Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_016928 | Staphylococcus aureus subsp. aureus M013, complete sequence | 11 crisprs | cas3,DEDDh,DinG,csa3,WYL | 8 | 3 | 11 | 1 |
NZ_CP039996 | Staphylococcus aureus subsp. aureus M013 plasmid pM013, complete sequence | 0 crisprs | csa3 | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_016928_1 | 775524-775609 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_016928_1
|
1 spacers
spacers of NC_016928_1
>1.1|775552|30|NC_016928|CRISPRCasFinder CAGAGAAATTGGAACGCCAATTTCTACAGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_016928_1
The CRISPR arrays of NC_016928_1 >merge|NC_016928|1|775524-775609|CRISPRCasFinder CAATGCGAGTTGGGGTGGGGCCCCAACACAGAGAAATTGGAACGCCAATTTCTACAGGCAATGCGAGTTGGGGTGGGCCCCAACAT >NC_016928|1|1|775524-775609|CRISPRCasFinder CAATGCGAGTTGGGGTGGGGCCCCAACA CAGAGAAATTGGAACGCCAATTTCTACAGG CAATGCGAGTTGGGGTGGGCCCCAACAT
>NC_016928.2|WP_000197262.1|774892_775435_+|5'-3'-deoxyribonucleotidase MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPHAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEK >NC_016928.2|WP_000663039.1|773675_774734_+|histidinol-phosphate-transaminase MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISSHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNEDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPPHVPVIIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEHFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE >NC_016928.2|WP_000180997.1|771921_773436_+|ABC-transporter-permease/substrate-binding-protein MTNFFDILSERKGQLFSTMIEHIQISFIALLIATAIAVPLGILLTKTKTISEIVMNIAAILQTIPSLALLGLMIPLFGIGRVPAIIALVVYALLPILRNTYTGIKEVDPSLIEAAKGIGMKPFRRLTKVELPIAMPVIMAGVRTAMVLIIGTATLAALIGAGGLGDLILLGIDRNNASLILLGAIPAALLAIIFDLILRLMAKLSYKKLLMTLGVIVMIIILAIAIPMFAQKGDKITLAGKLGSEPSIITNMYKILIEEETKNTVEVKDGMGKTAFLFNALKSDDIDGYLEFTGTVLGELTKEPLKSKEEKKVYEQAKQSLEKKYQMTMLKPMKYNNTYALAVKRDFAKQHNIRTIGDLNKVKDQLKPGFTLEFNDRPDGYKAVQKAYNLNLDNIRTMEPKLRYQAINKGNINLIDAYSTDAELKQYDMVVLKDDKHVFPPYQGAPLFKESFLKKHPEIKKPLNKLENKISDEDMQMMNYKVTVKNEDPYTVAKDYLKAKGLIK >NC_016928.2|WP_000589262.1|770951_771929_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIKFKNVTKRYGKHVAVDNISFNINEGEFFVLIGPSGCGKTTTLKMINRLIHLSEGYIYFKDKPISDYPVYEMRWDIGYVLQQIALFPHMTIKENIAQVPQMKKWKEKDIDKRVDELLEMVGLEPEKYKNRKPDELSGGQRQRVGVIRALAADPPVILMDEPFSALDPISREKLQDDLIELQTKIKKTIIFVTHDIQEAMKLGDKICLLNEGHIEQIDTPEGFKNNPQSEFVKQFMGSHLEDDAPCVEENAIIRDLDIMKPIDEVTTMSAYPIVYDNQQIEVLYQHLSESERVIVMQEDSVGQYVIDRKDIFKYLSQKKEVAQHD >NC_016928.2|WP_000983680.1|768948_770730_+|DNA-helicase-RecQ MMQQTLSHYFGYETFRPGQEEIISKVLDHRNVLGVLPTGGGKSICYQVPGLLLGGTTIVISPLISLMKDQVDQLKAMGIQAAFLNSSLTQKEQQRIEKALSNGEIQFLYVAPERFENRYFLNMLQRIKIHLVAFDEAHCISKWGHDFRPSYQNVISKVFTLPQDFTIIALTATATVEVQQDIREKLNIAQTDQIKTSTKRRNLIFKVNPTYQRQKFVLDYIKTHDEDAGIIYCSTRKQVEELQEALESQKIESVIYHAGLSNKEREEAQNDFLFDRVKVVVATNAFGMGIDKSNVRFVIHYNMPGDLESYYQEAGRAGRDGLKSECILLFSERDINLHEYFITVSQADDDYKDKMGEKLTKMIQYTKTKKCLEATIVHYFEPNEKLEECEQCSNCVQQDKSYNMTQEAKMIISCIARMKQQESYSVIIQVLRGESTDYIKYKGYDQISTHGLMKGYTTSELSHLIDELRFKGFLNENDEILMCDTSIKKLLSNEVEVFTTPFKQKATEKVFINTVEGVDRVLFSQLVEVRKKLSDKLTIAPVSIFSDYTLEEFAKRKPASKQDMINIDGVGSYKLKHYCPAFLETIQNYKAKV >NC_016928.2|WP_000525113.1|767053_768937_+|ABC-F-family-ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MGMEAYKIEHLNKSYADKTIFDNLDLSISEGEKIGLVGINGTGKSTLLKVIGGIDDDFTANVMHPNQYRIRYSSQKQDLNEDMTVFDAVLSSDTTTLRIIKQYEQAVQAYADDQSDKLFKRMMDAQEAMDQHDAWDYNAEIKTILSKLGIHDTTKYIKELSGGQQKRVVLAKTLIEQPDLLLLDEPTNHLDFESISWLINYVKQYPHTVLFVTHDRYFLNEVSTRIIELNRGKLASYPGNYESYIEMRAEREVTLQKQQQKQRALYKEELAWMRAGAKARTTKQQARINRFNDLENEVNQQYKDDKGELNLAYSRLGKQVFELEDLSKAINDKVLFEHLTEIIQKGERIGVVGPNGAGKTTLLNVLSGEDQQFEGKLKTGQTVKVAYFKQTDETLDRDIRMIDYLREESEIAKEKDGTSVSITQLLERFLFPSATHGKKVYKLSGGEQKRLYLLRLLVHQPNVLLLDEPTNDLDTETLTILEDYIHTFGGTVITVSHDRYFLNKVAQSYWFIHDGQMEKIIGTFEDYESYKKSLDKNKSTLKQQSKSSTTVRKKNGLSYKEKLEYEQLMKRIEQAEVRMEEIDVLMIEASADYGKIKELNEEKEQLEIQYDLDITRWSELEEIKEQQ >NC_016928.2|WP_000098285.1|764842_766783_+|polyglycerol-phosphate-lipoteichoic-acid-synthase-LtaS MSSQKKKISLFAFFLLTVITITLKTYFSYYVDFSLGVKGLVQNLILLMNPYSLVALVLSVFLFFKGKKAFWFMFIGGFLLTFLLYANVVYFRFFSDFLTFSTLNQVGNVESMGGAVSASFKWYDFVYFIDTLVYLFILIFKTKWLDTKAFSKKFVPVVMAASVALFFLNLAFAETDRPELLTRTFDHKYLVKYLGPYNFTVYDGVKTIENNQQKALASEDDLTKVLNYTKQRQTEPNPEYYGVAKKKNIIKIHLESFQTFLINKKVNGKEVTPFLNKLSSGKEQFTYFPNFFHQTGQGKTSDSEFTMDNSLYGLPQGSAFSLKGDNTYQSLPAILDQKQGYKSDVMHGDYKTFWNRDQVYKHFGIDKFYDATYYDMSDKNVVNLGLKDKIFFKDSANYQAKMKSPFYSHLITLTNHYPFTLDEKDATIEKSNTGDATVDGYIQTARYLDEALEEYINDLKKKGLYDNSVIMIYGDHYGISENHNNAMEKLLGEKITPAKFTDLNRTGFWIKIPGKSGGINNEYAGQVDVMPTILHLAGIDTKNYLMFGTDLFSKGHNQVVPFRNGDFITKDYKYVNGKIYSNKNNELITTQPADFEKNKKQVEKDLEMSDNVLNGDLFRFYKNPDFKKVNPSKYKYETGPKANSKK >NC_016928.2|WP_000022323.1|763364_764369_+|biotin-dependent-carboxyltransferase-family-protein MSIIIEKSGLFSSFQDFGRRGYEHDGVIPCGALDTLAHEIANRLVANDKNEATLEMTNKMATIRFTEPTLIALAGGNVKAYTEHMTISPYKLYLLDKGDVLKFRETSYTSRVYLAVGGGFELDAWLGSNSTDFNVKIGGFKGRTLQDGDEIKLKRDYTARHHKLFENLAHTKQTDWGIDGYALSFNYMSDVFHVVKNKGTEDFKEDAIQRFVKHDYKVTSKANRMGMMLEGEKIKAFYEDMPPYQTVKKGTIQIKRDGTPIILLNDHYTLGSYPQIGTIASYHLTKLAQKPQGSRLKFQFIDILTAEKNLVKYSNWLNQLFHGIEYRMQLEMMK >NC_016928.2|WP_000708692.1|762670_763381_+|allophanate-hydrolase-subunit-1 MKIYSQGDQAIVVAIEKEVSKSLTEDLLTLRSYLIEQNYPFIIEIVPSESDMMIVYDARDMIKHHNIQSPFLYMKALIESIHLNIKHDFNQQDLIEIPIVYGSKYGPDLESLLKHYKIKLETFIELHSKAQYFVSMMGYSPGFPYLTGLNKKLYINHTSKQKKFIPAGSVVLEGKKCGIVTTDTINDWLVIGYTPLSLFNPKESDFARLKLGDNIKFRPINENELEVGAFKDVNHN >NC_016928.2|WP_014363392.1|762367_762574_+|hypothetical-protein MIIVYIALLLILVYVNYRLVNRLLSENRIYVVRLIATITTVISFILVYALIHELMPFVVRAMDLMYHQ >NC_016928.2|WP_000429011.1|776042_776960_-|diacylglycerol-kinase-family-lipid-kinase MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMTHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILSANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >NC_016928.2|WP_031760357.1|777052_777154_+|hypothetical-protein MVITDIDVYRVGRENIVIAVYNEHIKLLFILIS >NC_016928.2|WP_000193751.1|777231_778737_-|peptide-MFS-transporter MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >NC_016928.2|WP_000930014.1|779076_779577_-|NADPH-dependent-7-cyano-7-deazaguanine-reductase-QueF MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >NC_016928.2|WP_001068497.1|779596_780463_-|DMT-family-transporter MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK >NC_016928.2|WP_000692521.1|781263_781662_+|class-Ib-ribonucleoside-diphosphate-reductase-assembly-flavoprotein-NrdI MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >NC_016928.2|WP_000855509.1|781624_783730_+|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-alpha MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYSVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >NC_016928.2|WP_000562498.1|783847_784819_+|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-beta MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >NC_016928.2|WP_000499195.1|785318_785474_+|hypothetical-protein MFYFTLSKQNTHSEKLNFSLIANINKIDTKLFERLLKLWSKNATINEKYYQ >NC_016928.2|WP_000876317.1|785512_786484_+|ABC-transporter-permease MKYLLKGNILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDLLHLTESQRNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSICGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMEGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_016928_2 | 952771-952928 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_016928_2
|
2 spacers
spacers of NC_016928_2
>2.1|952811|27|NC_016928|PILER-CR ATTGGAAATCCAATTGGGGCTCCGCGT >2.2|952878|19|NC_016928|PILER-CR CTGTGTTGGGGCCCACTCC >2.3|952871|29|NC_016928|CRISPRCasFinder ACTCCCCAACTCGCATTGCTTGTAGAATC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_016928_2
The CRISPR arrays of NC_016928_2 >merge|NC_016928|2|952771-952928|PILER-CR,CRISPRCasFinder AACTTGTATTGCTTGTAGAAATTGGAAATCCAATTGGGGCTCCGCGTCCAACTTGCATTGCTTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCACTCCCCAACTCGCATTGCTTGTAGAATCTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCC >NC_016928|2|1|952771-952915|PILER-CR AACTTGTATTGCTTGTAGAAATTGGAAATCCAATTGGGGC TCCGCGTCCAACTTGCATTGCTTGTAG AATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCACTCCCC AACTCGCATTGCTTGTAGA ATCTCTTTTCGAAATTCTC >NC_016928|2|2|952842-952928|CRISPRCasFinder TCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCC ACTCCCCAACTCGCATTGCTTGTAGAATC TCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCC
>NC_016928.2|WP_000390575.1|952457_952766_+|metal-sulfur-cluster-assembly-factor MEEALKDSILGALEMVIDPELGIDIVNLGLVYKVNVDDEGVCTVDMTLTSMGCPMGPQIIDQVKTVLAEIPEIQDTEVNIVWSPPWTKDMMSRYAKIALGVS >NC_016928.2|WP_001182436.1|951519_952344_-|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MQPHLICLDLDGTLLNDNKEISSYTKQVLNELQQRGHQIMIATGRPYRASQMYYHELNLTTPIVNFNGAYVHHPKDKNFKTCHEILDLGIAQNIIQGLQQYQVSNIIAEVKDYVFINNHDPRLFEGFSMGNPRIQTGNLLVHLKESPTSILIEAEESKIPEIKNMLTHFYADHIEHRRWGAPFPVIEIVKLGINKARGIEQVRQFLNIDRNNIIAFGDEDNDIEMIEYARHGVAMENGLQELKDVANNITFNNNEDGIGRYLNDFFNLNIRYYC >NC_016928.2|WP_001124491.1|950151_951468_-|CoA-disulfide-reductase MPKIVVVGAVAGGATCASQIRRLDKESDIIIFEKDRDMSFANCALPYVIGEVVEDRKYALAYTPEKFYDRKQITVKTYHEVIAINDERQTVSVLNRKTNEQFEESYDKLILSPGASAHSLGFESDITFTLRNLEDTDAIDQFIKANQVDKVLVVGAGYVSLEVLENLYERGLHPTLIHRSDKINKLMDADMNQPILDELDKREIPYRLNEEIVAINGNEITFKSGRVEHYDMIIEGVGTHPNSKFIESSNIKLDRKGFIPVNDKFETNVPNIYAIGDIATSHYRHVDLPASVPLAWGAHRAASIVAEQIAGNDTIEFKGFLGNNIVKFFDYTFASVGVKPNELKQFDYKMVEVTQGAHANYYPGNSPLHLRVYYDTSNRQILRAAAVGKEGADKRIDVLSMAMMNQLTVDELTEFEVAYAPPYSHPKDLINMIGYKAK >NC_016928.2|WP_000902813.1|949590_949980_+|YisL-family-protein MLHLHILSWVLAIILFIATYLNISKNQGGTPYFKPLHMVLRLFMLLTLISGFWILIQSFMNGGANHMLLTLKMLCGVAVVGLMEVSIAKRKRHEQSHTMFWITIALIIITMVLGVILPLGPISKLFGIG >NC_016928.2|WP_000670755.1|948360_949263_+|fumarylacetoacetate-hydrolase-family-protein MKFLSFKYNDKTSYGVKVKREDAVWDLTQVFADFAEGDFHPKTLLAGLQQNHTLDFQEQVRKAVVAAEDSGKAEDYKISFNDIEFLPPVTPPNNVIAFGRNYKDHANELNHEVERLYVFTKAASSLTGDNATIPNHKDITDQLDYEGELGIVIGKSGEKIPKALALDYVYGYTIINDITDRKAQSEQDQAFLSKSLTGGCPMGPYIVTKDELPLPENVNIVTKVNNEIRQDGNTGEMILKIDELIEEISKYVALHPGDIIATGTPAGVGAGMQPPKFLQPGDEVKVTIDNIGTLTTYIAK >NC_016928.2|WP_000154915.1|944541_948195_+|helicase-exonuclease-AddAB-subunit-AddA MTIPEKPQGVIWTDAQWQSIYATGQDVLVAAAAGSGKTAVLVERIIQKILRDGIDVDRLLVVTFTNLSAREMKHRVDQRIQEASIADPANAHLKNQRIKIHQAQISTLHSFCLKLIQQHYDVLNIDPNFRTSSEAENILLLEQTIDEVIEQHYDILDPAFIELTEQLSSDRSDDQFRMIIKQLYFFSVANPNPTDWLDQLVTPYEEEAQQAELIQLLTDLSKVFITAAYDALNKAYDLFSMMDGVDKHLAVIEDERRLMRRVLEGGFIDIPYLTGHEFGARLPNITAKIKEANEMMVDALEDAKLQYKKYKSLIDKVKSDYFSREADDLKADMQQLAPRVKYLARIVKDVMSEFNRKKRSKNILDFSDYEHFALQILTNEDGSPSEIAESYRQHFQEILVDEYQDTNRVQEKILSCIKTGDEHNGNLFMVGDVKQSIYKFRQADPSLFIEKYQRFTIDGDGTGRRIDLSQNFRSRKEVLSTTNYIFKHMMDEQVGEVKYDEAAQLYYGAPYDESDHPVNLKVLVEADQEHSDLTGSEQEAHFIVEQVKDILEHQKVYDMKTGSYRSATYKDIVILERSFGQARNLQQAFKNEDIPFHVNSREGYFEQTEVRLVLSFLRAIDNPLQDIYLVGLMRSVIYQFKEDELAQIRILSPNDDYFYQSIVNYINDEAADAILVDKLKMFLSDIHSYQQYSKDHPVYQLIDKFYNDHYVIQYFSGLIGGRGRRANLYGLFNKAIEFENSSFRGLYQFIRFIDELIERGKDFGEENVVGPNDNVVRMMTIHSSKGLEFPFVIYSGLSKDFNKRDLKQPVILNQQFGLGMDYFDVDKEMAFPSLASVAYRAVAEKELVSEEMRLVYVALTRAKEQLYLIGRVKNDKSLLELEQLSISGEHIAVNERLTSPNPFHLIYSILSKHQSASIPDDLKFEKDIAQVEDSSRPNVNISIVYFEDVSTETILDNDEYRSVNQLETMQNGNEDVKAQIKHQLDYQYPYVNDTKKPSKQSVSELKRQYETEESGTSYERVRQYRIGFSTYERPKFLSEQGKRKANEIGTLMHTVMQHLPFKKERISKVELHQYIDGLIDKHIIEADAKKDIRMDEIMTFINSELYSIIAEAEQVYRELPFVVNQALVDQLPQGDEDVSIIQGMIDLIFVKDGVHYFVDYKTDAFNRRRGMTDEEIGTQLKNKYKIQMKYYQNTLQTILNKEVKGYLYFFKFGTLQL >NC_016928.2|WP_000172334.1|941064_944541_+|helicase-exonuclease-AddAB-subunit-AddB MTLHAYLGRAGTGKSMKMLTEIKQKMKADPLGDPIILIAPTQSTFQLEQAFVNDSELNGSLRTEVLHFERLSHRIFQEVGSYSEQKLSKAATEMMIYNIVQEQQKYLKLYQSQAKYYGFSEKLTEQIQDFKKYAVTPEHLESFIADKNMQTRTKNKLEDIALIYREFEQRIQNEFITGEDALQYFIDCMPKSEWLKRADIYIDGFHNFSTIEYLIIKGLIKYAKSVTIILTTDGNHDQFSLFRKPSEVLRHIEEIANELNISIERQYFKQLYRFNNQDLKHLEQEFDALQINRVACQGHINILESATMREEINEIARRIIVDIRDKQLRYKDIAILYRDESYAYLFDSILPLYNIPYNIDTKRSMTHHPVMEMIRSLIEVIQSNWQVNPMLRLLKTDVLTASYLKSAYLVDLLENFVLERGIYGKRWLDDELFNVEHFSKMGRKAHKLTEDERNTFEQVVKLKKDVIDKILHFEKQMSQAATVKDFATAFYESMEYFELPNQLMTERDELDLNGNHEKAEEIDQIWNGLIQILDDLVLVFGDEPMSMERFLEVFDIGLEQLEFVMIPQTLDQVSIGTMDLAKVDNKQHVYLVGMNDGTMPQPVTASSLITDEEKKYFEQQANVELSPTSDILQMDEAFVCYVAMTRAKGNVTFSYSLMGSSGDDKEISPFLNQIQSLFNQLEITNIPQYHEVNPLSLMQHAKQTKITLFEALRAWLDDEIVADSWLDAYQVIRDSDHLNQGLDYLMSALTFDNETVKLGETLSKDLYGKEINASVSRFEGYQQCPFKHYASHGLKLNERTKYELQNFDLGDIFHSVLKYISERINGDFKQLDLKKIRQLTNEALEEILPKVQFNLLNSSAYYRYLSRRIGAIVETTLSALKYQGTYSKFMPKHFETSFRRKPRTNDELIAQTLTTTQGIPINIRGQIDRIDTYTKNDTSFVNIIDYKSSEGSATLDLTKVYYGMQMQMMTYMDIVLQNKQRLGLTDIVKPGGLLYFHVHEPRIKFKSWADIDEDKLEQDLIKKFKLSGLVNADQTVIDALDIRLEPKFTSDIVPVGLNKDGSLSKRGSQVADEATIYKFIQHNKENFIETASNIMDGHTEVAPLKYKQKLPCAFCSYQSVCHVDGMIDSKRYRTVDETINPIEAIQNINIDDEFGGEQ >NC_016928.2|WP_000711897.1|940329_940905_+|signal-peptidase-I MKKELLEWIISIAVAFVILFIVGKFIVTPYTIKGESMDPTLKDGERVAVNIIGYKTGGLEKGNVVVFHANKNDDYVKRVIGVPGDKVEYKNDTLYVNGKKQDEPYLNYNLKHKQGDYITGTFQVKDLPNANPKSNVIPKGKYLVLGDNREVSKDSRAFGLIDEDQIVGKVSFRFWPFSEFKYNFNPENTKN >NC_016928.2|WP_000758211.1|939789_940314_+|signal-peptidase-I MKKVVKYLISLILAIIIVLFVQTFVIVGHVIPNNDMSPTLNKGDRVIVNKIKVTFNQLNNGDIITYRRGNEIYTSRIIAKPGQSMAFRQGQLYRDDRPVDASYAKNRKIKDFSLRNFKELDGDIIPPNNFVVLNDHDNNQHDSRQFGLVDKKDIIGNISLRYYPFSKWTIQFKS >NC_016928.2|WP_000007965.1|939209_939785_+|TVP38/TMEM64-family-protein MSFHQVEEWFEIFRQFGYLPGFILLYIRAIIPVFPLALYILINIQAYGPILGILISWLGLISGTFTVYLICKRLVNTERMQRIKQRTAVQRLISFIDRQGLIPLFILLCFPFTPNTLINFVASLSHIRPKYYFIVLASSKLVSTIILGYLGKEITTILTHPLRGILMLVVLIVFWIVGKKLEQHFMGSKKE >NC_016928.2|WP_001044212.1|953419_955234_+|acetyltransferase MNKTKGFTKYKKMIYMPGLDGLRAIAVLGIIIYHLNKQWLTGGFLGVDTFFVISGYLITSLLLKEYDDTGIIKLKSFWIRRLKRLLPAVIVLLMVVGTATLLLKSENIIRVKHDIIAAIFYVSNWWYIAKDVNYFEQFSFMPLKHLWSLAIEEQYYIFFPVILVTLLLTIKKRYKIGFIFWGVSIISLGLMMFIYSINGDHSRVYFGTDTRLQTLLLGVILAFLWPPFKLKNDPPKVVKYIIDSIGSLSFIVLILLFFIINDETNWIYDGGFYLISILTLFIIASVVHPSTWIAKIFSNPVLVFIGKRSYSLYLWHFAVISFVHSYYVDGQIPVYVYFIDISLTIIFAELSYRFIETPFRKEGIKALNWRPSYIPQFIRMAIVVTLLIPFMLILVGAFNKYGKDIIGEKANSFDTTIEDNYLMRIAPIDNIHIDGLVSEKKKESSDVYNNIKPLLIGDSVMVDIGESFKSSVPKSRIDGKVGRQLYQTLPLVKANYSQYKKSSDQVVLELGTNGDFTVKQLDDLLNQFGKAKIYLVNTRVPRIYEANVNRLLADAAKRKSNVTLIDWYKRSQGHSEYFAPDGVHLEYKGVLALKDEILKALKKK >NC_016928.2|WP_000353962.1|955436_958046_+|ATP-dependent-chaperone-ClpB MDINKMTYAVQSALQQAVELSQQHKLQNIEIEAILSAALNESESLYKSILERANIEVDQLNKAYEDKLNTYASVEGDNIQYGQYISQQANQLITKAESYMKEYEDEYISMEHILRSAMDIDQTTKHYINNKVEVIKEIIKKVRGGNHVTSQNPEVNYEALAKYGRDLVEEVRQGKMDPVIGRDEEIRNTIRILSRKTKNNPVLIGEPGVGKTAIVEGLAQRIVKKDVPESLLDKTVFELDLSALVAGAKYRGEFEERLKAVLKEVKESDGRIILFIDEIHMLVGAGKTDGAMDAGNMLKPMLARGELHCIGATTLNEYREYIEKDSALERRFQKVAVSEPDVEDTISILRGLKERYEVYHGVRIQDRALVAAAELSDRYITDRFLPDKAIDLVDQACATIRTEMGSNPTELDQVNRRVMQLEIEESALKNESDNASKQRLQELQEELANEKEKQAALQSRVESEKEKIANLQGKRAQLDESRQALEDAQTNNNLEKAAELQYGTIPQLEKELRELEDNFQDEQGEDTDRMIREVVTDEEIGDIVSQWTGIPVSKLVETEREKLLHLSDILHKRVVGQDKAVDLVSDAVVRARAGIKDPNRPIGSFLFLGPTGVGKTELAKSLAASLFDSEKHMIRIDMSEYMEKHAVSRLIGAPPGYIGHDEGGQLTEAVRRNPYSVILLDEVEKAHTDVFNVLLQILDEGRLTDSKGRSVDFKNTIIIMTSNIGSQVLLENVKETGEITEPTEKAVMTSLNAYFKPEILNRMDDIVLFKPLSIDDMSMIVDKILTQLNIRLLEQRISIEVSDDAKAWLGQEAYEPQYGARPLKRFVQRQIETPLARMMIKEGFPEGTTIKVNLNSDNNLTFNVEKIHE >NC_016928.2|WP_001047064.1|958104_958974_-|LysR-family-transcriptional-regulator MNLDWYYTFVILAKTLNYRLASEEINLTIPSIHKQIKNLEQHLNVKLFETYKNQIILTEDGHTFLPIAQSFIEQYESGIKHIQLKKTMFQSKLNVVVSSYIATFIMPKFLKSFFNEHPFIDVSLHVKNENIEKDINNHTYDIGISRNQPKLREVHSEKVCEGKIVLIAPNKENNHLLTEASLFEKYKIISDNHPEYWSSLKNNILNIYEKAQFLSINDVHTSIKLIEMNQGISFLPLYITTNSDYNISVINTKILQAPISFTYIYSKKEIPEILVFIKSFKKYIANEQL >NC_016928.2|WP_000619354.1|959083_960229_+|2-isopropylmalate-synthase MIRIQDNTIRDGMQQSNVRKSLFIKKEVLKQINKLNINSVEVGMCTTIEDEFNIHQFRDILSPEKELVVLTRLNEKEIKKIVKLKIHNLVVKILLPISDLHIKEKLNFSNKYYIQKIKDCLEILKKDKKGVDICFEDATRTSREKLKEYMEIISKYQVRTVTFADTVGCSTPLEYGDIFNYFVKKYSNIIFSAHCHNDLGLATANTLAAILNGAKQIETTFLGIGERAGNAPIEEIITILTKKQIESTEFTLPDVYKTSINISKILDFQISENKPIIGENIFKHESGIHQDGTKKNINMYQYLVPSDLGLKNSQVVQFPISNISSKKILHNKFKSIVNTEEIDENISFYKLVNKFSPEVAPEDTVDLLQIIKRRSKDGNFK >NC_016928.2|WP_000404422.1|960212_960854_+|L-threonylcarbamoyladenylate-synthase MEILNDSVKSFEKLYLQLQDGFPVIVPTDTNYNLCSLPNNDLCIDKIFEYKKRSKDKPLSLFIDKPEDWKLYGDNQNTEIVDKLVEIFWPGPLNIILKNKTSYNYMLNNSDSIAIGCVQNKTMRRFISYINSPIAITSANISGTADDILITENEAIKHMGENVRYMLRSQNKTNYKTSSTIIKVTDNKIELLREGDIKFEEIKERLGTGIIYE >NC_016928.2|WP_000695347.1|961948_962464_+|YbhB/YbcL-family-Raf-kinase-inhibitor-like-protein MKIKTEFKGNNIPYEYAAGADVSDSINGNPIKSFPFEVTELPEGTKYLAWSLIDYDAIPVCGFAWIHWSVANVSVSGNSISIKADLSRTKGDYVQGKNSFTSGLLAEDFSEIENHYVGPTPPDKDHQYELTVYALGHSLNLKNGFYLNEFLKEVNQHKIDQTSINLIGRKI >NC_016928.2|WP_000769690.1|962774_963209_+|MAP-domain-containing-protein MKLKSFITVTLALGMIATTGATVASNEVSAAEKDKLPATQKAKEMQNVPYTIAVDGIMAFNQSYLNLPKDSQLSYLDLGNKVKALLYDERGVTPEKIRNAKSAVYTITWKDGSKKEVDLKKDSYTANLFDSNSIKQIDINVKTK >NC_016928.2|WP_000682089.1|963465_963651_-|YjzD-family-protein MKHLVTFFWALLLMQMVNFVLNSLVGGDSLNVVNPIIMAVLFTIFTAIFAAVIKPPKDSSQ >NC_016928.2|WP_001100526.1|963945_964887_+|ketoacyl-ACP-synthase-III MNVGIKGFGAYAPEKIIDNAYFEQFLDTSDEWISKMTGIKERHWADDDQDTSDLAYEASVKAIADAGIQPEDIDMIIVATATGDMPFPTVANMLQERLGTGKVASMDQLAACSGFMYSMITAKQYVQSGDYHNILVVGADKLSKITDLTDRSTAVLFGDGAGAVIIGEVSEGRGIISYEMGSDGTGGKHLYLDKDTGKLKMNGREVFKFAVRIMGDASTRVVEKANLTSDDIDLFIPHQANIRIMESARERLGISKDKMSVSVNKYGNTSAASIPLSIDQELKNGKLKDDDTIVLVGFGGGLTWGAMTIKWGK >NC_016928.2|WP_000081240.1|964898_966143_+|beta-ketoacyl-ACP-synthase-II MSQNKRVVITGMGALSPIGNDVKTTWENALKGVNGIDKITRIDTEPYSVHLAGELKNFNIEDHIDKKEARRMDRFTQYAIVAAREAVKDAQLDINENTADRIGVWIGSGIGGMETFEIAHKQLMDKGPRRVSPFFVPMLIPDMATGQVSIDLGAKGPNGATVTACATGTNSIGEAFKIVQRGDADAMITGGTEAPITHMAIAGFSASRALSTNDDIETACRPFQEGRDGFVMGEGAGILVIESLESAQARGANIYAEIVGYGTTGDAYHITAPAPEGEGGSRAMQAAMDDAGIEPKDVQYLNAHGTSTPVGDLNEVKAIKNTFGEAAKHLKVSSTKSMTGHLLGATGGIEAIFSALSIKDSKVAPTIHAVTPDPECDLDIVPNEAQDLDITYAMSNSLGFGGHNAVLVFKKFEA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_016928_3 | 1071296-1071388 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_016928_3
|
1 spacers
spacers of NC_016928_3
>3.1|1071326|33|NC_016928|CRISPRCasFinder TAAAAGAGGGATACTTGCGTCGAGCGCAAGCAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_016928_3
The CRISPR arrays of NC_016928_3 >merge|NC_016928|3|1071296-1071388|CRISPRCasFinder AAAAGCCCCTAACAACTAAAGGTTGTAAGGTAAAAGAGGGATACTTGCGTCGAGCGCAAGCATAAAAGCCCCTAACAACTAAAAGTTGTAAGG >NC_016928|3|3|1071296-1071388|CRISPRCasFinder AAAAGCCCCTAACAACTAAAGGTTGTAAGG TAAAAGAGGGATACTTGCGTCGAGCGCAAGCAT AAAAGCCCCTAACAACTAAAAGTTGTAAGG
>NC_016928.2|WP_000033477.1|1070238_1070814_-|ECF-transporter-S-component MSKGLKLSEILVTVLISVVFAVIYNLWWFVYNGVQATGLHLEQLTNGVWFMAAIVCYLIIPKPGIALLAEFAAGAGETIIMGRFDIPTIVYAFIQGLACELVFAIFKYQSRSVMVAMLAGFCTAIAAFPIDYFYGYLNEVAGWNLTLFIVFRLISGAVVAGVLSYLLVKALDKTGVTKLFRPAAKEDYDNL >NC_016928.2|WP_000921971.1|1068823_1070224_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLKVSDLRLKYPSGQRKIFDHLNITIQDKEKVLLLGPSGCGKSTLLNVLSGIVPNLIELPMKYDELIVDPLSGVIFQDPDSQFCMPKVYEELAFVLENRQVPREDMDALIINALNMVNLNVTPETYIKDLSGGMKQKLAIVETILQQSKTLFLDEPTAMLDVQATEDLWTKLIELWEDQTVVIVEHKVKHIWNHVDRVILMDYNGNIIADECPEIILQKYVHLLSEYGVWHPRAWEFAPSRVDFPTTNSHLLQFKNGRIIRGKSTLLSFSDLEIGLGEWITITGANGSGKTTLLESIMQLIKYQGDVYFENQRLTKIKHAAKHMYLVYQNPELQFITNSVYDEINIHFNHLSKDQSDDETIQLLKLLDLENVKDQHPYELSIGQKRRLSVATALSSKADIIFLDEPTFGLDSHNTFQLIKLFQKRINLGQSIVMVTHDDEIIERYPSRRLKISDGALLDCDGDTNV >NC_016928.2|WP_000273256.1|1068024_1068831_-|energy-coupling-factor-transporter-transmembrane-protein-EcfT MYEQWKVRQSFVDDVNIITKLFLGIILFFFIIFVHNFDFMLYITILMLVFLLMFNGTQFKITAIFITISIGFALLSSLFMILYGNGSHTILKFGFIHITTESLVRGLHVSLRTIAISFFGILIALTSQVVMIFYSLMQHLKVKSKVAYAFMAAIRMIPLMISSLIQLRRSLKMRYQMIDAANYRGLKRFKHLIIPLLSQNIRKAHQLSVAMESKGFRDGPRTYYYNVPFSYKDVIFIIVLIAIITLAYYCSITLPITGIDDVRLGRVG >NC_016928.2|WP_001101926.1|1066511_1067759_+|phosphoribosylamine--glycine-ligase MNVLVIGAGGREHALAYKLNQSSLVKQVFVIPGNEAMTPIAEVHTEISESDHQGILDFAKQQNVDWVVIGPEQPLIDGLADILRANGFKVFGPNKQAAQIEGSKLFAKKIMEKYNIPTADYKEVERKKDALTYIENCELPVVVKKDGLAAGKGVIIADTIEAARSAIEIMYGDEEEGTVVFETFLEGEEFSLMTFVNGDLAVPFDCIAQDHKRAFDHDEGPNTGGMGAYCPVPHISDDVLKLTNETIAQPIAKAMLNEGYQFFGVLYIGAILTKDGPKVIEFNARFGDPEAQVLLSRMESDLMQHIIDLDEGNRTEFKWKNESIVGVMLASKGYPDAYEKGHKVSGFDLNENYFVSGLKKQGDTFVTSGGRVILAIGKGDNVHDAQRDAYEKVSQIQSDHLFYRHDIANKALQLK >NC_016928.2|WP_000709285.1|1065011_1066490_+|bifunctional-phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide-formyltransferase/IMP-cyclohydrolase MKKAILSVSNKTGIVEFAKALTQLNYELYSTGGTKRILDEANVPVRSVSDLTHFPEIMDGRVKTLHPAVHGGILADRNKPQHLNELSEQHIDLIDMVVVNLYPFQQTVANPDVTMDEAIENIDIGGPTMLRAAAKNYKHVTTIVHPADYQEVLTRLRNDSLDESYRQSLMIKVFEHTAEYDEAIVRFFKGDKETLRYGENPQQSAYFVRTSNAKHTIAGAKQLHGKQLSYNNIKDADATLALVKKFDTPAAVAVKHMNPCGVGIGDTIEQAFQHAYEADSQSIFGGIVALNRAVTPELAEQLHSIFLEVIIAPKFTGEALDILKQKKNVRLLEIDMIIDSNEEEFVSVSGGYLVQDKDNYVVPKEEMKVVTEVAPTDEQWEAMLLGWKVVPSVKSNAIILSNNKQTVGIGAGQMNRVGAAKIALERAIEINDHVALVSDGFFPMGDTVELAAQHGIKAIIQPGGSIKDQDSIDMANKHGIAMVVTGTRHFKH >NC_016928.2|WP_000238670.1|1064430_1064997_+|phosphoribosylglycinamide-formyltransferase MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNKDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRQCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >NC_016928.2|WP_000030810.1|1063399_1064428_+|phosphoribosylformylglycinamidine-cyclo-ligase MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDLFLEPTKLYVKPVLTLKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGDIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDASRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >NC_016928.2|WP_000483727.1|1061922_1063407_+|amidophosphoribosyltransferase MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSNQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >NC_016928.2|WP_000032747.1|1059754_1061944_+|phosphoribosylformylglycinamidine-synthase-subunit-PurL MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKNYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGVLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >NC_016928.2|WP_000666799.1|1059090_1059762_+|phosphoribosylformylglycinamidine-synthase-I MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >NC_016928.2|WP_000064214.1|1071397_1071532_-|hypothetical-protein MSNENQNKKAAEKAKEVEEKLKDKKEEKTEDINQTKQDIQDTLN >NC_016928.2|WP_000009075.1|1071683_1072979_+|hypothetical-protein MSFLRKHAEIIFSYLIGIVSLFTGLIILINLPLIKQLNGGKKVDTHVHNVWEFLNAFFSEIIKVMSRFIGNFPIVSAIVIIIFGILVMLIGHTLLRTIKYDYDISIFFLVIGIMYFIITLILMTQVYGFFAVIFIIPFTIHIGYIVYKDELNQENVKNHYMWIIVSYGISYLITQIALYGRIDANEIESIDILSVNAFFIIMWLLGQMAIWNFLFLRRALPLTKQELGEEEPELSRTSKGNVTNQTKIHLKQLQDKTTEYARKTRRSVDLDKIRAKRDKFKKKVNDIIDIQEDDIPDWMRKPKWVKPMYVELFCGVVIFLFTFLEFNNRNALFVSGDWKLSQTQYVIEWVTLLILLFIIIAYIATTLTFHLKGKFYYLQLFMGSILFFKLLTEFINIMIHGLLLSVFITPTLLLMLLAIIISYSLQLRERP >NC_016928.2|WP_000685063.1|1073403_1074576_+|class-I-SAM-dependent-rRNA-methyltransferase MKIATLNKGKETKYFNGYPLIEEEDIYSQDHLKEGDIFQIVTDKSQYVATAYVGRQHKGLGWVLTYDKAQEINTAFFVKLFNTALAERDYYFNIDGTNAFRLFNAEGDGVGGLTIDNYDGHLLIQWYSKGIYKFKYAILEAVRKVFDYKSIYEKVRFKDSEYSGGFVEGDAPEFPIVIEENFTFYNVDLEDGLMTGIFLDQKEVRKKLRDQYAKERHVLNLFSYTGAFSVIAASEASSTTSVDLANRSRSLTEENFGLNAIDPKSQYIYVMDTFDFYKYAARHGHSYDTIVIDPPSFARNKKRTFSVQKDYDKLINGALNILSSEGTLLLCTNASVYPLKQFKNTIKKTLEESGVDYELTEVMGLPKDFKTHPHYKPSKYLKAVFVNIRH >NC_016928.2|WP_000505962.1|1074629_1075172_+|hypothetical-protein MGFKNNLTSNLTNKIGNSVFKIENINEKGAMPTTIKELNERRQRAEAIVKRKSLMSSTMSVVPIPGLDFGVDLKLMKDIIEDVNKIYGLDHKQVNSLGDDVKERVMSAAAIQGSQFIGKRISSAFLKIVIRDVAKRTAAKQTKWFPVVGQAVSASISYYFMNKIGKDHIQKCENVIKNVM >NC_016928.2|WP_000437472.1|1075325_1075592_+|phosphocarrier-protein-HPr MEQNSYVIIDETGIHARPATMLVQTASKFDSDIQLEYNGKKVNLKSIMGVMSLGVGKDAEITIYADGSDESDAIQAISDVLSKEGLTK >NC_016928.2|WP_000040057.1|1075594_1077313_+|phosphoenolpyruvate--protein-phosphotransferase MSKLIKGIAASDGVAIAKAYLLVEPDLTFDKNEKVTDVEGEVAKFNSAIEASKVELTKIRNNAEVQLGADKAAIFDAHLLVLDDPELIQPIQDKIKNENANAATALTDVTTQFVTIFESMDNEYMKERAADIRDVSKRVLSHILGVELPNPSMIDESVVIVGNDLTPSDTAQLNKEFVQGFATNIGGRTSHSAIMSRSLEIPAIVGTKSITQEVKQGDMIIVDGLNGDVIVNPTEDELIAYQDKRERYFADKKELQKLRDADTVTVDGVHAELAANIGTPNDLPGVIENGAQGIGLYRTEFLYMGRDQMPTEEEQFEAYKEVLEAMNGKRVVVRTLDIGGDKELSYLNLPEEMNPFLGYRAIRLCLAQQDIFRPQLRALLRASVYGKLNIMFPMVATINEFREAKAILLEEKENLKNEGHDISDDIELGIMVEIPATAALADVFAKEVDFFSIGTNDLIQYTLAADRMSERVSYLYQPYNPSILRLVKQVIEASHKEGKWTGMCGEMAGDETAIPLLLGLGLDEFSMSATSILKARRQINGLSKNEMTELANRAVDCATQEEVIELVNNYVK >NC_016928.2|WP_001289624.1|1077549_1077783_-|glutaredoxin-family-protein MSEIIVYTQNDCPPCTFVKNYLTEHQIVFEERNINNQQYRNEMIDFDAFSTPFILLNGNPMYHVDLDEINKVLNIQD >NC_016928.2|WP_000381849.1|1077980_1079342_+|cytochrome-ubiquinol-oxidase-subunit-I MDTVEISRFLTAMTLAVHIIFATIGVGMPLMFAIAEFLGIRKNDLQYIAMAKRWAKAYTITVAVGVVTGTIIGLQLSLIWPTFMEMGGHVIALPLFMETFAFFFEAIFLSIYLYTWDRFKNKWTHFLISIPVIIGGSFSAFFITSVNSFMNTPAGFELKNGKMVNVQPIEAMFNPSFIVRSFHVITTAGMTMAFVIASIAAFKLLRNRQPKDTVYHKKALKMSMIVGFFSTLLSMLAGDLSAKFLHKFQPEKLAAYEWHFDTSSHAKLLLFGVLDEKTQQVKGAIELPGLLSFLADNSVKTKVQGLNDFPKSLHPPMIVHYFFDLMVTMGILCFVISGVYVLTLMFKKLRKFSTHKWMLYGILLTGPASMLAIEFGWFLTEMGRQPWIVRGYMRVAEAATQAGGITFVTILFGILYIILMYTCAYVLIRMFKNKPAYEDVNRLAKKQGGEIEK >NC_016928.2|WP_000638454.1|1079338_1080358_+|cytochrome-d-ubiquinol-oxidase-subunit-II MIYAFIGITVLWLFLFCYIIIASIDFGAGFFALHSKLTGDEKKINHLISRYLNPVWEVTNVFFVFFFVGFVGFFPESIKYLGTVLLIPGSIALIMISLRNSFYAFENYGQDTKLAWMIMYGVSGLLIPASLSTALTITEGGYINVRNNVIDLDWVQLLLSPFAWSVVFLAIISVLYISSGFLTYYAKKANDEPAYNLTRQWHIFLGPPMIIICLFVFLSLRIQNSEHFYSAVFDYWWMFAISFLFFTLASLLTFFKKKHGLAFVFVILQMMFAFFGYGISKLPYLLYPFVKITDAYVNPEMGWTLVIVFILGLLLLLPSLILLLRLFVFDKEYVEGKKS >NC_016928.2|WP_000514290.1|1080490_1081153_+|TrkA-family-potassium-uptake-protein MGKEYVVIGLGRFGGSIVRELNALDMDVMAIDHDENRVNEYSDIATHAVVADTTDEAVMKSLGIRNFDHVIVAIGENIQSSTLTTLILKELGVKKVTAKAQNDYHAKILNKIGADTVVHPERDMGRRIAHNVASASVLDYLELADEHSIVELKATEKMAGQSIIDLDIRAQYGINIIAIKRGKEFIISPNPNINLEIGDILIMIGHDNDLNRFEKNIATR |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_016928_4 | 1155534-1155786 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_016928_4
|
4 spacers
spacers of NC_016928_4
>4.1|1155561|29|NC_016928|PILER-CR AGCTGACGAAAAATCAGCTTACAATAATG >4.2|1155617|29|NC_016928|PILER-CR AGCTGGCAGAAAGTCAGCTTACAATAACG >4.3|1155673|39|NC_016928|PILER-CR AGCTGGCAGAAAGTCAGCTTACAATAACGTGCAAGTTGG >4.4|1155739|29|NC_016928|PILER-CR GAAATTGGATTCCCAATTTCTACAGGCAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_016928_4
The CRISPR arrays of NC_016928_4 >merge|NC_016928|4|1155534-1155786|PILER-CR TGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCTGACGAAAAATCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGAAGCTGGCAGAAAGTCAGCTTACAATAACGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCTGGCAGAAAGTCAGCTTACAATAACGTGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACATAGTGAAATTGGATTCCCAATTTCTACAGGCAATGGAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGA >NC_016928|4|2|1155534-1155786|PILER-CR TGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGA AGCTGACGAAAAATCAGCTTACAATAATG TGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGA AGCTGGCAGAAAGTCAGCTTACAATAACG TGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGA AGCTGGCAGAAAGTCAGCTTACAATAACGTGCAAGTTGG GGTGGGGCCCCAACATAGTGAAATTGG ATTCCCAATTTCTACAGGCAATGGAAGTT GGCGGGGCCCCAACATAGA
>NC_016928.2|WP_001802045.1|1155106_1155331_+|hypothetical-protein MLIQERGLKMTELNNIINSLQSLFESESGYKISKNSGVPYQTVQDLRNGKTKLEDARFRTIIKLYSYYVSLKEH >NC_016928.2|WP_000765708.1|1155003_1155150_+|hypothetical-protein MKLFYIVFLIIIWLNIFLGNEIIHTLTVLITTLYIVNSRKGIKNDRVE >NC_016928.2|WP_000857485.1|1153371_1154331_-|beta-channel-forming-cytolysin MKTRIVSSVTTTLLLGSILMNPVANAADSDINIKTGTTDIGSNTTVKTGDLVTYDKENGMHKKVFYSFIDDKNHNKKLLVIRTKGTIAGQYRVYSEEGANKSGLAWPSAFKVQLQLPDNEVAQISDYYPRNSIDTKEYMSTLTYGFNGNVTGDDTGKIGGLIGANVSIGHTLKYVQPDFKTILESPTDKKVGWKVIFNNMVNQNWGPYDRDSWNPVYGNQLFMKTRNGSMKAADNFLDPNKASSLLSSGFSPDFATVITMDRKASKQQTNIDVIYERVRDDYQLHWTSTNWKGTNTKDKWTDRSSERYKIDWEKEEMTN >NC_016928.2|WP_000231631.1|1152661_1152895_-|hypothetical-protein MVFNDWEINVVYSGEHEVVANEKSLFVIDEFYDVAIAIYYLDGKLKVAHVNYGSDFTIDVANKVFELNIQNPNVDEH >NC_016928.2|WP_001032817.1|1151857_1152043_-|hypothetical-protein MNKHINKKATKLLEDYKKVQQRKSEETDRGCLKSVIMLIVLFFLIIFGIVACSTNVNFFFQ >NC_016928.2|WP_000669535.1|1150791_1151142_+|complement-inhibitor-SCIN-family-protein MKFKKYILTGTLALLLSSTAIATLEGNKVEASSKKDYIIQSEYHDKQIADELRSLLNKSNVYDLAAGSLNRYYKQTIMMNEHRAKAALRSNNFDKMAEAKVALEKIYKEIYEIINR >NC_016928.2|WP_000791583.1|1150140_1150638_+|complement-convertase-inhibitor-Efb MKNKLIAKSLLTIAAIGITTTTIASTADASEGYGPREKKPVSINHNIVEYNDGTFKYQSRPKFNSTPKYIKFKHDYNILEFNDGTFEYGARPQFNKPAAKTDVTIKKEQKLIQAQNLVREFEKTHTVSAHRKAQKAVNLVSFEYKVKKMVLQERIDNVLKQGLVK >NC_016928.2|WP_000584398.1|1149375_1149882_+|hypothetical-protein MIIKILTILLLLCILSYLVTNRKKPFLFLKTLFMGVVFIFIGYISLAISAVIIYGIIQFITIDFGSFFLMGIILILISSIFQLFIVRLLFRKKNVDLTEVVVLEHLIQWFLVYFAIYQAVNEKMDINDINIDNFQSVFFDVSNLNLVILPTLIISWVTIFNYRMRSYK >NC_016928.2|WP_000739567.1|1148306_1148705_-|formyl-peptide-receptor-like-1-inhibitory-protein MKKNITKTIIASTVIAAGLLTQTNDAKAFFSYEWRGLEIAKNLADQAKKDDERADKLIKEADEKNEHYKGKTVEDLYVIAKKMGKGNTRAVVKIKDGGKNGYYTFDITRPLEEHRKNIPVVGSGEISEITWQ >NC_016928.2|WP_000739208.1|1147607_1147937_+|complement-convertase-inhibitor-Ecb MKKNFIGKSILSIAAISLTVSTFAGESHAQTKNAETVKKYNEYQTNFKKQVNKKVVDAQKAVNLFKRTRTVATHRKAQRAVNLIHFQHSYEKKKLQRQIDLVLKYNTLK >NC_016928.2|WP_001038858.1|1156000_1156717_-|superantigen-like-protein-SSL12 MNKNITKNIILTTTLLLLGTVLPQNQKPVFSFYSEAKAYSIGQDETNINELIKYYTQPHFSFSNKWLYQYDNGNIYVELKRYSWSAHISLWGAESWGNINQLKDRYVDVFGLKDKDTDQLWWSYRETFTGGVTPAAKPSDKTYNLFVQYKDKLQTIIGAHKIYQGNKPVLTLKEIDFRAREALIKNKILYNENRNKGKLKITGGGNNYTIDLSKRLHSDLANVYVKNPNKITVDVLFD >NC_016928.2|WP_001063565.1|1156824_1157550_-|superantigen-like-protein-SSL13 MNNNITKKIILSTTLLLLGTASTQFPNTPISSSTEAKAYYINQNETNVNELTKYYSQQHLTFSNKTLWQKDNGTIHATLLQFSWYSHIQVYGPESWGNINQLRNKSVDIFGIKDQETIDSFALSQETFTGGVTPAATSNDKHYKLNVTYKDKAETFTGGFPVYEGNKPVLTLKELDFRIRQTLIKSKKLYNNSYNKGQIKITGADNNYTIDLSKRLPSTDANRYVKKPQNAKIEVILEKSN >NC_016928.2|WP_000739527.1|1157644_1158370_-|superantigen-like-protein-SSL14 MKKNIMNKLVLSTALLLLGTTSTQLPKTPISFSSEAKAYNISENETNINELIKYYSQPHLSLSNKWLWQKPNGSIHATLQTWVWYSHIQVFGSESWGNINQLRNKYVDIFGTKDEDTVEGYWTYDETFTGGVTPAATSSDKPYRLFLKYSDKQQTIIGGHEFYKGNKPVLTLKELDFRIRQTLIKNKKLYNGEFNKGQIKITADGNNYTIDLSKKLKLTDTNRYVKNPKNAQIEVILEKSN >NC_016928.2|WP_000793607.1|1158807_1159809_+|ornithine-carbamoyltransferase MKNLRNRSFLTLLDFSRQEVEFLLTLSEDLKRAKYIGTEKPMLKNKNIALLFEKDSTRTRCAFEVAAHDQGANVTYLGPTGSQMGKKETTKDTARVLGGMYDGIEYRGFSQRTVETLAEYSGVPVWNGLTDEDHPTQVLADFLTAKEVLKKDYADINFTYVGDGRNNVANALMQGAAIMGMNFHLVCPKELNPTDELLNRCKNIAAENGGNILITDDIDQGVKGSDVIYTDVWVSMGEPDEVWKERLELLKPYQVNKEMMDKTGNPNVIFEHCLPSFHNADTKIGQQIFEKYGIREMEVTDEVFESKASVVFQEAENRMHTIKAVMVATLGEF >NC_016928.2|WP_001074342.1|1159831_1160764_+|carbamate-kinase MAKIVVALGGNALGKSPQEQLELVKNTAKSLVGLITKGHEIVISHGNGPQVGSINLGLNYAAEHNQGPAFPFAECGAMSQAYIGYQLQESLQNELHSIGMDKQVVTLVTQVEVDENDPAFNNPSKPIGLFYNKEEAEQIQKEKGFIFVEDAGRGYRRVVPSPQPISIIELESIKTLIKNDTLVIAAGGGGIPVIREQHDGFKGIDAVIDKDKTSALLGANIQCDQLIILTAIDYVYINFNTENQQPLKTTNVDELKRYIDENQFAKGSMLPKIEAAISFIENNPKGSVLITSLNELDAALEGKVGTVIKK >NC_016928.2|WP_078065166.1|1161000_1162491_+|YfcC-family-protein MILFILTVVAVIATWVIPAGAYSKLSYEPSSQELKIVNPHNQVKKVPGTQQELDKMGVKIKIEQFKSGAINKPVSIPNTYERLKQHPAGPEQITSSMVEGTIEAVDIMVFILVLGGLIGVVQASGSFESGLLALTKKTKGHEFMLIVFVSILMIIGGTLCGIEEEAVAFYPILVPIFIALGYDSIVSVGAIFLASSVGSTFSTINPFSVVIASNAAGTTFTDGLYWRIGACIVGAIFVISYLYWYCKKIKKDPKASYSYEDKDAFEQQWSVLKDDDSSHFTLCKKIILTLFVLPFPIMVWGVMTQGWWFPVMASAFLIFTIIIMFIAGTGKSGLGEKGTVDAFVNGASSLVGVSLIIGLARGINLVLNEGMISDTILHFSSSLVQHMSGPLFIIVLLFIFFCLGFIVPSSSGLAVLSMPIFAPLADTVGIPRFVIVTTYQFGQYAMLFLAPTGLVMATLQMLNMRYSHWFRFVWPVVAFVLIFGGGLLITQVLIYS >NC_016928.2|WP_000149420.1|1162798_1163026_+|hypothetical-protein MTHLTKVLDTLTGICVVLLFSKYFVAYANMVFDWKLRWYLLENIPHLPIILFILMFIFGVPSEMIKDRQRKNNGV >NC_016928.2|WP_001239297.1|1163331_1164279_-|TDT-family-transporter MRLQKAPLVTSGLVLGLLGLGNLLKDLSLTLNAVCGIFAFLIWIHLLCTMLKYFNNVKEQLNSPLVSSVFTTFFMSGFLGTTYLNTFFSNITFINSLITPIWILCLVGIMTHMIIFSIKYLKDFSLENVYPSWTVLFIGIAIAGLTAPVSGYFFIGQLTVIYGFVATCIVLPIVFKRLKAFPLQTSIKPNTSTICAPFSLVAAAYVIAFPKANAFIVIILLLLAQIFYFYIIIQLPKLLKEPFSPVFSAFTFPLVISATALKNSLPVLMFPVIWKGLLFIEVLLATVIVLRVFIGYLHFFLKKENQDKFLRNASQ >NC_016928.2|WP_001245798.1|1164528_1164717_+|hypothetical-protein MRNQIQKLLDSDLSSLHISKQTGVPQSTIHRMRKNERSLDNMSLKNAELLYKFANGIFSDED >NC_016928.2|WP_000398672.1|1165629_1165764_+|beta-class-phenol-soluble-modulin MEGLFNAIKDTVTAAINNDGAKLGTSIVSIVENGVGLLGKLFGF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_016928_5 | 1230138-1230230 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NC_016928_5
|
1 spacers
spacers of NC_016928_5
>5.1|1230168|33|NC_016928|CRISPRCasFinder AATAAGCGGAACGCCTGAGCTAAAGCTCATGCA |
cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_016928_5
The CRISPR arrays of NC_016928_5 >merge|NC_016928|5|1230138-1230230|CRISPRCasFinder TAAGAAACAGTAATCAATAAATTGATAACTAATAAGCGGAACGCCTGAGCTAAAGCTCATGCATAAGAAACAGTAATCAATAAATTGATAACT >NC_016928|5|4|1230138-1230230|CRISPRCasFinder TAAGAAACAGTAATCAATAAATTGATAACT AATAAGCGGAACGCCTGAGCTAAAGCTCATGCA TAAGAAACAGTAATCAATAAATTGATAACT
>NC_016928.2|WP_000167269.1|1229279_1230014_+|3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein]-reductase MTKSALVTGASRGIGRSIALQLAEEGYNVAVNYAGSKEKAEAVVEEIKAKGVDSFAIQANVADADEVKAMIKEVVSQFGSLDVLVNNAGITRDNLLMRMKEQEWDDVIDTNLKGVFNCIQKATPQMLRQRSGAIINLSSVVGAVGNPGQANYVATKAGVIGLTKSAARELASRGITVNAVAPGFIVSDMTDALSDELKEQMLTQIPLARFGQDTDIANTVAFLASDKAKYITGQTIHVNGGMYM >NC_016928.2|WP_001043838.1|1228360_1229287_+|ACP-S-malonyltransferase MNKTAIIFPGQGAQKVGMAQDLYNNNDQATEILTSAANTLDFDILETMFTDEDGKLGETENTQPALLTHSSALLAALKNLNPDFTMGHSLGEYSSLVAADVLSFEDAVKIVRKRGQLMAQAFPTGVGSMAAVLGLDFDKVDEICKSLSSDDKIIEPANINCPGQIVVSGHKALIDELVEKGKSLGAKRVMPLAVSGPFHSSLMKVIEEDFSSYINQFEWRDAKFPVVQNVNAQGETDKEVIKSNMVKQLYSPVQFINSTEWLIDQGVDHFIEIGPGKVLSGLIKKINRDVKLTSIQTLEDVKGWNEND >NC_016928.2|WP_000239738.1|1227381_1228368_+|phosphate-acyltransferase-PlsX MVKLAIDMMGGDNAPDIVLEAVQKAVEDFKDLEIILFGDEKKYKLNHERIEFRHCSEKIEMEDEPVRAIKRKKDSSMVKMAEAVKSGEADGCVSAGNTGALMSAGLFIVGRIKGVARPALVVTLPTIDGKGFVFLDVGANADAKPEHLLQYAQLGDIYAQKIRGIDNPKISLLNIGTEPAKGNSLTKKSYELLNQDHSLNFVGNIEAKTLMDGDTDVVVTDGYTGNMVLKNLEGTAKSIGKMLKDTIMSSTKNKLAGAILKKDLAEFAKKMDYSEYGGSVLLGLEGTVVKAHGSSNAKAFYSAIRQAKIAGEQNIVQTMKETVGESNE >NC_016928.2|WP_001548538.1|1226804_1227377_+|transcription-factor-FapR MRGETLKLKKDKRREAIRQQIDSNPFITDHELSDLFQVSIQTIRLDRTYLNIPELRKRIKLVAEKNYDQISSIEEQEFIGDLIQVNPNVKAQSILDITSDSVFHKTGIARGHVLFAQANSLCVALIKQPTVLTHESSIQFIEKVKLNDTVRAEARVVNQTAKHYYVEVKSYVKHTLVFKGNFKMFYDKRG >NC_016928.2|WP_001151491.1|1224542_1226603_+|ATP-dependent-DNA-helicase-RecG MAKVNLIESPYSLLQLKGIGPKKIEVLQQLNIHTVEDLVLYLPTRYEDNTVIDLNQAEDQSNVTIEGQVYTAPVVAFFGRNKSKLTVHLMVNNIAVKCIFFNQPYLKKKIELNQTITVKGKWNRVKQEITGNRVFFNSQGTQNQENADVQLEPVYRIKEGIKQKQIRDQIRQALNDVTIHEWLTDELREKYKLETLDFTLNTLHHPKSKEDLLRARRTYAFTELFLFELRMQWLNRLEKSSDEAIEIDYDLDQVKSFIDCLPFELTEAQKSSVNEIFRDLKAPIRMHRLLQGDVGSGKTVVAAICMYALKTAGYQSALMVPTEILAEQHAESLMALFGDSMNVALLTGSVKGKKRKILLEQLENGTIDCLIGTHALIQDDVIFHNVGLVITDEQHRFGVNQRQLLREKGAMTNVLFMTATPIPRTLAISVFGEMDVSSIKQLPKGRKPIITTWAKHEQYDNVLMQMTSELKKGRQAYVICPLIESSEHLEDVQNVVALYESLQQYYGVSRVGLLHGKLSADEKDEVMQKFSNHEIDVLVSTTVVEVGVNVPNATFMMIYDADRFGLSTLHQLRGRVGRSDQQSYCVLIASPKTETGIERMTIMTQTTDGFELSERDLEMRGPGDFFGVKQSGLPDFLVANLVEDYRMLEVARDEAAELIQSGVFFENTYQHLRHFVEENLLHRSFD >NC_016928.2|WP_000623917.1|1222706_1224353_+|DAK2-domain-containing-protein MISKINGKLFADMIIQGAQNLSNNADLVDSLNVYPVPDGDTGTNMNLTMTSGREEVENNLSKNIGELGKTFSKGLLMGARGNSGVILSQLFRGFCKNIESESEINSKLLAESFQAGVETAYKAVMKPVEGTILTVAKDAAQAAVEKANNTEDCIELMEYIIVKANESLENTPNLLAVLKEVGVVDSGGKGLLCVYEGFLKALKGEKVEAKVAKLDKDEFVHDEHDFHGVINTEDIIYGYCTEMMVRFGKNKKAFDEQEFRQDMSQFGDSLLVINDEEIVKVHVHTEYPGKVFNYGQQYGELIKLKVENMREQHREVIRKEQHTAKPKMETVETAIITISMGEGISEIFKSMGATHIISGGQTMNPSTEDIVKVIEQSKCKRAIILPNNKNILMASEQAASIVDAEAVVIPTKSIPQGISALFQYDVDATLEENKAQMADSVNNVKSGSLTYAVRDTKIDGVEIKKDAFMGLIEDKIVSSQSDQLTTVTELLIEMLAEDSEILTVIIGQDAEQAVTDNMINWIEEQYPDVEVEVHEGGQPIYQYFFSVE >NC_016928.2|WP_000171418.1|1222317_1222692_+|Asp23/Gls24-family-envelope-stress-response-protein MTLEISNDYGKIDISNEVIASVVGGKAVECYGIVGMASRQQVRDGIAEILGHENYAKGIKVTENNGVVDIDMYIIVSYGVKISEVANNVQSTVKYTLEKSLNVSVNSINIYVQGVRVNNTGKKA >NC_016928.2|WP_000517908.1|1221686_1221875_-|50S-ribosomal-protein-L28 MGKQCFVTGRKASTGNRRSHALNSTKRRWNANLQKVRILVDGKPKKVWVSARALKSGKVTRV >NC_016928.2|WP_000547905.1|1220663_1221305_+|thiamine-diphosphokinase MHINLLCSDRHLPQDIWAKSNEGKWGGVDRGALILLKHQIIPFFSVGDFDSVSKEERQLLTEQLQIKPVQAEKADTDLALAVDKAVALGFDSITIYGATGGRLDHFFGAIQLLLKKAYYKHDVHIEVIDQQNKIELLPKGQHTVEKDKSYPYISFIPMTDDVELSLAGFKYNLARQMLNIGSTLTISNEIESLQAKVTVHDGLILQIRSTDLN >NC_016928.2|WP_000164340.1|1220012_1220657_+|ribulose-phosphate-3-epimerase MTKLYPSLLSVDFLVLQHELKRLEEAGVDGVHFDVMDGQFVPNISIGLPILDAVRKGTTLPIDVHLMIENPEKYIASFAEHGADMISIHVESTPHIHRAIQMIKHLDKKAGVVINPGTPISQIEPILDIVDYVLVMTVNPGFGGQSFIDQCVEKIAGLNAIKMERQLNFDIEVDGGVNTDTAKVCVENGATMLVTGSFFFKQEDYKKVTQALKG >NC_016928.2|WP_000426914.1|1230319_1230553_+|acyl-carrier-protein MENFDKVKDIIVDRLGVDADKVTEDASFKDDLGADSLDIAELVMELEDEFGTEIPDEEAEKINTVGDAVKFINSLEK >NC_016928.2|WP_000043237.1|1230668_1231400_+|ribonuclease-III MSKQKKSEIVNRFRKRFDTKMTELGFTYQNIDLYQQAFSHSSFINDFNMNRLDHNERLEFLGDAVLELTVSRYLFDKHPNLPEGNLTKMRATIVCEPSLVIFANKIGLNEMILLGKGEEKTGGRTRPSLISDAFEAFIGALYLDQGLDIVWKFAEKVIFPHVEQNELLGVVDFKTQFQEYVHQQNKGDVTYNLIKEEGPAHHRLFTSEVILQGEAIAEGKGKTKKESEQRAAESAYKQLKQIK >NC_016928.2|WP_000262685.1|1231546_1235113_+|chromosome-segregation-protein-SMC MVYLKSIDAIGFKSFADQTNVQFDKGVTAIVGPNGSGKSNITDAIKWVLGEQSAKSLRGSKMEDIIFSGAEHRKAQNYAEVQLRLDNHSKKLSVDENEVIVTRRLYRSGESEYYINNDRARLKDIADLFLDSGLGKEAYSIISQGRVDEILNAKPIDRRQIIEESAGVLKYKKRKAESLNKLDQTEDNLTRVEDILYDLEGRVEPLKEEAAIAKEYKTLSHQMKHSDIVVTVHDIDQYTNDNRQLDQRLNDLQGQQANKEADKQRLSQQIQQYKGKRHQLDNDVESLNYQLVKATEAFEKYTGQLNVLEERKKNQSETNARYEEEQENLIELLENISNEISEAQDTYKSLKSKQKELNAVIRELEEQLYVSDEAHDEKLEEIKNEYYTLMSEQSDVNNDIRFLKHTIEENEAKKSRLDSRLVEVFEQLKDIQGQIKTTKKEYQQTNKELSAVDKEIKNIEKDLTDTKKAQNEYEEKLYQAYRYTEKMKTRIDSLATQEEEYTYFFNGVKHILKAKNKELKGIHGAVAEIIDVPSKLTQAIETALGASLQHVIVDSEKDGRQAIQFLKERNLGRATFLPLNVIKSRVVATDIKSIAKEANGFISIASEAVKVAPEYQNIIGNLLGNTIIVDHLKHANELARAIKYRTRIVTLEGDIVNPGGSMTGGGARKSKSILSQKDELTTMRHQLEDYLRQTESFEQQFKELKIKSDQLSELYFEKSQKHNTLKEQVHHFEMELDRLTTQETQIKNDHEEFEFEKNDGYTSDKSRQTLSEKETHLESIKSSLKRLEDEIERYTKLSKEGKESVTKTQQTLHQKQSDLAVVKERIKTQQQTIDRLNNQSQQTKHQLNDVKEKIAFFNSDEVMGEQAFQNIKDQINGQQETRTRLSDELDKLKQQRIELNEQIDAQEATLQVCHQDILAIENHYQDIKAEQSKLDVLIHHAIDHLNDEYQLTVERAKSEYTSDESIDALRKKVKLMKMSIDELGPVNLNAIEQFEELNERYTFLSEQRTDLRKAKETLEQIISEMDQEVTERFKETFHAIQGHFTAVFKQLFGGGDAELQLTEADYLTAGIDIVVQPPGKKLQHLSLLSGGERALTAIALLFAILKVRSAPFVILDEVEAALDEANVIRYAKYLNELSDETQFIVITHRKGTMEFADRLYGVTMQESGVTKLVSVNLNTIDDVLKEEQ >NC_016928.2|WP_000007686.1|1235112_1236363_+|signal-recognition-particle-docking-protein-FtsY MSFFKRLKDKFATNKENEEVKSLTEEQGQDKLEDTHSEGSTQDVNDLAENAEVKKKPRKLSEADFDDDGLISIEDFEEIEAQKMGAKFKAGLEKSRQNFQEQLNNLIARYRKVDEDFFEALEEMLITADVGFNTVMTLTEELRMEAQRRNIQDTEDLREVIVEKIVEIYHQEDDNSEAMNLEDGRLNVILMVGVNGVGKTTTIGKLAYRYKMEGKKVMLAAGDTFRAGAIDQLKVWGERVGVDVISQSEGSDPAAVMYDAINAAKNKGVDILICDTAGRLQNKTNLMQELEKVKRVINRAVPDAPHEALLCLDATTGQNALSQARNFKEVTNVTGIVLTKLDGTAKGGIVLAIRNELHIPVKYVGLGEQLDDLQPFNPESYVYGLFADMIEQNEEITTVENDQIVTEEKDDNHGAK >NC_016928.2|WP_000531320.1|1236349_1236682_+|putative-DNA-binding-protein MGQNDLVKTLRMNYLFDFYQSLLTNKQRNYLELFYLEDYSLSEIADTFNVSRQAVYDNIRRTGDLVEDYEKKLELYQKFEQRREIYDEMKQHLSNPEQIQRYIQQLEDLE >NC_016928.2|WP_000863474.1|1236707_1238075_+|signal-recognition-particle-protein MAFEGLSERLQATMQKMRGKGKLTEADIKIMMREVRLALLEADVNFKVVKEFIKTVSERALGSDVMQSLTPGQQVIKIVQDELTKLMGGENTSINMSNKPPTVVMMVGLQGAGKTTTAGKLALLMRKKYNKKPMLVAADIYRPAAINQLQTVGKQIDIPVYSEGDQVKPQQIVTNALKHAKEEHLDFVIIDTAGRLHIDEALMNELKEVKDIAKPNEIMLVVDSMTGQDAVNVAESFDDQLDVTGVTLTKLDGDTRGGAALSIRSVTQKPIKFVGMSEKLDGLELFHPERMASRILGMGDVLSLIEKAQQDVDQEKAKDLEKKMRESSFTLDDFLEQLDQVKNLGPLDDIMKMIPGMNKMKGLDKLNMSEKQIDHIKAIIQSMTPAERNNPDTLNVSRKKRIAKGSGRSLQEVNRLMKQFNDMKKMMKQFTGGGKGKKGKRNQMQNMLKGMNLPF >NC_016928.2|WP_000268754.1|1238420_1238696_+|30S-ribosomal-protein-S16 MAVKIRLTRLGSKRNPFYRIVVADARSPRDGRIIEQIGTYNPTSANAPEIKVDEALALKWLNDGAKPTDTVHNILSKEGIMKKFDEQKKAK >NC_016928.2|WP_001261990.1|1238883_1239387_+|ribosome-maturation-factor-RimM MRVEVGQIVNTHGIKGEIKVKSNSDFTDVRFQPGQVLTVVHNNNDLEYTVKSHRVHKGLHMLTFEGINNINDIEHLKGSSIYQERDHEDIVLEENEYYYSDIIGCTVFDDQETPIGRVINIFETGANDVWVIKGSKEYLIPYIADVVKEVDVENKKIIITPMEGLLD >NC_016928.2|WP_000687320.1|1239386_1240124_+|tRNA-(guanosine(37)-N1)-methyltransferase-TrmD 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NC_016928_6 | 1438197-1438276 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_016928_6
|
1 spacers
spacers of NC_016928_6
>6.1|1438222|30|NC_016928|CRISPRCasFinder GCTTTCCGCAGCTACTATGTTGGGGACCCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_016928_6
The CRISPR arrays of NC_016928_6 >merge|NC_016928|6|1438197-1438276|CRISPRCasFinder CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGGCTTTCCGCAGCTACTATGTTGGGGACCCGCCAACTTGCACTTTATTGTAAGCTG >NC_016928|6|5|1438197-1438276|CRISPRCasFinder CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTG GCTTTCCGCAGCTACTATGTTGGGGACCCG CCAACTTGCACTTTATTGTAAGCTG
>NC_016928.2|WP_000192137.1|1437019_1437679_-|response-regulator-transcription-factor-ArlR MTQILIVEDEQNLARFLELELTHENYNVDTEYDGQDGLDKALSHYYDLIILDLMLPSINGLEICRKIRQQQSTPIIIITAKSDTYDKVAGLDYGADDYIVKPFDIEELLARIRAILRRQPQKDIIDVNGITIDKNAFKVTVNGAEIELTKTEYDLLYLLAENKNHVMQREQILNHVWGYNSEVETNVVDVYIRYLRNKLKPYDRDKMIETVRGVGYVIR >NC_016928.2|WP_000166795.1|1435667_1437023_-|sensor-histidine-kinase-ArlS MTKRKLRNNWIIVTTMITFVTIFLFCLIIIFFLKDTLHNSELDDAERSSSDINNLFHSKPVKDISALDLNASLGNFQEIIIYDEHNNKLFETSNDNTVRVEPGYEHRYFDRVIKKRYKGIDYLIIKEPITTQDFKGYSLLIHSLENYDNIVKSLYIIALAFGVIATIITATISYVFSTQITKPLVSLSNKMIEIRRDGFQNKLQLNTNYEEIDNLANTFNEMMSQIEESFNQQRQFVEDASHELRTPLQIIQGHLNLIQRWGKKDPAVLEESLNISIEEMNRIIKLVEELLELTKGDVNDISSEAQTVHINDEIRSRIHSLKQLHPDYQFDTDLTSKNLEIKMKPHQFEQLFLIFIDNAIKYDVKNKKIKVKTRLKNKQKIIEITDNGIGIPEEDQDFIFDRFYRVDKSRSRSQGGNGLGLSIAQKIIQLNGGSIKIKSEINKGTTFKIIF >NC_016928.2|WP_000180678.1|1432580_1435379_-|2-oxoglutarate-dehydrogenase-E1-component 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>NC_016928.2|WP_001115452.1|1431298_1432567_-|dihydrolipoyllysine-residue-succinyltransferase MPEVKVPELAESITEGTIAEWLKNVGDSVEKGEAILELETDKVNVEVVSEEAGVLSEQLASEGDTVEVGQAIAVIGEGSGNASKENSNDNTPQQNEETNNKKEETTNKSADKAEVNQTTDDNQQRVNATPSARRYARENGVNLAEVSPKTNDLVRKEDIDKKQQAPASTQTTQQAPAKEEKKYNQYPTKPVIREKMSRRKKTAAKKLLEVSNNTAMLTTFNEVDMTNVMELRKRKKDQFMKDHDGTKLGFMSFFTKASVAALKKYPEVNAEIDGDDMITKQYYDIGVAVSTDDGLLVPFVRDCDKKNFAEIEAEIANLAVKAREKKLGLDDMVNGSFTITNGGIFGSMMSTPIINGNQAAILGMHSIITRPIAIDQDTIENRPMMYIALSYDHRIIDGKEAVGFLKTIKELIENPEDLLLES >NC_016928.2|WP_000334509.1|1429909_1430719_-|hypothetical-protein MCGLRSITLGTTNIEQTKHFMVDILGLNCEELLENSIRFGDADISPGTRLQFIQVPSEQLEESHFVGIGLRTPTDSGLEEYAEILSSKEIPFTTTKELNGNKYFSFEDNNGHIFSIYSNENNYGVGLGMPSFESAVNPLHQVQGLGPVILKVNHVDITGQILTNIFGLEVFAEYQPFDNADYHVQVFKIGTGGLGGEIHLMPVETEMTMPEYGAVDQVEFETKDADFFNQAKSRLDEVEIPYQTLEQDDIESIRITENSGLSFIFTLQK >NC_016928.2|WP_000902174.1|1429677_1429881_-|hypothetical-protein MLHETWKERTPIKKVEVINTDAKKFTVSDMLTVGKQYDVINETEEYYQIIDNSGLIGGYYKTYFKEV >NC_016928.2|WP_001185421.1|1428705_1429497_-|MoxR-family-ATPase MALKHYKNSDSTVFNDAKALFDLNKNILLKGPTGSGKTKLAETLSEVVDTPMHQVNCSVDLDTESLLGFKTIKTNAEGQQEIVFVDGPVIKAMKEGHILYIDEINMAKPETLPVLNGVLDYRRQITNPYTGEVIKAVPGFNVIAAINEGYVGTLPMNEALKNRFVVIHVDYIDGDILKNVIKEQSLLQDDKQIEQIIKFNEDLRTMSKQGQISEEAASIRALLDLCDLITVMPVERAIKRTIIDKLEDEREQQAIYNAVELNF >NC_016928.2|WP_001283670.1|1426805_1428692_-|nitric-oxide-reductase-activation-protein-NorD MSDRFIKFNDEQLDAKQVMMLQDLARLLLKNEQTQVKIQKFPYYNPVQNVLITSWFWSHRPSHIEMAGLKTDVMLAAYGYHMMDVQIVNEVVQDKTFKHPKFYQQLFKLLEDMRVLNSIKVERPSTAKLIDLRLDTRISYTESQIKVYRTKTQYTDLLFLYLEHAFLSQDFFDIPSIHSDLDDILVNMFLYLPNFFQNQNSEDNMYLAQRIMYQVDDILKEDMLNEYYYLPKTLYNTLASPEFEDLKRTDASQVDGQDDTSEDDDNQSEKADSKSADSESKGGAYLEMELHEGQNSETLGNDEAREGDATDDMTDMMTKKGKGSNDTLNREEGDAVGQSQAFQLDGVNKNVEIKWQIPEIEPQYVLEYQESKQDVQYEIKDLIQIIKKTIEREQRDARFNLTKGRLQKDLINWFIDDQYKLFYKKQDLSKSFDATFTLLIDASASMHDKMAETKKGVVLFHETLKALNIKHEILSFSEDAFDSDEHAQPNIINEIINYDYSTFEKDGPRIMALEPQDDNRDGVAIRVASERLMRRNQHQRFLIVFSDGEPSAFNYSQDGIIDTYEAVEMSRKFGIEVFNVFLSQDPITEDVEQTIHNIYGQYAIFVEGVAHLPGHLSPLLKKLLLKSL >NC_016928.2|WP_001039275.1|1425237_1426581_-|branched-chain-amino-acid-transport-system-II-carrier-protein 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>NC_016928.2|WP_000913315.1|1443857_1444286_-|peptide-methionine-(R)-S-oxide-reductase-MsrB MLKKDKSELTDIEYIVTQENGTEPPFMNEYWNHFAKGIYVDKISGKPLFTSEEKFHSECGWPSFSKALDDDEIIELVDKSFGMLRTEVRSEESNSHLGHVFNDGPKESGGLRYCINSAAIQFIPYEKLEELGYGDLISHFDK >NC_016928.2|WP_000159902.1|1444278_1444812_-|peptide-methionine-(S)-S-oxide-reductase-MsrA MTKEYATLAGGCFWCMVKPFTSYPGIKSVVSGYSGGHVDNPTYEQVCTNQTGHVEAVQITFDPEVTSFENILDIYFKTFDPTDDQGQFFDRGESYQPVIFYHDEHQKKAAEFKKQQLNEQGIFKKPVITPIKPYKNFYPAEDYHQDYYKKNPVHYYQYQRGSGRKAFIESHWGNQNA >NC_016928.2|WP_000166052.1|1444901_1445741_-|fatty-acid-kinase-FakB2 MTKQIIVTDSTSDLSKEYLEANNIHVIPLSLTIEGASYVDQVDITSEEFINHIENDEDVKTSQPAIGEFISAYEELGKDGAEIISIHLSSGLSGTFNTAYQASQMVDANVTVIDSKSISFGLGYQIQHLVELVKEGVSTSEIVNKLNHLRENIKLFVVIGQLNQLIKGGRISKTKGLIGNLMKIKPIGTLDDGRLELVHNARTQNSSIQYLKKEIAEFIGDHEIKSVGVAHANVIEYVDKLKKVFNEAFHVNNYDINVTTPVISAHTGQGAIGLVVLKK >NC_016928.2|WP_000175746.1|1445755_1446235_-|dihydrofolate-reductase 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NC_016928_7 | 1985029-1985110 | Orphan |
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Consensus repeat of NC_016928_7
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CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_016928_7
The CRISPR arrays of NC_016928_7 >merge|NC_016928|7|1985029-1985110|CRISPRCasFinder TGTTGGGGCCCCGCCAACCTGCATTACCTGTAGAATTTCTTTTTTCGAAATTCTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCATT >NC_016928|7|6|1985029-1985110|CRISPRCasFinder TGTTGGGGCCCCGCCAACCTGCATT ACCTGTAGAATTTCTTTTTTCGAAATTCTCTA TGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCATT
>NC_016928.2|WP_000636142.1|1984087_1984846_-|type-I-methionyl-aminopeptidase MIVKTEEELQALKEIGYICAKVRNTMQAATKPGITTKELDNIAKELFEEYGAISAPIHDENFPGQTCISVNEEVAHGIPSKRVIREGDLVNIDVSALKNGYYADTGISFVVGESDDPMKQKVCDVATMAFENAIAKVKPGTKLSNIGKAVHNTARQNDLKVIKNLTGHGVGLSLHEAPAHVLNYFDPKDKTLLTEGMVLAIEPFISSNASFVTEGKNEWAFETSDKSFVAQIEHTVIVTKDGPILTTKIEEE >NC_016928.2|WP_001110179.1|1983484_1983871_-|hypothetical-protein MNYVERYIEQFLRATVRNNIKHYLLMLDEKMKNLDDYMRYLITKKEQLSKLIDSLMLTLENKYIDIAEAFQIQCAREINNQEIENIKSELNKVEAYYAQIETQIQQTSTEKIATEKTSYLINYMNAVA >NC_016928.2|WP_000149064.1|1982768_1983470_-|cell-wall-active-antibiotics-response-protein MTHKYISTQMLIIFTALMIIANFYYIFFEKIGFLLVLLLGCVLVYVGYLYFHKIRGLLAFWIGALLIAFTLLSNKYTIIILFVFLLLLIVRYLIHKFKPKKVVATDEVMTSPSFIKQKWFGEQRTPVYVYKWEDVQIQHGIGDLHIDLTKAANIKENNTIVVRHILGKVQVILPVNYNINLHVAAFYGSTYVNEKSYKVENNNIHIEEMMKPDNYTVNIYVSTFIGDVEVIYR >NC_016928.2|WP_001017131.1|1981728_1982772_-|sensor-histidine-kinase MNHYIRTIGSMLILVYSMLAAFLFIDKVFVNIIYFQGMFYTQIFGIPVFLFLNLIIILLCIIVGSVLAYKINQQNDWIKTQIERSMEGETVGINDQNIEIYSETLDLYHTLVPLNQELHKLRLKTQNLTNENYNINDVKVKKIIEDERQRLARELHDSVSQQLFAASMMLSAIKETKLEPPLDQQIPILEKMVQDSQLEMRALLLHLRPLGLKDKSLGEGIKDLVIDLQKKVPMKVVHEIQDFKVPKGIEDHLFRITQEAISNTLRHSNGTKVTVELFNKDDYLLLRIQDNGKGFNVDEKLEQSYGLKNMRERALEIGATFHIVSLPDSGTRIEVKAPLNKEDSYDD >NC_016928.2|WP_000153526.1|1981109_1981739_-|response-regulator-transcription-factor MTIKVLFVDDHEMVRIGISSYLSTQRDIEVVGEGASGKEAIAKAHELKPDLILMDLLMEDMDGVEATTQIKKDLPQIKVLMLTSFIEDKEVYRALDAGVDSYILKTTSAKDIADAVRKTSRGESVFEPEVLVKMRNRMKKRAELYEMLTEREMEILLLIAKGYSNQEIASASHITIKTVKTHVSNILSKLEVQDRTQAVIYAFQHNLIQ >NC_016928.2|WP_000037087.1|1979779_1980997_+|YihY/virulence-factor-BrkB-family-protein MSKKDHSSSKYLNSVKEAQEESKKKNKSNPKIDVDRTYIEPQQFQSKKPKKEDQVFFLSRLNKPAKYKKDSNFLSYLIYRIGKDDASGLAAQMTYHFVLAMFPMLLFLLTLLPFFNIKQSQITNMLSNAPAETSTLIKSVIGDITQNSSGGLLSIGLILAIWSASNGMTAIMNSFNVAYDVEDSRNGIVLKLLSVVFTVVMGVVFVVALALPTLGSVISHFLFGPLGFDEQVKWIFNLIRIVLPIIIIFIVFIVLYSVAPNVKTKLKSVLPGAVFTSIIWLAGSFGFGWYISNFGNYSKTYGSIAGIIILLLWLYITSFIIIVGAEINAIIHQRSVIKGKTPEEAALEHDDNNKNHYNENTRYEYAEDTNATHQRTYHVDEHPSDTYPEDDKNIKDKIVDKLKKD >NC_016928.2|WP_000428172.1|1979226_1979502_+|hypothetical-protein MENKFVPGILIGAVIGGAISLADKSTRQALVQSVKDAKNGNRTRKPSKVSKIKDEVLYWKDVVEEIRRNNPELERSLKDAKETFVNRKNQR >NC_016928.2|WP_000228666.1|1978755_1979220_+|low-molecular-weight-phosphotyrosine-protein-phosphatase MVDVAFVCLGNICRSPMAEAIMRQRLKDRNIHDIKVHSRGTGSWNLGEPPHEGTQKILNKHNIPFDGMISELFEATDDFDYIVAMDQSNVDNIKSINPNLKGQLFKLLEFSNMEESDVPDPYYTNNFEGVYDMVLSSCDNLIDYIVKDANLKEG >NC_016928.2|WP_000180460.1|1978408_1978609_-|DUF1128-family-protein MTNEEKVLAIREKLNIVNQGLLDPEKYKNANEEELTDIYDFVQSRERLSPSEVTAIADALGQLRHD >NC_016928.2|WP_078065149.1|1977149_1978406_-|aminopeptidase MGILTNYKEKLQQYAELLVKVGMNVQPKQPVFIRSSVETLELTHLIVEEAYHCGASDVRVVYSDPTLKRLKFENESVEHFANHEIKSYDVEARMDYVKRGAANLALISEDPDLMDGIDSQKLQAFQQQNARAFKGYMESVQKNQFPWVVAAFPSKAWAKRVYPELSVEEAYIKFIDEVFDIVRIDGNDPVENWRQHIANLSVYAQKLQQKNYHALHYVSEGTDLTVGLAKNHIWEDATSYVNGKEQAFIANIPTEEVFTAPDRNRVDGYVTNKLPLSYNGTIIDQFKLMFKDGEIIDFSAEKGEAVLKDLINTDEGSRRLGEVALVPDDSPISNRNTIFYNTLFDENAACHLAIGSAYAFNIEGGTEMTVEEKIASGLNDSNVHVDFMIGSSDLTIYGIFEDGSKELVFENGNWASTF >NC_016928.2|WP_000999708.1|1985374_1986361_+|aromatic-acid-exporter-family-protein MNDQWYKHLIGARTIKTGIAIFLTAVFCMALDLTPIYAILTAVVTIEPTAKASLIKGYRRLPATVIGAGFAVLFTYLFGDQSPFTYALSATFTILFCTKLKLQVGTNVAVLTSLAMIPGIHDAYIFNFLSRTLTAIIGLVTSGLINFMVFPPKYYGQVEEKLSKTDALMYKLFYDRCQELILSRLQSDKSEKAYKNIFNLNNQVETLISYQRDELSYHKKKECDWKLLNQLTKRAYTNRLFITHLSNIIYLPKNTRVNFSGDEKMALLKISSSIKDIFYDGSFKREDDSVETLRSTIKAHEISGENQIKSHILYEVLMIYRLLDSRYA >NC_016928.2|WP_025174552.1|1986793_1987207_-|hypothetical-protein MKPTKVILRDASYVHSKTSITFILKDVVIEEDNKIYYFDTSATFEDQEIKFEFALFDSDMDNLKHMEYDNPVTEIYFIEPDLHFTIIDFNQELLCIYIDFDSGLRHSNMATESGISLRINVTKSDFNKFINELASLH >NC_016928.2|WP_001790257.1|1987235_1987346_-|hypothetical-protein MDGNNQIDVCFFVLVNNYYTMSIYPRIINSNGDYAT >NC_016928.2|WP_000544973.1|1987431_1988163_-|type-1-glutamine-amidotransferase MHELTIYHFMSDKLNLYSDIGNIIALRQRAKKRNIKVNVVEINETEGITFDECDIFFIGGGSDREQALATKELSKIKTPLKEAIEDGMPGLTICGGYQFLGKKYITPDGTELEGLGILDFYTESKTNRLTGDIVIESDTFGTIVGFENHGGRTYHNFGTLGHVTFGYGNNDEDKKEGIHYKNLLGTYLHGPILPKNYEITDYLLEKACERKGIPFEPKEIDNEAEKQAKQVLIDRANRQKKSR >NC_016928.2|WP_001250333.1|1988164_1989478_-|Mur-ligase-family-protein MRQWTAIHLAKLARKASRAVGKRGTDLPGQIARKVDTDILRKLAEQVDDIVFISGTNGKTTTSNLIGHTLKANNIQIIHNNEGANMAAGITSAFIMQSTPKTKIAVIEIDEGSIPRVLKEVTPSMMVFTNFFRDQMDRFGEIDIMVNNIAETISNKGIKLLLNADDPFVSRLKIASDTIVYYGMKAHAHEFEQSTMNESRYCPNCGRLLQYDYIHYNQIGHYHCQCGFKREQAKYEISSFDVAPFLHLNINDEKYDMKIAGDFNAYNALAAYTVLRELGLNEQAIKNGFETYTSDNGRMQYFKKERKEAMINLAKNPAGMNASLSVGEQLEGEKVYVISLNDNAADGRDTSWIYDADFEKLSKQQIEAIIVTGTRAEELQLRLKLAEVEVPIIVERDIYKATAKTMDYKGFTVAIPNYTSLAPMLEQLNRSFEGGQS >NC_016928.2|WP_000949467.1|1989769_1990270_+|H-type-ferritin-FtnA MLSKNLLEALNDQMNHEYFAAHAYMAMAAYCDKESYEGFANFFIQQAKEERFHGQKIYNYINDRGAHAEFRAVSAPKIDFSSILETFKDSLSQEQEVTRRFYNLSEIARQDKDYATISFLNWFLDEQVEEESMFETHINYLTRIGDDSNALYLYEKELGARTFDEE >NC_016928.2|WP_001790679.1|1990351_1990444_-|hypothetical-protein MTKNTIISLENEKTQINDSENESSDLRKAK >NC_016928.2|WP_000613738.1|1990660_1991215_+|3'-5'-exonuclease MIQDAFVALDFETANGKRTSICSVGMVKVIDSQITETFHTLVNPQDYFSQQNIKVHGIQPEDVENAPTFDYVFPYMMQFIADLPVVAHNAAFDMNVLHQSIQNIGLPTPNLTYFCSYQLAKRTVDSYRYGLKHMMEFYQLDFHGHHDALNDAKACAMITFRLLKNYENLTYVTNIYGKNLKDKG >NC_016928.2|WP_000140176.1|1991281_1992352_-|DNA-polymerase-IV MTERRIIHIDMDYFFAQVEMRDNPKLKGKPVIVGGKASSRGVVSTASYEARKYGVHSAMPMSQAHKLCPNGYFVTSNFGAYRETSAQIMSIFRSYTDKVEPMSLDEAYLDITELVRPDLPASKIAQYIRKDILEQTHLTASAGVSYNKFLAKLASGMNKPDGMTVIDYQNVHDILMTLDIGDFPGVGKASKKVMHDNGIFNGRDLYEKTEFELIRLFGKRGRGLYNKARGIDHSEVKSSRVRKSVGTERTFATDVNDDEEILRKVWELSGKTAERLNKLQKSAKTVTVKIKTYQFETLSKQMSLRDSVSSEEDIYNIAYLLYNDLKDPDVPIRLIGVTVGNLEQSTYKNMTIYDFI >NC_016928.2|WP_000548782.1|1992598_1993129_-|DUF3267-domain-containing-protein MHKIDLTTNNFQMRRFIILQLVIALFVILFTYKWALGVTAVVDQNIIINLVYGFAGFIILLILHELIHRALFLLFKKDSKPMFNIKKDRILFQTADAYFNKWQFSIIMLSPLILLSTGLLILIKVFGYSSLIFMFSMHTAYCFIDILLVALTISSSFKYVQQDEDSIYLYHQKPTQ |
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NC_016928_8 | 2044800-2044885 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_016928_8
|
1 spacers
spacers of NC_016928_8
>8.1|2044829|28|NC_016928|CRISPRCasFinder TTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_016928_8
The CRISPR arrays of NC_016928_8 >merge|NC_016928|8|2044800-2044885|CRISPRCasFinder TGTTGAGGCCCCACCCCAACTTACATTGTTTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTATGTTGGGGCCCCACCCCAACTTACATTGT >NC_016928|8|7|2044800-2044885|CRISPRCasFinder TGTTGAGGCCCCACCCCAACTTACATTGT TTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTA TGTTGGGGCCCCACCCCAACTTACATTGT
>NC_016928.2|WP_000206634.1|2043361_2044585_+|ArgE/DapE-family-deacylase MTTFSEKEKIQLLADIVELQTENNNEIDVCNYLKDLFDKYDIKSEILKVNEHRANIVAEIGNGSPILALSGHMDVVDAGNQDNWTYPPFQLTEKNGKLYGRGTTDMKGGLMALVITLIELKEQNQLPQGTIRLLATAGEEKEQEGAKLLADKGYLEDVDGLIIAEPTGSGIYYAHKGSMSCKVTATGKAVHSSVPFIGDNAIDTLLEFYNQFKEKYSELKKHDTKHELDVAPMFKSLIGKEISEEDANYASGLTAVCSIINGGKQFNSVPDEASLEFNVRPVPEYDNDFIESFFQNIINNVDSNKLSLDIPSNHRPVTSDKNNKLITTIKDVASSYVDKDDIFVSALVGATDASSFLGDNKDNVDLAIFGPGNPLMAHQIDEYIEKDMYLKYIDIFKEASIQYLKEK >NC_016928.2|WP_000791403.1|2041870_2042926_-|bi-component-leukocidin-LukGH-subunit-H MKNKKRVLIASSLSCAILLLSAATTQANSAHKDSQDQNKKEHVDKSQQKDKRNVTNKDKNSPVPDDIGKNGKITKRTETVYDEKTNILQNLQFDFIDDPTYDKNVLLVKKQGSIHSNLKFESHKEEKNSNWLKYPSEYHVDFQVKRNRKTEILDQLPKNKISTAKVDSTFSYSSGGKFDSTKGIGRTSSNSYSKTISYNQQNYDTIASGKNNNWHVHWSVIANDLKYGGEVKNRNDELLFYRNTRIATVENPELSFASKYRYPALVRSGFNPEFLTYLSNEKSNEKTQFEVTYTRNQDILKNRPGIHYAPPILEKNKDGQRLIVTYEVDWKNKTVKVVDKYSDDNKPYKEG >NC_016928.2|WP_000595398.1|2040832_2041849_-|bi-component-leukocidin-LukGH-subunit-G MIKQLYKNITICSLAISTVLTVFPATSYAKINSEIKAVSEKNLDGDTKMYTRTATTSDSQKNITQSLQFNFLTEPNYDKETVFIKAKGTIGSGLRILDPNGYWNSTLRWPGSYSVSIQNVDDNNNTNVTDFAPKNQDESREVKYTYGYKTGGDFSINRGGLTGNITKESNYSETISYQQPSYRTLLDQSTSHKGVGWKVEAHLINNMGHDHTRQLTNDSDNRTKSEIFSLTRNGNLWAKDNFTPKDKMPVTVSEGFNPEFLAVMSHDKKDEGKSKFVVHYKRSMDEFKIDWNRHGFWGYWSGENHVDKKEEKLSALYEVDWKTHDVKFVKVLNDNEKK >NC_016928.2|WP_000239607.1|2039347_2040340_+|sphingomyelin-phosphodiesterase MVKKTKSNSLKKVATLALANLLLVGALTDNSAKAESKKDDTDLKLVSHNVYMLSTVLYPNWGQYKRADLIGQSSYIKNNDVVIFNEAFDNGASDKLLSNVKKEYPYQTPVLGRSQSGWDKTEGSYSSTVAEDGGVAIVSKYPIKEKIQHVFKSGCGFDNDSNKGFVYTKIEKNGKNVHVIGTHTQSEDSRCGAGHDRKIRAEQMKEISDFVKKKNIPKDETVYIGGDLNVNKGTPEFKDMLKNLNVNDVLYAGHNSTWDPQSNSIAKYNYPNGKPEHLDYIFTDKDHKQPKQLVNEVVTEKPKPWDVYAFPYYYVYNDFSDHYPIKAYSK >NC_016928.2|WP_001068527.1|2035656_2036943_+|aminotransferase-class-I/II-fold-pyridoxal-phosphate-dependent-enzyme MNPLAQSLNEQLQQSNATAFAMLSDLGQNMFYPKGILSQSAEAKSTTYNATIGMATNKDGKMFASSLDAMFNDLTPDEIFPYAPPQGIEELRDLWQQKMLRDNPELSIDNMSRPIVTNALTHGLSLVGDLFVNQDDTILLPEHNWGNYKLVFNTRNGANLQTYPIFDKDGHYTTDSLVEALQSYNKDKVIMILNYPNNPTGYTPTHEEVTTIVNAIKALADKGTKVIAVVDDAYYGLFYEDVYTQSLFTALSNLNSNAILPVRLDGATKEFFAWGFRVGFMTFGTSDQTTKEVLEAKVKGLIRSNISSGPLPTQSAVKHVLKNNKQFDKEIEQNIQTLKERYEVTKEVVYADQYHSHWQAYDFNSGYFMAIKVHDVDPEELRKHLIEKYSIGVIALNATDIRIAFSCVEKEDIPHVFDSIAKAIDDLR >NC_016928.2|WP_000990056.1|2035358_2035457_-|hypothetical-protein MMWWQEGMMTLITGGLLIIFRLWLELKWKNKK >NC_016928.2|WP_000681969.1|2034940_2035117_-|hypothetical-protein MKHLTKIFVVLAIILFIVGYYLQATNHESQGIKLLLAAIMFMICAFISRSNDRRKNNK >NC_016928.2|WP_000691584.1|2034019_2034400_-|GntR-family-transcriptional-regulator MKIILKNNSDFPIYEQIKQQVKQNILKGHVAPGEHLPSMRELAKDLQVSLITTKRAYEDLEKDGFVTTIRGKGTFVKEQDSSILKEKQFFTIENLVKELVNEAQAIEMSLEELQDILTFIYEEESS >NC_016928.2|WP_000991298.1|2033126_2034023_-|phenol-soluble-modulin-export-ABC-transporter-ATP-binding-protein-PmtA MNAIELSNVNYSSDQFNLKNISFKVPQGFVTGFIGRNGAGKTTIIRLIMDLYQPQTGVIRVLEEDMALNPIELKNRIGFVYAENYFNERWTTKQLEKMIAPFYRKWDHQVFEFYLEKFDLPINKSIKTFSTGMKMKLSLAVAFSHHAELYIFDEPTSGLDPLARNELLEIIQQELIDENKTIFMSTHIISDLEKIADYIIHLSDGEVILNGSKEQLLQRYQVVSGAIEDLDDELASLLIFEEHKRTGFIGLTEHAQVFKEILGHKVNITTPSIENLMVYLEKRKPKYHENIKLMEEGF >NC_016928.2|WP_000645729.1|2032445_2033126_-|phenol-soluble-modulin-export-ABC-transporter-permease-subunit-PmtB MKALLIRNFKLRRYTLIIYVLLLTLYPFYIMLDSTKFFYLLQSFISPTILIIWILDAGHLFRLNRRLGGNDSYYFYMSLPVSKKQLLNANYITCIVLTLIGTLVISLYAYEADVIEPNSIYFSTAYAFVISNFLSIPIAFSQFTELRRVKVPYGIYVFTIIILVPFLFSIAIVLVNYFVLSQSSFPDLYSYVLNIGFLIISIVILIVNYFKQLNKINTRKFKGGSR >NC_016928.2|WP_001045084.1|2045025_2046333_+|TrkH-family-potassium-uptake-protein MNKVHKPLYFYLMLFFSTTIIGALLLYLPFTGKKPISFLDALFIASSAFTVTGLSPVDIGSQFNILGEIVILLLIQIGGLGIVTVTLLTLVFLNRKISMKNRFLIMVTWNIDEPGGVIKLIKHLAIYSLVTELIGMICLCLSFIPKFGIGKGLFLSLFTSVSAFNNAGFALFKNNLIDYSSDPIVIITTSILIIFGGIGHFVVIDFINCKKLSKLSLHSKLVLTTTSILIIIGAITFFLLEQFNTMQNMGLVEKIGNSFFQSVTTRTAGFNSIDIAIINKSTALMLMLLMFIGGAPLSAAGGIKITTFAVAFIFVLNYIRKENNVSVFNKEISDKHIKLSIVTINISFLFISIITFILSIINPNISLIKLLFEVVSAFGTVGLSMNLTTEYHGITKIIIIFVMLCGKVGLLTLLRTFIPPKSPKNYRYTKGQIYL >NC_016928.2|WP_000240638.1|2046873_2048490_-|chaperonin-GroEL MVKQLKFSEDARQAMLRGVDQLANAVKVTIGPKGRNVVLDKEFTAPLITNDGVTIAKEIELEDPYENMGAKLVQEVANKTNEIAGDGTTTATVLAQAMIQEGLKNVTSGANPVGLRQGIDKAVKVAVEALHENSQKVENKNEIAQVGAISAADEEIGRYISEAMEKVGNDGVITIEESNGLNTELEVVEGMQFDRGYQSPYMVTDSDKMVAELERPYILVTDKKISSFQDILPLLEQVVQSNRPILIVADEVEGDALTNIVLNRMRGTFTAVAVKAPGFGDRRKAMLEDLAILTGAQVITDDLGLDLKDASIDMLGTASKVEVTKDNTTVVDGDGDENSIDARVSQLKSQIEETESDFDREKLQERLAKLAGGVAVIKVGAASETELKERKLRIEDALNSTRAAVEEGIVAGGGTALVNIYQKVSEIEAEGDIETGVNIVLKALTAPVRQIAENAGLEGSVIVERLKNAEPGVGFNAATNEWVNMLEAGIVDPTKVTRSALQHAASVAAMFLTTEAVVASIPEKNNDQPNMGGMPGMM >NC_016928.2|WP_000917289.1|2048565_2048850_-|co-chaperone-GroES MLKPIGNRVIIEKKEQEQTTKSGIVLTDSAKEKSNEGVIVAVGTGRLLNDGTRVTPEVKEGDRVVFQQYAGTEVKRDNETYLVLNEEDILAVIE >NC_016928.2|WP_000197629.1|2049024_2049768_+|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease 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>NC_016928.2|WP_000867953.1|2052175_2052961_+|carbon-nitrogen-family-hydrolase MKVQIYQLPIIFGDSSKNETQITQWFEKNMNDEVDVVVLPEMWNNGYDLEHLNEKADNNLGQSFSFIKHLAEKYKVDIVAGSVSNIRNNQIFNTAFSVNKSGQLINEYDKVHLVPMLREHEFLTAGENVAEPFQLSDGTYVTQLICYDLRFPELLRYPARSGAKIAFYVAQWPMSRLQHWHSLLKARAIENNMFVIGTNSTGFDGNTEYAGHSIVINPNGDLVGELNESADILTVDLNLNEVEQQRENIPVFKSIKLDLYK >NC_016928.2|WP_001823225.1|2053559_2053694_-|delta-lysin-family-phenol-soluble-modulin MSCLILRIFILIKEGVISMAQDIISTISDLVKWIIDTVNKFTKK >NC_016928.2|WP_001105712.1|2053929_2054499_+|accessory-gene-regulator-AgrB MNYFDNKIDQFATYLQKRNNLDHIQFLQVRLGMQVLAKNIGKLIVMYTLAYILNIFLFTLITNLTFYLIRRHAHGAHAPSSFWCYVESILLFILLPLVILNFHINPLIMIILTVISLGVISVYAPAATKKKPIPVRLIKRKKYYAIIVSLTFFIITLIIKEPFAQFIQLGIIIEAITLLPIFFIKEDLK >NC_016928.2|WP_001093929.1|2054495_2054636_+|cyclic-lactone-autoinducer-peptide MNTLFNLFFDFITGILKNIGNIAAYSTCDFIMDEVEVPKELTQLHE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_016928_9 | 2292382-2292466 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_016928_9
|
1 spacers
spacers of NC_016928_9
>9.1|2292412|25|NC_016928|CRISPRCasFinder TGTCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_016928_9
The CRISPR arrays of NC_016928_9 >merge|NC_016928|9|2292382-2292466|CRISPRCasFinder CCAACTTGCACATTATTGTATGCTGACTTTTGTCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTT >NC_016928|9|8|2292382-2292466|CRISPRCasFinder CCAACTTGCACATTATTGTATGCTGACTTT TGTCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCG CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTT
>NC_016928.2|WP_031844964.1|2292132_2292303_+|hypothetical-protein MFRFISFGQLVVYSTTFIPKKDILQLNDMECDINVKEPLKIYYVVILKSGIEMIFS >NC_016928.2|WP_000066900.1|2291656_2292007_-|HTH-type-transcriptional-regulator-SarV MSNKVQRFIEAERELSQLKHWLKTTHKISIEEFVVLFKVYEAEKISGKELRDTLHFEMLWDTSKIDVIIRKIYKKELISKLRSETDERQVFYFYSTSQKKLLDKITKEIEVLSVTN >NC_016928.2|WP_000184418.1|2290343_2291555_+|MFS-transporter MTNQGSLNKSPIFTKSFTINFFVNFIVYLCMYLLLVVIAGYSKQAFDASDSLAGLVVGLFIVGSLIGRFATGKFVNQIGPKRLLFIGLIALIITQLLYFIDRSLAFLIFVRLINGIATAVVTTATGTIAAYVTPVNRKSEGISLFSLSLVLGTAIGPFLGMLLITKYAINLLFIICVILGILGLIISLFIKVDFEVTNNKTETNVIDKPRFSIHQFIAKEAIPVAVIMLLIGVTYASILTYLQAFALERHLVTAASYFFICYAIASLITRPIAGRLMDDKNENIIVYPAFIMLFLSFVCLISSYQSWLILLAGACLGLGYGNLSSAMQSIAIKVSPPIKYGIATSTFYVGLDAGVGFGPSFLGLFTHMFSYSEIFGFMAALAIITMLVYFLIHGRHVTRNAMN >NC_016928.2|WP_000951066.1|2289910_2290351_+|winged-helix-DNA-binding-protein MLSQEFFNSFITIYRPYLKLAEPILEKHNIYYGQWLILRDIAKYQPTTLIEISHRRAIEKPTARKTLKALIENDLITVENSLEDKRQKFLTLTPKGHELYEIVCLDVQKLQQAVVAKTNISQDQMQETINVMNQIHEILLKEAHND >NC_016928.2|WP_000600972.1|2288983_2289748_-|VOC-family-protein MILKFDHIIHYIDQLDRFSFPGDVIKLHSGGYHHKYGTFNKLGYINENYIELLDVENNEKLKKMAKTIEGGVAFATQIVQEKYEQGFKNICLRTNDIETVKNKLQSEQVEVVGPIQMERDTHKDGKAKWQLLYIMNQDDDEIKPPFFIQWEESDSMRTKKLQKYFQKQFSIETVIVKSKNRSQTVSNWLKWFDMDIVEENDHYTDLILKNDDIYFRIEDGKVSKYHSVIIKDAQATSPYSIFIRGAIYRFEPLV >NC_016928.2|WP_031844963.1|2288740_2288992_+|hypothetical-protein MRTIILSLFIIMNIVAIIMTLSQPLTVNYFSLRVILIFFTFILSIFFILIKSSRLNNTLTILSIVLAIIHMGILAHSTYVYLY >NC_016928.2|WP_000413855.1|2287086_2288352_-|lipid-II:glycine-glycyltransferase-FemX MEKMHITNQEHDAFVKSHPNGDLLQLTKWAETKKLTGWYARRIAVGRDGEIQGVAQLLFKKVPKLPYTLCYISRGFVVDYSNKEALNALLDSAKEIAKAEKAYAIKIDPDVEVDKGTDALQNLKALGFKHKGFKEGLSKDYIQPRMTMITPIDKNDDELLNSFERRNRSKVRLALKRGTTVERSDREGLKTFAELMKITGERDGFLTRDISYFENIYDALHEDGDAELFLVKLDPKENIAKVNQELNELHAEIAKWQQKMETSEKQAKKAQNMINDAQNKIAKNEDLKRDLEALEKEHPEGIYLSGALLMFAGSKSYYLYGASSNEFRDFLPNHHMQYTMMKYAREHGATTYDFGGTDNDPDKDSEHYGLWAFKKVWGTYLSEKIGEFDYVLNQPLYQLIEQVKPRLTKAKIKISRKLKRK >NC_016928.2|WP_000592328.1|2283802_2286970_-|efflux-RND-transporter-permease-subunit MIKKLLQFSLGNKFAIFLMVVLVVLGGVYASAKLKLELLPNVQNPVISVTTTMPGATPQSTQDEISSKIDNQVRSLAYVKNVKTQSVQNASIVTVEYENNTDMDKAEEQLKKEIDKIKFKDEVGQPELRRNSMDAFPVLAYSFSNKENDLKKVTKVLNEQLMPKLQTVDGVQNAQLNGQTNREITLKFKQNELEKYGLTADDVENYLKTATRTTPLGLFQFGDKDKSIVVDGQYQSVDAFKNINIPLTLAGGQGQSQSQSDNKQNSAMSDVNQASPQQNSKASASNNISGMPTAKLGDLADITVGDVRTSISKTNGKDAVNLQITKAQDANTVQVAKDVQRKIDTFVDENKDFNVTKTMDTAKPVEKSLYTMVEKASLGTIVAIIVILLFLRNIRTTAISIISIPLSLLMALIALKLSDVSLNILTLGALTVAIGRVIDDSIVVVENIYRRLTDSEEQLKGGNLIISATTEVFKPIMSSTLVTIIVFLPLVFVSGSVGEMFRPFALAIAFSLLASLLVSITLVPALAATLFKKGVKRRNKQYQEGLGVVSTTYKKALHWSLNHKWIVIILSTLILVATIVFGGPRLGTSFISAGDDKFLAITYTPKPGETEQAVLNHAKDVEKYLKQKKHVKTIQYSVGGSSPVDPTGSTNSMAIMVEYDNDTPNFDVEADKVIKHADGFKHPGEWKNQDLGTGAGNKSVEVTVKGPSMDAIKSTVKDIEQKMKQVKGLANVKSDLSQTYDQYEIKVDQNKAAENGISASQLAMHLNENLPEKTVTTVKENGKTVDVKVKQNKQTDWSEDKLNNITLKKPTGGTIKLGDIATLVKTTTPSKLTQEQGDYATMVSAKVTNKDVGGTTRQVMSKINNLDKPNNVKVNIGGASDDINNAMTQLAFAMLAAIIIVYLILVITFKGGLAPFTILFSLPFTVIGVIIALLITGETISVPSLIGMLMLIGIVVTNAIVLIDRVINNEQQGMEMKEALIEAGGTRIRPILMTAIATIGALVPLLFGQDSSILISKGLAATVIGGLISSTLLTLVVVPVIYEILFTLKKRFTKR >NC_016928.2|WP_001161085.1|2283298_2283616_+|hypothetical-protein MQFYLILLAILYLIVSFISIFKMEVVFTRILRIIMGVLLLFVLALTTMSFPKENWWVFIVLLLLVGNVEVTGFKMLKKDLKGVNILNLMSLFIFVIYFILTIVLF >NC_016928.2|WP_000051210.1|2282889_2283054_+|hypothetical-protein MSLENQLAELKYDYVRLQGDLEKRESLNLDTSALVRQLKDIENEIRNVRAQMQD >NC_016928.2|WP_001824308.1|2292643_2293666_-|GTP-3',8-cyclase-MoaA MVEQIKDKLGRPIRDLRLSVTDRCNFRCDYCMPKEVFGDDFVFLPKNELLTFDEMARIAKVYAELGVKKIRITGGEPLMRRDLNVLIAKLNQIDGIEDIGLTTNGLLLKKHGQKLYDAGLRRINVSLDAIDDTLFQSINNRNIKATTILEQIDYATSIGLNVKVNVVIQKGINDDQIIPMLEYFKDKHIEIRFIEFMDVGNDNGWDFSKVVTKDEMLTMIEEHFEIDPVEPKYFGEVAKYYRHKDNGVQFGLITSVSQSFCSTCTRARLSSDGKFYGCLFATVDGFNVKAFIRSGVTDEELKEQFKALWQIRDDRYSDERTAQTVANRQRKKINMNYIGG >NC_016928.2|WP_000643988.1|2293685_2294285_-|molybdenum-cofactor-guanylyltransferase-MobA MKAIILAGGHSVRFGKPKAFAEVNGETFYSRVIKTLESTNMFNEIIISTNAQLATQFKYPNVVIDDENHNDKGPLAGIYTIMKQHPEEELFFVVSVDTPMITGKAVSTLYQFLVSHLIENHLDVAAFKEDGRFIPTIAFYSPNALGAITKALHSDNYSFKNVYHELSTDYLDVRDVDAPSYWYKNINYQHDLDALIQKL >NC_016928.2|WP_000866974.1|2294291_2294525_-|molybdopterin-converting-factor-subunit-1 MKVLYFAEIKDILQKAQEDIVLEQGLTVQQFEDLLFERYPQINNKKFQVAVNEEFVQKSDFIQPNDTVALIPPVSGG >NC_016928.2|WP_000808500.1|2294530_2294977_-|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-MoaE MKQFEIVTEPIQTEQYREFTINEYQGAVVVFTGHVREWTKGVKTEYLEYEAYIPMAEKKLAQIGDEINEKWPGTITSIVHRIGPLQISDIAVLIAVSSPHRKDAYRANEYAIERIKEIVPIWKKEIWEDGSKWQGHQKGNYEEAKREE >NC_016928.2|WP_000602934.1|2294990_2295476_-|molybdopterin-guanine-dinucleotide-biosynthesis-protein-B MILQIVGYKKSGKTTLMRHIVSFLKSHGYTVATIKHHGHGKEDIQLQDSDVDHMKHFEAGADQSIVQGFQYQQTVTRVDNQNLTQIIEKSVTIDTNIVLVEGFKNADFEKVVVYRDEEELQVLQQLSNVCYSINVREHEDFTAFEQWLLNKIKNDCDTQLT >NC_016928.2|WP_000259720.1|2295472_2296732_-|molybdopterin-molybdotransferase-MoeA MVVEKRNPIPVKEAIQRIVNQQSSMPAITVALEKSLNHILAEDIVATYDIPRFDKSPYDGFAIRSVDSQGASGQNRIEFKVIDHIGAGSVSDKLVGDHEAVRIMTGAQIPNGADAVVMFEQTIELEDTFTIRKPFSKNENISLKGEETKTGDVVLKKGQVINPGAIAVLATYGYAEVKVIKQPSVAVIATGSELLDVNDVLEDGKIRNSNGPMIRALAEKLGLEVGIYKTQQDDLDSGIQVVKEAMEKHDIVITTGGVSVGDFDYLPEIYKTVKAKVLFNKVAMRPGSVTTVAFADGKYLFGLSGNPSACFTGFELFVKPAVKHMCGALEVFPQIIKATLMEDFTKANPFTRFIRAKATLTSAGATVVPSGFNKSGAVVAIAHANCMVMLPGGSRGFKAGHTVDIILTESDAAEEELLL >NC_016928.2|WP_000134534.1|2296794_2297289_+|cyclic-pyranopterin-monophosphate-synthase-MoaC MTEFTHINQQGHAKMVDVSDKQITKRTAVAHSSITVNETIYKQISNNTNTKGNVLNTAQIAGIMAAKNTSTIIPMCHPLPLTGIDVHFSWDETNAPLYTLNIQTTVSTTGKTGVEMEALTAASATALTIYDMTKAVDKGMIIGETYLESKSGGKSGDFQRQSGQ >NC_016928.2|WP_000503820.1|2297290_2297797_-|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-MoaB MGEHQNVKLNRTVKAAVLTVSDTRDFDTDKGGQCVRQLLQADDVEVSDAHYTIVKDEKVAITTQVKKWLEEDIDVIITTGGTGIAQRDVTIEAVKPLLTKEIEGFGELFRYLSYVEDVGTRALLSRAVAGTVNNKLIFSIPGSTGAVKLALEKLIKPELNHLIHELTK >NC_016928.2|WP_000076924.1|2297827_2298832_-|molybdopterin-biosynthesis-protein-MoeB MSQERYSRQILFKQIGEIGQSKINQKCALIIGMGALGTHVAEGLVRAGIAKLIIVDRDYIEFSNLQRQTLFTEEDALKMMPKVVAAKKHLLALRSDVDIDDYIAHVDYYFLETHGQDVDVIIDATDNFETRQLINDFAYKHRIPWIYGGVVQSTYTEAAFIPGKTPCFNCLVPQLPALNLTCDTVGVIQPAVTMATSLQLRDAMKVLTEQPIDTKITYGDIWEGSHYSFGFSKMQRSACTTCGDIPSYPYLNKNEQRYATLCGRDTVQYENASITHDILVQFLKQHQLNYRSNSYMVMFEFKGHRIVAFKGGRFLIHGMTRTSDATHLMNLLFG >NC_016928.2|WP_000913006.1|2299000_2299606_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MLKINLKYQLKNTLIRINIDDTEPKIYAVRGPSGIGKTTVLNMIAGLRKADEAIIEVNGQLLTDTAKNVNVKIQQRRIGYLFQDYQLFPNMTVYKNITFMAEPSEHIDQLIQTLNIDHLMKQYPMTLSGGEAQRVALARALSTKPDLILLDEPFSSLDDTTKDESITLVKRIFNEWQIPIIFVTHSNYEAEQMAHEIITIG |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_016928_10 | 2446948-2447040 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_016928_10
|
1 spacers
spacers of NC_016928_10
>10.1|2446973|43|NC_016928|CRISPRCasFinder GCTTATGCAGTTGACGTTTTACGTCCTACTACGTTCCTTTGTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_016928_10
The CRISPR arrays of NC_016928_10 >merge|NC_016928|10|2446948-2447040|CRISPRCasFinder TTCTTCAAATTTATTTGTTAGAAAGGCTTATGCAGTTGACGTTTTACGTCCTACTACGTTCCTTTGTCTTCTTCAAATTTATTTGTTAGAAAG >NC_016928|10|9|2446948-2447040|CRISPRCasFinder TTCTTCAAATTTATTTGTTAGAAAG GCTTATGCAGTTGACGTTTTACGTCCTACTACGTTCCTTTGTC TTCTTCAAATTTATTTGTTAGAAAG
>NC_016928.2|WP_000019124.1|2445871_2446738_-|cation-transporter MSHNENLKLAQRGAYLSLIVYIILSIVKYVTGFVFNSAAVRADALNNMTDIIVSLAVIIGLKISIKPADRNHPYGHLKSENISSLLVSFVIMFVGIQVVIQNAPRLFKEDDVVPNAITIIVSLISGLIMLIVFAVNQSLAKRTKSSSLNSAAKDNLSDSLVSIGTAIGLIFTQIGFPIVDIILATLLGLLIVYTGFGIFKEAIFMLSDGFNETELEAYRNDILEVDEVQKVKSIKGRYHGSSVFIDVTIVVDANLSLVEAHQICDNVEHHLHKKGISSVYVHPEPDHL >NC_016928.2|WP_001125208.1|2444859_2445546_-|2,3-diphosphoglycerate-dependent-phosphoglycerate-mutase MPKLILCRHGQSEWNAKNLFTGWEDVNLSEQGINEATRAGEKVRENNIAIDVAFTSLLTRALDTTHYILTESKQQWIPVYKSWRLNERHYGGLQGLNKDDARKEFGEEQVHIWRRSYDVKPPAETEEQREAYLADRRYNHLDKRMMPYSESLKDTLVRVIPFWTDHISQYLLDGQTVLVSAHGNSIRALIKYLEDVSDEDIINYEIKTGAPLVYELTDDLEVIDKYYL >NC_016928.2|WP_000762708.1|2444601_2444706_+|putative-metal-homeostasis-protein MKLDLQTARRNLNSPNIKTRKRALKIIKQHKRAK >NC_016928.2|WP_000038954.1|2442988_2444428_-|multidrug-efflux-MFS-transporter-MdeA MSKKQKLTMIITMLMGGFFGLLNETLLVTALPSIMKDFEISYTQVQWLTTAFLLTNGIVIPLSALVIQRYTTRQVFLVGISIFFLGTLLGGLSPHFATLLVARIIQALGAGIMMPLMMTTILDVFQPHERGKYMGIFGLVIGLAPAIGPTLSGYLVEYFNWRSLFHVVAPIAAVTFLIGFKTIKNVGTTIKVPIDFISVIFSVLGFGGLLYGTSSISEKGFDNPIVLVSMIGGIVLVALFVLRQYRLSTPLLNFAVFKNKQFTVGIIIMGVTMVSMIGSETILPIFVQNLLHRSALDSGLTLLPGAIVMAFMSMTSGALYEKFGPRKLALVGMAIVVITTAYFVVMDEQTSTIMLATVYAIRMVGIALGLIPVMTHTMNQLKPEMNAHGSSMTNTVQQIAGSIGTAALITILAHASKNFSPTMSDYNGMNKIDMMNQIKVDTMLHGYHAGFLFALLITVVSFFCSFMLQGKKKEVDSRQ >NC_016928.2|WP_000825921.1|2442088_2442868_-|transporter-substrate-binding-domain-containing-protein MKRLLFVMIAFVFILAACGNNSSKDKEANKDSKTINVGTEGTYAPFSFHDKDGKLTGYDIDVIKAVAKEEGLKLKFNETSWDSMFAGLDAGRFDVIANQVGINPDREKKYKFSKPYTFSSAVLVIRENEKDIKDFDDVKGKKLAQTFTSNYGKLAKDKGADITKVDGFNQSMDLLLSKRVDGTFNDSLSYLDYKKQKPNAKIKAIKGNAEQSRSAFAFSKKADDETVQKFNDGLKKIEENGELAKIGKKWFGQDVSKSK >NC_016928.2|WP_000479576.1|2441388_2442108_-|amino-acid-ABC-transporter-permease MFLNLNSEQQHALDAAKQAFGPMLEGLVKYSIPITLVTFVLGLIIALFTALMRISTSKILRSISRVYVSIIRGTPMIVQLFIIFYGIPELGRLLTNDADNQWTLAPVVAAIIGLSLNVGAYASEIIRGGIISIPKGQTEAAYSIGMTYGQTIQRIILPQAIRVSIPALGNTFLSLIKDTSLLGFILVAEMFRKAQEVASTTYEYLTIYVLVALMYWVVCFIISIIQGIYESYIERGYRS >NC_016928.2|WP_000615464.1|2440660_2441392_-|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein MIQLNNIHKSFNDVEVIKGIDLSVEQGEVVTLIGRSGSGKTTLLRMINALEIPTEGTVYVNGKTYTSKDKKSQIEVRKQSGMVFQSYNLFPHKTALENVMEGLITVKKLKKDEARGKSLELLEKVGLTLVKDQRPHALSGGQQQRVAIARALAMNPKVMLFDEPTSALDPELVNDVLKVIKDLANEGMTMVIVTHEMRFAKEVSNNIVFIHEGMIGEQGAPEEMFNRPKTEELRRFLNVINEE >NC_016928.2|WP_001012236.1|2439313_2440564_+|FemA/FemB-family-glycyltransferase-FmhA MNFVTLTSDEFNAFTTKHFSHYTQSAIHYNHRVDLKGDVHLVGVKDDNGQVIAGCLLTEARTLKFFKYFYTHRGPVMDYTNQSLVAFFFKALTSYLKKQNCLYVLVDPYLIENLRNADGEIVKSYDNRAFVRTMDTLGYKHQGFPVGYDSMSQIRWLSVLDLKDKTEDQLLKEMDYQTRRNIKKTYDIGVKTKTLTIDETQTFFDLFHMAEEKHGFKFRELPYFEEMQKLYDDHAMLKLAYIDLNEYLKTLQLKQQQLTAELSGVEEALEENPNSKKNKTKRTQLEQQLNSNKRKIDNTIEQIEQDGAVLNLASALFIYNEHEVYYLSSGSNPKYNAYMGAYHLQWEMIKFAKAHHIDRYNFYGITGDFSESSEDYGVQQFKKGFNAHVEEYIGDFIKPIKPLLYKVQTYLNHKRR >NC_016928.2|WP_000819839.1|2438696_2439059_-|DUF4467-domain-containing-protein MKRFVAMVLLLLVFISGCGNDKYVKEIDEAVKIQNQKQEQLAKKGNGDRVDHFERKDANIYVYDKDKIIILAYKPLSNDDEVHYYAYDFSDKRVSYKQDFDSRRYYQQHDADYHEENMTN >NC_016928.2|WP_000162810.1|2438078_2438678_-|DsbA-family-protein MTKKLLTLFIVSMLILTACGKKESATTSSKNGKPLVVIYGDYKCPYCKELDEKVMPKLRKNYIDNHKVEYQFVNLAFLGKDSIVGSRASHAVLMYAPKSFLDFQKQLFAAQQDENKEWLTKELLDKHIKQLHLDKETENKIIKDYKTKDSKSWKAAEKDKKIAKDNHIKTTPTAFINGEKVEDPYDYESYEKLLKDKIK >NC_016928.2|WP_014532694.1|2447244_2447340_-|hypothetical-protein MLTNRLTSVNYVKKRLIQNIQRILSKEVLYG >NC_016928.2|WP_000792557.1|2447434_2448745_+|hypothetical-protein MKNKYISKLLVGAATITLATMISNGEAKASENTQQTSTKHQTTQNNYVTDQQKAFYQVLHLKGITEEQRNQYIKTLREHPERAQEVFSESLKDSKNPDRRVAQQNAFYNVLKNDNLTEQEKNNYIAQIKENPDRSQQVWVESVQSSKAKERQNIENADKAIKDFQDNKAPHDKSAAYEANSKLPKDLRDKNNRFVEKVSIEKAIVRHDERVKSANDAISKLNEKDSIENRRLAQREVNKAPMDVKEHLQKQLDALVAQKDAEKKVAPKVEAPQIQSPQIEKPKAESPKVEVPQIQSPKVEVPQSKLLGYYQSLKDSFNYGYKYLTDTYKSYKEKYDTAKYYTDKYFKYKGTIDKTVLSVFGNGYKSYIQPLKVEDQKNYVSKSYAQVRNYVTETLNTGKVLYAFYQNPNVVKAAITTAETAASIKNIFSSFTSFFK >NC_016928.2|WP_000594519.1|2449236_2450166_+|bi-component-gamma-hemolysin-HlgAB-subunit-A MIKNKILTATLAVGLIAPLANPFIEISKAENKIEDIGQGAEIIKRTQDITSKRLAITQNIQFDFVKDKKYNKDALVVKMQGFISSRTTYSDLKKYPYIKRMIWPFQYNISLKTKDSNVDLINYLPKNKIDSADVSQKLGYNIGGNFQSAPSIGGSGSFNYSKTISYNQKNYVTEVESQNSKGVKWGVKANSFVTPNGQVSAYDQYLFAQDPTGPAARDYFVPDNQLPPLIQSGFNPSFITTLSHERGKGDKSEFEITYGRNMDATYAYVTRHRLAVDRKHDAFKNRNVTVKYEVNWKTHEVKIKSITPK >NC_016928.2|WP_000916705.1|2450733_2451681_+|bi-component-gamma-hemolysin-HlgCB-subunit-C MLKNKILATTLSVSLLAPLANPLLENAKAANDTEDIGKGSDIEIIKRTEDKTSNKWGVTQNIQFDFVKDKKYNKDALILKMQGFISSRTTYYNYKNTNHIKSMRWPFQYNIGLKTNDKYVSLINYLPKNKIESTNVSQTLGYNIGGNFQSAPSLGGNGSFNYSKSISYTQQNYVSEVEQQNSKSVLWGVKANSFATESGQKSAFDSDLFVGYKPHSKDPRDYFVPDSDLPPLVQSGFNPSFIATVSHEKGSSDTSEFEITYGRNMDVTHAIKRSTHYGNSYLDGHRIHNAFVNRNYTVKYEVNWKTHEIKVKGQN >NC_016928.2|WP_000783428.1|2451682_2452660_+|bi-component-gamma-hemolysin-HlgAB/HlgCB-subunit-B MKMNKLVKSSVATSMALLLLSGTANAEGKITPVSVKKVDDKVTLYKTTATADSDKFKISQILTFNFIKDKSYDKDTLVLKATGNINSGFVKPNPNDYDFSKLYWGAKYNVSISSQSNDSVNVVDYAPKNQNEEFQVQNTLGYTFGGDISISNGLSGGLNGNTAFSETINYKQESYRTTLSRNTNYKNVGWGVEAHKIMNNGWGPYGRDSFHPTYGNELFLAGRQSSAYAGQNFIAQHQMPLLSRSNFNPEFLSVLSHRQDGAKKSKITVTYQREMDLYQIRWNGFYWAGANYKNFKTRTFKSTYEIDWENHKVKLLDTKETENNK >NC_016928.2|WP_000200957.1|2452711_2453179_-|hypothetical-protein MTSKDITQISVIAAILTILAVLKIPSIIPGLDFQLSAPVALLILAFFGIKKYFLGGLLSSVLLLIFGVFNPINVIISIIFRVIAIAVVYLLKINVLSLILASVLGSLISRLLLSIILNLPVWVVLLNAIPGVIFTLIVAIPLYLTLRKRMAVLLR >NC_016928.2|WP_000286874.1|2453189_2453882_-|6-carboxyhexanoate--CoA-ligase MYSIKMRSSNQDVHISGAETICEFDKIEQTVQRFYNKGFFHENGQPDFLNIKIQKIMEPIQQIKALQIIEDDKANLQHLTQECGVTEQALNQGMTYIKNETVYTGAIILSAISGKRLDSFGQRGIRATHFSFEDINNKGDLNERVTDALAIASCINAHPYIKGELCVSDDLTYTTGYFASAKIGYHRLFDIKPVNTRYGGRIIFVDDRIDLNHYISFLESTPKQVVYETV >NC_016928.2|WP_000971541.1|2453892_2455008_-|pyridoxal-phosphate-dependent-aminotransferase-family-protein MMFQEQIDLLQQKGLYRSLKSVGYIDRQYIEVENKRCTNYTSNDYLGLGQIAFDKDDFERFMRKYSYHLSSSRLISGSSTAYEEIETMLAGWLGYSACTILNSGYDANLALFNIFKNTNCVVFSDQENHASIIDGIKLSGLEKVIYKHLDIADLEKRLAECPNQNIQKIIISDSVFSTNGDVVDIGQLVSLKHKYNATLILDVSHSFGIENYSNYQGVDILTSSLSKACGAYGGVILSSNDVKDMLINHGRPLIYSSSLPIYNLYFIKRNIEKLINADDRRTKLNSLSKYFNQKLKALNVNYNSSNSPIKFIEFDDIEAAENIHQTLLKHHVFTSYLRYPTVTKPMLRISLSYFHTEQDVDRLFEILHQED >NC_016928.2|WP_001046638.1|2454985_2455993_-|biotin-synthase-BioB MNLAKRILQGEQLTKETVLKIYEDTNIDTLDLLNEAYILRKHYFGKKVKLNMILNAKSGICPENCGYCGQSRDIKEKQRYALIPEEQIIDGAKVAHDNHIGTYCIVMSGRGPSDKEVDHISNTVRTIKSQHPQLKICACLGLTNDEQAKKLKSAGVDRYNHNINTSENYHDNVVTTHSYKDRTDTIELMKANNISPCSGVICGMGESNQDIVDMAFALKEMDADSIPINFLHPIKGTKFGSMDDLTPMKCLRIVALFRLINPTKEIRIAGGREVNLRSLQPLALKAANSIFVGDYLITGGQPNQLDYDMINDLGFEIDYDTCENKENKNDVSRAN >NC_016928.2|WP_001110080.1|2455994_2457353_-|adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate-transaminase MNYTQQLKQKDSEYVWHPFTQMGVYSKEEAIVIEKGKGSYLYDTNGNKYLDGYASLWVNVHGHNNKYLNKVIKKQLNKIAHSTLLGSSNIPSIELAEKLIEITPSNLRKVFYSDTGSASVEIAIKMAYQYWKNIDREKYAKKNKFITLNHGYHGDTIGAVSVGGIKTFHKIFKDLIFENIQVESPSFYRSNYDTENEMMAAILTNIEQILIERNDEIAGFILEPLIQGATGLFVHPKGFLKEVEKLCKKYDVLLICDEVAVGFGRTGKMFACNHEDVQPDIMCLGKAITGGYLPLAATLTSQKIYDAFLSDSHGVNTFFHGHTYTGNQIVCTVALENIRLYEKRKLLSQIETTSSTLEKQLHALKRHRNVGDVRGRGLMFGVELVTDKDSKTPLEIEKVERIVRNCKENGLMIRNLENVITFVPVLSMSNKEVKTMVRIFKKAVHNILDRKC |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_016928_11 | 2788763-2788848 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_016928_11
|
1 spacers
spacers of NC_016928_11
>11.1|2788793|26|NC_016928|CRISPRCasFinder CCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_016928_11
The CRISPR arrays of NC_016928_11 >merge|NC_016928|11|2788763-2788848|CRISPRCasFinder CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTT >NC_016928|11|10|2788763-2788848|CRISPRCasFinder CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTT CCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCG CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTT
>NC_016928.2|WP_000491384.1|2788185_2788539_-|DUF3147-family-protein MFSIGSAILHFVIGGIAVALASIIADKVGGKLGGIIATMPAVFLAAIIALALDHRGTQLVEMSMNLSTGAIVGILSCILTVFLTSLYINHKGYRKGAIFTVVCWFVISLAIFSIRHL >NC_016928.2|WP_000779135.1|2787722_2788118_-|DUF3147-family-protein MKLTLMKFFVGGFAVLLSYIVSVTLPWKEFGGIFATFPAVFLVSMFITGMQYGDKVAVHVSRGAVFGMTGVLVCILVTWMMLHMTHMWLISIIVGLLSWFISAVCIFEAVEFIAQKRLEKHSWKAGKTNSK >NC_016928.2|WP_001054123.1|2786902_2787472_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MNLSKQIKKYRERDGYSQEYLAEKLYVSRQSISNWENDKSLPDIHNLLMMCELFNVTLDDLVKGTIPFVPDIKVQRSLNLWAYVMIIFMTLAAILTGPLIVYWNWAWGITVMVIYGIGYYASMKIEDFKKVHKMDNYDRIVAFMNGKDPSEVQTTKARNIKTSVLSFIAFVGAIILVALISMYLANKFL >NC_016928.2|WP_001059079.1|2786575_2786776_+|cold-shock-protein MNNGTVKWFNAEKGFGFIEQENGGDVFVHFSGIASDGYKTLEEGQKVTFEITEGQRGDQAVNVQTV >NC_016928.2|WP_000672036.1|2785992_2786184_+|peptide-resistance-ABC-transporter-activity-modulator-VraH MKFRELVKQSYEDLKNLTVTWYNVIALAMIVIVLSVVTTPIIGIPVGLLGGAYYLKRREEKGK >NC_016928.2|WP_000586238.1|2785038_2785536_-|hypothetical-protein MIINLETQQIHFDLEHETPYFQSPEKNRIRLDIDVLNKKQISNIINVIFNNQSKTKCTFLSEYLYPVKFREKTRIGRFFNITNWYEEIHSTDEKYVIATIKNIKNKDLIDYSLYIKKGLVEPFIVFYNQENIFYISNTVIDIISVSKDTLGYIKSEFNDHCASPY >NC_016928.2|WP_000672028.1|2784240_2784432_+|peptide-resistance-ABC-transporter-activity-modulator-VraH MKFRELVKQSYEDLKNLTVTWYNVIALAMIVIVLSSVTTPIIGIPAGLLGGAYYLKRREEKGK >NC_016928.2|WP_000143679.1|2782267_2784148_+|peptide-resistance-ABC-transporter-permease-subunit-VraE MTFNHIVLKNLRQNLKHYAMYLFSLFFSIVLYFSFTTLQFTKGVNNDDSMAIIKKGALVGSIFLFIIIVIFLMYANHLFVKRRTREFALFQLIGLTRQNILKMLALEQMIVFLITGVVGVLCGIAGAQLLLSIVSKLMSLSINLSIHFEPMALVLTILMLIIAYILILFQSSLFLKRRSILSMMKDSIKTDVTTAKVTTAEVISGVLGIAMIALGYYMATEMFGTFKALTMAMTSPFIILFLTVVGAYLFFRSSVSLIFKTLKKSKNGRVSITDVVFTSSIMYRMKKNAMSLTIIAIISAVTVTVLCFAALSKSNTDQTLISMAPNEFNVVASQDAQQFESKLSQQHITFTKNYYETITVNNVKDQVITLENGSDSGRTNSILSANTKLTGNNAIITNTKSLPNIINIHLNKDLVVKGTKNETFRVTQEDKGKVYPLNLSFNSPVVEVSPEKYQQLKTQNNVHTFYGYDIKQTSQKEKAQAIAKQFGDKVITYDDMKKEVDATNGILIFVTSFLGLAFLVAAGCIIYIKQMDETEDELSNFRILKRIGFTHTDMLKGLLLKITFNFGLPLLIAILHAVFAAIAFMKLMGNISFMPVIIVIIVYTLIYIVFALIAFVHSNKLIKKTI >NC_016928.2|WP_000154165.1|2781519_2782278_+|peptide-resistance-ABC-transporter-ATP-binding-subunit-VraD MTILSVQHVSKTYGKKHTFQALKDINFDIQKGEFVAIMGPSGSGKTTLLNVLSSIDQISSGSVIANGQELNKLNQKALAKFRKESLGFIFQDYSILPTLTVKENIMLPLSVQKMSKATMEENYKAITTALGIYDLGNKYTSELSGGQQQRTAAARAFVHKPQIIFADEPTGALDSKSANDLLQRLEEMNKSFDTTIVMVTHDPVAASFAERVIMLKDGQIHTQLYQEGRSKQAFYEDIVHLQSVLGGVSNDI >NC_016928.2|WP_000410770.1|2780717_2781230_-|HdeD-family-acid-resistance-protein MEKGNQGIKWSSLIMGVLLLMLAVVIFTFPIENFYAITWLIGLFVLINGVIQIVYRRKAKALVGGNQNWILFMGIVDILFGLIVIFNVGASSAFFIYMFAFWFIFSSIAGLFTFSGSGSLKLISVIFNLLGIVFGVILLFNPLMGIVFISTMIAIAFVFVGVIYVVDALA >NC_016928.2|WP_000742837.1|2789148_2789988_-|nucleoid-occlusion-protein MKKPFSKLFGLKNKDDIIGHIEEDRNSNVESIQIERIVPNRYQPRQVFEPNKIKELAESIHEHGLLQPIVVRPIEEDMFEIIAGERRFRAIQSLNLPQADVIIRDMDDEETAVVALIENIQRENLSVVEEAEAYKKLLEIGDTTQSELAKSLGKSQSFIANKLRLLKLAPKVLLRLREGKITERHARAVLSLSDSEQEALIEQVIAQKLNVKQTEDRVRQKTGPEKVKAQNLRFAQDVTQARDEVGKSIQAIQQTGLHVEHKDKDHEDYYEIKIRIYKR >NC_016928.2|WP_000215588.1|2790030_2790750_-|16S-rRNA-(guanine(527)-N(7))-methyltransferase-RsmG MTVEWLAEQLKEHNIELTETQKQQFQTYYRLLVEWNEKMNLTSITDEHDVYLKHFYDSIAPSFYFDFNQPISICDVGAGAGFPSIPLKIMFPQLKVTIVDSLNKRIQFLNHLASELQLQDVSFIHDRAETFGKGVYRESYDVVTARAVARLSVLSELCLPLVKKGGQFVALKSSKGEEELEEAKFAISVLGGNVTETHTFELPEDAGERQMFIIDKKRQTPKKYPRKPGTPNKTPLLEK >NC_016928.2|WP_000249657.1|2790749_2792627_-|tRNA-uridine-5-carboxymethylaminomethyl(34)-synthesis-enzyme-MnmG MVQEYDVIVIGAGHAGVEAGLASARRGAKTLMLTINLDNIAFMPCNPSVGGPAKGIVVREIDALGGQMAKTIDKTHIQMRMLNTGKGPAVRALRAQADKVLYQQEMKRVIEDEENLHIMQGMVDELIIEDNEVKGVRTNIGTEYLSKAVIITTGTFLRGEIILGNMKYSSGPNHQLPSITLSDNLRELGFDIVRFKTGTPPRVNSKTIDYSKTEIQPGDDVGRAFSFETTEYILDQLPCWLTYTNAETHKVIDDNLHLSAMYSGMIKGTGPRYCPSIEDKFVRFNDKPRHQLFLEPEGRNTNEVYVQGLSTSLPEHVQRQMLETIPGLEKADMMRAGYAIEYDAIVPTQLWPTLETKMIKNLYTAGQINGTSGYEEAAGQGLMAGINAAGKVLNTGEKILSRSDAYIGVLIDDLVTKGTNEPYRLLTSRAEYRLLLRHDNADLRLTDMGYELGMISEERYARFNEKRQQIDAEIKRLSDIRIKPNEHTQAIIEQHGGSRLKDGILAIDLLRRPEMTYDIILEILEEEHQLNADVEEQVEIQTKYEGYINKSLQQVEKVKRMEEKKIPEDLDYSKIDSLATEAREKLSEVKPLNIAQASRISGVNPADISILLIYLEQGKLQRVSD >NC_016928.2|WP_000362507.1|2792693_2794073_-|tRNA-uridine-5-carboxymethylaminomethyl(34)-synthesis-GTPase-MnmE MDLDTITSISTPMGEGAIGIVRLSGPQAVEIADKLYKGKHLLNDVPSHTINYGHIIDPESKEVVEEVMVSVLRAPKTFTREDIIEINCHGGILTINRVLELTMTYGARMAEPGEFTKRAFLNGRIDLSQAEAVMDFIRSKTDRASKVAMNQIEGRLSDLIKKQRQSILEILAQVEVNIDYPEYDDVEDATTEFLLEQSKEIKQEINHLLDTGAQGKIMREGLSTVIVGKPNVGKSSMLNNLIQDNKAIVTEVAGTTRDVLEEYVNVRGVPLRLVDTAGIRETEDIVEKIGVERSRKALSQADLILFVLNNNEALTQEDYTLYEVVKNEDVIVIVNKMDLEQNIDINEVKDMIGDTPLIQTSMLKQEGIDELEIQIRDLFFGGEVQNQDMTYVSNSRHISLLKQARQTIQDAIDAAESGVPMDMVQIDLTRTWEILGEIIGETASDELIDQLFSQFCLGK >NC_016928.2|WP_001789343.1|2794216_2794570_-|ribonuclease-P-protein-component MLLEKAYRIKKNADFQRIYKKGHSVANRQFVVYTCNNKEIDHFRLGISVSKKLGNAVLRNKIKRAIRENFKVHKSHILAKDIIVIARQPAKDMTTLQIQNSLEHVLKIAKVFNKKIK >NC_016928.2|WP_000240855.1|2794690_2794828_-|50S-ribosomal-protein-L34 MVKRTYQPNKRKHSKVHGFRKRMSTKNGRKVLARRRRKGRKVLSA |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_016928_11 | 11.1|2788793|26|NC_016928|CRISPRCasFinder | 2788793-2788818 | 26 | NC_016928.2 | 622588-622613 | 0 | 1.0 |
NC_016928_11 | 11.1|2788793|26|NC_016928|CRISPRCasFinder | 2788793-2788818 | 26 | NC_016928.2 | 1155770-1155795 | 0 | 1.0 |
NC_016928_11 | 11.1|2788793|26|NC_016928|CRISPRCasFinder | 2788793-2788818 | 26 | NC_016928.2 | 1292780-1292805 | 0 | 1.0 |
NC_016928_2 | 2.2|952878|19|NC_016928|PILER-CR | 952878-952896 | 19 | NC_016928.2 | 831049-831067 | 1 | 0.947 |
NC_016928_2 | 2.2|952878|19|NC_016928|PILER-CR | 952878-952896 | 19 | NC_016928.2 | 1292847-1292865 | 1 | 0.947 |
NC_016928_2 | 2.2|952878|19|NC_016928|PILER-CR | 952878-952896 | 19 | NC_016928.2 | 1292905-1292923 | 1 | 0.947 |
NC_016928_2 | 2.2|952878|19|NC_016928|PILER-CR | 952878-952896 | 19 | NC_016928.2 | 1986482-1986500 | 1 | 0.947 |
NC_016928_2 | 2.2|952878|19|NC_016928|PILER-CR | 952878-952896 | 19 | NC_016928.2 | 2326685-2326703 | 1 | 0.947 |
NC_016928_4 | 4.1|1155561|29|NC_016928|PILER-CR | 1155561-1155589 | 29 | NC_016928.2 | 831019-831047 | 1 | 0.966 |
NC_016928_4 | 4.1|1155561|29|NC_016928|PILER-CR | 1155561-1155589 | 29 | NC_016928.2 | 1055101-1055129 | 1 | 0.966 |
NC_016928_4 | 4.1|1155561|29|NC_016928|PILER-CR | 1155561-1155589 | 29 | NC_016928.2 | 1671182-1671210 | 1 | 0.966 |
NC_016928_4 | 4.1|1155561|29|NC_016928|PILER-CR | 1155561-1155589 | 29 | NC_016928.2 | 1986452-1986480 | 1 | 0.966 |
NC_016928_4 | 4.1|1155561|29|NC_016928|PILER-CR | 1155561-1155589 | 29 | NC_016928.2 | 2788829-2788857 | 1 | 0.966 |
NC_016928_4 | 4.2|1155617|29|NC_016928|PILER-CR | 1155617-1155645 | 29 | NC_016928.2 | 785002-785030 | 1 | 0.966 |
NC_016928_4 | 4.3|1155673|39|NC_016928|PILER-CR | 1155673-1155711 | 39 | NC_016928.2 | 785002-785040 | 1 | 0.974 |
NC_016928_4 | 4.4|1155739|29|NC_016928|PILER-CR | 1155739-1155767 | 29 | NC_016928.2 | 830961-830989 | 1 | 0.966 |
NC_016928_4 | 4.4|1155739|29|NC_016928|PILER-CR | 1155739-1155767 | 29 | NC_016928.2 | 867210-867238 | 1 | 0.966 |
NC_016928_4 | 4.4|1155739|29|NC_016928|PILER-CR | 1155739-1155767 | 29 | NC_016928.2 | 1292704-1292732 | 1 | 0.966 |
NC_016928_4 | 4.4|1155739|29|NC_016928|PILER-CR | 1155739-1155767 | 29 | NC_016928.2 | 1986511-1986539 | 1 | 0.966 |
NC_016928_4 | 4.4|1155739|29|NC_016928|PILER-CR | 1155739-1155767 | 29 | NC_016928.2 | 2209927-2209955 | 1 | 0.966 |
NC_016928_4 | 4.4|1155739|29|NC_016928|PILER-CR | 1155739-1155767 | 29 | NC_016928.2 | 2462320-2462348 | 1 | 0.966 |
NC_016928_4 | 4.4|1155739|29|NC_016928|PILER-CR | 1155739-1155767 | 29 | NC_016928.2 | 887606-887634 | 1 | 0.966 |
NC_016928_4 | 4.4|1155739|29|NC_016928|PILER-CR | 1155739-1155767 | 29 | NC_016928.2 | 1686570-1686598 | 1 | 0.966 |
NC_016928_4 | 4.4|1155739|29|NC_016928|PILER-CR | 1155739-1155767 | 29 | NC_016928.2 | 2615203-2615231 | 1 | 0.966 |
NC_016928_9 | 9.1|2292412|25|NC_016928|CRISPRCasFinder | 2292412-2292436 | 25 | NC_016928.2 | 1880662-1880686 | 1 | 0.96 |
NC_016928_9 | 9.1|2292412|25|NC_016928|CRISPRCasFinder | 2292412-2292436 | 25 | NC_016928.2 | 2292468-2292492 | 1 | 0.96 |
NC_016928_11 | 11.1|2788793|26|NC_016928|CRISPRCasFinder | 2788793-2788818 | 26 | NC_016928.2 | 784985-785010 | 1 | 0.962 |
NC_016928_11 | 11.1|2788793|26|NC_016928|CRISPRCasFinder | 2788793-2788818 | 26 | NC_016928.2 | 785041-785066 | 1 | 0.962 |
NC_016928_11 | 11.1|2788793|26|NC_016928|CRISPRCasFinder | 2788793-2788818 | 26 | NC_016928.2 | 1851817-1851842 | 1 | 0.962 |
NC_016928_11 | 11.1|2788793|26|NC_016928|CRISPRCasFinder | 2788793-2788818 | 26 | NC_016928.2 | 2326743-2326768 | 1 | 0.962 |
NC_016928_11 | 11.1|2788793|26|NC_016928|CRISPRCasFinder | 2788793-2788818 | 26 | NC_016928.2 | 830925-830950 | 1 | 0.962 |
NC_016928_11 | 11.1|2788793|26|NC_016928|CRISPRCasFinder | 2788793-2788818 | 26 | NC_016928.2 | 2034754-2034779 | 1 | 0.962 |
NC_016928_11 | 11.1|2788793|26|NC_016928|CRISPRCasFinder | 2788793-2788818 | 26 | NC_016928.2 | 2210007-2210032 | 1 | 0.962 |
NC_016928_1 | 1.1|775552|30|NC_016928|CRISPRCasFinder | 775552-775581 | 30 | NC_016928.2 | 816594-816623 | 2 | 0.933 |
NC_016928_2 | 2.2|952878|19|NC_016928|PILER-CR | 952878-952896 | 19 | NC_016928.2 | 183926-183944 | 2 | 0.895 |
NC_016928_2 | 2.2|952878|19|NC_016928|PILER-CR | 952878-952896 | 19 | NC_016928.2 | 622529-622547 | 2 | 0.895 |
NC_016928_2 | 2.2|952878|19|NC_016928|PILER-CR | 952878-952896 | 19 | NC_016928.2 | 932587-932605 | 2 | 0.895 |
NC_016928_2 | 2.2|952878|19|NC_016928|PILER-CR | 952878-952896 | 19 | NC_016928.2 | 1151519-1151537 | 2 | 0.895 |
NC_016928_2 | 2.2|952878|19|NC_016928|PILER-CR | 952878-952896 | 19 | NC_016928.2 | 1367484-1367502 | 2 | 0.895 |
NC_016928_2 | 2.2|952878|19|NC_016928|PILER-CR | 952878-952896 | 19 | NC_016928.2 | 1706269-1706287 | 2 | 0.895 |
NC_016928_4 | 4.1|1155561|29|NC_016928|PILER-CR | 1155561-1155589 | 29 | NC_016928.2 | 887719-887747 | 2 | 0.931 |
NC_016928_4 | 4.1|1155561|29|NC_016928|PILER-CR | 1155561-1155589 | 29 | NC_016928.2 | 1151653-1151681 | 2 | 0.931 |
NC_016928_4 | 4.1|1155561|29|NC_016928|PILER-CR | 1155561-1155589 | 29 | NC_016928.2 | 1686514-1686542 | 2 | 0.931 |
NC_016928_4 | 4.1|1155561|29|NC_016928|PILER-CR | 1155561-1155589 | 29 | NC_016928.2 | 821853-821881 | 2 | 0.931 |
NC_016928_4 | 4.1|1155561|29|NC_016928|PILER-CR | 1155561-1155589 | 29 | NC_016928.2 | 1984996-1985024 | 2 | 0.931 |
NC_016928_4 | 4.3|1155673|39|NC_016928|PILER-CR | 1155673-1155711 | 39 | NC_016928.2 | 183886-183924 | 2 | 0.949 |
NC_016928_4 | 4.3|1155673|39|NC_016928|PILER-CR | 1155673-1155711 | 39 | NC_016928.2 | 622549-622587 | 2 | 0.949 |
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ccgccagcttctatgttggggccccg CRISPR spacer ccgccagcttctgtcttggggccccg Protospacer ************.* ***********
59. spacer 11.1|2788793|26|NC_016928|CRISPRCasFinder matches to position: 2131007-2131032, mismatch: 2, identity: 0.923
ccgccagcttctatgttggggccccg CRISPR spacer ccgccagcttttgtgttggggccccg Protospacer **********.*.*************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_016928_4 | 4.1|1155561|29|NC_016928|PILER-CR | 1155561-1155589 | 29 | LN846932 | Carnobacterium maltaromaticum strain LMA28 LMA_pa plamid, complete genome | 10622-10650 | 7 | 0.759 |
NC_016928_4 | 4.1|1155561|29|NC_016928|PILER-CR | 1155561-1155589 | 29 | MT670422 | Pseudomonas phage phiPsa397, complete genome | 92793-92821 | 7 | 0.759 |
NC_016928_4 | 4.1|1155561|29|NC_016928|PILER-CR | 1155561-1155589 | 29 | NC_023601 | Pseudomonas phage phiPsa374, complete genome | 91745-91773 | 7 | 0.759 |
NC_016928_4 | 4.1|1155561|29|NC_016928|PILER-CR | 1155561-1155589 | 29 | MT670421 | Pseudomonas phage phiPsa381, complete genome | 92567-92595 | 7 | 0.759 |
NC_016928_1 | 1.1|775552|30|NC_016928|CRISPRCasFinder | 775552-775581 | 30 | KC139649 | Salmonella phage FSL SP-069 hypothetical proteins, RdgC exonuclease, hypothetical proteins, TerL, hypothetical proteins, deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase, hypothetical proteins, NinH, head morphogenesis protein, hypothetical proteins, capsid related protein, hypothetical proteins, enolase-like protein, hypothetical proteins, tail fiber, hypothetical protein, putative endolysin, hypothetical proteins, and DNA polymerase genes, complete cds | 9669-9698 | 9 | 0.7 |
NC_016928_1 | 1.1|775552|30|NC_016928|CRISPRCasFinder | 775552-775581 | 30 | KC139636 | Salmonella phage FSL SP-062 hypothetical proteins, RdgC exonuclease, hypothetical proteins, TerL, and hypothetical proteins genes, complete cds | 9669-9698 | 9 | 0.7 |
NC_016928_1 | 1.1|775552|30|NC_016928|CRISPRCasFinder | 775552-775581 | 30 | NC_025443 | Salmonella phage 9NA, complete genome | 7835-7864 | 9 | 0.7 |
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NC_016928_7 | 7.1|1985054|32|NC_016928|CRISPRCasFinder | 1985054-1985085 | 32 | NZ_CP009062 | Borreliella afzelii K78 plasmid lp28-1, complete sequence | 16532-16563 | 10 | 0.688 |
NC_016928_7 | 7.1|1985054|32|NC_016928|CRISPRCasFinder | 1985054-1985085 | 32 | NZ_CP018749 | Borreliella garinii strain CIP 103362 isolate 20047 plasmid lp28-7 | 15178-15209 | 10 | 0.688 |
NC_016928_7 | 7.1|1985054|32|NC_016928|CRISPRCasFinder | 1985054-1985085 | 32 | NZ_CP028869 | Borreliella garinii strain 20047 plasmid lp28-7, complete sequence | 11910-11941 | 10 | 0.688 |
NC_016928_7 | 7.1|1985054|32|NC_016928|CRISPRCasFinder | 1985054-1985085 | 32 | NZ_CP028878 | Borreliella bavariensis PBi plasmid lp28-7, complete sequence | 4741-4772 | 10 | 0.688 |
NC_016928_7 | 7.1|1985054|32|NC_016928|CRISPRCasFinder | 1985054-1985085 | 32 | NZ_CP028879 | Borreliella bavariensis PBi plasmid lp28-9, complete sequence | 11876-11907 | 10 | 0.688 |
NC_016928_7 | 7.1|1985054|32|NC_016928|CRISPRCasFinder | 1985054-1985085 | 32 | NZ_CP017215 | Borreliella burgdorferi strain B331 plasmid B331_lp28_6, complete sequence | 11994-12025 | 10 | 0.688 |
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NC_016928_7 | 7.1|1985054|32|NC_016928|CRISPRCasFinder | 1985054-1985085 | 32 | NC_017408 | Borreliella burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-6, complete sequence | 14812-14843 | 15 | 0.531 |
NC_016928_7 | 7.1|1985054|32|NC_016928|CRISPRCasFinder | 1985054-1985085 | 32 | NC_015920 | Borreliella bissettii DN127 plasmid lp56, complete sequence | 16601-16632 | 15 | 0.531 |
NC_016928_7 | 7.1|1985054|32|NC_016928|CRISPRCasFinder | 1985054-1985085 | 32 | NC_011779 | Borreliella burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_lp28-2, complete sequence | 16934-16965 | 15 | 0.531 |
NC_016928_7 | 7.1|1985054|32|NC_016928|CRISPRCasFinder | 1985054-1985085 | 32 | NC_001852 | Borreliella burgdorferi B31 plasmid lp28-2, complete sequence | 16891-16922 | 15 | 0.531 |
NC_016928_7 | 7.1|1985054|32|NC_016928|CRISPRCasFinder | 1985054-1985085 | 32 | NZ_CP017219 | Borreliella burgdorferi strain B331 plasmid B331_lp56, complete sequence | 14876-14907 | 15 | 0.531 |
1. spacer 4.1|1155561|29|NC_016928|PILER-CR matches to LN846932 (Carnobacterium maltaromaticum strain LMA28 LMA_pa plamid, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
agctgacgaaaaatcagcttacaataatg CRISPR spacer tgaagacgaaaaatcagattacgataaat Protospacer * ************* ****.****
2. spacer 4.1|1155561|29|NC_016928|PILER-CR matches to MT670422 (Pseudomonas phage phiPsa397, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
agctgacgaaaaatcagcttacaataatg CRISPR spacer gcaggccgaaaaatcagcttccaataacg Protospacer . * ************** ******.*
3. spacer 4.1|1155561|29|NC_016928|PILER-CR matches to NC_023601 (Pseudomonas phage phiPsa374, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
agctgacgaaaaatcagcttacaataatg CRISPR spacer gcaggccgaaaaatcagcttccaataacg Protospacer . * ************** ******.*
4. spacer 4.1|1155561|29|NC_016928|PILER-CR matches to MT670421 (Pseudomonas phage phiPsa381, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
agctgacgaaaaatcagcttacaataatg CRISPR spacer gcaggccgaaaaatcagcttccaataacg Protospacer . * ************** ******.*
5. spacer 1.1|775552|30|NC_016928|CRISPRCasFinder matches to KC139649 (Salmonella phage FSL SP-069 hypothetical proteins, RdgC exonuclease, hypothetical proteins, TerL, hypothetical proteins, deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase, hypothetical proteins, NinH, head morphogenesis protein, hypothetical proteins, capsid related protein, hypothetical proteins, enolase-like protein, hypothetical proteins, tail fiber, hypothetical protein, putative endolysin, hypothetical proteins, and DNA polymerase genes, complete cds) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
cagagaaattggaacgccaatttctacagg CRISPR spacer agctttaattggtacgccaatttctacatc Protospacer . ****** ***************
6. spacer 1.1|775552|30|NC_016928|CRISPRCasFinder matches to KC139636 (Salmonella phage FSL SP-062 hypothetical proteins, RdgC exonuclease, hypothetical proteins, TerL, and hypothetical proteins genes, complete cds) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
cagagaaattggaacgccaatttctacagg CRISPR spacer agctttaattggtacgccaatttctacatc Protospacer . ****** ***************
7. spacer 1.1|775552|30|NC_016928|CRISPRCasFinder matches to NC_025443 (Salmonella phage 9NA, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
cagagaaattggaacgccaatttctacagg CRISPR spacer agctttaattggtacgccaatttctacatc Protospacer . ****** ***************
8. spacer 7.1|1985054|32|NC_016928|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP024776 (Bacillus thuringiensis LM1212 plasmid pLM8, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
acctgtagaatttcttttttcgaaattctcta CRISPR spacer caaattaggatttcttttttcgaaatccttga Protospacer ***.*****************.**. *
9. spacer 7.1|1985054|32|NC_016928|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP009062 (Borreliella afzelii K78 plasmid lp28-1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
acctgtagaatttcttttttcgaaattctcta CRISPR spacer ggaaatagaatttgttttttagaaattcttgt Protospacer . .******** ****** ********.
10. spacer 7.1|1985054|32|NC_016928|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018749 (Borreliella garinii strain CIP 103362 isolate 20047 plasmid lp28-7) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
acctgtagaatttcttttttcgaaattctcta CRISPR spacer ggaaatagaatttgttttttagaaattcttgt Protospacer . .******** ****** ********.
11. spacer 7.1|1985054|32|NC_016928|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028869 (Borreliella garinii strain 20047 plasmid lp28-7, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
acctgtagaatttcttttttcgaaattctcta CRISPR spacer ggaaatagaatttgttttttagaaattcttgt Protospacer . .******** ****** ********.
12. spacer 7.1|1985054|32|NC_016928|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028878 (Borreliella bavariensis PBi plasmid lp28-7, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
acctgtagaatttcttttttcgaaattctcta CRISPR spacer ggaaatagaatttgttttttagaaattcttgt Protospacer . .******** ****** ********.
13. spacer 7.1|1985054|32|NC_016928|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028879 (Borreliella bavariensis PBi plasmid lp28-9, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
acctgtagaatttcttttttcgaaattctcta CRISPR spacer ggaaatagaatttgttttttagaaattcttgt Protospacer . .******** ****** ********.
14. spacer 7.1|1985054|32|NC_016928|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017215 (Borreliella burgdorferi strain B331 plasmid B331_lp28_6, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
acctgtagaatttcttttttcgaaattctcta CRISPR spacer ggcaacagaatttgttttttagaaattcttgt Protospacer . * ..******* ****** ********.
15. spacer 7.1|1985054|32|NC_016928|CRISPRCasFinder matches to NC_018987 (Borrelia burgdorferi 297 plasmid 297_lp28-6, complete sequence) position: , mismatch: 15, identity: 0.531
acctgtagaatttcttttttcgaaattctcta--- CRISPR spacer ---acaagaatttctaaaaaacaaattctgttgcc Protospacer ********* ******* *
16. spacer 7.1|1985054|32|NC_016928|CRISPRCasFinder matches to NC_017412 (Borreliella burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-7, complete sequence) position: , mismatch: 15, identity: 0.531
acctgtagaatttcttttttcgaaattctcta--- CRISPR spacer ---acaagaatttctaaaaaacaaattctgttgcc Protospacer ********* ******* *
17. spacer 7.1|1985054|32|NC_016928|CRISPRCasFinder matches to NC_017419 (Borreliella burgdorferi N40 plasmid N40_lp28-2, complete sequence) position: , mismatch: 15, identity: 0.531
acctgtagaatttcttttttcgaaattctcta--- CRISPR spacer ---acaagaatttctaaaaaacaaattctgttgcc Protospacer ********* ******* *
18. spacer 7.1|1985054|32|NC_016928|CRISPRCasFinder matches to NC_017408 (Borreliella burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-6, complete sequence) position: , mismatch: 15, identity: 0.531
acctgtagaatttcttttttcgaaattctcta--- CRISPR spacer ---acaagaatttctaaaaaacaaattctgttgcc Protospacer ********* ******* *
19. spacer 7.1|1985054|32|NC_016928|CRISPRCasFinder matches to NC_015920 (Borreliella bissettii DN127 plasmid lp56, complete sequence) position: , mismatch: 15, identity: 0.531
acctgtagaatttcttttttcgaaattctcta--- CRISPR spacer ---acaagaatttctaaaaaacaaattctgttgcc Protospacer ********* ******* *
20. spacer 7.1|1985054|32|NC_016928|CRISPRCasFinder matches to NC_011779 (Borreliella burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_lp28-2, complete sequence) position: , mismatch: 15, identity: 0.531
acctgtagaatttcttttttcgaaattctcta--- CRISPR spacer ---acaagaatttctaaaaaacaaattctgttgcc Protospacer ********* ******* *
21. spacer 7.1|1985054|32|NC_016928|CRISPRCasFinder matches to NC_001852 (Borreliella burgdorferi B31 plasmid lp28-2, complete sequence) position: , mismatch: 15, identity: 0.531
acctgtagaatttcttttttcgaaattctcta--- CRISPR spacer ---acaagaatttctaaaaaacaaattctgttgcc Protospacer ********* ******* *
22. spacer 7.1|1985054|32|NC_016928|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017219 (Borreliella burgdorferi strain B331 plasmid B331_lp56, complete sequence) position: , mismatch: 15, identity: 0.531
acctgtagaatttcttttttcgaaattctcta--- CRISPR spacer ---acaagaatttctaaaaaacaaattctgttgcc Protospacer ********* ******* *
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
753874 : 761694
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_016928|753874:761694|DBSCAN-SWA ATTATGACGTAATGTCTAATTTGTGTAATGTCACAGTCATCGTAGTTCCTACATCTATATCACTGCTTACACTGATTTTTGCGTTATTTTGTTGCGCGAGTTCATTAGCTATATATAAGCCTAATCCAGAACCACCCGTTTTTGTATTACGAGAGTTTTCTACTCTGAATGTACGTTCGAATATACGTTCTTGTAGTTCTGGTATAATGCCAATACCTTCATCGCTAATAGCAATGTCGATAGTATCTTGATCTTTATTTTCACTAATATTAATATCAATGCGACTACCAACATTTGAAAATTTTAGCGCATTATCAAGTAAGTTTGTTAAAATACGCTCAAGTGGCGTTCGATATTGATAAAATGCATCAATTTCGCTACAGAAATTCACTTCTAATGTGCGGTTTTCATGTTTGATACGTTGCTCATATGGTTGCAATATTGATACAAGTAATTGGTCTAGTTGTATTAATTCTGGGGGATATGTTTTACCTGTATTTAAAGTGATAATATGAGTCATATCATCAAATAATGTTGATAATCTGTTTGCTTGTTTAATTAATATGTCGTATGACTCTTTAATCTCATGATCCTTTGTGATTATACCATCACGTAGTCCTTCAGAATATGAAATAATGCTTGCTAAAGGTGTTTTTAAATCATGGGCTAAGTTTTGAATCAGTTCTGTTTTTTCTTGTTGTTCGGATTTAATTTGATTCATTTGTTGCGTAATTTCAGAAGCCATTTTATTAAAAGATTGATTTAATTCATAAATTTCTTTTGGTGAATTAAACGTTTTATCATTGCTTGCGTAATTTCCGTTAGCAAATTGCTTAGTTTTTATATTAAACTGCTTAATTTTTTGTATAAGTGGATTAATAAAAATACTACATATTAATAAGGTTAAACAGCTTGTAATTATTGTCGTTAAGGTCAAAGTTAGTGTCATATGGCCGTTAAACCACATTAAAATATATGCAATTGCTAAAATAGTTGAAGTTAATAGTATACTCGATACGACGCCAATAATGATTTGACTTCTAATTGATAACACCATTATCGGCTCCTTTCAAATTTATATCCTAATCCCCATACAGTTGTGATGGTATATGTTGTAAAGCTCTCTTTTTCTAATTTTTCTCTAATACGGTGTATATGGACATTCACGGTATTAGCATCTTCGTAATAGTCATATCCCCAAACTTTTTCAAGTAATTCTGATTTAGAAATAACTTCATTTTCTCTAGAAGCTAAATACCACAATAACTCAAATTCCTTAATACGCATAGGGACTTCGTGACCATTTACAGTCACAACTTTACTTAAGTTAATAAGTGTTAATTCATCAAACGACAGTTGTTCAACTGGTTGATGATGGTATTTCTTCATTCTTGTAAGTAAATTATTAATACGTAAAACGAGTTCCCTTGGACTAAATGGTTTTTTGACATAGTCATCTGCACCTAAAGTTAAGGCGTAAATGGTATCATGTTCTTGTGTTTTGGCAGTTAAATAGATAAAGGGGATATCTAATTTTTGCCTTTTCATTTCTTTGACAATGTCGTAACCATTAACTTCTGGCATCATGATATCAAGTACCATGATATCAATATCATTTGATAGTAAAGAAATTGCTTCTTTACCGCTAGTTGTCGTTGTTACTTTGTAACCTTCATATTCAAAATAGGTTTGACAAATGTCTACAATGTCTTGTTCATCATCCACGATCAGTAAGTGGGTCATCTATTTTTTCACCTCTGTTCTTACGACCTCTAAAGTAATTAATGATTTCTTTAAGTGAAATCTGTTTTAACAATGAGTGACTCATTAGTAAAAGGATAAAGAAAGTTAATTGAAGAGGATACGTAAATATCATATCTGCTAAGATATAATTTATCATAACAAAGGCTCCAAAGAAACTAGCAGCATATGCAAAAACTCCAAAAATTAAACCTAATCCAATTGCAATCTCTCCGAGTGGGACAACAATATCAAATAATGACGTCGTATGTGCAACTATATTTGCGAAAAACCACTTATACCACTCTGGTGAATCAGTATTGTTAGCGATGACTGGTACTAAACCTTTCAGCGTAAATCCGCCCGTTAATTTTTCGTAACCTTGCATTAACATAACAATACCTGAACCCACACGAATGATAAATGTAACGAGTAGCAATAATTTATTCATGATGTTCACATTCTTTCTATTTATTGTGTGTAATTTATATAAACATAAGATTAAGCAACATAATGCGATTTGTAGTGTTATGTGAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTACAATCTTATGGGATTTAATAGTTATATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTTAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAACTCAGAAATTGATTATTTTAATTTAGCGCCGCCGAAGATGACGTGAGCTTTTTTACAATAGATTGTTACTTCATCATATTTGCTTAAATCTACATTTTTAAGATCAAATGTTTGTTTTTCTTTATCGTAGTCAACCATTGCGATTTCTTTACCGTTTTTAATGTCGCCATTTTTTGTTAGATAGACGTATAAATCTGGACCTTTTGATGATTTGTAGTTAGTAAGCATTAATTTACCATTTTTAATCTCAGCTTTACCTTCAACAGTTTCACCGTTTTTAGAACTGAATGTACCTGTTAGGTGTTTTGTTTTATCAGTTTTAACATTGCTATCTTCTGACTTTGTTTTTTGTTCAGTTTTGTTACCTTGATCTTGTGAATTAGAATTACCACAAGCACCTAAAGCTAATGTTGTGATAACAGCACCAGCTGCTAAAAAATATTTTGTATTCATGCTAACTCCTCATTTCTTCAATTTGATAAGTTAAGTTTAAAATGAAGGCAAATAATATGCCATTAACTAATTCTTAACTTCGTTTAAATATCGCTTAACTAATATTGAAGAAAGAATAATTTGAAAATGAAAATAATTGTCTGATTTAAATAAATAGGAGTCAAAATAAGAGGAGGGCGGTTTTTTTAGTAAGAAAATATTTATCTAAACTAGTTATCACTATAAAACACTTCTGATATATCGAACTAAGAATATCAGAAGTGTTTTATAGTATTGGTATTAAAATTTATAAACCTTTTGCCACAATAAAAACAACAAGAAAATAAGATAGACGATTAAATACAAGTACCAATATGGTGTTAAAACCATCATAACGATAAATGAAATGTTAATAATGATAAGTCCTTTAATCATTAGTTTCTTTATTTTGTTATTATTTTCAGCAGTTTCATCTAAGTTATTAAATGTTGAAATAAACAACATAATACCACCAATGATAAAAATGGCAGGGGCTAAAAATGGAATAGACATATATATTGATTGTGTACTTGAAAAGTCGGTAACACGTTGCGTTAAACTGACAACAATCGTTAATATGATAGCAATAAATTTTTGGTCTGTAATGTATACAGGTTTTAATTTTTTATCAATGTAAAACTGTAGTATCGTCCAAATGATAAACATCGTTATAGTACACAGAGTAATAAAGTTATATTTATCAATTATGAATGTATTTATAAAGGCGTTTATAGTAATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTAATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTTATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGTAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCTTTTTTATTACTCCAAAGTAATGTATGAAGTTGTGGTAACACATAAACGTGATTCATATCATTACTTTGCATAACTAAATCTACCAACTGCTCGTAGCGTTCTAACAACTTTTCGGTATGATTATCTACGCTGTCTGATAAATATGGGTTACCAACTTGTAAATAGAACGGAATATCTGGATAACGGTGGTGTATCATTTTGGCAAAATCATAATCTTTATCGTCGAATACAACTACTTTTAAGTTTAATGAGGAAGGTACGCATTGTGCAATCACTTCATCTAACTTTTTTAAATCAGGTGTCATAGTTGAACTTGGTGGTTTTGGACTAATCGTTAAATCATCAATTTGTGTCATCCAAGGTTGGAATTTACTGCCTTGTGTCTCCAGTGCGCTGAAAATACCTTTATCTTGAAATAAGTCAACTAACTCTTGGATACCTTTAATTAATGCTGGGTTACCACCAGAAATTGTAACGTGGTTAAATAAATCGCCACCAATTCGTTTTAATTCATCATAAATTTCTTCAGCAGTCATGAGTTTTATATCGCTTTTAGCACTACCATCCCAAGTAAATGCAGAATCACACCAGCTACAGCGATAATCACATCCAGCTGTTCTCACAAACATCGTTTTTCTACCGATTACTCGACCTTCACCCTGAATGGTTGGACCGAATATTTCGAGTACAGGAATTTTAGCCATTAGTTACACCTGTTCCTTTGGTCTAAATACGACATAACTTGTTGGTGTTTCTCTTACAAATACTTGAATACATTTTGGTTGGTGTTCGAGCGATGCCAAATTTTCTTTAACAATTTGATAAATTGTTTCCGCTACGATTTCAGTTGAAGGGATTTTGTTTTTAAAAGCAGGTAAGTTATTTAACAGTTGATGGTCAAATTTACCGTGTATCATCTTTTTCAAATGGCTAAAGTTCACTAAAAAGCCAGTGTCATCTAGTTTATCACCGACAATTGTTAAATTAACAAAGTAAGTATGACCATGGACATTTTGACAAATACCTGCTTCTTCACACGGAATGTGATGTGCAGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_016928|753874:761694|758946_759615_-|WP_000446724.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL >NC_016928|753874:761694|757125_757710_-|WP_000637683.1|DBSCAN-SWA MIVYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNNLDETAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF >NC_016928|753874:761694|759965_760559_+|WP_000604508.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDIINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDEAIIMAFEHITFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI >NC_016928|753874:761694|753874_754930_-|WP_000244415.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCSEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENKDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS >NC_016928|753874:761694|756405_756846_-|WP_001093553.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAAGAVITTLALGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK >NC_016928|753874:761694|758525_758945_-|WP_000941336.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV >NC_016928|753874:761694|757808_758522_-|WP_001062976.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKSDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVIAQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >NC_016928|753874:761694|754929_755616_-|WP_000149344.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR >NC_016928|753874:761694|760542_761694_+|WP_001217800.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHVMCTHSLAKDDIYAVAYSFEKAESINSTYEHQTSYVSKHHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIVRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKTNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML >NC_016928|753874:761694|755590_756064_-|WP_001037807.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIVVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG |
10 | Hokovirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
773675 : 788185
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_016928|773675:788185|DBSCAN-SWA TATGAAAGAACAACTTAATCAACTATCAGCATATCAGCCTGGTTTATCTCCAAGGGCATTGAAAGAAAAGTATGGCATTGAAGGAGATTTATATAAACTTGCATCAAATGAAAATTTGTATGGACCATCGCCTAAAGTTAAAGAAGCGATATCATCACACTTAGATGAGTTATATTATTATCCTGAAACAGGATCACCGACATTAAAAGCGGCGATTAGTAAACATTTAAATGTAGATCAATCACGCATTTTATTTGGTGCGGGATTAGATGAAGTTATATTAATGATTTCTAGAGCAGTATTAACGCCAGGGGATACTATTGTTACAAGTGAAGCGACATTCGGTCAATATTATCACAATGCGATTGTTGAATCAGCTAATGTGATACAAGTACCTTTAAAAGATGGTGGCTTCGATTTAGAAGGTATTTTAAAAGAAGTTAATGAAGATACGTCATTGGTATGGTTATGTAATCCAAATAATCCTACAGGTACATATTTTAATCATGAGAGCTTAGATTCGTTTTTATCTCAAGTACCTCCACATGTACCAGTAATTATAGATGAAGCTTATTTTGAATTTGTGACAGCAGAGGACTACCCGGATACACTTGCTTTGCAACAAAAATATGACAATGCATTCTTATTACGTACATTTTCAAAGGCGTATGGATTAGCGGGTTTACGTGTAGGATATGTGGTAGCAAGTGAACATGCAATTGAAAAATGGAACATTATTAGACCACCATTTAATGTGACACGTATATCTGAATACGCAGCAGTTGCAGCACTTGAAGATCAACAATATTTAAAAGAGGTAACTCATAAAAATAGTGTTGAACGTGAAAGATTTTATCAATTACCTCAAAGTGAGCATTTCTTACCAAGTCAAACGAATTTTATATTTGTAAAAACAAAGCGGGTAAATGAACTTTATGAAGCACTTTTAAATGTAGGGTGTATTACGCGACCATTTCCAACCGGTGTTAGAATTACAATTGGTTTTAAAGAACAAAATGATAAAATGTTAGAAGTTTTATCAAACTTTAAATACGAATAGTAAGTGTCGTCACATTGTATAAAAATGTGCTAAAATGCAGTGTGAATTAAGAGGCGAGAGTATTCAGTGGTAAAATGTGACAATAGATGATATTGTTTTGTATCAATTGCTTTTTTGCTATACTGAATCAATACTGATATTTTGAGGAGAAGATTAAAATGACCCGTAAATCAATCGCGATTGATATGGATGAAGTATTGGCAGATACATTAGGAGAAATCATTGATGCTGTCAATTTTAGAGCGGATTTAGGTATTAAAATGGAAGCTTTGAATGGTCAAAAACTTAAACATGTTATTCCCGAACATGATGGATTAATTACAGAAGTATTGAGAGAACCAGGCTTCTTCAGACATCTTAAAGTGATGCCGCATGCACAAGAAGTTGTGAAAAAATTAACTGAACATTATGATGTATATATTGCTACAGCAGCAATGGATGTACCAACATCATTTAGTGATAAATATGAATGGTTACTAGAGTTCTTTCCATTTTTAGATCCTCAGCATTTTGTTTTTTGTGGTAGAAAAAACATCGTTAAAGCTGATTATTTAATAGATGACAATCCTAGACAGCTTGAAATTTTTACTGGTACACCGATTATGTTTACAGCAGTGCATAATATTAATGATGATCGATTTGAACGCGTAAATAGCTGGAAAGATGTTGAACAGTATTTTTTAGATAATATTGAGAAATAAAAATATATCACTTGAAGCATTTCATGTAGCAAATAAAATCATATACTGGGGCCCCAACAAAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCGAGTTGGGGTGGGGCCCCAACACAGAGAAATTGGAACGCCAATTTCTACAGGCAATGCGAGTTGGGGTGGGCCCCAACATAAAGAAATACTTTTTCTTTAGAAATTAGTATTTCTTATGCATGAGTTGCACTCATGCATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGTGACTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAACCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCTCACTCTCAATAAATGTAAGTCTATCTCATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGTCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGAATTTGAAAAAGACGCATAAACCACTATGATTTAAAATACAATATCAATCATTTTAGTGGCATGCGCCAAAATTATATGTCTGTTTTTGAAACAGGGTAATAGCTTAAAGCTAATAACAACGAATATAATGTACGTTGAATCTTATGATTACACTTTAAACCTAATATAATATCCCGTTAAGATCATTCCGGATGCTTACAAATCATTGACAGTAAGTAACTGAATGGCATTTGGTATAACTTCAATATCAATAGGTGTTTCTAATGAAATTTCGCCATCAATATCAACTTTCATTGCTGGATCTGTTGTAAGTGAAATCTTTTTACCAGGTATATGCTCAATACCTTGAGTAATTTCATTCCAATTCATGCTATCACGCTTTTTAAAAATATCATTTAAAATACTGAAACTTTGTTCATTAAAAATGAAAGTGTTCAGTTCACCATCTTGAGGAGACAAATCAGTCAATGGTATACGACTACCACCAATAAATGGACCATTTGCTGATAGTATCATGGTCGTTTCGCCAGAATATGTCTTATCATCAATTGATAATTGATAATTAAATTGTGTTGGATTTAGCAGTGTTTTGACAGTTGATCCAATATAACTCAATTTACCAAATATATCTTTTGAACCATCTTGTACGTTTTCAGCGTTTTGAACAATTAGACCTAAGCCAACAAAGTTGAGTGCATATTGATTATTTATTTTAATTACATCGTATGTACCAACTTGTGCAGAAATCATTTGTTCACTAGCTTGTTTATGATTAGGTGCTATATTTAGCGTTTTTGTAAAATCATTAAAAGTACCGCCTGGTAAAATGCCAATAGGGAGTTGAAGGTCATGTGTCATAACACCATTTATAAGTTCGTTAACCGTGCCATCACCGCCAAGAATAAATAATATATCTACATCTTTTGCATAGTTTTTAGTTTTGATTTCTTGGCAATATTTAATAATGTCACCTTCGTTTTCACTCAATTGAATAGAAAGATGCTTACAAATTGAACTTAATGCTGTTGTAACTTCCCCAATACCTTGATTAATATTTTTTAATCCACTATGTTCATGGTAAAAGAGGACACCATGTGTATATTTATTTTCCATAGTTTAGCCTACTTTCTAAAAATTGGTTCATTAAATATATATATACCCACTTTTAATTGTTAATACCAAAAATATGTTTTTAAATAGAGAAAATGGTAATAACTGACATTGATGTCTATAGAGTGGGACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAACGAGCATATTAAGCTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTAAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGAATGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAGGAAAATAAAGTAATTTGTTTGACCTAGTGGTTCTATTAACTTAACTAAAGTACCATTGATTGCTTGTGCAGAAGCGTTAGTTAAGTACCAAATACTCATCATTTGGGCATTAAATGCTTTAGGTGCTAACTTAACAGCAGCACTATTACCCGTTGGTGATAAGCAAAGCTCACCGATAACACAAATAATGTACGATAGAATAACCCAGTTAACTGAGAAGTTTGATGAACCTGATGCATAACCTACAATACCAATTAGTATGTATGACGCACCTGCTAAGAACGTACCAATTGCAAATTTTACTGGCAGGCTAGGTTGTTTAGTTCCAAGCTTTTGCCATAAAAGTGAAATAATTGGAGCTAATAATAAAATAAATAATGGGTTAATTGATTGGAAGATCGCTTCACCAAAGTTTGTTTTCCAACCAAATAGGTTTAATTTCATATCTGAATGTTCAATTCCATAAATGTTTAATACATTAGACCCTTGTTCTTGAATAGCCCAGAACACCATTCCAAGAATAAATAATGGAATAAATGCTTTAACACGAGAACGTTCAGTATCAGTGACATCTTTGCTTCTAATAATTAAAGTGAAGTAAATGATTGGTAATGCAATACCTAATACTAAAACAGTATTACTAACTAAGTTAAATGATAATGAGTTAGTTAATGCACCAATAACGATAATTAATACAATTGCTAAGACAACACTTCCGATAATAAGACCATACTTTTTCTTTTCAGCTGGTGTCAATGGGTTAGTAGGTTTCATACCAACGCTACCTAAGTTTTTGCGGTTGAAAAGTACATACCATACTAAACCTAATGCCATACCAACTGCTGCAATCAAGAATCCGCCGTGGAAGTTTTTAACATTAACAAAGTGTTGCAAAATAATAGGTGATAATAATGCACCCATATTAACTGACATATAGAAAATAACAAAACCTGCATCCATACGTCTATCATTTTCAGGATATAAACGGCCAACGATATTTGAAATGTTTGGCTTCATTAAACCTGAACCAATAATGATGAAGAACATTGATGTGAATAAGCCGATTAATGCAAATGGTAAGCTTAAACAAATATGTCCGATAATAATAAATACGGCACCTAATAAAGTAGCGCCTCTAGTGCCCGTAATTCTGTCAGCAATCCATCCGCCTGGTATTGATGTCATATAGATTAATGAACCATAAACTGACATAATTGACATAGCTGTTGTTTTATCAATTCCAAGGCCATTATCTGTTACGGCAAAGTACATGTAGAAAATGAGTAGGGCACGCATGCCATAATAACTAAACCTTTCCCAGAACTCTACAAAGAAGAGTACGCCTAGTCCTCGAGGATG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_016928|773675:788185|774892_775435_+|WP_000197262.1|DBSCAN-SWA MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPHAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEK >NC_016928|773675:788185|779076_779577_-|WP_000930014.1|DBSCAN-SWA MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >NC_016928|773675:788185|786470_787427_+|WP_001245572.1|DBSCAN-SWA MRNNNKKIMLLIAVTLLISMLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQAITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVLPVFLFGIQSVWVTNVYLNFIITLITMVLFALILFQGIFKIGHFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVLLVILLVITIFLLPYLDVLLLGRAEAINLGISYEKLTRILLVIVSVLVSVSTALVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWVVENVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVRRRNAQ >NC_016928|773675:788185|783847_784819_+|WP_000562498.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >NC_016928|773675:788185|781263_781662_+|WP_000692521.1|DBSCAN-SWA MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >NC_016928|773675:788185|779596_780463_-|WP_001068497.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK >NC_016928|773675:788185|787423_788185_+|WP_000616873.1|DBSCAN-SWA MIQVGNLTKTINNQTILEDISIDIEKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAICRLIRFDNGEVKIDGQLMSDYKNNDLSKKISILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRLTKEDHDIVNDALDLLQLQDIRNRNIKSLSGGQRQRAYIAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHAVQIMQTLKMLAHKMNKAIVIVLHDINFASCYSDQIVALKNGQLVKSDLKDNVIQSSVLSDLYDMDIQIEHIRNQRICLYFKD >NC_016928|773675:788185|776042_776960_-|WP_000429011.1|DBSCAN-SWA MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMTHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILSANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >NC_016928|773675:788185|781624_783730_+|WP_000855509.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYSVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >NC_016928|773675:788185|785318_785474_+|WP_000499195.1|DBSCAN-SWA MFYFTLSKQNTHSEKLNFSLIANINKIDTKLFERLLKLWSKNATINEKYYQ >NC_016928|773675:788185|777052_777154_+|WP_031760357.1|DBSCAN-SWA MVITDIDVYRVGRENIVIAVYNEHIKLLFILIS >NC_016928|773675:788185|785512_786484_+|WP_000876317.1|DBSCAN-SWA MKYLLKGNILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDLLHLTESQRNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSICGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMEGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ >NC_016928|773675:788185|777231_778737_-|WP_000193751.1|DBSCAN-SWA MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >NC_016928|773675:788185|773675_774734_+|WP_000663039.1|DBSCAN-SWA MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISSHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNEDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPPHVPVIIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEHFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE |
14 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
868819 : 890320
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_016928|868819:890320|DBSCAN-SWA 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>NC_016928|868819:890320|879731_880094_+|WP_001039168.1|DBSCAN-SWA MNKNQLKSEILEYIKAHAGTSFVEIERVFEENNFDYKGDGAYTSGQHPNVVFWIGWNQEAFDVIAELKKDRRIEMDICEPIVYMVDGKGLDLPIVRSKNIKTDHWLPVTFTISKKETECV >NC_016928|868819:890320|886626_886827_+|WP_000382163.1|DBSCAN-SWA MDVDNMSDYKLKIIELIKSDITGYQIHKQTGVAQYVISQLRQGKREVDNLTLNTTEKLYSYARQVL >NC_016928|868819:890320|881534_881876_+|WP_001190615.1|DBSCAN-SWA MQSIAEKETYHLPTEHLQVFNVIKNTSNKYITKTKILNQLGYEYNSSNERWLRRVINSLVYDYGYPIGCSYKPSERGYYIITTEQEKQQAMRSIKKLADGSMKRYEALKRIKV >NC_016928|868819:890320|885375_885933_-|WP_001035631.1|DBSCAN-SWA MNKKLLTRTLIASALVLTTVGSGFHSSSNYNGINNVAKASEITDRDLWKNVRDALKEANIIDKTANETVGVTYNLNNGGESSITGTADLDELSNFNNKPINTDSVKRIDLSRINPNGNRFDANDAWKKLTDKLKEKQIVKNGDTVTIHSKDKNDPPISAKVGENYNGNKGLMLNQRDITKITITK >NC_016928|868819:890320|876706_877027_+|WP_001103942.1|DBSCAN-SWA MNWEIKDLMCDIEVIKQKINDVATKHAWFVEDRFVKNELETKREHINFSASYLEHRIQNEHTVELLHVYLKEFSELIQKFHEIEKASSENFDEESDDAKNSIKVAE >NC_016928|868819:890320|880376_881018_+|WP_001019764.1|DBSCAN-SWA 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MIELKEVVKEYRTKNKEVLAVDHVNLSIRAGSIYGVIGFSGAGKSTLIRMFNHLEAPTSGEVIIDGDHIGQLSKNGLRAKRQKVSMIFQHFNLLWSRTVLKNIMFPLEIAGVPRRRAKQKALELVELVGLKGREKAYPSELSGGQKQRVGIARALANDPTVLLCDEATSALDPQTTDEILDLLLKIREQQNLTIVLITHEMHVIRRICDEVAVMESGKVIEHGPVTQVFENPQHTVTKRFVKEDLNDDFETSLTELEPLEKDAYIVRLVFAGSTTTEPIVSSLSTAYDIKINILEANIKNTKNGTVGFLVLHIPYISSVDFGKFEKELIERQVKMEVLRHG >NC_016928|868819:890320|880095_880380_+|WP_000998181.1|DBSCAN-SWA MNDKEKIYNQLHHDAPIQIMPAPENLFVEYIEDGEVWYSPVVCIALSKAHNINFYDSDDVGCIDKAATCSIKKFNPETGEFEQFSKMAQKEITQ >NC_016928|868819:890320|883411_883624_+|WP_045181470.1|DBSCAN-SWA MADDNIDDHIVKNHLEMIVDRVANDKEFYIFDSLIQGRSFKDISNVLECSEQSVRLWYETLLDKIVEVIE >NC_016928|868819:890320|883620_884190_+|WP_001293067.1|terminase|DBSCAN-SWA MSELTAKQARFVNEYIRTLNVTQSAIKAGYSANSAHVTGCRLLKKPHIKQYIQEQKDKIIDENVLTAKELLHVLTNAAVGDETETKEVVVKRGEYKENPKSGKVQLVYNEHVELIEVPIKPSDRLKARDMLGKYHKLFTDKHDINGNVPIFINIGEWDGDDEELDKAVKDVSNANPNHTVIVDDIPLED >NC_016928|868819:890320|875290_875623_-|WP_001260004.1|DBSCAN-SWA MRTNDEIITIIKTSMKEQNMSLSELARRVGVAKSAVSRYLNLTREFPLNRAEDFAKVLGIKTEYLLGFAEREESTKQDTIAAHLDGDFTEEELIEIRKYAELVRKAHRNQ >NC_016928|868819:890320|872822_873551_-|WP_000733774.1|DBSCAN-SWA MKKLISILLINIIILGVSNSASAQGDIGIDNLRNFYTKKDFVDLKDVKDNDTPIANQLQFSNESYDLISESKDFNKFSNFKGKKLDVFGISYNGQCNTKYIYGGVTATNEYLDKSRNIPINIWINGNHKTISTNKVSTNKKFVAAQEIDVKLRKYLQEEYNIYGHNGTKKGEEYGHKSKFYSGFNIGKVTFHLNNNDTFSYDLFYTGDDGLPKSFLKIYEDNKTVESEKFHLDVDISYKETI >NC_016928|868819:890320|876494_876704_+|WP_001058486.1|DBSCAN-SWA MNNEQKEVIEHLVYQLELSVMNNLESYEHTEYVNGIEVVSEISREKHLELIMKWCAQELKNNFQLEKGE >NC_016928|868819:890320|877976_879446_+|WP_000390454.1|DBSCAN-SWA MEDVTNEEVFEMIDSRTGVLNANDWKSQLRRSATTQALKKTTTNAEIILCNDESLKGLVQYDAFEKVTKLKRLPYWRSKGDTNYYWADIDTTHVISHIDKLYNVQFSRDLIDTVIEKEAYQNRFHPIKSMIESKSWDGIKRIETLFIDYLGAEDNHYNREVTKKWMMGAVARIYQPGIKYDSMIILYGGQGVGKSTAMSKLGGHWYNQSIKTFKGDEVYKKLQGSWICEIEELSAFQKSTIEDIKGFISAIVDIYRASYGKRTERHPRQCVFVGTTNNYEFLKDQTGNRRFFPITTDKNKATKSPFDDLTPDVVQQMFAEAKVYFDEDPTDKALLLDKEASEMALKVQEAHSEKDALVGEIEEFLERPIPSDYWYRTLEEKRVSAHDVIDQDYIKLYGDGKLIELPNTKPGAYVWRDKVCSMEIWKVMMKRDDQPQQHHLRKIDKALRNTSYCGQSKSRHRFGEGIGRQYGFGINLISYYQGLKSKEQK |
33 | Staphylococcus_phage(77.78%) | coat,terminase,integrase | attL 867126:867147|attR 887788:887809 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
978592 : 1022310
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_016928|978592:1022310|DBSCAN-SWA 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39 | Streptococcus_phage(33.33%) | transposase,tRNA,protease,holin,bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1056524 : 1064997
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_016928|1056524:1064997|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_016928|1056524:1064997|1061922_1063407_+|WP_000483727.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSNQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >NC_016928|1056524:1064997|1058121_1058826_+|WP_000174047.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHIKLLNIATDKDIETLKTKALEINQVLKNLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATSANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK >NC_016928|1056524:1064997|1064430_1064997_+|WP_000238670.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNKDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRQCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >NC_016928|1056524:1064997|1056993_1058118_+|WP_001010401.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVAVLDPAEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISSQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETCECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGNNNQITYFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKTAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSERKDSRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN >NC_016928|1056524:1064997|1059754_1061944_+|WP_000032747.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKNYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGVLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >NC_016928|1056524:1064997|1063399_1064428_+|WP_000030810.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDLFLEPTKLYVKPVLTLKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGDIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDASRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >NC_016928|1056524:1064997|1059090_1059762_+|WP_000666799.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >NC_016928|1056524:1064997|1058825_1059089_+|WP_000848350.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLDDEKENA >NC_016928|1056524:1064997|1056524_1057007_+|WP_000861570.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARERGIDIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILAARMLSIQNPSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1322942 : 1330446
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_016928|1322942:1330446|DBSCAN-SWA TATGAATTGCTATGATGAAATATACAATACAATCAAAAAATTGATAGAAAACAAAGAGATAACGAGTTATCAAATTAATAAAGATACAGGAATAAGTTACGGTAATATTAATGCTATGCGCCGTGGAGAAAGAAGAATAGAAAATTTAAGCTTAAAGAATGCAAAGATCTTATATGAATATGCGAAAAAGGTATTATAATATAAGCATTGAGTTCAATAGGCATACAATAACTGCCCAAACTAGTGACTGAGTGGGAGTTTTTATAGTATTAAAAGTTTTCTAAAAGCGAAAGAAATCATGTTTACTGATTTACTTATGTTTTTAGAAATAGTATAATAATTTTATATAATATATAGAACTTCAGTATACCTTTTGAGTATATATGGAGTTCTTTCTTTTTTACAAGATGTATATGTATAAATGGAAATGTTTATTACATTACATAAAAACCTTTAGGTGCTCTTAGATGGATGTTAATCATAAAACAAAGAGATTTTGAAAAATATAGGCTATTATAATTTAGAATTACAAATTATTAATCTTGCCATTGGATATGGGAATTCAAACATATCACTTACTCCAATTTGTGGAATGTTAAATAACTATAAAGAGGAAAGGAGAAAAAATGATAAGAATGGTTAAAGAAAAAGAACGAATAGCAAAATTAAATTTCGAATAGCTGTGACGAGCTTAATAATTCAAGTACTTAATTTTATCAAATCGTTCTTTTAAAAAGGCAAAGGGCAAAAGACCTTTACCACATTAAATAGGGAGGTGGTATTTATGACAAGAGAATTAAGGAAAAAATTAACTCTCTACCTTAACATTGCAACTTTAATATTATTTATTATTAATTTAACTAGAAAAAAATAAACTATTCTTTCATTTTGACAAAAATAATGAACCAGTTTAAAGAAATTTATAATACAATAGAAAAATTACTAAATGATAAATCAATATCTAATTATAGAATTAATCAAGACACTGGTGTTTCTTATGGTGGTATAAGTGAATCAAGAAGCGGGAAAAGAAAAGTGAATAATTTAACTTTAGAAACAGCGGAAAAACTCTATAATTACCAAAAACAATTAGAAATAATGATTGAAGATTAAAATAAGGCCATATCTTTTGAAATATCATGGAGTGAGCCTTTTAAATCATATAATTTTAAAGTATATTAAAGATGGATAGCTTAATGTGAATATAAATAAAAAATTATCGAATAATATAATATAGAATATATGAAGACAAGAAATTTTATCAATATATAATAAAAAAAGCCAATACTATTAGGTATTAGTTTTTGAATTAACTAGTTTGGCAACTACAAAGAAACAATGTATTGCTAAACGTAGTTACTGCATTAGGATTATTATAATTATAAATAGAAAGAGAGCGTGATTAAAAATGAATGAGATTGAAACTATTATAAGTGAAATAGAAAAGTTATTAACTAACAATACACCATATAGTATTTCAAAAAACTCAGGTGTACCACGTCAAACAGTTACTGATTTAAAGGTAGGTAATACTAAAATAAAGGATGCCAAATTTAAAACAATAATCAAGTTATACGAGTATCAAAAGTCGTCAGAAAATAATTCAGAGTGCTAATAAATATACCTTGTTTGATTAGGTGGACAAGAAATTAAATTTCTAATGATTTCATGGTTGTCTGTCCACGCTTTGTCCACCTCAATAAAATTATCTCTAGGTTTTTAAAATTGTACATGTTTAAACAATCAAAAGTATGCATTATTATATTATCATTTCCATAAAAATTTAAATGATCTTTAAGTGATGATATAAAAGGCTGAACATAGTAAATAAGTTAACTTTAATGCAGCATACTATACATATTTTATAATAATGTTTATGCACATAATTTTTTATTGACAATTTTTTATATTAAATTGTGTAATTGGCATATATGATGATTTGTGATAATTATATTGTAATATAGCATTTGGTTTTATGATTCTAAAATTAATAGATTTGAAAAGTATACTTTATTTCATGAAAGTTTTTGGTACATTTATTTGAAAATGTTTTTATTACAAAGTTACATGGCTAAATGTTTCTTAACAAAATTAATTCATCGAGTGTAAAGAATCGTGTGGTAAACATAATTTATATAGATTATAAGGAGGTGAAAATGGTCGAGGAAGTAAAAACGATAAAATAGTTTGAATGTTTTGATTTCAATTCTGATAGGACTATTGAATTTGCAAACTAATAAGAATGTGAGGTTTGATTTAATTCGAAGTCATATTCTTTGAATAAAATATTACTTTCTTACCATTAGTAAAATGAAGATGACTATTAAAGTGCGAAAAACAAATAAAAAAGAGAAAATAGAATTTTTAATAGGGACGTTTATAATTATTCTAGTAATATTAGGCTTCAAAATTATGAAATAAATGTATAGTATTTGAGAAGTCTATATGACTCCGGAAAAATTAAAGTCTAAAGATATTTCAATATCTCAAATTTAATAGACTACTGGAATTAGTAGTTTGAATATTGAAAGACTCTAATCTAATAAAAATACATAAAAGGTTAAACTTTAGAAGTGGTTGTAAACTTCAATGAATACTAAACATTGAAGTTTAGTAAAAGGCGTAAGGTATACAAGACAAATCGTTTGTCTTTGACAAAGTAATTGATGATGTAAAGTCGTTAATATGTAGAAACAAAAATTGAAAATATGAAATTTAACTATTATGAAGTGATGATAGCCATTAATGAATAGAAAAATAATAAAATCATTTATAAATAAAAAATACGTTAAGTTCACAGAATTTCGAAAAAAAGCAGTAAACATTGTACAGATATGGAGATGAAAAAAATGTCAGAATACAAGAAAAAGATAATTGAATTAATTGAAAGTAATTTAACAGGATATGAAATTTCTAAAAAAACTGGAGTTTCTCAATACGTACTTTCACAATTAAGACAGGGCAAACGCGAAGTAGATAATCTAACCCTGAATACAACAGAAAAATTATATGAATATGCCAATAAAGTTTTGTAATATAACTACTGTATAAATTAATCAAGCTATGTTTATTTGATTTAACTATTAATAAAAATCATATGGTGAATGGATATTATAATAATTAAAATACAAAAATAGTAGATTCCAATTTGTGAAAAAGGAGTATGTTGTTTCATTTAGAATTTATTGCACGAAATTAGCATCGAATAAGGGAAAATAAGTGTTAAGTTTTAAATGATAAAAAAGATTGGAATGGATCGTCTTGAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTCGAAGGGGGCATTTCCATTAAATTGTTATAGCTTTTTATATTTGTATAATGAACATATAAGTTTAAGAAGATGCGAGTGAAGGAAATAAAAAAGCTCAAATGTACCAAATTGTTAATCTTAATAAATCTCTACTTTATAAAGATTGAATGGACATTCGAGCGTTAATCAGTCAGGAGGGAATTTCACTCCTACAATTTAATAATAATACTTGCTTCACCACTGTACAAGGAGTGATTTGTTATGTTCAAAGTGAATTATTCGATTTTAAGTTATTATCCAGAATATAATATCGCAGTAAGTTGGCAACGTTTAAGAGAAGGAAAAATAATAAAAAACAAGATTTAATACTGCTGCGTCATGAGGCGCTTGAACATTATTTGATGAATAAGTATAATTACAACTATGATTATGCACATAAAATTGTATCAAAAAATACGATTATTCAATTTTTATAAAAATAAGGTGGATTAAATGCTTACATTAATAAAATTGAAAGAAGATGAACAGGTTATAATATATGAATATATACCTGAAGATGATATAAGTAACGGTAAAGGTTCAGTAACTTTTAATAAAAAAGATGCAGAGGTTATAGATTTTTCATTATCTGAAATAGAAAATGAAGAATATTTTATGTTATATCGTAATAAGTCTTTTTCTGTAGTAAGAGACTTTATCGAGAAGCAAGAATTTCCCGAAAATTATAAAATAGCTTGGTATTAAAGCATCCTTTCTACACAGATAAAGAGAAAGTGGTGCTATTTTTATACACTTTTTTAACTATTTACTGAAATAGCAGAATCACAAAAGTTAACATATTTAAAAGAACTTGGTGAAGATGGTGAATATAAATATGTTGCCAAAATAGATAGTGAAACATCTAAATTATGTCATTCACTCAACGGAAAAATATTTAAAGTTAAAGATATGATACCAGGTGTGAATGCGCCACCTATGCATCCTTGGTGTAGAAGTACCGCAGTGCCATATGTCGGCAAATGGCGAGACAAGTTCTTTAAAGAGCGTGAAGGTAAATATCAGGTAGAAGTAAAAGAAGCAAAATTACAGGAAAAAGCTAAAAACCAGATGAAAGAAATGATTGAAAGTGGTAAAATAAAAATAGAAATAAATCCTGAAAAACAGAATAGACATTCTTTAGGTCATAGACTATACGAAGAATATAAAAAAAGAATTTGTTGAAAGGAAAACAAACACCGAGTTATACACTACTAAAAAATGATGAATTAAATAAAATGCTAAATCAAAAATTTGGCACTGGACGGTTGATTATTGAAAATGAAAGAAAATGGAAAAATAAAGAAATAATTAATTTTGGTCAAATTATAGGAAAATATTACATAGATGGAAAATTTATAGAAACTAAATGGGGTACTGTTCATTATTCCAAAACTGGTAGTCATATTATTCCAAATGGAAAGGAAGGTAAGTAATGAAGTTATGGACTTACATTGGTAAAAAAGTAATGATCGAGTTAACTAATGGGCAAAAATTTATTGGAGAAGTTACAAATTATGACGATGAAATAGATAACGAAAGTGGAGAAGATTCTATACATTTAGATGACGGAATAGATTTATATGATTTTGATGAAAGCCAAATCAAATATATTGAAGTTTTAAAATAAGTATACTTTTGTAAGAAACGAATGTGTTACTATTTTTATACATTTTTTTAACCTTTCAATGTGAAGGTTATTTTTTATTGTCCAAAATGTGCTGATGACATTTTAAAAGCAAGTATGGAATATCAGTCGACAGACTATAAACGGAGGTATATCTCATGGAAAGAAATGAAAGTAATATTACTGATGTAACTCAGAACGAAGAGCAACTAGACAACAGTGATGAACAATCACAACAGAATGAGAAAACATTTTCTCAAGAAGAAGTATCACAATTGATTAAAGAGCGTATAGCTAGAGAGCGCAAAAAATCAGATGAACGTATTAAAGATGCCAAAGAAAACAATGATAGCAATGAAGTAGCTTATTTATTAAAAGGTGGTAAAGTTACAAAAGTATATGGTGATCAAGGTAGTGTATCTTATATGCTAAGGTAAAAAGCAACCGAATTATTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTCAGGATTTTCATTGAATAATTTAGAGATGTTTATTGAAAATAAATCTATCCGAACATTGACTATTGTTACTAACTACATTGTAGTAAAATATATAAGTAAAACTCCATTATATAATCAGTCTCAAGTTTATAAAATAATGAAAGATATAAAACAATCTATAACTATAAGAAATAATGAAGCGATAGTTGATAATATTCTAAAGCAACTTTATAATAAAAGATATATAAAACGAAAGTACAAATAGGAGTAATACATTATGTCAATTCAACATTTAGATGGTTACATTTCTATAGAAGATTTTTTTAAGCATATGGAAGAATTATCGAAGAAAGAAGAATTAGAAAAAGAAATTAATCAATCAAAGTCTAAATATCAATAGCATCCTTTCTACACAGATAAAGAGAAAGCGGTGCTATTTTTATACACTTTTTTAACTATTTACTGAAATATCAAAATCACAAAAATTAACATATTTAAAAGAACTTGGTGAAGATGGCGAATATAAATATGTTGCAAAAATAGATAGTAAAACATCTAAATTATGTCATTCACTTAACGGAAAAATATTTAAAGTTAAAGATATGATACCAGGTGTGAATGCGCCACCTATGCATCCTTGGTGTAGAAGTACCACAGTGCCATATGTTGGCAATTGGCGAGACAAGTTCTTTAAAGAGCGTGAAGGTAAATATCAGGTAGAAGAAAAAGAAGCAAAATTACAGGAAAAAGCTAAAAACCAGATGAAAGAAATGATTGAAAGTGGTAAAATAAAAATAGAAATAAATTGCGAAAAACAAAATAGACATATGTTAGGTCATCACCTATATAATGAAAATAAAAAAAGAGCCATTTTAAATAATAAGAAATTGCCTAGCTATACAATACTTTCTATAGATTTATTGAATGAATTGTTAAGAGAAAAAATGTCAACAGGCAATCTAATATTAAGTGATGAGCTATTTGATATGAAAGAGATTATTAATTTTAATCAAATTATTGGAAAAGTACATATCGATAATGTGTATATTGAAACCAGAAAAGGAAAAGTGCATTATTCGAAGACAGGTGCTCATATAGTACCTTATATTGATAAGTAGGTGAAAAGTATTGAGAATTGAAGATGCATATCGTAAAGATGTTATTATCACGCTTTTGAATAATGAAGAATACGAAGGGTTTGTAACTGACTATGAAAATGAATTCGAGAGCGAAACAGGAAATCTAGTTGTAGATATACAGACTGATTTTGCTGTTTATTCGTTTGATGAAACTGAGATAAAAAGTATTAGATTATTAAAATAATTACAAAATAGCATCCTTTCTACACAGATAAAGAGAAGGTGGTGCTATTTTTATACACTTTTTTAACTATTTACTGAAATAGCAGAATCACAAAAGTTAACATATTTAAAAGAACTTGGTGAAGATGGCGAATATAAATATGTTGCCAAAATAGATAGTAAAACATCTAAATTATGTCATTCACTCAACGGAAAAATATTTAAAGTTAAAGATATGATACCAGGTGTGAATGCGCCCCCTATGCATCCTTGGTGTAGAAGTACCACAGTGTCACATGTCGGCAATTGGCGAGACAAGTTCTTTAAAGAGCGTGAAGGTAAATATCAGGTAGAAGGTTCTTTTATTGAATCGGGTGCACTTAATAATAAAAGTGATGAATACGGTATCAAAAGGAACAGACATGCCCAAATTTATTATAATTCAGTTAGAAATCGAGATAAACAGATAGAGATTTCTAAAATTGCTAAAAATACTAATATAAATAAAAATACAATTCAAAGAGTTTATGAACATATATTTGAAAATAAGTATTTATTGGAAAGTGGATTTAAACAATTTGATCCTGACTTTTATATGGCTCAAAGTTGGCAACGTTTAAGAGAAGGGAAAAATATTAAAAAAATGGATATAATAATGTTGAAACATGAAGCTCTTGAACACTATCTAATGAATAAGTATAATTTGAACTATATAGAGGCACATAAACTTACAGAAATAAAATATAATTATAGTATTTTAATTAATTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_016928|1322942:1330446|1328843_1329494_+|WP_078097461.1|capsid|DBSCAN-SWA MSKSQKLTYLKELGEDGEYKYVAKIDSKTSKLCHSLNGKIFKVKDMIPGVNAPPMHPWCRSTTVPYVGNWRDKFFKEREGKYQVEEKEAKLQEKAKNQMKEMIESGKIKIEINCEKQNRHMLGHHLYNENKKRAILNNKKLPSYTILSIDLLNELLREKMSTGNLILSDELFDMKEIINFNQIIGKVHIDNVYIETRKGKVHYSKTGAHIVPYIDK >NC_016928|1322942:1330446|1327952_1328081_+|WP_071665623.1|DBSCAN-SWA MKVIFYCPKCADDILKASMEYQSTDYKRRYISWKEMKVILLM >NC_016928|1322942:1330446|1325790_1325976_+|WP_000006110.1|DBSCAN-SWA MSEYKKKIIELIESNLTGYEISKKTGVSQYVLSQLRQGKREVDNLTLNTTEKLYEYANKVL >NC_016928|1322942:1330446|1325251_1325362_+|WP_001788716.1|DBSCAN-SWA MKMTIKVRKTNKKEKIEFLIGTFIIILVILGFKIMK >NC_016928|1322942:1330446|1323829_1324054_+|WP_078065144.1|DBSCAN-SWA MTKIMNQFKEIYNTIEKLLNDKSISNYRINQDTGVSYGGISESRSGKRKVNNLTLETAEKLYNYQKQLEIMIED >NC_016928|1322942:1330446|1324349_1324556_+|WP_001002343.1|DBSCAN-SWA MNEIETIISEIEKLLTNNTPYSISKNSGVPRQTVTDLKVGNTKIKDAKFKTIIKLYEYQKSSENNSEC >NC_016928|1322942:1330446|1328047_1328326_+|WP_000440735.1|DBSCAN-SWA MERNESNITDVTQNEEQLDNSDEQSQQNEKTFSQEEVSQLIKERIARERKKSDERIKDAKENNDSNEVAYLLKGGKVTKVYGDQGSVSYMLR >NC_016928|1322942:1330446|1326487_1326592_+|WP_000477491.1|DBSCAN-SWA MFKVNYSILSYYPEYNIAVSWQRLREGKIIKNKI >NC_016928|1322942:1330446|1326718_1326970_+|WP_000956747.1|DBSCAN-SWA MLTLIKLKEDEQVIIYEYIPEDDISNGKGSVTFNKKDAEVIDFSLSEIENEEYFMLYRNKSFSVVRDFIEKQEFPENYKIAWY >NC_016928|1322942:1330446|1329504_1329699_+|WP_001217295.1|DBSCAN-SWA MRIEDAYRKDVIITLLNNEEYEGFVTDYENEFESETGNLVVDIQTDFAVYSFDETEIKSIRLLK >NC_016928|1322942:1330446|1327697_1327892_+|WP_000780597.1|DBSCAN-SWA MKLWTYIGKKVMIELTNGQKFIGEVTNYDDEIDNESGEDSIHLDDGIDLYDFDESQIKYIEVLK >NC_016928|1322942:1330446|1329777_1330446_+|WP_064137920.1|capsid|DBSCAN-SWA MAESQKLTYLKELGEDGEYKYVAKIDSKTSKLCHSLNGKIFKVKDMIPGVNAPPMHPWCRSTTVSHVGNWRDKFFKEREGKYQVEGSFIESGALNNKSDEYGIKRNRHAQIYYNSVRNRDKQIEISKIAKNTNINKNTIQRVYEHIFENKYLLESGFKQFDPDFYMAQSWQRLREGKNIKKMDIIMLKHEALEHYLMNKYNLNYIEAHKLTEIKYNYSILIN >NC_016928|1322942:1330446|1327443_1327698_+|WP_001813273.1|DBSCAN-SWA MKGKQTPSYTLLKNDELNKMLNQKFGTGRLIIENERKWKNKEIINFGQIIGKYYIDGKFIETKWGTVHYSKTGSHIIPNGKEGK >NC_016928|1322942:1330446|1322942_1323140_+|WP_001659797.1|DBSCAN-SWA MNCYDEIYNTIKKLIENKEITSYQINKDTGISYGNINAMRRGERRIENLSLKNAKILYEYAKKVL |
14 | Staphylococcus_phage(87.5%) | capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1504744 : 1586727
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_016928|1504744:1586727|DBSCAN-SWA CTTATGGATATAAACGGTTTAATAATCTTGGGAATGGCGCTGTTTCACGAACGTGTTCAACACCAGAAATCCATGCTACTGTACGCTCTAAACCTAAACCAAATCCACAGTGTGGCACACTACCATAACGACGTAAGTCTAAGTAGTAACTATATGCTTCTTCGTCTAATCCATGTTCTTTAACGCGTTGTTCTAACAATTCTAAGTCATCCACACGTTCAGATCCACCTATAATTTCACCGTATCCTTCAGGTGCAATTAAGTCTGCACATAATACAGTTTCTTCATTCTCAGGATTTGGTTGCATATAGAAAGGCTTAATTTTAGTTGGATAATTAGTAATAAACACCGGTAAATCATAATGATTAGCAATGGCAGTTTCATGTGGCGCACCAAAATCTTCGCCCCATTCAATATCATCAAAGCCTTCTGCTTTTAAGAATTCAATTGCATCATCGTATGAAATTCTAGGGAATGGTGTCGCAACTTTTTCAAGTTTTGATGTATCACGCTCTAAAATTTTCAACTCTAGTTTACAATTTTCTAAAACTGATTTTACTACATGTGTTACATATTGTTCTTGAATTTCTAAACTTTCAGCATGATTTGTGAAAGCCATTTCCCCTTCAATCATCCAGAACTCGATCAAGTGTCTACGTGTTTTTGATTTTTCAGCTCTGAAAGTTGGACCAAATGAAAATACTTTTCCGTGTGCCATTGCCGCAGCTTCTAAGTATAACTGACCACTTTGAGATAAAAACGCATCTTGATCAAAGTATTTAGTATGGAATAATTCACTTGTACCTTCTGGTGCACTTGCTGTCAAAATTGGTGGATCAACCTTTGTAAATCCATTTTTGTTGAAAAATTCATACGTTGCACGAATAACTTCATTTCTAATTTTCATTACAGCATGTTGTTTTTTAGAACGTAACCATAAATGACGGTGATCCATTAAAAATTCTGTACCGTGATTTTTAGGTGTAATCGGATAGTCATGCGCTTCTGAAATAACTTCAATTGATTTCACTTGCATTTCGTATCCTAAGTCAGAACGATTATCTTCTGTAATTGTGCCTGTAACATATAGAGATGATTCTTGAGTAATTTCTTTCGCAAGTTTGAATACCTCTTCATCAACTTCTGATTTAACTACTACGCCTTGCATAAAACCTGTTCCATCACGTAATTGTAAAAAGGCGATTTTACCACTTGAACGTTTATTTGTTAGCCAAGCACCAATTGTAACGTCTTGGTTTAAATGATCTTTCGCTTGTTTAATCGTTGTTTTCATAACCATTCTCCTATTTATTTTTTCGTTATACAATACTCATTCATTTTAACAAAATCCGCTTTCAAGTTCTAGAACTAGACTAAAAGATAACGTGTAAATGGTAATGATTTAAGCACAGATTTGAACATTAATTTATATTAAGACAGTGCAATCATCAGTTTCAGACAAAATATATAATAAAGCCTCAATATTATTAGTATGAAGGTCGTTTTTTGTGCTAACATTCAAGTTTAATTATAAAACTCAAATATTGACGACCAAACAAAAATTCTTGTAACAGAACATAGCACATGTCATGTCACAAGAATTTTACTTTGTATCTCACTTTTTCTTTTTTTGAATTTGTCTTAATAATTTTCCAAACTGTTGAATGTCGCCTTTTTTCTGACGATAATTTTCAAGTGTTTGTTCAAAAAAGTTTTTATAATTACTGTTTATGAGTCGATCATCAAATGAAACTATTATGCCGCGATCATTTTCATTTCTAATTAATCTTCCAAGTCCTTGTCTAAAACGTGTAACTGCATCAGGTAATACATATTCCTTGAAAGTTGAAGTGAATTCAGAATCCATAAGCCAATATTTTGCATTATGCTTGTTCATAAACGGTAACTTCGCTATCATCACACATTTAATACCATTTGCTTGAAAATCAAAGCCTTCAAAAAATGTTGACGTACCAAGCAGTATGGCCTTATCAAAATTATTAAACTGTTGTACTATTTTATAATTTTGGTTCTGCTGTTGTGTTAATACAACATAATCTTCAAATTCTGGCAATTCATTTAGCATATCTTGTACCATATGCATCATTTTATAACTCGTAAATAAGACTAAACATTTTGATGACGTTATAGTCGTATATTCAATAATATAGCTTACAATCGATGCTACATACTCATCTATATTTTTATATTGATAAGATGCTACATCACTCGGTATAAATACACTTGTATTTTTTGCACTTTGTAACGACGTGTTAACTTCAAATGTATTAAAGTGAACATCTTTGTTGAATAACTGTTTAAAAGCATCAAACGAATGATTAAATTTTAAAGTACCAGATATAAAAATGAGTGATTTAAATTTTTCCAATACTTGTTTCGTCAATACATCTTTTACAGCGTAATCTTTCACATATAAACGTATTGTTGATTTTTGAGATAAATTTTTAATTGAAATGAAACTAGTATGTCCAGCTTTTAAACTTTGTTCGATATTTTTAAATTTATCTTTTAAATACAACAACTGTTTCCGTAATGATTTAACTGTTTTATGACTAATGCCATTGAATATTTCTAGCGTTTTATTTAACTTATCGATAATCGCATGTAAATCCTTCAAAATGTCTTTTGTTTCAAAAGTAAATACATTATGGAAACGATGAATATCATCATCATAAACATCAGAATCATTGATAATCGTAAATATCGTTGAGAACAATTGCTCATTTAACTCATGAATCTCATTCATACTAGCCTTCAAGCCAAAAATATCAATTGGTGCAATATCTAATTTTTCCAATATTCGTTGCTTTTCCAGTTGATCAATTGCCTTTAACAATTTTTCATTTTCGTTTTTACCAATCAAACCAAGCTGATATTTAATATCAGCATAACTCAACTCATTTGTCACTTGATTTAAGGCATAGTCTGGTAAGCGATGTGCTTCATCTACTATACAATCATCAAACAATTGATATATTGAATTTTCAACATCAGAATGAATTAAATGTGCATGATTTGTAATACCAATTTGAATGTTCTGTGCATTTCGCTTAATAAAATTATAATAATGAACATCGTGACGTGCCGGTACATATGTTTCGATTTTCTGGTCAAAATACATCTTTTGACCACCTTTTAAATTTAATTCCTGGATATCTCCGGATGGCGTCTCTGTAATCCAAATCAGCAATTGCATTTTCAAGATATTCACTTCGTAATTACTTGTGTCATCTTTTAAAATTTGACTAATAAGTCCCAATGAAATGTAATCACTTTTACTTTTAATCAATAGTGCATTAATTTTAAAATTCAACGCTTCATTCATTGCTGGAATATCTTTTTCTAACAATTGACTTTGCAGTAATTTGGTATTGGTAGAAATCATGACATGCTTCCCAGTTTCAATATTATACATCAAGGCCGCAAGTAAATATGCTAATGATTTACCACTGCCTAGTGATGCTTCAATCATTGCTTTTTCACTATGCATGAGCTGATCTAATATAGTTTCCGCTAAATATAATTGCTGCGGTCGATATGTTAAGCCAAGTTGATCTACAGCTTTGCTATATAAAGACTTCAAGCTGCCTTTATAATTTGTTGTCGGCTTTTTAAAATCAACTTGCTTACGATAGATAATCTGTTCGAACTTTTCGTACGATTTATCCAATGGCTTTGCATCATATTGCCTAACCATCTCAAAGAAAATATCATACAAATCGTATTTCAACTGTTTACTTAAATAATATAATTGCTTTAAAGTATCTAACGGTAACTTTTCAAATTTTTCAAAAGCTAATATCATCAATTTAGCAGTAGTAGCGGCATCTTCGTCAGCTCGATGGGCATTTGCTAAAGTAATACCATGTGCCTCTGCTAATTCACTTAATTGATAGCTTTTATCTGTAGGAAAAGCTATTTTAAAGATTTCTAGTGTATCTATAACTTTTTTGGGACGATATTGAATATTACAATCTTTAAATGCCTTTTTAATAAAATTTAAATCAAAATCTACATTATGAGCGACAAAAATGCAATCTTTTATCTTATCGTAGATTTCTTGTGCAACTTGATTAAAATATGGCGCTTGTTGTAGCATATTTTCTTCAATGGATGTTAACGCTTGAATGAATGGCGGAATCTCTAAATTTGTTCTAATCATAGAATGATATGTATCAATAATTTGGTTATTGCGCACAAACGTTATACCAATTTGAATGATATCGTCAAAATCTAATTGGTTGCCTGTTGTTTCCAAATCCACAACGGCATAGGTTGCCATACCCATAGCTATCTCTCCTTGCTTTAGTGTTAAAAATCTATATCTGCACTAATTAAACGGTGTGATTCACCCGCTTCATCTCTAACAATTAGATAGCCATCGTAATCTAAATCAATTGCTTGTCCTTTAAACTGTTTATCATTTTCTGTAAATAGCAACGTTCTATTCCAAATATTAGAAGCTGCAATATATTCTTCACGAATTTCAGAAAAAGGTAACGTTAAAAATTGATTATATCTTTTTTCAATTTCTTGAAGTAATCTCTCTAAAAATTGATATCTATCTAATTTATTTTTATCATGTAATTGTATACTTGTTGCTCTATGTCTAATACTTTCATCAAAGTCTTCTAGTTGTTGCGTCAAATTAATACCTATACCACATATTATTGCTTCTATACCATCATTATTAGCAACCATTTCAGTTAAGAAACCACACACTTTACCATTATCAATATATATATCATTCGGCCATTTCACTTTGACTTCATCTTGACTAAAATGTTGAATCGCATCTCTTATCCCTAATGCAATAAATAAATTAAATTTAGATATCATTGAGAATGCAACGTTAGGTCTTAACACGACAGACATCCAAAGTCCTTGCCCTTTTGAAGAACTCCAATGTCTATTAAATCGCCCACGACCTTTCGTTTGTTCATCACTCAAGATAAAAAATGAAGATTGATTTCCAACAA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106 | Staphylococcus_phage(83.75%) | terminase,portal,holin,protease,head,capsid,tail,tRNA,integrase | attL 1564562:1564576|attR 1582544:1582558 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1642555 : 1650867
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_016928|1642555:1650867|DBSCAN-SWA ATTAATTACAACATTCTCGATTATGCTGATGATCGACAAAACGTACAGGATGTCCATAAATTTTTGAAATTTCAACTTCATCAAGTGATTTAAACTCATCAGTTGTACCATGGAAATGCAAATGCTTATTTAAACATGCTACTTCAGTAGCAGTATCTGCTACAACACCAATATCATGAGTAACTAAGATAATGGTGATACCTTCTTGTTTTAATTGATCTAAAGTATTATAAAATTCACTTACATGTTTTGCATCAATACCATTCGTTGGTTCATCAAGTACTAATACTGCAGGTTCTGAAATCAATGCTCGAGCAATCATTACACGTTGTTGTTGACCACCTGATAATTCTGCTATATTTTTATGAATTAAATCACTTATATTCAGTCTTTCTAGTACTTTAATCACTTTTTCATTATCTTTGCTATTAAATGTTTGGAAAAGACGTTTTGTCTTTGTTAATCCGCTTAAAACAACTTCTTTAACACTTGCTGGGAAACCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATACATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCTATACCTTCAACAAAAATCTCACCACTTTGTAAAGGTAATAATCCTAGAATCAACTTCAATAATGTTGATTTACCAGCACCATTTGGTCCAACAATTGCTAAAAATTCACCTTTATTTATTTTAATGTTTATATTTTCTAACACTTTTTTATGATCATAGTAGTAATTGACATTTTTCAATTCAAAGACTGGTGTCATCGTATTCTCACCTCGCATTCAACTATACAACTCCTAGTAACATATGTAAACAGTAATGTTTACGACTCAAAACAAGACAAAATAAAGAGATATGCCCCCTTCAAGTATTATTTATCGCATTTCTTGAAGAGAGCATTATCATTTTATTGTTGCATAACTTTATTTTTTAATTCTGGGTCAAATTGCTGTTGTTTTAACATTTCAATTTCAAGTTTATATGGCGGTTTTTTATTTTTCTTATCTTCACCAACATAAGGTGTTTCTAAGATTTTCGGAATATCTTTAAAACAATCATGATGCACAATGTAATTTAATGCATCAAAACCAATGTAACCGAAGCCAATATTTTCATGTCGGTCTTTTTGAGCGCCACGGTCATTTTTAGAATCATTGACATGAACAACTTTAATTCTGTCGACTCCAATGATTTTATCAAATTCATTTAATACGCCATCAAAGTCCTCTTTCACATTATATCCAGCATCATGCGTATGACATGTATCAAAACATACTGATAAACGTTCGTTATTATGAACTCCATCAATAATACGTGCTAACTCTTCAAACGAACGACCAATCTCTGTACCTTTACCTGCCATCGTTTCAAGCGCAATACGTACATTATTGTCATTCGTTAAAACTTCATTTAATCCTTCAATAATCTTATTAATTCCGGCATCAACACCAGCTCCAACATGCGCACCCGGATGTAATACAATATCTTTAGCGCCTATAGCTTGCGTTCTTTCAATTTCTTGTTGCAAGAAATCTACACCAAGATTAAACGTTTCTGGTTTGGTTGTATTTGCAATATTAATGATGTATGGTGCATGAACAACAATATTAGATAAGCCATATTTTTCCATCACTTCATGACCTTTAGTTATATTTAAATCTTCAATACTTTTACGGCGCGTGTTTTGAGGTGCACCAGTATAAATCATAAATGTTGTTTCACCATATTCATGCGCTTCTATAGCAGAACCTTCTAACATCTTTTTACCACTCATTGAAACATGTGATCCTAATAACATAAAACACACCTAACCTTTTTTGTTTTGCTTACGTTTTTGTCTATTTTGCTGCTTACTAAATTGTTTACGCTCTTGACGTTTCATTTTTTCAACTTCTTGTTTAAATTTCTTCTTATAACCTGGTTTAACTTTGTTTTTAATTTTACTTCGAACTTTGTTCTTCACTTGATTAGTTAAATGGTCATCTTTGCGCATTCTTGCTTGACGCTGATTGTGCGCTTTAACTTCTTTTAACTCACCATCTTTAATATCAACAGTATTGAAAACAAAACCACGATCTTCTATTAATGAAATATTGTGTTCTTCATCAGGACTATAAAGCGTAATTGCTACACCTTTATAATTCCCACGGCCAGTTCGGCCGACTCTATGTGTAAAGAAGTCAATATCATTTGGCACATCAAAATTGATGACATGACTAACACCTTCAATATCAATACCACGAGATGCTAAATCGCTGGCAATAACGTATTGGAATTCTAAATTACGTATACGTTTCATTTGTTGTTTACGTTCACGTGGCGTTAAACCACCATGAATCATACCAACTTTAATGCCAGCTTCATTTAGTGAACGTGCTAAATCATTTGCATTATCTCTACTATTACAGAAAATAATACATAAGTATGGATTTAGTATATCAATTAAATTTAAAGTCTTTTCAACTTTAGCTGCACCTTTAGTAGGTATTAAAAAGAATTCGATGTTCTTTTTATTTTGTTTTTTACTGTCGACAGCTACATATTCTGGATGACTTAAATATTTATTTAAAAATGGTTGTAACTGTTGTGGAATTGTAGCACTAAACACCGCAATATTTGCATTATCTTCCAATCTTGCAGCAATGTAATCTACATCTTCAATTAATCCTAAGTCAATCATAAGATCCGCTTCATCAATAACTAAATATGATGCTAAGTGCACATGTAAATGTCCCGTTTTAGCTAAGTCATTAATTCTAGTAGGGGTGCCTATAATCAATTGTGGTTGTGCATTACAACGTTGTCTATCTTTCTCTATATCTGTACCACCAATAAAAACTTTAACTGAAACGCCAGCTTTAAATTGGCTTAAATGGTTCGCTGCATCGTATAGTTGTTGTGCAAGTTCTCTTGTTGGTGCAACTACGATTGCTTGTGGTTCTTTTATTTCACTATCAATTAACTGCATTAATGGTAATAAAAATGCATGAGATTTCCCTGTACCCGTTTGAGATTGACCAATTAAATTTGTTCTCTTTAGTATTCTTGGAATAATTCGATTCTGAATTTCAGTTGGTTTTTCAAAATTAAGGTCTTTCACAGCGTCAATTAAACTAGATTCTAGATTAAATTGTTCGAATGGATGTTTTGCCATGATTTGGCCTCCTTCTATGTTCATCTTTACTATTATAAAGTATAAATGTGCTATTTTAAATAAAAATATTAAAACCTCGAAATTTCAAAATTTAGAAATCCCGAGATTTTAGTTTAAATATATTGAAATGGATCTGTATTAATTGTAGATGCTTCAACATCTATATTTATTTTTTCTGTATTGAACCAATTCATTAGTAACGTTTTTAAACCTTCTTTCATCACATATTCGCTGTAATGATTAATATCAATTAAGTTCACACCATGAATTTTAGCATCTAAGGCATCATGATGTTTAATATCACCTGTAACAAAGACATCTGCGCCTTGTTGAACAGCTTGATATTCATATCCAATACCTGAACCACCAATAATTGCAATACGTTTAATTTTCTGATTAGACACACCAACAAAACGGACACTTGGGATATTTAATTTAGATTTAATATCAGCTGCGAAATCTTCCAATGTCATTTGATTATCCACTTCTGCCATAACGCCAAGTCCATAAAGGGATGTTTGTTTTATCTCAATAAAATCAAATACCGGTGTTTCATATGGATGGTATTGTTTAATTAATTGCTCAGCCCTTGACTTTTGACATGCATCTATCATAAATTCAATTTTAACTTCATCTACATATTCAATTTTATCAATTTGTCCTATTGTTGGATTAGCTTCACCAACTGGTTTGAATTGCCCTCTTCCTTCACTTTCAAAGAAACAATATTCATAATTACCTTCTTGTGCTAATCCATTTTCACTAAGCTTATCTTTAAATGGTCCAACATTATCCTTAGGTATATATGTTTGAACTTTATAGTATACATCTTGTTGATTATTTATTATTGAAATGTTCTTCAATCCCATCGCCTTCGCCAACATCATATTGACACCATGAGGATTTACATCTAAATTTGTATGCATCGCTATTAAATTAATGTCATGTTGAATTAGTTTTCTAATAATCAAACCATAACCATTAGCTTTTAATGATGTTACGCCTTTAAAGATTAGAGGATGATGACTAATAATAGTATTATAACCTTTTTCGATTGCTTCATTTACTACTTCCAACGTACAGTCTAATGCTGTTAAAACACCAGTAACTGCAACATCTTCATCACCTATTAACAATCCTACATTATCCCAAGATTCAGCAGTTCTAAATGGCACATGATGATCTAACAATGTCATTAAATCAGCTATTTTCATTACTATAACACCCTTTCAATTACAGCAATTTCGTCATTAATTTGAGCTAAACGTTGATGATGTTGTTCAGTATTGAGTTTCGATTTAATATGATAAAGTGCTTCTAACTCTCTTTGCCATTTTTTTATAAAATATTCATTTTTGTTGTTCAGCAATTTTGGTCCGAATTTCAATTCATCAGATGATAGCTCTATTAATTGCGTAGAATATTCTGCTACAACAATTTCATAAATATGGCCTTTTTCTTCCATTATTATTTCATCAATTATTTCATAATTCAATTGTTGTAATGTTTGTCTTAAATTTTCAGTTTGGATATTACTTTGTAAAATCAACCTTGGATGTTGACTTAACTTATCTTGCCCATCTTTTAAAATTTTAGCAATAAGTGGTCCGCCCATACCACAAATTGTGATATTATCGATTACGTCCTCAGGATGAATAACACTTAAGCCATCCCCTAAACGTACATCAATTCTTTCTACTAATTGATTTGCAGCTACATTTTTCACAGCAGCTTGAAAAGGGCCTTGAATAACTTCTCCTGCAATACCGCAATCGCATAAGTGGTTTTGAATTGCATAGATTGGCAAATAAGCATGATCTGAGCCAATATCCGCGATTGTA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_016928|1642555:1650867|1646929_1647607_-|WP_000624567.1|tRNA|DBSCAN-SWA MISLNNRLTTVSRFLKQGTIADIGSDHAYLPIYAIQNHLCDCGIAGEVIQGPFQAAVKNVAANQLVERIDVRLGDGLSVIHPEDVIDNITICGMGGPLIAKILKDGQDKLSQHPRLILQSNIQTENLRQTLQQLNYEIIDEIIMEEKGHIYEIVVAEYSTQLIELSSDELKFGPKLLNNKNEYFIKKWQRELEALYHIKSKLNTEQHHQRLAQINDEIAVIERVL >NC_016928|1642555:1650867|1645826_1646927_-|WP_000683914.1|DBSCAN-SWA MKIADLMTLLDHHVPFRTAESWDNVGLLIGDEDVAVTGVLTALDCTLEVVNEAIEKGYNTIISHHPLIFKGVTSLKANGYGLIIRKLIQHDINLIAMHTNLDVNPHGVNMMLAKAMGLKNISIINNQQDVYYKVQTYIPKDNVGPFKDKLSENGLAQEGNYEYCFFESEGRGQFKPVGEANPTIGQIDKIEYVDEVKIEFMIDACQKSRAEQLIKQYHPYETPVFDFIEIKQTSLYGLGVMAEVDNQMTLEDFAADIKSKLNIPSVRFVGVSNQKIKRIAIIGGSGIGYEYQAVQQGADVFVTGDIKHHDALDAKIHGVNLIDINHYSEYVMKEGLKTLLMNWFNTEKINIDVEASTINTDPFQYI >NC_016928|1642555:1650867|1644366_1645713_-|WP_001062177.1|DBSCAN-SWA MAKHPFEQFNLESSLIDAVKDLNFEKPTEIQNRIIPRILKRTNLIGQSQTGTGKSHAFLLPLMQLIDSEIKEPQAIVVAPTRELAQQLYDAANHLSQFKAGVSVKVFIGGTDIEKDRQRCNAQPQLIIGTPTRINDLAKTGHLHVHLASYLVIDEADLMIDLGLIEDVDYIAARLEDNANIAVFSATIPQQLQPFLNKYLSHPEYVAVDSKKQNKKNIEFFLIPTKGAAKVEKTLNLIDILNPYLCIIFCNSRDNANDLARSLNEAGIKVGMIHGGLTPRERKQQMKRIRNLEFQYVIASDLASRGIDIEGVSHVINFDVPNDIDFFTHRVGRTGRGNYKGVAITLYSPDEEHNISLIEDRGFVFNTVDIKDGELKEVKAHNQRQARMRKDDHLTNQVKNKVRSKIKNKVKPGYKKKFKQEVEKMKRQERKQFSKQQNRQKRKQNKKG >NC_016928|1642555:1650867|1649067_1650867_-|WP_001217251.1|DBSCAN-SWA MRIDQSIINEIKDKTDILDLVSEYVKLEKRGRNYIGLCPFHDEKTPSFTVSEDKQICHCFGCKKGGNVFQFTQEIKDISFVEAVKELGDRVNVAVDIEATQSNSNVQIASDDLQMIEMHELIQEFYYYALTKTVEGEQALTYLQERGFTDALIKERGIGFAPDSSHFCHDFLQKKGYDIELAYEAGLLSRNEENFSYYDRFRNRIMFPLKNAQGRIVGYSGRTYTGQEPKYLNSPETPIFQKRKLLYNLDKARKSIRKLDEIVLLEGFMDVIKSDTAGLKNVVATMGTQLSDEHITFIRKLTSNITLMFDGDFAGSEATLKTGQHLLQQGLNVFVIQLPSGMDPDEYIGKYGNDAFTAFVKNDKKSFAHYKVSILKDEIAHNDLSYERYLKELSHDISLMKSSILQQKAINDVAPFFNVSPEQLANEIQFNQAPASYYPEDEYGGYIEPEPIGMAQFDNLSRQEKAERSFLKHLMRDKDTFLNYYESVDKDNFTNQHFKYVFEVLHDFYAENDQYNISDAVQYVNSNELRETLISLEQYSLNDEPYENEIDDYVNIINENGQETIESLNHKLREATRIGDVELQKYYLQQIVAKNKERM >NC_016928|1642555:1650867|1642555_1643341_-|WP_001213908.1|DBSCAN-SWA MRGENTMTPVFELKNVNYYYDHKKVLENINIKINKGEFLAIVGPNGAGKSTLLKLILGLLPLQSGEIFVEGIDFKNKKTSIKLSYVSQKANAFNSGFPASVKEVVLSGLTKTKRLFQTFNSKDNEKVIKVLERLNISDLIHKNIAELSGGQQQRVMIARALISEPAVLVLDEPTNGIDAKHVSEFYNTLDQLKQEGITIILVTHDIGVVADTATEVACLNKHLHFHGTTDEFKSLDEVEISKIYGHPVRFVDHQHNRECCN >NC_016928|1642555:1650867|1643466_1644357_-|WP_000924210.1|DBSCAN-SWA MLLGSHVSMSGKKMLEGSAIEAHEYGETTFMIYTGAPQNTRRKSIEDLNITKGHEVMEKYGLSNIVVHAPYIINIANTTKPETFNLGVDFLQQEIERTQAIGAKDIVLHPGAHVGAGVDAGINKIIEGLNEVLTNDNNVRIALETMAGKGTEIGRSFEELARIIDGVHNNERLSVCFDTCHTHDAGYNVKEDFDGVLNEFDKIIGVDRIKVVHVNDSKNDRGAQKDRHENIGFGYIGFDALNYIVHHDCFKDIPKILETPYVGEDKKNKKPPYKLEIEMLKQQQFDPELKNKVMQQ >NC_016928|1642555:1650867|1647737_1648844_-|WP_001283055.1|DBSCAN-SWA MSDNTVKIKKQTIDPTLTLEDVKKQLIEKGKKEGHLSHEEIAEKLQNFDIDSDQMDDFFDQLNDNDISLVNEKDSSDTDEKLNPSDLSAPPGVKINDPVRMYLKEIGRVNLLSAQEEIELAKRIEQGDEVAKSRLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNMGLIKAVEKFDFNKGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVQRQLLQDLGRDPAPEEIGEEMDLPAEKVREILKIAQEPVSLETPIGEEDDSHLGDFIEDQEAQSPSDHAAYELLKEQLEDVLDTLTDREENVLRLRFGLDDGRTRTLEEVGKVFGVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKRLKDFMD |
7 | Staphylococcus_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1721511 : 1730554
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_016928|1721511:1730554|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_016928|1721511:1730554|1724527_1726807_-|WP_000749798.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQFWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGMMKKRQLKKSPKQKLVVYKEKKSNDEKILV >NC_016928|1721511:1730554|1727081_1727342_-|WP_001160682.1|DBSCAN-SWA MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS >NC_016928|1721511:1730554|1721511_1722030_-|WP_000364543.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATNKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE >NC_016928|1721511:1730554|1722051_1724325_-|WP_000594983.1|DBSCAN-SWA MIKPKYKWKLNKPTEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESIISDTDINHDSLQLSDMTKTIERIKRAIANDEKILVYGDYDADGVTSTTILVTTLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSTLPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNDQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDDEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAEMKVKNGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIDNIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKPVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGSVQINEWNGNQSPQLIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVVLRDLPTSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDVFKKCYKALITKQETNIQKEGMLLCQHLSVKPDTLKFMLKVFLDLNFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS >NC_016928|1721511:1730554|1729549_1730554_-|WP_001005767.1|DBSCAN-SWA MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDEESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDTIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERE >NC_016928|1721511:1730554|1727360_1728500_-|WP_001112045.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF >NC_016928|1721511:1730554|1728522_1729548_-|WP_001019166.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFKPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLTEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETADLLNDTKSKGYRIISVGTTSTRTLETIRRDHDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSTRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1856531 : 1902458
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_016928|1856531:1902458|DBSCAN-SWA 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43 | Staphylococcus_phage(94.29%) | tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1908012 : 1916326
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NC_016928|1908012:1916326|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >NC_016928|1908012:1916326|1910882_1911233_-|WP_000702263.1|DBSCAN-SWA MKIRKSILAGTLAIVLASPLVTNLDKNEAQASTSLPTSNEYQNEKLANELKSLLDELNVNELATGSLNTYYKRTIKISGQKAMYALKSKDFKKMSEAKYQLQKIYNEIDEALKSKY >NC_016928|1908012:1916326|1910079_1910259_+|WP_000669789.1|DBSCAN-SWA MKFKTTKECKSNNIFKRSQEINNRESEKGCLWGISMLILLFLLILFGITACSSSIHFIN >NC_016928|1908012:1916326|1911917_1912367_+|WP_000727649.1|DBSCAN-SWA MKKKLATTVLALSFLTAGISTHHHSAKAFTFEPFPTNEEIESNKKMLEKEKAYKESFKNSGLPTTLGKLDERLRNYLKKGTKNSAQFEKMVILTENKGYYTVYLNTPLAEDRKNVELLGKMYKTYFFKKGESKSSYVINGPGKTNEYAY >NC_016928|1908012:1916326|1912461_1912920_-|WP_020444758.1|DBSCAN-SWA MDILFALHSIHISQQHRNITVATPHLKWCGYFYWKCVSGISNVKTPAKNEKNSPVPAGYTLDKNNVPYKKETGYYTVANVKGNNVRDGYSTNSRITGVLPNNATIKYDGAYCINGYRWITYIANSGQRRYIATGEVDKAGNRISSFGKFSAV >NC_016928|1908012:1916326|1908012_1908867_-|WP_001044434.1|DBSCAN-SWA MNKTNFGDYLNKSKSRKIYKIFDQNLKQEFSYWQFRKLFKSYTRQSDVHELKVCTQNDGTIEQIWIDKANQFGVSVTWKDNSIIGFVMRPLINYDAIKNETTLKYAVPTTDCYEVFWGGDNELYNYHYLYPHQRYAIDLVIKENHKTYKNLGKVNTDYFCFGKDIIAPANGTVEKVVSGVQDNSIGSTNESQFLGNYIVIKHAENEYSLIAHLQQYSIIVDEGQNVKYGDIIGKVGNSGNSTEPHIHFQVMNDKNIEACTSLKIRFINNRELIKGDVVCGLQGE >NC_016928|1908012:1916326|1915537_1916326_+|WP_000206347.1|DBSCAN-SWA MTTFDAKKLKKEYLDWYNQILEFSNLSNNVVKIDTPFKDNSLDNLKIYALYDQSRDMITLTDDGYTTFGLENNGVSLNKFKKRKKIFEEHLSAYGTKYNDKTHEIYVQTNFKNFNKSKHNLLQCLIFVSDMYLLSNPKSQNIFSEDVANKFDEHNIYYGRDLPIIGSSGVVHNFDFFISAKKNQKEKFINAISNPNNSMIIKSKITDAMQAKKIKRHRQNEFIFILNDSKKEKNEHNKNLLHENYISTIDYSELDEKIGLLI >NC_016928|1908012:1916326|1913098_1913860_-|WP_001066124.1|DBSCAN-SWA MNNSTNYKRLKANLEYLKMNQMINHLDDVIDFSIKNNLSFIDTLIKLSDYEIEIKEKNLIESMVKVAAFPFKKEISDFDFNFQPSINQQEIWDFTDLRFIEKYQNIVFLGSSGVGKTHLATGIGMAAAKNRVSTYFIKCHHLIENLRKAKLENRLENRLKHYSKYKLLIIDEIGYLPIGSEDAKLFFQLIDLRYEKKSTIFTTNINFNLWNEIFDDPKIANAILDRILHHSSVVKITGKSYRLKDHSPKKEIT >NC_016928|1908012:1916326|1909117_1909663_-|WP_049280116.1|DBSCAN-SWA MTEQSMYGIGASATRFDSKNIYIRITDIDEKSRKLNYQNLTTPDELNNKYKLKRNDILFARTGASTGKSYIHKEEKDIYNYYFAGFLIKFEIDEQNNPLFIYQFTLTSKYNKWVKVMSVRSGQPGINSEEYAKLPLVLPNKLEQQKIAEFLDRFDQQIELEKQKIEILQQQKKGLLQSMFI >NC_016928|1908012:1916326|1910569_1910830_+|WP_001791826.1|DBSCAN-SWA MCIVIYLIYSLIVYFICIINFFIMAAPFLMTNADYVWTPMTTVTLFILSLIIFLIFIKTKDVVHLTIFILNLLFSILYCLPILFYL |
9 | Staphylococcus_phage(77.78%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||
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NC_016928.2|WP_000384172.1|1881941_1882166_-|hypothetical-protein |
1881941_1882166_-
Protein sequences of NC_016928.2|WP_000384172.1|1881941_1882166_-|hypothetical-protein>NC_016928.2|WP_000384172.1|1881941_1882166_-|hypothetical-protein MDYAHLNLEHFFARNDDLDVIRDRADFVMINNFTNEMMYRDGQIEGTIDLNQYYYKNRSNAASFIMMDYKKGTK |
74 aa aa | NA | NA | NA | 1856531-1902458 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 9.1|2292412|25|NC_016928|CRISPRCasFinder matches to NC_016928 position: 1880662-1880686, mismatch: 1 tgtcagcttctgtgttggggccccg CRISPR spacer tgtcagcttctatgttggggccccg Protospacer ***********.************* |