Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_017337 | Staphylococcus aureus subsp. aureus ED133, complete sequence | 13 crisprs | cas3,DEDDh,DinG,csa3,WYL | 7 | 3 | 13 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_017337_1 | 637135-637217 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_017337_1
|
1 spacers
spacers of NC_017337_1
>1.1|637159|35|NC_017337|CRISPRCasFinder GGTGTGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017337_1
The CRISPR arrays of NC_017337_1 >merge|NC_017337|1|637135-637217|CRISPRCasFinder AATTCTACAGGCAATGCGAGTTGGGGTGTGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAATTTCTACAGGCAATGCGAGTTGG >NC_017337|1|1|637135-637217|CRISPRCasFinder AATTCTACAGGCAATGCGAGTTGG GGTGTGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCA ATTTCTACAGGCAATGCGAGTTGG
>NC_017337.1|WP_000667091.1|636203_636851_+|HAD-family-hydrolase MKFDNYIFDFDGTLADTKKCGEAATQNAFKACGLTEPSSKEITHYMGIPIEESFLKLADRPLDEAALAKLIDTFRHTYQSIEKDYIYEFAGITEAITSLYNQGKKLFVVSSKKSDVLERNLSAIGLNHLITEAVGSDQVSAYKPNPEGIHTIVQRYNLNSQQTVYIGDSTFDVEMAQHAGVPSAAVTWGAHDARSLLHSNPDFIINDPSEINTVL >NC_017337.1|WP_001051594.1|635542_636091_+|6-phospho-3-hexuloisomerase MAKFSDYQLILDELKMTLSHVEADEFSTFASKILHAEHIFVAGKGRSGFVANSFAMRLNQLGKQAHVVGESTTPAIKSNDVFVIISGSGSTEHLRLLADKAKSVGADIVLITTNKDSAIGNLAGTNIVLPAGTKYDEQGSAQPLGSLFEQASQLFLDSVVMGLMTEMNVTEQTMQQNHANLE >NC_017337.1|WP_000422864.1|634908_635541_+|3-hexulose-6-phosphate-synthase MELQLAIDLLNKEDAAELANKVKDYVDIVEIGTPIIYNEGLPAVKHMADNISNVKVLADMKIMDAADYEVSQAIKFGADVITILGVAEDASIKAAIEEAHKNNKQLLVDMIAVQDLEKRAKELDEMGADYIAVHTGYDLQAEGQSPLESLRTVKSVIKNSKVAVAGGIKPDTIKEIVAESPDLVIVGGGIANADDPVEAAKQCRAAIEGK >NC_017337.1|WP_000866427.1|634073_634832_+|glucosamine-6-phosphate-deaminase MKVLNLGSKKQASFYVACELYKEMAFNQHCKLGLATGGTMTDLYEQLVKLLNKNQLNVDNVSTFNLDEYVGLTASHPQSYHYYMDDMLFKQYPYFNRKNIHIPNGDDDDMNAEASKYNDVLEQQGQRDIQILGIGENGHIGFNEPGTPFDSVTHIVDLTESTIKANSRYFENEDDVPKQAISMGLANILQAKRIILLAFGEKKRAAITHLLNQEISVDVPATLLHKHPNVEIYLDDEACPKNVAKIHVDEMD >NC_017337.1|WP_001574742.1|633435_633798_-|YojF-family-protein MLEPIKEQEVIDLLASFEHKPVYLHVETTNGAYANHFDQRVFNAGTFLRNIQVTYTHAQLKGGNKEPYRIGLKLSNGGWVYVQGLTHFEINEHDEFLIAGFNYEGQLAAALQISERPFNL >NC_017337.1|WP_000129073.1|632756_633422_-|bacillithiol-biosynthesis-deacetylase-BshB2 MTDERHVLVIFPHPDDETFSSAGTLASYIQQGIPVTYACLTLGQMGRNLGNPPFATRESLPSIRERELEEACKVIGITDLRKMGLRDKTVEFEPYEHIDGMIKSLIDDTNPSLIISFYPGYAVHPDHEATADAVIRTVERMPKEERPRLTLVAFSNDATEALGEPDIQNDITDFKELKIKAFEAHASQTGPFLKQLASPEIDGKQHSFLTVEPYWTYHFKS >NC_017337.1|WP_000134232.1|631865_632744_-|GTP-cyclohydrolase-I-FolE2 MTEFDLSTREGRWKHFGSVDPIEGTKPTTKNEMTDLQSTHKDFLFEIEEVGIKNLVYPVLVDQYQTAGTFSFSTSLTKDEKGINMSRIIESVEKHYDNGIELEFNTLYQVLRTLQTNMKQNAAGVDVSGKWFFDRYSPTTNIKAVGNADVTYGLAIDGDKVTRKELTIEATVTTLCPCSKEISEYSAHNQRGVVTVKTYINKDQDIVDDYKNKILDAMEANASSILYPILKRPDEKRVTERAYENPRFVEDLIRLIAADLVEFDWLDGFDIECRNEESIHQHDAFAKLKYRK >NC_017337.1|WP_001106096.1|630093_631584_-|glycosyltransferase MNYFVGNSLGVNLTGIEKAIINRLNLFKEIGRPAQCVFLSWNRYLYRNAQNYITSSDYINMYDFFQEATYLERNEPFDWLSYWTDECHYTLKHVENSHDFRIYDQERFLMYAHFQDPKYRILDYVNHFDSQRRKVKRDFYDVRGFLNCSRILVDKQQTLCEFFYNPEGDTKLEKYFSYKDGKPEVQKIIVYYANKQYFFNNETELGAFFIKQLYQHGDLFFSDRNVYTAPIFNLTPESIPVVAVLHSTHIKNIDALDSSPFKNVYKAMFENLSRYRAIIVSTEQQKLDVEKRINYAIPVINIPVGYSDSIDTPVQTLDQRSVKLISVARYSPEKQLHQQIELVKRLVPYVPKVELHMYGFGSESKKLNELIQKYGLENHVYLRGFLSNLDQEYSDAYLSLITSNMEGFSLALLESLAHGVPVISYDIKYGPGELITSDFNGYLITKNGEDALFDKVKYVIDHPEVQQRLSKGSLAKAQQYSKASLIKQWDQFVRLI >NC_017337.1|WP_001106716.1|628498_629971_+|glycosyltransferase MNYILGTILESKITGVEKAQINRLKLFKQHGISSKCVYVKWNPYSYTYAKQHQIENDLFTMYDYFQKAINYKKTKQVNWIQYWEKSCRYTLKFVENSNDVRIYDEEQFIMYAHFLDKQYHQLNYVNYFDHKRRKVKRELYDGRGFLSCSRILGEGQRIVLENYYTPNGEIVIQKYFDDIKGKNTLTKVILNEDQHQQFFDTEDELVQYFLHQLCKNNDQIILDRPHELGNVIAGLNQSIPVIVVLHSTHLSGTGNDIKSFYKTVFNNLTRYKAIVVSTEKQCQDISQYIENKIPVINIPVGYVANLKYQFDSNQKDKNHIISIARLVENKQIKHQIEVIKQLVTKHPNIQLNIYGHGNGLLEYRQLVEDYHLSEHVKFHGFKTHINEEIAKAELMLSTSKMEGFGLAILESLSVGTPVISYDVDYGPSELIQDGFNGYLVPQGDINQMVEKVDQLLNNTQMMQQFSINSIESAQQYNATTISTKWQNILN >NC_017337.1|WP_000610274.1|625080_628380_+|MSCRAMM-family-adhesin-SdrE MINRDNKKAITKKGMISNRLNKFSIRKYTVGTASILVGTTLIFGLGNQEAKAAENTSTENAKQDDATTSDNKEVVSETENNSTTENNSTNPIKKERNTDSQPEAKEESTTSSTQQQQNNVTATTETKPQNIEKENVKPSTDKTATEDTSVILEEKKAPNNTNNDVTTKSSTSEIQTKPTTPQESTNIENSQPQPTPSKVDNQVTDATNPKEPVNVSKEELKNNPEKLKELVRNDSNTDRSTKPVATAPTSVAPKRVNAKMRFAVAQPAAVASNNVNDLIKVTKQTIKVGDGKDNVAAAHDGKDIEYDTEFTIDNKVKKGDTMTINYDKNVIPSDLTDKNDPIDITDPSGEVIAKGTFDKATKQITYTFTDYVDKYEDIKSRLTLYSYIDKKTVPNETSLNLTFATAGKETSQNVTVDYQDPMVHGDSNIQSIFTKLDEDKQTIEQQIYVNPLKKTATNTKVDIAGSQVDDYGNIKLGNGSTIIDQNTEIKVYKVNSNQQLPQSNRIYDFSQYEDVTSQFDNKKSFSNNVATLDFGNIDSAYIIKVVSKYTPTSDGELDIAQGTSMRTTDNYGYYNYAGYSNFIVTSNDTGGGDGTVKPEEKLYKIGDYVWEDVDKDGVQGTDSKEKPMANVLVTLTYPDGTTKSVRTDANGHYEFGGLKDGETYTVKFETPAGYLPTKVNGTTDGEKDSNGSSVTVKINGKDDMSLDTGFYKEPKYNLGDYVWEDTNKDGIQDANEPGIKDVKVTLKDSTGKVIGTTTTDASGKYKFTDLDNGNYTVEFETPAGYTPTVKNTTAEDKDSNGLTTTGVIKDTDNMTLDSGFYKTPKYSLGDYVWYDSNKDGKQDSTEKGIKDVTVTLQNEKGEVIGTTKTDENGKYRFDNLDSGKYKVIFEKPAGLTQTGTNTTEDDKDADGGEVDVTITDHDDFTLDNGYFEEDTSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDAGKHTPVKPMSATKDHHNKAKALPETGSENNGSNNATLFGGLFAALGSLLLFGRRKKQNK >NC_017337.1|WP_000347070.1|637652_639053_+|MFS-transporter MDFNKENINMVDAKKAKKTVVATGIGNAMEWFDFGVYAYTTAYIGANFFSPVESADIRQMLTFAALAIAFLLRPIGGVVFGIIGDKYGRKVVLTSTIILMAFSTLTIGLLPSYDQIGLWAPILLLLARVLQGFSTGGEYAGAMTYVAESSPDKRRNSLGSGLEIGTLSGYIAASIMIAVLTFFLTDEQMASFGWRIPFLLGLFLGLFGLYLRRKLEESPVFENDVATQPERDNINFLQIIRFYYKDIFVCFVAVVFFNVTNYMVTAYLPTYLEQVIKLDATTTSVLITCVMAIMIPLALIFGKLADKIGEKKVFLIGTGGLTLFSIIAFMLLHSQSFFVIVIGIFVLGFFLSTYEATMPGSLPTMFYSHIRYRTLSVTFNISVSIFGGTTPLVATWLVTKTGDPLAPAYYLTAISVIGFLVITFLHLSTAGKSLKGSYPNVDNEQDRAYYAEHPKEALWWVKERKN >NC_017337.1|WP_001100818.1|639596_640973_+|long-chain-fatty-acid--CoA-ligase MNVILEQLKIHTQNKPNDIALHIDDEIITYSELNARITSAVESLQKYSLNPVVAINMKSPVQSIICYLALHRLHKVPMMMEGKWQSTIHRQLIEKYGIKDVIEDTGLMQSIDSPMFIDSTQLQHYPNLLHIGFTSGTTGLPKAYYRDEDSWLASFEVNEMLMLKNENAIAAPGPLSYSLTLYALLFALSSGRTFIGQTTFHPEKLLNQCRKISSYKVAMFLVPTMIKSLLLVYNNEHTIQSFFSSGDKLHSSIFKKIKIQANDINLIEFFGTSETSFISYNLNQQAPVESVGMLFPNVELKTTNHDHNGIGTICIKSNMMFSGYVSEQCINNDEWFVTNDNGYVKEQYLYLTGRQHDMLIIGGQNIYPAHVERLLTQSSSIDEAIIIGIPNKRFGQIGVLLYSGDVTLTHKNVKQFLNKKVKRYEIPSMIHHVEKMYYTASGKIAREKMISMYLRGEL >NC_017337.1|WP_001070663.1|640974_642114_+|thiolase-family-protein MNQAVIVAAKRTAFGKFGGTLKHLEPEQLLKPLFQHFKEKYPEVISKIDDVVLGNVVGNGGNIARKALLEAGLKDSIPGVTIDRQCGSGLESVQYACRMIQAGAGKVYIAGGVESTSRAPWKIKRPHSVYETALPEFYERASFAPEMSDPSMIQGAENVAKMYDVSRELQDEFAYRSHQLTAENVKNGNISQEILPITVKGEIFNTDESLKSHIPKDNFGRFKPVIKGGTVTAANSCMKNDGAVLLLIMEKDMAYELGFEHGLLFKDGVTVGVDSNFPGIGPVPAISNLLKRNQLTIENIEVIEINEAFSAQVVACQQALNISNMQLNIWGGALASGHPYGASGAQLVTRLFYMFDRETMIASMGIGGGLGNAALFTRF >NC_017337.1|WP_001165060.1|642088_642454_+|hypothetical-protein MQHYLLDSNQRLNVSFSKDSVAAYYQCFNQPYRKEVPPLMCASLWPKFDLFKKYAYNELILTKSAINQTQKIEVDTIYVGHLEDIECRQIRNITRYTMALTLTKNDHHVITVTQTFIKAMK >NC_017337.1|WP_000671089.1|642456_642735_+|hypothetical-protein MKFNEIWINEYLALVNDDNPIHNEIVPGQLVSQMMLMAMSIEANQCQINYVKPILINENIEFIEEHEQEMIAINDDGEIKIKISLSTKNNRY >NC_017337.1|WP_000587958.1|642925_643093_-|protein-VraX MIIYRQYHHEGAPVYEIITKTFQHVSIKCDDSFSDTEIFKLLSLLQDDIDHMKVS >NC_017337.1|WP_001185462.1|643627_644458_-|bifunctional-hydroxymethylpyrimidine-kinase/phosphomethylpyrimidine-kinase MALKKVLTIAGSDTSAGAGMQADLKTFQELDTYGMVALTAIVTMDKDTWSHDVTPLPMDVFEKQLETALSIGPDAIKTGMLGTEEIIKRAGEVYEASNAQYFVVDPVMVCKGEDEVLNPGNTEAMIKYLLPKATVVTPNLFEAGQLSGLGKLNSIEDMKKAATIIFDKGAQHVIIKGGKALDQDKSYDLYYDGQTFYQLTTDMFQQSYNHGAGCTFAAATTAYLANGKSPKEAVISAKAFVASAIKNGWKMNDFVGPVDHGAYNRIEHIDVEVTEV >NC_017337.1|WP_000455262.1|644641_645298_+|uracil-DNA-glycosylase MEWSQIFHDITTKHDFKAMHDFLEKEYSTAIVYPDRENIYQAFDLTTFENIKVVILGQDPYHGPNQAHGLAFSVQPNAKFPPSLRNMYKELADDIGCVRQTPHLQDWAREGVLLLNTVLTVRQGEANSHRDIGWETFTDEIIKAVSDYKEHVVFILWGKPAQQKIKLIDTSKHCIIKSVHPSPLSAYRGFFGSKPYSKANTYLESVGKSPINWCESEA >NC_017337.1|WP_000248116.1|645298_645679_+|DUF5327-family-protein MVNRETLIARIEQELVQAEQAQHDHDFEKHMYAIHILTSLYASTSNTPHIGEQQMNRRIANHNQMPHSQITQPTHQVTAAEIEAMGGKVNTHSAHHHNKSYSQPSNQQQRLATDDDIGNGESIFDF >NC_017337.1|WP_000765183.1|645811_646180_+|DUF423-domain-containing-protein MKLFIILGALNAMMAVGTGAFGAHGLQGKISDHYLSVWEKATTYQMYHGLALLIIGVISGTTSINVNWAGWLIFAGIIFFSGSLYILVLTQIKVLGAITPIGGVLFIIGWIMLIIATFKFAG |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_017337_2 | 735365-735464 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_017337_2
|
1 spacers
spacers of NC_017337_2
>2.1|735395|40|NC_017337|CRISPRCasFinder ACTAAAGGAATACAGTTGATTGCTAATGCACCAACAGCAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017337_2
The CRISPR arrays of NC_017337_2 >merge|NC_017337|2|735365-735464|CRISPRCasFinder AAGATCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACTAAAGGAATACAGTTGATTGCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGG >NC_017337|2|2|735365-735464|CRISPRCasFinder AAGATCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGG ACTAAAGGAATACAGTTGATTGCTAATGCACCAACAGCAA AAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGG
>NC_017337.1|WP_000687412.1|734411_735278_+|LysR-family-transcriptional-regulator MKIEDYRLLITLDETKTLRKAAEILYISQPAVTQRLKAIENAFGVDIFIRTKKQLITTTEGTMIIEHARDMLKRERLFFDKMQAHIGEVNGTISIGCSSLIGQTLLPEVLSLYNAQFPNVEIQVQVGSTEQIKANHRDYHVMITRGNKVMNLANTHLFNDDHYFIFPKNRRDDVTKLPFIEFQADPIYINQIKQWYNDNLEQDYHATITVDQVATCKEMLISGVGVTILPEIMMKNISKEQFEFEKVEIDNEPLIRSTFMSYDPSMLQLPQVDSFVNLMASFVEQPKA >NC_017337.1|WP_000865622.1|733651_734296_+|DUF402-domain-containing-protein MKVKYIDKRHWRRLIDREYTEVKVNNNRFKGIIGLVTMKKVRDPLEVTVVGQNIIVADDNYKWLQILPEKKRYSITVMFDNKGNPLEYYFDINIKNITQKGNARTVDLCLDVLALPSGEYELVDEDDLMFALESEQITKKQFHEAYMIAHQIMAELENDFKGFQKKIMYCFNKINAKAQKNHQKPQNKTNFEKSKQIKPKQYNQTKNHQQQKKN >NC_017337.1|WP_014532581.1|733390_733507_+|hypothetical-protein MLQLFLMKLTLNDFENDKTILFIILKNHCYEEVCVLSN >NC_017337.1|WP_000833486.1|732825_733299_+|cupin-domain-containing-protein MKSAEQWIDELQLESHPEGGFYRETIREVLKDGRRAPFSSIYFLLTDDNISHFHRIDADEVWYYHAGDSLTIHMINPDGEYTTATLGTDIQNGDVLQYVVPKGTIFASSIEISNTYSLVGCMCQPAFEFKQFELFKQSELITQYPHLKSVIEKYALK >NC_017337.1|WP_000532966.1|732109_732826_+|YebC/PmpR-family-DNA-binding-transcriptional-regulator MGRKWNNIKEKKAQKDKNTSRIYAKFGKEIYVAAKSGEPNPESNQALRLVLERAKTYSVPNHIIEKAIDKAKGAGDENFDHLRYEGFGPSGSMLIVDALTNNVNRTASDVRAAFGKNGGNMGVSGSVAYMFDHVATFGIEGKSVDEILETLMEQDVDVNDVIDDNGLTIVYAEPDQFAVVQDALRAAGVEEFKVAEFEMLPQTDIELSEADQVTFEKLIDALEDLEDVQNVFHNVDLK >NC_017337.1|WP_001090984.1|731560_731920_+|HTH-type-transcriptional-regulator-SarX MNTEKLETLLGFYKQYKALSEYIDKKYKLSLNDLAVLDLTMKHCKDEKVLMQSFLKTAMDELDLSRTKLLVSIRRLIEKERLSKVRSSKDERKIYIYLNDDDISKFNALFEDVEQFLNI >NC_017337.1|WP_001129762.1|729264_731415_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MAKSCLHILTNNEYATTRCQDGIVLFWPIDGEIELQKFRKSKIIEDDIYIINHLDVFSIKNNKKTIMLYLSSDWFAELGFTFFNYHYTAKLIKSSYNLKCLLLKLTYRYLDNQPLNDADVRKLQDIIKIIAKEASMDKKIAQNQYRYAYYGDLRDELEYIYQNVNQRLTLKSVADKLFVSKSNLSSQFHLLMGMGFKKYIDTLKIGKSIEILLTTDSTISNISEHLGFSSSSTYSKMFKSYMDITPNEYRNLSKYNKCLMLKPEPLVGKMVQEVKEIILNYIEHYKNHLTDVIHIDEDKFETPKLFQTVIQINTYTEMKLVFLEGIFKTLLNKNSQVVFFIMPSILKSKNTMSEEEKFAIIKTIIESDLKIAFNINDIDTTYYVEEAFMSVFRQISPNELSNHNNYEVHFVFDLSLMEIRTIYRMILKLHNIMLNVKLGLNITCLFEKPSVFKSLVSQIKRLKFDSLIIDNANLSSPYLMGESDELLLKNILHFKNLKQVINELDIEQEKLIFLNVENHKLLNNKEQDLSNSAPLIYKTLSALYHNFAGFGLNIFDNHQAFNAMHLYDKNGFKTTLGLILEKFIEYVSKPKYENSYYSIFDIENYYCLVIYDWRVIESETIMSNFEDSQVYINFKNNVLNDKYLIVIETLDENSGNINHLISKELRDKYEWNPSLLSKIDNYLKPAIEIKEHNFSNNSLNINVTFNALYIIKIGKK >NC_017337.1|WP_000081602.1|727923_728568_+|Bax-inhibitor-1/YccA-family-protein MSQNTNHSYYHQNQHAQSISKVWLYFMYYWIIFGIGCYLGQFLPLSWRQPLSFGLLIIILATLVFERARRFGLIISHIYAVVIGLLSYATFTTYLQNLGPDIFYKNIALAIFAFIAFGIIGYFFVGDASSIGKYLFVTLITLIIASLIGIFLQNPIFYTIITVVSLLLFLLYTLYDFNRLKRGDYSPREMGFNLFINLLNIIKDILYLANMFRR >NC_017337.1|WP_000731644.1|726765_727563_-|LysM-peptidoglycan-binding-domain-containing-protein MKKLAFAITATSGAAAFLTHHDAQASTQHTVQSGESLWSIAQKYNTSVESIKQNNQLDNNLVFPGQVISVGGSDAQNTSNTSPQAGSASSHTVQAGESLNIIASRYGVSVDQLMAANNLRGYLIMPNQTLQIPNGGSGGTTPTATTGSNGNASSFNHQNLYTAGQCTWYVFDRRAQAGSPISTYWSDAKYWAGNAANDGYQVNNTPSVGSIMQSTPGPYGHVAYVERVNGDGSILISEMNYTYGPYNMNYRTIPASEVSSYAFIH >NC_017337.1|WP_000120365.1|725172_726180_+|inorganic-phosphate-transporter MSYIIIVTIAVVIFSLIFDFINGFHDTANAVATAVSTRALTPKTAILMAAVMNFIGALTFTGVAGTITKDIVDPFKLENGLVVVLAAILAAIIWNLATWFYGIPSSSSHALIGSIAGAAIASEGSFGVLHYQGFTKIIIVLIVSPIIAFCVGFLMYSIFKVIFKNANLTRANRNFRFFQIFTAALQSFSHGTNDAQKSMGIITLALIVANVQNDGSVEPQLWVKFACATAMGLGTAIGGWKIIKTVGGNIMKIRPANGAAADLSSALTIFVASSLHFPLSTTHVVSSSILGVGASNRAKGVKWSTAQRMIITWVITLPISAFLAAFLFYILNLFF >NC_017337.1|WP_041204357.1|735481_736702_+|sugar-efflux-transporter MDMFAALLQIKNYKLFVANMFLLGMGIAVTVPYLVLFATKDLGMTTNQYGLLLASAAISQFTVNSIIARFSDTHHFNRKIIIIFALLMGALGFSIYFFVDTIWLFILLYAIFQGLFAPAMPQLYASARESINVSSSKDRAQFANTVLRSMFSLGFLFGPFIGAQLIGLKGYAGLFGGTISIILFTLVLQVFFYKDLNIKHPISTQQHVEKIAPNMFKDKTLLLPFIAFILLHIGQWMYTMNMPLFVTDYLKENEQHVGYLASLCAGLEVPFMIILGVLSSRLQTRTLLIYGAIFGGLFYFSIGVFKNFYMMLAGQVFLAIFLAVLLGIGISYFQDILPDFPGYASTLFSNAMVIGQLGGNLLGGAMSHWVGLENVFFVSATSIMLGMILIFFTKNQKITKEDVIST >NC_017337.1|WP_000152589.1|736698_737187_+|DUF456-domain-containing-protein MTIILWLLILAAFMLAFVGLIKPIIPSVLVLWVGFLIYQFGFHNQHLSWVFYVSMALLTILILCADFLANKYFVNRFGGSKFGEYAALIGVVIGCFVLPPFGIIIIPFILVFIVELIQGYSFERAVKVSIGSIVAFLTSSIAQAIIMFIMIVWFFIDALLIN >NC_017337.1|WP_000842866.1|737285_737975_-|hypothetical-protein MKSTAQLTKENNVKSLRLSNTDREIFENYMTYMRSDFRVNPHDTELIINRILKQLLSAEQHGLLALDFFNHDPKAHAIKELKAMPNETFKNIFKYIYQHIVLLIGIVSFLKGFLGFFMEKSGSNLYFVSFPFSVVVGFFIVFLFIWFSFKTIQLQCFNNSNWIWIFTYLAIILLIVGFFYVFFIPQSLLAFGPYIQVSNWVFIIFSFIVMPIGLSIEKNISKKHSHTFL >NC_017337.1|WP_001259680.1|738101_738545_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MRTLNKDEHNYIKQIANIHETLLSQVESNYKCTKLSIALRYEMICSRLEHTNDKIYIYENEGQLIAFIWGHFSNEKSMVNIELLYVEPQFRKLGIATQLKIALEKWAKTMNAKRISSTIHKSNLPMISLNKDLGYQVSHVKMYKDID >NC_017337.1|WP_000733449.1|738612_738984_+|hypothetical-protein MKKLIISIMSVMILLAGCGKSEEKATLEKDIDNLQKENKELKDKKEKLQQEKEKLADKQKDLEKEVKDLKPSKEDNKDDKKYKDKEASQDKQSKDQTKSSDKDNHKKPTSTDKDQKANDKHQS >NC_017337.1|WP_000545116.1|739121_739421_+|hypothetical-protein MHEQDFRILEGQDITLPELGRELENITGRTIADSTGEIKRVIAHLPNFESDTDTFVATYRLNHQQDFIDATFTALKSDRARLKEVPVHVELISYISKSK >NC_017337.1|WP_000638610.1|739500_740043_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MIYCETERLILRDWHEDDLLPFQKMNANYDVRKYFPSLLSYRRSELDMRTMDAVIKDYGIGLFAVEDKESHQWIGFIGLNYIPETSDYPFKELPLYEIGWRLLPEFWGKGLATEGAKAALKLAEQHQIYDVYSFTAEANKASQRVMEKIGMPVYDHFELPNLSKYHLLKRQVRYYINLRK >NC_017337.1|WP_000820889.1|740137_740704_-|TIGR00730-family-Rossman-fold-protein MKRIAVYCGASKGHDPSYIQKAYDLGKYFAEQGYELVFGAGSIGIMGAIQDGVLDHGGKAIGVMPKMLDEHEITSQRLTELILVDSMHERKNKMAELADAFVMAPGGAGSLEEFFEMYSWAQIGIHEKPIAIYNINGFFNPLQTMIDHMIEEGFIDPKYRALAPLCDTKESLIESILNFKPLGTRSYD >NC_017337.1|WP_000148825.1|740705_741164_-|YaiI/YqxD-family-protein MTHIIIDGDACPVVDSIIDLTTETGIFVTIIRSFSHFSNQLYPPHVSTLYVDDGPDAVDYKIVQLSTKDDIVITQDYGLASLLVDKVLIVMHHNGKIYNSKNIQQLLDKRYMNAQIRKQSGRHKGPPPFTKQDQKVFEQSLLRVIQRIKELD >NC_017337.1|WP_000358506.1|741166_741850_-|hypothetical-protein MDKKKVIKFMINVLPIVLVPLIVERKRIKQHPDVQKVTDATSKVASKTSAAISNTASDVKEYVGDKKQDFENKRELKKFAREHDPAYIEKKGEKLAKQNRKDADKMNKILQKNIEKRHKEEQKAREKNKIQRIKDMKKSQKYEEKAGLTPNKLDEKTEKKGDKLAEKNRKEIAKMNKKLQKNIEKRHKEEQKRQQEADKARIKSFKKYKDYVAKSASQQNKENNTEA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_017337_3 | 882599-882732 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_017337_3
|
2 spacers
spacers of NC_017337_3
>3.1|882619|39|NC_017337|PILER-CR GATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCAAGTTGGGG >3.2|882678|36|NC_017337|PILER-CR GCTGGCGGAAAGGCAGCATACAATAATGTGCAAGTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017337_3
The CRISPR arrays of NC_017337_3 >merge|NC_017337|3|882599-882732|PILER-CR GCGGGGCCCCAACATAGAGGATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCAAGTTGGGGGGCGAGGCCCCAACATAGTAGCTGGCGGAAAGGCAGCATACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGAG >NC_017337|3|1|882599-882732|PILER-CR GCGGGGCCCCAACATAGAGG ATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCAAGTTGGGGG GCGAGGCCCCAACATAGTAG CTGGCGGAAAGGCAGCATACAATAATGTGCAAGTTG GCGGGGCCCCAACATAGAG
>NC_017337.1|WP_000732331.1|881493_882315_+|MetQ/NlpA-family-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKLFGLILVLTFAVVLAACGNGSKSGGDDKKITVGASPAPHAEILEKAKPLLEKKGYELDIKTINDYTTPNKLLDKGEIDANYFQHTPYLNTEKKDKGYKIVSAGDVHLEPMAVYSKKYKSLKELPKGATVYVSNNPAEQGRFLKFFVDAGLIKIKKGVKIEDAKFSDITENKKDIKFNNKQSAEFLPKIYQNEDADAVIINSNFAIEQKLNPKKDSIAVESAKDNPYANLIAVKEGHQDDKKIKALIEVLQSKDIQDFINEKYNGAVIPAK >NC_017337.1|WP_000520233.1|880780_881476_+|ABC-transporter-permease MGKSFSEIINEMITMPNIQWPEVWTAIVETLYMTVVSTIFAFILGLILGVLLFLSAKGKSIGARLFYSIVSFIVNLFRAIPFIILILLLIPFTSLILGTISGPTGALPALIIGAAPFYARLVEIAFKEIDKGVIEAAWSMGANTWTVIRKVLLPEAMPALVSGITVTAIALVGSTAVAGVIGAGGLGNLAYLTGFTRNQNDVILVSTVFILIIVFIIQFIGDWLTNKLDKR >NC_017337.1|WP_000571213.1|879762_880788_+|methionine-ABC-transporter-ATP-binding-protein MIELKEVVKEYRTKNKEVLAVDHVNLSIRAGSIYGVIGFSGAGKSTLIRMFNHLEAPTSGEVIIDGDHIGQLSKNGLRAKRQKVSMIFQHFNLLWSRTVLKNIMFPLEIAGVPRRRAKQKALELVELVGLKGREKAYPSELSGGQKQRVGIARALANDPTVLLCDEATSALDPQTTDEILDLLLKIREQQNLTIVLITHEMHVIRRICDEVAVMESGKVIEHGPVTQVFENPQHTVTKRFVKEDLNDDFETSLTELEPLEKDAYIVRLVFAGSTTTEPIVSSLSTAYDIKINILEANIKNTKNGTVGFLVLHIPYISSVDFGKFEKELIERQVKMEVLRHG >NC_017337.1|WP_001065801.1|879216_879513_+|thioredoxin-family-protein MNNSLDIKDVTTFYEEDKHLIFGYTPTCGTCKVSERMLDIANEILQLPLLKIDLNFYPQFCKDMQIMSTPILLLMNKDKEVKRIYAFKSVTDLLENLK >NC_017337.1|WP_001018959.1|878837_879224_+|hypothetical-protein MAIVNKVIIVEGKSDKKRVQQVIAEPVNIICTHGTMSIDKLDDMIESLYDKQVFVLADSDDEGDRIRNWFKRYLSECEHIFIDKTYCQVANCPKQYLAHVLSKHGFTCKKETPSLPNINNERLVLVNE >NC_017337.1|WP_000932207.1|877427_878306_+|DUF1963-domain-containing-protein MLNIQDVSHLSKKEQKAYNRFVESVENGNLPVLPCIEIDLKEMQEETLSQSKIGGMPFLKSFKDIPLDENNVPMVLLAQINLNDLPEQQELFPVNEGILQFWISSEDQMYGMSENLKGNNINSRLVYIKEPITDLSLENIQMHLKSLDADNEDIPFSGAFSIEFRLSKQTITCTDYKYDEDVLALWNKVNPSFALKSMFGGYDELMEPVCNTFTAKEPFNQLGGYPYFDQIDPRTNDQELKMYDRVLLQIDSTRDGNSSIIWGDLGIANILVKSTDLEAMKFDDYMYSWDCS >NC_017337.1|WP_000290491.1|876868_877249_+|glycine-cleavage-system-protein-GcvH MAVPNELKYSKEHEWVKVEGNVATIGITEYAQSELGDIVFVELPETDDEINEGDTFGSVESVKTVSELYAPISGKVVEVNEELEDSPEFVNESPYEKAWMVKVEISDESQLEALLTAEKYSEMIGE >NC_017337.1|WP_000589549.1|876354_876711_+|arsenate-reductase-family-protein MIKFYQYKNCTTCKKAAKFLDEYGVSYEPIDIVQHTPTINEFKTIIANTGVEINKLFNTHGAKYRELDLKNKLQTLSDDEKLELLSSDGMLVKRPLAVMGDKITLGFKEDQYKETWLA >NC_017337.1|WP_001147952.1|875890_876211_-|thioredoxin-family-protein MQAIKSNESFKSIINSDTPVIVKFEAGWCPDCRAMDLWIDPIVEQYNDYQWYTVNRDELEDVVVENEVMGIPSLLVFKNGDKIAHLHSANAKSPEQVESFLAETFK >NC_017337.1|WP_000422914.1|875200_875740_+|nitroreductase MELQQAIANRRSVKKFKRDMHIDDALLYQAIEKAADAPNHGMREPWRVVHVPKDRLGDMSKDISKFAFSNELDKQQCHYDAVTKLGGMLLLILKTDPRQRQNDENYFAFGAYAQNLMLLLYEAGIGTCWKSPLYIYDPKVRKTLGIKKDEVLAGFLYLTDLEEDMPKAPRKNRNLITLY >NC_017337.1|WP_000752917.1|883019_883214_+|CsbD-family-protein MADESKFEQAKGNVKETVGNVTDNKNLENEGKEDKASGKAKEFVENAKEKATDFIDKVKGNKGE >NC_017337.1|WP_001183843.1|883447_884299_-|DUF368-domain-containing-protein MQQFKWINILKGFAMGTSDLVPGVSGGTIALLLDIYNQFIASISGIFSRRFWPSFTFSIPIIIGMLLAMGSLSNLFNYLLSQHHIPTMFFFGGLIIGIVPYLLKISNYKTSFTTKHYMMVIAGIAILIVITLMNNGDKHAGETLTLSTGLIIKYFIAGMCASSAMLLPGISGSFMLLVFGVYGTVMLAISEVVKLNFAGLPILLAVGFGVLAGFIISSKIIQYFLTHHKLMTFALIIGFVVGSLFAVFPGLPTNIVMWFVSLVVFIIGFIVSLTLGRITAENE >NC_017337.1|WP_000168845.1|884627_885389_+|Fe-S-cluster-assembly-ATPase-SufC MASTLEIKDLHVSIEDKEILKGVNLTINTDEIHAIMGPNGTGKSTLSSAIMGHPSYEVTKGEVLLDGVNILELEVDERAKAGLFLAMQYPSEITGVTNADFMRSAINAKREEGQEINLMQFIKKLDKNMDFLDIDKDMAQRYLNEGFSGGEKKRNEILQLMMLEPKFAILDEIDSGLDIDALKVVSKGINQMRGENFGALMITHYQRLLNYITPDKVHVMYAGKVVKSGGPELAKRLEEEGYEWVKEEFGSAE >NC_017337.1|WP_000205583.1|885486_886794_+|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufD MTTDILNISEEQLVDYSKAHNEPSWMTELRKKALKLTETLEMPKPDKTKLRKWDFDSFKQHDVKGDVYQSLSQLPESVREIIDVNHSKNLVIQHNNTIAYTQVDDNASKDGVIVEGLADALMNHSDLVQKYFMKDAVTVDEHRITALHTALVNGGVFVYVPKNVVVEHPVQYVVLHDDENASFYNHVIIVTEESAEVTYVENYLSNASGEGNQLNIISEVIAGANSNITYGSVDYMDKGFTGHIIRRGITEADASINWALGLMNEGSQIIDNTTNLFGDRSTSSLKSVVVGTGEQKINLTSKIVQYGKETDGYILKHGVMKEHASSVFNGIGYIKHGGTKSIANQESRVLMLSEHARGDANPILLIDEDYVQAGHAASVGRVDPDQLYYLMSRGISQREAERLVIHGFLDPVVRELPIEDVKRQLREVIERKVSK >NC_017337.1|WP_001006453.1|886899_888150_+|cysteine-desulfurase MNEVAEHSFDVNEVIKDFPILDQKVNGKRLAYLDSTATSQTPVQVLNVLEDYYKRYNSNVHRGVHTLGSLATDGYENARETVRRFINAKYFEEIIFTRGTTASINLVAHSYGDANVEEGDEIVVTEMEHHANIVPWQQLAKRKNATLKFIPMTADGELNIEDIKQTINDKTKIVAIAHISNVLGTINDVKTIAEIAHQHGAIISVDGAQAAPHMKLDMQEMNADFYSFSGHKMLGPTGIGVLFGKRELLQKMEPIEFGGDMIDFVSKYDATWADLPTKFEAGTPLIAQAIGLAEAIRYLERIGFDAIHKYEQELTIYAYEQMSAIEGIEIYGPPKDRRAGVITFNLQDVHPHDVATAVDTEGVAVRAGHHCAQPLMKWLNVSSTARASFYIYNTKEDIDQLINALKQTKEFFSYEF >NC_017337.1|WP_001010508.1|888139_888604_+|SUF-system-NifU-family-Fe-S-cluster-assembly-protein MNFNNLDQLYRSVIMDHYKNPRNKGVLDNGSMTVDMNNPTCGDRIRLTFDIEDGIIKDAKFEGEGCSISMASASMMTQAVKGHSLGEAMQMSQEFTKMMLGEDYVITEEMGDIEALQGVSQFPARIKCATLAWKALEKGTVAKEGKAEGTTEEE >NC_017337.1|WP_001074405.1|888754_890152_+|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufB MAKKAPDVGDYKYGFHDDDVSIFRSERGLTENIVREISNMKNEPEWMLDFRLKSLKLFYKMPMPQWGGDLSELNFDDITYYVKPSEQAERSWDEVPEEIKRTFDKLGIPEAEQKYLAGVSAQYESEVVYHNMEKELEEKGIIFKDTDSALQENEELFKKYFASVVPAADNKFAALNSAVWSGGSFIYVPKNIKLDTPLQAYFRINSENMGQFERTLIIADEGASVHYVEGCTAPVYTTSSLHSAVVEIIVHKDAHVRYTTIQNWANNVYNLVTKRTFVYENGNMEWVDGNLGSKLTMKYPNCVLLGEGAKGSTLSIAFAGKGQVQDAGAKMIHKAPNTSSTIVSKSISKNGGKVIYRGIVHFGRKAKGARSNIECDTLILDNESTSDTIPYNEVFNDQISLEHEAKVSKVSEEQLFYLMSRGISEEEATEMIVMGFIEPFTKELPMEYAVEMNRLIKFEMEGSIG >NC_017337.1|WP_000274024.1|890480_890795_-|hypothetical-protein MYFVLAIFTIISASVSLGYSFQACASSHNINAYYALSRSLPLFLLAIFSLVIHSAIFLITISIAMILVQFLDAIVGYKSKDVFKTYGPLATSVVNLILLIVFLF >NC_017337.1|WP_000582326.1|891159_892200_+|HlyC/CorC-family-transporter MIIAIIILIFISFFFSGSETALTAANKTKFKTEADKGDKKAKGIVKLLEKPSEFITTILIGNNVANILLPTLVTIMALRWGISVGIASAVLTVVIILISEVIPKSVAATFPDKITRLVYPIINICVIVFRPITLLLNKLTDSINRSLSKGQPQEHQFSKEEFKTMLAIAGHEGALNEIETSRLEGVINFENLKVKDVDTTPRINVTAFASNATYEEVYETVMNKPYTRYPVYEGDIDNIIGVFHSKYLLAWSNKKEDQITNYSAKPLFVNEHNKAEWVLRKMTISRKHLAIVLDEFGGTEAIVSHEDLIEELLGMEIEDEMDKKEKEKLSQQQIQFQQRKNRNVSI >NC_017337.1|WP_000267243.1|892213_893281_+|nitronate-monooxygenase MWNKNRLTQMLSIEYPIIQAGMAGSTTPKLVASVSNSGGLGTIGAGYFNTQQLEDEIDYVRQLTSNSFGVNVFVPSQQSYTSSQIENMNAWLKPYRRALHLEEPVVKITEEQQFKCHIDTIIKKQVPVCCFTFGIPNESIIKRLKEANIKLIGTATSVDEAIANEKAGMDAIVAQGSEAGGHRGSFLKPKNQLPMVGTISLVPQIVDVVSIPVIAAGGIMDGRGVLASIVLGAEGVQMGTAFLTSQDSNASELLRDAIINSKETDTVVTKAFSGKLARGINNRFIEEMSQYEGDIPDYPIQNELTSSIRKAAANIGDKELTHMWSGQSPRLATTHPANTIMSNIINQINQIMQYK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_017337_4 | 927681-927762 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_017337_4
|
1 spacers
spacers of NC_017337_4
>4.1|927707|30|NC_017337|CRISPRCasFinder CGGGGCCCCAACACAGAGAAATTGGGGAGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017337_4
The CRISPR arrays of NC_017337_4 >merge|NC_017337|4|927681-927762|CRISPRCasFinder CAATTTCTACAGGCAATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAGAAATTGGGGAGTCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGG >NC_017337|4|3|927681-927762|CRISPRCasFinder CAATTTCTACAGGCAATGCAAGTTGG CGGGGCCCCAACACAGAGAAATTGGGGAGT CAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGG
>NC_017337.1|WP_000138487.1|926281_927526_+|Glu/Leu/Phe/Val-dehydrogenase MTENNNLVTSTQGIIKEALHKLGFDEGMYDLIKEPLRMLQVRIPVRMDDGTVKTFTGYRAQHNDAVGPTKGGVRFHPDVDEEEVKALSMWMTLKCGIVNLPYGGGKGGIVCDPRQMSIHEVERLSRGYVRAISQFVGPNKDIPAPDVFTNSQIMAWMMDEYSALDKFNSPGFITGKPIVLGGSHGRDRSTALGVVIAIEQAAKRRNMQIEGAKVVIQGFGNAGSFLAKFLYDLGAKIVGISDAYGALHDPNGLDIDYLLDRRDSFGTVTNLFEETISNKELFELDCDILVPAAISNQITEDNAHDIKASIVVEAANGPTTPEATRILTERGILLVPDVLASAGGVTVSYFEWVQNNQGYYWSEEEVNEKLREKLEAAFDTIYELSQNRKIDMRLAAYIIGIKRTAEAARYRGWA >NC_017337.1|WP_000167314.1|924982_926173_+|ornithine--oxo-acid-transaminase MTKSEKIIELTNHYGAHNYLPLPIVISEAEGVWVKDPEGNKYMDMLSAYSAVNQGHRHPKIIQALKDQADKVTLVSRAFHSDNLGEWYEKICKLAGKDKALPMNTGAEAVETALKAARRWAYDVKGIEPNKAEIIAFNGNFHGRTMAPVSLSSEAEYQRGYGPLLDGFRKVDFGDVDALKAAINENTAAVLVEPIQGEAGINIPPEGYLKAIRELCDEHNVLFIADEIQAGLGRSGKLFATDWDNVKPDVYILGKALGGGVFPISVVLADKEVLDVFTPGSHGSTFGGNPLACAASIAALDVIVDEDLPGRSLELGDYFKEQLKQIDHPSIKEVRGRGLFIGVELNESARPYCEALKEEGLLCKETHDTVIRFAPPLIITKEELDLALEKIRHVFQ >NC_017337.1|WP_000838020.1|923547_924675_+|NADH-dependent-flavin-oxidoreductase MKSKYEPLFDKVELPNGVELRNRFVLAPLTHISSNDDGTISDIELPYIEKRSQDVGITINAASNVSDVGKAFPGQPSIAHDSDIEGLKRLATAMKKNDAKALVQIHHGGAQALPELTPDGDVVAPSPISLKSFGQKQEHSAREMTNEEIKQAIKDFGEATRRAIEAGFDGVEIHGANHYLIHQFVSPYYNRRNDVWANQYKFPVAVIEEVLKAKEAYGNKDFIVGYRLSPEEAESPGITMEITEELVNKISHMPIDYIHVSMMDTHATTREGKYAGQERLPLIHKWINGRMPLIGIGSIFTADEALDAVENVGVDLVAIGRELLLDYQFVEKIKDGREDEIINYFDPEREDNHHLTPNLWHQFNEGFYPLPRKDK >NC_017337.1|WP_001067294.1|922809_923187_+|S1-RNA-binding-domain-containing-protein MNNYKIGQHIKVRVTGIQPYGAFVETPNHTEGLIHISEIMDDYVHNLKKFLSEGQIVKAKILSIDDEGKLNLSLKDNDYFKNYERKKEKQSVLDEIRETEKYGFQTLKERLPIWIKQSKRAIRND >NC_017337.1|WP_000035058.1|921800_922394_+|peptidylprolyl-isomerase MANYPQLNKEVQQGEIKVVMHTNKGDMTFKLFPNIAPKTVENFVTHAKNGYYDGITFHRVINDFMIQGGDPTATGMGGESIYGGAFEDEFSLNAFNLYGALSMANSGPNTNGSQFFIVQMKEVPQNMLSQLADGGWPQPIVDAYGEKGGTPWLDQKHTVFGQIIDGETTLEDIANTKVGPQDKPLHDVVIESIDVEE >NC_017337.1|WP_000781162.1|921353_921737_-|kinase-associated-lipoprotein-B MKLYRFSHKTGSYGVTIVEENGDDVLVKVEQVIKHPKQGDLHNPTETEGVFFHERKALSHFEKRYTKRSQLRDFNVDVLRYEDSLQQAITDLETKLKAQQTKHAEMSLASLARLKEDYSLQYKENFK >NC_017337.1|WP_000054596.1|918817_921223_-|Na+/H+-antiporter-Mnh1-subunit-A MSLLHIAVILPLIFALIIPILYRFFKRIHLGWFVLPVPIVIFIYMLTLIKTTMSGNTVMKTLNWMPHFGMNFDLYLDGLGLLFSLLISGIGSLVVLYSIGYLSKSEQLGNFYCYLLLFMGAMLGVVLSDNVIILYLFWELTSFSSFLLISFWRERQASIHGAQKSLIITVFGGLSLLGGIILLAIPTQSFSIQYMIQHASEIQNSPFFIFAMILIMIGAFTKSAQFPFYIWLPDAMEAPTPVSAYLHSATMVKAGLYLIARMTPIFAASQGWIWTVTLVGLITLFWASLNATKQQDLKGILAFSTVSQLGMIMAMLGIGAISYHYQGDDSKIYAAAFTAAIFHLINHATFKGALFMITGAVDHSTGTRDVKKLGGLLTIMPISFTITVITALSMAGVPPFNGFLSKESFLETTFTASQANLFSVDTLGYLFPIIGIVGSVFTFVYSIKFIMHIFFGQYKPEQLPKKAHEVSILMLLSPAILATLVIVFGLFPGILTNSIIEPATSSINHTVIDDVEFHMFHGLTPAFLSTLVIYILGILLIVTFSYWVKLLQRQPGKLTFNYWYNRSANVIPNYSEKMTNSYVTDYSRNNLVIIFGALILLTFVTVFSVPFNINFKDVSPIRIFEVCIVILLLSAAFLILFAKSRLFSIIMLSAVGYAVSVLFIFFKAPDLALTQFVVESISTALFLLCFYHLPNLNRYNEKRSFQLTNALIAGGVGLSVIIIGLIAYGNRHFESISKFYQEHVYDLAHGKNMVNVILVDFRGMDTLFESSVLGIAGLAVYTMIKLRKKRQTQGNEVKNHE >NC_017337.1|WP_001081626.1|918396_918825_-|Na+/H+-antiporter-Mnh1-subunit-B MNRQQNDLILQFAAVIIFFMVMVFGFSLFLAGHYTPGGGFVGGLLFASSLVIITIAFDIETMRKIFPLDFKILIGIGLVFCIATPIASWFLGKNFFTHVTFDIPLFILEPVHMTTAVFFDFGVLCAVVGTVMTIIISIGENE >NC_017337.1|WP_000402803.1|918055_918397_-|Na+/H+-antiporter-Mnh1-subunit-C MEIIMIFVSGILTAISVYLVLSKSLIRIVMGTTLLTHAANLFLITMGGLKHGTVPIYEANVKSYVDPIPQALILTAIVIAFATTAFFLVLAFRTYKELGTDNVESMKGVPEDD >NC_017337.1|WP_000573086.1|916566_918063_-|Na+/H+-antiporter-Mnh1-subunit-D MIESNMLVLTLVIPVITAILLVFIGKRPIIKRYVALGGTLLTLVAAIINLANVVKHGPLRVELGSWKAPYSIVFVLDIFSALLIITSIIITAIVILYSYQTIGIERERYYYYFSVLFMLIGIIGAFTTGDIFNLFVFFEVFLMSSYFLLVIGSTKIQLQETIKYVLVNVVSSSFFVMGVAILYSVVGTLNLADISNKLANLSAHDSGLVNIVFILFIFVFATKAGVFPMFVWLPSAYYAPPIPIIAFFGALLTKVGVYAIARTLSLFFSDNVSFSHYVILFLALLTIIFGCVGAVAYANIKKIILYNVMIAVGVILVGVAMMTESGMIGAIYYTLHDMLVKLALFLLIGIMIKITGTADLRQFGGLIKRYPVLGWSFFIAALSLAGIPPLSGFYGKFFIVQSTFERGFYLSGVIVLLSSLVVLYSVIRIFLQGFFGQPKGYDLNNKVDVKYLTTIAIVAVVITVLYGLSADYLYPMVKAGAETFYNPSTYVKAVLGGK >NC_017337.1|WP_000185329.1|927919_928849_-|glycerophosphodiester-phosphodiesterase MTNSSKSFTKFMAASAVFTMGFLSVPTAGAEQTNQIANKPQAIQWHTNLTNERFTTIAHRGASGYAPEHTFQAYDKSHNELKASYIEIDLQRTKDGHLVAMHDETVNRTTNGHGRVEDYTLDELKQLDAGSWFNKKYPKYARASYKNAKVPTLDEILERYGPNANYYIETKSPDVYPGMEEQLLASLKKHHLLNNNKLKNGHVMIQSFSDESLKKIHRQNKHVPLVKLVDKGELQQFNDQRLKEIRSYAIGLGPDYTDLTEQNTHHLKDLGFIVHPYTVNEKADMLRLNKYGVDGVFTNFADKYKEVIK >NC_017337.1|WP_000066053.1|929090_930470_-|argininosuccinate-lyase MSNKAWGGRFEVQPEEWVDDFNASITFDQTLIDQDIEGSIAHATMLANQGIISQQDSEQIIQGLKSIQHDYHQDQIQFSASLEDIHLNIEHELIKRIGDAGGKLHTGRSRNDQVATDMHLYTKKQVQDIIALIKSLQSVIVDIASNNVDTIMPGYTHLQRAQPISFAHHIMTYFWMLQRDQQRFEDSLKRIDINPLGAAALSGTTYPIDRHETTALLNFGSLYENSLDAVSDRDYIIETLHNISLTMVHLSRFAEEIIFWSTDEAKFITLSDAFSTGSSIMPQKKNPDMAELIRGKVGRTTGHLMSMLMTLKGLPLAYNKDMQEDKEGLFDAVHTIKGSLRIFEGMIQTMTINKERLNQTVKEDFSNATELADYLVTKNIPFRTAHEIVGKIVLECIQQGHYLLDVPLATYQQHHSSIDADIYDYLQPENCLKRRQSYGSTGQSSVKQQLDVAKQLLSQ >NC_017337.1|WP_000660038.1|930459_931665_-|argininosuccinate-synthase MKEKIVLAYSGGLDTSVAVQWLIDKGYDVVACCLDVGEGKDLDIVYKKALDMGAIECHIIDATKEFSDEYVSYAIKGNLMYENAYPLVSALSRPLIAKKLVEIAEKTNSVGIAHGCTGKGNDQVRFEVAIKALNPSLKAFAPVREWAWSREEEIDYAIKHNIPVSINHDSPYSIDQNLWGRANECGILEDPYAAPPEDAFDLTNALEETPDTADEIILTFVKGIPVQIDGKTYELDDLILTLNALAGKHGIGRIDHVENRLVGIKSREIYEAPAAEVILKAHKALETITLTKDVAHFKPIIEKQFAEQLYNGLWFSPLTDSLKLFIDSTQQYVSGDVRIKLFKGNAIVNGRKSPYTLYDEKLATYTKEDAFNQDAAVGFIDIYGLPTQVNAMLHGGYSNEQ >NC_017337.1|WP_000148855.1|932014_933346_+|glucose-6-phosphate-isomerase MTHIQLDFSKTLEFFGEHELKQQQEIVKSIHKTIHEGTGAGSDFLGWVDLPVDYDKEEFSRIVEASKRIKENSDVLVVIGIGGSYLGARAAIEMLTSSFRNSNEYPEIVFVGNHLSSTYTKELVDYLADKDFSVNVISKSGTTTEPAVAFRLFKQLVEERYGKEEAQKRIFATTDKEKGALKQLATNEGYETFIVPDDVGGRYSVLTAVGLLPIATAGINIEAMMIGAAKAREELSSDKLEENIAYQYATIRNILYAKGYTTEMLINYEPSMQYFNEWWKQLFGESEGKDFKGIYPSSANYTTDLHSLGQYVQEGRRFLFETVVKVNHPKYDITIEKDSDDLDGLNYLAGKTIDEVNTKAFEGTLLAHTDGGVPNMVVNIPQLDEETFGYVVYFFELACAMSGYQLGVNPFNQPGVEAYKQNMFALLGKPGFEDLKKELEERL >NC_017337.1|WP_000007963.1|934217_934793_+|TVP38/TMEM64-family-protein MSFHQVEEWFEIFRQFGYLPGFILLYIRAIIPVFPLALYILINIQAYGPILGILISWLGLISGTFTVYLICKRLVNTERMQRIKQRTAVQRLISFIDRQGLIPLFILLCFPFTPNTLINFVASLSHIRPKYYFIVLALSKLVSTIILGYLGKEITTILTHPLRGIIMLVVLIVFWIVGKKLEQHFMGSKKE >NC_017337.1|WP_000758212.1|934797_935322_+|signal-peptidase-I MKKVVKYLISLILAIIIVLFVQTFVIVGHVIPNNDMSPTLNKGDRVIVNKIKVTFNQLNNGDIITYRRGNEIYTSRIIAKPGQSMAFRQGQLYRDDRPVDASYAKNRKIKDFSLRNFKELDGDIIPPNNFVVLNDHDNNQHDSRQFGLVDKKDIIGNISLTYYPFSKWTIQFKS >NC_017337.1|WP_000711897.1|935337_935913_+|signal-peptidase-I MKKELLEWIISIAVAFVILFIVGKFIVTPYTIKGESMDPTLKDGERVAVNIIGYKTGGLEKGNVVVFHANKNDDYVKRVIGVPGDKVEYKNDTLYVNGKKQDEPYLNYNLKHKQGDYITGTFQVKDLPNANPKSNVIPKGKYLVLGDNREVSKDSRAFGLIDEDQIVGKVSFRFWPFSEFKYNFNPENTKN >NC_017337.1|WP_000172364.1|936072_939549_+|helicase-exonuclease-AddAB-subunit-AddB MTLHAYLGRAGTGKSTKMLTEIKQKMKADPLGDPIILIAPTQSTFQLEQAFVNDPELNGSLRTEVLHFERLSHRIFQEVGSYSEQKLSKAATEMMIYNIVQEQQKYLKLYQSQAKYYGFSEKLTEQIQDFKKYAVTPEHLESFIADKNMQTRTKNKLEDIALIYREFEQRIQNEFITGEDALQYFIDCMPKSEWLKRADIYIDGFHNFSTIEYLIIKGLIKYAKSVTIILTTDGNHDQFSLFRKPSEVLRHIEEIANELNISIERQYFNQLYRFNNQDLKHLEQEFDALQINRVACQGHINILESATMREEINEIARRIIVDIRDKQLRYQDIAILYRDESYAYLFDSILPLYNIPYNIDTKRSMTHHPVMEMIRSLIEVIQSNWQVNPMLRLLKTDVLTASYLKSAYLVDLLENFVLERGIYGKRWLDDELFNVEHFSKMGRKAHKLTEDERNTFEQVVKLKKDVIDKILHFEKQMSQAATVKDFATAFYESMEYFELPNQLMTERDELDLNGNHEKAEEIDQIWNGLIQILDDLVLVFGDEPMSMERFLEVFDIGLEQLEFVMIPQTLDQVSIGTMDLAKVDNKQHVYLVGMNDGTMPQPVTASSLITDEEKKYFEQQANVELSPTSDILQMDEAFVCYVAMTRAKGNVTFSYSLMGSSGDDKEISPFLNQIQSLFNQLEITNIPQYHEVNPLSLMQHAKQTKITLFEALRAWLDDEIVADSWLDAYQVIRDSDLLNQGLDYLMSALTFDNETVKLGETLSKELYGKEINASVSRFEGYQQCPFKHYASHGLKLNERTKYELQNFDLGDIFHSVLKYISERINGDFKQLDLKKIRQLTNEALEEILPKVQFNLLNSSAYYRYLSRRIGAIVETTLSALKYQGTYSKFMPKHFETSFRRKPRTNDELIAQTLTTTQGIPINIRGQIDRIDTYTKNDTSFVNIIDYKSSEGSATLDLTKVYYGMQMQMMTYMDIVLQNKQRLGLTDIVKPGGLLYFHVHEPRIKFKSWADIDEDKLEQDLIKKFKLSGLVNADQTVIDALDIRLEPKFTSDIVPVGLNKDGSLSKRGSQVADEATIYKFIQHNKENFIETASNIMDGHTEVAPLKYKQKLPCAFCSYQSVCHVDGMIDSKRYRTVDETINPIEAIQNINIDDEFGGEQ >NC_017337.1|WP_000154925.1|939549_943203_+|helicase-exonuclease-AddAB-subunit-AddA MTIPEKPQGVIWTDAQWQSIYATGQDVLVAAAAGSGKTAVLVERIIQKILRDGIDVDRLLVVTFTNLSAREMKHRVDQRIQEASIADPANAHLKNQRIKIHQAQISTLHSFCLKLIQQHYDVLNIDPNFRTSSEAENILLLEQTIDEVIEQHYDILDPAFIELTEQLSSDRSDDQFRMIIKQLYFFSVANPNPTNWLDQLVTPYEEEAQQAQLIQLLTDLSKVFITAAYDALNKAYDLFSMMDGVDKHLAVIEDERRLMGRVLEGGFIDIPYLTGHEFGARLPNVTAKIKEANEMMVDALEDAKLQYKKYKSLIDKVKSDYFSREADDLKADMQQLAPRVKYLARIVKDVMSEFNRKKRSKNILDFSDYEHFALQILTNEDGSPSEIAESYRQHFQEILVDEYQDTNRVQEKILSCIKTGDEHNGNLFMVGDVKQSIYKFRQADPSLFIEKYQRFTIDGDGTGRRIDLSQNFRSRKEVLSTTNYIFKHMMDEQVGEVNYDESAQLYYGAPYDESDHPVNLKVLVEADQEHSDLTGSEQEAHFIVEQVKDILEHQKVYDMKTGSYRSATYKDIVILERSFGQARNLQQAFKNEDIPFHVNSREGYFEQTEVRLVLSFLRAIDNPLQDIYLVGLMRSVIYQFKEDELAQIRILSPNDDYFYQSIVNYINDEAADAILVDKLKMFLSDIQSYQQYSKDHPVYQLIDKFYNDHYVIQYFSGLIGGRGRRANLYGLFNKAIEFENSSFRGLYQFIRFIDELIERGKDFGEENVVGPNDNVVRMMTIHSSKGLEFPFVIYSGLSKDFNKRDLKQPVILNQQFGLGMDYFDVDKEMAFPSLASVAYRAVAEKELVSEEMRLVYVALTRAKEQLYLIGRVKNDKSLLELEQLSISGEHIAVNERLTSPNPFHLIYSILSKHQSASIPDDLKFEKDIAQIEDSSRPNVNISIVYFEDVSTETILDNDEYRSVNQLETMQNGNEDVKAQIKHQLDYQYPYVNDTKKPSKQSVSELKRQYETEESGTSYERVRQYRIGFSTYERPKFLSEQGKRKANEIGTLMHTVMQHLPFKKERISEVELHQYIDGLIDKHIIEADAKKDIRMDEIMTFINSKLYSIIAEAEQVYRELPFVVNQALVDQLPQGDEDVSIIQGMIDLIFVKDGVHYFVDYKTDAFNRRRGMTDEEIGTQLKNKYKIQMKYYQNTLQTILNKEVKGYLYFFKFGTLQL >NC_017337.1|WP_000670752.1|943368_944271_+|fumarylacetoacetate-hydrolase-family-protein MKFLSFKYNDKTSYGVKVKREDAVWDLTQVFADFAEGDFHPKTLLAGLQQNHTLDFQEQVRKAVVAAEDSGKAEDYKISFNDIEFLPPVTPPNNVIAFGRNYKDHANELNHEVEKLYVFTKAASSLTGDNATIPNHKDITDQLDYEGELGIVIGKSGEKIPKALALDYVYGYTIINDITDRKAQSEQDQAFLSKSLTGGCPMGPYIVTKDELPLPENVNIVTKVNNEIRQDGNTGEMILKIDELIEEISKYVALHPGDIIATGTPAGVGAGMQPPKFLQPGDEVKVTIDNIGTLTTYIAK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_017337_5 | 1025379-1025536 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_017337_5
|
3 spacers
spacers of NC_017337_5
>5.1|1025405|16|NC_017337|CRISPRCasFinder ATCGCCATTGTCTGGA >5.2|1025447|19|NC_017337|CRISPRCasFinder GTTGTTAGGGTTATCTGGA >5.3|1025492|19|NC_017337|CRISPRCasFinder TTCATCTGGGTTGTTAGGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017337_5
The CRISPR arrays of NC_017337_5 >merge|NC_017337|5|1025379-1025536|CRISPRCasFinder GCGTCAGGGTTGTCTGAATTATTGTTATCGCCATTGTCTGGATTATCAGGGTTATTTGGTTCGTCTGGGTTGTTAGGGTTATCTGGATTATTAGGGTTGTCAGGGTTATTTGGTTCATCTGGGTTGTTAGGGTTGTCAGGATTGTTAGGGTTATCTGG >NC_017337|5|4|1025379-1025536|CRISPRCasFinder GCGTCAGGGTTGTCTGAATTATTGTT ATCGCCATTGTCTGGA TTATCAGGGTTATTTGGTTCGTCTGG GTTGTTAGGGTTATCTGGA TTATTAGGGTTGTCAGGGTTATTTGG TTCATCTGGGTTGTTAGGG TTGTCAGGATTGTTAGGGTTATCTGG
>NC_017337.1|WP_001088784.1|1024108_1025290_-|cysteine-protease-staphopain-B MNSSCKSRVFNIISIIMVSMLILSLGAFANSNKAKADSHSKQLEINVKSDKVPQKVKDLAQQQFAGYAKALDKQSNAKTGKYELGEAFKIYKFNGEEDNSYYYPVIKDGKIVYTLTLSPKNKDDLNKSKEDMNYSVKISNFIAKDLDQIKDKNSNITVLTDEKGFYFEEDGKVRLVKATPLPGNVKEKESAKTVSAKLKQELKNTVTPTKVEENEAIQEDQVQYENTLKNFKIREQQFDNSWCAGFSMAALLNATKNTDTYNAHDIMRTLYPEVSEQDLPNCATFPNQMIEYGKSQGRDIHYQEGVPSYEQVDQLTKDNVGIMILAQSVSQNPNDPHLGHALAVVGNAKINDQEKLIYWNPWDTELSIQDADSSLLHLSFNRDYNWYGSMIGY >NC_017337.1|WP_000284457.1|1023741_1024071_-|staphostatin-B MYQLQFINLVYDTTKLTHLEQTNINLFIGNWSNHQLQKSICIRHGDDTSHNQYHILFIDTAHQRIKFSSIDNEEIIYILDYDDTQHILMQTSSKQGIGTSRPIVYERLV >NC_017337.1|WP_000184945.1|1022682_1023504_+|1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-CoA-synthase MTNRQWETLREYDEIKYEFYEGIAKVTINRPEVRNAFTPKTVAEMIDAFSRARDDQNVSVIVLTGEGDLAFCSGGDQKKRGHGGYVGEDQIPRLNVLDLQRLIRIIPKPVIAMVKGYAVGGGNVLNVVCDLTIAADNAIFGQTGPKVGSFDAGYGSGYLARIVGHKKAREIWYLCRQYNAQEALDMGLVNTVVPLDKVEDETVQWCKEIMKHSPTALRFLKAAMNADTDGLAGLQQMAGDATLLYYTTDEAKEGRDAFKEKRDPDFDQFPKFP >NC_017337.1|WP_000150209.1|1021886_1022690_+|2-succinyl-6-hydroxy-2,-4-cyclohexadiene-1-carboxylate-synthase MTHYNYYEANVETNQVLVLLHGFLSDSRTYHNHIDKYTDICHVITIDLPGHGEDQSSMDETWDFDYITTLLDRILDKYKDKSITLFGYSMGGRVALYYAINGHIPISNLILESTSPGIKEEANQLERRLVDDARAKVLDIAGIELFVNDWEKLPLFQSQLELPVEIQHQIRQQRLSQSPQKMAKALRDYGTGQMPNLWPRLKEIKVPTLILAGEYDEKFVQIAKKMANLIPNSKCKLISATGHTIHVEDSDEFDTMILGFLKEEQND >NC_017337.1|WP_000526687.1|1020226_1021900_+|2-succinyl-5-enolpyruvyl-6-hydroxy-3--cyclohexene-1-carboxylic-acid-synthase MGNHKAALTKQVFTFASELYAYGVREVVISPGSRSTPLALAFEAHPNIKTWIHPDERSAAFFAVGLIKGSERPVAILCTSGTAAANYTPAIAESQISRIPLIVLTSDRPHELRSVGAPQAINQVNMFNNYVSYEFDMPIADDSKETIDAIYYQMQIASQYLYGPHKGPIHFNLPFRDPLTPDLNATELLTSEMKILPHYQKSIDASALRHILNKKKGLIIVGDMQHQEVDQILTYSTIYDLPILADPLSHLRKFDHPNVICTYDLLFRSGLDLNVDFVIRVGKPVISKKLNQWLKKTDAFQILVQNNDKIDVFPIAPDISYEISANDFFRSLMEDTTVNRVSWLEKWQCLEKKGRKEIKCYLEQATDESAFVGELIKKTSEKDALFISNSMPIRDVDNLLLNKNIDVYANRGANGIDGIVSTALGMAVHKRITLLIGDLSFYHDMNGLLMSKLNNIQMNIVLLNNDGGGIFSYLPQKESATDYFERLFGTPTGLDFEYTAKLYQFDFKRFNSVSEFKNATLLSETSTIYELITNREDNFKQHQILYQKLSEMIHDTL >NC_017337.1|WP_000190614.1|1018878_1020240_+|isochorismate-synthase-MenF MATGVLEDDIVKEIYDSSKEWVSVEVKLSQSLDPSTLFHLTDNEAGDRFYMRLNDNRTSYFGYKAIQLFKNNSKNKQSIFKDWEKLKHNITFIHPQSEKHHLRVVGGFQFSSHKSDDEWREFGLNHFVLPEVLISTDNNGTFLTYTVKRESFTVEALNDLMDLFNNISDIDVDEQIGEITRNEDIYKDDWRQLVVEAIESINNEEKIVLARRRLIKFDKDISIPYILKQAYSKEKNSYIFLLESQDSIFFSQTPEQLIKVNNKILSTKAVAGTIKRSQDEDEDTKNVEAFLKDNKNLIEHRFVVDSILHDIKPYITELHYDKTPKILKNDHLYHLYTEIKAPLKDDSYISLIDNLHPTPALGGYPKEFAMDFIEQKEFGTRGLYGAPVGYIDIYDDCEFIVAIRSMLIKKAQATLFAGCGIVKDSDPDSELAETNLKFTPMMNALGVDMNGKS >NC_017337.1|WP_000070966.1|1017758_1018697_-|1,4-dihydroxy-2-naphthoate-polyprenyltransferase MSNQYQQYSTVKKYWHLMRPHTLTASVVPVLVGTAASKIYFLGSEDHIKISLFIAMLLACLLIQAATNMFNEYYDYKKGLDDHESVGIGGAIVRNGMSPELVLRLAIAFYILAAILGLFLAANSSFWLLPVGLVCMAVGYLYTGGPFPISWTPFGELFSGVFMGMFIIVIAFFIQTGNIQSYVIWLSVPIVITIGLINMANNIRDRVKDKASGRKTLPILLGKNASLTFMAIMYFIAYAFIVLTIIIKPGGSLFYLLALLSFPMPVKVIRRFKKNDTPPTMMPAMAAAGKTNTFFGLLYALGIYISALFAGI >NC_017337.1|WP_000620951.1|1017156_1017708_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MIRQARPEDRFDIAKLVYMVWDDMELELVKHLPKDMVLDAIEKSCVDATYRTFYQHILVYEVENKVAGCIISYSGENELKYEKAWELLDLPEEIKQYGTPLPVKEAKDDEYYIETIATFEAYRGRGIATKLLTSLLESNTHVKWSLNCDINNEAALKLYHKVGFISDGQIELYKHMYHHLIVK >NC_017337.1|WP_000867357.1|1016776_1016992_-|TM2-domain-containing-protein MKVNKAIYVIVALFLGGLGIHKFYADKFGQGLFHLLFFWTGIPTIISIIHAIFVIFTKKADKDGYIIFPKN >NC_017337.1|WP_020978112.1|1016581_1016713_-|hypothetical-protein MRYVTMRQFIKRIVKTILVGYVIKFIRNKLSGKSSHPTDNKHN >NC_017337.1|WP_000777585.1|1026936_1028091_-|aminotransferase-class-I/II-fold-pyridoxal-phosphate-dependent-enzyme MKLSLNSNSKYLRAPSIRQFSNRMNNLDDCVNLTIGQPDFPMPDVVKKAYVDAINNDKTSYSHNKGLLETREAISQYFKNRYHFSYDPEEIIVTNGASEAIDTTLRSIIEPGDEIIIPGPIYAGYIPLIEVLGGKPIYIDTTATQFKITPDALESHISPKTKAVLLNYPTNPTGVVLKRNEVLNIVNVLKKYPIFIISDEIYAENTFSGKHVSFAEFEDIRDQLILIGGLSKSHSATGIRIGFLLGPQYLIDKLTFMHAYNCICANVPAQIACITALNEGLEAPKYMNEAYVERRNYLVSELTKLGFEITAQPEGAFYIFPSIKHITDDDFEFCVDLLESTHLAIVPGSSFTEFGKGFVRISYAYEMDVLKEGMKRLAKYLNTK >NC_017337.1|WP_000202431.1|1028286_1029297_-|acyltransferase-family-protein MTSLKERDYFFDNARAILILLVVFGHMLQPYTSGDKYLSALYLVIYSFHMPTFLFISGYFAKNIDKPYYLEKISKRLIVPYMIFFAFFSIYYFLTGKSDELQLDPFNPVFALWFLITLFFFHVILVIVRRFNPYKVLSVSIIISIGAGFSDNIDSYLSISRTIVFFPIFYLGYIFTKKHTAIFKNKKLIPLSIITFILFFIIYVIHPINADWLLGSSPYTSLENEGQSVFSPFKRLILYGIILIAMTAFLNLMSTKKKLYTYIGSRTLYVYLLHGLIIGIVRGFEWYPFDNPISLMTYLYLISISVIIVYVLSTNFVCKWTNPIINLQRPSQFKDS >NC_017337.1|WP_000278015.1|1029449_1029869_+|MarR-family-transcriptional-regulator MYKQLEKLITLTNNDLNLVNRRFGQRTDITSEQLELLRILFNYDRLSQYDLTMKISREQSIVSRWIKKLVLKGYITSQQSSEDLRCKELILTDQARTLISQINNARCELIEARCQCLSEVELDNLNQLLDKLNQRRISL >NC_017337.1|WP_001788579.1|1029895_1030006_+|hypothetical-protein MSLCTQQKLNHELQAKVAVIVKIDGKQSPLFLLVYV >NC_017337.1|WP_001074546.1|1030077_1033857_-|glucosaminidase-domain-containing-protein MAKKFNYKLPSMVALTLVGSAVTAHQVQAAETTQDQTTNKNVLDSNKVKATTEQAKAEVKNPTQNISGTQVYQDPAIVQPKTANNKTGNAQVSQKVDTAQVNGDTRANQSATTNNTQPVAKSTSTTAPKTNTNVTNAGYSLVDDEDDNSENQINPELIKSAAKPAALETQYKAAAPKAATTTAPKAKTEATPKVTTFSASAQPRSVAATPKTSLPKYKPQVNSSINDYIRKNNLKAPKIEEDYTSYFPKYAYRNGVGRPEGIVVHDTANDRSTINGEISYMKNNYQNAFVHAFVDGDRIIETAPTDYLSWGVGAVGNPRFINVEIVHTHDYASFARSMNNYADYAATQLQYYGLKPDSAEYDGNGTVWTHYAVSKYLGGTDHADPHGYLRSHNYSYDQLYDLINEKYLIKMGKVAPWGTQSTTTPTTPSKPTTPSKPSTPSTGKLTVAANNGVAQIKPTNSGLYTTVYDKTGKATNEVQKTFAVSKTATLGNQKFYLVQDYNSGNKFGWVKEGDVVYNTAKSPVNVNQSYSIKPGTKLYTVPWGTSKQVAGSVSGSGNQTFKASKQQQIDKSIYLYGSVNGKSGWVSKAYLVDTAKPTPTPTPKPSTPTTNNKLTVSSLNGVAQINAKNNGLFTTVYDKTGKPTKEVQKTFAVTKEASLGGNKFYLVKDYNSPTLIGWVKQGDVIYNNAKSPVNVMQTYTVKPGTKLYSVPWGTYKQEAGAVSGTGNQTFKATKQQQIDKSIYLYGTVNGKSGWVSKAYLAVPAAPKKAVAQPKTAVKAYAVTKPQTTQTVSKIAQVKPNNTGIRASVYEKTAKNGAKYADRTFYVTKERAHGNETYVLLNNTSHNIPLGWFNVKDLNVQNLGKEVKTTQKYTVNKSNNGLSMVPWGTKNQVILTGNNIAQGTFNATKQVSVGKDVYLYGTINNRTGWVNAKDLTAPTAVKPTTSAAKDYNYTYVIKNGNGYYYVTPNSDTAKYSLKAFNEQPFAVVKEQVINGQTWYYGKLSNGKLAWIKSTDLAKELIKYNQTGMTLNQVAQIQAGLQYKPQVQRVPGKWTDANFNDVKHAMDTKRLAQDPALKYQFLRLDQPQNISIDKINQFLKGKGVLENQGAAFNKAAQMYGINEVYLISHALLETGNGTSQLAKGADVVNNKVVTNSNTKYHNVFGIAAYDNDPLREGIKYAKQAGWDTVSKAIVGGAKFIGNSYVKAGQNTLYKMRWNPAHPGTHQYATDVDWANINAKIIKGYYDKIGEVGKYFDIPQYK >NC_017337.1|WP_000491989.1|1034084_1034519_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MFSKVNNQKMLEDCFYIRKKVFVEEQGVPEESEIDEYESESIHLIGYDNGQPVATARIRPINETTVKIERVAVTKSHRGQGMGRMLMQAVESLAKDEGFYVAIMNAQCHAIPFYESLNFKMRGNIFLEEGIEHIEMTKKLTSLN >NC_017337.1|WP_000088437.1|1034673_1035144_-|osmotic-stress-response-protein MSRKTYEKIANINGMFNMLEQQIIHSQDMAHFRSEFFYVNHEHRENYEALLIYYKNSIENPIVDGACYILALPEIFNSVDVFESELPFSWVYDENGITETMKSLSIPLQYLVAAALEVTDVNIFKPSGFTMGMNNWNIAQMRIFWQYTAIIRKEAL >NC_017337.1|WP_001032264.1|1035191_1036418_-|polyisoprenyl-teichoic-acid--peptidoglycan-teichoic-acid-transferase MNKFVKYFLILLALVLIVVPIVFATLLFKTSQDAFESSQDSKNANRQSNLRDNKVNPEEQPISILFLGIDDNDGRRKKGQDAEHSRSDAMILTTFNQSKHQIRMLSIPRDTISYIPKVGYYDKITHAHAYGGPIAAMDSVEATMNVPVDYYVRVNMKAFVEAVNELGGIYYDVPYDLNEPNTDDTGKIKIKKGYQKLNGDEALAVARTRHHDSDLKRGQRQMELIKILFQKAQEVDSIDKLDNVIQIVGKNAKHNLTNSEIKALAKMYLTNDVEIKTAQLKGKDDMLNGIYYYHPSVESIQKYANLLRNDLELSPINDKNDFLDQRVINHYGSLIPLTPLDSSLLRKEQNDTTDKDKSSNNTDDSNNSNNNNGVNNQQQPTTGQNTNQDQGNIQQTPQASNNQNGVVN >NC_017337.1|WP_000671249.1|1036866_1038060_+|teichoic-acid-D-Ala-esterase-FmtA MKFNKVKLVIHACVLLFIIISIALIFHRLQTKTHSIEPIHKETKLSDNEKYLVDRNKEKVAPSKLKEVYNSKDPKYKKIDKYLQSSLFNGSVAIYENGKLKMSKGYGYQDFEKGIKNTPNTMFLIGSAQKFSTGLLLKQLEEEHKININDPVSKYIPWFKTSKPIPLKDLMLHQSGLYKYKSSKDYKNLDQAVRAIQKRGIDPKKYKKHMYNDGNYLVLAKVIEEVTGKSYAENYYTKIGDPLKLQHTAFYDEQPFKKYLAKGYAYNSTGLSFLRPNILDQYYGAGNLYMTPTDMGKLITQIQQYKLFSPKITNPLLHEFGTKQYPDEYRYGFYAKPTLNRLNGGFFGQVFTVYYNDKYVVVLALNVKGNNEVRIKHIYNDILKQNKPYNTKGVIVQ >NC_017337.1|WP_001797236.1|1038596_1038875_-|cytochrome-aa3-quinol-oxidase-subunit-IV MKHTVGFIASIVLTLLAVYVTLYTSLTFHAKLTIIFGFAFVQAGLQLLMFMHLTEGKDGRLQTFKVIFALVITLCFVVGTYWVMQGGHSSHL |
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NC_017337_6 | 1060014-1060110 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_017337_6
|
1 spacers
spacers of NC_017337_6
>6.1|1060048|29|NC_017337|CRISPRCasFinder TAAAAGAGGGATACTTGCGCTGAGCGCAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017337_6
The CRISPR arrays of NC_017337_6 >merge|NC_017337|6|1060014-1060110|CRISPRCasFinder GCATAAAAGCCCCTAACAACTAAAAGTTGTAAGGTAAAAGAGGGATACTTGCGCTGAGCGCATGCATAAAAGCCCCTAACAACTAAAGGTTGTAAGG >NC_017337|6|5|1060014-1060110|CRISPRCasFinder GCATAAAAGCCCCTAACAACTAAAAGTTGTAAGG TAAAAGAGGGATACTTGCGCTGAGCGCAT GCATAAAAGCCCCTAACAACTAAAGGTTGTAAGG
>NC_017337.1|WP_000033477.1|1058960_1059536_-|ECF-transporter-S-component MSKGLKLSEILVTVLISVVFAVIYNLWWFVYNGVQATGLHLEQLTNGVWFMAAIVCYLIIPKPGIALLAEFAAGAGETIIMGRFDIPTIVYAFIQGLACELVFAIFKYQSRSVMVAMLAGFCTAIAAFPIDYFYGYLNEVAGWNLTLFIVFRLISGAVVAGVLSYLLVKALDKTGVTKLFRPAAKEDYDNL >NC_017337.1|WP_000921963.1|1057544_1058945_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLKVSDLRLKYPNGQRKIFDHLNINIQDKEKVLLLGPSGCGKSTLLNVLSGIVPNLIELPMKYDELIVDPLSGVIFQDPDSQFCMPKVYEELAFVLENRQVPREDMDALIINALNMVNLNVTPETYIKDLSGGMKQKLAIVETILQQSKTLFLDEPTAMLDVQATEDLWTKLIELWEDQTVVIVEHKVKHIWNHVDRVILMDYNGNIIADECPEIILQKYVHLLSEYGVWHPRAWEFAPSRVDFPTTNSHLLQFKNGRIIRGKSTLLSFSDLEIGLGEWITITGANGSGKTTLLESIMQLIKYQGDVYFENQRLTKIKHAAKHMYLVYQNPELQFITNSVYDEINIHFNHLSKDQSDDETIQLLKLLDLENVKDQHPYELSIGQKRRLSVATALSSKADIIFLDEPTFGLDSHNTFQLIKLFQKRINLGQSIVMVTHDDEIIERYPSRRLKISDGALLDCDGDTNV >NC_017337.1|WP_000273260.1|1056745_1057552_-|energy-coupling-factor-transporter-transmembrane-protein-EcfT MYEQWKVRQSFVDDVNIITKLFLGIILFFFIIFVHNFDFMLYITILMLVFLLMFNGTQFKITAIFITISIGFALLSSLFMILYGNGSHTILKFGFIHITTESLVRGLHVSLRTIAISFFGILIALTSQVVMIFYSLMQHLKVKSKVAYAFMAAIRMIPLMISSLIQLRRSLKMRYQMIDVANYRGLKRFKHLIIPLLSQNIRKAHQLSVAMESKGFRDGPRTYYYNVPFSYKDVIFIIVLIAIITLAYYCSITLPITGIDDVRLGRVG >NC_017337.1|WP_001101918.1|1055232_1056480_+|phosphoribosylamine--glycine-ligase MNVLVIGAGGREHALAYKLNQSNLVKQVFVIPGNEAMTPIAEVHTEISESDHQGILDFAKQQNVDWVVIGPEQPLIDGLADILRANGFKVFGPNKQAAQIEGSKLFAKKIMEKYNIPTADYKEVERKKDALTYIENCELPVVVKKDGLAAGKGVIIADTIEAARSAIEIMYGDEEEGTVVFETFLEGEEFSLMTFVNGDLAVPFDCIAQDHKRAFDHDEGPNTGGMGAYCPVPHISDDVLKLTNETIAQPIAKAMLNEGYQFFGVLYIGAILTKDGPKVIEFNARFGDPEAQVLLSRMESDLMQHIIDLDEGKRTEFKWKNESIVGVMLASKGYPDAYEKGHKVSGFDLNENYFVSGLKKQGDTFVTSGGRVILAIGKGDNVHDAQRDAYEKVSQIQSDHLFYRHDIANKALQLK >NC_017337.1|WP_000709282.1|1053732_1055211_+|bifunctional-phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide-formyltransferase/IMP-cyclohydrolase MKKAILSVSNKTGIVEFAKALTQLNYELYSTGGTKRILDEANVPVRSVSDLTHFPEIMDGRVKTLHPAVHGGILADRNKPQHLNELSEQHIDLIDMVVVNLYPFQQTVANPDVTMDEAIENIDIGGPTMLRAAAKNYKHVTTIVHPADYQEVLTRLRNDSLDESYRQSLMIKVFEHTAEYDEAIVRFFKGDKETLRYGENPQQSAYFVRTSNAKHTIAGAKQLHGKQLSYNNIKDADATLALVKKFDTPAAVAVKHMNPCGVGIGDTIEQAFQHAYEADSQSIFGGIVALNRAVTPELAEQLHSIFLEVIIAPKFTDEALDILKQKKNVRLLEIDMTIDSNEEEFVSVSGGYLVQDKDNYVVPKEEMKVVTEVAPTDEQWEAMLLGWKVVPSVKSNAIILSNNKQTVGIGAGQMNRVGAAKIALERAIEINDHVALVSDGFFPMGDTVELAAQHGIKAIIQPGGSIKDQDSIDMANKHGIAMVVTGTRHFKH >NC_017337.1|WP_000238666.1|1053151_1053718_+|phosphoribosylglycinamide-formyltransferase MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNEDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRQCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >NC_017337.1|WP_000030806.1|1052120_1053149_+|phosphoribosylformylglycinamidine-cyclo-ligase MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVEEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIDKNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDVSRALKILAEQNVEAYQIGRIVKNESTAIEFLGV >NC_017337.1|WP_000483713.1|1050643_1052128_+|amidophosphoribosyltransferase MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >NC_017337.1|WP_000032749.1|1048475_1050665_+|phosphoribosylformylglycinamidine-synthase-subunit-PurL MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKNYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKVVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGVLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >NC_017337.1|WP_000666804.1|1047811_1048483_+|phosphoribosylformylglycinamidine-synthase-I 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MKIATLNKGKETKYFNGYPLIEEEDIYSQDHLKEGDIFQIVTDKSQYVATAYVGRQHKGLGWVLTYDKAQEINTAFFVKLFNTALAERDYYFNIDGTNAFRLFNAEGDGVGGLTIDNYDGHLLIQWYSKGIYKFKYAILEAVRKVFDYKSIYEKVRFKDSEYSGGFVEGDAPEFPIVIEENFTFYNVDLEDGLMTGIFLDQKEVRKKLRDQYAKERHVLNLFSYTGAFSVIAASEASSTTSVDLANRSRSLTEENFGLNAIDPKSQYIYVMDTFDFYKYAARHGHSYDTIVIDPPSFARNKKRTFSVQKDYDKLINGALNILSSEGTLLLCTNASVYPLKQFKNTIKKTLEESGVDYELTEVMGLPKDFKTHPHYKPSKYLKAVFVNIRH >NC_017337.1|WP_000505962.1|1063350_1063893_+|hypothetical-protein MGFKNNLTSNLTNKIGNSVFKIENINEKGAMPTTIKELNERRQRAEAIVKRKSLMSSTMSVVPIPGLDFGVDLKLMKDIIEDVNKIYGLDHKQVNSLGDDVKERVMSAAAIQGSQFIGKRISSAFLKIVIRDVAKRTAAKQTKWFPVVGQAVSASISYYFMNKIGKDHIQKCENVIKNVM >NC_017337.1|WP_000437472.1|1064046_1064313_+|phosphocarrier-protein-HPr MEQNSYVIIDETGIHARPATMLVQTASKFDSDIQLEYNGKKVNLKSIMGVMSLGVGKDAEITIYADGSDESDAIQAISDVLSKEGLTK >NC_017337.1|WP_000040057.1|1064315_1066034_+|phosphoenolpyruvate--protein-phosphotransferase MSKLIKGIAASDGVAIAKAYLLVEPDLTFDKNEKVTDVEGEVAKFNSAIEASKVELTKIRNNAEVQLGADKAAIFDAHLLVLDDPELIQPIQDKIKNENANAATALTDVTTQFVTIFESMDNEYMKERAADIRDVSKRVLSHILGVELPNPSMIDESVVIVGNDLTPSDTAQLNKEFVQGFATNIGGRTSHSAIMSRSLEIPAIVGTKSITQEVKQGDMIIVDGLNGDVIVNPTEDELIAYQDKRERYFADKKELQKLRDADTVTVDGVHAELAANIGTPNDLPGVIENGAQGIGLYRTEFLYMGRDQMPTEEEQFEAYKEVLEAMNGKRVVVRTLDIGGDKELSYLNLPEEMNPFLGYRAIRLCLAQQDIFRPQLRALLRASVYGKLNIMFPMVATINEFREAKAILLEEKENLKNEGHDISDDIELGIMVEIPATAALADVFAKEVDFFSIGTNDLIQYTLAADRMSERVSYLYQPYNPSILRLVKQVIEASHKEGKWTGMCGEMAGDETAIPLLLGLGLDEFSMSATSILKARRQINGLSKNEMTELANRAVDCATQEEVIELVNNYVK >NC_017337.1|WP_001289616.1|1066268_1066502_-|glutaredoxin-like-protein-NrdH MSEIIVYTQNDCPPCTFVKNYLNEHQIDFEERNINNQQYRNEMIDFDAFSTPFILLNGNPMYHVDFDEINKVLNIQD >NC_017337.1|WP_000381838.1|1066699_1068061_+|cytochrome-ubiquinol-oxidase-subunit-I MDTVEISRFLIAMTLAVHIIFATIGVGMPLMFAIAEFLGIRKNDLQYIAMAKRWAKAYTITVAVGVVTGTIIGLQLSLIWPTFMEMGGHVIALPLFMETFAFFFEAIFLSIYLYTWDRFKNKCTHFLISIPVIIGGSFSAFFITSVNSFMNTPAGFELKNGKMVNVQPIEAMFNPSFIVRSFHVITTAGMTMAFVIASIAAFKLLRNRQPKDTVYHKKALKMSMIVGFFSTLLSMLAGDLSAKFLHKFQPEKLAAYEWHFDTSSHAKLLLFGVLDEKTQQVKGAIELPGLLSFLADNSVKTKVQGLNDFPKSLHPPMIVHYFFDLMVTMGILCFVISGVYVLTLMFKKLRKFSTHKWMLYGILLTGPASMLAIEFGWFLTEMGRQPWIVRGYMRVAEAATQAGGITFVTILFGILYIILMYTCAYVLIRMFKNKPAYEDVNRLAKKQGGEIEK >NC_017337.1|WP_000638453.1|1068057_1069077_+|cytochrome-d-ubiquinol-oxidase-subunit-II MIYAFIGITVLWLFLFCYIIIASIDFGAGFFALHSKLTGDEKKINHLISRYLNPVWEVTNVFFVFFFVGFVGFFPESIKYLGTVLLIPGSIALIMISLRNSFYAFENYGQDTKLAWMIMYGVSGLLIPASLSTALTITEGGYINVRNNVIDLDWVQLLLSPFAWSVVFLAIISVLYISSGFLTYYAKKANDEPAYNLTRQWHIFLGPPMIIICLFVFLSLRIQNSEHFYSAVFDYWWMFAISFLFFALASLLTFFKKKHGLAFVFVILQMMFAFFGYGISKLPYLLYPFVKITDAYVNPEMGWTLVIVFILGLLLLLPSLILLLRLFVFDKEYVEGKKS >NC_017337.1|WP_000514290.1|1069209_1069872_+|TrkA-family-potassium-uptake-protein MGKEYVVIGLGRFGGSIVRELNALDMDVMAIDHDENRVNEYSDIATHAVVADTTDEAVMKSLGIRNFDHVIVAIGENIQSSTLTTLILKELGVKKVTAKAQNDYHAKILNKIGADTVVHPERDMGRRIAHNVASASVLDYLELADEHSIVELKATEKMAGQSIIDLDIRAQYGINIIAIKRGKEFIISPNPNINLEIGDILIMIGHDNDLNRFEKNIATR |
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NC_017337_7 | 1940251-1940333 | Orphan |
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1 spacers
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>7.1|1940275|35|NC_017337|CRISPRCasFinder ATTTCTACAGACGATGCAAGTTGGGGAAACGGCCC |
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The CRISPR arrays of NC_017337_7 >merge|NC_017337|7|1940251-1940333|CRISPRCasFinder CAACATAGTGAAATTGGATCCTCAATTTCTACAGACGATGCAAGTTGGGGAAACGGCCCCAACATAGTGAAATCGGATCCTCA >NC_017337|7|6|1940251-1940333|CRISPRCasFinder CAACATAGTGAAATTGGATCCTCA ATTTCTACAGACGATGCAAGTTGGGGAAACGGCCC CAACATAGTGAAATCGGATCCTCA
>NC_017337.1|WP_000901023.1|1939504_1939900_-|hypothetical-protein MLGKYWIQLLIATVIISLISIKAFPLAIGALYLPVIFKVIKLQLNLSKGLIDDVNAQTFIKSNQSGIVISVICCLLITGILYYTLDGFYASLTGVLGTLVALNPYTTIVSAVLYILTAIATVEATKTKYRN >NC_017337.1|WP_000116236.1|1937923_1939309_-|class-II-fumarate-hydratase MSVRIEHDTFGEIEVPADKYWGAQTERSKRNFPVGKERMPIEVVYGFAQLKRAAALANFDLGKLSEAKKDAIVYACDQILSGELDEHFPLVVWQTGSGTQSNMNVNEVVSYVANMYLKDHQSDESIHPNDDVNKSQSSNDTFPTAMHVALYQEVETKLEPALKLLRNTLKEKEDKFDSIIKIGRTHLQDATPIKLGQEISGWRYMLDRCETMLSESKKHILNLAIGGTAVGTGINAHPEFGDKVAHYISENTGYPFVSSENKFHALTAHDEVVQLHGTLKALAGDLMKIANDVRWLASGPRAGLAEISIPENEPGSSIMPGKVNPTQCEMLTMVAVQVMGNDTVVGFASSQGNFELNVYKPVIMHNTLQSIYLLADGMETFNNNCAVGIEPIEENIDNYLNQSLMLVTALNPHIGYEKAAQIAKKAHKEGLTLKESAIQTGYVTEEQFEAWIKPEDMVDPH >NC_017337.1|WP_000669385.1|1936651_1937473_+|RluA-family-pseudouridine-synthase MKFKIPENFNDLSLRDIFQQLKVPKKDLHHLNMSKDITINDKPARLMNKVHTGDDVFVPTIDEKSNYVPSYRYAQIKYEDDDMAIVMKPKGVKTHPNDLKESNTLMNHVIYTIDSDYVEPIHRLDQETVGLLIVAKNPLMKKILDRMLEDNDITRIYKANVKALLPLKPQTIDMPIGKDKFHSNKRRVSPTGQRAITHILTSKMIKETVCQLEIKLDTGRTHQIRVHLAEIGHPVIGDPLYGDSTLRQLELESYKIEFVHPLTKEVISVSLDD >NC_017337.1|WP_000437971.1|1935376_1936489_-|GAF-domain-containing-sensor-histidine-kinase MEQRTRLALLKEIAEFLNEETEMYSMTQGALKYLIEGSNFTTGWIFFINSVGEHELVSHVALPQSLTADHCHYIKDGSCWCVKAFNQRRLMKASNIVNCSRINLASKAFPSQNDNITHHATVPLKSGQEQFGILNVASPNTEIYSDEDLELLESVAFQLGSAIKRIYLTDREKEAAKINERNRLARDLHDSVNQMLFSVKLTAHAAYGVSNESIAKQAFKTIEETSQNAVNEMRALIWQLKPVGLEQGLIHALTAYSKLMHIQLNVNVEGLIDLSNEIEENIYRALQECINNVKKHADTNKMDLTLKQMNDILYIDVIDYGQGFEIDNVQIASSHGINNIKQRVKLLRGKVTFHSQPTKGTQIQFTIPIK >NC_017337.1|WP_001045129.1|1934731_1935355_-|response-regulator-transcription-factor MNKVILVDDHHIVRQGLRFLLSTIENIEVLQDFADGETFLEYLKEHEHPDIVLLDLVMPGMNGIEITEYIKAHYPDIKVLVLTSYVDDEHVISAINKGADGYEMKDVEPQQLIETIRRVMNGEKMIHPKAQDVFETVSQKPHYTNKLSKREIEVLREMVKGKTNKEIAETLFVSEKTIKTHVSHIFSKLQVSDRTQAAIYAMENKLI >NC_017337.1|WP_000375864.1|1933911_1934376_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MDRQSFTDLIQTKFKMVRIEAGYTQDTMAQTIGLSKKTLVQIEKERVLPNWTTCISICALFRDSEVLNSTFGCDPLEIVQTISRNHCAYPNHAPTSDIYWNNIETRNGYILQSNKVSNIYRVLNPDNQPIFGTSKMREAETYFNRNAKEELVHI >NC_017337.1|WP_000992533.1|1932608_1933733_-|DUF445-domain-containing-protein MNALFIIIFMIVVGAIIGGITNVIAIRMLFHPFKPYYIFKFRVPFTPGLIPKRREEIATKIGQVIEEHLLTETLINEKLKSEQSQQAIESMIQQQLQKVTKDQLSIKQITSQIDIDLEQVLQTNGNQYIESQLNNYYTKHQNQTIASLLPNQLVTFLDQHVDNATDLLCDRARNYLSSAKGTQDINDMLDTFFNEKGKLIGMLQMFMTKESIADRIQQELIRLTSHPKARAIVTSLITNEYQTFKDKPLNELLDASQFNEIAENLSVYVTTYASKQANKPVVTLMPQFVDYLEGQLSSKLANLIIEQLSIHLSAIMKKVDLRGLIEEQINTFDLDYIEKLIIEIANKELKLIMSLGFILGGIIGFFQGLVAIFV >NC_017337.1|WP_000290301.1|1932195_1932540_-|YlbF/YmcA-family-competence-regulator MAVNLYDYANQLEQALRESEEYKAIKEAFANVKANEESKKLFDEFRETQINFQQKQMQGEEIAEEDLQKAQEQAQAIEKDENISALMNAEQKMSQVFQEINQIIVKPLDEIYAD >NC_017337.1|WP_014532656.1|1931414_1931513_-|hypothetical-protein MSVGSLVVLTTTEIAFPTEIFEKNQRTLQIKF >NC_017337.1|WP_000238227.1|1929921_1931118_-|exonuclease-SbcCD-subunit-D MVKFIHCSDLHLDSPFKSKSHISPKIFEDVQKSAYESFKNIVDIALQQDVDFVIIAGDLFDSENRTLRAEIFLKQQFERLQNEQIFVYVCHGNHDPLSSKISSNWPDNVSVFSNKVETYEAITKSGETIYIHGFSYENRASYENKIDEYPSSQGQKGIHIGVLHGTYSKSSVNERYTEFILEDLNSKLYHYWALGHIHERQQLSDMPVINYSGNIQGRHFNEQGEKGCLLIEGDHLKLKTKFYPTQYIRFEEATIETDKTSKQGLYEVIQNFKEQVREEGKAFYRLTLVINSETLISPQDLLQVEEMITDYEENENQFVYIDELKIQYAQNDESPLVNEFSAELLVDQTVFDKAMSDLYLNPRASKFLDDYGTFDHTALVNRAEEILKAEMRGEQNDN >NC_017337.1|WP_000031108.1|1940642_1940795_-|hypothetical-protein MSKDKDPKLNYHEEENSMVTDFEDLKELGKEMEQISDQNDQEKNSEEDSQ >NC_017337.1|WP_001251219.1|1940819_1941419_-|glucosamine-6-phosphate-isomerase MAMNFKVFDNSQLVAEYAADIIRKQFNNNPTTIAGFHLDTDQAPVLDELKKNIEKHAVDFSQINILDYDDKKSYFEALGVPAGQVYPIAYEKDAIELIADKIKTKENKGKLTLQVVSIDEQGKLNVSIRQGLMEAREIFLVVTGANKRDVVEKLYQENGKTSFEPADLKAHRMVNVILDKEAAAGLPEDVKAYFTSRFA >NC_017337.1|WP_000181394.1|1941577_1942048_-|tRNA-(uridine(34)/cytosine(34)/5--carboxymethylaminomethyluridine(34)-2'-O)--methyltransferase-TrmL MTNHIVLYQPEIPANTGNIARTCAGTNTHLHLIKPLGFRTDDKMLKRAGLDYWEFVNITYHDSIEAFFEATNGEYYLLTKFGKKTYSDFDFSNHDKDFYFIFGKETTGLPDWVKEKYQDTALRIPMSEHIRSLNLSNTAALLIYEALRQQDFPGLN >NC_017337.1|WP_000379979.1|1942052_1943180_-|tRNA-epoxyqueuosine(34)-reductase-QueG MDTKQLKQDIIDYAYTIGIDSIGFTTADPFDELKQKLEAYHANGYASGFEESDIALRTEPKLSLPTARSIIAIAVGYPNKLKGAPKSVRGDRRGLFARASWGQDYHTIMRKRLDMLAAFIESKVPDVEIKSMVDTGVLSDRAVAERAGLGFVGRNGFVINPKLGTWTYLGEMLVSIPFEPDDPLLDSCGDCTICVDRCPTSALVGNGQLNSQKCISFLTQTKGYMPDQYRYKIGNRLYGCDTCQQVCPKNRGINTEQDDIILEPEILKPRLVPLLRMSNKEFKQTYGHLAGAWRGKKPIQRNAILALAHFNEVDAIPELKKVATTDERPMIRATAYWAIGQILGEEARDFINANYDKEDAEVQNEMIKGLDTRRE >NC_017337.1|WP_000590809.1|1943330_1944053_-|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein MIKINNLNKVFGDNEVLKDINLEINQGEVVAIIGPSGSGKSTLLRCMNLLEVPTKGQVIFEGNDLTEKGTQVDKLRQKMGMVFQNFNLFPHKKVVDNIILAPKLLKKDNNDELHKEALSLLDKVGLKEKADVYPNQLSGGQKQRVAIARALAMHPDVILFDEPTSALDPEVVGDVLKVMKDLAKEGMTMVVVTHEMGFAKDVSDKVIFMADGVVVESGTPVEIFEQPQHERTQNFLARVL >NC_017337.1|WP_000649892.1|1944045_1945503_-|ABC-transporter-permease-subunit MKCLIRFILILGLLISSAMVYINPTAHAEQDQAWEKIKERGELRVGLSADYAPMEFEHTVNGKTEYAGVDIDLAKKIAKDNNLKLKIVNMSFDSLLGALKTGKIDIIISGMTSTPERKKQVDFSDSYMMTKNIMLVKKDKVNEYKDIKDFNNKKVGAQKGTEQEKIAQTEIENASITSLSRLPDVILALKSGKVEGAVVEKPVAEAYLKQNPKLGISNVKFNEEEKDTVIAVPKDSPKLLSQINKTIKEVKDKGLIDKYMTNAANAMNDDSGFISKYGSFFLKGIKITILISLIGVALGSILGAFVALMKLSKIKIISWIASIYIEILRGTPMLVQVFIVFFGITAALGLDISALVCGTIALVINSSAYIAEIIRAGINAVDKGQMEAARSLGLNYRQTMKSVIMPQAIKNILPALGNEFVTLIKESSIVSTIGVGEIMFNAQVVQGISFDPFTPLLVAAALYFVLTFVLTRIMNMIEGRLNASD >NC_017337.1|WP_000063555.1|1945760_1946822_-|PTS-transporter-subunit-IIC MSNAKNADNKQFFSKILNSIGAGVVIALVPNALLGEVLKIFKSGNEILELTYQLVILIQSFMAFIIGVLAAHQFKFNGAGAAIVGTSAMIGSGAVVYSNNSFMLKGIGDIINTSLVVIIACLIYMVLQNKLGSFELIILPVLVPIVSGGIGLITLPYIRKITQAIGNVIHSFTELNPLLMSILISVAFSLLMVTPISLVAIATAISLNGLGSGAANLGIVAACVTFLFGSLRVNSIGVNAVLLIGAAKMMIPVYLKNLIISIPLTINGIITGIIAYVLQVKGTPLSAGFGYTGLVGPINAFNRMSGDPTMNIILLALGYFVIPFVSAFIVHELCKKFIPIYSNDIYKFEVPKQ >NC_017337.1|WP_000110011.1|1955692_1956139_-|peroxide-responsive-transcriptional-repressor-PerR MSVEIESIEHELEESIASLRQAGVRITPQRQAILRYLISSHTHPTADEIYQALSPDFPNISVATIYNNLRVFKDIGIVKELTYGDSSSRFDFNTHNHYHIICEQCGKIVDFQYPQLNEIERLAQHMTDFDVTHHRMEIYGVCKECQDK >NC_017337.1|WP_001266846.1|1956235_1957186_-|phosphoglycerate-dehydrogenase MRVVGLNRMREVETELQQRFSDVDFKFYKKASEIPESDLADLDILVGYDGGINEAFLRRCPNLKWIAWFATGVNTLPLDYIADHGILLTNGKGVQAKQLSEYILAFILDDYKKMKLSYDNQRQHIYDSKITGKRLSGQTVLFLGTGAIATKTAKLAKAFNMNLIGLSKSGQNKDEFDEIYTIESLESTLPNADIVINALPETQETIHLLKKKHFELMKDEALFINIGRGSIVKEPLLIEILKSRVIRHAYLDVFENEPLKPNHELYELDNVTITAHITGNDYEAKYDLLDIFKNNLVNFLNKNGLIENEVDAKKGY >NC_017337.1|WP_000939521.1|1957191_1957647_-|thioredoxin-dependent-thiol-peroxidase MLQKGEQFPIFKLENQDGTVITNDTLKGKKAIIYFYPRDNTPTCTTEACDFRDNLEMFNDLDVAVYGISGDSKKKHQNFIEKHGLNFDLLVDEDFKLAKETGVYQLKKSFGKESMGIVRTTFIIDEQGKVLDVIEKVKVKTQIEELKNILG |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_017337_8 | 2235853-2235942 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_017337_8
|
1 spacers
spacers of NC_017337_8
>8.1|2235885|26|NC_017337|CRISPRCasFinder TGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTT |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017337_8
The CRISPR arrays of NC_017337_8 >merge|NC_017337|8|2235853-2235942|CRISPRCasFinder TTACAACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCATGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTTACAACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCA >NC_017337|8|7|2235853-2235942|CRISPRCasFinder TTACAACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCA TGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTT TTACAACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCA
>NC_017337.1|WP_000495692.1|2234747_2235839_+|hypothetical-protein MFTYFKSALKNAKPQLLITLIYALIAFAVIAVVYLLANFQLAKYVQNIAIYSQFGQKPPGDEYLKVIAVLLIAAIVSLFVLVQIFIGITNVMKRAMSHEKVKFTDLFIAFKKGIYLKSVLIGLVSIAMIIVLSLLTSLLYKLFSPVSEMIMNSVQSSYADSTHLIGIAITTQSIIIIVVLLIKAIITWLLLIPIFNFMTSFVESTNDKVKTHLANGFKAMKNGQKTFFKFFIGILLLNLIIILFKTPVGYLISFNTQSLSQSVAENIIRVYTVMTIILFVVIHAIILMGIVQYYLKRGQKITKDKVKTADKDKKVVTEPKNTKVENDKVTTSVETKTEKAQDSLNDNTTKTMTSDKPEDNQPK >NC_017337.1|WP_000019740.1|2233501_2234482_+|CDF-family-zinc-efflux-transporter-CzrB MSHSHHHHDHMHSHVTTNNKKVLFISFLIIGLYMFIEIIGGLLANSLALLSDGIHMFSDTFSLGVALIAFIYAEKNATATKTFGYKRFEVLAALFNGVTLFVISILIVFEAIKRFFVPSEVQSKEMLIISIIGLIVNIVVAFFMFKGGDTSHNLNMRGAFLHVIGDLLGSVGAITAAILIWAFGWTIADPIASILVSVIILKSAWGITKSSINILMEGTPSDVDIDEVITTIKKDSRIQSVHDCHVWTISNDMNALSCHVVVDHTLTMKECELLLENIEHDLLHLNIHHMTIQLETPNHKHDESIICSGTHSHSHNHQAHHHAHVH >NC_017337.1|WP_000003759.1|2233179_2233500_+|Zn(II)-responsive-metalloregulatory-transcriptional-repressor-CzrA MSEQYSEINTDTLERVTEIFKALGDYNRIRIMELLSVSEASVGHISHQLNLSQSNVSHQLKLLKSVHLVKAKRQGQSMIYSLDDIHVATMLKQAIHHANHPKESGL >NC_017337.1|WP_001024100.1|2232362_2233028_-|SDR-family-oxidoreductase MNILVIGANGGVGSLLVQQLAKENVPFTAGVRQSDQLNALKSQGMKAILVDVENDSIETLTETFKPFDKVIFSVGSGGNTGADKTIIVDLDGAVKSMIASKEANIKHYVMVSTYDSRRQAFDDSGDLKPYTIAKHYADDYLRRSGLNYTILHPGALTNAAGSGKIEAAQYFEGKGEIPREDVATVLKEIVTSNHFNHQEFQIISGEQDIKDALTQFEIEKD >NC_017337.1|WP_001127960.1|2230989_2231928_-|class-I-mannose-6-phosphate-isomerase MPLFLQPILKTKLWGGQRLSEFGYQLDNDTTGECWCVSAHPNGTSEIINGPYQGQTLDRIWSEHRELFGDFPSKDFPLLTKIVDARESLSIHVHPDNSYAYEHENGQYGKSECWYIIDAEEDAEIVIGTLAESREEVANHVQHGTIESILRYIKVKPGEFYFIPAGTVHTISSGILAYETMQSSDITYRLYDFNRQDNQYNDRPLNIEKALDVIQYNAPLPNILPESEIIENHKCTHIVSNDFFTLVKWEISGTLNYMKPREFCLVTVLEGEGQMIVDGEIFKLTTGTNFILTSEDLDSVFEGDFTLMISYV >NC_017337.1|WP_000808817.1|2230728_2230959_-|hypothetical-protein MKQFLYIALVCGVIAGLGAFLHIPQYPSMTIPRIVAILGIISAMLTFKDKQISASLKFSALLINVLPLCGTFVASN >NC_017337.1|WP_000123402.1|2228681_2230055_-|EVE-domain-containing-protein MTAETNYFWLNCGYNRWNHNEPLVGQTALFESGAHFNPSQGFRAFKKAKVGDQVIFYQVQTDTGLLGCGEIISVETGAQNKIRVQFRFNEQLKPLTADYLKRSEALEFRMSNMKETLFNQITAEEFDLISGLGKGEIKIPRYFFLAETEEFEPGNQYTIYTHTYNGIKRNGYHFYTQLEEGDNIIFYNRTKNQSVVGIGEVSKHIHEKPPIPGRTNSTVIEVSYEKDITPITLSTLNKHPKLKNLYFLQENAKQAIASMSQAQYDAIIEMSDNNGLKSPFEMVQKPDMLESEKEEALKPFILLVVDRKEEGLKAANDLLQKANANPVITTGHPDFSEDMLYGKYLPNETGALYYREGFITQLMPKKDKSYLVIDNFNRIDTDIFQTYINVLEGYEVTLPRYNKDGNMIKWSRQKDSFYYFNPNWHIVGITYDSLEEIKEKYSEQFLKYTRIVKVKHD >NC_017337.1|WP_001123306.1|2227810_2228224_-|thiol-disulfide-oxidoreductase-DCC-family-protein MPIVYYDGNCIYCYNYVIWLIQHDLPRNYQFATLKGEVGQQFFKQHPEAANKNSVILQKGDRIYFESQAIIQLITALPNRTKLLGVGLWLVPKPVRNFGYRMFANNRNRMWKTTWHQPNDYEKSFFLDDNAKVKLTD >NC_017337.1|WP_000070865.1|2227167_2227611_-|DNA-starvation/stationary-phase-protection-protein MSNQQDVVKELNQQVANWTVAYTKLHNFHWYVKGPNFFSLHVKFEELYNEASQYVDELAERILAVGGNPVGTLTECLEQSIVKEAAKGYSAEQMVEELSQDFTNISKQLEKAIEIAGNAGDDVSEDMFIGMQTSVDKHNWMFKSYLS >NC_017337.1|WP_000160304.1|2226336_2227047_+|purine-nucleoside-phosphorylase MTKGTPHIQPNGVKIAKTVLMPGDPLRAKYIADNFLENVEQFNDVRNMFGYTGTYKGKEVSVMGSGMGIPSIGIYSYELYNFFDVDTIIRIGSCGALQENVNLYDVIIAQAASTNSNYVDQYNIPGHFAPIADFELVTKAKNVADQIGATTHVGNVLSSDTFYNADPTFNDAWKKMGILGIEMESAGLYLNAIHAGKKALGIFTVSDHILRDEATTPEERQNSFTQMMEIALEIAE >NC_017337.1|WP_001802298.1|2236347_2236452_-|hypothetical-protein MLLLERTSMSDFEMLMVVLTIIGLVLISTQDHKK >NC_017337.1|WP_000370943.1|2239299_2240157_-|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MDNVKAIFLDMDGTILHENNQASTYTKDVINRLREKGYKVFLATGRSHSEIHQLVPQDFAVNGIISSNGTIGEVDGEIIFKHGLSLAQVQQIINLAKRQQIYYEVFPFEGNRVSLKEDETWMRDMICSQDPINGVSHSEWSSRQDALAGKIDWVTKFPEGEYSKIYLFSSNLEKITAFRDELKQNHVQLQISVSNSSRFNAETMAYQTDKGTGIKEMIEHFGINQEETLVIGDSDNDRAMFEFGHYTVAMKNARPEIQALTSDVTAYTNEEDGAAKYLAKHFLAD >NC_017337.1|WP_000909235.1|2240224_2241007_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLITLNHVGRLKQGKPILQDVSWQIDEGDKWVLYGLNGAGKTTLLNILNAYEPATSGTVNLFGKMPGKLGYSAENVRQQIGFVSHSLLEKFQEGETVIDVVMSGAFKSIGLYKNVDDDIISEAHQLLKLVEMSDKAQQFIGYLSTGEKQRVMIARALMGQPRILILDEPAAGLDFIARESLLNILDSLSDTYPTLAMIYVTHFIEEITANFSKILLLKDGQSIQQGAVEDILTSENMSYFFRKKVAVQRWNNRFSMAMLE >NC_017337.1|WP_000908616.1|2243402_2245406_-|AAA-family-ATPase MLISELHISNFRSFGNESQMIEIADLTALIGANSSGKTSLIMALLRLFGQKNTDRTLIKTDFHIPESADISKINEIDLMIEAKVIFPELKLESPANIKTVPEFIKHLIIEETDADPYLRIRLKGKWIQGSTPEGNIEQELVYVKIPYGREEKEEDLTRVPIHHQKLIQMMYIPAMRDPAKQLKNASGTLLWRIFDGIDWPENLNDYIKSLTSPIETLFKEIPSIKDIQGILNNQWNKYHKDKRYSNSQFKFNGNSLQEFLKNAEILFNPTIDGNSVKVDSLGDGLKSLFYITLVSTLLEIENKQEKDDKPLLNILAIEEPENHISQHLLGRIVRNLKEISKKDNAQVILSSHNSSIIGKVDPEYIRHLQIQNSESIVNNITLPEKNDDAHTYIKEAVKAYPDLYFSKLVILGEGDSEEIVLPKLLSADNIYLDDFNISVVPLGGRYVNHMWKLLNDLSIPHVTLLDLDRERGGGDWGRIKYVLKQLDENNRCSEQLRTVLLIPSNTYHTYSMEEIEDFHNRKSNRLNSLNTWIEKLEKEDVFFSYPLDLDFTMLMSFQEEYQNTMERGPQIPKDSNSTEYDEKLKKSIQATLKNEKAIAKTYSEDEKKLMIWYNSLFLGRGKPSTHIAALKDIDENEIIENAPKELLRLIQRVKEKVGLVGGSNIDE >NC_017337.1|WP_000334465.1|2245557_2247363_-|glutamine--fructose-6-phosphate-transaminase-(isomerizing) MCGIVGYIGYDNAKELLLKGLEKLEYRGYDSAGIAVVNDDNTTVFKEKGRIAELRKVADSSDFDGPVGIGHTRWATHGVPNHENSHPHQSSNGRFTLVHNGVIENYEELKGEYLQGVSFISETDTEVIVQLVEYFSNQGLSTEEAFTKVVSLLHGSYALGLLDAEDKDTIYVAKNKSPLLLGVGEGFNVIASDALAMLQVTSEYKEIHDHEIVIVKKDEVIIKDADGNVVERDSYIAEIDASDAEKGVYAHYMLKEIHEQPAVMRRIIQEYQDAEGNLKIDQDIINDVKEADRIYVIAAGTSYHAGLVGKEFLEKWAGVPTEVHVASEFVYNMPLLSEKPLFVYISQSGETADSRAVLVETNKLGHKSLTITNVAGSTLSREADHTLLLHAGPEIAVASTKAYTAQIAVLSILSQIVAKEHGREADIDLLRELAKVTTAIEAIVDDAPIMEQIATDFLETTRNAFFIGRTIDYNVSLEGALKLKEISYIQAEGFAGGELKHGTIALIEEGTPVVGLATQEKVNLSIRGNVKEVVARGAHPCIISMEGLEKEGDTYVIPHVHELLTPLVSVVALQLISYYAALHRDLDVDKPRNLAKSVTVE >NC_017337.1|WP_000083810.1|2248043_2249582_+|PTS-mannitol-transporter-subunit-IICB MSQTEEKKGIGRRVQAFGSFLSSMIMPNIGAFIAWGFIAAIFIDNGWLPNKDLATLAGPMITYLIPLLIAFSGGRLIYDLRGGIIAATATMGVIVALPDTPMLLGAMIMGPLVGWLMKKTDQLIQPRTPQGFEMLFNNFSAGILGFIMTIVGFKVLAPIMKFIMYILSVAVESLVHAHLLPVVSILVEPAKILFLNNAINHGVFTPLGTDQAAKVGQSILYTIESNPGPGLGILLAYMIFGKGTAKATSYGAGIIHFFGGIHEIYFPYVLMRPLLFIAVILGGMTGVATYQATGFGFKTPASPGSFIVYCLNAPRGEFLHMLLGVFLAALVSFVVAALIMKFTREPKQDLEAATAQMENTKGKKSSVASKLVSSDKNVNTEENASGNVSETSSLDDDPEALLDNYNTEDVDAHNYNNINHVIFACDAGMGSSAMGASMLRNKFKKAGINDITVTNTAINQLPKDAQLVITQKKLTDRAIKQTPNAIHISVDNFLNSPRYEELLNNLKKDDQA >NC_017337.1|WP_000927348.1|2249616_2251749_+|BglG-family-transcription-antiterminator MLLSTREKEMIALLIKYHGQYITIHDIAQQLAVSSRTIHRELKGVEAYLTSFSLTLERANKKGLRIAGEDSDLNDLKQSIAQHQTIDLSVEEQKVIIIYALIQAKEPVKQYSLAQEIGVSVQTLAKMLDDLELDLNKYQLSLSRKRGEGIYLVGTESKKREFLSQLMVNNLNSTSVYSVIENHFVFHSLNQIHKDFVDLERIFNVERLLMDYLSALPYQLTESSYLTLTVHIVLSISRIKNGEYVALNDDIYDSVQNTFEHKVASELADKLGQIYDVTFNQAEIAFITIHLRGAKRKNLNDTSLNNRCEENKIKAFVKKVEMISGMTFADLDTLVDGLTLHLNPAINRLQANIETYNPLTDMIKFKYPRLFENVRLALNDCWPDLIFPESEIAFIVLHFGGSIKNQGNRFLNILVVCSSGMGTSRLLSTRLEQVFSEIERITQASVSDLKSLDLSQYDGIISTVNLDIASPYLTVNPLLPDSDISYVAQFLNTKSTFSETHDKSSNMIDKDDVHVETKDIHGNTSFENEQTSYLTSVLEKHLSDEKSEQLMHHMRSGLTLLDSVKIVSTEVKQWQTYIADYLYQCDVINDPTSFAELLEQRLIDNPGWILSPYPVAIPHLRDNMIKHPMILITVLEEPLTLPSIQNDNQTIKYMISMFIPDNDFMASLVSDLSEFLSLKLESIDTFMENPQELETLLRNKFLERIKKQFI >NC_017337.1|WP_001292149.1|2251760_2252195_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA MSELFSNDNIFLNVNVNSQNEAIEKAGKALVDSGAVTDAYIQAMKDREQVVSTFMGNGLAIPHGTDEAKTNVIHSGLTLLQIPEGVDWDGEVVKVVVGIAGKDGEHLDLLSKIAITFSEEENVDRIVQAKSAEEIKQVFEEADA 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|
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NC_017337_9 | 2355802-2356020 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_017337_9
|
3 spacers
spacers of NC_017337_9
>9.1|2355843|18|NC_017337|CRT ACTTTTGTCAGCTTCTGT >9.2|2355902|18|NC_017337|CRT CTTTTTGAAATTCTCTAT >9.3|2355961|19|NC_017337|CRT ACTTGCTGTCAGCTTCTGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017337_9
The CRISPR arrays of NC_017337_9 >merge|NC_017337|9|2355802-2356020|CRT GTTGGGGCCCCGTTCCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTTGTCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCGTTCCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAATTTCTTTTTGAAATTCTCTATGTTGGGGCCCCGTCCCCCAACTTGCACATTATTGTATGCTGACTTGCTGTCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCGTTCCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTG >NC_017337|9|1|2355802-2356020|CRT GTTGGGGCCCCGTTCCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTG ACTTTTGTCAGCTTCTGT GTTGGGGCCCCGTTCCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAATTT CTTTTTGAAATTCTCTAT GTTGGGGCCCCGTCCCCCAACTTGCACATTATTGTATGCTG ACTTGCTGTCAGCTTCTGT GTTGGGGCCCCGTTCCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTG
>NC_017337.1|WP_031927354.1|2355570_2355741_+|hypothetical-protein MFRFISFGQLVVYSTTFIPKKDILQLNGMECDTNVKEPLKIYYVVILKSGIEMIFS >NC_017337.1|WP_000066900.1|2355094_2355445_-|HTH-type-transcriptional-regulator-SarV MSNKVQRFIEAERELSQLKHWLKTTHKISIEEFVVLFKVYEAEKISGKELRDTLHFEMLWDTSKIDVIIRKIYKKELISKLRSETDERQVFYFYSTSQKKLLDKITKEIEVLSVTN >NC_017337.1|WP_000184407.1|2353781_2354993_+|MFS-transporter MTNQGSLNKSPIFTKSFTINFFVNFIVYLCMYLLLVVIAGYSKQAFDASDSLAGLVVGLFIVGSLIGRFATGKFVNQIGPKRLLFIGLIALIITQLLYFIDGSLAFLIFVRLINGIATAVVTTATGTIAAYVTPVNRKSEGISLFSLSLVLGTAIGPFLGMLLITKYAIDLLFIICVILGILGLIISLFIKVDFEVTNNKTETNVIDKPRFSIHQFIAKEAIPVAVIMLLIGVTYASILTYLQAFALERHLVTAASYFFICYAIASLITRPIAGRLMDDKNENIIVYPAFIMLFLSFVCLISSYQSWLILLAGACLGLGYGNLSSAMQSIAIKVSPPIKYGIATSTFYVGLDAGVGFGPSFLGLFTHMFSYSEIFGFMAALAIITMLVYFLIHGRHVTRNAMN >NC_017337.1|WP_000951062.1|2353348_2353789_+|winged-helix-DNA-binding-protein MLSQEFFNSFITIYRPYLKLAEPILEKHNIYYGQWLILRDIAKHQPTTLIEISHRRAIEKPTARKTLKALIENDLITVENSLEDKRQKFLTLTPKGHELYEIVFLDVQKLQQAVVAKTNISQDQMQETINVMNQIHEILLKEAHND >NC_017337.1|WP_000600965.1|2352421_2353186_-|VOC-family-protein MILKFDHIIHYIDQLDRFSFPGDVIKLHSGGYHHKYGTFNKLGYINENYIELLDVENNEKLKKMAKTIEGGVAFATQIVQEKYEQGFKNICLRTNDIEAVKNKLQSEQVEVVGPIQMERDTHKDGKVKWQLLYIMNQDDDEIKPPFFIQWEESDSMRTKKLQKYFQKQFSIETVIVKSKNQSQTVSNWLKWFDMDIVEENDHYTDLILKNDDIYFRIEDGKVSKYHSVIIKDAQATSPYSIFIRGAIYRFEPLV >NC_017337.1|WP_001566779.1|2352178_2352430_+|hypothetical-protein MRTIILSLFIIMNIVAIIMTLSQPLTVNYFSLRVILIFFTFILSIFFILIKSSRLNNILTILSIVLAIIHMGILAHSTYVYLY >NC_017337.1|WP_000413855.1|2350524_2351790_-|lipid-II:glycine-glycyltransferase-FemX 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>NC_017337.1|WP_001161080.1|2346736_2347054_+|hypothetical-protein MQFYLILLAILYLIVSFISIFKMEVIFTRILRIIMGVLLLFVLALTTMSFPKENWWVFIVLLLLVGNVEVTGFKMLKKDLKGVNILNLMSLFIFVIYFILTIVLF >NC_017337.1|WP_000051210.1|2346337_2346502_+|hypothetical-protein MSLENQLAELKYDYVRLQGDLEKRESLNLDTSALVRQLKDIENEIRNVRAQMQD >NC_017337.1|WP_000230173.1|2356202_2357225_-|GTP-3',8-cyclase-MoaA MVEQIKDKLGRPIRDLRLSVTDRCNFRCDYCMPKEVFGDDFVFLPKNELLTFDEMARIAKVYAELGVKKIRITGGEPLMRRDLDVLIAKLNQIDGIEDIGLTTNGLLLKKHGQKLYDAGLRRINVSLDAIDDTLFQSINNRNIKATTILEQIDYATSIGLNVKVNVVIQKGINDDQIIPMLEYFKDKHIEIRFIEFMDVGNDNGWDFSKVVTKDEMLTMIEQHFEIDPVEPKYFGEVAKYYRHKDNGVQFGLITSVSQSFCSTCTRARLSSDGKFYGCLFATVDGFNVKAFIRSGVTDEELKEQFKALWQIRDDRYSDERTAQTVANRQRKKINMNYIGG >NC_017337.1|WP_000643981.1|2357244_2357844_-|molybdenum-cofactor-guanylyltransferase-MobA MKAIILAGGHSVRFGKPKAFAEVNGETFYRRVIKTLESTNMFNEIIISTNAQLATQFKYPNVVIDDENHNDKGPLAGIYTIMKQHPEEELFFVVSVDTPMITGKAVSTLYQFLVSHLIENHLDVAAFKEDGRFIPTIAFYSPNALGAITKALHSDNYSFKNVYHELSTDYLDVRDVDAPSYWYKNINYQHDLDALIQKL 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>NC_017337.1|WP_000076922.1|2361386_2362391_-|ThiF-family-adenylyltransferase MSQERYSRQILFKQIGEIGQSKINQKCALIIGMGALGTHVAEGLVRAGIAKLIIVDRDYIEFSNLQRQTLFTEEDALKMMPKVVAAKKHLLALRSDVDIDDYIAHVDYYFLETHGQDVDVIIDATDNFETRQLINDFAYKHRIPWIYGGVVQSTYTEAAFIPGKTPCFNCLVPQLPALNLTCDTVGVIQPAVTMATSLQLRDAMKVLTEQLIDTKITYGDIWEGSHYSFGFSKMQRSACTTCGDVPSYPYLNKNEQRYATLCGRDTVQYENASITHDILVQFLKQHQLNYRSNSYMVMFEFKGHRIVAFKGGRFLIHGMTRTSDATHLMNLLFG >NC_017337.1|WP_000913010.1|2362559_2363165_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MLKINLKYQLKNTLIRINIDDTEPKIYAVRGPSGIGKTTVLNMIAGLRKTDEAIIEVNGQLLTDTAKNVNVKIQQRRIGYLFQDYQLFPNMTVYKNITFMAEPSEHIDQLIQTLNIDHLMKQYPMTLSGGEAQRVALARALSTKPDLILLDEPFSSLDDTTKDESITLVKRIFNEWQIPIIFVTHSNYEAEQMAHEIITIG |
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NC_017337_10 | 2419470-2419556 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_017337_10
|
1 spacers
spacers of NC_017337_10
>10.1|2419497|33|NC_017337|CRISPRCasFinder TCAACTGTATACCTTTTGCCTTTAACTTAAGTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017337_10
The CRISPR arrays of NC_017337_10 >merge|NC_017337|10|2419470-2419556|CRISPRCasFinder ATTAGAGCCTCTTATGCAGTTGCTCAGTCAACTGTATACCTTTTGCCTTTAACTTAAGTTATTAGAGCCTCTTATGCAGTTGCTCAG >NC_017337|10|8|2419470-2419556|CRISPRCasFinder ATTAGAGCCTCTTATGCAGTTGCTCAG TCAACTGTATACCTTTTGCCTTTAACTTAAGTT ATTAGAGCCTCTTATGCAGTTGCTCAG
>NC_017337.1|WP_000691839.1|2418576_2419461_+|LysR-family-transcriptional-regulator MKIIQLEYFLAIVKYNSFTKAAQFLHISQPSLTATIKKMEADLGYDLFTRSTKDIKITEKGIQFYRYASELVQQYRSTMEKMYDLSVTSEPRIKIGTLESTNQWIANLIRKHHSDYPEQQYRLYEIHDKHQSIEQLLNFNIHLAITNEKITHEDIRSIPLYEESYILLAPKETFKNQNWVDVENLPLILPNKNSQVRKHLDDYFNRRNIRPNVVVETDRFESAVGFVHLGLGYAIIPRFYYQSFHTSNLEYKKIRPNLGRKIYINYHKKRKHSEQVHTFVQQCQDYLYGLLEAL >NC_017337.1|WP_001226815.1|2416755_2418417_-|urocanate-hydratase MRKIQAKKGLSIDCKGWEQEAVLRMLYNNLDPEVAERPEDLVVYGGIGKAARNWEAFEAIEKTLRELESDETMLVQSGKPVAVFKTHEEAPRVLISNSILVPEWANWDHFNELDKKGLIMYGQMTAGSWLYIGSQGIVQGTYETFAELGNQHFNGDLAGTVTLTAGLGGMGGAQPLAITMNHGVAICVDVDETRVDKRIDTKYCDVKTADLDEALKLAEEAKERGEGLSIGLVGNAVDIHQAILEKGFKIDIITDQTSAHDPLNGYVPQGYSVEEAKVLREKDPKKYVELSQASMAKHVELMLEFQKRGAVAFDYGNNIRQVAFNNGVKNAFDFPGFVPAYIRPLFCEGKGPFRFAALSGDPKDIERADEEMRKLFPENEKLLRWLDLAEEKISYQGLPSRIAWLGYGERAKMGLALNRLVRDGEISAPIVIGRDHLDAGSVASPNRETESMKDGSDAVGDWAVLNALINTAAGGSWISFHHGGGVGMGYSLHAGMVVVADGSERAERRLERVLTTDPGMGVARHVDAGYDIAIQTAKEKGIHIPMIDKAGDK >NC_017337.1|WP_000998761.1|2415517_2416756_-|imidazolonepropionase MNDLIINHIAELILPRSTDKPLKGKELDELNVVKNGTVVIKDGKIVYAGQHTDDYDATETIDASGKVVSPALVDAHTHLTFGGSREHEMSLKRQGKSYLEILEMGGGILSTVNATRETSEDDLFKKAEHDLLTMIKHGVLAVESKSGYGLDRENELKQLKVSNRLAEKYDLDMKHTFLGPHAVPKEASSNEAFLEEMIALLPEVKQYADFADIFCETGVFTIEQSQHYMQKAKEAGFKVKIHADEIDPLGGLELAIDEQAISADHLVASSDKGKEKLRNSDTVAVLLPATTFYLGKEDYADARGMLDNNGAIALATDYNPGSSVTNNLQLVMAIAALKLKLSPNEVWNAVTVNAAKAIDINAGTINTGDKANLVIWDAPNHEYIPYHFGINHAEKVIKDGKVIVDNTLSFKA >NC_017337.1|WP_000523133.1|2414118_2415240_-|M20-peptidase-aminoacylase-family-protein MGLKDQAVAWRRYFHQFPELSDKEFKTTQKIKDILTEHHIRILDLPLATGLVSEVGQGPSCIAVRADIDALPIQELVEQDFKSENEGVMHACGHDIHMASILATAVKLKEIEGTLTGRVKFIFQPAEELGYGAFKIIETHALKDVQAVLGFHNDPSRPLGTFAIKTGAITSAVDRFEFHIKGVGGHAAKPEQCNDPVIVLAQLINSIQSIVSRNLSAFHEAVVTIGQISCGNTWNVIADHAYVQGTVRSFDPVVRKLVETRLQDIADGLAQAYNMKINLNYTHLPGAVMNDEALTHKAIAVAQHVGYKVEMMEQPLTIGEDFSGYSQHFPSVFALIGSHSEYDLHHPQYKPDERILEKVPEYFVEFVKRLLHE >NC_017337.1|WP_000730049.1|2413126_2414008_-|SDR-family-oxidoreductase MAAQDPRTKFKTTDYEKQEQEVPGLQSEMTPAPDCGETSYQGHQRLQGYKMLVTGGDSAIGRAAAIAYAKEGADVAINYLPSEEQDAQEVRQVIEESGQKAVLIPGDIRDEQFNYDLVEQAYQQLGGLDNVTLVAGHQQYHDDIHGFTTEAFTETFETNVYPLFWTVQKALEYLKPGASITTTSSVQGYNPSPILHDYAASKAAIISLTKSFSEELGPKGIRVNCVAPGPFWSPLQISGGQPQSKIPTFGQKTPLGRAGQPVELCGTYVLLASEESSYTTGQVFGVSGGVQID >NC_017337.1|WP_001185197.1|2412067_2412640_-|hypothetical-protein MALIVSRAILFLILALAFGIATVFPEQKLPLYIVFTLFVVVAIVSNVWLTHQNVKKNIIKFNKRVAYFLGVLSGVFYIGIVIYGATIIGYYNFISFIIFAISIVSITILEIVLGINFKNTRPSNKQLKVISEQSAQQFKVISLILVSVSIVFIFIALMLKWWLLLVISIIVLIIITVAMIVYEKYYTTPD >NC_017337.1|WP_000451824.1|2410547_2411843_-|Na+/H+-antiporter-NhaC-family-protein MEVHKKSNAWALFPLLLFVALFLGVGIITGDFTSIPLNVAITITVIVALLMNRKESFAKKVEVFTKGAGHSNIILMMLIFILAGVFSNTAEKMGGVKSTVNLGLSLIPENLIIVGLFVICMFVSISMGTSVGTVAAIAPVGYGFAQATDVPTALAMATVVGGAMFGDNLSMISDTTIAAVRTQHTKMKDKFRVNFKIVLPGAILTIIILYFLTNGISLNHAKNYDYNLIKVVPYILVLVLALLGVNVIIVLIGGTLLAGIIGLIDGSFGWMGLLDAVSKGIISMEDIAMIALLIGGLVGIIQHNGGIEWLLQFVRSKVKSKRGAELGIASLVSVADIATANNTISIIMSGPLAKNIADEYDVDSRKSASILDIFGGCFQGLLPYSPQVISAAGVAGISPLMLFPYSIYPILLGVCGLIAILFNFPKLKKEH >NC_017337.1|WP_001051556.1|2409855_2410362_-|SRPBCC-domain-containing-protein MAKFNVENEHVEVEIEKLYKFSPELVYEAWTKKDLLKQWFMTSARTNKEIEADVKEGGKYRIVDQQRNGKVNVIEGIYESLVMDEYVKMTIGMPGLSETQDVIEVEFFERETGGTQMLFYYRSLVEKERRFTNLEYKQKKKEYHDAMVHGFELMFDKMYHVIETSTQQ >NC_017337.1|WP_000477989.1|2409033_2409798_+|MurR/RpiR-family-transcriptional-regulator MFLDEHINRNFDKLNDNDLHIAHFINTHIDECKNMKIQDLAQFTHASNATIHRFTRKLGFDGYSDFKSYLKFESNKTHQLPSNSIDSFKQEIDSTFSYLERVDYQLLTEKMHTASTIYLYGTGRAQLNVASEAQRILLTLHNHVIVLHDEHELKMILNKSEPNDLFFIISLSGETHELLEVTNLLQLRQKYFISVTTMKDNTLAQKANYNVYVSSNTFYLTDGTDYSSFISYHIFFETLVRKYNEYLLHNDISN >NC_017337.1|WP_000904065.1|2406503_2407034_+|hypothetical-protein MLIDKFETYIINIAGLNDRTTRKKLSKLCKSVQFCDALQFSINKQFNQYVLEISLPKQQLPYFISFLSFHQYSIFQVLSPKKINELLDSDNLYQSAKRFDINIDGLQDAFIKDKVIDIMNMFQNHTDITYTLNKSHAHIICTPEIFAKLLHTIATRNIDILSANYRSSSMSKARIS >NC_017337.1|WP_000920236.1|2419642_2420062_+|FosB/FosD-family-fosfomycin-resistance-bacillithiol-transferase MLKSINHICFSVRNLNDSIHFYRDILFGKLLLTGKKTAYFKLAGLWIALNEEKDIPRNEIHISYTHIAFTIDDSEFKYWHQRLKDNNVNILEGRVRDIRDRQSIYFTDPDGHKLELHTGTLENRLNYYKEAKPHMTFYK >NC_017337.1|WP_000277974.1|2420317_2421253_-|formimidoylglutamase MYKQGEPNLWTGRLDSETDPKKFRHFQTVTFEDLSKLEKSSRPSGVGILGYAVDEGVALNKGRIGAKEGPDAIKQAFAGLPDLNQFETLVDYGNVYHDHEELIDTQKEFAMLAAKSIANHRQTFLLGGGHDIAYAQYLATRKVYPTQSIGVINIDAHFDTRAEQQSTSGTSFRQILEEDENTDYLVLGIAQGGNTQSLFDYAKEKKIDYVFADELLSHVSPTIKDMIERFVHEHDVIMFTICMDVIDSAFAPGVSAPAVLGLYPHTVLELAKRIIPSDKVSSVSIAEMNPTYDADNRTAKLVANLVHHFLK >NC_017337.1|WP_000794448.1|2421542_2422799_+|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease-SdpC MKNNKISGFQWAMTIFVFFVITMALSIMLRDFQSIIGVKHFIFEVTDLAPLIAAIICILVFKYKKVQLAGLKFSISLKVIERLLLALILPLIILIIGMYSFNTFADSFILLQSTGLSVPITHILIGHILMAFVVEFGFRSYLQNIVETKMNTFFASIVVGLMYSVFSANTTYGTEFAAYNFLYTFSFSMILGELIRATKGRTIYIATTFHASMTFGLIFLFSEEIGDLFSIKVIAISTAIVAVGYIGLSLIIRGIVYLTTRRNLEELEPNNYLDHVNDDEETNHTEAEKSSSNIKDAEKTGVATASTVGIAKNDTEKTAADEPSIHEGTEKTEPQHHIDNQTESNHDEHHDITSESVESAESVKHAPQSDDLTNDSNEDEIQSLKEPATYKEDRRSSVVIDAEKHIEKTEEQSSDKNK >NC_017337.1|WP_000655867.1|2422864_2423551_-|ribose-5-phosphate-isomerase-A MKDVKALKLMTLNDVLSQINGDMTLGIGTGSTMELLLPQMAQLIKERGYNITGVCTSNKIAFLAKELGIKICEINDVDHIDLAIDGADEVDPSLNIIKGGGGALFREKVIDEMASRFVVVVDETKMVQYLGETFKLPVEVDKFNWYHILRKIESYADIKVERRVNEDVAFITDNGNYILDCKLPKGIDPYKFHEYLIHLTGVFETGYFLDMADQVIVGTQEGVKILEK >NC_017337.1|WP_000623448.1|2423721_2424375_+|MOSC-domain-containing-protein MISIHAISTGKIQDLPYSSKRPMRSALDKTKISQTTWLSSTGFTGDEQAYKDHGGPHKAVCGFSKHNYALYQDDLPSLPTHAMFGENLTFDYLDESDVYFGNQYRLGEALIEVSEIREPCWKIQAKYNIPGLVKRMSTSGKTGFYFRVLKQGYVSPNDQLYLIQEAPIEHRLSVQQLNDLYYNDRQNQDMLRYALNNPFLSPTRRDKLQKMYNRTLK >NC_017337.1|WP_000634685.1|2424610_2425630_-|galactose-mutarotase MIVEVEHQRQGVDLIKIDNDETKIIFTNYGARVVSWKYHDNNIVLGNVVEADEFYHSNPFKFGASIGRYSGRIDNAKFKLKGKEYQLEKNNGEHHLHGGCHGLDNKLFDYEIRNEIAQIKVIFKTVLKSADDHFPGDIDVTITHIYDADHQWSIEYEAVASEDTLFSPTNHVYFNLNRDNNVVDNHRISSNQLDMYVLDERNIVTGDILDLHEVFEDNKIKLSDIFTSQHAQLSQQMTRFGGLDHPFTVGEHKMYVENHEFMLEVDTDMPHVVFFTFNQPDEWDSPFNIYKPHSGFTLETQFLPNDINLYGEKAPSILKAGEVFNSKTSFRIEEKVEND >NC_017337.1|WP_000966695.1|2425659_2425986_-|YnfA-family-protein MLYPIFIFILAGLCEIGGGYLIWLWLREGQSSLVGLIGGAILMLYGVIATFQSFPSFGRVYAAYGGVFIIMSLIFAMVVDKQMPDKYDVIGAIICIVGVLVMLLPSRA >NC_017337.1|WP_072491263.1|2426034_2426220_-|hypothetical-protein MYLKNKIDESDTHLSYKMMMKACYSYFFIFSYRIMSKKVYNMNVKTNFLKWECEVRRNVNE >NC_017337.1|WP_000548682.1|2426203_2427436_-|ABC-transporter-permease MHKFWATFSLTYIKKIKAKSFVIFMIIIAALMIGLSNIDKIINMFDDGPDKIGVAAPNEQIYKVFKQQANTFHSDAKFTKVSIEDAEKEVKKHKLDKAYIIKVNQNRTLQGTIISEKRVSHEDSQKVQALLTAIQTNMVAGELNINKEDLQKLQAQSKVDNKVISNDEVDKVSEGQKIFNYALAYGIIFLMFFIVLNYASQIAMEIASEKTSRVIEMIITSISPIQHIFAKILGVIAVAVTQIILIVLMAVICIFAFDLKDLLQGFNVEMNQLSWQIIIVGIISSIVGIMAYVLLAAILGSLTSRIEDLNQSLMPLTLLGMIAFYIAIFTINNPDGQLALITSYIPFLAPFQLVVRAQTSGLQIHEVILSSLISIVMVAVLIWIAIKTYKDSVLTFERGLFNSMKRVFKK >NC_017337.1|WP_000524825.1|2427428_2428328_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MGLVIEHVTKRFGKMTAVNDISLELESGKMLGFLGRNGAGKTTTFRMILGLSEPTEGHITYNGKKLDKTMYNRIGYLPEERGLHGKLTVEEELKYLATLKGMSKTEIQQQISYWLERFDITENRKKRIDSLSKGNQQKIQLLASMLHKPELLILDEPFSGLDPVNVELLKEAVKDLNDWGSTIVYSSHRMEHVEELCDDVCILDKGQLVVSGDINHVRASNGNKKVVIESETTLPDLTHIRGIIHSENMKQGIQLTIENEDVAKDIYQVVAHQGYVKRFQVVEPSLQDIFIEKVGGKDA |
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NC_017337_11 | 2569913-2570008 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_017337_11
|
1 spacers
spacers of NC_017337_11
>11.1|2569942|38|NC_017337|CRISPRCasFinder AATTACTAGAGGCTCTTATACAGTTGTTGCGAAGCAAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017337_11
The CRISPR arrays of NC_017337_11 >merge|NC_017337|11|2569913-2570008|CRISPRCasFinder CAACTGTATTCCTCTATACCTGTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATACAGTTGTTGCGAAGCAAGCAACTGTATTCCTCTATACCTGTAATTTT >NC_017337|11|9|2569913-2570008|CRISPRCasFinder CAACTGTATTCCTCTATACCTGTAATTTT AATTACTAGAGGCTCTTATACAGTTGTTGCGAAGCAAG CAACTGTATTCCTCTATACCTGTAATTTT
>NC_017337.1|WP_001081688.1|2569009_2569831_-|histidine-racemase-CntK MNRQVIEFSKYNPSGNMTILVHSKHDASEYASIANQLMAATHVCCEQVGFIESTQNDDGNDFHLVMSGNEFCGNATMSYIHHLQESHLLKDQQFKVKVSGCSDLVQCAIHDCQYYEVQMPQAHRVVPTTINMGNHSWKAIEIIYETYVHYVIPVNQVTIEIQHLVETYVREQQWNHKYKTVGMMLFDEQRQFLQPLIYIPEIQSLIWENSCGSGTASIGVFNNYQRNDACKDFTVHQPGGSILVTSKRCHQLGYQTSIKGQVTTVATGKAYIE >NC_017337.1|WP_001058854.1|2568180_2568999_-|D-histidine-(S)-2-aminobutanoyltransferase-CntL MNNFNNEIKLILQQYLEKFEAHYERVLQDNQYIEALETLMDDYSEFILNPIYEQQFNAWRDVEEKAQLIKSLQYITAQCVKQVEVIRARRLLDGQASTTGYFDNIEHCIDEEFGQCSIASNDKLLLVGSGAYPMTLIQVAKETGASVIGIDIDPQAVDLGRRIVNVLAPNEDITITDQKVSELKDIKDVTHIIFSSTIPLKYSILEELYDLTNENVVVAMRFGDGIKAIFNYPSQETAEDKWQCVNKHMRPQQIFDIALYKKAAIKVGITDV >NC_017337.1|WP_000040592.1|2566886_2568188_-|staphylopine-dehydrogenase-CntM MSKLLMIGTGPVAIQLANICYLKSDYEIDMVGRASTSEKSKRLYQAYKKEKQFEVKIQNEAHQHLEGKFEINRLYKDVKNVKGEYETVVMACTADAYYDTLQQLSLETLQSVKHVILISPTFGSQMIVEQFMSKFSQDIEVISFSTYLGDTRIVDKEAPNHVLTTGVKKKLYMGSTHSNSTMCQRISALAEQLKIQLEVVESPLHAETRNSSLYVHPPLFMNDFSLKAIFEGTDVPVYVYKLFPEGPITMTLIREMRLMWKEMMAILQVFRVPSVNLLQFMVKENYPVRPETLDEGDIEHFEILPDILQEYLLYVRYSAILIDPFSQPDENGHYFDFSAVPFKQVYKNEQDVVQIPRMPSEDYYRTAMIQHIGKMLGIQTPMIDQFLARYEASCQAYKDMHQDQHLSSQFNTNLFEEDKALVTKFLEINRTLS >NC_017337.1|WP_001229092.1|2565145_2566744_-|staphylopine-dependent-metal-ABC-transporter-substrate-binding-protein-CntA MRKLTKMSAMLLASGLILTGCGGNKGLEEKKENKQLTYTTVKDIGDMNPHVYGGSMSAESMIYEPLVRNTKDGIKPLLAKKWEVSEDGKTYTFHLRDDVKFHDGTPFDADAVKKNIDAVQENKKLHSWLKISTLIDNVKVKDKYTVELNLKEAYQPALAELAMPRPYVFVSPKDFKNGTTKDGVKKFDGTGPFKLGEHKKDESADFNKNDQYWGEKSKLNKVQAKVMPAGETAFLSMKKGETNFAFTDDRGTDSLDKDSLKQLKDTGDYQVKRSQPMNTKMLVVNSGKKDNAVSDKTVRQAIGHMVNRDKIAKEILDGQEKPATQLFAKNVTDINFDMPTRKYDLKKAESLLDEAGWKKGKDSDVRQKDGKNLEMAMYYDKGSSSQKEQAEYLQAEFKKMGIKLNINGETSDKIAERRTSGDYDLMFNQTWGLLYDPQSTIAAFKAKNGYESATSGIENKDKIYNSIDDAFKIQNGKERSDAYKNILKQVDDEGIFIPISHGSMTVVAPKDLEKVSFTQSQYELPFNEMQYK >NC_017337.1|WP_000472235.1|2564197_2565133_-|ABC-transporter-permease MFKFILKRIALMFPLMIVVSFMTFLLTYITNENPAVTILHAQGTPNVTPELIAETNEKYGFNDPLLIQYKNWLLEAMQFNFGTSYITGDPVAERIGPAFMNTLKLTIISSVMVMITSIILGVVSALKRGKFTDRAIRSVAFFLTALPSYWIASILIIYVSVKLNILPTSGLTGPESYILPVIVITIAYAGIYFRNVRRSMVEQLNEDYVLYLRASGVKSITLMLHVLRNALQVAVSIFCMSIPMIMGGLVVIEYIFAWPGLGQLSLKAILEHDFPVIQAYVLIVAVLFIVFNTLADIINALLNPRLREGAR >NC_017337.1|WP_000584766.1|2563331_2564201_-|ABC-transporter-permease MIILKRLLQDKGAVIALGIIVLYVFLGLAAPLVTFYDPNHIDTANKFAGMSFQHLLGTDHLGRDILTRLIYAIRPSLLYVFVALFVSVLIGSILGFLSGYFQGFVDALIMRACDVMLAFPSYVVTLALIALFGMGAENIIMAFILTRWAWFCRVIRTSVMQYTASDHVRFAKTIGMNDMKIIHKHIMPLTLADIAIISSSSMCSMILQISGFSFLGLGVKAPTAEWGMMLNEARKVMFTHPEMVFAPGIAIVIIVMAFNFLSDALQIAIDPRISSKDKLRSVKKGVVQS >NC_017337.1|WP_000173873.1|2562519_2563335_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MTLLTVKHLTITDTWTDQPLVSDVNFTLTKGETLGVIGESGSGKSITCKSIVGLNPERLRVTGDITFDGKPMLSLSEAQLKKYRGKDIAMVMQQGSRAFDPSTTVGKQMFETMKVHTSMSTQEIEKTLIEYMDYLSLKDPKRILKSYPYMLSGGMLQRLMIALALALKPKLIIADEPTTALDTITQYDVLEAFIDIKKHFDCAMIFISHDLTVINKIADRVVVMKNGQLIEHGTRESVLHHPEHVYTKYLLSTKKKINDHFKHVMRGDVHD >NC_017337.1|WP_000590515.1|2561777_2562527_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIKIKDVEKSYQSAHVFKRRRTPIVKGVSFECPIGATIAIIGESGSGKSTLSRMILGIEKPDKGCVTLNDQPMHKKKVRRHQIGAVFQDYTSSLHPFQTVREILFEVMCQCDGQPKDVMEVQAITLLEEVGLSKAYMDKYPNMLSGGEAQRVAIARAICINPKYILFDEAISSLDMSIQTQILDLLIHLRETRQLSYIFITHDIQAATYLCDQLIIFKNGKIEEQIPTSALHKSDNAYTRELIEKQLSF >NC_017337.1|WP_000675398.1|2560572_2561766_-|MFS-transporter MKGAMAWPFLRLYILTLMFFSANAILNVFIPLRGHDLGATNTVIGIVMGAYMLTAMVFRPWAGQIIARVGPIKVLRIILIINAIALIIYGFTGLEGYFVARVMQGVCTAFFSMSLQLGIIDALPEEHRSEGVSLYSLFSTIPNLIGPLVAVGIWNANNISLFAIVIIFIALTTTFFGYRVTFAEQEPDTSDKIEKMPFNAITVFAQFFKNKELLNSGIIMIVASIVFGAVSTFVPLYTVSLGFANAGIFLTIQAIAVVAARFYLRKYIPSDGMWHPKYMVSVLSLLVIASFVVAFGPQVGAIIFYGSAILIGMTQAMVYPTLTSYLSFVLPKVGRNMLLGLFIACADLGISLGGALMGPISDLVGFKWMYLICGMLVIVIMIMSLLKKPTPRPANSL >NC_017337.1|WP_000072455.1|2559599_2560349_+|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MSNTNKHYIEEEYATEQSRFFKRDIGFIFLYIFLVNILPIIIVFLTFGLVAVFTQQAPWGFSFPISMNISYLLAVIISLAIFRRMHEDAFVPMIRSQIVASAKYKWHILISFTLSIVLFLLLNHFYIFALNVDSFTVFDIYPLIREYGSISLIAIFSLTIILNTLICQLIFRHILIQELSRLIPLKITIVLSVILETLYYYPYINTWWEFIPALILASSATYLYLKSNRNFMVSYFYQLAVILVLHIFM >NC_017337.1|WP_000910575.1|2570771_2571134_-|hypothetical-protein MLKEKESFRLLYQAIREIADKIGDNQLETNSVSLLLLDFDFEHEVFDELHLAILKYLNTVSIENISHSELLNLIGNTIPEDREINTFVKNKIIIGFANNYFPELQVLANEIKSDMASSLK >NC_017337.1|WP_000824955.1|2571397_2572216_-|SDR-family-oxidoreductase MKRLENKVAVVTGASTGIGQASAIALAQEGAYVLAVDIAEVVSETVDKIKSNGDKAKAYIVDIASEQQIDNFASEIREQFGHVDVLFNNAGVDNAAGRIHEYPTDVYDKIMNVDMRGTFLMTKMMLPLMMTKGGSIVNTASFSGQAADLYRSGYNAAKGAVINFTKSIAIEYGRDGIRANAIAPGTIETPLVDKLTGTCEDKEGKAFRENQKWMTPLGRLGKPEEVGKLVVFLASDESSFITGETIRIDGGVMAYTWPGEMLSDDSWKRTLE >NC_017337.1|WP_000202039.1|2572451_2573990_+|AbgT-family-transporter MTSKHQQKGSIVNRFLNSVEKIGNKLPDPSVLFFLMCVGLAIMTWVISLFNVSVKHPGTHQTIYIKNIISHDGFTMIMNDTIKNFSEFPALGLVLAVMIGIGVAEKTGYFDKLMISVVNRAPRFLILPTIILIGILGSTAGDAATIILPPLAAMLFIKIGYHPIAGLTMAYASAVGGFAANIVVGMQDALVYSFTEPATRIVSDSIKTNVAMNWYFIAASVVVLLPTILLVTTKLIIPRLGQYDDRLMHDDHEETSSHITDKEAHALKWANISFIVTIILLIITAIPEHSFLRNAKTGSLLDDAPLINGVGLIILVVFLVPGLVYGILSKEIKNTKDLGKMFGDAVGSMGTFIVIVFFAAQLLAYLKWSNLGIIAAVKGAKLLEHQNGIVLILGIIVLSAMVNMLIGSASAKWGILGPIFVPMLILIGFHPAFTQVIYRVGDSITNPITPMMPYLPLLLTYAQKYDKRMKLGALLSSLMPYSIALSIVWTVFVIIWFLLGIPVGPGGPIFVK >NC_017337.1|WP_001146762.1|2574101_2574524_-|carboxymuconolactone-decarboxylase-family-protein MPYNYKKQNGELMSVMSQGEKFIHQSPVNDELSALIKLLISKINGCHYCVDIHKKELKELGVTQMKIDEVLSFRHLDLFTDQEKVTLEFAEMLNSIKDFKKFEIIDRLKSFYDEEQIIDLVFVVNQINGWNRLNIISDKL >NC_017337.1|WP_000162201.1|2574979_2575399_-|DUF1433-domain-containing-protein MTKKHVFIIIGVILCICIVATVIYLKVKYDEKEKQKALYYKEQQERITLYLKHNTKEPNTIKTVHFTSLKTGPMGDAVIEGYINENKKADFVAYGSPEHNYQFGGDMIESEKLSELLKPANQLKSPDEIKEELDKKEGH >NC_017337.1|WP_000217469.1|2575649_2576345_-|SDR-family-oxidoreductase MTVLTDKVAVVTGAGSGIGEAIATLLHEEGVKVILAGRNKDKLQNVANQLAQDSVKVVPTDVTKKEEVDELIKIAQQTFGGLDIVINSAGQMLSSKITDYQVDEWDSMIDVNIKGTLYTAQAALPTMLEQSSGHLINIASISGFEVTKSSTIYSATKAAVHTITQGLEKELAKTGVKVTSISPGMVDTAITAAYNPTDRKKLEPQDIAEAVLYALTQPKHVNVNEITVRPV >NC_017337.1|WP_000220930.1|2576644_2576926_+|single-stranded-DNA-binding-protein MTYHERVLALRAERKRTAFDFRFEDLFSKEEWLSMSLAERQKAEKAFRHEVKKLDDVRMPFSSAHDAQVKLYNVVYSYNGIKRNFKQVENEGF >NC_017337.1|WP_001224379.1|2577185_2577377_-|hypothetical-protein MRKEIEALIFSDVSSYDIYVNTGVNQGLIGDIKDGYLTIDSMPYIDAERLYHFAMERKSLVTN >NC_017337.1|WP_000270267.1|2577730_2578024_-|hypothetical-protein MWYDSVVERIPSVPSINAVLQMRQITAVIAPEHNRIHHDHKNKLKNDEELLINQMSSHFKKFKGEFDNVAQGDWVKKAKNELDDISKKLKNIQRTEV >NC_017337.1|WP_000493749.1|2578026_2578353_-|hypothetical-protein MFTEYKKISDLETAYDEERRKLNDKLEQLQEIKHQIKLDCEYSYDCFLYLKNKMDYSQESNVKMTHIINEFNDEMTQRIKNEEMKIERSKDELKSEYLKEIEKMGGRE |
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NC_017337_12 | 2796823-2796901 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_017337_12
|
1 spacers
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>12.1|2796847|31|NC_017337|CRISPRCasFinder CTCGCATTGCCTGTAGAATTTCTTTTCGAAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017337_12
The CRISPR arrays of NC_017337_12 >merge|NC_017337|12|2796823-2796901|CRISPRCasFinder TTCTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTCGCATTGCCTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTTTGTTGGGGCCCCGCCAA >NC_017337|12|10|2796823-2796901|CRISPRCasFinder TTCTCTATGTTGGGGCCCCGCCAA CTCGCATTGCCTGTAGAATTTCTTTTCGAAA TTCTCTTTGTTGGGGCCCCGCCAA
>NC_017337.1|WP_000723829.1|2795555_2796608_+|polysaccharide-intercellular-adhesin-biosynthesis/export-protein-IcaC MKKIRLELVYLRAIICAIIIITHLLTQITLKHENLEGGSLVLQFYIRNIVIFGTPCFIILSQLLTTLNYQKVTYRYLTTRVKYILIPYILMGLFYSYSESLLTDSSFNKQFIENVLLGQWYGYFIVVIMQFFILSYIIFKINYNLFNSKILLLLSFILQQSFLYYFTNNTAFHDTVLHYYPLSENTIIFGWIFYFFLGAYMGYNYERVLNFLERYLVIMIVLAVATYFVFIALANGDYWNVTSFSYSLTPYNSIMFIVILGICTHFKTMLFNTIQMISAFSFFIYLLHPIILDSLFAYTNIFEDNTMVFLAISLLFILGLCIGVGMILREFYIFRFIIGKQPYKLNINAY >NC_017337.1|WP_000877363.1|2794696_2795569_+|intercellular-adhesin-biosynthesis-polysaccharide-N-deacetylase MKYRKLIILVLSILIILPVSTLDGHHIANADDDPPKKLKYKENSALALNYHRVRKANFLNNFIYFFSSSKEIKNYSVSQSQFESQIKWLKSHDAKFLTLKEFLYYKKKGKFPKRSVWINFDDMDETIYENAYPILKKYKIPATGFIITGHVGEENFHNLDMISKKELKEMYKTGLWEFETHTHDLHNLSKNNKSKLMKASEATVIKDLNKSEKYLTKNFKKSQKTIAYPYGLMNDDKLPVIKKAGLKYGFSLEEKAVTPNSNDYYIPRILISDDAFEHLIKRWDGFHEKD >NC_017337.1|WP_000240580.1|2794394_2794700_+|intracellular-adhesion-protein-D MVKPRQREYPTLKSSLNIVRETALIAISCVFWIYCLVVLLVYIGTIFEIHDESINTIRVALNIENTEILDIFETMGIFAIIIFVFFTISILIQKWQRGRES >NC_017337.1|WP_001159430.1|2793192_2794431_+|poly-beta-1,6-N-acetyl-D-glucosamine-synthase MQFFNFLLFYPVFMSIYWIVGSIYFYFTREIRYSLNKKPDINVDELEGITFLLACYNESETIEDTLSNVLALKYEKKEIIIINDGSSDNTAELIYKIKENNDFIFVDLQENRGKANALNQGIKQASYDYVMCLDADTIVDQDAPYYMIENFKHDPKLGAVTGNPRIRNKSSILGKIQTIEYASLIGCIKRSQTLAGAVNTISGVFTLFKKSAVVDVGYWDTDMITEDIAVSWKLHLRGYRIKYEPLAMCWMLVPETLGGLWKQRVRWAQGGHEVLLRDFFSTMKTKRFPLYILMFEQIISILWVYIVLLYLGYLFITANFLDYTFMTYSFSIFLLSSFTMTFINVIQFTVALFIDSRYEKKNMAGLIFVSWYPTVYWIINAAVVLVAFPKALKRKKGGYATWSSPDRGNTQR >NC_017337.1|WP_000653261.1|2792468_2793029_-|ica-operon-transcriptional-regulator-IcaR MKDKIIDNAITLFSEKGYDGTTLDDIAKSVNIKKASLYYHFDSKKSIYEQSVKCCFDYLNNIIMMNQNKSNYSIDALYQFLFEFIFDIEERYIRMYVQLSNTPEEFSGNIYGQIQDLNQSLSKEIAKFYDESKIKMTKEDFQNLILLFLESWYLKASFSQKFGAVEESKSQFKDEVYSLLNIFLKK >NC_017337.1|WP_000659677.1|2790958_2791621_-|capsular-polysaccharide-biosynthesis-protein-CapA MKEKFDLVKLLNILKKNIKLLLILPAICLVVSAALTFFVMPDKYTASTQILVNMKKSSSDLAFQNVQSSLQSVNTYTEIIKSPRILDKVSREFDGQYSTAELNSFLKVTNQTNSQIITVSVTTGNKSESDKIVNRISKVFAHDMPKIMSVDNVTILSSAHDNAVKVSPIVSVNLVISIIVGIVLAILIIFLKELLDKRIKTEEDVESQLGLPILGSIQKF >NC_017337.1|WP_000185863.1|2790249_2790942_-|polysaccharide-biosynthesis-tyrosine-autokinase MTNTRRSTSSLIVHEQPKSPISEKFRGIRSNIMFANPDSAVQSIVITSEAPGAGKSTIAANLAVAYAQAGYKTLIVDGDMRKPTQHYIFNLPNNEGLSSLLLNWSTYQDSIISTEIQDLDVLTSGPIPPNPSELITSRAFANLYDTLLMNYNFVIIDTPPVNTVTDAQLFSKFTGNVVYVVNSENNNKDEVKKGKELIEATGAKLLGVVLNRMPKDKSASYYAYYGTDES >NC_017337.1|WP_000565312.1|2789485_2790253_-|tyrosine-protein-phosphatase MIDIHNHILVDIDDGPKTIEKSIALLKQAKDEGVTSIVATPHHLHPRYDNTFQQVLVKLAELRTHPEVQALDIKLFPGQEIRITDSILQGLDNGSIQGINRSKYLLIEFPTGEVPHYTKQLFFEIQSRGYIPIIAHPERNRSIAKNPEILYELVANGALSQLTSSSLVGGFGKNIQKLSLQFIECNLAHFVASDAHSCDQRPFLMQELFHNHKLKKYSNDIEALLRNASSVINDNFVYLDRPTKPGKVKSFLKWF >NC_017337.1|WP_000244266.1|2788750_2789251_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MVLRKVIMQDLDQIIALENIGFSPEEAATPEALKLRIEQIQETFIVAEKNDEVIGYINGPVIKERYISDDLFKNVPTNNSEGGYISVLGLVVAPNYQGQGIAGRLLNYFENLAKNQHRHGVTLTCRESLISFYEKYGYRNEGVSESCHGGIKWYNLVKNIKKDDEV >NC_017337.1|WP_000301942.1|2788271_2788748_-|peptide-methionine-(S)-S-oxide-reductase MAVVYVAGGCLWGVEAFFTTIPGIIHTEVGRANGRSSKLDSPYDGYAECVKLHFDDRMLTITDIMNYLFEIIDPYSVNRQGNDIGEKYRTGLYSCVDDYLIEARQFIERRKDRDKIAVEVLPLSNYIKSAEEHQQHLEKYPEDMHMCHISIDLLNKYK >NC_017337.1|WP_000842039.1|2796998_2799041_-|YSIRK-domain-containing-triacylglycerol-lipase-Lip1 MKSQNKYSIRKFSVGASSILIATLLFLSGGQAQAAEKQVNMGNSQEDTVTAQSIGDQQTRENANYQRENGVDEQQHTENLTKNLHNDKTISEENHRKTDDLNKDQLKDDKKSSLNNKNIQRDTTKNSNANPSDVNQGLEQAINDGKQSKVASQQQSKEADNSQDSNANNNLPSQSRTKEALPLNKSNQTSQPEIVNKTEIEKVQPQQNNQANDKITNYNFNNEKEVKPQKDEKTLSVSDLKNNQKSPVEPTKDNDKKNGLNLLKSSAVATLPNKGTKELTAKAKGDQTNKVAKQGQYKNQDPIVLVHGFNGFTDDINPSVLAHYWGGNKMNIRQDLEENGYKAYEASISAFGSNYDRAVELYYYIKGGRVDYGAAHAAKYGHERYGKTYEGIYKDWKPGQKVHLVGHSMGGQTIRQLEELLRNGNREEIEYQKKHGGEISPLFKGNNDNMISSITTLGTPHNGTHASDLAGNEALVKQIVFDIGKMFGNKNSRVDFGLAQWGLKQKPNESYIDYVKRVKQSNLWKSKDNGFYDLTREGATDLNRKTSLNPNIVYKTYTGEATHKALNSDRQKADLNMFFPFVITGNLIGKATEKEWRENDGLVSVISSQHPFNQAYTNATDKIQKGIWQVTPTKHDWDHVDFVGQDSSDTVHTREELQDFWHHLADDLVKTEKVTDTKQA >NC_017337.1|WP_000732672.1|2799761_2800025_-|hypothetical-protein MKKLFNEYFFTTSQATALIIFSLPMTDLFTKNFLLYMLLFIVIIGSTFFIERELSKKYSLQEKAKKLCLSLLPINIIVVFIFFVFIL >NC_017337.1|WP_000186277.1|2800561_2801194_-|bifunctional-phosphoribosyl-AMP-cyclohydrolase/phosphoribosyl-ATP-diphosphatase-HisIE MTNYKIDFSKGLVPAILQDNQTKQVLMLGYMNQEAFDKTIEDGLVCFYSRSKQRLWTKGETSGHTQRVKDIHVDCDNDTILIDVIPNGPTCHTGSQSCFNTEVPFSVQTLAQTVQDSAQSNNEKSYTKYLLTEGIEKITKKYGEEAFEVVIEAIKGDKKAFVSEVADELYHLFVLMHALGVDFSEIEAELARRHHKRNNFKGERQNIEQW >NC_017337.1|WP_000592605.1|2801190_2801949_-|imidazole-glycerol-phosphate-synthase-subunit-HisF MIKKRIIPCLDVKDGRVVKGIQFKGLRDIGNPVDLAMYYNEAGADELVFLDISKTEEGHSLMLEVIEQTASRLFIPLTVGGGIQSLDDITQLLNHGADKVSLNSSALKNPQLIKQASDKFGRQCICIAIDSYYDPERKAHYCCTHGGKKMTNIKVYDWVQQVEQLGAGELLVTSMGHDGMKQGFDIEHLAKIKSLVNIPIIASGGGGSAQHFVELFDQTDVSAGLAASILHDRETTVQSIKEVIRQGGIAVR >NC_017337.1|WP_000571731.1|2801945_2802650_-|1-(5-phosphoribosyl)-5-((5--phosphoribosylamino)methylideneamino)imidazole-4--carboxamide-isomerase MIELWPAIDLIGSTSVRLTEGKYDSEEKMSRSAEESIAYYSQFECVNRIHIVDLIGAKAQHAREFDYIKSLRRLTTKDIEVGGGIRTKSQIMDYFAAGINYCIVGTKGIQDADWLKEMAHTFPGRIYLSVDAYGEDIKVNGWEEDTELNLFSFVKQLSDIPLGGIIYTDIAKDGKMSGPNFELTGQLVKATTIPVIASGGIRHQQDIQRLASLNVHAAIIGKAAHQASFWEGLK >NC_017337.1|WP_000635613.1|2802642_2803221_-|imidazole-glycerol-phosphate-synthase-subunit-HisH MIVIVDYGLGNISNVKRAIEHLGYEVVVSNKQNIIDQAETIILPGVGHFKDAMSEIKRLNLDAILAKNTDKKMIGICLGMQLMYEHSDEGDASGLGFIPGNISRIQTEYPVPHLGWNNLVSKHPMLNQDVYFVHSYQAPMSENVIAYAQYGTDIPAIVQFNNYIGIQFHPEKSGTYGLQILRQAIQGGFIND >NC_017337.1|WP_000640270.1|2803217_2803796_-|imidazoleglycerol-phosphate-dehydratase-HisB MIYQKQRNTAETQLNISISDDQSPSHINTGVGFLNHMLTLFTFHSGLSLNIEAQGDIDVDDHHVTEDIGIVIGQLLLEMIKDKKHFVRYGTMYIPMDETLARVVVDISGRPYLSFNATLSKEKVGTFDTELVEEFFRAVVINARLTTHIDLIRGGNTHHEIEAIFKAFSRALGIALTATDDQRVPSSKGVIE >NC_017337.1|WP_000639171.1|2803764_2804778_-|histidinol-phosphate-aminotransferase-family-protein MIYIDKNESPITPLDEKTMTSIISATPYNLYPDAAYEQFKDAYAKFYGLSPEQIIAGNGSDELIQKLMLIMPEGPALTLNPDFFMYQAYAAQVNREIAFVDAGSDLTFDLETILTKIDEVQPSFFIMSNPHNPSGKQFDIAFLTAIADKMKAINGYFVIDEAYLDYGMAYDVELAPHILRMRTLSKAFGIAGLRLGVLISTAGTIQRIQKIEHPYPLNVFTLNIATYIFRHRQETSRFLTMQRQLAEQLKQIFDTHVADKMSVFPSNANFVLTKGSAAQQLGQYVYEQGFKPRFYDEQVMKGYVRYSIATASQLKQLEEIVKEWSTKYDLSKTTKHS >NC_017337.1|WP_000930653.1|2804793_2806044_-|histidinol-dehydrogenase MLNAQQFLNQFSLEAPLDESLYPIIRDICQEVKVHGDKALKMYNLTFDHTKTDHLEISHEQIKAAFDTLDEKTKQALQQSYERIKAYQESIKQTNQQLEKSVECYEIYHPLESVGIYVPGGKASYPSTVLMTATLAQVAGVENIVVVTPPQPNGVSKEVLAACYITQVNQVFQVGGAQSIAALTYGTETIPKVDKIVGPGNQFVAYAKKYLFGQVGIDQIAGPTEIALIIDDTADLDAIVYDVFAQAEHDELARTYVISEDAQVLKDLESRIAKALPNVDRYDIVSKSIANQHYLIHASNFDEACYVMNTIAPEHASIQTVNPQPYIEKVKYVGALFIGHYSPEVIGDYVAGPSHVLPTNRTARFTNGLSVNDFLTRNTVIHLSKDTFDQIADSAQHIAHVEALYNHQQSILIRQS >NC_017337.1|WP_000944133.1|2806036_2806651_-|ATP-phosphoribosyltransferase MLRIAIAKGRLMDSLINYLDAIEFTTLSETLKNRERQLLLSVDNIECILVKGSDVPIYVEQGIADIGIVGSDILDERHYNVNNLLDMPFGACHFAVAAKPETTNYRKIATSYVHTAEAYFKSKGIDVELIKLSGSVELACVVDMVDGIVDIVQTGTTLEANGLVEKQHISDINARLITNKAAYFKKSQLIEQFIRSLEVSIANA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_017337_13 | 2826142-2826227 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_017337_13
|
1 spacers
spacers of NC_017337_13
>13.1|2826172|26|NC_017337|CRISPRCasFinder CCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017337_13
The CRISPR arrays of NC_017337_13 >merge|NC_017337|13|2826142-2826227|CRISPRCasFinder CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTT >NC_017337|13|11|2826142-2826227|CRISPRCasFinder CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTT CCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCG CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTT
>NC_017337.1|WP_000491379.1|2825564_2825918_-|DUF3147-family-protein MFSIGSAILHFVIGGIAVALASIIADKVGGKLGGIIATMPAVFLAAIIALALDHRGTQLVEMSMNLSTGAIVGILSCILTVFLASLYIKHKGYRKGAIFTVVCWFVISLAIFSIRHL >NC_017337.1|WP_000779131.1|2825101_2825497_-|DUF3147-family-protein MKLTLMKFFVGGFAVLLSYIVSVALPWKEFGGIFATFPAVFLVSMFITGMQYGDKVAVHVSRGAVFGMTGVLVCILVTWMMLHMTHMWLISIIVGFLSWFISAVCIFEAVEFIAQKRLEKHSWKAGKSNSK >NC_017337.1|WP_001054125.1|2824272_2824842_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MNLSKQIKKYRERDGYSQEYLAEKLYVSRQSISNWENDKSLPDIHNLLMMCELFNVTLDDLVKGTIPFVPDIKVQRSLNLWAYVMLIFMTLAAILTGPLIVYWNWAWGITVMVIYGIGYYASMKIEDFKKVHKMDNYDRIVAFMNGKDPSEVQTTKARNIKTGVLSFIAFVGAIILIALISVYLANKFL >NC_017337.1|WP_001059079.1|2823945_2824146_+|cold-shock-protein MNNGTVKWFNAEKGFGFIEQENGGDVFVHFSGIASDGYKTLEEGQKVTFEITEGQRGDQAVNVQTV >NC_017337.1|WP_000672031.1|2823361_2823553_+|peptide-resistance-ABC-transporter-activity-modulator-VraH MKFRELVKQSYEDLKNLTVTWYNVIALAMIVIVLSTVTTPIIGIPVGLLGGAYYLKRREEKGK >NC_017337.1|WP_000143659.1|2821389_2823270_+|peptide-resistance-ABC-transporter-permease-subunit-VraE MTFNHIVFKNLRQNLKHYAMYLFSLFFSIVLYFSFTTLQFTKGVNNDDSMAIIKKGALVGSIFLFIIIVIFLMYANHLFVKRRTREFALFQLIGLTRQNILKMLALEQMIVFLITGVVGVLCGIAGAQLLLSIVSKLMSLSINLSIHFEPMALVLTIFMLVIAYILILFQSSLFLKRRSILSMMKDSIKTDVTTAKVTTAEVISGVLGIAMIALGYYMATEMFGTFKALTMAMTSPFIILFLTVVGAYLFFRSSVSLIFKTLKKSKNGRVSITDVVFTSSIMYRMKKNAMSLTIIAIISAVTVTVLCFAALSKSNTDQTLTSMAPNDFNVVASQDAQQFESKLSQQHITFTKNYYETITVNNVKDQVITLENGSDSGRTNSILSANTKLTGNNAIITNTKSLPNIINIHLNKDLVVKGTKNETFRVTQEDKGKVYPLNLSFNSPVVEVSPEKYQQLKTQNNVHTFYGYDIKQTSQKKKAQAIAKQFGDKVITYDEMKKEVDATNGILIFVTSFLGLAFLVAAGCIIYIKQMDETEDELSNFRILKRIGFTHTDMLKGLLLKITFNFGLPLLIAILHAVFAAIAFMKLMGNISFMPVIIVIIVYTLIYIVFALIAFVHSNKLIKKTI >NC_017337.1|WP_000154162.1|2820641_2821400_+|peptide-resistance-ABC-transporter-ATP-binding-subunit-VraD MTILSVQHVSKTYGKKHTFQALKDINFDIQKGEFVAIMGPSGSGKTTLLNVLSSIDQISSGSVIANGQELNKLNQKALAKFRKESLGFIFQDYSILPTLTVKENIMLPLSVQKMSKATMEENYKAITTALGIYDLGNKYPSELSGGQQQRTAAARAFVHKPQIIFADEPTGALDSKSANDLLQRLEEMNKSFDTTIVMVTHDPVAASFAERVIMLKDGQIHTQLYQEGRSKQAFYEDIVHLQSVLGGVSNDI >NC_017337.1|WP_000410769.1|2819839_2820352_-|HdeD-family-acid-resistance-protein MEKGNQGIKWSSLIMGVLLLMLAVVIFTFPIENFYAITWLIGLFVLINGVIQIVYRRKAKALVGGNQNWILFMGIVDILFGLIVIFNVGASSAFFIYMFAFWFIFSSIAGLFTFSGSGSLKLISVIFNLLGIVFGVILLFNPLMGIVFISTMIAIAFLFVGVIYVVDALA >NC_017337.1|WP_001017428.1|2818731_2819544_+|arylamine-N-acetyltransferase MNIAKLENYLQIDSSRYNRPSIEALNYYATRFMLTVPFENIDVQNSKPISINIDALFNKIVRDKRGGFCYELNTFFKTYLQQKGFNPELMSATIHTPGGGRSLNGSHASLVVSINDVFYVTDVGFGDLPLHAIPITSSEHTQPITDISGTFRAIFNNQDKDIFYVQKFENDNWRTKYEAEFKAKCIADFDKNIKYNQTHPDSIFVQHLLITMPQSFDRATMSENHLTLTKAKDGISEKLAVTKDNYQHFLKTYFGLDVTINRIENSDSKS >NC_017337.1|WP_000215635.1|2817472_2818489_+|HoxN/HupN/NixA-family-nickel/cobalt-transporter MTVFKNERLSWLPYIAIVILLHVIGFSFLWIAGKDHHILFGMGILAYTLGLRHAFDADHIAAIDNTVRKLLQQRKDPSGVGFYFSIGHSSVVFLMAVFLGVSVKWAKDELPHFQDIGGTIGTLVSGFFLVLIGVLNLIILISLINLFAKLRREHIEEAEVDALLESRGFVSRFVGPYFKLITRSWHVLPLGFLFGLGFDTASEIALLALSSGASQQAISFIGILSLPILFASGMSLLDTLDGVVMKYAYNWAFFNPIRKIYYNITITAISVIAALVIGMIELLQILADKLDLHGAFWAFISSIEFDYLGYILVALFLITWLISSLIWKFGRIEHKWSK >NC_017337.1|WP_000742837.1|2826585_2827425_-|nucleoid-occlusion-protein MKKPFSKLFGLKNKDDIIGHIEEDRNSNVESIQIERIVPNRYQPRQVFEPNKIKELAESIHEHGLLQPIVVRPIEEDMFEIIAGERRFRAIQSLNLPQADVIIRDMDDEETAVVALIENIQRENLSVVEEAEAYKKLLEIGDTTQSELAKSLGKSQSFIANKLRLLKLAPKVLLRLREGKITERHARAVLSLSDSEQEALIEQVIAQKLNVKQTEDRVRQKTGPEKVKAQNLRFAQDVTQARDEVGKSIQAIQQTGLHVEHKDKDHEDYYEIKIRIYKR >NC_017337.1|WP_000215593.1|2827467_2828187_-|16S-rRNA-(guanine(527)-N(7))-methyltransferase-RsmG MTVEWLAEQLKEHNIELTETQKQQFQTYYRLLVEWNEKMNLTSITDEHNVYLKHFYDSIAPSFYFDFNQPISICDVGAGAGFPSIPLKIMFPQLKVTIVDSLNKRIQFLNHLASELQLQDVSFIHDRAETFGKGVYRESYDVVTARAVARLSVLSELCLPLVKKGGQFVALKSSKGEEELEEAKFAISVLGGNVTETHTFELPEDAGERQMFIIDKKRQTPKKYPRKPGTPNKTPLLEK >NC_017337.1|WP_000046623.1|2828186_2830064_-|tRNA-uridine-5-carboxymethylaminomethyl(34)-synthesis-enzyme-MnmG MAQEYDVIVIGAGHAGVEAGLASARRGAKTLMLTINLDNIAFMPCNPSVGGPAKGIVVREIDALGGQMAKTIDKTHIQMRMLNTGKGPAVRALRAQADKVLYQQEMKRVIEDEENLHIMQGMVDELIIEDNEVKGVRTNIGTEYLSKAVIITTGTFLRGEIILGNMKYSSGPNHQLPSITLSDNLRELGFDVVRFKTGTPPRVNSKTIDYSKTEIQPGDDVGRAFSFETTEYILDQLPCWLTYTNAETHKVIDDNLHLSAMYSGMIKGTGPRYCPSIEDKFVRFNDKPRHQLFLEPEGRNTNEVYVQGLSTSLPEHVQRQMLETIPGLEKADMMRAGYAIEYDAIVPTQLWPTLETKMIKNLYTAGQINGTSGYEEAAGQGLMAGINAAGKVLNTGEKILSRSDAYIGVLIDDLVTKGTNEPYRLLTSRAEYRLLLRHDNADLRLTDMGYELGMISEERYARFNEKRQQIDAEIKRLSDIRIKPNEHTQAIIEQHGGSRLKDGILAIDLLRRPEMTYDIILEILEEEHQLNADVEEQVEIQTKYEGYINKSLQQVEKVKRMEEKKIPEDLDYSKIDSLATEAREKLSEVKPLNIAQASRISGVNPADISILLIYLEQGKLQRVSD >NC_017337.1|WP_000362510.1|2830130_2831510_-|tRNA-uridine-5-carboxymethylaminomethyl(34)-synthesis-GTPase-MnmE MDLDTITSISTPMGEGAIGIVRLSGPQAVEIADKLYKGKHLLNDVPSHTINYGHIIDPESKEVVEEVMVSVLRAPKTFTREDIIEINCHGGILTINRVLELTMTYGARMAEPGEFTKRAFLNGRIDLSQAEAVMDFIRSKTDRASKVAMNQIEGRLSDLIKKQRQSILEILAQVEVNIDYPEYDDVEDATTEFLLEQSKEIKQEINRLLDTGAQGKIMREGLSTVIVGKPNVGKSSMLNNLIQDNKAIVTEVAGTTRDVLEEYVNVRGVPLRLVDTAGIRETEDIVEKIGVERSRKALSQADLILFVLNNNEALTQEDYTLYEVVKNEDVIVIVNKMDLEQNIDINEVKDMIGNTPLIQTSMLKQEGIDELEIQIRDLFFGGEVQNQDMTYVSNSRHISLLKQARQTIQDAIDAAESGVPMDMVQIDLTRTWEILGEIIGETASDELIDQLFSQFCLGK >NC_017337.1|WP_001789343.1|2831652_2832006_-|ribonuclease-P-protein-component MLLEKAYRIKKNADFQRIYKKGHSVANRQFVVYTCNNKEIDHFRLGISVSKKLGNAVLRNKIKRAIRENFKVHKSHILAKDIIVIARQPAKDMTTLQIQNSLEHVLKIAKVFNKKIK >NC_017337.1|WP_000240855.1|2832126_2832264_-|50S-ribosomal-protein-L34 MVKRTYQPNKRKHSKVHGFRKRMSTKNGRKVLARRRRKGRKVLSA |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_017337_1 | 1.1|637159|35|NC_017337|CRISPRCasFinder | 637159-637193 | 35 | NC_017337.1 | 834288-834322 | 0 | 1.0 |
NC_017337_9 | 9.2|2355902|18|NC_017337|CRT | 2355902-2355919 | 18 | NC_017337.1 | 801840-801857 | 0 | 1.0 |
NC_017337_9 | 9.2|2355902|18|NC_017337|CRT | 2355902-2355919 | 18 | NC_017337.1 | 1185504-1185521 | 0 | 1.0 |
NC_017337_9 | 9.2|2355902|18|NC_017337|CRT | 2355902-2355919 | 18 | NC_017337.1 | 2495365-2495382 | 0 | 1.0 |
NC_017337_12 | 12.1|2796847|31|NC_017337|CRISPRCasFinder | 2796847-2796877 | 31 | NC_017337.1 | 637124-637154 | 0 | 1.0 |
NC_017337_12 | 12.1|2796847|31|NC_017337|CRISPRCasFinder | 2796847-2796877 | 31 | NC_017337.1 | 834385-834415 | 0 | 1.0 |
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36. spacer 3.2|882678|36|NC_017337|PILER-CR matches to position: 2390602-2390637, mismatch: 2, identity: 0.944
gctggcggaaaggcagcatacaataatgtgcaagtt CRISPR spacer gctggcggaaagtcagcttacaataatgtgcaagtt Protospacer ************ **** ******************
37. spacer 3.2|882678|36|NC_017337|PILER-CR matches to position: 2390658-2390693, mismatch: 2, identity: 0.944
gctggcggaaaggcagcatacaataatgtgcaagtt CRISPR spacer gctggcggaaagtcagcttacaataatgtgcaagtt Protospacer ************ **** ******************
38. spacer 3.2|882678|36|NC_017337|PILER-CR matches to position: 2524697-2524732, mismatch: 2, identity: 0.944
gctggcggaaaggcagcatacaataatgtgcaagtt CRISPR spacer gctggcggaaagtcagcttacaataatgtgcaagtt Protospacer ************ **** ******************
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ctttttgaaattctctat CRISPR spacer cttttcgaaattctccat Protospacer *****.*********.**
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49. spacer 13.1|2826172|26|NC_017337|CRISPRCasFinder matches to position: 2390528-2390553, mismatch: 2, identity: 0.923
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50. spacer 13.1|2826172|26|NC_017337|CRISPRCasFinder matches to position: 2495408-2495433, mismatch: 2, identity: 0.923
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51. spacer 13.1|2826172|26|NC_017337|CRISPRCasFinder matches to position: 2524725-2524750, mismatch: 2, identity: 0.923
ccgccagcttctatgttggggccccg CRISPR spacer ccgccagctactgtgttggggccccg Protospacer ********* **.*************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_017337_6 | 6.1|1060048|29|NC_017337|CRISPRCasFinder | 1060048-1060076 | 29 | NZ_CP015322 | Mesorhizobium amorphae CCNWGS0123 plasmid pM0123d, complete sequence | 703321-703349 | 6 | 0.793 |
NC_017337_10 | 10.1|2419497|33|NC_017337|CRISPRCasFinder | 2419497-2419529 | 33 | NZ_CP039706 | Clostridium butyricum strain 4-1 plasmid p-butyl_plas_4-1, complete sequence | 164873-164905 | 8 | 0.758 |
NC_017337_10 | 10.1|2419497|33|NC_017337|CRISPRCasFinder | 2419497-2419529 | 33 | NZ_CP039703 | Clostridium butyricum strain 29-1 plasmid p-butyl_plas_29-1, complete sequence | 498457-498489 | 8 | 0.758 |
NC_017337_12 | 12.1|2796847|31|NC_017337|CRISPRCasFinder | 2796847-2796877 | 31 | NZ_CP009619 | Vibrio coralliilyticus strain RE98 plasmid p380, complete sequence | 270870-270900 | 8 | 0.742 |
1. spacer 6.1|1060048|29|NC_017337|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP015322 (Mesorhizobium amorphae CCNWGS0123 plasmid pM0123d, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
taaaagagggatacttgcgctgagcgcat CRISPR spacer gatcaaagggttccttgcgctgagcgcat Protospacer * *.**** * ****************
2. spacer 10.1|2419497|33|NC_017337|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039706 (Clostridium butyricum strain 4-1 plasmid p-butyl_plas_4-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
tcaactgtataccttttgcctttaacttaagtt CRISPR spacer ttatagttataccttttgcttttaatttaagtg Protospacer *.* ************.*****.******
3. spacer 10.1|2419497|33|NC_017337|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039703 (Clostridium butyricum strain 29-1 plasmid p-butyl_plas_29-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
tcaactgtataccttttgcctttaacttaagtt CRISPR spacer ttatagttataccttttgcttttaatttaagtg Protospacer *.* ************.*****.******
4. spacer 12.1|2796847|31|NC_017337|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP009619 (Vibrio coralliilyticus strain RE98 plasmid p380, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
ctcgcattgcctgtagaatttcttttcgaaa CRISPR spacer gctgcattacctgtagcatttcttttttcaa Protospacer ..*****.******* *********. **
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
321154 : 366548
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_017337|321154:366548|DBSCAN-SWA 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65 | Staphylococcus_phage(73.02%) | tail,integrase,protease,holin,plate,capsid,terminase,head | attL 321043:321061|attR 368718:368736 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
431631 : 448400
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_017337|431631:448400|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_017337|431631:448400|434757_435894_-|WP_000592971.1|integrase|DBSCAN-SWA MIKKYKKKDGSTAYMFVAYLGTDPITGKQKRTTRRGFKTEREAKIAEAKLQTEVSQNGFLNNDITTFKEVYELWLEQYQNTVRESTYQRVLTLFDTAILEHFQDVPIKKITVPYCQKVINKWNKKYSDIKAIRIYTSNVFKYAVSLKIIVDNPFAHTKAPRKKEAQQDASTKYYSSDELKQFLTFVEDDPLYYAIFRTLAFTGFRRGELMALTWNDIDFTKQTISINKTCARGANYKLVIQEPKTKSSHRTISIDDKTASVLKSWRTHQRVESLKYGHNTSDKHQHVFTTVRDNKPLYPEHCNKALDLICEKNSFKRIKVHGFRHTHCSLLFEAGLSIQEVQDRLGHGDIKTTMDIYAHVTEKQRDQVADKFAKYINF >NC_017337|431631:448400|441561_441768_+|WP_000884055.1|DBSCAN-SWA MLDHTNESVKRVFKYRDKQELLNKYHELLDKYFLHNISFYEEDKNNERIYGLVVHTKNKLGDEDYERV >NC_017337|431631:448400|440992_441337_+|WP_001082128.1|DBSCAN-SWA MNRSRMKQIILEYIKNNGSTSFVEIENVFEEQGFKYKGNGAYTSGNHKNIIFWMGWNEEAFNIVADLKRDGLIEMQICPPMYYLIDGKGLRLPIVKNKNIKIDHWLPVTFSLVN >NC_017337|431631:448400|437459_437606_+|WP_000773832.1|DBSCAN-SWA MKLNLLYITLTSLLTILLLAISNMYVAFSTYALLITLGFNLTGGLENE >NC_017337|431631:448400|441754_442813_+|WP_000657540.1|DBSCAN-SWA 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>NC_017337|431631:448400|443482_443638_+|WP_115118330.1|terminase|DBSCAN-SWA MDIHDINGNVPIFINIGEWDGDDEKLDKAVQDVSNANPSHPVIVDDIPLED >NC_017337|431631:448400|431631_433098_+|WP_000264071.1|DBSCAN-SWA MWESKFAKESLTFDDVLLIPAQSDILPKDVDLSVQLSDKVKLNIPVISAGMDTVTESKMAIAMARQGGLGVIHKNMGVEEQADEVQKVKRSENGVISNPFFLTPEESVYEAEALMGKYRISGVPIVDNKEDRNLVGILTNRDLRFIEDFSIKIVDVMTQENLITAPVNTTLEEAEKILQKHKIEKLPLVKDGRLEGLITIKDIEKVIEFPNAAKDEHGRLLVAAAIGISKDTDIRAQKLVEAGVDVLVIDTAHGHSKGVIDQVKHIKKTYPEITLVAGNVATAEATKDLFEAGADIVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQITAIYDCATEARKHGKAIIADGGIKFSGDIIKALAAGGHAVMLGSLLAGTEESPGATEIFQGRQYKVYRGMGSLGAMEKGSNDRYFQEDKAPKKFVPEGIEGRTAYKGALQDTIYQLMGGVRAGMGYTGSHDLRELREEAQFTRMGPAGLAESHPHNIQITKESPNYSF >NC_017337|431631:448400|442994_443486_+|WP_000253087.1|DBSCAN-SWA MVSDFESNDKITEVELLMHYNPKVINSKIKAMRSQIESLYHLNMNHVITNENDMLVSVSYPLDKLVLYIIEEKDKLEYYMKTAQDRLNLFKDIIKNYSKNERQDVMRYMLSSGKVKNEGVIERLKVDIYKVESIKRQERQNKREELHRIEFDKHLEQVKKELS >NC_017337|431631:448400|435977_436763_-|WP_000819103.1|DBSCAN-SWA 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MKQQMLSKVLLSTVVVMGSIAGSSLVMDDNAHAEQKSDNIGKLNQKNESTLHLSFEKGIKGTVDKNGKLTLSDGKTSKVMPTNAKDKKGNNVVLVYKKVKDGFDVQVIKSSQERKTNWVKCGLGTVGGAGTGGLGGASAASVIPGLGTVAGAIIGGVSGGATGAAASCFG >NC_017337|431631:448400|446710_447511_+|WP_001043553.1|DBSCAN-SWA MNKSRFISCVILIFSLILVLFTPNVLAESQPDPTPDELHKASKFTGLMENMKVLYDDRYVSATKVKSVDKFLAHDLIYNISDKKLKNYDKVKTELLNEDLAKKYKDEVVDVYGSNYYVNCCFSSKDNVGKVTGGKTCMYGGITKHEGNHFDNGNLQNVLIRVYENKRNTISFEVQTDKKSVTAQELDIKARSFLINKKNLYEFNSSPYETGYIKFIENNGNTFWYDMMPAPGDKFDQSKYLMMYNDNKTVDSKSVKIEVHLTTKNG |
19 | Staphylococcus_phage(35.71%) | terminase,integrase | attL 434650:434673|attR 448668:448691 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
766342 : 774163
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_017337|766342:774163|DBSCAN-SWA ATTATGACGTAATGTCTAATTTGTGTAATGTCACAGTCATCGTAGTTCCTACATCTATATCACTGCTTACACTGATTTTTGCGTTATTTTGTTGCGCGAGTTCATTAGCTATATATAAGCCTAATCCAGAACCACCCGTTTTTGTATTACGCGAGTTTTCTACTCTGAATGTTCGTTCGAATATACGTTCTTGTAGTTCTGGTATAATGCCAATACCTTCATCGCTAATAGCAATGTCGATAGTATCTTGATCTTTATTTTCACTAATATTAATATCAATGCGACTACCAACATTTGAAAATTTTAGCGCATTATCAAGTAAGTTTGTTAAAATACGCTCAAGTGGCGTTCGATATTGATAAAATGCATCAATTTCGCTACAGAAATTCACTTCTAATGTGCGGTTTTCATGTTTGATACGTTGCTCATATGGTTGCAATATTGATACAAGTAATTGGTCTAGTTGTATTAATTCTGGGGGATATGTTTTACCTGTATTTAAAGTGATAATATGAGTCATATCATCAAATAATGTTGATAATCTGTTTGCTTGTTTAATTAATATGTCGTATGACTCTTTAATCTCATGATCCTTTGTGATTATACCATCACGTAGTCCTTCAGAATATGAAATAATGCTTGCTAAAGGTGTTTTTAAATCATGGGCTAAGTTTTGAATCAGTTCTGTTTTTTCTTGTTGTTCGGATTTAATTTGATTCATTTGTTGCGTAATTTCAGAAGCCATTTTATTAAAAGATTGATTTAATTCATAAATTTCTTTTGGTGAATTAAACGTTTTATCATTGCTTGCGTAATTTCCGTTAGCAAATTGCTTAGTTTTTATATTAAACTGCTTAATTTTTTGTATAAGTGGATTAATAAAAATACTACATATTAATAAGGTTAAACAGCTTGTAATTATTGTCGTTAAGGTCAAAGTTAGTGTCATATGGCCGTTAAACCACATTAAAATATATGCAATTGCTAAAATAGTTGAAGTTAATAGTATACTCGATACGACGCCAATAATGATTTGACTTCTAATTGATAACACCATTATCGGCTCCTTTCAAATTTATATCCTAATCCCCATACAGTTGTGATGGTATATGTTGTAAAGCTCTCTTTTTCTAATTTTTCTCTAATACGGTGTATATGGACATTCACGGTATTAGCATCTTCGTAATAGTCATATCCCCAAACTTTTTCAAGTAATTCTGATTTAGAAATAACTTCATTTTCTCTAGAAGCTAAATACCACAATAACTCAAATTCCTTAATACGCATAGGGACTTCGTGACCATTTACAGTCACAACTTTACTTAAGTTAATAAGTGTTAATTCATCAAACGACAGTTGTTCAACTGGTTGATGATGGTATTTCTTCATTCTTGTAAGTAAATTATTAATACGTAAAACGAGTTCCCTTGGACTAAATGGTTTTTTGACATAGTCATCTGCACCTAAAGTTAAGGCGTAAATGGTATCATGTTCTTGTGTTTTGGCAGTTAAATAGATAAAGGGGATATCTAATTTTTGCCTTTTCATTTCTTTGACAATGTCGTAACCATTAACTTCTGGCATCATGATATCAAGTACCATGATATCAATATCATTTGATAGTAAAGAAATTGCTTCTTTACCGCTAGTTGTCGTTGTTACTTTGTAACCTTCATATTCAAAATAGGTTTGACAAATGTCTACAATGTCTTGTTCATCATCCACGATCAGTAAGTGGGTCATCTATTTTTTCACCTCTGTTCTTACGACCTCTAAAGTAATTAATGATTTCTTTAAGTGAAATCTGTTTTAAAAATGAGTGACTCATTAGTAAAAGGATAAAGAAAGTTAATTGAAGAGGATACGTAAATATCATATCTGCTAAGATATAATTTATCATAACAAAGGCTCCAAAGAAACTAGCAGCATATGCAAAAACTCCAAAAATTAAACCTAATCCAATTGCAATCTCTCCGAGTGGGACAACAATATCAAATAATGACGTCGTATGTGCAACTATATTTGCGAAAAACCACTTATACCACTCTGGTGAATCAGTATTGTTAGCGATGACTGGTACTAAACCTTTCAGCGTAAATCCGCCCGTTAATTTTTCGTAACCTTGCATTAACATAACAATACCTGAACCCACGCGAATGATAAATGTAACGAGTAGCAATAATTTATTCATGATGTTCACATTCTTTCTATATTATTGTGTGTAATTTATATAAACATAAGATTAAGCAACATAATGCGATTTATAGTGTTATGTGAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTACAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTTAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAACTCAGAAATTGATTATTTTAATTTAGCGCCGCCGAAGATGACGTGAGCTTTTTTACAATAGATTGTTACTTCATCATATTTGCTTAAATCTACATTTTTAAGATCAAATGTTTGTTTTTCTTTATCGTAGTCAACCATTGCGATTTCTTTACCGTTTTTAATGTCACCATTTTTTGTTAGGTAGACGTATAAATCTGGACCTTTTGATGATTTGTAGTTAGTAAGCATTAATTTACCATTTTTAATCTCAGCTTTACCTTCAACAGTTTCACCGTTTTTAGAACTGAATGTACCTGTTAGATGTTTTGTTTTATCAGTTTTAACATTGCTATCTTCTGACTTTGTTTTTTGTTCAGTTTTGTTACCTTGATCTTGTGAATTAGAATTACCACAAGCGCCTAAAGCTAATGTTGTGATAACAGCACCAGCTGCTAAAAAATATTTTGTATTCATGCTAACTCCTCATTTCTTCAATTTGATAAGTTAAGTTTAAAATGAAGGCAAATAATATGCCATTAACTAATTCTTAACTTCGTTTAAATATCGCTTAACTAATATTGAAGAAAGAATAATTTGAAAATGAAAATAATTGTCTGATTTAAATAAATAGGAGTCAAAATAAGAGGAGGGCGGTTTTTTAAGTGAGAAAATATTTATCTAAACTAGTTATCACTATAAAACACTTCTGATATATCGAACTAATAATATCAGAAGTGTTTTATAGTTTTGGTATTAAAATTTATAAACCCTTTGCCACAATAAAAACAACAAGAAAATAAGATAGACGATTAAATACAAGTACCAATATGGTGTTAAAACCATCATAACGATAAATGAAATGTTAATAATGATAAGTCCTTTAATCATTAGTTTCTTTATTTTGTTATTATTTTCAGCAGTTTCATCTAAGTTATTAAATGTTGAAATAAACAACATAATACCACCAATGATGAAAATGGCAGGGGCTAAAAATGGAATAGACATATATATTGATTGTGTACTTGAAAAGTCGGTAACACGTTGCGTTAAACTGACAACAATCGTTAATATGATAGCAATAAATTTTTGGTCTGTAATGTATACAGGTTTTAATTTTTTATCAATGTAAAACTGTAGTATCGTCCAAATGATAAACATCGTTATAGTACACAGAGTAATAAAGTTATATTTATCAATTATGAATGTATTTATAAAGGCGTTTATAGTAATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTAATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGTAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCTTTTTTATTGCTCCAAAGTAATGTATGAAGTTGTGGTAACACATAAACGTGATTCATATCATTACTTTGCATAACTAAATCTACCAACTGCTCGTAGCGTTCTAACAACTTTTCGGTATGATTATCTACGCTGTCTGATAAATATGGGTTACCAACTTGTAAATAGAAGGGAATATCTGGATAACGGTGGTGTATCATTTTGGCAAAATCATAATCTTTATCGTCGAATACAACTACTTTTAAGTTTAATGAGGAAGGTACGCATTGTGTAATCACTTCATCTAACTTTTTTAAATCAGGTGTCATAGTTGAACTTGGTGGTTTTGGACTAATCGTTAAATCATCAATTTGTGTCATCCAAGGTTGGAATTTACTGCCTTGTGTCTCCAGTGCGCTGAAAATACCTTTATCTTGAAATAAGTCAACTAACTCTTGGATACCTTTAATTAATGCTGGGTTACCACCAGAAATTGTAACGTGGTTAAATAAATCGCCACCAATTCGTTTTAATTCATCATAAATTTCTTCAGCGGTCATGAGTTTTATATCGCTTTTAGCACTACCATCCCAAGTAAATGCAGAATCACACCAGCTACAGCGATAATCACATCCAGCTGTTCTCACAAACATCGTTTTTCTACCGATTACTCGACCTTCACCCTGAATGGTTGGACCGAATATTTCGAGTACAGGAATTTTAGCCATTAGTTACACCTGTTCCTTTGGTCTAAATACGACATAACTTGTTGGTGTTTCTCTTACAAATACTTGAATGCATTTTGGTTGGTGTTCGAGCGATGCCAAATTTTCTTTAACAATTTGATAAATTGTTTCCGCTACGATTTCAGTTGAAGGGATTTTGTTTTTAAAAGCAGGTAAGTTATTTAACAGTTGATGGTCAAATTTACCGTGTATCATCTTTTTCAAATGGCTAAAGTTCACTAAAAAGCCAGTGTCATCTAGTTTATCACCGACAATTGTTAAATTAACAAAGTAAGTATGACCATGGACATTTTGACAAATACCTGCTTCTTCACACGGAATGTGATGTGCAGCTGAAAAATTAAAATCTTTATTTAATTCGAATTGATATGGATGCGTTGTACTAGGATAGATTTGTTGTAACATTTTAAAGCGCTCCTTTACTTTCAAGATATTGATTTAGTCCACGTTGACGTAAATGACAAGCTGGACATTCACCACAGCCATCCCCAATGATACCGTTATAGCATGTTAATGTTTTTGTACGAATATAATCTAAAACTTCTAGTTCATCACTTAATTTCCACGTTTCTGCTTTGTTTAACCACATTAAAGGAGTATGAATAACAAAATCTTTGTCCATAGCTAGGCTTAATGTTACGTTCATTGATTTTATAAAACTATCGCGACAGTCTGGGTAGCCTGAAAAGTCTGTTTCACATACGCCTGTAATAATATGCTTAGCCCCAATTTGATAAGCTAGAGCGCCTGCAAACGACAAGAAAAGTAAATTTCTAGCTGGAACAAATGTATTAGGTATACCATCTTCATTATTAGTAATTTCCATATCATGTTGTGTTAATGCGTTTGGAGTAAGTTGTGATAATAATGACATATCTAAAACGTGATGTTTCATTCCTTGATCTTGTGCAATTTGTTTGGCGACTTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATGTTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTCCTATCATTAATAATATTAATAAAGAGGTTAATGGCATTGATAAGCCCGTTTTTAATTTATAAAATAAAAAAAGCCTATCTCCATAAAAGATAGACGAAAGAAATGGGTTGCTCCTATAATATATATTAAAGGTTTACCAACGAATGTTTGAAATTTCAATGTCTAGTTTTTTATAGAGGGTTTCAGCTAGGAACCTCTGATATTCATTTATGTACGATGAATAGAATATACCATATATTAGTTAAAATCAAGGTCAGGATAATGACAATGCTTTTAAAGTTTTAGCTACATCCAATACATATTATAAAAATAAAACACATTTAGAACGGAGTATACAATGATTCTAGTCATAGATAATAATGATTCATTTACATATAATTTAATAGACTATATTAAGACTCAAACGAAACTAACAGTTCAAGTTGTTGGTATTGATAATCTGCTGATAGAAGACGTCATTAATATGAAGCCAAATGCAATTGTTATTTCACCTGGGCCGGGTAATCCGGATGATTATCCTATCTTGAATGAAGTGTTAGAACAATTTTATCAGCGTGTACCTATCCTAGGTGTATGTTTAGGATTTCAATGTATCGTGTCTTATTTTGGTGGAAATATCATTCACGGCTATCATCCTGTACACGGACATACTACACAGTTACGCCATACCAATGAAGGTATTTTTCAAGGACTGCCTCAAAATTTCAATGTAATGCGTTATCATTCATTAATTGCTGACGGAGCGACTTTTCCAAATTGCTTAAAGATTACAGCAAAAAACGATGAAGCGATTATTATGGCATTTGAGCATATTACATTTCCGGTTTTTGGTGTGCAATATCATCCTGAATCTATTTTGAGTGAATACGGTTATCGACAAGTTGAATTATTTTTATCGAAGGTAGGTGATTACTGTGAGAATAGAATATAATTATCGCTACTATTTAACTGAAAATGAATATAAGCAATACCATATTCAATTAAAGGGATTTATAAAGAAGTATGTTGCCACTAAATTGGCTGATGTGGGAGAAGTGATACACTTTGCACAAGCGCAGCAACGACAAGGTAGATATGTTTCGTTATATTTAAGTTACGAAGCGGCAAAGTATTTTAATCATGTTATGTGTACACATTCATTAGCTAAAGATGATATTTATGCAGTAGCTTATAGTTTTGAAAAAGCGGAAAGCATAAATTCAACATATGAACATCAAACTTCTTATGTATCAAAGCATCATTTTTCATTTGTTGAATCTTCTGAGGTTATGATGACTAATATTAAACGTGTCCAACAAGCAATTGTTGAAGGCGAAACGTATCAAGTGAACTATACGGCGCGCTTAACGGATAACATTTATTATCCTATTAGTACTTTATATGAACGATTAACTCAATTTAGTAATGGTAATTATACTGCGTTATTACAAACAGATGAAATCCAAGTAGCGTCTATCTCACCAGAATTATTTTTTCAAAAAGGACAGTTTAACAATGTCGATAACGTTATCATAAGCAAACCGATGAAAGGGACAATGCCTAGAGGTAAAACGGAAGCTGAAGATCAACAGTATTATAAAACATTGCAAACTTCTTCGAAAGATCGTGCAGAAAATGTCATGATTGTTGATTTACTAAGAAACGATATAGGGAGAATATCACAGAGTGGCTCAATTAAGGTGTATAAACTATTTTTCATTGAGACATATAAAACTGTATTTCAAATGACTTCGATGGTAAGTGGAACTTTAAAAACTAATACAGACTTAACTCAAATTTTAATATCGTTATTTCCTTGTGGTTCGATTACAGGTGCACCGAAACTGAATACAATGAAATATATTAAACAATTAGAAAGTTCACCTCGTGGTATATACTGCGGAGCAATTGGACTATTACTTCCAACTGAAGATGATAAAATGATTTTTAATATTCCGATTCGTACTATTGAGTATAAATATGGACAAGCGATTTATGGAGTCGGAGCAGGTATTACAATTGATTCTAAGCCAAAAGATGAAGTAAATGAATTTTACGCAAAAACCAAGATTTTGGAGATGTTATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_017337|766342:774163|771415_772084_-|WP_000446724.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL >NC_017337|766342:774163|772434_773028_+|WP_000604519.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDVINMKPNAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDEAIIMAFEHITFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI >NC_017337|766342:774163|770277_770991_-|WP_001062977.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKSDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVITQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >NC_017337|766342:774163|767397_768084_-|WP_000149344.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR >NC_017337|766342:774163|773011_774163_+|WP_001217799.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHVMCTHSLAKDDIYAVAYSFEKAESINSTYEHQTSYVSKHHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIETYKTVFQMTSMVSGTLKTNTDLTQILISLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML >NC_017337|766342:774163|768058_768532_-|WP_001037806.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIVVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSFLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG >NC_017337|766342:774163|766342_767398_-|WP_000244415.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCSEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENKDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS >NC_017337|766342:774163|768874_769315_-|WP_001093553.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAAGAVITTLALGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK >NC_017337|766342:774163|770994_771414_-|WP_000941336.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV >NC_017337|766342:774163|769594_770179_-|WP_000637684.1|DBSCAN-SWA MIVYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNNLDETAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQRVYKF |
10 | Hokovirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
786135 : 800515
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_017337|786135:800515|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_017337|786135:800515|799753_800515_+|WP_000616871.1|DBSCAN-SWA MIQVGNLTKTINNQMILEDISIDIEKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAICRLIRFDNGEVKIDGRLMSDYKNNDLSKKISILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRLTKEDHDIVNDALDLLQLQDIRNRNIKSLSGGQRQRAYIAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHAVQIMQTLKMLAHKMNKAIVIVLHDINFASCYSDQIVALKNGQLVKSDLKDNVIQSNVLSDLYDMDIQIEHIRNQRICLYFKD >NC_017337|786135:800515|797842_798814_+|WP_000876318.1|DBSCAN-SWA MKYLLKGNILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDLLHLTESQRNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSICGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ >NC_017337|786135:800515|794278_796384_+|WP_000855505.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >NC_017337|786135:800515|792250_793117_-|WP_001068497.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK >NC_017337|786135:800515|798800_799757_+|WP_001245577.1|DBSCAN-SWA MRNNNKKIMLLIAVTLLISMLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQAITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVLPVFLFGIQSVWVTNVYLNFILTLITMVLFALILFQGIFKIGHFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVLLVILLVITILLLPYLDVLLLGRAEAINLGISYEKLTRILLVIVSVLVSVSTALVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWVVENVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVRRRNAQ >NC_017337|786135:800515|786135_787194_+|WP_000663023.1|DBSCAN-SWA MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISAHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNEDMSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPPHVPVIIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSKHFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE >NC_017337|786135:800515|788685_789603_-|WP_000429015.1|DBSCAN-SWA MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMTHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLTIDDKTYSGETTMILSANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEIIPNAIQLLTVNDL >NC_017337|786135:800515|791736_792231_-|WP_000930021.1|DBSCAN-SWA MAHGRQQDELQDITLLGNQNNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKNR >NC_017337|786135:800515|796501_797473_+|WP_000562498.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >NC_017337|786135:800515|787591_788140_+|WP_000197263.1|DBSCAN-SWA MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPHAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEKEK >NC_017337|786135:800515|797648_797768_+|WP_014532584.1|DBSCAN-SWA MFYFTLSKQNTHSEKLNFSLIANINKIDTKLFERLLKLG >NC_017337|786135:800515|789884_791390_-|WP_000193751.1|DBSCAN-SWA MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >NC_017337|786135:800515|793917_794316_+|WP_000692523.1|DBSCAN-SWA MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVNEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY |
13 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
973275 : 1025290
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_017337|973275:1025290|DBSCAN-SWA 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51 | Streptococcus_phage(33.33%) | tRNA,bacteriocin,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1045245 : 1053718
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_017337|1045245:1053718|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_017337|1045245:1053718|1053151_1053718_+|WP_000238666.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNEDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRQCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >NC_017337|1045245:1053718|1045245_1045728_+|WP_001807178.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARKRGIDIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILAARMLSIQNSSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ >NC_017337|1045245:1053718|1047811_1048483_+|WP_000666804.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELKIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >NC_017337|1045245:1053718|1048475_1050665_+|WP_000032749.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKNYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKVVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGVLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >NC_017337|1045245:1053718|1047546_1047810_+|WP_000848350.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLDDEKENA >NC_017337|1045245:1053718|1052120_1053149_+|WP_000030806.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVEEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIDKNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDVSRALKILAEQNVEAYQIGRIVKNESTAIEFLGV >NC_017337|1045245:1053718|1050643_1052128_+|WP_000483713.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >NC_017337|1045245:1053718|1046842_1047547_+|WP_041204363.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGIENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHIKLLNIATDKDIETLKTKALEINQVLKKLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATNANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK |
8 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1105192 : 1132876
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_017337|1105192:1132876|DBSCAN-SWA 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57 | Staphylococcus_phage(65.38%) | portal,tail,protease,capsid,terminase,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1137439 : 1147112
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_017337|1137439:1147112|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_017337|1137439:1147112|1146566_1147112_+|WP_000136401.1|DBSCAN-SWA MTEIWKDVINYEGYYMVSNMGRVKSLKRVVKHGGSVTRTYPTVILKPNKVAFDYFQVTLNKNSIRKSRYVHNLVMEAFVGEKKLGYEVNHKNEDKSDNRLENLEYITSKENNNYGTRIERSIKKSTNGKRSKKIKGTHIITGEEVYFPSIAEAKRQGYGNHISDAIRGKRNHCYKYKWEFI >NC_017337|1137439:1147112|1137439_1138924_+|WP_000567409.1|tail|DBSCAN-SWA MIDTIKVNNKTIPWLYVERGFEIPSFNYVLKTENVDGRSGSIYKGRRLESYSFDIPLVVRNDYLSHNGIKTHDDVLNELVKFFNYEEQVKLQFKSKDWYWNAYFEGPIKLHKEFTIPVKFTIKVVLTDPYKYSVTGNKNTAISDQVSVVNSGTADTPLIVEARAIKPSSYFMITKNDEDYFMVGDDEVTKEVKDYMPPVYHSEFRDFKGWTKMITEDIPSNDLGGKVGGDFVISNLGEGYKATNFPDAKGWVGAGTKRGLPKAMTDFQITYKCIVEQKGKGAGRTAQHIYDSDGKLLASIGYENKYHDRKIGHIVVTLYNQKGDPKKIYDYQNKPVMYNKDRIVVYMRLRRVGNKFSIKTWKFDHIKDPDRRKPIDMDEKEWIDGGKFYQRPASIIAIYSAKYNGYKWMEMNGLGSFNTEILPKPKGARDVIIQKGDLVKIDMQAKSVVINEEPMLSEKSFGSNYFNVDSGYSELIIQPENVFDTTVKWQDRYL >NC_017337|1137439:1147112|1144118_1144898_+|WP_000746437.1|DBSCAN-SWA MKKRKTAFILTLCIVIMLVTSPLVNGSEKSEEIKEKDLHKKSELQGVALDNLRQIYYHNGKAITENKESDNQFLQHTILFNGFFTDHPWYNDLLVDFDSKVLADKYKGKKVDLYGAYYGYQCAGGTPNKTACMYGGVTLHDNNRLTEEKKVPINLWLDGKQNTVPLETVKTNKKEVTVQELDLQARHYLHGKYNLYNSDTFDGKVQRGLIVFHTSTEPSVNYDLFGAQGQYSNTLLRIYRDNKTINSENMHIDIYLYTT >NC_017337|1137439:1147112|1143295_1143664_+|WP_135831022.1|DBSCAN-SWA MTTKVDGVKEELTTRVDDIEVLANETADHVLNLRQEHTEHHNELRESHKELKDKQEKVVDENLEQTKILNRIEERYQVQVDTAQKNEEKTLAQNKWLVGAIWALVTIVMIAVITASITALIP >NC_017337|1137439:1147112|1145477_1145915_+|WP_000354124.1|holin|DBSCAN-SWA MDINWKLRFKNKAVLTGLVGALLLFIKQITDLFGLDLSTQLNQASAIIGAILTLLTGIGVITDPTSKGVADSSIAQTYQAPRDSSKEEQQVTWKTSQDSSLTPELSTKAPKEYDTSQPFTDASNDVGFDVNEYHYGGGDNASKTN >NC_017337|1137439:1147112|1145098_1145275_+|WP_078061146.1|holin|DBSCAN-SWA MDRWWLSEYKEVVPMVALLKSLERRRLMITISTMLQFGLFLIALIGLVIKLIELSIKK >NC_017337|1137439:1147112|1138939_1142725_+|WP_000582146.1|DBSCAN-SWA MIHVLDFNDKIIDFLSTDDPSLVRAIHKRNVNDNSEMLELLISSERAEKFRERHRVIIRDSNKQWREFIINWVQDTMDGYTEIECIASYLADITTAKPYAPGKFEKKTTSEALKDVLSDTGWEVSEQTEYDGLRTTSWTSYQTRYEVLKQLCTTYKMVLDFYIELSSNTVKGRYVVLKKKNSLFKGKEIEYGKDLVGLTRKIDMSEIKTALIAVGPENDKGKRLELVVTDDEAQSQFNLPMRYIWGIYEPQSDDQNMNETRLRSLAKTELNKRKSAVMSYEITSTDLEATYPHEIISIGDTVRVKHRDFNPPLYIEAEVIAEEYNIISENSTYTFGQPKEFKESELREEFNKRLNIIHQKLNDNISNINTIVKDVVDGELEYFERKIHKSDTPPENPVNDMLWYDTSNPDVAVLRRYWNGRWIEATPNDVEKLGGITREKALFSELNNIFINLSIQHASLLSEATELLNSEYLVDNDLKADLQASLDAVIDVYNQIKNNLESMTPETATIGRLVDTQALFLEYRKKLQDVYTDVEDVKIAISDRFKLLQSQYTDEKYKEALGIIATKFGLTVNEDLQLVGEPNVVKSAIEAARESTKEQLRDYVKTSDYKTDKDGIVERLDTAEAERTTLKGEIKDKVTLNEYRNGLEEQKQYTDDQLSDLSNNPEIKASIEQANQEAQEALKSYIDAQDDLKEKESQAYIDGKISEEEQRAIQDAQAKLEEAKQNAELKARNVEKKANAYTDNKVKESTDAQRKTLTRYGSQIIQNGKEIKSRTTKEEFNATNRTLSNILAEIVQNVTDGTTIRYDDNGVAQALNIGPQGIRLNADKIDISGNREINLLIQNMRDKVDKTDIVNSLNLSREGLDINVNRIGIKGGDNNRYVQIQNDSIELGGIVQRTWRGKRSTDDIFTRLKDGHLRFRNNTAGGSLYMSHFGISTYIDGEGEDGGSSGTIQWWDKTYSDSGMNGITINSYGGVVALTSDNNRVVLESYASSNIKSKQAPVYLYPNTDKVPGLNRFAFTLSNADNAYSSDGYIMFGSDENYDYGAGIRFSKERNKGLVQIVNGRYATGGDTTIEAGYGKFNMLKRRDGNRYIHIQSTDLLSVGSDDAGDRIASNSIYRRTYSAAANLHITSAGTIGRSTSARKYKLSIENQYNDRDEQLEHSKAILNLPIRTWFDKAESEILARELREDRKLSEDTYKLDRYVGLIAEEVENLGLKEFVTYDDKGEIEGIAYDRLWIHLIPVIKEQQLRIKKLEESKNAG >NC_017337|1137439:1147112|1142714_1142867_+|WP_001153680.1|DBSCAN-SWA MQDNKQGLQANPEYTIHYLSQEIMRLTQENAILKAYIQENKENQQCAEEE >NC_017337|1137439:1147112|1142913_1143201_+|WP_001040261.1|DBSCAN-SWA MAKEIINNTERFILVQIDKEGTERVVYQDFTGSFTTSEMVNHAQDFKSEENAKKIAETLNLLYQLTNKKQRVKVVKEVVERSDLSPEVTVNTETV |
9 | Staphylococcus_phage(77.78%) | holin,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_9 |
1625638 : 1633950
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_017337|1625638:1633950|DBSCAN-SWA ATTAATTACAACATTCTCGATTATGCTGATGATCGACAAAACGTACAGGATGTCCATAAATTTTTGAAATTTCAACTTCATCAAGTGATTTAAACTCATCAGTTGTACCATGGAAATGCAAATGCTTATTTAAACATGCTACTTCAGTAGCAGTATCTGCTACAACACCAATATCATGAGTAACTAAGATAATAGTGATACCTTCTTGTTTTAATTGATCTAAAGTATTATAAAATTCACTTACATGTTTTGCATCAATACCATTCGTCGGTTCATCAAGTACTAATACTGCAGGTTCTGAAATCAATGCTCGAGCAATCATTACACGTTGTTGTTGACCACCTGATAATTCTGCTATATTTTTATGAATTAAATCACTTATATTCAGTCTTTCTAGTACTTTAATCACTTTTTCATTATCTTTGTTATTAAATGTTTGGAAAAGACGTTTTGTCTTTGTTAATCCGCTTAAAACAACTTCTTTAACACTTGCTGGGAAACCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATACATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTCACCACTTTGTAAAGGTAATAATCCTAGAATCAACTTCAATAATGTTGATTTACCAGCACCATTTGGTCCAACAATTGCTAAAAATTCACCTTTATTTATTTTAATGTTTATATTTTCTAACACTTTTTTATGATCATAGTAGTAATTGACATTTTTCAATTCAAAGACTGGTGTCATCGTATTCTCACCTCGCATTCAACTATACAACTCCTAGTAACATATGTAAACAGTAATGTTTACGACTCAAAATTAGACAAAATAAAGAGATATGCCCCCTTCAAGTTTTATTTATCGCATTTCTTGAAGAGAGCATTATCATTTTATTGTTGCATAACCTTATTTTTTAAATCTGGGTCAAATTGCTGTTGTTTTAACATTTCAATTTCAAGTTTATATGGCGGTTTTTTATTTTTCTTATCTTCACCAACATAAGGTGTTTCTAAGATTTTCGGAATATCTTTAAAACTATCATGATGCACAATGTAATTTAATGCATCAAAACCAATGTAACCGAAGCCAATATTTTCATGTCGGTCTTTTTGAGCGCCACGGTCATTTTTAGAATCATTGACATGAACAACTTTAATTCTGTCGACTCCAATGATTTTATCAAATTCATTTAATACGCCATCAAAGTCCTCTTTCACATTATATCCAGCATCATGCGTATGACATGTATCAAAACATACTGATAAACGTTCGTTATTATGAACTCCATCAATAATACGTGCTAACTCTTCAAACGAGCGACCAATCTCTGTACCTTTACCTGCCATCGTTTCAAGCGCAATACGTACATTATTGTCATTCGTTAAAACTTCATTTAATCCTTCAATAATCTTATTAATTCCGGCATCAACACCAGCTCCAACATGCGCACCTGGATGTAATACAATATCTTTAGCGCCTATAGCTTGCGTTCTTTCAATTTCTTGTTGCAAGAAATCTACACCAAGATTAAACGTTTCTGGTTTGGTTGTATTTGCAATATTAATGATGTATGGTGCATGAACAACAATATTAGATAAGCCATATTTTTCCATCACTTCATGACCTTTAGTTATATTTAAATCTTCAATACTTTTACGGCGCGTGTTTTGAGGTGCACCAGTATAAATCATAAATGTTGTTTCACCATATTCATGCGCTTCTATAGCAGAACCTTCTAACATCTTTTTACCACTCATTGAAACATGTGATCCTAATAACATAAAACACACCTAACCTTTTTTGTTTTGCTTACGTTTTTGTCTATTTTGCTGCTTACTAAATTGTTTACGCTCTTGACGTTTCATTTTTTCAACTTCTTGTTTAAATTTCTTCTTATAACCTGGTTTAACTTTGTTTTTAATTTTACTTCGAACTTTGTTCTTCACTTGATTAGTTAAATGGTCATCTTTGCGCATTCTTGCTTGACGCTGATTGTGCGCTTTAACTTCTTTTAACTCACCATCTTTAATATCAACAGTATTGAAAACAAAACCTCGATCTTCTATTAATGAAATATTGTGTTCTTCATCAGGACTATAAAGCGTAATTGCTACACCTTTATAATTCCCACGGCCAGTTCGGCCGACTCTATGTGTAAAGAAGTCAATATCATTTGGCACATCAAAATTGATGACATGACTAACACCTTCAATATCAATACCACGAGATGCTAAATCGCTGGCAATAACGTATTGGAATTCTAAATTACGTATACGTTTCATTTGTTGTTTACGTTCACGTGGCGTTAAACCACCATGAATCATACCAACTTTAATACCAGCTTCATTTAGTGAACGTGCTAAATCATTTGCATTATCTCTACTATTACAGAAAATAATACATAAGTATGGATTTAGTATATCAATTAAATTTAAAGTCTTTTCAACTTTAGCTGCACCTTTAGTAGGTATTAAAAAGAATTCGATGTTCTTTTTATTTTGTTTTTTACTGTCGACAGCTACATATTCTGGATGACTTAAATATTTATTTAAAAATGGTTGTAACTGTTGTGGAATTGTAGCACTAAACACCGCAATATTTGCATTATCTTCCAATCTTGCAGCAATGTAATCTACATCTTCAATTAATCCTAAGTCAATCATAAGATCCGCTTCATCAATAACTAAATATGATGCTAAGTGCACATGTAAATGTCCCGTTTTAGCTAAGTCATTAATTCTAGTAGGGGTACCTATAATCAATTGTGGTTGTGCATTACAACGTTGTCTATCTTTCTCTATATCTGTACCACCAATAAAAACTTTAACTGAAACACCAGCTTTAAATTGGCTTAAATGGTTCGCTGCATCGTATAGTTGTTGTGCAAGTTCTCTTGTTGGTGCAACTACGATTGCTTGTGGTTCTTTTATTTCACTATCAATTAACTGCATTAATGGTAATAAAAATGCATGAGATTTCCCTGTACCCGTTTGAGATTGACCAATTAAATTTGTTCTCTTTAGTATTCTTGGAATAATTCGATTCTGAATTTCAGTTGGTTTTTCAAAATTAAGGTCTTTCACAGCGTCAATTAAACTAGATTCTAGATTAAATTGTTCGAATGGATGTTTTGCCATGATTTGGCCTCCTTATATGTTCATCTTTACTATTATAAAGTATAAATGTGCTATTTTAAATAAAAATATTAAAACCTCGAAATTTCAAAATTTAGAAATCCCGAGATTTTAGTTTAAATATATTGAAATGGATCTGTATTAATTGTAGATGCTTCAACATCTATATTTATTTTTTCTGTATTGAACCAATTCATTAGTAACGTTTTTAAACCTTCTTTCATCACATATTCGCTGTAATGATTAATATCAATTAAGTTCACACCATGAATTTTAGCATCTAAGGCATCATGATGTTTAATATCACCTGTAACAAAGACATCTGCGCCTTGTTGAACAGCTTGATATTCATATCCAATACCTGAACCACCAATAATTGCAATACGTTTAATTTTCTGATTAGACTCACCAACAAATCGGACACTTGGGATATTTAATTTAGATTTAATATCAGCTGCGAAATCTTCCAATGTCATTTGATTATCCACTTCTGCCATAACGCCAAGTCCATAAAGGGATGTTTGTTTTATCTCAATAAAATCAAATACCGGTGTTTCATATGGATGGTATTGTTTAATTAATTGCTCAGCCCTTGACTTTTGACATGCATCTATCATAAATTCAATTTTAACTTCATCTACATATTCAATTTTATCAATTTGTCCTATTGTTGGATTAGCTTCACCAACTGGTTTGAATTGCCCTCTTCCTTCACTTTCAAAGAAACAATATTCATAATTACCTTCTTGTGCTAATCCATTTTCACTAAGCTTATCTTTAAATGGTCCAACATTATCCTTAGGTATATATGTTTGAACTTTATAGTATACATCTTGTTGATTATTTATTATTGAAATGTTCTTCAATCCCATCGCCTTCGCCAACATCATATTGACACCATGAGGATTTACATCTAAATTTGTATGCATCGCTATTAAATTAATGTCATGTTGAATTAGTTTTCTAATAATTAAACCATAACCATTAGCTTTTAATGATGTTACACCTTTAAAGATTAGAGGATGATGACTAATAATAGTATTATAACCTTTTTCGATTGCTTCATTTACTACTTCCAACGTACAGTCTAATGCTGTTAAAACACCAGTAACTTCAACATCTTCATCACCTATTAACAATCCTACATTATCCCAAGATTCAGCAGTTCTAAATGGCACATGATGATCTAACAATGTCATTAAATCAGCTATTTTCATTACTATAACACCCTTTCAATTACAGCAATTTCGTCATTAATTTGAGCTAAACGTTGATGATGTTGTTCAGTATTGAGTTTCGATTTAATATGATAAAGTGCTTCTAACTCTCTTTGCCATTTTTTTATAAAATATTCATTTTTGTTGTTCAGCAATTTTGGTCCGAATTTCAATTCATCAGATGATAGCTCTATTAATTGCGTAGAATATTCTGCTACAACAATTTCATAAATATGGCCTTTTTCTTCCATTATTATTTCATCAATTATTTCATAATTCAATTGTTGTAATGTTTGTCTTAAATTTTCAGTTTGGATATTACTTTGTAAAATCAACCTTGGATGTTGACTTAACTTATCTTGCCCATCTTTTAAAATTTTAGCAATAAGTGGTCCGCCCATACCACAAATTGTGATATTATCGATTACGTCCTCAGGATTAATAACACTTAAGCCATCCCCTAAACGTACATCAATTCTTTCTACTAATTGATTTGCAGCTACATTTTTCACAGCAGCTTGAAAAGGGCCTTGAATAACTTCTCCTGCAATACCATAATCGCATAAATGGTTTTGAATTGCATAGATTGGCAAATAAGCATGATCTGAGCCAATATCCGCGATTGTACCTTGTTTTAAAAATCGACTTACCGTTGTTAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCATAAAGTCTTTCAAACGTTTACTACGACTTGGATGTCTTAATTTTCTAAGTGCTTTTGCTTCGATTTGTCGAATACGTTCACGTGTAACACCGAAAACTTTACCAACTTCTTCAAGTGTTCTTGTTCTGCCGTCATCAAGACCAAATCTTAATCGTAATACATTTTCTTCTCTATCAGTTAATGTATCAAGCACATCTTCTAATTGCTCTTTTAATAATTCATAAGCAGCATGATCTGAAGGGCTTTGTGCTTCCTGATCCTCAATAAAGTCTCCTAAATGACTATCATCTTCTTCACCAATTGGCGTTTCTAATGAAACTGGTTCTTGCGCAATTTTTAAAATTTCACGAACTTTTTCTGCTGGTAAATCCATTTCTTCACCAATTTCTTCTGGTGCTGGATCTCGACCTAAGTCCTGTAATAATTGACGTTGAACACGAATTAATTTATTAATTGTTTCTACCATATGCACAGGGATACGAATCGTACGTGCTTGGTCAGCAATTGCACGAGTGATTGCTTGTCTAATCCACCATGTTGCATATGTTGAAAACTTAAATCCTTTGTTAAAGTCAAATTTTTCAACAGCTTTAATAAGACCCATATTACCTTCTTGGATTAAATCAAGGAATAACATACCGCGACCTACGTATCTTTTAGCAATACTTACAACTAAACGTAAGTTCGCTTCTGCAAGTCTTGATTTTGCTACTTCATCACCTTGTTCAATACGTTTGGCTAATTCGATTTCTTCTTGTGCACTTAATAAGTTAACACGCCCAATTTCTTTAAGGTACATACGAACTGGGTCATTTATTTTAACACCTGGAGGGGCACTAAGATCACTTGGATTCAGTTTCTCGTCAGTATCTGAACTATCTTTTTCATTAACTAGTGAAATATCATTATCATTTAATTGATCAAAGAAATCATCCATTTGATCAGAGTCGATATCGAAATTCTGAAGTTTTTCAGCAATTTCTTCATGACTTAAATGACCCTCTTTTTTACCTTTTTCAATTAATTGCTTCTTAACATCTTCTAATGTTAATGTCGGATCAATTGTTTGTTTTTTAATTTTAACTGTGTTATCAGACATGAAACGGCCTCCCGATTTTAAATATGAACATTCGAAATTTATTCAATATTGCTATTTTAAACTAAATTCTTAATTAATTCATCCATATTTTTAATTTTATTTTACAAATAGGAACTAATCCCAATATTTATTTTTCAATAGTGTTGTTTAAATGCGGTAACTATCATTTACCCTTATACATTTTGACATAATCATTATTCGTATTATTCTTTAAAATCACATGCTACATGCGTTCCTTATTCTTAGCAACAATTTGCTGTAAATAGTATTTCTGTAATTCTACATCGCCAATCCTTGTAGCTTCCCTTAATTTATGATTCAATGACTCAATTGTTTCTTGTCCGTTTTCATTAATAACATTGACATAATCATCAATTTCATTTTCATATGGTTCATCATTCAAACTATATTGTTCTAAACTAATTAGTGTTTCTCTCAACTCATTTGAATTAACATACTGCACAGCATCACTGATATTATATTGATCATTTTCCGCATAAAAATCATGTAAGACTTCGAATACATATTTAAAATGCTGATTTGTGAAGTTATCCTTATCAACACTTTCATAATAATTTAAAAATGTATCTTTATCTCTCATTAAATGTTTTAAAAATGCTCGCTCCGCTTTTTCTTGACGGCTCAAATTGTCAAATTGTGCCATACCAATTGGCTCAGGTTCAATATAACCGCCATACTCATCTTCTGGATAATAATTGGCTGGTGCTTGATTGAATTGTATTTCGTTAGCTAATTGCTCAGGACTAACATTGAAAAATGGCGCAACATCATTTATAGCCTTTTGTTGTAGAATTGATGACTTCATAAGTGAAATGTCATGACTCAGTTCTTTCAAATAACGTTCATATGAAAGGTCATTATGTGCAATTTCATCTTTTAATATACTCACTTTATAATGTGCAAATGACTTTTTGTCATTTTTTACAAAAGCAGTAAATGCGTCGTTGCCATACTTACCAATGTATTCATCAGGATCCATGCCTGATGGCAATTGTATAACAAATACATTTAGCCCTTGCTGTAACAAATGTTGACCTGTTTTAAGTGTTGCTTCACTACCCGCAAAATCCCCATCAAACATTAATGTTATATTTGATGTTAACTTTCGTATAAAGGTAATATGTTCATCTGACAACTGTGTACCCATTGTTGCAACAACGTTTTTCAAGCCAGCAGTATCAGATTTTATAACATCCATAAAACCTTCTAGTAATACAATTTCATCTAATTTTCTAATTGATTTACGTGCTTTATCTAAGTTATATAACAACTTTCTTTTTTGAAAGATAGGTGTTTCAGGACTATTTAGGTATTTTGGTTCTTGACCGGTATATGTTCGACCTGAATATCCAACAATTCTTCCTTGCGCATTTTTCAAAGGAAACATAATACGATTTCGAAATCTATCGTAATAACTGAAGTTTTCTTCGTTACGTGATAATAATCCGGCTTCATATGCTAATTCAATATCGTAACCCTTTTTTTGAAGAAAATCATGACAAAAATGTGAGCTATCGGGTGCAAAGCCAATGCCTCGCTCTTTAATAAGCGCATCTGTAAAACCACGTTCTTGTAAGTATGTTAATGCTTGTTCGCCTTCGACTGTCTTTGTTAAAGCGTAATAATAAAATTCTTGTATTAACTCATGCATTTCAATCATTTGTAAATCATCAGAAGCAATTTGAACATTTGAGTTAGATTGTGTTGCCTCAATATCTACAGCAACATTAACTCTATCACCTAATTCTTTAACCGCTTCAACAAATGATATGTCTTTAATTTCTTGAGTAAATTGAAAAACATTGCCACCTTTTTTACAACCAAAACAATGACAGATTTGTTTATCTTCAGAAACTGTAAATGAAGGTGTCTTTTCATCATGAAAAGGACACAAACCTATATAATTGCGTCCTCTCTTTTCTAATTTTACATATTCACTTACCAAGTCTAAAATGTCGGTTTTATCTTTTATTTCATTAATGATCGATTGATCTATTCGCAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_017337|1625638:1633950|1625638_1626424_-|WP_001213904.1|DBSCAN-SWA MRGENTMTPVFELKNVNYYYDHKKVLENINIKINKGEFLAIVGPNGAGKSTLLKLILGLLPLQSGEIFVEGIDFKNKKTSIKLSYVSQKANAFNSGFPASVKEVVLSGLTKTKRLFQTFNNKDNEKVIKVLERLNISDLIHKNIAELSGGQQQRVMIARALISEPAVLVLDEPTNGIDAKHVSEFYNTLDQLKQEGITIILVTHDIGVVADTATEVACLNKHLHFHGTTDEFKSLDEVEISKIYGHPVRFVDHQHNRECCN >NC_017337|1625638:1633950|1627449_1628796_-|WP_001062177.1|DBSCAN-SWA MAKHPFEQFNLESSLIDAVKDLNFEKPTEIQNRIIPRILKRTNLIGQSQTGTGKSHAFLLPLMQLIDSEIKEPQAIVVAPTRELAQQLYDAANHLSQFKAGVSVKVFIGGTDIEKDRQRCNAQPQLIIGTPTRINDLAKTGHLHVHLASYLVIDEADLMIDLGLIEDVDYIAARLEDNANIAVFSATIPQQLQPFLNKYLSHPEYVAVDSKKQNKKNIEFFLIPTKGAAKVEKTLNLIDILNPYLCIIFCNSRDNANDLARSLNEAGIKVGMIHGGLTPRERKQQMKRIRNLEFQYVIASDLASRGIDIEGVSHVINFDVPNDIDFFTHRVGRTGRGNYKGVAITLYSPDEEHNISLIEDRGFVFNTVDIKDGELKEVKAHNQRQARMRKDDHLTNQVKNKVRSKIKNKVKPGYKKKFKQEVEKMKRQERKQFSKQQNRQKRKQNKKG >NC_017337|1625638:1633950|1632150_1633950_-|WP_001217248.1|DBSCAN-SWA MRIDQSIINEIKDKTDILDLVSEYVKLEKRGRNYIGLCPFHDEKTPSFTVSEDKQICHCFGCKKGGNVFQFTQEIKDISFVEAVKELGDRVNVAVDIEATQSNSNVQIASDDLQMIEMHELIQEFYYYALTKTVEGEQALTYLQERGFTDALIKERGIGFAPDSSHFCHDFLQKKGYDIELAYEAGLLSRNEENFSYYDRFRNRIMFPLKNAQGRIVGYSGRTYTGQEPKYLNSPETPIFQKRKLLYNLDKARKSIRKLDEIVLLEGFMDVIKSDTAGLKNVVATMGTQLSDEHITFIRKLTSNITLMFDGDFAGSEATLKTGQHLLQQGLNVFVIQLPSGMDPDEYIGKYGNDAFTAFVKNDKKSFAHYKVSILKDEIAHNDLSYERYLKELSHDISLMKSSILQQKAINDVAPFFNVSPEQLANEIQFNQAPANYYPEDEYGGYIEPEPIGMAQFDNLSRQEKAERAFLKHLMRDKDTFLNYYESVDKDNFTNQHFKYVFEVLHDFYAENDQYNISDAVQYVNSNELRETLISLEQYSLNDEPYENEIDDYVNVINENGQETIESLNHKLREATRIGDVELQKYYLQQIVAKNKERM >NC_017337|1625638:1633950|1628909_1630010_-|WP_000683917.1|DBSCAN-SWA MKIADLMTLLDHHVPFRTAESWDNVGLLIGDEDVEVTGVLTALDCTLEVVNEAIEKGYNTIISHHPLIFKGVTSLKANGYGLIIRKLIQHDINLIAMHTNLDVNPHGVNMMLAKAMGLKNISIINNQQDVYYKVQTYIPKDNVGPFKDKLSENGLAQEGNYEYCFFESEGRGQFKPVGEANPTIGQIDKIEYVDEVKIEFMIDACQKSRAEQLIKQYHPYETPVFDFIEIKQTSLYGLGVMAEVDNQMTLEDFAADIKSKLNIPSVRFVGESNQKIKRIAIIGGSGIGYEYQAVQQGADVFVTGDIKHHDALDAKIHGVNLIDINHYSEYVMKEGLKTLLMNWFNTEKINIDVEASTINTDPFQYI >NC_017337|1625638:1633950|1626549_1627440_-|WP_000924213.1|DBSCAN-SWA MLLGSHVSMSGKKMLEGSAIEAHEYGETTFMIYTGAPQNTRRKSIEDLNITKGHEVMEKYGLSNIVVHAPYIINIANTTKPETFNLGVDFLQQEIERTQAIGAKDIVLHPGAHVGAGVDAGINKIIEGLNEVLTNDNNVRIALETMAGKGTEIGRSFEELARIIDGVHNNERLSVCFDTCHTHDAGYNVKEDFDGVLNEFDKIIGVDRIKVVHVNDSKNDRGAQKDRHENIGFGYIGFDALNYIVHHDSFKDIPKILETPYVGEDKKNKKPPYKLEIEMLKQQQFDPDLKNKVMQQ >NC_017337|1625638:1633950|1630820_1631927_-|WP_001283055.1|DBSCAN-SWA MSDNTVKIKKQTIDPTLTLEDVKKQLIEKGKKEGHLSHEEIAEKLQNFDIDSDQMDDFFDQLNDNDISLVNEKDSSDTDEKLNPSDLSAPPGVKINDPVRMYLKEIGRVNLLSAQEEIELAKRIEQGDEVAKSRLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNMGLIKAVEKFDFNKGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVQRQLLQDLGRDPAPEEIGEEMDLPAEKVREILKIAQEPVSLETPIGEEDDSHLGDFIEDQEAQSPSDHAAYELLKEQLEDVLDTLTDREENVLRLRFGLDDGRTRTLEEVGKVFGVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKRLKDFMD >NC_017337|1625638:1633950|1630012_1630690_-|WP_000624575.1|tRNA|DBSCAN-SWA MISLNNRLTTVSRFLKQGTIADIGSDHAYLPIYAIQNHLCDYGIAGEVIQGPFQAAVKNVAANQLVERIDVRLGDGLSVINPEDVIDNITICGMGGPLIAKILKDGQDKLSQHPRLILQSNIQTENLRQTLQQLNYEIIDEIIMEEKGHIYEIVVAEYSTQLIELSSDELKFGPKLLNNKNEYFIKKWQRELEALYHIKSKLNTEQHHQRLAQINDEIAVIERVL |
7 | Staphylococcus_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1703356 : 1712399
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_017337|1703356:1712399|DBSCAN-SWA TTTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATTTCAATTCAATTATAAATGCAATACCTACTACGATACCGCCTAATTTTTCGACTAATTTTATTGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTTAAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCTAACAGGTGCAAAGCCAATCCCCATTGAATAAGCTACTGGACAGCCAATGATAAAGCCACGCGCTTCAGGTCCTACAACGATATCAACATCTCTGTCTTTTGCGTATTCTACAATTTTATCTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATAATAATTGCTTTTCAACATCCATACGTTGTTGTCTTAATTGATACACTTTGCTGGAATCAATCGATCTTTTATCAGGTTGTTGATTGATTCGAATTAAACCATCTTCTTGTGTTACAAAATTTAAGTCTAAGAAAACTTTCAATATGAATTTAAGTGTATCTGGTTTCACACTTAAATGTTGACACAATAACATACCCTCTTTCTGGATATTTGTTTCTTGTTTAGTTATTAATGCTTTATAGCACTTTTTAAAAACATCCATATTAGGTATACCATCGAAGTAAATCGAATGATTATGTTGTAAAACTATATAAAGTTGAGAAAATTGCAGTTGTTGCAGGGAATTAGACAAATCTTCCATTGACGTTGGTAAATCTCTTAATACTACTTTATCAGTTTGTTGTTTAATTTCTTCACCATAATAATATTCATTCGCATTTACTTTATCACTTTTAGGATGAATAAGCACGACAATATTTTTATCATTTTCTGTAAAAGGTAAACTTTTTCGCTTACTTCTATAATCTAATATTTGCTGTTCGTTCATCGCAATATCTTGAATAATTAATTGCGGTGATTGATTACCATTCCATTCGTTGATTTGAACAGAACCTAATATATTAATTGGTTGTTCATCTTGTAACTCAGGTTCTAAGTGTCCATTTTGCCAAAATAGTGCGGCGATATTACTTTCACCAAGTGTCAATTTTAGATGATTTTTTTGTTGACCTATCGCCTTAACTGAAGAAACTGATAAATCATCCATTTCAAAAATAGGTCTAGAAAAATCTGTTCCGAAGGGTCTTAAACGATTCATATCACGAATATTTTTAATCGTTATATCATTTTCTGTTAATAATACATCTACTGGCTTTACGGGATCTAACGAAGTTGTTTCAGATAATTCTTTCATCCATTTATTTAAACCTTCAGCTAACGATTCTATATTTTCAATATCCATCGTCATACCTGCAGCCATATGATGGCCGCCAAATTTAGCGATTAACTCTTGGTGTGCTGATAGTATTTCAAACATCGACACTTGATCAATTGATCTGGCGGAACCTTTTGCATGATTTTGCTCCCTATCAATATTTAAAATTAATGTTGGCAAAGCAAACGTTTCGACAATTTTCGAAGCAACAATACCTAAGACACCTTCATGCCAATTTTCTTTTGCTAAAAGTAAAAATAAATCTCCATTTTTAACTTTCATTTCTGCCATTGCCATTGCTTCTTCTGTGATAGTTGCTACAATATCTTTTCTTTCACGGTTAAAATGTTCAACTTGTTCTGCTAAAAATGCAGCTTCTTCTTCGTCGTCAGTCATCAACAATTCGCAAGCTAATGATGCGTCATCTAAACGACCTACAGCATTAAGTCTAGGTCCAATAATAAAACCAATTGTTTCTTCATCAATATTGTCATTGTATCCCGCTTCTTTTAGCAATGCTTTAACAGAGGTCGGACATTGATCATTTAAGACTTTTAATCCTTGTTTCACTAATGATCGATTTTCATCAGTTAAGGATACTAAATCCGCAATGGTACCTATCGCAACTAATGCTTTAAAATAGTCAGGTACATTTTCAATCAATGCTTGTGCTAATTTGTACGCAACTCCTGCACCACACAATTGTTGGAACGGATAATTAAACGATGGATGCATTGGATGTACGATTGCATATGCTTCTGGTAATGTACTACCAATTTCATGATGATCAGTTACAATGACATCAACTCCTAAATCTTGAACCATTTTAATTTCATTATGACCTTGTATGCCATTATCAACAGTTATGATTAATGTTATGCCTTCATCATGAGCATTTCTAAATGCTAGTTCGTTTGGTCCATATCCTTCGGTAAAGCGGTTAGGAATATGCCATCCTACTTGTGCACCTAAAAGTTGTAATGTTGTCACTAAAATTGTAGTTGAGGTAACACCGTCGGCATCGTAATCACCATAAACTAGGATTTTCTCATCATTCGCTATCGCTCTTTTAATTCTTTCAATAGTCTTTGTCATATCGCTCAATTGCAATGAATCATGATTGATATCTGTATCTGAAATGATGGATTCAATTGCTTGTTCATCAATAATCGATTTACTTTCTAATATTTTTTTTACGATTGGCGTTAACTTTAATTTTGATGTTAATTCATCACTTATGTATTCAGTTGGTTTAATTAATTTCCACTTATACTTCGGTTTAATCATATATATTTACGCCTCATTTCCAAAAGACATTATATCTAAAATTACTTTAAATAAAAAGCACTTATCTAAATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTATATATATTTTGTTAAATTTAAACAAAGTAAAAAGCGGTATGTGAACTCTTTATTGTTTCACATACCGCTTAATTCATTTTAAACTAAAATCTTTTCATCGTTCGATTTCTTTTCTTTATATACAACTAATTTGTGTTTCGGCGATTTTTTCAACTGACGTTTTTTCATCATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACAATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCAAACGTTACGATTGTATCATTAATTGAATAACCGACAATTGTTAATACAGCGGCGATAAATGTTAAATCTACTTCAATTCTAAATAAACTGAAAATCGCTACTATAATGAATACATCATGTAATAATGCCAATACAGATGAAAGACCCATGCGCCATTCAAATCGTAATGATACATAGATGATGATACCTATCGATGCATAGATTAATGCAAGCATTGCATTTTTTGCTAATTCCTGTCCAATAATTGGTGATACAGTGTTAATTTGAGGTGTGTCACCGAATTTCGATTTAATATTATCACTCAATTTATTATCTTGAGCACGCGTTAAATCGTCTTTAAATTGAACAGTTGCTACTTTATTATCTTTACCATTGATTTGAATTTGATCTGCTTTAAGTCCACTATCTTTTACAACTTGCTCAACCTTTTGTTGAGTAATTGCTTGTTTAGATTGGAAATCTACACGTGTACCACTTGAGAAATCAATTCCTAGGTTTAACTTGAAGATATAAAGAATAACTAAACCGACAACTACAATTAAAATACTTACTCCAATTAATGGCTTAGCTAATTTAACAAAATTCCATTTCTCGAATGAAGTTTTAAGATCATGAACATCTACACCTTCATTAATATCATGTCGTTTATTCTTTTTAACACCAAATAACCAAAATTGATTTTTGAATATATTTGATGAAACAAGTAATGATAATAAGAATCTTGATAAGAACACGGCTGTAACAAAGATCATTAGAATACCTAATAATAACATTGTCGCGAAACCTTTAACTGAACTTTCACCGAAGAAGAATAATACTGCTGCGGCGATAACTGTTGTTAAGTTAGAATCAAAAATTGTTAAGAACGAACTTTTGTTTGCTTTAGTAAAGGCTTGCTTTATCGTTCTACCTATTCGAAGTTCATCCTTAATACGCTCATACATGATAATATTGGCATCTACAGCCATACCTACACCTAATACCAACGCCGCTAATCCTGGTAAAGTTAGAACCCCAGAAATGAAATTAAACGCTACTAACGTTAGATAGATATAAGTTGTCAATGCAATAATCGCTACTAAACCAGGTAAGCGGTAGAATCCAAGCATGAATAAATAAATTAATGCTACACCAATAAACGATGCAAACACAGTTTTATCTAATGCATCTTGACCAAATTGGGCACCTACTGAGTTTGAATAAATTTCTTTCAAGTCAACTGGTAAAGAACCTGCATTTAACAATTCGGCGATTTGTTTTGCTTTTTTAACGCCTTCTTGTCCTTTAAATCCACCAGAGATTTCTACGCTATCAGAATTGATTGGTTGATCAACACTTGCTGCAGAAATAAATTTAGGGTTTTTCTTTTGTGCTTCTTTTTTATAGCTGTCACCTTTTTTGAAATCTAACCAAACAACCATGACATTATCACGTTTCTTAGAGATTTCTTCCGTTACTTTTTTAAATTTGTTTTTGTCTTTTACTTTAAAAGTAACTGTAGGCTGGTTTGTTTCCTGTTTAAATTCTTGTTTGGCAGATCCCTGTTTAATATCAGAACCGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_017337|1703356:1712399|1703356_1703875_-|WP_000364542.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATDKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE >NC_017337|1703356:1712399|1710367_1711393_-|WP_001019175.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLTEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMAQETADLLNDTKSKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDHDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSTRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII >NC_017337|1703356:1712399|1706372_1708652_-|WP_000749803.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFTKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQFWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGMMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV >NC_017337|1703356:1712399|1709205_1710345_-|WP_001112045.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF >NC_017337|1703356:1712399|1708926_1709187_-|WP_001160682.1|DBSCAN-SWA MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS >NC_017337|1703356:1712399|1703896_1706170_-|WP_000594981.1|DBSCAN-SWA MIKPKYKWKLIKPTEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESIISDTDINHDSLQLSDMTKTIERIKRAIANDEKILVYGDYDADGVTSTTILVTTLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSTLPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNDQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDDEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAEMKVKNGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIENIESLAEGLNKWMKELSETTSLDPVKPVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGSVQINEWNGNQSPQLIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDKNIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVVLRDLPTSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDVFKKCYKALITKQETNIQKEGMLLCQHLSVKPDTLKFILKVFLDLNFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS >NC_017337|1703356:1712399|1711394_1712399_-|WP_001005767.1|DBSCAN-SWA MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDEESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDTIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERE |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1836321 : 1914053
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NC_017337|1836321:1914053|DBSCAN-SWA 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73 | Staphylococcus_phage(92.59%) | tRNA,protease,integrase,transposase | attL 1902019:1902037|attR 1920815:1920833 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
1941577 : 2018463
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NC_017337|1941577:2018463|DBSCAN-SWA 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91 | Staphylococcus_phage(71.01%) | portal,tail,integrase,protease,tRNA,holin,transposase,capsid,terminase,head | attL 1982609:1982623|attR 2020020:2020034 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
2100511 : 2112018
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NC_017337|2100511:2112018|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_13 >NC_017337|2100511:2112018|2107114_2107756_-|WP_000595331.1|DBSCAN-SWA MIKQLFNNKEIRFIEKNNEYWAIATDVAKVLGFRDAFNATKYLPEHVRGTLKGSTTSDKKKARKYQDYTVINEKGIYRLVMRSNKAEALDFQDWICDVLVELRTSTKLKEYEVFHMLDKEKQKEAMGNLKNGIEAISKKDYCKAQTISNKAVSNIFGFPKMVKKEDMTNEMLELRQQVLNDTVEFMVFVDEYKLPLSVSKHIYDEYSSKHQIA >NC_017337|2100511:2112018|2102213_2102420_-|WP_000884055.1|DBSCAN-SWA MLDHTNESVKRVFKYRDKQELLNKYHELLDKYFLHNISFYEEDKNNERIYGLVVHTKNKLGDEDYERV >NC_017337|2100511:2112018|2107759_2107972_-|WP_000448766.1|DBSCAN-SWA METKVLELRGLIAKNGHTLRSFAKDSNISLSYLSLIVNKKAEPSPKMAKKIADNLNVDMEELFVYRTKEA >NC_017337|2100511:2112018|2100511_2101003_-|WP_000253083.1|DBSCAN-SWA MVSDFESNDKITEVELLMHYNPKVINSKIKAMRSQIESLYHLNMNHVITNDNDMLVSVSYPLDKLVLYIIEEKDKLEYYMKTAQDRLNLFKDIIKNYSENEQQDVMRYMLSSGKVKNEGVIERLKVDIYKVESRKRQERQNQREELHRIEFNKHLEQVKKELS >NC_017337|2100511:2112018|2110041_2111658_-|WP_000240648.1|DBSCAN-SWA MVKQLKFSEDARQAMLRGVDQLANAVKVTIGPKGRNVVLDKEFTAPLITNDGVTIAKEIELEDPYENMGAKLVQEVANKTNEIAGDGTTTATVLAQAMIQEGLKNVTSGANPVGLRQGIDKAVKVAVEALHENSQKVENKNEIAQVGAISAADEEIGRYISEAMEKVGNDGVITIEESNGLNTELEVVEGMQFDRGYQSPYMVTDSDKMVAELERPYILVTDKKISSFQDILPLLEQVVQSNRPILIVADEVEGDALTNIVLNRMRGTFTAVAVKAPGFGDRRKAMLEDLAILTGAQVITDDLGLDLKDASIDMLGTASKVEVTKDNTTVVDGDGDENSIDARVSQLKSQIEETESDFDREKLQERLAKLAGGVAVIKVGAASETELKERKLRIEDALNSTRAAVEEGIVAGGGTALVNVYQKVSEIKAEGDIETGVNIVLKALTAPVRQIAENAGLEGSVIVERLKNAEPGVGFNAATNEWVNMLEAGIVDPTKVTRSALQHAASVAAMFLTTEAVVASIPEKNNDQPNMGGMPGMM >NC_017337|2100511:2112018|2108800_2109973_+|WP_000179349.1|integrase|DBSCAN-SWA MASYEKRGNTWRYRISLGKDAETGKYKYISNSGFKRKSDAKHHAEMVERQLRNGEYIAPSTSTFKQVADDWLKQYANEVKVSSVRAREKAIHHAIERFNNKPIQTINKHEYQRFVNDISAQYSKNYVDSIIASTNMIFKYAYDMKLIRILPSEGIKRPKKKVSVEELEDTEIHKKFLEKDELFQFLEVAKNHHSPQNSFEVFCTLAYTGMRAGELLALKWSDIDFENNTINITKTYYNPNNNKKQYQVLTPKTESSIGKIPVDPHVIKLLKNYKVDVQDTWKNELYVDNNFVFTDVNGYPLVIKKLQLWIKAILKKTDITNKQISTHSFRHTHCALLIEAGVHIKEIQERLRHKDINTTMNIYAKITNSYKKDASQKFSKLMESVSKDLF >NC_017337|2100511:2112018|2102644_2102989_-|WP_001082128.1|DBSCAN-SWA MNRSRMKQIILEYIKNNGSTSFVEIENVFEEQGFKYKGNGAYTSGNHKNIIFWMGWNEEAFNIVADLKRDGLIEMQICPPMYYLIDGKGLRLPIVKNKNIKIDHWLPVTFSLVN >NC_017337|2100511:2112018|2106123_2106423_-|WP_001103962.1|DBSCAN-SWA MNWEIKNLMCDLKILKEKFEDLKDNHGSHFEDLYLHESNHTLNKDDVIKEGFSYHERRIHNDQMFDLLLLYTEKFDELITRFDALEKASSFADQSQDNA >NC_017337|2100511:2112018|2106637_2106787_-|WP_000762701.1|DBSCAN-SWA MKLDLLYITLTSLLTILLLAISNMYIAFSVYGMLITLGFYLTGGLENEK >NC_017337|2100511:2112018|2111733_2112018_-|WP_000917289.1|DBSCAN-SWA MLKPIGNRVIIEKKEQEQTTKSGIVLTDSAKEKSNEGVIVAVGTGRLLNDGTRVTPEVKEGDRVVFQQYAGTEVKRDNETYLVLNEEDILAVIE >NC_017337|2100511:2112018|2108125_2108788_+|WP_001070981.1|DBSCAN-SWA MNQEGTLGNAIKSARKKYPLTLEELGGKVGVSHAFLSRVENNKITPNDKLLVKIANVLDFNESQDFLNEFRILAGYYDNIDENTAIFNNLKSSGRLEINRFKREKKIVDKPYYKLNYLFECENKVFYDIKTSELGEKLVTIELPSDILHDIYKMINLEIIKTIKINSKLLYSIENPQVIEEYQKEVEKTRKEFTERLEKSLSTYDIDSVIREIYDDEYLI >NC_017337|2100511:2112018|2106423_2106648_-|WP_000787322.1|DBSCAN-SWA MKNEQKEVIQDIYNTLEAVAYNTSMEYIHNCVDGKKEWMENVNREEHLQAIIEWALQQIENNFDFENDTEMEEL >NC_017337|2100511:2112018|2106783_2107101_-|WP_000481975.1|DBSCAN-SWA MFNINIDEQEVRELLEQAINARVEELAKEKYFMTYKELANYLNLSKPTIEELLINNGMKYYMVGSTYRFKKSDVDEFMEQLTAHMNIQNNDFKQVNIKKLLEARQ >NC_017337|2100511:2112018|2103659_2106032_-|WP_000985240.1|DBSCAN-SWA MAIKKKDRIIGVKELEIPQELKLVPNWVLWRAEWNEKQQNYGKVPYSINGYRASTTNKKTWCDFESVSIEYEVDEQYSGIGFVLSDGNNFVCLDIDNAIDKKGQINSELALKMMQLTYCEKSPSGTGLHCFFKGKLPDNRKKKRTDLDIELYDSARFMTVTGCTIGQSDICDNQEVLNTLIDEYFKENLPVNDVVREESNTNMQLSDEDIINIMMKSKQKDKIKDLLQGTYESYFKSSSEAVQSLLHYLAFYTGKNKQQMERIFLNYNNLTDKWESKRGNTTWGQLELDKAIKNQKTVCTKSIDEFNVIQQGSKDIKQLLNQLGHEERTKMEENWIEEGKRGRKPTTISPIKCAYILNEHLTFILFDDEENTKLAMYQFDEGIYTQNTTIIKRVISYLEPKHNSNKADEVIYHLTNMVDIKEKTNSPYLIPVKNDVFNRKTKQLESFTPDYIFTSKIDTSYVRQDIVPEINGWNIDRWIEEIACNDNQVVKLLWQVINDSMNGNYTRKKALFLVGNGNNGKGTFQELLSNVIGYSNIASLKVNEFDERFKLSVLEGKTAVIGDDVPVGVYVDDSSNFKSVVTGDPVLVEFKNKPLYRATFKCTVIQSTNGMPKFKDKTGGTLRRLLIVPFNANFNGIKENFKIKEDYIKNQQVLEYVLYKAINLDFETFDIPDASKKMLEVFKEDNDPVYGFKVNMFDQWTIRKVPKYIVYAFYKEYCDENGYNALSSNKFYKQFEHYLENYWKTDAQRRYDNEELAKRIYNFNDNRNYIEPIESGKNYKSYEKVKLKAI >NC_017337|2100511:2112018|2101168_2102227_-|WP_000657539.1|capsid|DBSCAN-SWA MKEFKEQFGYQLSNFDDMDIKGYANLYQKDIGKDVSMIEQGLKQLSITETEVLLPEQINKKLLGVLNMNEVNQSSNTWVGTLTKQLVSSENNFNIQELPTARKEVFKELLVNRELLQTLRDVITITDDEHVESIPALTYIKDKLATNGIELSLNGSSKYFDRREGHIYTEVSDSVVHGSDRTLDDLLKEIFINECVSYETTLLLDKNNASGLIDKDNQDLSLYNQGIKEVSNTSMYDGIKQAIKDIPQTFRRSVSIVMNTDHHDKLIKELAQVGLGALAYDLTKLFNVSHVVVTDDAQDIFVGDFGHAIYAKYEPIMYNKKKQALKGVYQFALNYVFDIKIVPELLRMVKVK |
15 | Staphylococcus_phage(45.45%) | integrase,capsid | attL 2092393:2092416|attR 2115154:2115177 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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