Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_004567 | Lactobacillus plantarum WCFS1, complete genome | 1 crisprs | csa3,DinG,cas3,DEDDh | 0 | 0 | 6 | 0 |
NC_006375 | Lactobacillus plantarum WCFS1, complete genome | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NC_006377 | Lactobacillus plantarum WCFS1, complete genome | 0 crisprs | csa3 | 0 | 0 | 0 | 0 |
NC_006376 | Lactobacillus plantarum WCFS1, complete genome | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_004567_1 | 2763066-2763151 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_004567_1
|
1 spacers
spacers of NC_004567_1
>1.1|2763089|40|NC_004567|CRISPRCasFinder CGCATAACTGGTATAATACGCTATATAAAGAAAAAGTCAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_004567_1
The CRISPR arrays of NC_004567_1 >merge|NC_004567|1|2763066-2763151|CRISPRCasFinder TAAGAAACTTAAAGTGTCTTATTCGCATAACTGGTATAATACGCTATATAAAGAAAAAGTCAATAAGAAACTTAAAGTATCTTATT >NC_004567|1|1|2763066-2763151|CRISPRCasFinder TAAGAAACTTAAAGTGTCTTATT CGCATAACTGGTATAATACGCTATATAAAGAAAAAGTCAA TAAGAAACTTAAAGTATCTTATT
>NC_004567.2|WP_011102041.1|2761572_2763051_-|DHA2-family-efflux-MFS-transporter-permease-subunit MQAKAKISKATMTIAWVVVFGAMAPLLDSTMINIAINNLVTSFHSSVTTVQWAVTGYLLATGVAVPFSSWLLNRFDGKAVFVAGEILFGLGSIFAAVAPNIQLLIIARLVQGFAGGLIMPLLTTLLVQTAGAAVMGQMMATVGLPMILGPLIGPVIGGIIIKFASWHWIFWINVPVVLISIALILWKMPNYPAQNRTAKMDFIGILLLIVSSSAIIYSLVNAAHTDRFNNATSIEMLILGAIALISYVVWAAWQKERAVVPLHLFKFASFDGAGLGLFIAGTVLNGAMLLLPLYFQNVRGMSVINAALALLPQGAGMLVSRTLTGRLTDQIGAKYVVLGSVVITFVGTLPFYWFGQQTSYWILALILFVRGIGAGGILMPLMADAYTGMQPGQVPAATIGTRIIQNIGSAFGSALITAIVTAYSTHQVNVFERHLKAETYHVDAAHLQVFTTSHLQAIRLAAFQQGFLVIAIAAIVIILPTLLLTNKLKAAK >NC_004567.2|WP_003642346.1|2760502_2761456_-|aldo/keto-reductase MKTIQIGASQLKASAVALGIMRMVRLDTDAAANVLETVHDRGVNFIDSADIYGNGDSERIFGQALKQSSLKREDFFIQSKGGIVLDPEKSSGELVFGQRYDFSKQHLIATVDKILQRMQLDYLDSFLLHRPDPLMDPAEVAAAFDELQATGKVRHFGVSNFNPMQVEMLQAAVSQKLMINQLQFGVMHTGPIQFGLHTNMQDTASLNHDGEIIEYSRLHHMTIQAWSPYQYGMFAGTFIDNPKFPELNAKLQELADQYHVTKNAIATAWILRHPANMQVILGSMNPQHLDESIAGTDVTLTRQEWYDVYFAAGNDLP >NC_004567.2|WP_003642345.1|2759716_2760283_-|DUF1211-domain-containing-protein MNKARLEAFTDAIIAIVLTLLVLDLPRPQTPSVRALFAEWQSIYVYIITFTLLISIWLNHHDLFVQVKKIDRVVFWANSFWLLCQSFIPFMASWITKFPHSKWPAVFYILTGFVWMLAYQLLVAAVRRLNPHIHRMSSPALSVVFGGFLVVLTVALINPDVGLFLIPVHAFASVILATKRKWHLRKYF >NC_004567.2|WP_003642344.1|2758530_2759568_+|aldehyde-reductase MQKQLVVVTGGSGFIAIHIIRQLLQQGYAVRTTVRSLAKAPVIKEMLTNGGITDLSALEIVVADLAHDEHWSEAMAGATYAIDVASPTPKLNFKNKAEMIRPAVDGVRRVLTASRDAGVKRVVLTSAYGAIFAGHKNRTTPYTEADWSDLNWKAIHPYQESKTRAELAAWDFINHEGRGLELTTVNPVAVMGPVLSAKYSHSNIQIQQFLEGQVKAVPNVDSGYVDVRDVASLHLLAMTAPQANGERFLATTGETLSMLDVANVLRQAFPAFASQLPTKTIPNAAVKLAAKARPELRMVASLVGTYAETSNHKAQTLLDWHPRPAAESIIATAQSMIDLGIVTKP >NC_004567.2|WP_011102040.1|2757837_2758404_-|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MAATNHAQAIKKDSQTYLTTALLQLLRTHDLDTITVTQVVKRAGVSRMAFYRNFTTLEDLLTAYFAPAIAARFQDVLQHVPANRKLLAMGQFFSDFAPTLRLAEQRGFENIIQQLFNANMTNYYQATMTNGMLTAVQLKYWTRFMSAGVYAIWREWLLGGQLESLTTIHEILATLQTATMQALTQAQK >NC_004567.2|WP_003642342.1|2756950_2757679_+|SDR-family-oxidoreductase MKPLVVITGASSGFGAEIAKLFAADNYPLLLLGRRQAKLAALSANFENAMIDTVDVTNYHQFETAVRKAEAKYGKTDLLVNNAGLMLLGNVQNQDPQEWQTMLNTNVMGVLNGTQIVLNDMRDREHGTILNMSSLAGKKTFVNHAAYVASKFGVHGLSETLREENAPKNVRVMLVAPGAAETELLTHVTSKSALSDYEAWKASMGGLTLDPKHVAATVKFMYDMPQNVNIREVDIAATAQDA >NC_004567.2|WP_011102039.1|2756452_2756818_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MLKERVTAQPRYRNEFDATMQLIRGKWKIMILFELAEVKVSRFADLQHHIQAVSHKTLASQLKELEQDELIERHDFKTAQPHVEYRLTAKGQSLIPILDAICTWGDQHVDPALIERSLCDE >NC_004567.2|WP_003642340.1|2755884_2756169_+|DUF1905-domain-containing-protein MKTYQFDAPIQAATIGKGGAYVACPFDIRDLFGKGRVKVHATFDEVPYNGSIVNMGVKNLDGSICYILGIRKDIRAKLHKSIGDVVAVTVTAID >NC_004567.2|WP_011102038.1|2753016_2755599_-|SH3-domain-containing-protein MNFKSQNPIDASQSERFKLYKSGKLWLVAGLTFFSFLGGSVLNDTNVHADATNATTTSSSAASTASSASVATSSAASDETTKATSVSSSAATQVTSAATTKTTSQAATASSSAATSQSTSTASSSTSQATKTASSAATSTSATATSQATSVASSTATTTQVSHTASSTAASAASSTATVKAVKAASSTVSSAATTATKATAKVAAVAYTAATTSSTDVWTIGDTTRPRVDVVDVASYQSTMTQSDFNKLKAAGVKTVIVKSTEGTDYTNPAALNQAKMANKAGLNVDFYHYATFSTADAAKSEATNMAGFLVKNNVSTKVLLFADMEDSSSYSVNATANLNAFWSTLDSFGYKNHGVYTSNSYLYRDAVVKTVGQSRVWRAQYPYTPSANNLWNTNDGAWQFSDTALLPSGSDYTGYIDVSIDYNGLTEDSAGTNTFVTTTSSNDTTTSEVTTDTSATTNTSTSSTTKKASGWYTFTKNTAIKSAASDSAKTVGTYSKGNRVYYNAEITTNGETWLRYLSYSGSEHFVKIAAAKTTTTKPAASTSKTVTKNETGTYKFTKTTAIKGSVSDSAKTLGTYYKGDTVYYNAKVTKNGETWLRYLSYSGAQHYVKISGAATSTTTTKPATSSSKTVTKAETGTYKFTGTTAIKGSVNDSAKTLGTYYKGDTVYYNAKVTKNGQTWLRYLSYSGAQHYVKISGAATTTTTSSKSTATASAKTVAQSGTYKFAKTTAIKSSASDAASTVGTYYKGNTVNYNAKVTTNGQTWLRYTSYSGAQHYVKVSGGAATTTSSSASKTTAAAGTYTFKTTTNIRTAASLNASVVGQYSAGESVYYIGTVSADGYQWLKYLSNSGAYHYVAKIG >NC_004567.2|WP_003642338.1|2751333_2752746_+|NAD-dependent-succinate-semialdehyde-dehydrogenase MAYQTINPYTNEVVKTYDNATTDQIEQALTTGDALYHQWRHEPVSSRAASLHKIAALLREHKDELAKIATIDMGKLLSESQGEVELCAMIADYYADHGAELLAPTPISTQATGDAEIEKQATGVLMLVEPWNFPYYQIMRVFAPNYMVGNPMILKHASNTPGSAAAFAKIVEEAGAPAGSLTNLFLNYDQVSDIIADPRIQGVALTGSKRGGQAVAKAAGANLKKSSMELGGSDAFVVLADADIDEAVNLAWRVRLYNAGQVCTSSKRFIVAADVYDDFLAKLKERFAKLVPGDPMDPQTTLAPMNSKRAKEKLQDQVDRAIAGGATVAYGNEPIDLPGQFFQPTILTDIDQDNPLFYEEMFGPVAQVFKVDSEQAAIDLANNSELGLGGIVFAGTAAHGKAVAQQIETGMVFVNTFLSSLPELPFGGVKGSGYGRELSSLGLMAFVNEKLVVTAQKPDYDNGAGGLVVL >NC_004567.2|WP_003643398.1|2763168_2763768_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MTKTRRRGAELENAIYQAARDILNQDGLEQLTFANVAEQAGTSKPVIYRRWRSPLELAIAAIQDQIITENHGQLDEVSLTGQTLSEDLFQVLKRFTVSINTFNQALVITWFHHLDQQANPEVKDLLNAVKKIDAHAIERVCQRAQQRGELRTGTLSCDLQLMPFDWLRYRAFANEPITDATLHLLVDDLLVPAYQHALG >NC_004567.2|WP_044432936.1|2763888_2764770_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein MGSLLLGACGAKQPTSTTVTRTDYLKHKVKVPKHPKRIVASYLEDDLVALGIKPVVQWSVKNGSGTQAYLKEQLKGVPLIDYSLPYEAVTKAKPDLILIGTSSAVANGKYAQYNKIAPTYVVKNGTTVTWRQTFLDVAKVVNRQAKAKKVLAKYDKQVQTTRQALKKSGQHKVAVLWVTNNTAYMVNDNSASGALLYQDLQLGEPSLVKQVSKSATADWSAVSLEKLAKLDADDIFLVNSQKSASLFKDPLWKNIKAVKNNHLYQYGDSSSWQYSGPIAYSQMIDMVKTDLLK >NC_004567.2|WP_003642350.1|2765054_2765849_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MNTIEAQNISIGYGDKVIVDQLSITIPHGQITTLIGPNGSGKSTLIRAIAHLLPPTTGVILLDHQNIQQIKSKTFAKKIAVLPQTNQTANDLTVEELVSFGRLPYRRPLSGLTTTDHQKIEWALTQASLQDLRQRPLSTLSGGQRQRAWIAMAVAQDTDTIILDEPTTYLDLTHQLEVMQLVKKLNEQAHRTIIMALHDLNHAARISDQLIALKDGHVLAHGPVSTVMTAANLKTIFNIDATLVDYHGTPLILTYNGCQEVAPA >NC_004567.2|WP_003643400.1|2765845_2766844_+|iron-ABC-transporter-permease MKSTSRYWGWLALSTGVLILVMGLSLRFGADQMRTATVWHALTTTHTGNLDQQIIRHIRVPRVLGAALIGAALAGSGALMQAVTRNPLADSGLLGINAGAGLMLTLCLAFFPKLSTLQTTGWAIIGAAASAGLIFSISTARHVQLDPTILVLAGIAISSLLTALSEGLALVLQLKQDLAFWYFGGLGAVSWTQLKFLGPGLVLGLLLTLLLAPQLNLAYLTDDNAQSLGKSLPLLRGLALICAVILSGISVALVGTITFVGLMIPHMARWLVGANYRNSMPLTLILGATLTVGADLIARLVNPPHETPFGIIISLIGVPCFIYLARKEPMKA >NC_004567.2|WP_011102043.1|2766840_2767836_+|iron-ABC-transporter-permease MSPNRRLIIWSLLLTASMLGLAILNLSTGTMTISWPALLGILTSRGNATDMLVLVNFRLPRIVLAIMVGWALALSGNVLQTVTNNPMADPSLLGINNGAGLAVMLLIIGAGTNASLTLSLPIVALAGAWLSTALIFLLANQRQRGISSKRLLLVGVALSGCFSALMVLMTLKLSPDNYQFVMNWLAGSLWGTDWSYIGWALPWLAVGSGILFIQLPVLDAFTLGTTTAQTLGINLKRQQLGLISVAAMLAGVSVAISGGISFIGLITPNLARRIVGSRQRYQLPLAGLLGSTLLLAADTLGKLITTTTELPAGVLVALIGAPYFIYLLVRG >NC_004567.2|WP_003643401.1|2768079_2768592_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MANQRNQRMQATILLAYENLLSDKPFRKITVQDISDAALVHRSTFYKHFQDQYDLLEALFEQKRQQSKLTIDQIFTHPFETLNSFGNARFQETLRHQFNDDAFRDAFLNYLIHLCKDTVDDDQRLVRFLAVGRIKGLTLWITVGNAPYNIFTDTATLDNIFSNPLNTVNY >NC_004567.2|WP_011102044.1|2768572_2769466_-|SDR-family-oxidoreductase MKVFITGGTGFVGSAVVQELVANGFEVVGLARSETSAQKLISWGAQPVRGSLTSLSTLATAAAQADAIIHLGFNNDFRHFFQAGAMDRRAIETMGRAISGTNKPLVVTYGTTGIRKHVETEHEVADTGLLKWLTPRKSEIVARQLMAQNINAFVVRLSPAVHGAGDMGFTRTVIERAKKSHRAEYFGLGTHAWSAVHRLDAAHLFYLVTMYGLEHPTTNERVFNAVAEESITIAAIARTISRKLNVPLKAKYNPLSFGDTAMLYLINCPTSSQLTRQILGWVPVQPDLLTDISSSRY >NC_004567.2|WP_003642355.1|2769759_2770506_-|SDR-family-oxidoreductase MSIKGKVVVITGASSGIGAATAKLLAAKGAKVVLGARREERLQALSQAIGDNAVYQVTDVTDRQQVRALIDLAVSKFGRVDVLYNNAGTMPQGNLSDREYDKWQMMLNVNIMGVLNGIGEVLPIMQKQHDGLIIATDSVAGHVVYPASAVYNGTKYAVRAIMEGLRQEEKEHGIRSTIVSPGAVRTELVNTIGNTQIQAGISELMNADDRQGLALNPEDIANAVLFAIDQPKHVAISEVLVRPAQQEV >NC_004567.2|WP_022638457.1|2770522_2770978_-|hypothetical-protein MNVTREPSEIRERLAEITGQTIDISVEIRVPLWTDYGRNLKIGKRVFINDNVQITDLGGIKLADDVLIGPGAMLLSVNHPLDPAKRHAVEVQPIHIERNAWIGAGAKVLAGVTVGENAVVGAGAVVTKSVPANTVVAGVPAKVIKTIEQVD >NC_004567.2|WP_011102046.1|2771287_2772124_+|SDR-family-NAD(P)-dependent-oxidoreductase MQSKLAVIIGGTSGVGKHTAIDLANQNYHVIIVGSRADKGRQAQADISQATGNQAVQLALADLSTKTGVQQFAHQLAAMTDHIDILLNSIGVILPERHLSADGYDLNLVLNYLTHFWTIQALLPLLKHSDQARILLVGALPFVINHAKVSLPDFDAPATSKYNAMTVTAQATAARVLLTLALSERLTATNVTINIFHPGYVPDSNFGAGGSWVSRLAGRILGESFSRKNSPIGAWLATAPELTHTSGHFYDDRLRQVRLSKQYTRSKANDLWRLSSQY |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
321921 : 408741
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_004567|321921:408741|DBSCAN-SWA 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86 | Bacillus_virus(16.67%) | protease,bacteriocin,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
571807 : 664810
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_004567|571807:664810|DBSCAN-SWA 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109 | Lactobacillus_phage(34.04%) | tRNA,terminase,capsid,tail,plate,protease,portal,integrase,head | attL 570101:570116|attR 604538:604553 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1083488 : 1090553
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_004567|1083488:1090553|DBSCAN-SWA TATGAAAGGAATTATATTAGCTGGTGGTTCAGGGACTCGTTTATATCCAGTAACAAAGGTTACTTCCAAACAGTTGTTACCCATTTATGATAAGCCTATGATTTATTATCCACTTTCAACGCTCATGTTGTCAGGAATTAAGGATATATTAATCATTTCCACGTCGCGTGATTCGAATAGCTTTAAAGCTTTACTTGGTGATGGTTCAGAACTTGGCATTCATATAGAATATGCAATTCAGCAAGAACCTAATGGATTAGCGGAAGCCTTTATTATAGGTAAGCAATTTATAGGTGATGATTCGGTTTGTCTGATTCTCGGGGATAATATTTTTTATGGCAACGGTCTTTCTGAAACTTTACAAAAAGCCGTTCGGTTAAAAGATGGAGCAATTGTTTATGGTTATAGAGTCAAGGATCCAGAACGTTTTGGCGTTGTAAGTTTTGATAATAAAAAGAATGTGATTAGTATTGAGGAAAAGCCAACTGATCCTAAAAGTGATTTTGCGGTAACCGGGATATACTTTTTTGATAATGATGTTGTATCTATTGCTGAAAGTATTAAACCGTCTGCTCGAGGAGAGCTCGAAATTACGGATATTAATAATGTGTATTTGAAAAGGAAAAAATTGAAGGTCGAATTATTAAGTAGGGGCTTTGCCTGGTTGGATACAGGGACGCATGAATCATTGCAAGATGCCTCGTCATTCATTCAAACAGTGGAACGCCGACAAAATATTTTGATTGCAAGCATTGAAGAGGTCGCTTTTCGTATGGGGTATATTGATAGCAAACAACTGCAATCTCTTGCCGCGCCGCTACATAAAACGCGCTATGGACAGTATCTTGCATCACTGGTTGAGTAGTTAAGAATGAGTATCCGATAATATGAAAAAAAAAGTTTACACTTGGATATTAATTAGTGTTGTATTGCTTTCTTGCACGGCTTTGGTCATTGCTAATCAACATCGACTGCAGAGTTCGCAGGCTACCAATCGACAAGCTGTGTTGACTGCCAATAAGCCACTTACGGATAAAGTAGGTGGTTTTGTGTGGCTTTATGGTTATAAGAAAGGATCAACAAGGAATAGAGACTACATTAAGTCACAAGTTATAGCTGCCCATAGTACTCATCTACATTACGTTGTGATATCTATCTTATTTAATAATAAGTATGTGAATAAAGGAAAATTTGATTTTGAAGAGTTTGATTTTGCAATGAAAACGATTAAAGAAAATGGTCTTGTTCCTATTGTAGTGTTTTCTTCAAATGATTCGGTAGATGCCAATGAATATGCAAAGAATAAACGAGCAGTGTTAAATAAATACGAAAGATTAATTCGTTCAGTTATTATCAAATATCGTGATCACGGTGTGATTTGGCAAATGTGGAATGAGCCCAATGGTTTGTTTTGGTTTAACCAAAGTAATAGTGGTACAAATGCGGCTCAGGTCAGGACGTGGGTTGACTTTAATGCCAAGATTTTCGCATACGTTCGTAGATATGATCCAAATTCTGTCTTTTTGGCTGGTGCAATTGCTGGAAATTATAGTGATTCAAAACAGGACATGAGACTTGCAATTCAGAATCACATAACCAAATATGGAGATGCATTAGCTAATCATCCCTATTTGTCGAGTAGTTATCCAGATAATGGAGCTCCAGAGAATTTACTGAAGTTAAATTCTCGAAAATTTTTGCTTAGTCTGACAGCAGATAATTCAAAAAAAGCAGTAAGGTCGATTCCACTTGTTACCACGGAAATGGGATATTCAATGAGTAAGTCTCACTTTGGTAGTTGGTCTGAGGAAGACCAAGCAAATTATTTAGCACGAAGTATATTCGTGCTGGACATGATGCATCAACCGATTATTTCATTATATGCACTTGTTGATGAAAAGAATGGTAGTGGTGAATGGGGGCTATACAAGGGAATGAGTCCCCATTATGTGTCGAAGCAAAGTGCTAGATTAATCTCACAATTGCTAAGTAACTTAGATGGTTATTCTTTTGACGAACGGTTACACAGTGATACACGTGACTTTGTATTGAAATATAAAAAAAATGGCCAGCGCGATAGGATTGTTTGTTGGACAATGGATGATGATCATGTACTTAAAGTTTCTGGTCAGACAGTTCTGGTTACGAAGACACCACAAATTGTATATGAAAAATAATTCATCGTAAGTCTGAGCATTGGCGAATTCATTCAGGTGAAAGGGGTAAAAAATTTATAATGGGTAAATTAAAGGTAACAACGACTAAGTTACAAGATGTTAAGATTATTGAACCAGCAGTTTTTGGTGACAAGCGGGGGTTCTTTACGGAAACCTACTCTGACCGTGATTTCAAAGAAGCCGGCATTGATTTTGACTTCATTCAGGATAATCAATCATTGTCAGCGGAAGCGGGTGTTTTGCGGGGACTGCATTTTCAACGTGGCAAGGCAGCGCAAACTAAATTGATTCGCGTAGTGACTGGCGCCGTGCTTGATGTTATTGTGGACGTTCGTGCTGGCTCACCTACGTACGGGGAATGGGAAGGCTATATTATCTCTGAAAGTAACCACCGTCAATTGTTAGTCCCCCGTGGCTTTGCCCATGGCTTTGTGACATTGACTGATAATGTTAATTTCTTATACAAGTGTGATAACTACTACAATGCTGAAGCTGATGGTGGAATCACCTTTATGGATAAAGATTTAAACATTAACTGGCCTATTGACTACGATCAAGCTATTACTTCTGATAAGGATGCTAAACAACAGACCTTCAAAGAATTTGAACAGAATAATCCGTTTGTTTACGGCGAAATTTAAGGAGACGTCATGGAAAACTTATTAGTTACCGGTGGTGCCGGCTTTATTGGTTCTAACTTTGTTCACTATGTTTATAATCATCATCCCGAAGTCAAGATTACCGTGTTAGATAAGTTAACTTATGCTGGTAATCGGGCCAACTTGGAAGAAATTCTAGGCGACCGGGTTAAATTAGTTGTGGGTGACATTTGTGATGCGCCCTTAGTTGATGAATTAATGCAACAAACTGACGCGGTTGTCCATTATGCCGCTGAAAGCCATAATGATAATTCATTGAAGGATCCATGGCCATTCATCGAAACGAATATTATTGGGACTTATACGCTGATTCAATCCGCACATAAGTTTAACAAACGCTTCCACCATGTTTCCACTGATGAAGTATACGGTGATTTACCATTACGGGAAGATTTACCGGGCCATGGTGAGGGTGTTGGCGAGAAGTTTACACCAACTAGTCGGTATAAGCCTTCCAGCCCATACTCTTCATCTAAGGCCAGCAGTGATCTCTTAGTTCGGGCTTGGGTGCGTTCGTTTGGCTTACAAGCCACTATTTCAAACTGCTCAAATAACTATGGCCCTTATCAATATATTGAGAAATTTATTCCACGCCAAATTACCAATATTTTAAGTGGTATTCGGCCGAAATTATATGGTAGTGGTAAAAATGTTCGTGACTGGATTCACACGAACGACCATTCTGCGGCCGTTTGGGATATTTTAACCAAGGGTAAGATTGGCGAGACCTACCTGATTGGTGCCGATGGCGAAATGAACAATAAGGACGTCTTGGAAATGATTCTTGAATTAATGGGTCAGCCTAAAGATGCTTATGATGTTGTTAAGGATCGTCCCGGCCATGATTTACGTTATGCAATCGATTCAACTAAGTTGCGCACGGAATTAGGTTGGCAGCCAGAGTTTACTGACTTCCGGTCTGGTTTGAAAGCAACGATTGATTGGTATACGGACCATCAAGACTGGTGGCAAGCAGATAAGAACAAGGTTGAATCAAACTACGCCAAGAACGGGCAATAAAAACACAGAAGATTTTGAATAAGCGGAGTGTCGATTGACAGTTCGCTTATTTTTTAGGAGGAAATGAAAATGGCTAAAGTAATGATTGTTGGTGCCAATGGTCAGTTAGGTCATGAGTTACAACGACTATTAAATGAACAAGAGATTGCATTTGACGCGCTGACTGAAAAAGAATTGGATATTACAGACTTAGACGCAGTCAAAGCTAAGATTGCCGAATTACAACCAGCGGTCTTATATGATTGTGCGGCTTACACAGCAGTTGATAAGGCGGAAGATGAAGGCAAAGCCCTCAATTGGCTGGTCAATGTTGATGGAACAAAAAATTTAGCCCAAGTAGCAGCTGAACAGGGTGTTAAATTGGTTTATGTTTCTACTGACTACATTTTTGATGGCACTAATAAAGGTGAATATTTAGAAGATGATCCAGCCAACCCCAAGAATGAGTATGGGCGTGCTAAGTGGGCTGGTGAAGAAGCCGTTCGTCACAGCGGTGCTGATTACTATATTGTTCGGACTAGCTGGGTTTTCGGTGAATTTGGGCATAACTTTGTCTTCACAATGCAGAATTTAGCAAAGACGCATGACAAGTTGACAGTCGTCAATGATCAACTCGGACGGCCAACCTGGACGCGAACATTAGCAGAATTTATGGCCCACCTGGTGAAAACTGAAGCCGCTTCAGGGACCTATCAATTAAGTAACGATAATACAGCTACTTGGTATGACTTTGCGAAGGAAATTTTGAAGAATACTGATGTGGAAGTAGCACCAGTTACTTCTGAACAATTCCCACAAAAGGCTTACCGGCCACAGCATTCAGTGATGAATTTGGATAAGGCTAAAGCAACTGGTTACCATATTTTGACCTGGCAGGAAGCACTGAGTGAGTTTCTAGAGAGCCTTGGGTAGCAGAGAGAATATAATAAAAAGCCACTAAGTATTGTGTACTAGGCCCTGTCAAGTTGACAGATGAAATAATATAAAGCTTTGTTTGCTTTTAAATGGCTTCACTCCAGTATTCATCTGGGGTGAGGCCATTTCTTTGTGCCGAAAGATTGTGGTGGTTAAAATAATCGATCCCAGCTTCAACTAGCTTAACCAGTTCTTCGTACGTCTTTGCCATTGGATGACTCACCATCCAACGTAATTTAAATTCATTCCACCAACGTTCCATTGGCGCATTGTCATATGGTGTCCTGTGACGTGACATACTGCGTGTGATCTCAAATTGGCGGGGAGGTAATGATTGAAGGCCCCTGATGTGTAGGCAGAACCATGGTCCGTATGAATCATCGGGTGAACATTGCGAGCGGTGGCGAAAGAACGCTGAAAAACTTGAATCTCGGCGGCACTGGTTTCCGTGATGCTAAGGTTGTATGCCAGGATGCGCCGATCATAGAGATCCATGACGCCACCTAAACGGATCTTGTGCTCACCATTGACCCCATAAGCCAATTCAGTAGAGTCGGATAACCACACCTGGTTAGGTGCGTCCACGTCGAAATTCTGGTTAAGCAGATTGTCCCGGACATACTGGTCTTGCTGCTTGATTCGACTACGCTTCTTCGGCCGGACTTGACAACGCAAACCAAGCTCAAGTATCACCCGACGAACCATTTTGAACGTAACGGGGACGGTTATCTGGTTGTCGTGTTCTAGTCAATAGATTCCCGGCCCCGATGCCACGACGATGAAAATTAAACAGTACTGCGTGCGCGCCTTAAGCACGCGGTCATGGCTTTCCCATTCGGTCTCTTGACGTTTCAAACCCTGATAGTACGTTTGCCTGCTGACATCGAGGACTGCGATTAACTTTGATACGGCACCTCGATTACCTTGACTGACTACTTTGATTGCGTCGTAAGCCAGTCGTCGTTGTTTGGTCACCCCCTGCGCTGAAGTTCCAGCAATTTTTTTGCGAATGCCTCTACCAATTTCTTGTCGGCCAGTTGTGATTTAAGCTGACGGTTCTCAAGCCTGAGTTTGTCCACTTCGGTCAACTCAGCCGCTGATTTGCGGTGGCCGCGCTTATCTACCAGCGCCTCATAGCCGTTCTTCTGAGCCTTAATGACCCACGAACGGGCTTGTTGATAGGAAACCTGGAAGTGTTCGGCGGCTTCGGCATAACTGTGCTTGTGCTTTGTAACGTATTCAACGATTTCGATGCGCTCTTCAAAGGTAGTTTTACGACTCATGATGGGAATCTGCTTTCTGGACGGCGAAGCCGTCAAAGTTTGATTCCCATTATACTTGTTGAGCCAATCTAATAGTTGCTGTTTTGACCGCAGACCGAATCTAATCGCTGATTCTCTTAGCGAGCCTTCACCGTTCAGGTACGTGGTAACCGCCGCCAGCTGAGCCCCTGTGAATAATGCTGGTTCTTCCTGGCCTCCGCCAACCCTGCAAAACCATCACGTTCATACAGTGCTTGCCAATCCCGCATGGTATGCGGATCGACACCATGTGCTTGGGCAAAGATGCCAACGCGCTCGCCTGATTTCCTGAGTGCTTCCAATATCACCAGCTTCTCAGCAGTTGTGTATTTAGCTCTGGGCATACGAAAATTCCTCCATGATTATCAGATGAATTATGATATTCCATCTGACAACCATAAAGGGATTATCGCATATTAGTGGCTTTTTCGTATTCTAATCCCAATTGAAATCCAGCCATTTGTTTCAAAATAACATCCTGATTGAGCCCAATATACCGTTTTGTAATTGCTTCATTAGAATGATTGAAAATCATCATCAAAGTTCCAATATCGTGGGTTTGCTGATAATAATGGTAGCCAAAAGTTTTACGGAGTGTATGGGTACCGATATCGGTTCGGTGCATTTTACGGGCGATGGTTTGGAAAAGTTTATAAACGGCATTAACACTTAGCGGCTGATGTTGTCGATTGGTAAAAAGATATTCATTATCTGGTAAATCTTTAATATAGTGATTGATTTGTGGACGTAGGCGTGTGAGTAAAATCACACGCCTTTTTTTGGTCTTTTTTTCAGTAATGTGGACAATATCGTGATAGCGAATCTGTCCGACCTTTAAGTTAAGAATATCGCTCATTCGGAGTCCAGTATTTAAACCAATTAGAATTAACAACGCGTTACGCTCACCGTGCGTACCGTTCCGAGCCTTATTAACGAAGTCAGTGATTTCTTCATTGGAACGTAAGGGCTCAACATTGTAGTAAATATTAATCAC
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_004567|1083488:1090553|1089965_1090553_-|WP_011101297.1|integrase|DBSCAN-SWA MINIYYNVEPLRSNEEITDFVNKARNGTHGERNALLILIGLNTGLRMSDILNLKVGQIRYHDIVHITEKKTKKRRVILLTRLRPQINHYIKDLPDNEYLFTNRQHQPLSVNAVYKLFQTIARKMHRTDIGTHTLRKTFGYHYYQQTHDIGTLMMIFNHSNEAITKRYIGLNQDVILKQMAGFQLGLEYEKATNMR >NC_004567|1083488:1090553|1086314_1087343_+|WP_003643249.1|DBSCAN-SWA MENLLVTGGAGFIGSNFVHYVYNHHPEVKITVLDKLTYAGNRANLEEILGDRVKLVVGDICDAPLVDELMQQTDAVVHYAAESHNDNSLKDPWPFIETNIIGTYTLIQSAHKFNKRFHHVSTDEVYGDLPLREDLPGHGEGVGEKFTPTSRYKPSSPYSSSKASSDLLVRAWVRSFGLQATISNCSNNYGPYQYIEKFIPRQITNILSGIRPKLYGSGKNVRDWIHTNDHSAAVWDILTKGKIGETYLIGADGEMNNKDVLEMILELMGQPKDAYDVVKDRPGHDLRYAIDSTKLRTELGWQPEFTDFRSGLKATIDWYTDHQDWWQADKNKVESNYAKNGQ >NC_004567|1083488:1090553|1084374_1085664_+|WP_011101290.1|DBSCAN-SWA MKKKVYTWILISVVLLSCTALVIANQHRLQSSQATNRQAVLTANKPLTDKVGGFVWLYGYKKGSTRNRDYIKSQVIAAHSTHLHYVVISILFNNKYVNKGKFDFEEFDFAMKTIKENGLVPIVVFSSNDSVDANEYAKNKRAVLNKYERLIRSVIIKYRDHGVIWQMWNEPNGLFWFNQSNSGTNAAQVRTWVDFNAKIFAYVRRYDPNSVFLAGAIAGNYSDSKQDMRLAIQNHITKYGDALANHPYLSSSYPDNGAPENLLKLNSRKFLLSLTADNSKKAVRSIPLVTTEMGYSMSKSHFGSWSEEDQANYLARSIFVLDMMHQPIISLYALVDEKNGSGEWGLYKGMSPHYVSKQSARLISQLLSNLDGYSFDERLHSDTRDFVLKYKKNGQRDRIVCWTMDDDHVLKVSGQTVLVTKTPQIVYEK >NC_004567|1083488:1090553|1087412_1088255_+|WP_011101291.1|DBSCAN-SWA MAKVMIVGANGQLGHELQRLLNEQEIAFDALTEKELDITDLDAVKAKIAELQPAVLYDCAAYTAVDKAEDEGKALNWLVNVDGTKNLAQVAAEQGVKLVYVSTDYIFDGTNKGEYLEDDPANPKNEYGRAKWAGEEAVRHSGADYYIVRTSWVFGEFGHNFVFTMQNLAKTHDKLTVVNDQLGRPTWTRTLAEFMAHLVKTEAASGTYQLSNDNTATWYDFAKEILKNTDVEVAPVTSEQFPQKAYRPQHSVMNLDKAKATGYHILTWQEALSEFLESLG >NC_004567|1083488:1090553|1085723_1086305_+|WP_003644155.1|DBSCAN-SWA MGKLKVTTTKLQDVKIIEPAVFGDKRGFFTETYSDRDFKEAGIDFDFIQDNQSLSAEAGVLRGLHFQRGKAAQTKLIRVVTGAVLDVIVDVRAGSPTYGEWEGYIISESNHRQLLVPRGFAHGFVTLTDNVNFLYKCDNYYNAEADGGITFMDKDLNINWPIDYDQAITSDKDAKQQTFKEFEQNNPFVYGEI >NC_004567|1083488:1090553|1083488_1084352_+|WP_011101289.1|DBSCAN-SWA MKGIILAGGSGTRLYPVTKVTSKQLLPIYDKPMIYYPLSTLMLSGIKDILIISTSRDSNSFKALLGDGSELGIHIEYAIQQEPNGLAEAFIIGKQFIGDDSVCLILGDNIFYGNGLSETLQKAVRLKDGAIVYGYRVKDPERFGVVSFDNKKNVISIEEKPTDPKSDFAVTGIYFFDNDVVSIAESIKPSARGELEITDINNVYLKRKKLKVELLSRGFAWLDTGTHESLQDASSFIQTVERRQNILIASIEEVAFRMGYIDSKQLQSLAAPLHKTRYGQYLASLVE |
6 | Escherichia_phage(50.0%) | integrase | attL 1083083:1083096|attR 1097474:1097487 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1300477 : 1310325
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_004567|1300477:1310325|DBSCAN-SWA TGTGGCACGTGACGGGACCGTCACAGAGACAAATGATTTAAAATTGCACGCATTAGGGGAGATTATCGGGATGAACGAACAAGAAGCATATGTAACGACATTTTATTGGCTCGCGGATTGTTGGTTGGAAACTAGCTATCTGGGACTTGAGGATGAATTTGACGACGATGAAATCGATGACGCCGTCAAGTCACTACTAAATCGGATGCAAGCCGGGGCAATTTATGAGGTAACGGCGGATGATCCAATGTGGCAAGCATGGAAGCGGGCAGTTAGGGCCGTGCTTACGCCCAATGATCATGCTGAACATGAAGTTGATGAGACCGACGGAGAGGATGAATTAGTGCTACCAGCTGGGGTACGACCAGAACGTCAATTAGAAGAAGTTCAAGCCTATGCAGCGATGAACGCGTTTTTGCAGGCACAAGATCAGGAATATCTGCAAGAAATTGGTAAACGGGCGGCCACTCAGGTCAGTGGTGCCGGGTGGCAAGTGTGGCGTGCACATCGTCAGAGCATGCATCCGGAGTCTGCCGCCCCGCTGACGTTGACTGCTGAACAATTACCAGCCGTGATGTGGGCCTTTTTCGATAAGTACCAGGATACTGAGGACTCTTTTGAGATTTTTGAATTGGTTAATCGACTTGAACAATGGCAAAAAAGTGCTGATCGAGATTTGGACGCGCAATGGTCACAGCTTGTGGCGAAAAGTCAGATTGATCCGGCCGCAATTACGCTCATGCAGGGCTTGTCGTTAGCGATTGAGTTCTTTGATCAGCTTGAGTGGGACGGTGATTTGACTGCCAAGGCAACTTTGCAGAATAAATTGATGCAACGCACGCTCGATGACACGCTCAATGATGAGACGACAGCCAACTGGACGGATGCCTGGCAACACTGGGATTTAGCAGATCCGTTGACAACTGAACAGTGGGCCCGACGGTTTGATCCGGCGGACGACTATGAAGACGATGAAGACGAGAGTGAAGAAGATGGCGCGGCTCGGCCAGCTTGGCAACTTGGTGCGAGTTATAGTACCGTTTTGATTGCAATGCGCTTAGTCGCTTACGGTGTACTGCGGCCTGAGAGTGTGCCTGGTATGGCAACTGTGAAGATGGCGAACCGTGCACTGGCAGCTACCGTCAGTATTGGTATCGTGTTAGTTGCTTGGCTGGTCACAGCTATTCTGATTACAATTGTAATTTGGGGATGGCGGTGGCTGCGTAAGCTGATTTTTTAGTGCAGCTGAACGGCCAACTGAATCACAATAGTGCCGATTGACTAGGCTGAAGTTTGTGAATCCAGTAGTTGAAGCTGAAAGGACGGGGCGTCAGTGGTAGTGCTTCATGATGGTTCGTAACTCGGACAGAAAGTCGGCATCTAAATGGGGCGATTGTCCTAATTGTAATGGTGCCAATGGCTGATATAACGTTGGTATGTCTGGCTTTAACGGCTGGTTATTGAAGTATTGCTGACCATGGATTTTGACGGTCGCTTTGAGCGTTCCAATCGTCATGACGGCCACGGCGGTATTTAAAAAGACGCCACCATTGAGACTAGTATATCCAGCGGAAGAACGCCCAACTAAAGTAACGTGCGGGTTACGTTTTAGCGCCATGATGGTCACCTCCGCGGCACTCGCTGTCTGGTTACCAATAATGGCATAAATATGACGAAAGTGGGCCGCTGTTGGTTGCGAAAAGTTAACGTCATCTTGACCGAGTCCACCAGTGATTCGGCCATGGTACATCATACGTGGCCGGTTGCGATGATGGTTCGTGATGCCGGTGTAGATGGTGCCGTCTGGAATGATGGCGGCCAGGCCAGCAATCATCGGTGCCGAACTACCACCAGTATTTGCTGCGAAGTTTAAGATTAAATCGGTTGTCGGCTTAGTTTGTTTAATCAGGTGCTGGAGTTGTGTCCAATACTGTTTTTGTAATTGGTGCTGACTGCTGTAAAATGCTGGCACATTGATGATGGTGAGGCCGGCACTCATTGTCTTGGTCGGACGGGTGGCATGTTCGACTTGGCGGAGATTGGCGACGGCGAATGAATGTAAATTTGCAGCGCGCAGAATTTGATTGAGTTGGGTCAGTGACGTGATTTTGCGACCATGATCAGTCGCATGCAGCATGGCTTGCCATTGCGTGCGATGGTTGATAATGCCATATTTTGACATGTAGGTGATAGCCGGCATAGCGTTGAAGGACGCACGGAGCCGATTAGAAGCGGAAAGACCAAACGTTAGGACTATCGAAATTAGACCTACCAGTCCGTAACGGCATTTATTCGTTATCATGATAAGCCATCCTTACTTTTCGTGACTAGATTAGCATGTATTGGTTAGCTAAAGTGTAGGCGTGGCGTCAAAATTTCGCAACGAAAAGCATATCTTAACTGGTGCGTCTTTGAAATAATGGTTACTGTTAAAATACCCATCTACATTGGCCGTCTTAACGGCTAAGTAGATGGGTATTTGTTGTATCATGAAATTGTTGACGATTGTGCCAGATCGGCTTCTAACTGGGTTAAGAAGATCGTCACCAAGTCTTTTTCCACCTGGTTCAGTGAATGCTCGGCTGGAAAGGCAATGAAATAATTCAGGGACATTAACGCTTGGGGCAAAGGTAAGATGTTATAGCGTTCTGGATCAGGTTGAGTATGCACACTGTCTGGTAAAAAGGTAATACCCAGTCCAGCAGTGGCTAGTTTGGTGATGGTGGCGGTATTCGTGCTCTCAATTACAATATTCGGTGTCACGTTGTGCTTTTGTAATAAGTAGTCAACTTGGCGTCGAATCGATGACCCGTGGGGAGACAAGACTAGAGGCGCTTGTAGCAGGTCGTTAAGGGGTAGCGCTCCCGGATTAATGAAGGCCTGATGGGGTTGGTACCAGTTGACGGTGTTCGGGATAATCGCGTAGTACCCGTCCCGACCGCGGTCATAACTTTCAAGCCCCGGTGCGATAGTTTCCGGGTTTTGACCAATTAAGAAGTCCAGCTCACCGTGGAGCACGCGCTGTTCGTTGCGACTAGCGATATCTTCGGTTAATTCGATCTTAGTGGCCGGGTGGGCTTTCAAAAAAGCAGGTAAGAATAGGGGCAATAAGTAATAGCCGAGGCTAGATAAGACGCCCAGCCGAATTACTTGCTGGTTGGCATGTGTGTATTGCCTAATTTGCTTATTAAAGTAATCCTTCTCGTTTTCGAGCGCCGTCAAATATTGATAATAAGTCCGCCCAGCCGTGGTCAGTCGTAGTGGCGTGACTTCACGATTGATGATGGTGACGCCCAGTTCTTTTTCAACATTGCGGATGCTTTGGGTGAGGTAAGGTTGTGAAATGTAGAGATCTTTAGCCGCCCGGGTAAAATTGCCGTGCTTGAGTAACACATCTAAAAACCGTCGCATTTCGCTGGAATCTGATTTTGGCATAAAGCGCCTTCCTCTCGCATTGTGATTAGGTGAGTATTCGTTTGATTGCTGATTTGGTCATGTTGAGTTAGTTGCATTGCCATAAGGACGTTCAAAACATGTTCAATAAGTTCTGTCAACATCCTAGCGATAGTGGCTAAACAGCATTATGACCAACCATTTTAACATGATTAATTTTAACGCGAATCGTCGACATAGTAAATTTGTTATCGGAGTATAGATAAATAAATATTTCACAAGCGGAGCGCTTTCACTTACACTAATCAGTATTAAGAATGGCCAATCATTCAATAGCTACTCGTCGAAAACGACTGTTTAAATCATCCTGAAAGGATCTGAAATTATGAAATTTGTTGGGATTGTTGGGACGAATGCAACCAAATCGACCAACCGGCAGTTACTGCAATATATGCAACGGCATTTTCAGCAACAAGCCACGATTGAAATTTGTGAAATAAAAGATTTACCGGCTTTTAATGAACCGGAAGACCGAACAGCACCAGTAGCAATTCAACAGCTCAGTGATAAGATCACCGCAGCAGATGGCGTGATCTTTGCCACGCCGGAGTATGATCATTCAATTCCGGCCGTACTAAAAAGTGCAATCGAATGGCTGTCATATACCACGCGGCCGTTAATTAATAAACCAGTTATGATTGTTGGGGCCTCGAACGGCTCACTGGGAACCTCACGCGCTCAAGCGCACTTACGCCAGATTTTAGAAGCGCCGGAATTAAAAGCACTGGTGATGCCAAATATTGAATACTTACTAGGCCGTTCACTACAAGCTTTTGATGATCAGGGCGACCTGACTTATCCGGATAAAGTTCAGGAATTAGACAATGCGTTTGGCGAATTCATTGATTTTGTAGATTTAACGAATAAAATCATGCCGTCGAGTCAGTTTTTCGAAAAGAGTAAGCAGTTCTCGTGGCGGCAAGTGACTGGGGAGGAATAAACATGAAATTTGTTGGAATTGTTGGAACGAATGCTCAGCATTCGTACAATCGGATGTTGCTGGAATTTATGCAACGACATTTTGCGACACAAGCCGAAATCGAAATTTTAGAATTGACTGATGTCCCGATGTTTGATGAATCGAATGATCAAACTGACAGTACCATCATTCAAAACTTTGCCACTAAAATTGCGACGGCTGACGGGGTTATCATTGCCTCACCGGAACACAATCATTCCGTGCCTTCCGCGTTGAAAAGCATTATTGAATGGTTATCATTCAAAATTCACCCATTAGATGGTCAAGCAGTAATGATTGTTGGGGCTTCATACAGCGTCCAAGGATCGTCACGCGCGCAACTACACCTGCGCCAGATTTTAGACGCTCCCGGTGTTAACGCCAGTGTCATGCCCGGTTCAGAATTCTTATTAGGTCGTGCCCAAACGGCTTTTGACGATCAAGGTAATTTAAAGGTGCAAGGGACGGTTGATTTTCTGGACAGTTGTTTTGCAAAGTTTCAGAAGTTTGCGACCATCGTCGCCGAGATGCGGGCACCAGAAGCGCTTAGCTTTGCCCCGGGTACTTATCAGGTGACGGCCACTGGACA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_004567|1300477:1310325|1304254_1304869_+|WP_003643097.1|DBSCAN-SWA MKFVGIVGTNATKSTNRQLLQYMQRHFQQQATIEICEIKDLPAFNEPEDRTAPVAIQQLSDKITAADGVIFATPEYDHSIPAVLKSAIEWLSYTTRPLINKPVMIVGASNGSLGTSRAQAHLRQILEAPELKALVMPNIEYLLGRSLQAFDDQGDLTYPDKVQELDNAFGEFIDFVDLTNKIMPSSQFFEKSKQFSWRQVTGEE >NC_004567|1300477:1310325|1304871_1307310_+|WP_011101399.1|DBSCAN-SWA MKFVGIVGTNAQHSYNRMLLEFMQRHFATQAEIEILELTDVPMFDESNDQTDSTIIQNFATKIATADGVIIASPEHNHSVPSALKSIIEWLSFKIHPLDGQAVMIVGASYSVQGSSRAQLHLRQILDAPGVNASVMPGSEFLLGRAQTAFDDQGNLKVQGTVDFLDSCFAKFQKFATIVAEMRAPEALSFAPGTYQVTATGHNGELPMRVTLSADRIENIEIDTSSETQGIADVAFERIPKEIIAGQTLAVDAISGASITSHGVIDGVARAVKEAGANPDDLKKRRATKQVAQPAVKEVTTDVVVVGAGGAGMTAAAKVLQAGHQAVVLEKFPAVGGNTVRAGGPMNAADPDWQRQFAALPGEKQTLKDLSERDESTIAPEYRADFRKLKQQIDAYLTANTNQKGTLFDSTLLHRIQTYLGGQRTDLNGQEIHGQYDLVKELTDNALDSVKWLQSIGVKFDESQVTMPVGAIWRRGHKPMGDLGFAYIKTLRAFVEQQGGTIMTETPVKELLVTDGQVRGVIATNAAHEKVIVHADAVILASGGFAANTKMLQKYNTYWTAIDDDVKTTNSPAMTGDGIRLGTSVGAALVGMGFSQMMPVSDPETGELFSGLQVPPANFVMVNQQGKRFVNEYGSRDELTQAAIDNGSLFYLIADDEIKKTAYNTTQAKIDQQVANGTLFRADTLTDLAQQIGMDPAALTKTIADYNRYVDAGEDPEFHKTAFDLKVAVAPFYATPRKPATHHTMGGLKIDSDAHVLNTDGQVIDGLYAAGEVAGGIHAGNRLGGNSLSDIFTFGRIAAAHAVAEHVDPVTA >NC_004567|1300477:1310325|1301806_1302778_-|WP_011101398.1|DBSCAN-SWA MITNKCRYGLVGLISIVLTFGLSASNRLRASFNAMPAITYMSKYGIINHRTQWQAMLHATDHGRKITSLTQLNQILRAANLHSFAVANLRQVEHATRPTKTMSAGLTIINVPAFYSSQHQLQKQYWTQLQHLIKQTKPTTDLILNFAANTGGSSAPMIAGLAAIIPDGTIYTGITNHHRNRPRMMYHGRITGGLGQDDVNFSQPTAAHFRHIYAIIGNQTASAAEVTIMALKRNPHVTLVGRSSAGYTSLNGGVFLNTAVAVMTIGTLKATVKIHGQQYFNNQPLKPDIPTLYQPLAPLQLGQSPHLDADFLSELRTIMKHYH >NC_004567|1300477:1310325|1300477_1301716_+|WP_011101397.1|DBSCAN-SWA MARDGTVTETNDLKLHALGEIIGMNEQEAYVTTFYWLADCWLETSYLGLEDEFDDDEIDDAVKSLLNRMQAGAIYEVTADDPMWQAWKRAVRAVLTPNDHAEHEVDETDGEDELVLPAGVRPERQLEEVQAYAAMNAFLQAQDQEYLQEIGKRAATQVSGAGWQVWRAHRQSMHPESAAPLTLTAEQLPAVMWAFFDKYQDTEDSFEIFELVNRLEQWQKSADRDLDAQWSQLVAKSQIDPAAITLMQGLSLAIEFFDQLEWDGDLTAKATLQNKLMQRTLDDTLNDETTANWTDAWQHWDLADPLTTEQWARRFDPADDYEDDEDESEEDGAARPAWQLGASYSTVLIAMRLVAYGVLRPESVPGMATVKMANRALAATVSIGIVLVAWLVTAILITIVIWGWRWLRKLIF >NC_004567|1300477:1310325|1302963_1303911_-|WP_003643099.1|DBSCAN-SWA MPKSDSSEMRRFLDVLLKHGNFTRAAKDLYISQPYLTQSIRNVEKELGVTIINREVTPLRLTTAGRTYYQYLTALENEKDYFNKQIRQYTHANQQVIRLGVLSSLGYYLLPLFLPAFLKAHPATKIELTEDIASRNEQRVLHGELDFLIGQNPETIAPGLESYDRGRDGYYAIIPNTVNWYQPHQAFINPGALPLNDLLQAPLVLSPHGSSIRRQVDYLLQKHNVTPNIVIESTNTATITKLATAGLGITFLPDSVHTQPDPERYNILPLPQALMSLNYFIAFPAEHSLNQVEKDLVTIFLTQLEADLAQSSTIS >NC_004567|1300477:1310325|1308565_1308703_+|WP_080499794.1|DBSCAN-SWA MATDQSGQVSKTVTLPQTSENHQSLLIAILGLALLLLMLVWLPAK >NC_004567|1300477:1310325|1308028_1308469_-|WP_011101401.1|DBSCAN-SWA MAQIYIASPFFSPEQVTRVTQLEEALAQNPTVTDFYSPRLHQDAQAEQFTKTWATEIFHRDMAQIAAAQVIVTVLDFEAKNLDSGTAYELGVATMRDLPIIALQEKDEAVNLMITESLHWYTKQVSDFETYDFQQLPKGDFIGEIL >NC_004567|1300477:1310325|1307397_1307958_+|WP_011101400.1|DBSCAN-SWA MQKLMPVAVTNIADNITHQPAYMTIVLNDHKYSTARKKTPFILKALNEGAAAHGRLTITPSRLSLADERGTVFQTLAPIPTVITDVELGLYRSIVRQLGNGVRMKARYTLAVTLTSDTATYQMLNTDLSVLKPLLAWITDFHLHLTDSLQLATSDIDWPNLTADQFEALTKGTPYFAWQQTIGAHW >NC_004567|1300477:1310325|1309329_1310325_+|WP_003645220.1|DBSCAN-SWA MQNPRLTIIVPCYNEEAVLPKSAHILDGILTDLIQHKQVNAASKLLFVDDGSQDKTWKLIKSLEKQYSTVTGLKFSRNFGHQNALMAGMQVASPTAEIVITIDADLQDDPQVIPEMVARYRAGSDIVLGVRNDRSSDSLFKRWTADGFYRLMKRIGVQLVPNHADFRLLSQRAVQALLTYEETNLFLRGIVPRLGFPTTKLYYHRQPRFAGVSKYPLRKMVAFAFDGITSFSIAPIKVILLFGMVISGGSLMMMLYALIQGLLGTATSGWSSLMTSLWFLGGMQLIGISIVGEYVGKIFAEVKHRPRYIIETDDYTATQQPAIVNSQRVHG |
9 | Lactobacillus_phage(87.5%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2163937 : 2218340
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_004567|2163937:2218340|DBSCAN-SWA 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68 | Lactobacillus_phage(52.94%) | capsid,tail,terminase,portal,holin,integrase,head | attL 2204682:2204703|attR 2218518:2218539 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2421448 : 2429959
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_004567|2421448:2429959|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_004567|2421448:2429959|2421448_2422027_-|WP_011101893.1|DBSCAN-SWA MPNKIAVFASGNGTNFVALHQAIIERQLPVVIGLLVCDQPTAPVIDKARAANVPILIVDFHDYANKAAAEAIILTALQARQIELVLLAGYMRIIGPTLLNAYVHKIINIHPALLPKFPGRHGIEDAFAAGVTETGVTIHYIDAGIDTGQIIAQRVVPVAPDDTLASLATRIHDCEHQFYPDVLQTLINEGAI >NC_004567|2421448:2429959|2423041_2424496_-|WP_003642591.1|DBSCAN-SWA MPTEVRSLNEECGVFGVWGSPDAAQLTYFGLHALQHRGQEGAGITANDHGKLQTERGLGLLADVFRDPRRLARLTGQAAVGHVRYATAGNHGLENIQPLSFNFSDSQFALAHNGNLTNAVTLRRRLEQHGAIFHASSDSEILMHLIRRSPAATLTEQVKDALRQVHGGFAYLLLTNDCLIAALDPNGLRPLVVGQLPTGGYVVCSETCALDTIGATFVQDVQPGELLTIDDHGLTIDHYTTDTQLAICSMEFIYFARPDSDIHGVNVHSARKRMGAQLAVEQPVDADIVVGVPNSSLSAATGYAEASGLPYEMGLIKNQYSSRTFIQPTQALREQGVRMKLSAVKGVVAGKRVVLIDDSIVRGTTSRRIVKLLKDAGAKSVHLRIASPPLRYPCFYGIDIQSTNELIAAQQTIREMCQTFGADSLGFLSEQGVVDAVGLSTTEPYGGLCMAYFNGDYPTALYDYQAEYDAEIAQLQANHEGVIK >NC_004567|2421448:2429959|2422019_2423045_-|WP_011101894.1|DBSCAN-SWA MSDAYKRAGVDINAGYDVLKTVKQMSGNQQLGAFGGAFPLSPDATANDPVLVAGTDGVGTKLLVAIAADQHTTIGIDLVAMCVNDILAQGATPQFFLDYLGLGHTDQKRVKAILTGVVAGCQQAHTALIGGETAEMPDMYGQDHYDLAGFAVGIANRADLLSPANVRAGDVLIGLPSNGLHSNGFSLVRDILFKQHDYQLTTVFDELGHDLQTELLRPTTIYVDAVQPLLQQKLVTSIAHITGGGLIENVARALPAGLSAHLELGQWPVPPIMTLLAELGGLTATDLRSTFNLGLGMVLIVHPDQVAAVTANLTANAQSYYRVGTVQTGTTPVVFEEAEHA >NC_004567|2421448:2429959|2428362_2429493_-|WP_011101896.1|DBSCAN-SWA MNANFKEALLPPATIGIVGGGQLGQMMTLSAKAMGYRVGVLDPTPKAPAAQVADFQIVAAYDDQAALLDLARRSDVLTYEFENVDENALIAAQAYAKLPQGTALLHITGDRLNEKQFLHDHGIPVTSFAPVTDLQSLNYALNRVGTPAILKTAAGGYDGHGQTDLDTAVVTKAASALLTQPCILEARQKFRTEVSMMVTRSAAGVVTTFPLVENQHQHHILHTTIAPANVQPSVHSAARKIAVSIAESLELRGVLGIEFFVLPDDTLLVNELAPRPHNSGHYTIEACNISQFEAHIRSICGLPIPAITQTSPAVMRNLLGDDLTVARQQLVEHPEWHFHDYGKAAIKPQRKMGHVTVLNHDIDAALASLANLKGEQ >NC_004567|2421448:2429959|2427372_2427627_-|WP_003642588.1|DBSCAN-SWA MYLVKIYVTYKQSILDPKGEAIHDALHRLGYTNVDAVELGKYFEVKIHADDRPVAAEIDEMCDRLLANVNMETYRYEITEMEAL >NC_004567|2421448:2429959|2427628_2428360_-|WP_003642587.1|DBSCAN-SWA MTAAIEKQALLYTGKAKAMYATNDPEILWVEYLDQATALNGKRKVPIDQKGRLNNRIASLIFKDLANHGIANHFIEQPSDYVQLVRRVTMIPLETVVRNAASGSFERKFAVPHLTKFAEPVLEFFYKSDQLDDPFINDSQIHALNVATPAIVAEIKRQALQVNQRLTAIFAAMGVQLVDFKIEFGLTTTGKVLLADEISPDSCRLVDLKTGASLDKDVFRKDLGDLTSVYQEVLTRLATVEEA >NC_004567|2421448:2429959|2424480_2426700_-|WP_003645864.1|DBSCAN-SWA MLKKQPLSPTDVRDSKVYRDWGLTDAEYQLLTDKVLQRLPNETETGLFSGMWSEHCSYKNSKPVLKKFWTQGEQVLEGPGEGAGIIDIGDGQAVVFKAESHNHPSAVEPYEGAATGVGGIIRDIFSMGARPIALLDSLRFGEPTDAHTKYLISQVVAGIGGYGNCIGIPTIGGDTVFDASYQKNPLVNAMCVGILDQADIQKGQATGIGNAVIYVGAKTGRDGINGASFASAEFNDANETQRSAVQVGDPFMEKLLMEACLEVIHEHRDVLIGIQDMGAAGLVSSSAEMASKAGSGLSLNLDLVPQRETGMTPFELMLSESQERMLLCVKAGAEAEIYQVFEKYGLDAVTIGKVTAGHQYQLFHHGKLVADVPVDALATKAPVYEREKKRPTRLNHQSHHQFMPRLVDATGTLKKMLQQPTIASKASLYGTYDSQVQTNTVVKPGSDAGVIRIRHTDKALAVTTDVNGRYLYLNPRVGGEIAVAEAARNIVASGGQPLGITDCLNYGNPEKPEQFYDLDESAMGIARACQLFNTPVISGNVSLNNESNGEAIYPTPMIGMVGLIKHQKDITTSDFKHAGDAVYVLGTTEADFNGSELQKMLTGTISGELFDFDLVTENRNQRLLLTAIQKGLVASAHDVSEGGLITTIAESCFPQNIGVELASDLPAANFFAETQSRFVISVTPAQQAAFESLMEPYVTYLGRTTATDRLHVQTADQAFDIKVSFAKQLWEGALPCLLK >NC_004567|2421448:2429959|2426692_2427373_-|WP_011101895.1|DBSCAN-SWA MMKFAVPVFPGSNCDHDMVNALRDILHVTADLIPATATSLAGYDAVVLPGGFSYGDYLRSGAIARFAPIMPAVIAFANAGKPVIGICNGFQVLTEAGLLPGALQANRSAKFICQDSPLRIANHETIFTTAYGSTDQISLPIAHGEGNYYCDEATLAQLRANHQIIFEYVENPNGSTANIAGITNEAGNVLGMMPHPERAVEMILGSTDGLGIFQSVIASQEEVTHA >NC_004567|2421448:2429959|2429476_2429959_-|WP_003645861.1|DBSCAN-SWA MAKVGLIMGSISDWPTMQLAAEQLTALGVSYERHVISAHRMPQTLQSYGEEAASRGIQVIIAGAGGAAHLPGMLAANTLLPVIGVPIKTHTLNGVDSLLSIVQMPAGVPVATMAIGDAGAKNGALMAAQIIGLREPQVQHAIGEFRARQRQEAEQSERQF |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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