CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NC_017468	Lactobacillus helveticus H10 plasmid pH10, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
NC_017467	Lactobacillus helveticus H10, complete sequence	4 crisprs	cas14j,cas3,csa3,cas2,cas14k,cas5,cas8c,cas7,cas4,cas1,DEDDh,DinG,WYL,Cas14u_CAS-V	0	10	10	0

1. NC_017467

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NC_017467_1

• CRISPR_ID: NC_017467_1
• CRISPR_location: 578826-581585
• CRISPR_type: TypeI
• Repeat_type: I-C
• Spacer_info: 41 spacers
• Cas_protein_info: cas2,cas1,cas4,cas7,cas8c,cas5,cas3

Consensus repeat of NC_017467_1

Consensus_repeat	Method
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	PILER-CR
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	CRISPRCasFinder
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	CRT

spacers of NC_017467_1

>1.1|578858|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
GGTCAACGATGTTAAAGCAGCCAATCCTTATGAT
>1.2|578924|36|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
TTTAGTATCCATAGCCTGTAAGTCCTCCATCCACAA
>1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
TTCTAAGCAAAATAAAAGCCACCCGAAGGTGGCA
>1.4|579058|35|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
TTTGAAGTCCTGTGCCTGCGAACTGGTCAGTATAC
>1.5|579125|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
GTATGGGAACTTTTATCATAATCACTCTTGTTAA
>1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
AAGAAGATACTGCCTGACCGGTTCCACATTAGCA
>1.7|579257|35|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
ATGTAGTGAGTGGCTTTACCATCAGCTCTCATAAC
>1.8|579324|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
AAAACGAGCTTAAAGCGCCAAAAAACCAATGGAA
>1.9|579390|35|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
ATCAAGATTGTAGTTGCGCATTAGGAATTGTTTTT
>1.10|579457|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
ATTTGAATATGCACGCAGATGATGATGGCTTTTT
>1.11|579523|35|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
ATATCTCAATATCAGCTCCCTCCAAATATATTAAG
>1.12|579590|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
ACTTCGCCAACAGCCTTTTCAACCGCGCTATTAA
>1.13|579656|35|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
AAATATGATGATCCAAACGGTGGCGACAACGGACA
>1.14|579723|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
TTTAAAGACATCGTAGCACCGGCTGAAACTGATC
>1.15|579789|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
ATGATGGGCTACCAGTATCCAACACATTGTCTAA
>1.16|579855|33|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
AATCGAAAGCTCAATATATCCCTGTGAAATAAC
>1.17|579920|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
CGTTCTGCTGAAGAAATTGCTTTACTAATTCTCT
>1.18|579986|35|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
TCCGTATGGAATATCGGATAGCGCTTGAACACCAG
>1.19|580053|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
CGCTCTTGCCATATTTCGTAATTGCATATCGAGA
>1.20|580119|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
CTATTGCGTTGTTCATCGCAATAAGATGTAGGGT
>1.21|580185|35|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
TATCACAGAAAGCAACACTGCTACTTGGCATTCAA
>1.22|580252|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
AAAAGGTGAACCACATCAAGAATCCAAACAAGAT
>1.23|580318|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
AAACCAAGCCATGCCTGATGCTGTATAAGCATCC
>1.24|580384|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
ATAAAGGTCTTTAAGACCAGTACCATTAGCAAAG
>1.25|580450|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
TTGGTTACGACTCTGACAAAAGCAAGAAATCAGA
>1.26|580516|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
GTTTGTATTGCTTAACAATATGACCAAAAATTTT
>1.27|580582|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
AGTTGTTTGTTGATTAGTTACAGTTTTAGTAGTT
>1.28|580648|35|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
AAAGAACATAGTTTGCAGAACTGTTTCCAAGTAAA
>1.29|580715|36|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
TCTAAGAACTCTGAAACAGTGTGCTTGATCCAGTGC
>1.30|580783|36|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
GGCTTTAGATGCGTCAAATGCCGCCTGTGGGCTATC
>1.31|580851|35|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
ATATACTTGAGAGCCCCACCTTGAGTTTTGCCAAA
>1.32|580918|35|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
AAAAATTGTTAAATGCAGGATGGAGCTAGACTATG
>1.33|580985|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
ATTGATGGAAAATAGCCAAAGTCAGGGCTATCAA
>1.34|581051|36|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
CCTCCTAGATTTCTGCCAGTGAGCATTGTGTCTGTG
>1.35|581119|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
ATATAGCACATTAAGGCATGACCGAGTTAATATC
>1.36|581185|36|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
GCCTTCCTTGACCACATGTGCTTGACAGCCGGTATA
>1.37|581253|35|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
CAAAAGAACCAGTTCACGTGCCAACAGGTAAGTAA
>1.38|581320|35|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
ACTGCTAAGGGCAAACCATTGGACTTGCTTAAACA
>1.39|581387|35|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
ATCAAGCTTGCCAACGGGTCGATTTTATTCTGTGA
>1.40|581454|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
TTTTGAATAGATGGCATGTAAGTCTGATATAGTT
>1.41|581520|34|NC_017467|CRT
TTTAGGTCCATTGCACTCTTGCCAGTGAAGTCGT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017467_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NC_017467_1

>merge|NC_017467|1|578826-581585|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATGGTCAACGATGTTAAAGCAGCCAATCCTTATGATGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATTTTAGTATCCATAGCCTGTAAGTCCTCCATCCACAAGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATTTCTAAGCAAAATAAAAGCCACCCGAAGGTGGCAGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATTTTGAAGTCCTGTGCCTGCGAACTGGTCAGTATACGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATGTATGGGAACTTTTATCATAATCACTCTTGTTAAGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATAAGAAGATACTGCCTGACCGGTTCCACATTAGCAGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATATGTAGTGAGTGGCTTTACCATCAGCTCTCATAACGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATAAAACGAGCTTAAAGCGCCAAAAAACCAATGGAAGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATATCAAGATTGTAGTTGCGCATTAGGAATTGTTTTTGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATATTTGAATATGCACGCAGATGATGATGGCTTTTTGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATATATCTCAATATCAGCTCCCTCCAAATATATTAAGGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATACTTCGCCAACAGCCTTTTCAACCGCGCTATTAAGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATAAATATGATGATCCAAACGGTGGCGACAACGGACAGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATTTTAAAGACATCGTAGCACCGGCTGAAACTGATCGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATATGATGGGCTACCAGTATCCAACACATTGTCTAAGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATAATCGAAAGCTCAATATATCCCTGTGAAATAACGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATCGTTCTGCTGAAGAAATTGCTTTACTAATTCTCTGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATTCCGTATGGAATATCGGATAGCGCTTGAACACCAGGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATCGCTCTTGCCATATTTCGTAATTGCATATCGAGAGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATCTATTGCGTTGTTCATCGCAATAAGATGTAGGGTGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATTATCACAGAAAGCAACACTGCTACTTGGCATTCAAGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATAAAAGGTGAACCACATCAAGAATCCAAACAAGATGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATAAACCAAGCCATGCCTGATGCTGTATAAGCATCCGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATATAAAGGTCTTTAAGACCAGTACCATTAGCAAAGGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATTTGGTTACGACTCTGACAAAAGCAAGAAATCAGAGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATGTTTGTATTGCTTAACAATATGACCAAAAATTTTGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATAGTTGTTTGTTGATTAGTTACAGTTTTAGTAGTTGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATAAAGAACATAGTTTGCAGAACTGTTTCCAAGTAAAGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATTCTAAGAACTCTGAAACAGTGTGCTTGATCCAGTGCGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATGGCTTTAGATGCGTCAAATGCCGCCTGTGGGCTATCGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATATATACTTGAGAGCCCCACCTTGAGTTTTGCCAAAGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATAAAAATTGTTAAATGCAGGATGGAGCTAGACTATGGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATATTGATGGAAAATAGCCAAAGTCAGGGCTATCAAGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATCCTCCTAGATTTCTGCCAGTGAGCATTGTGTCTGTGGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATATATAGCACATTAAGGCATGACCGAGTTAATATCGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATGCCTTCCTTGACCACATGTGCTTGACAGCCGGTATAGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATCAAAAGAACCAGTTCACGTGCCAACAGGTAAGTAAGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATACTGCTAAGGGCAAACCATTGGACTTGCTTAAACAGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATATCAAGCTTGCCAACGGGTCGATTTTATTCTGTGAGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATTTTTGAATAGATGGCATGTAAGTCTGATATAGTTGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATTTTAGGTCCATTGCACTCTTGCCAGTGAAGTCGTGTCGCACTCCTTGTGATGCACTTGTGGGTGTA

>NC_017467|1|1|578826-581519|PILER-CR
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	GGTCAACGATGTTAAAGCAGCCAATCCTTATGAT
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	TTTAGTATCCATAGCCTGTAAGTCCTCCATCCACAA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	TTCTAAGCAAAATAAAAGCCACCCGAAGGTGGCA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	TTTGAAGTCCTGTGCCTGCGAACTGGTCAGTATAC
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	GTATGGGAACTTTTATCATAATCACTCTTGTTAA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	AAGAAGATACTGCCTGACCGGTTCCACATTAGCA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	ATGTAGTGAGTGGCTTTACCATCAGCTCTCATAAC
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	AAAACGAGCTTAAAGCGCCAAAAAACCAATGGAA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	ATCAAGATTGTAGTTGCGCATTAGGAATTGTTTTT
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	ATTTGAATATGCACGCAGATGATGATGGCTTTTT
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	ATATCTCAATATCAGCTCCCTCCAAATATATTAAG
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	ACTTCGCCAACAGCCTTTTCAACCGCGCTATTAA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	AAATATGATGATCCAAACGGTGGCGACAACGGACA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	TTTAAAGACATCGTAGCACCGGCTGAAACTGATC
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	ATGATGGGCTACCAGTATCCAACACATTGTCTAA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	AATCGAAAGCTCAATATATCCCTGTGAAATAAC
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	CGTTCTGCTGAAGAAATTGCTTTACTAATTCTCT
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	TCCGTATGGAATATCGGATAGCGCTTGAACACCAG
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	CGCTCTTGCCATATTTCGTAATTGCATATCGAGA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	CTATTGCGTTGTTCATCGCAATAAGATGTAGGGT
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	TATCACAGAAAGCAACACTGCTACTTGGCATTCAA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	AAAAGGTGAACCACATCAAGAATCCAAACAAGAT
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	AAACCAAGCCATGCCTGATGCTGTATAAGCATCC
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	ATAAAGGTCTTTAAGACCAGTACCATTAGCAAAG
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	TTGGTTACGACTCTGACAAAAGCAAGAAATCAGA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	GTTTGTATTGCTTAACAATATGACCAAAAATTTT
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	AGTTGTTTGTTGATTAGTTACAGTTTTAGTAGTT
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	AAAGAACATAGTTTGCAGAACTGTTTCCAAGTAAA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	TCTAAGAACTCTGAAACAGTGTGCTTGATCCAGTGC
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	GGCTTTAGATGCGTCAAATGCCGCCTGTGGGCTATC
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	ATATACTTGAGAGCCCCACCTTGAGTTTTGCCAAA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	AAAAATTGTTAAATGCAGGATGGAGCTAGACTATG
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	ATTGATGGAAAATAGCCAAAGTCAGGGCTATCAA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	CCTCCTAGATTTCTGCCAGTGAGCATTGTGTCTGTG
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	ATATAGCACATTAAGGCATGACCGAGTTAATATC
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	GCCTTCCTTGACCACATGTGCTTGACAGCCGGTATA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	CAAAAGAACCAGTTCACGTGCCAACAGGTAAGTAA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	ACTGCTAAGGGCAAACCATTGGACTTGCTTAAACA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	ATCAAGCTTGCCAACGGGTCGATTTTATTCTGTGA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	TTTTGAATAGATGGCATGTAAGTCTGATATAGTT
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT

>NC_017467|1|1|578826-581519|CRISPRCasFinder
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	GGTCAACGATGTTAAAGCAGCCAATCCTTATGAT
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	TTTAGTATCCATAGCCTGTAAGTCCTCCATCCACAA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	TTCTAAGCAAAATAAAAGCCACCCGAAGGTGGCA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	TTTGAAGTCCTGTGCCTGCGAACTGGTCAGTATAC
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	GTATGGGAACTTTTATCATAATCACTCTTGTTAA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	AAGAAGATACTGCCTGACCGGTTCCACATTAGCA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	ATGTAGTGAGTGGCTTTACCATCAGCTCTCATAAC
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	AAAACGAGCTTAAAGCGCCAAAAAACCAATGGAA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	ATCAAGATTGTAGTTGCGCATTAGGAATTGTTTTT
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	ATTTGAATATGCACGCAGATGATGATGGCTTTTT
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	ATATCTCAATATCAGCTCCCTCCAAATATATTAAG
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	ACTTCGCCAACAGCCTTTTCAACCGCGCTATTAA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	AAATATGATGATCCAAACGGTGGCGACAACGGACA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	TTTAAAGACATCGTAGCACCGGCTGAAACTGATC
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	ATGATGGGCTACCAGTATCCAACACATTGTCTAA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	AATCGAAAGCTCAATATATCCCTGTGAAATAAC
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	CGTTCTGCTGAAGAAATTGCTTTACTAATTCTCT
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	TCCGTATGGAATATCGGATAGCGCTTGAACACCAG
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	CGCTCTTGCCATATTTCGTAATTGCATATCGAGA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	CTATTGCGTTGTTCATCGCAATAAGATGTAGGGT
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	TATCACAGAAAGCAACACTGCTACTTGGCATTCAA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	AAAAGGTGAACCACATCAAGAATCCAAACAAGAT
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	AAACCAAGCCATGCCTGATGCTGTATAAGCATCC
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	ATAAAGGTCTTTAAGACCAGTACCATTAGCAAAG
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	TTGGTTACGACTCTGACAAAAGCAAGAAATCAGA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	GTTTGTATTGCTTAACAATATGACCAAAAATTTT
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	AGTTGTTTGTTGATTAGTTACAGTTTTAGTAGTT
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	AAAGAACATAGTTTGCAGAACTGTTTCCAAGTAAA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	TCTAAGAACTCTGAAACAGTGTGCTTGATCCAGTGC
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	GGCTTTAGATGCGTCAAATGCCGCCTGTGGGCTATC
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	ATATACTTGAGAGCCCCACCTTGAGTTTTGCCAAA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	AAAAATTGTTAAATGCAGGATGGAGCTAGACTATG
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	ATTGATGGAAAATAGCCAAAGTCAGGGCTATCAA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	CCTCCTAGATTTCTGCCAGTGAGCATTGTGTCTGTG
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	ATATAGCACATTAAGGCATGACCGAGTTAATATC
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	GCCTTCCTTGACCACATGTGCTTGACAGCCGGTATA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	CAAAAGAACCAGTTCACGTGCCAACAGGTAAGTAA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	ACTGCTAAGGGCAAACCATTGGACTTGCTTAAACA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	ATCAAGCTTGCCAACGGGTCGATTTTATTCTGTGA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	TTTTGAATAGATGGCATGTAAGTCTGATATAGTT
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT

>NC_017467|1|1|578826-581585|CRT
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	GGTCAACGATGTTAAAGCAGCCAATCCTTATGAT
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	TTTAGTATCCATAGCCTGTAAGTCCTCCATCCACAA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	TTCTAAGCAAAATAAAAGCCACCCGAAGGTGGCA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	TTTGAAGTCCTGTGCCTGCGAACTGGTCAGTATAC
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	GTATGGGAACTTTTATCATAATCACTCTTGTTAA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	AAGAAGATACTGCCTGACCGGTTCCACATTAGCA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	ATGTAGTGAGTGGCTTTACCATCAGCTCTCATAAC
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GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	ATCAAGATTGTAGTTGCGCATTAGGAATTGTTTTT
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	ATTTGAATATGCACGCAGATGATGATGGCTTTTT
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	ATATCTCAATATCAGCTCCCTCCAAATATATTAAG
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	ACTTCGCCAACAGCCTTTTCAACCGCGCTATTAA
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GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	TTTAAAGACATCGTAGCACCGGCTGAAACTGATC
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	ATGATGGGCTACCAGTATCCAACACATTGTCTAA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	AATCGAAAGCTCAATATATCCCTGTGAAATAAC
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	CGTTCTGCTGAAGAAATTGCTTTACTAATTCTCT
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	TCCGTATGGAATATCGGATAGCGCTTGAACACCAG
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	CGCTCTTGCCATATTTCGTAATTGCATATCGAGA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	CTATTGCGTTGTTCATCGCAATAAGATGTAGGGT
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	TATCACAGAAAGCAACACTGCTACTTGGCATTCAA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	AAAAGGTGAACCACATCAAGAATCCAAACAAGAT
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	AAACCAAGCCATGCCTGATGCTGTATAAGCATCC
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	ATAAAGGTCTTTAAGACCAGTACCATTAGCAAAG
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	TTGGTTACGACTCTGACAAAAGCAAGAAATCAGA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	GTTTGTATTGCTTAACAATATGACCAAAAATTTT
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	AGTTGTTTGTTGATTAGTTACAGTTTTAGTAGTT
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	AAAGAACATAGTTTGCAGAACTGTTTCCAAGTAAA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	TCTAAGAACTCTGAAACAGTGTGCTTGATCCAGTGC
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	GGCTTTAGATGCGTCAAATGCCGCCTGTGGGCTATC
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	ATATACTTGAGAGCCCCACCTTGAGTTTTGCCAAA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	AAAAATTGTTAAATGCAGGATGGAGCTAGACTATG
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	ATTGATGGAAAATAGCCAAAGTCAGGGCTATCAA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	CCTCCTAGATTTCTGCCAGTGAGCATTGTGTCTGTG
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	ATATAGCACATTAAGGCATGACCGAGTTAATATC
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	GCCTTCCTTGACCACATGTGCTTGACAGCCGGTATA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	CAAAAGAACCAGTTCACGTGCCAACAGGTAAGTAA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	ACTGCTAAGGGCAAACCATTGGACTTGCTTAAACA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	ATCAAGCTTGCCAACGGGTCGATTTTATTCTGTGA
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	TTTTGAATAGATGGCATGTAAGTCTGATATAGTT
GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT	TTTAGGTCCATTGCACTCTTGCCAGTGAAGTCGT
GTCGCACTCCTTGTGATGCACTTGTGGGTGTA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NC_017467.1|WP_014563221.1|586757_588089_+|DnaD-domain-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226138
NC_017467.1|WP_012212134.1|575825_576677_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csd2	cas7	COG3649_cas7_CAS-I-C	gnl|CDD|187820
NC_017467.1|WP_023061994.1|592083_592614_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NC_017467.1|WP_014563224.1|591411_591933_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NC_017467.1|WP_041809384.1|585682_586285_+|dephospho-CoA-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|234620
NC_017467.1|WP_014563208.1|578373_578664_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2	cas2	cd09725_cas2_CAS-I:CAS-II:CAS-III:CAS-V	gnl|CDD|187856
NC_017467.1|WP_023061995.1|589319_591254_+|threonine--tRNA-ligase	unknown	unknown	gnl|CDD|234752
NC_017467.1|WP_012212136.1|573106_573850_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas5	cas5	cd09752_cas5_CAS-I-C	gnl|CDD|273847
NC_017467.1|WP_014563226.1|593076_594327_+|DUF389-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|377221
NC_017467.1|WP_014563203.1|566644_567241_+|phosphoribosylglycinamide-formyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|187714
NC_017467.1|WP_014563219.1|584855_585686_+|DNA-formamidopyrimidine-glycosylase	unknown	unknown	gnl|CDD|234899
NC_017467.1|WP_014563204.1|567242_568784_+|bifunctional-phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide-formyltransferase/IMP-cyclohydrolase	unknown	unknown	gnl|CDD|234854
NC_017467.1|WP_023062002.1|568796_570056_+|phosphoribosylamine--glycine-ligase	unknown	unknown	gnl|CDD|234856
NC_017467.1|WP_012212135.1|573849_575823_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas8c/Csd1	cas8c	pfam09709_cas8c_CAS-I-C	gnl|CDD|378245
NC_017467.1|WP_012212133.1|576679_577336_+|CRISPR-associated-protein-Cas4	cas4	pfam01930_cas4_CAS-I	gnl|CDD|273040
NC_017467.1|WP_014563218.1|582183_584847_+|DNA-polymerase-I	unknown	unknown	gnl|CDD|235591
NC_017467.1|WP_003627138.1|586287_586755_+|transcriptional-repressor-NrdR	unknown	unknown	gnl|CDD|234774
NC_017467.1|WP_014563222.1|588120_589029_+|primosomal-protein-DnaI	unknown	unknown	gnl|CDD|236353
NC_017467.1|WP_014563206.1|570557_573092_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3	cas3	COG1203_cas3_CAS-I	gnl|CDD|224124
NC_017467.1|WP_014563207.1|577332_578364_+|type-I-C-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1	cas1	cd09721_cas1_CAS-I-C	gnl|CDD|188360

HMMScan for Signature genes

Protein	Cas_name	Cas_description	E-value	Identity	Coverage
NC_017467.1|WP_012212134.1|575825_576677_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csd2	cas7	COG3649_cas7_CAS-I-C	2.6e-104	343.2	1.7
NC_017467.1|WP_012212135.1|573849_575823_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas8c/Csd1	cas8c	pfam09709_cas8c_CAS-I-C	8.5e-100	329.5	0.0
NC_017467.1|WP_012212133.1|576679_577336_+|CRISPR-associated-protein-Cas4	cas4	pfam01930_cas4_CAS-I	5.5e-35	115.6	1.8
NC_017467.1|WP_014563206.1|570557_573092_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3	cas3	COG1203_cas3_CAS-I	2.9e-71	235.4	23.7
NC_017467.1|WP_014563208.1|578373_578664_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2	cas2	cd09725_cas2_CAS-I:CAS-II:CAS-III:CAS-V	3.4e-26	86.0	1.4
NC_017467.1|WP_012212136.1|573106_573850_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas5	cas5	cd09752_cas5_CAS-I-C	1.6e-59	195.8	0.0
NC_017467.1|WP_014563207.1|577332_578364_+|type-I-C-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1	cas1	cd09721_cas1_CAS-I-C	3.8e-136	448.3	0.0

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NC_017467.1|WP_014563221.1|586757_588089_+|DnaD-domain-protein	gnl|CDD|226138	COG3611, DnaB, Replication initiation/membrane attachment protein [DNA replication, recombination, and repair].	4.65175e-34
NC_017467.1|WP_012212134.1|575825_576677_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csd2	gnl|CDD|187820	cd09689, Cas7_I-C, CRISPR/Cas system-associated RAMP superfamily protein Cas7. CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats) and associated Cas proteins comprise a system for heritable host defense by prokaryotic cells against phage and other foreign DNA; Cas7 is a RAMP superfamily protein; Subunit of the Cascade complex; also known as Csd2 family.	6.96291e-109
NC_017467.1|WP_041809384.1|585682_586285_+|dephospho-CoA-kinase	gnl|CDD|234620	PRK00081, coaE, dephospho-CoA kinase; Reviewed.	9.76521e-84
NC_017467.1|WP_014563208.1|578373_578664_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2	gnl|CDD|187856	cd09725, Cas2_I_II_III, CRISPR/Cas system-associated protein Cas2. CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats) and associated Cas proteins comprise a system for heritable host defense by prokaryotic cells against phage and other foreign DNA; Cas2 is present in majority of CRISPR/Cas systems along with Cas1; RNAse specific to U-rich regions; Possesses an RRM/ferredoxin fold.	3.68589e-27
NC_017467.1|WP_023061995.1|589319_591254_+|threonine--tRNA-ligase	gnl|CDD|234752	PRK00413, thrS, threonyl-tRNA synthetase; Reviewed.	0
NC_017467.1|WP_012212136.1|573106_573850_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas5	gnl|CDD|273847	TIGR01876, cas_Cas5d, CRISPR-associated protein Cas5, subtype I-C/DVULG. CRISPR is a term for Clustered, Regularly Interspaced Short Palidromic Repeats. A number of protein families appear only in association with these repeats and are designated Cas (CRISPR-Associated) proteins. This small Cas family is represented by CT1134 of Chlorobium tepidum. This family belongs to a set of several Cas protein families, one each for a number of different CRISPR/Cas subtypes, that share a region of N-terminal sequence similarity modeled by TIGR02593. This family represents the Dvulg subtype of CRISPR/Cas locus.	2.66247e-86
NC_017467.1|WP_014563226.1|593076_594327_+|DUF389-domain-containing-protein	gnl|CDD|377221	pfam04087, DUF389, Domain of unknown function (DUF389). Family of hypothetical bacterial proteins with an undetermined function.	9.06373e-52
NC_017467.1|WP_014563203.1|566644_567241_+|phosphoribosylglycinamide-formyltransferase	gnl|CDD|187714	cd08645, FMT_core_GART, Phosphoribosylglycinamide formyltransferase (GAR transformylase, GART). Phosphoribosylglycinamide formyltransferase, also known as GAR transformylase or GART, is an essential enzyme that catalyzes the third step in de novo purine biosynthesis. This enzyme uses formyl tetrahydrofolate as a formyl group donor to produce 5'-phosphoribosyl-N-formylglycinamide. In prokaryotes, GART is a single domain protein but in most eukaryotes it is the C-terminal portion of a large multifunctional protein which also contains GAR synthetase and aminoimidazole ribonucleotide synthetase activities.	5.23207e-92
NC_017467.1|WP_014563219.1|584855_585686_+|DNA-formamidopyrimidine-glycosylase	gnl|CDD|234899	PRK01103, PRK01103, bifunctional DNA-formamidopyrimidine glycosylase/DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase.	4.51342e-155
NC_017467.1|WP_014563204.1|567242_568784_+|bifunctional-phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide-formyltransferase/IMP-cyclohydrolase	gnl|CDD|234854	PRK00881, purH, bifunctional phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/IMP cyclohydrolase; Provisional.	0
NC_017467.1|WP_023062002.1|568796_570056_+|phosphoribosylamine--glycine-ligase	gnl|CDD|234856	PRK00885, PRK00885, phosphoribosylamine--glycine ligase; Provisional.	0
NC_017467.1|WP_012212135.1|573849_575823_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas8c/Csd1	gnl|CDD|378245	pfam09709, Cas_Csd1, CRISPR-associated protein (Cas_Csd1). CRISPR loci appear to be mobile elements with a wide host range. This entry represents proteins that tend to be found near CRISPR repeats. The species range, so far, is exclusively bacterial and mesophilic, although CRISPR loci are particularly common among the archaea and thermophilic bacteria. Clusters of short DNA repeats with nonhomologous spacers, which are found at regular intervals in the genomes of phylogenetically distinct prokaryotic species, comprise a family with recognisable features. This family is known as CRISPR (short for Clustered, Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats). A number of protein families appear only in association with these repeats and are designated Cas (CRISPR-Associated) proteins.	2.97564e-90
NC_017467.1|WP_012212133.1|576679_577336_+|CRISPR-associated-protein-Cas4	gnl|CDD|273040	TIGR00372, conserved_hypothetical_protein, CRISPR-associated protein Cas4. This model represents a family of proteins associated with CRISPR repeats in a wide set of prokaryotic genomes. This scope of this model has been broadened since it was first built to describe an archaeal subset only. The function of the protein is undefined. Distantly related proteins, excluded from this model, include ORFs from Mycobacteriophage D29 and Sulfolobus islandicus filamentous virus and a region of the Schizosaccharomyces pombe DNA replication helicase Dna2p.	6.87674e-27
NC_017467.1|WP_014563218.1|582183_584847_+|DNA-polymerase-I	gnl|CDD|235591	PRK05755, PRK05755, DNA polymerase I; Provisional.	0
NC_017467.1|WP_003627138.1|586287_586755_+|transcriptional-repressor-NrdR	gnl|CDD|234774	PRK00464, nrdR, transcriptional repressor NrdR.	6.49925e-87
NC_017467.1|WP_014563222.1|588120_589029_+|primosomal-protein-DnaI	gnl|CDD|236353	PRK08939, PRK08939, primosomal protein DnaI; Reviewed.	5.82742e-151
NC_017467.1|WP_014563206.1|570557_573092_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3	gnl|CDD|224124	COG1203, COG1203, CRISPR-associated helicase Cas3 [Defense mechanisms].	2.63297e-58
NC_017467.1|WP_014563207.1|577332_578364_+|type-I-C-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1	gnl|CDD|188360	TIGR03640, cas1_DVULG, CRISPR-associated endonuclease Cas1, subtype I-C/DVULG. The CRISPR-associated protein Cas1 is virtually universal to CRISPR systems. CRISPR, an acronym for Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats, is prokaryotic immunity system for foreign DNA, mostly from phage. CRISPR systems belong to different subtypes, distinguished by both nature of the repeats, the makeup of the cohort of associated Cas proteins, and by molecular phylogeny within the more universal Cas proteins such as this one. This model is of type EXCEPTION and provides more specific information than the EQUIVALOG model TIGR00287. It describes the Cas1 protein particular to the DVULG subtype of CRISPR/Cas system.	6.22974e-173

Protein sequences

>NC_017467.1|WP_014563208.1|578373_578664_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2
MMVVVSYDINTESKSGQRRLRHVAKICLDYGQRVQNSVFECKVNSMQLELMKERLLDEIDDSQDSLYFFNLGKNYKNRIKSYGIKEVINLESPVIF
>NC_017467.1|WP_014563207.1|577332_578364_+|type-I-C-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1
MRQLLNTLYINTPDSYLSSDGNNVVVKIKNNAVGRLPLQNFEAIVTFGYSGVSPSLMQKCLEQDISISFLSRTGRLKGRVVGEPTGNVYLRKTQFFNSENDAASLLIAKNMIIGKVYNHRWIIERFIRDHGMQIDRDKFKSISENLKNGLKDLQQVDTIDSLRGLEGSLANGYFSVFDDMIINQKDDFFYHGRSRRPPLDRLNALLSFSYSLLANECADALTTNGLDPYEGFMHVDRPGRKSLALDLMEELRGVIADRFVLRLVNKKEIHASDFVCKADGAYLLTDDARKSFLAKWQDNKISELEHPFLKEKIEWGLVPFAQAQLLARYLRGDLDEYPPFMWK
>NC_017467.1|WP_012212133.1|576679_577336_+|CRISPR-associated-protein-Cas4
MSYDEKDYLMISGIQHFVFCKRQWALDHIENQWADNYLTVSGNRLHEKADDPYISETRGSKFVVRAMPIHSQEYGLTGIFDVVEFQKDTKGVQVFGKKEKYLPIPVEYKHGKSKIDDSDRLQVLAEAVCLEEMLFCHLDYGYLYYGRTRHREKVEFSEELRTELKKVISEMHYYWEKKYTPKVKVTKKCKSCSLRDICLPELLKRESVSNYISRKLNQ
>NC_017467.1|WP_012212134.1|575825_576677_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csd2
MVLSNKIDFKVYVAVHGANPNGDPLNGNRPRQTNDGFGEISDVAIKRKIRNRLQDMGHKIFVQSADRTDDGFKSLKDRADSIDAIKKAAKAKDADKYAEVACKNWMDVRSFGQVFAFKGDKLSVGVRGPVSIQTARSISPIFINEMQITKSVNSTTGDKKSSDTMGMKYSIDFAVYEFGGSINVQLAEKTGFSDDDAESIHKALETLFENDESSARPAGSMEVLRVYWWKHNSKLGQHSPAEMNRAVEIKNNNEPNAPRSLDDIEFIDKTPEDMKENEQIYEG
>NC_017467.1|WP_012212135.1|573849_575823_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas8c/Csd1
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>NC_017467.1|WP_012212136.1|573106_573850_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas5
MLNEIIKSPSFSYKVFGDWALFTDPIMRLGGEKFTYSIPTYQALKGIAESVYWKPTIVIHIDKVRVMKPILVEAKDMRLFKYNNSRSSDLARYTYLKDVEYQVLAHFEFNMNRLDLAKDRNIKKHLAIMKRCIKRGGRRDVFLGTRECQGYVEPCKFGEGEGYYDNSDDRLFGTMFHGFDYPDETGNSMLKARLWNVVMKKGVVDFIRPEDCPVHKPLHELQVKKFKKGENLESVDQLYSQMLEGDS
>NC_017467.1|WP_014563206.1|570557_573092_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3
MVGNFIGHTKKLKNNTIETQSLRDHLLNTQKYAEKYASDLSLEHVAGLAGILHDLGKYQSKFQEYIIESTRKGDQSKKGSIDHSSFGAIFLRDFISENFSEKENYYDFLDFGGILENAIFSHHNYLGLKDYINPDLMSPFLNRIEKFKDDEEKKRQLKKCKELFYKDVITEEKFTKYFQLAFDEYEAFISKIRNKVTLKTEQILNENAKNNKQVMLELQAKYFLSEYVYSCLLDADRTDATAFKLSKNPNFSDNTELFEKYYSKLVGKLHKLNKNDNSKINQLRAEISEECDQAAERPSGIYTLSASTGSGKTLTSLRFGLKHAKLYHKKHIIYVLPYITIIEQNSEVIRKFLNDNKDDSQNILEFHSNVSQKVADKSEETTNALDLTEDSWDSPIIVTTMVQFLDSIFASGTKHRRRFHNLCDSIVIFDEVQKVPIKCLDMFNEAVNFLKNFGNTNVLLCTATQPALEEVKQKLDLNIDHEIIPNLIEHEQQFKRVEFIDKTQNDDGIDLVLNSIQAAELIFKKSQNFKSILGIFNTIDVTKKIYSNLKNKFDSISDQIKLEYLSTNMCPADRKERIKNVLNLVKEGKRVICISTPLIEAGVDASFECVFRSLSGLDSLVQAAGRCNRNNELKLGKVYLLNMDPSEEHIAKLNEVKTGKDQVLELLSEGIKADDFLNANVIKKYFEMFYSKLASTMSYPTNGINLENYIDGIKNVHELAYQSKRKDASKFEKLTQFSGSETIAKYFQVIKNNTKSVLAPYGDKGEKLIADLNGNQDINSLIMLVKDAQPYIVNLYDNKFNQLFEEGDIYTLCQVGNEVIYAFRPYAYNKLVLGDRKQIEKSIF
>NC_017467.1|WP_023062002.1|568796_570056_+|phosphoribosylamine--glycine-ligase
MKDDLVLLVVGSGGREFAVAKKLKESRHVKTVYCAPGNVGMQTIGVETVPIEETDLDGLLDFAQSKHVDWTFVGPENVLCAGITDKFEKAGQKIFGPNQRAAQLEGSKDYALRFMNKYDVPTARHETFTSAETCIAGLKDFAYPVVIKEDGLAGGKGVTIAQNEAVAQETIKEMFAGGQTAVVLEECLVGPEYSMFVVVSEDQFTILPMAQDHKRVGDGDKGPNTGGMGSYSPLPQLKKEDRQRMIHEIVKPTMNGLVQGNYHYCGVLYIGLMMTEGGPKVIEYNVRLGDPETQVVLPRVKNDFAELIDAAVNHEKLPEIEENDQSVLGVVVCSKGYPTHPAPNVKIGKLPEGTNTYIDYANVKGDLDNLTGDGGRLFMVISEADNLVQAQDNVYSYLSKLDLPDCFYRHDIGNRALRD
>NC_017467.1|WP_014563204.1|567242_568784_+|bifunctional-phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide-formyltransferase/IMP-cyclohydrolase
MKRALISVSDKTNLVDFAKGLVRNGYEIISTGGTKKTLDEAGIKTISVEEVTNFPEILDGRVKTLNPYIHGGLLAKRDDPEHMATLKKLNIQPIDLVCVNLYPFKQTIEKADVTREEAIENIDIGGPSLLRAASKNYQDVTVVTDKADYDLVLKEIEEKGNTTLETRAKLAAKVFRATAAYDAIIANYLTKQVGLEDPEKLTLTYDLKEKMRYGENSHQKAWLYEDAIPKSFSILQAHQLHGKKLSYNNIKDADEALRCIREFQDEPTVVAMKHMNPCGIGRGDTLEEAWDRAYEADSVSIFGGVIALNRKVDLATAEKMHKIFLEIIIAPGFDDDALAVLEKKKNVRLLELDFSKENEKTRPEVVSVMGGILQQEQDILIENTDDWKVVTKAEPTATQLKTMMFALRAVKHTKSNAIVVANDERTLGVGAGQPNRIDSAKIAIKHAGDAIDDRTVLASDAFFPFNDCVEYAAKHGIKAIVQPGGSIRDKDSIEMADKYGVAMVFTGYRHFRH
>NC_017467.1|WP_014563203.1|566644_567241_+|phosphoribosylglycinamide-formyltransferase
MRVAILASGNGTNFEALTKKFQAGEIPGTEALMFCNHPNAPVVKRAERLGIPHEAFSVKECGGKTAYEKRLLKVLQDYQIDFIVLSGYLRVVGPTILNEYPNVIINLHPALLPSYPGLNSIERAFEDYKQGKIKETGVTVHFIDAHLDHGPIIAQQAVPIYPDDTVETLEARVHETEHQLFPATLKKVLSQRMEKEEN
>NC_017467.1|WP_014563218.1|582183_584847_+|DNA-polymerase-I
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>NC_017467.1|WP_014563219.1|584855_585686_+|DNA-formamidopyrimidine-glycosylase
MPEMPEVETVRRTLIPLIKGKTIEKVILWYPKIVATDHEKFLSELPGKKIIDIDRYAKYLLIRLSDNLTIVSHLRMEGKYHLTISDAPKDKHDHVEFIFTDGTALRYNDVRKFGRMQLILTGTERQTTGIGKLGYEPNSSEFTSEYLVNGLKRKKKNIKNTLLDQSVVAGLGNIYVDEVLWRTKIHPLSQANKIPAEKVIELHDQINQIITEAIKLQGTTVHSFLNANGQVGGFQSKLQVYGHVGEPCPVCGTKFEKIKVNGRGTTFCPHCQVIYK
>NC_017467.1|WP_041809384.1|585682_586285_+|dephospho-CoA-kinase
MSYVLALTGGIATGKSTADDFFRKKNIPIIDCDQIAHELMEPGNASWQAIKDHFGMEYLNSDQTINRKKLGQLVFSNKQALSELNQVTHPLIFDKTVAKIKEYRDFALVILDAPVYFEAGLDKKHVANGVLVITLPEQLQIERLKKRNNLTDQEAINRINSQMPLVEKEKMADFVVANTGKIKELENKLEQILIKIREEE
>NC_017467.1|WP_003627138.1|586287_586755_+|transcriptional-repressor-NrdR
MECPNCHQNASRVIDSRPSDENRAIRRRRECENCGFRFTTFERIETAPLLVIKNDGTREPFNRKKILHGVMAAGQKRPISSDQFEQLVDHVENKVRKQGISEISSKKIGQYVMDELADLDDVAYIRFASIYREFKDMSSFMKTMEDMMAKKGKGN
>NC_017467.1|WP_014563221.1|586757_588089_+|DnaD-domain-protein
MFETADPKHLYYVANRVRLFPEDEKVLIKLYQPLVGAVAVALYQTLIQNYDPYGIISDSKGIYSLQEQLDCSLKQLFNSLHKLEAVGLVQTFLSDNVFNNVLVFKLLQVPAADKFFATPLLASLLKEKVGVPTFHDLSHAFAQEAKLKEKPIKNAKDVSANFFDVFRLPGDEAITPSSDVVQAAQENKVHEVETAKVNDHDSIDWDFIKQEYSRYQIPASEIDLNKEQIRGLIQTYGLSEKEFVDESLPCLHGSYSLNMRDISNTLAENYKRTNTRENVQAQLNEGRKKALVAIKDMDDNDKKLLKAANESSPAEFLYKLKTQKGGITSANEKQIINNLHTQYGLPEDLINILTYTCLTYDTVVSSNLAYKIANDWLQHGVATAVQALQYVKKRRNSFGKKRPVRTYQKRVEKGTDWSKKKADRDAGISTEQLKNLFKDLNNK
>NC_017467.1|WP_014563222.1|588120_589029_+|primosomal-protein-DnaI
MEPIDKVIKKIVKERNLGDEQSLISQALHEPDVQAFLTANANKIDQKMVQNSMSNLYEYYSQKHTANKVMAGYAPQLFLNGKVIDIRYVPTKTKLAQDRKQAAERRLQLIDVPTRLHDVSLSEIDVNDDRKQVLTLIYDFLRKYKQDPHVQGLYLSGDYGVGKTYILAGLANYVVTNMNKNVVFLHVPTFIAGLASHFDDNSLQSEIRRLSECDLLILDDIGAESLSQWSRDDVLGVILQARMDNVLPTFFSSNLDMEALESHFEETRNATDPVKARRLMQRVRFLAKEVVVSGPDRRNSLH
>NC_017467.1|WP_023061995.1|589319_591254_+|threonine--tRNA-ligase
MSFSITLPDGSKKDFEESLTIADLAHNIATSLGKAAVAGKVNGELKPLDYKLDSDSEVAIITNKDEEGLDVLRATAAFVFEAVAKCEYPELRLGEHVADEGGFYVDTDKDDQIKVGELPKLEKAMQKVIKNGEKIEHVQIAKSELEDLYKNDKFKSELLAKVEGDTVDAYKLGDFVDFGFDALLPNTGKIKQFKLLSVAGAYWLGKSSSPMLQRIFGTAFFKEADLKADLKRRQEIKERDHRTIGRDLDLFFVDPKVGAGLPYWMPKGATIRRVVERYIIDREVADGYQHVYTPVLMNLDAYKTSGHWAHYRDDMFPPMDMGDGEMLELRPMNCPSHIQIFKHHIRSYRDLPLRVAELGMMHRYEKSGALSGLQRVREMTLNDGHTFVALDQVQTEFAKILKLIMDVYKDFDITDYYFRLSYRDPKNTDKYFANDEMWEKSQKMLKGAMDDLGLDYVEAEGEAAFYGPKLDIQTKTALGNDETMSTIQLDFMLPDRFGLTYVGKDGEEHRPVMIHRGIVGTMERFIAYLTEIYKGAFPTWLAPVQAEIIPVNNEAHGEYAEKVRAELAKRGFRVEVDDRNEKMGYKIRESQTQKVPYTLVLGDEEMKSGKVNVRCYGTDEEISKSLDDFINEIDADVKSYSREN
>NC_017467.1|WP_014563224.1|591411_591933_+|hypothetical-protein
MKRKLILFLTACSIIFSVALINQRKASAASWGAKSLYTTPKQTRGTWYYKKNGKIKKLRITAHTFDKVKLYKMLSNKQTRKWTKKLAKADQESGFKLAKKVGTSQYEADDFKFHKSAGFTINGWLSSDNADSGHTYVTVKKKYKGSKIKTLRVGNGADNAFLYYCYRTKKLAK
>NC_017467.1|WP_023061994.1|592083_592614_+|hypothetical-protein
MKKKLLLFLGAILLILGFAKLSSVNADAATIKAIDWGAKKVFTTPKKTRGVWYYKEGKKVKKFKITAHTIDGVKLYKELNGKTSDRWVNKLIKADKKSGYKLADKVGESAWACHTIKYHKIIGFNADGWLAGSGDGFYYVPVKKNVKGKKVNALRVGEGAGNYLSYYAYKSRKLVK
>NC_017467.1|WP_014563226.1|593076_594327_+|DUF389-domain-containing-protein
MSRKNYLSPQFLTKISEDGTLNIESLIILTCAIFIASIGLNVNSTATIIGAMLISPLMGPLLAIGTGLALYNTNILRKGAISLLAEIVISLVASTIYFHFSPLTYASQEIIARTSPTIWDVIIAFFGGSAGIIGARKKDANNIVPGVAIATALMPPLCTVGYSIAAGNLKYFLGSGYLFLINCVFITLTAFLGVKIMKWLSHSAGQPGLSFFRKPTLKETGIVLVVIILIIPSILSAGHMVNKTLVDQNVQNLVAHELGDVDLIKENVDSQEKTINLTVSGKKINAKKIQAAKANLAEYNLKGYSLNIVQVAQVNPNAENQLDRQVNNILNQRQREQEQANEERQQEQEKHNQEIEKLSPAISSVTAVSDNKNKQITLIELKKNISAKKKKALVKQIKEKYPNINLVEFVQESEKE

Crispr_ID: NC_017467_2

• CRISPR_ID: NC_017467_2
• CRISPR_location: 706414-706497
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NC_017467_2

Consensus_repeat	Method
GTGTATTCTCCACGTATGTGGAG	CRISPRCasFinder

spacers of NC_017467_2

>2.1|706437|38|NC_017467|CRISPRCasFinder
GTGATCCTATGATTGGGTAGACTTAGACGATGAATGGC

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017467_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NC_017467_2

>merge|NC_017467|2|706414-706497|CRISPRCasFinder
GTGTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCCTATGATTGGGTAGACTTAGACGATGAATGGCGTGTATTCTCCACGTATGTGGAG

>NC_017467|2|2|706414-706497|CRISPRCasFinder
GTGTATTCTCCACGTATGTGGAG	GTGATCCTATGATTGGGTAGACTTAGACGATGAATGGC
GTGTATTCTCCACGTATGTGGAG

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NC_017467.1|WP_080553156.1|698094_698442_+|restriction-endonuclease-subunit-S	unknown	unknown	gnl|CDD|341162
NC_017467.1|WP_014563305.1|699197_699812_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NC_017467.1|WP_041809432.1|706857_707739_-|L-serine-ammonia-lyase,-iron-sulfur-dependent,-subunit-alpha	unknown	unknown	gnl|CDD|129801
NC_017467.1|WP_014563318.1|710305_710980_+|amino-acid-ABC-transporter-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|223836
NC_017467.1|WP_041809429.1|706526_706853_-|metal-sulfur-cluster-assembly-factor	unknown	unknown	gnl|CDD|225062
NC_017467.1|WP_003627894.1|709665_710325_+|amino-acid-ABC-transporter-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|223836
NC_017467.1|WP_041809437.1|708519_708810_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NC_017467.1|WP_041809435.1|707753_708416_-|serine-dehydratase	unknown	unknown	gnl|CDD|129802
NC_017467.1|WP_014563319.1|710989_711730_+|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224051
NC_017467.1|WP_014563311.1|704107_704728_-|C39-family-peptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|227323
NC_017467.1|WP_014563310.1|703209_703713_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NC_017467.1|WP_014563312.1|704667_705072_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NC_017467.1|WP_014563303.1|697116_697974_-|IS982-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|372648
NC_017467.1|WP_014563306.1|699894_701139_+|DUF3883-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|379021
NC_017467.1|WP_014563309.1|702798_703011_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NC_017467.1|WP_014563321.1|714627_714921_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NC_017467.1|WP_003631275.1|712649_712964_-|metal-sulfur-cluster-assembly-factor	unknown	unknown	gnl|CDD|225062
NC_017467.1|WP_014563307.1|701260_702442_+|SLAP-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|367400
NC_017467.1|WP_007126420.1|711742_712603_+|transporter-substrate-binding-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|270412
NC_017467.1|WP_049773685.1|698462_699110_+|restriction-endonuclease-subunit-S	unknown	unknown	gnl|CDD|341135

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NC_017467.1|WP_080553156.1|698094_698442_+|restriction-endonuclease-subunit-S	gnl|CDD|341162	cd17273, RMtype1_S_EcoJA69PI-TRD1-CR1_like, Type I restriction-modification system specificity (S) subunit Target Recognition Domain-ConseRved domain (TRD-CR), similar to S.EcoJA69PI TRD1-CR1, MjaXIP/S.MjaORF132P TRD2-CR2, and S.HspDL1ORF16625P TRD2-CR2. Escherichia coli UCD_JA69_pb S subunit (S.EcoJA69PI) recognizes 5'... CCANNNNNNNCTTC ... 3'. The recognition sequences of Methanococcus jannaschii MjaXIP/S.MjaORF132P TRD2-CR2 and Halobacterium species DL1 S subunit (S.HspDL1ORF16625P) are undetermined. The restriction-modification (RM) system S subunit consists of two variable target recognition domains (TRD1 and 2) and two conserved regions (CR1 and CR2) which separate the TRDs. The TRDs each bind to different specific sequences in the DNA. RM systems protect a bacterial cell against invasion of foreign DNA by endonucleolytic cleavage of DNA that lacks a site specific modification. The host genome is protected from cleavage by methylation of specific nucleotides in the target sites. In type I systems, both restriction and modification activities are present in one enzyme complex composed of one DNA specificity (S) subunit (this family), two modification (M) subunits and two restriction (R) subunits. This model contains both TRD1-CR1 and TRD2-CR2. It also includes TRD-CR-like sequence-recognition domains of various putative type II restriction enzymes and methyltransferases and may also include type I DNA methyltransferases.	7.32186e-42
NC_017467.1|WP_041809432.1|706857_707739_-|L-serine-ammonia-lyase,-iron-sulfur-dependent,-subunit-alpha	gnl|CDD|129801	TIGR00718, Probable_L-serine_dehydratase_alpha_chain, L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit. This enzyme is also called serine deaminase. L-serine dehydratase converts serine into pyruvate in the gluconeogenesis pathway from serine. This model describes the alpha chain of an iron-sulfur-dependent L-serine dehydratase, found in Bacillus subtilis. A fairly deep split in a UPGMA tree separates members of this family of alpha chains from the homologous region of single chain forms such as found in Escherichia coli. This family of enzymes is not homologous to the pyridoxal phosphate-dependent threonine deaminases and eukaryotic serine deaminases. [Energy metabolism, Amino acids and amines, Energy metabolism, Glycolysis/gluconeogenesis].	5.40938e-107
NC_017467.1|WP_014563318.1|710305_710980_+|amino-acid-ABC-transporter-permease	gnl|CDD|223836	COG0765, HisM, ABC-type amino acid transport system, permease component [Amino acid transport and metabolism].	6.69903e-55
NC_017467.1|WP_041809429.1|706526_706853_-|metal-sulfur-cluster-assembly-factor	gnl|CDD|225062	COG2151, PaaD, Predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme [General function prediction only].	4.32997e-35
NC_017467.1|WP_003627894.1|709665_710325_+|amino-acid-ABC-transporter-permease	gnl|CDD|223836	COG0765, HisM, ABC-type amino acid transport system, permease component [Amino acid transport and metabolism].	1.42645e-52
NC_017467.1|WP_041809435.1|707753_708416_-|serine-dehydratase	gnl|CDD|129802	TIGR00719, Probable_L-serine_dehydratase_beta_chain, L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit. This enzyme is also called serine deaminase. This model describes the beta chain of an iron-sulfur-dependent L-serine dehydratase, as in Bacillus subtilis. A fairly deep split in a UPGMA tree separates members of this family of beta chains from the homologous region of single chain forms such as found in E. coli. This family of enzymes is not homologous to the pyridoxal phosphate-dependent threonine deaminases and eukaryotic serine deaminases. [Energy metabolism, Amino acids and amines, Energy metabolism, Glycolysis/gluconeogenesis].	4.06847e-43
NC_017467.1|WP_014563319.1|710989_711730_+|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein	gnl|CDD|224051	COG1126, GlnQ, ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component [Amino acid transport and metabolism].	2.38626e-120
NC_017467.1|WP_014563311.1|704107_704728_-|C39-family-peptidase	gnl|CDD|227323	COG4990, COG4990, Uncharacterized protein conserved in bacteria [Function unknown].	5.23243e-31
NC_017467.1|WP_014563307.1|701260_702442_+|SLAP-domain-containing-protein	gnl|CDD|367400	pfam03217, SLAP, SLAP domain. This short domain is found in a variety of bacterial cell surface proteins. The domain is about 60 residues in length (although previously defined as 2 copies of this domain). It usually occurs in tandem pairs. It may be distantly related to the SH3 domain.	0.00516634
NC_017467.1|WP_014563306.1|699894_701139_+|DUF3883-domain-containing-protein	gnl|CDD|379021	pfam13020, DUF3883, Domain of unknown function (DUF3883). This is a domain is uncharacterized. It is found on restriction endonucleases.	1.57142e-17
NC_017467.1|WP_003631275.1|712649_712964_-|metal-sulfur-cluster-assembly-factor	gnl|CDD|225062	COG2151, PaaD, Predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme [General function prediction only].	1.62886e-32
NC_017467.1|WP_014563303.1|697116_697974_-|IS982-family-transposase	gnl|CDD|372648	pfam13612, DDE_Tnp_1_3, Transposase DDE domain. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contains three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	3.11449e-18
NC_017467.1|WP_007126420.1|711742_712603_+|transporter-substrate-binding-domain-containing-protein	gnl|CDD|270412	cd13694, PBP2_Cysteine, Substrate binding domain of ABC cysteine transporter; the type 2 periplasmic binding protein fold. This subfamily comprises of the periplasmic-binding protein component of ABC transporter specific for cysteine and its closely related proteins. The cysteine-binding domains belong to the type 2 periplasmic binding protein fold superfamily (PBP2), whose many members are involved in chemotaxis and uptake of nutrients and other small molecules from the extracellular space as a primary receptor. The PBP2 proteins are typically comprised of two globular subdomains connected by a flexible hinge and bind their ligand in the cleft between these domains in a manner resembling a Venus flytrap. After binding their specific ligand with high affinity, they can interact with a cognate membrane transport complex comprised of two integral membrane domains and two receptor cytoplasmically-located ATPase domains. This interaction triggers the ligand translocation across the cytoplasmic membrane energized by ATP hydrolysis.	1.35372e-99
NC_017467.1|WP_049773685.1|698462_699110_+|restriction-endonuclease-subunit-S	gnl|CDD|341135	cd17246, RMtype1_S_SonII-TRD2-CR2_like, Type I restriction-modification system specificity (S) subunit Target Recognition Domain-ConseRved domain (TRD-CR), similar to Shewanella oneidensis MR-1 S subunit (S.SonII) TRD2-CR2. This model contains Shewanella oneidensis MR-1 S subunit (S.SonII) TRD2-CR2 and similar TRD-CR's. S.SonII recognizes 5'... GTCANNNNNNRTCA ... 3'. The restriction-modification (RM) system S subunit consists of two variable target recognition domains (TRD1 and 2) and two conserved regions (CR1 and CR2) which separate the TRDs. The TRDs each bind to different specific sequences in the DNA. RM systems protect a bacterial cell against invasion of foreign DNA by endonucleolytic cleavage of DNA that lacks a site specific modification. The host genome is protected from cleavage by methylation of specific nucleotides in the target sites. In type I systems, both restriction and modification activities are present in one enzyme complex composed of one DNA specificity (S) subunit (this family), two modification (M) subunits and two restriction (R) subunits. This model contains both TRD1-CR1 and TRD2-CR2. It may also include TRD-CR-like sequence-recognition domains of various type II restriction enzymes and methyltransferases and type I DNA methyltransferases. S.SonII TRD1-CR1 does not belong to this subfamily.	1.24493e-60

Protein sequences

>NC_017467.1|WP_014563312.1|704667_705072_-|hypothetical-protein
MKKIVFISIISCFLLTGFSTTVKADETDQSQTSQINSQTGSNTQQDNTQINKSDSTQDSGNKQNQTNQNSNNTPVKNNNGWKTVNGNTYYLKNGSATKGLKKLMVTGTYLTKMASCLKMCVKFLTPSITATLIN
>NC_017467.1|WP_014563311.1|704107_704728_-|C39-family-peptidase
MLKDVRKIPHTKHYSYFDQLGRRRMKNTSTKKAYYWINKKGQITGIKNNAKVICQRPKMPTGCEITAVTMMLNFAGKKVSKYQAAKVMPRSSNPNKGFAGSPYKKFPLGFWVAPGGVKPVVQHYLGKSKIMTNCSINAIKQKLLRSHLVVVWVGMFDGISNHAITLTGYHGNTLYYNDPWTGTKRKISVTKFKIHWALDGHRAISY
>NC_017467.1|WP_014563310.1|703209_703713_+|hypothetical-protein
MTRKKLTEVQFYFENVEDGAIPGNIIEDMQFDGVHVERYQHFERGDIIFNKVLIADNFLIKLDYELANKCFTNCNEPMGERLSDFNDIVDIVLCFEDGTQERIGFPWVGSSEDNNEYQRSGLEVNKPFDRNDFSELDPMLVEDIKESEKNDRFLNRKMLTVYVDKEN
>NC_017467.1|WP_014563309.1|702798_703011_-|hypothetical-protein
MKYLSRNQAEQWLNQHTLYGKKRKMFTNKFMKRLSKTCRLVPDKNTLFGKKYSLLELKEYANDINPRSFA
>NC_017467.1|WP_014563307.1|701260_702442_+|SLAP-domain-containing-protein
MKLKRIALSIVAGAALMVPAALTGQSQNSSIVQASTLKNKITFVKSYSQPMLYNKNGKSIANKNNINFNKPIRFYGQPTIIQGPKVNAFINLNGMPQSIIKGKTYADLGDGGYVDMKAVGSYNWNNNEIGLIKNAYVYNSKGQRLSTYRGRKAYLTKGSKIKYVGKSWVTYLDSYFNLGSGIYVKSNSVNTMNGKGVLKLNTNTAIYNKKGQRISFNGQRVLPNYSLVNYAGKRHAKTKSDDYYYTNLSGSKSYAVKNYKIKGQDYYYIGKGAYIKAINVGRINGNPVFRDGGATTIVPQMDLFIYNSKLKKTKQSVKKGQKIRALDPVILGSGDIAQLFYRIKGTSNYVSWGDYSEYGFEDDAYVGNFNFRVRLNPIKTIETAATRAAEESD
>NC_017467.1|WP_014563306.1|699894_701139_+|DUF3883-domain-containing-protein
MRKLSDFDYMLDTYDSQDQILEDLRKEFVNSFPIDYIRNQMTISEYIEGKGNKDSFCNRLERELAGLGSIKGATASKFGIYYSQKNQKYVINKVWQTPEGYPDLLSSFKKLRKSIADLIEAGGKNDEVTTQAHPLATMVKMKILSVYYPEKYLNIFSERMLNYFGYQFYGDSFPLNASRFEKQQKLLKLKDSDEATEKWNNIKFGNYLYHLFPYAYELGKENLDNGYKNYSKIHFIQIKPQPPRKKEPKFPVAYDKQAIEFLQKKTVRKVQGLSKIDYIAKQKTATAMGYLGEKEVIAYEQARLVKYPGLQRKIKWQSQVSDAIGYDILSFEKDGTPRQIEVKSTTAKISEKFDFILSENERLHALTLPNYWIYRVFDVKNKPVIYKIKNPLKSELAHLKPIKYQATIKVRDIR
>NC_017467.1|WP_014563305.1|699197_699812_+|hypothetical-protein
MAFILLVIDNWCDLKLAPFIKNFVAVISSVVSMGMIIMSAIQIKLAIDDKRQKKQPKLKIFTFTADDAYTDPETGDFKIDREGKYNYTFCTNLGETKRSFQYYGICRKRDYPKIILPEKRGEYGDLFWINDKALKYIYPYLDHPEFQPRWKFETLDTGEVSKHYKINLTKAKERLKTLSKNQLEEFYVLYVDSTGYIFKELIRM
>NC_017467.1|WP_049773685.1|698462_699110_+|restriction-endonuclease-subunit-S
MGNWLSKIQPASVLLEKIKAEKQELIKEKKIKKTKPLPPITYDEKPFDIPDSWEWVRLGDVLDVRDGTHGTPKYVSDGVPLVTAKNLRNGKIDFSNIKYISESDAKKINERSQVNENDVLFAMIGTIGNPVLVNTDRIFSIKNVALLKANTLINMRFVYMYILTIQDLLLKNASGGNQKFLSLRKINKLPFSLPPLPEQVKIIKMVNSLFDKGKF
>NC_017467.1|WP_080553156.1|698094_698442_+|restriction-endonuclease-subunit-S
MNNLGLEKSSAHLIPKDSLVVSSRAPIGYVNIVPFEYTTNQGCKSVSLYDDTNKQFIYFAIKNAVPEMNRRASGTTFKEISGTKFGQTIVPLPPLSEQSRNIYTTIRKTSDFAEV
>NC_017467.1|WP_014563303.1|697116_697974_-|IS982-family-transposase
MNYHKLKSFSHHLQVSFTRLNNICRSWYKLYAPNSLKHRRNTDQIKLSDSSILAMLIWQAELGIESQRRFCRFFVGLSHSRFNRRARQLLPLIYLIRHTLNQEVDLSGKILIIDSFPVPVFQPVRNYRVKIFHDIADIGYKATKKVYYYGFKVHAIVSDDGYLLDYAVTKASVHDAKETVELMNNAHPTNHYLLGDEGYLGKDLAAKLKHMGYVLWTPYRKNMQGAKKHNNHQLMAVRRTIESDFALLSYYNAENNRARSLAGFQERLEVAVLAYNMAYCLERFN
>NC_017467.1|WP_041809429.1|706526_706853_-|metal-sulfur-cluster-assembly-factor
MRDGETIKNDIINQLATVIDPELNVDVVNLGLIYEIDLDKDGICLINMTLTTPACPLTGYLIDSITQAVKKVLEVKNVDVEFVWYPVWTPDRMSDAAKKYFNIDEKQD
>NC_017467.1|WP_041809432.1|706857_707739_-|L-serine-ammonia-lyase,-iron-sulfur-dependent,-subunit-alpha
MYNHIKEIVADSEKQQKPISELIIEQECKLSGLPRQKVWNRMKHNLATMRAAVERGKSGDGVFSKTGLTGGEAVKIKKYRQTHHTLSGDTIMAAVQNAVATNEVNASMGVICATPTAGSSGTLPGVLFLLEKRMDLSEEQMIRSLFTAGGFGLVIANNAEIAGATGGCQAEVGSASAMGAAAAVEAAGGSAEQSAQAMSIAMSNLLGLVCDPIAGLVEVPCVKRNAIGAGNALISADMALAGCTSVIPADECIDAMKKVGHQMPASLRETGIGGLAGTPTGQAIKAKIFGKDA
>NC_017467.1|WP_041809435.1|707753_708416_-|serine-dehydratase
MTNRYKSVFDIIGPVMVGPSSSHTAGAVAIGRAGNKLFGGVPRKVTVHYYGSFAQTHRGHGTDYAIAAGILGFDTDDLRVPNAPEIAKKRGIDIRFVEEDGPSPIDHPNTAILDMSSGTKKAQISGCSIGGGSIEIRHLVIHDTEITPTGSLPIIIWLDYEKEIFNEQNLTSLLQEKTPFSKKRIFHTKDCNIYEYDVENYLKPALVKELKEKFENIICL
>NC_017467.1|WP_041809437.1|708519_708810_+|hypothetical-protein
MTKEKDELKKNLEKVAEEQGSQQAISYQDLFNPRFMQKNTHFTTIDVFVRELGVKNFPEIEQLGQKVIDDFVKKETNFNIWEELHQVSISMICWRE
>NC_017467.1|WP_003627894.1|709665_710325_+|amino-acid-ABC-transporter-permease
MDWTIIQQALPAYGHGFVLTVWLSLVGIIGSIIVGVIASLLQYFKTPILSQIATAYVELARNTPLLIQLFFLYYALPVIGWRMSSVTAGIIGLIFLGGGYMAEGFTGGFQGVTDSQINSGEALGMNRFQLARYVVFPQGFALSMPALAANVIFLIKETSIFTVIAIPELTNTALDLIGMYYRSNEYLLMLVIGYAIIMIPVILLLNWLERKVRYGAFGD
>NC_017467.1|WP_014563318.1|710305_710980_+|amino-acid-ABC-transporter-permease
MAHSGINVLFSGSNFDRLLVGLWTSIWIAALSIFIGLLIGTVFGVLRTMPNKIIRCILRVYMEIFRILPSVVLLYLVYYILPRSLHINWPGTWMAVLAFSLWVAAEFSDIVRGALQSVPLAQKESGLALGLSKTQLFLYVLLPQAFKLELPATINLATRVIKTTSILMLISVMDVINVGQQIIEANNQKFPTGVFWVYGLIFFFYFILDYPLSVWAKSLMAKQK
>NC_017467.1|WP_014563319.1|710989_711730_+|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein
MTEEILKVEHLNKFYGDWQALHDISFNLKKGEVLAILGPSGSGKSTLLRTLNGLENYKNGEIVFHGKKVQSSQKEWQAIRQKIGMVFQSYDLFPNLTVMQNILLAPTKVQKRDRAEVEQEAHHLLKRVNMDQYADTYPRELSGGQQQRVAIVRTLVMKPEIILLDEITASLDPEMVRGIEDIVKKLSENDHMTMVLVTHQMNFAKRVADQVLFLEKGRILEKTPCEQFFTEPQSERAQQFLTDMDF
>NC_017467.1|WP_007126420.1|711742_712603_+|transporter-substrate-binding-domain-containing-protein
MSGRKIFNTIISVIAAVVVLASAYMGLTKPYLARSAGGGGWSNNNSVTQIKRRGYIRIGVYGDLPPYGWVNSQGKRVGFDLRLARELAKELGVKPRFTQLNGNNRVDALNSNKVDMVLANFTKTPERAEVVDFAHPYMKVSTGVVSPKSHPITSEKQLRGKQLILLKGSTGENYFANRPGIKLLRFDSETQQFNAMKNKRGAALADDNSYLYAWIKKNPQYVVGIRSIGPHQFIAPAVKKGNKSLLKWTNKQIDRLTAEGFFKKDYQIELKPYFGKGIVPSDILLK
>NC_017467.1|WP_003631275.1|712649_712964_-|metal-sulfur-cluster-assembly-factor
MRDSETIKNDIINHLAKVIDPELNIDIVNLGLIYGIDLDEDGICLINMTLTTPACPLTQFLIDKIKAEVEQVEEVKNVDVEFVWYPVWSPNKMSDTAKKYFGIE
>NC_017467.1|WP_014563321.1|714627_714921_+|hypothetical-protein
MNQEKEQFKNNLKKVAAEQGSRQAISYEDLFNPRFMQKNTSFVTIDVFVKELGAKSFPDIDHLDKKIVDQFVKKETRFNSWEEMQQRAINEYMTSLF

Crispr_ID: NC_017467_3

• CRISPR_ID: NC_017467_3
• CRISPR_location: 1642306-1642485
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 2 spacers

Consensus repeat of NC_017467_3

Consensus_repeat	Method
ATGTGGGATTTGAACCCACGC	PILER-CR

spacers of NC_017467_3

>3.1|1642327|58|NC_017467|PILER-CR
ATGCTGGATCCACAAACCAGTGTGTTAACCCCTTCACCAATTCCGCCATAAACGGTCC
>3.2|1642406|59|NC_017467|PILER-CR
TCTCCTACGTGACAGGGAGGCGAGATAAACCACTGCTCCAATGGACCAATCAGAGGAGG

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017467_3

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NC_017467_3

>merge|NC_017467|3|1642306-1642485|PILER-CR
ATGTGGGATTCGAACCCACGCATGCTGGATCCACAAACCAGTGTGTTAACCCCTTCACCAATTCCGCCATAAACGGTCCATGTGGGATTTAAACCCACGATCTCCTACGTGACAGGGAGGCGAGATAAACCACTGCTCCAATGGACCAATCAGAGGAGGATGTGGGATTTGAACCCACGC

>NC_017467|3|2|1642306-1642485|PILER-CR
ATGTGGGATTCGAACCCACGC	ATGCTGGATCCACAAACCAGTGTGTTAACCCCTTCACCAATTCCGCCATAAACGGTCC
ATGTGGGATTTAAACCCACGA	TCTCCTACGTGACAGGGAGGCGAGATAAACCACTGCTCCAATGGACCAATCAGAGGAGG
ATGTGGGATTTGAACCCACGC

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NC_017467.1|WP_014564050.1|1647577_1648909_-|ISL3-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|376574
NC_017467.1|WP_148224876.1|1646603_1646948_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NC_017467.1|WP_023060908.1|1632162_1633491_+|NCS-family-uracil:cation-symporter	unknown	unknown	gnl|CDD|236744
NC_017467.1|WP_003626893.1|1653518_1653860_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NC_017467.1|WP_023060907.1|1631619_1632150_+|bifunctional-pyr-operon-transcriptional-regulator/uracil-phosphoribosyltransferase-PyrR	unknown	unknown	gnl|CDD|235365
NC_017467.1|WP_023060767.1|1649004_1649928_-|IS30-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225382
NC_017467.1|WP_014564041.1|1633545_1634382_-|aldo/keto-reductase	unknown	unknown	gnl|CDD|381359
NC_017467.1|WP_041809652.1|1629859_1631329_-|MFS-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|341045
NC_017467.1|WP_014564049.1|1647282_1647483_+|cold-shock-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224197
NC_017467.1|WP_014563294.1|1645364_1646543_+|IS256-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|307151
NC_017467.1|WP_013854590.1|1640691_1642158_-|MFS-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|129794
NC_017467.1|WP_041809976.1|1636375_1637191_+|PTS-system-mannose/fructose/sorbose-family-transporter-subunit-IID	unknown	unknown	gnl|CDD|377079
NC_017467.1|WP_014564047.1|1643758_1644136_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NC_017467.1|WP_003633113.1|1627434_1628517_-|M42-family-peptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|349906
NC_017467.1|WP_013854589.1|1640171_1640684_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|224228
NC_017467.1|WP_003633097.1|1642653_1643154_-|GNAT-family-N-acetyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|366181
NC_017467.1|WP_014564053.1|1652105_1653482_+|Na+/H+-antiporter-NhaC	unknown	unknown	gnl|CDD|188097
NC_017467.1|WP_014564036.1|1625708_1627331_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|237894
NC_017467.1|WP_014564044.1|1637230_1637707_-|GNAT-family-N-acetyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|366181
NC_017467.1|WP_041809658.1|1650369_1651740_-|23S-rRNA-(uracil(1939)-C(5))-methyltransferase-RlmD	unknown	unknown	gnl|CDD|225174

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NC_017467.1|WP_014564050.1|1647577_1648909_-|ISL3-family-transposase	gnl|CDD|376574	pfam01610, DDE_Tnp_ISL3, Transposase. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. Contains transposases for IS204, IS1001, IS1096 and IS1165.	3.74548e-51
NC_017467.1|WP_023060767.1|1649004_1649928_-|IS30-family-transposase	gnl|CDD|225382	COG2826, Tra8, Transposase and inactivated derivatives, IS30 family [DNA replication, recombination, and repair].	3.12449e-78
NC_017467.1|WP_023060908.1|1632162_1633491_+|NCS-family-uracil:cation-symporter	gnl|CDD|236744	PRK10720, PRK10720, uracil transporter; Provisional.	3.51862e-146
NC_017467.1|WP_023060907.1|1631619_1632150_+|bifunctional-pyr-operon-transcriptional-regulator/uracil-phosphoribosyltransferase-PyrR	gnl|CDD|235365	PRK05205, PRK05205, bifunctional pyr operon transcriptional regulator/uracil phosphoribosyltransferase PyrR.	1.39995e-97
NC_017467.1|WP_014564041.1|1633545_1634382_-|aldo/keto-reductase	gnl|CDD|381359	cd19133, AKR_AKR5F1, the AKR5F family of aldo-keto reductase (AKR). Klebsiella sp. 2,5-diketo-D-gluconic acid reductase (2,5-DKG reductase) is a founding member of aldo-keto reductase family 5 member F1 (AKR5F1). It catalyzes the reduction of 2,5-diketo-D-gluconic acid (25DKG) to 2-keto-L-gulonic acid (2KLG).	3.5672e-155
NC_017467.1|WP_041809652.1|1629859_1631329_-|MFS-transporter	gnl|CDD|341045	cd17502, MFS_Azr1_MDR_like, Saccharomyces cerevisiae Azole resistance protein 1 (Azr1p), and similar multidrug resistance (MDR) transporters of the Major Facilitator Superfamily. This subfamily is composed of multidrug resistance (MDR) transporters including various Saccharomyces cerevisiae proteins such as azole resistance protein 1 (Azr1p), vacuolar basic amino acid transporter 1 (Vba1p), vacuolar basic amino acid transporter 5 (Vba5p), and Sge1p (also known as Nor1p, 10-N-nonyl acridine orange resistance protein, and crystal violet resistance protein). MDR transporters are drug/H+ antiporters (DHA) that mediate the efflux of a variety of drugs and toxic compounds, and confer resistance to these compounds. This subfamily belongs to the Methylenomycin A resistance protein (also called MMR peptide) and similar multidrug resistance (MDR) transporters (MMR-like MDR transporter) family of the Major Facilitator Superfamily (MFS) of transporters. MFS proteins are thought to function through a single substrate binding site, alternating-access mechanism involving a rocker-switch type of movement.	5.88771e-46
NC_017467.1|WP_014564049.1|1647282_1647483_+|cold-shock-protein	gnl|CDD|224197	COG1278, CspC, Cold shock proteins [Transcription].	1.62078e-33
NC_017467.1|WP_014563294.1|1645364_1646543_+|IS256-family-transposase	gnl|CDD|307151	pfam00872, Transposase_mut, Transposase, Mutator family.	1.59755e-106
NC_017467.1|WP_013854590.1|1640691_1642158_-|MFS-transporter	gnl|CDD|129794	TIGR00711, Uncharacterized_MFS-type_transporter_YhcA, drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily. This subfamily of drug efflux proteins, a part of the major faciliator family, is predicted to have 14 potential membrane-spanning regions. Members with known activities include EmrB (multiple drug resistance efflux pump) in E. coli, FarB (antibacterial fatty acid resistance) in Neisseria gonorrhoeae, TcmA (tetracenomycin C resistance) in Streptomyces glaucescens, etc. In most cases, the efflux pump is described as having a second component encoded in the same operon, such as EmrA of E. coli. [Cellular processes, Toxin production and resistance, Transport and binding proteins, Other].	5.80947e-41
NC_017467.1|WP_041809976.1|1636375_1637191_+|PTS-system-mannose/fructose/sorbose-family-transporter-subunit-IID	gnl|CDD|377079	pfam03613, EIID-AGA, PTS system mannose/fructose/sorbose family IID component.	9.16499e-104
NC_017467.1|WP_041809658.1|1650369_1651740_-|23S-rRNA-(uracil(1939)-C(5))-methyltransferase-RlmD	gnl|CDD|225174	COG2265, TrmA, SAM-dependent methyltransferases related to tRNA (uracil-5-)-methyltransferase [Translation, ribosomal structure and biogenesis].	4.27023e-158
NC_017467.1|WP_003633113.1|1627434_1628517_-|M42-family-peptidase	gnl|CDD|349906	cd05656, M42_Frv, M42 Peptidase, endoglucanases. Peptidase M42 family, Frv (Frv Operon Protein; Endo-1 4-Beta-Glucanase; Cellulase Protein; Endoglucanase; Endo-1 4-Beta-Glucanase Homolog; Glucanase; EC. 3.2.1.4) subfamily. Frv is a co-catalytic metallopeptidase, found in archaea and bacteria, including Pyrococcus horikoshii tetrahedral shaped phTET1 (DAPPh1; FrvX; PhDAP aminopeptidase; PhTET aminopeptidase; deblocking aminopeptidase), phTET2 (DAPPh2) and phTET3 (DAPPh3), Haloarcula marismortui TET (HmTET) as well as Bacillus subtilis YsdC. All of these exhibit aminopeptidase and deblocking activities. The HmTET is a broad substrate aminopeptidase capable of degrading large peptides. PhTET2, which shares 24% identity with HmTET, is a cobalt-activated peptidase and possibly a deblocking aminopeptidase, assembled as a 12-subunit tetrahedral dodecamer, while PhTET1 can be alternatively assembled as a tetrahedral dodecamer or as an octahedral tetracosameric structure. The active site in such a self-compartmentalized complex is located on the inside such that substrate sizes are limited, indicating function as possible peptide scavengers. PhTET2 cleaves polypeptides by a nonprocessive mechanism, preferring N-terminal hydrophobic or uncharged polar amino acids. Streptococcus pneumoniae PepA (SpPepA) also forms dodecamer with tetrahedral architecture, and exhibits selective substrate specificity to acidic amino acids with the preference to glutamic acid, with the substrate binding S1 pocket containing an Arg allows electrostatic interactions with the N-terminal acidic residue in the substrate. The YsdC gene is conserved in a number of thermophiles, archaea and pathogenic bacterial species; the closest structural homolog is Thermotoga maritima FrwX (34% identity), which is annotated as either a cellulase or an endoglucanase, and is possibly involved in polysaccharide biosynthesis or degradation.	2.57949e-100
NC_017467.1|WP_013854589.1|1640171_1640684_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|224228	COG1309, AcrR, Transcriptional regulator [Transcription].	2.32543e-07
NC_017467.1|WP_003633097.1|1642653_1643154_-|GNAT-family-N-acetyltransferase	gnl|CDD|366181	pfam00583, Acetyltransf_1, Acetyltransferase (GNAT) family. This family contains proteins with N-acetyltransferase functions such as Elp3-related proteins.	3.72017e-13
NC_017467.1|WP_014564053.1|1652105_1653482_+|Na+/H+-antiporter-NhaC	gnl|CDD|188097	TIGR00931, Uncharacterized_Na+/H+_antiporter_HI_1107, Na+/H+ antiporter NhaC. A single member of the NhaC family, a protein from Bacillus firmus, has been functionally characterized.It is involved in pH homeostasis and sodium extrusion. Members of the NhaC family are found in both Gram-negative bacteria and Gram-positive bacteria. Intriguingly, archaeal homolog ArcD (just outside boundaries of family) has been identified as an arginine/ornithine antiporter. [Transport and binding proteins, Cations and iron carrying compounds].	5.05228e-110
NC_017467.1|WP_014564036.1|1625708_1627331_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein	gnl|CDD|237894	PRK15064, PRK15064, ABC transporter ATP-binding protein; Provisional.	0
NC_017467.1|WP_014564044.1|1637230_1637707_-|GNAT-family-N-acetyltransferase	gnl|CDD|366181	pfam00583, Acetyltransf_1, Acetyltransferase (GNAT) family. This family contains proteins with N-acetyltransferase functions such as Elp3-related proteins.	1.19355e-08

Protein sequences

>NC_017467.1|WP_013854590.1|1640691_1642158_-|MFS-transporter
MNKKQITMVTIALMLGNVMSGLDGTIINTAIPTIVAALHGIQFMGWIVAIFLLGMSISIPIWTKIGEKITNKKAFEISLVLFVLGAALQGMAPNIIFFLCSRFIMGIGAGGMGSLPYIIAGYVFKNIKTRTKVLGYLTASWNGAAILGPLVGGWLIDAFSWHWVFYINIPIGLIALIICLIYYKPVTPEKTPVFDIPGAGLLVIGLLLFLMGVQLVGLTANWIVISLIIISLVFIVLFFIRENHAANPIIPVSLFKNKDLDGDFLLFAFTWGAFIAVNTYMPMWAQALLGLSALLGGMTLIPNSIVEIIASQSVAAIQEHMSTFKLALIGIIAMMISSAGLFLADIHTPVQMLTFIGAFSGIGVGFIFVAMQLKVQLDAGLKNMATATSTSYLIRILAQTVMAAVYGVIMNLNLASGVHTYKGITMAMMNKLSDAKSAKLLPQELVPTMRTIFHAGIKEIMLVSLILLIIAFVLNFYFNFGKKRKKLQ
>NC_017467.1|WP_013854589.1|1640171_1640684_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator
MNMKSLHTQQHIEKALFSLLQKKPYAEISIAEITRKAHVSRTSFYRNYSQKNDVLTLFLANQYKKFIVDINEHKLKTLTKQLVAYLTFFKGNPKVMKILLDAGFEGSLLNFQTRYLKKLLSVYHPDLNLPDYAIAYQSGGIYMLLIWWVKQDYATPLEDLINYAEKHIML
>NC_017467.1|WP_014564044.1|1637230_1637707_-|GNAT-family-N-acetyltransferase
MYMKAFPAWERFSMLSLLAMSLHRNVKFHAIYDNGKFCGITYYAENDNTVYLTYLAVSEKLRGHGYGSKILTVLEDQFPDKQIVIDIEPVTKKAKNYKQRVSRLKFYERNGFHRTDQKLKDPDGEFEALTTGKKLDKNSFIKTLRQMSFGFYQAKVEK
>NC_017467.1|WP_041809976.1|1636375_1637191_+|PTS-system-mannose/fructose/sorbose-family-transporter-subunit-IID
MTKANTKTNSGKLTKKDLFRANWRWLWASQLSWNYERMMAPGYFYAVLPFLKRWYKDDELVEMMQMQTQFFNVNAYDGNFIIGVDLALEESQGIKSKDTVAGIKTGLMGPLAGIGDTIFSAIIPTICGSIGAYMGLRGNPLGSILWILVDIIILFLRFSFLPMGYYQGTKLIDSASGKLNAIADSAILLGVMVVGALIPTVIKAKVPYVFHTGKITLKMQSILNQIMPSLVPVLLVALVYWLLGKKVVTSTKMIWFVLILGIVLSYFHILG
>NC_017467.1|WP_014564041.1|1633545_1634382_-|aldo/keto-reductase
MEKSVTLNNGVKMPRLGFGVYQIDDLAQAQQVVEDGLEVGYRLVDTAQIYGNEQAVGDAIKHSAVPREDIFVTSKIWVDDYGYDQTLKAFDESMKKLQLDYLDLYLIHKPYNDYYGTWHALERLYKEGRIRAIGVSSFWNERLADLITFNDVKPAVNQIETNVWNQEWKSQKYMEKEGVQPEAWAPFAEGADHVFTNPVLEEIAEKHHKTTAQVMLRWFLQRNYVVIPKSVHKERLAQNFDIFDFELDKTDMEKIKTLDQGRSILEDEMDPEIAESFR
>NC_017467.1|WP_023060908.1|1632162_1633491_+|NCS-family-uracil:cation-symporter
MSKKENFRNPDAILDVYEKPEFGQGVLLSLQHMFAMFGSTVLVPILIGINPSIALLSSGIGTLVHMILTHFKIPAYLGSSFAFVATMQALMKADGYPAVAQGAIASGLVYVIVALIIAKVGSGWVNKVLPPIVVGPIIIVIGLSLATTAANDAMMNNQKYDLTYFGVAIFTLVMTLVFQMCFKGFTSLVSIMLGIICGYVLACFLGIVDFSGVEKAAWFSIPSLDVMGISYHFKWYPAAILAMAPIAFVTMTEHMGHIMVLNSLTKRNFFKNPGLHRTMMGDGISTIIAGFIGGPPTTSYGENIGVLAMTKVHSVWVLAGAAVCAIIFSFVGKLAALIESIPMPVIGGISFLLFGTIASNGLKILVDDKVDFGEKRNMLITSVILVIGIGGAYLQLGNFELTSVALSTIIGMILNWVLPKQAASEKALAEKNKEKQEGKIYQ
>NC_017467.1|WP_023060907.1|1631619_1632150_+|bifunctional-pyr-operon-transcriptional-regulator/uracil-phosphoribosyltransferase-PyrR
MAKEIIDAIGMKRALMRMTYEIVERNKGTENLVLVGIKTRGLYLAQRIAANLKKLEDVEITVGAIDVSQYRDDLPESKKEKMIHDQQLDFDITDKNVVLVDDVLFTGRTIRAALDALMDQGRPAKINLAVLVDRGHRELPIRPDFIGKNIPAAMNEEVKVSMTEVDDKDSIELINK
>NC_017467.1|WP_041809652.1|1629859_1631329_-|MFS-transporter
MNKKQLFMVTLALLLANIMSGLDATIINTTIPAIVSDLHGIQYMGWIVACFLLGMSVSVPIWGKLGERMGNKFAFELSLALFILGSLLEGIAPDIYFFLIARILMGVGAGGMGSLPYVIVGYIYPNIKRRTVILGYILASFSAASIAGPLVGGWIVDTLSWHWVFYINVPLGLIAIILSFVYYKGIRKPNKNTQFDKLGAFTLIAGLTSFLIGIQLLGMVSLPVVLGFIILGILLLVVFIRAERKAKSPVVPLSVFTNKALVEDFLIFALAWGSYIAVNTYLPMWAQAILGASALVGGMTLIPNSIVEIVGSQTAPYFLRHVNNYRLLIANLTIMAITAVGLILAPISTPYQILALIAAFSGFSVGSIFVILQIKVQVDASEKDMAPATSLSFLIRILAQTIMAAIYGVIMNLALGRGIAGHPGITMTMMNKLSDAESAKTLPVQLLPTMRKIFYGGIREIMIVSLVLLVAAYVVNYLYNRHEAKIMAE
>NC_017467.1|WP_003633113.1|1627434_1628517_-|M42-family-peptidase
MQKEQEIQMLKEFSDANSTSGFEEEFVKLFTSYAEKTANIEVDGMLNVYASKKENKGDRPVIQLDAHSDAVGFITQAVRPNGLIKFVPLGGWVKYNIPALKVKVRNRDGEYIPGVVATKPPHFMTAAERNNVPDVVDMSIDVGSSSREETIKDYKIDTGCPIFVDVKCEYHEKSGLFFGKDFDDRFGAGAMIDVLDNLKGEETNFDVVAALSSQEEVGLRGAYVTARKVKPDLCLVLESCPADDTFTPDWLSQTGLKRGPMLRDMDTTFLPNPKFQQYACDLADKNNIPYTRSVRTGGGQDGAAIYYENGAPTIVIGIPVRYEHSPYCFSSYKDFKASVDLATAIIRDITQEKLDSFKKF
>NC_017467.1|WP_014564036.1|1625708_1627331_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein
MITVSDLSLKFGGRTLYEDVNLKFTPGNCYGVIGANGAGKSTFLKLLEGKLEPTTGSISIDPNERMSSLNQDHFAFEDFTVMDTVIQGHKELYQVMKEKDALYAKPDFGDEDGVKAAELESKFAELDGWNAEANASKLLQSLDIPESEHQMLMKELPESEKVKVLLAQALFGNPDILLLDEPTNGLDVHTVEWLENFLADYPNIVIVVSHDRHFLNQVCTEMCDVDRGKIQLYVGNYDFWYESSKLANELVANQNAKKEEKIKQLQEFIARFSANASKSRQATSRKKQLDKITLDDIKPSSRKYPFVKFEMHRDLGNDLVKVENVSYSVDGEKILDNVSFIVRPGDKVAFLSRNALAATALLDIIAGKIKPDTGTVTWGQTTAFNYMSRDLNANFNNDDLTILDWLRQYATKEQDDNTFLRGFLGRMLFSGEEIEKKIKVLSGGEKVRCQLSRMMLEPANVLIMDDPTNHLDLESITALNDALVAYPGSILFTSHDHEFIQTIANHIIEVGPKGIVSRQDTTYDEFLDKESIQDQVEKIY
>NC_017467.1|WP_003633097.1|1642653_1643154_-|GNAT-family-N-acetyltransferase
MIIKPLISEDEAKETSRLFQKCWQNTYKDILPDVFLDNIPENAWVKRLNESGRHNLIFIDDDNKIRAAVSYGRPRDTRMLGCGELMALYVEPDFQGFNIGKTLLNAAENELKKMGYGKIYLWCIDGDENARQFFEHFGWVNNATEKFVEIAGKEYKYLLYQKNLHD
>NC_017467.1|WP_014564047.1|1643758_1644136_-|hypothetical-protein
METIQLIKDIILNELQDRVKYILSFKNKLEILEENDIQQGVTVARALQSFINAEDKEVTKTRYDRLMKSNNYLSNYKGFILEFRQFNGQITKRNLHSFIFEITSAHESTVLNALFPNGNVQFKDL
>NC_017467.1|WP_014563294.1|1645364_1646543_+|IS256-family-transposase
MNDFTKNMAQALFNQDKINDLLRKELQQAVNDLLEAELTAFLGYNPYARDGWNTGNSRNGAYFRKVDTQFGKIEIQVPRDRNGLFHQHTLPDYKQHADVLENMIIKLYSKGVTTREIADLIEKMYGSHYSPAQVSNISKQMIPKVEAYHKRKLNDKFFCVYLDAAYVPLRRITFDREAVYIAIGIKPNGHKEVIDYCIAPNENIEVWTELLQSMKSRGLEQAELFLSDGVVGMKTALAKTYPQAHFQRCLVHVMRNICAKVRVEDREAIMNEFKQIHQQANKAAAVDVLHAFYAKWDKSYNHVIRNLKDIEPDLLVFYNYPKQIRASIYSTNMIESFNNVIKRKAKPKAEFPTEQSLDTFIGIQAMSYNDRYFNRIHKGFGQVQDTLESYFD
>NC_017467.1|WP_148224876.1|1646603_1646948_-|hypothetical-protein
MNRILGIESYFRNERLTLRDKINKFIEELPESYRELLSEHVGNTDDWIGKLVSTRVFLTHGDRENMAVSNPYKLVQMTKKFGFMVRIFILQKLGITIDKPKILNKFKNVLTTHY
>NC_017467.1|WP_014564049.1|1647282_1647483_+|cold-shock-protein
MQNGTVKWFNADKGFGFITGSDGTDVFVHFSSIKTDGFKSLEEGQKVSYDVEQGRRGPQATNVVPQ
>NC_017467.1|WP_014564050.1|1647577_1648909_-|ISL3-family-transposase
MDYSTRTALGIKDSHLELDTAHFKNVIESHDNQVVVHLIQSYPLRCPRCGQLMLKNGFKIVNVLGPSLHYQPTIWSIRNQKYLCKPSSACPSTITELAKVKDIKYRHHISQAIKQQVMIQLTTNESQIDIAKELGISDWTVRRVIFNLDQFFKPNYHWLPRHIAFDDFKSGRFAPSGMSMILMNIENHRTIDIILSRRNRYLRNYFLRYDRAARLAVRTVTVDLYTPYRHLIHELFPHAIIIADHFHVVAQAYRALNKIRVKAMNQAGNGSHQWRALKHFWKLILTPAGLLKYDNYWSRRNFGYTQLTDVEVIQRLLAFNDDLKQAYRYYQDLILAINHRSKDELNHLLAIKWTQLPQSLQKVQRTLRRHRKEIITSFKYGDYTNGPVEGTNNKIKVIKRAAYGFRNFFNFRARILLALPNSYFAINWKNKRTAHVQSQTRAV
>NC_017467.1|WP_023060767.1|1649004_1649928_-|IS30-family-transposase
MSTTILSLQNRVVIETLHNEGRSLRYIANYLGFSKTTIFNELHRLNSEYQAELAQTDFERKVSQRGRKSSLTKNLKHLIEEKIQVQKWSPEQVAHVVGIAYKTVYNWIDQGWLDIQLPDLPDHGIRRHRAKEKRGTFNHGRSIEERPHQVETRQKFGHFEADTVLSGKRKGQAVATFVERKSRLTIVKRLHGRDSQSMTQAVLELASQLQDKLKTLTVDHGKEFANYQTIERQTGTQVYFAHAYSPHERGSNENRNRVLRRFIPKGQAIEELSDHKLIQINWYLNSRPLKCLNWHTPIEIFLLNLRH
>NC_017467.1|WP_041809658.1|1650369_1651740_-|23S-rRNA-(uracil(1939)-C(5))-methyltransferase-RlmD
MEKNQIIDLEITDLSYEAMGVAHYNGMTVFVTNALPGEVVSAKILKVKKNFAFAKIEKIKKESPDRVKVKLNQGVQSGLASLAHIKYDKQLDFKRNQVVNLLKKAHLENIEVGETLASPEEVGYRNKAQVPVREVNGQLEIGFFRRHSHDLMPLTHFFTTDPEIDRVLVAVRDILRKYKVPAYDEINNNGEVRYLEVRRSKSTGEMMVILVCLHKDFMQLPNVAAEVSQIPGVSGLILNHNPKKTNVILGPKDYLVFGNDQITDQIGDLKFRISPQSFFQINSLQTPRLYNLAIKQADLKPDDVVIDAYSGIGTIGLSVAKHVKAVRGIEVVRDAIKDAKDNAKLNDITNAKYYLGKAEEIMPRWAKSGLKTDVVFVDPPRKGLTPEFINAAVKTGPKKIVYISCNPATLVRDLQLFQEKSYEFNRIDPVDMFPQTPHVESVTVLKRTKNSRQTAL
>NC_017467.1|WP_014564053.1|1652105_1653482_+|Na+/H+-antiporter-NhaC
MKKEKVSFTESIIILIALLAILGISVIKFGLSPEVPVLFTVLLLTFWARFRGFTWKDVQDGIKEGIGVAIIPIFIFILIGALIGLWIKAGIIPSIMVLGFHLISGSFFVPSVFIACAIVGVAIGSGFTTISTVGIAFFGIGASMNANPALVAGAIISGAVFGDKMSPLSDSTNLSSAVAESELFAHIKNMMWSTIPSFVVSLILFWILGNSGHMDPTKIERTSHVLQTNFSISWWAVVPIVFMLLCAWRKVPAIPTLFINIAATVIMIFVQNPHESVQSLNNLIMNGFVAKTSDASVNALLTRGGISSMMATVALIISTLSLGGMLMKFNVVQSAMEPLVKHLRKPGRLITVTILSGICINLFVGEQYLSVILPGRAFKPAFDKIKLSPLALSRVLEDGGSVINYLIPWGVAGSFAATTLGVPVLQFLPFAFFSLLSPVFSIISGFTGIGLKWAKDKK
>NC_017467.1|WP_003626893.1|1653518_1653860_-|hypothetical-protein
MDKKYSDNEVRGERSSRPKQVEKQALTLSFTKNAWDKYRQLTGSQKTFIDRELDDLKFNQNRQKSKQVNAELDQVLVFEKNGAEIVITDIVYEPYRESKEHKKAQIRMEDMNN

Crispr_ID: NC_017467_4

• CRISPR_ID: NC_017467_4
• CRISPR_location: 2004248-2004400
• CRISPR_type: TypeV
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NC_017467_4

Consensus_repeat	Method
TTTGAACAAAACACATCATATACCATATTAGTTCGAATATCAAACTATT	CRISPRCasFinder

spacers of NC_017467_4

>4.1|2004297|55|NC_017467|CRISPRCasFinder
CTGGTTAACGGCATTGTATACGGGTTGCGAGGACCCGTAAAGATTTTTTTAAATA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017467_4

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NC_017467_4

>merge|NC_017467|4|2004248-2004400|CRISPRCasFinder
TTTGAACAAAACACATCATATACCATATTAGTTCGAATATCAAACTATTCTGGTTAACGGCATTGTATACGGGTTGCGAGGACCCGTAAAGATTTTTTTAAATATTTGAACAAAACACATCATATACCATATTAGTTTGAATATCAAACTATT

>NC_017467|4|3|2004248-2004400|CRISPRCasFinder
TTTGAACAAAACACATCATATACCATATTAGTTCGAATATCAAACTATT	CTGGTTAACGGCATTGTATACGGGTTGCGAGGACCCGTAAAGATTTTTTTAAATA
TTTGAACAAAACACATCATATACCATATTAGTTTGAATATCAAACTATT

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NC_017467.1|WP_013855208.1|1998531_1999002_-|acetyl-CoA-carboxylase-biotin-carboxyl-carrier-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|235777
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NC_017467.1|WP_002331365.1|2015910_2016444_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|379233
NC_017467.1|WP_041809770.1|2002215_2003199_-|ketoacyl-ACP-synthase-III	unknown	unknown	gnl|CDD|236475
NC_017467.1|WP_041809689.1|2008473_2009718_+|ISL3-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225995
NC_017467.1|WP_014564311.1|2016714_2017971_+|OFA-family-MFS-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|340911
NC_017467.1|WP_014564303.1|2003195_2003663_-|MarR-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|197670
NC_017467.1|WP_023061724.1|2005842_2006091_-|GlsB/YeaQ/YmgE-family-stress-response-membrane-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|225170
NC_017467.1|WP_003625233.1|2003692_2004139_-|3-hydroxyacyl-ACP-dehydratase-FabZ	unknown	unknown	gnl|CDD|234568
NC_017467.1|WP_014564301.1|2000987_2001905_-|ACP-S-malonyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|223408
NC_017467.1|WP_014564299.1|1999005_2000235_-|beta-ketoacyl-ACP-synthase-II	unknown	unknown	gnl|CDD|274452
NC_017467.1|WP_148224900.1|2007841_2008231_+|recombinase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|239737
NC_017467.1|WP_041809773.1|2009911_2010799_+|EamA-family-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|227309
NC_017467.1|WP_041809769.1|1996717_1998097_-|acetyl-CoA-carboxylase-biotin-carboxylase-subunit	unknown	unknown	gnl|CDD|236307
NC_017467.1|WP_014564315.1|2021391_2022231_+|carboxylating-nicotinate-nucleotide-diphosphorylase	unknown	unknown	gnl|CDD|181221
NC_017467.1|WP_014919539.1|2018088_2018328_-|integrase-core-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|372570
NC_017467.1|WP_023062170.1|2012685_2014953_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrA	unknown	unknown	gnl|CDD|223256
NC_017467.1|WP_014564300.1|2000256_2000988_-|3-oxoacyl-ACP-reductase-FabG	unknown	unknown	gnl|CDD|235500
NC_017467.1|WP_014919524.1|1998110_1998527_-|beta-hydroxyacyl-ACP-dehydratase	unknown	unknown	gnl|CDD|238615
NC_017467.1|WP_013855204.1|2001914_2002157_-|acyl-carrier-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|179197

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NC_017467.1|WP_013855208.1|1998531_1999002_-|acetyl-CoA-carboxylase-biotin-carboxyl-carrier-protein	gnl|CDD|235777	PRK06302, PRK06302, acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein.	1.93289e-43
NC_017467.1|WP_014564314.1|2020207_2021395_+|MFS-transporter	gnl|CDD|340923	cd17365, MFS_PcaK_like, 4-hydroxybenzoate transporter PcaK and similar transporters of the Major Facilitator Superfamily. This aromatic acid:H(+) symporter subfamily includes Acinetobacter sp. 4-hydroxybenzoate transporter PcaK, Pseudomonas putida gallate transporter (GalT), Corynebacterium glutamicum gentisate transporter (GenK), Nocardioides sp. 1-hydroxy-2-naphthoate transporter (PhdT), Escherichia coli 3-(3-hydroxy-phenyl)propionate (3HPP) transporter (MhpT), and similar proteins. These transporters are involved in the uptake across the cytoplasmic membrane of specific aromatic compounds such as 4-hydroxybenzoate, gallate, gentisate (2,5-dihydroxybenzoate), 1-hydroxy-2-naphthoate, and 3HPP, respectively. The PcaK-like aromatic acid:H(+) symporter subfamily belongs to the Metazoan Synaptic Vesicle Glycoprotein 2 (SV2) and related small molecule transporter family (SV2-like) of the Major Facilitator Superfamily (MFS) of membrane transport proteins. MFS proteins are thought to function through a single substrate binding site, alternating-access mechanism involving a rocker-switch type of movement.	9.50937e-60
NC_017467.1|WP_002331365.1|2015910_2016444_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	gnl|CDD|379233	pfam13518, HTH_28, Helix-turn-helix domain. This helix-turn-helix domain is often found in transposases and is likely to be DNA-binding.	8.18384e-07
NC_017467.1|WP_041809770.1|2002215_2003199_-|ketoacyl-ACP-synthase-III	gnl|CDD|236475	PRK09352, PRK09352, beta-ketoacyl-ACP synthase 3.	1.29675e-155
NC_017467.1|WP_041809689.1|2008473_2009718_+|ISL3-family-transposase	gnl|CDD|225995	COG3464, COG3464, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	1.3986e-50
NC_017467.1|WP_014564311.1|2016714_2017971_+|OFA-family-MFS-transporter	gnl|CDD|340911	cd17353, MFS_OFA_like, Oxalate:formate antiporter (OFA) and similar proteins of the Major Facilitator Superfamily of transporters. This subfamily is composed of Oxalobacter formigenes oxalate:formate antiporter (OFA or OxlT) and similar proteins. O. formigenes, a commensal found in the gut of animals and humans, plays an important role in clearing dietary oxalate from the intestinal tract, which is carried out by OFA/OxlT, an anion transporter that facilitates the exchange of divalent oxalate with monovalent formate, the product of oxalate decarboxylation. This exchange generates an electrochemical proton gradient and is the source of energy for ATP synthesis in this cell. The OFA-like subfamily belongs to the Monocarboxylate transporter -like (MCT-like) family of the Major Facilitator Superfamily (MFS) of membrane transport proteins. MFS proteins are thought to function through a single substrate binding site, alternating-access mechanism involving a rocker-switch type of movement.	5.27796e-108
NC_017467.1|WP_014564303.1|2003195_2003663_-|MarR-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|197670	smart00347, HTH_MARR, helix_turn_helix multiple antibiotic resistance protein.	4.05206e-16
NC_017467.1|WP_023061724.1|2005842_2006091_-|GlsB/YeaQ/YmgE-family-stress-response-membrane-protein	gnl|CDD|225170	COG2261, COG2261, Predicted membrane protein [Function unknown].	4.9666e-11
NC_017467.1|WP_003625233.1|2003692_2004139_-|3-hydroxyacyl-ACP-dehydratase-FabZ	gnl|CDD|234568	PRK00006, fabZ, 3-hydroxyacyl-ACP dehydratase FabZ.	5.70414e-77
NC_017467.1|WP_014564301.1|2000987_2001905_-|ACP-S-malonyltransferase	gnl|CDD|223408	COG0331, FabD, (acyl-carrier-protein) S-malonyltransferase [Lipid metabolism].	2.37037e-78
NC_017467.1|WP_014564299.1|1999005_2000235_-|beta-ketoacyl-ACP-synthase-II	gnl|CDD|274452	TIGR03150, fabF, beta-ketoacyl-acyl-carrier-protein synthase II. 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase 2 (KAS-II, FabF) is involved in the condensation step of fatty acid biosynthesis in which the malonyl donor group is decarboxylated and the resulting carbanion used to attack and extend the acyl group attached to the acyl carrier protein. Most genomes encoding fatty acid biosynthesis contain a number of condensing enzymes, often of all three types: 1, 2 and 3. Synthase 2 is mechanistically related to synthase 1 (KAS-I, FabB) containing a number of absolutely conserved catalytic residues in common. This model is based primarily on genes which are found in apparent operons with other essential genes of fatty acid biosynthesis (GenProp0681). The large gap between the trusted cutoff and the noise cutoff contains many genes which are not found adjacent to genes of the fatty acid pathway in genomes that often also contain a better hit to this model. These genes may be involved in other processes such as polyketide biosyntheses. Some genomes contain more than one above-trusted hit to this model which may result from recent paralogous expansions. Second hits to this model which are not next to other fatty acid biosynthesis genes may be involved in other processes. FabB sequences should fall well below the noise cutoff of this model. [Fatty acid and phospholipid metabolism, Biosynthesis].	0
NC_017467.1|WP_148224900.1|2007841_2008231_+|recombinase-family-protein	gnl|CDD|239737	cd03768, SR_ResInv, Serine Recombinase (SR) family, Resolvase and Invertase subfamily, catalytic domain; members contain a C-terminal DNA binding domain. Serine recombinases catalyze site-specific recombination of DNA molecules by a concerted, four-strand cleavage and rejoining mechanism which involves a transient phosphoserine linkage between DNA and the enzyme. They are functionally versatile and include resolvases, invertases, integrases, and transposases. Resolvases and invertases affect resolution or inversion and comprise a major phylogenic group. Resolvases (e.g. Tn3, gamma-delta, and Tn5044) normally recombine two sites in direct repeat causing deletion of the DNA between the sites. Invertases (e.g. Gin and Hin) recombine sites in inverted repeat to invert the DNA between the sites. Cointegrate resolution with gamma-delta resolvase requires the formation of a synaptosome of three resolvase dimers bound to each of two res sites on the DNA. Also included in this subfamily are some putative integrases including a sequence from bacteriophage phi-FC1.	6.54229e-25
NC_017467.1|WP_041809773.1|2009911_2010799_+|EamA-family-transporter	gnl|CDD|227309	COG4975, GlcU, Putative glucose uptake permease [Carbohydrate transport and metabolism].	9.66865e-118
NC_017467.1|WP_041809769.1|1996717_1998097_-|acetyl-CoA-carboxylase-biotin-carboxylase-subunit	gnl|CDD|236307	PRK08591, PRK08591, acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit; Validated.	0
NC_017467.1|WP_014564315.1|2021391_2022231_+|carboxylating-nicotinate-nucleotide-diphosphorylase	gnl|CDD|181221	PRK08072, PRK08072, carboxylating nicotinate-nucleotide diphosphorylase.	3.86206e-124
NC_017467.1|WP_014919539.1|2018088_2018328_-|integrase-core-domain-containing-protein	gnl|CDD|372570	pfam13333, rve_2, Integrase core domain.	1.0813e-14
NC_017467.1|WP_023062170.1|2012685_2014953_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrA	gnl|CDD|223256	COG0178, UvrA, Excinuclease ATPase subunit [DNA replication, recombination, and repair].	0
NC_017467.1|WP_014564300.1|2000256_2000988_-|3-oxoacyl-ACP-reductase-FabG	gnl|CDD|235500	PRK05557, fabG, 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase; Validated.	1.49589e-102
NC_017467.1|WP_014919524.1|1998110_1998527_-|beta-hydroxyacyl-ACP-dehydratase	gnl|CDD|238615	cd01288, FabZ, FabZ is a 17kD beta-hydroxyacyl-acyl carrier protein (ACP) dehydratase that primarily catalyzes the dehydration of beta-hydroxyacyl-ACP to trans-2-acyl-ACP, the third step in the elongation phase of the bacterial/ plastid, type II, fatty-acid biosynthesis pathway.	1.46713e-44
NC_017467.1|WP_013855204.1|2001914_2002157_-|acyl-carrier-protein	gnl|CDD|179197	PRK00982, acpP, acyl carrier protein; Provisional.	2.22825e-16

Protein sequences

>NC_017467.1|WP_003625233.1|2003692_2004139_-|3-hydroxyacyl-ACP-dehydratase-FabZ
MSVLDAAEIMDLIPNRYPILFMDKVDELNPGESIVCTKNVTINEEFFQGHFPGNPVMPGVLIIESLAQAASILILKTEKYQGKTAYLGAIDSAKFRKVVRPGDVLKLHVTMEKQRDNMGKVKCEAKVEDKVACSAELTFIVPDPKKKI
>NC_017467.1|WP_014564303.1|2003195_2003663_-|MarR-family-transcriptional-regulator
MNAISDEIKEDYNFISDSLVDIYDQIMRIEESEIKKSRFKDITAKELHLVHTIGLHDHKTTSEVARILRLSKGTLTANLNNLERKGYIFRIRNQRDRRIINLVLTSKGRLLYRAHYAFHRKLVEQCLKGFDGSDIKKMKQALMNVEDFIGEVSGR
>NC_017467.1|WP_041809770.1|2002215_2003199_-|ketoacyl-ACP-synthase-III
MKFEDFKIMATASSAPDHVVTNDELATMMDTSDEWITQRTGIKRRRIATEETTSSMCTDVATQLIAQSDLTAKDIDLIAVATMSPDYLTPSVSAMVQGNIGADHAIAFDIDAACSGFVYGLHLLKQMLIANQQKNAILIGGETLSKLLDWSDRSTAVLFGDGAGGVLIRNTAVDKGSFISEDLRTLGNLGQYLTAGQTGNPSPFATDQQPFSPFFKMDGRRVYSFAVKNVPESINDALKQANLTADEVDCFVLHQANRRIVERIADELAVSMAKFPINIDEYGNTAAASEPILLDQLVKQKIIKRGDVIALSGFGGGLTVGTMIMKY
>NC_017467.1|WP_013855204.1|2001914_2002157_-|acyl-carrier-protein
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MHWLWVLIVGAVIGAIAGAITNRGTAMGWISNIIAGLVGSSIGEAILGSWGPNIAGMAIIPSIIGAIVVVAVVSFFLSRSTR
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MVHLIEPNDTLIVTKLDRFARNTREALNLIDDLLEEKIMIKVLNLGTIDNTPIGRMIVRTLLSVAEMERDMIIERTQAGKIFARQHNPNYKEGRPKRKKDSRNMAIFEYSNSHTVKEAAEAFNISPRTV
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MSQYDPTLSVLGIPDHNIKVAFVRHEYRGNGVRRRQYHVIDAELTYRLTRCPLCGFEALHPNRFYTTHVRVLNGVEMPTVIDLHKQRWRCHSCYHTVSAKTPLVQPNHTIAAHMTERIMKLAHERLPVKTVARIIGISASSVQRIIDQNLKLRPARRLPTRLCFDEFRSTHGMMSFICLDADSHRLIALLGDRFNRTIKNFFIAHYSLTERTRVQTVTMDMNAAYQTIIHEVFPKAQVVIDRFHIIQLAARALDQVRVQALKQLDDKHSRPYKIMKTNWRLFHQTAPDAKHKQFLFGLNEDVTQHETIDIALDTEPKLKQTYETYLALHDALMVKKHPAELANLLATYEPNGTAMDMTIATLKRHKVAVLAAVTSPYSNGPIEGVNRLIKSLKRSCFGFKNQLNFFKRIYQITA
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>NC_017467.1|WP_023062170.1|2012685_2014953_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrA
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>NC_017467.1|WP_014564314.1|2020207_2021395_+|MFS-transporter
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>NC_017467.1|WP_014564315.1|2021391_2022231_+|carboxylating-nicotinate-nucleotide-diphosphorylase
MNPIVLKEKISEFLKEDLGFGDLSVAFLPGGTPLSGSFIAKQSGIICGQEIPQATYDLLGHATYKPRIPDGAPVKAGDIIGTVSGTAQTLLSGERVTLNLIQRMSGIATQTTHFVKLLDDATIRITDTRKTAPGLRLFDKYAVSVGGGFNHRFDLTGGIMLKDNHIALAGGVTQALAAVKRHVGPLTPVEVEVETEEELRQAVAGGANVIMFDNQNPETIKQWRQLVPKTIKVEASGGITAESISTFKGCGADFISIGNLTNDVTPLDISFLVAGAVKS

MGE targeting detection<

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NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP036330	Klebsiella pneumoniae strain BA28434 plasmid punnamed_1_VBA28434	15242-15275	5	0.853
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP015504	Klebsiella pneumoniae strain SKGH01 plasmid unnamed 4, complete sequence	25349-25382	5	0.853
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP009276	Klebsiella variicola strain DX120E plasmid pKV2, complete sequence	23410-23443	5	0.853
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP028794	Klebsiella pneumoniae strain WCHKP040035 plasmid p1_040035, complete sequence	35759-35792	5	0.853
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NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	MH791407	UNVERIFIED: Aeromonas phage AsFcp_4, partial genome	208161-208194	7	0.794
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NC_017467_1	1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	579191-579224	34	NZ_CP023352	Escherichia coli strain ETEC-2264 plasmid unnamed3, complete sequence	27122-27155	7	0.794
NC_017467_1	1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	579191-579224	34	NC_022333	Escherichia coli plasmid pCss165Kan DNA, complete genome, strain: 4266 delta cssB::Km	78391-78424	7	0.794
NC_017467_1	1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	579191-579224	34	NZ_CP025848	Escherichia coli strain 602354 plasmid p602354_148, complete sequence	28528-28561	7	0.794
NC_017467_1	1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	579191-579224	34	NZ_CP025850	Escherichia coli strain 600468 plasmid p600468_158, complete sequence	145044-145077	7	0.794
NC_017467_1	1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	579191-579224	34	NZ_CP022914	Escherichia coli O6:H16 strain 2011EL-1370-2 plasmid unnamed2, complete sequence	62338-62371	7	0.794
NC_017467_1	1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	579191-579224	34	NZ_CP024259	Escherichia coli O25:H16 strain F5505-C1 plasmid unnamed2, complete sequence	77420-77453	7	0.794
NC_017467_1	1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	579191-579224	34	NZ_CP024255	Escherichia coli strain ATCC 43886 plasmid unnamed2, complete sequence	86028-86061	7	0.794
NC_017467_1	1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	579191-579224	34	CP025928	Escherichia coli strain 520873 plasmid p520873_80, complete sequence	80338-80371	7	0.794
NC_017467_1	1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	579191-579224	34	CP025908	Escherichia coli strain 204576 plasmid p204576_146, complete sequence	12306-12339	7	0.794
NC_017467_1	1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	579191-579224	34	CP025890	Escherichia coli strain 503046 plasmid p503046_80, complete sequence	48530-48563	7	0.794
NC_017467_1	1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	579191-579224	34	CP025876	Escherichia coli strain 503458 plasmid p503458_80, complete sequence	30011-30044	7	0.794
NC_017467_1	1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	579191-579224	34	NZ_CP024238	Escherichia coli O15:H11 strain 90-9272 plasmid unnamed	148792-148825	7	0.794
NC_017467_1	1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	579191-579224	34	NZ_CP024237	Escherichia coli O6:H16 strain 2014EL-1346-6 plasmid unnamed5, complete sequence	70886-70919	7	0.794
NC_017467_1	1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	579191-579224	34	NZ_CP029980	Escherichia coli strain 99-3165 plasmid unnamed2, complete sequence	26865-26898	7	0.794
NC_017467_1	1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	579191-579224	34	NZ_CP024262	Escherichia coli strain F5656C1 plasmid unnamed2, complete sequence	9842-9875	7	0.794
NC_017467_1	1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	579191-579224	34	CP049615	Escherichia coli O157:H7 strain K1516 plasmid pK1516-3, complete sequence	79287-79320	7	0.794
NC_017467_1	1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	579191-579224	34	NC_007635	Escherichia coli plasmid pCoo, complete sequence	43943-43976	7	0.794
NC_017467_1	1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	579191-579224	34	CP025968	Escherichia coli strain 2407 a plasmid p2407a_135, complete sequence	43380-43413	7	0.794
NC_017467_1	1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	579191-579224	34	NZ_CP025917	Escherichia coli strain 120899 plasmid p120899_146, complete sequence	51559-51592	7	0.794
NC_017467_1	1.10|579457|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	579457-579490	34	NC_010179	Lactobacillus johnsonii prophage Lj771, complete genome	6058-6091	7	0.794
NC_017467_1	1.22|580252|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	580252-580285	34	NZ_CP044456	Acinetobacter indicus strain B18 plasmid pB18-1, complete sequence	208091-208124	7	0.794
NC_017467_1	1.22|580252|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	580252-580285	34	NZ_CP039144	Acinetobacter sp. 10FS3-1 plasmid p10FS3-1-1, complete sequence	31555-31588	7	0.794
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NC_015459	Pusillimonas sp. T7-7 plasmid unnamed, complete sequence	29605-29638	8	0.765
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP034093	Acinetobacter baumannii strain A52 plasmid pA52-1, complete sequence	105494-105527	8	0.765
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	CP033517	Acinetobacter baumannii strain 2008S11-069 plasmid p2008S11-069-1, complete sequence	74882-74915	8	0.765
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP016301	Acinetobacter baumannii strain CMC-CR-MDR-Ab66 plasmid pCMCVTAb1-Ab66, complete sequence	7129-7162	8	0.765
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP016296	Acinetobacter baumannii strain CMC-CR-MDR-Ab4 plasmid pCMCVTAb1-Ab4, complete sequence	7129-7162	8	0.765
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP016299	Acinetobacter baumannii strain CMC-MDR-Ab59 plasmid pCMCVTAb1-Ab59, complete sequence	7129-7162	8	0.765
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP024125	Acinetobacter baumannii strain AYP-A2 plasmid pAYP-A2, complete sequence	45149-45182	8	0.765
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP020585	Acinetobacter baumannii strain CBA7 plasmid pCBA7_1, complete sequence	53916-53949	8	0.765
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_MK386680	Acinetobacter baumannii strain ABAY04001 plasmid pABAY04001_1A, complete sequence	93515-93548	8	0.765
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP018257	Acinetobacter baumannii strain AF-673 plasmid pAF-673, complete sequence	70240-70273	8	0.765
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP010780	Acinetobacter baumannii strain XH386 plasmid pAB386, complete sequence	14817-14850	8	0.765
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NC_023688	Aeromonas phage PX29, complete genome	66607-66640	8	0.765
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	MH791401	UNVERIFIED: Aeromonas phage AsFcp_2, complete genome	15634-15667	8	0.765
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	MG250483	Aeromonas phage Ah1, complete genome	24520-24553	8	0.765
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	MG250483	Aeromonas phage Ah1, complete genome	123085-123118	8	0.765
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NC_014838	Pantoea sp. At-9b plasmid pPAT9B01, complete sequence	256805-256838	8	0.765
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP039519	Acinetobacter baumannii strain TG22653 plasmid pTG22653, complete sequence	34320-34353	8	0.765
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP033864	Acinetobacter sp. FDAARGOS_560 plasmid unnamed2	57129-57162	8	0.765
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NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP015484	Acinetobacter baumannii strain ORAB01 plasmid pORAB01-1, complete sequence	42436-42469	8	0.765
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP018333	Acinetobacter baumannii strain A1296 isolate A1296 plasmid pA1296_1, complete sequence	103864-103897	8	0.765
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	CP031744	Acinetobacter baumannii WM99c plasmid pWM99c-2, complete sequence	42437-42470	8	0.765
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP050905	Acinetobacter baumannii strain DT-Ab057 plasmid unnamed1, complete sequence	48331-48364	8	0.765
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NC_020524	Acinetobacter baumannii MDR-TJ plasmid pABTJ2, complete sequence	42437-42470	8	0.765
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP021327	Acinetobacter baumannii strain XH386 plasmid pXH386, complete sequence	105910-105943	8	0.765
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	MN871440	UNVERIFIED: Aeromonas phage AsFcp_1, complete genome	192053-192086	8	0.765
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	AY266303	Bacteriophage Aeh1, complete genome	135236-135269	8	0.765
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NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	JQ182729	Enterobacterial phage mEp390, complete genome	14126-14159	8	0.765
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NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	AF069308	Escherichia virus HK022, complete genome	14102-14135	8	0.765
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	MT740745	Ralstonia phage Raharianne, complete genome	19170-19203	8	0.765
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	KX397373	Erwinia phage vB_EamM_Stratton, complete genome	69873-69906	8	0.765
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	MN693182	Marine virus AFVG_25M24, complete genome	21668-21701	8	0.765
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NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	MT740726	Ralstonia phage Albius, complete genome	19232-19265	8	0.765
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	MT740743	Ralstonia phage Hyacinthe, complete genome	10630-10663	8	0.765
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	MN693905	Marine virus AFVG_250M498, complete genome	10443-10476	8	0.765
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	MN694008	Marine virus AFVG_250M442, complete genome	9189-9222	8	0.765
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	MN694337	Marine virus AFVG_250M497, complete genome	28547-28580	8	0.765
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	MN694038	Marine virus AFVG_250M496, complete genome	25131-25164	8	0.765
NC_017467_1	1.8|579324|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	579324-579357	34	NC_019782	Lactobacillus phage AQ113, complete genome	30436-30469	8	0.765
NC_017467_1	1.14|579723|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	579723-579756	34	CP006880	Rhizobium gallicum bv. gallicum R602 plasmid pRgalR602c, complete sequence	2165454-2165487	8	0.765
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	MH791407	UNVERIFIED: Aeromonas phage AsFcp_4, partial genome	211115-211148	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	MH791407	UNVERIFIED: Aeromonas phage AsFcp_4, partial genome	167454-167487	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NC_017069	Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC4, complete sequence	68758-68791	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NC_023688	Aeromonas phage PX29, complete genome	86330-86363	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	MH791401	UNVERIFIED: Aeromonas phage AsFcp_2, complete genome	35375-35408	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	MN871440	UNVERIFIED: Aeromonas phage AsFcp_1, complete genome	172323-172356	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	AY266303	Bacteriophage Aeh1, complete genome	96004-96037	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NC_005260	Aeromonas phage Aeh1, complete genome	96004-96037	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	LG264212	KR 1020160082141-A/2: Bacteriophage PBES01 of Cronobacter sakazakii and uses thereof	302-335	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NC_028672	Cronobacter phage PBES 02, complete genome	86936-86969	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	LG264211	KR 1020160082141-A/1: Bacteriophage PBES01 of Cronobacter sakazakii and uses thereof	301-334	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	LR597645	Escherichia phage Fraca genome assembly, chromosome: 1	14693-14726	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP021942	Klebsiella pneumoniae strain AR_0145 plasmid tig00000218j2847_linear, complete sequence	34123-34156	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP017988	Klebsiella pneumoniae strain 825795-1 plasmid unnamed3, complete sequence	33742-33775	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP023421	Klebsiella pneumoniae strain 1050 plasmid unnamed, complete sequence	48022-48055	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP026760	Klebsiella aerogenes strain AR_0062 plasmid unnamed4	29673-29706	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP031806	Klebsiella pneumoniae strain MSB1_8A-sc-2280397 plasmid unnamed6, complete sequence	38171-38204	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP027046	Klebsiella pneumoniae strain 1_GR_13 plasmid unnamed, complete sequence	24592-24625	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP031794	Klebsiella pneumoniae strain INF116-sc-2279924 plasmid unnamed2, complete sequence	23650-23683	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP024841	Klebsiella pneumoniae strain CRKP-1215 plasmid pCRKP-1215_3, complete sequence	25888-25921	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP036444	Klebsiella pneumoniae strain ABFPV plasmid tig00001255_pilon, complete sequence	193-226	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP050366	Klebsiella pneumoniae strain 47733 plasmid p47733L, complete sequence	24565-24598	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_LR025094	Klebsiella pneumoniae isolate KP9201 plasmid 4, complete sequence	22703-22736	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP011631	Klebsiella oxytoca strain CAV1374 plasmid pCAV1374-54, complete sequence	52021-52054	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP018314	Klebsiella pneumoniae strain Kp_Goe_822579 plasmid pKp_Goe_579-6, complete sequence	31709-31742	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP018688	Klebsiella pneumoniae strain Kp_Goe_149473 plasmid pKp_Goe_473-5, complete sequence	34187-34220	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP034057	Klebsiella pneumoniae strain KP_NORM_BLD_2015_112126 plasmid unnamed4, complete sequence	10916-10949	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP034049	Klebsiella pneumoniae strain KP_NORM_BLD_2014_104014 plasmid unnamed4, complete sequence	6039-6072	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP018697	Klebsiella pneumoniae strain Kp_Goe_149832 plasmid pKp_Goe_832-5, complete sequence	36125-36158	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	MH533020	Acinetobacter phage ABPH49, complete genome	118616-118649	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	HM452126	Aeromonas phage phiAS5, complete genome	90785-90818	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP012429	Klebsiella pneumoniae strain KP5 plasmid pSg1-3, complete sequence	23930-23963	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP018715	Klebsiella pneumoniae strain Kp_Goe_152021 plasmid pKp_Goe_021-5, complete sequence	42457-42490	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP018721	Klebsiella pneumoniae strain KP_Goe_828304 plasmid pKp_Goe_304-5, complete sequence	42082-42115	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP018703	Klebsiella pneumoniae strain Kp_Goe_827024 plasmid pKp_Goe_024-5, complete sequence	33781-33814	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_AP023151	Klebsiella pneumoniae strain SMKP03 plasmid pSMKP03S, complete sequence	48677-48710	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP041953	Klebsiella pneumoniae strain KP2 plasmid pKP2_7, complete sequence	30090-30123	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP021957	Klebsiella pneumoniae strain AR_0107 plasmid unitig_3j2_linear_pilon, complete sequence	37357-37390	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP024837	Klebsiella pneumoniae strain CRKP-2297 plasmid pCRKP-2297_3, complete sequence	43465-43498	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP008844	Klebsiella michiganensis strain M1 plasmid pKOXM1C, complete sequence	31135-31168	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP024433	Klebsiella pneumoniae strain DA48896 plasmid p48896_4, complete sequence	40181-40214	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP032191	Klebsiella pneumoniae strain AR_0075 plasmid unnamed6, complete sequence	43876-43909	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP021949	Klebsiella pneumoniae strain AR_0152 plasmid tig00000216_u, complete sequence	42137-42170	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_LR025090	Klebsiella pneumoniae isolate KP980 plasmid 4, complete sequence	29013-29046	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NC_019202	Pseudomonas aeruginosa plasmid pKLC102, complete sequence	51006-51039	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP021760	Klebsiella pneumoniae strain AR_0138 plasmid tig00000003, complete sequence	53258-53291	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	CP052339	Klebsiella pneumoniae strain D17KP0018 plasmid unnamed	30376-30409	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP018709	Klebsiella pneumoniae strain Kp_Goe_827026 plasmid pKp_Goe_026-5, complete sequence	40189-40222	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP014747	Klebsiella aerogenes strain FDAARGOS_139 plasmid unnamed	1374-1407	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP014747	Klebsiella aerogenes strain FDAARGOS_139 plasmid unnamed	53758-53791	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP032224	Klebsiella pneumoniae strain AR_0046 plasmid unnamed2, complete sequence	38313-38346	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	CP038007	Klebsiella phage 020009, complete genome	30809-30842	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	KY271402	Klebsiella phage 48ST307, complete genome	29665-29698	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	MT210154	Xanthomonas phage PPDBI, complete genome	13121-13154	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	MK416021	Klebsiella phage ST846-OXA48phi9.1, complete genome	15842-15875	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	MT119766	Xanthomonas phage PBR31, complete genome	13121-13154	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	AP013368	Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G11, isolate: uvMED-CGR-U-MedDCM-OCT-S25-C42	12246-12279	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	NZ_CP030914	Pseudomonas aeruginosa strain Y89 plasmid pY89, complete sequence	60297-60330	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	MK552327	Pseudomonas phage Psa21, complete genome	204242-204275	9	0.735
NC_017467_1	1.15|579789|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	579789-579822	34	NZ_CP009112	Rhodococcus opacus strain 1CP plasmid pR1CP1, complete sequence	759037-759070	9	0.735
NC_017467_1	1.17|579920|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	579920-579953	34	NZ_CP012101	Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-2, complete sequence	144691-144724	9	0.735
NC_017467_1	1.24|580384|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	580384-580417	34	MH649012	Podoviridae sp. isolate ctdc61, complete genome	582-615	9	0.735
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	MG250483	Aeromonas phage Ah1, complete genome	67907-67940	10	0.706
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	KY709687	Salmonella phage 29485, complete genome	34364-34397	10	0.706
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	MH370364	Salmonella phage S107, complete genome	16203-16236	10	0.706
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	MH370382	Salmonella phage S135, complete genome	16203-16236	10	0.706
NC_017467_1	1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	578992-579025	34	MH370383	Salmonella phage S137, complete genome	16203-16236	10	0.706
NC_017467_1	1.26|580516|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	580516-580549	34	MW057857	Providencia phage PSTCR5, complete genome	20095-20128	10	0.706

1. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP033624 (Klebsiella pneumoniae strain 4743 plasmid unnamed6) position: , mismatch: 5, identity: 0.853

--ttctaagcaaaataaaagccacccgaaggtggca	CRISPR spacer
agtcctta--aaaataaaagccacccgaaggtggct	Protospacer
  *.** *  ************************* 

2. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP036330 (Klebsiella pneumoniae strain BA28434 plasmid punnamed_1_VBA28434) position: , mismatch: 5, identity: 0.853

--ttctaagcaaaataaaagccacccgaaggtggca	CRISPR spacer
agtcctta--aaaataaaagccacccgaaggtggct	Protospacer
  *.** *  ************************* 

3. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP015504 (Klebsiella pneumoniae strain SKGH01 plasmid unnamed 4, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.853

--ttctaagcaaaataaaagccacccgaaggtggca	CRISPR spacer
agtcctta--aaaataaaagccacccgaaggtggct	Protospacer
  *.** *  ************************* 

4. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP009276 (Klebsiella variicola strain DX120E plasmid pKV2, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.853

--ttctaagcaaaataaaagccacccgaaggtggca	CRISPR spacer
agtcctta--aaaataaaagccacccgaaggtggct	Protospacer
  *.** *  ************************* 

5. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP028794 (Klebsiella pneumoniae strain WCHKP040035 plasmid p1_040035, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.853

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  *.** *  ************************* 

6. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP009878 (Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae strain KPNIH31 plasmid pKPN-852, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.853

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agtcctta--aaaataaaagccacccgaaggtggct	Protospacer
  *.** *  ************************* 

7. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT090961 (Klebsiella pneumoniae strain KP18-2079 plasmid pKP18-2079_54kb, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.853

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  *.** *  ************************* 

8. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP051184 (Bermanella marisrubri strain RED65 plasmid pBma45, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.853

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** .*.****** ******************** 

9. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP028992 (Klebsiella pneumoniae strain AR_0142 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.853

--ttctaagcaaaataaaagccacccgaaggtggca	CRISPR spacer
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  *.** *  ************************* 

10. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP052194 (Klebsiella pneumoniae strain F16KP0014 plasmid pF16KP0014-2, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.853

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  *.** *  ************************* 

11. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP045018 (Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae strain BK13048 plasmid pBK13048-3, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.853

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  *.** *  ************************* 

12. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP052354 (Klebsiella pneumoniae strain D16KP0146 plasmid unnamed) position: , mismatch: 5, identity: 0.853

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  *.** *  ************************* 

13. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP052395 (Klebsiella pneumoniae strain C17KP0040 plasmid unnamed) position: , mismatch: 5, identity: 0.853

--ttctaagcaaaataaaagccacccgaaggtggca	CRISPR spacer
agtcctta--aaaataaaagccacccgaaggtggct	Protospacer
  *.** *  ************************* 

14. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH791407 (UNVERIFIED: Aeromonas phage AsFcp_4, partial genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.824

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**   . ************************** 

15. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP051184 (Bermanella marisrubri strain RED65 plasmid pBma45, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.824

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  *.** .****. *********************

16. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to EU307293 (Burkholderia phage Bups phi1 clone 3 partial sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.824

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ctccgagcataaaaaaagccacccgaaggtggct	Protospacer
.**..**** ** ******************** 

17. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT701587 (Burkholderia phage Magia, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.824

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ctccgagcataaaaaaagccacccgaaggtggct	Protospacer
.**..**** ** ******************** 

18. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH221129 (Salmonella phage SPAsTU, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.824

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 ..**.****** * *******************.

19. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH221128 (Salmonella phage STsAS, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.824

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 ..**.****** * *******************.

20. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH791407 (UNVERIFIED: Aeromonas phage AsFcp_4, partial genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

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 . ****. ** * ******************** 

21. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_023688 (Aeromonas phage PX29, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

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 . ****. ** * ******************** 

22. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH791401 (UNVERIFIED: Aeromonas phage AsFcp_2, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

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 . ****. ** * ******************** 

23. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MG250483 (Aeromonas phage Ah1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

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    ****    ** * ******************** 

24. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_031107 (Erwinia phage vB_EamM_Asesino, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

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**  ..* ****  ********************

25. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN871440 (UNVERIFIED: Aeromonas phage AsFcp_1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

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 . ****. ** * ******************** 

26. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AY266303 (Bacteriophage Aeh1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

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  * ***. ** * ******************** 

27. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_005260 (Aeromonas phage Aeh1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

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  * ***. ** * ******************** 

28. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP034394 (Herbaspirillum seropedicae strain AU13965 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

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    **. *****  ******************** 

29. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP038446 (Aeromonas media strain R25-3 plasmid pAeme3, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

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   *.***   **** ***.**************** 

30. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP038449 (Aeromonas media strain R50-22 plasmid pAeme5, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

ttctaagc---aaaataaaagccacccgaaggtggca	CRISPR spacer
---tgagcgataaaaaaaaggccacccgaaggtggcc	Protospacer
   *.***   **** ***.**************** 

31. spacer 1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP025921 (Escherichia coli strain 103605 plasmid p103605_146, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

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 ************ * ********** ****  . 

32. spacer 1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP025911 (Escherichia coli strain 204446 plasmid p204446_146, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

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 ************ * ********** ****  . 

33. spacer 1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP025863 (Escherichia coli strain 504237 plasmid p504237_142, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

aagaagatactgcctgaccggttcca-cattagca	CRISPR spacer
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 ************ * ********** ****  . 

34. spacer 1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP025854 (Escherichia coli strain 510016 plasmid p510016_80, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

aagaagatactgcctgaccggttcca-cattagca	CRISPR spacer
cagaagatactgcattaccggttccatcattctt-	Protospacer
 ************ * ********** ****  . 

35. spacer 1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013194 (Escherichia coli strain FORC_031 plasmid pFORC31.4, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

aagaagatactgcctgaccggttcca-cattagca	CRISPR spacer
cagaagatactgcattaccggttccatcattctt-	Protospacer
 ************ * ********** ****  . 

36. spacer 1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP023347 (Escherichia coli strain ETEC-2265 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

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 ************ * ********** ****  . 

37. spacer 1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024276 (Escherichia coli O6:H16 strain M9682-C1 plasmid unnamed1) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

aagaagatactgcctgaccggttcca-cattagca	CRISPR spacer
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 ************ * ********** ****  . 

38. spacer 1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_009790 (Escherichia coli O139:H28 str. E24377A plasmid pETEC_74, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

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cagaagatactgcattaccggttccatcattctt-	Protospacer
 ************ * ********** ****  . 

39. spacer 1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024246 (Escherichia coli O27:H7 strain B4103-1 plasmid unnamed1) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

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 ************ * ********** ****  . 

40. spacer 1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP023352 (Escherichia coli strain ETEC-2264 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

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cagaagatactgcattaccggttccatcattctt-	Protospacer
 ************ * ********** ****  . 

41. spacer 1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_022333 (Escherichia coli plasmid pCss165Kan DNA, complete genome, strain: 4266 delta cssB::Km) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

aagaagatactgcctgaccggttcca-cattagca	CRISPR spacer
cagaagatactgcattaccggttccatcattctt-	Protospacer
 ************ * ********** ****  . 

42. spacer 1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP025848 (Escherichia coli strain 602354 plasmid p602354_148, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

aagaagatactgcctgaccggttcca-cattagca	CRISPR spacer
cagaagatactgcattaccggttccatcattctt-	Protospacer
 ************ * ********** ****  . 

43. spacer 1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP025850 (Escherichia coli strain 600468 plasmid p600468_158, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

aagaagatactgcctgaccggttcca-cattagca	CRISPR spacer
cagaagatactgcattaccggttccatcattctt-	Protospacer
 ************ * ********** ****  . 

44. spacer 1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP022914 (Escherichia coli O6:H16 strain 2011EL-1370-2 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

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 ************ * ********** ****  . 

45. spacer 1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024259 (Escherichia coli O25:H16 strain F5505-C1 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

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 ************ * ********** ****  . 

46. spacer 1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024255 (Escherichia coli strain ATCC 43886 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

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 ************ * ********** ****  . 

47. spacer 1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP025928 (Escherichia coli strain 520873 plasmid p520873_80, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

aagaagatactgcctgaccggttcca-cattagca	CRISPR spacer
cagaagatactgcattaccggttccatcattctt-	Protospacer
 ************ * ********** ****  . 

48. spacer 1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP025908 (Escherichia coli strain 204576 plasmid p204576_146, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

aagaagatactgcctgaccggttcca-cattagca	CRISPR spacer
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 ************ * ********** ****  . 

49. spacer 1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP025890 (Escherichia coli strain 503046 plasmid p503046_80, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

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cagaagatactgcattaccggttccatcattctt-	Protospacer
 ************ * ********** ****  . 

50. spacer 1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP025876 (Escherichia coli strain 503458 plasmid p503458_80, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

aagaagatactgcctgaccggttcca-cattagca	CRISPR spacer
cagaagatactgcattaccggttccatcattctt-	Protospacer
 ************ * ********** ****  . 

51. spacer 1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024238 (Escherichia coli O15:H11 strain 90-9272 plasmid unnamed) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

aagaagatactgcctgaccggttcca-cattagca	CRISPR spacer
cagaagatactgcattaccggttccatcattctt-	Protospacer
 ************ * ********** ****  . 

52. spacer 1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024237 (Escherichia coli O6:H16 strain 2014EL-1346-6 plasmid unnamed5, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

aagaagatactgcctgaccggttcca-cattagca	CRISPR spacer
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 ************ * ********** ****  . 

53. spacer 1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP029980 (Escherichia coli strain 99-3165 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

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cagaagatactgcattaccggttccatcattctt-	Protospacer
 ************ * ********** ****  . 

54. spacer 1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024262 (Escherichia coli strain F5656C1 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

aagaagatactgcctgaccggttcca-cattagca	CRISPR spacer
cagaagatactgcattaccggttccatcattctt-	Protospacer
 ************ * ********** ****  . 

55. spacer 1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP049615 (Escherichia coli O157:H7 strain K1516 plasmid pK1516-3, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

aagaagatactgcctgaccggttcca-cattagca	CRISPR spacer
cagaagatactgcattaccggttccatcattctt-	Protospacer
 ************ * ********** ****  . 

56. spacer 1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_007635 (Escherichia coli plasmid pCoo, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

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cagaagatactgcattaccggttccatcattctt-	Protospacer
 ************ * ********** ****  . 

57. spacer 1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP025968 (Escherichia coli strain 2407 a plasmid p2407a_135, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

aagaagatactgcctgaccggttcca-cattagca	CRISPR spacer
cagaagatactgcattaccggttccatcattctt-	Protospacer
 ************ * ********** ****  . 

58. spacer 1.6|579191|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP025917 (Escherichia coli strain 120899 plasmid p120899_146, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

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cagaagatactgcattaccggttccatcattctt-	Protospacer
 ************ * ********** ****  . 

59. spacer 1.10|579457|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_010179 (Lactobacillus johnsonii prophage Lj771, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

atttgaatatgcacgcagatgatgatggcttttt	CRISPR spacer
acttattaatgcacgcagatgatgatggttttct	Protospacer
*.**.   ********************.***.*

60. spacer 1.22|580252|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP044456 (Acinetobacter indicus strain B18 plasmid pB18-1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

aaaaggtgaaccacatcaagaatccaaacaagat	CRISPR spacer
atacagtgaatcacatcaagaatgcaaacagcat	Protospacer
* * .*****.************ ******. **

61. spacer 1.22|580252|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP039144 (Acinetobacter sp. 10FS3-1 plasmid p10FS3-1-1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

aaaaggtgaaccacatcaagaatccaaacaagat	CRISPR spacer
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* * .*****.************ ******. **

62. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_015459 (Pusillimonas sp. T7-7 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765

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    .**    *** * ********************.

63. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP034093 (Acinetobacter baumannii strain A52 plasmid pA52-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765

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** *  .  ****.******************* 

64. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP033517 (Acinetobacter baumannii strain 2008S11-069 plasmid p2008S11-069-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765

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** *  .  ****.******************* 

65. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP016301 (Acinetobacter baumannii strain CMC-CR-MDR-Ab66 plasmid pCMCVTAb1-Ab66, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765

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** *  .  ****.******************* 

66. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP016296 (Acinetobacter baumannii strain CMC-CR-MDR-Ab4 plasmid pCMCVTAb1-Ab4, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765

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** *  .  ****.******************* 

67. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP016299 (Acinetobacter baumannii strain CMC-MDR-Ab59 plasmid pCMCVTAb1-Ab59, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765

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** *  .  ****.******************* 

68. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024125 (Acinetobacter baumannii strain AYP-A2 plasmid pAYP-A2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765

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** *  .  ****.******************* 

69. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020585 (Acinetobacter baumannii strain CBA7 plasmid pCBA7_1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765

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** *  .  ****.******************* 

70. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MK386680 (Acinetobacter baumannii strain ABAY04001 plasmid pABAY04001_1A, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765

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** *  .  ****.******************* 

71. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018257 (Acinetobacter baumannii strain AF-673 plasmid pAF-673, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765

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** *  .  ****.******************* 

72. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP010780 (Acinetobacter baumannii strain XH386 plasmid pAB386, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765

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** *  .  ****.******************* 

73. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_023688 (Aeromonas phage PX29, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765

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**   . *** * ******************** 

74. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH791401 (UNVERIFIED: Aeromonas phage AsFcp_2, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765

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**   . *** * ******************** 

75. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MG250483 (Aeromonas phage Ah1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765

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**  * .  ***.******************** 

76. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MG250483 (Aeromonas phage Ah1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765

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   * * *** * ******************** 

77. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_014838 (Pantoea sp. At-9b plasmid pPAT9B01, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765

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*. .*  ** ** ******************** 

78. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP039519 (Acinetobacter baumannii strain TG22653 plasmid pTG22653, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765

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** *  .  ****.******************* 

79. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP033864 (Acinetobacter sp. FDAARGOS_560 plasmid unnamed2) position: , mismatch: 8, identity: 0.765

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** *  .  ****.******************* 

80. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP046537 (Acinetobacter baumannii strain XL380 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765

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** *  .  ****.******************* 

81. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP015484 (Acinetobacter baumannii strain ORAB01 plasmid pORAB01-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765

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** *  .  ****.******************* 

82. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018333 (Acinetobacter baumannii strain A1296 isolate A1296 plasmid pA1296_1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765

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** *  .  ****.******************* 

83. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP031744 (Acinetobacter baumannii WM99c plasmid pWM99c-2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765

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** *  .  ****.******************* 

84. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP050905 (Acinetobacter baumannii strain DT-Ab057 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765

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** *  .  ****.******************* 

85. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_020524 (Acinetobacter baumannii MDR-TJ plasmid pABTJ2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765

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** *  .  ****.******************* 

86. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021327 (Acinetobacter baumannii strain XH386 plasmid pXH386, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765

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87. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN871440 (UNVERIFIED: Aeromonas phage AsFcp_1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765

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**   . *** * ******************** 

88. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AY266303 (Bacteriophage Aeh1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765

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  .* * *** * ******************** 

89. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AY266303 (Bacteriophage Aeh1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765

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**.*... ** * ******************** 

90. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to JQ182729 (Enterobacterial phage mEp390, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765

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** ..  ** ** ******************** 

91. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_002166 (Bacteriophage HK022, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765

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** ..  ** ** ******************** 

92. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_005260 (Aeromonas phage Aeh1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765

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  .* * *** * ******************** 

93. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_005260 (Aeromonas phage Aeh1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765

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**.*... ** * ******************** 

94. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AF069308 (Escherichia virus HK022, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765

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** ..  ** ** ******************** 

95. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT740745 (Ralstonia phage Raharianne, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765

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.**.*.. ** * ******************** 

96. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KX397373 (Erwinia phage vB_EamM_Stratton, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765

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**  ..* ****  *******************.

97. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693182 (Marine virus AFVG_25M24, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765

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 * ** . **.* ******************** 

98. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to JX316028 (Erwinia phage phiEaH2, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765

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**  ..* ****  *******************.

99. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT740726 (Ralstonia phage Albius, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765

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.**.*.. ** * ******************** 

100. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT740743 (Ralstonia phage Hyacinthe, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765

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.**.*.. ** * ******************** 

101. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693905 (Marine virus AFVG_250M498, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765

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* *.**   *** **.***************** 

102. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694008 (Marine virus AFVG_250M442, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765

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* *.**   *** **.***************** 

103. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694337 (Marine virus AFVG_250M497, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765

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* *.**   *** **.***************** 

104. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694038 (Marine virus AFVG_250M496, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765

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* *.**   *** **.***************** 

105. spacer 1.8|579324|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019782 (Lactobacillus phage AQ113, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765

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*************.********.***** .....

106. spacer 1.14|579723|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP006880 (Rhizobium gallicum bv. gallicum R602 plasmid pRgalR602c, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765

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...* ********. ****************  *

107. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH791407 (UNVERIFIED: Aeromonas phage AsFcp_4, partial genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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 *   . *** * ******************** 

108. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH791407 (UNVERIFIED: Aeromonas phage AsFcp_4, partial genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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*   **..**** ****.**************. 

109. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_017069 (Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC4, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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  .  ******* ****.**************. 

110. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_023688 (Aeromonas phage PX29, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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 *   . *** * ******************** 

111. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH791401 (UNVERIFIED: Aeromonas phage AsFcp_2, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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 *   . *** * ******************** 

112. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN871440 (UNVERIFIED: Aeromonas phage AsFcp_1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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 *   . *** * ******************** 

113. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AY266303 (Bacteriophage Aeh1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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  * * . ** * ******************** 

114. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_005260 (Aeromonas phage Aeh1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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  * * . ** * ******************** 

115. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LG264212 (KR 1020160082141-A/2: Bacteriophage PBES01 of Cronobacter sakazakii and uses thereof) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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 * .   *************.********.*** 

116. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028672 (Cronobacter phage PBES 02, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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 * .   *************.********.*** 

117. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LG264211 (KR 1020160082141-A/1: Bacteriophage PBES01 of Cronobacter sakazakii and uses thereof) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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 * .   *************.********.*** 

118. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LR597645 (Escherichia phage Fraca genome assembly, chromosome: 1) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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. .*   ** ** ******************** 

119. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021942 (Klebsiella pneumoniae strain AR_0145 plasmid tig00000218j2847_linear, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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 **.  . ***  ******************** 

120. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP017988 (Klebsiella pneumoniae strain 825795-1 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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 **.  . ***  ******************** 

121. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP023421 (Klebsiella pneumoniae strain 1050 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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 **.  . ***  ******************** 

122. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP026760 (Klebsiella aerogenes strain AR_0062 plasmid unnamed4) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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 **.  . ***  ******************** 

123. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP031806 (Klebsiella pneumoniae strain MSB1_8A-sc-2280397 plasmid unnamed6, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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 **.  . ***  ******************** 

124. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP027046 (Klebsiella pneumoniae strain 1_GR_13 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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 **.  . ***  ********************.

125. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP031794 (Klebsiella pneumoniae strain INF116-sc-2279924 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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 **.  . ***  ******************** 

126. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024841 (Klebsiella pneumoniae strain CRKP-1215 plasmid pCRKP-1215_3, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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 **.  . ***  ******************** 

127. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP036444 (Klebsiella pneumoniae strain ABFPV plasmid tig00001255_pilon, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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 **.  . ***  ******************** 

128. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP050366 (Klebsiella pneumoniae strain 47733 plasmid p47733L, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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 **.  . ***  ******************** 

129. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR025094 (Klebsiella pneumoniae isolate KP9201 plasmid 4, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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 **.  . ***  ******************** 

130. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP011631 (Klebsiella oxytoca strain CAV1374 plasmid pCAV1374-54, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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 **.  . ***  ******************** 

131. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018314 (Klebsiella pneumoniae strain Kp_Goe_822579 plasmid pKp_Goe_579-6, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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 **.  . ***  ******************** 

132. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018688 (Klebsiella pneumoniae strain Kp_Goe_149473 plasmid pKp_Goe_473-5, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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 **.  . ***  ******************** 

133. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP034057 (Klebsiella pneumoniae strain KP_NORM_BLD_2015_112126 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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 **.  . ***  ******************** 

134. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP034049 (Klebsiella pneumoniae strain KP_NORM_BLD_2014_104014 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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 **.  . ***  ******************** 

135. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018697 (Klebsiella pneumoniae strain Kp_Goe_149832 plasmid pKp_Goe_832-5, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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 **.  . ***  ******************** 

136. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH533020 (Acinetobacter phage ABPH49, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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..*.*...****  ******************* 

137. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HM452126 (Aeromonas phage phiAS5, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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.*.*  . ** * ******************** 

138. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP012429 (Klebsiella pneumoniae strain KP5 plasmid pSg1-3, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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 **.  . ***  ******************** 

139. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018715 (Klebsiella pneumoniae strain Kp_Goe_152021 plasmid pKp_Goe_021-5, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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 **.  . ***  ******************** 

140. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018721 (Klebsiella pneumoniae strain KP_Goe_828304 plasmid pKp_Goe_304-5, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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 **.  . ***  ******************** 

141. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018703 (Klebsiella pneumoniae strain Kp_Goe_827024 plasmid pKp_Goe_024-5, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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 **.  . ***  ******************** 

142. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP023151 (Klebsiella pneumoniae strain SMKP03 plasmid pSMKP03S, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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 **.  . ***  ********************.

143. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP041953 (Klebsiella pneumoniae strain KP2 plasmid pKP2_7, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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 **.  . ***  ******************** 

144. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021957 (Klebsiella pneumoniae strain AR_0107 plasmid unitig_3j2_linear_pilon, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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 **.  . ***  ******************** 

145. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024837 (Klebsiella pneumoniae strain CRKP-2297 plasmid pCRKP-2297_3, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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 **.  . ***  ******************** 

146. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP008844 (Klebsiella michiganensis strain M1 plasmid pKOXM1C, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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 **.  . ***  ******************** 

147. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024433 (Klebsiella pneumoniae strain DA48896 plasmid p48896_4, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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 **.  . ***  ******************** 

148. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032191 (Klebsiella pneumoniae strain AR_0075 plasmid unnamed6, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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 **.  . ***  ******************** 

149. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021949 (Klebsiella pneumoniae strain AR_0152 plasmid tig00000216_u, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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 **.  . ***  ******************** 

150. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR025090 (Klebsiella pneumoniae isolate KP980 plasmid 4, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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 **.  . ***  ******************** 

151. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019202 (Pseudomonas aeruginosa plasmid pKLC102, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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.   **..****.***.**************** 

152. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021760 (Klebsiella pneumoniae strain AR_0138 plasmid tig00000003, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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 **.  . ***  ******************** 

153. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP052339 (Klebsiella pneumoniae strain D17KP0018 plasmid unnamed) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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 **.  . ***  ********************.

154. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018709 (Klebsiella pneumoniae strain Kp_Goe_827026 plasmid pKp_Goe_026-5, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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 **.  . ***  ******************** 

155. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014747 (Klebsiella aerogenes strain FDAARGOS_139 plasmid unnamed) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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 **.  . ***  ******************** 

156. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014747 (Klebsiella aerogenes strain FDAARGOS_139 plasmid unnamed) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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 **.  . ***  ******************** 

157. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032224 (Klebsiella pneumoniae strain AR_0046 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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 **.  . ***  ********************.

158. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP038007 (Klebsiella phage 020009, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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 **.  . ***  ******************** 

159. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KY271402 (Klebsiella phage 48ST307, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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 **.  . ***  ********************.

160. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT210154 (Xanthomonas phage PPDBI, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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.**. .. **.* ******************** 

161. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK416021 (Klebsiella phage ST846-OXA48phi9.1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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 **.  . ***  ******************** 

162. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT119766 (Xanthomonas phage PBR31, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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ctcctgaaaagagaaaagccacccgaaggtggct	Protospacer
.**. .. **.* ******************** 

163. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AP013368 (Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G11, isolate: uvMED-CGR-U-MedDCM-OCT-S25-C42) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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aacgcagacaaaaaaaagccacccggaggtggct	Protospacer
  *  **  *** ************.******* 

164. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP030914 (Pseudomonas aeruginosa strain Y89 plasmid pY89, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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**  .*   *** ***.**************** 

165. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK552327 (Pseudomonas phage Psa21, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

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ctttagacaaaataaagcccacccgaaggtgagc	Protospacer
.*.**..*********. *************.  

166. spacer 1.15|579789|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP009112 (Rhodococcus opacus strain 1CP plasmid pR1CP1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

atgatgggctaccagtatccaacacattgtctaa	CRISPR spacer
atggtgggctaccagtatccaccagtccgccgca	Protospacer
***.***************** **  ..*.*  *

167. spacer 1.17|579920|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP012101 (Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

cgttctgctgaagaaattgctttactaattctct	CRISPR spacer
ccaactggtgaagaaattgctttaataataataa	Protospacer
*   *** **************** ****  *  

168. spacer 1.24|580384|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH649012 (Podoviridae sp. isolate ctdc61, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735

ataaaggtctttaagaccagtaccattagcaaag	CRISPR spacer
gttaacagctttaacaccagtaccagtagcaaca	Protospacer
.* ** . ****** ********** ****** .

169. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MG250483 (Aeromonas phage Ah1, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706

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ccggtgtcaacaaaaaagccacccgaaggtggct	Protospacer
..   . *** * ******************** 

170. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KY709687 (Salmonella phage 29485, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706

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.. .  * **** ************.******* 

171. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH370364 (Salmonella phage S107, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706

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 . .  * **** ************.******* 

172. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH370382 (Salmonella phage S135, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706

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 . .  * **** ************.******* 

173. spacer 1.3|578992|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH370383 (Salmonella phage S137, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706

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174. spacer 1.26|580516|34|NC_017467|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MW057857 (Providencia phage PSTCR5, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706

gtttgtattgcttaacaatatgaccaaaaatttt	CRISPR spacer
tttattattgcttaccactatgaccaaaaccacc	Protospacer
 **  ********* ** *********** . ..

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	162933 : 233530	60	Enterococcus_phage(10.53%)	protease,tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_2	558472 : 567241	9	Prochlorococcus_phage(33.33%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_3	589319 : 644237	49	Tupanvirus(30.0%)	bacteriocin,transposase,protease,tRNA,integrase	attL 583301:583317|attR 616702:616718
DBSCAN-SWA_4	659037 : 719646	53	Lysinibacillus_phage(33.33%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_5	1377016 : 1438713	57	Streptococcus_phage(23.08%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_6	1491717 : 1500056	7	Streptococcus_phage(33.33%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_7	1588900 : 1649928	50	Bacillus_phage(14.29%)	bacteriocin,transposase	NA
DBSCAN-SWA_8	1709585 : 1838552	107	Lactobacillus_phage(18.52%)	capsid,holin,transposase,protease,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_9	1861356 : 2044042	152	Bacillus_phage(14.58%)	bacteriocin,transposase,integrase	attL 2012588:2012620|attR 2025490:2025522
DBSCAN-SWA_10	2069366 : 2129551	50	Lactobacillus_virus(31.25%)	protease,holin,transposase	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NC_017467|162933:233530|DBSCAN-SWA
ATTAAGCAACCATTAAAAGGCTGTTTGGCTCTTTTTCTTTGTACAGATTTTCTTCCAAACGAATTCTGGTTAAGAGATTGGTAAAACTAGAATAGCCAAAGGCAGTTCGTTCAATTTGTTTAATTTTGCGGTTGAAGCCTTCAAGACAACCATTAGAATAAGGCAATTCTGCTCCATTGAGCACTGCTGTTAGATTGTGTTTAAAGGTTAAAAGCGTTTTATGCATTAGAGTTCCAATTTGATCTTTGCAGTTGATTAATGACTTAAGCTTTTGAGTATTACCCGTTTCAATGGCTTGAATAAAGTCCTGCATTAGGTTATATGAATTCTCTAAAGCAGTATTGGCATTGATGCCTTCTGTGACTACTTGGGCTTGAGTTAAGCAGTCTTTATAATGCCAATTGTAGCGAGGATGAACCTTTTCGAGCTCATCAAACTTCTTCAAGCATAATTTCCAAGGAGATTTGAGCAGCTGATACTGTCTGGATCTTTTATCAAAGGTCTTCATGACTTGGACTCTCAACGAATTGAATGATCGGGTAAGCATTTGGATCATATGAAAACGATCGATGACAATCTGAGCATTAGGAAAACAGGCTCTGACGATATCTTGATAGTAAAAATTAAGATCCATCGTGACCGTTTTAACGTTAGCTCTAGCTTGAGGTGAGAAACGCCCAAAATACTTAAGCAAAGTCTTCTTGTAGCGAGTTCTAAGAATCTGAACGACCTGATGACTATCGCCGTCTAAGCAGATAAAGTGCAGCTGACGATCAACGCCTTTGAATTCATCGAAAGCCAAATGAGCTGGCAAATATTCGTAGCTGTCAATAAATCGGTGTGAACAGTTGCCCAGCACTCTTTGAACGGTATTGATCGAAACATTGTTTTCGCTGGCAATGCTGGTCATAGATCGATCTTCAGTTAAAGCTGATAATACTTTGAGCTTAGAAGCGTTAGAAATAGAACAGTATTTGTTTACTAGTTCAGATTGAGCCATGGACCAGCGCTCACAATCACGACATTTAACTCGCTGCTTAGCCAATCTGATAATGACAGGCAAACTGGCATTAGCTGTCGGATAGTGAATATTGGTAATCAAGTGGCCATTGTGCAAGAGATCCAGGGAGCCGCAAAAAGGACAAGCAGGTTGAATTAGCTCGGCTTCATAGATTTTATGATTTTGTAGTTTGATCGATTTATAAAAATAATCTTTAAAAACAATATTTTCGTCTTTAACATCAAGCTCGAATTTAATACAATGATTAAGAGAGGACATAGAAATCACCTTTATTTATAAGAATTTGTGTGGAAACGATTTTTATTAAAGAGGACTATGTCCTCCTTTTTTGATGCAATAAAAAACCTGTTAACAGCTTATCATACAGATAAATCATCAACAGGAAAAATTATAGAGCCAAAAAGAGAAGACGCGCGTCTTCTCTTTTTTTATCCATTATTTTTGAAGTAGCAATCTTCAAGATGGTCATTAATTAGGCCAATTCCTTGCAAGTAAGAGTAAATGATTACAGGACCTACGAAAAAGAAACCATCTTTTTTCATTTGCTTGGCAATCTGCTTAGCGATGTCGCTTGTGGTCGGAACCTCATCAATCGTATCGGGATGATGAACGATGGGTGAAGGGATAAAGTTTTGCAAGTATTTGGCAAAACTGCCATATTCTTTTTTTACTGCTAGGATTGCCTTGGCATTTTTAATTGCGGCATTGATTTTAATATGGTTGCGGATAATACCCTTGTCTTGCATGAGTAGTCCCACATCGTAATCAATCATTTGCGCCATTTTTTCTGCATCAAAATCTTTAAAAGCTTTTCTGAAATTTTCGCGTTTGTGCAGAATCGTTGCCCAGCTAAGTCCAGATTGAAAAAGTTCAAGCACTAACATCTCATAGAGATATTGATCATCTAAATTTAATTTACCCCACTCATGGTCATGATAGTTTCTCACTGTCGCATCTTGTACATCGCCCCAAGGGCAGCGAAATATCCTAGTTTCATTCATAAAAATTTCTCCTTTTAAAATAATATTTTTACTCTCTAATATTCATTACGCAAAAAAAGTGGATTTTTTCTGAGAAATTTTATTTTTAAGTTTGAAATGCAGGCTTTAATTCCTTTTTTTGCTATAATTAGGGGTGAATTTTGAGGAGGTTCATATGGAGAAATTAGATACCATGATGTTGGCTGATGATTTAGCCTTATCACAAGACAAGATTTTGAATGTTGAACAAGACTTTGACGCTGAAGCTGTCTATAAAGTGATTGATAACTTAGGCGTTTTGAATAATCCTATTAAAGATTACTTTGATATGACCGAAGAAGAATACTACGAAGCAGAAAGCGATCATAAATTAACTTTGATCAAAATGGCTGATAAGTTGACTGATTTGCATGACCGTATCTTAACTAACCACGTTGATGGTTACGTTGATAAGGATGAAATCAATTTGACTTACAACCATGAAAATCCATATGAAGATGATTTGTATGATCCAGCCACTGATTATCGAGTTATCGTTTACAGTTTAAAGGTTATTGGCGCAGTTCAATCAATTGCTGCCAAGGATTTACAAGAAGTATTGTCTAAAGACGCTGTTTTGTCAGTAGGACTTGCTGCTTATGCTTTAGCACACAACGCATAAATTATTTGAGTCGGGTCGCGAGAGTCGGCTTTTTTTGTCTTTGGGGCGAAAAAATGAAGCTATTGAAACATACAAAAGGAATAGTTGATAAGATCATAGGAGCAAGAAAGCGTTCAGCCATGAATAAAGATGGTGAGCTGCTTGATCCTATGCAAAAATATACTACTATTGGTGAATACCATGTTGATGCAGAAGATGGTACGCCAGATGGTAAAAAATTTGTGCTCACCGTTTATCAAGATAAGGACGGAGTATTGCGTCAGGCACTTAGTTCAGAGAGTACTACTGAACTGGCTCCTGAATATGTTCGTAAATACAGCGATGAATTAGGCCGCTTTAGAGCTTTTCATAATAAAAAGACGGGTCGTCGTTACTTAGTAGAAGATTATCTTGATGATTATGTGAGTGAGGTCAAAAAACACATTCGTGATGGCAAAAATTCAGTCAATCTCGGGGTAATTACTGATACTCACTTTAAAGATAAAGATAGTGTTGATTTCTATGGCTGGAATGGTTTGCAGCATGTCCAAGAATTTTCTTATTTAGAAAAGTTTGGCTTACTAGATCTGAAAGCACACCTTGGCGACTGGATCGACGGCTCTGATGCTGGTTTGATTGGCGAAAGCGAGCTTATTAAATTAAAAGATTCATTTAAATCAGATAAAGTTCCGTATTTGAATATTAAGGGAAATCATGATGAAAATGATAAGTTTGACGAGCATTATGATCTTAAAGCCTCATTCCCTGAAAATGAGTTTGAAAATATTATGTGGCCTGATATGTATCGTCAAAAGGGCATTCACTATGTTTCTCGTCAACATGGCGTAGCTTATTTTGATATTGATGATGTTCGCGTGGTTTCCGTTAATACTTCAGATGTGCCATATATTTTGGATAATAAAGGTCATAAACGTTACGATAATAAGATTACTTTAGCAGTACGCGAAGACCAGATTGAAGAAATCATTGAAATTCTCACCAAGTCTTCTAATAAAAAAATTGTTTTCATGAGTCATGCTAATCCAATTAATCGTAAAGGCTCGAATGCATTGAAATACAATGGTCGTTCACTGCATGAATTGCTCGTTGCCTTTAATCAACGCGAAAAAGGACGCATGCATGCTAGCGAAGGTGAACCAGCAGAATTTCGCTTGTCTAATTACTTTGATTTCACTAAGGTGAAAAATGCTCGCATTATAGCCTACTTCTGTGGTCATCGTCATCGCGAAGATCAATATCGCATTAACAGTATTCAATATATTCTGTTCAATTGCTCAGCTTTAATGGGCCCAAATCATTCGTTAACAACTAAATATAATAAAAACTTGAACCGTAAAATCGATCATAATAATGAGTTTGCGGGATACATTGTAAATATTGATTTGAAGCGTCATCGAATTCAATCGTTTGGTTATGGTGCAGCTTCAAGAAGACGCGTTTACTTTATTTAGTTAAAGAATGGTAAAGCCATTTGGCTATTACAAGTCTTTAGCTTATAATAAGAAAGTTAACGTGAAAAAATAACTAGATATAATTTTAGAGAGATTAACTTAGGGGAATTTGACTATGTGCGGAATTGTCGCATTTTATGATCCAAAAATAAATGAAAAACAAGCTGTCATTGGTAAGATGATGGCGACGATCAAGCACCGTGGACCTGGTTCCGACGGTTATTACACTAATGATGAAGTTGCACTTGGCTTTAGAAGATTATCAATTATTGATCTTCGAGGCGGAAGTCAACCAATTTATAATGAAGATAAAACTAGAGCAATCATCTTTAATGGTGAAATTTACAACTTTAAGCCATTAAGAGAAGAATTAATTAAAGCTGGACACGTTTTTTCAACTAAAGCAGATACTGAAGTTCTTCTTCATGGATATGAAGAATGGGGCATGGATGGCCTTCTTAAGCGTGTACGCGGAATGTTTGCTTTCCTTATTTGGGATGACAACAACAAGACCCTTTATGGTGCACGTGACTTCTTTGGTATTAAGCCAATGTATTACAGCAACCAAAATGGCCACTTGCTAGTTGGTTCAGAACTTAAGAGTTTCTTGGAATTTCCAAAGTTCAAGCGTGAATTAAACGTAGAAGCTGTTAAGCCATACTTAATGAACCAATATAATGACCTTGAAGAAACCTTCTTTAAGGGCGTTTACCGTTTTCCAGCTGGTCACTGGTTCGAATACAAAGATGGTGAAATGAAGACCCATCAATATTGGGATGCCGAATATAAAGAAAACAGCTTAAGCTTTGAAGAAACTTTAAAGCGAATCAACGATGATTTAAAGGAAACTGTTGATTTATACAGAAACGCTGATGTTAAGGTTGGTG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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_041809297.1|162933_164211_-|transposase	ISL3 family transposase	A0A2D1GQC1	Lysinibacillus_phage	6.9e-12	21.2
WP_014562892.1|164381_164954_-	DNA-3-methyladenine glycosylase I	NA	NA	NA	NA
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WP_023061592.1|167160_169110_+	asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)	L7RC73	Acanthamoeba_polyphaga_moumouvirus	4.0e-27	31.0
WP_014562896.1|169132_170416_+	carboxylate--amine ligase	NA	NA	NA	NA
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WP_023061596.1|175898_177116_+	MFS transporter	A0A2H4PQR6	Staphylococcus_phage	1.9e-51	32.8
WP_172981046.1|177206_179138_+	M13 family peptidase	E3T4I7	Cafeteria_roenbergensis_virus	1.0e-67	30.4
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WP_041809299.1|181683_182121_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_014918132.1|185800_185962_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_041809303.1|186738_187599_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_041809304.1|187725_188949_+	SLAP domain-containing protein	S5M9Y4	Brevibacillus_phage	4.6e-13	36.3
WP_014562910.1|188967_190059_+	SLAP domain-containing protein	A0A2H4JAS1	uncultured_Caudovirales_phage	1.0e-19	26.6
WP_014918137.1|190162_191998_+	monovalent cation:proton antiporter family protein	NA	NA	NA	NA
WP_014562912.1|193168_194575_-|transposase	ISLre2 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155244303.1|194770_194938_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_041809305.1|194918_195884_-	Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_080553147.1|196336_197566_+|transposase	transposase	Q5ULQ4	Lactobacillus_virus	3.1e-118	56.4
WP_014562917.1|198128_198884_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_041809307.1|199046_199739_+	2,3-diphosphoglycerate-dependent phosphoglycerate mutase	NA	NA	NA	NA
WP_014562919.1|199962_200565_+	pyroglutamyl-peptidase I	NA	NA	NA	NA
WP_003625545.1|200627_201188_+	aldose 1-epimerase	NA	NA	NA	NA
WP_014562921.1|201289_202399_+	LCP family protein	NA	NA	NA	NA
WP_014562922.1|202398_203016_+	glycerol-3-phosphate acyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_014562923.1|203051_206042_+	LTA synthase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_041809308.1|206127_207522_+	fibronectin type III domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_014562925.1|207775_209038_+|tRNA	tyrosine--tRNA ligase	K4F5T3	Cronobacter_phage	6.7e-84	41.9
WP_041809309.1|210123_211437_+	C1 family peptidase	R4TV59	Phaeocystis_globosa_virus	5.7e-62	33.0
WP_023061523.1|211436_212093_+	HD domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_041809310.1|212208_213351_+	IMP dehydrogenase	A0A1V0SHK8	Klosneuvirus	1.2e-63	34.3
WP_041809311.1|213403_214720_-	C1 family peptidase	R4TV59	Phaeocystis_globosa_virus	8.0e-64	36.1
WP_014562930.1|214860_215286_-	Hsp20/alpha crystallin family protein	NA	NA	NA	NA
WP_014562931.1|215518_215980_+	transcription elongation factor GreA	NA	NA	NA	NA
WP_012211324.1|216068_216731_+|protease	CPBP family intramembrane metalloprotease	NA	NA	NA	NA
WP_014562933.1|216891_217491_-	SOS response-associated peptidase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_014562934.1|217615_218638_+|tRNA	tryptophan--tRNA ligase	NA	NA	NA	NA
WP_014562935.1|218662_219142_+	ComE operon protein 2	A7KUY9	Bacillus_phage	3.9e-37	59.0
WP_023061528.1|219131_219740_+	TPM domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_041809312.1|220038_222702_+	magnesium-translocating P-type ATPase	M1HXH2	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	6.8e-38	24.6
WP_014562938.1|222794_224771_+|tRNA	methionine--tRNA ligase	A0A1V0SHR2	Klosneuvirus	1.0e-99	39.2
WP_014562939.1|224770_225538_+	TatD family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_014562940.1|225524_226091_+	ribonuclease M5	NA	NA	NA	NA
WP_014562941.1|226080_226965_+	16S rRNA (adenine(1518)-N(6)/adenine(1519)-N(6))- dimethyltransferase RsmA	NA	NA	NA	NA
WP_014562942.1|227103_228510_+|transposase	ISLre2 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_014562943.1|228633_228891_+	Veg family protein	NA	NA	NA	NA
WP_014562944.1|228993_229824_+	pur operon repressor	NA	NA	NA	NA
WP_014562945.1|229870_231256_+	bifunctional UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase/glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase GlmU	A0A0G2Y8M0	Acanthamoeba_polyphaga_mimivirus	5.1e-29	33.0
WP_193363591.1|231487_232474_+	SLAP domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_193363592.1|232528_233530_+|transposase	transposase	Q5ULQ4	Lactobacillus_virus	8.1e-93	48.1

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NC_017467|558472:567241|DBSCAN-SWA
CATGTCTGAAATAAGCGTAATTATGGGTAGTAAGTCAGATTGGCCAACGATGAAGCATGCGTGTGAAATCTTGGATCAGTTCAATGTTAGCTATGATAAACATGTTATCTCGGCCCATAGAATGCCAAAGGAAATGTACGATTTTGCCCAAGCCGCTGAAGAAAAAGGCACCAAGGTGATCATTGCTGGTGCAGGTATGGCAGCACATTTGCCTGGGATGACAGCCGCTAATACCGTGATTCCAGTAATTGGTGTTCCTGGACAAACTAAAGCATTGGGAGGGATGGATTCTCTTTTATCGATTGTTCAAATGCCAACCGGTATCCCTGTAGCTACCACTGCCATTGGTAATGCTGGTGCAAGCAACGCGGCACTTCTTGCACTAGAAATCTTGGGAATTAGTGACGAAAAAATAAGACAGCAATTGAAAGACTATCGCCAAAAGATGCATGATGAAGCAAAAGAAAGCAGTGCGGAACTTGATTGATCCAGATATTATTGAACAAGGAAAGACTATTGGCATCATTGGAGGCGGACAACTAGGTCAAATGATGGCTTTGTCAGCCAAGTATGGTGGAATGAAAGTCATCACCTTGGATCCAACGCCAGACTGTCCTTGTGGTCAGGTTGCTGACAAGCAGATTGTGGCCGAATATTCAGACATTAATGCAATTGAAGAGCTGGCTAAAGAGAGCGACGTATTAACGTATGAATTTGAAAATGTTGACCTTCAAGCTTTAAAGGATGTTGCCGATAAAGTGAAAATTCCTCAGGGGACTAATCTGCTTTATATCACTAAACACCGACTGCGTGAAAAGAACTTCCTGCGTAGTGCCGGTTGTATGACTGCGCCATATTTGCCCGTTAAAAATATGGCGGATCTAAAAGAGGCGATTAAAAAGATCGGCTATAACTGTGTCCTTAAAACCTGTGAAGGTGGCTACGATGGCCACGGCCAAGAAGTTTTAAAGAGCGATGCCGATCTGAAAAATAATGCGCATATCAAAGAAATTTTAGCTACGAGAGACTGCATTCTTGAAGGCTGGGTGCCATTCAAAGTTGAAGCTTCTGTCATGGTCGCAAGAAATGCAAAAGGCGAAGTAACAGTTTTCCCAGTTAGTGAAAACTACAATGCCGATGAAATTTTGCATATTAGTATTGTGCCAGCACGTGTTTCAAAAGAAATTTATGCTAAAGCACAGGCTATTGCTAAGCAAATTGCAGAAGCAATTCATTTGCGCGGTATTTTGGGTGTGGAGCTATTTATTCTGGATAACGGTGATATTTATGTCAATGAACTAGCACCACGTCCGCATAATTCAGGTCACTATTCGATTGAAGCCTGCAATTTTGACCAGTTTGATATCCATGATCGTGCTATTTGCAATTGGCCGTTGCCTAAGATTAAGCTGTTGTCCAAAGTGGTAATGGTGAATGTTTTGGGTCAACATGTAGCCGGCGTAAGAAAAGTCATTCCTGAAAAGAGCAACTGGCATTTTCACTACTATGGCAAGGCCGAAATCCGTCATAATCGTAAAATGGGCCACGTTACAATTCTTACTGACGATATTGAAAAAACGTTGCAAGAAATTAATGACACCCATATTTGGAAAACAAAAGTAAATTAATCTTGTTTAAGCAGAGCTATTAAAGCTCTGTTTTTTATTTATCATTTTTACTAAAACAAGAACAATACTTCATGATAGTATTGTTAATGTTCCATAGTATATTGACATTATAAGCGATAGTTGATAATATTGTTAGCATAAAAGTGAACAAATTAGTATTCACTCTTTAATAATGTTCGTGTTTTTTACCAAGGAGAAAAATAAAATGGCAAAGTTGTTGTATACCGGTAAAGTTAAGGAAATGTGGTCTACAGATGACCCAGAAGTTTTACGTGTGGTTTATACAGACCAGGCAACTGCCGGTAACGGCGAGAAGAAGGATAACTTTAAGAACAAAGCCTATTTAAACAACGAAATTTCAACTTTGATTTTTGAATACTTGTCCAAAAACGGAGTTCCAACTCATTTCATCAAGAAAATCTCAGACACTGAAGAATTAGTTAAAAAGTGCGACATGTTCCCACTTGAAGTTGTTACTAGAAATATTGCAGCTGGCCATTTCTCAAGTCGTTATGGCTTGGGCGAAGGTGAAAAATTCGATACGCCAGTCGAAGAACTTTTTTATAAGAGTGATGAACTCGACGACCCAATCATGAACGAATCTGATGCGATTGCATTACATATTGCGAACGCTGAAGAGCAAAAGAAGATCTGGGAATTGTCTCGTCAAGTTAACAAGCTTTTGATTCCGCTTTTTGATAAGGCTGGAATGGAATTAGTCGATTTCAAACTTGAATTTGGTAAAGATGCAGATGGAAATATCATCCTTGCAGATGAATTTTCACCAGATAACTGCCGTCTTTGGGATAAAAAGACCAAGAAGCATATGGATAAAGATGTCTACCGCAGAGACATCGGCGATTTAACCACTGTTTATGAACAAGACTTAGCCCGCATTCAAGAAGCACTTAAGGAGATCTAAATGACTACTGTCCGTATTTACGTAACCTACAAACCTTCAGTTTTTGATCCACAAGGAGCTGCAATCACCGATTCAGTTAATTCCCTTGGTCATGACGAAGTCAAAAAAATCGTTGTTGGTAAGTTCTTCGATGTAACTGTTGATGAAGATGACTTAGATAAAGTTAAGGCTGATGTGAAGGATATCGCTGAAGCTTTATTGGTTAACTTCAACATGGAAACTTACAAGATCAAAGTTTTGGAGAAAAACGCATGAAAATTGCAGTAATAGTTTTTCCAGGTTCTAACTGCGATATCGACATGTACGAAGCTTTTCGCACTGTTTGCCAGGCAGATGTCGAATATGTTTCTTACAAGGAAAAAAGTTTAGCTGGCTTTGATGTAGCTGTTTTACCAGGTGGCTTTTCTTATGGGGATTATTTAAGAACCGGCGCAATTGCTCGCTTTTCAAACATTATTCCAGCCGTTAAGAAGATGGCAGAAGAAGGAAAGTTAGTTTTAGGTGTCTGCAATGGTTTTCAGATTTTAACAGAAATGGGACTGCTTCCAGGAGCACTTAAGAAAAACGATAGCCTTCAATTTGTTTGCGAGACTGTCACTTTAGAAGTTGAGAATACGCATACGCCATTTACTACTGAGTATGAAGATAAAGAACTTGTCCGTATTCCTATTGCTCATGGCGACGGCAGCTATTACGCAGATGAAGATGTACTTGAAGATTTAGAAGTAAATCACCAAGTTGTCTTTAGATATCATGGTGAAAATCCTAACGGCAGTCTGCATGATATAGCTGGTATTTGTAACAAAGAAGGAAATGTTCTAGGCATGATGCCACACCCTGAAAGAGTGGTAGAACAAATTCTCGGTGGAACAAATGGGTTGCCTTTATTTAAGTCACTTTTAAAAGCAGGAGTTCAAGCATGAAACAAGCGATGACACCAGAAGAAATCAAAGAAAAGAAACCTTACCTTGATTGGAGTTTATCAGAACGTGAATATGACTATATTTGCGATCATTTGCTTCATCGCTTGCCCAACTACACAGAAATCGGCTTGTTCTCCGCAATGTGGAGCGAGCACTGTTCTTACAAAAAGTCTAAGCCAGTGTTGAAGCTGTTTCCAACCACGGGTAAACGCGTAGTACAAGGTCCAGGTGAAGGTGCTGGTGTAGTTGATATCGATGATGGTCAAGCCGTTGTTTTTAAGGCTGAAAGTCACAATCACCCAACTACAGTGGAACCTTACCAAGGTGCCGCAACCGGTGTTGGCGGTATTTTAAGAGACGTTTTCAGTATGGGAGCTCGCCCCGTTGCAATCCTTGATTCTTTGCACTTTGGTGAATTGAAAGATAATCCAACAATGCGTTACAAGATGGAAGAGACCATCAAGGGCGTCGGCGACTATGGCAACTGCATGGGAATTCCTAATTTAGGCGGAGAAACAACTTTTGATCCTTGCTATAATGGCAACATTTTATTAAACGCCATGAATGTGGGAATCATGGATATTAAAGATATGGAGCATGGGGATGCTACAGGCGTTGGCAATGCGGTAATGTACGTCGGTGCTAAAACCGGGCGTGATGGTATTCACGGTGCTACCTTTGCTTCAGCCGACTTTTCTGAAGAACATGCGACCCAACGTTCAGCGGTTCAAGTTGGTGATCCATTTATGGAAAAATTGTTGATGGAAGCTTGCTTGGAACTGATCTTGAATCATCGTGAATGGCTTGTTGGTATTCAAGACATGGGAGCAGCCGGCATCGTTTCTTCAAGTGCTGAAATGGCCACTGAAGGTAAATCCGGGATGGATCTCAATCTTAACTTGGTACCTCAGCGTGAACCTAACATGTCAGCTTACGAGATTATGCTTAGCGAATCGCAAGAAAGAATGCTCCTTTGTGTAAAGAAGGGCCATGAAGAGGACGTTAAAAAGATCTTCGATGAATTTAATCTTGACGCTGTAACTATTGGTCGCATTACTGATGATGGTAGATACGTGCTTCATCACGATGATCAAGTGGTATGTGATATTCCAGTGGTAACTTTAACTGAAAAAGTCCTTGAAGAAAAAAGCGCAGAAAAGAAACCACAAAGAATCATTGATGCTGAGCAAAGTGAAAATTGGCAACCAAATATTGAAAGTGCCGGTCAAACTTTAAAAGATCTTTTGAGCCAGCCAACCATTGCTAACGATCAATTTGTAACGCAACAATATGATTCACAGGTTCGAACGGACACGATTGTAGGTCCTGGTTCAGATAGCGGCGTCTTGCGCGTGCGCCATACTAAGAAGGCAATTGCGATGACTACTGATACTAATGGACGCTTTGTCTATCTTGATCCAAAAGTTGGTGGTCAAAGAACTGTCCTTGAAAGTGCAACAAATATCGTGGCTAGTGGTGCCCAACCTTTAGCAATTACTGACTGTCTTAACTATGGTGACCCTAATGATCCAGAAATTTTCTGGGAATTGTATCAATCTTGTCAAGGGATTGCCGATGCATGTGAAATCTTAGAAACACCGGTTGTTTCAGGAAATGTCTCTCTTTATAACGAAAATAATGGCAAGGCAATTTATCCATCACCAATGATTGGGATGGTTGGTTTAATCAAGGATTATGATCACGTCATTCCAATGCACATGCAAAAAGCAGGCGGCAAGATTTATCTAGTGGGTAAGACAGATGATGATTTTGCCGGCTCAGAATTGCAAAAGATGATTACTGGTGAAATTAGCGGTTTGCCACATGCACCAAACTTACCAGAGATAAAGCAATATCTTTACAAACTGCAAGCATTAATGGCTAACGGTTTAGTCAAAAGCGCGCACGATCTAAGCGAAGGTGGCTTAGGCGTTTCCTTAGCGGAAACACTTTTTGATACAGACTTTGGTGCAAAGATCGAACTTGATTTTGATAAAAATCTGCTTTTCAGTGAGACTCCAGGTCGCTTGATCGTTTCAGTTGATCCTGCAAATGCGGAAAAATTTGAACAAGAAATGGGCGATTCCGTTAGTGAAATTGGTCAAGTTACTGCTGATCAGCAATTGAACATTTCGCTGGCCAACGATCAAGTAAATGAAGATGTAGCTGAATTGCAAAAGATTTGGAAGGAGTGCATCCCTTGTTTAATGAAATCAAAAGCCTAAATGAGGAGTGTGGCGTCTTCGGTGTTTTCGGCGCTCCTGATGCTAGTCAATTAACATATCTGGGTTTGCATAACCTGCAGCACCGCGGACAAGAAGGGGCCGGCATCGTCTCAAGCGATGGTGAGCATTTGTATCAACACCGCGATCGTGGACTTTTATCCGATGCTTTTGCTGATCCGAATGATTTAAAAAAATTGGTCGGCGACAGTGCCATTGGTCACGTTCGCTACAGTACAACGGGTCGTAATTCGATTCAAAACGTACAACCATTTCTCTTTCATTTTCTAGACGGTGATGTTGCTTTAGCCCACAACGGCAATTTAGTTAATGCCGTGTCTTTACGAAACAAGCTCGAAAAACAAGGTGCGATTTTTCAATCCTCATCTGATACCGAAATCTTAATTCACTTGATTCGTAATCATATCAAAGATGGCTTTATTTCAGCTTTAAAGCAAAGTCTGAATGAAGTTCACGGTGGTTTTGCCTTCCTGCTTTTGCAAAAAGATCGCATGATTGCGGCACTTGATCCTAATGGGATTCGTCCCTTATGTATTGGTGAATTGGACAATGGCGCCTACGTTGTTTCTAGCGAAACTTGTTCACTTGACATCATCGGTGCCAAGTTCGTTCGTGATGTGCAGCCTGGTGAATTAATCATCATTGATCGAGATGGGATGAAAATTGATCATTTTACTAAAAATACGCATTTAGCAATCTGCTCAATGGAATACATCTATTTTGCTCGTCCTGATTCAATCATACATGGTGTGACTGTTCATAATGCTAGAAAAAGAATGGGGCGGCTGCTAGCTCGTGAGGCTCCAGCCGATGTCGACATGGTAATTGGCGTACCAAACTCATCTTTGTCAGCTGCTTCTGGTTACGCCGAAGAATTGGGGTTGCCTTATGAAATGGGTCTGGTTAAAAACCAATACGTTGCCAGAACCTTCATTCAGCCAACTCAAGCCTTGCGTGAAAAGAGTGTTAAGTTAAAACTGTCAGCTGTTCGTGGTGTCGTTGCTGGTAAAAAGATCGCGGTCATCGACGATTCGATCGTAAGGGGAACCACTTCTAAGCAAATTGTCAAAATGCTTAAAGATGCTGGTGCTAAAGAAGTCCATTTAAGAATTGCTAGTCCGCCATTTAGATTCCCTTGTTTTTATGGCATCGATATTTCAACTCGTTCTGAACTGCTGGCTGCCCATTACTCAGTAGAAGAAATGCGCAAAATCATTGGCGCTGATAGCCTTGGCTTTTTAAGCATTGATAGCTTGATCAAGGCCATCGATGTACCTGATAGAGGCGATTCATCGGGTCTGACAGTTGCCTACTTTAATGGAAAGTATCCAACTAAATTGGATGACTATGAAGCTGGCTATTTAGCTTCTCTTAATGCCCAGGAACGGCGACAAAGAAAGGAATTATCAAATGAATCGTTATAAAGAAGCCGGCGTAGATGTCACTGCTGGTTACGATTTAGTTAATCGAATCAAGCCGATGGTAGCTGCAACTAAGCGTAAAGGCGTCAGGGGTGGGATTGGTAGCTTTGGCGGCATGTTTGATTTAGAAGAATTGGGTTACAAGCATCCCGTTCTTGTTTCAGGCACGGATGGTGTAGGTACCAAATTAATGATTGCGCAAAAGATGCACCAAAACGACACGGTCGGCATCGATTGCGTGGCCATGTGCGTTAACGATGTGCTAGCCCAAGGTGCGGAACCTCTGTTTTTCTTAGATTACATTGCCTGTGGTCATAACGATCCAAAGAAATTGGCTGACGTAGTTAAGGGCGTGGCTGAGGGATGCAAGCAAAGCGGCTCTGCCTTAATTGGTGGTGAAACCGCGGAAATGCCCGATATGTATGAACCCCACGAATATGATTTGGCTGGTTTTTCAACTGGGATTGCGGAAAAAGAGGACTTATTATCTAGTTCTTTAGCCAAAGCAGGCGATCATTTAATTGCTTTGCCATCGAGTGGCGTCCATTCTAATGGTTTCAGTTTAATTAGAAAAATTTTGTTCAAAGATCACAACGTTTCATTAAGCGACAAACCAGCAGAATTAGCGGTCAAAACCGTAGGCGAAACACTCCTTACGCCAACCAGAATCTATGTCAAAGCAGTTTTGCCACTAGTAAAAAAGCATTTAGTTCACGGCATTGCCCATATTACTGGTGGCGGCTTTATCGAAAACCTACCTCGAATTTATGGCAATGACTTGCAAGCAGTGGTTAATAAAGGTTCGTGGCCTGTTTTACCAATTTTTGATTATCTGAAAAAACTAGGCGATTTAGATGAACGAGATTGCTACAACACTTTCAATATGGGCGTTGGTTTAGTTTTAGCCGTTCCAGTAGAAAACGTTGCTGCAGTCAAAGAACAACTAAATCGCGAGAATGAAAAATTCTACGAAATTGGTCAATTAGTTGCACGCCCCGAAGGGGAAGAAAAGATCGTAATCAAATAGAGGAGAAAAATGAGAGTTGCTATTTTAGCTTCTGGGAATGGAACCAACTTTGAAGCTTTAACTAAAAAGTTTCAAGCTGGCGAAATTCCCGGAACCGAGGCTTTAATGTTTTGCAATCATCCAAATGCCCCGGTAGTGAAAAGAGCCGAGAGATTAGGCATCCCGCATGAAGCATTTTCCGTTAAAGAATGCGGCGGCAAGACGGCTTATGAAAAGCGCCTGCTAAAAGTTTTGCAGGATTATCAAATTGATTTCATTGTTTTATCCGGATATCTCAGGGTGGTTGGACCCACGATTTTAAACGAATATCCCAATGTAATTATCAACTTGCATCCCGCCTTATTGCCAAGTTATCCCGGCCTCAATTCAATCGAAAGAGCTTTTGAAGATTACAAGCAAGGCAAGATAAAAGAAACCGGCGTGACGGTGCATTTTATCGATGCCCATTTGGATCATGGGCCTATCATTGCTCAACAGGCTGTCCCAATTTATCCAGATGATACGGTTGAGACGCTTGAGGCAAGAGTCCATGAAACAGAACATCAACTATTTCCAGCTACGTTAAAAAAAGTATTGAGTCAAAGAATGGAAAAGGAAGAAAACTAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_2

>NC_017467|558472:567241|558472_558958_+|WP_014563196.1|DBSCAN-SWA
MSEISVIMGSKSDWPTMKHACEILDQFNVSYDKHVISAHRMPKEMYDFAQAAEEKGTKVIIAGAGMAAHLPGMTAANTVIPVIGVPGQTKALGGMDSLLSIVQMPTGIPVATTAIGNAGASNAALLALEILGISDEKIRQQLKDYRQKMHDEAKESSAELD
>NC_017467|558472:567241|565597_566635_+|WP_041809380.1|DBSCAN-SWA
MNRYKEAGVDVTAGYDLVNRIKPMVAATKRKGVRGGIGSFGGMFDLEELGYKHPVLVSGTDGVGTKLMIAQKMHQNDTVGIDCVAMCVNDVLAQGAEPLFFLDYIACGHNDPKKLADVVKGVAEGCKQSGSALIGGETAEMPDMYEPHEYDLAGFSTGIAEKEDLLSSSLAKAGDHLIALPSSGVHSNGFSLIRKILFKDHNVSLSDKPAELAVKTVGETLLTPTRIYVKAVLPLVKKHLVHGIAHITGGGFIENLPRIYGNDLQAVVNKGSWPVLPIFDYLKKLGDLDERDCYNTFNMGVGLVLAVPVENVAAVKEQLNRENEKFYEIGQLVARPEGEEKIVIK
>NC_017467|558472:567241|561940_564169_+|WP_014563200.1|DBSCAN-SWA
MKQAMTPEEIKEKKPYLDWSLSEREYDYICDHLLHRLPNYTEIGLFSAMWSEHCSYKKSKPVLKLFPTTGKRVVQGPGEGAGVVDIDDGQAVVFKAESHNHPTTVEPYQGAATGVGGILRDVFSMGARPVAILDSLHFGELKDNPTMRYKMEETIKGVGDYGNCMGIPNLGGETTFDPCYNGNILLNAMNVGIMDIKDMEHGDATGVGNAVMYVGAKTGRDGIHGATFASADFSEEHATQRSAVQVGDPFMEKLLMEACLELILNHREWLVGIQDMGAAGIVSSSAEMATEGKSGMDLNLNLVPQREPNMSAYEIMLSESQERMLLCVKKGHEEDVKKIFDEFNLDAVTIGRITDDGRYVLHHDDQVVCDIPVVTLTEKVLEEKSAEKKPQRIIDAEQSENWQPNIESAGQTLKDLLSQPTIANDQFVTQQYDSQVRTDTIVGPGSDSGVLRVRHTKKAIAMTTDTNGRFVYLDPKVGGQRTVLESATNIVASGAQPLAITDCLNYGDPNDPEIFWELYQSCQGIADACEILETPVVSGNVSLYNENNGKAIYPSPMIGMVGLIKDYDHVIPMHMQKAGGKIYLVGKTDDDFAGSELQKMITGEISGLPHAPNLPEIKQYLYKLQALMANGLVKSAHDLSEGGLGVSLAETLFDTDFGAKIELDFDKNLLFSETPGRLIVSVDPANAEKFEQEMGDSVSEIGQVTADQQLNISLANDQVNEDVAELQKIWKECIPCLMKSKA
>NC_017467|558472:567241|558923_560099_+|WP_041809371.1|DBSCAN-SWA
MKQKKAVRNLIDPDIIEQGKTIGIIGGGQLGQMMALSAKYGGMKVITLDPTPDCPCGQVADKQIVAEYSDINAIEELAKESDVLTYEFENVDLQALKDVADKVKIPQGTNLLYITKHRLREKNFLRSAGCMTAPYLPVKNMADLKEAIKKIGYNCVLKTCEGGYDGHGQEVLKSDADLKNNAHIKEILATRDCILEGWVPFKVEASVMVARNAKGEVTVFPVSENYNADEILHISIVPARVSKEIYAKAQAIAKQIAEAIHLRGILGVELFILDNGDIYVNELAPRPHNSGHYSIEACNFDQFDIHDRAICNWPLPKIKLLSKVVMVNVLGQHVAGVRKVIPEKSNWHFHYYGKAEIRHNRKMGHVTILTDDIEKTLQEINDTHIWKTKVN
>NC_017467|558472:567241|561272_561944_+|WP_014563199.1|DBSCAN-SWA
MKIAVIVFPGSNCDIDMYEAFRTVCQADVEYVSYKEKSLAGFDVAVLPGGFSYGDYLRTGAIARFSNIIPAVKKMAEEGKLVLGVCNGFQILTEMGLLPGALKKNDSLQFVCETVTLEVENTHTPFTTEYEDKELVRIPIAHGDGSYYADEDVLEDLEVNHQVVFRYHGENPNGSLHDIAGICNKEGNVLGMMPHPERVVEQILGGTNGLPLFKSLLKAGVQA
>NC_017467|558472:567241|564144_565611_+|WP_035515999.1|DBSCAN-SWA
MFNEIKSLNEECGVFGVFGAPDASQLTYLGLHNLQHRGQEGAGIVSSDGEHLYQHRDRGLLSDAFADPNDLKKLVGDSAIGHVRYSTTGRNSIQNVQPFLFHFLDGDVALAHNGNLVNAVSLRNKLEKQGAIFQSSSDTEILIHLIRNHIKDGFISALKQSLNEVHGGFAFLLLQKDRMIAALDPNGIRPLCIGELDNGAYVVSSETCSLDIIGAKFVRDVQPGELIIIDRDGMKIDHFTKNTHLAICSMEYIYFARPDSIIHGVTVHNARKRMGRLLAREAPADVDMVIGVPNSSLSAASGYAEELGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQALREKSVKLKLSAVRGVVAGKKIAVIDDSIVRGTTSKQIVKMLKDAGAKEVHLRIASPPFRFPCFYGIDISTRSELLAAHYSVEEMRKIIGADSLGFLSIDSLIKAIDVPDRGDSSGLTVAYFNGKYPTKLDDYEAGYLASLNAQERRQRKELSNESL
>NC_017467|558472:567241|560304_561021_+|WP_041809374.1|DBSCAN-SWA
MAKLLYTGKVKEMWSTDDPEVLRVVYTDQATAGNGEKKDNFKNKAYLNNEISTLIFEYLSKNGVPTHFIKKISDTEELVKKCDMFPLEVVTRNIAAGHFSSRYGLGEGEKFDTPVEELFYKSDELDDPIMNESDAIALHIANAEEQKKIWELSRQVNKLLIPLFDKAGMELVDFKLEFGKDADGNIILADEFSPDNCRLWDKKTKKHMDKDVYRRDIGDLTTVYEQDLARIQEALKEI
>NC_017467|558472:567241|561021_561276_+|WP_041809376.1|DBSCAN-SWA
MTTVRIYVTYKPSVFDPQGAAITDSVNSLGHDEVKKIVVGKFFDVTVDEDDLDKVKADVKDIAEALLVNFNMETYKIKVLEKNA
>NC_017467|558472:567241|566644_567241_+|WP_014563203.1|DBSCAN-SWA
MRVAILASGNGTNFEALTKKFQAGEIPGTEALMFCNHPNAPVVKRAERLGIPHEAFSVKECGGKTAYEKRLLKVLQDYQIDFIVLSGYLRVVGPTILNEYPNVIINLHPALLPSYPGLNSIERAFEDYKQGKIKETGVTVHFIDAHLDHGPIIAQQAVPIYPDDTVETLEARVHETEHQLFPATLKKVLSQRMEKEEN

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_014563196.1|558472_558958_+	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide mutase	A0A2P0VNU7	Tetraselmis_virus	2.8e-22	46.4
WP_041809371.1|558923_560099_+	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide synthase	NA	NA	NA	NA
WP_041809374.1|560304_561021_+	phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide synthase	A0A0E3HWF9	Synechococcus_phage	9.7e-40	39.6
WP_041809376.1|561021_561276_+	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurS	NA	NA	NA	NA
WP_014563199.1|561272_561944_+	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurQ	NA	NA	NA	NA
WP_014563200.1|561940_564169_+	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurL	A6N228	Microbacterium_phage	2.9e-143	39.7
WP_035515999.1|564144_565611_+	amidophosphoribosyltransferase	A0A0M3SGR2	Mollivirus	4.1e-61	34.2
WP_041809380.1|565597_566635_+	phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase	Q58MH8	Prochlorococcus_phage	5.0e-61	41.5
WP_014563203.1|566644_567241_+	phosphoribosylglycinamide formyltransferase	E3SNR5	Prochlorococcus_phage	3.3e-25	35.7

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NC_017467|589319:644237|DBSCAN-SWA
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MADNIILECTECGDRSYLSKKNKRKHPERLSLKKYCPVERRATLHRETK
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MRTIKEIALESGYSPATVSRLLNNDPNLSITADTKNKILEIANKLGYWEDHQEKKIKPTIALLYRVNHKEQLQDEYFTSLKQALVSTVERDALKMKTFYDIEDLIKNASLFQGFIGVGAEPIENAQLVKLHKVLPNGVFVDTNPAPELFDSIRPNLPFTVKNAIDLFIKNGINKIGFIGGVGPKHDHIQENDLRSITFVEYMKTRGMDTKWTCVEGPVSVENGYKLGKMVLAKYKNDLPEAFLIASDTLAVGVLQAFNEENVNVPKDTKILSINNSNVVKYVSPPLSSFNINQQEMIDMALDTLTHLIIRPDRPKIDIRMNTNLVVRKSFVPQEK
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MKKKLLLFLGAILLILGFAKLSSVNADAATIKAIDWGAKKVFTTPKKTRGVWYYKEGKKVKKFKITAHTIDGVKLYKELNGKTSDRWVNKLIKADKKSGYKLADKVGESAWACHTIKYHKIIGFNADGWLAGSGDGFYYVPVKKNVKGKKVNALRVGEGAGNYLSYYAYKSRKLVK
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MAKILIIEDEKNLARFVELELQHENYETVVENNGRKGLEDALNQDFDAILLDLMLPDLNGLEIARRVRQVKTTPIIMMTARDSVIDRVSGLDHGADDYIVKPFAIEELLARLRAVLRRVKIEKDASRVTVAKQKIVKFKNLTIETANRIVHRGDGKAIDLTKREYNLLMTLIENKNNVVSRDQLLNKIWGPESNIETNVVEVYVRYLRNKIDVPGQPSYIKTVRGIGYMVRDEDDDQE

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
583301:583317	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_023061994.1|592083_592614_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_014563226.1|593076_594327_+	DUF389 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_080553153.1|596181_596715_+	translation initiation factor IF-3	A0A2L0UZ54	Agrobacterium_phage	4.0e-14	38.2
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WP_003627118.1|596980_597337_+	50S ribosomal protein L20	NA	NA	NA	NA
WP_014563231.1|597481_598006_+	YqeG family HAD IIIA-type phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_014563232.1|597998_599108_+	ribosome biogenesis GTPase YqeH	NA	NA	NA	NA
WP_023061987.1|599118_599775_+	nicotinate-nucleotide adenylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_003627112.1|599755_600349_+	bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase (symmetrical) YqeK	NA	NA	NA	NA
WP_003627111.1|600370_600718_+	ribosome silencing factor	NA	NA	NA	NA
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WP_041809389.1|604907_606179_-|transposase	ISL3 family transposase	Q6V7R1	Burkholderia_virus	1.3e-10	23.5
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WP_014563241.1|608484_609849_+	SLAP domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_014563242.1|609942_610320_+|integrase	tyrosine-type recombinase/integrase	H0USV4	Bacillus_phage	2.9e-11	42.2
WP_014563245.1|611916_612405_-|tRNA	aminoacyl-tRNA deacylase	NA	NA	NA	NA
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WP_014563250.1|615347_616397_+|tRNA	phenylalanine--tRNA ligase subunit alpha	A0A2K9L3A8	Tupanvirus	1.2e-33	37.3
WP_014563251.1|616400_618815_+|tRNA	phenylalanine--tRNA ligase subunit beta	NA	NA	NA	NA
616702:616718	attR	NA	NA	NA	NA
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WP_014563255.1|620844_621141_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
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WP_014563258.1|624966_627075_+	penicillin-binding protein 2	NA	NA	NA	NA
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WP_003627079.1|627349_627910_+	5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase	NA	NA	NA	NA
WP_014563259.1|627930_628611_+|protease	rhomboid family intramembrane serine protease	NA	NA	NA	NA
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WP_012212102.1|628897_629299_+	rhodanese-like domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_014563261.1|629377_630298_+|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-dimethylallyltransferase MiaA	NA	NA	NA	NA
WP_014563263.1|631667_633005_+	type I glutamate--ammonia ligase	NA	NA	NA	NA
WP_041809886.1|633257_633977_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_014563265.1|634118_635024_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_023060884.1|635124_636114_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_080553189.1|636180_637449_-|transposase	IS3 family transposase	A0A1B1P773	Bacillus_phage	1.8e-44	41.7
WP_003627059.1|637701_638694_-	UDP-glucose 4-epimerase GalE	A0A2K9L5H6	Tupanvirus	5.3e-52	38.4
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WP_014563269.1|639738_641625_-	beta-galactosidase	L0N6M2	Herpes_simplex_virus	3.6e-94	33.6
WP_014563270.1|641867_642875_+	LacI family DNA-binding transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_041809397.1|642959_644237_-|transposase	ISL3 family transposase	A0A2D1GQC1	Lysinibacillus_phage	1.8e-12	21.9

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NC_017467|659037:719646|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NC_017467|1377016:1438713|DBSCAN-SWA
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MSEAFKYLAASIAAGLAALAASLGNGKVISKTLEGMARQPESAGNLRATMFIGVGLIEAVPILAIVVAFLILFL
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MSIKAEEISSLIKQQLEHYDDKLDINEVGVVTYVGDGIARAHGLNNALAGELLKFDNGSYGIAQNLDSSDVGIIILGQFDNIREGDRVQRTGRIMSVPVGDALIGRVVNPLGQPVDGLGEIKSDKTRPIEEKAPGVMDRQSVNQPLQTGIKAIDALVPIGRGQRELIIGDRKTGKTSLAIDTILNQKNQDVICIYVAIGQKESTVRTQVETLKRFGAMDYTIVVEAGPSEPAPMLYIAPYAGTAMGEEFMYNGKDVLIVFDDLSKQAVAYRELSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERSAKLSDKLGGGSLTALPIIQTEAGDISAYIPTNVISITDGQIFLQSDLFFAGTRPAIDAGNSVSRVGGNAQIKAMKKVAGTLRTDLAAYRELESFAQFGSDLDQATQAKLNRGQRTVEVLKQPLHDPIPVEKQVLILYALTHGYLDSIPVEDISRFQNELFDNFDSSHADLLKTIRETGKLPDDKKLSAAIEEFSESFAPSEK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_148224897.1|1379922_1380495_-	type III toxin-antitoxin system ToxN/AbiQ family toxin	NA	NA	NA	NA
WP_041809572.1|1380738_1381269_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_014563840.1|1381268_1382369_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_041809575.1|1382392_1383319_-	glycosyltransferase family 2 protein	V5USA4	Oenococcus_phage	1.7e-76	49.0
WP_012211687.1|1383315_1383732_-	GtrA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_014563842.1|1383900_1384998_-	glycerophosphodiester phosphodiesterase	NA	NA	NA	NA
WP_014563843.1|1385738_1386917_+|transposase	IS256 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_014563844.1|1386956_1387175_-	SLAP domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_014563845.1|1387478_1387982_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_041809576.1|1388231_1390013_-	flavocytochrome c	A0A2P0ZL82	Lactobacillus_phage	8.5e-202	59.7
WP_014563847.1|1390211_1391426_-|transposase	IS110 family transposase	A0A1X9I619	Streptococcus_phage	1.1e-86	45.3
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WP_014563853.1|1393410_1394217_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
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WP_003626201.1|1398936_1399443_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_158304584.1|1399448_1399682_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_003626193.1|1400695_1401406_-	rRNA pseudouridine synthase	NA	NA	NA	NA
WP_014563859.1|1401395_1402274_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_003626189.1|1402331_1403549_-|tRNA	tRNA 4-thiouridine(8) synthase ThiI	NA	NA	NA	NA
WP_014563860.1|1403548_1404709_-	cysteine desulfurase	A0A1X6WFP1	Pacmanvirus	2.3e-38	31.8
WP_014563861.1|1404799_1406509_-	septation ring formation regulator EzrA	NA	NA	NA	NA
WP_014563862.1|1406791_1407403_+	30S ribosomal protein S4	NA	NA	NA	NA
WP_003626181.1|1407492_1407960_+	YueI family protein	NA	NA	NA	NA
WP_014563863.1|1407959_1409273_+	replication-associated recombination protein A	A0A127AWE7	Bacillus_phage	6.2e-101	49.3
WP_014563865.1|1409926_1410391_+	universal stress protein	NA	NA	NA	NA
WP_014563866.1|1410456_1411650_-	rod shape-determining protein RodA	NA	NA	NA	NA
WP_003626171.1|1411671_1411899_-	DUF2969 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_003628023.1|1411907_1412201_-	membrane protein insertion efficiency factor YidD	NA	NA	NA	NA
WP_014563867.1|1412214_1413204_-	rod shape-determining protein	NA	NA	NA	NA
WP_014563868.1|1413287_1413518_-	DUF1146 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_014563869.1|1413581_1414043_-	F0F1 ATP synthase subunit epsilon	NA	NA	NA	NA
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WP_014563871.1|1415516_1416479_-	F0F1 ATP synthase subunit gamma	NA	NA	NA	NA
WP_012211671.1|1416489_1418001_-	F0F1 ATP synthase subunit alpha	NA	NA	NA	NA
WP_014563872.1|1418015_1418564_-	F0F1 ATP synthase subunit delta	NA	NA	NA	NA
WP_023060971.1|1418563_1419073_-	F0F1 ATP synthase subunit B	NA	NA	NA	NA
WP_005718768.1|1419124_1419349_-	F0F1 ATP synthase subunit C	NA	NA	NA	NA
WP_014563875.1|1419368_1420082_-	F0F1 ATP synthase subunit A	NA	NA	NA	NA
WP_014563876.1|1420205_1420835_-	uracil phosphoribosyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_014919072.1|1420918_1421920_-	threonylcarbamoyl-AMP synthase	S4VW33	Pandoravirus	2.5e-49	38.4
WP_014563878.1|1421925_1422768_-	peptide chain release factor N(5)-glutamine methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_014563879.1|1422760_1423849_-	peptide chain release factor 1	W8EDB3	Pseudomonas_phage	1.4e-05	44.6
WP_014919074.1|1423865_1424465_-	thymidine kinase	A0A1W6JKV9	Lactococcus_phage	5.3e-47	48.5
WP_041809588.1|1424615_1425968_+	Mur ligase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_014563881.1|1426285_1427299_+	serine hydrolase	A0A1D8EXR7	Mycobacterium_phage	1.8e-07	27.0
WP_014563882.1|1427550_1428729_+|transposase	IS256 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_014563883.1|1430347_1431607_+|transposase	ISL3 family transposase	Q6V7R1	Burkholderia_virus	5.7e-11	23.1
WP_013854585.1|1431844_1433074_+|transposase	IS110-like element ISLhe4 family transposase	A0A1X9I619	Streptococcus_phage	1.8e-65	38.4
WP_014563885.1|1433415_1434756_-	glucose-6-phosphate isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_003626132.1|1434831_1435446_-	VanZ family protein	NA	NA	NA	NA
WP_014563886.1|1435570_1437760_+	LTA synthase family protein	W6LM83	Streptococcus_phage	1.5e-152	43.8
WP_041809589.1|1437855_1438713_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NC_017467|1491717:1500056|DBSCAN-SWA
TATGCTAGTACCTACAGTTATTGAACAAACTGCTCGTGGCGAACGCGCTTACGACATTTACTCACGCTTATTAAAAGATAGAATTATTATGTTGAGCGGCGAAATTAACGATCAAATGGCTAACTCAATTATTGCTCAATTGCTTTTCCTTGATGCACAAGACAACACTAAGGATATTTCACTTTACATCAACTCACCAGGTGGTGTTATTACTTCTGGCCTTGCAATCATGGATACTATGAACTTCATTAAGTCAGACGTATCAACTATTGCAATTGGTATGGCTGCTTCAATGGCTTCTATTCTTTTGACTAGTGGTACTAAGGGCAAGCGTTTTGCATTGCCTAACTCAACTGTCCTTATCCACCAACCTTTAGGCGGTGCTCAAGGTCAACAAACTGACATCCAAATTGCAGCTAACGAAATTTTAAAGAGTCGTAAGAAGATTAACGAAATCTTACACGAAACCACTGGTCAACCATTAGAAAAGATCCAAAAGGATACTGAACGTGATAACTACTTAACTGCTGAAGAAGCTAAGGAATATGGTTTGATCGATGAAATTATGGTTAACAAGAAGAAGTAATCATTAATTATATTTAAAAAAGAGGATTTGCATTTTGCAAATGAAGTGAGACCTAAAAGTGAGACACTTTTAGGTCTTTTACTATGTCTAAATTTAATAAAGAACAAAAGATAGAAATTTATCGTAAATGGAAAGATGAGAAAATCTCAATCAGTCAGTTGTCAAAAACATATAAAATGAACTTAGCTAATCTGGATTACATGCTTAGATTGATTGATATGCATGGAACAAATATTTTGAATACTAGAAAGCGGGTTTATTCTAAGAAGTTTAAAGAACAAACAATTGAACAAGCCATCTTTGGTACTAAGTCAGATGTTCAATTATCTCTAGAATTAGATTTCAAAAGCATTGGCAGGCTTAACAATTGGCTTAGAGAATACAAAGAAAACGGGTATAATGTCATTATCAAACAGAAAGGACGTCCTGCCCGTGGTCAAAGAGAGTCAAAAATCGCGCAAGGAACTGGAGAAAGAGATCCAAAAGCTGAAAGAAGAAAACTTGCGATTGCGTATTGTGAACGAATACGTAAAAAAACTGCAGGCCTTGGATCAGGAAAAAGATCAGAAGAGATAGCTAAGCTTATTGCCAAGATCAAAGAAATCTTTAATCATCATCAAGGCCGTTATGGCTATCGCCGAGCAGCGCTGCAGCTAATTAAAGAAGGCTGGGACATTACTGAAAAAACAGTTCGCTACTGGATGCATAAACTAGGCCTTAAGGGCATTAGACGCAATAAGCGCAAATACTCGAGCTATAAAGGTACTATTGGCAAAATAGCACCTAATTTGATTCATCGTGATTTCTTTGCGCCAATGCCTAATATGAAATGGCATACTGACATCACTGAATTTCACCTTAATGGTGAAAAGCTATATTTATCGCCTATTTTGGATGGTTGTGGAGGCGATATAGTTTCTTATTCTATTTCAAGACATCCAGATATGGATTTAGTAATGACGATGCTTGATAAAGCTTTCGTTAAAGAAACAGCTCTTAACAACTGCACTTTTCATACTGACCAAGGCTGTCAATATCAGAGTCCCCAATACCAACGTGCCTTAAAACTTCAGGGCATTACTCAAAGCATGTCTAGAAAAGGCAATTCCATGGATGATGGTTTAATGGAGAACTTCTTTGGTCTGCTTAAAACAGAGATGTTTTACGATCAAGAGTACAAATACCATAGCCTTCAAGAATTAACTCAAGCTATTAAAGAATATATTGAATACTATAACGAAGAAAGGATAAAGAGCAGATTAAAAGGCTTAACTCCGAAAGAATATCGGAATCAAGCCTCTATTAATCCTGTATTTTAAACTGTCTAATTTTTAGGTCTCAGTTCAAAATCCTCTTTTTCTATTCTTTTAAAGTTTCAGCTAATTCATGTAGCTTTTTAAATCGGTGATTAACACCAGATTTTGAAATTGGTCCGTCTGGAATTTGGTCCGCTACCTCTTTTAAAGTTAGTTCTGGATGAGCTAATCTAAAACGTGCTAAAATCTGTAGTTTTTCTGGTAAGCTGTCAATTCCCTTTTCTTTTTGAATCAACTGAATATCTTCAACCTGCTTGGCTGAAGCCGAAGCTGTTTTTTTCATATTAGCTGTATCGCAATTGACCAAACGATTAACTGAGTTGCGCATATCACGCATAATTCGTAAATCTTCAAAATTGAGCATAGCATTTAATGCACCCACCACATGCAAAAAATCACCAATCTTAGCTGCTTCTTTAAGATAAACGATATAGCCTCGCCGACGTTTAGTCATCTTAGCATTCAAATAAAAATACTCATTCATTAACTTAGCTAAATCTTCATTATGATCTTCATAAGTTGAATAAATTTCTAAGTGATATCTACTAGTTTCAGGATTATTAACACTGCCGCCAGCTAAAAATGCGCCTCTAAGATACGACATCGCACCTTCACTGGATTTCATAATCCTTTGAGGAATTCTGGTAACCAATCCTTTAGCTGGATCCCAAATATTTAAATTTTCTAATATCTTTTGCACATCGCGATTAAGCCGAACCAAATATTGGTTATTCTTTTTTAATTTCATCTTACGAGAAACAATTAACAATGGTTCAATTCCATATGCCACTTTAATTAATTTGAAAATTCGACGTGCAATAGCGGGATTTTCTGTAGTGATATCTAAACTAAATTGATGATCATGAAGATTTAAAACTCCATTCATCCGCAAAAAAGCAGCTAACTCCGCTTTAGCATGTTCCGGATGCACCTCAAGCGAAGTTAGCTCCTTTTTGACTTCACTAGCATAACTAGCCATTATTTTCCTTCATTCTTTTACGTGACATTGCCTCAAATGCCAAATTCATTATTTCTTTTGCTACTTTTTCTCCATCATGAAAGACCAAGCCGTGACGTTGATCAATAAAATCATCAGTAATTACTCGACACTCTTGTACTCTTAATCCATTAAAATCATTCTTAACCGGTTCAAGATAAGCATCATAATCTTCAGGATGGAACTTGCTCATATCAATTTTTGCCCCGTTGACCAAAGCTGTGTTGATATAATTTCCTCCTAAATGACGATTGATCACTTCAACGTGTTCTGCATCGCTAAAGTGATCCGTTTCTCCACGTTGAGTCATGATATTGCAAATATAAATTACTTCAGCTTCAGTTTCTCGAACTGCTTCACCTAAGTTAGAAATCATTAAATTAGGCAAAATCGAAGTGAATAAACTGCCGGGCCCTAATACTACAGCATCTGCCTGCATAATTGAAGCCAATACTGGCAAAACAGCTTTAGGCGTAGCTTTTGAATTAGTATCAGTTACCCAAACACGTTTAATTCGTTTGTCTTTAGATGTGATTTCTGTTTCTCCTGCTTCTGTTGTCGCATCCACAAATTCAGCATTTAAAGTTAAAGGTTCATTAGAAGCGGGGAATACATGGCCGTCTACTTTCATCATTTTAGATAAAGATTGAACAGCATCAAAAATATTGCCCTGCATTTCATTTAATGCGGCGATAATCAAATTACCAATGGCATGGCCCGAGAAGAATGCATCAGATGAATCAAAACGATATTGGAAAATATCTTTTTCTTCTTGTGGCAAATCACTCAAAGAAACCAACACGTTTCTAATATCACCTGGTGGAACAACGTTTATAAAATTCCGAATAGAACCAGATGAACCACCATCATCGGATACTGTAACAATGGCAGTAATTTCCGCATTTTGATCTTTCAGCGCATTCAAAATAACTGGTAAGCCAGTACCACCACCGATAACTACTACCCGCGGACGCCTACCTTTAATTACGCGCACAATTCGCGTTTCTCCATATGACATCGCGATATACCTACTTTCTAATGTAGCGACTTACCTCACGGTGAGTAATATCGACTGGATATTTTTTAGATAAGTCACGAGCAAGTTGTTGTGCAATTGATACGCTACGATGTTGACCACCAGTACAACCAATTGCAATTGTTAATTTTTCTTTTCCTTCTTTAATATAACCAGGAATGGCAGTTTCCAATAAATCCAATAATTTTTGGTAGAAAACCTGCGTCTCTTTCTTATTCATTACATAATCAAAGATACGCTTATCTAATCCTGTAAATGGGCGCAACTCTGGAATATAAAATGGATTAGGCAAAAAACGCACATCCATTACAATATCCGCATCAATTGGCATGCCATATTTAAAACCGAATGACATTACTTCAATTGAAAATGGTTGACGCTTGCGATCACTAAACGTATTAATTAACTTCTGTTTTAAATCTTTAGTTGATAAATTAGACGTATTAATGATGTAATTTGAACGATTCTTTATTGGCATCAAAATACGACGTTCTTCTTGAATGCCATCTAATAGACGTCCCTTGCCATTATTAGCTAACGGTGGAAGTCGTCTAGTTTCTTTATAACGTGCCACTAATACATCATCTGAGGCATCCAAGAATAGAATAGTTGCTTGAACGTTCCCATTATCTTCTAGTGAATTTACCTCATCTAATAAATCTGTATAAAAAGTTTTAACACGTAAATCAATTACTACTGCTACCTTGTGGAAGTCGTTTGAATTATAATCCCAAAAACTTCCCAATAATGTTGGTGGCAAGTTATCAACTACGAAGTAGCCCATATCTTCTAAATCATGAGCCACAACAGTCTTACCTGCCCCACTCATTCCTGTAACAATTAATAATTGTTTCTTATCATCAGCCATTGTTGACCCTCCTTCTGTAAATTATATCATACCGGGTGTTCTATTATAGTGCAAAAAAAGAGACCATCACGGCCTCTTTTTCATAATTATTAACGGTACATAAATGCAACGACTATTTCGTTGATACCAAATACCAACAACCAAAATGCAACTAACCATACTAAGCTTAATGCCGCAAAAAGTGGGTTAAAGATCAAGAAAATAGCAATAACTAAACTTAAGATATTCAAAACTAAGTTAAAGATAAAGTAACCTGTTGAAAAGGCACGCAAGTGCCATGAAAAGGCAATTCCGACAGCTGAGTCAACAAAGAACCAAATTGCAAATAAATATGCAATAGTTAATCCACCAATATCATATGAGCATAAGAACAAAATACCCACGATGATATCTAAGATACCTGAAATAAGTGCTACCCAACTCCGTGCAAAGAAAGCACGGAAACGTGAATAACCAGCTAGCCATACTAAACCTTGCAAAATTGACAAAATACCAAAGATTAGCACAAATACGTGCAATCCCTTAGCTGGATGTCTAAGTAGCAAAAAAGCAACAACAACCATTAATACACCAGCGATAAAGGCGCCCCAATCGAAGCCGCGATTATCTCTAGAACTTGAAAAAATGTCCATTATTCGTCCTCCTTGGTGCCTATTTTACACTTATTCAAGGACAGAAACACTTACACTCTACTTTTTATTTTTCTGCATCCCTAGTTAATTTAGTATCACGCTTTAAAACTGGCTTTAAATATTGACCAGTATAGCTCTCTTTTACTTCAGCTATTTCTTCAGGCGTTCCTGTAGCAACAACATTGCCGCCACCTTCACCGCCTTCAGGTCCTAAATCAATAATCCAATCGGCATTTTTAATCACGTCTAAATTATGTTCAATTACTAAAACGGTATTTCCTTCATCAACTAAACGCTGCAGAACTTCAAGCAAACGTTTAATGTCGTCAGTATGCAAACCTGTCGTTGGTTCATCCAAAATATAGAAATTCTTACCAGTTGACAGTTTTTGCAACTCTGCCGCTAACTTCATTCTTTGGGCTTCTCCACCAGATAAAGTTGTAGCAGATTGACCTAATTTAACATAGCCTAACCCTACATCGACAATGGTTTGCAGTTTACGTGCAATTTTAGGAATATTTTCAAAAAACTTGCATGCTTCATTAATTGTCATATCAAGCACTTGAGCAATATTCTTTTCACGATAAGTTACTTCCAAGGTTTCTGAATTATAACGGCTGCCGTGACAAACCTCACATGGAACATACACATCTGGCAAGAAGTTCATTTCGATCTTAATAATTCCGTCACCATGACATGCTTCGCACCGGCCGCCCTTAACGTTAAATGAAAAACGTGCTTTAGTATAGCCTCTCATCTTAGCTTCATTTGTTTGGGCAAAGAGCGTACGAATATCATCAAATACACTGGTATAAGTAGCTGGGTTACTGCGTGGAGTACGTCCAATAGGACTTTGATCAATATCGATTATTTTTTCAATATTCTTATACCCACGAATCGACTTATATTTGCCTGGCTTAGTTGAATTATGATTTAATTTCTGAGCCAATACTCGCTTCAAAATCATGTTAACCAGGGTTGATTTACCTGAACCTGAAACACCACTAACTACGATAAATTTTCCTAAAGGAAAATCAACGTTGATATTCTTCAAGTTGTTTTCTTGTGCACCAGTAATAGTGATCTTCTTACCATTGCCCTTACGCCGCTTCAATGGAACAGGAACAAATTTTTTACCAGACAAATATTGCCCAGTTAATGATTTAGGATTCTTTTCTACTTCTTCTGGCGTACCTTGAGCCATTACCTTACCGCCATATACACCGGCACCTGGTCCCATATCAATCAGATAATCGGCTTGACACATGGTCTCATTATCATGTTCAACCACAATCAAGGAGTTGCCTAAGTCCCGCATTCTCTTAAGTGAAGCAATTAATCGATCATTATCACGTTGATGAAGTCCAATTGAAGGTTCATCTAAAACATACATAACTCCTGACAAGTTAGAACCAATTTGAGTAGCCAAACGAATACGTTGAGCTTCCCCACCAGATAAAGTATTAGCAGAACGAGAAAGAGTTAAATAATCTAATCCTACACTATCCAAGAATGAAAGACGATCACATACTTCTTTCAAAATCGGCTTAGCAATCACAGTTTCTTGTTCGCTTAATTTGACGCTCTTAAAGAAATCCAAAGATTTACTAATTGAAAGTTCAGAAGCTTCAGCGATATCCTTACCCATCACTTTTACAGCCAGAGCTTTTTCATTCAATCGTTTACCGTGACAAGTTGAACAAGTCAGTTCTGTCATATACTTGCCCATTACATCACGCATGAATTTAGACATTGGATGCTTATAACGTCTTTCGACATTATCCATTACTCCTTCAAATGGCTGGGTTGTATCATTGACGCCAAAATCACCGGTAACATGGAATTTAACCGGCTTAGTTGAACCGTGAAGAATTGTCTCTCTTTGCTTTTTAGTCAATTTATTAAAAGGCTTATTCATTGGAATATCGAGTGCTGCACAGGCTTGCTCCAACATTTCAGTATAATAATTGGACGTCTTCCAAGGAGCTAATGCACCTTCTGCTAAAGTTTTACTCTTATCAGGCACAACCAAATCTTCATCAACTGCTAAATTCATCCCTAATCCATCACAATCAGGACAAGCACCAAATGGCGCATTAAATGAGAAGAGTCTTGGTTCCATTTCTCCTACTGTAAAGCCACACTTAGGACAAGCGTAATATTCGGAAAAGTTAAGCATCTCGTCGCCAATGACATCAACATTCATGTAGCCATCGGATAAACGAAGTGCTGATTCAATTGAGTCAAACAAACGAGATTTAATGCTGTCTTTCATGATCAAGCGATCTACCACAATATCAATGTTATGACGCTTATTTTTAGCTAAATTAAATTCTTCGCCAATTTCATGCATCTCGCCATCGACAATAACACGGACATAGCCTGCACGTTGTACTCGCTTAAAAACATCCTTGTGTTCACCACGTTTAGCTCGAATAACGGGGGCTAATAATTGAATTTTCGTTCTTTCTGGTAAAGCCATGATGCGATCTACCATTTGATCAACTGATTGTCGTTCAATTAAAGTTCCATCATTAGGACAAATAGGATGACCTACACGAGCCCACAAAAGACGCAAATAGTCATTGATTTCCGTTACCGTTCCTACAGTTGAACGCGGATTATGTGAGGTAGTTTTTTGATCAATTGAAATAGCAGGATTTAATCCATCAATTGAATCAACATCTGGCTTATCCATTTGACCCAAGAATTGTCTAGCATAACTAGAAAGTGATTGCACATAACGCCTTCTACCTTCGGCATATAAGGTATCAAAGGCTAAAGAACTCTTACCAGATCCAGATAGACCAGTAACTACTACTAATTTATTTTTAGGAATAGTTACATCGATATCTTTTAAATTATGTTCTCGTGCACCACGAATAACGATCTTATCATTTACCAT

Protein sequences of DBSCAN-SWA_6

>NC_017467|1491717:1500056|1494589_1495633_-|WP_012211623.1|DBSCAN-SWA
MSYGETRIVRVIKGRRPRVVVIGGGTGLPVILNALKDQNAEITAIVTVSDDGGSSGSIRNFINVVPPGDIRNVLVSLSDLPQEEKDIFQYRFDSSDAFFSGHAIGNLIIAALNEMQGNIFDAVQSLSKMMKVDGHVFPASNEPLTLNAEFVDATTEAGETEITSKDKRIKRVWVTDTNSKATPKAVLPVLASIMQADAVVLGPGSLFTSILPNLMISNLGEAVRETEAEVIYICNIMTQRGETDHFSDAEHVEVINRHLGGNYINTALVNGAKIDMSKFHPEDYDAYLEPVKNDFNGLRVQECRVITDDFIDQRHGLVFHDGEKVAKEIMNLAFEAMSRKRMKENNG
>NC_017467|1491717:1500056|1491717_1492302_+|WP_005718663.1|DBSCAN-SWA
MLVPTVIEQTARGERAYDIYSRLLKDRIIMLSGEINDQMANSIIAQLLFLDAQDNTKDISLYINSPGGVITSGLAIMDTMNFIKSDVSTIAIGMAASMASILLTSGTKGKRFALPNSTVLIHQPLGGAQGQQTDIQIAANEILKSRKKINEILHETTGQPLEKIQKDTERDNYLTAEEAKEYGLIDEIMVNKKK
>NC_017467|1491717:1500056|1496608_1497151_-|WP_014563932.1|DBSCAN-SWA
MDIFSSSRDNRGFDWGAFIAGVLMVVVAFLLLRHPAKGLHVFVLIFGILSILQGLVWLAGYSRFRAFFARSWVALISGILDIIVGILFLCSYDIGGLTIAYLFAIWFFVDSAVGIAFSWHLRAFSTGYFIFNLVLNILSLVIAIFLIFNPLFAALSLVWLVAFWLLVFGINEIVVAFMYR
>NC_017467|1491717:1500056|1493661_1494597_-|WP_012211624.1|DBSCAN-SWA
MASYASEVKKELTSLEVHPEHAKAELAAFLRMNGVLNLHDHQFSLDITTENPAIARRIFKLIKVAYGIEPLLIVSRKMKLKKNNQYLVRLNRDVQKILENLNIWDPAKGLVTRIPQRIMKSSEGAMSYLRGAFLAGGSVNNPETSRYHLEIYSTYEDHNEDLAKLMNEYFYLNAKMTKRRRGYIVYLKEAAKIGDFLHVVGALNAMLNFEDLRIMRDMRNSVNRLVNCDTANMKKTASASAKQVEDIQLIQKEKGIDSLPEKLQILARFRLAHPELTLKEVADQIPDGPISKSGVNHRFKKLHELAETLKE
>NC_017467|1491717:1500056|1497215_1500056_-|WP_041809609.1|DBSCAN-SWA
MVNDKIVIRGAREHNLKDIDVTIPKNKLVVVTGLSGSGKSSLAFDTLYAEGRRRYVQSLSSYARQFLGQMDKPDVDSIDGLNPAISIDQKTTSHNPRSTVGTVTEINDYLRLLWARVGHPICPNDGTLIERQSVDQMVDRIMALPERTKIQLLAPVIRAKRGEHKDVFKRVQRAGYVRVIVDGEMHEIGEEFNLAKNKRHNIDIVVDRLIMKDSIKSRLFDSIESALRLSDGYMNVDVIGDEMLNFSEYYACPKCGFTVGEMEPRLFSFNAPFGACPDCDGLGMNLAVDEDLVVPDKSKTLAEGALAPWKTSNYYTEMLEQACAALDIPMNKPFNKLTKKQRETILHGSTKPVKFHVTGDFGVNDTTQPFEGVMDNVERRYKHPMSKFMRDVMGKYMTELTCSTCHGKRLNEKALAVKVMGKDIAEASELSISKSLDFFKSVKLSEQETVIAKPILKEVCDRLSFLDSVGLDYLTLSRSANTLSGGEAQRIRLATQIGSNLSGVMYVLDEPSIGLHQRDNDRLIASLKRMRDLGNSLIVVEHDNETMCQADYLIDMGPGAGVYGGKVMAQGTPEEVEKNPKSLTGQYLSGKKFVPVPLKRRKGNGKKITITGAQENNLKNINVDFPLGKFIVVSGVSGSGKSTLVNMILKRVLAQKLNHNSTKPGKYKSIRGYKNIEKIIDIDQSPIGRTPRSNPATYTSVFDDIRTLFAQTNEAKMRGYTKARFSFNVKGGRCEACHGDGIIKIEMNFLPDVYVPCEVCHGSRYNSETLEVTYREKNIAQVLDMTINEACKFFENIPKIARKLQTIVDVGLGYVKLGQSATTLSGGEAQRMKLAAELQKLSTGKNFYILDEPTTGLHTDDIKRLLEVLQRLVDEGNTVLVIEHNLDVIKNADWIIDLGPEGGEGGGNVVATGTPEEIAEVKESYTGQYLKPVLKRDTKLTRDAEK
>NC_017467|1491717:1500056|1495643_1496519_-|WP_014563931.1|DBSCAN-SWA
MADDKKQLLIVTGMSGAGKTVVAHDLEDMGYFVVDNLPPTLLGSFWDYNSNDFHKVAVVIDLRVKTFYTDLLDEVNSLEDNGNVQATILFLDASDDVLVARYKETRRLPPLANNGKGRLLDGIQEERRILMPIKNRSNYIINTSNLSTKDLKQKLINTFSDRKRQPFSIEVMSFGFKYGMPIDADIVMDVRFLPNPFYIPELRPFTGLDKRIFDYVMNKKETQVFYQKLLDLLETAIPGYIKEGKEKLTIAIGCTGGQHRSVSIAQQLARDLSKKYPVDITHREVSRYIRK
>NC_017467|1491717:1500056|1492385_1493621_+|WP_014563930.1|transposase|DBSCAN-SWA
MSKFNKEQKIEIYRKWKDEKISISQLSKTYKMNLANLDYMLRLIDMHGTNILNTRKRVYSKKFKEQTIEQAIFGTKSDVQLSLELDFKSIGRLNNWLREYKENGYNVIIKQKGRPARGQRESKIAQGTGERDPKAERRKLAIAYCERIRKKTAGLGSGKRSEEIAKLIAKIKEIFNHHQGRYGYRRAALQLIKEGWDITEKTVRYWMHKLGLKGIRRNKRKYSSYKGTIGKIAPNLIHRDFFAPMPNMKWHTDITEFHLNGEKLYLSPILDGCGGDIVSYSISRHPDMDLVMTMLDKAFVKETALNNCTFHTDQGCQYQSPQYQRALKLQGITQSMSRKGNSMDDGLMENFFGLLKTEMFYDQEYKYHSLQELTQAIKEYIEYYNEERIKSRLKGLTPKEYRNQASINPVF

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_005718663.1|1491717_1492302_+	ATP-dependent Clp endopeptidase proteolytic subunit ClpP	A0A223W000	Agrobacterium_phage	1.1e-52	54.4
WP_014563930.1|1492385_1493621_+|transposase	IS3 family transposase	A0A1B1P773	Bacillus_phage	5.8e-56	47.7
WP_012211624.1|1493661_1494597_-	DNA-binding protein WhiA	Q7AWZ3	Streptococcus_phage	1.4e-46	35.2
WP_012211623.1|1494589_1495633_-	YvcK family protein	A1IMD5	Streptococcus_phage	2.4e-87	50.2
WP_014563931.1|1495643_1496519_-	RNase adapter RapZ	A0A0R8VB27	Thermobifida_phage	3.2e-08	30.0
WP_014563932.1|1496608_1497151_-	DUF308 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_041809609.1|1497215_1500056_-	excinuclease ABC subunit UvrA	A0A1B1IVR3	uncultured_Mediterranean_phage	6.5e-305	56.0

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NC_017467|1588900:1649928|DBSCAN-SWA
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MKNKSIGAELKRLRKSLGLMQAEMTLDGKIISVGQYSKVENGIHEIGVDTLLELLTVHDGINIKDFFLDLEKDYSKTMKKANKDYASEILSEKLMFAFYRNDLSEAKKLKKKINGLKENNELKLRATITVAILSGTILDLDEKTKEDISKNMFINDNWTRERDSLRLFSNSMIIIDRNILPTLIK
>NC_017467|1588900:1649928|1609617_1610535_-|WP_014564023.1|DBSCAN-SWA
MNVNEQLTDLERIELTKKSYDELQLGESIDIGSHHIGTVCRNVHAEDGMRAFVISNPQEVTILFKGSYGIKRGNPQTWRDEWFKTNLPILRAMLSHESRVPSQLKSASKLLNETIDQFKGTQIYIYGHSLGAINAQFALANCHHPEAIGAAYLYEGTNIWLLFTQKERRRVALMREKIFNYVDIYDPVTLGITETHHMVGKLCYVDSEPMKPIKQHMWGGYSFNPDGSVKLRKIDQAFLAEARSEHKLLTRSGDMTEFIEKISSNDEIKKMAAEKIDRMVEHYPDHSSLAKMATLFKSELLKDRD
>NC_017467|1588900:1649928|1602289_1602982_-|WP_014564015.1|DBSCAN-SWA
MDKTEQDRLKKEAAEKAASMVKSGMILGVGTGSTVAFFIDALGKRKDNDGLKLKAIVTTSNRSKNQLEGLGFKVSELADVDQVDLTVDGSDRVADNLDGIKGGGGALTLEKNVAINSKKIIWIVDESKLVHRLGGFPLPVEVLPISCEQNFKRFKQEGLKPQWRMDSDKRYITHYGNYIIDLAADPVPAPHGLADYLDHTVGVVEHGLFLDMCDEVIIAHSDGTIEDKIK
>NC_017467|1588900:1649928|1647577_1648909_-|WP_014564050.1|transposase|DBSCAN-SWA
MDYSTRTALGIKDSHLELDTAHFKNVIESHDNQVVVHLIQSYPLRCPRCGQLMLKNGFKIVNVLGPSLHYQPTIWSIRNQKYLCKPSSACPSTITELAKVKDIKYRHHISQAIKQQVMIQLTTNESQIDIAKELGISDWTVRRVIFNLDQFFKPNYHWLPRHIAFDDFKSGRFAPSGMSMILMNIENHRTIDIILSRRNRYLRNYFLRYDRAARLAVRTVTVDLYTPYRHLIHELFPHAIIIADHFHVVAQAYRALNKIRVKAMNQAGNGSHQWRALKHFWKLILTPAGLLKYDNYWSRRNFGYTQLTDVEVIQRLLAFNDDLKQAYRYYQDLILAINHRSKDELNHLLAIKWTQLPQSLQKVQRTLRRHRKEIITSFKYGDYTNGPVEGTNNKIKVIKRAAYGFRNFFNFRARILLALPNSYFAINWKNKRTAHVQSQTRAV
>NC_017467|1588900:1649928|1608684_1609479_+|WP_014564022.1|DBSCAN-SWA
MTAAKGITSKSSLDRWEKGNDNLSFSKVIDLLYRIHIQPDEFLGSNTPSQLANLYKQSMIAYYYSDISALKKLAQRYLELYKDSPEEKVYILQASVASNFYEDLTIENIFPSYLQIKLNQYFSNLETWTYENILYFSCTQLLIKPQLLFRLSKSLINFSIENHINRQNWHSLLLEAILNAIFALLKMKQLDKAKELVDVFYTMKFNENFIVEQIRINFMTSLIQYTSTKDKSEIQSQLLSIKNLGLDHLYNDLKFAANQIFSLY
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MQAFKILVPHFKHYKKDIFAALVAIIVSAFATLYQPKLLENIQRAIMLDQKDIVVRDGVILVVLGIVAIISGIFNLYYAARVAQGVTSDLREETYAKIQSFSFGNIEKFSAGSLTTRLINDMNQIMNMLMQLFMQLLRMPILIVGSFIFCIVIIPRFWWATVVMVILIIGFGIYVLKQMNSLFDKFQKTMDKISGRAQETLQGVRVVKSFNQGPQEIKEFNQTSDRLNNYNIVIGYWFSTIMPAFQLIAYLVITLVVYLIGQGIVAHPTDVAVVSPFVNYILTLLWTIMIAGMTMMQFARGNISLGRIREILDTEPDVKFNENAPTDVLGGSVEFDHVSFTYPDGDDETLKDISFKIKPGQMVGIVGATGSGKSTLAQLIARLYDPTKGEIKIGGHNLKDVNETALRKTVAFVLQRAILFSGTIASNLRQGNSRAKLHELQRAANMAQASEFIERYNDSFDHEVEERSSNFSGGQKQRLSIARGLVAKTPILILDDSTSALDAESEKKVQQALEHELPDTTTFIIAQKIVSVVHADIILVLDDGKLVAQGTHEELLKTSPVYQEIFKTQKGKRGGK
>NC_017467|1588900:1649928|1610610_1611264_-|WP_014564024.1|DBSCAN-SWA
METFIRAYSWVDIRFLLQGLWVTIYVSLISIALSFVVGLILGLIRYMKIKYVSAIVGFIIDIIRNLPLLLIIFFTYFGLPQLGIVTNPTTASIAALVIFEAAMLAEIVRSGIGSVDPGQMEGARSNGMSYGQAMYHVVMPQALHNMIPALLSQFVSLVKDTSLATIIVLPELLYHAQIIYSQNTTYLIPMYVIIAIMYFVVCFCLSTIANYLQKKYN

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_014564003.1|1588900_1589266_+|bacteriocin	bacteriocin immunity protein	NA	NA	NA	NA
WP_014564004.1|1589352_1589676_-	metal-sulfur cluster assembly factor	NA	NA	NA	NA
WP_014564005.1|1589675_1591079_-	Fe-S cluster assembly protein SufB	NA	NA	NA	NA
WP_014564006.1|1591071_1591533_-	SUF system NifU family Fe-S cluster assembly protein	NA	NA	NA	NA
WP_012211560.1|1591519_1592758_-	SufS family cysteine desulfurase	Q2XUY6	environmental_halophage	4.7e-98	41.8
WP_014564007.1|1592732_1594010_-	Fe-S cluster assembly protein SufD	NA	NA	NA	NA
WP_014564008.1|1594021_1594816_-	Fe-S cluster assembly ATPase SufC	A0A285PWH2	Cedratvirus	4.3e-12	28.5
WP_080553172.1|1594885_1595719_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_014564010.1|1595928_1596747_+	HAD family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_023061241.1|1597812_1598370_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_014564013.1|1598444_1599170_-	GntR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_012211554.1|1599169_1600096_-	nucleoside hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_014564014.1|1600213_1602229_-	KUP/HAK/KT family potassium transporter	M1IAJ4	Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus	1.0e-65	36.2
WP_014564015.1|1602289_1602982_-	ribose-5-phosphate isomerase RpiA	NA	NA	NA	NA
WP_023061243.1|1602981_1603908_-	ribokinase	A0A2H4N7X4	Lake_Baikal_phage	6.3e-07	37.5
WP_023061244.1|1603991_1604795_-	DUF4931 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_014564018.1|1604948_1606250_+	extracellular solute-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_014564020.1|1606625_1607609_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_148224899.1|1607623_1608505_-	SLAP domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_014564022.1|1608684_1609479_+	putative transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_014564023.1|1609617_1610535_-	DUF2974 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_014564024.1|1610610_1611264_-	amino acid ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_014564025.1|1611278_1611920_-	amino acid ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_014564026.1|1611919_1612738_-	transporter substrate-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_014564027.1|1612748_1613489_-	amino acid ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	3.6e-37	40.9
WP_041809649.1|1615670_1616135_+|transposase	IS200/IS605 family transposase	A0A0P0IQC6	Lactobacillus_phage	7.0e-31	47.4
WP_014564030.1|1618392_1618971_-	ECF transporter S component	NA	NA	NA	NA
WP_014564031.1|1619138_1620908_-	ABC transporter ATP-binding protein	W8CYL7	Bacillus_phage	2.4e-55	28.5
WP_014564032.1|1620907_1622638_-	ABC transporter ATP-binding protein	W8CYL7	Bacillus_phage	5.8e-30	26.1
WP_014564033.1|1622616_1623078_-	MarR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_014564034.1|1623219_1624038_+	transporter substrate-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_012211534.1|1624080_1624749_-	type 1 glutamine amidotransferase	NA	NA	NA	NA
WP_023060903.1|1624761_1625553_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_014564036.1|1625708_1627331_-	ATP-binding cassette domain-containing protein	A0A1V0SKJ1	Klosneuvirus	8.4e-55	27.8
WP_003633113.1|1627434_1628517_-	M42 family peptidase	NA	NA	NA	NA
WP_041809652.1|1629859_1631329_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_023060907.1|1631619_1632150_+	bifunctional pyr operon transcriptional regulator/uracil phosphoribosyltransferase PyrR	NA	NA	NA	NA
WP_023060908.1|1632162_1633491_+	NCS family uracil:cation symporter	Q9KX94	Enterobacteria_phage	3.4e-62	35.9
WP_014564041.1|1633545_1634382_-	aldo/keto reductase	A0A2H4PQR8	Staphylococcus_phage	5.1e-48	36.4
WP_041809976.1|1636375_1637191_+	PTS system mannose/fructose/sorbose family transporter subunit IID	NA	NA	NA	NA
WP_014564044.1|1637230_1637707_-	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_013854589.1|1640171_1640684_+	TetR/AcrR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_013854590.1|1640691_1642158_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_003633097.1|1642653_1643154_-	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_014564047.1|1643758_1644136_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_014563294.1|1645364_1646543_+|transposase	IS256 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_148224876.1|1646603_1646948_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_014564049.1|1647282_1647483_+	cold-shock protein	Q9AZD3	Lactococcus_phage	6.3e-21	71.4
WP_014564050.1|1647577_1648909_-|transposase	ISL3 family transposase	A0A1S5SBP9	Streptococcus_phage	9.3e-52	31.9
WP_023060767.1|1649004_1649928_-|transposase	IS30 family transposase	H7BVY4	unidentified_phage	3.9e-33	31.9

Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>NC_017467|1709585:1838552|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_014564097.1|1716644_1718456_-	glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)	Q76DQ7	Chlorella_virus	1.6e-91	37.4
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WP_023061031.1|1721587_1722961_+	amino acid permease	NA	NA	NA	NA
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WP_012211481.1|1724548_1724917_-	DUF956 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_014564102.1|1724920_1725841_-	PTS mannose/fructose/sorbose transporter family subunit IID	NA	NA	NA	NA
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WP_014564106.1|1730953_1732207_-	glycoside hydrolase family 32 protein	F8WPR5	Bacillus_phage	9.1e-09	26.1
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WP_023061875.1|1807144_1807495_-	SDR family oxidoreductase	Q06VL0	Trichoplusia_ni_ascovirus	1.6e-24	52.6
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WP_003680323.1|1808065_1808317_-	GlsB/YeaQ/YmgE family stress response membrane protein	NA	NA	NA	NA
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WP_014564164.1|1808901_1809087_-	DUF2273 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_014564165.1|1809098_1809659_-	alkaline shock response membrane anchor protein AmaP	NA	NA	NA	NA
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WP_041809716.1|1810538_1811816_-|transposase	ISL3 family transposase	Q6V7R1	Burkholderia_virus	4.0e-12	23.7
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WP_014564181.1|1829849_1830725_-	UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU	A0A127AW70	Bacillus_phage	1.6e-76	50.0
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WP_014564184.1|1834999_1836178_+|transposase	IS256 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_014564187.1|1837502_1838552_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	2.9e-48	35.7

Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

>NC_017467|1861356:2044042|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_10

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10

>NC_017467|2069366:2129551|DBSCAN-SWA
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MNKKILSGSLWLSFGSIVSRILGVVYLIPWLIMLGSYHNQLNAQALFNSSYTPYALFLSVGTAGLPSVIAREVSQLNSQNRYKDSLYITKLGLIIMLVMGLACGILLYATAPIIAKNSPVDSVASATISIRVLVPAVIILPSMSMVRGWFQGNNDMKPYGISQLWEQFARILFILLATLLVIEVFHHNYVIAVYFSVFGACVGAIASYLYLFAYLRKQWGHYKQLLESSEERALNNVTRSLLNLWYASIPFVLLGSFITVTQLVDQLLFKQVLINFNHLTSSYISYIYTIFSANPSKITTVIISLATAVSETSLPLLAGLKFKNKNRQESIKKLLLENYRLLLFVLLPIVALGVFAASPIYTVLFSHDSLGAYYLVENIVQSLLAGLVMNSLTLLLALNMNKLAVIYMVWGIVFKVILQVPMTMFMNADGAILSTDISFLIVIWLSYHKLNKTYSIRLTSLLPIVVTNEIYVVILFIYQLLIGNHFNHLGRVGSLIYLAIFGLVFLGLYILIANLMGISQDIFGKKIGYRYYRYKHYE
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MLGISVYFRDYDEQYLKEAAKAGAKYVFTSLQIPEEDYSNLDQKLPEFFKLCNDLKLEVIPDVSPVTLERLDIPKNDFKALKEKGFKALRLDYGLDDFKLVKRLQEDFNILLNASVVTPKYIETAKEANVDLNKLALTYNFYPHTDTGMGWDDFKRRNWLFKDLDLRTQAFVPGDEIKRFPLYEGLPTVEKNRGELPYVAAVELIQEANIDDIFIGDSRASIKQLRYIHDFQQNGVMNIECHLLKKYQTLYDQKFEIRKDIPKKIVRLTCPRTPGIAIEHALNRRKGSIVMQNKLAQRYSGEIDIVKQDLPFEARSNVIGWVTPEYVNLLNYIDDQTKIIFRKID

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_014564350.1|2072673_2073999_-	PTS sugar transporter subunit IIC	NA	NA	NA	NA
WP_041809795.1|2074087_2074789_+	ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	7.3e-32	34.7
WP_041809797.1|2077346_2077583_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_014564353.1|2077621_2079238_-	polysaccharide biosynthesis protein	NA	NA	NA	NA
WP_014564354.1|2079511_2080474_+	SLAP domain-containing protein	Q6SE63	Lactobacillus_prophage	6.9e-65	54.7
WP_014564355.1|2080539_2081214_-	DUF975 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_014564356.1|2081720_2081879_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_014564359.1|2082342_2082732_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_014564360.1|2082746_2083454_-|protease	CPBP family intramembrane metalloprotease	NA	NA	NA	NA
WP_041809802.1|2083502_2083703_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_014564361.1|2083914_2084859_-	serine hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_014564362.1|2084858_2086145_-	D-alanyl-lipoteichoic acid biosynthesis protein DltD	NA	NA	NA	NA
WP_003625019.1|2086137_2086377_-	D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit DltC	NA	NA	NA	NA
WP_014564363.1|2086435_2087674_-	D-alanyl-lipoteichoic acid biosynthesis protein DltB	A0A125RNP0	Pseudomonas_phage	9.0e-25	27.4
WP_014564364.1|2087673_2089188_-	D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit DltA	A0A2K9KZV5	Tupanvirus	1.5e-34	28.6
WP_003630630.1|2089203_2089356_-	teichoic acid D-Ala incorporation-associated protein DltX	NA	NA	NA	NA
WP_041809804.1|2089558_2089855_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_014564366.1|2089874_2091011_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_193363587.1|2091842_2093072_-|transposase	transposase	Q5ULQ4	Lactobacillus_virus	1.2e-117	56.4
WP_014564370.1|2093487_2095344_+	cadmium-translocating P-type ATPase	E4ZFI9	Streptococcus_phage	1.2e-68	30.6
WP_023060744.1|2095497_2096667_+	cation:proton antiporter	NA	NA	NA	NA
WP_003625002.1|2096795_2097104_+	type II toxin-antitoxin system Phd/YefM family antitoxin	NA	NA	NA	NA
WP_014564372.1|2097090_2097360_+	Txe/YoeB family addiction module toxin	NA	NA	NA	NA
WP_023060745.1|2097397_2098966_-	ABC transporter ATP-binding protein	A0A2R8FG22	Brazilian_cedratvirus	4.5e-13	32.0
WP_014564374.1|2098970_2099600_-	DUF4097 family beta strand repeat protein	NA	NA	NA	NA
WP_023060747.1|2099691_2100549_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_014919635.1|2100545_2100827_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_101871943.1|2100980_2101076_+|holin	putative holin-like toxin	NA	NA	NA	NA
WP_193363588.1|2101180_2102446_-|transposase	transposase	Q5ULQ4	Lactobacillus_virus	1.7e-124	58.5
WP_148224885.1|2103217_2103373_+	type I toxin-antitoxin system Fst family toxin	NA	NA	NA	NA
WP_014564379.1|2103567_2104224_-|protease	CPBP family intramembrane metalloprotease	NA	NA	NA	NA
WP_014919640.1|2104313_2105417_+	YdcF family protein	NA	NA	NA	NA
WP_014564381.1|2105441_2107778_+	ABC transporter ATP-binding protein/permease	G9BWD6	Planktothrix_phage	7.1e-31	39.8
WP_041809810.1|2107812_2108418_-	ECF transporter S component	NA	NA	NA	NA
WP_014564383.1|2108524_2109352_-	aldo/keto reductase	A0A2H4PQR8	Staphylococcus_phage	2.8e-22	28.8
WP_014564384.1|2109469_2110189_+	glucosamine-6-phosphate deaminase	NA	NA	NA	NA
WP_014564385.1|2110335_2111187_-	MurR/RpiR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_014564386.1|2111200_2112238_-	DUF871 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_049773758.1|2112306_2114289_-	penicillin binding protein PBP4B	NA	NA	NA	NA
WP_041809812.1|2114342_2115233_-	N-acetylmuramic acid 6-phosphate etherase	NA	NA	NA	NA
WP_172981370.1|2115254_2117237_-	PTS glucose transporter subunit IIA	NA	NA	NA	NA
WP_014564390.1|2117664_2118312_+	deoxynucleoside kinase	Q5ULP7	Lactobacillus_virus	1.4e-48	48.4
WP_041809814.1|2118336_2119023_+	deoxynucleoside kinase	Q5ULP7	Lactobacillus_virus	5.4e-56	50.0
WP_041809816.1|2120552_2121353_-	Cof-type HAD-IIB family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_014564394.1|2121589_2122897_+	NCS2 family permease	A0A0R6PHV4	Moraxella_phage	6.3e-37	29.2
WP_193363589.1|2124156_2125386_-|transposase	transposase	Q5ULQ4	Lactobacillus_virus	1.3e-124	58.5
WP_041809821.1|2126594_2127905_+	NCS2 family permease	A0A0R6PHV4	Moraxella_phage	9.1e-44	31.2
WP_014564397.1|2128144_2129551_+|transposase	ISLre2 family transposase	NA	NA	NA	NA