Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_017171 | Acinetobacter baumannii MDR-ZJ06, complete genome | 0 crisprs | DEDDh,RT,csa3,cas3,WYL | 0 | 0 | 7 | 0 |
NC_017172 | Acinetobacter baumannii MDR-ZJ06 plasmid pMDR-ZJ06, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
255625 : 277375
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_017171|255625:277375|DBSCAN-SWA 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21 | Vibriophage(40.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1227344 : 1239691
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_017171|1227344:1239691|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_017171|1227344:1239691|1235270_1235459_+|WP_000703023.1|DBSCAN-SWA MKISDLMTYHGCKNRKELSEKTGYSTVTLWKWENNGIPARTQAVLQVKTKGKLKADLQALTA >NC_017171|1227344:1239691|1234184_1234400_-|WP_000370485.1|DBSCAN-SWA MDNSKRPINQIIARINDAAKHGEALVLTAEEVKILSKDIGDKVFIPVLTNEQVVQLVKEGKLGQKINNTKD >NC_017171|1227344:1239691|1231102_1231393_-|WP_000656405.1|DBSCAN-SWA MKDYNCPTCKKMIPVDRSKIKAGDEVSFCRVTQSSKSARFSSKEGIVDCREGDVVLVKYRKEIIPLNIKDVSPVDAPSPLTYAFVGACECKEAEHV >NC_017171|1227344:1239691|1232029_1232272_+|WP_000051960.1|DBSCAN-SWA MSLGEEMFEWRKQMVEKLLLQESNIDQLEEKVDRAEKILFGDCTAAFKIECTLRNAYALKAILDDFATKNNCKVSIVECE >NC_017171|1227344:1239691|1232620_1233124_-|WP_001129676.1|DBSCAN-SWA MAKRYLPFYNNARFIALVLVGLFAIFSIIFKYLELNITINLVQFSFVLLLPLSQIYLAYKGMLDALKLDGLNQSERDRLTSTVDIRSKSSLYVAMLFIILVFSMYILNLLGLLSAKHLLALILSVGLTSIFSFFLAWSDLREISLLEKTLKDRKESREAKAKVLSNK >NC_017171|1227344:1239691|1232278_1232482_-|WP_000845537.1|DBSCAN-SWA 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23 | Acinetobacter_phage(95.45%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1243645 : 1272319
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_017171|1243645:1272319|DBSCAN-SWA 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|
38 | Acinetobacter_phage(93.75%) | terminase,head,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2403184 : 2447973
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_017171|2403184:2447973|DBSCAN-SWA 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65 | Acinetobacter_phage(94.83%) | head,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2656133 : 2697825
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_017171|2656133:2697825|DBSCAN-SWA 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65 | Acinetobacter_phage(93.44%) | plate,head,integrase | attL 2656033:2656049|attR 2697828:2697844 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2800998 : 2815803
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_017171|2800998:2815803|DBSCAN-SWA 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10 | Acinetobacter_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2895079 : 2916654
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_017171|2895079:2916654|DBSCAN-SWA 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MADFADVASTLSEQDLDHALANIKHFDQVSNYECEDCGAEIPERRRALGNVKLCIDCQTAVESKSKHFRGGL >NC_017171|2895079:2916654|2914855_2915275_+|WP_000221866.1|DBSCAN-SWA MTYMQNGIVTEMRDGELIPVPLKAGAVVLVGTFALVDDTGFAVASTAAIAATQKVMGVWDSSADNTDGESGDVLACVRRKKQFLFRNSTTDAVTQAELGEDVFVEDNQTVAKTTGAGLPVAGKFMGFDTQFTDCVWVEI >NC_017171|2895079:2916654|2896970_2897243_-|WP_001043036.1|DBSCAN-SWA MNKSELIKHIASSASLTQAQATAALNAVESGISKALAAGDDVALIGFGTFSVKERAARTGRNPKTGEELKIAAAKVPSFKAGKALKEAVK >NC_017171|2895079:2916654|2906698_2907247_+|WP_000090429.1|DBSCAN-SWA MARESSIDLLSAEDKTWLDKRFMDQGFCGYEEIAKILQERGYNVSKSSVHRYGQKVEQKLAAVQASTQAAMMIADAAPDDSDMRSSAVLSLVQTELFNALIALQESENPDADPADRIMLMAKAGKGIAEIAKASVNQKKWESEVKERVQAAAKAVDKIAKKGGLSAETAAEIRKQILGIVDK >NC_017171|2895079:2916654|2913770_2914859_+|WP_001126667.1|DBSCAN-SWA MPKSILVASCSIDLNATSTHLVLVPEGTFNGVDGRPFDAPHWILTPERGEQIVAALNQRAVDMVIDYEHATLKAQETGEPAPASGWLKAASFSYIKGVGICSTNFKWLDKAKEHIEKEEYKYLSPVLFYTKNTGEVVGLHSVALTNTPNLDNLPEARLAALAQDYFTQNSTQDSEMEELLEQLRWMLNLPLSATAEEILAELNKLSAQIKEKTGVAVAANGQHLFDALAAIDQLKLAANSQDQVDMTQFVPMAVYQEAVANAGNAEAVQKAKEIDDLIMAACSDGRLTGQVTIAWMKEQAKTNPDFVKAHIESLPKIAALTQRQTEQVNLAANHQQQPVVDEIATSIATQLGLDPADLGANP >NC_017171|2895079:2916654|2904546_2905101_+|WP_000793084.1|DBSCAN-SWA MKNLITIAGFLLLAGCSTQKQPQSEPPYVKQNYSESDPAAKLSVSQFAGVVKSIYPAYQISHSNDGSEVKFLPNDVKADTKFMPNNNWYSIKIIKEPNTENWKGLIVEVFNKGSFGESKAVAAKDCQKIFGNIDNRVPAVLYDLENRLNQSPNASISNRQYGYTFHLDASHYNQGYPVTCMVSN >NC_017171|2895079:2916654|2910312_2911932_+|WP_000250505.1|DBSCAN-SWA MVQNPQIVFASIMAKKDRTSKKQDRTALETQQTAEVSWLSNQWQEHPVVGMTPYRLHQLLTEAEQGNLQAQADLFCDMEERDGHIFAEMDKRKKGVNKLAWGVKPPKNASTQEKKIAEEVQEWIDDIKNFEMFLFNAMDAVGHGYSCQEIQWKRLGNLWLPDSFEHVVPRNFMTPHNQLNCLRLNDGSPDGAEFWDFGWFNHLHQAKTGYISRSGLYRVLAFPFVFKNYAVRDVMEFLEIYGMPIRIGKYPSGATKEEKMTLQRAVMLIGRNAGGTIPNGMSIDFESAADGDTANHMNMIKYFEQIQSKVIVGGTLISQADGKSSTNAQSKTHEIQFETLIKSDAKQLARSITDNLIDYLMRLNYPNIPKDRYPEFYFDTSDVEDMEVFSNSLEKLVGVGMKIPLSWAHEKLGIPQPANDKEPVLGIVQQPSQLPNLALNTYQPNLLNNLIAANSAQLPVEEQALQLLLKEQSETAQTTAEDWTKQLLNKINAGNEEEVLALLQDVYPADDEPALQEKLTRLIFAAEVMGHLSVQTEQS >NC_017171|2895079:2916654|2900445_2902197_-|WP_000184215.1|transposase|DBSCAN-SWA MTNPNLAKQDYLREIAAKLAAAEFGGKAAIVKTACDFLSLSKPQLYRELEKVGFKSERKQRSDKGKTVVPTEVAEMVGGMVHVATRANGKKTLPMTTALEMLIADGKAPRVSAATVARVMKQNMCHPKQLATPSAHTQQKSLHPNHVWQVDASVCVLFYLPKGGMQVMDEKKFYKNKPANVKKIENDRVIRYVMTDHYSGSIYVEYVYGSESSENLIEIFLNAIQRRSAQEPMHGVPNILYTDKGCANTSGLFRNLLERLDVTFIPHATGNSQAKGQVENAQNIVETQFEGRLRFMQINNIQELNAQATAWRMYWNETKIHSRTKRSRNAVWQTIKPEQLRIAPPMELCRELISTVPVEKTVKANLTVSHAIQGYGSQDYDVRHVDGVYPKAKLQIVVNPYRAPCIDVLTKDQHGNEVIFTCEPMQVDWVGFGNDAAIIGEEIKAMPQSKIDESRKRILKKAYDAETLEQVDKAIAKKKPAYDGQLNAMADVAAVEVPTYIKRAGEQVTTTKQRRESAPISTVEAAKEIRGLIGDLWTTDHYKALKKSYPDGLVPADAVREIAEAIKAEQELPQQRPQLRVVG >NC_017171|2895079:2916654|2907243_2908806_+|WP_000209115.1|DBSCAN-SWA MTTLEASPINLLQPDFDSDVPAVLLPYQQEWIADKSPLKIGEKSRRIGLTWAEAADAALECASDRSAGGQNCYYLGYNKDMTVEFIQACAMWARAYGLAAEEVEEGIWEDGDKHIQTYIIRFPKSGFRIEALTSRPSNLRGRQGRVILDEASFHESLDELLKAALALLIWGGCVRVISTHDGEDNPFNELINEIRAGKRKGTVHRTTFRDAVNQGLYKRVCMRKGIAYNETEEALWVQEVYDFYGSAADEELDAIPSKGGGRWLPHSLLESKKDSTVPVIRFEAPKGWDDFSNVSEEARNAEVQEFFNEHLKPLIEALPKKLKSYYGLDFARKRNACSFWPLVEQQNTRKRIPFLFEMFKVPYKQQEEFLKLIVAILPNFSKGAHDAGGNGGYLAEAMQVIYGERIEAIMLTEAWYRENTPHFKASLEDGDIENMPADQDVIEDHRAFVMVNGVARIPAQGKSNSNNKDRHGDSAIAHLLADYASNHPSAPIEFIPLPSREEIETNPDDYDGWFSDVGCY >NC_017171|2895079:2916654|2903897_2904545_+|WP_000151898.1|DBSCAN-SWA MTIGARLKEERERLGYTQPVFAELAGTTKKSQIDYEKDLTQPKAGYLAAIAEVGADIGYIVTGNKSPKLQNSDFAYEFDLVNVYDVSVSAGDGAVCLGETEPTSRLAFRKDWLARHGLYAKDLVIVYAKGDSMEPTIHDKEPLLINTIDKELTDGFIYVVRNHENFWVKRVQRQFNELLLLSDNEKYLPMKLDLNESTDVEIIGRWIPPSRGTFY >NC_017171|2895079:2916654|2897437_2897941_-|WP_000101702.1|DBSCAN-SWA MARKSLKEPQLQSWEAVDQTLAQMADINRDIALEEAACNEQVDKLKEATKQRLKPLLERVKAYELQLKEFCDHRKNEFLQIKSKKLTHGSVGYRLSTSVTIPDPVFTCQMLKQLKLEHCIRTKTEPDKESIKQLTPELIAEIGATLKQRNNFGYEIETVDPAATAAH >NC_017171|2895079:2916654|2908799_2909174_-|WP_000539650.1|DBSCAN-SWA MGWEIPIFHFRVNGEPRVLAYLKPHASEAYTEELSYVYDLVNDELNEYFNDDEFTYNSNELRLFYLQRPAEAFILWHPDQVHNQEQIQFVYGVGIPNANRLTTIDIPEIPESFPHIFWDKTEDQ >NC_017171|2895079:2916654|2899158_2900436_-|WP_000810199.1|DBSCAN-SWA MKQKDCSTKLKDLILDNGIIQADLARYVQLSPSSINIIINCLRWPKKNTDFVKARFREFLVNAKISESEIDDAFNEMFDAPPQKTLLERLGSEAASERELDHVYRALVARHGNKQINELLNEDEQAMLLAKQSLTQQAKKHFGLFDNPFTNEVRAVEELFLNSDINYVRQALYQTAKHGGFIAISGESGSGKSTLRRDLLDRIRREKLPILIIEPYVIATEDNDIQGKTLKSSHIAEAIINTVSAGQEKPRMSAEARFRQVHMILKNSSEAGYSHLLVIEEAHSLPIATLKQLKRFFELEDGYKKLIGIVLIGQPELANKLSERNPAVREVVQRCESVTLEPLTNTSLVEYLQHRVKSVDKKLESIITEEGIQAVVDRLTQINSAGKTTRSLLYPLAIGNLITSSMNLAAEIGEDVITRDIVMGV >NC_017171|2895079:2916654|2895717_2895942_-|WP_001004234.1|DBSCAN-SWA MNELLNWATVLAYFAVFLMGLGSCFKEAKLAWTTRNKTGLTIFEKRSYKFKAGASITLAFLAIIGLFQAFQGTV >NC_017171|2895079:2916654|2913178_2913682_+|WP_000008346.1|DBSCAN-SWA MSFIQIKNDALVSRLGQAADRMGDTTPLSAAIANTFAAITEDNFDAGGRPKWAGLAPDRSQPSYLYQSGNLRRSITTQYTRDQAIIGTNVPYAPILHNGGQTRPHVIRPRNKQALSFNGKVFKQVNHPGSKFPARPFLPMDEHGFLQKEAEDAVLDDVDFYWHRSFE >NC_017171|2895079:2916654|2905187_2905688_+|WP_000361736.1|DBSCAN-SWA MDKTFQTALKRVLQHEGGYINHPSDPGGETNYGITKSVARQYGYKGSMKDIPMDIVEKIYKNQYWNAMSCDNFPFSVAFQLFDAAVNHGLLNARKLLQRAVGVKDDGIVGALTLAAVRKQPQFALISLFNSKRIEFYTKISTFNAFGKGWMARVALNLKYAAEDMS >NC_017171|2895079:2916654|2895079_2895517_-|WP_000671220.1|DBSCAN-SWA MKFNKKANLIKLIHVGKTKLGLDDELYRDILTSTTGKTSSKDLNLAQLETVLDRFKQLGFEVESKNKSGVKNLASDAQSKLIRHLWLQLHAAGQVRNKDEKALAKFVENKVGVSALQFMSSHHADMIITHLRQWCKRCGIERTEQ >NC_017171|2895079:2916654|2906378_2906690_+|WP_000006949.1|DBSCAN-SWA MSFDLQKIRREGMRWHLLNALDKARPLGALDTLLLDVMRALYADTTPQELHVQLDYLEERKLVEIKKQPDGHWHAKLDRLGIDIVEYTIDCQAGIARPEKYWN >NC_017171|2895079:2916654|2897940_2898612_-|WP_000857166.1|DBSCAN-SWA MKTRCPACGATNSLDALLGHGEASKAFVASLNLVGDLATPLVKYLGMFRSQNRELTFERTAKLLGEIAADINAQQIKRGHHSYPAPKAAWIWAINTMLERRDQGKLQLPLKNHGYLYEVISSFKPENAPVPTERRAAAPLAKTEAERAAEQAEHERQKHERPNTNFKEMMGFVQMNEKQPERGLKNIPKEQLMAHVVKHKQPDETLEQCYQRLKAAETQEQTN >NC_017171|2895079:2916654|2898612_2898849_-|WP_001022461.1|DBSCAN-SWA MNIKQKRQHFNKDLNKLVDNKHAVIPNELTWEQLQKLSDDPEFVELYQEALHGDSGEDCAYLIIKAIHNALLRLAGSH >NC_017171|2895079:2916654|2903099_2903396_-|WP_020753236.1|DBSCAN-SWA MSSINKSAGKVLSVLFALRGHYITGVSNKQLSESLKESPTFITRALQTLEANGWAEKRDNGNYAPSMMAIRFGASCKEECDRMQARIDEYKQRLQTQF >NC_017171|2895079:2916654|2905684_2906041_+|WP_000084783.1|DBSCAN-SWA MSQWKRNFRRQLAKQNAVKNQLVANESQSIQGVPVKLKKRWIVENWRSGWLWLSNWILLVIAWVGYNGVPPEIIALIPEANRENVIPFLSALGVVFRFIDQNRKKPLPPASDTFKEDV >NC_017171|2895079:2916654|2903590_2903797_-|WP_000550335.1|DBSCAN-SWA MHLKTPEEVKQEFIEQGIPVSSWAESKGFTPQEVYKVLNGQSKGNFGRAHKIAVALGLKPEPKQKVTV >NC_017171|2895079:2916654|2902199_2903087_-|WP_000064373.1|DBSCAN-SWA MSNEVVTEVEIQNHTKAVAGLATQLGYEGALTVGALEDEIRFFQQRTVEAVMELGKRLLILKEISPHGEFNKRVEMLNFTPRMAQKFMSAVLKFSKTNSSSLLQKAGNQTKLLELVTLDDDEIQVIEQGGSIGELSLDSIETMSARELKDELRKIKADKEAADLLLQKKDQKINELDAKLTKLQSPVQIKKRAESEEQLIAAKALEEATSACLMMHNDTVRFKNTINSVLDTINEHGLYNIQEQLEALVISAFQQIAQTSVEFGIQIDFETMVNPAWLPPADQDATPFDATNVEQ |
31 | Pseudomonas_phage(22.73%) | head,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
54 : 7066
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_017172|54:7066|DBSCAN-SWA CATGAAAACCGCCACTGCGCCGTTACCACCGCTGCGTTCGGTCAAGGTTCTGGACCAGTTGCGTGAGCGCATACGCTACTTGCATTACAGTTTACGAACCGAACAGGCTTATGTCAACTGGGTTCGTGCCTTCATCCGTTTCCACGGTGTGCGTCACCCGGCAACCTTGGGCAGCAGCGAAGTCGAGGCATTTCTGTCCTGGCTGGCGAACGAGCGCAAGGTTTCGGTCTCCACGCATCGTCAGGCATTGGCGGCCTTGCTGTTCTTCTACGGCAAGGTGCTGTGCACGGATCTGCCCTGGCTTCAGGAGATCGGAAGACCTCGGCCGTCGCGGCGCTTGCCGGTGGTGCTGACCCCGGATGAAGTGGTTCGCATCCTCGGTTTTCTGGAAGGCGAGCATCGTTTGTTCGCCCAGCTTCTGTATGGAACGGGCATGCGGATCAGTGAGGGTTTGCAACTGCGGGTCAAGGATCTGGATTTCGATCACGGCACGATCATCGTGCGGGAGGGCAAGGGCTCCAAGGATCGGGCCTTGATGTTACCCGAGAGCTTGGCACCCAGCCTGCGCGAGCAGCTGTCGCGTGCACGGGCATGGTGGCTGAAGGACCAGGCCGAGGGCCGCAGCGGCGTTGCGCTTCCCGACGCCCTTGAGCGGAAGTATCCGCGCGCCGGGCATTCCTGGCCGTGGTTCTGGGTTTTTGCGCAGCACACGCATTCGACCGATCCACGGAGCGGTGTCGTGCGTCGCCATCACATGTATGACCAGACCTTTCAGCGCGCCTTCAAACGTGCCGTAGAAGGCACTGTTGCAAAGTTAGCGATGAGGCAGCCTTTTGTCTTATTCAAAGGCCTTACATTTCAAAAACTCTGCTTACCAGGCGCATTTCGCCCAGGGGATCACCATAATAAAATGCTGAGGCCTGGCCTTTGCGTAGTGCACGCATCACCTCAATACCTTTGATGGTGGCGTAAGCCGTCTTCATGGATTTAAATCCCAGCGTGGCGTTGATTATCCGTTTCAGTTTGCCATGATCGCATTCAATCACGTTGTTCCGGTACTTAATCTGTCGGTGTTCAACGTCAGACGGGCACCGGCCTTCGCGTTTGAGCAGAGCAAGCGCGCGACCATAGGCGGGCGCTTTATCCGTGTTGATGAATCGCGGGATCTGCCACTTCTTCACGTTGTTGAGGATTTTACCCAGAAACCGGTATGCAGCTTTGCTGTTACGACGGGAGGAGAGATAAAAATCGACAGTGCGGCCCCGGCTGTCGACGGCCCGGTACAGATACGCCCAGCGGCCATTGACCTTCACGTAGGTTTCATCCATGTGCCACGGGCAAAGATCGGAAGGGTTACGCCAGTACCAGCGCAGCCGTTTTTCCATTTCAGGCGCATAACGCTGAACCCAGCGGTAAATCGTGGAGTGATCGACATTCACTCCGCGTTCAGCCAGCATCTCCTGCAGCTCACGGTAACTGATGCCGTATTTGCAGTACCAGCGTACGGCCCACAGAATGATGTCACGCTGAAAATGCCGGCCTTTGAATGGGTTCATGTGCAGCTCCATCAGCAAAAGGGGATGATAAGTTTATCACCACCGACTATTTGCAACAGTGCCAAGCGCGGTGTCCGGAATTTCAGGTTTGTGTCTCTACAAAGACTAACTATCAGAAAAACTCATCGAGCATCAAATGAAACTGCAATTTATTCATATCAGGATTATCAATACCATATTTTTGAAAAAGCCGTTTCTGTAATGAAGGAGAAAACTCACCGAGGCAGTTCCATAGGATGGCAAGATCCTGGTATCGGTCTGCGATTCCGACTCGTCCAACATCAATACAACCTATTAATTTCCCCTCGTCAAAAATAAGGTTATCAAGTGAGAAATCACCATGAGTGACGACTGAATCCGGTGAGAATGGCAAAAGCTTATGCATTTCTTTCCAGACTTGTTCAACAGGCCAGCCATTACGCTCGTCATCAAAATCACTAGCATCAACCAAACCGTTATTCATTCGTGATTGCGCCTGAGCGAGACGAAATACGCGATCGCTGTTAAAAGGACAATTACAAACAGGAATCGAATGCAACCGGCGCAGGAACACTGCCAGCGCATCAACAATATTTTCACCTGAATCAGGATATTCTTCTAATACCTGGAATGCTGTTTTCCCGGGGATCGCAGTGGTGAGTAACCATGCATCATCAGGAGTACGGATAAAATGCTTGATAGTCGGAAGAGGCATAAATGCCGTCAGCCAGTTTAGTCTGACCATCTCATCTGTAACATCATTGGCAACGCTACCTTTGCCATGTTTCAGAAACAACTCTGGCGCATTGGGCTTCCCATACAATCGATAGATTGTCGCACCTGATTGCCCGACATTATCGCGAGCCCATCTATACCCATATAAATCAGCATCCAGGTTGGAATTTAATCGCGGCCTCGAGCAAGACGTTTCCCGTTGAATATGGCTCATAACACCCCTTGTATTACTGTTTATGTAAGCAGACAGTTTTATTGTTCATGATGATATATTTTTATCGGCACTGTTGCAAATAGTCGGTGGTGATAAACTTATCATCCCCTTTTGCTGATGGAGCTGCACATGAACCCATTCAAAGGCCGGCATTTTCAGCGTGACATCATTCTGTGGGCCGTACGCTGGTACTGCAAATACGGCACTGTTGCAAAGTTAGCGATGAGGCAGCCTTTTGTCTTATTCAAAGGCCTTACATTTCAAAAACTCTGCTTACCAGGCGCATTTCGCCCAGGGGATCACCATAATAAAATGCTGAGGCCTGGCCTTTGCGTAGTGCACGCATCACCTCAATACCTTTGATGGTGGCGTAAGCCGTCTTCATGGATTTAAATCCCAGCGTGGCGTTGATTATCCGTTTCAGTTTGCCATGATCGCATTCAATCACGTTGTTCCGGTACTTAATCTGTCGGTGTTCAACGTCAGACGGGCACCGGCCTTCGCGTTTGAGCAGAGCAAGCGCGCGACCATAGGCGGGCGCTTTATCCGTGTTGATGAATCGCGGGATCTGCCACTTCTTCACGTTGTTGAGGATTTTACCCAGAAACCGGTATGCAGCTTTGCTGTTACGACGGGAGGAGAGATAAAAATCGACAGTGCGGCCCCGGCTGTCGACGGCCCGGTACAGATACGCCCAGCGGCCATTGACCTTCACGTAGGTTTCATCCATGTGCCACGGGCAAAGATCGGAAGGGTTACGCCAGTACCAGCGCAGCCGTTTTTCCATTTCAGGCGCATAACGCTGAACCCAGCGGTAAATCGTGGAGTGATCGACATTCACTCCGCGTTCAGCCAGCATCTCCTGCAGCTCACGGTAACTGATGCCGTATTTGCAGTACCAGCGTACGGCCCACAGAATGATGTCACGCTGAAAATGCCGGCCTTTGAATGGGTTCATGTGCAGCTCCATCAGCAAAAGGGGATGATAAGTTTATCACCACCGACTATTTGCAACAGTGCCGTGTACATCGAAATACGGCTTATCAGGCGTTAAAAGATGCTTGCGATGACTTGTTTGCAAGACAATTCAGTTATCAGAGTCTTAGTGAAAAAGGTAACACTATTAATCACAAATCAAGATGGGTGAGCGAGGTGGCTTATATTGATAATGAAGCTGTCGTTAGACTTATTTTTGCCCCTGCTATTGTGCCTTTAATTACTAGGTTAGAAGAACAATTTACAAAGTATGAAATACAACAAATAAGTAATTTAACAAGTGCTTATGCTGTTCGTTTATATGAAATATTGATTGCATGGCGTAGTACTGGAAAAACGCCTCTCATAACTATGTATGATTTTAGACAAAAAATAGGTGTACTCGAGACTGAATACAAACGAATGTATGATTTTAAAAAATATGTTTTAGACATTGCATTAAAACAAGTAAATGAACATACCGATATTATTGTCAAAGTTGAACAGCATAAAACAGGTAGATCTATTACTGGTTTTTCATTTAGCTTTAAACAGAAAAAATCAGCCACGCATTCAGTCGAATCTAAAAGAGATCCGAATACATTAGACCTCTTTTCAAAAATAACAGATAAACAACGCCATCTATTCGCCAACAAGCTCTCAGAGCTTCCTGAGATGAGTAAATATTCACAAGGCACAGAAAGCTATCAGCAGTTTGCTGTACGTATAGCTGCCATGCTGCAAGATGCAGAGAAATTTAAGGAATTACTTCCTTTACTCAGAAAATTAGGATTTCAATGACATTGTTAATTGAAATTGTTAAGTTAACAGTCAGGTATTAACACAAGTTGAAAACTGGTTTACATAATGAAAAAACTGTCAGTTTCAGAGTTAGCTAAGCTTTATGGATATTCAAGACAAGCCATATATGCACATATAAACAAAGGAAATTTATCTAAAGGATCTGATGGATTAATTGACTTTTCAGAGGCCCTAAGAGTTTTTGGGGAACCACAAAAAAAAGAGGATACAGTCAATCAAAGTCAATCAATTAACAGTCAAAACTTGACAGAAGTTGACTTACTAAAACGTCAAGTTGACATACTGGAAAAACAATTAAATCAGGCAATACAGAGAGAAAATCAATCTTTAGAACGTGAATCGTTTTATCAAGGTAAGCGTAACGCCAACCACACATTCCAATCCTAACTGATCAACTTTACCCTGTCTGCCATTATCAACTGCCAGGGTAATCATCATGCACCGCACCAAAGAACAATGGTTCGCTTTATTCGCCGAGCAAGCCCAAAGTGGCCTCACCCAAACTGAATTTGCAAAACGTCAGGGCATCATTCCTACATATTTTAGTTATCGCAAGAGACAATTGTTGGCGTTTCAGGATGATGACGGTGGCTTTATTGAGCTGACGCCACAGGGCTTGCAGCTGAATAAATCCATTTTACTACGTAAGCGTGATGTGGAATTGCAGTTTCCAGCCGGCACTGATGTGCTGTGGTTAGCGGCCTTGCTCAGAGCGCTCTGACCATGAAAATGTTTCTTGATGTGCCCCAGGTCTATTTGCATAAACAGCCGGTCGACTTTCGTAAATCTATTAATGGTTTATCGTTGCTAGTTGAGCAAGAGATGCAGCTCTCGCCTTTTAGTGGCGCACTGTTTGTATTTTGCAATCAGCAGCGTACCCGGTTAAAAGTACTGTACTGGGATAGCACAGGCTTTTGCTTGTGGTACAAGCGGCTTGAAAAAGACAAGTTCCGCTGGCCAAGGCAGATGCCTGGCAAAATCCTGTCTATTAGCGAACAACAGTGGCATTGGCTGTTGCAAGGTGTCGATATTCAAAAAATCACCGCCCATCAGCCACTGCATTACCAGAGTGTGGGCTGATATGACGATCGGCTATAAATCCTTGTGATCGCATCCAAAACAATCTAAATCTTACCAAGCACTTAGTCCAATTGGCCGTTACAATAGCGGCCATGAAAAAGACACCTCAATCCTTACCTGATGATGTTGAACTGCTCAAGAAAATGCTGCTTGAGCAGACGCAAAAGCTTGAGCGGAAACTGGCGCAAAAAGATAAACGCATCGCCAAATTAGAGCGGGTTAACCAGCAACTGTCGGACAAGCTGCAGCAATTGCTGGAGCGTTACAACCTGAAGAAGTACCAGAAATTTAGCCCCAGCAGCGAGACCTACGAAGGTGATGGCGAAGTCTTAAATGAGGCCGAACAGCTGATTGAAGACGAGTCAGTAGCGACAGAGCCAGATAATCAGACGACCGAGAGCGCTGAGAAAGCCGCTAAGCCACGCCGCCCACGGATTGCCCCTGAGCTGCCGCGCGTTGATGTTATCCATGATATTGACGATAAAACCTGTACCTGCTGCGGCCATGCGCTGCATCAAATGGGTGAAGAAGTCAGTGAGCAACTCGAGTTCGTCCCAGCACAAATCCGGGTGCTTAGAAACGTGCGGCTGAAATACAGCTGCCGGCAGTGTGAGACCAACGGCACCAAGGTCGAGATAAAAATTGCCGATGTGCCGCCAGCAGTTATCCCGAAAAGCATGGCCACACCGAGTCTGCTTGCCCAAATCATCAGCAGCAAAATGCACTATGGCTTGCCGCTGTACCGTCAGGAGCAGTTGTTTAATCAGGCCGGCATTGAGCTTAGCCGTCAAACGATGAGCCGCTGGCTGATAAGCTGTGCAGAGAAACTGAAACCGTTACTGGCGTTAATGAAAGCTGAGCTTCTGAAACAGCCGGTGCTATGGGCAGATGAAACCACGGTTAATGTGCTGGATGTTGAGAAAAGCACCTGCTACATGTGGGTATATGGCTGTGGCTTAGAGCAAAGTACTGGCCCCAAACTGGTGCTGTTTGATTATCAGGATAGTCGCAGCAGCATACATCCCACCGACTTCCTGGCGGGGTTTGCCGGCTATCTGCAGGTTGATGGTTATGCCGGATATGAGAAAACCCATGCAACCTTAGTCGGCTGCTGGGCACATGCCAGACGTAAGTTCGTTGAAGCACAAAAAGCGCAGGGTAAAGGCAAAACGGGTAAGGCGGATGTGGCCCTTAACCATATCCAGAAACTCTATGCACTGGAGAGTCAATTAAAAACCGTGCCGCCTGATAAGAAATATGACGCCAGACAAACGCTAGCCAAGCCACTGTTAGAACAATTCAAAAGCTGGCTGGATAAATCAAGCGAGAGTGTCACGAAAGAAAGTTTACTGGGAGCCGCTATTACGTATAGCCTGAACCAGTGGCCCAAGCTGATGCGCTATCTGGATGATGGCAGGTTGAATATCGACAACAATCGCGCTGAGCGCGCCATCAAACCGTTCGTGATTGGTCGCAAGGCATGGCTGTTTGCCAATACCAAGTCGGGTGCACAGGCCAGTGCCGCATTGTACAGCTTGGTCGAAACCGCCAAAATCAATGGTCTGGAACCCTATGATTACTTATGCCGGTTGCTGACAGAGTTGCCCAAAGCCAATACCCACGAGCAATTGCAACAACTACTGCCTTACTGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_017172|54:7066|904_1609_-|WP_001067858.1|transposase|DBSCAN-SWA MNPFKGRHFQRDIILWAVRWYCKYGISYRELQEMLAERGVNVDHSTIYRWVQRYAPEMEKRLRWYWRNPSDLCPWHMDETYVKVNGRWAYLYRAVDSRGRTVDFYLSSRRNSKAAYRFLGKILNNVKKWQIPRFINTDKAPAYGRALALLKREGRCPSDVEHRQIKYRNNVIECDHGKLKRIINATLGFKSMKTAYATIKGIEVMRALRKGQASAFYYGDPLGEMRLVSRVFEM >NC_017172|54:7066|3485_4313_+|WP_000534216.1|DBSCAN-SWA MGSCAAPSAKGDDKFITTDYLQQCRVHRNTAYQALKDACDDLFARQFSYQSLSEKGNTINHKSRWVSEVAYIDNEAVVRLIFAPAIVPLITRLEEQFTKYEIQQISNLTSAYAVRLYEILIAWRSTGKTPLITMYDFRQKIGVLETEYKRMYDFKKYVLDIALKQVNEHTDIIVKVEQHKTGRSITGFSFSFKQKKSATHSVESKRDPNTLDLFSKITDKQRHLFANKLSELPEMSKYSQGTESYQQFAVRIAAMLQDAEKFKELLPLLRKLGFQ >NC_017172|54:7066|2790_3495_-|WP_001067858.1|transposase|DBSCAN-SWA MNPFKGRHFQRDIILWAVRWYCKYGISYRELQEMLAERGVNVDHSTIYRWVQRYAPEMEKRLRWYWRNPSDLCPWHMDETYVKVNGRWAYLYRAVDSRGRTVDFYLSSRRNSKAAYRFLGKILNNVKKWQIPRFINTDKAPAYGRALALLKREGRCPSDVEHRQIKYRNNVIECDHGKLKRIINATLGFKSMKTAYATIKGIEVMRALRKGQASAFYYGDPLGEMRLVSRVFEM >NC_017172|54:7066|5057_5414_+|WP_000781558.1|DBSCAN-SWA MKMFLDVPQVYLHKQPVDFRKSINGLSLLVEQEMQLSPFSGALFVFCNQQRTRLKVLYWDSTGFCLWYKRLEKDKFRWPRQMPGKILSISEQQWHWLLQGVDIQKITAHQPLHYQSVG >NC_017172|54:7066|54_1014_+|WP_002016386.1|integrase|DBSCAN-SWA MKTATAPLPPLRSVKVLDQLRERIRYLHYSLRTEQAYVNWVRAFIRFHGVRHPATLGSSEVEAFLSWLANERKVSVSTHRQALAALLFFYGKVLCTDLPWLQEIGRPRPSRRLPVVLTPDEVVRILGFLEGEHRLFAQLLYGTGMRISEGLQLRVKDLDFDHGTIIVREGKGSKDRALMLPESLAPSLREQLSRARAWWLKDQAEGRSGVALPDALERKYPRAGHSWPWFWVFAQHTHSTDPRSGVVRRHHMYDQTFQRAFKRAVEGTVAKLAMRQPFVLFKGLTFQKLCLPGAFRPGDHHNKMLRPGLCVVHASPQYL >NC_017172|54:7066|4770_5055_+|WP_000555098.1|DBSCAN-SWA MHRTKEQWFALFAEQAQSGLTQTEFAKRQGIIPTYFSYRKRQLLAFQDDDGGFIELTPQGLQLNKSILLRKRDVELQFPAGTDVLWLAALLRAL >NC_017172|54:7066|1721_2537_-|WP_000018326.1|DBSCAN-SWA MSHIQRETSCSRPRLNSNLDADLYGYRWARDNVGQSGATIYRLYGKPNAPELFLKHGKGSVANDVTDEMVRLNWLTAFMPLPTIKHFIRTPDDAWLLTTAIPGKTAFQVLEEYPDSGENIVDALAVFLRRLHSIPVCNCPFNSDRVFRLAQAQSRMNNGLVDASDFDDERNGWPVEQVWKEMHKLLPFSPDSVVTHGDFSLDNLIFDEGKLIGCIDVGRVGIADRYQDLAILWNCLGEFSPSLQKRLFQKYGIDNPDMNKLQFHLMLDEFF >NC_017172|54:7066|5506_7066_+|WP_000753551.1|transposase|DBSCAN-SWA MKKTPQSLPDDVELLKKMLLEQTQKLERKLAQKDKRIAKLERVNQQLSDKLQQLLERYNLKKYQKFSPSSETYEGDGEVLNEAEQLIEDESVATEPDNQTTESAEKAAKPRRPRIAPELPRVDVIHDIDDKTCTCCGHALHQMGEEVSEQLEFVPAQIRVLRNVRLKYSCRQCETNGTKVEIKIADVPPAVIPKSMATPSLLAQIISSKMHYGLPLYRQEQLFNQAGIELSRQTMSRWLISCAEKLKPLLALMKAELLKQPVLWADETTVNVLDVEKSTCYMWVYGCGLEQSTGPKLVLFDYQDSRSSIHPTDFLAGFAGYLQVDGYAGYEKTHATLVGCWAHARRKFVEAQKAQGKGKTGKADVALNHIQKLYALESQLKTVPPDKKYDARQTLAKPLLEQFKSWLDKSSESVTKESLLGAAITYSLNQWPKLMRYLDDGRLNIDNNRAERAIKPFVIGRKAWLFANTKSGAQASAALYSLVETAKINGLEPYDYLCRLLTELPKANTHEQLQQLLPY |
8 | Escherichia_phage(33.33%) | integrase,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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