Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_017925 | Blattabacterium sp. (Blaberus giganteus) plasmid pBGIBA, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NC_017924 | Blattabacterium sp. (Blaberus giganteus), complete sequence | 1 crisprs | DEDDh,cas3 | 0 | 0 | 1 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_017924_1 | 252002-252127 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_017924_1
|
1 spacers
spacers of NC_017924_1
>1.1|252047|36|NC_017924|CRISPRCasFinder ACAGATTCAGACAATATTCCAGATCATGAAGATCAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017924_1
The CRISPR arrays of NC_017924_1 >merge|NC_017924|1|252002-252127|CRISPRCasFinder TGTCCAGATCAATTTGGAAAAAAAGAAAATAAAGGATGTCCTGATACAGATTCAGACAATATTCCAGATCATGAAGATCAATGTCCAAATCAATTTGGAAAAAAAGAAAATAAAGGATGTCCTGAT >NC_017924|1|1|252002-252127|CRISPRCasFinder TGTCCAGATCAATTTGGAAAAAAAGAAAATAAAGGATGTCCTGAT ACAGATTCAGACAATATTCCAGATCATGAAGATCAA TGTCCAAATCAATTTGGAAAAAAAGAAAATAAAGGATGTCCTGAT
>NC_017924.1|WP_014726553.1|250693_251143_+|SsrA-binding-protein-SmpB MSILNRKARFRYDFIEYYIAGIQLFGTEVKSIRQNKANIMESFCQMKHGELYSINMYIAEYKFGTNWNHSSRRERKLLLKKKELMKINKKLKNTGLTLIPIELFFNDKGYIKMKIALAKGKKIYDKRESLRKKDFLREVKRSLKFKNRI >NC_017924.1|WP_014726552.1|249753_250614_-|transketolase MNKRYYLKDLCIQVRRDILRMINNAKSGHPGGSLGCTEYFVALYKKIMRYNPNKFSMNGKKEDLFFLSNGHISPVYYSILARSGFFSIKELSSFRKLNSRLQGHPTVHEGLPGIRISSGSLGQGMSVSIGAALSKKLNKEFRSIIYSLHGDGELNEGQIWEAVLYAGSRKIDNYIATVDYNGVQIDGTTDEVLPLGNLKKKFESFDWKVLEELEGNNIEKVINILKKAKNETGKGKPILIILYTKMGYGVDFMVGNNAWHGKSPNEEELKKALYQLPETYLGDFPL >NC_017924.1|WP_014726551.1|248780_249743_-|transketolase MKQYENKGFKETRAGFGKALTLLGRKNNKVVALCADLTTSLFMDQFSKEFPERFFQIGIAEANMIGIAAGLSIGEYIPFAGTFANFATSRVYDQIRQSVAYSYKNVKICASHSGLTLGEDGATHQSLEDIGMMKMLPGMTVINTCDYNQTYAATLAISNYLGPVYLRFGRPAVANFTDQDQIFEIGKAVVLTEGKDVTIVSTGHLVWESLEASKILYEKKGIECEVINIHTIKPLDEDTILKSINKTKCIVTAEEHNYWGGLGESIARVLTTKKWSIHQSLVAVNDTFGESGKPMELLKKYNIDRYSIINHVQFVLKKKK >NC_017924.1|WP_041178341.1|248447_248777_-|nucleotide-pyrophosphohydrolase MEINNLQKIVHNWIMNHGIRYFDVLTNTILLSEEVGEVSRIIARNYGEQSKKKNCKKNEDLGEELSDVLFIIACLANQTGINLEESFHKKLKKKEIRDHDRHHDNKKLK >NC_017924.1|WP_014726549.1|247186_248443_-|3-phosphoshikimate-1-carboxyvinyltransferase MSSYINVSKNRNSLYGSISITGSKSISNRLLILKALYKDDIHIENISNCEDTEVLKESLISTSNILDIHHAGTAMRFLTSYFSIQEEKKIILTGSNRMKERPIFILVEALRKLGSEIYYLEKKGFPPIKIFGKKILGGEIDMNAKISSQYISSLMLIAGKFKMGLKIFLKGNITSIPYIKMTFDLLTIAGIKADWKGERIIHIYPIKNKGKKYFYVESDWSSASYYYSMAAIAKKSYVILRSYNNTSLQGDKEVSYIYDKYFGISTVFDKNVITLKKKLHFLFPKFIELDLNKTPDLAQTIVVTCSTIGIKCSLKGLETLKIKETDRLQALKEELLKFGVIIKITDSCLEITDFYRKKIDSFIPIKTYQDHRMAMSFSTFGLCSDFIKIENPNVVEKSYPNFWKDLESLGFLISYYEG >NC_017924.1|WP_014726548.1|246710_247199_+|C40-family-peptidase MECYERIYFRKKKQYKNKNYFQLINQKLCFKKQTECIIENAINYINTPYRYGGTNKSGIDCSAFIKNIFASYQIFLPRISYHQAKKGFFVPKEKIEKGDLLFFATGTSKKINHVGMVIHTNNNNNNIFFIHASTSNGVIISQLYQKYWNHRFITARRILYPS >NC_017924.1|WP_014726547.1|246165_246408_-|30S-ribosomal-protein-S20 MANHLSSLKRIRQNHIRRLRNKYVYKSTKTAIKKLLMDKKNKKQYSIVISMIDKLAKKNIIHMNKAARFKKKIEKKLIFN >NC_017924.1|WP_014726546.1|245139_245946_-|glutamate-racemase MKTSLFSPIGIFDSGIGGLIIAKEIKIQMPNENFIYFGDTKNMPYGEKSKDFIRKNSMKIASFLYEKKCKALVIACNSIASNALDMIIKKFHRKILIFNVIDPVVKNTVLLSYKRIGIIATSATIHSNFYTKKIKEYYHHLDVVQMSTPLLAPIIENGWKMKKINPIIKNYLNHLKSIDAILLACTHYFFLKEEIDNFYHGKVHLIDIPKIVAQEIKEKLNEKKLLCFHPISTWNRFPIFYTSSSIPIFFEKKVRILFGKKVFLKHDF >NC_017924.1|WP_014726545.1|242869_245143_+|NADP-dependent-malic-enzyme MRKNISNFREESLNYHSQFPSGKIQITPTKKYSSQRDLSLAYSPGVAEPCKEIARSSIEVYKYTSKGNLVAVITNGSAVLGLGDIGALASKPVMEGKALLFKIFSGIDVFDIEIDASDPEKFIETVKAIAPTFGGINLEDIKAPEAFEIERRLKKELNIPVMHDDQHGTAIISGAALLNAITYVNKKIHEIKMVVNGAGAAAISCARTYKQLGVKPENILMFDSKGLLHVSRKDLNKEKREFSVNIDPIKKLDQAINNTDVFIGLSIGGILTPNMLKSMAKNPIVFAMANPDPEIDYNLAIKVRPDVIMATGRSDYPNQVNNVLGFPYIFRGALDVHANVINDEMKLAAVYAIASLAKEPVPEQVNIVYNKKNISFGKEYIIPKPFDNRLITRVAPAVAKAAMDSGVAKNPILDWKIYQEKLLDRMGYESKMLRMIQNRARTNPKKIVFCNGEEYDILKSVQILHEEGIISIPIVLGNEDRIKRLIHENNLNIELEIVDPEKNIKEVEEFSKILWKRRNRKGLTLYDSKIRMRTNDHFGAMMVDQGKADAVITGYSRSFSLSLRPMLEVIGKDDFVHKTAGMMILLTKRGPLFLADTAVIPDPTTEELARIALMASHVVKSFDIEPRIAMLSFQNFSSNSKTSSKVSKTVAFLHKKYPNLIVDGEVQPDFALNEFLLSRKFPFSKLVKKRANIFIFPNLESGNLTYKFIRGLGDVQTIGPVMLGMRKPAHVMQMQSSIEEIVHLATLAVIDAQIRKN >NC_017924.1|WP_014726544.1|242380_242863_+|cytochrome-Cbb3-oxidase-maturation-protein-CcoH MRIKFNWDIGIMLSLVIFIIFISYIAFFFPHVGSQLVSDRYYEEEMKYQEIINEKKNVLKLPGKIKVLILYSGIEIIFPPINNDIHGFFTLFRSSSKDLDFTRSFKILKSSKKILLIPKKLLKKGLYRLIIRWKTDKKYFFEKDIFWNQLNIFYLFSFLI >NC_017924.1|WP_014726555.1|252450_253263_-|twin-arginine-translocase-subunit-TatC MNENKMPFWKHIEELRKHIIHCICAIIISMIILMNNRNIIFDCIIFGPAKTNFITYRIFYKIVNSFSFLGMHLNSVSFLYKNLEIQNRQIFGQFHIYVWTCFIGGVILSFPYIFYEFWKFIKPALSDAEKKYSIWILFMGTFLFLLGILFGYFILCPFLIHFGYSFKISHIPKNIFDLSDYISLIVHSVLSMGILFLFPFFIFFLAKMELISYSFLKKYRKHAFLIMLVISSAITPGDILSTIIVLIPLLILYQVSVYISFHTTNKKKVS >NC_017924.1|WP_014726556.1|253343_254339_+|redox-regulated-ATPase-YchF MKCGIIGLPNTGKSTFFNLISNSKALSENFPFSTIKPNYGIAKIPDKKLYELKKIINPVKIIPSEIKIVDIAGLIKGSHKGEGLGNRFLSQIRETNVIIHIIRFFHDINILHVEGTVNPIRDKEIIDMELQFKDLETIEKRLKKINKYPCILKKILSFLKEGKNIRMFPFQKDDKEYIKDLQLLTVKPVIYVCNIDDEFNIKTNIHIENMKKMIQIENSTLVKLSLKKKNCLVINQVLKKIYKLLSLQSFFTIGKKEIRSWTIPNPCTAYNASSVIHTDFKKGFIRAKIIHYDDFIKYGSEENVKKAGKIFLAGRNHLIQDGDIIHFRFNQ >NC_017924.1|WP_014726557.1|254328_255405_-|M42-family-peptidase MINYSMNSDSIKFLEKYLNEFSPTGDEREGQKIWINHISPYVEKIQTDLYGTAVGIINPDSTYKLIIEAHVDEISWSVNYITEEGIIYVSRNGGSDHQIAPSKRIIIHTEKGFVHGVFGWPAIHTRKSSEEKSPNVDNIFVDIGVSNKTEAINMGVHVGCVITYPDQFFIMNHNYFVSRALDNKIGGFIIAEVAKMLIENSIDLKFGLYIVNSVQEEVGLKGAKMISQTIQPNVAIVTDVTHDTCSPMIDKKIQGDIKCGLGPVIGYAPSIHKNIRELIINTANSKKIYFQRLVSSRYTGTDTEAFAYSNKGVLSALISIPLKYMHTTVEMVHKKDVELTVSLIYETLLAMNNQFFIG >NC_017924.1|WP_014726558.1|255420_256218_-|diaminopimelate-epimerase MELNFYKYQGTGNDFIIIDSRQKQDKIGNSFLFKKLCDRHFGVGADGIILIQNDDENDESHFYMKYCNSDGKESTMCGNGGRCAISFAANRLGINKIHFRAVDGYHDGFIIDNLVSINMLNIDKKTIEIHPKYVFINTGSPHHVQFVENIKEKNVYKEGKKIRFQKDYCEKGVNVNFVKILENNMLQVRTYERGVEDETLSCGTGVVASVIAACETNKIKNHVEKILVQTLGGKLWVSLTKTKNEYQNVYLTGNVKFIFKGYILI >NC_017924.1|WP_014726559.1|256318_257827_+|Do-family-serine-endopeptidase MKKIVFYIVLSSIMSSIITIAAYKQYTNKEEPLVFPYSSSKTRLSSLGSGSSSLVSSAGFPDFTRVVSKTIHAVVNVKNYSKKYNNQFDPFDFFFGFPDDFGNNRGRKPQKNDIPGLHGSGVIISPDGYIVTNNHVIKDAEKIEITLSDQRTYKAKLIGTDPNTDIALLKINEKNLPFIYFSDSNKVQVGEWVLAIGNPFDLNSTVTAGIISAKNRSLGILRGETSSAIESFFQTDAAVNPGNSGGALINTNGELIGINTAISSASGNFIGYSFAAPSNLVAKVIQDIKKYGTVQRAYLGVRGMDLSKTEYLKAYNKETHQSIKSQQGFLIGEVFEKSGASDAGLKKGDIIKSIDEKPIQNLADLSFIVGTKYPGDKVKVNIIRNRQKKTFHVILKDLQGRTKIRTKEEITPSELLGAIFEPLSQECKKDFGIGYGIRIIEIKTGRLSAIGLEEGDIILSINGEKMKKPNDVDRVLKKYSGDVTIKSIKQNGQVYIAGFEMN >NC_017924.1|WP_014726560.1|257823_258909_-|YjgP/YjgQ-family-permease MKIIDRYIIRNFIETFIFITLSLQFLSVIIDISQRMHRLENNQGSIKEALIFYYPFWSIWLINTFSPISVFLSVIFFTSKLNHNSEITAILSSGISFRRLALPYLISSIMIGIVALITNYYFLPIANKKKNQFHYQYLLSPKYKNKYENNQTISAQISKNEYIFIRNFSKRENIGKECVYQKFNENKLAYILKCRNIFWSKKHKIYILFDYRETIIKKNHDFFIKGDYKIIKLPITPEQLLPEEYIAETMNIHELKKFIDVEKNKRNINMHLNEYYQRTSLPFSTFIFTILGLSISTKRKKGEIAYNMIIGIALAFFYIFFIEITKIYSTKDYIPSYLAVWLPNVIYGIITMLFYWNRNIN >NC_017924.1|WP_014726561.1|258910_260035_-|tRNA-guanosine(34)-transglycosylase-Tgt MKFNLIKTDCHSKARIGILETDHGKIETPIFMPVASKGYVKSVPIHELYKISKIILGNAYHLHFQPGIEVLHKAGGIHSFLNWKESILTDSGGFQIFSMRKLNKITEDGVVFKSIINGSYHFFSPEKSMEIQRFIGGDIIMAFDDCPPFPCSHTEAKKSVKKTHHWLKKCYSYLQNNPEIYNYQQSFFPIIQGSIYTDLRKYSAEEISLLEAEGYAIGGLSLGEEKEQTHSITNLVTDILPKKKPRYLMGIGNPVDLLEGIALGIDMFDCVLPTRNGRHGMLFTWKGIINIKNKKWEKDYSCLDEFGNSYVDQLYSKSYVRHLFLSRDNLAKEIASIHNLSFYFHLIQEAKIHIMHNNFFHWKKYMIPLLKKRL >NC_017924.1|WP_014726562.1|260106_261006_+|16S-rRNA-(cytosine(1402)-N(4))-methyltransferase-RsmH MNNQSHHKSVLTKESIENLITDQNGIYVDATFGGGGHSYAILKKLNKKATLIALDQDKESIKKNWIEDKRFHLFHNNFIHIRDILNRNHIGKVSGILADLGISSLQIDNPERGFSNQLNCILDMRMNQESSYSAQNVINECSREELFHIFYEYGEFKNAKKIVDKIFKKRFKKNITTTSDLIHLFFIKGSFKKRKKFFARLFQSIRIEVNNEINILKNFLLESSRILFPGGRIAMISYHSIEDRIIKYFFKKGIIINKKKLKTLPFRMIHKKVIKPNIQEIINNPRSRSAKLRIAEKNL >NC_017924.1|WP_014726563.1|261010_261352_+|hypothetical-protein MKINIQDILKGKFLVKEDAYRSWNFIVFITVLSLISITSSHMMDRKIRKITKISEEIKELKSEYADIHSKCMKMQLASFIKKKLVNGLKNLESPPYELVIENKKNMDKTQENK >NC_017924.1|WP_041178342.1|261348_263325_+|transpeptidase-family-protein MMKEKRYILLYKSYLIGFLFTFIAALIIFNLLYIQNYSEGYKKYVIEKTIRTNLIKAKRGNIYASDNSILAMSVIRYDIHIDFRSISEKLFQENIYSLCNSLENLFKKPKFFFYKKFQYEKKKGNRYFLLSKNLDYPHFKILRNFPIFNKGQIRGGFIVEKKICRISTLENIGKRTLGYDDHRGKAGLEGAFSKYLKGRDGKRLEQRISFKIWKPLKSENEIHPEDGKDVYSTINIYLQDIAYHALLQELSISKADHGCVILMDIKSGEIPAMINLEKTKQNTYEDLRNFAVWEGNEPGSTFKTMAILAALEDKKIDVDMIVNTKGGVMKLKGKKIRDSHYNGYVKMNPKQILELSSNVGIAKIIYENYKENPEKFIEHLRKWKLDRKIGIDIPGESMPFIPSPGKKNWSSITLPWMTFGYNIKLTPLQILTFYNAIANQGKMIKPLFIRAIKHHGKNIKKYTKPIVMNPSIAGKSSLIKIQNMLEGVVKNGTAKKYYNPEYPYAGKTGTTQLNYWKKGTPVSYNSSFVGYFPAKNPKYSCIVVISKPEKGYYGIEVAVPVFDQIAKSIYTRIGRKTFLKNRKNQEDLLNKIMKSKNFFIDKWIMPNVMSVPGKEIIPILENRGFHIQYEGIGKVVTQSVLPGRKLKKNQIIFLKLEE |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
160230 : 176387
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_017924|160230:176387|DBSCAN-SWA 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12 | Prochlorococcus_phage(20.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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