Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_018686 | Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC183, complete sequence | 1 crisprs | RT | 4 | 4 | 0 | 0 |
NC_018693 | Bacillus thuringiensis MC28, complete sequence | 2 crisprs | DinG,csa3,cas3,c2c9_V-U4,WYL,DEDDh | 0 | 28 | 7 | 0 |
NC_018685 | Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC95, complete sequence | 0 crisprs | csa3 | 0 | 0 | 1 | 0 |
NC_018684 | Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC8, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NC_018687 | Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC189, complete sequence | 2 crisprs | RT,csa3 | 0 | 2 | 1 | 0 |
NC_018694 | Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC54, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
NC_018689 | Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC429, complete sequence | 1 crisprs | cas14j,csa3 | 0 | 1 | 3 | 0 |
NC_018688 | Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC319, complete sequence | 0 crisprs | RT,cas14j,csa3,cas7,cas8c,cas5 | 0 | 0 | 1 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_018686_1 | 16801-17174 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_018686_1
|
4 spacers
spacers of NC_018686_1
>1.1|16857|19|NC_018686|PILER-CR TGAAGCGGTAGAACAAACG >1.2|16932|25|NC_018686|PILER-CR TGAAGCGGTAGAACAAACTGCAAGG >1.3|17013|25|NC_018686|PILER-CR TGAAGCGGTAGAACAAACTGCAAGG >1.4|17094|25|NC_018686|PILER-CR TGAAGCGGTAGAACAAACTGCAAGG |
RT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018686_1
The CRISPR arrays of NC_018686_1 >merge|NC_018686|1|16801-17174|PILER-CR GCAGGTGTAGCGACAGTACAACGTGATGTGAATGTGCAAAATAATGTAAGAGGAAATGAAGCGGTAGAACAAACGGCAGGAGCAGCAACAGTACAACGTGATGTAAATGTACAAAACAATGTAAGAGGAAATGAAGCGGTAGAACAAACTGCAAGGGCAGGAGCAGCAACAGTACAACGTGATGTAAATGTACAAAATAATGTAAGAGGAAATGAAGCGGTAGAACAAACTGCAAGGGCAGGAGCAGCAACAGTACAACGTGATGTAAATGTACAAAACAATGTAAGAGGAAATGAAGCGGTAGAACAAACTGCAAGGGCAGGAGCAGCAACAGTACAACGTGATGTAAATGTACAAAACAATGTAAGAGGAAA >NC_018686|1|1|16801-17174|PILER-CR GCAGGTGTAGCGACAGTACAACGTGATGTGAATGTGCAAAATAATGTAAGAGGAAA TGAAGCGGTAGAACAAACG GCAGGAGCAGCAACAGTACAACGTGATGTAAATGTACAAAACAATGTAAGAGGAAA TGAAGCGGTAGAACAAACTGCAAGG GCAGGAGCAGCAACAGTACAACGTGATGTAAATGTACAAAATAATGTAAGAGGAAA TGAAGCGGTAGAACAAACTGCAAGG GCAGGAGCAGCAACAGTACAACGTGATGTAAATGTACAAAACAATGTAAGAGGAAA TGAAGCGGTAGAACAAACTGCAAGG GCAGGAGCAGCAACAGTACAACGTGATGTAAATGTACAAAACAATGTAAGAGGAAA
>NC_018686.1|WP_000173523.1|11535_14163_+|type-IV-secretory-system-conjugative-DNA-transfer-family-protein MTLLKFKRNKYLHHNYNIDGEDLPQEKNRINKKALAISSLAVLFPLGGLNFVAGTYYAIVNELSKTVEKPTIFDVFGTDWEQGISIKNVFLPVLPTNMYLFGLLASTVMGFLVYSKVNYRSDENVAYGQKGDSRFTTIEEIQEQYREIPEKTETFEGYGGVPVSHYKNKYYVDTDTVNTAILGVSRSGKGETIVVPMIDNLSRAKNQSSMVVNDPKGELYSASKETLEKRGYDVQVLNISEPLQGMSYNPLQLVIDAWVNGDDQEAAKRANTLTFSLYNNPNAGDNAFFNTSAQNAINGIILAIVDYCVKNNCIEKITMHNVSQMLNELGTFYYKENPDDFTEKSALDEYFKSLPQGNVAKMQYGSTSFAGEKAKGSILATANQGLQTFADKMIAKMTSKSSLDLKQVGFPKNLFFQLDERFLNKRVTVSFHKNNQEKTEILSYEIKVKALGMCNMNFDESLEDGDLLLIRYQDAENPKKKYRLFYSLQFEKLLDEKGQVVYQKKEGCGNKPEYQRQVTLILKANTFPLQPKAKLSYSNKPTAVFMIVPDYDKSNHALASIFVKQLYTELSMNCNDTKGKKCYRRVHYLLDEFGNMPPIDDMGGVLTVCAGRNMLFNLVLQSYSQIEKLYDKQAKEIKQNCQNHLYIMSTDPETIEEISKRAGHETIIGKSSNESYLDTDNKVTKSADQQRIISPDRLSQFLEGETLVIRALHRQDLNRKKVRPYPIFNTQGMTMPFRWQFLSSLFDTSNDLNDIDIPSLHTGLDLTELYLNFLDFILNPVAKKEYIKKQQANPIVKKEQTDINEEIKSLIGLVKEKRNRNDTEDIQKRLVQMLLTYATKSMLPKTEEVKFLIEHSSDMEIKRHLEDLLGMLESN >NC_018686.1|WP_000276031.1|9583_11509_+|hypothetical-protein MYIVEFLQKEQSKAFKKFLRKNKAGNGKQLGLKVAEELIQRYIEQNQQSDQILLLLQDVENEKAYEFELPVQVGSKFSLLTAISNDLEKGTDFNLGMEIKQGIYESYRAEEGGAVIEHEEGAPKKKKGGLFAKLFGKNEEVPHGDNEVKKEFAGVEGNPFEEMPMHELKSKGTHHFEDEDIQGLQEHAAALNQKEDDDPFAIEEEHGELPTGVNLEKAVEELPFPTNEVDSVQSIEEELFNSDSDVQKINQEPVIEAQNQEVSFPDYEEYLNLSEVEKKQERYDSRFTIMHLLSRFGMSEEATTGLGKKKLQYAKNVLSGKDFLLIQDKYYQEINNLRDEIRLALENIYKEVMMRDYQKEAEERLQDIFEQGFQTRLAELNEFENKEMQEMHKKLSAFTEKQRLALESFKLQQEAELTAYQTELEERKNTLISACEEELKKENEIEKRKATLEKVYELKVEGKKELIDKKNEYLSDSIEMTEQIMNAANEQQEVRFSVLEDEIKQLIPEWKEEIQAEHDKEMKERQLKIEEEKNRIEVEALNLQQRKEEAKEVRSNDREQKLLNIIEDLKEKLLKAHANPEQQPLQQPVIMYPQPVQQPVYMYQQPVQQAPIQPQQPVMQQQTKTSTKKRRTFLARLMDSE >NC_018686.1|WP_001052931.1|9199_9499_+|TrbC/VirB2-family-protein MNLPKLNLLETAKSSLQTVVYNDFFDSVRSALTSWSGKLQGLGIAVIIFCVCIIAFMFMFGEGPSRTAKKWLMYIVVGGVLLWGAGTFASTVQGVTSGF >NC_018686.1|WP_000235841.1|8930_9182_+|hypothetical-protein MATSPRRNKVEKAPYQDAVTVILKKEGKTYESWSQEIVNSNCLSLLQGENPKWRNKMLEAASMEIIADSVVKQEEKRQNHSNN >NC_018686.1|WP_000892404.1|8765_8912_+|hypothetical-protein MLENNVFRLMVLMGGVMVLIAIITHCVDGIPEVEDVFQHFISHKNTKY >NC_018686.1|WP_000883996.1|8384_8747_+|hypothetical-protein MLDGSIMLIVKWFVGLMLIMMMVAVALFSIQLSDVNSYKQQVNYQIERHGGLTKEAAANLKDYSKKQYRGALSVKSDQLNKKVNFGDVVDYQVVANLKIILFDLPDVKMEFHGSAISQVR >NC_018686.1|WP_001266824.1|7594_8344_+|hypothetical-protein MRVVAAKSIKKNRYNRLFAEEDLYSMLEEMGNTQQMINKFQKKRLIQTLLLSFFGLLLGLFITSWCYLLALGLPFFFYRSKYTYVTKMYNAFKFERHLNFSKFTRLLIPYLKESGGSISLYQVFRKILNRMDNPVDKNSLAKLMSEMTDKPNDIQPFTDYALRSSGSDMSLNIMQTIYDFQQNSSDTNVINELGQMASAELQRAIDEIIAFKLRRFNFFPTKIVMSSFILVVGYAAAVLVLQLSAINFS >NC_018686.1|WP_000704107.1|6764_7598_+|hypothetical-protein MKISTFNAKTKKKKFVNAEEINAFKVAYGKPLNKKDYLRYAIIPGLVTGIFSFLLLYIWWLSLILGCIGALYGLKVLMPKIIKRAYERDSFRERNKFVNNMTSLLSNENKTLFTALDQASDRAEGELRGDLKILMANILGADQEQVLQAFKQTSNKYREDITFDQYLEQLETCVLEGRTNLETLKDIKTHHNETKEKKDDYERKKEGHLKDMKMLCGVIVVFVLAISFSFGFKTYLTAFAGHPIGWITSGIYMTLMFFFFKTFTTYLFDDSIMEVKT >NC_018686.1|WP_000888325.1|5381_6731_+|Flp-pilus-assembly-complex-ATPase-component-TadA MLEAIKNVSVKKKKENKFNDFSSVNFQKSLEAIRNDLKNSKAELVIDAMLKEEARQKIKDIIKEKYAAHFMDFPEDKLVEVYEYVVSEIVGTGVIERLINERPDITDISYNSSHLIVESSDYKEVHRDTDHQISEQYITRVIQKFAHAVGKEFAPKTPIFDGVYDSIRINAVHHQNTTGNSTMSLRIVRPRLALHEGNFETFAPTFMLEFFRILMETRNNIVISGETGTGKTEFLKLLFSYIRFEHKAIMIEDVPETHVKKLFPDKDVFSWLTGHGVTVTDLIEAALRNNPRWIMISELRGKEAYEMIQAVFSGHHIVTSLHSVDAETSPKRLVNMSKMGYQFDEKSLEEDILRYFNFGCHIKRLVVKTTKQGNVQINRVIRYLAKVVEYSPEGNRTVFEQKYKNGKFTYSTGSLSNQFYEKLAENDMNYTLPDFKDEVAVKKGLVISR >NC_018686.1|WP_000666485.1|4981_5365_+|hypothetical-protein MKEYPFILVIIVLGIFLVSIGGYYYRENFATDSVTQGVTETVRASVISNVDNSSRVQSGELFIVKSDFEKDFKKRIESNKLVKIGNDAKYEFKYLDNKNGSTKAIRAIIQDRDQTYQATYKVSIAAS >NC_018686.1|WP_014990426.1|17804_18083_+|hypothetical-protein MILGGLNVKVIDIANQRRIYFEMKQRESQASILIIIAGLFAAVAILVFQISFELVHLYHYIVIFSFLTYFSLHLYSKNKSSKNREKAKGILR >NC_018686.1|WP_001067157.1|18079_18289_+|hypothetical-protein MNNWIFAILMLGVAIVLSMIVTFLKQIFRVLRRKKKKDPKLVTVMNAEYVNQDFWGRNFYERVSNRNTK >NC_018686.1|WP_000657690.1|18257_19034_+|hypothetical-protein MKEFLIEILNNQFVMQIIFTTTLSFVVYMICFIAYNGGLWRDMQLDAKEHIFLELDPLLRIIVKPALLSWLIYDKPFIKQWFLWSLDHTLVKWIIGILFVLMVGVWILQIAMWVYCFVRETIYAIIRWKRKQRIAFTTQEEEIFDFCADKFPSYTEKYLANELTHSVEAKEIIYKSLLCLHILNPKGVRDYFGLSVYEYEIEYYPEEHPVKQYYAKFEKYPLFKKECMENDIKMFKTMNLFIKSTIREYKSCNKEGKN >NC_018686.1|WP_000367412.1|19066_19381_+|hypothetical-protein MDMMRNPKNTKQEIKLAFFYIMDGAIIALMLVLASYMPKVVPVGGFGRIMFYVLFGALGLFLCIKPHNSPTNRNIFVILDMLKMDNKNYHPIEVNTISSETKKK >NC_018686.1|WP_043324456.1|19444_20113_+|hypothetical-protein MRVATVESKKVNRKRQIESENSNGKQSFISTIFASFKNTDASIVNIAPYKRLEQKTGVLVDHRDNLQVYLKVKTTDLLSMNQDDLKRFMNQLTSLCRVYHEPFKVLSLTYSTETTEQQVYWKRMALRYQGKMSQDVSEKKEEHLWYQRYSLAIENLNRVLWVEKNLKELAFFIVVYGKSETELIKNVKDMKRYGGRQFNLQNMKAKEVEKLIFKLQNMNSEM >NC_018686.1|WP_000239771.1|20129_22067_+|ATP-binding-protein MVKLGKKDQQKYRTEGYDLDFISRMQPQGGIKFNEKYIAQGDCYVACLHVYSLAEDIPPLWLTALMNNKDTISSVDIATANKEEVVRDINRSITELKDRTTSERRSTDRDDAHWELQNLTDFARSITQQGEIVKLIKLRIFIYDPVLEQLEKRIGDIKKEIAGQNYKAQVYVFKQKEEWQTLFASYDDQMEYLGVKSGYPLPSKNIGFGIPFHHQDLKDPRGIYLGQTSTGGAFILDPFFSTSTRTSFSGFVFGKMGAGKSTLLKQLLEGLLAKDCFIRGFDKAKDYYTIVQQQGGKIIDLSGAKSNGIVETGRINPLEVFATIIDDDTGEVNEKGSFLQHLSKLTNNLRFLSVDISETAVKEFRNYLLEFYIEYGLIPRREDNKPLKITGLAPTDYPIMEEFLEYLNGVQLEKGSTAQRLRDLETLRVQVRDMVFVYGDIFNGHTTLRNFEDEKIVIFDIDGISKIDKPIFNCQLFTALTLIWSHALKNGRRMKYLREEKKYPVEDLTYFMVLLDECHNVINSENKFANKYILEFEREMRKFLAGIFFATQSPQEMLPPPGSNVDVSDMKAIFELTQYKIFLNMDNSVLENLKGVLGESLTESEFSILPELKRGEAIVQVSSTETFNVMFDPDEKQLERFKGGQ >NC_018686.1|WP_001192105.1|22068_22491_+|lysozyme-family-protein MQSTQEAQSSVVDKYKKVKKIKRLSSLIGGTSGVLVVGVTILLVIVLIGIFGGGNSKSTSTGGGISGTASVQNLPPEVMRWKEMVEKECAAQGVPELVPYVLAIIMVESNGISERLPDIMQSSGATRFSISTLVRNESVA >NC_018686.1|WP_000994091.1|23143_24949_+|group-II-intron-reverse-transcriptase/maturase MNARMRYWEYYNMQETFDKLYEDSRANKPFQGLYEMITAENNILLAYRTIKSNKGSKTAGIDSFAIDQYKSMDKAEFLNLVRNRLNQYKPKAVKRVFIPKPNGDKRPLGIPTMFDRLIQQMIKQILEPICEAKFYEHSYGFRPLRGARHAISRVMYLISRNTFHYAVEIDIKGFFDNVNHTLLLKQLWNMGIKDKRVLKLIYLILKAPIKGVGIPRKGTPQGGILSPLLSNVVLNDLDQWIARQWHHFQSDYDYTEPGNRSRALKRTKLKQGYIVRYADDFKIMAKDFRTAQKWFMATKLYLKERLKLDISPGKSRIINLRKNKSEFLGYSLYVVPKRNKWVCNSNISEKKKKQIESELRKRIKSIQRSTTRQNVQLYNAYVLGLRNYFRYATHVNIDMHELTFSVSLTFFNRLKSVGKYEVPINAPPVYKKFFKNNYRTFKVCGIYLFPLADIQTATIWNYTQSQTPYSKKGRNSAEHKELDRNVLVEITRLLTVNTISRSLEYSDNRISRYSMVMGKCEILKEFLTASEVHCHHYVPLGLGGTDDYSNLRIIRKDIHRLIHATDNRTIENYLKSLLLTDEQVKRINQYRRACNLEEIKY >NC_018686.1|WP_001067103.1|25843_26452_+|hypothetical-protein MNNVSKILGVVLILSLAYNGILSYSTKQEFDKKDKKYHTTVSEKEKQIGDLKVKLEQESKKVNEGAADENKKESNPTLDLQNKYREVANQFVHAYLDYSVQNKGERRNNLLKITDKKVVDVVAPNTDDLGDPNFKSHVNKAAIYVNSEGDISKICTSLLDVEYTIEGLENKKTTINSVVKITLEKQGEEIKVVEYNPYPVKR >NC_018686.1|WP_000926960.1|26540_26816_+|DUF5513-family-protein MLLSELKPNHDYVKEGRYLILSLRKKKGIRKDKFIEIPITWFDYNFGEKVEWLIVREYQSSVNGKEKYTNYKLENIHAQVSVVNVKGETTK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_018686_1 | 1.1|16857|19|NC_018686|PILER-CR | 16857-16875 | 19 | NC_018693.1 | 4506398-4506416 | 2 | 0.895 |
NC_018686_1 | 1.2|16932|25|NC_018686|PILER-CR | 16932-16956 | 25 | NC_018686.1 | 17256-17280 | 0 | 1.0 |
NC_018686_1 | 1.2|16932|25|NC_018686|PILER-CR | 16932-16956 | 25 | NC_018686.1 | 17418-17442 | 0 | 1.0 |
NC_018686_1 | 1.2|16932|25|NC_018686|PILER-CR | 16932-16956 | 25 | NC_018686.1 | 17175-17199 | 1 | 0.96 |
NC_018686_1 | 1.3|17013|25|NC_018686|PILER-CR | 17013-17037 | 25 | NC_018686.1 | 17256-17280 | 0 | 1.0 |
NC_018686_1 | 1.3|17013|25|NC_018686|PILER-CR | 17013-17037 | 25 | NC_018686.1 | 17418-17442 | 0 | 1.0 |
NC_018686_1 | 1.3|17013|25|NC_018686|PILER-CR | 17013-17037 | 25 | NC_018686.1 | 17175-17199 | 1 | 0.96 |
NC_018686_1 | 1.4|17094|25|NC_018686|PILER-CR | 17094-17118 | 25 | NC_018686.1 | 17256-17280 | 0 | 1.0 |
NC_018686_1 | 1.4|17094|25|NC_018686|PILER-CR | 17094-17118 | 25 | NC_018686.1 | 17418-17442 | 0 | 1.0 |
NC_018686_1 | 1.4|17094|25|NC_018686|PILER-CR | 17094-17118 | 25 | NC_018686.1 | 17175-17199 | 1 | 0.96 |
1. spacer 1.1|16857|19|NC_018686|PILER-CR matches to position: 4506398-4506416, mismatch: 2, identity: 0.895
tgaagcggtagaacaaacg CRISPR spacer tgaagcggtaggagaaacg Protospacer ***********.* *****
2. spacer 1.2|16932|25|NC_018686|PILER-CR matches to position: 17256-17280, mismatch: 0, identity: 1.0
tgaagcggtagaacaaactgcaagg CRISPR spacer tgaagcggtagaacaaactgcaagg Protospacer *************************
3. spacer 1.2|16932|25|NC_018686|PILER-CR matches to position: 17418-17442, mismatch: 0, identity: 1.0
tgaagcggtagaacaaactgcaagg CRISPR spacer tgaagcggtagaacaaactgcaagg Protospacer *************************
4. spacer 1.2|16932|25|NC_018686|PILER-CR matches to position: 17175-17199, mismatch: 1, identity: 0.96
tgaagcggtagaacaaactgcaagg CRISPR spacer tgaagaggtagaacaaactgcaagg Protospacer ***** *******************
5. spacer 1.3|17013|25|NC_018686|PILER-CR matches to position: 17256-17280, mismatch: 0, identity: 1.0
tgaagcggtagaacaaactgcaagg CRISPR spacer tgaagcggtagaacaaactgcaagg Protospacer *************************
6. spacer 1.3|17013|25|NC_018686|PILER-CR matches to position: 17418-17442, mismatch: 0, identity: 1.0
tgaagcggtagaacaaactgcaagg CRISPR spacer tgaagcggtagaacaaactgcaagg Protospacer *************************
7. spacer 1.3|17013|25|NC_018686|PILER-CR matches to position: 17175-17199, mismatch: 1, identity: 0.96
tgaagcggtagaacaaactgcaagg CRISPR spacer tgaagaggtagaacaaactgcaagg Protospacer ***** *******************
8. spacer 1.4|17094|25|NC_018686|PILER-CR matches to position: 17256-17280, mismatch: 0, identity: 1.0
tgaagcggtagaacaaactgcaagg CRISPR spacer tgaagcggtagaacaaactgcaagg Protospacer *************************
9. spacer 1.4|17094|25|NC_018686|PILER-CR matches to position: 17418-17442, mismatch: 0, identity: 1.0
tgaagcggtagaacaaactgcaagg CRISPR spacer tgaagcggtagaacaaactgcaagg Protospacer *************************
10. spacer 1.4|17094|25|NC_018686|PILER-CR matches to position: 17175-17199, mismatch: 1, identity: 0.96
tgaagcggtagaacaaactgcaagg CRISPR spacer tgaagaggtagaacaaactgcaagg Protospacer ***** *******************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_018686_1 | 1.1|16857|19|NC_018686|PILER-CR | 16857-16875 | 19 | NC_018686 | Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC183, complete sequence | 16857-16875 | 0 | 1.0 |
NC_018686_1 | 1.2|16932|25|NC_018686|PILER-CR | 16932-16956 | 25 | NC_018686 | Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC183, complete sequence | 16932-16956 | 0 | 1.0 |
NC_018686_1 | 1.2|16932|25|NC_018686|PILER-CR | 16932-16956 | 25 | NC_018686 | Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC183, complete sequence | 17013-17037 | 0 | 1.0 |
NC_018686_1 | 1.2|16932|25|NC_018686|PILER-CR | 16932-16956 | 25 | NC_018686 | Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC183, complete sequence | 17094-17118 | 0 | 1.0 |
NC_018686_1 | 1.2|16932|25|NC_018686|PILER-CR | 16932-16956 | 25 | NC_018686 | Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC183, complete sequence | 17256-17280 | 0 | 1.0 |
NC_018686_1 | 1.2|16932|25|NC_018686|PILER-CR | 16932-16956 | 25 | NC_018686 | Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC183, complete sequence | 17418-17442 | 0 | 1.0 |
NC_018686_1 | 1.3|17013|25|NC_018686|PILER-CR | 17013-17037 | 25 | NC_018686 | Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC183, complete sequence | 16932-16956 | 0 | 1.0 |
NC_018686_1 | 1.3|17013|25|NC_018686|PILER-CR | 17013-17037 | 25 | NC_018686 | Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC183, complete sequence | 17013-17037 | 0 | 1.0 |
NC_018686_1 | 1.3|17013|25|NC_018686|PILER-CR | 17013-17037 | 25 | NC_018686 | Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC183, complete sequence | 17094-17118 | 0 | 1.0 |
NC_018686_1 | 1.3|17013|25|NC_018686|PILER-CR | 17013-17037 | 25 | NC_018686 | Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC183, complete sequence | 17256-17280 | 0 | 1.0 |
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NC_018686_1 | 1.4|17094|25|NC_018686|PILER-CR | 17094-17118 | 25 | NZ_CP018742 | Bacillus cereus strain FORC_047 plasmid pFORC47_2, complete sequence | 61050-61074 | 3 | 0.88 |
NC_018686_1 | 1.2|16932|25|NC_018686|PILER-CR | 16932-16956 | 25 | NZ_CP031066 | Bacillus sp. SH8-8 plasmid pl193, complete sequence | 35580-35604 | 4 | 0.84 |
NC_018686_1 | 1.2|16932|25|NC_018686|PILER-CR | 16932-16956 | 25 | NZ_CP031063 | Bacillus sp. AR4-2 plasmid pl192, complete sequence | 35580-35604 | 4 | 0.84 |
NC_018686_1 | 1.3|17013|25|NC_018686|PILER-CR | 17013-17037 | 25 | NZ_CP031066 | Bacillus sp. SH8-8 plasmid pl193, complete sequence | 35580-35604 | 4 | 0.84 |
NC_018686_1 | 1.3|17013|25|NC_018686|PILER-CR | 17013-17037 | 25 | NZ_CP031063 | Bacillus sp. AR4-2 plasmid pl192, complete sequence | 35580-35604 | 4 | 0.84 |
NC_018686_1 | 1.4|17094|25|NC_018686|PILER-CR | 17094-17118 | 25 | NZ_CP031066 | Bacillus sp. SH8-8 plasmid pl193, complete sequence | 35580-35604 | 4 | 0.84 |
NC_018686_1 | 1.4|17094|25|NC_018686|PILER-CR | 17094-17118 | 25 | NZ_CP031063 | Bacillus sp. AR4-2 plasmid pl192, complete sequence | 35580-35604 | 4 | 0.84 |
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13. spacer 1.4|17094|25|NC_018686|PILER-CR matches to NC_018686 (Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC183, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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16. spacer 1.4|17094|25|NC_018686|PILER-CR matches to NC_018686 (Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC183, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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19. spacer 1.3|17013|25|NC_018686|PILER-CR matches to NC_018686 (Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC183, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.96
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20. spacer 1.3|17013|25|NC_018686|PILER-CR matches to NC_018686 (Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC183, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.96
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21. spacer 1.4|17094|25|NC_018686|PILER-CR matches to NC_018686 (Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC183, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.96
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22. spacer 1.4|17094|25|NC_018686|PILER-CR matches to NC_018686 (Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC183, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.96
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24. spacer 1.2|16932|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP015154 (Bacillus thuringiensis strain Bc601 plasmid pBTBC4, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
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25. spacer 1.2|16932|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP015154 (Bacillus thuringiensis strain Bc601 plasmid pBTBC4, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
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26. spacer 1.2|16932|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP015154 (Bacillus thuringiensis strain Bc601 plasmid pBTBC4, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
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27. spacer 1.2|16932|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP015154 (Bacillus thuringiensis strain Bc601 plasmid pBTBC4, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
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29. spacer 1.2|16932|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP013059 (Bacillus thuringiensis strain YWC2-8 plasmid pYWC2-8-4, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
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30. spacer 1.2|16932|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP013059 (Bacillus thuringiensis strain YWC2-8 plasmid pYWC2-8-4, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
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31. spacer 1.2|16932|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP013059 (Bacillus thuringiensis strain YWC2-8 plasmid pYWC2-8-4, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
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32. spacer 1.2|16932|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP013059 (Bacillus thuringiensis strain YWC2-8 plasmid pYWC2-8-4, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
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33. spacer 1.2|16932|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_MG710485 (Bacillus thuringiensis serovar israelensis strain Bti-UFT6.51 plasmid pBtiUFT6.51.1 complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
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34. spacer 1.2|16932|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_MG710485 (Bacillus thuringiensis serovar israelensis strain Bti-UFT6.51 plasmid pBtiUFT6.51.1 complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
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35. spacer 1.2|16932|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP011351 (Bacillus thuringiensis strain YC-10 plasmid pYC3, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
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36. spacer 1.2|16932|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP011351 (Bacillus thuringiensis strain YC-10 plasmid pYC3, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
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37. spacer 1.2|16932|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP011351 (Bacillus thuringiensis strain YC-10 plasmid pYC3, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
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38. spacer 1.2|16932|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP011351 (Bacillus thuringiensis strain YC-10 plasmid pYC3, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
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39. spacer 1.2|16932|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP011351 (Bacillus thuringiensis strain YC-10 plasmid pYC3, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
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40. spacer 1.3|17013|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP015154 (Bacillus thuringiensis strain Bc601 plasmid pBTBC4, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
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41. spacer 1.3|17013|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP015154 (Bacillus thuringiensis strain Bc601 plasmid pBTBC4, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
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42. spacer 1.3|17013|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP015154 (Bacillus thuringiensis strain Bc601 plasmid pBTBC4, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
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43. spacer 1.3|17013|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP015154 (Bacillus thuringiensis strain Bc601 plasmid pBTBC4, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
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44. spacer 1.3|17013|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP015154 (Bacillus thuringiensis strain Bc601 plasmid pBTBC4, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
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45. spacer 1.3|17013|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP013059 (Bacillus thuringiensis strain YWC2-8 plasmid pYWC2-8-4, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
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46. spacer 1.3|17013|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP013059 (Bacillus thuringiensis strain YWC2-8 plasmid pYWC2-8-4, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
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47. spacer 1.3|17013|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP013059 (Bacillus thuringiensis strain YWC2-8 plasmid pYWC2-8-4, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
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48. spacer 1.3|17013|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP013059 (Bacillus thuringiensis strain YWC2-8 plasmid pYWC2-8-4, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
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49. spacer 1.3|17013|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP013059 (Bacillus thuringiensis strain YWC2-8 plasmid pYWC2-8-4, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
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50. spacer 1.3|17013|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_MG710485 (Bacillus thuringiensis serovar israelensis strain Bti-UFT6.51 plasmid pBtiUFT6.51.1 complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
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51. spacer 1.3|17013|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_MG710485 (Bacillus thuringiensis serovar israelensis strain Bti-UFT6.51 plasmid pBtiUFT6.51.1 complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
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52. spacer 1.3|17013|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP011351 (Bacillus thuringiensis strain YC-10 plasmid pYC3, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
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53. spacer 1.3|17013|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP011351 (Bacillus thuringiensis strain YC-10 plasmid pYC3, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
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54. spacer 1.3|17013|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP011351 (Bacillus thuringiensis strain YC-10 plasmid pYC3, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
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55. spacer 1.3|17013|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP011351 (Bacillus thuringiensis strain YC-10 plasmid pYC3, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
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56. spacer 1.3|17013|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP011351 (Bacillus thuringiensis strain YC-10 plasmid pYC3, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
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57. spacer 1.4|17094|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP015154 (Bacillus thuringiensis strain Bc601 plasmid pBTBC4, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
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58. spacer 1.4|17094|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP015154 (Bacillus thuringiensis strain Bc601 plasmid pBTBC4, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
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59. spacer 1.4|17094|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP015154 (Bacillus thuringiensis strain Bc601 plasmid pBTBC4, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
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60. spacer 1.4|17094|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP015154 (Bacillus thuringiensis strain Bc601 plasmid pBTBC4, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
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61. spacer 1.4|17094|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP015154 (Bacillus thuringiensis strain Bc601 plasmid pBTBC4, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
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62. spacer 1.4|17094|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP013059 (Bacillus thuringiensis strain YWC2-8 plasmid pYWC2-8-4, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
tgaagcggtagaacaaactgcaagg CRISPR spacer tgaagcggtagagcatactgcaagg Protospacer ************.** *********
63. spacer 1.4|17094|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP013059 (Bacillus thuringiensis strain YWC2-8 plasmid pYWC2-8-4, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
tgaagcggtagaacaaactgcaagg CRISPR spacer tgaagcggtagagcatactgcaagg Protospacer ************.** *********
64. spacer 1.4|17094|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP013059 (Bacillus thuringiensis strain YWC2-8 plasmid pYWC2-8-4, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
tgaagcggtagaacaaactgcaagg CRISPR spacer tgaagcggtagagcatactgcaagg Protospacer ************.** *********
65. spacer 1.4|17094|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP013059 (Bacillus thuringiensis strain YWC2-8 plasmid pYWC2-8-4, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
tgaagcggtagaacaaactgcaagg CRISPR spacer tgaagcggtagagcatactgcaagg Protospacer ************.** *********
66. spacer 1.4|17094|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP013059 (Bacillus thuringiensis strain YWC2-8 plasmid pYWC2-8-4, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
tgaagcggtagaacaaactgcaagg CRISPR spacer tgaagcggtagagcatactgcaagg Protospacer ************.** *********
67. spacer 1.4|17094|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_MG710485 (Bacillus thuringiensis serovar israelensis strain Bti-UFT6.51 plasmid pBtiUFT6.51.1 complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
tgaagcggtagaacaaactgcaagg CRISPR spacer tgaagcggtagagcatactgcaagg Protospacer ************.** *********
68. spacer 1.4|17094|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_MG710485 (Bacillus thuringiensis serovar israelensis strain Bti-UFT6.51 plasmid pBtiUFT6.51.1 complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
tgaagcggtagaacaaactgcaagg CRISPR spacer tgaagcggtagagcatactgcaagg Protospacer ************.** *********
69. spacer 1.4|17094|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP011351 (Bacillus thuringiensis strain YC-10 plasmid pYC3, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
tgaagcggtagaacaaactgcaagg CRISPR spacer tgaagcggtagagcatactgcaagg Protospacer ************.** *********
70. spacer 1.4|17094|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP011351 (Bacillus thuringiensis strain YC-10 plasmid pYC3, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
tgaagcggtagaacaaactgcaagg CRISPR spacer tgaagcggtagagcatactgcaagg Protospacer ************.** *********
71. spacer 1.4|17094|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP011351 (Bacillus thuringiensis strain YC-10 plasmid pYC3, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
tgaagcggtagaacaaactgcaagg CRISPR spacer tgaagcggtagagcatactgcaagg Protospacer ************.** *********
72. spacer 1.4|17094|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP011351 (Bacillus thuringiensis strain YC-10 plasmid pYC3, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
tgaagcggtagaacaaactgcaagg CRISPR spacer tgaagcggtagagcatactgcaagg Protospacer ************.** *********
73. spacer 1.4|17094|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP011351 (Bacillus thuringiensis strain YC-10 plasmid pYC3, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
tgaagcggtagaacaaactgcaagg CRISPR spacer tgaagcggtagagcatactgcaagg Protospacer ************.** *********
74. spacer 1.2|16932|25|NC_018686|PILER-CR matches to NC_018686 (Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC183, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.88
tgaagcggtagaacaaactgcaagg CRISPR spacer tgaagcggtagaacaaacggcagga Protospacer ****************** ***.*.
75. spacer 1.2|16932|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP031066 (Bacillus sp. SH8-8 plasmid pl193, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.88
tgaagcggtagaacaaactgcaagg CRISPR spacer tgaagcggtagaacaaaccgtaaga Protospacer ******************.*.***.
76. spacer 1.2|16932|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP031063 (Bacillus sp. AR4-2 plasmid pl192, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.88
tgaagcggtagaacaaactgcaagg CRISPR spacer tgaagcggtagaacaaaccgtaaga Protospacer ******************.*.***.
77. spacer 1.2|16932|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP018742 (Bacillus cereus strain FORC_047 plasmid pFORC47_2, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.88
tgaagcggtagaacaaactgcaagg CRISPR spacer tgaagcggtagaacatactgtaaga Protospacer *************** ****.***.
78. spacer 1.3|17013|25|NC_018686|PILER-CR matches to NC_018686 (Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC183, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.88
tgaagcggtagaacaaactgcaagg CRISPR spacer tgaagcggtagaacaaacggcagga Protospacer ****************** ***.*.
79. spacer 1.3|17013|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP031066 (Bacillus sp. SH8-8 plasmid pl193, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.88
tgaagcggtagaacaaactgcaagg CRISPR spacer tgaagcggtagaacaaaccgtaaga Protospacer ******************.*.***.
80. spacer 1.3|17013|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP031063 (Bacillus sp. AR4-2 plasmid pl192, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.88
tgaagcggtagaacaaactgcaagg CRISPR spacer tgaagcggtagaacaaaccgtaaga Protospacer ******************.*.***.
81. spacer 1.3|17013|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP018742 (Bacillus cereus strain FORC_047 plasmid pFORC47_2, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.88
tgaagcggtagaacaaactgcaagg CRISPR spacer tgaagcggtagaacatactgtaaga Protospacer *************** ****.***.
82. spacer 1.4|17094|25|NC_018686|PILER-CR matches to NC_018686 (Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC183, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.88
tgaagcggtagaacaaactgcaagg CRISPR spacer tgaagcggtagaacaaacggcagga Protospacer ****************** ***.*.
83. spacer 1.4|17094|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP031066 (Bacillus sp. SH8-8 plasmid pl193, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.88
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84. spacer 1.4|17094|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP031063 (Bacillus sp. AR4-2 plasmid pl192, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.88
tgaagcggtagaacaaactgcaagg CRISPR spacer tgaagcggtagaacaaaccgtaaga Protospacer ******************.*.***.
85. spacer 1.4|17094|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP018742 (Bacillus cereus strain FORC_047 plasmid pFORC47_2, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.88
tgaagcggtagaacaaactgcaagg CRISPR spacer tgaagcggtagaacatactgtaaga Protospacer *************** ****.***.
86. spacer 1.2|16932|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP031066 (Bacillus sp. SH8-8 plasmid pl193, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.84
tgaagcggtagaacaaactgcaagg CRISPR spacer cgaagcggtagaacaaaccgtaaga Protospacer .*****************.*.***.
87. spacer 1.2|16932|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP031063 (Bacillus sp. AR4-2 plasmid pl192, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.84
tgaagcggtagaacaaactgcaagg CRISPR spacer cgaagcggtagaacaaaccgtaaga Protospacer .*****************.*.***.
88. spacer 1.3|17013|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP031066 (Bacillus sp. SH8-8 plasmid pl193, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.84
tgaagcggtagaacaaactgcaagg CRISPR spacer cgaagcggtagaacaaaccgtaaga Protospacer .*****************.*.***.
89. spacer 1.3|17013|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP031063 (Bacillus sp. AR4-2 plasmid pl192, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.84
tgaagcggtagaacaaactgcaagg CRISPR spacer cgaagcggtagaacaaaccgtaaga Protospacer .*****************.*.***.
90. spacer 1.4|17094|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP031066 (Bacillus sp. SH8-8 plasmid pl193, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.84
tgaagcggtagaacaaactgcaagg CRISPR spacer cgaagcggtagaacaaaccgtaaga Protospacer .*****************.*.***.
91. spacer 1.4|17094|25|NC_018686|PILER-CR matches to NZ_CP031063 (Bacillus sp. AR4-2 plasmid pl192, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.84
tgaagcggtagaacaaactgcaagg CRISPR spacer cgaagcggtagaacaaaccgtaaga Protospacer .*****************.*.***.
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation |
---|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_018693_1 | 749187-749279 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_018693_1
|
1 spacers
spacers of NC_018693_1
>1.1|749216|35|NC_018693|CRISPRCasFinder GTGAGGGGTATTTTATTTGAAGTATCAAAAGGTTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018693_1
The CRISPR arrays of NC_018693_1 >merge|NC_018693|1|749187-749279|CRISPRCasFinder ACAAAACACCTTAGTTGAAGGCATTATTAGTGAGGGGTATTTTATTTGAAGTATCAAAAGGTTAACAAAACACTTTAGTTGAAGGCATTATTA >NC_018693|1|1|749187-749279|CRISPRCasFinder ACAAAACACCTTAGTTGAAGGCATTATTA GTGAGGGGTATTTTATTTGAAGTATCAAAAGGTTA ACAAAACACTTTAGTTGAAGGCATTATTA
>NC_018693.1|WP_000966030.1|746889_747804_+|tyrosine-type-recombinase/integrase MLYKIAMQEFLDDRELRNLSKHTLKSYKGILKRFESFCVNKGIFDTDKVTSKVAKEFLIYCKHELKNSISTINEKNRTLKVYFKYLEEEGIVEENPFKKIKFSKEDTITDVLTDEQVKSVLEHFDRGHYKGTNFALMRNRMVIVLLISTGLRREELVNLKWSDIDMRNRTIMTYGKKRTVATIPYTRKLQKELAEYKTFLEFYFEEEKEVVYVFPDKWNRQLTTEAISTLFKRLKRNLNMEGLTCHAFRRYFASKCLKMGMDSLNLQKLMRHETLQMTERYVKLYGHALHDVNDKYNPLNFIEV >NC_018693.1|WP_000521231.1|745632_746772_+|class-I-SAM-dependent-RNA-methyltransferase MGKVTLIATAAMGIEALVAREVRDLGYECQVENSKVTFEADEKAICRTNLWLRTADRVKIKVGEFKATTFDELFEKTKALNWGDYIPENGEFPVIGKSLKSELFSVSDCQRIVKKAVVEKLKTTYKRTTWFEEDGPLFRIEIAMLKDIATLTIDASGVGLHKRGYRMDQGEAPLKETLAASLIKLTNWKPDRPFVDPFCGSGTIPIEAALIGQNIAPGFNRGFASDEWGWVGKQNWREARQEAEDLANYNQPLQIIGSDIDHRMIRVAQENAEEVGLGDLITFKQMQVKDFTTKEDYGYVVTNPPYGERLSEKALVEQLYKEMGQVFRPLDTWSAYVLTSYEAFEKCYGKDASKKRKLFNGFIRTDYYQYFGKRPPRNS >NC_018693.1|WP_000622427.1|744637_744973_+|cell-division-regulator-GpsB 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_018693_2 | 2820391-2823746 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_018693_2
|
74 spacers
spacers of NC_018693_2
>2.1|2820409|18|NC_018693|CRT CGAGGTAACACGGGCGCT >2.2|2820445|27|NC_018693|CRT ACTGGACCTCGAGGTAACACGGGCGCT >2.3|2820490|27|NC_018693|CRT ACTGGACCTCGAGGTAACACGGGCGCT >2.4|2820535|27|NC_018693|CRT ACTGGACCTCGAGGTAACACGGGCGCT >2.5|2820580|27|NC_018693|CRT ACTGGACCTCGAGGTAACACGGGCGCT >2.6|2820625|27|NC_018693|CRT ACTGGACCTCGGGGAACCAGGGGCGCT >2.7|2820670|27|NC_018693|CRT ACTGGACCTCGAGGTAACACGGGCGCT >2.8|2820715|27|NC_018693|CRT ACTGGACCTCGAGGTAACACGGGCGCT >2.9|2820760|27|NC_018693|CRT ACTGGACCTACTGGACCTCGAGGTAAC >2.10|2820805|27|NC_018693|CRT ACTGGACCTCGAGGTAACACGGGCGCT >2.11|2820850|27|NC_018693|CRT ACTGGACCTCGAGGTAACACGGGCGCT >2.12|2820895|27|NC_018693|CRT ACGGGGCCTCGGGGTAACACGGGCGCT >2.13|2820940|18|NC_018693|CRT ACTGGACCTCGAGGTAAC >2.14|2820976|18|NC_018693|CRT ACTGGACCTCGAGGTACC >2.15|2821012|27|NC_018693|CRT ACTGGGCCTACTGGATCTCGAGGTAAC >2.16|2821057|27|NC_018693|CRT ACTGGACCTCCTGGACCTGGAGGTGCA >2.17|2821102|27|NC_018693|CRT ACTGGACCTACGGGGCCTCGGGGTAAC >2.18|2821147|27|NC_018693|CRT ACTGGGCCTACTGGACCTCGAGGTAAC >2.19|2821192|27|NC_018693|CRT ACTGGACCTCCTGGACCTCGAGGTAAC >2.20|2821237|27|NC_018693|CRT ACTGGGCCTACTGGACCTCGAGGTAAC >2.21|2821282|45|NC_018693|CRT ACTGGACCTACTGGACCTCGAGGTAACACGGGCGCTACCGGCGCT >2.22|2821345|27|NC_018693|CRT CGAGGTAACACGGGCGCTACCGGTGCT >2.23|2821390|27|NC_018693|CRT CGAGGTAACTCGGGCGCTACCGGCGCT >2.24|2821435|27|NC_018693|CRT CGAGGTGCCACGGGCGCTACCGGCGCC >2.25|2821480|27|NC_018693|CRT GGAGGTAACACGGGCGCTACCGGTGCT >2.26|2821525|27|NC_018693|CRT CGTGGTGCCACGGGCGCTACCGGCGCT >2.27|2821570|27|NC_018693|CRT CAAGGTAACACGGGGGCTACCGGTGCC >2.28|2821615|36|NC_018693|CRT CGAGGTGCCACGGGCGCTACCGGCGCTACTGGGCCT >2.29|2821669|18|NC_018693|CRT GGAGGTAACACGGGCGCT >2.30|2821705|27|NC_018693|CRT CGAGGTGACTCGGGCGCTACCGGCGCT >2.31|2821750|27|NC_018693|CRT CGAGGTAACACGGGCGCTACCGGTGCT >2.32|2821795|27|NC_018693|CRT CGAGGTGCCACGGGCGCTACCGGTGCT >2.33|2821840|54|NC_018693|CRT CGAGGTAACACGGGCGCTACCGGTGCTACTGGGCCTACTGGACCTCGGGGGGGC >2.34|2821912|27|NC_018693|CRT CCTGGCCCTCGGGGTAACCCGGGCGCA >2.35|2821957|27|NC_018693|CRT GCTGGATCTCGAGGTAACACGGGCGGT >2.36|2822002|18|NC_018693|CRT GCTGGACCTCGGGGTGAC >2.37|2822038|27|NC_018693|CRT ACGGGGCCTCGGGGTAACACGGGCGCT >2.38|2822083|27|NC_018693|CRT ACTGGATCTCGAGGTGCCACGGGCGCT >2.39|2822128|27|NC_018693|CRT ACTGGACCTCGAGGTAACACGGGCGCT >2.40|2822173|54|NC_018693|CRT ACTGGACCTCGAGGTAACACGGGCGCTACTGGACCTACTGGTCCTCCGGGTAAC >2.41|2822245|27|NC_018693|CRT CCTGGCCCTCGGGGTAACCCGGGCGCA >2.42|2822290|27|NC_018693|CRT GCCGGACCTCGGGGTAACACGGCCGCT >2.43|2822335|27|NC_018693|CRT TCTGGACCTCGAGGTAACGCGGGCGCT >2.44|2822380|27|NC_018693|CRT ACTGGGCCTCGTGGTAACACGGGCGCT >2.45|2822425|36|NC_018693|CRT ACAGGACCTCGAGGAACCACGGGCGCTACCGGCGCC >2.46|2822479|27|NC_018693|CRT GGAGGTAACACGGGCGCTGCCGGTGCT >2.47|2822524|27|NC_018693|CRT CGGGGAACCAGGGGCGCTACCGGCGCT >2.48|2822569|18|NC_018693|CRT CGAGGTGACACGGGCGCG >2.49|2822605|27|NC_018693|CRT GCCGGACCTCGGGGTAACACGGGCGCT >2.50|2822650|18|NC_018693|CRT ACTGCACCTCGGGGTAAC >2.51|2822686|18|NC_018693|CRT GCTGGACCTCGGGGTGAC >2.52|2822722|18|NC_018693|CRT ACGGGGCCTCGGGGTAAC >2.53|2822758|18|NC_018693|CRT ACTGGACCTCGAGGCAAC >2.54|2822794|18|NC_018693|CRT ACTGGACCTCGAGGGAAC >2.55|2822830|27|NC_018693|CRT ACTGGGCCTTCTGGACCTCGGGGTAAC >2.56|2822875|27|NC_018693|CRT ACTGGACCTACAGGACCTCGAGGAACC >2.57|2822920|27|NC_018693|CRT ACTGGCCCTCCTGGCCCTCGGGGAAAC >2.58|2822965|27|NC_018693|CRT ACTGGACCTACGGGACCTCGAGGTAAC >2.59|2823010|36|NC_018693|CRT ACTGGCCCTCCTGGCCCTCGGGGTAACCCGGGGGCC >2.60|2823064|27|NC_018693|CRT CAAGGTGCTCAAGGTAACACTGGTGCT >2.61|2823109|27|NC_018693|CRT CAAGGGGTTCAAGGTAACACGGGGGCT >2.62|2823154|27|NC_018693|CRT TCTGGACCTCGGGGTAACGCGGGCGCT >2.63|2823199|27|NC_018693|CRT TCTGGACCTCGAGGTAACTCGGGCGCT >2.64|2823244|36|NC_018693|CRT ACTGGACCTACTGGGTCTCGGGGTAACACGGGCGCT >2.65|2823298|27|NC_018693|CRT ACTGGACCTCGGGGTACCTCGGGCGCT >2.66|2823343|27|NC_018693|CRT ACTGGACCTCAAGGTAACACGGGGGCT >2.67|2823388|36|NC_018693|CRT CAAGGTGCTCAAGGTAACACTGGTGCTACCGGTGCC >2.68|2823442|18|NC_018693|CRT CGGGGTAACACGGGTGCT >2.69|2823478|27|NC_018693|CRT CAAGGCGCTCAAGGTAACACGGGGGCT >2.70|2823523|36|NC_018693|CRT ACCGGACCTCAAGGGGTTCAAGGTAACACGGGGGCT >2.71|2823577|27|NC_018693|CRT CAAGGCGCTCAAGGTAACACAGGCGCT >2.72|2823622|27|NC_018693|CRT GCTGGACCTCGGGGTAACACTGGTGCT >2.73|2823667|18|NC_018693|CRT CAAGGGGTTCAAGGTAAC >2.74|2823703|26|NC_018693|CRT ACCGGGCCACTGGACGTCAAGGTAAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018693_2
The CRISPR arrays of NC_018693_2 >merge|NC_018693|2|2820391-2823746|CRT ACTGGACCTACTGGACCTCGAGGTAACACGGGCGCTACCGGCGCTACTGGGCCTACTGGACCTCGAGGTAACACGGGCGCTACCGGCGCTACTGGACCTACTGGACCTCGAGGTAACACGGGCGCTACCGGTGCTACTGGGCCTACTGGACCTCGAGGTAACACGGGCGCTACCGGCGCTACTGGACCTACTGGACCTCGAGGTAACACGGGCGCTACCGGTGCTACTGGGCCTACTGGACCTCGGGGAACCAGGGGCGCTACCGGCGCTACTGGACCTACTGGACCTCGAGGTAACACGGGCGCTACCGGCGCTACTGGACCTACTGGACCTCGAGGTAACACGGGCGCTACCGGCGCTACTGGACCTACTGGACCTACTGGACCTCGAGGTAACACGGGCGCTACTGGACCTACTGGACCTCGAGGTAACACGGGCGCTACCGGCGCTACTGGACCTACTGGACCTCGAGGTAACACGGGCGCTACCGGCGCTACTGGACCTACGGGGCCTCGGGGTAACACGGGCGCTACCGGCGCTACTGGACCTACTGGACCTCGAGGTAACACGGGCGCTACTGGACCTACTGGACCTCGAGGTACCGCGGGCGCTGCCGGCGCTACTGGGCCTACTGGATCTCGAGGTAACACGGGCGGTACCGGCGCTACTGGACCTCCTGGACCTGGAGGTGCACCGGTCGCTACAGGCGCTACTGGACCTACGGGGCCTCGGGGTAACACGGGCGCTACCGGTGCTACTGGGCCTACTGGACCTCGAGGTAACACGGGCGCTACCGGCGCTACTGGACCTCCTGGACCTCGAGGTAACACGGGCGCTACCGGTGCTACTGGGCCTACTGGACCTCGAGGTAACACGGGCGCTACCGGCGCTACTGGACCTACTGGACCTCGAGGTAACACGGGCGCTACCGGCGCTACGGGCCCTACTGGCCCTCGAGGTAACACGGGCGCTACCGGTGCTACTGGGCCTTCTGGACCTCGAGGTAACTCGGGCGCTACCGGCGCTACTGGCCCTACTGGATCTCGAGGTGCCACGGGCGCTACCGGCGCCACTGGACCTACTGGACCTGGAGGTAACACGGGCGCTACCGGTGCTAATGGGCCTACTGGACCTCGTGGTGCCACGGGCGCTACCGGCGCTACTGGACCTACTGGACTTCAAGGTAACACGGGGGCTACCGGTGCCACTGGGCCTACTGGATCTCGAGGTGCCACGGGCGCTACCGGCGCTACTGGGCCTACTGGACCTACTGGACCTGGAGGTAACACGGGCGCTACTGGACCTCCTGGCCCTCGAGGTGACTCGGGCGCTACCGGCGCTACTGGACCTACTGGATCTCGAGGTAACACGGGCGCTACCGGTGCTACTGGGCCTACTGGACCTCGAGGTGCCACGGGCGCTACCGGTGCTACTGGGCCTACTGGACCTCGAGGTAACACGGGCGCTACCGGTGCTACTGGGCCTACTGGACCTCGGGGGGGCACGGGCGCTACTGGACCTCCTGGCCCTCGGGGTAACCCGGGCGCAACCGGCGCTACTGGACCTGCTGGATCTCGAGGTAACACGGGCGGTACCGGCGCTACTGGACCTGCTGGACCTCGGGGTGACACGGGCGCTACTGGACCTACGGGGCCTCGGGGTAACACGGGCGCTACCGGTGCTACTGGGCCTACTGGATCTCGAGGTGCCACGGGCGCTACCGGCGCCACTGGACCTACTGGACCTCGAGGTAACACGGGCGCTACCGGTGCTACTGGGCCTACTGGACCTCGAGGTAACACGGGCGCTACTGGACCTACTGGTCCTCCGGGTAACACCGGCGCTACTGGACCTCCTGGCCCTCGGGGTAACCCGGGCGCAACCGGCGCTACTGGACCTGCCGGACCTCGGGGTAACACGGCCGCTACCGGTGCTACTGGGCCTTCTGGACCTCGAGGTAACGCGGGCGCTCCCGGCGCTACTGGCCCTACTGGGCCTCGTGGTAACACGGGCGCTACAGGCGCTACTGGACCTACAGGACCTCGAGGAACCACGGGCGCTACCGGCGCCACTGGCCCTACTGGACCTGGAGGTAACACGGGCGCTGCCGGTGCTACTGGGCCTTCTGGACCTCGGGGAACCAGGGGCGCTACCGGCGCTACTGGAACTACTGGACCTCGAGGTGACACGGGCGCGACCGGCGCTACTGGACCTGCCGGACCTCGGGGTAACACGGGCGCTGCCGGCGCTACTGGACCTACTGCACCTCGGGGTAACACCGGCGCTGCTGGACCTGCTGGACCTCGGGGTGACACGGGCGCTACTGGACCTACGGGGCCTCGGGGTAACACGGGCGCTACTGGTCCTACTGGACCTCGAGGCAACACGGGCGCTACTGGTCCTACTGGACCTCGAGGGAACACGGGCGCTGCCGGTGCTACTGGGCCTTCTGGACCTCGGGGTAACACGGGCGCTACAGGCGCTACTGGACCTACAGGACCTCGAGGAACCACGGGCGCTACCGGTGCTACTGGCCCTCCTGGCCCTCGGGGAAACACGGGCGCTACCGGCCCTACTGGACCTACGGGACCTCGAGGTAACACGCGCGCTACCGGTGCTACTGGCCCTCCTGGCCCTCGGGGTAACCCGGGGGCCACTGGCGCTACTGGACCTCAAGGTGCTCAAGGTAACACTGGTGCTACTGGTGCCACTGGACCTCAAGGGGTTCAAGGTAACACGGGGGCTACCGGCGCTACTGGGCCTTCTGGACCTCGGGGTAACGCGGGCGCTGCCGGTGCTACTGGGCCTTCTGGACCTCGAGGTAACTCGGGCGCTACCGGCGCTACTGGGCCTACTGGACCTACTGGGTCTCGGGGTAACACGGGCGCTGCCGGCGCTACTGGGCCTACTGGACCTCGGGGTACCTCGGGCGCTACCGGCGCTACTGGACCTACTGGACCTCAAGGTAACACGGGGGCTACTGGCGCTACTGGACCTCAAGGTGCTCAAGGTAACACTGGTGCTACCGGTGCCACTGGACCTACTGGACCTCGGGGTAACACGGGTGCTACTGGTGCCACTGGACCTCAAGGCGCTCAAGGTAACACGGGGGCTACTGGTGCCACTGGGGCTACCGGACCTCAAGGGGTTCAAGGTAACACGGGGGCTACTGGTGCCACTGGACCTCAAGGCGCTCAAGGTAACACAGGCGCTACAGGCGCTACTGGACCTGCTGGACCTCGGGGTAACACTGGTGCTACAGGCGCTACTGGACCTCAAGGGGTTCAAGGTAACACGGGGGCTACTGGTGCTACCGGGCCACTGGACGTCAAGGTAACACGGGGGCTACTGGTGCC >NC_018693|2|1|2820391-2823746|CRT ACTGGACCTACTGGACCT CGAGGTAACACGGGCGCT ACCGGCGCTACTGGGCCT ACTGGACCTCGAGGTAACACGGGCGCT ACCGGCGCTACTGGACCT ACTGGACCTCGAGGTAACACGGGCGCT ACCGGTGCTACTGGGCCT ACTGGACCTCGAGGTAACACGGGCGCT ACCGGCGCTACTGGACCT ACTGGACCTCGAGGTAACACGGGCGCT ACCGGTGCTACTGGGCCT ACTGGACCTCGGGGAACCAGGGGCGCT ACCGGCGCTACTGGACCT ACTGGACCTCGAGGTAACACGGGCGCT ACCGGCGCTACTGGACCT ACTGGACCTCGAGGTAACACGGGCGCT ACCGGCGCTACTGGACCT ACTGGACCTACTGGACCTCGAGGTAAC ACGGGCGCTACTGGACCT ACTGGACCTCGAGGTAACACGGGCGCT ACCGGCGCTACTGGACCT ACTGGACCTCGAGGTAACACGGGCGCT ACCGGCGCTACTGGACCT ACGGGGCCTCGGGGTAACACGGGCGCT ACCGGCGCTACTGGACCT ACTGGACCTCGAGGTAAC ACGGGCGCTACTGGACCT ACTGGACCTCGAGGTACC GCGGGCGCTGCCGGCGCT ACTGGGCCTACTGGATCTCGAGGTAAC ACGGGCGGTACCGGCGCT ACTGGACCTCCTGGACCTGGAGGTGCA CCGGTCGCTACAGGCGCT ACTGGACCTACGGGGCCTCGGGGTAAC ACGGGCGCTACCGGTGCT ACTGGGCCTACTGGACCTCGAGGTAAC ACGGGCGCTACCGGCGCT ACTGGACCTCCTGGACCTCGAGGTAAC ACGGGCGCTACCGGTGCT ACTGGGCCTACTGGACCTCGAGGTAAC ACGGGCGCTACCGGCGCT ACTGGACCTACTGGACCTCGAGGTAACACGGGCGCTACCGGCGCT ACGGGCCCTACTGGCCCT CGAGGTAACACGGGCGCTACCGGTGCT ACTGGGCCTTCTGGACCT CGAGGTAACTCGGGCGCTACCGGCGCT ACTGGCCCTACTGGATCT CGAGGTGCCACGGGCGCTACCGGCGCC ACTGGACCTACTGGACCT GGAGGTAACACGGGCGCTACCGGTGCT AATGGGCCTACTGGACCT CGTGGTGCCACGGGCGCTACCGGCGCT ACTGGACCTACTGGACTT CAAGGTAACACGGGGGCTACCGGTGCC ACTGGGCCTACTGGATCT CGAGGTGCCACGGGCGCTACCGGCGCTACTGGGCCT ACTGGACCTACTGGACCT GGAGGTAACACGGGCGCT ACTGGACCTCCTGGCCCT CGAGGTGACTCGGGCGCTACCGGCGCT ACTGGACCTACTGGATCT CGAGGTAACACGGGCGCTACCGGTGCT ACTGGGCCTACTGGACCT CGAGGTGCCACGGGCGCTACCGGTGCT ACTGGGCCTACTGGACCT CGAGGTAACACGGGCGCTACCGGTGCTACTGGGCCTACTGGACCTCGGGGGGGC ACGGGCGCTACTGGACCT CCTGGCCCTCGGGGTAACCCGGGCGCA ACCGGCGCTACTGGACCT GCTGGATCTCGAGGTAACACGGGCGGT ACCGGCGCTACTGGACCT GCTGGACCTCGGGGTGAC ACGGGCGCTACTGGACCT ACGGGGCCTCGGGGTAACACGGGCGCT ACCGGTGCTACTGGGCCT ACTGGATCTCGAGGTGCCACGGGCGCT ACCGGCGCCACTGGACCT ACTGGACCTCGAGGTAACACGGGCGCT ACCGGTGCTACTGGGCCT ACTGGACCTCGAGGTAACACGGGCGCTACTGGACCTACTGGTCCTCCGGGTAAC 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GCCGGTGCTACTGGGCCT TCTGGACCTCGAGGTAACTCGGGCGCT ACCGGCGCTACTGGGCCT ACTGGACCTACTGGGTCTCGGGGTAACACGGGCGCT GCCGGCGCTACTGGGCCT ACTGGACCTCGGGGTACCTCGGGCGCT ACCGGCGCTACTGGACCT ACTGGACCTCAAGGTAACACGGGGGCT ACTGGCGCTACTGGACCT CAAGGTGCTCAAGGTAACACTGGTGCTACCGGTGCC ACTGGACCTACTGGACCT CGGGGTAACACGGGTGCT ACTGGTGCCACTGGACCT CAAGGCGCTCAAGGTAACACGGGGGCT ACTGGTGCCACTGGGGCT ACCGGACCTCAAGGGGTTCAAGGTAACACGGGGGCT ACTGGTGCCACTGGACCT CAAGGCGCTCAAGGTAACACAGGCGCT ACAGGCGCTACTGGACCT GCTGGACCTCGGGGTAACACTGGTGCT ACAGGCGCTACTGGACCT CAAGGGGTTCAAGGTAAC ACGGGGGCTACTGGTGCT ACCGGGCCACTGGACGTCAAGGTAAC ACGGGGGCTACTGGTGCC
>NC_018693.1|WP_000450336.1|2818834_2819800_+|site-specific-integrase METTEFHDTIQAFSIFLLNKGRKTSTIKRYVYDIEDFGHWLEKNKKLPSSNIWATLCTKDYEDYFSELKTNRNYSEKTMHRVFIVLNRMNHFLNIPNPLKNMEISIQPDRALRNEDFISSNEEKKLKRIVTSLEGLSEKQRPVRPLLMDRNITILNLLIDYGLSLQELTALTMYHVHFETNTLSIPATAGVERTITLTKEDKKQLYTYYKSIPEPVRPKYHSNDPLFVAFDFNRGTYRWVYENDSPKGLTEIAIQKMIRLEVARANLRKGISGQHFRNTYILNLIKKETPESEIIKLAGFKSKVSLKRYYKYAENRKNALL >NC_018693.1|WP_000438193.1|2817613_2818570_-|stage-V-sporulation-protein-K MEQSMRKKNNNQINIVLNHRKKISLPASENKTEISNETTIKHEMLQRIEEEMGKLVGMDDIKKIIKEIYAWIYVNKKRQEMGLKSEKQVLHMLFKGNPGTGKTTVARMIGKLLFEMNILSKGHLVEAERADLVGEYIGHTAQKTRDLIKKAMGGILFIDEAYSLARGGEKDFGKEAIDTLVKHMEDKQHGFVLILAGYSREMNHFLSLNPGLQSRFPFIIEFADYSVNQLLEIGKRMYEEREYQLSKEAEWKFRDHLHAVKYSSQITSFSNGRYVRNIVEKSIRTQAMRLLQEDTYDKYDLIGISSVDLMLEEETHST >NC_018693.1|WP_000181509.1|2817443_2817581_+|hypothetical-protein MTNHVNKGAQKSSVNQFGHDSNSAHEKSAKMERFHKSHQEKEKKE >NC_018693.1|WP_000312263.1|2816719_2817343_+|trimeric-intracellular-cation-channel-family-protein MAWEIFSIIGTIAFALSGAIVAMEEDYDIFGVYILGMATAFGGGALRNLLIGYPIVAFWQQDMLFQIALLSMTIIFLFPNKLIKHWKKWENITDAIGLSAFAVQGALYAQKLNLPISATIVAAVLTGIGGGIIRDLLARRKPLVLRAEVYAFWTILAGFLIGAQIIVSDWALYTLFILIVCFRMLSIHYKWHLPHRRIDTNERSMHK >NC_018693.1|WP_000391424.1|2815352_2816627_-|GTPase-HflX MEEKEKVILVGCQLQQDDDEQFMHSMKELASLAKTARAKVLVSTTQKRPKFHPVTYIGKGKLEELTMLTEELEPDVIIFNNELTPSQIRNLSSVLDARVIDRTQLILDIFAQRAKSREGKLQVELAQLQYTMPRLMGQGLSLSRLGGGIGTRGPGETKLETDRRHIRSRIDEIKKQLAVVVEHRKRYRERRKDNKVFQVSLIGYTNAGKSTLFNRLTEADTFEENLLFATLDPTTRKMPLPSGYTVLLTDTVGFIQDLPTSLIAAFRSTLEEAGEADVILHVVDSADPNYVGHEKTVKKLLSELEINHIPIITLYNKKDALHQNFIPFPKSDFLMTSAFEESDLLHIKEAIETKMKEEMDPYQVEIPPSEGKLLTLLKTETLLTKMEFLEDKFVYNCTGYIFAYSPYNGQLKRFLVEEGENDNV >NC_018693.1|WP_000460315.1|2814088_2815360_-|methionine-gamma-lyase-family-protein 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MARYTKEDIFRLAKEENVKYIRLQFTDLLGVIKNVEIPVSQLTKALDNKMMFDGSSIEGFVRIEESDMYLYPDLDTWVIFPWTAEKGKVARLICDIYTADGAPFDGDPRNNLKRVLKEMEALGFSDFNLGPEPEFFLFKVDEKGNPTLELNDNGGYFDLAPMDLGENCRRDIVLELEEMGFEIEASHHEVAPGQHEIDFKYANAIRSCDDIQTFKLVVKTIARKHGLHATFMPKPLYGVNGSGMHCNLSLFKNGENVFFDQNGDLQLSDDARHFIAGILKHAPAFTAVANPTVNSYKRLVPGYEAPCYVAWSAQNRSPLVRIPASRGISTRVEVRSVDPAANPYLVMATLLAAGLDGIKNKLTPPAAVDRNIYVMTKEEREEAGIVDLPATLAQALVTLQSNEVVCSALGEHLLEHFIEAKEIEWDIFRTQVHQWERDQYMSLY >NC_018693.1|WP_001031074.1|2811129_2811870_-|LPS-biosynthesis-protein MNKEINLKNLFTVIWKRVWILLLFTTLTTVGGAMYSMYMKTPLYASSARVIVQANAETMNTLKAMVNEPVILEKVAAELNINRSAGALSGQISTESVQGSQIMRINVVDIDPVLAHKIANTTAAVYKKEVANILNFNNVSILPEDPVQKHSMPININHFKTILIAFSVGMVLSIGFIFLLDSFDDRIKSERRIEQLLDVPVLGGISKMNRKNTEDKFSEKNTVVLGDGTEWPTKIDEKQIKLKEKV >NC_018693.1|WP_000323601.1|2810518_2811181_-|CpsD/CapB-family-tyrosine-protein-kinase 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MGEMQREKVAVIIGPTAVGKTKLSIDLAKALNGEIISGDSMQIYRTMDIGTAKVTKEEMDGIPHYMVDIKDPEDSFSVAEFQERVRKHIREITERGKLPIIVGGTGLYIQSVLFDYQFTDDAGDAIYREQMEKLAQERGVEYVHEKLQEVDPESAERIHANNVRRVIRALEIFHTTGEKMSDQLEKQENELLYDVSLIGLTMDREMLYDRINLRVDLMMEQGLLEEVEGLYNRGIRDCQSIQAIGYKEVYDYFENRVSLEEAVSQLKTNSRRYAKRQLTWFRNKMDVTWFDVTDGEKTSEILRYIEGKLQLKSNNSK >NC_018693.1|WP_000814417.1|2827107_2827353_+|hypothetical-protein MKQSTINFSSLTKDLILATATKEQNCSQEELYFALNCLLRSFHSMLQETTLHPENKNTEYMQTQFCSAYKILTGTTIYPFQ >NC_018693.1|WP_000734606.1|2827415_2828345_-|3D-domain-containing-protein MKKLLGIATAAVFGLGIFAGSAKAETIVTTDVLNVRENPNVESKLVGKMLSGNKLDVINTENGWSKIKLDGKEAFVSAEFTKSTYYVTANVLNIRAGANTDSEILGKFNKNDLIETTNQVQNEWLQFDYNGKVAYVHVPFLTGEAPVIEKKEVVTQEEPARVNPSVKNNTAVKSKESVKNVESSKPVAKEKPAAKPVKKSAETNAPAGGREITVEATAYTANPSENGTYGGRVLTAMGHDLTANPNMKVIAVDPKVIPLGSKVWVEGYGEAIAGDTGGAIKGNRIDVLVGSDGSANSWGRKSVKVKVIQ >NC_018693.1|WP_000704650.1|2828693_2830550_-|PTS-fructose-transporter-subunit-IIABC MKITELLKRDTVIMNLTASNKEAVIDELVEKLSGANRLNSKTEFKEAILKRESQSTTGIGEGIAIPHAKTKAVKQPAICFGRSVSGINYESLDGQPAHLFFMIAASEGANNTHLETLSRLSTLLMDEGFRKQLLEAKDEEELLRLFDEKENEKEEEVEVAKPEGDEPYVLAVTACPTGIAHTYMAADSLKAKAAELGIAIKVETNGSTGIKNGLTKEDIERATAIIVAADKQVEMNRFAGKHVIQVPVADGIRKTEKLLNRAVKQDAPIFKGVKENGKSESIEKEKGLGIYKHLMSGVSNMLPFVVGGGILIALAFSFGGIKAEGPLAELFMSIGGGKTGAFLFLVPILAGFIASSIADRPGFMPGVVGGFLAAHANAGFLGGLIAGFLAGYVVLGLKRLFSGLPAQLEGIKPVLLYPVFGLLITGVVMQKVVNPPVVALNEMLTGWLNGLNGTNAILLGLILGGMMAIDMGGPINKAAFTFGIAAIEAQNFGVHSAVMAGGMVPPLAIAFATTFFKTKFTEAERKSGLTNYIMGASFITEGAIPFAAADPIRVIVSCVVGSSIAGALSMLFQITLPAPHGGLFVIALVNKPLLYIFSILVGTVISALMMGIWKKKVK >NC_018693.1|WP_000640840.1|2830563_2831475_-|1-phosphofructokinase MIYTVTLNPSIDYVVQVNSFDLGTVNRAEKDMKFPGGKGINVSRVLHRLGVGNVALGFTGGFTGQFIQDVLHDEGVTTNFVQVDEDTRINVKIKGEEETELNGQGPIVTKEQFGQLMKKIESMQREDCVVLAGSIPASIQNTFYESIAALGAEKGIRVVVDASGSALQHVIKNKPFLIKPNHHELGELFGVELSTVEEILPYGRKLVEQGVENVIVSMAGDGALLFTAEGIYEATVPKGVVINSVGAGDSLVAGFVGKYEQTKEIEKAFQYGVATGSATAFSADLCKKEKVEELLSQVIVVKR >NC_018693.1|WP_000957289.1|2831471_2832224_-|DeoR/GlpR-transcriptional-regulator MLTPERHQMILQLVKEQKVVKLQQLVERTESSESTIRRDLAQLEKQRLLKRVHGGASVLTAKGQEPTMIEKSSKNIQIKHQIAKYAATIVEQGDCIYLDAGSTTFEMIPFLINKDVTVVTNGLMHIEALVENNIRAYLLGGMMKSRTKALIGAMAQESMQKYRFDKCFLGANGVHEQFGFTTPDPEEALLKQMALTLANEGYFLIDESKFSEVAFAKIANVEDANIITNHLEIDLEKYKRQTNVIEADKQ >NC_018693.1|WP_001179085.1|2832384_2833548_-|iron-containing-alcohol-dehydrogenase MQNFVFRNPTKLIFGKGQLEQLKTEIPQFGKKVLLVYGGGSIKRNGIYDNVISILKDINAEVFELTGVEPNPRVSTVKKGIQICKENGVEFILAVGGGSVIDCTKAIAAGSKYDGDVWDIVTKKAFASEALPFGTVLTLAATGSEMNAGSVITNWETNEKYGWGSPVTFPQFSILDPVHTASVPKDQTIYGMVDIMSHVLEQYFHHGTNTELQDRYCESVLRTVIETAPKLLSDLENYEHRETILYCGTMALNGILAMGVKGDWATHNIEHAVSAVHDIPHGGGLAILFPNWMKHVIDENVSRFKQFAIRVFDIETDGKTDKEVALEGIEALRQFWTSIEAPVALSDYTIGENEIDLMADKAMAYGEFGNFKKLNKDDVLSIYKASL >NC_018693.1|WP_000228316.1|2833665_2834208_-|DUF420-domain-containing-protein MVDQSTNQKSYAPIVITLSVIVNAIILFLFFGPVGYEGEVHFDVTILPMLNAIFNSFTFVFLLAALYSIIKKNVKMHRGFILAAFTTTLLFCVSYLSYHYLAPATHFGGEGFIKYVYFIILITHIILAAIIVPLALFALVFGFTNQLTRHRKIVRWTMPIWLYVSLSGVIVYLMISPYYQ |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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NC_018693_2 | 2.66|2823343|27|NC_018693|CRT | 2823343-2823369 | 27 | MT380195 | Klebsiella phage KP_LZD_B01, complete genome | 78581-78607 | 3 | 0.889 |
NC_018693_2 | 2.66|2823343|27|NC_018693|CRT | 2823343-2823369 | 27 | KX845404 | Klebsiella phage vB_Kpn_IME260, complete genome | 83086-83112 | 3 | 0.889 |
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NC_018693_2 | 2.9|2820760|27|NC_018693|CRT | 2820760-2820786 | 27 | AP013669 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C108A-MedDCM-OCT-S25-C43, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 3910-3936 | 4 | 0.852 |
NC_018693_2 | 2.9|2820760|27|NC_018693|CRT | 2820760-2820786 | 27 | JQ691611 | Cronobacter phage CR9, complete genome | 9688-9714 | 4 | 0.852 |
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NC_018693_2 | 2.16|2821057|27|NC_018693|CRT | 2821057-2821083 | 27 | AY939844 | Prochlorococcus phage P-SSM2, complete genome | 25294-25320 | 4 | 0.852 |
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NC_018693_2 | 2.24|2821435|27|NC_018693|CRT | 2821435-2821461 | 27 | NZ_CP015065 | Mesorhizobium ciceri biovar biserrulae strain WSM1284 plasmid pMc1284, complete sequence | 245-271 | 4 | 0.852 |
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NC_018693_2 | 2.26|2821525|27|NC_018693|CRT | 2821525-2821551 | 27 | LR798305 | uncultured Caudovirales phage genome assembly | 33384-33410 | 4 | 0.852 |
NC_018693_2 | 2.31|2821750|27|NC_018693|CRT | 2821750-2821776 | 27 | KU682439 | Stenotrophomonas phage vB_SmaS-DLP_6, complete genome | 61554-61580 | 4 | 0.852 |
NC_018693_2 | 2.32|2821795|27|NC_018693|CRT | 2821795-2821821 | 27 | MN204498 | Streptomyces phage Saftant, complete genome | 18538-18564 | 4 | 0.852 |
NC_018693_2 | 2.32|2821795|27|NC_018693|CRT | 2821795-2821821 | 27 | NZ_CP015065 | Mesorhizobium ciceri biovar biserrulae strain WSM1284 plasmid pMc1284, complete sequence | 245-271 | 4 | 0.852 |
NC_018693_2 | 2.60|2823064|27|NC_018693|CRT | 2823064-2823090 | 27 | AP014498 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C73-MedDCM-OCT-S34-C64, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***, 4 ordered pieces | 16648-16674 | 4 | 0.852 |
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NC_018693_2 | 2.60|2823064|27|NC_018693|CRT | 2823064-2823090 | 27 | MN693001 | Marine virus AFVG_117M47, complete genome | 27308-27334 | 4 | 0.852 |
NC_018693_2 | 2.66|2823343|27|NC_018693|CRT | 2823343-2823369 | 27 | JQ691611 | Cronobacter phage CR9, complete genome | 9697-9723 | 4 | 0.852 |
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NC_018693_2 | 2.16|2821057|27|NC_018693|CRT | 2821057-2821083 | 27 | MH319751 | Marine virus AG-345-F15 Ga0172271_13 genomic sequence | 4770-4796 | 5 | 0.815 |
NC_018693_2 | 2.16|2821057|27|NC_018693|CRT | 2821057-2821083 | 27 | MH319751 | Marine virus AG-345-F15 Ga0172271_13 genomic sequence | 4845-4871 | 5 | 0.815 |
NC_018693_2 | 2.16|2821057|27|NC_018693|CRT | 2821057-2821083 | 27 | AY576796 | Actinoplanes phage phiAsp2, complete genome | 7964-7990 | 5 | 0.815 |
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NC_018693_2 | 2.20|2821237|27|NC_018693|CRT | 2821237-2821263 | 27 | NZ_CP052758 | Cellulosimicrobium sp. BI34T plasmid pCPRO01, complete sequence | 130138-130164 | 5 | 0.815 |
NC_018693_2 | 2.22|2821345|27|NC_018693|CRT | 2821345-2821371 | 27 | NZ_CP043441 | Cupriavidus campinensis strain MJ1 plasmid unnamed1, complete sequence | 434198-434224 | 5 | 0.815 |
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NC_018693_2 | 2.24|2821435|27|NC_018693|CRT | 2821435-2821461 | 27 | MK279903 | Mycobacterium phage Zetzy, complete genome | 2505-2531 | 5 | 0.815 |
NC_018693_2 | 2.24|2821435|27|NC_018693|CRT | 2821435-2821461 | 27 | NZ_CP030263 | Ensifer adhaerens strain Corn53 plasmid AA, complete sequence | 1180231-1180257 | 5 | 0.815 |
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NC_018693_2 | 2.25|2821480|27|NC_018693|CRT | 2821480-2821506 | 27 | KU682439 | Stenotrophomonas phage vB_SmaS-DLP_6, complete genome | 61554-61580 | 5 | 0.815 |
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NC_018693_2 | 2.26|2821525|27|NC_018693|CRT | 2821525-2821551 | 27 | KX507344 | Streptomyces phage Godpower, complete genome | 17467-17493 | 5 | 0.815 |
NC_018693_2 | 2.26|2821525|27|NC_018693|CRT | 2821525-2821551 | 27 | NC_021298 | Streptomyces phage Lika, complete genome | 17471-17497 | 5 | 0.815 |
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NC_018693_2 | 2.31|2821750|27|NC_018693|CRT | 2821750-2821776 | 27 | NZ_CP043441 | Cupriavidus campinensis strain MJ1 plasmid unnamed1, complete sequence | 434198-434224 | 5 | 0.815 |
NC_018693_2 | 2.32|2821795|27|NC_018693|CRT | 2821795-2821821 | 27 | NZ_CP043441 | Cupriavidus campinensis strain MJ1 plasmid unnamed1, complete sequence | 434198-434224 | 5 | 0.815 |
NC_018693_2 | 2.32|2821795|27|NC_018693|CRT | 2821795-2821821 | 27 | KX641263 | Mycobacterium phage Kalpine, complete genome | 5208-5234 | 5 | 0.815 |
NC_018693_2 | 2.46|2822479|27|NC_018693|CRT | 2822479-2822505 | 27 | MK450433 | Streptomyces phage Sebastisaurus, complete genome | 15095-15121 | 5 | 0.815 |
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NC_018693_2 | 2.47|2822524|27|NC_018693|CRT | 2822524-2822550 | 27 | NZ_CP045319 | Roseivivax sp. THAF197b plasmid pTHAF197b_a, complete sequence | 150938-150964 | 5 | 0.815 |
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NC_018693_2 | 2.72|2823622|27|NC_018693|CRT | 2823622-2823648 | 27 | MN434096 | Klebsiella phage JIPh_Kp127, complete genome | 81960-81986 | 5 | 0.815 |
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NC_018693_2 | 2.9|2820760|27|NC_018693|CRT | 2820760-2820786 | 27 | NZ_CP040338 | Bacillus luti strain FJ plasmid unnamed2, complete sequence | 22746-22772 | 6 | 0.778 |
NC_018693_2 | 2.9|2820760|27|NC_018693|CRT | 2820760-2820786 | 27 | NC_011771 | Bacillus cereus AH820 plasmid pAH820_10, complete sequence | 10423-10449 | 6 | 0.778 |
NC_018693_2 | 2.9|2820760|27|NC_018693|CRT | 2820760-2820786 | 27 | NC_011771 | Bacillus cereus AH820 plasmid pAH820_10, complete sequence | 10486-10512 | 6 | 0.778 |
NC_018693_2 | 2.15|2821012|27|NC_018693|CRT | 2821012-2821038 | 27 | NZ_CP015881 | Ensifer adhaerens strain Casida A plasmid pCasidaAA, complete sequence | 341551-341577 | 6 | 0.778 |
NC_018693_2 | 2.15|2821012|27|NC_018693|CRT | 2821012-2821038 | 27 | NZ_AP022593 | Mycolicibacterium arabiense strain JCM 18538 plasmid pJCM18538, complete sequence | 2863323-2863349 | 6 | 0.778 |
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NC_018693_2 | 2.22|2821345|27|NC_018693|CRT | 2821345-2821371 | 27 | MK450433 | Streptomyces phage Sebastisaurus, complete genome | 15059-15085 | 6 | 0.778 |
NC_018693_2 | 2.22|2821345|27|NC_018693|CRT | 2821345-2821371 | 27 | MN204498 | Streptomyces phage Saftant, complete genome | 18538-18564 | 6 | 0.778 |
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NC_018693_2 | 2.24|2821435|27|NC_018693|CRT | 2821435-2821461 | 27 | NZ_CP046333 | Cupriavidus metallidurans strain FDAARGOS_675 plasmid unnamed3 | 1250387-1250413 | 6 | 0.778 |
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NC_018693_2 | 2.24|2821435|27|NC_018693|CRT | 2821435-2821461 | 27 | NC_021298 | Streptomyces phage Lika, complete genome | 17471-17497 | 6 | 0.778 |
NC_018693_2 | 2.24|2821435|27|NC_018693|CRT | 2821435-2821461 | 27 | LR798305 | uncultured Caudovirales phage genome assembly | 33384-33410 | 6 | 0.778 |
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NC_018693_2 | 2.25|2821480|27|NC_018693|CRT | 2821480-2821506 | 27 | MK450433 | Streptomyces phage Sebastisaurus, complete genome | 15059-15085 | 6 | 0.778 |
NC_018693_2 | 2.25|2821480|27|NC_018693|CRT | 2821480-2821506 | 27 | MN204498 | Streptomyces phage Saftant, complete genome | 18538-18564 | 6 | 0.778 |
NC_018693_2 | 2.26|2821525|27|NC_018693|CRT | 2821525-2821551 | 27 | NZ_CP015065 | Mesorhizobium ciceri biovar biserrulae strain WSM1284 plasmid pMc1284, complete sequence | 245-271 | 6 | 0.778 |
NC_018693_2 | 2.26|2821525|27|NC_018693|CRT | 2821525-2821551 | 27 | NZ_CP043441 | Cupriavidus campinensis strain MJ1 plasmid unnamed1, complete sequence | 434306-434332 | 6 | 0.778 |
NC_018693_2 | 2.26|2821525|27|NC_018693|CRT | 2821525-2821551 | 27 | MK279903 | Mycobacterium phage Zetzy, complete genome | 2505-2531 | 6 | 0.778 |
NC_018693_2 | 2.30|2821705|27|NC_018693|CRT | 2821705-2821731 | 27 | KX912252 | Pseudoalteromonas phage PHS3, complete genome | 7236-7262 | 6 | 0.778 |
NC_018693_2 | 2.31|2821750|27|NC_018693|CRT | 2821750-2821776 | 27 | MK279903 | Mycobacterium phage Zetzy, complete genome | 2505-2531 | 6 | 0.778 |
NC_018693_2 | 2.31|2821750|27|NC_018693|CRT | 2821750-2821776 | 27 | MK450433 | Streptomyces phage Sebastisaurus, complete genome | 15059-15085 | 6 | 0.778 |
NC_018693_2 | 2.31|2821750|27|NC_018693|CRT | 2821750-2821776 | 27 | MN204498 | Streptomyces phage Saftant, complete genome | 18538-18564 | 6 | 0.778 |
NC_018693_2 | 2.32|2821795|27|NC_018693|CRT | 2821795-2821821 | 27 | NZ_CP021071 | Mesorhizobium sp. WSM1497 plasmid pWSM1497, complete sequence | 311-337 | 6 | 0.778 |
NC_018693_2 | 2.32|2821795|27|NC_018693|CRT | 2821795-2821821 | 27 | NZ_CP015063 | Mesorhizobium ciceri strain CC1192 plasmid pMc1192, complete sequence | 1470-1496 | 6 | 0.778 |
NC_018693_2 | 2.32|2821795|27|NC_018693|CRT | 2821795-2821821 | 27 | MK279903 | Mycobacterium phage Zetzy, complete genome | 2505-2531 | 6 | 0.778 |
NC_018693_2 | 2.32|2821795|27|NC_018693|CRT | 2821795-2821821 | 27 | MK450433 | Streptomyces phage Sebastisaurus, complete genome | 15059-15085 | 6 | 0.778 |
NC_018693_2 | 2.34|2821912|27|NC_018693|CRT | 2821912-2821938 | 27 | NZ_CP020698 | Sulfitobacter sp. D7 plasmid p4SUD7, complete sequence | 23625-23651 | 6 | 0.778 |
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NC_018693_2 | 2.41|2822245|27|NC_018693|CRT | 2822245-2822271 | 27 | NZ_CP020698 | Sulfitobacter sp. D7 plasmid p4SUD7, complete sequence | 23625-23651 | 6 | 0.778 |
NC_018693_2 | 2.44|2822380|27|NC_018693|CRT | 2822380-2822406 | 27 | JQ015307 | Pectobacterium phage phiTE, complete genome | 118080-118106 | 6 | 0.778 |
NC_018693_2 | 2.44|2822380|27|NC_018693|CRT | 2822380-2822406 | 27 | KY514263 | Pectobacterium phage vB_PatM_CB7, complete genome | 9726-9752 | 6 | 0.778 |
NC_018693_2 | 2.46|2822479|27|NC_018693|CRT | 2822479-2822505 | 27 | NZ_CP038636 | Cupriavidus oxalaticus strain X32 plasmid unnamed1, complete sequence | 790196-790222 | 6 | 0.778 |
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NC_018693_2 | 2.55|2822830|27|NC_018693|CRT | 2822830-2822856 | 27 | MN694359 | Marine virus AFVG_250M1098, complete genome | 4165-4191 | 6 | 0.778 |
NC_018693_2 | 2.55|2822830|27|NC_018693|CRT | 2822830-2822856 | 27 | MN694688 | Marine virus AFVG_250M1099, complete genome | 4186-4212 | 6 | 0.778 |
NC_018693_2 | 2.55|2822830|27|NC_018693|CRT | 2822830-2822856 | 27 | MN694415 | Marine virus AFVG_250M1100, complete genome | 4167-4193 | 6 | 0.778 |
NC_018693_2 | 2.55|2822830|27|NC_018693|CRT | 2822830-2822856 | 27 | MN694502 | Marine virus AFVG_250M1097, complete genome | 4184-4210 | 6 | 0.778 |
NC_018693_2 | 2.55|2822830|27|NC_018693|CRT | 2822830-2822856 | 27 | MN062708 | Mycobacteriumphage NothingSpecial, complete genome | 4830-4856 | 6 | 0.778 |
NC_018693_2 | 2.56|2822875|27|NC_018693|CRT | 2822875-2822901 | 27 | NZ_CP032531 | Bacillus megaterium NCT-2 plasmid pNCT2_3, complete sequence | 110573-110599 | 6 | 0.778 |
NC_018693_2 | 2.56|2822875|27|NC_018693|CRT | 2822875-2822901 | 27 | NZ_CP032531 | Bacillus megaterium NCT-2 plasmid pNCT2_3, complete sequence | 110609-110635 | 6 | 0.778 |
NC_018693_2 | 2.56|2822875|27|NC_018693|CRT | 2822875-2822901 | 27 | MT497070 | Flavobacterium phage vB_Fsp_elemo2-5C, partial genome | 22623-22649 | 6 | 0.778 |
NC_018693_2 | 2.57|2822920|27|NC_018693|CRT | 2822920-2822946 | 27 | NZ_AP014705 | Methylobacterium aquaticum strain MA-22A plasmid pMaq22A_1p, complete sequence | 813852-813878 | 6 | 0.778 |
NC_018693_2 | 2.57|2822920|27|NC_018693|CRT | 2822920-2822946 | 27 | NC_019387 | Thermus oshimai JL-2 plasmid pTHEOS01, complete sequence | 240656-240682 | 6 | 0.778 |
NC_018693_2 | 2.60|2823064|27|NC_018693|CRT | 2823064-2823090 | 27 | NC_031056 | Bacillus phage Deep Blue, complete genome | 146725-146751 | 6 | 0.778 |
NC_018693_2 | 2.9|2820760|27|NC_018693|CRT | 2820760-2820786 | 27 | MN693099 | Marine virus AFVG_25M184, complete genome | 13848-13874 | 7 | 0.741 |
NC_018693_2 | 2.9|2820760|27|NC_018693|CRT | 2820760-2820786 | 27 | MN693189 | Marine virus AFVG_25M326, complete genome | 18898-18924 | 7 | 0.741 |
NC_018693_2 | 2.19|2821192|27|NC_018693|CRT | 2821192-2821218 | 27 | NZ_CP012699 | Microbacterium sp. No. 7 plasmid B, complete sequence | 89553-89579 | 7 | 0.741 |
NC_018693_2 | 2.19|2821192|27|NC_018693|CRT | 2821192-2821218 | 27 | NZ_CP044072 | Pseudomonas oryzihabitans strain FDAARGOS_657 plasmid unnamed1, complete sequence | 88967-88993 | 7 | 0.741 |
NC_018693_2 | 2.46|2822479|27|NC_018693|CRT | 2822479-2822505 | 27 | NZ_CP013069 | Pannonibacter phragmitetus strain 31801 plasmid p.p-1, complete sequence | 316501-316527 | 7 | 0.741 |
NC_018693_2 | 2.46|2822479|27|NC_018693|CRT | 2822479-2822505 | 27 | NZ_CP032313 | Pannonibacter phragmitetus BB plasmid p.BB_1, complete sequence | 186437-186463 | 7 | 0.741 |
NC_018693_2 | 2.55|2822830|27|NC_018693|CRT | 2822830-2822856 | 27 | MN908690 | Microbacterium phage Hubbs, complete genome | 25999-26025 | 7 | 0.741 |
NC_018693_2 | 2.55|2822830|27|NC_018693|CRT | 2822830-2822856 | 27 | MN096374 | Microbacterium phage Roman, complete genome | 25847-25873 | 7 | 0.741 |
NC_018693_2 | 2.55|2822830|27|NC_018693|CRT | 2822830-2822856 | 27 | MK937596 | Microbacterium phage PhillyPhilly, complete genome | 25380-25406 | 7 | 0.741 |
NC_018693_2 | 2.55|2822830|27|NC_018693|CRT | 2822830-2822856 | 27 | MK919474 | Microbacterium phage Lupine, complete genome | 25201-25227 | 7 | 0.741 |
NC_018693_2 | 2.60|2823064|27|NC_018693|CRT | 2823064-2823090 | 27 | MK613348 | Roseobacter phage CRP-6, complete genome | 35766-35792 | 7 | 0.741 |
NC_018693_2 | 2.9|2820760|27|NC_018693|CRT | 2820760-2820786 | 27 | NC_015059 | Granulicella tundricola MP5ACTX9 plasmid pACIX904, complete sequence | 19531-19557 | 8 | 0.704 |
1. spacer 2.60|2823064|27|NC_018693|CRT matches to MN101228 (Klebsiella phage KPN4, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.926
caaggtgctcaaggtaacactggtgct CRISPR spacer caaggtcctcagggtaacactggtgct Protospacer ****** ****.***************
2. spacer 2.12|2820895|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP034351 (Streptomyces sp. W1SF4 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.889
acggggcctcggggtaacacgggcgct CRISPR spacer gcgggggctcgggggaacacgggcgct Protospacer .***** ******* ************
3. spacer 2.37|2822038|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP034351 (Streptomyces sp. W1SF4 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.889
acggggcctcggggtaacacgggcgct CRISPR spacer gcgggggctcgggggaacacgggcgct Protospacer .***** ******* ************
4. spacer 2.66|2823343|27|NC_018693|CRT matches to MT380195 (Klebsiella phage KP_LZD_B01, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.889
actggacctcaaggtaacacgggggct CRISPR spacer actggtcctcaaggtaacaagggggat Protospacer ***** ************* ***** *
5. spacer 2.66|2823343|27|NC_018693|CRT matches to KX845404 (Klebsiella phage vB_Kpn_IME260, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.889
actggacctcaaggtaacacgggggct CRISPR spacer actggtcctcaaggtaacaagggggat Protospacer ***** ************* ***** *
6. spacer 2.9|2820760|27|NC_018693|CRT matches to AP013411 (Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G16, isolate: uvMED-CGR-C108A-MedDCM-OCT-S29-C43) position: , mismatch: 4, identity: 0.852
actggacctactggacctcgaggtaac CRISPR spacer actggacctactggaccacaaggtaca Protospacer ***************** *.*****
7. spacer 2.9|2820760|27|NC_018693|CRT matches to AP013669 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C108A-MedDCM-OCT-S25-C43, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 4, identity: 0.852
actggacctactggacctcgaggtaac CRISPR spacer actggacctactggaccacaaggtaca Protospacer ***************** *.*****
8. spacer 2.9|2820760|27|NC_018693|CRT matches to JQ691611 (Cronobacter phage CR9, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.852
actggacctactggacctcgaggtaac CRISPR spacer atcggacctactggtcctcaaggtaac Protospacer *..*********** ****.*******
9. spacer 2.16|2821057|27|NC_018693|CRT matches to HQ632825 (Prochlorococcus phage P-SSM5 genomic sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.852
actggacctcctggacctggaggtgca CRISPR spacer cctggaccacctggacctggaggacca Protospacer ******* ************** **
10. spacer 2.16|2821057|27|NC_018693|CRT matches to AY939844 (Prochlorococcus phage P-SSM2, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.852
actggacctcctggacctggaggtgca CRISPR spacer cctggaccacctggacctggaggacca Protospacer ******* ************** **
11. spacer 2.22|2821345|27|NC_018693|CRT matches to KU682439 (Stenotrophomonas phage vB_SmaS-DLP_6, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.852
cgaggtaacacgggcgctaccggtgct CRISPR spacer cgcggtaacacgggcgcgaccggttcg Protospacer ** ************** ****** *
12. spacer 2.23|2821390|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP018048 (Pseudomonas aeruginosa strain DN1 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.852
cgaggtaactcgggcgctaccggcgct CRISPR spacer cagggcaactcgggcgctacaggcgct Protospacer *..**.************** ******
13. spacer 2.24|2821435|27|NC_018693|CRT matches to MN204498 (Streptomyces phage Saftant, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.852
cgaggtgccacgggcgctaccggcgcc CRISPR spacer actggtgccacgggcgctaccggtgcc Protospacer ********************.***
14. spacer 2.24|2821435|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP015065 (Mesorhizobium ciceri biovar biserrulae strain WSM1284 plasmid pMc1284, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.852
cgaggtgccacgggcgctaccggcgcc CRISPR spacer acaggtgccacgggcgcgaccggtgcc Protospacer *************** *****.***
15. spacer 2.26|2821525|27|NC_018693|CRT matches to MN204498 (Streptomyces phage Saftant, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.852
cgtggtgccacgggcgctaccggcgct CRISPR spacer actggtgccacgggcgctaccggtgcc Protospacer *********************.**.
16. spacer 2.26|2821525|27|NC_018693|CRT matches to LR798305 (uncultured Caudovirales phage genome assembly) position: , mismatch: 4, identity: 0.852
cgtggtgccacgggcgctaccggcgct CRISPR spacer actggtgctacaggcgctaccggcgct Protospacer ******.**.***************
17. spacer 2.31|2821750|27|NC_018693|CRT matches to KU682439 (Stenotrophomonas phage vB_SmaS-DLP_6, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.852
cgaggtaacacgggcgctaccggtgct CRISPR spacer cgcggtaacacgggcgcgaccggttcg Protospacer ** ************** ****** *
18. spacer 2.32|2821795|27|NC_018693|CRT matches to MN204498 (Streptomyces phage Saftant, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.852
cgaggtgccacgggcgctaccggtgct CRISPR spacer actggtgccacgggcgctaccggtgcc Protospacer ***********************.
19. spacer 2.32|2821795|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP015065 (Mesorhizobium ciceri biovar biserrulae strain WSM1284 plasmid pMc1284, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.852
cgaggtgccacgggcgctaccggtgct CRISPR spacer acaggtgccacgggcgcgaccggtgcc Protospacer *************** ********.
20. spacer 2.60|2823064|27|NC_018693|CRT matches to AP014498 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C73-MedDCM-OCT-S34-C64, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***, 4 ordered pieces) position: , mismatch: 4, identity: 0.852
caaggtgctcaaggtaacactggtgct CRISPR spacer caaggtgctcaaggtacaactggtagt Protospacer **************** ******. *
21. spacer 2.60|2823064|27|NC_018693|CRT matches to MH460463 (Dickeya phage vB_DsoM_AD1, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.852
caaggtgctcaaggtaacactggtgct CRISPR spacer gtaggtgctacaggtaacactggtgct Protospacer ******* ****************
22. spacer 2.60|2823064|27|NC_018693|CRT matches to MN693001 (Marine virus AFVG_117M47, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.852
caaggtgctcaaggtaacactggtgct CRISPR spacer ccagctgctccaggtaacactggtgat Protospacer * ** ***** ************** *
23. spacer 2.66|2823343|27|NC_018693|CRT matches to JQ691611 (Cronobacter phage CR9, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.852
actggacctcaaggtaacacgggggct CRISPR spacer actggtcctcaaggtaacacaggtcct Protospacer ***** **************.** **
24. spacer 2.16|2821057|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP020371 (Candidatus Thiodictyon syntrophicum strain Cad16T plasmid pTs417, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
actggacctcctggacctggaggtgca CRISPR spacer cctggccctcctggacatggaggtcga Protospacer **** ********** ******* *
25. spacer 2.16|2821057|27|NC_018693|CRT matches to MH319751 (Marine virus AG-345-F15 Ga0172271_13 genomic sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
actggacctcctggacctggaggtgca CRISPR spacer cctggacctcctggtcctgaaggtcct Protospacer ************* ****.**** *
26. spacer 2.16|2821057|27|NC_018693|CRT matches to MH319751 (Marine virus AG-345-F15 Ga0172271_13 genomic sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
actggacctcctggacctggaggtgca CRISPR spacer cctggtcctcctggacctgaaggtcct Protospacer **** *************.**** *
27. spacer 2.16|2821057|27|NC_018693|CRT matches to AY576796 (Actinoplanes phage phiAsp2, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
actggacctcctggacctggaggtgca CRISPR spacer cgtggacctcctggacctggtggagga Protospacer ****************** ** * *
28. spacer 2.18|2821147|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP052758 (Cellulosimicrobium sp. BI34T plasmid pCPRO01, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
actgggcctactggacctcgaggtaac CRISPR spacer cctgggcctcctcgacctcgaggtact Protospacer ******** ** ************ .
29. spacer 2.19|2821192|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP052758 (Cellulosimicrobium sp. BI34T plasmid pCPRO01, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
actggacctcctggacctcgaggtaac CRISPR spacer cctgggcctcctcgacctcgaggtact Protospacer ****.****** ************ .
30. spacer 2.20|2821237|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP052758 (Cellulosimicrobium sp. BI34T plasmid pCPRO01, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
actgggcctactggacctcgaggtaac CRISPR spacer cctgggcctcctcgacctcgaggtact Protospacer ******** ** ************ .
31. spacer 2.22|2821345|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP043441 (Cupriavidus campinensis strain MJ1 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
cgaggtaacacgggcgctaccggtgct CRISPR spacer acgggtacgacgggcgctaccggtgct Protospacer .**** ******************
32. spacer 2.24|2821435|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP043441 (Cupriavidus campinensis strain MJ1 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
cgaggtgccacgggcgctaccggcgcc CRISPR spacer acgggtgccacaggcgcgaccggcgcc Protospacer .********.***** *********
33. spacer 2.24|2821435|27|NC_018693|CRT matches to MK279903 (Mycobacterium phage Zetzy, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
cgaggtgccacgggcgctaccggcgcc CRISPR spacer aaaggtgacacgggcgctaccggcccg Protospacer .***** **************** *
34. spacer 2.24|2821435|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP030263 (Ensifer adhaerens strain Corn53 plasmid AA, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
cgaggtgccacgggcgctaccggcgcc CRISPR spacer caccgtgccgcgggcgcgaccggcgcc Protospacer *. *****.******* *********
35. spacer 2.25|2821480|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP043441 (Cupriavidus campinensis strain MJ1 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
ggaggtaacacgggcgctaccggtgct CRISPR spacer acgggtacgacgggcgctaccggtgct Protospacer . .**** ******************
36. spacer 2.25|2821480|27|NC_018693|CRT matches to KU682439 (Stenotrophomonas phage vB_SmaS-DLP_6, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
ggaggtaacacgggcgctaccggtgct CRISPR spacer cgcggtaacacgggcgcgaccggttcg Protospacer * ************** ****** *
37. spacer 2.26|2821525|27|NC_018693|CRT matches to NC_007974 (Cupriavidus metallidurans CH34 megaplasmid, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
cgtggtgccacgggcgctaccggcgct CRISPR spacer accggcgccacgggcgcaaccggcgct Protospacer .**.*********** *********
38. spacer 2.26|2821525|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP046333 (Cupriavidus metallidurans strain FDAARGOS_675 plasmid unnamed3) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
cgtggtgccacgggcgctaccggcgct CRISPR spacer accggcgccacgggcgcaaccggcgct Protospacer .**.*********** *********
39. spacer 2.26|2821525|27|NC_018693|CRT matches to KX507344 (Streptomyces phage Godpower, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
cgtggtgccacgggcgctaccggcgct CRISPR spacer actggagccaccggcgctaccggcgcg Protospacer *** ***** **************
40. spacer 2.26|2821525|27|NC_018693|CRT matches to NC_021298 (Streptomyces phage Lika, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
cgtggtgccacgggcgctaccggcgct CRISPR spacer actggagccaccggcgctaccggcgcg Protospacer *** ***** **************
41. spacer 2.30|2821705|27|NC_018693|CRT matches to MK279903 (Mycobacterium phage Zetzy, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
cgaggtgactcgggcgctaccggcgct CRISPR spacer aaaggtgacacgggcgctaccggcccg Protospacer .******* ************** *
42. spacer 2.31|2821750|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP043441 (Cupriavidus campinensis strain MJ1 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
cgaggtaacacgggcgctaccggtgct CRISPR spacer acgggtacgacgggcgctaccggtgct Protospacer .**** ******************
43. spacer 2.32|2821795|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP043441 (Cupriavidus campinensis strain MJ1 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
cgaggtgccacgggcgctaccggtgct CRISPR spacer acgggtacgacgggcgctaccggtgct Protospacer .***.* ******************
44. spacer 2.32|2821795|27|NC_018693|CRT matches to KX641263 (Mycobacterium phage Kalpine, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
cgaggtgccacgggcgctaccggtgct CRISPR spacer aagggtgccaagggcgataccggtgct Protospacer ..******* ***** **********
45. spacer 2.46|2822479|27|NC_018693|CRT matches to MK450433 (Streptomyces phage Sebastisaurus, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
ggaggtaacacgggcgctgccggtgct CRISPR spacer aagggtgacacgggcgctgcgggtgct Protospacer ...***.************* ******
46. spacer 2.47|2822524|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP045361 (Roseivivax sp. THAF40 plasmid pTHAF40_a, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
cggggaaccaggggcgctaccggcgct CRISPR spacer cggggaaccaggtgcgctaccgcctgg Protospacer ************ ********* *
47. spacer 2.47|2822524|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP045319 (Roseivivax sp. THAF197b plasmid pTHAF197b_a, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
cggggaaccaggggcgctaccggcgct CRISPR spacer cggggaaccaggtgcgctaccgcctgg Protospacer ************ ********* *
48. spacer 2.72|2823622|27|NC_018693|CRT matches to MN101228 (Klebsiella phage KPN4, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
gctggacctcggggtaacactggtgct CRISPR spacer caaggtcctcagggtaacactggtgct Protospacer ** ****.****************
49. spacer 2.72|2823622|27|NC_018693|CRT matches to MN434096 (Klebsiella phage JIPh_Kp127, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
gctggacctcggggtaacactggtgct CRISPR spacer cagggccctcagggtaacactggtgct Protospacer ** ****.****************
50. spacer 2.9|2820760|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP040338 (Bacillus luti strain FJ plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
actggacctactggacctcgaggtaac CRISPR spacer actggacctactggacctacaggagct Protospacer ****************** *** . .
51. spacer 2.9|2820760|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP040338 (Bacillus luti strain FJ plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
actggacctactggacctcgaggtaac CRISPR spacer actggacctactggacctacaggagct Protospacer ****************** *** . .
52. spacer 2.9|2820760|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP040338 (Bacillus luti strain FJ plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
actggacctactggacctcgaggtaac CRISPR spacer actggacctactggacctacaggagct Protospacer ****************** *** . .
53. spacer 2.9|2820760|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP040338 (Bacillus luti strain FJ plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
actggacctactggacctcgaggtaac CRISPR spacer actggacctactggacctacaggagct Protospacer ****************** *** . .
54. spacer 2.9|2820760|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP040338 (Bacillus luti strain FJ plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
actggacctactggacctcgaggtaac CRISPR spacer actggacctactggacctacaggagct Protospacer ****************** *** . .
55. spacer 2.9|2820760|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP040338 (Bacillus luti strain FJ plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
actggacctactggacctcgaggtaac CRISPR spacer actggacctactggacctacaggagct Protospacer ****************** *** . .
56. spacer 2.9|2820760|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP040338 (Bacillus luti strain FJ plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
actggacctactggacctcgaggtaac CRISPR spacer actggacctactggacctacaggagct Protospacer ****************** *** . .
57. spacer 2.9|2820760|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP040338 (Bacillus luti strain FJ plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
actggacctactggacctcgaggtaac CRISPR spacer actggacctactggacctacaggagct Protospacer ****************** *** . .
58. spacer 2.9|2820760|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP040338 (Bacillus luti strain FJ plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
actggacctactggacctcgaggtaac CRISPR spacer actggacctactggacctacaggagct Protospacer ****************** *** . .
59. spacer 2.9|2820760|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP040338 (Bacillus luti strain FJ plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
actggacctactggacctcgaggtaac CRISPR spacer actggacctactggacctacaggagct Protospacer ****************** *** . .
60. spacer 2.9|2820760|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP040338 (Bacillus luti strain FJ plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
actggacctactggacctcgaggtaac CRISPR spacer actggacctactggacctacaggagct Protospacer ****************** *** . .
61. spacer 2.9|2820760|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP040338 (Bacillus luti strain FJ plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
actggacctactggacctcgaggtaac CRISPR spacer actggacctactggacctacaggagct Protospacer ****************** *** . .
62. spacer 2.9|2820760|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP040338 (Bacillus luti strain FJ plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
actggacctactggacctcgaggtaac CRISPR spacer actggacctactggacctacaggagct Protospacer ****************** *** . .
63. spacer 2.9|2820760|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP040338 (Bacillus luti strain FJ plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
actggacctactggacctcgaggtaac CRISPR spacer actggacctactggacctacaggagct Protospacer ****************** *** . .
64. spacer 2.9|2820760|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP040338 (Bacillus luti strain FJ plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
actggacctactggacctcgaggtaac CRISPR spacer actggacctactggacctacaggagct Protospacer ****************** *** . .
65. spacer 2.9|2820760|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP040338 (Bacillus luti strain FJ plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
actggacctactggacctcgaggtaac CRISPR spacer actggacctactggacctacaggagct Protospacer ****************** *** . .
66. spacer 2.9|2820760|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP040338 (Bacillus luti strain FJ plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
actggacctactggacctcgaggtaac CRISPR spacer actggacctactggacctacaggagct Protospacer ****************** *** . .
67. spacer 2.9|2820760|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP040338 (Bacillus luti strain FJ plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
actggacctactggacctcgaggtaac CRISPR spacer actggacctactggacctacaggagct Protospacer ****************** *** . .
68. spacer 2.9|2820760|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP040338 (Bacillus luti strain FJ plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
actggacctactggacctcgaggtaac CRISPR spacer actggacctactggacctacaggagct Protospacer ****************** *** . .
69. spacer 2.9|2820760|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP040338 (Bacillus luti strain FJ plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
actggacctactggacctcgaggtaac CRISPR spacer actggacctactggacctacaggagct Protospacer ****************** *** . .
70. spacer 2.9|2820760|27|NC_018693|CRT matches to NC_011771 (Bacillus cereus AH820 plasmid pAH820_10, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
actggacctactggacctcgaggtaac CRISPR spacer actggacctactggacctacaggagct Protospacer ****************** *** . .
71. spacer 2.9|2820760|27|NC_018693|CRT matches to NC_011771 (Bacillus cereus AH820 plasmid pAH820_10, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
actggacctactggacctcgaggtaac CRISPR spacer actggacctactggacctacaggagct Protospacer ****************** *** . .
72. spacer 2.15|2821012|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP015881 (Ensifer adhaerens strain Casida A plasmid pCasidaAA, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
actgggcctactggatctcgaggtaac CRISPR spacer cctgggcctactggatctcgatctggg Protospacer ******************** *..
73. spacer 2.15|2821012|27|NC_018693|CRT matches to NZ_AP022593 (Mycolicibacterium arabiense strain JCM 18538 plasmid pJCM18538, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
actgggcctactggatctcgaggtaac CRISPR spacer cctgggcccactggatcttgaggtgct Protospacer *******.*********.*****. .
74. spacer 2.19|2821192|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP044073 (Pseudomonas oryzihabitans strain FDAARGOS_657 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
actggacctcctggacctcgaggtaac CRISPR spacer cgtcgacctcctggacctcgaggacat Protospacer * ******************* *.
75. spacer 2.22|2821345|27|NC_018693|CRT matches to MK279903 (Mycobacterium phage Zetzy, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgaggtaacacgggcgctaccggtgct CRISPR spacer aaaggtgacacgggcgctaccggcccg Protospacer .****.****************. *
76. spacer 2.22|2821345|27|NC_018693|CRT matches to MK450433 (Streptomyces phage Sebastisaurus, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgaggtaacacgggcgctaccggtgct CRISPR spacer aagggtgacacgggcgctaccggttcc Protospacer ..***.***************** *.
77. spacer 2.22|2821345|27|NC_018693|CRT matches to MN204498 (Streptomyces phage Saftant, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgaggtaacacgggcgctaccggtgct CRISPR spacer actggtgccacgggcgctaccggtgcc Protospacer ***. ******************.
78. spacer 2.24|2821435|27|NC_018693|CRT matches to NC_007974 (Cupriavidus metallidurans CH34 megaplasmid, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgaggtgccacgggcgctaccggcgcc CRISPR spacer accggcgccacgggcgcaaccggcgct Protospacer **.*********** ********.
79. spacer 2.24|2821435|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP046333 (Cupriavidus metallidurans strain FDAARGOS_675 plasmid unnamed3) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgaggtgccacgggcgctaccggcgcc CRISPR spacer accggcgccacgggcgcaaccggcgct Protospacer **.*********** ********.
80. spacer 2.24|2821435|27|NC_018693|CRT matches to KX507344 (Streptomyces phage Godpower, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgaggtgccacgggcgctaccggcgcc CRISPR spacer actggagccaccggcgctaccggcgcg Protospacer ** ***** **************
81. spacer 2.24|2821435|27|NC_018693|CRT matches to NC_021298 (Streptomyces phage Lika, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgaggtgccacgggcgctaccggcgcc CRISPR spacer actggagccaccggcgctaccggcgcg Protospacer ** ***** **************
82. spacer 2.24|2821435|27|NC_018693|CRT matches to LR798305 (uncultured Caudovirales phage genome assembly) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgaggtgccacgggcgctaccggcgcc CRISPR spacer actggtgctacaggcgctaccggcgct Protospacer *****.**.**************.
83. spacer 2.25|2821480|27|NC_018693|CRT matches to MK279903 (Mycobacterium phage Zetzy, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
ggaggtaacacgggcgctaccggtgct CRISPR spacer aaaggtgacacgggcgctaccggcccg Protospacer ..****.****************. *
84. spacer 2.25|2821480|27|NC_018693|CRT matches to MK450433 (Streptomyces phage Sebastisaurus, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
ggaggtaacacgggcgctaccggtgct CRISPR spacer aagggtgacacgggcgctaccggttcc Protospacer ...***.***************** *.
85. spacer 2.25|2821480|27|NC_018693|CRT matches to MN204498 (Streptomyces phage Saftant, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
ggaggtaacacgggcgctaccggtgct CRISPR spacer actggtgccacgggcgctaccggtgcc Protospacer . ***. ******************.
86. spacer 2.26|2821525|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP015065 (Mesorhizobium ciceri biovar biserrulae strain WSM1284 plasmid pMc1284, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgtggtgccacgggcgctaccggcgct CRISPR spacer acaggtgccacgggcgcgaccggtgcc Protospacer ************** *****.**.
87. spacer 2.26|2821525|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP043441 (Cupriavidus campinensis strain MJ1 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgtggtgccacgggcgctaccggcgct CRISPR spacer acgggtgccacaggcgcgaccggcgcc Protospacer ********.***** ********.
88. spacer 2.26|2821525|27|NC_018693|CRT matches to MK279903 (Mycobacterium phage Zetzy, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgtggtgccacgggcgctaccggcgct CRISPR spacer aaaggtgacacgggcgctaccggcccg Protospacer . **** **************** *
89. spacer 2.30|2821705|27|NC_018693|CRT matches to KX912252 (Pseudoalteromonas phage PHS3, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgaggtgactcgggcgctaccggcgct CRISPR spacer gtaggtgactttggcgctaccggcggc Protospacer ********. ************* .
90. spacer 2.31|2821750|27|NC_018693|CRT matches to MK279903 (Mycobacterium phage Zetzy, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgaggtaacacgggcgctaccggtgct CRISPR spacer aaaggtgacacgggcgctaccggcccg Protospacer .****.****************. *
91. spacer 2.31|2821750|27|NC_018693|CRT matches to MK450433 (Streptomyces phage Sebastisaurus, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgaggtaacacgggcgctaccggtgct CRISPR spacer aagggtgacacgggcgctaccggttcc Protospacer ..***.***************** *.
92. spacer 2.31|2821750|27|NC_018693|CRT matches to MN204498 (Streptomyces phage Saftant, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgaggtaacacgggcgctaccggtgct CRISPR spacer actggtgccacgggcgctaccggtgcc Protospacer ***. ******************.
93. spacer 2.32|2821795|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP021071 (Mesorhizobium sp. WSM1497 plasmid pWSM1497, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgaggtgccacgggcgctaccggtgct CRISPR spacer acgggtgctacgggcgataccggtgcc Protospacer .*****.******* *********.
94. spacer 2.32|2821795|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP015063 (Mesorhizobium ciceri strain CC1192 plasmid pMc1192, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgaggtgccacgggcgctaccggtgct CRISPR spacer acgggtgctacgggcgataccggtgcc Protospacer .*****.******* *********.
95. spacer 2.32|2821795|27|NC_018693|CRT matches to MK279903 (Mycobacterium phage Zetzy, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgaggtgccacgggcgctaccggtgct CRISPR spacer aaaggtgacacgggcgctaccggcccg Protospacer .***** ***************. *
96. spacer 2.32|2821795|27|NC_018693|CRT matches to MK450433 (Streptomyces phage Sebastisaurus, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgaggtgccacgggcgctaccggtgct CRISPR spacer aagggtgacacgggcgctaccggttcc Protospacer ..**** **************** *.
97. spacer 2.34|2821912|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP020698 (Sulfitobacter sp. D7 plasmid p4SUD7, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cctggccctcggggtaacccgggcgca CRISPR spacer ggaggcgctcggggtgacccgggcgct Protospacer *** ********.**********
98. spacer 2.38|2822083|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP010859 (Marinovum algicola DG 898 plasmid pMaD4, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
actggatctcgaggtgccacgggcgct CRISPR spacer cgccgatctcgaggtgctgcgggcgct Protospacer . *************..********
99. spacer 2.41|2822245|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP020698 (Sulfitobacter sp. D7 plasmid p4SUD7, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cctggccctcggggtaacccgggcgca CRISPR spacer ggaggcgctcggggtgacccgggcgct Protospacer *** ********.**********
100. spacer 2.44|2822380|27|NC_018693|CRT matches to JQ015307 (Pectobacterium phage phiTE, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
actgggcctcgtggtaacacgggcgct CRISPR spacer actggtcctcgtggtaacacaggtctg Protospacer ***** **************.**. .
101. spacer 2.44|2822380|27|NC_018693|CRT matches to KY514263 (Pectobacterium phage vB_PatM_CB7, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
actgggcctcgtggtaacacgggcgct CRISPR spacer actggtcctcgtggtaacacaggtctg Protospacer ***** **************.**. .
102. spacer 2.46|2822479|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP038636 (Cupriavidus oxalaticus strain X32 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
ggaggtaacacgggcgctgccggtgct CRISPR spacer tatcgcaacacgggcgctgcccgtgct Protospacer . *.*************** *****
103. spacer 2.55|2822830|27|NC_018693|CRT matches to MN694076 (Marine virus AFVG_250M1096, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
actgggccttctggacctcggggtaac CRISPR spacer attgggccttctggacctgggggaggg Protospacer *.**************** **** ..
104. spacer 2.55|2822830|27|NC_018693|CRT matches to MN694359 (Marine virus AFVG_250M1098, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
actgggccttctggacctcggggtaac CRISPR spacer attgggccttctggacctgggggaggg Protospacer *.**************** **** ..
105. spacer 2.55|2822830|27|NC_018693|CRT matches to MN694688 (Marine virus AFVG_250M1099, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
actgggccttctggacctcggggtaac CRISPR spacer attgggccttctggacctgggggaggg Protospacer *.**************** **** ..
106. spacer 2.55|2822830|27|NC_018693|CRT matches to MN694415 (Marine virus AFVG_250M1100, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
actgggccttctggacctcggggtaac CRISPR spacer attgggccttctggacctgggggaggg Protospacer *.**************** **** ..
107. spacer 2.55|2822830|27|NC_018693|CRT matches to MN694502 (Marine virus AFVG_250M1097, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
actgggccttctggacctcggggtaac CRISPR spacer attgggccttctggacctgggggaggg Protospacer *.**************** **** ..
108. spacer 2.55|2822830|27|NC_018693|CRT matches to MN062708 (Mycobacteriumphage NothingSpecial, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
actgggccttctggacctcggggtaac CRISPR spacer gctgggccttctggaccttgcggtcct Protospacer .*****************.* *** .
109. spacer 2.56|2822875|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP032531 (Bacillus megaterium NCT-2 plasmid pNCT2_3, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
actggacctacaggacctcgaggaacc CRISPR spacer caaggagctacaggacctcgaggagtc Protospacer *** *****************..*
110. spacer 2.56|2822875|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP032531 (Bacillus megaterium NCT-2 plasmid pNCT2_3, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
actggacctacaggacctcgaggaacc CRISPR spacer cgaggagctacaggacctcgaggagct Protospacer *** *****************.*.
111. spacer 2.56|2822875|27|NC_018693|CRT matches to MT497070 (Flavobacterium phage vB_Fsp_elemo2-5C, partial genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
actggacctacaggacctcgaggaacc CRISPR spacer caaggacctacaggacctcaaggacct Protospacer ****************.**** *.
112. spacer 2.57|2822920|27|NC_018693|CRT matches to NZ_AP014705 (Methylobacterium aquaticum strain MA-22A plasmid pMaq22A_1p, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
actggccctcctggccctcggggaaac CRISPR spacer gctggccctcctggccctccgggtcgg Protospacer .****************** *** .
113. spacer 2.57|2822920|27|NC_018693|CRT matches to NC_019387 (Thermus oshimai JL-2 plasmid pTHEOS01, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
actggccctcctggccctcggggaaac CRISPR spacer cctggccctcctcgccctctgggagtg Protospacer *********** ****** ****.
114. spacer 2.60|2823064|27|NC_018693|CRT matches to NC_031056 (Bacillus phage Deep Blue, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
caaggtgctcaaggtaacactggtgct CRISPR spacer atggatggtcaaggtaacactggtgca Protospacer .*.** ******************
115. spacer 2.9|2820760|27|NC_018693|CRT matches to MN693099 (Marine virus AFVG_25M184, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.741
actggacctactggacctcgaggtaac CRISPR spacer caaggacctactggacctcaaggtcct Protospacer ****************.**** .
116. spacer 2.9|2820760|27|NC_018693|CRT matches to MN693189 (Marine virus AFVG_25M326, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.741
actggacctactggacctcgaggtaac CRISPR spacer caaggacctactggacctcaaggtgct Protospacer ****************.****. .
117. spacer 2.19|2821192|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP012699 (Microbacterium sp. No. 7 plasmid B, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.741
actggacctcctggacctcgaggtaac CRISPR spacer caaggaccacctggacctcgaggtgtt Protospacer ***** ***************. .
118. spacer 2.19|2821192|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP044072 (Pseudomonas oryzihabitans strain FDAARGOS_657 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.741
actggacctcctggacctcgaggtaac CRISPR spacer cgtcgacctcctggacctcgaggacgt Protospacer * ******************* ..
119. spacer 2.46|2822479|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP013069 (Pannonibacter phragmitetus strain 31801 plasmid p.p-1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.741
ggaggtaacacgggcgctgccggtgct CRISPR spacer gagtacgacacgggcgctgccggtgcc Protospacer *.. ...*******************.
120. spacer 2.46|2822479|27|NC_018693|CRT matches to NZ_CP032313 (Pannonibacter phragmitetus BB plasmid p.BB_1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.741
ggaggtaacacgggcgctgccggtgct CRISPR spacer gagcacgacacgggcgctgccggtgcc Protospacer *.. ...*******************.
121. spacer 2.55|2822830|27|NC_018693|CRT matches to MN908690 (Microbacterium phage Hubbs, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.741
actgggccttctggacctcggggtaac CRISPR spacer ctaggaccttctggacctcggggtcct Protospacer . **.****************** .
122. spacer 2.55|2822830|27|NC_018693|CRT matches to MN096374 (Microbacterium phage Roman, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.741
actgggccttctggacctcggggtaac CRISPR spacer ctaggaccttctggacctcggggtcct Protospacer . **.****************** .
123. spacer 2.55|2822830|27|NC_018693|CRT matches to MK937596 (Microbacterium phage PhillyPhilly, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.741
actgggccttctggacctcggggtaac CRISPR spacer ctaggaccttctggacctcggggtcct Protospacer . **.****************** .
124. spacer 2.55|2822830|27|NC_018693|CRT matches to MK919474 (Microbacterium phage Lupine, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.741
actgggccttctggacctcggggtaac CRISPR spacer ctaggaccttctggacctcggggtcct Protospacer . **.****************** .
125. spacer 2.60|2823064|27|NC_018693|CRT matches to MK613348 (Roseobacter phage CRP-6, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.741
caaggtgctcaaggtaacactggtgct CRISPR spacer gttggcgctcaaggtaacactggtaac Protospacer **.******************. .
126. spacer 2.9|2820760|27|NC_018693|CRT matches to NC_015059 (Granulicella tundricola MP5ACTX9 plasmid pACIX904, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.704
actggacctactggacctcgaggtaac CRISPR spacer caatgacctactggacctcgaggccga Protospacer *******************. .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1176635 : 1224796
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_018693|1176635:1224796|DBSCAN-SWA 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54 | Clostridium_phage(18.18%) | portal,protease,terminase,coat,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1447881 : 1457517
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_018693|1447881:1457517|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_018693|1447881:1457517|1449753_1450689_+|WP_001148172.1|DBSCAN-SWA MQAKVLVNTLNMDHIQWLQARTQGIGGSDVSAIAGLNKWKSTVQVFLEKTQTIKKEDIQSEAAYFGNVLEEVVAKEFSKRTNLKVQRRNAILQHPEYPWMLANVDRLIVGEKIGLECKTASEYLKKEWEDEEVPTAYLLQCQHYMAVTGYEAWWVAVLIGGNKFVHKRIERDEELIQYLIDIEKDFWLNNVDKNEPPMFDGSDASTELLKHLYPESIADSFVSLGKQEELLIEARDQVDREIKILQELKAEYENKIKAKLGTNEAGRTENYKVYWKSYTTNRFDSKRFKAEHPDLYEQYAKESQSRKFTVK >NC_018693|1447881:1457517|1456397_1457039_+|WP_000595938.1|DBSCAN-SWA MIKRLFYYLLVFVIGSVICGLLRIMNEKLGECIGSLFISVYMLKAYYDCMNSTFFRKRLIRNKKVKYATLQEWVTGKYKGFYELENKIFEGEAKTDCLDNLRVIRRQILKLGKEKAKLFRAHLKVVDKNESYIEFSIKFITTMVMGIFLWAVKSILFKEGASYGFEEVINLITYCLLIVICISSIISNNLEYCYKSRVLLEVIDTIDDEEYLM >NC_018693|1447881:1457517|1455078_1455756_+|WP_000120344.1|DBSCAN-SWA MSYIEFKPTLKKVNLKADGKKEIVLEVSDSSLKGKLDSLSEMIDTKVLIALESMQVNFNVTINTKTNEPVTQYEVDEKGIVQEIKPSFEQLEADFDIPEEKIQTREEKEQADREIVDEFIISGLAPSFDGLPKKLPEIVKRRLEGESYLKLANELDMSSGQIIEVIDEYRKRVAPLVLKWHEWKEKQPETSQQPKVEEKDEKEDEQKVEKKSEQEPKVSDEDLEA >NC_018693|1447881:1457517|1448685_1448955_+|WP_000151195.1|DBSCAN-SWA MTIEEQIQQAVTKAIQPLVELLQHQQSQVVNQKPLLTLEEAMEVLGVGKNRMYEIVKTDGFPAFREGKRWMIITHKFYEWIERQAEKVV >NC_018693|1447881:1457517|1453413_1453602_+|WP_000334997.1|DBSCAN-SWA MCITCSNIGVIHKEIYPGMITIEGCTCEVAIQQEAIQKENWDAWLQKFEGWKRELLHGQRVG >NC_018693|1447881:1457517|1452775_1453408_+|WP_043322942.1|DBSCAN-SWA MIPEEFTDARFDSYKRETQEQKLLYSTMGKYLQSFKEIKGTKQNSLGFIATFGELRIKQLEPAKRAQAKREHNSFGLGKTHLQVAAAKYLMKQGYSVLLISDGTFMDDLIAAKMMNDDKKEFNKLLNHAKQVEVLIWDDLGKSKWSEAKENLYYQIIDFRYRHNLPILYSSNEDDETLPEKIGFAAKSRLFGMSKHYLIAVEGEDYREKE >NC_018693|1447881:1457517|1454647_1455064_+|WP_000049839.1|DBSCAN-SWA MSKYNNKKVRLDGHVFDSKAEADYYSGLKARQAAGEITSFELQPRFNLQPAFIKNGKKIVAITYSADFMVYLPNGDVEVIDIKGMVTETFAVKRKMFEYKYPHLQLILLKHVRKYGGFITLEEYNKLKREEKKLKQAK >NC_018693|1447881:1457517|1448452_1448644_+|WP_000854270.1|DBSCAN-SWA MKTLKQLRVEQGYTCKEVAEAVGITEVYYWYIENGKRRPYYDLIVKIAEFLKVKLDVIKIFCL >NC_018693|1447881:1457517|1451682_1452645_+|WP_000525984.1|DBSCAN-SWA MGNAVSEIGGLNLKGNVVDNEWFNHITFNNGKPHIVAIMVLSEIVYWYRPTVIRDEINGKITYKKKFKADKLQKNYQQLADTFGFTKLQVKRACDLLIEMILINIEFRTIHVEGKVLNNVMFVEPVASEIKKISTMYQQVNEDPGDLEVPHPLTSKSPPSLLESNDPPNLEVRTNTEITTEITTNIDDDNHHPLIDLQFKNSLEHLMKSNIPLSVVAEQELGEFCDLFGSELVKRAVDKAIDENAPRWAYIRKILMSWQKSNVKTMADVIKLDEDYKNQRGGVGNATRRGRTGRGFGTGRNYEEEIASRERNMPSFIKRV >NC_018693|1447881:1457517|1449453_1449675_+|WP_000892409.1|DBSCAN-SWA MLENPMVMQNGYGKADPQEQEGIITTTIDVEKLQDVISRAVLILQKCPEDADSEDLNGSINEALELLQKYSGQ >NC_018693|1447881:1457517|1455774_1456170_+|WP_000779203.1|DBSCAN-SWA MKLTNEERTALTYELGDIIEQKCRRCYYNRSSNESFSVNECKMCPTGEKLRQLGRYLDIQPKKNGGPRKRVPVGLTPEIVRDLNQQGISDKEISIMYDRSFTYVGKLKKQWESEGKWTGATDMREMKRQKF >NC_018693|1447881:1457517|1453776_1454091_+|WP_049820111.1|DBSCAN-SWA MSMAEFMKFVKCENEGVFDIKQMYSTEGAFKKMQNFRNLHFAYMGMRVNVAGMWGTIVGNWKTNLFVLFDGEIAKHNCHPYWEIAYYDDEGNVIRSYQKGEYAI >NC_018693|1447881:1457517|1456203_1456398_+|WP_001237530.1|DBSCAN-SWA MRLKSLGSIELINKINKLEFNDIFVIIVNDGNIKLTQLPEHGETKIITHQGKVKRVRFDEGEEF >NC_018693|1447881:1457517|1447881_1448235_-|WP_000491233.1|DBSCAN-SWA MFSHERLKSLIDKRGISQQQLANAIGVSHVSVYNYVEGKKQPGTRTLQKIANFLKVTTDFLLGLSDSPDLTADKDLQLTKEAQEILQIINELPEEKRKKALEQLEMFVNYEKAKENI >NC_018693|1447881:1457517|1449138_1449453_+|WP_187292043.1|DBSCAN-SWA MKAPVLAKDMKKKQVLDEFLKHCENKQIEALKNHDAHSLCKWIKEARLARRELATLYREKEKHETERERDRKNILKVIQRLKSQGINADVVERAHYITLSGEVS >NC_018693|1447881:1457517|1448965_1449136_+|WP_187292044.1|DBSCAN-SWA MNPALVENTFSLCMVAIAIVLFVGVVVILGTFIEKLINENERLEQENKQLRRGKRA >NC_018693|1447881:1457517|1457139_1457517_+|WP_001072807.1|DBSCAN-SWA MNQLSFFEDIDEKEMRRLVVKELKNYKALCVRMKNQEEQAQAGCVVLFPKMKGDDKNHEIRFKQIERTLQKALDKEQQQIIELKYLGNEKVKDSYVYNELMMRRDNFYENKKVAIRLIATALGII >NC_018693|1447881:1457517|1450704_1451511_+|WP_000224753.1|DBSCAN-SWA MATNQEVKNQLANRKTSASVTPEQTVEAYMKKMAPRFAEVLPKHMSMDRMSRIALTTIRTNPKLLECKVPSLMGAVMQAVQLGLEPGLLGHCYILPYKSEATFIIGYKGMIDLARRSGHIQSIYAHAVYENDEFEYELGLHPQLKHKPSFGDRGEFIGAYAVAHFKDGGHQMEFMPKGEIEKRRGRSASANSNYSPWKTDYEEMAKKTVVRYMFKYLPISIEVQSQAQHDEVVRKEITEEPEFIEADPIEVEQPTEGDGKGDVVIEGE |
18 | Bacillus_phage(54.55%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
2892911 : 3006390
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_018693|2892911:3006390|DBSCAN-SWA 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110 | Bacillus_phage(44.23%) | tRNA,portal,protease,terminase,head,coat,tail,integrase,capsid | attL 2947413:2947428|attR 3011608:3011623 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
3071449 : 3146059
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_018693|3071449:3146059|DBSCAN-SWA 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95 | Bacillus_phage(80.0%) | tRNA,portal,holin,protease,terminase,head,tail,integrase,capsid | attL 3103556:3103570|attR 3146099:3146113 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
3701133 : 3708806
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_018693|3701133:3708806|DBSCAN-SWA ATTAAGCATGAATACCCTCTCCATCCATTACATTTAAGAAATATTCTTCTAAGGAACTATGTTTCTTATTAATACTTTCAATTTCCACATCGTTCATAATAAGTGCTTTTGAAATGGCCTGCTGAGACGCTGACGTATCATACACACGAATCATGGTTCCACTCATTATTTTGTAGTTTTTTATACCAAGTTTATCTTCTAAAATATAAGCTGCACGTTTCACATCAGGAACAGTGATTTCAATGTACTCTGTTTGTTTTCCGTTAATACTCTTCATTGAAACTTCTTTTATTAGTTTTCCATTTTGAATCACACCAATTGTATCCGCCATTAGTTCCATCTCACCTAAAATATGACTAGAAACTAATAATGTAATACCGTATTCTTTGCAGAGCATTTTAAATAAGTCTCGTAACTCTTTAATACCAATTGGATCTAAACCGTTAATTGGTTCATCTAAAATGAGCAATTCTGGCTTTGTCACGATTGCCCTTGCAATACCGAGTCGTTGTTTCATCCCTAATGAAAAATCTTTTATTTTTTTATTGTCTATGCCGTGTAGTTTCACTAAATGTAAAGCATGATCAATGCCGTTTTTATCGTAATAGCCCATATATTCACAATGTAATTCTAGGTTTTCCTTCGCCGTTAATTTATCATAAAAGATTGGATATTCGATAATTGTTCCCATTCTTTTTAATACTTCATAAGATGTGTCTGTTAACTTCTCACCGAAAATTTCAATATCGCCGCTCGTCGGTTTTATTAAATTTGCAATCATTTTCATAATTGTTGTTTTACCAGCACCATTCGGTCCTAAGAAACCGTATATCTCTCCTTTTTTCACATGCATGTTAACGCTAGAAATAACTTCTTTTCCTTTAAACACTTTCGTTAACTGGTTCGTTTTTAATATATATGTCATGTCATTTTCCCCTTTCGCGCTGCTCTATATTTCTATAATAGACAACGGAAATCTCTTTTTTCTTACTCGTTCCTTACAAATTCCTTACGCTGAAAAAAAAGCTTGTAGAATTTACTTCTCTACAAGCTAAAACTTCATCTTTGTTAATACAACTGTAAAAATCGTTTTTTCATATGGCTTACTAGAAAGATGAATCTTTCCATCCATCGCTTCCACAAGCCTTTTCGTAATCGTTAATCCCAGGCCGCTTCCTTGGTACAATTTATTTCTTGAGTCTTCAAGTGTATACATACGCTCAAACACTTTATCAATATGAGATTCATCAATTCCTTTTCCTTTATCCCATACGTCTATATACACACTCGTTTCATCATCTCTTAACGTCATACCGAGTGTCTTTCCAGCCTCTCCATATGTAATTGCATTTGATATTAAATTATTTAACACTCTGCCTAATACTTCTGTATTTCCAAGTGCATATATATTTCTTTCAGGTATATCAATATGAACATGAAATCCTTTCGTCGTCACTAAATCATAAAAAGATAAAATCTTCTCGCGGCAAACTTCATTCATATTTACTTTTGTTATCTCTATTGCCTTGTCACCAGATTCTAATTTTGCTAAATCAAAGAACTTATGAATTAGTTCCATCACTTCCAGCGTTTTTATATGAACCTTTTCAAGTAATATTTTCTGTTCTTCTTCATTTATCGTTTTATCCTCATTTAACATTTCTGTATATCCAAGAATAACTGTTAGTGGTGTTTTCAAGTCATGCGAAATATTTGAAAGCATTTTTCTCATCGAAATTTCTACTTTTGCATGATCTGCATTCGTTTTCTGTTTTGCATCTAATAATTGATTAATTGCCACTAATAATTTTTGCAATTCTAGATCATCTGTCATAACGAGTAACGTCTCGCCTGTTTTTTCATTTACAATACTTTCTAATTTTTCATATGTGTATCGTAAGTTTTTGCTACTATTTTTTCTCATCTTATATTGTATGTAAATGATACATAACAATATAAAAATAATGCCCATTAACAGATTGGTCATATTACATCACTTCCAACTTATAGCCGATGCCCCATAACGTTTTAATATATTCTGGATTAGATGGATCACTTTCAATTTTCTCACGCAATCTTCTCATATGAACATTAATAACGTTATCATCACCGTAATACTCTTCATTCCAAACTAACGTATAGATTTGTGCTTTTGTAAATACACGATTTTGATTCTTTACGAACAGTTTTAAAATCTCAAATTCTTTTAAAGTAAGTTTGAGAGGGTTCCCGTTTTTTTCTACAGTAAAATTAATTGGATCGATTGTTAAATCACCAATCTGAATCATCTTTTCTGTTGTTTCCGTAGTCGAATATTTTGTAGACCTCCGAATACCCGCTTTTACACGTGCAGCTAATTCAATCATAGAAAATGGCTTACAAATGTAATCATCTGCCCCAAGTCCTAATCCAACAGCTTTATCAACATCTGTATCTTTTGCTGACATCATTAAAATTGGAACGGCACTTTTTTCTCGAATGATTCGTACAACCTCTAAGCCATCTAGCTTTGGCATCATAATGTCGAGGATAATCAAATCAAATGAACCTTTTAAATATGTATTTACTCCCTCTTCTCCATCAGACGCGATTGTAACTTGAAAGCCCTCTTTTATTAAATACTTTTCCACCATCTCTTGAATTGAGATATCATCTTCAACTAATAAAATATGATGTGACATATGTCTATCCCCTTTTTACAAACGTTAACAATTCAATTGTATCGTAACTACTACAGACTGGAAACAATTATATGAATTTTCAAACCAACTTCCCTTCCTTCCTTAACAATGATATGATGAAATTCACTACGATTGTTCATAATTAACTTTATATAAAGGAGACTTATCATGTCAGAGAATAAAAAAGTAAGCTTAGCTGATTTAATGCGCGAACAACTTGCTAAGAAAAAGCAAGGAAATGGAAATGGCCAAAATGCAAAAAGTCAAAGCCAACAAACGAAAAAATTACAAAACCAACAAACGAAAAAAACAAACAACCAACGTAGACGTACAGGTGTATAAATGAACGGACAAAAACGTTCTAATATCGCACCCGGTCTTGAAGTTGATATTGTATTAAAACAAGATCAACGAACAGGCAAATTAACACGTGGAATTGTAAAAGATATTTTAACAAACTCCCCTTCCCATCCGCATGGCATTAAAGTGCGATTGCAGGACGGGCAAGTCGGTAGAGTACAAAATATCGTTCAATAAGAAAAGGAGCTCAAGTAAACCCGAGCTCCTTTTTCTTTATTAGCCTTTAATTTTTTCGATGAAAACTACTTTTAAGTAGTCTCCCTCTTTAAATTGATCAATTGTACGAAAATCTTCTGGTAAAGAATGTTCTTCTAATATTTTGTATTTACCGTTCATTTCTTTAAATGCAGTATCGATAAAGCCTTTAAACTTTTTCATATCAAATGCGCTACAATTTGTAGAAGCAACGATAATACCGTTATTTTCTGTAATCGCGATCGTTTCTTTTAATAAGTTTTTATAATCTTTCGCTGCGCTAAATGTATACTTTTTAGAACGTGCAAAGCTTGGAGGATCTAATACAACCATATCGAACTTCATTTTTTTCTTCGCAGCATATTTAAAGTAAAGGAATACATCTTCTACAATAATATCTTGTGCTTCGTAATCAATTTCGTTGACACTAAATTGTTCAATCGTTTTACTTAAACTACGATTTGCAAGGTCCACACTCGTTGTTTTAGTCGCTCCACCAAGTGCTGCAAATACAGAGAAAGCACCTGTATAAGAGAACATATTTAACACAGTTCTTCCTTGTGCATATGTATCACGAATTTGTTTTCGAACGTTACGCTGATCTAAAAATACACCAACCATTGCTCCGTCATTTAAATAAACCGCAAAGTTCACACCATTCTCTTTTACGATAAGTGGGAACTCACCGCGCTCTCCTGCTACGAAATCATCGCCTTCAATGTATTTCCCTTTCGTATCAAAACGCTTTTTCTCATAAATACCTTTAAAGTTTGCTACTTTTTGAAGCGCCGCTATGATTTCATCTCTAAAAGTATAAATCCCTTCACTATACCAGCTCACTACGTAATAACCGTCATAATAATCGATGATTAAGCCGCCAAGACCATCACCTTCACCATTTAGGACACGGAATGCTGTCGTATCATTTGATTTGTAAAACTGTTTTCGTTTATGTAAGGCAGATTTGATTTTACTTTCAAAGAAAGATTGATTAATTTGTTCACTCTCTTTTCCCGTTAAAATCCAGCCGTATCCTTTATTTTGTTTTCCATAATAGCCTTTTCCGATAAATTGGTTCTTCTCATCTACTACTTTGATGATTGTCCCTTCTTCACGAATATCGTTTAAATTTTGAATTGCATCTTTTAAAATAAGCGGATATCCACTTTTAATTTCTTTTATAAATTTCGGTTTTATTTTTATAGTTACTTCAGATCGCATGTAATGTCTTCCTTTCCATTTGAATGCTTTCTATTAGTAGGAAGCATGTAAAAAACGAGGCCAAAAAACAGCCTCGTTTCACTATACCATATTATCGCTTTGCTAGTACAACCCGCTCAGCCTTACACCTAATCGCAATATATTTACTAACTTATGAAATAAACATCATACTTTCAAAAAAAATTTATATATTTCATTATTGCCATTGACAATGATAATGATTTTCATTATCATTTAATATATATGAGTTCTTGAAAATATAGCTACATTTATAGGAGGAATACACATGATTATTGTTACAAATACAGCTAAAATTACAAAGGGAAATGGACATAAATTAATTGAGCGTTTTAATAAAGTAGGTAAAGTTGAAACGATGCCAGGATTTTTAGGATTAGAAGTTCTTTTAACGCAAAATACAGTTGATTATGATGAAGTAACAATTAGCACTCGCTGGAATGCAAAAGAAGATTTCCAAGGTTGGACAAAGAGCTCAGCATTTAAAGATGCTCACTCACATCAAGGCGGAATGCCAGAATATAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_018693|3701133:3708806|3704389_3705589_-|WP_001255937.1|DBSCAN-SWA MRSEVTIKIKPKFIKEIKSGYPLILKDAIQNLNDIREEGTIIKVVDEKNQFIGKGYYGKQNKGYGWILTGKESEQINQSFFESKIKSALHKRKQFYKSNDTTAFRVLNGEGDGLGGLIIDYYDGYYVVSWYSEGIYTFRDEIIAALQKVANFKGIYEKKRFDTKGKYIEGDDFVAGERGEFPLIVKENGVNFAVYLNDGAMVGVFLDQRNVRKQIRDTYAQGRTVLNMFSYTGAFSVFAALGGATKTTSVDLANRSLSKTIEQFSVNEIDYEAQDIIVEDVFLYFKYAAKKKMKFDMVVLDPPSFARSKKYTFSAAKDYKNLLKETIAITENNGIIVASTNCSAFDMKKFKGFIDTAFKEMNGKYKILEEHSLPEDFRTIDQFKEGDYLKVVFIEKIKG >NC_018693|3701133:3708806|3701133_3702057_-|WP_000221075.1|DBSCAN-SWA MTYILKTNQLTKVFKGKEVISSVNMHVKKGEIYGFLGPNGAGKTTIMKMIANLIKPTSGDIEIFGEKLTDTSYEVLKRMGTIIEYPIFYDKLTAKENLELHCEYMGYYDKNGIDHALHLVKLHGIDNKKIKDFSLGMKQRLGIARAIVTKPELLILDEPINGLDPIGIKELRDLFKMLCKEYGITLLVSSHILGEMELMADTIGVIQNGKLIKEVSMKSINGKQTEYIEITVPDVKRAAYILEDKLGIKNYKIMSGTMIRVYDTSASQQAISKALIMNDVEIESINKKHSSLEEYFLNVMDGEGIHA >NC_018693|3701133:3708806|3705875_3706199_+|WP_000587821.1|DBSCAN-SWA MIIVTNTAKITKGNGHKLIERFNKVGKVETMPGFLGLEVLLTQNTVDYDEVTISTRWNAKEDFQGWTKSSAFKDAHSHQGGMPEYILDNKIAYYDVKVVRMPMAAAQ >NC_018693|3701133:3708806|3704155_3704350_+|WP_001014310.1|DBSCAN-SWA MNGQKRSNIAPGLEVDIVLKQDQRTGKLTRGIVKDILTNSPSHPHGIKVRLQDGQVGRVQNIVQ >NC_018693|3701133:3708806|3706265_3707030_-|WP_015001005.1|DBSCAN-SWA MNSKKERKKNSFFQRMLTIVFLGIFFYSMYELGGIFMDYYENRKVMAEAQHIYKRSPMEEKSEDGEVRKQFQALQKINPEIVGWITMDDTQINYPIVQAKDNDYYLFRNYKGEDMRAGSIFMDHRNDVKSQNRNTILYGHRMKDGSMFGSLKKMLDEEFFMSHRKLYYDTLFEGYDVEVFSVYTTTTDFYYIETDFENDAAYTSFLKEIQEKSLYKTDTELTANDEIVTLSTCDYALDPEAGRLVVHAKLVKRN >NC_018693|3701133:3708806|3702183_3703119_-|WP_000183219.1|DBSCAN-SWA MTNLLMGIIFILLCIIYIQYKMRKNSSKNLRYTYEKLESIVNEKTGETLLVMTDDLELQKLLVAINQLLDAKQKTNADHAKVEISMRKMLSNISHDLKTPLTVILGYTEMLNEDKTINEEEQKILLEKVHIKTLEVMELIHKFFDLAKLESGDKAIEITKVNMNEVCREKILSFYDLVTTKGFHVHIDIPERNIYALGNTEVLGRVLNNLISNAITYGEAGKTLGMTLRDDETSVYIDVWDKGKGIDESHIDKVFERMYTLEDSRNKLYQGSGLGLTITKRLVEAMDGKIHLSSKPYEKTIFTVVLTKMKF >NC_018693|3701133:3708806|3703981_3704155_+|WP_001293580.1|DBSCAN-SWA MSENKKVSLADLMREQLAKKKQGNGNGQNAKSQSQQTKKLQNQQTKKTNNQRRRTGV >NC_018693|3701133:3708806|3707062_3707833_-|WP_000403759.1|DBSCAN-SWA MEIKNVTFSYDNVTNRLKSVSSEIEIGKITTIIGPNGCGKSTLLSVMSRNHAPSSGEVILDGKAISEYKPKEFARKLAVVHQQNEAPADITVEKLISFGRMPYKNIFSPQTDEDREAIERALVCTNLQSKRDKPIYALSGGERQRVWIAMTLAQNTPMLFLDEPTTYLDIYYQIEILELVKELNEVYGLTIVMVLHDINQAIRYSDHIIVMKDGEIVTKGNPNDVITEEMVKAIYGVDVVVKQDEDTGLYMVPMGI >NC_018693|3701133:3708806|3703120_3703813_-|WP_000018038.1|DBSCAN-SWA MSHHILLVEDDISIQEMVEKYLIKEGFQVTIASDGEEGVNTYLKGSFDLIILDIMMPKLDGLEVVRIIREKSAVPILMMSAKDTDVDKAVGLGLGADDYICKPFSMIELAARVKAGIRRSTKYSTTETTEKMIQIGDLTIDPINFTVEKNGNPLKLTLKEFEILKLFVKNQNRVFTKAQIYTLVWNEEYYGDDNVINVHMRRLREKIESDPSNPEYIKTLWGIGYKLEVM >NC_018693|3701133:3708806|3707822_3708806_-|WP_001036848.1|DBSCAN-SWA MNKKTWSFLIVTALLIVMTSLSAMKGSLEVGIVELVQGIFTGGNEDVEVIKDLRFPRIIIALFTGAALAVSGVLFQAVMKNPLADAGVIGISSGASFMTLVIITLFPQFFFWTPVFAFLGGALACYLVYSFSWKSGLSPLRIILIGIAINAMFTGLNESFVTICGYFIKSIKQTTTSNITMKTWGDVEIMVTYGTIGLILALFVGAWCNLLSLQDKTAKNLGLHVTRVRLIISAIAVLLAAVSTAIAGVIAFVGLLVPHISRQLVGSDHKVLIPFSALAGALLILTADTIGRLIVPPNEIPAATIMAVIGGPFLIFLLRKSDKVHGN |
10 | Staphylococcus_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
4932251 : 4940626
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_018693|4932251:4940626|DBSCAN-SWA GATGATTAATCGTTATACACGCCCTGAAATGGGTGCTATTTGGACGGAAGAGAATAAATTTAAAGCATGGTTAGAAGTTGAGATTTTAGCTTGTGAAGCATGGGCTGAGCTTGGCGATATTCCAAAAGAAGATGTTAAAAAAATTCGTGAGCATGCATCATTTGATATTGATCGTATTTATGAAATTGAAAAAGAAACACGTCATGACGTAGTTGCTTTCACTCGTGCTGTATCAGAAACACCAACATTAGGTGAAGAACGCAAATGGGTTCATTACGGTTTAACATCTACAGACGTAGTAGATACAGCTTTATCTTACATTTTAAAACAAGCAAATGAAATCTTGTTAAAAGACTTAGAAAACTTCGTTAGCATTTTAGCTAACAAAGCGAAAGAGCATAAATACACGATTATGATGGGAAGAACGCACGGTGTTCATGCAGAGCCAACGACATTTGGTTTAAAACTTGGTCTTTGGTATGAAGAAATGAAACGTAACGTAGAGCGTTTCAAACAAGCTGCGGATACAGTTCGCGTTGGTAAATTATCTGGTGCAGTTGGTACATACGCGAACATTGATCCATTCGTAGAAAAATTTGTTTGTGAAAACTTAGGATTAGAAGCGGCACCAATTTCAACACAAACATTGCAACGTGATCGTCATGCACATTACATGTCAACACTTGCGCTAATCGCAACATCTATTGAAAAGATGGCAGTTGAGATTCGTGGTTTACAAAAGAGTGAAACACGTGAAGTTGAAGAGGCTTTCGCAAAAGGTCAAAAAGGTTCTTCTGCAATGCCACATAAACGTAATCCAATTGGATCTGAAAATATGACTGGTTTAGCTCGTGTTATCCGCGGTTATATGATGACGGCTTACGAGAATGTTCCATTATGGCATGAGCGCGACATTTCTCACTCTTCAGCAGAACGCGTAATTCTACCAGATGCTACAATCGCATTAAATTACATGTTAAATCGCTTTGGTAATATCGTTAAAAACTTAACTGTATACCCGGAGAATATGAAACGCAATATGACAAGAACATACGGCTTAATTTACTCTCAGCGCGTAATGCTTACACTAATCGACAAAGGTATGGTACGTGAAGAAGCTTATGATATCGTACAGCCTAAAGCGATGGAAGCTTGGGAAACACAAGTACAATTTAAAGAGCTTGTAGAAGCTGATGAGCGTATTACGAGCAAATTAACGCAAGAGGAAATTAACGAATGCTTCAACTATGAGCATCATATGCAACATGTTGATACAATCTTTGAACGCCTAGGATTAAACGAAGCGTAAAATTTTATATGGCACAGAATAGAGTCATTCTGTGCCATTCTTTATAAAAATATTATTCACATTTTTCAAACTACAGGGGGCTTGCGAAATGCAAAAGCTAGAATTGCTGTATGAAGGTAAGGCAAAAAGAATTTATCGTACAGAATCAGCAGATATGGTTTGGGTAGAGTACAAAGATAGTGCGACTGCTTTCAATGGGGAGAAAAAAGAGACGATTACAGGAAAAGGTCGTTTGAACAATGAGATTACAACTTTATTGTTCAGAAAGTTACAAGAAGTAGGAATAAAAACACATTTTGTTGAGAAGTTATCTGAAACAGAGCAACTTGTAAAAAAAGTGAGTATTATTCCTTTAGAAGTTGTCACAAGAAATGTAATTGCAGGAAGCCTTTCAAAGCGATTAGGAATGGAAGAGGGAACTGTACTTGCAGAACCAATCGTAGAATTTTACTTCAAAGATGATGATTTAGGTGATCCGCTTGTAACGGAAGATCATATTCGTGTATTAAATGTTGCGTCACCAGAGCAAGTAAGCGTATTACGAGATATGGCTCTACAAATCAATCAAGTATTGATTGAGCATTTCGCAAGCTGTCGTGTAAGATTAGTAGATTTTAAATTAGAGTTTGGTGTAACGGAAGAAGGAGAAATCATATTAGCGGATGAGATCTCACCAGATACTTGCCGTTTATGGGATGAAACGAGCAATGAAAAGTTTGATAAAGACGTATTCCGTCGCGATCTTGGAAATTTAACAGAAGCTTATGAAGAGATTTTAAAACGTTTAGGGGGAATTTCACATGTATAAAGTTAAGGTATATGTAACGTTAAGAGAAAGCGTATTAGATCCACAAGGAACAGCAGTAAAAGGGGCACTTCATAGTCTTTCATTTACAGAAGTACAGGATGTTCGAATCGGAAAGTACATGGAACTAACAATTGATAAATCTGTATCTGACCTTGACGCAAAGGTAAAGGAAATGTGTGAAAAATTATTAGCAAACGTTGTAATGGAAGACTTCCGTTATGAAGTTGAGGAGGTTGTCGCACAGTGAAATTTGCCGTAATAGTATTTCCGGGTTCGAACTGTGATGTCGATATGTTCCATGCAATTAAAGATGAGCTTGGTGAAGAAGTAGATTACGTTTGGCACGATAGAGAGAATTTAGATGAATATGATGCAATTTTACTACCTGGTGGATTCTCTTACGGTGACTATTTACGTTGTGGTGCTATTTCTCGCTTTGCTAACGCAATGAAAGCAGTGCAAAAAGCTGCTGAGCAAGGAAAACCAATTTTAGGAGTGTGTAATGGATTCCAGATTCTTGTTGAATCAGGATTACTACCAGGAGCACTAATAAGAAACGAAAACTTAAAATTTATGTGTCGCACTGTTCAGTTACGTGTTGAAAATAACGAAACGATGTTTACATCACAATATGAAAAAGATGAAGTAATCAATATTCCAATTGCACATGGTGAAGGGAATTACTATTGTGATGAAGTAACTCTTAAACAATTAGAAAAGAATAATCAAATCGCATTCCGTTATGTAGAAAATCCGAACGGTAGCGTTTCAGATATTGCTGGTATTGTAAATGAAAAGGGAAATGTACTTGGTATGATGCCACACCCAGAGCGTGCTGTAGATGAATTGCTTGGTGGTGCTGAAGGGTTAAAAGTCTTTCAATCTATCTTAAAACAGTGGAGGGAAACATATGTCGTTAATGCTTGAACCAAATCCAACACAAATTAAAGAAGAGCGTATATATGCGGAAATGGGGCTAACAGACGAAGAGTTTGCCATGGTTGAAAAGATTCTAGGCCGTTTGCCGAATTATACAGAAACAGGTTTATTCTCTGTAATGTGGTCTGAACATTGTAGTTATAAAAATTCAAAACCAGTTCTTCGCAAGTTCCCAACAACAGGTGAGCGTGTCCTGCAAGGCCCTGGAGAAGGCGCTGGAATTGTAGATATCGGTGATAATCAAGCGGTTGTATTTAAAATGGAAAGCCATAACCATCCTTCTGCTATTGAACCATATCAAGGAGCAGCAACAGGCGTTGGTGGTATTATCCGTGACGTATTCTCTATGGGAGCACGTCCAGTAGCTCTATTAAACTCACTTCGCTTCGGTGAACTACAATCACCACGTGTGAAATATTTATTCGAAGAAGTAGTAGCAGGAATCGCAGGATACGGTAACTGCATCGGTATTCCTACTGTTGGTGGCGAAGTACAATTCGATCCATGTTACGAAGGAAATCCACTTGTAAATGCAATGTGCGTAGGTTTAATTAACCACGAGGATATTAAAAAAGGGCAAGCACACGGTGCTGGCAATACAGTAATGTACGTAGGAGCATCAACTGGTCGTGACGGTATTCACGGTGCAACATTCGCATCTGAAGAACTATCTGAAAGCTCAGAAGCGAAACGTCCGGCAGTTCAAGTAGGAGATCCATTTATGGAGAAACTTCTTATCGAAGCATGTTTAGAACTTATTCAGTCTGATGCACTTGTTGGAATTCAAGATATGGGAGCTGCTGGTTTAACTTCATCTTCTGCAGAAATGGCAAGTAAAGCAGGTATGGGTATTGAAATGTACTTAGATGATGTACCACAGCGTGAAACGGGAATGACACCATATGAAATGATGCTATCTGAATCACAAGAGCGTATGTTAATTGTTATCAAAAAAGGTAGAGAGCAAGAAATAGTAGATTTATTTGAGAAGTATGGTCTTGCAGCAGTTACGATGGGGAAAGTAACGGAAGACAAAATGCTTCGCTTATTCCATAAAGGTGAAATGGTAGCTGAAGTACCAGCAGATGCTCTTGCAGAAGAAGCGCCAATTTATCATAAACCATCAAAAGAAGCAGCATACTTTGCTGAGTTCCAGCAGATGAAAGTGGAAACACCGCAAGTAGAAGATTATAAAGAAACGTTATTCGCTTTACTACAACAACCGACAATTGCAAGTAAAGAGTGGGTATATGATCAATATGATTATCAAGTACGCACAAGCACAGTTGTTACACCAGGTTCAGATGCAGCGGTTGTACGTGTACGCGGTACAGAAAAAGGATTAGCAATGACGACAGATTGTAACTCTCGCTATATTTACTTAGATCCAGAAACGGGCGGTAAAATTGCGGTAGCAGAGGCAGCGCGTAATATCGTATGTTCTGGTGGAGAGCCACTTGCAATTACAGATTGCTTAAACTTTGGTAACCCAGAAAAACCGGAAATCTTCTGGCAAATTGAGAAATCGGTAGATGGTATGAGTGAAGCTTGTCGCACATTACAAACGCCAGTTATTGGCGGAAACGTATCGATGTATAACGAGCGTAGTGGTGAAGCGGTATATCCAACACCGACTGTTGGGATGGTTGGTCTTGTCCATGATTTAAAACATGTAACAACACAAGAATTTAAGCAAGCTGGCGATTTAGTGTACGTAATTGGAGAGACGAAAGCTGAATTTGGTGGAAGTGAATTACAGAAAATGATCCACGGCAAAATTTTCGGCCAATCACCAAGTATCGATCTAGATGTAGAATTAAAACGCCAAAAACAAGTATTAGAAGCAATTCAAGCTGGCCTTGTTCAATCGGCACATGATGTTGCTGAAGGTGGTTTAGCAGTTGCAATTTCTGAAAGTGCAATTGGTGCTAACGGTTTAGGTGCTACTGTGAAATTAGACGGTGAAGCAACGGCGGTATTATTTGCGGAATCACAATCTCGCTTCGTTCTAACTGTAAAACGTGAAAACAAAGAAGCTTTCGAGAAAGTTGTCGAAGCAATTCAAGTTGGAGCAGTGACAGATACAAATGAGGTAACAATTCATAATGAAGAAAATGAAGTATTACTTACAGCAAATGTAGATGAAATGAGACAGGCTTGGAAAGGGGCAATCCCATGCTTGCTGAAATAAAGGGGTTAAATGAAGAATGTGGCGTCTTTGGAATTTGGGGGCATGAAAATGCGGCACAAGTTTCGTACTACGGATTGCACAGTTTGCAGCACCGTGGACAAGAGGGCGCAGGCATTGTTGTAAATAATGGGGAAAAAATCGTCGGTCACAAGGGATTAGGTTTAATATCGGAAGTGTTTTCAAGAGGTGAGCTAGAAGGATTGAACGGAAAATCAGCAATCGGACACGTACGATACGCGACGGCTGGTGGAAGTGAAGTAGCTAACGTGCAACCATTATTATTCCGTTTTTCTGATCATAGTATGGCATTAGCTCATAACGGAAATTTAATTAATGCAAAAATGCTTCGCCGCGAATTAGAGGCAGAGGGAAGTATTTTTCAAACGAGTTCAGATACAGAAGTACTTTTACATCTTATTAAGCGTAGTACGAAAGATTCTTTAATTGAAAGTGTAAAAGAGGCACTAAATAAAGTGAAAGGTGCGTTTGCATACCTTTTACTAACTGGGAATGAAATGATTGTTGCGCTAGATCCGAATGGGTTCCGTCCTCTTTCAATTGGAAAGATGGGTGATGCTTACGTTGTAGCATCAGAAACATGTGCTTTCGATGTAGTAGGTGCAACATACATTCGTGATGTAGAACCGGGTGAATTACTTATCATCAATGATGAAGGAATTCACGTAGATCGTTTTACAAATGAAGTAGATCATGCAATTTGTAGTATGGAGTACATTTACTTTGCGCGTCCGGATTCTAATATCGCTGGTATTAATGTCCACGCAGCACGTAAAAACATGGGGAAACGTTTAGCGGCAGAAGCTCCTATTGAAGCTGATGTTGTTACTGGTGTACCAGATTCTAGTATTTCAGCTGCGATCGGTTATGCTGAGGCGACAGGTATTCCATATGAGTTAGGATTAATTAAAAATCGTTACGTTGGACGTACATTTATTCAACCTTCTCAAGAACTGCGAGAGCAAGGGGTAAAGATGAAGCTTTCCGCAGTAAGAGGTGTAGTTGAGGGGAAACGAGTTGTTATGATTGACGACTCTATCGTAAGAGGAACGACAAGCAAACGAATTGTTCGTATGCTTCGTGAAGCTGGAGCGACAGAGGTTCATGTAAGAATTGCTTCACCGCCTCTAAAATATCCATGTTTCTATGGTATTGATATTCAAACGAGAAAAGAATTAATTGCAGCAAATAATACAGTAGAAGAAATCCGTGAAATGATCGGAGCGGATTCTTTAACATTTTTAAGTGAAGATGGATTAGTAGATGCAATTGGACGTCCATATGAAGGGAAATATGGCGGCCTATGTATGGCTTACTTCAATGGAGACTATCCAACAGCTCTTTATGATTATGAGCAAGAGCTTTTAGAAAGTATGAAATAAGAAAGTGAAAAAAGCTTCTACTTCTTTTGATGTAGAAGCTAGCTTCTTTCTTAAAAACGGCCGCCCTGGATGGGGAGAAATTAAAAGACGAGGTGTAAATAACGATGGCGAATGCATATAAGCAAGCAGGAGTAGATATTGAAGCTGGATATGAAGCGGTATCTCGCATGAAAAAACACGTACAAACAACAATGAGAAAAGAAGTACTAGGCGGTTTAGGCGGTTTTGGAGGTATGTTTGATCTATCAAAATTTGCATTAGAAGAACCTGTATTAGTATCTGGAACAGATGGCGTGGGAACAAAATTGATGCTCGCTTTTATGGCAGATAAACATGACACAATTGGTATTGATGCAGTAGCGATGTGTGTAAATGATATTGTTGTCCAAGGGGCAGAGCCGCTTTTCTTCCTTGATTATATTGCTTGTGGTAAAGCTGAACCTAGTAAAATTGAAAACATCGTCAAAGGTATATCAGAGGGCTGTCGCCAAGCTGGTTGTGCATTAATTGGTGGGGAAACAGCTGAAATGCCAGGAATGTATTCTACGGAAGAATACGATTTAGCTGGTTTTACAGTTGGGATTGTTGATAAAAAGAAAATTGTAACAGGTGAAAAGATTGAAGCTGGTCACGTATTAATTGGCTTAGCATCTAGCGGTATTCATAGTAATGGTTACTCTTTAGTACGAAAAGTGTTACTAGAAGATGGAGAACTATCTTTAGATCGCATTTATGGACGCTTAGAACTACCTCTTGGTGAGGAGTTATTAAAACCAACGAAAATTTATGTCAAACCTATTTTAGAACTATTGAAAAAACATGAAGTATACGGTATGGCTCATATTACAGGTGGTGGATTCATTGAAAATATTCCACGTATGTTGCCAGAAGGAATTGGTGCTGAGATTGAACTTGGATCTTGGGAAATTCAGCCGATTTTCAATTTGCTTCAAGAAGTTGGGAAACTAGAAGAGAAAGAAATGTTCAATATTTTTAACATGGGTATTGGTATGGTAGTAGCGGTAAGGGAAGAAGATGCAAAAGATATTGTTCGTCTTCTTGAAGAGCAAGGAGAAACAGCTCGTATTATTGGTCGTACTGTACAAGGGGATGGTGTTACCTTCAATGGGGGCACAGCACTATGAGTAGATTAGCAGTTTTTGCTTCTGGAAGCGGATCTAACTTTCAATCTCTCGTTAATGCGGTAGAAGAAAAGAGATTGGATGCAGATATTAGTTTATTAGTATGTGATAAACCAGAAGCACGCGTTATTGGACGGGCACATTATCATCATATCCCATGTTTCGCTTTTTCAGCGAAAGCATATGAGTCAAAAGAAGCATTTGAAAAAGAAATATTAAAGAAGCTAGAAGAGTATGAAATTGATTATGTTATTTTAGCTGGATATATGCGTTTAATTGGGCCAACTTTACTAGAAGCATATGGCGGGAAGATTATTAACATTCATCCATCACTACTACCGAGTTTCCCGGGGAAAGATGCTGTCGGTCAAGCGTTAGAAGCAGGTGTGAAAGTAACTGGAGTAACAATTCATTATGTAGATGCAGGTATGGATACAGGTCCAATTATTGCGCAAGAAGCAGTAGTTGTTTCTGAAGGTGATACGAGAGGAAGCTTACAAAAGAAAATTCAACAAGTTGAACATAAATTATACGTAAATACAGTGAATCAAATTGTTCAGTCTGTGAAAGAACCAACTGTTAACTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_018693|4932251:4940626|4937481_4938897_+|WP_000879031.1|DBSCAN-SWA MLAEIKGLNEECGVFGIWGHENAAQVSYYGLHSLQHRGQEGAGIVVNNGEKIVGHKGLGLISEVFSRGELEGLNGKSAIGHVRYATAGGSEVANVQPLLFRFSDHSMALAHNGNLINAKMLRRELEAEGSIFQTSSDTEVLLHLIKRSTKDSLIESVKEALNKVKGAFAYLLLTGNEMIVALDPNGFRPLSIGKMGDAYVVASETCAFDVVGATYIRDVEPGELLIINDEGIHVDRFTNEVDHAICSMEYIYFARPDSNIAGINVHAARKNMGKRLAAEAPIEADVVTGVPDSSISAAIGYAEATGIPYELGLIKNRYVGRTFIQPSQELREQGVKMKLSAVRGVVEGKRVVMIDDSIVRGTTSKRIVRMLREAGATEVHVRIASPPLKYPCFYGIDIQTRKELIAANNTVEEIREMIGADSLTFLSEDGLVDAIGRPYEGKYGGLCMAYFNGDYPTALYDYEQELLESMK >NC_018693|4932251:4940626|4934610_4935294_+|WP_000666770.1|DBSCAN-SWA MKFAVIVFPGSNCDVDMFHAIKDELGEEVDYVWHDRENLDEYDAILLPGGFSYGDYLRCGAISRFANAMKAVQKAAEQGKPILGVCNGFQILVESGLLPGALIRNENLKFMCRTVQLRVENNETMFTSQYEKDEVINIPIAHGEGNYYCDEVTLKQLEKNNQIAFRYVENPNGSVSDIAGIVNEKGNVLGMMPHPERAVDELLGGAEGLKVFQSILKQWRETYVVNA >NC_018693|4932251:4940626|4932251_4933559_+|WP_000610752.1|DBSCAN-SWA MINRYTRPEMGAIWTEENKFKAWLEVEILACEAWAELGDIPKEDVKKIREHASFDIDRIYEIEKETRHDVVAFTRAVSETPTLGEERKWVHYGLTSTDVVDTALSYILKQANEILLKDLENFVSILANKAKEHKYTIMMGRTHGVHAEPTTFGLKLGLWYEEMKRNVERFKQAADTVRVGKLSGAVGTYANIDPFVEKFVCENLGLEAAPISTQTLQRDRHAHYMSTLALIATSIEKMAVEIRGLQKSETREVEEAFAKGQKGSSAMPHKRNPIGSENMTGLARVIRGYMMTAYENVPLWHERDISHSSAERVILPDATIALNYMLNRFGNIVKNLTVYPENMKRNMTRTYGLIYSQRVMLTLIDKGMVREEAYDIVQPKAMEAWETQVQFKELVEADERITSKLTQEEINECFNYEHHMQHVDTIFERLGLNEA >NC_018693|4932251:4940626|4939001_4940042_+|WP_001262428.1|DBSCAN-SWA MANAYKQAGVDIEAGYEAVSRMKKHVQTTMRKEVLGGLGGFGGMFDLSKFALEEPVLVSGTDGVGTKLMLAFMADKHDTIGIDAVAMCVNDIVVQGAEPLFFLDYIACGKAEPSKIENIVKGISEGCRQAGCALIGGETAEMPGMYSTEEYDLAGFTVGIVDKKKIVTGEKIEAGHVLIGLASSGIHSNGYSLVRKVLLEDGELSLDRIYGRLELPLGEELLKPTKIYVKPILELLKKHEVYGMAHITGGGFIENIPRMLPEGIGAEIELGSWEIQPIFNLLQEVGKLEEKEMFNIFNMGIGMVVAVREEDAKDIVRLLEEQGETARIIGRTVQGDGVTFNGGTAL >NC_018693|4932251:4940626|4934359_4934614_+|WP_000278820.1|DBSCAN-SWA MYKVKVYVTLRESVLDPQGTAVKGALHSLSFTEVQDVRIGKYMELTIDKSVSDLDAKVKEMCEKLLANVVMEDFRYEVEEVVAQ >NC_018693|4932251:4940626|4940038_4940626_+|WP_000088571.1|DBSCAN-SWA MSRLAVFASGSGSNFQSLVNAVEEKRLDADISLLVCDKPEARVIGRAHYHHIPCFAFSAKAYESKEAFEKEILKKLEEYEIDYVILAGYMRLIGPTLLEAYGGKIINIHPSLLPSFPGKDAVGQALEAGVKVTGVTIHYVDAGMDTGPIIAQEAVVVSEGDTRGSLQKKIQQVEHKLYVNTVNQIVQSVKEPTVN >NC_018693|4932251:4940626|4933647_4934367_+|WP_001170546.1|DBSCAN-SWA MQKLELLYEGKAKRIYRTESADMVWVEYKDSATAFNGEKKETITGKGRLNNEITTLLFRKLQEVGIKTHFVEKLSETEQLVKKVSIIPLEVVTRNVIAGSLSKRLGMEEGTVLAEPIVEFYFKDDDLGDPLVTEDHIRVLNVASPEQVSVLRDMALQINQVLIEHFASCRVRLVDFKLEFGVTEEGEIILADEISPDTCRLWDETSNEKFDKDVFRRDLGNLTEAYEEILKRLGGISHV >NC_018693|4932251:4940626|4935277_4937497_+|WP_000055551.1|DBSCAN-SWA MSLMLEPNPTQIKEERIYAEMGLTDEEFAMVEKILGRLPNYTETGLFSVMWSEHCSYKNSKPVLRKFPTTGERVLQGPGEGAGIVDIGDNQAVVFKMESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDVFSMGARPVALLNSLRFGELQSPRVKYLFEEVVAGIAGYGNCIGIPTVGGEVQFDPCYEGNPLVNAMCVGLINHEDIKKGQAHGAGNTVMYVGASTGRDGIHGATFASEELSESSEAKRPAVQVGDPFMEKLLIEACLELIQSDALVGIQDMGAAGLTSSSAEMASKAGMGIEMYLDDVPQRETGMTPYEMMLSESQERMLIVIKKGREQEIVDLFEKYGLAAVTMGKVTEDKMLRLFHKGEMVAEVPADALAEEAPIYHKPSKEAAYFAEFQQMKVETPQVEDYKETLFALLQQPTIASKEWVYDQYDYQVRTSTVVTPGSDAAVVRVRGTEKGLAMTTDCNSRYIYLDPETGGKIAVAEAARNIVCSGGEPLAITDCLNFGNPEKPEIFWQIEKSVDGMSEACRTLQTPVIGGNVSMYNERSGEAVYPTPTVGMVGLVHDLKHVTTQEFKQAGDLVYVIGETKAEFGGSELQKMIHGKIFGQSPSIDLDVELKRQKQVLEAIQAGLVQSAHDVAEGGLAVAISESAIGANGLGATVKLDGEATAVLFAESQSRFVLTVKRENKEAFEKVVEAIQVGAVTDTNEVTIHNEENEVLLTANVDEMRQAWKGAIPCLLK |
8 | Synechococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
5098838 : 5143196
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_018693|5098838:5143196|DBSCAN-SWA 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MKKPFYKKWWFWVIVVIIVLGAYGNSNKDKEETKTASTEPKQEVKQETKKDEPKKDEAKKEEPKKELSKEGESSKVNIAVGTVETLESVGSEHINEKAQGVFKVVELTLTNNQKDAITLSSNSFKLVDNQDREFSPSSAAQIKLNVANGGNSKFLLEKLNPGLSQTGKIVFDVPKDAQGLVLKARGGMTGKEITLKLE >NC_018693|5098838:5143196|5140541_5141252_+|WP_000482991.1|DBSCAN-SWA MFNPFNKSLDLYTPDVAKEKKIVLLAVTREMYNAFRDRFDKWGNKNVVVYYGRFEELGRIDCLVSPANSFGLMDGGMDKLIIDYFGKDLENRVQQHIIDNFMGEQPVGTSFTIETNHNIIPYLAHTPTMRLPRDISSTMNVFFAMKAMLNAIGTNPNIKTIAVPALGAGTGNVSPSEVARQMEKAYEYFMLRPKKIDVQFVYERTVISEGYNGFSKHTAGGGSIISTKSNDDGKVF |
61 | Bacillus_phage(58.33%) | portal,protease,terminase,head,tail,integrase,capsid | attL 5115106:5115121|attR 5129142:5129157 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
15185 : 78176
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_018685|15185:78176|DBSCAN-SWA 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MKKENIFKWKQYQPDIIVLTVRWYLRYNLSLRDLVEMMEERGLSLVHTTIMQWVHQYGPELNERIRKHLKRTNDSWRVDETYIKIKGEKMYLYRAIDSEGNTIDFYLSSKRDAKAAKRFLKKALVSCHATGPRSITVDGDKAYPVAIRELKDEQCIPYGMPLRVKKYLNNIIEQDHRFIKKRIRNMLGLKSLHTATKMIAGIEAMYMFKKGQTLQGEKSVQKQIYLINELFGLTA |
53 | Bacillus_phage(30.77%) | integrase,transposase | attL 8505:8520|attR 77293:77308 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_018687_1 | 25312-25427 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_018687_1
|
1 spacers
spacers of NC_018687_1
>1.1|25340|60|NC_018687|CRISPRCasFinder CTTTTGTTATAGATAGATAACCAAATTTGTTATCTTTAGAACCATTCTTGTTATAGATAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018687_1
The CRISPR arrays of NC_018687_1 >merge|NC_018687|1|25312-25427|CRISPRCasFinder GTAACCAAATTTGTTATCTTTAGAACCACTTTTGTTATAGATAGATAACCAAATTTGTTATCTTTAGAACCATTCTTGTTATAGATAGGTAACCAAATTTGTTATCTTTAAAACCA >NC_018687|1|1|25312-25427|CRISPRCasFinder GTAACCAAATTTGTTATCTTTAGAACCA CTTTTGTTATAGATAGATAACCAAATTTGTTATCTTTAGAACCATTCTTGTTATAGATAG GTAACCAAATTTGTTATCTTTAAAACCA
>NC_018687.1|WP_000026502.1|23900_25112_-|replication-initiation-protein MSINQDLQIKENNIVSKSNTLIEANSRLNLVEQKMLLCLASNIEPNDRDFKTYTFPIKQFHDLLGLNGSTKYTELSKITKELLSKVIEIRAGEELIQVSWLSSAIYNRNKGTIDMRFDPLLKPFLLELSSKFTSYRLANVVKLKSTYAIRIYELLKQYEDLKERTISLENLRYYLDAMDVYPNYANFKQRVLKPSQKELNQKTDISFEFEEIKLGRKVQKIRFIIRAQKKKDSDMVHFEKKLDKFQQPNTFEQKIKRFEERCKEKVFPKVFEKWAAHKEIVLEIIEDIRFRSDIDSPIGYVEFILNSRLKELSDKQISHESIQNEDESNNTLLEIDTIIDSVITKYSTSTGTVATFLVKDTTIEELVKVVALEEAEAIWKEKETFVMDKIYEFIKKNRSKKRY >NC_018687.1|WP_043324601.1|22475_23582_-|histidine-kinase MNVHVKGNEQVIQTLNEWYFKIRARDLDAAISLKDKIDLVINEYKEEKILMLHYYLIDFRHNYLLNNLGISTDSFDIIETFDIPQDNSLTYYYHFFKAIYYNAIGNYQSSQKFYDKAESLLKYINNELEIAEFHYMLGYKFYETYKGFLALQELSKAKGIFSKYAECENNVAFCNNLLGLTYADLDEFELANKYYTLALNAFKNIKEETFILMVKQNIALMYAKQDRPDLAIQFLSEVNKKMLNNYKALFVEAREYVKLLEKDVACERIERGINICKNLGIEEYLHHFRILQALNDDVDASKLEIIILEGVEYFEKQKMTEYTKEYQEHLAHKYYEQKNYLKSCEYFELSRKTKNIFKKGDLNEETTS >NC_018687.1|WP_000417526.1|22096_22300_+|hypothetical-protein MEKYPVEFTIISPNSEVYAPDIVYITANTPDAAIKQVEKEIESRMGKYYTFKVKISIQNEEEQLSLF >NC_018687.1|WP_014990503.1|21199_21640_+|hypothetical-protein MMAKPKAIQIPLSEKMRQRCPELFVWIESQENPNEATRKVLEHFIALYGTQSVDNEEIKLGMAKDLLSAKGMLQGDIPRGLPSKSPLTYKQPEEGNVIEEVESLIVNANEDNQPRNVHIEKSKEKTQEYPVNKPIKRNIDINKWTN >NC_018687.1|WP_000671526.1|20002_21193_+|ParM/StbA-family-protein MKFNYFVEDDNGNSEKKITINGEMMKFPNTYSYVYKEPVPQDKKIEELVHGLIHNMDVTVNSSALKGQVSQRVFVGERAIRSGEDLQNLNIKSNRGKHRQDTTIMTTVSAIACRSVQDMFKDQNSIEEGTNIEAIVSMVTALPASEWTKEKAKQLSERFTNSSHHVTVTVGDLRVYVTLKFEKVIVVQEGTIALFALIEDGNGNYRNDDIFNEFKETYDMKDITGEYFQEKRLLHIDIGDGTTEYVVTKGYDYDNDHSSGERHGIGHAIERAKKDFEDEWGFSIERQEFAGYLKEEHPKYYEDAKKFLARAKFNLADEVLDTAETKLQDLKYDVEVVVVYGGGSIQLKENLFEDLKEICDSKKIKILWIDAKNATEMNVKGMTVFSSIAFQKEQVK >NC_018687.1|WP_001158047.1|19218_19782_+|DUF3967-domain-containing-protein MQERSFWTKDVAERLEIGTSTLRKWCIALEQAQYSFVKGAKNSRAFVAKDIKVLEQMKKLIQEAGMSIEGAVKVVLSVPSAEVETDNDLEDDNRTPSVLSENVMNLPKGFIEQLLQEQILLKEKIQQLERIEIMNAERLERMENRYNERDNLLLTHVREIQETKQLLVASQNKQKEKKWWEFWKKHI >NC_018687.1|WP_001020341.1|16672_17194_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MNIFSERLRKLRQERSWSMKELGEKLSEVVGSSFSSASVSNWEKKGSEPPYNILAALAQIFDVSADYLIGISDTATLNNEAPTEKIEHKQDIINNVELYLTISEHEKKQDIYAKVKELHQEILLLPDEKQERLEKELTEYLRFFGYKYDQLHIDFVNFTNYLQHELQKKVSKY >NC_018687.1|WP_000924393.1|16274_16475_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MLLIERQSKDYSLTQLGQKVNIKPQVLHAIEKGKTSVNSERAEKIAKFFNKPVEYFFIPTYYRVRE >NC_018687.1|WP_000920048.1|13844_16130_-|Cys-Gln-thioester-bond-forming-surface-protein MLKRSYQTLLIAMSMLLIVLNFVFPLTKASAEVINHEKYEMDWSFSPMYGKNLRTELLKNTNGQIAYCLTYGKLSPNGNDLPEMGRTDDIVYRVLLNGYPQKSPEELGVSNWKEAHYATQLSVWTALGQIDINEVQHRNGNVAKAAKAIIGGANASQETQDLYMNVTPTDNQEAKLNGEYFETTVYQIKSNAKNGVFTVQLANAPNGTKVVSTKGEAKQQFNLGEQFRILIPKSSQTGNFSLKVTSNLSNLQAVAYQGTDKVQDATVLLEKNEEKVSTDLQVNWKSLGGLKVVKVGEQKELLQGAVFEVMNSANQKVSTMTTNEQGSASLSGLEIGTYTLKEVKSPTGYVLNGQSQQIEVKTGEVATITVQNTKVKGNMEIKKLSDSGKTLPKVEFTVYTAEGKEITKVTTNEQGIAQVKDLPYGKYYFVETKGVEGYLLNQTKYPFEIKEQGKTLTFTVENKEVKGNVQLLKVDGENPDKKLEGAVFILQDSKGKKISEHKSDENGLIEVKDLPFGAYSFVEKQAPTGYVLTKESIPFSISEQGKTIMLTAKNKHITGELEISKVDIADGNNKLPNAEFTIFNEQGKEVAKGKTDENGIAKFKIPYGKYTYKETFAPDGYLLNEEIFSFEIKENGQIIKHTVKDQKKPTPPTPETPKPEQPEQPQKPEIPQKPEQPEAPQPQVPEQPKVTEKPVIPQLEKPQQIVMKPQLEQTPKKIETYLPTTGGKAENPYIKWIGLACVVLGLIGAVFAVRNRKKAQS >NC_018687.1|WP_001289503.1|13242_13701_-|hypothetical-protein MSEIHIGKMKNLGKPWEGVMRPKSAWLPEELMQAISIAQTVIKPLKQHDYWIESATKLLAGSILYLDQRHKNLYYLDVKKVIEFTEKMYESETKLIEVVNSLENEHPAYHIFHELGLYSKETRDAITITLLYILEKHQREKQGEQKEYFWFQ >NC_018687.1|WP_001273108.1|26027_29276_+|hypothetical-protein MSAIKIEDIYQEVLDGKRKQFPPYTWSEDINRNLVKRVIKYLVEIVLNWDDNMLKEGWNKKLIKKYKLDGAVCMIYRGSPYAMLNDAYPDRFKEWEFKMAPLNFWTKEKGLEALKWTIETKEKLTDEQLLQVYGTKWLTRHKIISPCAKFFNHSPYIMLNALYPGKFREWEMKHTPSNFWTKENALEALRWTIEEKEKLTEEQLFEVYNIKWLKQHNLAPACQIHWRNSPYSMLNALYPNRFKEWMFKVTPSNFWTKKKGLEALRWTIEEKEKLTNKELLCVYNQPWLNTHKLNTHKLNTPMKRYWNGSPYAFLNALYPGMFKEWDMKMAPVNFWTKGKGLEALKWTIEEKEKLTDEKLLRVYGTKWLQEHKLSTPCNKYWNASPYAMLNELYPGRFKEWELENVPTNFWTKEKSIEVIKWNIESKEKLIKENLIQIMNTEWLKMHRLITPFNKYWNGNIYAMLNELYPGDFKKWEMKKVSNNYWTKEITLKVIREKLQEKGNVSNEEFLQEYNMEWIKRNGLTTPLAMYWSNNPYNLLHDAYPARFTHEVIKAYKRIQQLRSIVPQDVELSHRSSNSVLTIEEIYQEVLNGKRDGFPYYVWSEGDKKLLARRVTKYLIEVILNWDTEEIKKGWSGKVIKKYKLNGMVTLVYNGSPYAMLNDLYPNRFKEWELSYTPSNFWTKETAIEALRWTIEEKEQLTGEQLLKVYSDKWLQEKRILTPCCKYWNCSPYAMLNELYPNRFKQWELKNVPTNFWTKEKALEALRWTIEEKERLIDEQLKKIYNIAWMKKQRLITPLMTYWNLSPYMMLNELYPGRFKEWEFSVVPRNFWTKEKGLEALRWTIEEKEKLTDGQLLQTFSNQWLVKHRLVTPLNKHWNNAYEMLNDLYPNRFKEWELQKVSKNFWTKEKGLEALRWTIEEKEKLTDEQLLRVYDITWMKKHGISMPVYEYWSNNPYLMLHDLYPNKFSKEVMKTYVSMRKWFKEFFETEGYSKMLNLVWENSYIHGDTFVFTHVKREEVIQFFYQIKGASSIESRYNELKGREEWYCTLSKWHPLVLKLKELGWKDTEDSINNLQNKCTPVN >NC_018687.1|WP_000451649.1|29467_29632_-|hypothetical-protein MEVFLEFLKEMIKAVIREITAHLFKKKFLDQRKTTLSSRRPKQKKKGGFRKYKR >NC_018687.1|WP_001129777.1|29790_30573_+|hypothetical-protein MAKSDIELSKQVKKHKLIDLTFNFEEANHYLQSVVQTKKLYQLLLLILISFILIYTPLWNFLYTNLFGETSKYVKAMLQSCFYTIPIAIPFFWIFRFDIQKIFKKFTLHQYKKTWWIALYIIFIIMFVALTVSTITSFEFATNQGFVGERKLILFRIFVLFIQLFGENLIFISLLLGCYKLLQYVTSHERTIIIISFLLASIIFGIFHLPTYNFNLIQCIFFIGIPALPHLIVFVKYQNAHMGYWVHLNYDLMLLVLVLL >NC_018687.1|WP_001017153.1|30725_31022_+|hypothetical-protein MNHYQMLYSTPYLYPSQMLKQMYNETNKEENVCAIRDHMLRYDVYLDRQYKFYYYLSQKIEEDLYGDEQAVSWNELLDEYQLFKDGKGNLSIKPKGWG >NC_018687.1|WP_000152452.1|31023_31209_+|hypothetical-protein MTIIGELGIVYGVTGASVLGIKFLKKKGFYLPGWLLRAGLKCLLIGTVWYVLMDILDVFLR >NC_018687.1|WP_187292049.1|33171_35178_+|pesticidal-protein MIQRIYLVLLTEILTILDTLLQIIRINHYKNWINMCQKNQQYGENLETFASADTIAGVSAGVIVVGTMLGAFAAPITAGLIISFGTLLPIFWKPGEDPKTVWQAFLKIGNRPFSSPVDQALIDLLSNKARSLESQFNDFQRYFDIWNNNKTPGNAGEVLRRFSSLDADIIRELEQLKGNYYITVLPGYAQVANWHLNLLRIAAFYYDQWASSSNLSIQSIYPEDYINDLQTCLTNCAIESGNKISSKYYKCVLKCRINEYINYCSKTYQEGLNILKNSSGLKWNEYNTYRREMTLNVLDLIAVFPNYDPDKYLISTKSQLTREIYTDALIDAFANAHFNINDIENSLTRPPGLVTWINRLDFYTGMFTKSVPGLTANGINYSFTNGNSNDSPIYGYRLSDDSSTPIQIPRNQYVYNMLITYLRDSPSVIQKIEFNLNNQQTRTYDTGLTLAPTYQSTINLSLPGKDRSFPPKFNNYTHFLSYVKTAPGDERPSSSRARNVCFGWMHFSVNDYDVLAGGYNTISNKIITQIPAVKARHLPLPSFVMPGPGHTGGNLVVLSTQIEFQCIVLNPVSYKIRMRYVAYSPNRSINLTVSIRSEIGNYQNIVPNISSTVQSPEDTKNPKYEHFQYLDISIPLELFGITNITITRSDSISNNTLIIDKIEFTPDV >NC_018687.1|WP_001040601.1|35980_36313_+|hypothetical-protein MAKEKKNSKQQQSDQPACTPNISAEVCVEADITIIPTVEAGTPVVHCVGVPSLETCADMGFTPSATGNCKFTISQVLCISIPISFGAETIAVPGTVACGHACNGPNCSTT >NC_018687.1|WP_000371951.1|36982_37243_+|hypothetical-protein MDQFRDKLMLGAIPIHQIDKNGIPLRQFDEVQYMGEQYIIIWHPMYGEFVASHCTGEFLPFNVLDKVEYTKNLKNYYSTKKKSFNI >NC_018687.1|WP_000410158.1|37643_38351_-|IS6-family-transposase MEKENLFKWKHYQPDIILLTVRWYLRYNLSFRDLVEMMEERGLSLSHTTIMRWVHQYGPELNERIPKHLKQTNDSWRVDETYIKIKGEKMYLYRAVDSKGSTLDFYLSNKRDAKAAKRFLKKTLASYHVTKPRVITVDGDKAYPVAIRELKNEKSIPHGMPLRVKKYLNNLIEQDHRFIKKRIWTMLGLKSLRTATKMIAGIEAMHMVKKGQLKLREQSVKNQNIFIQHLFGLNV >NC_018687.1|WP_000945858.1|39588_40191_+|replication-relaxation-family-protein MLRPRDKKIIQALQLFRCMSRDQIVKLFFSDVKNPITSANFVLKRLRREKHIDAYVDKQPYIYFPQPSIIKKNSQKIKHYLAIVDFYIDVCKHEYPTIFEVEKRYGSGYVQPDIFMVWQGRIFFVEIQLSRYSSELMKEKLNRYVNYFKSELWYRKKIEFNLNNLPFVWIISKNPYVIKDAKLQIIQTSNADKIFSNSSI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_018687_2 | 73038-73142 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_018687_2
|
1 spacers
spacers of NC_018687_2
>2.1|73067|47|NC_018687|CRISPRCasFinder CGTAGTTGGAACAATAACGTCCCTTGTTTGATGATGTGATATCCTTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018687_2
The CRISPR arrays of NC_018687_2 >merge|NC_018687|2|73038-73142|CRISPRCasFinder ATTCCGTTACGATCAACGTAATTACTATGCGTAGTTGGAACAATAACGTCCCTTGTTTGATGATGTGATATCCTTGATTCCGTTACGATCAACGTAATTACTATG >NC_018687|2|2|73038-73142|CRISPRCasFinder ATTCCGTTACGATCAACGTAATTACTATG CGTAGTTGGAACAATAACGTCCCTTGTTTGATGATGTGATATCCTTG ATTCCGTTACGATCAACGTAATTACTATG
>NC_018687.1|WP_014990527.1|71638_73030_-|phosphatidylinositol-specific-phospholipase-C-domain-containing-protein MDRSGFNVNRTVDYINTNWMANIPDSRRIGELSIPGTHGSMALHGGVAGAIGHIAINQTMDLTTQLNSGIRYIDIRCRHYHNNFAIHHGQIYQHAFFGPGVLEPVIRFLRQNPSETILMRIKEEYNPRGNTRTFSETFESFWNANQRYFWNLTSLNPTLGEVRGRIIVLQDFPGFNRNFGIGWGQLDIQDRWDVAGPNDIYNKWIAIRNHFHRIRNTGHLSINHLSGTGGFRLGGPTPWFLACGYRSRNNNSLLDVASSRPVLTGWLDFPRDRPTIGAVYWGGMNVLAAKRILDHRFTHTGIVAADFPGRGLIEGTIALNFPDIFMGSHQIASLFGHGTDVFDLNVGNSRVILYNNHFGNNQRWRFEFDRTWQVYRIFSVSHPNLLLTGSDNPSVGGPHYAFAASERPNWISQRWIVERGARGFKLRSMVNRNYVLTIRGSNLMVEPDTPFFIGNEEFTIRPI >NC_018687.1|WP_000536091.1|69936_70278_+|hypothetical-protein MGSYFYDNYEHGEKHDYFYDYDERRNYFYDYGERRKKESNRRDDYSFYSSICNIFKILKSGDDVDTLIINGKSHSVDAFVSFDEQTGIVTFVKDNGAVFIVGHDKVDAIIIDN >NC_018687.1|WP_000702449.1|68335_69244_-|UTP--glucose-1-phosphate-uridylyltransferase-GalU MKIRRAIIPAAGLGTRFLPATKAQAKEMLPIVDKPTIQYIVEEAVASGIEEIIIIIGRGKRSIEDHFDKSYELEDALLKKEKLDVLKEVQQISSLATIYYVRQKEPKGLGHAILCAQSFIGNEPFAVLLGDDIVMSETPCLKQIIDVFEYCNSSIVAVQSVPEKDISKYGIIKPKGTMIQPNLFSVACLVEKPKKEMAPSRYAIMGRYVLRPEIFKILTKLSVDQANNELQLTDAINELNKEQAVLAYNFEGNRYDIGDKVGFIKATIDFALHRDDIRNEVLAYLKDINAQDKFQITNEKFE >NC_018687.1|WP_000703245.1|67023_68334_-|UDP-glucose/GDP-mannose-dehydrogenase-family-protein MKISILGTGYVGLSTGVCLSEIGHSVICIDTDEQKIKSLNQGISPIYEPGLETLLTQNAAAGRLLFTTSHQEALNGAEIIIIAVGTPQMEDGRANLSYLEQAAKDIAVNLVKNAVIVIKSTVPVGTNEIIKKIMEDICNENVTLEIVSNPEFLRQGSAIMDTLKPDRIIIGSENEEVAKKIQEMYLPLNAPFLLTSIKSAEMIKYASNAYLATKISFINEIANLCEVIGSDVKDVVKGMGKDKRIGEAFLQPGIGYGGSCFPKDVKALLHTAKLHGIPFSLLKETVSINESQQELLVTKAINRLKDLKGKKITMLGLAFKPETDDMREAPSIKIAHSLVKLGAEVVAYDPAAIDNAKNILGDTIKFATSVFEATVHADAIFIVTEWNEFRCLELKELIKIMRQPIVFDGRNCFEEKQIRACDKIEYYPIGRPAIFI >NC_018687.1|WP_148283634.1|64145_65585_-|phosphatidylinositol-specific-phospholipase-C-domain-containing-protein MDRSGFNVNQSVQYTNRDWMNYIPDSRRVSELSIPGTHDSMALYGPGEPIPIPIGDDATITQTMNLDIQLNSGIRYIDIRCRHYYDSLQIHHGPVYQHASFNDVLVSMKSFLTHNPREIILMRVKEEIEKLTPPVGNTRSFGETFKSYLRGNEQYFWDFLKSQNPYNPTLGEARGKIILLQDFEANTFLGIPWYSLRPTIQDEFELGGRDQIYAKWEKVREHFFNAMQNTGQIYLNHLSATGKPSNLWDPVPWFVASGYGGPQNTNLPRQLSGPSSQWPDNPRSPTSGFVYYGGTNVLSTRRIRERTFTHTGIVIADFPGKGLIDGTIALNFPGTLSGDFQIVTALNNSSVVDLNVGSKNVTLWENNKENHQRWNFTYNRSENAYVIHSVHNPELALAWDTSSPNRNVFATSIDSLRQNEYYWILEQIGNYIYIFKNKKDINMVLTVTGGEIQPGTNLQVYPRTVGNAQPAQTFVLKFI >NC_018687.1|WP_000254349.1|59153_59966_+|hypothetical-protein MVSMMVRIVIVRIAGIMVSMMVGIVIVRIAGIMVSMMVGIVIVRIAGIMVSMMVGIVIVRIAGIMVSMMVGIVIVRIAGIMVSMMVGIVIVRIAGIMVSMMVGIVIVRIAGIMVSMMVGIVIVRIAGIMVSMMVGIVIVRIAGIMVSMMVGIVIVRIAGIMVSMMVGIVIVRIAGIMVSMMVGIVIVRIAGIMVSMMVGIVIVRIAGIMVSMMVGIVIVRIAGIMVSMMVGIVIVRIAGIMVSMMVGIVIVRIAGIMVSMMVGIVIVRIA >NC_018687.1|WP_000254348.1|58193_59150_+|hypothetical-protein MVSMMVRIVIVRIAGIMVNMMVGIVIVRIAGIMVSMMVGIVIVRIAGIMVSMMVGIVIVRIAGIMVSMMVGIVIVRIAGIMVSMMVGIVIVRIAGIMVSMMVGIVIVRIAGIMVSMMVGIVIVRIAGIMVSMMVGIVIVRIAGIMVSMMVGIVIVRIAGIMVSMMVGIVIVRIAGIMVSMMVGIVIVRIAGIMVSMMVGIVIVRIAGIMVSMMVGIVIVRIAGIMVSMMVGIVIVRIAGIMVSMMVGIVIVRIAGIMVSMMVGIVIVRIAGIMVSMMVGIVIVRIAGIMVSMMVGIVIVRIAGIMVSMMVGIVIVRIA >NC_018687.1|WP_000197242.1|56473_56740_-|hypothetical-protein MTRKRFFDLCEGDRIKVYSAGRFEGEGIFIRFTEEKCEDFIYWIKRNGNDCYTSLDAINIEKIRYGYSYRDEQHHHHGDHKGEHRYDD >NC_018687.1|WP_000368918.1|55201_55756_+|hypothetical-protein MDNKHQNHIQSESQDNPLATNFESNIQHSNVKEKNHRLPFSIVLNIPNGFQIQKEKNPKVMYDLNHLSMIKETCKKSIDVDNCGYVEVDLHALKIKGCLSFLLNLYIEPIHDGKFYEKNSKDGSIALSYKETLHVDHVVKYSVGQLPYYVIDDEHVQIRHLEIQVFDENCNIVKISGEFYFEYE >NC_018687.1|WP_000197243.1|54002_54275_-|hypothetical-protein MTRKRFFDLCEGDRIKVYSAGRFEGEGIFIRFTEEKCEDFIYWIKRNGNDCYTSLDVINIEKIRYGYSHHDEQHHHDEDRKGEYRHDDSC >NC_018687.1|WP_000495154.1|74227_75880_-|hypothetical-protein MFTSGAKNRLKIETTDHEIDQAAISIECMSDEQDLQEKMMLWDEVKLAKQLSQSRNLLYNGNFEDSSNGWKTSNNITIQLGNLIFKGKYLNMPGARDIYGTIFPTYVYQKIEESKLKSYTRYRVRGFVGSSKDLKLMVTRYGKEIDASMDVPNGLAYMQPNLSCGDYRCDSSSPSMMSQGYPTPYTDGYASDMYACPSNFGKKHVKCHDRHPFDFHIDTGELDINTNLGICILFKISNPDGYATLGNLEVIEEGPLTGEALAHVKQKEKKWNQQMEKKRSETQQVYDPAKQAVDALFTNAQGEELHYHITLDHIQNANQLVQSIPYVHHAWLPDAPGMNYDVYQGLNARIMQAYNLYDARNVITNGDFAQGLTGWHATGKAAVQQMDGASVLVLSNWSAGVSQNLHAQDHHGYVLRVIAKKEGPGKGYVTMMDCNGNLETLKFTSCEEGYMTKTVEVFPESDRVRIEIGETEGTFYIDSIELLCMQGYASNNNPQTGNMYEQSYNQNTSDVYHQGYTNNYNQDSSSMYNQNYTNNDDQHSGCTCNQEYNC >NC_018687.1|WP_000806152.1|75993_78057_-|hypothetical-protein MKPYQNENEYEILDTLPKYSNIVNVYSRYPLANNPQVPLQNTSYKDWLNMCQTITPLCTPIDIDSKLVATAIGILGAIFKAMPGPGSAVGLFLKTFSTIIPILWPNDNTPIWKEFTKQGLQLFRPELGRDAIEIIGNDVQSGFNALKDHMNDFETKFEIWDKDRTQTNATYLITAFGVVNGKIIDLKNQFLINPANQPAFLNLYAQTANIDLILYQRGAVYGDDWAKAINDSSISPFNSSQIFYDSLKAKIKEYTNYCAETYRNSLTILKNQPNIQWDIYNRYRREATLGALDLVALFPNYDICKYPISTKTELTRKVYMPSFYLQALQHSNIETLENQLTHPPSLFTWLNELNLYTIRENFNPALQVSSLSGLQAKYRYTQNSTILPNPPAQGITNGTPIPIIGLNNLFIYKLSMSQYRHPNDCVPIAGISDMTFYKSDYNGNASATQTYQAGRNSNNVIDTFMNGPQNASSSNNISINQTNHILSDIKMNYARSGGVYDFGYSFAWTHTSVDPDNLIVPNRITQIPAVKANYLSSPARVIAGPGHTGGDLVALLNGGTQAGKMQIQCKTGSFTGASRRYGIRMRYAANNAFTVSLSYTLQGGNTIGTTFITERTFSRPNNIIPTDLKYEEFKYKEYNQIITMTSPQNTIVTIAIQQLNPIPNDQLIIDRIEFYPVDQGVFACPVN >NC_018687.1|WP_080595736.1|78224_78554_-|DDE-type-integrase/transposase/recombinase MNQNQRRENVLYLAIVSEGNTIDFYWSSRQNTKAAKYFLKKSLASYHAAKPRVITVESDKPHPVTIMELKNAKRIHSMPLRVKKYLNNIIEQDHRFIKKRSQNMLGLTT >NC_018687.1|WP_000667332.1|78994_80155_-|site-specific-integrase MKFELHTIHSDTSLDNIEKQKQNFTNIIALWNHDYINEAELKKENNEREDSYTYEGFSDEEILYYYLNRQTHFDQEKRIKDASRTLYARDLSQFYFFIKQSTEFLQQDVKDYVVGQVWRNLRKRHIRNYQKWLSQEAISYQSKVKYKTSTISRKLGVIRSYLKWLYEIQYIQEPLHVEILSTTVNKHHKPKRELSYEEVKQLLHYYKDNEINYALLSVLATTGLRVAEVAHAKWEDLEYDAIRGRYYLIVDTKGDNERIVSINKEIFNRIVAFRIRRRLPVDIGNKNGETIFQTKNHTAYKENYLSQYISKIIKDTKLPFTENIRITPHFFRHFYVQYLYDYKGLAPHVIAAAVGHKNDRTTKDNYLKQRLTKDNDAGNLITEDEF >NC_018687.1|WP_000360259.1|80510_81494_+|hypothetical-protein MDKNQQIIMNTTEVKEYLGVSHFVVNNLMKKGKLVPINKDTWRLDGSFLFESEDVKVIKKERETEGLTLYQASKKYNVSTYQLEKWLEDGELTATIHEHRNREMKFIKEEELRQISHRFDQVNALYTYSQKYNTVLYHRYIKGNTIARVISIPKRGDIMLIDEFGSEFTLKEAEKLGFIPAYDLSDKPRSHHRRFVRFRIPKSDQLRSSSFQLIDLILHYVSPRNLKVLEEEGFWYFDIRQSLIELPMGMQLEWIESLTPYLIEGKLVKRVNNSVYLDSSSVTRPVTMSSKEYQSINNIVGKTNSTIEEFIASAIREKIHNYQGSHN >NC_018687.1|WP_148283635.1|82899_84312_+|phosphatidylinositol-specific-phospholipase-C-domain-containing-protein MDRSGFNVNRTVNYTNRHWMGRIPDSRRISELSIPGTHGSMALHGGVAGTIGDIAINQTMNLETQLNSGIRYIDIRCRHYHNNFAIHHGRIYQHAFFGSHVLEPVISFLRRNPSETILMRIKEEYNPTGNTRTFSETFESFWTPNQRYFWTPTGSNPTLGEVRGRIIVLQDFPSWHRIFGIHWGQLNIQDRWNVAGDLDIYNKWIAVRNHFSIAMNNRTRISVNHLSGTGGSGSPRPWFLACGYMQRSNNAPLARLGSPIFPFPLDQFPDFPRSSATSGPVFFGGMNVLATRRIRERRFNHTGIVAADFPGIGLIEGTIALNFPGIIAGNHQIVTALNNSSVLDLNRGDQVTLWSNNQGNHQRWTFEYIFELQAYRIASVSNPNLVLTVDTPVRAASRVYASPNYGQRGQFWIMERGIWGYKLRSFGDPNLMLIVAGPTSADGANLVVYREHGGGNELVNRSQEFTFRPI >NC_018687.1|WP_014990534.1|86091_87615_-|hypothetical-protein MFTSGAKNMLKIETTDHEIDETAISIKTMLEEEHSQEKMMLWDEVKHAKYLSQSRNLLQNGDFEDLFNGWTTSNNMSIQNDNSTFKGQYLNMSGARDIDGTLFPTYIYQKIDESKLKPYTRYQIRGFVGSSKELKLMVIRYGKEIDTIMNVPNDIPHVSSMSSCNELYNSGQSLYQNKNVGYYNPMPEYTSNTYQHIPDQKQVICRDSHQFKFHIDTGEVDYNTNLGMLILFKISSPDGYATLDNLEGIEEGPLTDEALTHVKQKEKKWNQQMEKKRMETQQVYDPAKQAVDALFIHAQGEELQYNTTLDHIKNADQLAQSIPYVHHAWLPDVPGMNYDLYTDLNARIMHARYLYDARNVITNGNFTQGLQGWHATGHVDVQQMDGASVLVLSNWSTGVSQNLHAQDHHRYMLRVIAKKEGPGKGYVTMMDCNGKQETLTFTSCEEGYMTKTVKVFPESDRVRIEIGETEGSFYIESIELICMNGYTSNNNQNMSNMYDQSYDSNYS >NC_018687.1|WP_000730235.1|91273_92200_-|ETX/MTX2-family-pore-forming-toxin MKKKRMLLKWVCGLTIGIGSLTGGSLNTFADEVSDSLADVGFLYGDYLYKTKQHPQGTLPITYPMREINNYQIIDKSISQVGSTEYEEGQTLYVDDDVFDNKTDTDQTFKTIQFEKEFSETATSSTTHSVGTSLEESVKFDFFVGEGSAKFTVNYNFSKTGSLSTSNKIKYTLPSQSINVPANKKYEVICVLETKKAKANVQFNVDVLGNAKYVYSNNSPYTPKYENGATMVKTLNEKNPTPSVSWLGKEWEKWEYHDGKARYKNGSGTVSAEYGTRMVLVINDITNNKTRGSKEIARIPVTPIQKQM >NC_018687.1|WP_001055929.1|92634_94068_-|IS4-family-transposase MNMHQKQELSLFAEELYRYMSPATLNQLAIKAGGMKRKRKCHGHHFLSLCVWLNQQIATTSLTQLCSQLETSTGILLSPEGLNRRFNSDSVAFFRTVFTTLLQAKIGGVSKISHSLSSYFERILVLDSTTFQVPDRFATTYPGAGGCSHTAGVKIQLEYDLLSGKFSDVEIEPGKRSDQAYSATRTGMAQKNELYIRDLGYFRLQDFKSIQDKQGYYLSRLKLPTKIYRKEFETVVFKTKPAQLKPVYIQIHLEDIMKQLQPGQVYELHDVYVGSKDKLPTRIVVYRCTEEQKQKRLRDRAIREKKKGITYTERTKLLQGITVYMTNIPTEWVPKEKIYDLYSLRWQIELLFKIWKSWFQIHRCKSIKQERLECHLYGQLISILLCSSTMFKMRELLLRKKQKELSEYKAMYIIKDYFLLFYQALHKNTQELSKVLLRLFNLLQHNGRKSHRYEKKTVFDILGVVYEYTTSTHQVAQ >NC_018687.1|WP_001243455.1|95832_96876_-|Fic-family-protein MRNFFEDKYLDIELQRELIKLISEISEYKGKISAYQERNPDIFNNLEKTIPLHYIKNFNRVFLGIKVPNKRLKELILNGMLPKTTEEDAIFCYYQTLSLVQKKFYDLPTNPETIQELHFQLIHYITSDSAIWREKEFIVPVVPEYGMHSSSYRPLSRKLIPKSVEQLCEQYNILEANKELHSLILIARFMLNFYCILPFNQGNRRLAFILMQFLLMKNEYTFIKYICLDKYITKHESKYYESIFKSSVNWYCSGHNISFWLKIFLTIILDAYRDLHLIVQGSTCRYTKIERIKNYILKQKKPFTKEDIRGVYPDIAESTISKALASFQSLGHIKLVSRGRSAQWKRI |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_018687_1 | 1.1|25340|60|NC_018687|CRISPRCasFinder | 25340-25399 | 60 | NC_018687 | Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC189, complete sequence | 25340-25399 | 0 | 1.0 |
NC_018687_2 | 2.1|73067|47|NC_018687|CRISPRCasFinder | 73067-73113 | 47 | NC_018687 | Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC189, complete sequence | 73067-73113 | 0 | 1.0 |
NC_018687_1 | 1.1|25340|60|NC_018687|CRISPRCasFinder | 25340-25399 | 60 | NZ_CP043834 | Bacillus sp. BS98 plasmid unnamed4 | 11976-12035 | 5 | 0.917 |
NC_018687_1 | 1.1|25340|60|NC_018687|CRISPRCasFinder | 25340-25399 | 60 | NZ_CP043834 | Bacillus sp. BS98 plasmid unnamed4 | 12062-12121 | 5 | 0.917 |
NC_018687_1 | 1.1|25340|60|NC_018687|CRISPRCasFinder | 25340-25399 | 60 | NZ_CP020436 | Bacillus sp. FDAARGOS_235 plasmid 2, complete sequence | 25314-25373 | 5 | 0.917 |
NC_018687_1 | 1.1|25340|60|NC_018687|CRISPRCasFinder | 25340-25399 | 60 | NZ_CP020436 | Bacillus sp. FDAARGOS_235 plasmid 2, complete sequence | 25400-25459 | 5 | 0.917 |
NC_018687_2 | 2.1|73067|47|NC_018687|CRISPRCasFinder | 73067-73113 | 47 | NC_018687 | Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC189, complete sequence | 82817-82863 | 7 | 0.851 |
NC_018687_1 | 1.1|25340|60|NC_018687|CRISPRCasFinder | 25340-25399 | 60 | NZ_CP043834 | Bacillus sp. BS98 plasmid unnamed4 | 12018-12077 | 9 | 0.85 |
NC_018687_1 | 1.1|25340|60|NC_018687|CRISPRCasFinder | 25340-25399 | 60 | NZ_CP020436 | Bacillus sp. FDAARGOS_235 plasmid 2, complete sequence | 25356-25415 | 9 | 0.85 |
NC_018687_1 | 1.1|25340|60|NC_018687|CRISPRCasFinder | 25340-25399 | 60 | NC_018687 | Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC189, complete sequence | 25296-25355 | 13 | 0.783 |
1. spacer 1.1|25340|60|NC_018687|CRISPRCasFinder matches to NC_018687 (Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC189, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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DBSCAN-SWA_1 |
78224 : 163995
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_018687|78224:163995|DBSCAN-SWA 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55 | Streptococcus_phage(25.0%) | integrase,tRNA,transposase | attL 73657:73676|attR 120779:120798 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
34879 : 54484
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_018694|34879:54484|DBSCAN-SWA ATTAAAGTACGTCTTTGTTATTACGTAACATTTCGACATACAAAGATAGTTGTTTAGCAAAACGTCCTTGCTGACGACCATCTAAGTCATTGTAGGCTCTTTGGACATCGCTTAGTAGTAAATCAAGTAAAGGGTCGTTTTGTTCGTTCTCAAAGCCAAGGAGGGTATCTGTTGAAACTCCAAAAATGGAACATAAACATTTTAAACTTTCTACATCTGGCTGATGCCGATCTGTTTCCCAATGTTTAATTTGACCTTTGCTAAATCCATATTTCTCGGCAAATTCATCTTGTGTTAAACTTAATTTTTTTCTAAAAGATTTAATCTGTTTCCCAATGGTATTCATATTTTGAGTATAGTAATTTCAGCGTTTGTATACCACAAAAGTTAGATATACTATTTTTTTTGGAACTAAAAGTTATTTTTTTGATAATCATAAAATAAATAAGAACAAAAGTTCTGTTTTGTGGTAAAGTATGAAAAGTGAAGTCTTTATTGTGTAATTTGCATAAGTTATTTTCAAAAATAATATTGGGGGGTTAAAAAATAGATAATTGGATGGTTTCATTCTCAATCAATTATGATAGTATGTTTTGATATTAGAATTTTGAAAAAATATTTTTTTCAGAAGAAAAATTGTTGAGAAAGTTTTTTTGTGGACTGATTCACATATATATACGTGTTATAATTTTAGTATATATATTATTGTAAATAAATTTGTATCAAGGGTTGAAAACATAAAAAACGGACGTAAGAAAAGACCCACGGTGTAAGTAGTGCTAGCCACACTCTTACACTGCCCCTATCACCCTAGGGAACATTGTCGCGGATCTCTTACATAATTATAACACATCTTAGATTAATAGTAGCGCGTTTTCCTTTATATGTAATTAATAAATCGGGGTTTACGTGTCTTTTTGTCCAAAGGGAGGACAAAAATTGTGCAAGGGTTATTAACCAATATGAATGAAAAGTTAAAATCAAATGGTTATACTAACAGAAATTTAGCTAAACGATTTGATGTAACGCATACTACGGTAAATGGCTATTTTAAAACAAAAGGTAAATTTGATTTCATGCATTTTGTAGATGCGCTAAGATTATATCAACCGAGTGACATTGAATTCCGTAGAAAATGGATAAAAAAGATAATACCTCATTTATCGCACAAAAATTTAAAATTAGCATTAGAAGTACTAGATATGTTCGGAGAGTATGACCTTCAAAAGCTGGTAATTGAAAAAATAATGAGTTCACGAACAAAAAAAGGTGATTCTTTAACTGTACGCACCAATGCAAAGATTGCTGAGTTTTATCAATTACTCAGACAAAGAAGTGAAGGTACTATCACTTCAAGGGATTTTTTTAATAAGGTCGAAAAGATTAGGAATTCACAAAAAAATATGGAAAATGATTTGATGATTATATCAGATTTTAGTGCGATGTATTCGTATTTAGATTTTAGTAATTATCAAAAGGTTAATGAATATGTCGAAAGCGTATCACCCCGAATTGAGAAAGTTTCAAAACAGACAAATAAAAATTCATTTTTACTTCGTGTGAAAGAAATGCAAGTGTCTATTCATTTACATAACAAGGGAGACTTGGATAAGGCGCGGGAAATTTGTTTGGAAATTATAAATGACCCTTTTAATTATTATGTAAGTACAAAAACGATCGCTTATTGTAAGTTAGGTGAGAGCTATGCGTTAATTGATTATGAAAAGGCGAAATATTACATTTGCAAGGCGCTTGAAATCATTGGGGAACCAACTAATAAAAAATTAAAAAAAAGAATAAAAAAAATACTAAATGTTCTTTTGTTTCTAAAAATACATCACGGAAAAGAACTAGATACAATCGATCGTATGAAACTTGATTTAGCAGAACTTGCGTTTTTTTATATAAGAATAGGGAAAAAAGAAGAAGCTATACAAATACTTAGAGGTCTTAAAAAACAAAATGGTTACCTTAGTAGTTTTCAGTTGTATTATATGGGGCTTGCAGTTGGAGGGGAAGAAGGGAAAAGATACCTAGAAATGTCAGCCGAAAGCTTTTCTAAAACAGGCGATTTTTTCTATATGTCTCTACCTATTAATGCGTTAAAATGTTATAATCAGATTATATAAGTCCGAGGCGGTGAAATGTTTGAAGTCCAAGTTATTTAAAGTTATTTTAACAATTGCGGCAGTCGCTACCTTTACATTTGCGCCAGCTACAAAGCAAGATAAGGTTAAAAATGCGGAAGCGCCAGTAATGTATTCGGATCCAAATCCGGGTGGCGGTTGATTTTTATAAATAATAATATTAAAAATGACACTATCATACTTGATAGTGTCATTTCTGCTTTATAGAGAGTGGAAACTTTTTTGATGAATCAATATAAAAAACGACAAAATCTTTCCAGCTTGTGCGGTGCACATAAAATAAAGAGGATGTAGGGGGAAATAGTAATGAATGTAGCAGTAGTAAACGCTGAAAAAAGTGTAGTGTTAAATAATTCGAAAGAACGATTAGCAAATAATTTATGGGAGTTATTGGTGCAAGGGGAAATTAAAGAAGATACAAATGTAAAAAAACAATTTGTTACTATAGAAAATGCAATTATGTCTAATAAAAAACACGACCGTTAGCGACTACTAACAATCGTGTTTTATTTTTTATTAATACCAAGAGCCGCTTCGAACATTCTCAAATACATTTCTTGCTCATGTTCGGGCTTATCTTGAAGTTCTTGAAATAACTCGTCGAATTTTTTTCTTAATCGTTTATGTTGTCCGCTGTCTAATCGAGGATCGTCGGAGAAACCAAGCAAGTAATCAGGAGTACATCCAAGAGCTTCTGCAAATTTAGAAACGTCTTTTTCACTTCGATTTTCTTTATTGTTTTCAATACCGGATATAGTAGATTTTTTTAAGTTAACTGCTAATCCCAACTGTTCTTGTGTCCAACCTCGCATTTTTCGTACGTATTTTACCCTATCTCCACGCATAAGCACTTCACCCTTTTATCTAAAAGTCCCTTACTTTACCATTCTAATTATGAAATCACAACAATATTGTATTATAAAAGTTCGGTTTAAGCAAACTTTTGTAATAATCAATAAAAAAAGTTCGGAAATTCTGAAAAAATAAGTTCCTATTTTCCGAACTTTTTGGTATGATGTTAATTGTAAAGAATAAGCGAGGTGAAATTAATGAAATTTGACAACGAGAGATTGTCTACCATGCTTAGGAGCAAAAAGATTAAACAATCGGAGCTGGCAGCTACAATAAATCGCGCGCCATCAACGGTTTCAGAATATGTTAATGGTACTGGTTCTCCAGGGGTTAGTGCTTTGACTGCAATCGCTCAAGCCCTAGATATACCAATAGATAGTTTATTGAAAGCTGATGAAGAAACAAAAAATATGTAATGTAAAAATCGAACTTTGTACGATTTATTTTTTTAATAATAAGTTCGGAAATCAAGAACTTTTAGGAGTGAGATTATGAGTCGATTACAAGCAATACAGCATCCGGTTAGTCATTTGGTATTTCTAGAAGGAAATGAATTAGTGACTGACAGTTTAACTGTTGCAGGGGTTTTTAATAAGCGTCATGCAGATGTACTGAAAAGTATTGAAACCTTAAGTTGTAGCGAAGATTTTAGCAAACGAAATTTTTCGTTGACTGAATATAAGGATGCTCAACAGAAGGTGAGACCTAAGTATTTACTTAAACGAGATGGTTTAATGTTTCTAGTTATGGGCTATACGGGTGAAAAGGCAGCTCAAATGAAAGAAAGTTACATTTATGAATTTAATCATATGGAACAAAAAATCAAACAGAGTATGCATCCATTACAAATGATTCACACGATTTCATCTGAAATGATGAAACAAGATGAACGATTAGAAACAATTGAAAACAAGTTGAATGAAAAGATGACGATTGATAGTTATCAACAAACAACGTTACTAAACGCGAAATTGCGTCGAGTTGAAAAACTTTGGGGAGAAGAACCGAAAATTCGCCAAGCGTTTGAAGATAAAAGAATTTTACATAGTCGAGCATGGAAGGATTATAAAATGGCTTTTGTAGTTCCGAGTTATCGTGATACAAAAGAAAAAGATTTTGAAGAAGCTTTAACTTATCTAAAAGCTTGGAGACCAGGCTTAGTATAAGCAAAATATGGGAGGTTTTACAGGTGCCAATAGATTTAAATAGTTTCGCAGATGGAGCAGTTGCAGAAAGATTTGATGCGGAATTTGAACGTGTTTTAGAAAATATGTCCGATTTAAACACGGATCCAAAGAAGCCAAGAACTATTACATTAACGCTTACAATTACGGGTGATAAAAAACGTGAAGTGTGGGATTGCCAGGTGCAAGCAAAGTCTAAGTTAGCGCCAACTATAGAGGTGGGCTCAAAAATCCTTATGGAGCGCGATGAAAATGGACAAATTGTTGGGCAAGAACTTGCTTCTGGTGTAAAAGGTCAATATTACATCGACCTTGAGGGAGATGTTGCGAATGATGTAGGTGAGAAAGTTGTTCATTTACAACAATAGGGACAGAACAGAGGTGAAATAGATGGGATTAGCCGATAGGGTACTTTCAGAGCATATACAAATAGCTTGGCCTTTAGAAAAGAAGTTACGTGAATACATGCAAAATCAAAAAATATTACTTCGTCAGTGTGATAGGGCAATGGCTACGGGCGATATAACAGCCGCACGAGAGTTAAAAAAACTAAGTGATAAACAATTGGAAGAATCAAATGCAGTAGAAAAAGAACTCATTGAATTGTACAAGAAAAAACAGAAAAGAGATCAAGAGCATAGAAATGAAGAACGAAAGAATGTATTGGATGTAGCGAATCGCTTGGAATCGCTAGGCGGTAATCCAAAAGTAGTAGAACAAATACGAAAAAATGCATAAAAAAAGATCCATCATGTTGATGGATACTCAAAAAAGTTAAAGGTAGATATAGATTTGGATTTGAAAATAAATTTACATT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MQGLLTNMNEKLKSNGYTNRNLAKRFDVTHTTVNGYFKTKGKFDFMHFVDALRLYQPSDIEFRRKWIKKIIPHLSHKNLKLALEVLDMFGEYDLQKLVIEKIMSSRTKKGDSLTVRTNAKIAEFYQLLRQRSEGTITSRDFFNKVEKIRNSQKNMENDLMIISDFSAMYSYLDFSNYQKVNEYVESVSPRIEKVSKQTNKNSFLLRVKEMQVSIHLHNKGDLDKAREICLEIINDPFNYYVSTKTIAYCKLGESYALIDYEKAKYYICKALEIIGEPTNKKLKKRIKKILNVLLFLKIHHGKELDTIDRMKLDLAELAFFYIRIGKKEEAIQILRGLKKQNGYLSSFQLYYMGLAVGGEEGKRYLEMSAESFSKTGDFFYMSLPINALKCYNQII >NC_018694|34879:54484|45959_46304_+|WP_000414269.1|DBSCAN-SWA MEKNIKVNKKEIRIEVLNLQDKHCKECDRRYSKQGDYCWRECEIGKRMNQLGIALGGRHGLKVKKQRTIKDWDELCVKALAMRKEGMTFKNIAKVLKVSEGSQITLQLRKRGLL >NC_018694|34879:54484|37331_37511_+|WP_001099889.1|DBSCAN-SWA MNVAVVNAEKSVVLNNSKERLANNLWELLVQGEIKEDTNVKKQFVTIENAIMSNKKHDR >NC_018694|34879:54484|49301_49721_+|WP_000451524.1|DBSCAN-SWA MEVELLNDLTKELKTRILSGAITWELMNAILLDRLERIADEAKMNEFGIGMYGVRWEDVDLKPYAALDNVIGVNDAHLISNLSPGHIKNLCAAGAIESKKIGGTWVINRERFEEWFKWSCKNETNSTQTKYCKREVKTI >NC_018694|34879:54484|38368_39043_+|WP_000088808.1|DBSCAN-SWA MSRLQAIQHPVSHLVFLEGNELVTDSLTVAGVFNKRHADVLKSIETLSCSEDFSKRNFSLTEYKDAQQKVRPKYLLKRDGLMFLVMGYTGEKAAQMKESYIYEFNHMEQKIKQSMHPLQMIHTISSEMMKQDERLETIENKLNEKMTIDSYQQTTLLNAKLRRVEKLWGEEPKIRQAFEDKRILHSRAWKDYKMAFVVPSYRDTKEKDFEEALTYLKAWRPGLV >NC_018694|34879:54484|42273_42855_+|WP_001216591.1|DBSCAN-SWA MRHTSNLYVITPEETQQTFDITELFEMQKELDKRIGYKGNDKLDMLFRALMVKIGKAWDKTSAFEMWSIGFGTTKDGLLEELVDGFRFLMKIVIELDHHTLKRKLVSGFSKQYIMKKNVLSINRLFEWYMRDILTAKRAWCQYRDLNVTLTHLHKAFGIFFRLCYLYGYKFEDIVQAYKDKNKENSERQASGY >NC_018694|34879:54484|43483_43675_+|WP_000417534.1|DBSCAN-SWA MEKYQVEVKVTKTYKTLVEVEIPEDANGDDFQRLVEEKVEPMDQEKLDYQDTNHFVLKINDIK >NC_018694|34879:54484|44589_44793_+|WP_000362235.1|DBSCAN-SWA MDKYRKLYVSLKNEDELITLFSKESFSDITDMLNEEKFIMLFDLRNGLYLPCALKIDHITVVFRGED >NC_018694|34879:54484|41827_42277_+|WP_000843532.1|DBSCAN-SWA MKSTYKYHISTVFPRWRCNHIVVKENEKMAKYHFYKQIKKQGFINMPFEQFEPFITCEYKGVVDIATLFGKEEPFRKMCNFRRIPFAKRGMRVEVQGRKGTIVGNYKNDLFVVLDDNPYKFRFNPHWEIVYFNNDGEIIKDYRKGGYAL >NC_018694|34879:54484|37531_37870_-|WP_001213815.1|DBSCAN-SWA MRGDRVKYVRKMRGWTQEQLGLAVNLKKSTISGIENNKENRSEKDVSKFAEALGCTPDYLLGFSDDPRLDSGQHKRLRKKFDELFQELQDKPEHEQEMYLRMFEAALGINKK >NC_018694|34879:54484|50836_51664_+|WP_000113809.1|terminase|DBSCAN-SWA MARQRSPDRNKAYEIYKEHNGEITNRKIAELLSTSEKTVSEKTVGGWKSKDEWIDKLNGVLHKNERSTPKKDTEYSKKKPGAPKGNKNAVNNRGGAKKGNKNATGNPGGSAPLRNDNAATHGLYRKYLPQELYDLKEELEEAINNDPLSILWESIMLQHAQIIHAQRIMFVNNKEDMTKELRKKKLSESGFEEEWEIQFAWDKQASFLNAQSKALSTLSALIRDFDRLANIDDERRAKLEFIQVQIDKIKSNTNNDDNNIEPVVIVDNVSGDLNV >NC_018694|34879:54484|51656_52934_+|WP_000038941.1|terminase|DBSCAN-SWA MSKKQIGEILPPAFHQVWLARKCESILKIVCKGGRGSGKSTDISICIVMDLIQFPITVLCIRKVKDTIRESCYEQIKEAIEILGVEHLFRFKESPMEIIYKPRGNKMIFRGADDPAKIKSIKIAKYPVAIAWFEELAEFKLEEDVSTIEKSILRKELPNGLRYKMYYSYNPPKRKQSWVNKKFETQFRPKNTFVHHSTYHDNPHISKQFVEEAEETKRLKPQQYEHEYEGKPTGSGVVPFSNLKFRRITDEEIKSFDNIRQGIDWGYGNDALSFGRMHYDKTRRKLYIFGEIYGVKISNRSLAEKIKQLGWDDVEIIADSSEPKSIDEMKNDHGIKRIKGAVKGPGSVEYGEKWLDDLEEIIIDPERCPKTAGEFENIDYEVDKDGNPKNRLQGTDNHSIDMTRYACEDDMGKRKVVMGGKVKRV >NC_018694|34879:54484|42876_43425_+|WP_000841932.1|DBSCAN-SWA MKSPYDYYITPDEYKRAEKNGISRCTLNGRVRVSMWDKEKAITEPLTHKDSQWSRWKEVAKKHGVGYQTYYHRVKRGLEPFEAATRPVMEKEQIFQKGRTAQAHKRVFTDEELRIATSNGIQYQTALYRYRKGGWNKEDAITKPPLSLKECMRRAREKSSWERIHFGRGLDILVEWKKASSS >NC_018694|34879:54484|48589_48814_+|WP_001263205.1|DBSCAN-SWA MRVFFRSESGEMILDSKNEDVASLMAVLRETNSIKIGLFNYDVKKYKLEYYRHPKNEEPEKELNIILKRNYNDQ >NC_018694|34879:54484|40875_41343_+|WP_000706095.1|DBSCAN-SWA MKIVAIPVPVPHFIKTPFEVGDWVVYENNDCKMFAEVKCMDVEQKSGRIKILGIWGNRSVMTAGDKGWQYADHCRLATEDEQYWEERRRVFAKKKRRNNEFHSGDFCNDGSRVLTVCHQDKDTGTVTVFVNNSDEKYDAEPQDLELLFCAEDAAG >NC_018694|34879:54484|43707_43920_+|WP_000784798.1|DBSCAN-SWA MKMVRRRAVIQLEKQRKSENRFSSVKWSVQISLGKRNHRTKDMLGAYQDMQVISNKVNKLLERENEKCQV >NC_018694|34879:54484|47224_47773_+|WP_000849232.1|DBSCAN-SWA MKTILRNIVSMALVLALFATSFAGISKAQEINSEEEKLVQEVAAQLKFVMEEAAVKDKHGRVVDIDIDMIENKYGKTEELEQLRQEIQRVNTPPGYEDPFKQETEAVDRCIERKIVANFKEFLSVGFLGSIIANITNKEYELAARKMIRLGVKGNLASLAGQLAWYFGTCLYEEEGWTGKTW >NC_018694|34879:54484|34879_35224_-|WP_001092095.1|DBSCAN-SWA MNTIGKQIKSFRKKLSLTQDEFAEKYGFSKGQIKHWETDRHQPDVESLKCLCSIFGVSTDTLLGFENEQNDPLLDLLLSDVQRAYNDLDGRQQGRFAKQLSLYVEMLRNNKDVL >NC_018694|34879:54484|39451_39799_+|WP_000521761.1|DBSCAN-SWA MGLADRVLSEHIQIAWPLEKKLREYMQNQKILLRQCDRAMATGDITAARELKKLSDKQLEESNAVEKELIELYKKKQKRDQEHRNEERKNVLDVANRLESLGGNPKVVEQIRKNA >NC_018694|34879:54484|39066_39429_+|WP_001121079.1|DBSCAN-SWA MPIDLNSFADGAVAERFDAEFERVLENMSDLNTDPKKPRTITLTLTITGDKKREVWDCQVQAKSKLAPTIEVGSKILMERDENGQIVGQELASGVKGQYYIDLEGDVANDVGEKVVHLQQ >NC_018694|34879:54484|50635_50815_+|WP_000390791.1|DBSCAN-SWA MEEETINVPTCSVCNEPCMWTLQMPLTITHFDKTYIREVNTGNAHICIECLEKEVQTIG |
32 | Bacillus_phage(71.43%) | terminase,integrase,portal | attL 38118:38131|attR 52567:52580 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_018689_1 | 300023-300113 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_018689_1
|
1 spacers
spacers of NC_018689_1
>1.1|300051|35|NC_018689|CRISPRCasFinder GGATGTTAAACCAGTAGCGCAATCAAATGAGGAAC |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018689_1
The CRISPR arrays of NC_018689_1 >merge|NC_018689|1|300023-300113|CRISPRCasFinder TAAAAGATAAAGAAGAGGATGTAAAAGCGGATGTTAAACCAGTAGCGCAATCAAATGAGGAACTAAAAGATAAAGAAGAAGATGTAAAAGC >NC_018689|1|1|300023-300113|CRISPRCasFinder TAAAAGATAAAGAAGAGGATGTAAAAGC GGATGTTAAACCAGTAGCGCAATCAAATGAGGAAC TAAAAGATAAAGAAGAAGATGTAAAAGC
>NC_018689.1|WP_000920897.1|297793_298276_+|hypothetical-protein MLKTKFKKIMLTSLCVGTLFLSAACGNSETNVGEEKDKQGHTPREMMLDFVKADLQHDHKTIRKLIVDGDKNTVLDPNRGPQNNLSYKDYTVKEYVVDKDTIMYNFISKKPPKNIDKAVKWVRVVRTEDGFKVRSYSSPYRNEIDEVANNKPTNEFSSKD >NC_018689.1|WP_001077398.1|295251_297792_+|ATP-binding-protein MNQVEFPVKYFHNNLIFNQDGSCWAYYEAYGIPYEFRGDDDKNTLFMRQLGLFWNFDEEKHLLMIPVYQNFQEKADEFKGTISGELKELAIYHTDDVVHELERKFGKNAVEYRYFIGVKLKVRHIQEGLKEMLYTAFHTFKNTAEQFGLLGDTKILKTDLEMFKREASAFKNKIRKHLAVRALETNETQWVILRNFYRTLEAPVTAGWTPPVQNDDSAIIPNQESLLRLSEAEFDVKGRHIEMSQIGTDGLEYPAYMSFLSASKIPYTMEFPDQEWMYMIQNIDFPIELSVRTENINHRKALSKLNKKKKDLEDQEAHARENAQTVGLNVYEGVQEATELQALIQKTRMPLVKTSVSFCICAEDLDTMRRNTNSLISIYREMMIELVRPYGDQFLLFNEFIPGSRRYVNDYIHFMEPGVLAAGMFGATQDLGDNIGFYIGTTGILNKAVYMTPSLAATNTVANQKTSALSVAVTGSTGSGKSFGTNLIVYLAVLGGAQTLIVDPKGERGNWTEDLHGLEGKVNVITLGTDRRDEGKLDPFIIHKHSRKDAIELAMTILTFITGIKPDNSEKFPRLASAVEFVAGMEEPCLTAVSQYLEDSEDKVDQQLAAHIQAFENLSFAHLIFGDGTNRDIELDTAVNIIQIQHLDMPDIQKDPKDYTLQENLSVSMLMSLSSFARKFFQKDPTKFKIVLLDEAWAIMGTSQGRELARKLVREGRALNSAVYFATQSASDLGDETFKNNIGMKFSFRNTDSKEISSILDFFGLPDNEENHAIITNLETGQCLFQDIQGRTGVVTMDVVFKDLYDAFDTRPNARKNYRKSNDDERQEVNATFVEEGGEKINVGVS >NC_018689.1|WP_000192361.1|294787_295192_+|conjugal-transfer-protein MTQKPTRKEVRTYNSIWDIPKSLYGIRDLTLPFPVPYRQLGFFVGSLFLILILDQFLPLGNNVFLKYLILPGGIAYFFGNVELDGKSPLKFLFRFFVFMFESKKISRYKDTTGNIGSYQYKTLIRFKDDSINNK >NC_018689.1|WP_000421392.1|294455_294746_+|hypothetical-protein MELLGLDMVAQQLPAITDAAVIGNINFGVNIKNWLVAQLGPIFLVVALIGVIVFAVKRQMAGLLGWIIVCALLSVFVFSPDIFKDLGTKLYNLVFK >NC_018689.1|WP_000239383.1|293346_294453_+|conjugal-transfer-protein MVKKKSQKNAEKKKFTFFKKAKNKTTELLDMQQENSEALKEKKTRKTREKVPVITGRKVGKVTFWCVMGFVFAGSSLSFIQLAGPPRAVAVQEKKEEPVKVKMSEAELIVYANSFAADYFNWKVDMNVAETRKKRLEKYLVEGSDEQGGLNRDSLKNASSTLVKSEAVEVRQKGNEAEVTLKIIQKLEPINNPAPGTTQAPDTPKEPKEVTRYFSIPILMEKGKMVIPDHPTIVHGEREKASYKVATFKSEGREINTDSEIKKVEQFLQSVFKVYTEGTPEEIAYYFEKSNITNGLKGIMTFSKLENLRIYEDKDKGYRVLVDAKLKDNDSSLEYTYTYDLNLVNKDNKFSINSMKKFENTLEKVEDK >NC_018689.1|WP_001118180.1|290637_292347_+|hypothetical-protein MAKPFVIKNKRSLNGETTTPVIVTIKSWQKLVEALEGKYYSFKDTYLEDIVNSMSYEERIADEEGFVEQAKPSFSLKMKKIVDKVSGIDKNEGRKHKLYGITNADLEVFLFLHKKCNTYGELSHVSIHMLWEDYKNYKEAFAHIHHSQFYVALKKLSFHNIITIENEYSGKYKITLTDFMNKETNKANAYTFISPIVFTKEFFELSIAAKKLFMDVAMQQKRETTLKRSLFKVDEQGNSTHFGGMYRYLHKKYPHQIRAVLEELETKLSATGSPLFKICKLEKGKKNKKQYTTLHLSVHPDFLCAKEEGAEYRDPFTPRDTYKRKVKFIENLLVEMNIAEFAKDMNQFINVLKHSCHRQIRQVVRGLREMIDRQEGYPKKLVYTLSKLLKQSSQYRVLDTAAKTGIYPLITHNVPKHEQEEAIFKFGTHFAIYSLRNVQKLFRKAHDLLHAKYAVPVTLDAYHRNYMQYQEESLFRKYAYEQGVNINAYTALEIEIRELLKSSGHQGTNMPSDIRELFIEKVDKLSKEKIRVIEVPEDFDLIQFLQSLEAYYRSTSETPHSVDQLLPAM >NC_018689.1|WP_000413552.1|286987_288397_+|NADP-dependent-phosphogluconate-dehydrogenase MEKLQIGVVGVGVMGKSLALNFESKGYSVALYDISKEKVDEIIEENRGKNLVGTHIVEEFVNSLESPRKILLMVNAGEITDKAIDSLVPHLDKGDILIDGGNTYFVDTIRRNKRLAEEGINFIGAGVSGGEEGALKGPSIMPGGQKDAYEKVKDMLENISAKVNNEPCCSYIGPNGAGHYVKMVHNGIEYGDMQLICEAYFFLKQTLDLTAEEFHEIFVEWNKGELNSYLIEITADIFKKKDEETGKPLVDVILDTAGQKGTGKWTSQSALDLGISLPIITESVFARCISALKEERVNASKVLSGPKDKTAIGVEKAELIEAVRQALYMSKICSYAQGFTQLKAASEEYDWNLDFGSISMLWRGGCIIRAAFLQNIKEAYETNTELPNLLLDPYFKEIVESYQGGLRQIISMAVQQGIPIPAFSAAISYYDSYRTAKLPANLLQAQRDYFGAHTYKRVDKEGTFHTKWI >NC_018689.1|WP_001131717.1|285376_286723_+|gluconate-permease-GntP MPLVIVAIGILALLLLIMRFKLNTFISLIIVSVGVALALGMPPEKIFKTIEAGLGGTLGHLALVFGLGAMLGKLLSDSGGAQRIAMTLVKKFGEKNIQWAVVTASFIIGIALFFEVGLVLLIPIVFAISRELKVSILYLGISMAAALSVTHGFLPPHPGPTAIAGELHANIGEVLLYGFMIAVPTVVLAGPVFTKLAKKLVPDAFTKTGNIKSLGEQKVFKLEETPGFGISVFTALLPVLLMAVATIITLLQKTMGFKDNSLLATIEFIGNADTAMLISLLVAIYTMGLARNIPIKNVMESCTTAISNIGMMLLIIGGGGAFKQVLIDGGVGNYVAELFKGTSLSPILLAWIIAAILRISLGSATVAALTTVGLVIPMLGQSDVNLALVVLATGAGSLIASHVNDAGFWMFKEYFGLSMKETFATWTLLETIVSVAGLGFTLLLSLFV >NC_018689.1|WP_000100536.1|283724_285260_+|gluconokinase MSSYMLGIDIGTTSTKAVLFTEKGEVIQTENIGYPLRTPDISTAEQDPEEIFQAVLQAISNITKQHSDKKPSFISFSSAMHSVIAMDENDQPLTPCITWADNRSEAWAHKIKDELNGHEVYRRTGTPIHPMSPLSKITWIVNAHPEIAIRTKKYIGIKEYIFKQFFDQYVVDHSIASCMGMMNLKTLDWDEEALKIAGITSAQLSELVPTTQIFSNCNPDLAQKIGIDSQTPFVIGASDGVLSNLGVNAIRKGEIAVTIGTSGAIRTIIDKPQTDKKGRIFCYALTEKHWVIGGPVNNGGMVLRWIRDELASSEVETAKRLGIDPYDVLTKIAERVRPGADGLLFHPYLAGERAPLWNPDVRGSFFGLTMSHKKEHMIRAALEGVIYNLYTVFLALTECMDGPVTRIQATGGFARSDVWRQMMSDIFASEVVVPKSYESSCLGACILGLYATGKIDSFEIVSEMVGSTYKHTPKEEATKEYRQLLPIFINLSRALEDDYTRIANYQRNLIK >NC_018689.1|WP_001130026.1|283000_283732_+|gluconate-operon-transcriptional-repressor-GntR MAKSMEFLYPEKWLSKASTGDRVASELRMRIIAGEIESGTILSENKLAADFSVSRSPVREALKVLASENIIRLERMGAVVIGLTEKEIEEIYDVRLLIETFIFERLVKMDTNDLVRELNKIMEMMKIAIKYHDSDEFSYQDLLFHETIIRTIEHSYILMIWNNLKPVMESLILLSMRTRFKEKYEDFERIIKNHELYIKAIESKDRALMIKALHQNFDDVQGKVEDFWMSQQMLSKGVEQGHE >NC_018689.1|WP_014990771.1|304309_304972_+|C40-family-peptidase MGEKVEITSKLYLSLYGTGYANYAVSKGGYTHENARAFSAEQSAKNGYRCASWRSAEAVANNWCYGDPDYVPHIMRYYQPGQTPGGSGGIAGGSVLGDDVFQAIMAEALKYQGWPYVFGGRIPNTSFDCSGIIEYTYSRVSINLFGTAQTQWDKTQRITDPKPGDLVFFHSTYATSNYITHVGIYVGNNTMYHAGDPIGYADLGKPYFQQHFAGYGRVVR >NC_018689.1|WP_000724398.1|305023_305620_+|hypothetical-protein MKKITIIIAILLIVSVGFLIKYQSDNEKLKTDNIKLTKKVEKVEAQYNDTKKELSALKSNNQQQVKEAAERFLKAFRTYDTGKGESYLANIDAYITPNAKKELTPPGGPTQSAPGAGDEKEKKKVSFQSEYTGGELYYAFLDTTEANVLAKVKSKITVNGVSSDNMSLMQINLIYDGNKKLWLVDKLIPLADLRDQMP >NC_018689.1|WP_000428112.1|305872_306175_-|hypothetical-protein MENKEILLAITELKSSIDKRFDALEKQFDKRLDSVSEELYKIKQNLVTVDGQQSEDTQKQIDKIEKDIKILNQDVMFLAGKLGVHDLKLIGIENKTYIKR >NC_018689.1|WP_000312828.1|306241_306616_-|hypothetical-protein MAYDNTFSCIKLTEEQYVKAVELLEKFKKESIYNFEVRPLDVVRNSIQTTHYFIIEMNLSREDLERLIMENNELKLRNNELTEEHNLYKYKIKELTLKNEELTKRLEKEKIKYLQQANFNRITS >NC_018689.1|WP_000377606.1|307591_308461_+|hypothetical-protein MDSKTYEKLQALRRYKEPIQAVLRTVKRHDKDDSDTEYAEFALENGKVIGICKKEDFSDYSFRSITQFTGNIFNVVITQMSDELDVNKVQVSVKEASRRSADALIRELIELEQVERLQEPTYEAEVTGYNINAQVPTIFLRINGAECFMKLHELNYGRVYKNAVDRYAPIGERIPVKVLQFNPEQRLIHVSRKAAMENPYQLLSELTEGDTIVGRVVNVDPRFGVFVELDQGCTIKGIVPKTIEQPVLDDVVSMRIVSVDVEKERGSGVIFKFPFGRKKVNDPTAFLYN >NC_018689.1|WP_001275775.1|308460_309432_+|hypothetical-protein MSAPQVSVQENGKAVQYWLNRDESLSLWDDPSLQGGPILPDKFKPLTDLRSIYDRINSGFINEKDNLILKLIWDSLAITEAQIKNFVESKISRSQVSESLKKLVLYGFVSRWEIKSALFPDQPKISAPITLNTAGYLMMWAYHNRNTNYSLKPEQWLRFGVAGVQRFVTMNQIKYEFAVGQQLLKNWCWYPKLKGTGNGYNPIAVGEIKTPIGNQNFIFERVQQGQRYAQHLKSRLKIWEDHIQNGPNNLLNFENTKSLPGIFILSISNLALAEHVRKELMLDLRKIPIMLVIDECIHSEGFAKSFYISTQKGIQQAPLPFLR >NC_018689.1|WP_079995239.1|310661_310763_-|YjcZ-family-sporulation-protein MGFGGSCGSCGGGFALLVVLFILLIIVGASCFC >NC_018689.1|WP_001277524.1|311494_311791_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MSCDFNMDSSDYKSSSKILELLGSPSRLLIVCELIVSGTLTVSQLSTATHISEPMILQHLRKLTIGNIVISERKGTRLYCRVEDKKVIEITELLGLAH >NC_018689.1|WP_000693609.1|313317_313596_+|hypothetical-protein MKIKFGVVKDENFDFTLLGTKLLKTFKEVDQVAIVEKVEDKIFEKDDVQIHLAEITINVTGKNIGYRSVSASIFIVLESLSIKLFNINISIH >NC_018689.1|WP_001216134.1|314198_314384_+|hypothetical-protein MRHKKDLLKQWKVDLQAVQKEKRMKKKAKNKKYSIPGNAAGFMNGKNTYRKENGVWKQRNK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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NC_018689_1 | 1.1|300051|35|NC_018689|CRISPRCasFinder | 300051-300085 | 35 | NZ_CP029455 | Bacillus cereus strain FORC087 plasmid pFORC087.1, complete sequence | 157156-157190 | 1 | 0.971 |
NC_018689_1 | 1.1|300051|35|NC_018689|CRISPRCasFinder | 300051-300085 | 35 | CP002509 | Bacillus thuringiensis serovar finitimus YBT-020 plasmid pBMB26, complete sequence | 101702-101736 | 1 | 0.971 |
NC_018689_1 | 1.1|300051|35|NC_018689|CRISPRCasFinder | 300051-300085 | 35 | NC_014172 | Bacillus thuringiensis BMB171 plasmid pBMB171, complete sequence | 112825-112859 | 1 | 0.971 |
NC_018689_1 | 1.1|300051|35|NC_018689|CRISPRCasFinder | 300051-300085 | 35 | NZ_CP009691 | Bacillus mycoides strain ATCC 6462 plasmid pBMX_1, complete sequence | 283995-284029 | 1 | 0.971 |
NC_018689_1 | 1.1|300051|35|NC_018689|CRISPRCasFinder | 300051-300085 | 35 | NZ_CP015592 | Bacillus cereus strain AR156 plasmid pAR460, complete sequence | 448056-448090 | 2 | 0.943 |
NC_018689_1 | 1.1|300051|35|NC_018689|CRISPRCasFinder | 300051-300085 | 35 | NZ_CP009336 | Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence | 6536-6570 | 2 | 0.943 |
1. spacer 1.1|300051|35|NC_018689|CRISPRCasFinder matches to NC_018689 (Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC429, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ggatgttaaaccagtagcgcaatcaaatgaggaac CRISPR spacer ggatgttaaaccagtagcgcaatcaaatgaggaac Protospacer ***********************************
2. spacer 1.1|300051|35|NC_018689|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP029455 (Bacillus cereus strain FORC087 plasmid pFORC087.1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
ggatgttaaaccagtagcgcaatcaaatgaggaac CRISPR spacer ggatgttaaaccagtagcgcaatcaaatgaggaat Protospacer **********************************.
3. spacer 1.1|300051|35|NC_018689|CRISPRCasFinder matches to CP002509 (Bacillus thuringiensis serovar finitimus YBT-020 plasmid pBMB26, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
ggatgttaaaccagtagcgcaatcaaatgaggaac CRISPR spacer ggacgttaaaccagtagcgcaatcaaatgaggaac Protospacer ***.*******************************
4. spacer 1.1|300051|35|NC_018689|CRISPRCasFinder matches to NC_014172 (Bacillus thuringiensis BMB171 plasmid pBMB171, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
ggatgttaaaccagtagcgcaatcaaatgaggaac CRISPR spacer ggacgttaaaccagtagcgcaatcaaatgaggaac Protospacer ***.*******************************
5. spacer 1.1|300051|35|NC_018689|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP009691 (Bacillus mycoides strain ATCC 6462 plasmid pBMX_1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
ggatgttaaaccagtagcgcaatcaaatgaggaac CRISPR spacer ggatgttaaaccagtagcgcaatcaaacgaggaac Protospacer ***************************.*******
6. spacer 1.1|300051|35|NC_018689|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP015592 (Bacillus cereus strain AR156 plasmid pAR460, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
ggatgttaaaccagtagcgcaatcaaatgaggaac CRISPR spacer ggatgttaaaccagtagcgcaatcaaacgatgaac Protospacer ***************************.** ****
7. spacer 1.1|300051|35|NC_018689|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
ggatgttaaaccagtagcgcaatcaaatgaggaac CRISPR spacer ggatgttaaaccagtagcgcaatcaaacgatgaac Protospacer ***************************.** ****
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
250250 : 258760
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_018689|250250:258760|DBSCAN-SWA TTTACATTTTTTCACCTGTTTGAGGGTTCCGCCCTGTTCGTGCAGATCTTTCCCGTACCTCAAATGTACCAAATTCAAGAATCTGTACTTTCTCTTCATTTGCAAGAGTATTTGTTATTGTGTCTAATACAGCTTGTGTCGCTGTAGCAGCATCCTTTTGTATAAGTTCTGCTTTATCCGCTATTACTTTTATTAATTCTGTTTTATTCATTTTCTGCATCTCTTTATATGTAATTAGAGACTATTATAACGTGCCTATACTCATGGTGCAATAAATAACATGTTGTACTGATATGCGTCACAAGTGTAATCGTCTATTTTCAATATTTTAAGAAGACCATCGTTATAACTCCTCCTTATTGTATATCCTAAAATATTTATTGTTTATATTATTTTATTGTTATATAATACTTAATGTCTTTACTTATATGCGATTACGATATATCAGAATTAGAAAAAGGGATCTTTCGGGATTCCTTTTTTCTATTAAAAAGAAAAAAGCAGCAGATTGGCTCTCCAGACATATTCCTACACCTCACGGTAATTCCTTTAAATCATTTTATTAAATCATCCACTTGATACTGTCTAAAAGTTATAAGTGTTTTATACATTTCATTTCAAACTAATTTTTAGATAGTTTCAAGATATGTTTTCGATTAATTTCACATCACTTTTAAATGTTGTCTAGAAGTATCAACTTTTAGTTAGTTAAACAGGACAAATCTATCAATTATATTAAATTAATTAATCAAACTATTACATTTTATTGTTTTATTCATATACTGTATTAGATTGCTAGAAAGGAGGCGTAAGCATGGACAGTTGTGTTTTGTTCGTTAATGGACAACCTTTTTTAGTGGTCTCAGTTGCTGGAATCGAAATTGCTAGATTAGAGCTTTCTCTTCAAGTAGCATTGACTTTAATAGCATTAGGGATTCCGATTTGTGCGTAAGACTTAGGTATTTATTAAAAAAAGGGCTTTTGTCCTCTTTTTTATTTATCCCTTTATCTTTCCTTAACAACAAACAAGACGCCACCCAGATCACGGCAGCGCCTACAATAATTACTATTGGGTTTAATCACTAATTTACTAACAATCCTAATTGACGTAGGATTTCTGAGAACAAATAACCATACGCAAAACCTACAATACGAATTCCTGGAGTGTATCTATGTTCTAAATCTTCATTGTACGTTTTCATATAATATGCTAGTTTAGAATCAATGTTATGTTTGTCGTTAATAATTACTTCATCGCTAGGAATTCCATCCATTTCAATTAGAACAGCTACATACTCTGCTTCTTCAATTAAAGCTTCATTAAAACACTTTTCTAACTTTTCTAACTCTTCTAATGTTATACCCATCACTCCCCTCCTAATTTAATGTCTGTTTTGCTCAATAAAAAAGAGCATCCACGTCAGTAGATGCTGAAATATGTGAATGGACTTCTCGATGATCATTGAATAGGATATAAGCAGTTAGCTTGTCCTACACTATACTATATGATTTCTTTATTAAAATGGTTCATCAAAAAGGCACCTTATCCAGGTGCCCTTTCGTGAACATAGGGGTAACACTAAAACGCAGCAATAATTCTAATATCGTGGTGTCAATATCATTCTATGCTCGATATTTCTTTATATGCTAAATGGTTAATGTGTAATTTCTATACAATAAAGAACAAAGCACCCGTGTTGGATGTTAATTATCATCCTGTTTCCTCTGCTTTATTCTTATCTCTGATAATTTCAACAATCCACGCTAAAGAAACAGCGATACCAAAAAGAACACTTACACCTGCAACGGTGTAATAACCTAACTGTTTAGCCGTTAAATCTACAGTGAGGGCTATCCCTAGTATAATGATTACAAACATTCTTTTCTTTCTTTGCTCGAACAAACTAATTTCTCCTCCACTCGAAGATCATCTATTTAAAATTCAATATTAAATATATTGATCACATACATCATAAAATCTATCTATCACTATTATCTCATTATACTAATTAATTCTCAACATCTCATATATATCGATTATCTTTATACCTAGAACACTCTTTAAATACAGTTATCATGTAATTTCTATATAAAAAAGAAAAAAGCACCCATTATGGATGCTTTCTCACTTATGCATTTAGTATTTCTTTGGTAACTCAGGGAATAAACTGATTCCTTCCTGCTCCACGTCATTACTGAATCGCATCTTGAGTGCTCTGTATTCCTTTAATACACTTACTACTTCCTTTTGTACTCTCTTATCATCGATAGCCAGTAATAAAGTTAATTGTCTCTCCATGAAGGAATCCCCCTATTTCTGAATTTGTTTTTTAACATCACATAAGGTACGTGAAATTTCACTATCTTATTATTGAATAAGGGAAACATGCATAGCGAGTAGCCCACACCATCCACTCTGCATGTTTCTGTTATCCATTAAGCCTTTAATAATTTACGTGTCTTATTTGCCATCTTTTCTTTTGCTGCTTCAATGTTATTTGTCACTCTCATATGATCCTGATCAATCTGAATCATTCCATCAAACATAACTGGAGCTCGTTCTGTCTGCACTACTAAGTACCCATAAATATCAAAGCCTTCTCCTGGTATAGACTTCTTGCCCTTCGGTTGATGAGACATCCTTACATAAGATTGAATGACTGATAGTGGTACTACGAATACTGATTTATCCTTACTAAACTCTATAAGAAAGAAACATATTGCTCCCATCTTTTCTGCTTTCTCCAGATAATCCAATTGATGCTGTGCAATGTTCTTTAAATCAAAACGTGTATCCTTCTCTGTAGATTTAGCTTCAAACGCAATAGCTTGTCCCTTATACACGCAATCATAGTCTACTATACTTTTAGCTTCATAGAATCCATTTAGTACACGGCCACTTTTACTTTTTAATACCTTCACAGGAGTCTGGAGCTTGTTTATAAGCTCCACTCCCCCCTCCTTGATACATTTTCGTTCGCTAGATTGATAAGCATTTCAAATGCCATTCCACGGTTACCTTGTCCCATTGTTATTCGTCGCTTTCTATTAAAATTATTATTTCATTTATTTCCCAAAAACGGTAATTAATATATAATTAAACTATTCAAATCTTAGGTGGTGATGCAAATGAATGATACGATCCGAATTGTTCTTTTCACTCTTGTAGGAATAAGTGCCGTATTTTCTGTAATTAAAGAATTTCAAAAACCAGAAAAGAAAAAATTTTGGATTACATTCGAAACTTTAATTCTAATCGGGGTAGCTTGGATGTTAATAGGGCTTCTCATGTAACCTACATAATTAATAAACCCCCTGAATAAAACTAAATATTTTGTCAATAATGTATATGACATTAGATTTTCTCCATTCCCCCTTGGAGATGAGCAGTTAGCTTTTGCTAGCTGCTCTTATTTTCTGAAATTGGTTACATTCCCCTGATGTTTTTAACTTAATATTACGTTACCATATAAAAGAGTAGAATATATTGAGCTGCTATACCATTACCCTAGGAAACTAGGGTTTTTATTTCTACAAAATGAAATTTTTATTAAATTGCTTATACTTTATTTCTCAACCACAACTTATGGAATTATAATGAAATGAATGGTAATATATAGACATCTCAATTACGTTAGAGCTTGTTTCCTTGCAAGCTCTTTTTTTTATTTAAATAGCGTTTTTGTTTAAAATAACAGCTCTAAATAAATTAGATACATTTACCAGTATGTTTACCACAACATTCATGTTAAAATCCCTTGTGAGTACGACATAACTCTACCTAATGAAGCCCTGCAGCCCTTATCGCGGGGCTCTTTTTTTATTTAAATTAACAATTTTGTTCACTTTTATAGCTTGCTATTCCTCATGGTTGTGTTTTGCTTCTAGGACTTTTATAAATTTAAAGTGTCCATCGAGATAACAATCATTGATAAAACCCACAAAATATATTTCATTAACTTTGCTTAAAGTAAAATTTTCATTTTTTCATTCAACCAAGTTCATAACATATTCTTTTCCTCTGGTAAAATAATGATTAGGTTCCCCATGCGCATTTTATCCACTGAAAATAACACCTTTTACGTACTTAACTATTAGAAACTTCATTTCTGCTACTTCTGCAATAGCAATTTTGTTCACTTTTTTGATACATTTATGAAACATTCATATGTTATCTTTAGTACGTTCTTTTCTTTTTGTAGAACCATGTGAGAATACCAAAACAAGAAGCCCTAGAGCCCTAACTCTAGGGCTTCTTCATTTTAAATAAGGATATTATTAAATTTTCAATTAAAATTTTTTATACTCTCTTTATCACTACCTCCAAAAAATATTCAGGAACCTTGCAAACTTGCAATGACAATGTAAGGTTATTAACTATGAACAAATGTATTTACGTAGTAAACTATTTAGTCAGAAATACATATTAAAGGAGAAACATTTATGAATTTTGAAGACAACCGTAAACTAGGTATTCAGTTAGGATGTATAGTAAAAACAGATAATACTCAATATCTAGTTTTTAAAAAGAATGAAAATTACTCATTATTAAACATAAAAACGGTAGAATGTATAAACTTTGAAGTCCCTTTAGAGCATCTTGAGGAAATGATTCTTGAAGATTTAAAAGAAGACATCCAAAGCATTATACCTCCGGAGAATATTAAGATTGTAGCTCAAAACAAAATATAGATTACGTTTCATTCAAAGAGTACTAATGGGTAGTGCTCTTTATTTACAATCAATCCAAATAACTATTTTGTTAAAATTGATTCACTATTTATTTTTATAAAAGCACCCTTTTTGGACAAATTTACCTGCTTAATTAACAGAAATTTCATTTTATTCTTAACTTGTTGAATAACCCAATACATTCAACAGTGCTCTTGATTGCATACTTAGTATGTAACCATCCAAATATCTTAGCTAATATGTCCCCTAATCGTCTTTATTACTAAGGTATCTTTTTAGATGCCCTGTGTGCAGGGCTTTTTTATTTCAGTGATAATGCTCTATTTCCCCTACAATTATCGATGCTTGTAATCCCATTTCATAACAAAATTCAAATTTGGTCTTACTTTATTCCGGTCGATCCAAACCCAAGATTTCCTCTTTCCGATTCTGATAGCTCGTCCACTTCATAAAAATTAGCTGTTATTACTGCCGCTATAACGCCTTGAGCAATCCTTGTTCCTCGTTCAATCACATGGGCTTGCATATTTAAACTTATTGGTTTTTCAGTGTGATCAACCAACACTCCAACTTCTCCGCGGTAGCCACTATCCACCGTTCCAAAAGCGGCCCTTAACTTTGTATCACGCGTCATACCGCTACGCGGGCGCACCTGCAATTCATATCCTGGCGGAATTTTGAACGCCAACCCCGTTGGTACAACCTTTGTTTCGCCAGGCCAAATAATCGTGACCTCTGGTACAACTAGATCAAAACCAGCATCAAATTCCCGTGCATACTTTGGTAAATCCACACCTTTCAATCGTTTAATCTTCATTCTTAATTTCATTCTGTCCCGCTCCTTATAAGTAATTTTTCAATTTCTCTTTCTATTTCTTCAACACTTCCAAGGAAAGCTTCGTCTTCCACTTCTCGTTATCCAATCCCACTAAGTGATATTCCATCTTACGAATTTCACTCTCTACTACTTGGAATTCACTTTGCACCTGCACTGCAGTTTCTTTTTTCATTACTTTCTTCCCTTTGCTTCGCTCATTAACTTCGTGATCTCGTACACACCGTTCTCCATTTTCATCACTACTGATACACTCCTTTTATTAGATTCCACAACTCTTGTTCAGTCATCTCGTAAAGTTGTCGCCCTGTCTTTTCTTCTTTATAAATTCCCTTTTGTAGTAATACATCGATGTAGATTTGTTTCCTGTCCATGCTGCCTCCTAGCTTCTTTTCTTCGTAGCTCTCCCTATAGGTGTAGTCGCTGCCCTTTGTGGATTCCATCTATTTATCATCATGGCGCTATGCCTCCTAATCCAAATTCATGATTTCCTCTAAGGTTCTATCCGAAATATAAGTAGTAATGATTTGTATCTTTCCGTATTTCTTTTTAGCCATTTCTATAGCTGCGCCCTCGGACTTCGCCTCAAACCAACGAAGCCTCCACTTCTCGTCTTTATCGTATAACTCTACTGAGTACGTCATAACACTATTACTCTTCAAAAATCTTTCCGCTGTACTTATTGCGCTATAATCAAAACTTCTTGCTACATCCTCCAGTGTTAGTTGCTTTATTTATTTTATTAATCATTGTTGGAGCTTCTTGCTTCTGCTAAAAAATTATCGGAAAAGGCACTCTTATATGGGTGTCTTTTCTTTATGAATAAGAGATACGTGGGAAAAATAAATTATAGGACAGGGATATAGTCTAAAACTTCTAAACTATCTTTTTATTTCCTTTCGACATAATATGACAATATAAAGATATTTAATATGTTATTATTACGTTGCAATCTAACATTTTACATAATTGGAGGAACAAACGTGGGAAAAATATTTAAGTTTGGATGCCTAGGCATTATAGCTTTATTTGTAATCGGAATAATTGCTATGGTTGCTGGTGGTGGAGATTCAACAGAAAAAACTTCAACAGACACTAAAGCGGTATCAAAAGAAGGTGTATCTTCTGATGTAAAAATCTCTGTAGGGTCTATGGAAACAGTAGATTCTGTGGGTAATGAATACTCAAAAGAACAAGCACAAGGTATCTTTAAGATTTTAGAAGTTACACTTACTAATAATCAAAAAGACGCTATCACTGTCGATACTAACAGCTTTAAATTGGTAGATAACAAAGGTCGTGAATTCACATCTTCAGTACAAGGTCAAACATCTTTTGACTTAGCTAACGGTGGAAAAACTGATTTCTTCTTAAAACAATTAAATCCTGGTCTAACACAGACAGGGAAAATTGTATTTGATATACCAAAAGATGCTGAAGGACTTTTCTTAAAAGCTAGTGGCGGTATGACAGGTAAAGAAATTAAGTTAAAAGTAGAATAGATAAAAAGGTACTCGAAAGAGTGCCTTTTTTCTCAATGGCCAATATTAATTAGCGTGGTAAAATAATATTTGGATTGGCATCTAATACCATATTACGTTGGTTCAAATCGTAAGAAGGCACCTTTGGGTGTCTTTTCTTTATAAAAAAGGACTCCTAAAACGCCTTAAATTAGTAAACTTCAATATTACTCTTTTTTTATTAATTTGTTTTAACTTAATATATTAATTTTAAGTTAAAAATTTGTTATAATTAGTAAATAATTATATTAATTAGATGGAGAGGATACAATATTATGGGTTATAAGTTTCGTAGAATTATCCAAGTTTCCCCAGGTGTGAAAATTAACTTTACATACACAGGTACGGGAGGCAGCGCCATTCCACCTGAATCAAGAACAATAACTTATATACCTGGAACTGGAATCTCGTATACACCACGAATAGCTGAGTCAAACAACTATTATATACAACGAGGGTTTCAAGGGCAAAACACTTCCTATCCCACTATGAATGAACAAGATTACAATACGGTAAGAGCATTTGAGCAGGTAAGAGAAACCAAAACTTACATTGTTACTGCTTTTCGTAAGAAGGATAATCAAGTAAACTCCGTGGGTAGAAAACTAATGAAACCACTTTCCATAATTACAGGCGTTTTTGCAGGCCTATTCTTAATTATGTTGCTTGTTATACCTGCTCTAGTCCTTGCAGTCATTTCTTTCCTATGCTATAAAAATATAAAAACACCATTTGCAGTGATATGCCCAGAATGTGATGCTGAGAATTTATTCATTTTTGAGGAAGAGAAGATTGCTTGTCGTAAATGCGAGAGCACTCTTATAATCCAAAAATAAAAGGTTCTCAAATACACTTCCCACAAATGGATTGTGGTATGGAAACAATTATGACCCTTGAAGCTCATAATTGTTTCCATACCTCCTTGAAGGCTCCAGCTCTCTTTTTTATTTCCATTAGACGATATATAACAATATAAAGATAAATAATTTGTTATTATATTTAAGGATTTATTTACATTAGGAGGAATGAACAACTATGTTTAAAAGATTAGCAGTATTACTTATTGGAGCTCTATTATTATTTGGTCTATCCGCTTGTGACAGCGTTAAATCAATGACAAGTAATGTCACGGTTGGTAAGGTAATTGACGAATTTAAAGCTGCAGGATTAGAAGCTGACAATCCTAGTGACCTACCAGAAAAAGAATTTGGAAATACTAGAAAAGAAGCAAAGCGCATTCTTGTTCCAGCATTAGGTGAAGATAGTGGTGGTAGAATATTTGAGTTTAAAAACAAAGAAGATCTTGAAAAAGCTAAGAAATACTATGACGATTTAGGTAATGGTAATCAGATGCTATTCTCTCATACTTACGCAAAAGGTAACTTCCTTATACAAATGAATGGTGATATGGAAGATGCCCAATTTAACAAATATAAAGAAGTTATGGACAAAGTAATTAAGTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_018689|250250:258760|250250_250460_-|WP_001043915.1|DBSCAN-SWA MNKTELIKVIADKAELIQKDAATATQAVLDTITNTLANEEKVQILEFGTFEVRERSARTGRNPQTGEKM >NC_018689|250250:258760|257571_258132_+|WP_000540766.1|DBSCAN-SWA MGYKFRRIIQVSPGVKINFTYTGTGGSAIPPESRTITYIPGTGISYTPRIAESNNYYIQRGFQGQNTSYPTMNEQDYNTVRAFEQVRETKTYIVTAFRKKDNQVNSVGRKLMKPLSIITGVFAGLFLIMLLVIPALVLAVISFLCYKNIKTPFAVICPECDAENLFIFEEEKIACRKCESTLIIQK >NC_018689|250250:258760|252386_252548_-|WP_000441076.1|DBSCAN-SWA MERQLTLLLAIDDKRVQKEVVSVLKEYRALKMRFSNDVEQEGISLFPELPKKY >NC_018689|250250:258760|258331_258760_+|WP_000476456.1|DBSCAN-SWA MFKRLAVLLIGALLLFGLSACDSVKSMTSNVTVGKVIDEFKAAGLEADNPSDLPEKEFGNTRKEAKRILVPALGEDSGGRIFEFKNKEDLEKAKKYYDDLGNGNQMLFSHTYAKGNFLIQMNGDMEDAQFNKYKEVMDKVIK >NC_018689|250250:258760|255810_255951_-|WP_000712300.1|DBSCAN-SWA MKKETAVQVQSEFQVVESEIRKMEYHLVGLDNEKWKTKLSLEVLKK >NC_018689|250250:258760|251960_252152_-|WP_000462901.1|DBSCAN-SWA MFEQRKKRMFVIIILGIALTVDLTAKQLGYYTVAGVSVLFGIAVSLAWIVEIIRDKNKAEETG >NC_018689|250250:258760|256759_257278_+|WP_000516004.1|DBSCAN-SWA MGKIFKFGCLGIIALFVIGIIAMVAGGGDSTEKTSTDTKAVSKEGVSSDVKISVGSMETVDSVGNEYSKEQAQGIFKILEVTLTNNQKDAITVDTNSFKLVDNKGREFTSSVQGQTSFDLANGGKTDFFLKQLNPGLTQTGKIVFDIPKDAEGLFLKASGGMTGKEIKLKVE >NC_018689|250250:258760|254692_254941_+|WP_001008433.1|DBSCAN-SWA MNFEDNRKLGIQLGCIVKTDNTQYLVFKKNENYSLLNIKTVECINFEVPLEHLEEMILEDLKEDIQSIIPPENIKIVAQNKI >NC_018689|250250:258760|256246_256510_-|WP_043324812.1|DBSCAN-SWA MKQLTLEDVARSFDYSAISTAERFLKSNSVMTYSVELYDKDEKWRLRWFEAKSEGAAIEMAKKKYGKIQIITTYISDRTLEEIMNLD >NC_018689|250250:258760|256479_256551_+|WP_181004292.1|DBSCAN-SWA MLHPPVLVALFILLIIVGASCFC >NC_018689|250250:258760|255323_255770_-|WP_000776806.1|DBSCAN-SWA MKLRMKIKRLKGVDLPKYAREFDAGFDLVVPEVTIIWPGETKVVPTGLAFKIPPGYELQVRPRSGMTRDTKLRAAFGTVDSGYRGEVGVLVDHTEKPISLNMQAHVIERGTRIAQGVIAAVITANFYEVDELSESERGNLGFGSTGIK >NC_018689|250250:258760|256018_256150_-|WP_080451858.1|DBSCAN-SWA MDRKQIYIDVLLQKGIYKEEKTGRQLYEMTEQELWNLIKGVYQ >NC_018689|250250:258760|251331_251616_-|WP_000513195.1|DBSCAN-SWA MGITLEELEKLEKCFNEALIEEAEYVAVLIEMDGIPSDEVIINDKHNIDSKLAYYMKTYNEDLEHRYTPGIRIVGFAYGYLFSEILRQLGLLVN >NC_018689|250250:258760|251063_251201_+|WP_000376551.1|DBSCAN-SWA MDSCVLFVNGQPFLVVSVAGIEIARLELSLQVALTLIALGIPICA >NC_018689|250250:258760|253378_253543_+|WP_001000165.1|DBSCAN-SWA MNDTIRIVLFTLVGISAVFSVIKEFQKPEKKKFWITFETLILIGVAWMLIGLLM |
15 | Bacillus_phage(88.89%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_2 |
318773 : 326951
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_018689|318773:326951|DBSCAN-SWA AATGCGTGGTAGGAAGGAAACAATTTCTTTTCGTGAGTTTATGAATCGGTCATATGAAGATAAAGAACAAAAAATACGTAAATACAATTCATTAAGTTCTTTCGCGTTCCTTCACATGTCGGATCAGGTACTCAATACTTACATTGCATTAGGCATAATGGGAACCGTTTTAATCGGGGCAGTCATGTTAGAAAAATATTTGGTACGACATGACTATATATCTGCAGCTAAATTTGTAAGTGAAGGAATTTATCACGGCATACGAATTGGTGGAGTTTGTTTGATTGGATATGTATTTATTCGCATCGTAATCATGTTTTAGGGGGAAGTATATGAAACTGATTAAGAAGTGGCTTCTTACACAAAGGTTAAGGAATCAACTTATAGAGGTATTTGGAAAAGTAGGTCTATATACGGAACATCAAACACGCGGGGGGAAAGTACCTATTTATCCAAAGGTACATAATATTTCTTCCTCAGCAGAAAGTGTGAGATATGTGTTTACCATACCAAACGGGTTAGATCCACAGAAGATTGAAAAGAAGTGGTTTTGTTTCCAGCAAATATTAGGACGAAATATTACGATTGAAGGTGATGTAAAAAAATTTGTCCTACATGTATTTCGCTCAAATACTGGGCTTAAATCGTACAATTATTGTTATAAAGAATGGAAGTCACTATTAAAAGATTACCGTTTACCTGTTGTTGTCGGTAGGGACCAATTCGGAAAGATGATTGCGTACGATATGATTGACTCCAATTCACCGCACTTATTAATTGCAGGGGAAACGGGAAGCGGGAAAAGTAGTATGGTACGTGTTGTATTATCAACCCTTATTCAATTTATGTCTCCTGAAAAGTTGCAGTTGTACCTTGGTGACTTAAAAAACTCTGAATTTCATTTTTTGCGTAGAGTGAAGCATGTAAAAGAAGTTTGTATGGAAGAAATCGAAATGAAAATAATGCTTCAAAAGTTATGGAAGGAAATCAGAGAACGAAGAAAACTTATGGAAGAATATGAAGTTGATCATATTGATGCGTACAACAAAATAAATCCTAATTATCAAAAACCATATATTCTACTTGCTATCGATGAGGTGGCTATGCTTAAAGATGAAAAAGAGTGTATGGCTACAATTGAAAAGATTTCAGCAGTCGGGCGGTCGCTTGGAGTCTTTCTTATGCTTAGTATGCAGCGACCAGATGCCAAGGTGTTAGATGGTAAGTTAAAACTTAATATGACTGTAAGAATTGGCTTTAAATGTGATAGTGTGATTAATAGTAATATCATGGGTACTCCTGGTTCAGAGTATTTAGAGCAATCTGGCCAAATGATTTTTAAACGAAATGGATTAAAGAAAGTGCAAGCACCTTACTTGTCACTATGTAAAGCCAAACAAATTATTGAGCCATATCGAATGCCTAAAGAGGAAAAAAAATCTAAAAAACCTCTGCAAAAAGAAATGCCTTTATTTGGGGTGCTAGATGATGAAGAGTAGAGATATAGGGATTTTGAATGACCTGAAACAATTTAGGTGTATGTCTCGTGACGATATTATTTATTTACATTTTCAAGGATTAAAGAATGCAATAACTTGTTGTAATACAGTTATGAAACGATTAAGAAGAGATGGGTATGTTGATGCTAACGTATTACAGCACCCATACATTTATTTTCCACAACCCAGTTCTATCAAAAAAACGAGTCAAAAAATTCCTCATTTCCTTGGTATTGTGGACGTATACAAACAACTCGTTCATTATGAAAATCCTAAGCTATTCGAAGTTGAACCAAAGTATGGGAAAGAATATATGGAACCGGATGCTTTTACAATATGGCGTAGATCGCCATTCTTTATTGAGGTTCAAAAGTCAGTGTACAGTAAAAAGATAATGCAAGATAAGATAAATAGATATGAGTTATACTTCCATAGCCAAGAATGGCATAATGAATCTTGGCAACCGAAAACTTCTAAATTCTTTCCTTCAATCCTTATCATTACTGACAAACATTACGACGTTCAATCTTCTTATTTCCGTATATTCCAGGCGAATTCTATAGAAAGTTTTATAAATAATTTAGCGGTAAAATCATAAAGAAAGCCTGCATAGTGCAGAGCTTTTTTCTTTTCAATAGAGAACAGATTAAGATTACAGTGTTATGAAAAATCCAAGAGGTAAACAACTTGAAAAAATATATGATACTTTTTAGTATTTTAGTTGGATGTGTTATCAATCGTATGGGTAAAGATGAATATTATGTTCAAATTAAAATGGATGGAAAAGAGGGAGTTTTAAAATCTATGGATGGTGAGGTTATGGGAAAGGAGTATGAATATACATTATCGAGTTTTAATAAGGGAGATAAAGAAAAGGAGTTAGAATTTACTGCGCATAAGAATCTTCGTAGAGAAGCATTCCTACTTGTATATCACACAGATAAAAAGGGTGTAACAGCTTGGGAAGAAGTGAAGAAAGACGGGCTTCCAACGAAAGCAAAAGAAAATATAAGTATGAAATAATTAGTTATTTGTGACGGCCGATTCTCTTACGTGGAGGGTTAGCTGTTTTTTATTATATTTTATCTCTTATTTTTCTATATAAAGTATATTAAAAAGATAGGGTAAATCTACTTCTGGAATGATACCTCCAAAATTAATAACTTGTACGATAATCTCTCAATTATCACTAAACCCATTCATATCAACAAATTCTCCCACATATCCGTTTGTACCAATACGTTACTAATGTACACATAAAAAATGCCCTTTATCTTATCTTTATCTTATCTTTACCTTATCTTTAAATTTTTATATTAAACTATAAATCTTAAAGTATTGATGTTTAAGTCTAAAAAGGAGCGGGAGATAGATGTTTATTACATATTTTATAAATAACCAATTACCTTTGAAAAATAGAATTTCTTATACGAGGAGGAATATATGAAGAATACGAGTAAAATACGAATTATTATATTATTGTTTATTAGTATTTTAGGTTTAGGAACAATGCTTGGAATACTATATCTTAATCATAAAACCAATATTCAACAAAATAAAGCGCTCGCAACCGAAAAACGTGTTTTGCAATATGAGCTCACCTTGAAAAAAGAATTAGAAAAATATAATTTAGGAGAGAAAACAGCAGTTTTATTAGGAATTATGTATCAAGAGAGTAGAGGTGAGGGCAACGACCCTATGCAGTCTTCTGAATCACTGGGATTAAAGCCAAATGAAATTCAAGAGACAAGCTTGAGCATTAAACAAGGGGTAAAACACTTTGCTAAAATGTACAAATATGGAACGGAAAAAGATGTTAGCATGGAGACAATTATTCAAAGCTATAATATGGGACCAGGGTATATTGATTTTATCGCCAGTCAAGAAGTTAAACAACACTCGGAAGATTCGGCTAAAAAGTTTTCTAAGATGAAAGTTGATCAAAATCCAGCGTTGTACACTTGTGGTGGAAATAAAAATAATTTTAGGTATCCATATTGTTATGGTGATTTCACATATGCCACAAAGGTAAATGAAAAAACAAAACTTATTGAAAAACTTCTTCGAAATGTACATGCCCCTTCTAAATAAGCTGTAAAATGATACTATCAGTCATCAACAATAAAATATTAGAATGTAACTTATATTTTAAATAATTATTTTTTGTTTATATTTTTGTTATGTTCTGATGCAGGATTCCTATAATAGGGGTCACGCAATATAGCTATCAGGCTAACAATACAAAATATCCCCTAAAATAAAAAAAGACGTTATTCTTTCTGAGAAATCATTGAAAAAATAACGTCTTTTTATCGATGTGACGGTATACTATATAAAAAATTTCAATCTTATTTCAATAAGGTGAAATAAGATTGAGACTCTCTTGTTATTTACTTTATGGATAATGGAATGGTAATCAAAAATTGTACGCCTTGTTTTGTATTACTCATAGAATACGTGATAAAAAGGGATTCTAAAATTTGTTTTACAATATATAACCCTAAGCCACTCCCTCCCGTATTTCGATTTCTTGACTTTTCGATTCGATAAAATGGTTTGAAAATATGTTGTATTTCTTCTTCTTTTATTTTGACACCTGTATTGATAACTCGTATTTGGATGTTGTTTTGTTTAGAATCCTTTGTTAACTTTATATAGACTTTTTCGTTATAAGGTGAATACATAATCGCATTATGAATGATATTTTTACAAGCTTTTTCTAAAAGAACATAATCCGTATAAACAAAAATGTCAGAATCGACTTCTTTTATTATTTGAATGCCTTTTTGAGAAGCAAAAAATTCGAGGTTTTTTGTGATTGTATCTATTGATTTCGAAAGATTTACTTCTTCCACTTGAAGTTTAAAGGTATGTTGTTCTAATCTTGACATGCTTAAAATTTCGCGAACCAGCTGTTCCAGATTTTCGATTATTTGGAAATTTTTCTTTAAATATTGGTCACGATTTTGATAAGGGCCGATATTATATATCATCCCTTCTGAGTATCCTTTCATAACAGTAAGAGGAGTTTTTAATTCATGTGCTACAATAGCAAAGAATTCCCTTCGCTTTGCTTCTATTTCTCTTTCTTTTTCAATATCACTTTTCAATTGATGATTCGCTTTTTGTAAATCAAAAATTGCCTGTTGTAAATTGATGGACATATCATTCAAGCTATTGGACAATTCCCCTAATTCATCCATAGAACGAACCTCAATTTTTTCGGAGAAATCCAAGTTTGCCATCTTTTGTGCACCTTCATTAATATAAATAAGTGGTTTAGTAATAAACCTTGAATAGAGATAAGCACTTCCTAAACCAATAACCAGTACAATGATACTAATATAAGGTAGAAAACGTACCAAGACCTGTGAAGCTTCATCGATCGGTTGAAATGTTGCGAACACCACAAGCGTTAAGTTAACATCTTGGAATTGTATTGGCTTGGTAGCCTCATATGAATTACGAGATTGAGCCAAACCCTTTATTGGTACTGTTGTAACAAAACCTTTTGCTGGAGTACCCCCCTGAACAGTACTCCCCTGAACAGTACTCCCTTGAATAGTACTTTTAAGAAAAGGATAATAAATAACCCTTCCCTCATTGTCTTGAAGATATATCATTGCATTATTTTTTTGTGCGTATTCATCAACAAGTGGTGTTGCATTTTGAAGCGTAAGATCTTTAGATTTATCAATTATTTCTTCGATTCCCGTTTGAAGCTGATCTGTTTTGTATTTCTCATAAAATTTAGGGAGAAAGAAGTATAAAGTTACATAAATTAAGGCTGCAAAGGCTAACAAAATGAGGGATGTAGTCATAAAGAGTTTATAGGTAATTCTCTTCATCTTCATGATTTTTACAATCCTATTCATCGATTTTATAACCAATGCCCTTTACTGTTTTAATATAGGGTATATCTAATTTTTTTCGTATGTTTTTCATATGCGTATCAATCATTCGTGTGTCTCCGGCATACTCATATCCCCAAATTTTTTCTACGATATTTTCTCTTGTGAGTACCTTTTTTTCATTTTGAAGTAGTAGTTGCAAAATTTCAAATTCTTTTGTCGTTAGGGGAACTTCAACTTTATTTACATATACTTTATATGCATCGCCATTGACATGTAGTTCTCTAAATACAAAATGATTATCCGTAATTTGATTATTACTTCTTCTCAGTACTGCTTCGACTCGTCTCATCAAAACATGAAAAGAAAAAGGTTTCGTAATATAATCATCGATTCCAAGATCAAATCCTTTCATTTGATCTTGTTCTTCTTCTAGCGCAGTTAGCATAATAATTGGTATATTTGACTGACTTCGAATCATTTTGGCAACTTCAAATCCATTTAGGTTTGGCATCATCACATCTAGAAGAATTAAATCGAAGGATTGCTTATTAAATTGTTTCATGCCCTCTAATCCATCTGATGCAACTATAACTTTATACTGTTGTGTCATTAAAAATTGTTTGATTAATTCTTGTATTTCTTGATCATCTTCTACCACCAGAATGTGATAGTTCTTCATAATATCACCTCTTGTAGTCATTATAACCTTCCAATCTGGAGTTGATGTGGAGACGTATTAGAAACACTATAAAAACTTCACAAGAAAACTACATGTATTTCAAACCAGCTCCAGATGCATGAGATAGGTTATATACATAACAAGACAGAGGGAGGTAATTAAGATGTCACTGGAAGCAAACATCATTCTTTCTTTATTAGATGTACAACTGTGGATGGTCCCTCATTCGAATAATAGACGCATCAAAGAGGAAAAACAAAAATTGAAATCAGCACCGTGCTTAAATAAATACACAAGTGTAAATAAAAGAAAGCTATATAAGTCTAGTGAACAAAAATAGGGAGGATCAAATTGATTCTCTCTATTTTTGTATTCAATAACTAGGTACTGAAAATCTTTACTATAACTCTAGATTAACTCCATATAGAATACAGATTAAGTTTGTATGATACATGTACCAAATAGAAAGGAATGATACATGATGTTGACGACTTACACAATCTATCAAATTTTATCCCTTCCTTCTTATTTACACACAAACCTATTACCATCCATTCTCACGAGAATGCTAGGATCTAAGTTTATAACAAAAGAATAAATAAGTTAATGGATGTTTATTGTCCCTTGTTTCCACTTTTTGCAAAACACCTGTATAAACACGCATGCTACTTTGTACATTGAATACCCTATTTGTTGAGAGCCGAATAGGCTCTTTTTTTAGAGACAAGCTCGAAATGTATTTAGATATTGTTATATATATTCATAGAAAAATTAAAATATAATGTTACCCCCACGAAAAAACAGTTGATTTATGTCTAAATCATGCCTAAATGTAAAAATTTCTTTTTTTGAAATGGTGATTCCTAAATATTACATTCATACATTGTATTTCAAATATGAAGAAAAAAATGTTCAATTGTAAATTAAAGGAGAAAGGGATGTTCACAATGGGACACTATGGTACAAATCAAACAGAAAGCAATAGGAATAAAGCCTATAAAAAAACAGGATATTTTTTCACAGGAGTAATTGGTGCAGTGATTGGTGCAATTACCATTGGGTTGACCACCCCTTATATAAATGAAATCAAAGGAAATGCAGGTCAATCTCCTAAGCATAACGAAGTAAATCAGGCTACGCCGATCTCTTACAAGCCAGAAGATGTGAGCAATCCTCAAAATATGATTGAATCTGCAAAAGAAGTTGTCGTAGGTGTCATTAACTATAAGCAAAATGCAGATTCATTTAATACGCAAGATCAATCAGAAGAAGCTGGTTCGGGATCGGGGGTCATATATAAAAAAAACGGCAATAAGGCTTTCATTGTTACAAATAATCATGTGATAGACGGTGCGAATAAAGTAGAAGTTAAATTGAATAATGGTAAAAAGGTTCCCGCTAAAGTAGTAGGGACAGACCCATTATTAGATTTAGCGGTATTAGAAATTGACGGGGCAGATGTAAAAAGAGTCGCAACACTTGGAGACTCAGAAAAAATTCGTACAGGGGAAACGGTAATAGCCATTGGGAATCCATTGGGGCTAGAAGGTAGTGTAACAAAGGGGATTATTAGTAGCAAGGAACGAGAAATACCTGTTAGTACCCTCGGAAATCAACAAGTTGATTGGCAAACACAGGTAATTCAAACAGATGCAGCTATTAATCCTGGGAATAGTGGAGGAGCTTTGTTTAATGAACAGGGTGAAGTCATTGGAATTAATTCGAGTAAAATTGCACAACAAGCTGTTGAAGGAATTGGATTTGCAATTCCGATTCATATAGCCAAAACGATCCTAGAGTCTCTTGAGAAAGATGGAACAGTTAAGCGTCCGATGATGGGTGTACAGTTATTAGATGTGGAGAAAATGACAGATTCTGCACGTAATCAATTAAAATTACCAAAAGAGATATCAAATGGTGCCGTGTTGGGGAATATCTCAAATCAATCACCAGCAGAAAAAGGTGGATTGCAACAATATGATGTTGTGATTGCATTAGATGGACAAAAAATAGAAAATGTCGTTCAATTCCGTAAATATTTATATGAAAAGAAAAAATTGGGGGATACAATTAAAGTAACAGTTTATCGAAATGGTGAAAAACTAACAAAAACCGTGAAATTAATGGAACAAACACGTACCACTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_018689|318773:326951|319104_320271_+|WP_000767011.1|DBSCAN-SWA MKLIKKWLLTQRLRNQLIEVFGKVGLYTEHQTRGGKVPIYPKVHNISSSAESVRYVFTIPNGLDPQKIEKKWFCFQQILGRNITIEGDVKKFVLHVFRSNTGLKSYNYCYKEWKSLLKDYRLPVVVGRDQFGKMIAYDMIDSNSPHLLIAGETGSGKSSMVRVVLSTLIQFMSPEKLQLYLGDLKNSEFHFLRRVKHVKEVCMEEIEMKIMLQKLWKEIRERRKLMEEYEVDHIDAYNKINPNYQKPYILLAIDEVAMLKDEKECMATIEKISAVGRSLGVFLMLSMQRPDAKVLDGKLKLNMTVRIGFKCDSVINSNIMGTPGSEYLEQSGQMIFKRNGLKKVQAPYLSLCKAKQIIEPYRMPKEEKKSKKPLQKEMPLFGVLDDEE >NC_018689|318773:326951|318773_319094_+|WP_001214906.1|DBSCAN-SWA MRGRKETISFREFMNRSYEDKEQKIRKYNSLSSFAFLHMSDQVLNTYIALGIMGTVLIGAVMLEKYLVRHDYISAAKFVSEGIYHGIRIGGVCLIGYVFIRIVIMF >NC_018689|318773:326951|320311_320869_+|WP_014990779.1|DBSCAN-SWA MSRDDIIYLHFQGLKNAITCCNTVMKRLRRDGYVDANVLQHPYIYFPQPSSIKKTSQKIPHFLGIVDVYKQLVHYENPKLFEVEPKYGKEYMEPDAFTIWRRSPFFIEVQKSVYSKKIMQDKINRYELYFHSQEWHNESWQPKTSKFFPSILIITDKHYDVQSSYFRIFQANSIESFINNLAVKS >NC_018689|318773:326951|320958_321294_+|WP_000760455.1|DBSCAN-SWA MKKYMILFSILVGCVINRMGKDEYYVQIKMDGKEGVLKSMDGEVMGKEYEYTLSSFNKGDKEKELEFTAHKNLRREAFLLVYHTDKKGVTAWEEVKKDGLPTKAKENISMK >NC_018689|318773:326951|324138_324804_-|WP_000800731.1|DBSCAN-SWA MKNYHILVVEDDQEIQELIKQFLMTQQYKVIVASDGLEGMKQFNKQSFDLILLDVMMPNLNGFEVAKMIRSQSNIPIIMLTALEEEQDQMKGFDLGIDDYITKPFSFHVLMRRVEAVLRRSNNQITDNHFVFRELHVNGDAYKVYVNKVEVPLTTKEFEILQLLLQNEKKVLTRENIVEKIWGYEYAGDTRMIDTHMKNIRKKLDIPYIKTVKGIGYKIDE >NC_018689|318773:326951|324967_325144_+|WP_000050963.1|DBSCAN-SWA MSLEANIILSLLDVQLWMVPHSNNRRIKEEKQKLKSAPCLNKYTSVNKRKLYKSSEQK >NC_018689|318773:326951|322661_324125_-|WP_043324884.1|DBSCAN-SWA MKMKRITYKLFMTTSLILLAFAALIYVTLYFFLPKFYEKYKTDQLQTGIEEIIDKSKDLTLQNATPLVDEYAQKNNAMIYLQDNEGRVIYYPFLKSTIQGSTVQGSTVQGGTPAKGFVTTVPIKGLAQSRNSYEATKPIQFQDVNLTLVVFATFQPIDEASQVLVRFLPYISIIVLVIGLGSAYLYSRFITKPLIYINEGAQKMANLDFSEKIEVRSMDELGELSNSLNDMSINLQQAIFDLQKANHQLKSDIEKEREIEAKRREFFAIVAHELKTPLTVMKGYSEGMIYNIGPYQNRDQYLKKNFQIIENLEQLVREILSMSRLEQHTFKLQVEEVNLSKSIDTITKNLEFFASQKGIQIIKEVDSDIFVYTDYVLLEKACKNIIHNAIMYSPYNEKVYIKLTKDSKQNNIQIRVINTGVKIKEEEIQHIFKPFYRIEKSRNRNTGGSGLGLYIVKQILESLFITYSMSNTKQGVQFLITIPLSIK >NC_018689|318773:326951|325742_326951_+|WP_000494789.1|DBSCAN-SWA MFTMGHYGTNQTESNRNKAYKKTGYFFTGVIGAVIGAITIGLTTPYINEIKGNAGQSPKHNEVNQATPISYKPEDVSNPQNMIESAKEVVVGVINYKQNADSFNTQDQSEEAGSGSGVIYKKNGNKAFIVTNNHVIDGANKVEVKLNNGKKVPAKVVGTDPLLDLAVLEIDGADVKRVATLGDSEKIRTGETVIAIGNPLGLEGSVTKGIISSKEREIPVSTLGNQQVDWQTQVIQTDAAINPGNSGGALFNEQGEVIGINSSKIAQQAVEGIGFAIPIHIAKTILESLEKDGTVKRPMMGVQLLDVEKMTDSARNQLKLPKEISNGAVLGNISNQSPAEKGGLQQYDVVIALDGQKIENVVQFRKYLYEKKKLGDTIKVTVYRNGEKLTKTVKLMEQTRTT >NC_018689|318773:326951|321714_322362_+|WP_000799428.1|DBSCAN-SWA MKNTSKIRIIILLFISILGLGTMLGILYLNHKTNIQQNKALATEKRVLQYELTLKKELEKYNLGEKTAVLLGIMYQESRGEGNDPMQSSESLGLKPNEIQETSLSIKQGVKHFAKMYKYGTEKDVSMETIIQSYNMGPGYIDFIASQEVKQHSEDSAKKFSKMKVDQNPALYTCGGNKNNFRYPYCYGDFTYATKVNEKTKLIEKLLRNVHAPSK |
9 | Bacillus_phage(85.71%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
358204 : 374836
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_018689|358204:374836|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_018689|358204:374836|372507_373041_+|WP_000406976.1|DBSCAN-SWA MEITVQDIKNRVNVQRMPDTVIQDLISQYELITKNYLRGKPSNPMKEKVRTSKLAWLSFRVENLIKVIHIGSGEEVTNSVFSDGCTVYGLSENQLYEFEYTIQDYDGLLTLMKKCIIDMTCYAVIRTNLQYENMKKSANIGDYSYEINIESLDEETVNKKVLKVLKKYRSRNPLIAL >NC_018689|358204:374836|363265_364048_+|WP_176548852.1|DBSCAN-SWA MNFLSDTCLICKQERKRMVRLMEIQGETICPVCRLEEENRRLEKEMNVFRYEKEERKRKSIFYDHSLIKDETIKLARFSTFISECEEDENNLILAKKALTDYLNDIRFNLILVGKVGAGKSHIAYSIAHEMNEQSSNKVMYVTSSELFDYIRSTFNTQSCETEHSITNMLISMDLLVIDDLGAELGDMDINDLKATAFVNRVLFKLFDGRQGKKTIITTNLTGEAIIKAYDERVTSRMFNTYRHVEFKKTRDKRKRKLPF >NC_018689|358204:374836|371332_372313_+|WP_001060156.1|capsid|DBSCAN-SWA 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MVFMPPRHSKSQSITETLPSWYLGNYPNKRVIEVSYASSLAEKFGRRNRAKIEEFGKEIFNIRIDERQGSVTDWALHNHSGGMLSVGVGGSITGEGADLLIIDDPIKNRQEAESITYRNRLWDEWEDTLSTRLQKGAKVILILTRWHEDDLAGRLLEKEQEKWTVLSIPAIAESKDDPLNRVIGRGLWVEHYGQNYYEDKKKFSSARSWLSLWQQKPSSDIGNIFKRNWFQYYDVLPNWEQFDQIITSWDMAFDNTTNKSSFVVGQIWGKVDGDKYLIDQVRAQMNFLETKKAFVVFHHKYESILRNSGFKKSIPKLVEKKANGPAIISSLKNEISGIIPINPQGSKETRAEAISPEFQSGNVYIPNPKIQSWVYDYVDELASFPSGKHNDQVDTTSQALEYFFTKQKKVMGGKIKRV >NC_018689|358204:374836|362517_363282_+|WP_000096620.1|DBSCAN-SWA MSSLLIQDEPLLVLPRLASKIGLNEAIFLQQIHYWLKRSKHYYDDRYWVYNSITNWHKQFPFWNERTLKRIVKNLEEFNLLISGNYNKLKFDKTKWYSINYNRLVELEIDNDCDKLSQRKEHIVMMENDNMSQPIPETTQKINSENTTQKDIVEIINYLNSVCNTSYRISTKKTQMLIKSRLQEGFNINEFKEVIETKAKEWLYTEQAKYLRPETLFGTKFEGYLQQRKMVKSNGFNKGNRYSTKSFEENELPF >NC_018689|358204:374836|373810_374227_+|WP_000208341.1|DBSCAN-SWA MTTKAIATIRNIIEKDTIVQSNLSKYEGEPALTFQTAQKDMKMPYAVMRIESNNPDDIEVIDRMILTFDIYCGQGDYEKADVISRRIEHLLDREAGLLRDSGIITIHRAGSVAVPDEDPSIIHISIKFLVRVGRMELY >NC_018689|358204:374836|360639_361284_-|WP_000834515.1|DBSCAN-SWA MKSFGLKLSQLMKKNNMTDEQLAELLSVSRTTVLRWRNGERSPKMSKISQIAKMLNVPATYFIDENESYCPEDHIITKRDIPIYGTIAAGKPIEAIENVIGDIQVPDIILDKYGFEKLLALRINGDSMNRIVHDGHIAVLERTTNINNGDIAAVLINGYDATLKRIYKTNNRIILEPDSFNPSIHPLMFDCTDIENCPEIKVVGKYIWSCAPIQ >NC_018689|358204:374836|364283_364922_+|WP_001261480.1|DBSCAN-SWA MRTYKGFEAIKRMKTNWITTVQETPMCWKIEGERVIADYLGKKESYQQINFFFENEFIDCRETIRKGELLYIENENSEKFIAEYCKENEKEIKHGSWFWINGEEFSNNYGHFEKRTKLKIRKAEKSEKLLFERAKLFAIKGRKIDEFRLGDVIERDNKLYKVAIVKSGSESQIVVGCVPINGGAICYYNSKDIEIQFFVEDMVVWQDEVIFN >NC_018689|358204:374836|373069_373396_+|WP_000392019.1|DBSCAN-SWA MEELYIHEVTVKRNQKVKQPAGNFKEEPVIIYERMKCRVTTHTAVDNERLKRNKQNFEPNFKIYTSAEHNIHTNDVIYFHDYVFEVRGEPRNPSFLNHHIELYCELLE >NC_018689|358204:374836|361421_361622_+|WP_000549411.1|DBSCAN-SWA MHKMIFLERKLKRKTIEEVADFLNVSPRTYWAKEHNKSEFTLKEAHMLSCYLEKSIEELFPDLFFK >NC_018689|358204:374836|365793_366294_+|WP_001205172.1|DBSCAN-SWA MRDLIIQYKETLCKLERAKTSAKEEEIKILTSMISDVTYALEWMKNAKMPGNRRGIERRAAYQREKSYDSLLMQRYFRSTDTTYEWDDENKESVISEWERIKLEDALSTLTKYEREIYIMSRGRGITQEKIAKYLNVSRSTIKTILYRSEIKIAKQVRKSLFCESS >NC_018689|358204:374836|366527_366713_+|WP_000892958.1|DBSCAN-SWA MLEQDIDTMPICSICLEKCLWVLKFPITIQYCEQMFIREVVDDNITTICIECLEKEVQMMS >NC_018689|358204:374836|372329_372494_+|WP_080595761.1|DBSCAN-SWA MKIIELELGVTYTAYGYTFFNGVKEKVANEKANYLLSTGHFKLIDSIEVKKKEK >NC_018689|358204:374836|358204_359026_+|WP_000477260.1|DBSCAN-SWA MFKTIDTNQKDVKLTVFSSDEKSFMVTATLVEKAGHAFLINSKFTQSDSKEIVEYLKKNDLSLDKIFIIHGDPDYYFGLESIKAAYPEAIAYATESTVEHIVHSVLGKLKVWKDTLGENAPSNVVLPQVFKEKAIDFQGLTFELVGLDYYRTSLFNKELKVLIGGIDVFNEIHVFLADTSSKAAMEAWIENLKVLQALHADIIVPSHGSIEKSLNNQALTATMDYLRTAIQASEESGASKDFVAKLEAAYPGYANKGVLELSAKVVTKEMPWG >NC_018689|358204:374836|365142_365523_+|WP_000931949.1|DBSCAN-SWA MLNIELPVLNKEATKENVLKAIKKYRLFMKCNYLNETILSNENILKENAKEERINYIIAMNKGLEKLDIESDRIIIQKYLLKNRVNRYEVMKELNLSEGDYYRKRNTAFYNYAYALGIEVEECKDY >NC_018689|358204:374836|359030_359423_+|WP_001046354.1|DBSCAN-SWA MNKYQKLLHETYALTGEGKLDAFKTYLSENVSWTEAAGFPYAGTYIGPDEVVKNVHERLGTEWDNYSAKDEIYTFNNNTVIVYGKYSGTYKATGKSFIADFCHLYEFDEKDKVKKFIQIVDSATVNEVLR >NC_018689|358204:374836|368752_370093_+|WP_000229506.1|portal|DBSCAN-SWA MVEKKAIKNVKVLKLQSREMTLRKEELQSKQMAIDPFAQVYGDKELVKPPYDMQVLLNLRESNPIHSACISAKVNDIAGMGFDFAPLDEVTEANQEQYKELKRFMRYCNNEMTSSEILRAVWEDYETVGWGIIEVVRNLKGEPAQLHHIPAHTVRAHKDKIRFAQIVNNEERWFKRFSYPYDFRLVDGETISDSLDENSLLDTEEKAGEVIVIRKFGSRSSYYGIPDYVSSIGSIVGSQAVRDYNINYFTGKTIPDAVLFVEGVDEIDDSVERELKTFFSVETKGEHHKLAVVPVPEGAKARLEKLGPDVKEASFRLYRQDNAMEICVAHRVPPYRIGWAMTGSLGQTTAKEMNEMYKRSIIEPGQQILEHRLNTQLFKEFTGTLGELDWQFQLNEIDTDDRASDMQYAIDGYEKSILTRNECRKVIGYEPVLEGDKFLNEDSNSI >NC_018689|358204:374836|373397_373814_+|WP_033663286.1|DBSCAN-SWA MTNTSEFMVTRNVEQVKEQLNKIMVERIISACNQLQREMKQTVSGSHNGVKYKIPRSSRTYIASKPGETFASRTGELQDSIKYGLHITDTEVVGTIGSQLKRAVYVENGTSTVEARPFFLKTFEKERGELKRTLGGEQ >NC_018689|358204:374836|366730_367222_+|WP_000113634.1|DBSCAN-SWA MARPMKLNDELINRLTQYIKVGNYIETACALVGISRSIVYVWLKQGRRAIETSEKTGEVVPRKDKIYVKLVMEIDQALAFSEARDVETIGEHAKSNWKAAAWRLERKFPTKWGRKDQLQANVNHSGEMKVEHNKMAMKIGCDEEMLDLAMKLFEKVQGGELQS >NC_018689|358204:374836|359576_360101_+|WP_000764188.1|DBSCAN-SWA MKLEKNLIITIISVFILGVVSTLVYQASTGNNKANSIKSENVSSVSKEATENEKNKKMVVDFYNEVFNKHNIDIIPKYVSEDYKQHNPFVADGRKAFMDFFKEDFVKNPNSSAEIKRVVAEGDTVALHVHSRTNSQDKGVAIVDIFRIKNGKIVEHWDVIQEIPSEAANDNTMF >NC_018689|358204:374836|364902_365079_+|WP_000765289.1|DBSCAN-SWA MKLFLINQLIENGIYKYKDKQLYELNSDELIKLIKNHKDKKINVSNTICEIIHKERKP >NC_018689|358204:374836|370121_371312_+|WP_001132396.1|DBSCAN-SWA MPNELKNVEISYVSLVTKGANGRPFAIMKGMNMNGSNVLKNVPILKREDEKQLVTGVVYEPNIEDAHGDIMTAEEIERAAYNFLEKYRYIDKNHDELAGKGTVVESWISKNNTVVGKQNIKKGTWLMTVRVDDSETWKEIKKGKITGFSMGGVGERMEMPQMDEFTQDEKGVIRKMFGFFKSQYDEEQTQEMDNQSLNNKQNSKMQKVFNLFEDVFYVGIWEGNVDIKRMVSTLDEMKDILNTMKGGDTDFSPEDITINSINEVGKILYKKDDKKFDEMISLMNQIQENKLQKNADQNVDEIADIVKREMGPFLERLQELEEQLNKELESTHDTNELENDRESKKTSEFIQKVIDPISKRLEVIERSAQVRKSLGADAKPTNEMRKPVNKWVGLDL >NC_018689|358204:374836|362152_362437_+|WP_000231465.1|DBSCAN-SWA MVFKVTKKPGYVSKSTNENEEFSNTSCFESEKLSNKQLKMIYAKMQILALKYDGVISKEEIKNKLKEKLKIQSLSDLTRKQANQAIQILIGWEI |
24 | Bacillus_phage(42.86%) | terminase,capsid,portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
269814 : 276349
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_018688|269814:276349|DBSCAN-SWA CTTATTCTACTTTTACAGTAAGACTATCTAAGAAATTACTAATTGAAGAAGCTTGAAAAATACGTAGATTAAAAGAGCTAATATCATAATGCTTTTCAGTAATTATAAGTATTGATGGAAAGAATTTAGATTCTTTTGGCTGCCAAGATTCGTTATGCCATTCCTGACTGTGGAAGTATAATTCATACCTATTTATTTTATCTTGCATAACTTTTTTACTGTAAACTGAATTCTGAACTTCAATGAAGAATGGAGATCTACGCCAAATTGTAAATGCATCAGGTTCCATGAATTCTTTACCGTACTTTGGCTCCACTTTAAATAGTTTCGGTTTTTCATAATGGATAAGCTGTTTATATACGTCTACGATGCCGAGGAAGTGAAGAATCTTTTGGCTAGTTTTGCGAAGTGTGCTGGGTTGAGGGAAATAAATGTATGGCTGCTGCGAGATATTGGCATCCACATGGCCATCCCTTCTTAATCGTTTCATCACCGTATTACAGCAAGTTACTGCGTTCTTTAATCCTTGAAAATGCAAATCAACAATATCATCACGAGACATACATCTAAAACGTTTCAGATTGCTAAGTATGGCTTTGTCTCTACTCATCATAATTTAACACCCCGAATAATTGATTTTCTTCTTGTGGTGGATTTTGAACTTTTATATTCTCTTTTAGAACACGATAAGGTTCAACCATCTTCTTAGCTTTACTTAATTCTAAATAAGGAGCTTGCACTTTCTTTAATCCATTTAACTTTAATATCATTTGGCCAGATTGCTCCAAGTGTTCTGAACCAGGGGTGCCCATAATATTACTGTTAATCGTACTATCACACTTAAAGCCCATTCTTACGGTCATATTCAGTTTCAACTTACCATCTAATACTTTTGCATCAGGACGTTGCATACTGAGCATCAGAAAGACTCCAAGTGCCCGACCGACTGCCGATATCTTTTCGACTATAGACATACACTCTTTTTCATCTTGTAACATTGCCACTTCGTCAATCGCAAGTAAGATATAAGGCTTCTGATTGTCAGGGTTCAATTTATTGTATTCATCAATATGGTCCACTTCATACTCTTCCATTAGTTTTCTACGCTTGCGTATTTCTTTCCACACTTTCTGGAGCATGATCTTTATTTCGATTTCTTCCATGCAAACCTCTTTTACATGCTTTACTCTTCTCAAAAAGTGAAACTCGGAATTCTTTAGATCACCCAAGTACAAATGTAATTCATCAGGAGACATGTGTTGAATAAGTGTAGATAACACAACGCGAACCATACTACTTTTACCGCTCCCTGTTTCTCCTGCAATTAGAAGATGCGGTGTGTTTGATTCAACCATGTCATACGTTATCATGTTGCCGAATTGGTCACGCCCTACCACTACAGGAAGATGATGTTGTTTTAGTAATGTCTGCCACTTCTTATAACTGTAATTGTATGCTTGTAGCCCTGCATTCGAATGAAATACATTAAGTACAAATCGTTTAATATCACCTTCAATCGCTATATTGCGCCCTAATATTTGTTGAAAGCAAAACCACTTCTTTTCGATGGTCTTCGGATCCAAACCGTTTGGAATGGTAAATATATATCGAACTTTTTCTTTCGTGGAAGTAATATCATGTATCTTCGGATAAATTGGTACTTTTCCACCTCGTGTTTGATGGTCCACATATAAACCTGCTTTCCCAAATACCTCTATAAGTCGATTCCTCAAACTTTGTTTATGAATCCATTGTTTGATAAGTCCCATGTGACACCCCCTAGAACATGATTAGGATTTTGATAAATACATAGCCAACGAAACAAACTCCACCTATCCTCATTCCATGATACATTCCATCACTTAAAAGTTTAGCTGCTGCAACGCGATCATTTTTTACAAGATGCTTTTCTAGCAGCACCCCTCCAATTGTCGTTACTCCTAAAACTCCTAAAGAGATAAATGTAGTTAACATATAAATCTCCCCTTTATAAACAGAATTTTGAACGCTGATTATATATAGATTTATAGGCCTAATACCTTGGTAGCATTACTTTGATAGCTACTTTGGTAGCAACCTTGATACATCATATTGTGGATGGCTTGTACAATATTCAAACTTTCGTGAAGTTTAAAAAGTTTAATTTTTGTACATACTTTTTACCAATTAAGAAAGTAAGGGAGAGGAAATGATGTTTGGACTAGGTAAACAACGTTCGCGTTTTGGTAAATTTATTGATAAAAACGGGCTTTCGCAACAAGATATAGTAAAAGAAAGTGGAGTAAACAGAGGGACCATCAGCAGGATATGTCAGGGAGATGCATTCCAACCTTCATTGAAGAATGGGAATAAGATTATAAGAGCGTTAAAAAAATTAACAGGTAAAAATGTTGATTATAATGATTTTTGGATATAGCTGACTAAACGTGGTCAGCTTTTTATATTGTTGAAACTTTAATAAAATAAAAACTAGCTGACTCGTGAGAGACTGCTAGTTTTTGTTTTATATTAAAAAATTCTAGCTCTAAAGTGTACGGAACTGTTGTTACTTCCATTTGGATCAAAAATTTTAACAACATAGGTCCCACTTGTAACTCTTAAATCTCTTACTTCAGCATACTGCCCTTGTGATGTTGCTCGCTGGATTAAAGATCCGTTTTTATAAACTTCAAAAGTCATTTTATTACTAGTGGAGTATTTATTCATCCAAAAATTTACATATGAATATGTCCCGCCACCTAATGGTGTTACATCGAAATAATAAACATCGTCAGCCTTCGCTCCGCCAAATCCTGCAGTATCTGTATCAAATACTCGTGTGTTTGAATTTAAATCCGCATGAACTGTGAAACCACCTAAGGCAAAAGAGTTATGTTTGACATCTGATTTATTAAGAATATTTACCGAATTTAAAGTTGGTGAATTGTTTTCCTCTGCACTTGCTGCAGTTGTTCCTATTAATCCTAATCCACTTAATCCAATTACCCCAGCTAGAGCAACTCTTGTAAAGTTTTTAACTATTTTCATTTTTAAATCCCCCTTTTCTTTTTTTAATATCACCACCAATTTACAACTGAATTCTAGAAATGTAAATATATACTAATTTTATAAATAAAATTTAAAAAATTGAAAATATTCAGTTAATAATTACCATTCAAGATTACCACTATCTATTATCCTGACAGATTGCCTACAAGGGAAATAACATAAAAGGTATTAATATTATTTCGGGAAATTGTCCCTAGAGTCATAGTTGATGACTTTTTATTTCCTGAAAAAACCCCTTTATAAAAGAACTGAAATTCGTACTTGGTATGAACTAACATTCTGTTGTTTAGGGGGATAATCTGGATTAAATGCAAAATTTACATTTGAAGAGTTAGTGAGGATAAAAAAGCGTCCAATTAAGGACGGTTCTTATTTTTCGCTTCACATATACATTGCTTTATGATAGTTTGACAACTTTTGTTCATTATTATGTACCTGTTTCTGGATAGGTTGAGTTACACAAAATGACCTGTGTGTTACATGAAGCTCGTTATCTCTTTCTCCGTATGAGCCTTTAATTTATTTTTGGTAGTGGAGAATTGTTTTCTTCAATTAAATCATTAATAAATTTGTCTAATACACTTCCGGCTGCTTCTCGCATTTGCTTTGGTGTTGAATTATTAAACACCTTTTCTATCTCCCCAAGTAGTTGTTTTAAAGAATGGTTGTCTTTGCTATTTTCTATGAATTCCTCACCTAATCCTTGAACAAATGTACTAATAACAATTACCTTTTCCAATTTAGTTAGTTCCAACTCTATTCCTCCTATCCAAATTACCATTCTCACCAAACATGACATCTTCTCTAATTAATACAAACGTACCAATCGTCTTTGTGTTATGACAATGTGATATCTTGGCTGTATATATTCTGTGGTCTACGATCAATGGTACCGTAGCAATTATCTTTCTTCTGTTCTTTATCAAAAATATGCGAGATATTATCAAGAAAAATTATAGAACCTCATTAAAAATTTACTCATAAAGATCGGATTACAATCTTTGATTTATTCCTATTTCATAAGACATTTACTACCTTAATATAGTTTTTAGTCTAGAGCACCATAATCTCCAATGGTTCTCTTTTATATTCAAATAACCCCTATCTATTTTGGACAAATTTACCGGCTGAATTAGCAGAAACTTTGTGTTATTCTGAACTTGTTGGATATCCCAATACATTCAACAATGCTCAAAATTGCATATTTATTATGCAACCATCCATCCAGATACCTTAGCTAATACTTCTCCCTAATTGTCGCTATTGCTAAGGTATCTTTTTAGATGTCCTGTGTGCAGGGCGTTCTATCTCAGTGATAAATCTATTTTCCCCATCATGTTATCAATACTTTTAGTACATGTTCTTAACAAAATTCGATTTCATATTTTTACTTTATATATAGATTTTACGTCTTTAAGTTTTGTTCTTATCATTTTGAAATCTTATGCTAAAATCTAAACATATTTTTGGACCACTAAACTAATATATAAAGTTTAAGTAACAAACTTTTATTTCATATTAAATGGTTTCCATAAAGATAATGCAAATATCCAAGTAGGATCCCCATTTCCTTGATAGCTTTGAACTGCTTCATAAAATTTCCCTTGATATTCTACTTTGTCTCCTTTTGTATATGCCTTTTTCGGATCCCATTTTTCATACGTTACATTTTGACTCTTTGTTGTCACTGTAAGGATGTTGCTTTGAACCGAGGTATTTCCAGCCGTATCTACAGCCTTTACAGTATATTTATATTCTTTATTAGCTGTAAGGTTTTGATCAGTGAACATTGTCCCTTGTACAGTTTGAATCAATTGTCCATCGCGTAACACCTGATATTCCTTTACACCCACATTGTCTGTAGAAGGATTCCATTTTAGCTCTACACTGTCTGATGCAACATCGCTTGCATATAATGCTTGTGGCTGTGTTGGAGCTTCTGTGTCCGGTTTCGCATTAACAATTTGACTTACTTTCTTCAGACCATCCTTTGTAATTTCATATATTACTTTTTTATCAAAGCTTTCGCGTTTATTATTATCTAAATTTGTTAATGTTGCCCTCTCTCCACCTTCTAGGTGTGTAAGTTCAATAAAATCCCCCACTTTTACTGGGACTGTTTTTGATTCAGCATTTTGTCCTTTATTCCCATAAACCTCTTTGTTATATACCACTTTACCTGATGTATCCTGTACTTTAATACTTGCATACGTGCTATCAAAATAATTGTGTGGTGTACCTGCCATTAAGTTAACTTGTAATTCTTCTGATGACTTATTTAAATTGACTTTTGCAAATTCAAAATCTCCTATACCTTTCATCGACCATGCAAACGTATCCCCTTCTAAAATGTTTGGAGATTCGTTTTTTATTTGTACCTTTTTTTCCACAGTTTGATCAAATATATCCGTTAATACAATTTTTGCATAAGCATTTGTTGGTAATGATATAGATTGACTGATTCCATTTTGATAAGATTTAATATCATCAATTACGTTAATAGGTTGGCCCGTCATATTTTCATTGTTATAAATTTCAATTTTCCCCTTAAATTGCGGTGTACTATTTTCTTTTAGTTTCCAAGATACATTTAATTTTTCATTTTCATAATATATAGACTTTATATCATAATCTAGTTTTCCTATTTCAGGTTCGCTAGGTTGATTTAACGTGAATGTTTTTCCTGCACCAATAGTTGATTGAGAGTTTCCCCCAGCCTTAAACCAAAGATATTCTGAAGTAGCTCCCCCATCCCAATTATTATTCAATGGCTCTTGCCCCTCTATTGATTGAGTATTCCAAGATGTCCATTTTTTATCTGAGATATTTCTTCCATATCCATTTTTTACACGTGCCTCTCTTACATCTTGTCCATTACCAAGCCAGTCTTCTTGAAACAGCGTTTGTCCATAGTTAAATGTAACGTTAGGAACTGGAAAGTCCATAATCCCAATAAGCTGCCATTGGTTTTTTGAAACATCTTTTAACCACTGTCCAAATTTTGTGTGTCCATTCTCTTGCCAAGAACGCATTGTCATGCGATACCAATTATAATTCTTCCAATCATATGTCGTCTGAATTTTAAGACCTGTTCCTTCTCCACCAAAATTACTTGCAACTGATGTAGGGGACACATATTCTGCTTTTATTGCTTCCTTAGAAGAAATAGGATCCCAAACTGCAAAGTGTAAAGTACGCTTTCCATTTTCATCAAAACCGCTTTGTTGTTGGAATCCAGCATACCCACCAGCTTCTCCCCCCTGGTTCCAGTTATGTACAGCCCAATATGTATAAGGTGCTGTTTGAACAGGAGACCAGTCTATACTAATAATATCTGAAGAAACACTATTTTTAGGTGTAACATAAACTCCTGGAGCAGACGCCGCCTCTATGATAGAAATTGATGATCCAAACATCGAAAACACCGTACTAGCTGCTGTAATTGCTAGGATTTTTTTGACGCCATTTCTTGTTCTTTGATTGAACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_018688|269814:276349|271592_271787_-|WP_000958236.1|DBSCAN-SWA MLTTFISLGVLGVTTIGGVLLEKHLVKNDRVAAAKLLSDGMYHGMRIGGVCFVGYVFIKILIMF >NC_018688|269814:276349|269814_270426_-|WP_000987741.1|DBSCAN-SWA MMSRDKAILSNLKRFRCMSRDDIVDLHFQGLKNAVTCCNTVMKRLRRDGHVDANISQQPYIYFPQPSTLRKTSQKILHFLGIVDVYKQLIHYEKPKLFKVEPKYGKEFMEPDAFTIWRRSPFFIEVQNSVYSKKVMQDKINRYELYFHSQEWHNESWQPKESKFFPSILIITEKHYDISSFNLRIFQASSISNFLDSLTVKVE >NC_018688|269814:276349|270415_271582_-|WP_000522930.1|DBSCAN-SWA MGLIKQWIHKQSLRNRLIEVFGKAGLYVDHQTRGGKVPIYPKIHDITSTKEKVRYIFTIPNGLDPKTIEKKWFCFQQILGRNIAIEGDIKRFVLNVFHSNAGLQAYNYSYKKWQTLLKQHHLPVVVGRDQFGNMITYDMVESNTPHLLIAGETGSGKSSMVRVVLSTLIQHMSPDELHLYLGDLKNSEFHFLRRVKHVKEVCMEEIEIKIMLQKVWKEIRKRRKLMEEYEVDHIDEYNKLNPDNQKPYILLAIDEVAMLQDEKECMSIVEKISAVGRALGVFLMLSMQRPDAKVLDGKLKLNMTVRMGFKCDSTINSNIMGTPGSEHLEQSGQMILKLNGLKKVQAPYLELSKAKKMVEPYRVLKENIKVQNPPQEENQLFGVLNYDE >NC_018688|269814:276349|274369_276349_-|WP_000483141.1|DBSCAN-SWA MFNQRTRNGVKKILAITAASTVFSMFGSSISIIEAASAPGVYVTPKNSVSSDIISIDWSPVQTAPYTYWAVHNWNQGGEAGGYAGFQQQSGFDENGKRTLHFAVWDPISSKEAIKAEYVSPTSVASNFGGEGTGLKIQTTYDWKNYNWYRMTMRSWQENGHTKFGQWLKDVSKNQWQLIGIMDFPVPNVTFNYGQTLFQEDWLGNGQDVREARVKNGYGRNISDKKWTSWNTQSIEGQEPLNNNWDGGATSEYLWFKAGGNSQSTIGAGKTFTLNQPSEPEIGKLDYDIKSIYYENEKLNVSWKLKENSTPQFKGKIEIYNNENMTGQPINVIDDIKSYQNGISQSISLPTNAYAKIVLTDIFDQTVEKKVQIKNESPNILEGDTFAWSMKGIGDFEFAKVNLNKSSEELQVNLMAGTPHNYFDSTYASIKVQDTSGKVVYNKEVYGNKGQNAESKTVPVKVGDFIELTHLEGGERATLTNLDNNKRESFDKKVIYEITKDGLKKVSQIVNAKPDTEAPTQPQALYASDVASDSVELKWNPSTDNVGVKEYQVLRDGQLIQTVQGTMFTDQNLTANKEYKYTVKAVDTAGNTSVQSNILTVTTKSQNVTYEKWDPKKAYTKGDKVEYQGKFYEAVQSYQGNGDPTWIFALSLWKPFNMK >NC_018688|269814:276349|273375_273615_-|WP_000424045.1|DBSCAN-SWA MELTKLEKVIVISTFVQGLGEEFIENSKDNHSLKQLLGEIEKVFNNSTPKQMREAAGSVLDKFINDLIEENNSPLPKIN >NC_018688|269814:276349|272321_272834_-|WP_148283640.1|DBSCAN-SWA MVKNFTRVALAGVIGLSGLGLIGTTAASAEENNSPTLNSVNILNKSDVKHNSFALGGFTVHADLNSNTRVFDTDTAGFGGAKADDVYYFDVTPLGGGTYSYVNFWMNKYSTSNKMTFEVYKNGSLIQRATSQGQYAEVRDLRVTSGTYVVKIFDPNGSNNSSVHFRARIF >NC_018688|269814:276349|272004_272229_+|WP_000467346.1|DBSCAN-SWA MFGLGKQRSRFGKFIDKNGLSQQDIVKESGVNRGTISRICQGDAFQPSLKNGNKIIRALKKLTGKNVDYNDFWI |
7 | Bacillus_phage(83.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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