Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_016821 | Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides J18 plasmid pKLE03, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NC_016820 | Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides J18 plasmid pKLE02, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 4 | 0 |
NC_016827 | Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides J18 plasmid pKLE01, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NC_016828 | Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides J18 plasmid pKLE04, complete sequence | 0 crisprs | csa3 | 0 | 0 | 1 | 0 |
NC_016805 | Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides J18, complete sequence | 1 crisprs | csa3,cas3,DEDDh | 0 | 0 | 5 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_016805_1 | 362155-362257 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NC_016805_1
|
1 spacers
spacers of NC_016805_1
>1.1|362181|51|NC_016805|CRISPRCasFinder CTGACTGTTAATCAGGTTGTCGCCGGTTCGAGCCCGGCAGTCGGAGTTTCG |
cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_016805_1
The CRISPR arrays of NC_016805_1 >merge|NC_016805|1|362155-362257|CRISPRCasFinder CCGACTTAGCTCAGTTGGTAGAGCACCTGACTGTTAATCAGGTTGTCGCCGGTTCGAGCCCGGCAGTCGGAGTTTCGCCGACGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAC >NC_016805|1|1|362155-362257|CRISPRCasFinder CCGACTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAC CTGACTGTTAATCAGGTTGTCGCCGGTTCGAGCCCGGCAGTCGGAGTTTCG CCGACGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAC
>NC_016805.3|WP_014324302.1|360424_361912_+|lysine--tRNA-ligase MAEEKALNDQMLARRQKLATIVSDLHLDPFGKRFERTAKAQELHNLYDASSLEELENAKHEVVIAGRMVAKRGAGKVIFADFRDVSGKIQVYARRDDLADNYPIIKRADLGDFLGIKGIMMKTEAGELTVLATELTHLSKALRPMPDKFHGISDVETRYRKRYLDLIANEDSFKKFQERSHIISAIRAYMDRNDFLEVETPILQTEAGGAAARPFITHHNALNIDMYMRIATELYLKRLVVGGMERVYEIGRIFRNEGMDPKHNPEFTTMESYAAYMDFTDVMDETEGIFKAAASVVSDDLKITYQGTEIDLGTKFARKHLVDLIKEQTGIDFWQEMSVEAAQKLADDNHVKYEKYWGVGHIINAFFEEFVEDTLVQPTFVYGHPVEVSPLAKKNTDDPRFTDRFELFIMGSEYANAFTELNDPIDQRARFEAQAAERENGNDEAEGIDEDFIEALEYGMPPTGGLGVGIDRLVMLLTDSDTIRDVVLFPTMRPE >NC_016805.3|WP_014324301.1|359443_360337_+|Hsp33-family-molecular-chaperone-HslO MADQFIKAITKNKYFRTFAVNGTNLVHQAAQIHETSRIAAVVLGRGLLATTLTAQAVLKGEETLSTKINGRGPIGNVVVESDAKGSVRGYVTNPNLETLINEAGQLDVAKAVGKNGFLQVTKFAPYSDPYIGQSQLVSGEIGDDFTYYLAQSEQTPSVIGVSVYMNSDDTVAGAGGFLVQALPDATDEAIDQLEVALKNMKPLSEMIQERYTPLEVLEEIFGKGEVEILQTAGIGLAAEPSKDAYAKMLLTLPASEIQAMIKEDHGAEIVGKFSGKRYFFTEEQLSEILKQIEKNNE >NC_016805.3|WP_011679262.1|357232_359335_+|ATP-dependent-zinc-metalloprotease-FtsH MNNNKGGFLRSSVFYIFIFLAVVGMVYGLFGNDKTTTKTITSSEFIKALNDKELKSVTVQPGNSIYNVTGTYKKAQTATKDKGLSLFQPTQKVTKFTSTLLPNDASLKSVTDAATKTKTELVTKQAENSGFWLNLLVSLVPVLLIVAVFYLMMNQAGGGKGGQGGMMSFGKSKAKPSDPKDNKVRFADVAGAEEEKQELVEVVEFLKAPKKFVNLGARIPKGVLLEGPPGTGKTLLAKAVAGEASVPFFSMSGSDFVEMFVGVGASRVRDLFENAKKSAPAIIFIDEIDAVGRRRGTGMGGGNDEREQTLNQILIEMDGFEGSEGVIILASTNRSDVLDPALLRSGRFDRKILVGAPDVKGREAILNVHAKNKPLADNVDLKAIAQQTPGYVGADLENLLNEAALLAARRNKSKVDAADIDEAEDRIFQGPAKTNHNMSESERRTTAYHEAGHALVGLVRSEASVVRKVTIVPRGRIGGYALMTPKNDRYNLKYSEAKEQLAGLMGGRASEIFMFNEASSGASNDFQQATGLARQMVTAFGMSDKLGMVQLEGNASVGYADQAGNRAYSEETARLIDEEVRRLAREAFDDAIAILRDNKDKLTAIAEALLEVETLDEKQIKDIYLTGTFTRKDIQDDTELAKAKSFEEAKAAADAKDSQAEQRFEKQDEEKSSDDHSESKNEDTDSTDKSETDDNNTENK >NC_016805.3|WP_010277907.1|356665_357205_+|hypoxanthine-phosphoribosyltransferase MDNDIQEVLYDQESIQKAAERLGKQITQDYAGSTPLFLSVLKGAYLWTADLLREVDLYAELEFIKISSYHGGVSSSDEITLVTDVRSDVRGRDVIILEDIVDTGQSLLFLKELLAKRGAKSIKVATLLDKIEGRKVEVDADYAGFNVRNEFVVGYGLDYEEHYRNLPYVGILKKEVYTK >NC_016805.3|WP_014324300.1|355372_356665_+|tRNA-lysidine(34)-synthetase-TilS MTEKILQTIQQYNWPETVIVAVSGGVDSVVLVHALSKTKANLVIAHVNYRLREESDDDADFVRQLATQTGAIFEEQVWQHIPDHAVEKAARQFRYDFFEELAQKYHTNTIAVAHHADDQAETVLLKMIRGGRLQQMGGMQTKNHKVIRPFLSITKQELITYAQDNQLGWHQDKTNFDVDYTPRNLLRNDVLPKLTTINQRAVRHINNMAAQILQQQRLIDNQAKIYANDIQDWQKIPTLWQLPTLKYWLQKNKLFNIKENQLQQMIQLLSNTHKPNGKIALADNFEFIKNYQKISIQKQQNMAQVLTPVMLKLNQWHSFAKTTFMWTDNVPMNGQSFIKFQLTRSLPYLSLRPAKASDKIALINGHKNLRRLAIDEKLTPQERTMMWVLATADDEVIAVHLRSNQWRVNADFAVKENTQPYWLVCQIEET >NC_016805.3|WP_011679260.1|354943_355342_+|septum-formation-initiator-family-protein MAGNFKRRQSNITPLNPAIAREIKKSERANSEAAKHYRKAHARREKKILLFGGLIAIIFVVQLLIGQVKLHAANQELTNTQDRLEKVQKTNTDLTADTKRLKDATYLQQLLRDKYGYSKQGELVYNLPSDNN >NC_016805.3|WP_014324299.1|354580_354862_+|RNA-binding-S4-domain-containing-protein MRLDKYLKISRLIKRRTVAKEIADQGRISINGKVAKSSSDVSTNDELEVRFGNKTLTVKVLKIVETTKKEESADMYEVVSEKFQQDFRKIGDE >NC_016805.3|WP_014324298.1|351025_354565_+|transcription-repair-coupling-factor MTLIDFLSDTVTIKKLNEQATVGSAQLLLGVNGTARAASIAALYRKNPRPMLIISDTQVHADQFFDDLSSLLEDLVYNFPAEESIATEMAISSSELRLQRVQTLLALKTEKPIIVVTSLAGAERLVPKKQSLEQAYLHVKVGDAYNLNVIKNTLMMMGYTPTKLVQTPGEFAHRGSIVDVYPITFDDPIRLDFFDDELDQLKSFDVATQKSTTSFDEINIDPATDFIVSEHQYDQAKLAIESAFSDYRTNLSGVDKKHATDGFAPTQYMLNERERGSVLVPYAPFFFDGQTTLLDYFPTDSLIIIDEYTRLMETRLQQMTRDQEWIEQQIEAYQLLPKQTWRTEITDLLASNQHATIYLANFQRGLNRIKFTNVEEVTTRPANQYYGQIPALKNDLIYAQESGITMVLLIPDAKRRANFSRSLSELEVPVTETRDIVKNQVQIMPGELSAGFEWPKLHLTVLTTHELFTQAKHSAPRTRKIANSERLKSYNELNVGDYVVHINHGIGRYEGLQTIEADGGKQDYLTIAYQQNAKIFIPVTQLNLIQKYVGASDVAKKPKLNKLGGSEWAKTKRQVAAKIEDIADDLLELYAKREAQQGYVFPPDDHAQIKFDDSFGYPETPDQIRSIEEIKVDMQKLRPMDRLLVGDVGFGKTEVALRAVFKAAHSGKQVAFLAPTTILVQQHYETMLARFSDFPEIKIGVLSRFQTPTQNKMIIEQLQNHEIDVVVGTHRLLSKDVDFSDLGLLIIDEEQRFGVKHKERLKQLRTSVDVLTLTATPIPRTLNMAMVGARDLSVIETPPANRYPIQTYVLAMDWKIVRDAIEKEIARNGQVFYLHNRVADLDRIVSQIEELIPSARVAAIHGQMSETQLESILYDFLNGQYDVLVTTTIIETGVDIPNANTLIVENADHMGLAQLYQLRGRVGRSTRLAYAYFTYPFTRTPSEEAEKRLEAIRDFTELGSGFRIAMRDLSIRGAGDLLGKQQHGFIDSVGYDMYTQMLKDTVAQKQGKQVTTSQPETDAELILGVLAYLPDEYVSDNAQKIELYSRIRQARTDAEFEDIESDMLDRFGEMPDEVARLLLVGQIKQLADQSQITNIRRQRKQLIMTFNETATKNLAGEAIFETMVDVPLKAAVRTEEGNLQVIFTVNDVAESSIWLNILRNFLLVIINKLSAKTLNELHH >NC_016805.3|WP_010291225.1|350458_351025_+|aminoacyl-tRNA-hydrolase MKFIFGLGNIGAEYDQTRHNIGFMAVDAFATANHMSFSPSKQFALVAKTIIGGESVMLVKPTTYMNDSGKAVRAILDYYDGDVDDVLVLVDDMDLPFGKMRFRAKGSAGGHNGLKSIMTHTGSQTFLRLKFGLGHPVHEQNVVVNYVLGKFTAAEKPDIDAMLDRSTQAIADWIQGATAPELSNRYNG >NC_016805.3|WP_011679258.1|349688_350333_-|CBS-domain-containing-protein MFQKSLVIPKSELTTVTENATIQEVYDIFNDPENAHTRTMPILDESGKLFRGNVYKQHVFEHVAKNGNMNLPATAIMRNSTKFIYTNSKFYEVFFAIRDLPFIAVLDENHQFYGIFTHDALMDLLSQSWSVRSGGVAIAISTHNTQGDLSKISKIITRYSNIESLLTIQSELKPLTVLFTLPLQEDSEQLEKLIKRLEKKGYHVSSVENLNRFR >NC_016805.3|WP_011679265.1|362381_362915_+|rRNA-large-subunit-pseudouridine-synthase-E MIVLFNKPYNVLTKFTDAEGRPTLADYIDIPRVYAAGRLDMDSEGLLLLTDSGKLNHELTDPDNKAYKTYVVQVEGVPTKSQLKQLEQGVALKDGLTLPAKVKRIPYPKWLWEREKPIRIRKNQPTSFIQLKIKEGRNRQVRRMTAAVGIPTLRLIRTHIGEYHIADLKPGQYRIVK >NC_016805.3|WP_014324303.1|362985_363702_+|YebC/PmpR-family-DNA-binding-transcriptional-regulator MGRKWENIKMKKAQTDGAAAKVNSKYGIEIYAAAKQGGSPDPEANSTLKFVIERAKQAQVPKHVIERAIEKAKGSGDETFIEGRYEGFGPNGSLIIVDTLTSNVNRTATNVRTAFNKNGGTYGAAGSVSYLFDETGVIVFEGEDADATLETLLDAEVDVRDAEQQDDHIVVYTEPTALHQAIAALRESGVSDFSTTEISMLPQSEMTLAGKDLEIFEKLIDVLESDDDVQKVYHNVEL >NC_016805.3|WP_014324304.1|363750_364698_-|ferrochelatase MNKKGLLLVNLGTPDSPHPDDVKAYLKEFLSDTNVIQMPRLLWQPILRGKILPKRSFKSAELYQKIWRKDGSPLMVYAKKQVEQVQQLQPNWIVRYAMTYRKPNIAETLKEMRLAGADDIVVLPLFPQYSVTSTQSVIDQVRKADKNINIVKSFYNDEAYLDLLARDIREAWAKNDYDRLIISYHGVPESYVRRGDPYVDHCTATTQGVLESVGPLTPDNTHQVFQSRFGPTEWVKPYLSDTLMSLPSQGIKRVLVATPAFVADCLETIEEIHVENHDIFKQAGGEVFDVVQPFNEHIDFSKYIASLANRHFAQN >NC_016805.3|WP_014324305.1|365510_366959_+|NCS2-family-permease MEKLFQLKENKTTVRREIIAGITTFVSMAYIFFLNPQILGQAGVPTQAVFLAAILVAVFGTLFMGLFANVPFALAPGIGMQAYFTYTIVFGFGFTWQQALAIVFLVGVVDIVITLTHGRRAIVKGIPTELKAAIGGGIGLFVTYIGLKNAGFINFIVDPSNIMTLNGKPFTGEVHGAVNSILANGGVTPELTKFNNASTLLALIGFIILVVLVMRKVPGAFLISLIVTTLIGIPMGVTNTHIGAGTSVSHAFGELGQVFGQSLGAQGLGSLFNNWHHASLALVTIFAMGLTGLFDAIGTLIGIGNQTGIFSKEDQKSFESSNGFNSKMDRALVVDTFTTAFAGIVGTSNTTTFIESASGVAAGARTGLANVVTAAGFALMILFAPLVGVVPTAATSPLLILVGIMMMGEFKKISWESLEVALPAFFTSVFMAFSYSISYGIAAGFIFFIIVKFALGKFKEVSPVLLIVSAFFLLNFAVLAFM >NC_016805.3|WP_014324306.1|367078_367879_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLNIKNLSVSYGRKVALTVPKLSINKGEIIGVMGKSGSGKSTLVNSCLGLIPFKGQVRIDTDDVGILMQEQHYVDTMTNQKMIEGMLNTRIKRDKKLTELINFFDFSDQLSLHFKNLSGGQKQRMSLIMVLYQEPELLFLDEMTTGLDFESRQALISQLKIYFKQHQTTVLMVTHYAQEIEALADKLLVIHDGQVKAFDEPKNLFKQYIGYSAFIVDNHTEKSIKVQQPEDEYKVACRLIDDGDDFRRTQSDIELVYTEVMKGQRA >NC_016805.3|WP_014324307.1|367875_368604_+|membrane-protein MIKKRKLVLEFQNLLGNIITLFFGFAFAPMMALVFGNSYANVPQALNQLYLGFFCTIPLSMVFVGFSSLFSQEVEQGFTLRAELFGYSRVSQALHKFMALTVFVLLSSIIYSWIFLSHFNLPLPNAVIIGQMAIFQILNTAVYFIIVFILTTILKKFSRVYGISMISYFAIMIISGIMGNMDVGKLGDYLPIKLFVTNYTNHLNDTDYISGKIGLYLLILLGILGVILKVIVRNKNGNKHQY >NC_016805.3|WP_014324308.1|368581_369049_+|LytTR-family-transcriptional-regulator MEININIDDKLKDVQVVISGSDIEQLADIAQYLKSRNTPSRQLAIKTADNIRVVDKEDIILVESYGNDLTFTLKNNHKITTRKTLKRFLEENQKSDFVQISKSEVMNLSYLSKMESAFSGNYYAFLTNQARVTVSRRFIKGILKRLEGSAEDEAF >NC_016805.3|WP_014324309.1|369035_369446_+|DUF3021-family-protein MKHFKEAIVYLLVGIGVGSFISLLSFTLNHATPSMKQFGLLMTMSAIMGLLSLIFEYDKITFITQLISHFILEMLTYGFFIWLTFGSAVITFTNIPTFVITYVIIFIYFRKQGRDNARRINEQLQKNKPKKSDSTN >NC_016805.3|WP_014324310.1|369579_371670_+|DNA-topoisomerase-III MPNYLILTEKPSAAANFVKALGGKTGVFGDFTYKITNLRGHVMTLKDPEEMVAEDLKKQYKSWLVKHLPWNLEDFSWARTYIRQRNIRTGKIESTKKLIDELKKESKSGYDAIVIATDTDPSGEGELLAWEALDAIGWRGQVLRANFMDESVSGIQKAMHQLRNVSDKMADGEYVKGESRNRWDFASMQLTRIATTAAKKEGFKVVAREGRLKSVIVWRIYQQLAAIKNYIKTPYFEVKFKDPAGHIFGRVTPQGEVIPWRFATKEQAKVDFNNYHETEVINEKHQTRTQAPGKLLDLAGLASILAPRGFSSKEVLSTYQKMYEAQIVSYPRTEDKTVTPEQFNELLPLIDQIAGVVGVDKNLLTHRSPRKTHVKSQGAHGANRPGENVPQTTQSLAKFGSSGPAIYEVLAKNYLAMLAEDYVYDHVTANLKDYPEFKTAFNIPIKLNFKLVYDSQKAIKVEEGEEEESISGQLGPQARPYLHEGANPKPQVPTTKWIMAFLEKHNVGTGATRVSTLSEMSRGTKAMLTEKRGKLGLTETGNVSAIMVKDTWIASPKITKRLFEMMDQVGRFEMTMVQVLDSATKVVEHDMPIMLDNAQTLETLLGKPKPSIKKPRKTSEKMTGIWQGQEITFAREWSGHVFTDEELQKLLTGSEVSFPAKSKRGKLYTAIGKMAKQTFKGNTFYGFKLNPKTKKA >NC_016805.3|WP_014324313.1|374410_375532_+|alanine-racemase MNYNAPHRHAVIELSQSAVVHNLKVIKENTHAKEIMAVLKANAFSHGLPEMASLSITAGATRFGMAMLDEALTLRDLGYIQPIDVLGLTDPRYARLAAERNITLAFSTKESIKAAAEQLAGTGLTLKVSLPVDTGLNRIGFKSREDLVAAIQEVSAQDTLIFQSMWTHFATADTPNVDYVDFQISEWQRLTHDLPVEPNEKHFANTGIATWYPEKINTDIVRLGIGLFGINGSVPIMSMPFELIPALSLKAKVVNSKPLKKGDAVGYGPEYHAPNDGYLITIPIGHSDGYPFNGSGMRALVADGQIGHIVGGVAMDQSMIFVTNPVAVGTTVTLIGRVGDQSITMQDLAEHTQSSIVALMNDFAPRLQRIIVS |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
58334 : 75032
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_016805|58334:75032|DBSCAN-SWA GATGTTAAACAATTTTGAGAAAATGAATATTGAACAACTAGAAACAGTGGTAGGTGGAGTAATGACTGGAAGAGGCCTCGCCAGAGCTATTGGAGGAGGGATTGTTGGTGGTGTGATTCGGGGAATACCTGGAGGGCCAGCTGGGATGTTCGTTGGAGCACATCTTGGGGCGGCAGCGGGAGCAGCTACTTATGCCGTAACTCATTATTAACAGTCATTGTACTGTGATAAATAATAGTAAGAGATAATTTATGAAAAAGATAAGCAATGAAAAGAAATTAATCAAACAGTTTTTACTAATGGATTGTGGCGCACTAGTATTTGGAATCGTATTTTTTTTGATAACAAATATGATGGGAGAAAAAACTACTATATTAGGTGCGGCTATAGCAACAATCATATTTTGGATATTTGATTTTGTTTTACGTGGATTTCTTGGCAAATTTAAAGAATGTTAATGTAGCTATTCAAAAAATGTAACATGCAATCAAATAGTTCAAACACTTCCAACTACATTTTAGTTATAGTGTAATGGAAGTGTTTTCGTTTTTGTGAAAGTAAACAACACAGATAAAAAAATGTAACAATATATCTTAGGAACTCAATGGATTTTTCACGCAAATTTTACAATAGCATACATGTATGTTTAATGTAAGATTTTCCTTTGTTATGCAACAGTTCAAATAAACATAGTACTTTAATGTTACCTCAAGATTTATCAACTCGAACCATGGTGTTGTTTATTTGTGTGTTTGGTTATTTATTCAGTATTCTAGACTTATCCTAGGTGTGTGCGAGACAAGCTAAAAAAGAATATAAACCCAATGCTTTGACATATAAGATGGGATTGAAATACTCGTAACAACAAATTTTTGGAGGGGTAGATAATGACTATTGACCGTATAATAACAATTATATCAAGAATGATTGGACAATTTATTGAACTCGTCTTGGTAACAGTATTAATTTATCTTATTTCAAGCATACCCCATATTTTTATATTTATTGATCAGTCTAACGGTTGGCTTGTACTAATATCAATGGCAGCTTCAGTTGTTGTTTCATATTTTGGCTATCGTTACTTAGCATCAAAGACAACTGCTATTTTTGAACGAATTAATCTGAAAAAAATAGGATTTATTATTATCATGTTGGTCCTGACCAGAGTTCTGATGGATTTTATAATACCGGCTATATTTGGACAAAATCAAGATATTAGTTTAAATCAAAAAATGATTGAAAGTATGTTTCAGCAAGGTGGGATGGTAGCATTATTATTTAAACTGAATACTGTTATTATTGCGCCAATAATTGAAGAAATTTCCTTTCGTGGCATTATATTTGAAGAGGCAAAGCCTTTAGGGGAAGTTGTACAGTTCATTTGGCCAACGTTTGTTTTTGCGGCAGTCCATGGGCCATCGACACCGGAGCAATGGACGGTTTATTTAACCGCAGGTGCCTTGTTGATGGTTGTTCGCTTAGTGACCAAAAAGTTACAATATTCAGTAATGTTTCATATGGCACATAACTTGATGGCAACGGTTGGCTTGTAGAATAAGGAAAAATAATCGTGATAAGTGGGAGTCACCTTAATTTGCTCTAATCAATAGGTAAAATGATTGCAACATCCGTGTTTAGAGAACATGGTATAATATTATTTAAGGAAAATTCCGCGAACAGTTTTTGTCCGCGGAATTTTTACAACCTATATAGAAAGAAGTAGAGAGTATATGACCGAATCAACACCAGTCATTGAAATGCGACATATTATCAAAAAATTTGGTGATTTTGCGGCCAATGATGACATTAACCTACAAGTCCAACAAGGTGAAATTCACGCGTTACTTGGTGAAAACGGTGCAGGAAAATCGACGTTGATGAACATTTTGACAGGATTACTGCAGCCCACTAGCGGTGAAATTCTGATTAATGGCAAAAAAGTATCAGTTGATTCGCCTTCAAAATCTGATGCATTAGGCATCGGAATGGTGCATCAACATTTTATGTTAATTGACGCCTTTACTGTAACAGAAAATATTATTCTCGGTTCAGAAGTAACAAAAGGATTGTCCTTAGACACTAAAACTGCTGCTAAGAAAATACAAGCTTTGTCAGATCAATATGGTTTATCAGTTGATCCAATGGCTAAGATTTCTGATATATCAGTTGGTCAACAACAGCGTGTCGAAATATTAAAGACCCTTTATCGTGGCGCTGATATTTTGATTTTTGATGAACCAACAGCAGTTTTGACACCACAAGAAATCGATGAGTTAATTGTCATCATGCACAATTTAGCACAAGAAGGTAAATCAATTATCTTGATTACGCATAAACTTGACGAAATACGTGCTGCTGCTGATACGGTGACTGTCATTCGTTCCGGTAAATCAATTGATACTTTCCCAGTTGCCGGTGTGTCTTCTCAGGAATTAGCTGACTTGATGGTTGGTCGTGAAGTTAGTTTTAAAACTGAAAAAGAAGTAGCTCAACCTGGTGCAGTGATATTGTCGATTGATAACTTAGAAGTGCAAGATACACGTCGTGTTGCTGCTGTTAAAAACTTTTCGCTAGATGTGAGAGCAGGTGAAATTGTTGGTTTAGCTGGTATCGATGGGAACGGCCAAACAGAACTAATCCAGGGAATTACTGGATTAACAAAGGTACAAGCAGGACATGTTAAGCTAAAAGGAGAGGATATCACCAATAAAAAGCCGCGTCATATTACTGAAGCGGGTGTTGGTCATATTCCTGAAGATAGATTGCGTTTTGGTATGGAAGTTGAAATGACATTGTCTGAAAACTTGTCATTGCAAACGTACTATAAACAACCTATTTCAAAATCAGGTGTCTTGCAACCTGCTGAAATGGATAAATTAGCTGACAAATTAGTTCAGGAATTTGATGTGCGAGCTGCCAGTATTCATGTGACCGCGGGTTCAATGTCGGGTGGAAACCAACAAAAAGCTGTAGTTGCACGTGAATTAAATCGTGATAATGATCTCGTGATTGCTGCCCAGCCAACTCGTGGGTTAGATGTTGGAGCGGTTGAATATATTCATCAACGTTTAATCGCACAACGCACAGCTGGTAAGGCCGTATTGGTCGTTAGCTTTGAGCTAGATGAAATTCTTAATTTATCGGATCGTATTGCTGTTATTAATGACGGTAAAATTGTCGGAATAGTTGACGCTCAAGACACAAACAAACAAGAGCTTGGCTTGTTGATGACAGGTATGAGCTTAACAGAAGCTCGTGCGGCATTGAAAGAAGAGGTGGGGTCCTAATGATTGCACAAAAGAATAACCTTTCTGTGGCAATGTTTTCTGTTTTATTCGGTTTAATTGTCGGCGCATTGATTATGTTAGTGTTCGGCTATAACCCAATTTCTGGTTATGTTGCGCTACTTGGTTCGGCATTTGGTTCAATGCAGGATATTGGTGGTGTATTGACGCAAATGACACCTTTAATTTTGACAGCATTAGGGTTTGCAGTGGCTTCGTCTGCAGGATTCTTCAATATTGGTTTATCAGGTCAAGCTTTAGCCGGATGGGTTGGGGCAGTTTGGTATGCTTTGAGTTTTCCTGATATGTCAGCTATCATCATGATACCAAGCGCGTTAATCATTGGAGCTGGTCTGGGTGCCATTGCTGGGTTCATTCCTGGCTGGCTACGCGCACAGTTTGGTGCTAGTGAAGTTATTGTGACGATTATGATGAATTATATTTTCTTATTTTTAGGAAATGATATCTTGCAAAATACGATGTCTAAGAATATTAAGGAGTCTGCAGAAACAACCAAACAAGTTGGTGCCAATGCATCGCTCCAGATGAAATGGTTGACTGATTTGACGCAAGGTTCAAGCATTTCAGCGGGAATATTTATTGCTTTAGCAATGATTGTTGTTGTTTGGTTTGTTATGAAGAAAACAACGCTTGGTTTTGAAATTCGTGCGGTTGGTTTAAACCCTGATGCGGCTAGATATGCTGGTATGTCAGCAAAGCGTAATGCTACAATAGCTATGGCAATATCTGGAGGTTTGGCAGGTTTAGCGGGAACCATTGAGGGACTTGGTAATTATCTGAACTTCTTTACGCAAAATGGGTCACCATCAATTGGCTTTGATGGTATGGCTGTTGCTTTACTTGGCGGTGGGTCTTATCTTGGTATACTTGGTGCTGCTGCAATTTTCTCTATATTAAAAATCGGTGGATTAGGAATGCCAATGTCTTCTGGTGTGCCATTTGAGTTGGTGGATATCGTTACAGCCTCAATTATTTTCTTTGTTGGTGTGCGCTATTTGATTCTATTAATTCAAAAGCGAATTAAAGATATGGACGAAAAAGCGGCGTTAGAGGCAGCCAATAAAAAAGCGGCAAAAGCAAATCAGCAGAAAGGCGGTGAATAAAATGTCACTCATGGCAATGTTATCACTTGTTATATCTAGCACACTAGTTTATTCAGCACCTCTGATATTCACTTCAATTGGTGGCACTTTTTCCGAACGTTCAGGTGTCGTTAACGTCGGCCTGGAAGGAATTATGGGAATGGGAGCTTTTGCAGCAGTCGTCTTTAACCTAACATTTGCTGGACAACTTGGTGCTGCCACACCTTGGTTAGGCTTGCTAGCTGGTGCCATTGTTGGGGTTGTTTTTTCGCTAATTCACGCTGTTGCTACAGTCACACTACGTGCGGATCATATTATTTCTGGAACAGTCATTAACTTGATGGCCCCAGCTTTGGGTGTATTCTTAATTAAAGTTTTATATGGTAAGGGGCAAACGGAGTCCATCGGGCAAGACTTTGGTTATGCCACGGTTCCTGGATTATCAAAAATGCCAGTATTAGGGCAATTATTCTTTGAAAAAACATCTGGGCCAGCTTGGTTAGCAATTCTTGTTGCTGGGATATCATGGTATATTATCTTTAAAACAAAGTTTGGTTTACGTCTGCGCTCGGTTGGTGAGAATCCACAAGCTGCCGATACACTTGGCTTAAAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_016805|58334:75032|74067_74244_+|WP_010287032.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA MINSTAVKELNDMELESINGGWSPQGFAISFVLGGAVGVGAYSIYQFGMDQGYRNNKK >NC_016805|58334:75032|63738_64653_-|WP_014324151.1|DBSCAN-SWA MRKIGVVGIGHVGVTVAHIIIAQGLADEIVLVDKNPEKLASEELDFRDAASLLDHHVEVHAGTVTDLADAEVVISALGHIELIKPGGDRFTELKANTPEVQQVGSDLKQAGFNGVLIVISNPVDVITGIYQKATGLPAKQVFGTGTYLDTARLKRALGDTLAIDPRGISGYMLGEHGDSQFAAWSTVNALGKNADELVKLYDINLDKVAEAARVGGFTVFAGKKYTNFAIAHAAVSLAKLVLSNARREAIVSHYDERFEGYISTPAIIGRDGVTAEFDLQLTDEEKVLLQKSANAIAEKTAAYL >NC_016805|58334:75032|68528_69266_+|WP_002815471.1|DBSCAN-SWA MKNIVITGGTSGVGFAIAKEIAKEGHNIIIVGRHEYKAHIAQKKLGNNVKVAIGDLSDEAEREGVIDEIKRSFSHIDVLIHSAGVLPRNASENIYVNLLPHYYLTTRLRGLLANSRVLIITGHPQAVNLVPICEIQSSAFSRAAWVITHKTLLMILLNQMLRDCNTTVNSFYPGQVNSNLMRYTKKIDNTEVPVGAYLALNATLEKMSGIFFDENGKIVQLDNKKYNLKTAEEILAPYLSKITTY >NC_016805|58334:75032|65516_66416_-|WP_014324153.1|DBSCAN-SWA 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>NC_016805|58334:75032|64768_65524_-|WP_014324152.1|DBSCAN-SWA MTKPVFSLKDVIVTVGDSIQILKSINFDIYDGDFITVLGTNGAGKSTLFNTIAGNLSVASGEILHNGNNIAHETAVKRTNYIARVFQDPKMGTAPRMTVAENLLLAEKRGSKRTLRSRGLTQKKLTEYAALTKVMGNNLDRRLNTATGDLSGGQRQALSFLMATRVKPELLLLDEHTAALDPKTSEQLMLATNEQVTANNLTALMITHNLADALKYGNRLIILNAGNIVLDVRDDEKKALDETQILKYFVS >NC_016805|58334:75032|74894_75032_+|WP_014324157.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA MSLKNNIVGFNKLGSEELKNINGGCYPLVIIGALAGIAIRNRIKK >NC_016805|58334:75032|58334_58544_+|WP_014324148.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA MLNNFEKMNIEQLETVVGGVMTGRGLARAIGGGIVGGVIRGIPGGPAGMFVGAHLGAAAGAATYAVTHY >NC_016805|58334:75032|66412_67417_-|WP_011679060.1|DBSCAN-SWA MNKRLLSAITIIVAFLAVAFIVTSKPNTQEKKSTYVPTVGILQLVTHPALDQIHHGIVAGLKSQGYSGKKIKIDYQNAQADQSNLKTMSQKFANENADLTIGIATPAALSLAKTADGNNPVILAGITDPAGSGLVKTTQRPGNNVTGVSGDSPLQQHLDVVQQVVPKAKTLGIIYTTSDHGGEYNAKNMEKLAKKAGYTVKMYTISTTNDMQQVAETMASQVDVVYAPQDNGVASAMKTLINVTNQEKIPVIPAVDTMVKDGGVATVSVSQYDIGYQAGVMAGQVLKGKNTATYPVKTITKGEMTINLKQAKLLGINLPASMVKEAETKGEVFK >NC_016805|58334:75032|71689_73837_-|WP_014324156.1|DBSCAN-SWA MRKFHYISQLEEKDCGVAALAMILKRHGSDVSLANIRERCQTSLSGTTALGLVKAAESFNMDVRPIQADLTLFDMKDLPLPFIAHVEKKGQYLHYYVVYGFTKNKVIIADPDPTVAKTAMTLQEFSKEWTGVALFMSPSPRYKPFKENKNSILSFLPIISRQKGLIANIVVASLLVTLISIAGSYYMQLVIDAHIPSAMSNTLTVVSLGLIATYVLQQLLSFARTYLLTIMGQRLSIEVILSYIRHLFELPVNFFATRRTGEIVTRFNDANTIIDAMANTILSLFLDLGITIIVGSVLAIQNTKLFLLSLISFPIYFLIVYCFMKPFERLNQEQMASNATLSSSIIEDINGIETIKSLTSEKTSYQKIDREFVDYLKKSFAHQKSEAIQNSIKQATQLIINVLVLWLGAKLVISNQISVGQLVTYNALLGYFTEPFQNIINLQAKLQTATVANRRLNEVYLVKSEFKKSESQELHHNNPHNIIVDDVSYQYGYQKNILHHFSIKIPFGEKIALVGVSGSGKSTLAKLLVHFISPSAGNIFIGEQNIKHVQRQNLRQHILYLPQNPYIFTGSILDNLTLGARENTTQEDILHAVELADIKDDIENMPQSYQTGISEEGGMSGGQKQRIALARALLSNSQILILDESTSNLDVATEKKIIDNLLSLKNKTIIFIAHRLTIAEKVQRVILLEKGIISEDGSHAELIHKKSKYYHLVKH >NC_016805|58334:75032|69381_69507_+|WP_011679061.1|DBSCAN-SWA MAEKNDLSSAYRRLKSPNAKTRDRALKLLKEIKAKKSQKSK >NC_016805|58334:75032|70322_71672_-|WP_014324155.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA MFNERLLESSEFYTKRYQNFTTLIIFPTLILLVLLILLACLTHKETVIKSTGEIAPIKILRTIQSTSNNPIIKNELLTKKEITAGDILIQYQNTESDTNLQLQKSSLKNLQEHVQALIIYKDSIKQNQNLFTDDDNFGCSTSYQSYLSQRRSLSTDHQQQVNDQDRVKQQKIIISEAINKKNSELSQYQDLINAIIKNTSLSPKNAYYSTFLDYQHQTKELPISQVDKLKKETVTSIQQQIDSINDALTSYKTQYAGFSSTNLAEDALTNKLNELKSQQLASITKELETLNQEIEQTKIQHAATETSGKNTIIATESGTVNLLINKTKLTSIPQGTNIAQIYPNLKKTPDLKVSFYISANEISEIVENQSIRYHLTEKNSKHMVIPGNITSIPANPITTKTGNFYQVSAILNLRPKDYQNIHYGQTGTVSIITGKSTWISHIKNTLIHQ >NC_016805|58334:75032|59505_59886_+|WP_049639999.1|protease|DBSCAN-SWA MDFIIPAIFGQNQDISLNQKMIESMFQQGGMVALLFKLNTVIIAPIIEEISFRGIIFEEAKPLGEVVQFIWPTFVFAAVHGPSTPEQWTVYLTAGALLMVVRLVTKKLQYSVMFHMAHNLMATVGL >NC_016805|58334:75032|61619_62741_+|WP_011679056.1|DBSCAN-SWA 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>NC_016805|58334:75032|67883_68471_+|WP_014324154.1|DBSCAN-SWA MNDLVNTFSEVNNLGRLIRGMREARGVSVNDLVRATGLSRSMISKFERGQTDIQLSSVIKIFSAMSLTLDDLCHARLFDEFLMNELCEKAYQFQNDHIVLKQILDEICSRDFLIRQEEILKLILQTLLNSNRGLPSEVENYFDNLDGIWSFDTYLALLAEPFLTQRIHLRIAKELAQYQGYRPKIINTAYHVFVH |
18 | Bacillus_virus(33.33%) | protease,bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
545458 : 558623
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_016805|545458:558623|DBSCAN-SWA 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13 | Bacillus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
800717 : 809376
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_016805|800717:809376|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_016805|800717:809376|802984_804019_+|WP_014324574.1|DBSCAN-SWA MNDLTWMKLAADEAIRAMPYQTFENPRVGAVIVKDGQVIATGYHEKFGEAHAEINAFNRVKNKTDILGATLYVTLEPCSTQGKVGSCAVQIQNWGLKRVVVGSIDPNPSTNGTGIKMLRSAGITVDVLNTVENKEINPAFHYFYTTRLPYVQLKLAMSQNGFVAEKFGKRKKLTDELADADVHRERATRSAIMIGSETMITDQPMLTVRHINISHKQPLRVVIDRRGRLQNTNFDFSNNWLIYTENVLFSKQHSYVKLMSGALKDILIDLAKQNIQSVMVEGGPSLIHSFLKENLWQEMLIYTTDKVLSKDSLKGISVSQKPKNEVQVGNAVKKVYINHQGGTQ >NC_016805|800717:809376|806736_809376_+|WP_014324576.1|DBSCAN-SWA MEAFRRGVKETIASHHVDMGKGLDAEQVSKNREEYGANVFVAEKKVSLLKKILISLNDVATIILLIAAVISFVATYLEDTGNYFESLLIIGIVVINSVLSIVQEGKAEDSLAALQNLNRTQVKVLRNGQIEQIDADDVVLGDVLVVENGSAIAADARLIEAIELQAEESALTGESLPVEKNADATFKPDDEVGLGERITMVYRGTTIVNGHGRAIVTAVGMQTEMGKIASLLSNESKIPLTPLQRRLVQLGKNISWVAIGAAVVVLGLGIYQGMDLKHIFLTAISLAVAVVPETLAVIVTMTLALGVQRIAQKHAIIRRLPAVETLGTTNVIASDKTGTLTQNKMTVRRVWQDEQDHLTNIADGLDDATKEVLSLAAISTNVSVKTVEGQTVYDGLPTEVALVRAIDKEATREELLEKYPLVEQIPFNSTKKRMTTVHKQPEGGYIAITKGAFDVLLPMIKHGNRDKAESVNKTFGGQALRVLTIAKRTFDVMPEAPTQEFYEQDLTLVGLVGIIDPPRPESAPAVEKARLAGVRTIMITGDHVETASAIAREIGILRNGDQTITGSELAKLSDKELDGNVQKYSVYARVTPTDKIRIIKSWQRQDATIAMTGDGVNDAPALKAADVGISMGETGTDVAREASDIILTDDNFATIINAISEGRGVYVKVRKTINFLLSANISELLVILIAMLLGWGSPLLPVHLLFINLVSDGLPGFALSREPMLTNVMNEPPMPKNTKLFAQGLGRQIGLNAALFAIVTLAAIWVGQNVVFGGLQANEQIGQTMAFTILSLTSIFHVFNIRSEKTLFAISYRANPSLVNMAFLATVITLVITLMPFTQTLFGLTALSLGHWIVIIVLSLAPTIVIELLKYVRPTLFKV >NC_016805|800717:809376|804611_805805_+|WP_014324575.1|DBSCAN-SWA MTSTTEKVKTAVKELKKGKLIILSDDKKREHEGDLVGLASFVTAATVNEALSIARGVLAVPITKSRADELGLDQMTTHNSEKFGTKFTVSVDHIDSTTGVSAYERAATIKNLANLSTTSVDFETPGHIFPLVAEDGGVLTRQGHTEGAVELAKIAGVPPVAYIIEILAQDGTMAREKELKELAKKHDIFQLSMQDLINYREDQKQAGIDEGPTVYLPTQYGDFHLTEFSVNDEEKSDLLIQSSRSFDQIPLVRLHSECLTGEIFGSQRCECGPQLREALKTINKQGGALVYLRQEGRGIGLHEKLKSYVLQENKFDTYDANVHLGHLPDERDYKKAAKILKISGLTKIRLLTNNPDKVQSLIDEGIEVIEQVPLITGINDKNEQYMQTKKEKFNHKL >NC_016805|800717:809376|804018_804609_+|WP_011679597.1|DBSCAN-SWA MFTGITQEVGRLISIYQRNDKEMRLKIAASEDYFSDSRVGDSIMVDGVCLTINQLESNYAEFDIMVPTFETTIVKFYQVGQKVNLEKALLVSNRFDGHFVLGHVDQTAEVVKKEYSEETTLLTFKLADRQQINQIVNKGSVTISGVSLTIVQAREDVFQVGLIPLTLTKTTLGLLHERDLVNVETDILAKYLMKGK >NC_016805|800717:809376|801642_802602_+|WP_014324573.1|DBSCAN-SWA MKINVYNEYDPLKEVIIGDATKLYFPDTHEIEQEEHTAKWKQFMTKHIYTLLRGKKVPSFLAKKFQRELAEFQRILETHGVKVHHVDSVTPTKLDPYGMGQMYARDSAMSVGEHFIEGNVQIEMRKIERRGYQRIVAAINDQNQVHTLNQKDKIYLEGGDVIVNYPYVFVGIGKYASNEAGAKWLQSILDKDFENEIVDRPWKVVPVYLNDDAILHLDCCMTIIGPKTAIIHKPVLKDLPKELVDYKFIDIDAKTRKEMGGNVLVIGPKKVIVQKRHTALQEALKNEGYTVIPIVFTWHSLLDGALRCASCPLVREKNE >NC_016805|800717:809376|805829_806300_+|WP_011679599.1|DBSCAN-SWA MIYKAKLIDQTNKKIAIVASKFNDLIVKQLISGAQESLEMHGIDESNIDIIWVPGALEIPMVAKRIAQVQKYDGIVTLGAVIKGDTDHYDLVINGVANGISQISLSTDVPIVFGVLTTDTLEQAQQRSGAKSGNKGAEVALSLLELINIFEQIKSI >NC_016805|800717:809376|800717_801623_+|WP_014324572.1|DBSCAN-SWA MTQKKIEQRAFMVGLAMNLLMGSLGIVVYYITQIQALFVDSYFTIMTLVSGIAAITISKYSARTSERFPNGHFMFEPMYAAFKSMMTLILLTTSTIQVSQKAYQYFVYHKGDVLNLTPIIPYEIIMVILCLTISLFYSRQNQKIGRASTMLSAESKSTRIDSIMCGGIGLAAFLVLLIPKNSILGFLLYTGDFFVTVILVLFSITTPVKVLKNAFIEICGGRLIDENIQNEFEACLRKHFGKEVILTGCHIYKTGMYFSVKVMVDVVDDEIGTVLLRDKKVRILEELKACYEFVHLEFVYA |
7 | Staphylococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1408726 : 1421778
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_016805|1408726:1421778|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_016805|1408726:1421778|1414550_1415468_-|WP_014324994.1|integrase|DBSCAN-SWA MTQNQTFHAYFKDWMTLYKQGAVRPVTFQKYVITHQHLVKLAPRLKTSKLSRATYQQLLNDFAKNHERQTVMDFHHHLKSSIIDAMEEDILKRDPTRKIVIKGTVQRLHKPKFLNQFEVQSLLKQLNLQDEVNWDYFILLITKTGLRFAEALGLTPADFDFEKQIITIDKTWNYKAVQADFAPTKNNSSVRKVQIDWQTAIRFSVIVRNLPRDEPIFVRGRVYNATVNDRLAAICKQVEIPVISIHGLRHTHASLLLYAGVSVASVARRLGHSNMTTTQKTYIHVIQELENQDNDLVMKHLAQLM >NC_016805|1408726:1421778|1409914_1410682_-|WP_011680189.1|DBSCAN-SWA MVEEPVWHRFWRYFNPVNIFKELLFGWKWAEGVLFLVLILLQLLVWTLGVVHNSTLDWFGLATGMMNIITVVLVAKGRITNYFWGLIYSVMYMPLAFQSQLFGEVALSAFWVVMQFVGVAAWLGFMKRDNLSEKDSQDVVATKYMTFKQWLLVIPVFLVILVIVGMILHQAGSRQPYMDGLTTTISMGAQILQTAKFAESWYAWLLFDIVEIVLWGRAWTGHADPSAFAMLGMNLALSVNAIYGIIQWRKLTKKE >NC_016805|1408726:1421778|1415539_1416793_-|WP_060499447.1|DBSCAN-SWA MTDKTMPALRFRGFYDAWEQRKFSEILEYSISNNTLSRANLNYDEGAIKNIHYGDILVKFGSIVDVNQPNVPYVTNGKPSDFTSQLLQNGDVIVADTAEDETTGKAIEVTGITDNYAASGLHTMVARPNVEFARKYLGYYLNSPSYHNALLPLMQGIKVLSLSKANIAKTVVSFPKDVKEQANIGIFFKQLDSLIAQNERKTHLLKQLKQAYLQKIFSQELRVAGFKDDWEERKLGELASVLTGFPFKNEDFVANGKYLVITNGNIQNDSSVVDVLLGNRIDDISDEIKERYYLNKNDILVTMDGTVGRTAKVVDDNLILAQRVGRLVSNTNPEFVYQWLNHGSFFNEMTKVSHGGTIKHISLNEISNYRSTVPSNNIEQQKIGAFFKQLDITIDLHQQKLDLLKKQKQAYLQKMFI >NC_016805|1408726:1421778|1411916_1413167_-|WP_011680190.1|protease|DBSCAN-SWA MANTPNFEEEIHCSFCGKSASEVKKIVAGPNDVYICNECVALAEGIIEEELTVDRAAEVLSLPTPHEIVNELNDYVIGQEDAKKTLAVAVYNHYKRINENVAPTLDVELQKSNIALMGPTGSGKTYLAQSLARILNVPFAIADATTLTEAGYVGEDVENIILKLLQAADFDVAAAERGIIYVDEIDKIAKKSENVSITRDVSGEGVQQALLKMLEGTTASVPPQGGRKHPQQELIQVNTTNILFIVGGAFAGIDTIIKERLGERVIGFGSDANENAEALNDDNILHHVQPEDMTKFGLIPEFIGRLPIVTVLDELTISDLTRILTEPKNALIKQYTALLGLDDVELEFQPDALDAMASVAIKRHTGARGLRSIIENVMKDVMFDIPSRDDVAKVIITKASVEQGEQPELQLKKVSE >NC_016805|1408726:1421778|1418916_1421778_-|WP_014324996.1|DBSCAN-SWA MVQTESKLENQLIAQLGKSSWQFRPELNHYSLIVNHFRVLLNRRNIDKLDGTLLTDQEFQRFLNEILGSKSIYQLGRYLRGDDQFQGGRAQIQRDDGSDITLSFFDPRDAENNIYEVAHQVVVNDKYENRYDVTLLINGLPLVQIELKRHSVEMSQAFQQILRYRRESFNVGGSLFRYLQIFVISNGMSSRYFSNNDGELNKNFIFNWSDENNRWIDEIEPFTASFLSPLNIHEMISKYTIFDADQKVMKIMRPYQVYAQKSIMSQAEIHPATNGYVWHTTGSGKTITAFKAASQLALHTDAQKIIFLVDRRDLDSQTINNFNAYLPKRADGQSSIDRTDNTSVLVEQLKNSTDTLIVTTIQKLANAVKNERYRSVLEPYKEQRVIFIEDEAHRTQFGEMRKQVNSWFKNAQHFGFTGTPIFKENIGADGRTTDDIYDTRLHTYLIKDAVRDHNVLPFNVTYINTIHSKEDIENLNGEVEALNIKEVYENEKRLNQIAQHIILNHSSKTYNRQYNAIFAVSDTRTALKYYDIFKEINNDLKVTTIFTWTANEDDNDEHQKDDTLTSRHGLEKVIDDYNDKYHQNFSTDTFSDFFNDVSKRMKNHDAKSPENNIDVLIVVNMFLTGFDAPTLNTLYVDKNLQYHGLIQAFSRTNRVQKAPKDYGNIVAYRNIKSKTDEAVQLFSQGDKAAFFAPSYENLKLDFQQAISALRDKVATPEDTNRLLDEGETAELEFIKLFRNVMSLQSRISVYEEFDWSEIETELDWTQQIFDDFKGKYATFYERHKARQKEKASIIDDVDFYPELLMVDAIDVDYINRLISQIDLSSPNARTEGVEKVKKALTNNTEPTLFSKRELLEQFLDSVIPELNHDANITGELNHFLADKRQAEIYHFAEEHRLEPSQLAEQVAEYEVSQHENSKALSELTAGMTFKEKRTAKQSIKNFIIETAKKFVMN >NC_016805|1408726:1421778|1416785_1417001_-|WP_060499448.1|DBSCAN-SWA MDKYAHVASFDEIVENDFNLNIPRYVDTFEEEEPIDLAQVEAELKAVDIEIAKAQAEFDAMVAELVETKND >NC_016805|1408726:1421778|1410784_1411228_-|WP_010281611.1|DBSCAN-SWA MTKYNDEELRARLTPEEYEVTQHAATERPFTGKYDQWWEDGIFVDVVSGEPLFSSTDKYDSGCGWPSFTKGIDDDEHLQENTDRSLGMTRTEITSKEAASHLGHVFNDGLPDRGGLRYCINSASLRFIPKKDLEKDGYGKYLKLFKD >NC_016805|1408726:1421778|1413396_1414488_+|WP_193391377.1|DBSCAN-SWA MTERVTRKNKNNESSRPLTISAQNGLIDQNDFFGKQIASRDVSGYFLVKNGEFAYNKSYSNGYPWGAIKRLNNYDMGVLSTLYIVFRPINISSQFLVYYYDTSIWHKEIAKNAAEGARNHGLLNIAPVDFFGTSLVIPNSIEEQQKIGLIFKQLDNLITQNEHKTHLLKQLKQAYLQKVFSQKLRFAGFSDDWKECKVSDIADRLDNSRIPITSSDRISGDTPYYGANGIQDYVEGFTHDGEFILVAEDGANDLKNYPVQYVNGKAWINNHAHVLQGKKTVTDNKFLMNAIKNFNIEPFLVGGGRAKLNADIMMKINIQSPSYEEQQKVGSFFQQLDNLIALHQQKLNLLKKQKQAFLQKMFI >NC_016805|1408726:1421778|1416940_1417354_-|WP_060499450.1|DBSCAN-SWA MTDKTMPALRFRGFYDAWEQRKFSEILEYSISNNTLSRANLNYDEGAIKNIHYGDILVKFGSIVDVNQPNVPYVTNGKPSDFTSQLLQNGDVIVADTAEDETTGKAIEVTGITQNVKVWINMHTLQVLMKLLKMILI >NC_016805|1408726:1421778|1411331_1411916_-|WP_002815235.1|DBSCAN-SWA MDVHNVEMVMSAVSASQYPTDGKPEIALVGRSNVGKSSLTNTLIQRKNFARTSSQPGKTQTLNFYDVEDKLYFVDVPGYGYAKVSKAQREAFGVMIEEYITSRKQLRGVISLVDARHEPSEDDISMYEWLHYYNIPILVVATKSDKISRGKFNKAESVIKKALGFDNEDSDFQFFSSETKYGKDEVWHWIEQHI >NC_016805|1408726:1421778|1408726_1409869_-|WP_002815228.1|DBSCAN-SWA MRTIAGNLFTDDLQGDKIGVFFGTLAPMHVGHQAEIYKAAALNDGVVVIASGYTNDRGYQIGLSVEKRFRYLREAFSDETDIKVDYINEDNIPMMPDGWDEWTRIIVETVKRNIVNKDATITFYTGEKDYKNQLETRLPKNGQFKVSLMDRTVLKISATDIRKDPIGNWDYINRVFRRHFAKKVTVMGSASTGKSTLVRRLARTSNSPFSEEYAREYQEKSNVSDEELVVKDYIRLIQGQYDANSREINSPANNGLTIFDTDAMVTKVYADMWLNDVDNAQLKPLFDNTIGEELIDLILLIPPVTPYVDDGFRNMTTSDNDSRWAFHRHLLEVIEEYGFTDKLVILDAKGDSDDPYGYYARYLQALDAIQTRTGFNIKHI |
11 | Staphylococcus_phage(37.5%) | protease,integrase | attL 1399899:1399913|attR 1418675:1418689 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1635025 : 1645796
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_016805|1635025:1645796|DBSCAN-SWA CTCATCGCTTTGCTCCTTCAACTGCTTGCCTTAAATCTGCCAATAGGTCCTCTTTACCTTCTAATCCGGCACTCACACGCACCAATTGATTGGTAATACCCAAGTGATCACGCTGCTCTTGACTCATATCGTGATGTGTTTGCACCGCAGGAATCGTAATTAGCGTTTCTGGACCACCCAAGCTTTCCGCAAAAGACCCGATTTGTAATCCTTTCAAAAAAGCATCTACATCATAATCGTTTGACAAATAAAAACTCAACATTCCACCAACACCAGCATATAAGACTTTATCTATACCGGGAATACACGGTAATTTTTTGGCCAAATATTGACCATTTTCATTGTGGCGTTGCATCCGAAGATGCAACGTTTTCAAGCTACGCAACAATAACCAAGAGCTAAACGAATCTAAAACCTGTCCGCGTGTCGTCAGTGATATTTCTAATTTTTCAGCTAAATCATCACTATTAACAATTACTGATCCAGCCAAAATATCATTATGTCCACCAAGATACTTTGTGGCCGAATGGACGACAATATCCGCGCCAAGTGTCAACGGCTGTTGAAAAATAGGTGTTAAGAAAGTGTTATCAACAGCAATTAAAATATCAGGATTGATGCCTTTTACTTTTGCACTTAACTTCTGAATATCGATTACTTTCATCGTTGGATTAGATGGTGTTTCCAACCAAATAAGTCGCGTGGTTTCGTTAATTAAGGTCGAAATGTCATCCACCCCATTCCAAACATCATAGCTCACGCCACTCTGTTCAACAATGGCATCGAAATAGCGATATGTGCCGCCATATAGATCATCCGAGGTAACAAAATGGTCCCCATTTTTAATCAATGACGCAAACAAAAGATCAATCGCTGCCATACCAGAGCTGGTAGCAAATGCCTGCACGCCCTGTTCCAAATCCGCTAACTGCTCTTCCAATATTTGACGTGTGGGTGTTTGTAAACGTGCATAGTCAAAGCCAGATGATTCACCCAAATTGGGATGTCGATAGGCCGTTGAAAAATACAATGGACTAACTACTGCCCCTGTTTTAATGTCATCACTGCCGTTACCGCCCTGTGCTAATAATGTATCAATTTTAATGCTCATAAGTATTTACATCGCGAGGTCCCTAGACCCAGCTTGTTCCTCTCTTGATTTAATGTTGGTATTGTTGATCTTGATGAAGTCATCTTTTCCATCAACAGTTCCCCCCAATTTACAAAAAATTTTTCAGCATAAGTCTGCCATGTATTGGTTGGTTTATTATTATAAAAATAGTTCTTAGGCTTAATTGTGTTTGGGTCAATTGCTATATCACGAAGATATTCGTTCTCTAAAGTCTCAGTGTCGTATTCGAAATGTCCAGTAATGTAGGTTGAGTTTACATGTTCATCCCTCAAAATAAATGCGCCCAAAATATCGTCACCAGCAACTTTCAAGCGTCTAGCCACACCAAAATTTGGTACCGTAAAGTAACGAGATTGTGGCATACTAATGTTTTCCAAATCTTTTAATAATGAATGACGTTTAAAAATTTGGCTAGCTTGAAAGACGCCCGAAATTTTTTCTGACAAGGCTTTAACAGGAAAGTTTCTCTCTGCATAGCCAGCGCCATACGCTGCCCAACATGCAAATAGACTTTCAGTTACATGTGTTTTTCGCCATTCTAGTAAATGACGAAATTCATCCCAATAGTCGATTTGTTCAAATTTCATGCGATCCACTGGCGCACCTGTAACGATCATGCCATCGAATTTTTTGTGCCAAATATCGTTGAGTGTGACATAGTTAGTCATAATTGCATCCGTATCGTGGCGAATTTTATGCTCACTTGGTACTGCAAATGTTACTCGCACATTGATAGGCAAATGACTCAACAATCTTGTGAACTGCTTTTCAGTCTGTAATCGATTGGGCATTAAGTTGACCAAGAGTATATTGATAGTCGGTTCTAATACTTCAAAACGACCGATTACAAAGCTTTCACGCTTCAACAAACCGTTATTTAATATAACACTCATACGTTCCCTCCAAATTCTTAAAAAATAAAAAACGTCCCGTAGTATCTAAAGATACTACGGGACGTTAATTGACGTGTTACCACCCGGTATTTATGTAAACATTGCCAGTTTACACCTCCAAACGTACGCCAAAAAATTTCGTCGAGAACATCTGTGAAAGCTTTGGTTTATACGTTGTCCAGTAACGGGGACGCCCGATTTCAACTTACCGCGTAACACATATGAGTGTTCGCTTGCTCGTATCCGTAAAAAACTCCAAGACCATTTTCCAACTAATTATCTTACCCGCTTTCACCAAACACGAGCTCTCTAACTAAGATTCAAAGATGTACTTATCTTTTCAACGTTTATATTGATTATTACTATAACTTTTAATTTGATATATGTCAATAGTTTTTAATATTTCTCATGGTATTTTTTTATATCTTCTTTCATCTCGGTTTTATATTCAGCATTAGAAACTACTTTATGGTACAATTCTACTAGAATTTAGTGAGGTAAATAAATTATGTACGAACCAACACATAACTCAAATGAAGCTGTTGAGGAACATATAAACAAGCCCGGTCGTCATGTCATGTTTCTTTCTGCAGATTGGTGTGGTGATTGTAAAGCCATAAAGCCTTTTATTCAAACTATCAAAGATGAAGTTACACAAACTGCTGAATGGTTTGATGCTGATAGAGACGAAAATATTGATGTCGCAACAAAACATAATATGCGTGGTATTCCATCTTTTGTTTTGTTTGAAAATGGACAAGAAATTTCACGTATCGGACACGGCGAACGCCTAACACCAAAAGAAATCGTAGATTGGTATCATTCAACACTTTAGTTTTAATGCCAAAAATAGCCCATAAATATCGCAAGAAATTACTAAACTTGTGATATTATGGGCTATTTCTATGTTGCGTTAATATGTTAGTTACTACTTTTCGGTATTCTTAATAAATGTCTGAACAATATCTGCTGGAATAGCAAATCCCATGCCTTCAACACTCGTACCGTCCGTAGAAGAAGCTATTTTTGACGAGTTAATACCAACTACTTGACCTTTTAGGTTAATCAATGGTCCACCAGAATTACCAGGATTGATAGCGGCATCTGTCTGAATAGCAGTAGTTGCTGAAGAACCCGTTTCTTCAGCAGAAAGTGTGCGGCGTGGGGCTGAAACAATACCACTAGTCAAAGAAGTAGCATAATCAGAACCCAAAGGAGAGCCGATTGCTAAGACCTGTTGACCAGACTGCAGTTTTTTGGCATTACCAAAGGATGCTGATGTTTTGATATCTGTGGTTTTTGCCTTTAACAGAGCCAAATCTTTGCTTGAATCTGTGCCAACGATAGTTGCTTGGATTTTTTTACCGCTAGCGGTAATTAATTGTAATTCATCAGAATCAGCTACCACGTGATTATTGGTAATAATATACGCATAGCCACCAGAAATTTTATAAACAACACCTGAACCCTCTGATGCTGTTTCCAATTCAGAACTACTATCTTGCTGATTTTGCTGGAAATATGATGACCAACTACTGCTTGACGATGTTTTCTGTAAATTCTGAACAGTAACCACAGCGTTTTTCACTTTGTTATAAGCCGTTGTTGCCGTATCACTACTTGTGTAAGCTGTTTTGGCAATAGTTGTTGTACCAGCTGAGTTGCTTGTTTTTGTTGTATTTGTACGTTGCTGGAACCAAGAATCTGGTTGCAATCCAGAATAGACAACAAAACTTGCTACCAATGCCGAAACTATAGCAACGATAATTAAAGAATGCTTTTTCATAACTCGCCCTTTCATATGTGTACATTATTGCTTTTCTGACAAAATCCACACCCTATTATATCCATAATAATGACATAAAGTAAATTAAACATTAAAGAGGTAAAATGACTTTAAAAACAGTACCTTGCGGCTGATTATCTGCTACTGTTATTTTACCACCGTGAGCATGAACTACCCATTCAGCAATCGATAATCCAAGTCCGGTACCACCAGTTTGACGATTACCAGTTTTGTCTTCACGATAGAAACGATCGAAGACATGTTTTTTAGCCTCATCACTAATTCCTCGACCGCTATCAGCAATGGTGAGGACAAACTTTTTCTTTTCAATACCTGCTTTCACAGCAATTGTCGCACCAGCATCTGAGTACTTCAATGCGTTATCAAGTAACAAAACTAGTAACTGATGAATTCGTTTCTGATCTATAAAGATCGCTTGATTTACATCAACCTCAAGTGTCACAGCTTTCTCTTCAAACTCTGCCATTTCTTGATATGGTGTAATAATGTTTTCTAAGAATTGCTTGACATCCGTTGATTCTTTTTCAATGGTGGTCATATTAGACCCTGTTTTTGCTAACGTTAACATATTATTTGTTAAAGAATTTAACCGTCGCACTTCAGAAAGCGATAAAATAATAGCATTTGACTGATCACGAACCGTTGATTCCGGTTTTGTCAGCATTGTCTCTAGCTTACCTTGAATAACGGCCATAGGTGTCCGTAATTCATGAGCCGCATTGTTAACGAAGTCTTGTTGTTGTTGCCAGGATTTTAATATTGGTTTCATATTTCGCCGAGCAATTAAATATGATACTATCACTAACAAAATACCAAAAAGACCAAAGGACCAGAACAATACTTTCTTAAAATTATTCAAGTTATCCATGGTGTCTGTAACATTAACCGTTACCATACCATGGACTGCAATTTGATTATAGCCCTTAGCAGCATTTTTCTTGAACTGAAAACCAATGATTCGGTAATAATTACCATAAAATTTATAGGTATTAGGTTTAACCGTCATTGTTGCTTTATCAAATTTGATAGCTTGTTGCAGCGCTTTTTGCAAAGCTGCTTGACGTGTATCCTCCGTATTGCTATCAATTATCAACTTACCATTTTTGTCAAATAACCATGTTTCTGTTCGCGTGCTGGTATTATTATACAAAGGTTGTGGCTTCTTGAC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TTGCTACAGCGAACATTGAATATCCAGCAAAGTCAAAAAATAAATTCAAACCGTAAATATACATATACGCTATTATCCACCATGACCATCCGCCTTGAGCGTGTGCAGAAATAATCGCCATACGCTCAACATTTGGCATTAATACAGTTCCCAAAGCATGAGAGACGATGAATTTATACAAAAAACCAATGAAAAGGTATTTGACAGCTTTGCCAAGCATTTCTAGATACTTATCGCGTGTCGGTGCTTTCTCAACATCTTTCACAAAACGACGGTACCGATCAATAGGACCTGACGAAATTGTTGGCATAAACAGCATGAACCGCAAGAAAAGCCAAGGATTAAATTCTTGAATCGAACCATCACGTATTTCCATCACCATACCAACTGAACGGAATGTCAAATACGAAATACCCATAAATCCGAGTAAGGTTGTCACTTGCAACCAATTAGCAACTGGCGCAACCTTAATTAATACTAGTGGCAAGATAGCTAAAATAGTTGTGACATAAAACACCCAAGCTTGGTTGTACTTTTTACGATACAAAGTATAGGCCCAAACAAGCAGCCATTGACAAATCATGTAAATAATTAATGCGATACCTTCATGGTATTTCTCACCATCAAACATCAAGAAAATAAAGACAAGTGAGACCAGCACTTCATACCAAGCTATACGCTTTCCAAAGTATAAACCAATGGCTAGAGGCAGTAGAGCCAACAATAAAATAATGAAGTACTGCGGATCTGCATAGGGTTGTAGATTAAGCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_016805|1635025:1645796|1641391_1642513_-|WP_014325120.1|DBSCAN-SWA MTDNDILCLRPTWLDIDLKAIQTNAKLIMRHAGAQRLIAVVKANAYGHGAKQVVGALFEVGVYDFAVATIGEGVDLRKYYPQAEINIFLLGVQDVTQTEVMVENRLSPAVGTTEWLDEAVNYIKDGQKLDVQLAVDTGMGRMGAHSASAVEDMYHLIQGTEKFQLAGVFTHFATADDNNQNYYDEQVQRFYQWVQSAGIPKQYWHLANSGSAIWHHDEIYTDTIRVGSVLYGYNPGAPEKKMSLPLKPALQLKSKLGSVHQLTTGESVSYGATYTAEKPQWIATLPIGYADGYLRRMSGMKVLVDGHIEHVIGRVTMDQIVITLKQKYPVGKTVTLVGLEGENQISVEEIAEYAQTIPHEILTNFGARLPRIY >NC_016805|1635025:1645796|1638926_1640225_-|WP_010280580.1|DBSCAN-SWA MPNAINKKQQVRGFIWLLASFFVIFSILASVIFVSYTRTVFNSADSAINQTLSMYDSNGLLSTSDKDVKKPQPLYNNTSTRTETWLFDKNGKLIIDSNTEDTRQAALQKALQQAIKFDKATMTVKPNTYKFYGNYYRIIGFQFKKNAAKGYNQIAVHGMVTVNVTDTMDNLNNFKKVLFWSFGLFGILLVIVSYLIARRNMKPILKSWQQQQDFVNNAAHELRTPMAVIQGKLETMLTKPESTVRDQSNAIILSLSEVRRLNSLTNNMLTLAKTGSNMTTIEKESTDVKQFLENIITPYQEMAEFEEKAVTLEVDVNQAIFIDQKRIHQLLVLLLDNALKYSDAGATIAVKAGIEKKKFVLTIADSGRGISDEAKKHVFDRFYREDKTGNRQTGGTGLGLSIAEWVVHAHGGKITVADNQPQGTVFKVILPL >NC_016805|1635025:1645796|1640205_1640907_-|WP_011680398.1|DBSCAN-SWA MSKAIKILLIEDDVNLADNVVGFLQDFADINAVTDGLDGEFEAQEAPYDLIISDLMLPGETGLELIKNLRANDVETPVLILTAKTSLDDKIEGFNVGADDYLTKPFHREELLVRVKALLRRSGVYSEDNTLAVGDVMINLENRGVQVHGQPVKLVGKEFDILTYLAQNKNIIVTRDQIFDRVWGIDSDTTINVVNIYLNNLRRKLEAVGQNNLIKTLRNIGFILEVEDAERNQ >NC_016805|1635025:1645796|1635025_1636135_-|WP_014325118.1|DBSCAN-SWA MSIKIDTLLAQGGNGSDDIKTGAVVSPLYFSTAYRHPNLGESSGFDYARLQTPTRQILEEQLADLEQGVQAFATSSGMAAIDLLFASLIKNGDHFVTSDDLYGGTYRYFDAIVEQSGVSYDVWNGVDDISTLINETTRLIWLETPSNPTMKVIDIQKLSAKVKGINPDILIAVDNTFLTPIFQQPLTLGADIVVHSATKYLGGHNDILAGSVIVNSDDLAEKLEISLTTRGQVLDSFSSWLLLRSLKTLHLRMQRHNENGQYLAKKLPCIPGIDKVLYAGVGGMLSFYLSNDYDVDAFLKGLQIGSFAESLGGPETLITIPAVQTHHDMSQEQRDHLGITNQLVRVSAGLEGKEDLLADLRQAVEGAKR >NC_016805|1635025:1645796|1636131_1637049_-|WP_014325119.1|DBSCAN-SWA MSVILNNGLLKRESFVIGRFEVLEPTINILLVNLMPNRLQTEKQFTRLLSHLPINVRVTFAVPSEHKIRHDTDAIMTNYVTLNDIWHKKFDGMIVTGAPVDRMKFEQIDYWDEFRHLLEWRKTHVTESLFACWAAYGAGYAERNFPVKALSEKISGVFQASQIFKRHSLLKDLENISMPQSRYFTVPNFGVARRLKVAGDDILGAFILRDEHVNSTYITGHFEYDTETLENEYLRDIAIDPNTIKPKNYFYNNKPTNTWQTYAEKFFVNWGELLMEKMTSSRSTIPTLNQERNKLGLGTSRCKYL >NC_016805|1635025:1645796|1640987_1641353_-|WP_002815839.1|DBSCAN-SWA MTEEHQAVMRGDVFYADLKQGIGSEQAGVRPVLIIQNDVGNANSPTTIVAAITSQISKPKLPTHVLLPEHMSGMKRDSVILAEQVRTIDKRRLRDKIAHINASSNEMQLVAHALRISVGLK >NC_016805|1635025:1645796|1644587_1645796_-|WP_014325122.1|DBSCAN-SWA MLNLQPYADPQYFIILLLALLPLAIGLYFGKRIAWYEVLVSLVFIFLMFDGEKYHEGIALIIYMICQWLLVWAYTLYRKKYNQAWVFYVTTILAILPLVLIKVAPVANWLQVTTLLGFMGISYLTFRSVGMVMEIRDGSIQEFNPWLFLRFMLFMPTISSGPIDRYRRFVKDVEKAPTRDKYLEMLGKAVKYLFIGFLYKFIVSHALGTVLMPNVERMAIISAHAQGGWSWWIIAYMYIYGLNLFFDFAGYSMFAVATGYVMGIEVPMNFNLPFLSRNLKEFWNRWHMTLSFWFRDFVFMRLVFLMMKKKWFKSRVTTSNVAYIINMLIMGFWHGLKWYYIAYGLFHGVGLVVNDMWLRYKKKHHVPHNKFTNALAIVITFNVVMISFLLFSGLLDKIWFQR >NC_016805|1635025:1645796|1642990_1644277_-|WP_014325121.1|DBSCAN-SWA MLKKRGLWWIFGPVILAFVMVTALFLAPFSLNYLSNKDIQKASVSFSKNVFKGESVKMAAFSNSTTNYVPFFGSSELLRLDTMHPSVLAAKYKRNYQPFLLGQAGTESLSHYLGMQEMTPALHKKQAVFIISQQWFTKRDSKWAFPQFYSPLQTVNWLRNIKTISATDRFIAKRLLEQKQISDNSFYARLITKIKNNEPLSETDQSLLMLRNRMLLREDQLFSNFAVSNNWDKQVEPALKSLPKTDNVSLLEREAMRVAKKQTGNNKFGIKNSFFRMRVKPSLKKLENSQSHFDYRQSDEYSDFQAVLQEFAKEHTDVLFIIQPVNKRWSKYTGLSTKRYYQSVDKVKKQLKSQGFNQIADFSHDGGHKYFMQDTIHMGWRGWVAADTKIKPFFARGYQEPTYHINDNYLSKKWQNLIPTDKNLKNFK >NC_016805|1635025:1645796|1644281_1644518_-|WP_010292689.1|DBSCAN-SWA MDLKEQIVEILNTIIGEDISDQMDDDFFENGLLDSMATVELLLDLESKFNIQAPVSEFNRDEWNTPNKVVAKVESLIG >NC_016805|1635025:1645796|1642509_1642920_-|WP_002815841.1|DBSCAN-SWA MIIGIGNDTEAISRVAEIVERQKSFITLILTPAERAAAAERKGKHQNEYIAGRFSAKEAFSKATGYGIGEKVQWQDIEILNEPNGRPVMKVKNFPYHTYVAITHSGDQVNTVVVIERLTLLEKMSIKLFPKRGVLS >NC_016805|1635025:1645796|1637977_1638835_-|WP_010280582.1|DBSCAN-SWA MKKHSLIIVAIVSALVASFVVYSGLQPDSWFQQRTNTTKTSNSAGTTTIAKTAYTSSDTATTAYNKVKNAVVTVQNLQKTSSSSSWSSYFQQNQQDSSSELETASEGSGVVYKISGGYAYIITNNHVVADSDELQLITASGKKIQATIVGTDSSKDLALLKAKTTDIKTSASFGNAKKLQSGQQVLAIGSPLGSDYATSLTSGIVSAPRRTLSAEETGSSATTAIQTDAAINPGNSGGPLINLKGQVVGINSSKIASSTDGTSVEGMGFAIPADIVQTFIKNTEK >NC_016805|1635025:1645796|1637557_1637884_+|WP_002815833.1|DBSCAN-SWA MYEPTHNSNEAVEEHINKPGRHVMFLSADWCGDCKAIKPFIQTIKDEVTQTAEWFDADRDENIDVATKHNMRGIPSFVLFENGQEISRIGHGERLTPKEIVDWYHSTL |
12 | Pandoravirus(14.29%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
0 : 14729
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_016828|0:14729|DBSCAN-SWA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_016828|0:14729|1572_1854_+|WP_014335295.1|DBSCAN-SWA MSTIDKTLTLINFENNWCAQCYTQRPIINKISHDFNSYLNVRVVNSDAHPELAKKYNVYSVPSTILLRDGRIVEKITRFIDQSQLTTLIKYYL >NC_016828|0:14729|3707_4355_+|WP_014335309.1|DBSCAN-SWA MEIKYWSDIACPFCYIGSNRMKRAMKEIGIYDTTELEFKSFELNPATPKETDEGYINHFTQGNKAMEPQAKKQMAYIEQMAHNDGLPMDLDSVVPTNSMDAHRIIKFAETKNDPDLTERVIRRFYQVYFSDGQSISDHDVLLNAAMEAGLAKDEVEKVLNSNQYHQAVVNDEAEAQQSGIHAAPFFVINNKYAISGAQPYEVFVKALKRVQEEEN >NC_016828|0:14729|10891_11197_+|WP_078126288.1|DBSCAN-SWA MDEVISEADIFVYRNNEIIIGFLGELDGYIAGLFVDMNYRNQGIGSRLINYLKQINDKLTLSVYVDNINAVNFYENKDFIIDSVGMDTETNSKEYHMIWEK >NC_016828|0:14729|802_1447_+|WP_014335296.1|DBSCAN-SWA MFEQAVNYKNGLYEELSKIGKGLSSDRRLEILDLLTQAPKSVETIANGVGISVANASRHLQILKDSHLVKTKRKGNHIIYSLSSPRISDLVHLLTDIGNSELSDMKTIQDKSDAQDNVKTISLKQAQEEYKNCFVLDVRPTDEYAAGHIQSAINVPLETLKESMPKLPKDQKIIVYCRGRLCANSNIATQILNKNGFDAVSLNSSHYDWNKITE >NC_016828|0:14729|6279_6618_+|WP_014335306.1|transposase|DBSCAN-SWA MIHKHHHLIEFIHDRLSKTIIEHFIKNYSLSERQAVKTVSIDLNANYQSVIHKIFPNAQIIVNRFHIVQLYSRALDQVRISCLKKINDKHSRLYKALKSNWHRYEYIYFNVT >NC_016828|0:14729|9305_10733_+|WP_014335303.1|DBSCAN-SWA MQEVESKKIKLNNTRYRLGYHIMAPSGWINDPNGFCYFQGYYHIFYQHYPNDSKWGPMHWGHARSKDLVHWESLPIALTPGDKEDEDGCFSGSAVVYNGKMYLIYTGHHYYGDGDSDHFWQNQNLAISEDGIHFEKYENNPIISQAPEDNTQHFRDPKVWYNNGKWYLILGSQNKQELGRVLLYKSDNLIDWILVGPVAESKDTKKEGYMWECPDFFRLGDNDFLLMSPQGIEADKGRFKNLHETGYLVGNYRYNDNNFERGDFNELDNGHDFYATQTTLTPDGRRIVIGWMDMWESPMPESADGWAGALTIPRELIYQDGILKMKPIKELEKLRTRELLNKNYLVKGNQNIVSNSRNYEAKLNLNVGDNDEAGFELRNEENNLILRVVYDKRNNRIVLNRSGDDPEREAILSKSEQLKFHLYVDTSSIEIFVNDGERTFTERFYSDGAKLNVISENDMKVQASVYQLDKNAVKF >NC_016828|0:14729|8062_9295_+|WP_014335304.1|DBSCAN-SWA MRKNTYVRLSAFFFFFFVSWSACYSLFAIWLGQEIHLNGEATGIIFGINAAFTLLMQPLYGYISDKLGTRKDLLVYLSGILIFTGPFFIYVYGPLLKFNVVIGAIVGGIFLGVGYLASCGAVESYIEKISRKYDFEYGRARMWGSLGWAVATFFAGQLFNINPSYNFWIASIAAIVMFLIILTTKVEVTDVEVKNADSVTVKDVFNLFKLKDFWFFVIFVLGITCVYGVYDQQFPRYFAEQFATVKLGNQMFGYLNSFQVFLEAGMMFLAPKIVNKIGARNSLLLAGFLMAFRITGSGLVDGPILISMMKLIHSFELPILLVSVFKYLDANFESRLSSILYLVGFQFFGQIGTIGLSSLVGKMYDSLGFKITYLYLGIFVCVFAVISVFTLKKGDSQITKTNSIDAHVQS >NC_016828|0:14729|6968_7946_+|WP_014335305.1|DBSCAN-SWA MKAKIDDVAKLAGVSKTTVSRVMNKRGYLSEKTIKKVHDAMDELNYQPNVVARQLFKQETKLVGLIFPTVNNPFFGQLVATMEKKLFSKGFKVLLGDSMNDPEKEKLYLRELMAHQVDGLIVGAHNQGIKEYQNANLPIIAIDRIMNNDIPVVSSDNYQGGKMATELLIKNGAKVIIHTNGPKTLQTPAQKRYQAYEDTMIQYGLKPITYTVDFNVSYEQKAKFLKNIFKEHPDVDGMFISNDVDAAQAIDIAGDLGYKVPEDLKIVGYDGAEATRILLPNLTTIIQPIDRMAETAVNMLVARISNNDAGENKVLPVKVWRGKTV >NC_016828|0:14729|11841_13077_+|WP_014335300.1|DBSCAN-SWA MAHLKKNTRGAVPGLAVHFERKTDHHTNTEIDVSKSYLNQDLMADGSDMLSRFSARLNDVYCMKRDDVKALATWIVTLPEELAEAPYEQQSAFFEATTNFLSERYGQENAVAAVVHYDETTPHLHYAFVPVVFDDKKSRYKVSAKEVLTRPDLQTFHEDLDQHLKKVLPFYEQGILNNKTLPFENVAEIKKYNDQFNALKNELADVEENIRAKQAVLKITDQALTEVDLAEKQIDTFKQALSKNLFGKTVLKPDDLDRFKSVLGTMKKATLQSQHETEELKQTLGQVKAQLADVQADYQNLKETHQVLQQRQRDQQQLDYAMRDMLKNDYGVDKLSHTDVEARYVLYKLDHEELTKNKKVAQSWLKTLTTARADPDTKIAPTRLDHGIEQVKALIHRIIELTRDIFKGPSL >NC_016828|0:14729|13574_14729_+|WP_014335299.1|DBSCAN-SWA MSIIPESKTRQVHTLNELSKRKVVEHNSLITSIAKMDKTPLKMFELAVSLIDTDNPPQDQTVYLSKQELFAFFKVNDSNKHSRFKEAIEKMQKQAFFQIKKEQEKGFKYTSIVPIPYVEWTDYNDEVKIEFHREIMPYLINLKNNFTQHALSDIAELNSKYAIILYRWLSMNYNQYEHYSVKGGRREEQVESYRNPIISMRELREMTDTVNEYKLFTNFSKKILDKPLQEINEQTTFNVTYEKVKKGRSIDSIVFHITKKQVAADSSYKQDDPVYIEGKIRQEETEDMLTVKAIKSPYTKLLMEQFLLSYIDLTDTTILSGLQKNVYPLYDELKELRGLKGVKEHLAYIRDKQDDYSKKNIAKYLKKSIEQYLPIVKRQDIDHE >NC_016828|0:14729|2744_3689_+|WP_006844822.1|DBSCAN-SWA MRKYDVVVIGAGPGGMTAALYAARANLNVAMLDRGIYGGQMNNTDDIENYPGFTTIKGPELGEKMYQGTVKAGVNFVYGDVQNVTVDDQQMKHIQTDSDELVASAVIIATGSNNRKLGVPGEEKFSGKGVSYCAVCDGSFFKGKNVTVVGGGDSAISEGLYLANVTDGVNVIHRRDQLRAQKVLQNRAFDNDKIDFTWNTSVTEILGDENHVTGVKIHNNQVGDDTTLDTDGVFVYVGNFPNSQIFNNLNITDQAGWIITNDQMETTIPGIYAIGDVRQKQLRQITTAVGDGGIAGQNAFEYFEAIKHRQTVKD >NC_016828|0:14729|4516_5848_+|WP_014335307.1|DBSCAN-SWA MKFDYVVIGSGPSVYRFLLGMQNSGKKIAVVEKNRFGGICPNEGCEPKIFLEGAARATLTSMRLQGKGITQPAKLDWKELIQQKNKAMASFLNNMQSMYEGLGATTIKGEASFVDQHTIEVNNKKITADNFVIATGKKPHPLNIPGHEYLLTSTNLFELEDTPKNVAIIGSGYVGMEFATLLSAAGVKVTVIVRSGQPLEGFYSQHVHQLVDEMKNSLGINFIFNTNVTAVTEAQTGYEVQSANGNLGTFDKVINASGRVPEINALKLDNAGVEYSNRGIKVDKYLTTSANNIYAMGDIVDKTAPALTSTAQFEADYLSALLTNKTTEPLRYPVIGTVTFTFPQLAQAGISIDKAKEDSNYSIKDIDITQGDFFYAGTDDHARLSLVFDKQNHLVGAAEISQTAVDDINALIPVMAINVDPEVWKEKMIMAFPGLAYKIRTLI >NC_016828|0:14729|2202_2526_+|WP_014335294.1|DBSCAN-SWA MEQLSVMNKKEFDKKLKNGKYILVFMASWCPDCSFIKPHLPEIEQEFKDYTFISVDRDENTELAQELNIFGIPSFVIFRDGQEIGRLVNKDRKTKEEVENFITNTIK >NC_016828|0:14729|1867_2182_+|WP_006844824.1|DBSCAN-SWA MVKNLTDKDFVKETSTGVTLTDFWATWCPPCRMQGPIIEQLDKEIGDKVKITKMDVDANQETPMEFGIMSIPTLIIKKDGQVVDKLVGLQSKDQLKTVLAQYTN |
14 | Streptomyces_phage(16.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
0 : 9468
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_016820|0:9468|DBSCAN-SWA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_016820|0:9468|3697_4378_-|WP_014333924.1|DBSCAN-SWA MEYKKLTLSEKLNIIRAGVLGANDGIIGGAGVILGITGATTNNTVVFVAGIAEMLAVAFSMASGEFVSVSSQKDTEKAVVAKAETLLATQPTIVHDEIAIYYEQRGADPKLAARVADDLMTNDALKHYVQIKYGIVVGKYLSPAHALVSSFIASISGGIWPLLSVILLPDNLKVIGIILATLWALFLTGWLSAWAGRAPISPAILRNIFTGVLTMAFTYWLGTLFK >NC_016820|0:9468|4379_5054_-|WP_049640002.1|DBSCAN-SWA MNIQISKKINILRAIVMGANDGIISIAGVVFGVYGASMNTWTIFLAGLTATIAGTFSMATGEYVSVNSQLDSERSAKDEQRSALVNNFSQEAQFLIQHYQTDGISEENARLLAQQSMQKDALGETLHARYGINEDDFISPAEAAIASMMAFPLGAILPMVGMIFVPMTYRVVITLIFVIFALVLTGYFSAVYGNTPKKTMILRNVLMGLLTMSVTYLIGLLMAA >NC_016820|0:9468|7031_7436_+|WP_014333928.1|DBSCAN-SWA MKKVYFLCTGNSCRSQMAEGYAKQILPANNFKIESAGVESHGLNPMVIKVMAEDGVDISKQYSKLIDLQYFNTADVIITLCGDAKDKCPMIPAQTKSLHWPLSDPAQTKGTIEEQLQEFRNIRDQIKALITELK >NC_016820|0:9468|2654_3617_+|WP_010277818.1|DBSCAN-SWA MEYLLIMFLVIVTIFLGKVGTWFGFSEVVGQLFSGIILGSSIFNIVQSSNLIHLIAEIGIFLLMLNSGLESDLKEMKRYIKASSLIAVMGVLLPLITFPIAFLLLGYNIQTSIFAGVVFSATSISITLAVLSEQKKLATAIGAIILSAAVIDDIIALFAVTLFSVLVGGGALGINSILPLLAFALGILLRKYNFSDKIGVISTKMGNSFFYPVFFGSIGLEIVIQGLGDKITAIIIFSILAIVTKFVGSLWGAKISGLDTRVSSAIGAGMISRGEMALVIIQIGISSHIIDDYTSAEFIVAVIVSTIVAPIIMKPLFKKI >NC_016820|0:9468|8634_9468_-|WP_014333932.1|DBSCAN-SWA MTTKLLFGNFKGGVGKTTNSVMVAYELAKKGYKTLVCDLDPQANSTQLLRRTYGLQNGIELPIENTMMVALQENTIKNSLVEIMDNLYLLPSHKDFVNYPDFLELKFLPNKPDYKKKRISFFQDQLSKIEDDFDYIIFDVPPTLSIYTDTALYSSDYVIIVLQTQQRSLDGAEAFWEYLQTFYNTYKDVDFDIAGILPVLLKNNVGLDNQIIDDAKKIFGEETLFNVIIKHMERLKRYDRQGISEQQMTAQNDFHDIKVHRIYSDLTDEIIERTHQN >NC_016820|0:9468|34_382_+|WP_013102144.1|DBSCAN-SWA MNFFNFYLYFCLAAGLGAVIRYLVISFMPRITNFFTGVFYVNIIGAFLMGVLSVNMNSNVWHIIIGTGFIGGLTTFSTMMTQGEQFNSFKRSMVYFALTLVLGIFLFIVAIHIHV >NC_016820|0:9468|556_2089_+|WP_014333923.1|DBSCAN-SWA MFKKRIRLNTSKLSVVLYGTLIGFLTGIVVSVFRWTIEKLLQFVQTLYLDISHGNIALIFLVITANLICFLIVSWMLNKEPNISGSGIPQVEGLLLGELKINWWSTLWRKFISGILAIGSGLMLGREGPSIQLGASIGQGVASYKRLSHNQSKGLIASGAAAGLSSAFNAPLAGVMFVLEEVYHSISPFVWVGALTGASVSDFVSTVLFGQTPVLSIGHLSVFPVQLYGLLLVFGIILGLFGFLYQKFLLFSLNCYSKIRVPKYLYGIVPFILVIPIGILWPNLLGGGNNLILSLKEAPMTMKMIIVILLVRFVFSMISYGSGLPGGIFLPILTLGALSGALMAHIFVYLHLMSANYALNFIVIGMAGYFACIGKAPFTAIILIFEMVGSVTHILPLALVSLVAYLVVDLLNGAPIYESLLERLLKRKPAHLAMSSMITMEVTVLAGGMLEDQQIRDLQLESNSLITLVRRSENVLIPKGDLVLRAGDIIYIRMNQKDAKITRNQLSLNN >NC_016820|0:9468|8254_8632_-|WP_014333931.1|DBSCAN-SWA MAKLEFNKDPNRKKSFKKVEETHISEPKKTFSTTATLENTPKPYNTTPNPKIGRPRKNKTYSTIRIQRHTVNRINALQNTLNFDTQDDLIINMLDKLETVLDSEQKTMLDMYMKTYTAKEKRQNS |
8 | Staphylococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DBSCAN-SWA_2 |
13998 : 21974
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_016820|13998:21974|DBSCAN-SWA TATGTCAATTCGTTATTCACAAGATTTCAAAGATTCATTGGTTAGACTTCACCAAGAAGGCCGTTCACTTAAATCATTAGCAGAAGAATTTGGTCCGTCGAAAGATTCTATTGCTATTTGGGTTAAACAAGCTACCCCAATCATGATCAAGGGTCAGTCAAAGACTTTAAAAGACGTCAAGCAACTAGAGAAGCGCCTCGCTATTTTGGAGGAAGAAAACGAAATTTTATCACGCATAGCCTGACAGGCATTGAGCGGCCATCTTACTAGCCAAAAAATAGTCCGTAATGTGGGATTGCCGCTAGTTAACCAATTTTTAGCACAAGGCTACGCGCTTGTGCGTATTTTAAGTGCACTTAAAATCAAACCTAGTACCTATTACAACTGGCGCCATTGGCAGCCCAGTCGACAAGAAAAGCGTAGAGAATCCCTGAAACCTTATATTTTAGACGTTTGGAAAACCTTTAAATTTTATGGTTATCGTCGTATTGCTGCTTATAGTCAACAAACCGACGGTCCGAAAGTATCTGAGTATATGACACTCAAATTGATGCGTGAATTAGGGATTAAATCCCGCATGCAAAAACGTCATCGCAAACCCAAAACTGTTGTGACGGTTGATCAAAAACCCAATCTGATTAGACACTTGCATGATTTGAGCGGTGTTTGGCAAACAGATATCACTTGTATTCAGTTGACTAATCACAGATGGGTCTATTTAGCGACCGTTTTGGATCCTGAGAAGAGAAAAGTATTGGACTATAAAATTGGCGATACAATGACAGCCGAGCTAGCCACAAGTGCCTTACAGATGGCGTTAGATAAGCATCGAAAGCCACTCATTATTCATTCAGATATGGGGTCACAATACACGAGTGCTGAGTTTAATATTAAATGCCAAAATTATGGCTTGAAACATTCATATTCACTCAAAGGCCATCCGTACGATAATGGCCGTATGGAAGCGTTTCATTCAATATTGAAGCGTGAAGAGGTGTATCTGAAGGCATACCAAACATTAACTGAAGTCCAAGCAGCCATTGGTTGGTATATCAATTTTTATAATCGAAATCGTATCTCAAATGTTGCCTAAGTAACTGAATAAAAATAGTCCAATTTATTGACTTCTGAGCAAAAAAAGGCGCTCTGTTGCTCGTGGGGCGCTTCTGAGAGTTCTTCAGGTAAAGTGACAATCCAAGTCGCTAACGCCTTCACATCGTCTCTTTTCATGCAATAAACGTCATTTAAACGCTCATTGAAGCGTGAAAGCATATCAGAACCATCTGTCATCAGATCTTGATTCAGGTAAGTTTTCGACACATCAATTTCTTTGTTGGTGTGATGGTCAGTTTTACGTTCAAAATGAACGGCTAAACCAGGCACCGCACCACGCGTATTTTTCTTTAAATGCGCCATCAAAAATGCCTCCTCGAAAAGGTTTTTCCAAGACCAGTATAACACCGTTAAAAATCTGGTATAGCTTGTTATACCAAAATGATATTTTGGACAGGCTCTGCGAGGCGCGTCATCGACAAGCGATGCCAGTAGCGTTTCCCCTTCCTGCTGGGGAAACTGCTATTTTACAGCGCCACTTATCCGGCTTGTAAAACCTCCGGCGGGTCACGCCGTGACAGGGCAATTTATCATTGCATGATCACCTTCAGCGGGAGCATGTCATGCAGAACGCTACCCGCGTTGGGCAAGTTGGCGTCAGCTTAACCACATAAAATACAGTAAAAAAGATGAATCATATATTCAAAAAATGGATGGTTTTTTTGAGTATATGATCATTCTTGTTTACAATTACTTTGATAGTTGCTGGTTGGCTAACGTTCCACAAGGATAGATTATCACCAATGAATGCCTCTTTACGACTATTTGTTATCCAAAAGAAATTTGCGCTAAAATAATTGAATTATCTATAATTGATTGAGGGGGAATCAGATCATGAAAATATCAGAATATTGTTGCAATAATCTTGTACAAAAAAATAACATACAAATTGGGAATTATTTGCAAAGTTATTTCTAAATAAATTTAATTACTTAATTATTTTAGATCCTGATTTGAGATTTGATCACATAGTTAAATTATTGAATAGAAAGGTGCATAATGAAACATTTTAGTAATATTATTATCGGATTTGGAAAAGCGGGTAAAACACTTGCAGGCACACTTGCAAAACATGGTGAAGAAGTATTAGTTATTGAAAAAGACCCCAACATGTATGGTGGTACGTGTATAAATATTGCTTGTTTACCAACTAAAAATATGATTATCAATGCACACCGTGGCATAAGATATGAAGCTGCCTTAAAAAAGAAAAATGATCTAACTGCAAAGCTACGTAATAAAAATTATCATAAGGTGGCTGATTTAAGCGGCGTAACAGTTTTGACAGCTACTGCTGAATTTTTAGATGATCATACACTGCAAGTATCTGATAATTCAGGGCAGGAAACATTGCAAGCAGATCGAATTTTTATTAATACAGGGGCCAGACCAGTTTGGCCTAATATTGATGGATTGCTTAATAGTAAAAAGGTTTATTCATCAACAGATCTACTTGCAAAAGATAAACAATTAAAAGAGTTAGTTATTCTAGGTAGTGGTCCCATTGGATTAGAATTTGCATCAATGTATACACAATTTGGTAGCCATGTAACGATCGTTGATAAGGCACCTAAGATTTTGGGGAAATTTGAACCTGAGGTTGCTCAACAAGCTAAACATGATTTAGAAGAGGATGGGATATCCTTTTTGTTAGAAAGCCATATAACTAATGTAAATGACACGCTAAATGGTGTTACATTAACAATAAGCACACCAGAAGGAATGAAAGAAATACAGGCAGATGGACTACTAGTTGCTACAGGTCGTCGAGCTAATGTGACCGATTTGCACCTAGAACGAACCAGCATTAAAACAGGTAGTCACGGTGAAATTTTAGTCAATGATGTACTAGAAACAAATGCTAAAGATGTCTATGCTTTAGGCGATGTTACTGGTGGACCACAATTCACGTATATTTCATTAGATGATTGGCGCATTATAGCTAATAATTTGTATGGTAATAAGACACGAAGTCGTTTAAATCGACCAGTATTCGCGAACACTATTTTTTTAAATCCGGCTATTAGTAGTGTTGGAAGAACAGAGGAACAGCTCCGTGAGGCAGGCATTGATTATACAGTATTGAAAATATCTGCAGCTAGTGTGCCTAAAGCACAAGTAATTGGTAATCCAAGAGGCATTTATAAAGCATTGATAGATCCACAGAGTCATCAGATTTTGGGTACAACAATTTATGCTGAAGAATCATTTGAAACGATTAATATCATTAGCCTAGCGATGCAGAATCACCTTCCAGCTGAAGCTTTGCGCGATCAAATATACACCCATCCAACAATGACAGAGGCATTAAATGATTTGTTTGATCAAATCTAATAAATCATTTATAACAAATTAAAATAGAGATCCTCAAGGAATAAGTCCTTGAGGATTTTTATATAGAAAAGTTCGTTTTAGCTGCTTCCTCTAGTATAGTTATAGCAAGTAAGTTGGGTCTATTATATGCTCTTCTGCTAGATTTACGGACAGATTTTCTTCTGCCCTGTAAACTAATAGCATAGGAGCATTTTTTAATATGATTCGATACAAAAAAGAATTTAAGCAGTCTCTTGTTAAGATGCACAATCAAGGCCGTTCATATACTGATCTATCTTATACAAAGTGAAAAGCGCTATCCCTACTTACTGTAAGGGTAGCGCTTTTTTTGTTAGTGGTAGTTTGCAGTGTTCGGTTAATTCTTGCAATCTACCATAAGTTAATTGTTTTTTAGCAGAAAAATTAAGTATAGTAATAATGGTAAGCGTTAATCTTGCTAGTTTTATGATTTTTTAAGATAATAATGTAAGGGCGTATGGGCGTTCTAATTAAAATATAAGGGAGATTTTTTATGTGGAAAGAATTTAGAGACTTTGCCTTTAAGGGAAATGTCGTCGATCTAGCAGTGGCTGTCATTATAGGTGGTGCTTTTGGATTAATTGTAAAATCATTGGTTAATGATATTATTATGCCACTTGTGGGTATATTAATTGGAGGGATTGATATTTCTAAGATGGCTGTAAAAGTTGGAACAGCTACTGTAGCCTATGGATCATTCTTACAGACAATTATTAACTTTTTGATTATTGCTTTTTCAATATTTATAATGGTTAAAGTATTTAACAAAGTAAATAAGAAACGTGTTGAAGAAAAAGTTGTTGAAGAAACCAATACAGAAAAATATTTGAAACAAATTACAGAAATTCTTGAGAAAAAATAAATTACAATTTTTAACATACGTACTGATACCTTATTATTTGGTGTTAGTACTTTTTATTCTTTTGGATAATTAATTTCAATAAAAAAGGCCATTCTGGGGGAATGGCCTTTTTTGAGAGAATAATTGATGAATAAAATTTATGGGAGAGAAGAGAATAGTCATCTAATTGACTATGTATTGAGTATAAAATAGCTAGATTAACTCTAGGCTAAATAATGGATGTAGTTATTATTTATTTTTTTGTTCATCAGAATACCATAGATAGTTTGAAAGTGTATCGGTTATTACACTGATTAAATCGGCTATAATTGAAAAAATAAATTGCCTTTCTGTTCAAATCACAAATTCTTTGTTTTTAAGTAATTCTTCCTGTTTCTTACCAATGGCATAGGTGTAAATTGCCATTAAGACTTTTTTCTTGTCGCGATCTTTTTCGTTTAAAGCATTATCCATTAATACTTGTAAGTTTGTTTTTTCAGCTTCCAAAAAAACTTTTCAAAAATATTTTTATCAGCCATAATTTAAGCTCCCTGTTGTCTTTAAATTAGTATCTAATCTAATTATACTAATAAGCAAAATAATCCGTCAGCAAAACGAATAAAATGAGTTTAATGCGCACTTACACATAGAAAATTCTATGGTAGTCCGTATGACCTATTTTTTAGGTCAATGCGCACTTACACATAGAAAATTCTATGGTAGTCCGTATGACCTATTTTTTAGGTCAATGCGCACTTACACTCCACCAAGAAACTGGTTGATTAATTGCTAGAAAGCAGTGTGTCAGAAGTCGCTATAGGCGACAACTTAAAAACTATCAAAAATTCTTGTTGCGAGCATACTATGTGTGGCCACACATGAGGTGAAAACATATCAATATTGATATGCTTTTGTTTGGGAAATTCGCAATCCCTTTTTGAATTAAAATCAATTTTGATAAGCGGACGGTTGATGAACGAAAAATACTAACAAACAAAACGGACGCTATAAAAGTAACCTTAGAAGAAAATTATTGAAATAGTCAACAAAAATTAAATCTGTTATATTAGTTACCGAGGCGTTAAGATTAAGCGCCGTGAAGGGAGGTGGGTCTCCTTGATACTATTAGTTAATGAATTGCAACTGCTCAACGCTGCATTATGGCAAATTTTTGTTGGCATAACGTTAATCTGGTTGCAAAAGTATTTCGACGATCGTCGTTAATGCATGTGCCTCGTCCTGCCAGACGGGGTTTTTTTGTAAAATAAAAGCTCGTCGCCTGCCAGCGATGAGCTCGAAAGGATTGGAATCTCCAAACCTATTAGTTAATGTACATATATTATAACGTAATTAGTTTGTTTTATGCAATTAACAGATATTTTAAGTCTTAATTTCAATAATTTATAGTGTATGATGATAGGTTTAAAATGGAAAATAGTTATGTATTATTTTTGTGCTTGTTCTAGGCGATCAACATCATTTGCTAGATCAAGGATATAATTTTCTTGCGATTTTCTGCCCCATATGAAGCCTACTAAAAATAAGCAAACCTTAGCTATAACTACAACTATAGCCGTAGTTATAGCTAATGAGCTTAACCAAAATCAATTTGATTCAACATAGTCTCACGGCTGGCTTGATCTAAACCAAGGTAAGCCAGTGTCATGGCCGCACTAGAATGATTCAATAAGTGCATGACTAAGCCAATATTATAATATTTTTACTTATTTAGAACTATTTCATAAACTTGATGGACGTCAAGTTTATATCTCCCAAAAGTTAATACACTTTAGTTGAACTAAAATTAAGGGAGAAATCATATGCAACATAATATTCTTAAATATAAAAATAAAATTATGAGTATCACTGGCTTACTCATTGCCTTAGGACTAATTTCACACTTTATTTTTGCCAATACAATAATTTTTAATAGTGCTTTTATTATAGCTTCGATATTAGGCGCTACCCCCATTTCTTTACAGGCTTATCAGGCTATGAAAGTAAAAGTAGTAAGTATTGATGTTTTAGTAACGATAGCGGTCATTGGTGCTCTCTTTATTCAAAATTATGAAGAATCAGCAATTGTTACTTTTTTATTTTTATTTGGATCATATTTAGAACAACGAACACTTAACCGAACACGATCAGCTATTAAAGAGTTGACGGAAATGGCTCCAGAAACTGCTTTTAAGCAATTGACAGGGGGACAATTTGCAGAAGTAGATATTGATGAAGTAGAAGAAGGGGATATTCTCCTAGTAAAGACTGGTGCCAAGATTCCCGTAGATGGTCGGGTAACTACTGGAAAAGGATATGTAAATGAGGCTAATATCACAGGTGAATCTTTACCTTTAAAGAAAGAAAAAGACGATGAAGTATTTGCCGGTACTATTATGGACAATGGTACTATTCAAATAGTGGCTGATAGAGTAGGGGAAGATTCTACATTTGGAAAAATTATTGAGTTGGTAGAAGAAGCACAGGATTCTAAATCAGAAGCAGAACGATTTATTGACCAGTTTTCTCGCTGGTATACACCTGCAGTACTTACAATTGGGCTGTTGGTTTGGGTATTAACCAAAGATACAGAACTTGCGATTACCGTATTAGTACTTGGTTGCCCAGGAGCCTTGGTAATTGGTGTACCTGTTTCAAACGTTGCGGGGATAGGAAATGGCGCAAAAAATGGTATTTTATTTAAAGGTTCTGAAGTGATTAGTCATTTTGCCAATGCAGATACAGTGTTATTCGATAAAACAGGTACCTTAACTGAAGGAAAGCCTGAAGTGAGCGATATTATTTATTATGGAAATAATCAGGAGGAGGATTTATCTCTATTGCTTTCAGTTGAAAGTGAGTCTGATCATCCATTAGCTGTCGCTATTGTAAATAAATTAGCACAATATAAAGTAAGGCCTATAGAAAATACACAGGTTGTAAAAGGTGGGGGCGTAATTGCTCACGTAGATGGGCACATTGTTTCAGTAGGGAATAAAACCTTAATGAAACAAGAAAGTATACCGCTATCTGATGATGTTCTTAAAAAATTGAATAAATTAGAAAGAACCGGTAATTCAATTGTATTAACGGCAGTTGATCATAAGTTAATCATGTTAATGGGTATCCGCGACAAAGTTCGACCAGGTGTTAAGCAGGACTTACAAAAATTAAAATCACTTGGTATTAAAAATCTCATTGTATTATCAGGTGATAACCAAGGTACAGTTAATTCAGTTAAAAAGGAACTAGGTTTAACCGAAGCCCATGGTGATATGCTACCAGAGGACAAGCAAGCATTTCTAAAAAGACGACAGGACTCAGGTGAAATAGTTGTTTTTATCGGTGACGGCGTTAATGACAGTCCCTCTCTGGCTACTGCAGAGGTAGGTATAGCTATGGGGAATGGAACAGATGTCGCAATTGAAAGTTCAGATATTGTCTTAATGAATTCTAACTTTAACCGCCTTCCTCATGCTTTAGGCCTAGCAAAAGGAACATATGCGAATATGCGACAAAATATTCTAATTGCTGTTGGAGTCGTAATAATACTATTGGTTAGTTTAATATTTAGTGAATGGATGTCCATGTCAATTGGGATGTTGGTTCATGAGGCCAGTATTTTAGTAGTTATTTTAAATGCAATGAGATTAAGAGGTTATCAATTAAGATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_016820|13998:21974|20123_21974_+|WP_049640003.1|DBSCAN-SWA MQHNILKYKNKIMSITGLLIALGLISHFIFANTIIFNSAFIIASILGATPISLQAYQAMKVKVVSIDVLVTIAVIGALFIQNYEESAIVTFLFLFGSYLEQRTLNRTRSAIKELTEMAPETAFKQLTGGQFAEVDIDEVEEGDILLVKTGAKIPVDGRVTTGKGYVNEANITGESLPLKKEKDDEVFAGTIMDNGTIQIVADRVGEDSTFGKIIELVEEAQDSKSEAERFIDQFSRWYTPAVLTIGLLVWVLTKDTELAITVLVLGCPGALVIGVPVSNVAGIGNGAKNGILFKGSEVISHFANADTVLFDKTGTLTEGKPEVSDIIYYGNNQEEDLSLLLSVESESDHPLAVAIVNKLAQYKVRPIENTQVVKGGGVIAHVDGHIVSVGNKTLMKQESIPLSDDVLKKLNKLERTGNSIVLTAVDHKLIMLMGIRDKVRPGVKQDLQKLKSLGIKNLIVLSGDNQGTVNSVKKELGLTEAHGDMLPEDKQAFLKRRQDSGEIVVFIGDGVNDSPSLATAEVGIAMGNGTDVAIESSDIVLMNSNFNRLPHALGLAKGTYANMRQNILIAVGVVIILLVSLIFSEWMSMSIGMLVHEASILVVILNAMRLRGYQLR >NC_016820|13998:21974|13998_14241_+|WP_014333936.1|transposase|DBSCAN-SWA MSIRYSQDFKDSLVRLHQEGRSLKSLAEEFGPSKDSIAIWVKQATPIMIKGQSKTLKDVKQLEKRLAILEEENEILSRIA >NC_016820|13998:21974|16109_17444_+|WP_014333939.1|DBSCAN-SWA MKHFSNIIIGFGKAGKTLAGTLAKHGEEVLVIEKDPNMYGGTCINIACLPTKNMIINAHRGIRYEAALKKKNDLTAKLRNKNYHKVADLSGVTVLTATAEFLDDHTLQVSDNSGQETLQADRIFINTGARPVWPNIDGLLNSKKVYSSTDLLAKDKQLKELVILGSGPIGLEFASMYTQFGSHVTIVDKAPKILGKFEPEVAQQAKHDLEEDGISFLLESHITNVNDTLNGVTLTISTPEGMKEIQADGLLVATGRRANVTDLHLERTSIKTGSHGEILVNDVLETNAKDVYALGDVTGGPQFTYISLDDWRIIANNLYGNKTRSRLNRPVFANTIFLNPAISSVGRTEEQLREAGIDYTVLKISAASVPKAQVIGNPRGIYKALIDPQSHQILGTTIYAEESFETINIISLAMQNHLPAEALRDQIYTHPTMTEALNDLFDQI >NC_016820|13998:21974|15086_15413_-|WP_014333938.1|DBSCAN-SWA MAHLKKNTRGAVPGLAVHFERKTDHHTNKEIDVSKTYLNQDLMTDGSDMLSRFNERLNDVYCMKRDDVKALATWIVTLPEELSEAPHEQQSAFFCSEVNKLDYFYSVT >NC_016820|13998:21974|17955_18324_+|WP_013102133.1|DBSCAN-SWA MWKEFRDFAFKGNVVDLAVAVIIGGAFGLIVKSLVNDIIMPLVGILIGGIDISKMAVKVGTATVAYGSFLQTIINFLIIAFSIFIMVKVFNKVNKKRVEEKVVEETNTEKYLKQITEILEKK >NC_016820|13998:21974|14286_15090_+|WP_014333937.1|transposase|DBSCAN-SWA MGLPLVNQFLAQGYALVRILSALKIKPSTYYNWRHWQPSRQEKRRESLKPYILDVWKTFKFYGYRRIAAYSQQTDGPKVSEYMTLKLMRELGIKSRMQKRHRKPKTVVTVDQKPNLIRHLHDLSGVWQTDITCIQLTNHRWVYLATVLDPEKRKVLDYKIGDTMTAELATSALQMALDKHRKPLIIHSDMGSQYTSAEFNIKCQNYGLKHSYSLKGHPYDNGRMEAFHSILKREEVYLKAYQTLTEVQAAIGWYINFYNRNRISNVA |
6 | Lactobacillus_phage(25.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_3 |
25577 : 27745
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_016820|25577:27745|DBSCAN-SWA ATTACCCAAAATCAATTTGATCTAACATTGTTTCGCGACTTGCTTGATCTAACCCCAGATAAGTAAGCGTCATAGCCTCACTCGAATGATTCAATAAGTGCATGACTAAACCAATATTGTAGTTTGATTGCGTATAAACGCGATAGGCGCCTGTTTTACGCATGGTATGTGTGCCCAGATAGTTGATGCCTAAGAGATCACCAACGCGTGCCATCACCTTATAAAACTGCTTCTCAGTAATATGACGGTCTGGATGGGCCGTTGAGGGAAATAACCAGTCTGAATTGATATTCTGTTGGACTAGCCAATCATGATATTGCAACAAGTCTTGTTGCACGGGCTTTAAATATAGTGTATTTGCTTTACCGGTCTTTTTATCATGAATAAAGGCCGTGTGTTTAACAGAGCCATCTGGATTATAGACATCGGATTTCTTTAACGTCATCACATCACTCACCCGCAGCAGGGTGGCTTTGCCAACTTGAAAGATGGTGTAGTTACGGCGACCTGCCCGAAAACTATCTAGTAAGGTGTCTTGCACCATTTTTAAGACGTTAGAGTCTTTGATTGGGAGTACGATTTGTTGCATATCTATTTAACCTCAATAATAGAACAGTCCTTGCCTATAATTGGTTCACTTTTGTCAATGAATGACCAATTATTTTTATCGTAGTGGTAGATTGTAAAATTAATCCGAACGCTGTTCGGACAAAAAAGATCAGTTTCCATCATAAAGGACTCCCCGCGGGACTGCAATCAGGAGTCATTACTTCAACTGTTTTTGTTCATTATAGAAATTACGGTAAGCTAAATAGCACGCAATGATTGACCCCAAACTAGTCGCTGATAAGAGCATGAACGTGACCATAATTTGATACCTAATGGCCCGTACTGGATCGACCCCTGCAAAGATCAAACCGGACATCATCCCTGGCAGACTGACTAGACCCACAGTCTTTGCCGAATCAATGGTTGGTGACATCCCCGTACGAATCGCCTCACGCACGATGGCAATCGAAGCATCAAGTAGACCAGCCCCTAACGCCAACCGTTCAAGCACACCTTGCCGCTGGTCATGAAACTGACTATTGAGGCTGCGATAAGCCAGCCCAATTGCGACCATTGAATTCGACGCAATCATACCAGAAATGGGAATCATTTGCGATGGCACAAACTTAATCGCACCAGATAGCACGAGGACGCCGAGTGTTACCCCCGTACTAACAAAAATGGCTAATAACGAAATGGCTAATGCATGGTCAATCCCCGGCCCCCGTTTTTTCGCATTCCAAGCCGCATTGAAGATAATGAAGCCTATCATCGCCAGCGTTAGCCACAAATTGTTGACTCGGAAAATATACTTTAGCAAGTAACCCACGATAAATAGTTGTACAACAGCCCGCACGACACCAATGACGATGTCCCTATCCAAGCCAAGTTTCTGCCACAAACTAATTCCTAACGCGACGAGCACTAACATTGCCGCCAAAAATAGCGACGTATTATTAACTGCTAAATTCATGCGTGTACCTCCAATCTGCCAGCAACCACTTTCGCTAATTGATCTGCCGCAGCAATCTCTGTCGCGTCATGAGTAATCATGATCGTTGTCACGTGATCCTGCTCATTTAACTGTCGTAACCAGGCGTGCACGATTTGCTTATTATTTTCATCCAAACCAGCTGTCACCTCATCTAATAACAACACTTTTGGTAAGAATAAGATGTTGCGAATCAGCGCGACCCGCTGCCGTTCACCACCGGAAAGCTCGATAATCGGCTGATGCAGGGTTCGTTCGGACAGCCCAACATTATTTAACGCCGTTACCACTCGTTGCGTATCCATGACTTGCTTACGAATTTGGTACGGGAAAGCTAAGTTATCTGCCACCGTCTCACCAAATAACGTCGGTTGTTGGAAACAATATGAGACTTGCCGCCGATACATGATTGGATCATAACTTTCAATCGGCTGCCCATCAAAAATCAAGGTCCCACTTGTTTTAGAAATCATGGCCGCAATGATCCGTAATAACGTACTTTTCCCACCACCGGATGGTCCCGTCAATGTAATATGAGCCCCAGCTGGAATCTGCCAATCAACATCATGTAAAATATGTTGATCAGCGATTTGATAATTAACTTTTTCTAAACTAATCAATGAATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_016820|25577:27745|26342_27098_-|WP_010276774.1|DBSCAN-SWA MNLAVNNTSLFLAAMLVLVALGISLWQKLGLDRDIVIGVVRAVVQLFIVGYLLKYIFRVNNLWLTLAMIGFIIFNAAWNAKKRGPGIDHALAISLLAIFVSTGVTLGVLVLSGAIKFVPSQMIPISGMIASNSMVAIGLAYRSLNSQFHDQRQGVLERLALGAGLLDASIAIVREAIRTGMSPTIDSAKTVGLVSLPGMMSGLIFAGVDPVRAIRYQIMVTFMLLSATSLGSIIACYLAYRNFYNEQKQLK >NC_016820|25577:27745|25577_26165_-|WP_006844813.1|integrase|DBSCAN-SWA MQQIVLPIKDSNVLKMVQDTLLDSFRAGRRNYTIFQVGKATLLRVSDVMTLKKSDVYNPDGSVKHTAFIHDKKTGKANTLYLKPVQQDLLQYHDWLVQQNINSDWLFPSTAHPDRHITEKQFYKVMARVGDLLGINYLGTHTMRKTGAYRVYTQSNYNIGLVMHLLNHSSEAMTLTYLGLDQASRETMLDQIDFG >NC_016820|25577:27745|27094_27745_-|WP_010383508.1|DBSCAN-SWA MNSLISLEKVNYQIADQHILHDVDWQIPAGAHITLTGPSGGGKSTLLRIIAAMISKTSGTLIFDGQPIESYDPIMYRRQVSYCFQQPTLFGETVADNLAFPYQIRKQVMDTQRVVTALNNVGLSERTLHQPIIELSGGERQRVALIRNILFLPKVLLLDEVTAGLDENNKQIVHAWLRQLNEQDHVTTIMITHDATEIAAADQLAKVVAGRLEVHA |
3 | Bacillus_phage(50.0%) | integrase | attL 24841:24855|attR 28816:28830 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
32057 : 33935
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_016820|32057:33935|DBSCAN-SWA ATTAGGCGACATTTGAGATACGATTGCGATTATAAAAATTGATATACCAACCAATGGCTGCTTGGACCTCAGTTAATGTTTGGTATGCCTTCAAATAAACTTCTTCACGCTTCAATATTGAATGAAACGCTTCCATAAAGTCATTATCGTATGGATGTCCTTTGAGTGAATATGAATGTTTCAAGCCATAATTTTGACCCTTGGTATTAAATTCAACACTCGTGTATTGTGACCCCATATCCGAATGAACTATTAGTGGCTTTTGATGATTATCTAACGCCATCTGTAAGGCACTTGTAGCTAGTTCGGCTGTCCTTGTATTGCCAATTTTATAGCCTAATACTTTTCTCTTCTCAGGATCCAAAACGGTTGCTAAATAGGCCCATCTGTGATTAGTCAACTGAATATAAGTGATATCTGTTTGCCAAACACCGCTCAAATCATGCTAGTGCCTAATCAGATTAGTTTTTTGAGAAACCGTTACAACGGTTTTGTGTTTGCGATAACGTTTTGCATGCTTGATCTAATCCTTAATTCAAGCATCAATTTGAGTGTCATATACTCAGATATTTTCGGGCAGTCATTGGTTAGTTGACTATAAGTAGCAATACGACGATAGCCATAAAATTTAAAGGTTTTCCAAACGTCCAAAATATAAGGTTTTAGGCATTCTCTACGCTTTTCTTGTCGACTGAACTGCCAATGGTGCCAGTTGTAATAGGTACTAGGTCTGATTTTAAGTGGACTTAAAATACGCACAAGCGCGTAGCCTTGTGCTAAAAATTGATTAACTAGCGGCAATCCCACATTACGAACTATTTTTTGGCTAGTAAGATGGCCGCTCAATGCTTGTCAGGCTATGCGTGATAAAATTTCGTTTTCTTCCTCCAAAATAGTGAGGCGCTTCTCTAGTTGCTTGACGTATTTTAAAGTCTTTGACTGACCCTTGATCAAGATTGGAGTAGCTTGTTTAACCCAAATATCCATAGGATCGTTCGACGGTCCGAATCCTTCTGCTAGTGATTTAAGTGAACGGCCTTCTTGGTGAAGTTTAACCAAGAAACCTTTGACATCTTGTGAATAACGGACTGAATAAAGATAGTCCATTTTTTAGTATATTAGCATCGGATTATGCCCTAGAAATAAAGCAGTCCTGATTTTCAGTATACGAGCATTGTAAATCTAGGTAAAGTTGGTTGATTATAATAAAGTGTGAGTCTGGTATAAGCGTTTGTCCATGTTACTGAACTGATATCATATATGCATATCAATTGGAAGACGTATATTTTTGTCATCTGCCATTAATTTAATATAATTAATCTTGAATAAACAATTTTTTAATGTATTGTACTGTTCTAACAGAAATATTGAAAGCTTCTGCTGTAGATTTTATTGTGTGTGTTTGAGAATACTCAAAGATAGCTGTGTTTCGGCTATCTTTTTTTCTTTTGGGTCTACCTTCTTTATAGTTGGGATTGTGTTGCCTTGCAAATATCTTACCAGCCTGCGTACGTTCGATAATCATGTCGCGTTCCATTTCCGCAACCGAAAGTAAAGTTCTTACAATCATGCGACCCATTGGGGTATTGTCAATTGTTCCTAAGTTTAGAACTTTAATCACAATTTTTTGTTTCAGAAGATCATCAATTAAATTTAATGCTTCACGTGTATTTCGAGCAAAGCGATCTAACTTGGTGACGATCAATGTGTCATTAGGTTCAATTAGATTGACAAGTTTTTTAAACTGTGGTCGTGATGTAGTTGTACCTGAATATTTTTCACTGAAAATCATTTCAGCCCCGGCATTTTTCAAAGTCTCTTTTTGTTCATATAAAGATTGTCCAGCTGTTGAAACCCGTGCATAACCATAAACTGTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_016820|32057:33935|32908_33163_-|WP_013102142.1|transposase|DBSCAN-SWA MDYLYSVRYSQDVKGFLVKLHQEGRSLKSLAEGFGPSNDPMDIWVKQATPILIKGQSKTLKYVKQLEKRLTILEEENEILSRIA >NC_016820|32057:33935|32536_32863_-|WP_146017152.1|DBSCAN-SWA MGLPLVNQFLAQGYALVRILSPLKIRPSTYYNWHHWQFSRQEKRRECLKPYILDVWKTFKFYGYRRIATYSQLTNDCPKISEYMTLKLMLELRIRSSMQNVIANTKPL >NC_016820|32057:33935|33371_33935_-|WP_010277799.1|DBSCAN-SWA MTVYGYARVSTAGQSLYEQKETLKNAGAEMIFSEKYSGTTTSRPQFKKLVNLIEPNDTLIVTKLDRFARNTREALNLIDDLLKQKIVIKVLNLGTIDNTPMGRMIVRTLLSVAEMERDMIIERTQAGKIFARQHNPNYKEGRPKRKKDSRNTAIFEYSQTHTIKSTAEAFNISVRTVQYIKKLFIQD >NC_016820|32057:33935|32057_32495_-|WP_014333947.1|transposase|DBSCAN-SWA MSGVWQTDITYIQLTNHRWAYLATVLDPEKRKVLGYKIGNTRTAELATSALQMALDNHQKPLIVHSDMGSQYTSVEFNTKGQNYGLKHSYSLKGHPYDNDFMEAFHSILKREEVYLKAYQTLTEVQAAIGWYINFYNRNRISNVA |
4 | Bacillus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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