Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_017847 | Acinetobacter baumannii MDR-TJ, complete sequence | 1 crisprs | cas3,DEDDh,WYL,csa3,RT | 0 | 0 | 8 | 0 |
NC_020524 | Acinetobacter baumannii MDR-TJ plasmid pABTJ2, complete sequence | 0 crisprs | DEDDh | 0 | 0 | 2 | 0 |
NC_017848 | Acinetobacter baumannii MDR-TJ plasmid pABTJ1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_017847_1 | 2357078-2357163 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_017847_1
|
1 spacers
spacers of NC_017847_1
>1.1|2357101|40|NC_017847|CRISPRCasFinder GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017847_1
The CRISPR arrays of NC_017847_1 >merge|NC_017847|1|2357078-2357163|CRISPRCasFinder CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGAGGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGGCCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA >NC_017847|1|1|2357078-2357163|CRISPRCasFinder CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGA GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG CCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA
>NC_017847.1|WP_000795915.1|2355840_2356077_+|hypothetical-protein MKNQRDAVLGYADEQHAYYIRLIENDAVLGESYGIFCENPESEAAESIMTTLFLKKSFWLNGSEFTDIVKGLHPLTHS >NC_017847.1|WP_001124846.1|2354946_2355558_-|translesion-error-prone-DNA-polymerase-V-autoproteolytic-subunit MPKKKEFEHGGARENAGRKAQFNEPTKVIRVPESQVNFIKNWLLNNVKTNNQTDFTSKLKIQQVHPNNDKIYHIPLATERVAAGFPSPAQDDIEQALDLNEYLIRNENATFIVKANSLSMLDAGIDIDDPLIVDRSIPAKSGDIVIALIDNDFTVKRLMIDTQFHPPKVWLKAENPDYQNIYIEEGQELVIWGVVTYNLKRMR >NC_017847.1|WP_000885229.1|2354264_2354876_+|LysE-family-translocator MAFNIFIAFWSVSILFIITPGADWAYAISAGIKGKVVVPAVAGMLFGHFITILLVAAGVGLLVANNPTALMILTVAGSAYLLWMGINLLLTPPTPNESGSEKAQSWLRWATKGVYVSGLNPKVFLLFLALLPQFIDTTASWSVTTQILAFGVVHIISCAIIYLMVGYGSEAILKTRPQAAQLVGRFSGGLMVVIATCLLIGQI >NC_017847.1|WP_000376215.1|2353652_2354108_-|Lrp/AsnC-family-transcriptional-regulator MDRTDKKILAELQLNGRLSITELAEKVGLSISPCHRRVKALEESGAIKGYRAELDPNLVGFEFSAIVFITLKEGDKQAVEKFENAVIEIPQIIQAQRLFGEPDYLLHVVARDLPAFQRLYDEKLSAIPSVQRLISTIVMKDVVPERLFPIG >NC_017847.1|WP_001990047.1|2351947_2353594_+|allantoin-permease MTENDWEIDVMSVSEHPNLDTVQGADSQKAVNETLEDYTLRYAPHSFRRWSPKVVAITALGGIAYLADFSIGASIGMSYGTTNAVFSILFAAIIIFLTGIPLAYYAARYNIDLDLITRGAGFGYIGSVLTSIIFASFTFIFFALEGSIMAQGLLLGLGIPLWAGYLISTVMVIPLVIYGMKALSKLQVWTTPLWLVLMIGPVAYLIYQEPTLVSQFATFTGHEGFAPVDMAAIMLGAGICLSLIMQIGEQIDYLRFMPAKTKENSKAWWAAVISAGPGWVILGAIKQIIGAFLGFYLLTKIPGVNSTEPVQQFNAAFHDMLPGWAALTLAVILVVISQIKINVTNAYSGSLAWTSAYTRISKHYPGRIVFVIVNLAIALALMEGNMFAVLGKILGFYSNFAIAWVVVVATDISINKYVLKLSPKEPEYRRDMLYNVNPVGMVAFLVSAGLSIAAFFGLLGSFLAPYSPIIALVLAFVLTPIMGLLTKGKYYIKSHDDGVKEPRYDAEGTPVATVYHCRVCEQGYERPDIMFSHKHNGTICSLCKTLDA >NC_017847.1|WP_000115408.1|2348317_2351782_-|response-regulator MSVMPDTSRPQQAPQRVIKTRREYNIWVADESIEDYALRYAPTSVRKWSPWTVTNTAISTVSFLAMEAIGATMLWQYGFSNALWAAIVVCTIIFLTSWPISYYAAKYNVDVDLLTRGAGFGYIGSTITSLIYASFTFILLAFEAAIMAMALELALGIPQVIGYLISALVILPLVVKGIGFINKVQAVTQPIWLLLLLLPWFFVLWKQPQILSSSLHFVGAVSNSTDFNLYYFGAACTLIFSFVIQIGEQADYLRFLPQKEKNRTAWRFAVFLGGPSWIIFGFLKVLMGMLLMVLAFQLFIPVSELDNPTYLYWVAYQQFIPNPQLALILTLALVCLAQIKINMTNAYAGSLAWSNFFARLTHSHPGRIVWLLFNVFIAIVLMEMGISHAVERILGLYSNIALAWIGAVVADLIICKPLGLSPKGIEFRRAYLYDINPVGVGALLIASVLSMLSYLGFFGLMAKGLASFIALGSAVLCVPVIAYLTTGKYYIARQPEKIQATLVANCVVCERDYELADMAGCPAYNGTICSLCCSLEARCHDLCKPDARWSVQLKKAIWHYLPERWASRLNSRVSLYLLLTLGLSIVLAVSLSLVYIQEKTYLETINAAAVPQLFTLFVKIYTILFLLMSVAAWWLVLNDESRRNAEIETHQQTALLIDEIAAHEVTSKDLQDARIAAERANDAKSRYVIGISHELRTPLNSILGYSQLLQKQEQLSEQGKMALGVISRSGQHLTSLIDGLLDLARIETGKISLNVVDVHFPNFIEQIIQMFQPQFEQKNLQFVYEIGENLPHYVRTDKKRLEQVLINLLGNALKFTTSGTITLKVEYRFQTAYFEIRDTGCGIAEADLERIFNPFERGSNVVQGGFTGIGLGLPIVKLLVDLLGGQLSVTSQLNQGSQFKIKFYLPSKEVVHPISNVYSNQITGYQGERKRILVVDNEAVDRGLVANFLKPLGFMIEEAESGIDCLRRVPIFQPNLILMDLNMPLMGGWETARLLRQNNITNVPILIISANAGEREVNPQDAVLSEDFMLKPIDLNLLLSKIGDKLGLVWIDSKSETLLENNEVQALDLNIYKQEQVAVHTLIQQPENNELLDFPQSLQQLNDLIGQGYIRGIQQTLTQCRQNFPKHNELWEQLEQAIQKFDLKHAQRLIQDKQ >NC_017847.1|WP_000107128.1|2347361_2348321_-|response-regulator-transcription-factor MSTQHVSFQQASPNEQAVILIVDDVPENLGLLHESLDQAGYRVLVTTDGLSAIEIAHRCLPDMILLDGNMPHMDGFESCIQLKASPITQFIPVIFMTGLSETEHIVRGFQVGGVDYVTKPLNIEEVLARVKTHLAHAKLLQQQKQVIDATETAILALDVHGKIVWKTQKASDLLNQYLPELEGFEAGLKAWFSDLEHEKDPKKLTSCSYSTPSQQLQLLLLTPWETEPSVAKNYLIQIKTSTPALEMADILKYCPQLTQREAEVMHWLLLGKTNKDIAEILELSPRTVNKHLEHVFEKLCVENRTAAVAHINSLVQEFH >NC_017847.1|WP_001025680.1|2346933_2347218_-|N-acetyltransferase MNIQQKDDTKHGSFSLLDGETVAGEMTYTWAGESMLIIDATDVNENYRGQGVGRQLLDALVAFVREKDVKVIPLCPYAKSVFDKDPSIGDVLRK >NC_017847.1|WP_002017921.1|2346711_2346825_+|hypothetical-protein MCNKFIFFPIGLKLFLLDKLFYKFDKFDLAIENLQIS >NC_017847.1|WP_000937460.1|2345987_2346623_-|amino-acid-ABC-transporter-permease MLPQFFSATLTTLKISIISIILAIIVGLICSILITYHVRVLNRIAQFYIELSRNTPLLIQLFFLYYGLPKLGIKIDGFACGVIGLTFLGGSYMAEAFRAGLQSVAKGQIDSAKSIGLKPTQIFRYVIFPQALAISIPAIGANCLFLIKESSVVSAIAVVELLFVTKDLIGMDYKTTEALFLLIMAYLIILLPVSILTSYLEHRSRKVSHGT >NC_017847.1|WP_000983628.1|2357794_2358208_+|hypothetical-protein MMQPTHTHSTLQYIHISVPEILLSNIQIKNSWQDYNQEWSYRLDPPHASHPFQRDLYIIKSKNIETEDIKKILDNIVVKNSKNKDDLKNIVEAETVIKEILDLSNYIPIENWLNDTGNRSIVESMIDKNKVKLLDII >NC_017847.1|WP_000432330.1|2358349_2359228_+|glucose-1-dehydrogenase MENTTNQYPSEVPAQVQPHQPGDQEKMHPEPEIIKASHKGSEKLKGKVAVISGGDSGIGRSVAVLFAREGADIAVLYLKEDQDAEITKQLIEKEGQQCLLLKGDISDPDLAKQNIDKVLQHFGKINILVNNAGVQYQQKEIESISNEQLEKTFKTNIFTMFYLTKEAIPYMEEGDSIINTTSITSYQGHDELIDYASTKGAITSFTRSLSNNLMKQKKGIRVNGVAPGPIWTPLIPSSFDAETVEKFGKDTPMGRMGQPSEVAPAYLFLASDDASYITGQVIHVNGGQIVNG >NC_017847.1|WP_001990041.1|2359284_2361429_-|catalase-HPII MDMNDNTKSTNKTSEMAGADAANKANTTQKTEQLDTVRDDATNEALTTNQGVKIADNQNSLRAGIRGSTLLEDFILREKITHFDHERIPERIVHARGVGAHGYFQAYEGNERLTKAGFLTDPTIQTPIFVRFSTVQGPRGSADTVRDIRGFAIKFYTQEGNFDLVGNNAPVFFVQDGIKFPDFVHAVKPEPDTEIPTGATAHDTFWDFVSLVPESAHAVIWAMSDRAIPRNLRSIQGFGVHTFRLINAEGKSHFVKFHWTPKQGLSALVWDEAQKLAGKDPDFHRRDLYEAIEHGFYPEWELGVQIVEEEDEMNFDFDLLDPTKIIPEELVPVTPIGRFVLNRNVDNFFAETEQVAFCPGHVVPGIDFTDDPLLQARLFSYTDTQLSRLGGPNFHQIPINKPVCPFHNNQRDGIHQHTIHKGQAAYQPNSIDGNWPVETPPAASNGGFESYPEKISGHKLRQRSETFSDYFSQPRLYYKSLAPHEQKHVVDAYTFELSKVQRKHIRERQVQQILANIDLDLARQVGANLGIEVPDLTLSYKKTAVEKSAKLSFLAFPPEDIQGRKVAVLIHNMVKSDALEAIKNWAIKEGVILHLLAPSLAPVKDHKDNVIVADGMQMSEPSIAYDAVIIPDGDNLNTVMQDGVARHYLLEAYKHLKPIVFLGNKSDLLEPLGLVADEGTLIEDEFQHVAEKFKNLIKAHRVWSREQIAAHVPA >NC_017847.1|WP_001145693.1|2361483_2362893_-|iron-containing-redox-enzyme-family-protein MPVVVKKRLLDLLQDNQQNYYELFVFFLDPDVSSFEKEKKARDFLVKEIDKLEMKEIDFPSDINLIKAWCENDNKKNCQEFQAYLNRRQSGQDREYFKNVAQAFEFLIKVSPTKKVDGAWLYSSVHYWNDPIFHELIITYLEELGLGEPKANHVCIYDDLLRSLGLDSFDLLLEDEYYHQAVVQLALGYAPPEFIPEIVGFNLGYEQLPLHLLISNYELAELGIDSKYFNLHITIDNIDNGHAYKAIKVIEDIYNQYRDKELFLTKLKRGFALNNHGVSSSNIIKNLNTEDFVHRIFKRKALVGQLIHNETRQFGCKTINQWLSNPDDIAGLITHLTEHKWIKFNTDPEQSVFWRMINEENGKMFGVFNPVERQIIHDWIAGSDHSSSFLAYSRELKNSQRIQDYLFSYISDGELDALQERVQQSSDLAIKICKLTPFLAPDSHHKSIGLWSTRKYVELLFPYLGTFKN >NC_017847.1|WP_000482091.1|2363208_2363688_+|CinA-family-protein MFNKCCELLAKEKIKIAFFESASAGYLAYRFSLSPYSGDILIGSLVSYDLRVKENTLHISEELIEKYTAESMQVTVEMINKGKELLHADLYVACTGLLKKGGSETPEKPVGTFFYSIYYKNNFYNFRRVLRGPAFLKLRKLIYYVTQDIKLIILEDKRR >NC_017847.1|WP_000108365.1|2363972_2364194_+|hypothetical-protein MSTTNNQANQRNNQQQQQQQNDNRNQQQHGNQQQNDQQQQNNQQQQQNDNRGQQQGSNQKDSGQQNSNNNQQR >NC_017847.1|WP_000132044.1|2364299_2364617_+|hypothetical-protein MTDQNTDHAQLVAGDHNYSDSRWRESYLTRPYYQEAQLTTPDLDYDRDFSAAYELGHRARSESKEGTQFEDMEGSLQQKWEELKAESRLKWEHAKQAIKDAWDDI >NC_017847.1|WP_000498477.1|2364701_2364923_-|hypothetical-protein MFVYFTDGTCINDSEIYGVKAKYEQNKYVVEVTIKPTHVLATTPSVQFKKEVFDDPNLANQYLSHNFNMPPFF >NC_017847.1|WP_001136759.1|2365010_2365439_-|hypothetical-protein MPQYLKIAEKIYQNVKEKKGFTDDPMEDLNNLMIELRQEIKGTKLKLLYNYIDFAEILIKPLQESKIKLDLSLIPKSKNTQEFVLWLAGFIERITTGGQEKLPPIRAKITLPAYAYEETYPSQKKPVNNGEEIIEYFKKNQS >NC_017847.1|WP_000251637.1|2365708_2365852_-|hypothetical-protein MVRIFCAVSMVLAIAMGMSACQDRNSRNDGMHEASDPATSHDMNKNS |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
989749 : 1034187
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_017847|989749:1034187|DBSCAN-SWA CATGTCTACTGTATCAAATCAGATGAATAAAGACAAATTGTTAGAGTTAAAGCGCCAGCAAAGTTACCAGTCCTGGCATGGGCCAGCTTTAAAAACGCTTGCCGATTTATTGAAAGAACGCAAAGCGAACTTAAAGAAACGTAACCATGATGAAAACCAAGCAGCGGTAACACGTGATGAGTTTATGCAAGGCCTAGTTAATGATCATGGTGTACACGGCATAAATCTTTATCACGCGGGTGTAATTATCTCGAGTCTGTATAGGGCTAAAAAAATTCGATATTTGGGTAGCTTCATCCAAATTATTGAAGGGGATGGTGGCGCGTGATCCCACAAGAACTAATTAATGAAATTAGGCAAAATGCCCTTTTTGTTATAAATCATAGCGGTGGAAAAGATAGCCAAGCCATGATGATAAAACTACTTGAGTTTGTTCCTAAGGAGCAAATTCTTGTAGTTCATGCAAGTCTTGGTTTTATGGAATGGCCAGGAGCATTAGAGCTTGCACAGAGTCAAGCTGCTGCAGCTGGCGTTGATTTTATTGTGGCCAAAGCAAGTAAAACATTTCTTGATATGGTTCTGAAACGATTTTCTGAACGCCCTGAGGTTCCTTCATTTCCTTCACCTAAGTACCGCCAATGCACCAGTGACTTAAAAAGAGATCCTATCAAGCGAGAGGTACGCCGTTACGCAAAGGCTAATGATTTCAATCGAATAGTAAATTGTGTTGGTTTGCGTGCTGAGGAATCTAGCCATCGTGCAAAGCAAATGATCTTTAAACCTGCAGCTGAGAATGGTAAAGCAGGTCGCACCTGGCATGACTATCTTCCGATACATTCTCTTACAACCAATGAGGTTTTTCAGACCATTAAAAATGCTGGTCAATCACCTCATTGGGCGTACCAGGATAATGATCGTTTAAGTTGTATCACTTGCATTATGGCAAGCGCGAGAGACTTAATTAATGGTGCAACAAAAAATCCTGAATTCTATGCATTGATGTGTCTGGTAGAACAAATTACTGGATATGCAATGCACGCTAGTTTGCGGTTCCTTCCTGATCTAACCGGTATACATCCTAATTATTCACTTTTAAGCGAATACCAAGATCTAGTTTCAAAGTTTTCAAATACGCGCTCTAACAGAAAACGTATACAAATGCTGGAGGTTGCAGCATGAGTAAGTATGTCCCTAATTCATTCCAAGTTGCGAACGCTTTTGTAGATGAAGCAATGAGTAAAATCTCTGATGCTTCAGTAAAAATCTATTTGATTATTAACCGTAAAACACGTGGCTGGGCAAAAGAATGTGATGCGCTTTCACTTACGCAACTAGAAGAACTGTCAGGGAAAAGTCATCCAACAGTCGTTAGATGTACAAAAGAGCTTGTTAAAGTTGGTTTAGTAAGAAAACATGAGCAATCTGTATATGGGAATGTTTACTCATTAATAGACAATTATTTTGTTGGTGAGCATGTAAACTTCCCAAACAAGAGTTCAGTACTTGTTCAGTCTTTTAGCTTATTTAATGGGCAGCTAGTTAAAATTTTTAACTACCAAAAGCCTGTGTCTAAAAAATCAGTTAAGAGCAAAAAGAGTAAAAATCTGTGTTTAAATTTTCCACAAAAATCTCGGTTGCTAGTTAAAAATTTTAACTACCTTGAAAATACTAGCCAGTTAAATTTTTTAACTACTGCTAGTAAAAATTTTTTACCCCTACTAGTTAAAATTTTTAACACACAAAACACACTATCAAAACCAACTTATCAAAATAAAAAAATACATGGTTTGTTTTAGAAAATTTGAAGTTTGAAATTTGTTCTATCAATCCGTCAATTGATACGGATGAGATTTTCAAGGCCTCTTGGTTTGAGAGAGAGTTAAAAGCATTCAAAGGTTTTAACGAAGGTCGCAATCACTCTGATTACGATATGGTTCGATTCTTTGCTGAGTGGATGCTTAAAGCACGCGCTAAATACGCCAAGATGAAAACACCGGCACCTCGCCAAAACAATTATTCAAATGGTCAGTCAGCTAAACCAGCTAATCAAATTCCTGAAGTAATTACTTTCGCATCTGAAAAACAACTATTCGCGTTCGCACGCCGTTTAGTAAACCATCCTGATTTCAAAGATACATTTTGCCATACCGGTGAATCATGGATGGATGCTGGAAAGCGTATGGCTCAAAAGTTGGTAGATCCTCAGGAACAAAAACCATTTATTCCGTATTTGATCGAGATGGGTTTTAAAAACTCATCCAAGGAGACGGCTGCATGATTACTCTAAATAAAACTACCGGCATTCAAAAATTAAAAGAGATTCTTCAAGAATTTGATTCTTGTATGTACATCGAACGTGACAATTTTTTTGACAAGCATTATGACCTAGTTAAAAGCGAAAGTGATATTGAGCAAATTCGTATTGCAGTCAAAGCAGCTGAATTAAAGAGGGGTACACGTGTCAAAGTAAATTTCACACATGTACCAGACAAGGGTCAAAACAAAATTCATTTTGTTGGCAATGGTACTGTCGATCTGTTTGAAGATAACCGGGTATTTGGTCGTTTAGATGATGGCCGACCTTTTTGCTGTTTAGTCTCAGATATAGAAATTTTGGTTTCAGAAAAATTAGAAAAGGAAGATGGCTACGAAGAATCTAAGGCAGTCAATAAAGTCTATTTTTTTCTTTGTTTGGTCTTGGGCTGTGCAGTAGTTAAGGGGTGTGGCCTATGAAAAAGGTTATCAGTTTTAGTGGTGGACGTACTTCAGGGTATGCAGTCAATCTCTTTAAAAATGATCCTGATGCTTATTTTATTTTTATGGATACTGGCGCAGAGCATCCAGCTACTTACCAATTTATTAAAGATATTGTTAAACATTGGAAAATAAATCTTGTATGTCTTCGTGTAGTCGTTAATCCACAAATGAAAAAGGGTGTGGGCTACAAAATTATACCCCTTGATGAGCTCAAACAAGACTTGGAACCTTGGAGAGATATGCTCAAAAAGTATGGAAGTCCTTATTACGATATGCCGTTTTGTACAGCTCGTATGAAAACTGAACCTTTTGAAAAATATTGCAATGATGTGTTTGGGAAAAACAACTATGAACGATGGATTGGTATTAGATCTGATGAGCCAAAACGGTTGCCAATTGAGGTTTTAGAAAAGCTTGGTTTACCTATTCATAAAGACGCAAAGAAGCAGAAAGCCGGGTTTAGATATTTAGCTGAAATTAGTGATTTCACTAAAGAAGATGTTTTGGACTGGTGGGAACAACAACCTTTTGATTTAGCAATTACAGAACATCTAGGTAATTGTGTTTTTTGTATTAAAAAACACTTAAACAAAGTTGCACTAGCTGCCAAAGACGAACCTGAACAAGCAGTGAAATGGATAGCGGTTACTGAAGGCGAAAACGTCAGATCTGAAGGTAGAAAATACAACCATCATCGGATGTATCGAACGCGGTTACATTTGAGCGATGTTATAGAGGCTTTCAAAAATCATGACAGAGATGAGCTTTACAACGCTCTTAGAAGTAGCAAGCGCTATGAAACAGGCTCTTGTACTGAATCATGCGAAGCCATTATTTGAGGGAATGGTGGATGAAGTTAACTAAACAACAACGGGCAGAGTTAAAACAAAAATTTGGCGGCCATTGTGCGTATTGCGGTGAAATGCTCGGTGATAAATGGCATGCGGATCATATCGAAGCTGTGAAACGAGATTTAATTCATGTTGGCGGTGGCAAGTTGATTACTGGAGAAATGACTAGACCGCAAAACGACACTTTGGAAAACATGAATCCAGCGTGTGTTCCTTGTAATACAAACAAGTCGTCTATGCCCTTGGAAGGGTGGCGGAGGATGCTCACACATTATCGTGATGTTCAGTTGTTACGAGATAGCACACATGCTCGTCATTTACTACGTTTTGGGCTGATTGAAATCAAATCTGAGCCTGTGAAGTTTTTCTTTGAGAGTTATAAAGAGGGCCAGTCATGAATAAACCATTAGAAACTTTTGATATAGACGCAGCAAAGGCTCGCTACGAAAAATTACGAGGCCGATATAACCGGAGTGGGCTATCTAATACTGATTACAACGAGCTACTTCAATTAGAAAAGGCAATCGAGCAAGCAAAGAAAGTTAATGAAGGAGCGCCGATTGATGAGCGAAAATAAGTTATCACCAAGACAGTTGGTACTCATTCGACGGGCAGCTGAAGATGCTATACATGCTTGCAATAGACATTACGGCCCATTTGTTGACTATGTTGCTCACCCATTAAATATCATTTCATTGGTTGATATGGCGCAAGAAAGCCTACACCAGCAAGAGCTAATAAAACAAAAGGATACAGTAATAAAATTTGCTAACAGTATGGCGAATTTAGATCAACAGAAGTTCAAGGAATTACAAGAACGGATAAATCTTGCCCTGCAACAAATACAAGGCAATTTGCAATATGTTGAGCAGGATAAGAGAGAAAACTTTGAATTTCTGCAAATGGCTATGATTCGAGCATTTAAAGAATTAGAGAAAGTGCTCAATGGTGGTGAGCCTAAATGACATCGATGAGTTTAGCGGATTATCACTCTAAATTTCCAAACGGCCATAAAGCTAAAAAGGGCCGTAATAAATTTAATGCTTCAAAAGTCACATTAGATGGGATGACTTTCGACAGCAAAAAAGAACTCAAGCGATATATCGAACTTAAAGCCATGCAGCAACGCGGTGAAATCTTTGGATTAGAGCACCATGCAAAATTTGAATTGGCTCCTAAAACTAAGATAGAGGGGGAAAAGAGAACAAAGCCGGCACTTAGATATTTTGCTGATTTTACTTACTACCTCATCAATGGCGAGTACATCGTTGAGGACGTTAAGTCTATTGCTACTAGGAAATTACCTAGTTATCGCAATAAGAAACATTTAATGAAAACTGTACACGGTATTGATATTAGAGAGGTTTGAGAAAAGTTTATGAGCGACATTGA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54 | Acinetobacter_phage(65.71%) | holin,integrase,tail,terminase,capsid | attL 1019428:1019442|attR 1044052:1044066 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1198534 : 1213331
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_017847|1198534:1213331|DBSCAN-SWA 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10 | Acinetobacter_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1376287 : 1400787
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_017847|1376287:1400787|DBSCAN-SWA 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22 | Escherichia_phage(28.57%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1575049 : 1617033
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_017847|1575049:1617033|DBSCAN-SWA 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57 | Acinetobacter_phage(96.43%) | capsid,integrase,plate,transposase | attL 1574872:1574889|attR 1617541:1617558 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2744022 : 2776058
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_017847|2744022:2776058|DBSCAN-SWA 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46 | Acinetobacter_phage(43.33%) | head,integrase,tail,protease,terminase,portal,capsid | attL 2743809:2743862|attR 2779895:2779948 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2787089 : 2815762
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_017847|2787089:2815762|DBSCAN-SWA 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37 | Acinetobacter_phage(93.33%) | capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_7 |
2819720 : 2832068
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_017847|2819720:2832068|DBSCAN-SWA 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ACTGGCGACTCAATGTTTCCAGCAATTCGTAATGGCTGGTATGTTGTATGCGACCCTGATGCAGATCTTGTGCCGAATGAGTTTGTTCAGGTGTGCTTGAAGGATGGAAGATGCACAATTAAAGAATTTGTCGGCATCAATGGTGGGGTTTTAAGTTTGCTTTCTGTGAATGGTGGTGAGCGATTTTTCTTTGAAATGGACGAAGTTGAAAGTATTACCGCTATTACAGATATCGTGCCGCCAAGTCAGCACAGACAAGAACATCCTTATTCGCATTAATCACAGGAAGACTTATGGACAATTCAAAACGACCAATCAACCAGATTATTGCTCGCATCAATGATGCTGCGAAACATGGTGAAGCTTTGGTGCTAACAGCCGAAGAAGTGAAGATCCTCTCAAAGGACATTGGTGATAAAGTCTTTATTCCAGTCCTTACAAATGAACAAGTAGTGCAGTTGGTAAAAGAAGGAAAGCTTGGGCAGAAAATTAACAACACCAAAGATTAATAAGTTGTGAACCCGACACAGTACTTTAGAGCGATTCGGGAGGAGGAAATAATGAGTAAAACAGTAGTAAAAGACAAAACAGTACACTACAAAAAAGTAGATTTTCTAAAAGGCGCCAATCTAGGTCAATTACTAAAAGCACAATTGCTGGATAAGGATTCTTTTTACTATAAAGCCATAAATCGTCAACAATTTGTCTCCGCAACAAAAGATGATTTTATTCTAATTAATCATGCTAGTTCACACCAAAGCATGTTCTTTGGCGAGTTGATTATTGTTGAGTCAGGCAAAGCTCAGGCTGTATTAAAGATAGACAGTGATGATGCTACTGAATTTCCCATTAAAACCTATTTAACAGATGATCTGCCAGATGATGAAGATGGCGTTGACGCTACAGAGGTTGTAAGAAAAGAGTTTATTGATAGTGTTCTTTACTTTGGTGTTATTGATAACCATGTCGCAATCATTCAATCAAGATCACTTACCGCTAGAACCTTGGAGTCATATTTGGGCTGGCTTTTGGGTGAAGCAGCCAAAGCATTGCCAGAGAATAGTGCATTAATATTAAAAGATGCTCCAAATCCCACTGTTAAGCAAAAGCTTGAATCAACTCCAGCTAAAACTATTTCAATCTCATCTGGCATTGGGTCAACAGAACTTCAACCTGTTCATACTGTCGAATCAAGCATACCTGCGAAAATTGACTATAAAATTGAAGATAATGTGGTTGATGTGCTTAAGTCAGCTTTTGGAGTTGATTTAGAAAATTTAAAACTAGAGGATGGGCTTGATGACGCAAACCTAAAGTTAAAATTAACACTTACATACAACCGCAAAACCTCAAAAAGTGGGCAAAAAGTTATTGATACTGTAGCTTCATCCATGCGACATAATGATGATTATGTTATTACTCTTGAGGATGGGACCAAGGTTACGGCTGATAATCTAAAAATGAGCGGCAAGATTTCAGTTGAAACAATCAATAATAAAGTTTATAACGACGGCCTAAAAGTTCAATTGTATAATTGGATGACTACCAATATAAATTTTGGTGACTAATATGGCTAAACGCTACTTACCCTTCTACAATAATGCTAGATTTATCGCACTAGTGTTAGTCGGTCTGTTTGCTATATTTTCAATAATTTTTAAATATTTAGAGTTAAATATTACAATAAATCTGGTTCAATTTTCATTTGTACTGCTTCTCCCTTTAAGTCAAATTTATTTGGCTTATAAAGGTATGCTCGATGCATTAAAGCTTGATGGTTTAAATCAGTCAGAACGAGATAGGTTGACTTCAACTGTGGACATAAGAAGTAAGTCATCTTTATATGTGGCTATGCTTTTTATTATTCTTGTTTTTAGTATGTATATACTTAATTTATTAGGCTTACTTTCAGCTAAGCATCTTTTAGCTCTAATACTTTCTGTTGGACTCACCTCAATTTTTAGCTTCTTCTTAGCTTGGTCTGACTTAAGAGAAATCTCTTTGCTTGAAAAAACATTAAAAGATCGCAAAGAATCAAGAGAGGCAAAAGCAAAAGTATTGAGCAATAAGTAAAAAGCGATCCAATTCATCTAATCTACCCACCACCACGGTGGGTTTTCTTTTTTAATATATTCAAATTTTCCCTGATATTATGGGATTAAGACTTTGTGCCAACATTGATCTTAAATAACCATTAATATCGGAGAAAATATGAAAACTGAAATCATAGAAGCTCTAGCGTTAGAGCTTACTAAGGCAACCATTGCTGATACTGATCCTTCAACCATCAATATAAAAAGTGCTGATCTTTGGGTTAAAACCTACCAGGAATCACTGAAAGCGGTAGAAGAAGCTTTAAAAGAACTTAAGCCAAAGCCTAAAGCCACATCAAAACCCATTTCAGGAATGAGCTAACCCTGATTACTCACACTCTACTATACTTACCTTGCAGTTATTCTTGGTGGCAAAGTCATCAAGAATAGCTTTCAGCGCATACGCGTTCCGAAGCGTGCACTCTATTTTGAAAGCGGCTGTGCAATCACCAAAAAGAATCTTTTCAGCACGATCAACTTTTTCTTCTAGTTGATCAATATTACTTTCCTGAAGCAGTAGTTTCTCAACCATCTGCTTGCGCCATTCAAACATTTCTTCGCCTAGACTCATTTCTATCACCTTTGATAGTTGGGTTTTCTTTTGTCTATTAAAGCATGAATTATAGTTAATAAAAAGATTAACCATTGTTAACTTTTCTCTTGACTAAAAAATTAACCATAGTTAATATAAATCTCGTAGACAACAAAAAAGCACATCGACTCTCTTACCTTCCGATGTGCTTTTGCAAACTGCGAGATCAATTATGAACGTAAAAGCTACCCCTTTCAACTCATTTGCATTTGTCAGCATGGCTGCTCTTGCAATCTCTGGTGGTTCTTTAGTTGCTTGCCAATTGCAACCAGCTTTCCAAACAAAAGACGCACCTACTCTTTTTACACCTAAAACTCAACCAAGTACTTACAGCGTGTTAACCGCAAAAATCACAGGTAAGCATTCTGGAGTTGCTGTAATTAAATTAGATAGCTTCCGTTTAAACGTTAGCTTTGATTTTGAAGCTCATCCAGACAGCTACGGCGTTCCGGGTTCTGAATTCACCACTGTTGATATTACCCAACTCACAGTAAATGAAATCACTGACATTAATGGTAAGTCATATAACGATTTCACCGAATTTGAAGACATCCGCAACATCAATAGCCTTCTAAAAGGCTTCATCGAACGTAACAAGTTGGTGGAGGCAGCCTAATGAAAGATTACAACTGCCCTACTTGCAAGAAGATGATTCCTGTTGACCGTTCAAAAATCAAAGCTGGTGATGAGGTTTCATTTTGCAGAGTAACCCAATCTTCTAAATCTGCTCGTTTTTCTTCAAAAGAAGGAATTGTCGATTGCCGTGAAGGTGATGTGGTTTTAGTTAAATATCGCAAAGAAATTATTCCTTTAAATATTAAGGACGTCTCACCTGTAGATGCTCCTAGCCCGCTTACGTATGCCTTTGTTGGTGCATGCGAATGTAAGGAGGCTGAACATGTCTAATTTCAAAAAGCACCCTGACGGCTATAAGTCTTTTTTAGGTCGTGATGATAAAGGGCTGTATTCAGTTCGCATCGGCTGGCAAGTGTACGCATCTAATGCTAATGGCTCAGTTCTTTACAAAGTTAAAGACGGATTTAAGACGCCTTTAAATGTGTTCAGGTTCCAAACTGACTATCCAAAAGTTTGGAATGAACTCACACAAGAAATTGATTTTCAGCGCAGAAAGCAGCTCGCTATAAAACTGCGTGAAACAAATATCCCTACCTATGACCGCAAAGCTTATAAAACTAAGCGCGGCTTCACTGGCTCAAGATAAGGATAATAAAAATGGCTCTACCGATTATTACTGCTGACCAAACTTTATTAGTTCAAGCAATTATTGTGTACCTATACGCTGATCCGGGTTTAGGTAAATCATCGATGGGCTTTACTGCGGAAAAAGCAATTTCTTTTGACTTTGACCGTGGTGCTCACCGTACTGGTGAATTACGTCGAGGTGCGGTTGTACAGGTTCAACAATGGAGTGATGTTGCAAACCTTACGCCGCAGGACTTAGCACCCTATAAAACCGTAGTCATTGATACCGTGGGTGCAATGCTTGAATGCATTAAAACCCACCTGTTACTTACGGCAAATAACCGTCAAAAAGATGGTTCTTTAAAGTTAAAGGCTCAAGGATTAGCGAACCAAACGTTCAAGCAATACATCAATACTTTGATCAGTTTAGGTAAAGACGTTGTTTTCATTGCACACGCTTCAGAAGATCAAAACGGTGATCAAATTATTTACCGACCAGATCTAGGTGGTAAAAACCGTAACGAGCTTTACCGTATCGCAGATGTGATGGGTTATCTAACAACTGTTACTACAGGTGAAGGTAAAAATGCCCGCGTTATTAATTTTAAACCCTCGCCTACACATCATGCGAAAAACTCAGGTGCTTTAGGTGGTGAAACTGGTGAAGTATGGGTACCAGATCTTAAAGCACATCCTACTTTCTTGGCTGACCTGATTACTCAAGCTAAAGATCACATTAACACCTTAACGCCTGCACAACTTGCAGCAGCTAAAGCCCAAGAAGAGCTAGAAAACTGGAAACAAAGCTGTGAAGAAGCTGAGCATGCAGGTGACCTTAATCAATTAACTGAGTCGCTTGATAAAGAACACATGTATTACCAGAACATGCGCCAAGCAATGTTAATGAGAGCTAAAGCATTGAATTGCACGTTTGATAAACAACGTGGCACTTGGATTAGTCCACCAGAATTTAACGGTATCTCAGATCAACAAAGAGATGAACTTCAAAACTTTATTGCTGAACGTGGCCTCGATGTAAAAACAGTTTGTGAGCACTTCGGCATAGATGCCCTGATCCAAATTGAAGCGGCAAAACTAACTGCAGTTAAACA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_017847|2819720:2832068|2824245_2824998_+|WP_000052252.1|DBSCAN-SWA MSLHTRIRQKLEEKKLRAADLARATKKSPVAAKKWLDGTSVPTAENLKVIAKFLGVSDDWLLYGGSDEQESSNNLAQLNVIDIEAFKQKYNIPDSEDAVKFVQAPAKPFPIQKRYVPVKAYSKMGMDGYFTDMGYDGNAGDGYVPTHTAGPRAYGIKGTGDSMFPAIRNGWYVVCDPDADLVPNEFVQVCLKDGRCTIKEFVGINGGVLSLLSVNGGERFFFEMDEVESITAITDIVPPSQHRQEHPYSH >NC_017847|2819720:2832068|2820979_2821318_-|WP_000647826.1|DBSCAN-SWA MKASKLIRDKGLQYAKEIVDSAPSNATEWNEGFEFQCGQSVEISKADREKYFVDLSELKRLVESVDLVESWGGIDDVKLYDLSHCKNRPESAGYKLLQAIADYESIYGGGYV >NC_017847|2819720:2832068|2826930_2827134_+|WP_000845537.1|DBSCAN-SWA MKTEIIEALALELTKATIADTDPSTINIKSADLWVKTYQESLKAVEEALKELKPKPKATSKPISGMS >NC_017847|2819720:2832068|2823621_2823942_-|WP_000048916.1|DBSCAN-SWA MSKVLNELPASASNNESLILQALNASNQRQVAEMINVDASILSRMKTEKKSNGWTEIEFISFLLTAIGLKVVQESDVYCSPEIAEATRVYLAHAFTSPEYMRILFK >NC_017847|2819720:2832068|2827576_2828020_+|WP_001101038.1|DBSCAN-SWA 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>NC_017847|2819720:2832068|2831345_2832068_+|WP_000004579.1|DBSCAN-SWA MSESTLWAVAMRPEGYSPFKQTPAASKEIAERAVERYRKMHEKEGNNFFLEIFDDVIKVQKWHGSRKDHIKNLFYVESWFSEPMYQCFDLKTAERVFKFDEIVICYKKGSAPLVTKSFDEAKLFYGSSETGFKYQIQPIEPPENLFNWFHPDIELFDTIEEGAEAYTREQWAQLQMNLRVEIETQLLDYDEIPNIPEDAVVWPNWKPEPPEQGLFLIAAFDSEDGPVLWWANPKAESKEK |
24 | Acinetobacter_phage(95.65%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
3641833 : 3698906
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_017847|3641833:3698906|DBSCAN-SWA 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54 | Staphylococcus_phage(14.29%) | integrase,transposase,tRNA | attL 3681241:3681300|attR 3705266:3707457 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
14817 : 41687
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_020524|14817:41687|DBSCAN-SWA AATGAATGAGCGCATACATATTTTAAGACAAGCAATTGTCGTCGTTACCCAAGCACTGACTAACTCTGATATTGCAGTAACGCAAGAAGGTATTGAGGCAGGTGTGCATAAGGATCCAAAGACAGGCAAACCTGTGCGAATTAACCTTCCATATCTTCCGGACAATTCACCAGATTCGCTGATTGATGCGGTTCAAGGTTTTCTTGATCAAGAGGTAGCGAAGTATCTTTTTACCGATTTTTCTCTCAAGCTAAAAGGATCTGAAGAGGTAAAGACTTTAACTTCATTGTTAGAAGAAGCGCGTGTAGAACGTTGCATGGCTGAAAAATATCGCGGTTCAAATATCAATATGAAAAATGCGAGCCAATTTTTCATTGATGAATTGATTGACGATAAATACCAAAAACTTGTAAAGGAAAAAGCTTCTGATGAAGAAATTACGCAACATTTAATGTTGCCAATGTTACGTGCGTTAAGTGGTCAGGAAGTCTTTGAACATTACTTAAAAGACAAAATGAAGCATATTAAACCTGTGTGGGACATGCTTACTCCTTTTAAGCCAGAGATTGAAAAATTAAAGTCCACAAAAGACACAATGGATTTGGCTCAGCGTATCTATAAGGTACTGAAAGATGAGCCTGAATTGCCAGAACTCCCTGACAGCGAGCATGATGAAGATAGCGACAGCTTACCAGAGCCAAAATCGCCAGGTAAAAGCGCTGGTGTAGGCAATAGCGAAGATGAGAATGAAGAAGATGATGATGAAGGTGGTTCTCTAGGTGGAGCTGTTGGTGCCGATGAGGGCGAAGATGAAGAAGGCGAAGGCGGTAGTGGTGGAAAAGCTAAACAACGGCCTAATGCAGTTAAGCATTCACTAGAAAGTGACGATAAGAAGAGTGCCCCTCCTCGTAGTGAATTTGTGGCCGCAATTCTGGACTCGTTAAAAGACACCGAAAACAACTACAGTGAGCAACTAAGCAAGAAGATTGCACAACGCACAGCAGCGGACGTTAAAAAATCTAAATACGCAGTATTTACCAATGAAGGTGATGTCATTGAACCGCTTGAAGTTCCTAAACTTCATTACGATGACAAGATGTTTAAACGTCTTGAAGACAAGGTAGCTTCAATGGTTGGTCCTATGCAGAAAGATATGGAGCGGGCAATTCAGGCACGAAGTAAATCTGTATGGGAAAATGGATTAAAACAAGGAAAATTAAACAGTTCATCTTTAGCACGACTGGCTTCAACTGGTGATTGTCGAATTTTTCGTAAGCGCGTTGAATCAAAAACCAAAGACGTTGCTGTGAGCTTGGTCGTCGATATGTCAGGTTCAATGTGCGGTTCTAAAATCCATACTGCCGCTGCTGCGAGTTACGCACTATCAAACGTTCTGGATCGTCTCAAGATTCCTCATGAAGTGATCTGCTTTACTACTCATACAGACTCAGCCACTTACCACAAGCGTTTAAAGCAAATTCGTGAAGCAGAAAAAAAATATGGCGTTAGTTATTCACGCTATGAAAACCTTTATATGCCTGTCATTAAAGGCTACAACGAGCGCATTAATACTGAAACAAAACGTCGATTTGGATGGCTTCCTCACTCAGGTTTAATGGCGAGTAACATTGATGGCGAATGTGTAGAAATTGCTGCACGTCGTCTAATGGGTCGTAAGGAAGCAGGTAAAATTATGATGGTGCTATCTGATGGCTCACCTGCGGGTGGAGGTAACAGTCGAGATCTGGAATATCATTTAAAAGAAGTGGTGAAGAAAATCGAGAAGAGCAAGGTAGACGTCATTGGTATTGGAATTGAAGATGATTCTGTTCGTAGATTCTATGACAAACATGTGGTGATTCATGACGTTGAGCAATTACCTAGCCTTGTAATCTCGCGTTTACGCAGTATGTTGTTAGCTTAGAATTTGGGTGGAGATTGCATCATTTGGGTATTATAAAATATTAGTAAGCACTTACTTTATTTTTATGATGCAATCTTATAAACTTTCAATATCAGTTAGTGATACTTTTTCATAAATTATCGAATCCGTTTTTGGAGCTTATAAATGTCTAACGATCCTATTATCTGTGAAATCTGTGGTGGAAAAACTCACGTAATTGCTAAGCATTTAAAAGAAAAACATCCTGAAACTACGTATGAAGAGTACAAGAAACAGTATCCAGATAGCCCTTTATTGTCGCCTTTAGCGCAGAAAAAGATGCAAGAACAGGCTGAACTGAAAAGAGCTAAAGAAGCAGAGTTAGCAAAGGCGCAACAAGAAAAAGCAACAGATACTTCAACATCTAAGGAAGAAACAACAGTGTCTACTAATAACCACAATGTAAAGTTAGCGCTTACTAATATTGAGGCAAAACCAAACGATATTGTGGTGTCTAAACCATTTCATGAAATCTTTGATCTGAAAGGTAAAAGCGCGCTTAGTGGTTCAGGTAAACCGATTCCAATCTCATGCATTGAGAACTCTGCCTTCCCGGAAATGATTCCAGAAATTAATGATACGTATGTATGGAACGTGAACGAGCTGAAGGATGTCATGATTGCATTGGAGCTAAACATCAACCCTTACGTGTGGGGACACAAAGGTGCTGGTAAATCAGAAATGTTTGACCAGATCGCAGCTCGAACTGGCCGTCCTCTTGTTCGTATTCAGCACACTTCAAATACAGAAGAATCTCACATTGTAGGTATGTGGACGGTTAAAAATGGTGAAACCATCTTTGAGCTTGGGCCATTAGCTTTAGCGATGAAGCATGGCTGGATGTATTTGGCTGACGAATATGATTTCGCGCAACCAAACGTTTTATCTGTATATCAAGCTGTACTAGAAGGTAAACCTTTATATATCAAAGAAGCAGATGCAGCTAACCGTGTCATCAAACCACATCCAAACTTCCGTTTTGCTGCAACAGGTAACACGAACGGTTCAGGTGATGAAACTGGTCTTTATCAGGGTACTAACTTACAGAACTCAGCGAACTACGACCGTTTTGGCTCAGTGATCTATAAGAGCTACATGAAGAAAGAAGATGAGTCCTTGATTATCCAGAAACGTGTAGGTTTATGCGCAGAGGATGCTGACAAGTTAGTGGATTATGCAAACTTGGTACGCGAGCAATATGCAAACTCTAAGATCAGCGACACCATCTCACCACGTTCATTAATCAACGCAGCAATGATTGGCTTGCGTCGTAACGATTACAAGCACGGTCTCAAATTGGCGTTTACTAACAAGCTCACTCAAGTCGATCAGCAAGTTGCGGAAGACTTGGCTCAACGAGTGTTCGGTTAATTCGGACACTTTTGGGGGTGGGCTATGGTAAGAAATCAAGATCAGCTTTTCAGAGATCATGACAAGCTTCTTCGTCATTTGGCACACCGGAATATTAGCCGACTTACCTCAGTCGGCTATTGCATTGACGTTGAAGAGCTGTATGCCATTTTCTGTGAAGTTTTCGTGGTATCGATTCAGACTTGGGATGAAAGCAAAGGCAAATTAACGACTTATTTAACTACTGCTTGCCTCAACATGGTATCGAGATTACTGAAAAAATACCATTTGGGCGATAACAGAACGGAATACGAGTCCGACATTTTGCATCGTATGGGTGATGGTGAAGATGACTGTGATTATGACGTTTTTGTTGATCACCAGAGCCAAAATATTTTAGGCCCATATGAGTTGATGCAGACTCTTACAGAAGAAATGCAGCAGCTTTCACCGTTCGCAAAAATTTTACTCAAATTCACCTTAAATCCGCCTGATTTCATTGAAAGAGAGTTGTTGGCACAAGAAGCCAAATATCAGCTTTCCCTCAATACGCCTGAGAAAAATGAATCGCGGGGACCAAGACGTCGCAAATTGAATCTAAGTTTTGTGGCTAATTGCATCATGAAAACAGCCGAAACAAACAAAGAAAAACGATTCATTCGTGACGCTGTGAAAGAAGTTGAAGAAGCCGTTACGCGAGTTGCTATCTAAATCATTTCAACACTTTAAAAGTGTATATAGCGCAAAAGAGAGCGTTTTAAATGAAATCAAACGAAAACGAAAGAATAGATTTTATTGAAGCAAAGGCTTTTGGTTGTTTTGGTTCAATCTCATGTTTTTCGCGTGATAGCGAATATTGCCAACGATGCCCGGCATTTGAGGCTTGTGAGCAGAAATCATATGAAACGCTTAACGCGATCAAGCAGGTTGTTAATGTAAACGATTTACTCAAACAGCATGAAAAAGCTCGGATGGCGCAAGAAGCTAAACGCAGAGCCTTACGTGAAGAAATGAATGCAGCCAAAAGTCTTTCTTCGGGTGGGATCCAACCAAAGAAACCGACTCTCGTTGAACGAGCAACCAAGGTAGAGAAAGTCTTTTTTGAGCCTACACCGGAACAGCAGGAATTAATCGTGAAGCTGCCTGTAAAAGCTCAATCGTTTGCATTGACCTTAGTTAAGAGCGGTTTAGTGACCGAGATTAAGGATGGATTGGCCAAAAACGAAAATGCCATGAAAGGAAAAACTCCAGTTTGGCTCAGTCTTGCCGTCGAAAAGCTTCTTTTGGGTGGATATACGCGCAGTGAACTAAAAAAAGCGTTTATGGAAGAACTCAACTGGAAAGAAAACACTGCACAAAGCCATGTGTCGTTAGCTTTTGTTCTTTTGACCTGTTTTGGGATTGCGAAAGAAGAGTCTTCCAAATTGTTAATTTCCAAATGATTTTTAATTTAATAGCTGTAAGAGATTAGTTGTATAGGATTCTCTATGTTAAACCACGCAATGTCAGTGCAATCTGACTTTTCGATAGGAAAATCATTATTAACGGTAGACAAAATTGTCGAAGCTGCAAAAGGCTTAGGCTATTCATCGGTCGCAATCGTTGATGACATGTCCTTACATGCATTGGTAGATTTTTCGAACAAAGCCACCAAAGCCAATATCAAGCCGGTGTTTGGTTGTCGTTTGCGTGTATATGACGATTCTAA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26 | Pseudomonas_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
48008 : 110528
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_020524|48008:110528|DBSCAN-SWA 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63 | Salmonella_phage(28.57%) | tail,portal,terminase,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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