Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_018108 | Taylorella equigenitalis ATCC 35865, complete sequence | 2 crisprs | cas3,cas2,cas1,cas4,cas7,cas8c,cas5,DEDDh | 0 | 5 | 5 | 1 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_018108_1 | 225724-227879 | TypeI |
NA
Consensus repeat of NC_018108_1
|
32 spacers
spacers of NC_018108_1
>1.1|225756|36|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT ACTTTTGAAGTTTACTTCCGAATAAGTAGTTTAGAA >1.2|225824|34|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCAGTAAGTGCCATTCAACCCGTCCTTCCAGTTA >1.3|225890|33|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTGGTTCGGTGGTGACCGTATAGTTTCGGCAGA >1.4|225955|34|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCAATTAGTGCTTTTTCTATTCGATGTTTTTTAC >1.5|226021|34|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAATTTGGGGTTACACAAGCGATGATTGAGAAAA >1.6|226087|34|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCAGTAAGTGCCATTCAACCCGTCCTTCCAGTTA >1.7|226153|33|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTGGTTCGGTGGTGACCGTATAGTTTCGGCAGA >1.8|226218|34|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCAATTAGTGCTTTTTCTATTCGATGTTTTTTAC >1.9|226284|34|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAATTTGGGGTTACACAAGCGATGATTGAGAAAA >1.10|226350|34|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATGAAGTATATTGTTGGACGAGATTACACAATC >1.11|226416|35|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGCATAAAAAATGAAGTGGCATTAATTGCCATAG >1.12|226483|34|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CGACCTTTAAGCAATCGTAAAGTTGGTGACGTTC >1.13|226549|35|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCTGTTAATTTGCAAGCGTATCCAGTCGAAACTTC >1.14|226616|35|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCTGTTAATTTGCAAGCGTATCCAGTCGAAACTTC >1.15|226683|35|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTTGATTCATTTTTTTTGTCCTTTTACTTAATTAA >1.16|226750|35|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCAAGTTTTACGGTGTACCCATTCGATTATTTGCG >1.17|226817|34|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTATGGACCGTCGCACTAAGGTCTACTTGGACAT >1.18|226883|34|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCGAGCCATACTTGATAAGCTGTTTTCCAGCGGG >1.19|226949|34|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGTAAGCTGAAATAGCTCTGTTAATGAATCTTG >1.20|227015|34|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACCTTGCGATTGGTGTCTTAGTTAGACTCTCGTC >1.21|227081|36|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTTGATTCATCTGCAAATCCTCTAATGGACTCTGTT >1.22|227149|35|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CGAACCAATCAGCAACCGTGCTCATATTGTCACGT >1.23|227216|35|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATCAAGCAGGTGCTAGCATTTCCGCGACATTAGCC >1.24|227283|34|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATATTATTTTCAACTAACAAGTTTTTAATCTCAG >1.25|227349|34|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGGGTTCCCTTGATGCTGTAGTTTCGAACGTTCC >1.26|227415|35|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATCAAGCAGGTGCTAGCATTTCCGCGACATTAGCC >1.27|227482|34|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATATTATTTTCAACTAACAAGTTTTTAATCTCAG >1.28|227548|35|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATGTCATAAAAGTTAAGGCGTGTGAATTACTTGCA >1.29|227615|34|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATAGATGACCGTGAAATCGATTGATGAGCTCATC >1.30|227681|34|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAGAATTAATCAGACAGCCCGAATCTATTCAAGC >1.31|227747|35|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAGTTAACAATTAAAATAGTCTCGCAAAATGTATA >1.32|227814|34|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACCGAAATGGTTGAAGTTAAGGTGGATAGATAAT |
cas3,cas2,cas1,cas4,cas7,cas8c,cas5 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018108_1
The CRISPR arrays of NC_018108_1 >merge|NC_018108|1|225724-227879|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTTAAACACACAGTCAAGCGAACGTGACTGAACTTTTGAAGTTTACTTCCGAATAAGTAGTTTAGAAGTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGATCAGTAAGTGCCATTCAACCCGTCCTTCCAGTTAGTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGACTGGTTCGGTGGTGACCGTATAGTTTCGGCAGAGTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGACCAATTAGTGCTTTTTCTATTCGATGTTTTTTACGTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGAGAATTTGGGGTTACACAAGCGATGATTGAGAAAAGTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGATCAGTAAGTGCCATTCAACCCGTCCTTCCAGTTAGTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGACTGGTTCGGTGGTGACCGTATAGTTTCGGCAGAGTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGACCAATTAGTGCTTTTTCTATTCGATGTTTTTTACGTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGAGAATTTGGGGTTACACAAGCGATGATTGAGAAAAGTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGAAATGAAGTATATTGTTGGACGAGATTACACAATCGTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGATTGCATAAAAAATGAAGTGGCATTAATTGCCATAGGTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGACGACCTTTAAGCAATCGTAAAGTTGGTGACGTTCGTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGATCTGTTAATTTGCAAGCGTATCCAGTCGAAACTTCGTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGATCTGTTAATTTGCAAGCGTATCCAGTCGAAACTTCGTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGACTTGATTCATTTTTTTTGTCCTTTTACTTAATTAAGTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGACCAAGTTTTACGGTGTACCCATTCGATTATTTGCGGTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGATTATGGACCGTCGCACTAAGGTCTACTTGGACATGTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGATCGAGCCATACTTGATAAGCTGTTTTCCAGCGGGGTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGATTGTAAGCTGAAATAGCTCTGTTAATGAATCTTGGTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGAACCTTGCGATTGGTGTCTTAGTTAGACTCTCGTCGTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGACTTGATTCATCTGCAAATCCTCTAATGGACTCTGTTGTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGACGAACCAATCAGCAACCGTGCTCATATTGTCACGTGTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGAATCAAGCAGGTGCTAGCATTTCCGCGACATTAGCCGTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGAATATTATTTTCAACTAACAAGTTTTTAATCTCAGGTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGAAGGGTTCCCTTGATGCTGTAGTTTCGAACGTTCCGTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGAATCAAGCAGGTGCTAGCATTTCCGCGACATTAGCCGTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGAATATTATTTTCAACTAACAAGTTTTTAATCTCAGGTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGAATGTCATAAAAGTTAAGGCGTGTGAATTACTTGCAGTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGAATAGATGACCGTGAAATCGATTGATGAGCTCATCGTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGAGAGAATTAATCAGACAGCCCGAATCTATTCAAGCGTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGAGAGTTAACAATTAAAATAGTCTCGCAAAATGTATAGTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGAACCGAAATGGTTGAAGTTAAGGTGGATAGATAATGTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA >NC_018108|1|1|225724-227879|CRISPRCasFinder GTTTAAACACACAGTCAAGCGAACGTGACTGA ACTTTTGAAGTTTACTTCCGAATAAGTAGTTTAGAA GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA TCAGTAAGTGCCATTCAACCCGTCCTTCCAGTTA GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA CTGGTTCGGTGGTGACCGTATAGTTTCGGCAGA GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA CCAATTAGTGCTTTTTCTATTCGATGTTTTTTAC GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA GAATTTGGGGTTACACAAGCGATGATTGAGAAAA GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA TCAGTAAGTGCCATTCAACCCGTCCTTCCAGTTA GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA CTGGTTCGGTGGTGACCGTATAGTTTCGGCAGA GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA CCAATTAGTGCTTTTTCTATTCGATGTTTTTTAC GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA GAATTTGGGGTTACACAAGCGATGATTGAGAAAA GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA AATGAAGTATATTGTTGGACGAGATTACACAATC GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA TTGCATAAAAAATGAAGTGGCATTAATTGCCATAG GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA CGACCTTTAAGCAATCGTAAAGTTGGTGACGTTC GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA TCTGTTAATTTGCAAGCGTATCCAGTCGAAACTTC GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA TCTGTTAATTTGCAAGCGTATCCAGTCGAAACTTC GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA CTTGATTCATTTTTTTTGTCCTTTTACTTAATTAA GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA CCAAGTTTTACGGTGTACCCATTCGATTATTTGCG GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA TTATGGACCGTCGCACTAAGGTCTACTTGGACAT GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA TCGAGCCATACTTGATAAGCTGTTTTCCAGCGGG GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA TTGTAAGCTGAAATAGCTCTGTTAATGAATCTTG GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA ACCTTGCGATTGGTGTCTTAGTTAGACTCTCGTC GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA CTTGATTCATCTGCAAATCCTCTAATGGACTCTGTT GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA CGAACCAATCAGCAACCGTGCTCATATTGTCACGT GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA ATCAAGCAGGTGCTAGCATTTCCGCGACATTAGCC GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA ATATTATTTTCAACTAACAAGTTTTTAATCTCAG GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA AGGGTTCCCTTGATGCTGTAGTTTCGAACGTTCC GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA ATCAAGCAGGTGCTAGCATTTCCGCGACATTAGCC GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA ATATTATTTTCAACTAACAAGTTTTTAATCTCAG GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA ATGTCATAAAAGTTAAGGCGTGTGAATTACTTGCA GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA ATAGATGACCGTGAAATCGATTGATGAGCTCATC GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA GAGAATTAATCAGACAGCCCGAATCTATTCAAGC GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA GAGTTAACAATTAAAATAGTCTCGCAAAATGTATA GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA ACCGAAATGGTTGAAGTTAAGGTGGATAGATAAT GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA >NC_018108|1|1|225724-227879|CRT GTTTAAACACACAGTCAAGCGAACGTGACTGA ACTTTTGAAGTTTACTTCCGAATAAGTAGTTTAGAA GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA TCAGTAAGTGCCATTCAACCCGTCCTTCCAGTTA GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA CTGGTTCGGTGGTGACCGTATAGTTTCGGCAGA GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA CCAATTAGTGCTTTTTCTATTCGATGTTTTTTAC GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA GAATTTGGGGTTACACAAGCGATGATTGAGAAAA GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA TCAGTAAGTGCCATTCAACCCGTCCTTCCAGTTA GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA CTGGTTCGGTGGTGACCGTATAGTTTCGGCAGA GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA CCAATTAGTGCTTTTTCTATTCGATGTTTTTTAC GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA GAATTTGGGGTTACACAAGCGATGATTGAGAAAA GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA AATGAAGTATATTGTTGGACGAGATTACACAATC GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA TTGCATAAAAAATGAAGTGGCATTAATTGCCATAG GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA CGACCTTTAAGCAATCGTAAAGTTGGTGACGTTC GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA TCTGTTAATTTGCAAGCGTATCCAGTCGAAACTTC GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA TCTGTTAATTTGCAAGCGTATCCAGTCGAAACTTC GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA CTTGATTCATTTTTTTTGTCCTTTTACTTAATTAA GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA CCAAGTTTTACGGTGTACCCATTCGATTATTTGCG GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA TTATGGACCGTCGCACTAAGGTCTACTTGGACAT GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA TCGAGCCATACTTGATAAGCTGTTTTCCAGCGGG GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA TTGTAAGCTGAAATAGCTCTGTTAATGAATCTTG GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA ACCTTGCGATTGGTGTCTTAGTTAGACTCTCGTC GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA CTTGATTCATCTGCAAATCCTCTAATGGACTCTGTT GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA CGAACCAATCAGCAACCGTGCTCATATTGTCACGT GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA ATCAAGCAGGTGCTAGCATTTCCGCGACATTAGCC GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA ATATTATTTTCAACTAACAAGTTTTTAATCTCAG GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA AGGGTTCCCTTGATGCTGTAGTTTCGAACGTTCC GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA ATCAAGCAGGTGCTAGCATTTCCGCGACATTAGCC GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA ATATTATTTTCAACTAACAAGTTTTTAATCTCAG GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA ATGTCATAAAAGTTAAGGCGTGTGAATTACTTGCA GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA ATAGATGACCGTGAAATCGATTGATGAGCTCATC GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA GAGAATTAATCAGACAGCCCGAATCTATTCAAGC GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA GAGTTAACAATTAAAATAGTCTCGCAAAATGTATA GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA ACCGAAATGGTTGAAGTTAAGGTGGATAGATAAT GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA >NC_018108|1|1|225792-227879|PILER-CR GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA TCAGTAAGTGCCATTCAACCCGTCCTTCCAGTTA GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA CTGGTTCGGTGGTGACCGTATAGTTTCGGCAGA GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA CCAATTAGTGCTTTTTCTATTCGATGTTTTTTAC GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA GAATTTGGGGTTACACAAGCGATGATTGAGAAAA GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA TCAGTAAGTGCCATTCAACCCGTCCTTCCAGTTA GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA CTGGTTCGGTGGTGACCGTATAGTTTCGGCAGA GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA CCAATTAGTGCTTTTTCTATTCGATGTTTTTTAC GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA GAATTTGGGGTTACACAAGCGATGATTGAGAAAA GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA AATGAAGTATATTGTTGGACGAGATTACACAATC GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA TTGCATAAAAAATGAAGTGGCATTAATTGCCATAG GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA CGACCTTTAAGCAATCGTAAAGTTGGTGACGTTC GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA TCTGTTAATTTGCAAGCGTATCCAGTCGAAACTTC GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA TCTGTTAATTTGCAAGCGTATCCAGTCGAAACTTC GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA CTTGATTCATTTTTTTTGTCCTTTTACTTAATTAA GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA CCAAGTTTTACGGTGTACCCATTCGATTATTTGCG GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA TTATGGACCGTCGCACTAAGGTCTACTTGGACAT GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA TCGAGCCATACTTGATAAGCTGTTTTCCAGCGGG GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA TTGTAAGCTGAAATAGCTCTGTTAATGAATCTTG GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA ACCTTGCGATTGGTGTCTTAGTTAGACTCTCGTC GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA CTTGATTCATCTGCAAATCCTCTAATGGACTCTGTT GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA CGAACCAATCAGCAACCGTGCTCATATTGTCACGT GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA ATCAAGCAGGTGCTAGCATTTCCGCGACATTAGCC GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA ATATTATTTTCAACTAACAAGTTTTTAATCTCAG GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA AGGGTTCCCTTGATGCTGTAGTTTCGAACGTTCC GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA ATCAAGCAGGTGCTAGCATTTCCGCGACATTAGCC GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA ATATTATTTTCAACTAACAAGTTTTTAATCTCAG GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA ATGTCATAAAAGTTAAGGCGTGTGAATTACTTGCA GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA ATAGATGACCGTGAAATCGATTGATGAGCTCATC GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA GAGAATTAATCAGACAGCCCGAATCTATTCAAGC GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA GAGTTAACAATTAAAATAGTCTCGCAAAATGTATA GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA ACCGAAATGGTTGAAGTTAAGGTGGATAGATAAT GTTTAAACACACAGCCACGCGTACGTGGCTGA
>NC_018108.1|WP_044953910.1|222867_225258_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MFIAHTRTLDSVTQPLDAHLMNVGSLSEKFAQKLNLGEIGALLGLLHDLGKFSDNFQNYIKYNSFNSDKDDAEINNNIHISRVDHSTCGAQWIKDHFLNSNNNVLLGQILSICIASHHGKGLIDVINNNEKTWFNRLKKSRLETNFQSALSNAVNSNSIALKKAVELKESSFDTFNKHISSLYNSNNLSYIEKKFYLGCLTKFLFSCLIDADRIDSADFESNTSTSDRNIFRNYEWDIALKTLENHLKNFSSESDIQKIRESISNKAFECGSKPKNILKFTVPTGGGKTLSSLRFALKHCLEHKLDRIIYVIPFTSIIDQNAQVVRKVLGDEWVHEHHSNIEPEEVTWKNKLISSNWDKPIIFTTMVQFLDSWFSIGTRGVRHIHPMTNSVIIFDEIQSLPLKCTYLFCNVINWLNLYGNSSIVLSTATQPPLELLEPKENGALKFDNDSEIIGNLNEVDELYDNLSRVNIHFDSVKKDIDKTFSFVKEISNSENKILFIANTKKTVLDLFNKFKENNYSLENIYALTTYQCPSHRKAIINELKEKLRNNEKTVCISTQLIEAGVDISFQTVIRVLAGLDSIAQAAGRCNRNKEQDKGNLYIIDVLENLDKLPEISNAKVSVQAVLHEFNNDLHKILKPDAINKYFKQYYELQRNELIYPIESEQTSMLDLLSANSDCIYRKALDDRLLKQSFRIAAENFKSIDAPTKSVICPYEKGVNLIAILCGEWDPKKFRETLIEAQQFSVALYPSTWKMLLDEGAIHPINDTGIYYLDEKYYDSKLGLNFEGNAQMGEFYI >NC_018108.1|WP_014840099.1|221218_222865_+|U32-family-peptidase MKKPELLLPAGGLERMRTAFFFGADAVYAGQPRYSLRARNNEFVRFEKMEQAINEAHALGKKFYVTSNLLPHNSKLRTYLDDLAPIMELKPDALIMADPGLIMKVKERWPDAVIHLSVQANTTNYWGVQFWQRMGISRIILSRELSLDEIEEIRQECPDMELEVFVHGALCIAYSGRCLLSGYFNQRDPNQGTCTNSCRWDYKVLPTVESDAGDARLAPGAERFGFGGGMSLDSGYGSGLEPGGGFGATDGTAFGRGSTGGVAGGLVAGSDSTGSVGSSESRNLTGSYSSNEFRVPYTGLEGFDFNAMREEADQQFASVGGAPRHPLAENVYLLEEGNRKGQYMPIMEDEHGTYIMNSKDLRAIEQVERLVKIGVDSLKVEGRTKSMYYVGRVANAYRRAIDDAVAGRPFNPELLADLQNIANRGYTPGFLERHQTQDYQNYLHGYSVSRLSQFAGVVLDVDDDGWATVEVKNRFRVGDKIEIIHPSGNAVVVLEAMEIDGEPTDLAPGNGREARIPNMHGKKGALLARLLSEGERERLVKLTGVSGE >NC_018108.1|WP_014840098.1|220413_220926_+|ATP-binding-protein MQEGALPELFNLSSHEMKHNYVSSLKDTILLRDIVARYKVKDIKLLEDLFVYLVNTASSLVSITNIVNFFATKKRKTNYETLSSYINYFDNAFLIHRAECYSIKGKDTISGNCKYYLNDLSYRNYLYVAYDYVVGHLLENAVYLSLRRAGFRVYVGSIKDKEINFVCMRS >NC_018108.1|WP_014840097.1|219565_220291_+|fumarylacetoacetate-hydrolase-family-protein MSEIKTVLPLPKPATIAIYGRKERFPVGRIFCIGRNYQEHATEMSYGAVDKSQTDPIFFIKSACHVAHFESGEVGKLPYTKGTQNLHHEVELVLAFGNDIADGASKEEIQDAIYGYCVGLDMTRRDFQSISKKNGFPWDGAKDFEDSVILGELTEKSSLANPWMDDVGIKLSVNDEIRQDGDTSDLIWKIDECVSYLSKFYNLRAGDLIMTGTPSGVGPVVRGDVLKGQIAGLQDLVVEYI >NC_018108.1|WP_014840096.1|217515_219558_+|primosomal-protein-N' MAKSWARIALDVPLFSFFDYIIPSGMKVERGQRVIVDFGKKELIGVVVNILSSCEIPEDKQKPLKEVIDDLPPFSEKWLKLCEFAANYYIRPVGEVILPVIAPPLRNINSYRGKTKTSPVERLDKRKIKIDSEYSQNTAPELNDDQLAAANYIKSIKGYETVVLHGITGSGKTEVYLNVAEHILSTGKQVLFLVPEINLTPQFEQLIRHRFSALYGQDAVVTMHSGLSDGQRLKSWVRMCRQEAKILVGTRMSIFSPFENIGLIIVDEEHDASYKQQDGLRYSARDLAIWRANQLEVPVVLGSATPSLETWRNMQTGRYKLLSLKKRASSGNPPQIHILNTKKLKSINGIAQPLFNLISKKLSDGEQVMIYLNRRGFAPVLRCGSCGWVSTCPNCSVHTVMHRNIKRDLNILQCHHCGFRSHVPLCCPDCGEVDLSALGYGTQKIEEGLINHFPDAKILRIDADSTRLKGSAERLFTQATEGHVDIIIGTQMLAKGHDFKKLSLVAVLNSDLMLYNADFRSSERLFSQLLQVAGRAGRHIKDAKVVVQTEFDRHPVYDALIAQDYEQFSQSALEERKSATLPPYSYQILFTAQSKKILNALEFLEQVASIGANAKYEDVRIYDPVPLQIVRVANVERAQLLFESQSRTRLHSLVYEILPHIDNIKSSKISYHIEVDPLTI >NC_018108.1|WP_014840095.1|216216_217287_+|uroporphyrinogen-decarboxylase MNDTFLRALLRQKCEYTPIWLMRQAGRYLPEYRATREKAGSFLGLAKSPEFACEVTLQPIDRFNLDAAILFSDILMVPDAMGLGLDFVAGEGPKFANPIRDEEDVKNLKVPDMNELRYVFDAVKLIRGQLQDRVPLIGFAGSPWTIACYMIEGCGSKEYRQIKSMMYSRPELLHSVLEICAQSTAQYLIEQVKAGAQAIMIFDSWGGVLAHGYYQEFSLKYMRSVLDTLRGFLNSNEHKGVTVPVIAFTKGGGLWLEDMVDAGFDALGLDWTVGLSDARRRVQDRVALQGNLDPMALFSDEKSVRAQARNVIDDFGPVASGGHVFNLGHGISQFTNPDIVEALVDEVHNYSKSKHL >NC_018108.1|WP_013521986.1|215149_216172_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MRETLDCAVLYTDHFKAQAASLVNLTDKTKRVQFKEFNLGDLTNSNLPSYVVNDYELPHPNTLRELGPLLHRYDVVILPVNQKVLIWLRVMLSNCPDFPTPVMILCDDVHPTALPDLAKLGVVDFISFEDSTPIIMARIKSAIERYSYFRQREIISINRLMAEVDDQNREPKYTSASIREGLAARKNALKELEYTESVGSYTLYNFSDSSSSLNYEKSLIGQPSSIETRKISFVPPFSHLELDDADVKPPLRKSPKRKIITANITTVESTPSEQESIKDDDSFKDAKDKIVSAFEKEFIINALIQSKGNIAQAAKRSGKNRRSFWELMRKHEISAKQFRH >NC_018108.1|WP_014840094.1|214293_214779_-|RNA-polymerase-binding-protein-DksA MELPIMAKAVKSPKTTNKSKSNSGSEVILTEEQIKQMSEDEYMNDLQLAFFKDRLKKLESDILNNAGVTTENLRETQFVPDPADRATIEEEHTLELRTRDRERKLLKKVQNSLQLIESKEYGWCEETGEPIGIPRLLARPTATLSLEAQERREKRQKLYND >NC_018108.1|WP_014840093.1|212884_214225_+|esterase-like-activity-of-phytase-family-protein MKKIALLLSLAFASGAYAAEQYPATLAGHAVLPAATFIDPPADAPDYFKISARYKNDKYNRVDEAESMDGFNGPRKTGIKKPFNGQPVQGHSGIKIMKDGTFWLISDNGFGNKLNSPDAMLFLNQYKVDFESGKFEPLKTVFFKDPNKVIPFHITQEATKERYLSGMDLDPESFQPIGEHFWVGEEFGPYLLELGADGTVLSIFETEVDGKKIISPDHYSINLPGKPDGKMPMYQSSRSKGFEGMAASPDQSKLYPLLEGALYDHDKKEYENTDGKNYLRILEFDTQAKKWTGKSWKYHLEDNGNAIGDFNMIDDTYGMIIERDNSEGSADKLCPQGQKGDNCFETSAKFKRIYKVKLDPNSDVAEKIGFIDLMAIEDPNKVARKPLVDGKFTFPFFTIEDVDVLDQDHIIVGNDNNLPGSASRDPNKADDNELIKLKVTEFLQAK >NC_018108.1|WP_013521983.1|212187_212754_-|ATP-dependent-protease-subunit-HslV MEQFHATTILCVRKGDEVAIGGDGQVTLGNVVIKGSARKIRKLYHDKVLSGFAGATADAFTLQERFEAKLEKHQGHLLRAAVELTKDWRTDRVLRRLEAMLIVADKDHTLVLTGNGDVLEPELGVAAIGSGGSYAQSAAQALLQNTDLTPEEIVKKSLEIAGDLCIYTNQNHVIQKLDIDESKNKKES >NC_018108.1|WP_014840101.1|228052_228346_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MLVLITYDVDMKDNSGAKRMRKISNACQNFGLRVQYSVFECDIDPEKWIKLKSTLLDLYAPEKDSLRFYNLGSKWRGKVEHHGAKPSIDIFKDPLIL >NC_018108.1|WP_044953912.1|228348_229362_-|type-I-C-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKKLTNSIYVTSQGSYLHKERDTIVLEVDKKKVAQIPIHSIGQIFCFGNVLISPFLVGFCGEKNVLLCLYTEHGRFLGRYVGKQNGNVLLRKNQYRMADNCPLPIAKNIIAAKIQSSKRVLQRFIRNHTNNSEIESTIGSLTFILNNIKNITSKQSLLGLEGDAASRYFSVFDTLILKPSNFRFNGRFKRPPTDPVNAILSFLYSVLSNDITSALQGVGLDPQVGFLHSDRSGRSSLSLDILEELRAWLVDRLVLTMINLKQIDINGFEVELSGAIRMKDDLRKKILSIYQSKKQELIIHPYINEKIPIGLIPHIQSQLLARHIRGELQEYPPFLMR >NC_018108.1|WP_014840103.1|229345_229975_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MVDKPYFQLSALQHYAFCKRQAYLIYVEGLWAENYLTASGDLIHSKVDSGVSDSRNNIKQVRNIQIVSHKYQMSGLIDLIEYSDMNHITIIEYKRGKPKPNEMDEVQVCAQALCLEEMLGVVLSYGYIWYDLNKARHKVCFTDELRDITISLINEVQILFDSPKAPNPVLCSSCKSCSIYDTCLPNIISLDKTKEYIDNLYDSSYEEID >NC_018108.1|WP_014840104.1|229964_230813_-|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csd2 MTLENKIDFALIIKVKNANPNGDPLNGNRPRVNFDGLGEISDVCLKRKIRNRILALKGNEEGFKIFVQSDDNNVDGITTLEKRAEDEEHGLGKRGFNDRNTAYENACKKWYDVRAFGQVFAIKKKAGESEGVSIGIRGPVTIQPAFSVDPVNITSTQITKSVSGSGDGKKKSSDTMGMKHRIDEAVYVSFGSISPQLAEKTGFSNDDADILKNAMLSMFEGDASSARPEGSMEILKLIWWKHDSKLGKHSSAKVHQSLEVNSDGSFNINDLSELKPEILDGR >NC_018108.1|WP_014840105.1|230825_232718_-|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas8c/Csd1 MSWISSLVEAYDFIDQDIKSNINESKKIEPLTPILHNKQKVDLIVTIDIDGNFKSVESISSESKNNSYLIPVTPQSDSRTSGTEPHPLADNLGYVAGDLKDYFSTPKEVNKFEEKNSKYLELIGQWSKTESYKVLQAINKYVNKKSLIKDLLNNNVLAISEEQKLIYSLTEKGDVDKLFVVWSVIDSAGNSYQSWSDENLISSWIDFCSTKLDNKFCFYYGENKTYSTSYSCKISNAGDREKIISSNDSKGFTYRGRAIEAHEAATISVEASYKLHAMLRWLKERGQSFTYDNIEIISWANLNLKPIVLPTLEIEEPSNPFDDEETNSEPDWTSSYGFQASKKLKEKLAGFSNNLSDSDKISIIIFKSASPGRRSILYFREMLKDDYLRNINKWIEDLSWTFSIKGEAYEFSPSPWIIVNELYGNESTTLKTSILSNLIPIQINNLQIPWDLVSKAFHNACNPLKYDNFKRRKNISLACSIYKGYSIRNLNKEVEMSLNLTNKSRDYLYGRLLAVAQAVEDSVIKDIEPGSKRDTSAERYFQRFSTRPYTTWKVIYDSLKIYSKRYRFGNPDIIIGEIMELFDEESYKNDKALSPEFLLGYHCQLNEIYKRKGSDTHSETTVATEESTLN >NC_018108.1|WP_014840106.1|232720_233437_-|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas5 MESNYLSFKVWGREALFTDPLTKLGGEKFTYQVPTYEAIKGIVKSIYWKPTFIWHIDKIRIINPIKMASKSMKPRKWNVDENSLSYYTYLTNVEYQVLAHFTWNENWVELEKDRNTEKHSSIAKRMLERGGRQDIFLGSRECQGYVEPCEFNSGNGFYDDADLTFGNMFHSYGYPEETGENKLINRFWSAEMKKGIISFPEINDPKLKLNFIREMRPTKCFGEESINNTNNLYSEKEE >NC_018108.1|WP_148267233.1|234286_237160_+|ATP-binding-protein MVEQLSEGEIKPKDYSILSNLDSANYFNSFKKEINKIQGKNPIFALLLNFITFEELNKILKLEPSEEAYKFDNKFSLALCFDKELKLMPEEIFVTVSSYIKNKNAIPSLGEFEDYENKLKEFISSLFLTENIVNYEEVFNEDINKLFHKFKVDTDKSGFKTYPSIEGANTNLHSFFIKDLQKAKDLSTRNLDDYLIDNLDARLRQRVNLATRVESDDFDEKTLNTFLEILQPKNYPISRFPSSPKYALSLMQQVAVNLSVHDDSNTIRSVNGPPGTGKTTLLKDIFAHLVVEQAKEICSLSNKKIEGSETTKYSDTKSIGVLPKQISDRGIVVASSNNGAVKNIVDELPKIESIADEFKDAILHVDYFKDIANLRENSDNDQSEIINSKSGNNWGLFSKEGGKKANINQILSALDGVIKDLKNNPNPNSNAYEEFRKYLKEISEFIVKKQKEFEHLKKQKFFSKDILKQFHNEGIKLKNPDSIVNNAMACKTELEKVRKNIAKERETFSLKNLPQPKWYDFWSNERKELNNLKSEHNKKLEPLQKQKQELLARFNYLKQVHKIASVANKNILDFTDDYDSLHLSNPWFDAKFREMQSNLFISALKVRKQFLLENVDNLEAAHNIWKEQLYKPNSKFLNDVVITQAWNWINLTIPVISTTFASVSTMFKNLDNEVIGNLFIDEAGQALPQASVGAIFRSKKVLAVGDPAQIKPVLTLDPVILEKIREKYNAGKLDIPETYLSENSSTQTLIDRISKYGFRKNGEDDNWIGIPLWVHRRCKSPMFEISNQVSYDGNMVQGKTDDKPGIAEWYDVTGSADDKYVMEQGKFLVEKLKELEGNKDFFVISPFKNVAQKLIERLNSEGLVRRDKNGKVTNIGTVHTFQGKEAPVVFLVLGADERSKGAANWSMGSNHPNIMNVAATRAKEEFYIIGNKKLYQGLESRVVDTAIEEIEKFNNRK >NC_018108.1|WP_013522000.1|237400_239035_+|peptide-ABC-transporter-substrate-binding-protein MNFKKSLLSIAVAGIATLGVAQAANVPAGTELAPKQELIWNNGANPASFDPHKIEGVPEGNVARQVFEGLVTSDEKGQLRPGVAVSWEHSDDFKTWTFHLRKDAKWSNGDPVTAHDFVYAWQRLVDPKTASPYASYVEFLKLKNAKDILGGKKPITDLGVEAKDDYTLVLNLDESVGFADKLSEHYVLYPVNKKVVEKFGDKWTAPENFVGNGAFKIESFTVNDKTVLTRNENYWDNKNTVLDKITLLAIENSATDVQRYRAGDEDITNSSLPVELFSKLKKELPEELKVNPTLCTYTYEFNNEKAPFNDVRVRKALSYAIDRDIITTKILQAGQKSAYGFTPPYIGGGDKLTKPEWASWDAKKRYVEAEKLLSEAGYSKSKPLNFTILYNTNDNHKKLAVAVGSMLNKNLGGAVNVKLENQEWKTYLDNRKAGKFDVARAGWCADYNEATTFLTYFLSDSSNNKAFYKSAEYDGLVNGSYSAKDDVARSEAYAKAEAVLNKDTPFAPVYYYVDPQLVKPWVQGFAYSHPAKNYYLKDVYIIKH >NC_018108.1|WP_013522001.1|239096_240017_+|oligopeptide-ABC-transporter-permease-OppB MIKFIFRRILEAIPTLFVLITVSFFLMRLAPGSPFTSEKDYPPEVMANINAKYGLDKPLLVQYGNYLNDLAHGDFGPSFKYKDHSVNELVAKAFPVSLKLGILAFIIAKLIGITAGILAALKQNKWLDYFIMTFSMTGVVLPNFVIAPLLVLFFAIFWKLLPSGGWNGGAPLYMILPIFALTVSTIAGTARIMRGSMIEVLHSNYIRTAKAKGLPMRHIIIKHALRPALLPVISYLGPSFVAIITGSMVIESIFSIPGIGQLFVQGAINRDYSLVMSLTILVGTLTITFNAVVDILYAFIDPKLRY >NC_018108.1|WP_013522002.1|240026_240944_+|oligopeptide-ABC-transporter-permease-OppC MITQKNKEFVQDLASNLESTEFVKGRSLWQDARRRFFRNRAALISLVILVLITCFVIFAPMLIPFDYADTDWAMMSMAPDFESKHYFGTDSSGRDLLVRVAVGGRISLMVGVAGALIAVIVGTLYGAIAGFVGGIVDSLMMRFLEILYSFPFMFFVILLVTFFGQNILLIFVAIGMVSWLDMARIVRGQTLSLKKKEFIEAAIVSGVSKRKIIWNHIVPNVLGVVVVYASLLVPSMILFESFLSFLGLGTQEPLSSWGALLNDGAISMEVSPWLLIFPSIFIVVTLFCFNFIGDGLRDALDPKDR |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_018108_2 | 1217413-1217685 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_018108_2
|
3 spacers
spacers of NC_018108_2
>2.1|1217452|39|NC_018108|CRISPRCasFinder AAATTGGCTAATGATGAAGATTGGAGTGTAAGGTGGGAA >2.2|1217530|39|NC_018108|CRISPRCasFinder AAATTGGCTAATGATGAACATGAGGATGTAAGAGCTTCG >2.3|1217608|39|NC_018108|CRISPRCasFinder CAGTTGTCTTGCGATAAAAGTAGTAAAGTAAGGCTTGCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018108_2
The CRISPR arrays of NC_018108_2 >merge|NC_018108|2|1217413-1217685|CRISPRCasFinder GTAGCTAGACGCAAGGATTTATCACAAGACTTAGTAGATAAATTGGCTAATGATGAAGATTGGAGTGTAAGGTGGGAAGTGGCAGAACGGGTGGATTTGAGTCAAGACTTAGTAGAGAAATTGGCTAATGATGAACATGAGGATGTAAGAGCTTCGGTGGCAGAACGGGTGGATTTGAGTCAAGACTTAGTAGAGCAGTTGTCTTGCGATAAAAGTAGTAAAGTAAGGCTTGCGGTGGCGGTAAGAAAGGATTTATCCCAAGATTTGGTAGAG >NC_018108|2|2|1217413-1217685|CRISPRCasFinder GTAGCTAGACGCAAGGATTTATCACAAGACTTAGTAGAT AAATTGGCTAATGATGAAGATTGGAGTGTAAGGTGGGAA GTGGCAGAACGGGTGGATTTGAGTCAAGACTTAGTAGAG AAATTGGCTAATGATGAACATGAGGATGTAAGAGCTTCG GTGGCAGAACGGGTGGATTTGAGTCAAGACTTAGTAGAG CAGTTGTCTTGCGATAAAAGTAGTAAAGTAAGGCTTGCG GTGGCGGTAAGAAAGGATTTATCCCAAGATTTGGTAGAG
>NC_018108.1|WP_100248699.1|1216784_1217258_+|DUF2336-domain-containing-protein MNEGKVNKYALATDKLTDDFILEFLANDEDPSIRRTLTLREYLPETILETLANDYQINVRNAVASREDLPSSLIEKLAEDENKYVRRTIAQRDDLSQDLVAKLANDESEVVRSAIAGRKDLSDELVEKLANDKSEEVRQSIKTNPYIKREKTKELVM >NC_018108.1|WP_013521316.1|1215828_1216431_+|hypothetical-protein MAQEEKEKSSEQKLKDFLLNVHENNISYMTPEVKNKYEYAYEDCFTQGKDGYLVAYLHKIDDKYIATMLDEASDEFKVMKVSNKEIDLKEALIEFCIDCVDDPIKVLNDFKINPTFLFNDVELDFNEEVFIIHDDPLRGARMVVDNNVTIPYSSSHFSKSLMFENASKAQEWIDSREDKGKYLIIPINNPYTFNNKDLVM >NC_018108.1|WP_126476011.1|1215508_1215817_+|hypothetical-protein MFDYVYEEEPLQDDLFTVNDYEEYTALNLSESLNENPIDNFEVAKIKTNKKVFKPRLTQEEKKAKLNKVILRIKERYPEAYKKFQNQKDDEKQSKLLDELIL >NC_018108.1|WP_013521314.1|1214673_1215471_+|hypothetical-protein MKIDELSYEENKLVYQAVDPYLSDKDIEELSHNKFWEVRQNIARREDLSQDLVEKLADDEHEYVRHAVARRPDLPQELVEKLSNDENGYVRSAVAYRMDLSHELVEKLANDEDWLVREGIARKDVLTTSLFEKLANDKDSEVRCAIAEREDLSQDLVEKLADDESWYVRSSVARRENLSQKLIEKLSNDEDDDVRYTVAEREDLPESVMQILADDEYWGVRQAVASREDLPSSLIEKLANDEDWEVRQAIKTNRNIDREPQDLTM >NC_018108.1|WP_013521313.1|1214012_1214630_+|hypothetical-protein MELKQKVKDWIEKDLIPDYNEFDEVVDEYFNLSEYIIGPEDDHEDYPVEFRLINLDNELYATFYDKSEKNIYTLGKVENGMDFENLARIEIQDWDGDPIPHLYMYGLFGREQFNEVEDNYDNPVFLFYENDGFINFYRRATNKSLEGWDYLNEINCLEEALEFPSSQEAFEYLEDMGEKIYYNHFVATAKDPINLSRERQSVLTL >NC_018108.1|WP_014840491.1|1213311_1214022_+|hypothetical-protein MGFLMGNEMHVTTKRDRELKALILGKDLFFSSSQLIDLKMLYFDSMIDKVAGEHSIYFLHKIGGEFFISHFDMDSRCINFIAYLNDLEEFRNVLLEHLLEGNKCEKSDETKIKTLGQYSLLTTNHLNRVPPKYKGSVYLFCNPYYEELMVLTLDRQIPYCFKPLDKGLPEGILEFEKFKYALKFIKDNKLWERYKECIIVSAEKPFIFSKEDTEHDLITITSPFGEVFCKERWKWN >NC_018108.1|WP_013521311.1|1210877_1213283_+|conjugal-transfer-protein MITADWLKNILNKQTAHVDYLPKISHHVTPELISYEDGYLAWVIQVDGMPFESQNNSHIITHFEQLNNLLTAIGKTTGNRLALWTTLQRKKRQFEREYSVDNLFTNEFLSKYVEKFKESSYFSNYFYITGVLKIDDIDEGIKEANELIALMLNGLQAYTPTLLKAYTEEDVMFSEIWEFFATLINYKHEQIPETHISQKNVIGNTDLHFGTDVCQLRTQSETLYCVSFDLKDFGISKPKILVDILNLPFEFTLTQSFVFVNSAEMQGVIDKQLNNLVSAGDLAIHQQEELLYGKGFLSAGELMFGEYHSCLVVYGESPSVASQNGSKAVSRFLNAGGFRFTKAGLSAPATYFSQIPKSPLRPRKYPKTTQNLATTFGMHNYSAGKEIGNPIGDGTAIMPLKTVSNTIYDFNFHYSNVNEDNLGDKIAGHTLILGATGTGKTTLETSLLTFTNRFNPYLFVMDLDEGMKIFLSALGGTYFTFEEGKPTGLNPFQIEDTPANREFLYTLVGVCGRNVDGTVTADEEGQIKLAVDTLFNIIDFENRNFSTLLQSIPYQNENPNSLRTRLSKWCRSTDGRFSWCLDNETNIFNHHEFTKIGFDLTDILQDKYPPTEPVLLYLFYLRSLMMERVAKEDGILCTVIEEFWYPLRFSTTSELILKMLKTDRKLGGWCVLTSQSPEDAITSDIFPAIVQQTPTKVFLPNPDAVYEGRYEFVGITRKEFDELVKLSLDSRTFLVKQSKQSAFAKLDLYGFSDEMAVLSGNSANNELLDEIIKRVDSKNPDVWYPIFKETINERRKAKKLI >NC_018108.1|WP_014840490.1|1210552_1210978_+|VirB3-family-type-IV-secretion-system-protein MDDLPEYPTFNGLSRSAMIWGIPIMALALIVGVSMVISLILLQFIGLQGFLAFALAIPLLFMLKSISANDDQAMNILWYEVLCLLKKKNSKAFGGTNTILATKFGNTKDDYSRLVKEYFEQANRARRLLAKNKPSRNTRIN >NC_018108.1|WP_013521310.1|1210256_1210553_+|hypothetical-protein MKKFLNLLVIIVLGGLSTVAYSAGFGDAVAGKMEELRKAILIVVGVVATIALLWQMAEGFMGKKTWPDVFQTCLWILGAGAAVAIANWVFTTGQGISF >NC_018108.1|WP_013521309.1|1209414_1210146_+|lytic-transglycosylase-domain-containing-protein MKKLIYITLFLMAYSSNANANDYDDVIKSCSPNVAPETMRAIIRVESSFNPYAIGVVGGEVKQPKTLDEALKTVQKLKKEKLNFSMGLAQINRYNLSKYNLTEVSVFNPCSNLKASEAILSECFQRAKSEGSNDQVALQKALSCYFAGNFSTGFKKSKGLSYVDKIKRVALANEGFLVPKINPKVDYTPTPKGKGEFEKVKESEKVFNPKDSNGNDDSKQKEKKYYEWDLFNDFALEGGMYMK >NC_018108.1|WP_013521319.1|1217894_1218554_+|hypothetical-protein MQITINNEKFDVDTKNQTITYDDKQYHQTGTFEQRQFTDSEGQKVDDDLNKKLTSALIRGYTNDKKAREKEHGGMEIKSYGDTFYVNTAEKSVLFNDEKFTQVGDFDNKKFIDSQRKEVNPKLEDKLKGALISAYVKEKEARERKNDGKEISLKGTKYYVNLDKGTIKSDHIDVTHKDDGFYDNKTNEKVTDKDTLDCLNFAENIIKKQERKQTQDLVM >NC_018108.1|WP_013521320.1|1218639_1219344_+|hypothetical-protein MKVQKKLSSEAFELLTTYGRTIDLLISNDLIEELKETAIELREARFTKNLAFLHKIEGKYIASCFLKDDGYFQVFSISKEKPNLDEELKNYLSLYTTHPFYWFNDFKYDSFEFLNLVGPDYEDKVIICSYDEHNVEMLVKKEQEIYFDPQLALSNDEFAMPIYFNTAKEAKDFIKNRYFDDVGNKKYYLVNGKHTFRNQRIEQLSNQKILKKACEEREEENPNPNQSEGRSQSV >NC_018108.1|WP_013521321.1|1219340_1220270_+|hypothetical-protein MSNSKYQRSIKNAQSYVEENINLTDDEKKAIDMSQTNIKDMVDDMYRLYWHHIKHPQTESDRIDVDVFVKQNVFEFFLDGEGKFSCPWEENGRLPWVENENGDEYLYSKEEFVLDNLKNTYFKVANQVLEFEYLDTPDYEKFWKKVDYQKEALPKTLDEFSKLVLNSKEYSQLNPIDEEQKILEKLELAKECIVKPIIDEYFYKRLYSDKYQSIPFIITSYRDKEIYDLINKPLDEKVFTDSDLFKKQMEDDYSNLFALDLYTRISNDLTDDEIDTFKEFCAKASKVVSDFVCETTQNHVNKKPKELVM >NC_018108.1|WP_013521322.1|1220312_1220552_+|hypothetical-protein MNLEDIKLKLAKNNVTPSFLIKKLSNDENTYVRRMVAQREDLSQDLVEKLALDESIWVRGAIKKCYGITQEPEPQDLTM >NC_018108.1|WP_013521323.1|1220582_1220963_+|hypothetical-protein MKNEQLKQLLNPIKEYLLSLSYSESLEKHRLIFKKYLVLRDDVGLFRELAKKDWGFLSYATDRVLKDKEVILNAIAYNPKAQKFIREYYEKGFETDIEFQIKKVEAIKKSQSLIKNDTKEVSNEIV >NC_018108.1|WP_013521324.1|1220949_1221579_+|type-VI-secretion-protein MKLSKLFLYTVLSVGFANVHAGGIPVIDTAQLTQEAQNFLKSLAEMKNQVENQIKQITELKAQVSALTSQRGLGNVLRDELKSNIPDSWKEMYGKVGNLDILKGENFDPEGSAKNLVAMLEGTEKSFDSIKERMKKIDELTNLINTTKDIKETGDLQARIQSEQLAITNEQIKLDQLARAYEIQKEVNSKQRIRQETCSLAKWAGRTCE >NC_018108.1|WP_013521325.1|1221587_1222712_+|type-IV-secretion-system-protein MEFVQRIFDFITTAMSSGLYNRANNIITNVVYAFSMGFTIYMLYVIWDFYQRGVDASLMDFTRKVFGWLLIIAIAFNGPNYQTIATYLYELPESLVGWINGTPMDAKYFTEMVTVINQNISNLQAQQDSAGWATKVLIGISMGIVMLLGYGGLFLTIGMYLIAKASLAVILTLGPIFIGFLLFSNTRQWGMNWISQILNYSITIGLYSIIIVIQQDTMKGLKLTNKVENHWFWGESTAVNLGDIMNFTLAIIAISAILIPVIMSIPSIASALVGGASASSQTGGFGRMAMAGATGAGTGAGAVLSRGAGMALRSANWTSGGTLGKAGNALINSGLAHKAVGVAKATKGFFRDGGGRRLGHKSALEKSRMNNPSN >NC_018108.1|WP_013521326.1|1222748_1223279_+|hypothetical-protein MKKYLALLLLPISIACNGADKDIEMVKAYVTQTKLETNEICSDLLWYEFDSTYTNDGQLELVKLGILKKVDSKNPSKTKVALNEGASAYLERGFGDDNFSICATGKPIKTIEKIERVGTNNVIKVSLKVDNSKVSKWFLDKSLEKTKLKNMQKQFIEDEVLYFEVVNGIVWKRYSE >NC_018108.1|WP_013521327.1|1223330_1223918_+|hypothetical-protein MKKLFISLVLVLPFAQAFAEDKQISEIRQDVLKTIPKVEEVCSNPIPLNFGENIVSEYIHLGFLRKTNKTSQSSLENAVFSDGKLIELTDEGKKYAKTDSNGKLIFCAGKVGIKIKSIEKEKENDRLYKVVVEIDKSNLADWIYDKGFQHSSNGPFIKNYTPTEEIHFLFRSRKDGSKIIEHYHLSGHPFIFKYF >NC_018108.1|WP_014840498.1|1224055_1224226_+|hypothetical-protein MKQNKEYKLKKQRAREYSLEEDMDLEIEIPLSYEEVKAIGLDDPDYDTYSDLVEKE |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_018108_1 | 1.24|227283|34|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 227283-227316 | 34 | CP024685 | Bacillus wiedmannii bv. thuringiensis strain FCC41 plasmid pFCC41-1-490K, complete sequence | 288796-288829 | 7 | 0.794 |
NC_018108_1 | 1.27|227482|34|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 227482-227515 | 34 | CP024685 | Bacillus wiedmannii bv. thuringiensis strain FCC41 plasmid pFCC41-1-490K, complete sequence | 288796-288829 | 7 | 0.794 |
NC_018108_1 | 1.24|227283|34|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 227283-227316 | 34 | NZ_CP012100 | Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-1, complete sequence | 342046-342079 | 8 | 0.765 |
NC_018108_1 | 1.24|227283|34|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 227283-227316 | 34 | NZ_CP029455 | Bacillus cereus strain FORC087 plasmid pFORC087.1, complete sequence | 153352-153385 | 8 | 0.765 |
NC_018108_1 | 1.27|227482|34|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 227482-227515 | 34 | NZ_CP012100 | Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-1, complete sequence | 342046-342079 | 8 | 0.765 |
NC_018108_1 | 1.27|227482|34|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 227482-227515 | 34 | NZ_CP029455 | Bacillus cereus strain FORC087 plasmid pFORC087.1, complete sequence | 153352-153385 | 8 | 0.765 |
NC_018108_1 | 1.30|227681|34|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 227681-227714 | 34 | NZ_CP026693 | Nostoc sp. 'Lobaria pulmonaria (5183) cyanobiont' strain 5183 plasmid pNLP1, complete sequence | 97774-97807 | 8 | 0.765 |
NC_018108_1 | 1.4|225955|34|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 225955-225988 | 34 | MF403008 | Agrobacterium phage Atu_ph07, complete genome | 266155-266188 | 9 | 0.735 |
NC_018108_1 | 1.8|226218|34|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 226218-226251 | 34 | MF403008 | Agrobacterium phage Atu_ph07, complete genome | 266155-266188 | 9 | 0.735 |
1. spacer 1.24|227283|34|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to CP024685 (Bacillus wiedmannii bv. thuringiensis strain FCC41 plasmid pFCC41-1-490K, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
atattattttcaactaacaagtttt---taatctcag CRISPR spacer atattcatttcaactaacaagttttctataaatt--- Protospacer ***** ****************** *** .*
2. spacer 1.27|227482|34|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to CP024685 (Bacillus wiedmannii bv. thuringiensis strain FCC41 plasmid pFCC41-1-490K, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
atattattttcaactaacaagtttt---taatctcag CRISPR spacer atattcatttcaactaacaagttttctataaatt--- Protospacer ***** ****************** *** .*
3. spacer 1.24|227283|34|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP012100 (Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
atattattttcaactaacaagttttt----aatctcag CRISPR spacer atattcatttcaactaacaagttttctatgaatt---- Protospacer ***** ******************. ***.
4. spacer 1.24|227283|34|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP029455 (Bacillus cereus strain FORC087 plasmid pFORC087.1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
atattattttcaactaacaagtttttaatctcag CRISPR spacer atattcatttcaactaacaagttttctatgaatg Protospacer ***** ******************. ** *
5. spacer 1.27|227482|34|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP012100 (Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
atattattttcaactaacaagttttt----aatctcag CRISPR spacer atattcatttcaactaacaagttttctatgaatt---- Protospacer ***** ******************. ***.
6. spacer 1.27|227482|34|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP029455 (Bacillus cereus strain FORC087 plasmid pFORC087.1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
atattattttcaactaacaagtttttaatctcag CRISPR spacer atattcatttcaactaacaagttttctatgaatg Protospacer ***** ******************. ** *
7. spacer 1.30|227681|34|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP026693 (Nostoc sp. 'Lobaria pulmonaria (5183) cyanobiont' strain 5183 plasmid pNLP1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
gagaattaatcagacagcccgaat---ctattcaagc CRISPR spacer aagaattaatcaaacagccagaatcggctatttt--- Protospacer .***********.****** **** *****.
8. spacer 1.4|225955|34|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF403008 (Agrobacterium phage Atu_ph07, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ccaattagtgctttttctattcgatgttttttac CRISPR spacer ccaattaatgatttttctattcgatcacctgtga Protospacer *******.** ************** ..* *.
9. spacer 1.8|226218|34|NC_018108|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF403008 (Agrobacterium phage Atu_ph07, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ccaattagtgctttttctattcgatgttttttac CRISPR spacer ccaattaatgatttttctattcgatcacctgtga Protospacer *******.** ************** ..* *.
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
251257 : 259118
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_018108|251257:259118|DBSCAN-SWA CATGTCAAAGCCAGTAGGACAATTTTGTCCACCACAAATGCTAGATAATTTAAACCATCAGACTTGGCCACAACCCGCACTATACGTGGTTTCTACGCCTATAGGAAATTTAGCAGATATAAGTTATAGAGCTGTGTTCGCATTGCAACTATGTGATGTGATTGCCTGTGAGGATACGAGGACAGCTAAACTGCTTCTTAACCAATTACAAATCGAATATAAGCAATTAGTGGCTTTGCATAAATTTAATGAGTCTGAATCCGTAGGGCATATAGCTAATTTATTAGATGAAGAAAAAAGAGTGGCTTTGATATCGGATGCAGGATCGCCAGCTATTTCCGATCCTGGAAGTGTGCTAGTGGAACAGTTGATAGGCAGAGGGTATCGGGTGATTCCAGTGCCTGGGGCCTCTGCTGTTATTGCGGCAGTGATGGCCTCTGGTGTAAGACCAAGATTAGGGGAACTGAACGGGTTTGTGTTTCTTGGCTTTCTTCCGCCTAAAAGTGGGGAGAGGAGGGCGTTTATTGTGGGTGAGCTAGAGCATTGCCAAAGACCTGCAGTTTTATTTGAAGCTCCGCATAGGATTGTGGATGCAATAGCGGATTTAAGGGCTGTTTTAGGAGATATCCGAACTGTCACTATCTGCAGGGAGTTGACTAAAAAATTTGAGTCGATTTATACAGGAAGTTTAGAGGAAGTTTCTGATTGGATTAATGGCGATTCGAATAATCAAAAGGGTGAATTTGTTTTAATCGTGCATCCCTCCGAAGTTGTAGAAGGTGATGAAGTGGATACGCAAAAGCTTTTAAGTTTGCTACTTAAAAAAGGCGTGTCTCTTAAGGATTCAGTTTCGATTGTGCAGGAGTATGCATTGAAATCTAAAAAAGAAATCTACGATCTGGCTTTAAAAATAAAAGAAGATTTGTCAAATTAGAAATCAGATTTAAAACCAACTAGTTCAATCTTAACTTTGTCCGTACCCTTTTTATGAATGCCTAGCTGCTTAGCGGCTTCATAAGATAAGTCTATTATGCGATTGTTATGAAATGGTCCGCGATCGTTAATATACACGATCACGCTTTTGCCTGTAGTTTCACTAGTAACTTTAACGATACTGTTAAAAGGTAGTTCTTTGTGAGCTGCAGTTAGGGCATTTTGGTTGTACTTCTGACCGTTTGCTGTAAGGCGTCCATGAAAGCCAGGGCCGTACCATGAGGCAGTACCAGTTTGAGAGAATTCTTTTATTTTTGTGTATGGACGATAAACTTTACCTGCAACCTTGTAAGCTTTTCCTTTTTGAGCTTGTGAGTCATGATAGAAATGAGGAGTCTCTGCATGAACAGATGCACCTACAGTTAAACATAGCCCGATAACAAGTTTTGGAAAATGAGCAATAAAGTTCATAAATATCCGTAAAAATCAGAGTCTAGCAAAATGAGCCAAGGCCCTATGTCTCACACGAAGTGGCTTGTGATGACTAAATTTCTCAGCAAGTTTTTCAGCTATATACACAGATCTATGCTGACCACCCGTGCACCCTATGGCAATAGTTAAGTAGCTACGAGTATCTTGCATATAACTAGGTAGCCACTTACTAACAAATCTTTCTATATCAGATATCATCTCTAAAACTTCAGATTTGCTATTAAGCCATTCCGCAACTTCGATATCTAAACCAGTTAATTTCTTTAGTTGAGCATCGTAGTAGGGATTAGGTAGACATCTTACATCAAAAACTAGGTCTGCACTACTTGGGACTCCGTATTTGTAACCAAAGGATTCAAATGTAATTAGGGTTTCACCCTGTCTCGTATCTATTGATTCCCTAATCCAAATGCGCAATTCACTAGGTTTTAATAATGAAGTATCAATGACTTGCTCGGTCTCTTTAATGGAACTTAATAAGTTCCTTTCATAGGCAATGCACTCCTCCAAAGAGGGTGTATGGTTTGTCTCATTTTTGATACGTGAAGTGAGTGGGTGGACTCTTCTAGTTTCAGAAAATCTATGCATTAATACATCATCTGCGGCGTCCAAATATATGACCTTGATGTGATAGCCATTTTCACGAAGATTATTAATTGTGGCTGGTAAGTGATGTATGTCATTGTGACTGCGAGCATCCACTGCGGCTGCTAAGAAATCTTCACCTTTATAGCTTGAATCATCTATAAAGCTTTTAACTAAGGAAACAGGTAGATTATCAACGCAGTAATATCCTGCGTCCTCTAGCTGCTTGATAGCAACTGATTTACCTGACCCAGAGATTCCAGTAACTATCACTACAGATTTCATCGAGGGCCCCTATATCTTGGAATTCTTAAGAATAGCTTCTGATTGTTTCTTCATAAAGTCACTAAGCGTATCTATGCCTCTTATTTTAAGAACCATATTTCTTACAGCAGCCTCTACAAGAACAGCGAGATTTCGACCAGCAGCTACCTGCAATGTGACTTTTTTTATGGGCATACCTAAAATTTCTTCTGATTGATCCTGCATCGGCAATCTTTCGAAAAATTCTGTATTTGCTCTCACAAGATTAACGATTAGTTTTAGGCTCATCTTACGCCTAACGGCAGTTTCTCCGAAAATAGTCCTAATATCCAAAAGTCCTAGCCCGCGAACCTCAAGAAGGTTTCTTAGTAGCTCGGGGCAACGACCTTCGATGTAATTCGGATACGTGCGAGCAAATTCAACTGCATCATCGGCTACAAGCCCATGACCACGTGAAATTAATTCTAAAGCTAGTTCACTTTTGCCTAATCCCGATTCACCTGTTATTAGAACGCCAACACCTAATACATCCAGGAAAACACCATGAACAGTTGTTTTGGGTGCAAACCTTCTAGTTAGATAAACTCGAAGCACGTCAATAATACGTGACGCATCTACAGGGGAAGTTAGAAGAGGGACCTTATTGATTTCGCAAAATTCAATAATAGACCGTGGAGGAGGAATGTCCTCTGCGATTATGATTGCTGGGACTTGACCTTCTTTTAGGGTTGTGAGGTAATGCTCTGTTTGTTGATTATCTAATTTAAGAAAAAAATCAATCTCAACGACACCAAAAACTTGAACCCTTTGAGGGTGCATGATATTTAAGTGTCCAATTAAATCAGCAGCTGTAGTATTGGATTCTTCAGAAGAAGACAACATGCGACCGCCATATAAGTCGCTTAGATACCAATTAAACTTTAAAGTATCACTATTGTCATCTACTAAAACTTTAATACTAAGCATCGCTCTCGTCTTGGGTTAGTATGTTGTAGATCTCTTCTGGAGATTCTACGGAAAATAAATTTTTTCTAGTCTCTTCGTTAGATAGTTTTTTTGCAATGGTGGCTAGTAAATCTAGATGCTCTTGGGTGGCAGACTCTGGTACTAGAAGACAGACTAGCAACCGCACATTTTCGCTATCAGGTGCATCAAAGGCAATCGGCGTTTCTAGTCGAAGAACTGCTATATGAGTCTCTTCTAGTTTAGGGATGCGTCCATGCGGGATGGCTACACCATGGCCTAAAGCCGTTGATCCAAGGCGCTCTCTAGCAAATAGGCTATCGAAAACTGTCGCCCTGGCAATGCCATATTGATCTTCAAAAATTTGAGCAACTTGTTCGAAGGCTCTTTTTTTGCTAGATGCTTGAACATTAAGAAGAATATTTTCAACGGACAAGTTAGCTTTAATCTGGTTCATAATAGTTACTCTACATGCGGAAATTTTCACCTAGATACACTTTGCGTACATCTGGGTCTTGAATTATCTCTTCAGGTGTGCCACTTGTAAGCACAGTTCCGTCTGAGATTATATAAGCTCTATCGCAAATTCCTAAAGTTTCTCTAACATTGTGGTCGGTTATCAAAACCCCTATGTTTCTTTCTTTTAGGAAATTTACAATTCTCTGAATTTCTATAACAGCAATAGGATCCACCCCTGCAAATGGCTCATCCAATAAGATAAATCTAGGTTTTGTAGCTAGTGCACGTGCAATTTCAACTCTTCGTCTTTCACCTCCAGACAATGAAATTGCGGGACTTGTGCGGATATGTTGAATTTGTAGCTCATCGAGTAAATTATTAAGTTCCTCTTTAAGGTTTAATTTTCTACCTATTGCCTTATTGAAATACTGTTGGATCTCTAAAACTGCAAGTATATTTTGTTCTACTGTAAGCTTGCGAAAAATAGATGCCTCTTGTGGTAAATATGAAAGTCCAATCTTTGCCCTTTTGTGAATTGGCAATGTAGTAATATCCCTATCATCTATTTGAATAGCACCATAATCGGCAGGCACTAATCCCACGATAATATAAAAGCTTGTAGTTTTTCCTGCACCGTTAGGACCTAGCAAGCCAACTATTTCACCGCTATTAACTTCAAGGCTAACATTTTTTACAACGGATCTTTTGCCATAGTCTTTTCGTAGTCCAATGGCTTTAAGAGTACCATCAGAGTTAATTGGAATCATCTTTTATGTTTAGAGTAGAGGGCATGGGCTTGCTATTATACTTTTTTCTACATTCCTCCACGGCTTTATCTTCTTTTGAGCGAGGTTGAAGTACGGAACGTACACGATCTGTTTTAGAGCGATTGGCTCTGTAAGTGCTCTTAGCATTATCGAATATAATTTCCTCGCCTCTAATACTATCGACGACCGTACCGCATATGCTTCTAGTAATGACGGCATCGCCTCTTAAGAAAACTCTCTCGGTTTTGCCATCATAAATTGCGGTTTTGCTAGTGCCCTTAAGCAATTCGTATAAATCAAGTCGCTCATTATAAAGCTCAACCTTTTTATCTCCATTTACTATAGCTGTACCAGTTTGTGTGCCATCAGGTTTTTCAGAGACACGTAGTTCGTCAGCCAATAATTTCATGGAACCTCTTTGAAGAATTACATTACCCGAAAAAACAGTCGCCTTCGTATTATTGTTGTACTGTAATGAGTCTGAAAGAATTGTAGTCTTAGGTTCTTCTTCGTTTTTGTTCTGTTGGGATTTCATTAAATCACCAAGGCTTTGACCTTTGGCAATGCCAGCAAAGAGCAAGGTTGCAAAAACAAATTTATTAAATCTTAGTTTCATAAATTATCGTAATTCAGTTTTAAATCGTTTTTTATTCTCTGGAAGCCCTTTGTTTAGGTCATCTGGTGAAATCTCAACACCTGAATTATTCATAACATTAAGTAGTCCAGTATTATTATCAAACTTCATGCCTACACCTTTAAGTATAGACTCGCCGTGGTGCACAACCACCTCAGTTTTGGTTTCGATAATACCTGTTTTTGTATGGATTTCTAGTTTATCAGATTCGATTTTAATGTTTGGCTGTTTATCGGTTGCAGGGCGATTCACAACAGCATTGCCATCCAAAATAATAAGGTCCCCGTTTTCTAGGACTTGGGCTTTAGTTGCAGTTCCTATCGTTCTGGGGGTATCGATGTTTTGACCAATAAGATTAGGATTATCGATAATATAAAAATCACCTTGCGGGAAATGGTCAATTCTAGTACCTTTGAGACGATTAATAGCATTTCCTTTTTCGTCGGAGGTAATCATTTTAAAATTTCCAGTCCACGCATCTGGCTTATTTTTTTTAACTACGGCAGTATCTACGGTTATGGATTTTTTTGCGTATTCAGAAGCCCACCAAGTGGCAATGACCAACAATATCAAAAGTCCGAATGCCAATATGGTTGGGAATTTATCTTTCATACTATTGAAGATTTATTCGAGTTTTAAGGGACTGACTCAGCAACCCTTGAGCAGCTAAGATTATGTCTATAAATTCGCGGGCTGCCCCATGTCCTCCTTCTTTAGTGCTTATCCAGTGTGCAGCTTCTTTTATATATGTAGGAGCATGTGGCACACTTGCAGATAATCCAACTGATTTCAAAAGAGGATAGTCCAGTATGTCATCACCCATAAAAGCCACTTCCTTAAGTGTTAATTTATGCTCCTCTAAAATCGTAAGCATAATTTGGTATTTGTCACGTGCGTTCTGGTAAAGTCCATGGATGCCTAGTTCTTGGGCACGTTTTTCAACAATTGGACCGCCTCTGCCTGTAATCCAGACGACCTTAAAACCATTCTCCCTAAGCCTGTTAATTCCACCTCCATCCTGAGTATGGAATCTTTTCATAACTTCCCCATCCGACCCCAAATACAATGCACCATCAGTAAGCACACCATCAACATCAAATGCGACCAGTTTAATATCCAAAGCTTTAAGTCTTACTTGAACTGGAACTGAAGCTAAAACTTGTAATTCGCATGGTTGCTTAACTTTGTGCATATTTTCCTCTTTAAATTACTTTTGATCTAAGTAGGTCCTGCATGTGTAAGGCTCCTGCTAATTTACCCTGTTCATCTGTAACTAGCAGAAGATTAATAGAATATGTCTCCATTATGTTTAAAGCTTCAGTAGCCATCAAATCCTCAGAGATAGTTTTTGGAGACTTAGACATAACTTGAGACATAGTAAAAGAGCGCACATCTCCGTGTTTTTGAATCAGACGACGTAGATCCCCGTCAGTAAAAATACCTTTAGGTTTTTGAATATCGTCTATAGAGCAAGCCATACCAAGAGTTTTAGATGACATGGTTTTGAGGATTTGGTCCATAGTGGCATCTACACTTACTATAGGAAGGTCATGTAGAGGTCGCATAATGTCTGAAACTTTAGTTAGTAGTTTGCGACCCAAAGCACCTCCAGGGTGGGAGCGTGCAAAATCCTGATCACTAAATTGCATGGCTTTCAAGCATGCTATGGCAATAGCATCTCCCATAGCCATAGTTGCGGTTGTACTCGTGGTAGGTGCCAATCCCATAGGGCATGCCTCACGTTCAACTTTTACATTAAGTACTATATTTGAAATTTGTGCCAGTTCCGACTCAAGCCCTCCTGTGATTGCGATAATTTGAGCTCCAGACCTTTTAATAATAGGCAGAATCGTAGCAAATTCAGCACTCTGACCAGAATACGAAATGGCGATAACAATATCATCCTTAGTAATCATACCTAAATCGCCATGTATGGCTTCAGCAGCATGCACAAAATAAGCCGCAGTTCCGGTGGATGATAGTGTAGATGCAATTTTCCGAGCGACATGCCCAGACTTTCCTATGCCTGTAACTATAACTCTACCTTTGCGTGCAAGTATGAGTTCGACGGCGTCAATAAACTCATGCCCAATTTTGCTGGCAATGTTTTGTAACGCACTCGCTTCAATGTTAAATGTCGTCCTTGCGGACTCAAGATGATCTGTTGATTTCATTTGCATATTTTAACTTAGCTTATAATAATTAAGTTACAAATTTCCTCTCAAATCATGCAATACAACCCTATAGAAACAGTCAGAAAAAATATACGTACTATTCCCGATTGGCCTCAACCAGGCGTTAATTTTCGTGACATAACGCCCGTATTGCAAGATCCAAGATGTTTTCGCATGCTCATTGATATATTTATATCTCGATACATGAGTCAAAATTTAGATGTTGTCGCTGGGGTTGATGCCCGTGGATTTATTTTAGGTAGTGTCGTTGCCTACGAATTAAACCTAGGATTTGTTCCGATTAGAAAAAAAGGGAAATTGCCATTTAATACTCTAGGCGAAGACTATAACCTTGAGTATGGAAGTGCATCAGTAGAAATTCACACTGATGCCGTTCATGCTGGTCAAAGAGTGCTTTTAATGGATGATTTAATAGCTACAGGTGGGACACTACTTGCGGCTAGTAGGCTTTTGAAACGTCTCGGGGCAAATATAGTCGAAGCCTGTGCCATCATAGATCTCCCAGAATTGGGAGGTTCAAAGCTTATAGAGGAGTCAGGTACATCCGTATTTAGTCTTTACCAGTTTTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_018108|251257:259118|254488_254950_-|WP_013522024.1|DBSCAN-SWA MNQIKANLSVENILLNVQASSKKRAFEQVAQIFEDQYGIARATVFDSLFARERLGSTALGHGVAIPHGRIPKLEETHIAVLRLETPIAFDAPDSENVRLLVCLLVPESATQEHLDLLATIAKKLSNEETRKNLFSVESPEEIYNILTQDESDA >NC_018108|251257:259118|257555_258533_-|WP_014840113.1|DBSCAN-SWA MQMKSTDHLESARTTFNIEASALQNIASKIGHEFIDAVELILARKGRVIVTGIGKSGHVARKIASTLSSTGTAAYFVHAAEAIHGDLGMITKDDIVIAISYSGQSAEFATILPIIKRSGAQIIAITGGLESELAQISNIVLNVKVEREACPMGLAPTTSTTATMAMGDAIAIACLKAMQFSDQDFARSHPGGALGRKLLTKVSDIMRPLHDLPIVSVDATMDQILKTMSSKTLGMACSIDDIQKPKGIFTDGDLRRLIQKHGDVRSFTMSQVMSKSPKTISEDLMATEALNIMETYSINLLLVTDEQGKLAGALHMQDLLRSKVI >NC_018108|251257:259118|252675_253551_-|WP_013522022.1|DBSCAN-SWA MKSVVIVTGISGSGKSVAIKQLEDAGYYCVDNLPVSLVKSFIDDSSYKGEDFLAAAVDARSHNDIHHLPATINNLRENGYHIKVIYLDAADDVLMHRFSETRRVHPLTSRIKNETNHTPSLEECIAYERNLLSSIKETEQVIDTSLLKPSELRIWIRESIDTRQGETLITFESFGYKYGVPSSADLVFDVRCLPNPYYDAQLKKLTGLDIEVAEWLNSKSEVLEMISDIERFVSKWLPSYMQDTRSYLTIAIGCTGGQHRSVYIAEKLAEKFSHHKPLRVRHRALAHFARL >NC_018108|251257:259118|258581_259118_+|WP_014840114.1|DBSCAN-SWA MQYNPIETVRKNIRTIPDWPQPGVNFRDITPVLQDPRCFRMLIDIFISRYMSQNLDVVAGVDARGFILGSVVAYELNLGFVPIRKKGKLPFNTLGEDYNLEYGSASVEIHTDAVHAGQRVLLMDDLIATGGTLLAASRLLKRLGANIVEACAIIDLPELGGSKLIEESGTSVFSLYQF >NC_018108|251257:259118|256966_257545_-|WP_014840112.1|DBSCAN-SWA MHKVKQPCELQVLASVPVQVRLKALDIKLVAFDVDGVLTDGALYLGSDGEVMKRFHTQDGGGINRLRENGFKVVWITGRGGPIVEKRAQELGIHGLYQNARDKYQIMLTILEEHKLTLKEVAFMGDDILDYPLLKSVGLSASVPHAPTYIKEAAHWISTKEGGHGAAREFIDIILAAQGLLSQSLKTRINLQ >NC_018108|251257:259118|255705_256335_-|WP_013522026.1|DBSCAN-SWA MKLRFNKFVFATLLFAGIAKGQSLGDLMKSQQNKNEEEPKTTILSDSLQYNNNTKATVFSGNVILQRGSMKLLADELRVSEKPDGTQTGTAIVNGDKKVELYNERLDLYELLKGTSKTAIYDGKTERVFLRGDAVITRSICGTVVDSIRGEEIIFDNAKSTYRANRSKTDRVRSVLQPRSKEDKAVEECRKKYNSKPMPSTLNIKDDSN >NC_018108|251257:259118|256338_256965_-|WP_013522027.1|DBSCAN-SWA MKDKFPTILAFGLLILLVIATWWASEYAKKSITVDTAVVKKNKPDAWTGNFKMITSDEKGNAINRLKGTRIDHFPQGDFYIIDNPNLIGQNIDTPRTIGTATKAQVLENGDLIILDGNAVVNRPATDKQPNIKIESDKLEIHTKTGIIETKTEVVVHHGESILKGVGMKFDNNTGLLNVMNNSGVEISPDDLNKGLPENKKRFKTELR >NC_018108|251257:259118|253560_254496_-|WP_013522023.1|DBSCAN-SWA MLSIKVLVDDNSDTLKFNWYLSDLYGGRMLSSSEESNTTAADLIGHLNIMHPQRVQVFGVVEIDFFLKLDNQQTEHYLTTLKEGQVPAIIIAEDIPPPRSIIEFCEINKVPLLTSPVDASRIIDVLRVYLTRRFAPKTTVHGVFLDVLGVGVLITGESGLGKSELALELISRGHGLVADDAVEFARTYPNYIEGRCPELLRNLLEVRGLGLLDIRTIFGETAVRRKMSLKLIVNLVRANTEFFERLPMQDQSEEILGMPIKKVTLQVAAGRNLAVLVEAAVRNMVLKIRGIDTLSDFMKKQSEAILKNSKI >NC_018108|251257:259118|254960_255719_-|WP_013522025.1|DBSCAN-SWA MIPINSDGTLKAIGLRKDYGKRSVVKNVSLEVNSGEIVGLLGPNGAGKTTSFYIIVGLVPADYGAIQIDDRDITTLPIHKRAKIGLSYLPQEASIFRKLTVEQNILAVLEIQQYFNKAIGRKLNLKEELNNLLDELQIQHIRTSPAISLSGGERRRVEIARALATKPRFILLDEPFAGVDPIAVIEIQRIVNFLKERNIGVLITDHNVRETLGICDRAYIISDGTVLTSGTPEEIIQDPDVRKVYLGENFRM >NC_018108|251257:259118|251257_252190_+|WP_013522020.1|DBSCAN-SWA MSKPVGQFCPPQMLDNLNHQTWPQPALYVVSTPIGNLADISYRAVFALQLCDVIACEDTRTAKLLLNQLQIEYKQLVALHKFNESESVGHIANLLDEEKRVALISDAGSPAISDPGSVLVEQLIGRGYRVIPVPGASAVIAAVMASGVRPRLGELNGFVFLGFLPPKSGERRAFIVGELEHCQRPAVLFEAPHRIVDAIADLRAVLGDIRTVTICRELTKKFESIYTGSLEEVSDWINGDSNNQKGEFVLIVHPSEVVEGDEVDTQKLLSLLLKKGVSLKDSVSIVQEYALKSKKEIYDLALKIKEDLSN >NC_018108|251257:259118|252186_252660_-|WP_013522021.1|DBSCAN-SWA MNFIAHFPKLVIGLCLTVGASVHAETPHFYHDSQAQKGKAYKVAGKVYRPYTKIKEFSQTGTASWYGPGFHGRLTANGQKYNQNALTAAHKELPFNSIVKVTSETTGKSVIVYINDRGPFHNNRIIDLSYEAAKQLGIHKKGTDKVKIELVGFKSDF |
11 | Synechococcus_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DBSCAN-SWA_2 |
265816 : 273393
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_018108|265816:273393|DBSCAN-SWA TATGCCAGGGTTTGAAAAAAAAATATTGCCACCTCATGAGTTAAGTAAAAGATTAAAAACTTTTTCTAAAGTAGTTTTTACAAATGGGGTGTTTGATATATTGCATCGCGGTCATGTAAGTTATCTAGCAGACACAAAAGAGCGTTTTGGAGGGGTTCTGGTTGTAGCTTTAAACTCTGATGCTTCCGTGAAGCTATTAAATAAAGGAGATGCCAGACCTTATAATTCGCTTTCAGATAGGATGGCGATGATAGCAGCCTTAGAAAGCGTTGATTTTGTGACGTATTTCGAGGAATCAACGCCATATAATTTGATTGAGTTACTAAGACCTAATGTGATAGTCAAAGGCGGTGACTATGATATGAGTAAGCTACCAGAAACCGAACTAGTGAAGTCGTGGGGTGGTCAGGCATATGCGATTAAGTTTGAATATGACTGCTCAACTACTAAGCTAGTTGAAAAAATTAAAAGTAATTAAAAAATAAATTCAGACTCTACGAAAGCCGACCCGTGCAGTTTTTCTATTACGGTTTCGGTTAAGTTCACTTCATCAAATTCAGAGGCACTCATACGGGTGATAAGCTTCATCTCGATTACTGGAGGAGTCCCAATAAAACCCACCAATCGACCACCAACGGAAAGCTGATACTTCAAGGCATCAGGTAACTTAGGGCAAGAACCTGTAATAGCGATTGCGTTATATTCACGTGTACCCCATCCAGAAGATGCATCTCCAATCTGCACACGTACATTACTAATATGATTACGTGCTAGGTTCTCCATCGCAAAGTTTGCAATATTAGGATTTATCTCTACTGACTCAACTTCTGTACATAGGCGACTTAGAAGTGCTGCTTGAAATCCGCTACCAGTACCAATCTCTAAGCAAGTGTCGGTAGGAAGTAATGAAAGAGACTGTGCGATTCTAGCTTCCGTAATTGGTGTAAGCATGTGCTCGCCAGATGGCTCTCCGTTTACTACTATAGGTATGCTAGTGTCTGAATAAGCAACTGTGACAAATTCAGGTGCCACAAATGCCTCTCGAGAAAGTCCTAAAAGTGCGTTAAGCACAAGCTCATCCAAAACACCAGCAGGTTTAATCTGCTGTAGAATCATATTGATGCGGCTTTTCTCGAGAAGTGAATTTAAGCTAGACATAGGACACCTTTAAAATTTGTGAACACATTTTACCAAACATTGTAAAAATGATGTATAGGTCCGTGTCCATGCCCCACTGACAATAAGTTAGAGTTTTCAATGGCTTCGTGCACATACTTAATTGCATCTCGCGTGGCCCTCGGTACATCGCTATATCTAGCTTGTAGAGCACATATCGCAGAAGACAGCGAACATCCCGTCCCGTGCGTATTTTTTGTATCAAATTTGGGATTAACGTGCTCAATCATCCTGTCACCATTAAAAAGTAAATCAACGCTCTCAGCTTCACTTGAGTGCCCGCCCTTCAAAAGAACCCAACTTTCTCTGGATTGGTTCATAAGTTTATGTAGTTTTTCTGTAGCTTTATAAGCCTCTTTTAGGTTGGCAATGCCCCCCTGATTCAACAACTCAGCTGCTTCGGGCAAATTTGGTGTAATCATATGGGCAAATGGAAGTAGATCATGAGCCAATGAAGAAATAGCTGAGTCCTCTAATAACTTGTCCCCACTTTTTGCAACCATAACAGGATCTAAAACAATAAACGGTGGGTTATGTTTTTCAAGCCCATCGGCAACAGTTCTAATAGTGTTTGAATCCCCGAGCATGCCAATTTTTACAGAGTCAATACGTACATCTTCAAATAGAGTATCGATTTGAAGGTTTATAAAATCTCTACCGATAGGTTTAACACCAGTTACACTTTGGGTATTTTGAGCTGTTAGTGCAGCTATGACTGCACAAGCATAGGTTCCAAGGGCGGACATTACTTTTACATCTGCTAAAACACCAGCCCCGCCTGACGGGTCTACACCTGCTATTGTTAATGTGTTTTTAATCATATCCATACTTATTTGTTTTAGATTTTTAATAATATTGTAAAGGCTTCAAGTAGTAAAATAACAGAAGTTACAATTTGTGAAATCAGGAGCCCCATATGGTCGCAAAGAAGACTTCAAGCCCAACCAAAAGGACTGAAACTAAGTCTACTACTGCAAGTAAAACCAGTTCTAAAACGCCAACACGAAGCACCTCAAAATCCACAACTAAAACTTCATCCAGAGCTTCAACTCGAGCTCCAAAAGCAATAGAGCCTAGATCACGTAAGACTATCGAGGGTGATACCATTACGGGTAGCACTCAAGCTGCTACTAGACGAAATGTAGTCTCTCATAAAGTTATATCCAAAGCTGAACTTCAAGCTGCAAACCTTGCCCGAGAGCTTGCACATGCGGAGACTTCGGTAGATCGTCACGAAAGGGCGAATGCATTATTAGAAATACTATCTCCAGATGATAGAAATGCTTTGCTCAAAGTTTTACGTGAAGAAAAACGTAGACTTGAATCATCAAGCAAAAAAAATCCCGATTTGGAATTAGTTGATGACTGGCAAAAAGAGGGCGTGTACCCTTACAAATATTTAATGAGCAGACGCAACTATGAATTCCAAAAATATAATCTACAGGTTGAATTATTAAAGCTTCAACAGTGGGTTCAGGATTCTGGAGCACGCGTAGTTATTATCTTTGAAGGACGCGATGCTGCTGGTAAAGGGGGTACCATTAAGCGTTTTATGGAGCATTTAAATCCACGTTATGCTCGCATCGTAGCTCTTCAAAAACCAACTGAGCGTGAAAGTGGACAGTGGTATTTCCAAAGATATGTTGAGCATCTTCCAACAAAAGGAGAAATCGTACTTTTTGACCGCTCATGGTATAACCGTGCTGGGGTTGAGCGTGTAATGGGTTTTTGTACAGATGCTGAGTATCAAGAATTTATGCGTCAGGCTCCTGAGTTTGAGCGTAATCTTGTGAGGAGCGGAATTGTTCTGATTAAGTTCTGGTTCTCTGTAAGTCGTGATGAGCAACGTCGTCGTTTCCGTGAGCGCCAGCATCACCCACTCAAACGTTGGAAGCTATCTCCAATCGATTTGGCTTCACTTGATAAATGGGATGACTACACTAAAGCTAAAGAAGCGATGTTCTTTTATACCGATACAAGTGATTCTCCATGGACAGTTGTTAAGTCTAATTGTAAAAAACGTGCTCGACTAAATGCTATGCGTTATGTACTTAACAAATTTAACTACAACAACAAGGATATGGAAGCTATAGGTAAAATTGACCCACTAATAGTAGGTCGTTCAAATGTAGTTTACGAATCAGGCGAAGAGTATATTTCTCATAATGATAAGAAATAGTATCCATCGGATAAGTAGCTATACTTAAAATTGGCATTATGGCTAAATAGTGATACGGCAATACTGAGTATAATTAGTATTGTCGTTTTTTTTGATATTTTTTATGCCTACATTTGATTATGATTTATTCGTTATAGGTGCAGGTAGTGGCGGTGTTAGAGCCTCTCGCATGGCTGCCAGTATGGGTGCCAGAGTTGCTGTGGCAGAAGATGCACCCTTAGGTGGCACATGCGTAAATTTAGGATGTGTACCAAAAAAACTCTACAAATATGCATCAGATTTCTCAGGTGACTTTGAGGCTTCAAGGGGCTTTGGTTGGAGCATCGAAGGCATCTCATTTGATTGGGAAGTTTTAAAAGCTAATCGAGCAAAAGAAATTTCTCGTCTAAATAATATTTATCAAAACATATTAGAAAAACCAGGCGTTCAAATCATCCGAGGTCGTGCAAGCCTTGTGGATGAGCACACTATAGAAGTTGAAGGAAAACATTACACCTCTAAAAATATACTTATTGCCACAGGTGGATGGCCAGGTATTCCTGAAATAGAGGGAGGAGAGTTATCAGTAAACTCCAATCAGATTTTCGATTTGGAAGAGCTTCCTAAAAAGATTGTTATCGTTGGCGGGGGATTTATTGCCTGCGAATTTAGTTCAATCTTTAATGGGTTGGGAGTACAGGTACATCTTATTGTTCGCTCAAAGATGCTTAAAAACTTTGATGCCCCAAGTATGGATTTCTTGAAAGAAGAGATGATTAAGCATGGAGTGGATATACAAGAAGGCGTTAATATCAAATCCATAGATTTGAACGATGAAGGGTCCGAGTTTAAATTGACAGTGCATCTTGATAATAATGTATCCCTTCAGGCCGATGAAGTTCTTATGGCTGTAGGTCGCATACCAAATACTGAAGGTCTAAATTTAGATGAAGTTGGTATTGAAACATCGAAATCAGGACATATAAAAGTAAATGAAAATTTTCAAACATCTGTGCCTTCAATTTTTGCATTGGGTGATGTGGTAGGTCGATTAGAACTCACTCCAGTCGCTATTGCTGAAGCAATGACTCTAGTTAATCATATGTTTGGAGATGGCACTCGTAAGATGTCTTATCAAAATGTTCCGTTTGCCGTCTTTACAAATCCTACTTTTGGGTCTGTAGGGCTTACTGAAAGCGAAGCTCAGGAAAAATTTTCTGATGATGTTGAGATATTCGAATCTAACTTTAAGGCTATGAAGCACACGCTTTCTGGCAAAGATGAAAGAACCTTAATGCGTATCATCGTACAAAAATCAACGGACAAAGTTTTGGGTGTACATATGGTGGGTGAGGATGCTCCTGAAATTATCCAAGGTTTTGCTGTTGCATTGAGAGCTGGAGCGACAAAGGCGGACTTTGACTCAACTATTGGTATTCACCCAACCTCTGCTGAAGAGCTCGTAACCATGCGTACTCCAAAATCAAAATAGGAATTTTTATGTCTATTATTTCTTCTACTGTTGCAATAGGTACTCTTGGCGGTACTATTACTATGACAAAATCCACCGATTCAGGTGGTATTAAATCTACATTATCAGCGGAAGATTTGATTTCTTCTGTACCTGGTTTGCAGGACATGTCACTAGAGATTTGGCAAAAAACAATTGCTAACGTTGCCAGTGGGTCGCTGGATTTTGATACGGTCTTCGCATCCCTTGCTTGGGCAAAGCAACAAGTGGAACACGGTGCTCAGGGTGTTGTTTTAGTTCAGGGTACAGATACTCTGGAGGAAACTTCATATCTTTTAGATTTGTACTGGCCGTATGCAGCACCGCTTGTACTCACAGGTGCTATGAGACATCCAGAATTAGCTGGTGCAGACGGGGCCGCAAATTTACTCGCTGCCATTAAAGTTGCAGTCGACATTAAATCTCGAGGGCATGGGGTATTTGTAGTTATGAACGATGAAGTACATCAAGCCCGTTACGTAGCAAAAACTCACGCCAATGCTGTAGATGCTTTTGAATCCCCTCAGACAGGACCTGTTGGAGTGGTTACTGAAAACAGTCTTCATATAAGAAGATCGCCAAATGAACGTATGCTTTTCCCTGTTCCTGAGGATTACGATGCACGTGTTCTTCTATTAGAGTCTACTTTAGATGAATCTGGTGAAATTTATGATTGGATACCGAAGTCATCTTATAAAGGTCTTGTGATTGCTGGATTTGGAAGTGGACATGTTCCAGGTAGCATTGCCAGCAAAATAGAAAAGATAATTAACGATATGCCTGTGTTGGTCTGCTCCAGGACTGGGCGTGGGACTACAACTTACAAAACATATGCGTATGAAGGTAGTGAAATCGATCTTCAACAAAAAGGTGCCTTGATGGGTGGCTTTTTATCTCCTCGTAAAGCTAGGCTTCTTTTGAGTGCGATGATTTGGTCGAAGATGGATAGAAGTAAAATTTGCGAGCATTTGCGTAATTACAATAAGGACTCTGTCTAAGGCATGAGCGAAAAAGCTTTAGTTGTTTTTTCTGGCGGTCAGGATTCTACTACCTGTCTGCTTCAAGCTATTGAAAATTTTGGTGTTGGCAATGTTAAAGCAATCACTTTTATATATGGTCAACGACATGAGATTGAACTGAAAAAGGCTAGAGAAATTGCGATTGATCTCGGTATTGAGCAGACTATACTTGATCTTAGTGTGATGAAGTCAATCACCACAAATGCACTTATGCAAAAGGGTGCTGAGATTAAGACTGACGAATCAGGTCTACCTAATACATTTGTAGATGGTCGCAATGCATTGTTTCTTTTATATTCCTGTATCTATGCAAAGTCTCAGGGCATAAAAAATATTGTTATCGGTGTGTGTGAAACTGATTTTAGCGGTTATCCAGATTGCCGAGATATTTTTGTGAAATCGATGAATGTGAGTATGAACCTTGCTATGGACTACGATTTTGTTGTTCATACACCGCTTATGTGGCTTACTAAGGCTCAAACATGGGAGTTAGCTGATAAGTTGGGGCGTTTAGATTATGTTAGAACTCGTACGCATACATGTTATGAAGGTGTTGAAGGTGGGTGCGGAAACTGTCCTAGTTGTGTACTTAGAAATCGTGGACTTGAAGAGTATTTAAATTCCAAAAATGAAAGTAGTAAAAACGTTTAACTTCGACATTGCCCACCTGCTTGATGGTCATGACGGTAAGTGCAAAAATTTGCACGGGCATACATATAGACTTGAAGTTGAGGTTGCTGGACCAGTTATTGAAGATGGTCCGAAAAAGGGTATGGTTATTGATTTTGCGGACCTAAAGAGTGTGGTCGATGACTTAATTATTGCCCGTATGGACCATGCTTTTTTGTACGATTCTACTAATGAAAGAGAGACTGCAATAGCTCAATTACTAGAGGGCTGGAACATGAAAACTTATCCATTCAAACATAGAACAACTGCCGAAAATATTTCTCGTCATATTTTAGATTTGCTAAGAGAACGCCTTGAAGGCGTTAATCGAGTTCGTTTGTGGGAGACACCTTCTTCTTATAGTGAATGCACTTTCGATGACGAAATTTGAAATTATAAGATTGCAGTCTGGTGCGACGGAACCGCAATTTCGCATAGTTGAAATTTTTAAAAGCCTTCAAGGAGAAGGGTTTAACACGGGGATGCCTGCTACATTTGTGAGGCTTGGGCGTTGTAATCTTGCTTGTGGATGGTGTGATACAAACTACAATTCGTTTGGTTTAAAGTCTCTTTCGGAAATTCTGCAGATTGTTGAAGATTTGGGTCAGTCAAATATTATTTTGACGGGTGGAGAGCCTTCAGTGCATCCAAATGTTGAGCTTTTAATCGAGGCGTTTAAGAGTCGTGGGTACTATTTGTGCATTGAAACTAACGGTATTAGTGATGTGCCAGAGGGTATAGATTATATTGCCATAAGCCCAAAGTATTGCTATAAGGAGCGTTACGAAAAGGTTGGTTTGAGGTATGCAGACGAAATCAGAATTGTTGTTGATTTTAATGAGACAAACCGAGAAGATTTTTTGAATTGGCTACAAGATATAAATGAGAAATTTAATTCAAAAAAATATTATTTATCCCCATTGGAACATGATGGTAGCATGAACATTCAACAGACTATAAAAATTATTGGGGAATTGAATGGTTTAAAAATTGGACCTAGGTGGGAGTTAAGCCTGCAAACTCATAAGCTTGCAGGCATAGAGTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_018108|265816:273393|269273_270641_+|WP_014840120.1|DBSCAN-SWA MPTFDYDLFVIGAGSGGVRASRMAASMGARVAVAEDAPLGGTCVNLGCVPKKLYKYASDFSGDFEASRGFGWSIEGISFDWEVLKANRAKEISRLNNIYQNILEKPGVQIIRGRASLVDEHTIEVEGKHYTSKNILIATGGWPGIPEIEGGELSVNSNQIFDLEELPKKIVIVGGGFIACEFSSIFNGLGVQVHLIVRSKMLKNFDAPSMDFLKEEMIKHGVDIQEGVNIKSIDLNDEGSEFKLTVHLDNNVSLQADEVLMAVGRIPNTEGLNLDEVGIETSKSGHIKVNENFQTSVPSIFALGDVVGRLELTPVAIAEAMTLVNHMFGDGTRKMSYQNVPFAVFTNPTFGSVGLTESEAQEKFSDDVEIFESNFKAMKHTLSGKDERTLMRIIVQKSTDKVLGVHMVGEDAPEIIQGFAVALRAGATKADFDSTIGIHPTSAEELVTMRTPKSK >NC_018108|265816:273393|266289_266973_-|WP_014840118.1|DBSCAN-SWA MSSLNSLLEKSRINMILQQIKPAGVLDELVLNALLGLSREAFVAPEFVTVAYSDTSIPIVVNGEPSGEHMLTPITEARIAQSLSLLPTDTCLEIGTGSGFQAALLSRLCTEVESVEINPNIANFAMENLARNHISNVRVQIGDASSGWGTREYNAIAITGSCPKLPDALKYQLSVGGRLVGFIGTPPVIEMKLITRMSASEFDEVNLTETVIEKLHGSAFVESEFIF >NC_018108|265816:273393|270649_271657_+|WP_013522042.1|DBSCAN-SWA MSIISSTVAIGTLGGTITMTKSTDSGGIKSTLSAEDLISSVPGLQDMSLEIWQKTIANVASGSLDFDTVFASLAWAKQQVEHGAQGVVLVQGTDTLEETSYLLDLYWPYAAPLVLTGAMRHPELAGADGAANLLAAIKVAVDIKSRGHGVFVVMNDEVHQARYVAKTHANAVDAFESPQTGPVGVVTENSLHIRRSPNERMLFPVPEDYDARVLLLESTLDESGEIYDWIPKSSYKGLVIAGFGSGHVPGSIASKIEKIINDMPVLVCSRTGRGTTTYKTYAYEGSEIDLQQKGALMGGFLSPRKARLLLSAMIWSKMDRSKICEHLRNYNKDSV >NC_018108|265816:273393|272724_273393_+|WP_081482425.1|DBSCAN-SWA MTKFEIIRLQSGATEPQFRIVEIFKSLQGEGFNTGMPATFVRLGRCNLACGWCDTNYNSFGLKSLSEILQIVEDLGQSNIILTGGEPSVHPNVELLIEAFKSRGYYLCIETNGISDVPEGIDYIAISPKYCYKERYEKVGLRYADEIRIVVDFNETNREDFLNWLQDINEKFNSKKYYLSPLEHDGSMNIQQTIKIIGELNGLKIGPRWELSLQTHKLAGIE >NC_018108|265816:273393|265816_266293_+|WP_014840117.1|DBSCAN-SWA MPGFEKKILPPHELSKRLKTFSKVVFTNGVFDILHRGHVSYLADTKERFGGVLVVALNSDASVKLLNKGDARPYNSLSDRMAMIAALESVDFVTYFEESTPYNLIELLRPNVIVKGGDYDMSKLPETELVKSWGGQAYAIKFEYDCSTTKLVEKIKSN >NC_018108|265816:273393|267002_267812_-|WP_014840119.1|DBSCAN-SWA MIKNTLTIAGVDPSGGAGVLADVKVMSALGTYACAVIAALTAQNTQSVTGVKPIGRDFINLQIDTLFEDVRIDSVKIGMLGDSNTIRTVADGLEKHNPPFIVLDPVMVAKSGDKLLEDSAISSLAHDLLPFAHMITPNLPEAAELLNQGGIANLKEAYKATEKLHKLMNQSRESWVLLKGGHSSEAESVDLLFNGDRMIEHVNPKFDTKNTHGTGCSLSSAICALQARYSDVPRATRDAIKYVHEAIENSNLLSVGHGHGPIHHFYNVW >NC_018108|265816:273393|271660_272329_+|WP_014840121.1|DBSCAN-SWA MSEKALVVFSGGQDSTTCLLQAIENFGVGNVKAITFIYGQRHEIELKKAREIAIDLGIEQTILDLSVMKSITTNALMQKGAEIKTDESGLPNTFVDGRNALFLLYSCIYAKSQGIKNIVIGVCETDFSGYPDCRDIFVKSMNVSMNLAMDYDFVVHTPLMWLTKAQTWELADKLGRLDYVRTRTHTCYEGVEGGCGNCPSCVLRNRGLEEYLNSKNESSKNV >NC_018108|265816:273393|267907_269170_+|WP_013522040.1|DBSCAN-SWA MVAKKTSSPTKRTETKSTTASKTSSKTPTRSTSKSTTKTSSRASTRAPKAIEPRSRKTIEGDTITGSTQAATRRNVVSHKVISKAELQAANLARELAHAETSVDRHERANALLEILSPDDRNALLKVLREEKRRLESSSKKNPDLELVDDWQKEGVYPYKYLMSRRNYEFQKYNLQVELLKLQQWVQDSGARVVIIFEGRDAAGKGGTIKRFMEHLNPRYARIVALQKPTERESGQWYFQRYVEHLPTKGEIVLFDRSWYNRAGVERVMGFCTDAEYQEFMRQAPEFERNLVRSGIVLIKFWFSVSRDEQRRRFRERQHHPLKRWKLSPIDLASLDKWDDYTKAKEAMFFYTDTSDSPWTVVKSNCKKRARLNAMRYVLNKFNYNNKDMEAIGKIDPLIVGRSNVVYESGEEYISHNDKK >NC_018108|265816:273393|272306_272738_+|WP_014840122.1|DBSCAN-SWA MKVVKTFNFDIAHLLDGHDGKCKNLHGHTYRLEVEVAGPVIEDGPKKGMVIDFADLKSVVDDLIIARMDHAFLYDSTNERETAIAQLLEGWNMKTYPFKHRTTAENISRHILDLLRERLEGVNRVRLWETPSSYSECTFDDEI |
9 | uncultured_marine_virus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DBSCAN-SWA_3 |
334281 : 345352
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_018108|334281:345352|DBSCAN-SWA AATGTCGACATCTATCTCATATGATGTTGTGATTCTAGGGGCTGGAGCTGCAGGGCTTATGTGTGCTTCGCAGCTTGCTGGCACTTCTATTAAAGTTTGCGTTTTAGATCATGCACGTAAATTAGGCGAAAAGATACGTATAAGTGGTGGCGGTCGATGCAATTTTACGAATCGCTATGTCAGCGAAAAAGACTACTATACGAGAAATCCGCAATTTCCACGTTATGCATTAAATGCCTACAAGCCAAGGGATTTTTTAAACTTAGTTCAAAAGCATAATATCGCCTGGGTACTGAAAAATGGTGTTCAGTACTTTACTCGTGATGGAAGCCATGCAATTATCAATATGCTTCTAGAAGAAAGCTCCTGTCCTAATATTGAAATTCGTCATCCAGTGCGGATTTTCGATGCTCAAAAGGATAGCGATTTATTTAGTATATCCACCGATATAGGGAAGATTAGATGCTCCTATTTAATCGTGTCCATGGGCGGGCTGGCAGCTCCAGCTGTAGGTGCTAGCGATTTTGGATTATCTATAGCAAAAAAATTTGGTCATCATGTTGTAGGCCCAAAACCTGCACTCGTACCTCTTATATTTGATATTGATAATTGGAAGCCATATTCGGAATTAGCTGGAATCAGTATAAAAGCCTCTATAAATCTCGATGGTGCTCAGTTTGAGGACGATATGCTGTTTACGCACAAGGGATTATCAGGTCCTTTGATTCTTAATATTTCTACATATTGGAATGAGGGCGATGAACTTAAGATTAATCTATGCCCTAATGTGGATTTGTCCTCTGTGCTTATAGAAGCTTCTAAATTGGGCAATACCAAACCTATATCCGTGCTTGAGCAGTATTTACCTAAAAGGTTGGCAATGGTGCTTGTGGGGGTATTGCCACCAAATAAAAATTTATCGGAAATTGGTCATAAAACCATAAAGCAGTTCGCAGATTCGATTCATAATTTTCGTGTAAATCCTGCAGGTACGCAGGGATACAAAAAGGCAGAGGCTATGTCAGGCGGGGTTGATACGAAGCAGATAGACCCTAAAACAATGCAAAGCTTTAATGTGGAAGGACTATATTTTATCGGCGAGGTTTTGGATGTGACGGGTCACTTGGGAGGTTTCAACTTTCAGTGGGCATGGTCGAGTGCCTATGTTTGTACACAAGCACTCAAGCGGTTATCGCAACAATCAGCCAAATAAATGCTTCTCTGCGATTCGTGTGCCTTCTACTAGGCTCTCTAACTTCGCCCACGCAATTTGATGATGTAGTCGGCCGCCCAATCCGCAGTCCGTGGATACGATAAGGTTTTCAGGACCAACCAATTCAGCAAAACGTATAACACGCTCTGCCACGAGTTCTGGATGTTCTACTACGTTTGTGCTGTGGCTTACAACTCCAGGCACAATTTTTGCCCCTGGTGGCAATGTATGGTCCTTCCACAATGTCCATTCATGAGCATGTCGGGGTGATGCTGCTTCAAAGCTGTATGCCCCTGCATTAACAGCCAAACACTGATCTACGATATCTTTAAATGCAATATCCGTTGTATGTGGACCATGCCATGATCCCCAGCAGATATGCAAACGTACAAGCTCCCGAGGTATGCCTTCTATTGCACGATTTATAGCATCGATACGAAGCTGCAACCATTTTTGGTAGTCTTCTACTGAAGGCTCTGGATTAATCTGATCCCACGATTCCGCAAGGTCAGGGGCATCTAACTGAACAATAAATCCTGCATCTGTAATCGCTTTATATTCATGAGCCATAGCCCTAGAACAAGCATCTAGCACTTCCTCGTCCGATGAATAAAATTCGTTTTTAATACGTGCACAAGACCCAGGAGAAAGTGCAGCTATGAACCCTTGCTTTACACCGTATTTTTCAAAGGCTTTTTTCATCAGATTTATATCTGTCTGAACTTGCTCTAGACCAATATAAGTAAGTTCTCCAGTTATCTTAGGATTGCCCACTTTTTTGCGTCCTGTAAATATGCCTGAGTCGGGATCTTCGTATGCTTCTTTAAATTTAACTCGATCACGACGATCCTGAAATGATGTCAGCTTGATATCACCTGGGGCGGAGCGAACAATATCCTGATTGGCCCAGCGATCTTCGTCAGTTAAAGTTAGACCACCAAGTCGACTAAACGAATAATTCCACCAAGCACCGTAATCAACAGCCCCACTAGTAATATGCCCATATTCACCTTCATTTATGATATCTAGTCCAATATCTACTTGACGCTTTACAACTTTATCTACGGCTTCTTGCAGGATATCGAAAAATTCATCGTTACTGATATCGTTTGTCGCTCTACGGTCATTAGCAGCCAGAAGTTCAGGGGTTCTAGGCAATGAGCCCACATGGGTTGTTAGAATTTTATGTGTCATATCAGTAATCCTATGTTTTTTCTAAATATACTCTTTATGATTTATTGGAACAATTATATTCAAATAAAGAAAAGTCATAAGATACAATTAATGGTTATATTTTGGAGATTTTATGAGTGCAAAACGTACGCAACTTTATGACCTACATATAGAATCAGGAGCAAAATTAATCGATTTTGGTGGATGGGAGATGCCCGTCTCATACGGATCTCAAATAGAAGAACATAAAGCGGTACGGACAAACGTGGGCATGTTTGATGTTTCTCACATGTTGCGTATCGACTTATCTGGAACACGTATCGTAGATTTTTTGCGTAAGCTTCTTTCAAACGACATTTTAAAAATATCTGAATCCCCTGGAAAAGCCCTATACTCCTGCATGCTGAACGAGGAGGGCGGAATTATTGATGACCTTATTACCTATTATGTTGATGATGGTGACTGGCGTTTAGTAGTAAATGCTGGATGTGCTGATTCGGATCTCGAGTGGATTTCAAAGCAAGCTCGTGCATTTGAGGTTCAAGTTACATCACGTCGCGATTTGGCAATGATTGCCATCCAAGGTCCTCTTTCTCAAGAAACCCTATCCAAGGCACTCCCCGAGGATGTTGATCTCTCAGTTATAAAGCCATTTTCATGTAAGCAAGTTGGTGAATTTTTCTTAGGACGTACAGGTTATACGGGAGAGGATGGATTTGAAATCTCTGCAAAACCTGATTTAATCATTAATTTATGGAAGCGTTTGGTGTCACTTGGTGTACAACCATGCGGACTTGGAGCAAGGGATACATTGCGTCTTGAGGCTGGGATGAATTTATATGGTTCTGATATGGATACAAGTACCCAACCATCAGAGAGTGGCTTGCAGTGGACAGTTTCACTTAAAGATGAAGAACGTGATTTTATTGGTCGATCAGCTTTAGATAACTCTCGCAAAAAATCATTTTTAGGTATTCGCCTTTTAGGACGTGGTGTTATGCGCTCTCATATGAAAGTTCGTACTGCTGATGGCGCTGAAGGTGAAATTACAAGCGGAACCATGTCCCCTTCATTAGGATATTCAATAGGTTTTATTCGCATGCCGTTTGGCACAGAGCCTAATCAAAAAGTTGAAGTAGATATTCGCGGAAAATGGCATGAAGCGGAATTGGTCAAATTGCCATTTGTTAAAAACGGAAAAGCATTAGTTTAAGTTTAAAGGTTTAAGTTTAAAGGAAATTTTATGAACCTACCTACAGATCGTAAATATACAAAAACACACGAATGGGTAAAAAAAGAAGGAGACTTCTTTTTAGTCGGAATCACAGACGATGCTCAGGATCAGCTTGGTGACTTGGTATTCGTAGGTGATGCAAAAGTTGGGGAAACTTTAAAAGCAGGAGATACGGCTGCTGTAGTTGAGTCCGTAAAGGCTGCTTCTGATATTTATGCCCCTTTAGATGGAGAAATCGTTGAATTTAATGAGGCATTGGATTCTGATCCAACTTTAATTAATCAGGATGCTTATGCTAACTGGATATTCAAAATTAAAGCTAGTGATGCCTCTCAATTTGATAGTTTACTTAACTCTGAACATTACGAGGCTTAATAACATATGAGTTTACCAGTTGGGATTTACGGGCCATGGGTTAGTTATTCAAGGCCTCTAATAGTTCTTAAGTCTTTCAAGGATAGACATATTGGTTTGAGTTCAGAGGCTCAAGACGAGATGCTGGCCGAGCTTGGGTACGATTGTCTTGAATCCTTTATAGAAGATGTAGTTCCAAATTCAATTTTTGATCCTGAAAGATTAGGTGGAGCATTATATTCTTACTCTGGGACAAGCGAGGAAGAAGCACTTAATGAAATATCTAAGATAGCATATGAAAATAAGCCAATAGTTAATTATATTGGTCAGGGATACTACGGCACATTCACTCCAAGTGTTATTAAAAGAAATATATTAGAAAACCCAGCTTGGTACACAGCCTACACTCCATATCAACCCGAGATATCACAGGGGCGACTCGAAGCACTTCTGAATTTTCAGACTATGGTGTCGGATTTGACAGCATTACCAATAGCAAATGCATCACTACTAGATGAAGGAACGGCAGCGGCTGAAGCGATGCTTGTAATGTATCGATCAGCCAAGAACAAAAGTAAAACATGCTTTGTTTCAAAATATCTACATCCTCAAACGATAGAGGTCCTCAAAACTAGGGCGGCCCCTCTTGGAATAGATCTCGAAATTGGCGATGAATTTGACGGCTTCGGAAATTGCTTTGGCGTTATTCTTCAATACCCACGAACTAATGGTGCCATCTACGACTATTCCGAAGAGGTGCAAAAAGCACATGGTTTAGGTGCACTAGTTGCTGTTGCTACCGATTTATTGGCACTTACATTGCTTAAACCGCCTGGAGAGTGGGGTGCAGACATTGCATTCGGGAACTCTCAACGATTCGGTGTGCCTATGGCTTTTGGTGGTCCTCATGCCGCATTTTTTGCTGTTAACGAAAAATTAAAGCGTGCCATTCCAGGGCGATTAGTAGGAGTGTCAGTTGATGCTCAGGGTGCTCCTGCCCTTAGGTTGGCAATGCAAACGCGAGAGCAACATATTAGACGTGAGAAAGCCACTTCCAATATTTGTACTGCTCAAGCTCTTTTAGCGATTATGGCAAGTATGTATGCCGTATATCATGGTCCTGATAATTTAAGGAATATAGCTCTTCAGATATTTCAGGCTACTGATGATTTTGCTAAGTATCTAACTAAAATAGGTTATAAAGTACTGACTAAAAGATATTTTGATACCATCTCTATCGATTGCCCTTGGGCTCAGGATTTAGTTGCTGATTTAGCAAAAGAAGGTGCAAATATTCGTCTTGTCGATTCTAAAACCGTATCTGTAAGTTTTGATGAAGTGAATTGGTTAGACGGTTATAGCTTGGGTGAATTGTTTTTTGAATCTGCTAAAAAATACGGCAAGAATTATTTATTTCCTTTAAATGAGAATGCAACACTAAATAGTGGAAATGAGAGTGCGAACCAGGTATTTAATAATAAGTTAGGTCATTTAGTTAGAACCTCTAAATTTCTATCTCACTCTATATTCAATACATATCACTCAGAAACTCAACTTATGCGATATATGCGTAAGTTGTCCGATAAGGATTTGGCTTTGGACCGTACAATGATTCCATTAGGTTCATGCACCATGAAGTTAAATTCAGCTTCATCGATGATTCCGATAACAATGTCTGAATTTGCAAATATGCACCCATTTGCACCAAATGAGCAAGCAACTGGATATGGAACGCTTATAGATCGGCTTACAAACCTAATGAAAATGGTTACGGGATATGATGCGTTTTCATTTCAACCGAATTCTGGTGCTGCAGGTGAGTATGCGGGGTTACTAACTATCCGTGCATATCATGAGGCAAATGGTGAGGGTCATCGCAATATCTGCTTAATTCCAGCTTCTGCACACGGTACAAATCCAGCTTCTGCCGCTATGGCGGGTTATCAAGTTGTTATTATTAATACGACTAAAGACGGCTATGTTGACGTTGATGACCTTAGGGATAAACTAAATGAGATGGGTGCACAGGTAGCTGCATTGATGATTACCTATCCATCTACTCATGGTGTATTTGAAGATAATATTATTCAAATATGTGATTTGGTACATATGGCTGGGGCTCAAGTCTATCTAGATGGGGCAAATATGAATGCAATGGTAGGACTTGCTGCACCAGGATTGTTTGGTTCAGATGTTTCTCACTTTAACTTGCATAAAACCTTTGGTATTCCTCATGGTGGAGGTGGACCGGGAGTAGGTCCAATAGGTGTTAAAAAGCATCTTGCCCCTTATTTGCCAGGCATCTTAAATGAGCGGGGAGTACTTACAGATTCTGATGAGCCAGGTCCTGTATCGTCTGCACCATTTGGATCGGCTGGGATATTGCCAATTCCATATATGTACTTAAACATGCTTGGATCGCAAGGGTGCATACTTTCTTCAATTTGTGCGATTTTAAATGCAAACTATATTGCACATAAATTGGAAGGCTATTATCCAATTTTGTATACGGATAAGAAAGGTTTTGTAGCCCATGAGTGTATTATCGATCTGCGTCCAATCAAGGATTCATGCGGTGTTACGGTGGATGATGTAGCTAAACGTTTGATGGACTATGGTTTCCATGCACCTACCATGAGCTTTCCTGTGCCAGGAACGCTTATGATTGAACCCACTGAATCTGAAGATATAGGGGAAATTGAGCGTTTTATCAATGCCATGATTCAAATTCGCAAAGAGATTACTCAGATAGAATCGGGTGCTGCTGATTCTACAGACAATCTGTTGAAAAATGCCCCTCACACAGCACAAATGATAGCTTCAGACAACTGGACTCATCCATATTCACGACAAGAAGCTGCATTTCCAGAGGGAGTAGATCCTGCAACTAAATATTGGTGTCCTGTAGCTCGTGTGGATAATGCATATGGTGACAGGAATTTGATTTGTACATGTCCTCCAATGGAGGCTTATAAATAATATGCGTCAATACGAAGATTTTATGCACCATGTATTTGAAACTGGTGTGGATAAAACTGATAGAACCGGAACGGGAACTAAGTCTGTATTCGCTTATCAAATGCGTTTTGATTTGCAAGAAGGCTTTCCAATGGTCACTACGAAGAAACTTCATCTAAAAAGCATTATCTATGAACTGTTATGGTTTTTGCGTGGAGATTCAAATGCCAAATGGCTCCAAGAAAGAGGCGTTTCAATTTGGAATGAGTGGGCCGATGAAAATGGTGAACTAGGTCCAATATATGGGGTGCAATGGAGAAGCTGGCCAGCACCCGATGGCACGAAAATCGATCAGATTTCACAAGTTGTCGATCAAATAAAATCCAATCCAGACTCACGCAGGTTGATAGTGAGTGCATGGAATGTAGGGCTTATACCTCAAATGAAACTGCCTCCATGCCATGCTTTTTTTCAATTTTATGTAGCTGAGGGTAAGCTTTCATGCCAGTTATATCAACGAAGTGCTGATATATTTTTAGGTGTACCTTTTAATATTGCAAGTTACTCATTACTCACACATATGATTGCACAACAGTGCAATCTCGATGTGGGTGAATTTATATGGACAGGTGGTGACTGCCATATATACTCAAATCACTTTGAACAAGTGAAGGAGCAACTGTCACGCGATCCATATCCATATCCAAAACTTCATATAAAACGTAAACCAGAAAGTATCTTCGATTATGAATTTGAAGATTTTGAAGTGTTGGACTATCAACATCATCCACATATAAAAGCTCCTGTAGCAGTATAGTTATGCCTAAAATTTGTCTTATCGTTGCATATTCTGAAAACCATGCTATTGGTCTTAACGGTGATATGCCGTGGAGGCTTAAAGGTGACCTTGCCTATTTCAAAAAAACCACAATGGGGTGTCCCATTATCATGGGTCGCAAAACGCGTGACTCGCTCGGTAGGCCATTGCCAGGCAGGATAAATATTGCAATTTCACGGGATGCAGACTATTTTGCAGAGGGGACGGTAGTATTGCCATCCTTAGAACAATCGTTGGAATATGCAAATAATAATTCTGATGCCTCGAAAATTTTTATAATAGGAGGTGGGCAGATTTACAAACAGGCATTGCCCGTAGCGGATAAAGTATACGCAACTGAAATTCATAAGAGTTTCGAAGCGGATACATTTTTTCCACAACTTGATAAATCGCAATGGACCGAAGTTTCAAGAGATCCTCAGCCTGAGGAAAACGGTCTTGCGTACGATTTCGTGGTTTACGAAAAGAAGGAGTTTTAAGTGAATCTTGAGGAGTTAAAGTTAGCTGTTATCGGATTAGGCTATGTTGGTCTGCCACTTGCAGTTGAATTTGGAAAAAAACGTGATGTATTAGGTTTTGATATTAATCAGAAGCGCATCGAACAGCTAATGAAGGGAGAGGATATAACTCTCGAAGTGGATAATTCAGAATTGGCAGAAGCTAAAAATTTAAATTTTTCCTGCAATCCTGAGGATTTAAGAGATTCCAATACTTACATTGTAACCGTCCCAACTCCAATCGATGAGCATAAAAGTCCTGACTTTACTCCATTGGTAAAAGCTAGTGAAACTATTGGTGCTTACCTCAAAAAAGGGGATATCGTAATCTACGAATCTACTGTATACCCTGGAGCTACAGAGGAAGTTTGTATCCCTGTCTTAGAAAAAGTATCTGGCCTTAAATATAACGTGGATTTCTACGCAGGATATAGTCCTGAGCGCATAAATCCAGGTGACAAACAGCATAGAGTTTATAACATTAAAAAAGTCACTTCAGGTTCTACTCCAGAAGTCGCTCAAGTTGTAGATGATTTGTATAAATCCATTATTACAGCAGGCACACACAAAGCTTCATCAATTCGTGTTGCAGAGGCAGCTAAAGTTATAGAAAACACTCAGCGCGACGTTAATATTGCATTGATTAATGAGCTTGCACTTCTTTGTAATAGGCTTGGAATCGATACTGAGGACGTACTTGAAGCGGCTGGCACAAAATGGAACTTTTTGCCATTTAGACCAGGGCTTGTAGGTGGTCATTGTATAGGTGTGGATCCATATTATTTAACTCATAAAGCTCAATCAATTGGCTATCACCCTGAGATTATTTTGGCTGGTCGTCGTCTTAATGATTCGATGGGTAGATATGTTGTTGAGCAGTTAGTTAAGGCGATGACTAAGAAAAACATTAAAGTTGTTGGCAGTCATGTGCTTGTTATGGGTCTTACATTTAAAGAAAACTGCACGGATATTAGAAATACACGTATTGTCGATATAGTTAAAGAATTGGGCGATTACAACATTGTAGTAGACGTGTATGATCCATGGGTAGATCCAGAAGAGGCTATGCAAGAGTATGGCATCAAAACAGTGGATTCAGTTAGTGACGGTCAGTATGACGGCATCATACTTGCTGTAGGTCATAAGGAATTCCGCGAAATGGGCGTCGATAAAATACGTGCTCTCGGAAAGGAAAATCACGTACTTTACGATTTGAAGTATGTGCTTGATAAAGAAGACTCTGATATCAGACTTTAGGCTTTTGTATAGTCAAACATTAGTGGGGTTCCGAGAAGCCCCAACTTAATGAGGACCGAATTTACTTTTGGTGGGCTCAAGGTCTTTCAAATCTATGGCTCGGTCCTTAAGTCGTTCCTCATGATCCTCTAGTACGGCAATCGTAAAATCCAGTAGTTTACAAAGCTCTTCTTCGGAAGTTGCCTCGATAACAATTGTTAATTTCTGCTCCGTATTAGATGGTCGCATAAGCAAAAATCCGCCTTCTATCTCGATACGTAACCCGTCTATTTCAGTAAAAGAGATGGGGTTTAGATTCTTTTGAGCAGAATCTTTTACATGCAAAAGTAGTCCTTTGACTAGCTCCCTTGGATATGGAATTCTAATTTCAGGTACCATTAAATCATGTGGTAGATGTTCAAAAGCCTCTGGTCCAACTTCTTCTATAAATCTTAAAAATCTAAATCCAGAATAGACCGCATCATTTAAAATAAGTCCATCCTTCTTGAAGTAGTAATGACCACTATATTCTCCTCCAAAAAGAGCACCCTCAATTTGTGCAACTTTCTGCATCATATTTGAATGCCCTGTTTTAGATAAATGTGGCAATGCCCCCGCCGCCTCAATCTCTCTTTGTATATGCCGACTTGATTTTATGTCATACACTATATGCACGGGTTTCGCAGGGTCATAATCAGAGTAAGACTTATAAAATTTCATCATCTCTCGAATTAAAAAAATAAACACCCTATCAGACCCTATAATCTGACCTTGATAGTCCACAACTCCCAATCTATCAGCATCTCCGTCAAATGCCAGCCCGATATCGCATCCATGTTCAACTACAAACTTACGCAACTGCATTAAATTATCGGGAACAGAGGGGTCGGGATGATGATTTGGAAACGCACCGTCTGGTATGCAGTTAAGTTCTAAAACCTCATGCCCCATTTTTTCGTATAACTCACGGGCAATGAGACCCGCAACGCCATTGCCACCATCAATAGCAATTTTTAATATGTACTTTTCCTGACAATAATCGGGCTCGCTAAGCAAAGCGTTTATATACTCGCTATTTTCGATTTCTTCGATAGGAGGCTGCTCAAAAATTTCCTCACTATAATGCAGGAATTTGAAGTCAGCATCTGCGAGTCGTTTCATGTTGTAAGCTATAAGCTTTATAGTCTCAGAATCTATGGGTAACGAATCGCAATAAATTTTGAATCCATTAAACCCAACAGGGTTGTGGCTGGCTGTTATATAAATAATAAGCCCGTAATTTTTATGGATATTATGAATAGCTAAAAGCCCAGGATGTTCCAACCCAGCAAACTGTATGTGCTCACTTTTAACCCGGGTTTTAAGTGCGTTATATAGGGCTTTGGCTAGCTCTGGTCCCCCCTCACGTGCATCATGGGCAATTAATACGCTACCTATGTTTTGGGGTGGCAATACCTCCATAAGAGCAAACCCAAGCAAATACGCAAATTGGGGGTTGATTTCGTCAGGATAGTGTCCACGAATATCATATTCCTTGAATACATTTAGTGGGATCGTCGTGATTAACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_018108|334281:345352|342031_342529_+|WP_014840155.1|DBSCAN-SWA MPKICLIVAYSENHAIGLNGDMPWRLKGDLAYFKKTTMGCPIIMGRKTRDSLGRPLPGRINIAISRDADYFAEGTVVLPSLEQSLEYANNNSDASKIFIIGGGQIYKQALPVADKVYATEIHKSFEADTFFPQLDKSQWTEVSRDPQPEENGLAYDFVVYEKKEF >NC_018108|334281:345352|334281_335493_+|WP_014840150.1|DBSCAN-SWA MSTSISYDVVILGAGAAGLMCASQLAGTSIKVCVLDHARKLGEKIRISGGGRCNFTNRYVSEKDYYTRNPQFPRYALNAYKPRDFLNLVQKHNIAWVLKNGVQYFTRDGSHAIINMLLEESSCPNIEIRHPVRIFDAQKDSDLFSISTDIGKIRCSYLIVSMGGLAAPAVGASDFGLSIAKKFGHHVVGPKPALVPLIFDIDNWKPYSELAGISIKASINLDGAQFEDDMLFTHKGLSGPLILNISTYWNEGDELKINLCPNVDLSSVLIEASKLGNTKPISVLEQYLPKRLAMVLVGVLPPNKNLSEIGHKTIKQFADSIHNFRVNPAGTQGYKKAEAMSGGVDTKQIDPKTMQSFNVEGLYFIGEVLDVTGHLGGFNFQWAWSSAYVCTQALKRLSQQSAK >NC_018108|334281:345352|335481_336687_-|WP_014840151.1|DBSCAN-SWA MTHKILTTHVGSLPRTPELLAANDRRATNDISNDEFFDILQEAVDKVVKRQVDIGLDIINEGEYGHITSGAVDYGAWWNYSFSRLGGLTLTDEDRWANQDIVRSAPGDIKLTSFQDRRDRVKFKEAYEDPDSGIFTGRKKVGNPKITGELTYIGLEQVQTDINLMKKAFEKYGVKQGFIAALSPGSCARIKNEFYSSDEEVLDACSRAMAHEYKAITDAGFIVQLDAPDLAESWDQINPEPSVEDYQKWLQLRIDAINRAIEGIPRELVRLHICWGSWHGPHTTDIAFKDIVDQCLAVNAGAYSFEAASPRHAHEWTLWKDHTLPPGAKIVPGVVSHSTNVVEHPELVAERVIRFAELVGPENLIVSTDCGLGGRLHHQIAWAKLESLVEGTRIAEKHLFG >NC_018108|334281:345352|341234_342029_+|WP_014840154.1|DBSCAN-SWA MRQYEDFMHHVFETGVDKTDRTGTGTKSVFAYQMRFDLQEGFPMVTTKKLHLKSIIYELLWFLRGDSNAKWLQERGVSIWNEWADENGELGPIYGVQWRSWPAPDGTKIDQISQVVDQIKSNPDSRRLIVSAWNVGLIPQMKLPPCHAFFQFYVAEGKLSCQLYQRSADIFLGVPFNIASYSLLTHMIAQQCNLDVGEFIWTGGDCHIYSNHFEQVKEQLSRDPYPYPKLHIKRKPESIFDYEFEDFEVLDYQHHPHIKAPVAV >NC_018108|334281:345352|343849_345352_-|WP_014840157.1|DBSCAN-SWA MLITTIPLNVFKEYDIRGHYPDEINPQFAYLLGFALMEVLPPQNIGSVLIAHDAREGGPELAKALYNALKTRVKSEHIQFAGLEHPGLLAIHNIHKNYGLIIYITASHNPVGFNGFKIYCDSLPIDSETIKLIAYNMKRLADADFKFLHYSEEIFEQPPIEEIENSEYINALLSEPDYCQEKYILKIAIDGGNGVAGLIARELYEKMGHEVLELNCIPDGAFPNHHPDPSVPDNLMQLRKFVVEHGCDIGLAFDGDADRLGVVDYQGQIIGSDRVFIFLIREMMKFYKSYSDYDPAKPVHIVYDIKSSRHIQREIEAAGALPHLSKTGHSNMMQKVAQIEGALFGGEYSGHYYFKKDGLILNDAVYSGFRFLRFIEEVGPEAFEHLPHDLMVPEIRIPYPRELVKGLLLHVKDSAQKNLNPISFTEIDGLRIEIEGGFLLMRPSNTEQKLTIVIEATSEEELCKLLDFTIAVLEDHEERLKDRAIDLKDLEPTKSKFGPH >NC_018108|334281:345352|337909_338275_+|WP_013522104.1|DBSCAN-SWA MNLPTDRKYTKTHEWVKKEGDFFLVGITDDAQDQLGDLVFVGDAKVGETLKAGDTAAVVESVKAASDIYAPLDGEIVEFNEALDSDPTLINQDAYANWIFKIKASDASQFDSLLNSEHYEA >NC_018108|334281:345352|338281_341233_+|WP_014840153.1|DBSCAN-SWA MSLPVGIYGPWVSYSRPLIVLKSFKDRHIGLSSEAQDEMLAELGYDCLESFIEDVVPNSIFDPERLGGALYSYSGTSEEEALNEISKIAYENKPIVNYIGQGYYGTFTPSVIKRNILENPAWYTAYTPYQPEISQGRLEALLNFQTMVSDLTALPIANASLLDEGTAAAEAMLVMYRSAKNKSKTCFVSKYLHPQTIEVLKTRAAPLGIDLEIGDEFDGFGNCFGVILQYPRTNGAIYDYSEEVQKAHGLGALVAVATDLLALTLLKPPGEWGADIAFGNSQRFGVPMAFGGPHAAFFAVNEKLKRAIPGRLVGVSVDAQGAPALRLAMQTREQHIRREKATSNICTAQALLAIMASMYAVYHGPDNLRNIALQIFQATDDFAKYLTKIGYKVLTKRYFDTISIDCPWAQDLVADLAKEGANIRLVDSKTVSVSFDEVNWLDGYSLGELFFESAKKYGKNYLFPLNENATLNSGNESANQVFNNKLGHLVRTSKFLSHSIFNTYHSETQLMRYMRKLSDKDLALDRTMIPLGSCTMKLNSASSMIPITMSEFANMHPFAPNEQATGYGTLIDRLTNLMKMVTGYDAFSFQPNSGAAGEYAGLLTIRAYHEANGEGHRNICLIPASAHGTNPASAAMAGYQVVIINTTKDGYVDVDDLRDKLNEMGAQVAALMITYPSTHGVFEDNIIQICDLVHMAGAQVYLDGANMNAMVGLAAPGLFGSDVSHFNLHKTFGIPHGGGGPGVGPIGVKKHLAPYLPGILNERGVLTDSDEPGPVSSAPFGSAGILPIPYMYLNMLGSQGCILSSICAILNANYIAHKLEGYYPILYTDKKGFVAHECIIDLRPIKDSCGVTVDDVAKRLMDYGFHAPTMSFPVPGTLMIEPTESEDIGEIERFINAMIQIRKEITQIESGAADSTDNLLKNAPHTAQMIASDNWTHPYSRQEAAFPEGVDPATKYWCPVARVDNAYGDRNLICTCPPMEAYK >NC_018108|334281:345352|342529_343804_+|WP_014840156.1|DBSCAN-SWA MNLEELKLAVIGLGYVGLPLAVEFGKKRDVLGFDINQKRIEQLMKGEDITLEVDNSELAEAKNLNFSCNPEDLRDSNTYIVTVPTPIDEHKSPDFTPLVKASETIGAYLKKGDIVIYESTVYPGATEEVCIPVLEKVSGLKYNVDFYAGYSPERINPGDKQHRVYNIKKVTSGSTPEVAQVVDDLYKSIITAGTHKASSIRVAEAAKVIENTQRDVNIALINELALLCNRLGIDTEDVLEAAGTKWNFLPFRPGLVGGHCIGVDPYYLTHKAQSIGYHPEIILAGRRLNDSMGRYVVEQLVKAMTKKNIKVVGSHVLVMGLTFKENCTDIRNTRIVDIVKELGDYNIVVDVYDPWVDPEEAMQEYGIKTVDSVSDGQYDGIILAVGHKEFREMGVDKIRALGKENHVLYDLKYVLDKEDSDIRL >NC_018108|334281:345352|336799_337879_+|WP_014840152.1|DBSCAN-SWA MSAKRTQLYDLHIESGAKLIDFGGWEMPVSYGSQIEEHKAVRTNVGMFDVSHMLRIDLSGTRIVDFLRKLLSNDILKISESPGKALYSCMLNEEGGIIDDLITYYVDDGDWRLVVNAGCADSDLEWISKQARAFEVQVTSRRDLAMIAIQGPLSQETLSKALPEDVDLSVIKPFSCKQVGEFFLGRTGYTGEDGFEISAKPDLIINLWKRLVSLGVQPCGLGARDTLRLEAGMNLYGSDMDTSTQPSESGLQWTVSLKDEERDFIGRSALDNSRKKSFLGIRLLGRGVMRSHMKVRTADGAEGEITSGTMSPSLGYSIGFIRMPFGTEPNQKVEVDIRGKWHEAELVKLPFVKNGKALV |
9 | Bacillus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DBSCAN-SWA_4 |
1018709 : 1025555
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_018108|1018709:1025555|DBSCAN-SWA ATTATACTTGTATTCCTGACTTCAAGGGTACAAACCGTGTAGACTCATAATCCGTACTCGACCAATTTGTATCAGAAACCCTTCTAATTGTTACAATTTTTTGCTCTACAGAACCTACTGGTGCCACTAAAATACCACCAATATTTAATTGATTAAGTAGTTCTGTAGGGACTTCTAATCCAGCTGCTGCCAAAATAATTGCATCAAAAGGAGCATGTTTTGGCAAGCCCAAAATGCCATCACCTAATGTTATATTAATTTTTGGCAAATCAATAAATTTTGCAAGATTTGACATTGCCAACTTATATAAACCAGTAACTCTTTCTATGGAATAGACTTCTTTATATATACAGGACAGTACAGCAGCTTGATAACCACATCCTGTCCCGATTTCCAAAACCCTATTTAGCATATTATTTTGTAAGGCCAAAGATATCATACGAGCCACAACTGACGGCTTAGAAATAGTTTGACCATAGCCAATTGGAAGTGCTTCGTCTACATAAGCCCTACTTCTAGTACCAGGATCCATGAAGACATGTCTCTGAACTTGCGTTAATGCATCCAACACTCTTTGGTCGTTAGTAATACCAAATTCCTTAAGGGCATTAACCATGCGTAATCGGTGAATATCAGAATTCAATCCCGTATTAAGCTCCAAGGCTTTTTGGAGTCTATTTTTAACTTCAGGAGATGGTCCTTTTATGCCAATATTTCTAGAACCTGAAGATAGTCTAGTATTGCTATTTGTGGAAATGATTTGTTTTTTTATCATTATTCCACTTTAGAATTAACTTGTCCTTCTAACCAAGCTTTAGTTGATTCAAGCTTTTTATAATGAGTCATATCAAGCTGGATAGGTGTAACAGAAATAAAGCCATTATCCACAGCATAGAAATCTGTATCCTCTCCAAAATCCATAATCTCACCAGATGCACCAATCCAAAACAAATCCTGACCAAATGGACTTTTAGTCCTTTCTACTGGTTGGGATTGATGTCTGCGACCCAATCTAGTCACCCTAAAATCTTTTAAACTATACGATTCCTTAGGGGGAATATTAATGCTTAAAAGAGTTTTAGTTTCTGTAGGATTAGCTACTATCAATTTCACAAATTCACTTGCAATGTTAGCAACTTCATCTATTTGTGGCCAATTATAGTGAGTTAAAGAAAATGCTATAGATTGGTAGCCAAAAAGATACCCTTCAGTAGCGGCAGCAACAGTACCTGAATAAAGAGTATCCTCGCCTAAATTAGCTCCGTTATTAATACCAGAAACAACAATGTCAGGTACAAAATCTAAAAAATTTGTAAGTGCAACATGCACGCAATCGCTAGGAGTACCGTTGATAATATTAAAACCTTTTGAGGATTTTTTAAGGCTTAGTGGTCTATTAATTGATAGTGAATTAGAAGCACCACTGTGGTTAGTTTCTGGTGTAAAGACCACAACTTCCGCCCATTTAGAAAGCTCTTCATATAGTTTTTCTAACCCAAGAGCGTAATAACCGTCATCATTTGCCAATAGGATTTTAGTAGTCATAACAATTCTTTTAAATTCAAAGTAATTTATTTTAATATATAAAAAAATAATAATTGAGGTTATAAATGACGGATTATTTGGCTATTCCAATTGCATATTTAATAGGATCCATACCCTTTGCTGTAGTAATAAGTAAACTTTTTGGTTTAAGCGATCCTAGAACCTATGGCTCTGGAAATCCAGGTGCTACTAATGTACTTAGAAGCGGAAATAAATTAGCAGCAGCCTTAACTTTTTTAGGTGATGCATCTAAGGGTGCTATAGCAGTTTTGCTGACATTTCATTTCTTACCCAATGTCTCATCTACAGTAATAGCTTTAGTAGCTTTAGCAGCATTTCTAGGACACTTATTTTCACCTTTTCTGGGGTTTAAAGGAGGTAAAGGTGTAGCTACGTCATTAGGAATCTTTTTAGCATTGGATTTTTATTTTGCCATTGCCCTTTTATCTGTTTGGGTTTTAGTTGTAGTGCTTTTTAAAATTTCCGCTTTAGCTGCAATCATCACTGCATTATCAGCACCATTCCTATACATATTTTTAAATATTAACAACTATATACAATGGCCTATATTTGCAGCAGTTTTAATTATGGCCACCCTTCTTCTTTATAAACACAAATCCAATATAGATAAATTATTTAATAAAAAGCATTAACCGATTCTAAAGACCAATTAGCTCTTACTGGTTGGTCATATTTCTTCTCTAGTTTTACAAGGCCAGCTTTTATCCTTTCACTAGCTGCGTGGGCAATCATTGCCCCATTATCTGTGCAAAATTCCATAGGTGGAAAATAAACTTTTGCTTGAATTTTCTCGCACTCATTTTTTAGAAACCCCCTTAATTTTAAGTTAGCTCCAACACCGCCAGCGACAACTAGAGTATGTATACCAGTCTCCTTTAGGGCTTGCATAACCTTGAATCCAAGGACATCAACAATCGCTTCTTGCGTTGAGGCTGCAAGATTAGATAAGGAAATCTCATCATGTTCCGTTAATTCTAGCTTTTTATACTGATTCATAACCGCAGTTTTCAATCCGCTAAAACTAAAATTTAAATCCCCACTATGCTTCATAGGTCGTGGCAATGCAAACGCATTTGAGTCACCATTTATTGCCAACCTTGCTAAGTGGGCTCCGCCTGGATATGGTAAACCTAAAATTTTCGCTGTTTTATCAAAAGCCTCTCCCGCAGCATCATCCAAAGTTTCACCCAAAAGTTTGTAATAACCCACCCGCTCTACAAGCATGATTTGAGTATGCCCGCCACTTACAAGTAGAGCTATAAATGGAAATTCTGGTTTAGGCTCAGAAAGTAATGGCGACAACAAATGACCCTCTAAATGATGTACGGGAACTAACGGCAAACCCCTGCTCCAAGCCAGTCCATGGGCAAAGGATGATGCAACAAGGAGTGCACCCTGCAAACCAGGTCCCGCAGTGTATGCAATAACATCGACATCATCCAAGGTTTTGTTAGTATTAAACAAAAGCTCATCCAAGAGTGGCAACAAATTTTTAATATGGTCCCGTGAAGCTAATTCTGGTACAACACCCCCATATTCTCCGTGCATACTAATCTGGGAATGCAAGGTATGACCTAACAGCCCTAACTCAGTGTCCACAAGGGCTAAACCAGTTTCATCACAGGAACTTTCAATACCAAGAACTAACATATATTGTTGTTATAAAAAAACATTTACTTACAAATATAGACTTTAAATAAAATTTTAATATATATGACTTTTAACAATAAGAGTAATCCCTTAAATACGAATTAAAATTACACATTCTTTCACCCACTTGGAGTTTTAATCATGTTTGAGAAAATGTTCAAACTTTCTGAACATCATTCAAATATAAGAACAGAGGTTCTTGCAGGCATAACAACCTTCCTCACTATGTCCTACATTATATTTGTTAACCCTAATATTTTAGGAACTACTGGTATGGACACTGGTGCAGTTTTCGTCGCTACCTGCTTAGCAGCAGCCGTTGGATCATTTATTATGGCATTCCTTGCTAACTGGCCAATTGGTATGGCTCCAGGTATGGGGCTTAATGCATTTTTTGCGTTCGGGGTAGTTGGTGCTATGGGCTACACATGGCAACAAGCCTTGGCTGCGGTATTCCTATCTGGAGTTATCTTTATGATACTAACTCTGACTGGAGCAAGAAGATGGCTAATTGAAGGCATACCACAATCCCTAAGATCTGCCATAGTAGCAGGAATTGGTTTATTTCTTGCATTTATTGGGTTTCAATCATCTGGGATTGTTGTCGATAATCCAGCTACTCTAACAGGACATGGTGACTTCTCCTCACATCAAGTTAAGTTAGCTATAGTTGGATTTTTCCTAATAGTTATTCTTGATTGCTTAAGAGTTCGTGGAGCTATTTTAATAGGAATTTTATCTGTATCAATTCTATCAATCATATTAGGTCATACTTCTGTACCACATAGCATTATTTCATCTCCTCCATCTATAAGTTCCACCTTTCTAGCACTAGATATACCAGGTGTTATGGAAAAAGGTTTAATTAGCGTTTTATTAGTTTTCGTTCTAGTCGAAGTGTTTGATGCGACTGGAACTATGATTGGTGTTGCTAAGAGAGCCAATCTTCTTAAAGATGGTCCCAACCACAAAAGCAACCTAGGTAAAGCATTAATGGCTGATTCTGCTGCCATTCTTGCAGGATCTATTATCGGCACATCAAGTACTACAGCTTATGTAGAAAGTATGTCTGGAGTTCAATCTGGAGGACGTACAGGATTAACTGCATTTGTCATTGGCTTAATGTTTTTGTTGGCATTATTCTTCTCTCCTTTAGCTGCTGTGATTCCTGCATATGCAACGGCTCCTGCTCTTATATATGTAGCCTTACTTATGTTAAGAGAAATCACCGAAATTGATTGGGAAGACATGACTGAGGTTGTACCTTCTGCAATTACACTTATATCTATGCCATTTACATATTCGATTGCCGAAGGCATGGCATTTGGTTTTATAAGTTATGTAGTCATTAAAGTATTTACTTTAAGATATAAGGAAGTACATCCAGCTACTACAATTATTGCTGGATTGTTCATTTTAAGATTTGCTATAGCCTAAGAATCAGATTTAATCCAAACCCCCTTACCCTTGGTCAGATTAGTTATGGTCTGACCAAGTTCATCTGCAAAATCAGTTTCAACTGCTAATCTCCAAACCACACCCATCTCTGAAAAATTTTCACTTAATACAGTAACTCTATTAATGAATTTTGATTTCACTTTGGCAATGTCCGAGAAAACGACCTCACATAAAATTTCTACAGTTGGAATAATCTCAATCTTGTGTGCTAGATCAAGGCACTTAGAAGTTACTCCTCCATAAGCCCTTGCTAGCCCCCCAGTACCAAGTTTCACACCGCCATAGTACCTAATAACAAGTGAAGCCACATTAATTAAAGCCTTACCATCAATTGCTTGTAGAATAGGACGACCAGCTGTTCCCCCAGGTTCTCCATCATCATTAAATCGATAATTATCTATCAGTTTATATGCCCAACAATTATGAGTTGCATCGGGTTTACTAAATTTAGAAAAAAATTCTAAAGCTTCTTCTGAAGATTGCACGGGAGCACAGTGACATATAAAGAGACTGTTTTTTATACGCTCTTCATAATACTGATGGGCTTCAATTTTAAATTGAATGGAGGGCATTAAATTTCAATTTGTCTAGATCGCAAATAGTCATCATAGCTTCCTTGATAATCGATTATTTCACCATTTGACAATATTTCTATTATCCTATCAGCTAATCCACTAACAAACTCCCTGTCGTGCGACACAAAAACTAATGTACCTTTAAATTTTTCAAGTGCCATCTGGAGTGATTCAATAGATTCCATATCAAGATGATTTGTCGGCTCATCAAGTAGTAAAACATTGTGCCTTCCTAACATCAAGCTCCCAAAGAACATCCGATTTTTCTCTCCACCTGACAAAACACTTACGTTCTTCACAATGTCGTCTGCTGAAAATAACAACCTACCTAGAATGGAGCGAATTTGCTGATCATCGTCTCCTTCTTGACGATATCTAGACATCCAATCAACTAGGTTCATAGGTTTCGTAAATGAACCAGATACATCCTGAGCCATATATCCAATATCTGCATTTTCAGACCATTTTATATTTCCCGAATCAGGTGGCAAATCCAATGCAAGCATACGTAAAAGCGTAGTTTTACCTACCCCATTACCTCCAATAATTGCAATTTTTTGGCCAGCATCAACCATAGCACTAAAGTCTTTAATTACTGGATTATCGTATGACTTTGAAAGTTTGCTAGCTTCAAATGCAAGTCTGTGAAGCGGTTTCTTTTGTTCGAACCTAATGAATGGATTTTGTCTTGAGGATGGCTTTATCTCAACTTGCTCAGACTTTATTTTGTCTATCTGTTTTAACCGTGAAGTAGCTTGACGGGATTTAGATTTATTGGCAGCAAACCTTCTTACAAAATCTTGAAGCTCTGAGACTTTTTCTTTTGCTTTTGCATTGTCTGATAGTAATCTTTCCCTTGCTTGTGCAGATGCAAGCATAAAATCGTCGTAATTACCTGGATAAATTCGCAATTCACCATAGTCTAAATCTGCCATGTGGGTACAAACTTGATTTAAAAAGTGTCTATCGTGACTTATGATAATCATCGTACTTTCGTACTGATTTAATATATTTTCTAACCATCTAATGGTATTAATATCTAAGTTATTTGTGGGCTCATCAAGTAAAAGTACATCTGGGTTAGAAAACAATGCTTGAGCTAAAAGAACTCTAAGCTTTAAACCTGGAGGAACTTCACTCATAGTGGCATTGTGCTTATCTATAGGTATTTCAAGCCCTAATAAAAGCTCTCCAGCCCTGGCCTCAGCGGTATACCCACCGTATTCAGCAAACTTTGCTTCTAGCTCAGCTGCATGCATATAATCATCTTCTGTAGCTTCAGGATTAGCATAGATAGCATCCCTTTCAGTCATAGCATCCCACAACTCTGTGTGACCCATTATTACAACGTCAAGTACTCGCTTATCTTCATAAGCAAATTGATCTTGTCTTAACTTTCCGAGCCTAATACCTGGATCCAGCGAAACACTACCAGAGGTTGGTTCTAAATCACCACCCAAAATCTTCATAAGAGTAGATTTACCAGAACCGTTAGCTCCAATTAATCCATACCTATTACCACCTGAAAATTTAACGCTCACATTTTCGAAAAGTGGCTTAGGTCCAAATTGAATTGTAAGGTTAGCTGTCTGTATCAC
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_018108|1018709:1025555|1018709_1019483_-|WP_013522700.1|DBSCAN-SWA MIKKQIISTNSNTRLSSGSRNIGIKGPSPEVKNRLQKALELNTGLNSDIHRLRMVNALKEFGITNDQRVLDALTQVQRHVFMDPGTRSRAYVDEALPIGYGQTISKPSVVARMISLALQNNMLNRVLEIGTGCGYQAAVLSCIYKEVYSIERVTGLYKLAMSNLAKFIDLPKINITLGDGILGLPKHAPFDAIILAAAGLEVPTELLNQLNIGGILVAPVGSVEQKIVTIRRVSDTNWSSTDYESTRFVPLKSGIQV >NC_018108|1018709:1025555|1020889_1021924_-|WP_013522703.1|tRNA|DBSCAN-SWA MLVLGIESSCDETGLALVDTELGLLGHTLHSQISMHGEYGGVVPELASRDHIKNLLPLLDELLFNTNKTLDDVDVIAYTAGPGLQGALLVASSFAHGLAWSRGLPLVPVHHLEGHLLSPLLSEPKPEFPFIALLVSGGHTQIMLVERVGYYKLLGETLDDAAGEAFDKTAKILGLPYPGGAHLARLAINGDSNAFALPRPMKHSGDLNFSFSGLKTAVMNQYKKLELTEHDEISLSNLAASTQEAIVDVLGFKVMQALKETGIHTLVVAGGVGANLKLRGFLKNECEKIQAKVYFPPMEFCTDNGAMIAHAASERIKAGLVKLEKKYDQPVRANWSLESVNAFY >NC_018108|1018709:1025555|1020318_1020906_+|WP_014840417.1|DBSCAN-SWA MTDYLAIPIAYLIGSIPFAVVISKLFGLSDPRTYGSGNPGATNVLRSGNKLAAALTFLGDASKGAIAVLLTFHFLPNVSSTVIALVALAAFLGHLFSPFLGFKGGKGVATSLGIFLALDFYFAIALLSVWVLVVVLFKISALAAIITALSAPFLYIFLNINNYIQWPIFAAVLIMATLLLYKHKSNIDKLFNKKH >NC_018108|1018709:1025555|1019482_1020253_-|WP_013522701.1|DBSCAN-SWA MTTKILLANDDGYYALGLEKLYEELSKWAEVVVFTPETNHSGASNSLSINRPLSLKKSSKGFNIINGTPSDCVHVALTNFLDFVPDIVVSGINNGANLGEDTLYSGTVAAATEGYLFGYQSIAFSLTHYNWPQIDEVANIASEFVKLIVANPTETKTLLSINIPPKESYSLKDFRVTRLGRRHQSQPVERTKSPFGQDLFWIGASGEIMDFGEDTDFYAVDNGFISVTPIQLDMTHYKKLESTKAWLEGQVNSKVE >NC_018108|1018709:1025555|1023953_1025555_-|WP_014840418.1|DBSCAN-SWA MIQTANLTIQFGPKPLFENVSVKFSGGNRYGLIGANGSGKSTLMKILGGDLEPTSGSVSLDPGIRLGKLRQDQFAYEDKRVLDVVIMGHTELWDAMTERDAIYANPEATEDDYMHAAELEAKFAEYGGYTAEARAGELLLGLEIPIDKHNATMSEVPPGLKLRVLLAQALFSNPDVLLLDEPTNNLDINTIRWLENILNQYESTMIIISHDRHFLNQVCTHMADLDYGELRIYPGNYDDFMLASAQARERLLSDNAKAKEKVSELQDFVRRFAANKSKSRQATSRLKQIDKIKSEQVEIKPSSRQNPFIRFEQKKPLHRLAFEASKLSKSYDNPVIKDFSAMVDAGQKIAIIGGNGVGKTTLLRMLALDLPPDSGNIKWSENADIGYMAQDVSGSFTKPMNLVDWMSRYRQEGDDDQQIRSILGRLLFSADDIVKNVSVLSGGEKNRMFFGSLMLGRHNVLLLDEPTNHLDMESIESLQMALEKFKGTLVFVSHDREFVSGLADRIIEILSNGEIIDYQGSYDDYLRSRQIEI >NC_018108|1018709:1025555|1023357_1023954_-|WP_013522705.1|DBSCAN-SWA MPSIQFKIEAHQYYEERIKNSLFICHCAPVQSSEEALEFFSKFSKPDATHNCWAYKLIDNYRFNDDGEPGGTAGRPILQAIDGKALINVASLVIRYYGGVKLGTGGLARAYGGVTSKCLDLAHKIEIIPTVEILCEVVFSDIAKVKSKFINRVTVLSENFSEMGVVWRLAVETDFADELGQTITNLTKGKGVWIKSDS >NC_018108|1018709:1025555|1022065_1023361_+|WP_013522704.1|DBSCAN-SWA MFEKMFKLSEHHSNIRTEVLAGITTFLTMSYIIFVNPNILGTTGMDTGAVFVATCLAAAVGSFIMAFLANWPIGMAPGMGLNAFFAFGVVGAMGYTWQQALAAVFLSGVIFMILTLTGARRWLIEGIPQSLRSAIVAGIGLFLAFIGFQSSGIVVDNPATLTGHGDFSSHQVKLAIVGFFLIVILDCLRVRGAILIGILSVSILSIILGHTSVPHSIISSPPSISSTFLALDIPGVMEKGLISVLLVFVLVEVFDATGTMIGVAKRANLLKDGPNHKSNLGKALMADSAAILAGSIIGTSSTTAYVESMSGVQSGGRTGLTAFVIGLMFLLALFFSPLAAVIPAYATAPALIYVALLMLREITEIDWEDMTEVVPSAITLISMPFTYSIAEGMAFGFISYVVIKVFTLRYKEVHPATTIIAGLFILRFAIA |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(33.33%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DBSCAN-SWA_5 |
1132033 : 1143925
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_018108|1132033:1143925|DBSCAN-SWA CTCATAACCCGAAGGTCGTAGGTTCAAATCCTGCCCCCGCAACCATCTTCATATCCTCTGCTACATCACATCTAAAGCATAACCTTTCCCCAGACACTGGATCATTAAATTGAAGCTCATATGCATGAAGCATTTGTCTTAGGTTTTTAAAAGTTTTTAATTTAATTCCACCGTACAATTCATCTCCAACTAGAGGATGATTAATTGAAGCCATATGAACCCTTATTTGATGAGTACGTCCAGTTTCTAACCTACAATTAATCAAACTTATATTTTTATCCTCTATATATCCGTGCCTAATAGTCTCATAATGCGTAATAGCTTCTTTTGGGGATATGGGTTTAACTATTTTTGAAGAAGCCATCTTTATCGGATTTCTAGGGTCTCTACCTATTTCATCAGCTATAACACCCTGATCGGATGTAGTACCGGAAACTATGGCTATATACTTTCTACCCATAGTTCTTGCTTGCAGTTGCTTTATAAAATTGAATTGCGACATTTCATTTCTAGCTACTACAAGTACCCCAGAAGTATCTTTATCTAGTCTATGAACAATACCAGCCCTAGGTACATGTTTAAGTTCAGGAAATCTGTAAAGCAAACCATTAAGAAGAGTTCCAGACCAATTGCCAGAGCCAGGATGAGTAACTAGTCCAGCTGGCTTTCCAATTACAATCCAGTCTGTAGACTCATCTATCACATCAAAATTAATATCTTCGGGTTGAAAAGCCCTAGTGTGCTCATCTGGCTGTATATCGACTTCTATAACATCTAAAGGACCTACGACAGTTCTTACTTTTGATTCATTTGCTGACTTTGAATTAATCCTTACATGCCCTTCCTCAATCCAATTTTGGATTCTACTTCTTGAATATTCTGGCAATAACTGAGCTAACACTTTATCCAACCGATCTGCTTTAGTCGTTATATCCAAGGTAAATATGCGTTTTTCTAAATTTTCATCCAGCATAAACTTAATTAATTTAAAGTTATTATTGTTTCTTATGTATAGAGCTAGTTAATGTTATTATTAATCGTTTAGTTTTAAGATATTCTTCTCATAATAAAATGAAAAAAACACTAAGGAACATTTTAATCTTATCCTTTACAGCTATCTTGTCTGCTTGTGGTATTTTTGACCGAGAAATTGACGAGACTGCAGGTCTTCCAGCAGATAAACTTTACGATACCGCTCGTACCTACGTGCGTGGACGAGATTGGGATAGTGCAAGAAAGTATCTTGCTGCTATCGAAAACCGTCATCCATACAGTTCTTACGCTCAACAGGCTATGATTGATGAAGCCTATGTTAACTGGAAGGATGAACAACCTGAACGTGCAATTGCAGTAATCGACAGATTCCTTCAGATATATCCTAGCCACCCAGGTACAGAATATATGCTTTACCTAAAGGGTCTAATCACATTTACACCCCCAACTCACTTTTTAACTAGTTTTGCTGGACAAAAGCCAAGTGAACGTGATCCTAGAGGTTTAAGACAATCTTATACTGCTTTCAAAGTTCTAATTGATAATTATCCAAACAGTAGATACGCTGCGGATGCACGTCAGCGCCTTGTTTGGTTGGTTACTACACTAGCTGAACATGAAGCAAATGTAGCTAAGTATTATTATGAGAAAAAAGCATATGTAGCTGCTATTAATAGAGCTCAGGTAGTTCTGACTGAATTCTCAGGTGTTCCTTCTGCTGAATTAGCTCTATATGTATTAATGAAATCTTATGAGGCTTTAGGGTCTGAAGATCAAGCTGCTGATGCCAAAAGCGTGTTAGTTAAAAACTACCCTAATAGTCGATATTTGACCCATGGATTTAAAGGCGAAGGAGGTATTATGAAATACCTTTCACCTACAAACTGGTTTAACTAAATACTTAATTATCAGGACCTATCAAAGGTCCTGATTTTTTATCTAGAAACCATCAAGAACAAACCAATAAATCATTAAATCTTGTAGTAAAACAAGGGCTAAGATAATTTCTCTGCATATGCCATCGTGAAGACAATAATGACTGGCTTAATTTCAATGCCCCTTTACCAAATCTTTGATTTGTCTCATCGATTGTCTTCATAAGCTCTTTTCTTCTATCGAACTCCTCTAAGTGTGTCGCACTATCCCATAGTGAAAGTTGATGACTAGTGGGGGCTGGGGTAATTTCACCTAAAGTTATTCCAGCTTTTTTGTAGTTGTATCCGCTTCTGTAGACGACCTTCAGAAGTTCCTGAGCTTTTGAATTTAAGGTCAAAGTATCATCCGTAGCTTCAATCAATCTAGCCATCTTGTAACCGCCATACTGCTGGTCTTGCTCTCTATAACGATTTGTCTTTATGAATACGGATAATTCTTTAGTAAAGCTATTTTGTTTGCGAAGTTTGCGAGCACCCTCAGCTATATGCTCTGATATAGCAGACTGAAGTGAATTTAAATCTGTAATTAACTCTCCAAAACTTCTGCTACATACAATTTGTTTTCTATCCTGCAATTCCTCAAGATCTGCACAGGGGATTCCTTTTAACTCAAGCTGAGTTCGCTCCATAACTACAGAAAAATGCTTACGTAAAAGCCTAGAATCCGCATTAACCAAATCGTACACCGTATCGATACCCATAGTATGTAACTGCTTTGAAATACGTCGACCAATACCCCATATTTCTGATACATCCATAGACTTAAATGCCCTATCCCTAATGGACTTTGACCAATCAGACCAAACCACTACACCCCCGAAAGATTCAGGATATTTTTTTGCTAAATGATTACAAAATTTAGCCAATGTTTTAGTCGGTGCTATACCTATACAAGTTGGGATACCTACCCACTTTAAAACTCTGTCTCTAATTGTTCTACCAACCTCTTTATAAGACCTGCGTGAATCAATATAGGCAAAGCACTCATCGATAGAATAAACCTCTATATCTGAAACTACTGAAGAAATAGTATTCATCATACGCGAAGAGATATCGGCATATAACTCATAGTTGCTTGAAAACGCATAAACTTCACCGCTTTCAACTAAATCTCTAATCTTAAAAAAAGGAAGTCCCATAGGAATGCCTAGAGCTTTTGCTTCACGTGTACGAGCAACCACGCAACCATCTTGATTTGAAAGCACTACTACAGGAACTTCCTTCAAATCAGGACGGAACACACGCTCACAGGAGCAATAAAAACTATTACCATCTATAAGAGCAAACATAACTAGTTTCTAAAGTCCTTAATAACATGTAAAAGCACACCAACTATCCGTAATTGCTCCTGATCACGAAATTTGATTGGAGTATAGATTCCACTTCGATTTTCTGGTCTAAGCTCAACAGACCCGTCTGGCAATATGCATAATCTTTTGATTGTGTACTCATTTCCGATATCTGCCATAACAATATCCATATGCTTAGCGGTGACAGATCTATCGATTATTAAAATATCATCTTTTGATATACCTACATCAATCATAGAATCACCACCGCTACGTACCGCAATAGTAGCCATGGGGTTCTGAACAAGGTATGTATTAAAGTCTAAATAGTCAGCCACGTAGGATTCAGCTGGGGATGGAAAGCCTGCAGGAATCCTCTCTAAGGCTAGAGGAATAGCCAACTCAGGCACACGGCTTTCAGACCATGAATCAGGGAACTGCTGTAACTTTAAATTCTCGATAAGAGTATCAATAGTAGGTATAAGGCTAGCAGGTACTCTTTTAACAACCATAGCCTCACCTAAAACTGACTTACGTCCAGCCCCCTTACGACAGCCTCCCCTGGAACCAGAATTATGTACGATTTTTAATTTAGGATCAGGCATAGCATCAATAAAATTTGATTTCGTTACGAAATCATAGTTTATATCGATAATACTGTCAAAACAATTTTAAAAATTATAAAAATTAAATTATTGAGAGCTTTGCAACTGACAGAGAAAGTGTTTTAGTTCCCACAGAGAAAAATTGAATCTGGGCTTGAGCATCATCACCTTGCCCTATTATTTTAATAATAACACCTTCACCAAATTTAGGATGAGATACACTCATTCCTATCCTATATGGTGAGTCGGAATGATAAATTTTCTCTTTTGTTTTTGGTGAGGCAAACTCTTCAAAGCTATCTAGACTATATCTAGAGTCTGAATACAGTTGAGGCTTATCGGTAAGCCATTTGACATGGTCTTTAGTAATTTCATCTAAAAATATAGATTTTTTGGTTGGATGAGTCTTACCGTATATTTGTCGTGACATTGTGAATAGCAAGTACAACCTTTTGCGTGCACGCGTCATTGCCACGTACATAAGACGTCGCTCTTCTTCTAATCCGCCAGGCTCAGAAATACTATTATCATGTGGAAATAGACCCTGCTCCAAGCCTGCAATAAACACAGCATCAAACTCTAAACCTTTTGAAGAATGTACAGTCATCAATTGAACGGCATCGAGGTTTCGCTTAGATTGATTGTCCCCCGCTTCTAGACTTGCTGTACTTAGGAATAAAGCTAAAGGAGTCATATTTTTGGCATCCACGCCTTCAATTACTTCAATAGACTTTAGGAAGGCAATACCCTCTTCCTTGCAGAAAACTTTTGCAGCATCAATAAGCTCTGACAGATTCTCCAAACGCTCTTCACCGTCTTGCTCGTTGTTATAGTACTCATCGATACCTGTCTGCTCAATCACAGCCTCTACCAATTCAGGCAATGTAGATTCAGCTGCGACTTCTTGCAATCTCTTAATAAGATAGATAAAACCATTTACTTTTTTCGCAGCCTCTCCATTTAAGCCACCAGCAGCCAAAGCGAGGCTACAACCAACGCTTTTTGCAATCTCATCAAGCTTTTCAATTGTGCGGTTTCCAATACTACGTGCAGGAAAATTAACAACTCTCAAAAAAGCATTATCGCTATTTAAATTATGAATAAGTTGAAGATAGGCTACTACGTGTTTAATCTCTTGACGTTCATAAAATCGTAGCCCTCCATAAACCACATATTTGACTCCAGCCCTTGCAAAGCTGTGCTCTATAGCCCTAGATTGAGCATTGCTTCTATATAAAATAGCAATTTGTCTATGATCGAAACCTTCCCTAATAAGCTGTTTGGTTTCTTCAAGTATCCATTGAGCTTCTTCATTTTGATCATAAAGGCTGGCAATGCTTATTTGTTCGCCCTGCCCTTTATCTGACCACAAATTTTTTCCTAAACGATTTGTATTATTAGCAATAAGTTCATTAGCCGCACACAAAATATGGTTATAGGACCTGTAGTTTTGCTCTAGACGAACTAAATTCTCCTTTGCATATTTACGTTCGAAGTTTCTCATATGCTCCACATTTGCTCCGCGGAAGGAGTAAATGGATTGATCATCATCACCAACAGCAAATATCGAAGTACTTGGTCCTGCAAGTAAATTTAACCACTTATACTGAAGAAAGTTAGTATCCTGAAATTCGTCTATCAAAATATGCTTAAATCTTAAGTTATAGTGTCCTATTATAGTTTTATTATTTTCTAGCAATTCAACTGTTCTTAATAGTAGCTCTGCGAAATCGACTACCCCCTCCTTCTGACACTGTTTTTCGTAGGTTTTATATATTTCAACATATGTTTCGTCAAATTCATACGTTGGGATAACCTGTTCTGCCCTTAATCCAGATTCTTTTTTATTATTAATGCCATATTGAACTTCCCTAATTGGATATAACTTATCATCATCCAATTTCATGCTTTTCAAAATTCTTTTGAGCATAGATTTTTGATCAGCCATATCCAAAATTTGAAAAGCTGCTGGTAACCCAACTTCCTTATGATGAGCCCTTAGAATCCTGTGACAGATACTATGAAATGTACCCACCCACAGACTCTTTGGATTTACGGGAATATATTTTCCTATGCGCTCCATCATCTCTTTAGCAGCTTTATTAGTAAAGGTTACAGCTAAGATCCTCTCAGGAGTGGCAATGCCCTGCTGAACCAACCAAGCTATTCTAGTGGTCAATACCTTTGTTTTTCCACTGCCAGCACCAGCCAACACTAACAAATGCTTAGCCTCGCTAGTTACCGCAGCTAGTTGTTGCTTATTTAGAGAATCTAAAACCGAACTCATCACTAATCAACCTTCTCCATAACTGCCGCAAAGAAACCGTCCGTCCCATGAATATCAGGTCTAAGAACTAGCATATCATCTACGTCTTCCAATCCTGTAATCCTATCTCCTAGAACTTTTTGAGGATTTATCAATTTAAAATTTGTGTTGATTTTAAGAAACTTGTTTATTTGTTGTTGATTTTCTTCTTCTAAAACACTACATGTTGAATAGATTAGTCTTCCACCATTTTTTACGCATTTTGAAGCAGCAGTAAGTATATTGAATTGCAACTCTACTAGCTCACTTAAATCTTTTTGAGTTTGTCTCCACTTCAAATCTGGGTTTCTTCTTAAAGTACCTAGACCAGTACAAGGAGCATCTACTAAAACCTTATCGGCTTTTCCGTGAAGTCGCTTCACCCGCTCCGCATTTTCAGATTTTATCGGTATTAGAGTTACATTACTTAAACCACTTCTTACAATTCTTGGTTTAGCTTTGCCAAGTCTATTACTTGAAGTATCTAATGCATAAAGCCTCCCCTTAGAGTGCATCAATGCCCCAAGTAACAACGTTTTACCACCTGCTCCAGCACAAAAGTCAATTACCCAATCACTTCTCTTAGGGCTAACTAACTGACATAAAATTTGGCTACCTTCGTCTTGTACTTCAACTTTGCCATCAATAAATAAATCCCATCTGTTAATCGAAGGATTTGTTTTTATGCGAATTCCCCAAGGTGAAAATTTTGTGTTTTCGTACTCTTGATTATCAAGTAATCCCCTTGATTTTATCTCCTGAAGAACCTCATCCCGACTTGCTTTCAAAGGATTAACCCTAATATCAAGCGGTGCCTTTTGATTAAGAGCTTCAAGTAAAGACTCATAATTTGGTAGTTTAGAAACCTTATTAAAAAACCAATCTGGCACACTATATTTGATTAAGTCATTTAGAGTTGAAGTGTCTATCTTATAAATTCTTTCAAACCACTCTGCTTGCTCTTCCTTAAGCATAGCAACCACAGACTCCCTAGAACAAACAGAATTAAGCCCTAGAATGGCAAGCCTTTGATTTTCAGGACCTACACCACTTTGAGCAAAATTTCTATACATCCTAAGATTTCTAAGAATATCAAACACCGCTTCGGCAACGATAGCACGATCGCCATGCCCTAGTTTCTTATTAGATTTAAACCAATTTGATAGCACTGAATCTGCTGGATACTTGAATTTCAATACTTCTTCAAGGACTTCAGCTATTTGAAAAACTTTAAGATAGGATAATTTTGCTTTCATATTTCTTCTGAATAAAATGTGGTTTTAACTTCTTTATCAAACTTCACAACCCTATCATCTATTCTTACTATTCCTTGAGTTAAATATTCCACTACTGTAGGATATACCTGATGTTCTACCTTTAAAACTCGATCTGCTAGAGTTTGAGCTGAATCTGATTTAAATACTGGCACGACCCCTTGAGCAATTATAGGACCATCATCAAGTTGTGGATTTACAAAATGAACGGTACATCCATGCACGCATACACCAGTTTTAAGTGCTCTCTCATGAGTATCAAGTCCAGCAAAACTTGGTAGCAATGAGGGGTGTATATTGATTAGCCTGCCCTCAAGCCCATCTACAAACGATGAATTTAAAATTCTCATGTACCCTGCAAGTAAAACATAATCAGGGCTATAAGCAAGAACTTTGTTTAGAAGTTCATAATCAAATTGTGCTCTGTCATATCCTTTTTCCTGTGGCAATGGCACATATTCCACGTGAATTCCATTTTCCTTAGCCCAATTTAGACCTAATGACTTTGAGTTGTGGGAAATAACTGCAACAATCTCAATATTTTTATTAATTTTTGCGCGTTCTACTATCGCTTTCATATTTGATCCGCGACCAGAGATTAAAATAACGAAACGCATTGATATTCCATATCCTTACTAATAAATCAAAAATTTTAATATTTTAGAAGTGTTTAATTCTATCAATCTTCCGCATATTTCTAGAAATCTTTTATCTAATTCGTCGACCTGTCTTACGGTAGGTAATTTTGACGGGGTTCACCTTGGACATCAGTCTATTTTAAAGCTGGTATCACAATCCGCTATAACTAAAGAGTTAGTCCCAAGTGTTCTAACTTTTGAACCGCATCCACGTGAGTATTTTGGAGTAACTGGAAATCGTCCCGAACTTATACCTACAAAAATTCAAGGTCTTAGAGATAAGGTTTTATCCCTTGGTCGATGTGGTATTAGCGAAATTTTTATTCAACGTTTTAATAAAACTACTGCATCCATGCTACCAGAGGATTTTATAACAAGCATATTAGTCAAAGGCTTAAAAGTGAAATCACTTTTTGTTGGAGCTGATTTTCGTTTCGGATATAAACGTAAGGGCGATTCCGAAATGCTTAAATCTGCCTCTAAAAAATTTGGTTTCGATGTTAATTTTATAGATGACATTCTAGATACCAATCAAATTAGATATTCAAGTTCTGAGCTACGTAATGCCCTTGCCTACGGTAATATTTCTCAGGCTTCTCAAATCATGGGTCGGAATTATCATTTCACTGGTCGTGTTATTCATGGAAAAAAACTAGGGGCTAAAATCGGAACTCCAACCATGAATATGAGAGTACCTCAAAGATTTGCTCTTAGGTCGGGGATTTATATTGTTACCGTTAGCGGTTTAAGTGCTGAGCCTCTACAAGCTGTAGCTAATTTAGGAATCAGACCCACAGTAGAAAGTAGTGGTGAAGTATTACTCGAGGTCCATATTCTCGATAGAATCATCTCTGCTTACGGTAAAATTATTAACGTTTCATTTCTCGATTTCATCAGGGATGAAGAAAAATTCCCTTCAGTTGAAGCTATGGCCATTGCCATCCAAAAAGATATAGAAAAAGCAAAAAATTATTTTAAAAAACATGGAATATAAAGATACTTTACAGTTACCAATAACAGATTTTCCAATGCGAGGCAATCTTTCAAAACGTGAACCGCAATGGATAAAAGAATGGATGGATAAGGGTGTCTATCTAGCAATTAGAAAAGCTAGTGCAGGTAGACCAAAATTTATTCTTAATGATGGACCTCCATACGCTAATGGAGACATTCATATTGGTCATGCTGTAAATAAAATATTGAAGGATATTATTATTAAGAGTAAATCCATGGCAGGATTTGATGCACCCTACATTCCAGGTTGGGACTGTCATGGCATGCCAATTGAAATTCAAATAGAAAAGAAATTCGGAAAAAATCTGCCTACTTCTGAAGTACAGTCAAAAGCTCGCGAATATGCTTCTTTACAAGTTCAAAAGCAAATGGAAGGATTTCAAAGGCTTGGTGTTCTAAGTGATTGGGAGCATCCTTATCTAACCATGAACTATCTAAATGAAGCAAATGAAATTCGTGCGTTGGCTCGTATTATCGAACATGGGTATGTTTTCCGTGGATTAAAACCAGTTAATTGGTGTTTTGATTGTCAGTCAGCTTTAGCAGAAGCGGAGGTTGAATATCAAGACCGTACCGATCCAACTATTGATGTTGCCTTTCCTTTTGCCGAACATGAAAAACTAGCACAAGCATTTGGAATTGAATCTGTAGCTGATGGTGCCATAGTAATTTGGACCACTACTCCATGGACTATACCTTCAAATCAGGCTCTTAACGTTGGTCCAGAGACTGAATATGCTTTAGTTAAATTATCTGAAGCACGTCAAGGTACAGGTGAGTTACTGCTCCTAGCCAAAGAACGAGTTCAAGCTTGCTTAGAAAATTGGGGACTTGAAGGGGAAATTATTGCCACATGCATGGGATCTTATTTGGACGGAATCGCTTTTCATCACCCACTATATAAGGCTCACTCTCAATATAATCGACTTTCTCCTATTTACGTAGCCGATTATGTAACGACAGATACTGGTACTGGTATTGTTCACTCTGCACCTGCTTATGGTGTGGATGACTTTATATCATGCAAGTCTCGTGGCTTAACTGATGAGCAAATCATTAGTCCTGTTATGGCAAATGGGGTTTATTCATCCAAACTAGCATTATTTGGCGGTTTAAAGATATGGGATGCAAATCCTAAAATCGTTGACACGCTACACGAACAAGGTGTACTACTAAAAACGCAAAAACTTCAACATAGTTATATGCATTGTTGGCGTCATAAAACACCTGTTATTTATAGAGCTACAAGTCAGTGGTTTGCAGGTATGGACGTTATGCCAAATGACAATTCTGGAACTTTACGCCAAAAGGCTCTTAAAGCGGTTGAGAACACTAATTTCTATCCTTCTTGGGGGCGTGCACGACTTCATGCGATGATTGCAAATAGACCTGATTGGACCTTATCGCGTCAAAGGCAATGGGGAGTTCCCATGGCATTTTTCGTGCATAAGGAAACGGGAGAATTACATCCTAATACAGTAGAACTTTTGCTTAAAGTTGCTGATTTAGTTGAAATAGAAGGTATCGAAAAATGGCAGTCAGTTGAAGTTACTGATTTATTGCCACCAGAAGAAGCAAAAGATTATATTAAAAATTCTGATACCTTAGACGTTTGGTTTGATTCTGGATCAACTCATATAACTGTTAACGGTGGCCGTGATCAGGAATTTAATGGCTCGCATAAGAATGACTTAACTTGGCCAGCCGATCTATATCTTGAGGGTTCTGATCAACATCGTGGATGGTTTCACTCTTCATTACTTACTTCTTCTATGATTTATGGTAGGGCTCCATACAAATCTCTACTTACACACGGATTTGTCGTAGATGGACAGGGACGTAAGATGTCCAAATCTGTAGGTAATGTTATTGCACCTAAGCAAGTTGCTGATACTCTTGGTGCTGAAATCATTAGGTTATGGACTGCTGCTACGGATTATTCAGGCGAGCTTTCTATTTCAGATCAAATTTTAAAACGTGTTGTTGAAAGTTATCGTCGTATACGAAATACGATTTGTTTCTTGCTTGGTAATCTACATGATTTTGATGCTAGTAAGGACTTGATAGATACAGATAATATGTTGGAAGTTGATCGGTATGCAGTTGCTATAGCTTCCCAATTAAGTGAACAAATTACCTCTCTTTATGAGAAGTTTGAATTCCATCCTGCAGTTTCTCGATTTCAAACTTACTGCTCCGAAGACTTAGGTTCTTTTTACTTAGATATCCTAAAGGACCGCTTATATACATGTGCAGCTGACAGTTATGCTAGAAGATCGGCTCAAAGTGCACTCTATCATATAACTATGAATATGATTAAGCTTATGGCACCTATCTTATCCTTTACAGCTGAAGAAGCTTGGAGTGAGATGTGTAAGACTTTTTTACAAAACTCTAACTCAAAAAGCGAATTAACAATCTTTACGCAATTGTTCGAAACATTGCCACAAGTAAATAATAAAGAAGCATTAGTTGAAAAATGGAATCGTATTCTAGAAATTAGAGATTTACTTAATAAAGAACTTGAAAATAAGCGTGAGGCTGGATTAATTGGTTCTTCTCTACAGGCTGAAGTTGTTATAAACGCTCCTAGAGATGATTTTGAGCTGCTCAGTTCATTAGGCGAGGATTTGAGATTTGTATTTATGGTTTCTTATGTTACTTTAAAACAAACCGAGAGTTCAGAAAATTCGTTTGAAATTACTCCATCTACGCACCAGAAATGTGAAAGATGTTGGCATTACAGAGAGGATGTTGGGGCTAATGCTGACCATCCAACTATTTGTTCACGATGCGTAAGTAATTTGTTTGAGGGCGGTGAAAACAGAAAGCATGCATGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_018108|1132033:1143925|1141054_1143925_+|WP_014840461.1|tRNA|DBSCAN-SWA MEYKDTLQLPITDFPMRGNLSKREPQWIKEWMDKGVYLAIRKASAGRPKFILNDGPPYANGDIHIGHAVNKILKDIIIKSKSMAGFDAPYIPGWDCHGMPIEIQIEKKFGKNLPTSEVQSKAREYASLQVQKQMEGFQRLGVLSDWEHPYLTMNYLNEANEIRALARIIEHGYVFRGLKPVNWCFDCQSALAEAEVEYQDRTDPTIDVAFPFAEHEKLAQAFGIESVADGAIVIWTTTPWTIPSNQALNVGPETEYALVKLSEARQGTGELLLLAKERVQACLENWGLEGEIIATCMGSYLDGIAFHHPLYKAHSQYNRLSPIYVADYVTTDTGTGIVHSAPAYGVDDFISCKSRGLTDEQIISPVMANGVYSSKLALFGGLKIWDANPKIVDTLHEQGVLLKTQKLQHSYMHCWRHKTPVIYRATSQWFAGMDVMPNDNSGTLRQKALKAVENTNFYPSWGRARLHAMIANRPDWTLSRQRQWGVPMAFFVHKETGELHPNTVELLLKVADLVEIEGIEKWQSVEVTDLLPPEEAKDYIKNSDTLDVWFDSGSTHITVNGGRDQEFNGSHKNDLTWPADLYLEGSDQHRGWFHSSLLTSSMIYGRAPYKSLLTHGFVVDGQGRKMSKSVGNVIAPKQVADTLGAEIIRLWTAATDYSGELSISDQILKRVVESYRRIRNTICFLLGNLHDFDASKDLIDTDNMLEVDRYAVAIASQLSEQITSLYEKFEFHPAVSRFQTYCSEDLGSFYLDILKDRLYTCAADSYARRSAQSALYHITMNMIKLMAPILSFTAEEAWSEMCKTFLQNSNSKSELTIFTQLFETLPQVNNKEALVEKWNRILEIRDLLNKELENKREAGLIGSSLQAEVVINAPRDDFELLSSLGEDLRFVFMVSYVTLKQTESSENSFEITPSTHQKCERCWHYREDVGANADHPTICSRCVSNLFEGGENRKHA >NC_018108|1132033:1143925|1133974_1135249_-|WP_013521238.1|DBSCAN-SWA MFALIDGNSFYCSCERVFRPDLKEVPVVVLSNQDGCVVARTREAKALGIPMGLPFFKIRDLVESGEVYAFSSNYELYADISSRMMNTISSVVSDIEVYSIDECFAYIDSRRSYKEVGRTIRDRVLKWVGIPTCIGIAPTKTLAKFCNHLAKKYPESFGGVVVWSDWSKSIRDRAFKSMDVSEIWGIGRRISKQLHTMGIDTVYDLVNADSRLLRKHFSVVMERTQLELKGIPCADLEELQDRKQIVCSRSFGELITDLNSLQSAISEHIAEGARKLRKQNSFTKELSVFIKTNRYREQDQQYGGYKMARLIEATDDTLTLNSKAQELLKVVYRSGYNYKKAGITLGEITPAPTSHQLSLWDSATHLEEFDRRKELMKTIDETNQRFGKGALKLSQSLLSSRWHMQRNYLSPCFTTRFNDLLVCS >NC_018108|1132033:1143925|1138143_1139415_-|WP_013521241.1|DBSCAN-SWA MKAKLSYLKVFQIAEVLEEVLKFKYPADSVLSNWFKSNKKLGHGDRAIVAEAVFDILRNLRMYRNFAQSGVGPENQRLAILGLNSVCSRESVVAMLKEEQAEWFERIYKIDTSTLNDLIKYSVPDWFFNKVSKLPNYESLLEALNQKAPLDIRVNPLKASRDEVLQEIKSRGLLDNQEYENTKFSPWGIRIKTNPSINRWDLFIDGKVEVQDEGSQILCQLVSPKRSDWVIDFCAGAGGKTLLLGALMHSKGRLYALDTSSNRLGKAKPRIVRSGLSNVTLIPIKSENAERVKRLHGKADKVLVDAPCTGLGTLRRNPDLKWRQTQKDLSELVELQFNILTAASKCVKNGGRLIYSTCSVLEEENQQQINKFLKINTNFKLINPQKVLGDRITGLEDVDDMLVLRPDIHGTDGFFAAVMEKVD >NC_018108|1132033:1143925|1135936_1138141_-|WP_014840459.1|DBSCAN-SWA MSSVLDSLNKQQLAAVTSEAKHLLVLAGAGSGKTKVLTTRIAWLVQQGIATPERILAVTFTNKAAKEMMERIGKYIPVNPKSLWVGTFHSICHRILRAHHKEVGLPAAFQILDMADQKSMLKRILKSMKLDDDKLYPIREVQYGINNKKESGLRAEQVIPTYEFDETYVEIYKTYEKQCQKEGVVDFAELLLRTVELLENNKTIIGHYNLRFKHILIDEFQDTNFLQYKWLNLLAGPSTSIFAVGDDDQSIYSFRGANVEHMRNFERKYAKENLVRLEQNYRSYNHILCAANELIANNTNRLGKNLWSDKGQGEQISIASLYDQNEEAQWILEETKQLIREGFDHRQIAILYRSNAQSRAIEHSFARAGVKYVVYGGLRFYERQEIKHVVAYLQLIHNLNSDNAFLRVVNFPARSIGNRTIEKLDEIAKSVGCSLALAAGGLNGEAAKKVNGFIYLIKRLQEVAAESTLPELVEAVIEQTGIDEYYNNEQDGEERLENLSELIDAAKVFCKEEGIAFLKSIEVIEGVDAKNMTPLALFLSTASLEAGDNQSKRNLDAVQLMTVHSSKGLEFDAVFIAGLEQGLFPHDNSISEPGGLEEERRLMYVAMTRARKRLYLLFTMSRQIYGKTHPTKKSIFLDEITKDHVKWLTDKPQLYSDSRYSLDSFEEFASPKTKEKIYHSDSPYRIGMSVSHPKFGEGVIIKIIGQGDDAQAQIQFFSVGTKTLSLSVAKLSII >NC_018108|1132033:1143925|1132033_1133005_-|WP_014840457.1|DBSCAN-SWA MLDENLEKRIFTLDITTKADRLDKVLAQLLPEYSRSRIQNWIEEGHVRINSKSANESKVRTVVGPLDVIEVDIQPDEHTRAFQPEDINFDVIDESTDWIVIGKPAGLVTHPGSGNWSGTLLNGLLYRFPELKHVPRAGIVHRLDKDTSGVLVVARNEMSQFNFIKQLQARTMGRKYIAIVSGTTSDQGVIADEIGRDPRNPIKMASSKIVKPISPKEAITHYETIRHGYIEDKNISLINCRLETGRTHQIRVHMASINHPLVGDELYGGIKLKTFKNLRQMLHAYELQFNDPVSGERLCFRCDVAEDMKMVAGAGFEPTTFGL >NC_018108|1132033:1143925|1133103_1133922_+|WP_014840458.1|DBSCAN-SWA MKKTLRNILILSFTAILSACGIFDREIDETAGLPADKLYDTARTYVRGRDWDSARKYLAAIENRHPYSSYAQQAMIDEAYVNWKDEQPERAIAVIDRFLQIYPSHPGTEYMLYLKGLITFTPPTHFLTSFAGQKPSERDPRGLRQSYTAFKVLIDNYPNSRYAADARQRLVWLVTTLAEHEANVAKYYYEKKAYVAAINRAQVVLTEFSGVPSAELALYVLMKSYEALGSEDQAADAKSVLVKNYPNSRYLTHGFKGEGGIMKYLSPTNWFN >NC_018108|1132033:1143925|1140099_1141065_+|WP_014840460.1|DBSCAN-SWA MFNSINLPHISRNLLSNSSTCLTVGNFDGVHLGHQSILKLVSQSAITKELVPSVLTFEPHPREYFGVTGNRPELIPTKIQGLRDKVLSLGRCGISEIFIQRFNKTTASMLPEDFITSILVKGLKVKSLFVGADFRFGYKRKGDSEMLKSASKKFGFDVNFIDDILDTNQIRYSSSELRNALAYGNISQASQIMGRNYHFTGRVIHGKKLGAKIGTPTMNMRVPQRFALRSGIYIVTVSGLSAEPLQAVANLGIRPTVESSGEVLLEVHILDRIISAYGKIINVSFLDFIRDEEKFPSVEAMAIAIQKDIEKAKNYFKKHGI >NC_018108|1132033:1143925|1135251_1135854_-|WP_013521239.1|DBSCAN-SWA MPDPKLKIVHNSGSRGGCRKGAGRKSVLGEAMVVKRVPASLIPTIDTLIENLKLQQFPDSWSESRVPELAIPLALERIPAGFPSPAESYVADYLDFNTYLVQNPMATIAVRSGGDSMIDVGISKDDILIIDRSVTAKHMDIVMADIGNEYTIKRLCILPDGSVELRPENRSGIYTPIKFRDQEQLRIVGVLLHVIKDFRN >NC_018108|1132033:1143925|1139411_1140050_-|WP_013521242.1|DBSCAN-SWA MRFVILISGRGSNMKAIVERAKINKNIEIVAVISHNSKSLGLNWAKENGIHVEYVPLPQEKGYDRAQFDYELLNKVLAYSPDYVLLAGYMRILNSSFVDGLEGRLINIHPSLLPSFAGLDTHERALKTGVCVHGCTVHFVNPQLDDGPIIAQGVVPVFKSDSAQTLADRVLKVEHQVYPTVVEYLTQGIVRIDDRVVKFDKEVKTTFYSEEI |
9 | Bodo_saltans_virus(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_018108.1|WP_013521353.1|1243509_1243950_+|hypothetical-protein |
1243509_1243950_+
Protein sequences of NC_018108.1|WP_013521353.1|1243509_1243950_+|hypothetical-protein>NC_018108.1|WP_013521353.1|1243509_1243950_+|hypothetical-protein MKVEQNGLNSKDKETFQYISGWEALNIKNEKGLTADWHPLNYFQKNKPFKLYTLDKSMPLGTKGIKLRYIPFLKKQYYVASFARAIADLVYFDDSYGLKNCVYDFLDDEDTNELYSYLKIINQTKNVEQFMKYELTKLYFRDKNYA |
146 aa aa |
86
gnl|BL_ORD_ID|86 information
|
NA | NA | No | NA |