Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_017043 | Rickettsia montanensis str. OSU 85-930, complete genome | 0 crisprs | DEDDh | 0 | 0 | 1 | 0 |
1. NC_017043
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0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
104987 : 167221
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_017043|104987:167221|DBSCAN-SWA AATAAATAGTAGTACGGAAGCAGGGGGCGTTTTAATATTACAGACTTTATATAACAGTATCATCACCGAAATAAATGCTAGATCACCAATGAGGCAGTTAGCTTCGATTGAAACAATTTCTACGAATGCACTTGATATAATAAGCGAGGATGGCAAATTTAGCAGTGGCTAGATTGGGGAAGTAGAAGCTCGAGAAGAGACTCCGGCAACGAAGTTAAAGCAGCAGCGTATTTTTGTTCATGAACTATATGCACAGTCTAAAGCTAGCCAGGCATTACTTGAGGATACGACTATTAGAGTTGAAAATTGGTTCGGTGAAAGATTGCGTGATAGTGTCGTTAAAATGGAAAATAATGCGTTTATCAATGGTGACGGTATAAAAAACCTAGAGATATTTTATCACCTGACCATGATAAAATCGAGAAGATTAAGATGGATAATAAAATTACCGCCGATGGGCTGCTTGATTTTATAAACTCCCTTAAAGAAGAATATTTAGTGAATGCAACTTTGCTCATGAATCGTATTACTTTATCCGAAATTCAGAAGCTTAAAGATCACCAAGGACGTTTTATTTGGCAGTCTTCACCATCCGATTCCTTTAAACAAACTATATTTGGAGTACTGGTAGTTTGTAGCTCCGCTATGCCTCCTATAGATAAAAAGGGCAATGCTATAGCGATAGGTGACTTTAAAGCAGGTTATAAAATAGTAGATAGAAGCGGTATTAATATTATACGTGATCCTTACACTGAAAAGCCTTTTGTAAAGTTTTATGCCGTAAAGAGAGTAGGAGGTGATGATGTGGTGAACCAAGAAGCTATTAAGAGTGGGGTATTAATTAGATATACTTGTATGTCATTCCTGCGAAGGCGGGAATCCATGGTAAAGCGAGATAAATCGAGCTTTTAATATTAAAAATTCAATATATTTATACCTTTTTATTATGTCACTGAATTCCCGCCTTCGCGGAAATGACATAAACGATCCATGCAGGCAACGCCTACAAGTGAGCTAGGATGACATCTTACTTAATTTAAAAGGTAATAAAATGACAAAAACAGTCGTTAAAAATTTTCAGCATCAAGTTAAATTTTTAAAAAATATCGCAGGAGAAGAAATGGAAGAGGATAGATGGGTAGAGAAATTAACAAGCTATGCCGAAATTAAACCACTATGTGATAGTAAATTCCTTGCTCTAGAAAATATAATCTTAGGACGTATAATAACAGAAGGATATTTTTTATTTAAAATAAGATTTATTAAAAATATCACTACTAAAATGCGTATTTTATTTAAAGAACGGGAATTTGAAATTAAACGAATTATTAACGTTGAAGAAAAGAGTAAATTTTTAAATATAATAGCGTTGGAAATATATGTATCATGATTTTATCTATAATTTGCAGCTAAGTTTGTATAAATTACTTATAAACGATAATGAAATCAAAACTAAAATTAATAAAATATATTTTTCTGTTGTTCAGGATGCAAAATGTCCGTTCTTACTTGTTAATATATTGAATGTTAATAATATATCTACTAATGTACAAAATATAATGCAACTGGAATTTGAAATATGTATTTTTACTAATGATAAAAACCGTAATATTGCTCTAAGCCTTGCTAGTAAAATAAGCGATAAAATAGAACATCACTCATTTGAAAATGTTGCTGGTATAAAAACAAATAAAATAGAATTTCAAACTAGCCAAGACTTAGTCAGTACAAAACTGGTAATGAATTATCAGGCATTATTAAAGCAAAAAATAGGAGTATAAAATGCATTTAATCGCAGGGCTAGATATAAGTAGTCTATTAAAATCAAGGAAGAAATTCAAAGAGTTTCGTAAACATTTAGATACATACTGAGCAGAATAAAGCCGGCAGTATCCAATCTTTTGAATTTTGTTATGAACTAGCTTGGAAAACAATGAAACGCTTTTGTGAAAAATCCGGCAAAACACCTTATATTTTAAAGGATGTATTTCGGGAAGCAGCGGTTAGCGGGTTGATTTCCGACCCTAGAATATGGTTTAAATTTATAGAGATTCGTAACATTACGGTTCATACTTATAATGAAAAAAATTTAGAACTAGTAATTAGTATTTTTGATGATTTTTCTGATGCTTTAAATGAGCTTATAAATAATTTGGAGAAATATAGTGGTTCAGATTGAAAAGCAAGATTTGTTAATATTACGTTCTATACTTGGGAAATATCCTTATAAATTTTATGCCTAAGGTTCAAGGATTAAAGGTAATGCAAAAAAATTCTCCGATCTTGATCTTTGTATTTGATATTAATTATGAAGTTTTGCTTGAAATTAGGGAAGCACTAGACGAATCTGATATATCAATACATATAGATATAAAAAGATGGAATATAGATATGAATGAAGATTTTCGCTCTTTAATTAAAAATGATCTTATCCTTTTTAATTAACAGCTCAGGTATCTTATGAATTTTCACGATATACGCATGCCGGAATTTATTGAAAGTTTTGCAGTTGGGAAGCCGGAATTGTCTACTTCTCACGCTATAACTAAATCCGGTAGAGAAGCAAGACATTTAGATCGCAACTATGACTGTCAGAAATATTTAATCAAAAATGCAAGGTTAAGCAGTACGGAATTTGAGCAATTTAATAGCTTTTTTAAAGCAAGACGTGGAAGTAATTTTGCTTTGAGATTTAGGAATTATGCAGATTATAGAGGCATTAACGAAGTTATTGCTAAAGGGGACGGTAATTTAAATAAATTTCAGCTAAGGAAGATATATAGCGATCCTATTGCTCCTTACGAACGAGTTATCACTAAACCGGTTAATAATAGTGTAATTCTATATATTAATAATGTAAGAACTATGGGCATTGTAGATTACAACGATGGTATAGTGACCTTACCAAGTCCCTTAGGTCAAGATGTAATTTTAACTGCTGATTTTACTTTTGACGTAGCAGTTAGATTTAGTATAGATAGCTTTGTAATGACGGTTCTATAGCGTTATCCAACATAGAGTTAGTGGAGGGATTATATGAGTATTGCGATTGAAGAGGTAATTACAAAGCTTACGAATTTTGTTTATTGTTTTCAAATTGAGCGAGCGAGCGGTGAGGAATTACACTTAACAAATAACGATCATGCTATAAAAAGTGAAGAGAGAGTGTTTTTACCGAATTCCGGTTTAGATTTAAAAGAAGCGGAATTTAACGATTCCGCACAAAACCATATATAATCATTGAAGGTATTTTTGAGGAAAACAGCATTACGACGACAATGGACTTAAATAATGCTATTGTTAAAATAATAATACATACTGACAAGGTTTTTGAGCATTTCGTTACATATTATTGCACTTTATATACAAAATACGATTTAAACTTTAAAATACATTTAAAACCCGAAACGGTAAAATATAATCAGACTATAATTAATCGATATGGCAAAACATGTAGAGCAATTTTCGGAGATAGTCAATGTAAAATAGATAAAGTTTATATAGTGGCATATATAAGGTTAAAGAAATGCTCAAGGAAAGTTTAAAAATACTAGATTTAGATAAAGAAAACGGCTATTATAACGGCGGTCAAATTATATTCAGCGAAAATTGTTTTAACAGTAAAGTTCTAAGCAATTTCGGTGATTTGATTATATTAGAGGATATTATACCGGATTATGTTAAAGATGCCGAGGAAGTAAAAATTACTGCCGGATGTGATAAAAATTTTATAACCTGTTGCAATAAATTTAATAATGCTATAAATTTTAGGGACAAACCGCTAATGCCAAAAACAGATTTTATAAATTTAGTATAATCAATGAAACAAAGTTTTATAAAACTAGTATATGCAGAGCTAAAGAATATAATAAATATGAAAAGCTCCAAACAACAGCAAAAAAAAGAAACGCAATTAATTGATTATTTTAAAATAGTTGAAAGTAATATATCATATACATTTCAAAAAATAAAAAAGAAATATGAAAGAGACTAAACGTTTTTTTAACAAAAATAATAGATTAAATAAAGGTTATGCTAAGACTTTTAGTGTAAACGAACCTGATAATAATTTTTACCGTAAAAAATTTGAACATATATTACCGCCAATTGATTTAATCAGTGAGTATGAGAGTATTTATCCCGGTACTTTACAGGAATTAATGCATATGGCACAAAAAGAACAAGCTCATAAGCATGCTATAGACCTAAAAAACTTGAAAATACAGGCAAGAGTCGCTAAATTAACACGAATCTGTTTATTAATATTTGGAATTTGCCTTGTAGTTTCAATTTTTTTAAAAGCTTTCTAAATAAAATTAAAGATAAAATATTTTATTTACTTGTAATTTTAAATAAAATAAGTTAAATGCAATATATATTTATTTATAAACATAATACGGAGAAATTTTATTTCTAAAAATAATTTTCCTAAGGCTAATAGAGAAATCAGAGCTAGAGAAGTTCGTTTAATAGGCGGAAACGGCGAAATGCACGGCGTCGTAAATATTAGAGAAGCATTAGATATGGCGGAAAGAGCCGGTCTTGACTTAGTCGAGATATCACCGAATGCTGTACCCCCTGTCTGTAAAATTCTAGATTTTGGTAAGTTTAAGTACGAAAGCAAAAAACGTTTGCATGAAGCACGCAAAAAGCAAAAAATCGTCGTACTTAAAGAAATGAAATTTAAACCTAATATTAGTATAGGTGATTTTGAAACTAAGCTAAGAAAAATAAAAGAATTTTTAAAAGACGGAGATAAAGTAAAAATTTCTTTATGGTTTAAGGGACGAGAGATTCTTCATAAAGAGGTCGGTCAAGAACTATTTAAACGTATAGAAGTAGGGCTCGAAGGACTCGTTAAAATCGATCAGCATGCTAAAATGGAAGGTAAGCAGATGATAATGATCGTTAGCCCTGATATTAAGGTGCAATAGCTACTCAAATCGTCATTACGCGCGAACGTAGAGAGTGTGACAATCTCAGGAATTTTACTGTTTCAT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60 | Agrobacterium_phage(25.0%) | integrase,head,transposase,capsid | attL 111306:111342|attR 170267:170303 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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