Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_017024 | Enterococcus faecium Aus0004 plasmid AUS0004_p3, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NC_017022 | Enterococcus faecium Aus0004, complete genome | 1 crisprs | DEDDh,cas3,DinG,cas2,RT,csa3,cas14j | 0 | 0 | 12 | 0 |
NC_017023 | Enterococcus faecium Aus0004 plasmid AUS0004_p2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NC_017032 | Enterococcus faecium Aus0004 plasmid AUS0004_p1, complete sequence | 0 crisprs | cas14j | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_017022_1 | 2469810-2469919 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_017022_1
|
1 spacers
spacers of NC_017022_1
>1.1|2469836|58|NC_017022|CRISPRCasFinder CCTATTCACTTCGTTCATAGTGATTCTACTCGCTTTGCTCGAAAGGAAACTCCTTTCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017022_1
The CRISPR arrays of NC_017022_1 >merge|NC_017022|1|2469810-2469919|CRISPRCasFinder CTTTGCTCAACCAGTATTATTCATCACCTATTCACTTCGTTCATAGTGATTCTACTCGCTTTGCTCGAAAGGAAACTCCTTTCGCTTTGCTCAACCAGTATTGTTCATCA >NC_017022|1|1|2469810-2469919|CRISPRCasFinder CTTTGCTCAACCAGTATTATTCATCA CCTATTCACTTCGTTCATAGTGATTCTACTCGCTTTGCTCGAAAGGAAACTCCTTTCG CTTTGCTCAACCAGTATTGTTCATCA
>NC_017022.1|WP_002291634.1|2469233_2469737_-|50S-ribosomal-protein-L10 MSEAIIAKKAAIVDEVSEKFTAAASVVVVDYRGLTVDEVTRLRKQLRDANVEMKVIKNSILSRAAKKAGLEGMDEVFTGPTAVAFSNEDVVAPAKIMDEFAKEAKALEIKGGIIEGKVSSLEEITALAKLPNREGLLSMLLSVLQAPVRNVAYAVKAVADKEDGDAA >NC_017022.1|WP_002294588.1|2468812_2469181_-|50S-ribosomal-protein-L7/L12 MALNIENIVAELKEATILELNDLVKAIEEEFGVSAAAPVAVAAAGGAAAAEEQTEFTVELTAAGDQKVKVIKAVREATGLGLKEAKAVVDGAPAPVKEGVSKEEAEELKAKLEEVGASVTVK >NC_017022.1|WP_002296327.1|2468017_2468707_-|TVP38/TMEM64-family-protein MKKKIIRLMLISLGIILILVVGYRLYLEYQTDIQLFLNPRASKAELLAHIRSHGTFASILLIVLTAVMCAVPGIPTSVVGVIAGLSFGPLTGAIINILGNALGNITAIFLMHRLKFLDKKTETNHWVQAIRQMKHPKIGVMLGYMIPVIPSSMVNFAADAMKLPLQQIILSIVIGVIPSSVLYACGGEALFHGYNKTAVTLVASVTVLVGLVVFIYKDRKKKQGKQKHK >NC_017022.1|WP_002320938.1|2466886_2467936_-|MFS-transporter MKSNEKTPLTTSLILLLSITCGVVVANMYYIQPIGTKVAASLSVSTSAVGILTMLTQLGYALGLLFLVPLGDVVDRPKLIIRMVALSAVSLLAAFFAPSFTLFACASFLIGLLSIVPQIIIPYGAVLAGPKARGKVMGTLLSGLLVGILLSRTVSGIVASLFSWRMIYLFALCAVGILTLLLYWKMPRSVQQSSTAVSYLDSLKSLPHLVASQRLLREAAVSGFFMFGTFSIFWSTLIFYISSPAYNWGTFEAGILAIFGLSGAVAAPIVGRLADSYSERKIVYMGLVMQTISFIALLVGGSHLAILLLAIILLDVGNQFGQVANQTRVQGLGEAASNRNNTVFTRGAS >NC_017022.1|WP_002295743.1|2465884_2466793_-|IS982-family-transposase MRSSKYTEHYTDTFITFKEIMRTVSNIYHNCVPDKIKNRRNTDQLKQRDTVIIACVIWGIINGYTSQRATYRAVCSVLFPNGDFPSRSRFTRLSSNLAYTIKIIRYFFIKKLTKGELVGIIDSFPSPLCKPVRNRQAKLLNQIAKVGYNSTKKSYFYGLKIHMIVTKTGFPITYSITNPGVHDVKVLETLSEEANLPNILGDKGYISHKIHEKLALKGITISVPPRKNMDKSEKLDHSLLGKQRKTVETVFSSLEKLGCQNFNSRSVKGLESRFESILLAYSVLLSRAQRRFEGTLRYSLGY >NC_017022.1|WP_002288865.1|2465685_2465856_-|MFS-transporter MFMYFIGGAAGSLLGTTMWQQYGWLGVTVSGLVFQGCAFFFQTVVFKGKRNLENKK >NC_017022.1|WP_002290558.1|2463962_2465495_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MSILTLNNITQQFGDKILYEGVDLQLNAGEHLGLIGQNGAGKSTLIKIITGEILPDDGQIHWQKNIHKGYLDQYVEVDETLTIEEFLKTAYAKEYEKEEKIAFLYQTYSETFDDSLLEKAGKLQTELDQGVFYQIDTLVAEMSSGLGIDVLGLDSLLKNLSGGQRSKVILAKLLLENPDVLILDEPTNHLDDQHIQWLTQFLQDFDGAYIVISHDQEFLDQITTHIADIEFGKITKYTGHLKQALKQKEQNRESYLRQYHAQQKQIEKTEAYIRKYKAGSRSTMAKSRQKQLDKIERLTPPASASKAVFDFPFSPIVTTLAVETTDLVIGYDRPLLAPINLTIRFGENIAIRGFNGIGKSTLLKTLIGEIEKISGDFHFPDNTKINYFSQDLYWENPLETPLQYLSSQFPKATIKELRRQLAKAGLVNQLASEPLTTLSGGEQTKVKLAQLTMNQGNLLILDEPTNHIDQETKESLQDGIQKFPGTVIIVSHEQEFYQDLVQRVIEIEPK >NC_017022.1|WP_002287787.1|2463027_2463729_-|glucosamine-6-phosphate-deaminase MEIIRVKNAEEGGKKAFEIIKEGMNKGAKVLGLATGSTPVTLYKEMTSSDLDFSEMTSVNLDEYVGLGGSDEQSYRHFMDVQLFDKKPFKETFVPDGKAEDLEAACKKYDQIIDAHPIDIQILGIGQNGHIGFNEPGASFDGTTSVVDLTESTINANKRFFDKAEDVPTKAVSMGIGSIMKSKEIVLMAFGESKADAIKGMIEGPVTNHLPASVLQNHDNVVVIIDEEAASKL >NC_017022.1|WP_002287788.1|2462060_2462774_-|MgtC/SapB-family-protein MNDMVLTIPEIILRLGIAMLFGGAIGFERQYKNRPAGMRTHILVCMGACIIALIQVEIASGALRDALEYPQLAGTIRSDEARLIAQVVSGVGFLGAGTIIVTKQSVTGLTTAASLWAIAGLGIAIGMGYYSIAIISFIGIAIALTVVKRVIHVPTTKKLEIQFIHRKETKDFLTDYFEEKNIVIEDVNFDVKFVDDYRVYKNIYTIDLPKGLTYADVIEELSVHKNITKLHLVSIAQ >NC_017022.1|WP_002287791.1|2460612_2461752_-|AI-2E-family-transporter MQSRFKQSKLFFWTVELVLTIIGVYFILQMPNIFSPILKMLSAIFLPLLVAGFIYYMFDPIVVFLEKHRIPRVFGFLLTFLVVIILVVLTVMNVVPQLMEQTIQLTQSLPMYADETSKWLNELAQREEFKNFNLEEQLASANLSLSNLFNIILVSLSASVSKIISFMMQFFILLFTVPFILLFMFKDGHKFIDALSHFFPKAIRKELRQTVKELNETLSAYISSTILDALIIGVMSFLAMRIFDQPYSLLLAVICGITNIIPYVGPFIGAVPAIIVGLFISPFQALYMALSILVIQQLDGNLIKPLLFGKSMNIHPLTIILVLIGAGSVAGILGMLICIPVYAVIKTIILNIRKIYLLRRMEHVSEKLDSPKVLEETSE >NC_017022.1|WP_002294587.1|2470146_2470836_-|50S-ribosomal-protein-L1 MAKKSKKMQDALKKVDSSKVYPVAEAVALAKETNIAKFDATVEVAYRLNVDPKKADQQIRGAVVLPNGTGKTQTVLVFAKGDKAKEAEAAGADFVGDDDMVQKIQNGWFDFDVVVATPDMMATVGRLGRVLGPKGLMPNPKTGTVTMDVTKAVNEVKAGKVTYRVDKAGNIHVPIGKVSFDDEKLVENFAAIHDVLLKAKPSAAKGQYMKNVTITTTFGPGIHVDQASF >NC_017022.1|WP_002291638.1|2470939_2471362_-|50S-ribosomal-protein-L11 MAKKVEKIVKLQIPAGKATPAPPVGPALGQAGINIMGFTKEFNARTADQAGLIIPVVISVYEDRSFTFVTKTPPAAVLLKKAAKIEKGSGEPNKNKVAKVSSDQVREIAELKMEDLNAANVEAAMRMVEGTARSMGITVE >NC_017022.1|WP_002294585.1|2471704_2472373_+|L-serine-ammonia-lyase,-iron-sulfur-dependent,-subunit-beta MKDLRYRSVFDIIGPVMIGPSSSHTAGAARIGKIIRSIFGEQPDSVDIYLYESFAKTYRGHGTDIALVGGLLGMEPDDERLADSLKLAYEAGMEVLFVPKSEKAEHPNSVKMLLKKGTRKLSVTGISIGGGNIQISELNGFKISLSMGTPTLIVVHQDVPGMIAKVTSILSETNTNIGTMTVTRESKGENAIMIIEVDDPQVEETVKRLKQLPNIDSVNYFD >NC_017022.1|WP_002294584.1|2472385_2473258_+|L-serine-ammonia-lyase,-iron-sulfur-dependent,-subunit-alpha MFLSIEELVDQAKAYPSVAELMIAVEMEMSGRSRSHIIEIMEKNLSVMEQSINEGKEGVTSVTGITGGDAKKLDDYLNEADFLSGETILKAVRNAVAVNEVNAKMGLICATPTAGSAGVVPGVLMAVRDRLDLTHEQQLEFLFTAGAFGLVIANNASISGAEGGCQAEVGSASAMAAAALVCAKNGTPHQAAQAVAITLKNMMGLICDPVAGLVEVPCVKRNALGSSQAFISADMALAGIESVIPPDEVVAAMYQVGRQMPSIFKETAEGGLAVTPTAKRLAEEILNKRA >NC_017022.1|WP_002294583.1|2473348_2474368_-|L-lactate-oxidase MEAGAFGYIRGGSEDEWTMKENTTSFNTKKIMPRILRGIDSADLHTSVFGIELDTPIIQAPSAAQGLAHEKGEADTAKGVAAAGSIFSISTYANTTIKDAADAAPGAPQFFQLYMSKDDRFNEFILNKAVEAGAKAIILTADSTLGGYREEDVINQFQFPLPMPNLAAYSEQSASGNGEGKGIAEIYAAAKQGLTPDDIKTIKEITHLPVIVKGIQSPEDAVIAISAGADGIWVSNHGGRQLDGGPASFEVLPKIAEVVNKRVPVIFDSGVRRGEHVFKALASGADLVAIGRPVIYGLNLGGAEGVTSVFEHLNKELSITMQLAGTKTIDEVKNTKLMD >NC_017022.1|WP_002294581.1|2474540_2475428_-|alpha/beta-hydrolase MTEPIKNLCKRATAAALVLISLFALSGCQTTKINTTEVSDKEKTAESSKVIEKTTIPTLFFHGYSGTENSFKGMLRRLEKNQQAVKELVLTVGTDGQIQATGDLSGKADNPMVQVLFEDNKNNEWNQAEWIKTCLLYLKENYGIDKVNIVGHSMGGVSALRYLGTYGQDTSLPQVQTLTAIGAPFNDFVDDSAQSLTDELAKGPAVVSNRYQDYQQMIGNIPITTRFFLIAGQLDETDLSDGTVPLNSALAVYALLKQRGNEIEEKVVTGENASHSMLHENQEVDQLVSRFIWKE >NC_017022.1|WP_002294580.1|2475504_2476050_-|transcription-termination/antitermination-protein-NusG MESFEKNWYVLHTYSGYENKVKANIESRAQSMKMADFIFRVVVPEEKETEVKNGKEKEIVHKTFPGYVLVEMIMTDASWYVVRNTPGVTGFVGSHGAGSKPAPLLPEEVNHILRSIGMSLRQNDLEVEVGEVVKIIEGAFAGLEGQVTEVDGEKEKLKVNIDMFGRETSTELDFDQVDKID >NC_017022.1|WP_002294579.1|2476150_2476321_-|preprotein-translocase-subunit-SecE MKFLKSVKDEIKQVTWPSRKQLRKDTLVVIETSIIFGLMFYVMDTAIQSLFGWILK >NC_017022.1|WP_002294578.1|2476344_2476497_-|50S-ribosomal-protein-L33 MAKKKAALACSVCGSRNYTKSVSEGKSGERLEINKFCKYCNQYTLHKETK >NC_017022.1|WP_002294577.1|2476658_2477303_+|CBS-domain-containing-protein MLLKTLVYKKKDLTTVTETSTLEEALKILETSGYRCVPILDSSGNIFRGNIYKMHIYRHKANGGDMTLPVTHLLKNATKFIYLDTSFFKVFFTIKELPYIAVLDSENHFYGILTHSTLLNMLSQSWSVEQGSYVLTIASTGKQGDLAAIAKIISKHSSIASCITLDIEKDEYIRRTLITLPANTEAKVCETIVNHLEKKNYKVVEIENLQNQEA |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
51279 : 76049
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_017022|51279:76049|DBSCAN-SWA TATGGAACTTAAATATGTCATTCCCAATATGGAAAAAACATTTGGACAATTAGAATATGCTGGTGAAGGGAACATTGAACAACGTCGAATAAATGGCAGACCAACCATTCTCTCTCGTAGTTACAATTTATACTCAACGATTCAACGAGCAGATGATATTGTTGTCATTCTTCCCTCCGAAGCTGGCGAGAAACATTTTGAATCCGACGAAAAAGTCAAACTCATCAACCCACATATTACCGCAGAAGGTTATAAAATTGGCAATCGAGGATTTACCAATTACATTATGCACGCAGACGATATGGTGAAAGCATAAGAAAGGAAAGGTGAAAAAATATGAGATTAGCAGAAGGTATTGTGATTGAAAAAGACCAGACATTTGGCACATTGAAATTTTCCGCCTTGCGTCGTGAGGTTCGTATCCAGAATGAAGATGGTACGGTTTCCGAAGAAATTAAAGAACGTACCTATGACTTAAAATCAAAAGGACAAGGACGCATGATACAAGTCAGTATCCCCGCTTCTGTTCCTTTGAAAGAATTTGACTACAACGCAGAAGTGGAATTAATCAATCCTGTGGCAGATACCGTAGCGACGGCTACTTTTCGAGGGGCAGACGTTGATTGGTACGTGAAAGCAGACGATCTTGTATTAAAAGGACAGACAAAACCTCATCAGAAATATAAAAAAGAAGCGTCCGAAAGTGAAAAATAGGTGTTGCTTATGACAAACACACCATTGATTTTGAAAGAAATTCCGAAGGATGAAGCCATTTCTTTTATTCGGCAATACCATTATTCAAAGATACTCCCTAGATTGTGTAAATACTTTCTAGGGATTTTTTCAGAAGAAAAATTATTAGGCGTTGTGGAATTAGGCTGGGGTACGCAACCCCTACAAACCATACGCAAACTCTTTCCCGACAGTTCCCTTCAAACCACAGATTATTTAGAAATTGGAAAGATGTGTTTTCTTCCAGAAATGAATCAAACCAATTATTTTGGCAGTCAAGCTCTTTCAGCTCTAATTAAGTGGTTGAAAGAACATACGGACTGTCATTTTTTATATACACTGGCAGATGGAATTGAGGGAAAATGTGGCTATGTCTATCAAGCGTCCAACTTCTTTTACTGCGGGTATTTCAAGACAAGTGTCTATCGTGATAAGCAGTCATGGGAAAAGATACACCCTCGAAGTGCTCGCCTTTTATTAGAGGAAAATGCTCGCTTTGAACAGGTAGAGAAAAAGCATTGGCTTTCCCAGGCATTTTGCGAATACAAAGGGATTGAGAAAATCAATGGACGCATGTTTCGCTATCTCTATCCGTTGACAAAAGAAGCGAAAAAACTGTTAGGACACACTCTCTATCGACGTCATTATTATCCGAAAGAAAAAAATTTACGCTTTGAAAAGCGAATCGCTTATCAGAAATATGAAGCCATTTCTCAACCAACTTTTGATAAACAGGCTCGTATCTACAATACACAATTATTTTGATAGGTGGAAAGGAGGATTTTTATGCCATTGCTTCATGACAGAGGAGAGCGAATCAAAGCCAACGATAAGCACTTGGTCTATCATTTTGTACTAATTTCATTGCTGGTAGTTTTTCTAGTCGTCCTACTCCCTTTTCATTGGAGAGCGTTACAATCGGTGAACTGGCAAGCAGTTCAGTTAGATACATTTTTCTATCAACTTCATACGCCATACTTTTGGAGCAGTATTCTCACTGCTCTTTTTGTATGCGGACTTATCAGCTGGCTTTATTATCACTATCGTATAGATTCTATAAAACAGTTAGAGCACCGTCAAAAGTTAGCTCGTATGATTTTAGAAAATCATTGGTATGAAGCCGAAGAAACTCAATCAGAGGGATTCTTTAAAGATTTACCCAGCAAGAAAACCAAACAACGAATCCGCCATTTTCCTAAAATATATTATCGAATGAAAGATGGACTAATCCATATTCATGTAGAAATCACCTTAGGGAAATATCAAGATCAGCTTTTGCACCTAGAAAACAAACTAGAAACAGGATTGTATTGTGAATTAGTGGAAAAAACGTTGAAAGATTCTTATGTAGAGTATGTCCTACTTTATGATACTATTGGCAATCGAATTGGCATTGAAGACGTGGTAGCTCAAGATGGACGTGTCAAATTGATGGAATCGGTCTATTGGGAGTTCGATTCTCTCCCTCACATGTTAATTGCTGGGGGCACTGGTAGTGGAAAATCCTATTTTATTCTCACATTGATTGAATCTCTCCTGCATACAAATGCAAAGCTTTATATTCTTGACCCTAAAAATGCTGATTTGGCAGACTTAGGGGCGGTCATGAATAATGTCTATTACCGTAAAGAAGATATGTTGGCATGTATCAATCAATTTTACGAAGATATGATTGATCGCAGTGAAACCATGAAACAACACCCTAACTATAAAACAGGAGAAAATTATGCTTATCTTGGTTTGTCTGCCAATTTTCTTATTTTTGATGAATATGTGGCAATGATGGATATGCTAGGTCGTGAAAGTACCACCGTTATTCATAAACTCAAACAAATTGTAATGTTAGGACGACAAGCAGGCTTCTTTTTAATTCTTGCCTGTCAACGTCCAGACGCAAAATATTTTAGTGATGGGATTCGGGACAACTTTAACTTCCGTGTGGCTTTGGGTCGTATGTCTGAAATGGGCTTTGGTATGATGTTCGGAAGCGATACACAAAAACAATTTTTCTTAAAACCCATCAAGGGAAGAGGTTACGTGGATACAGGAAAAAGTGTGATTAGTGAGTTTTATACACCCCTTGTACCAAAAAGGTACGATTTCTTAGGAGAAATAGGAAAAGTCATTCAAAAAAAGCAATCTGAGCCTGTACCGCACGAAGTGAAAGGTACAGGTTCAGACTTGCTTTGATTGGTGTGGCGTTAGCCACGCCAATCCTTTAGCCCCCTCTATCTAACAGGGGGGCACAAATACAACTGAAAACAGGCAATTCTCATCAACCAATGTTGATGGTACAAAGGATTGCGGAAAATATGAAAGGTGTAAACTCAAGGGTCATAGTTTACATCTTTTTTAGATTGGAGGTTTGCGAATGGAAAACGAAAAAATTTGGATTAAGGAATTGAAAGAAAAGCGACTGGCTTATGGCGTTTCTCAAAATAAACTGGCGGTTGCTTCTCATATTACCAGACCTTACCTATCGGATATTGAAACAGGCAAGGCAGTCCCTACTCAACAGGTGAAAGAAGATTTACTGAACGCTTTGGAACGCTTCAATCCCGATAACCCATTGGAGATGTTATTCGACTATGTACGGATTCGATTCCCTACCAATGATGTGGCTCAAATTATCGGTGAGGTTTTACGTTTGAATATGGATTATATGCTACACGAAGACTTTGGCTATTATTCTTATCCCGAACACTATCGTTTCGGTGATATTGTTGTCCTAGTCTCTCATGATGTAAGTAAAGGTGTTTTATTAGAACTGAAAGGAAAAGGCTGTCGGCAATTTGAAAACTTTCTATTGGCTCAACATCGGAGCTGGTATGATTTCTTTCAAGATTGCATGGAACATAAAGGTATTTTCAAACGCTTGGATTTAGCTATCAACGATAAAACAGGGATTTTGAATATTCCAGATTTGGCAAAGAAATGTAAACAGGAAGAATGCATTTCCGTCTTTCGAAGCTTTAAAAATTATCGCAGTGGTGAATTGGTTCACCGTGATGAAAAACCATACATGGGAAACACACTTTATATTGGCTCATTAAAAAGTGAAGTCTATTTCTGTATATATGAGAAAGATTATGAGCAATACGTGAAAAATGATGTTCCCTTAGAAGACGCAGAAGTAAAGAATCGGTTTGAAATTCGGTTAAAAAATGACCGAGCCACCCAAGCCATGAAAGATTTATTGGCACATCAACAGGCGGAAAAAACAGCCTTTGAAATTATCAATCGCTATATCCGCTTTGCAGATAAAGACGACACTAAACGTCGGAGTGATTGGAAAACTAATGAACGTTGGGAATGGTTTATCGGTAAAAATCGTGGAGCATTACGCCTAACCACACAGCCAGAGCCTTATTCTTTTGAACGAACATTGAACTGGTTACATCATCAAGTCGCCCCTACATTAAAAATCGCAAGCATTTTAGATGTTCTCAACGGTACAACCATTATCTCCACCATGATTCAGGAAGCCAAACTGACAGAAAAACATGAGAAATTAATTGAACAACAACATCTAGCCATGGAGGATTTGATTACATGAGCCTTTTAACAAAAGAATTAAAGAAGTTAGGGTTTCAGTGTGGCATTGAGTTTCAAGCGTATATACAAAATACAGGGAAATATACGTCTCTCATTATTGAGGGAAAACGGCAAGCTGGTGATACCATCTATACCTATGATTTTTACAAGGTGAGATTTTATAATAATTATACCAATCGAGTAACCGTCTATGGAGAGCATTTAACCCCTTTTCAATTATTAAGGCGTGTAAAAAGCTATATCTATTATCGAGAAAAATATCTTAAGGAAAGGAGGACAATCACATGAATTTTGGGCAGAATTTGTACAACTGGTTCTTGGATAATGCACAGTCATTGGTATTGTTAGCGATTGTTGTCATTGGACTGTTTTTAGGTTTTAAACGAGAATTTTCAAAACTCATTGGCTTCTTGATTATTGCTCTAATCGCCGTCGGACTTGTGTTCAATGCAGCTGGCGTGAAAGATGTGTTATTAAACTTATTTAACCGAATCATTGGTGCTTAACAGATATTTTTCATGATAAAATAGGAAGTATATATTTTGTTATGAAAGGATTTATGAATATGTTTACAAATGATCAATTTAAATCTCTTTTAATTAAAACATTAGAAAGAAAGAGCTCTTCAAATTATTATGAAGGAGGTAACGAGATTGTTTCTAAAATGAAAATATCAGAGGTAACTTTAGATGAGACTGACGATTTTACTTATT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28 | Streptococcus_phage(85.0%) | integrase | attL 65088:65101|attR 79427:79440 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
746236 : 754708
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_017022|746236:754708|DBSCAN-SWA 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GGAAGAAGCAGTGCTGACTCAGTTGCGCCAACTAGCTGAAAAAGTAGAAGAAGCACTGAGAAGAGTCCAAAAACATGGGAAAACAGTAGTTTTGAAGGTCAGGTACACGGACTATTCTACTGTGACCAAAAGAGTGACATTGCCAGAATATATCTATAAAAAAGAAGCACTCTTTTATCAAGCAAGCCTTATATGGGAGGAAATCTTGGGAGTAGAAAAAGGAATCCGATTGTTAGGGATTACTTTGACGAATCTGGACCCGATGACTTATGAAAACATCGTCCTTCCATTATGGGAAAATCAAGAAATATAAAAACAGCTTTGAGAGTTGAAACCGGAAATCCGTTTTCTCTCCCAAAGCTGTTTTTATATCAAGTCTTGCTTTTTGATTTGTTCATAGGTTTCTGTTGCATCCGTACATTTTTCCCAAATCACAACTTGATTGGATTCTAAAGATTTTTGGACGTCAATGATCCGCTGGTTGCTACTTCCGCGAAATTGTAGTTTTAGGTCACGTTTGCTTAATTCAAAGCGTCCGTCAACAAGGATATCGATTTGCGAAAGGAGTTCTAATTTATCTTCTGAATCTTGTAGCAATTCATCAAAGGTATAGCCTGTCCATGACCAGATATCTTTTGTCGTACCGAACTCTTTTCGGATACGTCGTACGACTTGCAGACAAACATCTGTATTCAAAAAAGGTTCGCCACCAAGTAAAGTTAATCCTTGCACGTAATCGTTGCGCAAGTCAGCGATGATTTGTTCTTCTAATTCAGGTGTGAATGGTTTGCCATATCGGAAATTTTGTGCAGCTTTGTTGAAGCAGCCTTCGCAGGCAAATAAGCAGCCACTAACGTAAAGACTGTTGCGGACACCTTCACCATCGACAAAATTAAACGGTTTGTAGTCAGCAATATAGTTTTGGCTGTAGTCTTTTGCTAACCATTCTTTTGGTTTTGGATTTCTCATAAAAAAACTTCTTTCATTTAAGGTTCAAAGATATAGCTATTGAAGATAAAATCTACTCGACCACATAAATAAGAACAAACTGACCTAAATCCATTGTTCAAGAAAGCTTGTTCTTATTTTGATAGAGGGCGTTCAAAGATACAAAGCCATCGAAAGAGGGTGGTGAAAAAAGACTTGTCATAGCCTCTTATTCTGAATAAACGGTGTTCAAAAGCTTGCATCTGCAGTAATAAGCCCAACTAAACGAAAAATATGAGGAACTATTTTTGTTTAGCTATTCTTATTACTTGATGCAGGACAGCTTTTTCACAACCTCATTTCATGTGTTTCACACGTGAGGAAATTTCTTTATGGCGGCCATGTACCATCGGACGAGCTTGCGGATTTCCTAAATAGCCACAAGTACGTTTGACTACATCACATGTTTTTGGATCATGATTTCCACATTCTGGACATTCGAACCCTCGTTCTGTCGGTTTGAAATCACCTTCGAAACCACATTGATAGCAATGATCGATTGGCGTATTCGTACCAAGATACCCGATTTTGTCATATGCAAAATCCCATACAGCTTCTAAAGCTTTCGGATTTTGTTGGAGCATAGGGTATTCACAGTAGTGGATGAATCCACCTGAACAATATTTTGGATAATCCTTCTCAAATTCCAATTTTTCAAATGGCGTTGGGTTTTTACGCACATCATAGTGGAAACTGTTTGTATAATATTCTTTATCTGTGATATTTTCGATGATGCCGAATTTTTCTGTATCCAAACGGCAGAAACGGTCAGTTAGACTTTCACTTGGAGTTGAATAGACACTGAAATGATAACCATATTCATCCCCCCATGCATCTGCATTAGCTTTTAATTCTTTGACGATATCAAGTGTGAAAGCTTTTGCTTCTGGGTTTGTTTCCCATTCGCCACCGAAGAAAGCTGAAGCAACTTCATACAATCCAATGTAGCCTAACGATACAGTAGCTCGACGGTTTTTGAATAATTCATTGACAGAATCGGTACGTGAAAGACGTTTCCCGAAAGCACCATACATATATAAAATTGGCGCATTTGCTGGAATGGCTTCTTTACAACGTTCTACACGATAGAGAAGCGCATCTTTCATGATTTCTAAGCGGTCAGACAGTAACTGCCAGAATTTATTCTGATCTCCTTTTGATTCGATCGCGATTCTTGGCAAATTCAATGTAACAACACCTAAATTCATTCGTCCGACATTTACTTCTTGACCATTTTCGTCTTTCCACCCTTGCAAGAATGAACGACAGCCCATAGGTACTTTGAAACTTCCAGTTAATTCAACGATTTTATCGTAATTCAGAATATCAGGATACATTCTTTTCGTTGCACATTCCAATGCTAGTTGTTTGATGTCGTAATTAGGATCTTCAGGGTTTAAGTTCACACCTTTTTTCAAAGTGAAGATCAGTTTAGGGAAGATAGCTGTCCGCTTTTCACTCCCTAATCCATTGATTCGAATCTGTAAAATTGCTTTTTGAATTTCTCTTTCAAACCAGTTTTCTCCTAGTCCAAATCCTAATGAAGTGAAAGGAGTTTGTCCATTTGAAGTAAATAAGGTATTGATTTCATATTCCAAACTTTGCATAGCATCGAAGATATCTTTTTTGGTTTTTGCTTTTGCATATTCTTTTTGGCGTTCTGGCGAATCGATCCATTCTTCCGCGTCTTTTAGATGTTTTTTATAGTTCAATTCTGCAAAAGGAGCAAGCAATTCATCTGTTCGGTCGGCAGAACAGCCACCATATTGACTTGACGCTACATTGGCAATAATCTGTGAGATTTGTGCTGTGGCGGTCTGGATAGATTTTGGCGATTCGACTTCGGCATTGCCGATTTTGAACCCATTGTTCAGCATGCCTTTGAAATCAATCAAGCAGCAATTCGTCATCGGTGTATAAGGATGATAATCCAAATCATGGTAATGGATATCGCCTTTTTGATGCGCATTTGCTATATGTGGTGGCAACATTTTCAGTCCGATTGATTTTCCAACGATCCCGGCTGTCAGATCTCGCTGTGTATTGAAAACATTACTGTCTTTATTTGCGTTTTCGTTCACGACAGTTTGGTCCTTGTTGATTAGCTTTTCAATCGAAAAGTTGATATCTGTTGCTTTACTGCGAGCAAAATCTCGTTTGGTACGATAATTGATGTACTCTTCTGCTAATTCATATTCGTTTTTTTCTAGTAATATATGTTCCACGATGTTTTGAATCTCATAGATTTTGACATTTTCAGCAAACCGGCTTTTGATTTCTTGGACAACCAAGTCTGCAATCATTTGAATTTTTTCATAAGTAAGTGGTGATAATGAGCCGTGAATTTTCTTTTCTGCTTTGATCAGTGCTTCATTGATCTTTTGTTCATCGAAATCAACATGGCGGCCATCGCGTTTGATGACTTTCATCTGGGATGTCTCTGGCTGCTGAGTAACGACAGTTTTTTCTTCATAATTTACTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_017022|746236:754708|746236_746881_+|WP_002294039.1|DBSCAN-SWA MNGLFITIEGPDGAGKTSILNELYPLLKEVAKTEIIQTREPGGIPIAEEIRAVILDPKNDRMDERTEALLYAAARRQHLVEKVLPALAKGKIVLCDRFVDSSLAYQGAGRRIGVTEIARLNEFATEGTTPDFTLYLDVDSDTGLRRIKKNRQNQIDRLDSEGLEFHQRVRHAYLKLAEENPERIHKVDARKSFEEVLQTSYHTIIEQYPQFFEN >NC_017022|746236:754708|746895_747225_+|WP_002292340.1|DBSCAN-SWA MKIILAIIQDKDSNRLSNELIDANIRATKLSSTGGFLKAGNSTFIVGIEDDRVEEALEIIKKTCESRKQFVSTPVTLDISMDGGVPYPVEVEVGGATVFVLPVEGFHQF >NC_017022|746236:754708|750426_751548_+|WP_002294035.1|DBSCAN-SWA MMELQFPLHNDTSRKIIHIDMDAFFASVEERDHPEFRGHPLVIARHPSDTGGRGVVTTANYEARKFGIHSAMSAQKAYELCPQAIFKPGDHHKYSDISKQVREVFYRYTDIVEPVSIDEAYLDVTENKINCKSAIKIARMIQADIWESVQLTCSAGVSYNKFLAKLASDYQKPRGITVVAPQDAVPFLKALPIEKFHGVGKKTVPRMHELGIYTGKDLYECTEMMLIRNFGKMGYSLYRKVRGIHDSPVNVTRERKSVGKEHTYGQPLQTEEAVLTQLRQLAEKVEEALRRVQKHGKTVVLKVRYTDYSTVTKRVTLPEYIYKKEALFYQASLIWEEILGVEKGIRLLGITLTNLDPMTYENIVLPLWENQEI >NC_017022|746236:754708|749029_749377_+|WP_002288076.1|DBSCAN-SWA MDKRSLYDGLNQLESELRNTLTELVEMKHALHEIVEKNTTLEMENQRLREHLRELNQVAQAPAENVKQELSKSRMNLEKIYEEGFHVCYDLYGSRRDNDEPCAFCLEVIYRESGR >NC_017022|746236:754708|752518_754708_-|WP_002288083.1|DBSCAN-SWA MKVNYEEKTVVTQQPETSQMKVIKRDGRHVDFDEQKINEALIKAEKKIHGSLSPLTYEKIQMIADLVVQEIKSRFAENVKIYEIQNIVEHILLEKNEYELAEEYINYRTKRDFARSKATDINFSIEKLINKDQTVVNENANKDSNVFNTQRDLTAGIVGKSIGLKMLPPHIANAHQKGDIHYHDLDYHPYTPMTNCCLIDFKGMLNNGFKIGNAEVESPKSIQTATAQISQIIANVASSQYGGCSADRTDELLAPFAELNYKKHLKDAEEWIDSPERQKEYAKAKTKKDIFDAMQSLEYEINTLFTSNGQTPFTSLGFGLGENWFEREIQKAILQIRINGLGSEKRTAIFPKLIFTLKKGVNLNPEDPNYDIKQLALECATKRMYPDILNYDKIVELTGSFKVPMGCRSFLQGWKDENGQEVNVGRMNLGVVTLNLPRIAIESKGDQNKFWQLLSDRLEIMKDALLYRVERCKEAIPANAPILYMYGAFGKRLSRTDSVNELFKNRRATVSLGYIGLYEVASAFFGGEWETNPEAKAFTLDIVKELKANADAWGDEYGYHFSVYSTPSESLTDRFCRLDTEKFGIIENITDKEYYTNSFHYDVRKNPTPFEKLEFEKDYPKYCSGGFIHYCEYPMLQQNPKALEAVWDFAYDKIGYLGTNTPIDHCYQCGFEGDFKPTERGFECPECGNHDPKTCDVVKRTCGYLGNPQARPMVHGRHKEISSRVKHMK >NC_017022|746236:754708|748212_749037_+|WP_002288073.1|DBSCAN-SWA MVEVVGVRYRDAGHIYYFAPGDSEYVYSDKVLVESQQSLHIATVVLPKKEIDPNDLPEAIRPILHKASQAELEKDKKNKKDAYDALKIAKEKVQLRELEMKMVKAEYTFDRNKLIFSFTADGRIDFRELVKDLAAVFRTRIELRQIGVRDEAKIIGGIGPCGRPLCCSSFLGDFVPVSIKMAKDQSLSLNPTKISGLCGRLMCCLQYESEEYETAKKELPDFGKVIATPDGKGKVVGLNLLSRIVSIRLTGRENPVEYEWDELKEFIQVGEMNG >NC_017022|746236:754708|751601_752204_-|WP_002288081.1|DBSCAN-SWA MRNPKPKEWLAKDYSQNYIADYKPFNFVDGEGVRNSLYVSGCLFACEGCFNKAAQNFRYGKPFTPELEEQIIADLRNDYVQGLTLLGGEPFLNTDVCLQVVRRIRKEFGTTKDIWSWTGYTFDELLQDSEDKLELLSQIDILVDGRFELSKRDLKLQFRGSSNQRIIDVQKSLESNQVVIWEKCTDATETYEQIKKQDLI >NC_017022|746236:754708|749445_750318_+|WP_002288078.1|DBSCAN-SWA MYNQKSFKGNPVYGDLYLVPTPIGNLEDMSYRSVRMLQESDLIASEDTRNTQKLLNHFEIHTPQKSLHEHNYKERVPQLIALLKEGKTIAQVSDAGMPSISDPGHELVLACIKEGISVISIPGPTAGMTALIASGLVPQPFLFYGFLPRKKKEQKETLKKLKEQTVTLIFYESPYRITATLTNFLEIFGNRQVVLCRELTKVHEEYLRGSTEELLAYIEEHPVKGECCLLVEGNLFEMPVTEVDEELGTLKEQVEAKIASGEKPNAAIKAVALKNGLKKQEVYRQYHELD >NC_017022|746236:754708|747238_748177_+|WP_002288071.1|DBSCAN-SWA MNQEINLAQMQPIVYQQLQRSFEHGRIAHAYLFEGEKGTGKHEVGIWLAQHLFCTQMKDNLPCGKCNNCQRIEKKEHPDVLVIEPEGQTIKVDQIRRLQTEFSRSGYESRKKVFLIKEAEKMNSSAANSLLKFLEEPPGDFLAVLETDAVGRILPTIQSRCQVLHFQELSKEALIHRLQEEQIPLEKAKLLAFLTNSLGKAVEISQDEWFNDAKDLIYQWFVYLQKQDTQAFIYVQKKLVKSFKEKTQQFTGLSVLMFYYQEAQRQAVANGEYGKVKQINQIIERILIAEQKLRSNVSFQAVAEQFVLHTIF |
9 | Streptococcus_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
807718 : 855407
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_017022|807718:855407|DBSCAN-SWA AATGAAAATGAAAGAAACCTTGCAATTAGGAAAAACAAAATTCCCTATGCGTGGTAATTTGCCAAACCGAGAAGGCGAGTGGCAAAAAGAATGGGAAGAAAATCGAATCTACCAAAAAAGACAAGAGTTGAACGAAGGAAAACCTAGCTTTGTTCTTCATGATGGACCTCCATATGCCAATGGTAATATCCATTTAGGACATTCATTGAATAAAATCAGTAAAGACATTATCATTCGTTCAAAATCAATGTCTGGCTATCGTGCACCATATGTTCCAGGATGGGATACACATGGATTGCCGATTGAACAAGTATTGGCTAATAAAGGCGTGAAACGTAAAGAAATGTCCATGGCAGAATACTTGGAAAAATGTCGTGAATATGCACTTTCCCAAGTAGATAAGCAACGAGCAGATTTCAAACGCCTAGGAGTTGCAGGAGATTGGGAACATCCTTATGTTACATTAGATCCTTCTTATGAAGCTGCACAAGTACGCGTATTTGGTAAAATGGCTGAAAAAGGCTATATTTACAAAGGATTGAAACCAATTTACTGGTCTCCGTCAAGTGAGTCTTCTTTAGCGGAAGCTGAAATTGAATATAAAGATGTAAAATCTCCATCTATTTTTGTAGCTTTCAATGTCAAAGACGGCAAAGATATTCTTGATGAAGATACAGCTTTTGTCATTTGGACGACAACACCATGGACATTGCCAGCAAACCAAGGTATTGCTGTAAATCCAAAATTTACGTATGTATTGGTGGAAGCCGATGGCCGTAAGTTTGTCGTAGCGAAAGATTTGCTAGAAACAGTCCAATCAGAAATCGGTTGGGAAAATGTAACAGTTCTAAAAGAATTTGCTGGACAAGAAATGGAATATATGACTGCAAGTCATCCATTCTATGAACGTGAATCACTTGTGATTTTAGGCGATCATGTTACTTTAGACGCTGGTACTGGATTAGTCCATACTGCTCCAGGACATGGGGAAGATGACTATATCGCTGGTAGCAAATATAAACTATCTGTAGTGTCACCTGTAGACTCAAAAGGATTGTTTACAGAAGAAGCACCTGGATTTGAAGGTATCTTTTATGACAAAGCAAATCCTATGATCACTGATCTATTAAAAGAAAAAGGAGCTTTGCTGAAGCTAGATTTCTTTACTCATAGTTATCCTCACGATTGGCGGACGAAAAAGCCTGTGATCTATCGGGCAACTCCACAATGGTTTGCATCTATCGATAAATTCCGTCAGAATATTTTGGATGAAGTAGAAAAAGTAGAGTGGGTTATCCCATGGGGTAAAACACGTTTGTATAATATGATCCGTGACCGCGGCGATTGGGTAATTTCCCGTCAGCGTGCATGGGGAGTACCACTTCCGATTTTCTATGCTGAAAATGGAGAAGCAATCATCACACCAGAAACAATCGAACATGTGGCAAAATTATTTGCTGAACATGGATCAATTATCTGGTTTGAAAAAGAAGCGAAAGAACTTCTTCCTGAAGGATTTACCCACCCAGGTTCTCCTAATGGCGAATTTACAAAAGAAAAAGATATCATGGATGTCTGGTTTGATTCTGGTTCTTCTCATGAAGCTGTTTTACGTCAGCGACCAGAATTATCATTCCCAGCAGATATGTATTTAGAAGGATCAGACCAATATCGTGGCTGGTTCAACTCAAGTATCACGACTAGTGTGGCTATCAATGGTGTAGCACCATACAAATCAGTTATTTCTCAAGGATTTGCTTTAGATGGTGAAGGCCGTAAGATGAGTAAATCTTTAGGAAACATCATTGCACCAGAAAAAGTGATCAAACAATTTGGTGCAGATATCCTTCGCTTATGGGTATCTAGTGTAGATTATGAAGCAGATGTTCGTGTTTCTATGGATATCTTAAGTCAAGTGGCAGAAGTATATCGTAAAATCAGAAATACGATGCGTTTCTTATTAGCGAATACAGAAGATTTCGATCCTAAAAAAGATACTGTTTCGTACAATGATTTACGTTCTGTAGACAAATATATGACCGTTCGATTGAACCAAGTAATCAAAGAAATCCGAGAAGAAGGGTACGACAAATATAACTTCATGCATATTTACCGTACAGTTATGAACTTCTTGACGGTTGATCTATCGTCATTCTACCTGGATTTTGCTAAAGATGTAGTTTATATTGAAGCAGAAGATGATTATCAACGTCGTTGCATGCAAACTGTTTTCTATCAAACAGCTGTAGCTTTGACAAAATTATTGACTCCTATCATTCCGCATACAGCAGAAGAAATCTGGTCATTCCTGAAAGAAGAAGAGGAGTACGTTCAGTTAAGCGAGTTTCCTGGTTATGAAGAGTTTGCAAACCAAGAAGAATTGATGGATACCTGGACTGCTTTCATGGACTTCCGTGATAATGTCTTAAAAGCATTGGAAGAAGCAAGAAACAGCAAATTGATTGGTAAATCTTTGGAAGCAAAACTAACTGTTTATCCAAAACAACAAGTTCGTGAAATGTTAAAAGCTTTGGATGCAGATATTGCACAATTATTGATCGTTTCACCAGACTACTTTGAAGTTATGGCAGCAGATGAACAAGTGCCAGATAACGCTATGGTATTTGATGATGTTGCTATTACAGTGGAAAAAGCAGACGGGGAAACTTGCGATCGCTGTCGCCAAGTTCGTAAAGATGTAGGAGTAGATGAAAAACTTCCTCATCTATGCGGTCGTTGTGCAAAAATCGTTGAAGACTTCTATCCTGAAGCTGTAGCTGAAGGATTCGAAGAAAAGTAAAAGGGAAAAGGGGGTGTGACATGTTCTTTGTCACACCCCCTTTTGTTATCAATCGTTTAATTTTCCACGTTCACGATACCAGTTATCTGGTTGCCAGATCCATTCGAATCCGTCTTTTTCAAGTAGTTCGAAAGCTGCTTTAGGTCCCATTGATCCAGCTTTGTAGTTGGGAAAATCCGGTTGTGTTTGGTCCCAAGCTTTTCGAATGACATCCACGATATGCCAAGATTGAGCGACTTCTTCCCAATGAGAGAAGTTCGTTCCATCACCATTCAACGCATCTAATAGTAATTTTTCGTAAGCTTCTGGGCTATTTTCAACCATTTCTGCACTATTTCTAAATTCCAATTTGATTGGTTCCGTTTCAAATCCTTGCCCTACTTCTTTCCCATTCAAGGATAAAGAAAATCCTTCAGTTGGCTGAATATAGATCGTTAGAACATTAGGTGGAAGTGTCGTATCGTCACATGGTTCATCGACAGATGTTTTGAATACATTAACAGGAACTTGTTTGAATACGATGTTGATCCGAGTCCCTTTTTCAGTCAAACGTTTGCCTGTACGTACATAGAAAGGAACACCTGACCAACGGAAGTTATCGATAGTGAATTTGCCTGCGACGAATGTTTCAGTCTCTGATTGAGCATCCACTTTGTCTTCTTCGCGATAGCCCTTGAATTGTACACCATCCAATTCACCTTGAGCATATTGCCCGCGAACGAAGTTTTCTAACACTTCTTCTTCGTTATAAATGCGGATAGCTTTCAATGCTTTGATCTTTTCTGTACGGATTTCTTTTTCGGAAAATGCTACTGGCGGTTCCATTGCAAGTAATGCTACAACCTGTAAAATATGATTTTGCACCATGTCTTTAAGTGCGCCACTATGATCGTAGTAGCCCCCGCGATCTTCTACACCGAGGTTTTCGCCAAAAGTAATTTGGATATTGTCGATATAGCGATTGTTCCATTGAGCCTCAAAAATATTATTGGCAAAACGGATAGCTGAGATGTTTTGGATCATTTCTTTTCCTAAATAATGATCAATCCTGAAAATATCTTGTTCTGGGAATACTTCTCTGATTTGCTGGTTCAATTCAAAAGCAGACTGGTAATCAGAACCGAACGGTTTTTCTATGATCAAACGATTGAAGCCATTTTTTGTCATAATATTTTGTGATTTCAAATGAGAAACGATCGTTCCAAAAAATTGAGGTGCCATAGCCAAATAATAGACACGGTTACCGTTTAATTGATAGTGTCCATCTAATCGGTCAGACAATTCTTTTAATGTCTGATAATGCGTTGAATCATTTACATCATGGGATTGATAGTAAAAATGGCTTGCAAAGGTAGTTGCTTCTTCATCTGAAGGATTCAATGCACGGATTGTTTCTTTGACAACTTCACGGTAGTGCTCATCGCTCCAGGGACGGCGAGCGGTTCCGATTACAGCAAAATGCTCGCCTAAATTTCCTTTTCTGTAAAGGCGGAACAAAGACGGGTACAATTTACGCTGGGCTAGGTCACCTGTACCGCCGAATATCGTAAACAATACATTTTTTTCATTAGACATGTGGATACACTCCTTTATATTTTATCGACAAAAATCGTGCTGGCCGCCTTAAAGCTGACGGGGATTTTCTTTCTATCATTTTGGATAGTGATCGGTCCTTCATAAGCTGCGATGTCAACGATCTCATATTCTTCGTTGATATTCAGGTCAATAGTGACTAAGTAATCCAACAATTCTTTTTCATCAAGCACTCGTGCGATACGCACTTTTGTACCGACAGGATAGGACTCCAATGTTTGTCGGCGTTCTTCATGGACAACTTCCTCTTTTTTAGGAATCGATCCTCCATGAGGACAATGTTCAGGATGATTCAAATAGTTTTCTAAATGATCTGCAAGATGTTCCGAAGTCACATGTTCCAATACTTCAGCATCATCATGGACTTCATTCCAGCTATAGTCTAAATGTTCAACTAAAAAAACTTCCCATAAGCGATGTTTGCGAATCAGACTGCTAGCTTTTTGCAGTCCGCTTGCAGTCAATTGTACACCTTGATAAGGGGAATGTTCTACAAGCTCTTCTTTCACAAGTTTAGAAATCATTTCACTGACAGATGCAGCTGAGACATCTAGACTAGATACGATTTGTTTATTGTTGACTTTCGTTGTATCTCCACCTAGTTCTA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61 | Enterococcus_phage(27.59%) | head,capsid,protease,portal,tail,integrase,terminase,tRNA | attL 819179:819193|attR 826246:826260 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1134378 : 1143425
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_017022|1134378:1143425|DBSCAN-SWA GTCATTTCAGATAGCCTCCATTTTCAATAATTTCACTAATCACTTCTGGATAGATTCGATGCTCTACTCTATGGATTTTTTCTTCTAAAGAATCGAACGTGTCCTCCTGTTCAATTCTCACTTTTTCCTGCCGGATGATTGGTCCAGTATCTACACCTTGGTCGATATAATGAATTGTGACACCCGTTTCTTTTACTCCAGCTTCAAAGGCATCACGTATGCCATGCAAACCAGGGAAGGCAGGTAAAAGAGACGGATGGATATTGATGATTCTTTTATCATAATTTTTCAGCAATACCGGTCCAATGATTCGCATATATCCAGCTAATACGATCAAATCGATCTTTTTTTCTTTCAATTTATGCAAAATTGCTTCTTCATACTCTTTTTTTGAATCAAATTCTTTAGGTGAAAAACAATCTGCCGGTACACTCAACGCAGTTGCACGTTTCAAAACATATGCTTCAGGCTGATCACAAAACAACCAGTCAATCGAAGATTCCAATCCTTTTTTCGATAGATAATCGGCTAGCGCTTGAAAGTTGCTTCCGTTTCCAGAAGCAAAAACAGCGATTCTCATCGTTCTTCTCCTATAAACACCACACGATGTTTTTCTTTGGCGATCACTTTCCCGATTTCATAAACTTTTTCGCCAGCTTGCTCAATTTCGTGTACTATTTCTTTTACTTTCGATTCTTCGACTGCCAGGACCATACCGATGCCCATATTGAAGATTTCATACATCTCCATCTCAGGAATTTCACCATATTTTTGTAAACAGCCGAATATTGGAAGAATCGGCCATGAGCCAAGTTTGATTTGTGCAGCCATAGATTCTGGTAACATTCGCGGGATATTTTCTACAAACCCTCCACCAGTGATATGTGCAGCTCCTTTTATTTTCTTTTCTTTGATCAGCGGAAGCAAGGAAGAAACATAGATTTTCGTTGGCTCAAGCAATTCTTCGCCAAGTGTTTTTTTCAATTCTGGCAGTTTTGATGATAAAGAAAACTGCTGCTGCTCAAAGAAAATTTTGCGAACAAGAGAGTACCCATTTGAATGAATCCCGCTAGATGCTATTCCAAGCAACACATCTCCTGGGTTGATCGTTTCTCCTGTCAATAATTGAGATTTTTCAGCTATCCCTACAGCAAATCCGGCTAGATCATAATCATTACCTGAGTACATACCAGGCATTTCAGCTGTTTCTCCGCCAATCAGCGCCATATTTCCTTGAACACATCCATCTGCTACACCTTTTACTACATTTTCCAAACGTAACGGATCATTTTTCCCCGTTGCTAAGTAGTCTAAGAAATATAACGGCTCTGCGCCTTGTGCTAAGATATCATTGACACACATCGCTACGCAGTCGATCCCGATTGTATCGTGTTTGTCTGCTTCGATTGCCACTGCTAATTTCGTCCCCACGCCATCGGTCCCCGAGACAAGGACTGGCTCTTTTAATTGAAAGACCGATAAATCAAAACAACCGCCGAATCCTCCTATAGCGCCCATCATACCTAAACGTTCCGTTTTTTTGACATGCTTCTTGATCCGTTCTACTACTTCATATCCAGCTTCGACATCTACGCCAGCTTTTGCGTATGCATTTGCCATTGAATTCATATACTCCCTTCTTGGTCTGCTTTTAAAAGAACGATACTTTTTCTTTTAGTGATTCCTGATATTTTTCTTCATAGTCATATAACGGCGTCGGATAATCTCCGTTGAAATAAGCCATACACAATCCTGAATACGGAGCATCTTTTTCCAGACCGATCGATTCGATCAGACCCTCTTCACTTAAAAAACCTAAAGAATCTGCACCGATACATTCTTTGATTTCATCAATCGTGTGATTTGCCGCAATGAGTTCTTTACGCGTTTGAATATCAATCCCGTAAAAACATGGATATTTCAAAGGAGGAGAAGCAATCCTCACATGGACTTCTTTTGCCCCTGCTTCTTTCAAAAGATGGACGATCCGTCTGCTTGTCGTACCCCGAACAATTGAATCATCGACCATAATCACCTTTTTACCTTCCACTACTCCTCGTACAGCAGATAATTTCATTCGAACACCTTGCTCTCTTAGCTCAGGCGTTGGCTGGATAAATGTTCGGGCAATGTATTGATTTTTTACTAATCCGATTTCATAAGGGATTCCACTAGCTTCCGCATAACCGCTTGCGGCTGACAAAGAAGAATTAGGTACGCCAACGACCATATCTGCTTTTACTGGCGATTCTTTCGCTAAATTCCGTCCCATATTTTTCCGTGCAGTATGCACATTGATCCCTGCGATGTTTGAATCTGGTCTGGCAAAATAGATATATTCCATCGAACAAATAGAAAGCTGCGTGTCCTTCGTAAAGCAATCAATCTGGATTCCTTCGTCATTGATGATCACTATCTCACCAGGCTGGACATCTCTTATAAAACGTGCCCCAATAACTTCTAATGCACAAGTTTCCGAGGCAATCACGTATGCTCCGTTTTTCATTTGTCCGATTGCTAATGGACGAAAACCATTTGGGTCCAAAGCGGCAATCATTGCCGTTTCTGTCATTAATAAATAGGCAAAGCCACCTTTGACTTCATTCAAAGCACTTTTTAATTTATTTAAAAAATCTGTTTCTTCACTTCGTCGGATCAAATGCATCAATATCTCCGTATCGGAGTTAGAATGGAAGATCGCCCCATTTTCCTCTAACTCTTTTCTAAGGGAACGAGCATTGATCAAGTTACCATTATGCGCTAAGCCGATCGACTGATCATGAAATTTGAATAGAAAAGGCTGAATATTGTCCACACTTCCATTGCCTGCTGTTGCATAACGTACATGTCCGATTGCAGCTTCTCCTGTTAACTGCTGCAATTTTCTTTGATCTTTGAATACCTCAGAAAGCAGCCCCAAATCTCGATGCCCCTTAAGCTTTCCTCGATCATTGGACACGATACCTGCACCTTCTTGTCCTCGATGCTGAAGACTATGGAGCCCGAAGTATGCCACACTAGCGGCGTCTGGATGACCCCAAACACCGAAGATCCCGCATTCTTCATTTAAACTCTTCACTTCATAAGACATACGATTGCATCCTCCCAGCACTTTCTTGCTACTGCAGTTTCTATTTTGATCTGACCGTCAGTTGCTGAAATTTCGATTATCGCTTCATCCGTCACCTTACCTGCTAAAACAGCAGCATCTCCCATCATTTCTTCGAATCGTGTCTTATTTTCCGGTGCGACTGTCAACACAAATCTTGATTGAGTTTCTGCAAATAATTGAGCAGAGGACAATTCAAACTGTACAGATATCCCTAGCTGATGTTTGAAAGCTGATTCTGCCAGTGCAATTGCCAAGCCACCTTCTGAACAGTCATGAGCACTTTCAATCAATCCGTTTTGGATGGCTGTCAATACTAACTCTTGGTTTCTCTTTTCAATGGATAGATCAAAGTTTCGGATCACACCTTCGATTCTTCCAAGCTGCATCTTTTGTAATTCACTGCCATCAAAATCTGCAAACGTCTTACCTAATATATAGATTAGATCCCCTGATTTTTTGAATTCCTGAGTAGTGATATGTTTATGATCCTCAATCAATCCGACCATACCAATCATTGGTGTTGGATAGATTGCTTGACCATCCGTTTCATTATATAAAGAGACATTTCCTGAAATAACAGGAGTTCCTAACGTTTCACACGCAGCAGCAATTCCGTCAGCTGAAGTCGATAATTCCCAAAAAACTTCTGGTTTATCAGGAGAACCATAGTTCAGGCAGTCGGTGATCGCCAAGGGCTTACCACCGCTAGCAATAATATTTCTAGCAGCTTCTGCCACTGCTATTTGTCCTCCGATTTTTGGATCCAAATACAGATAGCGCGCGTTGCAGTCTGTGGTCATAGCTAACGCTTTATTCGTCCCTCTAACCCTCATCACAGCAGCATCGCTTCCTGGACGGACAACTGTATTGGTTTGTACTTGTGAATCATAAGTTTCGTAGATTGAACGTTTTGAAGCAATCGTCGGTTGCTGCAGCAGATCAAGCAATACTTGTCCAGGTTCTTCGATAACTGGCTGATAAGGAGCTAACTGCTGAAATTCTACGATTCGAGCTGGTTCTTTCATTTCTTTATGATAAACTGGTGCATCTTCAGCTAATGCATCGACTGGCAGATTTGCTACTTCTTCTCCTTGATGATATAGCCGATATTGCCCGTCGTCTGTTACTTTACCGATAGTGACTGCATCTAGATCATACTTCTGAAATAGTTCTTGGATTTTTTCTTCCTCTCCTGATTTAACACAAATCAACATCCGTTCTTGTGATTCCGATAACATCATTTCATAAGGTGTCATCCCAGTTTCTCTTTGTGGGACTTCATCTAATGTCAATATAAGTCCTGAGCCAGCTTTTGAAGCCATTTCCGCACTAGATGAAACAAGTCCTGCTGCTCCCATATCCTGTATACCTATTAGAGAATCCGAATGATGCAAGATTAATTCCAAACACGCTTCAAGCAGCAGCTTTTCCATAAAAGGATCGCCTACTTGTACAGCAGAACGTTGCTGTTCTTCTTCTTGATTAAATTCTTCTGAGGCAAAAGTTGCTCCGTGGATACCGTCGCGACCTGTTTTTGCACCTACATACATGATCGAATTACCGACGCCAGCGGCTTGCCCTTTCTGGATATGTTTGTGTTCAATCAAACCTACGCACATTGCATTGACTAATGGGTTTCCTTCATAACAAGGATCAAATGCAATTTCGCCGCCTACAGTCGGTATGCCGATACAATTGCCGTATCCGCCGATACCTGCAACTACTTCTTCTAGTAAATATTTCGTTCTTGGATTATCTAATTCGCCGAACCTCAATGAATCTAGCAACGCAATTGGACGAGCCCCCATGCTGAAAATATCTCTGATGATTCCGCCAACTCCTGTCGCAGCTCCTTCATAAGGCTCCACGGCTGAAGGATGATTGTGAC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_017022|1134378:1143425|1139675_1140347_-|WP_002288017.1|DBSCAN-SWA MKFAVIVFPGSNCDADMLWAVREIMGADAEFVRHDESSLEGFDGVLLPGGFSYGDYLRCGAIARFSTIMEEVIRFAEEGKPVFGTCNGFQILTEAGLLPGVLRRNESLHFICKTVPLKVNPKTAFTSEYEADEIIYLPVAHGEGNYFCDEETLQELKKNNQIAFTYNDNINGSVENIAGITNKAGNVLGMMPHPERAVEDLLGSEDGKRFFASILKNFGKVTV >NC_017022|1134378:1143425|1134953_1135997_-|WP_002321731.1|DBSCAN-SWA MANAYAKAGVDVEAGYEVVERIKKHVKKTERLGMMGAIGGFGGCFDLSVFQLKEPVLVSGTDGVGTKLAVAIEADKHDTIGIDCVAMCVNDILAQGAEPLYFLDYLATGKNDPLRLENVVKGVADGCVQGNMALIGGETAEMPGMYSGNDYDLAGFAVGIAEKSQLLTGETINPGDVLLGIASSGIHSNGYSLVRKIFFEQQQFSLSSKLPELKKTLGEELLEPTKIYVSSLLPLIKEKKIKGAAHITGGGFVENIPRMLPESMAAQIKLGSWPILPIFGCLQKYGEIPEMEMYEIFNMGIGMVLAVEESKVKEIVHEIEQAGEKVYEIGKVIAKEKHRVVFIGEER >NC_017022|1134378:1143425|1142177_1143425_-|WP_014387011.1|transposase|DBSCAN-SWA MITEVSYETLQKKKTLVVDAVLSPTPRACRSCGSTVVDGNGKAIIVKNGKKETIVRFEQYNHMPLVMRLKKQRYTCKNCRTHWTAQSYFVQPRHSIANHVRYKIASLLTEKVSLSFIAKSCQVSLTTVIRTLKEFKSYLPKQSKKILPRVLMVDEFRSHASIEDKMSFICADGETGKLIDVLPTRKLPRLTSYFLGCTNPEEVEFLVTDMNAAYFQLTKRVLPNAKVVIDRFHIVKHMNQAFNELRIREMNELRKAGQKSQAEKLKKNWRFLLKNRANINHYEYKTWKSFRAPKYPFLTEAMMIDRLLEFSPPLKEAYPFFHELVEAFRDKDPDLFFSLLAELPETLDDSFREKLQNLLTYEEGITNAMIYPYSNGKIEAKNTHIKTMKRVSYGFKSFENMRIRIFLINQLINVR >NC_017022|1134378:1143425|1140602_1141331_-|WP_002288021.1|DBSCAN-SWA MEKKELLYEGKAKKIYLTSDENLIWIEYLDQATALNGARKDQISGKGELNNQITSAIFRYLTQRGIKNHFIEQLSKTEQLAKKVQIIPLEVVIRNIAAGSFSKRLGVPEGKEFIKPIIEFYYKDDQLDDPFINEEHIYFLQLAKPEEISELKAQALAINEILTELFAKVGLVLVDFKLEFGRSNGQILLADEVTPDTCRLWDERTNEHMDKDVYRRDLGDLIPVYQEVYNRLSELTEEKERV >NC_017022|1134378:1143425|1134378_1134957_-|WP_002288010.1|DBSCAN-SWA MRIAVFASGNGSNFQALADYLSKKGLESSIDWLFCDQPEAYVLKRATALSVPADCFSPKEFDSKKEYEEAILHKLKEKKIDLIVLAGYMRIIGPVLLKNYDKRIINIHPSLLPAFPGLHGIRDAFEAGVKETGVTIHYIDQGVDTGPIIRQEKVRIEQEDTFDSLEEKIHRVEHRIYPEVISEIIENGGYLK >NC_017022|1134378:1143425|1141586_1141964_+|WP_002297115.1|DBSCAN-SWA MEDAIKQGQLFLSELTAEERSCLYNDLLSIKDVYLCNKDTSFYTFRKIRRATKRCAECRKRTFLYQTEHKGELSISQIHEQKRFKNHYRIQILFNGQEMEYAFLENLLQHLHNQHFSYNSQAIYA >NC_017022|1134378:1143425|1136028_1137468_-|WP_002288013.1|DBSCAN-SWA MSYEVKSLNEECGIFGVWGHPDAASVAYFGLHSLQHRGQEGAGIVSNDRGKLKGHRDLGLLSEVFKDQRKLQQLTGEAAIGHVRYATAGNGSVDNIQPFLFKFHDQSIGLAHNGNLINARSLRKELEENGAIFHSNSDTEILMHLIRRSEETDFLNKLKSALNEVKGGFAYLLMTETAMIAALDPNGFRPLAIGQMKNGAYVIASETCALEVIGARFIRDVQPGEIVIINDEGIQIDCFTKDTQLSICSMEYIYFARPDSNIAGINVHTARKNMGRNLAKESPVKADMVVGVPNSSLSAASGYAEASGIPYEIGLVKNQYIARTFIQPTPELREQGVRMKLSAVRGVVEGKKVIMVDDSIVRGTTSRRIVHLLKEAGAKEVHVRIASPPLKYPCFYGIDIQTRKELIAANHTIDEIKECIGADSLGFLSEEGLIESIGLEKDAPYSGLCMAYFNGDYPTPLYDYEEKYQESLKEKVSFF >NC_017022|1134378:1143425|1140348_1140603_-|WP_002295474.1|DBSCAN-SWA MYFVKVYVTYKDSVLDPQGEAVKKAVHRMGYETIEDIRIGKYFEIQLADAEEPIDTVIETICDKLLANVNMETYRYEIKKMEEV >NC_017022|1134378:1143425|1137452_1139675_-|WP_002288015.1|DBSCAN-SWA MKTLKEPTAEEIKKKRIYAEWGLTDEEYRMIEEDILGRMPNYTETGLFSVMWSEHCSYKNSKPVLRKFPTSGPHVLQGPGEGAGIVDIGDGLAVVFKAESHNHPSAVEPYEGAATGVGGIIRDIFSMGARPIALLDSLRFGELDNPRTKYLLEEVVAGIGGYGNCIGIPTVGGEIAFDPCYEGNPLVNAMCVGLIEHKHIQKGQAAGVGNSIMYVGAKTGRDGIHGATFASEEFNQEEEQQRSAVQVGDPFMEKLLLEACLELILHHSDSLIGIQDMGAAGLVSSSAEMASKAGSGLILTLDEVPQRETGMTPYEMMLSESQERMLICVKSGEEEKIQELFQKYDLDAVTIGKVTDDGQYRLYHQGEEVANLPVDALAEDAPVYHKEMKEPARIVEFQQLAPYQPVIEEPGQVLLDLLQQPTIASKRSIYETYDSQVQTNTVVRPGSDAAVMRVRGTNKALAMTTDCNARYLYLDPKIGGQIAVAEAARNIIASGGKPLAITDCLNYGSPDKPEVFWELSTSADGIAAACETLGTPVISGNVSLYNETDGQAIYPTPMIGMVGLIEDHKHITTQEFKKSGDLIYILGKTFADFDGSELQKMQLGRIEGVIRNFDLSIEKRNQELVLTAIQNGLIESAHDCSEGGLAIALAESAFKHQLGISVQFELSSAQLFAETQSRFVLTVAPENKTRFEEMMGDAAVLAGKVTDEAIIEISATDGQIKIETAVARKCWEDAIVCLMK |
9 | Synechococcus_phage(16.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1408779 : 1460169
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_017022|1408779:1460169|DBSCAN-SWA 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49 | Escherichia_phage(21.43%) | holin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1463376 : 1494404
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_017022|1463376:1494404|DBSCAN-SWA 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47 | Enterococcus_phage(30.77%) | head,capsid,protease,portal,tail,integrase,terminase | attL 1476548:1476565|attR 1497665:1497682 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1605269 : 1683820
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_017022|1605269:1683820|DBSCAN-SWA 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82 | Erysipelothrix_phage(58.49%) | holin,head,transposase,capsid,protease,lysis,tail,portal,terminase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1748274 : 1802607
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_017022|1748274:1802607|DBSCAN-SWA 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54 | Streptococcus_phage(20.0%) | transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1822645 : 1928027
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_017022|1822645:1928027|DBSCAN-SWA 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100 | Streptococcus_phage(50.0%) | integrase,protease,tRNA,transposase | attL 1836058:1836073|attR 1937597:1937612 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
2160544 : 2166217
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_017022|2160544:2166217|DBSCAN-SWA TCTAAGAAATCTGTTTAGCTATGATCGTTGTATAATCTTTAAACGCCGTTCCTTCATTGATTGAAATAATTTTATAACTCTTGTTTTTCCAAGCTACTTTCATATCGTTTGTTAGTTCATAATCTTGATCGTATCGAATAATAAACGTCAACGTTCCTTCAAGAATGGTACCTACACTAGCAAGCACGTCTTTTAGCATTTGTGAACGCACATTAGCCCAACATTCAAATACAGTTTCTTCACTATCCACCATCTGCCCATCTTCATCTTTTACCCGTTTTGTCTTTTTAAACTTGACTCTCTCAGTCAATTCATTTACATTCTTAATGATTGGCATAATAAGCACCTCTCATTTGTTGTACTAATGCTTGTACCGTTACTGGTATCCGTTCGCTGCTGGCTTCTTGACGGTTCAAATACCAATGTTGAGTAAGTAATGACACCGCCAAATCAAATTGCTGATAATTATCCATATCTTTATCCGTTGCGCTACTATCAATAGCACTTTTTATATATTCGCCTGCTGTATCAATCAATTGTTGAATAAAGTCATCATCAATAGTGTGATCGATCCGCATACTTTTTTTTATGCTATCCAAAATTACCATTTTATCTCTCCTAATGAAAAAAAGGCAGTGGGATAAACCGCCGCCCAATATTTTTCTATACTTTTGGTGTTACAACTGGCGTAAACTCAATATACACTGAAGCATTTTGATCAATTTTCTTATAATCGTTGCGAACGATCACTGCAAGTCCTTGTGAGTAGTAATCGAATTTTTCCCATTGAGTCGTTACTTGATTTCTACGAGCAACAAAGATAGATTGTGCAATATCCCCCATAATCATAGGGAATGTTCCAGCTTTAGGATTGGCAAACAATGTATCTGCAATCAATACTACTGGCATACCGAATAATGATTTACCACTAGGTGCTGTCACATCGGGTTGTAAAATGTAACGTCCATCTGAATCTTTCAATGTATCTAGGTGGTAATATCCGCTTTGGTTTAGAATTACCATTTTATTTAATGCTGGGTCTAATGCCACATTGTATAGTTGTTTCAAATCGTCCAACGTAGCAGCCGTTTTCTTAGTGAATGTTTTTAATAAATCCATGATATGCTTATTGTCAGTGTTTTCTACCAATTTCGCTAACTGATCTTTGACCTCTTGTACAATATTCACTGCTGAATCTTCCACAACCTCATTTGATAAGGCAATCTTACCAGCACGAGTTTCTACTTTATAATCAACTGAAGTAAACATTTCAGCGTCAATATCACCAATTTCAGCAAGTTCAGCTTTTGTTGCTAACACTGCTTGTTGGTTAGTTGCTACTGGATATTTACCTTGTCCATTTGATACTGTTTTTACTGTTGCATATTGAGCTAAGTTATAATTTGAACGTTTCAAATCAAAGACTTCACCGATTACTTCTTCGGGAACAACTGCCGCTGCATTTACAGTAGTGACTCCATCACGCACTTCGCCTTGTGAACGGATATATTCTTCATACCCACGCAATTCTGTTTTTTCGTTATCGATTAAAGTTTTTTCCATGTTATTACTCTCCTTTTGTGCTTTAGAAGTGGATTCTAAGCTATTGTTTGTTTGTTTTGCTTGGTTGTTACTCATAAACGATTCGTAAGAACGCTTATTTACTTGGACATTTGATGAATCATAAGCGGGAACGGTCACGACACTAATTTCATTAAGTGCTTTGATTTTATCTATTGATCGTTCAATTGTGCCATCTTCTTTTTTGTCGAATGAATCTAATCCAAGCACGAACCCAAAGGACATAGAATCAACAACCCCTTTTGAGATATTCTCATACACATCATTTGAATAGGTCGTGTCGGTTAGCTCTGCTTCAAAATGTAATCCTGTATCATCGACATTCAATTTCAACGTACCTGCTTTGACACTAGCTAGTGGCTTTGAATAATCGTGTCCATATAATAAGAACACATTTGATAAATCCACCTCTTTTAATGCTTCGGGTGTAATCACTTCTACAAAGCCGCCTAAATCTTTTGACGGTTGCCCGAATTTCAACGCATAGCCTGAAATAGTTTTGCCGTCTGTTGGTTGTTTTTCATTTTCTTTCTCTACTTTGGGAGAATCGGCTGTTAGCTCAGCTTCTTCTGTCAGCCGTTTTTCCTTTTCTTCTTCATTATTCAACTGGTGTAACTCCTTCCTGTTCTTTTAATTGATATTTCTCCAACGTATCTAAATACGTAAAGTTCAAACTTGCTAGTAAACGATCGCCACCATCCATGGGGGGTAGCCCCATTTTCGACCGCCCCTCATTAATCGTGAGAAGTGACCCTTTGACCTGATCCAATACATTTTTTACTTTTGTTTCAGGATCAGTCTCTAGTAACTGATCGGAATTAAAGCGGATATTGGTTTCAAGTTTCGTATCTAATTCACTCACAAACACATTAAAGTAATGAATCAGCGTACTTTGGATATACTGGAGATTACTTTGAACGGTGCTAGAATGTTCATTTTCAACGCCTAAACGCTCAATCGGTACACCAAACGCCTTGGCAATTTGTTTTGTGTTCCAATCATTGGAATTGATAAGCTTCAAAACATCGGTGTTTATTTCTAATGTTTTGTAGTCCATTGTTTCATCAAGAATGATCGTTCTAAGAGCATTATCTCCACTACTTGAACCGTTGGCTTCTTCAAACTTTTCACGAATTGCGTTCTTTGCTGATCCGTCTAAATCTGACTTATGAACCTTCAAAATACCTGACCCACTGACACCACGAGTAAAGAAATTGTGCAATGTGCGGTTGCCAGCTTGTTGAATTTTCAGTTCATCACGTAACGCATAAAGTGGTGGTAATCCTGTTAAACCATCTTGGGTGAAATATTTGAAGTGCAAAATATCGCTAGACTTCACACGTCTTTTTTTATCACCAATCTGATAAGACAACGTACCATTATCTAATTGAGTAACCGTTACACTTGAGTTAGGTAATAAGTGAATTTCTTCTACCTTTTCACCGTTGCGTTTAATCTCTGCAAAGCTATTACCGTTTAGCAACATATTGACCGCCAAAGCAAACTTTAAATGCCAACCATCCATTTCTGAATTAGGTTTCTCGTTTAGTAACTTCACCAGTTCATTATCAGCTTGTGGCATATTGTTTTTGACCAATTGAATCGGACTTGAAGCAATATCACTAGCAATAATTCGAACGGCTGCAAACACATCACTATTTCTTAATGCACGAACGCTTGTAAAGCTGGTGGTGTAATCATCCGATTGGATTGATACCACATGTTGTAGGAAAGGATCTCCCGTTGTATTTTGTCTCGCTTTAAAAAATGCCATCTTTTAACCTCCCTTCTGTTCTGTATTTAGCATGACCGCTACCCCAATAAGCACTATGCCCAGCGCTAACAAGCCATAGTAGACATTTGTTAGTAAGGTGATAGCAACCAACACACACACCAATCCAAGAAGTAAAAGAACGGTATGAATGTAATTAGAAAGAAAATTCTTCACTTGTATAAAATTCATTGTCTGCTTTCGCTCCTTCCGTTGTGGTGAAGTAATCCATTGCAAACACATAGGCATTGATTAATGCAGCTATTGGATCAATTTTGTTACTGTTCTTTGATTTATTAATCTGAATGCCGTTGTTATCCGTTTTTAAAATAGCGTTGTTCACTGCATGGGTGAGAATCGTATTTTTATTGTGAATAACGTTGCCTTCATAAACTTGTTCTCTAAAAGTTCGGGTCGGAACGTTTAGAGTAATCGTTCCTTGTCTTACTTCTAACATTGGGTAGTTGGCTTTTTCAGCTTTACTGATAAGCGAATTAGCGTTATACGGGTCATAACAAATCCCCATACATTCCAAATCATTTTCTTGAATCAAATCTTGAATAAACTGAAATACTTGGTCATAGTCCACGATTCCACTTTCTAATTGAGTAATGGAACACTCACCAGCTTTTTCTAGTTCTCGATAAGGCAAACCGTCGCGCTTTTCTTTGTCTTGAAGCCCATATTTGGTGGCTACAAAGCTATGTGAATCACAATAAAGTTCGCCGTTATCTAGCGGTACGATCCATGAAACGCTAGTTAAATCATCTGTTTTAGATAAATCCACTCCGATATAAACGGGCTTGCCTGTAATATCTTGTGGTTCTACTTCGGTTGCCTGCCAGTCTTCAGCAATCATATAGCTGTCCTCACTCGCTTGTCTCCATAAATTGAAGTTTTTCACCAATACAGAATTAAGGTTATTTTGTTTCAAAGCAAGGTTCACATCATCTTGAATGGTTGGAATCATTACTTTTTTGATTTCTTCACTTTCAAAAATCGGATTGGCTTTGATCCATTTCTCTTGATCGTGAATTTCTTCGGGATCGTCCAATTCCCATATCGCTATAAAGTACCTGTCGGCTTGTTCTTCGCCTTTTAGCACACGATCTAACAATAAGTATTCCTCGTACATAGGAACGTTTAAATCAAGCCCAGCGGTACTAATAACACACAATAAGCCGTTCTTTTGTTGGGTCATTCCTGACTTAATGACGTTGTACGTTTTACGAGTTTTTGCTTCGTGCCACTCGTCAAGAATTGCGGTTGTTGGTGCAAACCCATCTAGCGTGCTGGTTTCACTAGCCAGTGCCATAGCGAACGAATTAGAGGGCAAGTGCTGAATCTTAGAGTTCATAATTTTCAGTTGTGGTCTTAAAAACTTACTAGACTTGACCACGTTTCTAAGTGAATTAGACAGCATATCATAGCCCAATTTAGCTTGTTTCAAAGCGTTACTTACAAACAATACTTGCCTTGCTTCTGCTGGTTCTTGTTCCATAATCAACGCATTGGCAGCCATGCCACTTGCGATATACGTTTTCCCATTCTTACGGCTCATACTGGTAAACGCTCGATTGAATCGCCTGTAATTCCCTTCTTTAGTACGCCAGCCATAAAGACTGCCTAGAATGAATTTTTGAAATCCTAACATCTTGATTGCTTTACCGTCCGTAGATGGTAGCAACTCAATGAATTTAATCGCTTTGGTGGCTTGTTCTTCATCGAACACATAAGGGAAGCTATCTGACTTAGAACGCTCCAAATCGCTTATATGACGCTCACACGCTTGGATAATTTTCTTGGGTGCAATCAGCTTACCTGATAGGACTTTCTCAATGTAATCATTCATGAATTCATCAACTCTTTGAACGGGTCTTCGGGTTCATCATTTTTAACCTTGTTCAAAGCTAGTTTTGATCGTGATTCTAAGGTCATACCTAGTGAGGTGGCTTGTTTTTTCAAATCACTCATAGCTTGTGATTGAACCCGAACCGCTGGATTGGCTTTCTTTACTCCGTTTTCGCATGTGATAAACGTACCTGATTTTCTTATCTCGGCTTCGGCTGTTTTCATTCGAGCAAAGGCTAAACAATAGGCTACCAATGAACCATAATCTGCTTCACTCAATGGATAATCTTTTTTTAATGTTGGTACGATACGATTCCATTCACTTCTAGCGCTCGCTGCCATCCAGTCAGGGGGCGTGATATTTATTAATGGTTGCTGCTTGAACAATTCTTCTCTAGCGTCCACACGGATTGCTTTTTCTTCACTTGATATATTGCCTTTTGTATCGTGTAATATTTTAGGGTGTCCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_017022|2160544:2166217|2163901_2164087_-|WP_002317249.1|DBSCAN-SWA MNFIQVKNFLSNYIHTVLLLLGLVCVLVAITLLTNVYYGLLALGIVLIGVAVMLNTEQKGG >NC_017022|2160544:2166217|2165743_2166217_-|WP_002296488.1|terminase|DBSCAN-SWA MGHPKILHDTKGNISSEEKAIRVDAREELFKQQPLINITPPDWMAASARSEWNRIVPTLKKDYPLSEADYGSLVAYCLAFARMKTAEAEIRKSGTFITCENGVKKANPAVRVQSQAMSDLKKQATSLGMTLESRSKLALNKVKNDEPEDPFKELMNS >NC_017022|2160544:2166217|2161206_2162730_-|WP_002296485.1|capsid|DBSCAN-SWA MNNEEEKEKRLTEEAELTADSPKVEKENEKQPTDGKTISGYALKFGQPSKDLGGFVEVITPEALKEVDLSNVFLLYGHDYSKPLASVKAGTLKLNVDDTGLHFEAELTDTTYSNDVYENISKGVVDSMSFGFVLGLDSFDKKEDGTIERSIDKIKALNEISVVTVPAYDSSNVQVNKRSYESFMSNNQAKQTNNSLESTSKAQKESNNMEKTLIDNEKTELRGYEEYIRSQGEVRDGVTTVNAAAVVPEEVIGEVFDLKRSNYNLAQYATVKTVSNGQGKYPVATNQQAVLATKAELAEIGDIDAEMFTSVDYKVETRAGKIALSNEVVEDSAVNIVQEVKDQLAKLVENTDNKHIMDLLKTFTKKTAATLDDLKQLYNVALDPALNKMVILNQSGYYHLDTLKDSDGRYILQPDVTAPSGKSLFGMPVVLIADTLFANPKAGTFPMIMGDIAQSIFVARRNQVTTQWEKFDYYSQGLAVIVRNDYKKIDQNASVYIEFTPVVTPKV >NC_017022|2160544:2166217|2160866_2161151_-|WP_002296484.1|head,tail|DBSCAN-SWA MVILDSIKKSMRIDHTIDDDFIQQLIDTAGEYIKSAIDSSATDKDMDNYQQFDLAVSLLTQHWYLNRQEASSERIPVTVQALVQQMRGAYYANH >NC_017022|2160544:2166217|2160544_2160880_-|WP_002296483.1|head,tail|DBSCAN-SWA MPIIKNVNELTERVKFKKTKRVKDEDGQMVDSEETVFECWANVRSQMLKDVLASVGTILEGTLTFIIRYDQDYELTNDMKVAWKNKSYKIISINEGTAFKDYTTIIAKQIS >NC_017022|2160544:2166217|2164052_2165747_-|WP_002296487.1|terminase|DBSCAN-SWA MNDYIEKVLSGKLIAPKKIIQACERHISDLERSKSDSFPYVFDEEQATKAIKFIELLPSTDGKAIKMLGFQKFILGSLYGWRTKEGNYRRFNRAFTSMSRKNGKTYIASGMAANALIMEQEPAEARQVLFVSNALKQAKLGYDMLSNSLRNVVKSSKFLRPQLKIMNSKIQHLPSNSFAMALASETSTLDGFAPTTAILDEWHEAKTRKTYNVIKSGMTQQKNGLLCVISTAGLDLNVPMYEEYLLLDRVLKGEEQADRYFIAIWELDDPEEIHDQEKWIKANPIFESEEIKKVMIPTIQDDVNLALKQNNLNSVLVKNFNLWRQASEDSYMIAEDWQATEVEPQDITGKPVYIGVDLSKTDDLTSVSWIVPLDNGELYCDSHSFVATKYGLQDKEKRDGLPYRELEKAGECSITQLESGIVDYDQVFQFIQDLIQENDLECMGICYDPYNANSLISKAEKANYPMLEVRQGTITLNVPTRTFREQVYEGNVIHNKNTILTHAVNNAILKTDNNGIQINKSKNSNKIDPIAALINAYVFAMDYFTTTEGAKADNEFYTSEEFSF >NC_017022|2160544:2166217|2162722_2163898_-|WP_002296486.1|portal|DBSCAN-SWA MAFFKARQNTTGDPFLQHVVSIQSDDYTTSFTSVRALRNSDVFAAVRIIASDIASSPIQLVKNNMPQADNELVKLLNEKPNSEMDGWHLKFALAVNMLLNGNSFAEIKRNGEKVEEIHLLPNSSVTVTQLDNGTLSYQIGDKKRRVKSSDILHFKYFTQDGLTGLPPLYALRDELKIQQAGNRTLHNFFTRGVSGSGILKVHKSDLDGSAKNAIREKFEEANGSSSGDNALRTIILDETMDYKTLEINTDVLKLINSNDWNTKQIAKAFGVPIERLGVENEHSSTVQSNLQYIQSTLIHYFNVFVSELDTKLETNIRFNSDQLLETDPETKVKNVLDQVKGSLLTINEGRSKMGLPPMDGGDRLLASLNFTYLDTLEKYQLKEQEGVTPVE |
7 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | head,capsid,portal,tail,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
2397908 : 2449397
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NC_017022|2397908:2449397|DBSCAN-SWA GCTAAATGTTATTCGAATTAAATTCTAAATATTTTCGTGGAGAAGCCAGCCACTCAGTGTCTTTTTCCATCAAAAGTGTTCCAATTATCCGAGTGATGGAATTGATATTTGGAAAAATCCGAATCACTCGTTCTCTCCGGCGAATCTCTTCGTTCAACCGTTCCAACACATTGGTTGTACGAATCCTTCGGCGGATATTTTCAGGAAAAGACAAAATTTGAATAGCATCTTCAAAGCCGTTTTCTAAAATGTCGCAAGCAGCACTTAATTTTGAATCACAACCATATTTTTCCAAGAAGTGCTCTTTTCTTTCACGTGTCAATTCAAGTTCAGAGGCTTTAAAGATACTCTTCAACTCGTCTTTTACATCAGAAGAAACTTTCTTTGGCAGCTTATCAAAAATATTTCTCAAAAAGTGGGCTTGGCATCTTTGCCAGCTCGCACCTAAAAAGTTCTTGCGAACAGCCTTAACTAACCCTTTGTGTGCATCAGAAATGACCAGTTTTACACCGAACAAACCTCGTTGAACGAACGATTGAAAAACGGTATCCCAATTATCTTCCGATTCGCCGTCTTGAACATCAAAACCAAGAATCGTACGTCGTCCATCAGAATCAATGCCGATACCAATATATACACCTTTTGAGACAATACGATGATTTTCCCTTACTTTCATATACAGGGCATCACACATGAAAAATGGATATTCCGAGCCTTCTAGGCTCCGGTTTCTCCACTCAAAAACAAATGGATCCAACTGTTTCATCAGATTTGAAACGAATGATTTAGAAACAGTCGCACCATCCGTTAGCAGTTCAACTGTTTTAGTTACTTTGCGAGTGGAGACACCAGAAATGACCATTTCAATCATGGCAGCGATCAAAGCTTTTTCGCTTCGCTGATATCTTTCAAAGATAGTAGGACTAAACTTACCGTCTCTGGTTCGTGGAACATGAAGTTCTAACGTACCAATTCGAGTTGTAAACGAACGATCGTAGTAACCATTTCTTTGTGATTGCCGTTCTTCTGAACGTTCATAGGCATTTGCCTGAATATATTGATTTCGTTGTTCTTCCATCAGCTGATTAAACATGATAGTCATAAGTGTTTTTGCGGTATCATTCGCACCGCTTTCGTTTATAATTGCTTGAATTTCTTCGCTTTCAAAAGTAAAATGTACTTGAGTCATTGATATCAGTCCTATTCGAGTATGTTTTCTGCAAAAAACATTGTACTCCTAACTGAGATCAATGGCTTTTTTGATGCTTCACTTTTACACAATTATATGGACGTAATCGTGAATGGATATTTACTTTTAATAGATAAAATATTATAACTATTAAAAATAACTATTTTCATTATAATTACACACAAAAAAGAGCGTGGGACAAAAGTAAAGAACACTTTTGTCTCACGCTCTAAACACGTATAAACAGCGGAAGCAGAAGCAACTCCTTCGGAAATAAGCTGAAATTCACAAAAATTTGAAAAGCAATTTCCGTGAATTTCTTCTTATTTCTTGGAGTTAAACGCTTCTGTTCCAGCCTCTTTTTATCTGTCTTTCACTAATGATCAGTTGTAGATAAGCAAGTTGCTTTTTCTTACATCATACCGCCCATCAAGACAAACGTTTTTAGCTTGTACGTACTGGGCAAAAATCCCATTATATCAAGGAAAAACAACATTGATAGTACTTAAAATTATTAGGCTAGAACGGACTAGTAAGAGTTTTTTGCCCCTTTTTTGCCCCCTCTATCTACAATAAAAATATTATCCATTCTTATATGACCCTATATAAATAATAAAAAGAGGAGAAAAAATATCTCCTCTTTTTTCATATTACTACACCAACCTAAAAAGGAGGCGAAGCGAGGTTTCTACCTCATAAGTTGAATTAATACTATCATTCAACACAGAATTCGTCAAGAATTTTTGTTAATGAATTAAAAAAATTCTTAATGTGCATATTTTGTTCATGTAGTTCTAAAGTTTTATTTACTCTTTCTAAATAGTTAGAAAAATCTTTATTTCTGTGTGAACGCATCCCTTCTGAACACATAATTCTATGTAGTTCAAACAAAGCAAATATCCTTGCAACATTCAAATTTGTAATCTCATCATGTGTAATACCAATCCGTCTAGCATTAGCATATACAGAATTTTTTATTATGCTTTTCCGCTGTAAATTCAATAATATAGGTTTATTATGAGCACAAGAATTTCTAATGTACGATACGTATCCTATATTGTTCTTAATCATTTTTAGATTATTATTATTAGGCTGTTTATTTGCCAAATAATTTACAAAAAACTTAATTTTACTAATAGAAGCTAAATCTAGAACTACCCAGATAGGAGGTTCATTATAATATTTTTCAAATCCTTCTTGAAAAGCAAGATTACCGTCAGAATCTCTATATCTCACTCCATTAAATATTTGATCTTTCAAATCTTTTGGAGTATCTTCATCTGCTAAAACACTTTTTACAATTTCATAACCATTTTCTGCATATTCACCGTTCTTATTTTTTCGATTAGTAATTAATCTCATAAGATATGTTTTTAAAGAGTGTTCAATATCCAAACAATAAGGTAACAACACATAACGAAGTTGCATATCTAGTTTAGCCAAATCTACTATACTTAAAAAAGAAATATTATATTTTTTTTTGCTCATTTTTATCATAATTTTTTCTATAAGCTAATAGCTTGAAAAAATAATTGTGATTACTCAAAATGTTTTTTGCTTCATGAATTTCATTATCTGCTACATAGATTCCTAAATCATTTAGCTTTTCTAGTTGTTCATTAAATCTAAGTATAGGTTTATCATCTTTTAAGCTCAAACCAATATCCTCCTTGTTAGACCTTTATATTGAACATTTCTTATGTACCCTGTAGGACTCGAACCTACGACCGGACGGTTATGAGCCGTCTGCTCTGACCAACTGAGCTAAGGGTACTGGTTGTTGCCACATAAAGCCATAAACAATCAACCAGTAGAATGTGTGGCAACAAACCTGTTATCGCATAGCTTGGAGTGTGACTATTATGGGTGATAGTGAAGATATGCGATAACATCACTATTTTATCGAATGATTTTTATAGTTGTCAATATAGTTATGTAATGCTCCTCAACGAGGAGCTATTTTTATCGTTTAGGAATATTTAAATACCAACGTTTGTCATGGAAATCTTGCGCACCGCCTTTAGTGTTTCCCTCTGGATCATTCGTTGCCCGCATCATGACATAGACTTTCTTATTAGGGAAGTTACGCATGTTAAAAGATACATGATAGCCAACATTTCCAGAAGTATTATAAGCTTGATTTACATCTGATCTATAAATTCCATCAGCTCTTACTCGAGCTAATTCTTTCCCAGTATTGTAATCCATAATGAAGATATACTCGTATTTATAATTAGCAATGTGCCATCCAGCTACATGCAAATTTGCATTTTCGATTTCTCCAAACTGATCAATGTGGGCGTAATTCGTTCCATCTGTCAGTGTAGGATTAGCTGCACCAGCTCGTGTTGGATCAATGACAGGCTTGTTTTCAGAAGTTGTTGGATTTTCATCGGTAAATCCATGAGCTAAATCATATGCTAATTTTTCTTTACTTACGCCCATTTCAGAAAGATAACCGTAAGGATCTGTATGATCGCCCCAGATGTTTTGTGTTACCCATAAATGCGATTTGATTCCCGGTTGGTTATAAGGAGTGTCCAACGTTAATGGAATACCATATTTCATTGCTGAATCTCTAGCCAATTCAACGTATGCCTTGTAGTTTTTCTCAAACGTTGCTTTATCATGTGTGTGTTGTAACTCAATCTGCACAGGACTGTTGGCATTAGCATACGAACCAGCACCGTACTGTACATAACCAGGTTGACCGACTTGATAAACAATTCCGCCGTCTCCCACAATATAAGCAGTATAAGCGCTAGTCCATGAACGTTGCATATACTGCGCTTCATTGCGTCCTGTTGCTGTTTCATTAGCCGTTTCATGCAGTAAAATATACTGATTATTTGCTACTTGTGAGCTACCTTCATTTGCGCCCAAATTAAATTCATTGTTGATAGTATAGGCAAATCCGTTAATTGGCAATAAAAAAAGAGCCGTTAACAGGCTCATCGCAGTAATAGTAATTTTCTTTTTCATTTGTTTCCTCCTTCTTCGCTTTCAGCCGAGAACATTTTGTAGGTTCGATTTGATACACCCAACACACTCCCTAAAAACGCGCCAAAACCAGTAATGATGACAACACAGATATCTGTGTACTGCCAATTGAGCGCTTTACCAACTAACCCCACGAAAGTAGCTAGTGCGGGAATAATTACCAGTGCGAACCATTTTAGTACTTCGAACGTTTTATTATTCATTTTCTTCTCTCCCTAAACAAAGTTTTGATTTGTTGCGTGTGTTCCACCAATTTTTCTGTATGTGTATCTAATCTTTCATCGTGTTTCTTTAGTTCTTCATGAATCATCAATCGATCTGATTTGCTCGATTCTAAATCTTTAGTCAGCAAATCTAAATTGTGGCTTACTTTTGAAAGAGTCTCAGTAATTTTCGAGAAAGATGCAGCAATCGGTCTAATTACTAATAAAATCAAAGAAACGATAGCGGTTATTGATCCTGCTATCATTCCCCATTCCCCTAAATTAATCATGTGACAACTCCTTTACCTTAAATAAAAACGCATCAATTAAGATGCGCTCTTATCTTTATTAATGATTTTATCTGCTTCTTCGTCTGTAATGCATAATGGAACGAAAACCATTACTTGTTCGTTAGTGAAACAGCCCCAGTCATACATTAGTTTGATATCTTCATATGAATACATGTTACTTCCCACCTTGTAATTGTTTTTTGATTTCTTCGATTTCCTTGGTATTTTGTACAGAAGCAAGCATCGTTTTTGAATTCAACTGCGCTAAACTTTCTGACTTTTCTTTCAATAAGACATTTTCTTGCTTGATTGCTACAT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64 | Enterococcus_phage(27.27%) | holin,head,transposase,capsid,protease,bacteriocin,tail,portal,integrase,terminase | attL 2399510:2399528|attR 2434943:2434961 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
2770951 : 2828979
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NC_017022|2770951:2828979|DBSCAN-SWA AATGCAAGGAGTGATAGCTATGATGTCTAAAAACAATACGAATGGTAGAAATCAATTTGCGATGCTTACGATTGATGATCTAGTTCCTCAAGATCATCTCGTTCGAAAGATTGATGCCGCGCTTGATTTTGAATTTATTTATCCAATCGTCGAAGCCACTTACTCCGATTTAGGTCGCCCAAGTATCGATCCAGTGATTCTGATCAAATTGGTGTTTATTCAGTATTTATTCGGTATCCGTTCCATGCGACAAACCATTAAGGAAGTCGATACCAATGTCGCTTACCGCTGGTTTTTAGGCTACTCCTTCGAGGAGAAAATCCCCCATTTCTCAACTTTTGGAAAGAATTATGTTCGCCGATTTAGAGAAACGACGGTGTTTGAGGATATTTTTGCCTATATTTTAGAACAAGCAGTTAAAGCAGGTTTTGTAACAGAGGATAATTTGTATCTGGATTCTACCCACATCAAAGCTAACGCCAATAAACATAAGTTTACGAAAGAAATGACCCATGATGAAGCGAAAGCCTATCAGGATGAATTAGAAGATGAGATCAATCGTCAACGAATAGAGGCTGGAAAACGCCCTTTTACTTTGGACTTAGAAAAGGAAGTGAAGCTGAAAGAAAGAAAAATAAGTAAAGCTGATCCGGAAAGCGGCTACTACGTCAAAGGCGAACGAGAAAAACAATTTGCTTATTCTGTCCATACTTCATGCGACGACAATGGATTTATTCTTAGCACAATCATCACTCCTAGAAATATTCATGACAGTCAAGTCGCCTTTCAGCTCGTCAAACAATCGAAGAGACTTTTTCCTGAAATCAATTGTGTTGTCGCTGATGCTGGGTATAAGACACCTAAGTTTGTTCACTTTTTGACTCATTTGAACCTTCGACCTTGTTTGCCTTATTCAAGGCCCAAAGGGAAAAAGGAGCTATTATCAAAAAATGAGTTTCTCTATGACGAGTATTTTGATTGTTATATTTGTCCGCAAGATCAAATGCTCGCTTTTTCAACGGTTACTCGAGAAGGGTACCGAGAATACAAATCCAATCCAAAAGAATGTGTGAACTGTCCTCTGCTAAACCAATGTACCATAAGTAAAAATCATCAACGAGTCATCACGAGACATGTTTGGGGAGATCTGATGGATGAAGTGGAACATCTTCGCCTAACAGATCTGAATAAATCAATTTACAAAAAACGGAAACAAACGATTGAACGAATATTTGCGGATGCAAAAGAAAAGCATGGGATGCGTTGGACCAAGTATCGAGGCTTGGAAAAAGTCGCGACGCATACGATGCTAGTGTTTGCTGCAATGAATTTAAAGAAATTAGCCACCTGGCTATGGAAAGGCAAGGAGCCTTTATTTTTTTGTTCAAAAATTCGAAACGAAGTAGATAAAAAGCTGTTCCAAGCTCGAGTTACGAGTTTGGAACAGCTTTTGTCTACAGTCTGAATTTTATATAATAAAATGCAATACTTTTCGAGAGTGTAAAATATTTTGTGTAAATAGAAAAAAGGAAGTCCCTTCTGTAGAATAGAGTTACCACAACACATTCACAGAAAAGAGGACTTCCATATGAACGATTTTACTACAGAAATTCTAAAGACTCTAGCGAACAAAGGCGATTTGAATGAATTATTCCGTGTCCATTTGGAAAAAGCTGTCAATACGCTTCTCAAAACGGAGTTAACGGCTTTCCTCGATTACGAAAAGTACGATCGCATTGGTTTTAACACGGGGAATTCTCGTAACGGCTCCTATGACCGTACGGTCAAGACCGAGTACGGGGAACTTCATCTCCAGATTCCGCGCGACCGCAACGGCGAGTTCAAGCAACAGACTGTTCCTGCTTATAGACGGACGAATGATACCTTAGAGGAGACCGTCATTCACCTCTTCCGAAAAGGTATTACCATGTCGGAAATCGCAGACTTGATTGAGAAAATGTATGGGCATCACTACACGCCCCAAACCATGTCCAACATGACTAAAGTGCTGACTGAAGAAGTAAATGCATTTAAAGTTAGAACTCTAAATGATAAGTATGTCGCTATTTTCATGGATGCTACTTATATTCCTTTAAAACGGCAAACCGTCTCCAAAGAAGCAATCTATATTGCCATTGGTATACGAGAAGACGGCACTAAAGAAGTACTAAGTTATGCGATTGCTCCGACTGAATCGACCTACGTTTGGAATGAGTTGTTACAGGACATTTACTCCAGAGGGGTTCATGATGTCTTACTGTTTATTACCGATGGCTTAAAAGGCATGAAAGATACGATTCACCAGATTTATCCTAAAGCTAAATACCAACATTGCTGTGTTCACGTTTCCCGTAATATTGCTCATAAAGTACGTGTCAAAGATCGAAAAGAAATCTGTGATGATTTTAAGGCTGTTTATCAAGCTAGCTCAAAGGAAGAGGCAAATACCTTTTTAGGGAGTATGATTGAGAAGTAGCAAAAAACTTATCCTAAAGTGACGCAGTCACTGATAAAAAATCAAGATTTATTGACTTTTTATGAGTTTCCGCCTGGTATCCGCCGAAGCATTTACTCAACTAATTTAATCGAATCTTTCAAGAAACAAATCAAGAAATACAGCCGCAGAAAAGAGCAGTTTCAAAATGAAGAATCACTAGAGCGTTTCCTAGTATCCATCTTTGATACATACAATCAAAAATTCTTAAATAGAAGCCATAAAGGCTTCCAACAAGTGACGGATACATTAGCTTCAATGTTTACTGAGTAACCCATTATTTTGCAGAAGGACGAGTTATTTACACAAAATTATTGACGCTCCCTCCAAATTACTTCATCAAAACATTGATATAATTTTTATTATATCAGTATTTATTCTTGATACATAAATGAGAAAATAAATACTTTAAATCTATTGACTACAAGTAGTCATTAAGTCTTCATAAGATGTACAATATGACATTAAAAAAATAAAAGCTTACGACCATCCGTTAAATCTGACACTAAATAATGGACTGCTTTCTTTTGTATTAGCAGGTTACGTTGACTATGAATATTCACCAGATTATTTGGAGAAACCTCTTCAACACGAGAACAATGATATTAATTTTAGATTTGTCTACGAGTCAAAAAGTAAAACATGGTTAGTTGATCAATTAAGCACGATAAACACAAGCTTCCATGAATTACCTAAACCTGAAAATGAAGTTGAGATGGTCATTAAAATCTTCTAAAAAAGAAGCGTTGAAGGGGAAATATTCCTTTCAACGCTCTTTTTTATATGCTTAGAAACATAAATAAATTGTATACTTTCTTTTTAGCCCCTATTACTTTTCACGAAAAATATCTTTTTTTCGACGCTAGCGTTTCTCTACTTCTAATACTGTACACAGTTTTTGTATTATTGAAAAATTACTCATTATTTAGCATTAATCCACATCGTTTTATCAATCGACCTTCATACTAAACTACTTTAAAGTCATCTTCCTTCTCGTTTTTCATTAATGGAATGGCAACAGTTTTTTTGACAAATTTTATAAGGTGCAGAACTTCTTTCCGTATGCTATTCCGATTGTCCTTGACAATGAGCCTCCTCGGATGTGACGATCTTCGGCAGGAGCTAACAGTTAAAGTTAGACTGCCTCGCTAGCGTTAGCACATCCGAGCTCATTATCAAGGATTCGCTGCGCCAATCTCTGGTTACGGTAACCAACCGGTGTCTCGTAGCCAAGTGTACCGTGCAACCGAAGGTGGTTCCACCAATTGACATAGTCAAATAACTCCAAATCCAATTGTTGTAAGGTTTCAAATGTGTATTGATAGACAAATTCTACTTTCAACGACTTATAAGTTGATTTCAGCTACGGCATTATCAAAAGGACAGCCTTTATGACTCAATGATCGATTGATGTCAAAAGTTGTTAATAATTCATCAATAGCTTGGTTATCAAACTCTTTTTCCACGATCAGTATGAAAAATCTCAACCTCTGTCAGAGGTTGTTTGATACGGCTAAATGCTTTTTTTACTAGAACGGCATCTTTATGTTCTCCACAAGAATAGCCGAGAATTTCTCGATTGAACAGATCCAAAATGAAACAGACATAATTCCATTTTTTCCCGACTCGTACATAAGTCAAGTCTGTTACGATCGCTTCTAATGGGTTGTCTCTTAAGAATTTACGATTCAATACGTTTGTCGTTTTGGCTTCATTGCAAGTAGAATGATGTACTTTAAAATAAGCAACAGTATAGCTCGATTTTAATCCTCTATTTTTCATGATTCTACTAATTTTTCGTCGGCTGATCTGAATGCCTCGTTTTGATAAGGCTTTTTTATTTTTCTTGAGCCGTAGGCCTTTCGGCTGCGGATAAATTCTTCAGCGACTACTTCTTCAAGTTCTGATTCGTCTTTCTTTGGTTTTGATTGATAATAATAGGACTGACGTGATAGACCTAATATTCTGCACATCGCTGATATAGGGTAAAGATGCTTATTCGCATCGATTACTTGTCTCTTCGTCCGAATATCAGCGCTGCTTGCTTTAAAATATCATTTTCCATTTCTAATTGCTGGTTTCTTTTACGTAGTTCTAACAATTCTTTTTGTTCAGGCGTAAGATTATCTTTTTCTTTGAATGAACCACTCGTTTTAGATTGCTTTACCCATTTGTCAAATGCTGAAGCCGTTAGTTCATATTCTCGAATGATTTCTACACGTGGCTTTCCAGCTAAGTAAAGATTGACGATTTGTTGCTTGAATTCTTGTGAAAAAGTTCTTCGTGTTCTCTTAGACATAAAAATTCCTCCTGGTATGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTAAATCAGATACATAAGCCCATGTACCCGTTCGTTGTAAATAAAGTTCTTCTTGTAACAACTCCCATTTTCTCTTAGAAATCATAATGACGCCATCGTTCAATCCATTTTTAGAATCCCTAGTAATTTCTA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53 | Streptococcus_phage(71.43%) | integrase,transposase | attL 2769014:2769029|attR 2789342:2789357 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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