Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_017495 | Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 plasmid pQA518, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NC_017492 | Lactococcus lactis subsp. cremoris A76, complete genome | 2 crisprs | cas3,DinG,csa3,WYL,DEDDh | 0 | 0 | 20 | 0 |
NC_017497 | Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 plasmid pQA504, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NC_017493 | Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 plasmid pQA549, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NC_017496 | Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 plasmid pQA554, complete sequence | 0 crisprs | RT | 0 | 0 | 1 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
32765 : 42082
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_017496|32765:42082|DBSCAN-SWA AATGAATCATTTTAAAGGCAAACAATTCAAAAAAGACGTGATGATTGTCGCTGTTGGTTACTACCTGCGTTACAATCTAAGCTATCGTGAAGTTCAGAAATTGTTATATGATCGTGGAATAAATGTTTGTCATACTACGATTTATCGTTGGGTGCAAGAGTACAGCAAAGTCCTCTATTATCTTTGGAAGAAGAAAAATAGACAATCCTTCTATTCATGGAAAATGGACGAATCCTATATCAAAATTAAGGGACGTTGGCATTATCTTTATCGTGCAATTGATGCGGACGGCTTAACCTTAGATATCTGGTTACGAAAGAAACGGGATACGCAAGCAGCCTATGCTTTCTTAAAACGACTCCATAAACAGTTTGGTGAGCCGAAAGCAATTGTGACCGATAAAGCACCTTCTCTTGGCTCCGCCTTTAGAAAGTTACAGAGTGTGGGTTTATATACTAAGACAGAGCACCGAACTGTGAAGTATCTTAACAATTTAATAGAACAAGACCATCGACCTATTAAACGACGGAATAAATTTTATCAAAGTCTCCGTACAGCCTCTTCCACGATTAAGGGCAGGGAGACCCTTCGAGGAATATATAAAAAGAACCGAAGAAATGGAACGCTCTTCGGCTTTTCGGTGTCTACTGAAATCAAGGTATTAATGGGAATACCAGCCTAAGATATTTGGAGTTCACAGAGGGCGCGTTTGATTTTCAAACTTCGCAACAGAACCGTAATTCTTATTTTTATAGAATGCTTTGCTGTAGATAAAATTATGAATAAATAAAGTAAAAAACACATCCTGACTTATAATACAGTTCATTAGGGTGTGTTTTTGCTAAGCATTTAATAAAAAATTAGGAGCCATTGATGAAAAAAACTATAATCTTTATATTACATATTCCATTTATACTTCTCCTCTGGCTCTGTATAACGTCTCCCTTTTTTATAAAAAATAGTCTGCTTAATTCATCCTTTGGTCACATTTTTAAAGGAGTAGAAAATATTTCTCATAGTGGACCTCTAGCAACAGTTTTGTTGTTATTCGTCATACCTTTACTTTCACTCATTTCATGCTTATACCTTGCTTTTAAGAAAAACCAGAGCGGAAGAAAATATGTGATTTATATTTTGATGTCGTTATTTTCTCTTGTTTGCCTCTCAGTTTTTTCTATTATTATGATAATAGGTTTAGGAAACTATTTATGAAAAAAGCCTCTACAAGCTAAATGGCTTGTAGAAGCTTTTTTTGTTATAATAATGGAGTAGAGTTTATGAACGGTAGCTTTGATTGGAGGTGGTGCTTATGATTATTTCGTGGGCAAAACCTCACAAAACATGAAAGGCGAAAATTTTTTGACTGTATTTCAGGCATTGAGTCTCATGATTGCATTTGCAACTTTGATGATTCTTGTCATTAATACGAGTAACAAAAAATGACCGTTCATCTTAGCGGATAAGGTCATTTAGATAGTATTTGCTACCGTTCTTAAAACGGCTACATTGGACTTGTTACTAGCAAGTCCTTTTTTCTTTATCTTTATTTTATCACAACTTCCATTTTTTGTCATCTCGTTTATTTAAGAAAGAAAAAACGCTCTGACGAATCGTGTGTGAAATCAGAATGCTTTTTGCTTTTGTTTAAGACTCTCTAAAAATAACATAATTTTTGAAGATAAACAAATCTTATTTTCTATAAAAATATACTAAGTATTTTGATTAAAAACACTCTCATTTTCTCATGAATTTGCCATATTCAGCGATTTTGAGCCCTTTTTTATCACTCATAATATGAGAATCGCTTAACCGTGTGTTTTACGGTCGTTATAAGTGTACGAAAAATCTTAATTTTTCTGAAAAAAGCATTTTGAAAGCTACTTCTCCTAAAAAATATTTGCTCATCTGCCCGAATGCTCGATAAATTTATCTTCCACTAAAAATCGATGGTTCTGATAATTTTTATTCTTTTTGACTTCACCAATATACAAAGCTTCATAATCCAACAATTCACCTACAATATATTTTTTTTGGCGCTCGACCAATAAAACTTCTATAATTTATTGATGACTGTTCAATAATTTCTAACCAGTCATCATCAGGTATCTCTTTTATTATTTCTCGTAATTTCATTTTAAAATATTCTTTCTGTCTAACACTTCAATTTGGAAGAACAAAAGAATTAAAGCCCCTGGGAGAGCAAATAAAAACTTTGAGCTAAAAAGTCAATAAATTGTTTTTCTGTCATCATTATTATTTGTTGTCCCCTTTGTTCAGCTTGTTTAGCTTCCGATAGTTTTTGTGAAGGTGTAAAGGGCCATGCTAAAATGTAGGAAACGGGCCATTGAAAATGTAGGTTAACTTTAAAATTGTGATAGGCTTTTCCTTATGAGAAAAGACATCCTAGAAAGTATAACCGAACATCTTATGACTGGAATTAAACCTAATTTCGCTGATATTGCCAGACGCTATAATTGTGACTATCGGACGGTCAAACGTTATTATGACCTCGGAAAAGAAAAGACCCTTGAAGAAGCTTCAAAACGAAGGGTCCCACCGTCACTTATTGAGAACTATAAATCAATCATTGAAGATAAACTCAAGCTTGGCTGCTCTGTGCGCTCAATTTACTACTTCATCCAACTAAAAGGCTATCAAGGCTCATATACGACCGTCAAACGCTATGCCAGATTGATTCGAGAATCCTGCAAACATAAAGCAACGATTCGAATTGAAACAACGCCTGGACTTTCTGCTCAAGTCGACTGGAAAGAAAATTTAAAACTGATCTCACGAAATGGTGAAGTGTTTACGATTAATATCTTTCTGTATATTCTTGGCTACTCTCGGATGAAGTATCTTCAATTGACCGTCGACCGTCTCCAACCCACACTCTTTGAGTGTCTCAATCACGCTTTTGAGAAATTCGGAGGTGTCCCTGAAGAAATTTGGTTTGACAATATGAAAACAGTGGTGGACCATTCTAAAAGTCAATTCTCAAATGTTGTTTTCAATGAACGATTCAGGCAGTATGCAAAAGATGCTGGATTTAAACCCATTGCTTGTCGGCCATTCAGACCTCAAACCAAAGGTAAAGTAGAAGCGCTTGCGAGAACTGTTGACCGCCTGCTTGTCTTTAACAATGAGTTTGAAGACCTTGAAGAATTACAAGCACTGGTCCAACAATTGATGGAAGATTTGAATCATAAAGAAATCTCTCAAGCGATTGGAACCTCACCTTCTGAACGTCTTGACCAAGAGGCGTTGAATCTCAAGGCTTTTGATTTAGAGCTTCTCAAAGTTTATAGTCAATTGAGTGTTCCTTTGACTCGAAAAGTCTCTAAAGAGGCACTTGTGATCTTTGAAGGGCGTAAATATTCAGTGCCGGTTAAATATATTGGACAGACCGTAACCTGTGAAAAAGAACAAGAGGACCTTAAAGTCTATTGTGACCAACGCTTGATTGCTCGTCATCCTTTAAGCGACCGTCCCTTTAATTATCGCCGTGAAGATTACGTTGAAATTCTTAAATCAGATGTCTTCAAACATCTTGAAGAAGACGAACTAGAGGCTTATGTGGATGAGAATCTTCAAGCCTACGATTTATTGTGAAGGGAGCGCTTATGACAACTTATCATCAATTACTCAACCAATTGGACCATTTAAAACTCGATCGTGTGCGTCAGCTCTTACCAGAGTTCTTAGATGAGCATGCGGATATTTCCTTAGTAGAGGGCCTTCATGAACTCTTGAGTGAAGAACTTCGTGAACGAGAAGCGCTCCTTCAGGAAAGACGATTAAAAAAAGCCCATCTGCCTTATGAAAAGCGTGTGATGGACTTTGATTTTCAGTTTCAACCGAAAATTAATAAAGCAGAGATTTTAGATTTACATACCTTACGTTTTTTAGATAAGCATGAGAATCTTCTCTTCATTGGCAATAGTGGCGTAGGTAAGACACATTTAGCTATTTCTATCACTTTAGAAGCCCTAGAGAAAGGTTATAGCTCTTACTTTTGTATGAGTACTGAATTAGTGGACCGTTTATTAAGAGCCAATCAAAAAGGAACTTTAGAGCGAGTATTAAAACAGTATGCCAATTATGATGTACTTGTTATTGATGAAGTGGGTTATCTGCCCTTTTCAAGAGATGGAGCGAGTCTTCTCTTTCAACTGATTAATATGAGATATGAAAAGAAATCCACGTTGATTACTACGAATATCCCACTTTCTCAATGGTCTGAGTTTCTTCAAGATAAGAAATTAACGAATGCTTTATTGGACCGCTTGGTTCATCATTCTAAAGTCATTTCTATTACTGGAAAATCTTATAGAATGAAAGACTATAGTGAGAAGAAAACCAAAACCCCAAAAAGTAAATAAAGTGATGGGCCCAAAACCAACAATTTGGGTGGCCCATTTCCTACATTTTCAATGACCCAAAACCAACATTTTTAGATGGCCCTTGACATGTGAAGGGCGATATCCTTTTATTAAGTCAATAGGAAAGTAACCTGTAACAAGTCGAGTCGTATTTTTAGTCACAGAATTCTGATTATGTCCTTTTAAACCTGTAATGATTGATTGTGCTTGTTTCCTTATCATAGTTGTAAGTGTGCTAGTAAATACAAAATACTCATTTTCTAACATTCAAAACACCTCTGCTGTTCTTCTGAATGCACTCAATGCTCAACTTTTTTGACCTTCTATGAATCCAATCATATCAGAAAACAAATATGAAATTTAGAAGTATACCCTGTTGGCCTTATATAATTCCAGATATAAAAAAAGTACCTGAGTAATGTAGTGACCCCCAAAATATAGACTTTTCAAATCTATATTTCGGAGGTCTTTTCTTATGGTCAAATATTCCATAGAATTAAAACAACGCGTTATTCAAGATTATTTATCTGGCAAGGGAGGCTCTACCTATCTTGCTAATCTGCACAACGTAGGTTCATCTAGTCAGGTTAGACGCTGGATTCGCAATTATCGAGCAGAGGGACTTCCTACAGCTCACTCCAAAGTCAATAAAAATTATTCTATGGAGTTGAAAGAAAATGCGGTACAATGTTATTTAACAACTGATTTAACGTATGAAGCTGTGGCAAGAAAATTCGAAATTACTAATTTTACCTTACTTGCAAGCTGGGTTAATCATTTCAAAATTTATGGAGAAGTCCCAATAAGCAAAAAGAGAGGACGGCGTAAAAAACTAGAAAGCATTGCATCGTCTATGACTCAGAACCCAAATGATTCTCAACGAATTAAAGAACTTGAACAAGAATTACGTTATGCCCAAATTGAGGTAGCTTATTTAAAAGGACTTCCGAGATTGGAGAAAAATGCTCTAATGAACAAAAATCAAGACTCATCTACAGTCTCCGTAAAACCTTCAAACTCAAAGAAATCTTGAAAGTTACAGGATTCCCTAAAGCCACTTATTATTATTGGGTTAACTGTTTTGAACGGGTAAACAAAGATGAGCTTATCGAAAAAGAAATGCTTAAAATACGTCAAGAACATGCCAATGCAGGTTATCGTCCAATGAGTGAATTACTTAAGCAACGTGGCTATCACGTCAACCACAAGAAGGTACAGCGCTTAATGAAGAAGCTAGGGCTTCGTGTGATGTCTTATTGGCACAAATCACGTAAATATAATTCATATAAAGGAAAAGTAGGGACGGTAGCTAAAAATAAATTGCACAGACGATTCAGAACTTCCATTCCTCATCAAAAAATCACAACAGATACGACAGAATTCAAATATTATGAAGATGGAATTCAGAAAAAGTGTTATCTCAATCCTTACATTGATTTATTTAATAGCGAGGTGATTAGTTATCATATCTCTAAACAACCCTCTTATCAATCAATTGATATTGCTCTAAATCAAGCCTTAGCTGTGACATCTGATTGTCCTTATCGACGTACTTTCCACTCAGATCAAGGATGGGGATACCAAATGAGAGACTATGTTTCTAAATTAAAATCTCATAGAATTTTTCAGTCTATGAGCCGTAAAGGAAACTGTCATGATAATTCAGTTATGGAGAATTTCTTTGGGCTACTTAAACAAGAAATTTACTACGGACATATCTTCTCGTCTTTCGAAGAACTTGAACAGGTTATTGTAATCTGGATTAGGTACTATAATACAAAACGAATCAAACAAAAATTGAACTGGATGAGTCCAATTCAATTTCGCTTGAATTACCAAAACAATTAAAAAAATCCAAGTATTTCTACTTGGATAAAAAGTCTAACTTTTGGGGTGCACATCAATTTGCTGGCACTTATGTTTAAGGTACTCCATTAAACACATCTCTCTATTTTTGACCTTAAGACTATCTATACGGTATTATTAATTTGTATGTTTTAAATATTAACTTCTTAATCTATGAACATGCACCAAAAACTGCTTATCATTATGTGCTGTGATAGGTGGTTTTTTATATAAATCTTTTAAATATTAATTTTAATTAATAAACATTAAAAAAACCACTCTATATTAAAGTGCCCCTAATTTATGAATGGGAAGTGTGAGTTTCCTCTTGCTGGCTAATTATATCATACTCTCTCATAATTGCAACTGAATATAAAAAAACTGAAGTCATGACTCCAGTTTTTGCACGATTTTCAGATACAATTATGCTTTTGTGATATTAACTGCTTGAGGTCCACGTTGACCTTCTTCAACATCAAATTCAACTTTTTGACCTTCATCAAGTGTTTTGAATCCATCAGATTGGATTGCTGAGAAGTGAGCGAACAAATCTTTACCTTCTTCTGAAGTGATAAAGCCAAATCCTTTATCTGCGTTAAACCATTTTACTGTTCCATTTGCCATAATATTTATTTCCTTTCGACAAAATTGTAAATCTCATTTTGCGAAAAGTGAATCTATAAAACATTTTACTCATGACAAAATTTACTTCTTCATAATAACACTAATTATAGTCAATGTCAAACTACTCTCCATTAATAAAATCCATGTCGTAGTGACATGGATTTTATTAACTGTAGGGAAAGCAACTAATCCTTCCCTCACTCAGTATAACATTTTAATTCGTTTTTGCAATAGCAATAAATAAAAAAGCAAAGGACACCCCATGCTTTAACTCATTTATCTTTTATGTACGTTGGAAGCATAACGTCCACGAGACGTCATTTTGATATCAAAAGTAACCTTTTGACCTTCATCGTATTTTTTAAAATCATTTCCTTGAATAGATAAGAGATAAGCAAACACATCTTGCATATCATCTGCCATAATAAAACCATAGCCTTTGTCAGCGTTAAACCAATTTATTGTTCCTTTATTCATGTAATACATCCTTTCGCATCATCTGTAAATCCTATTTTGCGAAAAAGTGCATTCCTAAAACATTTAAACTCGAGACAAAACCTACCTCTTAATAGTAACACCTATTCTTACCAAAGTCAAATTGGTCTATTTAAAACTTATTGATTTTCTTGTGATTCCCCAGATTTTCATGAGGATTTGCTTTAGCAAGTGTCAGGGTTTCTCTATCAACCACCCTGACATCATGGTTTTCTAATTCAACAACTAGTGCATACTTATAGAGATTAATATCTCCAGAAACGACTGTTGCTTGTTCCCCATTAGATAATGTAATTTTATCTCCTGTTTTCATTTTTCACTTCCATTCTAGGAGCTGCCTATAACACGAAAAAATTTTTACTTAAGGGTGAGTTTTTTATAAGAAAAATAAGGGCTCCCTAAAGCCCTTAAAATATTGCGGGAATAGGATTTGAACCTATGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCTAACTGCTCCATCCCACTTCGCAAGTGTAACACTAATATCAGTTAAAGTCAATTTAACATTAGGATTCATAAATTATTTAAAAAATGTGTTACCTTATCCGAACATTAAGTTATTTCTTACATTAGTAAAGCTATCACTAGATATATCACTAAAATACTTACTACAAACCCAAAAAACAGTAGGCCTATGATCGCCTTTTTTTCTTTATTTTTATTCGTTAGATGCTCCATACTCTTATTATCAAACTGATTTTTGTTTATAGTTACACATTATTTAAAAAAGCTACCCCCATTTGAGTAGCTAATGATGAAGGTGTGGTGCTTTCGCTAAACCACCCATGAGCTAAGTATATCACTTTAATTCGAAATTACAATATCAACCAAAAAAATAGAAACCAATTTTGGCTTCTATTCCACAACAGATACTGTAATCTCATAAAATTAAGTATAGCACCTTGTTAAGCTCAATACTGATTATTAGTTTATAAAGAGAAAAACATATAGCTTAAAAGCATCAAACAAACTTAACATAATAAAAAGTCATTAATTCAATTCTTAATGACTCTTTAATTTATTTTTTGTGCAAATCTTCCAAAATAATATGCTTAGTTCCTTAACTTTATAAACTCAAAAATTCAATGAGATTAAATCGTAGCTATGATTTTATACCATAATTGCCCCAAATTTGTCCCAATTTATTTTTCAATTTAAGAGGTTTTCTATGAAACAGGTTTATAAAGGCTTATAGGTTCTGTTGCAAAGTTTTCCAAAAAATCTATTTTAGTGTAAAATTGAGAAAAAAGACAGAGAGGACAGAGTAATGAATCATTTTAAAGGCAAACAATTCAAAAAAGACGTGATGATTGTCGCTGTTGGTTACTACCTGCGTTACAATCTAAGCTATCGTGAAGTTCAGAAATTGTTATATGATCGTGGAATAAATGTTTGTCATACTACGATTTATCGTTGGGTGCAAGAGTACAGCAAAGTCCTCTATTATCTTTGGAAGAAGAAAAATAGACAATCCTTCTATTCATGGAAAATGGACGAATCCTATATCAAAATTAAGGGACGTTGGCATTATCTTTATCGTGCAATTGATGCGGACGGCTTAACCTTAGATATCTGGTTACGAAAGAAACGGGATACGCAAGCAGCCTATGCTTTCTTAAAACGACTCCATAAACAGTTTGGTGAGCCGAAAGCAATTGTGACCGATAAAGCACCTTCTCTTGGCTCCGCCTTTAGAAAGTTACAGAGTGTGGGTTTATATCCTAAGACAGAGCACCGAACTGTGAAGTATCTTAACAATTTAATAGAACAAGACCATCGACCTATTAAACGACGGAATAAATTTTATCAAAGTCTCCGTACAGCCTCTTCCACGATTAAGGGCAGGGAGACCCTTCGAGGAATATATAAAAAGAACCGAAGAAATGGAACGCTCTTCGGCTTTTCGGTGTCTACTGAAATCAAGGTATTAATGGGAATACCAGCCTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_017496|32765:42082|35152_36376_+|WP_003331415.1|transposase|DBSCAN-SWA MRKDILESITEHLMTGIKPNFADIARRYNCDYRTVKRYYDLGKEKTLEEASKRRVPPSLIENYKSIIEDKLKLGCSVRSIYYFIQLKGYQGSYTTVKRYARLIRESCKHKATIRIETTPGLSAQVDWKENLKLISRNGEVFTINIFLYILGYSRMKYLQLTVDRLQPTLFECLNHAFEKFGGVPEEIWFDNMKTVVDHSKSQFSNVVFNERFRQYAKDAGFKPIACRPFRPQTKGKVEALARTVDRLLVFNNEFEDLEELQALVQQLMEDLNHKEISQAIGTSPSERLDQEALNLKAFDLELLKVYSQLSVPLTRKVSKEALVIFEGRKYSVPVKYIGQTVTCEKEQEDLKVYCDQRLIARHPLSDRPFNYRREDYVEILKSDVFKHLEEDELEAYVDENLQAYDLL >NC_017496|32765:42082|41401_42082_+|WP_014573532.1|transposase|DBSCAN-SWA MNHFKGKQFKKDVMIVAVGYYLRYNLSYREVQKLLYDRGINVCHTTIYRWVQEYSKVLYYLWKKKNRQSFYSWKMDESYIKIKGRWHYLYRAIDADGLTLDIWLRKKRDTQAAYAFLKRLHKQFGEPKAIVTDKAPSLGSAFRKLQSVGLYPKTEHRTVKYLNNLIEQDHRPIKRRNKFYQSLRTASSTIKGRETLRGIYKKNRRNGTLFGFSVSTEIKVLMGIPA >NC_017496|32765:42082|39414_39615_-|WP_011669084.1|DBSCAN-SWA MANGTVKWFNADKGFGFITSEEGKDLFAHFSAIQSDGFKTLDEGQKVEFDVEEGQRGPQAVNITKA >NC_017496|32765:42082|39891_40092_-|WP_003132324.1|DBSCAN-SWA MNKGTINWFNADKGYGFIMADDMQDVFAYLLSIQGNDFKKYDEGQKVTFDIKMTSRGRYASNVHKR >NC_017496|32765:42082|37194_37413_-|WP_014573528.1|DBSCAN-SWA MLENEYFVFTSTLTTMIRKQAQSIITGLKGHNQNSVTKNTTRLVTGYFPIDLIKGYRPSHVKGHLKMLVLGH >NC_017496|32765:42082|36387_37146_+|WP_003331414.1|DBSCAN-SWA MTTYHQLLNQLDHLKLDRVRQLLPEFLDEHADISLVEGLHELLSEELREREALLQERRLKKAHLPYEKRVMDFDFQFQPKINKAEILDLHTLRFLDKHENLLFIGNSGVGKTHLAISITLEALEKGYSSYFCMSTELVDRLLRANQKGTLERVLKQYANYDVLVIDEVGYLPFSRDGASLLFQLINMRYEKKSTLITTNIPLSQWSEFLQDKKLTNALLDRLVHHSKVISITGKSYRMKDYSEKKTKTPKSK >NC_017496|32765:42082|40222_40423_-|WP_014573531.1|DBSCAN-SWA MKTGDKITLSNGEQATVVSGDINLYKYALVVELENHDVRVVDRETLTLAKANPHENLGNHKKINKF >NC_017496|32765:42082|32765_33446_+|WP_014573524.1|transposase|DBSCAN-SWA MNHFKGKQFKKDVMIVAVGYYLRYNLSYREVQKLLYDRGINVCHTTIYRWVQEYSKVLYYLWKKKNRQSFYSWKMDESYIKIKGRWHYLYRAIDADGLTLDIWLRKKRDTQAAYAFLKRLHKQFGEPKAIVTDKAPSLGSAFRKLQSVGLYTKTEHRTVKYLNNLIEQDHRPIKRRNKFYQSLRTASSTIKGRETLRGIYKKNRRNGTLFGFSVSTEIKVLMGIPA >NC_017496|32765:42082|37621_38993_+|WP_155114655.1|transposase|DBSCAN-SWA MVKYSIELKQRVIQDYLSGKGGSTYLANLHNVGSSSQVRRWIRNYRAEGLPTAHSKVNKNYSMELKENAVQCYLTTDLTYEAVARKFEITNFTLLASWVNHFKIYGEVPISKKRGRRKKLESIASSMTQNPNDSQRIKELEQELRYAQIEVAYFKRTSEIGEKCSNEQKSRLIYSLRKTFKLKEILKVTGFPKATYYYWVNCFERVNKDELIEKEMLKIRQEHANAGYRPMSELLKQRGYHVNHKKVQRLMKKLGLRVMSYWHKSRKYNSYKGKVGTVAKNKLHRRFRTSIPHQKITTDTTEFKYYEDGIQKKCYLNPYIDLFNSEVISYHISKQPSYQSIDIALNQALAVTSDCPYRRTFHSDQGWGYQMRDYVSKLKSHRIFQSMSRKGNCHDNSVMENFFGLLKQEIYYGHIFSSFEELEQVIVIWIRYYNTKRIKQKLNWMSPIQFRLNYQNN |
9 | Lactococcus_phage(62.5%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_017492_1 | 1580727-1580823 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_017492_1
|
1 spacers
spacers of NC_017492_1
>1.1|1580752|47|NC_017492|CRISPRCasFinder TGAAGAAGATGAATCTGAATTGGCAATTGGACCCTGAGCCGAACTTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017492_1
The CRISPR arrays of NC_017492_1 >merge|NC_017492|1|1580727-1580823|CRISPRCasFinder CCAAAACTGGTGAATCTGAACTGGTTGAAGAAGATGAATCTGAATTGGCAATTGGACCCTGAGCCGAACTTGCCAAAGCTGGTGAATCTGAACTGGT >NC_017492|1|1|1580727-1580823|CRISPRCasFinder CCAAAACTGGTGAATCTGAACTGGT TGAAGAAGATGAATCTGAATTGGCAATTGGACCCTGAGCCGAACTTG CCAAAGCTGGTGAATCTGAACTGGT
>NC_017492.1|WP_014572859.1|1578107_1578599_-|hypothetical-protein MTQNKEPERKPIDPKDLNKFVNGLNDYRDNWMSEINGKDYLTPNRKIEENKKSKKEQNNSTKALQKIEDLLNDSNKSVDSEMILQIAKKKLESGEFNSEDAEDFIVHDLLLLTTTPGKQGITNRERDYINSRRKRGGMRTALISVIGTIIIFLAWAIKMGFFK >NC_017492.1|WP_021165395.1|1577720_1578098_-|hypothetical-protein MKSITSKQTAFVGNILTTVMVAFMGTINIINNLYSFAGYSPFVIALMGIVAMSVYPALEWVAYSRIGKRGGKWWKLFLLVMGILSIFHSYSSLGNILVFSFRIIIGICYIFTFFLKDTKLSSNSN >NC_017492.1|WP_011675812.1|1577126_1577705_-|hypothetical-protein MSQNKEIENLDDIFLTKDKNKSKKNKEKTAEEKARETEQIVANLKEMQERGKKWNEEHKSEVYYDRRGLVRFESLTKQKPRTIKRGRKYQVFMENIDSYLDSNEIRLEIKKLLQDTKDYLLQGIFDIFDANRYLRGNINFLVHQGSQLNDYERKILKSFKNKSYIKNIITIISICVIIYLIPELLVDYLAMT >NC_017492.1|WP_014572314.1|1576254_1577145_+|IS982-family-transposase MTYNSTLPKVFVYLLTTIDTLYQTRVPLEVQNRKNVHLATSDCLVIACYLWGVLHFSETIKAKHQLAQSLFPNFLEYSRFVRRCNALLPSIQVIRQALVFKEVEGMSVSIIDSFPIPLCQPIRNFKSKGLGDYANVGYNATKGQYFYGCKCHALVSESGYVIDYTITPASMADSSMTEEVLSQFGTPTVLGDMGYLGQSLHDRLELKGIDLMTPVRKNMKQKKILFPNFSKRRKVIERVFSFLTNLGAERCKSRSPQGFQLKLEMILLAYSLLLKSAKSLEPETLRYSIGYQVMAK >NC_017492.1|WP_014572856.1|1572977_1573865_-|bifunctional-methylenetetrahydrofolate-dehydrogenase/methenyltetrahydrofolate-cyclohydrolase MKVGLWYNSFMNLIDGKALAAKMQAELKVKVDKLKEAGSVPGLAVILVGEDPASQIYVRNKARQATAIGLNSSVVRLPETVSEKELLELIEQYNQSEQWHGILVQLPLPKHISEEKVLLAIDPEKDVDGFHPMNMGRLWAGNPLMIPSTPAGIMEMFREYNVELSGKRAVVIGRSNIVGKPMAQLLLMADATVTIAHSRTKNLRELTKEADILVVAIGRDRMIKADDVKDGAVVIDVGMNRDEDGKLHGDVDFDEVKEVASLITPVPGGVGPMTITMLMEQTVRAATRKMNENSN >NC_017492.1|WP_031286477.1|1571553_1572807_-|exodeoxyribonuclease-VII-large-subunit MTEYLSVSTLTKYLKAKFERDPYLERVYLTGEISNFRRRPNHQYFALKDEGAVIQATMWAGQFRKLDFELEEGMKVLAIGRISIYPPSGSYSINIESLVPDGVGALALKFEQLKKKLAAEGLFDQRWKQNLPQFSKKIAVATSPSGAVIRDIITTVQRRFPMSQIVLYPTKVQGAGAAEEISGNIRRANERGDFDVMIIGRGGGSIEDLWGFNEEIVVRAIFESRIPIISSVGHETDVTLADFVADSRAATPTTAAELATPNTKIDLINWANEQESRLFNRLTHLIKIRRERLEKLSQSVVFRQPERLYDGHVQKLDRLCERLTVLTENKVANMKHRYELSANRLIPTYSKIVESKKNKTEQLYQSLLLLDISKIKARGFSLITDENGKIIKSVSDVKKGQALDVELTDGQVKVEVK >NC_017492.1|WP_011675817.1|1571311_1571551_-|exodeoxyribonuclease-VII-small-subunit MATKKEEVKFEDNLAELENIVRKLESGDVALEDAIAEFQKGMKISETLKKTLNEAEQTLVQIVGKDDNESEFSAEQKEY >NC_017492.1|WP_014572855.1|1570194_1571085_-|IS982-family-transposase MTYNSTLLKVFVYLLTTIETLYQTSVPLEVQNRKNVHLATSDCLVIACYLWGILHFSETIKAKHQLAQSLFPNFLEYSRFVRRCNALLPSIQVIRQALVFKEVEGISVSIIDSFPIPLCQPIRNFRSKGLGDYANVGYNATKGQYFYGCKCHALVSESGYVIDYTITPASMADSSMTEEVLSQFGTPTVLGDMGYLGQSLHDRLELKGIDLMTPVRKNMKQKKILFPNFSKRRKVIERVFSFLTNLGAERCKSRSPQGFQLKLEMILLAYSLLLKSAKSLEPETLRYSIGYQVMAK >NC_017492.1|WP_014572854.1|1568990_1570136_-|glycerate-kinase MNKKFVLAPDSFKESLSAKEVCQAMERGIKKVFPEAEIILAPMADGGEGTIEALIDATEGRRVFKNVRGPLENSEVEAYFGILGNSDTAVIEMAKASGLELLALKDRNPLITSTYGTGQLIKAAIDEGMHKIIIGIGGSATNDGGSGMARALGAKFLDEKGEEIPSGGGFLKKLNQIDMSNFDKRLQEVEIFIASDVTNPLVGKNGASYVFGPQKGASAKMVEELDENMNHYANIIYRDLGKNIKNKAGAGAAGGLGAGLLAFTDAEMKLGIELVANNIHLEDKIKEADYIFTGEGGMDYQTKFGKAPFGVSKLAKKYKKPCFALAGHIGEGIEVLYEEGMTAIFGIQGTAQTLPEALKSGTKNIERTSENIARILSITEY >NC_017492.1|WP_014572853.1|1567908_1568766_-|polyprenyl-synthetase-family-protein MDTKILKLEHFLTEFYESAEFPKGLAEPAKYSLMAGGKRIRPLLFLNLLEAFDLEVTTAHYQVAAALEMIHTGSLIHDDLPAMDNDDYRRGKLTNHKKFDEATAILAGDTLFFDPFYVLSSSDLSAQTIVSLTRELAYASGSYGMVAGQILDMAGEGKDLTLTQIEQIHRLKTGRLLTFPFVAAGIVAQKTNQEIEKLRVVGQILGLAFQIRDDILDVTATFAELGKTPGKDVLEEKSTYVAHLGLEGAKISLTDKLSEVKKLLTELNVTDSSEIFKIIEQLEVE >NC_017492.1|WP_011835503.1|1581381_1582884_-|ABC-transporter-permease/substrate-binding-protein MSQLISTFQNQQGQFWQALLEHIQISLISIFIAILISIPLALLLRRFPKIAEPILQVTGIFQTIPSLALLGLLIPFIGIGSLPAIVALVVYAIFPIVQNTYTGLEQIEPSLIEAATAFGMNRRERLMKFELSLAMPFIMAGIRTSTVMVIGTATLAALIGAGGLGNFILLGINMNDVSLILIGAISSALLAIIFSSLLKFLEKAKIRTILISFFIGLLVLGGSYYRPQTSDHPQITIAGKLGAEPDVLINMYKLLIEKDSNIRVNLKSNFGDTTFLYNALKAGKIDIYPEYTGTITSTFLKDPVNSTDPAVVWQKAEEGIKKLNQFTYLSPMKFQDTYALAVKSDFAKEHQLTKISDLPNVSGLTAGFDVEFANRSDGNIGLKKLYGLDLNVKTMQSSLIYNALNSGAVNVAEVYSTDSQIKQYNLTVLKDDKNLFPPYQAAPLMKESLLKKYPELKKILNKLSGKITDQEMIEMNYDVNVKQEDASKVAERYLKAKGLI >NC_017492.1|WP_011675807.1|1582880_1583798_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIEFQNVSKAFASKKILDHANFTIKDQEFFVLVGPSGSGKTTTLKMINQLVTHSEGKILINNEEVSTTNLRKLRLSVGYVLQQIALFPNLTVSENIALIPEMKGWDKTKITDRTNELLDLVGLDAKDYAHRQPSELSGGEQQRVGILRAIAANPKIVLMDEPFSALDPISRRQLQIFIKDLQKKMNLTIVFVTHDLDEALYLADRVAVMNDGLIQQIAEPADIYQHPANDFVKTFFKEYHQNLSTVSVENLLLTELSVNPEAQEVAENTTISEIINRLSEKEVLKYRGKSITSDDIICYIAGGEK >NC_017492.1|WP_014572861.1|1583926_1585234_-|NAD(P)/FAD-dependent-oxidoreductase MFDYIIIGAGPGGLGLAYRLKTKDNKIAMIENDKWGGTCPNYGCDPTKMMMAVIEAKSHVEHLKGQGISGDLKIDWKGLRSRKLNITDPYEKSTFEGLKNADIETIYGSASFTEQGELQVAGEIYQAKTYIIATGSRPRHLELDGDEFLKTSNDFLALEELPAKISFMGSGPISLELAQIAKAAGSDVTIISRKKSNVAHFDEEMGQEFINYLKNQGINFIENISVSKVEKFTDGFLLTDGAGFEHKTDLVIAGVGRQPNSDQLNLDKVGVETDHKGIKVNDYLQTSNPKIYAMGDVLSKAEPHLTPVSSFEGNYLGQNLPNANKVPIHYPQIPTIIFGTAKLAEVGILTGTGIRTKSLNLKSWYTYKRINDPLAKLKVAINENQEIVGASTVSSVADEVINLISILIQQKMTLADVEKMIFTYPTVASDLEYFY >NC_017492.1|WP_011675805.1|1585372_1585801_-|Spx/MgsR-family-RNA-polymerase-binding-regulatory-protein MIKIYTVASCSSCKKAKEWLEKHQLAYQEINLVTNHIGREDLLEILSLTEGGTVDIISKRSQAYERLNIDFESIKLNDLVELIEMNPTILRRPLIIDNKRLQVGYNDDEIRKFLPRKMRKIQIEAATERLYQFDLEEQFQEG >NC_017492.1|WP_011675804.1|1585961_1587065_-|alanine-racemase MKTSPHRNTSAIVDLKAIRNNIEKFKKHINPNAEIWPAVKADAYGHGSVEVSKAVSDLVGGFCVSNLDEAIELRNHLVTKPILVLSGIVPEDVDIAAALNISLTAPSLEWLKLVVQEEAELSDLKIHIGVDSGMGRIGIRDVEEANQMIELADKYAINFEGIFTHFATADMADETKFKNQQARFNKIMAGLSRQPKFIHSTNTAAALWHKEQVQAIERLGISMYGLNPSGKTLELPFEIEPALSLVSELTHIKKIAAGETVGYGATYETSEETWIGTVPIGYADGWTRQMQGFKVLVDGKFCEIVGRVCMDQMMIKLDKSYPLGTKVTLIGRDKANEITTTDVADWRGTINYEVLCLLSDRIKRIYK >NC_017492.1|WP_011675803.1|1587108_1587468_-|holo-ACP-synthase MVFGTGVDNVELSRIQKALTRSERFVEQVLTTMELEKYNNFQSTARKTEFLAGRWAAKEAFSKAYGTGFGKALGMHDLEIKNDELGKPYFSKHPFEGQVHLSISHSNLEAVAFVVLEKN >NC_017492.1|WP_014572862.1|1587596_1589015_-|dipeptidase-PepV MTTIDFKAEVEKRKDALMEDLFSLLRIDSAMDMEHADAENPFGPGPRKALDAFLKIAERDGYTTKNYDNYVGHFEYENGANADAEVLGIIGHLDVVPAGSGWDSNPFEPEIRNGNLYARGASDDKGPTVACYYALKILKELNLPLSKKIRFIVGTNEETGWADMDYYFEHCELPLPDFGFSPDAEFPIINGEKGNITEYLHFSGKNAGQVVLHSFKAGLAENMVPESATAVISGAKDLEAALEKFVAEHASKNLRFDLEEADGKATITLYGKSAHGAMPEKGINGATYLTLFLNQFDFADGAAAFIKVGAEKLLEDHEGEKLGTAFVDELMGNTSMNAGVWSFDENGEGKIALNFRFPQGNSPERMQEILAKLDGVVEVELSKHLHTPHYVPMSDPLVSTLIDVYEKHTGLKGYETIIGGGTFGRLLERGVAYGAMFEGEPDSMHQANEMKPVENIYKAAVIYAEAIYELAK >NC_017492.1|WP_041168177.1|1589366_1590542_-|IS256-like-element-IS905-family-transposase MTQFTTELLNFLAQKQDIDEFFRTSLETAMNNLLQAELSAFLGYEPYDKVGYNSGNSRNGSYSRQFETKYGTVQLSIPRDRNGNFSPALLPAYGRRDDHLEEMVIKLYQTGVTTREISDIIERMYGHHYSPATISNISKATQENVATFHERSLEANYSVLFLDGTYLPLRRGTVSKECIHIALGITPEGQKAVLGYEIAPNENNASWSTLLDKLQNQGIQQVSLVVTDGFKGLEQIISQAYPLAKQQRCLIHISRNLASKVKRADRAVILEQFKTIYRAENLEMAVQALENFIAEWKPKYRKVMESLENTDNLLTFYQFPYQIWHSIYSTNLIESLNKEIKRQTKKKVLFPNEEALERYLVTLFEDYNFKQSQRIHKGFGQCADTLESLFD >NC_017492.1|WP_041168229.1|1590626_1590959_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MDESIFYKRLKLLSKNLGKSLNQVEKELGYSRNGLNNYKTNHMPSALRLLELSEYFNVSPEYLFGKSELYELKGHDDKNSAEIIFRRLDEKQKLNMCKITNNWLIHEKNG >NC_017492.1|WP_014572864.1|1591933_1593094_-|A/G-specific-adenine-glycosylase MDWSKNKIKEFQKDLLSWYDANKKPLPWRQTTEPYKIWISEIMSQQTQVETVIPYFERFMKKYPTVESLAQADDTELLKLWEGLGYYSRARNLKIAAQEVVNEYNGKFPDNLKEILSLRGIGPYTAAAIASISFDLAEPAIDGNLMRVTSRIFELECDISKSSSRKIFDEHLRTLVSKKRPGDFNQGLMDLGSLVCSPKKPKCETCPLNKYCAAVADGKQLNYPVKTKNLKQKELYYTAFALENSLGEYYLEKRPSKGLLADMWTFPLTELSSVDFEKIITDGAISKNITIPELPESISKMEYFGNFTHIFSHQKWHIVLIKVKAEEKFEIADELLTADKKWVYYDSKKLGENVVNLNQDLSKISRLKLPLSGPQVKMFELLDKKI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_017492_2 | 2174102-2174197 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_017492_2
|
1 spacers
spacers of NC_017492_2
>2.1|2174126|48|NC_017492|CRISPRCasFinder CCCAATTCTTTTAAAATAAACATTTACGCAAGTTATACTTAGTAATAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017492_2
The CRISPR arrays of NC_017492_2 >merge|NC_017492|2|2174102-2174197|CRISPRCasFinder TTTGCCAGAATCTTCCTCAATCTTCCCAATTCTTTTAAAATAAACATTTACGCAAGTTATACTTAGTAATATTCTTCCTCAATTTTCCCAATTCTT >NC_017492|2|2|2174102-2174197|CRISPRCasFinder TTTGCCAGAATCTTCCTCAATCTT CCCAATTCTTTTAAAATAAACATTTACGCAAGTTATACTTAGTAATAT TCTTCCTCAATTTTCCCAATTCTT
>NC_017492.1|WP_011677113.1|2170926_2174031_-|helicase MSRMMPARVRSEGIALYAKGFLNDPIETDFKLTAEIDGEEVSYDLDGAQDSCTCSIFQQNHRYCKHIAAIEEYLKNQDKGSLETKDKETKGAERGLYNENIAFLDAVNGETQLNFSTDQYSIEVQIEDNSQLYDYFSMDYFLYFDLKLKSKNLGRSYVIKDIPYFLRALKNYSQYSLGSLHYIDLFFDNFDEASQEFLSFLLKIDGKSDEALTKSLYIKNGRYLNIPFLFLEEAMDLVSALEVYQLKIIGRTVNYFTFIPLDNDSEIFKFKVESQQDYIELSLFSEDYHNFYDYSLLYDNNVFYKLSQEQRRLLLVLDKQFAQKSKIKFSYSEKDKLAQALQQLSTLGKIEAPEHFVVKPFDAKFTFDLLDEKTLSLAMKFDYGTFSIDSFHDLETLEFSRDLRKEQKIFALMERLQFAKAFNSTLEITEHLSENFFLKILPSFQKLGQIELSPTLRNMRMDEVPEIHIDSQGGLLDISFNIPHVEDGEFANVIAKLQENAEFYISESGKFYHFNEKFDRLKAALHELDDQFVIQGSSLHVNINRSFQISKIFEKISGASFSEKFKSLYQHLTHPEEFPYEKPEHIKASLRSYQETGVRWMSMLSHYNLGGILADDMGLGKTVQAITFILSNLKKDESVLITAPASLTYNWASEFEKFTDEIDFVVIDGNKADRTKEIQENHQIYITSYGSFLKDFEDYQDKKLNYLLLDEAQVVKNYSSKTNKSLSALNVEHTFALSGTPLENRIEEIWAIFQVVMPGFLPKREKFNKMEPSVISRLIQPFIMRRKKEDVLEELPEKMEITVYNQLADDQKVIYLAQLELMQKQVLEMDNAALSRSRIEILAGITRLRQICNTPALFMDDYKGSSGKLERLRELLAQIKDSGHRPLIFSQFTKVFPHIEKLMEEQEMTAYKLTGSTPIKDRLSMVQAFNAGSRDAFLVSLKAGGVGLNLTSADVVILVDLWWNPAVEEQAIARAHRMGQKNTVEVIRLITQGTIEEKIMEIQERKKDLIANVLEGDTVDKVLSEAEIREILGV >NC_017492.1|WP_011677112.1|2170110_2170710_-|hypothetical-protein MVERRVVFPVIGDDEVLQKDTRVIFTNQQLLTRNPSLQDEASIETSKSKTDAKRPESFKPYKAKTSFSTQHRPLNSNHAGVSSYDKMPKKTSVDESKERAKRAAATLPKPPKQYVSPLERDKEDLTVRRSTSAILNKRPSTNDNPIRDMKKQGMNVSDAVAKNGSGMKKATPHGGAANDTQKGSYFENKRKNIFDRGIV >NC_017492.1|WP_014573279.1|2168578_2169910_-|UDP-N-acetylmuramate--L-alanine-ligase MEKTYHFTGIKGSGMSALALILHQMGKNVQGSDSTDYFFTQRGLEQVGVPLLPFDEKNIKPEFELIVGNAFRDDNNVEIAFAHKNGFPFKRYHEFLGHFMEDFTSIGVAGAHGKTSTTGMLAHVMSNIVDTSYLIGDGTGRGNAGSEYFVFESDEYERHFMPYHPEYTIMTNIDFDHPDYFEGIEDVTSAFQDYANNIKKGIFAYGEDVNLRKLSAKAPIYYYGFEANDDYRAENLIRSTRGSSFDAYFRGEKIGHFVVPAYGKHNVLNALSVVAVCHNLGLDMTDVADHLLTFRGVKRRFTEKKVGETVIIDDFAHHPTEIEATLDAARQKYPDREIVAVFQPHTFTRTIAFADEFAEVLDHADTVYLAQIYGSAREVDHHEITAQDLADKVRKPAKVIELDNVSPLLDHDRGVYVFMGAGNIQKYEIAFEKLLSQTSTNLQ >NC_017492.1|WP_004254487.1|2167960_2168419_+|arginine-repressor MKRDKRLEIIKEIVTNNKISTQEELQSLLLERGVEVTQATLSRDIRKLNIIKKRDKGESFYSFLTSGNSKINSDLQLYFYNFVISAKSVGALVVIRTKLGEADVLANALDDERDSRTDILGTIAGADTLLVICASEKAANILTAEIKYILLG >NC_017492.1|WP_011677109.1|2166198_2167893_-|arginine--tRNA-ligase MDEKQLVSQALSAAIDGVLGVEQIAAIIEKPKSSDLGDLAFPAFQLAKTLRKSPQIIAGEIAEKIDTKGFEKVIAVGPYVNFFLDKNATASEVIREVLTEGEHYGDANIGEGGNVPIDMSAPNIAKPFSIGHLRSTVIGDSIAKIYEKLGYQPIKINHLGDWGKQFGLLITAYKKYGDEATITANPIDELLKLYVKINAEAKEDPEVDEEGRQWFLKMEQGDEEALRIWKWFSDVSLIEFNRIYGKLGVTFDHFMGESFYSDKMDAIVEDLENKNLLHESKGALIVDLEKYNLNPALIKKTDGATLYITRDLATAAYRKKTFNFVKSLYVVGGEQTNHFKQLKAVLKEAGYDWSDDMVHVPFGMVTQGGKKFSTRKGHVVKLEMALDEAVDRAEKQIEAKNPNLENKEEVAKQVGVGAVKFYDLKTDRNNGYDFDLDEMVSFEGETGPYVQYAHARIQSILRKANRKVNIDNISLVVSDAEAWEIVKALKEFPNIVKRAADNYEPSIIAKYAISLAQAFNKYYAHVRILEDDAQLDGRLALISATSIVLKEALRLLGVAAPENM >NC_017492.1|WP_014573278.1|2164665_2165898_-|arginine-deiminase MNNGINVNSEIGKLKSVLLHRPGAEVENITPDTMKQLLFDDIPYLKIAQKEHDFFAQTLRDNGAETVYIENLATEVFEKSSETKEEFLSHLLHEAGYRPGRTYDGLTEYLTSMPTKDMVEKVYAGVRKNELDIKRTALSDMAGSDAENYFYLNPLPNAYFTRDPQASMGVGMTINKMTFPARQPESLITEYVMANHPRFKDTPIWRDRNHTTRIEGGDELILNKITVAIGVSERTSSKTIQNLAKELFANPLSTFDTVLAVEIPHNHAMMHLDTVFTMINHDQFTVFPGIMDGAGNINVFILRPGQDGEVEIEHLTDLKAALKKVLNLSELDLIECGAGDPIAAPREQWNDGSNTLAIAPGEIVTYDRNYVTVELLKEHGIKVHEILSSELGRGRGGARCMSQPLWREDL >NC_017492.1|WP_011677108.1|2163435_2164500_-|ornithine-carbamoyltransferase MTSPLITKAEVNSVFQGRSLLAEKDFTPAEINYLVDFGLHLKALKQQNIPHHYLEGKNIALLFAKTSTRTRAAFTTAAIDLGAHPEYLGANDIQLGIKESTEDTARVLGSMFDAIERRGFSQKEVEDLAKYSGVPVWNGLTDDWHPTQMIADFMTVKENFGYLKGLTLVYVGDGRNNMANSLIVTGSMLGVNVHIVAPDSLHPSKEVMDIANKFAEKSGAKPLATSNIEEGVKGANIIYSDVWVSMGESNWEERVKLLTPYRITMDMLKMTGNADNGKLIFMHCLPAFHDTETEYGKEIKEKYGLTEMEVTDEVFRSKYARQFEEAENRMHSIKAIMAATLGNLFIPAVPEDFK >NC_017492.1|WP_014573277.1|2161723_2163304_-|amino-acid-permease MDAENKKGIGLAALVAIIVSGAIGGGVFNLSNDLATNASPGGVVISWIVIGFGILMLVLSLNHLVVNKPELSGVSDYARAGFGNMVGFISGWGYWLSAWAGNIAFAVLMMTAVDYFFPGVFQAKNGSLTILSVIVVSIVSWGLTLLVMRGVEGAAAINAIVLVAKLIPLFVFVIAGIVTFKAGVFSAHFWQNFVANTNADGVIKSLTWSNMTGGDLFSQVKGSLMVMIWVFVGIEGAAMMGDRAKRKSDAGKASILGLIALLVIYILLSLLPFGFMSQQELANTGQPGLVHILNAMVGGWGGSLMAIGLVISLLGAWLSWAMLPVEATQQLSEQKLLPSWFGKLNDKGAPKNSLLLTQLIVQIFLIVTYFVADVYNVFVYLCTAVIMICYALVGLYLFKLGIQEKKTSNIIIGFIAAAFQILALYYSGWQFVWLSLILYAVGFILYALGKKEYGTKMSTAELIATFILTVLGILAVFGVYGNWLGLQDALGIDGNTLLVAVVPLIVVTFIVYFVVRSDINKKGIKN >NC_017492.1|WP_014573276.1|2160761_2161706_-|carbamate-kinase MVSRIVVALGGNAILTKDPSAAAQKKALEVTAEQLMPLIKDNDRQMVVTHGNGPQVGNLLLQQLGSDSEKNPAMPLDTVGAMTQGEIGFWTVQAFTRAMANNGLERYPVISAVTQTLVDENDPAFKNASKPIGPFYTEEQLPEIKKQFPDWELMEDAGRGYRRVVPSPKPLEIIEAKAFGPILESGSLLIASGGGGIPVIKDGNGYKGVEAVIDKDFSAAKLAEMVGADELLILTSGGDVYLNYGKEDQVHLETVKVSEMRKYVDEERFAKGSMVPKVEAAVSFVERTGKVATITSLDNVENFVKSGSGTRIVP >NC_017492.1|WP_014573275.1|2159784_2160729_-|carbamate-kinase MVRRMVVALGGNAILTDDPTAKAQERALETTAEQLIPLIRNNDVEMVFTHGNGPQVGNLLLQQLAADSPKNPAMPIDTAVAMTQGQIGFWMGQAFTRALIKNKMERVPVISVVTRTVVDKDDSAFEKPTKPIGPFYDEKGLAEMKAQYPDWTFVEDSGRGYRRVVPSPKPTRIVEAEAIKPLISSSVLVTVSGGGGIPVIETQEGYEGVEAVIDKDFSAAKVAELVEADNLLILTAVDNVFVNFNKPNQKKLETVTMAEMKAYIKEGQFAAGSMLPKVEAAMEFVTRTGRPATITSLENLEDFLNNDSGTKIIP >NC_017492.1|WP_014573283.1|2174791_2175682_-|IS982-family-transposase MTYNSTLPKVFVYLLTTIETLYQTRVPLEVQNRKNVHLSTSDCLVIACYLWGVLHFSETLKAKHQLAQSLFPNFLEYSRFVRRCNALLPSIQVIRQALVFKEVEGISVSIIDSFPIPLCQPIRNFRSKVLGDYANVGYNATKGQYFYGCKCHALVSESGYVIDYTITPASMADSSMTEEVLSQFGTPTVLGDMGYLGQSLHDRLELKGIDLMTPVRKNMKQKKILFPNFSKRRKVIERVFSFLTNLGAERCKSRSPQGFQLKLEMILLAYSLLLKSAKSLEPETLRYSIGYQVMAK >NC_017492.1|WP_014573284.1|2175866_2176484_+|hypothetical-protein MRKIIGKKNKVHYVEETTRFQMVKSHKGWLVIGASMFALGLGLNIPATTAHASQLDGQWAARTVQEIKADFDKSGTSQSYKIQWGDTLSAISAQYPSINVETADGLATLETSNPDLKAAFDAAKSDKDDSDFELENAKIAVSDASVAKPNMQADLIKDENTIASLTERINTDTAKVSPLESKLTTETATLSDLQQQLDNAKKQQR >NC_017492.1|WP_014573285.1|2176461_2179695_+|hypothetical-protein 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>NC_017492.1|WP_014573287.1|2180239_2181130_+|IS982-family-transposase MTYNSTLPKVFVYLLTTIETLYQTRVPLEVQNRKNVHLATSDCLVIACYLWGVLHFSETLKAKHQLAQSLFPNFLEYSRFVRRCNALLPSIQVIRQALVFKEVEGMSVSIIDSFPIPLCQPIRNFRSKVLGDYANVGYNATKGQYFYGCKCHALVSESGYVIDYTITPASMADSSMTEEVLSLFGTPTVLGDMGYLGQSLHDRLELKGIDLMTPVRKNMKQKKILFPNFSKRRKVIERVFSFLTNLGAERCKSRSPQGFQLKLEMILLAYSLLLKSAKSLEPETLRYSIGYQVMAK >NC_017492.1|WP_014573290.1|2183788_2185834_+|hypothetical-protein 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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DBSCAN-SWA_1 |
14040 : 72577
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_017492|14040:72577|DBSCAN-SWA 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47 | Bacillus_phage(23.08%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
76242 : 135421
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_017492|76242:135421|DBSCAN-SWA 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55 | Bacillus_phage(23.08%) | integrase,tRNA,transposase | attL 72652:72669|attR 106803:106820 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
438651 : 450808
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_017492|438651:450808|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_017492|438651:450808|442172_443801_+|WP_011675465.1|DBSCAN-SWA MSKEIKFSSDARTAMMRGIDILADTVKTTLGPKGRNVVLEKSYGSPLITNDGVTIAKEIELEDHFENMGAKLVSEVASKTNDIAGDGTTTATVLTQAIVREGLKNVTAGANPVGIRRGIELAAETAVASIKEMAIPVHDKSAIAQVATVSSRSEKVGEYISDAMERVGSDGVITIEESKGMQTELDVVEGMQFDRGYLSQYMVSNTEKMVAELDNPYILITDKKISNIQEILPLLEQILKTNRPLLIVADDVDGEALPTLVLNKIKGVFNVVAVKAPGFGDRRKAQLEDLAILTGGTVITEELGLDLKDATLEALGQAAKATVDKDHTTIVEGAGSVDAISDRVAIIKAQIEKTTSDFDREKLQERLAKLAGGVAVVKVGAATETELKAMKLLIEDALNATRAAVEEGIVSGGGTALVNAIAALDKLSEEGDIQTGINIVRRALEEPVRQIAANAGYEGSVIIDKLRSEKVGTGFNAATGQWVNMIEEGIVDPAKVTRSALQNAASVAGLILTTEAVVANKPEPAAPAMPPMDPSMGMGGMM >NC_017492|438651:450808|447153_447789_+|WP_014572049.1|DBSCAN-SWA MNGILISLEGPDGAGKTTVLQEILPEIQKMKREVVPTREPGGVRVAEEIRQIILDPKNTEIDSKTELMLFAAARRLHMQEKMLPALRAGKVVIVDRFIDSSVAYQGYGRDLGVEVVDWLNYFATDGLKPDLTLYFDIDTDVALERIMKNRSDEVNRLDLERAEMHRKVREGYLEIVAKEPERFVKIDASQSLEKVVADTLEVLKKRFVSEF >NC_017492|438651:450808|444854_446282_-|WP_011675468.1|DBSCAN-SWA MIKFFNSMIFKGVVAHLLLFVILFMSNFDYNLIHLSTFIGYYLFSLVFVLVFLNQQHRMIVNVSKQMNDIKNGYLNRDKIPKGTSEINELYEEILKLGEDIVRTQNNLENQRNQLDSILAYMVDGVIATDRRGNIIMANKSALHYLNTSNELLMEKNIVDVLKIADQYNFYDLLEKEPEITIETHDAGNKSISLHIKFALFRRESGFISGIIAVLHDMTEQDKAERERRLFVSNVSHELRTPLTSVKAYLEALEDGAIDDKETASSFIGVSLTETNRMIRMISDLLTLSRMDQDRIVLNKEIINLIAFLDYQINRLDQILETESNDLISSNFTLVRKYSDKPIWVEIDTDKIAQVIDNIIGNAIKYSPKGGTITISIETRERDVLISIKDEGMGIPKSDLLKIFDRFYRVDNASRNSKVGGTGLGLSIVHDIVKIHGGTIFASSEGEGKGTTFSFTLPYSSETAEYWDDAADDFE >NC_017492|438651:450808|439074_439701_+|WP_011675461.1|tRNA|DBSCAN-SWA MIATYNTNVGDVLMLITANDRGEKVNFERKGKVARIFIEETGATVAWNIFEAKSLLTDLSGNGQVKLSSDDVEILNKELGKSGFSDVLVHDSQPKFVVAEIVEMQDHPDSDHLHICKVNVGFADPVQIVCGAPNASLGLKTVAALPGAMMPNGALIFPGALRGVQSYGMLCSARELELPDAPDVRGIIELSSALAAGTAFDSETMWQA >NC_017492|438651:450808|449932_450808_+|WP_014572050.1|DBSCAN-SWA MENKFNIQRSFKGVKTAGSLYLVPTPIGNMQDMTLRSLETLKTVDLICSEDTRNTLRLLNHFEIKVPQESFHEHNSQEKIPKLIDFLKSGQSIAQVSDAGMPSISDPGHDLVLAAIKEEIDVVALPGASAGITALIASGLVPQPHIFYGFLPRKKGEQQKFLKTKLAYPETQIFYESPFRVADTLSNMQEIYGDREVVLVRELTKIYEEYRRGKISEVLNSLVEQPIKGECLIILSGADELVQEIQEPELTALEAVKNLVAQNVKPNVAIKEIAKERGLNRQDLYAEFHDL >NC_017492|438651:450808|446274_446976_-|WP_003131580.1|DBSCAN-SWA MKKILVVDDEKPISDIVKFNLTKEGFEVFTAFDGEEALEAFKEVQPDLILLDLMLPKLDGLDVAREIRKTSDTPIIMVSAKDSEFDKVIGLELGADDYVTKPFSNRELLARIKANLRRINVAPAESTDNVKKELIIGNLRINPAHYAAYKNDKQLDLTHREFELLYYLAQHLGEVITRENLLETVWGYDYFGDVRTVDVTVRRLREKVEDTPSRPQYVSTRRGVGYYMSNPHD >NC_017492|438651:450808|447921_448782_+|WP_011675470.1|DBSCAN-SWA MEIVDIQPQLYKQFSTILQHGKLSHAYLFSGGFGSFELAIWLSQALFCENPENSLPCGHCRSCRLVAQQEFADLHIVEPDGQTIKTAQIRDLTQVFSESGYEGKQQVLLFREAEKMHPNAANALLKSIEEPETEIVVFLLTDNENMILQTIKSRTQIINFRKNVQFLQDFLEKNGILKTQAELLAEICNSTDRALELAQQSWFNEGLQRIQHFVKLLKKSADEAFLYLKDLVEIFDDKEKQNQAFELLLQLFNQERMSQELLKTFQAIKMWKSNVRFESSLTFIVL >NC_017492|438651:450808|438651_438969_+|WP_011675460.1|DBSCAN-SWA MIIPENIENLAELVKGPEKTVFFFTAGWCGDCNFIKPKMPEIETENPEFRFVEVDRDEYMDLAIEWGIMGIPSFVVIEDGQEKARLVNKLRKTKEEVNTFLASAK >NC_017492|438651:450808|448831_449614_+|WP_011834464.1|DBSCAN-SWA MIYEIKFAHGESNIFATSEAELVPQSEVIIRSEKGTFYGKIIRSFSDDANLETHHTIEREVTDEDLEVILKLEELSKKAKDKVRQLVVEQELEMKIIDVAYTFDQMQLFISFTAENRVDFRLLLRELATTFRIRIELRQIGPRDAAKIHGGLGPCGRPLCCSEFVYEFPNVSIKMAKNQNLSLKQNKLNGLCGRLMCCLTYEDSFYKEAQQLFPDFGEFVTTSEGKGKVVGLNVLKNRVKIRFGEYSKDFELAEIEVNHG >NC_017492|438651:450808|441801_442086_+|WP_011675464.1|DBSCAN-SWA MLKPLENRVVLRVKEEEEKSMGGIVLTSASQEKPQTAEVIAVGEGKTTNHGTLISPLVKVGDTVIFEKFSGTTVKMDGEEFLILKDSDLLAIVE >NC_017492|438651:450808|449606_449933_+|WP_011675472.1|DBSCAN-SWA MADKYDVFDQLGELENTLNTTLTQISGIRQVLEASMTENATLRMELEKLRDRLAEFEKKEVKKETPKDQPNPNLIQIFNEGFHVCHLHYAERLAEGESCLDCLELLYR >NC_017492|438651:450808|439862_441203_+|WP_014572047.1|DBSCAN-SWA MKIVVIGTNHAGIATANTLLEQYPGHEIVMIDRNSNMSYLGCGTAIWVGRQIEKPDELFYAKAEDFEAKGVKILTETEVSEIDFANKKVYAKTKSDDEIIEAYDKLVLATGSRPIIPNLPGKDLKGIHFLKLFQEGQAIDAEFTKEKVKRIAVIGAGYIGTEIAEAAKRRGKEVLLFDAENTSLASYYDEEFSKGMDENLAQHGIEFHFGELAKEFKANEEGYVSQIVTNKATYDVDLVINCIGFTANSALASDKLATFKNGGIKVDKHQQSSDPDVYAVGDVATIYSNALQDFTYIALASNAVRSGIVAGHNIGGKELESVGVQGSNGISIFGYNMTSTGLSVKAAKKLGLEVSFSDFEDKQKAWFLHENNDSVKIRIVYETNSRRIIGAQLASKSEIIAGNINMFSLAIQEKKTIDELALLDLFFLPHFNSPYNYMTVAALNAK >NC_017492|438651:450808|443852_444665_-|WP_011675466.1|DBSCAN-SWA MTEQNGFKYSILASGSTGNSFYLETPKKKILVDAGLSGKKIESLLSEIDRDIHDIDALLITHEHSDHIKGIGVLARKYGINLYANEDTWSELDGKNALGKIPLEQKHLFEMGKTMTFGDIDIESFGVSHDAIAPQFYRFMKDDKSFVMLTDTGYVSDRMRGTIENADAYLMESNHDIEILRMGAYPWRTKQRILSDQGHLSNEDGAEAAFNIHGNKTKKIFLGHLSLNNNIKELAHLTMDGYLQQHDVDTKNELKILDTSHEHASPLYDI >NC_017492|438651:450808|441293_441683_+|WP_011675463.1|DBSCAN-SWA MNKTMLIGHLTNAPEISKTTNNKSYVRVTLAVNRRFKNEKGEREADFISIILWGKSAETLVSYAKKGSLISVEGEIRTRNYTDKNEQKHCITEILGLSYDLLESRATLALRESAVNFEELLLEADELPF |
14 | uncultured_virus(30.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
498174 : 503905
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_017492|498174:503905|DBSCAN-SWA AATGGAGGTTCTAATGGAACAAGTAGTTACGCATTACAGAGAAACTATTCAGCAGCATAGTGTTGAGTGGTACAAAAAACAACTGTTAAAAGATTTTTCTGTTCAATTTATGGTTCTGTTGCAAAGTTTTCCAAAAAATCTATTTTAGTGTAAAATTGAGAAAAAAGACAGAGAGGACAGAGTAATGAATCATTTTAAAGGCAAACAATTCAAAAAAGACGTCATTATTGTCGCTGTTGGTTACTACCTGCGTTACAATCTAAGCTATCGTGAAGTTCAGGAATTGTTATATGATCGTGGGATTAACGTTTGTCACACAACTATTTATCGTTGGGTACAAGAATACAGTAAAGTCCTCTATCATCTCTGGAAAAAGAAAAATAGACAGTCCTTCTATTCGTGGAAAATGGATGAAACTTATATCAAAATCAAAGGTCGTTGGCATTATCTCTATCGTGCAATTGATGCGGATGGATTGACTTTAGACATCTGGCTACGCAAGAAACGGGATACTCAAGCTGCTTATGCGTTCTTGAAACGACTACATAAACAGTTTGGTCAACCAAGAGTAATTGTCAAGGATAAAGCGCCCTCTATTGGTTCTGCATTTAGAAAGTTACAGAGTAACGGTTTATATACTAAGACAGAGCATCGAACCGTGAAGTATCTCAATAACCTCATTGAGCAAGACCATCGACCAATCAAACGACGCAATAAATTTTATCGAAGTCTACGAACTGCCTCAACCACGATTAAGGGCATGGAAACAATTCGAGGAATATACAAAAAGAACCGAAGAAATGGAACGCTCTTCGGCTTTTCGGTGTCTACTGAAATCAAGGGATTAATGGGAATACCAGCCTAAGATATTTGGAGTTCAGAAAGGGCGCGTTTGATTTTCAAACTTCGCAACAGAACCTTGCGATTGATACGAACGATGCATACATGAGTACACGCTTACCACATCACTTTTATCGAATTGTTGGTTCAGGTTCAGCAAATACTGATGACAAGCCACAAATGGTTACTCTAAATCTTGATGGTCAATTTGGAAATGCGACCGCTAAACGATTGCAAGAATACTTTGATACTGCTGGTAAAGACGGAGTAATCAGTCACCAGTACAAACAAACCTTTAATCAAAATATTTATGCTGCTCAGTTTGATTCATCACTGACTGGTTCAAACGTGGTTAAAGCATTGCAAAGATTTTTAGGAATTGGACAAGACGGACTGTTTGGGCAAGCTACGATTAAAGCACTACAAAAACATCTTGGAACAACACAAGACGGAATAATTAGCCCAGTATCTGATTCTGTCAGAGAATTACAACGTCGATTAAATGCGAATAAACTATAAAAATAACCCCTGACTTCGTGATGTGAACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATACTTGGATTTTTTTATTTGTTCTTGAAACTCTTCCGATATTCAATCGGAGACAACCAGGATAGATTTTTCTTAATTCGGAGATTATTGTAGTAGTGAATGTAGTTACTAATTGTCATTTCTAAACTCTCAAATGAATCAAATCGTTTTCCGTAATAAACTTCTTGTTTTAGTATACCAAAAAAGTTATCCACGACAGAATTGTCATGACAGTTACCTTTGCGACTCATAGATTGATAAATATTGTGCTCTTGGAGCTTTTGACGATAATACGGTGTCTGATAAGCCCAACCTTGGTCTGAATGGAAAGTACGCCGATAAGGACAATCAGATGTGATTTCTATTGCTTTACTTAATGCATTGCTTATTGCTATAAAGTTTGGTTGCTTGCTTATCTCAAAAGAGACAATTTCACGATTAAACAGATCCATATAAGGGTTGAGGTAAGCTTTCTTCACTTGCCCATTATCGTAGTATTTAAACTCAGTAGTATCAGTTACCAGTTTTTGATGAACAACTTTGGAATTAAAACGTCTATTTAATAAATTTTTTGCGACTTTTCCAACTTTTCCTCTGTAGGAACTATACTTCCGTGTTTTCCTCCAAAAAGAAGTAATACAAAGTCCTAGCTTTCGCATTAAACGTTGAACTTTTTTATGGTTAACAATATATCCTTCACGCTTTAAAAGGTCTACCATGGGGCGATAACCTGCATTAGGGTGTAATTTTCTAAGCTTAATCAATACTTTTTCGATTTCTTCGTCTTTATTTGGGCGTCCGAAACAATTAACCCAATAATAATACGTTGCCTTAGGTAGTCCTGAAATAATTAACAGTTGTTTGATTGGGAACTTGAATTCTCTGTGGAGGGTTTGAACAAGACGTGCTTTTCCTTCGCATTAATAAAGTCTTTAACCCGTATAGTTATTTGACTTTTAATAGTTCTTAAAGTAAACTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATGGATGCGTTGACTTTGCTTGAAATTATAATCTTCAAACAAAGTAACTAAGTAACGTTCCAGAGCCTCCTCGTTAGGAAAAAGAACCTTCTTTTTCGTTTGACGTTTGATTTCTTTGTTAAGAGACTCAATGAGGTTTGTCGAATAAATGCTGTGCCAAATCTGGTAGGGAAACTGATAAAAAGTTAAAAGATTATCCGTATTCTCCAGACTTTCCATGACTTTCCTATACTTTGGTTTCCATTCGGCGATAAAGTTCTCTAAAGCTTGCACTGCCATTTCTAAATTTTCAGCACGATAAATCGTTTTAAATTGCTCCAGAATAACCGCTCTATCTGCTCGTTTCACTTTACTAGCTAGATTTCGACTAATATGAATTAAGCAACGTTGTTGTTTAGCTAATGGGTAAGCCTGACTGATAATCTGTTCAAGCCCCTTGAAGCCATCGGTCACTACAAGAGAAACCTGTTGGATTCCTTGGTTTTGAAGCTTGTCTAACAGGGTGGACCAAGAAGCATTGTTTTCATTTGGGGCGATTTCATATCCAAGAACAGCCTTCTGTCCTTCTGGTGTAATGCCAAGTGCGATATGAATACATTCTTTACTAACGGTTCCACGTCTTAATGGAAGATAGGTTCCGTCAAGAAATAAAACAGAGTAATTGGCTTCTAAGCTTCGCTCATGAAAAGTAGCGACATTCTCCTGAGTTGCTTTTGAGATATTAGAAATTGTGGCAGGACTATAGTGATGACCATACATTCGCTCGATGATATCACTAATTTCTCGAGTCGTTACACCGGTTTGATAGAGTTTGATAACCATCTCTTCCAAGTGGTCATCTCGACGTCCATAAGCGGGAAGCAAAGCTGGACTAAAGTTCCCATTACGATCTCTAGGAATGCTCAACTGAACAGTCCCATATTTGGTTTCAAATTGCCGTGAATAGCTTCCGTTACGACTATTCCCAGAATTATAGCCTACTTTATCGTAAGGTTCATACCCTAAAAAGGCTGATAACTCTGCTTGAAGCAGATTATTCATAGCAGTTTCAAGAGAAGTACGGAAAAATTCATCAATATCTTGCTTTTGGGCTAGGAAGTTAAGTAGTTCTGTGGTAAACTGAGTCATAGGAATAAATCTCTTTCTAGTAATGTTTCGCAACTCTACTATAACGGATTTATTCCTTTTTGTGTTTACACAACTTATTTTACACTACCTTGGTTTCTCATATATGAATTTTCGAATTTTAAATTCATTAATAATATTTACATCAACATTGCTCTTTTTAAAAATATCTAAAGAATTATTCGGAAAAACAGTATCTTACTTTTCAACAATAAGTTTTATGATGTTTGCAATTATACAACCTCTTTATTTAGTTCCATATACAGATACATATTGTCTATTGCCCGTCTTCTTATCTATATATTTCATAACAATTTGTATCAAAAGCAAAAAAACTTTTTCGTTAATATTTAGCTCTATTGGTTCTGCTTTTTTTCTTGCCATATCTTACCTAACGAGACCGAGTAGCATTACATTTATTATAGCGGTACTTTTATTTATTTTAATAAATTTATATAAAAAAGATATAAGAATAAAAAGTCTTATTTCATTTCCTCCGTTTTTATTAACCGTAATTCTTACATTAACAATGTTTAATCTATTCGTAAGTAATCAAAAAATAGTTAAAATTGATAAATCGAAAGAACTTCCAATGGCCCATTTTATTTTGATGGGGAGTTTTGGAGATGAGGATAATCGTGAATCTATTCATGGAACTTGGAATGCAGGAGACTTAAAAAGCACACTTGCAGAGAAAAATAAATCTGATAAATCAAAAAAAGATATTGAATTATTTGTAGAGAGAACAGCCAATCGCGGTCTGGCTAGAACTATAAAATTCTATGGACAGAAATATTTCCAAATTACTGATACAGGAGTTATAGGATATCATCGTGATGGTTTGTGGCTTAATTATGCTTATTCAGCAAATGGAAGCTTATCAAACAAAATACAACAAATATATTATGAAAATGGAAAATTAAGACCAAGTTTCAACTTTTTATGTCAAATTTTTTGGATAATAACCCTTATTTCAAGTATTATTGCATTATACTTTAATAGAACATGGAAAGTTGGTGTGGTAACTCTCAGTTTACTTGGTGGATTGTTGTTCCTTTTGATATTCGAATCTGGCGGAACTAAATATATGTTCCAATATATTTATCTGATTTGCCTGCTATCTGGTTTAGGAATTTCTTATTGTTTAAATAGATTTTCAGGAGATATAGCTATACAAAAAGAAGGAGTGAAAAAAAATGAGGATGAGCAAACTCTCAATAATAGTTCCAGCTTACAACGAAGAAGAAACACTAGAAATATTTCTAAACGAAGTAAATAAACAAAGTGTTGAATTACCTCTAGAAAAAACATATTTTTTTATTAACGATGGTTCAACAGACAATACGTTAGAGGTTTTAAAAAATTTAACTACTAAATATGATAACGTGAAATATATTAGTTTTTCAAGAAACTTTGGTAAAGAAGCTGCTTTGATAGCGGGTTTAGAAGTTTCAGATGGTGATTTTGTAACCGTCATGGACGCAGATTTACAAGATCCACCAGAAATGTTAAACGAAATGTTTACAAAAATAACTGAAGGTTATGATGTTGTAGGAACTCGAAGAGTATCAAGGGTAGGTGAACCTCCTATTCGTTCTTTTTTTGCAAAAACGTTTTATAAATTAATAAATAAAATATCTGACACTGAAATGGTAGACGGAGTACGTGATTTTCGTTTAATGACTCGGCAAGTAGTTGATAGTATTCTTGAGTTGAAAGAAAATAACCGTTTTTCAAAAGGAATTTTTAGTTGGGTAGGCTTTAAAACGACATATCTTCCTTATGAAAACCGAGAACGTGTTGCTGGTACAACATCTTGGAACTTCTTTGGATTGCTAAAATATTCCATAGACGGTATTGTTAACTTTTCGGAAGCACCCTTAAATATCGCAACATTTGTTGGTTTTATAAGTTTTTTAGCTTCAGTGCTACTCAGCGTTTTTTACCTTCTTAAAACACTTTTTTTTGGTGATCCTGTTCAAGGCTTCCCAACTTTGATTTTTTTGATTTTGCTTTTGGGTGGTTTACAGCTCCTTTCTCTTGGAATCATTGGTAAATATATCGCTAAAATATTTCTGGAAACAAAAAAACGTCCCAATTATATTATTAAAGAAAGTAATATAAAGCCAAATTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_017492|498174:503905|498174_498321_+|WP_155114618.1|DBSCAN-SWA MEVLMEQVVTHYRETIQQHSVEWYKKQLLKDFSVQFMVLLQSFPKNLF >NC_017492|498174:503905|498357_499038_+|WP_014572082.1|transposase|DBSCAN-SWA MNHFKGKQFKKDVIIVAVGYYLRYNLSYREVQELLYDRGINVCHTTIYRWVQEYSKVLYHLWKKKNRQSFYSWKMDETYIKIKGRWHYLYRAIDADGLTLDIWLRKKRDTQAAYAFLKRLHKQFGQPRVIVKDKAPSIGSAFRKLQSNGLYTKTEHRTVKYLNNLIEQDHRPIKRRNKFYRSLRTASTTIKGMETIRGIYKKNRRNGTLFGFSVSTEIKGLMGIPA >NC_017492|498174:503905|499605_500436_-|WP_155114619.1|transposase|DBSCAN-SWA MKQLLIISGLPKATYYYWVNCFGRPNKDEEIEKVLIKLRKLHPNAGYRPMVDLLKREGYIVNHKKVQRLMRKLGLCITSFWRKTRKYSSYRGKVGKVAKNLLNRRFNSKVVHQKLVTDTTEFKYYDNGQVKKAYLNPYMDLFNREIVSFEISKQPNFIAISNALSKAIEITSDCPYRRTFHSDQGWAYQTPYYRQKLQEHNIYQSMSRKGNCHDNSVVDNFFGILKQEVYYGKRFDSFESLEMTISNYIHYYNNLRIKKNLSWLSPIEYRKSFKNK >NC_017492|498174:503905|500597_501773_-|WP_041168177.1|transposase|DBSCAN-SWA MTQFTTELLNFLAQKQDIDEFFRTSLETAMNNLLQAELSAFLGYEPYDKVGYNSGNSRNGSYSRQFETKYGTVQLSIPRDRNGNFSPALLPAYGRRDDHLEEMVIKLYQTGVTTREISDIIERMYGHHYSPATISNISKATQENVATFHERSLEANYSVLFLDGTYLPLRRGTVSKECIHIALGITPEGQKAVLGYEIAPNENNASWSTLLDKLQNQGIQQVSLVVTDGFKGLEQIISQAYPLAKQQRCLIHISRNLASKVKRADRAVILEQFKTIYRAENLEMAVQALENFIAEWKPKYRKVMESLENTDNLLTFYQFPYQIWHSIYSTNLIESLNKEIKRQTKKKVLFPNEEALERYLVTLFEDYNFKQSQRIHKGFGQCADTLESLFD >NC_017492|498174:503905|502972_503905_+|WP_080561976.1|DBSCAN-SWA MSKLSIIVPAYNEEETLEIFLNEVNKQSVELPLEKTYFFINDGSTDNTLEVLKNLTTKYDNVKYISFSRNFGKEAALIAGLEVSDGDFVTVMDADLQDPPEMLNEMFTKITEGYDVVGTRRVSRVGEPPIRSFFAKTFYKLINKISDTEMVDGVRDFRLMTRQVVDSILELKENNRFSKGIFSWVGFKTTYLPYENRERVAGTTSWNFFGLLKYSIDGIVNFSEAPLNIATFVGFISFLASVLLSVFYLLKTLFFGDPVQGFPTLIFLILLLGGLQLLSLGIIGKYIAKIFLETKKRPNYIIKESNIKPN >NC_017492|498174:503905|499118_499532_+|WP_014572083.1|DBSCAN-SWA MSTRLPHHFYRIVGSGSANTDDKPQMVTLNLDGQFGNATAKRLQEYFDTAGKDGVISHQYKQTFNQNIYAAQFDSSLTGSNVVKALQRFLGIGQDGLFGQATIKALQKHLGTTQDGIISPVSDSVRELQRRLNANKL |
6 | Lactococcus_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
590193 : 697926
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_017492|590193:697926|DBSCAN-SWA 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111 | Lactococcus_phage(73.53%) | terminase,portal,transposase,holin,capsid,integrase,tail,head | attL 622605:622626|attR 659567:659588 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
854180 : 862230
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_017492|854180:862230|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_017492|854180:862230|861825_862230_+|WP_041168192.1|DBSCAN-SWA MKKIYFLCTGNSCRSQIAEGYGHVFLKDWEVRSAGIERHGLNPHAVTVMAEDGIDISAQKSELIDMTYFNDCDLIITLCGDALDKCPMIPKSVSHEHWDLQDPARAVGTEEDILTEFRKTRDLIKERVQNLSNI >NC_017492|854180:862230|857856_859228_+|WP_155114623.1|transposase|DBSCAN-SWA MVKYSIELKQRVIQDYLSGKGGSTYLANLHNVGSSSQVRRWIRNYRAEGLPTAHSKVNKNYSMELKENAVQCYLTTDLTYEAVARKFEITNFTLLASWVNHFKIYGEVPISKKRGRRKKLESIASSMTQNPNDSQRIKELEQELRYAKIEVAYFKRTSEIGEKCSNEQKSRLIYSLRKTFKLKEILKVTGFPKATYYYWVNCFERVNKDELIEKEMLKICQEHANAGYRPMSELLKQRGYHVNHKKVQRLMKKLGLRVTSYWHKSRKYNSYKGKVGTVAKNKLHRRFRTSIPHQKITTDTTEFKYYEDGIQKKCYLNPYIDLFNSEVISYHISKQPSYQSIDIALNQALAVTSDCPYRRTFHSDQGWGYQMRDYVSKLKSHRIFQSMSRKGNCHDNSVMENFFGLLKQEIYYGHIFSSFEELEQVIVIWIRYYNTKRIKQKLNWMSPIQFRLNYQNN >NC_017492|854180:862230|854180_855473_+|WP_014572319.1|DBSCAN-SWA MHDNDIILKVDEKPAASQWFGLSFQHLFAMFGSTVLVPILVGINPAIALLSSGLGTLAHMSVTKFKVPAYMGSSFAYIGAMTLLMKNGGMPAIAQGAMTGGLVYLIVALIVKFAGKGWIDKVLPPIVVGPIVMVIGLSLAPTAINDAMYTDVANLKGYSLAYIIIALITVLSIVVYSIYGKGFLSVVPILLGIVTGYVAAMIIGKITGMNIVSFTGISQAKWLTLPPMEIPFASYKWAFYPSAILTMAPIAFVTMTEHFGHIMVLNSLTKKDYFKEPGLEKTLTGDGLAQIIAGFIGAPPVTSYGENIGVMAITKIHSIYVIAGAAVLAIVVSFVGKITALLQSIPAPVIGGASIALFGVIAASGLKILVENKVDFDIKRNLLISSVVLVIGIGGMIINITQNLQISSVAIATILGIVLNLVLPKDASEI >NC_017492|854180:862230|860617_861388_-|WP_014572323.1|DBSCAN-SWA MKFNTIQVLIASTLALGTVAVAQEVSAAEQTTSIYRLYNKNTGEHFYTQSRTEQLNAIIAGWNNEGIGWVAPSYSNSPVYRVYNPHAKGGDHYYTRSKYEAQSLVNKGWKWDRNGKPVFYSGGKASVYVAYNPNAQSGSHNYTPNSFEQQSLLNNGWKFGSTAWNAVTKFNWTLAQYRALTVGDSDGKGGVNYNAIIAAHDIPSDVTIYENGSYSSKNVLYSNSDFNSGVYQYVSLTFVKQANGDYLLSNKSYLSL >NC_017492|854180:862230|855628_856561_+|WP_014572320.1|DBSCAN-SWA MSVKNGLVQLENLTSMENLSVDEVMGLIKRSSAFKAGKADFALDEQTFASNLFFENSTRTHHSFHIAERKLGLDVLEFDAQASSISKGETLYDTVLTLDALGVDICVIRSGVEHYYEELVNSDNIHCAIVNGGDGSGQHPSQCLLDLMTIYEEFGKFEGLKIAISGDLTHSRVAKSNMMMLQKLGARLYFTGPAAWYSEEFDDYGHYANLDRILPELDVHMLLRVQHERHDSGESFSKEGYHTHFGLTQERAKMLKPTAIIMHPAPVNRDVEIADSLVESPQSRIVQQMSNGVYTRMAILEAILAGKKAK >NC_017492|854180:862230|856648_857722_+|WP_011676639.1|DBSCAN-SWA MSKRLLILEDGTIFEGEALGANLDVTGELVFNTGMTGYQESITDQSYNGQILTFTYPIVGNYGVNRDDYESIHPTCKAVVVHEAARRPSNWRMQMSFDEFLKSKNIPGITGVDTRAITKIVREHGTMKASLVQARDEVDHQMSQLQATVLPTNQVETSSTATAYPSPNTGRKVVVVDFGLKHSILRELSKRECNLTVVPYNTSAKEILEMEPDGVMLTNGPGDPTDVPEAIEMIKEVQGKIPIFGICLGHQLFSLANGATTYKMKFGHRGFNHAVREVATGRIDFTSQNHGYAVSSENLPEDLMITHVEINDNSVEGVRHKHFPAFSVQFHPDAAPGPHDASYLFDDFMDLMDNFKK >NC_017492|854180:862230|859301_860448_+|WP_095586744.1|transposase|DBSCAN-SWA MARRKFDKQFKNSAVKLILEEGYSVKEVSQELEVHANSLYRWVQEVEEYGESAFPGNGTALADAQHKIKLLEKENRYLQEELELPKKVPGLLEAKQVKRFEFLLKHHGKIKIKHAVKVLKVSRSGFYEYMHRRPSKQQVEREILSEKIKAVFHEHKGRYGAVRITKVLHNTGIMTNTKRVGKLMHLMGLYAKGSRYKYKHYNRKGASLSRPNLINQIFKATAPNKVWLGDMTYIPTKEGTLYLAVNIDVFSRKIVGWSMSSRMQDKLVRDCFLQACGKEHPQPGLIVHTDQGSQYTSSRYQSTLRQVGAQSSMSRKGNPYDNAMMESFYKTLKRELINDAHFETRAEATQEIFKYIETYYNTKRMHSGLDYKSPKDFEKYNS |
7 | Enterobacteria_phage(14.29%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
940129 : 1065048
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_017492|940129:1065048|DBSCAN-SWA 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MEIEKTNRMNTLFEFYATLLTDKQMNYIELYYADDYSLAEIAEEFNISRQAVYDNIKRTEKVLESYEEKLHLFSNYVVRNQLLEELMKKYPSDQYLISKLQEIQQIDEEEF |
108 | Bacillus_phage(20.59%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1085186 : 1134347
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_017492|1085186:1134347|DBSCAN-SWA 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43 | Bacillus_phage(16.67%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1204081 : 1273546
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_017492|1204081:1273546|DBSCAN-SWA TATGACTCAGTTTACCACAGAACTACTTAACTTCCTAGCCCAAAAGCAAGATATTGATGAATTTTTCCGTACTTCTCTTGAAACAGCTATGAATAATCTGCTTCAAGCAGAGTTATCAGCCTTTTTAGGGTATGAACCTTACGATAAAGTAGGCTATAATTCTGGGAATAGTCGTAACGGAAGCTATTCACGGCAATTTGAAACCAAATATGGGACTGTTCAGTTGAGCATTCCTAGAGATCGTAATGGGAACTTTAGTCCAGCTTTGCTTCCCGCTTATGGACGTCGAGATGACCACTTGGAAGAGATGGTTATCAAACTCTATCAAACCGGTGTAACGACTCGAGAAATTAGTGATATCATCGAGCGAATGTATGGTCATCACTATAGTCCTGCCACAATTTCTAATATCTCAAAAGCAACTCAGGAGAATGTCGCTACTTTTCATGAGCGAAGCTTAGAAGCCAATTACTCTGTTTTATTTCTTGACGGAACCTATCTTCCATTAAGACGTGGAACCGTTAGTAAAGAATGTATTCATATCGCACTTGGCATTACACCAGAAGGACAGAAGGCTGTTCTTGGATATGAAATCGCCCCAAATGAAAACAATGCTTCTTGGTCCACCCTGTTAGACAAGCTTCAAAACCAAGGAATCCAACAGGTTTCTCTTGTAGTGACCGATGGCTTCAAGGGGCTTGAACAGATTATCAGTCAGGCTTACCCATTAGCTAAACAACAACGTTGCTTAATTCATATTAGTCGAAATCTAGCTAGTAAAGTGAAACGAGCAGATAGAGCGGTTATTCTGGAGCAATTTAAAACGATTTATCGTGCTGAAAATTTAGAAATGGCAGTGCAAGCTTTAGAGAACTTTATCGCCGAATGGAAACCAAAGTATAGGAAAGTCATGGAAAGTCTGGAGAATACGGATAATCTTTTAACTTTTTATCAGTTTCCCTACCAGATTTGGCACAGCATTTATTCGACAAACCTCATTGAGTCTCTTAACAAAGAAATCAAACGTCAAACGAAAAAGAAGGTTCTTTTTCCTAACGAGGAGGCTCTGGAACGTTACTTAGTTACTTTGTTTGAAGATTATAATTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCGATTATTGGTAAAAAACATCTGATTTTTGATATATAATTAATTATAGAAATTAGGTATTCTTATAGCATTGAGAAAGGTGAACAAAATGACAGAAAAAATTAAAGGAATTAATTTAGGTGGATGGCTTGTTTTAGAAAAATGGATGTCTCCTAAACTTTTTGAAGATGTAGCCGCAGAAGATGAATATTATTTGGCACATGACTTATCTGAGAGTGAATATAAGGCACGAATCAAAGTTCATCGCTCAGAGTTTATAACAGAAACCGATTTTTTACGTCTTTCCTCAGCCGGATTTAATTTAATACGAATTCCAGTTCCTTATTTTATTTTCGGAGATCGCTTACCATTTATCGGTTGTATTGAGGAATTAGATCGAGCGTTTAACTGGGCAGAAGCCTATGGGGTACGTATTTTATTAGATTTACATACAGCACCTTTTAGTCAAAATGCATTTGATAATGGCGGATTATCCGGAGTTTGTAGATGGGCACAAATGCCAAAAGAAGTTGAATTTGAATTAACAGTATTAACAAGATTAGCAGAACGCTATAAAAATCATGCTGCTTTATGGGGAATCGAAGTGATTAATGAGCCAATTACTGAACGTATTTGGAAAACGATGAATCCTCAAAAACGATATATTCCTCGAGATTTAAAACTGGCTGTTGACAGTGCACCTATATCGTTAGAGTTTCTACAAGAATTTTATAAAGAAGCATATTTCCGCTTAAGAAACATACTTCCAGAAGAGACGGTTATTTCATTTCATGATGGTTTTGAACTACATTCTTGGAAGGAATTTTTTAAAGAAAATGACTTTAAAAATGTCATGTTAGATACCCACCAATATGTGATGATTGCAGAATTAAAAGGAACACCGCAAAGTTTAGAAGCTTATAAAGTGTATCTGGACGATTTAGGAAAGCAAATTGCCGAGGTACAAAAATATGTTCCTGTTTTTGTAGGGGAATGGTCACTTTTTAATTCGTATACTGCTGGAGTTGATACAAAAGGAGGAATCAATCCAACTCAAGAAGAATTTTTAGATAAAAAAATAATGTCAAAAAATGAATTAGCAATGACTTATTTAGAACTATGGAATGCTTCAGTGAAAGCTTGGAACCAAGGTGAAGGTCATATTTATTGGACTTATAAATTAAATATTGATACTGTAAATGAACCAGCGTGGTATGGTTGGGATTCATGGGATATGAGCCGTTGCTTAATTAATCAGTGGGTTGATCCAATGAATGATATAAAATATTAGAAATCGAAATAATTAAGAAAGGTTTTCTTTAAATGGTGAAGATAAAAAATCCAATTATTCCTGGAATGGCTCCAGATCCATCTATTATTCGAGTTGAGAATACATATTATTTAGCTACTTCAACGTTTCATTGGATGCCAGGCATTCAATTGTATAAATCTACAGACTTAGTCAACTGGACACTTATTGATAATGTATTAAAAAAAGACAAAATCAATTTACAAGGAACAAATACACCTGGTGGAATTTGGGCTCCTCATTTATCATATGATATAGAAACTAAAAAATATTGGTTAGCCTATTCCCACATGGTAAACATGGCTGGTAGAGAATTTAGTTCAAATTCTTATATGATGTGGTCTGAAAATATTAGTGGACCCTGGTCTGAACCAATTTATTTAACATCAATTGGTTTTGACCCCTCTTTATTCCACGATGAAGATGGTAGGCACTATGCTGCAATATTAGAATGGGAGAGCAGGGAAGGTTACCAATCTCCAGGACACATTGTCATTGCAGAAATTTCCTTGGAAAATGGAGAAGTTTTAGGTCAGTGGAAAAGAGTAACCCAAGGTTTTACTACTCGGGGATGTGCCGAAGCACCACAAATTTATAAACATGCGGGCTACTATTATTTATTACTGGCCTCAGGTGGGACAGGTTATGCCCATGGGGTCGAAATCGGTCGTTCAAAAAGTATAATGGGTCCTTATGAGCCACATCCGACGGGAGAACCAATCATTACTTCGTCACCTCGGCATCTCTTTTCTTTAGGAGATCCTGATGCAGGACATTTTGAGATATATAATCCAAATTCTTTAATCCAAAAAGCCGGACATGGCTCCCTAGTAGATACCCCAACTGGTGAATGGTATATCACTCATCTTATGTCACGACCGTTGCCAGGAACACTTTTAAATCCATTGGGACGAGAAACTTCAATACAGAAAATGCGTTGGAATGATGATAATTGGCTAGAAATGGAAGATGGTTCAAATCTAGCAAAAATTGAAGTAGAAGGTATTTCTGGTATAGAAGATTTGAAGTTATTAAATCATGATGTACAAGAATATTTTGAAGCCCCAAAGTACAGTAATCAGTTTATGACACCGTATCAAGCACAAACTATTGAATGGGTTAATACTACAGAACGACCGGGCTTTTTACGAATTTATGGTGGAGACTCATTTTTTTCACAAGTAAATCCATCAATAATGGCGACTAGAGCAACATCATTTTTGTATGAAATTGATACAAAAGTAATTTTTAATCCTAATCATTATTCAGAAACGGCAGGTGTCGGGCTCTACTATGATTCAAATAATTGGGTTTATCTCCATATTACCTATTCAGAAATTACGAAAGGCCCCGTATTATCGGTTTTACAGGCAAAATTAGGTGAGAGAAAAGAAATTTTTCAACCAATCATCGAAGTACCTAGTGGAACTGTAGAATTAAAAATAATTTATAATATGGGCTTTTCTGAAATGTATTTTCGATTAGTGGACCAAGAGGAATGGCAACTTGTTATGGAAAAGATTGATGTGACCTATTTATCTGATGAAGGTGTAAATGGGGAATCGGGTGAAATTGGTGGTTTCACGGGATTGTTCAACTTTATTGGCACAGTAGATGCACATCAGCATGATTCGTTTGCTGATTTTCAATTCTATAAAGTGGTAAATTTCGAATAAAGATTAAATATAGTTTATTTGCTTGCCATAAGCTAAAGTGAAGCCTATCTATAGTGACAATATATCAGGAAGTTAGGGTCAATGAAAAAATATTTAAAAAGATTCATTATCTAATTACCTACTGATCATGTGGAAATTAAGTTCTTTTTTTGAAAAAGAACTTTTTTCTATGAAAGAATAAACTAAATAAAATCTAAGGGAAATATGATTTATGTCAGAAGAAGAAAATACATGAAAAGAACTTTTTGGAGTTGAAATAAATTCTCTGCCCTTAAGTGACTTTGGACATGTGAACTTGAAACTAGAGAGTTTACATTCGTAAAATAAAAAGGAGAATGAGTGAAATACTTATCGTTTTAGTCCAGTAAAGTTATTTGACGAATTAAGTCAATGTTAAAATAAAAAGCCAAGTAAATTTAATTGGTTAATAAGTTTGAGTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGATAGGCTTCTTCAAAGTTCTTATATTTAAATTGATACACCCACTCTCTTTTTAAATGTCCATGCCAAGATTCAAGACTGGTATTATGATAAGGGTATCCCCTTCGACTGAAAGAGTGAGTCATCCCATAATACTTAAGCAACTCTTCATACTCTAGACTCGTATACTGGCTTCCTTGGTCAGAATGAAGAATAACAGCTTCTGGATAGTCTTGTGATT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54 | Staphylococcus_phage(30.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1334059 : 1404920
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_017492|1334059:1404920|DBSCAN-SWA 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57 | Bacillus_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1423927 : 1437645
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NC_017492|1423927:1437645|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >NC_017492|1423927:1437645|1436952_1437645_-|WP_011675982.1|DBSCAN-SWA MSIIKLSNVSKKYSNGTTALRNISLEIEAGEFTYIVGPSGAGKSTFIKLLYRELKIDRGSGTVAQYDLSKLRRRDVPLLRRSVGVVFQDYKLLSKKTVYENIAYAMEVIGKSPREIKKRVNEVLDLVGLKHKIRSFPNELSGGEQQRVAIARSIANAPKVLIADEPTGNLDPENSWEIMNLLEKINLQGTTILMATHNSQIVNTLKHRVIAIENGRIVRDQEEGVYGYDD >NC_017492|1423927:1437645|1436024_1436960_-|WP_014572761.1|DBSCAN-SWA MIRNFFKHILVSLKNLKRNGWMTVAAVSSVTITLVLVGLFLSIILNTQRLTKGIENNVRIVAYMKLDVHDQEAKIQDPKNNKKIINNPDHLKIYDSIKEIPNVKTVTFSSKEAQLQELTKALGNNWNLFKGDANPLYDAYIVEADKPINVKAVTSKISKLSGIEKATYGGANTAKLFQIARGVQTWGTAAAILLIFVAVFLISNTIRITILSRQREIQIMRLVGAKNGYIRWPFFLEGAWVGLLGSIIPSLIVAWAYRLAFVSLTPSLQSQKLSMYETSEFIPAIVGLMAIIGILIGSFGALLSMRRFLKI >NC_017492|1423927:1437645|1428557_1430492_-|WP_014572759.1|DBSCAN-SWA MVIDINNYDDSAIQVLEGLDAVRKRPGMYIGSTDGTGLHHLVWEIVDNAVDEALSGFGNKITVTINADGSLSVEDEGRGMPVGKHAMGIPTVEVIFTILHAGGKFGQGGYKTSGGLHGVGSSVVNALSTWLEVEITRDGTVYRERFENGGHPATTLEKIGKAPKSKTGTKVTFMPDSTIFSTTEFKYNIISERLNESAFLLKEVTISLEDKRTDEKEEFHYENGVQDFVAYLNEDKDSLTPVLYFEGKQDGFEVEVALQYNDGYSENILSFVNNVRTKDGGTHEAGLKTAITKAMNEYARKVNLLKDKDKNLEGSDYREGLTAVLSVLIPEEHLQFEGQTKDKLGSPLARPVVDSLVSEKLSFYLMENGELAQNLIRKAIKAREAREAARKAREDSRNGKKSKKDKGLLSGKLTPAQTKNPNKNELYLVEGDSAGGSAKQGRDRKFQAILPLRGKVINTEKAKMQDILKNEEINTMIYTIGAGVGADFTLADRNYDKVIIMTDADTDGAHIQTLLLTFFYRYMKPLVEAGHVYIALPPLYKMSEGKGKKEKIEYAWTDGELAELRKQFGKNANLQRYKGLGEMNADQLWETTMDPETRTLIQVTIDDAAQAEKRVSVLMGDKVEPRRKWIENNVKFTMEEDTAF >NC_017492|1423927:1437645|1426674_1427124_-|WP_014572756.1|DBSCAN-SWA MTAIWKLKNFNQLTTDEMYQLLSLRTAVFVVEQNCPYQELDGKDQVAQHLWLENDKGELMALCRLLPQGISFNEASIGRVLVNPEFRGQNLGRGLIDKALEVLKENGEAAVTIEAQYYLRDFYASFGFVENSEPFYEDDIKHVNMILNF >NC_017492|1423927:1437645|1431585_1431804_+|WP_011675987.1|DBSCAN-SWA MVTVYSKNNCMQCKMVKKWLSEHEIAFNEINIDEQPEFVEKVIEMGFRAAPVITKDDFAFSGFRPSELAKLA >NC_017492|1423927:1437645|1423927_1426402_-|WP_014572755.1|DBSCAN-SWA MSNIQTLPLEDIMGDRFGRYSKYIIQERALPDIRDGLKPVQRRILYSMNKDGNTFDKSYRKSAKSVGNVMGNFHPHGDSSIYEAMIRMSQDWKMGEPLIEMHGNNGSMDGDPPAAMRYTEARLSEISGYLLSDIEKDTVSQAWNFDDTEKEPTVLPAAFPNLLVNGSTGISAGYATDIPPHNLGEVIDATIHMIDHPKADVEKIMEFLPGPDFPTGGIIQGKGEIRKAYEKGKGRIVVRSKVDIEPMKGGREQLIVTEIPFELNKANLVKKIDDVRVNAKVPGIAEVRDESDREGLRIAIELKKEADSQLVLNYLFKNTDLQVNYNFNMVAIDNMTPVQTGVLQMLRSYVKHREDVIIKRSQFDLNKAEKRLHIVEGLIRMVSILDEVVATIRASENKADAKENIKVSFGFTEEQAEAIVTLQLYRLTNTDIVTLQNEQAELEQKILELKAIINDERTLFNLMKRELREVKKKFAKPRRSELQDEVQTIEIEASELIVAEDTVVSVTRSGYIKRTSPRSFASSALEEIGKRDDDELLYYANAKTTQHLLIFTNLGNVIYRPIHELSDVRWKDIGEHLSQSLSNFLSDEKVIYVQIVDAFAGENLVVVTRNGQIKQIERESFSPWRTYRSKSTPYAKLKGNDDEIVLISPVQFTDLMIISENGYALRFNLDDVPVLGARAAGVKAMNLKNDDKIKAAFFVNSNSWYLLTQRAFIKRVKTEDIPATSRANRGLQVLRTLKTNNHTVFAAGLINSTADLSALTEELDLFSQAKAPATKETDEQVLEVISETGKKYDINLCDLSLSDRTSNGHPIADDLEKIASVKIK >NC_017492|1423927:1437645|1434937_1435915_+|WP_011675984.1|DBSCAN-SWA MSETENLTVPTYYSAIDWNSIEDSIDKYTWEKLTSQFWLDTRVPVSNDLDDWRKLPQLERDTFAKAFAGLTLLDTLQSVDGAEVLKHDARTPQEIACFNNIQFMESVHAKSYSTIFSTLNTKKEIEELFNWVDTNVYMQTKAEIINKIYESGTALQKKVASVFLETCLFYSGFYTPLLYLGNNKMINSAEIIKLIIRDESVHGTYIGYKFQLGFNELSEDEQSEFRDWMYELLYKLYENEENYSHLLYDKVGWTDEVLTFLRYNANKALMNLGQDPLFPDTAADVNPVVMNGISTSSSNHDFFSQVGNSYLLGEVEAMSDEDYDI >NC_017492|1423927:1437645|1431805_1432228_+|WP_011675986.1|DBSCAN-SWA MKLAYFSVTGQTRRFVSKTDLPNVEITPDDDLEMDEPFLLITPSYAEESPTVSKSIDVMDPVFDFMAYNDNYKHCRGIIGTGNRNFAGIYIFTAKEVSAKYQIPLLYDFEFNGTPADVAAVEKLAAQLDQGAKVTFKNPL >NC_017492|1423927:1437645|1430770_1431412_+|WP_011675988.1|DBSCAN-SWA MLIIILLLIASYLLGAIPFGLWIGKIFFKKNLHDYGSGNTGTTNTFRILGVKAGIAVFIFDLLKGTLATLLPLIFHINGVSPLIFGLLAVIGHTLSIFDHFKGGKAVATSAGVVLGFSPFFLLYLLVIFILVLWLFSMISLSSVVAAIFALLGILIFPSFGFILTSYDLLFSIIIFALAIIIIFRHKTNLKRIKNHCESLVPFGLNLSGQKEK >NC_017492|1423927:1437645|1432364_1434533_+|WP_011675985.1|DBSCAN-SWA MSLKQLKDVTYFKLNNEINIPVNGSIPLAKDKEAITAFFKENVEPNRYEADTYIDKLNWLVKEEYLEAEFLEKYKPEFITNLRKELSKFEFHFDSFMAAYKFYNQYAMKNNDGSLYLEDFEDRVLMNALYMADGDEKLANNLAFAMINRRYQPATPTFLNAGRKRRGEFVSCFLLQLTDDMNSIGRTINSALQLSKNGGGVGLNLTNLRAAGAPIKGYDGVAAGVVPVMKLFEDAFSYANQLGQRQGAGVVYLSLFHPDIMEFLSTKKENADEKIRVKTLSLGVTVPDKFYELVKKGETMYLFEPYFVEKYYGKPFAEVDITAEYDKMVANPEIRKTPINARELEQELSKLQQESGYPYIVNVDTVNQANPVDGVISMSNLCSEILQVQTPSVLNDDQTYKVVGTDVACNLGSTNVLNMMTSSDEFGTSVESMVRALTFISETSNLDTVPTVRKGNDEMHAIGLGAMGLHSFLAQNQIHYDSKEAVEFTSVYFMLLNYYTLVASNKLAVEKGASFKNFEKSAYADGSYFDKYLTHDYFAAVSPKVQELFKGIAVPTIADWTELRDTVKTSGLYNSYRMAVAPNGSISYINDCSSSIHPIVNRIEERQEKKVGKIYYPAAGLATETIPYYKSAYDTDMRSVIDVYAAATEHVDQGLSLTLFMRSTLPEGLYEWKVANNKMTTRDLSILRNYAYKKGIKTIYYIRTFTDDQEEVGANQCESCVI >NC_017492|1423927:1437645|1427120_1427954_-|WP_011675992.1|DBSCAN-SWA MSEKYVVFDFETTGFSAQKNEIIQIGAVKYDENNQELARFNQLVKNQRSYVSTEITQLTGIKPADLLNQPTIEEILPDFLDFIKGHLLVAHNAPFDISFLYQAIIDCAITDVEAFRVYDTLAESKKLLTMSSYALENFKDLLEMNDLRSHDALNDCLITAKLYQYLQKIEEVERSVESEVADELGQLDLFGDSSDEITDSIRRKLNLPITKALVYYQQNLERKWERFEVLGISVEREYSTGSSLKIRLHNSEKVKIHSDFLKEMQKANFVTIMEEEK |
11 | Bacillus_virus(25.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
1442917 : 1507320
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NC_017492|1442917:1507320|DBSCAN-SWA 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55 | Streptococcus_phage(33.33%) | integrase,transposase | attL 1445553:1445612|attR 1488577:1488770 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
1535277 : 1577145
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NC_017492|1535277:1577145|DBSCAN-SWA 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>NC_017492|1535277:1577145|1567908_1568766_-|WP_014572853.1|DBSCAN-SWA MDTKILKLEHFLTEFYESAEFPKGLAEPAKYSLMAGGKRIRPLLFLNLLEAFDLEVTTAHYQVAAALEMIHTGSLIHDDLPAMDNDDYRRGKLTNHKKFDEATAILAGDTLFFDPFYVLSSSDLSAQTIVSLTRELAYASGSYGMVAGQILDMAGEGKDLTLTQIEQIHRLKTGRLLTFPFVAAGIVAQKTNQEIEKLRVVGQILGLAFQIRDDILDVTATFAELGKTPGKDVLEEKSTYVAHLGLEGAKISLTDKLSEVKKLLTELNVTDSSEIFKIIEQLEVE >NC_017492|1535277:1577145|1543923_1544169_+|WP_011675844.1|DBSCAN-SWA MNQTSTLFSFGIVGTLILLVWYVLIIVQAFLGYGTAYRKAKTNGDNGLSLFGWLIVYCSLASLVPYLGIHLWKKNKNIDKK >NC_017492|1535277:1577145|1542925_1543651_-|WP_011675845.1|DBSCAN-SWA MKNYLIWLKDELKSINTAGSIMLAFIIGVQLAFFLTSTITTLSVITLIATLMGSACTVYMMIGKPINGLLGLISAFGYIYINWTAGHYASVLDQIVFVLLIDLPLIFTWKTWGHRIENGVKFMKLRGWVLTIISMLILWWPITLIYTKLGDTNPLWDALTLIIGAAASILVVKGYGDSYSLWLLSDAVMIVLWATALVAGYSASSLPMLLTITFYLVTSLYGKFFSIWKNDKKEAQEVEVD >NC_017492|1535277:1577145|1559682_1560063_-|WP_011675830.1|DBSCAN-SWA 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MTYNSILPKVFVYLLTTIETLYQTSVSLEVQNRKNVHLATSDCLVIACYLWGVLHFSETLKAKHQLAQSLFPNFLEYSRFVRRCNALLPSIKVIRQALVFKEVEGISVSIIDSFPIPLCQPIRNFRSKVLVDYANVGYNATKGQYFYGCKCHALVSESGYVIDYTITPASMADSSMTEEVLSQFGTPTVLGDMGYLGQSLHDRLELKGIDLMTPVRKNMKQKKILFPNFSKRRKVIERVFSFLTNLGAERCKSRSPQGFQLKLEMILLAYSLLLKSAKSLEPETLRYSIGYQVMAK >NC_017492|1535277:1577145|1566082_1566529_-|WP_011675823.1|DBSCAN-SWA MKREERLNFIAQFIRENEIKTQEELVNTLLTHGIDVTQATVSRDIKSLALIKVPAESGGYRYDLPKNKEVLQSSLHKALAFDAITGVKMKDNMLWILANPGTTSLVKNYLLEEYGDDIFSIIIDDDSALVIFEIEEEAKTLYNLLTEF >NC_017492|1535277:1577145|1547902_1548319_+|WP_014572840.1|DBSCAN-SWA MQNLDLIENEIKTVIDTCDKLIHQEKFDELVNFYTEDAVLVIKPGMLANGREQIKSAFIKIASYFDNSIKPLEGKMVYLLAGDTVFVLAQTFIEANQSATAQSEFSMERRATYVFRNIDGKWLCAIDNSYGTTLIDEK >NC_017492|1535277:1577145|1553408_1554071_-|WP_011835483.1|DBSCAN-SWA 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38 | Staphylococcus_phage(28.57%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
1589366 : 1654357
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NC_017492|1589366:1654357|DBSCAN-SWA 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48 | Staphylococcus_phage(21.05%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
1760815 : 1797200
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >NC_017492|1760815:1797200|DBSCAN-SWA 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>NC_017492|1760815:1797200|1774275_1774833_-|WP_011675652.1|DBSCAN-SWA MVLAKDLKSGMTFLNGEKLLRVMEASHHKPGKGNTIMRMKLKDVRSGSTFDDTYRPEDKFEQAVIETVTAQYLYSMDDIANFMNNETYEQYEIPVEQVKDELLYVLENTDVKIQFYGTEVIGIQLPTTVVLEVTETQPSIKGATVTGSGKPATMETGLVVNVPDFVEVGTKLEINTQTGEYLKRA >NC_017492|1760815:1797200|1777682_1778216_-|WP_011675648.1|DBSCAN-SWA MKIIIIGSSGSGKSTLARELAKKTDYPVLHLDKVFHKHPSDLGRIKLREATRDFISQNENGIIDGNYGSSLSERLPYIDEIVWLKGSRFKTVFRVIKRSILVRLFHKNRSDMAEEFREKWDKDYLEFLNFVWTFPEKEFPQIEQKISEFAVWDKVIILKNRKDKEKYLIKYDRKTKN |
27 | Bacillus_phage(40.0%) | bacteriocin,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_16 |
1945373 : 2014239
Sequences of DBSCAN-SWA_16
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16 >NC_017492|1945373:2014239|DBSCAN-SWA 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83 | Lactococcus_phage(83.02%) | terminase,portal,transposase,holin,integrase,tRNA,tail,protease,head | attL 1957437:1957453|attR 2018540:2018556 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_17 |
2111919 : 2120171
Sequences of DBSCAN-SWA_17
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17 >NC_017492|2111919:2120171|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_17 >NC_017492|2111919:2120171|2116091_2116427_-|WP_014573239.1|DBSCAN-SWA MKLKELQTIDQNIIKFLAEHRGIDRAVKGKILAQALDIDFRTLQSRIEYLHKQGCAIGSIDNGYFIPTNEDERRAGIIKKQRTGIAINNAVNGYTLAELDWIDQLFKEVDH >NC_017492|2111919:2120171|2118561_2118738_-|WP_080562017.1|DBSCAN-SWA MKKALRRVQADKLLNKKDLAKYIGVSESTAKSITKDNEPQNVKNKVFNAVVSAIAENC >NC_017492|2111919:2120171|2119976_2120171_+|WP_011677061.1|DBSCAN-SWA MKLSDYLKSIDHLDERMEKAVIIAGYEKMFGEHYRLPQEQFADLMELPLPKLRRVIHEMKKAID >NC_017492|2111919:2120171|2113661_2115290_-|WP_014573237.1|DBSCAN-SWA MTDQLEKLVAETPQSNIRSPKPKIEDFTEYGEDGKKVVNIAGYQENLKDWLEQEKEIIDSPDYVKANTQTLIAVRKLFFEHRNLFLSTPKEDGNTPKSLTPLDTARIIYKTLKVIKLDNQSGLLGVYNHELGIYETNENFFHRLIYWLEPSYSQARSKEVLFKLETLAEVKQQTAEAHLIPVANGIFNKKTQQLEPFSPQYVFTSTIATKYNAKAKAPNINGWNIDDWLNDLMSGDKELVSLLWQIISASTNGNYSYRKGVWLVGKGNDGKGTFQSLIMNLIGRENVASVKAEQFAERFALSQVVGKTCIIGDDSQVSYLDNAGNYFSVVTGDPVPIEAKGKQPTLAVFNKLVIQSTNFLPKFRNKSNGTYRRLLIVPFEKSFTADNDNWKIKDDYIKRKDVLEYVLKIALSLNFDKFDEPKATKGLLDDFKISNDNVLAFVNDIFDEFVSDFLPTTFLSALYRAWCEDEGIKPFTKREFENKLPDHIKEKWIKTTQRPNSAGFNRAIDLHRAEEYELFRRLFHWDDDKQKKVAKGYLRKKK >NC_017492|2111919:2120171|2119016_2119400_+|WP_014573248.1|DBSCAN-SWA MTISERIKELADKQGKPLQKVSEDLGFGVNYLYRLKNQQPTAEKLTLIADYFNVSVDYLLGRAEAKPVNEPIDLAEVANSDDDAVWSRLLSSGGRPLTEKDKMAIKLLFSDKWDEITQKAKDLDNKD >NC_017492|2111919:2120171|2118411_2118558_-|WP_014573246.1|DBSCAN-SWA MNKLDTAIKRSKQWKKGSRGFEIRVNIGILSFEMTKPIKGSTGGRPTN >NC_017492|2111919:2120171|2118085_2118280_-|WP_014573245.1|DBSCAN-SWA MNKPTNKETYILDDSIAFELMDLLKAKARHFIQLNEYVYRLFDGQSVVTFTTLENDIQVEMVKG >NC_017492|2111919:2120171|2119411_2119963_+|WP_011677060.1|DBSCAN-SWA MDKQELNGLLICEIEKLGVVYRLGDLDNQKAFISLELGFGAYTELARPFDHAHEYIHAYYKDDRRLGECDTLSPAEKRANKEAILMLWDWFIQNGGNFDDITQFCEITGCHYDDTKRLITSMCCDMSNKSFRDCAIDYISHFDIITRDTLNIYNFLDFYGYHHNAYDEARALLYELCWFELVG >NC_017492|2111919:2120171|2116496_2116736_-|WP_014573240.1|DBSCAN-SWA MQNIVKICPYVAGIDSLGMQNLKAYHTELTDKQIEKLDPLNANTGTVDYSFKVRKYKHGIRFEGEKEGGEINLFDEVAK >NC_017492|2111919:2120171|2115300_2116095_-|WP_014573238.1|DBSCAN-SWA MTPKEQALNCINRGFSVIAGFPAGKSERAVIKGTSSGTLDEITVSAWFDEIPNRNIMINLRNSGLICIDLDQHQNGQNGRAVFSRLWNEHSEGEILSTYVEKTPTGNGLHVFFKVPKELFSQPIVSELADGVEIKTHFTPIYPSKRTDGDYMPLNDTETNEPLTFDSLCDCPDWLLEMIQRPQARATTGTSSRTYGAEMWELFNQGARKGNRNNDTNRILHYWRKIGIDNNSCMDLLRTFNNRTSPPLPDDELATIWKSVFKMK >NC_017492|2111919:2120171|2111919_2112330_-|WP_011677045.1|DBSCAN-SWA MKDKTDRIISDYVNGRTQAKIKAIESRYLYRVKQDNLGIRTAYKGTAEPEGKTLNKERMEEDKDLIELRRTLELLGTLYNTLTVSEKRVIELRYKGYNGFTWYRVDMELESAGIEIPIKRAKKIYIAFKEDVARVL >NC_017492|2111919:2120171|2112326_2112770_-|WP_011677046.1|terminase|DBSCAN-SWA MTPKQRKFCDEYIKTGNATQSAINAGYSQKTAKSIGAENLTKPDLKKYIDSKLKDISNNAIATAEETLAILTQIVRGEHTEQAITAEGDVIDKRPDTNQVIRASAEILKRYPLAQDINIKGSLKVSNPFENLTEEELRILASREGEA >NC_017492|2111919:2120171|2117046_2117283_-|WP_014573242.1|DBSCAN-SWA MIEEINLKNAEISAILTMVFDEVQGIYEFEKGSREYELDRLKDTLITSFFMMSERVEDINEIAGLIMKKEKPKEVSRE >NC_017492|2111919:2120171|2116772_2117054_-|WP_014573241.1|DBSCAN-SWA MNEDTLTNLVARGLVDEVIHLFNEHLSSQLKIRNEKRVLPYISKKRVMEDLDISDRTLDNWEKHGLKRYKPRYKTSLIYYLIDDICKFIIIDT >NC_017492|2111919:2120171|2117275_2117479_-|WP_014573243.1|DBSCAN-SWA MKINTISDLKALVTSLERYDDNTPLAISINGQAEKFAVVPLPFSKTFGQKQPDLVSLQIFKKGEKND >NC_017492|2111919:2120171|2112902_2113445_-|WP_011677047.1|DBSCAN-SWA MNNEITKHLNKAKALLIEKYSDSIDEQASQEALKNIKQDFEAIEIYANESDTEPQEYEPQETVKSIIEEMQELTFAPHEISGNDTQVFADLLTDSIERLIKALGLNEMSLSAESENKPQELALKAQVQDLYSLNDSMITDDPNYIPRYTDGTIIKLSDLVDMNVNALDNIAELIGFELEE |
16 | Lactococcus_phage(100.0%) | terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_18 |
2124743 : 2181130
Sequences of DBSCAN-SWA_18
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18 >NC_017492|2124743:2181130|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_18 >NC_017492|2124743:2181130|2124743_2125925_+|WP_011677065.1|integrase|DBSCAN-SWA MNIKEYIKKDGTKVYRTNVYLGVDNLTGKQVRTSVSANSRKMCDIKARQAINKFINNGSTIAREKVVFDNFESLALSWFESYKLTVKENSISVADNYLRNYILPPIGSYKLSKITPMLLQELVNKWANNANTAEIINGKRERGKCKDYKLLLNFIKRILDYGMQLGAIEDNSAIKVFPPKLKTRTVKKIKYFDNEELKQFLLYLDTLEPSTDNRKSKTLYKLLLATGLRVGEAMALSWSDIDFNNHYLSVSKTLIQQSNLIQDSAKTKESNRSVFLDNDTLESLKEWRKYQNDGAISLHDSLVFSYHQKMRSYEIERQKLVRHFKNAGVPNIGFHGFRHTHASLLMNNDVNPKEIQRRLGHADYAITMNTYSHLAKSKEKETAEKFSSILKAL >NC_017492|2124743:2181130|2137033_2137891_-|WP_011677079.1|DBSCAN-SWA MSIIGQTISAIIVEESERFYFLQKGEDLLRLDKTEGEHAIGDVVTGFVYVDKDEHRRLTTLEQKATNEQYGWGTVTAVRKDLGAFVDTGLPGKDVVVSLDDLPLEKDQWPKVGDQLYVKLIVDRKERIWGHLAWHEDFWNLAGPGYDNMQNQDLRAIVYRNKESGTFVYLPDNNMLGFIHPNERFSVPRVGQELQVRVIGFRKEDRSLNLSAKPRAYEMLDADSQMILAYLQSMGGKMAFNDKSNPDEIKATFGISKGQFKKALGGLMKAKKIKQSPEGTELIGE >NC_017492|2124743:2181130|2167960_2168419_+|WP_004254487.1|DBSCAN-SWA 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49 | Lactococcus_phage(14.29%) | integrase,tRNA,transposase | attL 2122408:2122425|attR 2166671:2166688 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_19 |
2252554 : 2304193
Sequences of DBSCAN-SWA_19
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19 >NC_017492|2252554:2304193|DBSCAN-SWA 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>NC_017492|2252554:2304193|2258873_2259947_-|WP_021216261.1|DBSCAN-SWA MTLGRRKNGMKRLRTYMQTDILRLLRPKGKKLALIKQAKLIQLMGNLLNNGFHLGEVINFLALSKLVEKEFVFKMHQGLSSGNSLSEILDSLSFSKNVVTQLALVEVHGNLVGTMQLVELHLKKQLKVKKKLIEVATYPVVLLVFLIGIMWGLKNYLLPQIDKGNNFATLLINHLPLVFFSVGALIVLLTSLSIIIFKHLSALTNFTFLVKVPLVSSFIRLYLTAYFSREWGNLIAQGVELRQIIELMKKQKSRIFAEVGIKLDLGLKAGQNFEQAVSHFSIFLPELSLMIEYGAIKDKLGLELSVYADECWEQFFSKIDRLMQLIQPLIFIFVALMIVLLYAAMSLPIYSNMGSGI >NC_017492|2252554:2304193|2261900_2266808_-|WP_014573342.1|DBSCAN-SWA 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>NC_017492|2252554:2304193|2258478_2258856_-|WP_011677184.1|DBSCAN-SWA MKIENITLIMSKALSLIKIHGRKLWQKKQKAFTLIEMLIVLAIISILILLFVPNLIKEKAQVQKTGEAAVVKVVESQAQLYELDHDNDKPNLSELLSAGMITQKQVTAYDDYYDQNKNEQRNFDD >NC_017492|2252554:2304193|2266981_2267284_-|WP_011677186.1|DBSCAN-SWA MYLLAFCLLFRYDSRKFEKKLSLEQESVRKKESLASQLKKLKEEEKIQKALNHFERIPAEFKTIETVSHMIRYMKRGEAQTLEEALYFWEMDENNHSTNK >NC_017492|2252554:2304193|2293986_2295717_-|WP_014573357.1|DBSCAN-SWA MSSTVIILIVVLLVILVAFYAFAILMRKKTEDRILALEERKESLFDLPVQEEIDSVKKMHLVGQSQTIFREWNQKWLDLSSNSFADLEEHIFEAEQLNDSFHFFRARESVADSEAQIEMMEGDVEGIRQGVAQLVEQEKRNSNKIQESLDLYDNLRSDIADNADLYGTVITELEKHLANIETEFSQFVTLNSTGDPIEAAEVLETAEEHTIALRAITEQIPSFIKTIEKDVPKRLEELQEASDKFIAEDYILPENVNLKERMDDLQHHLEESSSLLEQFELDRVEAELDLIQERVEELYSIFEREYSARRNVEKRSSVLKEYIEHIRVNNKNLLLEIDHVTQAYILSGNEKGYVRGYQEHLESLDADVDEIIANIEAKAIPYSSLSRRVNSVVNSLEDIEKNQIKISETLSGLRDEERAGQEIAERFDSELRTIKRYVEKCNLPGLPKDYLDLFFMTGDRVQNLFKELGRVRINIDTINHLVDVSTEDMHVLKEATTNLTDHAVLAEQLIQYANRYKASNEQVAQGISRALQLFENSRDYDGSFDEISKTLEIVEPGAASRISGVYFKNKPTPDYL |
35 | Bacillus_phage(33.33%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_20 |
2354727 : 2373241
Sequences of DBSCAN-SWA_20
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20 >NC_017492|2354727:2373241|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_20 >NC_017492|2354727:2373241|2362463_2363258_+|WP_014573412.1|DBSCAN-SWA MTPKEQALNCISRGFSVIAGFPAGKSERAVIRGTSSGTLDEITVSEWFDEIPNRNIMINLRNSGLICIDLDQHQNGQNGRSVFSRLWNEHSEGEILSTYVEKTPTGNGLHVFFKVPKEIFNKPLVRELADGVEIKTHFTPIYPSKRTDGDYIPLNDTETNEPLTFDNLSDCPDWLLEMIQRPQKRQNPTLGSRTYGAEMWELFNQGARKGNRNNDTNRILHYWRKIGIDNNSCMDLLRTFNNRTSPPLPDDELATIWKSVFKMK >NC_017492|2354727:2373241|2370338_2370728_-|WP_050800270.1|DBSCAN-SWA MAEFVMKNLVLKSEHESEFIIESRATSSWEHGNPIHSGTQEKLREQGIDFDIHKSSQKITSTDFYAFDKIIAMDESNLKNLREMAPAGTAHKIEMLLDNDVPDPWFTGDFQETYQLVNAGCQKLLDKIV >NC_017492|2354727:2373241|2356775_2356970_-|WP_014573398.1|DBSCAN-SWA MKLSDYLKSIDHLDEKMEKAVIIAGYEKMFGEHYRLPQEQFADLMELPLPKLRRVIHEMKKAID >NC_017492|2354727:2373241|2361333_2361573_+|WP_041168276.1|DBSCAN-SWA MTNIIRACPYVAGIDSVGMRSLKAYHTELTDKQIEKIDPLNANTGTVDYSFKVRKYKHGVRFEGEKEGGEISLFDEVAK >NC_017492|2354727:2373241|2361009_2361291_+|WP_014573408.1|DBSCAN-SWA 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MIEHHQGYTTIKRYGRNSFRQAGKHPFKMIYNARAVKYDLVQQFEESTGIILPSGVKSNLCTQPVPFLGKELAIMKLQIKETKK >NC_017492|2354727:2373241|2361820_2362135_+|WP_014573410.1|DBSCAN-SWA MTLRKLSDEEKQEINNLDLTHEDMYKMLKAQPDIEIKNITIEALFKDDDLLAVTPQFDDISNLETVNILLNVLIADVRQNTDIENFIKTIISIWGTYDEAEGKL >NC_017492|2354727:2373241|2366743_2367073_+|WP_041168278.1|DBSCAN-SWA MVRYYWGRPQDVVRWYLRGTLYLSAQSRKSYIEKIGAEPGNLPRLLKLLDNLDELFDSVDTDIVAVLCLRYVELLSIAETTKRTGLLAYQITAKTGKVMKKAKEIISKA |
29 | Lactococcus_phage(86.36%) | protease,transposase,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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