Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_017351 | Staphylococcus aureus subsp. aureus 11819-97, complete sequence | 8 crisprs | WYL,cas3,DEDDh,DinG,csa3,RT | 5 | 9 | 11 | 0 |
NC_017350 | Staphylococcus aureus subsp. aureus 11819-97 plasmid p11819-97, complete sequence | 0 crisprs | csa3 | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_017351_1 | 871209-871290 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_017351_1
|
1 spacers
spacers of NC_017351_1
>1.1|871234|32|NC_017351|CRISPRCasFinder TTTCATTTCGAAATTCTCTATGTTGGGGCCCC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017351_1
The CRISPR arrays of NC_017351_1 >merge|NC_017351|1|871209-871290|CRISPRCasFinder ACCCCAACTTCCATTGCCTGTAGAATTTCATTTCGAAATTCTCTATGTTGGGGCCCCACCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAA >NC_017351|1|1|871209-871290|CRISPRCasFinder ACCCCAACTTCCATTGCCTGTAGAA TTTCATTTCGAAATTCTCTATGTTGGGGCCCC ACCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAA
>NC_017351.1|WP_000070831.1|870375_871005_+|DUF4887-domain-containing-protein MSNQNYDYNKNEDGSKKKMSTTAKVVSIATVLLLLGGLVFAIFAYVDHSNKAKERMLNEQKQEQKEKRQKENAEKERKKKQQEEKEQNELDSQANQYQQLPQQNQYQYVPPQQQAPTKQRPAKEENDDKASKDESKDKDDNASQDKSDDNQKKTDDNKQPAQPKPQPQQPTPKPNNNQQNNQSNQQAKPQAPQQNSQSTTNKQNNANDK >NC_017351.1|WP_000816304.1|868770_869673_-|TIGR01777-family-protein MKQYLITGGTGMVGSQLVNEIKKSDSHITILTRHDQISNDKKISYVNWAKSGWEHKVPQNIDVVINLAGATLNKRWTPEYKQTLMLSRIQSTQALYELFKSRNKAPKVLFNASATGYYPPDLFMSYTEVYKTLPFDFLSDIVYQWERFAQQFEQLGTRVVIGRFGMILSNEGGALQTMKLPYKYYIGGKLGSGQQWYSWIHINDLIQAILFLINNESASGPFNLTAPIPERQNLFGYTLARAMHKPHETWAPSLAMRLILGQMSTVVLDTQKVLPNKIQALGFQFKYSNLKMALEDLIKE >NC_017351.1|WP_001049165.1|867940_868528_+|ATP-dependent-Clp-endopeptidase-proteolytic-subunit-ClpP MNLIPTVIETTNRGERAYDIYSRLLKDRIIMLGSQIDDNVANSIVSQLLFLQAQDSEKDIYLYINSPGGSVTAGFAIYDTIQHIKPDVQTICIGMAASMGSFLLAAGAKGKRFALPNAEVMIHQPLGGAQGQATEIEIAANHILKTREKLNRILSERTGQSIEKIQKDTDRDNFLTAEEAKEYGLIDEVMVPETK >NC_017351.1|WP_000006551.1|866432_867377_+|DNA-binding-protein-WhiA MSFASEMKNELTRIDVDEMNAKAELSALIRMNGALSLSNQQFVINVQTENATTARRIYSLIKRVFNVEVEILVRKKMKLKKNNIYICRTKMKAKEILDELGILKDGIFTHEIDHSMIQDDEMRRSYLRGAFLAGGSVNNPETSSYHLEIFSQNESHAEGLTKLMNSYELNAKHLERKKGSITYLKEAEKISDFLSLIGGYQALLKFEDVRIVRDMRNSVNRLVNCETANLNKTVSAAMKQVESIKLIDKEIGIENLPDRLREIARIRVEHQEISLKELGEMVSTGPISKSGVNHRLRKLNDLADKIRNGEQIEL >NC_017351.1|WP_001248939.1|865326_866322_+|YvcK-family-protein MRQIKVVLIGGGTGLSVMARGLREFPIDITAIVTVADNGGSTGKIRDEMDIPAPGDIRNVIAALSDSESVLSQLFQYRFEENQISGHSLGNLLIAGMTNITNDFGHAIKALSKILNIKGRVIPSTNTSVQLNAVMEDGEIVFGETNIPKKHKKIDRVFLEPNDVQPMEEAIDALREADLIVLGPGSLYTSVISNLCVNGISDALIHSDAPKLYVSNVMTQPGETDGYSVKDHIDAIHRQAGQPFIDYVICSTQTFNAQVLKKYEEKHSKPVEVNKAELEKESINVKTSSNLVEISENHLVRHNTKVLSTMIYDIALELISTIPFVPSDKRK >NC_017351.1|WP_000369722.1|864418_865330_+|RNase-adapter-RapZ MDNNEKEKSKSELLVVTGLSGAGKSLVIQCLEDMGYFCVDNLPPVLLPKFVELMEQGNPSLRKVAIAIDLRGKELFNSLVAVVDKVKSESDVIIDVMFLEASTEKLISRYKETRRAHPLMEQGKRSLINAINDEREHLSQIRSIANFVIDTTKLSPKELKERIRRYYEDEEFETFTINVTSFGFKHGIQMDADLVFDVRFLPNPYYVVDLRPLTGLDKDVYNYVMKWKETEIFFEKLTDLLDFMIPGYKKEGKSQLVIAIGCTGGQHRSVALAERLGNYLNEVFEYNVYVHHRDAHIESGEKK >NC_017351.1|WP_000134963.1|862775_863711_+|thioredoxin-disulfide-reductase MTEIDFDIAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGIPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAVYQYGDIKSVEDKGEYKVINFGNKELTAKAVIIATGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQRILQDRAFKNDKIDFIWSHTLKSINEKDGKVGSVTLTSTKDGSEETHEADGVFIYIGMKPLTAPFKDLGITNDVGYIVTKDDMTTSVPGIFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAAEYIEHLNDQA >NC_017351.1|WP_000057543.1|861269_862709_+|tetratricopeptide-repeat-protein MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMAKQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDLEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLKQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYQNELFVSENDLMVAWINQGELIIAEKVDLTDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI >NC_017351.1|WP_001224793.1|860776_861262_+|acetyltransferase MRKFLSKTHHHTNPLWRVYRLVKFSKVFKNVIIIEFSKFIPSMVLKRHIYKQLLNINIGNQSSIAYKVMLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLIGANATILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR >NC_017351.1|WP_000513305.1|859929_860769_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MGIVFNYIDPVAFNLGPLSVRWYGIIIAVGILLGYFVAQRALVKAGLHKDTLVDIIFYSALFGFIAARIYFVIFQWPYYAENPSEIIKIWHGGIAIHGGLIGGFIAGVIVCKVKNLNPFQIGDIVAPSIILAQGIGRWGNFMNHEAHGGPVSRAFLEQLHLPNFIIENMYINGQYYHPTFLYESIWDVAGFIILVNIRKHLKLGETFFLYLTWYSIGRFFIEGLRTDSLMLTSNIRVAQLVSILLILISISLIVYRRIKYNPPLYSKVGALPWPTKKVK >NC_017351.1|WP_000654030.1|871706_872720_+|sugar-binding-transcriptional-regulator MKDLLQAQQKLIPDLIDKMYKRFSILTTISKNQPVGRRSLSEHMDMTERVLRSETDMLKKQDLIKVKPTGMEITAEGEQLISQLKGYFDIYADDNRLSEGIKNKFQIKEVHVVPGDADNSQSVKTELGRQAGQLLEGILQEDAIVAVTGGSTMACVSEAIHLLPYNVFFVPARGGLGENVVFQANTIAASMAQQAGGYYTTMYVPDNVSETTYNTLLLEPSVINTLDKIKQANVILHGIGDALKMAHRRQSPEKVIEQLQHHQAVGEAFGYYFDTQGQIVHKVKTIGLQLEDLESKDFIFAVAGGKSKGEAIKAYLTIAPKNTVLITDEAAAKIILE >NC_017351.1|WP_000279414.1|872772_873783_+|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase MAVKVAINGFGRIGRLAFRRIQEVEGLEVVAVNDLTDDDMLAHLLKYDTMQGRFTGEVEVVDGGFRVNGKEVKSFSEPDASKLPWKDLNIDVVLECTGFYTDKDKAQAHIEAGAKKVLISAPATGDLKTIVFNTNHQELDGSETVVSGASCTTNSLAPVAKVLNDDFGLVEGLMTTIHAYTGDQNTQDAPHRKGDKRRARAAAENIIPNSTGAAKAIGKVIPEIDGKLDGGAQRVPVATGSLTELTVVLEKQDVTVEQVNEAMKNASNESFGYTEDEIVSSDVVGMTYGSLFDATQTRVMSVGDRQLVKVAAWYDNEMSYTAQLVRTLAYLAELSK >NC_017351.1|WP_001074742.1|873921_875112_+|phosphoglycerate-kinase MAKKIVSDLDLKGKTVLVRADFNVPLKDGEITNDNRIVQALPTIQYIIEQGGKIVLFSHLGKVKEESDKAKLTLRPVAEDLSKKLDKDVVFVPETRGEKLEAAIKDLKEGDVLLVENTRYEDLDGKKESKNDPELGKYWASLGDVFVNDAFGTAHREHASNVGISTHLETAAGFLMDKEIKFIGGVVNDPHKPVVAILGGAKVSDKINVIKNLVNIADKIIIGGGMAYTFLKAQGKEIGISLLEEDKIDFAKDLLEKHGDKIVLPVDTKVAKEFSNDAKITVVPSDSIPADQEGMDIGPNTVKLFADELEGAHTVVWNGPMGVFEFSNFAQGTIGVCKAIANLKDAITIIGGGDSAAAAISLGFENDFTHISTGGGASLEYLEGKELPGIKAINNK >NC_017351.1|WP_001260087.1|875233_875995_+|triose-phosphate-isomerase MRTPIIAGNWKMNKTVQEAKDFVNALPTLPDSKEVESVICAPAIQLDALTTAVKEGKAQGLEIGAQNTYFEDNGAFTGETSPVALADLGVKYVVIGHSERRELFHESDEEINKKAHAIFKHGMTPIICVGETDEERESGKANDVVGEQVKKAVAGLSEDQLKSVVIAYEPIWAIGTGKSSTSEDANEMCAFVRQTIADLSSKEVSEATRIQYGGSVKPNNIKEYMAQTDIDGALVGGASLKVEDFVQLLEGAK >NC_017351.1|WP_001085505.1|875997_877515_+|2,3-bisphosphoglycerate-independent-phosphoglycerate-mutase MAKKPTALIILDGFANRESEHGNAVKLANKPNFDRYYNKYPTTQIEASGLDVGLPEGQMGNSEVGHMNIGAGRIVYQSLTRINKSIEDGDFFENDVLNNAIAHVNSHDSALHIFGLLSDGGVHSHYKHLFALLELAKKQGVEKVYVHAFLDGRDVDQKSALKYIEETEAKFNELGIGQFASVSGRYYAMDRDKRWEREEKAYNAIRNFDAPTYATAKEGVEASYNEGLTDEFVVPFIVENQNDGVNDGDAVIFYNFRPDRAAQLSEIFANRAFEGFKVEQVKDLFYATFTKYNDNIDAAIVFEKVDLNNTIGEIAQNNNLTQLRIAETEKYPHVTYFMSGGRNEEFKGERRRLIDSPKVATYDLKPEMSAYEVKDALLEELNKGDLDLIILNFANPDMVGHSGMLEPTIKAIEAVDECLGEVVDKILDMDGYAIITADHGNSDQVLTDDDQPMTTHTTNPVPVIVTKEGVTLRETGRLGDLAPTLLDLLNVEQPEDMTGESLIKH >NC_017351.1|WP_001121760.1|877644_878949_+|phosphopyruvate-hydratase MPIITDVYAREVLDSRGNPTVEVEVLTESGAFGRALVPSGASTGEHEAVELRDGDKSRYLGKGVTKAVENVNEIIAPEIIEGEFSVLDQVSIDKMMIALDGTPNKGKLGANAILGVSIAVARAAADLLGQPLYKYLGGFNGKQLPVPMMNIVNGGSHSDAPIAFQEFMILPVGATTFKESLRWGTEIFHNLKSILSKRGLETAVGDEGGFAPKFEGTEDAVETIIQAIEAAGYKPGEEVFLGFDCASSEFYENGVYDYSKFEGEHGAKRTAAEQVDYLEQLVDKYPIITIEDGMDENDWDGWKQLTERIGDRVQLVGDDLFVTNTEILAKGIENGIGNSILIKVNQIGTLTETFDAIEMAQKAGYTAVVSHRSGETEDTTIADIAVATNAGQIKTGSLSRTDRIAKYNQLLRIEDELFETAKYDGIKSFYNLDK >NC_017351.1|WP_000785252.1|879299_879758_+|hypothetical-protein MADRTNKEIKTGRFIATASIVFSILLIIHYFVSLDNATAKALLNLTNQNTSDKAIDYILNSFRFTGIMYILAYLAGFITFWNRHTYVWWFMFAVYVSNSLFTLINLSITIQAIKAAHGAYLTLPILIVIIGSVALAIYMLVVSIKRKSTFNR >NC_017351.1|WP_000556760.1|879824_880058_+|preprotein-translocase-subunit-SecG MHTFLIVLLIIDCIALITVVLLQEGKSSGLSGAISGGAEQLFGKQKQRGVDLFLNRLTIILSILFFVLMICISYLGM >NC_017351.1|WP_001165962.1|880173_880914_+|alpha/beta-hydrolase MQIKLPKPFFFEEGKRAVLLLHGFTGNSSDVRQLGRFLQKKGYTSYAPQYEGHAAPPEEILKSSPFVWFKDALDGYDYLVEQGYDEIVVAGLSLGGDFALKLSLNRDVKGIVTMCAPMGGKTEGTIYEGFLEYARNFKKYEGKDQETIDNEMDHFKPTETLKELSESLDTIKEQVDEVLDPILVIQAENDNMIDPQSANYIYDHVDSDDKNIKWYSESGHVITIDKEKEQVFEDIYQFLESLDWSE >NC_017351.1|WP_001050063.1|880947_883320_+|ribonuclease-R MNLKQSIEEIINQPEYEPMSVSDFQDALGLSSADSFRDLIKVLVELEQSGLIERTKTDRYQKKHSSRGQSKLIKGTLSQNKKGFAFLRPEDEDMEDIFIPPTKINRALDGDTVIVETHQSKGEHKGKIEGEVKSIEKHSVTQVVGTYSEARHFGFVIPDDKRIMQDIFIPKGQSLGAVDGHKVLVQITKYADGSDNPEGHISAILGHKNDPGVDILSIIYQHGIEIEFPDEVLQEAEAVPDHIENTEIKGRHDLRDELTITIDGADAKDLDDAISVKKLANGNTQLTVSIADVSYYVTEDSALDKEAYDRATSVYLVDRVIPMIPHRLSNGICSLNPHVDRLTLSCRMEIDASGRVVKHEIFDSVIHSDYRMTYDAVNQIITEKDPNIREQYKEITPMLDLAQDLSNRLIQMRKRRGEIDFDISEAKVLVNEDGIPTDVQLRQRGEGERLIESFMLIANETVAEHFSKLDVPFIYRVHEQPKSDRLRQFFDFITNFGIMIKGTGEDIHPTTLQKVQEEVEGRPEQMVISTMMLRSMQQAHYDDVNLGHFGLSAEYYTHFTSPIRRYPDLTVHRLIRKYLIEKSMDNKEVKRWEDKLPELAEHTSKRERRAIEAERDTDELKKAEYMIQHIGDEFEGIVSSVANFGMFIELPNTIEGMVHIANMTDDYYRFEERQMALIGERQAKVFRIGDTVKVKVTHVDVDERLIDFQIVGMPLPKNDRSQRPARGKTIQAKTRGKSLDKSKSDDKGRKKKGKQRKGKNQRNNDKSGNSKHKPFYKDKSVKKKARRKKK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_017351_2 | 890288-891249 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_017351_2
|
12 spacers
spacers of NC_017351_2
>2.1|890320|40|NC_017351|CRT TTCGGGTAGTGACTCTACATCAGATAGTGGTTCAGATTCA >2.2|890392|76|NC_017351|CRT TTCAGCGAGTGATTCAGATTCAGCGAGTGATTCAGATTCAGCAAGTGATTCAGACTCAGCAAGTGATTCAGATTCA >2.3|890500|58|NC_017351|CRT TTCAGCGAGCGATTCAGATTCAGCGAGTGATTCAGATTCAGCGAGTGATTCAGATTCA >2.4|890590|58|NC_017351|CRT TTCCGATAGTGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCCGATAGTGACTCAGACTCA >2.5|890680|58|NC_017351|CRT TTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGTGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGATTCA >2.6|890770|58|NC_017351|CRT TTCCGACAGCGATTCAGATTCCGACAGTGACTCAGACTCAGACAGTGATTCGGATTCA >2.7|890860|58|NC_017351|CRT TTCAGATAGCGATTCCGACTCAGACAGTGACTCAGATTCCGACAGCGATTCAGATTCC >2.8|890950|40|NC_017351|CRT TTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCGGATTCA >2.9|891022|22|NC_017351|CRT TTCAGATAGCGATTCTGACTCA >2.10|891076|22|NC_017351|CRT CTCAGACAGCGATTCAGATTCC >2.11|891130|22|NC_017351|CRT CAGCGATTCAGACTCAGACAGT >2.12|891184|34|NC_017351|CRT TAGTGACTCCGACTTAGACAGCGACTCAGATTCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017351_2
The CRISPR arrays of NC_017351_2 >merge|NC_017351|2|890288-891249|CRT GGCAGCGATTCTAATTCAGATAGCGGTTCAGATTCGGGTAGTGACTCTACATCAGATAGTGGTTCAGATTCAGCAAGCGATTCAGATTCAGCAAGTGATTCAGATTCAGCGAGTGATTCAGATTCAGCGAGTGATTCAGATTCAGCAAGTGATTCAGACTCAGCAAGTGATTCAGATTCAGCAAGTGATTCAGACTCAGCAAGTGATTCAGATTCAGCGAGCGATTCAGATTCAGCGAGTGATTCAGATTCAGCGAGTGATTCAGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCCGATAGTGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCCGATAGTGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGTGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGTGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCCGACAGTGACTCAGATTCCGACAGCGATTCAGATTCCGACAGTGACTCAGACTCAGACAGTGATTCGGATTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCGGATTCAGATAGCGATTCCGACTCAGACAGTGACTCAGATTCCGACAGCGATTCAGATTCCGACAGTGACTCAGACTCAGACAGTGATTCGGATTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCGGATTCAGATAGCGATTCCGACTCAGACAGTGACTCGGATTCAGATAGCGATTCTGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGATTCCGATAGCGATTCAGATTCCGACAGTGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCGGATTCAGATAGCGATTCTGACTCAGATAGTGACTCCGACTTAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCCGACAGTGACTCAGA >NC_017351|2|1|890288-891249|CRT GGCAGCGATTCTAATTCAGATAGCGGTTCAGA TTCGGGTAGTGACTCTACATCAGATAGTGGTTCAGATTCA GCAAGCGATTCAGATTCAGCAAGTGATTCAGA TTCAGCGAGTGATTCAGATTCAGCGAGTGATTCAGATTCAGCAAGTGATTCAGACTCAGCAAGTGATTCAGATTCA GCAAGTGATTCAGACTCAGCAAGTGATTCAGA TTCAGCGAGCGATTCAGATTCAGCGAGTGATTCAGATTCAGCGAGTGATTCAGATTCA GACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGA TTCCGATAGTGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCCGATAGTGACTCAGACTCA GACAGCGATTCAGATTCAGATAGTGATTCAGA TTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGTGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGATTCA GATAGCGATTCAGATTCCGACAGTGACTCAGA TTCCGACAGCGATTCAGATTCCGACAGTGACTCAGACTCAGACAGTGATTCGGATTCA GATAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCGGA TTCAGATAGCGATTCCGACTCAGACAGTGACTCAGATTCCGACAGCGATTCAGATTCC GACAGTGACTCAGACTCAGACAGTGATTCGGA TTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCGGATTCA GATAGCGATTCCGACTCAGACAGTGACTCGGA TTCAGATAGCGATTCTGACTCA GATAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGA CTCAGACAGCGATTCAGATTCC GATAGCGATTCAGATTCCGACAGTGACTCAGA CAGCGATTCAGACTCAGACAGT GACTCGGATTCAGATAGCGATTCTGACTCAGA TAGTGACTCCGACTTAGACAGCGACTCAGATTCA GATAGCGATTCAGATTCCGACAGTGACTCAGA
>NC_017351.1|WP_001167158.1|887790_888321_+|N-acetyltransferase MQIRQIHQHDFAQVDQLIRTAFENSEHGYGNESELVDQIRLSDTYDNNLEIVAVLQNEVVGHGLLSEVYLDNGAQREIGLVLAPVSVDIHHQNKGIGKRLIQALEREAILKGYNFISVLGWPTYYANLGYQRASMYDIYPPYDGIPDEAFLIKELKVNSLAGKTGTINYTSAFEKI >NC_017351.1|WP_000608182.1|887130_887652_+|hypothetical-protein MINIISAIGSIGTFIMALFYFVSVSVQLYQMKISFLPALGFNQILLEREEDQLNIMNSATEEHHHKDYIKLYNLGGGAAKKIAIEVLLGNDKVIQKKYVNILPSKEGYMLPINKNVYEELERTIENNGYEADLNVRMTYYHNVSRKQQEVILKGQIDRFNTYNNKEIYDLQFI >NC_017351.1|WP_001790158.1|886967_887123_+|hypothetical-protein MMVKKLLKAIKQNFLYEQSNITFKMIVFGYKRLSKMLFQFEINHINFLWEG >NC_017351.1|WP_000757406.1|885804_886533_-|DUF5067-domain-containing-protein MKKVMGILLASTLILGACGHHQDSAKKESTSHKKKENDNEELNEELKEFKSKKNMDIKIKGDTIVSDKFEAKIKEPFIINEKDEKKKYIAFKMEITAKKDDKDLNPSSISHDYINITQDDKNTVNKLRDGYLLSDKKYKDWTEHNQDQIKKGKTAQAMFIYELRGDGNINLNVHKYSEDKTVDSKSFKFSKLKTEDFSHRAETREEVEKKEKEFEEEYKKEQEREKEKEKQKDDDHSGLDEV >NC_017351.1|WP_001058299.1|885127_885451_-|hypothetical-protein MNNEELEMRLLLMKQSIEQLQEELAPNLKTRDLVLLRYMYSYKEINMLDSYLFQLATNKEQITKKQFKTKLENIREVPEIPIRQVNDILEGYKNSELYVELINSILK >NC_017351.1|WP_001085185.1|883341_883806_+|SsrA-binding-protein-SmpB MAKKKSPGTLAENRKARHDYNIEDTIEAGIVLQGTEIKSIRRGSANLKDSYAQVKNGEMYLNNMHIAPYEEGNRFNHDPLRSRKLLLHKREIIKLGDQTREIGYSIVPLKLYLKHGHCKVLLGVARGKKKYDKRQALKEKAVKRDVARDMKARY >NC_017351.1|WP_001050063.1|880947_883320_+|ribonuclease-R MNLKQSIEEIINQPEYEPMSVSDFQDALGLSSADSFRDLIKVLVELEQSGLIERTKTDRYQKKHSSRGQSKLIKGTLSQNKKGFAFLRPEDEDMEDIFIPPTKINRALDGDTVIVETHQSKGEHKGKIEGEVKSIEKHSVTQVVGTYSEARHFGFVIPDDKRIMQDIFIPKGQSLGAVDGHKVLVQITKYADGSDNPEGHISAILGHKNDPGVDILSIIYQHGIEIEFPDEVLQEAEAVPDHIENTEIKGRHDLRDELTITIDGADAKDLDDAISVKKLANGNTQLTVSIADVSYYVTEDSALDKEAYDRATSVYLVDRVIPMIPHRLSNGICSLNPHVDRLTLSCRMEIDASGRVVKHEIFDSVIHSDYRMTYDAVNQIITEKDPNIREQYKEITPMLDLAQDLSNRLIQMRKRRGEIDFDISEAKVLVNEDGIPTDVQLRQRGEGERLIESFMLIANETVAEHFSKLDVPFIYRVHEQPKSDRLRQFFDFITNFGIMIKGTGEDIHPTTLQKVQEEVEGRPEQMVISTMMLRSMQQAHYDDVNLGHFGLSAEYYTHFTSPIRRYPDLTVHRLIRKYLIEKSMDNKEVKRWEDKLPELAEHTSKRERRAIEAERDTDELKKAEYMIQHIGDEFEGIVSSVANFGMFIELPNTIEGMVHIANMTDDYYRFEERQMALIGERQAKVFRIGDTVKVKVTHVDVDERLIDFQIVGMPLPKNDRSQRPARGKTIQAKTRGKSLDKSKSDDKGRKKKGKQRKGKNQRNNDKSGNSKHKPFYKDKSVKKKARRKKK >NC_017351.1|WP_001165962.1|880173_880914_+|alpha/beta-hydrolase MQIKLPKPFFFEEGKRAVLLLHGFTGNSSDVRQLGRFLQKKGYTSYAPQYEGHAAPPEEILKSSPFVWFKDALDGYDYLVEQGYDEIVVAGLSLGGDFALKLSLNRDVKGIVTMCAPMGGKTEGTIYEGFLEYARNFKKYEGKDQETIDNEMDHFKPTETLKELSESLDTIKEQVDEVLDPILVIQAENDNMIDPQSANYIYDHVDSDDKNIKWYSESGHVITIDKEKEQVFEDIYQFLESLDWSE >NC_017351.1|WP_000556760.1|879824_880058_+|preprotein-translocase-subunit-SecG MHTFLIVLLIIDCIALITVVLLQEGKSSGLSGAISGGAEQLFGKQKQRGVDLFLNRLTIILSILFFVLMICISYLGM >NC_017351.1|WP_000785252.1|879299_879758_+|hypothetical-protein MADRTNKEIKTGRFIATASIVFSILLIIHYFVSLDNATAKALLNLTNQNTSDKAIDYILNSFRFTGIMYILAYLAGFITFWNRHTYVWWFMFAVYVSNSLFTLINLSITIQAIKAAHGAYLTLPILIVIIGSVALAIYMLVVSIKRKSTFNR >NC_017351.1|WP_000791706.1|891716_893261_+|von-Willebrand-factor-binding-protein-Vwb MKNKLLVLSLGALCVSQIWESNRASAVVSGEENPYKSESLKLNGKRSTTITSDKYEENLDMLISSLSFADYEKYEEPEYKEAVKKYQQKFMAEDDALKKFFSEEKKIKNRNTNTNTNTNTSNYLGLTHERYESIYNSLKKHREEFSKEIEEINNKNPELKEYNNEEQTKADTELNTLENQVLMIGYTFYHSNKNEVEDLYNKLDMILGYKDEERKKKRATNQRMFNNKKEDLETIIDEFFGEIGQQRPTSIPTLAPKEEKETNTNNANKLKYDTEAAKTDESKRSNRSKRSLDSQNYKSVSKEVTAEQKAEYEKRAEERKARFLDRQKSKKEPVVSLEYDFEHKQRFNNANDKQLVVSAPTKKPTTPTTYTETTTQVPMPTVERQTQQQIVYKTPKPLVGLNGESHDFTTTHQSPTTSNHTHNNVVEFEETSALPGRKSGSLVGISQIDSSHLTEREKRVIKREHVREAQKLVDNYKDTHSYRDRLNAQQKVNTLSEGHQKRFNKQINKVYNGK >NC_017351.1|WP_000728072.1|893611_894634_+|extracellular-matrix-protein-binding-adhesin-Emp MKKKLLVLTMSTLFATQLINSNNAKASVTESVDKKFVVPESGINKIIPSYNEFKKAPKVNVSNLTDNKNFVVSEDKLNKISDPSAASKIVDKNFAVPESKLGNIVPEYKEINNRVNVTTNNPASQQVDKHFVAKGPEVNRFITQNKVNHHFITTQTHYKKVITSYKSTHVHKHVNHAKDSINKHFIVKPSESPRYTHPSQSLIIKHHFAVPGYHAHKFVTPGHASIKINHFCVVPQINSFKVIPPYGHNSHRMHVPSFQNNTTATHQNAKVNKAYDYKYFYSYKVVKGVKKYFSFSQSNGYKIGKPSLNIKNVNYQYAVPSYSPTHYVPEFKGSLPAPRV >NC_017351.1|WP_000824472.1|894968_895439_+|hypothetical-protein MKRKVLVLTMGVICATQLWHSNHANALVTESGANDTKQFTEIVSEEKVITVEHAQINIFQSNSNSNLMEFNILTMGGKSGAMVGYSEIDSSHFTDRDKRVIRRDHVKEAQSLVENYKDTQSADARMKAKQKVNTLSKPHQNYFNKQIDKVYNGLQR >NC_017351.1|WP_001566557.1|895779_896466_+|thermonuclease-family-protein MTEYLLSAGICMAIVSILLIGMAISNVSKGQYAKRFFYFTTSCLVLTLVVVSSLSSSANASQTDNGVNRSGSEDPTVYSATSTKKLHKEPATLIKAIDGDTVKLMYKGQPMTFRLLLVDTPETKHPKKGVEKYGPEASAFTKKMVENAKKIEVEFDKGQRTDKYGRGLAYIYADGKMVNEALVRQGLAKVAYVYKPNNTHEQLLRKSEAQAKKEKLNIWSEDNADSGQ >NC_017351.1|WP_001059082.1|896822_897023_+|cold-shock-protein MNNGTVKWFNAEKGFGFIEREDGSDVFVHFSAIAEDGYKSLEEGQKVEFDIVEGDRGEQAANVVKM >NC_017351.1|WP_000005884.1|897517_897736_-|hypothetical-protein MSEWHINNQSTKPFLIQQAEKQLSIVKPLPNGSFQILTEIDLENGNVSNIDHSLLVSVDPKALEISIFDAVN >NC_017351.1|WP_001004394.1|897797_898082_-|hypothetical-protein MNELTKEQKYTIAKFYKLYIERSNKGETETVANFFGDAKDARENYFCDRDYQDFLTNCQILIQNKYLTGEILDDNIYNISILNKTFIEFEQNFG >NC_017351.1|WP_001106652.1|898169_898739_-|hypothetical-protein MNYIKRTIILLILFVVVSPINSPKTIADNKYSEIQDDKFQLQPGDIIVTKGPVMWGFFGHCSIAIDDKTILQIEGPGDKPTTQSFESFKYNYASGKNDWMKVYRCSYPGAGKKAADWVKKNYENTNHRYLVTLNLNSKKFTYCTKIIYQAYKFGVSEKSVKSYGLHIISPYAIKDNFIDPYKLRLVKAY >NC_017351.1|WP_000052076.1|898926_899115_-|hypothetical-protein MSLHFAILFWLALIFLVAATFILVLMKKTGKESKKESYLSFTVILYIFGFAILIYTFIFGVL >NC_017351.1|WP_001059690.1|899143_899404_-|hypothetical-protein MNNILLNAINIVITTTFVIFNILITYNKDLDDLCWLLPGIIICGVILIVSFTIAMITKNWLSEILFFINIVLVLYYIYPIFYSFIG |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_017351_3 | 1258679-1258763 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NC_017351_3
|
1 spacers
spacers of NC_017351_3
>3.1|1258709|25|NC_017351|CRISPRCasFinder CGGGGCCCCAACATAGAAGCTGGGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017351_3
The CRISPR arrays of NC_017351_3 >merge|NC_017351|3|1258679-1258763|CRISPRCasFinder AAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGAAGCTGGGGAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG >NC_017351|3|2|1258679-1258763|CRISPRCasFinder AAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG CGGGGCCCCAACATAGAAGCTGGGG AAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG
>NC_017351.1|WP_000181404.1|1258031_1258382_+|50S-ribosomal-protein-L19 MTNHKLIEAVTKSQLRTDLPSFRPGDTLRVHVRIIEGTRERIQVFEGVVIKRRGGGVSETFTVRKISSGVGVERTFPLHTPKIEKIEVKRRGKVRRAKLYYLRSLRGKAARIQEIR >NC_017351.1|WP_000687328.1|1257191_1257929_+|tRNA-(guanosine(37)-N1)-methyltransferase-TrmD MKIDYLTLFPEMFDGVLNHSIMKRAQENNKLQINTVNFRDYAINKHNQVDDYPYGGGQGMVLKPEPVFNAMEDLDVTEQTRVILMCPQGEPFSHQKAVELSKADHIVFICGHYEGYDERIRTHLVTDEISMGDYVLTGGELPAMTMTDAIVRLIPGVLGNEQSHQDDSFSDGLLEFPQYTRPREFKGLTVPDVLLSGNHANIDAWRHEQKLIRTYNKRPDLIEKYPLTNADKQILERYKIGLKKG >NC_017351.1|WP_001261987.1|1256688_1257192_+|ribosome-maturation-factor-RimM MRVEVGQIVNTHGIKGEIKVKSNSDFTDVRFQPGQVLTVVHNNNDLEYTVKSHRVHKGLHMLTFEGINNINDIEHLKGSSIYQERDHEDIVLEENEFYYSDIIGCTVFDDQETPIGRVINIFETGANDVWVIKGSKEYLIPYIADVVKEVDVENKKIIITPMEGLLD >NC_017351.1|WP_000268754.1|1256225_1256501_+|30S-ribosomal-protein-S16 MAVKIRLTRLGSKRNPFYRIVVADARSPRDGRIIEQIGTYNPTSANAPEIKVDEALALKWLNDGAKPTDTVHNILSKEGIMKKFDEQKKAK >NC_017351.1|WP_000863479.1|1254423_1255791_+|signal-recognition-particle-protein MAFEGLSERLQATMQKMRGKGKLTEADIKIMMREVRLALLEADVNFKVVKEFIKTVSERALGSDVMQSLTPGQQVIKIVQDELTQLMGGENTSINMSNKPPTVVMMVGLQGAGKTTTAGKLALLMRKKYNKKPMLVAADIYRPAAINQLQTVGKQIDIPVYSEGDQVKPQQIVTNALKHAKEEHLDFVIIDTAGRLHIDEALMNELKEVKDIAKPNEIMLVVDSMTGQDAVNVAESFDDQLDVTGVTLTKLDGDTRGGAALSIRSVTQKPIKFVGMSEKLDGLELFHPERMASRILGMGDVLSLIEKAQQDVDQEKAKDLEKKMRESSFTLDDFLEQLDQVKNLGPLDDIMKMIPGMNKMKGLDKLNMSEKQIDHIKAIIQSMTPAERNNPDTLNVSRKKRIAKGSGRSLQEVNRLMKQFNDMKKMMKQFTGGGKGKKGKRNQMQNMLKGMNLPF >NC_017351.1|WP_000531320.1|1254065_1254398_+|putative-DNA-binding-protein MGQNDLVKTLRMNYLFDFYQSLLTNKQRNYLELFYLEDYSLSEIADTFNVSRQAVYDNIRRTGDLVEDYEKKLELYQKFEQRREIYDEMKQHLSNPEQIQRYIQQLEDLE >NC_017351.1|WP_000007687.1|1252828_1254079_+|signal-recognition-particle-docking-protein-FtsY MSFFKRLKDKFATNKENEEVKSLTEEQGQDKLEDTHSEGSTQDVNDLAENAEVKKKPRKLSEADFDDDGLISIEDFEEIEAQKMGAKFKAGLEKSRQNFQEQLNNLIARYRKVDEDFFEALEEMLITADVGFNTVMTLTEELRMEAQRRNIQDTEDLREVIVEKIVEIYHQEDDNSEAMNLEDGRLNVILMVGVNGVGKTTTIGKLAYRYKMEGKKVMLAAGDTFRAGAIDQLKVWGERVGVDVISQSEGSDPAAVMYDAINAAKNKGVDILICDTAGRLQNKTNLMQELEKVKRVINRAVPDAPHEALLCLDATTGQNALSQARNFKEVTNVTGIVLTKLDGTAKGGIVLAIRNELHIPVKYVGLGEQLDDLQPFNPESYVYGLFADMIEQNEEITTVENDQIVTEEKDDNHGSK >NC_017351.1|WP_000262700.1|1249262_1252829_+|chromosome-segregation-protein-SMC MVYLKSIDAIGFKSFADQTNVQFDKGVTAIVGPNGSGKSNITDAIKWVLGEQSAKSLRGSKMEDIIFSGAEHRKAQNYAEVQLRLDNHSKKLSVDENEVIVTRRLYRSGESEYYINNDRARLKDIADLFLDSGLGKEAYSIISQGRVDEILNAKPIDRRQIIEESAGVLKYKKRKAESLNKLDQTEDNLTRVEDILYDLEGRVEPLKEEAAIAKEYKTLSHQMKHSDIVVTVHDIDQYTNDNRQLDQRLNDLQGQQANKEADKQRLSQQIQQYKGKRHQLDNDVESLNYQLVKATEAFEKYTGQLNVLEERKKNQSETNARYEEEQENLMELLENISNEISEAQDTYKSLKSKQKELNAVIRELEEQLYVSDEAHDEKLEEIKNEYYTLMSEQSDVNNDIRFLKHTIEENEAKKSRLDSRLVEVFEQLKDIQGQIKTTKKEYQQTNKELSAVDKEIKNIEKDLTDTKKAQNEYEEKLYQAYRYTEKMKTRIDSLATQEEEYTYFFNGVKHILKAKNKELKGIHGAVAEIIDVPSKLTQAIETALGASLQHVIVDSEKDGRQAIQFLKERNLGRATFLPLNVIQSRVVATDIKSIAKEANGFISIASEAVKVAPEYQNIIGNLLGNTIIVDHLKHANELARAIKYRTRIVTLEGDIVNPGGSMTGGGARKSKSILSQKDELTTMRHQLEDYLRQTESFEQQFKELKIKSDQLSELYFEKSQKHNTLKEQVHHFEMELDRLTTQETQIKNDHEEFEFEKNDGYTSDKSRQTLSEKETHLESIKASLKRLEDEIERYTKLSKEGKESVTKTQQTLHQKQSDLAVVKERIKTQQQTIDRLNNQSQQTKHQLNDVKEKIAFFNSDEVMGEQAFQNIKDQINGQQETRTRLSDELDKLKQQRIELNEQIDAQEATLQVCHQDILAIENHYQDIKAEQSKLDVLIHHAIDHLNDEYQLTVERAKSEYTSDESIDALRKKVKLMKMSIDELGPVNLNAIEQFEELNERYTFLSEQRTDLRKAKETLEQIISEMDQEVTERFKETFHAIQGHFTAVFKQLFGGGDAELQLTEADYLTAGIDIVVQPPGKKLQHLSLLSGGERALTAIALLFAILKVRSAPFVILDEVEAALDEANVIRYAKYLNELSDETQFIVITHRKGTMEFADRLYGVTMQESGVTKLVSVNLNTIDDVLKEEQ >NC_017351.1|WP_000043237.1|1248384_1249116_+|ribonuclease-III MSKQKKSEIVNRFRKRFDTKMTELGFTYQNIDLYQQAFSHSSFINDFNMNRLDHNERLEFLGDAVLELTVSRYLFDKHPNLPEGNLTKMRATIVCEPSLVIFANKIGLNEMILLGKGEEKTGGRTRPSLISDAFEAFIGALYLDQGLDIVWKFAEKVIFPHVEQNELLGVVDFKTQFQEYVHQQNKGDVTYNLIKEEGPAHHRLFTSEVILQGEAIAEGKGKTKKESEQRAAESAYKQLKQIK >NC_017351.1|WP_000426914.1|1248035_1248269_+|acyl-carrier-protein MENFDKVKDIIVDRLGVDADKVTEDASFKDDLGADSLDIAELVMELEDEFGTEIPDEEAEKINTVGDAVKFINSLEK >NC_017351.1|WP_000915242.1|1258836_1261443_-|lipoteichoic-acid-specific-glycosyltransferase-YfhO MLKKWLNSNVKQFFVITFISVILTLILFSTHIYDYIVNGTVFSGAGDGFRQMMPFQMYLYEHLSSFSSLYDASFGLGGDYMKGLSYYYSLSPLMWLNFLFIKIGETVGIFNPTTIHFWPTNQLIMAMIRAIITFVVTFYLFKILHFKRSTNMIATILYGMSTVVIYFNFTWSFYGNLLYLLPLSILGLERYFQQRKIGIFIVAIALTLFSNFYFSYYQAIIIGCYYLYRLIFTYKYDIVSRTQKLICVISATVLSVLSSVFGLFTGISAFLENDRKQNPNVDIPFLTPLDYHYFFFSDGFYITISILTIVALLSFKLYRFYFYRLFAIVTWILFIGSLSQYFDSAFNGFSFPERRWVYILALSSSALCGLFIQHLSTLNMKYYLIRTIPVSIIALLYVLPSPTHPLALIVGIILLMVLAVILKFSLWRYKKLTVAILVLIVMIQQIAILDNNKNMAIKPYQQSISTLKQHDYHSNYVNQLIKKINQNATGPFNRIDYMSDYALNSPFIYHYNGISLYSSIFNGDILKYYDKTLQINMPIDKNSTYRLLGNRQNLLSLWNVNDRIRVNHDDNLPYGFKINSEHKDNKVRWIHSKNTIHYPSAHITNKVFSNKELKSPLDKEQAMLQGIVSNNTKDVNTHFKANKNLLSDSTIKLNSAAWQSPTKHLLQVKQNNGGLTVQLPKSVSNQFKDLYFEMDLELLSPDKAHDVKVNEYTQERNKLTYKYRRFVTPVTIRIKASDRIRLSLPKGKYRVNLKGIYGEDYTTLKDASNSLEAVKVSKTKQGYTITKNKNSSGYIVLPTAYNQGMKATSGDQSLKVEQVNGIMTGIKAPKNITKIQLSYTPPYYYLLITITIFGIICSIIFTRWARQK >NC_017351.1|WP_000236712.1|1261843_1262728_+|ribosome-biogenesis-GTPase-YlqF MVIQWYPGHMAKAKREVSEQLKKVDVVFELVDARIPYSSRNPMIDEVINQKPRVVILNKKDMSNLNEMSKWEQFFIDKGYYPVSVDAKHGKNLKKVEAAAIKATAEKFEREKAKGLKPRAIRAMIVGIPNVGKSTLINKLAKRSIAQTGNKPGVTKQQQWIKVGNALQLLDTPGILWPKFEDEEVGKKLSLTGAIKDSIVHLDEVAIYGLNFLIQHDIERLKAHYKIDVPEYAEILAWFDAIGKKRGLIRRGNEIDYEAVIELIIYDIRNAKIGNYCFDIFKDMTEELANDANN >NC_017351.1|WP_000176405.1|1262711_1263479_+|ribonuclease-HII MTLTIKEVTQLINAVNTIEELENHECFLDERKGVQTAITRRRKALEKEQALKEKYVEMTYFENEILKEHPNAIICGIDEVGRGPLAGPVVACATILNSNHNYLGLDDSKKVPVTKRLELNEALKNEVTAFAYGIATAEEIDEFNIYKATQIAMQRAIDGLSVQPTHLLIDAMTLDNALPQVSLIKGDARSVSIAAASIMAKVFRDDYMTQLSKDYPEYGFEKNAGYGTKQHLLAIDDIGIMKEHRKSFEPIKSLL >NC_017351.1|WP_001020803.1|1263587_1264754_+|ADP-forming-succinate--CoA-ligase-subunit-beta MNIHEYQGKEIFRSMGVAVPEGRVAFTAEEAVEKAKELNSDVYVVKAQIHAGGRGKAGGVKIAKSLSEVETYAKELLGKTLVTHQTGPEGKEIKRLYIEEGCAIQKEYYVGFVIDRATDQVTLMASEEGGTEIEEVASKTPEKIFKETIDPVIGLSPFQARRIAFNINIPKESVNKAAKFLLALYNVFIEKDCSIVEINPLVTTADGDVLALDAKINFDDNALFRHKDVVELRDLEEEDPKEIEASKHDLSYIALDGGIGCMVNGAGLAMATMDTINHFGGNPANFLDAGGSATREKVTEAFKIILGDENVKGIFVNIFGGIMKCDVIAEGIVEAVKEVDLTLPLVVRLEGTNVELGKKILKDSGLAIEPAATMAEGAQKIVKLVKEA >NC_017351.1|WP_000110253.1|1264775_1265684_+|succinate--CoA-ligase-subunit-alpha MSVFIDKNTKVMVQGITGSTALFHTKQMLDYGTKIVAGVTPGKGGQVVEGVPVFNTVEEAKNETGATVSVIYVPAPFAADSILEAADADLDMVICITEHIPVLDMVKVKRYLQGRKTRLVGPNCPGVITADECKIGIMPGYIHKKGHVGVVSRSGTLTYEAVHQLTEEGIGQTTAVGIGGDPVNGTNFIDVLKAFNEDDETKAVVMIGEIGGTAEEEAAEWIKANMTKPVVGFIGGQTAPPGKRMGHAGAIISGGKGTAEEKIKTLNSCGVKTAATPSEIGSTLIEAAKEAGIYESLLTVNK >NC_017351.1|WP_001041668.1|1265910_1267029_+|LysM-peptidoglycan-binding-domain-containing-protein MNKQQSKVRYSIRKVSIGILSISIGMFLALGMSNKAYADEIDKSKDFTRGYEQNVFAKSELNANKNTTKDKIKNEGAVKTSDTSLKLDNKSAISNGNEINQDIKISNTPKNSSQGNNLVVNNNEPTKEIKIANLEAQNSNQEKMNKVTNNYFGYYSFREAPKTQIYTVKKGDTLSAIALKYKTTVSNIQNTNNIANPNLIFIGQKLKVPMTPLVEPKPKTVSSNNKSNSNSSTLNYLKTLENRGWDFDGSYGWQCFDLVNVYWNHLYGHGLKGYGAKDIPYANNFNSEAKIYHNTPTFKAEPGDLVVFSGRFGGGYGHTAIVLNGDYDGKLMKFQSLDQNWNNGGWRKAEVAHKVVHNYENDMIFIRPFKKA >NC_017351.1|WP_000672867.1|1267056_1268301_+|FemA/FemB-family-glycyltransferase-FmhC MKFSTLSEEEFTNYTKKHFKHYTQSIELYNYRNKINHEAHIVGVKNDKNEVIAACLLTEARIFKFYKYFYSHRGPLLDYFDAKLVCYFFKELSKFIYKNRGVFILVDPYLIENLRDANGRIIKNYNNSVIVKMLGKIGYLHQGYTTGYSNKSQIRWISVLDLKDKDENQLLKEMEYQTRRNIKKTIEIGVKVEDLSIEETNRFYKLFQMAEEKHGFHFMNEDYFKRMQEIYKDKAMLKIACINLNEYQDKLKIQLLKIENEMMTVNRALNENPNSKKNKSKLNQLNMQLSSINNRISKTEELIFEDGPVLDLAAALFICTDDEVYYLSSGSNPKYNQYMGAYHLQWHMIKYAKSHNINRYNFYGITGVFSNEADDFGVQQFKKGFNAHVEELIGDFIKPVRPILYKFAKLIYKV >NC_017351.1|WP_000593192.1|1268473_1269346_+|DNA-protecting-protein-DprA MIKLFLLKLYWAHFSTKQIHQFLMAYPNVIKEEGRKKDSYLCEWVNREENVHLLRKYYAFIKLDHNDIIKELQKLKVSYITYMDSEYPVLLKEIYQFPLLLFYKGNIKLINNMHHLAVVGARDSTSYTQQSLEFLLSNDKSKYLTIVSGLAQGADAMAHQIALKYNLPTIAVLAFGHQTHYPKSTLALRNKIEEKGLVISEYPPHTPIAKYRFPERNRIISGLSKGVLITEAKEQSGSHITIDFALEQNRNVYVLPGSMFNPMTKGNLLRIQEGAKVVLNANDIFEDYYI >NC_017351.1|WP_001557331.1|1269519_1271595_+|type-I-DNA-topoisomerase MTLADNLVIVESPAKAKTIEKYLGKKYKVIASMGHVRDLPRSQMGVDTEDNYEPKYITIRGKGPVVKELKKHAKKAKNVFLASDPDREGEAIAWHLSKILELEDSKENRVVFNEITKDAVKESFKNPREIEMNLVDAQQARRILDRLVGYNISPVLWKKVKKGLSAGRVQSVALRLVIDRENEIRNFKPEEYWTIEGEFRYKKSKFNAKFLHYKNKPFKLKTKKDVEKITAALDGDQFEITNVTKKEKTRNPANPFTTSTLQQEAARKLNFKARKTMMVAQQLYEGIDLKKQGTIGLITYMRTDSTRISDTAKAEAKQYITDKYGESYTSKRKASGKQGDQDAHEAIRPSSTMRTPDDMKSFLTKDQYRLYKLIWERFVASQMAPAILDTVSLDITQGDIKFRANGQTIKFKGFMTLYVETKDDSDSEKENKLPKLEQGDKVTATQIEPAQHYTQPPPRYTEARLVKTLEELKIGRPSTYAPTIDTIQKRNYVKLESKRFVPTELGEIVHEQVKEYFPEIIDVEFTVNMETLLDKIAEGDITWRKVIDGFFSSFKQDVERAEEEMEKIEIKDEPAGEDCEVCGSPMVIKMGRYGKFMACSNFPDCRNTKAIVKSIGVKCPKCNDGDVVERKSKKNRVFYGCSKYPECDFISWDKPIGRDCPKCNQYLVENKKGKTTQVICSNCDYKEAAQK >NC_017351.1|WP_000195254.1|1271750_1273058_+|methylenetetrahydrofolate--tRNA-(uracil(54)--C(5))-methyltransferase-(FADH(2)-oxidizing)-TrmFO MTQTVNVIGAGLAGSEAAYQLAERGIKVNLIEMRPVKQTPAHHTDKFAELVCSNSLRGNALTNGVGVLKEEMRRLNSIIIEAADKARVPAGGALAVDRHDFSGYITETLKNHENITVINEEINAIPDGYTIIATGPLTTETLAQEIVDITGKDQLYFYDAAAPIIEKESIDMDKVYLKSRYDKGEAAYLNCPMTEDEFNRFYDAVLEAEVAPVNSFEKEKYFEGCMPFEVMAERGRKTLLFGPMKPVGLEDPKTGKRPYAVVQLRQDDAAGTLYNIVGFQTHLKWGAQKEVIKLIPGLENVDIVRYGVMHRNTFINSPDVLNEKYELISQPNIQFAGQMTGVEGYVESAASGLVAGINLAHKILGKGEVVFPRETMIGSMAYYISHAKNNKNFQPMNANFGLLPSLETRIKDKKERYEAQANRALDYLENFKKTL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_017351_4 | 1727667-1727752 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_017351_4
|
1 spacers
spacers of NC_017351_4
>4.1|1727694|32|NC_017351|CRISPRCasFinder GCACATTATTGAAAGCTGACTTTTGGTCAGCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017351_4
The CRISPR arrays of NC_017351_4 >merge|NC_017351|4|1727667-1727752|CRISPRCasFinder TCTGTGTTGGGGCCCCATCCCCAACTTGCACATTATTGAAAGCTGACTTTTGGTCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCGTCCCCAACTT >NC_017351|4|3|1727667-1727752|CRISPRCasFinder TCTGTGTTGGGGCCCCATCCCCAACTT GCACATTATTGAAAGCTGACTTTTGGTCAGCT TCTGTGTTGGGGCCCCGTCCCCAACTT
>NC_017351.1|WP_000567017.1|1726686_1727355_-|tetratricopeptide-repeat-protein MIDQQTIYQYIQNGKIEEALQALFGNIEEDPTIIENYINAGIVLADANEIEKAERFFQKALTIDPKNGVVFYNLANVYYNQQRYQEAIKLYQQALQTEIEQVDCNYMIGMAFNQLESFKLALPYLMTAAELDKDKDAEVQFQYGLVLCQLEMFNEAITQLKHVLTIDKNHVDARYNLGLALFMKNEDIDEAITHFKEAVTIDPKHLLSQHALKTFTKMKEEE >NC_017351.1|WP_001283311.1|1724207_1726685_-|ATP-dependent-RecD-like-DNA-helicase MSDPTLFDYSMIKGTVEAILFQNSDNFYTVLKVDTIETNEDFDTMPTVVGFLPNIVEGDVYTFKGQVVDHPRYGKQLKAETFEKEMPQTKEAIISYLSSDLFKGVGKKTAQNIVNTLGDNAINDILDDHSVLEKVSGLSKKKQKQIAEQISANQESEKIMIRLHDLGFGPKLSMAIYQFYLGDTLTILDRNPYQLIYDIKGIGFNKADQLARNIGIAYNDNERLKAALLYTLEEECIKQGHTYLPINVVIDLTVDVLNYQDEEVIEPEKLDEMLQYLNEEKRLIIDNEQVAIPSLYYSEIKSVQNLFRIKTHTNKLTEIEQSDLQMHIGEIEDANQVNYAASQKEALQTAINSKVMLLTGGPGTGKTTVIKGIVELYAEIHGLSLDYDDYVNDDYPVVLAAPTGRASKRLQESTGLEAMTIHRLIGWNQDTKPEDILENEINARLIIIDEMSMVDTWLFHQFLSAVPLDAQLIFVGDEDQLPSVGPGQVFKDLIESKAIPRVNLTEVYRQQDGSSIIELAHRMKLGQKIDITQRFHDRSFINCQANQIPTVVEKVVTSAVNKGYTMADIQVLAPMYKGNAGIKRLNQVLQDILNPKKKDTREIEFGDVVFRKGDKVLQLVNRPNDNIFNGDIGVIVGIFWAKENALNKDVLVVDFEGNEITFTKQDMMELTHAYCTSIHKSQGSEFPIVIMPIVKQYFRMLQRPILYTGLTRAKTSLVLLGDPEAFDIGLKTNGQARLTQLCTLLKNYFNSEDEEMLENTATNDTGASQTTIDDQVEAPMSSNDSEEVMSDSTKTDTNVLTEATMFKIDPMINMGEITPYDFIER >NC_017351.1|WP_000734074.1|1721234_1723865_-|alanine--tRNA-ligase MKKLKASEIRQKYLDFFVEKGHMVEPSAPLVPIDDDTLLWINSGVATLKKYFDGRETPKKPRIVNSQKAIRTNDIENVGFTARHHTFFEMLGNFSIGDYFKQEAIEFAWEFLTSDKWMGMEPDKLYVTIHPEDMEAYNIWHKDIGLEESRIIRIEGNFWDIGEGPSGPNTEIFYDRGEAYGQDDPAEEMYPGGENERYLEVWNLVFSEFNHNKDHSYTPLPNKNIDTGMGLERMASVSQNVRTNYETDLFMPIMNEIEKVSGKQYLVNNEQDVAFKVIADHIRTIAFAISDGALPANEGRGYVLRRLLRRAVRFSQTLGINEPFMYKLVDIVADIMEPYYPNVKEKADFIKRVIKSEEERFHETLEDGLAILNELIKKAKATTNEINGKDAFKLYDTYGFPIELTEEIAVQAGLKVDMTTFESEMQQQRDRARQARQNSQSMQVQSEVLKNITSASTFVGYDTATAQTTLTHLIYNGEEVSQVEAGETVYFMLTETPFYAVSGGQVADTGIVYNDNFEIAVSEVTKAPNGQNLHKGVVQFGQVNVGATVSAEVNQNDRRDIQKNHSATHLLHAALKSVLGDHVNQAGSLVEADRLRFDFSHFGPMTNDEIDQVERLVNEEIWKGIDVNIQEMDIASAKEMGAMALFGEKYGDVVRVVNMAPFSIELCGGIHVRNTSEIGLFKIVSESGTGAGVRRIEALTGKAAFLYLEDIQEKFNTMKSQMKVKSDDQVVDKLTQLQDEEKALLKQLEQRDKEITSLKMGNIEDQVEEINGYKVLVTEVDVPNAKAIRSTMDDFKSKLQDTIIILASNVDDKVSMVATVPKSLTNNVKAGDLIKQMAPIVGGKGGGRPDMAQGGGTQPENISKSLSFIKDYIKNL >NC_017351.1|WP_000426912.1|1720911_1721172_-|IreB-family-regulatory-phosphoprotein MENFDKTMKFDYEELPTQDVRDVLNNVYRTLDERGYNAVNQIVGYLLSGDPAYIPRQNEARNQIRHIDRDVIMEELVSYYLKEQNK >NC_017351.1|WP_000939059.1|1720479_1720908_-|Holliday-junction-resolvase-RuvX MLQHKILGLDVGSRTVGIAISDIMGWTAQGLDTLRINEENNELGIDQLVDIIKKHNVGTVVIGLPKNMNNSIGFRGEASLTYKEKLLEAYPSIEIVMWDERLSTMAAERSLLEADVSRQKRKQVIDKMAAVFILQGYLDSLH >NC_017351.1|WP_000134779.1|1720156_1720465_-|DUF1292-domain-containing-protein MTEHNHDSQLEINNEEELLTLFDEEGNEVLYRKVLEFYHPEFKKEYVILAEEGAQSDEDDMIELVPMINEPDESGDGGKLVPIETDEEWDMIEEVVNTEMEE >NC_017351.1|WP_000342258.1|1719233_1719872_-|O-methyltransferase MDDLNKKYLIDLHQHQNSSIEVLREFAEGNEVPIVDRLTLDLIKQLIRMNNVKNILEIGTAIGYSSMQFASISDDIHVTTIERNETMIQYAKQNLATYHFENQVRIIEGNALEQFENVNDKVYDMIFIDAAKAQSKKFFEIYTPLLKHQGLVITDNVLYHGFVSDIGIVRSRNVRQMVKKVQDYNEWLIKQPGYTTNFLNIDDGLAISIKGE >NC_017351.1|WP_000137774.1|1718307_1719231_-|U32-family-peptidase MTELLVTPKSLSHMETLIDLGADAFVIGEQKFGLRLPGEFNRQQMTEAVALAHKNDKKVYAAVNGLFHNYHLDAVEDYINFLHEIRVDRIIFGDPAVVMYVKAQENPIPLHWNAETLVTNHFQCNYWGKRGASRAVLARELNLDEIINIKENSNVEIEVQVQGMTCMFQSKRMLLGNYYTFQDRQMKIERRNDEQSLLLYDEERQNNYPVYEDYNGTHIMSPNDICLIEELAPFFEAGIDSFKIDGILQTEEYINVVTEQYRQAIDLYNEDPEIYEDEKFMLIDPIEEIQPDHRPFDEGFLYKQTVY >NC_017351.1|WP_000848304.1|1717027_1718296_-|U32-family-peptidase MKTIEEIKSTPKTVMKKPELLAPAGNLEKLKIAVHYGADAVFLGGQEYGLRSNADNFTMEEIAEGVEFANRYGAKIYVTTNIIAHDENIEGLESYLRNLEKTGATGIIVADPLIIETCKEVAPKLEIHLSTQQSLSNYKAVEYWKEEGLDRVVLARETGAMEMREMKEKVDIEIEAFIHGAMCIAYSGRCTLSNHMTARDSNRGGCCQSCRWDYELLEVDDNGELDVFYNQGEVTPFAMSPKDLKLIESIPQMMDIGVDSLKIEGRMKSIHYIATVVSVYRKVIDAYAADPDNFKINPEWLIELDKCANRDTAPAFFEGTPGYEEQMFGQQQSKKSPFDFCGLVLDYNEDTKIATIQQRNNFKPGQEIEFFGPEIETFTQVVEAIYDEEGNSLDAARHPLQIVQIKVDRPIYPNNMMRKEIG >NC_017351.1|WP_000648617.1|1716404_1717028_-|uridine-kinase MKATTIIGIAGGSGSGKTTVTNEIMKNLEGHSVALLAQDYYYKDQKHLTFDERLETNYDHPFAFDNDLLIENLKDLKNGKAVEVPTYDYASHTRSDITIDFKPKDVIIVEGIFALENKVLRDMMDVKIYVDTDADLRILRRLTRDTKERGRSMDSVINQYLSVVRPMHDQFIEPTKKYADIIIPEGGSNKVAIDIMTTKIQSLVSKQ >NC_017351.1|WP_000066097.1|1727933_1729052_-|tRNA-2-thiouridine(34)-synthase-MnmA MSNKDIRVVVGMSGGVDSSVTAHVLKEQGYDVIGIFMKNWDDTDENGVCTATEDYNDVIEVCNQIGIPYYAVNFEKEYWDKVFTYFLDEYKKGRTPNPDVMCNKEIKFKAFLDHAMNLGADYVATGHYARIHRHEDGHVEMLRGVDNNKDQTYFLNQLSQQQLSKVMFPIGDIEKSEVRRIAEEQGLVTAKKKDSTGICFIGEKNFKTFLSQYLPAQPGDMITLDGKKMGKHSGLMYYTIGQRHGLGIGGDGDPWFVVGKNLKDNVLYVEQGFHHDALYSDYLIASDYSFVNPEDNDLDQGFECTAKFRYRQKDTKVFVKRENDHALRVTFAEPVRAITPGQAVVFYQGDVCLGGATIDDVFKNEGQLNYVV >NC_017351.1|WP_000409167.1|1729052_1730195_-|cysteine-desulfurase MEIYADYAATTPVKPEVVDAMMTIYNSHYGNPSSIHAKGRDARKYLDESRRQIAQLLGADTHEIIFTSGATESNNTAIKGIVKANEQLGNHIITSKIEHHSVLHVFEQLEREGFDVTYLDVDDTGAIDLDQLEETITDKTILVSIMFVNNEVGTVQQIYDIQDIIAETNAYFHVDAVQAIGHLDVKFDEFEIDAMSITAHKFGGPKGVGALLVKDHVTLDYPQLGGEQELKRRAGTENLAQIVGMAKALQLAEKNRDDNNIHLMNLKEQFLVKLQERAIPFELNGSMTDATGHIVNLYFPFVEVETMLTLLDMAQIYVSSGSACTAGSTQPSHVLDAMFEDEERSNHSIRFSFNELTTENEINAIVAEIHKIYFKFKEES >NC_017351.1|WP_000985872.1|1730506_1731520_+|LLM-class-flavin-dependent-oxidoreductase MAIKYSALNLVPIREGDDEQTAINDMVNLAQHLDELSYERYWIAEHHNAPNLVSSATALLIQHTLEHTKHIRVGSGGIMLPNHAPLIVAEQFGTMATLFPNRVDLGLGRAPGTDMMTASALRRDQHDGVYKFPEEVSLLQQYFGPAHQQAYVRAYPAVGKNVPLYILGSSTDSAHLAARKGLPYVFAGHFAPQQMKEAIEIYKTLFEPSDVLDEPYVIVCLNTIVAENDDEAQYLASSMAQVMVSITRGRMQPVQPPTHELQNILTPREYAMAMERQKISLIGSENTVQQKIQDFMETYGEVNEIMAISYIYDKDMQLDSYRRFKNVINQINEKNTL >NC_017351.1|WP_000009238.1|1731756_1731903_-|hypothetical-protein MSFMDKAKDAVEKFKNSDNEQVKNVKDKINEYTGSNNEEKKENEDKEK >NC_017351.1|WP_000752909.1|1731942_1732125_-|CsbD-family-protein MADESKFDQFKGNVKETVGNVTDNKELEKEGQQDKATGKAKEVVENAKNKITDAIDKLKK >NC_017351.1|WP_000704122.1|1732224_1732647_-|Rrf2-family-transcriptional-regulator MKISTKGRYGLTLMISLAKKEGQGCISLKSIAEENNLSDLYLEQLVGPLRNAGLIRSVRGAKGGYQLRVPAEEISAGDIIRLLEGPITFVESIESEPPAQKQLWIRMRDAVRDVLDNTTLKYLAEYVDTSEDLDGYMFYI >NC_017351.1|WP_000102738.1|1732731_1734006_+|replication-associated-recombination-protein-A MSTEPLASRMRPKNIDEIISQQHLVGPRGIIRRMVDTKKLTSMIFYGPPGIGKTSIAKAISGSTQYKFRQLNAVTNTKKDMQLVVEEAKMSGQVILLLDEIHRLDKAKQDFLLPHLENGKIVLIGATTSNPYHAINPAIRSRAQIFELYPLNDEDVRQALTRAIEDEENGLKTYQPKIDEDAMAYFSTQSQGDVRSALNALELAVLSADNDKDGYRHVTLQDAKDCLQKGAFVSDKDGDMHYDVMSAFQKSIRGSDVNAALHYLARLIEAGDLPTIVRRLLVISYEDIGLASPNAGQRTLAAIESAERLGLPEARIPLSQAVIELCLSPKSNSAMSAIDSALSDIRNGHVGQIPNHLKDGHYQGAKDLGRSIGYKYPHQYVNGYVSQQYLPDKLKNKIYYEPKTTSKSEQQLKEIYNNLLKQRP >NC_017351.1|WP_000682642.1|1734166_1734940_-|tRNA-threonylcarbamoyladenosine-dehydratase MKHQFSRNELAIGQQGLDLLKQQTVVILGVGGVGSFAAEALARTNIGHIILIDKDDVDITNVNRQLHALTTTVGQSKVSLMEERIKLINPDCKVTPLHLFYTEETYEEIFDNYDIDYFVDASDTIMYKVHLMKECLDRGIKVISSMGAANKTDPTRFTISDISKTHTDPMAKIIRQKLKKLGIRKGIPVVFSDESPIVIREDVKDIVGDKNAINRKGQMPPSSNAFVPSVVGLICASYVVNDVLKDIPVRRIKDKGQ >NC_017351.1|WP_031864484.1|1734939_1735068_-|hypothetical-protein MGLIGFNKCFLVEFWKNNQSDNAKHKILSYYVLMYKSVKEVK >NC_017351.1|WP_000044799.1|1735400_1737167_-|aspartate--tRNA-ligase MSKRTTYCGLVTEAFLGQEITLKGWVNNRRDLGGLIFVDLRDREGIVQVVFNPAFSEEALKIAETVRSEYVVEVQGTVTKRDPETVNPKIKTGQVEVQVTNIKVINKSETPPFSINEENVNVDENIRLKYRYLDLRRQELAQTFKMRHQITRSIRQYLDDEGFFDIETPVLTKSTPEGARDYLVPSRVHDGEFYALPQSPQLFKQLLMISGFDKYYQIVKCFRDEDLRADRQPEFTQVDIEMSFVDQEDVMQMGEEMLKKVVKEVKGVEINGAFPRMTYKEAMRRYGSDKPDTRFEMELIDVSQLGRDMDFKVFKDTVENDGEIKAIVAKGAAEQYTRKDMDALTEFVNIYGAKGLAWVKVVEDGLTGPIGRFFETENVETLLTLTGAEAGDLVMFVADKPNVVAQSLGALRVKLAKELGLIDETKLNFLWVTDWPLLEYDEDAKRYVAAHHPFTSPKEADIAKLGTAPEEAEANAYDIVLNGYELGGGSIRIHDGELQEKMFEVLGFTKEQAQEQFGFLLDAFKYGAPPHGGIALGLDRLVMLLTNRTNLRDTIAFPKTASATCLLTNAPGEVSDKQLEELSLRIRH |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_017351_5 | 2016580-2016664 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_017351_5
|
1 spacers
spacers of NC_017351_5
>5.1|2016606|33|NC_017351|CRISPRCasFinder TTGCCTGTAGAATTTCTTTTTTGAAATTCTCTA |
DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017351_5
The CRISPR arrays of NC_017351_5 >merge|NC_017351|5|2016580-2016664|CRISPRCasFinder TGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAATTTCTTTTTTGAAATTCTCTATGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCA >NC_017351|5|4|2016580-2016664|CRISPRCasFinder TGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCA TTGCCTGTAGAATTTCTTTTTTGAAATTCTCTA TGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCA
>NC_017351.1|WP_000636142.1|2015582_2016341_-|type-I-methionyl-aminopeptidase MIVKTEEELQALKEIGYICAKVRNTMQAATKPGITTKELDNIAKELFEEYGAISAPIHDENFPGQTCISVNEEVAHGIPSKRVIREGDLVNIDVSALKNGYYADTGISFVVGESDDPMKQKVCDVATMAFENAIAKVKPGTKLSNIGKAVHNTARQNDLKVIKNLTGHGVGLSLHEAPAHVLNYFDPKDKTLLTEGMVLAIEPFISSNASFVTEGKNEWAFETSDKSFVAQIEHTVIVTKDGPILTTKIEEE >NC_017351.1|WP_001110179.1|2014979_2015366_-|hypothetical-protein MNYVERYIEQFLRATVRNNIKHYLLMLDEKMKNLDDYMRYLITKKEQLSKLIDSLMLTLENKYIDIAEAFQIQCAREINNQEIENIKSELNKVEAYYAQIETQIQQTSTEKIATEKTSYLINYMNAVA >NC_017351.1|WP_000149064.1|2014263_2014965_-|cell-wall-active-antibiotics-response-protein MTHKYISTQMLIIFTALMIIANFYYIFFEKIGFLLVLLLGCVLVYVGYLYFHKIRGLLAFWIGALLIAFTLLSNKYTIIILFVFLLLLIVRYLIHKFKPKKVVATDEVMTSPSFIKQKWFGEQRTPVYVYKWEDVQIQHGIGDLHIDLTKAANIKENNTIVVRHILGKVQVILPVNYNINLHVAAFYGSTYVNEKSYKVENNNIHIEEMMKPDNYTVNIYVSTFIGDVEVIYR >NC_017351.1|WP_001017131.1|2013223_2014267_-|sensor-histidine-kinase MNHYIRTIGSMLILVYSMLAAFLFIDKVFVNIIYFQGMFYTQIFGIPVFLFLNLIIILLCIIVGSVLAYKINQQNDWIKTQIERSMEGETVGINDQNIEIYSETLDLYHTLVPLNQELHKLRLKTQNLTNENYNINDVKVKKIIEDERQRLARELHDSVSQQLFAASMMLSAIKETKLEPPLDQQIPILEKMVQDSQLEMRALLLHLRPLGLKDKSLGEGIKDLVIDLQKKVPMKVVHEIQDFKVPKGIEDHLFRITQEAISNTLRHSNGTKVTVELFNKDDYLLLRIQDNGKGFNVDEKLEQSYGLKNMRERALEIGATFHIVSLPDSGTRIEVKAPLNKEDSYDD >NC_017351.1|WP_000153535.1|2012604_2013234_-|two-component-system-response-regulator-VraR MTIKVLFVDDHEMVRIGISSYLSTQSDIEVVGEGASGKEAIAKAHELKPDLILMDLLMEDMDGVEATTQIKKDLPQIKVLMLTSFIEDKEVYRALDAGVDSYILKTTSAKDIADAVRKTSRGESVFEPEVLVKMRNRMKKRAELYEMLTEREMEILLLIAKGYSNQEIASASHITIKTVKTHVSNILSKLEVQDRTQAVIYAFQHNLIQ >NC_017351.1|WP_000037079.1|2011275_2012493_+|YihY/virulence-factor-BrkB-family-protein MSKKDHSSSKYLNSVKEAQEESKKKNKSNPKIDVDRTYIEPQQFQSKKPKKDDQVFFLSRLNKPAKYKKDSNFLSYLIYRIGKDDASGLAAQMTYHFVLAMFPMLLFLLTLLPFFNIKQSQITNMLSNAPAETSTLIKSVIGDITQNSSGGLLSIGLILAIWSASNGMTAIMNSFNVAYDVEDSRNGIVLKLLSVVFTVVMGVVFVVALALPTLGSVISHFLFGPLGFDEQVKWIFNLIRIVLPIIIIFIVFIVLYSVAPNVKTKLKSVLPGAVFTSIIWLAGSFGFGWYISNFGNYSKTYGSIAGIIILLLWLYITSFIIIVGAEINAIIHQRSVIKGKTPEEAALEHDDNNKNHYNENTRYEYDEDSNATHQRTYHVDEHPSDTYPEDDKNIKDKIVDKLKKD >NC_017351.1|WP_000428172.1|2010722_2010998_+|hypothetical-protein MENKFVPGILIGAVIGGAISLADKSTRQALVQSVKDAKNGNRTRKPSKVSKIKDEVLYWKDVVEEIRRNNPELERSLKDAKETFVNRKNQR >NC_017351.1|WP_000228666.1|2010251_2010716_+|low-molecular-weight-phosphotyrosine-protein-phosphatase MVDVAFVCLGNICRSPMAEAIMRQRLKDRNIHDIKVHSRGTGSWNLGEPPHEGTQKILNKHNIPFDGMISELFEATDDFDYIVAMDQSNVDNIKSINPNLKGQLFKLLEFSNMEESDVPDPYYTNNFEGVYDMVLSSCDNLIDYIVKDANLKEG >NC_017351.1|WP_000180463.1|2009904_2010105_-|DUF1128-family-protein MTNEEKVLSIREKLNIVNQGLLDPEKYKNANEEELTDIYDFVQSRERLSPSEVTAIADALGQLRHD >NC_017351.1|WP_001793428.1|2008645_2009902_-|aminopeptidase MGILTNYKEKLQQYAELLVKVGMNVQPKQPVFIRSSVETLELTHLIVEEAYHCGASDVRVVYSDPTLKRLKFENESVEHFANHEIKSYDVEARMDYVKRGAANLALISEDPDLMDGIDSQKLQAFQQQNARAFKGYMESVQKNQFPWVVAAFPSKAWAKRVYPELSVEEAYIKFIDEVFDIVRIDGNDPVENWRQHIANLSVYAQKLQQKNYHALHYVSEGTDLTVGLAKNHIWEDATSYVNGKEQAFIANIPTEEVFTAPDRNRVDGYVTNKLPLSYNGTIIDQFKLMFKDGEIIDFSAEKGEAVLKDLINTDEGSRRLGEVALVPDDSPISNRNTIFYNTLFDENAACHLAIGSAYAFNIQGGTEMTVEEKIASGLNDSNVHVDFMIGSSDLTIYGIFEDGSKELVFENGNWASTF >NC_017351.1|WP_000999718.1|2016930_2017917_+|aromatic-acid-exporter-family-protein MNDQWYKHLIGARTIKTGIAIFLTAVFCMALDLTPIYAILTAVVTIEPTAKASLIKGYRRLPATVIGAGFAVLFTYLFGDQSPFTYALSATFTILFCTKLKLQVGTNVAVLTSLAMIPGIHDAYIFNFLSRTLTAIIGLVTSGLINFMVFPPKYYGQVEEKLSKTDALMYKLFYNRCQELILSRLQSDKSEKSYKNIFNLNNQVETLISYQRDELSYHKKKECDWKLLNQLTKRAYTNRLFITHLSNIIYLPKNTRVNFSGDEKMALLKISSSIKDIFYDGSFKREDDSVETLRSTIKALEISGENQIKSHILYEVLMIYRLLDSRYA >NC_017351.1|WP_001837236.1|2018406_2018820_-|hypothetical-protein MKPTKLILKDASYLHSKTSITFILKDVVIEEDNKIYYFDTSATFEDQEVKFEFALFDSDMDNLKHMDYDNPVTEIYFIEPDLHFTIIDFNQELLCIYIDFDSGLRHSNMATESGISLRINVAKSDFTKFINELASLH >NC_017351.1|WP_000544969.1|2019045_2019777_-|type-1-glutamine-amidotransferase MHELTIYHFMSDKLNLYSDIGNIIALRQRAKKRNIKVNVVEINETEGITFDECDIFFIGGGSDREQALATKELSKIKTPLKEAIEDGMPGLTICGGYQFLGKKYITPDGTELEGLGILDFYTESKTNRLTGDIVIESDTFGTIVGFENHGGRTYHDFGTLGHVTFGYGNNDEDKKEGIHYKNLLGTYLHGPILPKNYEITDYLLEKACERKGIPFEPKEIDNEAEIQAKQVLIDRANRQKKSR >NC_017351.1|WP_001250335.1|2019778_2021092_-|lipid-II-isoglutaminyl-synthase-subunit-MurT MRQWTAIHLAKLARKASRAVGKRGTDLPGQIARKVDTDILRKLAEQVDDIVFISGTNGKTTTSNLIGHTLKANNIQIIHNNEGANMAAGITSAFIMQSTPKTKIAVIEIDEGSIPRVLKEVTPSMMVFTNFFRDQMDRFGEIDIMVNNIAETISNKGIKLLLNADDPFVSRLKIASDTIVYYGMKAHAHEFEQSTMNESRYCPNCGRLLQYDYIHYNQIGHYHCQCGFKREQAKYEISSFDVAPFLYLNINDEKYDMKIAGDFNAYNALAAYTVLRELGLNEQTIKNGFETYTSDNGRMQYFKKERKEAMINLAKNPAGMNASLSVGEQLEGEKVYVISLNDNAADGRDTSWIYDADFEKLSKQQIEAIIVTGTRAEELQLRLKLAEVEVPIIVEHDIYKATAKTMDYKGFTVAIPNYTSLAPMLEQLNRSFEGGQS >NC_017351.1|WP_000949467.1|2021383_2021884_+|H-type-ferritin-FtnA MLSKNLLEALNDQMNHEYFAAHAYMAMAAYCDKESYEGFANFFIQQAKEERFHGQKIYNYINDRGAHAEFRAVSAPKIDFSSILETFKDSLSQEQEVTRRFYNLSEIARQDKDYATISFLNWFLDEQVEEESMFETHINYLTRIGDDSNALYLYEKELGARTFDEE >NC_017351.1|WP_001790679.1|2021965_2022058_-|hypothetical-protein MTKNTIISLENEKTQINDSENESSDLRKAK >NC_017351.1|WP_000613736.1|2022272_2022827_+|3'-5'-exonuclease MIQDAFVALDFETANGKRTSICSVGMVKVIDSQITETFHTLVNPQDYFSQQNIKVHGIQPEDVENAPTFDYVFPYMMQFIADLPVVAHNAAFDMNVLHQSIQNIGLPTPNLTYFCSYQLAKRTVDSYRYGLKHMMEFYQLDFHGHHDALNDAKACAMITFRLLKNYENITYVTNIYGKNLKDKG >NC_017351.1|WP_000140182.1|2022893_2023964_-|DNA-polymerase-IV MTERRIIHIDMDYFLAQVEMRDNPKLKGKPVIVGGKASSRGVVSTASYEARKYGVHSAMPMSQAHKLCPNGYFVTSNFGAYRETSAQIMSIFRSYTDKVEPMSLDEAYLDITELVRPDLPASKIAQYIRKDILEQTHLTASAGVSYNKFLAKLASGMNKPDGMTVIDYQNVHDILMTLDIGDFPGVGKASKKVMHDNGIFNGRDLYEKTEFELIRLFGKRGRGLYNKARGIDHSEVKSSRVRKSVGTERTFATDVNDDEEILRKVWELSGKTAERLNKLQKSAKTVTVKIKTYQFETLSKQMSLRDSVSSEEDIYNIAYLLYNDLKDPDVPIRLIGVTVGNLEQSTYKNMTIYDFI >NC_017351.1|WP_000548781.1|2024210_2024741_-|DUF3267-domain-containing-protein MHKIDLTTNNFQMRRFIILQLVIALFVILFTYKWALGVTAVVDQNIIINLVYGFAGFIILLILHELIHRALFLLFKKDSKPMFNIKKDRILFQTADACFNKWQFSIIMLSPLILLSTGLLILIKVFGYSSLIFMFSMHTAYCFIDILLVALTISSSFKYVQQDEDSIYLYHQKPTQ >NC_017351.1|WP_001147864.1|2024910_2026272_-|23S-rRNA-(uracil(1939)-C(5))-methyltransferase-RlmD MQAIAKNDIKTGTVVDLTHEGHGVVKIDRFPIFIPQALINEQIEYKIIKVKKNFAIGKLLNINTRSENRVAPPCIYYERCGGCQLQHLSYEAQLEMKKEQVINLFQRKAHFDNSKINDTVGMTDPWRYRNKSQIPVGKNEQNEVIMGFYRQRSHDIIDMESCLIQDSQHQEVMNEVKSILKDLNVSIYQEQLKKGLMRHLVVRTGYHTDEMMIIFVTNGKKWPQKNAVVEKILDAFPNVTSIKQNINDSHSNVIMGRQSITLYGKDTIIDQLTDSTFKISDQSFYQINSEQTEKLYNKAIEYAQLTGNEVVLDTYCGIGTIGLYMAPHAKHVYGVEVVPSAIEDAQQNATINQCNNTTFVCGKAEEVILQWKAQGIKPDVVMVDPPRKGCDETFIQTLLTLEPKRIVYISCNPATQQRDALLLAEKYQLEEVTPVDMFPQTTHVETVALFNLK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_017351_6 | 2262006-2262092 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_017351_6
|
1 spacers
spacers of NC_017351_6
>6.1|2262033|33|NC_017351|CRISPRCasFinder TTGCATATCTTTAGCTTTATTGTTTGCAACTGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017351_6
The CRISPR arrays of NC_017351_6 >merge|NC_017351|6|2262006-2262092|CRISPRCasFinder GCCAACTGATGTTTGCGTATCATTAGTTTGCATATCTTTAGCTTTATTGTTTGCAACTGAGCCAACTGATGTTTGCATATCATTAGT >NC_017351|6|5|2262006-2262092|CRISPRCasFinder GCCAACTGATGTTTGCGTATCATTAGT TTGCATATCTTTAGCTTTATTGTTTGCAACTGA GCCAACTGATGTTTGCATATCATTAGT
>NC_017351.1|WP_000648723.1|2260276_2261383_+|mannitol-1-phosphate-5-dehydrogenase MKAVHFGAGNIGRGFIGYILADNNVKVTFADVNEEIINALAHDHQYDVILADESKTTTRVNNVDAINSMQPSEALKQAILEADIITTAVGVNILPIIAKSFAPFLKEKTNHVNIVACENAIMATDTLKKAVLDITGPLGNNIHFANSAVDRIVPLQKNENILDVMVEPFYEWVVEKDAWYGPELNHIKYVDDLTPYIERKLLTVNTGHAYLAYAGKFAGKATVLDAVKDSSIEAGLRRVLAETSQYITNEFDFTEAEQAGYVEKIIDRFNNSYLSDEVTRVGRGTLRKIGPKDRIIKPLTYLYNKDLERTGLLNTAALLLKYDDTADQETVEKNNYIKEHGLKAFLSEYAKVDDGLADEIIEAYNSLS >NC_017351.1|WP_001292149.1|2259842_2260277_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA MSELFSNDNIFLNVNVNSQNEAIEKAGKALVDSGAVTDAYIQAMKDREQVVSTFMGNGLAIPHGTDEAKTNVIHSGLTLLQIPEGVDWDGEVVKVVVGIAGKDGEHLDLLSKIAITFSEEENVDRIVQAKSAEEIKQVFEEADA >NC_017351.1|WP_000927359.1|2257698_2259831_+|BglG-family-transcription-antiterminator MLLSTREKEMIALLIKYHGQYITIHDIAQQLAVSSRTIHRELKGVEAYLTSFSLTLERANKKGLRIAGTDSDLNDLKQSIAQHQTIDLSVEEQKVIIIYALIQAKEPVKQYSLAQEIGVSVQTLAKMLDDLELDLNKYQLSLSRKRGEGIYLVGTESKKREFLSQLMVNNLNSTSVYSVIENHFVFHSLNQIHKDFVDLERIFNVERLLMDYLSALPYQLTESSYLTLTVHIVLSISRIKNGEYVALNDDIYDSVQNTFEHKVASELADKLGQIYDVTFNQAEIAFITIHLRGAKRKNLNDTSLNNRCEENKIKAFVNKVEMISGMTFADLDTLVDGLTLHLNPAINRLQANIETYNPLTDMIKFKYPRLFENVRLALNDCWPDLIFPESEIAFIILHFGGSIKNQGNRFLNILVVCSSGMGTSRLLSTRLEQVFSEIERITQASVSDLKSLDLSQYDGIISTVNLDIDSSYLTVNPLLPDSDISYVAQFLNTKSTFQEMHDKSSNMIDKDDVHVETKDIDGNTSFENEQTSNLTSVFEKHLSDEKSEQLMHHMRSGLTLLDSVKIVSTEVKQWQTYIADYLYQCDVINDPTSFAELLEQRLIDNPGWILSPYPVAIPHLRDNMIKHPMVLITVLEEPLILPSIQNDNQTIKYMISMFIPDNDFMASLVSDLSEFLSLKLESIDTFMENPQELETLLRNKFLERIKKQFI >NC_017351.1|WP_000083807.1|2256125_2257664_+|PTS-mannitol-transporter-subunit-IICB MSQTEEKKGIGRRVQAFGSFLSSMIMPNIGAFIAWGFIAAIFIDNGWLPNKDLATLAGPMITYLIPLLIAFSGGRLIYDLRGGIIAATATMGVIVALPDTPMLLGAMIMGPLVGWLMKKTDQLIQPRTPQGFEMLFNNFSAGILGFIMTIAGFKILAPLMKFIMHILSVAVEALVHAHLLPLVSILVEPAKIVFLNNAINHGVFTPLGADQAAKAGQSILYTIESNPGPGLGILLAYMIFGKGTAKATSYGAGIIHFLGGIHEIYFPYVLMRPLLFIAVILGGMTGVATYQATGFGFKSPASPGSFIVYCLNAPRGEFLHMLLGVFLAALVSFVVAALIMKFTREPKQDLEAATAQMENTKGKKSSVASKLVSSDKNVNTEENASGNVSETSSSDDDPEALLDNYNTEDVDAHNYNNINHVIFACDAGMGSSAMGASMLRNKFKKAGINDITVTNTAINQLPKDAQLVITQKKLTDRAIKQTPNAIHISVDNFLNSPRYEELLNNLKKDDQA >NC_017351.1|WP_000334465.1|2253639_2255445_-|glutamine--fructose-6-phosphate-transaminase-(isomerizing) 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>NC_017351.1|WP_000370929.1|2251700_2252558_-|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MDNVKAIFLDMDGTILHENNQASTYTKDVINQLREKGYKVFLATGRSHSEIHQLVPQDFAVNGIISSNGTIGEVDGEIIFKHGLSLAQVQQITNLAKRQQIYYEVFPFEGNRVSLKEDETWMRDMIRSQDPINGVSHSEWSSRQDALAGKIDWVTKFPEGEYSKIYLFSSNLEKITTFRDELKQNHVQLQISVSNSSRFNAETMAYQTDKGTGIKEMIAHFGIHQEETLVIGDSDNDRAMFEFGHYTVAMKNARPEIQALTSDVTAYTNEEDGAAKYLAKHFLAD >NC_017351.1|WP_001792784.1|2250884_2251043_+|hypothetical-protein MSKSSDALFNSLTQSFELIEGVYNELVTDNLKIVMYKPRKESTSGRINRRFK >NC_017351.1|WP_001802298.1|2250100_2250205_-|hypothetical-protein MLLLERTSMSDFEMLMVVLTIIGLVLISTQDHKK >NC_017351.1|WP_000495670.1|2248509_2249601_+|lytic-regulatory-protein 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MLESKWGLRFIAFLLALFFFLSVNNVFGNIFNTGNLGQKSSKTIQDVPVEILYNTKDLHLTKAPETVNVTISGPQSKIIKIENPEDLRVVIDLSNAKAGKYQEKYQVKGLADDIHYSVKPKLANITLENKVTKKMTVQPDVSQSDIDPLYKITKQEVSPQTVKVTGGEEQLNDIAYLKATFKTNKKINGDTKDVAEVTAFDKKLNKLNVSIQPNEVNLQVKVEPFSKKVKVNVKQKGSLADDKELSSIDLEDKEIEIFGSRDDLQNISEVDAEVDLDGISESTEKTVKINLPEHVTKAQPSETKAYINVK >NC_017351.1|WP_000347896.1|2271804_2272614_-|TIGR00159-family-protein MDFSNFFQNLSTLKIVTSILDLLIVWYVLYLLITVFKGTKAIQLLKGILVIVIGQQISMILNLTATSKLFDIVIQWGVLALIVIFQPEIRRALEQLGRGSFLKRYTSNTYSKDEEKLIQSVSKAVQYMAKRRIGALIVFEKETGLQDYIETGIAMDSNISQELLINVFIPNTPLHDGAMIIQGTKIAAAASYLPLSDSPKISKSLGTRHRAAVGISEVSDAFTVIVSEETGDISVTFDGKLRRDISNEIFEELLAEHWFGTRFQKKGVK >NC_017351.1|WP_000167873.1|2272802_2273711_-|arginase 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MRLKSIITVIALILIMFMSAIESSIISLALPTIKQDLNAGNLISLIFTAYFIALVIANPIVGELLSRFKIIYVAIAGLLLFSIGSFMCGLSTNFTMLIISRVIQGFGSGVLMSLSQIVPKLAFEIPLRYKIMGIVGSVWGISSIIGPLLGGGILEFATWHWLFYINIPIAIIAIILVIWTFHFPEEETVAKSKFDTKGLTLFYVFIGLIMFALLNQQLLLLNFLSFILAIVVAMCLFKVEKHVSSPFLPVVEFNRSITLVFITDLLTAICLMGFNLYIPVYLQEQLGLSPLQSGLVIFPLSLAWITLNFNLHRIEAKLSRKVIYLLSFTLLLVSSIIISFGIKLPVLIAFVLILAGLSFGYIYTKDSVIVQEETSPLQMKKMMSFYGLTKNLGASIGSTIMGYLYAIQSGIFGPNLHNVLSAVAVISIGLIVLWVVFFKEQSSQSKE >NC_017351.1|WP_000047255.1|2284974_2285658_-|hemolysin-III-family-protein MSKSTKKSNDTIVETFKDIIPLSFGEEIGNAASHGVAALLTLLVLPYAAVHSYIAHGTLASVSMSIYVISIFMMFISSTIYHSMQNETPHKYILRIIDHSMIYVAISGTYTPILLTVVGGWIGWTVFILLWGTTLWGILYKSIAVKVNQKLSLIVYLVMGWVGIILLPIIFIRTSWIFILFIFLGGVSYTIGAWFYAQKNRPYFHMIWHIFIVIASLLHLIAILYFM >NC_017351.1|WP_000884737.1|2285676_2286864_-|UDPGP-type-1-family-protein MLDKNQLAKYKQDHLCEYEKIMSNNEKEALEEKVASLDLDFIAKLYNDLYINKKTIDDVSAVSEVKYDIKSQMSDDEIKRLEEQGLQAIKEGQFAVLLMAGGQGTRLGYKGPKGSFEIEGVSLFELQANQLKTLNHQSGHTIQWYIMTSDINHEETLAYFEAHSYFGYDQEAIHFFKQDNIVALSEEGKLILNQQGRIMETPNGNGGVFKSLDKAGYLEEMSNNGVKYIFLNNIDNVLVKVLDPLFAGFTVEHDYDITSKTIQPKPVESVGRLVNVDCKDTVLEYSELDPEVANQFNNANIGIHAFKLGFILNAVNRELPYHLAIKNLKQLDENFGVIEQPTLKFELFYFDIFTYGTSFVTLQVPREEEFSPLKNKEGKDSVATATEDLRRMGLI |
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>7.1|2485948|28|NC_017351|CRISPRCasFinder CACTTCGCTTCGGTTCGCCTGCGCTTTT |
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The CRISPR arrays of NC_017351_7 >merge|NC_017351|7|2485915-2486008|CRISPRCasFinder GCGCATGCATAAAAGCCCCTAACAACCAGAGGTCACTTCGCTTCGGTTCGCCTGCGCTTTTGCGCATGCATAAAAGCCCCTAACAACCAAAGGT >NC_017351|7|6|2485915-2486008|CRISPRCasFinder GCGCATGCATAAAAGCCCCTAACAACCAGAGGT CACTTCGCTTCGGTTCGCCTGCGCTTTT GCGCATGCATAAAAGCCCCTAACAACCAAAGGT
>NC_017351.1|WP_000727323.1|2485401_2485758_+|DUF4889-domain-containing-protein MKKKKGFGLGISLIAIMLIVCIVLVIMMMTGGKKDTYYGIMKDNATIEKMISEKDESIEKNVKLPSDADVKVKKGDFVIVYKLADSDKIVKVKKVDHDDVPHGLMMKIHDMGKMHMKH >NC_017351.1|WP_000071906.1|2484714_2485137_+|pyridoxamine-5'-phosphate-oxidase-family-protein MSNSQAIQAIENVLATSKVGVLSTAYNNKPNSRYMVFYNDGLTLYTKTNIHSAKVKEIKDNPAAYVLLGYNDTTTRSFVEMEATIEVVTDQKVIDWLWETQDKSFFSSKEDPELCVLKVTPQSVKLMNDKSLDTPIKIDL >NC_017351.1|WP_000128366.1|2482538_2484644_+|AraC-family-transcriptional-regulator-Rsp MTCQLKIHHTLSTIPSRNINNIMVLFSLTSKLNITINGETKDVSNYIILINHGDIYNINHGENIIELMIPVFYFYQQDDDFFNGYLDRHLLQSSNYIKSLIADLISTPTSSSLMGKNIGQSIIDTLLKEAFIRIDHEYLPNIALSNPVFIDCVNYIHDNIDAHLSLKDIAMHCNISESYCSNLFVRYLSMNFKDYFTSIKLVNAINLLLSTKHSITTVSELAGFNSHTNFANQFKNYLHFSPKQFRSLVSKITEPPQIHFQQDNVSQFTELISTIDLTAQLATNTTDIHIDDFNPKDRSQRAKVFVRFSNFNELFQFIFNEYYDINFEHLPKPVVFIDDIHDIEISQTNYNLLNRCFEKLFEKNIGLAIAIKSTQQFETMKQLILTFLQGNQDYKTSKKLVKFMLVFCSNSMTAEEIHLCHLKIKNKNKEIKYSVTVDGFLETYSTVEQVYDVMQRLKFHYYFIDIENSKTATHLITKNQHYHQTDTHFEQYKKFILDSGISSTQFVYNNLSVSGFKYTNDGKNPIQLSDIVYHLIALLRYGGGISYQLLDDHSNYISLYNKYGSPLPLMHLYKMFRPFVNEDIEITNNYVLSRKDNNYHFLLFNKINDRYMSDVKQDFIFHNELPQDSLMIIKTLNHEHGSIQHLLPISDQLVYIEKEILDELDKTNYPKTELAVQEETGRTFELKLNHDEVKYICFKPS >NC_017351.1|WP_000664361.1|2480667_2481051_+|YbgA-family-protein MKERGHIEQLWREEKYHVLLHSQQSYQMIRNALKTDLSLHQVQQMIDDALLIEPSIGSVCNAFDHMWGYFKKCANEEERKQSKLLKADFINSKIDTQTLLDFLAELANKYDVQYLLQSRVLNTKRKR >NC_017351.1|WP_001108129.1|2479042_2480485_-|PTS-sucrose-transporter-subunit-IIBC MNYKQSAEEILNAIGGEENLDAMAHCATRLRLVLNDESLVNEEALNNMDVVKGTFSTGGQYQIIIGSGTVNKVFSELEKLTGKEASTTSEVKAQSAKNMNPLQRFVKMLSDIFVPIIPAIVAGGLLMGLNNILTAKDLFFSGKSLIDVYSQFAGLAEMINVFANAPFTLLPILIGFSAAKRFGGNPFLGAALGMILVHPSLMSAYDFPKAVEAGKAISYWDVFGLHINQVGYQGQVLPMLVAAYILASIEKGLRKVIPTVLDNLLTPLLSIFITAFLTFSFVGPITRQLGYWLSDGLTWLYEFGGAIGGLIFGLLYAPIVITGMHHSFIAVETTLIADATKTGGSFIFPIATMSNVAQGGAAIAAFFIIKQNKKLKGVASAAGISALLGITEPAMFGVNLKLRYPFIGAIVGSGIGSAYIAFFKVKAIALGTAGLPGFISINPVHAGWLHYFVGMTISFIVAITVTLILSKRKANKEVVE >NC_017351.1|WP_000633068.1|2478012_2478957_+|magnesium-transporter-CorA-family-protein MITSFRHSEDIDKHIIKTPLDHTASWINVVEPDREEIENLMEQYNIPEDFIRDPLDSEESSRIEYDEDTGYSLIIIDLPIVNSTNRSVLSFVTIPLGIIIGNGIIVTVCDAENEFLENLPKRDINLKFHSRFALEILTTIADHYNRNLRLLNKSRIRIEKELKNNITNKQLFKLMEVEKSLVYFLAALKGNDTIIKKLFRLPAIKRFEEDEELLEDLIIENNQAIETTELHQRILESITTSYASLLSNDMNTIMKTLTLFTVLLTLPTLVFSFFGMNVPLPIDDHSYISWIIVVGISLILVVIVSIFLWRKQKL >NC_017351.1|WP_000656766.1|2477343_2477967_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MKEDRRIRKTKSSIKQAFTKLLQEKDLEKITIRDITTRADINRGTFYLHYEDKYMLLADMEDEYISELTTYTQFDLLRGSSIEDIANTFVNNILKNIFQHIHDNLEFYHTILQLERTSQLELKINEHIKNNMQRYISINHSIGGIPEMYFYSYVSGATISIIKYWVMDKQPISVDELAKHVHNIIFNGPLRIMAENRLHKSNLDSLT >NC_017351.1|WP_001020030.1|2475905_2477183_-|YhgE/Pip-domain-containing-protein MNIFKNKLLWIAPIATMIILVIFSLAFYPAYNPKPKDLPIGILNEDKGTTIQDKNVNIGKKLEDKLLDSDSNKIKWVKVDSEKDLEKDLKDQKIFGVAIIDKDFSKDAMSKTQKVVMDSKKEEMQQKVASGEIPPQVVQQMKQKMGNQQVEVKQAKFKTIVSEGSSLQGSQIASSVLTGMGDNINAQITKQSLETLTSQNVKVNAADINGLTNPVKVDNEKLNKVKDHQAGGNAPFLMFMPIWIGSIVTSILLFFAFRTSNNIVVQHRIIASIGQMIFAVVAAFAGSFVYIYFMQGVQGFDFDHPNRIAIFVAFAILGFVGLILGVMVWLGMKSVPIFFILMFFSMQLVTLPKQMLPESYQKYVYDWNPFTHYATSVRELLYLNHHIELNSTMWMFIGFMIFGAVSSLVSAIVRKHSTKRTEVPS >NC_017351.1|WP_001253464.1|2475267_2475699_-|DUF2871-domain-containing-protein MRRLLYSFLFYMIIGLFSGFFYRELTKAYDFTGTTQLSLVHTHTLILGMFMFLILLPLEKLFKLSSYYLFNWFFYVYNIGVIVTIGMMVTKGFFQVTGKSYSPEAFAGFAGIGHTGMLAGLLLLFFLLRQAILKEPRDESFKK >NC_017351.1|WP_001806771.1|2475046_2475163_-|hypothetical-protein MANYAIYFNNININSIMALNDNNYQFERVNERNEYRES >NC_017351.1|WP_001173165.1|2486040_2487318_-|cation:dicarboxylase-symporter-family-transporter MALFKRKISLPMQVVIALVLGVVVGLLLYGQENVANYIKPFGDVFLNLIKMIVIPVVFCSLALSISNVGESKTVGRYGWKTILYFEIITTIAIGLGIIFGNLFKPGAGLDPTKLPKGDISKYQSTAHAAEQSTYGNHFIDTIVHIIPTNFFEALNKGELLPIIFFAVFFGLGLAAVGKKAEPVKEFLSGSLEAVFWMINKILKLAPLGVFAFICTTIITFGASALLPLLKLVLVVVFAMVFFVFAILGLVAWMCGINIMNIIRILKSELLLAFSTSSSEAVLPVMMKKMENFGSPKEITSFVIPIGYTFNLDGSALYQSIAALFVAQMYGMHLTLSEQIVLMLTLMITSKGMAAVPGTSIVVLLTTLGAMGLPAQGLALIIGVDRILDMVRTCVNVIGNALSTIVIAKWENVYDKAKGQEYLKSI >NC_017351.1|WP_000727537.1|2487499_2487865_-|DUF3139-domain-containing-protein MKKKKNAIKVIIILFISLIVAVAFFFGLKTYQGHKNIQLIDSYLEEKNLKDKIKSEKTEYSAKKGLFYKEVTFKDEPGVTYVVQPISTNKGLFVEGFDTETKKSLKTAKHKYFNQNYKPSK >NC_017351.1|WP_000289213.1|2488262_2488709_+|MarR-family-transcriptional-regulator MYVENSYLSKQLCFLFYVSSKEIIKKYTNYLKEYDLTYTGYIVLMAIENDEKLNIKKLGERVFLDSGTLTPLLKKLEKKDYVVRTREEKDERNLQISLTEQGKAIKSPLAEISVKVFNEFNISEREASDIINNLRNFVSKNFDYSDKK >NC_017351.1|WP_077477314.1|2488924_2489353_+|Hsp20-family-protein MILNFNQFENQNFFNGNPSDTFKDLGKQVFNYFSTPSFVTNIYETDELYYLEAELAGVNKEDISIDFNNNTLTIQATRSAKHKSEQLILDERNFESLMRQFDFEAVDKQHITASFENGLLTITLPKIKPSNESTSSTSIPIS >NC_017351.1|WP_000278558.1|2489459_2490629_-|NarK/NasA-family-nitrate-transporter MYKTKGGFQLTLQTLSLVVGFMAWSIIAPLMPFIKQDVNVTEGQISIILAIPVILGSVLRVPFGYLTNIVGAKWVFFTSFIVLLFPIFFLSQAQTPGMLMASGFFLGVGGAIFSVGVTSVPKYFPKEKVGLANGIYGMGNIGTAVSSFLAPPIAGIIGWQTTVRSYLIIIALFALIMFIFGDTQERKIKVPLMAQMKTLSKNYKLYYLSYWYFITFGAFVAFGIFLPNYLVNHFGIDKVDAGIRSGVFIALATFLRPIGGILGDKFNAVKVLMIDFVVMIIGAIILGISDHIALFTVGCLTISICAGIGNGLIFKLVPSYFLNEAGSANGIVSMMGGLGGFFPPLVITYVANLTGSSHLAFIFLAVFGCIALFTMRHLYQKEYGSLKNG >NC_017351.1|WP_000706315.1|2491056_2491710_-|response-regulator-transcription-factor MKIVIADDHAVVRTGFSMILNYQNDMEVVATAADGVEAYQKVMEYKPDVLLMDLSMPPGESGLIATSKIADSFPETKILILTMFDDEEYLFHVLRNGAKGYILKNAPDEQLLLAIRTVYKGETYVDMKLTTSLVNEFVSNSNQDTANTTDPFKILSKRELEILPLIAKGYGNKEIAEKLFVSVKTVEAHKTHIMTKLGLKSKPELVEYALKKKLLEF >NC_017351.1|WP_000606546.1|2491732_2492767_-|sensor-histidine-kinase MINEDSIQLDTLLKKYYEHSIEKIVFADDNGKIIAMNDAAKDILSEEDNYSAVANAICHRCEGYTNAYDVQSCKDCFLESMQVQATNFQVFMKTKDQKVMPFTATYQLIDQDRGIHAFTLQNVSSQIEQQEKLHQQRMMRKTISAQENERKRISRELHDSVIQEMLNVDVQLRLLKYQEDTTKLLEDAENIEYIVAKLIDDIRNMSVELRPASLDDLGLEAAFKSYFKQFEENYGIKIIYTSNIKNTRFDSDIETVVYRVVQEAILNALKYADVNEINVGIRQTGRHLVAEVIDAGNGFDPSSKPKGSGLGLYGMNERAELVSGSVNIETKIGEGTNVTLNIPI >NC_017351.1|WP_000186933.1|2492790_2493243_-|GAF-domain-containing-protein MTPEAIIEDRRFQETLDKIRKEEGYDFAAIAFYESNKPSSPIKWHYVSGNKNNRFKLIILRKGRGLAGTVMKTGKRMVIANVGLALGPEEKIDYPILLSESLTAVLAVPLWYKNQVYGVLLFGQRDGRPLPKIFDNDDIQRKFGIFNDDK >NC_017351.1|WP_000934153.1|2493262_2493940_-|respiratory-nitrate-reductase-subunit-gamma MLNQFLWVIFPYLCLVVFVAGHIARYRYDKFSWTAKSSELIERKRLMWGSLLFHLGIIPVFFGHVVGLLIPKSWMDAAGVSEHLYHIGAVYIGSIFGIITLVGMFLLTARRVTTKSIRRLSSASDIFVNFLLLLIVFMGCYATLVTNVQHPDFNYRTSLSIWFRQLFMLKPDASLMSGVPIAFKIHILLGFTIMACWPFTRLVHVWSVPLTYINRRYIIYRKNKV >NC_017351.1|WP_000606772.1|2493932_2494508_-|nitrate-reductase-molybdenum-cofactor-assembly-chaperone MINFDNFKKYQESFGYMAQQLCFPEKLTFHPKTFEETISTDHPAYEDLVAFRNVMMTFSLSEIKAIYTDTFDFTKKAPLYMTYNKFDTQKERGQMLAKLKVLYEMFGLEMVDNELSDYLPLMLQFLQVAEWRNDPRAEENIQLIIMIIEDGTYVMANVLGEDNNPYAYVIQALRKTLKLCLTSPKGVKHHA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_017351_8 | 2518928-2519025 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_017351_8
|
1 spacers
spacers of NC_017351_8
>8.1|2518957|40|NC_017351|CRISPRCasFinder TTATGCATTAGTAGCGAAGCTAACTAATGCGTTCCTTTAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017351_8
The CRISPR arrays of NC_017351_8 >merge|NC_017351|8|2518928-2519025|CRISPRCasFinder TTTCTGCGAATTTTATGAGCTAGAAAGGCTTATGCATTAGTAGCGAAGCTAACTAATGCGTTCCTTTATTTTCTGCGAATTTTATGAGCTAGAAAGGC >NC_017351|8|7|2518928-2519025|CRISPRCasFinder TTTCTGCGAATTTTATGAGCTAGAAAGGC TTATGCATTAGTAGCGAAGCTAACTAATGCGTTCCTTTAT TTTCTGCGAATTTTATGAGCTAGAAAGGC
>NC_017351.1|WP_000019127.1|2517921_2518788_-|cation-transporter MSHNENLKLAQRGAYLSLIVYIILSIVKYVTGFVFNSAAVRADALNNMTDIIVSLAVIIGLKISIKPADRNHPYGHLKSENISSLLVSFVIMFVGIQVVIQNAPRLFKEDDVVPNAITIIVSLISGLVMLIVFAVNQRLAKRTKSSSLNSAAKDNLSDSLVSIGTAIGLIFTQIGFPIVDIILATLLGLLIVYTGFGIFKEAIFMLSDGFNETELEAYRNDILEVDEVQEVKSIKGRYHGSSVFIDVTIVVDANLSLVEAHQICDNVEHHLHKKGISSVYVHPEPDHL >NC_017351.1|WP_001125208.1|2516908_2517595_-|2,3-diphosphoglycerate-dependent-phosphoglycerate-mutase MPKLILCRHGQSEWNAKNLFTGWEDVNLSEQGINEATRAGEKVRENNIAIDVAFTSLLTRALDTTHYILTESKQQWIPVYKSWRLNERHYGGLQGLNKDDARKEFGEEQVHIWRRSYDVKPPAETEEQREAYLADRRYNHLDKRMMPYSESLKDTLVRVIPFWTDHISQYLLDGQTVLVSAHGNSIRALIKYLEDVSDEDIINYEIKTGAPLVYELTDDLEVIDKYYL >NC_017351.1|WP_000762708.1|2516650_2516755_+|putative-metal-homeostasis-protein MKLDLQTARRNLNSPNIKTRKRALKIIKQHKRAK >NC_017351.1|WP_000038960.1|2515036_2516476_-|multidrug-efflux-MFS-transporter-MdeA MSKKQKLTMIITMLMGGFFGLLNETLLVTALPSIMKDFEISYTQVQWLTTAFLLTNGIVIPLSALVIQRYTTRQVFLVGISIFFLGTLLGGLSPHFATLLVARIIQALGAGIMMPLMMTTILDVFQPHERGKYMGIFGLVIGLAPAIGPTLSGYLVEYFNWRSLFHVVAPIAAVTFLIGFKTIKNVGTTIKVPIDFISVIFSVLGFGGLLYGTSSISEKGFDNPIVLVSMIGGVVLVALFVLRQYRLSTPLLNFAVFKNKQFTVGIIIMGVTMVSMIGSETILPIFVQNLLHRSALDSGLTLLPGAIVMAFMSMTSGALYEKFGPRKLALVGMAIVVITTAYFVVMDEQTSTIMLATVYAIRMVGIALGLIPVMTHTMNQLKPEMNAHGSSMTNTVQQIAGSIGTAALITILSHASKNFSPTMSDYNGMNKIDMMNQIKVDTMLHGYHAGFLFALLITVVSFFCSFMLQGKKKEVDSRQ >NC_017351.1|WP_000825921.1|2514136_2514916_-|transporter-substrate-binding-domain-containing-protein MKRLLFVMIAFVFILAACGNNSSKDKEANKDSKTINVGTEGTYAPFSFHDKDGKLTGYDIDVIKAVAKEEGLKLKFNETSWDSMFAGLDAGRFDVIANQVGINPDREKKYKFSKPYTFSSAVLVIRENEKDIKDFDDVKGKKLAQTFTSNYGKLAKDKGADITKVDGFNQSMDLLLSKRVDGTFNDSLSYLDYKKQKPNAKIKAIKGNAEQSRSAFAFSKKADDETVQKFNDGLKKIEENGELAKIGKKWFGQDVSKSK >NC_017351.1|WP_000479576.1|2513436_2514156_-|amino-acid-ABC-transporter-permease MFLNLNSEQQHALDAAKQAFGPMLEGLVKYSIPITLVTFVLGLIIALFTALMRISTSKILRSISRVYVSIIRGTPMIVQLFIIFYGIPELGRLLTNDADNQWTLAPVVAAIIGLSLNVGAYASEIIRGGIISIPKGQTEAAYSIGMTYGQTIQRIILPQAIRVSIPALGNTFLSLIKDTSLLGFILVAEMFRKAQEVASTTYEYLTIYVLVALMYWVVCFIISIIQGIYESYIERGYRS >NC_017351.1|WP_000615461.1|2512708_2513440_-|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein MIQLNNIHKSFNDVEVIKGIDLSVEQGEVVTLIGRSGSGKTTLLRMINALEIPTEGTVYVNGKTYTSKDKKSQIEVRKQSGMVFQSYNLFPHKTALENVMEGLITVKKLKKDEARGKSLELLEKVGLTHVKDQRPHALSGGQQQRVAIARALAMNPKVMLFDEPTSALDPELVNDVLKVIKDLANEGMTMVIVTHEMRFAKEVSNNIVFIHEGMIGEQGAPEEMFNRPKTEELRRFLNVINEE >NC_017351.1|WP_001012218.1|2511361_2512612_+|FemA/FemB-family-glycyltransferase-FmhA MNFVTLTSDEFNAFTTKHFSHYTQSAIHYNHRVDLKGDVHLVGVKDDNGQVIAGCLLIEARTLKFFKYFYTHRGPVMDYTNQSLVAFFFKALTSYLKKHNCLYVLVDPYLIENLRNADGEIVKSYDNRAFVRTMDKLGYKHQGFPVGYDSMSQIRWLSVLDLKDKTEDQLLKEMDYQTRRNIKKTYDIGVKTKTLTIDETQTFFDLFHMAEEKHGFKFRELPYFEEMQKLYDDHAMLKLAYIDLNEYLKTLQLKQQQLTAELSGVEEALEESPNSKKNKTKRTQLEQQLNSNKRKIDNTIEQIEQDGAVLNLASALFIYNEHEVYYLSSGSNPKYNAYMGAYHLQWEMIKFAKAHHIDRYNFYGITGDFSESSEDYGVQQFKKGFNAHVEEYIGDFIKPIKPMFYKIQQYLNHKRR >NC_017351.1|WP_000819843.1|2510744_2511107_-|DUF4467-domain-containing-protein MKRFVATVLLLLVFISGCGNDKYVKEIDEAVKIQNQKQEQLAKKGNGDRVDHFERKDANIYVYDKDKIIILAYKPLSNDDEVHYYAYDFSDKRVSYKQDFDSRRYYQQHDADYHEENMTN >NC_017351.1|WP_000162810.1|2510126_2510726_-|DsbA-family-protein MTKKLLTLFIVSMLILTACGKKESATTSSKNGKPLVVIYGDYKCPYCKELDEKVMPKLRKNYIDNHKVEYQFVNLAFLGKDSIVGSRASHAVLMYAPKSFLDFQKQLFAAQQDENKEWLTKELLDKHIKQLHLDKETENKIIKDYKTKDSKSWKAAEKDKKIAKDNHIKTTPTAFINGEKVEDPYDYESYEKLLKDKIK >NC_017351.1|WP_001789935.1|2519218_2519323_-|hypothetical-protein MLTNRLTSVNYVKKRLIQNIQRILSKEVLYGEMQ >NC_017351.1|WP_000792572.1|2519417_2520728_+|immunoglobulin-binding-protein-Sbi MKNKYISKLLVGAATITLATMISNGEAKASENTQQTSTKHQTTQNNYVTDQQKAFYQVLHLKGITEEQRNQYIKTLREHPERAQEVFSESLKDSKNPDRRVAQQNAFYNVLKNDNLTEQEKNNYIAQIKENPDRSQQVWVESVQSSKAKERQNIENADKAIKDFQDNKAPHDKSAAYEANSKLPKDLRDKNNRFVEKVSIEKAIVRHDERVKSANDAISKLNVKDSIENRRLAQREVNKAPMDVKEHLQKQLDALVAQKDAEKKVAPKVEAPQIQSPQIEKPKAESPKVEVPQIQSPKVEVPQSKLLGYYQSLKDSFNYGYKYLTDTYKSYKEKYDTAKYYYNTYYKYKGAIDQTVLTVLGSGSKSYIQPLKVDDKNGYLAKSYAQVRNYVTESINTGKVLYTFYQNPTLVKTAIKAQETASSIKNTLSNLFSFWK >NC_017351.1|WP_000594514.1|2521262_2522192_+|bi-component-gamma-hemolysin-HlgAB-subunit-A MIKNKILTATLAVGLIAPLANPFIEISKAENKIEDIGQGAEIIKRTQDITSKRLAITQNIQFDFVKDKKYNKDALVVKMQGFISSRTTYSDLKKYPYIKRMIWPFQYNISLKTKDSNVDLINYLPKNKIDSADVSQKLGYNIGENFQSAPSIGGSGSFNYSKTISYNQKNYVTEVESQNSKGVKWGVKANSFVTPNGQVSAYDQYLFAQDPTGPAARDYFVPDNQLPPLIQSGFNPSFITTLSHERGKGDKSEFEITYGRNMDATYAYVTRHRLAVDRKHDAFKNRNVTVKYEVNWKTHEVKIKSITPK >NC_017351.1|WP_000916704.1|2522759_2523707_+|bi-component-gamma-hemolysin-HlgCB-subunit-C MLKNKILATTLSVSLLAPLANPLLENAKAANDTEDIGKGSDIEIIKRTEDKTSNKWGVTQNIQFDFVKDKKYNKDALILKMQGFISSRTTYYNYKKTNHVKAMRWPFQYNIGLKTNDKYVSLINYLPKNKIESTNVSQTLGYNIGGNFQSAPSLGGNGSFNYSKSISYTQQNYVSEVEQQNSKSVLWGVKANSFATESGQKSAFDSDLFVGYKPHSKDPRDYFVPDSELPPLVQSGFNPSFIATVSHEKGSSDTSEFEITYGRNMDVTHAIKRSTHYGNSYLDGHRVHNAFVNRNYTVKYEVNWKTHEIKVKGQN >NC_017351.1|WP_000783428.1|2523708_2524686_+|bi-component-gamma-hemolysin-HlgAB/HlgCB-subunit-B MKMNKLVKSSVATSMALLLLSGTANAEGKITPVSVKKVDDKVTLYKTTATADSDKFKISQILTFNFIKDKSYDKDTLVLKATGNINSGFVKPNPNDYDFSKLYWGAKYNVSISSQSNDSVNVVDYAPKNQNEEFQVQNTLGYTFGGDISISNGLSGGLNGNTAFSETINYKQESYRTTLSRNTNYKNVGWGVEAHKIMNNGWGPYGRDSFHPTYGNELFLAGRQSSAYAGQNFIAQHQMPLLSRSNFNPEFLSVLSHRQDGAKKSKITVTYQREMDLYQIRWNGFYWAGANYKNFKTRTFKSTYEIDWENHKVKLLDTKETENNK >NC_017351.1|WP_000200945.1|2524737_2525205_-|QueT-transporter-family-protein MTSKDITQISVIAAILTILAVLKIPSIIPGLDFQLSAPAALLILAFFGIKKYFLGGLLSSLLLLIFGVFNPINVIISIIFRVIAIAVVYLLKINVLSLVLASVLGSLVSRLLLSIILNLPVWVVLLNAIPGVIFTLIVAIPLYLTLRKRMAVLLR >NC_017351.1|WP_000286875.1|2525215_2525908_-|6-carboxyhexanoate--CoA-ligase MYSIKMRSSNQDVHISGAETICEFDKIEQTVQRFYNKGFFHENGQPDFLNIKIQKIMEPIQQIKALQIIEDDKANLQHLTQECGVTEQALNQGMTYIKNETVYTGAIILSAISGKRLDSFGQRGIRATHFSFEDINNKGDLNERVTDALAIASCINAHPYVKGELCVSDDLTYTTGYFAAAKIGYHRLFDIKPVNTRYGGRIIFVDDCIDLNHYISFLESTPKQVVYETV >NC_017351.1|WP_000671751.1|2525918_2527034_-|pyridoxal-phosphate-dependent-aminotransferase-family-protein MKFQEQIDLLQQKGLYRSLKSVGYIDRQYIEVENKRCTNYTSNDYLGLGQIAFDKDDFERFMRKYSYHLSSSRLISGSSTAYEEIETMLAGWLGYSACTILNSGYDANLALFNIFKNTNCVVFSDQENHASIIDGIKLSGLEKVIYKHLDIADLEKRLEKYPNQNIPKIIISDSVFSTNGDVVDIGQLVSLKHKYNATLILDVSHSFGIENYSNYQGVDILTSSLSKACGAYGGVILSSNDVKDMLINHGRPLIYSSSLPIYNLYFIKRNIEKLINADDRRTKLNSLSKYFNQKLKALNVNYNSSNSPIKFIEFDDIEAAENIHQTLLKHHVFTSYLRYPTVTKPMLRISLSYFHTEQDIDRLFEILHQED >NC_017351.1|WP_001046646.1|2527011_2528019_-|biotin-synthase-BioB MNLAKRILQGEQLTKETVLKIYEDTNIDTLDLLNEAYILRKHYFGKKVKLNMILNAKSGICPENCGYCGQSRDIKQKQRYALIPEEQIIDGAKVAHDNHIGTYCIVMSGRGPSDKEVDHISNTVRTIKSQHPQLKICACLGLTNDEQAKKLKSAGVDRYNHNINTSENYHDNVVTTHSYKDRTDTIELMKANNISPCSGVICGMGESNQDIVDMAFALKEMDADSIPINFLHPIKGTKFGSMDDLTPMKCLRIVALFRLINPTKEIRIAGGREVNLRSLQPLALKAANSIFVGDYLITGGQPNQLDYDMINDLGFEIDYDTCENKENKNEVSRAN >NC_017351.1|WP_001110064.1|2528020_2529379_-|adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate-transaminase MNYTQQLKQKDSEYVWHPFTQMGVYSKEEAIIIEKGKGSYLYDTNGNKYLDGYASLWVNVHGHNNKYLNKVIKKQLNKIAHSTLLGSSNIPSIELAEKLIEITPSNLRKVFYSDTGSASVEIAIKMAYQYWKNIDREKYAKKNKFITLNHGYHGDTIGAVSVGGIKTFHKIFKDLIFENIQVESPSFYRSNYDTENEMMTAILTNIEQILIERNDEIAGFILEPLIQGATGLFVHPKGFLKEVEKLCKKYDVLLICDEVAVGFGRTGKMFACNHEDVQPDIMCLGKAITGGYLPLAATLTSKKIYNAFLSDSHGVNTFFHGHTYTGNQIVCTVALENIRLYEKRKLLSHIETTSSTLEKQLHALKRHRNVGDVRGRGLMFGVELVTDKDSKTPLEIEKVERIVRNCKENGLMIRNLENVITFVPVLSMSNKEVKTMVRIFKKAVHNILDRKC |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_017351_1 | 1.1|871234|32|NC_017351|CRISPRCasFinder | 871234-871265 | 32 | NC_017351.1 | 379384-379415 | 1 | 0.969 |
NC_017351_1 | 1.1|871234|32|NC_017351|CRISPRCasFinder | 871234-871265 | 32 | NC_017351.1 | 1100266-1100297 | 1 | 0.969 |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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NC_017351_2 | 2.11|891130|22|NC_017351|CRT | 891130-891151 | 22 | NZ_CP047808 | Staphylococcus aureus strain UP_1612 plasmid unnamed, complete sequence | 15760-15781 | 2 | 0.909 |
NC_017351_2 | 2.11|891130|22|NC_017351|CRT | 891130-891151 | 22 | NZ_CP047808 | Staphylococcus aureus strain UP_1612 plasmid unnamed, complete sequence | 15868-15889 | 2 | 0.909 |
NC_017351_2 | 2.11|891130|22|NC_017351|CRT | 891130-891151 | 22 | NZ_CP047808 | Staphylococcus aureus strain UP_1612 plasmid unnamed, complete sequence | 15904-15925 | 2 | 0.909 |
NC_017351_2 | 2.11|891130|22|NC_017351|CRT | 891130-891151 | 22 | NZ_CP047808 | Staphylococcus aureus strain UP_1612 plasmid unnamed, complete sequence | 15922-15943 | 2 | 0.909 |
NC_017351_2 | 2.11|891130|22|NC_017351|CRT | 891130-891151 | 22 | NZ_LT009691 | Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2 | 9751-9772 | 2 | 0.909 |
NC_017351_2 | 2.11|891130|22|NC_017351|CRT | 891130-891151 | 22 | NZ_LT009691 | Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2 | 9895-9916 | 2 | 0.909 |
NC_017351_2 | 2.11|891130|22|NC_017351|CRT | 891130-891151 | 22 | NZ_LT009691 | Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2 | 9589-9610 | 2 | 0.909 |
NC_017351_2 | 2.11|891130|22|NC_017351|CRT | 891130-891151 | 22 | NZ_LT009691 | Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2 | 9679-9700 | 2 | 0.909 |
NC_017351_2 | 2.11|891130|22|NC_017351|CRT | 891130-891151 | 22 | NZ_LT009691 | Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2 | 9805-9826 | 2 | 0.909 |
NC_017351_2 | 2.11|891130|22|NC_017351|CRT | 891130-891151 | 22 | NZ_LT009691 | Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2 | 9949-9970 | 2 | 0.909 |
NC_017351_2 | 2.11|891130|22|NC_017351|CRT | 891130-891151 | 22 | NZ_LT009691 | Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2 | 9985-10006 | 2 | 0.909 |
NC_017351_2 | 2.11|891130|22|NC_017351|CRT | 891130-891151 | 22 | LR134125 | Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5 | 156007-156028 | 2 | 0.909 |
NC_017351_2 | 2.11|891130|22|NC_017351|CRT | 891130-891151 | 22 | NZ_CP035292 | Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence | 17465-17486 | 3 | 0.864 |
NC_017351_2 | 2.11|891130|22|NC_017351|CRT | 891130-891151 | 22 | NZ_CP035292 | Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence | 18779-18800 | 3 | 0.864 |
NC_017351_2 | 2.11|891130|22|NC_017351|CRT | 891130-891151 | 22 | NZ_CP035292 | Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence | 19925-19946 | 3 | 0.864 |
NC_017351_6 | 6.1|2262033|33|NC_017351|CRISPRCasFinder | 2262033-2262065 | 33 | JN882286 | Cronobacter phage vB_CsaP_GAP52, complete genome | 23035-23067 | 7 | 0.788 |
NC_017351_6 | 6.1|2262033|33|NC_017351|CRISPRCasFinder | 2262033-2262065 | 33 | CP030544 | Staphylococcus aureus strain ER04166.3 plasmid unnamed2, complete sequence | 7568-7600 | 7 | 0.788 |
NC_017351_7 | 7.1|2485948|28|NC_017351|CRISPRCasFinder | 2485948-2485975 | 28 | NZ_CP017941 | Phyllobacterium zundukense strain Tri-48 plasmid unnamed1, complete sequence | 286024-286051 | 7 | 0.75 |
NC_017351_5 | 5.1|2016606|33|NC_017351|CRISPRCasFinder | 2016606-2016638 | 33 | MT150133 | Enterobacteria phage vB_EcoM_IME540, complete genome | 25909-25941 | 8 | 0.758 |
NC_017351_5 | 5.1|2016606|33|NC_017351|CRISPRCasFinder | 2016606-2016638 | 33 | MK234886 | Escherichia phage AnYang, complete genome | 114958-114990 | 8 | 0.758 |
NC_017351_5 | 5.1|2016606|33|NC_017351|CRISPRCasFinder | 2016606-2016638 | 33 | MF036691 | Serratia phage CBH8, complete genome | 7593-7625 | 8 | 0.758 |
NC_017351_5 | 5.1|2016606|33|NC_017351|CRISPRCasFinder | 2016606-2016638 | 33 | MF036690 | Serratia phage CHI14, complete genome | 7593-7625 | 8 | 0.758 |
NC_017351_5 | 5.1|2016606|33|NC_017351|CRISPRCasFinder | 2016606-2016638 | 33 | MF036692 | Serratia phage X20, complete genome | 7813-7845 | 8 | 0.758 |
NC_017351_2 | 2.8|890950|40|NC_017351|CRT | 890950-890989 | 40 | NZ_CP035292 | Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence | 16613-16652 | 9 | 0.775 |
NC_017351_2 | 2.8|890950|40|NC_017351|CRT | 890950-890989 | 40 | NZ_CP035292 | Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence | 16925-16964 | 9 | 0.775 |
NC_017351_2 | 2.8|890950|40|NC_017351|CRT | 890950-890989 | 40 | NZ_CP035292 | Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence | 18281-18320 | 9 | 0.775 |
NC_017351_2 | 2.12|891184|34|NC_017351|CRT | 891184-891217 | 34 | MN582098 | Podoviridae sp. ctKoA10, complete genome | 1995-2028 | 10 | 0.706 |
NC_017351_1 | 1.1|871234|32|NC_017351|CRISPRCasFinder | 871234-871265 | 32 | NZ_CP018781 | Ochrobactrum pituitosum strain AA2 plasmid pOAAA2, complete sequence | 148984-149015 | 11 | 0.656 |
1. spacer 2.9|891022|22|NC_017351|CRT matches to NZ_CP023562 (Staphylococcus aureus strain TF3198 plasmid pTF3198, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.955
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2. spacer 2.9|891022|22|NC_017351|CRT matches to NZ_CP023562 (Staphylococcus aureus strain TF3198 plasmid pTF3198, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.955
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3. spacer 2.9|891022|22|NC_017351|CRT matches to NZ_CP047808 (Staphylococcus aureus strain UP_1612 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.955
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4. spacer 2.9|891022|22|NC_017351|CRT matches to NZ_CP047808 (Staphylococcus aureus strain UP_1612 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.955
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5. spacer 2.9|891022|22|NC_017351|CRT matches to NZ_LT009691 (Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2) position: , mismatch: 1, identity: 0.955
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6. spacer 2.9|891022|22|NC_017351|CRT matches to NZ_LT009691 (Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2) position: , mismatch: 1, identity: 0.955
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7. spacer 2.9|891022|22|NC_017351|CRT matches to NZ_LT009691 (Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2) position: , mismatch: 1, identity: 0.955
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8. spacer 2.9|891022|22|NC_017351|CRT matches to NZ_LT009691 (Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2) position: , mismatch: 1, identity: 0.955
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12. spacer 2.10|891076|22|NC_017351|CRT matches to NZ_CP047808 (Staphylococcus aureus strain UP_1612 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.955
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13. spacer 2.10|891076|22|NC_017351|CRT matches to NZ_LT009691 (Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2) position: , mismatch: 1, identity: 0.955
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18. spacer 2.11|891130|22|NC_017351|CRT matches to NZ_CP047808 (Staphylococcus aureus strain UP_1612 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.955
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19. spacer 2.11|891130|22|NC_017351|CRT matches to NZ_CP047808 (Staphylococcus aureus strain UP_1612 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.955
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21. spacer 2.9|891022|22|NC_017351|CRT matches to NZ_LT009691 (Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
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23. spacer 2.10|891076|22|NC_017351|CRT matches to NZ_CP023562 (Staphylococcus aureus strain TF3198 plasmid pTF3198, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
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24. spacer 2.10|891076|22|NC_017351|CRT matches to NZ_CP023562 (Staphylococcus aureus strain TF3198 plasmid pTF3198, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
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31. spacer 2.10|891076|22|NC_017351|CRT matches to NZ_LT009691 (Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
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45. spacer 2.11|891130|22|NC_017351|CRT matches to NZ_CP035292 (Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
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47. spacer 2.11|891130|22|NC_017351|CRT matches to NZ_CP035292 (Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
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48. spacer 2.11|891130|22|NC_017351|CRT matches to NZ_CP035292 (Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer cagtgattcagactcagacagc Protospacer ***.*****************.
49. spacer 2.11|891130|22|NC_017351|CRT matches to NZ_CP035292 (Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer cagtgattcagactcagacagc Protospacer ***.*****************.
50. spacer 2.11|891130|22|NC_017351|CRT matches to NZ_CP035292 (Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer cagtgattcagactcagacagc Protospacer ***.*****************.
51. spacer 2.11|891130|22|NC_017351|CRT matches to NZ_CP035292 (Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer cagtgattcagactcagacagc Protospacer ***.*****************.
52. spacer 2.11|891130|22|NC_017351|CRT matches to NZ_CP023562 (Staphylococcus aureus strain TF3198 plasmid pTF3198, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer tagcgattcagactcagacagc Protospacer .********************.
53. spacer 2.11|891130|22|NC_017351|CRT matches to NZ_CP023562 (Staphylococcus aureus strain TF3198 plasmid pTF3198, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
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54. spacer 2.11|891130|22|NC_017351|CRT matches to NZ_CP023562 (Staphylococcus aureus strain TF3198 plasmid pTF3198, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
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55. spacer 2.11|891130|22|NC_017351|CRT matches to NZ_CP023562 (Staphylococcus aureus strain TF3198 plasmid pTF3198, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
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56. spacer 2.11|891130|22|NC_017351|CRT matches to NZ_CP023562 (Staphylococcus aureus strain TF3198 plasmid pTF3198, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
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57. spacer 2.11|891130|22|NC_017351|CRT matches to NZ_CP023562 (Staphylococcus aureus strain TF3198 plasmid pTF3198, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
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58. spacer 2.11|891130|22|NC_017351|CRT matches to NZ_CP023562 (Staphylococcus aureus strain TF3198 plasmid pTF3198, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
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59. spacer 2.11|891130|22|NC_017351|CRT matches to NZ_CP047808 (Staphylococcus aureus strain UP_1612 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer tagcgattcagactcagacagc Protospacer .********************.
60. spacer 2.11|891130|22|NC_017351|CRT matches to NZ_CP047808 (Staphylococcus aureus strain UP_1612 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer cagcgactcagactcagacagc Protospacer ******.**************.
61. spacer 2.11|891130|22|NC_017351|CRT matches to NZ_CP047808 (Staphylococcus aureus strain UP_1612 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer tagcgattcggactcagacagt Protospacer .********.************
62. spacer 2.11|891130|22|NC_017351|CRT matches to NZ_CP047808 (Staphylococcus aureus strain UP_1612 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer cagcgactcagactcagacagc Protospacer ******.**************.
63. spacer 2.11|891130|22|NC_017351|CRT matches to NZ_CP047808 (Staphylococcus aureus strain UP_1612 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer cagcgactcagactcagacagc Protospacer ******.**************.
64. spacer 2.11|891130|22|NC_017351|CRT matches to NZ_LT009691 (Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer tagcgattcagactcagacagc Protospacer .********************.
65. spacer 2.11|891130|22|NC_017351|CRT matches to NZ_LT009691 (Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer tagcgattcagactcagacagc Protospacer .********************.
66. spacer 2.11|891130|22|NC_017351|CRT matches to NZ_LT009691 (Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer tagcgattcagactcagatagt Protospacer .*****************.***
67. spacer 2.11|891130|22|NC_017351|CRT matches to NZ_LT009691 (Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer cagcgactcagactcagacagc Protospacer ******.**************.
68. spacer 2.11|891130|22|NC_017351|CRT matches to NZ_LT009691 (Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer tagcgattcggactcagacagt Protospacer .********.************
69. spacer 2.11|891130|22|NC_017351|CRT matches to NZ_LT009691 (Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer tagcgattcggactcagacagt Protospacer .********.************
70. spacer 2.11|891130|22|NC_017351|CRT matches to NZ_LT009691 (Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer cagcgactcagactcagacagc Protospacer ******.**************.
71. spacer 2.11|891130|22|NC_017351|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer cagcgattccgactcagacagc Protospacer ********* ***********.
72. spacer 2.11|891130|22|NC_017351|CRT matches to NZ_CP035292 (Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.864
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer cagcgattcagactcagactca Protospacer *******************
73. spacer 2.11|891130|22|NC_017351|CRT matches to NZ_CP035292 (Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.864
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer cagcgattcagactcagactca Protospacer *******************
74. spacer 2.11|891130|22|NC_017351|CRT matches to NZ_CP035292 (Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.864
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer cagcgattcagactcagacgca Protospacer *******************.
75. spacer 6.1|2262033|33|NC_017351|CRISPRCasFinder matches to JN882286 (Cronobacter phage vB_CsaP_GAP52, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
ttgcatatctttagctttattgtttgcaactga CRISPR spacer ttgcatatctttagctttatagcttttatatgc Protospacer ******************** *.** .* **
76. spacer 6.1|2262033|33|NC_017351|CRISPRCasFinder matches to CP030544 (Staphylococcus aureus strain ER04166.3 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
ttgcatatctttagctttattgtttgcaactga CRISPR spacer ttgaataactttagctttattgttataaacagt Protospacer *** *** **************** *** *
77. spacer 7.1|2485948|28|NC_017351|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017941 (Phyllobacterium zundukense strain Tri-48 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
cacttcgcttcggttcgcctgcgctttt CRISPR spacer tgtttcgcttcggatcgcctgagcttcc Protospacer ...********** ******* ****..
78. spacer 5.1|2016606|33|NC_017351|CRISPRCasFinder matches to MT150133 (Enterobacteria phage vB_EcoM_IME540, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
ttgcctgtagaatttcttttttgaaattctcta CRISPR spacer taacaaagagaatttctttttcaaaattctcta Protospacer * .* . *************..**********
79. spacer 5.1|2016606|33|NC_017351|CRISPRCasFinder matches to MK234886 (Escherichia phage AnYang, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
ttgcctgtagaatttcttttttgaaattctcta CRISPR spacer taacaaagagaatttctttttcaaaattctcta Protospacer * .* . *************..**********
80. spacer 5.1|2016606|33|NC_017351|CRISPRCasFinder matches to MF036691 (Serratia phage CBH8, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
ttgcctgt---agaatttcttttttgaaattctcta CRISPR spacer ---gatgtgaaaggatttcttttttgaaattatctt Protospacer *** **.***************** ***
81. spacer 5.1|2016606|33|NC_017351|CRISPRCasFinder matches to MF036690 (Serratia phage CHI14, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
ttgcctgt---agaatttcttttttgaaattctcta CRISPR spacer ---gatgtgaaaggatttcttttttgaaattatctt Protospacer *** **.***************** ***
82. spacer 5.1|2016606|33|NC_017351|CRISPRCasFinder matches to MF036692 (Serratia phage X20, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
ttgcctgt---agaatttcttttttgaaattctcta CRISPR spacer ---gatgtgaaaggatttcttttttgaaattatctt Protospacer *** **.***************** ***
83. spacer 2.8|890950|40|NC_017351|CRT matches to NZ_CP035292 (Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.775
ttcagatagcgattcagactcagacagtgactcggattca CRISPR spacer tagcgactctgattcagactcagacagcgactctgattca Protospacer * **. .*****************.***** ******
84. spacer 2.8|890950|40|NC_017351|CRT matches to NZ_CP035292 (Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.775
ttcagatagcgattcagactcagacagtgactcggattca CRISPR spacer tagcgactctgattcagactcagacagcgactctgattca Protospacer * **. .*****************.***** ******
85. spacer 2.8|890950|40|NC_017351|CRT matches to NZ_CP035292 (Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.775
ttcagatagcgattcagactcagacagtgactcggattca CRISPR spacer tagcgactctgattcagactcagacagcgactctgattca Protospacer * **. .*****************.***** ******
86. spacer 2.12|891184|34|NC_017351|CRT matches to MN582098 (Podoviridae sp. ctKoA10, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
tagtgactccgacttagacagcgactcagattca CRISPR spacer tgacaactccgactttgacaacgactcagacgtt Protospacer *....********** ****.*********. .
87. spacer 1.1|871234|32|NC_017351|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018781 (Ochrobactrum pituitosum strain AA2 plasmid pOAAA2, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.656
tttcatttcgaaattctctatgttggggcccc CRISPR spacer accatcttcgtaatgctctatgttggggcggt Protospacer .. .**** *** ************** .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
63073 : 69842
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_017351|63073:69842|DBSCAN-SWA GGTGAAAAATTTGAATAATATAATTGAAATAAATAACTTAACAAAGCAATATGGAAGTCAGATAGCAGTTAATAATTTGAGTATAACTGTTGAAAGTGGACAAATTTATGGTTTTTTAGGAAGAAATGGTGCAGGCAAAACAACTACTATAAGAATGCTTTTAGGCTTAATTAAACCTACGAAAGGTAATATTAAAATATTTGAAAAAGAGTTCGAAAGTAATAAAACTGAAATTTTAAAAAATATTGGTGCTATGGTTGAAACGCCAGGTTTTTATAGTAATTTGACAGCTAAAGAGAACTTAACTATAAATGCTAAAATATTAGGTATACAAAAAGAAAATGCAATTGAAGAAGTGTTAGAAATAGTAGGACTAGCTTCTGAAAAAGTAAAATTGTTTAAAAATTATTCTTTAGGTATGAAGCAACGTTTAGGGATTGCGAGAGCTTTATTGCACAATCCCGAATTATTGATACTTGATGAGCCGACGAATGGATTAGATCCTATTGGCATAAAAGAAATTAGAAAGTTGATTAAGGATCTGGCTCAATCTAGAAATATAACCATTTTAATTTCAAGTCATATATTGTCAGAAATAGAGCAGTTAGTAGACAAGGTGGGTATTATTCATAACGGAGTTTTGTTAGAAGAAATTATGTATGAAGATTTAAAAAAAAAGAACAGACAATTTATAAGTATATCAGTATCAGATGAAGAAAAAGTTGCATGTTTGTTGGAAACTAACTTCGGAATTTATGACTATAAAATTAAAGAAAATGGCGAATTTAAAATTTATTCACATATTGATAGACAACAAGAAATTAATAGATTATTAGTATTAAACAATATTGATGTTTTCCAGATGAGAGTGATAGAAGATAATCTAGAAACTTATTTCGAAGACTTAGTAGGAGGTGGCACAATTGGATAATCTACTCCGTACAGAATTTATTAAGTTAAAAAGATCATATATGTTTCTAATAAGTATTTTAGGTACATGCGTAGCACCTTTTATGGTGGTTGTAGCTTCTTTTATTAGTATGCGGACGAAAGTACCGACTCCTAATATTGTATTTAAACAGTTATTTGAAGAAGTCAGTTTATATCATATGCTAATTATTGGACCTCCTCTATATGGGGTTATAATAGCCTATTTGTTTGGAAGAGAATATATAGAAGATACTTTAAAAAACTTATTAATTATACCTATATCTAGAGAAAGTTTTTTAGTAAGTAAAATAATATTATTATTCTTGTGGATTCAAACACTATCTGTTATTGCATGGTTGCTAACTTTAATGCTAGGTATGCTATTGCATTTTCAAGGGTTAAGCCAGAGTTTAATAATTGATTCATTCTTTACATTTGTTATTGGCGGAGTGTTATTATGGATATTATCTCCACCAATAATTATTTTGTCGATATATTTTAAAAATTATGTTCCCACAATTGTTTTAACCATAATAATTACTTTGATAAATTTAATGACTGCTAATTCTGAACATAGAGGATTATTTCCTTGGGCTGCAGTTGGAGACATATCTAGAGGAACATTACCTAATACTTATCCATTTCTATTATCTTTAATTATCATAATTGTTACATCTATATTCAGTGTAATTATATTATTCTCATACTTTAAAAAAACTGATATAAGTTAAAAGGAGGAGAAAAATGGGTTTTATAGAGCAGATTAAAGCATTTATTTTAGGTGTAGTTGAAGGGTTGACAGAATTTGCTCCAGTATCATCAACAGGTCATATGATTATTGTTGATGATATGTGGTTAAACACTGCTGACGATTTAGGAAGTGCGTCTGCAACTACTTTTAAGGTGGTAATACAGTTAGGAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATTTATAATATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAAAAAGCTTATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTATATCAAAATAAAAGGAAAATGGAGCTATTTATATCGTGCCATTGATACAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAGCCTCAAAAGGTAGTTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGCAGCAATGGCTAAAATAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTCATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACCGTCATATTAAAGTAAGAAAGACAAGATATCAAAGTATCAATACGGCAAAGAATACTTTAAAAGGTATTGAATGTATTTACGCTCTATATAAAAAGAACCGTAGGTCTCTTCAGATCTACGGATTTTCCCCATGCCACGAAATTAGCATCATGCTAGCAAGTTAAACGAACACTGACATGATATATTAGTGATTAGCTATATTTTTTACTTTGCAACAGAACCATCATTTTTATTAAAATACTCTTTTGTAAAATCTTTCTGCTCTTCAATGTATTTAATTTCTTTACCTCTAAATCTATTATAGCTATTTGATGATTACAATAAAATTGATCTTACCTTATTGCCCTTGGAAGAGTTAGATAATTACCTAAAGGGCGATAAATTAATAAAGGTTCTAATTGATAAAGATTGTAGAATTAAAAGGGACATAGTTCCGACTGATATAGATTATCATGTAAGAAAGCCAAGCGCAAGGGAGTATGATGATTGCTGCAATGAATTTTGGAATGTAACACCTTATGTTATTAAAGGATTGTGCCGTAAGGAAATTTTATTTGCTATTGATCATTTTAATCAGATTGTTCGCCATGAGCTGCTGAGAATGATATCATGGAAGGTCGGCATCGAAACAGGCTTTAAATTAAGTGTAGGCAAGAACTATAAGTTTATTGAAAGGTATATATCCGAGGATTTGTGGGAGAAACTTTTGTCCACCTACCGGATGGATTCCTATGAAAACATATGGGAAGCATTATTTCTATGCCATCAATTGTTCAGGGCGGTATCCGGTGAGGTGGCGGAAAGGCTTCATTATGCCTATCCGGAGTATGATAGGAATATAACAAAATATACCAGGGACATGTATAAAAAATACACTGGTAAAACCGGCTGCCTGGATAGCACATATGCCGCTGATATAGAAGAGAGGCGGGAACAGTGATTACAGAAATGAAAGCAGGGCACCTGAAAGATATCGATAAACCCAGCGAACCATTTGAGGTGATAGGTAAGATTATACCGAGGTATGAAAACGAGAATTGGACCTTTACAGAATTACTCTATGAAGCGCCATATTTAAAAAGCTACCAAGACGAAGAGGATGAAGAGGATGAGGAGGCAGATTGCCTTGAATATATTGACAATACTGATAAGATAATATATCTTTACTACCAAGACGATAAATGCGTCGGAAAAGTTAAACTGCGAAAAAATTGGAACCGGTACGCTTATATAGAAGATATCGCCGTATGTAAGGATTTCAGGGGGCAAGGCATAGGCAGCGCGCTTATCAATATATCTATAGAATGGGCAAAGCATAAAAACTTGCATGGACTAATGCTTGAAACCCAGGACAATAACCTTATAGCTTGTAAATTCTATCATAATTGTGGTTTCAAAATCGGCTCCGTCGATACTATGTTATACGCCAACTTTGAAAAAGCTGTTTTCTGGTATTTAAGGTTTTAGAATGCAAGGAACAGTGAATTGGAGTTCGTCTTGTTATAATTAGCTTCTTGGGGTATCTTTAAATACTGTAGAAAAGAGGAAGGAAATAATAAATGGCTAAAATGAGAATATCACCGGAATTGAAAAAACTGATCGAAAAATACCGCTGCGTAAAAGATACGGAAGGAATGTCTCCTGCTAAGGTATATAAGCTGGTGGGAGAAAATGAAAACCTATATTTAAAAATGACGGACAGCCGGTATAAAGGGACCACCTATGATGTGGAACGGGAAAAGGACATGATGCTATGGCTGGAAGGAAAGCTGCCTGTTCCAAAGGTCCTGCACTTTGAACGGCATGATGGCTGGAGCAATCTGCTCATGAGTGAGGCCGATGGCGTCCTTTGCTCGGAAGAGTATGAAGATGAACAAAGCCCTGAAAAGATTATCGAGCTGTATGCGGAGTGCATCAGGCTCTTTCACTCCATCGACATATCGGATTGTCCCTATACGAATAGCTTAGACAGCCGCTTAGCCGAATTGGATTACTTACTGAATAACGATCTGGCCGATGTGGATTGCGAAAACTGGGAAGAAGACACTCCATTTAAAGATCCGCGCGAGCTGTATGATTTTTTAAAGACGGAAAAGCCCGAAGAGGAACTTGTCTTTTCCCACGGCGACCTGGGAGACAGCAACATCTTTGTGAAAGATGGCAAAGTAAGTGGCTTTATTGATCTTGGGAGAAGCGGCAGGGCGGACAAGTGGTATGACATTGCCTTCTGCGTCCGGTCGATCAGGGAGGATATCGGGGAAGAACAGTATGTCGAGCTATTTTTTGACTTACTGGGGATCAAGCCTGATTGGGAGAAAATAAAATATTATATTTTACTGGATGAATTGTTTTAGTACCTAGATTTAGATGTCTAAAAAGCTTTAACTACAAGCTTTTTAGACATCTAATCTTTTCTGAAGTACATCCGCAACTGTCCATACTCTGATGTTTTATATCTTTTCTAAAAGTTCGCTAGATAGAGTTCTATATTAGAGATGTAAAGAGTTTTGGTGAAGAGGTTTGTGAGTATGGCTTTTATAACCAGGGTGCAATGAGAAGCACTAACAGCAGCTAGCTTAAGAACGCATAGGATATACTTTTTATGGAAGTCACAGAGGAGGAATAAAATTTGAACAGGATTAACAGAGTAACCTCTATTCTTATTCAGCTGCAATCAAAAAAAATAATTCCTGCCAAAGAAATTGCACAGCGATTTAATATAAGCTTAAGGACAGTTTACAGAGATATCCGGACACTTGAAGAAGCCGGAATACCAATTGGATCTGAGGCCGGAAAAGGATATTTTCTTGTAGAGGGCTTCCTACTTCCGCCGGTAATGTTTACAGCGGCGGAAGTGGGTGCATTGATTACAGCAGGGAAATTTTTAAATTGCCATGGAGATGAATCATTTATAAAGGATTTTGATTCAGCTATGTATAAAATCAAATCTATTTTGAAGCATGGTGAAAAAAACTATGCACAGGAGTTGGAGAACAGTATTAACGTGTACAGCACATCTGGACAGAAAAATACATTGGCGGATAACGTTATTGCAGCAATTCAGACTGCAATCTGCAATAAAAGGGTAATATCAATTCAATATCCTGCATCAGGAGGGCAAGAACCGGAAAGCAGAATGATAGAGCCTATATCACTGGGGTTTTATGAACAGAACTGGTACTTAATCGGTTTTGCAGGCTAAGAAATGAATATAGGAATTTTCGTGTGGATCGGATTAAAAGCATTTGCATAGAAGAAGAGCTCTGTCAAAGCCATGATGGCTCTTTGGAACAAATATTAAAACAAATGCTTTCATATAAAAAACTATATAATGTAATTCTTAGAGCTGAAAAAGGGGAGACATACAATTCTATCAAGAACAGGTATTCTCTCGGCTTCCTTGAAGAAACCGATTTGGGAAGTAAAATGGAAATCGAATTCCAGACAGATTCCTTTGAGATATTGAGCAAGCAGCTGATTGAATATGGATCAGGCATTGAAATAGTCCAACCTGATGAATTAAAATGCATAACCCGTAAACACCTGGCACAAATTACGAATCACTGCCTAAACTTGATTTAGAGAAAGCGATTGGTCTGTTATGTATTTTTTGTAAGGTTTCATATCCCCTGCTGACATACAGCTGTCAGTGTATTATGATATTCTACTATCAAAAAGGAGGATTGAAAAATATGAAACCAAAGATAATTATGCACACACAAATTAGCCTTGATGGCCGCATTAAAGGCTTTGATAATCCGGAAGTTTACTACCAGGTTGCCGGGGGAATTCATTCGGATGCGGTGCTGTTTGGGTCCAATACTGTTTTTACTGCATTTGAAAAATATCCTGCTGAAACAGAGGCTGATTTTGAGAAAATCATAACAAGCCCGGAGGACCCCAGACCAATAGGAGTCATACCTGACAGCAGAGGTATCTTGAGAAGTCTTCATTGCTTAAGAAATCTTGGATATCTGAAGGAAATTGTCATTCTGGTATCAACTGCCACTCCGAAGGAATATTTGAATTATTTGGAGGAAAGGCATTACCCATATATTGTGTCAGGAAATGATCATGTGGACTATGAAAAAGCCTTTCAGATCCTGCATGAGCAATATGGGTGTAAATACATGCGGACAGACAGTGGCGGTGGATTAACCAACAAATTATTAGAAAACGGACTTATTGATGAAATCAGTCTTGTGATATCACCATGTTTTGTAGGTAATAAAGAAAAACAACTATTTGATAACCTTCTGTTATCTGAAAAAGTTAATTTGGAATTGCAGGGAACAGAGAATGCAGAACATGGCTGTCTGTCATTGCGCTATGCTGTGAAAAATAAGGATTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_017351|63073:69842|66426_66957_+|WP_000627289.1|DBSCAN-SWA MITEMKAGHLKDIDKPSEPFEVIGKIIPRYENENWTFTELLYEAPYLKSYQDEEDEEDEEADCLEYIDNTDKIIYLYYQDDKCVGKVKLRKNWNRYAYIEDIAVCKDFRGQGIGSALINISIEWAKHKNLHGLMLETQDNNLIACKFYHNCGFKIGSVDTMLYANFEKAVFWYLRF >NC_017351|63073:69842|64979_65654_+|WP_001105960.1|transposase|DBSCAN-SWA MNYFRYKQFNKDVITVAVGYYLRYALSYRDISEILRERGVNVHHSTIYRWVQEYAPILYQIWKKKHKKAYYKWRIDETYIKIKGKWSYLYRAIDTEGHTLDIWLRKQRDNHSAYAFIKRLIKQFGKPQKVVTDQAPSTKAAMAKIIKAFKLKPDCHCTSKYLNNLIEQDHRHIKVRKTRYQSINTAKNTLKGIECIYALYKKNRRSLQIYGFSPCHEISIMLAS >NC_017351|63073:69842|63995_64733_+|WP_000369394.1|DBSCAN-SWA MDNLLRTEFIKLKRSYMFLISILGTCVAPFMVVVASFISMRTKVPTPNIVFKQLFEEVSLYHMLIIGPPLYGVIIAYLFGREYIEDTLKNLLIIPISRESFLVSKIILLFLWIQTLSVIAWLLTLMLGMLLHFQGLSQSLIIDSFFTFVIGGVLLWILSPPIIILSIYFKNYVPTIVLTIIITLINLMTANSEHRGLFPWAAVGDISRGTLPNTYPFLLSLIIIIVTSIFSVIILFSYFKKTDIS >NC_017351|63073:69842|64746_64950_+|WP_000505741.1|DBSCAN-SWA MGFIEQIKAFILGVVEGLTEFAPVSSTGHMIIVDDMWLNTADDLGSASATTFKVVIQLGGSVAKLNL >NC_017351|63073:69842|63073_64003_+|WP_000793446.1|DBSCAN-SWA MKNLNNIIEINNLTKQYGSQIAVNNLSITVESGQIYGFLGRNGAGKTTTIRMLLGLIKPTKGNIKIFEKEFESNKTEILKNIGAMVETPGFYSNLTAKENLTINAKILGIQKENAIEEVLEIVGLASEKVKLFKNYSLGMKQRLGIARALLHNPELLILDEPTNGLDPIGIKEIRKLIKDLAQSRNITILISSHILSEIEQLVDKVGIIHNGVLLEEIMYEDLKKKNRQFISISVSDEEKVACLLETNFGIYDYKIKENGEFKIYSHIDRQQEINRLLVLNNIDVFQMRVIEDNLETYFEDLVGGGTIG >NC_017351|63073:69842|68119_68692_+|WP_001079938.1|DBSCAN-SWA MNRINRVTSILIQLQSKKIIPAKEIAQRFNISLRTVYRDIRTLEEAGIPIGSEAGKGYFLVEGFLLPPVMFTAAEVGALITAGKFLNCHGDESFIKDFDSAMYKIKSILKHGEKNYAQELENSINVYSTSGQKNTLADNVIAAIQTAICNKRVISIQYPASGGQEPESRMIEPISLGFYEQNWYLIGFAG >NC_017351|63073:69842|69182_69842_+|WP_000802831.1|DBSCAN-SWA MKPKIIMHTQISLDGRIKGFDNPEVYYQVAGGIHSDAVLFGSNTVFTAFEKYPAETEADFEKIITSPEDPRPIGVIPDSRGILRSLHCLRNLGYLKEIVILVSTATPKEYLNYLEERHYPYIVSGNDHVDYEKAFQILHEQYGCKYMRTDSGGGLTNKLLENGLIDEISLVISPCFVGNKEKQLFDNLLLSEKVNLELQGTENAEHGCLSLRYAVKNKD >NC_017351|63073:69842|67049_67844_+|WP_001096887.1|DBSCAN-SWA MAKMRISPELKKLIEKYRCVKDTEGMSPAKVYKLVGENENLYLKMTDSRYKGTTYDVEREKDMMLWLEGKLPVPKVLHFERHDGWSNLLMSEADGVLCSEEYEDEQSPEKIIELYAECIRLFHSIDISDCPYTNSLDSRLAELDYLLNNDLADVDCENWEEDTPFKDPRELYDFLKTEKPEEELVFSHGDLGDSNIFVKDGKVSGFIDLGRSGRADKWYDIAFCVRSIREDIGEEQYVELFFDLLGIKPDWEKIKYYILLDELF >NC_017351|63073:69842|68664_69072_+|WP_072387101.1|DBSCAN-SWA MVLNRFCRLRNEYRNFRVDRIKSICIEEELCQSHDGSLEQILKQMLSYKKLYNVILRAEKGETYNSIKNRYSLGFLEETDLGSKMEIEFQTDSFEILSKQLIEYGSGIEIVQPDELKCITRKHLAQITNHCLNLI |
9 | Streptococcus_phage(71.43%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
643673 : 712080
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_017351|643673:712080|DBSCAN-SWA GTTAATAAAAATCAATATTCTTTATTTTGATAGAATGCTTAGTTTTCCCTCTTTTAACGTGAATGTACTCTATTTCAATAGATTTTATGGCCATCTTAATGAAGTCTGCTTTATCTTCTAAAGTAAAGGCATTCCATGAGTCTAAAAGAATATTTTTGAATTTTTTTATCTTACTGACATCTAATCGTTTTTCAGGAACTCTCTCTTTTTGTTTTTCGTATTCTGAAATCTTTTCGTCAGTTTCTTTTATTAATTCAAATAATTCTTCTTCTTGCATCATGCCGTTTGCGTATAATTTGTGATATCTTTTTCTTTGTTCCATAACTTTATTTATATCAATGGTTACAATTTTTTTATCTTCTTTTTCTTTTGTTTTGTATTTACTTAAATCTAACTTAGAAAGGTAATCGTAAAATACTTTTAAAGCTTCTTTTTCGGTAAATGAAAAAGCACCATTTTTATTAACTTTGCAATTATTACAATAATAATTTTTGTGTATAACATCTCCACGTTTAAGTTTTCTATAACTGGTATTCAAACATAATCTTCCATTGCAATTAGGGCAGATGAGTTTACCTCTAAAAACTGAAGTATGAGTTATTGTTTTCGCATTAACACGTTCATTCAAGCGTTCCTTTATTTCGTTATACATTTCATCTGTAATTATTGGTTCGTGAGAGTTTTCAATAAATATATCCCCCCAAAAATAGTGCCCTTTTGATAAAGGGCTCCTTAAAGCTCTTGTTATTGTCCTATCTTCCCACTGTATGCCGTTTGGTGGTGGTATATCAGATGCGTTTAACTTCCTTGCTATACCTTTAGCGCTATTTCCTTTTTTAACCTCTTCATAAGCCCACACAACTACATCTTTATATTTATTAGGAATATATTTATTATCTACACGATCATAGTAGAATGGGGGAGGTGTTAATATCATGCCTTTTCTAATCGCTGCTTGCTTGCCCATCATTGCCCTTTCCCTTATCGTTTCACGTTCCCACTCAGCCATAGCACCTACTAAAGTGACGAATAGGCGACCCATTGCCGTCGATGTATCATAAACTTCTGTGGCACTTCTGAAAGATACGTTTTCTCGCTCAAATATTTCTAATAAATCAAGTAAATCTTTTACATTACGCGTCAACCTGTCTAACTTATAGACTAATACTAAATCTATTTTTGATAAATTTTCCTTTAATCTATTAAGTTCAGGTCGGTCAGTTTTAGCACCAGAATAGCCAGCATCTACATAAACACCTTGTATAGTCCAGTCGTTTATGTCGCTGTATGCTCTTAATTTTCTTTCTTGTTCTTCAATAGAGTGTCCTTTTTCTTTTTGTTCAAGTGTACTTACTCTAGTATAAATTGCTACTTTCATGTGCTCCCTCCTCAAAATTGGCAAAAAATAATAAGGGTAGGCGGGCTACCCGTGAAAATTGTATAAAAAAAGAGAGAACGCAGATGCACCCTCTCATGTCGCAAATATTTCAGCGACTTGTCTAATTTGAAGCTTGCCGCAAATATTTCAGCGGCTTGTTTTGTATATATGTAATATACCATCAAAGAGAGTGTAGTTCAAGCGATTTAACTAAGAAATCTAATTTTTATACTATTTTCAATTTTATCTACTGTTTCTTTTGAATATGATATTTCTCCGGCAGGGTCATACCTATTAATTTTCGATATTCTATCCTTGCTGATTGTAGTGATATTTAAAACGTTAGCATAGGTCTTTTTATACTTGAATCGCTCATATCTTTTGCGAACCTTCGAATATTTTTTGAAGTCGTCATTCAGCGATTTGTTTTCATCAAGTAATTTTTGATCGTATGGGTTTTCTGCTTTTGACACCTTTTCAAGATTGTTCATGATTTTTTTAGCTAAATCCTTACCCGTTACGTCCATTTTTTCCAATACTAAAGGTAACAAATCTTCTTCGATATGCACATTGAATTTACTTCTGGAAGATGTAAGTGGAACTACCGTTAATATTGGATTTTTATTTGAATCGTGATTATTAAGTACCATACAAAAATGGTTTCCAGAAAACTCTCTGCCAACATTAACACCTAACTTTACATAAATTATAGTGCCTTTTTTATATCTGGTGTAACTTTTGTTTTCTTTTAACAATCTAACTTCATCCAATAAAAACTCTGAATATTCAAGACACCATGAATTCATATATTTAAATTTGTAAATCTCGCTATTTTGAATCTTTTTAAAATTATTAACTGCTGTTTCTAAAGGTGCGTTCTCTTCCATCCCTCATCCTCCTCGCGCCACATAGGCGTTATTAATCACAATACAACTTTGCCCATTACTTTAATATTACTAAACGAAGCGACTTTGATATCATCATACTTCGGATTTAGAGATACCAAATTAATATAGTCTTCGCATATATCTACACGCTTGATAAGACTTACTCCATCTAATACAACGAGTGCAATTGTACCATCTTTAATAGAATCTTCTTTCTTAATAAAAGCGTATGTTCCTTGTTTTAACATAGGTTCCATTGAATCACCATTAACTAAAATACAAAAATCAGCATTTGATGGCGTTTCGTCTTCTTTAAAAAATACTTCTTCATGCAATATGTCATCATATAATTCTTCTCCTATGCCAGCACCAGTTGCACCACATGCAATATACGATACTAGTTTAGACTCTTTATATTCATCTATAGAAGTGACTTTATTCTGTTCATCTAATTGCTCATTTGCGTAGTTAAGTACGTTTTTTTGTCTTGGAGGCGTGAGTTTACTGTATATGGAAGTGATGTCGTTTTTTTTATTATTTCTTGTAGGAAACAAATCATCGATACTGATATTTAAAATATGAGCAATTTCAAACAAATCATCTTGTTTAGGAGTTCTGTACCCTGTCTCATAATTTGAAATAGTAGCCTTTTTAGTGTTGAGTTTTTCTCCAAGTTGATCTTGAGTTAAGTTCAATTTGGTTCTATAGTATCTGATTTTATTGCCTATAAATTTCGCTAATTCTTTTTTATCCATTTTCTTACCTCCTTAAATTTACCTATAGTATAACCCAATTATTTTTGGTATTCAACAAAAAAATACACGAAAAGCAAACTTTTATGTTGACTCAAGTACACGTATCGTGTATAGTTAGTTTTGTAAGCGGGAGGTGACAACATGCAATGGAATTTAATAAAGTTGAGAAAAGAAAGAAAGTGTACTCAAGAAGATTTAGCAAACCTCTTGAATATATCAACTGAAGGTTATCGTTTAAAGGAATTAGGAAAGCATCAATTTAAGAATGATGAGATGTTTATTATCGCTGATTTTTTTGACGAAAATATTGGAGATATTTTTTTACCCACAAAGTACACGAAACGCAAACAAACATTTTAAAAGGAGGAACGAACAATGCAAGCATTACAAACATTTAATTTTAAAGAGCTACCAGTAAGAACAGTGGAAATTGAAAACGAACCTTATTTTGTAGGAAAAGATATTGCTGAAATTTTAGGATATGCAAGGGCAGACAATGCCATCAGAAATCATGTTGATAGCGAGGACAAGCTGACGCACCAATTTAGTGCATCAGGTCAAAACAGAAATATGATCATTATCAATGAATCAGGATTATACAGTTTAATCTTTGACGCTTCTAAACAAAGTAAAAACGAAAAAATCAGAGAAACCGCTCGAAAATTCAAACGATGGGTAACATCAGACGTCCTACCAGCCATTCGCAAACACGGTATCTACGCAACAGACAATGTAATTGAACAAACATTAAAAGATCCAGACTACATCATTACAGTGTTGACTGAGTATAAGAAAGAAAAAGAGCAAAACTTACTTTTACAACAAGAAATTGGAGAGCTAAAACCCAAAGCAGACTATGTAGATGAAATCTTAAAGTCAACTGGAACATTAGCTACAACTCAAATCGCGGCAGACTACGGTATATCAGCACAAAAGTTAAACAAACTACTACACGAAGCTAGATTACAACGAAAAGTGAATAAACAGTGGGTGCTTTACTCAGAACACATGGGCAAGAGTTACACAGAATCAGACACTATACCAATTGTACGCTCTGACGGTAGAGAAGACACAGTTTTACAAACTAGATGGACACAAAAAGGTAGATTGAAAATACATGAAATCATGACTGAATTCGGTTATGAAGCTAACGTAACTGCTTAACAGGAGGGCGCAGCAAATGGAAGATCAAAACAAAAAAGTCATTTATTACTACTATGACGAAGCAGGTAATAGACAACTATTATCAATTGGAGATTTGAATCTCTATTTATTAAAAGATATTAAATCAAGATTTGGTTTATATAAAAAACAAATCCCTGATTTAGATAATCTGTTCGTTCAAATAGACGGTGTTGAATTTAAAGTACTATAACCCGAGCAATGCACCTCTTAAACAACATTATACACGAAAGGAGCATAAACAAATGAACACACTATACAAAACAACCCTCCTCATCACAATGGCAGTTGTGACGTGGAAGGTTTGGAAAATTGAACGAAATACGAGAAAGCCTGTAATCAATCGAAATGATTTTAGTAAAGAGTCTACAGCAGAAACGATTGAGCGACACAGTGATCCTGATTCAGGAATAAAACTACTTAAGGCGTTTTCCGACTTTACTAAAGAGAACCTTTCCTAATTCTAAGAAGATGAAGTTTCGTTGGTACTCAAGTGACTCATGTAAAGCAGTAGAGTAAATCTTTTCACTGGAAACACCTTCATCAGCATTCTCTGTAAGTTTTTGAAGGTTCTTCTTGAAGTGTTCACTTTGACCACCGTATAGTTCATCAGCTTCATTAACAATTTTATAGTAAAGCTGTTCATATTCACTATATGACATATTATCCACCTCCTTTCAATAGGAGATAACTAAATTATACACGAAAGGAATGATAGAAATGCCACCACACATTCAACAAATGCTATTCGACTTTGCATTAGAGAGAGGATATATAGACATGATTATAAAAATGAAA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92 | Staphylococcus_phage(83.33%) | holin,portal,terminase,tRNA,integrase,tail,capsid,plate,head,transposase | attL 688839:688855|attR 716849:716865 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
796191 : 804011
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_017351|796191:804011|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_017351|796191:804011|797246_797933_-|WP_000149344.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR >NC_017351|796191:804011|802859_804011_+|WP_001217797.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHVMCTHSLAKDDIYAVAYSFEKAESINSTYEHQTSYVSKHHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKTNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML >NC_017351|796191:804011|802282_802876_+|WP_000604515.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDVINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDEAIIMAFEHITFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI >NC_017351|796191:804011|797907_798381_-|WP_001037807.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIVVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG >NC_017351|796191:804011|800125_800839_-|WP_001062965.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKGDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQLWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVITQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >NC_017351|796191:804011|796191_797247_-|WP_000244415.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCSEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENKDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS >NC_017351|796191:804011|800842_801262_-|WP_000941340.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDNTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV >NC_017351|796191:804011|801263_801932_-|WP_000446724.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL >NC_017351|796191:804011|799442_800027_-|WP_000604990.1|DBSCAN-SWA MILYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNSLDETAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF >NC_017351|796191:804011|798722_799163_-|WP_001093560.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAVGAVASVLTLGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNIDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK |
10 | Hokovirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
815983 : 830312
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_017351|815983:830312|DBSCAN-SWA TATGAAAGAACAACTTAATCAACTATCAGCATATCAGCCTGGTTTATCTCCAAGGGCATTGAAAGAAAAGTATGGCATTGAAGGAGATTTATATAAACTTGCATCAAATGAAAATTTGTATGGACCATCGCCTAAAGTTAAAGAAGCGATATCAGCACACTTAGATGAGTTATATTATTATCCTGAAACAGGATCACCGACATTAAAAGCGGCGATTAGTAAACATTTAAATGTAGATCAATCACGCATTTTATTTGGTGCGGGATTAGATGAAGTTATATTAATGATTTCTAGAGCTGTATTAACGCCAGGGGATACTATTGTTACAAGTGAAGCGACATTCGGTCAATATTATCACAATGCGATTGTTGAATCAGCTAATGTGATACAAGTACCTTTAAAAGATGGTGGCTTCGATTTAGAAGGTATTTTAAAAGAAGTTAATGAAGATACGTCATTGGTATGGTTATGTAATCCAAATAATCCTACAGGTACATATTTTAATCATGAGAGCGTAGATTCGTTTTTATCTCAAGTACCTCCACATGTACCAGTAATTATAGATGAAGCTTATTTTGAATTTGTGACAGCAGAGGACTACCCGGATACACTTGCTTTGCAACAAAAATATGACAATGCTTTCTTATTACGTACATTTTCAAAGGCGTATGGATTAGCGGGTTTACGTGTAGGATATGTGGTAGCAAGTGAACATGCGATTGAAAAATGGAACATCATTAGACCACCATTTAATGTGACACGTATATCTGAATACGCAGCAGTTGCAGCACTTGAAGATCAACAATATTTAAAAGAGGTAACACATAAAAATAGTGTTGAACGCGAAAGATTTTATCAATTACCTCAAAGTGAGTATTTCTTGCCAAGTCAAACGAATTTTATATTTGTAAAAACAAAGCGGGTAAATGAACTTTATGAAGCACTTTTAAATGTAGGGTGTATTACGCGACCATTTCCAACTGGTGTTAGAATTACAATTGGTTTTAAAGAACAAAATGATAAAATGTTAGAAGTTTTATCAAACTTTAAATACGAATAGTAAGTGGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTCTCAAAATTTATTTCGTCGTCCCACCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCCTGACTAGAATTGAAAAAAGCTTGTTACAAGCGCATTTTCGTTCAGTCAACTACTGCCAATATAACTTTGTAGAGCATTGAACATTGATTTATGTCTCAAGCTCAATGCAGTGTGAATGATGAGGTGAGAGTATTCAGTGTAAAAAGCAACAATAGATGATATTGTTTTGTATCAATTGCTTTTTTGCTATACTGAATCAATACTGATATTTTGAGGAGAAGATTAAAATGACCCGTAAATCAATCGCGATTGATATGGATGAAGTATTGGCAGATACATTAGGAGAAATCATTGATGCTGTCAATTTTAGAGCGGATTTAGGTATTAAAATGGAAGCTTTGAATGGTCAAAAACTTAAACATGTTATTCCTGAACATGATGGATTAATTACAGAAGTATTGAGAGAACCAGGCTTCTTCAGACATCTTAAAGTGATGCCACATGCACAAGAAGTTGTGAAAAAATTAACTGAACATTATGATGTATATATTGCTACAGCAGCAATGGATGTACCAACATCATTTAGTGATAAATATGAATGGTTACTAGAGTTCTTTCCATTTTTAGATCCTCAGCATTTTGTTTTTTGTGGTAGAAAAAACATCGTTAAAGCTGATTATTTAATAGATGACAATCCTAGACAGCTTGAAATTTTTACTGGTACACCGATTATGTTTACAGCAGTGCATAATATTAATGATGATCGATTTGAACGCGTAAATAGCTGGAAAGATGTAGAACAGTATTTTTTAGATAATATTGAGAAATAAAATATATCACTTGAAAAATTTCATGTAGAAAAGATGATGGATAGGCTATAAAGTAATTGTGACTGAGATGAACTTTTATGTCTTAGACACTACAACACTATATTGGCAGTAGTTGACTGCGGGGCCCCAACATAAAGAAATACTTTTTCTTTAGAAATTAGTATTTCTTATGCATGAGTGTAACTCATGCATTCATATTTTTAAGTACACATTAGCTGTGACTAATGATAAAGAATCGCTACATAACCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTCTATCTCATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGAATTTGAAAAAGACGCATAAACCACTATGATTTAAAATACAACATCAATCATTTTAGTGGCATGCGCCAAAATTATATGTCTGTTTTTGAAACAGGGTAATAGCTTAAAGCTAATAAAAACGAATATAAGGTGCGTTGAATCTTATGATTACACTCCAAACCTAATATAATATCGGGTTAAGATCATTCCGGATGCTTACAAATCATTGACAGTAAGTAACTGAATGGCATTTGGTATAACCTCAATATCAATAGGTGTTTCTAATGAAATTTCGCCATCAATATCAACTTTCATTGCTGGATCTGTTGTAAGTGAAATCTTTTTACCAGGTATATGCTCAATACCTTGAGTGATTTCATTCCAATTCATGCTATCACGCTTTTTAAAAATATCATTTAAAATACTGAAACTTTGTTCATTAAAAATGAAAGTGTTCAGTTCACCATCTTGAGGAGACAAATCAGTCAATGGTATACGACTACCACCAATGAATGGGCCATTTGCTGTTAGTATCATGGTCGTTTCGCCAGAATATGTCTTATCATCTATTGATAATTGATAATTAAATTGTGTTGGATTTAGCAGTGTTTTGACAGTTGATCCAATATAACTCAATTTACCAAATATATCTTTTGAACCATCTTGTACGTTTTCAGCGTTTTGAACAATTAGACCTAACCCAACAAAGTTGAGTGCATATTGATTATTTATTTTAATTACATCGTATGTACCAACTTGTGCAGAAATCATTTGTTCACTAGCTTGTTTATGATTAGGTGCTATATTTAGCGTTTTTGTAAAATCATTAAAAGTACCGCCTGGTAAAATGCCAATAGGGAGTTGAAGGTCATGTGACATAACACCATTTATAAGTTCGTTAACCGTGCCATCACCGCCAAGAATAAATAATATATCTACATCTTTTGCATAGTTTTTAGTTTTGATTTCTTGGCAATATTTAATAATGTCACCTTCGTTTTCACTCAATTGAATAGAAAGATGCTTACAAATTGAACTTAATGCTGTTGTAACTTCCCCAATACCTTGATTAATATTTTTTAATCCACTGTGTTCATGGTAAAAGAGGACACCATGTGTATATTTATTTTCCATAGTTTAGCCTACTTTCTAAAAATTGGTTCATTAAATATATATACCCACTTTTAATTGTTAATACCAAAAATATGTTTTTAAATAGAGAAAATGGTAATAACTGACATTGATGTCTATAGAGTGGGACGAGAAAAAATAGTTATAGCTGTCTATAACGAGCATATTAAGCTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGAATGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAGGAAAATAAAGTAATTTGTTTGACCTAGTGGTTCTATTAACTTAACTAAAGTACCATTGATTGCTTGTGCAGAAGCGTTAGTTAAGTACCAAATACTCATCATTTGGGCATTAAATGCTTTAGGTGCTAACTTAACAGCAGCACTATTACCCGTTGGTGATAAGCATAGCTCACCGATAACACAAATAATGTACGATAAAATAACCCAGTTAACTGAGAAGTTTGATGAACCTGATGCATAACCTACAATACCAATTAGTATGTATGACGCACCTGCTAAGAACGTACCAATTGCAAATTTTACTGGCAGGCTAGGTTGTTTAGTTCCAAGCTTTTGCCATAAAAGTGAAATAATTGGAGCTAGTAATAAAATAAATAATGGGTTAATTGATTGGAAGATCGCTTCACCAAAGTTTGTTTTCCAACCAAATAAGTTTAATTTCATATCTGAATGTTCAATTCCATATATGTTTAATACATTAGACCCTTGTTCTTGAATAGCCCAGAACACCATTCCAAGAATAAATAATGGAATAAATGCTTTAACACGAGAACGTTCAGTATCAGTGACATCTTTACTTCTAATAATTAAAGTGAAGTAAATGATTGGTAATGCAATACCTAATACTAAAACAGTATTACTAACTAAGTTAAATGATAATGAATTAGTTAATGCACCAATAACGATAATTAATACAATTGCTAAAACAACACTTCCGATAATAAGACCATACTTTTTCTTTTCAGCTGGTGTCAATGGGTTAGTAGGTTTCATACCAACGCTACCTAAGTTTTTGCGGTTGAAAAGTACATACCATACTAAACCTAATGCCATACCAACTGCTGCAATCAAGAATCCGCCGTGGAAGTTTTTAACATTAACAAAGTGTTGCAAAATAATAGGTGATAATAATGCACCCATATTAACTGACATATAGAAAATAACAAAACCTGCATCCATACGTCTATCATTTTCAGGATATAAACGGCCAACGATATTTGAAATGTTTGGCTTCATTAAACCTGAACCAATAATGATGAAGAACATTGATGTGAATAAGCCGATTAATGCAAATGGTAAGCTTAAACAAATATGTCCGATAATAATAAAGACTGCACCTAATAAAGTAGCGCCTCTAGTACCTGTAATTCTGTCAGCAATCCATCCGCCTGGTATTGATGTCATATAGATTAATGAACCATAAACTGACATAATTGACATA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_017351|815983:830312|827445_827601_+|WP_000499195.1|DBSCAN-SWA MFYFTLSKQNTHSEKLNFSLIANINKIDTKLFERLLKLWSKNATINEKYYQ >NC_017351|815983:830312|823709_824108_+|WP_000692521.1|DBSCAN-SWA MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >NC_017351|815983:830312|817380_817923_+|WP_000197262.1|DBSCAN-SWA MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPHAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEK >NC_017351|815983:830312|827639_828611_+|WP_000876319.1|DBSCAN-SWA MKYLLKGNILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDLLHLTESQRNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSICGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFVNHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ >NC_017351|815983:830312|818489_819407_-|WP_000429006.1|DBSCAN-SWA MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMSHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILTANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >NC_017351|815983:830312|824070_826176_+|WP_000855505.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >NC_017351|815983:830312|828597_829554_+|WP_001245577.1|DBSCAN-SWA MRNNNKKIMLLIAVTLLISMLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQAITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVLPVFLFGIQSVWVTNVYLNFILTLITMVLFALILFQGIFKIGHFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVLLVILLVITILLLPYLDVLLLGRAEAINLGISYEKLTRILLVIVSVLVSVSTALVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWVVENVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVRRRNAQ >NC_017351|815983:830312|815983_817042_+|WP_000663035.1|DBSCAN-SWA MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISAHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNEDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESVDSFLSQVPPHVPVIIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEYFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE >NC_017351|815983:830312|829550_830312_+|WP_000616840.1|DBSCAN-SWA MIQVENLTKTINNQMILEDISIDIEKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAICRLIRFDNGEVKIDGQLMSDYKNNDLSKKISILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRLTKEDHDIVNDALDLLQLQDIRNRNIKSLSGGQRQRAYIAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHAVQIMQTLKMLAHKMNKAIVIVLHDINFASCYSDQIVALKNGQLVKSDLKDNVIQSSVLSDLYDMNIQIEHIRNQRICLYFKD >NC_017351|815983:830312|826293_827265_+|WP_000562498.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >NC_017351|815983:830312|819676_821182_-|WP_000193751.1|DBSCAN-SWA MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >NC_017351|815983:830312|819497_819599_+|WP_031835073.1|DBSCAN-SWA MVITDIDVYRVGREKIVIAVYNEHIKLLFILIS >NC_017351|815983:830312|822042_822909_-|WP_001068497.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK >NC_017351|815983:830312|821522_822023_-|WP_000930014.1|DBSCAN-SWA MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR |
14 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1001482 : 1055271
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_017351|1001482:1055271|DBSCAN-SWA 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53 | Streptococcus_phage(33.33%) | tRNA,bacteriocin,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1075499 : 1083972
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_017351|1075499:1083972|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_017351|1075499:1083972|1075499_1075982_+|WP_000861572.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARERGINIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILAARMLSIQNPSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ >NC_017351|1075499:1083972|1078065_1078737_+|WP_000666798.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSCDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >NC_017351|1075499:1083972|1082374_1083403_+|WP_000030803.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEIIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDASRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >NC_017351|1075499:1083972|1083405_1083972_+|WP_000238658.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVEHIESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHGIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVSLLNEDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDCGMDTGEIIEQRQCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >NC_017351|1075499:1083972|1077096_1077801_+|WP_000174053.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHVKLLNIASDEDIEILKSKALKINNVLKQLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATNANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK >NC_017351|1075499:1083972|1075968_1077093_+|WP_001010406.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVVVLDPAEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISAQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETSECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGNNNQITFFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKTAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSERKDSRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN >NC_017351|1075499:1083972|1078729_1080919_+|WP_000032727.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGDHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKDYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGLLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >NC_017351|1075499:1083972|1080897_1082382_+|WP_000483713.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >NC_017351|1075499:1083972|1077800_1078064_+|WP_000848350.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLDDEKENA |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1522922 : 1610092
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_017351|1522922:1610092|DBSCAN-SWA 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103 | Staphylococcus_phage(83.12%) | holin,capsid,portal,terminase,tRNA,protease,tail,plate,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1665212 : 1673542
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_017351|1665212:1673542|DBSCAN-SWA ATTAATTACAACATTCTCGATTATGCTGATGATCGACAAAACGTACAGGATGTCCATAAATTTTTGAAATTTCAACTTCATCAAGTGATTTAAACTCATCAGTTGTACCATGGAAATGCAAATGCTTATTTAAACATGCTACTTCAGTAGCAGTATCTGCTACAACACCGATATCATGAGTAACTAAGATAATGGTGATACCTTCTTGTTTTAATTGATCTAAAGTATTATAAAATTCACTTACATGTTTTGCATCAATACCATTCGTTGGTTCATCAAGTACTAATACTGCAGGTTCTGAAATCAATGCTCGGGCAATCATTACACGTTGTTGTTGACCACCTGATAATTCTGCTATATTTTTATGAATTAAATCACTTATATTCAGTCTTTCTAGTACTTTAATCACTTTTTCATTATCTTTGCTATTAAATGTTTGGAAAAGACGTTTTGTCTTTGTTAATCCGCTTAAAACAACTTCTTTAACACTTGCTGGGAAACCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATACATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTCACCACTTTGTAAAGGTAATAACCCTAGAATCAACTTCAATAATGTTGATTTACCAGCACCATTTGGTCCAACAATCGCTAAAAATTCACCTTTATTTATTTTAATGTTTATATTTTCTAACACTTTTTTATGATCATAGTAGTAATTGACATTTTTCAATTCAAAGACTGGTGTCATCGTATTCTCACCTCGCATTCAACTATACAACTCCTAGTAACATATGTAAACAGTAATGTTTACGACTCAAAATTAGACAAAATAAAGAGATATGCCCCCTTCAAGTTTTATTTATCGCATTTCTTGAAGAGAGCATTATCATTTTATTGTTGCATAACCTTATTTTTTAATTCTGGGTCAAATTGCTGTTGTTTTAACATTTCAATTTCAAGTTTATATGGCGGTTTTTTATTTTTCTTATCTTCACCAACATAAGGTGTTTCTAAGATTTTCGGAATATCTTTAAAACTATCATGATGCACAATGTAATTTAATGCATCAAAACCAATGTAACCGAAGCCAATATTTTCATGTCGGTCTTTTTGAGCGCCACGGTCATTTTTAGAATCATTGACATGAACAACTTTGATTCTGTCGACTCCAATAATTTTATCAAATTCATTTAATACGCCATCAAAGTCCTCTTTCACATTATATCCAGCATCATGCGTATGACATGTATCAAAACATACTGATAAACGTTCGTTATTATGAACTCCATCAATAATACGTGCTAACTCTTCAAATGAGCGACCAATCTCTGTACCTTTACCTGCCATCGTTTCAAGCGCAATACGTACATTATTGTCATTCGTTAAAACTTCATTTAATCCTTCAATAATCTTATTAATTCCGGCATCAACACCAGCTCCAACATGCGCACCTGGATGTAATACAATATCTTTAGCCCCTATAGCTTGCGTTCTTTCAATTTCTTGTTGCAAGAAATCTACACCAAGATTAAACGTTTCTGGTTTGGTTGTATTTGCAATATTAATGATGTATGGTGCATGAACAACAATATTAGATAAGCCATATTTTTCCATCACTTCATGACCTTTAGTTATATTTAAATCTTCAATACTTTTACGGCGCGTGTTTTGAGGTGCACCAGTATAAATCATAAATGTCGTTTCACCATATTCATGCGCTTCTATAGCAGAACCTTCTAACATCTTTTTACCACTCATTGAAACATGTGATCCTAATAACATAAAACACACCTAACCTTTTTTGTTTTGCTTACGTTTTTGTCTATTTTGCTGCTTACTAAATTGCTTACGCTCTTGACGTTTCATTTTTTCAACTTCTTGTTTAAATTTCTTCTTATAACCTGGTTTAACTTTGTTTTTAATTTTACTTCGAACTTTGTTCTTCACTTGATTAGTTAAATGGTCATCTTTGCGCATTCTTGCTTGACGCTGATTGTGCGCTTTAACTTCTTTTAACTCACCATCTTTAATATCAACAGTATTGAATACAAAACCGCGATCTTCTATTAATGAAATATTGTGTTCTTCATCAGGACTATAAAGCGTAATTGCTACACCTTTATAATTCCCACGACCAGTTCGTCCGACTCTATGCGTAAAGAAGTCAATATCATTTGGCACATCAAAATTGATGACATGACTAACACCTTCAATATCAATACCACGAGATGCTAAATCGCTGGCAATAACGTATTGGAATTCTAAATTACGTATACGTTTCATTTGTTGTTTACGTTCACGTGGCGTTAAGCCACCATGAATCATACCAACTTTAATACCAGCTTCATTTAGTGAACGTGCTAAATCATTTGCATTATCTCTACTATTACAGAAAATAATACATAAGTATGGATTTAGTATATCAATTAAATTTAAAGTCTTTTCAACTTTAGCTGCACCTTTAGTAGGTATTAAATAGAATTCGATGTTCTTTTTATTTTGTTTTTTACTGTCGACAGCTACATATTCTGGATGACTTAAATATTTATTTAAAAATGGTTGTAACTGTTGTGGGATTGTAGCACTAAACACCGCAATATTTGCATTATCTTCCAATCTTGCAGCAATGTAATCTACATCTTCAATTAATCCTAAGTCAATCATAAGATCCGCTTCATCAATAACTAAATATGATGCTAAGTGCACATGTAAATGTCCCGTTTTAGCTAAGTCATTAATTCTAGTAGGGGTGCCTATAATCAATTGTGGTTGTGCATTACAACGTTGTCTATCTTTCTCTATATCTGTACCACCAATAAAAACTTTAACTGAAACACCAGCTTTAAATTGGCTTAAATGGTTCGCTGCATCGTATAGTTGTTGTGCAAGTTCTCTTGTTGGTGCAACTACGATTGCTTGTGGTTCTTTTATTTCACTATCAATTAACTGCATTAATGGTAATAAAAATGCATGAGATTTCCCTGTACCCGTTTGAGATTGACCAATTAAATTTGTTCTCTTTAGTATTCTTGGAATAATTCGATTCTGAATTTCAGTTGGTTTTTCAAAATTAAGGTCTTTCACAGCGTCAATTAAACTAGATTCTAGATTAAATTGTTCGAATGGATGTTTTGCCATGATTTGGCCTCCTTATATGTTCATCTTTACTATTATAAAGTATAAATGTGCTATTTTAAATAAAAATATTAAAACCTCGAAATTTCAAAATTTAGAAATCCCGAGATTTTAGTTTAAATATATTGAAATGGATCTGTATTAATTGTAGATGCTTCAACATCTATATTTATTTTTTCTGTATTGAACCAATTCATTAGTAACGTTTTTAAACCTTCTTTCATCACATATTCGCTGTAATGATTAATATCAATTAAATTCACACCATGAATTTTAGCATCTAAGGCATCATGATGTTTAATATCACCTGTAACAAAGACATCTGCGCCTTGTTGGACAGCTTGATATTCATATCCAATACCTGAACCACCAATAATTGCAATACGTTTAATTTTCTGATTAGACTCACCAACAAAACGGACACTTGGGATATTTAATTTAGATTTAATATCAGCTGCGAAATCTTCCAATGTCATTTGATTATCCACTTCTGCCATAACGCCAAGTCCATAAAGGGATGTTTGTTTTATCTCAATAAAATCAAATACCGGTGTTTCATATGGATGGTATTGTTTAATTAATTGCTCAGCCCTTGACTTTTGATATGCATCTATCATAAATTCAATTTTAACTTCATCTACATATTCAATTTTATCAATTTGTCCTATTGTTGGATTAGCTTCACCAACTGGTTTGAATTGCCCTCTTCCTTCACTTTCAAAGAAACAATATTCATAATTACCTTCTTGCGCTAATCCATTTTCACTAAGCTTATCTTTAAATGGTCCAACATTATCCTTAGGTATATATGTTTGAACTTTATAGTATACATCTTGTTGATTATTTATTATTGAAATGTTCTTCAAACCCATCGCCTTCGCCAACATCATATTGACACCATACGGATTTACATCTAAATTTGTATGCATCGCTATTAAATTAATGTCATGTTGAATTAGTTTTCTAATGATCAAACCATAACCATTAGCTTTTAATGATGTTACGCCTTTAAAGATTAGAGGATGATGACTAATAATAGTATTATAACCTTTTTCGATTGCTTCATTTACTACTTCCAACGTACAGTCTAATGCTGTTAAAACACCAGTAACTTCAACATCTTCATCACCTATTAACAATCCTACATTATCCCAAGATTCAGCAGTACTAAATGGCACATGATGATCTAACAATGTCATTAAATCAGCTATTTTCATTACTATAACACCCTTTCAATTACAGCAATTTCGTCATTAATTTGAGCTAAACGTTGATGATGTTGTTCAGTATTGAGTTTCGATTTAATATGATAAAGTGCTTCTAACTCTCTTTGCCATTTTTTTATAAAATATTCATTTTTGTTGTTCAGCAATTTTGGTCCGAATTTCAATTCATCAGATGATAGCTCTATTAATTGTGTAGAATATTCTGCTACAACAATTTCATAAATATGGCCTTTTTCTTCCATTATTATTTCATCAATTATTTCATAATTCAATTGTTGTAATGTTTGTCTTAAATTTTCAGTTTGTATATTACTTTGTAAAATCAACCTTGGATGTTGACTTAACTTATCTTGCCCATCTTTTAAAATTTTAGCAATAAGTGGTCCGCCCATACCACAAATTGTGATATTATCGATTACGTCCTCAGGATGAATAACACTTAAGCCATCCCCTAAACGTACATCAATTCTATCTACTAATTGGTTTGCAGCTACATTTTTCACAGCAGCTTGAAAAGGGCCTTGAATAACTTCTCCAGCAATACCGCATTCGCATAAATGGTTTTGAATTGCATAGATTGGCAAATAAGCATGATCTGAGCCAATATCCGCGATTGTA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_017351|1665212:1673542|1666123_1667014_-|WP_000924214.1|DBSCAN-SWA MLLGSHVSMSGKKMLEGSAIEAHEYGETTFMIYTGAPQNTRRKSIEDLNITKGHEVMEKYGLSNIVVHAPYIINIANTTKPETFNLGVDFLQQEIERTQAIGAKDIVLHPGAHVGAGVDAGINKIIEGLNEVLTNDNNVRIALETMAGKGTEIGRSFEELARIIDGVHNNERLSVCFDTCHTHDAGYNVKEDFDGVLNEFDKIIGVDRIKVVHVNDSKNDRGAQKDRHENIGFGYIGFDALNYIVHHDSFKDIPKILETPYVGEDKKNKKPPYKLEIEMLKQQQFDPELKNKVMQQ >NC_017351|1665212:1673542|1668483_1669584_-|WP_000683933.1|DBSCAN-SWA MKIADLMTLLDHHVPFSTAESWDNVGLLIGDEDVEVTGVLTALDCTLEVVNEAIEKGYNTIISHHPLIFKGVTSLKANGYGLIIRKLIQHDINLIAMHTNLDVNPYGVNMMLAKAMGLKNISIINNQQDVYYKVQTYIPKDNVGPFKDKLSENGLAQEGNYEYCFFESEGRGQFKPVGEANPTIGQIDKIEYVDEVKIEFMIDAYQKSRAEQLIKQYHPYETPVFDFIEIKQTSLYGLGVMAEVDNQMTLEDFAADIKSKLNIPSVRFVGESNQKIKRIAIIGGSGIGYEYQAVQQGADVFVTGDIKHHDALDAKIHGVNLIDINHYSEYVMKEGLKTLLMNWFNTEKINIDVEASTINTDPFQYI >NC_017351|1665212:1673542|1667023_1668370_-|WP_001062180.1|DBSCAN-SWA MAKHPFEQFNLESSLIDAVKDLNFEKPTEIQNRIIPRILKRTNLIGQSQTGTGKSHAFLLPLMQLIDSEIKEPQAIVVAPTRELAQQLYDAANHLSQFKAGVSVKVFIGGTDIEKDRQRCNAQPQLIIGTPTRINDLAKTGHLHVHLASYLVIDEADLMIDLGLIEDVDYIAARLEDNANIAVFSATIPQQLQPFLNKYLSHPEYVAVDSKKQNKKNIEFYLIPTKGAAKVEKTLNLIDILNPYLCIIFCNSRDNANDLARSLNEAGIKVGMIHGGLTPRERKQQMKRIRNLEFQYVIASDLASRGIDIEGVSHVINFDVPNDIDFFTHRVGRTGRGNYKGVAITLYSPDEEHNISLIEDRGFVFNTVDIKDGELKEVKAHNQRQARMRKDDHLTNQVKNKVRSKIKNKVKPGYKKKFKQEVEKMKRQERKQFSKQQNRQKRKQNKKG >NC_017351|1665212:1673542|1669586_1670264_-|WP_000624580.1|tRNA|DBSCAN-SWA MISLNNRLTTVSRFLKQGTIADIGSDHAYLPIYAIQNHLCECGIAGEVIQGPFQAAVKNVAANQLVDRIDVRLGDGLSVIHPEDVIDNITICGMGGPLIAKILKDGQDKLSQHPRLILQSNIQTENLRQTLQQLNYEIIDEIIMEEKGHIYEIVVAEYSTQLIELSSDELKFGPKLLNNKNEYFIKKWQRELEALYHIKSKLNTEQHHQRLAQINDEIAVIERVL >NC_017351|1665212:1673542|1671724_1673542_-|WP_001217257.1|DBSCAN-SWA MRIDQSIINEIKDKTDILDLVSEYVKLEKRGRNYIGLCPFHDEKTPSFTVSEDKQICHCFGCKKGGNVFQFTQEIKDISFVEAVKELGDRVNVAVDIEATQSNSNVQIASDDLQMIEMHELIQEFYYYALTKTVEGEQALTYLQERGFTDALIKERGIGFAPDSSHFCHDFLQKKGYDIELAYEAGLLSRNEENFSYYDRFRNRIMFPLKNAQGRIVGYSGRTYTGQEPKYLNSPETPIFQKRKLLYNLDKARKSIRKLDEIVLLEGFMDVIKSDTAGLKNVVATMGTQLSDEHITFIRKLTSNITLMFDGDFAGSEATLKTGQHLLQQGLNVFVIQLPSGMDPDEYIGKYGNDAFTTFVKNDKKSFAHYKVSILKDEIAHNDLSYERYLKELSHDISLMKSSILQQKAINDVAPFFNVSPEQLANEIQFNQAPANYYPEDEYGGYDEYGGYIEPEPIGMAQFDNLSRQEKAERAFLKHLMRDKDTFLNYYESVDKDNFTNQHFKYVFEVLHDFYAENDQYNISDAVQYVNSNELRETLISLEQYNLNDEPYENEIDDYVNVINEKGQETIESLNHKLREATRIGDVELQKYYLQQIVAKNKERM >NC_017351|1665212:1673542|1665212_1665998_-|WP_001213908.1|DBSCAN-SWA MRGENTMTPVFELKNVNYYYDHKKVLENINIKINKGEFLAIVGPNGAGKSTLLKLILGLLPLQSGEIFVEGIDFKNKKTSIKLSYVSQKANAFNSGFPASVKEVVLSGLTKTKRLFQTFNSKDNEKVIKVLERLNISDLIHKNIAELSGGQQQRVMIARALISEPAVLVLDEPTNGIDAKHVSEFYNTLDQLKQEGITIILVTHDIGVVADTATEVACLNKHLHFHGTTDEFKSLDEVEISKIYGHPVRFVDHQHNRECCN >NC_017351|1665212:1673542|1670394_1671501_-|WP_001283055.1|DBSCAN-SWA MSDNTVKIKKQTIDPTLTLEDVKKQLIEKGKKEGHLSHEEIAEKLQNFDIDSDQMDDFFDQLNDNDISLVNEKDSSDTDEKLNPSDLSAPPGVKINDPVRMYLKEIGRVNLLSAQEEIELAKRIEQGDEVAKSRLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNMGLIKAVEKFDFNKGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVQRQLLQDLGRDPAPEEIGEEMDLPAEKVREILKIAQEPVSLETPIGEEDDSHLGDFIEDQEAQSPSDHAAYELLKEQLEDVLDTLTDREENVLRLRFGLDDGRTRTLEEVGKVFGVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKRLKDFMD |
7 | Staphylococcus_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1742858 : 1751901
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_017351|1742858:1751901|DBSCAN-SWA ATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATTTCAATTCAATTATAAATGCAATACCTACTACGATACCGCCTAATTTTTCAACTAATTTTATTGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTTAAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCTAACAGGTGCAAAGCCAATCCCCATTGAATAAGCTACAGGACAGCCAATGATAAAGCCACGCGCTTCAGGTCCTACAACGATATCAACATCTCTGTCTTTTGCGTATTCTACAATTTTATCTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATAATAATTGCTTTTCAACATCCATACGTTGTTGTCTTAATTGATATACTTTGCTGGAATCAATCGATCTTTTATCAGGTTGTTGATTGATTCGAATTAAACCATCTTCTTGTGTTACAAATTTTAAGTCTAAGAAAACTTTCAACATGAATTTAAGTGTATCTGGTTTCACACTTAAATGTTGACACAATAACATACCCTCTTTCTGGATATTTGTTTCTTGTTTAGTTATTAATGCTTTATAACACTTTTTAAAAATATCCATATTAGGTATACCATCGAAGTAAATCGAATGATTATGTTGCAAAACTATATAAAGTTGAGAAAATTGCAGTTGTTGCAAGGAATTAGACAAGTCTTCCATTGACGTTGGTAAATCTCTTAATACTACTTTATCAGTTTGTTGTTTAATTTCTTCACCATAATAATATTCATTCGCATTTACTTTATCACTTTTAGGATGAATAAGCACGACAATATTTTCATCATTTTCTGTAAAAGGTAAACTTTTTCGCTTACTTCTATAATCTAATATTTGCTGTTCATTCATCGCAATATCTTGAATAATTAATTGCGGTGATTGATTACCATTCCATTCGTTGATTTGAACAGATCCTAATATATTAATTGGCTGTTCATCTTGTAACTCAGGTTCTAAGTGACCATTTTGCCAAAATAGCGCGGCGATATTACTTTCACCAAGTGTCAATTTTAGATGATTTTTTTGTTGACCTATCGCCTTAACTGAAGAAACTGATAAATCATCCATTTCAAAAATAGGTCTAGAAAAATCTGTTCCGAAGGGTCTTAAACGATTCATATCACGAATATTTTTAATCGTTATATCATTTTCTGTTAATAATACATCTACTTGCTTTACGGGATCTAACGAAGTTGTTTTAGATAATTCTTTCATCCATTTATTTAAACCTTCAGCTAACGATTCTATATTTTCAATATCCATCGTCATACCTGCAGCCATATGATGGCCGCCAAATTTAGCGATTAACTCTTGATGTGCTGATAGTATTTCAAACATCGACACTTGATCAATTGATCTGGCGGAACCTTTTGCATGATTTTGCTCCCTATCAATATTTAAAATTAATGTTGGCAAAGCAAATGTTTCGACAATTTTCGAAGCAACAATACCTAAGACACCTTCATGCCAATTTTCTTTTGCTAAAAGTAAAAATAAATCTCCCTTTTTAACTTTCGTTTCTGCCATAGCCATTGCTTCTTCTGTGATAGTTGCTACAATATCTTTTCTTTCACGGTTAAAATGTTCAACTTGTTCTGCTAAAAATGCAGCTTCTTCTTCGTCGTCAGTCATCAACAATTCGCAAGCTAATGATGCGTCATCTAAACGACCTACAGCATTAAGTCTAGGTCCAATAATAAAACCAATTGTTTCTTCATCAATATTGTCATTGTATCCCGCTTCTTTTAGCAATGCTTTAACAGAGGTCGGACATTGATCATTCAAGACTTTTAATCCTTGTTTCACTAATGATCGATTTTCATCAGTTAAGGATACTAAATCCGCAATGGTACCTATCGCAACTAATGCTTTAAAATAATCAGGTACATTTTCAATCAATGCTTGTGCTAATTTATACGCAACACCTGCACCACACAATTGTTGGAACGGATAATTAAACGATGGATGCATTGGATGTACGATTGCATATGCTTCTGGTAATGTACTACCAATTTCATGATGATCAGTTACAATGACATCAACTCCTAAATCTTGAACCATTTTAATTTCATTATGACCTTGTATGCCATTATCAACAGTTATGATTAATGTTATGCCTTCATCATGAGCATTTCTAAATGCTAGTTCGTTTGGTCCATATCCTTCGGTAAAGCGGTTAGGAATATGCCATCCTACTTGTGCACCTAAAAGTTGTAATGTTGTCACTAAAATTGTAGTTGAGGTAACACCGTCGGCATCGTAATCACCATAAACTAGGATTTTCTCATCATTCGCTATCGCTCTTTTAATTCTTTCAATAGTCTTAGTCATATCGCTCAATTGCAGTGCATCATGATTGATATCTGTATCTGAAATGATGGATTCTATTGCTTGTTCATCAATAATCGATTTACTTTCTAATATTTTTTTTACGATTGGCGTTAACTTTAATTTTGATGTTAATTCATCACTTATGTATTCAGCTGGTTTAGTTAATTTCCACTTATACTTCGGTTTAATCATATATATTTACGCCTCATTTCCAAAAGACATTATATCTAAAATTACTTTAAATAAAAAGCACTTATCTAAATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTATATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATGTGAACTCTTTATTGTTTCACATACCGCTTAATTCATTTTAAACTAAAATCTTTTCATCGTTCGATTTCTTTTCTTTATATACAACTAATTTGTGTTTCGGCGATTTTTTCAACTGACGTTTTTTCATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGCGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCAAACGTTACGATTGTATCATTAATTGAATAACCGACAATTGTTAATACAGCGGCGATAAATGTTAAATCTACTTCAATTCTAAATAAACTGAAAATCGCTACTATAATGAATACATCATGTAATAATGCCAATACAGATGAAAGACCCATGCGCCATTCAAATCGTAATGATACATAGATGATGATACCTATCGATGCATAGATTAATGCAAGCATTGCATTTTTTGCTAATTCCTGTCCAATAATTGGTGATACAGTATTAATTTGAGGTGTGTCACCGAATTTCGATTTAATATTATCACTCAATTTATTATCTTGAGCACGCGTTAAATCGTCTTTAAATTGAACAGTTGCTACTTTATTATCTTTACCATTGATTTGAATTTGATCCGCTTTAAGTCCACTATCTTTTACAACTTGCTCAACCTTTTGTTGAGTAATTGCTTGTTTAGATTGGAAATCTACACGTGTACCACTTGAGAAATCAATTCCTAAGTTTAACTTGAAGATATAAAGAATAACTAAACCGACAACTACAATTAAAATACTTACTCCAATTAATGGCTTAGCTAATTTAACAAAATTCCATTTCTCGAATGAAGTTTTAAGGTCATGAACATCTACACCTTCATTAATATCATGTCGTTTATTCTTTTTAACACCAAATAACCAAAATTGATTTTTGAATATATTTGATGAAACAAGTAATGATAATAAGAATCTTGATAAGAACACGGCTGTAACAAAGATCATTAGAATACCTAATAATAACATTGTCGCGAAACCTTTAACTGAACTTTCACCGAAGAAGAATAATACTGCTGCGGCGATAACTGTTGTTAAGTTAGAATCAAAAATTGTTAGGAATGAACTTTTGTTTGCTTTAGAAAAGGCTTGCTTTATCGTTCTACCTATTCGAAGTTCATCCTTAATACGCTCATACATGATAATATTGGCATCTACAGCCATACCTACACCTAATACCAACGCCGCTAATCCTGGTAAAGTTAGAACCCCGGAAATGAAATTAAATGCTACTAACGTTAGATAGATATAAGTTGTCAATGCAATAATCGCTACTAAACCAGGTAATCGGTAGAATCCAAGCATGAATAAATAAATTAATGCTACACCAATAAACGATGCAAACACAGTTTTATCTAATGCATCTTGACCAAATTGGGCACCTACTGAGTTTGAATAAATTTCTTTCAAGTCAACTGGTAAAGAACCTGCATTTAACAATTCGGCGATTTGTTTTGCTTTTTTAACGCCTTCTTGTCCTTTAAATCCACCCGAGATTTCTACGCTATCAGAATTGATTGGTTGATCAACACTTGCTGCAGAAATAAATTTAGGGTTTTTCTTTTGTGCTTCTTTTTTATAGCTGTCACCTTTTTTGAAATCTAACCAAACAACCATGACATTATCACGTTTCTTAGAGATTTCTTCCGTTACTTTTTTAAATTTGTTTTTGTCTTTTACTTTAAAAGTAACTGTAGGCTGGTTTGTTTCCTGTTTAAATTCTTGTTTGGCAGATCCCTGTTTAATATCAGAACCGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGAACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCTTTTTTATCTATTTTGTCGCCTTTATTTAAAGGATCGACTTGATAAAGCACCTCAAATCCACCTTGCAAATCAAGTCCTAAATTGACATTCTTTATAACACTTTTATAAGTTGCAGCCATTCCGGCAAACAACAATACGACTAAAAGCAAGAACGCAATTATTCTACTACTTTTCTTCACATGAACACCTCATTATTTACGTATGTATTTAGAATACTTGAATACTATTTTATAACGCAAGTTAAATCTTTCTTACAAAATTTATTAGCCTTATACATATTAACATACTAGAGCAGGGAGTAAAAATAATCATAGATATATTTAATTTAAATTTAACAATTATTATGTATCACAATTTCTTTTTTTGGAATAAAAATAAGCTATTCTACATACTACTTATAACTTAAAAAGGATGAAACGCTATTCGTTTCATCCTTTTTAATACCACTTCTCATTATGAAGGGTCAACTTGTTTAATAGCAGGTTTTTCGAAAGTTAATTCAGTACCATGACCATTAACTGTAATAACAACAGTTGTTTCATCTACTGCTTTAACAGTACCTTTAATACCACCAATAGTTGTAATTCTTTGACCAGATTGAATGTTATTAATCAACTCACGATGCTGTTTCGCACGTTTTTGTTGTGGTCTGATCATCAAGAAATACATAACCGCAAAAATTACGACTATATATATTAGTAATGAAAATTGCATTTTATACGCTCCTCTTGCTTAAAAGTTTTTTGGGTTCTCAACATTTAATCCATATTGCTCGAAGAATTCTTCTTTGAAATCTAAAAGACGATCTTCTCGAATGGCTTGTCTTATATCTTCCATTAATTTTAGCAGAAAATGTAAATTATGAATAGTAGTAAGACGAATACCAAAAGTTTCCTCTGCCTTGATTAAATGACGTATATACGCTCTTGAATAGTTTTGACATGTATAACAGTCACAATTCTCATCTAACGGTCTTAAATCATCTGCAAATTTTGCATTTTTAATAACTAAACGACCTTGCGATGTCATACAAGTACCATTTCTGGCAATACGTGTCGGTAAGACACAATCAAACATATCCATGCCGCGAATACTACATTCGATTAACGCATCTGGAGATCCTACACCCATTAAATATCTTGGTTTATCTTTAGGCATAAACTGCTCTGTATGTTCAACCATTTTATACATAACCGGTTTAGGTTCACCAACTGACAAACCGCCGATTGCATAACCAGGAAAATCTAATTCTACTAAATCCTTTGCACTTTGTTCTCTTAAATCTTCATATTCGCCACCTTGTATAATGCCGAACAATGCTTGATCTTCAGGTCTTTGGTGTGCATCTAGACATCGTTTCGCCCAACGTGTTGTACGTTCAATAGATTTTTTTACATAATCATATTCAGCCGGCATCGGTGGACATTCATCAAATGCCATCATAATATCAGAACCTAAATCATTTTGAATTTGCATTGATTTCTCAGGACTCAAAAATAATTTAGACCCATTAGTATGATGTCTAAATTCCACGCCTTCTTCTGTAATTTTACGTAAATTACTTAAACTAAACACTTGGAAACCGCCTGAATCTGTAAGAATCGGACCATCCCAATTCATGAATTTATGTAATCCCCCAGCGTGTTTGATAATATCATTTCCGGGTTGTAACCACAAATGATATGTGTTGCCCAAAATGATTTTTGCTTCAATTTGTCTTAACTCTTCTGGACTCATTGTTTTAACGGTTGCTTTAGTACCAACTGGCATAAACATAGGTGTTTCAAATGAACCGTGTGGTGTGTGCACGATACCTAAACGCGCACCTGATTGTTTACAAGTTTTAATGTGTTCGTATGTTACTGCAGGCATATTCAAAATCCTCACATTCTTTTTATATAATTAACATTGCATCGCCAAAACTAAAGAATCTATATTCTAAATTTACTGCCGTTTTATAAGCATTCAGAACATTTTCACGAGTACTAAACGCTGATACTAGCATAACTAATGTTGATTTTGGTAAATGAAAATTAGTAATCTGGCCATCAATTGCTTTAAAATCAAATCCTGGATAAATAAATATATTAGTCCAGCCACTCGTTTCAACAAATTTATCATGATCGCGTCGAATTGTTTCAAGTGTACGTGTTGAAGTTGTACCAACTGATATAATGCGATGTCCTTTGGACTTAGTATCATTTAATAAATCAGCTGTTTCTTGTGTCATTTGATAATATTCACTATGCATTTCGTGGTCATTCACATCATCGACGCTCACCGGTCTAAACGTACCTAACCCAACATGTAATGTAACAAATGCGATATTAACACCTTTATTTTTAATTTCAGTTAATAACTCATCAGTAAAATGTAATCCTGCTGTTGGTGCTGCCGCTGAACCACTTTCTTTAGCGTAAACTGTTTGATAACGATCTGGATCATCTAAACGTTCTTTGATGTATGGTGGCAGTGGCATTTCCCCTAATTCATCTAATCTTTCTTGTAAAATACCTTCATAATGTAAACGCATGATGCGTCCACCTTGATCCATTTCTTTTATGCATTCAGCTATAATTTTGCCATTACCAAAATTCAATTTATTACCAACTTTAATACGCTTAGCTGGTTTCAGTAAGACTTCCCAATCATTACCTTCAATTTGAGTTAACATTAACATTTCAACTTTTGCACCAGTTTCTTCTTTTAAACCAAAAAGTCTAGCTGGCATTACTCGCGTATCGTTAAGCACTAATGTATCACCAGGTCTAAAATACTCAATGATATCTTTGAAATGTAAATGTTTCATTTCACCAGTTTCTCTATCCATGACTAATAAACGACTATGATCACGATCTTTTAAAGGCGTTTGAGCAATTAATGATTCTGGTAAGTCATAGTCAAATTCTTCAATATTCACGTTATTCTCTCTCCTCATTCGACTTTGCAAAATGTTCATAAGCTAATGGTGTTGCTTTTCTGCCACGTGGCGTACGTTCTAAAAAGCCTTTCTGAATAAGAAATGGCTCATAAACGTCCTCAATTGTAATACGTTCTTCACCAATTGTTACGGCAATCGTATCTAAACCAACAGGTCCACCATTATACTGCTTAATAATACAGTTCATCATTTTATGATCAATGTAATCTAGTCCGTGTTGATCAACTTGAAGTAAACCTAATGCGTGCTTCGTTGTTTCAATGTATATTTGTTCATCTTCATTCACTTGCTGGAAGTCTCTTACCCGCTTCAATAGTCGATTTGCTACTCTTGGAGTCCCTCTAGAACGTTTAGCAAGTTCAATGGCACTTTCTTCATCAATACCTGTGCCTAAAACCTCAGCTGTTCTAATAATGATTTCTTTTAAATCTGATTCATTATAATATTCTAATCTTAAGTGCACACCAAATCGATCCCTTAGTGGACCTGTTAAGCTGCCAGCTCGCGTTGTTGCACCTACCAAAGTGAATGGAGGTAAGTCGATACGGATACTTCTAGCCTCATCGCCTTTACCAATGATAATATCTAAAAAGAAATCTTCCATTGCAGGGTATAACACTTCTTCAACAACACTACTCAGTCTGTGTATTTCATCAATAAACAAAACATCTCCAGGTTGAAGTCCTGATAAAATTGCAGCCAAATCACCAGGTCTTTCTAATGAAGGCCCTGATACTGTACGTATATTAACTTCCATTTCATTGGCAATGATATTAGATAATGTTGTCTTACCTAATCCAGGGGGGCCAAAAAGCAATACATGATCTAATGGTTCATGACGAAGTTTAGCCGCTTTAATAAATACTTCTAAATTACTTTTTATTGAATTTTGACCAATATATTGTCGTAATCTCGTAGGTCTAAGCGACAATTCGAAATCAGTTTCTTCACTATGCATTGATTGATCAACCATACGCTCATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_017351|1742858:1751901|1748428_1748689_-|WP_001160682.1|DBSCAN-SWA MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS >NC_017351|1742858:1751901|1749869_1750895_-|WP_001019178.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLTEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETADLLNDTKSKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDHDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSTRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII >NC_017351|1742858:1751901|1742858_1743377_-|WP_000364542.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATDKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE >NC_017351|1742858:1751901|1745874_1748154_-|WP_000749795.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQFWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV >NC_017351|1742858:1751901|1743398_1745672_-|WP_000594999.1|DBSCAN-SWA MIKPKYKWKLTKPAEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESIISDTDINHDALQLSDMTKTIERIKRAIANDEKILVYGDYDADGVTSTTILVTTLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSTLPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNDQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDDEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAETKVKKGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIENIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKQVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGSVQINEWNGNQSPQLIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVVLRDLPTSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDIFKKCYKALITKQETNIQKEGMLLCQHLSVKPDTLKFMLKVFLDLKFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS >NC_017351|1742858:1751901|1748707_1749847_-|WP_001112045.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF >NC_017351|1742858:1751901|1750896_1751901_-|WP_001005767.1|DBSCAN-SWA MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDEESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDTIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERE |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1875484 : 1947654
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_017351|1875484:1947654|DBSCAN-SWA 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69 | Staphylococcus_phage(94.64%) | tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
2031024 : 2125021
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NC_017351|2031024:2125021|DBSCAN-SWA 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111 | Staphylococcus_phage(85.53%) | holin,capsid,portal,terminase,tRNA,integrase,tail,protease,head | attL 2027523:2027544|attR 2114158:2114179 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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