Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_015672 | Flexistipes sinusarabici DSM 4947, complete sequence | 7 crisprs | csa3,cas3,cas2,cas1,cas4,cas5,cas7,cas8b2,cas6,DinG,cas3HD,csx20,csm5gr7,csm4gr5,csm3gr7,csm2gr11,cas10,csx1,PrimPol,DEDDh,Cas9_archaeal,WYL,cmr6gr7,cmr5gr11,cmr4gr7,cmr3gr5,cmr1gr7,RT | 1 | 3 | 14 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_015672_1 | 1011494-1014319 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NC_015672_1
|
43 spacers
spacers of NC_015672_1
>1.1|1011523|37|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT AGGCTAGAACACTGGCACACAAACTTAACATTCCATT >1.2|1011589|36|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTGCTGTGTTTAAACCTTGTGCCATATCATACAAAT >1.3|1011654|36|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAACATTATATTTCCATTATTAACTTGAACGCTATA >1.4|1011719|38|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCAAGATTTGCCCGTAAAGGTCTGCATCTTAACATTAA >1.5|1011786|36|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CACTTGAGATATTTGAATATTATTTTTTATTAGAAG >1.6|1011851|36|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AACTCGTTCGTTGATTGTATAATCAACGTGAATAAT >1.7|1011916|38|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCAAGATTTGCCCGTAAAGGTCTGCATCTTAACATTAA >1.8|1011983|35|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CACTTGAGATATTTGAATATTATTTTTATTAGAAG >1.9|1012047|36|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACATCACCGATCATCTACATGTACTTGCTCTTTATG >1.10|1012112|36|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCGCAAATCCATTGTCCATTCCGGTATTTGGAGACG >1.11|1012177|36|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCCTCCACTATTCTTTGTGTACCGTCTTCTGTAGTA >1.12|1012242|36|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCAGTAGCGAACTGTTTTAACAATATTAACTTCACT >1.13|1012307|36|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTTTTAGCGACTGCAATATGCCGAGCCCCTCCGTT >1.14|1012372|35|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTCTATGAGCTCCCGTTACAATTATATTCTTAAAC >1.15|1012436|36|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTCTGCTGTATCTGGTACATATACTGAAACATCAAG >1.16|1012501|36|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAACTGTCAATCTCTTGTCCACGTATATTAAATACG >1.17|1012566|36|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAGTTGGGAGAATATAAAACATTAGGTACTTATGAG >1.18|1012631|36|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTTTCTCAAGATTTTGTGCGCTTCTGAGTGTTGCC >1.19|1012696|36|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGCCTTGTAAATCTTCTTCTGCTTCCGCCCTTTAAT >1.20|1012761|36|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CACTTTGTACGATATCGAATAATGCAGGATTCCGTT >1.21|1012826|36|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTCTCGTCTCACTTTTCTAGCCTCGCTCCATGTAAT >1.22|1012891|36|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTGCTTGTGCTATTCTATCCCCTACATTTATTTTAA >1.23|1012956|36|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCTGTCTTCTATAAAGCAGAACAAATGCCCGAAATG >1.24|1013021|36|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTATGTAAACAATTGACTAAAATTGCTGAAAGAGT >1.25|1013086|36|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGAACACGTTTCATTGCGTGTTCCTGAATCAAGCGA >1.26|1013151|36|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTGAAGGAATTTTCGGTAAACTTGACGGCATTTTT >1.27|1013216|36|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AACATATTATGACACAAAAACCGAAGTAAGTTCAGA >1.28|1013281|36|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CGGGAGGAAGCCAAAAGCGATTCCTTTTTCCGCAAA >1.29|1013346|36|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTCTCACCTGCATATTTAATATAGTTCGTTTCATT >1.30|1013411|36|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGCTACTGCTGACATAGTTCCTTTAATGCTCACTA >1.31|1013476|36|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TACAGAAGCGTCTCTAATACCGTATTGCTTTCTTAT >1.32|1013541|36|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATCTTGCAATGACCCTAATGTACTTCAACAACAAT >1.33|1013606|36|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACTGCTAACGCTGAATATGAAGATACTGCTTTTATT >1.34|1013671|36|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACTCTCTTATTTTCTTCGGGACTTTTTTCAAGTCCT >1.35|1013736|36|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTCTGAAATAGTAAAACTTATAAGGCCATTATCATA >1.36|1013801|36|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCTATCTACCGTCCCTACAGATGATAAGTCAAGCTG >1.37|1013866|35|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGGCGTGCTGCCTTCCAAAGTGCTACTAAGAACGC >1.38|1013930|36|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTTTGTTAGGTCTGGAGATAAGGTAGAAGCTTTTA >1.39|1013995|36|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATACCGTTTATCGTTACATCTATACTATCCAATTG >1.40|1014060|36|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGTTCATCTTGCCGTTGTTTACAGAATTCTGCAACT >1.41|1014125|36|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AACAGCACCGACAATGCCTACCTCTCTAACATCAGC >1.42|1014190|36|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAGAGGACAGAAAGATGAAATACGTAGCAAGGGACT >1.43|1014255|36|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTCTTGAGCATTATTAAAGCGTGTGCCTCTGAAATT |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b2,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_015672_1
The CRISPR arrays of NC_015672_1 >merge|NC_015672|1|1011494-1014319|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTTCCTCCCCAGAATTGGGAACTAAAACAGGCTAGAACACTGGCACACAAACTTAACATTCCATTCTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAACCTGCTGTGTTTAAACCTTGTGCCATATCATACAAATCTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAACTAACATTATATTTCCATTATTAACTTGAACGCTATACTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAACTCAAGATTTGCCCGTAAAGGTCTGCATCTTAACATTAACTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAACCACTTGAGATATTTGAATATTATTTTTTATTAGAAGCTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAACAACTCGTTCGTTGATTGTATAATCAACGTGAATAATCTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAACTCAAGATTTGCCCGTAAAGGTCTGCATCTTAACATTAACTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAACCACTTGAGATATTTGAATATTATTTTTATTAGAAGCTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAACACATCACCGATCATCTACATGTACTTGCTCTTTATGCTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAACTCGCAAATCCATTGTCCATTCCGGTATTTGGAGACGCTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAACCCCTCCACTATTCTTTGTGTACCGTCTTCTGTAGTACTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAACCCAGTAGCGAACTGTTTTAACAATATTAACTTCACTCTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAACTTTTTTAGCGACTGCAATATGCCGAGCCCCTCCGTTCTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAACTTCTATGAGCTCCCGTTACAATTATATTCTTAAACCTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAACCTCTGCTGTATCTGGTACATATACTGAAACATCAAGCTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAACAAACTGTCAATCTCTTGTCCACGTATATTAAATACGCTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAACGAGTTGGGAGAATATAAAACATTAGGTACTTATGAGCTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAACTTTTTCTCAAGATTTTGTGCGCTTCTGAGTGTTGCCCTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAACTGCCTTGTAAATCTTCTTCTGCTTCCGCCCTTTAATCTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAACCACTTTGTACGATATCGAATAATGCAGGATTCCGTTCTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAACTTCTCGTCTCACTTTTCTAGCCTCGCTCCATGTAATCTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAACCTGCTTGTGCTATTCTATCCCCTACATTTATTTTAACTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAACGCTGTCTTCTATAAAGCAGAACAAATGCCCGAAATGCTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAACTTTATGTAAACAATTGACTAAAATTGCTGAAAGAGTCTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAACGGAACACGTTTCATTGCGTGTTCCTGAATCAAGCGACTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAACGTTGAAGGAATTTTCGGTAAACTTGACGGCATTTTTCTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAACAACATATTATGACACAAAAACCGAAGTAAGTTCAGACTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAACCGGGAGGAAGCCAAAAGCGATTCCTTTTTCCGCAAACTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAACTTTCTCACCTGCATATTTAATATAGTTCGTTTCATTCTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAACTTGCTACTGCTGACATAGTTCCTTTAATGCTCACTACTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAACTACAGAAGCGTCTCTAATACCGTATTGCTTTCTTATCTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAACTATCTTGCAATGACCCTAATGTACTTCAACAACAATCTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAACACTGCTAACGCTGAATATGAAGATACTGCTTTTATTCTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAACACTCTCTTATTTTCTTCGGGACTTTTTTCAAGTCCTCTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAACGTCTGAAATAGTAAAACTTATAAGGCCATTATCATACTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAACGCTATCTACCGTCCCTACAGATGATAAGTCAAGCTGCTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAACAGGCGTGCTGCCTTCCAAAGTGCTACTAAGAACGCCTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAACATTTTGTTAGGTCTGGAGATAAGGTAGAAGCTTTTACTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAACAATACCGTTTATCGTTACATCTATACTATCCAATTGCTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAACTGTTCATCTTGCCGTTGTTTACAGAATTCTGCAACTCTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAACAACAGCACCGACAATGCCTACCTCTCTAACATCAGCCTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAACCAGAGGACAGAAAGATGAAATACGTAGCAAGGGACTCTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAACTTCTTGAGCATTATTAAAGCGTGTGCCTCTGAAATTCTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC 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TTTCTCACCTGCATATTTAATATAGTTCGTTTCATT CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC TTGCTACTGCTGACATAGTTCCTTTAATGCTCACTA CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC TACAGAAGCGTCTCTAATACCGTATTGCTTTCTTAT CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC TATCTTGCAATGACCCTAATGTACTTCAACAACAAT CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC ACTGCTAACGCTGAATATGAAGATACTGCTTTTATT CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC ACTCTCTTATTTTCTTCGGGACTTTTTTCAAGTCCT CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC GTCTGAAATAGTAAAACTTATAAGGCCATTATCATA CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC GCTATCTACCGTCCCTACAGATGATAAGTCAAGCTG CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC AGGCGTGCTGCCTTCCAAAGTGCTACTAAGAACGC CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC ATTTTGTTAGGTCTGGAGATAAGGTAGAAGCTTTTA CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC AATACCGTTTATCGTTACATCTATACTATCCAATTG CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC TGTTCATCTTGCCGTTGTTTACAGAATTCTGCAACT CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC AACAGCACCGACAATGCCTACCTCTCTAACATCAGC CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC CAGAGGACAGAAAGATGAAATACGTAGCAAGGGACT CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC TTCTTGAGCATTATTAAAGCGTGTGCCTCTGAAATT CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC
>NC_015672.1|WP_013886098.1|1009416_1011162_-|DUF262-domain-containing-protein MSYETALKISDVINEIHRKKYLLPAIQREFVWSTYQIERLFDSLMRDYPIGSFLFWKVEKDKTSEYEFYEFLREYHERDKKHNPKANITGDEEITAVLDGQQRLTSLYIGLKGSFAYKLPRKRWDNDQAYPRRKLFLNLVSQSKDPDFEYEFAFLTKQESEKIDEEYFWFPVGEILNYKEPGKVNSYLLQNNVFQNFNKEKADFANHALFKLHATIHNQGSISYYQEKSQLLDKVLNIFIRINSGGTVLSYSDLLLSIATAQWESKDAREEINNFVDEINNIGDGFNFNKDFVLKSCLVLSDFNDIAFKVDNFNKANMLKIENNWDRITNSIRIAVSLVASFGYNRETLTSNNAIIPIAYFLNKINAKDTYALSNKNLEKKIKIKKWLVLSLIKRAFSGQPDNVLRPIRKIIQESGKDRYPLETIISYFKGTNKTLIFSDEDIENLLYYKYGQGFTFSVLSLLYPSLDYKNLFHVDHIFPKSQFTKAKLRKKGISEDEIDTFQKYVNFLGNLQLLEATPNIEKLNKNFDLWLYETYPNENDRKDYMKKHLIPDVDLSFENFIEFFERREKMLKHEFQKILQ >NC_015672.1|WP_013886097.1|1008126_1009011_-|transposase MARTKRFKINGDVGYYHVISRTVGGEFLLGDVEKEKLLSVIKQFSSLYFVSVIGYCIMDNHFHLLVKTSSVEDIDNEELKERLSRHNKNISDEITESEIIKYKKKLTDISEYVKSIKMTFSRWYNKRNNRKGYFWGDRFKSVLVESGESLLNMLAYIDLNPVRAKICNKPEEYRWSSFSHRLAKSSDDLLSFEGTEIDSFKDYVSFVYGVGKLEKKTEKGKEKGRISDETDAAVNIWHHKVRYFTDTLVIGSKGFIEYAYKTFDDKISKKERKAHKVPIDLPYQLYSIQRLNSV >NC_015672.1|WP_013886096.1|1006634_1007945_-|ATP-binding-protein MRFYGRKSELSDLNNSYRLSAVNSQMAVITGRRRVGKTRLIQKFVEDKSAIYFVVSRKDEHLLCEEFVDIVQKQTNVKFFGKIERFHDFFEFLLENFKDKNFVIVFDEIQEFKYINPSVYSEIQKLWDMYKDSASLQLIFSGSVYSMMKDIFENSKEPLFGRASLKINLTPFDIKTLKDIYSSNVDKTDNFDFFAFYAITGGVPKYVEYFVDRKIFSFDAIINEIFRENSFFVEEGKTTLIEEFGKEYTTYFSILSLIASSKTSRSEIESILEKDVGGFLQRLEKDFCIIKKIKPVFSKPNSRVQKYAIEDNFLSFWFRFIYKYNSAVEIGNYEYLKDVVRRDFNSYAGKILEKYFRAKLTMERNFNIIGNYWEKGNKNEIDIVGVNDYEKLLFFAEVKLDSKKASLDELKEKSQKIIRKFNDYKVEYRIFSLHDL >NC_015672.1|WP_169310277.1|1006271_1006487_+|hypothetical-protein MLEGKSTALLVTGAGPYENNAEGMIDAFRRMQKPHKSISAGELYIGRCTTPEALGKDIKQQSIDFAQKIAG >NC_015672.1|WP_013886095.1|1004904_1006218_+|IS1380-like-element-ISFsi1-family-transposase MSKLNYKLERSNDKITPFGGISLLIPLLDKMGIRDFLDKELDHPGSNRGKPPSSKIIPVILSMICGGRSFSDIDKLSFDKVLSYISGIEDIPDSSSISRYFSKTESMLDEVAVNKTISKLGSLNYKIVKDALKRENLFSVTLDQDATYAKVYKRDAKYCYKKFKAYSSMTCFIGESGYCIDEEFREGNVSAQVGILEQLQRVHKYLESCGIEVSNVRNDSAGYQSKVLNYCFDNDLTFFIGGDLDSSVRKGINHIPSDSWKRYRNRYGDESDNEEIAEFIHCMENTKESFRIIVVRKKIESDNPTVPELLGDKYEYRVIATNSKLDAEKVVHFYNLRGVCEYNIKEAKYGFNLKSFPSGNLAGNGLWFKTGILAYNLIMYLKRIIMGGVYKNKEMGSIRYQVISIAGKLVSHGGNKLKLCCSVKYNLPVPISLSISL >NC_015672.1|WP_013886094.1|1003413_1004460_-|homocysteine-S-methyltransferase-family-protein MKKPLLQRLDEGPVICGEGYLFELERRGYLQAGSFVPEVALNNPEVLEEVHRDFVKAGSDIVQAFTYNGHREKMRIIGKEEKLESLNRSAIRVAKKVASDFNDEPLVAGNVSNTNIFNPSDHSSKEKVRLMFSEMIGWCKEEDVDMIIGETFYYLEEALLALEVMKQHNFTSVITLGIMAENILEDGYTPTEACKILKDSGADVVGLNCFRGPETMLDIALDIRRNVSGHIAVLPVTYRTTAEEPTFFNITDKKRTACPQHGRCFPDALEPLYCNRYEIAEFAKKAYENDIRYLGLCCGCNPAFLRAMAEAVGRNTINSEYSPDITKHFLYGKDPTLKKHIQDLGNKA >NC_015672.1|WP_148255815.1|1002286_1003291_-|aminodeoxychorismate-synthase-component-I MKTSKFTKEHFTTDKAKFTEKFNNLFAKRIPFVFIIDYNVNNLLIEKITDADDKGISFIFPGLKNISDIDVSKNVNLSICPPSYDKYLRGFEIVRKNLLEGNTYLANLTFKSEIYSSLSLKKIFHKSKAKYKIKYNDDFVLFSPETFVKISDGYIYTYPMKGTVVAGDKNAAANLMEDEKEIAEHLTIVDLMRNDLNMVSSEIEVTKFRFLSEINTGNRQLLHTSSEINGKLTKYYMENPGEAILKLLPAGSICGAPKKRTLEIIKTAENYNRGFYSGIAGVYDGKDIDSCVMIRFIEKNSGKMFYKSGGGLTVYSDPKKEYEELVNKIYVPVN >NC_015672.1|WP_013886092.1|1001712_1002303_-|aminotransferase-class-IV MCLLIETIKLQNGIFHNLDYHNERLNNSRKNIFKKSEPLDLYSYLREFDYPKKGLFKVRVEYAENFKNTSFVSYTPVTITSLKVVINNNISYYYKYADRKCFQNIITGKNEEAIIIKNGFVTDCTYANLAFSDGKSWFTPNTYLLNGTKRQLYIDRGEIIPVEMRVKDIFHFKKVSLINSMLDLKEVCISTENIRK >NC_015672.1|WP_148255814.1|1001495_1001699_+|DUF3179-domain-containing-protein MIYLSPFPYLSPFPYYSFSGEKITISYNQESRFAKVTDTEGDEISSVISFWFAWQAFYPDTFLWRKK >NC_015672.1|WP_013886091.1|1000363_1001401_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MYTLEVKNIEKTFSAEKPLKSVNLNLASGEIGCLVGPSGCGKSTLLRIISGLETAERGSVKINNRMVFDKNINMPPFKRNVGMIFQDFSLFSHMNVFENVAFSIKKGSKATIKKKVYSILECFQISDIKFKYPHELSGGQQQRVALARTFIKNPDILLMDEPFSNLDVSLKDKLLKEIKSIIKSYQTTTLMVTHSMEEALKMSDKVGILKNGEIIQWASPYAIYHRPVDKFTADFSGDTSYIHARLINGVLETGLGKFDFNDKKYSDGEYDLLIRPEDITVSSEGIDAKVLNKEFMGAYTNYQIKLSSDDKILIKLPSHLNFSIGTNINVTPDFKHFIMFPSEKT >NC_015672.1|WP_013886099.1|1014454_1014736_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFVIAVYDISTVELEGQKRLSKMMKLLRQYLHHTQKSVFEGEISESKLFELQKKSQNIINEDQDYIVFYKIDNKNNVKRMMYGIGSDPNETII >NC_015672.1|WP_013886100.1|1014739_1015729_-|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MRDYYIFKSGRISRKDNSVMFDYFDNGVAKKIPIPVNDIDSIFVFSETDFNTKLINFFSKNNVMIHFFNYYGYYTGTFYPKEFLNAGEVVVKQSEHYLNNSYRLELAQEFVKGAAHGMLQNLKRYQTYTFEQIDKIKLLISAIDEQYSVPSLMGVEGNIKEIYYSSFKKIIKQKIDFEKRIKNPPNNMMNAIISFMNGLIYSNVLREIYRTQLNPTISFLHEPWYRRFSLALDVAEIFKPIYGDRIIFDLLNNDELQPKHFDKDLNFAYLKEDGRKIVVKAFDEKMKKTVRHKQLKRDVSYRKFIRLELYKLIKHILNEKNYKSLRIWW >NC_015672.1|WP_013886101.1|1015732_1016227_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MLNPIVTGTQINYYFVCKRKLWLFSHNISMEQYSESVEIGKIVHETSYERKRKEIELDGIKIDFFDKNKGIIHEVKKSKAIEDAHIWQLKYYIYYFRQLGINVTGKINYPLIRKTENIDLNDEDIYHIVNICDKINEITSRETPPDVINEKICKKCSYFELCYV >NC_015672.1|WP_013886102.1|1016230_1018372_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MYAKSNPPKTIFEHNEDLVKNYDILKRYISPQLIEKYDKYLQKMLELHDYGKINTRFQNKLGICKNKIPKELTDIPEVPHEWLSLAFIPKNLKEEILNLDANNFNLYNVLRYSIAFHHTRNEIFDKNDFKSTVEYDLERNKHLLGIKYALNKLLNLTNLENSINDNFENIFEYLVLFKGILHKCDFSASAGTPCETEYKGNYQNDFKIGLQKRGIKELKPFQKNAKNLSDKNVILIASTGIGKTEYSMNWIKGNKAFYLLGIRIAVNAMHKRFADFFSKENVALLHGDISYFLTNETDSKNDYDHKMSKAKQLSYPLTIATADQMVTSVFKYNGFELPYLVASYSKVVVDEIQSFAPESIACIVVFLQEVSHLGAKFLIMTATLPPFIKEEFKNIVHFENPQLSEKKRHKIEVLDMQIEDYDFEKIQSNNVLVICNTVSKAQKIYEKLKEKKPKLLHSKFINKHRNVKEKTIMKCSNGIWITTQIVEASLDIDFDLLLTECCTIDGLLQRFGRCYRKREYYGENPNILIFKFDNISEKIYDKNLLQRSFSILRNDYNKKLLTEKDKQEMIDKVFQDIEKTCYYKSYKEYKELLKSGFKSSKNEAQKLFRKITNTHNVIPEPVYNKNEEEIKEIISQIEETSSLERIKLKEKLNKYCVSLQIFANKAKDIVKPLPVDSKYIKKSEIKMLKGVEYTYEKGVEFKKEYNDMDNFIL >NC_015672.1|WP_013886103.1|1018374_1019094_-|CRISPR-associated-protein-Cas5 MISLKLSLYQNMVNFRKENSFGHVQSYPLPTPSMVRGMAHQILELTKYNPLKISIQGNSDSVTVNMQKVMKFDRDPKSRPINPYIVKVGNSVKTATHGIAFVDNLINCKLIIHIAFENEELTKNLYEKVMKNTVILGRNEDIARVNFDETKLTEISYSDDENELPYSIYVNSEDAKKLQLSGTSFRLPFRYENVTSFSDSRIFHKVNCQFISKNTILNEYTAETFLIDEDGLFVSFLET >NC_015672.1|WP_013886104.1|1019090_1020026_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MSKHLHLGIIFKGTNLNYGESMGNYTSLKKCSIGEQTYSYITRQAIRYDIVRIMEEECGYDKAEIDNVQKVVQFASGAKITDYPEIDFFGYMKTEKKKSNKDEDKNQSDNEGKTKIRKAIARISDAVSLEPFYNEIDFSTNMGLAARKNLENQIYQTETHRSYYSYSVTVDLDKVGVDENDSVNLDTTEKIKRLKALFYSVKTLNRDIKGRRENLNPIFVIGGIYESGNPFFYNQLKLSFSKDGVFLNENIVNSILETQLFNEKPIKNNTQAGAVDGHFKNTDKLNIEIKSVEEFFTNLNNKIKQYFEGQN >NC_015672.1|WP_013886105.1|1020018_1021599_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas8b1/Cst1 MSDELIRIYTGDWYFNAGIVGFLRTICNNNFEKLSEFDNQDLYIGDNFLDFNPNILKYFKENFYKQLFLNYFNKTQYLAYINKALTHKNKDNSLNISKSKKEVDKFPFQGLWKTLDQSLESKNDFLEFYAKIESITKEQIYELIKNKDKASLEKLLGYLTNGIIGLSKIGQYINDSVDKKYKIKSKKNRFCISCQERKGKFDVSNAISNIIGFNSDNSNWIWGFDANKVKFCSVCSLIYISASVGLVFSKKGKNYNNCFYFVNHNGNINLLLKSYIQFRYQLEDIKSSFSIYPVMVKESVKFTKSTKAEKTLHNISFVEVKESGMGGQSTKGYNVYSFSMPEKLANFIDKNNQLIPKGYYKIDKSFFDIEENILKSTIEQTLGYKDIDKYIRIYISNTDGGRKFSPYKIIKYILRYINFIHGGNSMDMEKISKKGFANGKEIGNLFRSSERENQINSLVYQFLNDLKVANREKFLDKYLRVTISNGLESRFGNVEMNNKDAFLQFGYSFINGLLNTYQNEKGENNE >NC_015672.1|WP_013886106.1|1021595_1022333_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRLTYWLKFAKGDNKIRTEYRRDVLRYIKNSLSEYAPEIYEKYYANKKENQPKPFTFSVSFSIAEKPNSRNDYFILENDSLKIHFSFADYTFGMTVYNALLQEKNEAKIFGDAVQKIEHINLEKDKKIDDSTTVFKTLSPILVRDLHNGKGKGFIDSNHKNFSGNLTKNITHLANHFLQETNISENEISVEPVKMKSDIINHYGGEIGNTGIIKISAPGEILQLIYDAGLGAKRSQGFGMLEVIG >NC_015672.1|WP_013886107.1|1022627_1023116_-|HyaD/HybD-family-hydrogenase-maturation-endopeptidase MKISIFGAGNTLLSDEGFGVHFVRYLQSRYDFPENIDVVDAGTMGMLASGFIENYDYVFIIDVVEIKDKPGTILIYDYDDIRLNKMPAKLSPHQIGVQEMLLMCDIRGVSPDNLKLISVVPESMTIGDSLSKTLKNCLKEVENILLKELESLNIPFYKKSIN >NC_015672.1|WP_013886108.1|1023112_1024795_-|nickel-dependent-hydrogenase-large-subunit MSKKITIDPVTRIEGHLRIDVEVDNDRVTNAWSSAQMFRGIETILKGKRPEDAWSYAQRFCGVCTTVHAIASIRSVENALNVQVPLNGQYLRNLMIAMHSMQDHIVHFYHLSALDWVDITSCLKADPKKTSLLAESMSDFGGHGVDDFKNVQKKLKHFVDSGRLGIFASGYWGHQAMKLSPEENLLLFSHYLTALDYQKKAAQAVAVIGGKNPHIQNLVVGGVATAVNMDNMATLNVERLSLIRKKLGEVKKFIDKVYMNDLVLLADRYREWFDIGQSVGNYIAVPEYPLDIHSKEFLIQGGIFFNGEQNIHHKILDHSDDYLINNITESSEFAWYNNPAPLHPWEGSSDPRFTGYDHDSKYTWCKAPRFKEKAIETGPVAQILAGYHTGNEFIKREIDFYNSTLSIDNSKYNSTMGRLLARGYRAKFSAETAEYFLDKLIENIAAGDSDYANPTEIPSGEYKGVGFHEAPRGMLSHFIHIKNKKIENYQAVVPSTWNASPRDENGVMGPYENSLINTQLAETEKPLEILRTIHSYDPCIACAVHAVDPDGGDIVKVKVL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_015672_2 | 1428419-1430685 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NC_015672_2
|
30 spacers
spacers of NC_015672_2
>2.1|1428455|40|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT TGAAGATTAATGACCCGAAGCAAATCCAGATTTTAGAAGA >2.2|1428531|38|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT CATAGGCTCATTAAAGGGCATGTAAGCATGGAGCTTGT >2.3|1428605|38|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT GCAAAATACAACTGAAAACACAAGTAAAGTAAAACTAA >2.4|1428679|38|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT AAAAGGGTCAATGATTTCTTATTTAAAAAGATACAGCT >2.5|1428753|37|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT GCGCCGCCGTAAGTTTTTTAACGGCGGATATAAGGCT >2.6|1428826|41|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT AGTTAAAAGCTGTTTTCACTCTCCTGAAATGGGAGAGTGAA >2.7|1428903|39|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT CAAAAATCTGCGTGAGCCAGAGATAGAAGAAGGCAGTAC >2.8|1428978|40|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT AAGATATGTATAACGTAGCCTTCGAACTGTACTGTGAGAA >2.9|1429054|38|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT GAAAATTGTCATGGCAATTCTATTTTTTGGCGGTCTAG >2.10|1429128|40|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT AAAATTTAGTATTAACAACAAGTGGAAACAAACTCTATGT >2.11|1429204|40|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT ACCATTGTTCAACACACTATTCAATGCTGTGACAAAGAAC >2.12|1429280|40|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT AAAATATGGCGCGAGGTTTGCAGACTTGCAGCCTCACGCT >2.13|1429356|36|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT ATTAATTTTCTTATCAGGGGGGGAAGAAAAAATAAA >2.14|1429428|39|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT AAAAAGGTAAAAAAATATACAATTAAAGACGAGTTGGGA >2.15|1429503|39|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT TCCATGGTCAGAGCTCGAATCCGCAATCGGGCACCCGGA >2.16|1429578|39|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT TAGATGTTGCAAAGCAGCCGGTTAAGCTCCGGCTGCTAT >2.17|1429653|37|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT CATAAGTGCATCTGAATTTTGGGAGCGCGCAGTAAAA >2.18|1429726|38|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT TAATATTACAAAATGTTATATTAATAATAATATTGATA >2.19|1429800|37|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT AAAATCAAATAAATTTAAGAAGTCTGCAAAGCGCAGG >2.20|1429873|38|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT CGAATCCGCCATCGGGCACCCGGATACAGCCCGGGTGC >2.21|1429947|38|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTTAAAAGCTTTATGGAACAAAATGGCCTGGCGGAAAT >2.22|1430021|39|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGATTAAAAGATTTATATAAAAAGTACGGCGCTGAGTAT >2.23|1430096|39|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TACTTCCGCGTAGAAGTACTTTAAAAAAATAAAAACCGT >2.24|1430171|36|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CGGCGGGTATAAAGCAGTCCTCAGATACTTTGAGGA >2.25|1430243|38|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATAATAAGCGCCTTATCCAATCAAAAAATTTTTCTTTT >2.26|1430317|39|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCCCGGGGAGAAAAGAGACATAGCAAAGCAGCCGGTTAA >2.27|1430392|37|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAGCAATAAGCTTACATAAAAATTCTTTCTCTCCTTT >2.28|1430465|36|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGATTGTTCTACTCTTACCTTTATTCGTCTTTATGA >2.29|1430537|39|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAATGAGAAATGAAATAATTGTAAATAAGATTTCAGAA >2.30|1430612|38|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGAAGGGGCAACAACCCTTCCGGAGGGTTTTAAAATGA >2.31|1428469|40|NC_015672|PILER-CR TGAAGATTAATGACCCGAAGCAAATCCAGATTTTAGAAGA >2.32|1428545|38|NC_015672|PILER-CR CATAGGCTCATTAAAGGGCATGTAAGCATGGAGCTTGT >2.33|1428619|38|NC_015672|PILER-CR GCAAAATACAACTGAAAACACAAGTAAAGTAAAACTAA >2.34|1428693|38|NC_015672|PILER-CR AAAAGGGTCAATGATTTCTTATTTAAAAAGATACAGCT >2.35|1428767|37|NC_015672|PILER-CR GCGCCGCCGTAAGTTTTTTAACGGCGGATATAAGGCT >2.36|1428840|41|NC_015672|PILER-CR AGTTAAAAGCTGTTTTCACTCTCCTGAAATGGGAGAGTGAA >2.37|1428917|39|NC_015672|PILER-CR CAAAAATCTGCGTGAGCCAGAGATAGAAGAAGGCAGTAC >2.38|1428992|40|NC_015672|PILER-CR AAGATATGTATAACGTAGCCTTCGAACTGTACTGTGAGAA >2.39|1429068|38|NC_015672|PILER-CR GAAAATTGTCATGGCAATTCTATTTTTTGGCGGTCTAG >2.40|1429142|40|NC_015672|PILER-CR AAAATTTAGTATTAACAACAAGTGGAAACAAACTCTATGT >2.41|1429218|40|NC_015672|PILER-CR ACCATTGTTCAACACACTATTCAATGCTGTGACAAAGAAC >2.42|1429294|40|NC_015672|PILER-CR AAAATATGGCGCGAGGTTTGCAGACTTGCAGCCTCACGCT >2.43|1429370|36|NC_015672|PILER-CR ATTAATTTTCTTATCAGGGGGGGAAGAAAAAATAAA >2.44|1429580|36|NC_015672|PILER-CR GATGTTGCAAAGCAGCCGGTTAAGCTCCGGCTGCTA >2.45|1429655|34|NC_015672|PILER-CR TAAGTGCATCTGAATTTTGGGAGCGCGCAGTAAA >2.46|1429728|35|NC_015672|PILER-CR ATATTACAAAATGTTATATTAATAATAATATTGAT |
csx20,csm5gr7,csm4gr5,csm3gr7,csm2gr11,cas10,csx1,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_015672_2
The CRISPR arrays of NC_015672_2 >merge|NC_015672|2|1428419-1430685|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR,PILER-CR,PILER-CR 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MDVNYFGLDKRKTALLIIDVQEKLTPVMKKDVYEKIKNNILILAKGANKLNIPIFYTQQYTKGLGETDPDIKKELNDATFYEKTSFSCCGEDTFLDSFMEMDFESVIVAGMETHICVLQTVTDLVANGMAVHVAADAVCSRDKFNWKFGLEFMKDAGAIITVTETALFQLLGKAGTENFKYISKLVK >NC_015672.1|WP_013886463.1|1418774_1419866_+|NADH:flavin-oxidoreductase MDNIFRESKINNAVLSNRLIRSATWEGMCDNTGAPTEKLIKFYEEMIKGGIGLIITGYQYVKKDGQQLPGQIGIHDDSLAKSHKNLTKRIHEAKGKIFAQLVHCGGQSSSKSSGFQPSAPSALKSPQYPEKVKELTEEEIEILISSFADAAMRTKEWGYDGIQLHAAHGYLINQFLSPNTNRRNDRFGGTLHNRARFLYDIYENIREKTGNEFPIIVKLNGSDNLDGGFELDEAVKVAEKLDEMGIDAIEVSGGTPASGEKTPVRTDISESGKEGYNMHEALKIKKNVSCPVISVGGFRSYKVVEKALEQIDFVSMARPLICEADLPTIWKRKDKNTSDCISCNGCFRPGLKESGIRCVIKNP >NC_015672.1|WP_013886462.1|1417379_1418732_+|NAD(P)/FAD-dependent-oxidoreductase MNNTQKYDFIAIGSGVAGSTAVIECARHGLKTAIVDNKPYGGTCPLRGSDPKKILLGAAELYDWFSRMKNTGIINGDIRIDWQNLIQYKCSYTNNIPMKVEQSLKKMSIDSLSGNAEFANENTLKIGDKFYTADNILVASGSVPTKLPFNGAEMMSSSDDFLSLKTLPDKIIFVGGGFISMEFAQAAARAGAKSIIVHSGERILLGFDKELVGLLNKAAQESGIDIIVNNRVSKIETDGDTLIAHLSNSEETIRADMIVHGAGRMANVYNMNLETGNVAYDSGGIKVNEYMQNTSNSSVYAAGDVTDSEGPYLATVAAMEGRIAAENIIHGNKRKPQYENIPSVVFTIPTLASVGMQEEDAAKAGIKYNSRFQETSDWFTSYRVGEKYSGYKIITDENNTKILGAHLLGPSSEDVINLFTFAINRGITPEEMKNMVYTYPTASSDIVYML >NC_015672.1|WP_013886461.1|1416527_1417274_+|nitrilase/cyanide-hydratase-and-apolipoprotein-N-acyltransferase MKISLLQLKIKSKPEENIDKVINKTKNLNGHIVLLPEMFTTGFDYPLINSLDEKHPEILKNLPDSNVYMGSILRKTSKGKFNSFFIKNGRNITFPYDKLHLFPLMQEEKHLMPGERLNTFTLKNILCAAGICFDIRFPEMFRYYFKKNASIIFIPSEWPSKRIKQLIRLVRARAVENQCFYVMCNAAGKTTGHHFGGMSAVFDPLGNNLNKMTAKCDEIISTEIDTNKISIAKNNIETLNHLRNDIYG >NC_015672.1|WP_013886472.1|1430993_1431377_-|hypothetical-protein MNFFLVFSHSLTNVQIEDAKSMGVENFFYFPAQLQNIWSNIRPEGDLPVSDLDRIVDWIDANSSKGDFALVQGDFGATYYIVNRCFDMGLIPVYSTTKRIASEESISASEVGKQSVFEHVNFRRYVK >NC_015672.1|WP_013886473.1|1431373_1432507_-|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm5 MSMICKYNIQAFLASPVHIGTGEMYDPFSYVIKGNVFYHFETAAFLSNLSSEKTKQFTYILKNPSRDSILKSREFIYNNFDADVMKDIIIDEIDLSKSSFPKDYEEKLSDLANKDPRNKAINLLEIEQTYSSGGFPIIPGSSLKGSIRTAIINQLIEDNNIRVDKGRYSYKKLMRDMDLSYQNDIFDMLKISDFHKENAGKWIGYFKNYPKSKMEKSISQNNQIDVATEVLRPFQVFKGEINIFPKEKRHQFEKQFNDITKTKVNIFKCLNRHYLDLFKQEYNFFKKKNPKSNFFKIIEQKNFLEKLESNEYAVLKVGKHSGAEGVTFKDRAIFIKGSKNKDAKYDAKTSTTTWYFSQKKELSVPNLLYPLGWIILI >NC_015672.1|WP_013886474.1|1432508_1433435_-|hypothetical-protein MKYYKATIFPKSPFATPPMSDTLFGQLIWMLNDLGEDVAKMLATYDSNPCFVVSDFIANNQGVAPKMPTTYNLGKSKMEKIQEILDRKELKKRSKIDLDKLYKMQKIDSKKIIDNSIKKNHDEINETVHCSLNRLTGTTGNGFDPYSVIETVYKKDTFFTCYFYVSENEHVEKIKDALILMGKIGFGKDASIGKGRFSVDKFEEINFSHNNKNSIYTLGNVVLDGINDYKNCYYEIFTRFGKHGNILSVTGNPYKNPVVMAKQGALITDVSDKLFEKPFIGKSLKGLSYHQETVHQGYSLYVPIDVEV >NC_015672.1|WP_013886475.1|1433444_1434143_-|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm3 MEKLKIKNITGKIVLESGLHISGGDTEMHIGGVDNSVIKDSLSKAPYIPGSSLKGKVRSLLEYFVNAQLKTDGKPLQYNNLENSSDEEEKNIVKLFGTGGSEKNRDNFNPDYAITRVIFSDCYLNKDSEEELLKKVGKLTEIKAENSIDRVNGTAESPRFIERVPKGAIFDFDVSIRLFPKDNEENLMGTLLKGFKLLTFDALGGSGSRGYGKVNMKFDQEETQKQFDSIQI >NC_015672.1|WP_013886476.1|1434153_1434576_-|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Csm2 MARQENSSDVVKTSFKKYEFSDLIKTKAKEVAELMKKEHDDRKINKNSQIRKFFDDLYSVKNTIDSSSDKEKSFNENLPMIYLVASKGAYAKGRKHIGQNFYNFLSNNITTIDTLDDFEKFISYFEAILGYYRYLNPKEN >NC_015672.1|WP_041262310.1|1434568_1435228_-|hypothetical-protein MFFAYYLPHICKKYFGNVYTVFAGGDDLFLIGPYDEILELNFLINHEFFKFSGCNEELTLSSGISIAKHNTPLFFISEMAENNLNISKNYPDNPLSKGYTHVFGATEKTEEFKDEFDNLYNFISSSILNHLQNNTSFWYKLLGILDMRININENIRNIMWMPRLKYLFARSFPNKNKETESEFKKFIYTMTDRNPSLLRALITKFLYAKKYKILGGQNG >NC_015672.1|WP_013885271.1|1435400_1436768_-|IS5-family-transposase MRPKKQDSTTQELLEPLLVNIIDMKHPLIQLADKIDWEYFEKEFGSLYHRNDGRPGIPIRMMVGFHYLKYTYNLSDEDVVHGWKENPYWQYFTGEKVFQTKVPINPTSMTRFRNRLKEEDLLKFLEETINTAFRSGYLNKNDVKKVAADTTVQEKNITFPTDIKLFYTMIKYLVKFSKKHEIRLKETHEYSGKKLLMKYSGYVHAKQYKRAGKAVKKMKTKMGKLYRSIERVLPEELRNSDEFQQLKLFYESLWNRSKKSKNKLYSLHSPEVECISKGKSHKRYEFGNKVGFVGTLKKNFILSCKSFHGNPYDGHTLEENLCEAKTLLGSNGTIDTILVDLGYRKHNYRGDAKVHVVPRSMKKFKVNFKRLLKRRSCVEATIGHTKRDNRMDRNYLKGKEGDKANAILAASGHNLRLILAFLLFFLKKFMDNIAKKLANFANEVFLDKKYAKIYV >NC_015672.1|WP_041262311.1|1436818_1438516_-|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Cas10/Csm1 MDDNTLKNTLVGLAALLHDIGKAYQRSGKKLSSKYKNTEEWQILLNKYSHYHSLHTAEFFDNQIENSYINKLWSESFPEISMQKASAGHHNPQDYLTQIVAISDQIASGFDRERYEIRSNKKPYDYRKVHLAPLLKHVSLQKDIVDKDYRYNLEEISVNSIFPVHKNELSNIKVEEKYENLVNNFEKDLKKIFANKKFDIFISEIQTIFEKYFSFVPSSTLDEYDEISLFDHSKTSAAFAASTYDYFSKENLDKLNYNQIKDKNLYMLIRGEFFGIQKFIFGDDTENSQNTAKALRGKSFYVSILSQLTAYHIIKEIKLPSFNIMLNAAGMFVILAPNKETVKQKIKDIKAEINDWLYDTFYGEVSFGIVNVESSPKDYIDKRFEKLWLDLISLMEHEKYAKFNLTKRKSLFEDYHKEFDVSGSCNTCGKRSATNNNNCEMCNTFIDIGKQLVNNRYLHLYEKKKGEFFQRYSIKFSNEIQLSNEYIDVLDLEPLKSYEGGSIVYINNYVPKNNYEIMSFEEIVENNNSERKKPLGILKADVDNLVSPEKLDNYLIILELTKEIC >NC_015672.1|WP_013886477.1|1438516_1439689_-|DUF1887-family-protein MADNILITMVSDQTVPNIVFVKEAIDKFGCNKFVFVTTKEMKEKNKTKNIQKVCNLSDESLQVLVVESDDFNDNLKKLNSLDIRNSDKIYANLTTGTKIMSLALFEFAKNYVKSENLYYFTFGKDTFVNILSGATYRVENKITIQEYLDAYGVNISNKDKLQNKKECAEKRKELTYQIWNLFNNNPSEIKENAEKIRTYFNSSKVKGKEKKINIEELKTNASYFINKLNLNFDNETKKRLKHWIEYLTGGWFEELIYFKTKEFLEIENNEYIQIGMEIEHGGKNELDVAVCYNNNLYYLECKTGLGEKERDVLTGTFYKLSHLKDNENFGLGMTNALISLDDKVLYDKKGELQAKYKDSVRYYRLKFFGWKDIKEKGLENIIKEIFNKGE >NC_015672.1|WP_013886478.1|1439681_1440593_-|CRISPR-system-precrRNA-processing-endoribonuclease-RAMP-protein-Cas6 MFIKYQKYDFTIQFSETTYSDVFPAFLLRSVLGKELKSFACVLRRRKCEGCPLKFQCAYSYIFESPISKDNEFLKGRDKVSHPFTISCSEDADKKLDSLHFRLTLFGRGIDYFPYIFYAFKKGGESGLFRRKTKYDIVSIFADGKMVNDGESEELGIPEPKDWELSTGTSEIYKKISINMDSPLRLKINGKYTDKITYRDFLYAAVRRAEILSSKYGINNVDTHLTKKLSEKSENICIYWKDYDRYSARQKQKMKLGGCLGTMDIEGNFNSYELSLFNFCEIFGLGKNTAFGFGNVSVEVSDG |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_015672_3 | 1709332-1709573 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NC_015672_3
|
2 spacers
spacers of NC_015672_3
>3.1|1709372|49|NC_015672|PILER-CR ACATTTGCGCAATATCTCATCGCAAATGTTTCTGTTCAGAGCTTGCTGG >3.2|1709461|34|NC_015672|PILER-CR AGTATATCTTAACTTAACAAATGGATTAGAAGAC >3.3|1709498|39|NC_015672|CRISPRCasFinder TCGGGTGCTGCGTATTATGCAACTGCTCCCACGGAAGGG |
csx20,cmr6gr7,cmr5gr11,cmr4gr7,cmr3gr5,cas10,cmr1gr7,csx1,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_015672_3
The CRISPR arrays of NC_015672_3 >merge|NC_015672|3|1709332-1709573|PILER-CR,CRISPRCasFinder TTATGTCGTAATCCCTTCAAAACATTTGCGCAATATCTCATCGCAAATGTTTCTGTTCAGAGCTTGCTGGAAATCAGGTCATTAATTCCAATAGTATATCTTAACTTAACAAATGGATTAGAAGACTTTTGTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAATTCGGGTGCTGCGTATTATGCAACTGCTCCCACGGAAGGGGTCGTAATCCCTTCTAATCAGGTCAATTCCGAAAATA >NC_015672|3|5|1709332-1709497|PILER-CR TTATGTCGTAATCCCTTCAAAACATTTGCGCAATATCTCA TCGCAAATGTTTCTGTTCAGAGCTTGCTGGAAATCAGGTCATTAATTCC AATAGTATATCTTAACTTAACAAATGGATTAGAAGACTTT TGTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCC AAT >NC_015672|3|3|1709462-1709573|CRISPRCasFinder GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAAT TCGGGTGCTGCGTATTATGCAACTGCTCCCACGGAAGGG GTCGTAATCCCTTCTAATCAGGTCAATTCCGAAAATA
>NC_015672.1|WP_013885895.1|1707786_1709154_-|IS5-family-transposase MRPKKQDSTTQELLEPLLVNIIDMKHPLIQLADKIDWEYFEKEFGSLYHRNDGRPGIPMRMMVGFHYLKYTYNLSDEDVVHGWKENPYWQYFTGEKVFQTKVPINPTSMTRFRNRLKEEDLLKFLEETINTAFRSGYLNKNDVKKVAADTTVQEKNITFPTDIKLFYTMIKYLVKFSKKHEIRLKETHEYSGKKLLMKYSGYVHAKQYKRAGKAVKKMKTKMGKLYRSIERVLPEELRNSDEFQQLKLFYESLWNRSKKSKNKLYSLHSPEVECISKGKSHKRYEFGNKVGFVGTLKKNFILSCKSFHGNPYDGHTLEENLCEAKTLLGSNGTIDTILVDLGYRKHNYRGDAKVHVVPRSMKKFKVNFKRLLKRRSCVEATIGHTKRDNRMDRNYLKGKEGDKANAILAASGHNLRLILAFLLFFLKKFMDNIAKKLANFANEVFLDKKYAKIYV >NC_015672.1|WP_013886722.1|1707264_1707711_+|hypothetical-protein MSDICFLRPTAAKRIENWLNSNNYSLHNGYFTLEYNFSPIVDDGIILSFIDNKTGDIHKLVVQDDIEGIIEPDEECSVSQISIDYIPLSLELTPETLEKFSEIESRKFEAEVEELVEPVGCGIKFEIYSDSYAIFACKKELQRTQIGE >NC_015672.1|WP_013886721.1|1706841_1707243_+|type-II-toxin-antitoxin-system-VapC-family-toxin MSYLFDTNICIYIIKNKYKQIAKKMQEAGLEKICISAITVAELEYGISKSSKKDENRIALLEFLIPFTVLNFDQNDARKYGQIRYNLQKAGTPIGNMDLLIGSQALARDMTLITNNEKEFSRIQGLKIENWIK >NC_015672.1|WP_013886720.1|1706613_1706841_+|AbrB/MazE/SpoVT-family-DNA-binding-domain-containing-protein MDTAKIFENGKSQAVRLPKKYRFDSDDVFIKKIDDIVVLIPKDKVWQIFSSSLDKFSEDVDFQKDNSIPQEREEI >NC_015672.1|WP_013886719.1|1703239_1706488_+|UvrD-helicase-domain-containing-protein MSDQALKDSHARKKIINDLDTNFLVEAGAGSGKTSSLVKRITSLITNGKNKISEIAAITFTKKAASELMERLLNELEDRHNSETDPTIKENLYDAINNFDQCFTGTIHSFCSGILRERPVEAGVDPDFDEIDDSDEFGLITEVWNEFIKSTRAENPDMLKLTEKIGVSPEELQDSFVMLNKYPEIKIHAEKSEKPDLKPAVKKVLEICKEASKYIPDEEPDKGYDAFQKNVQSTLRLLEYRNLYEDKYAIEILTKFEKTPKITQNRWLDKKTAKNFQDVILPDLVENTVYPVLRKHREHIYTYFIDFFQDALTYYENKRNQESILNYNDLLTLTSKMLRNNSKVREYFQNKYKTTLVDEFQDTDPIQAEIIMYLTGEDLKETDWSKLRPKKGSLFVVGDPKQSIYRFRRADIDIYNFVKEIISQTGGEILELTSNFRSLNSIADYLNPVFEERFPESGDRYQAPMAKIRAIRENNYEHGVKKILVQCDSRKKEDVVEIDAENIARYIKYAVDGGIKLARNEEEKSKGLNEKPVYSDFLIITKHKDLLEQYANTLEKYGIPSTVTGDDFFSQSEEINHIYKLLKFLSKPDDEILLVSVLRGMFFGLSDNDLYQFKASNGYLNIFSSIPESLDENIKNLFNNCFSTLRKYKKIINELPPSSALETIFQDLGILPYTSLKNLSKSRAANIYFLIEQVKQKETTEFYSFGNVVNHIGRLLESKFEQRNSLEVESNCVRIMNLHKAKGLEAPVVFLAHPHKNTKHDPTQHINRREGEPIGYFALTKKKGIHHKKIFAQPKNWEEFQEEEQKFLDAEFERLVYVAATRAKNLLIISCKEKGNGSQNPWLSLLGNLKDDDVIDVPDVSIEHDSGVNELSVKDINDKKAEISHWRHSVSEENYSNMTPTEVKDLEKIFAGERLEGGGQDWGTAVHNFLEFAVMTKDTGYEDLDTYIKFTFEELDISSDRTEEAKKIIEDFKQTDLFNRIKNAEQVETEAPISMKINPESEIMNLFNTKTSNKPIILAGVIDLVFKEKDGWVIIDYKTDRVNSEEEYEKLRQAYLNQVEIYAKAWEEITGEKVKEKNIYFV >NC_015672.1|WP_013886718.1|1700229_1703247_+|PD-(D/E)XK-nuclease-family-protein MKSVLKSLENICSKNITKRKILVMPSYTEGLSLLNALALNNVNIANIKVETPLSLAKDISKMSLYKSGKDFLDRSSARYVVLNLFNQLLTENKLKYFQQLSPSVGVISELENVLYELRITDYTHINFPVNSFIDPEKEHDIKTLLQKYENYLENNNRIDEPGLYKHSIQMLQKDSFHKDKLFLIPANLELPLLSKSFISMLTKNNHEIIKFAQLKSLNVPENYYSNNPYSDTIDNCFSWLYELNNSENLDKNPGFEIYRAYGESNEAKKVIRVLKRDAINLDDAVIYTTSSQLYNQILYDLSCTYNIPMTFEEGISVSNTSPGKLLLSVLEWISEKYSVPKFCTMSTGGFFKFSNNEISPLKISKILKESKIAWGKKRYKKILENELTNTTNDYKIEILNVVLSELNSIFDEIPDTENTSSISLSEFSKGLVNILNKHTRIRNETDASALTTLTENLSNLADYSTQEFQEKEIIKMLKKLVYGININASSAKPGHIHVTNFQNGIWHNRKHNFILGLDAEKFPGKGGESPFLLDMEKERIGKIQTSIQRKSRNIYKMTELLANTNGKIYAMFTNYDTEAARLQSPSSLLLQIYRLQEKLDKSTPDKEHIESYLPFKNSEKEILDETELWLHKAFYSGGIKNNEEIFPSVYPVFNKGLFALSERQSSINEYNGCELNISDEIVNKLLYEKTFSNSKLETMGSCPLRFFFQHILYLKPLEEYEYDPWRWLDPLERGTLLHRIFELFYKELINKKEMPELDKHMGLLENIAKTETEELKDLLQPPSETVYESEFNEILDSCRIFLQKESTKLSKEGHPLYLELYFGNYPESEGSSFPTAVFTLPSGRKIQLSGRIDRIDQLNNGSYKIIDYKTGSTRDYSSNEYFKKGKQLQHALYSLAFEKLMGNKYKISQSGYYFPTTKGEGSEYMYPPSDGKHKREEVLEIVDILLDNIENRFFPPVKYDNKNDSCRFCDYKEICDREKNDSLTKMLEYEENKYLQNYRRIESYE >NC_015672.1|WP_013886717.1|1698624_1700028_+|ATP-binding-protein MNTPDFLNREKELNFLHSQFARKEASFIVIYGRRRVGKTSLIKEFIKDKSSLFFMADKQSEKGILDRFAKTASTFLEDEFLEKLTFNSWEDFFGYITQKLDESKKYVLVIDEFQYLPDINHAFPSILQRIWDEKLKDKNIMLILCGSLINMMYSTTLSYQSPLYGRRTGQIKLDPISFDYCHNFFPNIDERKLIEYYSVTGGIPKYMEMFDATNDILYDIKTNVLSKNSYLYNEPRFILNEEVTETATYFSILKAIAAGEHKIGKIASIVGVKTNVLAKYFNVLADLQIIERQVPVTEENPEKSKKGLYFIKDNFFRFWFRYIFPYQSFLEIERDDVVLKEIQKSFNIFVSFVYENLCLQKIPDLTQNGVINFKIEKWGRWWSKDEEIDIVATSKKDKNILFGECKWSDTPIGVSVYADLKAKAKNVKWHTDERNEYYILFSKSGFTEDLMDINEKTSSLILIDSIV >NC_015672.1|WP_013886715.1|1697555_1698053_-|hypothetical-protein MSKQKRVKDQFNWTPPHEQKGRFVFPLSDKVEERKPLLWLVRTNSEKNMVDDVFLVNLTGEVLDMVAAGNTGFQSIDDEEQVNLISGSRFVYENVETNEAVKVEEYDGILDYDSMLGITLYIKSKKLGNIQIGTDVKKGGVENMVLLWDTGETGKKAGVSEWDDD >NC_015672.1|WP_013886714.1|1697020_1697518_-|hypothetical-protein MKKSVEIVKFKQMYDFIIFLLSKTCNEISQEKLNNELRNSFITGICECISDKNDEFYGKCCGTFYLNTMSEKEGIFSADDYFLFFSNIGIFIFHTDNKGHLKECEFFYESEYFPEFYLEILKEFKTDSGFKNYMKYLKVNDVKLRTLAELKEVFSIEKTNVIEVE >NC_015672.1|WP_013886713.1|1696327_1696960_+|hypothetical-protein MKSVSYAINNILDACNKEDGLWIGNTRKGIEVSEKKEIENLFDLIISGNTILDNILILEIEEPCFSRKFIANYWSDLNLKKFFQKRNSQKTLLLCNGQSLQDIYIGLKGSYDKQELYFNVISSSSQNSKTTNKFKFLPYPYIEKTGVWIKAKDLINSEVNPDKIIKKIGNKIPENVISKKYDLIKANIQSFINEFSIKKNAHIKIINVNN >NC_015672.1|WP_013886724.1|1712960_1713365_-|hypothetical-protein MNYYKTNKNLLLIFSHSLTNVQIEDAHSMNITSFVYLPDDLQNIWSNIRPEGDLPVSDLDRIVDWIDANSSKGDFALVQGDFGATYYIVNRCFDMGLIPVYSTTKRIASEESISASEVGKQSVFEHVNFRRYVK >NC_015672.1|WP_013886725.1|1713351_1714668_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr6 MIPVHKEIKDLVTKDKFNQGNFGLWFYKFVFLDGNTLKSGVNDVNDYKDQYENLREYNRFLKELIETKHLNQYAFCKSKEKTHKILTFRATLSSPMVTGIGNAHPCEVGMTFDHSLGIPYIPASSIKGIVRFAHTLSLVDEAYGKNIVDEEGWFDDEADWTKIPTIFGTSQDNGRRGKVIFLDAYPEKTPYLHVDIMSPHYGPYYSEFKPPADYYDPTPIKFLTVAKGTTFIFRVLIDKETKDIEQIMHDVSSAVKNSLEKDGVGAKTAVGYGRFTIESNEEPQDLIDAYEEKFLTEEEKLKREIKSFIDKIQVTNDNSSIDSLFQQWENNDKINDNKEIAETFKKKVKKTKANGEFTAHYKKVAEILDINLEESFGKDISEETERQTDNDIENDLKKALRKIKKANGDKKKIKRILKDHKKIKDKILEECPDLNELL >NC_015672.1|WP_013886726.1|1714651_1715074_-|type-III-B-CRISPR-module-associated-protein-Cmr5 MRTLGQKRAEYALEKVLTISCDKKDFKSLSSGVPSMILQNGFGQTMAFLVAKGTDKDMKIKENDKHIVMFRIIKEWLIKELSTVGFNKNNNEKEFIKEISQLSQMDYLTAQKETLALLEWVKRYANAWFSGEESKNDTGS >NC_015672.1|WP_013886727.1|1715070_1716024_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr4 MNKEICSILSFYAVSPIHAGSGASVATVDLPIQRERHTGYPIIQASGVKGAMRDHFRNNVKNKSDREYLTNWIFGIDKDNDGEVVFKDGNYVSEKLEENKNYKKLEDKENKITSFPGSISVSDAKLLAFPMRSNLAPFVWVTSPTILKKLTKDLEYLNISETFGDLNIEEDNAKIIKGNFNDNSRIILEDVTVNVNANEKLESEFLNDKFPQVERLLLISDEMFDYCVTSCTEVQTNIKINSEKGTAAEGGLRYQEFLPSDSVLYSVVYFSGKSNELQADAIKKYLQESIDSFFQIGGDITLGKGICNVSWIDGGTK >NC_015672.1|WP_013886728.1|1716039_1716948_-|CRISPR-associated-protein,-Cmr3 MYNWYSFEPNDTVFFRGAEPMEKGEDHNANFNFPPPVHTMAGAIRTYFYNIDKKNNEDKFSDIVRIGEEYGGFKLVGPFFKIDEKIYLPAPYSWFVEKSCATSENGKYNIIKGFSIQSDLIKTSSDDLYWAKGESELESIGGKWINYNDLINGSDKAEVKDVKDFYVSELRTGIALNKDHTARESHIYSFNHCRLKKGVSFIFGIDIDDLGNGGILTLGAEQRFGKFKKEDLEINLNTNGELFMSLSLMPASAKVNDSVISTGKIQYLGGWDLHKRFHKPMKGYFPAGTVFNSNFDNCISIN >NC_015672.1|WP_013886729.1|1716940_1719643_-|type-III-B-CRISPR-associated-protein-Cas10/Cmr2 MAINLPANYWDNKFWAYMHDPFDKCFDIKGHVERAKEIVSIFGIDSPNQDFWKKADGIASGFERGQIVGYSSDEEKSGAVDFLKNPVITHPTGEKSHLKFDLSDASAKQIWEKLKNYLEKEIGKEAGTGGYSDQFEGKPNDFKKARFLYTHLVLRFRLAQDNVGDIGALWHRLPADTRFPDHSIWQHNALVSAIQSCFELGGKDDLGMMVFNISPVQAFISKARKLRDYWTGSVFLSYLAFEGIRWVVENLGPDHILYPSLIDQFLVNEYLRKEWKVKYGVNFLNKESDIASFPNKFLFLLPFSKSEEIAEEVEKSIKQAWKEIYSSVKEGIFQELHMNSDERSYIDSIFNRQNDNFWEFKWASVKMLKEENKDEIKSLLPSKVYNANFDVLKCFNDMIKDKKYYEKSGIGTLYSVSHSLCQSALAAEKNRKTIEREPEPGEKCHICGEFEVVHSNPYEKGMSANEYKTNIDNFWKNLKESWEGEDGSDLKDNEKLCSICLTKRLSYYYIKKYKEHLLFKTFKDSSNFPSTTYMALHDYYIREGIEDENEKIEKAQGIHDSHVSDKEMRYSDKYYALLLMDGDRMGKLVNGETIASTWESIMHPEIFDKLQNGKIESPYSENWQKIFQESPKRNLTPAIHSAISESLGDFAIYGVANIVNNYDGKLIYAGGDDVCAVLPVSNVLKAAEEINDYYKSTFKLIESNQNKINISNISENFKPNPGKLSLSLGKGEEISISAGALICHHKADLTHMIKEAHNLLDKKAKDEGGRNAIAIQLKKRSGGDRFFICKWDDKERLKAFLSIQNKMGEEMSRSLAYRLAELKDGIDAIKNLKGHQESEQNDLLEKFILKQLDRSGKKSEEKEEIAANISKIIFDHQDNFSNEGLIIAGFLHRDEEVANV >NC_015672.1|WP_013886730.1|1719633_1720527_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr1 MGFNIARYRDIEEKIYEMEIVTPMFLGGADQNDAELRIPSIKGMLRFWWRALYGTDDLEQTIKNESEIFGNTDYKSPTTISFKNQNISISNEKLDNNNFSIYEYLAYGYRVKNNIKNYIEPKSSFSLKLSTLKMQEIENSINALCSFGGLGSKSRNGFGSLKIIDSKKFNTLDFLNQFRKRDMTTYTTISKQSKILFGKQHKTWKEALAEIGELYKQSKYFLKYQGDKRQLIAKSQGSRYAKPYFLHISKLDNDQYQGQILFMPYEYKDSSKTDEYLDTCEQMNEKIEELAGGNKWQ >NC_015672.1|WP_013886731.1|1720527_1721787_-|TIGR02221-family-CRISPR-associated-protein MGRKVFLSFLGTGDYKNCNYYFDNQKIDNIIYIQEAVLRIFCKDWYKSDAGFVLTSSDAKNKHWQNLKNGLQDLPFSVEHVDIPTGSCENEIWDIFQTIIDIIKEDDEILIDITHGFRLMPVILSSAISYLESIKKVKIIGIYYGAFETLGTQSEVEKMPVEERNAPIFDLTPTFTIQKWAKAAEIFEETGSVKQIRNLSLIEVSSILKETKGKNQEAQKIKKVVSELYKFVNEIEACRSKETVTKNFQQLKTEINDLKELGVVKPLEGILEKIHKNVSNFQNDIFENSFAIIKWCISYGLVQQAYTFLSETVITFFTKLDYGFDKIWDRDIREKVSYSINSYFKDGANEENISNIKNSINWLSGTDKDEFYNKMDLLKKYRNDMNHCGYREDSLDYKKLTEKIKELNQYFYKILCKGE >NC_015672.1|WP_013886732.1|1721779_1722691_-|CRISPR-system-precrRNA-processing-endoribonuclease-RAMP-protein-Cas6 MFIKYQKYDFTIQFSETTYSDVFPAFLLRSVLGKELKSFACVLRRRKCEECPLKFQCAYSYIFESPISKDNEFLKGRDKVSHPFTISCSEDADKKLDSLHFRLTLFGRGIDYFPYIFYAFKKGGESGLFRRKTKYDIVSIFADGKMVNDGESEELGIPEPKDWELSTGTSEIYKKISINMDSPLRLKINGKYTDKITYRDFLYAAVRRAEILSSKYGINNVDTHLTKKLSEKSENICIYWKDYDRYSARQKQKMKLGGCVGHMDLEGYFTSYELSLLNFSEIFGLGKNTGFGFGKISVEDLDG >NC_015672.1|WP_013886733.1|1722808_1724224_+|cold-shock-protein MADDVVKTGFFAQNSTLNKCNAAILSGISIYNVMIYIGEDMEQLQELRKKANNLKDNRKYEQATEIYKQIIDNHESHCNDWDYWNYAFCLKKQRMYNAASEICKSLLRINKDFVPAKNLLCWCLFYSKIKNKKSEDEFLEASRKVLKLCSQKDKYSPYTITVFKVLEHFKHKNDYPAEKILKCTNMLDPELLNFEPYRIKENDKEIELASQLELYFMHRTKALLNCGKYDQCINECDHALKSLNKFHYNNDIWFKWRMALSYKALAKYKESIEGLYEIATRKKDWFILKEISENLYHQNKVEEAFMYAVKACLRKGDIDKKLNLFLLIADILISLNDKVNAQKHVDFVYHFKIKEERETGTYLNNLISANNFEISEDLDLDMQYKQLVEFWTQIKASRQKRNTGFIKKLLPNGKSGFIEASDGKTYYFQIRNIKNNPANLHESQKVTFCIEDGFDAKKNKPSKIAVEIKTE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_015672_4 | 1709819-1710226 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NC_015672_4
|
5 spacers
spacers of NC_015672_4
>4.1|1709855|39|NC_015672|CRISPRCasFinder GGTATAGATAATAAAAAAATTGTCCATGTATTTGATATA >4.2|1709930|37|NC_015672|CRISPRCasFinder AATAAACTATCCAAGAACTTTTGGAATTGAGATAGAA >4.3|1710003|39|NC_015672|CRISPRCasFinder TGGTTCAGTACAAAAATAGCCATAAAAAAGCCATTAAAA >4.4|1710078|39|NC_015672|CRISPRCasFinder ATCCGACCAAATTCCATGGTCGGAGCTCTCTTCAGCTAT >4.5|1710153|37|NC_015672|CRISPRCasFinder AAATTTCCGGACTGAGGCAATTAGGATGGCAAAAAAA >4.6|1709859|49|NC_015672|PILER-CR GGATTCCAATGGTATAGATAATAAAAAAATTGTCCATGTATTTGATATA >4.7|1709934|47|NC_015672|PILER-CR TAATTCCAATAATAAACTATCCAAGAACTTTTGGAATTGAGATAGAA >4.8|1710007|49|NC_015672|PILER-CR GAATTCCAATTGGTTCAGTACAAAAATAGCCATAAAAAAGCCATTAAAA >4.9|1710082|49|NC_015672|PILER-CR GAATTCCAATATCCGACCAAATTCCATGGTCGGAGCTCTCTTCAGCTAT >4.10|1709931|34|NC_015672|CRT ATAAACTATCCAAGAACTTTTGGAATTGAGATAG >4.11|1710004|36|NC_015672|CRT GGTTCAGTACAAAAATAGCCATAAAAAAGCCATTAA >4.12|1710079|36|NC_015672|CRT TCCGACCAAATTCCATGGTCGGAGCTCTCTTCAGCT >4.13|1710154|34|NC_015672|CRT AATTTCCGGACTGAGGCAATTAGGATGGCAAAAA |
csx20,cmr6gr7,cmr5gr11,cmr4gr7,cmr3gr5,cas10,cmr1gr7,csx1,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_015672_4
The CRISPR arrays of NC_015672_4 >merge|NC_015672|4|1709819-1710226|CRISPRCasFinder,PILER-CR,CRT TCCGAGCTTGCTGGAAATCAGGTCATGGATTCCAATGGTATAGATAATAAAAAAATTGTCCATGTATTTGATATAGTCGTAATCCCTTCTAATCAGGTCATTAATTCCAATAATAAACTATCCAAGAACTTTTGGAATTGAGATAGAAGTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAATTGGTTCAGTACAAAAATAGCCATAAAAAAGCCATTAAAAGTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAATATCCGACCAAATTCCATGGTCGGAGCTCTCTTCAGCTATGTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAATAAATTTCCGGACTGAGGCAATTAGGATGGCAAAAAAAGTCGTAATCCCTTCTAATCAGGTCAATTCCGAAAATA >NC_015672|4|4|1709819-1710226|CRISPRCasFinder TCCGAGCTTGCTGGAAATCAGGTCATGGATTCCAAT GGTATAGATAATAAAAAAATTGTCCATGTATTTGATATA GTCGTAATCCCTTCTAATCAGGTCATTAATTCCAAT AATAAACTATCCAAGAACTTTTGGAATTGAGATAGAA GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT TGGTTCAGTACAAAAATAGCCATAAAAAAGCCATTAAAA GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT ATCCGACCAAATTCCATGGTCGGAGCTCTCTTCAGCTAT GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT AAATTTCCGGACTGAGGCAATTAGGATGGCAAAAAAA GTCGTAATCCCTTCTAATCAGGTCAATTCCGAAAATA >NC_015672|4|6|1709833-1710142|PILER-CR AAATCAGGTCATGGATTCCAATGGTA TAGATAATAAAAAAATTGTCCATGTATTTGATATAGTCGTAATCCCTTC TAATCAGGTCATTAATTCCAATAATA AACTATCCAAGAACTTTTGGAATTGAGATAGAAGTCGTAATCCCTTC AAGTCAGGTCATGAATTCCAATTGGT TCAGTACAAAAATAGCCATAAAAAAGCCATTAAAAGTCGTAATCCCTTC AAGTCAGGTCATGAATTCCAATATCC GACCAAATTCCATGGTCGGAGCTCTCTTCAGCTATGTCGTAATCCCTTC AAGTCAGGTCAT >NC_015672|4|3|1709892-1710226|CRT TAGTCGTAATCCCTTCTAATCAGGTCATTAATTCCAATA ATAAACTATCCAAGAACTTTTGGAATTGAGATAG AAGTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAATT GGTTCAGTACAAAAATAGCCATAAAAAAGCCATTAA AAGTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAATA TCCGACCAAATTCCATGGTCGGAGCTCTCTTCAGCT ATGTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAATA AATTTCCGGACTGAGGCAATTAGGATGGCAAAAA AAGTCGTAATCCCTTCTAATCAGGTCAATTCCGAAAATA
>NC_015672.1|WP_013885895.1|1707786_1709154_-|IS5-family-transposase MRPKKQDSTTQELLEPLLVNIIDMKHPLIQLADKIDWEYFEKEFGSLYHRNDGRPGIPMRMMVGFHYLKYTYNLSDEDVVHGWKENPYWQYFTGEKVFQTKVPINPTSMTRFRNRLKEEDLLKFLEETINTAFRSGYLNKNDVKKVAADTTVQEKNITFPTDIKLFYTMIKYLVKFSKKHEIRLKETHEYSGKKLLMKYSGYVHAKQYKRAGKAVKKMKTKMGKLYRSIERVLPEELRNSDEFQQLKLFYESLWNRSKKSKNKLYSLHSPEVECISKGKSHKRYEFGNKVGFVGTLKKNFILSCKSFHGNPYDGHTLEENLCEAKTLLGSNGTIDTILVDLGYRKHNYRGDAKVHVVPRSMKKFKVNFKRLLKRRSCVEATIGHTKRDNRMDRNYLKGKEGDKANAILAASGHNLRLILAFLLFFLKKFMDNIAKKLANFANEVFLDKKYAKIYV >NC_015672.1|WP_013886722.1|1707264_1707711_+|hypothetical-protein MSDICFLRPTAAKRIENWLNSNNYSLHNGYFTLEYNFSPIVDDGIILSFIDNKTGDIHKLVVQDDIEGIIEPDEECSVSQISIDYIPLSLELTPETLEKFSEIESRKFEAEVEELVEPVGCGIKFEIYSDSYAIFACKKELQRTQIGE >NC_015672.1|WP_013886721.1|1706841_1707243_+|type-II-toxin-antitoxin-system-VapC-family-toxin MSYLFDTNICIYIIKNKYKQIAKKMQEAGLEKICISAITVAELEYGISKSSKKDENRIALLEFLIPFTVLNFDQNDARKYGQIRYNLQKAGTPIGNMDLLIGSQALARDMTLITNNEKEFSRIQGLKIENWIK >NC_015672.1|WP_013886720.1|1706613_1706841_+|AbrB/MazE/SpoVT-family-DNA-binding-domain-containing-protein MDTAKIFENGKSQAVRLPKKYRFDSDDVFIKKIDDIVVLIPKDKVWQIFSSSLDKFSEDVDFQKDNSIPQEREEI >NC_015672.1|WP_013886719.1|1703239_1706488_+|UvrD-helicase-domain-containing-protein MSDQALKDSHARKKIINDLDTNFLVEAGAGSGKTSSLVKRITSLITNGKNKISEIAAITFTKKAASELMERLLNELEDRHNSETDPTIKENLYDAINNFDQCFTGTIHSFCSGILRERPVEAGVDPDFDEIDDSDEFGLITEVWNEFIKSTRAENPDMLKLTEKIGVSPEELQDSFVMLNKYPEIKIHAEKSEKPDLKPAVKKVLEICKEASKYIPDEEPDKGYDAFQKNVQSTLRLLEYRNLYEDKYAIEILTKFEKTPKITQNRWLDKKTAKNFQDVILPDLVENTVYPVLRKHREHIYTYFIDFFQDALTYYENKRNQESILNYNDLLTLTSKMLRNNSKVREYFQNKYKTTLVDEFQDTDPIQAEIIMYLTGEDLKETDWSKLRPKKGSLFVVGDPKQSIYRFRRADIDIYNFVKEIISQTGGEILELTSNFRSLNSIADYLNPVFEERFPESGDRYQAPMAKIRAIRENNYEHGVKKILVQCDSRKKEDVVEIDAENIARYIKYAVDGGIKLARNEEEKSKGLNEKPVYSDFLIITKHKDLLEQYANTLEKYGIPSTVTGDDFFSQSEEINHIYKLLKFLSKPDDEILLVSVLRGMFFGLSDNDLYQFKASNGYLNIFSSIPESLDENIKNLFNNCFSTLRKYKKIINELPPSSALETIFQDLGILPYTSLKNLSKSRAANIYFLIEQVKQKETTEFYSFGNVVNHIGRLLESKFEQRNSLEVESNCVRIMNLHKAKGLEAPVVFLAHPHKNTKHDPTQHINRREGEPIGYFALTKKKGIHHKKIFAQPKNWEEFQEEEQKFLDAEFERLVYVAATRAKNLLIISCKEKGNGSQNPWLSLLGNLKDDDVIDVPDVSIEHDSGVNELSVKDINDKKAEISHWRHSVSEENYSNMTPTEVKDLEKIFAGERLEGGGQDWGTAVHNFLEFAVMTKDTGYEDLDTYIKFTFEELDISSDRTEEAKKIIEDFKQTDLFNRIKNAEQVETEAPISMKINPESEIMNLFNTKTSNKPIILAGVIDLVFKEKDGWVIIDYKTDRVNSEEEYEKLRQAYLNQVEIYAKAWEEITGEKVKEKNIYFV >NC_015672.1|WP_013886718.1|1700229_1703247_+|PD-(D/E)XK-nuclease-family-protein MKSVLKSLENICSKNITKRKILVMPSYTEGLSLLNALALNNVNIANIKVETPLSLAKDISKMSLYKSGKDFLDRSSARYVVLNLFNQLLTENKLKYFQQLSPSVGVISELENVLYELRITDYTHINFPVNSFIDPEKEHDIKTLLQKYENYLENNNRIDEPGLYKHSIQMLQKDSFHKDKLFLIPANLELPLLSKSFISMLTKNNHEIIKFAQLKSLNVPENYYSNNPYSDTIDNCFSWLYELNNSENLDKNPGFEIYRAYGESNEAKKVIRVLKRDAINLDDAVIYTTSSQLYNQILYDLSCTYNIPMTFEEGISVSNTSPGKLLLSVLEWISEKYSVPKFCTMSTGGFFKFSNNEISPLKISKILKESKIAWGKKRYKKILENELTNTTNDYKIEILNVVLSELNSIFDEIPDTENTSSISLSEFSKGLVNILNKHTRIRNETDASALTTLTENLSNLADYSTQEFQEKEIIKMLKKLVYGININASSAKPGHIHVTNFQNGIWHNRKHNFILGLDAEKFPGKGGESPFLLDMEKERIGKIQTSIQRKSRNIYKMTELLANTNGKIYAMFTNYDTEAARLQSPSSLLLQIYRLQEKLDKSTPDKEHIESYLPFKNSEKEILDETELWLHKAFYSGGIKNNEEIFPSVYPVFNKGLFALSERQSSINEYNGCELNISDEIVNKLLYEKTFSNSKLETMGSCPLRFFFQHILYLKPLEEYEYDPWRWLDPLERGTLLHRIFELFYKELINKKEMPELDKHMGLLENIAKTETEELKDLLQPPSETVYESEFNEILDSCRIFLQKESTKLSKEGHPLYLELYFGNYPESEGSSFPTAVFTLPSGRKIQLSGRIDRIDQLNNGSYKIIDYKTGSTRDYSSNEYFKKGKQLQHALYSLAFEKLMGNKYKISQSGYYFPTTKGEGSEYMYPPSDGKHKREEVLEIVDILLDNIENRFFPPVKYDNKNDSCRFCDYKEICDREKNDSLTKMLEYEENKYLQNYRRIESYE >NC_015672.1|WP_013886717.1|1698624_1700028_+|ATP-binding-protein MNTPDFLNREKELNFLHSQFARKEASFIVIYGRRRVGKTSLIKEFIKDKSSLFFMADKQSEKGILDRFAKTASTFLEDEFLEKLTFNSWEDFFGYITQKLDESKKYVLVIDEFQYLPDINHAFPSILQRIWDEKLKDKNIMLILCGSLINMMYSTTLSYQSPLYGRRTGQIKLDPISFDYCHNFFPNIDERKLIEYYSVTGGIPKYMEMFDATNDILYDIKTNVLSKNSYLYNEPRFILNEEVTETATYFSILKAIAAGEHKIGKIASIVGVKTNVLAKYFNVLADLQIIERQVPVTEENPEKSKKGLYFIKDNFFRFWFRYIFPYQSFLEIERDDVVLKEIQKSFNIFVSFVYENLCLQKIPDLTQNGVINFKIEKWGRWWSKDEEIDIVATSKKDKNILFGECKWSDTPIGVSVYADLKAKAKNVKWHTDERNEYYILFSKSGFTEDLMDINEKTSSLILIDSIV >NC_015672.1|WP_013886715.1|1697555_1698053_-|hypothetical-protein MSKQKRVKDQFNWTPPHEQKGRFVFPLSDKVEERKPLLWLVRTNSEKNMVDDVFLVNLTGEVLDMVAAGNTGFQSIDDEEQVNLISGSRFVYENVETNEAVKVEEYDGILDYDSMLGITLYIKSKKLGNIQIGTDVKKGGVENMVLLWDTGETGKKAGVSEWDDD >NC_015672.1|WP_013886714.1|1697020_1697518_-|hypothetical-protein MKKSVEIVKFKQMYDFIIFLLSKTCNEISQEKLNNELRNSFITGICECISDKNDEFYGKCCGTFYLNTMSEKEGIFSADDYFLFFSNIGIFIFHTDNKGHLKECEFFYESEYFPEFYLEILKEFKTDSGFKNYMKYLKVNDVKLRTLAELKEVFSIEKTNVIEVE >NC_015672.1|WP_013886713.1|1696327_1696960_+|hypothetical-protein MKSVSYAINNILDACNKEDGLWIGNTRKGIEVSEKKEIENLFDLIISGNTILDNILILEIEEPCFSRKFIANYWSDLNLKKFFQKRNSQKTLLLCNGQSLQDIYIGLKGSYDKQELYFNVISSSSQNSKTTNKFKFLPYPYIEKTGVWIKAKDLINSEVNPDKIIKKIGNKIPENVISKKYDLIKANIQSFINEFSIKKNAHIKIINVNN >NC_015672.1|WP_013886724.1|1712960_1713365_-|hypothetical-protein MNYYKTNKNLLLIFSHSLTNVQIEDAHSMNITSFVYLPDDLQNIWSNIRPEGDLPVSDLDRIVDWIDANSSKGDFALVQGDFGATYYIVNRCFDMGLIPVYSTTKRIASEESISASEVGKQSVFEHVNFRRYVK >NC_015672.1|WP_013886725.1|1713351_1714668_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr6 MIPVHKEIKDLVTKDKFNQGNFGLWFYKFVFLDGNTLKSGVNDVNDYKDQYENLREYNRFLKELIETKHLNQYAFCKSKEKTHKILTFRATLSSPMVTGIGNAHPCEVGMTFDHSLGIPYIPASSIKGIVRFAHTLSLVDEAYGKNIVDEEGWFDDEADWTKIPTIFGTSQDNGRRGKVIFLDAYPEKTPYLHVDIMSPHYGPYYSEFKPPADYYDPTPIKFLTVAKGTTFIFRVLIDKETKDIEQIMHDVSSAVKNSLEKDGVGAKTAVGYGRFTIESNEEPQDLIDAYEEKFLTEEEKLKREIKSFIDKIQVTNDNSSIDSLFQQWENNDKINDNKEIAETFKKKVKKTKANGEFTAHYKKVAEILDINLEESFGKDISEETERQTDNDIENDLKKALRKIKKANGDKKKIKRILKDHKKIKDKILEECPDLNELL >NC_015672.1|WP_013886726.1|1714651_1715074_-|type-III-B-CRISPR-module-associated-protein-Cmr5 MRTLGQKRAEYALEKVLTISCDKKDFKSLSSGVPSMILQNGFGQTMAFLVAKGTDKDMKIKENDKHIVMFRIIKEWLIKELSTVGFNKNNNEKEFIKEISQLSQMDYLTAQKETLALLEWVKRYANAWFSGEESKNDTGS >NC_015672.1|WP_013886727.1|1715070_1716024_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr4 MNKEICSILSFYAVSPIHAGSGASVATVDLPIQRERHTGYPIIQASGVKGAMRDHFRNNVKNKSDREYLTNWIFGIDKDNDGEVVFKDGNYVSEKLEENKNYKKLEDKENKITSFPGSISVSDAKLLAFPMRSNLAPFVWVTSPTILKKLTKDLEYLNISETFGDLNIEEDNAKIIKGNFNDNSRIILEDVTVNVNANEKLESEFLNDKFPQVERLLLISDEMFDYCVTSCTEVQTNIKINSEKGTAAEGGLRYQEFLPSDSVLYSVVYFSGKSNELQADAIKKYLQESIDSFFQIGGDITLGKGICNVSWIDGGTK >NC_015672.1|WP_013886728.1|1716039_1716948_-|CRISPR-associated-protein,-Cmr3 MYNWYSFEPNDTVFFRGAEPMEKGEDHNANFNFPPPVHTMAGAIRTYFYNIDKKNNEDKFSDIVRIGEEYGGFKLVGPFFKIDEKIYLPAPYSWFVEKSCATSENGKYNIIKGFSIQSDLIKTSSDDLYWAKGESELESIGGKWINYNDLINGSDKAEVKDVKDFYVSELRTGIALNKDHTARESHIYSFNHCRLKKGVSFIFGIDIDDLGNGGILTLGAEQRFGKFKKEDLEINLNTNGELFMSLSLMPASAKVNDSVISTGKIQYLGGWDLHKRFHKPMKGYFPAGTVFNSNFDNCISIN >NC_015672.1|WP_013886729.1|1716940_1719643_-|type-III-B-CRISPR-associated-protein-Cas10/Cmr2 MAINLPANYWDNKFWAYMHDPFDKCFDIKGHVERAKEIVSIFGIDSPNQDFWKKADGIASGFERGQIVGYSSDEEKSGAVDFLKNPVITHPTGEKSHLKFDLSDASAKQIWEKLKNYLEKEIGKEAGTGGYSDQFEGKPNDFKKARFLYTHLVLRFRLAQDNVGDIGALWHRLPADTRFPDHSIWQHNALVSAIQSCFELGGKDDLGMMVFNISPVQAFISKARKLRDYWTGSVFLSYLAFEGIRWVVENLGPDHILYPSLIDQFLVNEYLRKEWKVKYGVNFLNKESDIASFPNKFLFLLPFSKSEEIAEEVEKSIKQAWKEIYSSVKEGIFQELHMNSDERSYIDSIFNRQNDNFWEFKWASVKMLKEENKDEIKSLLPSKVYNANFDVLKCFNDMIKDKKYYEKSGIGTLYSVSHSLCQSALAAEKNRKTIEREPEPGEKCHICGEFEVVHSNPYEKGMSANEYKTNIDNFWKNLKESWEGEDGSDLKDNEKLCSICLTKRLSYYYIKKYKEHLLFKTFKDSSNFPSTTYMALHDYYIREGIEDENEKIEKAQGIHDSHVSDKEMRYSDKYYALLLMDGDRMGKLVNGETIASTWESIMHPEIFDKLQNGKIESPYSENWQKIFQESPKRNLTPAIHSAISESLGDFAIYGVANIVNNYDGKLIYAGGDDVCAVLPVSNVLKAAEEINDYYKSTFKLIESNQNKINISNISENFKPNPGKLSLSLGKGEEISISAGALICHHKADLTHMIKEAHNLLDKKAKDEGGRNAIAIQLKKRSGGDRFFICKWDDKERLKAFLSIQNKMGEEMSRSLAYRLAELKDGIDAIKNLKGHQESEQNDLLEKFILKQLDRSGKKSEEKEEIAANISKIIFDHQDNFSNEGLIIAGFLHRDEEVANV >NC_015672.1|WP_013886730.1|1719633_1720527_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr1 MGFNIARYRDIEEKIYEMEIVTPMFLGGADQNDAELRIPSIKGMLRFWWRALYGTDDLEQTIKNESEIFGNTDYKSPTTISFKNQNISISNEKLDNNNFSIYEYLAYGYRVKNNIKNYIEPKSSFSLKLSTLKMQEIENSINALCSFGGLGSKSRNGFGSLKIIDSKKFNTLDFLNQFRKRDMTTYTTISKQSKILFGKQHKTWKEALAEIGELYKQSKYFLKYQGDKRQLIAKSQGSRYAKPYFLHISKLDNDQYQGQILFMPYEYKDSSKTDEYLDTCEQMNEKIEELAGGNKWQ >NC_015672.1|WP_013886731.1|1720527_1721787_-|TIGR02221-family-CRISPR-associated-protein MGRKVFLSFLGTGDYKNCNYYFDNQKIDNIIYIQEAVLRIFCKDWYKSDAGFVLTSSDAKNKHWQNLKNGLQDLPFSVEHVDIPTGSCENEIWDIFQTIIDIIKEDDEILIDITHGFRLMPVILSSAISYLESIKKVKIIGIYYGAFETLGTQSEVEKMPVEERNAPIFDLTPTFTIQKWAKAAEIFEETGSVKQIRNLSLIEVSSILKETKGKNQEAQKIKKVVSELYKFVNEIEACRSKETVTKNFQQLKTEINDLKELGVVKPLEGILEKIHKNVSNFQNDIFENSFAIIKWCISYGLVQQAYTFLSETVITFFTKLDYGFDKIWDRDIREKVSYSINSYFKDGANEENISNIKNSINWLSGTDKDEFYNKMDLLKKYRNDMNHCGYREDSLDYKKLTEKIKELNQYFYKILCKGE >NC_015672.1|WP_013886732.1|1721779_1722691_-|CRISPR-system-precrRNA-processing-endoribonuclease-RAMP-protein-Cas6 MFIKYQKYDFTIQFSETTYSDVFPAFLLRSVLGKELKSFACVLRRRKCEECPLKFQCAYSYIFESPISKDNEFLKGRDKVSHPFTISCSEDADKKLDSLHFRLTLFGRGIDYFPYIFYAFKKGGESGLFRRKTKYDIVSIFADGKMVNDGESEELGIPEPKDWELSTGTSEIYKKISINMDSPLRLKINGKYTDKITYRDFLYAAVRRAEILSSKYGINNVDTHLTKKLSEKSENICIYWKDYDRYSARQKQKMKLGGCVGHMDLEGYFTSYELSLLNFSEIFGLGKNTGFGFGKISVEDLDG >NC_015672.1|WP_013886733.1|1722808_1724224_+|cold-shock-protein MADDVVKTGFFAQNSTLNKCNAAILSGISIYNVMIYIGEDMEQLQELRKKANNLKDNRKYEQATEIYKQIIDNHESHCNDWDYWNYAFCLKKQRMYNAASEICKSLLRINKDFVPAKNLLCWCLFYSKIKNKKSEDEFLEASRKVLKLCSQKDKYSPYTITVFKVLEHFKHKNDYPAEKILKCTNMLDPELLNFEPYRIKENDKEIELASQLELYFMHRTKALLNCGKYDQCINECDHALKSLNKFHYNNDIWFKWRMALSYKALAKYKESIEGLYEIATRKKDWFILKEISENLYHQNKVEEAFMYAVKACLRKGDIDKKLNLFLLIADILISLNDKVNAQKHVDFVYHFKIKEERETGTYLNNLISANNFEISEDLDLDMQYKQLVEFWTQIKASRQKRNTGFIKKLLPNGKSGFIEASDGKTYYFQIRNIKNNPANLHESQKVTFCIEDGFDAKKNKPSKIAVEIKTE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_015672_5 | 1710472-1710885 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NC_015672_5
|
5 spacers
spacers of NC_015672_5
>5.1|1710508|37|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT GTTGAAGCACTCGGCGCAGTTCTATCTTTTGAGCAGA >5.2|1710581|39|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT AGAGAGATTTCTCCATTTCCTAAATTTAATACAGTTGAT >5.3|1710656|41|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT CTTCCGGAGGGTTTTAGATTTAAGTACCTCAAAGTCGAGGT >5.4|1710733|39|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT ATATGTCGCCCAGCTCATGGGCGGCAGGTTGCCGGAAGG >5.5|1710808|41|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT TACACAACTAAAACAGATACTTTGATTATTGTCTTTTCCTA >5.6|1710523|37|NC_015672|PILER-CR GTTGAAGCACTCGGCGCAGTTCTATCTTTTGAGCAGA >5.7|1710596|39|NC_015672|PILER-CR AGAGAGATTTCTCCATTTCCTAAATTTAATACAGTTGAT >5.8|1710671|41|NC_015672|PILER-CR CTTCCGGAGGGTTTTAGATTTAAGTACCTCAAAGTCGAGGT >5.9|1710748|39|NC_015672|PILER-CR ATATGTCGCCCAGCTCATGGGCGGCAGGTTGCCGGAAGG |
csx20,cmr6gr7,cmr5gr11,cmr4gr7,cmr3gr5,cas10,cmr1gr7,csx1,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_015672_5
The CRISPR arrays of NC_015672_5 >merge|NC_015672|5|1710472-1710885|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCCGAGCTTGCTGGAAATCAGGTCATGGATTCCAATGTTGAAGCACTCGGCGCAGTTCTATCTTTTGAGCAGAGTCGTAATCCCTTCTAATCAGGTCATGGATTCCAATAGAGAGATTTCTCCATTTCCTAAATTTAATACAGTTGATGTCGTAATCCCTTCTAATCAGGTCATGGATTCCAATCTTCCGGAGGGTTTTAGATTTAAGTACCTCAAAGTCGAGGTGTCGTAATCCCTTCTAATCAGGTCATGGATTCCAATATATGTCGCCCAGCTCATGGGCGGCAGGTTGCCGGAAGGGTCGTAATCCCTTCTAATCAGGTCATGGATTCCAATTACACAACTAAAACAGATACTTTGATTATTGTCTTTTCCTAGTCGTAATCCCTTCTAATCAGGTCAATTCCGAAAATA >NC_015672|5|5|1710472-1710885|CRISPRCasFinder TCCGAGCTTGCTGGAAATCAGGTCATGGATTCCAAT GTTGAAGCACTCGGCGCAGTTCTATCTTTTGAGCAGA GTCGTAATCCCTTCTAATCAGGTCATGGATTCCAAT AGAGAGATTTCTCCATTTCCTAAATTTAATACAGTTGAT GTCGTAATCCCTTCTAATCAGGTCATGGATTCCAAT CTTCCGGAGGGTTTTAGATTTAAGTACCTCAAAGTCGAGGT GTCGTAATCCCTTCTAATCAGGTCATGGATTCCAAT ATATGTCGCCCAGCTCATGGGCGGCAGGTTGCCGGAAGG GTCGTAATCCCTTCTAATCAGGTCATGGATTCCAAT TACACAACTAAAACAGATACTTTGATTATTGTCTTTTCCTA GTCGTAATCCCTTCTAATCAGGTCAATTCCGAAAATA >NC_015672|5|4|1710472-1710884|CRT TCCGAGCTTGCTGGAAATCAGGTCATGGATTCCAAT GTTGAAGCACTCGGCGCAGTTCTATCTTTTGAGCAGA GTCGTAATCCCTTCTAATCAGGTCATGGATTCCAAT AGAGAGATTTCTCCATTTCCTAAATTTAATACAGTTGAT GTCGTAATCCCTTCTAATCAGGTCATGGATTCCAAT CTTCCGGAGGGTTTTAGATTTAAGTACCTCAAAGTCGAGGT GTCGTAATCCCTTCTAATCAGGTCATGGATTCCAAT ATATGTCGCCCAGCTCATGGGCGGCAGGTTGCCGGAAGG GTCGTAATCCCTTCTAATCAGGTCATGGATTCCAAT TACACAACTAAAACAGATACTTTGATTATTGTCTTTTCCTA GTCGTAATCCCTTCTAATCAGGTCAATTCCGAAAAT >NC_015672|5|7|1710487-1710807|PILER-CR AATCAGGTCATGGATTCCAATGTTGAAGCACTCGGC GCAGTTCTATCTTTTGAGCAGAGTCGTAATCCCTTCT AATCAGGTCATGGATTCCAATAGAGAGATTTCTCCA TTTCCTAAATTTAATACAGTTGATGTCGTAATCCCTTCT AATCAGGTCATGGATTCCAATCTTCCGGAGGGTTTT AGATTTAAGTACCTCAAAGTCGAGGTGTCGTAATCCCTTCT AATCAGGTCATGGATTCCAATATATGTCGCCCAGCT CATGGGCGGCAGGTTGCCGGAAGGGTCGTAATCCCTTCT AATCAGGTCATGGATTCCAAT
>NC_015672.1|WP_013885895.1|1707786_1709154_-|IS5-family-transposase MRPKKQDSTTQELLEPLLVNIIDMKHPLIQLADKIDWEYFEKEFGSLYHRNDGRPGIPMRMMVGFHYLKYTYNLSDEDVVHGWKENPYWQYFTGEKVFQTKVPINPTSMTRFRNRLKEEDLLKFLEETINTAFRSGYLNKNDVKKVAADTTVQEKNITFPTDIKLFYTMIKYLVKFSKKHEIRLKETHEYSGKKLLMKYSGYVHAKQYKRAGKAVKKMKTKMGKLYRSIERVLPEELRNSDEFQQLKLFYESLWNRSKKSKNKLYSLHSPEVECISKGKSHKRYEFGNKVGFVGTLKKNFILSCKSFHGNPYDGHTLEENLCEAKTLLGSNGTIDTILVDLGYRKHNYRGDAKVHVVPRSMKKFKVNFKRLLKRRSCVEATIGHTKRDNRMDRNYLKGKEGDKANAILAASGHNLRLILAFLLFFLKKFMDNIAKKLANFANEVFLDKKYAKIYV >NC_015672.1|WP_013886722.1|1707264_1707711_+|hypothetical-protein MSDICFLRPTAAKRIENWLNSNNYSLHNGYFTLEYNFSPIVDDGIILSFIDNKTGDIHKLVVQDDIEGIIEPDEECSVSQISIDYIPLSLELTPETLEKFSEIESRKFEAEVEELVEPVGCGIKFEIYSDSYAIFACKKELQRTQIGE >NC_015672.1|WP_013886721.1|1706841_1707243_+|type-II-toxin-antitoxin-system-VapC-family-toxin MSYLFDTNICIYIIKNKYKQIAKKMQEAGLEKICISAITVAELEYGISKSSKKDENRIALLEFLIPFTVLNFDQNDARKYGQIRYNLQKAGTPIGNMDLLIGSQALARDMTLITNNEKEFSRIQGLKIENWIK >NC_015672.1|WP_013886720.1|1706613_1706841_+|AbrB/MazE/SpoVT-family-DNA-binding-domain-containing-protein MDTAKIFENGKSQAVRLPKKYRFDSDDVFIKKIDDIVVLIPKDKVWQIFSSSLDKFSEDVDFQKDNSIPQEREEI >NC_015672.1|WP_013886719.1|1703239_1706488_+|UvrD-helicase-domain-containing-protein MSDQALKDSHARKKIINDLDTNFLVEAGAGSGKTSSLVKRITSLITNGKNKISEIAAITFTKKAASELMERLLNELEDRHNSETDPTIKENLYDAINNFDQCFTGTIHSFCSGILRERPVEAGVDPDFDEIDDSDEFGLITEVWNEFIKSTRAENPDMLKLTEKIGVSPEELQDSFVMLNKYPEIKIHAEKSEKPDLKPAVKKVLEICKEASKYIPDEEPDKGYDAFQKNVQSTLRLLEYRNLYEDKYAIEILTKFEKTPKITQNRWLDKKTAKNFQDVILPDLVENTVYPVLRKHREHIYTYFIDFFQDALTYYENKRNQESILNYNDLLTLTSKMLRNNSKVREYFQNKYKTTLVDEFQDTDPIQAEIIMYLTGEDLKETDWSKLRPKKGSLFVVGDPKQSIYRFRRADIDIYNFVKEIISQTGGEILELTSNFRSLNSIADYLNPVFEERFPESGDRYQAPMAKIRAIRENNYEHGVKKILVQCDSRKKEDVVEIDAENIARYIKYAVDGGIKLARNEEEKSKGLNEKPVYSDFLIITKHKDLLEQYANTLEKYGIPSTVTGDDFFSQSEEINHIYKLLKFLSKPDDEILLVSVLRGMFFGLSDNDLYQFKASNGYLNIFSSIPESLDENIKNLFNNCFSTLRKYKKIINELPPSSALETIFQDLGILPYTSLKNLSKSRAANIYFLIEQVKQKETTEFYSFGNVVNHIGRLLESKFEQRNSLEVESNCVRIMNLHKAKGLEAPVVFLAHPHKNTKHDPTQHINRREGEPIGYFALTKKKGIHHKKIFAQPKNWEEFQEEEQKFLDAEFERLVYVAATRAKNLLIISCKEKGNGSQNPWLSLLGNLKDDDVIDVPDVSIEHDSGVNELSVKDINDKKAEISHWRHSVSEENYSNMTPTEVKDLEKIFAGERLEGGGQDWGTAVHNFLEFAVMTKDTGYEDLDTYIKFTFEELDISSDRTEEAKKIIEDFKQTDLFNRIKNAEQVETEAPISMKINPESEIMNLFNTKTSNKPIILAGVIDLVFKEKDGWVIIDYKTDRVNSEEEYEKLRQAYLNQVEIYAKAWEEITGEKVKEKNIYFV >NC_015672.1|WP_013886718.1|1700229_1703247_+|PD-(D/E)XK-nuclease-family-protein MKSVLKSLENICSKNITKRKILVMPSYTEGLSLLNALALNNVNIANIKVETPLSLAKDISKMSLYKSGKDFLDRSSARYVVLNLFNQLLTENKLKYFQQLSPSVGVISELENVLYELRITDYTHINFPVNSFIDPEKEHDIKTLLQKYENYLENNNRIDEPGLYKHSIQMLQKDSFHKDKLFLIPANLELPLLSKSFISMLTKNNHEIIKFAQLKSLNVPENYYSNNPYSDTIDNCFSWLYELNNSENLDKNPGFEIYRAYGESNEAKKVIRVLKRDAINLDDAVIYTTSSQLYNQILYDLSCTYNIPMTFEEGISVSNTSPGKLLLSVLEWISEKYSVPKFCTMSTGGFFKFSNNEISPLKISKILKESKIAWGKKRYKKILENELTNTTNDYKIEILNVVLSELNSIFDEIPDTENTSSISLSEFSKGLVNILNKHTRIRNETDASALTTLTENLSNLADYSTQEFQEKEIIKMLKKLVYGININASSAKPGHIHVTNFQNGIWHNRKHNFILGLDAEKFPGKGGESPFLLDMEKERIGKIQTSIQRKSRNIYKMTELLANTNGKIYAMFTNYDTEAARLQSPSSLLLQIYRLQEKLDKSTPDKEHIESYLPFKNSEKEILDETELWLHKAFYSGGIKNNEEIFPSVYPVFNKGLFALSERQSSINEYNGCELNISDEIVNKLLYEKTFSNSKLETMGSCPLRFFFQHILYLKPLEEYEYDPWRWLDPLERGTLLHRIFELFYKELINKKEMPELDKHMGLLENIAKTETEELKDLLQPPSETVYESEFNEILDSCRIFLQKESTKLSKEGHPLYLELYFGNYPESEGSSFPTAVFTLPSGRKIQLSGRIDRIDQLNNGSYKIIDYKTGSTRDYSSNEYFKKGKQLQHALYSLAFEKLMGNKYKISQSGYYFPTTKGEGSEYMYPPSDGKHKREEVLEIVDILLDNIENRFFPPVKYDNKNDSCRFCDYKEICDREKNDSLTKMLEYEENKYLQNYRRIESYE >NC_015672.1|WP_013886717.1|1698624_1700028_+|ATP-binding-protein MNTPDFLNREKELNFLHSQFARKEASFIVIYGRRRVGKTSLIKEFIKDKSSLFFMADKQSEKGILDRFAKTASTFLEDEFLEKLTFNSWEDFFGYITQKLDESKKYVLVIDEFQYLPDINHAFPSILQRIWDEKLKDKNIMLILCGSLINMMYSTTLSYQSPLYGRRTGQIKLDPISFDYCHNFFPNIDERKLIEYYSVTGGIPKYMEMFDATNDILYDIKTNVLSKNSYLYNEPRFILNEEVTETATYFSILKAIAAGEHKIGKIASIVGVKTNVLAKYFNVLADLQIIERQVPVTEENPEKSKKGLYFIKDNFFRFWFRYIFPYQSFLEIERDDVVLKEIQKSFNIFVSFVYENLCLQKIPDLTQNGVINFKIEKWGRWWSKDEEIDIVATSKKDKNILFGECKWSDTPIGVSVYADLKAKAKNVKWHTDERNEYYILFSKSGFTEDLMDINEKTSSLILIDSIV >NC_015672.1|WP_013886715.1|1697555_1698053_-|hypothetical-protein MSKQKRVKDQFNWTPPHEQKGRFVFPLSDKVEERKPLLWLVRTNSEKNMVDDVFLVNLTGEVLDMVAAGNTGFQSIDDEEQVNLISGSRFVYENVETNEAVKVEEYDGILDYDSMLGITLYIKSKKLGNIQIGTDVKKGGVENMVLLWDTGETGKKAGVSEWDDD >NC_015672.1|WP_013886714.1|1697020_1697518_-|hypothetical-protein MKKSVEIVKFKQMYDFIIFLLSKTCNEISQEKLNNELRNSFITGICECISDKNDEFYGKCCGTFYLNTMSEKEGIFSADDYFLFFSNIGIFIFHTDNKGHLKECEFFYESEYFPEFYLEILKEFKTDSGFKNYMKYLKVNDVKLRTLAELKEVFSIEKTNVIEVE >NC_015672.1|WP_013886713.1|1696327_1696960_+|hypothetical-protein MKSVSYAINNILDACNKEDGLWIGNTRKGIEVSEKKEIENLFDLIISGNTILDNILILEIEEPCFSRKFIANYWSDLNLKKFFQKRNSQKTLLLCNGQSLQDIYIGLKGSYDKQELYFNVISSSSQNSKTTNKFKFLPYPYIEKTGVWIKAKDLINSEVNPDKIIKKIGNKIPENVISKKYDLIKANIQSFINEFSIKKNAHIKIINVNN >NC_015672.1|WP_013886724.1|1712960_1713365_-|hypothetical-protein MNYYKTNKNLLLIFSHSLTNVQIEDAHSMNITSFVYLPDDLQNIWSNIRPEGDLPVSDLDRIVDWIDANSSKGDFALVQGDFGATYYIVNRCFDMGLIPVYSTTKRIASEESISASEVGKQSVFEHVNFRRYVK >NC_015672.1|WP_013886725.1|1713351_1714668_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr6 MIPVHKEIKDLVTKDKFNQGNFGLWFYKFVFLDGNTLKSGVNDVNDYKDQYENLREYNRFLKELIETKHLNQYAFCKSKEKTHKILTFRATLSSPMVTGIGNAHPCEVGMTFDHSLGIPYIPASSIKGIVRFAHTLSLVDEAYGKNIVDEEGWFDDEADWTKIPTIFGTSQDNGRRGKVIFLDAYPEKTPYLHVDIMSPHYGPYYSEFKPPADYYDPTPIKFLTVAKGTTFIFRVLIDKETKDIEQIMHDVSSAVKNSLEKDGVGAKTAVGYGRFTIESNEEPQDLIDAYEEKFLTEEEKLKREIKSFIDKIQVTNDNSSIDSLFQQWENNDKINDNKEIAETFKKKVKKTKANGEFTAHYKKVAEILDINLEESFGKDISEETERQTDNDIENDLKKALRKIKKANGDKKKIKRILKDHKKIKDKILEECPDLNELL >NC_015672.1|WP_013886726.1|1714651_1715074_-|type-III-B-CRISPR-module-associated-protein-Cmr5 MRTLGQKRAEYALEKVLTISCDKKDFKSLSSGVPSMILQNGFGQTMAFLVAKGTDKDMKIKENDKHIVMFRIIKEWLIKELSTVGFNKNNNEKEFIKEISQLSQMDYLTAQKETLALLEWVKRYANAWFSGEESKNDTGS >NC_015672.1|WP_013886727.1|1715070_1716024_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr4 MNKEICSILSFYAVSPIHAGSGASVATVDLPIQRERHTGYPIIQASGVKGAMRDHFRNNVKNKSDREYLTNWIFGIDKDNDGEVVFKDGNYVSEKLEENKNYKKLEDKENKITSFPGSISVSDAKLLAFPMRSNLAPFVWVTSPTILKKLTKDLEYLNISETFGDLNIEEDNAKIIKGNFNDNSRIILEDVTVNVNANEKLESEFLNDKFPQVERLLLISDEMFDYCVTSCTEVQTNIKINSEKGTAAEGGLRYQEFLPSDSVLYSVVYFSGKSNELQADAIKKYLQESIDSFFQIGGDITLGKGICNVSWIDGGTK >NC_015672.1|WP_013886728.1|1716039_1716948_-|CRISPR-associated-protein,-Cmr3 MYNWYSFEPNDTVFFRGAEPMEKGEDHNANFNFPPPVHTMAGAIRTYFYNIDKKNNEDKFSDIVRIGEEYGGFKLVGPFFKIDEKIYLPAPYSWFVEKSCATSENGKYNIIKGFSIQSDLIKTSSDDLYWAKGESELESIGGKWINYNDLINGSDKAEVKDVKDFYVSELRTGIALNKDHTARESHIYSFNHCRLKKGVSFIFGIDIDDLGNGGILTLGAEQRFGKFKKEDLEINLNTNGELFMSLSLMPASAKVNDSVISTGKIQYLGGWDLHKRFHKPMKGYFPAGTVFNSNFDNCISIN >NC_015672.1|WP_013886729.1|1716940_1719643_-|type-III-B-CRISPR-associated-protein-Cas10/Cmr2 MAINLPANYWDNKFWAYMHDPFDKCFDIKGHVERAKEIVSIFGIDSPNQDFWKKADGIASGFERGQIVGYSSDEEKSGAVDFLKNPVITHPTGEKSHLKFDLSDASAKQIWEKLKNYLEKEIGKEAGTGGYSDQFEGKPNDFKKARFLYTHLVLRFRLAQDNVGDIGALWHRLPADTRFPDHSIWQHNALVSAIQSCFELGGKDDLGMMVFNISPVQAFISKARKLRDYWTGSVFLSYLAFEGIRWVVENLGPDHILYPSLIDQFLVNEYLRKEWKVKYGVNFLNKESDIASFPNKFLFLLPFSKSEEIAEEVEKSIKQAWKEIYSSVKEGIFQELHMNSDERSYIDSIFNRQNDNFWEFKWASVKMLKEENKDEIKSLLPSKVYNANFDVLKCFNDMIKDKKYYEKSGIGTLYSVSHSLCQSALAAEKNRKTIEREPEPGEKCHICGEFEVVHSNPYEKGMSANEYKTNIDNFWKNLKESWEGEDGSDLKDNEKLCSICLTKRLSYYYIKKYKEHLLFKTFKDSSNFPSTTYMALHDYYIREGIEDENEKIEKAQGIHDSHVSDKEMRYSDKYYALLLMDGDRMGKLVNGETIASTWESIMHPEIFDKLQNGKIESPYSENWQKIFQESPKRNLTPAIHSAISESLGDFAIYGVANIVNNYDGKLIYAGGDDVCAVLPVSNVLKAAEEINDYYKSTFKLIESNQNKINISNISENFKPNPGKLSLSLGKGEEISISAGALICHHKADLTHMIKEAHNLLDKKAKDEGGRNAIAIQLKKRSGGDRFFICKWDDKERLKAFLSIQNKMGEEMSRSLAYRLAELKDGIDAIKNLKGHQESEQNDLLEKFILKQLDRSGKKSEEKEEIAANISKIIFDHQDNFSNEGLIIAGFLHRDEEVANV >NC_015672.1|WP_013886730.1|1719633_1720527_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr1 MGFNIARYRDIEEKIYEMEIVTPMFLGGADQNDAELRIPSIKGMLRFWWRALYGTDDLEQTIKNESEIFGNTDYKSPTTISFKNQNISISNEKLDNNNFSIYEYLAYGYRVKNNIKNYIEPKSSFSLKLSTLKMQEIENSINALCSFGGLGSKSRNGFGSLKIIDSKKFNTLDFLNQFRKRDMTTYTTISKQSKILFGKQHKTWKEALAEIGELYKQSKYFLKYQGDKRQLIAKSQGSRYAKPYFLHISKLDNDQYQGQILFMPYEYKDSSKTDEYLDTCEQMNEKIEELAGGNKWQ >NC_015672.1|WP_013886731.1|1720527_1721787_-|TIGR02221-family-CRISPR-associated-protein MGRKVFLSFLGTGDYKNCNYYFDNQKIDNIIYIQEAVLRIFCKDWYKSDAGFVLTSSDAKNKHWQNLKNGLQDLPFSVEHVDIPTGSCENEIWDIFQTIIDIIKEDDEILIDITHGFRLMPVILSSAISYLESIKKVKIIGIYYGAFETLGTQSEVEKMPVEERNAPIFDLTPTFTIQKWAKAAEIFEETGSVKQIRNLSLIEVSSILKETKGKNQEAQKIKKVVSELYKFVNEIEACRSKETVTKNFQQLKTEINDLKELGVVKPLEGILEKIHKNVSNFQNDIFENSFAIIKWCISYGLVQQAYTFLSETVITFFTKLDYGFDKIWDRDIREKVSYSINSYFKDGANEENISNIKNSINWLSGTDKDEFYNKMDLLKKYRNDMNHCGYREDSLDYKKLTEKIKELNQYFYKILCKGE >NC_015672.1|WP_013886732.1|1721779_1722691_-|CRISPR-system-precrRNA-processing-endoribonuclease-RAMP-protein-Cas6 MFIKYQKYDFTIQFSETTYSDVFPAFLLRSVLGKELKSFACVLRRRKCEECPLKFQCAYSYIFESPISKDNEFLKGRDKVSHPFTISCSEDADKKLDSLHFRLTLFGRGIDYFPYIFYAFKKGGESGLFRRKTKYDIVSIFADGKMVNDGESEELGIPEPKDWELSTGTSEIYKKISINMDSPLRLKINGKYTDKITYRDFLYAAVRRAEILSSKYGINNVDTHLTKKLSEKSENICIYWKDYDRYSARQKQKMKLGGCVGHMDLEGYFTSYELSLLNFSEIFGLGKNTGFGFGKISVEDLDG >NC_015672.1|WP_013886733.1|1722808_1724224_+|cold-shock-protein MADDVVKTGFFAQNSTLNKCNAAILSGISIYNVMIYIGEDMEQLQELRKKANNLKDNRKYEQATEIYKQIIDNHESHCNDWDYWNYAFCLKKQRMYNAASEICKSLLRINKDFVPAKNLLCWCLFYSKIKNKKSEDEFLEASRKVLKLCSQKDKYSPYTITVFKVLEHFKHKNDYPAEKILKCTNMLDPELLNFEPYRIKENDKEIELASQLELYFMHRTKALLNCGKYDQCINECDHALKSLNKFHYNNDIWFKWRMALSYKALAKYKESIEGLYEIATRKKDWFILKEISENLYHQNKVEEAFMYAVKACLRKGDIDKKLNLFLLIADILISLNDKVNAQKHVDFVYHFKIKEERETGTYLNNLISANNFEISEDLDLDMQYKQLVEFWTQIKASRQKRNTGFIKKLLPNGKSGFIEASDGKTYYFQIRNIKNNPANLHESQKVTFCIEDGFDAKKNKPSKIAVEIKTE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_015672_6 | 1711131-1712652 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NC_015672_6
|
20 spacers
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csx20,cmr6gr7,cmr5gr11,cmr4gr7,cmr3gr5,cas10,cmr1gr7,csx1,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_015672_6
The CRISPR arrays of NC_015672_6 >merge|NC_015672|6|1711131-1712652|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR 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>NC_015672|6|6|1711131-1712652|CRISPRCasFinder TCCGAGCTTGCTGGAAATCAGGTCATGGATTCCAAT CTGAAGCGAATCAATTATATAAAAATTCTTTCTCTTCT GTCGTAATCCCTTCTAATCAGGTCATGGATTCCAAT AGTGATGCGGGGTGGGTACGTCGGTTTGCATATCGAAA GTCGTAATCCCTTCTAATCAGGTCATGGATTCCAAT ACATCAAGAACAGAAAGCGCTGTTTGAAATGGCAGCTC GTCGTAATCCCTTCTAATCAGGTCATGAATTCCAAT CAGGTTGCCGGAAGGGGCAACAACCCTTCCGGAGGGTTT GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT ACAGAAGCAATTTCATTATATAAAAATTCTCTCTCTAAA GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT ACAAACTTATAAAAGGATATGTGAATCTGGAACACGTT GTCGTAATCCCTTCTAATCAGGTCATGGATTCCAAT GATGTAAGAGTATATTACGATGAGACAAGACAATTATC GTCGTAATCCCTTCTAATCAGGTCATGGATTCCAAT AAAACCACAAACGGTATGATCTTAAGGGTCGATGACAGAC GTCGTAATCCCTTCTAATCAGGTCATGGATTCCAAT AGGAACTAAGCATGCAATAAACACTGCTGAAAGATTAGGT GTCGTAATCCCTTCTAATCAGGTCATGGATTCCAAT AATTATGGATGAAACTAATGTCCATCCTTCCTGATTATGA GTCGTAATCCCTTCTAATCAGGTCATGGATTCCAAT AAAATGTATCTATTGAATGCGTTCAGCTTGCAGATG GTCGTAATCCCTTCTAATCAGGTCATGGATTCCAAT ACAGAAGCGTATCATTTAAGTAAAAATTCTTTCTCTTA 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>NC_015672.1|WP_013885895.1|1707786_1709154_-|IS5-family-transposase MRPKKQDSTTQELLEPLLVNIIDMKHPLIQLADKIDWEYFEKEFGSLYHRNDGRPGIPMRMMVGFHYLKYTYNLSDEDVVHGWKENPYWQYFTGEKVFQTKVPINPTSMTRFRNRLKEEDLLKFLEETINTAFRSGYLNKNDVKKVAADTTVQEKNITFPTDIKLFYTMIKYLVKFSKKHEIRLKETHEYSGKKLLMKYSGYVHAKQYKRAGKAVKKMKTKMGKLYRSIERVLPEELRNSDEFQQLKLFYESLWNRSKKSKNKLYSLHSPEVECISKGKSHKRYEFGNKVGFVGTLKKNFILSCKSFHGNPYDGHTLEENLCEAKTLLGSNGTIDTILVDLGYRKHNYRGDAKVHVVPRSMKKFKVNFKRLLKRRSCVEATIGHTKRDNRMDRNYLKGKEGDKANAILAASGHNLRLILAFLLFFLKKFMDNIAKKLANFANEVFLDKKYAKIYV >NC_015672.1|WP_013886722.1|1707264_1707711_+|hypothetical-protein MSDICFLRPTAAKRIENWLNSNNYSLHNGYFTLEYNFSPIVDDGIILSFIDNKTGDIHKLVVQDDIEGIIEPDEECSVSQISIDYIPLSLELTPETLEKFSEIESRKFEAEVEELVEPVGCGIKFEIYSDSYAIFACKKELQRTQIGE >NC_015672.1|WP_013886721.1|1706841_1707243_+|type-II-toxin-antitoxin-system-VapC-family-toxin MSYLFDTNICIYIIKNKYKQIAKKMQEAGLEKICISAITVAELEYGISKSSKKDENRIALLEFLIPFTVLNFDQNDARKYGQIRYNLQKAGTPIGNMDLLIGSQALARDMTLITNNEKEFSRIQGLKIENWIK >NC_015672.1|WP_013886720.1|1706613_1706841_+|AbrB/MazE/SpoVT-family-DNA-binding-domain-containing-protein MDTAKIFENGKSQAVRLPKKYRFDSDDVFIKKIDDIVVLIPKDKVWQIFSSSLDKFSEDVDFQKDNSIPQEREEI >NC_015672.1|WP_013886719.1|1703239_1706488_+|UvrD-helicase-domain-containing-protein 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>NC_015672.1|WP_013886713.1|1696327_1696960_+|hypothetical-protein MKSVSYAINNILDACNKEDGLWIGNTRKGIEVSEKKEIENLFDLIISGNTILDNILILEIEEPCFSRKFIANYWSDLNLKKFFQKRNSQKTLLLCNGQSLQDIYIGLKGSYDKQELYFNVISSSSQNSKTTNKFKFLPYPYIEKTGVWIKAKDLINSEVNPDKIIKKIGNKIPENVISKKYDLIKANIQSFINEFSIKKNAHIKIINVNN >NC_015672.1|WP_013886724.1|1712960_1713365_-|hypothetical-protein MNYYKTNKNLLLIFSHSLTNVQIEDAHSMNITSFVYLPDDLQNIWSNIRPEGDLPVSDLDRIVDWIDANSSKGDFALVQGDFGATYYIVNRCFDMGLIPVYSTTKRIASEESISASEVGKQSVFEHVNFRRYVK >NC_015672.1|WP_013886725.1|1713351_1714668_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr6 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MNKEICSILSFYAVSPIHAGSGASVATVDLPIQRERHTGYPIIQASGVKGAMRDHFRNNVKNKSDREYLTNWIFGIDKDNDGEVVFKDGNYVSEKLEENKNYKKLEDKENKITSFPGSISVSDAKLLAFPMRSNLAPFVWVTSPTILKKLTKDLEYLNISETFGDLNIEEDNAKIIKGNFNDNSRIILEDVTVNVNANEKLESEFLNDKFPQVERLLLISDEMFDYCVTSCTEVQTNIKINSEKGTAAEGGLRYQEFLPSDSVLYSVVYFSGKSNELQADAIKKYLQESIDSFFQIGGDITLGKGICNVSWIDGGTK >NC_015672.1|WP_013886728.1|1716039_1716948_-|CRISPR-associated-protein,-Cmr3 MYNWYSFEPNDTVFFRGAEPMEKGEDHNANFNFPPPVHTMAGAIRTYFYNIDKKNNEDKFSDIVRIGEEYGGFKLVGPFFKIDEKIYLPAPYSWFVEKSCATSENGKYNIIKGFSIQSDLIKTSSDDLYWAKGESELESIGGKWINYNDLINGSDKAEVKDVKDFYVSELRTGIALNKDHTARESHIYSFNHCRLKKGVSFIFGIDIDDLGNGGILTLGAEQRFGKFKKEDLEINLNTNGELFMSLSLMPASAKVNDSVISTGKIQYLGGWDLHKRFHKPMKGYFPAGTVFNSNFDNCISIN >NC_015672.1|WP_013886729.1|1716940_1719643_-|type-III-B-CRISPR-associated-protein-Cas10/Cmr2 MAINLPANYWDNKFWAYMHDPFDKCFDIKGHVERAKEIVSIFGIDSPNQDFWKKADGIASGFERGQIVGYSSDEEKSGAVDFLKNPVITHPTGEKSHLKFDLSDASAKQIWEKLKNYLEKEIGKEAGTGGYSDQFEGKPNDFKKARFLYTHLVLRFRLAQDNVGDIGALWHRLPADTRFPDHSIWQHNALVSAIQSCFELGGKDDLGMMVFNISPVQAFISKARKLRDYWTGSVFLSYLAFEGIRWVVENLGPDHILYPSLIDQFLVNEYLRKEWKVKYGVNFLNKESDIASFPNKFLFLLPFSKSEEIAEEVEKSIKQAWKEIYSSVKEGIFQELHMNSDERSYIDSIFNRQNDNFWEFKWASVKMLKEENKDEIKSLLPSKVYNANFDVLKCFNDMIKDKKYYEKSGIGTLYSVSHSLCQSALAAEKNRKTIEREPEPGEKCHICGEFEVVHSNPYEKGMSANEYKTNIDNFWKNLKESWEGEDGSDLKDNEKLCSICLTKRLSYYYIKKYKEHLLFKTFKDSSNFPSTTYMALHDYYIREGIEDENEKIEKAQGIHDSHVSDKEMRYSDKYYALLLMDGDRMGKLVNGETIASTWESIMHPEIFDKLQNGKIESPYSENWQKIFQESPKRNLTPAIHSAISESLGDFAIYGVANIVNNYDGKLIYAGGDDVCAVLPVSNVLKAAEEINDYYKSTFKLIESNQNKINISNISENFKPNPGKLSLSLGKGEEISISAGALICHHKADLTHMIKEAHNLLDKKAKDEGGRNAIAIQLKKRSGGDRFFICKWDDKERLKAFLSIQNKMGEEMSRSLAYRLAELKDGIDAIKNLKGHQESEQNDLLEKFILKQLDRSGKKSEEKEEIAANISKIIFDHQDNFSNEGLIIAGFLHRDEEVANV >NC_015672.1|WP_013886730.1|1719633_1720527_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr1 MGFNIARYRDIEEKIYEMEIVTPMFLGGADQNDAELRIPSIKGMLRFWWRALYGTDDLEQTIKNESEIFGNTDYKSPTTISFKNQNISISNEKLDNNNFSIYEYLAYGYRVKNNIKNYIEPKSSFSLKLSTLKMQEIENSINALCSFGGLGSKSRNGFGSLKIIDSKKFNTLDFLNQFRKRDMTTYTTISKQSKILFGKQHKTWKEALAEIGELYKQSKYFLKYQGDKRQLIAKSQGSRYAKPYFLHISKLDNDQYQGQILFMPYEYKDSSKTDEYLDTCEQMNEKIEELAGGNKWQ >NC_015672.1|WP_013886731.1|1720527_1721787_-|TIGR02221-family-CRISPR-associated-protein MGRKVFLSFLGTGDYKNCNYYFDNQKIDNIIYIQEAVLRIFCKDWYKSDAGFVLTSSDAKNKHWQNLKNGLQDLPFSVEHVDIPTGSCENEIWDIFQTIIDIIKEDDEILIDITHGFRLMPVILSSAISYLESIKKVKIIGIYYGAFETLGTQSEVEKMPVEERNAPIFDLTPTFTIQKWAKAAEIFEETGSVKQIRNLSLIEVSSILKETKGKNQEAQKIKKVVSELYKFVNEIEACRSKETVTKNFQQLKTEINDLKELGVVKPLEGILEKIHKNVSNFQNDIFENSFAIIKWCISYGLVQQAYTFLSETVITFFTKLDYGFDKIWDRDIREKVSYSINSYFKDGANEENISNIKNSINWLSGTDKDEFYNKMDLLKKYRNDMNHCGYREDSLDYKKLTEKIKELNQYFYKILCKGE >NC_015672.1|WP_013886732.1|1721779_1722691_-|CRISPR-system-precrRNA-processing-endoribonuclease-RAMP-protein-Cas6 MFIKYQKYDFTIQFSETTYSDVFPAFLLRSVLGKELKSFACVLRRRKCEECPLKFQCAYSYIFESPISKDNEFLKGRDKVSHPFTISCSEDADKKLDSLHFRLTLFGRGIDYFPYIFYAFKKGGESGLFRRKTKYDIVSIFADGKMVNDGESEELGIPEPKDWELSTGTSEIYKKISINMDSPLRLKINGKYTDKITYRDFLYAAVRRAEILSSKYGINNVDTHLTKKLSEKSENICIYWKDYDRYSARQKQKMKLGGCVGHMDLEGYFTSYELSLLNFSEIFGLGKNTGFGFGKISVEDLDG >NC_015672.1|WP_013886733.1|1722808_1724224_+|cold-shock-protein MADDVVKTGFFAQNSTLNKCNAAILSGISIYNVMIYIGEDMEQLQELRKKANNLKDNRKYEQATEIYKQIIDNHESHCNDWDYWNYAFCLKKQRMYNAASEICKSLLRINKDFVPAKNLLCWCLFYSKIKNKKSEDEFLEASRKVLKLCSQKDKYSPYTITVFKVLEHFKHKNDYPAEKILKCTNMLDPELLNFEPYRIKENDKEIELASQLELYFMHRTKALLNCGKYDQCINECDHALKSLNKFHYNNDIWFKWRMALSYKALAKYKESIEGLYEIATRKKDWFILKEISENLYHQNKVEEAFMYAVKACLRKGDIDKKLNLFLLIADILISLNDKVNAQKHVDFVYHFKIKEERETGTYLNNLISANNFEISEDLDLDMQYKQLVEFWTQIKASRQKRNTGFIKKLLPNGKSGFIEASDGKTYYFQIRNIKNNPANLHESQKVTFCIEDGFDAKKNKPSKIAVEIKTE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_015672_7 | 1734298-1735756 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NC_015672_7
|
19 spacers
spacers of NC_015672_7
>7.1|1734334|36|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT TGGGAAATATATAGATACCTGTCCTTCCGGGTTTGA >7.2|1734406|39|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTAAAAAGAATCCCAAAGAAAATAGAGGAACTCCTCAAG >7.3|1734481|40|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAAAAAAATGAATAACATGGAACAAATAAAAGAACTAGA >7.4|1734557|38|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATACCCCTGACGATGTAAAAGTCAGAGGTATAGATAA >7.5|1734631|39|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CGGGAGAGAATTCCGGACTGAAGCATATCATTTACAAAA >7.6|1734706|38|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAATCAAGAAATAAAAAAGGAGGAAAAAAATGTTTTTA >7.7|1734780|39|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATTGGAGGAGATAAAAGCGAAGAAGGAAAAAGAAGAAA >7.8|1734855|39|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTCGGGGTTGAACATAACCGAATAAATGTCTCCCTGAAA >7.9|1734930|39|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATACATGGGCAAAAAATAGACAGTTTTCCGGTATCAAAA >7.10|1735005|39|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCAGAATTGCAACCTCACGCTCCAGTGAGGTTGTATGTA >7.11|1735080|39|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GATGCTGGGTGAGTTCCCGGCATCTGTCAAGATTGACGA >7.12|1735155|38|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGTATAGATGAGGATAACATTCTTCATGTATATAACAT >7.13|1735229|39|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACGATAAGCTCAACAAAAAAGAGCTTTTAAAAATAATAA >7.14|1735304|40|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTTGAACATGCTGAAATGTTATCAAGAAATATCGGATAT >7.15|1735380|39|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CGGTTATGTGTTGTGCTGGCATTTCAACCAGCACGACCT >7.16|1735455|40|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAGGGGAGAAGCCCGCAATTCGAGATGGTTAAAGCTCCAT >7.17|1735531|39|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCTGAAATGGGAGAGTGACACCAAGAAAAGAAAAATAGG >7.18|1735606|39|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT CCGTCGAACACGTAGTGAAACGTGTACCAGAATCAAATG >7.19|1735681|40|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT ATCTTCGTCCTCGTGGGATATCCCCGAGGACTTGAAAAAA >7.20|1735606|44|NC_015672|PILER-CR CCGTCGAACACGTAGTGAAACGTGTACCAGAATCAAATGACGGC >7.21|1735686|40|NC_015672|PILER-CR ATCTTCGTCCTCGTGGGATATCCCCGAGGACTTGAAAAAA |
PrimPol,cas1,cas2 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_015672_7
The CRISPR arrays of NC_015672_7 >merge|NC_015672|7|1734298-1735756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCCGAGCTTGCTGGAAGTCAGGTCATGAATTCCAATTGGGAAATATATAGATACCTGTCCTTCCGGGTTTGAGTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAATTTAAAAAGAATCCCAAAGAAAATAGAGGAACTCCTCAAGGTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAATAAAAAAAAATGAATAACATGGAACAAATAAAAGAACTAGAGTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAATTATACCCCTGACGATGTAAAAGTCAGAGGTATAGATAAGTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAATCGGGAGAGAATTCCGGACTGAAGCATATCATTTACAAAAGTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAATTAATCAAGAAATAAAAAAGGAGGAAAAAAATGTTTTTAGTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAATTATTGGAGGAGATAAAAGCGAAGAAGGAAAAAGAAGAAAGTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAATCTCGGGGTTGAACATAACCGAATAAATGTCTCCCTGAAAGTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAATATACATGGGCAAAAAATAGACAGTTTTCCGGTATCAAAAGTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAATGCAGAATTGCAACCTCACGCTCCAGTGAGGTTGTATGTAGTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAATGATGCTGGGTGAGTTCCCGGCATCTGTCAAGATTGACGAGTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAATGGTATAGATGAGGATAACATTCTTCATGTATATAACATGTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAATACGATAAGCTCAACAAAAAAGAGCTTTTAAAAATAATAAGTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAATATTTGAACATGCTGAAATGTTATCAAGAAATATCGGATATGTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAATCGGTTATGTGTTGTGCTGGCATTTCAACCAGCACGACCTGTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAATTAGGGGAGAAGCCCGCAATTCGAGATGGTTAAAGCTCCATGTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAATCCTGAAATGGGAGAGTGACACCAAGAAAAGAAAAATAGGGTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAATCCGTCGAACACGTAGTGAAACGTGTACCAGAATCAAATGACGGCAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAATATCTTCGTCCTCGTGGGATATCCCCGAGGACTTGAAAAAAGTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT >NC_015672|7|7|1734298-1735756|CRISPRCasFinder TCCGAGCTTGCTGGAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT TGGGAAATATATAGATACCTGTCCTTCCGGGTTTGA GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT TTAAAAAGAATCCCAAAGAAAATAGAGGAACTCCTCAAG GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT AAAAAAAAATGAATAACATGGAACAAATAAAAGAACTAGA GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT TATACCCCTGACGATGTAAAAGTCAGAGGTATAGATAA GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT CGGGAGAGAATTCCGGACTGAAGCATATCATTTACAAAA GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT TAATCAAGAAATAAAAAAGGAGGAAAAAAATGTTTTTA GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT TATTGGAGGAGATAAAAGCGAAGAAGGAAAAAGAAGAAA GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT CTCGGGGTTGAACATAACCGAATAAATGTCTCCCTGAAA GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT ATACATGGGCAAAAAATAGACAGTTTTCCGGTATCAAAA GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT GCAGAATTGCAACCTCACGCTCCAGTGAGGTTGTATGTA GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT GATGCTGGGTGAGTTCCCGGCATCTGTCAAGATTGACGA GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT GGTATAGATGAGGATAACATTCTTCATGTATATAACAT GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT ACGATAAGCTCAACAAAAAAGAGCTTTTAAAAATAATAA GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT ATTTGAACATGCTGAAATGTTATCAAGAAATATCGGATAT GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT CGGTTATGTGTTGTGCTGGCATTTCAACCAGCACGACCT GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT TAGGGGAGAAGCCCGCAATTCGAGATGGTTAAAGCTCCAT GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT CCTGAAATGGGAGAGTGACACCAAGAAAAGAAAAATAGG GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT CCGTCGAACACGTAGTGAAACGTGTACCAGAATCAAATG ACGGCAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT ATCTTCGTCCTCGTGGGATATCCCCGAGGACTTGAAAAAA GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT >NC_015672|7|6|1734298-1735756|CRT TCCGAGCTTGCTGGAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT TGGGAAATATATAGATACCTGTCCTTCCGGGTTTGA GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT TTAAAAAGAATCCCAAAGAAAATAGAGGAACTCCTCAAG GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT AAAAAAAAATGAATAACATGGAACAAATAAAAGAACTAGA GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT TATACCCCTGACGATGTAAAAGTCAGAGGTATAGATAA GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT CGGGAGAGAATTCCGGACTGAAGCATATCATTTACAAAA GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT TAATCAAGAAATAAAAAAGGAGGAAAAAAATGTTTTTA GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT TATTGGAGGAGATAAAAGCGAAGAAGGAAAAAGAAGAAA GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT CTCGGGGTTGAACATAACCGAATAAATGTCTCCCTGAAA GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT ATACATGGGCAAAAAATAGACAGTTTTCCGGTATCAAAA GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT GCAGAATTGCAACCTCACGCTCCAGTGAGGTTGTATGTA GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT GATGCTGGGTGAGTTCCCGGCATCTGTCAAGATTGACGA GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT GGTATAGATGAGGATAACATTCTTCATGTATATAACAT GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT ACGATAAGCTCAACAAAAAAGAGCTTTTAAAAATAATAA GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT ATTTGAACATGCTGAAATGTTATCAAGAAATATCGGATAT GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT CGGTTATGTGTTGTGCTGGCATTTCAACCAGCACGACCT GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT TAGGGGAGAAGCCCGCAATTCGAGATGGTTAAAGCTCCAT GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT CCTGAAATGGGAGAGTGACACCAAGAAAAGAAAAATAGG GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT CCGTCGAACACGTAGTGAAACGTGTACCAGAATCAAATG ACGGCAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT ATCTTCGTCCTCGTGGGATATCCCCGAGGACTTGAAAAAA GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT >NC_015672|7|9|1734370-1735756|PILER-CR GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT TTAAAAAGAATCCCAAAGAAAATAGAGGAACTCCTCAAG GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT AAAAAAAAATGAATAACATGGAACAAATAAAAGAACTAGA GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT TATACCCCTGACGATGTAAAAGTCAGAGGTATAGATAA GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT CGGGAGAGAATTCCGGACTGAAGCATATCATTTACAAAA GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT TAATCAAGAAATAAAAAAGGAGGAAAAAAATGTTTTTA GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT TATTGGAGGAGATAAAAGCGAAGAAGGAAAAAGAAGAAA GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT CTCGGGGTTGAACATAACCGAATAAATGTCTCCCTGAAA GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT ATACATGGGCAAAAAATAGACAGTTTTCCGGTATCAAAA GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT GCAGAATTGCAACCTCACGCTCCAGTGAGGTTGTATGTA GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT GATGCTGGGTGAGTTCCCGGCATCTGTCAAGATTGACGA GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT GGTATAGATGAGGATAACATTCTTCATGTATATAACAT GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT ACGATAAGCTCAACAAAAAAGAGCTTTTAAAAATAATAA GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT ATTTGAACATGCTGAAATGTTATCAAGAAATATCGGATAT GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT CGGTTATGTGTTGTGCTGGCATTTCAACCAGCACGACCT GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT TAGGGGAGAAGCCCGCAATTCGAGATGGTTAAAGCTCCAT GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT CCTGAAATGGGAGAGTGACACCAAGAAAAGAAAAATAGG GTCGTAATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT CCGTCGAACACGTAGTGAAACGTGTACCAGAATCAAATGACGGC AATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAATATCTT CGTCCTCGTGGGATATCCCCGAGGACTTGAAAAAAGTCGT AATCCCTTCAAGTCAGGTCATGAATTCCAAT
>NC_015672.1|WP_013886740.1|1732446_1733964_+|SAVED-domain-containing-protein MKTIFDNIQEGRNHKIIEQCIKDGSINQDSLPYCYSLFSKTEFAEYRSLKSNFLQSVFIYDHLFNVEYLCEHLQITENDCYALKNAKIKRAYFPVTSHNNGNESEIQELIFFDVELESSTLTFPNENNHVKDALISVSKALKRNFFIMFDNYFAGRSFSLAAAAAGLLKEDKLKYFAFSGEVKENANIAKVENLPAKRKISEEKDLFFVSPDSVDNLNQLTKLNAETVDIPFIQLFGKQKTELEKNLEKISGNEIVNDYKIWVGILGGDKSLVFTHTEEMLENTTEVWDELLLDFYEKINKLYQLPYYVNIHFLGSLSAFAFLSGIVFGAKNKITIHHYQDGSIFRVMDFSEKSVRLLKSKTKKYEKVKYSVEYTVAESEDAAIVIYLASHNPKNDAQKYIESHLKCSLLFICLENNQGNIDLNEDDWIKTVAEIYSLVDEAGELIGKSIRKYHFFMSIPVPVAFGFGMAYGDYKKIAVYNYVKSQSTYKKVADSDLSRNLKMAF >NC_015672.1|WP_013886739.1|1731548_1732463_+|hypothetical-protein MKSNSNLEELFKIYKKLKSTRFEQGEMVEKMQGDYSKFMSLFKRSSITTPKTPTTHNTSTYELGELYIVDDMIFLLAGEHGDFYFGYKVTEWVEFATHEDFVFKFSGNSWMAILSTELYIPKEKLGSFIGALDEEYADALYEYMVNDYLEEKFTGRKIPTDDYNYLENQFRILELKKVADYCFGQFIAMEEDIRKNENEIINLNDLKERLSFMLKNTDLPNAAFDARQSAIGENFILIFDPNDKILTITISEKLLLKRFAKMEFFGNTFYFYIEKPQIEIEVPFDFINVDYLAENIRVVDENDI >NC_015672.1|WP_013886738.1|1730893_1731559_+|sigma-70-family-RNA-polymerase-sigma-factor MRNDKEIIKFLKRPESSEEGYHSLLQLFSYSFYKFDVIKNNYECDAVFHDFLLKNIFHNKTFFLFLHSSDEKDIMPYLKKMIRNFLINLRNKTIRKGTDLSLDETLNDDSNDTFADMLKNERVSHELIFEAKSILSIFLNTLTEKNKRILCQYLYSKKYQFISGISRDAFDKAVERTKKKVQEIVEQNKLSFDSIKVFFDYIYVSEVCEKMRLNNGDSDEK >NC_015672.1|WP_169310290.1|1730748_1730904_+|hypothetical-protein MLDEILREEGVYKEAAESCRDSTGKIPQVIKYCGLCNKDYVNSIKRKIYEK >NC_015672.1|WP_013885355.1|1729517_1730567_-|IS5-family-transposase MEKYIEPTVLDSMLDFKANDSTYLDKINSLIDWKKVKSILDKKYRWTKNTSGSRAYSPLLLFKILLVQSWEKLSDPQAEFALKDRLSVIRFVGVSVSGEVPDHSTISRFRSRLLELEIFDELFSEINRQLSELNLIVKSRKEAIIDATLVESSCRPRKVVNDIAEDRHEGDDDNDSSCGGSGGNNESNISYSKDTDASWLKKGNRAYYGYKQFFCVNSDGYILGEMVKSARESEVRNLAPLLQKLNLPKGTAIYADKGYSSESNRKDISGTYADMIMYKAARNKPLTGFQKFHNKAVSKVRYVVEQAIGLIKLHFGYTRSRFIGIDKVRLELSIHCMAYNLRKGALRMI >NC_015672.1|WP_013885349.1|1727894_1729214_-|IS1380-like-element-ISFsi1-family-transposase MSKLNYKLERSNDKITPFGGISLLIPLLDKMGIRDFLDKELDHPGSNRGKPPSSKIIPVILSMICGGRSFSDIDKLSFDKVLSYISGIEDIPDSSSISRYFSKTESMLDEVAVNKTISKLGSLNYKIVKDALKRENLFSVTLDQDATYAKVYKRDAKYCYKKFKAYSSMTCFIGESGYCIDEEFREGNVSAQVGILEQLQRVHKYLESCGIEVSNVRNDSAGYQSKVLNYCFDNDLTFFIGGDLDSSVRKGINHIPSDSWKRYRNRYGDESDNEEIAEFIHCMENTKESFRIIVVRKKIESDNPTVPELLGDKYEYRVIATNSKLDAEKVVHFYNLRGVCEYNIKEAKYGFNLKSFPSGNLAGNGLWFKTGILAYNLIMYLKRIIMGGVYKNKEMGSIRYQVISIAGKLVSHGGNKLKLCCSVDMFKKMEQWRTECLTL >NC_015672.1|WP_013886737.1|1727384_1727696_+|hypothetical-protein MFNLGDLESFRELKKHYRLNDAEIYVVNVCLAYHCFDQLLTGDIEYLSKNKAKKRPIVIYQSEGNKAYFFPLSTNQNTFRDKDILFDYSKCSIQSTCNDSINL >NC_015672.1|WP_013886736.1|1725509_1727267_-|DNA-primase MPQSNDLGYQKSYEEYLKTAEEAENQGDIQAMLKNLNLALQHTDNKKPIFEKLLEYHLNDTNPTRALKILKSLIEIEPKNAGYYKQAVNILLEIDNAESAEKLARYAFKQTNNSYFKNIFEDKNQNYLMQKQFSNTTLTMLFSLFNGREGVYARQWKSPEGKTGYIPVYEPLSEKVIRNHLNGNITIGIYQHRLDSTINWICIDVDIAKFALKQALSDDEKWKELDIATQNTAKSIADECSKFNIPVYIEHSGYKGRHCWIFLVKPLPARLAKRFGEHIKLNIPSKIPEVAIEVFPKQNFVKTNGVGNLVKMPLGIHLANGRRSCFLDSKGREITDVDNYLKNIQKASESEILDYLNYYRLSSIYENTGTKQMAPSEKMEIPVHTTQYNIDSDKEFQYLIYKCPVIKEIFNNAICKNELSYDEMIVLTHTVGHLENGVEAVNSIFAKCFNIQQEKFLKSKLKGNPVSCAKIRSRVPNITSKMDCNCQFVYAEGLYPTPVLHLQEQDIPSKIPRGLDINSVNFQNALEDYIKLKKQTYETKLIMKEYEEKFEKLFKNSGVDTFSTAIGKFRRVVDENGKVTYKLDV >NC_015672.1|WP_013886735.1|1724502_1725513_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MIVYITEQGAYITIAGERLVIRKNGNIVGTFLSKDLDQIVIMGNISITTQAMKHMLKNKIDTVFTTYSGKYLGRLVAELGKNIVLRRMQFETLSDENIKLSLARSIIGSKVKNCIQTLRKFNYYHKSGEVSKILNQLTASLKEIDKIDNISSLLGFEGRTANLYFRAFDHLLKGPIFFEKRTRRPPQNEFNAMLSFGYTILLNLVRTSVNTVGLDPYYGAYHAEEYGRPSLVLDLMEEFRPVAVDFPVISSVNKNIMQKSDFVWNTDGDPDKLPVQLTVFGRKKFISLLEKRFNQKFWHDTKMRNMSLRDIIRYQCYLFSKSLVDKVEYKGFRVSL >NC_015672.1|WP_013886734.1|1724224_1724506_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MKKHYVICYDISDDRKRNKIDQLLKNKGMRVQKSVFECIITEAEFLKLKDRLVKYIDFDTDSIRYYFLCKHCVEMIETAGNTPTHEEKDLTII >NC_015672.1|WP_013886741.1|1736262_1736760_-|DUF1998-domain-containing-protein MELAKFNGERKQKHKELHSEKFCKKELLLAPINLAHIFETDVVIFRFQKLLIDNKSKAVARTLAESARFAAVNLLDLINNEIRATFKIKEDSLDIVLFDSVAGGAGYVSKLFDMDINNFLNSIKKQLSCHEKCNTGCRNCLCDYTNQSFWDIFERKSALEWINMF >NC_015672.1|WP_083816882.1|1736969_1737500_+|HD-domain-containing-protein MRNLNNKLFGKFLRYPCSVKSHDSRKHGLFHHTFKLLKQISNLNDVGNKTKDLCLVGAVFHDIGKIKSLHNYVEKSKNIYSYDFLIGHKQNSIEIFDDLSSRINNFPSIYHRLIKNIIIWTHNVDYDVPGTLPGKIISILDNTDAAISSLIEKDKKISVGRFSKLPYQKNYYYKAI >NC_015672.1|WP_013886742.1|1738279_1738426_+|hypothetical-protein MKKYQKLYNLKYSDLSKVWGLSEGTLRNWKSSGVFKQGRDYVGRGKNN >NC_015672.1|WP_013886743.1|1738504_1739554_+|tyrosine-type-recombinase/integrase MSKKDVKLYKDRNYFLVAFYYNGVRVRERLNLKSSGRKDAEKWAERRRSDIEAKLLENSFEYAKEFPNSKNLRRFGIISHESKNKTFSEVCEEIDEINDLYYKKGIIKRSTVKNYKKNTNILKKWLGEKYVKNISPADIKQFKLEYLESVSVKTVNNKLTSLRNIIRFCAESGYIENDFADSIKNLKTNNAEVDVVENVFTEEEVAAILNHIYKYHRYAYAFYYVGFHTGMRIGELLAMKWSNIDWHSKTYFVQETMTEYTLSRPKTESSIRNVSLFDDVLSVLDYHKKHFGKKSKFIFVNQYGNNYISNNAFTDIVWKPTLEELGLRYRIPSICVTLMQPMRSSTEKI >NC_015672.1|WP_041262577.1|1740127_1740520_+|YjbQ-family-protein MEVGFSVADITGKISDFVEKSGFKEGTVNVFAKGSTASVTTTEYEPGTVKDLRQLFHQLAPAGKYYEHHKTWNDGNGHSHLQASILGPSITLPVQNGNILTGTWQQIILINHDVRERKRTVVLTAIGNFY >NC_015672.1|WP_013886748.1|1744576_1744837_-|type-II-toxin-antitoxin-system-RelE/ParE-family-toxin MYDLEFSENAKKFIKKLPANDKKKIKSKLETLAKDPDKLKNNIKKLKGEYGDFFRLRISNYRLIYKRYDKRLVIYILKAGHRKDVY >NC_015672.1|WP_013886749.1|1744829_1745030_-|hypothetical-protein MEAPNLTYIVDEKQKKKAVVIPIEEWQAILEELQDYYDVKEATEILKRIEAGTEKTYSMDEVFNDV >NC_015672.1|WP_013886750.1|1745166_1746318_-|site-specific-integrase MAVYNRCNNCKSLNKPTNKNCKNCNEKLGKHFYITYKISGKSRLEYAGNRLTDARNLDIQRKTEKMQGKLKLPDKKQNVPFWKDIVENEYLPDARDRLRSFKATKSRYEEVRDFKGFQKPIDQLTIQDLDSYLDWQRKYTDRTASTINRNLTVARSIMSFICERKKDIVPNNPWRDFKLLKEHNKERRSLSINEMQDLLDACKGKNYYIYAVVLIACWTGARRGEILNLRWRDVNDFAETLTLRHTKNGKDRTIPYSHFKNELLPELEKIKEITGNYEYVFTNPDTGTKLTDIKRAYRSALKEAGITDADFHCLRHTAISNMSHAGFSDIQISYISGHEDIQVIKRYSHSNISQKTEMMNDFRQFIDSQKGKKKVVDITEKAK >NC_015672.1|WP_013886751.1|1746599_1747556_+|4-hydroxythreonine-4-phosphate-dehydrogenase-PdxA MKKTKIVITLGDPAGIGPEITAKLLSHTWITDNYHIIISGNRHLLLKWIKKIPSNIDILEEDKFSGFNFPTGVTDKFAGEASILYIKNAVELIQNGEAEALCTCPINKKSIQMAGYDYKGHTDLLAELTNSHDYSMMLMCEYMKVVLATTHIPLREVPDNIKPDKLLKTIKNTHNAGRLFGTPEPKIAVSGLNPHSGDEGVIGFEEQKIIDPVIGEAENLGINIEGPFAADSLFTEKNLNRYDFFIAMYHDQGLIPLKMKCFSEAVNVTLNLPIIRTSVDHGTAYDIAGKNIASENSLIQAVKTADKMVRNAKANKNI >NC_015672.1|WP_013886752.1|1747530_1748337_+|ribosomal-RNA-small-subunit-methyltransferase-A MLKLTKIFRDEFGHTDKNFGQHFLVNDHYLNEIVESLEISDEKNIVEIGPGCGALTLKFLEKGAHVTAVEIDKKLVDFLERYLFFYNNLEIIHDDFLNIDKYQLPPQFSFAGNLPYNLSTKILMKTTAFHERIDKMVFMFQKEVASRINAVPNTKDYSWISVISRYFFDIKKIRNIGGGNFWPKTKVNSTVLVFTPRKRHFQDSNREKKFLEMVKKSFVTKRKTLKNNLKNEIPDIENILEELFANKSIRAEQISLEGFIKLYERIYT |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_015672_3 | 3.1|1709372|49|NC_015672|PILER-CR | 1709372-1709420 | 49 | NC_015672.1 | 1428384-1428432 | 0 | 1.0 |
NC_015672_3 | 3.1|1709372|49|NC_015672|PILER-CR | 1709372-1709420 | 49 | NC_015672.1 | 1426648-1426696 | 1 | 0.98 |
1. spacer 3.1|1709372|49|NC_015672|PILER-CR matches to position: 1428384-1428432, mismatch: 0, identity: 1.0
acatttgcgcaatatctcatcgcaaatgtttctgttcagagcttgctgg CRISPR spacer acatttgcgcaatatctcatcgcaaatgtttctgttcagagcttgctgg Protospacer *************************************************
2. spacer 3.1|1709372|49|NC_015672|PILER-CR matches to position: 1426648-1426696, mismatch: 1, identity: 0.98
acatttgcgcaatatctcatcgcaaatgtttctgttcagagcttgctgg CRISPR spacer acatttgcgcaatatcccatcgcaaatgtttctgttcagagcttgctgg Protospacer ****************.********************************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_015672_1 | 1.30|1013411|36|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1013411-1013446 | 36 | MN693380 | Marine virus AFVG_25M72, complete genome | 41514-41549 | 6 | 0.833 |
NC_015672_7 | 7.6|1734706|38|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1734706-1734743 | 38 | NC_011412 | Clostridium perfringens plasmid pCP8533etx, complete sequence | 64601-64638 | 8 | 0.789 |
NC_015672_1 | 1.8|1011983|35|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1011983-1012017 | 35 | NZ_AP019741 | Acinetobacter radioresistens DSM 6976 = NBRC 102413 = CIP 103788 strain NBRC 102413 plasmid pARA1, complete sequence | 55619-55653 | 9 | 0.743 |
NC_015672_1 | 1.8|1011983|35|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1011983-1012017 | 35 | NZ_CP009218 | Rickettsiales bacterium Ac37b plasmid 1, complete sequence | 36470-36504 | 11 | 0.686 |
1. spacer 1.30|1013411|36|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN693380 (Marine virus AFVG_25M72, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
ttgctactgctgacatagttcctttaatgctcacta- CRISPR spacer ttgctactgctgatatcgttcctttaata-ttattag Protospacer *************.** ***********. *.*.**
2. spacer 7.6|1734706|38|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_011412 (Clostridium perfringens plasmid pCP8533etx, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.789
--taatcaagaaataaaaaaggaggaaaaaaatgttttta CRISPR spacer ggtactta--aaataaaataggaggaaataaatgtttatg Protospacer ** *.* ******** ********* ******** *.
3. spacer 1.8|1011983|35|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_AP019741 (Acinetobacter radioresistens DSM 6976 = NBRC 102413 = CIP 103788 strain NBRC 102413 plasmid pARA1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
cacttg---agatatttgaatattatttttattagaag CRISPR spacer ---ttaaatagatatttgaatggtatttttattaatat Protospacer **. ************. ***********. *
4. spacer 1.8|1011983|35|NC_015672|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP009218 (Rickettsiales bacterium Ac37b plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
cacttgagatatttgaatattatttttattagaag CRISPR spacer taaagcagatattttagtattatttttattaatca Protospacer .* ******** *.**************. .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
137532 : 181651
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_015672|137532:181651|DBSCAN-SWA 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36 | Burkholderia_phage(14.29%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
314982 : 365515
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_015672|314982:365515|DBSCAN-SWA 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49 | Planktothrix_phage(12.5%) | tRNA,transposase,integrase | attL 316672:316731|attR 352465:352527 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
574600 : 632824
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_015672|574600:632824|DBSCAN-SWA 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59 | Burkholderia_phage(30.0%) | transposase,tRNA,integrase | attL 602523:602540|attR 636512:636529 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
693978 : 747665
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_015672|693978:747665|DBSCAN-SWA 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46 | Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus(20.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
753901 : 823284
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_015672|753901:823284|DBSCAN-SWA 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49 | Burkholderia_phage(27.27%) | holin,transposase,integrase | attL 746503:746562|attR 809832:811168 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
835023 : 892328
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_015672|835023:892328|DBSCAN-SWA 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52 | Enterobacteria_phage(16.67%) | protease,transposase,tRNA,integrase | attL 852305:852364|attR 884531:884590 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1332400 : 1403286
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_015672|1332400:1403286|DBSCAN-SWA 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60 | Planktothrix_phage(25.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1479959 : 1488827
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_015672|1479959:1488827|DBSCAN-SWA AATGAAGATTGCAGAAATAACTGAGTTATCAAAATTTTATAAAAAAGAAAAAGCGATAAACAGTATTTCTTTTTCCGTAGAAGAAAACTCTCTCTTCTGTATGGTGGGTGCCGACGGAGCAGGAAAATCCACTACTTTAAAAATCCTTGCAGGTATTCTCAATTTTGAAAAAGGCAGTGTAAAAGTGTTTGGAGAAGATTTCAGAAACAAACGCAAAGCTGAAAAATTCAGAGACAAAATAGCTTTTATGCCCCAGGGGCTAGGGCAAAATCTGTACCACAACCTCTCTGTGGAAGAAAATATCGATTTCTTTGCAAATCTGCACGGACTGCGGAGAAAAGAAATAGCGGATAGAAAGAATAAGCTTTTGAAGATAACCGGCCTTGAAAAATTTACAGAGAGACAGACCTCCAAACTTTCCGGCGGAATGAAACAAAAGCTGGGAATTTGCTGTTCCCTAATTCATCTGCCAAGACTCATAATACTTGATGAGCCCACAACAGGGGTGGATCCTATATCACGAAGAGAGCTTTATGGGCTTCTTAACGAATTCATTGAGAACGAAGGGTTAACCGTTATCGTGTCCACTGCCTATATTGATGAAGCCGAGCGCGGTTCAAAAATAGCGGTAATGCACGAAGGTGAAATTATTTTTCTGGGGAGTCATGATGATTTTTTAAAGAAAGCTCCAAACGTTTATAGTTATTCTCAAAACGATTTTCTGCAAAAATACAGCAGCCTTGAAAGTGATAAATATGATTTCATCAAATTGGGAAAAAACAGCTTCTACTACAGTCCTAAAACAAAAAACGGCCTAATAGAAAACTCTAACCGAAAAAATGCCGAACTGGAAGATACTATACTCAGCACAATAGGAAGCAGAAAACTGAATTTCTCATTTTCATCTTCAGAACCGACTAAAGATAAAAAACAGATATGCAACATTGAAAATATAAGCAAACGCTTCGGGGATTTTTATGCCCTGAAAAACATTACTATGTCAGTACGAAAAGCTGAAATTTTTGGTCTGCTGGGCCCTAACGGTGCAGGTAAAACCACACTGATCAAAATAATACTAGGACTGCTGAATCCAACAGAAGGAACATTTCAAATCAATGCTCCAAATTCAAATATTAAGGAAAATATAGGTTATATGTCCCAGAAATTTTCACTTTACGGAGATCTTACAGTTTATGAAAACATCTATCTGGCGGGATCCATCCGAAAAATACCTTATGACAAGCTGAATAAAAAAATAGATAATCTGATGGAGCTGGGTAATCTCTATAATTATTCAGGTGAAATTGTGGATAAACTTCCCCTCGGTATCAAGCAGCGGCTGGCTCTCATGACATCAATTATACATGATCCTGTTATAATATTTCTTGATGAGCCTACTTCAGGTGTGGATCCTTCTGAAAGGGACACATTCTGGCAGCTTATCAGATACCTTTCCTATGAAAAAAATACCACCGCGATAGTAACTACACACTTTACCGAAGAATCTGAATATTGTGATAAGATCAGTTTGATGAGCGGAGGCAGAATAGCCGGAATGGGTTCTCCGGAATCGCTTAAGCAGAAAACGGAAAAGATTGCCGGAAAACCATATGAAATAAACACAGCAACCCCTTTTGAGACGGCGGAACACTTAAAAAAATTAAACGTAAAAACGGACATTTTCGGAAGTAAAGTCAAATTTTTCATAAAAGACAGATCCTTACTCCCCAAAATAAATTATAATTACAAAAAGGGAGAAATCACAATGGATGATGTTTTTGTGAGTATAACGCAAAATGAATATTAACAAGATGGCGGCGGTGTACATCAAAGAACTTAAAGAGCTGCGAAGGGACAAAATTTCCCGGATAATGGTATTTTTCATGCCAATCACCATTCTCATAGTTTTCGGTTACGGCATGGCCATGGATGTGGAAAATATCCCCTTTTCAGTGCTTGATCATGATAAAAGTGTATTGAGCAGGGAATTTGTATCCAAATTTTCACAAAACGAGCGGTATTATTCATTTAAGGGTTACGTTTCATCCCAAAATGAGGGCATCGAACTAATAGACAAAAGCAGGATCAGAACGCTGATCGTAATCCCTGAAAATTTTTCCGATAACTTAAAACAAAACCGGAGTGTGAATATTCAAATTATGGAGGACGGGGTCTTTCCCTACAGGGCTTCCGTATCCGCAAGTTATGCAGAAGCCATTGTATCTGATTTTAATCTGGAAGTTCTGGAAAATAAAGGGATGCAATATTCTCCCCTCAATCTGAAAGTCAGATACTGGTTCAACGAAGAGATGAAGCAGAAGTATGTGACAACTTCCGGTGTACTGGCAATCGCCCTGTTTCTCGGCTCTGCCATGATTTCATCACAGCTCATTGTAAAAGAAAAGGAATCAGGCTCCATTTATAACATTTACACATCTTCCATTTCAAAGCTGGAGTTTATTTTAAGCAAACAGATGTTCAGTTTTACTATTTTCGTAATAAATTATTTTATCCTATTTTTACTCATCATATTACTGTTTCAGGTTCCGTTTAAAGGTAATTTTCTCCTTTTCACACTTTCGTCGATGATCTATATACTCGTCTCAACTGCTTTGGGAATACTGATATCCACTTTTGTAAACACACAGGTTACCGCAGTCGTAGGAACAGCTATTATATGCATTATTCCGGCTTTTCTATATTCAGGCTACATCGCACCTGTCAGCTCAATGACAAACGAGGCATACGTTGTGGCTCATCTTTTTCCCACATATTACTACCTTAATATTGTCAAAATGTTCTTTTTAAAAGGCGTAAATATGAAACTTTTTATAAATCACTCGATTATACTTATTATATTTTATTTTGTGCTCATTGCGTGCTGTGTACTTAGGTTCAGGAAGTATGAAAAATGAGACTGCTTGTACTTATTTATAAAGAGCTTTTACAGTTCGTCAGAAATAAAGGTCTTTTTATCTTTGTGATTTATCTTTTCACTGCAGACCTCTATATCGCTGCAAACGGTATCGATTTAACACTTAAAAATGCTAAATTTTATGTAGTTGATGAAGATATGACTGTAATATCCCGCCAAATGATATCTGAATTCACAAAACCCTGGTTCAACTTCCAGGGATATTTACAGAATAAAAATAAAATGGAAAACCTGCTTATGCGTGATATGGCAGTGGGTGTTATTATTATTCCGGAAGAGTTCAGCAAAAACATCAAATCTGGAAAAACGCCCGAAATTGCAATGTTTATAAACGGTACAGAAAGTACTTCCGGCTATCTTTTCAGCGGCTACTCAACAAGAATCATAAACAATTTCGTAATTAATTATGCAGGAAAAACTGATTCAGCGAGAGATCCACCTGTCATAAACGTAAGAGAGAGGGTCTTATATAACCCAAACGCCGACAGCAGAATATTTATGACAATCACCGAACTTTTTTCTGTGATTACACTTCTGGCTTTAATACTCCCTGCTTCGGCAATCACCAGGGAAAAGGAAAACGGCAATATCGAAATGATTATCATCTCCCCTTTGAAAATGCAGGAATTTCTTCTATCAAAAATTATTGCAATGAGCCTTATCACCATAGCGGGTACAACGGCAGCCACATACCTTGTAATTGAGGGCATTCTTGATGTTTCTTTTGAGGGGAGCTTTATACTTTTTCTGCTGCTCACTATTTTTTATGTATTTACGGCTTCGGGCATATCCATGCTTATCTCATCCATATCAAAGAATATGCTTCAGGTTTCCCAAATTACCATAATGGTGCTCCTGCCTATGCTCTTTCTGTCCGGCTCCTGGACACCTTATGAAAGCATGCCTGCTGTTTTTCAGAAACTCACTTATATTTCCCCGCTGAAATATTATTTAGAAGGATCTTTTGATGTAATTTTAAAAGGGTTAGGCTTCAGTTATATTTTTACAGATTTTATCGGGATAATTGTGCTGGGTATTCCCACTTTCATAGTCGGAGCATATTTTCTGGTGAAAAGGATATAAAAGTATAAGATACTTCGAAATACTGAAAGATATCATTAGTGCTATACCTTTTATCAATTAAACACTCATAAATATTGACTATGTAGTAATTATGTGAAATATTCCACTATGTTAATAAAAATATACAAAACAATTCTTTATTCATTTATAATTTTTATTTTGACAATAAATATATGTTCGTTTTTAACGACTTTTAACCCGAAATCACTTATCAATCCATTTCACCTGAAATCCCGCACAATCAGTTGCTATCTGCTAAGTAAACATATCATTTTCAAATCAGGGATTTTTCTCAACAAAGCCTCAAAAAATGAAATCATATCATTAATAGACAAATATTCTAAAAAGTACAATGTAGACCCTGATCTTATAAAAATAATGGTGGAAGTAGAGTCGGAATACAATCAATTTGCAATCTCACGCACCGGTGCAATGGGATTGATGCAGATCATGCCGGCTACATTTAACGATATGAAGCATACAGATCCTTTTGATGCCGAACGAAATATTTCTGCAGGTATAAAATATTTTTCAATACAAAAAAGGACTTTCAAGAAGCTGGAACTGGCACTCTCAGCATATAATGCGGGGCCTTCTCATGTTTACAAAAATCACACTGTGCCAAATTTTATAGAAACAAAAAGTTATGTTTCTGAAATCATGTCTAAATACAGGAAGTTAAAAGCTATTGACTCTGATTGATTTCCTTTTGAATATTAAAAAGATCCCCAACAGTATCAAAGTTCTTATTTGCCTGGTAGATAATCTTATTGAAAACCTCGGCTGTCGCCAGAGCATCACCGAGAGCCGTATGCCTGCCTGTACAGACAACATTGTAAACATCAAACAGATAATCAAGACTTACGTGGGTATCTTTTCTTACAATGGCATTTGAATAGAGAAGCATAGTGTCGATTGTATAATTTTCCAGTTTGCAACCGAAAAATTCCCCAAGCTCCTTATTTATCATTTTTACGTCAAAACCGATATGATGACCTACAATAGGGTTATCAGAGACAAACTTCAGAAACTCCGGCATCACCTCGATTGCTTTAGGCTTATCTTTTACCATATCATCGGTAATCCCGTGCCAATCTATTGAGGAAGGCGGAATCTTCATTTGTGGATTAATAAAAGCGTTATAAAAATCAACTATTTTAAAATTTTTAACTTTGACTGCAGCTATATTAATCACTCTTGCATTTGCTATTTCCAGACCTGTGGTTTCAGTATCCACCACGGAAAATTCGGCATTCTGAATGGGTTCGTCAAGGCTGCGGTTCTTTTTAACCATTTCACACAGTCTGAGAACGTATGAATTAACAGGATCAGTATTCTTATTATATATATTCTTTTTAAACAAAAATTTTTCTATCATAATATTGTAATTCAGCCACTTAAGTATTTGTGGATAATTATAGGAGAAGCGGAATATTTTTCAAGGAAAAACATTGTTTTATTGAAAGAAAAGCTATTATTTGCCTACATCAATACTCTCAGATGTTATCTTTTCGCATGCTCCCCATATTGATTCCAGATGATAAAACTCCCGGGATGCGGCAGTCATTATGTGAACAATTATCTCACCATAGTCCACACATATCCATTGGGAATTTTCTTTGCCTTCAACAGCTATATATGAAACTCCTTTCTTCTTCATCTCTTCAATCAGCGTTTCTGCAAGAGCCCTGGCGTGCACTTCAGAATTTGCGGTACAAATTAAAATATAGTCTGCCAGAGAAGATACTTCATTGATTTTAAAAGCAACGATATCCTCGCCCTTTTTATCATCGAGCAAGCCGATAATCTTTCTCAATAATTCTCGTTCTTCCATTATACCTCCATATACAAATCATTTTTTTCAATATATTCTGAAACCTCTTTGGGCAGAAAAAATTCAAAATTTTTCTCCTTTAAATTTTTTCTTATCTCAGTGCTGGATATATCTATTTCACTCATCGTATGCAGTACAATCCTTCCTGCTTTGCATCCTTCAAACGTATCTTTATGTCTAATTATTTTCAACAGTTCATCAGGAATTTCCATAAACATTTTACTAAAAGGCATCTCTTTTCTGTTTACCACGATAAAGTTTGCCAGGTCAAACAACTCTCTCCAGTTATTCCAGGTTTTTATTGTGGCAAAAATGTCACTTCCGGCTATAAAAAAAAGCTGGTCCTCCGGAAATCTGTTTCTGAAATACAGCAGGGTTTTATATGTGTAGGAGACACCTTTCTGGTTAATTTCATAATCTGAAACCTGAAAGTGTGAATCAAGGCTGCTCACGGCACTTTTTACCATGTTAAACCGGTCTTTTGCACCGGTTGAACCTAAATTTTTATGCGGCGGAATCTTTGAAGGGATAAAAATAAATTCATCCAGTCCGAATGATGAATATACATCCCTGGCTAATTTTATATGCCCTATATGAATTGGATTGAATGTCCCCCCGAAAAGACCGATTTTCTTCAAATATTACTCCTTAATATGTCCGTGTCCGTAAATCATATATTTTGATGTGGTGAGGTCGTAAGCTCCCATGGGTCCTCTGCAGTGCAGCTTCTGGGTACTGATTCCTATCTCAGCTCCCAGCCCGAATTCCGCGCCATCGGTAAACCGTGTTGAGGCATTTACATATACAGCCGATGCATCTATTGAATTCATAAAATCCATTGCTCTTGAATAGTCAGAGGTAACCACAGCTTCCGAATGCATGGAACCGTATTGATTAATATGATCGATCGCCTCCTGCATATTCTCAACACTTTTAACAGAAAGAATCAAATCAAGATATTCTGTACGCCAGTCTTCTTCGGATGCATGCTTCGTATTGTATATTTCAGCAATATCAGCAGAAGCTCTCACTTCCACCCCGGCTTTTTCATACTCAGGCATTAATTTGTCCAGAACTTCCCTGTATACCTTCTTATTCAGAAGAAGAGTCTCCATCGCATTGCAGACACCGGGTCTCTGAACTTTAGCATTATAAGCTATATCAACCGCCATATCGATATCTGCCGATTCATCAACGTAAACATGACATACACCTTTATCATGTTTAACAACAGGAATAAGGGAATGTTCTGTCACGTAGCTTATCAACCCTTCACCGCCTCTGGGTATGATTATATCGATATATTCTTTGGCTTTAAGCATTGAATGAAGTATACTGCGGTCAGGGTCATAAACGGTTTTTACGCACTCTGCCGGCAAACCAGCCTCTGAAAGCGCTTCACTGATAAGCCTGCCAAGCAAAGCATTACTGTAACGGGCTTCCTTGCCCCCTCTTAAAAAAGCACAGTTCCCTGATTTGATGCAAAGAGCAGCAGCATCAACCGTAACATTGGGTCTGGATTCATATATTATCCCCACTACCCCAAGAGGAACTCTAACTTTATGGATTAACAGTCCGTTTGGTCTTTTATACCCCTTTTCAACGGTCATGACAGGGTCATCCTGAGCAATTATTTCATTGACTCCTTCCACCATAGCATTCAGACGCTTTTCATTTATAACAAGCCTGTCCGTCAAAGCGGGAGAGAGTTTCATTTCCACTGCGTTATCCACATCTTTTTTGTTTTCAGTGAAAATCACTTCTTTGTTTTTCAGCAGTTTATCTGCAAGAATTTCAAGAGCCTTGTTTTTTTCAGCTGTATTTTTAGTCATCAAAATTTTGGATGCATTTTTCATCTTCATAAAATCTTCCACAGGCACCTCCTAAGTAATTTCAAGTACCATATCGTCTCTATGAATCACTTCATCGCTGAATTTGTAGCCGAGAATATCATAAATTTCAGAGGTTTTCCTGCCCATAATCTTTTTCAGATCAAAATGGGAGTAACGCACCTTACCTCTTCCAATTTCCTCTTCATTTTTATTTACAATTCTAACAACATCACCAATACCGAACTTACCGGAAACATCCACAATACCCGAAGGAAGCAGAGATTTTTTATTTATTCTGACAGCTCTTACAGCACCGTCATCAACCACTATATCACCTTTGGGAATAGTAGCATAGGCAAGCCATAATTTCTTTTTATTTTTGGGATCCTCAATATGTGAAAAAAAAGTTCCCGTTTCCTCTCCTCTTAAAAATTTCAAAACATTTTCTGTGGAGTTGCCATTGATTATTCCCACATAACATCCTGAATCCAAAGCCTTTTTAGCTGCTTTAATCTTGGACTTCATTCCGCCCGTACCTATACCCGAAACCGAGTCACCGGCGTAATTAAGCATCTCATTATTGACATATTTTACTTCGCTCACAAGTTTTGCATCAGCATATTTTGTAGGGTCTTTGTCAAAAAGCCCCTCCACATCAGATAAAATCAGAAGCATATCTGCCGAAATGAGACCGGCAACAAGGGCGGATAAATTATCATTGTCACCGAAACTTTCTATATATTTTAACTCGTCAACCACCACAGAGTCATTCTCATTTATTATCGGTATGCTTCCGTGCTCAAGCAATTTTCTTATTGTGTATCTTGCATTGAGGTAGCGTCTTCTGTTTGATAAGTCATCTTTGGTTAAAAGAATCTGGGCGACATTGATATTATTTTTACTGAATTCCTTTTCGTAAAGACGGATAAGCCTGGTTTGGCCAACCGCTGCGCATGCCTGTTTGTCAATTATATCTTCAGGTTTGGATTTGTATCCGAGACACCGAAAACCCGCAGCTACTGAGCCGGAAGAGACTATAACAACATTCTCTGCAAATTCTTTCACACGAGAAATTGTCCCGGATAATTCGGAAATAAAGGTCTGGTTTATGCCATTTATTTGGTCGGTTATAATATTGCTGCCGATCTTGATAACAATTGTTTTTATTATAGGAATTTTTCGCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_015672|1479959:1488827|1484661_1485354_-|WP_013886521.1|DBSCAN-SWA MIEKFLFKKNIYNKNTDPVNSYVLRLCEMVKKNRSLDEPIQNAEFSVVDTETTGLEIANARVINIAAVKVKNFKIVDFYNAFINPQMKIPPSSIDWHGITDDMVKDKPKAIEVMPEFLKFVSDNPIVGHHIGFDVKMINKELGEFFGCKLENYTIDTMLLYSNAIVRKDTHVSLDYLFDVYNVVCTGRHTALGDALATAEVFNKIIYQANKNFDTVGDLFNIQKEINQSQ >NC_015672|1479959:1488827|1485809_1486448_-|WP_013886523.1|DBSCAN-SWA MKKIGLFGGTFNPIHIGHIKLARDVYSSFGLDEFIFIPSKIPPHKNLGSTGAKDRFNMVKSAVSSLDSHFQVSDYEINQKGVSYTYKTLLYFRNRFPEDQLFFIAGSDIFATIKTWNNWRELFDLANFIVVNRKEMPFSKMFMEIPDELLKIIRHKDTFEGCKAGRIVLHTMSEIDISSTEIRKNLKEKNFEFFLPKEVSEYIEKNDLYMEV >NC_015672|1479959:1488827|1485450_1485810_-|WP_013886522.1|DBSCAN-SWA MEERELLRKIIGLLDDKKGEDIVAFKINEVSSLADYILICTANSEVHARALAETLIEEMKKKGVSYIAVEGKENSQWICVDYGEIIVHIMTAASREFYHLESIWGACEKITSESIDVGK >NC_015672|1479959:1488827|1479959_1481765_+|WP_013886517.1|DBSCAN-SWA MKIAEITELSKFYKKEKAINSISFSVEENSLFCMVGADGAGKSTTLKILAGILNFEKGSVKVFGEDFRNKRKAEKFRDKIAFMPQGLGQNLYHNLSVEENIDFFANLHGLRRKEIADRKNKLLKITGLEKFTERQTSKLSGGMKQKLGICCSLIHLPRLIILDEPTTGVDPISRRELYGLLNEFIENEGLTVIVSTAYIDEAERGSKIAVMHEGEIIFLGSHDDFLKKAPNVYSYSQNDFLQKYSSLESDKYDFIKLGKNSFYYSPKTKNGLIENSNRKNAELEDTILSTIGSRKLNFSFSSSEPTKDKKQICNIENISKRFGDFYALKNITMSVRKAEIFGLLGPNGAGKTTLIKIILGLLNPTEGTFQINAPNSNIKENIGYMSQKFSLYGDLTVYENIYLAGSIRKIPYDKLNKKIDNLMELGNLYNYSGEIVDKLPLGIKQRLALMTSIIHDPVIIFLDEPTSGVDPSERDTFWQLIRYLSYEKNTTAIVTTHFTEESEYCDKISLMSGGRIAGMGSPESLKQKTEKIAGKPYEINTATPFETAEHLKKLNVKTDIFGSKVKFFIKDRSLLPKINYNYKKGEITMDDVFVSITQNEY >NC_015672|1479959:1488827|1484084_1484678_+|WP_013886520.1|DBSCAN-SWA MLIKIYKTILYSFIIFILTINICSFLTTFNPKSLINPFHLKSRTISCYLLSKHIIFKSGIFLNKASKNEIISLIDKYSKKYNVDPDLIKIMVEVESEYNQFAISRTGAMGLMQIMPATFNDMKHTDPFDAERNISAGIKYFSIQKRTFKKLELALSAYNAGPSHVYKNHTVPNFIETKSYVSEIMSKYRKLKAIDSD >NC_015672|1479959:1488827|1486451_1487672_-|WP_041262551.1|DBSCAN-SWA MKMKNASKILMTKNTAEKNKALEILADKLLKNKEVIFTENKKDVDNAVEMKLSPALTDRLVINEKRLNAMVEGVNEIIAQDDPVMTVEKGYKRPNGLLIHKVRVPLGVVGIIYESRPNVTVDAAALCIKSGNCAFLRGGKEARYSNALLGRLISEALSEAGLPAECVKTVYDPDRSILHSMLKAKEYIDIIIPRGGEGLISYVTEHSLIPVVKHDKGVCHVYVDESADIDMAVDIAYNAKVQRPGVCNAMETLLLNKKVYREVLDKLMPEYEKAGVEVRASADIAEIYNTKHASEEDWRTEYLDLILSVKSVENMQEAIDHINQYGSMHSEAVVTSDYSRAMDFMNSIDASAVYVNASTRFTDGAEFGLGAEIGISTQKLHCRGPMGAYDLTTSKYMIYGHGHIKE >NC_015672|1479959:1488827|1482869_1483976_+|WP_013886519.1|DBSCAN-SWA MRLLVLIYKELLQFVRNKGLFIFVIYLFTADLYIAANGIDLTLKNAKFYVVDEDMTVISRQMISEFTKPWFNFQGYLQNKNKMENLLMRDMAVGVIIIPEEFSKNIKSGKTPEIAMFINGTESTSGYLFSGYSTRIINNFVINYAGKTDSARDPPVINVRERVLYNPNADSRIFMTITELFSVITLLALILPASAITREKENGNIEMIIISPLKMQEFLLSKIIAMSLITIAGTTAATYLVIEGILDVSFEGSFILFLLLTIFYVFTASGISMLISSISKNMLQVSQITIMVLLPMLFLSGSWTPYESMPAVFQKLTYISPLKYYLEGSFDVILKGLGFSYIFTDFIGIIVLGIPTFIVGAYFLVKRI >NC_015672|1479959:1488827|1487693_1488827_-|WP_013886525.1|DBSCAN-SWA MRKIPIIKTIVIKIGSNIITDQINGINQTFISELSGTISRVKEFAENVVIVSSGSVAAGFRCLGYKSKPEDIIDKQACAAVGQTRLIRLYEKEFSKNNINVAQILLTKDDLSNRRRYLNARYTIRKLLEHGSIPIINENDSVVVDELKYIESFGDNDNLSALVAGLISADMLLILSDVEGLFDKDPTKYADAKLVSEVKYVNNEMLNYAGDSVSGIGTGGMKSKIKAAKKALDSGCYVGIINGNSTENVLKFLRGEETGTFFSHIEDPKNKKKLWLAYATIPKGDIVVDDGAVRAVRINKKSLLPSGIVDVSGKFGIGDVVRIVNKNEEEIGRGKVRYSHFDLKKIMGRKTSEIYDILGYKFSDEVIHRDDMVLEIT >NC_015672|1479959:1488827|1481754_1482873_+|WP_013886518.1|DBSCAN-SWA MNINKMAAVYIKELKELRRDKISRIMVFFMPITILIVFGYGMAMDVENIPFSVLDHDKSVLSREFVSKFSQNERYYSFKGYVSSQNEGIELIDKSRIRTLIVIPENFSDNLKQNRSVNIQIMEDGVFPYRASVSASYAEAIVSDFNLEVLENKGMQYSPLNLKVRYWFNEEMKQKYVTTSGVLAIALFLGSAMISSQLIVKEKESGSIYNIYTSSISKLEFILSKQMFSFTIFVINYFILFLLIILLFQVPFKGNFLLFTLSSMIYILVSTALGILISTFVNTQVTAVVGTAIICIIPAFLYSGYIAPVSSMTNEAYVVAHLFPTYYYLNIVKMFFLKGVNMKLFINHSIILIIFYFVLIACCVLRFRKYEK |
9 | Streptococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1683055 : 1746318
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_015672|1683055:1746318|DBSCAN-SWA AATGATTGAATCTCCTGTATTTGCCGTAATGTTCACTTTCGGGGTTTATTTTTTATCTTCAAAATTATATTCAAAATTTAATTTTTTTCTTTTTAATCCTATCCTGTTGTCAATTGTTTCCATTATTGTTTTCCTTAAAATTTTTAACATAGACTATAATACTTATTTTGCAGGAGCTAAAATAATAAGTTTTTTTCTGCCGGTATCTGTGGTAGCCCTGGGTGTCCCTCTTTACCTACAGCTGGGTGAAATAAAAAAGCGCGGTTTCTCGATAATACTGTCCACCATAATCGGAAGTATTGTAGGCATACTATCAGCGGCGCTTACCGCAAAATATATGGGTGCATCCAGGGAAATAGTTGCAAGTATAGCCCCCAAGTCCGTCACCACACCGATAGCCATGTCGATTTCTGATAAAATTGGGGGAATACCGCCGTTGACGGCAGCTTTAGTCATTTGTACAGGAATTTTCGGTGCAATACTGGGGCCTGCAATTTTAAATCTGTTCAAAATAAAAGACAAAGTTGCATTCGGGCTGGCAATGGGGTCCGCTTCCCATGGGATAGGAACGGCAAGAGCAGCAGAAGAAGGTCAGCTTGAAGGTGCTGTGTCAGGTCTGGCTATATCCCTCAACGGAGTAGCTACTGCAATTCTTACGCCAATCTTGTTTAAACTGATCTATCTGATCCTATGATTGATATAGTAGATATTCTCATAAAAAAATATGATTTGAGCGGCAGACAGGCCAAAAAACTTATAAAAAAAGGATGTGTGCTGCTTAATGATAAGCCTGTAAACTCAAGATATATAGAAAAAAGCGGAACGGATAAAATTACAGTCAACCTAAAAAGACCGGAAATCATATACGATACCCATGATTTCTTTATTAAACAAACCCCGCATGTCCTTTTCCTCTACAAACCTCCGTTTATGCATACAGAAAGGATAACCCCTTTTGACCCTTTAACACTGCAGGATATTGTACAAAACGAATTTCCAGGTTACAAGCTGATTTCAAGACTGGATTTTGAGACAGACGGAGTTGTTGCAGCAATCAGGGATTTACCGGAATATTCTACAAAAAAACAGTATCTCGCTTTCATTTGCGGAAAACTTAGGGAAAACATAAAGCTTTCAAATGAAATAGACGCATCTCATCGAAAAAAGGTAAAAGTTTTAAACAAGCAGGGAAATAATACAACAATTTTAAGCCCGATAAAGCAGTTCAAGGATAATTCCGGAGATGAGGTCACACTGATCGGCGTTTCACTAAATTATGCTGTAAGACATCAAATCAGAGCCCTTTGCGCCCATATCGGCATGCCTATTGTAGGTGATACTTTATACGGTTTCAAAGATTACAAACGAATGCTTCTTCACTGCAAATACACGAAAATTGTCTCCCCACTGCTTAATGAAAAGGAAATTCAGACTTTCAGCCCCAAGTGGCAGAGTTTTGTAAAATCTTTCGATTAAAGATTTTTTATGTTATAATTCATTCAAAAGGAGGAAATATGAAAGTTGCTGTTATCGGAGGAATTGCCGCCGGATTGTCCGCTGCAAGCAGGGTAAAAAAAGAGAACAAAAACGCCGAAGTTGTTGTGTTTGAAAAAAGAGGTGACCTCTCCTATGGGGCATGTGGTATGCCCTATAATCTAACAATGGAAAATAGCCCTCCGGAAAGTCTTTACGCTCTTGATTATCAAACCATAACCCAAAAAAGGGGTATTGATTACAGACTGTATACCCAGGTTAATGAAATACTGCCTGAGAAAAACAAGCTTAAAGTATATGATTTCAACAATAACGAAAGATACGATTACCATTACGATTATCTCGTTTGTGCAACCGGTGCAATATACAACAGGCTTGATTTCGAAGGATTTGACGAAAGGGTTTTCTATTTTAAAAATCTTAATCATCTGCGAAATCTGAAAAACTTTCTCTATAAAAATAAACCGAAAAAGGCATGTTTGGTTGGTGCCGGCTATATTAATCTGGAACTGGCTGAAAACCTTGTTAACCTCGGTATTGATGTTACTATAATCGAAAAGTCAGACAGGCTGCTGCCTTTTTTACCCGTGGAACAGCAGCAATTTGCTCTCTCACACCTTGAGTCAAAAGGGGTAAAAGTGTTTCTAAACACAGATATAATTTCAAAACAGGGCAATCTGTTTAACACTTCCAAAGGAACTTTTGAATGTGACTTTGTTGTTGTGGCAATAGGAGTAAAACCTAATACCGAAATTTTTCATGGCTCGGGCATTACCCTTGGTATAAAAAATGCTGTAAAAGTAAACCACAATCTGCAGACTAACATCGAAAACATCTTTGCAGCAGGCGATTGCGCAGAACATTATGTTCCGCTTTTGAAAGACTGGACATATATGCCTCTGGGAACAACAGCGAATAAAATGGGAAGAATTTCAGGTTACAATATTGCCAACATAAATAATATGGAAACCTTTTACGGAATAAACCAGTCAGCGGCATTCAGGATATTTGATATTTCCGTAGCAACAACCGGCCTGAACGAAAAGCAATTAAGTGATTACAAGTTCAACTATAAAAAAACCGAAATAAGTATCCCGGACAGACCTGAATATATAGGGGGCGATACACAGAAAATATGTTTACTGTACGACAGCAAAACGGGACAAATATACGGCGCTCAGATAACGGGACACGGAACGGTTGCAAAAAGAATTGATATTTTATCAACAGCCATACATGCAGGAATGACTGTTGAAGATTTTTCCCATACAGATCTTACATATGCTCCGCCTTTTGCAAATGTATGGGACAGTCTTCTGGTGGCAGCAAATGTAGCATTAAAAAATTTATAATAAAAGGAGGATAAAATGTACAAAACAGAAAAAATATTGGTTCCCACTGATTTTTCAGAGTTCTCCGATAAAGCTTTGAAGAAGGCTGTCGATATCGCTGAAACGTTTAATTCCGAAATTTTTCTTCTTCATGTAATCCCCGATGAAGTGGGAATATCCATGGCTTATTTGGATAACGAAACCCAAAAAGAACTTAATGAAAGAATGAAAAAAGAAAGTATGAATGAGATGAAAAAGCAGGCAGAAAAAATTCTTAAAGGAAAGAACTTAAAAATAAATTATACCGTTAAAAAAGGTGTACCATATCATGAAATTTTAAACTATGAAACCGAAGCCGGAACCGACCTTCTGGTCATTGCATCACACAGCAAATCTTTTATCGAGGAAGCTTTCTTCGGAAGTACAACTGAAAAAGTTGTAAGAAGATCAAAGTGTTCTGTATTTGTTGTAAGAGATTAATTGCAACATATGTAAGTTGCCTTACCTACATTTTTTAAGTGTAGGTAAGGTTTCATTTGATTTAGGCTGCCTGTTACAAATCTGAAAAATCCAGCGTTGCAAAATAATCTTCAATTGTTTCCGCTCTCCTTATCTGCTTTACGCTGCCGTCAGGCCTAATGAGGAGTTCGGCAGATCTGAGTTTACCGTTATAATTAAATCCCATTGCATGACCATGCGCACCTGCGTCATGGATTACAATGATATCGCCGATATCAATTTTAGGCAGTTTACGGTCTATGGCAAACTTATCGTTATTTTCACACAAAGACCCCACTATATCGTATGTATGATCATGAGGTTTATTTTCTTTGCCCAAGACGGTTACATGATGATATGCCTGATACATGCCGGGCCTCATCAGATTAGCCATACTTGCATCAAGTCCTATGTAATTTTTATAGATTTCTTTTTTATGAATAGCTCTCGCTACAAGATATCCATACGGACCGGTTATCATTCTGCCGTTTTCCATATAAAGTTTCAACGGATCCAGTTCAGAACCTTTTATCTTTTTATCAAATATTTTCTTCACTTCACCAGCAACATATTCGAGATCAACCGGCTCTTGATCAGGCTGATACGGAATACCTATTCCGCCTCCCATATTGATAAATTCAAAATTTATTCCCAGCTTACTGTGGATTTCGATAACCAAGTCCACCAGCATATTAACGGTCTCAACAAAGTAATCGGCATTAAGTTCATTTGAAGCCACCATTGTATGAATACCAAAACGTTTCACTCCTTTCTCTTTTATCATACGGTATCCTTCAAATAGCTGCTCTTTGGTAAAACCGTATTTAGCCTCCTCGGGATTGCCTATTATGGCATTCCCCTCTCTCAAAGGCCCTGGATTATATCTGAAACTCAGCAATTCCGGCAACCCCACCTGCTCTTCCAAATAATTGATGTGAGTTATATCATCAAGATTAATGATAGCGCCCAGCTCTTTGGCTTTACTGTATTCTTTTGCAGGTGTTTCATTTGAGGTAAACATAATATTTTCGCCGGTTATACCGGTTTTTTCAGATAAGATGAGCTCCGGAAGGGAGCTGCAGTCCGTGCCGAATCCTTCATCCTTCATTATTTTTAATATATGAGGATTGGGGGTGGCTTTTACGGCAAAATACTCCTTAAAATCGTCACCAAGCCAGCTGAAAGCTTTCTTCAGCCTGCGGGCATTTTCTCTGATTGCCTTCTCGTCATAAATATGAAACGGTGTGGGGTACTTTTCAGCAATCTTCTCTATTTTTTCTTTATTAAAAGGAACTTTCTTCTCAGACATAATTTTCCTCCAGATTATTTCAAATTGAAATCATTTTATAAATGCAAATACGCACATTTTCAACCAAAAATTAGGATATTGTATAATCGGCAATAAAAATCAGTGATAAAATATTGTTGAATTTACATGGAAAGAGATTTTTACTAATCAATACAAAAAAATATACTTTTAACTTACTGGGAATTATAACTTTTTAAAACAAAAAAGGCCCTTTCAAGGGCCCAATAATTTACTTAACTGCTTCTTTAAAATTCTTGCCGGGCGTAAACTTAGGAGTCTTTCCGGCTGGTATTTTTATTTCAGCACCTGTTTGAGGATTGCGTCCTTTCCTTGCCTGACGCTGTTTCTGTTCAAAGCTTCCGAAACCT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51 | Geobacillus_virus(14.29%) | transposase,lysis,integrase | attL 1740593:1740641|attR 1746476:1746524 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1771986 : 1829237
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_015672|1771986:1829237|DBSCAN-SWA 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59 | Bacillus_phage(33.33%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1835756 : 1882612
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NC_015672|1835756:1882612|DBSCAN-SWA 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39 | Tupanvirus(22.22%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
1972004 : 2090160
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NC_015672|1972004:2090160|DBSCAN-SWA 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110 | Bacillus_phage(12.5%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
2170080 : 2229680
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NC_015672|2170080:2229680|DBSCAN-SWA 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54 | Tupanvirus(37.5%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
2418338 : 2496145
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NC_015672|2418338:2496145|DBSCAN-SWA 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58 | Staphylococcus_phage(18.18%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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