Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_017519 | Mycoplasma hyorhinis MCLD, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 2 | 0 |
1. NC_017519
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0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
338191 : 353422
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_017519|338191:353422|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_017519|338191:353422|350399_350972_-|WP_013301938.1|DBSCAN-SWA MFGKEYEELISTFKTFPGVGKKQAEKFFYFLLNKDIEFFQDLSQKIIKLKQNLQPCERCNFVSLNVVCSICLDPDRSSQIMLVENSSDVIKFENLRFYEGKYFVFDYKKGVDNKYLTAKINKLRNLIRENTELIVAFSFNIEGLVLANFVMNHKDLKNVKISKLASGIPLGAQIEYVDELTLKEAIKNRK >NC_017519|338191:353422|348863_349757_-|WP_014335381.1|DBSCAN-SWA MKHFSKIIATQEQLFHAFLIASLNEDNIDKNVEILLHKVGVNPNKNNLNFQMFDVKKTLHKSEILSAFNDLYFSSFTQQDEKVLLIKNIDLANTSILNAILKTLEEPPKNTLIILTTTHIDKVLPTIRSRCQVFNFYEDNKKEILEILNKENKAFEYNTLFVNIYSGLEQVKRNINDENLKLLKEIQQTLNKHYKSNLELINFFYKKLTKENALFLLSILKLFFFSIFAKDFSIFPSFWKDIFRNWENRLKQQKDKFAPKHFEIISLIENFIQSLETAQNFTLQKNNFLVNFYESLK >NC_017519|338191:353422|349735_350383_-|WP_014335380.1|DBSCAN-SWA MFITFEGIDGSGKSTLIKKLYHYLQNEFPKKEIILTREPGGFQVREAEIIRNLLLDKKYEISKFTEVILFAASRRLHLEKLIWPSLQEGKIVISDRFIDSSIAYQAFGNKIDINQVEQLNDWISNKTQPDLTFWLDVPIQQAFERKTSDNDRIEDKGNKFFSKVCSGYEYLSKKYPERIIRIDALQNEDKVFEQIKKAFEEKREKLVKKWNTFQK 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14 | Planktothrix_phage(20.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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| DBSCAN-SWA_2 |
735346 : 744558
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_017519|735346:744558|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_017519|735346:744558|740446_742171_+|WP_014335632.1|DBSCAN-SWA MKFKLKSRYKWTIFSLILLLISSLMIAFKVNLPFRPLIMNYESYLSEPGKEELEKDFDYREFGDVSEFTKAIEDKRTIGGVGSDFQIARLVQKNLIQKIDWSKLFQNSQNEKLKKGFKTPANYYSLTKKEKEVVLARKRRTFESLIRPEVVSHIDEYDKFLVDEKGNKIDSDKDGIADRFWEFFVPYYTQDKVIAYTVGDYKNKNNEIVEIKPELLKNEKYRENKAFIQEKGIKFLDQTVAEIGKTLREYGYKYFEWTEAMRDNLLLGSEKIGNYTGIVTKDNYKQQIDDFVSYIKDITNKNFADLRFNYYSSSGLDLTTNLIDIEKKPEVGFIYNGDALDAHYSKDNFDWLKDGKTINIIRPKNNLTLLDGWILLKDISSDVVDKFYNSLYNSVYKGEDLSEDQMFKMALEKARYKDPEDDQIKSGYYLDYEKLPNLANFDFINYTPSFTNTFEFFKKTYFNDNVETVNALDDNNVETGDEIDLIKDKNGIVAANEATPTIAFEQLAATAEERASLFGLNIYLSQQPKQTIYGQRPEDFPNDTTYDIHYSFIAPVDENLDSNIRTYYIIKTKS >NC_017519|735346:744558|742213_742447_+|WP_013302284.1|DBSCAN-SWA MLKELLLGIIILISLCIMILSLLMSPHSNSFSGALVGSSDLDLFKVSKERGFRKFTKWAMFICGLLFLTIALIIRLL >NC_017519|735346:744558|735346_736699_-|WP_013302289.1|DBSCAN-SWA MSKISKIKAREVLDSRGNPTIQVEVWTEAGGHGSAIVPSGASTGTREALELRDGGTVYESNWFGGKGVQTAVDNVNNKIAVLLKGHCVLNQRKLDNMMLQLDKTENKSALGANAILGVSLAIAKAAADELKIPLYRYLGGTNAHQLPVPMLNVINGGEHASNTLDFQEFMIMPLGAKTFKQALQVANKIFHTLAKLLKKAGHGTQVGDEGGFAPNLKSHEEALDFLVKAIEEAGFRPATEGENAVAIAIDAAASELYHDGIYTFKKLKKAIEEKRQGFEPTRVQFTTEEMIQYFGHLFHTYPIISVEDGLAESDWKGFVRFTQKFGKTHQIVGDDLTVTNAKILAEAIEKKAINSILIKLNQIGTVSETLDTIELAHKAGYTTVISHRSGESEDTTIADLAVAVNAGQIKTGSLSRTDRIAKYNRLLAIEEAIQSTAQYKGEKVFFNIKK >NC_017519|735346:744558|739629_740457_+|WP_014582759.1|DBSCAN-SWA MTRILDYIKEKEIWKKSYVWLILILFYIPIIFGAFFSFNAPSKKGFISTTWNSFSLQAFRDLSTKNFASALVNSIIIALVTALIVIIISLITVFALWKQRNKTVKSYVNISSNIPLINPDVITAVAMAIILSLLFGTLVATKEGLLRSIVSHIVMTLPYGILLLYPRSEKFSKTLFEASQDLGNNKFKTWFLIYLKYMIPAIILASVVIIFLSFDDFIITKITSNAQTVGTLLYQGTFKTWALLLGAIMLTMIVIGNVIWIRYKLNKSKRGKNEI >NC_017519|735346:744558|737431_738772_+|WP_014335634.1|DBSCAN-SWA MTNFKKDEILISLVDVEKEFDGKKILNQINLDIKKGEFVTLLGPSGSGKTTILRLIGGFEWTTRGEIKFNGVDIKDVPPHKRDTATIFQDYALFPHLSVKGNIKFGLKLKRYPLNKEEIKPATLLRLEENKKQWALKAKQKMNELNKIQIEYEKHIEDPSVDAKTKKKYQNWLDDSDFKYSYWENFVSSKVEAFEKKYLTRKITKEEMEKEIAEIIELVGLKGNENKSIFELSGGMKQRVALARSLVIEPEIVLLDEPLSALDAKIRQKMQVFLKDIQQKLGLTFVFVTHDQDEALELSDRIAVIRNGKIEQYDKAKNIYDYPVNKWVANFIGDSNFFHAKFLGNNKVLLLDKEIKTIHSEFKTNQIVDALIRPEDIDIDLNFGFFKGIVVKNSYKGSYYFVDVKVNEKIIFVETNDNYDVGQEVFLKWDLDAIHLMTKEDESLTN >NC_017519|735346:744558|738752_739637_+|WP_014582758.1|DBSCAN-SWA MNHLLTKLKTKVINFVLDFKSSWNLRLSLSLPYIIFSFIFIVIPLLLLFIKSVSPVEFENNYQSIKTNFSVVREASTWLIIWRSVYLGILTALICLIFALPYAFFVSTNKSKAFKIYAISLIVSPLVIFTIAKVFSLRALFVAIFDDEELNNQGFMLLGLVFLNFPFMVIPLYTVFRDMSKNLLEASADLGYNKFQTLIKVALPYGLKAIFSGIALVFLMAATSIVISDKLLPSGQQNQLIGNFINNSANLANPFDLAKTSSLVLITILVLLEIYGLIYFVPLAIMKFKGVEHD >NC_017519|735346:744558|742473_744558_+|WP_014582760.1|DBSCAN-SWA MQINNEQLFAFLKQPKSFIEIARKFNITFNENAQLSSYLSHLLESHLIFKNHKGLYFSPKILSSHIGVFHSTQKGFGFVELKDHQNSVFIPAKFTSSAQDYDEVKINVFQDELKPDKTYGVVTKVISRKLKFLIGKVIKNGDYFDFEPYNSFKNEVFFRWVSTKNLVLGEFVKVEILEYQKKFLKIALVQNIANENEKFWYLKVPIVDSGVEVEFNSNIEEELKQIPDAIETIEPNRVDLRSSTIVTIDGDDTKDFDDAISVEKLENNNYTLGVHIADVSYYVKEDTFLDDEAATRGTSIYLPNMVIPMLPEKLSNGICSLNPNVDRYTITMEAEIDKYGNNLSVKIYPSVINSKARLTYNQVNKYYENQEISFTNEVKLLLDDALELAKILRKYKENQGYVNLEIEETKVILDEEGYTKDLQIKKSGISEALIEDFMVRANENVSEFLAKRKFPVIYRIHDKPDIERIEEFNGVLKSLGVNVVIPYQLDSKSFADAVEKIKEQRLDNFIKIMILRTMQKAVYSPVNHGHFGLASKFYSHFTSPIRRYPDLLLHRIIRHFLFEHKKDLLHFERILEFQSKSTSELEQRAQTLERKVVSIKKTEYFSSRIGQKYRGQITSIKKFGFFVELENNVDVLVHISDLQTNEQEEFILSDDSFTLANKFYKYQLGQFVEVEILSIDIPFGKISAKVVLKN |
7 | Mycoplasma_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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