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DBSCAN-SWA_1 |
0 : 47260
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_016772|0:47260|DBSCAN-SWA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_016772|0:47260|25833_26724_-|WP_000091216.1|terminase|DBSCAN-SWA MSRRSIERDKAFEMYKDSKGEKPIEEIAEDLGKSISLIRKWKSKDKWDENITGNITTGKKVITKVENPKTKKKLKEILDDEELSEKERLFCLYYVKYFNGTQAALKAGYSKDGAHVQASRLLRRERVSSYIKELKGELVENVFVEAMDVLKEYIKIAFADITNYLNFGQREITIQDDDGNEVTRLVNFVDLYEADMVDGSIITEVKQGRDGISVKLADKMKALDKLSQYFDLVPDNFKKQIEEERHKMQMEVQKVHVEKMRAEIKELTDDHGNGGKVIIVNDKEAMRKAMENDQDS >NC_016772|0:47260|30326_30710_-|WP_000436121.1|DBSCAN-SWA MEQLAFFPEIDDKEYKLIQKAVVKVLRDYKALAVRMENQTECERESIQLFPELRDTRKLNDYKYLQIKRALDHSLDLEQREIIERKYLKGGVMNDTLIKAQMMLEHKWYYYQKKSAIMAIATALRMI >NC_016772|0:47260|26807_27023_-|WP_000773609.1|DBSCAN-SWA MKLNKQEQTVVVGQLINNVIGLELVKQHIDPQKLEKAVDLHNKMNDDMTPKQCREALISVLDKTIDEFLKA >NC_016772|0:47260|35710_35848_-|WP_000511092.1|DBSCAN-SWA MGIGFSLGFRHHEWRFGISIDFKKTYMEVSAGPFYFKVRVGGIEE >NC_016772|0:47260|34454_34667_-|WP_014298088.1|DBSCAN-SWA MRLLDKYRKLYVSLKNEDELITLFSKESFSDITDMLNEEKFIMLFDLRNGLYLPCALNTDHITVVFRGED 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74 | Bacillus_phage(98.65%) | portal,plate,capsid,terminase,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_016771_1 | 1239568-1239802 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_016771_1
|
3 spacers
spacers of NC_016771_1
>1.1|1239593|59|NC_016771|CRISPRCasFinder GAGAATCCGTTAGCGATAGTCGCGGTTCCTTCTGCATGTGCTGCTTCGCCTAAAGCGAT >1.2|1239677|59|NC_016771|CRISPRCasFinder TAGGAGCCACCTGCTGTCGTTTCACTTCCTTCACTATGGGAACTATGTCCAGTTGCTTT >1.3|1239761|17|NC_016771|CRISPRCasFinder AAAGAACCTTTTGCATG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_016771_1
The CRISPR arrays of NC_016771_1 >merge|NC_016771|1|1239568-1239802|CRISPRCasFinder TGTATGATTACCTTCCGCATGAGAAGAGAATCCGTTAGCGATAGTCGCGGTTCCTTCTGCATGTGCTGCTTCGCCTAAAGCGATTGTATGTTTACCTTCCGCATGAGAATAGGAGCCACCTGCTGTCGTTTCACTTCCTTCACTATGGGAACTATGTCCAGTTGCTTTTGTTTTTGATCCTTCTGCATGAGAGAAAGAACCTTTTGCATGTGTCAGAAGTCCTTCTGCATGTGAA >NC_016771|1|1|1239568-1239802|CRISPRCasFinder TGTATGATTACCTTCCGCATGAGAA GAGAATCCGTTAGCGATAGTCGCGGTTCCTTCTGCATGTGCTGCTTCGCCTAAAGCGAT TGTATGTTTACCTTCCGCATGAGAA TAGGAGCCACCTGCTGTCGTTTCACTTCCTTCACTATGGGAACTATGTCCAGTTGCTTT TGTTTTTGATCCTTCTGCATGAGAG AAAGAACCTTTTGCATG TGTCAGAAGTCCTTCTGCATGTGAA
>NC_016771.1|WP_001079095.1|1237978_1238872_+|RluA-family-pseudouridine-synthase MNRFTLKWDIDSAEEGTLVREFLKTKGISKAALTDIKFHGGSIEVNGQHASVRHQLQAGEELRVFFPVEERSEGMIAEDIPLCIVYEDDAVLVINKEANMSTIPSREHPAGSVANALLSHYDKRHLTSTVHIVTRLDRDTSGLMLIAKNRFVHHLLSKQHQQKAVKRTYEAIVHGEMVEREGTIDAPIGRKSDSIIERTVCEEGQRAVTHFRVIDSVNHKTHVSLELDTGRTHQIRVHMAYIGHPLLGDNLYGGKRDEMKRQALHSTSLTFYHPILEKEMSFTTPIPSDMQAVLRHT >NC_016771.1|WP_000673184.1|1237165_1237963_+|NAD-kinase MKFTIMSKGDQSSDALASTMKEYLLDFGFIMDEKEPDIVISVGGDGTLLYAFHRYYNRLDETAFVGVHTGHLGFYADWLPTEVEKLVIAIAKTPFQVVEYPLLEVIIRYVNGSKESQYLAMNEATVKSAEGTLVTEVEIRGEYFETFRGDGLCISTPSGSTAYNKALGGAIIHPSIEAIQIAEMASINNRVFRTVGSPLVLPKHHTCVLKPTAGMNLQITVDHLTMVHQDVKSIQYRVANEKVRFVRFRPFPFWKRVRDSFVADK >NC_016771.1|WP_001081482.1|1236508_1237147_+|GTP-pyrophosphokinase-family-protein MNRNWEEFLAPYHQAVAELKVKLKGMRTQFAMLTEHSPIEFVTGRVKSVASIIDKAEKRNVPLDRLREDMQDIAGLRMMCQFVDEIKPVVEYLRKRNDFEIVEERDYVTQKKDSGYRSYHVVISYPVQTIQGEQKVLVEIQIRTLAMNFWATIEHSLNYKYSGRFPEDIKIRLQRAAEAAFLLDEEMSSIRLEIQEAQKAFSRKQETKDSES >NC_016771.1|WP_001180003.1|1236106_1236478_+|hypothetical-protein MQNKIQVKSVEKRENALIFCAENSEIEVKELSARNHVLVDSDNLSFLYILENESSFIYVSIPHTCWEAMHEAMNNDVVMFVRVNDIEMELEGLKEEVEYLVENIEGNANYGEELVTAVEKVFL >NC_016771.1|WP_000191110.1|1235381_1235960_-|CYTH-domain-containing-protein MTQEIEIEFKNIVTEEEFNTLCKSFSIEGFTKQVNHYFETPSFSLKEAGSALRIRHKGETYTLTLKQPAEVGLLETHQVITADEARLMMETNTIIQGAVVDQLHTLQIPVSALTYMGSLTTERAETLFEGGTLVFDHSFYYNHDDYEIEFEVQDEEAGKAAFIHLLKQHDIPIRHTNNKVKRFFLAKQNKAR >NC_016771.1|WP_000043379.1|1234802_1235201_-|hypothetical-protein MSKQPMTPFEAIGGEQCIAILVDTFYSYVSKHPDLSPIFPDDLTETARKQKQFLTQYLGGPNLYTEEHGHPMLRARHLPFEITPKRAEAWLSCMEQAMDDTGVDGHIREFVFERLALTAQHMVNTPDETGEI >NC_016771.1|WP_000360652.1|1233909_1234803_-|DsbA-family-protein MDKQEAKHINMPSPSACEHKSVEAYLFIDPLCKDCWEIEPFIIKLWLEYGKYFSIRHIVTGKVDGTNASSHKWNKPANIRFVWEKTTSLQGFSCDGKVHMQEASSTPYLVSMAIKAAELQGRKAGSKFLRKLQEYIFLENVSNPDCELLLACAKDSNIDVEEFKKDLYSASAKKAFQCDLKFTNEMHITEIPSLVFFHANSDEEGIKIAGTYSYDVYVQLLKELVKCEIEPEPLPPLEVLLEATQFISSKEVAFIYDCSKQEIERELKKLQLKRKVQMIDVKCERYWKWIAKEKDLV >NC_016771.1|WP_000754592.1|1233506_1233680_-|hypothetical-protein MKKTYILLIILAIIVSFFLYILSLLQAFPKMIAFPLLFGVIVIALSYFNHKKRFKGF >NC_016771.1|WP_000003390.1|1231562_1233389_+|oligoendopeptidase-F MSEQNTAKTLPDRNEIEESSTWRLEDIFQTDAEWEQEFQAIKELLPKLTEFKGKLGDSANNLLEALQYEDEISMRLGKLYTYAHMRYDQDTTNSVYQALNDRATNLYSQVSSSTAYIVPEILSISEDTLQTFLKENRDLSVYEHALEEITRQRPHVLSEAEEALLAEASEVMSASSNTFGMLNNADLKFPSIKGEDGEEVEITHGRYIQFLESDDRRVREDAFKAVYETYGKYKNTFASTLSGAVKRNNFNARVRKYDSARQAALSNNNIPEAVYDQLVQSVNDNLHLLHRYIDIRKRALGLDELHMYDLYTPLVPEVKMNVKYEEAQDMLLKSLHVLGDEYVDILKEAYENRWVDVYENKGKRSGAYSSGAYGTNPYILMNWHDNVNNLFTLAHEFGHSVHSYYTRKTQPHVYGDYSIFVAEVASTCNEALLNDYLLKTTEDKKERLYLLNHYLEGFRGTVFRQTMFAEFEHIIHKKVQEGHAVTPDMLTEIYYDLNKKYFGDALVIDEEIGLEWSRIPHFYYNYYVYQYATGFSAATALSKQILEEGQPAVERYINEFLKAGSSDYPIEVLKKAGVDMASPEPVKEALQVFEEKLNELEALLFEEK >NC_016771.1|WP_000612264.1|1230267_1231512_+|competence-protein MIPIFIAKRENGEKIHLLDHHDEELLHHMRKRESFFCIACGKEVLMRLGKQKRWHFAHKKVDSCLAFYEAESTYHMYGKELLYRWFKRQKVHVEIEHYLPEIQQRPDIFIERAGRKIAIEYQCANLSIEQLCKRTYSYWKAGIQVIWIIGGNQLKKHSAYWMKFSSIMAFSLQSYPQPLLIFFCSKQKSFMKCTFITSFSTSVAFSHIIYLPIETTTFEMLFSPVPFQREVLNREWKKRKDYFRQNALPILNYNDKSLLRLLYQCKCTPANFPSEIGVPLPSSFAFQTNSFIWQAFLYMKCIGELAVGDCISLKYVCSYIKKYTKRRMLPYFSQHIWKVAVTEYMTFLCYVGVLQRVGTYKYRKIRGISMLKTEEEVMKYDERSLAYALSLFEAKYNMREGKADIIKTDREGIT >NC_016771.1|WP_000872720.1|1240506_1241247_-|bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase-PrpE MKYDIIGDIHGCLQEFQNLTEKLGYNWSSGLPVHPDQRKLAFVGDITDRGPHSLRMIEIVWELVIHKKVAYYAPGNHCNKLYRFFLGRNVTIAHGLETTVAEYEALPSHKQNMIKEKFITLYEQSPLYHVLDEKRLLVCHAGIRQDYIGRQDKKVQTFVLYGDITGEKHADGSPVRRDWAKEYKGTTWIVYGHTPVKEPRFVNHTVNIDTGAVFGGKLTGLRYPEMEIVSVPSSLPFVPEKFRPIS >NC_016771.1|WP_000655329.1|1241321_1242482_-|rod-shape-determining-protein-RodA MKDSNSQYQIDYVLLFILFAIGIVSCFAIASAQASLPSFLQHVNFVLKQIQWYFIGFIAIGIIMIIDFDRYQKIAWYLYSFALVLLIGLEFQVPGAVTIKGATAWYRLPGIGNFQPSEIMKLFLIIVIGRIIANHNEKYFYRTIQDDFLLLGKICATSLPPLLLIAKEPDLGNTMVISAMLAAMILVSGIRWRFIFGLASGIFAAGVTLTYIFFTHTKFFKAHILQEYQLNRFYGWLAPYKYDAQGYQLRQAFLATGSGEMQGKGWENGQVYFPEPHTDFIFTNVAEQFGFLGASVIIALFFLLIFRMIHIAIESNDPFGSYICAGTIGMFTFQVFQNIGMTIGLLPITGITLPLMSYGGSSLLTYMIAIGFVLNVRSRTKIFMFN >NC_016771.1|WP_000427737.1|1242624_1243560_-|glycosyltransferase-family-2-protein MENIKNVPLVSILIPTYNRPHYFKIALESALAQTYSNIEIIVGDDSTNNETEKLIYRDYLHKHKHITYIRNPSTLGQFHNALMLLEQSNGEYINFLMDDDIFYNNKIEKMMFYFQKDLDQNLALITSYRTWINDDGEIIEQHPSMNRLYDEDTLLNGKDLGNHMLILGQNIIGEPTTVLFRKRLLTEPFGTLNGRNYNCSVDMASWISLLSKGDAIYITEPLSSFRLHTGQQVHHKYLEGCEDFSHLVLHSKKYGFLQETDYYKTSLLKACEWYKNATTFYQLYPELIPTTDTHTRLSHCLNIVTKELHAI >NC_016771.1|WP_001004740.1|1243566_1244325_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_016771_1 | 1.3|1239761|17|NC_016771|CRISPRCasFinder | 1239761-1239777 | 17 | NC_016771.1 | 2090290-2090306 | 1 | 0.941 |
1. spacer 1.3|1239761|17|NC_016771|CRISPRCasFinder matches to position: 2090290-2090306, mismatch: 1, identity: 0.941
aaagaaccttttgcatg CRISPR spacer aaaggaccttttgcatg Protospacer ****.************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
267023 : 274972
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_016771|267023:274972|DBSCAN-SWA CATGCTAAAGCCATTAGGTGATCGCGTTGTAATTGAGCTTGTTCAAGCGGAAGAAAAAACAGCAAGTGGTATTGTATTACCAGACACAGCAAAAGAAAAACCACAAGAGGGTAAAGTTATTGCAGTAGGTACTGGTCGAGTGCTTGAAAATGGTGAGCGTGTTGCTTTAGAGGTAGCAGCAGGTGATCTTATCATCTTCTCAAAATATGCAGGTACTGAAGTGAAATATGAAGGTACAGACTACTTGATTTTACGTGAAAGTGACATTTTAGCAGTTATCGGTTAATTATATAAATCTTAAAAAATCCAAGGGGGTCAATTATTATGGCAAAAGATATTAAATTTAGTGAAGAAGCACGTCGTTCGATGCTTCGCGGTGTCGACACTCTTGCAAATGCAGTAAAAGTAACGCTTGGACCAAAAGGTCGTAACGTTGTTCTTGAGAAAAAATTCGGTTCACCACTTATTACAAATGACGGTGTAACAATCGCAAAAGAAATTGAATTAGAAGATGCATTCGAAAACATGGGTGCGAAATTAGTAGCAGAAGTTGCTAGCAAAACAAATGATGTAGCTGGTGACGGAACAACAACTGCAACTGTATTAGCACAAGCTATGATTCGTGAAGGTCTTAAAAACGTAACAGCTGGTGCGAACCCGATGGGTCTTCGTAAAGGTATCGAAAAAGCTGTAGTTGCTGCAGTAGAAGAATTAAAAACGATTTCTAAACCAATCGAAGGTAAATCTTCTATCGCACAAGTAGCTGCTATTTCTGCTGCTGACGAAGAAGTAGGTCAATTAATCGCTGAAGCAATGGAGCGCGTTGGTAACGACGGCGTTATTACTTTAGAAGAATCTAAAGGTTTCACAACAGAATTAGACGTAGTAGAAGGTATGCAATTTGATCGTGGATATGCATCTCCTTACATGATTACTGATTCTGACAAAATGGAAGCAGTTCTTGATAACCCATATATCTTAATCACTGACAAAAAGATTTCTAACATCCAAGAAATCTTACCAGTATTAGAGCAAGTGGTACAACAAGGTAAACCGCTTCTTATCATTGCTGAAGATGTAGAAGGCGAAGCGTTAGCTACATTAGTAGTGAACAAACTTCGTGGTACATTCAATGTAGTAGCTGTTAAAGCTCCTGGATTTGGTGACCGTCGTAAAGCAATGCTAGAAGATATCGCAATCTTAACTGGTGGCGAAGTAATCACTGAAGAATTAGGCCGTGACTTAAAATCTGCTACAGTTGAATCTTTAGGACGCGCTGGTAAAGTTGTTGTAACGAAAGAAAACACAACTGTAGTTGAAGGTGTAGGAAGCACAGAACAAATCGAAGCTCGCATCGGTCAAATCCGTGCGCAATTAGAAGAAACAACTTCTGAATTCGATCGTGAAAAATTACAAGAGCGTCTTGCAAAACTTGCAGGTGGCGTAGCAGTAATTAAAGTAGGTGCAGCAACTGAAACTGAGTTAAAAGAGCGTAAACTTCGCATTGAAGATGCACTTAACTCAACTCGTGCAGCAGTAGAAGAAGGTATCGTTGCAGGTGGTGGTACTTCACTTATGAACGTATACACGAAAGTAGCTTCTATCGTAGCTGAAGGCGACGAAGCAACAGGTATCAACATCGTACTTCGTGCACTAGAAGAGCCAGTTCGCCAAATCGCAATCAACGCTGGTCTAGAAGGATCTGTAGTTGTAGAGCGTCTAAAAGGCGAAAAAGTAGGCGTTGGTTTCAACGCAGCTACTGGCGAGTGGGTTAACATGCTTGAAACTGGTATCGTAGATCCAGCTAAAGTAACTCGCTCTGCACTTCAAAACGCAGCATCTGTTGCAGCTATGTTCTTAACAACTGAAGCTGTAGTAGCTGACAAACCAGAACCAAATGCACCAGCAATGCCTGACATGGGCGGCATGGGCATGGGCGGTATGGGCGGAATGATGTAATTCCGTTTGCCCTAAAAAAACATCCATTTCTATATAGAAATGGATGTTTTTTTATGTTTTTTAGAAAAGGAAATGAATTTCTGTAGAATTTTGTCGCTTTCTCTCTTGACCATATTGATACTTCATTGTTAGAATCTAGGAAGATAATATAAAACGATCCTTCATATATCCTCAAAGATATGGTTTGAGAGTCTCTACCAGGTTACCGTAAACAACCTGACTATGAAGGCAGTGTGTCTTATATTTATAAAGAGCGGAGACTATCTTTCTTTATAAAGCCAGACCCCTGCCTTTTCTTTGTTATGAGACTAGAGGCGGAGGACTGGCTTTTTTTATTATATTGGTAATGCTTTTCGCCTAATTGGTGAAAATATTTATATACGAGAACTAACGTTGGGGTGATTATTTTGAAGAAGCAACACGATACAATTATCGTTTTAGATTTTGGAAGTCAATACAATCAGTTAATAGCACGTCGAATTCGTGAGTTCGGTGTATACAGTGAACTTCATCCGCATACAATTACTGCAGAAGAAATTAAAGAAATAAATCCAAAAGGGATTATTTTCTCTGGTGGACCAAATAGTGTATATGGTGAAGGTGCATTACATTGTGATGAAAAAATCTTTGACCTAGGATTACCGATCTTCGGTATTTGTTACGGTATGCAACTTATGACACAAAAATTCGGTGGTAAAGTAGAACGTGCAAACCACCGTGAGTATGGAAAAGCGGTTCTTAAAGTAGAGAACGAATCAAAATTATATGCGAACCTTCCAGAAGAGCAAGTTGTATGGATGAGCCATGGCGACTTAGTAACTGGTTTACCTGAAGGATTCGTAGTAGACGCAACAAGTGAGTCTTGCCCAATTGCTGGTATGAGCAATGAAGCGAAAAACTTATACGGTGTACAATTCCACCCAGAAGTACGTCACTCTGAGCACGGTAACGATTTAATTAAAAACTTCGTATTCGGCGTATGTGGTTGTTCTGAAGGATGGAACATGGAGAACTTTATCGAAGTAGAATTAGAAAAAATTCGTGAAACTGTTGGAGACAAAAAAGTTCTATGCGCACTTAGTGGCGGTGTAGATTCTTCTGTTGTAGCAGTATTAATTCATAAAGCAATCGGCGATCAATTAACTTGTATCTTCGTTGACCACGGCTTACTTCGTAAAGGCGAAGCAGAAGGCGTTATGAAAACATTTAGCGAAGGCTTCCACATGAACGTTATTAAAGTGGATGCAAAAGAACGCTTCATGAACAAGTTAAAAGGTGTAGAAGATCCAGAACAAAAACGTAAAATTATCGGTAACGAATTCATTTACGTATTTGATGATGAAGCTTCTAAATTAGAAGGAATGGACTTCTTAGCACAAGGTACACTGTACACAGATATCGTTGAAAGTGGTACAGCAACTGCACAAACAATTAAATCTCACCATAACGTTGGTGGACTTCCAGAAGACATGCAGTTCAAATTAATTGAGCCTTTAAACACGTTATTTAAAGATGAAGTACGTGTATTAGGATCTGAACTAGGAATTCCTGATGAGATCGTATGGCGTCAACCATTCCCAGGCCCTGGTCTTGGTATTCGTGTACTAGGTGAAATCACAGAAGAGAAATTAGAAATTGTTCGTGAATCTGATGCGATTTTACGTGAAGAAATTATTAAAGCTGGCTTAGATCGCGAAATCTGGCAATACTTCACTGCGCTTCCTGGTATGCGTAGCGTAGGTGTTATGGGTGACGAGCGTACTTACGATTACACAGTAGGTATCCGCGCAGTAACATCTATCGATGGTATGACAGCTGACTGGGCACGTATCCCTTGGGACGTATTAGAGAAAATCTCTGTACGTATCGTAAACGAAGTAAAACACGTTAACCGTATCGTGTATGATGTAACGAGTAAGCCACCAGCAACTATTGAGTGGGAATAGTATTATACAAAAAGATCCATCTATTGCTCATGCATAGATGGATCTTTTGTATTCCTACTATTAATACGAACAAAATTATAAATGTTTACAAAAATGTTCGTTTTTAAATTGACAAAACTACTTCATCGAGTTAATATGAGTATGTAATTCAAACGAAAAGTGAATATTATGCCGTCGTATAATATCGGGGATATGGCCCGAAAGTTTCTACCTAGCTACCGTAAATGGCTTGACTACGAGGCGTTTTTATAAAGGTGAGGGGAATCTTATCTTTATTCATAGAACGCTTCCATGTATATGCAATGGAAGCCTTTTTTATTTTTAATAGATAAAAGAGGGCTAGGGGGATTACGGCGAGTAATCATATAACGGGGGAAACGTAAGATGAAACGCTATTTTCAGTTTGATGAACTCGGCACAAATTATAAAACAGAGTTCATAGCAGGTTTAACGACATTTTTATCTATGGCTTACGTACTATTTGTCAATCCTGCTACGCTGTCACTTGGAAATGTTAAAGGATTACCGGCAGGTACAGGAATGGATCCAGGTGCAGTATTCGTTGCTACAGCATTAGCAGCAGCGATCGGTTCGTTAATTATGGGTATTTTCGCGAAGTATCCAATTGCTTTAGCGCCAGGTATGGGAATTAACGCGTTCTTTGCTTATACAGCAGTGTTAACGATGGGTATTCCATGGCAAACGGCAATTGCTGGAACGTTAATGTCAGGTATTATCTTTATTATTCTTACTGCTTCAGGTATTCGTGAAAAAATCATTAATGCAATTCCATCGGAGTTAAAGTTTGCAGTAGCGGCAGGTATTGGATTATTCATTGCTTTCCTTGGATTCCAAAATGCCGGAATTATCGTGAAAAATGATGCTGTTCTTGTTGGGTTGGGGGACTTAACAAAGGGCACAACGTTACTAGCAATTTTCGGAGTTGTTACGACCATTATCTTCATGATTAAGAAAGTTAATGGTGCAGTATTTTACGGTATGATTCTTACGGCAATCTTAGGAGTAGCAACCGGATTAATTGATACTCCGAAAGCGGTAGTGGGAGCAATACCGAGTTTAGAACCAACGTTCGGTGCGGCGTTAACGCACTTTGGAGATATTTTCACTGTTCAAATGGGGATTGTTATTATAACGTTCTTCTTTATCGATTTCTTTGATACAGCAGGTACGCTTGTAGCGGTTGCGAATCAAGCAGGATTAATGAAGAACAATAAATTACCACGTGCAGGAAAAGCATTATTTGCAGATGCAATTGCAACTGTAATTGGTGCGATCTTAGGTACATCAACAACAACGTCTTATATTGAATCTTCTGCAGGGGTAGCAGCGGGTGGACGTTCTGGATTTACAGCAGTTGTAACAGCAGGATTCTTCTTATTGGCACTATTCTTCTCGCCATTATTAAGTGTTGTAACACCAGCTGTAACAGCGCCAGCGTTAATTATTGTAGGGATCTTGATGGTTTCATCTTTAGGAGAAATTGATTGGAAGAAATTCGAGATTGCAGTACCAGCATTCTTTACAATTATCTCTATGCCACTTACGTATAGTATCGCAACGGGAATTGCGATTGGATTTATCTTCTATCCAATTACAATGGTAGTAAGCGGTCGTCGTAAAGAGATTCATCCGATTATGTATGTTATGGGAGTTTTATTCGTACTATATTTCATCTACGTTCGTAAATAAAAGGGGTTTTTTGAAAGGTCTAGACTTAAGGGGAGTCTAGACCTTTTTTGCGTCTTCAGAAAAACTTAAGGATTTCCGAGCGTTTTTCTTCAGAAGTTTTCCTATAATAGAAGTTAGGGATTAAAAAGTGATGGGGGAGATATTGTGGCAAATGAAACGATACTTGTCGTAGATGATGAAAAAGAAATTAGGAATCTTATTACAATCTATTTAAAGAATGAAGGATATAAAGTATTGCAAGCAGGGGACGGAGAAGAAGGATTACGTTTACTAGAAGAAAATGAAGTACATCTAGTCGTATTAGATATTATGATGCCGAAAGTAGATGGCATTCATATGTGTATGAAAGTAAGGGAAGAAAAAGAAATGCCGATCATTATGCTTTCCGCGAAAACGCAAGATATGGATAAGATTTTAGGGTTAACAACGGGTGCAGATGATTACGTAACGAAACCGTTTAATCCGTTAGAGTTAATCGCAAGAATTAAATCGCAGCTACGCCGTTATATGAAAATGAATGGTTTCGCTATACAAAACGAGGACGAGCTAGAAATTGGAGAGATGAAAATAAACATCTCAACCCATAAAGTTATTGTAGAGGGAGAAGAAGTGAAACTGACCCCGAGGGAATTTTCAATTTTAGAATTGCTAGCACGTAATCCGGGGATGGTCTTTAGCGCGGAGCAAATTTATGAAAAGGTGTGGAACGAAAGATCTTTCCAGTCTGATAATACTGTAATGGTGCATATTAGAAAAGTGCGTGAAAAGATTGAGGAGAATCCAAGGAAACCTAGATATATAAAAACGGTATGGGGAGTGGGGTATAAGATTGAAAAAGATATTTAATCCATTCGCTTATATTAGGAAAATAAGACAATTAATTGAGAAATTAGTAAAGAGCGTACGAAAGAGTATAAGAATTCAACTGATTACTACTTTTGCTGCTTGTGCGTTATTAGGAGTTTTTTTTGCAAAGGGAGCTGCGCCATTTTTTGAGAATGCGAATCGTAAAGCGACTGTCGATTATCGGTCTGGTATGCAACAAATTAATTATCAAGCTCAAAAAGCAGCAAATAGTTCGGTGCATGAAAATAAATTAGAAGCTATATCCAATATGATCGAAACGGAGAATCAAAATTTAGAGCGAGGAAATAGAGCTTTAAAAATATTGGTTACTGACGAAAGTGGTAAAGTTGTATATAAAACGAAGCAGGCACAAGAAGAGCAAATCGATCTGCATAATACGATTCGTAATGCAGCATCATTTGCGATTAACTATTCAAATGGTCAAGATATATTTGAAAATACGAGAAAAGAATTTATAGCTTTTTCACCTATTACAATAGAAAATAAGAATTTATATATGTTCGTTAGTGGAATTCCGGATGGTGTAGTAATGTATGATACGCAAGAAGGCCCATTCCCATTTTTAATTGGTGTACTCGTATTCATTTTCTCTTTCTTCTATATAACAAAGAGAAAGATGAAACAAATTGAAGCGATGGCAGAAGGTGTAAAGGAAATAGAAAAAGGTAACTTAGCGTACCGCATTGAGAAGAAAGGTGAAGATGAGATTGCGTCTTTAACTGAGAATATTAATAATATGGCGGAAGAGCTTATGAATAATATAGAAAAGGAACGTAAATTAGAGAAGCAAAAGAACGAGCTTATTACAAATGTATCTCACGATTTGCGTACACCACTGACTTCTATTATGGGTTACTTGCGATTACTTCGAGATTCTAAATATGAAAATAAAGAGCAACACGATGAATATACGAGAATTGCTTTTGCGAAGTCAGAGCAGTTAAAGAATTTAATAGAAGATTTATTTGAGTATACGAAGTTAACGAATGAACAAGTTGTATTAGAAAAACAAGAAGTATGTGTAAATGAGTTGCTCGAGCAATTAATAGAAGAGTTAGTACCGCAGGCGGAAGAGCATGGACTTACGTTCGTTAAGAAGTTTCCTGAGGAACGTGCCTATGCAGCGATTGATTCGGAAAAGATGGTTCGTGTATTTGATAATTTATTAATGAACGCGATTAAGTATAGTAAAGATGATGGGGAGATAAAAGTTTCTCTTCAAAGGCAGCGCCGGGATATACAAATTGTAATTGCGAATCATAGTGAAGCGTTTACGAGAGAAGAGTTAGCGAGTTTGTTTGAACGTTTTTATAAGAAAGATCAATCTAGAAGTAGAGTAACTGAAGGGTCGGGTCTTGGATTGGCGATTGCGAAAAGTATTGTTGAATTACAAGGTGGTAGTATTCGAGCTGAATATGAGGATGGTATTATTCAGTTTATCGTCTCGTTGCCAATTATAGAAAAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_016771|267023:274972|272781_273483_+|WP_001262951.1|DBSCAN-SWA MANETILVVDDEKEIRNLITIYLKNEGYKVLQAGDGEEGLRLLEENEVHLVVLDIMMPKVDGIHMCMKVREEKEMPIIMLSAKTQDMDKILGLTTGADDYVTKPFNPLELIARIKSQLRRYMKMNGFAIQNEDELEIGEMKINISTHKVIVEGEEVKLTPREFSILELLARNPGMVFSAEQIYEKVWNERSFQSDNTVMVHIRKVREKIEENPRKPRYIKTVWGVGYKIEKDI >NC_016771|267023:274972|267346_268981_+|WP_001029999.1|DBSCAN-SWA MAKDIKFSEEARRSMLRGVDTLANAVKVTLGPKGRNVVLEKKFGSPLITNDGVTIAKEIELEDAFENMGAKLVAEVASKTNDVAGDGTTTATVLAQAMIREGLKNVTAGANPMGLRKGIEKAVVAAVEELKTISKPIEGKSSIAQVAAISAADEEVGQLIAEAMERVGNDGVITLEESKGFTTELDVVEGMQFDRGYASPYMITDSDKMEAVLDNPYILITDKKISNIQEILPVLEQVVQQGKPLLIIAEDVEGEALATLVVNKLRGTFNVVAVKAPGFGDRRKAMLEDIAILTGGEVITEELGRDLKSATVESLGRAGKVVVTKENTTVVEGVGSTEQIEARIGQIRAQLEETTSEFDREKLQERLAKLAGGVAVIKVGAATETELKERKLRIEDALNSTRAAVEEGIVAGGGTSLMNVYTKVASIVAEGDEATGINIVLRALEEPVRQIAINAGLEGSVVVERLKGEKVGVGFNAATGEWVNMLETGIVDPAKVTRSALQNAASVAAMFLTTEAVVADKPEPNAPAMPDMGGMGMGGMGGMM >NC_016771|267023:274972|271311_272637_+|WP_000833093.1|DBSCAN-SWA MKRYFQFDELGTNYKTEFIAGLTTFLSMAYVLFVNPATLSLGNVKGLPAGTGMDPGAVFVATALAAAIGSLIMGIFAKYPIALAPGMGINAFFAYTAVLTMGIPWQTAIAGTLMSGIIFIILTASGIREKIINAIPSELKFAVAAGIGLFIAFLGFQNAGIIVKNDAVLVGLGDLTKGTTLLAIFGVVTTIIFMIKKVNGAVFYGMILTAILGVATGLIDTPKAVVGAIPSLEPTFGAALTHFGDIFTVQMGIVIITFFFIDFFDTAGTLVAVANQAGLMKNNKLPRAGKALFADAIATVIGAILGTSTTTSYIESSAGVAAGGRSGFTAVVTAGFFLLALFFSPLLSVVTPAVTAPALIIVGILMVSSLGEIDWKKFEIAVPAFFTIISMPLTYSIATGIAIGFIFYPITMVVSGRRKEIHPIMYVMGVLFVLYFIYVRK >NC_016771|267023:274972|273466_274972_+|WP_000719191.1|DBSCAN-SWA MKKIFNPFAYIRKIRQLIEKLVKSVRKSIRIQLITTFAACALLGVFFAKGAAPFFENANRKATVDYRSGMQQINYQAQKAANSSVHENKLEAISNMIETENQNLERGNRALKILVTDESGKVVYKTKQAQEEQIDLHNTIRNAASFAINYSNGQDIFENTRKEFIAFSPITIENKNLYMFVSGIPDGVVMYDTQEGPFPFLIGVLVFIFSFFYITKRKMKQIEAMAEGVKEIEKGNLAYRIEKKGEDEIASLTENINNMAEELMNNIEKERKLEKQKNELITNVSHDLRTPLTSIMGYLRLLRDSKYENKEQHDEYTRIAFAKSEQLKNLIEDLFEYTKLTNEQVVLEKQEVCVNELLEQLIEELVPQAEEHGLTFVKKFPEERAYAAIDSEKMVRVFDNLLMNAIKYSKDDGEIKVSLQRQRRDIQIVIANHSEAFTREELASLFERFYKKDQSRSRVTEGSGLGLAIAKSIVELQGGSIRAEYEDGIIQFIVSLPIIEK >NC_016771|267023:274972|269385_270927_+|WP_162830862.1|DBSCAN-SWA MLKKQHDTIIVLDFGSQYNQLIARRIREFGVYSELHPHTITAEEIKEINPKGIIFSGGPNSVYGEGALHCDEKIFDLGLPIFGICYGMQLMTQKFGGKVERANHREYGKAVLKVENESKLYANLPEEQVVWMSHGDLVTGLPEGFVVDATSESCPIAGMSNEAKNLYGVQFHPEVRHSEHGNDLIKNFVFGVCGCSEGWNMENFIEVELEKIRETVGDKKVLCALSGGVDSSVVAVLIHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEAEGVMKTFSEGFHMNVIKVDAKERFMNKLKGVEDPEQKRKIIGNEFIYVFDDEASKLEGMDFLAQGTLYTDIVESGTATAQTIKSHHNVGGLPEDMQFKLIEPLNTLFKDEVRVLGSELGIPDEIVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEEKLEIVRESDAILREEIIKAGLDREIWQYFTALPGMRSVGVMGDERTYDYTVGIRAVTSIDGMTADWARIPWDVLEKISVRIVNEVKHVNRIVYDVTSKPPATIEWE >NC_016771|267023:274972|267023_267308_+|WP_000917306.1|DBSCAN-SWA MLKPLGDRVVIELVQAEEKTASGIVLPDTAKEKPQEGKVIAVGTGRVLENGERVALEVAAGDLIIFSKYAGTEVKYEGTDYLILRESDILAVIG |
6 | uncultured_virus(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
320328 : 328701
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_016771|320328:328701|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_016771|320328:328701|322436_322691_+|WP_000278826.1|DBSCAN-SWA MYKVKVYVTLRESVLDPQGTAVKGALHSLSFTEVQDVRIGKYMELTIDKSVTDLDSKVKEMCEKLLANVVMEDFRYEVEEVVAQ >NC_016771|320328:328701|323354_325574_+|WP_000055586.1|DBSCAN-SWA MSLMLEPNPTQIKEERIYAEMGLTDEEFAMVEKILGRLPNYTETGLFSVMWSEHCSYKNSKPVLRKFPTTGERVLQGPGEGAGIVDIGDNQAVVFKMESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDVFSMGARPVALLNSLRFGELQSPRVKYLFEEVVAGIAGYGNCIGIPTVGGEVQFDPCYEGNPLVNAMCVGLINHEDIKKGQAHGAGNTVMYVGASTGRDGIHGATFASEELSESSEAKRPAVQVGDPFMEKLLIEACLELIQSDALVGIQDMGAAGLTSSSAEMASKAGMGIEMYLDDVPQRETGMTPYEMMLSESQERMLIVVKKGREQEIVDLFEKYGLAAVTMGKVTEDKMLRLFHKGEMVAEVPADALAEEAPIYHKPSQEAAYFAEFQQMKMETPKVENYKETLFALLQQPTIASKEWVYDQYDYQVRTSTVVTPGSDAAVVRVRGTEKGLAMTTDCNSRYIYLDPEMGGKIAVAEAARNIVCSGGEPLAITDCLNFGNPEKPEIFWQIEKSVDGMSEACRTLQTPVIGGNVSMYNERSGEAVYPTPTVGMVGLVHDLKHVTTQEFKQAGDLVYIIGETKAEFGGSELQKMLHGKIFGQSPSIDLDVELKRQKQVLAAIQAGLVQSAHDVAEGGLAVAISESAIGANGLGATVKLDGEATAALFAESQSRFVITVKRENKEAFEKAVEAIQVGEVTNTNEVTIHNEENEVLLTANVDEMRKAWKGAIPCLLK >NC_016771|320328:328701|325558_326974_+|WP_000879038.1|DBSCAN-SWA MLAEIKGLNEECGVFGIWGHENAAQVSYYGLHSLQHRGQEGAGIVVNNGEKIVGHKGLGLISEVFSRGELEGLNGKSAIGHVRYATAGGSEVANVQPLLFRFSDHSMALAHNGNLINAKMLRRELEAEGSIFQTSSDTEVLLHLIKRSTKGSLIESVKEALNKVKGAFAYLLLTGNEMIVALDPNGFRPLSIGKMGDAYVVASETCAFDVVGATYIRDVEPGELLIINDEGIHVDRFTNDVEHAICSMEYIYFARPDSNIAGVNVHAARKNMGKRLAAEAPIEADVVTGVPDSSISAAIGYAEATGIPYELGLIKNRYVGRTFIQPSQELREQGVKMKLSAVRGVVEGKRVVMIDDSIVRGTTSKRIVRMLREAGATEVHVRIASPPLKYPCFYGIDIQTRKELIAANHTVEEIREMIGADSLTFLSEDGLVDAIGRPYEGKYGGLCMAYFNGDYPTALYDYEQELLESMK >NC_016771|320328:328701|328113_328701_+|WP_000088580.1|DBSCAN-SWA MSRLAVFASGSGSNFQSLVNAVEEKRLDAEISLLVCDKPEARAVGRAHYHHIPCFAFSAKAYESKEAFEKEILKKLEEYEIDYVILAGYMRLIGPTLLEAYGGRIINIHPSLLPSFPGKDAVGQALEAGVKVTGVTIHYVDAGMDTGPIIAQEAVVVSEGDTRESLQKKIQQVEHKLYVNTVNQIVQSTKEPTVN >NC_016771|320328:328701|322687_323371_+|WP_000666779.1|DBSCAN-SWA MKFAVIVFPGSNCDVDMFHAIKDELGEEVDYVWHDTENLDEYDAILLPGGFSYGDYLRCGAISRFANAMKAVQKAAEQGKPILGVCNGFQILVESGLLPGALMRNENLKFMCRTVQLRVENNETMFTSQYEKDEVINIPIAHGEGNYYCDEETLKQLEENNQIAFRYVENPNGSVSDIAGIVNEKGNVLGMMPHPERAVDELLGGAEGLKVFQSILKQWRETYVVNA >NC_016771|320328:328701|320328_321636_+|WP_000625677.1|DBSCAN-SWA MISRYTRPEMGAIWTEENKFKAWLEVEILACEAWAELGDIPKEDVKKIREHASFDIDRIYEIEKETRHDVVAFTRAVSETPALGEERKWIHYGLTSTDVVDTALSYILKQANEIILKDLENFVSILANKAKEHKYTIMMGRTHGVHAEPTTFGLKLGLWYEEMKRNVERFKQAANTVRVGKLSGAVGTYANIDPFVEKYVCENLGLEAAPISTQTLQRDRHAHYMSTLALIATSIEKMAVEIRGLQKSETREVEEAFAKGQKGSSAMPHKRNPIGSENMTGLARVIRGYMMTAYENVPLWHERDISHSSAERVILPDATIALNYMLNRFGNIVKNLTVYPENMKRNMTRTYGLIYSQRVMLTLIDKGMVREEAYDIVQPKAMEAWETQVQFKELVEADERITSKLTQEEINECFNYEHHMQHVDTIFERLGLNEA >NC_016771|320328:328701|321724_322444_+|WP_001170542.1|DBSCAN-SWA MQKLELLYEGKAKRIYRTESADMVWVEYKDSATAFNGEKKETITGKGRLNNEITTLLFRKLQEVGIKTHFVEKLSETEQLVKKVSIIPLEVVTRNVIAGSLSKRLGMEEGTVLAEPIVEFYFKDDDLGDPLVTEDHIRVLNVASPEQVSVLRDMALQINQVLIDHFASCRVRLVDFKLEFGVTDEGEIILADEISPDTCRLWDETSNEKFDKDVFRRDLGNLTDAYEEILKRLGGISHV >NC_016771|320328:328701|327076_328117_+|WP_001262449.1|DBSCAN-SWA MANAYKQAGVDIEAGYEAVSRMKKHVQTTMRKEVLGGLGGFGGMFDLSKFALEEPVLVSGTDGVGTKLMLAFMADKHDTIGIDAVAMCVNDIVVQGAEPLFFLDYIACGKAEPSKIENIVKGISEGCRQAGCALIGGETAEMPGMYSTEEYDLAGFTVGIVDKKKIVTGENIEAGHVLIGLASSGIHSNGYSLVRKVLLEDGELSLDRIYGRLELPLGEELLKPTKIYVKPILELLKKYEVYGMAHITGGGFIENIPRMLPEEIGAEIELGSWEIQPIFSLLQEVGKLEEKEMFNIFNMGIGMVVAVKEEDAKDVVRLLEEQGETARIIGRTVQGAGVTFNGGTAL |
8 | Synechococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1879589 : 1888919
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_016771|1879589:1888919|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_016771|1879589:1888919|1880967_1881732_-|WP_001194312.1|DBSCAN-SWA MQTNIHSKKETIIFIHGLVGNRRAFKKEHKRFSASYNIITYDLLGHGDDKGEAIEFSLQRLVDQLLNLYEKEGIQKAHICALSYGCYISTIFAQMHPEKVLSICHIGGHYNNPSLLYNVFQKFWEKRGDDYSKWLSQYANTIFPSGILKASPFAVISRNIYYRFGLQLHSSIIAQSLRHRLEFDLKSKLKSLPHPILWVMGEHDHLYKSCLFDLKSILPNVLYKEIPLAGHAANLFRPNYFHDLYARFLNGKLQ >NC_016771|1879589:1888919|1886375_1887095_+|WP_000818985.1|DBSCAN-SWA MAELLQGKNALITGAGRGIGRAVAIALAKEGVNVGLLARSEENLKAVAKEVEAEGVKAVIATADVSSYEEVTTAIETLKNGLGSIDILINNAGISKFGKFLELDVADWEKIIQVNLMGVYYATRAALPSMIEQQSGDIINISSTAGQKGAPVTSAYSASKFGVLGLTESLAMEVRKHNIRVTALTPSTVATDMAVDLGLTDGNPDKVMQAEDIAEFIVAQLKLNKRTFIKSAGLWSTNP >NC_016771|1879589:1888919|1879589_1880870_+|WP_014297774.1|DBSCAN-SWA MKKVIAGLAVASVAGVAVPGMDSAHAQVSNEALKEINGQTQTQTTVTETKTVETKSDLKYTVTADVLNVRSGAGTGHSVISKVKQGQVLQVIGQENGWFKVTVNGQTGYVSGDFVTTGGKTGTTVQQGTGTYTVNVSSLNVRTGPSTSHTVLGSVNKGKTVQVVGEVQDWFKINFNGGTGYVSKDFVTKGGSAVSNQTQQPTTNNNTTTVQTGGSYGVNTGALKVRTGPATYNAVIGGVTNGTVLNVTGAENGWYKINHNGRTGYVSADFVKFVKGGVNNVTNNNNVTNNVQQPGKDVQKPTTGGDTSSIAGFARSLNGSPYRTAGTTPAGFDCSGFIHYVLNQTGHKGARQTVAGYWSSKTKTSNPQPGDLVYFQNTYKSGPSHMGVYLGNGQFISAETDATGVRISSVSNSYWSKHLLGYTKAY >NC_016771|1879589:1888919|1888046_1888919_+|WP_001258509.1|DBSCAN-SWA MRTEKEMLDLIINTAKEDERIRAVIMNGSRVNPHVKRDCFQDFDIMYVVKDIQSFTSNHNWIHRFGEIMIVQMPEEMSLVPPDGDGKFPYLMQFMDGNRIDLTLVPVDLTKKFVGQDSLSKLLLDKDNCMEEFPPASDKDYLIKKPTEKEFLGCCNEFWWCSTNVAKGLWREELSYVKWMLDGPVRDMFIIMLEWHIGMKTDFTVNAGKFGKHFEQYFEGEMWEQFKQTFSNAEYENIWESFFVMGDLFREVANEIANTYGYRYPQDDDDKVTNYLKHVKALPKGSTSIY >NC_016771|1879589:1888919|1883820_1884498_+|WP_000937026.1|DBSCAN-SWA MLPKILIVDDDPHIRELVSVFLEREGFQTYEAIDGLDALQKIDEVKVDMVILDIMMPNMDGFDVCFELRKYYDIPILMLTAKGETSQKVKGFHLGTDDYLVKPFDPIELVVRVKALLKRYQITVSQSIQVGNVLLNRKTFEVTIGEQTVTLPLKEFELLFTLGSKTGRTCSREQLIEDVWGYDFEGNERTLDVHINRLREKFQEEKSKFSIKTIRGLGYRLEVSK >NC_016771|1879589:1888919|1884494_1885568_+|WP_001254317.1|DBSCAN-SWA MRRRERMNKVKILKVIGAVLALFSFLTIIWSIAFYVSSSVINALEIRVSPFVTFLISDMVGFVFIVLIWVLIGVLMRPKREAMIWTIIEPIQKIAKGDFSVKIRNEEKYNGEIGVLVKSINDMTDELNAMEKMRQEFVSNVSHEIQSPLTSIKGFARALQDNNLSEEKREHYLTIIETETTRLSKLSQNLLKLTLLESEEYTPERVTYRLDQQLKQIVLNSEPLWAEKEIELDLDLEKVHITADQESMSQVWINLIHNSIKFTPSSGTISIKLKEYETLVEVRIRDTGIGISEEQKQHIFERFYKADSSRNRAYGGSGLGLAIVKKVLDLHQGEIKVESEEGSGTEFIVRIPNHEEK >NC_016771|1879589:1888919|1881971_1883732_+|WP_041184410.1|DBSCAN-SWA MEVRNEIKKKGSWRQFLRLIQDTNPPKGILVFALFMSLLSTGASLFIPMLTKGLVDNFSLSSISTGQIVGLVAFFIMQTIAAGLSIYLLNYIGQKIVAGLRERLWKKVLILPVSYYDQNRTGDTISRMTNDTGVVKTLISEHLSNLLTGGISIVGSLIVLFVLDWKMTLLLLTVIPLSVLILVPLGRKMYKISKALQDETASFTSVLTQVLSEIRLVKSSNTEKREYETGNKGIEKLLQFGLKEGKVQALISPVMSFVLMALLVIIVGYGGMRVSSGALTTGELVAFILYLVQIIMPMSQLSMFFTQFQKAIGATERINTILEYEVEDHETGVKVTNAKQPIVLENVHFEYNEEEQVLKNIDFTIESGKVTAIVGPSGSGKTTLFSLLERFYEPTSGAIKLGKDTITNYLLQSWRRQIGYVSQDSPLIDGTIRDNICYGVEGEVTDEEIEKVAAMAYVDAFIHDLPNGYATEVGERGVKLSGGQRQRIAIARALLRNPQILMLDEATSSLDSKSESVVQKALNNLMKGRTTLVIAHRLSTVVDADKIIFIEKGNLTGSGTHDELLRTHDMYREFATQQLKIKEGVL >NC_016771|1879589:1888919|1887242_1887914_+|WP_000061722.1|DBSCAN-SWA MSMIEKWTAVDQYMSDVLIPKDSTLEEVLQENATANLPAHDVSPTQGKFLQLLVQIQGARNILEIGTLGGYSTIWLARALPYGGRIVTLEASEKHAEIARSNIERANLTDKIEIRVGLALDSLQQIENEKYEPFDFIFIDADKQNNPAYFEWALKLSRPGTVIIGDNVVREGEVIDNTSNDPRVQGIRRFYELIAAEPRVSATALQTVGSKGYDGFVMAVVKE |
8 | Bacillus_phage(71.43%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2017681 : 2061120
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_016771|2017681:2061120|DBSCAN-SWA AATGATAAAAGATATGCAACCATTTTTACAACAAGCTTGGGAGAAGGCTGGTTTTAAAGAGTTAACTGAAATTCAAAAACAAGCGATTCCAACTATTTTAGAAGGACAAGACGTTATAGCTGAATCTCCAACTGGAACAGGAAAAACATTAGCGTACTTATTACCCCTTTTACATAAAATTAATCCTGAAGTAAAACAGCCACAAGTTGTTGTTTTAGCACCAACACGTGAACTTGTCATGCAAATTCATGAAGAGGTTCAAAAGTTTACAGCAGGAACTGAGATCTCAGGTGCATCTTTAATTGGTGGTGCAGATATTAAGCGCCAAGTTGAAAAATTAAAGAAACACCCGAGAGTGATTGTCGGTTCACCGGGACGTATTTTAGAATTAATTCGTATGAAAAAGCTAAAAATGCATGAAGTGAAAACAATTGTATTTGATGAGTTTGATCAAATTGTAAAACAAAAGATGATGGGCGCTGTACAAGATGTAATTAAATCTACGATGCGCGATCGTCAATTAGTATTCTTCTCGGCTACAATGACAAAAGCAGCAGAAGATGCGGCGCGTGATTTAGCAGTTGAACCACAATTAGTACGTGTAACACGTGCAGAATCAAAAAGCTTAGTTGAGCATACGTATATCATTTGTGAGCGACGCGAGAAAAATGATTACGTAAGAAGAATTATGCATATGGGCGATGTAAAAGCAGTTGCTTTCTTAAACGACCCATTCCGTTTAGACGAAATTACTGAGAAATTGAAATTCCGTAAAATGAAAGCAGCGGCTCTTCATGCAGAAGCAAGTAAACAAGAGCGTGAAGCGACGATGCGTGCTTTCCGCGGAGGAAAATTAGAAATTTTACTTGCTACTGATATTGCAGCACGCGGTATCGATATTGACGATTTAACACATGTAATTCACTTGGAATTACCAGACACAGTAGACCAATATATTCACCGCTCAGGACGTACTGGACGTATGGGTAAAGAAGGAACTGTTGTATCTCTTGTAACACCGCAAGAAGAGCGTAAATTACTACAATTTGCGAAAAAACTAGGTATCGTATTTACGAAGCAAGAAATGTTCAAAGGATCATTTGTAGAAACAAAACCGAAAGCACCAAAGAAAAAGAAACCAGCATTTACTGGGAAGAAAAAGCCTAGATAAAGAATGGGGAAGGCGTAACTATTTGTAGTTACGTCTTTTTTGTTTGTCATTAAATGAAAAAGGAATAATAACAGTATCTGTAGAAAGCTACATAGAATATAAAAATCATTAGGGGGAAATGCAGTGATCCATAAAGTAGGACAAATTATGTTATATGTAAATAATCAAGATGAGGCAGTCAATTTTTGGACGGAAAAGATAGGGTTTCATGTAGTAGCAGAGGAAGATAACAAACAAGGAATGAGATGGATTGAAATCGCTCCGACTAACGGTGCTGAAACGAGCATTATACTACATAACATGTATTAACCCAAACAAACCCTTTCAATACAAGGTTTGTTTGGGTTTTTTATATAAAATGCAAACATTTTGCAAACATTAGCTACCCAAAGATACTTTTACCAAAATTTTTCACTGCTTCTTCCTGCATGTTCGGTAAAACATGAGAATAAACCCTGAGTGTCAATGAAATGTCTGTATGACCTAATCTCTCACTGATAATTTTCGGGTTAACTCCTTGTTTCAATAATATAGTTGCGTGTGTATGTCTTAAATCATGGATTTTAATTTTCTTCACTTTTGCATTGTTTATTTCTTTATAAAACTTTCTCCTAAAAGCATCTCTCTTTAAAACCCCACCCGATTCATTACAATTAATTAAATCTAAATCTTGATAAGCAGAACCCATTCGTAATTTCTCTTTATTAATTTGTATTCGATGTTTTTTTATTGCTTCTATTGTTTCTACGGGAACAGGGATTGTACGTTTTGATGCATTTGTTTTTGCGGTATTTTTAACTTTATCATCACCGCCAACAGTTTGATTGATGGTGACTGTATGATTTCTAAAATCAACATCCTGCCAACGTAAGCCTAAAACTTCTCCCAAACGCATGCCTGTAGTAATTGCTATTAAGTAAGCAATGTGATATCGTGATTCTTGTGAATGTAATAAAAAACGTTTTACTTCTTCCTCTGTCCACGTCTGGATGGAGGTTTTTTCTTTTTTTGGTATCTCCACAAAATCAGCCGGATTTCTAGAAATAATATTTTGTTTTACGGCTAAATTTAAAGCTGTTTTTAATATCCGATGCAATAGGAGTATAGAATTATTTGAAACACCATTATCCAGTGCTGACTTATAGCATTTTTGAATGTGAATAACATTTAATTTATGAAGTGCAATCATTCCTATGCTAGGTATAATATGATAGGTTATATTGCTACTATAAGAACTGAAGGTACTCTTTTCTACACACATCTTTTTAATTTCTAACCACTGAACCAAGTAATCCTTTAAAGTGATCTTAGACGGCTCCACAAAAGTCCCTTCATTCAACTCAGTAATTTTTTTTGCTACATCAGCCTGTGCTTCTTTTTTTGTCTTATAGCCAGAAAACCACTTCTGTCTTCTTTTTCCTGTCTCTGGATCAGGACCGATATCAATAACGATACAGTACTTATTTCCTCTTTTTCGAATATGTCCTTTCACTTAATACACTCCTTCATTTTGTTTTGAATCAAGTTGTGTAAGTCTAGTTGTATTTTTGCTGCTATGAAAATTACATGTTTGGACATATCAGCGATGGATATATTTTATCATATTTAAATTGTTATTAATGAATAAAAGTATCCGTTAAGGTAATTTTTATTTTCTTAAAATTGAGTCGGATTAGCAGAAGTATCTTCTTCAAAATGTTTCTCAAGTTTTATTTGTCACTTAACAGAATACATGTTTGTTTACTTATGATAATATACGCTTATAGAATAAATTAAGAAGGAGGACTAGTGTGAAACCGCTACATATTGAAGTTTGTAATATGATTGAAGACAATGAGAACTTAACGTTTACGGATGTTGCAGAGTTACTCGGAGTAAGTATTCAATATATATCGAAATTTAAGAACAAAGGGATAATAGGTTTTTGTAAATTGTTGAAAATTTCTTATATATTAACTACTTCCGCCGAAGAGCAACGCAAAGTTATGTCAGATTGGTGTTTAAAATTGGAAAAAACAGAAGCGATAAAACAAAGCTTTGAGTATGCAACAATTACAAGAAATATTTCACTTTTAGAAAAACTTCTAGGAAAATATAAACATGAAAATGGAACGATTAAAGAATATGTATCGGTTTATAAAATATTGTATAACTATATAACTAATGAAATATCAGGTGATAAATTAATCGATGAAATACAAACAATAGGTCTCCCAACTGATTCGGACTTGCGTATTTTAATGAATATAATGAAGTGTTATAATTACTACTTTTCTAAGGAATTTGTTTTGATGTTAGGAGTTGCGCAAGAAACGGAAAAACAAATAATGAAGTTGAAAGGTGAAAGAAAATTATTTATAAAGCAGTGTTATATACACCGGATTGCCGAAGTGTTAGGACCTGCATATTTACGTTTAAATAACTTGGAAGCAGCGCGGCATTATGCATACATAATTAAACATGCTAATATCAGTAAAAAAATGCTTTCTGATGCTTTGTATATTATAGGAATGTCACACTTGACGGAAAATAAAGAACAATGCATTAATTTCTTGAAGAAAAGTTATAAAGAAGCTAAAATGATAAGTGAGAAGCGGTTAGAAGTTGAGGCCAAATGCAACTTAAAAATGGTAGAAATGTATTATGAATTAGTGGATAGTGACTGTGTTAAAAGCATGAATTTTATAATGAAAATGGAAGAAATGTTTTATCAAAGAGAAAATGAAGATTTCATAAAATTCTTTAAAGCTGCTTGTCAAGAAAGCAATATTGAATTACATAAGTGTTTACGTGAGTTTTTTACACAATCCAATTATTTATTTTCCAGCTTAATAGCTAAGGAATTATATAGACGTGGTGAACAATCTATGGTTATTGAGTGGATGATTGATTTTAAAAAAGAACAAGGAGATGGATATTTTGAAGAAGATTCTATTGATGTCTTTCATGGTATTATCACTAGTAACAACAGGTTTAGCAAATGATTATAAAACAGTAAACAAAAGTAGCATTGACAAAATAGCTTATATGCAAGTTGATATTAAGCCAGGAGGCTAAATGAAAGTGAAAATACGATCAAAAGATCGTATTTTTTTGTTGAGCTCACATACATACTTGCCAAAATTCAATAATTAAAATTTAAGTTAGTTTAGCTTTCTTTTGGTAGAATTTTGTTAAAATTAACTTATAAATCAGAAATATCTGTGAAGGGGAAGGCTATAATGAAGGATGAGAAAAATGTAGAGAATTTACTATTAGTTAAGAAAGCTTTATTACTTGTAGGATACAAAAAAAATCGCAAGGAAGAAGTATTGAATATGTGCTTAAAGAATGTAAAAGTAAAAAAAATCATTTAAAATAGACTATCTTTTTATTTTGATAGTCTATTTTTATTAGTTATTCCTCTTTGTTTTTTCATAATTAACAAACATCTCCAACTGTTCCAATGCCTTTTTGCGTTGTTTTTCAGGCAAATCATTAATAATTTGAAGGATTTCTTGGGCTTCTTTTGTAAGTTGTAGATCTTGGTCTGCTGTTAAATGTGGTGAATCAGATACTCCTAATAGATAATCAGTAGTAACTTTTAAATGTTTTGCTATCTTTTGTAGTGTACGTATACCTGGTTTCTTTTTTCCCTCAACATAATTATAGACCGAAACATGGCTAACACCAATCGCATCAGCTAATTGTTGTTGGGAAATACCTTTTTTATCAATCAGCGATTTCAACCTTTCATGATTAAACATATTCCAAGCTCCCTAAAATTTATTTTATATTATGTAATAACATGCTCATTTATTTTATATTACCTCACTGACATTATATATTA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61 | Bacillus_phage(96.55%) | head,portal,terminase,protease,integrase,tail,capsid | attL 2051046:2051061|attR 2056125:2056140 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2593677 : 2602020
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_016771|2593677:2602020|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_016771|2593677:2602020|2600419_2601805_+|WP_000714650.1|DBSCAN-SWA MKKFSLLLTAFVMILSLFIPNLTSARSFPDVQSNHWAIKEINYLSDKGIIKGTPEGTFKPSDDVTRGQMALMLDLSLKLEKPSSYNHIFSDVAKGIYYYDSVHKLAHNNIVQRETNYFPDRSLTRAEMAKVLVKTFDLKPTGADVNFPDVPSTHWGYNYVKILAQNNITTGLPDGTFGPGVKVTREQFAAFLARVLEPNFRPALPKPKGELEVHYIDVGQGDATFIKSPSGETILIDGGNNGKGKVVADYLKGLGFQTIDYMIATHPDADHVGGLDEVLYSMNVKNVYAPKVSHTTQTFKDFLTAVANKGLTIKEAKSGVTLPINGLNSQFLAPVKEYGNDLNEWSAVLKVTHGSKSFLFTGDAESKSENDMVETHGSNLKSDILKPGHHGSKTSSSQPFLDAVKPSIAVISAGTGNRYGHPTQETLAKLNAMSVKVYRTDLNGTVIITSDGSNISVRTER >NC_016771|2593677:2602020|2593677_2595045_-|WP_000795732.1|DBSCAN-SWA MKNQFLKQLQNMKMNKKSLGAVALTAGIIGTTLIPQNAYAHGFVEKPSSRSALCSPTYGALNVNCGSVMYEPQSLEAPKGFPQTGPVDGQIASAGGKFGGILDQQTADRWFKNTITGGENTFTWKYTAPHLTSKWHYYITKKGWNPNKALTRADFEPIGTVQHDGSAASNHLTHKINVPTDRSGYHVILAVWDVADTANAFYNVIDVNLINDVKPDTEAPSIPNRIQAQKVTANSIELAWNDSTDNVGVKGYQIFRNGEMIDTVPGTHFIDKKLQPSTEYSYTIKAIDAAGNVSKESATLTVKTTVEAPDTEAPTQPKGLHSMGTTASSVDLMWSPSDDNIGVDHYDIYRETKGSMEKIATSNTTSYMDKYLLSNTTYKYVVKAVDVAGNESVQSDIFIITTKTESVSYEEWDAKKAYEKGDKVLHEGKVYEAVQSYKGNGDPNWIYALSLWKTV >NC_016771|2593677:2602020|2598485_2599193_-|WP_000655489.1|DBSCAN-SWA MKDTIKDTYDKLASTYKENLDVANPYNSYYERPAMMEMVPKKLEGKSILDAGCAAGWYTSQFVERGANVTAIDVSYEMVKAAKESMGDKATFLCHDLQEVLPFEDHTFDVIVSSLTLHYLENWNQVFQEFRRVLKPGGEFIYSIHHPFMDFTKFTCKNYFEKQLLVDTWVKPNITIEVEFFRRSLQDIINETTNYFMLEKMVEPRPVKKMKEVNEKSYYYLNTNPHFLIVKAVNK >NC_016771|2593677:2602020|2597508_2598012_-|WP_000720544.1|DBSCAN-SWA MKKIILIGSGGSGKSTLAKQLGNKLNIKVHHLDVLFWKPNWEGVPKEEQRTVQNELVKEDEWIIDGNYGGTMDIRMNAADTIIFLDIHRTICVYHAFKRVVQYRNKTRPDMGAGCEERFDLQFFKWIWEYPNVKRPTIIKKLEQLPEEKKVIVLKSSSEVRKFLERI >NC_016771|2593677:2602020|2601807_2602020_+|WP_000820162.1|DBSCAN-SWA MKRGIIDRFEGELAVIEVNNITMDVPKSKLPSTAKEGDVLIIEGDTYTIDKDETDKRRREIQDLMNKLFE >NC_016771|2593677:2602020|2598033_2598420_-|WP_001093431.1|DBSCAN-SWA MNTKRNRLLYAMFTILVIILGLSSRKFAFALPALLNDYLGDALWALMIFIGFGFLFPKIETKKLAFISLMFCYGIEVSQLYHAEWIDSIRATTLGGLVLGYGFLWNDLVAYIIGVGVGMFCEFMLRNK >NC_016771|2593677:2602020|2599214_2599568_-|WP_000648514.1|DBSCAN-SWA MKATRAYCVSKRKATEDSPDGWNATCMRLNNKIFAILNHEEGEKATITLKCDPELALRLREEYPETIIPGYHMNKKHWNTVYIHKDVEQVQINKMIDWSYDLVLQSFSKRKQQELLD >NC_016771|2593677:2602020|2599581_2599989_-|WP_000288952.1|DBSCAN-SWA MYTYKLQHDQPICAGKIKMLYNSVGWWPERKEIDIEKMLKNSIAIGVWEENELIGFARVVSDGVFRAYIEDVVVHERVRNKGIGEKMLTMLLEEISHIDIVSLFCGEKLIKFYGQQQFQATKQIVMHRNQIVKEI >NC_016771|2593677:2602020|2595402_2596596_-|WP_000124904.1|DBSCAN-SWA MARVLFINTGSEGHINPTLQVVEELVSRGEEVVYFSIEAFRERIEKTGAIVRTIDDQRFIKAFLSGGRNYLQERINGLLHTADVIIPSVLEQIEGEHFDYMIHDSMFGCGRIIAQILKLPAINSCTSFAQDEKSFQQMLDHLSKSIPVKVQERIHNDFERLTKEVAEKYSVEINSPYEVFCNPASLTIVYTIKEFQPFGDMFNETFKFVGPSVPAQVKNEDFDFTSIEEKSPIYISLGTVFNEALDFYKLCMKAFENSEHTIVMSIGNKTNISDLGEIPKNFIVKNYVPQTKLLAYTKLFITHGGMNSTHEGLYNGIPLIVIPQSADQPVIAKQVENLGAGIKLSMKELTVEQLRESVELVLNNPSYKEVAWNLKESFLKSGGYQEAADEIFTFIGQ >NC_016771|2593677:2602020|2596681_2597362_-|WP_001058134.1|DBSCAN-SWA MNNDLIQRINSLMVNIPKGEVVLRDDRIKKEWQVQIKPFLLAKYVVTMELYDGIINSTCNDYKNSNKPVVNISWHDAITFCNSLSKTAGLTEFYSIQDDGKKVSCNLHSNGYRLPSEAEWQYACKADTPGYTYGELQKIAWYNENSNGQIQDVGKKEPNAWGLYDMLGNVWEWCYDLYDEKVYGSYRIFRGGSWAEEARGCGATCRRRSHPTFHIDDLGFRLARSI |
10 | Geobacillus_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
3654357 : 3735376
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_016771|3654357:3735376|DBSCAN-SWA 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98 | Bacillus_phage(58.93%) | head,plate,portal,terminase,protease,integrase,tail,transposase,holin,capsid,tRNA | attL 3705026:3705042|attR 3733326:3733342 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
4670011 : 4725804
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_016771|4670011:4725804|DBSCAN-SWA CATGCATAATAGATATGTACATATATTAGAAAGCGGTGAAAATATGGTTTCAAATACTGTAATTGCCAGCATCATCTTTCAACTCATTGTCTCGATTCTGGTCCCAATTATTGTACTCGTTTATTTCCGTAAAAAATATAATATAAATTGGAAAGTAGTCGGCATTGGTGTTCTTATCTTTATCGGATTTACCCAAATTCTCGAAACACCATTCCACCTATTTATGCGCGGTAATCCAGCAATCGCTCCAATTTTAGAAAATCCATTTGTTTTCGCACTTTATGGCGGACTAACTGCTGGTATTTTTGAAGAATTAGGACGCTTCGTTGCCTTCTTCTTCCTACTAAAAAAATATCAAGAATATAAAGATGGCTTTGCTTACGGAATCGGTCACGGCGGAATTGAATCCATTTTAGTTGGCGGATTCTCTGCATTCCAAGCACTTATATTTGCGAATTCAATTAACAACGGTAGCTTCGCCCAGATGGTCGAAAAAATGCCAGAACTAAGCCGCCTACAAGACATGTTAATTCAGCAACCTGCCTACTTATACTTCCTTGGCAGCTTAGAAAGAATTATGGCACTCGTGCTGCAAATCGCCTTTACAATGCTTGTTTTATACGCAGTAAAACAGAAGAAGTATATCTTCCTTGTGTACGCTATACTATTCCACGCACTTGTAGACTTCTTCGCGGCACTTTACCAAACGAAAACAATTAACATCTTTGTTGTAGAAGGAATTACCCTTCTCTTCACAATCGGTGCTATCATTCTTATTCGTAAAATGAAAGAGAAATTAATGAGTGTGCCAAAGTAAAAATAACCCGCCTGTTGGTGGGTTATTTTTTATATGGATTATCATAGTGATGATAACTTTTGCCACTTTGCAGCTCCTTCTTTGTTTCTGCATCTATAACGATGTACTTGTGTAACTCTTCTACTTCATTTTGAGAAAAGGAAGCGAAAAAATAAACTTGGCGATCAGGGTGAATAAATGAATCTTGAAGCACCACTTCACCCCGACAACCCGCGGCTGTTTTTTGTAGAAAGGAAAATTCTTCGTCGGGTACTTCTTTAAATAAAATCTTTTTTCGAACACTATACGCTGCATTATTGTATTCTTTATACATTTTCTTATCTAACTGTTCGTAAAACACATCTTCGCTCACAAATGGCTTATTTCGATTACTTGGATAATCTAACTTTTGATTGGATTGTGCATATGTTGTGGACAGTTGCGTAAGAAAACAAATCATGAATACGAGACATATCATTTTTTTCATACTGGCACCTCAATTTTCATTATCCACATTACTTTTCCACATCTATAAATCAATATGCCGTTTCCAATAAAAAGGAATTTTTTCCGCATTTGTCGAAGTATATAGCGTCAACTTGAAAGATGGGGATGAATTATGAAGAAAATCATTGTAATACGACATTGTTCAGCCGCTGGACAAGAACGTCATGCCGAATTAACGACCGATGGAAAAAAACAAGCAAACACCCTTGCTACATTCCTTTTAGAAAACCAACTACAAATAGATCATATTATTTCAAGCCCATTTGTGCGAGCTATCGATTCTATTCGGCCCTATGCACTCCAAGCTAATTTGTCTATCCAAGAAGATGAACGCTTAGCTGAACGCATATTAAGCGACGTTTCAATGGACGATTGGATGCAAAAACTAGAATCTACTTTTACAAATATAGATATTGCCTTTTCAGGCGGAGAGTCAACAAAACAAGCAACGGACCGTGCTATATCGCTTATCGAAGACGTTTTAAAATTAAACCATACTACAATATTACTCGTTACACATGGAAACTTACTTACGCTCATTTTAAAGCACTTTGATCATACGATCGGCTTTCATGAATGGAGAGCTTTAACGAATCCTGATATGTACGAAATTACAATTGATGAACAATGTAGCCTAAAACGATTATGGAAAGCACCGTCCAAGTAATATCTCTTTCCAACACATTCAGTTGACGCCACGAGAAGAAACTGTACTAATAATAGAAAGGGGTATCACTCCATATGTACGAAGATGTACTTGCTTTACTACATAAAACAAATGTTTCTTATGAAAAATTCGAACACGAACCGGTACTCGATTATGAGACAGATCGGATCGTACGCGAGAGGCTTGGCCTACAAGGTACTCCAAGTAAAAGCTTATTTTTAAAATCAAAGGCTGGAGATTATTACGTATTTTTCACGTTAGAGGGCACAAGGCTTAACCGCGGAGAGATGAAAGAACTAACAGGAGAACGCTTATCTCTCTGTTCCGCTGATGAACTGCGAGACAAAACTGGTTGTACGCCAGGATGTGTAGCTCCTTTCGGGTATTCACACGATGTAACAATTATTGTGGATAACGCTATTTATACGTACGATAAAATTTTAATTACACCTGGTGTACCTGAATTTACAATTGAATTATCCACAGAAGAATTAAAAAAGATTTTATTAACATGTTCAAATACTGTTTTGGAGTACAAACAAAAAGAGAGCTAATCATTAGCTCCCTTTTTTCATTATTTTGCTTCTGCTGTGTTTTCTTTTGCAGAACGAACTTGCTCGTCCGCATGGTAAGAAGAACGCACAAGTGGGCCAGCTTCACAGTGGCTAAAGCCTTTGCTAAGTGCAATTTCTTTTAGCTCTGCAAATTCCGCTGGTGGGTAATATTTAAGAACTGGTAAATGCTTCTTAGATGGTTGTAGGTATTGTCCAAGAGTTAAAATATCCACATTGTTTGCACGTAAGTCATCCATTGCTTCAATTAAATCTTCTCTCGTTTCACCTAAGCCCACCATAATGCTCGATTTAGTTGGAATATCAGGCTGCATTTCTTTCGCTCGACGTAAAAACTCTAATGAACGATCATATTTTGCTCTAGCGCGAACTCGGTCAGATAATCGACGTACTGTTTCAATGTTATGGTTTAAAATATCTGGTTTTGCATCCATTAACATTTTTAAGTTTTCTTCTACTCCACCCATATCAGATGGTAATACTTCAATTGACGTAAATGGATTTTTACGACGAACAGCGCGTACTGTTTCAGCAAAAACAGCTGCTCCCCCGTCTTTTAAATCATCACGTGCAACCGCTGTTATAACAACGTGCTTTAAGCCCATTTGTACTACAGAATCTGCTACGCGTTCTGGCTCTTGTAAATCAAGCTCAGTTGGTAAGCCTGTTTTAACCGCACAGAAACGACAAGCACGTGTACATACTGCACCTAAAATCATGAATGTTGCTGTTTTTCTTACAGCCCAGCATTCATGAATATTCGGACATTTCGCTTCTTCACAAACTGTATGAAGATTCTTAGAACGCATCATTTTCTTTAAGCCTGTATAGTTTTCATTCGTGTTTAACTTAATTTTCAACCATTCGGGCTTGCGCTTATATTCTGTTTGTTTTGTCATGGTTATCAACTCCGCACAATATGAAATAGTTTACCGTGTTCGCTTCTTTCAATGTAACATATCTATTCTAACGTATGAAAGCGATTTGCTCAAATGAAGATTCTAAGATTTTTTCCAATCGTTCCCTATAATGAAATACTCCGTATATCCCACACTAAAAAGAGTGATGATGTGAAAGGAGTCTATTTCATGCTTCGAAAAATTTCTCTTTTGCTTTCGATTTGCTTTCTTCTCCACCAAAACATCGCTTACGGTGAAGATAATCAGCAAAGCATATACGAAAAGCGCATGGCACTATATAAAGAAACCGAGCAATCTTCAGGCATTCCGTGGTATTACTTAGCTGCAATGGATCAATACGAAAGAAATATACGGAGCGTAAGAAAAGATATTCCGAAAAAACCAGATGCCATCATTTCCCTTTATTTCAAACCAGAAATATGGGCTGGACCTGTTAATGGTAACGACACTCTCCCCCATACAATTGCTCTATTTGGCGGGTTAGGTTTAGATGGTGACAAAGATGGATTTGCAAATGCAAATAACGACCGTGATCTTTTGCATACAGCAGCAACGATTTTAAAGAAACAAGGAACGTCAGAAGAACGCATTAAAATCATGCTCTGGGAATATTATAGACGTGCAAAAACAGTTGATTTAATTACCGAATACGCCCAAATTTATAAACATTACGGACGTATTAATTTAGAAGGAAATGCGTTCCCTCTTCCAATTCGCAGTGACCATAGCTACCGTAGTACTTTTGGCGCTGGAAGAAGTTTTGGGGGAAGAAGGGTTCATGAAGGAACCGATATATTCGCAGGCTATGGCGTACCAGTAAGATCCACTTGCTATGGCATTATTGAAACAAAAGGCTGGAACCGCCTTGGCGGATGGCGCATCGGTATTCGTGACCTTCATAACAATTATCATTATTACGCTCACTTAGGCGGGTTCTCAAAAGAGATACAGCTTGGACAAATTGTCGAACCCGGAAAAGTAATCGGATTTGTTGGTAGCACCGGTTACGGTCCTCCCGGCACAGCTGGAAAATTCCCGCCTCACCTACATTTCGGCATGTATAAAGACAATGGTTATACAGAATGGGCTTTCGACCCCTACATGCACTTAAGTCTTTGGGAGCGAAAAGAACGCGCAAATACAAAACGATAACCGTAGCACATTGCTACGGTTATTTTTTCTTTATGACTAACTATCCGTTTTCTTTTTATCAGGTACAACAACACTTCCGCTTCCGTAATAAGTAGGCACTTCCCCTTGAACAATGCGCGTCGCAATCGGAACATCTTGTTTTACTTTTATTTCTTTCGTATGAAATGGAATAACCACTTGCAACGTGACTTCCATCTCCATAATAATTTGAATCGCTGTCGTATTGATCCCGTGCGGCTCAATTTTTTGTTTAATATCCGTATTTACATGACCAATCGTTGTGAAATCAATTGGAATGTCGGGTCCTATATTTCCAAGAAGCGCATTATTCGTTACACGGCCAAACGGAACTGTCATCGTTGCCCCATTTTTTTCAGAAATACCTA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59 | Bacillus_virus(16.67%) | transposase,protease,coat | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
143613 : 198535
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_016792|143613:198535|DBSCAN-SWA 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50 | Bacillus_phage(33.33%) | protease,integrase,transposase | attL 144540:144555|attR 173518:173533 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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