CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NC_016809	Haemophilus influenzae 10810, complete genome	1 crisprs	DEDDh,DinG,cas3,WYL	0	0	6	0

1. NC_016809

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NC_016809_1

• CRISPR_ID: NC_016809_1
• CRISPR_location: 346279-346359
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NC_016809_1

Consensus_repeat	Method
AAGTTATCAATGAAGGGAACATTA	CRISPRCasFinder

spacers of NC_016809_1

>1.1|346303|33|NC_016809|CRISPRCasFinder
CGGCACAAGATTTCGTGGTACTTAATGGCGATG

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_016809_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NC_016809_1

>merge|NC_016809|1|346279-346359|CRISPRCasFinder
AAGTTATCAATGAAGGGAACATTACGGCACAAGATTTCGTGGTACTTAATGGCGATGAAGTTATCAATAAAGGGAACATTA

>NC_016809|1|1|346279-346359|CRISPRCasFinder
AAGTTATCAATGAAGGGAACATTA	CGGCACAAGATTTCGTGGTACTTAATGGCGATG
AAGTTATCAATAAAGGGAACATTA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NC_016809.1|WP_015701492.1|355335_356052_-|ribonuclease-PH	unknown	unknown	gnl|CDD|178914
NC_016809.1|WP_015701489.1|353447_353726_-|tRNA-dihydrouridine-synthase	unknown	unknown	gnl|CDD|236713
NC_016809.1|WP_005653377.1|352596_353442_+|RNA-polymerase-sigma-factor-RpoH	unknown	unknown	gnl|CDD|235838
NC_016809.1|WP_005653382.1|349091_349691_+|glycerol-3-phosphate-1-O-acyltransferase-PlsY	unknown	unknown	gnl|CDD|234691
NC_016809.1|WP_015701488.1|351445_352471_+|UDP-N-acetylmuramate-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|234593
NC_016809.1|WP_015701487.1|349732_351436_+|nitrate/nitrite-two-component-system-sensor-histidine-kinase-NarQ	unknown	unknown	gnl|CDD|236800
NC_016809.1|WP_005686679.1|336448_337096_+|outer-membrane-protein-assembly-factor-BamC	unknown	unknown	gnl|CDD|225854
NC_016809.1|WP_041175099.1|356564_356801_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NC_016809.1|WP_005648863.1|337268_337592_+|ribosome-associated-translation-inhibitor-RaiA	unknown	unknown	gnl|CDD|182378
NC_016809.1|WP_015701490.1|353725_354592_-|co-chaperone-DjlA	unknown	unknown	gnl|CDD|236512
NC_016809.1|WP_005668884.1|348652_349009_-|dihydroneopterin-aldolase	unknown	unknown	gnl|CDD|183219
NC_016809.1|WP_005648859.1|335440_336337_+|4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate-synthase	unknown	unknown	gnl|CDD|235107
NC_016809.1|WP_015701480.1|338027_338924_-|glycosyltransferase-family-8-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|133037
NC_016809.1|WP_015701481.1|339058_339646_-|RdgB/HAM1-family-non-canonical-purine-NTP-pyrophosphatase	unknown	unknown	gnl|CDD|234648
NC_016809.1|WP_015701485.1|344067_345759_+|ShlB/FhaC/HecB-family-hemolysin-secretion/activation-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|225387
NC_016809.1|WP_015701479.1|334872_335340_-|thioredoxin-dependent-thiol-peroxidase	unknown	unknown	gnl|CDD|181857
NC_016809.1|WP_015701482.1|339657_340383_-|3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|234975
NC_016809.1|WP_015701491.1|354670_355312_-|orotate-phosphoribosyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|234771
NC_016809.1|WP_015701484.1|341824_343987_+|TonB-dependent-hemoglobin/transferrin/lactoferrin-family-receptor	unknown	unknown	gnl|CDD|273807
NC_016809.1|WP_015701483.1|340459_341503_+|glycosyl-transferase	unknown	unknown	gnl|CDD|366450

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NC_016809.1|WP_015701492.1|355335_356052_-|ribonuclease-PH	gnl|CDD|178914	PRK00173, rph, ribonuclease PH; Reviewed.	2.62096e-179
NC_016809.1|WP_015701489.1|353447_353726_-|tRNA-dihydrouridine-synthase	gnl|CDD|236713	PRK10550, PRK10550, tRNA dihydrouridine(16) synthase DusC.	7.21042e-48
NC_016809.1|WP_005653377.1|352596_353442_+|RNA-polymerase-sigma-factor-RpoH	gnl|CDD|235838	PRK06596, PRK06596, RNA polymerase factor sigma-32; Reviewed.	0
NC_016809.1|WP_005653382.1|349091_349691_+|glycerol-3-phosphate-1-O-acyltransferase-PlsY	gnl|CDD|234691	PRK00220, PRK00220, glycerol-3-phosphate 1-O-acyltransferase PlsY.	8.48773e-102
NC_016809.1|WP_015701488.1|351445_352471_+|UDP-N-acetylmuramate-dehydrogenase	gnl|CDD|234593	PRK00046, murB, UDP-N-acetylmuramate dehydrogenase.	0
NC_016809.1|WP_015701487.1|349732_351436_+|nitrate/nitrite-two-component-system-sensor-histidine-kinase-NarQ	gnl|CDD|236800	PRK10935, PRK10935, nitrate/nitrite two-component system sensor histidine kinase NarQ.	0
NC_016809.1|WP_005686679.1|336448_337096_+|outer-membrane-protein-assembly-factor-BamC	gnl|CDD|225854	COG3317, NlpB, Uncharacterized lipoprotein [Cell envelope biogenesis, outer membrane].	8.79468e-75
NC_016809.1|WP_005648863.1|337268_337592_+|ribosome-associated-translation-inhibitor-RaiA	gnl|CDD|182378	PRK10324, PRK10324, ribosome-associated translation inhibitor RaiA.	6.00428e-42
NC_016809.1|WP_015701490.1|353725_354592_-|co-chaperone-DjlA	gnl|CDD|236512	PRK09430, djlA, co-chaperone DjlA.	2.1859e-155
NC_016809.1|WP_005668884.1|348652_349009_-|dihydroneopterin-aldolase	gnl|CDD|183219	PRK11593, folB, bifunctional dihydroneopterin aldolase/7,8-dihydroneopterin epimerase.	1.59897e-54
NC_016809.1|WP_005648859.1|335440_336337_+|4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate-synthase	gnl|CDD|235107	PRK03170, PRK03170, dihydrodipicolinate synthase; Provisional.	1.63249e-173
NC_016809.1|WP_015701480.1|338027_338924_-|glycosyltransferase-family-8-protein	gnl|CDD|133037	cd04194, GT8_A4GalT_like, A4GalT_like proteins catalyze the addition of galactose or glucose residues to the lipooligosaccharide (LOS) or lipopolysaccharide (LPS) of the bacterial cell surface. The members of this family of glycosyltransferases catalyze the addition of galactose or glucose residues to the lipooligosaccharide (LOS) or lipopolysaccharide (LPS) of the bacterial cell surface. The enzymes exhibit broad substrate specificities. The known functions found in this family include: Alpha-1,4-galactosyltransferase, LOS-alpha-1,3-D-galactosyltransferase, UDP-glucose:(galactosyl) LPS alpha1,2-glucosyltransferase, UDP-galactose: (glucosyl) LPS alpha1,2-galactosyltransferase, and UDP-glucose:(glucosyl) LPS alpha1,2-glucosyltransferase. Alpha-1,4-galactosyltransferase from N. meningitidis adds an alpha-galactose from UDP-Gal (the donor) to a terminal lactose (the acceptor) of the LOS structure of outer membrane. LOSs are virulence factors that enable the organism to evade the immune system of host cells. In E. coli, the three alpha-1,2-glycosyltransferases, that are involved in the synthesis of the outer core region of the LPS, are all members of this family. The three enzymes share 40 % of sequence identity, but have different sugar donor or acceptor specificities, representing the structural diversity of LPS.	5.21257e-85
NC_016809.1|WP_015701481.1|339058_339646_-|RdgB/HAM1-family-non-canonical-purine-NTP-pyrophosphatase	gnl|CDD|234648	PRK00120, PRK00120, dITP/XTP pyrophosphatase; Reviewed.	3.7184e-116
NC_016809.1|WP_015701485.1|344067_345759_+|ShlB/FhaC/HecB-family-hemolysin-secretion/activation-protein	gnl|CDD|225387	COG2831, FhaC, Hemolysin activation/secretion protein [Intracellular trafficking and secretion].	3.66575e-128
NC_016809.1|WP_015701479.1|334872_335340_-|thioredoxin-dependent-thiol-peroxidase	gnl|CDD|181857	PRK09437, bcp, thioredoxin-dependent thiol peroxidase; Reviewed.	5.6345e-112
NC_016809.1|WP_015701482.1|339657_340383_-|3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid-kinase	gnl|CDD|234975	PRK01723, PRK01723, 3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase; Reviewed.	7.0978e-129
NC_016809.1|WP_015701491.1|354670_355312_-|orotate-phosphoribosyltransferase	gnl|CDD|234771	PRK00455, pyrE, orotate phosphoribosyltransferase; Validated.	2.71741e-87
NC_016809.1|WP_015701484.1|341824_343987_+|TonB-dependent-hemoglobin/transferrin/lactoferrin-family-receptor	gnl|CDD|273807	TIGR01785, Heme/hemopexin_utilization_protein_C, TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein. This model represents the TonB-dependent outer membrane heme/hemoglobin receptor/transporter found in bacteria which live in contact with animals (which contain hemoglobin or other heme-bearing globins) or legumes (which contain leghemoglobin). Some species having hits to this model such as Nostoc, Caulobacter and Chlorobium do not have an obvious source of hemoglobin-like proteins in their biological niche and so the possibility exists that they act on some other substance. [Transport and binding proteins, Cations and iron carrying compounds, Transport and binding proteins, Porins].	0
NC_016809.1|WP_015701483.1|340459_341503_+|glycosyl-transferase	gnl|CDD|366450	pfam01075, Glyco_transf_9, Glycosyltransferase family 9 (heptosyltransferase). Members of this family belong to glycosyltransferase family 9. Lipopolysaccharide is a major component of the outer leaflet of the outer membrane in Gram-negative bacteria. It is composed of three domains; lipid A, Core oligosaccharide and the O-antigen. All of these enzymes transfer heptose to the lipopolysaccharide core.	5.24422e-100

Protein sequences

>NC_016809.1|WP_015701485.1|344067_345759_+|ShlB/FhaC/HecB-family-hemolysin-secretion/activation-protein
MRPRYSVIASAVSLGFVLSKSVMALGQPDTGSLNRELEQRRIQSEAKPSGELFNQTANSPYTAQYKQGLKFPLTQVQILDRNNQEVVTDELAHILKNYVGKEVSLSDLSNLANEISEFYRHNNYLVAKAILPPQEIEQGTVKILLLKGNVGEIRLQNHSALSNKFVSRLSNTTVNTSEFILKDELEKFALTINDVPGVNAGLQLSAGKKVGEANLLIKINDAKRFSSYVSVDNQGNKYTGRYRLAAGTKVSNLNGWGDELKLDLMSSNQANLKNARIDYSSLIDGYSTRFGVTANYLDYKLGGNFKSLQSQGHSHTLGAYLLHPTIRTPNFRLSTKVSFNHQNLTDKQQAVYAKQKRKINSLTAGIDGSWNLIKDGTTYFSLSTLFGNLANQTSEKKHNAVENFQPKSHFTVYNYRLSHEQILPKSFAFNIGINGQFADKTLESSQKMLLGGLSGVRGHQAGAASVDEGHLIQTEFKHYLPVFSQSVLVSSLFYDYGLGKYYKNSQFLEQGVKNSVKLQSVGAGLSLSDAGSYAINVSVAKPLDNNINNADKHQFWLSMIKTF
>NC_016809.1|WP_015701484.1|341824_343987_+|TonB-dependent-hemoglobin/transferrin/lactoferrin-family-receptor
MRFSKLSLAIATTLVTANALAQSVELDSINVIATRDPSRFAYTPEKQSKDSLLSKQATSVAAALEDIPNVDIRGGSRSIAQKPNIRGLSDNRVVQVIDGVRQNFDLAHRGSYFLPMSLIQEIEVIKGPSSSLWGSGALGGVVAMRTPNALDLLKNNDKFGVKIRQGYQTANNLSERDVSVFAANDKFDVLISGFYNNADNLRTGKGNKLNNTAYKQFGGLAKFGWQINDANRVELSHRETRFKQTAPSNNEVENELTNEQITDQIREFHKPNNGSPPKAKPSQEEFYSGVKTRFGSVSYLTDQQIPDQSTVFNYYLTPDNPYLNTHIALYNNKTIEKEQRKVSGVKDQTKLTTRGINLRNSSELSHISFVYGVDYMRDKIRTERGTNNTDAKFRAEPYNANSNTTGVYLIAHIPLFGEKLLISPSVRYDHYDTSSKTVKYKDNHLSPATKLTWIVTNWLDFTAKYNEAFRAPSMQERFVSGAHFGASLIGGLDTINRFVANPNLRPETAKNKEITANLHFDSLFKQGDKFKIEATYFRNDVKDFINLKIFNDANTNKNASASANGALLPLPTKSQYQNITNARLSGIELQAQYQTERLTLFTNYGSTKGKDKDSGEALSNIAASKIGVGVNYALVKDKFTVGATVTHYAAQRRVPKDHGVTYPSYILTDLRATYAPLKGEWKNLRLDFALENLFDRKYQPAFSLMEGTGRNAKISAVYSF
>NC_016809.1|WP_015701483.1|340459_341503_+|glycosyl-transferase
MPLFTEAPKSLCILRLSAVGDVCHALAVVQHIQAYYPQTEVTWIVGKTEMGLLSGIPNVTLIPYDKKAGWKGVLSLWKQLKNKQFDALLNMQTAFRASILSLGIKAKFKIGFGEKRSREGQWLFVNRRIRDPFSPHVLDGFMAFAEYIGVPKSEPQWELAISEDDYKFADQFIDFSRKNLLISPCSSKAEKDWLIEGYAEVANIAHQHNINVIFCSSPAKRELEIVEKITALCHFTPTNIAGKTNLKQLTALISKVDLVLSPDSGPAHIATTQGTPVIGLYAYHNPLRTAPYKNLDNVVSVYEENAQKEFGKPSSELPWATKLKGKNLMAEIQVEPVIEQMKKLGLF
>NC_016809.1|WP_015701482.1|339657_340383_-|3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid-kinase
MHQFQQDNQYFIFNFDRTFEQATEFFQAEFWQKQERVIGSAKGRGITYFLQTEDWFGVNCALRHYYRGGLWGKLNKDRYRFSALDTTRSFAEFHLLQRLYEAGLPVPKPIAARIQKGKLGICYQADILTEKIENAQDLTALLQTQTLPKETWRQIGRLIRKLHDLQICHTDLNAHNILLQQTEQGQKCWLIDFDKCGEKLGDFWKAQNLNRLKRSFEKEVGRMNIQFTEQNWADLTAAYHQ
>NC_016809.1|WP_015701481.1|339058_339646_-|RdgB/HAM1-family-non-canonical-purine-NTP-pyrophosphatase
MKQKIVLATGNKGKVKEMADVLSDFGFEVIAQTDLGIESPEETGLTFVENALLKARYASEKSGLPAIADDSGLVVSALNGAPGLYSARYAGEEGNDAKNREKLLAELAHIAQDQRQAKFVSCIVFLQHPTDPSPIIAEGECHGVIGFEEKGENGFGYDSLFFSPEQGCTFAELETAEKKKISHRAKALSVLKNKL
>NC_016809.1|WP_015701480.1|338027_338924_-|glycosyltransferase-family-8-protein
MNIIFSSDNYYATYLAVSIFSIIKNTPEKINFYILDMKINQENKTIINNLASAYSCKVFFLPVCEADFQNFPKTIDYISLATYARLNLTKYIKNIEKAIYIDVDTLTNSSLQELWDIDITNYYLAACRDTFIDVKNEAYKKSIGLEGYSYFNAGILLINLNKWKEENIFQKSINWMNKYNNVMKYQDQDILNGICKGKVKFINNRFNFTPTDRGLIKKKNLLHVKMPIVISHYCGPHKFWHKKCSHLNCHIGNLLLKEMDKIIDIPSSWYDHFEKIPFLIKIKRLRKRIKDKLIYGIY
>NC_016809.1|WP_005648863.1|337268_337592_+|ribosome-associated-translation-inhibitor-RaiA
MTLNITSKQMDITPAIREHLEERLAKLGKWQTQLISPHFVLNKVPNGFTVEASIGTPLGNLLASATSDDMYKAINEVEEKLERQLNKLQHKSESRRANERLKDSFEN
>NC_016809.1|WP_005686679.1|336448_337096_+|outer-membrane-protein-assembly-factor-BamC
MKKIILSLTTAIILVGCSSNPETLKASNDSFQKSEASIPHFSPLATGGVQLPKADDAYSLPNIEVKKRGDIDIRPPLIPLAIIQNSITKFDGERSLIVYPKQQAKLYNLQQVERLLKDEGISSTTDGSILTTDWTKTERIGDKPIEIKYQIEQVMTPDVSAITVSILHMRRDGIIFTPNVSDKQYYTSERLNRIVLTLTTAYNKQLQDLSSTSIQ
>NC_016809.1|WP_005648859.1|335440_336337_+|4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate-synthase
MSAQNSLFSGSIVALVTPMNHYGEVDFSCLEKLVEHHIEAGSNALVSVGTTGESATLSIEENVKVIEKTVEFAKGRIPIIAGAGANATSEAITMTKLLRDSGVAGCLSVVPYYNKPTQEGMYQHFKAIAECTDLPQILYNVPSRTGSDMKPETVARLAEIENIVGIKEATRDVSRIVKIKQLAGKNFIVLSGDDATGLEAIKLGAEGVISVTNNIAAKDMADMCRYALAGDFDKAEEINARLMRLHHDLFIESNPIPVKWAAYRLGLIKSPHLRLPLTTLSEEIQPKVEDALKIAGLL
>NC_016809.1|WP_015701479.1|334872_335340_-|thioredoxin-dependent-thiol-peroxidase
MNPLSVGNQAPAFTLLNQQEKFVSLSDFRGKKVLIYFYPKALTPGCTTQACGLRDSKSELDVLGLVVLGISPDAPKKLAQFIEKKELNFTLLSDPDHQVAEQFGVWGEKKFMGRTYDGIHRISFLINESGTIMQVFDKFKIKYHHQMIIDYLRSL
>NC_016809.1|WP_005668884.1|348652_349009_-|dihydroneopterin-aldolase
MDRVFIEELTVFAQIGVYDWEQQIKQKLVFDLEMAWDCKQAAETDDVAYCLNYAEVSQAIIDYVESKPFLLIERVAYEVADLLESRYQLQGLKIKLSKPKAVAQARNVGVLIVRGCLK
>NC_016809.1|WP_005653382.1|349091_349691_+|glycerol-3-phosphate-1-O-acyltransferase-PlsY
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>NC_016809.1|WP_015701487.1|349732_351436_+|nitrate/nitrite-two-component-system-sensor-histidine-kinase-NarQ
MYTKGSVSTRIAKYLFIILIVAGVISSLSLAIMSSNKYDAEAINISGSLRMQSYRLLYEMQEQPESVETNLRRYHISLHSSALLEVQNQFFTPNVLKHSYQNILQRWTNMEKYARQQDVKNYSKQLTNYVADVDYFVFELQRFSEQKWILGVSVLFFAMLLILAMVSYVIWYTQREVVKPLHLMTKASMQVQMRQFNHIPLDTRKQNELGTLARVFTQMSTELGQLYSRLEEAVNEKTQKLRQTNRTLSTLYQSAQLLNTNTINDKILNQVLNYIFISNHLNFVKVEVMGAEHWDITLGKQDANNELQIETLSVDNEELGVLSWQAGLPCPDPRIMQNLAQMLARALYFHKNLRQKEQLLLMEERSIIARELHDSLAQVLSFLQIQLTLLKHNLKKEDEQSKEKSLAIIANFEQALSGGYAQLRELLATFRLTIQEANLQLALKQVIDSLRSQTTMQMNVNCQLPSQSLNPQQLVHVLQIVREATTNAIKHSQGTVIEISARINAEGEYEILVEDDGVGIPNLEEPEGHYGLNIMAERCRQLNAQLHIHRREQGGTQVKITLPHTLY
>NC_016809.1|WP_015701488.1|351445_352471_+|UDP-N-acetylmuramate-dehydrogenase
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>NC_016809.1|WP_005653377.1|352596_353442_+|RNA-polymerase-sigma-factor-RpoH
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>NC_016809.1|WP_015701489.1|353447_353726_-|tRNA-dihydrouridine-synthase
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>NC_016809.1|WP_015701490.1|353725_354592_-|co-chaperone-DjlA
MEFIGKIIGVFLGWKVGGFFGAIAGLILGSIADKKLYELGSVSSSFFKKKTTRQDLFMQTSFAVLGHLSKSKGRVTEEDIQLANQLMIQLKLDDAGRKLAQDAFRRGKESDFPIRQAIREFRIGCGQRADLLRMFLQVQVQAAFADSELHENEKEVLYVIAEELGLSRMQFEQMIAMEMAARAFTQGGFYQQYQQGAYQGGYQYQQQNSGGYQHASGPTLNDAYKVLGVTESDEQNTVKRAYRRLMNEHHPDKLVAKGLPPEMMEMAKEKTQQIQAAYDLICKAKGWK
>NC_016809.1|WP_015701491.1|354670_355312_-|orotate-phosphoribosyltransferase
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>NC_016809.1|WP_015701492.1|355335_356052_-|ribonuclease-PH
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>NC_016809.1|WP_041175099.1|356564_356801_-|hypothetical-protein
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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
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DBSCAN-SWA_2	519877 : 577028	60	uncultured_Caudovirales_phage(43.75%)	integrase,tRNA,terminase,protease,tail,head,capsid,portal	attL 561971:561992|attR 577394:577415
DBSCAN-SWA_3	1378414 : 1386928	8	Bacillus_virus(33.33%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_4	1645017 : 1677064	46	Haemophilus_phage(46.34%)	capsid,holin,tail,terminase	NA
DBSCAN-SWA_5	1765691 : 1777298	10	Haemophilus_phage(55.56%)	integrase,transposase,plate	NA
DBSCAN-SWA_6	1780977 : 1789944	16	Mannheimia_phage(40.0%)	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NC_016809|353447:397603|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

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MPERHLQEYEMFYQEQPFGLWREDYRTAQVSHLLAMINRDPKSKPPELSDFMPFYQEKMDDEDDDGVADYLANR
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MLIHKKIRHQVSDMLKSSIKGVENIYSGRPLFIDIDQEKTAIAVFLDEISCEEVDLCHHEYTAALNIAIYLKTALGDDALDDIADKIKERLSVAISNDELSENISEMTLISYEYEQDTTNRTWFVSNLKYQIKYED
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MKKLLFAALSTALLAGCAPTPKQINIPYQFDSNQAKKQLEPGSETLQGNAFLRQVGGGIVNCAGYNVDLYPSSPYTKARIEGMYPLNQWLGNRFISADTFNPDYPDFKNIKRSTTCDSEGNFVFDSLKTGEYIVVTEVRWSVPSQFGMQQQGGYILKPITITKGQKNKLVISQ
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MKSETIGKRIRQRRTELKLTQKDVANAIKGVSHVAISQWESDTTKPNSENLVDLSTVLECDLLWLLRGEGSSSNVMPASIGTNKVPLISYVQAGTWTGIDDLKESTGDFNYIYTFIDTSDDAFALEIKGDSMEPDFKAGDVIIIDPRIEPRAGEFVAAINGDYEATFKKYRPIGDIDELGRHHFELVPLNSDYPTLSSLKQEIRIIGTMIEHRIYRRKR
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MSYSVERVLEKWGNCWGRDRIGTEYPSTTISIPVLPTVRKAHIRFLTDDECLKIEEQIMNLHEDSLLQYQILMALYVQQAKERDICTALHISPAHMYRERARGVRFLKGAFTGAKIKFMFLG
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MRPNNRENNQPRQIKITRNYTKHAEGSVLVEFGDTKVLCTATVEDAVPRFLKGQGQGWVTAEYGMLPRSTHSRMQREAAKGKQGGRTMEIQRLIARSLRAMVDLKALGERAITLDCDVIQADGGTRTASITGAAVALCDAINGLIENGTLKTNPIKGLVSAISVGIVDGQAVCDLEYVEDSAAETDMNVVMMEDGRMIEVQGTAEGEPFSHEELLTLLDLAKQGCNQIFIAQRKALGL
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MSVKFKDLMNNLPAEKQAKVKAMADDMRMELQLYRIREELELSQKQMAEALSISQPSVVALEKRGNDIKLSSVKRYIEAMGGVLNLSVELPTGKTVTFNL
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MFSRFETAIKLTALCLILGLCGWTWFQSQKISSLKAENQAQAQTIQQQENANKSLILALQQERDAVIEQQERNDEIERIATENAESVKKIIKTQPCANTRLPQSVLDRLYK
>NC_016809|353447:397603|384375_384918_-|WP_015701520.1|DBSCAN-SWA
MILTKTRKALGVCSVITVMGLMYAQFGGELRLSPVGAEIIGNAEGCRRDPYQCPADVLTVGIGSTEYGGKKINPKHRYTDLEIAERWKNDIVIAERCVNKYGNGEVLPQSVFDSAVSITFNVGCGAVSKSTMFKYLRAKQYEKACGEFPRWVYASGKKLAGLVVRREKEKALCLADLKLP

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_015701494.1|357151_357748_-	hypothetical protein	A0A0M3LR33	Mannheimia_phage	5.6e-41	44.9
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WP_015701497.1|364380_365139_-	C40 family peptidase	A0A0M3LP75	Mannheimia_phage	2.7e-64	48.8
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WP_015701500.1|367761_368097_-|tail	phage tail protein	NA	NA	NA	NA
WP_015701501.1|368105_371447_-	tape measure protein	A0A0E3JPV7	Enterobacteria_phage	4.8e-73	28.4
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WP_015701504.1|372685_373069_-	type II toxin-antitoxin system RelE/ParE family toxin	NA	NA	NA	NA
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WP_005651206.1|374745_375156_-|tail	phage tail protein	NA	NA	NA	NA
WP_015701508.1|375164_375695_-|tail	phage tail protein	M9NZH5	Enterobacteria_phage	2.9e-17	42.4
WP_015701509.1|375697_376009_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_015701510.1|375989_376313_-	DUF2190 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_041175036.1|376391_378368_-|protease	Clp protease ClpP	A0A1W6JT88	Pseudomonas_phage	2.4e-197	57.1
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WP_015701512.1|378590_380105_-|portal	phage portal protein	K7PJP3	Enterobacteria_phage	1.3e-158	58.6
WP_015701513.1|380108_380330_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_015701516.1|381008_383129_-|terminase	phage terminase large subunit family protein	K7PH52	Enterobacterial_phage	6.0e-271	66.2
WP_015701517.1|383131_383605_-	DUF1441 family protein	K7PJY2	Enterobacterial_phage	1.6e-38	51.7
WP_015701518.1|383874_384156_-	hypothetical protein	Q776X1	Haemophilus_phage	1.4e-29	71.1
WP_015701519.1|384067_384403_-	DUF2570 family protein	Q7Y5U9	Haemophilus_phage	2.6e-27	67.7
WP_015701520.1|384375_384918_-	lysozyme	A0A0M3LPQ1	Mannheimia_phage	1.5e-45	51.4
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WP_015701521.1|385255_385834_+	hypothetical protein	A0A0M3LS77	Mannheimia_phage	5.2e-68	63.0
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WP_005643898.1|387933_388302_-	hypothetical protein	Q7Y5V5	Haemophilus_phage	1.8e-37	63.4
WP_015701525.1|388303_388858_-	recombination protein NinG	D0UIK8	Aggregatibacter_phage	4.8e-63	71.3
WP_015701526.1|388860_389064_-	elongation factor Tu	NA	NA	NA	NA
WP_005662137.1|389143_389560_-	recombination protein NinB	Q7Y5V7	Haemophilus_phage	9.3e-59	82.4
WP_015701527.1|389560_390484_-	N-6 DNA methylase	A0A0M3LQ47	Mannheimia_phage	1.2e-95	57.5
WP_005633909.1|390480_390705_-	hypothetical protein	A0A0M3LR43	Mannheimia_phage	1.1e-10	47.9
WP_015701528.1|390701_392075_-	AAA family ATPase	A0A0M3LQC0	Mannheimia_phage	1.1e-124	52.5
WP_015701529.1|392071_392899_-	hypothetical protein	Q7Y5W1	Haemophilus_phage	1.8e-77	56.8
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WP_015701531.1|393055_393298_-	hypothetical protein	A0A0M3LR73	Mannheimia_phage	7.9e-10	44.2
WP_015701532.1|393366_393810_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_015701533.1|393864_394047_-	Cro/Cl family transcriptional regulator	A5VW97	Enterobacteria_phage	8.2e-12	61.7
WP_013527627.1|394151_394811_+	helix-turn-helix domain-containing protein	A0A0M3LSL8	Mannheimia_phage	1.3e-38	43.0
WP_015701534.1|394856_395294_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_015701535.1|395283_395805_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_015701537.1|397108_397603_+	hypothetical protein	A0A0M3LSK4	Mannheimia_phage	1.6e-17	36.9

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NC_016809|519877:577028|DBSCAN-SWA
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MNKEFEIRSSEITADSENKKLVGYVVKWNSPSEVLYCDFVEQFSANAFSESLSSGADVRALFEHDHSKLLGRTRAGTLKLEEDTIGLRFELMPPDTTLGRDLLVSVERGDITGMSFGFWAKEETWNFDVEPCQRTVAKAELFEITVTSIPAYPESSVEIAKRSMATAKGKTQGKSTALLKQWLDVAEA

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_005659843.1|521169_522036_-	pyridoxal kinase	NA	NA	NA	NA
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WP_015701627.1|523144_523930_-	zinc ABC transporter permease subunit ZnuB	NA	NA	NA	NA
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WP_077643694.1|524907_526332_+	murein DD-endopeptidase MepM	A0A2K9VGT1	Pontimonas_phage	3.8e-19	48.7
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WP_015701629.1|527865_528834_-	23S rRNA pseudouridine(955/2504/2580) synthase RluC	NA	NA	NA	NA
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WP_005649264.1|533566_534376_+	bifunctional hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase	NA	NA	NA	NA
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WP_015701634.1|535050_536355_+	MHS family MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_015701635.1|536523_537903_+|tRNA	tRNA 5-hydroxyuridine modification protein YegQ	Q6DW11	Phage_TP	1.9e-164	77.2
WP_015701636.1|537936_539256_-	ATP-dependent RNA helicase SrmB	A0A1V0SIR5	Klosneuvirus	6.2e-48	30.5
WP_041175042.1|539325_540024_+|tRNA	tRNA1(Val) (adenine(37)-N6)-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_015701638.1|540055_541111_-|tRNA	tRNA/rRNA methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_015701639.1|541257_542625_+	CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_005652140.1|542668_543394_-	fatty acid metabolism transcriptional regulator FadR	NA	NA	NA	NA
WP_015701640.1|543518_545063_+	Na(+)/H(+) antiporter NhaB	NA	NA	NA	NA
WP_015701641.1|545072_545606_+	disulfide bond formation protein DsbB	NA	NA	NA	NA
WP_015701642.1|545660_547493_-	glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)	A7IW18	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	1.9e-132	44.0
WP_005630954.1|547605_547878_-	HU family DNA-binding protein	A7KV42	Bacillus_phage	5.9e-22	61.1
WP_015701643.1|548017_548608_-	YjaG family protein	NA	NA	NA	NA
WP_015701644.1|548643_549438_-	NAD(+) diphosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_005649300.1|549504_550101_-	Fe-S biogenesis protein NfuA	NA	NA	NA	NA
WP_015701645.1|550176_550863_-	ComF family protein	NA	NA	NA	NA
WP_015701646.1|550875_552213_-	type IV pilus secretin PilQ family protein	NA	NA	NA	NA
WP_015701647.1|552222_552636_-	competence protein	NA	NA	NA	NA
WP_015701648.1|552632_553154_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011272049.1|553150_553657_-	competence protein ComB	NA	NA	NA	NA
WP_005693722.1|553657_554455_-	competence protein A	NA	NA	NA	NA
WP_015701649.1|554553_557148_+	penicillin-binding protein 1A	NA	NA	NA	NA
WP_015701650.1|557224_558070_+	23S rRNA (adenine(2030)-N(6))-methyltransferase RlmJ	NA	NA	NA	NA
WP_005629464.1|558222_558552_+	YbaB/EbfC family nucleoid-associated protein	NA	NA	NA	NA
WP_005626527.1|558684_559287_+	recombination protein RecR	NA	NA	NA	NA
WP_015701651.1|559302_561258_+	DNA topoisomerase III	A0A1X9I6W8	Streptococcus_phage	2.4e-40	31.2
WP_005649335.1|561366_561708_+	preprotein translocase subunit SecG	NA	NA	NA	NA
561971:561992	attL	NA	NA	NA	NA
WP_015701652.1|562035_563262_+|integrase	tyrosine-type recombinase/integrase	A0A1B5FPC6	Escherichia_phage	1.2e-61	36.4
WP_015701653.1|563433_565203_-	DNA primase	Q7M2A8	Enterobacteria_phage	5.5e-76	37.5
WP_015701655.1|565574_566213_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_015701656.1|566199_566406_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_015701657.1|566395_566596_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_015701659.1|566949_567879_-	host cell division inhibitor Icd-like protein	NA	NA	NA	NA
WP_015701660.1|568045_568357_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_015701661.1|568368_568578_-	AlpA family phage regulatory protein	NA	NA	NA	NA
WP_050792024.1|568750_569713_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_015701664.1|570436_570721_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_015701665.1|570717_572385_-|terminase	terminase large subunit	A0A2H4JB64	uncultured_Caudovirales_phage	3.6e-247	71.6
WP_015701666.1|572391_572760_-|terminase	phage terminase small subunit P27 family	A0A2H4JHS3	uncultured_Caudovirales_phage	8.0e-38	67.0
WP_015701667.1|572956_573343_-	HNH endonuclease	A0A2H4JAS8	uncultured_Caudovirales_phage	2.4e-29	53.6
WP_015701668.1|573357_573672_-|head,tail	phage gp6-like head-tail connector protein	A0A2H4JD08	uncultured_Caudovirales_phage	1.6e-18	48.5
WP_041175043.1|573658_574003_-|head	phage head closure protein	NA	NA	NA	NA
WP_041175044.1|573986_575219_-|portal	phage portal protein	A0A2H4JFJ9	uncultured_Caudovirales_phage	6.2e-143	62.5
WP_015701671.1|575220_575787_-|head,protease	HK97 family phage prohead protease	A0A2H4JB68	uncultured_Caudovirales_phage	6.3e-50	63.4
WP_015701672.1|575840_577028_-|capsid	phage major capsid protein	A0A2H4JED2	uncultured_Caudovirales_phage	9.5e-133	63.3
577394:577415	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NC_016809|1378414:1386928|DBSCAN-SWA
TTTAATCAATATGGAAACAAGCGATTAATTTTCCATCAGTATATTGTTCCAAGTGCGGTTGATTTTCACGACATTTTTCTGTCGCTTTCCAACAACGAGGATTAAATGCACAGCCTTTTGGCGGATTAATTGGGCTTGGCAATTCGCCTGTCAGCTTAATACGCTCACGGCGCAAGTTTGGCGACAAACGTGGTGTCGCTGAAAGTAACGCTTTGGTATAAGGATGCTGAGGATTAGAGAAAATTTGTTCTGTCGTCCCTTTTTCAATACAACGACCTAGATACATTACCATCACTTCATCAGCGATATGTTCTACCACAGAAAGATCGTGTGAAATGAATACGTAAGACAAGCCTAATTCATCTTGTAAATCCATCATTAAATTCAGTACTTGTGCACGCACGGAAACATCCAATGCAGAAACAGGCTCATCGGCAACAACGACATCGGGATCTAACATTAAACCACGAGCGATGGCAATACGTTGGCGTTGTCCGCCTGAGAACATGTGGGGATAACGATCATAAAATTCAGCGCGCAAGCCCACTTTTTCCATCATCGATAAAACTTTTTCTCGACGTTCTTTGGCGGAAAGTTTTGTATTGATGATTAATGGTTCTTCCAAAATTGAACCAATCTTTTTGCGTGGATTTAACGATGCGTAAGGATTTTGAAAAACTATTTGAATTTTTTTACGACGTAGTGCTTTTGTTTCAGAATCATTTTCTAAAAAATTATGTCCTTTGTAATAAAGTTCGCCTTTGGTTGGTTCTTCAATCATTGTCAATAAACGACCTAGCGTTGATTTTCCACAACCAGATTCCCCCACGACTGCTAAAGTTTTACCTCGTTCAAGCTGAAAAGAGACACCATCCAACGCTTTTACTTGCTGTGGTTTTGCAAACAAGCCTTTTTTTACAGGGTAATATTTTTTTAAGCCAATGGCATTTAATAATGGCGTATTTTCTTTTACTTCATTCGTCATTATTAAGCTCCTTGATATTCAACTGGATTGCCTTGCTCGTTCAGCGGAGTATGGCATTTTACTTTACGCGAACCGATATGATGCAATTGAGGTTCAACTTGGCGACAATATTCGGTGGCATAAGGGCAGCGAGGATTTAATAAACAGCCTGCTGGGCGATCGTATTTTCCAGGGACGACCCCTTGTAATGATTCTAAGCGAGATTTTCCCTCTGCAAATTCAGGTAATGAACGTAACAAGGCTTGTGTGTAAGGGTGTTTTGGCTCGCGGAAAATATCTTTTGCGGTGCCTTCTTCAACGATTTGTCCAGCATACATCACGATAATTCGCTCTGCCGCTTCAGCCACAAGTGCTAGATCGTGAGTAATCAAAATTAGGGACATGCATTCTTTCTTTTGCAATTCAAGTAAGAGTTCCATAATTTGAGCTTGGATAGTCACGTCCAATGCCGTGGTTGGTTCGTCAGCAATCAATAATTTAGGTCTGCAAGCAATTGCCATCGCAATCATCACGCGCTGGCTCATTCCACCAGACAGCTGATGGGGATAAACATCAATCCGAGATTCAGGATCAGGAATACCGACCAATTTTAAAAGCTCTAAAGTGCGGTCTTTTCTTGCCTTTTTTGTGCCGCCCTCGTGAGTTTTTAACGCTTCCATAATTTGGAAGCCCACAGTATAAGCAGGATTCAAACTTGTCATCGGATCTTGGAAAATCATTGCTACATCAGCACCAATAAGCTGGCGTTTAGCTTTACTCTCTAAAGTGAGTAAATCAGTATTTTCAAATTGCAAGGATTCAGCAGATACACGTCCAGGATGATCAATTAATCCCATAATTGCGAGAGAACTCACAGATTTACCCGAACCTGATTCTCCCACAATGCCAAGCACTTCGCCTTGTGCGACTTGATAGCTAATGCGATCCACTGCTTTAAATGGCGTTTTTTTATCGCCAAAGTGAACAGAAAGTTCTTTTACGTCTAATAATGCCATTCTGTTTTCCTATTGTTTGAGTTTTGGATCAAGGGCATCACGCAAGCCATCGCCCATTAAGTTGAAAGCTAATACCAAAGATAAAATCACTAAGCCAGGAATTGTAACTAACCAGTTTGCCGCTTGCATAAAACCGCGTGCTTCTGAAAGCATTGTGCCAAGTTCAGGTGTTGGTGGTTTTGCACCAATGCCTAAGAAACCAAGTGTTGCGAGTTCTAAGATGGCATTGGAAATGCCCATTGTCATTTGCACAATTAAAGGGGCTAAACAGTTTGGTAAAATCACAATAAACATGAGGCGTAAAATACCTGCCCCTGCCACTTTAGATGAAGTCACATAATCACGATTTTTTTCATTCATCATCGCTGCTCGAGTTAAACGCACATAGCTAGGAATCGATACCACGGCGATCGCTAAAGTGGCATTGGCGAGTGATGGCTCTAAAATAGAGACGACTACAATCGTCAAAAGTAAGTTTGGAATCGCGAGCATAATATCAATTAGGCGAATGATAATTGTATCTAGCACGCCGCCATAATAGCCAGAAATTAAGCCAAGACTGGTGCCGAAGGCACAGGATAGCAATACAATGACAAATCCCGCAAAGACGGAAATTCGCGTTCCATAAATAATACGCGAAAGAATATCTCGCCCAATATCGTCTGTGCCGAGTAAATAAGCAGGATTACCGCCCTCATACCAAGCAGGGGGAAGTAAAAGTGCGGTACGATTTTGTTCTGTTGGATCAAAAGGTGCAATATAAGGTGCGAGAATGCTGATTAAGGCAACAATCAAAATAAAAATTAAACCAATTAGCGCACCACGATTTTGTTTAAAGTAAAACCAAAATTCTTGTAAGGGTGTTTTTGGCGCGAAAGTTAAAGGCGTGTCAGACATAATTTCTCCTACAATTAATGACGGATACGCGGATTGACCACACCGTAAAGTAAATCGACGGTTAAATTCACCACAATAATAATCGTCGCAATAATCAGTACAGAACCTTGCAACACTGGATAATCACGGGCTTGAATGGCATCAATAATCCATTTTCCAATCCCCGGCCAAGAGAAAATAGTTTCTGTGAGAACTGCACCAGAAAGCAATTGACCTACAATTAACCCGACCACAGTGACAACAGGAATTAACGCATTACGCAATGCGTGAACAATAACAATTCGAGTATAGCTTAAACCTTTTGCCTTTGCCGTGCGAATGTAATCTTCACCTAACACTTCCAACATCGCAGAGCGTGTCATACGCGTAATAATGGCGAGAGGAACTGTGCCTAAGACGATGGCAGGAAGAATTAATGATTTCACCGCATTTTCGAAGGCACCAGAAACACCTGAAAGCCAGCTATCAATAAGCATAAATCCTGTTGGTGTATCGATCCAAAATTCATTATCTAAACGCCCACCTTGTGGCAAACCGAGTTGTGGCGAAACATATAAAATTAAAATTAAACCCCACCAGAAAATCGGCATAGAATAACCTGTGAGCGATGCAGCTGTAACGGTGTGAGAAATCCAACTGTCTTTTTTTACTGCGGCAATCGTGCCTAAAATTATTCCACCTAATAATGACCAAAATAACGCAAAAAAAGCTAATTCAGCGGTAGCAGGAAAAAGCGTAAAAAATTCAGTAAGGACAGGTTGTTGAGTGCGGAACGATGCACCGAAATCCCCTTGAATTACATTGCCAATATAGTGGAAATATTGCTGATAAAGAGGTAAATCTAAACCCAATTGGTGCATCATTTGTTGATGTACTTCTGCCGTTAAGCCGCGTTCCCCCATCATAATTTCCACAGGATCACCGGGAATAAAATGCACAAGGGCAAAGGTAATAAGAGTAATGGCAATAAAAGTAGGGATCACCATTAAGATTCGTTTGAATACAAATTTAAACATTCCATCACTCGTAGATAATAAAAGTGCGGTAAAAATTCACCGCACTTTTCAAAGAAATTAATCGGTAAAAAATATAATACTCTTGAATTCTACCGCACTTTTTCCAGTTTTGCCAAATGCGCAATAAGCCATTTAATGCCTTGCGCTTGGAACGCTATTTGTAAACGTGTGTTATTTTCAGATCCTTCCACATTAATCACTGTGCCGAAACCAAATTTTTCGTGTTTAACTTTTTGACCCATTTTCCATTCATTTTCGACCGCACTGGTATTCGACAATGAACCGACTTTTGCTAGGGTCATCGCACGCGTGACTGTCCCTCGTAAACGAATTTCTTGGATACATTCTCTCGGTAATTCTGCGATAAACCGTGATGGCAAATGGCGTTCTTCTTTGGCATATAATCGACGGCTTTCCGCATAAGAGATGGTCAGTTTTTTCTGTGCGCGAGTAATACCGACATAAGCTAAACGACGCTCTTCTTCTAAACGTCCGGGTTCTTCAAAAGAACGAAAACTTGGGAATAATCCTTCTTCTACGCCCACCATAAATACACGAGGAAATTCTAAGCCTTTCGCAGAGTGCAACGTCATCATTTCTACACAAGATTGATGCGGCGAGGCTTGTTCTTCTCCAGCTTCTAAGGAAGCGTGCGTTAAAAAGGCAGTGAGTTCGGTCATTTCTTCCGCATTATCAGGTTTGATAAATTCACGGGTTGCGGTAACTAATTCTTCCAAATTTTCAATACGCACTTCGCCTTTTTCGCCTTTTTCTTGTTGATACATTTCATATAAGCCCGAATGTTTAATCACAAAATCAGTTTGTGCGAAAAGCGGCATTTCTGCGGTATCAAGTTGTAGTGAATTAATTAATTCTTGGAAACGTAATAAGGCTGTTGAGGCTCGCCCTGCCAACATATTTTCTTGTGTTGCGACTTGTACTGCTTGCCATAAGGTAATTTGGCGTTCACGTGTTAAGTTACGCAATATATCTAAAGTGCGGTCGCCAATGCCACGGGTTGGCGTATTAATTACACGCTCAAAAGCCGCATCATCTTGACGATTATTAATCAAACGAAGATAGGCTAACGCATCTTTAATTTCTTGACGTTCGAAGAAACGCATACCGCCATAAATACGATATGGAATTTGACAACGAATTAAGGCTTCTTCAATAACCCGTGATTGGCTATTACTACGATAAAGTACAGCGCAATCATCAAGTTTTCCGCCATTTTCTACCCAATCCTGAATTTGTGAAGCGACAAATTTTGCTTCGTCTAATTCATTAAAGGCAGCATAGATGCCCACAGGATCGCCTTTTTCACCCTCTGTCCATAAATTTTTACCAAGACGATCACTATTGTTTGCAATTAATTCATTTGCGCTGTTTAGGATATTGGCGGTAGAACGATAGTTTTGTTCAAGGAGAATTGTCTCGGCTTTGAAATCTTTCAAGAATTTTTGGATATTTTCAATTTGTGCGCCACGCCAACCGTATATAGATTGATCATCATCGCCCACAATCATGACTTGGCCTGTTTTTCCAGCAAGAATTTTGATCCATTTATATTGGATTTTATTGGTGTCTTGAAATTCATCCACCAAAATATGCTGAAAACGTTGTTGATAACGTTGCAAAATTAATGGTTTTTTCTCAAATAATTCATAGACCCGAATTAATAATTCAGCAAAATCGACCAACCCTGCGCGATCGCAAGTGTCTTGATAGATCTGATAAATTTTAATCCATTCACGTTCTTGGCGATCATTAAAATCTTCAATATCATTTGGTCGCAAGCCTTCATCTTTTTTGTTATTGATGTACCAACAAGCCTGTTTAGGCGGAAAAGCTTTTTCATCAAAATTATGTAATTTTAATAATCGTTTAATTAAACGAAGTTGATCTTCTGAATCTAAAATTTGGAAATCTTGTGGCAATCCCACATCTAAATGATGAGCTCGTAATAAACGATGGGCAATGCTGTGGAAGGTTCCAATCCACATACCAACTAATTGATGTTGTGCGTGTTTGGCAAGGGTAGATTGAATACGATGACGCATTTCTGCTGCGGCTTTATTGGTAAACGTCACCGCCATAATGCTGCCTTCAGAAATATTTTCGACCGCAATTAACCAAGCAATACGGTGCGTCAATACACGCGTTTTGCCCGATCCTGCACCAGCTAGCACTAAGTGATTACCAAGAGGAGCAGCTACGGCTTCGCGTTGTTTATCGTTGAGTCCGTCAAGTAATTCAGAAATATCCATCATAAACTATCTTTAATCTGTTTAAATTTACAGTTATTATAGTCCCATCTATCTTGTGAAACAATAAGATTTGTGAGTATATCAAAAGTAGGGTAGAACATTTTAAGAATAATATTAAGCGGGATTCTCCTATATCCTTAAACTCAACATCAAAACCATATGCTTTGAAAGCTATTTTTATACTATCTATAAACAAATTTTTAATTCGTTTACCTCTCATTCCTAAAATGCAAGGTTTCTCATTTTTCCAAAAATACCCATGATGAACAATAATAGTATAGGAATGTTGTTTAATGACTTAATCAATACTTGATTTGCTAGGATTCCTGTAATGATTTTATAAACATTTGCTTTTCCTTCTACTTGCACGCCATTTTACGCATAGTCGGTGATTTTGTCCGAATTAAGTTTTAGGTTAAAAAGTTACTCAAATTCAATGTTATTCATAATTAATACAAATAAGAAAGAGTGAGATATGGTACAAAATTCCAAAAAATGGTTAGCACAAAGGAATGGGAGAAGTGTGCTATCCAAGTTTCATTATGATCACTCTCTAAAGTAGAAAACGTCATATACTAAATTATATACTGATCAAAAAATAATATTTCCTTCTATTACTCAATACCAATCAATTTATGTGTTTGTAAACTTAGCTGCCATTTAGGTTTATTTGAACGTTGATTCAATTGACCAAGTAAAGTGATAGTCTCAAGTAAATTCATTTTCCCATCAATTTCACAAGGTGAAAGATAGTAATTCTTTGCTTTTATTTTTTGCTCGATCAATTCACAAAATGATGGCATATTACTGTCCATTACAATGCGTACTTCATTTGCAAATGGAATGCAACGTTTTTCATACTTATGAGCATAAAGGCTCTTAGGACTCGTCGAAATATAATCTATTTGTGCAGGAATTGCTTTTAGACCATTGGTTTCAATTGCAAGAAAATAGCCATCTGATTTAAATTGCTCAAGTAAGTATTCAATTTTTGGTACAATTGTTGGCTCACCACCTGTGATGATAATATTCTTTGACGAAAATGACCGCACTTTTTCTAGAATTTGTGATACAGACCAGCGTTTAAAATTATTATAAGGTGTATCACACCAAGGACAGTCTAGATTGCATTTACCAAATCGTACAAAAACACTTGGCATTCCCGTATTGAAGCCCTCCCCTTGCAGACTTTCAAAAATTTCGACTATGTTAAAGTTCGGTTCAAAATCATGATATTTTTCCATCAACATTTACTCCTGATACTCGCAAAATGAAGTTGGGGTTTCCCATAAACGAATGGATGATATGGACAGTTGTTCATCATGTTTTAAACGATTAAAAATAAAACGAGCTATTTCTTCTGCCGTAGTTCTAAAGGGAACACCAAAAGTTTTTGAGTTTAACTTTTGCAATAGAGTGGCAATTTGGCTTTCTCGCTCATTGGTTTGATCATAAATAAAGGCGTGATCCATCGGATCTAAAATAACTTTTTTCACAATAGACTTTAGATCTGAAAAATCAATGACCATTGCTTTTTTTGCACCTGATTCATATAAGTCACCCGAAATTTCAACTTGTAATTTATATGTGTGTCCATGTAAATTTTGACATTTCCCATCATGTCCATCTAATAAATGTGCCATGTCAAAGCTAAATTCTTTGGAAATTTTAAACATTTTTTCTACCTTTTTGAGTCAAATATTTCTTTAGACCTTTATTGCGTAAAATACAGCTTGGGCATTTTCCGCATCCACCTTCGATGCCTTCATAGCAAGTGTGAGTATGTTTTTGTACATAATTTAATACGCCTAATTCATCAGCAAGCTGCCAAGTTTGGGCTTTAGTGAGATACATTAATGGTGTTTTGATATTGAATTGATAATCCATAGCTAAATTTAATGTGACATTCATTGACTTGATAAACACATCTCGGCAATCTGGATAACCGCTGAAATCTGTTTCACATACGCCAGTGATAATATCTTGAATGCCTTGGCCTTTCGCATAAATCGCTGCATAAAGTAAAAATAGGGCATTGCGACCATCAACAAAAGTGTTTGGCAATTCACTCTCTTTTTGCTCAATATGCGCCTGTTCATCCATTAATGCATTATGCGTGATAGCTTTCATAACAGATGTATCAATCAAGGTTTGTTTAATGCCGAGATCTTGCGCAATGGCACGCGCCTTTTCTAACTCAATAGCATGACGCTGCCCATATTGAAAGGTAATGGCTTCTATGTTTTCTTTGCCGTATTCAGCAATAGCTTGGAATAAACAAGTCGTGGAGTCTTGTCCACCTGAAAAGATGACAATCGCTTTACGATCGTGGTTTGGATTGAAAATATTCAT

Protein sequences of DBSCAN-SWA_3

>NC_016809|1378414:1386928|1382395_1384576_-|WP_041175117.1|DBSCAN-SWA
MDISELLDGLNDKQREAVAAPLGNHLVLAGAGSGKTRVLTHRIAWLIAVENISEGSIMAVTFTNKAAAEMRHRIQSTLAKHAQHQLVGMWIGTFHSIAHRLLRAHHLDVGLPQDFQILDSEDQLRLIKRLLKLHNFDEKAFPPKQACWYINNKKDEGLRPNDIEDFNDRQEREWIKIYQIYQDTCDRAGLVDFAELLIRVYELFEKKPLILQRYQQRFQHILVDEFQDTNKIQYKWIKILAGKTGQVMIVGDDDQSIYGWRGAQIENIQKFLKDFKAETILLEQNYRSTANILNSANELIANNSDRLGKNLWTEGEKGDPVGIYAAFNELDEAKFVASQIQDWVENGGKLDDCAVLYRSNSQSRVIEEALIRCQIPYRIYGGMRFFERQEIKDALAYLRLINNRQDDAAFERVINTPTRGIGDRTLDILRNLTRERQITLWQAVQVATQENMLAGRASTALLRFQELINSLQLDTAEMPLFAQTDFVIKHSGLYEMYQQEKGEKGEVRIENLEELVTATREFIKPDNAEEMTELTAFLTHASLEAGEEQASPHQSCVEMMTLHSAKGLEFPRVFMVGVEEGLFPSFRSFEEPGRLEEERRLAYVGITRAQKKLTISYAESRRLYAKEERHLPSRFIAELPRECIQEIRLRGTVTRAMTLAKVGSLSNTSAVENEWKMGQKVKHEKFGFGTVINVEGSENNTRLQIAFQAQGIKWLIAHLAKLEKVR
>NC_016809|1378414:1386928|1381304_1382306_-|WP_005694256.1|DBSCAN-SWA
MFKFVFKRILMVIPTFIAITLITFALVHFIPGDPVEIMMGERGLTAEVHQQMMHQLGLDLPLYQQYFHYIGNVIQGDFGASFRTQQPVLTEFFTLFPATAELAFFALFWSLLGGIILGTIAAVKKDSWISHTVTAASLTGYSMPIFWWGLILILYVSPQLGLPQGGRLDNEFWIDTPTGFMLIDSWLSGVSGAFENAVKSLILPAIVLGTVPLAIITRMTRSAMLEVLGEDYIRTAKAKGLSYTRIVIVHALRNALIPVVTVVGLIVGQLLSGAVLTETIFSWPGIGKWIIDAIQARDYPVLQGSVLIIATIIIVVNLTVDLLYGVVNPRIRH
>NC_016809|1378414:1386928|1380402_1381290_-|WP_015702107.1|DBSCAN-SWA
MSDTPLTFAPKTPLQEFWFYFKQNRGALIGLIFILIVALISILAPYIAPFDPTEQNRTALLLPPAWYEGGNPAYLLGTDDIGRDILSRIIYGTRISVFAGFVIVLLSCAFGTSLGLISGYYGGVLDTIIIRLIDIMLAIPNLLLTIVVVSILEPSLANATLAIAVVSIPSYVRLTRAAMMNEKNRDYVTSSKVAGAGILRLMFIVILPNCLAPLIVQMTMGISNAILELATLGFLGIGAKPPTPELGTMLSEARGFMQAANWLVTIPGLVILSLVLAFNLMGDGLRDALDPKLKQ
>NC_016809|1378414:1386928|1385190_1385826_-|WP_080006075.1|DBSCAN-SWA
MLMEKYHDFEPNFNIVEIFESLQGEGFNTGMPSVFVRFGKCNLDCPWCDTPYNNFKRWSVSQILEKVRSFSSKNIIITGGEPTIVPKIEYLLEQFKSDGYFLAIETNGLKAIPAQIDYISTSPKSLYAHKYEKRCIPFANEVRIVMDSNMPSFCELIEQKIKAKNYYLSPCEIDGKMNLLETITLLGQLNQRSNKPKWQLSLQTHKLIGIE
>NC_016809|1378414:1386928|1379400_1380393_-|WP_015702106.1|DBSCAN-SWA
MALLDVKELSVHFGDKKTPFKAVDRISYQVAQGEVLGIVGESGSGKSVSSLAIMGLIDHPGRVSAESLQFENTDLLTLESKAKRQLIGADVAMIFQDPMTSLNPAYTVGFQIMEALKTHEGGTKKARKDRTLELLKLVGIPDPESRIDVYPHQLSGGMSQRVMIAMAIACRPKLLIADEPTTALDVTIQAQIMELLLELQKKECMSLILITHDLALVAEAAERIIVMYAGQIVEEGTAKDIFREPKHPYTQALLRSLPEFAEGKSRLESLQGVVPGKYDRPAGCLLNPRCPYATEYCRQVEPQLHHIGSRKVKCHTPLNEQGNPVEYQGA
>NC_016809|1378414:1386928|1385826_1386252_-|WP_005647466.1|DBSCAN-SWA
MFKISKEFSFDMAHLLDGHDGKCQNLHGHTYKLQVEISGDLYESGAKKAMVIDFSDLKSIVKKVILDPMDHAFIYDQTNERESQIATLLQKLNSKTFGVPFRTTAEEIARFIFNRLKHDEQLSISSIRLWETPTSFCEYQE
>NC_016809|1378414:1386928|1386244_1386928_-|WP_015702110.1|DBSCAN-SWA
MNIFNPNHDRKAIVIFSGGQDSTTCLFQAIAEYGKENIEAITFQYGQRHAIELEKARAIAQDLGIKQTLIDTSVMKAITHNALMDEQAHIEQKESELPNTFVDGRNALFLLYAAIYAKGQGIQDIITGVCETDFSGYPDCRDVFIKSMNVTLNLAMDYQFNIKTPLMYLTKAQTWQLADELGVLNYVQKHTHTCYEGIEGGCGKCPSCILRNKGLKKYLTQKGRKNV
>NC_016809|1378414:1386928|1378414_1379398_-|WP_005663823.1|DBSCAN-SWA
MTNEVKENTPLLNAIGLKKYYPVKKGLFAKPQQVKALDGVSFQLERGKTLAVVGESGCGKSTLGRLLTMIEEPTKGELYYKGHNFLENDSETKALRRKKIQIVFQNPYASLNPRKKIGSILEEPLIINTKLSAKERREKVLSMMEKVGLRAEFYDRYPHMFSGGQRQRIAIARGLMLDPDVVVADEPVSALDVSVRAQVLNLMMDLQDELGLSYVFISHDLSVVEHIADEVMVMYLGRCIEKGTTEQIFSNPQHPYTKALLSATPRLSPNLRRERIKLTGELPSPINPPKGCAFNPRCWKATEKCRENQPHLEQYTDGKLIACFHID

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_005663823.1|1378414_1379398_-	ABC transporter ATP-binding protein	G3M9Y6	Bacillus_virus	3.2e-17	27.3
WP_015702106.1|1379400_1380393_-	dipeptide ABC transporter ATP-binding protein	G3M9Y6	Bacillus_virus	2.0e-14	30.8
WP_015702107.1|1380402_1381290_-	ABC transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
WP_005694256.1|1381304_1382306_-	ABC transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
WP_041175117.1|1382395_1384576_-	DNA helicase II	A7KV33	Bacillus_phage	1.1e-115	37.6
WP_080006075.1|1385190_1385826_-	7-carboxy-7-deazaguanine synthase QueE	A0A218M2Y8	Acidovorax_phage	4.9e-11	35.2
WP_005647466.1|1385826_1386252_-	6-carboxytetrahydropterin synthase QueD	A0A1U9WRB3	Streptococcus_virus	7.8e-21	42.7
WP_015702110.1|1386244_1386928_-	7-cyano-7-deazaguanine synthase QueC	A0A2H4J8Q7	uncultured_Caudovirales_phage	3.9e-54	50.2

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NC_016809|1645017:1677064|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_015702275.1|1648666_1649311_-	hypothetical protein	D0UIH7	Aggregatibacter_phage	3.6e-94	79.4
WP_015702276.1|1649307_1650180_-	hypothetical protein	D0UIH8	Aggregatibacter_phage	4.5e-140	86.6
WP_041175080.1|1650194_1650374_-	hypothetical protein	D0UIH9	Aggregatibacter_phage	1.9e-21	94.9
WP_013525922.1|1650456_1650765_-	hypothetical protein	D0UII0	Aggregatibacter_phage	1.9e-45	80.4
WP_015702277.1|1650770_1651547_-	hypothetical protein	Q7Y5T0	Haemophilus_phage	1.3e-85	68.9
WP_015702278.1|1651552_1653643_-	hypothetical protein	Q7Y5T2	Haemophilus_phage	1.4e-219	70.6
WP_015702279.1|1653793_1654204_-	hypothetical protein	Q776V6	Haemophilus_phage	3.5e-50	72.9
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WP_041175128.1|1656167_1656530_-	hypothetical protein	Q7Y5T6	Haemophilus_phage	2.5e-44	72.3
WP_015702283.1|1656594_1656966_-	hypothetical protein	Q776V7	Haemophilus_phage	5.2e-45	70.7
WP_015702284.1|1656962_1657409_-	hypothetical protein	Q7Y5T8	Haemophilus_phage	1.5e-54	70.9
WP_015702285.1|1657409_1657772_-	DUF4054 domain-containing protein	Q7Y5T9	Haemophilus_phage	1.8e-34	67.2
WP_015702286.1|1657781_1658696_-	DUF2184 domain-containing protein	Q7Y5U0	Haemophilus_phage	2.1e-151	90.5
WP_015702287.1|1658705_1659146_-	hypothetical protein	D0UIJ1	Aggregatibacter_phage	1.3e-47	71.1
WP_015702289.1|1660348_1661782_-|capsid	minor capsid protein	Q7Y5U5	Haemophilus_phage	6.6e-88	76.7
WP_015702290.1|1661810_1663142_-	DUF1073 domain-containing protein	Q7Y5U6	Haemophilus_phage	3.0e-212	84.7
WP_015702291.1|1663143_1664487_-|terminase	PBSX family phage terminase large subunit	A0A220NQL3	Acinetobacter_phage	1.2e-123	53.2
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WP_041175081.1|1665646_1665928_-	hypothetical protein	Q776X1	Haemophilus_phage	6.1e-30	71.1
WP_041175082.1|1665839_1666163_-	DUF2570 family protein	Q7Y5U9	Haemophilus_phage	1.7e-20	55.6
WP_015702296.1|1666155_1666758_-	glycoside hydrolase family 19 protein	Q7Y5V0	Haemophilus_phage	9.6e-57	53.9
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WP_015702300.1|1668759_1669053_+	putative addiction module antidote protein	A4JWV1	Burkholderia_virus	3.2e-13	45.5
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WP_005662137.1|1670294_1670711_-	recombination protein NinB	Q7Y5V7	Haemophilus_phage	9.3e-59	82.4
WP_015702303.1|1670747_1670972_-	hypothetical protein	A0A0M3LR43	Mannheimia_phage	1.1e-10	47.9
WP_015702304.1|1670968_1671595_-	replication P	A0A0M3LS65	Mannheimia_phage	8.8e-29	37.5
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Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NC_016809|1765691:1777298|DBSCAN-SWA
TTTAACTTTTCTCTTTATTAAATATAGCCGCTAGTTGATTCGGACTAAACCGCCAACCATTTTCCCCACCGCAAATCGCATTAAAACACCATTCACTGCAAAAATATTTTGAGCGTTTTTGTTTGATGCCTAGTACGATACCTAACGCACCCCACCAGTCATATTTACAGCCCAAAGTGCGGTCAAAATAGGCTTTGATTTGTGCTTCGGTAACTCCCTCTAGCTCAATTAACTCCCATTTTTCTCTATCATAAACATCAATTTGCTTACAACGCACGCCACCGTCTCGAATTGAAGACGAATAACACTCGTACATCACTTCTGTTTCATAGTGATGCCCACTGAAAAATACTTCTTTCATTACTGCAATTTCACAATGCGAATACACGCCTTTTGTCAATTTACGAGTGAGCCAGTCACTCAAACGTGCCAAAAGTGCGTTCGGGTTTTTACCCGTTTTTTTACCTTTGTATAATGCGAGATAGATTTTAGTGCCTATCATTGTTGTGCCTCCGCTAGTTGTCGCATTTTTGAAACAATATCGTCATGAATGTTTTTCAGTTCTTCATCACTCAACGCCTCATGCTTTAACTCATACTTACGCATTCTTTGCACTGCTAATTGTTGTTGCAATGCACGTAATCTTTCTGCTTGCTGAAGAATCAAAAGTGACGCAGACTGATTATCAAGACCCGCAACCGTTGCAAAACTGCTAATATAAACGCTTACTTCTCCAGCAAAATTTGCTTCTTTAAAGGCAATAGCGGCAGCTTCTCGCTCCTTATACTCTTCGGCAAACCTTGTCCATCTAGAACTAATGTTCGCCGCTGTATCATCAATGCTATCAACTAGATTTTTAATGAGTTCACGCTTAATTTCAGTTTTCTTTTTTTTATCGACAATCCAGCTGTTTCCGTTCCATTTGTGAAATTCTGTTGGTTGTCTATCAACTAGAATGTATTGACTTTTAAAATCAATAAGTTGTTTAGTCTCAAGCTCTGATTCGTTTTCTACTTCCATTTCCACAAAATCATTTAAGTTTTGCGGAATAGGGAAAATTTGATAACTATTCAAATTTTCTTTTAAAAAATAGGCTTTCATTTAACGCTCCTTTATCGAATATCAATGCGTTTTACAAAACGACCAGCAAGATCTTGAATTTGTATTGTTGTACCGTTTCTATCAACAGTCACAGCGAATGTCTTGACTTCTACATAATTCAAAAATGAACCATTACGGGGAAATCCTCGTACTTGACGAACATCAAGCCAATGAACTCCGCCTCCTGTTTTACCTTCAATTTCTGCACCCACTTCAAAACTGACGAGTTCAATATCGTTATTATCATCAAGCCTGTGCCTTTCTGATGATTGAAGATATAAAATTAACGTTTTACCGAAGCACTTCTCTGATAGAGTAATTTGCCCAGAATTCACGTTACCTTCCCAGACTTTTTTTAATGTGCCAATTTGAGATAAATCCTGTTTTGCCTGCAAAAATTGCTGATTTATATCAACTTTTGCATTGGTGATTTCTCGCAAAGTTGATTGTTTATTCTCTTCTATTTTTTGTTTAACACTCTCAGATAACGCTTGCATATTTTGTGCAAGTGTACCCGCATCTAAAGCCCCAGCATTTTCAACAACACCGAATGCCTTCACCCAGAATTGCACGTCATCAAATGTGTTTTTTGCTTTGATGCATAATTTGAGGATTAATGATTTAGGACGAGTTTCATTTCCACCTGTTGCCATTGGGCTATCTAATAGCGGATGCATAAATCCATTATCACTAAGATTATCATCAGTTGTAGTTGCAGTGCGTAATCGTGAATCTATAACTGTTTTCGTTTTGTCATAAAAAATATTACTATCACTTGAATTAACCCAGTGTGTTCTCACTTTGTGAACGTGCTTTTTAATCTCGTCACTTTGCGTTTCACCAACAGATAAATTGCTTGATGCATTTCTAATAAATCGGTCTTCAGCTAATGGCACATTTGAAATAGAACCATATTTACCAACTAAGTGACGATATAACTCGGGGTAATTTTGCTGTGTAACGGTTGTTCTGATTGAATCAAAGGCAATCCAGCCGTTAGGAATGTTATCCACGGCAAAATAAGCCGTCATCCCCACATCACTACGGGTTAAATCAGGAAGTTGGTTGCTGTCGCCCAAAGTGCGGTATAAATCGGGAAAGGTTTTGGCGTTGAACGTCGAACCATCAGCACGTAAAAAACCGACGGGATTAGTTACCCACCACCGCACCAATAGGCACGCCGTCGCCGCCTGTCTCTTTCCATTCTGACCAATTTGAGCCATTAAAAAAGCGTGTTTTGATTTTGTTATCATTTGCTTTACGTGCAATTTGACGCACCGCATTTGTTGCCCCACCGCTCACTACTTCAATATGCCATGCCCCATTTTCGGGTAGATTTTGACCGCTTGCTAAGTAATAATTGCCATCGGTTTTATAGCCATTGGCATCGCCCTGCCCTTGTTCTACTTTAAAATTCCCAATACCATAGCCTGCAAGTGTATTAGGCTTGCCTTCAATATCCGTATTAAATTGGGGTTTTGCCCCAGCGTGGTAGATTTTTTGATTGTTATATGACAATTCCCCATTTGCCCGAATACGAATGGTGCCGATAGCTCGGTTATTTTTTTTATACTCTATCCAGCCGTCGCCATCATTCGCCCCCATATTTAAGAGATGATTAGCATTTGCATAAGTTTGCGAATCAGCCACCCCAATGCCACGAAACCCAATAATTTTAGATTCAAAACTTTTGGTACCTTGAATCGATTCATTGCCCCTTAATCCCACTTTGCTCTCTGCGGCAGTTTTGGCTTCTACTGCTTTGTCATAGGCGGTTTTCACGGCTTTTGATGTTGCAGCTTCGGTTTCGCTGTCGCTGTTAGTGGACGAACTAAGCTGAACTTCGCCTTTTTGAGTTAAACTTGCCGTCTTTCGGTTATCATCAATAATCTTCACAATCGCTTGATATAACTGCGTTTGTGTTTCTGCCTTCGGGGTAAACCCCGCTTTTTGCAACACATAATGCGCTTCCGCTTGTATATCACGTACTCGGTCTTGCAAATTATTAAGCCACGTATCGGTTACTCGCGTGCCTTGTTCGCCTGTTGCTGGATTACCATTGTGAAAAAGGCCGTCATTGGAATCAATTTGAGGCATTAAACTTTTCATATATTAAGATCCTGTTTGATAAGCAAAATAACAGTAAGTATGTGCAGGTTTTAAATCTCGGAAGAACTCCTCAATAATCGGGTCGCCAAATTCCACTAAATGATTACCTGCAAAGGAGCTACCTGCACGAAAATACACAATATTGTCATCGCCATTAAGCACCGATACTCGCCACATAAAAATCAAGTTATCACGTGCTTCATTGCGAAATTGAGCCAAATCTCCCGTTGTTGGTAAATCATTCGCAAGGGGAGAAAACTCTTTAATTTCGATGCGATATCCAATACTTTCCGCAATCCGTTTAAAATAGGGAATGGATAAGCCCCCAATCGCATTTAACTTGGCAATGACACGTTTTACTCGTGCTTGATAGTTATTGCTATAATCTGTTTTTATGCCGCATAAACGTTCCCAATCGGACAACATGGTATCGGAGGTGGCAGGTTCAATAATTTGCAATAAATCCACCGCACTTTTTTGTAATCGGTCAAAGGCATTACCATCCACCTCACATTGCGCTAAAAAACGTTCGCCATTAACGTCGTACGAAATAGGCGGATAAAGTTTTGCCAATACCTTTTTGTGGTCAGTTTGCATCATGCCATCTCCGTAACGGTAATTTGACCTAATCGAAACCACTCAATTTTTGTACGCACATCTGCTTTTAGATTAGTGATAGGTGCTGTAAACTTACGATCAACCACACCGACCAAGTTATTCACTACCGCTTCACATTGCGACACAATCAAATCATCGCCTGGGATTAACGTATTAAAATAATCCGCAAGTGCGGTGGAAATCGCTGCCTTAATTTCGGGGAAGGTCACGCCACTGATTTTTACCTGAATATTAAAATTGACTTTTGTTACATCAGGTTTTACCACTTTGCTTTCTCGCGCGGTTACTGGGCGCACATCATCAATATATGCTTGGCAGCGACCTATTGTTTCATCGCTTGGCACATCGTTATTTGATGTAATCGCAATATCTACCGTACCAAGCCCACGACGCAACGGGTAAACATAAGCCGCATCCACGCCATCCACCGATAACGCCCATGTACGATAGTCATAACGATTACCCCCTGCAGGTGGTCGGCGAATAATCTCAAGCAAGCGTTCAAGCAAAGACGCATCGCTTTCCGCATCCGTTGCACCAATTACCTCATTGAGCACCACATTGGATTGCACGCCTAAAGGTGCCGCCATAAAGTTTGCTTTTGTCGCAGTTTTAATATTTTGGCTTGCACCTGTCGCAAGACTTCGCACGGCAACAACGGCAGAACCGCTTGCAGAAATCACCGCACTTTCAGTGGTTTCATAAAATCGGTTATCGTCTGTTTTAATTTGTAATCCAGCTTTAAGTACTGTATCAGGGGTACCAGTTACAGTTGCACCACGCCCACTGGCATAAGTCGCATTACGACGGCGAATACCACGCAAACCAGCATGTTTTTCAAGAAAATCCGTGTCGGCAGTATCGGGAAAGAATTGTTTAATAATCCATTTTTGATGGGCGTAAATCCCTTCCGCTACGGCAGCAAGGCTACTGGCACGTGCATAATAGTCACTATCTATGCTCACATCGGCTCTCGGCTCTAATGACTGCACATCGCGCAAAATCGCTTGGCGAATATCTGCTAAACTCGGCACAATAAACATGGTTTAAACCCTTTTTAAATGACTTTTACCGGGTGTTTAAAATGATAGGTTTCGCCCCGGTTATCTCGGATAGATATATCTAAAATCAATACACCGTTATGTGGCTGGGTATGATTGACAATAATTTCG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5

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MFIVPSLADIRQAILRDVQSLEPRADVSIDSDYYARASSLAAVAEGIYAHQKWIIKQFFPDTADTDFLEKHAGLRGIRRRNATYASGRGATVTGTPDTVLKAGLQIKTDDNRFYETTESAVISASGSAVVAVRSLATGASQNIKTATKANFMAAPLGVQSNVVLNEVIGATDAESDASLLERLLEIIRRPPAGGNRYDYRTWALSVDGVDAAYVYPLRRGLGTVDIAITSNNDVPSDETIGRCQAYIDDVRPVTARESKVVKPDVTKVNFNIQVKISGVTFPEIKAAISTALADYFNTLIPGDDLIVSQCEAVVNNLVGVVDRKFTAPITNLKADVRTKIEWFRLGQITVTEMA
>NC_016809|1765691:1777298|1776947_1777298_-|WP_015702393.1|DBSCAN-SWA
MSRFLPNSFQIPNSFVDEYLDSLSGKAIKCYLLIARKTTGWRKDSDRISTSQFMAQCGIKDRKTAYAAIEELESVNLVNIERKQGEINEFSLNFFIDENNDFKPAPKNGTSTKKWD
>NC_016809|1765691:1777298|1771640_1772765_-|WP_015702388.1|DBSCAN-SWA
MSNNYPYENDVTVEVDGKAHNSWKSYDIDSDFLIPADAFKFDLGVPSNSTVLPDFSGAEVKVRINGKLVMTGIVDTTQHTMSKTNRTYSLNGRDRASILVDCSAPITNVKGLTVLDAVKKIVEPLGIKKVALRAENNPTLDKVDIDVGETAWNAAMRCANSAGLHLWFEPNGELIVGGADYSTPPVATLCCMKDGKRNNFEQSDLTFDVSNRFSEVTFLAQSHGKQGQDNKNDLKWVYHDPEMTTYKPKTVVVSDVDNLEALQKWAKKYIADSMLEGFTLTIVVPDHKMQGGTLRQPGQRVHVICEEYEIDAIFFLMGRRFTLSRNAGTQTELRFKQDGIWTPDAYSAKAEKARKRKGKKLMATNGHGSWVAAN
>NC_016809|1765691:1777298|1770575_1770926_-|WP_015702386.1|DBSCAN-SWA
MDREISPLTGDYTSKQISTLANAAYIRLTTPLGSWWADGRVGSLLHLIPREEDLSRIGLIAQQYAEEALQPLIDDGRADEIIVNHTQPHNGVLILDISIRDNRGETYHFKHPVKVI

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_015702380.1|1765691_1766192_-	hypothetical protein	F6MIM0	Haemophilus_phage	3.1e-53	63.5
WP_015702381.1|1766188_1766791_-	hypothetical protein	Q94MX9	Haemophilus_virus	1.2e-91	88.5
WP_103746088.1|1768903_1769500_-	DUF2313 domain-containing protein	F6MIL7	Haemophilus_phage	6.0e-67	63.5
WP_015702385.1|1769496_1770561_-|plate	baseplate J/gp47 family protein	F6MIL6	Haemophilus_phage	1.4e-122	63.7
WP_015702386.1|1770575_1770926_-	phage GP46 family protein	A0A0M3LQK5	Mannheimia_phage	4.1e-44	74.1
WP_015702387.1|1770995_1771631_-|plate	phage baseplate assembly protein V	A0A0M3LPA3	Mannheimia_phage	1.2e-62	58.7
WP_015702388.1|1771640_1772765_-	hypothetical protein	F6MIL3	Haemophilus_phage	4.3e-143	71.5
WP_015702389.1|1772754_1774092_-	DNA circularization N-terminal domain-containing protein	F6MIL2	Haemophilus_phage	5.0e-106	44.5
WP_103746089.1|1775902_1776859_+|integrase,transposase	DDE-type integrase/transposase/recombinase	NA	NA	NA	NA
WP_015702393.1|1776947_1777298_-	replication protein	A0A0P0IKQ2	Acinetobacter_phage	1.0e-13	52.6

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NC_016809|1780977:1789944|DBSCAN-SWA
ATTAAGCCATTTCAACCTTAGTTGATTGGTTAGTTGATTTAACTAAGTCAATAGCGTGTAAACAATCAGTGTAGTTTTTATAGCCTTCCCCGCTATCTGCAATGATTTTACCGTTATCCGCTTTTAGACGCCATCGCCATTCAATGCGAGCGTCCACATAAGTTTCAAATTTCATAAGGGGGTCCTCAATGAAAAAGTATTTATTCCATTATTACTTCCAAGGCACCAAATGGGCATGCGATGTTTACGCAAATAACCCGGAAGAAGCCAAAGAAAAAATAAAGGCAATGTCCCAAGCTATTTATGACGGCGAATTAAAATTTGAGATTCACATCCCAGAAAATCCGCTTTCAAAACTAGCAAGATTAGTTGCAAGGATAATCAAAAAGTTTACTTAAGTCAGTGACTTTCATCACAAATTTTAAACAATTTGGTTAAAGAAACTCTCTCGGCGGAAGCACAGACGGAAGCCCAACGGTGCTAAGCGGTCGTTAGATTGAAAGCCCTAACCTACTTAGTTAAGAGTGAGTTTTAAAGTCTGCCCATGCAAAGCCAGTGAAAAACGGTGCAGTTGCCGAAAGTGGAGCTCAAGCAGGCGAATATCCCAATGTGGATATTTCAAAACACATTTGCTAGTACAGAGACACAACGGCATGTGAAACCGTTGCGAATGATAGATGAAGTGTGTTTTGAAATGGCAGACAAACGAGGAATGCTACAATGGAAAAATTAGAAATTAAAGTGTAATCACAGCCCTATTCTAGACAAAATCAGCATAGACTGATTGCACTACTCCACTGACCGCTCGAAAGGGCGGTATTTTTTTAAACATTTGACACCGCCCCCACTTCGGATTAAGATACCCTCACTTTCAACAGAAAGTCTGCAGCCACATTTTGTGGCTTTTTTTGTACTTTACTTAGAGGGGACCAAAATGAAGATAAAAAAGAACATCAAGAATGGATTAAACAATACGCCAAAAGTCATAACCTTACCGAAGAAGCTGCGTTGAATAAATTGATTGGTGACGTGCGCGAAACGCAAGAAACTGAACGAGTGAATTTACAACAGCAAATTATCGAAAGATTACCGCACTTAAACCTCGAACAAATGCGTGAAATTCGTCAGCGTGTTGAGCAGTTTTACCCAACGTTCTTTCACGTTTTGTCAGAAGCAATTAAAAAATAATTTCGCTTTACAACCCAAAATTCTTATATTACTATTCGCTCTAAGGTCTCAAACCTAAAACTCAAGGCGGATAGTTCACTAATCGCCACAAGGCGATTTTTTTATATCCGTAATCCTGACTATGTCGGGAGGGCGACTAATACAATACCGAAAGGAAATACGTCCAGCCCTACCTTGAGTGGGTTTTTGAGCCTCCCGACGCCATTCTCAAAAATGGCTTGTTTTAAACAAATACTCAAGGATTACAATATGTCAAATCTTACTATCTTCAAATTTGAAAACGCTCCTGTTCAAACCATTGTAGAAAACAATGAGATCTTTTTTAGAGCAGCTCAGCTTGCAGAGTTATTGCAATATAAAAATCCACATAAAGCGATTAAAGATCACGTAGATCCTGACGACCTAACGAAACGTGAGGTCGTCAATACCATCAATAAACGTGCTCAAGTTCTCTTCGTGAATGAAAGCGGAATGTATTCATTAGTCTTGAGTTCAAAATTAGAGCAGGCTAAAAAAGTAAAACGCTGGGTCACTTCTGAAGTGTTACCGGCAATTAGAAAAACAGGAAAATATCAACTTCAACCACAACAGCTCGCCTTGCCAGAACCTGAAAAATTCACGCACGAGCTCACCGAATTTGAAATAGAAACGCTCGTTTGGCTCCTTAGAGGACATCACCAAATGAACACCCTACTCGGGCAACTTGAAAAGCCACTTGACGCCATCGGCAGCAATCTACACCCCGCTGTGTACAGCTACTGGAAAGAATATGGCCGCCAATACAAAGATGCACTCCCAACCATTAAACGCTTAATGGCACCCTTCAAACAATCAAACCGTTTGAATTGGGCACGTGCACAACACCTTATAAACCAATAAAACATCACAAAATCCGACCGCACTTTACCTCAAGAAATCCGTGCGGCGGATTGCTACACCCTAAATTCACTAAATCGACTAAAAAGGAAACAAAATGAAACATTCAAAAACCCCATTACGCCAAGAAAAACAAAGCTTCACACATTTTATGAAAGGCAGTGAAAAATGGCTAACTCGAATCAGCTATTTTCTCGCCGCCTTGGTTATCGCCCTAATTGTGGGCGGGATTAGCCTACACGCCAATGCCAACCCCACCGACTGGCACGACAACGCCCTCAGCGAACAAATCCAACAAGAAGAACGCGCGAGAGCAAAAGCCCAATGGCGTGAAGAAAATTGCATCTATCAAGCAAATCTTACCCCACAAGTTAATGCCGATATGTATCGTTATGTCGAGCAAAAACAAGCAGAAATTAACCGCACTTTAGGAGAAAAATAATGAAAATCGAAAGCTACAAAACACAAATCGTCCGCACCAAAAACGGAAGTTATTTTGGCGAATTATGGGTGAACAATAAGCTGTACCAAAAAACTTCCTATTTTGCCAATGAAGCCATTGCAACCTTACGCCTAAATAAACGAATCGAAAATTTTAATGCAATGGAAAACACCAATATTCCGCCTTATCAAAAAGATGCGGAAACTAATCAATTTACTGCCACACCGAAGAAAAGTGCGGTCGAAAAAGAAGTGGTTTCAACAAAACCACAAGCCCCTAAAACAGAAGCGAAACCTAAACCGACTACCCCACGTCGCAAACCCTTCACGCCCTACGGATTAAACGGCTATTTTGTGGATAAACAAGGCAATATCCGCCTACATTTAGACCGAAAAGCACACGCACATACCATTGTGCTAAACCCTGAAATGTTCTCAATGCTTGCCAATATGGTACAAGCCACACAGGAGCAAAACAATGAAACCCTACGCTGATTACTACGCTCAACTCAATGCGGCACACCAACGTAAAGTGGATTGGCAAGCAGGCTATGAAATCGCCTTAGATGAAGTCGCCACGGAAATTGAAAATGATTTACAACAAGGCGACCAAACACATTATCACGAACTCACGGAAATGTTGTGTGATAACGATAATTTCTGGCTTGCCATTGGTAGCGGTGCAAGTTATGAGCCTTATAGACAAGAGGCGATTAAGAAAATCGCCGAGCGTGAATTAAACGACAGAATGAATGATTATGACCCGGATTAATGGAGGGTGAGATGACAAACCAAGTCCAACATCAACAAAATAAACAGCCACCTGCGCTTAAAACATTTTTTGAAAGTGCGAATGTGCAAAATAAGATTAAGGAACTTGTTGGCAAAAATGCGGCAACCTTTGCAACAAGTGTTATGCAAATCGCCAATAGCAATGCAATGCTTAAAACAGCAGACCCAATGAGCATTTTTAACGCTGCCTGTATGGCTGCGACACTGAATTTGCCACTACAAAATGGTTTAGGCTTTGCTTACATAGTCCCTTTCAGAAACAACAAAGAAAAGAAAACCGAAGCGCAATTCCAAATTGGCTATAAAGGCTTTATCCAATTAGCACAACGTAGCGGGCAATTTAAACGCTTAGTCGCATTGCCTGTGTACAAAAAGCAACTTATCAAAAAAGATTTCATCAATGGTTTTGAGTTCGACTGGGAGCAAGAACCTGAGCAAAACGAAAACCCAATCGGCTATTACGCCTATTTTAAACTGGTAAACGATTTTTCGGCTGAACTCTATATGAGTCACGATGACATCGTCAAACACGCTCAACGCTACAGCCAAACATTCAAAAAAGGCTATGGCGTATGGCACGATAACTTCGAGGCAATGGCATTAAAAACCGTAACTAAGTTATTGCTATCAAAACAAGCTCCACTCTCTGTTGAAATGCAGCAAGCTGTATTAGCCGACCAAGCCGTTGTGAAAGATGTAGAAAATCAAGAGTTCAACTACACCGACAATATTCAAGAAGCGGAATTTTTAGCGGTTGTTGATGAAGCCACATTCAAACAATGCAAACAAAGCATTGCCAACGGCGAAACGACCCTGCAAGAACTTTGTGATAGCGGGGCGTATGAATTTAGTCAAGAGCAGATTGCGGAGTTGGAGGCGATTGAGAATGGAAATGTACAAACTCAAAGCTAGATGCTCTGGCTTAGCTGATTTAATGGCAAAGCCTAAAAGCGGTAACGGAATTTCTGCGACAGCCAAAAGTGCGGTGCGAAAAATCGTTAAATTCGATCTCTTTGGTTATCAAGATTTCGAAGGAAATAAATACACTGAGAAAGGCATCGCATTAGAAGAACAAGCCATTAAGTTAAGCGGTCGTAAACGTGGATTACCGCTTAAAAAGAACACGGAAAGGCGTGAAAACGATTGGATTGCAGGCGAGTGCGATATTTATGTGCCAAGTCGAAAATTAATCATAGATACTAAATGCTCTTGGGATATTGGCTCACACCCTTTCTTTGCTGACGAAGCAGAAGAAAAAGCGAAAAAAGCGGGTTATGACGCACAAATGCAAGGCTATATGTGGCTATGGGATTGTGATGAAGCGCACATTGATTTTGTCCTCCTCCCCACCCCTTACGACCAATTATCAAGCTATGACGATTCAACCCGATACATTGACTTGGTTGAGCAAATCCCTCAAGAAAAACGTATTACCACCGTCACAATTAAACGTGATGAGAAAATCATCGAGAAAATCAAAGAGCGGGTAGAAATTGCGCAAGAATATTATCAACAACTTATACAGGAGATGCACTAATGGCACGTAACACCAACACCGTGATATTAGTCGGTCATTTAGGCAGTGACCCAGAAATCCGCCAATTCCAAAATGGCGGGCAAATTGCCACATTTAATCTTGCTATCGGTGATGATTACCGAGATAAACAAGGTAATACAGTTAAACGTACGCATTGGATACCTATTGTGGTGCATGGCAATTCTGCTGATGTAGCAAGACAATATCTACAAAAAGGCTCAAAAATCTGTGTAACAGGGAAACTGGTACAGGAAAGCTGGCTAGATCAAAACGGCAATAATCGCACCGCACTTAAAGTAGCGACACAATCCTTTGAAATGCTAGACAGCAAGGTAAGCAATGAAACGCAACAGCCAAGCAAAAACAAAGAAAAACCCGATCCATTAAGCGCAGCAGCAGAACAAGATGGGTTTAATGATGATATTCCGTTTTAGAGGGAAAGATAGCTTGTATAACCCTCTGAAGAAATAAAATCCGTAAGTAAATAGAGGCTTCATTTAGCGCGATTGCTTCCACAATTCAACCGCCTGAATAATCAGTTGGTTTTGTGGAATATCGTGTTGTTTGCTGAGTTGTTCGATCTCGGCAATAGTTGCTAATGGCAACTTGTAAGACTTCGATTTTACGCCGCGCTTTTCATCTGAACGCGCTTTAATTTCGTTGATTGACAATTTCATCTTTATAGCCCATAATTTTGAAGAACTGGGGGAACTGGTACTTCCCCCAGATTATCGTTACCTATTAATAAGCAGGAAAGCTAATTAGTAGTAAGACAACGATAAGGAAAATGCGAACTAACATTTTATTTTCCTTCTTCGTAACGTGGGATTAAGCCACACGCTCACTTTCAAGCTTCCCCTTGAAAGTGAGATTATTATAAATCGGTATACCGATAAAATCAACAAATATCTAAGAAAGCCATTGTATTTTACAATGGCTTTTTTATTACCCTCTACCCAGCTCGCTTAGGCGAGCTTTTTTATTATCAGGAAAAACAATGAACCTATTAAAACTCCTCGCTAAAATAATCCTCCAAGAGGAAATCGAAAATAATAAATATCATTTTGAAAAATTAGGCAATGAAAATCTTGCCAAATCAAGACGTATTAAAGAGCTTGAAAGCGATAATGACCGCCTAAGAATTAAAGTAGAGCAAATCCGACAGGACAATTTAAAACTCCGAGAAAATCGACCGCACTTTAAACATCATAAGAAAAAAGGAGGGAGAAAATGAATGAAATTAACATCAAAATCCCCTTACATAAATTCCAAGATTTAATGATTAGTCACGTCCGATACAGCTTGCCACGACATACTTATATCGTTAGCGAAACTATTCACGATGTTAAAACCTACTGGAGCGTGTTAAGCAGTAATACTCGAGAGGTAATTACGCGCGATATTAATGAGCATCTGAAACACTGGGAAAGTGACCGAAATGACCCATTCCTCAAACTTGACTACGATTCGTGGGAGGAATTAGCTGACTGGATAAATGATAACCGCAGCAGCGCATCAACAACAGCTACAACAGCAAAACCGATTGTGCCTGTGTTGCCTGTGATTAATTTAAAACAGAGGGAAAGATGACTTTTTGCTCAAAAATCCGGAATTATGAAAATTTGCGAGCGACATCACAATTACATATCCCATATTATGGTATATTCCTCTTTACCACAATTGAATTAGGTATAGGTATAAGAGTATGGAAGAATTTGGGAATTATTTTATTGAGCCAGTTAATAAAATTGGTTCTGGCACTTTTGGTTATGTTGAAAAAGTGAATGTTTATAATAAATCACGAACCCATAAAACAATTTTCGCAAGGAAGTATTTTCGTCCAAGTTATAAACCTTCTGAATCTGAGTTAAATGAACTTCAAGAACGATTTAAACGAGAAGTAACCTATCAAGCAAAGTGTTTCCATAACAATATTGTGCCAATTTACATGTGTAATTTAAATTCTGCAACGCCTTGGTTTGTTATGGAAATTGCAGAAAGTAATTTAGACGAAATCCTTTATAACAATGATTGTGTGGAAGGAGAAAGAAAGTTATCAGAACGTTATAAACTAGATGTTCTGCATATGGTCTTAAACGGCGTTGCTTACCTTCATCAGAATGGCTTTTTACACCGAGATATTAAGCCCCTCAACATTTTGAAATATCCTGATGGAACTTATAAAATATCTGATTTTGGGTTAGTTAAAAATCTCAATAGTCAATCGAACCCTATCACCCAAATTGGGCAACAAATGGGAACGAATAAATATATGGCACCTGAAATTGAAAATGGCATTTATTCTCCTCAATCTGATATTTATGCTCTAGGGATTTTAATGGAAGAATTAGATCTTAGTGAAAAATATGACGAAATAATAGAAAAGGCAACACAGAGAAAACCTAAAAATAGATTTCAATCTGTTAATGAAATGATTGAAAGAATAAATCAAATAGAAGGAAAATAAGCAATGTTACATTTAATTTCATCATCAACATATTGCTTTCCAAAAGAATTAGTGCGCGAAAACCAAGACCACATTTTAGCTCCGCAAAAATACCAAAGCGGCTATCTTTTCGCAGTTGCCGATGGCGTAGGTGGGTATAAAGGTGGAGAAATTGCTTCTCAAATTGCCATTAAAAACCTTGAGCAAGATCCGAAAAACGTATTTCAAGCCACTTTAGCCGAAATTAAACAACTGCCTGAAGAATATCAACGGGCTTCAACCACTCTAACCTTTGGCTATCTCGCGCCTGAAGGCTTATATATCGGGCATATTGGTGACTGTCGCTTATACATCAAGCAAGGCAACAAATTACGTCAAAAAACCAAAGACCACACCACGCACCAACGCTTGCTAGATGAAAAGATTTACACCAAAAAAGAATTAAAAGAGCAACCAGGGAAAAACATCATAACCACTGCCATTTCAACGCAAGTTGAAATGAAGCCTGATGAATTTTTTATCCCTATTGACGAACTCAAAGATGAAAACAACGAAGTATTTATCTACATTATGTCAGACGGTGCACACCATTTTTGGGAACACCGCCCACGCTTTTCAGATGCCACAATGCAAAGTATTAGCAGATTTTCAGCAGCATTGCAAAAACGTATCGAAAAAGCACCAACGGATGACTATTCCCTTGTTGCTGTACAGTTTAAAATAGACTAACCTCCGCCCCGAAAATTCGGGGCTTTTTATTGACACCGCCCCCACTTCGGATTAAGATAACCACACTTACTTACACATAGCGGTTATCCGCACCCGAAAGCATAGCGGTTTTTTTATGCCTAAAATTTAAATCTGCAGATCTGCAGATTTAGAAAAAAGTACAGAAATGTACCTTTCGAAGATCGGGGCGAGAGAGCGATATACAACACATCTGAATAAGCTCCGCCAACTATGTGTGGTAAGTTGAACCCCGATCGCCTACTTAACGATCGGATTTCTTAACTTAAATCACATAGGGCATAAAAATGTCAAACTTAACAATTCTCAAAACTTCTATTCGTTCATACGGAAATCTTTATTCATTAAACGATCTTCATAAAGCAAGTGGTAATGCAGAAAAACATAGACCATCTTTATTCGTTCGTTTAGATACAACTCAAGATCTAATTTCAGAAATTCAAAAAGAAGTTAAAAGCACAGATCTGATCTTTAAAACTACTGGCGGTCGTGGGCTGCGTGGAACCTACGCTTGTGAAGAACTTGTAATAGCCTACGCAATGTGGATTAGTCCAAAATTCCATTTGATCGTATTACGTGCGTTCTTAGCAATGCACCGCAATCAACCGCAACAACTCGCATTGCCAGAACCTGAAAAGAAATTCACCCGTGAATTTACAGAGCATGACCTGCAACAGCTCGTCTGGGCGTGGTTTGCTTTATTGCGTGGCATGGAACTTTGCCAAGTACTTCACCCAGCATTAAAACAAATTGGTTCGCACTACGCTGCTTCCGTTTATAGCATGGCTTACGAATATCGCAGCACTCTCCGTCATGCCCATAACGTATTGACACGCATTACAGAGCAATTTGAATGCGAGCAAGGTAATAACTGGCGCGTATTAAAATATCTTCGAGCCTATAACCCTAAAGCAACAGGCTTTCAGCTAGATATTCTCTAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_6

>NC_016809|1780977:1789944|1787040_1787400_+|WP_015702403.1|DBSCAN-SWA
MNEINIKIPLHKFQDLMISHVRYSLPRHTYIVSETIHDVKTYWSVLSSNTREVITRDINEHLKHWESDRNDPFLKLDYDSWEELADWINDNRSSASTTATTAKPIVPVLPVINLKQRER
>NC_016809|1780977:1789944|1789290_1789944_+|WP_015702406.1|DBSCAN-SWA
MSNLTILKTSIRSYGNLYSLNDLHKASGNAEKHRPSLFVRLDTTQDLISEIQKEVKSTDLIFKTTGGRGLRGTYACEELVIAYAMWISPKFHLIVLRAFLAMHRNQPQQLALPEPEKKFTREFTEHDLQQLVWAWFALLRGMELCQVLHPALKQIGSHYAASVYSMAYEYRSTLRHAHNVLTRITEQFECEQGNNWRVLKYLRAYNPKATGFQLDIL
>NC_016809|1780977:1789944|1786807_1787044_+|WP_015702402.1|DBSCAN-SWA
MNLLKLLAKIILQEEIENNKYHFEKLGNENLAKSRRIKELESDNDRLRIKVEQIRQDNLKLRENRPHFKHHKKKGGRK
>NC_016809|1780977:1789944|1782413_1783043_+|WP_015702396.1|DBSCAN-SWA
MSNLTIFKFENAPVQTIVENNEIFFRAAQLAELLQYKNPHKAIKDHVDPDDLTKREVVNTINKRAQVLFVNESGMYSLVLSSKLEQAKKVKRWVTSEVLPAIRKTGKYQLQPQQLALPEPEKFTHELTEFEIETLVWLLRGHHQMNTLLGQLEKPLDAIGSNLHPAVYSYWKEYGRQYKDALPTIKRLMAPFKQSNRLNWARAQHLINQ
>NC_016809|1780977:1789944|1786307_1786487_-|WP_005652248.1|DBSCAN-SWA
MKLSINEIKARSDEKRGVKSKSYKLPLATIAEIEQLSKQHDIPQNQLIIQAVELWKQSR
>NC_016809|1780977:1789944|1781984_1782164_+|WP_015702395.1|DBSCAN-SWA
MNKLIGDVRETQETERVNLQQQIIERLPHLNLEQMREIRQRVEQFYPTFFHVLSEAIKK
>NC_016809|1780977:1789944|1780977_1781151_-|WP_015702313.1|DBSCAN-SWA
MKFETYVDARIEWRWRLKADNGKIIADSGEGYKNYTDCLHAIDLVKSTNQSTKVEMA
>NC_016809|1780977:1789944|1781164_1781374_+|WP_005692473.1|DBSCAN-SWA
MKKYLFHYYFQGTKWACDVYANNPEEAKEKIKAMSQAIYDGELKFEIHIPENPLSKLARLVARIIKKFT
>NC_016809|1780977:1789944|1783481_1783976_+|WP_015702398.1|DBSCAN-SWA
MKIESYKTQIVRTKNGSYFGELWVNNKLYQKTSYFANEAIATLRLNKRIENFNAMENTNIPPYQKDAETNQFTATPKKSAVEKEVVSTKPQAPKTEAKPKPTTPRRKPFTPYGLNGYFVDKQGNIRLHLDRKAHAHTIVLNPEMFSMLANMVQATQEQNNETLR
>NC_016809|1780977:1789944|1784264_1785185_+|WP_015702399.1|DBSCAN-SWA
MTNQVQHQQNKQPPALKTFFESANVQNKIKELVGKNAATFATSVMQIANSNAMLKTADPMSIFNAACMAATLNLPLQNGLGFAYIVPFRNNKEKKTEAQFQIGYKGFIQLAQRSGQFKRLVALPVYKKQLIKKDFINGFEFDWEQEPEQNENPIGYYAYFKLVNDFSAELYMSHDDIVKHAQRYSQTFKKGYGVWHDNFEAMALKTVTKLLLSKQAPLSVEMQQAVLADQAVVKDVENQEFNYTDNIQEAEFLAVVDEATFKQCKQSIANGETTLQELCDSGAYEFSQEQIAELEAIENGNVQTQS
>NC_016809|1780977:1789944|1785159_1785810_+|WP_015702400.1|DBSCAN-SWA
MEMYKLKARCSGLADLMAKPKSGNGISATAKSAVRKIVKFDLFGYQDFEGNKYTEKGIALEEQAIKLSGRKRGLPLKKNTERRENDWIAGECDIYVPSRKLIIDTKCSWDIGSHPFFADEAEEKAKKAGYDAQMQGYMWLWDCDEAHIDFVLLPTPYDQLSSYDDSTRYIDLVEQIPQEKRITTVTIKRDEKIIEKIKERVEIAQEYYQQLIQEMH
>NC_016809|1780977:1789944|1785809_1786244_+|WP_015702401.1|DBSCAN-SWA
MARNTNTVILVGHLGSDPEIRQFQNGGQIATFNLAIGDDYRDKQGNTVKRTHWIPIVVHGNSADVARQYLQKGSKICVTGKLVQESWLDQNGNNRTALKVATQSFEMLDSKVSNETQQPSKNKEKPDPLSAAAEQDGFNDDIPF
>NC_016809|1780977:1789944|1788280_1788985_+|WP_015702405.1|DBSCAN-SWA
MLHLISSSTYCFPKELVRENQDHILAPQKYQSGYLFAVADGVGGYKGGEIASQIAIKNLEQDPKNVFQATLAEIKQLPEEYQRASTTLTFGYLAPEGLYIGHIGDCRLYIKQGNKLRQKTKDHTTHQRLLDEKIYTKKELKEQPGKNIITTAISTQVEMKPDEFFIPIDELKDENNEVFIYIMSDGAHHFWEHRPRFSDATMQSISRFSAALQKRIEKAPTDDYSLVAVQFKID
>NC_016809|1780977:1789944|1787515_1788277_+|WP_015702404.1|DBSCAN-SWA
MEEFGNYFIEPVNKIGSGTFGYVEKVNVYNKSRTHKTIFARKYFRPSYKPSESELNELQERFKREVTYQAKCFHNNIVPIYMCNLNSATPWFVMEIAESNLDEILYNNDCVEGERKLSERYKLDVLHMVLNGVAYLHQNGFLHRDIKPLNILKYPDGTYKISDFGLVKNLNSQSNPITQIGQQMGTNKYMAPEIENGIYSPQSDIYALGILMEELDLSEKYDEIIEKATQRKPKNRFQSVNEMIERINQIEGK
>NC_016809|1780977:1789944|1783137_1783482_+|WP_015702397.1|DBSCAN-SWA
MKHSKTPLRQEKQSFTHFMKGSEKWLTRISYFLAALVIALIVGGISLHANANPTDWHDNALSEQIQQEERARAKAQWREENCIYQANLTPQVNADMYRYVEQKQAEINRTLGEK
>NC_016809|1780977:1789944|1783959_1784253_+|WP_015701538.1|DBSCAN-SWA
MKPYADYYAQLNAAHQRKVDWQAGYEIALDEVATEIENDLQQGDQTHYHELTEMLCDNDNFWLAIGSGASYEPYRQEAIKKIAERELNDRMNDYDPD

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_015702313.1|1780977_1781151_-	DUF1508 domain-containing protein	A0A2P1N580	Mycobacterium_phage	6.8e-08	62.5
WP_005692473.1|1781164_1781374_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_015702395.1|1781984_1782164_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_015702396.1|1782413_1783043_+	hypothetical protein	A0A1J0MFR6	Staphylococcus_phage	4.3e-23	44.4
WP_015702397.1|1783137_1783482_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_015702398.1|1783481_1783976_+	hypothetical protein	A0A0M3LSK4	Mannheimia_phage	5.5e-18	37.5
WP_015701538.1|1783959_1784253_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_015702399.1|1784264_1785185_+	recombinase RecT	A0A0M3LNU3	Mannheimia_phage	1.4e-115	71.2
WP_015702400.1|1785159_1785810_+	hypothetical protein	A0A0M3LP90	Mannheimia_phage	1.4e-85	72.0
WP_015702401.1|1785809_1786244_+	single-stranded DNA-binding protein	L7TJL2	Pseudomonas_virus	1.3e-18	34.4
WP_005652248.1|1786307_1786487_-	hypothetical protein	Q19US2	Mannheimia_phage	1.8e-11	62.1
WP_015702402.1|1786807_1787044_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_015702403.1|1787040_1787400_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_015702404.1|1787515_1788277_+	serine/threonine protein kinase	I6PD73	Cronobacter_phage	1.7e-50	43.8
WP_015702405.1|1788280_1788985_+	serine/threonine-protein phosphatase	I6PCV8	Cronobacter_phage	2.7e-50	44.0
WP_015702406.1|1789290_1789944_+	KilA-N domain-containing protein	D0UIK6	Aggregatibacter_phage	5.4e-45	81.9