Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_018081 | Enterococcus hirae ATCC 9790, complete sequence | 2 crisprs | cas2,DEDDh,DinG,cas3,cas9,cas1,csn2,cas14j,csa3 | 0 | 1 | 5 | 0 |
NC_015845 | Enterococcus hirae ATCC 9790 plasmid pTG9790, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_018081_1 | 513137-513243 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_018081_1
|
1 spacers
spacers of NC_018081_1
>1.1|513165|51|NC_018081|CRISPRCasFinder CGTTCTTAGTGATTCACTTCGCTTGAGAGGGAACTTCGCTCACTCTGTTCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018081_1
The CRISPR arrays of NC_018081_1 >merge|NC_018081|1|513137-513243|CRISPRCasFinder CCAAGTATTGTTCATCATCTACTCACTTCGTTCTTAGTGATTCACTTCGCTTGAGAGGGAACTTCGCTCACTCTGTTCGCCAAGTATTGTTCATCATCTATTCACTT >NC_018081|1|1|513137-513243|CRISPRCasFinder CCAAGTATTGTTCATCATCTACTCACTT CGTTCTTAGTGATTCACTTCGCTTGAGAGGGAACTTCGCTCACTCTGTTCG CCAAGTATTGTTCATCATCTATTCACTT
>NC_018081.1|WP_010720149.1|512577_513081_-|50S-ribosomal-protein-L10 MSEAIIAKKAAIVDEVSEKFTAAASVVVVDYRGLTVDEVTRLRKQLRDANVEMKVIKNSILSRAAKKAGLEGLDEVFTGPTAVAFSNEDVVAPAKIMDEFAKEAKALEIKGGIIEGKVSSLEEITALAKLPNREGLLSMLLSVLQAPVRNVAYAVKAVADKEDGDAA >NC_018081.1|WP_010720148.1|512156_512525_-|50S-ribosomal-protein-L7/L12 MAMNIENIVAELKEATILELNDLVKAIEEEFGVSAAAPVAAVAAGGAAAAEEQTEFTVELTAAGDQKVKVIKAVREATGLGLKEAKAVVDGAPAPVKEGVSKEEAEELKAKLEEVGASVTVK >NC_018081.1|WP_010738507.1|510909_512055_+|site-specific-integrase MAMIKQYQKKNGEKAWYFKTYLGIDPLTGKKRYTTKRGFKTQKEAKIALARLEVLATDKKLVKDNNYTFTQVKDMWIEQYKPTVRESTYLRVKFLFDKNISTFFGNKKIQSYNIAYCQEAINKWKEQYSTYKALKCYTSAVFDYAKKMNLIKENPMKEVTFSKGERKQKKTKLKYFEKEELQDFLECCQKDKFLITYPLFRVLAFTGIRKGEALALTWDDVDFFNKTLEINKTITRNSDNKFISTPPKTNTSIRKISLDDETLNILKAWKTQQKRYLLAHGQHAKTKNQIIFSSKNNNCIDITRPNIILSRICKEHNFNDITIHGFRHTHCSLLFETGLSIKEVQERLGHSDIHTTMNIYTHVTKKQKERSADKFAAYLNF >NC_018081.1|WP_010738506.1|510582_510897_+|hypothetical-protein MQYQEFKEWLENNSNSKHIFLTKWKDYQISKNSKRTGKTKKWDDDKIIRTGEEEWKKIVMNTYQKLKSHLGIPKYNGYQEWIDFIEKNEILESFDNSILEIELE >NC_018081.1|WP_010738505.1|509399_510479_+|LPXTG-cell-wall-anchor-domain-containing-protein MKKALLSSVALLSLICASPVVYGETTSDSGPQKTTVSSVEKNSTTTSSTTPVKDSSTSSTTSSSTKDSTSSSSSAKTETSTTSKLETQNSTQASSSTTSRSTTKSSTSSSTESSSTTNSSTQETTQSSASPVTTLKATSKSYGVKPGVTISKNELLQLITYTNGDKNNLDVIITSNYAYISKNGQQNSKVYYTDLNALIGPANLNNIQVMTIAQALKLGFTPAQGNANKNIEVINCSLPGQYKITFRDRKTGLSTTTTVTVGNPASAVVSGNTQNSGTVNQTTMTTSSSTVATPKTNNATTKSPAPIATKSSVGTTKKNPVSTSKYTMPKTGEKVNHILSTAGVLMTLIVGSVALIWKF >NC_018081.1|WP_010738504.1|509022_509259_+|type-II-toxin-antitoxin-system-RelE/ParE-family-toxin MKKVIFKKQPLKFLKKQDEKTKSRIIKAIYALPSGDVKPLQGHSSYKRLRVGTFRIIFDDDGKVCIIARIGNRGDIYK >NC_018081.1|WP_010738503.1|508788_509022_+|hypothetical-protein MTTKQEELSYAIKNLDDEATEIVLQLVYKLSNGNDLINEDGEVIVDDFYKKLLSSIDETDSGQDFTYEELKKELGIM >NC_018081.1|WP_010738502.1|508046_508787_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MSETMAERIKRLRIEHNMTQEELGEKVGIKRAAINKYEKGNVENMKRSMIEKMSSIFGVSPVYLMALDDYSSSSIEKIYNQLSPPRQEKVYVFAKNQLDEQEKENSRNKNITSLEQYKQRKQQKKSMSVFYWCGAVSAGTGEFLADEYREEITLPTEIIPDDADFCLTVNGASMEPIFHDDDYVFVKRQLEVFSGAIGVVILNGQAFLKRIWFENDIARLQSFNSDYDDIIVTENDDFRIIGKVVM >NC_018081.1|WP_010738501.1|507664_507883_-|hypothetical-protein MNKEKLRSIIVLNGENQNVLSLFMGITPQSFSGKINERNGAEFTQSEIKLIKDRYNLTAEEVDEIFFSHFVS >NC_018081.1|WP_010738250.1|507324_507609_-|hypothetical-protein MQLNIPDEVIQNELASNITFIVLKEIEKRSSLLTKTVELPPYPNKSQVKEILRIGDDKLSGWISKGLKIQQWSEQDIRIERTELQRFLKETFEI >NC_018081.1|WP_010720150.1|513459_514149_-|50S-ribosomal-protein-L1 MAKKSKKMQDALKKVDSSKVYPVAEAVALAKETNIAKFDATVEVAYRLNVDPKKADQQIRGAVVLPNGTGKTQTVLVFAKGDKAKEAEAAGADFVGDDDMVQKIQNGWFDFDVVVATPDMMATVGRLGRVLGPKGLMPNPKTGTVTMDVTKAVNEVKAGKVTYRVDKAGNIHVPIGKVSFDNEKLVENFATIHDVLVKAKPSAAKGQYMKNITVTTTFGPGIHVDQASF >NC_018081.1|WP_010720151.1|514252_514675_-|50S-ribosomal-protein-L11 MAKKVEKIVKLQIPAGKATPAPPVGPALGQAGINIMGFTKEFNARTADQAGLIIPVVISVYEDRSFTFVTKTPPAAVLLKKAAKIDKGSGEPNKTKVAKVSSDQVKEIAELKMEDLNAADIEAAMRMVEGTARSMGITVE >NC_018081.1|WP_010720152.1|515213_515882_+|L-serine-ammonia-lyase,-iron-sulfur-dependent,-subunit-beta MKELRYRSVFDIIGPVMIGPSSSHTAGAARIGKIVRSIFGEQPDSVDIYLYESFAKTYRGHGTDIALVGGLLGMEPDDERLADSLQLAYEAGMEVLFVPKGEKAEHPNSVKLLLKKGKRKLSVTGISIGGGNIQISELNGFKISLSMGTPTFIIVHQDVPGMIAKVTNILSETNTNIGTMTVTRESKGENAIMIIEVDDPQVDDTISKLTQLPKIDSVNYFD >NC_018081.1|WP_010738508.1|515895_516762_+|L-serine-ammonia-lyase,-iron-sulfur-dependent,-subunit-alpha MFFSIEELVRQAENYPSVAELMIAVEMDMSGRPREQIIAIMEKNLSVMEQSIAEGNEGVTSVTGITGGDAQKLARYLKEADFLSGETILSAVRNAIAVNEVNAKMGLICATPTAGSAGVVPGVLMAVRDRLSLTHEQQIEFLFTAGAFGLVIANNASISGAEGGCQAEVGSASAMAAAALVCAKNGTPHQAAQAIAITLKNMMGLICDPVAGLVEVPCVKRNALGSSQAFISADMALAGIESVIPPDEVVAAMYQVGRQMPAIFKETAEGGLAVTPTAKRLTEDILNR >NC_018081.1|WP_010738509.1|517014_517899_-|alpha/beta-fold-hydrolase MKNWRKSGIVGFLLMISVLFISGCQTKETSQSSEAAKTVETTQATKEKETQSTTPTLFFHGYSGTVNSFKGMIQRLESSESGKKELTLTVDVNGNVQAEGELSKEADNPMIQVLFVDNKNNEWNQTEWIKDCLSYLQQTYGINQVNLVGHSMGGVSGLRYLATYGQDQTLPKVDKFVAIAAPFNDFEENNGQSISDELANGPAIASSRYQDYQRLIGNVPTTTQILLIAGQVSETDLSDGTVPLSSALAVYALLKQHGNQVEEKVITGENVTHSMLHENKEVDALTRQFLWNMK >NC_018081.1|WP_010720157.1|518142_518688_-|transcription-termination/antitermination-protein-NusG MESFEKNWYVLHTYSGYENKVKANIESRAQSMKMADFIFRVVVPEETEKEVKNGKEKEIVHKTFPGYVLVEMIMTDASWYVVRNTPGVTGFVGSHGAGSKPAPLLPEEVSHILRSIGMSLRQTDLEIEVGEVIKIIEGAFAGLEGQVTEVDEEKEKLKVNIDMFGRETSTELDFEQVDKID >NC_018081.1|WP_010720158.1|518787_518958_-|preprotein-translocase-subunit-SecE MKFIKSVKDEMKQVTWPSGKQLRKDTLVVIETSIIFGVMFFVMDTAIQSLFAYLLK >NC_018081.1|WP_002294578.1|518976_519129_-|50S-ribosomal-protein-L33 MAKKKAALACSVCGSRNYTKSVSEGKSGERLEINKFCKYCNQYTLHKETK >NC_018081.1|WP_010738510.1|519289_519931_+|CBS-domain-containing-protein MLLKTLVYKKKDLTTVTETSTLEEALAILESSGYRCVPILDASGNIFRGNIYKMHIYRHKANGGDMTLPVTHLLKNATKFIYLDTSFFKIFFTIKELPYIAVLDNDNHFYGILTHSTLLNMLSQSWSVEQGSYVLTIASTGKQGDLATIAKIIAKHSSIASCITLDIEKEEYIRRTLITLPAHTDQKVCDTIVNHLEKKNYKVIEIENLQNPE >NC_018081.1|WP_010738511.1|520141_520645_-|QueT-transporter-family-protein MQKTMERQRLMVVVVNGIIMALYLALTILVAPVSSGPIQFRISESLNHLVVFNRKLLWGVLGGVIVYNAFFGFGILDVVYGGGQTLISLGLTALLQNKVKNVKIRLALNTLFFTISMGLIAYMLVPTGGQAFWTTYGTLALSEFIIMAISAPLMYYLDRSLDFEKRV |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_018081_2 | 1209433-1209598 | TypeII |
II-A,II-B
Consensus repeat of NC_018081_2
|
2 spacers
spacers of NC_018081_2
>2.1|1209468|31|NC_018081|CRISPRCasFinder CTTTCGCAAGCTCTAACCACTCGTCGTCGTT >2.2|1209534|30|NC_018081|CRISPRCasFinder TGTAGAAGCGTTGTGCTTTACTCGATCGCT |
csn2,cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018081_2
The CRISPR arrays of NC_018081_2 >merge|NC_018081|2|1209433-1209598|CRISPRCasFinder GTTTTAGAGCTATGTTGTTTTGAATGCTTCCAAAACTTTCGCAAGCTCTAACCACTCGTCGTCGTTGTTTTAGAGCTATGTTGTTTTGAATGTTTCCAAAATGTAGAAGCGTTGTGCTTTACTCGATCGCTGTTTTAGTTTTGTGTTATTTTGAGTGCTGACCTCA >NC_018081|2|2|1209433-1209598|CRISPRCasFinder GTTTTAGAGCTATGTTGTTTTGAATGCTTCCAAAA CTTTCGCAAGCTCTAACCACTCGTCGTCGTT GTTTTAGAGCTATGTTGTTTTGAATGTTTCCAAAA TGTAGAAGCGTTGTGCTTTACTCGATCGCT GTTTTAGTTTTGTGTTATTTTGAGTGCTGACCTCA
>NC_018081.1|WP_010737005.1|1208657_1209317_+|type-II-A-CRISPR-associated-protein-Csn2 MNLNFSLLEQPISFEKALIFVIEDVEVFSKVVHGVYQYGENSMLKFFNDKLQLLKPSELIVVTDILSFDSQAPTTLKLIYADLEQQLNENIELKSRIDQLTTKVQEWISEELLEHELDLVCEEMSMVELFKALKIRITTQPESIFQKIMEILQIYKYLVKKKCLVFINVGAYLTTTEMAELQEYISLCHMPVLFIEPGKIKGLKQTVLDQDYFLCEEMW >NC_018081.1|WP_010720992.1|1208323_1208668_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MSYRYMRMLLMFDLPTETSDDRKVYRRFRKFLLSEGFIMHQFSVYSKLLLNGTANQAMLGRLKAHHPKKGLVTLLTVTEKQFSRMVYLCGEKDLSPANSDERVIFLGEDVEDEP >NC_018081.1|WP_010720993.1|1207460_1208327_+|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGWRTVVINTHSKLTYANNHLVFKNAQQTEKIHLSEIDILILETTDITITTMLLKRLTDEKILVIFCDDKRLPSSQLFSYYGRHDSSLQLSKQIQWESDLKGVVWTTIIAQKIHNQCRFLQENDFVEKASALSKLSEELETFDPTNREGHAARIYFQTLFGNQFTREESNEINAGLDYGYTLLMSLFAREIVKNGCMTQFGLKHANQFNDFNLASDLMEPFRPLVDQIVYTYRDQPFPIIKRRLFDLFSQKYLYGKKEMFLTNIVTDYTNKTIKTLNNEGKGVPYFGI >NC_018081.1|WP_010737004.1|1203468_1207479_+|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9 MTKDYTIGLDIGTNSVGWAVLTDDYQLMKRKMSVHGNTEKKKIKKNFWGARLFDEGQTAEFRRTKRTNRRRLARRKYRLSKLQDLFAEELCKQDDCFFVRLEESFLVPEEKQYKPASIFPTLEEEKEYYQKYPTIYHLRQKLVDSTEKEDLRLVYLALAHLLKYRGHFLFEGDLDTENTSIEESFRVFLEQYSKQSDQPLIVHQPVLTILTDKLSKTKKVEEILKYYPTEKINSFFAQCLKLIVGNQANFKRIFDLEAEVKLQFSKETYEEDLESLLEKIGDEYLDIFLQAKKVHDAILLSEIISSTVKHTKAKLSSGMVERYERHKADLAKFKQFVKENVPQKATVFFKDTTKNGYAGYIKGKTTQEEFYKFVKKELSGVVGSEPFLEKIDQETFLLKQRTYTNGVIPHQVHLIELKAIIDQQKQHYPFLEEAGPKIIALFKFRIPYYVGPLAKEQEASSFAWIERKTAEKINPWNFSEVVDIEKSAMRFIQRMTKQDTYLPTEKVLPKNSLLYQKYMIFNELTKVSYKDERGVKQYFSGDEKQQIFKQLFQKERGKITVKKLQNFLYTHYHIENAQIFGIEKAFNASYSTYHDFMKLAKTNQKAMQEWLEQPEMEPIFEDIVKILTIFEDRQMIKHQLSKYQEVFGEKLLKEFARKHYTGWGRFSAKLIHGIRDRKTNKTILDYLINDDDVPANRNRNLMQLINDEHLSFKEEIAKATVFSKHKSLVDVIQDLPGSPAIKKGIWQSLKIVEELIAIIGYKPKNIVIEMARENQKTHRTSPRLKALENGLKQIGSTLLKEQPTDNKALQKERLYLYYLQNGRDMYTGEPLEIENLHQYEVDHIIPRSFIVDNSIDNKVLVASKQNQKKRDDVPKKQIVNEQRIFWNQLKEAKLISPKKYAYLTKIELTPEDKARFIQRQLVETRQITKHVANILHQSFNQEEEGTDCDGVQIITLKATLTSQFRQTFGLYKVREINPHHHAHDAYLNGFIANVLLKRYPKLAPEFVYGKYVKYSLARENKATAKKEFYSNILKFLESDEPFCDENGEIYWEKSHHLPRIKKVLSSHQVNVVKKVEQQKGGFYKETVNSKEKPDKLIERKNNWDVTKYGGFGSPVIAYAIAFVYAKGKTQKKTRAIEGITIMEQAAFEKDPTTFLKEKGFPQVTEFIKLPKYTLFEFDNGRRRFLASHKESQKGNPFILSDQLVTLLYHAQHYDKITYQESFDYVNTHLSDFSAILTEVLAFAEKYTLADKNIERIQELYEENKYGETSMIAQSFLQLLQFNAIGAPADFKFFGVTIPRKRYTSLTEIWDATIIYQSVTGLYETRIRMGDLWAGEQ >NC_018081.1|WP_010720995.1|1202666_1202795_-|hypothetical-protein MSKKWIKLGIGLGILTLGAVYLGKKTGLLEDDRHLYDEFESI >NC_018081.1|WP_010720996.1|1200918_1202613_-|oleate-hydratase MRKSKAIMIGAGIANMAAAVYLIQEGNWRGDQITFYSLDDHGSNDGAPTDTVVDEYWNKNHPLENKKGYIARGGRMLNYRTYVDLMDLLSRIPSVTEPGMTAAEDTRDFDAKHRTFDKARLMEGGKGIIDGGKLGFNNKDRLLLTKLIAMPDSEEEKLDNVTIEEYFKDDPHFFETNFWFMWETTFAFRTRSSAQELRRYMHQMIYEFTQIEHLVGVNRTRYNQYESIMLPLINYLKDQGCQIILNRRVVDWEFKETPMQDEITVTGLKMINTLTNEEEHVVVDGDTGVLFTNGSITDSATLGDYDTPAVENMDYGAASSLWKKASERFYNLGNPDKFFADRDASEWVSFTLTTKDHLLLNEITRITTQVPGNALNSFISTTPITPLGQKDVNMSIVVHHQPHFTSQKPNETVIWGYFLYPRRRGEFVDKQYIKMTGKEMLEELIGQLSKVDPGPENIRTKETEIFDSVVNNIPVYMPYASALFNNRAKSDRPKVIPQHSTNLAFTGEFVEQPYQMIFTEQSAVRSGEIAAFHFAGIPMSRLVKTPRYDKDIPTLMRAAKKMFE >NC_018081.1|WP_014834430.1|1199945_1200791_+|hypothetical-protein MVTFACSVTLFVIISVGIIQVTFFDQAYLLGQIEKTKYSELVLAEAAQNFRKENTEESEFSEVVATALSPRFVEEALRPFIQHTYEETNYELRDSNEVSEIIAQAVATVATKKQLTIDKEEKNKIETMIFIYMYHFQSALGDRYLTIFIENIVSARKIVVPLFYICLGLLAFWLVYLYRLINKTPFSFLRYGMFILGTTGSMFCVLAGLLYIQDVLHNIAFHSQATLQLMTHYVQDLLLYPAIIGGILLFCAVLFGGGSKLLQKRQNKKWLKTGSSTLKKA >NC_018081.1|WP_010737002.1|1198523_1199657_-|alcohol-dehydrogenase-catalytic-domain-containing-protein MKAVTWQGNQKMEIRNVDDPKIVEPTDAIIRITATAICGSDLHLYHHGEAVLEKGYVVGHEPMGIVEEVGPAVKKLKKGQRVVIPFNISCGHCHFCTHEMESQCDRSNPDQLYGGLFGFGRLNGNHWGGQAEYLRVPFADSTSFIVPDNDLADEKVLFLSDILPTAYWSVQNANVKKGDTVVVLGSGPVGLFAQKFAAMAGAERVIAVDPVQHRIDKAARYNHVETYLLEDTQSAGKELYELAKGGADVIIDCVGMDGLEPVKEKAKNLVSLQSGTISPIQMAAQAVKKFGTVQITGVYMTPASSYPLQEFFMRDITVKHGQAPIVHLMPKIYEMIAAGLFDPTQIITHAMPLADAARAYEIFDKKEDKNIKVVLKP >NC_018081.1|WP_014834429.1|1198184_1198496_-|YrhK-family-protein MPEIKRKSHEIDIGKEEDIEIAGQRFRLYFQNRYTLLSLAVDLLTGIFYIFGSVALLTDIPDRYSTYCYLVGAIFLTARPILKIVRNVFIYDEKKNKKERKKE >NC_018081.1|WP_010737001.1|1197419_1197887_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MKGYELVKIRERPEWLEQAAQWFTSKWHLPLSFYQESMEDSLQSSNAVPQWYIVVTSEQKIIAGAGVIANDFHDRPDLTPNVCALFVEKEYRNQGIAKEILSFIRKDMGALGISQLYVATDHTGFYERYEWEYLTTVQDNEGIPVYLYQLAIFTT >NC_018081.1|WP_010720990.1|1209935_1210307_+|DUF1622-domain-containing-protein MFDTNLITYLDWLIAILNIASIIILLVGIFLVLKNLFDWHPLKKDYEQRNFRNAEVRKLLASYILLSLEVLVVADIIESVIKPTWTDILKLAVIIIIRTIISYFLNLETQDKKQVKVGTHNGN >NC_018081.1|WP_010737006.1|1210296_1210656_+|DUF1622-domain-containing-protein MEINLIEKLAPYLEQLVIILDVFAILIILWGAWLAIKDFLYFSFTERRIKAERINQNNAIKKMLGGYILLSLEVLISAGIIESIIKPTLEDVFQLAALVVIRTIISFFLNKEIGSDARQ >NC_018081.1|WP_010720987.1|1212814_1214647_+|tyrosine-decarboxylase MKDMDIKAVFIGDKSENGAFYKMQLNKMVDEHLGWRENYLPGDVAAISEADKQAPRYIATREHMVEVLDEVSQRMRAGSIPWHSAGRYWGQMNAETLMPALLAYNFAMLWNPNNVALESSMATSQMEAEVGQDFADLFNMTGGWGHITADGSIANLEGLWYARCIKSIPLAVKEVYPEKVKDKTDWELLNLSVEEILEMVGTFSDEELDAVKAASSRSGKHLQELGKWLVPQTKHYSWMKALDICGIGLDQMIAIPVQEDYRMDVAILEKTIRELAAQKIPVLGVVAVVGTTEEGQVDSVDKIVELREKLYKEGIYFYLHVDAAYGGYARALFLNEAGEFVPYESLPDFFEEHHVFNYDVSIDQSVYDGFKAISEADSVTIDPHKMGYVPYAAGGIVIKHKEMRNIISYFAPYVFEKSVKAPDMLGAYILEGSKAGATAAAVWTAHRVLPLNITGYGQLIGASIEAAQRFRAFLEQLSFTIKGKTIEVYPLNHPDFNMVNWVFKVKGCTDLKTINELNEKMFNRSSYMEGDVYSEHFITSHTTFMKEEYGDSPLPFIERIGLSKEEWQKEQKVTLLRAAIMTPYLNDDKIFEFYTQGITKAMEKTLNEIL >NC_018081.1|WP_010737008.1|1214962_1216393_+|amino-acid-permease MTDSKTSQITTLTFIGMTCALVASVRNIPDVAATGWTMLFYMLVAVLFYAFPISLISGEFAGMFPQKGGPELWVSNSLGRKWGFVVSWLLWVQMFPGMVMVASALAPLLGNMIDNVPLGLNSKFTLIVILVVYWIITLLNLKFDMAKIGGKIGVWLGLYIPLAIMLLLGIFSWIKVGIQPHATLGHFSWAKLIPDAETAKSFVYFAPIMFIFTGIEMSSVYITRLKNPVKTYTKGIFAALIFLFFVNTLNALVVANVVPKGQMELNNIAQSISIYCQILGLPHIIVNIFSLLVFVGVAVQLSAWASGPAKTVTASARKGAYPPKFNFWKTNQFDVSKSVILTQSTIISIFALFYLLIPGVNQAFLMLVNSTTVIYCIVYVIMGIAILKLRKAKPELARPFRIGKKGGKGDLGAWIVVLVLFAAIGCSVGLTMQAGTLINFFAVTVISLILFIAPLCIDKIRKPSWEQEVQQKLNQE >NC_018081.1|WP_010737009.1|1216409_1217729_+|amino-acid-permease MERTTMKKTLTNRNIQMIALGGAIGTGLFLGSAKAIKLAGPAVLLTYFVCGLAIYGLMYAMGELFLSNNEFQSIGDFIQYYLGERWAFLVNWTYWLCWMGAGLTELTAIGLYIRFWLPALSPLISGIFALIALVIINVVAVRWFGELESLFSTIKIFGILLFILLGIGVCFLYFKSPRIGVRENFDQLQTIFPFGLTGLVAAFPMVLFSFAGVEMIGLTVGETADPQKNLKKAIQCLPARILFFYIGTIVAILLVVPWQSLDLKESPLVTMLQFIHCSKGAGVINLIILVASLSSTNSAIYSTSRILYNTAKEKNLSKWFLTLSSRGVPLHGILFTGGMFLLGLCLHFFVSDSRILFQLLAGMTTISFLFVWSAILFAHLKLTKSQLKKWKDRLILCFFGLVGISLFFEPTTRVIPVVSVVWFGALNLIYQRIRQTSPK >NC_018081.1|WP_010737010.1|1217838_1220382_+|HAD-IC-family-P-type-ATPase MVWYKETAQEVMKTLKTTPDGLNQDERISRLKENGYNHIEVKKKVSPLRKFLKHLTELLMIILLVASLLKFFTGEVIEGSIILAVVLVNSFVGYWQERKAEEALNGLEKLLGQNAVIFTEGIKELVPAKELVPGDLLALKAGDVIPADVRLIEVHDFMVEEAALTGESEAVEKTSERLTTTVSTGDQKNLAFSGTLVQTGTAIGVVIETGDTTEIGKINQALQSVQQQTTPLVKKINQLNKQIFRGILFLSLFLLFFTTFRYGLEMNFLFSTIIALIVSMIPEGLPAVLTMILSLGVNEMAKEQAIIKGLPSVETLGSMTVICSDKTGTLTKNEMSVVETVTDQEETMLAIMKNCQEIQTKANQNVTELTGNPTELALLRYTAKASLPLEPVKGKIPFSSSYKYMATMHDKQEHAIVYVKGAPEVLLAKANLTPKQVGKWQEEAMKLAQKGQRVLGFAYKTLAPDQELGHDQLNELTFVGIAGIIDPPKESAIRAVKECQNAGISVKMITGDHKDTAQAIAEQIGLKHTKNVLEGIDIDRLSDEELAKQVKSVDVFARTTPEHKLRIVDALQKNEEIVGMTGDGVNDAPALKRADVGIAMGIKGSEVSKQAADRVLGDDNFHTIAKAVKEGRRILDNLQKTINFFLPTALAQGLVIIWALLVNQPLPLTPVQILWVNMVTTITLSYALGFEKAGKDTMSRSPRDPKQGILTRYSVFRIFYVSLLIMIPAYLLAMSFEGQALQQTMLLQNIVAAQAVYMINCRELLDPSLNRSLFENKALFLSLGMLVLLQAGVIYLPIAQQLIGTTSLSLTEQLPILLNILILFVIVEIEKRISKMIAKKRNAELPT >NC_018081.1|WP_010737011.1|1220519_1221974_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MYSLMKKIITEKDIKRQVSLVELLLNHSQITVNELAEVVNTTERTIFSDLQTIKTQLPKGWLINSDQSGIQLKNEQNLLTNELWEIFLTQSISVQLLKELLTIKEVATPTFLARNGLSYETLNRHVKKLNQQLVVYELQIEQNRHRLSFSGEEETIRLFYHRLLMPFTHNNYFFEDYSIHESHYFRFLKRLRQAELAVDTEEVFGICWFFINTIRIKAGCRIPTSLFSTQDQLFLLYAPELEKLYRTEGVYLKDKEAAFAFSCFLDSWNYNNSYPPMILDILHRHPAETNIREFVNRLSESLAIKELEQTNLPENLILLLLKYYESPLLIEQTTKQYHYYLKEYEQEYPELYPHKFALLQQVKESTSMVKKVTNETYFFYLLSLLIQQTLLAVQPYQATIYFIFQGEPSWKAFLQQELNAYLGKRVILEPIELSQLSDITIKKNDLLVSNIPIDTPPMPVIYLSTIPTKNELDRLSDLSLRSYL >NC_018081.1|WP_010737012.1|1222230_1222830_+|NUDIX-hydrolase MENRLNDYRRLLAIAQAGLLYGKDVFDKERYEELQEISLKLLSEVGLETKEEWTSLIEAHEGYPTPKVDVRAWIKQDEKILLIEDTKTQEWSLPGGFAEVGLSPKENIRKEVKEETGLEVEVGQLLAIFDTNLRTDIPQAFQYYKIVFSCAILSGTFVANHETSNMKFFHLNDLPKLSLKRTTKEQLLILEKATLPYCD >NC_018081.1|WP_010737014.1|1223390_1223915_+|GNAT-family-N-acetyltransferase 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_018081_2 | 2.1|1209468|31|NC_018081|CRISPRCasFinder | 1209468-1209498 | 31 | HG796332 | Uncultured bacterium plasmid pRGI00484 | 2500-2530 | 9 | 0.71 |
NC_018081_2 | 2.1|1209468|31|NC_018081|CRISPRCasFinder | 1209468-1209498 | 31 | NZ_CP007795 | Azospirillum brasilense strain Az39 plasmid AbAZ39_p2, complete sequence | 819082-819112 | 9 | 0.71 |
1. spacer 2.1|1209468|31|NC_018081|CRISPRCasFinder matches to HG796332 (Uncultured bacterium plasmid pRGI00484) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
ctttcgcaagctctaaccactcgtcgtcgtt CRISPR spacer ctttcgcaagatttaaccactcgttaatcaa Protospacer ********** *.***********.. .
2. spacer 2.1|1209468|31|NC_018081|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP007795 (Azospirillum brasilense strain Az39 plasmid AbAZ39_p2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
ctttcgcaagctctaaccactcgtcgtcgtt CRISPR spacer gctcgacaagctctacccactcgacgtcgac Protospacer .*. .********* ******* ***** .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
66364 : 155215
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_018081|66364:155215|DBSCAN-SWA 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100 | Enterococcus_phage(26.47%) | capsid,tail,terminase,tRNA,protease,integrase,head,portal,plate | attL 67389:67404|attR 155586:155601 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
422269 : 506150
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_018081|422269:506150|DBSCAN-SWA 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79 | Bacillus_phage(26.32%) | capsid,terminase,tail,protease,portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1586014 : 1593612
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_018081|1586014:1593612|DBSCAN-SWA CATGGCATATCAAGCACTCTATCGTGTCTGGCGTTCACAGCGTTTCGAAGACATCGTCGGGCAAAAAGCGGTGACACAGACGTTGAAAAATGCTATCGTTTCCCATAAAACTTCTCATGCTTATCTATTTACAGGACCACGAGGAACTGGTAAAACGAGTGCAGCTAAAATTTTTGCAAAAGCTATCAACTGTCCGAATAGTCAAGATGGAGAACCTTGTAATCATTGTGAAATGTGTCAGTCGATTACAGCGGGAACACAAGAAGACGTGATTGAAATCGACGCAGCAAGTAATAACGGAGTCGAAGAAATACGTTTTATTCGAGATCGAGCGAACTACGCACCGACAAAAGCAACTTATAAAATCTATATCATAGATGAAGTGCATATGCTTTCTACCGGAGCGTTCAATGCATTGTTGAAAACTTTAGAAGAACCTAAAGAAAATGTTATTTTTATTTTAGCAACAACCGAGCCACATAAGATACCAGCAACGATCATTTCCAGAACACAACGCTTTGATTTCAAACGAATCAATGCAGCAGATATCGTTGAGCATTTGGCATACATTTTAAAGCAATCAGACGTACAATATGAAGAACCAGCACTAGGGGTTATTGCTCGAGCAGCAGAAGGCGGGATGCGTGATGCGCTAAGTATCATGGACCAAGCGATTTCTTTTAGTAATGGGATCGTAACTGTGGATGATGCGATGCAAGTTACCGGTAGTCTAACCAACGAGATGATGGATGAATTTTTAGGCGCTTGTGTGAATAATGAAGTGCCCAAAGCGTTAGAATCATTAACAGATATCTTAGCTGCTGGTAAGGAAGCACGGCGCTTTTTAGAAGATCTTTTACAGTATTGTCGTGACTTACTGATGTACCAACAAGCACCAAACCTCGTAGCAGAACGAACAACTTCACTTCGAGAACCATTTGTCGAACTAGCAAAAGAAGTACCTGCACCTCGACTTTTTCAGATGATCCATATTTTGAGTGAAACACAAAATGAGATTCGTTTTACTAATAGTGCTACGATCTATCTGGAAGTAGCAACCGTCAAGCTAGCTCAAGCTTCTGGTTCAGCTGCTCCTTCAAGTAGTAACCAAGCAAGTGAAGTAGACAGTCAGTTAATTAATCAGCTACAAGCAGAGATCAAAGAGCTGAAAAAAGCGATCAATGAGATCAAAACGAATGGGGGAACCCCTTCAACTACTGCCAAGCAAACACAAGCTCCTGTTCAAAAGAAACAAGCAAGTACGTATCGGATACCAACTGAACGAGTGTATCAGGTTCTAAGAGAAGCGACCAGAAAGCATTTGAATGAAGTCAAAGAAGTCTGGGACGATTTGTTGATGAGTTTGTCTGTGACACAACGAGCGATGCTTAAAGCAAGTGAACCAGTTGCGGCTAGTCCTAATGGGTTAGTCATTGCGTTTGATTACGAGATCGTTTGTCAACGAGCTGCTAACGACGAAGAATTACAGTTGGCGATCCATAATAATTTAAGTCGAATGATCAAAGACTATGCACCAGATTCAGTCTATATCACGAGAGAAAGCTGGCCAACGATCCGCAAAGACTATTTAGTCCAAGCAAAAGACGGGAGTAATGATGATTCTTTTGCTCCGGAAGATTCAGATGAAGAGATCGAACTGATCCCTCAACAAGCACCAAGTGAAGAAACGATCGTCACGAAAGCCGAAGAAATCTTTGGCACAGATGTTGTGACAATCATTGATGATTAAATAAAAAAGGAGAATGATCAATTATGATGCGCGGAATGGGAAACATGCAAGGGATGATGAAACAAGTCCAAAAAATGCAAAAAGAGATGGTTCAAGCACAAGAACAATTGAACGAAACAGAATTTACTGGTGTAGCAACCAATGAGTTAGTGAAAGTTATTTTTACAGGTGATCGTCGGATGAAAGACATCCAAATCAGTGAAGGTGTCGTGGATCCTGAAGATACAGAAATGTTGCAAGACCTGTTGATGATGGCTGTCAATGATGCTTTGACAAAAATCGATGCAGAATCTGAAAAAACAATGGGAAAATATACTAAGGGGTTACCCTTCTAATTTTTCCTAAAGGGGTAATGAAAATGCAATATCCAGAACCAATTGCTAAATTGATCGATAGTTACATGAGACTGCCAGGGATCGGTCAGAAAACAGCCACAAGATTAGCTTTCTACACGATCGATATGAAAGATGAAATCGTGAATGAATTTGCTAAATCGTTGTTAAGTGTCAAACGAGATCTTCATTTTTGTAGTGTTTGCGGCAACATCACAGAAGAAGACCCATGTGAGATTTGTAAAGATCCTTCAAGAGACCGGGGGGTTATCTTAGTTGTCGAAGAACCAAAAGACGTGATGGCGTTAGAAAAAATGCGGGAATATCGTGGGCTTTATCATGTTCTACATGGGGTTCTTTCTCCAATGGAAGGGACTGGACCTGAAGATATCAACATTTCTTCGTTACTTGAACGCCTACATGATGATCAAGTGAAAGAAGTGATCATTGCAACAAATGCAACCACTGAAGGAGAAGCTACTGCCATGTATCTTTCACGATTGATCAAACCGGCTGGTATCAAAGTCACTCGATTGGCCCACGGCTTATCCGTTGGTTCGGATATCGAATATGCTGATGAAGTGACCCTGTTAAAAGCGGTAGAAGGCAGACGCGAGTTATAAATTTTCTATAAAAAAGAATTTCGGCTACAATAAAGAAGTAACGCAAGAGATGGGGGCAAAAATGTGAACGGACTATTTATTACGATCGAGGGACCAGATGGAGCTGGGAAAACCAGTATTCTAAATGAGTTATTCCCTCTTTTGAAAAAAGTAGCAAAAACAAAGATCATTCAAACAAGAGAACCAGGTGGGATCCCGATTGCCGAAGAGATTCGGGCAGTTATCCTTGATCCTAAAAATGATCGGATGGATGAACGGACAGAAGCTTTGCTATATGCTGCGGCTAGAAGACAGCATTTGGTCGAGAAAGTCCTACCTGCTTTATCAGAAGGAAGCATTGTTTTATGTGATCGATTTGTAGACAGCTCATTGGCTTATCAAGGGGCGGGACGTAGAATCGGTGTTTCTGAGATTGCCCGCTTGAATGAATTTGCTACAGAAGGTACGACACCTGACTTTACCCTTTATCTCGATATTGATTCAGATACTGGATTGCATCGCATTAAAGAGAACCGAAGAGGTCAAATCGATCGATTAGATTCAGAAGGATTGGAATTTCATCAACGAGTACGTCATGCGTATTTAAAAATAGCTGAAGAGAATCCTGAACGTATTTATAAAATTGATGCAAGAAAGAGTTTTGAAGAGGTACTTCAAACAAGTTACAGAGCCATTGTTGAACAATATCCACAATTTTTTGAAAACTAGGAAGGTGACTGTATATGAAAATTATTTTAGCAATTATTCAAGACAAAGACAGTAATCGTTTATCCAATGAATTGATTGATGCCAATATCCGTGCAACAAAATTATCTTCAACTGGTGGCTTTTTGAAAGCTGGCAACAGTACATTTATTGTTGGGATTGAAGACGAACGTGTAGAAGAAGCATTAGAAATCATCAAAAAAACTTGTGAATCAAGAAAACAATTTGTTTCAACACCTGTCACGTTGGATATCTCTATGGACGGTGGAGTTCCTTATCCAGTAGAAGTTGAAGTCGGTGGAGCAACCGTCTTTGTGTTACCAGTTGAAGGATTTCATCAATTTTAGGAGGCGCCATGGATCAAGAATTTACGCTGGATCAAATGCAACCTATCGTGTATCAACAGCTTCAACGAAGTTTTGAGCATGGGCGCCTCGCTCATGCTTATCTTTTTGAAGGCGAAAAAGGAACGGGAAAACACGAAATGGGGATTTGGTTAGCACAACACCTGTTTTGTACGAATCTGCAGGAACAACTTCCTTGTGGAGTATGCAATAATTGTCAACGAATCCAAAACCAAGAACATCCAGACGTTTTAACGATCGTACCAGAAGGGCAAACGATCAAAGTCGATCAAATTAGACGTTTACAAACCGAATTTAGTCGTAGTGGTTATGAATCTCGGAAGAAAGTTTTCCTTATTCAAGAAGCAGAAAAGATGAATGCAAGTGCAGCAAATAGTTTGCTTAAGTTTTTAGAAGAACCACCAGGCGATTTTCTAGCGATCTTAGAAACAGATTCGATTGGGCGAATCCTACCAACGATTCAATCACGCTGCCAAATCTTGCATTTTCAGGAGCTGGCTAAAGATGCGTTGATTTATAAATTACAACAAGCACAGATTCCTTTAGAAAAAGCGAAACTTTTGACTTTCTTGACGAACAGTTTCACAAAAGCAGTTGAAATATCGCAAAATGAATGGTTTAATGATGCTAAGGATTCGATTCAACAGTGGTTTGTGTATTTGCAAAAAAATGATACACAAGCATTCATTTATGTTCAAAAAAAGTTAATAAAGACTTTTAAAGAAAAATCGCAACAATTTACTGGTTTATCGATCTTAATGTTTTATTATCAAGAAGCTTTACAACAAGCTTTAATAGCAGAAAATCTTAGAAAAGTAACACGTATTAATCAGACGATTGAGCGTATTTTATTAGCGGAACAGAAATTAAGAAGCAATGTCAGCTTCCAAGCAGTAGCGGAACAGTTTGTTTTACAAACAATTACTGGCTGAGACAGCAGGAAAAATGAGGGTCAAGGGGGATGGAAATGGTCGAAGTAGTAGGTGTCCGTTATAAAGAAGCAGGTCCTATCTATTATTTTAAACCTGGTCAATTAACGTATGAATACAACGAGAAAGTAATCGTTGAAACTCAAAAAAACTTACATATTGCAACTGTCGCCATTCCTAAAGCAGAACTTGATCCGGAAGAATTGCCTGAGCAAATCAGTTCAATTTTGCATAAAGCGACACAAGCAGAACTCGAAAAAGAACAAAAAAATAAAGAAGATGCAGAACAAGCCAGG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_018081|1586014:1593612|1588121_1588718_+|WP_010718690.1|DBSCAN-SWA MQYPEPIAKLIDSYMRLPGIGQKTATRLAFYTIDMKDEIVNEFAKSLLSVKRDLHFCSVCGNITEEDPCEICKDPSRDRGVILVVEEPKDVMALEKMREYRGLYHVLHGVLSPMEGTGPEDINISSLLERLHDDQVKEVIIATNATTEGEATAMYLSRLIKPAGIKVTRLAHGLSVGSDIEYADEVTLLKAVEGRREL >NC_018081|1586014:1593612|1588781_1589426_+|WP_010718689.1|DBSCAN-SWA MNGLFITIEGPDGAGKTSILNELFPLLKKVAKTKIIQTREPGGIPIAEEIRAVILDPKNDRMDERTEALLYAAARRQHLVEKVLPALSEGSIVLCDRFVDSSLAYQGAGRRIGVSEIARLNEFATEGTTPDFTLYLDIDSDTGLHRIKENRRGQIDRLDSEGLEFHQRVRHAYLKIAEENPERIYKIDARKSFEEVLQTSYRAIVEQYPQFFEN >NC_018081|1586014:1593612|1593351_1593612_+|WP_002328071.1|DBSCAN-SWA MKTYVGLLDKIRVIKTQPLLVRFTLETIHQPLNCIVANVEIADKLMMMEERKYNIAVTGHLNRRNQLVVESLQVRNPDQYTRNLKI >NC_018081|1586014:1593612|1591572_1591917_+|WP_010718685.1|DBSCAN-SWA MDKRSLYDGLNQLESELRNTLTELVEMKQALHEIVEKNTTLEMENQRLREHLRELNQVQTPADNVKQELSKSRMNLEKIYEEGFHVCYDLYGSRRENDEPCAFCLEVIYRESGR >NC_018081|1586014:1593612|1586014_1587763_+|WP_010738042.1|DBSCAN-SWA MAYQALYRVWRSQRFEDIVGQKAVTQTLKNAIVSHKTSHAYLFTGPRGTGKTSAAKIFAKAINCPNSQDGEPCNHCEMCQSITAGTQEDVIEIDAASNNGVEEIRFIRDRANYAPTKATYKIYIIDEVHMLSTGAFNALLKTLEEPKENVIFILATTEPHKIPATIISRTQRFDFKRINAADIVEHLAYILKQSDVQYEEPALGVIARAAEGGMRDALSIMDQAISFSNGIVTVDDAMQVTGSLTNEMMDEFLGACVNNEVPKALESLTDILAAGKEARRFLEDLLQYCRDLLMYQQAPNLVAERTTSLREPFVELAKEVPAPRLFQMIHILSETQNEIRFTNSATIYLEVATVKLAQASGSAAPSSSNQASEVDSQLINQLQAEIKELKKAINEIKTNGGTPSTTAKQTQAPVQKKQASTYRIPTERVYQVLREATRKHLNEVKEVWDDLLMSLSVTQRAMLKASEPVAASPNGLVIAFDYEIVCQRAANDEELQLAIHNNLSRMIKDYAPDSVYITRESWPTIRKDYLVQAKDGSNDDSFAPEDSDEEIELIPQQAPSEETIVTKAEEIFGTDVVTIIDD >NC_018081|1586014:1593612|1590755_1591580_+|WP_010738041.1|DBSCAN-SWA MVEVVGVRYKEAGPIYYFKPGQLTYEYNEKVIVETQKNLHIATVAIPKAELDPEELPEQISSILHKATQAELEKEQKNKEDAEQARLIAKEKVKKHGLEMKIIHVEYTLDRSKLIFSFTADGRIDFRELVKDLAAVFRTRIELQQIGVRDEAKLLGGIGPCGRPLCCASFLGDFVPVSIKMAKNQNLSLNPTKISGLCGRLMCCLQYENEEYELAKKALPDFGTVVNTPDGKGKVVGLNLLNRLVNVRLTGRENPIEYEWDELKNFIQVGEING >NC_018081|1586014:1593612|1587786_1588098_+|WP_010718691.1|DBSCAN-SWA MMRGMGNMQGMMKQVQKMQKEMVQAQEQLNETEFTGVATNELVKVIFTGDRRMKDIQISEGVVDPEDTEMLQDLLMMAVNDALTKIDAESEKTMGKYTKGLPF >NC_018081|1586014:1593612|1589778_1590720_+|WP_010718687.1|DBSCAN-SWA MDQEFTLDQMQPIVYQQLQRSFEHGRLAHAYLFEGEKGTGKHEMGIWLAQHLFCTNLQEQLPCGVCNNCQRIQNQEHPDVLTIVPEGQTIKVDQIRRLQTEFSRSGYESRKKVFLIQEAEKMNASAANSLLKFLEEPPGDFLAILETDSIGRILPTIQSRCQILHFQELAKDALIYKLQQAQIPLEKAKLLTFLTNSFTKAVEISQNEWFNDAKDSIQQWFVYLQKNDTQAFIYVQKKLIKTFKEKSQQFTGLSILMFYYQEALQQALIAENLRKVTRINQTIERILLAEQKLRSNVSFQAVAEQFVLQTITG >NC_018081|1586014:1593612|1589440_1589770_+|WP_010718688.1|DBSCAN-SWA MKIILAIIQDKDSNRLSNELIDANIRATKLSSTGGFLKAGNSTFIVGIEDERVEEALEIIKKTCESRKQFVSTPVTLDISMDGGVPYPVEVEVGGATVFVLPVEGFHQF >NC_018081|1586014:1593612|1592339_1593206_+|WP_010718684.1|DBSCAN-SWA MLNQKSFKGHHETGSLYLVPTPIGNLEDMTYRSVRILQEVDLIASEDTRNTQKLLNHFEIQTPQKSLHEHNYKERIPQLIAELMSGRSIAQVSDAGMPSISDPGHELVLACIQAGIPVVAIPGPTAGMTALIASGLLPQPFLFYGFLGRKKKEQQTTLETLKEYTATLIFYESPYRISATLTNMLTVFGNRQVVLCRELTKIHEEYLRGSIEELLDYIEEHPVKGECCLLVEGNTGSEEPQTQIEGSLKEQVEQLIALGEKTNAAIKAVAVKNGLKKQEVYRQFHDLD |
10 | Streptococcus_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1816862 : 1925033
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_018081|1816862:1925033|DBSCAN-SWA GATGAAAATTGATGTCTTAACACTCTTCCCACGAATGTTTGAAGGACCAATGGGTGAATCGATCATCGGTAAAGCGGTCAATAAAGGATTGTTAGAGATCAATGTTTCTAATTTTAGAGACTATTCCGATAATAAACACCAAACGGTCGATGATTATCCATATGGTGGCGGGGCAGGGATGTTGTTAAAAGTCCAACCTATCTATGACAATATCAAAGCTATTGAACAAGCAAATCCTGAAACAAAAAAACGTGTGATTTTATTGGATCCAGCTGGTAAACGATTTGATCAAGCGATGGCGGAAGAATTTTCGAATGAAGAACATTTAGTATTTATTTGTGGACATTACGAAGGCTATGATGAACGAATCCGTTCGCTAGTTACGGATGAAGTCTCTTTAGGTGATTATGTCTTGACTGGTGGCGAACTTGGCGCAATGGTGATGATTGATGCAACAGTCCGCTTACTACCGGATGTTTTAGGAAATCAAACATCCGCTCAAACAGATTCTTATTCAACGGGATTATTGGAACATCCTCAATATACACGGCCAGCAGAATTTAACGGGATGAAAGTCCCAGAAGTTTTAACAAATGGAAACCATAAATTGATTGAAGAATGGCAACTGAAAGAATCCTTAAGAAGAACCTATCAACGCCGACCTGACTTATTGGAACAATTATCAATGACTCCACAAATGCTGAAATTGTTAGAAGAAGTCAAAAAAGAAGAATCAGACGAAATAGAATAAGAAATATCAATATGACTCTTTACACTAAATTGATAGTATGATAGTATCTTATGGTGAGTGCAAAAGCACTTAACTATTACGATGTTCCGCTGTGAGGGAAAACTCATAAGAATGTTTGGAATAAGGAGAAAAGATCAATGAATCCATTAATCGAAGAATTAACAAAAGAACAATTACGTTCTGACATCCCAGCTTTCCGCCCTGGTGACACTGTACGTGTTCATGCGAAAGTTGTCGAAGGTACACGTGAACGTATCCAGTTATTTGAAGGTGTTGTAATCAAACGCCGCGGAGCTGGAATCAGCGAAACTTATACAGTACGTAAAGTTTCTAACGGAGTAGGCGTTGAACGTACATTCCCATTGCATACACCACGTGTTGCAAAGATCGAAGTCGTTCGCTACGGTAAAGTACGTCGTGCAAAATTGTACTACTTACGTGCATTACACGGAAAAGCTGCTCGTATCAAAGAAATCCGTCGTTAATCTATCGTTATCTGATAGTGGAAGAACCCTTGAATTTCAAGGGTTCTTTTTTTGATTATTTTTATAAGCAGTAAGTCTAGATTGTTTGACATTATAGATTTGCAAGAGTGGCAAACAAGGAGCAAAAAGTCGAGTCACTTTGGTATATCTTAAATATACGTCAATCAGATGACACGATGACAGTCCTATTCATACCAAAGGGGCGACAGATCTGGTAGGTGAACGTAATCAGCTTATCAAGTTTATATGTACTACACGCAAACGCTATGCGTATTAAAGAGATCAGAAAAAAATCCTGCTAGAGAGTGTCTAAAAATATAAATTGCGACAGTTCTTGAATAATAAGAACTTTTTTTGAATGTTTTTACTAACAATCGTTTTGTCATTGGCAAGTTAACTGAAAATGAGACTGAAGAATCTGTTCTGATTCATCAGTCTCATAATTTTAACTTATTCAAAATGCAACGATGATCCCAAAGGTCGGTTGTTAAGAGAATTGAGGACTTTTTTTACATATTTACTAAACGAGAAAGTCTACTTTTTTAGGAGCGGAGGTGTCAATTATTGATTAGTGATTTCAGCTTCCTTTTGAGCCATTTTTGCCGTTACGTGTTCATCAATGCGTAGGAATGGTAGATAGATAAATACGCTAACCGCAATGATTAGAACTTGCAGTACTGCTGCTCGCCAATCTCCACCTGTCGCAAGGAATCCTGAAATAACTGGTGGTGTGGTCCACGGTATCTGAACTACCACATGATTGATTAAGCCGGCTGCAGTCGCAAAGTAGGCAGTTACTAACGAGAAGATTGGTGCTAACACAAACGGAATAATTAGACTCAAGTTAAATACGATCGGTAATCCAAAGATGATCGGCTCACTGATATTAAACATCGCTGGTGTTACCGATAGTTTAGCAAAGTCTTTATAATCTTTTCGACGACTGAAGATGAAAATCGCAATCAATAAGGCGATCGTATTTCCTGAACCACCCATAACAGCAAAAGTATCCTTGAAAGCCATGTTGATAATATGTGGGATGTGTTCATGGTTTGCATAAGCTGCCATATTTTCTTGCATGTTTTGTAGTAAGAACGGATCAAGTAAAGAACCTGAAATTACAGCTTGATGAATTCCAAAACCAAAGAATAAATTGGCGATTGATGTGATTAAGATAAAGCCAGGTAAACCAGTTGTGATGTGACTTAAAGGTCCCGTGATCGCTTTAGTGATCACGCCATTTACGTCCATGTTGAATAACTGATTGACAGCGAAAGATAGAATCGCAAAACCAGTAACAGTAATCATAATCGGGATCAATACATTGAATGACTTCAACACTGCGGGCGGAATATTTCCAGATAGTTTGATTTGCAATTTTTCATTTGTAGATAATTTAATGAATAGCTCAGTAGCTACTAATCCAACAAAGATTCCGACAAACATTCCTGATGCACCTGTATGGGAACCTGGAATAACTCCGGTTACTTCAATCGCTTTTTTTGCATTTTCCGGAGTGAACATCATTTTCATTGGTGTTAAAACGATGAAAGTTGAGATCGAAACTAAAACCGCTGCGATATGATTTGTATAATTTCTGCTAACACACATATGATAAGAAACTGCAGCTACAACTAATAGCGTCGTAATACTCAATGTTCCATTGGCGATCGACATGCCAATTTCTTGAACTTTCATTAATGTTTCGGGTTTAACAATTTTACCCATAAAACCAGTTGGTTCTAAGATAACGTAATTAATCAAAGTCACGAATCCAGCTAACATCATAAATGGCATGAATGTTGCAAATGCATCGCGTAATGTACGCATATGAATTTGATTTCCTAGCTTCGATGCGATCATACCAAATCGTTCAAACACCTGTTCCTTCTTATTTGTTTTCTTCATGGTATATTCTCCTTGTTTTTTATTTGTAAGCACTTACCGTAGTTCAATAATAGAACGGAATTTGATAAAAGTAAATAACTTTTTTTAAAATTATATACTTTAATGAAAAAGGGCAAAAAAAAGAGCTGATTTCCTCAGCTCTTTCAATCATTTTTCAACAAAAACGGCTTCAAAAACAAAATCTTGATACAAATGCCTTGTAATGGAGTATTCAAAAGGAGTCCCGTTTGCCAAAGAAACACTTTTTTCAACTTCGATCATAAAGTCTCCGGCATCAATTCCTAATATATTTGCATCAAACTCGGTTGCCAGTACGCCCTTCATCCAAACGTGAGAAGCATTGATCTCTAACTGCAGTTCATTGCGAATATAGGAATAAACCGATTTTTTCAAGTGTTTAGGTTCCAAACCAGGAATAATTGATAGCGGCATAAAAGTTTGTTCCAATGAATAGGGTTGTTGATCGACAAAACGACTGCGAACAATATTATAAATGTATTCCTTGTCGTTAATCTGTAATCGCTCTGCTATTTTTTTTGACGGTAATTCAATTGAAAACATATGAATTTCAGAGTCTACATGTTCTTCGCCAACTACGCTCATAAAACCTTCGCTTGGACCGAAAACTTTCGAATTATGGATCGGTTTGCGCAAAACTTCGGTTCCAAATCCACTTCGACTATGTAAAACTCCTTCAGAAACTAACATGTCTAATCCTTTTTTTACTGTCAATTTACTCGTATGATATTGTTTTGCCAATTCGGAACCAGTTGGTAATTTTTCACCGATTGCGTAAGTACCGTTTTCAATTTTCTTTTTTACATCAGAATAAACTTCCATATATTTCGCATTCTTCTTCATTTTTTCCCTCCTATAGTTACCGCGTAAAGATATAAATAATTATATACCTTTCTTTAATTTTAGCAATCTTTAAAGGGTAAAACAATTAACATTTATAAAAAGTATATATTTTTTAATAAAAAAATATTCCAATTTATTGGAAGCGGTGTTATGATGGAGTAGTACTCAAGAGAATGTCATTTTAGGAGGATACAATGAACAAACAACAATTAACATTTCCAGAAAACTTTTGGTGGGGTTCTGCTTGGTCAGCTGAGCAAGCAGAAGGTCGTGGTGAAACTGGAAAAGCCGAAACGGTTTGGGAACGTTGGTACAAAGAACAACCATACCGTTTTTATCAAAGGATTAGTTCAGAAATTACGACAGATCACATTCATCGTTATAAAGAAGACGTTCAACTGATGAAGCAAACCGGACATAATTCCTTTCGGGTCTCGATCTCTTGGGCGCGGATGTTCCCAGATGATGGAGTAGGGGAGGTAAATCCAAAAGCGGTTGAATTTTATCGGGATTTATTTACTGAGATGAATAACAATGGTATTAAAGTATTCGCCAATCTTTATCATTTTGATATGCCAGCAGCCCAACAGGATAAAGGCGGTTGGGAATCACGGGAAGTTGTCGATGCATATGTGCAATTTGCAGTTACTTGTTTCAAGGAGTTTGGCGATCTCGTCTATCACTGGTTCACTTTCAATGAACCGTTGGGGCCGATCTTAGGGTCATATCTGGAAGACTTCCATTATCCAAATTTGATTGATTTCAAACGAGGAGCGCAAGCGGCTCACTTTACTATTTTGGCTCACGCGAAAGCAATTGCAGCACACAAAGAGTTGAATTTGAACAGTAAAATAGGTGTTATCTTGAATTTAAGCCCGACGTTTCCAAGGAGTCAAACCCCCGCTGATGTGAAGGCAGCTGAAATTGCGGATCTTTTTTATGTTCGCAGCTTTTTAGATCCAATGGTCAAGGGTGTTTATCCAGAAAAATTAATT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123 | Enterococcus_phage(36.54%) | capsid,terminase,tail,tRNA,transposase,protease,integrase,head,portal,holin,plate | attL 1879173:1879196|attR 1914457:1914480 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2512485 : 2521544
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_018081|2512485:2521544|DBSCAN-SWA TCTAGTCATTTTTTTCTTCCTCCACTTTTTGCATTTCTTTGATGACTGCTTCGATTATTTTAGGATAGGTCTGATGTTCGATTTGATGAATCTTTGCTTCTAAGCTATCCAATGTGTCTTCTTTCGTGATCTCTATGGTTTCTTGGTGAATGATGGGTCCTGTATCTATCCCTTTATCAATGTAATGAATCGTTATACCTGTTTCTTTGACTTCCGCAGCAAACGCATCACGAATCCCATGTAAGCCAGGAAAATCAGGTAAAAGAGAGGGGTGGATATTAATGATCCTTGACTCATAAGCATTCAATAAAGTCGGACCAATAATCCGCATGTATCCTGCTAATACAATGAGTTCAATTTCTTTTTCCACTAGGATCTCTAAAATTTTTTCTTCATATTCTCTTTTAGATGAAAATTCTTTTGGTGAAAAAAAATGAAATGGTACATGTAACTTTTCTGCCCGTTCTAAGACAAAAGCATTCGGCTGGTCACAAAAAAGCCATTCAAAGGTATCTGGCAACTTATTTTCCCGAAAATAGTCAACTAAAGCTTGAAAGTTGCTGCCATTTCCTGAAGCAAATACGGCAATCTTCATTTTTCTTCCTCATCAAACAACACTGTTTTATTTTTTAAGGGAATTACTTCACCGATTCGATAAGCTGCTTCTCCTTGCTCATTGATTTTTTCAATGACTTCATCGACTTGAGAAGCTGCTACTGCTACAACCATTCCAATACCCATATTAAAAATCTCAAACATCTCTTGTTCAGGGATTTCACCTAAACGTTGGAGACAATCAAAAATCGGCAAGCTAGGCCATGAACCTAATTGAATTTGCGCGGCCGTCCCTTCCGGCAACATCCGAGGAATATTTTCTACGAATCCACCACCAGTGATATGTGCCGCACCTTTGATCTTTTGTTCTTTTATGATTGGCAGCAAAGCTGATACATAGATTTTTGTCGGCTTTAACAATTCTCGGTCCAGTGTTTCAGACAGACCCTCTATCTGATCGGTTAATGTGTAACTATTTTGTTCAAAAAACACTTTCCGAACCAATGAATAGCCGTTTGAATGAATCCCGCTAGAAGGTAAGCCTAACAGAACATCACCAACTTCGATTTCACTTCCTGTGATCAATTGCGACTTTTCTGCAACCCCAACTGCAAAACCAGCAAGATCATACTCATTTTCCGCGTACATCCCTGGCATCTCTGCGGTTTCGCCACCGATCAACGCAAGATTACCTGCTACACAACCATCCGCCACGCCAGCGACGACTTTTTCTAATTTTCGTGGATCATTTTTTCCAGTAGCTAAATAGTCTAAGAAATATAAAGGTTCCGCACCTTGAGCTAAAATATCATTGACACACATCGCCACACAATCGATTCCGATCGTTTCATGTTGATCCGCTTCGATGGCTACTAACAATTTTGTTCCTACCCCATCTGTCCCTGATACCAAAACTGGTTCTTTTAATTGGTAAGAACTTAAATCAAAACAGCCACCAAAACCGCCTAAAGCACCCATTACCCCTAGTCGCTCTGTTTTTTCACGTGTTTCTTGATTCGTTCTACTACTTCATAGCCAGCTTCTACATCCACACCAGCATTCGCATAGGCATTGCTCATGTTACTTCCTCCTTTATTGAAAAAAAGATACTTTTTCTTTCAATGATTCACGGTATTTTTCTTCATAGTCGTATAAAGGCGTCGGATAATCACCATTAAAATAAGCCATACATAACCCAGAATAAGGAGCTGCTTCTTTTAATCCGATTGCTTGGATCAATCCATCCTCACTCAAAAATTCCAATGAATCTGCTTCGATACATTGTCTGATTTCTTCGATACTATGATTCGCTGCAATTAGTTCTTTTCTCGTTTGAATATCGATGCCGTAAAAACAAGGATATTTTAACGGTGGTGAAGCAATTCGTACATGAACCTCTTTTGCTCCTGCTTCTTTTAATAGACGTACGATTCGCCGGCTCGTTGTTCCTCTAACGATCGAATCATCCACCATCACGATTCGTTTGCCTTTAACAACTCCTCTGACAGCCGAAAGTTTCATCCTGACACCCTGTTCCCTTAACGCTGGTGTAGGTTGAATAAAGGTTCTGGCAATGTATTGATTTTTTACTAGTCCAATCTCATAAGGGATGCCACTAGCTTCGGCATAGCCACTGGCTGCTGATAGCGAAGAATTTGGAACACCTACAACCATGTCAGCATCAATTGGCGCTTCCTGTGCTAAATTTCTCCCCATATTTTTACGAGCAGTGTGTACATTGACACCAGCGATATTTGAATCTGGTCGTGCAAAGTAGATATATTCCATGGAACAAATCGCTAACTGGGTTTCGGTCGTATAAGTATCGATCGTGTAGCCTGAGTCATCAATGATCACTACTTCCCCTGGACGAACATCTCGAATAAACCGCGCACCGATGACTTCCAGTGCACAAGTTTCAGAAGCAATCACATATGCACCATTTTTCATTTGACCGATTGCCAAAGGTCGAAAACCATTCGGATCAAGAGCGGCGATCATGGCATCTTCTGTTAAAAGCAAATAGGCAAATCCGCCTTTCACTTCATTTAATGCTTCTTTTAAACGATCGAGCAATGTTGTTTTTTTACTTCGACGAATCAAATGCATCAAAATCTCTGTATCTGAATTGGAATGGAAAATCGCACCGTCTTTTTCTAACGACGTTCTCAACGAACGGGCATTCGTAAGATTACCATTGTGAGCTAGACCGATTGACTGGTCATAAAATTTAAATAAAAAGGGTTGGATATTGTCCACACTACCATTACCTGCTGTAGCATAACGCACATGTCCAATCGCTGCTTGTCCAGAGAGTGCAGCTAGCTTTCTTTGATCTTTGAAAACTTCTGAGAGTAAACCTAGATCCCGGTGTCCTAATAGTTTCCCTTGATCATTTGAAACGATCCCAGCACCTTCTTGACCACGGTGCTGAAGACTATGAAGCCCAAAATACGTTACGCTAGATGCTTCTTGATGTCCCCAGACACCAAACACCCCACATTCTTCATTTAAACTTTTTACTTCATAAGACATTCGATTGCGTCCTCCCAGCATTTTTTAGCTGTTGTAACAGCTAGATGGATTTCCCCATCACTTGCTTGGATCACGATATTACTTGACTCAGTCACTTTACCGATACAACTTGCTTTTTCGCCCATCAAACGTTCAAATTCCTCACGATCTTCTGGAAGGATGGTGACCACAAATCTTGATTGTGTCTCTGAAAAAAGTTGTGCTGTCGTCAGATTTACTGTGACATCTAATCCCAATTGGGTACCAAAAGCTGCTTCAGCCAACGCCACAGCCAAACCGCCTTCCGAACAATCATGCGCACTGGTTACCACTCCTGCTTGAATAGCCGCCAGTAGACTTTCTTGGTTTTGTTGTTCCGTCAATAGATCAAAATGCTCGATGTCCCCTTCAATTTTTCCTAATTGCATTTTTTGCAATTCACTACCATTGAAATCGTCATAAGTTTCACCAACAAGATAAATCAAATCATCCGCCATTTTGAAAGATTGAGTGGTGATGTGTTGGTGGTCTTTGATCAATCCGACCATGCCGATCATCGGGGTAGGATAAATCGCTTTGCCATCCGTTTCATTGTATAAAGAAACATTCCCGGAGATCACAGGTGTCGCAAAGACTTCACATGCTTTGGCAATCCCGTCTGCTGATTTGACCAGTTCCCAAAATACTTCTGGCTTATCAGGAGAACCATAATTCAAGCAGTCTGTGATCGCCAATGGACGTCCGCCACTAGCTACAATGTTTCTGGCAGCCTCTGCAACAGCAATTTGGCCACCTATCTCGGGGTTTAAGTAAAGGTAGCGGGCATTACAGTCAGTCGTCATAGCAATTGCTTTTTCAGTTCCACGAATACGCAATACGGCAGCATCACTTCCAGGGGAAACTACTGTATTGGTTTGTACTTGAGAATCATAGGTTTCATAAATCGCATGTTTTGAAGCTATTGTCGGTTGTTTCAATAAATCTAGCAATAATTGATTCGCATCTTCAATGATTGGTTGATATTGCCCTAACTGTTTAAATTTTTCGATTCGAGCGGGTTCTTGCACTGCCTTTTCATAAACAGGTGCATCTTCGGCTAAGGCATCAACTGGTAAGTTAGCCACTTCTTCCCCATGATGGTACAAGCGATACAAGCCATCATCGGTGACTTCTCCAATCGTAACAGCATCCAAATCATATTTTTTAAACAATTCTTTGACTCTTTCCTCTGCCCCAGCTTTTACACAAATCAACATTCGTTCCTGTGATTCTGAAAGCATCATTTCGTAAGGAGTCATATTTGTTTCTCGTTGTGGCACATCGTCTAATGTCAAAATCAAACCAGATCCAGCTTTTGATGCCATTTCCGAACTTGAAGAAACCAATCCAGCAGCGCCCATGTCTTGGATCCCTACTAAAATGTCCGCATGTTCCAGGATCAATTCTAAGCAAGCTTCAAGTAATAGTTTTTCCATAAAAGGATCGCCTACTTGAACTGCGGAACGTTGCTGTTCTTCTTCTTGACTGAACTCTTCTGAAGCAAAAGTCGCACCGTGAATGCCGTCGCGTCCTGTTTTCGCACCGACATACATGATCGAATTACCCACACCAGAAGCTTGCCCTTTTTGAATGTCTTTGTGATCGATCAATCCTACACACATGGCATTAACTAACGGATTCCCTTCATAACAAGGATCAAACGCTACTTCTCCTCCAACCGTCGGTATTCCGATACAATTACCATACCCAGAAATCCCTGCGACTACTTCTTCCAATAAGTACTTGGTTCGTGGTTGGTCTAACTCGCCAAAACGTAAGGAGTCAAGTAAAGCAATCGGACGTGCACCCATACTGAAAATATCACGGATGATCCCACCAACACCGGTTGCCGCTCCTTCATAAGGTTCTACTGCTGAAGGGTGATTATGACT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_018081|2512485:2521544|2518455_2518710_-|WP_010737437.1|DBSCAN-SWA MYFVKVYVTYKDSVLDPQGEAVKNAVHRLGYETVEDIRIGKYFEIQVSAEASAVEETIEGICDKLLANVNMETYRYEIEQLEGI >NC_018081|2512485:2521544|2518724_2519441_-|WP_010737436.1|DBSCAN-SWA MEQKDLLYEGKAKKMYHTSDEQVIWVEYLDQATALNGLMKDQVNGKGELNNQITSKVFHYLSEQGIANHFIQQIGKDEQLVKKLNILPLEVVVRNSAAGSFSKRLAIPEGQKLPTPIVEFYFKDDQLDDPFINDEHVLFLQIADEAEITELKTQARKINHLLIQLFEKIDLQLIDFKLEFGKTATGEIVLGDEISPDTCRLWDLKTNEHMDKDVYRRKIGEIVPVYQEVLTRLTQVGL >NC_018081|2512485:2521544|2513075_2514017_-|WP_014834718.1|DBSCAN-SWA MGALGGFGGCFDLSSYQLKEPVLVSGTDGVGTKLLVAIEADQHETIGIDCVAMCVNDILAQGAEPLYFLDYLATGKNDPRKLEKVVAGVADGCVAGNLALIGGETAEMPGMYAENEYDLAGFAVGVAEKSQLITGSEIEVGDVLLGLPSSGIHSNGYSLVRKVFFEQNSYTLTDQIEGLSETLDRELLKPTKIYVSALLPIIKEQKIKGAAHITGGGFVENIPRMLPEGTAAQIQLGSWPSLPIFDCLQRLGEIPEQEMFEIFNMGIGMVVAVAASQVDEVIEKINEQGEAAYRIGEVIPLKNKTVLFDEEEK >NC_018081|2512485:2521544|2520236_2521544_-|WP_010737434.1|DBSCAN-SWA MLERYTRPEMGNIWTEQNKYQAWLEVEILADEAWAELGEIPKEDVKKIREHASFDIERILEIEKETRHDVVAFTRAVSETLGEERKWVHYGLTSTDVVDTAYGYQIKQANDLLRDDLKRFTAIIGEKAKEHKYTVMMGRTHGVHAEPTTFGLKLATWYSEMKRNIERFEHAAKGVEAGKISGAVGTFANIPPFIEEYVCEKLGIRPQEISTQVLPRDLHAEYFATMALIATSIERFATEIRGLQKSETREVEEFFAKGQKGSSAMPHKRNPIGSENMAGLARVIRGHMVTAYENVSLWHERDISHSSAERIILPDTTILLDYMLNRFGNIVKNLTVFPENMKRNMEATFGLIYSQRVMLKLIDKGMTREEAYDLVQPKTAYAWDHQVQFRPLLEEDPTVTSVLTKEEIDDAFDYHHHLKNVDVIFDRVGLGEKDK >NC_018081|2512485:2521544|2514131_2515574_-|WP_010737440.1|DBSCAN-SWA MSYEVKSLNEECGVFGVWGHQEASSVTYFGLHSLQHRGQEGAGIVSNDQGKLLGHRDLGLLSEVFKDQRKLAALSGQAAIGHVRYATAGNGSVDNIQPFLFKFYDQSIGLAHNGNLTNARSLRTSLEKDGAIFHSNSDTEILMHLIRRSKKTTLLDRLKEALNEVKGGFAYLLLTEDAMIAALDPNGFRPLAIGQMKNGAYVIASETCALEVIGARFIRDVRPGEVVIIDDSGYTIDTYTTETQLAICSMEYIYFARPDSNIAGVNVHTARKNMGRNLAQEAPIDADMVVGVPNSSLSAASGYAEASGIPYEIGLVKNQYIARTFIQPTPALREQGVRMKLSAVRGVVKGKRIVMVDDSIVRGTTSRRIVRLLKEAGAKEVHVRIASPPLKYPCFYGIDIQTRKELIAANHSIEEIRQCIEADSLEFLSEDGLIQAIGLKEAAPYSGLCMAYFNGDYPTPLYDYEEKYRESLKEKVSFFQ >NC_018081|2512485:2521544|2512485_2513079_-|WP_010737442.1|DBSCAN-SWA MKIAVFASGNGSNFQALVDYFRENKLPDTFEWLFCDQPNAFVLERAEKLHVPFHFFSPKEFSSKREYEEKILEILVEKEIELIVLAGYMRIIGPTLLNAYESRIINIHPSLLPDFPGLHGIRDAFAAEVKETGITIHYIDKGIDTGPIIHQETIEITKEDTLDSLEAKIHQIEHQTYPKIIEAVIKEMQKVEEEKND >NC_018081|2512485:2521544|2515558_2517781_-|WP_010737439.1|DBSCAN-SWA MKTRNEPSPLEIKEKKIYAEWGLTDEEYRMIEEDILGRMPNYTETGLFSVMWSEHCSYKNSKPILRKFPTSGPHVLQGPGEGAGIVDIGDGQAVVFKAESHNHPSAVEPYEGAATGVGGIIRDIFSMGARPIALLDSLRFGELDQPRTKYLLEEVVAGISGYGNCIGIPTVGGEVAFDPCYEGNPLVNAMCVGLIDHKDIQKGQASGVGNSIMYVGAKTGRDGIHGATFASEEFSQEEEQQRSAVQVGDPFMEKLLLEACLELILEHADILVGIQDMGAAGLVSSSSEMASKAGSGLILTLDDVPQRETNMTPYEMMLSESQERMLICVKAGAEERVKELFKKYDLDAVTIGEVTDDGLYRLYHHGEEVANLPVDALAEDAPVYEKAVQEPARIEKFKQLGQYQPIIEDANQLLLDLLKQPTIASKHAIYETYDSQVQTNTVVSPGSDAAVLRIRGTEKAIAMTTDCNARYLYLNPEIGGQIAVAEAARNIVASGGRPLAITDCLNYGSPDKPEVFWELVKSADGIAKACEVFATPVISGNVSLYNETDGKAIYPTPMIGMVGLIKDHQHITTQSFKMADDLIYLVGETYDDFNGSELQKMQLGKIEGDIEHFDLLTEQQNQESLLAAIQAGVVTSAHDCSEGGLAVALAEAAFGTQLGLDVTVNLTTAQLFSETQSRFVVTILPEDREEFERLMGEKASCIGKVTESSNIVIQASDGEIHLAVTTAKKCWEDAIECLMK >NC_018081|2512485:2521544|2519702_2520080_+|WP_010737435.1|DBSCAN-SWA MEEAAVCAQCFLMDLSPEETSRLYNDLLSIKDVYLCNKDTSFYTFRKIRRAAKRHTECRKRTFEYQTFSEHQLVISQIHEQKLFKNHYRIQVTYDQQEFDYTFIEELLSLLHTKHFNYSAQALYG >NC_018081|2512485:2521544|2517782_2518454_-|WP_010737438.1|DBSCAN-SWA MKFAVIVFPGSNCDADMLWAIRDIVGVEAEYVRYDETSLQGYDGVLLPGGFSYGDYLRCGAIARFSAIMKEVVRFAEEGKPVFGTCNGFQILTEAGLLPGVLRKNDSLRFICKTVPLKVNNQTAFTSEYETDEIIQLPVAHGEGNYFCDDQTLQELKANNQIVFTYAENINGSVANIAGITNKAGNVLGMMPHPERAMEALLGSEDGKRFFASMLKNFGKVTV |
9 | Prochlorococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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