Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_018510 | Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid pBTHD789-3, complete sequence | 0 crisprs | csa3 | 0 | 0 | 7 | 0 |
NC_018516 | Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid pBTHD789-1, complete sequence | 1 crisprs | NA | 0 | 2 | 1 | 0 |
NC_018511 | Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid pBTHD789-5, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NC_018517 | Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid pBTHD789-4, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
NC_018508 | Bacillus thuringiensis HD-789, complete sequence | 3 crisprs | csa3,WYL,c2c9_V-U4,cas14j,DinG,cas3,DEDDh,cas14k | 0 | 3 | 13 | 0 |
NC_018509 | Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid pBTHD789-2, complete sequence | 0 crisprs | RT,cas4 | 0 | 0 | 2 | 0 |
NC_018512 | Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid pBTHD789-6, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_018508_1 | 192488-192563 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_018508_1
|
1 spacers
spacers of NC_018508_1
>1.1|192513|26|NC_018508|CRISPRCasFinder TGGTGGGCACAATCATAACGGCGGAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018508_1
The CRISPR arrays of NC_018508_1 >merge|NC_018508|1|192488-192563|CRISPRCasFinder ATCATCATCATGGAGGACACAATCATGGTGGGCACAATCATAACGGCGGACATCATCACCATGGAGGACACAATCA >NC_018508|1|1|192488-192563|CRISPRCasFinder ATCATCATCATGGAGGACACAATCA TGGTGGGCACAATCATAACGGCGGAC ATCATCACCATGGAGGACACAATCA
>NC_018508.1|WP_000743027.1|190707_192237_-|cardiolipin-synthase MKKPIVQLLLIFTIVSIVLFLLNTSYISLYTFVGALWSITIVGISFVIFIENRSPQSTLAWFLVLALLPIIGVLLYAIFGRSRWRRKKHLHRSEEQRKLFREILEGRRLELLLTVPLNERSIHLTEVIQKFGGGPAADKTTTKLLTNGDQTFSEILRAIEQAKHHIHIQYYIYKSDEIGTKVRDALIQKAKDGVIVRFLYDGLGSNTLRRRFLQPMKEAGIEIVEFDPIFSAWLLETVNYRNHRKIVIVDGEIGFTGGLNVGDEYLGRSKKFPVWRDSHLKIEGKALYKLQAIFLEDWLYASSGLNTYSWDQFMNRQYFPGKEISHAEGAVQIVASGPSSDDKSIRNTLLAVMGSAKKSIWIATPYFIPDQETLTLLRLSAIAGIDVRILYPGKSDSIISDQASQSYFTPLLKAGASIYSYKDGFMHAKIVLVDDTIATIGTANMDVRSFELNYEIISVLYESKTVHDIKRDFEKDFKHSTEIKWNSFQKRSIKKRILESFMRLISPLL >NC_018508.1|WP_000892989.1|189686_190580_-|MoxR-family-ATPase MLEQFHIHSDLKQQLSTIHEKNKQEAGENAHLIGTKIYKASDNSIIEDAITALLLGKNILLKGPTGSGKTVLAETLSSLFQKPMHSINCSVDLDVEGILGYNTLQTKDGASEVSFVNGPLMKAMKNGHFLYIDEINMAKPETLPLLHGALDYRKMITNPFTQEVVYGDEEYRVIAAINEGYVGTSELNEALKNRFVIIEVPYIQGDTLKELLLAESKLNDVATIEKFVAFASDLMPLARDGRVSEEAASIRGIIDACDLGVYIPVMRAIERSIIAKLNDETEQMTVRELAESYFFEG >NC_018508.1|WP_001248844.1|187799_189683_-|VWA-domain-containing-protein MRQIFSDKKIDASLFLQMENLMYALLKEDDAYLEYGYKAYYDEIEKKVVISHFWDDRKEEDTVIGLKSEVFLKALGNKHYSDMTLIRSYAIELQESPLKKFLTQLFVLLEDLRVEEIVKNLRPGTKHIFKRRKEMYRNYFGSQNEINRVRNYHGDRLFCLCYLSLTSDKYEMFNNEYFEQIEAILHETFQARNTEDIMYVVEKIRYRLEALLESDMLNNYFGHAPLYLSVLADEKNCRVEDLANDDTQLIDDDENKNKMDESFSTWHRENKNNENENFLRFELESGTKTNMMGDTARESEDGDQALGSVQGTSQKSTQSNFDGADTEEARASHASSQHDGAYGKYNVGASHTFKEARKANIDEKKDYQAIKSVVNKDVKELKKIIEKTIENKTNANNDKYYGRLRKKFLRIYTEKQPRMFYKKGQESQELDVAFQLLVDCSGSMYNKMEETKKSVVLFHEALKSLKIPHAISGFWEDASSAKPEDKPNVIHEVVNYKNSTLPNVGPEIMQLREEEDNRDGYIIRIVSEKLAKRPEKHKFLLVFTDGEPSALDYQQDGILDTHEAVKLARKSGMEVIGIFIEEGEAKEATYQLMKNIYNHHFLVANHAEDLRLKIKPLLKKLLLKTIE >NC_018508.1|WP_001189930.1|187339_187762_+|NUDIX-hydrolase MQRVDVVYALIHDEETDKILMVHNAEQNVWSLPGGAVEKGEILEEALIREVKEETGLIATLGGLVAINEKFFEESGNHALFFTFRANVVKGELIAEDEGEISAIEWVDRTIANERFPYYDGGFESLLEVAIPYKFQPETK >NC_018508.1|WP_000723120.1|186314_187280_+|L-threonine-3-dehydrogenase MKKILVTGSLGQIGSELVMKLRDVYGASNVIATDIRETDSEVVKSGPFETLDVTDGQKLHDIAKHNEVDTIIHLAALLSATAEKNPLFAWNLNMGGLVNALEAARELNCKFFTPSSIGAFGPSTPKDNTPQDTIQRPTTMYGVNKVAGELLCDYYHQKFGVDTRGVRFPGLISYVAPPGGGTTDYAVEIYYEAIKKGAYTSYIAEGTYMDMMYMPDALQAIISLMEADPSKLVHRNAFNITAMSFEPEQIAASIRKHIPTFTMDYAVDSARQTIADSWPNSIDATAAMKEWGFKAEYDLDKMTTDMLAKLKKKLTAELVMN >NC_018508.1|WP_000095913.1|185079_186270_+|glycine-C-acetyltransferase MSSKTLAKFLEENLEDLKSKGLYNVIDPLESSNGPIITIGGKEYINLSSNNYLGLATDSRLQEAAIGAIHKYGVGAGAVRTINGTLDLHIKLEETIAKFKHTEAAIAYQSGFNCNMAAISAVMDKNDAILSDELNHASIIDGSRLSKAKIIVYKHSDMEDLRQKAIAAKESGLYNKLMVITDGVFSMDGDVAKLTEIVEIAEELDLMTYVDDAHGSGVLGKGAGTVKHFGLSDKVDFQIGTLSKAIGVIGGYVAGKQNLIDWLKVRSRPFLFSTALTPADAAACMRSIEILMESTELHDRLWENGRYLKQGLKELGFNIGESETPITPCIIGDEVLTQEFSKRLNEEGVYAKSIVFPTVAKGKGRVRNMPTAAHTKEMLDEAIRKYEKVGKEMGII >NC_018508.1|WP_000885973.1|184134_184866_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MAFTESDVYNNTAFFEQYMKRRYRENSPNESIEKPVFFQLIGHVQGKQILDLGCGDAKFGAELLEKGCYSYTGIEGSELMYEKAKNQLENKNGSVHFLNLKDYTYPSSTFDLVTSRLALHYIEHLDTIFQNVFQTLKTNGTFTFSVQHPVITSSFESLQTSGKRTSWLVDDYFKLGKRVEPWIDQEVIKYHRTTEEYFTLLQQAGFTITSLKEATPNPIYFQNEEEYKRRLRIPLFLLFSCTK >NC_018508.1|WP_001167972.1|183281_184103_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MQKALETKRLTLSYGETSIIDELNLEIPKGEITIFIGSNGCGKSTLLRSLARLLKPTTGDILLDNQAIQSMQTKQIARQMAILPQGPQAPEGLTVLQLVKQGRYPYQTWLKQWSEKDEEMVQKALAATGMTEFAERDVHALSGGQRQRAWIAMTLAQDTDIILLDEPTTYLDMTHQIEVLDLLFELNETEQRTIVMVLHDLNLACRYADNIVAIQDKQIYAQGKPEEVVDEKLVRDVFRMECQISTDPLFGTPLCIPHGRGRRVVKEVAQAIR >NC_018508.1|WP_000760052.1|182210_183269_+|iron-ABC-transporter-permease MKKYIPFRIGKGELSFLMYKRACLVLLSLLLVLIGLFFASAGMGDMKIAPYDVWQAITGNGDAMSNMVVNKFRMPRILIAILVGIALAVAGCILQGLVRNPLASPDIIGITGGASVAVVLFLALFSDKNNALTVSIHYMPLAAFAGATIVAVFVYLFAWQNDGLSPISLVLIGVGFWALTKAATTLFMLLAPIYQASQANVWITGTVYGSSWQNVMVLAPWVLILTVISFIAARHLNAQELGDDIAVGLGVPLTKSRVFMLLLSTALIGGAVAFAGGIGFVGLMAPHISRRLVGSLYGALLPVAAIVGAILVLAADLIGRTIFTPLEIPAGVFTSAIGAPYFIYLLYKSRNS >NC_018508.1|WP_000925213.1|181209_182214_+|iron-ABC-transporter-permease MLLKTNRAKGIGLFVGIIAVVICIWGSIIFGYTNTSWKLALDAFFHFNGSNEHIIIQNVRLPRALIAASVGASLAIAGCLMQTLTKNPLASPDFIGLNSGAAFFIVVAIVIFSVTSLSAFTWIAFLGAAVAAVLVFASSSLGKEGTTPLKLTLAGVAISALFSSLTQGLLVLNEKALEEVLFWLAGSVQGRKLEILQSVFPYLLIGWIASLIMAGKVNTLMMGEDVAKGLGQRTILMKSFVLLIIVLLSGGSVAVAGPIGFIGIITPHFARFLVGVDHRWRVPYSGLLGAILLILADIAARYVIMPQEVPVGVMTAFIGAPFFIYIARKRGLSK >NC_018508.1|WP_000893348.1|193286_194990_+|EAL-domain-containing-protein MLEQRGHALYDSSLRDLKLALDESSIVAITDRKGLITYVNDKFCEISKYKREELIGKDHRILNSGHHPKTFFQNLWKRILNGKVWTGEIRNRAKDGTYYWVKTTIVPFLNEKGEPYQFIAIRNDISSRKEAEHRLRLSESRYRELAYHDALTSLPNRLQLITTVNKLIADKKEFGMIYFDLDRFKLVNDTLGHMIGDLLLSEVASRLHYVLGEKDVLARLGGDEFVLLTKNHRQDDMSQLATSVLSCFQAPFMLEGHEVYISASLGLCSYPQDGLDVETLLKNSDLAMYSAKEQGRNAACFFTDELRAKINRRMKVEFALQKAIRDEELDVALQPIIDLKTKRYSGIEALVRCMTEDGPIAPSEFIPVAEESGLIIKLGDWVLEKSCRLFKTLPNYQEGLKLSVNLSIQQLMQKRFILSVRSILKRTGFPPNRLILEITESIAVRHFDYIIATLQELRNMGVLIALDDFGTGYSSLYYLKQLPLDIVKIDRNFIREFHYDHAQPERTIVKSVIEIAHSLNLAVVAEGVETVEQESLLQSMSCDYVQGFYYAKPLSVGELKEKLITDF >NC_018508.1|WP_000448446.1|195021_196419_-|amino-acid-permease METKKWGLWVLTAFVIGNMVGGGVFMLPANLAQVSGPMGSTLAWSITGLGVFMIALVFGNLAIRKPELKAGPQSYAQAMFPSKKAGKVAGYSMAWGYWAANWAATASVIISFAGYLSTFFPVLQSKQILFSINGFSLELGKGLTFLVCSLMLWGIQYILSQNIDRAGNMNLLATIAKIIGFTMFIVITLFIFNASNFGDGQTFMNEAGQSISLGGQINSAAIATLWAFIGIESAVMLSNRAKSQRDVKKATIFGLIIALLIYMSITLLTMGALPQDALKESQKPLVDALNLAIGNKGAYIMALLALISLFGSTVGWIVVSSEVPYQAAKNGLFPKFFGKTNKKGSPSKSLLITNVMTQIFLFSTISGTVSEAYSFAIVVATLAYLIPYLVSTLYQFKLVITGETYDIMPGSRIKDGIITTLAFVYSIWVIKTGTADLKTFFLGIGLFVLGLILYPVLMKDSQKTD >NC_018508.1|WP_000987242.1|196871_197582_+|trehalose-operon-repressor MMSKYEQIYTEISKSIDNKQLKEGCKIPSETELMKQYEASRGTVRKAVDLLQERGYVQKIHGKGVFVLKRKNIEFNFGGIVSFQEENERLGRHCITEVVEMDKEKATKEIAKLLNVKEKTEIDHIKRVRNIDGEKVILDINHFVSEFIPGLTKEIATASIYKYIEKELGLHISYSQRVIEVQPCTEDDRKYLDLNGTDYVVVVKNFTHLYDGSQFEYTESRHRLDIFHFSDVARRK >NC_018508.1|WP_000513939.1|197724_199152_+|PTS-system-trehalose-specific-EIIBC-component MGKDYRKTAEEVLQYIGGKDNIEQAAHCVTRLRIALKDESKIDNDKLQSVSLVKGAFHNAGIFQVVIGPGDVDRVYAELITLAGMEESTVADVKDSGNQKLNPAQKFVKIFSDVFMPILPAIVTAGLLMGINNLLGAKDLFFDGKNLLDVYPNLGGLWDLINMMANTAFVFLPALVGWSATKRFGGSPILGIVMGLMLVHPALLNAWDYGKAATGLEGQKIEYFNILGLFQIEKVGYQGQILPVLVAAFVLSKVEIFLKKHVPNAIQLLVVPITTIVVTGVLALGIIGPVTRHIGDLLTVGLVGVYETVPVVGAVLFGALYAPLVITGMHHMFIAIDLQLIAQHGGTFIWPMIALSNIAQGSAALAMFWISKNQNDKSMASTSAISAYFGITEPAMFGVNLRNKFPFYAAIIGSAVAAIFITLNGVLAPAIGIGGLPAFISIIPKSIPMFIVGMIIAVVIPFTLTWLFAKRVKQK >NC_018508.1|WP_000656109.1|199165_200827_+|alpha,alpha-phosphotrehalase MKDWHKSVVYQIYPKSFNSYYNKETGDIKGVTEKLDYLKELGVDYIWLTPIYQSPQNDNGYDVSDYYSIDPSYGTMEEFEELLAEAKVRNIEIMLDIVVNHSSTEHKWFKEAKEDKNSPYRNYYIWRDEKNNWQSKFGGSAWKYDEKTEQYYLHLFDETQADLNWENEQLREEVYDMMRFWLDKGVTGFRLDVINLISKDQCFLNDEGNTATSDGRKYYTDGPRVHEYLQEMNRKVFAGKDVITVGEMSSTTIDNCIKYSNPERNELSMTFSFHHLKVDYPNGDKWTKAEFDFIKLKEIMSNWQIEMQKGGGWNALFWCNHDQPRIVSRFGDDRKYRNESAKMLATAMHMLQGTPYIYQGEEIGMTNPKFESIEQYRDVESLNIYDIKREEGLSKEEIIGILKQKSRDNSRTPMQWNEEMNSGFTTSTPWISVAENFTEINVEKALEDKESVFYHYKKLIELRKTYDVITEGEYAILDKNDPKIWAYTRTTESEVLLVINNFYGEEITYSVPAHVQLDGMKQEVLLSNYKDASKDIAKLNLRPYESIVYRYTK >NC_018508.1|WP_000185806.1|201964_203071_-|GerAB/ArcD/ProY-family-transporter MTNTQSKISLVQLTFFVIQCQIGVGILSLPNRLHPIAKGGGWISVLIAGLATQLIILLMWFLLRRFPDANMYEIACMMFGNKFGKLLGFSYVFYFTLIGMTVMLNACTVIKIWILQATPWYAILLLFTIACCYVAYNTFKVIVRFYVMASILILPMALLIGLGLSRADFSYIFPITEAGWWNIIKASKETITAMYGFEIFLIAFPKVNGTAVAKLKAISIANGFVTLFYAFTVWICFIVFSPKQVELIPEPVAYLLRSLHIGIVDRTDLIFIPIWMITVVASIASCYAAASIGIGHIFNLANHKKSVPIVGVISFSIALFIDTPEELKLIANFTDKFTYIFIIVLPFLFLLYSLLRNKKGAPYAQKNS >NC_018508.1|WP_000193671.1|203051_204554_-|spore-germination-protein MTQQEEQQKSKNQKHMFPSLPENINYIENKLCHSDDIKKLDIPFQNGKGIILYIESLADPNLIHQLALEPLLTRSDLSLDKAFSTLNMKKETNLNYGVQLLLQGKSLYFHEHVESFCTFETALSLKRAITEPDNEGIVRGPHTGFVEDLATNLASIRKLIKSPNVVVKYFTLGEEMHTKVAITYIQNIANDDLVAEVKRRLEMIKTDALMPPGYIQEFIEDTSFSPFPQQLNTERPDRTAANLMEGRVAILSDGDPTALIVPVTLFAFYQSPDDYNNRWIVGSFVRMIRLVSFLIAFLLPAIYIATVAFHPDVLPLELVYTIKASLEQVPLPPIFEALLMELIFELLREAGIRLPSRVGQTIGIVGGLVIGDAIVKAGLVSYTMIIVVALTAIASFLVPSNDMSSAVRILRFPLMVLAAIFGYVGISFGIIITFVHLCQLHSFHTPYLSPLAPMRIKDMKDSFVRFPIWSFWERPHDSKPKKMQRQHVTREDENGDKHAK >NC_018508.1|WP_000401661.1|204742_205564_+|phosphotransferase MEIAVERVFTKEILRRAAKAFHVTVEEKPLGDFENYIFKAKGDNDEDYVLRLTHSSHRSKKEVEAELDFLRYVAEHGAKVAGPLNSTSQNLVEEIGAEDSTFFFASLFTYAKGEQVKGEGSPYWGDDYFEAWGKAIGQLHRLTMSYPKTDYRDTWEEDESGIVNELEDDQVKKIAAVLMDEIKALPVERETFGLMHGDIHPGNFHYDGKELTIFDFDDAAYNYFIHDLAMVLYYSILFTPWTAEEKTDFARKQLQVLRKGYEHEHRLADSWYE >NC_018508.1|WP_003309076.1|205570_205714_+|hypothetical-protein MFLRLRDVGLYGTLQKKFKGKGMPDNFRELSEELYERIIKREAIVNI >NC_018508.1|WP_000387173.1|205873_207334_+|alanine:cation-symporter-family-protein MEAFVNWLNNIVWSPALVYLCLGVGLYFSIRTRFLQVRHVGEMVKLTFQGEKSEAGVSSFQALALSLSGRVGTGNIAGVATAVAFGGPGAVFWMWAVAFLGAGSAYIESTLAQIYKTKHQGQFRGGPAYYIEKGLGVKWYALVFVAATILATGLLLPGVQANSIAVSLETAFGINTTVSGVLLVVVLAIIIFGGVKRIVNVAQVVVPFMAVGYILVACVIVAMNIEKLPEAFMLIIRSAFALEAAFGGIIGLAISWGVKRGIYSNEAGQGTGPHAAAAAEVSHPAKQGLVQAFSVYIDTLFVCSATAFMMIITGMYNVFDASGKNFIVNKLNGAQPGPGYTQAAVESVFPGFGNGFVAISLLFFAFTTIMAYYYIAETNIAYLNRDKDRPWLSIVLKFVFLGAVFYGCIKTAATAWALGDIGVGIMAWVNIIAILLLQKPALVALKDYEKQKKEGKDPVFDPQPLGIKNADFWEHEYGKDKKEEVS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_018508_2 | 4521837-4521953 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_018508_2
|
1 spacers
spacers of NC_018508_2
>2.1|4521873|45|NC_018508|CRISPRCasFinder CGTTAACCTTTGAACTACATGAGTTTCTTTCTACCGAACATACAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018508_2
The CRISPR arrays of NC_018508_2 >merge|NC_018508|2|4521837-4521953|CRISPRCasFinder CTTAAACAAGCGTTTGATTAATTCTCCATTTTTCTTCGTTAACCTTTGAACTACATGAGTTTCTTTCTACCGAACATACAGCTTAAACAAGCGTTTGATTAATTCTCCATTTTTCTT >NC_018508|2|2|4521837-4521953|CRISPRCasFinder CTTAAACAAGCGTTTGATTAATTCTCCATTTTTCTT CGTTAACCTTTGAACTACATGAGTTTCTTTCTACCGAACATACAG CTTAAACAAGCGTTTGATTAATTCTCCATTTTTCTT
>NC_018508.1|WP_000218968.1|4521275_4521641_-|arsenate-reductase-family-protein MTVTFYSYPKCGTCQKAKKWFEANDVAYEMIHIVENPPSKEDLRNLHEKSELPLKKFFNTSGMRYRELGLKDKLKDASEDEMYELLASDGMLIKRPIVTDGTNVTLGFNEEQFESVWKKYQ >NC_018508.1|WP_000026896.1|4520850_4521234_-|glycine-cleavage-system-protein-GcvH MSIPNNLRYSEEHEWVKTEGNEVVIGITHFAQGELGDIVFVELPEVGATIEADEPFGSVESVKTVSELYAPVSGKVVAVNEELSDQPELVNESPYEGAWMVKVELSDASQVEKLLTAEKYAEMTNQD >NC_018508.1|WP_000640870.1|4519895_4520240_-|hypothetical-protein MIYVEKVIIVEGTSDRRKIESIIREPVEIVCTNGTIGLSKMDELVDQFFDKEVYVLVDADDAGEKLRKQFRKEFPQAEHIYIDRSYREVATAPSTHLANVLWGADIDVYTEYLR >NC_018508.1|WP_000568179.1|4519583_4519883_-|thioredoxin-family-protein MIDWTGAEATSLIENEEKTVLYVYTPMCGTCQLAKKMLTVVEMTIEELKIGMLDLNYAPHLAKEYGIESVPCLLVFENGTLMKKIYAFHSVEYLYTELK >NC_018508.1|WP_001242142.1|4519086_4519431_-|hypothetical-protein MRLYSLLQSFVNYANGQYHLEPLLRREEKTVNFRLGDESCSLQISRDYIELVHEERGTEQIICLDEKDIEQLVNGNVRLQMLMNDGRVQYSGTYRTMLLVESMFHICKPMPVGA >NC_018508.1|WP_000601782.1|4517647_4518673_-|methionine-ABC-transporter-ATP-binding-protein MILLENVKKIYKAKSGDVTAVDNANLKIEKGEIFGVIGYSGAGKSSLIRLFNQLEKPTSGQITIANRVISTITGSELRKARQEIGMIFQHFNLLWSRTVRENIEFPLEIAGVDKTKRRKRVDELIHLVGLEGRGDAYPSQLSGGQKQRVGIARALANNPQVLLCDEATSALDPETTDQILDLLLDINKRLGLTIVLITHEMHVIRKICNRVAVMERGKIVETGPVLDVFRNPKQDITKRFVQQLTDSEDTNETIESLIEKYPDGKVIRLQFIGEAVERPVLQRLMQRSDIEVSILQGNIAQTNNGSYGSLVVHLNGEETAIQQAIEGIHQDQVELEVIAHG >NC_018508.1|WP_000359401.1|4516989_4517655_-|ABC-transporter-permease MDKLLANVDWNQMLEATGETLYMTAIAALATFVLGLILGLLLFMTAKDNLWENKSINTVIGAFVNIFRSIPFIILIILLIPFTKILLGTILGASAALPALIIGAAPFYARMVEIALREIDKGVIEASKAMGAKTSTIILKVLIPESLPALVSGITVTTIALVGYTAMAGVVGAGGLGTLAYLEGFQRGNNDVTIVATICVLLVVFLIQWIGDSLTTRIDKR >NC_018508.1|WP_000735090.1|4516153_4516966_-|MetQ/NlpA-family-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKLLLTALISTSIFGLAACGGKDKDEKKLVVGASNVPHAEILEKAKPLLEKKGIELEVKKFQDYVLPNKSLADKDLDANYFQHIPYLEKEIKDKKYDFEVAGKIHLEPIGVYSQKYKSLKELPDGATIIMSNSVADHGRGLAILQKEGILKVKDGVDPVKATPKDIADNPKNLKFKTDIEPGLLPQVYNNKEGDAVLINSNYAIDAKLNPEKDAIAIEGNDSPYANIVAVRKGDKDKKEIKALVEVLHSKEIEDFINKEYKGAVVPVKE >NC_018508.1|WP_001226751.1|4515275_4516082_-|MetQ/NlpA-family-ABC-transporter-substrate-binding-protein MRKILLSVVTALSVFTLAACGGKEENKLVVGASNVPHAVILEKAQPILEKKGIKLEIKKFQDYVLPNKALADKEIDANYFQHIPYLDKEIQEKGYKIVNAGKIHLEPMGIYSKKYKSLKELPDGGTVIMSNNVAERGRMLALLQKGGVIKLKDGVDVVKATVKDVVENPKNLKFKTDVEPGLSPKLYENNEGDALFINSNYAIDAKLNPTKDAIAIEGSDSPYANIIAVRKGDEKKKEIKELVEVLHSKEIQDFINKEYKGAVLPISE >NC_018508.1|WP_000929162.1|4514251_4515037_-|Fe-S-cluster-assembly-ATPase-SufC MAGSTLTVKDLHVSIDGKEILKGVNLEVKGGEIHAIMGPNGTGKSTLSSAIMGHPKYEVTEGSIIIDGEDVLEMEVDERAQAGLFLAMQYPSEISGVTNADFLRSAINARREEGDEISLMKFIRTLDKNMEFLEMDPEMAQRYLNEGFSGGEKKRNEILQLMMIEPKIAILDEIDSGLDIDALKVVSKGINQMRGEEFGCLMITHYQRLLNYITPDFVHVMMNGRIVKSGGPELAQRLEAEGYDWIKKELGIEDETAEQEA >NC_018508.1|WP_000826875.1|4522052_4522580_-|hypothetical-protein MKRLSYFLFFILICLVGAGCAKDKEGEKLEYNGRALVIGVVGEKPKDTFRNVKFEEMKLEALEKKSKEVDGFLIMKDHFQEASTEQYKNVFSSLKKPVFFIGLQDKLYSIFITKGIEYNSARKDVNAMYTQGFANIGSGEGQQWAIGLSNGGNTEESIHNMYIVVFQTIADYLNR >NC_018508.1|WP_000713769.1|4522724_4523372_+|phosphatase-PAP2-family-protein MKKFKLSSFLPLSYILLLVLVSPLYDVLNKSTVHAVDVTTVVDDWIPFVKAFIIPYLLWFPYLYGALIYYCFADRKQYYVTLSSVIFGKLACFSIYYFWQTTVPRPTVVGTDVFSELVRYIYSIDQPVNCFPSIHVLTTFVIMLAAFKRREQHAFEYYILTFFGTLIILSTLFTKQHAFLDAVSGMTLASILYFGVQLLLAKEPIKVPVKQNHKM >NC_018508.1|WP_000666176.1|4523431_4524445_-|PTS-sugar-transporter-subunit-IIC MKEYIMSRVFKASAGIAQGIFVSLGIGLLIENIGRIVDIPLLITIGVVAKSLMAPAIGAGIAFMLGANGLVIFSAMVAGAIGAGSISITEAGLIIKTGEPIGALLTATLAVYIGKRLSGKTALDMMLVPFAAILGSGLVGIWLSHNITPVLNTVGAFIKDSSAGSPFIASIVIAVVWGLLLISPASSAALAIALSLDGVAGGAALAGCVAQFIGFSVISAKENNLGGILAQALCTPKVQLPNITKNPMILVPTVVASAIVGPVSALIFQLEAGKEIAGLGLSSLIAPINLISSEGWEVVPAMVITYIIIPVAVSYILYIALKKAGRIHSGDMTVPQS >NC_018508.1|WP_106081637.1|4524467_4525637_-|L-lactate-dehydrogenase MRSFYFLYVNKYIINIFPVVTNMTKMEYNNSQKGQKLCSIFHKVSMVSIVGTSIIKNVKNKRNRLYDQLGEIAMKRHTRKIAIIGTGLVGSSCAYSIVNQGICEELLLIDINHERAVGEAMDLSHCINFTNTRTKVYAGSYEDCKDMDIVIITAGPAPKPGQSRLDTLGASAKIMESVVGGVMESGFDGIFLLASNPVDIITYEVWKLSGLPRNRVIGTGTSLDSSRLRTILSEMLHVDPRSIHGYSLGEHGDSQMVAWSHVTVGGKPILQILEEQKERFGEIDLDEIVEKTAKAGWEIYKRKGTTYYGIGNSLAYIASSIFNDDHRVIAVSAILDGEYGEYDICTGVPAIITRDGIREVVELNLTEDEESRFAKSNDILRDYMKTIGY >NC_018508.1|WP_001002987.1|4525663_4525912_-|spore-coat-protein MNEKDMVNDYLAGLNASLTSYANYIAQSDNEQLHQTLIQIRNQDEMRQRNMYEYAKQKSYYKPAAPANPMIVQQLKSQLSAE >NC_018508.1|WP_001180555.1|4525925_4526111_-|hypothetical-protein MQNLTELEVENLRHLIGGHATIINKLEQYAQTCTDPQLKQMLQKDAQDARNTKQQLMTFLG >NC_018508.1|WP_000864824.1|4526224_4526944_-|MBL-fold-metallo-hydrolase MKVISVGTVHQIAFLPRLFPINCYFVEEETGLTLIDAALPFCAKKILQSARKIGKPITNIVITHAHDDHVGALDVIKQVLPDVPVYISKRDACLLEGDKVLQEGERNTPIKVGVSKQINTIPDILLQEGDKVGSLVAIGAPGHTPGSMAFLDTRNDALIVGDAFQTRGGLAVAGQLKWLFPFPMFGTWDAEVSLASAQKLLEYKPSLLATGHGKMIENPLIQMQRAIEEAERNLSRKSL >NC_018508.1|WP_002008874.1|4527059_4528862_-|acyl-CoA-dehydrogenase MKEEIFMEKTVGNAVKGGSFLVDEITIDQVFTPEDFSSEHKMIAKTTEDFIVNEVLPELEYLEQHEFDRSVRLLKEAGELGLLGADVPEEYGGIGLDKVSSALIAEKFSRAGGFAITHGAHVGIGSLPIVLFGNEEQKKKYLPLLATGEKLAAYALTEPGSGSDALGAKTTARLNAEGTHYVLNGEKQWITNSAFADVFIVYAKIDGEHFSAFIVEKEYAGVSTSPEEKKMGIKCSSTRTLILEDALVPKENLLGEIGKGHIIAFNILNIGRYKLGVGTVGSAKRAVEISAQYANQRQQFKQPIARFPLIQEKLANMAAKTYAAESSVYRTVGLFESRMSTLSEEEVKDGKAVAASIAEYAIECSLNKVFGSEVLDYTVDEGVQIHGGYGFMAEYEIERMYRDSRINRIFEGTNEINRLIVPGTFLRKAMKGELPLLQKAQKLQEELMMMMPEEVGDEPLALQKYLVTNAKKIGLMVAGLAAQKYGKALDKEQEILVNIADIVSNLYAMESAVLRTEKAIKTTGLEKNKQKVLYTEVFCQEAFNEIEADAKETLIAVENGDMLRMMLSSLRKLTRHTPLNVIPKKREIAAKILEDERYTV >NC_018508.1|WP_001206329.1|4529232_4530405_-|acetyl-CoA-C-acetyltransferase MREAVIVAGARTPIGKAKRGSLKTVRPDDLGALVVKETLKRANYEGPIDDLIFGCAMPEAEQGLNMARNIGGLAGLSYDVPAITINRYCSSGLQSIAYGAERIMLGHSEAVLSGGAESMSLVPMMGHVVRPNSRLVEAAPEYYMGMGHTAEQVAVKYGISREEQDAFAVRSHQRAAKALAAGNFADETVSVDVTLRSVGSNNKLQEETIIFAQDEGVRAETSLDILGKLRPAFNVRGSVTAGNSSQMSDGAASVLLMDREKAVSDGMKPLAKFRSFAVAGVPPEVMGIGPIAAIPKALKLAGLELSDIGLFELNEAFASQSIQVIRELGLDEEKVNVNGGAIALGHPLGCTGAKLTLSLIHEMKRRNEQFGIVTMCIGGGMGAAGVFELL >NC_018508.1|WP_000486369.1|4530426_4532808_-|3-hydroxyacyl-CoA-dehydrogenase/enoyl-CoA-hydratase-family-protein MFQIKKAAVLGSGVMGSGIAAHLANIGIPTLLLDIVPPALTKEEEAKGLTLEHKSVRNRFSNTAVQKLLKQKPAPLTVKGNLALIEAGNLEDDLERLADVDWIIEVVVENLDIKKKLFEKVDAVRKPGSIVSSNTSGISVEKMAEGRSDDFQKHFLGTHFFNPPRYLKLLEVIPTKETDPQVLSFMKLFGEDVLGKGVVIAKDTPNFIGNRIGTYGLLVTLQEMIKRGYSIGEVDSVTGPLIGRPKSATFRTLDVVGLDTFVHVANNVYENVQEEERDVFKVPAFMHDMLEKKWLGSKTGQGFFLKQGKEILELNPETMEYEARKKLKAASVELSKQEKGLANKLKALVYAKDRAGELLWNIITPTLLYSAKLHKEIADDIVAIDQAMKWGFGWEQGPFEVWDAIGVEKSVQKMEENGVVVPTWVKEMLEKGFTTFYKHDNGDSYYYDNGEYKLIERNKKAISLKQLKAKNGVLKKNSGASLIDLGDGILCLEFHSKSNAIGMDITQMINYAVDEVEKNYKGLVIGNQSKNFCVGANLAMILMEAQDDNYFEIELVVKNFQDAMTKIKYSSKPVVAAPYGMTLGGGTEVCLPAASIQASSETYMGLVEVGVGLIPGGGGNKELYIKHLNKMPNGVEFDLQKVANKVFESVAMAKVSTSAQEAVSNNFLGDKDGISVNGDHLLYDAKQKALALYEAGYKAPIRKKIPVVGETGYATLVLGAEAMHLSGYISEHDLHIAKKLAYVIAGGKVPYGTEVDEQYLLDVEREAFISLVSEMKSQARMQHMLVKGKPLRN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_018508_3 | 4777128-4777261 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_018508_3
|
2 spacers
spacers of NC_018508_3
>3.1|4777151|31|NC_018508|CRISPRCasFinder TTCTTCTTTTTTGTCACTAGTTGAACCGCTT >3.2|4777205|34|NC_018508|CRISPRCasFinder CTTGTCTTCTGTTTTATTTTCTGGTTTCGTGCTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018508_3
The CRISPR arrays of NC_018508_3 >merge|NC_018508|3|4777128-4777261|CRISPRCasFinder GTTGATTTTTCTTCTTTCTTCGGTTCTTCTTTTTTGTCACTAGTTGAACCGCTTGTTGATTTCTCTTCTTTTTGAGACTTGTCTTCTGTTTTATTTTCTGGTTTCGTGCTCGTTGACTTCTCTTCTTTTTGAGA >NC_018508|3|3|4777128-4777261|CRISPRCasFinder GTTGATTTTTCTTCTTTCTTCGG TTCTTCTTTTTTGTCACTAGTTGAACCGCTT GTTGATTTCTCTTCTTTTTGAGA CTTGTCTTCTGTTTTATTTTCTGGTTTCGTGCTC GTTGACTTCTCTTCTTTTTGAGA
>NC_018508.1|WP_000008903.1|4776805_4776940_-|hypothetical-protein MSFLFVLSTAIILLFVLFTLYYYIAGKKEVPHHQLLEEELEREE >NC_018508.1|WP_000544012.1|4776224_4776497_-|sporulation-transcriptional-regulator-SpoIIID MHDYIKERTIKIGKYIVETRKTVRVIAKEFGVSKSTVHKDLTERLPEINPELANEVKEILDYHKSIRHLRGGEATKQKYRKEDVEKPVRQ >NC_018508.1|WP_000457978.1|4775062_4776064_-|rod-shape-determining-protein MFARDIGIDLGTANVLIHVKGKGIVLNEPSVVAIDRNSGKVLAVGEEARSMVGRTPGNIVAIRPLKDGVIADFEITEAMLKYFINKLDVKSFFSKPRILICCPTNITSVEQKAIREAAERSGGKTVFLEEEPKVAAVGAGMEIFQPSGNMVVDIGGGTTDIAVLSMGDIVTSSSIKMAGDKFDMEILNYIKRKYKLLIGERTSEDIKIKVGTVFPGARSEELEIRGRDMVTGLPRTITVCSEEITEALKENAAVIVQAAKGVLERTPPELSADIIDRGVILTGGGALLHGIDMLLAEELKVPVLIAENPMHCVAVGTGIMLENIDRLPKRALR >NC_018508.1|WP_000931959.1|4774199_4774634_-|3-hydroxyacyl-ACP-dehydratase-FabZ MLNIEQIKEIIPHRYPFLLVDKILEVDEGKRAVGIKNVSANEEFFNGHFPDYAVMPGVLIVEALAQVGAVAVLKKEENRGRLAFFAGIDNCRFKKQVRPGDQLRLEVEMTRVRGPIGKGKAIATVDGEVACEAEITFAIGDKKE >NC_018508.1|WP_000467945.1|4773180_4773858_-|CpsD/CapB-family-tyrosine-protein-kinase MFGRKKRKPLRQLITHKEPKSRITEQYRNIRTNIEFTSVDNHVRSIIVTSADPGDGKTTTIANLAVVFGQQGKKVLLIGADLRKPTIQNLFAIHSSNGLTNLLSGQAKLMQCIQKTDIENVYLMAAGPIPPNPAELLGSRAMDEALLEAYNMFDIILIDTPPVLAVTDAQILANKCDGIVLVVRSEKTEKDKIVKAKQILDKASGKLLGVVLNDKREEKEQYGYY >NC_018508.1|WP_000393115.1|4772173_4772917_-|capsular-polysaccharide-biosynthesis-protein MEETISLKELFHIFKKRLAMILVIAFGAAIVSAIISFFFMTPIYQSSTQILVNQKKQEGAMFQAGEIQTNIQLTNTYKVIIKSPVILEQVNEKLNLNMTAQELTKKVNVANEKDSQVIAVTAEDKDPKIARDIANATADVFKGEVAKIMNVDNVTVISKAEVAENQSPIKPAPMLNIAIAFIVGLMASVGLAFLLEYLDNTVKKEEDVENLLGLPVLGIVARMDEETLNVKSHAPSSRKVRGQTIGS >NC_018508.1|WP_001207164.1|4771482_4772184_-|CpsD/CapB-family-tyrosine-protein-kinase MALNLFKKKKNHRQRRQLIAHQQPKSPISEQYRNIRTNIEFAAVDTNLHSLMVTSANPSEGKTTTTANMAVVFAQQGKKVLLIDADMRKPAMHQMFQVDNIFGLTNVLTHSERLEKCVQTTSVDNLHFLACGPIPPNPAELLGSKSMKELLGQAYSMYDLVIFDMPPILAVTDAQIMANVCDASILVVRSESTEKETAVKAKGLLESAKGKLLGVVLNDREREEGLYYYYGAN >NC_018508.1|WP_014894859.1|4770603_4771371_-|tyrosine-protein-phosphatase MIDLHCHILPGIDDGAQTITDSLTMAQQAVSEGIHTIVATPHHQNGKYINEYTSVIHHVKQLNDELQQYNIPLTILPGQEIRLYGDLLEDYEAGKIVTLNETNKYIFIEFPSNHVPRYAEHLLYELRVKGMIPIIVHPERNAELIERPDKLYNLVNKGALTQVTAGSLLGNFGKKIKKFSLQLVEHNLTHMVASDAHNTTSRGFHLAESYELIEKEFGTSVMSDLKENPYLLISGKAIYKEDPEQIRRKKLFGIF >NC_018508.1|WP_000757801.1|4769485_4770364_-|UTP--glucose-1-phosphate-uridylyltransferase-GalU MKKVRKAIIPAAGLGTRFLPATKAMPKEMLPIVDKPTIQYIVEEAIESGIEDIIIVTGKGKRAIEDHFDHSFELEQNLLEKGKYEMLEKVQASSKINIHYIRQKEPKGLGHAVWCARKFIGNEPFAVLLGDDIVQAETPCLRQLMNQYEGTQSSVIGVQTVPENETHRYGIIDPIERNGRSYQVRQFVEKPAEGTAPSDLAIMGRYVLTPEIFMFLEDQQTGAGGEIQLTDAIQRLNEMQRVFAYDFEGTRYDVGEKFGFIRTTIEMALQQKELKEQLIKYMVELVHKEAIK >NC_018508.1|WP_000847747.1|4768807_4769467_-|sugar-transferase MKTGENIARDYQITPDTQTIQVESNQSKIYLGIKYLLDVMFSLVGLILLMPVILIFSILIILESPGSPFYLQERLGLNGKRFKVIKLRSMRNDAEKNGAKWAEKNDPRVTKIGLFIRKTRIDELPQLFNILKGDMSLVGPRPERPIFTEKFERDIPGFKKRLEVKPGLTGWAQVNGGYEITPKEKLNLDVYYINHASIILDFKIIIKTVRVVITGDGAR >NC_018508.1|WP_000144420.1|4778149_4778857_-|ABC-transporter-permease MTFSMKRFSAIVRKEINDAGKNSQVILMALLPILLAVFYSNMDSIKEFFAGFVIVMTITMVGSYVQAIIIAEEKEKHTLRVLMLSPASPIEVILGKSVLTVFFVLASSFISLVILDTFKGNIGMLVIIILIGTLLCVVLGTIVGLLSQNIAQTSILGLPIFIIFIMGPMLQEMVKNEFIIKVVNLLPTNHVMEALQKVIKGEGFIAIQEHILNNTIWTICLIILCIIVYKKKQLD >NC_018508.1|WP_000170827.1|4778856_4779699_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MTLAIEMKDVMKSFDGKTALRNVNIEVKQGEIFGFLGPSGSGKTTTVKILTSQLLHSVGTVRVLGKDITGPSSIDYKRIGILTDNSGLYERLSIYDNLLLFCDLYDCKKERIDEVLAQVNLLDDKKTPVKKLSKGMKQRVTLARAILHKPDILFLDEPTSALDPVNVQNIHKILKDLNEEGTTIFLTTHNMDEAETLCNRIAFLCGGEIVALDTPENLRLQYAKDQIEVVLKDKQKEVVQKDELGAKRISEWMKKGELLSIHSHEPTLGDIFIEVTGRGL >NC_018508.1|WP_000243437.1|4779880_4780888_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MVLLELKQLGKTNQLPVIDLKVAKGQCVVLQCNNHTAKVLHRIIIGEEEASTGNVLFEGGAIGKKNYPRIGFCFLKDEAYDRLKVKEYFKFLIGLYESKISIEEVVQSVGLLDKLNVKIEKLSFSEKRRLHIGRVMIHNPDLVILEEPEQNVDIESTIIIRKAIMKMKEQGKAIFITSSFLSDALSLTEDVYILNNDGVKKIEIEQEEVEEVGEEKVIQMIPQMKLERIPAKVNDKIILLDPMEIHFIETQNGVTHIHVREGDFVCALTLSELEARLTGFGFFRCHRSYLVNLQRVREVITWTRNSFSLILDDERKSSIPLSKGRMDELKGVIGL >NC_018508.1|WP_000672657.1|4780986_4782006_-|stage-II-sporulation-protein-D MKFSKPLFITVALLIALVIIVPAALVIPFAKAKVGEETASKTPPAIESIPAPGKVDTAVQVAVYREKQKKVESLPMEEYVTGVVASEMNASFEIEALKAQALAARTFVVQRMLSGGKKNNADVTDTVKDQVYKSKEELKKQWGNNYENNLKKIEEAVSKTAGQVLTYDGKPISASFFSTSNGRTENAADYWGNDYPYLKSVDSPWDQASPKFTSEQTFTVADFQKRLGVKVLADGKVGNIKDLTEGKRVKDVAFQGKTLTGKEVREKLDLRSSDFTWKQRGDKIIITTKGFGHGVGMSQYGANGMAAEGKKYTDIVAHYYKGVEIKTMNDYEGKLMVKK >NC_018508.1|WP_000411275.1|4782214_4783519_-|UDP-N-acetylglucosamine-1-carboxyvinyltransferase MEKIIVRGGKRLNGTVRVEGAKNAVLPIIAAALLASDGKNVLSEVPVLSDVYTINEVLRHLNAEVVFENNQVTIDSSKELNIEAPFEYVRKMRASVQVMGPLLARNGRARIALPGGCAIGSRPIDQHLKGFEAMGAKVQVGNGFVEAYVEGELKGAKIYLDFPSVGATENIMSAATLAKGTTILENAAKEPEIVDLANFLNAMGAKVRGAGTGTIRIEGVDKLYGANHSIIPDRIEAGTFMVAAAITGGDILIENAVPEHLRSITAKMEEMGVKIIEENEGVRVIGPDKLKAVDIKTMPHPGFPTDMQSQMMALLLQADGTSMITETVFENRFMHVEEFRRMNADIKIEGRSVIMNGPNSLQGAEVGATDLRAAAALILAGLVSEGYTRVTELKHLDRGYVDFHKKLAALGATIERVNEKVEEVKEQEVSDLHA >NC_018508.1|WP_003272396.1|4783558_4784269_-|YwmB-family-TATA-box-binding-protein MKLKLKAILIVALSVVLFLVGYREMKPISDEQKMESMIKALEKNDAKVEKWSWLARETKTISNIHTFQKLLNDVKDKANIQKWEVEQSPDGYKATSYKKFASHEERVVVTWSKENTKENTFIIFEVSGAKWDPKYVQKVNKIFSEKPIIYTCVQGVLNDKIEGVLQNKTNQVLKDLSARAIEQVEERAFVSVSAYNKKWDDALSTNREKINVQIAIRSTDNKDTIVVGTPIITSEY >NC_018508.1|WP_000057889.1|4784314_4784551_-|DUF1146-domain-containing-protein MAQLLGQQALIAIVSHLLFITITWWALQGIHIERLMKSGKVLQTRVLLILITIAIGTSVSNFFLDYLGYSKSLTYLVK >NC_018508.1|WP_000367477.1|4784753_4786274_-|NADH-quinone-oxidoreductase-subunit-NuoN MDMNTLLSLSWHLMVPEFIILGAAILLSICDLFFKLNHRYVALGAIAAIVLAIVSLITLYSEPAGDILNGSFVLDGFSKGFKTLLLGASALILCIAMSDDKKNPIEDKGEYYYLFLMALLGAMFMASSVDFITLFVGLELLSLSSYILVGIRKKNRASNEAAMKYVISGGIGTAITLFGMSYLYGITGSTNIVDMQKVLTGELASGIQLLLALAFLLLLVGLSFKIATVPFHMWAPDVYEGATTPVTAFLGTISKIAGFLLIIRLFLMVFASVLIQGDMQSLYGHMSIYIAVLASITMIVGNVVALKQYNIKRLFAYSGIAHAGYLLVPLVALSPFTLDSMWFYMLAYMLMNIGAFAIIHGLILQNDKENITIFTGLYKKSPFAAIMMTIFILSLAGIPGTAGFIGKINIFLGALHVEPAHYVLASIMMGTTVVSFVYYFRILQQMFFRTGETEERIRLPLNIKVVMSLCAISIVILGIMPMIGYNFFYEYFPLMKDFFFLGNVVQ >NC_018508.1|WP_000998960.1|4786275_4787778_-|NADH-quinone-oxidoreductase-subunit-M MNDLLLTFFIFSPLLGILLLVLTSKKELRTVRALGLFGTALPFGIAIVLACTYASGKSLSLFDEKVKWIKFGDFTAVDKRWFSIYYELGIDGLSLIMMVLTALLAMLAAIAAFSIKSNLKAFYMLLLMLEIGMLGVFAAQNLMLFFIFLEITLPPMFLLIGKWGKLSSEKAAYSYLIYNGIGSAILLIVFSILFAKTGTTNIVELKEILRSVSAGGELVIPSSLQLGVFIAIMIAFAIKLPVFPLHRWMVNVHIEAHPAVVMLHAGVLLKIGAYGIIRFGKGLFPEYFHDVATLIAILGVINLLYGTFLALIQTDFRKVLAYSSISHMGIVLMGLASLNAPGTQGALFQVVSHGLIAALLFFLLGVIEQRFGTSDIMVLGGLAKSVPILSGFFLAGGMASLGLPGMSGFVSEFLAFLGLFQGEPVIAAVGVIGIILTAVYVLRATLQVTFGKKEWEAKSDIHGWEYVPVLLLIFCIIAIGVMPEILGDPLQNTLKTLGVK >NC_018508.1|WP_000568213.1|4787774_4789637_-|NADH-quinone-oxidoreductase-subunit-L MIDYAWLIPLFPLVSFLLLIIFGKKIREGSSVLSIFFVFLSFILAVLVLIERFSEASVKHKWVWLRAGDVDISFGFEVTALGALMLFIVTLVSLLVHVYSKGYMKGDERLPTFYAYLGLFTFAMLGLVISTNLLQLYIFWELVGLGSFLLIGFYFFKEEAKAAAKKAFIMTRIGDVGLFIGMILIFWYAGSFEYDAIFRAIYTGALPPYMITITAILIFIGAMGKSGQFPLHTWLPDAMEGPTPVSALIHAATMVAAGVYLVATMFPLFSASAVAMQTVAIVGAFTAIFAASIGLVQTDIKRVLAYSTVSQLGYMMLALGSAGYVAGIFHLTTHAFFKALLFLAAGSVIHAVHTQNINKMGGLQKKMKVTGTLFLIGTLAISGVPLLSGFFSKDEILAATWMNGNYFLFVLAVIAAFLTAFYMFRLYFLVFTGEAKTKEDVHESPRVMKYPMIVLGVLAVVAGYINTPWFGTFLGDWLTKDVGFKVEEAHGPVWIMIVATLVSFAGIALAYFIYGKKSISREWAGGTGTSFYNLLKEKYYVDELYNMTVIPITKGIARVLRLFEVYVVEGIAVLIGSVVKGTSNLGSKLQNGNVQVYGTVTAVSLAVLVIILLYTGGDLR |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_018508_1 | 1.1|192513|26|NC_018508|CRISPRCasFinder | 192513-192538 | 26 | NZ_CP045855 | Agrobacterium sp. MA01 plasmid punnamed1, complete sequence | 103187-103212 | 5 | 0.808 |
NC_018508_3 | 3.1|4777151|31|NC_018508|CRISPRCasFinder | 4777151-4777181 | 31 | JX238501 | Bacillus phage phiAGATE, complete genome | 124559-124589 | 8 | 0.742 |
NC_018508_3 | 3.2|4777205|34|NC_018508|CRISPRCasFinder | 4777205-4777238 | 34 | NZ_CP014851 | Bacillus thuringiensis strain HD12 plasmid pHD120112, complete sequence | 100650-100683 | 8 | 0.765 |
NC_018508_3 | 3.2|4777205|34|NC_018508|CRISPRCasFinder | 4777205-4777238 | 34 | MN812210 | Flavobacterium phage vB_FspS_hemulen9-1, complete genome | 22854-22887 | 8 | 0.765 |
NC_018508_3 | 3.2|4777205|34|NC_018508|CRISPRCasFinder | 4777205-4777238 | 34 | MN812215 | Flavobacterium phage vB_FspS_lillamy9-4, complete genome | 22191-22224 | 8 | 0.765 |
NC_018508_3 | 3.2|4777205|34|NC_018508|CRISPRCasFinder | 4777205-4777238 | 34 | MN812216 | Flavobacterium phage vB_FspS_lillamy9-5, complete genome | 22191-22224 | 8 | 0.765 |
NC_018508_3 | 3.2|4777205|34|NC_018508|CRISPRCasFinder | 4777205-4777238 | 34 | NC_048835 | Flavobacterium phage vB_FspS_lillamy9-1, complete genome | 22191-22224 | 8 | 0.765 |
NC_018508_3 | 3.2|4777205|34|NC_018508|CRISPRCasFinder | 4777205-4777238 | 34 | MN812213 | Flavobacterium phage vB_FspS_lillamy9-2, complete genome | 22191-22224 | 8 | 0.765 |
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NC_018508_3 | 3.2|4777205|34|NC_018508|CRISPRCasFinder | 4777205-4777238 | 34 | NZ_HG813246 | Staphylococcus epidermidis PM221 plasmid 1, complete sequence | 48333-48366 | 11 | 0.676 |
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6. spacer 3.2|4777205|34|NC_018508|CRISPRCasFinder matches to MN812216 (Flavobacterium phage vB_FspS_lillamy9-5, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
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8. spacer 3.2|4777205|34|NC_018508|CRISPRCasFinder matches to MN812213 (Flavobacterium phage vB_FspS_lillamy9-2, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
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18. spacer 3.2|4777205|34|NC_018508|CRISPRCasFinder matches to MN812232 (Flavobacterium phage vB_FspS_snork6-2, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
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cttgtcttctgttttattttctggtttcgtgctc CRISPR spacer tatgtcttctgtttttgtttctggttccccagct Protospacer . ************* *********.* .. ..
22. spacer 3.2|4777205|34|NC_018508|CRISPRCasFinder matches to NZ_HG813246 (Staphylococcus epidermidis PM221 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
cttgtcttctgttttattttctggtttcgtgctc CRISPR spacer tatgtcttctgtttttgtttctggttccccagct Protospacer . ************* *********.* .. ..
23. spacer 3.2|4777205|34|NC_018508|CRISPRCasFinder matches to NZ_HG813246 (Staphylococcus epidermidis PM221 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
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24. spacer 3.2|4777205|34|NC_018508|CRISPRCasFinder matches to NZ_HG813246 (Staphylococcus epidermidis PM221 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
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25. spacer 3.2|4777205|34|NC_018508|CRISPRCasFinder matches to NZ_HG813246 (Staphylococcus epidermidis PM221 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
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26. spacer 3.2|4777205|34|NC_018508|CRISPRCasFinder matches to NZ_HG813246 (Staphylococcus epidermidis PM221 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
215088 : 223246
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_018508|215088:223246|DBSCAN-SWA TTTAGCAGCTTTTTTCGTCTTCATACATATGTAAAACTTCTTTCGCACGCATAAGTAAACCATCTATCAATTCTTTCGGTTCTAAAATTCGTGCATCTTTTCCAAGTCTATAAAATAAAGGGGTAATAAAGTTGATTTCGCCTTTATCAATTGTTGAATGTATATATCCTGTCCCGTCTTCGTTTATTACCACGAATTCTTCAAGGTAAGGAACACTTTTACATTGGCGCACGCCTTCTGTCGTTAGTAAAACATGTAATTGGGTAGGAATGTGCACTACGTTAGAGCTAGAGGTAAACCATTCTTCTAAATTCATGAACGTACTTTCATTTTTTTCTGTTGATAATATAGAAAGAATACGATCAACACGATACAGTAATACTTTTTTTCTCCTGAAGTCATAGGATGGTAAGTACCATAGCCCATCATGAGCGTATACACCGATAGGATGAACATGTTTTGTTTTTATCCCCGATTTAGATTCGTATTGAAAGTGTAAATTTTTATTTTCAATAGCCGCACTTAACACTGCGTTTAATAGAGGTGTATCAATTGTTCTCTTCGGATTCCAAAAAGCGATATAAGAACGTATTTTATTAACTTTCACTTTCGCATCATGTTGTAGAGAGCTATACAGTTTATGCGTAACGGAATTGATTTCTGTGTTAAAAGGTAAGTCTCGATAGTAACTTAAAGATTGAAAAGCAAAAAAGATGGATACCGCTTCTTCTTCAGTAAATAAAATAGGGGGAATGACTTTATTCGTTAATACTTTATATCCTCCATTACGACCTTGTTCTGCATAAATAGGTAATCCCATATCACTTAAATCTAAAATGTATCTGTGGACAGTACGAACGGAAATATTAAATTCATCAGCTATTTCTTGAGCTGTAAATGCTTTTTTTGCAGAAGCAAATATAAGAATATCTAATAAGCGTTTAGCTTTTGACAAATGTATCACCTTTTTTCTTTTTAAACATGACATAAATTGTCGTGTTTTATTGTTAGTATATTGTTTACAGCATAATGTTATCAAGATGAGATGTAAGGAGGAAAAAATATGTCACGTGAAATAGTTTTATTTATAGCCGCTAGCTTGGATGGATATATTGCGAAAGAAGATGATGATTTACAGTGGTTAATGGAAACCGAAGGAGAGGGAGATAACGGTTATACAGAAATGTACGAAACGATTGATACAATAATTATGGGAAAAAGAACGTACGATTATGTAGTAGAGCATATGGAAACATTCCCGTATTTAGATAAAAAATGTTATGTTTTTTCTAACTCACAAAAAGGTTCAAATGAACACGTGGATTTTGTAAATGAAGAGGTAGTGGAGTTTACGAAAAGGTTGAAAGAGCAAGAAGGATCTAAAATATGGATGGTCGGTGGAGGGAGTCTACTGAGAGAGTTCTTTAAGAATAATTTAATTGATGAATATGTTGTTACAATTACACCGCATATATTAGGTTCTGGAGTTCCGTTATTTCAAGACAAGAATCCAGAAATTAATTTAACTTTAACGGATACGAAACGTTTTGGGCAATTTGTAAATTTATATTATAAAGTAAAATGATAAAGTGAAACTTTAATCAGTGGGGGTTTTGTTCATCTCCCACTGATTATTAGTTGAACCAATCGGGCTTTTACGGGCAGTTGATCCCCCACCTAACTTCTTTGCTTCCGCTGAATTTTGATGTAGGGGTCTTACTGCCCGTTAATGCGGGATAAAAAAACACGACTATTGATGATAGTCGTGTTTCTTTATGGATGGTAATGAAACTATAAAGCAAGACCCGTAATCGACTTCGCTCGTTACAGTAATATTTCCGCCGTGTAGTTCTACAATTTCCTTCACGATAGAGAGTCCTAAACCAGTTCCGCCTGTAGATCGTGATCTTGCTTTATCGACACGGTAAAAGCGGTCAAAAATGTGAGGGAGGTCTTCAGGTGGAATACCTTCGCCTTCATCTTCAATTGTAATGGAGATACGTTTATGTTCGTCTGTAATAGAAATGTTTATATGAGAATGTTCTTTTGAATGTCTATAAGCGTTATTTAAAATGTTCACTATCACTTGTTCGAATCGCTGTTCATCTAAGTTTACTAGCAATGTAGGAGAACAAGAGAAAGAAACTTTAATGTATCTTTCTTTATACATGGCGTTTACTTTTTCAGCTATGCGAGTAAGGAAGGTGTGTAAATGCACTTCCTTTACTTGAATAGAAAAGCTATGTTGTTCTATTTGTGCAAGTGAAAATAAATCTTGAACTAAGTTTGTAATGTAATCAGACTCGTCTTTTATAATTGATAAATATCGCAAACGTTGTTCAGGAGGGGTGCTTTCTTTTAAAGCAATGTCAGCATAACCTCGTACGTATGTTAACGGTGTTCGTAATTCGTGAGCAACACTTGCTAGAAATTCACTTCGCTCTGTTTTCATATAATGTAAATCATTTGCGAGCGTTTGAATAGATGATGCTAGTTCACCAATTTCATCATTTCGAGTAGTCGTTAATGAAACGGACAAATCGCCTTTACTCATTTTTTCAGTTGCATGTTTCATGTGTAACAATGGCTTTGTTAATAAATGTGATAATAGGAAAATTGTGATGACTGTGAGTAGAAACGTGATGGCACCAGCAATAATGAATTGTTTCGTTAATCCATTAACCAACTTTTCAATTGATTCTGTTCCAAGAAACATGTACACATAGCCTTCATGTTTTCCATCGACTACAATAGGGCTAACTGTACATATATAATTAGATGTTTTCCAATGATTTTCTATAATCGCTCCATTATGGTCTGTTCGAGTTTGCATTTTACTAATATGATCGTTTATAGTCGTGTTTATTTCGTTAGATTTAGCTAGTATTTCTTTATTTGTATTTGTAATAACGACAGTTGTTTCAGCTTCAGATTCCATTAGTGCTACGTGAGAGATTGTTTGCTTATCATAATATTTTTCAAGTACATCACGATGACTGTTTCCACGTTTTAATAAAGCAGTCATTTCTTCATTTACTCTAGTGTTTACGAGACTATAATAGAGCAATACAAATAGAACACTTTCAATTAAAAGTGTGACAATTAAAAAATAAAATCCGAATTGAATAGAGATTCGTTTCATCACTTTGCTCCTTAATGTTCGGTATCAATCCATCGATAACCTACTCCATACACGGTTTTTAAATGATGATCAATAGGGAAATTTGCTTTTCGCAATTTATCACGCAAATTACGAATATGTGAATCGACTGTGCGATCTTCTGTATTTGTGTTTAATCCCCAAATTCGTTCAATGAGCTGATCACGGCTTAATACATAATTCACATGGCGTAAAAATAACCCGAGTAAAGAGAATTCGATCGGTGTGAGAAGAAGTTCTTCATTATGTACAGAAGCGAAGTGTTTTGTTTCATCCCATACAATACCGTGATATTGGATTTGTTTATGTTCATTTGTACGTCTTAAAACGGCTTCAATTCTTGCGAAAAGTTCTTCTTCATGGAAAGGTTTCGTTACGTAATCATCCGCTCCGAGTTTTAATCCTTGGATGACATCTACTGTTTGATCACGAGCGGTAACCATAATAATAGGAACGTTACTAAATGAACGGATTCTTTTGCACGTTTCCCATCCGTCCATCTTTGGCATCATAATATCGAGTAAAACAAATTTAAAGTTTCGATTTTCTATATGTAAAATAGCTTCTTCTCCGGAAGTCGCACATACGCAGTTATATCCAATTGGAGTAAGATAAAGCGTTAATAATTCAAGCATTCTCGGTTCATCGTCTACGAGCAGTATATCAATCATAGAGAGCCCTCCATATTTATAATCGTTACTTAAAGTGTAATGCAAAATCATGAAGAAATGGTGCAGATTATGATGTGTCTGCATAATTTCTTCAGAATTGCTTGTTATTGTGGAGTTGAAATTACATTTTAGGTAATCATATTGGCTCAAAAATGATTAATACGGAGGCGGTATAGTGAAAAAAATGACCCGAATTTTTGGGATAACAATAATTACAGCAGTTGGTCTTGCTGCATGTGGGCAAACGAATACAGACCATAAAAATCATGAATCTACAAAAGAGAAGAAAACAGAGCAAAAGGAAATGAAAATGAATCAGGAAGTAACCGCGCCAAAAGAAATGAACGAAGGGGCATCGAATGATTTATTAACGACAAGTCTAAAAAATGTAACGAGGTTAAATACAAATGACCCCCTAAAAATGGCAGTGTTAACTTCGCAAACGATATGGCCAGCAACCCATAAAGAGAACCAGCCAGGTGCTGTTATTTTAGTACCAGCAAGCGAGTGGCAATTAGGTATTGCGAGTGCAGACCTTATTCATCATCCGAATAACGGGCCGATTTTATTTATAGAAAAAGAAAAGATACCGGAAATGACGTTAAAAGAAATAAAACGATTAAATCCAATCGGAACGAAAGATGGAACACAAATTATGGTGATGGGAGATGTAGGTACTAGCGCGCTTGAACAATTGAAAGGTTATAAAGTAAAACAAATAAAAGAAACGGACCCAGCTATATTTGCGAAGGATGTTGATAAGGAGTATGCCGATATAACAGGAAGCTACCCAAATAGTGTTATTATCGGTTCGTCTGCAGAAGAAGGACGTTTATATACAACACCCGCTGTAAATTGGATTTCTCATATGCCGGAACCACTACTCTATACAGAAAAGAATAAAGTGCCAGAAGCGACAATAGAGGCATTAAAAATGAGAAAAGATAAAGCAAATATATATGTATTAGGGCCAGAAAAAATTGTTTCAAAAGAAGTAGAAAAAGAGTTAAGCAAATACGGGAAAGTAACGCGTATTAGTGGAGAGACCCCTACAGAAAACTCGATTGCGTTCGCTAAATTTAAAGATGAAAAAACAAAATTTGGCTGGGGATTCACAAAACCTGGTCACGGTTTATCATTTGTTTCAAGCAAAACACCAGATTTAGCAG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_018508|215088:223246|219093_220341_+|WP_000738865.1|DBSCAN-SWA MKKMTRIFGITIITAVGLAACGQTNTDHKNHESTKEKKTEQKEMKMNQEVTAPKEMNEGASNDLLTTSLKNVTRLNTNDPLKMAVLTSQTIWPATHKENQPGAVILVPASEWQLGIASADLIHHPNNGPILFIEKEKIPEMTLKEIKRLNPIGTKDGTQIMVMGDVGTSALEQLKGYKVKQIKETDPAIFAKDVDKEYADITGSYPNSVIIGSSAEEGRLYTTPAVNWISHMPEPLLYTEKNKVPEATIEALKMRKDKANIYVLGPEKIVSKEVEKELSKYGKVTRISGETPTENSIAFAKFKDEKTKFGWGFTKPGHGLSFVSSKTPDLAVAGAPFSHMGKHAPVVLLEEGKASQPVYDFLATIQPKFKDDPTLGPYNHGFLLGSTSDISFETQGILDERLEIVQESGQGHGGH >NC_018508|215088:223246|215088_216075_-|WP_114365429.1|DBSCAN-SWA MSCLKRKKVIHLSKAKRLLDILIFASAKKAFTAQEIADEFNISVRTVHRYILDLSDMGLPIYAEQGRNGGYKVLTNKVIPPILFTEEEAVSIFFAFQSLSYYRDLPFNTEINSVTHKLYSSLQHDAKVKVNKIRSYIAFWNPKRTIDTPLLNAVLSAAIENKNLHFQYESKSGIKTKHVHPIGVYAHDGLWYLPSYDFRRKKVLLYRVDRILSILSTEKNESTFMNLEEWFTSSSNVVHIPTQLHVLLTTEGVRQCKSVPYLEEFVVINEDGTGYIHSTIDKGEINFITPLFYRLGKDARILEPKELIDGLLMRAKEVLHMYEDEKSC >NC_018508|215088:223246|216837_218229_-|WP_000822548.1|DBSCAN-SWA MKRISIQFGFYFLIVTLLIESVLFVLLYYSLVNTRVNEEMTALLKRGNSHRDVLEKYYDKQTISHVALMESEAETTVVITNTNKEILAKSNEINTTINDHISKMQTRTDHNGAIIENHWKTSNYICTVSPIVVDGKHEGYVYMFLGTESIEKLVNGLTKQFIIAGAITFLLTVITIFLLSHLLTKPLLHMKHATEKMSKGDLSVSLTTTRNDEIGELASSIQTLANDLHYMKTERSEFLASVAHELRTPLTYVRGYADIALKESTPPEQRLRYLSIIKDESDYITNLVQDLFSLAQIEQHSFSIQVKEVHLHTFLTRIAEKVNAMYKERYIKVSFSCSPTLLVNLDEQRFEQVIVNILNNAYRHSKEHSHINISITDEHKRISITIEDEGEGIPPEDLPHIFDRFYRVDKARSRSTGGTGLGLSIVKEIVELHGGNITVTSEVDYGSCFIVSLPSIKKHDYHQ >NC_018508|215088:223246|221017_221362_+|WP_000831286.1|DBSCAN-SWA MKRTAEFVLGLIGGIFGIICAFVALLIGGMGAAFEADGANTVIGLGWGAVALSILGIVGSVMVRSKAKVGGIMMTVAAIGGFICISIIYLLPGVLLLIGGLMGIFRKDKATVSA >NC_018508|215088:223246|216150_216672_+|WP_000085772.1|DBSCAN-SWA MSREIVLFIAASLDGYIAKEDDDLQWLMETEGEGDNGYTEMYETIDTIIMGKRTYDYVVEHMETFPYLDKKCYVFSNSQKGSNEHVDFVNEEVVEFTKRLKEQEGSKIWMVGGGSLLREFFKNNLIDEYVVTITPHILGSGVPLFQDKNPEINLTLTDTKRFGQFVNLYYKVK >NC_018508|215088:223246|221794_223246_+|WP_000487912.1|DBSCAN-SWA MFQTIKNDWFSNVRGDVLSGIVVALALIPEAIAFSVIAGVDPTVGLYAAFCIAVTISFVGGRTGMISAATGAMALLMVTLVKDHGLQYLFATTILTGIVQIIFGVFKLSSFMKFVPKSVMSGFLNSLGILVFTAQLPHFKNATWQMYALVVLGLAIIYLFPRITTAVPSTLISIIIVTSIALMSGLQLKTVGDMGSLPKELPFFSIPDVPFTLETLGIILPYAVMLAIIGLLESLLTASVLDDMTHTESNKHKEARGQGIANIVAGFFGGMAGCAMIGQSVINIKSGGRGRLSTFVAGGFLIVLLFVLGNYVVHIPMAALVAVMIMVSIGTFDWNSVTTIHKVPKGNAFVMIVTVVIVLITHNLALGVIIGTVISAVLFAFNMAKIHVKHLYIENKKIYEIHGQLFFASTADFINNFSFNEDVKEIEMNFTHAHVWDDSAVASIDKVIMKYEQSGVKVSITGLNERSSKLVANLATYNKRIAS >NC_018508|215088:223246|218240_218918_-|WP_000565487.1|DBSCAN-SWA MIDILLVDDEPRMLELLTLYLTPIGYNCVCATSGEEAILHIENRNFKFVLLDIMMPKMDGWETCKRIRSFSNVPIIMVTARDQTVDVIQGLKLGADDYVTKPFHEEELFARIEAVLRRTNEHKQIQYHGIVWDETKHFASVHNEELLLTPIEFSLLGLFLRHVNYVLSRDQLIERIWGLNTNTEDRTVDSHIRNLRDKLRKANFPIDHHLKTVYGVGYRWIDTEH >NC_018508|215088:223246|220474_221005_+|WP_000277057.1|DBSCAN-SWA MYKKLGTIALTGALAFSLAACGETEVKEVSKNDAPKQAEKKDKKEKAESKIYKIGDTVEVNGLQLTFSSAKFVEPNEYVKAEKGKVLEIAFNAKNNGKKDIYFGTSELKIADTNGNQFKEYFGGENTFINENIAPGNQITNKMLFDVPEGDKFVGTFKPTFTFDEKSVKVEFEVAK |
8 | Bacillus_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1404002 : 1412857
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_018508|1404002:1412857|DBSCAN-SWA TATGAAAAAAGTAATTGCAGGTTTAGCAGCAGCTTCTGTAGCTGGCGTTGCAGTTCCAGGAATGGATTCTGCTCATGCACAAGTTTCAAATGAAGCGCTAAAAGAAATTAATGGACAAACTCAAACTCAAACGACTGTAACTGAAACAAAAACTGTAGAAACAACTTCTGAATTAAAATACACAGTAACTGCTGATGTATTAAATGTTCGTTCAGGTGCTGGTACAGGACATAACGTTATTTCTAAAGTAAAATCAGGCCAAGTGCTACAAGTAGTTGGACAAGAAAATGGTTGGTTCAAAGTAAACGTAAATGGTCAAACAGGTTATGTAAGTGGTGACTTCGTAACGACTGGTGGCAAAACAGGAACGACTGTTCAACAAGGAACAGGTACTTACACAGTAAACGTTTCTTCACTTAACGTACGTACAGGCCCAAGTACATCTCATACAGTATTAGGTTCTGTAAACAAAGGTAAAACAGTACAAGTTGTAGGTGAAGTACAAGATTGGTTTAAAATCAACTTCAATGGTGGAACTGGATACGTAAGCAAAGACTTCGTAACAAAAGGTGGTTCTGCTGTATCTAACGAAACACAACAACCAACTACAAACAACAATACTACAACAGTTCAAACTGGTGGTTCTTATGTTGTTAACACTGGTGCTTTAAAAGTACGTACAGGCCCAGCTACATACAACGCTGTAATCGGTGGAGTAACAAATGGTAAAGTATTAAACGTTACTGGCGCTGAAAATGGTTGGTACAAAATTAACCATAACGGCCGCACAGGTTACGTAAGTGCAGACTTCGTTAAGTTTGTAAAAGGCGGAGTAAATAACGTTACAAATAACAATAACAATAACAATAACGTTACAAATAACGTTCAACAACCAGGTAAAGACGTACAAAAACCAACAACAGGTGGAGATACATCTTCAATCGCTGGATTCGCTAGATCTTTAAATGGTTCACCATACAGAACTGCTGGTACAACACCTGCTGGTTTTGACTGCAGTGGATTCATTCACTACGTATTAAATCAAACTGGTCATAAAGGCGCTCGTCAAACAGTTGCTGGATACTGGAGCTCTAAAACAAAAACTAGCAATCCACAACCAGGTGATTTAGTATACTTCCAAAATACTTATAAATCAGGTCCTTCTCACATGGGTGTTTACTTAGGAAACGGTCAGTTCATTAGTGCAGAAACAGATGCAACTGGTGTACGTATTAGTTCTGTAAGTAACTCTTACTGGAGCAAGCACATTTTAGGTTACACAAAAGCATACTAAGAAAAAGTAGTTTTATATACTTTTCGTATAGAGAAAAGGCTTTCCAAGGAAACTTGGGAAGCCTTTTTATAGTTGAATAAATTGGAAGTTTAATAGTTTTTATTTTAACTTTCCATTTAAAAATCGATCATATAAGTCGTGGAAATAGTTAGGACGAAATAAGTTCGCTGCATGTCCTGCTAAAGGTATTTCCTTGTATAGAACGTTAGGTAAAATAGATTTCAAATCAAATAGACAAGATTTATAGAGATGATCATGCTCTCCCATTACCCATAGTATAGGGTGAGGGAGTGATTTTAATTTAGATTTTAAATCGAATTCTAACCGATGTCGTAATGACTGGGCAATTATGGATGAATGTAATTGTAATCCGAAACGGTAGTAAATATTTCTTGAAATGACTGCGAATGGATTTGCTTTTAGTATACCACTTGGAAAAATAGTATTTGCGTATTGAGAGAGCCATTTAGAGTATTCATCTCCTCGCTTCTCCCAAAAATTTTGAAATACATTATATAAACGAGAAGGGTTATTGTAATGTCCTCCAATATGACAAATACTTAATACTTTTTCTGGATGCATTTGTGCAAAAATTGTAGAGATGTAACAGCCGTAACTTAGTGCACAAATATGAGCTTTTTTAATATTTTCTTGTTCATATAAGTTTAATAATTGATCTACGAGGCGCTGTAATGAAAAGTCGATTGCTTCTCCTTTATCATCACCGTGACCTAATAAGTCATAAGTTATAATGTTGTAGGAGGCAGAAAATCGTTTTTGCTCCTTTTTGAAGGCGCGACGATTACCAACTAACCCATGAATAAAAATAATTGTTTCCTTTTCAGAATGTATATTTGTTTGCAAAAAGGATACTCCTTTCACTAACTGGAGATTTATATCGTGTTGTAAATTATTTATAATTTACATAGAATAATATTAAGTACCAGGTAATAATATCAGATGTTTATATCTGTTGTAAAGATGAGTTTTTATGTATATTTTGTAAAAATAGAAAAAGTGTGTTTACATTCAGTTTACATTTGTATCGTATTCTAATTTTAGAAAGAACAGATTTGTTTAACACGAGGAGATGAACAGGAATGGAAGTTAGAAATGAAATGAAGAAAAAAGGGAGTTGGAGGCAGTTTTTACGCCTTATTCAAGATACAAATCCTCCGAAAGGAATTTTAGTTTTTGCATTATTAATGAGTTTGCTTTCTACGGGAGCGAGTTTATTTATTCCCATGCTAACAAAAGGATTAGTAGATAATTTTTCGCTTTCTTCAATTAGTGCAGGACAAATTGTTGGGTTAGTTGCTTTCTTTGTAATGCAAACTATTGCGGCAGGGTTATCTATATATTTACTAAATTATATTGGGCAGAAGATTGTAGCGGGACTAAGAGAACGTTTGTGGAAAAAGGTACTTATCTTGCCGGTATCTTATTACGATCAAAATAGAACAGGTGATACGATTAGCCGTATGACGAATGATACAGGTGTTGTGAAAACGTTAATTTCTGAGCATTTGTCAAACTTATTAACAGGTGGTATTTCAATTGTTGGATCGTTAATTGTATTATTTGTTTTAGATTGGAAAATGACTGCGTTACTTTTAACGGTTATTCCGTTGTCTGTATTAATTTTAGTTCCACTTGGACGAAAAATGTATAAGATTTCAAAAGCGCTTCAAGATGAAACGGCATCTTTTACAAGTGTGTTAACGCAAGTGTTATCGGAAATTCGTTTAGTGAAATCTTCAAATACAGAAAAAAGAGAATATGAAACGGGTAATACAGGTATACAAAAGTTATTACAATTTGGTTTGAAAGAAGGAAAAGTGCAAGCATTAATTTCGCCAGTTATGTCGTTTGTTTTAATGGCACTACTTGTTATTATCGTAGGATATGGCGGGATGCGAGTTTCTAGCGGTGCATTAACAACTGGTGAACTTGTAGCGTTTATTTTGTATTTAGTTCAAATTATAATGCCGATGAGTCAATTATCTATGTTCTTTACACAATTTCAAAAGGCAATCGGTGCAACGGAAAGAATTAGTACGATTTTAGAATATGAAGTAGAAGATCATGAAACTGGTGTGAAAGTGGCAAATGCTAAGCAGCCGATCGTTCTTGAAAATGTACATTTTGAGTATAACGAAGAAGAGCAAGTTTTGAAAAATATTGATTTCATAATTGAATCTGGAAAAGTGACAGCGATTGTAGGACCAAGTGGTAGTGGGAAAACAACGTTATTCTCATTACTGGAACGTTTTTATGAGCCAACTAGTGGTGCCATTAAATTAGGAAAAGAATCAATTACGAGTTATTCATTACAGTCATGGCGACGTCAAATCGGTTACGTATCACAAGATAGTCCGTTAATCGATGGAACGATTCGTGATAATATTTGTTACGGTGTTGAAGGCGAAGTAACGGATGAAGAAATTGAAAAAGTAGCAGCAATGGCATATGTTGATGCATTTATTCATGACTTACCAAACGGTTATGCAACAGAAGTTGGAGAACGCGGTGTGAAGCTTTCTGGTGGACAAAGACAGCGAATTGCCATTGCCCGAGCGTTACTTCGAAATCCGCAAATTCTTATGCTAGATGAGGCAACTTCAAGCTTAGATAGTAAATCTGAGTCTGTCGTTCAAAAAGCGTTAAATAACTTAATGAAAGGCAGAACAACGTTAGTGATTGCGCATAGACTTTCTACTGTTGTAGATGCAGATAAAATTATCTTTATTGAGAAAGGGAATCTTACAGGTAGTGGTACGCATGATGAATTATTACAGACGCATGATATGTATCGTGAGTTTGCAACGCAACAATTGAAAATTAAAGAGGGTGCATTTTAAAAAAATATATTAGATGCTAAGTAGAAAGGAAATGGTTCCTTTGATACCTAAAATTTTAATAGTAGACGACGATCCACACATTAGGGAACTCGTTTCTGTATTTTTAGAACGAGAAGGTTTTCAAACATATGAGGCAATTGATGGAGTAGATGCACTTCGGAAAATGGATGACGTAAAAGTCGATATGGTTATTCTTGATATCATGATGCCAAATATGGATGGATTTGATGTATGTTTTGAATTAAGAAAATACTATGATATCCCGGTTCTGATGCTAACTGCCAAAGGGGAAACATCACAAAAAGTAAAAGGATTTCACCTTGGGACAGATGATTATCTTGTAAAGCCATTTGACCCTATAGAACTAGTAGTGAGAGTAAAGGCATTATTGAAACGTTACCAAATTACAGTTTCACAATCGATTCAAGTTGGAAATGTATTATTAAATCGTAAAACATTCGAAGTTACATCTGGAGAACAAACGGTTACGTTACCGTTAAAAGAATTTGAGCTGCTCTTTACTTTAGGGTCTAAATCGGGAAGAACTTGTTCGAGAGAGCAATTAATTGAAGAAATATGGGGATATGATTTTGAAGGGAATGAACGTACACTAGACGTTCATATTAATCGGTTACGTGAGAAGTTTCAAGAAGAGCAGTCGAAATTTAGTATTAAAACGATAAGAGGATTAGGGTATCGCTTAGAGGTAAGTAAATGAGAAAAAGAAAACGAATGAGTAAGTTGAAGATGCTGAAAGTATTTGGAGCGGTATTAGCGCTCTTTTCTTTTCTTACTATCATTTGGTCTATCGCATTTTATATAGCAACTAGTATATTGAATGCTTT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_018508|1404002:1412857|1405394_1406159_-|WP_001194308.1|DBSCAN-SWA MQTNIHSEKETIIFIHGLVGNRRAFKKEQKRFSASYNIITYDLLGHGDDKGEAIDFSLQRLVDQLLNLYEQENIKKAHICALSYGCYISTIFAQMHPEKVLSICHIGGHYNNPSRLYNVFQNFWEKRGDEYSKWLSQYANTIFPSGILKANPFAVISRNIYYRFGLQLHSSIIAQSLRHRLEFDLKSKLKSLPHPILWVMGEHDHLYKSCLFDLKSILPNVLYKEIPLAGHAANLFRPNYFHDLYDRFLNGKLK >NC_018508|1404002:1412857|1404002_1405295_+|WP_000755524.1|DBSCAN-SWA MKKVIAGLAAASVAGVAVPGMDSAHAQVSNEALKEINGQTQTQTTVTETKTVETTSELKYTVTADVLNVRSGAGTGHNVISKVKSGQVLQVVGQENGWFKVNVNGQTGYVSGDFVTTGGKTGTTVQQGTGTYTVNVSSLNVRTGPSTSHTVLGSVNKGKTVQVVGEVQDWFKINFNGGTGYVSKDFVTKGGSAVSNETQQPTTNNNTTTVQTGGSYVVNTGALKVRTGPATYNAVIGGVTNGKVLNVTGAENGWYKINHNGRTGYVSADFVKFVKGGVNNVTNNNNNNNNVTNNVQQPGKDVQKPTTGGDTSSIAGFARSLNGSPYRTAGTTPAGFDCSGFIHYVLNQTGHKGARQTVAGYWSSKTKTSNPQPGDLVYFQNTYKSGPSHMGVYLGNGQFISAETDATGVRISSVSNSYWSKHILGYTKAY >NC_018508|1404002:1412857|1411987_1412857_+|WP_001258546.1|DBSCAN-SWA MRTEKEMLDVIINTAIEDERIRAVIMNGSRVNPNVKRDCFQDYDIMYVVNDIQSFTSNHNWVHRFGEIMIVQMPEEMSLVQPDEDGKFPYLMQFMDGNRIDLTLVPVELIKKFVGQDSLSKLLLDKDNCLEEFPPASDKDYLVKKPTEKEFLDCCNEFWWCSTNIAKGLWREELSYAKGMLEGPVRDMFIVMLEWYIGMKTDFTVNTGKFGKHFEQYIEEDMWEQFKRTFSNAEYENIWESFFVMGDLFREVANEIANTYEYQYPQDDDKVTNYLKHVKALPKDSTSIY >NC_018508|1404002:1412857|1406395_1408156_+|WP_000453881.1|DBSCAN-SWA MEVRNEMKKKGSWRQFLRLIQDTNPPKGILVFALLMSLLSTGASLFIPMLTKGLVDNFSLSSISAGQIVGLVAFFVMQTIAAGLSIYLLNYIGQKIVAGLRERLWKKVLILPVSYYDQNRTGDTISRMTNDTGVVKTLISEHLSNLLTGGISIVGSLIVLFVLDWKMTALLLTVIPLSVLILVPLGRKMYKISKALQDETASFTSVLTQVLSEIRLVKSSNTEKREYETGNTGIQKLLQFGLKEGKVQALISPVMSFVLMALLVIIVGYGGMRVSSGALTTGELVAFILYLVQIIMPMSQLSMFFTQFQKAIGATERISTILEYEVEDHETGVKVANAKQPIVLENVHFEYNEEEQVLKNIDFIIESGKVTAIVGPSGSGKTTLFSLLERFYEPTSGAIKLGKESITSYSLQSWRRQIGYVSQDSPLIDGTIRDNICYGVEGEVTDEEIEKVAAMAYVDAFIHDLPNGYATEVGERGVKLSGGQRQRIAIARALLRNPQILMLDEATSSLDSKSESVVQKALNNLMKGRTTLVIAHRLSTVVDADKIIFIEKGNLTGSGTHDELLQTHDMYREFATQQLKIKEGAF >NC_018508|1404002:1412857|1410171_1410891_+|WP_000818985.1|DBSCAN-SWA MAELLQGKNALITGAGRGIGRAVAIALAKEGVNVGLLARSEENLKAVAKEVEAEGVKAVIATADVSSYEEVTTAIETLKNGLGSIDILINNAGISKFGKFLELDVADWEKIIQVNLMGVYYATRAALPSMIEQQSGDIINISSTAGQKGAPVTSAYSASKFGVLGLTESLAMEVRKHNIRVTALTPSTVATDMAVDLGLTDGNPDKVMQAEDIAEFIVAQLKLNKRTFIKSAGLWSTNP >NC_018508|1404002:1412857|1408196_1408874_+|WP_000612415.1|DBSCAN-SWA MIPKILIVDDDPHIRELVSVFLEREGFQTYEAIDGVDALRKMDDVKVDMVILDIMMPNMDGFDVCFELRKYYDIPVLMLTAKGETSQKVKGFHLGTDDYLVKPFDPIELVVRVKALLKRYQITVSQSIQVGNVLLNRKTFEVTSGEQTVTLPLKEFELLFTLGSKSGRTCSREQLIEEIWGYDFEGNERTLDVHINRLREKFQEEQSKFSIKTIRGLGYRLEVSK >NC_018508|1404002:1412857|1411603_1411858_+|WP_002083265.1|DBSCAN-SWA MLINKIIRLIFEWALKLSRPGTVIIGDNVVREGEVINDTSNDPRVQGIRRFYELIAAEPRVSATALQTVGSKGYDGFVMAIVKE >NC_018508|1404002:1412857|1408870_1409944_+|WP_001231613.1|DBSCAN-SWA MRKRKRMSKLKMLKVFGAVLALFSFLTIIWSIAFYIATSILNAFDVNVSPFVAFLISDMVGFVFIILIWTLIGILMRPKREAMIWTIIEPIQKIAKGDFSVKIRNEEKYDGEIGVLVKSINDMTDELNTMEKMRQEFVSNVSHEIQSPLTSIKGFARALQDDNLSEEKRKHYLTIIETETTRLSKLSQNLLKLTLLESEEYTPERVSYRLDQQLKQIVLNSEPLWAEKEIELDLDLEKVHVTADQESMSQVWINLIHNSIKFTPSGGTITIQLKEHETVVEVRICDSGIGISEEQKQHIFERFYKADSSRNRASGGSGLGLAIVKKVLDLHQGEIKVESEEGKGTEFIVRIPNYEEK |
8 | Bacillus_phage(71.43%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1598894 : 1605804
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_018508|1598894:1605804|DBSCAN-SWA CATGGAAAATATATTAAAGGTATCTTCAAAATCAAGCCCAAATTCAGTCGCAGGTGCAATAGCAGGTGTACTAAGAACAAGTGGTAATGTGGAAATTCAAGCGATTGGGGCTGGAGCTATAAATCAAGCGATTAAAGCAATTGCGATTGCAAGAGGGTTCGTCGCTCCAAGTGGTATTGACTTAGCTTTTGTTCCAGCGTTTCAAGAGATTTCTATTAATAATGAAGAGAGAACAGCGATTAAATTAATTGTAGGCCCTAGAAAGAAAAGGTCTTAGTAGAAGAGAGTGTTACTATAAGGGGAAAAGACTAATAGACTTCCCAGGTTAGATACGTTATTTTATGTAACCGATCCTTGGGTGTGGACACGGCATTATACCGGACGCATGTCTGTTAATTTCTCCTTAAATTTAGCAGGTGTTCTAAATACTTAAAAATGCCAAATCCTTTGTGATATAAGGGATTTGGCATTTTTGATGTTTTTAAAAATAAACAACCTTAAAACTGCTCATTTAGAAGATTTAGTTTTAGTAGCGGCCATTGAACGTTTTTATGATAGTTTACCTGATAAATGGAGAGAAATAGTAGCAGACAATATTGATTGTGCTAGTTATGTAGATGGGAAATATGAAGCGCACGTTTTAATGGAAAATGGTATGGAAATAAAAATAGAAATCTTTTATGTGGAAGAAGACAAAGATGAAGAATGGATATATAAAGCTTATAAAGTTTTATTATAGAAATTTCATTTTCATACAAAGGGGAATTGATATGAATTTTGTAAACTTTGAAACACAAGAGCAATTTAAACAGTTACAAAAAAATAATGTTGTAATTGTGAAATGGAAAAAAAGCGTAAGGCAGTACAAGGAATTAGGAGAAATCACACATCATAATTCTTACACAATTAATCGTATAAATGAATTGATTTTGAAAATAGTTTAGATGTTGTTGGAAATATAGTTAGTATATGTCCGAACTGTCATAGGTTGATTCATTATGGAAGAGACAAAGATAAGAAAAAAGTTTTAGAACTTCTCTTTGAACAAAGAAAAGATTCTTTGAAGAAGTTCGGTATTGAGGTATCTCTCAAAGAGCTATTTGGATACTATGGAATTCTAAAATAAGAATATTCATAGCTATAGTGAAGGTAGAATGTTTCATACTTAAACATAGGTATTATTGTGATGGAAATTTAAATTTCGTCTTTTGAAAGTATCAATAATTTGTATTATTTTTATAGGGTTATATATTTTTCTTTTGCTCTGCTGTATAGCAGAGCTCTTTTTTGTCGTACAAAAGCCACCTATATATGTGAAGTGCACCCCAATTGTTAGGCTGTGTCTAACAATTGGGGTGCACTTCAGTACTGTCGGGCGGCTTCTTTTAATTTATATTCACCAATTCATCAAACTTAAACTTAGTATTCAAACCAAAAGCATCTGTACAATATATAGTTTTCGTCATCGGTTCAATATGTAATACATTTATGTACATGTCTTGCACCATTCCATCACGATAGTATGAGGTATGTATTTCTTCTTCCTCGTGAAAAGATTGCATTAACGCTCTTTCTATTCGTTCCATAGTATCTTGTGTTAAAAAAGGTTTAGGTACTTTATATTGTTCCTCAAACATTCTATGTATTTCCTCGTATTGCTCCGGTATTGAAGCAAACGGATTCCATTTCACCATACCTCTTCCACGTACTACAGGAAAGCTGTTATATCCCATGATGTAATACCTCACGTTTGTTTTTTTAACTCCACTACAAATATGTGTTCTTTTTTAAGGTTTGAAAAGGGACCATTTTGTTAACATGAATATTCAAAAATAATTTTTTCAAGTTAGAATATTCAAAAACTTATTTATGCAAACAAGCATGTCATGATAACATTTAACAAAAGGGGGTAGAAGTAGATGAGTGTTGACATTATTTCTAAAGAAGAAATCACAAAATTATTAAACGAATGGTATCAAGCTATGATTTCACAACGTGTATTACAGTCTCAGAAAATAAAAGAAGATATTGCAAATAAAATCAATAATATTAAGGAAGACCAAACAATATTAGTCTACTACGCTTTATTGAATGCACGGTATAAACTGCTAATTCGGGATATGGATAGTACAAAAGATATTCTGGACAAAATCGAGCCTTTACCAGAGTCTACAGAAACATTTTTAGAGTACTATCATCATTTATTTAAAGCAATTTACGCTATTAATAAAGCAAACCATAGTGAAGCAAGAATGCAATTTGAAAAAGCTGAAACGTTTTTAGAGTACATGCATGATGAAATTGAAAAAGCTGAATTTAATTATTGGCTTGCAGTCCATTACTATCACGTATTAAAACCGATCCTAGCAGTTCAATTTGCTACAAAGGCGAATGAAGTATTTTCAATTAGTCCAGGGTATGAATTAAAAACTGCAGCATGCTTAAATACTTTAGGAATGGCACACATTCGACTAAATGAATTCGAAAGTGCAGAGGAATATTTACTTTCAGCACTAGGTACCTTCCAAAAATCTAATGATGAACTTCTTATTAAACGAGTTAAGCATAATTTAGGACTTTTATACGCAAGTCAAAACATGCCAGAGTTAGCAATTAAACACTTAGAGGATTCATTAGAAAATAACGCTAAAACTATGTTTCTTTTAGCAAGAGAACATTTTAAGTTAGGTTATAGTCATATCGCTAATGAATATATTGAGAATGGCTATAAGATTAGCGACTTATGTTATCGTCATCATTTCCGAATTTTAAAAGCAGTACATAACTATGTACCGCAAGAAGAATTAGAAAATGTGGTTATAGAAGGTATTTCGTATTTTGAAAAAGAAGAATTATATGATTGGGTAAAAGAATATGCTTCTCTTTTAGGTGAAAGATTCTATGGTTCAGAAAATCACAGAAAAGCAAGCAAGTATTTGCACATCGCTTTAGATGCAGACAAAAAGAGCATAGAAAGAAGGGCGCTAAAATGAAAAAAGCAATCTTATTAATGATGATGTTATCCGCTGTTTTTACTTTTGGTCTTACTAATGTAAAAGACATACCACAAAACGAAGCAATTGAAGTGTTTATGGATCATGGAGAACATATTTAAAACCTAAGGAAGAGGGCGCTTATAGTGTCCTCTTTTTAATATTTATTATTTATATGATGAGGTTGCAGGTACGTCTTTTGGTTATTGTTTGATAAACGTAAGATGTTTCTAAAAATGTGTATACAAAGGTGTAATTTTGTACTGTATATGTTCACATATTTGCTCACATTTTGTTCACGTACTATATAAAAAAGTATGAAAATCTATAAAAATAATTATTTCAATAAAATTTGTTTTAGATATTAAAAAGTGCCAAAACCCTTGTGGTATAAGGGGTTTGGCACTTTTGTGTTTTTTATATTTTATCAAATAAACAACCCTAAAACTGCTCATTCTTCTCCCAAGATTCAACGATATAATGTGCAATCGTCGGATTGAAGCCTTTACCAACTAAAAACATAATCGCAGCAACTTCTGTTAATGCGTGTTCATGTGATGTATGTTTTGCTTCATTTAAACCGTAATCTACCCATGGTTTTACGAAATCTAGTACGGGTTTCTTGAAAGGTAAAAACTGTGTACCGACAACTTGTTGAATTTGTTGTTGTGTTGGTTCAGTAATTGGTCCAGGTGGCAATATTTGTGGTTGTGTAATGTCTAGTGTTGGTCCAGGCGGTAAAATTTGTGGTTGAGTTGGATCTATTGTTGGTGGTTTAGGTGGTGAGACACGTGCGTCGTAGTTTGGTTGATACATTTGTTGTTGGTATTGCGGTTGTTGTGGTTGAGTTGTGTATGGGTTTTGTGGTGCTGCATATGGATTTTGTTGATATTGTTGTTCTTGGTTTTGTGGTGCTACATATGGATTTTGAGGATATTGTTGTTCTTGGTTTTGTGGTGCTGCATATGGATTTTGTTGATATTGTTGTTCTTGGTTTTGTGGTATTACATATGGATTTTGAGGATATCGCTGTTCTTGATTTTGTGGTGCTGCATATGGATTTTGAGGATATTCATAATTTGGACGTGCGTCATATGGATTTTGTTGAAATTCAGTTTCTTGGTTTTGCGTTGTTGCATATGGGTTTTCGTCATATTGTGGTTCTTGCTGTTGTAACTCTTGTTCTTCGTATTGTTCTGTGTATCTCTGTTCTTGTTGTTGAGGATACAATGGTTGCCTTGGATAAGGCGGTTGATTATTATAGAACATGTTTATTCCTCCTTCATGATGATGCCTACCACCTAGTGTATGGGCGGACAAGAAAATATGTGATGAAAAAATGCGGGCGTGTTACAATAAGTAACTGGGTGAAGATAAAATGACAAAACAAGAAAAAATTCAAAAAACAATTACTTTTGTAAAACATATTTTAGAAAAAGATGCGAGTGGGCATGATTGGTATCATATTGAACGTGTACATAAAATGGCGATTTCTTTATCTGAGCAAGAAGGTGGAAATCGTTTTATAATTGAAATGGCAGCATTACTTCACGATGTGGCAGATGAAAAGCTAAATGAAAGTGAAGAAGCAGGAATGAAAAAAGTTTCTGATTGGTTAGAAGAGCTACGGGTTGAAGAAGAGGAAAGTAAACATATTCTTCATATCATCGCCAATATGTCTTATAAAGGTGGCCATGGCGGCACAGTAGAGTCACTTGAAGGGAAAATTGTTCAAGATGCGGATCGTTTAGATGCTCTTGGTGCAATAGGAATTGCTCGTACATTTGCATATGGCGGGGCAAAAGGGAGATTAATGTATGACCCAACTATTCCGCCGCGTGAAGAAATGACGAAAGAAGAATATAGAAAAAATAATGATCCATCTTTAAATCATTTTTATGAAAAACTTTTGAAATTAAAAGATTTAATGAATACGAATGCAGCAAAACAAGAGGCTGAAATTCGTCATCGTTATATGGAACAGTTTATTGAACAATTTATGAAAGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_018508|1598894:1605804|1599368_1599632_+|WP_000478848.1|DBSCAN-SWA MFLKINNLKTAHLEDLVLVAAIERFYDSLPDKWREIVADNIDCASYVDGKYEAHVLMENGMEIKIEIFYVEEDKDEEWIYKAYKVLL >NC_018508|1598894:1605804|1602327_1603155_-|WP_000499713.1|DBSCAN-SWA MFYNNQPPYPRQPLYPQQQEQRYTEQYEEQELQQQEPQYDENPYATTQNQETEFQQNPYDARPNYEYPQNPYAAPQNQEQRYPQNPYVIPQNQEQQYQQNPYAAPQNQEQQYPQNPYVAPQNQEQQYQQNPYAAPQNPYTTQPQQPQYQQQMYQPNYDARVSPPKPPTIDPTQPQILPPGPTLDITQPQILPPGPITEPTQQQIQQVVGTQFLPFKKPVLDFVKPWVDYGLNEAKHTSHEHALTEVAAIMFLVGKGFNPTIAHYIVESWEKNEQF >NC_018508|1598894:1605804|1599815_1600019_+|WP_074789606.1|DBSCAN-SWA MDFENSLDVVGNIVSICPNCHRLIHYGRDKDKKKVLELLFEQRKDSLKKFGIEVSLKELFGYYGILK >NC_018508|1598894:1605804|1600278_1600626_-|WP_000541075.1|DBSCAN-SWA MGYNSFPVVRGRGMVKWNPFASIPEQYEEIHRMFEEQYKVPKPFLTQDTMERIERALMQSFHEEEEIHTSYYRDGMVQDMYINVLHIEPMTKTIYCTDAFGLNTKFKFDELVNIN >NC_018508|1598894:1605804|1598894_1599170_+|WP_000427801.1|DBSCAN-SWA MENILKVSSKSSPNSVAGAIAGVLRTSGNVEIQAIGAGAINQAIKAIAIARGFVAPSGIDLAFVPAFQEISINNEERTAIKLIVGPRKKRS >NC_018508|1598894:1605804|1600812_1601886_+|WP_000109862.1|DBSCAN-SWA MSVDIISKEEITKLLNEWYQAMISQRVLQSQKIKEDIANKINNIKEDQTILVYYALLNARYKLLIRDMDSTKDILDKIEPLPESTETFLEYYHHLFKAIYAINKANHSEARMQFEKAETFLEYMHDEIEKAEFNYWLAVHYYHVLKPILAVQFATKANEVFSISPGYELKTAACLNTLGMAHIRLNEFESAEEYLLSALGTFQKSNDELLIKRVKHNLGLLYASQNMPELAIKHLEDSLENNAKTMFLLAREHFKLGYSHIANEYIENGYKISDLCYRHHFRILKAVHNYVPQEELENVVIEGISYFEKEELYDWVKEYASLLGERFYGSENHRKASKYLHIALDADKKSIERRALK >NC_018508|1598894:1605804|1603908_1605804_+|WP_000783172.1|DBSCAN-SWA MKMLTVENLSKSYGEKPLFDGLSCSITEGQRVGIIGVNGTGKSTLLKIIAGLETPDTGDMTHSRGYTISYLSQQPEFDEKLTVLEQVFHGDTPLIRLLRDYEKALLNIEKDPSNEKVQEQLFAVQQRMDAMSAWEANANAKSLLTKLGITDFTAIVGNLSGGQKKRIAMAQCFIETPDLLILDEPTNHLDHETVEWLEEYLARYTGSVLLVTHDRYFLDRVTNRIFELDNGKLYSYEGNYSTFLEAKALREEQELAQESKRQNLYRRELAWIRRGAKARSTKQKARIQRFDELKEQEGPAAKQSVDIALSGSRLGKKVLELKDVTKKFGDKTVLHNFNHIVKPGDRIGIIGANGSGKSSLLNMLAGKLSPDSGEVEVGQTVKVAYYTQENEEMNLNQRMIEYIKEIAEVIHTTDGKVIGASQMLERFLFPTHSHGTPLGKLSGGERRRLYLLRILMGEPNVLLLDEPTNDLDTQTLTVLEDYLEDFPGVVLTVSHDRYFLDKVVDELFIFTGGGEVREFLGSYTDYLEMEKTRELMEKAEVQKEKKVVEEAPKQQRKRKLSYNEQREWETIEDTIAELEEKIESIGEELAKVGSDFTKAQELSEAQQKTEEELEKKMERWSELSDIVEGLK >NC_018508|1598894:1605804|1601882_1602008_+|WP_000709202.1|DBSCAN-SWA MKKAILLMMMLSAVFTFGLTNVKDIPQNEAIEVFMDHGEHI >NC_018508|1598894:1605804|1603264_1603912_+|WP_000165966.1|DBSCAN-SWA MTKQEKIQKTITFVKHILEKDASGHDWYHIERVHKMAISLSEQEGGNRFIIEMAALLHDVADEKLNESEEAGMKKVSDWLEELRVEEEESKHILHIIANMSYKGGHGGTVESLEGKIVQDADRLDALGAIGIARTFAYGGAKGRLMYDPTIPPREEMTKEEYRKNNDPSLNHFYEKLLKLKDLMNTNAAKQEAEIRHRYMEQFIEQFMKEWNAQI |
9 | Bacillus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2898896 : 2990640
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_018508|2898896:2990640|DBSCAN-SWA 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87 | Bacillus_phage(82.09%) | head,portal,tail,capsid,terminase,protease,integrase,holin,coat | attL 2978741:2978758|attR 3001578:3001595 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
3050146 : 3060495
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_018508|3050146:3060495|DBSCAN-SWA TATGAAAAAGAAACAAGCAATTACCATTCTTGCTAGCATAGAGACATATGAAAACTTAGCATCCTTTCAAACTCTTACAGAATTGAATGATACCGTTCGAACGTATAAAAAACAATTTGCTAATCAGTTAAATAAAAACCAATTGGCTGTACTTAATCACTTACACAGCCATTCTTCTAAATACTTTGGCGTTTCTTTTAAATCCAAAAAGAAGATTGCTGAAGTACTTCATATTAGTCGTAGAACAGTTATTCGTGCATGCCAACACTTAGAATTACTTGGTATCATCAAACAACTAGAAATGAAACGTAAAAGTGATATGAGACAAACAAGTAACATTATTGTAATCCAGCCAATCATCACAAAAGAAGAGTTTGTCACAGAAGACCCTACTAAAAATGCTGAAATTTGTCACACCAAGAAAACAACTACTAAAATCTTAAAACAAAGGATTAAAGATATAAATAAACGTAAAGAGGAAGTTTCGCAATCTTTTCGACATGATTTAGACTTCATTGATTATCGTGTGCCACAATCTATGCGTATGGAATTACAAACTTCTTTTTCATCAAATGTTATTAATGAATCCTTCAAAAATGCCAAAAATATTGCGAAGAAGGCTGCAAAACAATTTAATTTACTAGGGGATACAGATATATTTCACAACCTTCTTGCGAATGCTTCTTCGGTTTTGTACTCTAAAACACATAAGTACGAGCATAACGGAAATTTGATGAAAAATCCTATTGGATACTTTACTCGAACATTCAAAAGGATGGTCTATAACTACATTGATAACTTTAGAGAGATACATAATCTTGCAAATCGTAAGACAAGTGCATGCACTAGTGATGGGATATTTTATAATTGGCTAGAGGTTGATGGCTCAAAAATACCTTCCACAAAGACAATAGACAGCTCTTTTGCTCCAGGTGTATATTATAAAATCTCTAAAGAAGAAGCTGATGGAATGGGGCTATATTGAATAGAGCAGATGTCCTGATTTCACTTTACACTTCAGGTGCCACATATACCTTTGCATATACACCATGCTGCATAGCAAATTGTTCTAGCGTCTTTTGCCTATATGGTGTGATTGTAAAGAAGTGAACAATAGGAACTTTCCCGTTATATTTATTTTTATAATACAAGGTGAATTCACCATACTTATTCATTTTTTCACTGTTCACATTCATCATTTGTGTACGATCTATTTCGACTGCGTTTAAAATCCCGTCACTATCCCGGTACTTTACATCTGGAATAATCGTTCTCTTATTTTCATGCACTTTATAACGTATAGGGGCTTCTATCTGCCAGTCTTCGGGACAAAATAGATGCAACCACGCTTCGTTTCTCATGAGGCTGTGTGCTAATCGAATGGTGGGCACAACCTTTTCTGCATCATCGAATAACGCACGTCCTTGTTTATTGAGGTAGTATACATGCTCTTTTTTATAAACGGTACTATTCACATATGGGCTTAAATCTTTTAGAATCCGATTCGCATTCCGTATTCCTCCCATATCGTGAATGGCCATCAAATGTCTTCTAGTGGCGAATTTCAACTTTCTAATCGAGGTCAAAATCATCATCTGACGATTCATTTTGATATGTGTCTGCATATGCATCTTTTTTCACCTCGTATTGTTTTAATACGTCCCACATCTGCTCATTTGAGATATAAGGGACTTGAATCTCTGTTAATCGATCTGTTTTAAAAAGCGCGCGCCCTGGTATACTTTCAATCGATTCCAGACCCGTTTCATCAATGACAACTTGAGAAGCTGTTTGAGTTGGTAATCGAAATCCTAATTTTGCATCACTGTTTTGCTTCACTTGACGTGGTAAAGTATCACCAGTAGGGTACTGTGTACAAAATATCAATCGAAATCCTAATGCTCCACCTATACGCGCTATATGAGACAGCATTTGTTGGCAAGCTCCTAATAACTTTTGTTGTTTTCTATTCATACTTTTATCAGGACAAAGTTCTGCGCCTTCATCCACGATAATAAAATAGCGTTCTTTTATATTTGTTTCTACCACATTGGTATAATGGTGTTCTTTCATAAAAAGCATTTTCTCTTCCATCTTTTTCAAAACCATGTTCAATAACTGAAAAGCTTCGATTGGGTTTTCTGCAATCGACTCAATCTGTTTTACATTTTTGTATGGTCCGAACTCTAATCCTCCTTTTAAATCAATAATAAACAAGTGCGTATATTCTGCTTGTGCAGTAATAAGAGATGTCATCACATTCTTTAGGAATACAGTCTTTCCCATACGTGTTAAACCACCTAATGTCATATGTGGTGTTTTATCAAAATCGTGATAAATCAATTGTTCTAAACTTTGCCCTATTGGCACAAGCCATTTTCCACCTTGAATTAAATTGTTTGACCATTCCCACTTCTTCGGTATTTCTTGGTCGAATACACGAATGTTCAATTTATAATTGTCATACTGAATTCGAACAGGTTTATTTAACCCTTCACTTACAACATCTTCAACCTTTCGAATAATTTTACTTGGCATACCAACAGGCAACTCATACACGTATGTTGTACTTCTATCATCATGAGTTCGCTTTTTAAATTTTGGATAATGAATCTTATCATCTTTTTTAATTGCAATTCCTGACACTTCAAAAAATACTTGTATCTTCTTTTTATCATCTATTTTATTTTTAAAACGATCACTTACGAATGCAATAGTTAAAGCTGTCGTCGGGACCAATAGTAATTCCAGCATAAACATTTCTCCTTTAGATATCCTATAAGGATATCATTGCACTTTGTTGGAAGAAGACAGAACAAGCATTTTCGCTTATGATTTCTACTGTCCCTCTCTTCCACATCATATTCCTTCATAGAAACATAACGAGAACATAACGTAGAAGATATAAGAACGAGCCCGTAAGCGTCGTATACAAGGTTATACGTGGAAGCCAATGTGGAACACTCTTCCCCATTTTTTCAGCTACATTCATCGCGATTACAGACAAACCTGTTGCTGTCCAAATAATGACTGCTTCTCCTGCAAGTGTCATAACCATTCCTCCTCGGTCAGTTCTTCTTTTTCACGAAATTTAATCCCCGATTTAGTAGCTACAATCTGATACCGCTCCATTAAATCTTGCCAATTCAATATATCCTCCTCTTCTCCATATAAATCTTCTTCAATGACTTGTGATAAACTGAAATACCCTTTGTACTCTTTGTTATCAAATACTTCATGGTTCCTCATGTGAGTAAGAATTGATTCCGTCTCTTTTCTAGATCTTGACTCGTTATACATGTGGCGTAATTCTTTTGATGAATATAAATACGGCGTTACATTGAGATAACTATAATGAGAACGCATGTAACCCTCTCCTCTCTTGATATCTACAGTGCCATACGAAATTCCAAGTAGAATTCTTCGTGGGCTTCCATATGGAAGTAATATAGGTATATGACGTGGAAATTGTTTTTTGCATGTCCTCATCATTTTTTCCACTTATTACTTGTACTTTTTTTGCAGGTATTTGAAATTACTTGTAGAAATTGATTTCTTGAGGTGAACACGTATGAATTTTAAATGTAGATTGAAAATCATATTTGCAGAAATGGATATTAAACAAAGTGACTTTGCTAAAAAAATCGGCATCGACGGCTCGACTCTTAGTGCCATTGTTCGGAATAGAACTCAGCCAAGATTTGATACTGCATATATGATTTGTAAAGAACTAAAAAAACCTATTGAAGAAATATGGATACTTGAAGAGGAGTAACACAATGCAAAAACCACCATTCAAAACACTAAATCAAATCGTTGAAGGATACTATCATCCAGGAAAGGGATTATCTGAGGTTGCAAAGTTTATTGTAGAACATGAGGAAGAATCTTTATTTGTACTGGATTACAAAGGAATTTTGTATCAAAAAACATCCGGTCAAAAATATGATCAAGGTTACGAAACACTACTGCTTCCTTATACAGAAATTCATTCAAATTCAAAGCAAGATTTATTACAACTGTTAAAGCGAAAAATAATTGTTTATTTTACATATAACGAACGAGATCAACAGAAAGAAGAGTTTATACCTCATATGGGGAAGCAACTGTTTTCGTTTATGAGTCATCTACTGAAAAATATCCAGCAGAATAAAAAAACAAACTCAATTAAATTTATTCTCATGGATATTGAAGCTATAGGTTACATTCCTAAGCTTCCTAAAATTTTGGCTGGTTGCCGAGGGTTTAACATGGGGACCTGCTTATTTGTAGATGATAAAGAAACGCTACTATACGGATATAGCAAAGAACAAGTAGATAAGATGTATAAAAGCAGTATCGTTATTTCTAAAGTACACAAATAAAAAATCCGCCTCCAAAAGGAGACGGATTTCTTCGATATATTGAGTATTGGGGTAAATAGAATGTTCAATTGAAAATATAATACATTTAGATACAACAGTCAAGAACCTGTTCTATCTTTAATTCTTATTGCATATACTGTTTATGCATCTGGAGAATCACCACACGAGAGACACCTTCAACTGAGGAAGGTGTCTCTTGTTTTCAAAGCATGTTAAGCACTTTAGAAGCATATATTAAATTGCTCCGGCTATGTCATACAACATGCCAATCTATACAGAAAAAAGCACTCCCCTCTCACAAGGAATGCTTTTTTGTCTGCCCTATTTTACGCATATATAAAACCTTTTGGTAATTGCATACTATGCATACTCTTCAAAACCGTTCCATCCTACCCCTCAAACCGCACATACTCCCCTGATACCCATTGGTCTCCACCAACGTTGTACCAGCCATTTTGAATGCCCCAAGATTGATAGCGTTCTCCGCGGTACACCTTTTTCACAATGTCGTAATTCGTTCCTGGTCCCGTACGAACGCGTAATACATCCGCTGTAATGGTAACGACACCTACACCATTGTTAGACGGTTGTGTGGATGGTGCTGTATTGCCGCCACCGTCATATGCGTTTTGCACC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CTATGGTCCTCATTATTTTTGTCAAATGCAAGGCTTTGATAGACATTCTCTAAAGGTTCTTCCTCTTGTCCTTCTTTCAAAGCAAAGATTTCTTTTTTATTTTTTACAAGATTACCTGTATTTTCATTCCGAACTTGAATGGATTGCGTATTTTTTTCATATTTATCTTGATTCCCACTATAATAATCCACACGTCGAATATCTTGCTGGGCCGTATTGGAATTGAGTTCAATCATGCGTTGAAGCGTAGCACGCTGATTATCATCTAGACCACCATTGTCTTTTTCCCAATCCTTCACCATAGAAGACGCTTGTTCTCTTTCTATATCGCTTTTCTTTTTACGAGGCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_018508|3050146:3060495|3056223_3060495_-|WP_014895315.1|DBSCAN-SWA MPRKKKSDIEREQASSMVKDWEKDNGGLDDNQRATLQRMIELNSNTAQQDIRRVDYYSGNQDKYEKNTQSIQVRNENTGNLVKNKKEIFALKEGQEEEPLENVYQSLAFDKNNEDHRKPPERNPFLDQIKAANSISQSTSTDWMKQQEEASRTNRMMSTIDRIAKQPPQEGGFFDDLKFGAKKFGEMIKPPEGKTRQEVWDEYMKDGGKSRGTKEVNRFANRTMDSTLLNAPSAAMKKVRAQDSVDWQDHREGVGENIADFVSTGIGYVLPGAGAANVAGKLGMAAKVGENTSKLGKIGQYAKEGAVTGALIAGAETPAKAYVNPEQTVGDHLKRIGVETAAGAAITPLAHGLMNAVQNLRKTKGNTSTSNVSDDVIQQERQQREFTNQAAEEQALQDTRIKNEPESLPIQAASESAPSLEQAIESVAKQKKKASSNGELPDDVQAMRHAPPVIQSAMAPDGRTITQKKLMDSFRDNVGITLRTGRMGLGDDAVSGIYKNSPEVIRTRDYGDLETLAHETGHHLDKKFGLNDPKFDDELMKLGSHTSGQNYTPEQIRQEGMAEFMRRYLLNPAMAEQEAPAFMKHFQNTIPEDVQKGLKTVQEDAQIWANQGDEARFRGKINVNEKTKGLERVKQVLQKLPNSKEELYTDVMDRLYPISKAEKEILGGELADASVSPYKKARLAAGTPKKAQMKVEEFRNIFGDSKVDMADIRDYVTATHARDLEKQGIKTGFTPDEIEKTIAKFDNPEIQAAHKKIKAYNDSLLDMLVEGQMLSKDAVTAMREKHPNYMPFNRYFDEEGMGEGFGGGKGFVDLTNPVKRIEGSSRNVIDPFESIVKNTFKSMQAIERNKVGLALADLAENEGAGKWIEKLAGDGKESVAKENIVTVFRNGEKQQYQLAPELYRAVKAMDKEVTNKFILAASKPSDWLRAGATLTPEFALRNPIRDQFAAYVVSDTGYNPFDFVKGLKEVGKKKFGKGSEVYDDWVNQGGAYGGYLSADRDLLKEQLSGLEKQESGLPKAIKAITAPVNPKNWLKVLQNISEVSEEATKVGAYHKGLKKGLTPEESAYQARDLMDFNRMGNSMQSANRIFTFLNANVQGKDKLIRAMKEHPVRTSARIAGSTLPPSALAIASYANANDKQKEMMDNMPQQEKDTYWSYAIPGTDKVGRIPKPFDISLLANTVERANKYREGNQYAFDGFDKTVNDAVKVPWIPTTLQPIVENMANYSFFRDGPIVPKRDEKNSPKEQYGPNTSLTAREMASALDKVGIEASPYKIDNLYKGYTAGLGQFPLKGLDSAISLISNKGVPTPIAQEWNESTPGAKAFFVNGQGGGKVMEDYYNIMDEQQAIQADSKKNEEDASNAEEMKVFNRIDRDMAKLRKEYYVVKSDTEMNPEVKRSELDRLDEEMRALARKGITVFRPDYK >NC_018508|3050146:3060495|3051717_3052899_-|WP_014895314.1|DBSCAN-SWA MLELLLVPTTALTIAFVSDRFKNKIDDKKKIQVFFEVSGIAIKKDDKIHYPKFKKRTHDDRSTTYVYELPVGMPSKIIRKVEDVVSEGLNKPVRIQYDNYKLNIRVFDQEIPKKWEWSNNLIQGGKWLVPIGQSLEQLIYHDFDKTPHMTLGGLTRMGKTVFLKNVMTSLITAQAEYTHLFIIDLKGGLEFGPYKNVKQIESIAENPIEAFQLLNMVLKKMEEKMLFMKEHHYTNVVETNIKERYFIIVDEGAELCPDKSMNRKQQKLLGACQQMLSHIARIGGALGFRLIFCTQYPTGDTLPRQVKQNSDAKLGFRLPTQTASQVVIDETGLESIESIPGRALFKTDRLTEIQVPYISNEQMWDVLKQYEVKKDAYADTYQNESSDDDFDLD >NC_018508|3050146:3060495|3053716_3053920_+|WP_001009469.1|DBSCAN-SWA MNFKCRLKIIFAEMDIKQSDFAKKIGIDGSTLSAIVRNRTQPRFDTAYMICKELKKPIEEIWILEEE >NC_018508|3050146:3060495|3051155_3051776_-|WP_003262705.1|DBSCAN-SWA MHMQTHIKMNRQMMILTSIRKLKFATRRHLMAIHDMGGIRNANRILKDLSPYVNSTVYKKEHVYYLNKQGRALFDDAEKVVPTIRLAHSLMRNEAWLHLFCPEDWQIEAPIRYKVHENKRTIIPDVKYRDSDGILNAVEIDRTQMMNVNSEKMNKYGEFTLYYKNKYNGKVPIVHFFTITPYRQKTLEQFAMQHGVYAKVYVAPEV >NC_018508|3050146:3060495|3053193_3053511_-|WP_001256514.1|DBSCAN-SWA MRSHYSYLNVTPYLYSSKELRHMYNESRSRKETESILTHMRNHEVFDNKEYKGYFSLSQVIEEDLYGEEEDILNWQDLMERYQIVATKSGIKFREKEELTEEEWL >NC_018508|3050146:3060495|3050146_3051130_+|WP_000730121.1|DBSCAN-SWA MKKKQAITILASIETYENLASFQTLTELNDTVRTYKKQFANQLNKNQLAVLNHLHSHSSKYFGVSFKSKKKIAEVLHISRRTVIRACQHLELLGIIKQLEMKRKSDMRQTSNIIVIQPIITKEEFVTEDPTKNAEICHTKKTTTKILKQRIKDINKRKEEVSQSFRHDLDFIDYRVPQSMRMELQTSFSSNVINESFKNAKNIAKKAAKQFNLLGDTDIFHNLLANASSVLYSKTHKYEHNGNLMKNPIGYFTRTFKRMVYNYIDNFREIHNLANRKTSACTSDGIFYNWLEVDGSKIPSTKTIDSSFAPGVYYKISKEEADGMGLY >NC_018508|3050146:3060495|3053014_3053197_-|WP_000170774.1|DBSCAN-SWA MTLAGEAVIIWTATGLSVIAMNVAEKMGKSVPHWLPRITLYTTLTGSFLYLLRYVLVMFL >NC_018508|3050146:3060495|3055899_3056124_-|WP_003261708.1|DBSCAN-SWA MEDIKKKIEELTLEQKEIMREIRNLEMRTTINEKDISTVNKQLEKISLNTTWILRIVIGGVVTGVLGLVVKGIM >NC_018508|3050146:3060495|3055602_3055833_-|WP_000392441.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA MEEQIFNSMIQQGAFAALFVWMLFTTQKKNEQREEQYQKVIEKNQDVITKQAEAFGDLSKDVSEIKQKILGSGDVQ >NC_018508|3050146:3060495|3053924_3054509_+|WP_001171598.1|DBSCAN-SWA MQKPPFKTLNQIVEGYYHPGKGLSEVAKFIVEHEEESLFVLDYKGILYQKTSGQKYDQGYETLLLPYTEIHSNSKQDLLQLLKRKIIVYFTYNERDQQKEEFIPHMGKQLFSFMSHLLKNIQQNKKTNSIKFILMDIEAIGYIPKLPKILAGCRGFNMGTCLFVDDKETLLYGYSKEQVDKMYKSSIVISKVHK >NC_018508|3050146:3060495|3054898_3055603_-|WP_000405770.1|DBSCAN-SWA MEIRKKLVDPSKYGIKCPYTMNPEFITVHNTYNDASAENEIAYMIRNNNEVSFHIAVDDKEAVQGIPLERNAWHCGDGGGNGNRKSIGVEICYSLSGGDRYYKAENNAAIIMAQLMRQYNIPISKVRTHQSWSGKHCPHRMLAEGRWGSFIERVQNAYDGGGNTAPSTQPSNNGVGVVTITADVLRVRTGPGTNYDIVKKVYRGERYQSWGIQNGWYNVGGDQWVSGEYVRFEG |
11 | Bacillus_phage(100.0%) | bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
3064935 : 3090676
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_018508|3064935:3090676|DBSCAN-SWA TCTATTTGGTATATCCAGTTGCTTCTTGCACGTCTGACAGTTGCCAGAAGGCATTACGTGCGTGACATACCATTGTTTCTAACATATACGCGGTCGCTTCATATGCAGCTTTATTCGGTACACGCGAGAACATCGAACCATCCTCTTCCATGAACTGAAGGTCCGCTACACGGTATAATCCTAAATCGTCATAATTTCCTCCCCACACAATACCTGCCGGCATATAACGGTCTACTAAGAATGGTTTCCCATCAAACTCTAATGCAGAATAGCCACCTTCTAACTGCATTACATTTGTGTAGCGTTTATTTGTAGTCAGTACAGCCTCGTATGCTGCACGTACACCGTGCGAACCCATAAGAAAGTCTGTTTCTTTCCCACTCACAATAGATGTTTCATCCATCACTAAACGTAGTAGCGCATCGGAAATCGGACGAGCCGTTCCATTATTCGCAAACATATTTGCTTTCCACCATGTATATGTGGAAGGATTTAACCCTTGTAAGATGAGCTTATCATCAATAATTCCATTTAACCCCATTGGCTCTAAATTAGAAGACCCAGCTGACACAATGCCATCTGTTGCCGCGGTTGCAACTGCAGCACCATCAATCGTAATGGTAGTCGCTGCACGATCAATTGCTGTAACAGTTCGATTGCTGGTTGTCACGCTACCTGTCGCATTGACAATATCTACTTTTTGTCCAACGAAGAATCCCTTCACACTACTTACCACAAGTGCATTCGCAGCCGTCGCCTGTGCGGTACAATTCGCAATACGTCCTGAACCATTACCGAAGGTAACACGTGCACGGAAGTTCTTCATATCCGTTGTTAAACCTTTTACCTCAGATTCTACTGCACGAAGATAAGACGTTTCATTTTTCTTCGATGATTCAATGGTTTGTACGGTAAGTTCTAAACGACCAGCCACCATACGTGCTGTACCTGTCGAGCTCTTATACGCTTGTTGCCCCGCTGTTGGTAAGTTACCATTTTCAGCAACTGCTCCAACCCCCGTGTTACGTCCAAAGTGGTGAGGAATTAAGAAATTCGAACCATCACCATTAATCTTTTCCACTTTCTTTTCTAACTGTGAAACGATGTAGTTCGCATTGTTAATCTGTTCTTTAATCCCTGGCAAGTAATCGATTTTTAAAACATCCGCTAATGTCGTTAATGTAGCACCCATAAGTAGGATACCTCCTTAAATTTGTTGGTTTGCTGATCGTAATCGTTGTAATGCTCTTTCACGCGCCACTTTAAAATCTGTAGTTGGTTCATCCGAGACAAGTCCTGTTACACCAGGACCTTCCACCTTCGGCGCTTTCTTACTTTGTAAATATTCTTGAATGGCCGTTTCTTTTGCTGAAGTAAGCTGTTCTTCTAACTGCTGCGCACGCATGGCGTTATACGCCACTTCAAAATTAGGAACATTTTGTTCCACCATAAATTGTTCTAACGCTGCTGCATCTGCGCCTTTTTCTTGCGCGAATTGCCCTAACGCTTGAGTGAATCGTTGTGATAATTGGTGCTGTTCACGCTGATATTCCAGTTCTTCTGCTCTTTGTGCCTTTGCTTCCAGACTCTCTAATTTCTGCTGAATTTCAGGCGTCACACCAAACTTTTCAGCACGTTGTAATAAGTCTTGTTGTTCAATTGCTTGCATCATACTATCAAGATCGTTGTACCCTGCTTGTTGTTGAAAAAAGTTAATCGCACGATCATACTTGTCATAGTTACCATATCGTTCAGAAACTTCTTGTTCCCAACGCTGACGTTCTTCCATAAGAGCCGCTTGTGTACGTTCTTGTAATCTCTTCGCAAAAGCTTGAGATTGTTCAATATTTTCTGGTGGTTGCCCTTCTGGATTATTTTCTATTGGCGGTTGCTCAATTTGTTCAGGTGGATTTGTGACCTCACCTGCACCTTGTGGAGGTGCGCTTTCCCCACCTTCAACGCCAGAAGATGCAGTTTCAATTACTGCTTCTCCGCCACCTTCCAAACCATTAAAGAATTGAAAATTACCTAAACGTAAACGAAATGGTTTTAACATATTTCTTTCCTCCTGTGGGTGGGCGCAAGTCCACATTCAACGCCCGAATTTTTGTATATAAAAAAGCCGCTTTTTATAGCGACTTACTTAGCTAATTCACATTGCAATCTGTAGCCCTCTAAATGCCAAATCTTATCAACAATTCGTTCTTTGCAACATTCAATTCCAATGTTTACATCATAATTAGTAGGGTCAACACATGCACTGGATTCCGTCAGAATGAAACCATTCGGTAATTTAGCAACAACTACTGTACATTTACCGTGAAACTCTTCTACCGTCCACTGTGTTTTATCTAAAATAGCGTTAATATCTTCTTGTGTAATTTTATTTTTCATTATTCAACCACCATCCAATCCTCTGCTAACACATCAGAAGTGCTAGGGGACCATGTAGCAACATCGTTTTGGGCTGTTTTCAATGCAAGATATGCACGATACGGGACATTTTCTCCGCCAAATGCTTCTTTCATAATATCTGTAGCTGGTGGATATGATGCAGCAGGCACATAATAAACAAACATACATTTCCCGTTCCAACCTTTACGTGCAATTTTATTCCCTTTTTTAACTGCTTCAATTGCTTGTCCGAATTTCATCATTCAACAACCTCCCAATCTTCTGCTAACATATCTGTTTGTGATGCTAACCAAGGAACAAATGTATCATCAACTGTTTTCATACCAATCCAGGGGAGGAGTCCTTTGCATTTGTTACCACCTACCACCTCAAAAGAGATATCAAACTCCCCCTGCTTTACGAGTCTTACCCACATACCTACATCATTCCAACCTTTACGAGCCACTGTCTTACCTTGTTTCAATGCTTCAAGCGCTTGGCCAAAAGTCATTATTCTACAACCTCCCAGTCATTTGCGAACATATCCAAGTTGGTTGGCTTCCAACCTACGGATATTGTATTCTGCGCGGTTTTAATAGCAATTGAATCCTCAAATCGCGGTTCCCCTGCATACTCTCCATATCCATATCTAAACGCGGTAGAAAAATCGTTCCCGTTAACCAGATACAGAAACATCCCTTTACCATTCCATCCGGAACGAAATACCCTTTCTCCTTCTTTTAACCGATGCCATGCCCAACCAAAATCACCAATAGTTAAATCCATTTATCTCTCACCCTTCTGCACTTGTTTTTCTACTTTCTTTTCTTCAATATCTAATTTACGATGTTGTAACTGTAAGTCTTGTTCTTTCATAGCTTTCTGCGCTTCTTGCATGTGTTGTTCTTGTTCCATCTGCTGCCTTCTATCCGCTTCCATTGGCGCATTGAGTGCCTCCATATGTTGCTGTACATGGTCATCAACTAACTGTTGCACTTCAGGCGGTAATTCATCGTATAAGCTTGATTTTCGGAATGCATTATGAATATATACATGCACTTCATGGTCATAAAAATCACGCACCTGCGGTGTCGCCAGTGGTAGTTGTGGAGGTTGCATGCCAGCCTGCATGGGGTCTACACCTTGCGCTTGCATCGCTTGGGCTTGCTCCTCAAACTGTTGTTGCTGGATGCTGTATTGTTGCAATGCTTGTAACGACTCTGGATTCTGTGCAATTTCCTCGAACTGCTTGTTTTCCATTTTTGCTTTGTTTTCATCAAGCTGCTGCATTTCAAACAGCTCATTACTATCTCCCATACCCATTAATTTTAAAAATCCTTGGGTATCTGGTGAGCCGTCTTTCTTAACAATTGCCCCTTTATCCCACATGGTCATAATGCGGTCTTGTTGCGCCGATTTCATTTCAGGGAGAGAAGAACCTTGAATAATATTAATGTCCTCTCCACCGCTTAAATCAGACCCAGTAAAGCTTACTAATTCAATATCATTATCCGGACCAAGAATACGGGCCATACGTTCCTCTGTATAATGTTTCTTCATCAGCAACAGTACACGTTGCAATAAACGCTTCATCCCATGCTCATAGTTTTGAGAAGAAACGGCAAGCTTCTCATTCTCCTGTTCTACCATGAGAGACAATCCGCTATACGTATCTAATCCAGACGGCAAACGTCCTTGTGAGATTTCACGCGCACCTGATAAATCGTCGATATCAGCATCATGATTATTTAAGATACGATCATAGAAGGACGGGATATCTGGCGCACCAACTCTTTCCGGTCTCACACCCTCTATCGGTGTATAGTGAACAATTCCACCTTCTTCATTTGTAATTTCATCTTCATCCACACTTGACCCCATGGGCACAAGCCACATACTATTCCCCATTTTCCTTGCATGTGTGGCAAACATAGAGCGCATAATATTGATTTCACGCTGAATCGGCAACATATCTTTAATAAATGCTTCCGCTTTTACGCTCCCTGGTATCGGAATATCACCAAAGATAAAGAAAGGAATGTCCCCAGCATTTTCGTCTATATCCAGCAATTGTCCACCTGCAATCGTAACTTTCAATCCATTTGGATGCTTACCACACGGTTTTACCCACATTTCATCCACCATTGCCATGTTGGGGCGTTTTTTACTAGTCGAGTTGAATCCATTTTGTGGTGTCACATCAAATGCAGCCGCAAACCCTACATTCTCATCAGCAGCGACATCTTTTCCGTAGCGCTCTTTAATGTAATCAATATCACGTGGCTTTCTTTCCACAATCCAACGAATCTCTTCGTCCATTTCAGCGGCGGGGTCAATGTATACAGTGAGCGGGTCACAAATACGACACCGAATTTCACCCGTATATAAACGTTGCATATCTTCCTCAAAACCAACTTCGCCTTCCCCTGGCGTAATATCTTGACCAGCTTCCGCATCAAAATATACTTTTGCGGCACACCAGCCTTTTACACCGTTATTCAGGAAAATATCACGTGTTTTACGATCCATTCCTGTTTGTTCCCACCAATATTTAAGAAATTTTGATGCTGCTTTCGCAATTTCAATGCGTGTTTCATCGTTACTAT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MTKMQTFAHNMFGNLEVFIKDGKEYFPATDVAKVLGYTNPHKAIRDHCKQEGVNETLVPTNSGKQMKKFINEPNLYRLIAKSKLPQAEQFEKWVFEEVLPSIRKHGAYMTPHTINALLQDPDLLIGLASQLKQEQQARQVAEQKNLMLTQQVAEHASKITYLDQILQSKDTVTVSQIAADYGLSAVRLNKILKDEKIQYKVNNQWLLYAKHQNKGYTKSQTIDVTHSDGSKSVKMNTRWTQKGRLFIHDMLTKRGIIPEMDKEAV >NC_018508|3064935:3090676|3066141_3066990_-|WP_000917220.1|DBSCAN-SWA MLKPFRLRLGNFQFFNGLEGGGEAVIETASSGVEGGESAPPQGAGEVTNPPEQIEQPPIENNPEGQPPENIEQSQAFAKRLQERTQAALMEERQRWEQEVSERYGNYDKYDRAINFFQQQAGYNDLDSMMQAIEQQDLLQRAEKFGVTPEIQQKLESLEAKAQRAEELEYQREQHQLSQRFTQALGQFAQEKGADAAALEQFMVEQNVPNFEVAYNAMRAQQLEEQLTSAKETAIQEYLQSKKAPKVEGPGVTGLVSDEPTTDFKVARERALQRLRSANQQI >NC_018508|3064935:3090676|3064935_3066126_-|WP_014895319.1|capsid|DBSCAN-SWA 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MCYVHEGRYKKAPHSEFVGGVIQEAIDKKKQMNASEIPTTNQYIAINMPPRHSKSMTITETLPSYYLGNFPEDRVIEISYSDTFARRFGKKNKEKVKMYGTDLFDIKISKESSAHDEWLLDNEIGGMISRGVLSGITGMGADLMIIDDPIKNREEADSETHRGKIWDEWIDSFSTRLHPGAIVILILTRWHEDDLQGRLLSKEYGEPLPWQVYNLPLEAEEDDVIGRAVGEPLWPERYGLEFIQERKRYPSSFNSLYQGRPTAAEGNLLKRKWWQYYDTLPKMVHTIMSIDATFKDEADSDFVCIQVWGKNGADMYLIDNLKARMNFPTTLQAIRNMVRKYPKAHAKLVEDKANGPAIISMLKNEIGGMIPVNPQGGKVSRVNAVSPYIESGNVYLPRQAPWVHDFVEECASFPQGKNDDQVDAMSQALNRFIYYHANEKFIPKEPVTLEEKVHRHIIRLSRGRRKGGQLQ |
36 | Bacillus_phage(56.52%) | integrase,terminase,capsid | attL 3054451:3054469|attR 3101622:3101640 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
3205998 : 3214289
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_018508|3205998:3214289|DBSCAN-SWA CATGGAAAAGTTAACGAAACGCCAGCAAGACATTCTCGACTTTATTAAGCTAAAAGTACAAGAAAAAGGATATCCACCTTCCGTACGTGAAATTGGTCAAGCAGTCGGCCTCGCTTCTAGTTCTACAGTGCACGGACATTTATCACGATTAGAAGAAAAAGGATACATTCGACGCGATCCAACAAAACCACGTGCCATTGAAATTTTAGGCGAAGACCGAATGGATACGGAAACACAATCTGTTATTCAAGTTCCAATTGTCGGAAAAGTTACTGCTGGTTTACCAATTACAGCGGTCGAAAGCGTAGAGGAACATTTCCCACTTCCAGCTAGCATTGTTTCCGGAGCAGACCAAGTGTTCATGTTACGTATTTCTGGAGATAGTATGATTGAAGCTGGTATTTTCGATGGAGATTTAGTTGTTGTTCGCCAACAACAGTCTGCATATAATGGTGAAATTGTAGTCGCTTTAACAGAAGATAACGAAGCAACTGTTAAACGTTTCTATAAAGAAAAAGACCATTTCCGTCTACAACCAGAAAACTCTTCATTAGAACCTATCATTTTAAAACAAGTGTCAGTTATCGGGAAAGTAATTGGCGTATATCGTGATTTACATTAAAAATAACAAAAAGAAGATAATTACCTTATTTATATACGGTAATTATCTTCTTTTTGTATTTTGATAGATTTCCATGCACTCTATTTCTTATTAACGAGTTTCAATCGTGACATCTCCAGCAGCCGTTTTACCGCTAATCTTTTTACTACCATTTCCAATTGTTACGTTATTATTTTCTTCATTAAAAATTGTTACATCTCCGGCAGCACTTTGCCCAGTAATTACCGCATCTTGTGGTTTTTCCGATAAAGTAATATCTATATCTCCCGCAGTTGAACTTGCTTCTAGATTATACTTAGAATCATGATCTTGAATATTTATTTCCCCACTTGTTGTTTTTGCGGTCACTTTCCCTATTACTTTTTTAAAGTTCACCTCACCAGCTTTTGTAGATCCCTCCACATTCTTAGACGTTACTTGTTTCAGCTCTACTTCTCCAGCAAGTGTTCTAACACTTACACTATCACTTTTCACATCACTCATTTCGATTTGTCCAGCAGATGAATTTACTTTTACATCTTGATAAGAGCGTTCGGGCACAAGGAGAGTCAATTTAGACGTTTGGAACCTAAAATCGTAAAAAGAAAAATCAAATGAAGCACCTTTTTCTCTTTCCCCAATAATTTTTAATGTGTCACCATCTTCTGCAATACGAATCACTTGTTTACGTACATCTCCTGATTGCTTTACATAAAAAGAAGAGTCAGGAGATTTTTGGATAACAATATCTCCGGCATCTAACTTAACTTCTATATTTTTTAATGTTTCGTTTTTAATTACATCTTCTTTATCGCCTTTTTCAGCAGTTTGTACTGCTTTTTCATATGTTTGGGAAATTCCTATTACTCCAATAATGATACAAGCGATAGCGATTAAAAATAGTTTTTTCATCATTTACTCTCCTTTTATCATTTTGAAGTTCCATATTACGTATCGTACACACAATCTCTTAAACCACTTTGTACTATAAAAAGCGATAATACATAACAACAAACCTACTCCAACAAACGTTATACTAACGAAAAGATCCAACCATATAAAAGTACCCATAAATACTTTTCCAATAACGAAAAATGGTGTTACTACACTAGCAATACCACCAATCCAAAAAGAAAATATAAAAGCAATAATTGCGACTAACGGGCCTAACACAATAATAAAATTAAACAAACTAAGTCCAATCGCTGCCATAACAGCTCTTGTCACATTTGAAGTCGATGGATTTTTTTTCATTTCATCGAAGCGATACATCGCAAGTAATTCTTTTGCGATTACTTTCGGAGAACCAAGGCCCTGTATTATTTCTGATTCAGTTTTCCCCTCTTCTAGTCCAAACTGAAAGTGCTCTTCATAATCCAATAAAATATCTTGCCTCTCTTCCTCTGGTAACTTTCTAAGATAACTTGATAATTCTTTAAGAAACCCTTCTTTACTCATCCCATTCCACCCCTTCAATAATTTCTTGTACCCCTTTCGCAAAATCACGCCATTCTGTTACTAACAAATGAAATTGCGTCTCCCCTTGTTCTGTTAATTGATAATATTTACGAGGTGGCCCTTCCGTAGATTCCTTTAAATACGTTTGAAAATACCCTTCTTTCGTCAAACGACGTAACAAAGGGTATACTGACCCTTCCGATATTAAAAATTTATTAGAGATTTGCTGAACAAGTTCATAACCGTAACTATCTTTACGTTTTACAAGTGCTAATACACAAAGTTCAAGCACACCTTTTTTAAACTGAACGTTCAAGTGCCATCCTCCTTCCCTATCTCAGTACTGTTCAATACACGGTACCTGATTTATCCATAATATACCACTTAGTATTATTTATTGCAAGGTACTAAGCTATATTTATTCCCTAAATTTAGAAAGCGAACTAACGAATCCCTGAATAAGACTGTGTTATAACTAAGCATCCTTCAAGGTTTCATTTCATTTACATTAAATATTAGACTTCATTCACTCTTTCCTCTTGAAGAATCCACCACAACCTTATTCACTATAGCTAATGAGAAAAAGCCCCAATACTTATCGGTATTAGGGCTTTTTCTCATTATTATATATTAATTGAATTTCTATTTGAGAACCTACATACGCGACAAATAATTTAATATCATATTTTATTTCTCATCCCCGTTTCCCAATATTTTTTGCTTAACATCTGATAAATCCTTTGACAACGAACTAAATGCTTTTGCTTGTTCTTCAATGACCTGTTGATTTTTTTCAATAACTTTTTGATATTGTTCTTCGCGCTGTTCATTCTTTTTTTGCGTAGTAAACAGCATCCACACAAATAAAGCTGCGAATGCTCCTTGTTGAATCATTGAATTGAAGATTTGTTCTTCCATCGTTCTCATCTCCTTTTCAAAAATTAAAAAGAATCACACGAGTGACCCTACTCTAATATCCTTATCTCACATTAAAATGTTCTTCTTTTACCCATGTATTTTGTCCAATATCGATATAACCATCTTTTCTTGCAAAAATCCCATATGGATAAGATCCATCTACATTTCCTTTATAATTTCCATTTGGACCATCATATGTGTTAATACCATAACCTGCTGGATATTTTGAATAAGCATGGAACCACTCTACTTCAAAGTGTTCTTCTTTTGCCCATGCTTCCCAACCTAGGCACAACATATTTTCATTCCCACCATACCAAGCAGCATCTATAATTAAATATGGCATTTTTGTATTAATGACATGACCTGTGAACCAAGCATCTTTTCCAGGGCCACTATATAAATTGATACCCGATCCTTCTGGGTATTTAGACGTTGCGATTCCTAGTCCTTTTGGTTGTAACGGTTTATTGTCACCACCATCAGTTCCTCCGTTAAAATCAACATATTGCTTAACAATTTCAGAGTAGAAGAAATTCCCCCCATTTTTATATCGATAACCACCATTGTAGGCAACAGCGATAGGGTGACTATATTTCACCATAGCACCAGTTGTATTTCCGAGTGATGGAGCAACAACTGTTTTAGAATACAAATCTGCTACCGGTAATGAATGCTGTTTATTGTTAGAAGCTAACCAGCGAAGGTAAGCTCGTCCAAAATTATACGATTGAACAATGGCACTTAAATCTGTAATACCATTTTTCTTTGCATCATCAAAAGCTCCCTTTAAATGCTTTACTCCGTAATAAATTGAATCCTTAGGATTTTTAATTGTATTCATTGGCCAACCTTGTGATTCACTGGACTGCATAATATCGGGGGGTGTTTCAGAGTTCCCTCCACTTTCCACCATAATAATTCCAAGTACGTAAGGAACTAACTCAGGTACTCCTTGTGCGGAACATTCACTTTCTACCATTGATTGCCAACGTAACACTTGTTGTGGCAAATTCTTTGTTTTGACTGAAGCAGCTAATAAATTCATCATTAAACATCTCCTTATTTGCTATTATTTTCGCCTGTAAACCTACTACTTTACTAAATATAACCGGAAGCCAAATGCCCATTTATCTATAAAATCACTTCATGTTACTCACCTTCTTTCACAACAAAAAGAGCAACCATAAAAATAGTTGCCCTTTCGTCGAAATCTTATATTACTACTATAAATCACTTTTTCAATACTTTCTGTACACTGCATGTATCCTACAAAAAGGTAACATTAAAACCCATCTAAAAACTTGACAATCTTTCTTATTTCAGCATGTTTTCGGCGGATATAGCCTGTACTATAATGTAATTCAAACGCTATTTGTTCTAAAGTCATTCCATCAACATATTTCATTTTAAGTATTTGATGATCCAGTCCTGTAAACTTATTAATTAAAAGCTTTAAATCATACTCTTCATTCATCTTATAAGCTAATTCATATTCAATTACTTCAATTCGTCCTTCTACCTTAGCCCCTTCCGATTCAGCGTTTAATCGTACATTTTGCAAATCACCACTAATCCAACGCTTCAATTCGGCTTTTGATTTATCTAAGTTGTATTCTAAATAAGTAATTTCTTCTTCTAACTTCTTATAATCTTTGAGCCATTCGAACACTTACCGATTCACCCACTTCCGTTCTTTTTACAAAGTCTCTTAATACTAATTTAATAGAATGAATATGCTTATTAACTTTTTCAATCTTTATTACTTGTAAATTATCTTTCATTTTATAAACACAACCCTTTCCTAACATTTTTTTACCCTCTATTGATAAGTTCCTTACATCTTTAGAATTCAGATATTGTAATTAATTCCTGAATCCTTTTGAAAAAACTTCTAACAGTTCCCATAGAACTTTAAGAAATAAACTGAAATTACAAATGGTTCATACTTGATCCAAACATTCACTAATATCTTTATAATACTGTTCACTATGCATCGGGAATCTTTAAAGAATATAAATGTATTATTTTTTATTAAGGTAATATATTTCAAAATAACAAAATCATCTAACGTTTTTTCTTATGACTTATATTTATTTAACACTTCTTGTAATCTCTCACGCTCTTCATCAGTAGATTGCACGATTTTTCTTTCCTCTTCTTGATTTGTTGATTCATCATCTTTGTATAACCAATCAGGTACAATCTCTTTTCTATTTGAATACTTCCTACCTATCCCATTATATTTCTTTTTCTTGCTCATTTCGAAACGTCTATCTAGTATGGCCACATCAACTAATGTTTTAACTTCTTGCTCCTTCCAATTCCTCAATATAGCCTTAATGTAGTTCCATCTTGGTGCATTCTCATCAACGGCTTTATTAATTGCATGCTGAATTAATTCATCACTAAACAAATTACAAAAATCCCCCAACTCTGCAATTGCAATTTCACTTAACGGAATGCCCGTCCCCTTAATAAAGTTGCAACTTACTTTAACCTTCTCATTGCTGGATACACAAGAATCTAATTTATCAATATCATCATAATGATTAGTATTTTGTATATTAGTATTTCGTTTATTAGTAGTTATTCTATTAGTATTTAGTAGTGCTTGATTTTCCTCATATGGCTTTACCACATCTTGGTTTTCCACTTGTGGCATGTTCCTTTGTGGCGTTTCGTAAATTTCCGTATCCCACCTTGTAATTTTTTTGGTATTCCCATCACGAACAGGATAACGTTTTACATAACCTAATTCTTTTAATTCCTTAAAACCTGTACGGAGCGAATCTTCTCCATCCTTAGCATGTCGAGCTAATTCGCTAATATGAAAAGTCCAATCGTCTGGTAATGTAAGCGCATAGGCTAAGATTCCTTTCGCTTTCCAAGACAACCTTTCATCTTTTAAACCAGTATTATTTATAACGGAATAATTACTATCTTTTTTCACTCGAATAATTCCCATACTAGCCACCTCATAAATTCTCAAAAACGGTATTCAATGGTATACTTATCTAGAGATATTTTTTCTTATAGAATCCGCTGCAACGGATTCTTTTCTTATACATTCATTCAAAACAATTATGCTATCCGTATCAATTTTCTCCTAAACCTCTCTTATTCCTCAAATTCAACATCCACTTGAATTTCGATATTCATAGGAATTTCTTGTGTTATACGAATCACATTTTGACTCACTCCTTTTTGAATAAGCTTTCTAACCTGCTCTTTTGCATCTTCTTTTGTTTTAAATTCACTGACAGTTGGTAGTCCTGCTAAACTGCTAGTAATGACTAAAATCTTTCTTTGCATGTTCTTTCCTCCTACTGAATTTCTGCCATATTTATTTGTGAGTTTTTAACTGTAATTTCTTCATTTAAAACAGTTGGAATTGAATATTCTTCATTAATAATTTGTATCGCTCTATCCAAATGATAACGTTTAATAGCTTTATAACTATTCACACCAAATTCCCGATGTAACTGACTATAAATATCTCTATATAACTTTCTTCTAAGGCCGATATCCTGATAAGAATTTGAATTTTTACCTCCCAATAACATAACACCTAACCTCTTTACAGCCCTTATTATCTCTTCACACTCAATAGCATAAAGCGGCGTATTTTCTCGCAATTCCTTCACCTCAGACTTAATCTCTTGTATCTCCTGAGTATGCCCTTCTAACGCAGCAAATGTTAACTTTAAAACCCCCATTGGATCCTTTGGCACATTTTGTTGATTTTGTATATACTGCTTCATTCGTTTGAACTCTTTCATAAATTTAATTTTCATTCCAACCGCTTCTCTAGTGGTATATCCCATAACAAGTAACGTGAATGCTTCTTCTGTTAAATCATATTTAGGGATCCACCTGTTCTTTGAATTAACATAAGTGGACTCGTGAAAATTTTCTCCTCCAAACTCTTCATCTACATATACAATTTGTTTTCGAACTTCCTTCAAAACGTCGAAGTGATCTTTTTTGAATATCTTTGCAATTACCAAACTATCCGTTACTACTTTGCCATTAACTTCAAATACTAATGAACTATGTACTGATGAGTCAGTTAATTGCCCCATCCTCATCTCCTCCTCACTACTAATTTTGAACTATCTTTATTGTATTGAGATAATTTCGCACTACGCATAATTCGTTGCTTTCTTTTTACAGATTAACTAATTATCGAAATTTAATATAAATACTATAATATGAACCCTTTTATTAAGTCATTATTCAATAATTCGGTTATCCATTTTAAGCAATTCTCCTCCGATTTCAATTCGCTTCGTTTTCTTCAAATTCAAAAAGATATTCCAAATTATGTTCTGGAAAAAAAGTTTTCTTAATTTCAAAAGCTTCATCATAATAAAAACGAAATTTACCATTTATTTTGTCGCTCACTGTTGCGTGGCGAAGTTTCAGATGCGAAGAAATTTGTGTAATCATAATTCTTTTTCTCGCCATCTCTGCACGCAAATCCGGATACATCGACTCACCACCTATTTTATGTACGATATTGCGTTCATTTCCATTTAAATATAAACTCAATTTCGTATATATTTCTATTTACTAACAAATTCAGTTAGGTTATGATATATACAGAAATACGCAATATCGTATACATTTTAATACGAAAGATGGTGAAAGTAATGAAAAAAGCAGAGGTTGTAACACGCTTAATAAAAGAAGCTGGCTATAGCAAAAGAGCCTTCGCCGAAAAAATAGGTCTCCCCCCCACAACACTGCAATCCATGTTATCAAGAGGGATTGGTAAAGCATCTGTTGATAATGTAATAAAAGTTTGTAAGGGATTAGGAATCACTACTGATGATTTAGAAAAACTCGCAACCCAAGAGGACAATACTGTTAAAGAAGAAGTTTCTATTTATGAAACCATCCAAAACGATCAATCAAATATTATTCATATTCCTATCATTGGTTCTGTAGCAGCTGGTACACCTATATTCGCTGAAGAAAATATCGAAGGCTATTTACCAATGCTAAGTACATTTTTAAACAAGCGTAAAAAGTATTTTTACCTTACTGTAAAAGGCACTAGCATGAATCTCGAATTCCCTGATGGTTCTTATGTTTTAGTAGAGGAAACTCCTTATGTTGAAAACGGACAAATTGCTGTTGTAAAAGTCAATGGTTATGATGCTACCGTGAAAAAGATTTCAAAATCTGGAAGCATCATTACTTTAATACCATTGAGTAATGACCCTATCCACGAACCAAAAACTTACGATCTTTCAGCTGAAGATGTAAAAATCATTGGTCGCGTTGTACAGGCAGTAAAGAATTATTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_018508|3205998:3214289|3209035_3210025_-|WP_080592076.1|DBSCAN-SWA MMNLLAASVKTKNLPQQVLRWQSMVESECSAQGVPELVPYVLGIIMVESGGNSETPPDIMQSSESQGWPMNTIKNPKDSIYYGVKHLKGAFDDAKKNGITDLSAIVQSYNFGRAYLRWLASNNKQHSLPVADLYSKTVVAPSLGNTTGAMVKYSHPIAVAYNGGYRYKNGGNFFYSEIVKQYVDFNGGTDGGDNKPLQPKGLGIATSKYPEGSGINLYSGPGKDAWFTGHVINTKMPYLIIDAAWYGGNENMLCLGWEAWAKEEHFEVEWFHAYSKYPAGYGINTYDGPNGNYKGNVDGSYPYGIFARKDGYIDIGQNTWVKEEHFNVR >NC_018508|3205998:3214289|3208743_3208974_-|WP_000392443.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA MEEQIFNSMIQQGAFAALFVWMLFTTQKKNEQREEQYQKVIEKNQQVIEEQAKAFSSLSKDLSDVKQKILGNGDEK >NC_018508|3205998:3214289|3207513_3208056_-|WP_000031383.1|DBSCAN-SWA MSKEGFLKELSSYLRKLPEEERQDILLDYEEHFQFGLEEGKTESEIIQGLGSPKVIAKELLAMYRFDEMKKNPSTSNVTRAVMAAIGLSLFNFIIVLGPLVAIIAFIFSFWIGGIASVVTPFFVIGKVFMGTFIWLDLFVSITFVGVGLLLCIIAFYSTKWFKRLCVRYVIWNFKMIKGE >NC_018508|3205998:3214289|3211054_3211942_-|WP_000511422.1|DBSCAN-SWA MGIIRVKKDSNYSVINNTGLKDERLSWKAKGILAYALTLPDDWTFHISELARHAKDGEDSLRTGFKELKELGYVKRYPVRDGNTKKITRWDTEIYETPQRNMPQVENQDVVKPYEENQALLNTNRITTNKRNTNIQNTNHYDDIDKLDSCVSSNEKVKVSCNFIKGTGIPLSEIAIAELGDFCNLFSDELIQHAINKAVDENAPRWNYIKAILRNWKEQEVKTLVDVAILDRRFEMSKKKKYNGIGRKYSNRKEIVPDWLYKDDESTNQEEERKIVQSTDEERERLQEVLNKYKS >NC_018508|3205998:3214289|3206709_3207513_-|WP_000976234.1|DBSCAN-SWA MMKKLFLIAIACIIIGVIGISQTYEKAVQTAEKGDKEDVIKNETLKNIEVKLDAGDIVIQKSPDSSFYVKQSGDVRKQVIRIAEDGDTLKIIGEREKGASFDFSFYDFRFQTSKLTLLVPERSYQDVKVNSSAGQIEMSDVKSDSVSVRTLAGEVELKQVTSKNVEGSTKAGEVNFKKVIGKVTAKTTSGEINIQDHDSKYNLEASSTAGDIDITLSEKPQDAVITGQSAAGDVTIFNEENNNVTIGNGSKKISGKTAAGDVTIETR >NC_018508|3205998:3214289|3213629_3214289_+|WP_000708856.1|DBSCAN-SWA MKKAEVVTRLIKEAGYSKRAFAEKIGLPPTTLQSMLSRGIGKASVDNVIKVCKGLGITTDDLEKLATQEDNTVKEEVSIYETIQNDQSNIIHIPIIGSVAAGTPIFAEENIEGYLPMLSTFLNKRKKYFYLTVKGTSMNLEFPDGSYVLVEETPYVENGQIAVVKVNGYDATVKKISKSGSIITLIPLSNDPIHEPKTYDLSAEDVKIIGRVVQAVKNY >NC_018508|3205998:3214289|3205998_3206619_+|WP_000413739.1|DBSCAN-SWA MEKLTKRQQDILDFIKLKVQEKGYPPSVREIGQAVGLASSSTVHGHLSRLEEKGYIRRDPTKPRAIEILGEDRMDTETQSVIQVPIVGKVTAGLPITAVESVEEHFPLPASIVSGADQVFMLRISGDSMIEAGIFDGDLVVVRQQQSAYNGEIVVALTEDNEATVKRFYKEKDHFRLQPENSSLEPIILKQVSVIGKVIGVYRDLH >NC_018508|3205998:3214289|3213255_3213468_-|WP_000283161.1|DBSCAN-SWA MYPDLRAEMARKRIMITQISSHLKLRHATVSDKINGKFRFYYDEAFEIKKTFFPEHNLEYLFEFEENEAN >NC_018508|3205998:3214289|3212300_3213059_-|WP_000531298.1|DBSCAN-SWA MGQLTDSSVHSSLVFEVNGKVVTDSLVIAKIFKKDHFDVLKEVRKQIVYVDEEFGGENFHESTYVNSKNRWIPKYDLTEEAFTLLVMGYTTREAVGMKIKFMKEFKRMKQYIQNQQNVPKDPMGVLKLTFAALEGHTQEIQEIKSEVKELRENTPLYAIECEEIIRAVKRLGVMLLGGKNSNSYQDIGLRRKLYRDIYSQLHREFGVNSYKAIKRYHLDRAIQIINEEYSIPTVLNEEITVKNSQINMAEIQ >NC_018508|3205998:3214289|3208048_3208372_-|WP_001102628.1|DBSCAN-SWA MNVQFKKGVLELCVLALVKRKDSYGYELVQQISNKFLISEGSVYPLLRRLTKEGYFQTYLKESTEGPPRKYYQLTEQGETQFHLLVTEWRDFAKGVQEIIEGVEWDE >NC_018508|3205998:3214289|3212094_3212289_-|WP_001189066.1|DBSCAN-SWA MQRKILVITSSLAGLPTVSEFKTKEDAKEQVRKLIQKGVSQNVIRITQEIPMNIEIQVDVEFEE >NC_018508|3205998:3214289|3210259_3210646_-|WP_000464432.1|DBSCAN-SWA MFEWLKDYKKLEEEITYLEYNLDKSKAELKRWISGDLQNVRLNAESEGAKVEGRIEVIEYELAYKMNEEYDLKLLINKFTGLDHQILKMKYVDGMTLEQIAFELHYSTGYIRRKHAEIRKIVKFLDGF |
12 | uncultured_Caudovirales_phage(44.44%) | bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
3269483 : 3399626
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_018508|3269483:3399626|DBSCAN-SWA 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118 | Bacillus_phage(43.4%) | head,portal,tail,capsid,terminase,tRNA,protease,integrase,holin,bacteriocin,coat | attL 3290449:3290466|attR 3398861:3398878 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
3817790 : 3829033
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_018508|3817790:3829033|DBSCAN-SWA TATGAAAAAGAAACAAGCAATTACCATTCTTGCTAGTATAGAAACATATGAAAACTTAGTATCTTTTCAAAATCTCAAGGAGTTAAATGACACTGTGCGCGCATATAAAGATCAATTTGCTGATCAATTAAATAAAAATCAATTGGCTGTACTCAATCACTTACACACCCATTCTTGTAAATATTTTGGCGTTTCTTTTAAATCCAAAAAAAAGATTGCTGAAGTACTTCATATTAGCCGTAGAACGGTCATTCGTGCATGCCAACACTTAGAATTACTTGGTATCATCAAACAGCTAGAAATGAAACGTAAAAGTGATATGAGACAAACAAGTAACATTATTGTAATCCAGCCAATCATCACAAAAGAAGAGTTTGTCACAGAAGCCCCCACTAAAACTGTGGAAATTTGTCACACCAAGAAAACAACTACAAAAACCTTAAAACAAAATATAAAAGATATAAACAAACGTAAAGAGGAAGTTTCGCAATCTTTTCAACATGATTTAGACTTCATTGATTATCGTGTGCCACAATCTATGCGTATGGAATTACAAACTGCTTTTTCATCAAATGTTATTAATGAATCTTTCAAAAATGCCAAAAATATTGCGAAGAAGGCTGCAAAGCAATTTAATTTACTAGCGGATACAGATATATTTCACAACCTTCTTGCGAATGCTTCTTCGGTTTTGTACTCTAAAACACATAAGTACGAGCATAACGGAAATTTGATGAAAAATCCTATTGGATACTTTACTCGAACATTCAAAAGGATGGTCTATAACTACATTGATAGCTTTAGAGAGATACATAACCTTGCAAATCGTAAGACAAGTGCATGCACTAGTGATGGAATATTTTATAATTGGCTAGAGGTTGATGGCTCAAAAATACCTTCCACAAAGACAATAGACAACCCTTTTACTCCAGGTGTATATTATAAAACATCTAAAGAAGAAGCTGATGAAATCGGGCTATATTGAATAGAGCAGATGTCCTGATTTCACTTTACAATTCAGGTATAACATGTACTTTTGCATATACACCTTGTTGCACAGCGAATTGTTCTAACGTCTTTTGCCTGTATGATGTGAGTGTAAAAAAGTGAATAATAGGGACTTTCCCGTTATATTTGTTTTTATAATACACAGTGAATTCACCATACCGATTCATTTTTTCAGCGTTTATATTCATCGTCTGTTTACGATCAATTTCTACAGCGTTTAATATCCCGTCGTCATCCCGGAATTTCACATCAGAAATAATCGTTTTCTTTCGGTCATTTACTTTATAACGGATGGGTGCTTCTATTTGCCAGTCATCGGGACAAAACAGATAAAGCCATGCTTCATTTCTCATAAGACTATGCGCTAACCGACTATTGGGTATAACTTTCTCATTATCATCAAATAGCTCTCTACCATTTTTATTTAGGTAATATACATGTTCTTTTTTATACACTGTACTATTCACAAATGAGCTTAAATCCTTTAATATGCGGTTTGCATTTCTTATGCCACCTAAATCATGTATAGCCATTAAATGCCTACGTGTAGCAAATTTCAGCTTTCTAATCGAGGTCAGAATCATCATTTGTCTGTTGATTTTGATATGTGTCTGGATGTTCATCTTTCTTCACCTCATATTGTTTTAGTACATCCCACATCTTTTCATTCGTAATATAAGGAACTTGCACTTCAGTCAATCGATCAGTCTTAAAAATCGCACGCCCTGGAATGCTGTGTATGGTTTCAAGCCCTGGTTCATCTATAACAACATGTGAAGCTGTTGCTGTTGGCAACCTGAAGCCTAGCTTCGCATCTGAATTCTGTTTCACTTGGCGTGGTAACGTATCCCCAGTTGGATACTGTGTACAGAAAATTAGTCTAAACCCTAATGCTCCACCTATACGCGCTATATGAGACAGCATTTGTTGGCAAGCTCCTAATAACTTTTGTTGTTCTCTATTCATACTTTTATCAGGACAAAGTTCTGCGCCTTCATCCACGATAATAAAATAGCGTTCTTTTATATTTGTTTCTACCACATTGGTATAATGGTGTCCTTTCATAAAAAGCATTTTTTCTTCCATCCTTTTTAAAATCATACTCAATACTTGAAAGGCCTCAATTGGCTTTTCCGCAATAGATTCTACCTGTTTTACGTTCGTGTAAGGTCCAAACTCCAATCCACCCTTTAAATCAATAATGTAAAAGTGAACATGCTCTGGATTAGCTACAGTAAGTGAAGTGAATACATTCTTTAAAAACACCGTTTTTCCCATCCTCGTTAGTCCACCTAAAGTCATGTGCGGTGTTTTATCAAAGTCATGACAAATTAACTCTTCTAAACTTTGCCCGATTGGTACACGCCATTTGCGCTCTTGAATTAAATTCGTTGACCATTCCCATCTCGTAGGTATTTCTTTATGGAATACTCGAATATTCAATTCATAATTATCATACTGGATTCGAACGGGTTTATTTAGTCCTTCAGAAACAACATCCTCGACCTTCTGAATGATTTTACTTGGCATACCAACAGGTAAAGTGTAAATGTATGTTGTACTGCGATCATCAATATTTTTCTTTTGAAATTTTGGATAACATAGCTTTTCTTCTTTTTTGATTGCGATTCCAGACACTTCAAAGAATACTTGTATCTTGCGTTTATCATCATCTTTACGTTTGAGCTTATCACTTACCAAGGCATATCCAAATGAAGCAACGGGTATTAACAATAATTCAAGCATTGATGAACACTCCTTATATATCCTATAAGGATATAGTTGCATTTTTTTGGAAGATAACAGGACGAGCATTTTTGCTTGTGAGGTCTATTGTCCCTCTCTTCCACATCGTATTCCTTCATAGAAACATAACGAGAATATAACGTAGAAGATATAAGAACGAGCCCGTAAGCGTCGTATACAAGGTTATACGTGGAAGCCAATGCGGAACACTCTTCCCCATTTTTTCAGCTACACTCATCGCGATTACAGACAAACCTGTTGCTGTCCAAATAATTACCGCTTCCCCTGCAAGTGTCATCTAAACCCCTCTTTTCTTTTTAGCTGTAGAACCTTCTTTGAATTCATTATTGGTTGATAATCGTTAATGACATCCCCCCATTCCAACACTTCATCTCCATCTTCATATAAATCATCGATAATTTCGCTTGATAAATGGTAATAGCCTTTATATTCACGATTATTAAATACTTCATGTCTTTCCATGTGGTTCACTATCGCATTCATTTCTTTCTTACCCTTAGAACTCCTATGCATATTTCTCAATTCCTTCGATGGATATAGATAAGGTGTTTCGTTTAAATGTGAATATTGCCAACGCATATGTGCTCTCTCCCCTCCAGATTTCCTTGCTTCCACTTGGTATTCCTCATGGTATTAATATAGGTATATGACTTAGAAGAAGGATTATTACCCATATTGAGAAATTATTTTTCTTTAATATAGAAGATAAATTATAATAGAGGTATTTTTTTATGTGTGTTGAAATAATTTGCAGGTGATAAAATATGGAGATAAAACTTAAAAGTAAAATTGGAGATTGGGTAGAAAAAAGTGGATATCGAAAAGATTTTATAGCGAATAAACTAGGAATAACCGTAAAACAACTCAACAACTACATAACTGGAACTTCTTTTCCAAATGTTCATCGTTTATACCAATTAGCTTGTATCTTTAATTGTAGAGTTGACGATTTATATGAAGTACAAAAAAATGACCCTGCTAATTAATTATTAACAGGGTCCAATTTGTAAACAGGATTTCTTTCATTTTGCAACACTTCTATGTACATCTCAGCAAGTTTTGGTCCATCGATTAGTTGGATATTTAATCCTTCAGCATAACGCTGGGCATTTACAGTATAACTCCCAGTTGTTACTACGTATCCGCCCTTCGCGTCTTCTTTTACCATATTTGAATGAACTAACGCGATAGCATTAAAAGGCATGTCCGAATTATAACATTTCACTTGTCCAAGATATAATTCGTCATTTAACTTATGTTCAAAATCAACACCGTAATCATTTGACCCCCTCGTTACGTAAACTGATCCTCCATAGTACCTTTCAAATACGTCTCCAACAAAATGTTCAAATGCTATTGGATCTTCCCCAATAAATACATTAGATACTTTTTCTTCTTCTGTCTGTTTCATGAATCGATAATACAGCCCCATAGCTACAGTTTTTTTAAAATCTACATCATTATTTGCTAAATGTAATAAATTCAAAAAGTCGTGCTCTTTTTTCCTTCGTAACAATACCCAATTAATAACAGAAATACACGTTATAAATAAGAGAACAATTGTGAAAACAGACATTTTAACACCTCCATTTCAATAATTTTACCCTTTTTCACAATATGTAATCCCACCAACAAAAAAGCCGTCCCCACTAAAGGAAACGGCTCTTTTCTTTACATACAATTTTAGATTAAAGAATATAATAAAAATATACTCTATCGTCAATATTTCGTTCTATCGCTCGCTTTTATTACATATACTAAAACTAACACCGAGAGAAATTTATATAAACCGGACGCTTTCCTAAAGAAAGCGTCTTTTTATTTTGTATTCATACATTATTTTCACGCGCATATAGTAAGAATGTCATCGGAGAATACTCCTCATGGAAAAAGACACTTTCAACTGAGAGAAAGTGTCTTTTTCTATTTTTAAGGAATATTAAGTACCTAACATGCATATAGCTAAACTAATAACAGTTTTCTCCCATTAGAACCTTATACTACTCTACATAAAGAGCATTCCTTATATTGGAGTGTTCTTTTTTTATTTTTTAGTAATACAATATAATTTTTTCACATATATATTTAATGGTTCAAGAGAAACCACGAAACCAGCGTACTCCTCAGTCAAGAGTGCACTGGTTTTTTATTTTTACTGTTATAATATATTGTAACTATTGCATATCATATAATAAGCTTTACAAATAACTGACATCCCTAGAAGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_018508|3817790:3829033|3819361_3820543_-|WP_000891527.1|DBSCAN-SWA MLELLLIPVASFGYALVSDKLKRKDDDKRKIQVFFEVSGIAIKKEEKLCYPKFQKKNIDDRSTTYIYTLPVGMPSKIIQKVEDVVSEGLNKPVRIQYDNYELNIRVFHKEIPTRWEWSTNLIQERKWRVPIGQSLEELICHDFDKTPHMTLGGLTRMGKTVFLKNVFTSLTVANPEHVHFYIIDLKGGLEFGPYTNVKQVESIAEKPIEAFQVLSMILKRMEEKMLFMKGHHYTNVVETNIKERYFIIVDEGAELCPDKSMNREQQKLLGACQQMLSHIARIGGALGFRLIFCTQYPTGDTLPRQVKQNSDAKLGFRLPTATASHVVIDEPGLETIHSIPGRAIFKTDRLTEVQVPYITNEKMWDVLKQYEVKKDEHPDTYQNQQTNDDSDLD >NC_018508|3817790:3829033|3823053_3823758_-|WP_000405774.1|DBSCAN-SWA MEIRKKLVDPSKYGTKCPYTMNAEFITVHNTYNDASAENEIAYMIRNNNEVSFHIAVDDKEAVQGIPLERNAWHCGDGGGNGNRKSIGVEICYSLSGGDRYYKAENNAAIVVAQLMKQFNIPISKVRTHQSWSGKYCPHRMLDEGRWNSFIERVQNAYNGGGNTAPSTQPSNNGVGVVTITADVLRVRTGPGTNYDIVKKVYRGERYQSWGIQNGWYNVGGDQWVSGEYVRFEG >NC_018508|3817790:3829033|3818799_3819420_-|WP_001025806.1|DBSCAN-SWA MNIQTHIKINRQMMILTSIRKLKFATRRHLMAIHDLGGIRNANRILKDLSSFVNSTVYKKEHVYYLNKNGRELFDDNEKVIPNSRLAHSLMRNEAWLYLFCPDDWQIEAPIRYKVNDRKKTIISDVKFRDDDGILNAVEIDRKQTMNINAEKMNRYGEFTVYYKNKYNGKVPIIHFFTLTSYRQKTLEQFAVQQGVYAKVHVIPEL >NC_018508|3817790:3829033|3824054_3824279_-|WP_000389432.1|DBSCAN-SWA MEDIKKKIEELTLEQKEIMREIRNLEMRTTINEKDISTVNKQLEKISLNTTWILRIVIGAVVTGVLGLVVKGIM >NC_018508|3817790:3829033|3817790_3818774_+|WP_000730122.1|DBSCAN-SWA MKKKQAITILASIETYENLVSFQNLKELNDTVRAYKDQFADQLNKNQLAVLNHLHTHSCKYFGVSFKSKKKIAEVLHISRRTVIRACQHLELLGIIKQLEMKRKSDMRQTSNIIVIQPIITKEEFVTEAPTKTVEICHTKKTTTKTLKQNIKDINKRKEEVSQSFQHDLDFIDYRVPQSMRMELQTAFSSNVINESFKNAKNIAKKAAKQFNLLADTDIFHNLLANASSVLYSKTHKYEHNGNLMKNPIGYFTRTFKRMVYNYIDSFREIHNLANRKTSACTSDGIFYNWLEVDGSKIPSTKTIDNPFTPGVYYKTSKEEADEIGLY >NC_018508|3817790:3829033|3821328_3821550_+|WP_000403528.1|DBSCAN-SWA MEIKLKSKIGDWVEKSGYRKDFIANKLGITVKQLNNYITGTSFPNVHRLYQLACIFNCRVDDLYEVQKNDPAN >NC_018508|3817790:3829033|3823757_3823988_-|WP_000392441.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA MEEQIFNSMIQQGAFAALFVWMLFTTQKKNEQREEQYQKVIEKNQDVITKQAEAFGDLSKDVSEIKQKILGSGDVQ >NC_018508|3817790:3829033|3820658_3820841_-|WP_000170776.1|DBSCAN-SWA MTLAGEAVIIWTATGLSVIAMSVAEKMGKSVPHWLPRITLYTTLTGSFLYLLRYILVMFL >NC_018508|3817790:3829033|3820837_3821143_-|WP_003256223.1|DBSCAN-SWA MRWQYSHLNETPYLYPSKELRNMHRSSKGKKEMNAIVNHMERHEVFNNREYKGYYHLSSEIIDDLYEDGDEVLEWGDVINDYQPIMNSKKVLQLKRKEGFR >NC_018508|3817790:3829033|3821546_3822140_-|WP_000110514.1|DBSCAN-SWA MSVFTIVLLFITCISVINWVLLRRKKEHDFLNLLHLANNDVDFKKTVAMGLYYRFMKQTEEEKVSNVFIGEDPIAFEHFVGDVFERYYGGSVYVTRGSNDYGVDFEHKLNDELYLGQVKCYNSDMPFNAIALVHSNMVKEDAKGGYVVTTGSYTVNAQRYAEGLNIQLIDGPKLAEMYIEVLQNERNPVYKLDPVNN >NC_018508|3817790:3829033|3824377_3829033_-|WP_014895334.1|DBSCAN-SWA MPRKKKSDIEKEQASSMVKDWEKDNGGLDDNQRATLQRMIELNSNTAQQDVRRVDYYSGNQDKYERSTQPIQVRNENTGSLVKKKKEIFALRNGEEDEPVENVYQNLEFDKNNEDHRKPPERNPFLDQIKAANSISQSISTDWMKQQEEASRTNRMMGTIDRIAKQSPPQEGGFFGDLKFAAQKFGEMIKPPEGKTRQQVWDEYMKDGGKSEATKEVNRFATRTLDSTLLNAPSATMKKVRGQDAVDWQDHREGVGENIADFASMGLGYVLPGAGAVKVAGKLGLAAKVGENTSKLGKIGQYAKEGAATGALIAGAETPAKAYVNPDQTIEDHLKRIGVETAAGAAITPLAYGIGNVIKSLRKTKGDTSNIADDVIQQERQQRELVNQAVEEQVLQNTRTKNESESLPIQSELESNTFFKEYNDAVNEQYKYLKNSSGKGVEPGGIIRDELGDVVNRYGRISNNPSWYQEFYKTNGRKPNNTELRELAESHVRNGYQENGVDIPSWSPSSVKKIDEQIGQATALIKQNPSDQEALQPVIDALKQEREIGLQKFYTELNGKKASSNGELPDDVQAMRNAPPVIQSAMAPDGRTITQKKLMDSFRDNVDITLRTGRMGVGDDAVSGIYKNGPEVIRTRDYGDLETLAHETGHHLDKKFGLNDPKFDDELMKLGSHTSGQNYTPEQIRQEGMAEFMRRYLLNPAMAEQEAPAFMKHFQNTIPEDVQKGLKKVQEDAQIWANQGDEARFRGKINVNEKPKSLERVKQVLQKLPNSKEELYTDVIDRLYPISKAEKEILGGELADASVSPYKKARLAAGTPKKAQMKVEEFRNIFGDSKVDMADIRDYVTATHARDLEKQGIKTGFTPDEIEKTIAKFDNPEIQAAHQKIKAYNDSLLDMLVEGNMLSKDAVTAMREKHPNYMPFNRYFDEEGVGEGFGGGKGFVDLTNPVKRIEGSSRNVIDPFESIVKNTFKSMQAIERNKVGLALADLAENEGAGKWIEKLAGDGKESVAKENIVTVFQNGEKQQYQLAPELYRAVKAMDKEVTNKFILAASKPSDWLRAGATLTPEFALRNPIRDQFAAYVVSDTGYNPFDFVKGLKEVGKKKFGKGSEVYDDWVNQGGAYGGYLSADRDLLKEQLSGLEKQESGLPKAIKAITAPVNPKNWLKVLQNISEVSEEATKVGAYHKGLKKGLTPEESAYQARDLMDFNRMGNSMQSANRIFTFLNANVQGKDKLIRAMKEHPVRTSARIAGSTLPPSALAIASYASANDKQKEMMDNMPQQEKDTYWSYAIPGTDKVGRIPKPFDISLLANTVERANKYREGDQYAFDGFDKTVNDAVKVPWIPTTLQPIVENMANYSFFRDGPIVPKRDEKNSPKEQYGPNTSLTAREMASALDKIGIEASPYKIDNLYKGYTAGLGQFPLKGLDSAISLISNKDVPTPIAQEWNESTPGAKAFFVNGQGGGQVMEDYYNIMDEQQAIQADSKKNEEDASNAEEMKAFNRIDREMAKLRKEYYVVKSNTEMNPEVKRSELDRLDEEMRTLAREGITVFRPDYK |
11 | Bacillus_phage(100.0%) | bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
3835862 : 3858352
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_018508|3835862:3858352|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_018508|3835862:3858352|3843421_3845287_-|WP_000276479.1|DBSCAN-SWA MYKGYLKGNGKHAASKFKDGTKLLSYHTARKHDSFVGILDDDYIMVDIDDIDEAEMLLDIIEDKNIRCSVLETTNGMHFYFKGYDITANKIKWFSNIGLLCDYKLGIKNTADPLKINGETRRWLRKTNEHDPLPTWLYPYNKKNPNLTKMTEGDGRNDKLFTYILKLQSQGMAKNDIKETISIINNYILEEPVEQNELNIILRDEAFMKESFYIKGAFQHEKFGDFLINEHHICKITNILHIYKDGVYSDKQEDIEEAMIKHIPALKRMQRQETLAYLQLKAKHKNFASTKYVVVKNGVFNLETWQLEDFTPEIITRNKIPVAYIPDAYYKVTDKTLNKIAVNDKTIRSILEEILGYILFRRNEFAATFILTGNGSNGKSSYLKIIRQLVGEENASSLDLNELDQRFKTAELFGKLANIGDDIGKGYIKESSVFKKLSTGETLNVERKGKDPFDFTNYAKLIFSANEMPRINDFTDGLGRRLQIVPFKAKFTPEGEDYDPFITDKLLSDESMQYILILALKSLKRLLEEKKFTKSKAVEEELVKYQEENNPIISFVNNENIELERSVVGDVYLQYKVYCVENGFQSVSNINFSKQISQLFGYKSHVQKVDGKNKRIFINNE >NC_018508|3835862:3858352|3836326_3838450_-|WP_000467411.1|DBSCAN-SWA 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MVIYKDEQRGTYYFVTRVRQLDGTLKQVKRRGFKTKKEAREAEAKMLVEKVTTSSLTFSQVADSYFDWYSQRRKQSSIVTIRNVIYNHLITEFGKLKIEQITPKHIMNYQNKIINQYSAKHLKKIHAVLSAIFNFSIKFHGLTTNPARITGNFEKESNKRMNFWEFEEFKQFIAVVDELLYKAFFSTLYYSGARKGELLALTWSDINFEEKTIDINKTEFERKVTKPKTKASNRIIMLPTHCIDLLKELHCEKSKEFPVKNDYVVFGEFRSSIAVSTLSRNYQKYLKMSDVKKILIHEFRHSHASYLINKGVSPLVVAQRLGHSNVSTTLNTYSHLYPSKQAEVVAFMENDLV >NC_018508|3835862:3858352|3852984_3853182_-|WP_001025461.1|DBSCAN-SWA MNIQEYGDREKKLVRLIGTSKLWNFNQFVLDLVEIHGVEKTQEIVSELGRHAVDTAKLHEETIAK >NC_018508|3835862:3858352|3842580_3842976_-|WP_000483565.1|DBSCAN-SWA MFNWLKVYQELEGEIEYIEFNLQRSQRELKRWRGGDLSKYKLAPDSDGTKVEDHIERIEYELAHKMNDLHDLKKLIRTFKGLEHKIMYGKYVEGKTLEYLAIEFGYSRSYIYQKHAEIMRRIKFAEKLTLF |
25 | Bacillus_phage(75.0%) | integrase,terminase | attL 3850392:3850407|attR 3864023:3864038 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
3994502 : 4056260
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NC_018508|3994502:4056260|DBSCAN-SWA 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60 | Klosneuvirus(22.22%) | tRNA,coat,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
4098462 : 4106150
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NC_018508|4098462:4106150|DBSCAN-SWA ATTAAGCATGAATACCTTCTCCATCCATTACATTTAAGAAATATTCTTCTAAGGAACTATGTTTCTTATTAATACTTTCAATTTCCACATCGTTCATAATAAGTGCTTTTGAAATGGCCTGCTGAGACACTGACGTATCATACACACGAATCATGGTTCCACTCATTATTTTGTAGTTTTTTATACCAAGTTTATCTTCTAAAATATAAGCTGCACGTTTCACATCAGGAACAGTGATTTCAATGTACTCTGTTTGCTTTCCGTTAATACTCTTCATTGAAACTTCTTTTATTAGTTTTCCATTTTGAATCACACCAATTGTATCGGCCATTAATTCCATCTCACCTAAAATATGACTAGAAACTAATAATGTAATACCGTATTCTTTGCAGAGCATTTTAAATAAGTCTCGTAACTCTTTAATGCCAATTGGATCTAAACCGTTAATTGGTTCATCTAAAATGAGCAATTCTGGCTTTGTCACGATTGCCCTTGCAATACCGAGTCGTTGTTTCATTCCTAATGAAAAATCTTTTACTTTTTTATTATCTACCCCTTGTAGTTTCACTAAATGTAAAGCATGGTCAATTGCATTTTTATCGTAGTAGCCCATATATTCACAATGCAGGTCTAAGTTTTCTTTCGCCGTTAATTTATCATAAAAGATTGGGTATTCAATAATTGTCCCCATTCTTTTTAATACTTCATACGATGTATCTGTTAATTTCTCACCGAAAATTTCTATATCACCACTCGTCGGTTTTATTAAATTTGTAATCATTTTCATAATCGTTGTTTTACCAGCACCGTTTGGTCCTAAAAAACCATAAATTTCTCCTTTTTTCACATGCATGTTAACACCGGAAATAACTTCTTTCCCTTTAAACACTTTCGTTAACTGGTTTGTTTTTACTATATATGTCATGTTACTTTCCCCTTTCGCAATACTCTATATTTCTATAATAGACAACAGAAATCTCTTTTTTCTTACCCGTTCCTTACAAATTCCTTACGCTGAAAAAAAGCTTGTAGAATTTACTTCTCTACAAGCTAAAACAGCATCTTTTTTAATACAACTGTAAAAATTGTTTTTTCATAGGGCTTACTAGAAAGATGTATTTCTCCGTCCATCGCTTCCACAAGCCGTTTCGTAATCGTTAATCCTAGACCGCTTCCTTGGTACGATCTATTTCTTGAATCTTCAAGTGTGTACATTCGCTCAAACACTTTATCAATATGAGATTCATCAATTCCTTTTCCTTTATCCCATACGTCTATATACACACTCGTTTCATCATCTCTTAAAGTCATACCGAGTGTCTTTCCATCATCTCCATATGTAATTGCATTTGATATTAAATTATTCAATACTCTGCCTAATACTTCTACATTTCCAAGTGCGTATATATTTCTTTCTGGTATATCAATATGAACCTGAAAACCTTTCGTCGTCACTAAATCATAAAAAGATAAAATCTTCTCGCGGCAAACTTCATTCATATTTACTTTTGTCATTTCAATTGCTTTGTCACCAGATTCTAATTTTGCCAAATCAAAAAACTTATGAATTAGCTCCATCACTTCTAATGTTTTCGTATGCACTTTTTCAAGTAATATTTGTTGTTCTTCTTCACTTATCGTTTTATCCTTATTTAACATTTCTGTATATCCAAGAATAACTGTTAGTGGTGTTTTCAAGTCATGCGAAATATTTGAAAGCATTTTTCTCATCGAAATCTCTACTTTGGCATGATCTGCATTCGTTTTCTGTTTTGCATCTAATAATTGATTAATTGCCACTAATAATTTTTGCAATTCTAGATCATCTGTCATAACGAGTAACGTCTCGCCTGTTTTGTCATTTACAATACTTTCTAACTTTTCATATGTGTATCGTAAATTTTTACTACTATTTTTTCTCATTTTATATTGCATATAAATGACACATAACAATATAAAAATAATACCTATTAACAAATTGACCATATTACATCACTTCCAACTTATAGCCGATGCCCCATAACGTTTTAATATATTCTGGATTAGATGGATCACTTTCAATTTTCTCACGCAATCTTCTCATATGAACATTAATAACGTTATCATCACCGTAATACTCTTCATTCCAAACTAACGTATATATTTGCGCTTTTGTAAATACACGATTTTGATTTTTTACGAACAGTTTTAAAATCTCAAATTCTTTTAAAGTGAGCTTGAGAGGGTTCCCGTTTTTTTCTACAGTAAAATTAATTGGATCGATTGTTAAATCGCCAATCTGAATCATCTTTTCTGTTGTTTCTGTAGCCGAGTATTTCGTAGACCGCCGAATCCCTGCTTTTACACGTGCAGCCAATTCAATCATAGAAAATGGCTTACAAATGTAATCATCTGCTCCAAGTCCTAAGCCAACAGCTTTATCAACATCTGTATCTTTTGCCGACATCATTAAAATCGGAACAGCACTTTTTTCACGAATAATACGTACAACCTCTAATCCGTCTAACTTCGGCATCATTATATCAAGGATCACTAAATCAAAAGATGATTTAAAAAAGGTTTGCACCCCTGCTTCCCCGTCAGACGCCATCGTAACTTGAAAGCCTTCCTTTAATAAATATTTTTCCACCATCTCTTGAATTGAAATATCATCTTCAACTAATAAAATATGATGTGACATATGTCTATCCCCTTTTTTTACAAACATTAACATATCAATTGTATCGCAACGAATGAATGCTGGAAACAGTTATATGAATTTTCAAACCAACTTCCCTTCCTTCCTTAACAATGATATGATGAAATTCACTACGATTGTTCATAATTAACTTTATATAAAGGAGACTTATCATGTCAGAAAACAAAAAAGTAAGCTTAGCTGATTTAATGCGTGAACAACTTGCTAAGAAAAAGCAAGGAAATGGAAATGGTCAAAATGCAAAAAATCAAAACCAAGAAACGAAAAAATTACAAAACCAACAAACAAAGAAGACAAACAACCAACGTAGACGTACAGGTGTGTAAATGAACGGACAAAAACGTTCTAATATCGCACCCGGTCTTGAAGTTGATATTGTATTAAAACAAGATCAACGAACAGGCAAATTAACACGTGGCATTGTAAAAGATATTTTAACAAACTCCCCTTCCCATCCACATGGCATTAAAGTGCGATTGCAGGACGGGCAAGTCGGTAGAGTACAAAATATCGTTCAATAAGAAAAGGAGCTCAAGTAAACTCGAGCTCCTTTTTCTTTATTAACCTTTAATTTTCTCGATGAAAACTACTTTTAAATAGTCTCCTTCTTTAAATTGATCAATGGTACGGAAATCTTCTGGTAAAGAATGTTCTTCTAATATTTTATATTTGCCATTCATTTCTTTAAAGGCTGTATCGATAAAGCCTTTAAACTTTTTCATATCGAATGCACTACAATTTGTAGAAGCAACGATAATACCGTTATTTTCTGTAATAGCAATTGTTTCTTTCAATAAATTTTTATAATCTTTTGCTGCACTAAATGTATATTTTTTTGATCGGGCGAAGCTTGGAGGATCAAGTACGACCATATCAAATTTCATCTTTTTCTTAGCTGCATATTTGAAGTAAAGAAATACATCTTCTACAATAATATCTTGTGCTTCATAATCAACTTCATTGACACTAAACTGCTCAATCGTTTTACTTAAACTACGATTTGCAAGGTCAACACTCGTCGTTTTACTCGCTCCGCCAAGCGCTGCAAATACAGAGAAAGCACCTGTATAAGAGAACATATTTAACACTGTTCTTCCCTTTGCATATTTATCACGAATTTGTTTTCGAACGTTACGTTGATCTAAAAATACACCAACCATTGCCCCGTCATTTAAATAAACAGCGAAGTTCACACCGTTCTCTTTTACGATAAGCGGGAACTCACCGCGCTCTCCTGCTACGAAATCATCACCCTCAATATATTTCCCTTTCGTATCAAAACGCTTCTTCTCATAAATGCCTTTAAAGTTTGCTACTTTTTGCAGAGCTGCTATAATCTCATCTCTGAAAGTATAAATCCCTTCACTATACCAACTTACTACGTAGTAGCCGTCATAATAATCGATAATTAGTCCGCCAAGACCATCACCTTCACCGTTTAGGGCGCGGAATGCTGTCGTATCACTTGATTTATAAAATTGTTTTCGTTTATGTAAGGCAGATTTGATTTTACTTTCAAAGAAAGATTGATTAATTTGTTCACTCTCTTTTCTCGTTAAAATCCAGCCGTATCCTTTATTTTGTTTTCCATAATAACCTTTTCCGACAAAGTTGTTCTTCTCATCTACTACTTTGATGATTGTCCCTTCTTCACGAACATCGTTTAAATTTTGAATTGCATCTTTTAAAATAAGTGGATATCCACTTTTAATTTCTTTTATAAATTTCGGTTTTATTTTTATAGTTACTTCTGATCGCATATAATAACTTCCTTTCCATTTGCATGCTTTCTCTATAGGAAGCATTTAAAAAACGAGCCTGAAAAAACAGCCTCGTTTCACTATACCATATTATTGCTTTGCTAGTACAACTCGCTCATTCTCGCACTTAACCGCCACATATTTACTACGTTTTGAAATGGAAATCTCACTGTCCAAAATAATAGAAAAAAATTATATATTTCACATTTACCATTGACAATGATAATGATTTTCATTATCATTTAATGTATATGAGTTCTTGAAAATATAGCTACATTTATAGGAGGAATAAACATGATTATTGTTACAAATACAGCTAAAATTACAAAGGGAAATGGACATAAATTAATTGAGCGTTTTAATAAAGTAGGTAAAGTTGAAACGATGCCAGGCTTTTTAGGTCTAGAAGTTCTTTTAACGCAAAATACAGTTGATTATGATGAGGTAACAATTAGCACTCGATGGAATGCAAAAGAAGATTTCCAAGGTTGGACAAAGAGCGCCGCATTTAAAGATGCTCACTCACATCAAGGTGGAATGCC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_12 >NC_018508|4098462:4106150|4105166_4106150_-|WP_001036830.1|DBSCAN-SWA MNKKTWSFLIVTALLIVMTSLSAMKGSLEVGIVELVQGIFIGGNEDVEVIKDLRFPRIIIALFTGAALAVSGVLFQAVMKNPLADAGVIGISSGASFMTLVIITLFPQFFFWTPVFAFLGGALACYLVYSFSWKSGLSPLRIILIGIAINAMFTGLNESFVTICGYFIKSIKQTTTSNITMKTWGDVEIMVTYGTIGLILALFVGAWCNLLSLQDKTAKNLGLHVTRVRLIISAIAVLLAAVSTAIAGVIVFVGLLVPHISRQLVGSDHKVLIPFSALAGALLILTADTIGRLIVPPNEIPAATIMAVIGGPFLIFLLRKSDKVHGN >NC_018508|4098462:4106150|4100448_4101141_-|WP_000018046.1|DBSCAN-SWA MSHHILLVEDDISIQEMVEKYLLKEGFQVTMASDGEAGVQTFFKSSFDLVILDIMMPKLDGLEVVRIIREKSAVPILMMSAKDTDVDKAVGLGLGADDYICKPFSMIELAARVKAGIRRSTKYSATETTEKMIQIGDLTIDPINFTVEKNGNPLKLTLKEFEILKLFVKNQNRVFTKAQIYTLVWNEEYYGDDNVINVHMRRLREKIESDPSNPEYIKTLWGIGYKLEVM >NC_018508|4098462:4106150|4103609_4104374_-|WP_002162479.1|DBSCAN-SWA MNSKNGRKKNSFFQRILTIAFLGIFFYSMYELGGIFMDYYENRKVMAEAQHIYKRSPMEEKSEDGEVRKQFQDLQKINPEIVGWITMDDTQINYPIVQAKDNDYYLFRNYKGEDMRAGSIFMDHRNDVKSQNRNTILYGHRMKDGSMFGSLKKMLDEDFFMSHRKLYYDTLFEGYDVEVFSVYTTTTDFYYIETDFENDAVYTSFLKEVQEKSLYKTDTELTANDEIVTLSTCDYALDPEAGRLVIHAKLVKRN >NC_018508|4098462:4106150|4098462_4099386_-|WP_000221121.1|DBSCAN-SWA MTYIVKTNQLTKVFKGKEVISGVNMHVKKGEIYGFLGPNGAGKTTIMKMITNLIKPTSGDIEIFGEKLTDTSYEVLKRMGTIIEYPIFYDKLTAKENLDLHCEYMGYYDKNAIDHALHLVKLQGVDNKKVKDFSLGMKQRLGIARAIVTKPELLILDEPINGLDPIGIKELRDLFKMLCKEYGITLLVSSHILGEMELMADTIGVIQNGKLIKEVSMKSINGKQTEYIEITVPDVKRAAYILEDKLGIKNYKIMSGTMIRVYDTSVSQQAISKALIMNDVEIESINKKHSSLEEYFLNVMDGEGIHA >NC_018508|4098462:4106150|4103213_4103537_+|WP_000587818.1|DBSCAN-SWA MIIVTNTAKITKGNGHKLIERFNKVGKVETMPGFLGLEVLLTQNTVDYDEVTISTRWNAKEDFQGWTKSAAFKDAHSHQGGMPEYILDNKIAYYDVKVVRMPMAAAQ >NC_018508|4098462:4106150|4101719_4102919_-|WP_001255945.1|DBSCAN-SWA MRSEVTIKIKPKFIKEIKSGYPLILKDAIQNLNDVREEGTIIKVVDEKNNFVGKGYYGKQNKGYGWILTRKESEQINQSFFESKIKSALHKRKQFYKSSDTTAFRALNGEGDGLGGLIIDYYDGYYVVSWYSEGIYTFRDEIIAALQKVANFKGIYEKKRFDTKGKYIEGDDFVAGERGEFPLIVKENGVNFAVYLNDGAMVGVFLDQRNVRKQIRDKYAKGRTVLNMFSYTGAFSVFAALGGASKTTSVDLANRSLSKTIEQFSVNEVDYEAQDIIVEDVFLYFKYAAKKKMKFDMVVLDPPSFARSKKYTFSAAKDYKNLLKETIAITENNGIIVASTNCSAFDMKKFKGFIDTAFKEMNGKYKILEEHSLPEDFRTIDQFKEGDYLKVVFIEKIKG >NC_018508|4098462:4106150|4104406_4105177_-|WP_000403765.1|DBSCAN-SWA MEIKNVTFSYDNVTNRLKSVSSEIEIGKITTIIGPNGCGKSTLLSVMSRNHVPSSGEVILDGKAISEYKPKEFARKLAVVHQQNEAPADITVEKLISFGRMPYKNIFSPQTDEDREAIERALVCTNLQSKRDKPIYALSGGERQRVWIAMTLAQNTPMLFLDEPTTYLDIYYQLEILELVKELNEVYGLTIVMVLHDINQAIRYSDHIIVMKDGEIITKGNPNDVITEEMVKAIYGVDVIVKQDEDTGLYMVPMGI >NC_018508|4098462:4106150|4099511_4100447_-|WP_000247674.1|DBSCAN-SWA MVNLLIGIIFILLCVIYMQYKMRKNSSKNLRYTYEKLESIVNDKTGETLLVMTDDLELQKLLVAINQLLDAKQKTNADHAKVEISMRKMLSNISHDLKTPLTVILGYTEMLNKDKTISEEEQQILLEKVHTKTLEVMELIHKFFDLAKLESGDKAIEMTKVNMNEVCREKILSFYDLVTTKGFQVHIDIPERNIYALGNVEVLGRVLNNLISNAITYGDDGKTLGMTLRDDETSVYIDVWDKGKGIDESHIDKVFERMYTLEDSRNRSYQGSGLGLTITKRLVEAMDGEIHLSSKPYEKTIFTVVLKKMLF >NC_018508|4098462:4106150|4101485_4101680_+|WP_001014310.1|DBSCAN-SWA MNGQKRSNIAPGLEVDIVLKQDQRTGKLTRGIVKDILTNSPSHPHGIKVRLQDGQVGRVQNIVQ |
9 | Staphylococcus_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
5363735 : 5372111
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NC_018508|5363735:5372111|DBSCAN-SWA GATGATTAGTCGTTATACACGCCCTGAAATGGGTGCGATTTGGACGGAAGAGAACAAATTTAAAGCGTGGTTAGAAGTTGAGATTTTAGCTTGTGAAGCATGGGCTGAGCTTGGCGACATTCCAAAAGAAGATGTTAAAAAAATTCGTGAACATGCATCATTTGATATTGATCGTATTTATGAAATTGAAAAAGAAACACGTCATGACGTAGTTGCATTCACTCGTGCTGTATCAGAAACGCCGACATTAGGCGAAGAACGTAAATGGGTTCATTACGGTTTAACATCTACAGACGTAGTAGATACAGCATTATCTTACATCTTAAAACAAGCGAATGAAATCATATTAAAAGACTTAGAGAACTTTGTAAGCATTTTAGCTAACAAAGCGAAAGAGCATAAATACACAATCATGATGGGAAGAACACACGGTGTTCATGCAGAACCAACAACATTTGGTTTAAAACTTGGTCTTTGGTATGAAGAAATGAAACGTAACGTAGAGCGTTTCAAGCAAGCAGCTGATACAGTTCGCGTTGGTAAATTATCTGGTGCGGTTGGTACATATGCAAATATCGATCCATTCGTAGAAAAGTATGTTTGTGAAAACTTAGGATTAGAAGCAGCACCAATTTCAACACAAACATTGCAACGTGATCGCCATGCTCATTACATGTCAACACTTGCACTAATCGCAACATCTATCGAAAAGATGGCAGTTGAGATTCGTGGTTTACAAAAGAGTGAAACACGTGAAGTTGAAGAAGCTTTCGCAAAAGGTCAAAAAGGTTCTTCTGCAATGCCGCATAAGCGTAATCCAATTGGATCTGAAAATATGACTGGTTTAGCTCGTGTTATCCGCGGTTATATGATGACAGCTTATGAGAATGTTCCATTATGGCATGAGCGTGATATTTCTCACTCTTCAGCAGAACGCGTAATTTTACCAGATGCTACAATCGCGTTAAATTACATGTTAAATCGCTTTGGTAATATCGTTAAAAACTTAACTGTATACCCAGAGAATATGAAACGCAATATGACAAGAACATACGGCTTAATTTATTCTCAGCGCGTAATGCTTACACTAATCGACAAAGGTATGGTACGTGAAGAAGCTTATGATATCGTACAGCCTAAAGCGATGGAAGCTTGGGAAACACAAGTACAATTTAAAGAGCTTGTAGAAGCTGATGAGCGTATTACAAGCAAGTTAACACAAGAAGAAATTAATGAATGCTTCAACTATGAGCATCACATGCAACACGTTGATACAATCTTTGAACGCCTTGGATTAAACGAAGCGTAAAATTTCATATGGCACAGAATAGAGTCATTCTGTGCCATTATTTATAAAAACATTATTCACATTTTTCAAACTACAGGGGGCTTGCGAAATGCAAAAGCTAGAATTGCTGTATGAAGGTAAGGCAAAAAGAATTTATCGTACAGAATCAGCAGATATGGTTTGGGTAGAGTACAAAGATAGTGCGACTGCTTTCAATGGGGAGAAAAAAGAGACGATTACAGGAAAAGGTCGTTTGAACAATGAAATTACAACTTTATTGTTCAGAAAGTTACAAGAAGTGGGAATTAAAACACATTTTGTTGAGAAGTTATCTGAAACAGAACAACTTGTTAAAAAAGTGAGTATTATTCCTTTAGAAGTTGTCACAAGAAATGTAATTGCAGGAAGTCTTTCAAAACGATTAGGAATGGAAGAGGGAACTGTACTTGCAGAACCAATCGTAGAATTTTACTTCAAAGATGATGATTTAGGAGATCCGCTTGTAACGGAAGATCATATTCGTGTATTAAACGTTGCATCGCCAGAGCAAGTAAGTGTATTACGAGATATGGCTCTACAAATCAATCAAGTGTTGATTGATCATTTCGCAAGCTGTCGTGTAAGATTAGTAGATTTCAAATTAGAGTTTGGTGTAACGGAAGAAGGAGAAATCATTTTAGCGGATGAAATTTCACCAGATACTTGCCGTTTATGGGATGAAACGAGCAATGAAAAGTTTGATAAAGACGTATTCCGTCGTGATCTTGGAAATTTAACAGAAGCTTATGAAGAGATTTTAAAACGTTTAGGGGGAATTTCACATGTATAAAGTTAAGGTATATGTAACATTAAGAGAAAGCGTATTAGATCCACAAGGAACAGCAGTAAAAGGAGCACTTCATAGTCTTTCATTTACAGAAGTACAAGACGTTCGAATCGGAAAGTACATGGAACTAACAATTGATAAATCTGTATCTGATTTAGATAGCAAGGTAAAAGAAATGTGTGAAAAACTATTAGCGAACGTTGTAATGGAAGACTTCCGTTATGAAGTTGAGGAGGTTGTCGCACAGTGAAATTTGCCGTAATAGTATTTCCGGGTTCGAACTGTGATGTCGATATGTTCCATGCAATTAAAGATGAGCTTGGCGAAGAAGTAGATTACGTTTGGCACGATACAGAGAATTTAGATGAATATGATGCAATTCTACTACCAGGTGGATTTTCTTATGGTGACTACTTACGCTGCGGTGCTATTTCTCGCTTTGCTAATGCAATGAAAGCAGTGCAAAAAGCTGCTGAGCAAGGAAAGCCGATTTTAGGTGTATGTAATGGATTCCAGATTCTTGTTGAATCAGGATTACTACCAGGAGCGTTAATGAGAAACGAAAACTTAAAATTTATGTGTCGCACTGTTCAGTTGCGTGTTGAAAATAATGAAACGATGTTTACATCACAATATGAAAAAAATGAAATAATCAATATTCCAATCGCTCATGGTGAGGGGAATTACTATTGTGACGAAGAGACTCTTAAACAATTAGAAGAGAATAATCAAATCGCATTCCGTTACGTAGAAAATCCTAACGGTAGCGTTTCAGATATTGCTGGTATTGTAAACGAAAAAGGAAATGTACTTGGTATGATGCCACATCCAGAGCGTGCTGTAGATGAATTACTTGGCGGTGCTGAAGGGTTAAAAGTCTTTCAATCTATCTTAAAACAGTGGAGGGAAACATATGTCGTTAATGCTTGAACCAAATCCAACACAAATTAAAGAAGAGCGTATATATGCGGAAATGGGGCTAACAGACGAAGAGTTTGCCATGGTTGAAAGGATTTTAGGTCGTCTGCCAAATTATACAGAAACAGGATTATTCTCTGTAATGTGGTCTGAACATTGTAGTTATAAAAATTCAAAACCAGTTCTTCGTAAGTTTCCAACGACAGGTGAGCGTGTTCTGCAAGGACCTGGAGAAGGTGCTGGGATTGTAGATATAGGTGATAATCAAGCAGTTGTATTTAAAATGGAAAGTCATAACCATCCTTCAGCTATTGAACCATATCAAGGAGCTGCAACAGGTGTTGGTGGTATTATTCGTGACGTATTCTCTATGGGAGCACGTCCGGTAGCTCTATTAAACTCACTTCGTTTCGGTGAATTACAGTCACCACGTGTGAAATATTTATTCGAAGAAGTAGTAGCAGGAATTGCAGGATACGGTAACTGCATCGGTATTCCGACTGTTGGCGGCGAGGTACAATTTGATCCATGTTATGAAGGAAATCCACTTGTAAATGCAATGTGCGTAGGTTTGATTAATCATGAAGACATTAAAAAAGGGCAAGCGCACGGTGCTGGTAACACAGTAATGTACGTAGGGGCATCGACTGGTCGTGACGGTATTCACGGTGCAACATTCGCGTCGGAAGAACTATCTGAAAGTTCAGAAGCGAAACGTCCAGCGGTTCAAGTAGGGGATCCATTTATGGAGAAACTTCTTATTGAAGCGTGTTTAGAATTAATTCAATCTGATGCACTTGTTGGAATTCAAGATATGGGTGCGGCTGGTTTAACATCATCTTCTGCAGAAATGGCAAGTAAAGCAGGAATGGGTATTGAAATGTATTTAGATGATGTACCACAGCGTGAAACAGGAATGACACCATATGAAATGATGCTATCTGAATCACAAGAGCGTATGTTAATTGTTGTGAAAAAAGGTAGAGAACAAGAAATAGTAGATTTATTTGAGAAGTATGGTCTTGCAGCAGTTACGATGGGGAAAGTAACAGAAGATAAAATGCTTCGTTTATTCCATAAAGGTGAAAAGGTAGCTGAAGTTCCAGCAGATGCTTTAGCAGAAGAAGCACCAATTTATCATAAGCCATCAAAAGAAGCAGCATACTTTGCTGAATTCCAAGCAATGAAAATGGAAACGCCAAAAGTAGAAAATTATAAAGAAGCGTTATTCGCTCTATTACAGCAACCAACAATTGCAAGTAAAGAGTGGGTATACGATCAATACGATTACCAAGTTCGCACAAGTACAGTTGTGACACCAGGTTCAGATGCTGCAGTTGTACGTGTACGCGGTACAGAAAAAGGATTAGCAATGACGACAGATTGTAACTCTCGCTACATTTATCTAGATCCAGAAATGGGCGGTAAAATTGCAGTAGCAGAGGCAGCGCGAAATATCGTATGTTCTGGCGGGGAGCCACTTGCAATTACAGATTGCTTAAACTTCGGTAACCCAGAAAAACCAGAGATTTTCTGGCAGATTGAGAAATCAGTAGACGGTATGAGTGAAGCTTGTCGCACATTACAAACACCAGTTATCGGCGGAAACGTATCGATGTATAACGAGCGTAGTGGCGAAGCTGTATATCCAACACCAACTGTTGGGATGGTCGGACTTGTACATGACTTAAAACATGTAACAACACAAGAGTTTAAGCAAGCTGGCGATTTAGTTTATGTAATCGGTGAGACGAAAGCTGAGTTTGGCGGAAGTGAATTACAGAAAATGATTCACGGTAAAATCTTCGGGCAATCACCAAGTATCGATTTAGATGTAGAATTAAAACGCCAAAAACAAGTATTAGAAGCAATTCAAGCTGGTCTTGTTCAATCTGCACATGATGTTGCTGAGGGTGGTTTAGCAGTTGCGATTTCAGAAAGTGCAATTGGTGCTAAAGGCTTAGGTGCTACTGTGAAATTAGATGGAGAAGCAACAGCAGCATTATTCGCTGAATCACAGTCTCGCTTCGTGATTACTGTAAAACGTGAAAATAAAGAGGCGTTTGAGAAAGCGGTAGAAGCAATCCAAGTTGGAGAAGTAACAAGTACAAATGAAGTAACAATTCATAATGAAGAAAATGAAGTATTACTTACAGCAAATGTAGATGAAATGAGAAAGGCTTGGAAAGGGGCAATCCCATGCTTGCTGAAATAAAGGGGTTAAACGAAGAATGTGGCGTTTTCGGAATTTGGGGGCATGAAAATGCAGCACAAGTTTCATACTACGGATTGCACAGTTTACAGCACCGTGGACAAGAAGGCGCAGGCATTGTCGTAAATAATGGTGAGAAAATCGTCGGTCACAAGGGGTTAGGTTTAATATCAGAAGTGTTTTCAAGAGGCGAGCTAGAAGGATTAAATGGAAAATCAGCAATCGGACATGTACGATATGCAACAGCTGGTGGAAGTGAAGTTGCTAACGTTCAACCATTGTTGTTCCGTTTTTCTGATCATAGTATGGCGCTAGCTCATAACGGGAATTTAATTAATGCAAAAATGCTTCGCCGTGAATTAGAGGCAGAGGGAAGTATTTTTCAAACAAGTTCAGACACAGAAGTACTTTTACATCTTATTAAACGTAGTACGAAAGACTCTTTAATTGAAAGTGTAAAAGAGGCTCTGAATAAAGTGAAAGGTGCGTTTGCGTATCTTTTACTAACTGGAAATGAAATGATCGTTGCGTTAGATCCAAATGGATTCCGTCCGCTTTCAATTGGAAAGATGGGGAATGCTTACGTTGTAGCATCTGAAACATGTGCTTTTGATGTAGTAGGTGCAACATACATTCGCGATGTAGAACCTGGTGAATTACTTATCATTAATGATGAAGGAATTCACGTAGATCGTTTTACAAACGATGTAGAACATGCGATTTGTAGTATGGAATACATTTACTTTGCACGACCAGATTCTAATATTGCTGGTGTTAACGTTCATGCAGCGCGTAAAAATATGGGAAAACGTTTAGCAGCGGAAGCTCCTATTGAAGCGGATGTTGTTACTGGTGTACCAGACTCTAGTATTTCAGCAGCGATTGGCTATGCGGAGGCAACAGGCATTCCGTATGAATTAGGATTAATTAAAAATCGTTACGTTGGACGTACTTTTATTCAGCCTTCTCAAGAACTGCGTGAGCAAGGGGTTAAGATGAAGCTTTCAGCAGTAAGAGGTGTAGTGGAAGGGAAACGAGTTGTTATGATTGACGATTCTATCGTAAGAGGAACGACAAGTAAACGAATTGTTCGTATGCTTCGTGAAGCTGGAGCGACAGAAGTTCACGTAAGAATCGCTTCACCACCTCTTAAGTATCCATGTTTTTATGGCATTGATATTCAAACGAGAAAAGAATTAATTGCAGCAAATAATACAGTAGAAGAAATCCGTGAAATGATCGGAGCAGATTCTTTAACATTTTTAAGCGAAGATGGATTAGTAGATGCAATTGGGCGTCCATATGAAGGGAAATATGGCGGTCTATGTATGGCTTATTTTAATGGGGACTATCCAACAGCTCTTTATGATTATGAGCAAGAGCTTTTAGAAAGTATGAAATAAGAAAAGTGAAAAAAGCTTCTACTTCTTTTGATGTAGAAGCTAGCTCCTTTCTTAAAATAGCCCGCCCTGGATGGGGAGAAATTAAAAGACGAGGTGTAAATAACGATGGCGAATGCATATAAGCAAGCAGGAGTAGATATTGAAGCTGGATATGAAGCGGTATCTCGCATGAAAAAACACGTACAAACAACTATGAGAAAAGAAGTACTAGGCGGTTTAGGCGGTTTTGGAGGTATGTTTGATCTATCAAAATTTGCATTAGAAGAACCTGTATTAGTATCTGGAACAGATGGCGTGGGAACGAAATTGATGCTCGCTTTTATGGCAGATAAACATGACACAATTGGTATTGATGCAGTAGCAATGTGTGTAAATGATATTGTTGTCCAAGGAGCAGAGCCGCTTTTCTTCCTTGATTATATTGCTTGTGGTAAAGCTGAACCTAGTAAAATTGAAAACATCGTCAAAGGTATATCAGAGGGCTGTCGCCAAGCTGGTTGTGCATTAATCGGTGGAGAAACAGCTGAAATGCCAGGAATGTATTCTACGGAAGAATATGATTTAGCTGGTTTTACAGTTGGGATTGTTGATAAGAAGAAAATTATAACAGGTGAAAAAATTGAAGCTGGTCACGTGTTAATTGGCTTAGCATCTAGCGGTATTCATAGCAATGGTTACTCTTTAGTACGAAAAGTGTTACTAGAAGATGGAGAACTATCTTTAGAGCGTATTTATGGTCGCTTAGAGCTACCTCTTGGTGAAGAATTATTAAAACCAACGAAAATTTATGTCAAACCTATTTTAGAACTATTGAAGAAACATGAAGTATACGGTATGGCGCATATTACAGGTGGCGGATTTATTGAAAATATTCCACGCATGTTGCCAGAAGGAATCGGTGCTGAGATTGAACTAGGATCTTGGAAAATTCAGCCGATCTTTAGTTTACTTCAAGAAGTTGGAAACCTGGAAGAGAAAGACATGTTCAATATTTTTAACATGGGTATTGGTATGGTAGTGGCAGTAAAGGAAGAAGATGCAAAAGATGTTGTTCGTCTTCTTGAAGAACAAGGAGAAACGGCTCGTATTATTGGACGTACTATACAAGGAGCTGGTGTTACTTTTAATGGGGGCACAGCACTATGAGTAGATTAGCGGTTTTTGCTTCTGGAAGCGGATCTAACTTTCAATCTCTCGTTAATGCGGTAGAAGAAAAAAGATTGGATGCAGAAATTAGTTTATTAGTATGTGATAAACCAGAAGCACGCGCTGTTGGTCGGGCACATTATCATCATATTCCGTGTTTTGCTTTTTCAGCGAAAGCATATGAGTCAAAAGAAGCGTTTGAAAAAGAGATATTAAAGAAGCTAGAAGAATATGAAATTGACTATGTTATTTTAGCTGGATATATGCGTTTAATCGGGCCGACGTTACTAGAAGCATACGGCGGGAAGATTATTAATATTCATCCATCATTACTACCGAGCTTTACGGGTAAAGATGCTGTCGGTCAAGCATTAGAAGCAGGTGTGAAAGTAACTGGAGTAACGATTCATTATGTAGATGCAGGTATGGATACAGGGCCAATTATTGCGCAAGAAGCAGTAGTTGTTTCTGAAGGGGATACGAGAGAAAGCTTACAAAATAAAATTCAACAAGTTGAACATAAATTATACGTAAATACAGTGAATCAAATTGTTCAGTCTGTGAAAGAATCAACTGTTAACTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_13 >NC_018508|5363735:5372111|5365131_5365851_+|WP_001170545.1|DBSCAN-SWA MQKLELLYEGKAKRIYRTESADMVWVEYKDSATAFNGEKKETITGKGRLNNEITTLLFRKLQEVGIKTHFVEKLSETEQLVKKVSIIPLEVVTRNVIAGSLSKRLGMEEGTVLAEPIVEFYFKDDDLGDPLVTEDHIRVLNVASPEQVSVLRDMALQINQVLIDHFASCRVRLVDFKLEFGVTEEGEIILADEISPDTCRLWDETSNEKFDKDVFRRDLGNLTEAYEEILKRLGGISHV >NC_018508|5363735:5372111|5371523_5372111_+|WP_000088579.1|DBSCAN-SWA MSRLAVFASGSGSNFQSLVNAVEEKRLDAEISLLVCDKPEARAVGRAHYHHIPCFAFSAKAYESKEAFEKEILKKLEEYEIDYVILAGYMRLIGPTLLEAYGGKIINIHPSLLPSFTGKDAVGQALEAGVKVTGVTIHYVDAGMDTGPIIAQEAVVVSEGDTRESLQNKIQQVEHKLYVNTVNQIVQSVKESTVN >NC_018508|5363735:5372111|5368965_5370381_+|WP_000879034.1|DBSCAN-SWA MLAEIKGLNEECGVFGIWGHENAAQVSYYGLHSLQHRGQEGAGIVVNNGEKIVGHKGLGLISEVFSRGELEGLNGKSAIGHVRYATAGGSEVANVQPLLFRFSDHSMALAHNGNLINAKMLRRELEAEGSIFQTSSDTEVLLHLIKRSTKDSLIESVKEALNKVKGAFAYLLLTGNEMIVALDPNGFRPLSIGKMGNAYVVASETCAFDVVGATYIRDVEPGELLIINDEGIHVDRFTNDVEHAICSMEYIYFARPDSNIAGVNVHAARKNMGKRLAAEAPIEADVVTGVPDSSISAAIGYAEATGIPYELGLIKNRYVGRTFIQPSQELREQGVKMKLSAVRGVVEGKRVVMIDDSIVRGTTSKRIVRMLREAGATEVHVRIASPPLKYPCFYGIDIQTRKELIAANNTVEEIREMIGADSLTFLSEDGLVDAIGRPYEGKYGGLCMAYFNGDYPTALYDYEQELLESMK >NC_018508|5363735:5372111|5370486_5371527_+|WP_001262424.1|DBSCAN-SWA MANAYKQAGVDIEAGYEAVSRMKKHVQTTMRKEVLGGLGGFGGMFDLSKFALEEPVLVSGTDGVGTKLMLAFMADKHDTIGIDAVAMCVNDIVVQGAEPLFFLDYIACGKAEPSKIENIVKGISEGCRQAGCALIGGETAEMPGMYSTEEYDLAGFTVGIVDKKKIITGEKIEAGHVLIGLASSGIHSNGYSLVRKVLLEDGELSLERIYGRLELPLGEELLKPTKIYVKPILELLKKHEVYGMAHITGGGFIENIPRMLPEGIGAEIELGSWKIQPIFSLLQEVGNLEEKDMFNIFNMGIGMVVAVKEEDAKDVVRLLEEQGETARIIGRTIQGAGVTFNGGTAL >NC_018508|5363735:5372111|5363735_5365043_+|WP_000625687.1|DBSCAN-SWA MISRYTRPEMGAIWTEENKFKAWLEVEILACEAWAELGDIPKEDVKKIREHASFDIDRIYEIEKETRHDVVAFTRAVSETPTLGEERKWVHYGLTSTDVVDTALSYILKQANEIILKDLENFVSILANKAKEHKYTIMMGRTHGVHAEPTTFGLKLGLWYEEMKRNVERFKQAADTVRVGKLSGAVGTYANIDPFVEKYVCENLGLEAAPISTQTLQRDRHAHYMSTLALIATSIEKMAVEIRGLQKSETREVEEAFAKGQKGSSAMPHKRNPIGSENMTGLARVIRGYMMTAYENVPLWHERDISHSSAERVILPDATIALNYMLNRFGNIVKNLTVYPENMKRNMTRTYGLIYSQRVMLTLIDKGMVREEAYDIVQPKAMEAWETQVQFKELVEADERITSKLTQEEINECFNYEHHMQHVDTIFERLGLNEA >NC_018508|5363735:5372111|5366094_5366778_+|WP_000666782.1|DBSCAN-SWA MKFAVIVFPGSNCDVDMFHAIKDELGEEVDYVWHDTENLDEYDAILLPGGFSYGDYLRCGAISRFANAMKAVQKAAEQGKPILGVCNGFQILVESGLLPGALMRNENLKFMCRTVQLRVENNETMFTSQYEKNEIINIPIAHGEGNYYCDEETLKQLEENNQIAFRYVENPNGSVSDIAGIVNEKGNVLGMMPHPERAVDELLGGAEGLKVFQSILKQWRETYVVNA >NC_018508|5363735:5372111|5366761_5368981_+|WP_000055594.1|DBSCAN-SWA MSLMLEPNPTQIKEERIYAEMGLTDEEFAMVERILGRLPNYTETGLFSVMWSEHCSYKNSKPVLRKFPTTGERVLQGPGEGAGIVDIGDNQAVVFKMESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDVFSMGARPVALLNSLRFGELQSPRVKYLFEEVVAGIAGYGNCIGIPTVGGEVQFDPCYEGNPLVNAMCVGLINHEDIKKGQAHGAGNTVMYVGASTGRDGIHGATFASEELSESSEAKRPAVQVGDPFMEKLLIEACLELIQSDALVGIQDMGAAGLTSSSAEMASKAGMGIEMYLDDVPQRETGMTPYEMMLSESQERMLIVVKKGREQEIVDLFEKYGLAAVTMGKVTEDKMLRLFHKGEKVAEVPADALAEEAPIYHKPSKEAAYFAEFQAMKMETPKVENYKEALFALLQQPTIASKEWVYDQYDYQVRTSTVVTPGSDAAVVRVRGTEKGLAMTTDCNSRYIYLDPEMGGKIAVAEAARNIVCSGGEPLAITDCLNFGNPEKPEIFWQIEKSVDGMSEACRTLQTPVIGGNVSMYNERSGEAVYPTPTVGMVGLVHDLKHVTTQEFKQAGDLVYVIGETKAEFGGSELQKMIHGKIFGQSPSIDLDVELKRQKQVLEAIQAGLVQSAHDVAEGGLAVAISESAIGAKGLGATVKLDGEATAALFAESQSRFVITVKRENKEAFEKAVEAIQVGEVTSTNEVTIHNEENEVLLTANVDEMRKAWKGAIPCLLK >NC_018508|5363735:5372111|5365843_5366098_+|WP_000278823.1|DBSCAN-SWA MYKVKVYVTLRESVLDPQGTAVKGALHSLSFTEVQDVRIGKYMELTIDKSVSDLDSKVKEMCEKLLANVVMEDFRYEVEEVVAQ |
8 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_018516_1 | 267554-267691 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_018516_1
|
2 spacers
spacers of NC_018516_1
>1.1|267578|30|NC_018516|CRISPRCasFinder GTTGAGACTTCGCTTGTTGTGTTTGAGCAA >1.2|267632|36|NC_018516|CRISPRCasFinder ACTCTTCTTTAGGCTGTTCTGTTGGTTTAGGTGCTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018516_1
The CRISPR arrays of NC_018516_1 >merge|NC_018516|1|267554-267691|CRISPRCasFinder CTTCTTGCTTTTGAACAGGTTTAGGTTGAGACTTCGCTTGTTGTGTTTGAGCAACTTCTTGCTTTTGTACAGGTTTAGACTCTTCTTTAGGCTGTTCTGTTGGTTTAGGTGCTTCTACTTTCTTTTCAGTAGGTTGAG >NC_018516|1|1|267554-267691|CRISPRCasFinder CTTCTTGCTTTTGAACAGGTTTAG GTTGAGACTTCGCTTGTTGTGTTTGAGCAA CTTCTTGCTTTTGTACAGGTTTAG ACTCTTCTTTAGGCTGTTCTGTTGGTTTAGGTGCTT CTACTTTCTTTTCAGTAGGTTGAG
>NC_018516.1|WP_000924700.1|266190_267039_-|GIY-YIG-nuclease-family-protein MLLKDMLQVCGLDLTKRIKVARHVDKDIDVQELYEKDNFELYQSYQGKNSFNCDYIVSFLGLENSQAVFIGVYEVKNPTEVTGLPQSIDTTEELRKRLSKAKWQYTLEKVDGFETLENRVIVQWEGVATSWCRYLNTFDLEVLQMLPKGETRKFTGYLDFILKRWELESIVNNPLKYKSWHESLSIVAGVYLIVDTKTGKQYVGSAYNTEGIWGRWKTYVNNGHGGNKLLMEILKQDPDRVNDFTYTILQVLPNTYKDTEVFKVESLYKRKLGSRAFGLNSN >NC_018516.1|WP_000957118.1|265625_266024_-|hypothetical-protein MLTNEYLDDLFEGIKIEGEDYFYYFYVYQIPKEGVLLVNGIIPVGDIEHIIVCFTNKRLLFLEITMMGKYTGNMKSIDLIEFEHIKVKRGMIRTSIVLTSKNGKGNTVIKANSFTFGLSNQKKNLIALEKLY >NC_018516.1|WP_001246921.1|264936_265548_-|hypothetical-protein MRNYEKVSLETWVNQLNSLVEYEIKETQVHVEENNFEPFSRGNIGRSTVHDLEELEGILAGVVVEGDMLTIKLLDGKQSSYDLNYVTSIMRRTDSPCFYLYFGRVETHVEITIKVDRLGVPIKSTSSINKNISKDINIPVKEFINNKELVKSVNNGNNSEGYIVLKDVELRLPINALNGIRETEDGCLLSFHVAQTLDIKVDK >NC_018516.1|WP_003254758.1|264088_264829_-|hypothetical-protein MEVVKMGEIKLAEDIKGEVISFKNFVSELKEKENKHIVVHKLIADLDKELYTDGELLHVKEGRGGSFTLIVDEEQAPSERTYFSFLVKEIRKNKTKYYMIFKQGYVLEFSFKKSGSPCIKREVKVATKPTSNKEASELRHTLNNLGFTETRSFKTFSNFLLKSKESGYTDILTINPKGKKVEGLLDSVTIIDGGILVHVYQLGKGLSAVKFLEQDTILVSEVKMEDLVYFMVYGKSIVSPVIVKTK >NC_018516.1|WP_000843774.1|263652_264069_-|hypothetical-protein MKSVKVNSNCSVIIEQHLVESLLRKANLKEGEEVFTIQFNQDYKYILLGYIKQDLYIFLMTNKRMLLHKVNETTGHLMGGLITLDEKKVLIGNMETGVISLPFKEKKHQTFISYLVGVSEDYKSNLFRYRERFKWVKE >NC_018516.1|WP_001007096.1|263266_263647_-|hypothetical-protein MNEWMREEVLKTVEDYVKGSGVQDYFFVSGKKFLHELLECGKYPYRLTALWEGYTYTGKVNEIVKEEEKGTITINLDVTEEGKEKSMVLEEIHTKHAIMQRTVDSVHFTLFYKDSLVPLHFVYLKK >NC_018516.1|WP_000204760.1|262888_263248_-|hypothetical-protein MTSTLSTKRKQVLISNVGKSKVIPFNKLFYHMFKRIETGATISTFQDGLVVRGKFVSLTNLIHKNEIELILELPNSREVELYFKANDIEEVVHGFGSNYNSYTLFTSREVVPIIISNIE >NC_018516.1|WP_000961607.1|262166_262877_-|hypothetical-protein MLVTEERTARGIKDLKGSKITFQELVAKLKSYEGCLVELTRVRDVGLHPVIVRSIETCQINQVDVQEDAWFKLHLENEQDHYYYFKSSIECILQNGTTYYIIQTNNTYFEFKVKEEVCHSKRLKNYIDGMRNSLGVFRFTDTLTYDDFLEFLDNFEDYNYTKVSVLDGNGNHVTGQIDEVITSRARVGFCIILDNGEHTTIDFERENIVSIVDIKNSRNKYFMIYELDSITPLILE >NC_018516.1|WP_003298828.1|261584_261842_-|hypothetical-protein MYPMRNYQEAMAFINYKFQQYHANDVSMLINFLESQATSLQYQVNQLLTHYQPNYNLIERNRTYIDILGVDVDKLKQARAIINQY >NC_018516.1|WP_000218244.1|261240_261564_-|hypothetical-protein MTVQYDYKAMIQANKDFDVSTLENARHYVQQLSQGRSYTSVKDLLAGIDWLHTQAHHNIARYDGEATPQQLEHMKDVKQLYYVQKQKLSEVFKTYKNYGFDPSQVLF >NC_018516.1|WP_000810633.1|268946_279527_-|isopeptide-forming-domain-containing-fimbrial-protein 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>NC_018516.1|WP_000444162.1|296444_296855_-|hypothetical-protein MESKLFKTEKTERGTRVFLKDPLLHNMLPKRVFFFLERPVWSIFSIPFTIPFLPVRVSFGLSTNEFSRVLDKYCENLEELSNIQVVDPKTSILPYPSLGVYKVNMVEGVMFDFKSDKDMKSLLCKMDKAVERFRRT |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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NC_018516_1 | 1.1|267578|30|NC_018516|CRISPRCasFinder | 267578-267607 | 30 | NZ_CP053979 | Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_795 plasmid unnamed3, complete sequence | 71082-71111 | 0 | 1.0 |
NC_018516_1 | 1.1|267578|30|NC_018516|CRISPRCasFinder | 267578-267607 | 30 | NZ_CP013277 | Bacillus thuringiensis serovar israelensis strain AM65-52 plasmid pAM65-52-2-350K, complete sequence | 289404-289433 | 0 | 1.0 |
NC_018516_1 | 1.1|267578|30|NC_018516|CRISPRCasFinder | 267578-267607 | 30 | NZ_CP039723 | Bacillus thuringiensis strain BT-59 plasmid p2, complete sequence | 56805-56834 | 0 | 1.0 |
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NC_018516_1 | 1.2|267632|36|NC_018516|CRISPRCasFinder | 267632-267667 | 36 | NZ_CP053979 | Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_795 plasmid unnamed3, complete sequence | 71022-71057 | 0 | 1.0 |
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NC_018516_1 | 1.2|267632|36|NC_018516|CRISPRCasFinder | 267632-267667 | 36 | NZ_CP045024 | Bacillus thuringiensis strain JW-1 plasmid p2, complete sequence | 288957-288992 | 0 | 1.0 |
NC_018516_1 | 1.1|267578|30|NC_018516|CRISPRCasFinder | 267578-267607 | 30 | NZ_CP022523 | Pseudoalteromonas sp. NC201 plasmid pNC201, complete sequence | 39281-39310 | 5 | 0.833 |
1. spacer 1.1|267578|30|NC_018516|CRISPRCasFinder matches to NC_018516 (Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid pBTHD789-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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2. spacer 1.1|267578|30|NC_018516|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP053970 (Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_796 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gttgagacttcgcttgttgtgtttgagcaa CRISPR spacer gttgagacttcgcttgttgtgtttgagcaa Protospacer ******************************
3. spacer 1.1|267578|30|NC_018516|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP053979 (Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_795 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gttgagacttcgcttgttgtgtttgagcaa CRISPR spacer gttgagacttcgcttgttgtgtttgagcaa Protospacer ******************************
4. spacer 1.1|267578|30|NC_018516|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013277 (Bacillus thuringiensis serovar israelensis strain AM65-52 plasmid pAM65-52-2-350K, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gttgagacttcgcttgttgtgtttgagcaa CRISPR spacer gttgagacttcgcttgttgtgtttgagcaa Protospacer ******************************
5. spacer 1.1|267578|30|NC_018516|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039723 (Bacillus thuringiensis strain BT-59 plasmid p2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gttgagacttcgcttgttgtgtttgagcaa CRISPR spacer gttgagacttcgcttgttgtgtttgagcaa Protospacer ******************************
6. spacer 1.1|267578|30|NC_018516|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP009348 (Bacillus thuringiensis HD1002 plasmid 2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gttgagacttcgcttgttgtgtttgagcaa CRISPR spacer gttgagacttcgcttgttgtgtttgagcaa Protospacer ******************************
7. spacer 1.1|267578|30|NC_018516|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP009334 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gttgagacttcgcttgttgtgtttgagcaa CRISPR spacer gttgagacttcgcttgttgtgtttgagcaa Protospacer ******************************
8. spacer 1.1|267578|30|NC_018516|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP045024 (Bacillus thuringiensis strain JW-1 plasmid p2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gttgagacttcgcttgttgtgtttgagcaa CRISPR spacer gttgagacttcgcttgttgtgtttgagcaa Protospacer ******************************
9. spacer 1.2|267632|36|NC_018516|CRISPRCasFinder matches to NC_018516 (Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid pBTHD789-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
actcttctttaggctgttctgttggtttaggtgctt CRISPR spacer actcttctttaggctgttctgttggtttaggtgctt Protospacer ************************************
10. spacer 1.2|267632|36|NC_018516|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP053970 (Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_796 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
actcttctttaggctgttctgttggtttaggtgctt CRISPR spacer actcttctttaggctgttctgttggtttaggtgctt Protospacer ************************************
11. spacer 1.2|267632|36|NC_018516|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP053979 (Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_795 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
actcttctttaggctgttctgttggtttaggtgctt CRISPR spacer actcttctttaggctgttctgttggtttaggtgctt Protospacer ************************************
12. spacer 1.2|267632|36|NC_018516|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013277 (Bacillus thuringiensis serovar israelensis strain AM65-52 plasmid pAM65-52-2-350K, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
actcttctttaggctgttctgttggtttaggtgctt CRISPR spacer actcttctttaggctgttctgttggtttaggtgctt Protospacer ************************************
13. spacer 1.2|267632|36|NC_018516|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039723 (Bacillus thuringiensis strain BT-59 plasmid p2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
actcttctttaggctgttctgttggtttaggtgctt CRISPR spacer actcttctttaggctgttctgttggtttaggtgctt Protospacer ************************************
14. spacer 1.2|267632|36|NC_018516|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP009348 (Bacillus thuringiensis HD1002 plasmid 2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
actcttctttaggctgttctgttggtttaggtgctt CRISPR spacer actcttctttaggctgttctgttggtttaggtgctt Protospacer ************************************
15. spacer 1.2|267632|36|NC_018516|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP009334 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
actcttctttaggctgttctgttggtttaggtgctt CRISPR spacer actcttctttaggctgttctgttggtttaggtgctt Protospacer ************************************
16. spacer 1.2|267632|36|NC_018516|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP045024 (Bacillus thuringiensis strain JW-1 plasmid p2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
actcttctttaggctgttctgttggtttaggtgctt CRISPR spacer actcttctttaggctgttctgttggtttaggtgctt Protospacer ************************************
17. spacer 1.1|267578|30|NC_018516|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP022523 (Pseudoalteromonas sp. NC201 plasmid pNC201, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
gttgagacttcgcttgttgtgttt-gagcaa CRISPR spacer tttgcgagttcgcttgttgtgtttcgtgca- Protospacer *** ** **************** * ***
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
80407 : 90207
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_018516|80407:90207|DBSCAN-SWA CTCATTTCTCTTCTACAATCCAACCGTTTAACATAGCGTATTTATACTTTCTTGGATACTTTCTCTTCCAGTTTTCCCATTCTTTCGAGTGTCCTATTGTGGCTAAAGGGTCATTCCTTTTCTTCTTTTCAAGAATCTTTGCAACCCACTCAGGAACTACAGGTTTATAAAATTCATTTTCGTTCATTTTGACACTCCTTTGTGTCTTCCTCGATTACTTCAACCGTTACTTTAACCTTCTTACCTTCAAAGTTAAACAGGTCTTGTGTTAAATAATCATTAATTTCTTTTATGTATACATCATGGTAAAGTGCATTACTGTTTCCATAATCAATTTCTTGCTCTACTACTTTACCGATGTACGTTTTCTTTTGTGGCATATAAGACACCTCTTACCCTAATGTAGTAAATCCTGCTGTTTTATAGCTCACATCACGGTCTACTATACTAAATTTACTATACATTGCATGAATTTCTAAGTCTTCTTCTACTAACTGGAATCCATACTCACGACACATTGCTTGAGCAATTACTTCATGTTGATTTGTATCTACTTGTTTTACAATTCGATGATATAAGTCTAAGAATTCTTCGTTTGTTATGTCTCCACGAATCATAAGTGTAGAGTAAGAGTATTCACTATGCTCATCTGTTGCAAAGCGTACAAATCTTACTTTAGGTAATCCTTGTAACTTTTCTTTTGTTGTCTCTTCATACTCTAACCAACTCTCTAATAATTCTCTCAGTTGAAATTTTGAAGATGCTTCTAGTGTTGTAAGTAGTTCTTCTCTATCTGCAATTTTAATTTCTGCTTTGAAAATCTCAGTCTTCTCACCTTTTCTCATTTTAGTCATTTCATAAACCGTCACTTCAAAACCTAATTCATCATACTTATTTAAAATCTCCATTTTACTACCCCTATTCTTGATTCTCTTTATCGTTTAACTTTACTTTATTCTCACACGAGAAACAAATGAACCCACACTCTGTTAACGAATGAATTGTAACAGACATTTGTTTCTCTATATTATGCCGTTTATTTTCTAACTCTTTATAGTCTACTTTGTTCTCACACTCATTACAGATTAATGTAAAACCTTTACTCATGTTTAACTACCCCTTAGTATGGTGAATATACTTCTATACGTCTTAAATCGTCTCTTACTACGTCTTCTTTCTTATAATCTTGTACAATACCAAATCCACTCATTGCATGAATCTCGAAAAAGTGAGTTTCTTTTACAAAACCATAACGTTTACATAACTCGTCTGCTATCTGCTCACGATTTAAATTTATACCTTCTGACACCACTTGATTGTACATGGAAATAAACTCTTGTTTGCTTAAATCTTTCTCAGTTAGTAAAGTTATAAATGTATAATCTCCAAAAGTTCCATCTGATATACGAAATGATTTCATCGCCTACCCCTCCTGTTATTTTGTTCTATTCCATACTATTTTTCTAGGTTGTTTCTTTTCTTTCACGGTTGCAATGTCAATATAATCTTTACCTTCTTCGTAAGGAATAACATCGGTATCTGATACAGGTTTATATACTTCAGTTGTGGCTCTAATTTCAAGTTTCTCTCTAGCTACAACTAAATCGAATCTTCTTTCCATTTCCTCTGCTAATTCCTCCAAGTCTCTATACTCTTTATCTTGTACGACTTCGTTATACATATCTATGAATTCCTTGTTTGATATACCTGATAATGATACCATAATAATTGCTTCATAGTCTGCATATTCCGAAAACCCTAGTTTAAAGTATGTTGCCATAACTCTACATCCCTTTCTATTCGTTTATTTCTGTTTCAAACTCTTTTAAATACGCAATGAACTTATTGTAAGATACAAGTCTTGATTGTAAAACATCAATGTCTACCCCTAAACTCTGTAACCCATCTGATTCGAATATCTCGTCTCCGTTTTCTACTCTTGTATGTAAAGACTCAATCTTACGTTTTGCACGTTCTAACTTCTCTTTTAACTCGTTTTCTACCAGTTTCTTTTCTGCCACTACTTTTGCTAATTGTATCTCTACTCGTCTCTTTTGGTCTTCGATAACCTTAACCTTTTTATTGTAATCCTCTATAGTAGGTAGTTCTTTCTCTTCTTTCATCGTAATAGTTGAACCTTCGTTTGCTACTTGTAAAGAATCAGTTTCTTCGCTACCATATACCTCTTTGATTGTTTTATTCCATGATTCAAAATGGTTTTCCTTTGTCATTATGAACATCCTTTCTTTATTACCTGTTTGCACTTTATCCTCCAAAATAAAAATAGTGCTACAAGTATTTTTCTCATTTACTTATAACACTATTATACCATAAATTTATTAATTTGTCAAGTATGTTTCCATATCTTACCTAACTTGTTTCTAAAATATTTATCTATAGTTTAGAAATCTAAATAAATAACTTTCTCTCCAACGTTTCCTTTTCGAATACTTGCACCCTTTAAAGTATATCCGTAGTTTGTTATCTCATTCGTATCACAATAAATTTCTACAATTGGATAACCTACAAAGGTACTTAGTTCTCTTGCTACTTCTTCCATGTTTCCCTCTACTGTAATCAAACAACCATCATCACAAGATGTCAATTGTATAATATCAAAATTTCTAAATCCTTCTTGTTTAGGCGGTAGAGAAATTTGTCTAAACCCGTTCTGATAGATAAAGAATAAAGGTTTCTTTTCTTCACTCTCTAGTTTCTTCTTTCTAGCTTCTTTCATCTTGTTTTTACGTTCTTCTATAAACCATACACCATTTGAGATAAATTCAGGTTCTAAATCAGCCATCGACTCTTGACCGTGAAAATAATAGTTTGTTTCTCCTAATTTACACTTTACATGTGTTTGATTGTTTGCCCATAACTTCATTGCTTTCCACATCGGAACTTCTTTCCAGTCTACCCCAAGACCGAACCTGTCTTTATCTGTATATCTACTTGCTCTACTCATAGTTCCCTACCCCTCTACAAACCATTGACCTTCTTTTACGAAGTCTTGGTCTAATTTATGTATCGTCTCTCCACCTTTAAAATAGTACTGTGAACGTTTCACTTGACATCGAATACTCTTACCTTCCTCAGCCCATAGTTTCATTGCTTTCCACATCGGTACTGATTCCCAAGTTGTACTATCATACCAGTTTTCTTTACTCACCTTTTAACCCTCCTTGTTTAAGCCACCATACTTCTATATACATACCCTCTATTTATTTTCTCTTCCTTACTTGTTGCGTTAGAACATGCACCTACTCGTTTTAATTCCATTTCAAAGTATACATCACCATCTTTAAAAGGTTTATTCTTTACGAAACAAGCATAATGACATAACTCGTGTTTCAGCACATCAACGATTGCTTCATTTTTAAAATGTTTATTTGCAAATGAACTAATATCTATGCTTTTCGGTTTTCTAGTTTCTTTTCCGTTTTCATAGATTAAAGCACCAGTAAATCTTGCAAACAGTTTACGTAATCTACCGTTTATTTTAACAGGTATCGTTAAATCTAAACCCCAATTCTCTTTACACAACTCTTTTGCTAATTGGTTTAAATACACTTCTGTACGTTCCATTTCACTATACCCCTTTCTGAACTATTAAAGCCATATGATAAAACTACTACCTATTATAGTGAAGAATATACCTGTTATCACATTCACTATCTTCATTTTACGCATTTCATCCTCGGTTACATCTTTTCTATTAGAAGGTTTTACTAGAATGCAAACTACCCCTAATATGATGAAGTATAGACCAACCATTATGATTATAGAGTTAGACATCGTTTATGCTACCTTTCTATAAGTTTATCTAGTTTATTTCATGAGTTCTTCTAGTTTACGTAATGCTTCTTTTCCTCTTCTGCTTAATACATCCGAAGTAAAAACAACATTTTTCTTTAACAGTTCTTTTGGATTATGTTCTTCTTGATAAGATTTATTGTACTTAATCCATTGGTTTTTAAGGTCTGTATATCTAAAATCAGATTTACTTTTTAATACAATTACTCTATCGTTTAACTCTATTCCTGCAAAAGTTACTACACGTAACAAGTCTGGATTAGGTAAAGAAACCTTAATTTCTTCAATTAACTCTTCTTTTGTCATTGACATGATATTTCCTCCAATACGTTTCATTTATATAAATAAAAAAAAATAGTACTACAAGATTTACTTTATCTCATAGTACTATTATACCATATGTTTATTAATTTGTCAAATATGTTTACTTTTCAGAACTTCCAAACAGACTAGAGAAGAAGTTTCCAATTGCTGAACCAATGTCTTTAATGAACTGCCATGAAGACTGAATGAAATTTTGACCTGCTTCGCTATCTTTAAAGTCTTTTAATTTACCAAACAGTTCTTTAGAACCTTCTACGATACTATCTTTGTATGTACCGATTTGTTTTACAAACTCTTCACTGTTTGCAATGTTTGAATCTTTAAAGTTGAACATGAAGTTTACAATTATATCTTTTTGCTTATCAGATACCGCTTGTTCAAGTTCAAGGGCTTTTAACTTCTCGTCTACAATCTTTTCAACATCTTCTTTTGTTAATTGTTTCTTTTGGGCTTCATCTAACTTAGCGATATCTTGTTTCATATCAGCGATAGCAACGTTTAATTGTTGGTCAGAGAAGTCTTTCTTATCTTTATTCTGTTCGTTGATTTTACCTAACATAGAAACTTCATCTTGTGCTAGTTTCATATCTTTTTGGTCAAGTTCAACACCGTTTTCTTTAAATGCATAATATACCCCTGCAAGTGCACCTTCACCAGTTGCTTTAACAGAAGAAGCTACCTCAATGTTTACATCAGTTAATCCAGCTGTTAGTGCCGCATTACGATATTGGTCTTGTGTAATACGAGTAATGTTTTTAGGTGTTTTGATGTCTACCTTAACTCCATCACCTTTATCAGTCTTTTGAACTACTACAGAAGAATAAATGTTTGAAGATGGGTCACCTTCACCTAAAAGTTCAACCATTTTCTTACCATCCATAGTAAGTGTTTTAAAGTTTTCTTTTACTGCAAGGTCTTTCTTAACTGAACCTAAATCAGCTTCCTTTAAAGATACCCCTTTTACGAATACTGGTTCAGACCAAGTTTCATGTACTACATCATCTTTTTGGATTTTGTCACTACCGTTTGTTTTTGTAGAGTCAGTTGAAGTTTTTGTGTCAGTAGAAGTTTGTGACTGTTTAGGCGTAGTATCTCCTGTTTCTGCTGATGCCACTGTTAACCCTGTAGTTAAAGTTGGTACTACCAATGATGCCGTTAGTGCTGTTGCAACGATTTTCTTTTTCATGTTTAATAATCTCCTTTTCCTATAAGGCGGTTTGTATATAAGATATTGCATGTTTATATAATATATGAATGCCTTCCCTAATAAACCTTATACACATGTATTTTATTTTAACCGCTATTTTTTTTACTTATTTTAAATCTAATACTATTATACCATAGGTTTACTTATTTGTCAAGTATGTTTGTATTAGTTTAATTTTTCTTTGTACTTTTGTAACTCTAATTCTAATTCAGACACTTTGTTTAATAAAGCTACATAAGTTTGATTACCTGATTCAAGTAAAGTTCTCAATCTTCCAAAAGATAAGACTGGCATTCCACTTTCAACTGACTCGTCTGTTCTATGAAATACGTTTAATTTCACCGTATTTCCCATGTACGGAATTTCAAATTGTTTATCTATCACATTTTTCGCAGATTTTCCTTCTGCTTCACCTCCTAATACCCATACGTCTTTCTATCATAAGTATAGTTTAAAGATGGTGTTTTAGACCAAAACTTGCTCAAGTTGGGTTGTCTGTACAGACAGTGGAATAGAATCTAAGTTAGATAAAATTTTATAAGTTCAATTAAAAATAGCCTAATTTTAACGATTCTCACCCTCTTACCTCAACTTTTATTATCTTTCCGTTTCCTCCTACCCCTTACAACTTGCACTAATTTTAACCTATACTTTTCTTTAAATATGTTTCTTTCTATAATAAAAAGGTATGCCACTCATAGTTTGAATGACATACCTTCTCGTTACTACCTATTCTTAATAAGAACTTAATGCATAGATATATTTGCTATCCATGATTTCGCCTTGTGACATTTCTAGTTCTAAGTCTACCCCTGTAAGAATAGACATCATCGTTTTAACCTGTTTTGGCAAGATACGACCAATTGGTTTTCTTACTTCATCACCCTTCTTTAATGAAATATAAACCGCCTTGTTTAACTGGTCTTCACTATCTTCTGACTTCGTTACTTCTGCTTTTAAAAGACTTACTAAAGCTGTCATTTTATGTTTTGGCATATTATCTGTTAATAATATATTTACAACAGGATACTGAATACCTGTTACTACGTTTCGTGTAATCTTATCTGTAATACCTGCTACTTCTTTATGTCTTACCTCTTCTTCGTATACTTGCATAATTACTACCCCTTCTTTCTACTTGATTACGGTTACTAGAGGTCTGTTTACGCTACCGCAAACATAACCTCTCGTTGTACTGCATTTAAATTCGCACTTGTGATATAAGCGTTTGTAAGGATTTCTTTATCCTTTTCTACATCAATGAATACGACTTGATATCCTGTTTTATCTTGATGAACCTTCGGTTTAATGATTTGCATAATACTTGGAACAAACTTGAAGTATGCTTTCTTCTCTTCTACGTTTAAGAAACAACCATACTCATTTATTTTTGTTAATAAGAGTTGTTTATTGCTTTCAGCGTCTTCCCTTGCATTGTAGTAATATTCACCTTCATGCTCGTTTACTGCTGACTTTGCTTGTTCTTTCTCTACATCAACATCATGTGGTGATAGCAACTGTACAGTCGCTCTATCAATACCCCTGTATTGGCAATAGAAATCAAGTAAAACTTGTAAATCTTCAAAGTTTCCTAATACCATATCTTTTGGTATTTCATTTACATACCACTGTTTGTCCACTTTTAACTTCTTACAATATGCTGTTACTTTCTCATCTAATGTAATTTCATGTGTTTTAGATGGTGGTACAAGTTTATCTGCACGGTGCTTGATAATAGATAATACGTTTACATCGAAATCGTATCTGTTACCTGCTTCTAATTGTGAGAAGTAATTTTTCATTAACTCGTCTTGTACTCTATTGACTTGTGAGTTAATGTAATCATAAGTTACTGCTGAAATAACTTGACCGTTATTTTCTTTATTATTTAAGTATCTATCTGCATACTCTAGTTCGAATTGGTTAATACGTTTTGGAACCCACTCACAGAACTCATCTAAGTTACCGTTCCAATCGAACTCACTTGTTTTACCTTGGATTTCTTGTTGTAGTTCTGTAGGAATCTCAACTGCTTTTGCTTCGTACCATGAACGACCTACCCCAAACCCGATGTATAGAGGACAGAAACCGTCTACTTTTAATTCCATTTCTTCTTTTAATACTTTCATCCAGTCTAGCGGGTGAATCTCCATTGACACTTCCATTAACAGTTCATCATGAATGAAGCCCGGAAGTAATACTTTGTCTAACCAACCTTCATTGATGATTCGTAGGAATAAACGTACAACTGCTTGTTTATAAATGTCTGCCGCTGTACCTTGGATACGCTGATTACCACCTTGACGTTTAATAGAACCAACTGATGTTGTTTCTTTATTATAGTAACGTCTACGACCAAAGTGTGTTTCTGTATAACCATATTTAACTGCATCACGTTGGGCGTTTACGAAGAACTCACGAACGTTATCTTGCCCTTTGAAGTATCTTTCACGTAAAGCCGTTGCTTTTCTTGTATTCTCTTTTGATACCTTACCGAATATTGTCATACCCAGTTTCTCATTACCCATACCAAACGGAATACCGAAGTTAAAGGCTTTCGCTTCACCACGCATGGCTTTTGATACAAGTTCATATGGTATCTGATACATGTTTGATGCTTGTAGTTTATGATAATCCGTATTCGGGTCTTGGAAGGCTTCAATTAATGATAACTGTTTACTCATTGAAGCGATTACTCGATACTCAATACTTGAGTAATCCATGTCTCCCATCCAAAAACCAGGTCTTGGCTTAATGTACTTTTTAACGGTATCATTGTAAGACTGGTAGTTTGGTTTCGAAATAGATACACGACCTGTTTTTAAGAACTGTTTTACCCCACTAAACATGAAACCATCAGGCGTACAGAACTCAGGTAAGTTCTTGGAGAAGTTTTTACGTAATGTGTTTACTTCATTGAACTCTTGGAAGTAGTTAACGAACGGATACTTAGGTGTATCATCAGGGTTTGTCATCTTAGACAAGTTCTTTAATGCCTTTTTATCCGCTGTTAGCTTACCATCTAACTTGTACTGCTCAGGCGCACCAAACACTTCATATATGATTTTCAGTTTTTCCACGTTTGATTGTGGGTTGAAATTATCTGCATCATAGTTTACTTTACGTAATTCATTACGCATTTTACGTTCTGCTTCTTGTAAATCTCGGTCAATATCTTGTACTAGTTGGTCTGTTTCATTTACATTAACGAACTGACCGTGAAACTCACTATACCCTATCGCACATGCGAAGATAGACTCGAATTGTACTACTTTTGTAGCACCCCAGTTTTCTAGCATGTTTGTTTCTAGCATATAATGATATAATGCTAACGTATTATCAGCATCGGCACAAGCATATAGACGTACAAGTTCTTTTGGTAAATCTGCGAAGTTTTGGTCAATTGAACCAAAATCACCATTCTTACATAAATCATCCAATTCCAGTGAATCACGTTTAAGCAATAATGAAATTAAGTGCTTCAAACCAACTGGTGTTTGATATTTTGCATTTAGTGTTAATGAGAATACCGCAAATGTATCTATTACTACGTTTAACACGATACCGTAAATATAAATAACTTTCCAGTCGAACGATGCGTTGTGGACAATGATGTCTTTCTTTTCTAATAACGGTTTCATGTATGTTTCCATGAAGTACCAATCATCGCCACCACATAAGTTATCAAACTGTGTATGTTTGAATGGGAAGTAGAAACTCTCCCCTTCTTTACCTGTTATGATTAAACCTACACACTCATCATGCTCACCTGTTCTTGACTTGAATGTAATGTCTAATCCTGTTGTCTCGGTATCGACTGCTAATACTTTAAATGTATTTAAATACTCAATCGTTTCCTGTAATGTCTCATCTGTTACCATGATATAATTTCTATCTAGTAACCAACTAAAGTCTCTATCAGGATTGGCTTCCATAATCTCTTCAATTGTTTGATAGAATGGAGAATCCATATCATTAATGTTACCGAAGTCTAGTATCTTTTTCTTACGTTCTACGATACCAAAGAAATCAAATAAATCGTCTTTCTTGAATTTAGCCGTTACATTCTCTTTTGTTGTTCTGTATGCTTCTGTATACCCTGTAGACTCTTGCTCATACAGTTTAATATCAAAACCATACCCCTCAAATGAGAACTTTGTGATATTACTATAACTTAATTCAACCCATGCATAGTAGTCTCCTACTTGCACTTCATGTTGTGTTGTAACCCTTGGGTCAAATGCATTACCTACTAGTTTTAATGTATTGTTAATATTTCTACAATTGTTTTTGATGTAACGCATTAATACCCCTAGACGACCAAAGAAATCCATGTTTGGCGTAAATCGTTTACCATCAGGCGCACGTTCTGACTCTACCGCCATTGTAGTTCCTTTAATCTGAATACGCTTTTCTGTATAAGCTAACTGCGTATTATCAGGGTCTAGATACTGCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_018516|80407:90207|81841_82186_-|WP_000257080.1|DBSCAN-SWA MATYFKLGFSEYADYEAIIMVSLSGISNKEFIDMYNEVVQDKEYRDLEELAEEMERRFDLVVAREKLEIRATTEVYKPVSDTDVIPYEEGKDYIDIATVKEKKQPRKIVWNRTK >NC_018516|80407:90207|82202_82682_-|WP_003298987.1|DBSCAN-SWA MEDKVQTGNKERMFIMTKENHFESWNKTIKEVYGSEETDSLQVANEGSTITMKEEKELPTIEDYNKKVKVIEDQKRRVEIQLAKVVAEKKLVENELKEKLERAKRKIESLHTRVENGDEIFESDGLQSLGVDIDVLQSRLVSYNKFIAYLKEFETEINE >NC_018516|80407:90207|81526_81826_-|WP_000834751.1|DBSCAN-SWA MKSFRISDGTFGDYTFITLLTEKDLSKQEFISMYNQVVSEGINLNREQIADELCKRYGFVKETHFFEIHAMSGFGIVQDYKKEDVVRDDLRRIEVYSPY >NC_018516|80407:90207|82807_83371_-|WP_000085609.1|DBSCAN-SWA MSRASRYTDKDRFGLGVDWKEVPMWKAMKLWANNQTHVKCKLGETNYYFHGQESMADLEPEFISNGVWFIEERKNKMKEARKKKLESEEKKPLFFIYQNGFRQISLPPKQEGFRNFDIIQLTSCDDGCLITVEGNMEEVARELSTFVGYPIVEIYCDTNEITNYGYTLKGASIRKGNVGEKVIYLDF >NC_018516|80407:90207|83592_83991_-|WP_000442474.1|DBSCAN-SWA MERTEVYLNQLAKELCKENWGLDLTIPVKINGRLRKLFARFTGALIYENGKETRKPKSIDISSFANKHFKNEAIVDVLKHELCHYACFVKNKPFKDGDVYFEMELKRVGACSNATSKEEKINRGYVYRSMVA >NC_018516|80407:90207|83377_83575_-|WP_000032377.1|DBSCAN-SWA MSKENWYDSTTWESVPMWKAMKLWAEEGKSIRCQVKRSQYYFKGGETIHKLDQDFVKEGQWFVEG >NC_018516|80407:90207|81324_81513_-|WP_000033408.1|DBSCAN-SWA MSKGFTLICNECENKVDYKELENKRHNIEKQMSVTIHSLTECGFICFSCENKVKLNDKENQE >NC_018516|80407:90207|80798_81314_-|WP_000404429.1|DBSCAN-SWA MEILNKYDELGFEVTVYEMTKMRKGEKTEIFKAEIKIADREELLTTLEASSKFQLRELLESWLEYEETTKEKLQGLPKVRFVRFATDEHSEYSYSTLMIRGDITNEEFLDLYHRIVKQVDTNQHEVIAQAMCREYGFQLVEEDLEIHAMYSKFSIVDRDVSYKTAGFTTLG >NC_018516|80407:90207|84643_85729_-|WP_000727297.1|DBSCAN-SWA MKKKIVATALTASLVVPTLTTGLTVASAETGDTTPKQSQTSTDTKTSTDSTKTNGSDKIQKDDVVHETWSEPVFVKGVSLKEADLGSVKKDLAVKENFKTLTMDGKKMVELLGEGDPSSNIYSSVVVQKTDKGDGVKVDIKTPKNITRITQDQYRNAALTAGLTDVNIEVASSVKATGEGALAGVYYAFKENGVELDQKDMKLAQDEVSMLGKINEQNKDKKDFSDQQLNVAIADMKQDIAKLDEAQKKQLTKEDVEKIVDEKLKALELEQAVSDKQKDIIVNFMFNFKDSNIANSEEFVKQIGTYKDSIVEGSKELFGKLKDFKDSEAGQNFIQSSWQFIKDIGSAIGNFFSSLFGSSEK >NC_018516|80407:90207|86485_86866_-|WP_001198496.1|DBSCAN-SWA MQVYEEEVRHKEVAGITDKITRNVVTGIQYPVVNILLTDNMPKHKMTALVSLLKAEVTKSEDSEDQLNKAVYISLKKGDEVRKPIGRILPKQVKTMMSILTGVDLELEMSQGEIMDSKYIYALSSY >NC_018516|80407:90207|85915_86134_-|WP_000565922.1|DBSCAN-SWA MIDKQFEIPYMGNTVKLNVFHRTDESVESGMPVLSFGRLRTLLESGNQTYVALLNKVSELELELQKYKEKLN >NC_018516|80407:90207|86913_90207_-|WP_003298979.1|DBSCAN-SWA MQYLDPDNTQLAYTEKRIQIKGTTMAVESERAPDGKRFTPNMDFFGRLGVLMRYIKNNCRNINNTLKLVGNAFDPRVTTQHEVQVGDYYAWVELSYSNITKFSFEGYGFDIKLYEQESTGYTEAYRTTKENVTAKFKKDDLFDFFGIVERKKKILDFGNINDMDSPFYQTIEEIMEANPDRDFSWLLDRNYIMVTDETLQETIEYLNTFKVLAVDTETTGLDITFKSRTGEHDECVGLIITGKEGESFYFPFKHTQFDNLCGGDDWYFMETYMKPLLEKKDIIVHNASFDWKVIYIYGIVLNVVIDTFAVFSLTLNAKYQTPVGLKHLISLLLKRDSLELDDLCKNGDFGSIDQNFADLPKELVRLYACADADNTLALYHYMLETNMLENWGATKVVQFESIFACAIGYSEFHGQFVNVNETDQLVQDIDRDLQEAERKMRNELRKVNYDADNFNPQSNVEKLKIIYEVFGAPEQYKLDGKLTADKKALKNLSKMTNPDDTPKYPFVNYFQEFNEVNTLRKNFSKNLPEFCTPDGFMFSGVKQFLKTGRVSISKPNYQSYNDTVKKYIKPRPGFWMGDMDYSSIEYRVIASMSKQLSLIEAFQDPNTDYHKLQASNMYQIPYELVSKAMRGEAKAFNFGIPFGMGNEKLGMTIFGKVSKENTRKATALRERYFKGQDNVREFFVNAQRDAVKYGYTETHFGRRRYYNKETTSVGSIKRQGGNQRIQGTAADIYKQAVVRLFLRIINEGWLDKVLLPGFIHDELLMEVSMEIHPLDWMKVLKEEMELKVDGFCPLYIGFGVGRSWYEAKAVEIPTELQQEIQGKTSEFDWNGNLDEFCEWVPKRINQFELEYADRYLNNKENNGQVISAVTYDYINSQVNRVQDELMKNYFSQLEAGNRYDFDVNVLSIIKHRADKLVPPSKTHEITLDEKVTAYCKKLKVDKQWYVNEIPKDMVLGNFEDLQVLLDFYCQYRGIDRATVQLLSPHDVDVEKEQAKSAVNEHEGEYYYNAREDAESNKQLLLTKINEYGCFLNVEEKKAYFKFVPSIMQIIKPKVHQDKTGYQVVFIDVEKDKEILTNAYITSANLNAVQREVMFAVA >NC_018516|80407:90207|80407_80593_-|WP_001004734.1|DBSCAN-SWA MNENEFYKPVVPEWVAKILEKKKRNDPLATIGHSKEWENWKRKYPRKYKYAMLNGWIVEEK >NC_018516|80407:90207|84234_84555_-|WP_003298982.1|DBSCAN-SWA MKRIGGNIMSMTKEELIEEIKVSLPNPDLLRVVTFAGIELNDRVIVLKSKSDFRYTDLKNQWIKYNKSYQEEHNPKELLKKNVVFTSDVLSRRGKEALRKLEELMK >NC_018516|80407:90207|80579_80786_-|WP_001135708.1|DBSCAN-SWA MPQKKTYIGKVVEQEIDYGNSNALYHDVYIKEINDYLTQDLFNFEGKKVKVTVEVIEEDTKECQNERK |
15 | Bacillus_phage(83.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
163865 : 174842
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_018509|163865:174842|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_018509|163865:174842|170228_172190_+|WP_000881565.1|DBSCAN-SWA MLATVENPLMGTLNSSQQRAVLTTEGRVLVLAGAGSGKTKVLTTRIAYLLQQGVDPWRILAITFTNKSAKEMKERVTGMDSRASKSWIGTFHSICNRILSTNIHHLGMDMFTLMDDTDQKALVKTAAVQLGLEADKNIVYNLLSQISLWKNEAISPGQAQSNSTGDKEKLAVSHIYQKYEDLKAIHNYFDYDDLLLKTVHLFQNNPELLGRYQNLFRYVLVDEFQDTNKIQFDLIEMLSQKHGNIFLVGDADQSIYSFRSAKIENILSYQKIHPETQLILLQENYRSTQNIVNASNSLVGNNKMRLEREAFSVSGVGDDIHVFRFNDASREADFVARMIVNMKKATQCDWKDFAVLYRMNFQSKHLELALRDENIPYKIVGTTSFYDRKEIKDLVSYIRASHNLTDDYALERVINVPSRKIGKTTIEKIYAFAHERRIPFFVALQNIDEVAALSKINKSTVAKIKEFATLMQELSQLALVGEFSATKFMQTLIKKTDFMGQFDKEKEEDETRIENVTHLRDYARHWDAQEKEINSLAQFVSEITLDGDSDEDEEDFVTLTSVHSAKGLEWPETFVIGLEDDVFPHYRSKQKLSDLEEERRLMYVAMTRAGKRLYLTHSAFKYEYGSQKPIRQKPSPFLGEIPDNYKTVMIQTA >NC_018509|163865:174842|168558_168768_+|WP_000945823.1|DBSCAN-SWA MLRNRSCSWCDGTGIVKSGFCSMCKGKGYVEVLKQVETSSKKQPSLACLIRSISKHTTPEQFSNIMNDC >NC_018509|163865:174842|168861_169752_+|WP_000487831.1|DBSCAN-SWA MFQSNQGGKQMTAVTTEAPPVEQDVVEEPVKLEKNYFAEMAGMDVTKYLEKKNGFSYMSWAHAVEQLKRKHPDAKINVKRFPEPETGGLLVPYIRTALGYFVEVEVIVNGVSVSEPFPVLDFRNKPIAKPTTFDINNSIQRAKVKAIAGHGLGLYVYAGEDLPVDSDDKGPNQAPQNYQQQNYQQQQQQQQYQNPPQQQNPYAATEPQKHQMRDLAMQIATLTLGAGATQENVVAKLKDIYGQFKITSNLTKEIADVKINELGAAVKAIHDNRMVQQAQVAQQTQSNTLFNMPQAQ >NC_018509|163865:174842|168037_168556_+|WP_000624473.1|DBSCAN-SWA MISLIVAADENNAIGFENKLLCRLKDDMKHFIKKTKGKPIIMGYKTFASLGHKPLKDRFNIVLTRSPMALTLDHLHLVGENLVFESLEYIQFMIEQSKDKEIVVIGGQQTYELFLPMASRVYLTRIHHSFPEADSYFPMLDSSEWSSKLDAKHAESEDNDHPFSIYTFERKG >NC_018509|163865:174842|169881_170079_+|WP_003254307.1|DBSCAN-SWA MDNKGALIRIIVFALAWLNQYLVAKGQQPLPVVGETEIAAVLTFVASVMTLVKDNKVAPKTKEPK >NC_018509|163865:174842|172699_173314_+|WP_000583728.1|DBSCAN-SWA MIIIALEGLDKSGKKSQADKLHEALYERGYNVEQSEFHRYDTPTGGLIRQFLDGEYNPGQLAIECIMAADKYAQLNWFEELAEKLDVLILDRYLVSQLVYSTANGVDIDFTANLLDRMPEPNFQIFLDIEPEESMKRKGKHGENDKYESDKELLTRARDLYLRYMKLEEEDGNAMILDGTLAVEELHQQILERTLSLLTESKGE >NC_018509|163865:174842|166722_167112_+|WP_000398537.1|DBSCAN-SWA MEGITLSTTATITKDSEVRFTIENKSGYLNAELGIRKVKLFKPSTKQQGIGIVTTMLVDAGIGETRIVVFNSKENSGELYLRAPQSKSFVGGEVKFYDEVKINKSSQDYLLSLLDSYVEKENVQRVKLL >NC_018509|163865:174842|173821_174100_+|WP_000156298.1|DBSCAN-SWA MTITEHAVRRYKQRVGKRTASKKRVVMQINRDLARDVKYKKKSKVKDHYILVTSRYQAVCYKHRVVTITGLNEDASNFKQTSSCDEELSLVA >NC_018509|163865:174842|174092_174842_+|WP_000548555.1|DBSCAN-SWA MHKCNEETHNKCENSALCHLCDGVRLYKNSKEERERKLEAREANKQAERNAAFRTYKSEKKEGMAFEKDVTKKWNDAFNKVNKQTDLFKQGTKKTKIQKPRIQVNEPVKEEPPKPIEKPVPSIILSSMGATPTMKNKPIVDARRQANSGALWYAKGDIKTQDYLMECKERGTINARGEKSISIPKDWLLKQELEAFQENRPYWVIPFRYKNDDSIYLVKSFDQEIEMYQQMRILREENEKLKRQIEKNT >NC_018509|163865:174842|163865_165482_+|WP_001031181.1|DBSCAN-SWA MNKELSLNGYGYNKEDSNQDQYPQFEQSVKNFFDMAINSGKKLFTTNVDELYEIYLNNLPAEARQHYTCNACRTFINRFGGLVTIDENGTMNSAMWNEDITPRFFAPAVSAMKKAVLNSRVNGVFIPDARVLGIPRTGEWTHLSVALPQTLVNRSVIRTAHQVMAEKLEDFKMLIRALMEYSVDVVDQAVGLLKTESLYRSEKCLGTAEWFREVHEKRDNVKNSRHKENIVWLAVATAPTGFCHVRSSMIGTLLDDIASGMSFDSVSRRFAEKMHPLQYQRPQAAPSAGNIAQAEKIVEKLGIQKSLIRRFARVDELKTEWTPKGKKETIKNSGGIFSHIQSKDKKELPKMNVPPVTMTWRKFMETVLPLAEEIEYQVKSVDNFSAILTASYEDAPPILQWDKEEQRNPFSWYVYSGGSNASKWNVSTGYQKVTAITFQPSMWYDENAHQGKAVFLILDGAKDNRFNSAGNALFPEILKSELREIRSTLESYSKGAAIEEYDEASACGVRLQYGGTWNAMVRVTTKTGTAVYKLDRWD >NC_018509|163865:174842|165593_166673_+|WP_000691718.1|DBSCAN-SWA MKIINFGSTYKIYGDDLKTYDKLPAATYKVEFNPRSGFSLEKIDNFESTEAKIYGSHPEKINKVLKSYEKFERSLGLILSGNKGMGKSMFVQLIAEAVVKKEIPVIMVTKAFPGIADFIEQIDQEALIILDEFEKMFNPRNEEAEKQENLLGLFDGTSQKKRIYAITVNDLNKVNEFMLSRPGRFHYHIRFDYPTATEIEIYLKDKIAEQYHGEIKHVVAFANRVKLNYDSLRAIAFELNEGYTFRSAIGDLNILTTDSQRYDVKVILDNGKSIELRSKSINLFSETIQLSGYMHGGDYFSMSFNPANIVEETHKMLVDGEFVKAKFQDEDDEPLKGIKVESVIITHAAEAGVNYKFAS >NC_018509|163865:174842|167180_168041_+|WP_001173852.1|DBSCAN-SWA MALIDDYQKDTLKLILAQEWIPDNRAVWEDGSPIATKRIFGVVNRYDLSKEFPAPTTRPLPLKTIFDEVDWIYRKRSNNVNDMRAKIWNQWAFKKTRLRFSKTFPFVRLEKKGSIGEAYGYQVAKPIFGYDNQMDYVLGELKRDPFTRRAVIEMWNVDDTGRMNLPPCAHHLQFWSDGKKTNLILKQRSQDFVTANAFNVCEYAILLHMVARHIGQEVGELLHIIGDCHIYNKHLELAEELVKREPYAAPTLWINPEKTDFYSFTADDFRLENYDKHPQMKIEVAV >NC_018509|163865:174842|172220_172703_+|WP_001023489.1|DBSCAN-SWA MNILKLFKNKKVRGFEVLNDFKEHFENFSVLKPTRKTLNAAGYDIAAVGDYVIPPNSKAIINTGLTAYMKEDEWLALFVRSGLAYGKDLTLQNATGVIDADFYGNHIRILLRNEGTEPFVVNHGDRIAQGIFLPYLTADDDYASELRTGGFGSTGGVSAA >NC_018509|163865:174842|173317_173797_+|WP_001068334.1|DBSCAN-SWA MNPIVDMTAEQWAAYRRELNQNTQSIHIPTDVNPAMAISILSRIDSIYSTLRIQFSDLESSKERIDLMVKEIERVGLTGKNEDERKRNAVMEVRKITTQEGLTLYDMQRESTERYMFIKGILDVLINKQNRLITINGLLKLDKDLMVSQESFSSLGRAS |
14 | Bacillus_phage(55.56%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
192819 : 228533
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_018509|192819:228533|DBSCAN-SWA 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53 | Bacillus_phage(60.71%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
0 : 81903
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_018510|0:81903|DBSCAN-SWA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_018510|0:81903|5443_6019_-|WP_000899477.1|DBSCAN-SWA MLFTDLDCSLQRGFLVDLRGIVRMLLQDMDYVIVEEDVSFITDDFVEKVIIYLEKTRFFQKWIEVDVSAVDVKELLQQIEISMRKRKSTLRQRNYFTNLLYAVDLRENIPTDYLCMKKRLLELECLKEQQKHAQSLIPVSTQQITVLKRAWKETMGRKLEVSEDMKQREVDELFSRINRKQCKIQRQRQER >NC_018510|0:81903|56896_58828_-|WP_000390241.1|DBSCAN-SWA MEDSSLDTLSIVNETDFPLYNNYTEPTIAPALIAVAPIAQYLATAIGKWAAKAAFSKVLSLIFPGSQPATMEKVRTEVETLINQKLSQDRVNILNAEYRGIIEVSDVFDAYIKQPGFTPATAKGYFLNLSGAIIQRLPQFEVQTYEGVSIALFTQMCTLHLTLLKDGILAGSAWGFTQADVDSFIKLFNQKVLDYRTRLMRMYTEEFGRLCKVSLKDGLTFRNMCNLYVFPFAEAWSLMRYEGLKLQSSLSLWDYVGVSIPVNYNEWGGLVYKLLMGEVNQRLTTVKFNYSFTNEPADIPARENIRGVHPIYDPSSGLTGWIGNGRTNNFNFADNNGNEIMEVRTQTFYQNPNNEPIAPRDIINQILTAPAPADLFFKNADINVKFTQWFQSTLYGWNIKLGTQTVLSSRTGTIPPNYLAYDGYYIRAISACPRGVSLAYNHDLTTLTYNRIEYDSPTTENIIVGFAPDNTKDFYSKKSHYLSETNDSYVIPALQFAEVSDRSFLEDTPDQATDGSIKFARTFISNEAKYSIRLNTGFNTATRYKLIIRVRVPYRLPAGIRVQSQNSGNNRMLGSFTANANPEWVDFVTDAFTFNDLGITTSSTNALFSISSDSLNSGEEWYLSQLFLVKESAFTTQINPLLK 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56 | Streptococcus_phage(41.67%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
86596 : 166558
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_018510|86596:166558|DBSCAN-SWA 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58 | Bacillus_phage(21.43%) | bacteriocin,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
176564 : 177692
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_018510|176564:177692|DBSCAN-SWA CTTATTTCGGCAAATACGGTGCTGGGTCGACTTGACCAAACATCAAAGATGTTTTGATCTCAAAGTGAAGATGTGGCCCTGTTACCTGCCCTGTTCTTCCGCAAACGCCTACCTGTTGACCGACTCCAATGTTTTGCCCTTCCTGTACAGTAATAGACGACATATGACCGTATAAACTCCAATATCCATTCCCATGATTAATGACAACTACGTTTCCATATCCGCCAAAACCAGAACCAGAAGCGCCAAATTTCGCCCACTCTACAACGCCACTTTTCGACGCGGCAATTTGAGTGACACCGTCCTGGCAAGAATAATCAATACCTTTATGAATCGTGCCCCAGCGCGGTCCAAATGGACTTGTAATCGTTGTTTGAGCAATAGGACGAATAAACCCTTGTGAGCTTGCTGATCCCGTATCTACAACGCCGCCTGGTTTTCCAGCTTCACAATTGAAAGTAAGGCCGCCCATTTGCGCCACAAATTTTGTTACTAATACTGGCCATAAACCATTTGTACCATGCGGATCGTTTGCGGCTCCTGGCGGTGCATATTTCGCTCCAATTGCTTCTATAGTTGTAATCCCCATACCGATATAGTTTTTATATAAATTTCGAGCCATAGCGTTGATTCCTTCATCTAAAGTGGCAAACTTCATGAACCCTTTCATTTGTGAACTGCTAGGGTCCATAAGGCCGCCTGGGTTGTTATAGTTCTTTACTGCATTAGAAGTACCATTACCCGTTTCTAATCTCGCAATGGCCGCTAATAAAACAGGATCGATTTGGTTTTGTGTTCCTGCATTTAAAAAGGCCTGTGCTTTCCCTGTAAAAACGCCGCCCAGGTGGGGTTGTAGTTCTTCTGGTGCCACTGTTTTTCCACCTGGACGACAGACCGTCATGCCATTACTTGGGATGGTTGCTGGTGCTTCCTCTTCTTTTTTGCCAATGCCTTGCCCCAAAACGATAAATAAAAGAAATCCAATACAAACGAACAATCCTATCGTGAAAGTAGAACTCCCAAAAAGAAATGTCAGTAACCAGGATTTCTTTTTCTTCTTCTTTTTTTGTTCTTGTGCAATCTCTTCTTGTACCGTTTTATCTACAACTTCTTTTATTTCTGGTCTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_018510|176564:177692|176564_177692_-|WP_001247229.1|DBSCAN-SWA MRPEIKEVVDKTVQEEIAQEQKKKKKKKSWLLTFLFGSSTFTIGLFVCIGFLLFIVLGQGIGKKEEEAPATIPSNGMTVCRPGGKTVAPEELQPHLGGVFTGKAQAFLNAGTQNQIDPVLLAAIARLETGNGTSNAVKNYNNPGGLMDPSSSQMKGFMKFATLDEGINAMARNLYKNYIGMGITTIEAIGAKYAPPGAANDPHGTNGLWPVLVTKFVAQMGGLTFNCEAGKPGGVVDTGSASSQGFIRPIAQTTITSPFGPRWGTIHKGIDYSCQDGVTQIAASKSGVVEWAKFGASGSGFGGYGNVVVINHGNGYWSLYGHMSSITVQEGQNIGVGQQVGVCGRTGQVTGPHLHFEIKTSLMFGQVDPAPYLPK |
1 | Rhodococcus_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
181390 : 183961
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_018510|181390:183961|DBSCAN-SWA ATTACGCCAATTGTTGTGCGCGTTCTTCGTCTGTTTTCGTAGAGGAATCAAATGCAGTCTTTAATTCTTGGAAAACAGGATCAATTTCTACAACCGCGGTTCGGCCAAAAATATCCTGGAACAAGGCTTCGCCGCGTCGTAACTGGCGTAACATTAAGATATTTTCTTCTGTGACCGGTAAGTTATAGTAACGCAACATTTCTTCCGCTTCCTTATCGTATTTCAGCGCAAAACAGAACTTCATACCCACATTGGCAACCTCTTTGTTTTCAGATTGATAATCGGATGCGTTTTGTGTTCCTAAATACAATCCGATATTGTGATAACGTCCTTCTCGAATGATTTTGTCAGAAGACGCCGCACCCTCTTTATTTTTCAAAATACTTGATGCCTCATCTTGTAGGTATACTTTGAAAATACTACGGTCGGAATGCATTAAGGATTTACCAAATGCCGCTAATGCAATTAAGATACTACGAGATAATTTGTCTGTAACACTCTCATTCTTTTCCTCTGATTTCGGAATGCGTAAATGTTGAATTTGCAATACTTGTAATGGCCGTTCTAGGCTTAATACGCGGTAATCTTGACCTGGTCTACCAAACAATAAATCTCCGAGCTGAATACCTTCTAAGGTTGCTAAACGATTTGTAAGAGCGTTTAACCGTTCTAATTCAGTTGGCAATAAGTTAGGTTCTTTCTTCATCTCCACTAGTTCTTTACGAACCAAAGTTAAACATGCATCTTCTTTTTCCGCCACTCGTTCAATCGCTTTATATAAATAGTCATATCTGATATCCTCTAAACCTACATCCGATAGGAACGTCAAAATTTCAAGTGCTAAACTCTTCGCATCTTCTATCGTTGCACTGATTCGAAATGGGTCTAAACAGCCCGCATCTTCTTTATTCTTCCCAAGCGTCCATACTTGCAAGGTATCCTCATTGAACCCTGGTAATAATTCGGGCCACCTTGTTCTGTCGCCCTTAGGATCAATGATAAATGCTCTTCCGCCACTCATAACAATCCAGAAAGCGAGTAAGTTCATTAAGAAGGATTTTCCTTTCCCTGTTTGCCCCGCAAACATAACCGATAAACTCTCAAATGCTGTCACAATGTTATCTAATGCTTTCGCGGCTAGTTCGGGACGAACAAAAACAGGACGATTTAATTTCTTTGTCTTTCCAATGTAAAACCCTTGATTGTCGCCAATTTGTGTTGTGGCCCCGAACATTCCCATTGCAAGTACGCCTGGTTCCACAAATAACTTAAAGTCCGTATTATAACGTTTAGAGCCTGGTAAGAACTCGTAGAAGTATGCTAATTGTTCTCCATATGGATTGACCAATTCAATTTTCATTTTGCGATATTCTGTAATCAGCGTATTGACGCGTGATTTTAATGTTTTCTCATCTTCTGCATATACACAAAACAGTACACTTAGTTCATATCCAGGTGCTCCCGTTGTTTCAAATCGATCTTTTACAATTTTGACGCCTCTTGCTTTACGATCAATTGTTAAATCTGTTGTGCGACCACCTACCATCGCTTGTTGACGTTGATCGTTTAATTCCAGTTCACTGTTCGAAAGTTTTTGGGTAACCATCTGGTTTTCTAAATGATACGCTCGAATACTCATTTCAACAGGAAACTTTAATGAATGAGATTGAATGCGATAAATCCACTCTCCACCAGGAAAAGCCGATATTTCGGGCATATCTTTCACCGCAAGAAAAGCAACATGAGAGGTTTCAATTTCCCCTTCTTCATTTTGTCTTTCGAGTATAAGAGAACGCCCTGGGCTTTCATCAATCACCGTATCTGTTAATTGCACCATTTCTTGTAAGTCTGGACGGCGTACCTTTACCGCCTTTCCTTCTTCATTTTGTAATGTAACTGTAAAACCTACTTTCCAGTTTTGATCCCGATTCAGCTCTTTCATGCCACGTTTGAAGTTATGATGGAATAAAAAGCGCGTTGTTGACGGTTTCGCACGTCTTGTATTAGGAAAGGCCCCTCTAACCTGGCTAAATAACACGTCTTCTACTTCTAAATAATTTTCAATTTCCTCTTCTAAAATATCCGTCACATTCATACCCGATATGTTTTGAGCTGTCTCTGCAAATCCTTCTCTAACCTTCTTCATAAACTTCCATGTTTCTACGACAGGGTTACGAATTTGTCTTTCTTTCTGTTCCATATTCAGTTGTACTAAAACGAAAAAGCGATATTCCATGTTCTCTTTCGCAATGGCCGCATTTCGTAAGTATTCTTTTACCTTTTTGAAAAGAAAGCGTCCTGTTGGTGCCATCGGCCCTTTTAAAGTGGAAATATGTTCATCCAGAATTTCATCTGAATTTGTTGTACGAGGAATCACAAGCAAGTGGATATCATATTCTTGATGGGTAAATAGAGCGAGTTGATTGCGATAATATACTTTTTTCGTACTTTCGTCTTGATGATCGTATTCAAATCCGTCTACTTCATACACTGCGGATACTTTTCCGTCTGTACTAAACGCTAAATTCTTTTCAACGTGCTTTAATGGTGGTCTGTTCATCTTTTTCAACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_018510|181390:183961|181390_183961_-|WP_000914527.1|DBSCAN-SWA MLKKMNRPPLKHVEKNLAFSTDGKVSAVYEVDGFEYDHQDESTKKVYYRNQLALFTHQEYDIHLLVIPRTTNSDEILDEHISTLKGPMAPTGRFLFKKVKEYLRNAAIAKENMEYRFFVLVQLNMEQKERQIRNPVVETWKFMKKVREGFAETAQNISGMNVTDILEEEIENYLEVEDVLFSQVRGAFPNTRRAKPSTTRFLFHHNFKRGMKELNRDQNWKVGFTVTLQNEEGKAVKVRRPDLQEMVQLTDTVIDESPGRSLILERQNEEGEIETSHVAFLAVKDMPEISAFPGGEWIYRIQSHSLKFPVEMSIRAYHLENQMVTQKLSNSELELNDQRQQAMVGGRTTDLTIDRKARGVKIVKDRFETTGAPGYELSVLFCVYAEDEKTLKSRVNTLITEYRKMKIELVNPYGEQLAYFYEFLPGSKRYNTDFKLFVEPGVLAMGMFGATTQIGDNQGFYIGKTKKLNRPVFVRPELAAKALDNIVTAFESLSVMFAGQTGKGKSFLMNLLAFWIVMSGGRAFIIDPKGDRTRWPELLPGFNEDTLQVWTLGKNKEDAGCLDPFRISATIEDAKSLALEILTFLSDVGLEDIRYDYLYKAIERVAEKEDACLTLVRKELVEMKKEPNLLPTELERLNALTNRLATLEGIQLGDLLFGRPGQDYRVLSLERPLQVLQIQHLRIPKSEEKNESVTDKLSRSILIALAAFGKSLMHSDRSIFKVYLQDEASSILKNKEGAASSDKIIREGRYHNIGLYLGTQNASDYQSENKEVANVGMKFCFALKYDKEAEEMLRYYNLPVTEENILMLRQLRRGEALFQDIFGRTAVVEIDPVFQELKTAFDSSTKTDEERAQQLA |
1 | Streptococcus_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
194103 : 202873
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_018510|194103:202873|DBSCAN-SWA AATGGATAACAATATATTTGGGAAAAATATACGAAAGTTAAGAGCAATGAAAGGCCTTAGTCGAAAAGAGTTTGCTCAAGCCATAAATACACCATATAGTACCGTAACAAGCTGGGAAAATGGAGATAAAGTCCCTAAGATTGAACGTCTACCGACAATCGCGAAATTTTTTAATGTTAGTGAATCAAGACTTTTACACCATCAAATGAGTGATAATGAAATTTTAGAAAAAGATAGTAGTGAAACCGACCCAATAGAACGTATGGCTCAAATTTTGATTGAAAAATATAGAAATGTTCCAGAAGAACACAAACCAAGAATCGAAAAAGAAATTCTTAGGATGGCGCAACTTCTGGAAATTGAAATAGAAATGCAATCGCAACACGAGGAGTAGAGCGCATCATAATAACAAATTAGAGTACATATAATTATCTATACTTTTTATTTAATTACGAGTAATCAATATCCAAATGGTTTGTACTATCATATAAATCAATTAATTTTCCCATGATTTCTAAATCTCCATTACATGCCTGAACAATTTGAACAATAAGTGATTCGCAATTAGCTTTATTTTGAATATTTTCCATATAACCACTCCTTTTTTGGGATTAATTGATATTCTTGTTCGCCGAAATCCAGTTCGAACATTTAAAAAACTGTTTATAAAGTAACAAAAGACACCGTATAAACGGTGTCTTTTGTTACTTTTTGTTTTTCTACAGTCAGCCCATTCCTCCAGGATCGACCATATATTGCACATTATTAGAATTTTGGACCTTATTTTTTTCTGAAATACTTAATCCACTTAATAAAATTAATGATACAGTACATAAAATGGCTAGTTTTTTCATTTTACGCCTCCACATTTTAACAATTCTTTACAATCATTATAAGCCTTTGTTGCATATTGGGCAAAAAAGTAATCACCATTTTCAATGAATAATTTTTTTGATTCGGCTATTATATCCAGGTCCATTTTTGCTTGACCTAAATAACAATACTGAATTGGCGTCAGTTTTTTATTTTTATTTTTTAATTTCATTAATATTTCTATTGCTTTTAAATACTCTTTCTTTAAAACAAAATACAACGCTAATTCTGCTGGATGGAGCTGTTCTAAGTTAATTGTATCTATTTCTATATTGTGTATAAGTTTTAAAAAGTTCATGTTATTTATGGCTATTCTATACTTAAAATCACATTTATTTTCTAATTCTTCAAGTGCTTTTAAAGTAAAATCATATGACTTTTGATAATCCGAAAATAAAAAACTCTCTCCTAGCCTCAAATTGTTCATCGCACTCATAACGGGGAAATATTGTATATTTTCATACATCATTAATTTACTATTTTGTTCTCTAAATTCATTGACTTTTAGCCTTCTTAATAAAGCATAACTCCAAATGTCAGTAATCCAGTAATTATAAAGTAGTTTTAAATCCTGATTTTTAATCTTAGAAATATTGGTAACAACACGATCTCTATATGTATCAAACATTCCGAAATCACCGATATCACCACTAGAAAGTAAGTATAAAATATCACAAAATATCTCCATATCTAAATTTTCTTTTTTAGGAACTGTTTTTCGAATATCTTCTAAACACAAAAGATGTTCCTTCGGATTTCCGCCCCTGGGACGTTCATAGAACAGTTTAAAAAGTGGAGAATATTTTTTTACATTATAATCTGTATGGCTACTAGATAAATCAACTAAATATTTTAAAATCGAGGAATAACCGTTAAGATAAGCGATAACAAATAACCTTTTCATATTAATTTTTACATTTCTTTCATATTGATCAAAAATGTTTATACAACATTCTTCATGAATGTTTCTTCTATCAGGGAAAAGAACTTTCGCCATTTTAAACACACTAAACATTGAAACTTCTTTATTGTATTTAAACAAATCTGTTAAAGTAGACTTAGAAACTTTTGCTTCAACAGCAAAACAATCATATGTCTTATGTGCATTATTAATTTCTTCTTGTAATTTCCTATTCCAGTAGTTCATACATTCCCACCTCTTGAAAGAAAATTCAGACATATTCAATATATTATATCAAACGATTGTTCTGAATGAAGGGTTTTATTACAGAAATAGGTAAATGTACATGTTTCTCAATATTTTTCAGACAAATAGAGACCTTTAAACAACTATTTTCTATACAAAATAAACACATTATTAACACTTTAGTGTAATTTTTACTTTCAAAAGATTGATATTCTGTAAGAAGAACGATAAAATATATTTATCAAAACAAAAAAAAACCTACCTCACAAATTTTTAATTGGTTGTTCCGGTCGGCAAACTAGACACCAATTAAAAATCCCAGAAAGTAGGGTTTTTAACGCATAGAATTTATTCACTTATATACGTTTATTTTAGCACAAAGTGAATCTCTTGTGAAGAAAATCCTCTACTTTTCCTTAACAAATGTGTGGTGGAAAAAATAGGAGGTTTTTTTGTGCTACTAAATAACTTTTTGCTAAGTACAGCAAAACGAGAATTAAGCCCACAACTGGTTCATGTTCCTACAGGTGCTATTAATAAAACAGTACAAAAAGTAATTAAAGCTATCGATACAATTCTTTTAGATACAGAAGGTAAAACCACTAAAGATTTCTTCGTACAAACACCACGCCGCTATAAGGCATTGGAAGTTGTTTTATCTTACCTAGTACAAGAAGGATACTCTCAAATGAGACAAAATCAAATCAGTGAAAAATCGGGTATTTCTGTACCGATCATCAACTTTATTCTGAATTGGTTAGAGGATCTTCAAGTATGTCATCAAATCAAAACAAGACGTCATGGTAAGATTGCACCATCTATTTACATATTAAGCCTCAATACTAATTATTTAAAAATCATTGAGTATTTTAAGCAAAAATGGGCGTTTTCCATTGATATTTTTTCTACATTTACTAAGTTTCTATCTAAAAAACTAAGTAAAAAACAGGAGAAATCTATAGATCAAACCGAAAAACCTACTGTGCCTACATGCCAGGGAATAGATATATTGGATGCTGTTGCTCCTACAATTGAAGAAGTAGAAGAAAAACAGCCAATGAATGCCCCTGATTCGGTTGAAAAGTTAGAACTACGCTTCCGCAAAATGGATGAGTTTATGAGTGAAGATCAAAAGAAACTTTATATGTATATCATAAGTAAAGATACAAATATCACTGAAAAGGATGCTTATACAATCGCATTACGTATGCCGCCATGCGTAGATTGGGAAGCAAGAAAAACTTTTGAGGACTGTGTACAGCTGTTTGAAGTAAACAAATCGCAAGTAAGTACACCTGCACATTTCATAACAACATATACAAAACAGTTAACTGCAAACAGAAAGCGTAGAGAGCAACAAGCAAAAGAACGCACAACAAATATGGCATTTGGAAAACCAATGAAGAGTCTCATACCATCAATGGATTTATTCAAAAAAATGATTGATCCGAACGCCTAAATCTCTTTTTTCAAAAAAATAATTGTTTTATAGCCTTGTTCAAAAAAATCTCCCCTAACAAGGCTTTTTGTCATGCCATTCTTTATTTTAATAGATTAAACATATTATCAACCTATTATATTTTCGTAAATTAAGGACGTTCTTCACAACAAATCCACTATGAATTTATACTGGAATTGAACCTGCTCTTAAATCAGTAATTAAATAAGAAGAATTTTCTAATCCCTTGTGAGAGTAAGGCTTATTGAGCAAAAATAAATCCTAATGTATTTAATAGTTTTAATTTTTTTTAAAACAAGATTTATTATAAAAAGTATCCCATATTTGGAACTATAATTTTCTAGATTTTTAAACATAAACCCCCAGATCAAACTAGATACCAAAATAGAAATCTTCTTGTCATTTAATATACAAATCTACGGAACACTGAACATCTGTAGACAGTATAAATACTAATATTCGTGATTTTTACCATAAATATATAGTACAGCACTCTAAAAACAAACAATCATTTCTGTTCATTATAAGCATTTCAGTAAAGAGAATAACCTCAGAATTAATTCAGAATAATATGAGATAAATCTACAGAATTAGTTGCGATAACATACCTAGGTTATTCTGAACTTATTCTTATCTTAAACTCATTGATAGAACTAGGTTCCGCGGAATATTTAGAAACTTAGATTTACCTTGAAGCTCTCCTGGTAAGGGTATCTTGATTCAGCTATGAATCAGATTCCGTTGCCAGGTAGATTTTCATAAAACTACGTAGGCGGGGCGGCGGCCATTCCCATTCCTCGCATATCGTCCTCCTTCAACATCGGCCCATCATTCGCCTTCCACTCATTCCTACACATCTATATATCCACCTATATCACAACTCTACGCCCTGTCTAGCCACGCCCATATGTCTCCGCATATCCCCGCAATGTCCTGGCCCTGGAATCCCACAAGCCAAAAAGAAAACACCTCAAGCTAGAATCCCCTATTGCTTGTTTGTATTGTTCTCATATATAATTGCGGTACACAATTTTTAGGACAAAGGAGTATATAAACATGACTTGGGAATTTTCCGTTGATGTTTTCCTTGCTGATCTGTTAAAACATGGCCGCAAATCTTCCACCGTTAAACAATACCGCTACGATCTCACCCTTTTCACATCATGGATTCAGAAATACGTCAAATTACCTCCAGAATCGTTTTTTCATTCTTTTGATGCAAATATATTAGAAAGATACTTAAAAGCTCTTAAAAAGGAACGTGGAGCGTCGATTTCTAATATCAAGCGTGTACGAGGCATTCTGATTAACTTTTTACAATTTCATGGTGTGGCCCAGGATTTAAAAAGTGATGTCTCCCCTCCTGGACTAACATCTAAACACTTTGCATCGGACAAAGAAATTAAAAAGCTATTCCGCGTCATGCGTAGTTATAACGGGTTAACCGACTACCAGGCGTCAGGAAGAAAGTTTATTCTGGAACGTAACCTTTTATTGATCCACTTCATGTTAGATTATGGGCTATCTATCCAGGACATTCTCACGCTATCCATGCATGATATACACTTTGGGACAAATACGATTACCCCAGGAGGGCTACACGCCCACAAACGATCCATCACCCTTTCAAAAGAACATATAAAACTTGCCTTATCGTATTACAACAAGATTCCTAATCTTGTTAGACCGCGCCAACAAACGGGCGACCCCTTCTTTGTGGCGTTTGATTTCGGCCCGCAAACATTCCGCTGGGACTATGAAAACGATCAACCCGCCGCTTTAACTCGAATCGCTGTACAACGCATGTTACAAAAAGAAGTAAAACGTGCTGAAATCCATGTAACGCCAACTATGCTACGTAACCGTTTTATACTAAATGCGCTACAGAATGGCATGAAGCCCTTTGAAATTAAAGCGTTTTTGGGATTAAAAAGCGTTGAGGCCCTGCATAGATACGTTCAATTCTGGAATAAACAGCAGTAAAAAGAAGACCAAACTAGAACAAATCTAGTTTGGTCTTCTTTTTATTTTAAATTCAGTAATAATTGCCTTTTTTACATCACTATAAAATACCATTATCAGCATTCCCAATATAGTTATAAATAAAGAAAGTCCTTCAATGCCAATAAATATCCCTATAAATATAAGAACAATACCTATGAAAAAGCCAAAATCATTTTCATTTTCATCATCTTCACACTCATCCTTATCCTTTTTATTTAACTCCTCTCTAGCATCCTCTGATCCCTTTATTAACTCATCAATTGTTACTTCATATAATTCACTAAGTAAAATCAAATTATCAATATCAGGATAACTTTTATTGCTCTCCCATTTATAAACAGCTTGTCTAGTCACTCCAACCTTTCGAGCCACATCTTCTTGTGAAAAGCTTTTTGATTCACGAAACCTTTTCAATTGAGAACCTAAATTCATATTATTCACCTCTAATAAATCATTACATATAAACCCCTAATCAATAAAGAAACCATTAATATAATACATGTAAACTAATGGTTCACATATTTAAGCTCTTACTAAATTACCTTCCATATTCAATTAACACAATATTATCAGGAACTAAAAAAGAATCCCATAAATATAAGAATATTTTTTATCTTTAATTTAATGTAAAATTAGTATGGTATTTGTTTTATGAAAAAAGTGATGATAAAACGTAGTTAGAAGTAATTGATTTGAAAAAATTAATTTTATTGTTTTTATTAATTATATTGAGTTTAAATATTACAGGGTGTTTCAATAATACGGCGATACTAGATAAACCTAAATCTTCAGCATCTGCTACGGTTAAATGTATTAATAAAGCATGGTATAAAAAACATAAATTATGTAATAGTTTCTTAGGAAAACGATTATTTGTTAATCATAATATACATGTGTTATAAATAAATTCTCTAAAACTACCTAAAAAAGGCTATCAGCAATGATGGTCTTTTTTAGGTTGGTGAAATTGCACTAGTATGATAGGTGTTAACTAGCGTAAAGAAGTGCCACAATCGGCTTTGGCTAACTGCTACGAAAGCTCATGTCATTGCTAACGTTTGCAGTTAATCATCCACAGTTAGGGTGGACTCCATAGATTGCGAGTAAATGCCACACCCCTTAACAATTTGTTAGGGGCTTTTTTATACATCCAACAAAATATGACAAAAATGATGTAACTGAATCTGTTATTATGTTCTAGAAATCTTACATTTATATATTTTAGGGATGAAGTGGATTTATCTAAGAATTAATTACGAGAGCACTCGAAAGGGTGCTTCTGGTTTGCCTAAATCAACAAGTATTCTCAGGAGGAAAAACGCATAAAAAAACCAATGTTTAAACATTGGTTTTTTTAGGTGATTACTTCTCCAATTGTCATAGTAGGGGGCAATTAAAAGTGTACGTTTGCACATAAATTAGACACATTCTAGCCGATTCCCTGTACGTTAAGCGATCGGCTATTATCATTCTAGGGAGACCGCCAGCATTTCGGAAAAAAACTACGCTAAAAGTAGACAAAGTTTTATGCAAAAAATAGGGAGACATAGGGAAGCCAAAAGGCGCTCTAGAATAGGAATGTATAAAATCATGCATAACGTTATAGAAAACAACAAAGGCGAATCCCTACTCTCAGAAGGGATTCGCCTTTGTCCTTGCTACTGATAATAGGACGTTATGTTAACCAAGTGTGTATAGAATATACATTGATTTTCACTTTTGAATTTTACAATTCTGTTATACAGGGGTAGAAAGATATTATAATTAATTTGTTTTAAAATAAGTAGAGGATTATAAAGTGTGTTCGATTTTTGGCCAAGTCCTATATGTCTTATCCTTTGGAGGAAATATGCTTAAAGATAATTTTAAAATTAGTAATATTCCCACTGTTTTATGGGGAAATAAGAGTGAAAAAATTTTTATTGCAGTACATGGAAATATGTCAAATAAAGAAGATGCAGTTATTGAAATGTTAGCTGAAGAAGCCAATCGAAAAGGTTATCAAGTATTAAGCTTTGATTTACCTGAGCATGGAGAAAGAATAAATGATAATACTCCTTGCAAAGTACAGTTTTGTGTTAATGAATTATCTATAGTTATGAATTACGCAAAAGAACATTGGAAAGAGGTAAGTGTGTTTGCATGTAGTATGGGAGCTTATTTTAGCCTTTTAGCCTATCAAAATGATGTGTTAGAAAAGGCATTATTTTTATCACCAGTAGTTAATATGGAACGAATTATAGAAAATATGATGAAATGGTTTAATGTAACACCAGAGCTTTTGCAAAAAGAAATGACTATAGAAACACCTGTTGGTCAAAAGTTATATTGGGATTATTTATGCTATGTAAAAGAACATCCTATTAATATGTGGAATACAGATACATATATTATGTATGGAGCCAAGGATGAACTGTGCGAATTTGAAATTATTAACTATTTTACAAAAAAACATCATTGTGAATTAGAAGTCATGGAAACAGGTGAACATTATTTTCATACTGAAGAGCAGTTAAAGGTATTTAAACAGTGGTTACACAAACATATCGATTAACAAAATTGTTATTAAAGAGAAGATGTTAAACTACTGAGAAATATATTTGAATTATTTACTTCCGCTAACGAGAATTATGTAAATAAAAAAGCCCTGTTGCAAACAAAAACAGGGCTTTTTCAAACTATTCCATACAAGTACTACTAGCTTAAAAGTTTTATATATTATTATTTTTTAAATGGTGGTAAATATTTTGTTGGGTCTACACGTTCACCATGAAGTTTATCTGTTCTTACTTCTAAGTGGAGATGATTGCCTGTCGCTTGTCCTGTTTTACCAACTTCTCCTATTTTTTGGCCCGCCTCTACCGTTTCATCTTTCTTCACTGACATCTTACTCATATGAGCATACAAAGTATAAAGTTTCTTTTTATTATAAGTATGCTCAACAACTACTACATTACCATAACTAGTGAATCCATTATCTTTACTTCCAAATCCAGCAAAGACTACTTTACCAGATTGAACAGCATCTATTCTTGTCCCTTGTGGTGCTGCAAAATCAAAACCTTTATGTACTCTCCCCTTCTTTTCATCTAAATTATACGGATCGGTAGAAGTTACTTTTTTCATATCTATAGGCATCTTCGCTATATCTTTAAATTCTGATTCCTTGACTGCAGTATTGATTTCGGACTTCACCGAATCATAATCCGGTGATTCAGCAAATGCATTTCCACTAACCGAGAATAATAAACCTGTTGCTAAGGTACTTACTATCATTTTCTTAAACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_018510|194103:202873|196576_197581_+|WP_000926058.1|DBSCAN-SWA MLLNNFLLSTAKRELSPQLVHVPTGAINKTVQKVIKAIDTILLDTEGKTTKDFFVQTPRRYKALEVVLSYLVQEGYSQMRQNQISEKSGISVPIINFILNWLEDLQVCHQIKTRRHGKIAPSIYILSLNTNYLKIIEYFKQKWAFSIDIFSTFTKFLSKKLSKKQEKSIDQTEKPTVPTCQGIDILDAVAPTIEEVEEKQPMNAPDSVEKLELRFRKMDEFMSEDQKKLYMYIISKDTNITEKDAYTIALRMPPCVDWEARKTFEDCVQLFEVNKSQVSTPAHFITTYTKQLTANRKRREQQAKERTTNMAFGKPMKSLIPSMDLFKKMIDPNA >NC_018510|194103:202873|201383_202139_+|WP_003254204.1|DBSCAN-SWA MCSIFGQVLYVLSFGGNMLKDNFKISNIPTVLWGNKSEKIFIAVHGNMSNKEDAVIEMLAEEANRKGYQVLSFDLPEHGERINDNTPCKVQFCVNELSIVMNYAKEHWKEVSVFACSMGAYFSLLAYQNDVLEKALFLSPVVNMERIIENMMKWFNVTPELLQKEMTIETPVGQKLYWDYLCYVKEHPINMWNTDTYIMYGAKDELCEFEIINYFTKKHHCELEVMETGEHYFHTEEQLKVFKQWLHKHID >NC_018510|194103:202873|198637_199564_+|WP_000219639.1|integrase|DBSCAN-SWA MTWEFSVDVFLADLLKHGRKSSTVKQYRYDLTLFTSWIQKYVKLPPESFFHSFDANILERYLKALKKERGASISNIKRVRGILINFLQFHGVAQDLKSDVSPPGLTSKHFASDKEIKKLFRVMRSYNGLTDYQASGRKFILERNLLLIHFMLDYGLSIQDILTLSMHDIHFGTNTITPGGLHAHKRSITLSKEHIKLALSYYNKIPNLVRPRQQTGDPFFVAFDFGPQTFRWDYENDQPAALTRIAVQRMLQKEVKRAEIHVTPTMLRNRFILNALQNGMKPFEIKAFLGLKSVEALHRYVQFWNKQQ >NC_018510|194103:202873|194103_194496_+|WP_000369749.1|DBSCAN-SWA MDNNIFGKNIRKLRAMKGLSRKEFAQAINTPYSTVTSWENGDKVPKIERLPTIAKFFNVSESRLLHHQMSDNEILEKDSSETDPIERMAQILIEKYRNVPEEHKPRIEKEILRMAQLLEIEIEMQSQHEE >NC_018510|194103:202873|194952_196122_-|WP_001110320.1|DBSCAN-SWA MNYWNRKLQEEINNAHKTYDCFAVEAKVSKSTLTDLFKYNKEVSMFSVFKMAKVLFPDRRNIHEECCINIFDQYERNVKINMKRLFVIAYLNGYSSILKYLVDLSSSHTDYNVKKYSPLFKLFYERPRGGNPKEHLLCLEDIRKTVPKKENLDMEIFCDILYLLSSGDIGDFGMFDTYRDRVVTNISKIKNQDLKLLYNYWITDIWSYALLRRLKVNEFREQNSKLMMYENIQYFPVMSAMNNLRLGESFLFSDYQKSYDFTLKALEELENKCDFKYRIAINNMNFLKLIHNIEIDTINLEQLHPAELALYFVLKKEYLKAIEILMKLKNKNKKLTPIQYCYLGQAKMDLDIIAESKKLFIENGDYFFAQYATKAYNDCKELLKCGGVK >NC_018510|194103:202873|202306_202873_-|WP_000473938.1|DBSCAN-SWA MFKKMIVSTLATGLLFSVSGNAFAESPDYDSVKSEINTAVKESEFKDIAKMPIDMKKVTSTDPYNLDEKKGRVHKGFDFAAPQGTRIDAVQSGKVVFAGFGSKDNGFTSYGNVVVVEHTYNKKKLYTLYAHMSKMSVKKDETVEAGQKIGEVGKTGQATGNHLHLEVRTDKLHGERVDPTKYLPPFKK >NC_018510|194103:202873|199588_200017_-|WP_014895400.1|DBSCAN-SWA MNLGSQLKRFRESKSFSQEDVARKVGVTRQAVYKWESNKSYPDIDNLILLSELYEVTIDELIKGSEDAREELNKKDKDECEDDENENDFGFFIGIVLIFIGIFIGIEGLSLFITILGMLIMVFYSDVKKAIITEFKIKRRPN |
7 | Marinitoga_camini_virus(40.0%) | integrase | attL 197253:197267|attR 202495:202509 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
207039 : 209853
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_018510|207039:209853|DBSCAN-SWA AATGTTTTTCCGCAAAAATAGAACTAAATTAAAAAAATGGTTAGATCGGCAAGGAATCGAACAACAGGAACTAGCCAAAAAGTCGAAGGTTTCTGTTCAAACCATCAGTAAAGCATGTAGAGATACAGATTATATCCCCAAACCTGAAATCATGAAAAAACTATTAAATGCTATTAGAAAAATTGATCCTTACGCCAAAATCAATGACTTTTGGGATATGTAAAAAGCACAAGAAACAGTATCTTGTGCTTTCATAATTTTACTTTGACTGAACCTACTTGAACCGAAATGTCTTTAGGTTGCTGTACTTGTGCAAGAAAATGCTGAATAGAGGGCGCTTGAAAAATACGAAAGTTAGAACTAGAGATTGGATATTTGAGGTCAGTAAGGATTAAAAGAGAGGGAAATACCATATTATGTTTTGGTTGCCACGATTCTTTTTTCCATTCCATGCTACGAAAATACGATTCATAACGTTTTATTTTCGTTTGGATCGTAGCCTTATTATAGATGGAGTTCTGGACTTCTATAAAAAATGGACTTTTACGCCAAATGGTAAATATATCGGGTTCCATATAACCTTTCTTATACTTAGGTTCTACTTGAAATATCTTCGGTCTTTCGGTTCGTAATAACTGCTTATATACATCTACAATCGCTAAAAAATGACGTATCTTTTGGCTTCCTTTACGAATGGTATTTGGATAAGGAAAATACACGTATGGACGTTGTGATGTATCTACATCAATATATCCTTCGCGGCTTAATCGCTTTGTAACAGTATTACAGCATGTTACTGCATTTTTAACATTTCTAAAATGAAGATCAATAATATCATCACGCGACATACATCTAAATTGTTGTAAATGGCATATAATTTGCTTATCTCTATTCGTTAGCATCATCTAACACCCCAAAGATTTTATCTTCTCGATACTCTGACTCTTCCTTCTTTACACTTTGCTCTTTAGATAAACGATACGGTTCTATTATTTCTTTTGCCTGGTCCAATGCCAAAAAAGGAGCCTGCACCTTTTTTAAACCATCTAATTTTAAAATCATTTGGCCCGATTGACTTAAATTTTCTGATCCAGGCGTCCCCACAATGTTACTGTTAATTAAGTCTGCACATTTAAAGCCCATTCTTACCGTCAAATTGAGCTTTAACTTACCATCCAGTATTTTTGCATCTGGACGTTGCATACTTAGCATGAGGAAGATACCAAGCGATCTGCCGACAGCTGATATTTTTTCTATTATGGTGACACATTCCTTTTCGTCCTGTAGCATTGCTACTTCATCAATGGCAATAAAAATATAGGGTAAGGGTTTATCTTTTGTTATTTGATTGTATTCATCAATATGACCCAGCTCATATTCTTCCATTAACTTTCTTCTATGCAATACCTCTTTCCACAATTTTGATAACATACTTGTCATTTCATGTTCTTCCATGCAAACATACTTTACGTGCTTCACTCTTCTTAAAAAATGAAACTCTGAATTTTTTAAATCCCCCAGGTACAAATGTAAATGCTCTGGTGACATATGTTGGATTAATGTGGCTAAAATTACGCGCACCATACTACTTTTTCCGCTTCCTGTTTCTCCCGCAATTAGTAAATGAGGTGTATTTGAATCAACCATATCATACACAATTGTATTTCCGAATTGGTCCCGTCCTACTACCACAGGAAGACGATACGGTTTTAATAATGGTTGCCATTGTTTATAACTGTAATCGTAAGGCTGTAAACTTGCATTAGAATGAAATACATGGAGTACGAACTTTTTAATAGTACCTTCCATCATTAGATTTTCACCTAGTATTTGCTGAAAACAGAACCATTTCTTATGAATTTGAGCTGGATCAACGCCATTAGGTAGTGTAAAAGTGTACCGTACACTTTCCTTTCCTTCGTATACATCATGAATCGTAGGATAAATGGGGACCTTTCCACCTCGTGTCATGTGCTCATCATATAGCTTCGCTTTCTTAAATACTTCTTCTAACTGATATTTATATTTTTTCTTTTTTAACCATCCTTTCATTAGTAACCCTCCTTATAACATGAGTAAAATGCGAATAAACGCATAACCAATGAACCCAATCCCTCCAATTCTTACACCGTAATACAGACCATTAGAAAGGAGATTGGATGCAAAAACATAATCATTTCGTACTAAGTATTTTTCCAACAAAACAGCTCCAATTGTAAGGCCGCCTACTATTCCCAGGGCTACATACGTATGAATAAGTGGTGATGACATATGAAAAAATGCGAATGGACTAATAGGGCCAATGCTATATATTTTTGTTTGCTTTTTCTTCTTATAAGATTGGTCCATAAAGGCTTGAAAAGAAATTGTTTCTTTTCGCTTTAGCATGTTTCCCCTCCTAAAAAAAGAATATCGTTAACAAATTTGGTATCCAGTCCAAAACAAAACATATACAATCTAACACCATATGAGAGGTATTCTTAATGAGTTCAAATGCATCAACAGGTACATGTGTTATGAAACTCGCAAGTTCGTCTAGCAACTTTCGCATTTCTTGTGCTGTACTGCCTAATGGTTCAGTCAGATACCAACTAATCCACCTATATAAGAAATCTGTTGTATCCGTTGTACTCATTGCATTTTGATTGAGCGCATCCCACCCGCACATAATTTCGTTTGTTGAACTTCCACACCATTCTGTAATTTCTTTCACATTTCGAAATTGCAGACTAGGTATGTTGTTCCATCCTCTCGTTAGATCATCCCTCAAATAATATTTAATTTGATTACCAATAATCTCATAAGAATTATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_018510|207039:209853|209102_209426_-|WP_000919693.1|DBSCAN-SWA MLKRKETISFQAFMDQSYKKKKQTKIYSIGPISPFAFFHMSSPLIHTYVALGIVGGLTIGAVLLEKYLVRNDYVFASNLLSNGLYYGVRIGGIGFIGYAFIRILLML >NC_018510|207039:209853|209436_209853_-|WP_001066181.1|DBSCAN-SWA MNNSYEIIGNQIKYYLRDDLTRGWNNIPSLQFRNVKEITEWCGSSTNEIMCGWDALNQNAMSTTDTTDFLYRWISWYLTEPLGSTAQEMRKLLDELASFITHVPVDAFELIKNTSHMVLDCICFVLDWIPNLLTIFFF >NC_018510|207039:209853|207039_207261_+|WP_000466109.1|DBSCAN-SWA MFFRKNRTKLKKWLDRQGIEQQELAKKSKVSVQTISKACRDTDYIPKPEIMKKLLNAIRKIDPYAKINDFWDM >NC_018510|207039:209853|207926_209090_-|WP_000679431.1|DBSCAN-SWA MKGWLKKKKYKYQLEEVFKKAKLYDEHMTRGGKVPIYPTIHDVYEGKESVRYTFTLPNGVDPAQIHKKWFCFQQILGENLMMEGTIKKFVLHVFHSNASLQPYDYSYKQWQPLLKPYRLPVVVGRDQFGNTIVYDMVDSNTPHLLIAGETGSGKSSMVRVILATLIQHMSPEHLHLYLGDLKNSEFHFLRRVKHVKYVCMEEHEMTSMLSKLWKEVLHRRKLMEEYELGHIDEYNQITKDKPLPYIFIAIDEVAMLQDEKECVTIIEKISAVGRSLGIFLMLSMQRPDAKILDGKLKLNLTVRMGFKCADLINSNIVGTPGSENLSQSGQMILKLDGLKKVQAPFLALDQAKEIIEPYRLSKEQSVKKEESEYREDKIFGVLDDANE >NC_018510|207039:209853|207289_207943_-|WP_042993018.1|DBSCAN-SWA MMLTNRDKQIICHLQQFRCMSRDDIIDLHFRNVKNAVTCCNTVTKRLSREGYIDVDTSQRPYVYFPYPNTIRKGSQKIRHFLAIVDVYKQLLRTERPKIFQVEPKYKKGYMEPDIFTIWRKSPFFIEVQNSIYNKATIQTKIKRYESYFRSMEWKKESWQPKHNMVFPSLLILTDLKYPISSSNFRIFQAPSIQHFLAQVQQPKDISVQVGSVKVKL |
5 | Bacillus_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
220170 : 222215
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_018510|220170:222215|DBSCAN-SWA ATTATCCTTTCTCTACATGGCATTCTTTTTTATCGACATGTTTTGTATTTTCTTGCGCTTCATATTCTTTTACTAACTTGTAAAAAGAAGAACGCTTTATATCATATTTTCTCATCACTCCGACCGCCGTAATCTTTCCAGATTGCCATGCCTCATATGCCTCAATAAATTGCTCCGTAATTTGTACCGGTGGTCTTCCTATATGTTTCCCGTGCTTCTTTGCTAATGCAATCCCTTCTGCTTGTCGTTGTTTGATATCATTCCTTTCTTTTTCTGCAAAGGCAGAAAGAATGGTAAGAGTTGCTTTTTGTACAGCCTGTTGAATGATATCATTTGTACTTTCTCCACTATAATTCACATTAATAAAAGGCTCTTTAATAAATTGTAAATTAATTTGCTGTTGTTCGTAATATCTAAATTCTTCTAGCACATCGTTCATGCTACGACCTAATCTTGTTAAGGAATCAAAAATAATGGTATCACCCGTACGAGCTAATCGTTTTAGCATTTGATAATTTTCTCTCTTCATATTCTTACCAGACTGCTTATCAATAAAAATATCCCGATCTTCTATCCCAAGACATTTCATATTTTCAATCTGGCGTTCTTCGTTTTGGTCTTTACTGGAAACTCTGACATATCCAAACTTTTTATATTGCAATTCCTTCACCTCAACCACAATTATATCTCATTCACGTCTGTAAAGGTATATAAAAATTAAAGACATCTGTAAAATGAAAACGCAACTTTTATGGATGCGGTTTTCCCTATGTTTCTATGAATCTGTAAAAGTACACCTTTACGAACTACTAGATTTATTCTTCGCTTAAAAGAAACATCACCATAAAAAGAAAATTGTACGTTAAGGAAGTTTTTTACATGAAAAAGATTATTCTTTTTATAGTGTTTTTTAATCCTAACTAGAAATTATTTATCAATATCTATCTAGGAAGAAATTTGGAGGTATTTGTAAAAAGAAAAAGAATGTTTATAATTGCTAGATAAAAAAATTACAAATGTAGGAGGATGTTAAAATGGAAAAAACAATGATGGTAGGTACAACAAATATGATGATGTCTATGGAAAAAATGATGTGTGAAATGAAGTGTATGAAGATGATGATGAACAACATGATGCAAATGAATGTAAACATGGATAAAGCTATGGTTAATACAATGCATGAATGTGATGAAATGATGACTTCTACTATGTCTATGATGAAAGCTATGAAAGAGAAATGTTGTTAAAACATATTGGTATTCCATTCCGTATAGCACATGGTCTTCTATATGGCTTTTAGCTGTCATATATGAATGTACATTTGCATTTTATTTCTTAGAAGACGGGTCAATATTGACCGTCTTTTTCGTTTGTAGACCTCACCTGAGGTAAGGTAACATCGCCATCAAGCTAAGGGGGACAAAACATAGCAATGTGTAAAACCCTTTTTGTAGTGCTTCAATAAAAAGAGCTTTATTAAAAAATGGAACAATCAAATAGAAGCGAAGAAACAAAAAAATCGAATATGGCCTTTGTGTAGCAATGGAACAGGATAACGCAACAAGCATTAGCGGACATCAGAAATGATAAAAATGCACTTTTTATAAGAAAATCGTTTAGATTTAGATACATTTTCATTCTTATGAAACAGAAAAGTTCAGTTTTGTAAAAAGATCAAAAGCATATTTTACTGGTAATGTCCTATAAGTATCATTAGCGGACATTAAGTCATTACAAATAGCTATTTTATGTCCACTAATATACGAAATAATCCTTAAAATGAATGTCCGCTAATACTTATTGCGTGATTTGGTTCCATTGCTACACATACCCCATATTCTTCAGAAGTATATTAGACTTGCAAAGTTAGAAGGATTTAGTGCCCATGATTTAAGGCATCGCTTTGGTTATGTGATGGCTGAACGCACACCATTACATCGTCTTGCACAAATTATGGGACACGATAACTTGAATACCACGATGATTTATGTAAGAGCTACACAAGAAGATTTACAGGGAGAAGTAGAAAAGATTGCCTGGAACTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_018510|220170:222215|220170_220830_-|WP_014895403.1|DBSCAN-SWA MQYKKFGYVRVSSKDQNEERQIENMKCLGIEDRDIFIDKQSGKNMKRENYQMLKRLARTGDTIIFDSLTRLGRSMNDVLEEFRYYEQQQINLQFIKEPFINVNYSGESTNDIIQQAVQKATLTILSAFAEKERNDIKQRQAEGIALAKKHGKHIGRPPVQITEQFIEAYEAWQSGKITAVGVMRKYDIKRSSFYKLVKEYEAQENTKHVDKKECHVEKG >NC_018510|220170:222215|221203_221416_+|WP_000416119.1|DBSCAN-SWA MEKTMMVGTTNMMMSMEKMMCEMKCMKMMMNNMMQMNVNMDKAMVNTMHECDEMMTSTMSMMKAMKEKCC >NC_018510|220170:222215|221987_222215_+|WP_003254188.1|integrase|DBSCAN-SWA MLHIPHILQKYIRLAKLEGFSAHDLRHRFGYVMAERTPLHRLAQIMGHDNLNTTMIYVRATQEDLQGEVEKIAWN |
3 | Salmonella_phage(50.0%) | integrase | attL 211436:211449|attR 223486:223499 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
113 : 14576
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_018517|113:14576|DBSCAN-SWA TCTAAATATTCACCTTCCACATTCCGTAACCCGGAAATCTTTCTTTTAATCTTTGTAGCGTTTCGTCGCACCATTCCTCATTACAGAAATCTCCTACAATCAATCGGTAAGCGTTTTTCTCTAGTCGCATATCCCAAACACCATACCCTTCTAGAAACTCTTTCACTTCCCTTTTAGAATCTCCCGCCCAAGTCAATTCGTCAAAGTCTCCTATATGAATTTGGAAGTTTGTATTCACGCTTCCTGTAAACCATTTAAGAGGTTTTGTACCTGTCAGATAGTTTAAATCTACGTCACCCGATATACCGTCCACACGCCCCGTTTCGCTGTATTGCCATAGGTCACAAGGGAATAGAGGTTTGTTAGGATAGCGCGGTATCCATACAGCATCCGCATTGATTTTATCGGCTTGGAATTCCTTGTATTTATGATGTGCTACATAGATTCCGACGCGTTTCGCTCCTAGTCTTCGCAACTCGTCTATGAACGCTTGTGTTCCGGCTCTCATATCATCCATTGTGGTTACTTCTATATCAGCAAACCATATTGTCGCATCCTTGTCTCCACGTTCCCAGAAGTCACGCGCTTCCACTCTAGCATCATTTTCAGATACAAAACGACAAAACGCATAGTTACCGAATGGTACACCATAGGCTTTACATCCCGTTACATTCTTTTGATACTCACGATCTATAACCCTACTTCCATCTTGCACACGTAATATAGTAAAATCTAATTGTTTACTTGCACGACTCCAATTTACTATTTCATGATGTGATAAATCAGCTATTACACCCATTCTAATTTCCTCCCTTTAATATGCACATTGCCATGTGCCACCGATTTTGGTGTTTGTCGCGTTCGGGTCACCATTTACCCTATTTTCCATTTGTATAATTTGTCCGGCTTGGTCGACGATCATTGTTTGACTTCCGTATGTGGAATCAGCTTTTGAATACATTGCTTGTATAGGTGTTTCGTATAACGGGGCAAACTCTTTCGGGACACGTCCCACGATTTTATAAGCCCCACCGTTACCATGTAGCAGGTCACCGAATAGTGTTACAATGTCCCCACGCTTGGTATAAAGTAACCCGTCACCACGATGGTAAAAACCTGTTGCGGGGTCTAGTGTCACTTGTCGGAACCCTATTGTATTCTTTTTCAAATAGAGTTCTTCGGCTTTGTTCTCGGTTAATAGTCGTCGCCCACCTTCATATACGCCTTGTGTATCACCTGTTACACTTGACCAAACAAGGGTATACCCACGCTCGGTAAACTCCATGTCTACCTCAAAATACTCTTTACATTCAATCGAATGGTAGACGATTACACCACCCCTTGAATAAGGAGATAGAACAAGATATAGGATGTGAAATCCTTCCGGGTCTTTGTATACTTCAAAGCGGTAACTATCTTCACGAGAATCTCCTACTTTCAGTAAGGACGGTTTGAGAAGTGAAGCAGGTCCACCGTTTCGAACACCGAATGAAAAGGTGTATAACGGTTGCGCTGTACCCGTGAATCCAAAGTTACTTTGCGGGAAAAGTTGTCCTTGTAGAACAGACCCTTCCGCGCTATCAACCGGGTTTCTTGATTGAATTCTAGCAACCTTGTAATAAAGAGGTCGTTCATTCGTTTGGGGTAACCTCTTTGTTTTTGTTTCTATTACTGGAAACGGTTTAATCAAAGCCATATTTTACACCCCCAAAATACGGACAGTTCCAGAACCGCTTGTACGAATCATATTGACCTTGCTTGTTTTTCTTGTAAAGTCTGTAATAGATTCACCTGGTCGCATTCTGATAGTAGCAGCTCTACCCGTTAATCCGGCTCCTTTTAGATCGTTAGGAGTCGCTTGATATGAATCAAAGTTTATAAATAAATCTGTATCCCCTTCATTCAAAATATAATTGAATTTAAGTACGTCATGCTGTCCCATATCGAACACAACATGATTTACACTAATTGTTCCTTCCCACGCAATACAAGAAGCTCGAACAGGGTCATTCGTAACCTGTACAGGTGGCATACTCGCAATAGAAACCCCGCCTTCTACGTTTACACTTCCGATATGACTTGTACCTTCAGCAAGTGGTGGTAGTTTCGTGACACCTACGTTACCAATCATATTTGTACCCGATGGTAATGTTTTAAACTCAATTGGAACGGTAGGCATTTCCGTCACAACTACTTTTCCTAGATTGTTATTTCCGGCAGGAAGCGCGCTTGAGAATCCTTTTACAATGACGTTTCCATCTGTAGCACCACCGCCACCCCCGCCACTTGTACTACTTGCACTATTAGCAAGTACAGCCGGGTTAAATGGTTCGTTGAATGTTGTTAAAATGATACGCGCCGTGACGTCACTATCATTGTAAATTTCAATTTGGGAAGACCCTTCTTTTCTTGCTAGGATGTTACGCCCGTTACTTGGAACCATTAGTTCATATTCGTGTGGACTTGGTAGGACACGTACGCCCGCGTATAGCGTCGCTACAGATAGATTGTTAATGTCATAGTGATTTGGTTTTGTATCTTCAAATACGTGTGTATACGCCATTCTAGGCGGTAATGTGAGTGTGACCTCACGCCATGTATTATCCTTCGTCATGTTCTCAACTCCTTATAGTAGTTTTACTTTCATATCTGGGAAGGCTTGGAAGAAGAAATATACAGCTATAATTAAAAACACCAAGATCATAACGGCGCGTATGATTCCCATAAATGCACTTGTAATAAATCCTTTGTCGGAATTTGGGGAAGCCGTACCCGTACTTAGCGCACCGCCACCGTCACCCGTTGGCCTGTCTATCAATGTTTTATCGCCTACGTACATCTTTCCGGCTTGGTGTTTTCCCTCTTGCCACCCGACGTGTACATGATCGTAGTGCCCAGCCGTTTGCCATAACACTTCCGTAAATAGCGGTGACGTTTTCGCCCATTTTGCAAATTCGTCCATTTTATCTTTTGAACCCGCGAAGTCCATAGCCATGCCTTGGGAATGGCTATCCGGTCTCCCACTTGGTCCGGTAGAACCGGGGCGGTATCCGCTTGTGAATCGCAAACCAAGGGATAACGCCTTGTCATATACTTGCTTCAACTTGTCGTTTAGTTTGAGTCCCTGTAGTTCCGCCATTCGTAGCACCGCCTTTCGGTTTTACTTTTTTATATCCCTTAGATCGTGGGGAAGACTTTGTAACTTTCTTTGCTCCACTCTTTGCCGTAGCTTCCACTTGCGGGAATGCCTTGGCAAAAAAGAGAACACAAGCCACAAAAGCCAATAGAATAAGCAAGGCACGAATGACACCATTAGCGACGCTTGTGAATATTCCACGTTTATCACTCCCTCCACCAGCAGGAACGCTTCCTTCTCCGGTGTATGGCGTCCCGTCGTCGTACTTATCTAATCCATTTTGTTTAATAATAGAAATCAGTTGCCCCGCATAATTCGGGTCAGTTGCGTATCCGCCCGCCTTAATCCCGCGCGCGAAATCCTCGAATGTTTTCGCGTTTTGTAGTTGGGAAGCATAGCGCGGTGTTTGTAAGAGTCGTGCATGGTCAAGCATGGATTCGTAATAAGAATTGTATTTCCGGAATCCGGAAACACGTCCACCACCTTTGTCGTATTCCATTGACCATACAGTCGTTGTCCCGGCAGGTCCTACACCTTTGATACCAAATAAATTTTTCGAGTTATAGGCAAGTCCGGACATTCCACCGGGGTTGCTACCACTAGATTCAAAGACCATTTGACCTAGAATAATAGAAGCAGGGATTCCTGTTTCTTTTTGGATTCGTTGGGCGTCGTTTATGAATGGTCTAACATCTAAAGCCATTAATAACTCCTAGAATGTGCGCCATAACTTGGTGCGTCCCCGGTCTTCACTTTCCCGACTTCCATTCCGCCCCACTGTTTGTCTTGGACACCTTTTTTCACAAGGTCAGCCATTTCTTGACGGTCTTTCCCGTATGCTTCTACAACGTAGTAATCCTTTGCGCCCGCCCATCCATTTTCAATAAATTGTTTTCTGACATACGTCGTACTTGCTCCGGCATTAATTAAATATTGTTGACGTTTTAAGGCGTCCTCACTACTGTCGAACGTGACATAAATCTTTGTTAGTTCAGCCGGGTCTTTCTTCCCTTGTGCTTCCAACATGGCGTTTAACATTTCCTCTTGTCTTCCGACTAGTGTGTTCATCCCGTCTTGCACGACACTGTTTTGACTTCCGAGCGTTGGATAGTTTGTATAGTAATCCTTCAATTCTTCCTCTACGGCTTCTTGTGAAGAACCACCGCTATGTTTCGCCTTGTTCATAAAAAGAGCCACTAGGACGACGGCAATTCCGCCCCCTAGTAATAGCATCTTTTGTTTTTTGTCAAACTTCGGTTTATGTTTTCCGCCACTCCCACCACTTGCAGGAGGGTCGAGTCTTTCAAATTCTGGCATTCCCTACACCCCCATAATTGGATTTCCGAAATAATAGCCTTGCGGGAAATCCTCTCTTCGGATTTGTTCATTTTGCAAGTTTGGTCGTGTTTTCTCCCACGGTTCTTTTATCGGGTCAGCAACCACCATTTTCGGTTGCTTTGCCGTATGCTTTACTAATAAGGCATAAGAGCCGAGATACTCGTCAAACTCCACATTCAGATTGATAGAGGGTTCATATACAGGTTTGTCCAATGCACGGAACGCGTGACGGTTTAAATTGTCGCGCTTGTAATCCATGTGAATCCCTCCTATCGTCCTTGTAATGTTTTAATGCCCGCAATTGAGTTTTTACCCATTGCTTCAATGATTGACACTGTTTCTCGACCATTTGAAAGGAACAAATAAATACCAATGAGCATTCCAATTCCCGCGATCATATCGAATACTTTTGTCATACTCTCACCTCATTTAATAGTTTTATAAACTTGTCCGAATTTGTAACAACCATACTCATTAACACGAGTAGCAAAAAACCATTTGTTACACGTTCATTTGTGAAGGATTGCAATAGGACGGTCACGGACATAAAGAAGATGACGAATGGCATTGACTCCGTAAATTCTTTCATTTAAACCACCCTTTCACCGTACCCCACGTATCCTCAAATAAGTCCTCCCAACTGTATCCGAGCCACCCCTTATCTTTATACGCGTTCGTTTCGGCACGTTTCTTACTCTGTTCAGAAAGACGTTCTAACACTTCTTTCTTTTTGGGGTCTTTTTCATTCTTTGCAGGTTTTTCAAACAGAATTTCACCCGCTTTTTTATCCGCTTCTTTTTGTGCTTCCCTTGTATTCTTTGTTGTTTCTTTTACAGACTCTTTTGCACCATCCACCACTTTCTCCGCGACCTCTCCAGCGCTTGGAAGTGATAAGTCCGGCGTCATCATTTGCGCCAATTTTGATAGACGTTTCTTTCCGACAAAATCGTCAAACACGAGCCATAAAAATAAAAGGGATAGAGTGAGAAACGTTAAACCCTTTGCGTCGTTGTTCATGTCACATCACGCCTTCGCTTTTTTCTTGCGGATTACAAAGAACCATAGAGCGAGAATAGCGACAACTAGAATTAATGATTTACTCATGCGCCTTACCACCCATTTGCTCTATTTTTTGTTGTAATTGCATTACGATTTGTGTATTAGAATTGATTGTTTGCGTGTTCGAATTGATAGATTGTGTAACGCCTTCTAGTGTCTTTTTCATAGAGGTAGCAAAAAGGATACACATATAAATCGGAAATCCATAGCTACCAATTAATTGACCTACCATTTGAGCGTCCATAACTTACAACCTCCCCGCCACATAACCGAATGCAATTATGATGATGATAAATAGACCAATCGACTTCCAAATGCTTGCCCCTGTTACTGGGTCACTCTTTGGCTTTACGTCTGTCTTAATATCCTTTTCATCCACTAATACAACTTGGTCACCCATTTCCGCTACAGTCGTTCCGCTTGTTGTACGAAACCCCGTATCCGGGTATAAATCATGATAGTAATGATTCAGTCCCATTCTGTTCCCTCCTTATAAATAGGTAAGGAGCATAAAGCCCCTTACATTTGTAATCGTGATAATGTTTCTGATACTACAGTGACTTTCCCGCCTACTTGTGTGCTAAATCGGAACCAAAATTCCGTTAATCGCTCACTATCAATATAGTCACGGCTACCGCCTAAATTCGGTACACCTTGATTACTGAAATCGAAGCAATACACACCCGGTGGAAGTGGGTATCCTAAGTCAGAATGGTTTTTATGAACCAATACTTCCGGCTTGATATTGTATGGCGTGTCCGCTTGGTTAAAGACAAGCTCCATATTTCCAGTAAAGTCTTTTGGCTCTAACGGTTTCCCGTTTGAATCCTCGATATAGAATAGTAGTTTACGATAAATCGTCCCTACGTTTAGTTTTAAAATATTTTGTCCTCCGCCCGAGAATAAGTCCGACTTCGATTGTACGAGTTTCAGTACAGACATATCCGGTTGACCGCCCGGGATAGAAGGAATCGAAAACGTTTCGATAACAGGTGTAATGGACATAGATTTAAATGTCACTTGGTCACTATTTGACGCATTTAATTTGTACGCATTCGCTAGTTGGTCAACGGATACTGTTAGATTCACGTTAGCCGTATTGTTTTGTAACATAACCATACCTACAGGGTCACGGTCATTTAAACTTACAGGGATCGGAACGGTAAATTGAATTTCATTATCTTTACCGGCTGTTGTTGCTACGTTTTCCACAAAGTTTAATGATTGTTTATTTGCACCTGGTAATAACACGTCTGGATGTTGTCGTAAAACGTTATACATAAACAGTTCTTTACCTGATACAATGTAAGGTGAGAAGCCGTTATTTAAGTTGAGTTCTACTCGACGTAAAATACCATATGGAGACATCGGGTCACGTTGAATGTTCCCGCTAGAGCTTTTCAACGTGGCTACGGCTTTGACATGTAACCATATCTTTGTTAATAAACGCGCTTTCGGCAATGTGAAATCAAGTGTCATACCCTCTTGTGTGACTACTTGTGTAGGCAATGTTTGTTGATATTGACGCGTTGACGTTGCCCAAATCATCGCGCGTTGTTGCGGTGAATATTGCTCTTTCTGTTGTGCCATTAGTTTGTTCCTCCTTCAGCTTGTTGGGCTTTTTTAATACGTTCTAATTCCGCTTGCTTTTGCTCTTCCGCTAAACGTTCTTTACGCGCGCCCTCGAATAATTCAAATTCCGCAAAACGCTCAGACGTTGCCACAAACGCACCGTTTTCATAGCGATTTTTATAATCCACTAATTGTTGAAACGTTGGTTTTGTTGCACTGAAATGCGTATTAATTCGATTCATATTTACATCTAAAATATCAACTACGTGCATGTTATACCGCCTCCGCAATCGGTCTTACAACCGGAATATTGTACTTCTCAGAACCTTTTTTAATTAGATAAATGAAAAACATTGTGACAAATGTTGATACAAACATAGATACCCACCAAGACGGGCTAAATAGTTTACCCATTTTCTTTTCCTCCTTGTTATACGGCTTGGACAACTTCACTAAGTCCTTTCACCGGATGTTTTGTTAAAATCGCTTTTGCCATGACTGTTAATAAAATGAACATGAGCCATAGGACAATAATATTTTTGAGTCCGACCCCTGCAAATTTACCCTCCACATTGTCACCCCCTTTCAAAGTTTCAAAGTGGCGCGAACAGGTTCATCGTCACTATCCCGCATATACCAAAAGTTATACTTACCGGGCTTTTCGTAAAACTCCGGACACCCTGTAGCTTTTACAATGCGGTCACGGTCAGCCGGAATATTTAAATCGAAAATAAAGAAGTGACTGGAATTGTTAAACACATCAATCGGGATTGTAGCGGGTCTTTGTGTACATGCCCATACCGTCGCTTCCTTACTACGCCCGCGCGTCATAAGTGCGCGCAAATGGAACGGATACTTTGTAGGAGACGGGGCAACCTGCATCAATTCGTCAATCCATAGAATGGTATTTTCGCGCTCATACACCCACTTCATAAGCGCGTCATAATGTTCTTCGTCCTGTTCTTCTGGAATTGGACAATAAATAATTTTCTTTGTCCGGGCTTCGGCTACTTCTTCCAGTGTCTCGACCAGTACAAAGTCTTTGCCTTCCCGTAACCCGTACCAAAGTTCCTTGCCTTTCTTCCTACGCTCCAAACATTGTCCTTTTGTATCTAACATCACAACATGTTCATACCCGGCTAAATACACTTCAGCAAGAAATGACTTCCCACTACCTGTTTTCCCTGCAATAAAGACATGTTCGTCAGTCGGGATGCCATTCATGTTTCTTCACACCCTTCTTGTCATAACTCCTTTCCGTCCGCAAAACACCTTTACCATTTTTAAGAGCTTGCTTTCGTGACGCATACGGAACGCGTGGTAATAAAGCATTGAAAAAGTGTTCGTCCATACGGTAGCAATGTTCTTTGTATTCAAAAACAACATACTTTTCGCCTACCGTGACAGACCATTCTTCAACGAACGGAAAACAAGGTTTCCAATTCTTGTGCCAATCACCTAGCGGTATAGAATAGATACACCTACTCGCTCGGATAAGTACCGTATTGGACATAGTCAATCACTTCTTTCAGCTTTTCAAGACCATTGTCGATTTGCTCGTCAAAGTCCTCAAAATGGAGCGCTTGCCGGAATGAGTTGATTGAGTTCCCCGCTAAAACTTTGACCGGAAACGGTAGATGGTCTAGCACTTGGTCCGCTACTTGTTCCAGTCTCTCTTGTTTTGTTTCCCCCGGCGTTTCCGGTAGGTTGAATTGGTTTAGCATAATTTGTTACCACCTGCGCTTTCTTTTGTTTTCGTGTGGCATTCCACATCAAGAATTTTGGTACAAAGATTGTAAAACATGCGATAGCAAGTGCAATCGCGTCACTATTTTCCCCGACTTTTTCAAGTGCTGACGTTTTTGCTAACATGTTCTCTATCGGTTCACATAGCGTATCAATTTCGGTTTCACTTAAAGCCCATATTTCGAACCCTTCACGGGTAGCCACCATTTGTGACACTGTCATTAGAATTGGTTTTAATTGAAAGATTTCCATTGACGGTGCTTTTGCTTTTCCTTTAGATCGTGGGGAAGATTTTGCATTCGCGCGTGAACGGGCTTTTCGTTCCCTGTCCTTTTTGCGCTTCTCTTCTAACTTTGCATCAATCTCCGCCTTTTCTTCTTCTTTCCCCGGAACGTCTACAGGAACCAACTTAGGAAGCTTTTCTTCTTCGGTTTGTTGTCCTCTTCCTCCAGTTCCTCCACTTCCGGTTCTTCCTCTTCCTCGACTTTTGGTTTCGGTGGTACTGGTACTTTTTGCGCCCCCGCTTCCTGTTCCTTCGGCTTTATTACTTCCTGTATCGTCGACATGAATGTCTTTGCCCATTGTGGTGCATCCTCCTCACTTTTTGATTTTGGTTTACGTTTTGGTTTCGGCTTTTCGTCTTCCTCTTCTTCCTCTTCCTCAACCTCTTCAAACTCTTCCTCTTCTTCCTCTTCCTTCTTTTTGGCGAAGAATTGGAGATTATTTATTGACAAGAAAGTTTTACCCATGCCCGTTGTTTTTAAAAATGGTACACGTTCATGTTCTTCCTCTAATGCTTTCAGTTCGTCTTCACATGCTTTTCTTCTTTCCATATGTCACACCCCTTAATTCGATTTGTATAAATCAGAAATTCTAGTTTCTATCATTGCTTTTAATCCATCATCAGATATAAGGTTTTTTAATTTAAGAGTTTGTTCTTTTGTCATAATCGTAGTTGCATGACGCACAAGCATTTCCACTTTATTGTTAGCTATGATTAGTTCCGTTAAAGCATCCACTTTGTCACACTCCTTATCGAATGTTTGTTCGCTATATGTATACTATAATACGAACGAGTGTTCCGCATAACGTCACACGTGTGTCATTTTGGACAAATAAAAAAGACTAGCAACTTTGCTAGTCCTTTTCTACTATTCCTTGTTCAACAAGAATCTCTATTGCCTTCATGGTTTCAAGTAATGTCGGTTTTGCTTGTCTCCTTAATGCTTTCCAACAATCCGCATACTGTTTATCAGTCATCCTTCTTCCCCTCCACATTCTTTTCTAGTTCCTTGTAGTCTTCTTTTGTTACTTGCATCAGTCTATCAATGACATACGACTTGCTTACGACTTGTTTGCTAGATTGTGATAGTTCGATGATAAAGTCGAGCAATTTGTCACGCATACCTTTTCCCTCCTTATAACAACTGGATGGCTCTAGGTCTTTGATGTACTCTCCTAATACGTCCTTTACTTTCCAATTGCATTAAATAGCGATGTGCTGTCTTATGACTTACGTACATTCGACTCGCCATATCTCGCACGCTTGGCGCGAACCCAAACTCTTCCATATACCCGCTTATACATTCTAACGTATCCTGTTCCCTTGGCGTCAACATTTTCGTCACTCCCTATTATAAGAAACTTAATTCACCTAATAGTTCTTTCATGTCCCATCCTGTCTTTTTACACCAATCTTGAATCGGTAGTCCCTCATTTGAAAAACACATAGCTTTCGCTTTTGAAGAATACTCTTTATAAAGTCCGTATAGCTTCCTTTGCTTTTTCTCTGGTATTTGTATCTTTCCAAACTTCATACAAAGTTCCTCTACCGCATTCATATCATCATTAAACTCTTCCAATCTTTCATACCATTCATCAAACTCATACTCTGACTTTTCGTCCTTATTTTCCCCATAGTCATTACGAACTAGAGGTGAGGTAGTATTTTTATTTAGGTCAATGTTTCTTTTTTGTTCCCTAGCAAAATTAATTGTTTTATGCATTTCCGCTAGTTCATTCATTTCTATATTATTTTTAGATTTCGTCAAGAATTTTTGAACACGTTCCCCGCCTTTATAAATAGGAATTTCCGCTTTTCCTCTTTTTACTTGTAAGTACCACTTTTTAAACGTATTATAATCTAGTTGTTCCTCTACTACCCATTTCGGAACGCCTTTCATTCGTAATACTTCCTCATATTCACCATCGGTATTAATAGCTTTTTCCGCGTACATTTTTGGTTGGAAATAGAGCCCTTCAATAACATACCCTTCTAACTTCCACTTACCATATTCCTTATCATGCACCATTTTATCAGGAAATTTCGTAGTTGTTGCGCAACTGTCCGTATCACAATAAGCCAAAATTCCTTTTTCATGCGCGTACTTCAAACCTTTAAATAATAGTATTCTAGCAATAGAAGTAATATATGCTGAAATATGTGGTTGAATATATTCAGCCTTAGCATATCCATCATACTCTAAAAATTCCATTCGAATTCCATTCATATCATATATAATTTCGCTTACTGTATGTCCTTCTGCCTCAAGTTTATCTCTCTCAGAAATATCAGCATACATGATGCGTTCCCGCTGCATTGCAAATTTTCCATACAAAGCATTCTGCATAAGTTTAGAAAATGCCCGTTTAGCGCCTTTACTTGTATTTTTTATTTCCTCAAAATACGAAATAAATTCACGAAAGACAGGTGCTGTTTTCTCAAATACCACACCACTCTCAATTTTTTCTATTCTACATCCTTCCGCTTCTGCTAACGCTAATTCCGGGAATGTCCAAACACCTTCTATTTTGCCAACTGGAAAAATCAATTTACCTGTATAGTCTTTTTTAGGTAGGATAGGAATATACATATCTTCAGGTACATGCACCTTCGCATGTATAAAACCTGCTCCATATTTTCTTCTTTTCCATAAATCAAAAGAAAGTTCCGCTTCTTCATTATCCAATACATTCGGATACCCAACAGGCATTTCAGCCATTTTCATAACATACGGATATAAGCTATTTTTGTCATAATGATATCCATTTTCTATTCTAGGTGTGAAAACTTCGGTTCTCCCTCCATAGTAACCTTTTCTAATAAAGGCTTCTAATCCTTTTCCTATCTGTTTATGATTATATTGTTTTGTAGAAATAGCAACTTTATAATCTTTCTTATACTGTTCTTTATAAACTGTTTTAGCAAGGGAAGCCGTAGTCGGACAATTAATAAATTGTTCAACTTCTAATTTTGATAGACCTATTACAATTTCTAAGATTTTATATAAGCTACGACAATCATATTCCATGTACTCACATAGAACAGGGTCATCCTTATCTACGGTTGTAAAGAAATTACCTTTTGTAAGTCTCTTGTTCAATTTACGGTTTTTTACATTATAAATACCATAATTGTTTTCTTCCATATAATCGACAATATCCATCTTCCCGCCTTCTAAAAGGTCGAAATCTCTACATAAGTTTTCAAGTGAAGACGGTAGCAATCGGAAGCTATCATGTAGTATAATATGAGAAGCGGTAAACGTTACTATATTACCATTGATAAATAGCGAGTTATTAAATGTCGGTTCGGCATAATCACGTAACTCTGCTATGATCTTGGAAAGGTCGAAGTCTAGGTTATGTATATACACATGACAGTCATATGCTTTGTACTTTTCAAACACTGGTAATACGTCTGCAAACGTATAGCCAGTATAGTATTGTTTTCCATCGAATAGTCCAATTCGAAACACGTCGCCGTCCAAACCACGTGTTTCAGTATCTAGCGTAAAGAGTTTAATCTCTCTACGCTTTTTTCTATTAGTAGTAGTCATCATTATCCCAACTTTCTTTCTTATACGACTTTGTATCGTATATCTTTTGTATCTCCTTTGCGTTCTTTTTAGCCTTTTCATAAGGTAAAGAACGTAGCTTAGCTACTAATTCCTTTAAATATTTGTCACGCTCTTTTACATCATACACACCGACCATAATCGTTTCTATAGCCGTTAATAGTTTTGATAACTCTTTCCCTTGCCCTTCATATATCTTTACATAACCATGATTTCTCCAAAGTGTATTCGTTTTCGAAACATCACGCTTTGGAACTATACGTATAGCAACCCTTCCCAAAAAGAGTTTATTATGAGCATTCTGTAACCATCCTATTATGGATTCTGTAATTTGAGATCGTGATCTTGTATTATTTCTCTTTTTAAAATCGTATATAAACTTACTATCTGTCTCACCTGTAAAGTCTTGATAGTATATTAATAGAAAAGGTGCTTCCCTATCTTGTTCTTTTTTAATTCTCTCTATTTCGGGAAGTAACTTTTTCCAAGAGTTATACTTACTCGGTGATAGACCCCACTGTTTTGCTAGGTTTGCTATTTCCCTAGCGCGCTCTCTATTTTTCCTATTATGCGCTTTCTTTTTATAAACAGTTTCTAACTCTCTACCTTTCAGCTTCTTTGTTTCTTTCTTACTATAACCTTCCGAAACAAGTAACGACTTTTTACGTTTGGTTTCTAGTTTCTTCTTTAACCGTTTATTTGCCATTGTATCACCTACTTATAAAGCCATGTGACCCGTAACAACTAGGTCACAGGTCTTTGGCTTACATGGCTTTCTTTTCTGTAATAGAGTTCATAAAGTTTGCTATCACATTATCAAAATTAGACATAGCTGCAACCACGTCCAACTCTTCTTTTGTTAACACTACCGATGTTTCGTCATCTTCTAATTTTTGTTTCAAATGAACCATTCCATTAAAAGATACAAATTCTAGTTCTCGCTCATTTGTTCGAATAGATACCTGAACCAAATTTTTAATAGCGTTCACGTCTGCACCGTCCTTTTGTGTTTTAAAAAAGAGGATACACCATGTGTACCCTCATTCATTTGTTATAGGAATTAGCCTTGTAGTTGAAGTGTTAATGTTTTGAAACCTTTACGCGTTTTTACTTCATAAGGTACAATTTTAAGTGGTTCATCTGTCCATGGAGCTGGTCCAACAATGCTGATAATCTTTTGAATAGACGATACAACACCTTGTGAAACGGCGTGATAACCTTTTCCATCCTTGTCCAATAATACAACTCGTAAAGCATCCACATTTTCTTTCGTTTGTTCATCTTCTAAAGTAATAGCATGAGCCACCATGTCCGTAATTTGCAAAACTTCACCAGTATGATCTGATAGAGCATTTTCACTTGAGTTAATAGCATTGTACATTTTAACTGCTGATTTACGGTCTGTTTTTTGAATAGATGAGAAGAATACTTCTTTTGAACCTTCTGCTTCAAAGATAGATGGTGTTACCTTGTCCACTGTCATAATATCATTTGTATTTATTGTCTCTTCCACTACCGCGATTTCGTTAACCTCATTATTTAATTGTTTAGTATTGTTTTCCATTGAATATTCCTCCTATTAATTGTCCAGTTTATTTTTATTTTCCAATAGTCCTTTTGCATCTTCCTCTTTAATGAGGAATTTGTTTGCTACTTTTGAAGCGTCCAACTTTCCAGAATGTATCATTCTATGGATAGTCTTTTTATGAACACGCAATAAGTCTGCAACCTCTTGCGCAGTCAGTAGTTTACTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_018517|113:14576|113_911_-|WP_000538150.1|DBSCAN-SWA MGVIADLSHHEIVNWSRASKQLDFTILRVQDGSRVIDREYQKNVTGCKAYGVPFGNYAFCRFVSENDARVEARDFWERGDKDATIWFADIEVTTMDDMRAGTQAFIDELRRLGAKRVGIYVAHHKYKEFQADKINADAVWIPRYPNKPLFPCDLWQYSETGRVDGISGDVDLNYLTGTKPLKWFTGSVNTNFQIHIGDFDELTWAGDSKREVKEFLEGYGVWDMRLEKNAYRLIVGDFCNEEWCDETLQRLKERFPGYGMWKVNI >NC_018517|113:14576|3950_4565_-|WP_001113796.1|DBSCAN-SWA MPEFERLDPPASGGSGGKHKPKFDKKQKMLLLGGGIAVVLVALFMNKAKHSGGSSQEAVEEELKDYYTNYPTLGSQNSVVQDGMNTLVGRQEEMLNAMLEAQGKKDPAELTKIYVTFDSSEDALKRQQYLINAGASTTYVRKQFIENGWAGAKDYYVVEAYGKDRQEMADLVKKGVQDKQWGGMEVGKVKTGDAPSYGAHSRSY >NC_018517|113:14576|926_1808_-|WP_001173934.1|DBSCAN-SWA MALIKPFPVIETKTKRLPQTNERPLYYKVARIQSRNPVDSAEGSVLQGQLFPQSNFGFTGTAQPLYTFSFGVRNGGPASLLKPSLLKVGDSREDSYRFEVYKDPEGFHILYLVLSPYSRGGVIVYHSIECKEYFEVDMEFTERGYTLVWSSVTGDTQGVYEGGRRLLTENKAEELYLKKNTIGFRQVTLDPATGFYHRGDGLLYTKRGDIVTLFGDLLHGNGGAYKIVGRVPKEFAPLYETPIQAMYSKADSTYGSQTMIVDQAGQIIQMENRVNGDPNATNTKIGGTWQCAY 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22 | Bacillus_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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