CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NC_017477	Lactobacillus johnsonii DPC 6026, complete sequence	1 crisprs	cas2,cas3,c2c9_V-U4,cas14j,RT,DEDDh,DinG,csn2,cas1,cas9,csa3	0	16	3	0

1. NC_017477

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NC_017477_1

• CRISPR_ID: NC_017477_1
• CRISPR_location: 1199794-1201611
• CRISPR_type: TypeII
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 27 spacers
• Cas_protein_info: csn2,cas2,cas1,cas9

Consensus repeat of NC_017477_1

Consensus_repeat	Method
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	CRISPRCasFinder
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	CRT
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	PILER-CR

spacers of NC_017477_1

>1.1|1199830|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT
GTTATAATCCTCTTGTATAATTATATTTTT
>1.2|1199896|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR
CTTTTGCTTTATCTTCAACATCATCCATAG
>1.3|1199962|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR
ATCAATACCGTACAGGTTTTTAATTGTATC
>1.4|1200028|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR
TAAACGTATCAATCTCTGTATGTTTGCTTA
>1.5|1200094|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR
TAAATTACGTCTCGAATTAAACAACATTAA
>1.6|1200160|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR
TATTTAAAGGCTAGTAACTCACTAGCCTTT
>1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR
TTTCTTTCTGTATCTTTAGCTCCTATATCA
>1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR
TTTCTTTCTGTATCTTTAGCTCCTATATCA
>1.9|1200358|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR
ATCTTCTTGAAGAACGAGGATATATTGTCA
>1.10|1200424|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR
TGCTTGCTTAGCATTCATCCAAGTTGTATT
>1.11|1200490|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR
TCCTATCTTTTAATAATTCACGTATTTCTT
>1.12|1200556|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR
CAAAACCATCTGAATCAAAATCACAGCAGG
>1.13|1200622|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR
TAATCAGCTGGGCTGTGATTGCCTCCTTAG
>1.14|1200688|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR
GGAACAACAAGTTCTGAAAGAACAACGAGA
>1.15|1200754|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR
GGAGCGTTAAATACACTTTTGACTAATTTG
>1.16|1200820|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR
TGAGGCTGGTGTGATTGTACCTAAAGAGGT
>1.17|1200886|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR
TTTCTCAATTTAATAAACAATATCGTGAAG
>1.18|1200952|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR
AATGATAAGAGCTTATATTGTAGAGCCACG
>1.19|1201018|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR
GCACTATTGGGAATATGTTTACGGTACATG
>1.20|1201084|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR
TTGATGATACCAGAGATACTGATAGCAACG
>1.21|1201150|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR
GCTTCCCATGCAGTCACTAGAATATTGATA
>1.22|1201216|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR
GAGAATGAAGAACGGCAATCAGTCTTTGAA
>1.23|1201282|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR
AGAATTGCTGCTTAATCTTCTGAAATGCTG
>1.24|1201348|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR
GAACATTAGTTGTTAATAACGTCTGATTAA
>1.25|1201414|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR
GTACTATCGGAAACATGTTTTCAGTACATG
>1.26|1201480|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR
CAGCAGGTATGCCATTTTTAAAAGGATAAC
>1.27|1201546|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR
TTTCTATGATGACAAAGGTACTGTTTTAGG

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017477_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NC_017477_1

>merge|NC_017477|1|1199794-1201611|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR
AAGAGTACCATATTTGATCTAACAACCATCTAAAACGTTATAATCCTCTTGTATAATTATATTTTTGATCTAAACTTTATTCATCTAATAACCATCTAAAACCTTTTGCTTTATCTTCAACATCATCCATAGGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACATCAATACCGTACAGGTTTTTAATTGTATCGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACTAAACGTATCAATCTCTGTATGTTTGCTTAGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACTAAATTACGTCTCGAATTAAACAACATTAAGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACTATTTAAAGGCTAGTAACTCACTAGCCTTTGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACTTTCTTTCTGTATCTTTAGCTCCTATATCAGATTTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACTTTCTTTCTGTATCTTTAGCTCCTATATCAGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACATCTTCTTGAAGAACGAGGATATATTGTCAGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACTGCTTGCTTAGCATTCATCCAAGTTGTATTGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACTCCTATCTTTTAATAATTCACGTATTTCTTGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACCAAAACCATCTGAATCAAAATCACAGCAGGGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACTAATCAGCTGGGCTGTGATTGCCTCCTTAGGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACGGAACAACAAGTTCTGAAAGAACAACGAGAGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACGGAGCGTTAAATACACTTTTGACTAATTTGGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACTGAGGCTGGTGTGATTGTACCTAAAGAGGTGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACTTTCTCAATTTAATAAACAATATCGTGAAGGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACAATGATAAGAGCTTATATTGTAGAGCCACGGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACGCACTATTGGGAATATGTTTACGGTACATGGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACTTGATGATACCAGAGATACTGATAGCAACGGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACGCTTCCCATGCAGTCACTAGAATATTGATAGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACGAGAATGAAGAACGGCAATCAGTCTTTGAAGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACAGAATTGCTGCTTAATCTTCTGAAATGCTGGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACGAACATTAGTTGTTAATAACGTCTGATTAAGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACGTACTATCGGAAACATGTTTTCAGTACATGGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACCAGCAGGTATGCCATTTTTAAAAGGATAACGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACTTTCTATGATGACAAAGGTACTGTTTTAGGGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC

>NC_017477|1|1|1199794-1201611|CRISPRCasFinder
AAGAGTACCATATTTGATCTAACAACCATCTAAAAC	GTTATAATCCTCTTGTATAATTATATTTTT
GATCTAAACTTTATTCATCTAATAACCATCTAAAAC	CTTTTGCTTTATCTTCAACATCATCCATAG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	ATCAATACCGTACAGGTTTTTAATTGTATC
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TAAACGTATCAATCTCTGTATGTTTGCTTA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TAAATTACGTCTCGAATTAAACAACATTAA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TATTTAAAGGCTAGTAACTCACTAGCCTTT
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TTTCTTTCTGTATCTTTAGCTCCTATATCA
GATTTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TTTCTTTCTGTATCTTTAGCTCCTATATCA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	ATCTTCTTGAAGAACGAGGATATATTGTCA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TGCTTGCTTAGCATTCATCCAAGTTGTATT
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TCCTATCTTTTAATAATTCACGTATTTCTT
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	CAAAACCATCTGAATCAAAATCACAGCAGG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TAATCAGCTGGGCTGTGATTGCCTCCTTAG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	GGAACAACAAGTTCTGAAAGAACAACGAGA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	GGAGCGTTAAATACACTTTTGACTAATTTG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TGAGGCTGGTGTGATTGTACCTAAAGAGGT
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TTTCTCAATTTAATAAACAATATCGTGAAG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	AATGATAAGAGCTTATATTGTAGAGCCACG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	GCACTATTGGGAATATGTTTACGGTACATG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TTGATGATACCAGAGATACTGATAGCAACG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	GCTTCCCATGCAGTCACTAGAATATTGATA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	GAGAATGAAGAACGGCAATCAGTCTTTGAA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	AGAATTGCTGCTTAATCTTCTGAAATGCTG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	GAACATTAGTTGTTAATAACGTCTGATTAA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	GTACTATCGGAAACATGTTTTCAGTACATG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	CAGCAGGTATGCCATTTTTAAAAGGATAAC
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TTTCTATGATGACAAAGGTACTGTTTTAGG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC

>NC_017477|1|1|1199794-1201611|CRT
AAGAGTACCATATTTGATCTAACAACCATCTAAAAC	GTTATAATCCTCTTGTATAATTATATTTTT
GATCTAAACTTTATTCATCTAATAACCATCTAAAAC	CTTTTGCTTTATCTTCAACATCATCCATAG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	ATCAATACCGTACAGGTTTTTAATTGTATC
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TAAACGTATCAATCTCTGTATGTTTGCTTA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TAAATTACGTCTCGAATTAAACAACATTAA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TATTTAAAGGCTAGTAACTCACTAGCCTTT
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TTTCTTTCTGTATCTTTAGCTCCTATATCA
GATTTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TTTCTTTCTGTATCTTTAGCTCCTATATCA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	ATCTTCTTGAAGAACGAGGATATATTGTCA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TGCTTGCTTAGCATTCATCCAAGTTGTATT
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TCCTATCTTTTAATAATTCACGTATTTCTT
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	CAAAACCATCTGAATCAAAATCACAGCAGG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TAATCAGCTGGGCTGTGATTGCCTCCTTAG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	GGAACAACAAGTTCTGAAAGAACAACGAGA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	GGAGCGTTAAATACACTTTTGACTAATTTG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TGAGGCTGGTGTGATTGTACCTAAAGAGGT
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TTTCTCAATTTAATAAACAATATCGTGAAG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	AATGATAAGAGCTTATATTGTAGAGCCACG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	GCACTATTGGGAATATGTTTACGGTACATG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TTGATGATACCAGAGATACTGATAGCAACG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	GCTTCCCATGCAGTCACTAGAATATTGATA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	GAGAATGAAGAACGGCAATCAGTCTTTGAA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	AGAATTGCTGCTTAATCTTCTGAAATGCTG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	GAACATTAGTTGTTAATAACGTCTGATTAA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	GTACTATCGGAAACATGTTTTCAGTACATG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	CAGCAGGTATGCCATTTTTAAAAGGATAAC
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TTTCTATGATGACAAAGGTACTGTTTTAGG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC

>NC_017477|1|1|1199860-1201611|PILER-CR
GATCTAAACTTTATTCATCTAATAACCATCTAAAAC	CTTTTGCTTTATCTTCAACATCATCCATAG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	ATCAATACCGTACAGGTTTTTAATTGTATC
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TAAACGTATCAATCTCTGTATGTTTGCTTA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TAAATTACGTCTCGAATTAAACAACATTAA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TATTTAAAGGCTAGTAACTCACTAGCCTTT
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TTTCTTTCTGTATCTTTAGCTCCTATATCA
GATTTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TTTCTTTCTGTATCTTTAGCTCCTATATCA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	ATCTTCTTGAAGAACGAGGATATATTGTCA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TGCTTGCTTAGCATTCATCCAAGTTGTATT
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TCCTATCTTTTAATAATTCACGTATTTCTT
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	CAAAACCATCTGAATCAAAATCACAGCAGG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TAATCAGCTGGGCTGTGATTGCCTCCTTAG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	GGAACAACAAGTTCTGAAAGAACAACGAGA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	GGAGCGTTAAATACACTTTTGACTAATTTG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TGAGGCTGGTGTGATTGTACCTAAAGAGGT
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TTTCTCAATTTAATAAACAATATCGTGAAG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	AATGATAAGAGCTTATATTGTAGAGCCACG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	GCACTATTGGGAATATGTTTACGGTACATG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TTGATGATACCAGAGATACTGATAGCAACG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	GCTTCCCATGCAGTCACTAGAATATTGATA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	GAGAATGAAGAACGGCAATCAGTCTTTGAA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	AGAATTGCTGCTTAATCTTCTGAAATGCTG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	GAACATTAGTTGTTAATAACGTCTGATTAA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	GTACTATCGGAAACATGTTTTCAGTACATG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	CAGCAGGTATGCCATTTTTAAAAGGATAAC
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TTTCTATGATGACAAAGGTACTGTTTTAGG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NC_017477.1|WP_014567557.1|1195323_1196052_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NC_017477.1|WP_014567564.1|1210261_1211146_-|glucose-1-phosphate-thymidylyltransferase-RfbA	unknown	unknown	gnl|CDD|130274
NC_017477.1|WP_144018423.1|1212320_1213493_-|methyltransferase-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|133381
NC_017477.1|WP_014567562.1|1208620_1209607_-|dTDP-4-dehydrorhamnose-reductase	unknown	unknown	gnl|CDD|367904
NC_017477.1|WP_187286467.1|1213763_1213904_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NC_017477.1|WP_014567555.1|1193823_1194264_-|8-oxo-dGTP-diphosphatase	unknown	unknown	gnl|CDD|239519
NC_017477.1|WP_014567565.1|1211152_1212190_-|dTDP-glucose-4,6-dehydratase	unknown	unknown	gnl|CDD|224013
NC_017477.1|WP_044025951.1|1199280_1199538_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NC_017477.1|WP_044025948.1|1197902_1198328_-|HIRAN-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|214906
NC_017477.1|WP_014567554.1|1193134_1193794_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|374106
NC_017477.1|WP_014567556.1|1194415_1195258_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|275056
NC_017477.1|WP_014567561.1|1203707_1207835_-|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9	cas9	mkCas0193_cas9_CAS-II-A:CAS-II-B:CAS-II-C	gnl|CDD|374653
NC_017477.1|WP_044025950.1|1198951_1199182_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NC_017477.1|WP_044025954.1|1202592_1203501_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1	cas1	cd09720_cas1_CAS-II-A:CAS-II-B:CAS-II-C	gnl|CDD|187851
NC_017477.1|WP_014567563.1|1209623_1210232_-|dTDP-4-dehydrorhamnose-3,5-epimerase	unknown	unknown	gnl|CDD|376414
NC_017477.1|WP_004897483.1|1192059_1192440_-|DUF1828-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|378071
NC_017477.1|WP_044025953.1|1202309_1202615_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2	cas2	mkCas0206_cas2_CAS-I:CAS-II:CAS-III	gnl|CDD|226043
NC_017477.1|WP_014567558.1|1196777_1197695_-|M48-family-metallopeptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|320699
NC_017477.1|WP_014567559.1|1201644_1202313_-|type-II-A-CRISPR-associated-protein-Csn2	csn2	cd12218_csn2_CAS-II-A	gnl|CDD|213411
NC_017477.1|WP_004897486.1|1192528_1192930_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown

HMMScan for Signature genes

Protein	Cas_name	Cas_description	E-value	Identity	Coverage
NC_017477.1|WP_014567561.1|1203707_1207835_-|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9	cas9	mkCas0193_cas9_CAS-II-A:CAS-II-B:CAS-II-C	0	2010.3	78.3
NC_017477.1|WP_044025954.1|1202592_1203501_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1	cas1	cd09720_cas1_CAS-II-A:CAS-II-B:CAS-II-C	2.4e-89	293.8	5.2
NC_017477.1|WP_014567559.1|1201644_1202313_-|type-II-A-CRISPR-associated-protein-Csn2	csn2	cd12218_csn2_CAS-II-A	4.9e-69	227.0	19.9
NC_017477.1|WP_044025953.1|1202309_1202615_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2	cas2	mkCas0206_cas2_CAS-I:CAS-II:CAS-III	3.6e-56	182.4	0.8

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NC_017477.1|WP_014567564.1|1210261_1211146_-|glucose-1-phosphate-thymidylyltransferase-RfbA	gnl|CDD|130274	TIGR01207, Glucose-1-phosphate_thymidylyltransferase_1, glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form. Alternate name: dTDP-D-glucose synthase homotetramer This model describes a tightly conserved but broadly distributed subfamily (here designated as short form) of known and putative bacterial glucose-1-phosphate thymidylyltransferases. It is well characterized in several species as the first of four enzymes involved in the biosynthesis of dTDP-L-rhamnose, a cell wall constituent and a feedback inhibitor of the enzyme. [Cell envelope, Biosynthesis and degradation of surface polysaccharides and lipopolysaccharides].	2.08582e-170
NC_017477.1|WP_044025948.1|1197902_1198328_-|HIRAN-domain-containing-protein	gnl|CDD|214906	smart00910, HIRAN, The HIRAN protein (HIP116, Rad5p N-terminal) is found in the N-terminal regions of the SWI2/SNF2 proteins typified by HIP116 and Rad5p. HIRAN is found as a standalone protein in several bacteria and prophages, or fused to other catalytic domains, such as a nuclease of the restriction endonuclease fold and TDP1-like DNA phosphoesterases, in the eukaryotes. It has been predicted that this protein functions as a DNA-binding domain that probably recognises features associated with damaged DNA or stalled replication forks.	9.60257e-20
NC_017477.1|WP_014567562.1|1208620_1209607_-|dTDP-4-dehydrorhamnose-reductase	gnl|CDD|367904	pfam04321, RmlD_sub_bind, RmlD substrate binding domain. L-rhamnose is a saccharide required for the virulence of some bacteria. Its precursor, dTDP-L-rhamnose, is synthesized by four different enzymes the final one of which is RmlD. The RmlD substrate binding domain is responsible for binding a sugar nucleotide.	7.16782e-99
NC_017477.1|WP_014567561.1|1203707_1207835_-|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9	gnl|CDD|374653	pfam16592, Cas9_REC, REC lobe of CRISPR-associated endonuclease Cas9. The REC lobe of Cas9 - the CRISPR-associated endonuclease Cas9 - includes the REC1 and REC2 domains. REC1 forms an elongated, alpha-helical structure consisting of 25 alpha helices and two beta-sheets, whereas REC2 inserted within REC1 adopts a six-helix bundle structure. The REC lobe and the NUC lobe of Cas9 fold to present a positively charged groove at their interface which accommodates the negatively charged sgRNA:target DNA heteroduplex. CRISPR (clustered regularly interspaced short palindromic repeat)-Cas system occurs naturally in bacteria as a defense against invasion by phages or other mobile genetic elements. Cas9 is targeted to specific genomic locations by sgRNAs or single guide RNAs, in order to complex with invading DNA in order to cleave it and render it inactive.	2.31325e-135
NC_017477.1|WP_014567565.1|1211152_1212190_-|dTDP-glucose-4,6-dehydratase	gnl|CDD|224013	COG1088, RfbB, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase [Cell envelope biogenesis, outer membrane].	0
NC_017477.1|WP_014567555.1|1193823_1194264_-|8-oxo-dGTP-diphosphatase	gnl|CDD|239519	cd03427, MTH1, MutT homolog-1 (MTH1) is a member of the Nudix hydrolase superfamily. MTH1, the mammalian counterpart of MutT, hydrolyzes oxidized purine nucleoside triphosphates, such as 8-oxo-dGTP and 2-hydroxy-ATP, to monophosphates, thereby preventing the incorporation of such oxygen radicals during replication. This is an important step in the repair mechanism in genomic and mitochondrial DNA. Like other members of the Nudix family, it requires a divalent cation, such as Mg2+ or Mn2+, for activity, and contain the Nudix motif, a highly conserved 23-residue block (GX5EX7REUXEEXGU, where U = I, L or V), that functions as a metal binding and catalytic site. MTH1 is predominantly localized in the cytoplasm and mitochondria. Structurally, this enzyme adopts a similar fold to MutT despite low sequence similarity outside the conserved nudix motif. The most distinctive structural difference between MutT and MTH1 is the presence of a beta-hairpin, which is absent in MutT. This results in a much deeper and narrower substrate binding pocket. Mechanistically, MTH1 contains dual specificity for nucleotides that contain 2-OH-adenine bases and those that contain 8-oxo-guanine bases.	7.74293e-48
NC_017477.1|WP_014567558.1|1196777_1197695_-|M48-family-metallopeptidase	gnl|CDD|320699	cd07340, M48B_Htpx_like, Peptidase M48 subfamily B HtpX-like membrane-bound metallopeptidase. This HtpX family of peptidase M48 subfamily B includes uncharacterized HtpX homologs and consists of proteins smaller than Ste24p, with homology restricted to the C-terminal half of Ste24p. HtpX expression is controlled by the Cpx stress response system, which senses abnormal membrane proteins. HtpX participates in the proteolytic quality control of these misfolded proteins by undergoing self-degradation and collaborating with FtsH, a membrane-bound and ATP-dependent protease, to eliminate them. HtpX, a zinc metalloprotease with an active site motif HEXXH, has an FtsH-like topology, and is capable of introducing endoproteolytic cleavages into SecY (also an FtsH substrate). However, HtpX does not have an ATPase activity and will only act against cytoplasmic regions of a target membrane protein. Thus, HtpX and FtsH have overlapping and/or complementary functions, which are especially important at high temperature; in E. coli and Xylella fastidiosa, HtpX is heat-inducible, while in Streptococcus gordonii it is not.	2.1616e-100
NC_017477.1|WP_044025953.1|1202309_1202615_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2	gnl|CDD|226043	COG3512, COG3512, CRISPR-associated protein, Cas2 homolog [Defense mechanisms].	4.54346e-26
NC_017477.1|WP_014567556.1|1194415_1195258_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|275056	TIGR04211, hypothetical_protein, SH3 domain protein. Members of this protein family have a signal peptide, a strongly conserved SH3 domain, a variable region, and then a C-terminal hydrophobic transmembrane alpha helix region.	5.28791e-07
NC_017477.1|WP_014567563.1|1209623_1210232_-|dTDP-4-dehydrorhamnose-3,5-epimerase	gnl|CDD|376414	pfam00908, dTDP_sugar_isom, dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase. This family catalyze the isomerisation of dTDP-4-dehydro-6-deoxy -D-glucose with dTDP-4-dehydro-6-deoxy-L-mannose. The EC number of this enzyme is 5.1.3.13.	2.07065e-99
NC_017477.1|WP_144018423.1|1212320_1213493_-|methyltransferase-domain-containing-protein	gnl|CDD|133381	cd01106, HTH_TipAL-Mta, Helix-Turn-Helix DNA binding domain of the transcription regulators TipAL, Mta, and SkgA. Helix-turn-helix (HTH) TipAL, Mta, and SkgA transcription regulators, and related proteins, N-terminal domain. TipAL regulates resistance to and activation by numerous cyclic thiopeptide antibiotics, such as thiostrepton. Mta is a global transcriptional regulator; the N-terminal DNA-binding domain of Mta interacts directly with the promoters of mta, bmr, blt, and ydfK, and induces transcription of these multidrug-efflux transport genes. SkgA has been shown to control stationary-phase expression of catalase-peroxidase in Caulobacter crescentus. These proteins are comprised of distinct domains that harbor an N-terminal active (DNA-binding) site and a regulatory (effector-binding) site. The conserved N-terminal domain of these transcription regulators contains winged HTH motifs that mediate DNA binding. These proteins share the N-terminal DNA binding domain with other transcription regulators of the MerR superfamily that promote transcription by reconfiguring the spacer between the -35 and -10 promoter elements. Unique to this family, is a TipAL-like, lineage specific Bacilli subgroup, which has five conserved cysteines in the C-terminus of the protein.	1.3571e-39
NC_017477.1|WP_014567554.1|1193134_1193794_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|374106	pfam15782, GREB1, Gene regulated by oestrogen in breast cancer. GREB1 (gene regulated by estrogen in breast cancer 1) was first identified as an oestrogen-regulated gene expressed in breast cancer. Its exact function is not known but its expression is regulated by the coordinated binding of oestrogen-receptors to distal sites interacting with Pol II to activate gene transcription from core promoters located at a considerable distance from the greb1 gene.	0.000456572
NC_017477.1|WP_044025954.1|1202592_1203501_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1	gnl|CDD|187851	cd09720, Cas1_II, CRISPR/Cas system-associated protein Cas1. CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats) and associated Cas proteins comprise a system for heritable host defense by prokaryotic cells against phage and other foreign DNA; Cas1 is the most universal CRISPR system protein thought to be involved in spacer intergration. Cas1 is metal-dependent deoxyribonuclease, also binds RNA; Shown to possess a unique fold consisting of a N-terminal beta-strand domain and a C-terminal alpha-helical domain.	1.08859e-99
NC_017477.1|WP_004897483.1|1192059_1192440_-|DUF1828-domain-containing-protein	gnl|CDD|378071	pfam08861, DUF1828, Domain of unknown function DUF1828. This presumed domain is functionally uncharacterized.	1.17074e-12
NC_017477.1|WP_014567559.1|1201644_1202313_-|type-II-A-CRISPR-associated-protein-Csn2	gnl|CDD|213411	cd12218, Csn2, CRISPR/Cas system-associated protein Csn2. Csn2 is a Nmeni subtype-specific Cas protein, which may function in the adaptation process which mediates the incorporation of foreign nucleic acids into the microbial host genome. Csn 2 may interact directly with double-stranded DNA. CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats) and associated Cas proteins comprise a system for heritable host defense by prokaryotic cells against phage and other foreign DNA. Csn2 has been predicted to be a functional analog of Cas4 based on anti-correlated phyletic patterns; also known as SPy1049 family.	4.18493e-69

Protein sequences

>NC_017477.1|WP_044025951.1|1199280_1199538_-|hypothetical-protein
MRNLRFKKDDFLFIRTTYPSLFIKFKNSYEENGIVNVPMQNERDYDYYFDIVGDYIATSLNEVGELNEDGLRLEAAWDYADWSQE
>NC_017477.1|WP_044025950.1|1198951_1199182_+|hypothetical-protein
MVTIILVSNSNKEVIYKFLDGNDNYKGQITVNKVDLSYKLKDKEKFTNSYETQAYRLVKRCIQLNKYPSTASKGWG
>NC_017477.1|WP_044025948.1|1197902_1198328_-|HIRAN-domain-containing-protein
MSMYRNDDVLITDLMDRISNLENQMTELKKIYYKQSGESHSTFLYGCEVRGSDYLHLEDKIVPRLKENDPVLLVREADNKYDKNAISVTTPSGLKLGYIPHEHNLIFSRLIDAGNLLFGRVKTFHWDGKNLELVIKVYLAG
>NC_017477.1|WP_014567558.1|1196777_1197695_-|M48-family-metallopeptidase
MLYKQIEQNKRNTWIILGLYTLLILIISIFLGMLFTVYIGGAFFIIGLIYIAHVYFDATRHLMKVTNAVEITKETEPQIYELVEELCLAGGLPVPKLYITPDQAPNAFATGRDPQHASLALTQGLLNMMNKKEVQGVIGHELSHIRNYDTRITVLASALTSLITMTGVGIAVFGWTALTSENKGLLGLLIKFFALFLIIVGGVISIIGIPIAKLLFLLVSRQREYLADIGSVDLTREPSGLISALSKLEKLEEGESTPQIGSQDLALQYLYFNFPSAHNWISRLFSDHPPLDKRIERLENSNRIK
>NC_017477.1|WP_014567557.1|1195323_1196052_-|hypothetical-protein
MGLGTSACSSQTNNSSSKQTTTSRSKKSVEKTDENSSESTKRSKKDLSTAADNQANNSNSNDGKAYGGNFQDSKGYIAINNVTNVTVKNSNDDEHYALVQGTFTNNAKESVDPTSFFSDHLKVMEKVGKATYDLVLVTTDIENELTPWGNQIKEGRKKVEPNMTGNFVIVYKLDPANGAKTNATHYVFEPYDSKFGKSLTVKVYESKTIKKSSDNAGSNSHSDESTDTNSSADTSSDVDTDD
>NC_017477.1|WP_014567556.1|1194415_1195258_+|hypothetical-protein
MTLQINTRVDSITWPLNQNLTNQEIISQLELTVTENGHLISNDNLSINKKAVNRSEAGVYPVIITAIGTNNEYATKKIQAWVTDKNNVVDSSPTPQPAPAKPAQYTSSNKPASPKKKGKKKIVYIVLGVLVLLIAIIFGISACQAHNDTVQNEQAQSNALNNTNSKLDNLSEQNKQLMQQNKELQSAINTYKQDQNKEELQNQLNQIKTENEQLKNNAANNQALQNQINQLGSTIDQIKQNPNQADSLLDQMKNNQNEFMQNLNATFQKLVSDFQQLIGQ
>NC_017477.1|WP_014567555.1|1193823_1194264_-|8-oxo-dGTP-diphosphatase
MKRSEAVTLTNMCMIKNKDKILVLNRTDPVWPGLTFPGGHVESHEAFHDSVVREIKEETGLEIKDPRLVGVKQFFDHNDERYLVFFYVATKFTGTLKASDEGDLTWMTREEIEKSKLAYNFDHDLPIFFDEKLSEHILDGDRDQTY
>NC_017477.1|WP_014567554.1|1193134_1193794_+|hypothetical-protein
MEEINLKKLIVGALSCSLLLLAGCRNNLVEPKHKSSAADYAIIQSSHKQSHKKVEKEKPKNKDDKKEKSEKTDQKKDEDIKMDDQLDSLQNKEEQSSSESQSSSSSSTPTPIQRSEHKASSTLPKSNFGTSFYTVPRRNYSYYNPQPNYYFDNNWTTNSNANATTQSSATSSSNSENSTTSSSSTASSESSSSSSKETETPASQNNESESTSSTENTQD
>NC_017477.1|WP_004897486.1|1192528_1192930_-|hypothetical-protein
MYDLEDVLMKSFREDNGISSAFSIEPIDDNEYRVSTNVVDGLNDTIHFYLVVYPNGTYALNDRVFTAQMIDNNIGSFASIASDVARLASEFGVLLDDRGELTRDYINARDLRDEVNNFTQLLNRVVEFAQIHR
>NC_017477.1|WP_004897483.1|1192059_1192440_-|DUF1828-domain-containing-protein
MKDSEIELIGQKAMNWLKENIHFIKAGSDIEVATPLIGAYGDLVYCWIEKEDDYYRITDDGGTLFKLDPGQENMDLLEEAMDIVIGAGFEFDEETLEIYQVVDQEDIPATLNDLTQLQVALTYLAS
>NC_017477.1|WP_014567559.1|1201644_1202313_-|type-II-A-CRISPR-associated-protein-Csn2
MIFSYLSHKKMSLNGYGMQIIATSSPIAYQDITQSFQNEKQMILISDDEYNQLDINKNFDFIGDLLLTKNILDKYMLLIVKKYIENLDEDNRNKIIKAYYNLESLVQDSLFLEDLPLELDFSEDLKKFLKLENLHLDSKFLKEPYAIIESILRIHQTCNLKTVPVVCNVAHYLDSTQLNMLNNLLKSMKLKMILIEFTSKDILVYPKDADYFYIDQDLVDWY
>NC_017477.1|WP_044025953.1|1202309_1202615_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2
MRLMIMFDLPVDTADERREYRQFRKRLINEGFLMIQYSIYERVCVSRKTATFLENRIKSFLPTSGVVQSLMVTEKQYNDMHFLVGDPVRDVRNSSDRTVIL
>NC_017477.1|WP_044025954.1|1202592_1203501_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1
MGWRSVIITQHAKLTYSMNMMIVQTRDGVNQIPIDDINLVLISTSQAVITSALISKLAEKQSKVIFVDDKYQPISETVDYYPGSRNLAKLENQFRWNEKRKELLWTKIVTRKIQNQIAVLQNYKLDGEDIQEELDRIEINDSTNREALAARKYFMKMFGKDFIRRNSDVINAALDYGYAILLSAFDREIAVNGYLSYLGIHHHSQENQFNLGSDLMEPFRPVVDYWVKAHENISEFTPDIKFGLVELLSLEIKFNRKRTILSNAITVYVRDCLRFLSGEIDKVKIEMELIHEVPNDAINDNV
>NC_017477.1|WP_014567561.1|1203707_1207835_-|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9
MTKIKDDYIVGLDIGTDSCGWVAMNSNNDILKLQGKTAIGSRLFEGGKSAAERRLFRTTHRRIKRRRWRLKLLEEFFDPYMAEVDPYFFARLKESGLSPLDKRKTVSSIVFPTSAEDKKFYDDYPTIYHLRYKLMTEDEKFDLREVYLAIHHIIKYRGNFLYNTSVKDFKASKIDVKSSIEKLNELYENLGLDLNVEFNISNTAEIEKVLKDKQIFKRDKVKKIAELFAIKTDNKEQSKRIKDISKQVANAVLGYKTRFDTIALKEISKDELSDWNFKLSDIDADSKFEALMGNLDENEQAILLTIKELFNEVTLNGIVEDGNTLSESMINKYNDHRDDLKLLKEVIENHIDRKKAKELALAYDLYVNNRHGQLLQAKKKLGKIKPRSKEDFYKVVNKNLDDSRASKEIKKKIELDSFMPKQRTNANGVIPYQLQQLELDKIIENQSKYYPFLKEINPVSSHLKEAPYKLDELIRFRVPYYVGPLISPNESTKDIQTKKNQNFAWMIRKEEGRITPWNFDQKVDRIESANKFIKRMTTKDTYLFGEDVLPANSLLYQKFTVLNELNNIRINGKRISVDLKQEIYENLFKKHTTVTVKKLENYLKENHNLVKVEIKGLADEKKFNSGLTTYNRFKNLNIFDNQIDDLKYRNDFEKIIEWSTIFEDKSIYKEKLRSIDWLNEKQINALSNIRLQGWGRLSKKLLAQLHDHNGQTIIEQLWDSQNNFMQIVTQADFKDAIAKANQNLLVATSVEDILNNAYTSPANKKAIRQVIKVVDDIVKAASGKVPKQIAIEFTRDADENPKRSQTRGSKLQKVYKDLSTELASKTIAEELNEAIKDKKLVQDKYYLYFMQLGRDAYTGEPINIDEIQKYDIDHILPQSFIKDDALDNRVLVSRAVNNGKSDNVPVKLFGNEMAANLGMTIRKMWEEWKNIGLISKTKYNNLLTDPDHINKYKSAGFIRRQLVETSQIIKLVSTILQSRYPNTEIITVKAKYNHYLREKFDLYKSREVNDYHHAIDAYLSAICGNLLYQNYPNLRPFFVYGQYKKFSSDPDKEKAIFNKTRKFSFISQLLKNKSENSKEIAKKLKRAYQFKYMLVSRETETRDQEMFKMTVYPRFSHDTVKAPRNLIPKKMGMSPDIYGGYTNNSDAYMVIVRIDKKKGTEYKILGIPTRELVNLKKAEKEDHYKSYLKEILTPRILYNKNGKRDKKITSFEIVKSKIPYKQVIQDGDKKFMLGSSTYVYNAKQLTLSTESMKAITNNFDKDSDENDALIKAYDEILDKVDKYLPLFDINKFREKLHSGREKFIKLSLEDKKDTILKVLEGLHDNAVMTKIPTIGLSTPLGFMQFPNGVILSENAKLIYQSPTGLFKKSVKISDL
>NC_017477.1|WP_014567562.1|1208620_1209607_-|dTDP-4-dehydrorhamnose-reductase
MKVFVTGVNGQLGHDVMNELAKRGYEGVGSDLAPEYAGVADGTAVTKAPYVSLDITDAAAVDKVISEVNPDVIVHCAAWTAVDMAEDDDKVAAVRKVNVDGTQNIANVAKKLDAPMVYLSTDYVFDGQGTTPWKPDFKGYKPLNVYGETKLGGEEAVANTLDKYFIVRIAWVFGVNGSNFIKTMLKVGSNHEEVKVVSDQVGTPTYTFDLARLLVDMIETDKYGYYHATNAELPASEGDHDENGTKTGYISWYDFTKEIYRQAGYKTRVTPVTTEEYGLSKAVRPFNSRLDKSKLEENGFKPLPTWPDAISRYLDILKADGFFDELGK
>NC_017477.1|WP_014567563.1|1209623_1210232_-|dTDP-4-dehydrorhamnose-3,5-epimerase
MGQIKVEKNVGGIEGLAVITPTVHGDDRGYFMETFNQRDMMDAGFSINFVQDNQSSSTKGVLRGLHFQKKYPQIKLVRAVRGSVFDVAVDLRSDSKTYGKWYGVELTAENKKQFLIPQGFAHGFLVLSDEAEFCYKVNDFWHQNDEGGMAWNDPEIGIEWPHLKGDYPGSPDASGYTLDDGTKLTLSDRDQEWKGLKDTFKF
>NC_017477.1|WP_014567564.1|1210261_1211146_-|glucose-1-phosphate-thymidylyltransferase-RfbA
MKGIILAGGSGTRLYPLTLVTSKQLLPVYDKPMIYYPLSTLMLAGIKDILVISTPADTPRFKELLGDGSQFGVNLSYKVQPSPDGLAQAFTLGEDFINGEACAMVLGDNIFYGNGFTDLLKNAAEDAQKGKATVFGYYVNDPERFGVIGFDENGNVVSIEEKPEHPKSNYAVTGLYFYPAGVSEKAAQVKPSTRGEVEITSLNDMYLQDDNLGVQLLGRGYAWLDTGTMQSLVDASNYVKMIEERQGVSVSAPEEIAYVHGWINKDQLLEAAKHYGKSPYGKHLKSVAEGKVRY
>NC_017477.1|WP_014567565.1|1211152_1212190_-|dTDP-glucose-4,6-dehydratase
MKVIVTGGAGFIGSNFVFYMLKKHPDYEIICLDSLTYAGNLSTLKDVMDNPNFKFVKLDIRDREGVYKLFEEEKPNVVVNFAAESHVDRSIENPEIFLETNIIGTSVLMDACRKYGIKRFHQVSTDEVYGDLPLDRPDLFFHEDTPLHTSSPYSSSKASADLLVGAYGRTFNLPVTISRCSNNYGPYQFPEKLIPLMIQRALNNEKLPVYGDGKNVRDWLYVEDHCKAIDLILENGKPGEVYNIGGHNEMANIDIVKLICDYLEKPYSLIEHVTDRKGHDRRYAIDPEKIHTELGWLPETMFKDGIKKTIQWYLDNKEWWENIISGDYQNYYDEMYGKKQVLDKD
>NC_017477.1|WP_144018423.1|1212320_1213493_-|methyltransferase-domain-containing-protein
MRTYYTSGEFAKKAHVSIRTIRYYDQKNLLKPSTHTASGARRYTDADFAKLQQILLLKYLGFSLTDIREMTLGSGDRQLLLDSLQIQKRLVEERLKEMQNVAAAIDSTSSTLKAGQEVDWNKMLDLIHLTSMNQYLSTQYQNASNISARIKLHRDYSLNKEGWFHWLFRQLDLKPGMKILELGAGNGTLWAQNLDRIPKGLTIVLSDISEGILADAKNEIGDRAEFQYAVFDAQKIPFADNTFDLVIANHMLFYCDNIPRTLKEVKRVMKKGASFACSTYSKRHMHEITDLVQEFNPEIVLSSTNLYDLFGLDNGAEILSHDFTDVTCHKYEDAIELSESTPVISYILSCHGNQNSILLDHYNEFKNYVDDKVSDGFHITKDAGYFICKK
>NC_017477.1|WP_187286467.1|1213763_1213904_-|hypothetical-protein
MSKYTVETKLKVIEKLLSHEIFIPYYDTVKNKGLDMFGEIDWNEER

MGE targeting detection<

CRISPR_ID	Spacer_Info	Spacer_region	Spacer_length	Hit_phage_ID	Hit_phage_def	Protospacer_location	Mismatch	Identity
NC_017477_1	1.12|1200556|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1200556-1200585	30	NC_010179	Lactobacillus johnsonii prophage Lj771, complete genome	9799-9828	0	1.0
NC_017477_1	1.12|1200556|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1200556-1200585	30	NC_024206	Lactobacillus phage phi jlb1, complete genome	8707-8736	0	1.0
NC_017477_1	1.15|1200754|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1200754-1200783	30	NC_005354	Lactobacillus prophage Lj928, complete genome	35335-35364	0	1.0
NC_017477_1	1.15|1200754|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1200754-1200783	30	AY459533	Lactobacillus johnsonii prophage Lj928, complete genome	35335-35364	0	1.0
NC_017477_1	1.4|1200028|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1200028-1200057	30	AJ131519	Lactobacillus bacteriophage phi adh complete genome	9866-9895	3	0.9
NC_017477_1	1.4|1200028|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1200028-1200057	30	NC_000896	Lactobacillus prophage phiadh, complete genome	9866-9895	3	0.9
NC_017477_1	1.11|1200490|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1200490-1200519	30	MF547662	Clostridioides phage LIBA6276, complete genome	75730-75759	4	0.867
NC_017477_1	1.11|1200490|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1200490-1200519	30	MF547663	Clostridioides phage LIBA2945, complete genome	74453-74482	4	0.867
NC_017477_1	1.1|1199830|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT	1199830-1199859	30	MK448815	Streptococcus phage Javan585, complete genome	5478-5507	5	0.833
NC_017477_1	1.2|1199896|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1199896-1199925	30	NZ_CP039265	Lactobacillus johnsonii strain DC22.2 plasmid pLjDC22.2_4, complete sequence	2599-2628	5	0.833
NC_017477_1	1.1|1199830|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT	1199830-1199859	30	MK448992	Streptococcus phage Javan6, complete genome	4315-4344	6	0.8
NC_017477_1	1.1|1199830|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT	1199830-1199859	30	MK448888	Streptococcus phage Javan26, complete genome	4315-4344	6	0.8
NC_017477_1	1.1|1199830|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT	1199830-1199859	30	NZ_CP012100	Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-1, complete sequence	405281-405310	6	0.8
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NC_017477_1	1.16|1200820|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1200820-1200849	30	NZ_CP039041	Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence	174290-174319	7	0.767
NC_017477_1	1.17|1200886|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1200886-1200915	30	NZ_CP013982	Staphylococcus equorum strain KM1031 plasmid unnamed2, complete sequence	23805-23834	7	0.767
NC_017477_1	1.17|1200886|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1200886-1200915	30	NZ_CP013982	Staphylococcus equorum strain KM1031 plasmid unnamed2, complete sequence	48969-48998	7	0.767
NC_017477_1	1.26|1201480|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1201480-1201509	30	MN693467	Marine virus AFVG_25M393, complete genome	23462-23491	7	0.767
NC_017477_1	1.26|1201480|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1201480-1201509	30	GQ451696	Leuconostoc phage 1-A4, complete genome	6607-6636	7	0.767
NC_017477_1	1.1|1199830|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT	1199830-1199859	30	NZ_LR214943	Mycoplasma orale strain NCTC10112 plasmid 4	1004-1033	8	0.733
NC_017477_1	1.1|1199830|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT	1199830-1199859	30	MK448894	Streptococcus phage Javan272, complete genome	4067-4096	8	0.733
NC_017477_1	1.1|1199830|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT	1199830-1199859	30	MK448725	Streptococcus phage Javan275, complete genome	4066-4095	8	0.733
NC_017477_1	1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1200226-1200255	30	NZ_CP019739	Lactobacillus brevis strain TMW 1.2108 plasmid pl12108-5, complete sequence	27005-27034	8	0.733
NC_017477_1	1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1200292-1200321	30	NZ_CP019739	Lactobacillus brevis strain TMW 1.2108 plasmid pl12108-5, complete sequence	27005-27034	8	0.733
NC_017477_1	1.11|1200490|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1200490-1200519	30	AP013359	Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G1, isolate: uvMED-CGR-U-MedDCM-OCT-S28-C23	29525-29554	8	0.733
NC_017477_1	1.11|1200490|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1200490-1200519	30	NZ_CP013198	Spiroplasma citri strain R8-A2 plasmid pSCI26, complete sequence	16321-16350	8	0.733
NC_017477_1	1.11|1200490|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1200490-1200519	30	NZ_CP013240	Clostridium butyricum strain CDC_51208 plasmid pNPD4_1, complete sequence	6243-6272	8	0.733
NC_017477_1	1.11|1200490|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1200490-1200519	30	NZ_CP047434	Spiroplasma citri strain BLH-13 plasmid pSciBLH13-6	70641-70670	8	0.733
NC_017477_1	1.11|1200490|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1200490-1200519	30	NZ_CP013199	Spiroplasma citri strain R8-A2 plasmid pSCI15, complete sequence	6356-6385	8	0.733
NC_017477_1	1.12|1200556|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1200556-1200585	30	MN693498	Marine virus AFVG_25M563, complete genome	29278-29307	8	0.733
NC_017477_1	1.17|1200886|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1200886-1200915	30	NZ_CP025124	Planococcus sp. MB-3u-03 plasmid unnamed1, complete sequence	46400-46429	8	0.733
NC_017477_1	1.24|1201348|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1201348-1201377	30	NZ_CP045351	Vibrio sp. THAF100 plasmid pTHAF100_a, complete sequence	632003-632032	8	0.733
NC_017477_1	1.24|1201348|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1201348-1201377	30	MK250021	Prevotella phage Lak-B2, complete genome	494176-494205	8	0.733
NC_017477_1	1.24|1201348|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1201348-1201377	30	MK250024	Prevotella phage Lak-B5, complete genome	487359-487388	8	0.733
NC_017477_1	1.24|1201348|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1201348-1201377	30	MK250028	Prevotella phage Lak-B9, complete genome	491790-491819	8	0.733
NC_017477_1	1.24|1201348|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1201348-1201377	30	MK250023	Prevotella phage Lak-B4, complete genome	493407-493436	8	0.733
NC_017477_1	1.24|1201348|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1201348-1201377	30	MK250025	Prevotella phage Lak-B6, complete genome	490453-490482	8	0.733
NC_017477_1	1.24|1201348|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1201348-1201377	30	MK250022	Prevotella phage Lak-B3, complete genome	490543-490572	8	0.733
NC_017477_1	1.24|1201348|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1201348-1201377	30	MK250027	Prevotella phage Lak-B8, complete genome	493938-493967	8	0.733
NC_017477_1	1.24|1201348|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1201348-1201377	30	MK250026	Prevotella phage Lak-B7, complete genome	492975-493004	8	0.733
NC_017477_1	1.24|1201348|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1201348-1201377	30	MK250020	Prevotella phage Lak-B1, complete genome	491773-491802	8	0.733
NC_017477_1	1.26|1201480|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1201480-1201509	30	NZ_CP013419	Burkholderia sp. MSMB0266 plasmid pMSMB0266, complete sequence	327563-327592	8	0.733
NC_017477_1	1.26|1201480|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1201480-1201509	30	NZ_CP032123	Acinetobacter lwoffii strain ED45-23 plasmid pALWED2.8, complete sequence	727-756	8	0.733
NC_017477_1	1.1|1199830|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT	1199830-1199859	30	MT774392	CrAssphage cr128_1, complete genome	91119-91148	9	0.7
NC_017477_1	1.2|1199896|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1199896-1199925	30	NZ_CP024444	Moraxella osloensis strain NP7 plasmid pNP7-1, complete sequence	5385-5414	9	0.7
NC_017477_1	1.2|1199896|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1199896-1199925	30	NZ_CP040258	Moraxella osloensis strain MOXF1 plasmid pMOXF1, complete sequence	4680-4709	9	0.7
NC_017477_1	1.3|1199962|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1199962-1199991	30	NZ_CP031992	Acinetobacter haemolyticus strain 2126ch plasmid pAhaem2126chf, complete sequence	41085-41114	9	0.7
NC_017477_1	1.3|1199962|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1199962-1199991	30	NZ_CP018872	Acinetobacter haemolyticus strain TJS01 plasmid pAHTJS1, complete sequence	40955-40984	9	0.7
NC_017477_1	1.2|1199896|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1199896-1199925	30	MN694537	Marine virus AFVG_250M1002, complete genome	38418-38447	10	0.667

1. spacer 1.12|1200556|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_010179 (Lactobacillus johnsonii prophage Lj771, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

caaaaccatctgaatcaaaatcacagcagg	CRISPR spacer
caaaaccatctgaatcaaaatcacagcagg	Protospacer
******************************

2. spacer 1.12|1200556|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_024206 (Lactobacillus phage phi jlb1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

caaaaccatctgaatcaaaatcacagcagg	CRISPR spacer
caaaaccatctgaatcaaaatcacagcagg	Protospacer
******************************

3. spacer 1.15|1200754|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_005354 (Lactobacillus prophage Lj928, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

ggagcgttaaatacacttttgactaatttg	CRISPR spacer
ggagcgttaaatacacttttgactaatttg	Protospacer
******************************

4. spacer 1.15|1200754|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AY459533 (Lactobacillus johnsonii prophage Lj928, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

ggagcgttaaatacacttttgactaatttg	CRISPR spacer
ggagcgttaaatacacttttgactaatttg	Protospacer
******************************

5. spacer 1.4|1200028|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AJ131519 (Lactobacillus bacteriophage phi adh complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9

taaacgtatcaatctctgtatgtttgctta	CRISPR spacer
agaacgtatcaatctctgtatgttcgctta	Protospacer
 .**********************.*****

6. spacer 1.4|1200028|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_000896 (Lactobacillus prophage phiadh, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9

taaacgtatcaatctctgtatgtttgctta	CRISPR spacer
agaacgtatcaatctctgtatgttcgctta	Protospacer
 .**********************.*****

7. spacer 1.11|1200490|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF547662 (Clostridioides phage LIBA6276, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.867

tcctatcttttaataattcacgtatttctt	CRISPR spacer
tattatcttttaataattcatctatttctt	Protospacer
* .*****************. ********

8. spacer 1.11|1200490|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF547663 (Clostridioides phage LIBA2945, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.867

tcctatcttttaataattcacgtatttctt	CRISPR spacer
tattatcttttaataattcatctatttctt	Protospacer
* .*****************. ********

9. spacer 1.1|1199830|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448815 (Streptococcus phage Javan585, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833

gttataatcctcttgtataattatattttt	CRISPR spacer
gatataatcctcttgtatgtttatatttga	Protospacer
* ****************. ********  

10. spacer 1.2|1199896|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP039265 (Lactobacillus johnsonii strain DC22.2 plasmid pLjDC22.2_4, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833

cttttgctttatcttcaacatcatccatag	CRISPR spacer
ctttagctttatcttcaacagcatcccaac	Protospacer
**** *************** *****  * 

11. spacer 1.1|1199830|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448992 (Streptococcus phage Javan6, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

gttataatcctcttgtataattatattttt	CRISPR spacer
gatataatcctcttgtatctttatatatga	Protospacer
* ****************  ****** *  

12. spacer 1.1|1199830|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448888 (Streptococcus phage Javan26, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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gatataatcctcttgtatctttatatatga	Protospacer
* ****************  ****** *  

13. spacer 1.1|1199830|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP012100 (Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

----gttataatcctcttgtataattatattttt	CRISPR spacer
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    ***    ***** ***** ***********

14. spacer 1.2|1199896|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_014390 (Butyrivibrio proteoclasticus B316 plasmid pCY186, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

cttttgctttatcttcaacatcatccatag	CRISPR spacer
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******************.****  *  *.

15. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN539736 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM-A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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** .* *************** ******. 

16. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KY581279 (Staphylococcus phage pSa-3, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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** .* *************** ******. 

17. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ206562 (Staphylococcus phage 812 isolate host-range mutant 812F1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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** .* *************** ******. 

18. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK417514 (Staphylococcus virus Sa83, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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** .* *************** ******. 

19. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK584893 (Staphylococcus phage vBSM-A1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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** .* *************** ******. 

20. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN336263 (Staphylococcus phage Sb1M_9832, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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** .* *************** ******. 

21. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH107769 (Staphylococcus phage vB_SauM_0414_108, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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** .* *************** ******. 

22. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN336262 (Staphylococcus phage Sb1M_6168, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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** .* *************** ******. 

23. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AY954969 (Bacteriophage G1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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** .* *************** ******. 

24. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN539738 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM-D, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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** .* *************** ******. 

25. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT080601 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW72, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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** .* *************** ******. 

26. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK331931 (Staphylococcus phage Sa30, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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** .* *************** ******. 

27. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT080600 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW71, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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** .* *************** ******. 

28. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT080585 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW18, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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** .* *************** ******. 

29. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ206563 (Staphylococcus phage 812 isolate host-range mutant K1/420, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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** .* *************** ******. 

30. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to JX080302 (Staphylococcus phage 676Z, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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** .* *************** ******. 

31. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN045228 (Staphylococcus phage Maine, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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ttattatctgtatctttagctactatattt	Protospacer
** .* *************** ******. 

32. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN047438 (Staphylococcus phage vB_SauM-515A1) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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** .* *************** ******. 

33. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF405094 (Staphylococcus phage JA1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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34. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KY779849 (Staphylococcus phage qdsa002, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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35. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN336261 (Staphylococcus phage Sb1_8383, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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36. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN539737 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM-C, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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37. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to EU418428 (Staphylococcus phage A5W, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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38. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KP687431 (Staphylococcus phage IME-SA1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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39. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK417516 (Staphylococcus virus J-Sa36, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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40. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT080602 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW74, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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41. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_019726 (Staphylococcus phage JD007, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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42. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ206561 (Staphylococcus phage 812 isolate host-range mutant K1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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43. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_047721 (Staphylococcus phage SA5, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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44. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KP687432 (Staphylococcus phage IME-SA2, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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45. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_047722 (Staphylococcus phage Staph1N, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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46. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK656892 (Staphylococcus phage vBSP-A20, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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47. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT080591 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW29, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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48. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_047723 (Staphylococcus phage A3R, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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49. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_047720 (Staphylococcus phage ISP complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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50. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to JX080303 (Staphylococcus phage Fi200W, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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51. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MG656408 (Staphylococcus phage B1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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52. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KF766114 (Staphylococcus phage K, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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53. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LR215719 (Staphylococcus phage Stab21 genome assembly, chromosome: I) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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54. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KR902361 (Staphylococcus phage IME-SA118, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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55. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH844529 (Staphylococcus phage 812h1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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56. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KC012913 (Staphylococcus phage Team1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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57. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK331930 (Staphylococcus phage CH1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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58. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to JX080305 (Staphylococcus phage P4W, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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59. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ206560 (Staphylococcus phage 812 isolate host-range mutant 812a, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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60. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF398190 (Staphylococcus phage vB_SauM-fRuSau02, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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61. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KR908644 (Staphylococcus phage IME-SA119, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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62. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT554104 (Staphylococcus phage ESa1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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63. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT080589 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW26, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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64. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK417515 (Staphylococcus virus Sa87, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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65. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH844528 (Staphylococcus phage 812, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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66. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_007066 (Staphylococcus phage G1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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67. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to JX080304 (Staphylococcus phage MSA6, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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68. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_023573 (Staphylococcus phage phiSA012 DNA, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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69. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH136584 (Staphylococcus phage HYZ21, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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70. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_019448 (Staphylococcus phage GH15, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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71. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_023009 (Staphylococcus phage Sb-1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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72. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN539736 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM-A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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73. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KY581279 (Staphylococcus phage pSa-3, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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74. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ206562 (Staphylococcus phage 812 isolate host-range mutant 812F1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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75. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK417514 (Staphylococcus virus Sa83, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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76. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK584893 (Staphylococcus phage vBSM-A1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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77. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN336263 (Staphylococcus phage Sb1M_9832, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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78. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH107769 (Staphylococcus phage vB_SauM_0414_108, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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79. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN336262 (Staphylococcus phage Sb1M_6168, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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80. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AY954969 (Bacteriophage G1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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81. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN539738 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM-D, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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82. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT080601 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW72, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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83. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK331931 (Staphylococcus phage Sa30, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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84. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT080600 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW71, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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85. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT080585 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW18, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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86. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ206563 (Staphylococcus phage 812 isolate host-range mutant K1/420, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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87. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to JX080302 (Staphylococcus phage 676Z, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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88. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN045228 (Staphylococcus phage Maine, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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89. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN047438 (Staphylococcus phage vB_SauM-515A1) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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90. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF405094 (Staphylococcus phage JA1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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91. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KY779849 (Staphylococcus phage qdsa002, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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92. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN336261 (Staphylococcus phage Sb1_8383, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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93. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN539737 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM-C, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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94. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to EU418428 (Staphylococcus phage A5W, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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95. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KP687431 (Staphylococcus phage IME-SA1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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96. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK417516 (Staphylococcus virus J-Sa36, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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97. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT080602 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW74, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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98. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_019726 (Staphylococcus phage JD007, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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99. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ206561 (Staphylococcus phage 812 isolate host-range mutant K1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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100. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_047721 (Staphylococcus phage SA5, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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** .* *************** ******. 

101. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KP687432 (Staphylococcus phage IME-SA2, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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** .* *************** ******. 

102. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_047722 (Staphylococcus phage Staph1N, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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** .* *************** ******. 

103. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK656892 (Staphylococcus phage vBSP-A20, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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104. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT080591 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW29, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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** .* *************** ******. 

105. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_047723 (Staphylococcus phage A3R, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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** .* *************** ******. 

106. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_047720 (Staphylococcus phage ISP complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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** .* *************** ******. 

107. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to JX080303 (Staphylococcus phage Fi200W, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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** .* *************** ******. 

108. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MG656408 (Staphylococcus phage B1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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** .* *************** ******. 

109. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KF766114 (Staphylococcus phage K, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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** .* *************** ******. 

110. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LR215719 (Staphylococcus phage Stab21 genome assembly, chromosome: I) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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111. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KR902361 (Staphylococcus phage IME-SA118, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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** .* *************** ******. 

112. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH844529 (Staphylococcus phage 812h1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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** .* *************** ******. 

113. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KC012913 (Staphylococcus phage Team1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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** .* *************** ******. 

114. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK331930 (Staphylococcus phage CH1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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** .* *************** ******. 

115. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to JX080305 (Staphylococcus phage P4W, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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** .* *************** ******. 

116. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ206560 (Staphylococcus phage 812 isolate host-range mutant 812a, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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** .* *************** ******. 

117. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF398190 (Staphylococcus phage vB_SauM-fRuSau02, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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118. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KR908644 (Staphylococcus phage IME-SA119, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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** .* *************** ******. 

119. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT554104 (Staphylococcus phage ESa1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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** .* *************** ******. 

120. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT080589 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW26, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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** .* *************** ******. 

121. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK417515 (Staphylococcus virus Sa87, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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** .* *************** ******. 

122. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH844528 (Staphylococcus phage 812, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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123. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_007066 (Staphylococcus phage G1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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** .* *************** ******. 

124. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to JX080304 (Staphylococcus phage MSA6, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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** .* *************** ******. 

125. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_023573 (Staphylococcus phage phiSA012 DNA, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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** .* *************** ******. 

126. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH136584 (Staphylococcus phage HYZ21, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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** .* *************** ******. 

127. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_019448 (Staphylococcus phage GH15, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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** .* *************** ******. 

128. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_023009 (Staphylococcus phage Sb-1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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** .* *************** ******. 

129. spacer 1.10|1200424|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN856033 (Myoviridae sp. isolate 312, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 ***  .***************** ** **

130. spacer 1.11|1200490|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN694358 (Marine virus AFVG_250M310, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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* .* *  **********.***********

131. spacer 1.17|1200886|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK415403 (CrAssphage ES_ALL_000190F, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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     *********************.***

132. spacer 1.17|1200886|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK415410 (CrAssphage YS1-2_2437, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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     *********************.***

133. spacer 1.19|1201018|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MG983840 (Escherichia phage myPSH1131, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 .***. ******** **** ********* 

134. spacer 1.19|1201018|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT127620 (Escherichia phage PGN6866, partial genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 .***. ******** **** ********* 

135. spacer 1.19|1201018|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MG976803 (Escherichia phage myPSH2311, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 .***. ******** **** ********* 

136. spacer 1.19|1201018|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK373770 (Escherichia phage vB_EcoP_WFI101126, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 .***. ******** **** ********* 

137. spacer 1.19|1201018|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT446410 (UNVERIFIED: Escherichia virus TH38, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 .***. ******** **** ********* 

138. spacer 1.19|1201018|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_027395 (Phage vB_EcoP_SU10, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 .***. ******** **** ********* 

139. spacer 1.19|1201018|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to EU330206 (Enterobacteria phage phiEco32, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 .***. ******** **** ********* 

140. spacer 1.19|1201018|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN045231 (Escherichia phage Paul, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 .***. ******** **** ********* 

141. spacer 1.19|1201018|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN508615 (UNVERIFIED: Escherichia phage ES17, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 .***. ******** **** ********* 

142. spacer 1.19|1201018|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT446386 (UNVERIFIED: Escherichia virus TH06, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 .***. ******** **** ********* 

143. spacer 1.19|1201018|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LC553735 (Escherichia phage O18-011 DNA, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 .***. ******** **** ********* 

144. spacer 1.26|1201480|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN552147 (Leuconostoc phage P974, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 *  * ************* *** ******

145. spacer 1.26|1201480|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KX578044 (Leuconostoc phage CHA, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 *  * ************* *** ******

146. spacer 1.26|1201480|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KC013028 (Leuconostoc phage phiLNTR2, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 *  * ************* *** ******

147. spacer 1.26|1201480|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KC013027 (Leuconostoc phage phiLN34, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 *  * ************* *** ******

148. spacer 1.26|1201480|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KC013029 (Leuconostoc phage phiLNTR3, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 *  * ************* *** ******

149. spacer 1.26|1201480|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KX578043 (Leuconostoc phage CHB, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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-aatagcgtatgccattttttaaacgataaa	Protospacer
 *..** ************* *** ***** 

150. spacer 1.27|1201546|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AP014348 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S38-C73, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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* **   ***** ***************.*

151. spacer 1.2|1199896|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_LR214939 (Mycoplasma salivarium strain NCTC10113 plasmid 2) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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******.*********** *****.. .*.

152. spacer 1.2|1199896|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP046630 (Streptococcus equinus strain CNU G6 plasmid p1_CNU_G6, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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.***** ****** *********** .*  

153. spacer 1.2|1199896|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP046920 (Streptococcus sp. CNU G2 plasmid p_CNU_G2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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.***** ****** *********** .*  

154. spacer 1.11|1200490|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MG543995 (Staphylococcus phage UPMK_1, partial genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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.. ****************  *******  

155. spacer 1.11|1200490|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MG592671 (Vibrio phage 2.275.O._10N.286.54.E11, partial genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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*   *  ************* **.******

156. spacer 1.11|1200490|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_047764 (Lactobacillus phage P1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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*  * ******************..***. 

157. spacer 1.11|1200490|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KY381600 (Lactobacillus phage P2, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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*  * ******************..***. 

158. spacer 1.11|1200490|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MG744354 (Lactobacillus phage Satyr, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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*  * ******************..***. 

159. spacer 1.11|1200490|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MG765274 (Lactobacillus phage Maenad, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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*  * ******************..***. 

160. spacer 1.12|1200556|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_LR215019 (Mycoplasma canis strain NCTC10146 plasmid 10) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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161. spacer 1.12|1200556|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_LR215019 (Mycoplasma canis strain NCTC10146 plasmid 10) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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**********  ***********.*  *. 

162. spacer 1.16|1200820|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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* . ..******** **.************

163. spacer 1.17|1200886|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP013982 (Staphylococcus equorum strain KM1031 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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* * . ****.***** ************.

164. spacer 1.17|1200886|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP013982 (Staphylococcus equorum strain KM1031 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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* * . ****.***** ************.

165. spacer 1.26|1201480|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN693467 (Marine virus AFVG_25M393, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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.*** ****************    *** *    

166. spacer 1.26|1201480|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to GQ451696 (Leuconostoc phage 1-A4, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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 *  * ************* *** ***** 

167. spacer 1.1|1199830|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR214943 (Mycoplasma orale strain NCTC10112 plasmid 4) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 *.*  .. ***** ***************

168. spacer 1.1|1199830|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448894 (Streptococcus phage Javan272, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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****************.** ***  *    

169. spacer 1.1|1199830|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448725 (Streptococcus phage Javan275, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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****************.** ***  *    

170. spacer 1.7|1200226|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP019739 (Lactobacillus brevis strain TMW 1.2108 plasmid pl12108-5, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 *.  *** ********.**********..

171. spacer 1.8|1200292|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP019739 (Lactobacillus brevis strain TMW 1.2108 plasmid pl12108-5, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 *.  *** ********.**********..

172. spacer 1.11|1200490|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AP013359 (Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G1, isolate: uvMED-CGR-U-MedDCM-OCT-S28-C23) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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   .************** * *******  

173. spacer 1.11|1200490|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP013198 (Spiroplasma citri strain R8-A2 plasmid pSCI26, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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  *.*****************  ****.  

174. spacer 1.11|1200490|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP013240 (Clostridium butyricum strain CDC_51208 plasmid pNPD4_1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 . *   ************  *********

175. spacer 1.11|1200490|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP047434 (Spiroplasma citri strain BLH-13 plasmid pSciBLH13-6) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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  *.*****************  ****.  

176. spacer 1.11|1200490|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP013199 (Spiroplasma citri strain R8-A2 plasmid pSCI15, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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  *.*****************  ****.  

177. spacer 1.12|1200556|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN693498 (Marine virus AFVG_25M563, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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*********.*****.******* .. *  

178. spacer 1.17|1200886|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP025124 (Planococcus sp. MB-3u-03 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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    * *********** ******* ***.

179. spacer 1.24|1201348|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP045351 (Vibrio sp. THAF100 plasmid pTHAF100_a, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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...** ****************** **.  

180. spacer 1.24|1201348|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK250021 (Prevotella phage Lak-B2, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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.* .*   .**********.**********

181. spacer 1.24|1201348|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK250024 (Prevotella phage Lak-B5, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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.* .*   .**********.**********

182. spacer 1.24|1201348|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK250028 (Prevotella phage Lak-B9, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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.* .*   .**********.**********

183. spacer 1.24|1201348|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK250023 (Prevotella phage Lak-B4, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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.* .*   .**********.**********

184. spacer 1.24|1201348|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK250025 (Prevotella phage Lak-B6, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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185. spacer 1.24|1201348|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK250022 (Prevotella phage Lak-B3, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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.* .*   .**********.**********

186. spacer 1.24|1201348|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK250027 (Prevotella phage Lak-B8, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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.* .*   .**********.**********

187. spacer 1.24|1201348|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK250026 (Prevotella phage Lak-B7, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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.* .*   .**********.**********

188. spacer 1.24|1201348|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK250020 (Prevotella phage Lak-B1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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.* .*   .**********.**********

189. spacer 1.26|1201480|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP013419 (Burkholderia sp. MSMB0266 plasmid pMSMB0266, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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.******.**************. .*  .*

190. spacer 1.26|1201480|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP032123 (Acinetobacter lwoffii strain ED45-23 plasmid pALWED2.8, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 *.************ ******* **    

191. spacer 1.1|1199830|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT774392 (CrAssphage cr128_1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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 . **********  ***********.  .

192. spacer 1.2|1199896|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP024444 (Moraxella osloensis strain NP7 plasmid pNP7-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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 ***************** ***....*   

193. spacer 1.2|1199896|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP040258 (Moraxella osloensis strain MOXF1 plasmid pMOXF1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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 ***************** ***....*   

194. spacer 1.3|1199962|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP031992 (Acinetobacter haemolyticus strain 2126ch plasmid pAhaem2126chf, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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****************** **  ... * .

195. spacer 1.3|1199962|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP018872 (Acinetobacter haemolyticus strain TJS01 plasmid pAHTJS1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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****************** **  ... * .

196. spacer 1.2|1199896|30|NC_017477|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN694537 (Marine virus AFVG_250M1002, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.667

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. .  ***************** ***   .

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	522376 : 602432	59	uncultured_virus(23.08%)	bacteriocin,tRNA,transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_2	638939 : 673639	37	Bacillus_phage(50.0%)	bacteriocin,transposase	NA
DBSCAN-SWA_3	814422 : 918308	109	Lactobacillus_prophage(53.73%)	holin,capsid,transposase,head,tRNA,portal,tail,terminase,integrase,protease	attL 837654:837671|attR 892119:892136

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NC_017477|522376:602432|DBSCAN-SWA
GATGACGAGGACTTGCCCTCGCACTACCGAAACTATTACCTATAAGAGACGCAAGCGAGTCGGCAGAAAGCAAGACGTCTTAGACTCTCTGCCGGGTGAGGAGGTTCATCACCGTTTGGATGACCTTACCTGTCCAGACTGCCAACACGAACTGAAAGAGATCGGCAGCTTCTGTGCTAGACAAGAGCTACTCTACATTCCAGCCCAAGTTAAGAGAATCGATCACATCCAACACTCTTACAAGTGCCAGCACTGCAGTGATAAAGCGCCAGCTGACAAGATTATCAAAGCTCCTGTACCCAAGGCCCCGTTAACCAACAGTCTTGGCTCAGCTTCTTTGATCGCTAATACGATCTATCAGAAGTACGTTCTCAAGGTTCCTGCCTACCGACAGGAGAAGGACTTGCAGCGTATGGGCCTTCCGCTTGATCACAAGACGGTTTCGAATTGGCATATCAAGGTCTGCGAGTACTACCTCTCTAGCCTTTACGAGCTCTTGAGACAAGAGCTGCTAAAGCTGGATGTCATTCACGCAGATGAGACGCCATATCGAGTCTTAGACAGCGAAAGAGTCAAAGACTACGTCTGGACTTTCTTGTCAGGCAAGCATACCGAAAAGCCGATAGTCCTATATCACCATGGATCACGAAAAGGAGCAGAAGCGTGGGATTTCCTTACAGGCTTCAGCGGATACCTTCATTGTGATCAATATCCTGGCTATTTACGATTAAGCCAGCAAGATGTGACTCTTGTAGGCTGTATGGCTCATGCAAGGCGGAAGTTCTGTGATTCCTTGCCTAAAGACAAGGCCAGAGAATCCGACGCTACTTCGGTGGCTAATCAAGGGATCCACTACTGTAATCAAATGTTTCGCCTGGAGCGCGCCTGGGAAGACCTTTCCGCTGAAGAAAGATACGAGAAGCGTCAGTCCGAATTAAAGCCTCTGCTAGAGAAGTTTTCCGACTGGTGCTCCAAGAAATCAATCTCCGTGTTGCCTTCCGGCAAGCTAGGGATAGCCTTCCAGTATTGCATAAAGCACATGGACAAGTTCATGAACGTCCTAAAAGATGGTTGCCTTGAACTGTCCAACAACAGAGCAGAACGAGCAGTCAAAGAGATCGTCATGGGACGCAAGAACTGGCTCTTTTCACAGAGCAGTACCGGCGCCAAATCCATGGCAATTATTATGAGCATACTCGAAACTGCCAAGCAAAATGGCTTGGATCAATTCAAATATATCAACTATCTTCTGGACAAATTGCCCAATGAGCTGTCATTATTAGACACTCAACGTCTGGAAGCCTATTTACCATGGGCTGAGAATGTCCAGCTCCACTGTAAATAAAGTCCCATAAACTGATTAATCCCATCTTAGCATTGCTAGGATGGGATTTTAATATACTCTGCTATTGGGTGCTTACGATTTACCAGACTTATCTGTGAGTCAAGATACCGTTAAAATGATAAGGTGCTATCAGCTGTAGGCCTTTTTCCAAGATTAATCAATAGGCAAGAACTCGTTTTTGAGTACTTGCCTATTTTTTGTAAAATCATAAGTTAATCGCAACAATAAAATGATAAATAATGGATGATTAGGAAACGCTAGAAAGAGCAACATAAAGCTAGTAAGCGGTTTCAAATAAATACAAATGAGTTAAGTAAATTAGTATAGCTGAATTGTTTAAAAAATGTTCGTTATATGTTATGATACTTGTTAGGTTATAAGAATATAGCTTAAAAAGAGAAGACTTATATCAAAGCTATTGTGCTTTTCATAGAAAGTGGGGGATTATAAAATGTTGTCTAAGAACAACCGGAAGCTGCAAGAGCGCAAGCTTCAAGAAAAACAACGTTTTGGATTTAGAAAATATAGTTTTGGCTTAGCTTCAGCCTTGCTTGGTGTGTCATTCATGCTGGGGACTGGTAGTACGGTTTCAGCTGCTACGACTACTCCATCTGAAACTGTAGCAGCCACTAAGAGTGATATTTATTCGGGTACTGGGGCAGGAGATAAAGCAACTGACAATAAGATCACTCCTGCAACTAGTCAATCAGGCGCTAGTGCTACTGAGAAGCCAACTGGTTCAGCTGCCCAAGCAACTGACAATAAGATCACTCCTGCAACTAGTCAATCAGGCGCTAGTGCTACTGAGAAGCCAACTGGTTCAGCTGCCCAAGCAACTGACAATAAGATCACTCCTGCAACTAGTCAATCAGGCGCTAGTGCTGAAAAGGCAACTGATTCAGCTGCACAAGCAACTAATGCGTTAAAGGCAGCTGCTGTAGCAACTGACGCTTCAGCAACTACTACTGATGCAGATTCAACGATCACTGCAACTGATGATGCTGCATCTGCAAAAGGTAAGATCACTGACGAAGGCAAATCAAAGGGCTTGACTGACAGTGATGTTGACCCAGAGATGAGCGATGCTAACGGGGCAAGTTTGGTCGCTGATGATTCAAATATCCCAAGTGGTTACAAGGCTGACCCGACTGAAGGGCGCTACACGTTTGGGATTGTCAGCTTAGGTGGTGACTTTGATAAATGGGTTAAGGGTGACGCTAGCAAATTTAAGAGCTACAACGGTGAAAATAAAACCAACTACTATTTACGATTCTCAACTAGCAAAAACGCAACTAGTGGTACATATGACAGTACTGTACATGCACAAGTAGTTGATGCTACTACTGATACAGTTAAATGGGAACAGGCTTTAACTCCTAACTCGGGTGCAGTAAAAGTTAATAATGGTACTGACGGGTTTGAATTATCTAGTAAAGTAGCTGGCGTTACTCAATATTATGAACTTAAGTATACTGATACTAAGATTGGCAATGCTTCTACTTCTCGGATTACGATTAATCCTAATAACGGTAGTTTAACTGCAGTAACTGTTTATAGTAATGGTAAAGCAATACCTGCTGGTAGCGCTACTCCTGGGACCTATACATCAGTATTGTTCCCAGCTACGGGGGTCATCAAAACTGAATATATTGCCCGAGATGCAAAAGGAAATGAAACTACCTTGGCAACATACGAAGAAGGAGGACGTCAAGGTTACACATATACTATTTCCGATTCTAGAGTAATCAAGGGCTATGACTTAATCAGCTCTCCCTCTACAACAACTGGTATTTTGGGTAAAACATATAATGTTGGTGATGTATATGCCGGTGGTAATTTGGAATTATCTGATCAACTTCAGCTTGCCAGAGTTTACGTTGCTACATCGGAATATGGGGATGCTAAAGTCGAAGTAAGAGTTGCCTTGAAAAAAGATGCTGACGGCAATGCGATTACAATTAGCAGTCTTAATGACGCGAATATTTGGAAGACAATTTTATCCACTGATTCCTTGGCACCTGGTGCGACTGCTTCTGACGGTAACTACGGGAATGGTGCTTCATACTACATTAATGGAACGGACGGTATAAAGTACATAACGGATGCAGGCTTTACTGAGGAACAACTCGCTGGATACAAGAGCCACCTTGCGGTCATCATTTTGGCCAACGGTTTGACTCAAGGTCAAGAACCTGCTAAGTACTACTACGCACCACAAGGTCAAGTTCGCATCAACTACGTAACCAGCGACGGTAAGGAGATTCGGGGTAAGGATCCGGTTAGTGCGTACGAAAATTCAGGTGCCAACACTTCTTACGACGTAACCGGCTCAACTTACCAGCCACAGACCATTACTGCTGATGGCAAGACTTACCGTTTTGTTAAGAGCGACAAGTCAATGGGGACTGCTGGTACGACTGAAATCAATGGTTACACTTACAATGTAACCCCATCAGACGCTACGGGTACGATCAAGTCCACTACGGTTAACGACGTTTACTACGTTTACGAACAGGTAACTTACCACACGGAAGCTGAATCCAAGGACGTAACTCGGACGATCGAATACTACGACAGCGTGACTGGTGAACCAATTCCATCTGACTTGGAAAAAACGGTCACTCAGACTGCAACGCTGACCCGTACCAAGATTTACGATGACCAAAACAACCCCATCGGTTATGGTACTGTTTCAGAAGATGGTTCAAGCTACACGATCGATGACAGCTGGAAGGTGGCTGACCAGACTTGGACTAAGCAAGATTCTGCTGATCTTTCTGGTTACGGCTACACGGCGCCCGATCGTGCTTCAGTAGATGCGGTAACGGTTGATGGTGACACGACCAACGTAACGGAAAAGGTATACTACGGCCACCAGACTGTTCTAGTAACTCCAGAAAACCCAGGTACTCCAGGTGAACCGATCAACCCTAACGACCCTAACAGCCCAGTTTACGGTGAAGAAACTGACCGGAAGAACTTGGTTAAGGACGCAAGTCAAACCATTCACTACGTAGGTGCAGGTGACAAGACTCCAGCTGACAACGTTGTAACTCAGAAGGATGCCTTCACGCGGACTGTTACTATTGACAAGGTAACTGGTAAGGTTCTGTCCTACACTGACTGGACTGGCGAAAAGACTTTCAACACTGTTGATACTCCAGTTGTTCAGGGCTACCACGCAGACAAGAAGACTGCTGGTGGTTTGACTGCAACTGTAGACAACCCAGACGTCGAAGAAACTGTAACTTATTCACCAAACGGTAAGATTGTTCCAGTTGATCCTAACGGTACTCCAATTCCAGGTGCGGTTACTCCAACTTACCCAACGGACCCTAACGATCCAACTAAGGTAGTTCCAAACGAACCAATTCCAGATGTTCCAGGCTACACTCCAGTAGATCCAAGTCCTGTAACTCCAACTAACCCTGGCGAAGACACTCCAGTGCCTTACACTAAGAACGAAACTCCAGAAGTTAAGTACGGTCTGACTGAAAAGTTTGTTGACGAAGAAGGCAACGAACTGCTGCCAAGTGAAGGCAAGGGTACTGACTACAAGACTGGTGACTCTTACGACGTAACTAAGGATGCCAAGGTAATCACTGGCTACGTTCTGGTTAAGACTACTGACACGACTGGTACTTTCACTGATGGC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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_014567203.1|570922_571555_+	NAD(P)H-binding protein	NA	NA	NA	NA
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WP_014567205.1|574520_575087_+	DNA-3-methyladenine glycosylase I	NA	NA	NA	NA
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WP_014567207.1|576040_576826_+|protease	CPBP family intramembrane metalloprotease	NA	NA	NA	NA
WP_004896866.1|576865_577618_-	aquaporin family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_080558341.1|580940_581516_+	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
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WP_014567211.1|583495_584827_-	uracil transporter	Q9KX94	Enterobacteria_phage	3.1e-63	35.7
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WP_014567214.1|586710_587331_+	phosphatase PAP2 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_014567215.1|587411_588767_-	peptidase C45	NA	NA	NA	NA
WP_014567216.1|588800_590126_-	C1 family peptidase	R4TV59	Phaeocystis_globosa_virus	7.3e-73	34.6
WP_014567217.1|590152_591748_-	amino acid permease	NA	NA	NA	NA
WP_014567218.1|591890_593315_-	C69 family dipeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_004896885.1|593348_594674_-	C1 family peptidase	R4TV59	Phaeocystis_globosa_virus	9.8e-70	33.2
WP_014567219.1|594708_596358_-	amino acid permease	NA	NA	NA	NA
WP_011161666.1|596881_598258_+	APC family permease	NA	NA	NA	NA
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WP_014567221.1|599551_599782_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NC_017477|638939:673639|DBSCAN-SWA
ACTAAAGTCTTTTTTGATTATGTGTGGCTACGTTGTAATCATATAGTTGATCATTGATAATCAGGGCATAAATGGTTCTGATTAGTTTATGAATTGAAGCAATAGCTATCTTTTTGAACCCTTTGGTTTGAGAGGATAGCTTTTTGCTTTCATAATAATCTGCTATATGACACGGATTTGTCTTAGCTGCATTATCAATTTGTCCAATAGCTCGATAAAGCAACTTACGTGCGACTGCATTGCCATGTTTAGTAATACTTAAATTAGAGTCCATTTCTCCTGACTGATATCTGCCTGGATCAATTCCGATAAAAGCATTGATTTTATTAGGATTACTAAATCTGCGTAAATCTCCTAACTCTGCTAAAACTCTGACTGCAGTGGTCTGTGCAAAGCCTGGAATGCTTTCTAGGTTTTCTAAGTCATGATTAGGCAAAGTTTTGGCGAGTTTAACCATTTTGGTAATTATACGTTGACGTTGATTGCTTAGATTAAGCAGTCTTCGGGCATAATATTGTGCTTGCTGGACTTCTATGTCAGAGCAAGAAACAACTGGATAAGCTAAATGAGCTAATTCAATTAGTTTATCTGTTGTCCTTTGTGCATGATTAAAAGCGATGCCTTTCAATTTCATCAACCAGTTAATAATTTGCTTTTTATCATCTTTTCTTACTAAATCACAATGAGGATAACGAGCAACTATTTGCCAATAATTCTTACCTCTAGCAATAGAAAATAAGTTTTCAATTTCGGGAAAGGTTGATTGTAGAGCTTGGTGAAGTCGATTTTTAGCTATTACCAAGTCACTTGTCAGCTGGTCATAGAAGCGGCTCAAAGCATTAAGCTGCTTATAAGTTGGGGATTCGCTTTGATTAACCGGATGGCGATAAAGTCTTTGAATTAAAGCTAAATGATAAGCATCAGTTTTATCGGTCTTGTTGTAGCGTAGCCCCATATTCATCTCTTTTTTGGCTTTAAGCGGATTAAGAACAACATATTCATAGCCGTAGTCTTCAAGAAAAGCCTGCAGTCTGCGTGAATAAACACCGGTAGCTTCAAAAATAATTTGTGGATGTTTAGAAAAAGCAGCCAGCTCATGAAGTAATTGAATAAAACCAGGACGATCATTGGTAATAGTAAGTTCATTTTTACTTTCACCAATTAGTTCACAAACAGTAGAATTCGACTTGCTTACATCAATTCCAAAAGTAACTTGCATAATATAACCCCCTAAGCTCAAGTAGTAAAACGTATTTACTTAAGAAATCAGATCTAATTTTCTAAACTCGACATCTAAGTGTCCACATTCTTCGAAGAGACTCCTGAAAACTCAAGCAAAACTGCCAGTTTATTATGCGACATCAAGTGTCTAAAGCCCCGATGACATATAGTTTTACTACTACTTAAATTCTACAAGAGAATAAAAATAGTGAATCAATTATCCCGTCGGATAACTAATTCACTATTTAGCTTAGAATGTTTATTATGACTTAGTGAAGGGATAGGTGAGTACAGATGGATGCAAAGAATTATGAAAGTACCGAATTCTATTCCTATAAGTATAGAAATTTTTCGACTATGATTATTATTCCAGCAGCTATTTTTGTCTTACTTTTATTTGTTGGATCTTTTTTTGCAGTTAGGCAGAATACAGTCTCTTCGGTTGGCGTTGTTGAACCAACGGTTGTAATTAAGCGGAAAAATGTTAACTATGATGAGGGACAAGTCGTTACGAAATATGGTCAAAAGTGGGTAGCTCATGTTGATCAAGGTGGTGGGATTAGTTTAATGCCTGTTATGAAACCTAAAAGCAAAGTAAAAATTGTAACTTATGTGACAAGTGATAAAATCTCGACTATTAAAAAGGGACAGTCGTTAACCTTTTCTGTACCTACTGGAGATGGCTTAACTAGACACTTGACTGGTAAGGTAAAGGAAATTGGAGTCTATCCTGTGAACATGAATAAACAAAATATGTACGAAATTATTTCGACTGCAAAAGTTAATGATGAGAATATTAAATATGGGATGCAGGAGAATGTGACGATAATGACCGGTAGGAGTACGTATTTAAAATATCTTTTGGATAAGGTAAGGAATAATAAGTAAAAAATACTAATTTAGTTAATAAAAGTAATTTTAGACACAAATAGAACAATATTGGTCAATTTTATATCTTAAGATGATAACTTTAGTAAGCTATGCATATAAATAAAATTTTAGGAGGTTTCTATCATGAAACAATTTAATTATTTATCACATAAAGATTTAGCAGTCGTTGTTGGTGGAAGAAATAATTGGCAAACAAATGTGGGAGGAGCAGTGGGATCAGCTATGATTGGGGCTACAGTTGGTGGTACAATTTGTGGACCTGCATGTGCTGTAGCTGGTGCCCATTATCTTCCTATTTTATGGACAGGGGTTACAGCTGCAACAGGTGGTTTTGGCAAGATAAGAAAGTAGGATTTTGACAATGAAATTAAATGACAAAGAATTATCAAAGATTGTTGGTGGAAATCGATGGGGAGATACTGTTTTATCAGCTGCTAGTGGCGCAGGAACTGGTATTAAAGCATGTAAAAGTTTTGGCCCATGGGGAATGGCAATTTGTGGTGTAGGAGGTGCAGCAATAGGAGGTTATTTTGGCTATACTCATAATTAAACTATAGTCAATTAAAGTAAAACAGTGATGATTTGATATTTAGCACTGCATTACTTTATTCATAGATTCATTAGTAGGTAGTTTAAATGACTAAACATTATAAAATTATTGGTCTAAGGATATTGTCATGGGTAATTACGATTACTGGATTGATAATATTTATCGGAAATGTTCATGAGTATGGCTTACATTTTACTTATAATCAAGTATTGGCAATAATTATTGTGATTTTACTTTTAGTTACTACTATGTATTTTTCAGTTACACCCAAATTATTGAAATGGAATGAAAAATATGAGCTTGTATGGTGGTTATGCTATTTATGTGCTCCTATATATCTCTTTTTAACTAATTTATATAATTCAACAGATCTTGGTTATACTATCAAGTTTTGGCTTTTCTTTGGTGGAGGAGCAGCTTTAATAATCATAAGTAAGTATATTTTGAAAAACAAAAAATAAAGTCTAAATAATTTATCTATTTCAATCGTATATAAATAAAAATTAGAATACCAAATTGGTCTGTAAAACGACTAATTTGGTATTTTTTATCTTATGAAATTTTGAACCTGATAAAATTTTTAATAAGGTAAAAAAGAGAGCGTGATAAAAATGGAAATAATTAAAAATAATGAAAAGATAGCATCAAATAAAGAAAAATGGATAACACTAATTCTAGCTGCTGCTTTTGGATATTCAATGAATAAATTGTTTTCGCTGATTGTAAAATTAAATTGAACACTTGATAAAAAATAAAAAGTCCATTCGGACCTGTTTGATAGAATGTTAATAACCACAAAAACTTTCTATTGGAGGTCAAAATGGACTCTTTACATTCTACCATGAACCAGCACGTTAAAGGCAAGCATTTATCATTTGAAGAGCGAGTTATTATTCAATTGCGTTTGAAAGATGGCTATTCTTTGCGATCATTAATCTCTTTGGGACGTTCCTCAATACTTCGACCTAATTTCTTCTTATTTTTATGAATACGATGAATCTTAGTATTACGCTTTAGCTTTTCAGGCAAATCAGAGTTTCTGATAGCTAATAAACCCTGGTCTACATAGTTATATAAAGTTCTAGTGCAAACTGTTTGATGATGAGAAAATTCTCCTATGGCTAAACTACGATTAGCACATACGTCAAGCGACCAGCCATCTTCAAAGAAATGTTTATTGACATACTTGATGAAATCAGCTTTCTTTAAAAAATCTGATTTACGACCGCAGTGACTACGATTAGATTGATAAACACTTTGACCATGATCTGCCTTATACCGCTTTTGCTTGCCATGATAAAGAGAAACAGTACCACGTCTAACTTCGTAACTGATTGTTGAGGGAGAACAAGCTAGTTCACGAGCAATAGCTCTGATAGAGCAATTATCTTTTAAGCGCGTTTGGATAATAACTCGCTCTTCTAGTGATAAATGCTTTCCCTTTTTGTGCTTAGGCATGATAGAATGTAAAGAGTCCATTTGTGACCTCGTTTCTGAATGTTGTGTTGGTAATTACATTCTATCAAACAGGTCCAGATGGACTTTTTTATTTTTCAAAAGTGTTCAACTTAATTTTACAATCGGCCGAAAAATTAAATACTTATACTAAAACTAATTTAAAGTCAGACGCATTTAAAAAGTATAAAGATGTAAATCATGTGAATATTAGGTCTTTGAAAAGTATTATTATTTCAAAACTTACAGAGATGTATAATTTGGAGATTTCTTATAACTTTGAATGTGATGAGGTAATAAATAAAATTCCTCCGCACATTAATGAAATTGATTTAGTAAGAATTATAGGAATTACATGTGATAATGCAATAGAAGAAAGTCGAGAGTTAATAAGAAAAGGAGAAGATGCTCAAATTGAAATAATGATCTATTCAACAGAGGAGACATTAGAATATGAAATCCAAAATAAGAAAAGAAATCTTGCAATTTCAACAAAAAAAATACAGCAAAAAGGTTTTTCTACTAAAAAGGAGCATTCTGGATTAGGGTTATCAACAATAAGAAAAATAACTGAAACTTATGAAAATATGTCAATTACTTATGATATAAGTAACGATTATTTTGATTTCTATCTTGTAATGGATCGGGAAGTATAAAAATGAAATATTCTATAATTATTTGTGATGATAATAAACTATTAGCTACTGATTTATCACATAAGATTCAGATTGCACTTCAAAATATGTTGGATAATAATGAGATATATCGAAAAAGTGAATTTAATATTGATTTAATTGCTAATACCTTTGAGCAAGTCGTAAGTTATGTGGTGGCTAAGGATATCCATAATGCAATTTACTTCTTAGATATTGAATTAAGTCAA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MNNKDLKKVVESALDKQKVPHVKLKKIGASKVDVASLTEPSKETRQEYWGKGLTYCAIILIIILVASIIGFIGFHGLETFTKDHVNVFQFLTSSDWDPGEGKNHVGAAAMIVTSFSVTLLAALVATPFAIAVALFMTEYSSKKGARFLQSVIELLVGIPSVVYGFLGLTVIVPFIRNIFGGTGFGILSATLVLFVMVLPTITSLTVDSLKAVPSDYRKASLALGATKWQTIYKVILRVASPRIMTAVIFGMARAFGEALAVQMVIGNAVLMPANLVSPSATLTSQLTSQMGNTVMGTLPNNALWSLALLLLIMSLVFNFLVRLIGKRGQK
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MSKFQQLTTEDLMETKGGKIYHATPWQICNSKTHKCWADNAAIARTCGRVIVNGWLQHGPWGAR
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MKYSIIICDDNKLLATDLSHKIQIALQNMLDNNEIYRKSEFNIDLIANTFEQVVSYVVAKDIHNAIYFLDIELSQNSEAKNGVDLAEFIKKQDPNAQIIFVTAYDKYAPLTYRRRIGAIDYINKSLDRQNMLKRIEETITHAVTSINHLLKVNRKELIYQIGKRVKKVENSMIYYIENSPTQHKVTLITETGSAEFRSNISKISDENDFLVKVSQSCVVNPNNIDSIDFSKKTITFPNGDEVIFARSFKKHVKNLLSKYPEINVK
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MKMQAFYYAMPTLAVIVIAAYIFTSVKIHKFIWFSPVVYLALIGSIGLWIKIGTNIFSTSETGVFGLLTLEAILLEGIIEEYRYQKQNLEKNEE
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MKLNDKELSKIVGGNRWGDTVLSAASGAGTGIKACKSFGPWGMAICGVGGAAIGGYFGYTHN
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MSKKPLIISTDPGIDDIAAMTISLFADELDVKMIVPTWGNVSLAHTLQNTLDLENFLHTKVPVVKGANQPLVRPAISAASVHGETGIAGFEFEKASDELLEPGLAATKMYEAIKNSPEKVTLLGVGPLTDFALLFKQYPDVVENIAEVYIMGGNIGHGNHSPFAEYNIAGDPEAAQIVFHSGLPVYVAPLEIGDKAHLTQDQMDKIKECGEVGKMLYSMFSNIHEPDGDTRIKIYDPTAVGIMLHPEFFTLKPANVEIELAGRYTYGASVMDFLSEKHNAQIATDVDTEKFAAWFIDSIKTANNGRK
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MDIREVKDHKKQYLDLLLLADEQEDMVDRYLDRGRMYILIDDGKVRSECVITYEDNRTIEIKNLATYPVDQGKGYAKKLINYISEKYKGDYKFLQVGTGDSPLTIPFYLKCGFKPSGRIKNFFVDNYNYPIYEAGHQLIDMIYLKKKI
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MELEKGIEVITLTEKDDEDDEIIKVAQLSVEDALKELNTEQAGLTIDEVHTLQQTYGKNVFAKAKQEPLWKKFIANFTSLMAILLWVAGIIAFCANLVQLGIAIWAVNIINGIFSFWQEFQADKATEALANMLPSYTRVVRNGKEEKILAKDLVPGDIVKLEEGDDIPADIRVIAATSAQVDQSSLTGEVNPVHKDTHRIENVEKKNHADLNNMIFSGTNMMKGNVTGAVVKTGMNTDFGKIAELTQNVKQQKSPLEKELDTLTKQISILAISIGIIFFLVATFFVHYPLVKAFVFALGMIVAFIPEGLEPTVTLSLAGAVQRMARKHALIKRLSSVETLGSTSVICSDKTGTLTKNEMTVKELWTLEKSYHVSGEGYAVRGHIKEGPTHIFAKDNDALKEVLLGGVFADNARIQKPDQQHPRYQILGDPTEACLEVVARKGKIDVEAEVEKTPRVKELPFDSSRKMMTVIQSSDGTHRFNTYTKGAPNCVVDKCTSYLCDGKIQPITQEIKDKIMRANDGYAKDGLRVLAVAGRNLDQKLMDNLDLATIDTVERDLTFLGLTVMMDPPRAEVYKAARECRKAGIKVTMVTGDYGLTAKSIAREIGLTDPDKPLTVITGDALKTMPDEELRHYLEGEVVFARMAPEQKYRVVSMYEKMGKIVAATGDGVNDAPALKKANIGIAMGGTGTDVAKEAADMILTDDNFASIVGAIKEGRGVYSNIRKFLIYILNSNMPEAVPSVLFLLSGGAIPLALTVMEILFIDLGTDMIPALGLGREDPEKGIMDRPPRSPKDHLINKDVLAKAFLWYGLIASIIATAAFFIANFYRGHIFPNLPASGWDYRQATTVTLAAIIFCQIAAVLNIRYARQSMFNKYFFKNSMIFIGIIMEIVLLLCISYVPVFQSFFGTEPLNAHDWMMLVCIPLPLILIDELRKWILRKESKNK
>NC_017477|638939:673639|658489_659380_+|WP_004896942.1|DBSCAN-SWA
MNAKTRNKIATAGIYTLVSIVVIILFGILGDILVSGVPHLSWHFLSSEASSYQAGGGVRDQLFNSLYLLVLTLIISLPIALGAGIYLAEYAKDNWFTNLIRTTIEILSSLPSIVVGLFGYLLFVVQFGFGFSIISGALALTFFNLPTLTSNIEQAIEGVPQAQRDAGLALGLSNWKTIRGIVLPAALPGILTGIILSAGRIFGEAAALIYTAGQSGSTIDYSNWNPFSPTSFLNVMRPAETLAVHIWKVNTEGIIPDATIVSAATSALLIIVVILFNLGARALGNHLYRKLTAAKS

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_187286473.1|638939_640160_-|transposase	IS110 family transposase	A0A1X9I619	Streptococcus_phage	1.1e-94	47.9
WP_014567248.1|640453_641047_+	HlyD family efflux transporter periplasmic adaptor subunit	NA	NA	NA	NA
WP_014567249.1|641173_641401_+|bacteriocin	bacteriocin class II family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_011161713.1|641686_642061_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_014567251.1|643081_643711_+	GHKL domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_014567252.1|643713_644511_+	response regulator transcription factor	NA	NA	NA	NA
WP_014567253.1|644523_646683_+	peptide cleavage/export ABC transporter	W8CYL7	Bacillus_phage	2.2e-47	26.9
WP_014567254.1|646693_647287_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_004896927.1|647436_647631_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011161719.1|647743_648034_+|bacteriocin	bacteriocin immunity protein	NA	NA	NA	NA
WP_043921300.1|648229_648592_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_004896932.1|648796_649027_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_004896933.1|649149_649464_+|bacteriocin	bacteriocin immunity protein	NA	NA	NA	NA
WP_004896934.1|649466_649751_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_014567257.1|649814_652646_+	cation-transporting P-type ATPase	M1HJQ2	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	3.0e-76	27.7
WP_014567258.1|652717_653566_+	patatin family protein	NA	NA	NA	NA
WP_044025987.1|655151_655877_+	amino acid ABC transporter ATP-binding protein	W8CYL7	Bacillus_phage	1.1e-14	36.8
WP_044025922.1|655972_656494_+	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_004896940.1|656611_657481_+	phosphate ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_011161729.1|657497_658490_+	phosphate ABC transporter permease subunit PstC	NA	NA	NA	NA
WP_004896942.1|658489_659380_+	phosphate ABC transporter permease PstA	NA	NA	NA	NA
WP_004896943.1|659390_660191_+	phosphate ABC transporter ATP-binding protein	W8CYL7	Bacillus_phage	6.2e-11	29.0
WP_004896944.1|660201_660957_+	phosphate ABC transporter ATP-binding protein	G3M9Y6	Bacillus_virus	4.6e-16	28.2
WP_004896945.1|660973_661657_+	phosphate signaling complex protein PhoU	NA	NA	NA	NA
WP_004896946.1|661675_662122_+	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_004896947.1|662265_663804_+	YfcC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_004895429.1|663887_664355_+	DNA starvation/stationary phase protection protein	A0A2K9VDB4	Lactobacillus_phage	4.9e-16	32.1
WP_004896948.1|664444_665371_+	ribokinase	NA	NA	NA	NA
WP_014567261.1|665370_666069_+	ribose-5-phosphate isomerase RpiA	NA	NA	NA	NA
WP_014567262.1|666134_666947_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_014567263.1|667103_668603_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_014567264.1|668595_669708_+	lanthionine synthetase C family protein	NA	NA	NA	NA
WP_014567265.1|669929_671504_+	ABC transporter ATP-binding protein	W8CYL7	Bacillus_phage	2.3e-17	25.6
WP_014567266.1|671596_672520_+	nucleoside hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_004895425.1|672519_673248_+	GntR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_004896951.1|673312_673639_-|bacteriocin	bacteriocin immunity protein	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NC_017477|814422:918308|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_004897133.1|815328_816267_+	riboflavin biosynthesis protein RibF	NA	NA	NA	NA
WP_004897134.1|816525_818037_+	ABC-F family ATP-binding cassette domain-containing protein	A0A2I4R674	Erysipelothrix_phage	1.3e-25	24.7
WP_014567314.1|818052_818679_+	GyrI-like domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_004897145.1|818820_819879_+	heat-inducible transcriptional repressor HrcA	NA	NA	NA	NA
WP_004897146.1|819890_820469_+	nucleotide exchange factor GrpE	NA	NA	NA	NA
WP_004897147.1|820486_822361_+	molecular chaperone DnaK	G8DDB7	Micromonas_pusilla_virus	1.1e-135	46.3
WP_004897148.1|822440_823607_+	molecular chaperone DnaJ	A0A1V0SBY2	Catovirus	4.4e-13	21.6
WP_014567315.1|823752_825591_+	elongation factor 4	E4ZFJ7	Streptococcus_phage	2.4e-21	25.1
WP_014567316.1|825758_826448_+	class A sortase	NA	NA	NA	NA
WP_014567317.1|826547_828818_+	single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ	A7KV88	Bacillus_phage	7.3e-81	34.3
WP_014567318.1|828952_829480_+	adenine phosphoribosyltransferase	A0A1V0SKE5	Klosneuvirus	1.4e-24	39.3
WP_014567319.1|829604_831113_+	glutamate/gamma-aminobutyrate family transporter YjeM	NA	NA	NA	NA
WP_014567320.1|831165_832653_-	cardiolipin synthase	NA	NA	NA	NA
WP_004897155.1|832788_833745_+	thymidylate synthase	A0A0N9SH48	Staphylococcus_phage	2.2e-111	58.0
WP_014567321.1|833762_834266_+	dihydrofolate reductase	G3MBI7	Bacillus_virus	6.9e-24	39.2
WP_014567322.1|834442_835786_+	SLC45 family MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_014567323.1|835859_838127_-	HAD-IC family P-type ATPase	M1I547	Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus	6.4e-45	26.2
837654:837671	attL	NA	NA	NA	NA
WP_004897158.1|838250_839099_+	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_014567324.1|839578_840754_-|integrase	site-specific integrase	Q6SEA7	Lactobacillus_prophage	2.7e-220	98.7
WP_014567325.1|841052_841943_-	type II toxin-antitoxin system PemK/MazF family toxin	A0A1S5S7V3	Streptococcus_phage	1.5e-21	31.7
WP_014567326.1|842247_842466_-	hypothetical protein	E9LUL0	Lactobacillus_phage	1.2e-14	54.0
WP_044025991.1|842510_842738_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_014567328.1|843130_844312_-	Abi family protein	NA	NA	NA	NA
WP_011161477.1|844753_845176_-	ImmA/IrrE family metallo-endopeptidase	Q6SEA2	Lactobacillus_prophage	1.8e-78	100.0
WP_014567329.1|845179_845524_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	Q6SEA1	Lactobacillus_prophage	4.7e-24	54.5
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WP_044025930.1|852325_852655_+	sporulation protein Cse60	NA	NA	NA	NA
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WP_044025931.1|852979_853441_+	RusA family crossover junction endodeoxyribonuclease	Q20DF1	Lactobacillus_phage	6.9e-63	77.8
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WP_014567350.1|854268_854457_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144018420.1|854483_854924_+	hypothetical protein	Q6SEE2	Lactobacillus_prophage	4.7e-77	95.9
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WP_014567355.1|858720_859995_+|terminase	PBSX family phage terminase large subunit	Q6SE84	Lactobacillus_prophage	1.5e-237	89.9
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WP_014567357.1|861439_861727_+|protease	ribosomal-processing cysteine protease Prp	Q6SE82	Lactobacillus_prophage	3.3e-31	72.3
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WP_014567359.1|863205_863856_+	DUF4355 domain-containing protein	Q6SE80	Lactobacillus_prophage	1.7e-75	73.1
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WP_014567361.1|864244_865294_+|capsid	major capsid protein	Q6SE78	Lactobacillus_prophage	4.0e-191	97.4
WP_044025934.1|865303_865621_+|head,tail	phage head-tail connector protein	Q6SE77	Lactobacillus_prophage	3.3e-48	96.2
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WP_014567364.1|865963_866512_+	HK97 gp10 family phage protein	Q6SE75	Lactobacillus_prophage	1.1e-96	96.7
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WP_014567366.1|866884_867376_+|tail	tail protein	Q6SE73	Lactobacillus_prophage	3.0e-72	87.3
WP_014567367.1|867448_867859_+	hypothetical protein	Q6SE72	Lactobacillus_prophage	7.0e-67	96.3
WP_014567368.1|867951_868245_+	hypothetical protein	Q6SE71	Lactobacillus_prophage	1.3e-46	95.9
WP_014567369.1|868244_874313_+	lytic transglycosylase	Q6SE70	Lactobacillus_prophage	0.0e+00	95.3
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WP_014567371.1|874700_880040_+	peptidase	Q6SE68	Lactobacillus_prophage	0.0e+00	54.6
WP_187286471.1|880032_880191_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_014567372.1|880174_880435_+	hypothetical protein	Q6SE67	Lactobacillus_prophage	6.2e-37	94.2
WP_044025935.1|880434_880833_+	hypothetical protein	B8R662	Lactobacillus_phage	9.6e-13	29.5
WP_014567374.1|880846_881065_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_014567375.1|881061_881406_+|holin	holin	Q38316	Lactobacillus_phage	2.8e-45	82.5
WP_014567376.1|881409_882345_+	SH3 domain-containing protein	Q6SE63	Lactobacillus_prophage	6.3e-148	81.1
WP_144018415.1|882592_882697_-	type I toxin-antitoxin system Fst family toxin	Q65YV5	Lactobacillus_phage	4.1e-08	82.4
WP_011161515.1|882770_882989_+	hypothetical protein	Q6SE62	Lactobacillus_prophage	3.5e-33	100.0
WP_004897159.1|883363_883948_+	phosphatase PAP2 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_004897160.1|884125_885412_+	phosphopyruvate hydratase	A0A1X9I5Z8	Streptococcus_phage	2.6e-107	51.7
WP_172821771.1|885525_885807_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_014567377.1|885873_887496_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	A0A2K9L3Z8	Tupanvirus	4.9e-47	26.4
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WP_080558344.1|889202_889553_-	IS66 family insertion sequence element accessory protein TnpB	NA	NA	NA	NA
WP_004897518.1|889546_889723_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_014567380.1|889855_890836_+	choloylglycine hydrolase family protein	M1HS66	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	4.6e-24	30.5
WP_011162169.1|890885_891275_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_014567381.1|891505_892357_-	DNA/RNA non-specific endonuclease	NA	NA	NA	NA
892119:892136	attR	NA	NA	NA	NA
WP_014567382.1|892356_893052_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_014567383.1|893467_894322_+	MetQ/NlpA family ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_004897167.1|894338_895388_+	methionine ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	3.5e-30	37.0
WP_004897168.1|895380_896082_+	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_014567384.1|896219_897626_+	class II fumarate hydratase	NA	NA	NA	NA
WP_014567385.1|897640_899014_+	flavocytochrome c	M1HTN0	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	9.3e-47	30.5
WP_014567386.1|899093_900020_+	L-lactate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_014567387.1|900128_901511_+	threonine/serine exporter family protein	NA	NA	NA	NA
WP_014567388.1|901604_902630_+	asparaginase	NA	NA	NA	NA
WP_014567389.1|902646_905076_+	HAD-IC family P-type ATPase	M1HLC0	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	8.7e-40	26.4
WP_014567390.1|905155_906847_+	cell division protein	NA	NA	NA	NA
WP_014567391.1|907012_908692_+	cell division protein	NA	NA	NA	NA
WP_127835455.1|908766_910168_+|transposase	IS3-like element IS1223 family transposase	A0A1B1P773	Bacillus_phage	3.8e-40	39.6
WP_004897177.1|910253_910757_-|tRNA	Cys-tRNA(Pro) deacylase	NA	NA	NA	NA
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WP_004897179.1|911799_912180_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011162153.1|912197_914447_+	bifunctional (p)ppGpp synthetase/guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase	A0A1X9SH80	Bradyrhizobium_phage	5.6e-09	41.4
WP_004897181.1|914446_914884_+|tRNA	D-tyrosyl-tRNA(Tyr) deacylase	NA	NA	NA	NA
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