879582|CRISPRCasFinder GTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAAC CCAAAATCAGGCCGTGCATGGGTGAACCAGGAAGCAAA GTTGAAGAGGTACTTTCAGTAAAACAAGGATTGAAAC ATACATAACAGAATTCGCCTCCCAATTTATCATTATAG GTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTAAAAC >NC_017304|1|1|879396-879663|CRT GTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAAC CCAAAATCAGGCCGTGCATGGGTGAACCAGGAAGCAAA GTTGAAGAGGTACTTTCAGTAAAACAAGGATTGAAAC ATACATAACAGAATTCGCCTCCCAATTTATCATTATAG GTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTAAAAC ATATGAGACTCTATTTCAAGCCTTACAGAATCAGAACTTCCACC AATCCATTTTCTGTGCCGTTAAAACAAACCTTGTAAG
>NC_017304.1|WP_003516061.1|877636_879103_+|TIGR02710-family-CRISPR-associated-protein MELYKDLMKKTIFWREMDRSSEKLRIASEEYYKKELMPLIIEYFIQENAKKISGSCDAMVLTLGTSYEPLVLSISVLKPEKVLILYTDKSHHLLDDVIEFTKLKPSQYVATDVDAENPLQLYRKIKDVYEKWGRPRNIYVDFTGGTKSMAAGCAMAGSAIGAKLIYIAGNFLTDLRKPEPGSEKLCYIDDPYTVFGDLEREQAISLFNKMDYVSAYRIFEELEQRVPGTKEYSALKYISKAYNAWDSLDISGAADNLSKCYEIVVTEGKIDKSFVLNSHIEKLEKQLGVIRVLEKIHCSEEAAKNKSVIFDNIGYLIANLYQNAMRREKQEKYEMASLLLYRILEIVEQKRLWNYGVDTSDADFTKLCEDEKVLLEKANKIIRSVKGFNEWKQLDKKISLLAGYILLAAVGDDIIKTKKPGKEIDSINRLRNKVEARNNSIFAHGYEFISKEKYNEFKKVVEDYMNLLCSIEGIDKEELFDSCEFIKL >NC_017304.1|WP_003521380.1|877413_877593_+|hypothetical-protein MNDSKERRKKSANTLNKNTKGENRREIGSKKPGSLLSIEHDRKDIAEKLEELKKKITRS >NC_017304.1|WP_003516071.1|875335_877414_+|TIGR03986-family-CRISPR-associated-RAMP-protein MNSYSKAPFNFVRLPERPVIRYSSIDELPGHDNYRGKNGEELLSGYIEYTLTAETPTPIIVSGGIEEMDGYRHARFFENVEGKKAIPGNTIRGMVRSNLQILSFSNILGGVNEKGKYLNSDIQDSRFLFRDVAGNNSLSRKYANIMGIVPGKRIAENVHAGYIMKEGKFYKYIPAKKINNMPYIRIDEIELRKIADPDLEIKYMYTRKLLEYEEKIHELNKIIAEAEDKGKDKEQEDLVKKAKNELNGILNDCKNNGYEPYCADISFEIDNQNNKIIKVGKRGKYTYSGVILSGGWILGKRSHYIVGEEDSSIAAIKIDDSIIDDYKKDLILTKKEKKTVKSSRDREIQVEKRKDKSEKNDSNEGFYALPERGKKKPFFYINHAGIFHFGFTPYMRLFYRNSVFDYIPETYKAVEGISYSEALFGFIGRFHGGKNVHYKSRLSFEDAVIIGDAQEYSENGIGLVLAAPKPTCYHIYLEQKKNADKKKLNTYEDDSNEENNFKIRGIKQYWLKDRIIVPKEEVKKENVVVYLHPLKERTKFKGRIYFNNLYADELGLLLWSLRLEDNCYQTIGMAKPFGFGRVKVGDIKLHVEDLNKKYSEFCFDYEKTEDIDKYISLYKEDFSKKYLNGNSIENSKPVEELITIKSQILPIKYCEYMGFNEYRKKGYFPKIIEWIEITKNEGNDNYKNIKKT >NC_017304.1|WP_003516073.1|874863_875331_+|hypothetical-protein MMQTEYLLKELSKENIENLLGVEIDCSLRDLISNPELLKKIGLEFAIVYNYDSVLSDRIENLKIDCDSIIEGRFFNEVAEIRVFLDGENLNGNIFVENEKCEKKIEMEFLLYPRNGEKEKTGYAEKLKVKKYISYDEDGQAFISYVKPCKLIFKE >NC_017304.1|WP_003516075.1|873484_874867_+|hypothetical-protein MRWVTILQAEIKSKSPLFIGDGSDLFLIDDETGKAYLPATSVAGAFRAYLKSIGERYQDLFGEQSDEGKVKMSKVFISDAFADVKGIDRRIEIKIDSEKGSSMDGSKRDVCYLSPGLKFELVFEIYNDEENDELVKMLYKCLSALDKGYIRLGGNKSNGLGVFEVVKAGKVTFDLTNRNEWMKFLNGEYSVYNAESDEFLKEIKNLKIEGYVEFKIDGKFTTPVLVKSPESAENDADYKNVKSGDKFVIPGSSFKGILRSRMERIANYFGIKNEIEELFGNVSPGSYQEDTNDEVNGEGIENAEDENKKDKYSLSRIFVGEAAIDEIKQEGDRSFKKYNKIHIDKFTGGVMNTALMGEIPVQGNTSFNVLYKKLGNSEKDNLAVGLITFALRDLGTENLAVGSGNSTGRGRFKASKMVISDSDTVIEIDFDNKSISPNKDILNRYIEAVRSYAGKGEISQ >NC_017304.1|WP_003516077.1|871883_873485_+|hypothetical-protein MFKYIEYDIETLQNVKLARTDSKEDSEESIDYISGSAIRGAFIYKYIKKYGVDISQGIHKKKIFSGDITFLNAYPKHDDKRSMPFPKCYFAPKDEMKKFKKSNSTLEIKLRPDIGYERVRLCNFAVANDDLNNYKGIKVEKESNLHINKNKTDSKTKMFRYESIKRGQVFRGIIRVKEEYIDEVRELLNDSIIYIGGSKGNGYGQCKIKNMSEAKEKNPEYELYEKKNSFDKKLYLIAISDIIYRNKLGEYKTFIDEDFLEEKLGLEKVSFVNSNIEIHTISGFNNKWNCRIPQVVGIKAGSVFEYDITGKVDNHKLIEFMNEGIGERKVEGYGRFVIVDSISDAKFEMAEKEEKEDKLSLLRKKRDLEGKLSDSEKKQIQNLLNSIYRKRITDQLSKEVESVTSDLKDGDRLNNSQWGKLMNLFKELKYMQPEEGIGKFEKYKERVMNKTGSYGQNKTAYEQLKYVKIKEDNILDYFTEIVKNSISITWLEEDDLIDSFEEFDVGMDENFAYRVNMEFLSELCRYQLRKEEE >NC_017304.1|WP_003516078.1|871225_871891_+|hypothetical-protein MSGLYRIEMELLSEAIFGSGYSIPGSVDLEIVCDEYGIPFMKAKTFKGNLREVMEDAAKLLGKGYEEKVEQLLGKENSGVDSWKNLKFSDCRLQENVREYIRLAIETNKITAAEVKEAMTSIRSFTSIDDNGSSKKGSLREYRVIKKGLVFEVDVECERELSEEELALLAVSVKSLRYIGMMRTRGKGRVSCRLLVKENEKYKDVTDFYVNKLLEGARANV >NC_017304.1|WP_003516080.1|869719_871225_+|hypothetical-protein MAEALVLWEVSRKQDYIFTSNKLKENIGASIIIDKITSELPTKIDERYQENKVYSGGGSSLYRFKSREEAKSFIESLSEKILREYPGVEVFMVVEEYDDEVTNAIDRAHKKLAQKKNQRKNSGQQLSFGIERICSSTGLPAVKKYPEPDGRVRYISYETEVKIKNDTRYERFQKLIPKGYEFPSMFSELIKGEKSYIAVVHTDGNRMGRLQDELKACYAHLNGDITQKNEEYLLNLRRFSDDITKAYEESFIAMTDTIDKNKKEIFDCTNIKEKVFPVIPVIVAGDDITYVTNGKIGIETARIFLEHLSKKQIRLYGDKFVNLNACAGVAIARVTNPFAKTYQLAEDLCRNAKAKLLEECQDEDYSLIDWHIEQGEFIGSITEIREKYYISEDGKNLTMRPLYINNEGNFRSYKNFKTARNYIKRIKINKKSVSRSKLKELIGVLKKGETETKLFLKFNKIENYFPRLEGTSGDYCFSSDGTCLYYDAIEVMDLFIDLEGC >NC_017304.1|WP_003521384.1|868710_869700_+|hypothetical-protein MYNRVDYIVSLVGKNPMPSFITIFNYIEDNPKVFLIHTEKSEENIGTKKVAQNIKEVLIKKNSKLTIELEKCDKSNPGEINKVVKSIVEAIKKDVSERKKDEDEVILLLDYSSGTKAMSAIFYEQIVNFEDDIICTVVSYIDDKIIKLYSKIKNLNNVKIGDVFSGKNISIGDIVKLHGYKISSDFNRIGKDIDYIEEIHSNEIVFEKDNENSNKKGNKKSNNNQKFKVNGVAFLPSKGSLVLCFDSKESNYKKQKLELFEKKYYANKLGGDKSLFLFRGSFKNEEGKDYKDDLINEIVRLYDYDMRNRCYLIDSEESFEEYIKKYFKS >NC_017304.1|WP_003521386.1|867734_868721_+|hypothetical-protein MLDEILRTTQGDILIELNYTCGKKIMSSVVYDVIKNKKFKNTGRNIEINLTYIDAERELMYVEQLDKRKVSSIKLCDLEESFELSVIDIIETYNTEICEFIEAPKYEKLSNKIGGVFESISNKEKGRKDYDDLMKARKRITKEKKNEKIFMDELNATLKDFKLSEEDINSAGFKNEKEIKEYFEGSKWFEEYILNKLLPLKEEKIIDGLVANIKRKQVLNEREFEVDIVLYKRYKMYALSLSATNSLNTATEKLYEIFQRSTDLAGDETEKGLITLLWDGELKELKAKCMNLWDDDLPSGVFISGVKDLPCLKDKVKNWICGGGINVQ >NC_017304.1|WP_003516055.1|880662_880953_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MLTWVIYDIASNKTRNNIIKKCKNAGLYRVQKSVFLGDIESNKFDELKLELDSIIDKDNDSVYVFTMTKAELNKAGLLGQAFDKELVTDEIISKFF >NC_017304.1|WP_003516053.1|880927_881557_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MKSSQSFFNENQYYITPSDMIEFLYCKRYIYYMKCLGIDQNVEKRFKVMIGREIHERRGEQNKNYLPKKIGSIHKMIGVNLVSEKYGIKGNADEVHTLADGTMAPLDYKFARYDERLFKTYKNQLVMYAIMIEETFGRKVNKGFLVYCREGNRLVEVCVTEEDKDKLCRCIEEYKMVLDGYYPEATKQKSKCLDCCYKNICIKWLSCTS >NC_017304.1|WP_003512622.1|881639_882863_+|IS256-like-element-ISCth4-family-transposase MARKRIITPEKKELIRNLISEYNITSAKDLQEALKDLLGDTIQNMLEAELDEHLGYEKYESTEEAKSNYRNGYTSKTLKSSVGQVEIDIPRDRNAEFEPKIVPRYKRDISEIENKIIAMYARGMSTREINEQIQEIYGFEVSAEMVSKITDKILPEIEEWQKRPLGEVYPIVFIDAIHFSVKNDGIVGKKAVYIVLAIDIEGQKDVIGIYVGENESSKFWLSVLNDLKNRGVKDILILCADALSGIKDAINAAFPNTEYQRCIVHQIRNTLKYVSDKDRKEFARDLKRIYTAPNEKAGYDQMLEVSEKWEKKYPAAMKSWKSNWDVICPFFKYSEELRKIMYTTNTIESLNSSYRRINKSRTVFPGDQSLLKSIYLATVKITSKWTMRYKNWGLILGQLQIMFEGRI >NC_017304.1|WP_014522598.1|883053_883302_-|hypothetical-protein MWKVVQENYGSVLGCKTIEASLVYDNKMYYRLYTAYDADSKNLKPKVFKPGMLVNVIKQEQYNFTFRYYYGCQLIGSVNIFV >NC_017304.1|WP_003519516.1|883412_883553_-|hypothetical-protein MNKVNEAIECYKPGIKNNPKELSFYMSLSDLLLYAGNVSEAMECLN >NC_017304.1|WP_003520010.1|884378_885026_+|hypothetical-protein MKRKIFLLFMSLIMLLNVGIGNVYADETGKNALNFRKIYKEHRTYSSAVGISANSLGDIAIGFNDDYINVYDKQGSFKYSFAFEVNGNYFFEFDNENNIVIFSVTDGMRYYFNNDAELIKTEKISDPEELKNYYKNRPDKENVNIDGVNYSLKQVLGYIKFAKTDADGNESVIYETGLQYAVKAFVALTVLAFLAIVICGFIKTISTEMKKYTEV >NC_017304.1|WP_003519514.1|885162_885960_+|hypothetical-protein MPSLDWNSDRYKNIGKDETCNEDIVKTSLTNTDFLKIVDDGKVYYGGNQNWFQKYTQSFGGCGPTAAANILAYMAMTDPKFAKLYEYDLKNITKADFVKFMEEVYKYVTPLEVPVFSHMSDKKGKQAGIPSLGITGLAAFAKGVEKFAKSRGIKLKAKWSGEKPTFDNAVSYIREGLRKNRPVALLNMFNPVSMQWADPQTSKIKSMTYERHWVTITGMIENRKTGEVTLEVSTWGGKATLSFNELYNNMDWNEMIFPAGIIYFE >NC_017304.1|WP_003519513.1|886001_886499_+|hypothetical-protein MKNGKKVAWMLVSVCFLSMIALVIIYVNISPPVEGWKDFKKNCISNYSFVDDVNLDRITPVDFRISYTLNRKITQEEVDSVFSWTTKYIQSEKVFSDLKKYHAKRYRYSFARLAIVFTYRDNNEHFECNIFSSPVSNGEPNYADYKTWYIEYNGKSSEVYNPMLK >NC_017304.1|WP_003519512.1|887008_887869_+|hypothetical-protein MNKRLILFIISMLCFTTLTGCGIDRRELVGDIIIGNGYTGIADYLIKYNPAAKEFESVVPGFYYEVEYNEDKSKILCYKSLRYSEILNSEICEYDIKSNEFSEAIFNWSEYPDEFEGNVKYVPNSDSISFILGDALHIYDRSSGTLTKLFKVAFDWYSWDNTGKKLLYGDYDENIYMYDMESKEEKKILEGRHPVYSNSNEYIAYMGKDQKLTVYNVNTGENWKTVTIGSSTRYIFSPDDKYILLGTEYWDIVSIPHYIIYALDYKTGKKKRLFGGEGNVPSLDWK >NC_017304.1|WP_011838186.1|888112_889264_-|IS3-like-element-IS120-family-transposase MEKRKHFTPEQKAKIVIEVIKGERTLNEIAAEYGIHPNLLSRWKTEFISNAGRVFSKETDEVEKVKQSYEKEKDELLKQIGQLSYEVAWLKKNLASSKSREDRMKMIDRNEKKLSITRQAELLSLNRTSVYYKPAPVNEEEYLIKRIIDEIYASYPEYGYRRMTSILNKDYHIHINRKRTRRYMREMGIHGFCPGPNLSKRIHGKNLYPYLLRNLKIDHPNQVWSIDVTYCRMKRGFMYMVAIIDWYSRYIVGFELSNTLDKTFVIEAIQKAIKRYGKPEIMNSDQGSQFTSDDYINLLKNNGIKISMDGKGRALDNQRIERFFRSYKWEKLYLEECETVQQLRQITKEYVEHYNHRRPHQSLDYKTPAEYYFGGYDQLLAVV |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_017304_2 | 976887-982276 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_017304_2
|
80 spacers
spacers of NC_017304_2
>2.1|976917|37|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT AAAACTTACCCGAAAGGGAAACAGCATCGGAATTCAC >2.2|976984|37|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACACCTGAGAAACTCGTGATTGTTCACAAGTACTCAC >2.3|977051|41|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAGTTAAGTTACGCTCATCAGCTATTGCTTTTACTTTGTCA >2.4|977122|37|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCTGTTATCTTTGCCACATAATCTCTCCTTTATAAAT >2.5|977189|36|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCGCAGCAGGGATAGAACTGACAGCAGACTACTGCG >2.6|977255|43|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAAAAACTCAGGAATGATTTGTATTTCACCGTCTACAGTACGA >2.7|977328|36|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCAGCTCATAAAGGATAGGTAAAAAGCTGTCGTCTG >2.8|977394|39|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTGAAACAGTGAAAAAGATGGGATATACCTTTGTATGT >2.9|977463|37|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACGGAGGATGGGGAACTATTAGCACTACTATTGGATT >2.10|977530|38|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAGTTTGTAGTATCTGATAGGTTCAAGGATGAAAACGG >2.11|977598|36|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAGTATTAGAGAAAACGGGACAGAAGTAACTACAGC >2.12|977664|37|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAAACTGCACGAATAACTTGGATGAATATGTTTTGGG >2.13|977731|35|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATGGCTCGGAGCAGTTCGCATGCTTAGTTGACAA >2.14|977796|36|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TACCTGAAGACGTGCTTATTAAGGTTGATGGAAATG >2.15|977862|35|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAAGAGCCCAAGGAAGAAAAGCCTGCGGACAAGCT >2.16|977927|36|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGCTCCAAGCTACTTGTAGGGGGTGTATATATGGC >2.17|977993|38|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CGTCCACTTCTAGCCGCCTTTCGGAGTGTTGACGTCCC >2.18|978061|36|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAATAAGCGACCTCAAGGCAGCTGGACTGTTAGAT >2.19|978127|38|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACCAAATGTTTCATAAGGTATTGCAAAAATGAAATCTT >2.20|978195|36|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTGTTGAAATTGGCTCAGGCAGCGACAAATTTATTT >2.21|978261|35|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAAGCCTGATAGTCTTAACAGTGTACTTGATCGCA 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CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017304_2
The CRISPR arrays of NC_017304_2 >merge|NC_017304|2|976887-982276|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR 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>NC_017304.1|WP_003518280.1|976308_976641_-|hypothetical-protein MLNEVDYLDDILAKFVDVGVSGATILHSQGMASAIVNSENNKISLFSALKSIIENIRPYNKTIFTVLESEELVEKAVSAVQSVIGKAPTSGVGFMFTVPIGKIYPMGLQE >NC_017304.1|WP_003518283.1|975796_976276_+|transcriptional-regulator-MntR MENSEFHTVRGYQLIEQEKKLLTSAMEDYLEMIFRNIKKEGYMRINTLAEMLNVRPSSATKMVQKLSEKGFVEYKRYGIITLTEKGKALGEFLLKRHNIIEKFLRSIGISDNLLIETELIEHNLSVDTLRSIDELNSFFEEYPEILEKFRRYKNKKAKK >NC_017304.1|WP_003518285.1|975397_975637_-|ferrous-iron-transport-protein-A MAGKQITLASLPIGKKARVKSLTLDGTIRRRIMDLGLVSDTIVEALQKSPSGDPTAYHIRGAVIALRSEEASKIMVEVN >NC_017304.1|WP_003520743.1|973164_975315_-|ferrous-iron-transport-protein-B 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MIKLLIRWFIKDYQNVDNKKVREAYGVLSGVTGIICNVFLFIVKITVGLVMNSIAVISDAFNNLSDLGSSLVGILGVKLSNRPPDEEHPHGHGRYEYISSLVVSFIIFGVGLELLRNSFWKIIKPEEVTLSTMSILLLVISVAVKLWMFSYNRYIGKIINSGINKATAQDSLNDAIATTAVLAGTLIGRFVSFPLDGIMGLIISALIMYTGFGIAKDSVDLLLGLCPNSELIESINSYFLVGEKIKGTHDLKVHDYGPGRISASIHAEVPEGADIVEIHSIIDEIEQRIKNELGIDIVVHMDPVEEKKEDCCNDDK >NC_017304.1|WP_003518303.1|965343_966114_+|tryptophan-synthase-subunit-alpha MNKLERAFSNGKAFIPFITAGDPSLEITEQLVYRMAEAGADLIELGIPFSDPVAEGPVIQEADYRALSAGTTTDKIFDMVGRIRKSCDIPIAFMTYANPIFTYGSEKFLKRCGETGIDALIVPDIPFEEKEELAPFCKEYDVRFISMIAPTSKERIRMIAREAEGFIYCVSSMGVTGVREKIGDDAKEMIKIVKEVRDIPCAVGFGISTPEQAAQMAGFSDGVIVGSAIVKIIAQYGAECIPYVEEYVRKMKNAIK >NC_017304.1|WP_003518272.1|982665_983913_+|glycosyl-hydrolase-53-family-protein 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MVKKFTSKIKAAVFAAVVAATAIFGPAISSQAVTSVPYKWDNVVIGGGGGFMPGIVFNETEKDLIYARADIGGAYRWDPSTETWIPLLDHFQMDEYSYYGVESIATDPVDPNRVYIAAGMYTNDWLPNMGAILRSTDRGETWEKTILPFKMGGNMPGRSMGERLAIDPNDNRILYLGTRCGNGLWRSTDYGVTWSKVESFPNPGTYIYDPNFDYTKDIIGVVWVVFDKSSSTPGNPTKTIYVGVADKNESIYRSTDGGVTWKAVPGQPKGLLPHHGVLASNGMLYITYGDTCGPYDGNGKGQVWKFNTRTGEWIDITPIPYSSSDNRFCFAGLAVDRQNPDIIMVTSMNAWWPDEYIFRSTDGGATWKNIWEWGMYPERILHYEIDISAAPWLDWGTEKQLPEINPKLGWMIGDIEIDPFNSDRMMYVTGATIYGCDNLTDWDRGGKVKIEVKATGIEECAVLDLVSPPEGAPLVSAVGDLVGFVHDDLKVGPKKMHVPSYSSGTGIDYAELVPNFMALVAKADLYDVKKISFSYDGGRNWFQPPNEAPNSVGGGSVAVAADAKSVIWTPENASPAVTTDNGNSWKVCTNLGMGAVVASDRVNGKKFYAFYNGKFYISTDGGLTFTDTKAPQLPKSVNKIKAVPGKEGHVWLAAREGGLWRSTDGGYTFEKLSNVDTAHVVGFGKAAPGQDYMAIYITGKIDNVLGFFRSDDAGKTWVRINDDEHGYGAVDTAITGDPRVYGRVYIATNGRGIVYGEPASDEPVPTPPQVDKGLVGDLNGDNRINSTDLTLMKRYILKSIEDLPVEDDLWAADINGDGKINSTDYTYLKKYLLQAIPELPKK >NC_017304.1|WP_003518265.1|987582_988401_+|glycosyltransferase-family-8-protein MKSILVTLDSNYLKPLKVMLKSLFINNPNEEFDIYLMHSSIKEEELEDLDRFIEAEGGRLKIVQINDSYFEDAPTLLHYTKAMYYRLLAFKFLPEELDRILYLDPDILVINPIDELYNMDIDNYLYAAAYHNIITIKRINRIRLNAYDIKEYYNSGVLLMNLKLQRETISEEEIFDFVKNNRSKLIMPDQDIINSLYSKKIKSIDEKLYNYDARYYSYYKITSNGKCDMDYVINNTVFIHFCGKKKPWKKSYSGKFHSLYKHYEKLAMNTKY >NC_017304.1|WP_003518263.1|988440_989985_+|cardiolipin-synthase MWSRIKSIVKFLYHRVVLISLAILIQLIALVSVVLKFNDYFVFFYWACLIISMIAVFLILNGKSNPSYKIAWIIPILLFPIFGGLFYIFFGGKKLSRRERRKLKSIGMKVENALVLQPEVLSEIMLHDDGAAVQSRYIQNVAHYPPHKNSTAEYLSIGEKKYEKLKEELKKAKHFIFMEYFIIQEGIMWNSILEILVEKAKNGVDVRLIYDDMGCLLFLPRNYNKKLESMGIKCCVFNPVSPILSAKINNRDHRKIAIIDGHTAFTGGINLADEYINEIKKHGHWKDTAIMIKGEAVWNMTVMFLSMWDYLRGIEEDFEKFRYKFKKESEIEDGYFQPFSDSPFDDETVGETVYLNLLNKAKRYVYITTPYLVIDYKMTQALASAAKSGIDVRIITPHIEDKWYVHAVTRSNYRFLVESGVKIYEYTPGFIHSKTLVSDDEYAVVGTINMDYRSFYLHFECGVWTYKSKSVLDIKEDFLSTLDVCTEITMDMIKKTKWYKTLIGTLLRVFAPLM >NC_017304.1|WP_003518261.1|990069_990261_+|hypothetical-protein MNDLLNDAKTTEKVYFHSLNVYKEYDIVELRKRVGMVFQKPNPFPMEIQMASCCKIQVIVKYI >NC_017304.1|WP_037295225.1|990324_991035_+|response-regulator-transcription-factor MAKKLIYIVEDEKHIQELLRFNLEENGYEVECFEDGETMFEVVERKKPDLFVLDIMLPGVDGFEICKKIKENYDLKKIPIIMLTAKNDELDRVLGLELGADDYISKPFSVREFVARVKVAFRRQADSFENSPKRVNVGRITIDFERREVYKDNQIIEMTFKEFELLKLLIMNRGKVLSRDMLLQKIWGFDFFGETRTVDVHIRYLRQKIEDDDNNPVYIETVRGIGYRFSDKEVRE >NC_017304.1|WP_003521619.1|991037_992807_+|HAMP-domain-containing-protein MKKKIFKYYLLLILIILSVTVIFIPKVSRKFYTQEVENKLEGIAFSIEYYLLNEAKNGEIDFDFIAKDYAAKYNQNSTFQGESLRITFISYDGKVLGDSDANFNQMENHLSRKEIQDALKGNVGKDIRSSKTLKLDLLYMAIPVEELNVIARVSVPLVQIKKINRLIWLYSILIFIMALIITVIVSLRIAGLVIRPLNDIISVSKEITNGNYSRRIKLKSKDELGQLAVHFNKMASKLERTISDLNTKKIELESIVESITNGIVAVDGNNKVILINPAAFTVFNLDADAEILGDDIENHIKNSQINSLLKDAIQKNKPLEAEVAIDGRVLLVNASPIRPKDSDIDNSGGIVFIQDITKVRKLEQIRTEFVSNVTHELKTPITSIRGFIETLKNGAMNNPVVAERFLEIIDIEAERLHELINDILLLSEIETKLKDTNLEIFDLKSMVDDVFKVMQNIAKEKKISLNNNVRDEVLMKANINRMKQLIMNLVDNGIKYNVQNGSVSVDGYREDGKVVISVKDTGIGIPSAHIPRIFERFYRVDKGRSRGMGGTGLGLSIVKHIVNLYNGEIKVNSVVGEGTEFIVKIPCQP >NC_017304.1|WP_003518251.1|993623_995159_+|2-isopropylmalate-synthase MRRIRIFDTTLRDGEQTPGVNLNIQEKVDIAKQLARLGVDVIEPGFPLTSPGDFEAVQRIAREVEGPYICGFSRAIIRDIDETWKAIKDAQKKCFHIFISSSDIQIKHQLGKTEKDVLEIVKSTVYHAKQYTDEVEYSPMDASRTRLEFLYEVIEAAIDNGATVINIPDTVGYATPIEFGELIQKIRKNVRNIDKAIISVHCHNDLGMAVANSIVAAMNGAQQIECTINGVGERAGNAALEEVVTHIAARKDYLGFETGIDLSQLYKTSKIVSRYMGIPIPVNKPIVGKNVFTHESGIHQDGVLKERSTYEVIDPRLVGRDDSVILLGKHSGRHALKVEAEKLGYDLDEERLNKLFNDFKKLTDVKKNVTTADLESLIIESAAKAVEEAYVLEKIRVVSGNIETPSAKVVIKDSKGNLLEAEQTGNGPVDAVFKAINSVIKETENLTLYKYSVSAVTEEMESLGEVSVTLREKEKLYTGIGTHTDIITSSAIAYIDAINKAIAANARAQKN >NC_017304.1|WP_003518248.1|995296_996229_-|alpha/beta-hydrolase MIAQTFTFKAKDKTEIFVYKWMPEKGIKGIVQIAHGIGEHGGRYENFARDLSNSGYMVYANDHREHGKTAKTASQHNLQKRRIWNLMVEDLRQLTEIIRNENPNVPVFFFGHSMGSFLLRQYLYKYPNSIDGAILAGTGIYEKLLVDAGILIIKRLISKGADKKKSYYIINKILFRGFNSKIDNPKTNFDWLSRDVKVVLDFINDPFCTIPRSVDFFLEFLYGIKEVHKKENIEKIPKNTPIFIISGDKDPVGHWGSDIPTLARLYGKTGIKDVTYKLYKDARHELVNELNRDEVINDIIMWMNKRNPSA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_017304_3 | 1914892-1916668 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NC_017304_3
|
26 spacers
spacers of NC_017304_3
>3.1|1914922|39|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT AGGTCCTGCAGGATATCAGTTAGATACAGATACTTGGGA >3.2|1914991|36|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT TTCTCCTGCGACTCTCCCAATTTTCAAAAAATCCTC >3.3|1915057|38|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT CATATTCCAAGTGGATTACCTGCCAGAAAAGAGAGAAA >3.4|1915125|36|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT TTGTATCCTCCCACTTCTGCAGTTTGGAATACTCTA >3.5|1915191|37|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT TTTACCGCTTTCATCTTTATATGTTGATGGAATGAAA >3.6|1915258|37|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT GAGAACACGAAAATAAATGTTTCTTTAATCCTGCTGT >3.7|1915325|37|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT GCATAGGTTTCCAAGGCAACTATGAGCCCTTCGACCC >3.8|1915392|35|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT TACTCCGTGAATACCAAGCCAGAGTAAAACACAAA >3.9|1915457|37|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT GAAGAATGGCTGTGGAATCAATCCAATGAAAAAATAG >3.10|1915524|39|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT CTGGAACGGTGATTTGAGAAGAGTAGAGATTAACAAAGA >3.11|1915593|37|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT CACGGAACGGTTTTTTGTGTGGAAAACGGTTTGCGCA >3.12|1915660|37|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT ATTTCCAACATGTCTGCTATTTCTCTGCTGTCAATCG >3.13|1915727|38|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT CCTTTTGCTTTTTCAAGAGCTGCAATCGCTTTTGCTTT >3.14|1915795|36|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT TCATTATGAAGTTGACGGAAAGCCATATCTTGCAGT >3.15|1915861|36|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT CCCTTCGAACATTTCGATTATGCATGTATTAGAACC >3.16|1915927|40|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT TGGCTTGGTAAGTATAACACAGAGCAAGAAGCTGAAAATA >3.17|1915997|36|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT TTATTTCACTGATTCCAATGCCAATGTTTTCAAGTT >3.18|1916063|40|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT GGATTGGAAGCAGCAACCGCTTCAATGGCAGCTTGTTTAA >3.19|1916133|37|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT CTGTTGCTGGCGCAATTGCAGACCTCGGAAACACCAA >3.20|1916200|37|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT ACAAACATGCTGGGTTTCCCAGTACCTATGAATAGGA >3.21|1916267|37|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT AAGAGGAGGAAGGTTTCAGATGGGAGCAGTGGCAGGC >3.22|1916334|36|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT GAAGCTATTGAAGTGCTGAGCAGGAAGGGGGAAGAA >3.23|1916400|36|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT TCCGGCAGAATGGGATCTTACCGACAGTGCCGGCAA >3.24|1916466|39|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT CTAGACAGTCACGCGCGATTGCCTGTACAATGTTTTCAA >3.25|1916535|36|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT GAGCTTCAGGTATATCAGAGATATTGCAGTAATTTA >3.26|1916601|38|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT CACTTGGTGGCCATCAAAGACCACCAACATTTTTTATC >3.27|1914992|36|NC_017304|PILER-CR TTCTCCTGCGACTCTCCCAATTTTCAAAAAATCCTC >3.28|1915058|38|NC_017304|PILER-CR CATATTCCAAGTGGATTACCTGCCAGAAAAGAGAGAAA >3.29|1915126|36|NC_017304|PILER-CR TTGTATCCTCCCACTTCTGCAGTTTGGAATACTCTA >3.30|1915192|37|NC_017304|PILER-CR TTTACCGCTTTCATCTTTATATGTTGATGGAATGAAA >3.31|1915259|37|NC_017304|PILER-CR GAGAACACGAAAATAAATGTTTCTTTAATCCTGCTGT >3.32|1915457|38|NC_017304|PILER-CR GAAGAATGGCTGTGGAATCAATCCAATGAAAAAATAGA >3.33|1915524|40|NC_017304|PILER-CR CTGGAACGGTGATTTGAGAAGAGTAGAGATTAACAAAGAA >3.34|1915593|38|NC_017304|PILER-CR CACGGAACGGTTTTTTGTGTGGAAAACGGTTTGCGCAA >3.35|1915660|38|NC_017304|PILER-CR ATTTCCAACATGTCTGCTATTTCTCTGCTGTCAATCGA >3.36|1915727|39|NC_017304|PILER-CR CCTTTTGCTTTTTCAAGAGCTGCAATCGCTTTTGCTTTA >3.37|1915795|37|NC_017304|PILER-CR TCATTATGAAGTTGACGGAAAGCCATATCTTGCAGTA >3.38|1915861|37|NC_017304|PILER-CR CCCTTCGAACATTTCGATTATGCATGTATTAGAACCA >3.39|1915927|41|NC_017304|PILER-CR TGGCTTGGTAAGTATAACACAGAGCAAGAAGCTGAAAATAA >3.40|1915997|37|NC_017304|PILER-CR TTATTTCACTGATTCCAATGCCAATGTTTTCAAGTTA >3.41|1916063|41|NC_017304|PILER-CR GGATTGGAAGCAGCAACCGCTTCAATGGCAGCTTGTTTAAA >3.42|1916133|38|NC_017304|PILER-CR CTGTTGCTGGCGCAATTGCAGACCTCGGAAACACCAAT >3.43|1916200|38|NC_017304|PILER-CR ACAAACATGCTGGGTTTCCCAGTACCTATGAATAGGAT >3.44|1916267|38|NC_017304|PILER-CR AAGAGGAGGAAGGTTTCAGATGGGAGCAGTGGCAGGCT >3.45|1916334|37|NC_017304|PILER-CR GAAGCTATTGAAGTGCTGAGCAGGAAGGGGGAAGAAT >3.46|1916400|37|NC_017304|PILER-CR TCCGGCAGAATGGGATCTTACCGACAGTGCCGGCAAA >3.47|1916466|40|NC_017304|PILER-CR CTAGACAGTCACGCGCGATTGCCTGTACAATGTTTTCAAA >3.48|1916535|37|NC_017304|PILER-CR GAGCTTCAGGTATATCAGAGATATTGCAGTAATTTAA >3.49|1916601|39|NC_017304|PILER-CR CACTTGGTGGCCATCAAAGACCACCAACATTTTTTATCA |
cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017304_3
The CRISPR arrays of NC_017304_3 >merge|NC_017304|3|1914892-1916668|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR,PILER-CR ATTCTAATTCTTCATAGGTACGATACACACAGGTCCTGCAGGATATCAGTTAGATACAGATACTTGGGAGTTTCAATTCCTCATAGGTACGATACAAACTTCTCCTGCGACTCTCCCAATTTTCAAAAAATCCTCATTTCAATTCCTCATAGGTACGATACAAACCATATTCCAAGTGGATTACCTGCCAGAAAAGAGAGAAAATTTCAATTCCTCATAGGTACGATACAAACTTGTATCCTCCCACTTCTGCAGTTTGGAATACTCTAATTTCAATTCCTCATAGGTACGATACAAACTTTACCGCTTTCATCTTTATATGTTGATGGAATGAAAATTTCAATTCCTCATAGGTACGATACAAACGAGAACACGAAAATAAATGTTTCTTTAATCCTGCTGTATTTCAATTCCTCATAGGTACGATACAAACGCATAGGTTTCCAAGGCAACTATGAGCCCTTCGACCCATTTCAATTCCTCATAGGTACGATACAAACTACTCCGTGAATACCAAGCCAGAGTAAAACACAAAATTTCAATTCCTCATAGGTACGATACAAACGAAGAATGGCTGTGGAATCAATCCAATGAAAAAATAGATTTCAATTCCTCATAGGTACGATACAAACCTGGAACGGTGATTTGAGAAGAGTAGAGATTAACAAAGAATTTCAATTCCTCATAGGTACGATACAAACCACGGAACGGTTTTTTGTGTGGAAAACGGTTTGCGCAATTTCAATTCCTCATAGGTACGATACAAACATTTCCAACATGTCTGCTATTTCTCTGCTGTCAATCGATTTCAATTCCTCATAGGTACGATACAAACCCTTTTGCTTTTTCAAGAGCTGCAATCGCTTTTGCTTTATTTCAATTCCTCATAGGTACGATACAAACTCATTATGAAGTTGACGGAAAGCCATATCTTGCAGTATTTCAATTCCTCATAGGTACGATACAAACCCCTTCGAACATTTCGATTATGCATGTATTAGAACCATTTCAATTTCTCATAGGTACGATACAAACTGGCTTGGTAAGTATAACACAGAGCAAGAAGCTGAAAATAATTTCAATTCCTCATAGGTACGATACAAACTTATTTCACTGATTCCAATGCCAATGTTTTCAAGTTATTTCAATTCCTCATAGGTACGATACAAACGGATTGGAAGCAGCAACCGCTTCAATGGCAGCTTGTTTAAATTTCAATTCCTCATAGGTACGATACAAACCTGTTGCTGGCGCAATTGCAGACCTCGGAAACACCAATTTTCAATTCCTCATAGGTACGATACAAACACAAACATGCTGGGTTTCCCAGTACCTATGAATAGGATTTTCAATTCCTCATAGGTACGATACAAACAAGAGGAGGAAGGTTTCAGATGGGAGCAGTGGCAGGCTTTTCAATTCCTCATAGGTACGATACAAACGAAGCTATTGAAGTGCTGAGCAGGAAGGGGGAAGAATTTTCAATTCCTCATAGGTACGATACAAACTCCGGCAGAATGGGATCTTACCGACAGTGCCGGCAAATTTCAATTCCTCATAGGTACGATACAAACCTAGACAGTCACGCGCGATTGCCTGTACAATGTTTTCAAATTTCAATTCCTCATAGGTACGATACAAACGAGCTTCAGGTATATCAGAGATATTGCAGTAATTTAATTTCAATTCCTCATAGGTACGATACAAACCACTTGGTGGCCATCAAAGACCACCAACATTTTTTATCATTTCAATTCCTCATAGGTACGATACAAAC 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>NC_017304.1|WP_003520948.1|1909514_1910177_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MSIKWEQEWDRIYKEQGEVQSEILPTVKVEKDIFKRFGCKKVMDLGCGTGRHTIYLAQNGYQVFAVDISETGIEVTRAKAEKLNLTNIEFAQLDMRNLSVDDNLMDAIMCVWTSGHGTFEDARKNLKEMYRILRLGEILVIDYVSREDENYGKGTEIEKNTFINNVEGEENIPHHYFAKEEIEELYTDFSDVDINPVDYYFTDSYGTRHTIKAFVVIAVK >NC_017304.1|WP_003516483.1|1908193_1909237_-|copper-amine-oxidase-N-terminal-domain-containing-protein MQKNFLFRRTGVIVTLFALILGFACNISFASTPMQRELKVYVDDREVKFPDAKPYISEAGRTMVPIRAVAESFGAKVDWDAVLRKVTITYDDIEIEFLPDYVEDVMLVRSIEKNQRKTVQLDSKPVIRNDRTYLPYRAISEAFGYKVYWDEKEYKVIVDTKDRQPVFYINPGLSDNDYECIANYNTDFDNLAQVLKRTDVEIQLTDEMRESYLYRAKNYIENIIGNVDYSKEFEPEFPTAPFTPVMEEVYNDAVKNSIIREVKFIADPSDIEVLMIHPIENRPYKVMVLGRLEFIYHEASDEYLEKFGGKLKKGVRYSTKIAVTFELKPNDAGLGHAILDNTFEEIE >NC_017304.1|WP_003516485.1|1907871_1908072_+|hypothetical-protein MESIQRNKQLINKFNEIQEEILKIGWNGIIQKYHPDINCDDENSEKTFKMYKCIYENMRKRLIVNP >NC_017304.1|WP_003516489.1|1906229_1907297_-|hypothetical-protein 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NC_017304_4 | 1930002-1933245 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NC_017304_4
|
48 spacers
spacers of NC_017304_4
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cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017304_4
The CRISPR arrays of NC_017304_4 >merge|NC_017304|4|1930002-1933245|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR 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>NC_017304.1|WP_014522622.1|1928940_1929762_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MESMKGKVIRDIRNQEAKRKQLQKEIFNQRYNATKEAKFIDKEDINMNSFRAIPKSVIQELGLSKAALAIYPVLCAKADFEKNNSFPISQKNIARFAGVSENSVRNALKELENAGLLTKEKVTDGPRHFYVYKVTFYRRPELEANEQRGDAIYFYNCIIDNGIWAELKPRTKVLYLTLRAVAKQDIELYSVIEGENYGGDWNGVNYDDYIRNRKWDVCDISLSKLCKLAKIERTNLTPILEELERYKLIERVGEWTKVYNAPHCQDSFLAFLS >NC_017304.1|WP_095522195.1|1927599_1928752_+|IS3-like-element-IS120-family-transposase MEKRKHFTPEQKAKIVIEVIKGERTLNEIAAEYGIHPNLLSRWKTEFISNAGRVFSKETDEVEKVKQSYEKEKDELLKQIGQLSYEVAWLKKNLASSKSREDRMKMIDRNEKKLSITRQAELLSLNRTSVYYKPAPVNEEEYLIKRIIDEIYASYPEYGYRRMTSILNKDYHIHINRKRTRRYMREMGIHGFCPGPNLSKRIHGKNLYPYLLRNLKIDHPNQVWSIDVTYCRMKRGFMYMVAITDWYSRYIVGFELSNTLDKTFVIEAIQKAIKRYGKPEIMNSDQGSQFTSDDYINLLKNNGIKISMDGKGRALDNQRIERFFRSYKWEKLYLEECETVQQLRQITKEYVEHYNHRRPHQSLDYKTPAEYYFGGYDQLLAVV >NC_017304.1|WP_080550893.1|1926287_1926449_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MPELLTVSEVAQLMKVTPQTVLQWIYTKRLKAYKAGGQWRIRPEDLQLFLKGS 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MSQIFYKLSDKVQKKIWDIGWKHFTPIQEKAIPVIIDTEKDVVLSSGTASGKTEAAFLPIISKIHETASNVLKVLYVSPLKALINNQFERLQKLCEEMNIPVHRWHGDVSQHSKKKLINNPAGILQITPESIESLFINRTQFLKQLFQELEFIVIDELHAFIDTERGVQLRSLLSRIKQYTKRCPRIIGLSATIDNFSLIKKWINCNNPDNVEIIEVKGFERDIYYSLMHFEKSKTGNYPLELYEDILELTRNYTSLIFFNSRAAVEEATVILNRLAQREKLGERYFAHHSSIAKAEREFVEKLMSESTGIKSVIATSSLELGIDIGEIDLVIQVDSTFTVSSLKQRLGRSGRKQGEGQYLQMYTTDKYGLLQSIAVMDLLLQGWTEPCKGYPYPYDILFHQIISICHQLNGIPLEKLVSLVSENAAFYELPESDIRMLVEHMIGKEYLEILAGTQELIVGLEGERLLRQKDFYSVFMTPEVYEVFYGTKNIGEIEKTFLLNEGDNIILAGRLWKIEEIDFHRNKVYVKKAMDGKPPRYSGGLAPLHPRIPERMHEILCLDCKFDFIDDRAQTALEELKVPYKYFNVKPDERIIWQTKEKLLFETFTGTNIFRTLIWMLRYYGVDEVKTDGIGRMEIPLNDEFIDILQDIKSRKWSLRSLLPYTKEEEFFVSKYSDFLPSELQIKMHGAYNVDIEGVLKFLDKFRIRIISLE >NC_017304.1|WP_003519448.1|1918471_1918804_-|hypothetical-protein MMTVEIKIIENPLSDWKLGDPCSICNRMFSYTEAEYVAVVYVDEERDFICGDCLKKGPEAIKKAAQKRAQEIRDEIRLGLKEAELLEKIASGDIVYPWDDQEKFSKCANK >NC_017304.1|WP_003519449.1|1917244_1918396_-|recombinase-family-protein 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MKKLIITVIVSAVLLTALIPQLPVFAADYNYGEALQKAIMFYEFQMSGKLPDNIRNNWRGDSCLGDGSDVGLDLTGGWFDAGDHVKFNLPMAYTATMLAWAVYEYKDALQKSGQLGYLMDQIKWASDYFIRCHPEKYVYYYQVGNGDMDHRWWVPAECIDVQAPRPSYKVDLSNPGSTVTAGTAAALAATALVFKDTDPAYAALCIRHAKELFDFAETTMSDKGYTAALNFYTSHSGWYDELSWAGAWIYLADGDETYLEKAEKYVDKWPIESQTTYIAYSWGHCWDDVHYGAALLLAKITNKSLYKEAIERHLDYWTVGFNGQRVRYTPKGLAHLTDWGVLRHATTTAFLACVYSDWSECPREKANIYIDFAKKQADYALGSSGRSYVVGFGVNPPQHPHHRTAHSSWCDSQKVPEYHRHVLYGALVGGPDASDAYVDDIGNYVTNEVACDYNAGFVGLLAKMYEKYGGNPIPNFMAIEEKTNEEIYVEATANSNNGVELKTYLYNKSGWPARVCDKLSFRYFMDLTEYVSAGYNPNDITVSIIYSAAPTAKISKPILYDASKNIYYCEIDLSGTKIFPGSNSDHQKETQFRIQPPAGAPWDNTNDFSYQGIKKNGEVVKEMPVYEDGVLIFGVEPNGTGPATPTPKPSVNPSPSPTPTSDILYGDINLDGKINSSDVTLLKRYIVKSIDVFPTADPERSLIASDVNGDGRVNSTDYSYLKRYVLKIIPTIPGNS >NC_017304.1|WP_003517661.1|1944101_1944740_-|thiamine-diphosphokinase 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NC_017304_5 | 3480109-3481947 | TypeI-B |
NA
Consensus repeat of NC_017304_5
|
27 spacers
spacers of NC_017304_5
>5.1|3480139|38|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT TTTATCAAAGCTTTTGAAAACAGTTGCCTGAAAATTTA >5.2|3480207|36|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTATTTGAACGGCACATCCTTCAAATCCGCACCATC >5.3|3480273|39|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGCTATAAAAAACAATAGAAATGCGATAGGTATAGAAT >5.4|3480342|35|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAGATAAGCCTTGTTATACTGTTCTGGTTAGACCT >5.5|3480407|36|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATTTGTGCATGCAGGATGGGAAAAAATTATTAAAA >5.6|3480473|38|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGAGGGATTTGTATGAAAGCAATGAAAGTTTTCACTAT >5.7|3480541|35|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAGAAGCCTCCAACCAAAGGAAGAATCTATAGGAG >5.8|3480606|38|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTGAGCCTGATGTTTTGTTCCCTTTCCACGCAGGAACA >5.9|3480674|40|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGGTTTAAATCTGTACCAATGCTTGAAGTAGATGGAAATA >5.10|3480744|36|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGACTGAAAAGGATGTTATCAAATTGTTTGCCATAT >5.11|3480810|39|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAGAACAAATTGAGAAATTAGGAGTTGAGATATAATGTG >5.12|3480879|38|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAATATTGATGGGTCTGACAGTTTCGTCCCTCCAAATT >5.13|3480947|39|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTGCTTGTGATTCAAGTTCATTTTCTGATATAGTCAGCA >5.14|3481016|36|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCTGTTCAATTGCTGTTATAGTATCGACTTGCATTT >5.15|3481082|38|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACTGTAAGCGAAAATATAACCGGCATAACTCTTTATAA >5.16|3481150|35|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAGGGTAGCTATAACCCCCGCCTCCGGATTCACAT >5.17|3481215|31|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGGATTGGATTCGGATTGGATTGGATTGGAT >5.18|3481276|36|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAATGCATTGGGTAAGCTGTGTATGCACTGAATTAA >5.19|3481342|35|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGATATTAAAACCAGGGATGAACAACTTGAAGCAC >5.20|3481407|36|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AACAAAGATTGACATTGGATGCTTCACATTTAATTT >5.21|3481473|38|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GACGCACTTCCTGAACAAAATTTCATGGCACAATATCA >5.22|3481541|40|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAGGTGTCAAGAAAGGATGATGGTATGAAGGTTTTAGAGC >5.23|3481611|38|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCGTTTGTACCCTCTGAGGGGTACTTTCAGGAGTTCCT >5.24|3481679|40|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAGTATGCAATTTGCAATGATTTCGATTTTTTTGTTACGT >5.25|3481749|35|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTCCTTGCCCTTGACTGCATGAGCGGCGAGCCGGA >5.26|3481814|37|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGGCAGTAGGCTCTTACTTCCTCAAGGGTGGGTGGTA >5.27|3481881|37|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCCGGGAGCACCCCAGCCTGGACCAGACCGTCCAGGA |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b1,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017304_5
The CRISPR arrays of NC_017304_5 >merge|NC_017304|5|3480109-3481947|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTTTAATTCGTCATAGATGCGATAAAAAGTTTATCAAAGCTTTTGAAAACAGTTGCCTGAAAATTTAGTTTCAATTCCTCATTGGTACGATAAAAACGTATTTGAACGGCACATCCTTCAAATCCGCACCATCGTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAACTTGCTATAAAAAACAATAGAAATGCGATAGGTATAGAATGTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAACGAGATAAGCCTTGTTATACTGTTCTGGTTAGACCTGTTTCAATCCCTCATAGGTACGATAAAAACAATTTGTGCATGCAGGATGGGAAAAAATTATTAAAAGTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAACGGAGGGATTTGTATGAAAGCAATGAAAGTTTTCACTATGTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAACTAGAAGCCTCCAACCAAAGGAAGAATCTATAGGAGGTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAACGTGAGCCTGATGTTTTGTTCCCTTTCCACGCAGGAACAGTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAACGGGTTTAAATCTGTACCAATGCTTGAAGTAGATGGAAATAGTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAACTGACTGAAAAGGATGTTATCAAATTGTTTGCCATATGTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAACAAGAACAAATTGAGAAATTAGGAGTTGAGATATAATGTGGTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAACTAATATTGATGGGTCTGACAGTTTCGTCCCTCCAAATTGTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAACGTGCTTGTGATTCAAGTTCATTTTCTGATATAGTCAGCAGTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAACTCTGTTCAATTGCTGTTATAGTATCGACTTGCATTTGTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAACACTGTAAGCGAAAATATAACCGGCATAACTCTTTATAAGTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAACCAGGGTAGCTATAACCCCCGCCTCCGGATTCACATGTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAACAGGATTGGATTCGGATTGGATTGGATTGGATGTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAACTAATGCATTGGGTAAGCTGTGTATGCACTGAATTAAGTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAACGGATATTAAAACCAGGGATGAACAACTTGAAGCACGTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAACAACAAAGATTGACATTGGATGCTTCACATTTAATTTGTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAACGACGCACTTCCTGAACAAAATTTCATGGCACAATATCAGTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAACGAGGTGTCAAGAAAGGATGATGGTATGAAGGTTTTAGAGCGTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAACGCGTTTGTACCCTCTGAGGGGTACTTTCAGGAGTTCCTGTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAACGAGTATGCAATTTGCAATGATTTCGATTTTTTTGTTACGTGTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAACGTCCTTGCCCTTGACTGCATGAGCGGCGAGCCGGAGTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAACTGGCAGTAGGCTCTTACTTCCTCAAGGGTGGGTGGTAGTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAACCCCGGGAGCACCCCAGCCTGGACCAGACCGTCCAGGAGTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC >NC_017304|5|5|3480109-3481947|CRISPRCasFinder GTTTTAATTCGTCATAGATGCGATAAAAAG TTTATCAAAGCTTTTGAAAACAGTTGCCTGAAAATTTA GTTTCAATTCCTCATTGGTACGATAAAAAC GTATTTGAACGGCACATCCTTCAAATCCGCACCATC GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC TTGCTATAAAAAACAATAGAAATGCGATAGGTATAGAAT GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC GAGATAAGCCTTGTTATACTGTTCTGGTTAGACCT GTTTCAATCCCTCATAGGTACGATAAAAAC AATTTGTGCATGCAGGATGGGAAAAAATTATTAAAA GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC GGAGGGATTTGTATGAAAGCAATGAAAGTTTTCACTAT GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC TAGAAGCCTCCAACCAAAGGAAGAATCTATAGGAG GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC GTGAGCCTGATGTTTTGTTCCCTTTCCACGCAGGAACA GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC GGGTTTAAATCTGTACCAATGCTTGAAGTAGATGGAAATA GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC TGACTGAAAAGGATGTTATCAAATTGTTTGCCATAT GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC AAGAACAAATTGAGAAATTAGGAGTTGAGATATAATGTG GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC TAATATTGATGGGTCTGACAGTTTCGTCCCTCCAAATT GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC GTGCTTGTGATTCAAGTTCATTTTCTGATATAGTCAGCA GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC TCTGTTCAATTGCTGTTATAGTATCGACTTGCATTT GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC ACTGTAAGCGAAAATATAACCGGCATAACTCTTTATAA GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC CAGGGTAGCTATAACCCCCGCCTCCGGATTCACAT GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC AGGATTGGATTCGGATTGGATTGGATTGGAT GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC TAATGCATTGGGTAAGCTGTGTATGCACTGAATTAA GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC GGATATTAAAACCAGGGATGAACAACTTGAAGCAC GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC AACAAAGATTGACATTGGATGCTTCACATTTAATTT GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC GACGCACTTCCTGAACAAAATTTCATGGCACAATATCA GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC GAGGTGTCAAGAAAGGATGATGGTATGAAGGTTTTAGAGC GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC GCGTTTGTACCCTCTGAGGGGTACTTTCAGGAGTTCCT GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC GAGTATGCAATTTGCAATGATTTCGATTTTTTTGTTACGT GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC GTCCTTGCCCTTGACTGCATGAGCGGCGAGCCGGA GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC TGGCAGTAGGCTCTTACTTCCTCAAGGGTGGGTGGTA GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC CCCGGGAGCACCCCAGCCTGGACCAGACCGTCCAGGA GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC >NC_017304|5|5|3480109-3481947|CRT GTTTTAATTCGTCATAGATGCGATAAAAAG TTTATCAAAGCTTTTGAAAACAGTTGCCTGAAAATTTA GTTTCAATTCCTCATTGGTACGATAAAAAC GTATTTGAACGGCACATCCTTCAAATCCGCACCATC GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC TTGCTATAAAAAACAATAGAAATGCGATAGGTATAGAAT GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC GAGATAAGCCTTGTTATACTGTTCTGGTTAGACCT GTTTCAATCCCTCATAGGTACGATAAAAAC AATTTGTGCATGCAGGATGGGAAAAAATTATTAAAA GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC GGAGGGATTTGTATGAAAGCAATGAAAGTTTTCACTAT GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC TAGAAGCCTCCAACCAAAGGAAGAATCTATAGGAG GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC GTGAGCCTGATGTTTTGTTCCCTTTCCACGCAGGAACA GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC GGGTTTAAATCTGTACCAATGCTTGAAGTAGATGGAAATA GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC TGACTGAAAAGGATGTTATCAAATTGTTTGCCATAT GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC AAGAACAAATTGAGAAATTAGGAGTTGAGATATAATGTG GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC TAATATTGATGGGTCTGACAGTTTCGTCCCTCCAAATT GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC GTGCTTGTGATTCAAGTTCATTTTCTGATATAGTCAGCA GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC TCTGTTCAATTGCTGTTATAGTATCGACTTGCATTT GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC ACTGTAAGCGAAAATATAACCGGCATAACTCTTTATAA GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC CAGGGTAGCTATAACCCCCGCCTCCGGATTCACAT GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC AGGATTGGATTCGGATTGGATTGGATTGGAT GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC TAATGCATTGGGTAAGCTGTGTATGCACTGAATTAA GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC GGATATTAAAACCAGGGATGAACAACTTGAAGCAC GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC AACAAAGATTGACATTGGATGCTTCACATTTAATTT GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC GACGCACTTCCTGAACAAAATTTCATGGCACAATATCA GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC GAGGTGTCAAGAAAGGATGATGGTATGAAGGTTTTAGAGC GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC GCGTTTGTACCCTCTGAGGGGTACTTTCAGGAGTTCCT GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC GAGTATGCAATTTGCAATGATTTCGATTTTTTTGTTACGT GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC GTCCTTGCCCTTGACTGCATGAGCGGCGAGCCGGA GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC TGGCAGTAGGCTCTTACTTCCTCAAGGGTGGGTGGTA GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC CCCGGGAGCACCCCAGCCTGGACCAGACCGTCCAGGA GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC >NC_017304|5|6|3480177-3481947|PILER-CR GTTTCAATTCCTCATTGGTACGATAAAAAC GTATTTGAACGGCACATCCTTCAAATCCGCACCATC GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC TTGCTATAAAAAACAATAGAAATGCGATAGGTATAGAAT GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC GAGATAAGCCTTGTTATACTGTTCTGGTTAGACCT GTTTCAATCCCTCATAGGTACGATAAAAAC AATTTGTGCATGCAGGATGGGAAAAAATTATTAAAA GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC GGAGGGATTTGTATGAAAGCAATGAAAGTTTTCACTAT GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC TAGAAGCCTCCAACCAAAGGAAGAATCTATAGGAG GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC GTGAGCCTGATGTTTTGTTCCCTTTCCACGCAGGAACA GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC GGGTTTAAATCTGTACCAATGCTTGAAGTAGATGGAAATA GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC TGACTGAAAAGGATGTTATCAAATTGTTTGCCATAT GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC AAGAACAAATTGAGAAATTAGGAGTTGAGATATAATGTG GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC TAATATTGATGGGTCTGACAGTTTCGTCCCTCCAAATT GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC GTGCTTGTGATTCAAGTTCATTTTCTGATATAGTCAGCA GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC TCTGTTCAATTGCTGTTATAGTATCGACTTGCATTT GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC ACTGTAAGCGAAAATATAACCGGCATAACTCTTTATAA GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC CAGGGTAGCTATAACCCCCGCCTCCGGATTCACAT GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC AGGATTGGATTCGGATTGGATTGGATTGGAT GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC TAATGCATTGGGTAAGCTGTGTATGCACTGAATTAA GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC GGATATTAAAACCAGGGATGAACAACTTGAAGCAC GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC AACAAAGATTGACATTGGATGCTTCACATTTAATTT GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC GACGCACTTCCTGAACAAAATTTCATGGCACAATATCA GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC GAGGTGTCAAGAAAGGATGATGGTATGAAGGTTTTAGAGC GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC GCGTTTGTACCCTCTGAGGGGTACTTTCAGGAGTTCCT GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC GAGTATGCAATTTGCAATGATTTCGATTTTTTTGTTACGT GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC GTCCTTGCCCTTGACTGCATGAGCGGCGAGCCGGA GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC TGGCAGTAGGCTCTTACTTCCTCAAGGGTGGGTGGTA GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC CCCGGGAGCACCCCAGCCTGGACCAGACCGTCCAGGA GTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC
>NC_017304.1|WP_003520733.1|3479020_3479560_-|hypothetical-protein MGKKNYILSKAIVSFCGSFLIIFIPFLLNMLLNHITYLENENTYRGIRFSHIYCSSFINDAPVNNSKMFLYPLYIKCQILYNIIYTFMISIFSGILGLFAFACSLKIKKHKVFIFVPVYALFMLTKLAGSSFSYYGELLYFVMIQAINGINVGMFFLLCLALVVYSLISLKLECGREDL >NC_017304.1|WP_003518152.1|3478545_3479004_-|hypothetical-protein MTVNKKKNLLSLLIIIPVTVVFNYTLLWPGESSSLSQMLVSNLYDVKSIYEEKTLILAANSIYFIVLFHILFGTYIYKDFISNGAYIFTRLKSRKTWFYRKSFEIIKFSMIYSILFVGTLLALCSYYKKELPGADVLYTVFFCGFHAVFLLH >NC_017304.1|WP_037294722.1|3478237_3478501_-|hypothetical-protein MGFLTGYGTLVLLISASINFEYIPLIGKYTLLSIINPASIMFLYLLEQKIVVFFGFVYYIALTAFLINMCASLVNKIDVSIPLRENG >NC_017304.1|WP_003513467.1|3477547_3478228_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MHTIELRNISKVIKNNIVLSNINYKFESGKVYGLKGRNGSGKSMLLRTISGLIRPTSGSVIIDGKELHKEIESPGNIGIVVENAGLYPDFTGFYNLKYLAGIMGQISDDEIINAIKRVGLDLYDKKIVKKYSLGMKQKIVIAQAIMEKPDFLLLDEPTNALDESGVKLLREIVQEEATRGALVIIASHNQEDIELLCDKVIIMADGKISDEYVNSREMNLCSEETQ >NC_017304.1|WP_003513469.1|3476849_3477569_-|hypothetical-protein MFRRNAIISVVIIILTVILGQIAKANLLVDNKILKIKTVDELNKLVFQFDLSLDDYIYPNYYTPEKALEVNDRAEIIAVVSPTGRIEQYHWLLRQEVVINKVVRGDKSLEGMTAKLDVSNGLVYYNIDEKRDPFDPRGFNLYYTNTVNIMQPGNEYLAFFNRMPLQDYAEDDIIFNCISTEYSYFNLSLPENDLLITDATANYKLEDLKEYEYFTGSKRMLDLWYDVKEAAVKKYLDPQ >NC_017304.1|WP_003513471.1|3476145_3476700_-|phosphatidylethanolamine-binding-protein MKRVSVFLLICVLAILTFSACSKSKQSLKTIKPGEEIKITSSSLNSDGKWKSVITAYMGENKSPQLSWTPVEGASCYAIYMIDTTASNWCHWIAKDVKVTELELGAELENSQYIGPYPPGGVHTYEVMIFALKNSPDSYEGYFDNSNPSLDKIIEALDTSGGTTGNILARGVLSGTYKAGDIVE >NC_017304.1|WP_003513473.1|3475240_3476173_+|AraC-family-transcriptional-regulator MDLFTRSYDKDWNRIVYLKVLENQEACLHLKDDKTCKLILLLEGNPTIRYNNQTAFIIAPSVLCLNHLDTVEFDYNPNCKMTVLFFRPSALNDQLEYSAFHSNLYEKMVGTTLFQDMVLLSSFYDINDSKRELILLDTVSAVSLMQLLNKINQELTEQKDGYWPCRSRSYFIELLFFLEGLRCNESLQKMRIILGKNKNSIVHNIIQYLNQNIDKKITLEHLEKTFACNRNQINKEFQKELNTTVMKYFTQMRMQLASILLRDTEIPILEVALRVGYSDAGYFSKTFKLYSGISPSEYRNSFYSTISPAL >NC_017304.1|WP_003513475.1|3474279_3474840_-|tyrosine-type-recombinase/integrase MTVEPIRNKAKIKQMYYYLNGKDPKYGLLFKFGLNTGLRISDILPLKVKDIYTPDNRFREYLILKEKKTDKEKKIKINDSLKKEIENYVKTHNLSQEDCLFSSKKGGHIGRVQSYRVLREAAEAVGIENFGTHSLRKTWGYWTYKMSRYNIGLIMDTFNHSSQRITLRYIGVNQDQKDELYSLVQF >NC_017304.1|WP_003521663.1|3473008_3473434_-|purine-binding-chemotaxis-protein-CheW MNDLLTSQYVAYELAGEKYALKISDVYEIIKMQSITPIHNSKPFLEGVINLRGKIIPVANLHKRFGLGNYTHTKKTRIVVVKSRDEMIGIVVDKVNQVIRFSDIQPPPEMVAGIDGSYFEGVGITDEGVISILKIDKVLHE >NC_017304.1|WP_003518456.1|3470885_3472994_-|chemotaxis-protein-CheA MASIFESPELIGAFIGEVEEQLQLLENNVVELEKNGGTAEVVQELFRAAHTLKGSSATMGFEKMKTLTHEMENVLDKIRNGLLEISRPVIDVLFECLDCLNMLKEDFVSDSNNVKTEITPVITKLKEISSENETNNQNSDSDKAENLETGRREQPIFVLDEKQQEQINQALGIGQNVLVCEVEILEDSQMKSVRACLIMNFLNEWGTVINMVPNVMEIPIDSDVGKVAFLVVTQMSADELRQKVQNDLMDIKEVRVFPYFIQNSISQTKDGETGVRDKDNSSGVKTATEEKRVVHTVRIDVDRLERMMDLVGELVIEQIRIAQVANNLYNQYPSDETVDDLIGISNRVSILINELQEGIMKTRMIPVQQLFSRFPRMVRDLSVSLNKEVNLVLEGGETEIDRTIMEEMSDPLIHLIRNAIDHGIENPEIRKKLGKPEQGTLRVTALPEDSNVIITVEDDGAGIDPQEIKQSAIKKRIVTEQEANNMTEQQLINLIFQTGFSTSQKVSDVSGRGVGMDIVKTHIEKLNGIIDVETCAGSGTKFIIKLPIKLPLTLAILKGLLVKISNETYALPMNNVVEIVRKPKNEIESINGQAVAVIRDRAIPLIWLHDYFGIPRGNERKNTLIVLLGIAEKRFGLVVDELIGNQEIVVTNLGSYIGKVEGISGATILGDRSVACILDVVGIAKIVNSRKVSRIDVEYSKQ >NC_017304.1|WP_003513463.1|3482113_3482377_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFVIMVYDAGERRNSKVLKVGRKYLHWVQNSVFEGELTEANYHKLKEEVRRKVDNEEDSVIFYKFRTMKYTEREVIGKNVDPNNFIL >NC_017304.1|WP_003513460.1|3482390_3483383_-|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKKSAFIFSDGELKRKDSTVLFESEDSKNYLPIEDISDIYIFGEVTVTKKFLELATQKEILLHFYNYNEYYVGTYYPREHYNSGFMILKQAEHYLDEEKRMAIAKKFIHGSVKNMLAVLKYYNNREKDLDRQITAISDLAEKIDEMDEINKLMAIEGNIREIYYGSFDIIVDDEYFEFGKRTKQPPKNRMNSLISFGNSILYTTVLSEIYKTHLDPRIGYLHSTNHRRFTLNLDVAEIFKPIIVDRVIFTLIGKKMLGEKHFEEKAGGIVLNDKGRKQFVAQMLEKLNATLMYKPLGREVSYRRLIRLELYKLEKHLMGEQEYKPYVASW >NC_017304.1|WP_003513458.1|3483396_3483903_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MYEADVRINGTLIWYYFICKREVWLISHGITADQEDENIEIGRFIHENAYSREKKEIDFDNFKVDVADSIDGKIIVQEVKKSSKFKKSARMQLLFYIYEIKKSGIDARGILLFPEERKREEVVLDEASQKELDSVIKDIFKIVNLEKPPIPEKCKYCRNCAYSELCWA >NC_017304.1|WP_003518145.1|3483921_3486174_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MYFAKPVDNYEGTYEYHVKRCAEILEFEIRSKYPAFKRILSSYGFDVEDFIEKMKTAVVFHDFGKLNPYFQEYMKRKIEKKKLSGIKHFRHEVLSCLFLMSNEKSKEAYFPYHILAVLGHHKMLSSDLKSFERERVWQDRWPEISEDAVKHAMEIASEFGIKVDGRSGPQGKSANNYLNALLKLALMLYEKDREKLKVVYSVSKGLLHNCDWIASSNLDYNRVCLIGVSANDIEKKLKEKLEKENKKYVRREFHSICANAVGDVVAIAPTGSGKTEAALMWALNSETTKIIFLMPTMVTSNSLYERLSTHYFPKESCGLSHSGAETYFYKKSKEDDTENDYDWSQILHQKAFIPAVMVSTVDQVLSTEFHTGLWNQKEYALVGSSVIFDEIHAYDGYTIGLITGVIKKIKKYGGRVMLMSATMPKFLRNHFLDLLDSKCLVVAEELMERASNEWAYLDTDLEGIREKVLKEVSEGKKVALIVNDVETAKKEYKYYSKKGFDVLCLHSEFTMKDRQEKEGRLTSKEGNPYRLVISTQVIEVSLDVSFDVMFSECAPIDSLVQRAGRCNRHGLINFGRFYVFNPSDTAVKYVYRKQKDILDKTVEVIRKNSGRLTEKQIMAMVEEVYEGFNLYDEDYKLGIDIVRDIEQRYNFFDVNIFQEDENLSTRKFDVVKVPVIPADEYMEIVEKLFESKDYKMISLYEIPVSISKFKKYIRRLEISNKYNLPIFKIKYSSEYGIDYEEDDSNTCYLY >NC_017304.1|WP_003518143.1|3486195_3486921_-|CRISPR-associated-protein-Cas5 MYGLIVTLYAKTASFRDPGAQLYHETMPLPPPSTITGIAGAALGLSFEDALAFMKENAVMVGCNGSSEGRGKDLWNYTKIKSGEITNAIIIRNFLADLKVEIFFACEKREVITRLADAFENPVYAITLGNSDEIAKICSIEIFEEISCEKKKILTNTWLPGDYSRKLKVDWEKVKKAKISLTLKPPIVKKLPCDFEFDANGVRKAVKYLNITFMGDNHILETEAEVLVFGNKFAAVMKHEG >NC_017304.1|WP_003513455.1|3486939_3487824_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MKDAKAITVTYLTKASYSSLNGADKEADNIVSIKKIQMNDGKEYPYCSSQAVRRALREQLASMGWELSETTVAKQKKGAASTLCEPSKYIDDDLFGFMNADSSKTVKRTSPVRVSPLVALEPYGGGMDFGTNYMSVKAGGTPNIFETEIHSGYYVGTVLIELDRVGEKSPGDEYDLSLSQDEKKKRVNALVDAIQNLWTVGRQSRFLSDVSPKFVAAAVLKVKNPIFLECIKIGSSGSVDMSLVKNTVDDFHKQIIDYAIGERKGFFAQDSETALPLGQCFEKIHSWVEEYYKD >NC_017304.1|WP_003513454.1|3487829_3489506_-|hypothetical-protein MEYSIALRRHWWFDAGIAGLYSISKSRDDRLLEFDVEVKVDSENQALTFEGKDTDTLRAYFETCYEILAERYWNVSTIKQKENPELVVYDKEKDEIMLMPKRNPTPVVSLFIGARSWQGEGIPYGDITEPLKSRVDEFLEKTRAKLWGSKKLLLLSQPVCHQKLTILPEEKKKGKTEVCCVCGKHSLYMIEVGLPSFLLFASSNATKSFNSQGKNPAKLCWECEFISKFAIESASYKRTNDSIFVIQVTSPDIDKLIEMQKEFGSLSELRMLDDKYFYANIGLEEDSLIKKCSAPYELLWAFMEEKYSLLLKESSEGEETFDDVSADNFFFEFIEKLSKMPVQIYVLYATDSGQTFLTKNLVLYDELGYFYRLIHHMKKSGVNTRKLFSSLYEEKYDFREKILRNVLRKNSILRHIEQFAFRMVMRDQRISMGNILKFTIEYEQIIRGDEMNKEQIETAVNLGKQIVIQAVETARAENENEKQALKKIKGDLYQLRKSRTKTDFINQLNNLQFRYGIAVSKNILDGILEEVDFEDFRAYCVLGALNVYNAKNNKDKED >NC_017304.1|WP_003513453.1|3489517_3490240_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRFKVGIEFDESLELPFNYNKILQGFIYRNIMDKDLARFIHDRGFSYEKRKYKMFTFSRLQGKFSIDSKKKKIIYQSPVELVVSSCYEDFFIDLSLSLLRRDVEIAGHKAYVSKMDIIMEEPKSIQKIRMLSPVTAYSTLDDKRTVYFSPYNHDFKRIIKENLIKKYKAFYKDDSKDNVDFDIELVSDKYAKVISSYDGFIIEGWMGDFVLKGDQEVIKLAYDAGIGGKNSQGFGCFKLI >NC_017304.1|WP_003513452.1|3490496_3491417_+|methylenetetrahydrofolate-reductase MLKQKILNRESGIITYGITPPKKNNTEEKIKEISQKHIERISGLDIDGLVIYDLQDEKERVSEERPFPFIETIDPQIYSENYLKDLKIPKIIYRCVGKYTPDEFRRLTRPVSGQDAFSVFVGAASRNQSVLLKLSDAYKIRQDVNPDLLLGGVAIPERHMKNTDEHLRIIDKINKGCKYFITQAVYNVEAAKDFLSDYYYYSKNNNLKMVPIIFTLTPCGSTKTLEFMKWLGISIPRWLENDLMNCEDILNKSVSLSKSIFNELMEFCLEKGIPIGCNIESVSVRKVEIEASIALAKDIKYIMKGI >NC_017304.1|WP_003513451.1|3491446_3492265_-|undecaprenyl-diphosphate-phosphatase MLELIKAIFLGIVEGITEWLPISSTGHMILVEEFINMNLSDEFMEMFRVVIQLGAIMAVVVLYWNKLFPFSFEDGIQIKKDTFSLWIKVLAATLPAALIGVPFDDKIDELFYNYITVAITLIVYGVLFIIMENRNKSKIPAISTFEELGYKAVLLIGAFQVLALIPGTSRSGATILGAIMIGCSREIAAEFSFYLAIPVMFGASLLKLVKFGFAFSQTELIILLTGMIVAFAVSIFAIKFLMGYIKRNDFKAFGYYRIILGLIVVLYFLAVR |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_017304_2 | 2.32|978995|36|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 978995-979030 | 36 | NZ_CP048423 | Sphingomonas insulae strain KCTC 12872 plasmid unnamed4, complete sequence | 7989-8024 | 7 | 0.806 |
NC_017304_3 | 3.24|1916466|39|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT | 1916466-1916504 | 39 | MT330372 | Cronobacter phage JC01, complete genome | 8028-8066 | 7 | 0.821 |
NC_017304_4 | 4.16|1931043|36|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT | 1931043-1931078 | 36 | NZ_KT020842 | Clostridium perfringens strain JP838 plasmid pJP838B, complete sequence | 16212-16247 | 7 | 0.806 |
NC_017304_4 | 4.64|1931044|36|NC_017304|PILER-CR | 1931044-1931079 | 36 | NZ_KT020842 | Clostridium perfringens strain JP838 plasmid pJP838B, complete sequence | 16212-16247 | 7 | 0.806 |
NC_017304_3 | 3.47|1916466|40|NC_017304|PILER-CR | 1916466-1916505 | 40 | MT330372 | Cronobacter phage JC01, complete genome | 8027-8066 | 8 | 0.8 |
NC_017304_2 | 2.52|980337|36|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 980337-980372 | 36 | NC_015511 | Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 plasmid pHALHY01, complete sequence | 123093-123128 | 9 | 0.75 |
NC_017304_4 | 4.27|1931778|37|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT | 1931778-1931814 | 37 | NC_010929 | Agrobacterium tumefaciens Ti plasmid pTiBo542, complete sequence | 26866-26902 | 12 | 0.676 |
NC_017304_4 | 4.27|1931778|37|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT | 1931778-1931814 | 37 | NZ_KY000026 | Agrobacterium genomosp. 6 strain CFBP1873 plasmid pTi_CFBP1873, complete sequence | 26868-26904 | 12 | 0.676 |
NC_017304_4 | 4.75|1931779|37|NC_017304|PILER-CR | 1931779-1931815 | 37 | NC_010929 | Agrobacterium tumefaciens Ti plasmid pTiBo542, complete sequence | 26866-26902 | 12 | 0.676 |
NC_017304_4 | 4.75|1931779|37|NC_017304|PILER-CR | 1931779-1931815 | 37 | NZ_KY000026 | Agrobacterium genomosp. 6 strain CFBP1873 plasmid pTi_CFBP1873, complete sequence | 26868-26904 | 12 | 0.676 |
1. spacer 2.32|978995|36|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP048423 (Sphingomonas insulae strain KCTC 12872 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
ccgcca-gctccggacggaagcgaggcaacggcggaa CRISPR spacer -ggcgacgctgcggacggaagcggggcaacggcgaac Protospacer ** * *** ************.**********.*
2. spacer 3.24|1916466|39|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT330372 (Cronobacter phage JC01, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.821
ctagacagtcacgcgcgattgcctgtacaatgttttcaa CRISPR spacer ccagcacgtcacgcgcgatagcctgtacgatgttttcca Protospacer *.** ************ ********.******** *
3. spacer 4.16|1931043|36|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KT020842 (Clostridium perfringens strain JP838 plasmid pJP838B, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
-gtggtacgttctgccataccatttagccttatactc CRISPR spacer aacagtat-ttcttccataccatttagccttatattc Protospacer ...***. **** ********************.**
4. spacer 4.64|1931044|36|NC_017304|PILER-CR matches to NZ_KT020842 (Clostridium perfringens strain JP838 plasmid pJP838B, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
-gtggtacgttctgccataccatttagccttatactc CRISPR spacer aacagtat-ttcttccataccatttagccttatattc Protospacer ...***. **** ********************.**
5. spacer 3.47|1916466|40|NC_017304|PILER-CR matches to MT330372 (Cronobacter phage JC01, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.8
ctagacagtcacgcgcgattgcctgtacaatgttttcaaa CRISPR spacer ccagcacgtcacgcgcgatagcctgtacgatgttttccac Protospacer *.** ************ ********.******** *
6. spacer 2.52|980337|36|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_015511 (Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 plasmid pHALHY01, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
tatagtagatgcagaagaagccttgcaggaaatact CRISPR spacer gttgggcattgccgaagaagtcttgcaggaaatact Protospacer *.* . *** *******.***************
7. spacer 4.27|1931778|37|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_010929 (Agrobacterium tumefaciens Ti plasmid pTiBo542, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.676
ttggtcaaggtgttgacgaggacaaagacaaaattgg CRISPR spacer tcggtcaagatgttgacgaggacaacgaaggtcgcaa Protospacer *.*******.*************** ** .. ...
8. spacer 4.27|1931778|37|NC_017304|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KY000026 (Agrobacterium genomosp. 6 strain CFBP1873 plasmid pTi_CFBP1873, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.676
ttggtcaaggtgttgacgaggacaaagacaaaattgg CRISPR spacer tcggtcaagatgttgacgaggacaacgaaggtcgcaa Protospacer *.*******.*************** ** .. ...
9. spacer 4.75|1931779|37|NC_017304|PILER-CR matches to NC_010929 (Agrobacterium tumefaciens Ti plasmid pTiBo542, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.676
ttggtcaaggtgttgacgaggacaaagacaaaattgg CRISPR spacer tcggtcaagatgttgacgaggacaacgaaggtcgcaa Protospacer *.*******.*************** ** .. ...
10. spacer 4.75|1931779|37|NC_017304|PILER-CR matches to NZ_KY000026 (Agrobacterium genomosp. 6 strain CFBP1873 plasmid pTi_CFBP1873, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.676
ttggtcaaggtgttgacgaggacaaagacaaaattgg CRISPR spacer tcggtcaagatgttgacgaggacaacgaaggtcgcaa Protospacer *.*******.*************** ** .. ...
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
881639 : 954098
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_017304|881639:954098|DBSCAN-SWA TATGGCAAGAAAAAGGATAATAACACCAGAAAAGAAAGAGCTTATCAGAAATCTCATTTCTGAGTACAACATTACTTCAGCAAAGGATTTGCAGGAAGCATTGAAGGATCTGCTCGGAGATACGATACAAAATATGTTGGAAGCAGAGCTGGATGAACATCTCGGATATGAAAAGTACGAATCAACTGAAGAAGCGAAATCAAATTACCGTAACGGGTACACATCAAAAACATTAAAGTCAAGTGTAGGGCAAGTGGAAATAGATATCCCGCGGGACCGGAATGCAGAATTCGAGCCGAAAATTGTTCCCAGGTATAAAAGGGACATTTCAGAAATTGAAAATAAAATAATAGCAATGTATGCGCGGGGGATGTCTACCAGAGAAATCAACGAGCAGATACAGGAAATCTACGGATTTGAAGTATCTGCCGAGATGGTAAGTAAGATCACTGATAAAATACTACCTGAGATAGAAGAGTGGCAGAAAAGGCCTCTGGGAGAGGTTTATCCGATAGTATTTATTGACGCAATTCATTTTTCAGTAAAAAATGACGGCATTGTTGGGAAGAAGGCCGTATATATTGTGCTGGCGATTGATATAGAAGGGCAGAAAGATGTTATCGGTATTTATGTAGGAGAAAATGAGAGCTCAAAATTCTGGCTGAGTGTCTTAAATGACCTTAAAAACAGGGGTGTTAAAGACATTCTGATTCTCTGTGCTGATGCACTTTCAGGGATAAAGGATGCAATCAATGCGGCTTTTCCGAATACTGAATATCAGAGGTGTATAGTACACCAGATAAGAAACACGCTAAAGTATGTGTCAGATAAAGACCGAAAGGAATTTGCCAGGGACTTGAAACGGATATATACGGCTCCGAATGAGAAGGCAGGGTACGACCAGATGCTTGAGGTTTCAGAGAAATGGGAGAAGAAATACCCGGCAGCTATGAAGAGCTGGAAGAGCAATTGGGATGTTATTTGTCCATTTTTTAAGTATTCGGAGGAACTACGTAAAATCATGTATACGACCAATACTATTGAGAGCCTGAATAGCAGTTATAGAAGGATAAACAAATCAAGGACAGTATTTCCTGGCGACCAGTCACTTTTAAAGAGCATATATTTAGCTACAGTGAAGATTACTTCAAAATGGACGATGCGTTACAAAAACTGGGGTTTGATACTGGGACAGCTACAGATTATGTTCGAAGGGCGTATATAGTATAATCAAGGGGTTCAGGGAAACTCTGGTTTCCTGAACCCCCCTGTAATATTTTATACGCATCATCTTTGTCAAATTTTTCTTTTGTAAGAATTTCTTATCAGAAATTCTTTTGAATCTATAAAATTTGACAAAGCAGACTTTCGAGTCTTAAAATATATTTAAATACTAACATAGAAGGAAAATTAGTTTACACAAAAATATTTACACTGCCAATCAATTGGCAGCCGTAATAATATCTAAAAGTAAAATTATATTGTTCCTGTTTGATAACGTTAACAAGCATGCCCGGCTTGAAAACTTTCGGCTTCAGATTCTTAGAGTCGGCATCATATGCAGTATAGAGTCTGTAATACATTTTATTGTCATAAACCAAAGATGCTTCGATAGTCTTACATCCCAATACAGAACCGTAATTTTCCTGGACAACTTTCCACATAAACACTTACTCCTGTCAATGCCTTGAAAGCAGTTGAATTATTAATATTGTTAAAGTCCTTATCATTTATTGCGAGAGCTTTAAGCTAAGGGTCTAATTGAATGGCTTTCTTAATTTAGACACTCCATTGCTTCGCTGACATTGCCTGCATAAAGCAGGAGATCACTTAACGACATATAAAAGGACAATTCTTTCGGGTTATTCTTTATTCCAGGCTTGTAACATTCGATAGCTTCGTTTACTTTATTCATTTCAAACAAAGTCCATGCTTTGGACACATATAAGCGTATATGGTTTGGTGCAAGAGCGATTCCCTGTTTTATTAAAGTTTGCATTGTATCAAATGATTAAATTACCAAAAGCATTATTTAAAAAATGAGATGATTATTGCAAAAGCTTATCAATAAAGCTTTAATTTCCATCCATTAATTAGTTTTAGTACTGGAATATAGTTGCATTTCTTATCTTCTTTGGTATGATATTAATATGGACTAATGTAACACAAATAAGAAAGAAGCATACATATTTAGATTTATTAAGCTATAATTCAAAAACATTTTTAAATTATATTAATATTGAAATTTACATGATTGCTAAAAAAGTGATAGAAATTATTTTTGTTTAATTCTTTGAAGTACAGAAAATGTATGGTATGGTTTTTAAAAGCATTATAATGTTTGGTTTGAGATTCAAATTATGATACTTTGGGATAATTAAAAGATGTTTTTATAATTGTACCAATATTAGATTGGAACTAAGATTATTTAAAAAGTATAAGGCGGGGTGTTGAATATGATACTGACAAAATGAATCACTTTCTTGTATGAAAAAATCTTTCATTTATAAAATATTTTATTAAATTTTAGTCATTATCAATGCACATGTGAGGATAAGTTGGATGGTCTTGAATATCCATTTGCGGGGGCGATTGGTATTTGGATTTCTGTTGTAGTTTATTGAAGTATATATTTTGGATGTGCAGTTTCGTGTTGAAGGAAATAGATAAGCACTTTTTTAGACTAATTGCTTAGTAAGTGAAGGTATTTATAATGAAAATGGTGGTGTGGTGATGGCGAGTGAAAAGAAAAATATTTCTTTTATTTATGTCACTAATCATGCTGCTGAATGTGGGAATTGGCAATGTATATGCCGATGAAACCGGCAAAAATGCCTTGAATTTCAGGAAGATTTATAAGGAGCATAGAACGTATTCATCAGCAGTTGGTATTTCGGCTAATTCTTTAGGTGATATCGCTATAGGATTTAATGATGATTATATAAATGTCTATGATAAGCAGGGAAGCTTTAAATATTCCTTTGCTTTTGAGGTGAACGGCAATTATTTTTTTGAATTTGATAATGAAAACAATATCGTGATTTTTTCGGTTACAGATGGTATGCGTTATTATTTCAATAACGATGCGGAACTAATAAAGACAGAAAAAATCTCTGATCCGGAAGAGCTTAAAAACTATTATAAAAATCGCCCGGACAAAGAAAATGTAAATATTGATGGTGTTAATTATTCGCTAAAACAGGTCCTTGGATATATTAAATTTGCGAAGACCGACGCCGACGGTAATGAATCGGTAATATATGAAACCGGCTTACAATACGCTGTTAAGGCATTTGTGGCATTAACGGTTCTGGCATTTCTGGCCATAGTAATATGCGGATTTATTAAAACTATATCAACGGAAATGAAAAAATATACGGAAGTGTAAAGAGGATATGAAGGAGACACTGTCAAAGATGAAATTACTCAAAGAAAAGAAGTTTATGATATATTGAAGTAACATAAGTATGATAATTGCAATAGACTGTTTTATAGGAGAATAATTCAATAATATTTTTAGAAACATGCCAAGCTTGGATTGGAATTCAGATCGTTATAAAAATATAGGTAAAGATGAGACTTGCAATGAAGATATAGTTAAAACAAGTCTTACCAATACGGATTTTTTGAAAATTGTTGATGATGGTAAAGTATATTACGGCGGTAACCAAAACTGGTTTCAAAAGTACACTCAGAGTTTTGGAGGCTGTGGTCCTACTGCGGCAGCCAATATATTGGCGTATATGGCAATGACGGACCCGAAATTTGCAAAACTGTATGAATATGATTTGAAAAATATAACTAAAGCAGATTTTGTGAAGTTTATGGAAGAAGTATATAAATATGTGACTCCATTGGAAGTCCCGGTTTTTAGCCATATGAGTGATAAAAAAGGCAAACAAGCGGGAATACCGTCCTTAGGTATTACCGGTTTGGCTGCGTTTGCTAAAGGAGTTGAGAAATTTGCCAAAAGTAGAGGGATAAAGCTGAAAGCAAAATGGAGTGGTGAAAAGCCAACTTTCGATAATGCTGTAAGCTACATTCGGGAAGGATTGAGAAAAAACAGACCTGTTGCGCTCCTGAATATGTTTAATCCGGTTAGTATGCAGTGGGCCGATCCGCAAACAAGTAAAATTAAATCAATGACCTATGAACGGCATTGGGTAACTATTACCGGTATGATTGAAAATAGAAAGACGGGAGAGGTAACCCTTGAGGTGTCAACGTGGGGAGGAAAAGCAACGTTGAGTTTTAATGAGTTATATAATAACATGGATTGGAATGAGATGATTTTTCCTGCAGGGATAATATATTTTGAATAGAAAAAGCATGGGTTGTATAGTTTGTATTGAGGAGGCTACCAATGAAAAACGGAAAAAAAGTTGCTTGGATGCTTGTATCTGTTTGTTTTCTTTCGATGATTGCATTAGTAATTATTTATGTGAACATTAGTCCGCCGGTAGAGGGATGGAAGGATTTTAAGAAGAATTGTATCAGCAATTATTCATTTGTTGACGATGTGAACTTGGACAGAATTACGCCTGTAGATTTTCGTATTAGCTACACTTTAAACAGAAAAATAACTCAAGAAGAAGTAGACAGTGTATTTTCCTGGACGACAAAATATATACAATCGGAAAAGGTATTTAGCGATTTAAAAAAATACCATGCTAAAAGATATAGGTATAGTTTTGCTAGATTAGCAATTGTTTTTACATACAGAGACAATAATGAACATTTTGAATGTAATATTTTTTCTTCACCTGTTTCAAATGGGGAGCCCAATTATGCCGACTATAAAACATGGTATATTGAATATAATGGTAAATCTTCAGAAGTGTACAATCCAATGTTAAAGTAATTTTAATGTCGGGAAAAGAGAGCGTTTTTATAAATATTTTATAATCCAAATCAGAGAGTTAGAAATAAAAAAATACAACTTATAAATTTGTGCGCATGAGTATAATGAAATTAATTTTATGCGTAGAAGCAAACTGTAG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57 | uncultured_virus(22.22%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1179125 : 1188548
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_017304|1179125:1188548|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_017304|1179125:1188548|1182788_1183814_+|WP_173668641.1|DBSCAN-SWA MMTTYKDAGVDVEAGYEAVRLMRNDVKRTFRPEVLTDIGGFGGLFGLNKDKYSEPVLVSGTDGVGTKLKIAFLLDKHDTVGIDCVAMCVNDIVCSGAEPLFFLDYIALGKNRPEKVAQIVKGIADGCVEAGCALIGGETAEMPGFYPEDEYDLAGFAVGIVEKSKIIDGSKIKAGDKLIGLASSGIHSNGYSLVRKILAPTAKKLAEEIKMLGTTLGEELIKPTRLYVKTILDLKEKFEIKGIAHITGGGFIENIPRMLPQGLGVKVVRGSWPVLPIFTLLKDLGNLDEMDMYNTFNMGIGMTIAVDAEIANSVVEYLNKDKEQAYIIGEVVSDKEGLEIC >NC_017304|1179125:1188548|1187375_1188548_-|WP_003517446.1|DBSCAN-SWA MKRKYGEQKLNKELVSVIICVYNGEKYIESSIKSALAQTYQNIEIIVIDDGSTDRTGEIVKNYCPDVKYIYQENKGVSEARNTGLRHCSGNYIAWLDADDLYLPDKIKEQVDFLQQNKDIDCVYNDAFLIDAHDNLVKVLRSDYGNLAPNDFLAQLLFRQTIPCPPSTLYRRKCFENLRFIPGMRYAEDYWSSIQLAQRFKCGYLPKILYKYRRHDSNLTNNKEKQEEMEIKVVKSLGIDKIKDIVEKSSYPEHEKLLLLGKIFIKISEYEEACKALEKIQVPDYIQDRKTKFLKYFYLGNVNYLTKEYNKAKFCYEKSLRTDPGKAEAYNNLGAALYHLSETEEALENFNKALALKKEYLDPQNNLKNIKTGGDLKITIRELRENLMVY >NC_017304|1179125:1188548|1183807_1184437_+|WP_003517452.1|DBSCAN-SWA MLRIGVLVSGGGTNLQAIIDRIESGYIKDCSIVTVVSSKPNVYALERAKKHNISAVCIARKDYPSVHEYGEALIQHFERCEVGLIVMAGFLSILGENFVKRFENRIINIHPSLIPAFCGKGYYGIIPHQKALEYGVKVTGATVHFVDVEADSGPIILQKAVYIRDDDTPETLQKRVMEEAEWEILPEAIKLFAEGRLEIDGRKVRIKDN >NC_017304|1179125:1188548|1179125_1180523_+|WP_003517459.1|DBSCAN-SWA MEKFFKLKENGTNVRTEFIAGLTTFVTMAYVIFVNPNTLEASGMDKGAVFVATILAAIIGTLIMGLVANVPYAQAPGMGLNAFFAYTVVLGQGFTWQQALALVFLCGLINILITVTRIRKMLIAAIPQSLQYAISGGIGLFITYIGIKQAHLLDFTVSSGTYTTLPNGNVVSGDIVPALADFTDPVTQLALIGLVITVVLMLLKVRGAILWGIMATTVIGLFMGITPIPELTASNFLPPSISPTFLKLDLAGLFTDPAKIPTVLATILAFSLSDTFDTIGTFLGTGRKTGIFDEEDEKALHSGKGFKSRLDKALFADSTATSIGALLGTSNTTTYVESAAGISVGGRTGLTSVFTALFFFLALFLSPIAGMVTSAATAPALIVVGILMMESLAKIKWDEFEEAVSAFFTVVVMPFTYSISNGVAAGFVFYVITKIVKGKAKEVHPILYVVVLLFILNFVFSALKL >NC_017304|1179125:1188548|1186069_1187329_+|WP_003517447.1|DBSCAN-SWA MKVLVVGSGGREHALVWKIVQSPRVEKVYCAPGNGGISAIAECVPIKAMDIEGIVNFSKEKKIDMVVVAPDDPLAAGMVDALEEAGIRAFGPNKAAAVIESSKAFAKNLMKKYNIPTARYEIFENSADAINYLQDQKYPVVVKADGLALGKGVIIAQNFDEAKQAVQSIMEDKVFGEAGNKVVIEEFLVGQEVSMLAFTDGKTIKTMVSSQDHKRALDNDQGLNTGGMGTFSPSRIYTEEIDRYCMERIYKPTIEAMEKEGRKFKGVLYFGLIITKDGPKVLEYNARFGDPETQVVLPRLNTDIIDIFEAVIDERLDEVEISWNDSACVCVIMASGGYPKEYKTGYEISGIEDAERDANIVVFHAGTKRENGKYYTAGGRVLGVTAMENTLDEAIKKAYEGVGKIKFQDMHYRKDIGKK >NC_017304|1179125:1188548|1180660_1181182_+|WP_003517457.1|DBSCAN-SWA MGVTNVEKKPKVAVVMGSDSDFSVLQNCIKVLKQFDVEVSAIVCSAHRTPDKAAEFAKGAEENGFDVIIAGAGKAAHLPGVLAAFTPLPVIGVPIKSSTMDGLDSLLSIVQMPSGIPVATVAIDGAENAALLAVQILSTAYKDLRDKMKEYKKQLEKKVEEKNKALQEKIKEL >NC_017304|1179125:1188548|1184500_1186045_+|WP_003517450.1|DBSCAN-SWA MIKRALISVSDKTGIVEMARELQSMGVDIISTGGTAKTLSDAGIKVINISDVTGFPECLDGRVKTLHPKVHAGILAIRSNEEHMRQLKELNIETIDMVIINLYPFKQTILKENVDLSEAIENIDIGGPTMIRAAAKNYQDVVVIVDPSDYAAVLEELKTTKDVSLKTKFKLAYKVFEHTSHYDTLIAKYLREQIGEDEFPQTLSLTFEKVQDMRYGENPHQKAVFYKEVGANVGCITAAKQLHGKELSYNNINDANGAIEIIKEFDEPTVVAVKHANPCGVASASNIYDAYIKAYEADPVSIFGGIIAANREIDEKTAEEINKIFVEIVIAPSFTEGALKILTQKKNIRLLQLEDISAKIPKGTYDMKKVPGGLLVQNYNSELLNMNDLKVVTEKKPTQEELEDLIFAMKVVKHTKSNGIALAKGKQTIGVGPGQTNRVTACKIAIEYGGERTKGAVLASDAFFPFADCVEAAAAAGITAIIQPGGSIRDQESIDACNKYGIAMVFTGMRHFKH >NC_017304|1179125:1188548|1181232_1182699_+|WP_003517455.1|DBSCAN-SWA MFDVIRGKHFNYVHNLLKKDEFGFDKPKEECGVFGIYSKGNLDTARLTYYALYALQHRGQESAGIAVNNGGTLLFHKDMGLVPEIFNEKILNSLKGKIAIGHVRYSTTGASSRENSQPMVIKYKNGQMAMAHNGNLVNAAKIREKLEEEGIIFQSTIDSEVILNLISRFRLTSNNIEEAIVKVMKEIKGAYSLVILTPNKLIGIRDPHGIRPLCIGRIDDSYVLASETCALDAVDAEYVRDVNPGEIIVIEESGMTSIQTEVPEKTALCIFEYIYFARPDSYIDGVSVHRARIEAGRRLAREHPVEADIVFGVPDSGVSAALGYSMESGIPYDLGLIKNKYIGRTFIQPEQGQRESGVKIKLNALKEAVNGKRVVMIDDSIVRGTTSKRLVQILRDAGAKEVHMRISSPPYMYPCFFGVDTSSRSQLIAAECSVEEIRKMTGADSLGYLSLEGLLKTPVGAKCGFCTGCFTGKYPMEVPKDASKYSCG |
8 | Prochlorococcus_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
2217048 : 2286526
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_017304|2217048:2286526|DBSCAN-SWA 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51 | Bacillus_phage(21.43%) | tRNA,coat,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2783691 : 2862003
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_017304|2783691:2862003|DBSCAN-SWA 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78 | Erysipelothrix_phage(69.23%) | holin,protease,capsid,tail,terminase,portal,head,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
3124567 : 3205645
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_017304|3124567:3205645|DBSCAN-SWA 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57 | Enterobacteria_phage(28.57%) | tRNA,holin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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