Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_016937 | Francisella tularensis subsp. tularensis TI0902, complete sequence | 0 crisprs | DEDDh,cas9,cas4,csa3,cas3 | 0 | 0 | 4 | 0 |
1. NC_016937
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0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
208877 : 270266
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_016937|208877:270266|DBSCAN-SWA AATGAGTAGTAAATTAAAAGATTTGATAAAAACAACGATAAAAGAATATTTAGAAGCTAATGATATCACAGTTAAAGATGCTATTAGAGGCAAGATTAGAGAGCAGATTAGTGAGTTTTTAGGCGAGGTAAGCGAGATAAATGAGCAGGTTAAAGAACAAATTTCAGCGCTTGTGAAAAAGCATGTAACAGAATTACAAGAAAGCTCACAAATTGCTTTAAGAAAAGAAAAGCTAAAAACTTTAGCTCAGCAAAATAATGGCATAAGCCATCCAAATAGTTTCCGAAGAAATGCTGTTGCTATAGAGTTACAGGCTCGCTATGCTGATAAGACTAAGCAAGAATTAGAAGAGCTAGATAATAAACAACAATATAGTTTGACAGGTAGAGTAGTTCTACGCCGTGTCATGGGTAAAGCATCTTTTATAACACTACAAGATTATACTGGTAGAATCCAAGTTTATCTAAAAAAGAGTGACTTGCCAGATGGGCAATATGAAACTTTTAAGAATCTATGTGACTTGGGTGATATAGTTGGTATTACTGGTACTATGTTTAAGACAAATACTGGTGAACTTTCTGTTGAAGCAAATCACTTTGAGATTTTGACAAAGGCAATTCGTCCTTTGCCTGATAAATTCCATGGTTTGGCAGATCAAGAAATGAGATATCGTCAAAGATATGTTGATTTAATTACAAATGAAAAGGCAAGAGAAGTCTTTAAAGTACGCTCAAAAGTTGTGAACTTTATCCGTAACTATTTTGATAGACTAGATTTTATGGAAGTAGAGACGCCGATGATGCATGTTTTGCAAGGTGGTGGTGCTGCTAAGCCATTTAAAACTCATCACAATGCTTTGGATATGCCTTTATATTTGCGTATTGCTCCAGAACTTTATCTAAAAAGACTAGTTGTTGGTGGTTTTGAGCGAGTTTATGAGATAAACCGTAATTTTAGAAACGAAGGTGTATCTTCACGCCATAATCCAGAATTTACAATGCTAGAGTTCTATATGGCGTATGCTGATTATAATGACCTTATGGATCTAACAGAAGATATGCTATCTAAACTTGTACAGGAAGTAATTGGTAGCGAGATACTTGAGTATGGTGAGTATAAAATCAACTTTGGTGGTAAGTACGAACGAATCTCAATGGTTGACTCAATTGTTAAGTATAATGATGATATTACCAAAGAAGATTTAGTAACATTTGAATCTGCTAAAAAGATTGCTGAGAAACTAAAAATAAAAGTTGAAGCTTACCATGAACTTGGACATTTGATAAACGAAATATTTGAAGAAACTGTCGAGCATCAGCTTATTCAACCGACATTTATTACAGATTATCCAGCTGTAGTTTCACCATTGGCGCGTAGACAAGACGGTAACCCTGAGTTTACCGATAGATTTGAGTTCTTTATTGGAGCACGTGAAGTTGCTAACGGCTTCTCTGAGCTAAATGATGCTGAAGATCAAGCAGAGCGTTTCAGAAAACAGGTTGAAGCTGCGGCATCTGGAGATGATGAAGCTATGCCTTATGACAAAGACTATATCCGCGCACTAGAGTATGGTATGCCTCCTACAGCGGGACAAGGAATCGGTATTGATAGACTGGTAATGTATCTAACAAACTCTCAATCAATTAGAGATGTGATTCTATTTCCGCATATGAAGCCTGAGTAAAATATGTCAAAAAAAATTACTAAAATTTTTATTTAAAAATATTTATAGTCCAGATATTGTTTCTAAAAAATTTATTCAAAAGTTTGTACACGCAGATTATAAGCAAATTGTTGATGGTCATGAAATTGATTATGATGGCTTTTTTAAGCATATCAAAAAAACGACATAAAATAGTTTATGGTGTTTTATATATCTAGTTGAAGAAAATTATACTATAGCCTCTTTCCATAGAGTATATGCCTCAATTAAACCAGATAATTCCAAGTTAATAGCGAAAAAAGTTCTGATATGCTGGTTCCTTGTGATGAGGATACTAGGATTATTCATGGTAAGTCTAAAGATAAAGATTTAGGGCATAGAAAATAATATAAAGAAACTTATTAATTAATGATCATCATCATAGCTAGCTTTATGAGATTTACCTTCAATAAACGAAGTAAATGCGATCAGTAATGCAGATACTACAAATACCATATGTATAGCGGCAGACCATGCTAAATCTCTGTCAGTTGCCTGAGAAACTTCTAGGAACTTCTTTAAAAGAGAAATAGAAGAAATACCTATAATTGAGCCAGCGATCTTTAGTTTAACTGCATTTGGAGATAACTTTTTGATCCAAACAGGTTGGCCACCACTTTTTTTATCAAGGTTCATTTTACTTACGAAGTTTTCATAACCACTAATGACTACAATTACTACAAGGTTTGCAACTAGTACAACATCACATAGTGTTAGAGCTATTATAATAAGTTGGTCTTCATCAATAGTATGGTAATGAGTAAATAGATGATATAACTCATGATATATTTCATAGATAAAACCAAATAGAACTAGTGATAAAAGTAGATAAATTGGTGCTTGAATCCAGCGAATCCCAAATATGAACATTTCTATTATTGATAATATTTTGTTTATAAATTTACTCATCTACTAATCCTTTTTGAACTTCGTGAATTATTTATTAGTAAAGATATATAAATTTAAAATTAAAAGCAATAAATATTTGTTTATGAAATTATGAAGTTTTACAATGGATAAGCTTTAGCTAGTATTGGGTAAGTAAAGAATATAAACTGGCCAATATTGACAAGATAATGACAAATAATACTCGCTTCTATCTTTCTGGTCTTAGAGTATGCGGTACCATATATAAGGCTAGCTATAAATGCTAGCAAGGCAAAACGAGTTCCTGCAAATGCGATATGAATAAATGCAAATGCAAATGATGTTATTATTATAGCTATAATTGAGTTAAAATATTTTTCGAGCCTAGATTGAATAAAACCTCTCCAAAAGATTTCCTCAGGTAGACATGTAAATATCAGATTTACAAAAATAAATACTAAAGTATATTGCGTGAGTTTAAAATCAAATCTAATGAAGTCAAATAAATAGCTTATGAGAATTAAAATAAAAGATGCTAATAAACCATAAAAAATACCTGATTTTATAACTAGTAGTAGTTTATTTGAACTTTCTAAAATCCCAATTTCTGATGAAAAAAGTAATAAAAAATATGTTGGTATAATAGAGCTATAGTTTAAATATAAGCTAATAGCTATAGCATCTTGTGAAATTTGAGCATTTTTAATTATACATATGTTATTAAAGCCAGGAAAAAAATGCATGTAGTTAAGAAATAGAATCACTGCAGAAATAATAAAGAAAAATAAACTAACTCCTTTTTTATCTTTAAAATAAAAACTCAAATAAATAAGAATACCTATTACGCAAATAACTAAAAGACCTGTTAAGTTTAATACTCCTGATAGGAGTGCAAATACTAGAGATGTTGTAATTGTAATATATCCAAATATTCTAAACTTTATCATCCATAAAGATAAAAGCGAAACAATAGCTAAGATATACGCTAAGTATATGAATAGTAAATTGATCATAGGCTAATTTAAGTTCTGTCTAACAGCTCAATTATAGAAATATTATTATTCATTATAGCATCATCTAATGGCTTTTTACCCCATCTGTCTATAGCATTAATATCCGCTCCTTTGCGGATAAGGTATTTAACAATATCTTCATGACCTTCAGCAGCGGCTAGGTGAAGAGCTGTTCTTTTATCATAATCACCTTTGTTAATATCAACACCTAAGGCAACGGCTCTTTTAATCTCTGATAAGTCACCGGCACTTGCTGCCCAAATTAGTTCAAATGTTAAATTTGATTCGACAACCATTCTATTCTCAACGGGATTTATTTTGTCACAATGAGTTATATGATCATAGTTATGGAAACTAAACTTCTCTATTAGCCTTTTACTAAATTCAACACCTCTTACGGAGTTATGATTAGGGTCAAGTCGAGGAGAAAAAATTGCAAAACCACCAACATTTGGAATAGCTATAGCTAGAGCTCCTGACACCCCTGATTTTGCAGGTAATCCAACAGAGAACGCATATTCACCTGAAAAATCATACATCCCACACGAGTACATCATTGATAAGCAATTCCGAATCGTTGTTGGTGAAAATATTTTTTTACTAGTAAAAGGGCATACTCCGCCATTAGCTATGGAAGCCATAATTTTTGCCATTTTTTTTGCGTTAACTTGAATAGAGCAAGTTTGGAAATAGAAATCTAGAGCAGTGTGGATATTTGTGCCCTCTGGAAAAGCACCTACTTCTTTCATAAAATGAGCTAGAGCATAATTTCTATCTGCGGTCTCTTTTTCGGAGTGATATACAGCGTTATCAAAGCCGATAGGTTCGCCACCTGCTAGATCTTGCCAAACGTTAGTAATATATTCAAATCTATCAGCAAGATTCCACTCCGGTTTTATTAGTGAGCACATCATGATAGCGCCGGAGTTTATCATTGGATTATGAGGTAGGTCATACTTGTTTAATGCTATAGCATTAAAAGTAATACCACTTGGTTCTCTGCCAACATGTTGATGAACTTTATCTTCGCCATTTTCTTCAGTAGCTATACAATATGTGATAGTTTTTGCAGTTGATTGTACACAGTATGGTTGTAGATAATCTCCTAAGGTAATTATTTGACCATCAACACTACAAAAAGCCACAGCAAAAAGATTAGGGTCAACCCTTGCTAGTTGAGGAATATAGTTTGCGTTTCTGCCTGTTTCATTCTTTTTAGTTTCGTTATATATGGCTTCAATTTCTTTTTTGAAATCCTTAAAGTTGGGAATGATAAAGCCTTTATTAATAGCTTTTTCGATAAGACCTATATTTTCAAAAGTAATTTCTTGAAATGTATCAAAATCAATCTTATCAATATCACAGAATTTATTTAATTTGGCGATTAATTTAGTAATGCGAGGATCATCATTGCTAAT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58 | Morganella_phage(23.53%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
351113 : 384421
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_016937|351113:384421|DBSCAN-SWA 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30 | uncultured_Mediterranean_phage(25.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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| DBSCAN-SWA_3 |
1624588 : 1683753
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_016937|1624588:1683753|DBSCAN-SWA 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58 | Erysipelothrix_phage(33.33%) | tRNA,holin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
1739128 : 1747948
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_016937|1739128:1747948|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_016937|1739128:1747948|1739128_1739743_-|WP_003022621.1|DBSCAN-SWA MSEYSLFVMLCVIAAISSYFNLRFLKLPKAIGLTVVSALISLMLVVLIKLEPKLFYPAYHMLNSIDFKILVLKVLLGYLLFAAAMHLNFLEIKNFLASIFVLSSLGVVVSTFIIGTLCWLAAPIVIKHDVSYIYCLIVGAIFSPTDPVTVFAVFKTSKSVPMRVKSILSGEAMFNDVFSIVIFLILLSLVISGKSDIVNPRVFC >NC_016937|1739128:1747948|1743458_1743977_+|WP_003014032.1|DBSCAN-SWA MSLEILKYPHPVLKEVAKEVTKDEINDDLRATIAEMHELMLEANGVGLAAIQVGIKKRFFIMYDNLEEQNPEIITIINPEIIEQNGKIIDEEGCLSFPGVSAKVNRATVVKIKALNEFGEEIEVEKDGFLARCIQHEIDHLNGITFFDHLGSLKRKMIEKKYKKLMQENAKS >NC_016937|1739128:1747948|1741791_1743003_+|WP_003022626.1|DBSCAN-SWA MFEQIKNNVENAIEALKQGKPVVVLDDYDRENEGDLILPGQKATEENIAFMLEHTSGIICLAMDSKKARELNLTPMVAADQNNSTFTTPFTVTIEAKEGVTTGVSAKDRAHTIQVASKADSKAEELARPGHIFPLIANDKGVLGRNGHTEATVDLMKLSGFNSAGVLCELMNKDGTMMKAAELEAFAKKHDLPLLTIAELYQYRLATENFVTKMASSTIPFKKIGELEMSVYKDNFSGDEVVVLSKPYSGNNPLVRMHSSCITGDIFGSLRCDCQDQLHKGIEMISEEGGFFIYLDQEGRGIGLTNKLKAYNLQMNENMDTLEANLALGLPADARKYDLAIQVLKYNNVNRCRLISNNPEKLAALRNVDIETQPVYCEAFVNSHNRNYLITKKIKAKHTIKGI >NC_016937|1739128:1747948|1740133_1741201_+|WP_003022623.1|DBSCAN-SWA MKNIDKYYMQQALTLANRGRLTVSPNPMVGCIIVKNGAIISEGWHETVGEAHAEVHALTKAVDKAKGATAYVTLEPCCHCGRTPPCTDTIIKAGIKKVIIATLDPNPKVAGKGVERLKNAGITVEVGLLEKQAQELNKIFFHYQTTKKPFVYAKWAMSLDGKIAVNDGDSKKISSHQAFVNTHELRNICDAILIGKQTLIDDNPSLDVRININKIKHPTRFILANHLTTINHNWRVLDQRHAKTIFVCSKISARVATKLNQLGIEYWLLPQSQHQVCLDTLLEKMGKIGITSLLVEGGNKTLNSFINQKLVNEFYTYLAPVIIADYNPKQQLSFNQISVREDIIINSCFKENSNV >NC_016937|1739128:1747948|1743012_1743456_+|WP_003017614.1|DBSCAN-SWA MRKLAIVVSEFNSLITDKMLEGALEEAYAQGLKDSQICIKKVPGAVELPYAAKLLAETKEFDAIVLLGCVIRGETDHYDYVCDQVSYGTQKVMHQYNLPVIFGILTTHNKEQALERVGGKKGHKGKYSIQAAITMAKMKKDILEQGV >NC_016937|1739128:1747948|1741193_1741799_+|WP_003022624.1|DBSCAN-SWA MFSGIVQQLGTIKKITTKDSLKTFCIKFDNSLQCSIGDSVAINGTCLTVTKLDKQNLTANFDAVPETLKKTNLDTLKENQLVNIELAMRYGDHIGGHMVQGHIDEPGQIKSIQNVGGAWLIEISASREFLKYLVKKGFVTIDGMSITVINVLKDSFTVTLIPHTIEVTIAKNYSNGSMVNLEADATGKYIYKYIQGFKENV >NC_016937|1739128:1747948|1745070_1746150_-|WP_003022640.1|tRNA|DBSCAN-SWA MENKKVIVGISGGVDSSVSALLLKQQGYDVTGVFMKNWEEDDTDEFCSAEQDIADAQAVCDSIGIPFKKINFAAEYWDNVFEHFLIEYKAGRTPNPDILCNKEIKFKAFLSYVHLLGGDYIATGHYAQTRLAADGSVQLVKGLDDNKDQTYFLYTLGQEQLRQTIFPIGNIEKSKVREIAKENNLVTFDKKDSTGICFIGERKFKEFLSKYLPAQKGEIHDENGIKIGMHDGLMYYTIGQRQGLGIGGVKDRPEVPWFAAKKDLENNVLIAVQGHDHPLLFKQSLQAIELSWVAGMAPADKFRCAAKVRYRQKDQSCEVEVNQDGSVNVTFDQPQRAITPGQSVVFYIDDVCLGGGVII >NC_016937|1739128:1747948|1744058_1745051_+|WP_003022628.1|DBSCAN-SWA MEFSMRNIFKKTLLILLLSVIIASCGMLSNDQFVYLGHGENSPDYQLYYDKTQKLFVLIDKRNGCFQKDDTGTCLAFTLKQAREFREYVLAKMIEIDVRLAKDDYGNYAIEELRKAGVTTVNKPIKTKKVFATPVKQIVLDRKQQYHLVRKEYEIDSNLVAMVVNDKEGKKRIKVAYTVDFPGLEKEYSTELRPFIIDPEYLYTHMTIDAVHEAQFMQRDVMKSQTNVKKKVDDYLKDVVDSDKKDTGYTHQEVASSVAALDNDLITKADEQREDKETTLASGSSISTIAKKPINQESSGSTIQTATKTASTTQVDSNDTPKTTLASDNK >NC_016937|1739128:1747948|1746163_1747948_-|WP_003022642.1|DBSCAN-SWA MKNIRNFSIIAHIDHGKSTLSDRFIQVCNGLSEREMKEQVLDSMDIERERGITIKAQSVTLDYTARDGQTYQLNFIDTPGHVDFSYEVSRSLAACEGALLVVDAAQGVEAQTVANCYTAIEQNLEVIPILNKIDLPSAEPDRVAQEIEEIIGIDATGATTCSAKIGIGVEDVLETIVAKVPAPEGDVNAKLQALIIDSWFDNYLGVVSLVRVKNGTIKKGEKFKVMSTGVAYQVDRLGVFTPKMKDLDHLKAGEVGFIVAGIKDIHGAPVGDTLTHAHNPTDKPVPGFKKVQPQVYAGMFTISSDDYPDFREALEKLSLNDASLFFEPEVSQALGFGFRCGFLGMLHMEIIQERLEREYNLDLITSAPTVVYKAIKKDGEIIEVDNLSKLPEPGAIAEIQEPIVRANILVPKDYVGSVITICIEKRGVQVDLNYVGNQVSITYDLPMIEVVSDFFDTLKSVTKGYGSLDYELIRYEPANMVCLDVLINGDKVDALASIVHKDQAKYKGRELVERLKELIPRQMFEVAIQAAIGGTIVARSTVKALRKNVLAKCYGGDVSRKKKLLEKQKEGKKRMKNIGSVEIPQEAFLSVLKK |
9 | Indivirus(28.57%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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