Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_018880 | Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_15p, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NC_018878 | Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_502p, complete sequence | 1 crisprs | c2c4_V-U1,DEDDh,cas5,cas7,cas8a2,cas6,cas3 | 0 | 1 | 0 | 0 |
NC_018883 | Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_6p, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NC_018882 | Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_7p, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NC_018877 | Bacillus thuringiensis Bt407, complete sequence | 5 crisprs | cas3,csa3,RT,WYL,c2c9_V-U4,DinG,cas14k,DEDDh | 9 | 11 | 12 | 0 |
NC_018881 | Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_8p, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NC_018885 | Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_2p, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NC_018884 | Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_5p, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NC_018886 | Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_9p, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NC_018879 | Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_78p, complete sequence | 0 crisprs | RT,csa3 | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_018878_1 | 4430-4536 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_018878_1
|
1 spacers
spacers of NC_018878_1
>1.1|4454|59|NC_018878|CRISPRCasFinder TGAATGTTATTGAGTTACAATGAAATCAAGTTAGGAAAACGAAAACAAACTTTAAAACT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018878_1
The CRISPR arrays of NC_018878_1 >merge|NC_018878|1|4430-4536|CRISPRCasFinder TTTAAGTAATTAATAATTGACTAATGAATGTTATTGAGTTACAATGAAATCAAGTTAGGAAAACGAAAACAAACTTTAAAACTATTTAGTAATTAATAATTGACTAA >NC_018878|1|1|4430-4536|CRISPRCasFinder TTTAAGTAATTAATAATTGACTAA TGAATGTTATTGAGTTACAATGAAATCAAGTTAGGAAAACGAAAACAAACTTTAAAACT ATTTAGTAATTAATAATTGACTAA
>NC_018878.1|WP_001288315.1|2375_4310_+|DNA-gyrase-subunit-B MSEEYNGDSIEILEGLEAVRKRPGMYIGSTNTKGLHHMIKEITDNSVDEAVAGYCDEIITRIHKDNSISIEDNGRGVPVDVHRKAGYSTARVIYTILHAGGKFGGNGYKVSGGLHGVGASVVNALSSYLEVEIHRNGKIYKDRYENGGVPVIPLTENGELPSIGDTDRRGTKVRFLPDNTILETTEWNIETIEKRLQESAFLNKGLKFVFIDERTGYEKTFCEKDGIGGLVKEINHSKPTLTDVISFSGVSKDIEVQIAFQYVQEYNEHLISYCNNIITPHGGTHIVGLKSGITRLINGYAKELGLLKTKDNTIDGAHIRTGIVAVVSIRHSNPQYEGQTKEKLGSTDAKGAVEEVIKNEGSKFFDLHVEEVKRIIENAMRVSKIRETEEKSRDNSLQKKDAQLQTNGKLASASSKTPVKKKEIYLVEGDSAGGTAKQARDRKTQAILPAKGKIINVEKARIDKVLSNEEIQSIIVAIGGGHGKAFDISKVNYGRVVIMTDADVDGAHIRTLLLTFFYRYMRPLIEEGYVWIAVPPLYQIVHEEQKGRKKVETSMYAYSDEELVSVKNLLGNKIKRIQRYKGLGEMSATQLWDTTLNPETRKQIQVRIEDAKEADAVTELLMGDKVAPRREFIISEAHKANIDI >NC_018878.1|WP_000906491.1|1907_2210_-|hypothetical-protein MLILVINVLLVAISCMAIILTLINLTKTFKVHSHLPDEIKKHTKSTVFTCFILFIFSIGCAIGAGFLWNQLFFYVFILLSGFLSLAIYQLINENLAEFVD >NC_018878.1|WP_000906848.1|1145_1868_+|uracil-DNA-glycosylase MLIPENVHPSWDEFLTNDRKEEVNVIFDEIKQDFTPSDPKLVLRFLERDLNKVKVIWLGQDPYPIEGKASGRAFEDATIKDWTDKGVGRSIKNVIRSIYRMENNIEDYKDVKTYKKIQKEIKNGAFNIKPPKEWFDSLENQGVLFLNVYFTCQVGRGKAGTHRDEWKDFSAKLLKYINSNNPNVIWFLWGNPSRKIGDIMQFNNIYESRHPAYQNKASGEDILDFEGFRGTNHMINWLGK >NC_018878.1|WP_001110333.1|100_1123_+|DUF91-domain-containing-protein MNYYEDEIALLLKEELSILYGISSFDVLYRYVVLRFGCDSIDDKKKKEEFIYKKNFIQFILNELQIEVKKDNVNYKGEFISINPIIGSCFANAIEDWCFSSTFYPVTTEEDVSQDVTTYLSDLEKDLVKRAKKKNRKYKKESDYWYRVKYEYLMLLNELFQVQISSPNRIRGFACVDDRVSIETLESRYSRMFISDVQYSSNVELITEAMLEEYMKRNLSLVESGLKLIATQYMLPKGRIDMLAKDSNGLYVIIELKVEEDTDIVWQSLYYRNEIKRIKNVNKVRFITVMPKCEDHIFDSLQSVGGVEIFEYIPMIKNEQLIKVQFKKKSTGTTNVKNVA >NC_018878.1|WP_000790425.1|4654_7120_+|LPXTG-cell-wall-anchor-domain-containing-protein MKNITKGKVVGTALTTALAFGTLGALGTTAHADQLKDAEVNLPKTEIVAPQHAQVAPVKEVKEEAKVKEVKETAKEVKTEQPQKAESNNVVENKKQEVKQTVKQETKQEVKQEVKQDAKQEVKSIAPQKNVVAPQPKVAQAPQQHTVKDVKFVDHFYRVQGQDPKRQPIEKFVVSGLGNGVTAKVLYSFEANDTEYVKIEVKDGFGNTITHDIPVSVNTMPVITLDKHRVLVEQGQGVNVLNALGAKGYDEETGVLNIKVTGNTDTSVLGERSLNLKVTDNTNLSVSENVIMNVVRFKGVLQIEQNENINYIDATRFVEGLSNTARAIITNVDEVSGMVTVKVTDGENSISKAVKVTKAHVNEEPSISVENDYVFAKQGEVKDIIASAKVTASDREDGDLSKSIKVSGFDPQASGVQTVTLTVTDSEGATVERKVYVRMINFVDSIKIEKGFRVENIANEKLVTGLKGSDGVSIKDNGNGTITVSVRDNALNTTIQSVVKVEVEGNKEEDKGTNEDKGTNEDKGTNEDKGTNEDKGTNEDKGTNEDKGTNEDKGTNEDKGTNEDKGTNEDKGTNEDKGTNEDKGTSEDKGNKEDNGTVTEDKGTNEDKGNKEDNGTVTEDKGTNEDKGNKEDNGTVTEDKGTNEDKVNKEDNGTVTEDKGTNEDKVNKDDKGTVTEDKGTNEDKGNKDDKGTVTEDKGTQTDGGSVTGNKDNKIEDKVTAEKENKETVTSTNNEGNEKVAEKQVDKKETVKDEINKPTDKKVEKDTKATSKETAKETKAEAKDKKLPETGGDQSTTMGSLIAGGLAILASVVMRRKSKKQN >NC_018878.1|WP_000508999.1|7405_9628_+|DNA-topoisomerase-4-subunit-A MGGKIETISYSKEMKSSFIDYALTVVTDRALPDVRDGLKPVHRRILYAMGDLGMYPDKAYKKSARIVGEVIGKYHPHGDSAVYESMVKQAQDFVKNAPLIDGHGNFGSVDGDSAAAMRYTEARLSPVAMEMIQDLSKGVVDFRDNFDASEREPVVLPAKVPNLLVNGGVGIAVGMAYKTPPHGVNSVVDTLIAYADKQDIDIESLIDIIEAPDYPSGGIITNKNELRDLYRTGIGKAVIRAKIDIEDAGYGRKNLVVKEIPYPYSGSKTNLTYKLITMVIEKKLEEIVNVTDESDKDGIRIVLEVKKGVDIDNLLNKLYSKTPLQSSESYQYLVLVNGVPTTINLKDYCKHYFDFQKEITRKRYEYLLSKAQVRKEILEGLVKAEEMMDTIIEMLRGAKKSKEAKVCLMEGNTESISFKTKKHENIAKKFAFTEKQAQAILDMRLQKLIGLEVEQLNQEYKEVLAEMEEYELVLGSEKEMLKVIKKYLRGFKKDFGRERRTEIQEKKTIEYVEEIKEEDVWVLIDKFGYTKSVDTISVERSSEETLSEYKQEILTKNTSKLSVFTNQGRLYQIKLADIPKVKIKDKGVPIQRLGKMKKNEYPLYITTNTELETERVIMLTKTGLIKQTLCSELISSRSVVVATKLEEDDEVIQITPINEVDEDVLVFSKKGYILRFSINEIPVLRKNAKGVKAVSLMEEDVIEGVYILNENNKDVKQLNGKQIELSKVERKTRGKKGINF >NC_018878.1|WP_001033964.1|9748_10558_+|hypothetical-protein MNKITVKNTEDIKSLYAEMLLTPLMIYSALHSGNQLELNWNNQDGYNRILDVLSRHITKQAFKKYSKMEMQEKGFEDVYISACLSKELLQQVEGMSILVQMISDRLQEFFESQKQLDIETFILFNTSDLKRSAVLFVNSMENALTSFEQDAEEEQDVSLICFQTLISKGKSLCAFERLELLLVNERVEIKDSDGDVYTADTMKECFGIELYDTRVKMNSLIHDLSFVTALALLMETESITISYANPEFLELLKTSFDEFGITIEVQVND >NC_018878.1|WP_000161251.1|10550_11087_+|crossover-junction-endodeoxyribonuclease-RuvC MTKIIACGIDQGLANLGYAFIEYDIDTNQYMKLDTGTLKTKSSELLEDRLLTIYEMIKTYNLKYNTDIIACEKLFYNPKQKNDNRNKSASIMTTNMVTGVVFLVAGELGLWIKDFVPGTVKKHVAGYGRATKEDLQKAIEDFCEQHGIKAKTNHETDAIGIALTAIKAYIEEFVKKGA >NC_018878.1|WP_000376231.1|11091_12180_+|hypothetical-protein MDRTKMKYLFQKHKDKLLVGLSIAVTIGIGTGVYFVFFHDNETKSKNETLFDKHIKLADTIVTGDKNGKVSLLDTKSGDELDNVSLGDGKGNEFKFARSKNLESVYAYNQKNHTFYEITVNEKQLHNKEIVSVSDALVDFDSFQSDGKNIVFLSKDKKELTHVKDKSTYKKYASTEEVSDFLVDKGQLVFATNSFIHSVDLKDEKEKKIEIGDSTTGLFAVKNEIIAYNKFGNGKEDSIVLRLRADDLYVKEMHKFESNRVEPLVPDGDDETLIYSQKVNEKTHPKQLIQVLNNKDKFKKDVRPFQTPNNRKIVDYEKSNSVASKGYVYSKKGTRLEITDIRGEKIAYTLDVPKEFAMPIIQ >NC_018878.1|WP_000840826.1|12353_12815_+|single-stranded-DNA-binding-protein MAERKYYSFVSFRNTEENKAFGAIEGYITKPVELEDTTNGKKVAKVSMVSQNVTKKIGKALKVEVQEKDSEFINITGWEQLGERMSKAVQKGDTVIFTGDLKSREYNGNKYFDLTAWDFTIKRKGNGNQSSNEEPSDNNIGQPIDIADDDLPF >NC_018878.1|WP_000783481.1|12912_14361_+|DUF3854-domain-containing-protein MKMNREEFIEEVIAKVKQLPISSVMETRIDVVRRGHSFQAKCPFHNDNKLGSFSISNKKGIFKCFSCDEGGDAVKFIAKYDKISFGASAIKIALEFGLITNEEYKEAFGDKAEVDVAETVRKTYIASMDKVDYEEERADIEVLHNVFSVFSKGISLCEGHDKLTEEHKAYLKGRGLSDKDIEEDGYFSFPGRHSAFLTNFYNTMYEEFGYTPEILKDIPGFFCTENCKMDFQTKDGEITVPIYAYRRQEGICIPMKNAKGQIAGIQIRLDEVKDSSRRYIWFSSTFADAEDRSNMYINGTGAGAPLDVVYPEKIKHTTLFITEGRFKARKIASTYGCIAISVQGIGNWRNIEKEIKDIEERTGYDIKHICIAYDADMSYNINVYNQFKKMTDKLKEEFDKNIYVCMWATELGKGIDDILENDKGNMIDKMEKTQFDSYYAQYVKMVTDKEGKKAFKEKPKPLLKAYFDREVLPKFNKYKDIV >NC_018878.1|WP_000611380.1|14656_14851_+|hypothetical-protein MINVNTKVKELIVITLKEEKDMILDRVKGYSHTISSHVLRKIVAVNPCVLNGINYFINTHIHMN >NC_018878.1|WP_000067227.1|14952_16407_+|hypothetical-protein MSNLGHAWFEKNSNSTIVEKDFIPLKTICSIEEKNRVQEIVKLEVPLFDEVIEVCDEFGINPENMYVCKNIAEPFWYWDGIVFVSVVQISEQAFIMMDMEKRVKAKENLVKEAYKTKDFYKVFSFTEDFLKPYILNKIYREIPCEERYKLFREIYTYINYSHKVIKKEVIDEAISCQTEEFKKELMLKLNSLSNNDFVVVYRGEGTFSVSHETAMSWTTNIQVARKFAVKGSVYKGEVLKENVIDYIEDRNESEILVYPSNVMNITEITKKKELDVMKELNLLQDEGYVDEFATYRDTFILDEYYHNPTSVHGPLHVKRVLLLVLSLSRTLKLSSVERAILANVAIFHDIGREHDGYCTKHGEWSIEKHEELVAIPFVGVNYVTPRTKGRFDYDLEFLTDENIEIIKFIIEYHCKDDESAKKHLEKSKAISKGTKEMTWNLYECFKDCDALDRVRLGDLDVSYLRKEESKERVALAHQLLTGIS >NC_018878.1|WP_000267595.1|16530_16905_+|hypothetical-protein MWPFRKQENSQVQWKERVNIKDDEVDEYEEEEDDDKETLSFLIHFTKSRVYVYVADDEFYEDGGVMKTCGKDYCVYRFMGECVSLQKKVLVSRTDTINEVLDMYDLKESGNTPYKIIEIECDSE |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_018878_1 | 1.1|4454|59|NC_018878|CRISPRCasFinder | 4454-4512 | 59 | NC_018878 | Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_502p, complete sequence | 4454-4512 | 0 | 1.0 |
1. spacer 1.1|4454|59|NC_018878|CRISPRCasFinder matches to NC_018878 (Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_502p, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tgaatgttattgagttacaatgaaatcaagttaggaaaacgaaaacaaactttaaaact CRISPR spacer tgaatgttattgagttacaatgaaatcaagttaggaaaacgaaaacaaactttaaaact Protospacer ***********************************************************
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation |
---|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_018877_1 | 1117213-1117328 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_018877_1
|
1 spacers
spacers of NC_018877_1
>1.1|1117245|52|NC_018877|CRISPRCasFinder GATGCAGACGGGTATAGGGAAATTGCAAGATGGCTCCGGAAAAGTAACAGGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018877_1
The CRISPR arrays of NC_018877_1 >merge|NC_018877|1|1117213-1117328|CRISPRCasFinder GGTTTAAATACGTTAAATAGCAAAACAGGTGAGATGCAGACGGGTATAGGGAAATTGCAAGATGGCTCCGGAAAAGTAACAGGCGGTTTAAATACGTTAAATAGCAAAACGGGTGA >NC_018877|1|1|1117213-1117328|CRISPRCasFinder GGTTTAAATACGTTAAATAGCAAAACAGGTGA GATGCAGACGGGTATAGGGAAATTGCAAGATGGCTCCGGAAAAGTAACAGGC GGTTTAAATACGTTAAATAGCAAAACGGGTGA
>NC_018877.1|WP_000963378.1|1115693_1116266_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MAIDRKRSIIEAATKSFSAFGYKATTMDQVAKLANVGKGTIYTFFKNKEELFGEIISNLITEMKQVAENAIRSDVSFFENVHRALYSILEFRKEHQLMIKLIQEERDMGTKEVQEVMQQVDVEIVSVIQSYLKIAIEKGEISKCDPEITAFIMLRLYVSLIFDWEKNHEPLEKEKIAELFELYLLKGLSN >NC_018877.1|WP_015055096.1|1113484_1115422_+|M56-family-metallopeptidase MIDTLINVYLPHFFDWLIETSLMASILVGFILCIKVLFRNKLTPRWQYMLWIVLMIRLLLPWSPDSSYSIYSLLSYSSSVSEVIPKNMPATENIVNIESDRKVELESNPKMVTKTSEPEVEVSSEKQTTFSLYKLALYVWLAGVIILAAITFLTNRRLYSYIKKQPDITDEQVITVFDRCKQSMKVKKAVSLRLAGKIASPTVFSFFRPKVLLSKKHMKVLNEQQLQYVFYHELAHIKRKDVAVNWIMYSLILLNWFNPILWYAYFCMREDQELACDAYALTFIDKEEQIAYGHTIITLLEHYSYQVPSLANLSRNKRTLKRRIVMIKKFQKKSYRLSLLGIIAIAAIAGGFLLNAKITEGDERQEEKVVEKKQSKAAFEKAIETVLGTPENASREWGMSIKSYKRDTDFLYLAEKNFTKEEFEQYVQLFKEAKEIHKKAMVNKKVPENYDRDTKEFKRERLNKADQERLASIEKKLVPLSERVEKSLTYTIEEAKEHVPYQIKQPTYIPEGYELKREWADSYFGRDVELVVKSEYTNGKYGFTIYQSRIYAGGNKDPLHYMMPGEENLESYNLDGKGMVYNKSSHGEDKLKGLKMFVPEQGKNSEYQVVIVNDIFTRDTKIYEEIIDDELTKKEMEKILISMSK >NC_018877.1|WP_000184503.1|1113080_1113482_+|BlaI/MecI/CopY-family-transcriptional-regulator MTNQLPKISEAELEIMKVLWSNSPQTANEIIEELEDAMDWKPKTIRTLINRLVQKEAVSYHQDKGRMYAYYPLVSQDNYLQVETKSLLKRFCGAAFKPLLVNFLKEEKLSSEDINELKRILDEKTEENKRKDR >NC_018877.1|WP_000984143.1|1111996_1112851_-|hypothetical-protein MMRALRLNIKQAFCNRVSLIIMFSGFVLICIYHYYYVIRYLGDAANGPISTDIKWIGFRDNEMDVYLLLMPVIASFPFSTSYNSDKSDGFKPFVSKGISLFPYSVTKYIVTFFCGGFLYTFPFILSLLFCKLTIPDGEPTAGSGIINDNGMFANLYYESPLTYIAVYIGINFLFAGLMALLGLAASAWSQKDYMAILFPFAVASIPYVLLNTIFPTIGGAPFHLYDPKQPLHGMSPYILTMQCTFFLLVSLIMYIQGVKRDRKKYRRRLQKRERCRKAFQTISD >NC_018877.1|WP_001176841.1|1111611_1111911_+|hypothetical-protein MQLQINGKLMNQLAIFFSTIVMLQFVADITGLTSNLDITYNLINTAASYITFSLAVIFTLIGARRELSKYAIILLCSVVGIKAIYFAVFVILWGLAGTP >NC_018877.1|WP_000279269.1|1109113_1111480_+|endonuclease MAVKKLLSVFLSFLLLLSFTGTLAQAEETASMSVEKAIQVFKQQGKTKGIVEGYIVGYTQSSSKYTKDPAKFDDTNVAIADSPNETNPDKIMPIQLPKGDVRTAVNVKDHPENIGKKVSLTGTLELYFSNPGLKSVTAYKFQGEGQNRVSDVVASPNGGEVAKGTAVTLTTNTEGATIYYTLDGSNPTNKSVRYNGQIVMNENSVVKAIAEKEELTSSAISTFSFIIVNNEPVRIHDIQGKSHISPYNGKKVNNVEGVVTALDKNGFYIEDNQPDNDPATSEGIYVYKKDANVAVGDLIQVDGVVEEYVGPGYAERFETDLTTTEIKASRVAVIAKNQTLPAPIVLGENGVKIPDQIIDNDAFGLFDPNEDAIDFYESIEGMRVTMPTPKIITPQKNGNLYVTVKNGGDKIVTQYGTPLLDENQLNPERLSVKVPRDYVAKVGDTFTGDITGVVGYDYGSFRISPITELPAVVDGGFKQVGANIQPRLDKLTVATYNIENFSANKKETTDEKVKALAYSIKYNLKMPDIIGVEEMQDNNGSINDGTTDASLSAKRIIDAVLEIRGPKYEYVEIAPNNNQDGGAPGANIRVGFFYNPSRVKLATVPKLLDKNVVRIGDENPLFESTRKPLAAEFTFQGQNIVVVANHLNSKLGDATPFGKVQPLVLKSEDKRIQLAQEVNHFVQGIQEKNTNAPVVVLGDMNDFEFSKPLKALEGTILKDMLNTVPKENRYTYIHEGNAQVLDHILVTNNIAPHTIVDPVHLNSNIMKEHGRVSDHDPVLAQIDLKKAS >NC_018877.1|WP_000453694.1|1107519_1108872_-|DUF4026-domain-containing-protein MEVQTETYRAAMNGTLERHFSDMIAVIPTRITIEQLKHRLEIIATKVDELKIVYSDETSLIVELHMGETVIPYELHIDEANDPEEYKMYNRQDSTIVDRNFEDVAFGTEIFTRTLFVGDVLDCFFQQLQFLWNLAPDLLFVIDSSAAMKVISRSYIEYHVENELLPDIPDLYVIHSVYEDDKDDEPTQYWFHTHGLLRAGVTEIELIIPNRISSYYGIGDLFQTFANNAVENGQVPMNEPIVIAHSQQGSIHTVAVPWEKGLSYIGHKTSMDQLSSIEDEEVKLQPIDAQNTFLGGMDARDEYHQSPSVLLFKFNTSEEYIENFFKEHEEATGLMFYKTNSETARMAYNAKNTFGYFSNIFHIEQSNEDFRFLAKFGVSYEEGKSEHMWFEMQNITEDFIQGILINEPYFIKDMSEGNSYHLDFDNLTEWVIYAGDAVIKPNNLYMFIGE >NC_018877.1|WP_001228113.1|1106046_1107468_+|protoporphyrinogen-oxidase MRKKVVIVGGGITGLTAMYNLQKNIHEKNLPIDTLLIEASGKLGGKIQTVRKDGFTIERGPDSFLARKESVARLVKELGLGDELVNNQAGQSFILVNNRLHKMPNGSMMGIPTQITPFLFSGLFSPIGKLRAGFDLLMPRSKPVSDQSLGQFFRHRLGNEVVENLIEPLLSGIYAGDIDEMSLMSTFPQMYQIEQKHRSISLGMRTLAPKEEKAEPKKGMFQTVKTGLESIVKSLEAKMHEGTIIKGTRIEKIAKQGDGYTITLSNGKEIEADAIVVATSHKVLPSMFAQYKQFRFFRNIPSTSVANVALAFPKSAIQRDINGTGFVVSRNSDYTITACTWTHKKWPHTTPEGKTLLRCYVGRAGDEAVVEQTEEELVQLVLEDLRKTMDITEDPEFTIVSRWKEAMPQYTVGHNERMKKLTTFMEKELPGIYLAGSSYAGAGLPDCINQGEEAAKRVLSHLEKVIDAELIAQ >NC_018877.1|WP_000726787.1|1105091_1106027_+|ferrochelatase MKKKIGLLVMAYGTPYKEEDIERYYTHIRRGRKPSPEMLEDLTERYRAIGGISPLATITLEQAKKLEKRLNEVQDEVEYHMYLGLKHIEPFIEDAVKDMHNDGIQDAIALVLAPHYSTFSVKSYVGRAQEEAEKLGNLTIHGIDSWYKEPKFIQYWVDAVKVIYNGMSDAEREKAVLIVSAHSLPEKIIGMGDPYPDQLNETADYIARGAEVANYAVGWQSAGNTPDPWIGPDVQDLTRELNEKHGYTSFVYAPVGFVAEHLEVLYDNDFECKVVTDEIGAKYYRPEMPNASDAFIDCLTDVVLKKKESVL >NC_018877.1|WP_000252605.1|1104030_1105077_+|uroporphyrinogen-decarboxylase MVRTINETFLKACRGERTDYVPAWYMRQAGRSQPEYRKIKEKYSLFEITHNPELCAYVTKLPVDQYNVDAAILYKDIMSPLPAIGVDVEIKSGIGPVIDNPIRSLQDVEKLGEINPEDDVPYILDTIRLLTTEMLDVPLIGFSGAPFTLASYMIEGGPSRNYHNTKAFMYAEPKAWFALMDKLADMVITYLKAQINAGAKAVQIFDSWVGTVNVADYRVFIKPAMERIFAEVRKMGVPMIMHGVGAAHLVNEWHDLPLDVVGLDWRLPIEEARARGVHKAVQGNMDPSFLLAPWSVIEEHVKGILDQGMKQPGYIFNLGHGVFPEVNPDTLKRLTTFIHEYSKGQLAK >NC_018877.1|WP_014481972.1|1119229_1119442_+|hypothetical-protein MMRGNLTYYFIVNPLIIFLVYALSPILFDKEVYTSMKDAFGILTFYYVLMGGYYFIDILSEKIKKKSDGG >NC_018877.1|WP_000140289.1|1119445_1119751_+|DUF2087-domain-containing-protein MTESEMKFRDTTIRNFFDKEDRLKSIPGQKKKKLVLLEHLISKLNAENQYTEKEINTFIKQYHDDFCTIRREFIVQGFMDREDNMYRINGREVWTKWEELK >NC_018877.1|WP_001068221.1|1119777_1120131_-|PlcR-regulated-protein-PRP2 MNPILTAAKQLLHKEEKILSTLKCSLTGYMITHKVPYPGMLLATNRRLLFFSQYKNTFIAEFDYEKILSIETKRRIFDKKIIFYYEDEYITLGYITSSNVEAFIDLLQRNSKTSTGL >NC_018877.1|WP_000620470.1|1120264_1120774_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MIRLVKETDAEAIMNIRKEIILSETTTKFFIVSPKKLPNDSNAEREKIRKSNEKGNLYIVYEVDGKVVGFLLFNRYELERLQHAGTMGMGIKEAYCNQGIGTKLIEFLISWAKGQKGLEKICLGVVSVNDRAIKVYKRMGFVEEGRQRKQIKYEDGSYGDDVLMGFYIE >NC_018877.1|WP_000103715.1|1120968_1121982_+|LacI-family-DNA-binding-transcriptional-regulator MSTIEDVAKLAGLSRTTVSRVINNHPYVSDEKKKRVQLAMKHLGFVPNSAARRLRKQKTETIAVLVPRITNPFFSRFIEAIEIAASEHKYKLIICQTRYLPEKEMEYLQLLSTKQVDGIILCSLENPWEDVEPYLQHGPIVLCNEYIEEANIPTVKFDHAQGAYIAAKHVLDQGYRNLIFCRGNETKVVSQQRKMGFLRAITEKSRQVEAIDFLENAFSWEDGKRIFHEVLKDKKNPTAILAGGDEVAAGIISEAKRHNWSIPDDLAVIGFDNQILSQITEPGITTIEQPIDEMARKVVDLMMDKIHTKNYRKKELYEFELELLVKGSTMKDKMLLA >NC_018877.1|WP_000567010.1|1122021_1122150_-|YhfH-family-protein MIDQPMEFFRNLPTKTCAHCGKEIDEQHEAYHNKCDDCVHEE >NC_018877.1|WP_000784690.1|1122353_1123088_+|MBL-fold-metallo-hydrolase MKMTVVGFWGGFPEAGEATSGYLFEHDGFRLLVDCGSGVLAQLQKYITPSHIDAVVLSHYHHDHVADIGVLQYARLITSATTRQLPELPIYGHTFDENGFHSLTHEPHTKGIAYNPEETLQVGPFSISFLKTVHPVTCFAMRITAGDDAVVYSADSSYIPEFIPFTKDADLFICECNMYAHQEAAKAGHMNSTEVASIAKDANVKELLLTHLPHTGNPSDLVTEAKQIFSGHITLAHSGYVWNS >NC_018877.1|WP_000897280.1|1123097_1124087_+|lipoate--protein-ligase MLFIDNKGITDPRINLAIEEYCVKNLDINETYLLFYINEPSIIIGKNQNTVEEINADYVKEKGIHVVRRLSGGGAVYHDLGNLNFSFITKDDGDSFSNFKKFTEPVTKALSKLGVNAELSGRNDILAEGRKISGNAQFSTKGRMFSHGTLLFDSEIDHVVSALKVKMDKIQSKGIKSIRSRVANITEFLNEEMTTEEFRQLLLETIFEGETEIPTYELTEEDWKEIHKLSEERYQNWDWNYGKSPKFNLQHSHRFPVGQVDVRLEVKKGTVTECKIYGDFFGSLDVHDIEERLTGVQFDKDAFTAALEGVDIARYFGNITTEDFLHLFF >NC_018877.1|WP_000832166.1|1124226_1124655_+|hypothetical-protein MKRVIHIVILLGFVIGIAACNSETSSSRTLLSIGKPARDNVIYFTHTDNKRKIQDIQDRFQNKEWKRNETFSTVNKTPDVVLSIDENNKGLPTLYVTVYFHENGADVLNLYGEYTNLNKEELNKLREKMNAYYPKMISGLVS >NC_018877.1|WP_001055187.1|1124816_1126349_+|fatty-acid--CoA-ligase-family-protein MNLVQSLAETAKKKGDKPAYIFMDQSVSYDQLNKMVTRFSSNLAEMGIGKGDNVALVVGNSPHFLVGLYGTMKAGATVIPVNPIYTADEMHYILQNGDVKTIIVLDVLLPVIQSLTTRLPSLENIIICETSSEFNHTETEKMKTFTSFVGAGDLQYEGPELDEEDVAVILYTSGTTGKPKGAMLTHKNLYSNANDVASYLQFTADDRVVAALPMFHVFCLTVAVNAPIVNGATILMLPKFSPKEVFRICRTYEPTIFAGVPTMYNYLYLFEEASAEDVKTLRLCISGGASMPVALLQNFEKRFNVIVSEGYGLSEASPVTCFNPLDRPRKPGSIGTNIWHVENKIVNELGEEVSVGAVGELIVRGPNVMKGYYNAPEDTAATLKDGWLYTGDLAKMDEEGYFYIVDRKKDIVLVGGYNVYPREVEEVLYTHESVAEVVVIGVPDENLGEAVRAYVVLKQANVTEEELMHYCALHLAKYKVPKSIEFLIELPKNTTGKLLRRALREKAMQV |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_018877_2 | 3435307-3435417 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_018877_2
|
1 spacers
spacers of NC_018877_2
>2.1|3435334|57|NC_018877|CRISPRCasFinder CGGGGTTACAGGTCCTACCGGAATCGGAATAACTGGTCCTACTGGGGTTACAGGTTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018877_2
The CRISPR arrays of NC_018877_2 >merge|NC_018877|2|3435307-3435417|CRISPRCasFinder TACCGGAATTGGAATAACTGGTCCTACCGGGGTTACAGGTCCTACCGGAATCGGAATAACTGGTCCTACTGGGGTTACAGGTTCTACCGGAATCGGAATAACTGGTCCTAC >NC_018877|2|2|3435307-3435417|CRISPRCasFinder TACCGGAATTGGAATAACTGGTCCTAC CGGGGTTACAGGTCCTACCGGAATCGGAATAACTGGTCCTACTGGGGTTACAGGTTC TACCGGAATCGGAATAACTGGTCCTAC
>NC_018877.1|WP_001095202.1|3432660_3434562_-|mannonate-oxidoreductase MNTMTFEKLQYNELKDIVKSYCVSGLGKELVNKLEPSTSIKVVRNRLNETTEARAILDAEGHVPFFGISNIASTIQKLEKGMILDPEELVSVSDFLRGCRKIKKFMLDKEFFAPVLASYANSMTEYKSIEEEINFSIKGNSIDVAASKELKRIRNNIDSVDGKIKERLTKFLNSSANKKFIQEFFISKKDDRYTIPIKSSYKNQVAGSIIEASAKGSTVFIEPHTVTKLNAELAGLKAEEAVEEYQILATLSGMVLENIYNIKINMELISQYDMVFAKAKFSKSIDGIEPKLNDHGYIHLVNCKHPLLTGQVVPLHFKIGQEYRSLIITGPNAGGKTIVLKTIGLLTLATMSGLHIAGDKGTEIAIFENVFVDIGDNQSIENALSTFSSHMKNLSEIMRMSNNNTLLLFDEIGSGTEPNEGAALAISILEEFYLAGCITVASTHYGEIKRFSEMHDDFMNAAMQFNSETLEPLYKLVIGKSGESNALWIANKMSVKEHVLKRAKEYMGNKEYALEKVNESKIRKPKFVQEKRESHYEYKIGDRVNLLDHDDFGIIYKEKDNFYNVVVYYNGEFVEVNVKRITLEVAAKELYPEGYDLNTLFVDYKERKMQHDIERGSKKALRKIQKEIRKNRG >NC_018877.1|WP_000256462.1|3432129_3432654_-|N-acetyltransferase MVTIRQEQKNDYRKTEEVIKEAFLKEEFSDKTEHELVKRIRECDAFVPELSIVAVDEDIVGHIMLSKITIEQDGTSVESLALAPVSVARGHQKKGIGGNLIVAALEKAKELGYGSVVVLGHPEYYPKFGFKKASEWNIKAPFEVPEEVFMIMELTENSLRGVEGIVQYSSAFAE >NC_018877.1|WP_001042044.1|3431258_3431969_-|histidine-phosphatase-family-protein MNKRETDSNENAVTLYVTRHGKTILNTNHRAQGWADSPLVEKGVEVATNLGTGLKDIHFMNAYSSDSGRAIETANLVLKYSEQSKLKLEQRKDLRELNFGIFEGEKLENMWDVVGKAAGVASPEELMKFSIQEVINLIRVADPTKQAEDWELFSTRIKAEIDKISEEAAGNGGGNVLVVVHGLLITTLIEMLDSSKTKLGVENASVTKIVYQDGTYTVESVGDMSYVAKGKESVEI >NC_018877.1|WP_000645266.1|3430227_3431193_+|quinone-oxidoreductase MKALCFETFGDANVLHYKEIHDPIISPNEILVRTKAIGLNFADIYRRRGDYHLAGNPPYVLGYEGAGIVEKVGADVTTINLGDRIAFADVPFANAELVAVPSEKVIPLPDSISFETAASVLLQGLTAHYLTHDSYQLKQGDIALVHAAAGGVGQLLIQMIKLQGGTVIGLTSSKEKAKIATLAGADHVFLYNEEWHTKVLEMTNGTGVNLVYESVGSTLEESFNATKIGGTVVFYGMAGGNPAPVDPRMLMDTSKTLTGGDLWNVLTTYEERKKRSTQLFDWIATGKLNISNPTTFSLQDGALAHELLESRKSTGKILLIP >NC_018877.1|WP_000403896.1|3429210_3430104_-|LysR-family-transcriptional-regulator MEIKQLITFKVAAHTLNFTQTAKKLNFAQSSVTAQIKTLEAELGTPLFERLGKRLFLTEAGRKFQLYADKMIALSNEAKMAVKDDEEIAGTLIIGAQESQCTYRLPSILKRFKIKFPKIKLIFKPAHSNKDAKEQLMEGKVDLAFILDECKTEDVLHVEPLMKEELKVVAAPTHRLLEQPSVSIKDLESETLLLTELGCSYRTLFEELFRWEDVYPANKIEFVSVEAIKQCVIADLGIAVLPAIVVEKDIREGTIKELHLENTISPIYTQIAWHKDKWMTVPLRQFIDVTREFFVTD >NC_018877.1|WP_000473732.1|3428397_3428910_-|YjfA-family-protein MFKKLMKVCVLSAASIGVLFSFQGSTFAATDLSSYYDGKNPATTKVYGGSTTCDADGFNAKSTAVYEGSKKVGTVYLRYSNKCHAAWAKFVLDQPAPAVSGGVYAYAVVNKYKNGVFQKSVTSNQGNGTIKTGQTSTYTGMVFDLTADFGYTADAEAVTFNNGYGKTARY >NC_018877.1|WP_000771162.1|3427903_3428380_-|YjfA-family-protein MKLLKKTSACLLLSLLVVTSMFSTTNSDKAYAEDHSYDGKSPYYNSCDQSAVTKEKKWIDSNSYVELKFSTTCKTAWAKVTVTRLAVYNNEADARIVRKTDGKAYTCGSAGGNGVVNKGQTSCYTPMVYDLDPRKAQAQGKHAIPNSDAYNYAETIWY >NC_018877.1|WP_000902416.1|3427301_3427790_+|DUF664-domain-containing-protein MLHILKQQYNLISSTRETLFTFLEEIPLEKLHSTVPNFGSGSIIKTHIHVADCYRYWLGSFAFKQKRADFSFASDYEIEHADVAKVRARFKLVDETVQSFLNEYNDRWLENIANEVKWQREPWSTTPLWLLTHTETHEFHHKGQIVSMARHLGYNPPDTDLS >NC_018877.1|WP_001081125.1|3426653_3427109_-|DinB-family-protein MNRLVGLKQFEITRGALLKFMETLDDKTVDTQPEGFNNTIRWHIGHVLTAAEVFMFGKEFKQLPTEYPGMFGYGSRPSKWKTEGPSLEVLTAQLKEQAKRINEIPVEAFENKLPEPFLGLETVGELYGMMLYHEADHIGQMKAMERIIKAL >NC_018877.1|WP_003271092.1|3425423_3426461_-|DUF4003-domain-containing-protein MEYTYNNREELEIGVNTMITLEQKLEQYKHTYVQLKGELKWKTSDSRTGMMIAAMYAGSDKLFDLGRFLEISSYIKNQVGMFSYLKSYHRFVVAATLDIHFTDYNEAFRTFLDLYEQLVTGGFSRSIFTYLAAAVLLTEENEQHGTHIQRSMQVYKRMKKDHLFLTSTNDYPLAVLLAGQSEHVETLMDRVERLYQKLATAGLRKGNDLQFLSHILSLKKDVREELLVAKCTNIWNLLKQEKVKVKQMHYPAIGLLALLEDGEKEIHSIRAFIEKLQGDKLFRWHTDTNILIAIQLFVSQKGEESKATNTGLQTMIEVLIQAQQAAMMATIAASSAATSSASSSS >NC_018877.1|WP_000476397.1|3435996_3437538_-|alpha-amylase MFKRITIVGLSVVLFLPSIYGESKAYADTVNNGTLMQYFEWYAPNDGDHWNRLRTDAENLAQKGITSVWIPPAYKGTTQNDVGYGAYDLYDLGEFNQKGTVRTKYGTKAQLKSAIDALHKKNIDVYGDVVMNHKGGADYTETVTAVEVDPSNRNVEVSGDYEISAWTGFNFPGRGDSYSNFKWKWYHFDGTDWDEGKKLNRIYKFRGIGKAWDWEVSSENGNYDYLMYADLDFDHPDVANEMKKWGTWYAKELNLDGFRLDAVKHIDHEYLRDWVNHVRQQTGKEMFTVAEYWQNDIQTLNNYLAKVNYNQSVFDAPLHYNFHYASTGNGNYDMRNILKGTVVANHPTLAVTLVENHDSQPGQSLESVVSPWFKPLAYAFILTRAEGYPSVFYGDYYGTKGNSNYEIPALKDKIDPILTARKNFAYGTQRDYFDHPDVIGWTREGDSVHANSGLATLISDGPGGSKWMDVGKNNAGEVWYDITGNQTNTVTINKDGWGQFQVSGGSVSIYVQQ >NC_018877.1|WP_000129189.1|3437741_3438533_+|hypothetical-protein MTDFQKQFFARLHIEEKDTVSFEDLSNIMYAMAQTVPFENLNILEKNFKEISKENLKEKILVNNRGGLCYELNPTMYYFLKDSGFDVHLFSGTVYNAANSIWAVDSGHMATVLTHHNELYLIEVGFGSYLPLAPVPFSGEVIHSVTGDYRIRKEMTEKGNYILEMRKNNEFLDQSSADDWTLGYAFYIEEVDEEKANTAQKIIVEHEGSPFNKLPLIVKLTEDGHASLTKDSLTVAKNGKKTKETVTDMQFTNLLHSKFGIIL >NC_018877.1|WP_000137534.1|3438650_3440438_+|oligoendopeptidase-F MTELKDRLQVADIEKWDLTDIYHTIEDWESDFHKIEVLTKELHEFNGNIHDGNSLLAYLTKSEEISSIISLMFAYARLQSDLDTRDTDAQSLVDKVSQLHVKVSAAKSFFSPFLLSIDESTLHSYIEETEGLQYYKEDLFELYRYKKHVLNKDQEAILSQMGEALSSPQHTFGMLNNADILFGEVTTDDGEKVNLTRGMYAKLIEDTNREKRKEAYKAYYKPYVQLKNSIASTLSAAIKNNVTVSKLRNYPSALEKSLFGDMVPKEVYENLIDTTKKNIQTLHTYNEIRKEKLNVDELRQYDLGVDLVEGAKQDIPYSEAFDIMIASLAPLGEEYIETLKSFKDKRYIDVRETPGKRSGAYNFGVYGVHPFILLNHHDDLNSLFTLTHECGHGMHTHYSHGYQPRISAHYSIFVAEVASTVNEVLLIHYLLKEAKETNVRNHLVNHFIEKFKGTFFTQIMFAEFEKITHEMAEQGKPLNAQVFSEIYEKLFKEYNGDSLVFDEEVKYGWARIPHFYRPFYVYKYATGFASAIQIADKLLSGDPNAQKNYIEFLKGGSSDYPLNLLKKAGVDLTTPEPIESALKQFTQLVEEFSAL >NC_018877.1|WP_001244187.1|3440485_3441532_-|agmatine-deiminase-family-protein MRNIENSLFYMPAEWEKHEGTWLQWPHDKAHRGEGYRAKLDDIWISMAKELHYGENVHIVVCDEEEKIHVQSKLMEANVNMDKIDFLIQETDDIWIRDNGPIFVTDKEGNRCLTHWIFNGWGNKYPYEKDANIPNKISEMYRIPKVESSVCLEGGGIEINGNGTLMAAKTSIINENRNPTLSQKEIEMELTKYLGVTNFIWITGIRGEDNYDEDTDYHIDGAARFVNENTILYEYDPFGEGEPYLLEAYEKHYQELRQAKNIDGKPFQLIPVPVTRKVVKEADCKGSYLNFYIGNEVVLVPVYGDEHDKLGLQIIEGQFPGRRIVGIYVNELYAYGGMIHCVTQQHIE >NC_018877.1|WP_000287981.1|3441719_3442541_-|MerR-family-transcriptional-regulator MYTIAEFSRICKMSTRMLRHYDKEEILKPAYVNPVNGYRYYEQEQLEVALKIKKLREYKFPLPKIKIVLQSSDQDSFVQHIQSQIIELSHEVKQNLQVISEMNEMVMVNSSLNIARHRSYDILMGMRNEVTLITQRVKIDIDDIDDYFYDLYEEVQKNNFQIVGSPSAVFYDEEYIPSNSDIELRIPVMQGNDEDVAPKYEMKQLSPHHIVTTMHYGSYDYIGYAYIALEEWVEKNGCVIVNSPYEVYIKGPECDCLAEEYVTQICFLVTKIE >NC_018877.1|WP_000435522.1|3442583_3443561_-|hypothetical-protein MEQKHNGIIFTAIPDESNEYYQPFYEDLIYFNECLNEKKSIADQLISLSVEEQDFHTSCFEYDDIWLRDVAPVVTNHLVKFKYRPNYLPDDQGRYLDQQFNKWLKKNDFEYVKSPLILDGGNLIWNKKDTVILTERIFDDNDDWTEEEIIEQLEWDLEVSRVIIIPAEEGDVLAHADGMVKFIDEHTMFISDFLGDHEFRYSVQEIIQEQMPEAEFIVVPSSYTEKGQYDQEIASAKGLYINMLESCDALYVPKFGLAKDEEVLRYIQQYTEKQVIQIHVGEISTMGGAMNCLTWYCPSHLLPSKMRRLKNQNEDFSMKKIFDWF >NC_018877.1|WP_000582243.1|3443792_3444725_-|hypothetical-protein MIHYNNQNSLHQIFTLKGTIIRDIFPQIVLYTCISTIVAVINYYYTEININQTPWVIVGGALGLLLVFRTNTAYDRYWEGRKLFGTIGACTRNLAISFLCHWDSKGKSMEQEKIKFLHLLIAFPKLAKGHLREEKNLSEVKSLLAVCSEKEKALLVESNHLPISIVFMLKTILSKGLKTGQIHPNAIISMEMDLNTLLTSVGGCDRIKTTPIPFAYFAHIKILLIIFCATLPIGLVDSLGWFTVLATTFISFAFIGIEAIGVEIEDPFGQDPNDLPLEGICIGVEAHLVNLYNQNDLLEVMGLNLDTKII >NC_018877.1|WP_000916570.1|3444905_3445322_-|phosphate-starvation-inducible-protein-PsiE MLKNFKIVFSYFPIVLQYILNVALICLGVVLSVFLMKEVIQFIQELKLDGNESSYHLIDSIVVFFLYFEFIVMIIKYFQMNFHFPLRYFIYIGITAIVRLIIIDHDSPLDLLLYACAIFVLISALFIANSKMMRRDLE >NC_018877.1|WP_000709187.1|3445490_3446648_-|agmatine-deiminase-family-protein MKKAIKFCLIATLSTTIISGCSFEGNNENVKGKEGEKVEVQKNAGKYTMPDEKDKHEGTWLQWPHEYTYGEEYKQEVEPIWVKMASALTEGEKVHIVAYDQEEKERINNLLTDEGLNMEKIDFFIAPTDDVWARDSGPIFVYDSNKNLKILDPAFNGWGKKTPYKNDAQIRKNVSKQSGIERIDWGKFVLEGGAIELDSNGTALLTRSAVTNKNRNPDLSEKEIEKYISDLGVSNFIWLDGVPNLDITDFHIDGFAKFHNKSTIVTMKEDDLAEWGLSNKDMDTLLDAKNASGQKYKYEYLPLSKEKVALENGKTLDYKGSYINYYIGNTVVLVPNYNDPNDKIANDTIQKLYPDRKVVGIDVRELYKNGGMIHCVTQQQPIALK >NC_018877.1|WP_000915203.1|3446977_3448105_-|serine-hydrolase MLKKWLIVFFIFAVFCGSVVTLIHANKGKKYDTKAFSNVNSKQKDVKQEVDANEKKRYEIAAGKLDQYLKDKGFNGSVLVASKDHVILRKGYGYANVKDQVLTTPRTKYRIGSITKTVVAISIMQLKEKGKLNIEDNVNKYIPSFPADKNITLRNLLTHTSGLPEQGQGSVDAASRLKLVTWIGAQTLQFPAGTGWKYTDYNYMVLAYIVEKISNKPLAEYVKENILTPVEMNESGMGATLPEDIFLAEGYTKKDNKLIATPRLKMNWLYGCGEMYTTVEDMKKLDEAIMDGKLLSKQSVSDMFSASPARKYGFSFYIYPDYYHNHGVLAGWNTFNNFNWDKRTFVILFSNVQNGMNDAFNQEFRKMANDLIEGK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_018877_3 | 3683558-3683872 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_018877_3
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7 spacers
spacers of NC_018877_3
>3.1|3683576|27|NC_018877|CRT TGCCACTGGACCTCGAGGTAACACGGG >3.2|3683621|18|NC_018877|CRT ACCTCAAGGTAACACGGG >3.3|3683657|27|NC_018877|CRT TGCCACTGGACCTCGAGGTAACACGGG >3.4|3683702|18|NC_018877|CRT ACCTCAAGGTAACACGGG >3.5|3683738|18|NC_018877|CRT TGCCACTGGACCTCGAGG >3.6|3683774|27|NC_018877|CRT CGCTACTGGACCTCAAGGTAACACGGG >3.7|3683819|36|NC_018877|CRT TGCCACTGGACCTCAAGGTGTTCAAGGTAACACAGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018877_3
The CRISPR arrays of NC_018877_3 >merge|NC_018877|3|3683558-3683872|CRT TGCTACTGGCGTTACCGGTGCCACTGGACCTCGAGGTAACACGGGCGCTACTGGCGCTACCGGACCTCAAGGTAACACGGGCGCTACTGGCGCTACCGGTGCCACTGGACCTCGAGGTAACACGGGCGCTACTGGCGCTACCGGACCTCAAGGTAACACGGGCGCTACTGGCGCTACCGGTGCCACTGGACCTCGAGGTAACACGGGCGCTACCGGCGCTACTGGACCTCAAGGTAACACGGGCGCTACTGGCGCTACCGGTGCCACTGGACCTCAAGGTGTTCAAGGTAACACAGGTGCTACCGGTGCCACTGG >NC_018877|3|1|3683558-3683872|CRT TGCTACTGGCGTTACCGG TGCCACTGGACCTCGAGGTAACACGGG CGCTACTGGCGCTACCGG ACCTCAAGGTAACACGGG CGCTACTGGCGCTACCGG TGCCACTGGACCTCGAGGTAACACGGG CGCTACTGGCGCTACCGG ACCTCAAGGTAACACGGG CGCTACTGGCGCTACCGG TGCCACTGGACCTCGAGG TAACACGGGCGCTACCGG CGCTACTGGACCTCAAGGTAACACGGG CGCTACTGGCGCTACCGG TGCCACTGGACCTCAAGGTGTTCAAGGTAACACAGG TGCTACCGGTGCCACTGG
>NC_018877.1|WP_000450330.1|3681789_3682755_+|site-specific-integrase METTEFHDTIQAFSIFLLNKGRKPSTIKRYVYDVEDFGHWLEKNKKLPSSNIWATLCTKDYEDYFSDLKTNRHYSEKTMHRVFTVLNRMHHFLNIPNPLKNMEISIQPDRTLRNEDFISPDEEKRLKYIVTSLEGLSEKQLPVRPLLMDRNIAILNLLIDYGLSLQELTALTMHHVHFETNTLSIPATAGVERTITLAKEDKKQLYNYYKSIPEPVRPKYHSDDSLFVAFDFNRGTYRWVYENDAPKALTEIAIQKMIRLEVARANLRKGISGQHFRNTYILNLIKKETPESEIIKLAGFKSKISLKRYYQYAENRKNALL >NC_018877.1|WP_000438179.1|3680568_3681525_-|stage-V-sporulation-protein-K MEQSMRKKNNNQINIVLNHRKKISLPAAENKTVISNETTIKHEMLQRIEEEMGKLVGMDDIKKIIKEIYAWIYVNKKRQEKGLKSEKQVLHMLFKGNPGTGKTTVARMIGKLLFEMNILSKGHLVEAERADLVGEYIGHTAQKTRDLIKKAMGGILFIDEAYSLARGGEKDFGKEAIDTLVKHMEDKQHGFVLILAGYSREMNHFLSLNPGLQSRFPFIIEFTDYSVNQLLEIGKRMYEDREYQLSKEAEWKFRDHLHAVKYSSQITSFSNGRYVRNIVEKSIRTQAMRLLQEDTYDKNDLIGISSMDLMLEEETHST >NC_018877.1|WP_000312267.1|3679676_3680300_+|trimeric-intracellular-cation-channel-family-protein MAWEIFSIIGTIAFALSGAIVAMEEDYDIFGVYILGMATAFGGGALRNLLIGYPIVAFWQQDMLFQIALLSMTIIFLFPNKLIRHWKKWENITDAIGLSAFAVQGALYAQKLNLPISATIVAAVLTGIGGGIIRDLLARRKPLVLRAEVYAFWTILAGFLIGAQIIVSDWALYILFILIVCFRMVSIHYKWHLPHRRIETKERSMHK >NC_018877.1|WP_000391413.1|3678309_3679584_-|GTPase-HflX MEEKEKVILVGCQLPQDDDEKFMHSMKELASLAKTARAEVLVSTTQKRPKFHPATYIGKGKLEELTMLTEELEPDVIIFNNELTPSQIRNLSSVLDARVIDRTQLILDIFAQRAKSREGKLQVELAQLQYTMPRLMGQGLSLSRLGGGIGTRGPGETKLETDRRHIRSRIDEIKKQLAVVVEHRKRYRERRKDNKVFQISLIGYTNAGKSTLFNRLTEANTFEENLLFATLDPTTRKMPLPSGYTVLLTDTVGFIQDLPTSLIAAFRSTLEEAGEADVILHVVDSADPNYIGHEKTVKRLLSELEINHIPIITLYNKKDELHQNFIPFPKSDFLMTSAFEESDVLRIKEAIEMKMKKEMDRYRVEIPPSEGKLLTLLKTETILAKMEFLEDKFVYDCAGYIFTHSSLNVQLKRFLVEEGENKNV >NC_018877.1|WP_000460310.1|3677045_3678317_-|methionine-gamma-lyase-family-protein MFDRLKNGEKIAPIVKEVESQITEVHKRADEVIESNQFRVLESFRKHKISDSHFIPTTGYGYDDIGRDTLEKVYADVFGAEAGLVRSQIISGTHAISTALFGILRPGDELLYITGKPYDTLEEIVGVRGKGVGSFKEYNIGYNAVPLTEGGLVDFEAVAAAIHSNTKMIGIQRSKGYATRPSFTISQIKEMIAFVKEIKPDVVVFVDNCYGEFIEEQEPCHVGADLMAGSLIKNPGGGIVKTGGYIVGKEQYVEACAYRLTSPGIGAEAGASLYSLQEMYQGFFLAPHVAGQALKGAIFTAAFLEKLGMNTSPAWNAPRTDLIQSVQFDDKDRMVAFCQAIQYASPINSHFTPYANYMPGYEDDVIMAAGTFIQGASIELSADGPIRPPYVAYVQGGLTYSHVKIAICSAIDELIEKNLLTIS >NC_018877.1|WP_000656783.1|3676481_3676871_-|transcriptional-repressor-GlnR MKEDRRSAPLFPIGIVMDLTQLSARQIRYYEEHNLVSPTRTKGNRRLFSFNDVDKLLEIKDLLDQGLNMAGIKQVLLMKENQTEAVKVKEETKEISKTELRKILRDELQHTGRFNRTSLRQGDISRFFH >NC_018877.1|WP_000092763.1|3675098_3676433_-|type-I-glutamate--ammonia-ligase MSRYTKEDIFRLAKEENVKYIRLQFTDLLGVIKNVEIPVRQLTKALDNKMMFDGSSIEGFVRIEESDMYLYPDLDTWVIFPWTAEKGKVARLICDIYNADGTPFDGDPRNNLKRVLKEMEALGFSDFNLGPEPEFFLFKVDEKGNPTLELNDNGGYFDLAPMDLGENCRRDIVLELEEMGFEIEASHHEVAPGQHEIDFKYANAIRSCDDIQTFKLVVKTIARKHGLHATFMPKPLYGVNGSGMHCNLSLFKNGENVFFDANGDLQLSDDARHFIAGILKHAPAFTAIANPTVNSYKRLVPGYEAPCYVAWSAQNRSPLVRIPASRGISTRVEVRSVDPAANPYLVMATLLAAGLDGIKNKLTPPAAVDRNIYVMTKEEREEAGIVDLPATLAQALVTLQSNEVVCGALGEHLLEHFIEAKEIEWDIFRTQVHQWERDQYMSLY >NC_018877.1|WP_001102628.1|3674156_3674480_-|PadR-family-transcriptional-regulator MNVQFKKGVLELCVLALVKRKDSYGYELVQQISNKFLISEGSVYPLLRRLTKEGYFQTYLKESTEGPPRKYYQLTEQGETQFHLLVTEWRDFAKGVQEIIEGVEWDE >NC_018877.1|WP_000031386.1|3673621_3674164_-|DUF1700-domain-containing-protein MSKEGFLKELSSYLRKLPEEERQDILLDYEEHFQFGLEEGKTESEIIQGLGSPKVIAKELLAMYRFDEMKKNPSTSNVTRAVMAAIGLSLFNFIIVLGPLVAIVAFIFSFWIGGIASVVTPFFVIGKVFMGTFIWLDLFVSITFVGVGLLLCIIAFYSTKWFKRLCVRYVIWNFKMIKGE >NC_018877.1|WP_000976233.1|3672817_3673621_-|DUF4097-family-beta-strand-repeat-protein MMKKLFLIAIACIIIGVIGISQTYEKAVQTAEKGDKEDVIKNETLKNIEVKLDAGDIVIQKSPDSSFYVKQSGDVRKQEIRIAEDGDTLKIIGEREKGASFDFSFYDFRFQTSKLTLLVPERSYRDVKVNSSAGQIEMSDVKSDSVSVRTLAGEVELKQVTAKNVEGSTKAGEVNFKKVLGKVTAKTTSGEINIQDHDSKYNLEASSTAGDIDITLSEKPQDAVITGQSAAGDVTIFNEENNNVTIGNGSKKISGKTAAGDVTIETR >NC_018877.1|WP_087944820.1|3685084_3686439_-|IS3-family-transposase MAKFTADEKIQIVLRYLNGNESYREIGRSLGINDTIILNWVNQYKQNGLEAFLKRCTNYTQQFKLDVLNFMIENGMSLFETAAIFNIPAPSTISVWKKQLETQGIDALQSKKKGRPSMKKDSNKQLKQPLAEGSVEALEARIKQLEMENEYFKKVKCLSSKQGKITKQDKAQVVYELRHKYSVKALVELATIPRSTYYDLVKKMNRPDLDADLKAEIKAIYEENEGRYGYRRIRDELTNRGQKVNHKKVQRIMKELGLKCVVRMKKYKSYKGKVGRIAPNILERNFYTDAPNQKWVTDITEFKLFGEKLYVSPVLDLYNGEIITYTIGSRPTYSLVSDMLEKALERLPETHQLLMHSDQGWHYQMRQYVGTLESRAIVQSMSRKGNCYDNAVIENFFGIMKSEFLYIKEFENVEHFKIELEKYIDYYNTKRIKAKLKMSPVQYRTHFYQAA >NC_018877.1|WP_000813896.1|3686531_3686756_-|RNA-chaperone-Hfq MKQSINIQDQFLNQLRKENTFVTLYLLNGFQLRGLIKGFDNFTVLLETEGKQQLIYKHAISTFVPQKNVSIELE >NC_018877.1|WP_000504953.1|3686777_3687731_-|tRNA-(adenosine(37)-N6)-dimethylallyltransferase-MiaA MGEVQREKVAVIIGPTAVGKTKLSIDLAKALNGEIISGDSMQIYRTMDIGTAKVTQAEMDGIPHYMVDIKNPEDSFSVAEFQERVRKHIREITERGKLPIIVGGTGLYIQSVLFDYQFTDDAGDVIYREQMEKLALERGVEYVHKKLQEVDPESAERIHANNVRRVIRALEIFHTTGEKMSDQIEKQEKELLYDVSLIGLTMDREMLYDRINLRVDLMMEQGLLEEVEGLYNRGIRDCQSIQAIGYKEIYDYFENRAPLEDAVSQLKTNSRRYAKRQLTWFRNKMDVTWFDVTDGEKTSEILRYIEGKLQVKSNNSK >NC_018877.1|WP_000814431.1|3687912_3688158_+|hypothetical-protein MKQSTINFSSLTKDLILATSTKEQNCSQEELYFALNCLLRAFHSTLHETTSHPENKNTEYIQTQFCSAYKIITGKTIYPFQ >NC_018877.1|WP_000735452.1|3688220_3689153_-|SH3-domain-containing-protein MKKLLSIATAAVFGLGIFAGSAKAETIVTTDVLNVRENPNVESKLVGKVLSGNTLDVINTENGWTKIKLNGKEAFVSADFTKSTYYVTAGVLNVRAGANTDSEILGKLNKNDVIETTNQVQNEWLQFDYNGKVGYVHVPFLTGTAPVIEKKEVVAQEEAPVKNNTAVKNKESVKSNDSIKNVESSKPVVKEKPAAKPVAKSTETSAPTGGREITVEATAYTADPSENGSYGGRVLTAMGHDLTANPNMKVIAVDPKVIPLGSKVWVEGYGEAIAGDTGGAIKGNRIDVLVGSDGSANNWGRKSVKVKVIQ >NC_018877.1|WP_000704592.1|3689502_3691359_-|PTS-transporter-subunit-EIIA MKITELLKRDTVIMDLTASNKEAVIDELVEKLHGANRLNSKTEFKEAILKRESQSTTGIGEGIAIPHAKTKAVKQPSICFGRSVSGINYESLDGQPAHLFFMIAASEGANNTHLETLSRLSTLLMDEGFRKQLLEAKDESELLQLFDEKENEKEEEIEFAKPEGNEPYVLAVTACPTGIAHTYMAADSLKAKATELGIAIKVETNGSTGIKNGLTKEDIERATAIIVAADKQVEMNRFAGKHVIQVPVADGIRKTENLLKRAVKQDAPIFKGVKEDGKTESIEREKGLGIYKHLMSGVSNMLPFVVGGGILIALAFSFGGIKAEGPLAELFMSIGGGKTGAFLFLVPILAGFIASSIADRPGFMPGVVGGFLAANANAGFLGGLIAGFLAGYVVLGLKRLFSGLPVQLEGIKPVLLYPVFGLLITGVVMQKVVIPPVVALNEMLTGWLNGLNGTNAILLGLILGGMMAIDMGGPINKAAFTFGIAAIEAQNFGVHSAVMAGGMVPPLAIAFATTFFKSKFTEAERKSGLTNYIMGASFITEGAIPFAAADPVRVIVSCVVGSSIAGALSMLFQITLPAPHGGLFVIALVNKPLLYIFSILIGTIVSAIMLGVWKKKVQ >NC_018877.1|WP_000640854.1|3691372_3692284_-|1-phosphofructokinase MIYTVTLNPSIDYVVQVPSFDLGTINRAEKDMKFPGGKGINVSRVLQRLGVKNIALGFTGGFTGQFIKEVLHDEGVTTNFVQVDEDTRINVKIKGKEETELNGQGPIVTKEQFEQLMKKIESMQPGDCVVLAGSVPISIPSTFYESIAAFGAEKGIRVVVDASGSALQHVIKNKPFLIKPNHHELGELFGVELSTVEDVLPYGRKLIEQGVKHVIVSMAGEGALLFTAEGIYEATVPKGVVINSVGAGDSLVAGFVGKYEQTKDIEKAFQYGVATGSATAFSADLCKKEKVEELLSQVIVAKR >NC_018877.1|WP_000957288.1|3692280_3693033_-|DeoR/GlpR-transcriptional-regulator MLTPERHQMILQLVKEQKVVKLQQLVERTESSESTIRRDLAQLEKQRLLKRVHGGAAVLTGKGQEPTMVEKSSKNIQIKQQIANYAASVVEQGDCIYLDAGSTTFEMIPFLINKDVTVVTNGLMHIEALVENNIRAYLLGGMMKSRTKALIGAMAQESMQKYRFDKCFLGANGVHEQLGFTTPDPEEALLKQMALTLANEGYFLIDESKFSEVAFAKIANVEDANIITNHLEIDLEKYKKQTNVIEADKQ >NC_018877.1|WP_001179067.1|3693192_3694356_-|iron-containing-alcohol-dehydrogenase MQNFVFRNPTKLIFGKDQLEQLKTEIPQFGKKVLLVYGGGSIKRNGIYDNVISILKDINAEVFELTGVEPNPRVSTVKKGIQICKDNGVEFILAVGGGSVIDCTKAIAAGSKYDGDVWDIVTKKAFASEALPFGTVLTLAATGSEMNAGSVITNWETNEKYGWGSPVTFPQFSILDPVHTASVPRDQTIYGMVDIMSHVLEQYFHHGTNTELQDRYCESVLKTVIETAPKLLSDLENYEHRETILYCGTMALNGILAMGVKGDWATHNIEHAVSAVHDIPHGGGLAILFPNWMKHVVEENVSRFKQFAIRVFEIETDGKTDKEVALEGIEALRQFWTSIEAPATLADYGIGENEIDIMANKAMAYGEFGNFKKLNKDDVLSIYKASL >NC_018877.1|WP_000228315.1|3694473_3695016_-|DUF420-domain-containing-protein MVDQSTNQKSYAPIVITLSVIVNAIILFLFFGPVGYEGEVHFDVTILPMLNAIFNSFTFVFLLAALFSIIKKNVKMHRGFILAAFTTTLLFCVSYLSYHYLAPATHFGGEGFIKYVYFIILITHIILAAIIVPLALFALVFGFTNQLTRHRKIVRWTMPIWLYVSLSGVIVYLMISPYYQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_018877_4 | 3683954-3684502 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_018877_4
|
12 spacers
spacers of NC_018877_4
>4.1|3683972|18|NC_018877|CRT ACCTCAAGGTAACACAGG >4.2|3684008|27|NC_018877|CRT CGCTCAAGGACCTGCTGGTGCTACCGG >4.3|3684053|36|NC_018877|CRT CGTTCAAGGTAACACAGGTGCTACTGGTGCTACCGG >4.4|3684107|27|NC_018877|CRT CGTTCAAGGTAACACAGGTGCTACTGG >4.5|3684152|27|NC_018877|CRT CGTTCAAGGTAACACAGGTGCTACCGG >4.6|3684197|27|NC_018877|CRT TGTTCAAGGTAACACAGGTGCTACCGG >4.7|3684242|27|NC_018877|CRT CGTTCAAGGTAACACGGGCGCTACTGG >4.8|3684287|18|NC_018877|CRT TGTTCAAGGTAACACGGG >4.9|3684323|27|NC_018877|CRT TGCTCAAGGTAACACAGGTGCTACCGG >4.10|3684368|18|NC_018877|CRT CGTTCAAGGTAACACGGG >4.11|3684404|36|NC_018877|CRT TGCTCAAGGTAACACAGGTGCTACTGGTGCTACCGG >4.12|3684458|27|NC_018877|CRT CGTTCAAGGTAACACAGGTGCTACCGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018877_4
The CRISPR arrays of NC_018877_4 >merge|NC_018877|4|3683954-3684502|CRT ACCTACTGGACCTCAGGGACCTCAAGGTAACACAGGTGCTACTGGACCTCAAGGCGCTCAAGGACCTGCTGGTGCTACCGGCGCTACTGGACCTCAAGGCGTTCAAGGTAACACAGGTGCTACTGGTGCTACCGGCGCTACTGGACCTCAAGGCGTTCAAGGTAACACAGGTGCTACTGGTGCCACTGGACCTCAAGGCGTTCAAGGTAACACAGGTGCTACCGGCGCTACTGGACCTCAAGGTGTTCAAGGTAACACAGGTGCTACCGGTGCTACTGGACCTCAGGGCGTTCAAGGTAACACGGGCGCTACTGGCGCTACTGGACCTCAAGGTGTTCAAGGTAACACGGGTGCTACTGGACCTCAGGGTGCTCAAGGTAACACAGGTGCTACCGGTGCCACTGGACCTCAAGGCGTTCAAGGTAACACGGGTGCTACTGGACCTCAAGGTGCTCAAGGTAACACAGGTGCTACTGGTGCTACCGGCGCTACTGGACCTCAAGGCGTTCAAGGTAACACAGGTGCTACCGGCGCTACCGGACCTCAAGG >NC_018877|4|2|3683954-3684502|CRT ACCTACTGGACCTCAGGG ACCTCAAGGTAACACAGG TGCTACTGGACCTCAAGG CGCTCAAGGACCTGCTGGTGCTACCGG CGCTACTGGACCTCAAGG CGTTCAAGGTAACACAGGTGCTACTGGTGCTACCGG CGCTACTGGACCTCAAGG CGTTCAAGGTAACACAGGTGCTACTGG TGCCACTGGACCTCAAGG CGTTCAAGGTAACACAGGTGCTACCGG CGCTACTGGACCTCAAGG TGTTCAAGGTAACACAGGTGCTACCGG TGCTACTGGACCTCAGGG CGTTCAAGGTAACACGGGCGCTACTGG CGCTACTGGACCTCAAGG TGTTCAAGGTAACACGGG TGCTACTGGACCTCAGGG TGCTCAAGGTAACACAGGTGCTACCGG TGCCACTGGACCTCAAGG CGTTCAAGGTAACACGGG TGCTACTGGACCTCAAGG TGCTCAAGGTAACACAGGTGCTACTGGTGCTACCGG CGCTACTGGACCTCAAGG CGTTCAAGGTAACACAGGTGCTACCGG CGCTACCGGACCTCAAGG
>NC_018877.1|WP_000450330.1|3681789_3682755_+|site-specific-integrase METTEFHDTIQAFSIFLLNKGRKPSTIKRYVYDVEDFGHWLEKNKKLPSSNIWATLCTKDYEDYFSDLKTNRHYSEKTMHRVFTVLNRMHHFLNIPNPLKNMEISIQPDRTLRNEDFISPDEEKRLKYIVTSLEGLSEKQLPVRPLLMDRNIAILNLLIDYGLSLQELTALTMHHVHFETNTLSIPATAGVERTITLAKEDKKQLYNYYKSIPEPVRPKYHSDDSLFVAFDFNRGTYRWVYENDAPKALTEIAIQKMIRLEVARANLRKGISGQHFRNTYILNLIKKETPESEIIKLAGFKSKISLKRYYQYAENRKNALL >NC_018877.1|WP_000438179.1|3680568_3681525_-|stage-V-sporulation-protein-K MEQSMRKKNNNQINIVLNHRKKISLPAAENKTVISNETTIKHEMLQRIEEEMGKLVGMDDIKKIIKEIYAWIYVNKKRQEKGLKSEKQVLHMLFKGNPGTGKTTVARMIGKLLFEMNILSKGHLVEAERADLVGEYIGHTAQKTRDLIKKAMGGILFIDEAYSLARGGEKDFGKEAIDTLVKHMEDKQHGFVLILAGYSREMNHFLSLNPGLQSRFPFIIEFTDYSVNQLLEIGKRMYEDREYQLSKEAEWKFRDHLHAVKYSSQITSFSNGRYVRNIVEKSIRTQAMRLLQEDTYDKNDLIGISSMDLMLEEETHST >NC_018877.1|WP_000312267.1|3679676_3680300_+|trimeric-intracellular-cation-channel-family-protein 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MSRYTKEDIFRLAKEENVKYIRLQFTDLLGVIKNVEIPVRQLTKALDNKMMFDGSSIEGFVRIEESDMYLYPDLDTWVIFPWTAEKGKVARLICDIYNADGTPFDGDPRNNLKRVLKEMEALGFSDFNLGPEPEFFLFKVDEKGNPTLELNDNGGYFDLAPMDLGENCRRDIVLELEEMGFEIEASHHEVAPGQHEIDFKYANAIRSCDDIQTFKLVVKTIARKHGLHATFMPKPLYGVNGSGMHCNLSLFKNGENVFFDANGDLQLSDDARHFIAGILKHAPAFTAIANPTVNSYKRLVPGYEAPCYVAWSAQNRSPLVRIPASRGISTRVEVRSVDPAANPYLVMATLLAAGLDGIKNKLTPPAAVDRNIYVMTKEEREEAGIVDLPATLAQALVTLQSNEVVCGALGEHLLEHFIEAKEIEWDIFRTQVHQWERDQYMSLY >NC_018877.1|WP_001102628.1|3674156_3674480_-|PadR-family-transcriptional-regulator MNVQFKKGVLELCVLALVKRKDSYGYELVQQISNKFLISEGSVYPLLRRLTKEGYFQTYLKESTEGPPRKYYQLTEQGETQFHLLVTEWRDFAKGVQEIIEGVEWDE >NC_018877.1|WP_000031386.1|3673621_3674164_-|DUF1700-domain-containing-protein MSKEGFLKELSSYLRKLPEEERQDILLDYEEHFQFGLEEGKTESEIIQGLGSPKVIAKELLAMYRFDEMKKNPSTSNVTRAVMAAIGLSLFNFIIVLGPLVAIVAFIFSFWIGGIASVVTPFFVIGKVFMGTFIWLDLFVSITFVGVGLLLCIIAFYSTKWFKRLCVRYVIWNFKMIKGE >NC_018877.1|WP_000976233.1|3672817_3673621_-|DUF4097-family-beta-strand-repeat-protein 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>NC_018877.1|WP_000504953.1|3686777_3687731_-|tRNA-(adenosine(37)-N6)-dimethylallyltransferase-MiaA MGEVQREKVAVIIGPTAVGKTKLSIDLAKALNGEIISGDSMQIYRTMDIGTAKVTQAEMDGIPHYMVDIKNPEDSFSVAEFQERVRKHIREITERGKLPIIVGGTGLYIQSVLFDYQFTDDAGDVIYREQMEKLALERGVEYVHKKLQEVDPESAERIHANNVRRVIRALEIFHTTGEKMSDQIEKQEKELLYDVSLIGLTMDREMLYDRINLRVDLMMEQGLLEEVEGLYNRGIRDCQSIQAIGYKEIYDYFENRAPLEDAVSQLKTNSRRYAKRQLTWFRNKMDVTWFDVTDGEKTSEILRYIEGKLQVKSNNSK >NC_018877.1|WP_000814431.1|3687912_3688158_+|hypothetical-protein MKQSTINFSSLTKDLILATSTKEQNCSQEELYFALNCLLRAFHSTLHETTSHPENKNTEYIQTQFCSAYKIITGKTIYPFQ >NC_018877.1|WP_000735452.1|3688220_3689153_-|SH3-domain-containing-protein MKKLLSIATAAVFGLGIFAGSAKAETIVTTDVLNVRENPNVESKLVGKVLSGNTLDVINTENGWTKIKLNGKEAFVSADFTKSTYYVTAGVLNVRAGANTDSEILGKLNKNDVIETTNQVQNEWLQFDYNGKVGYVHVPFLTGTAPVIEKKEVVAQEEAPVKNNTAVKNKESVKSNDSIKNVESSKPVVKEKPAAKPVAKSTETSAPTGGREITVEATAYTADPSENGSYGGRVLTAMGHDLTANPNMKVIAVDPKVIPLGSKVWVEGYGEAIAGDTGGAIKGNRIDVLVGSDGSANNWGRKSVKVKVIQ >NC_018877.1|WP_000704592.1|3689502_3691359_-|PTS-transporter-subunit-EIIA MKITELLKRDTVIMDLTASNKEAVIDELVEKLHGANRLNSKTEFKEAILKRESQSTTGIGEGIAIPHAKTKAVKQPSICFGRSVSGINYESLDGQPAHLFFMIAASEGANNTHLETLSRLSTLLMDEGFRKQLLEAKDESELLQLFDEKENEKEEEIEFAKPEGNEPYVLAVTACPTGIAHTYMAADSLKAKATELGIAIKVETNGSTGIKNGLTKEDIERATAIIVAADKQVEMNRFAGKHVIQVPVADGIRKTENLLKRAVKQDAPIFKGVKEDGKTESIEREKGLGIYKHLMSGVSNMLPFVVGGGILIALAFSFGGIKAEGPLAELFMSIGGGKTGAFLFLVPILAGFIASSIADRPGFMPGVVGGFLAANANAGFLGGLIAGFLAGYVVLGLKRLFSGLPVQLEGIKPVLLYPVFGLLITGVVMQKVVIPPVVALNEMLTGWLNGLNGTNAILLGLILGGMMAIDMGGPINKAAFTFGIAAIEAQNFGVHSAVMAGGMVPPLAIAFATTFFKSKFTEAERKSGLTNYIMGASFITEGAIPFAAADPVRVIVSCVVGSSIAGALSMLFQITLPAPHGGLFVIALVNKPLLYIFSILIGTIVSAIMLGVWKKKVQ >NC_018877.1|WP_000640854.1|3691372_3692284_-|1-phosphofructokinase MIYTVTLNPSIDYVVQVPSFDLGTINRAEKDMKFPGGKGINVSRVLQRLGVKNIALGFTGGFTGQFIKEVLHDEGVTTNFVQVDEDTRINVKIKGKEETELNGQGPIVTKEQFEQLMKKIESMQPGDCVVLAGSVPISIPSTFYESIAAFGAEKGIRVVVDASGSALQHVIKNKPFLIKPNHHELGELFGVELSTVEDVLPYGRKLIEQGVKHVIVSMAGEGALLFTAEGIYEATVPKGVVINSVGAGDSLVAGFVGKYEQTKDIEKAFQYGVATGSATAFSADLCKKEKVEELLSQVIVAKR >NC_018877.1|WP_000957288.1|3692280_3693033_-|DeoR/GlpR-transcriptional-regulator MLTPERHQMILQLVKEQKVVKLQQLVERTESSESTIRRDLAQLEKQRLLKRVHGGAAVLTGKGQEPTMVEKSSKNIQIKQQIANYAASVVEQGDCIYLDAGSTTFEMIPFLINKDVTVVTNGLMHIEALVENNIRAYLLGGMMKSRTKALIGAMAQESMQKYRFDKCFLGANGVHEQLGFTTPDPEEALLKQMALTLANEGYFLIDESKFSEVAFAKIANVEDANIITNHLEIDLEKYKKQTNVIEADKQ >NC_018877.1|WP_001179067.1|3693192_3694356_-|iron-containing-alcohol-dehydrogenase MQNFVFRNPTKLIFGKDQLEQLKTEIPQFGKKVLLVYGGGSIKRNGIYDNVISILKDINAEVFELTGVEPNPRVSTVKKGIQICKDNGVEFILAVGGGSVIDCTKAIAAGSKYDGDVWDIVTKKAFASEALPFGTVLTLAATGSEMNAGSVITNWETNEKYGWGSPVTFPQFSILDPVHTASVPRDQTIYGMVDIMSHVLEQYFHHGTNTELQDRYCESVLKTVIETAPKLLSDLENYEHRETILYCGTMALNGILAMGVKGDWATHNIEHAVSAVHDIPHGGGLAILFPNWMKHVVEENVSRFKQFAIRVFEIETDGKTDKEVALEGIEALRQFWTSIEAPATLADYGIGENEIDIMANKAMAYGEFGNFKKLNKDDVLSIYKASL >NC_018877.1|WP_000228315.1|3694473_3695016_-|DUF420-domain-containing-protein MVDQSTNQKSYAPIVITLSVIVNAIILFLFFGPVGYEGEVHFDVTILPMLNAIFNSFTFVFLLAALFSIIKKNVKMHRGFILAAFTTTLLFCVSYLSYHYLAPATHFGGEGFIKYVYFIILITHIILAAIIVPLALFALVFGFTNQLTRHRKIVRWTMPIWLYVSLSGVIVYLMISPYYQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_018877_5 | 5281933-5282066 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_018877_5
|
2 spacers
spacers of NC_018877_5
>5.1|5281956|31|NC_018877|CRISPRCasFinder TTCTTCTTTTTTGTCACTAGTTGAACCGCTT >5.2|5282010|34|NC_018877|CRISPRCasFinder CTTGTCTTCTGTTTTATTTTCTGGTTTCGTGCTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018877_5
The CRISPR arrays of NC_018877_5 >merge|NC_018877|5|5281933-5282066|CRISPRCasFinder GTTGATTTTTCTTCTTTCTTCGGTTCTTCTTTTTTGTCACTAGTTGAACCGCTTGTTGATTTCTCTTCTTTTTGAGACTTGTCTTCTGTTTTATTTTCTGGTTTCGTGCTCGTTGACTTCTCTTCTTTTTGAGA >NC_018877|5|3|5281933-5282066|CRISPRCasFinder GTTGATTTTTCTTCTTTCTTCGG TTCTTCTTTTTTGTCACTAGTTGAACCGCTT GTTGATTTCTCTTCTTTTTGAGA CTTGTCTTCTGTTTTATTTTCTGGTTTCGTGCTC GTTGACTTCTCTTCTTTTTGAGA
>NC_018877.1|WP_000008903.1|5281464_5281599_-|hypothetical-protein MSFLFVLSTAIILLFVLFTLYYYIAGKKEVPHHQLLEEELEREE >NC_018877.1|WP_000544012.1|5280883_5281156_-|sporulation-transcriptional-regulator-SpoIIID MHDYIKERTIKIGKYIVETRKTVRVIAKEFGVSKSTVHKDLTERLPEINPELANEVKEILDYHKSIRHLRGGEATKQKYRKEDVEKPVRQ >NC_018877.1|WP_000457978.1|5279721_5280723_-|rod-shape-determining-protein MFARDIGIDLGTANVLIHVKGKGIVLNEPSVVAIDRNSGKVLAVGEEARSMVGRTPGNIVAIRPLKDGVIADFEITEAMLKYFINKLDVKSFFSKPRILICCPTNITSVEQKAIREAAERSGGKTVFLEEEPKVAAVGAGMEIFQPSGNMVVDIGGGTTDIAVLSMGDIVTSSSIKMAGDKFDMEILNYIKRKYKLLIGERTSEDIKIKVGTVFPGARSEELEIRGRDMVTGLPRTITVCSEEITEALKENAAVIVQAAKGVLERTPPELSADIIDRGVILTGGGALLHGIDMLLAEELKVPVLIAENPMHCVAVGTGIMLENIDRLPKRALR >NC_018877.1|WP_000931959.1|5278857_5279292_-|3-hydroxyacyl-ACP-dehydratase-FabZ MLNIEQIKEIIPHRYPFLLVDKILEVDEGKRAVGIKNVSANEEFFNGHFPDYAVMPGVLIVEALAQVGAVAVLKKEENRGRLAFFAGIDNCRFKKQVRPGDQLRLEVEMTRVRGPIGKGKAIATVDGEVACEAEITFAIGDKKE >NC_018877.1|WP_000467944.1|5277835_5278513_-|CpsD/CapB-family-tyrosine-protein-kinase MFGRKKRKPLRQLITHKEPKSRITEQYRNIRTNIEFTSVDNHVRSIIVTSADPGDGKTTTIANLAVVFGQQGKKVLLIGADLRKPTIQNLFAIHSSNGLTNLLSGQAKLMQCIQKTDIENVYLMAAGPIPPNPAELLGSRAMDEALLEAYNMFDIILIDTPPVLAVTDAQILANKCDGIVLVVRSEKTEKDKIVKAKQILDKASGKILGVVLNDKREEKEQYGYY >NC_018877.1|WP_000393129.1|5276831_5277575_-|capsular-polysaccharide-biosynthesis-protein MEETISLKELFHILKKRLAMILVIAFGAAIVSAIISFFFMTPIYQSSTQILVNQKKQEGAAIQYNEVQTNIQLTNTYKVIIKSPVILDQVKEKLGLNITAQELNKKIEVANEKDSQVVAVTAQDKDPKLARDIANTTAEVFKGEVAKIMSVDNVTVLSKAELSEELSPIKPRPMLNVAIAFVVGLMASIGLAFLLEYLDNTVKKEEDVENLLGLPVLGIVARMDEETLNVKSHAPSSRKVRGQTIGS >NC_018877.1|WP_001207174.1|5276140_5276842_-|CpsD/CapB-family-tyrosine-protein-kinase MALNLFKKKKNHRQRRQLIAHQQPKSPISEQYRNIRTNIEFAAVDTNLHSLMVTSANPSEGKTTTTANMAVVFAQQGKKVLLIDADMRKPAMHQMFQVDNIFGLTNVLTNSERLEKCVQTTSVDNLHFLACGPIPPNPAELLGSKSMKELLGQAYSMYDLVIFDMPPILAVTDAQIMANVCDASILVVRSESTEKETAVKAKGLLESAKGKLLGVVLNDREREQGLYYYYGAN >NC_018877.1|WP_000566188.1|5275265_5276033_-|tyrosine-protein-phosphatase MIDLHCHILHGIDDGAQTVTDSLAMAQQAVSEGIHTIVATPHHQNGKYINERTSIIHHVKQLNDELQQYNIPLTILPGQEIRLYGDLLEDYEAGKIVTLNETNKYIFIEFPSNHVPRYAEQLLYELRVKGMIPIIVHPERNAELIERPDKLYNLVNKGALTQVTAGSLLGKFGKKIKKFSLQLVEHNLTHMVASDAHNTTSRGFHLAESYELIEKEFGMNVMSDLKENPYLLISGKAIYKEDPEQIRRKKLFGIF >NC_018877.1|WP_000757789.1|5274142_5275024_-|UTP--glucose-1-phosphate-uridylyltransferase-GalU MKKVRKAIIPAAGLGTRFLPATKAMPKEMLPIVDKPTIQYIIEEAIESGIEDIIIVTGKGKRAIEDHFDHSFELEQSLLEKGKYEMLEKVQASSKINIHYIRQKEPKGLGHAVWCARKFIGNEPFAVLLGDDIVQAETPCLRQLMDQYEGTQSSVIGVQTVPENETHRYGIIDPVEQNDRRYQVRQFVEKPAQGTAPSNLAIMGRYVLTPEIFMFLENQQTGAGGEIQLTDAIQRLNEIQRVFAYDFEGTRYDVGEKFGFIKTTIEMALQHEELKEDLMKYMNTIVGKENVFI >NC_018877.1|WP_000392722.1|5273443_5274124_-|sugar-transferase MEERNLINKSATETIDTVRKQNVLYLLMKRAIDIVGAIIGLIIFSPFFIIIPILYMRGEGKGPVFFRQSRIGQNGETFGIYKFRSMVIDAEKKLKQNEVLYKKYIDNNYKLEPEEDPRITSVGRFLRKTSLDELPQFINVLKGDMSLVGPRPVVQEELLEYGERKSDFLSVKPGITGYWQVSGRSDVGYPERVDLELHYVYNASLFFDIKILFLTVVNVVLRRGAY >NC_018877.1|WP_000144445.1|5282953_5283658_-|ABC-transporter-permease MTFSMRRVSAIFRKEVQDFKTNSQVLLMAFLPIILSFLFSRFGVGKEMLGITTITAFLFVAGFVQSMVIAEEKEKHTLRVLMLSPASSVEVLLGKSILTACLTLGICIVNLFILDQFSGNLLLLGFIFLCGTILFIVIGTMIGLLAASVPQTSIIGMPILMTMYLAVQFEPMVENKVIKTMIGYLPTSHIVKALNSLVGGAGFSSISGHVLNVAIWLIIALIACLIVYKKKQMD >NC_018877.1|WP_000170868.1|5283657_5284500_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MTLAIEMKDVMKSFSGKTALRNVNIEVKQGEIFGFLGPSGSGKTTTVKILTSQLLHSVGTVRVLGKDITGPSSIDYKRIGILTDNSGLYERLSIYDNLLLFCDLYDCKKKRIDEVLTQVNLLDDKKTPVKKLSKGMKQRVTLARAILHKPDILFLDEPTSALDPVNVQNIHKILKDLNEEGTTIFLTTHNMDEAETLCNRIAFLCGGEIVALDTPENLRLQYAKDQIEVVLKDKQKAVVQKDELGAKRISEWMNKGELLSIHSHEPTLGDIFIEVTGRGL >NC_018877.1|WP_001185911.1|5284681_5285689_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MALLELKQLGKANQLPAIELEVEKGKCIVLQCNNHTAKVLHRIIIGEEEASTGNVLFEGEAIGKKNYSRIGFCFLKDEAYDRLKVKEYFKFLLGLYESKISIEEVVQSVGLLDKLNVKIEKLSFSEKRRLHIGRVMIHNPDLVILEEPEQNVDIESTVIIRKAIMKMKEQGKAIFITSSFLSDALSLTEDVYILNNDGVKKVEIEQEEAEKVDEEKVVQIIPQMKLERIPAKVNDKIILLDPMEIHFIETQNGVTHIHVREGDFVCALTLSELEARLTGFGFFRCHRSYLVNLQRVREVITWTRNSFSLILDDERKSSIPLSKGRMDELKGVIGL >NC_018877.1|WP_000672649.1|5285788_5286808_-|stage-II-sporulation-protein-D MKFSKPLFITVALLIALVIIVPAALVIPFAKAKVGEETASKTPPAIESIPAPGKVDTAVQVAVYREKQKKVELLPMEEYVTGVVASEMNASFEIEALKAQALAARTFVVQRMLSGGKKNNADVTDTVKDQVYKSKDELKKQWGNNYENNLKKIEEAVSKTAGQVLTYDGKPISASFFSTSNGRTENAADYWGNDYPYLKSVDSPWDQASPKFTSEQTFTVADFQKRLGVKVLADGKVGNIKDLTEGKRVKDVAFQGKTLTGKEVREKLDLRSSDFTWKQQGDKIIVTTKGFGHGVGMSQYGANGMAAEGKKYTDIVAHYYKGVEIKTMNDYEGKLMVKK >NC_018877.1|WP_000411275.1|5287015_5288320_-|UDP-N-acetylglucosamine-1-carboxyvinyltransferase MEKIIVRGGKRLNGTVRVEGAKNAVLPIIAAALLASDGKNVLSEVPVLSDVYTINEVLRHLNAEVVFENNQVTIDSSKELNIEAPFEYVRKMRASVQVMGPLLARNGRARIALPGGCAIGSRPIDQHLKGFEAMGAKVQVGNGFVEAYVEGELKGAKIYLDFPSVGATENIMSAATLAKGTTILENAAKEPEIVDLANFLNAMGAKVRGAGTGTIRIEGVDKLYGANHSIIPDRIEAGTFMVAAAITGGDILIENAVPEHLRSITAKMEEMGVKIIEENEGVRVIGPDKLKAVDIKTMPHPGFPTDMQSQMMALLLQADGTSMITETVFENRFMHVEEFRRMNADIKIEGRSVIMNGPNSLQGAEVGATDLRAAAALILAGLVSEGYTRVTELKHLDRGYVDFHKKLAALGATIERVNEKVEEVKEQEVSDLHA >NC_018877.1|WP_003272396.1|5288359_5289070_-|YwmB-family-TATA-box-binding-protein MKLKLKAILIVALSVVLFLVGYREMKPISDEQKMESMIKALEKNDAKVEKWSWLARETKTISNIHTFQKLLNDVKDKANIQKWEVEQSPDGYKATSYKKFASHEERVVVTWSKENTKENTFIIFEVSGAKWDPKYVQKVNKIFSEKPIIYTCVQGVLNDKIEGVLQNKTNQVLKDLSARAIEQVEERAFVSVSAYNKKWDDALSTNREKINVQIAIRSTDNKDTIVVGTPIITSEY >NC_018877.1|WP_000057889.1|5289114_5289351_-|DUF1146-domain-containing-protein MAQLLGQQALIAIVSHLLFITITWWALQGIHIERLMKSGKVLQTRVLLILITIAIGTSVSNFFLDYLGYSKSLTYLVK >NC_018877.1|WP_000367476.1|5289553_5291074_-|NADH-quinone-oxidoreductase-subunit-NuoN MDMNTLLSLSWHLMVPEFIILGAAILLSICDLFFKLNHRYVALGAIAAIVLAIVSLITLYSEPAGDILNGSFVLDGFSKGFKTLLLGASALILCIAMSDDKKNPIEDKGEYYYLFLMALLGAMFMASSVDFITLFVGLELLSLSSYILVGIRKKNRASNEAAMKYVISGGIGTAITLFGMSYLYGITGSTNIVDMQKVLTGELASGIQLLLALAFLLLLVGLSFKIATVPFHMWAPDVYEGATTPVTAFLGTISKIAGFLLIIRLFLMVFASVLIQGDMKSLYGHMSIYIAVLASITMIVGNVVALKQYNVKRLFAYSGIAHAGYLLVPLVALSPFTLDSMWFYMLAYMLMNIGAFAIIHGLILQNDKENITIFTGLYKKSPFAAIMMTIFILSLAGIPGTAGFIGKINIFLGALHVEPAHYVLASIMMGTTVVSFVYYFRILQQMFFRTGETEERIRLPLNIKVVMSLCAISIVILGIMPMIGYNFFYEYFPLMKDFFFLGNVVQ >NC_018877.1|WP_000998943.1|5291075_5292578_-|NADH-quinone-oxidoreductase-subunit-M MNDLLLTFFIFSPLLGILLLVLTPKKELRTVRALGLFGTALPFGIAIVLACTYASGKSLSLFDEKVKWIKFGDFTAVDKRWFSIYYELGIDGLSLVMMVLTALLAMLAAIAAFSIKRNLKAFYMLLLMLEIGMLGVFAAQNLMLFFIFFEITLPPMFLLIGKWGKLSSEKAAYSYLIYNGIGSAVLLIVFSILFAKTGTTNIVELKEILRSVSAEGELIIPSSLQLGVFISIMIAFAIKLPVFPLHRWMVNVHIEAHPAVVMLHAGVLLKIGAYGIIRFGKGLFPEYFHDVATLIAILGVINLLYGAFLALIQTDFRKVLAYSSISHMGIVLMGLASLNAPGTQGALFQVVSHGLIAALLFFLLGVIEQRFGTSEITALGGLAKSVPVLSGFFLAGGMASLGLPGMSGFVSEFLAFLGLFQGEPVIAAVGVIGIILTAVYVLRATLQVTFGKKEWEAKSDIHGWEYVPVLLLIFCIIVIGVMPEILGDPLQNTLKTLGVK >NC_018877.1|WP_000568236.1|5292574_5294437_-|NADH-quinone-oxidoreductase-subunit-L MIDYAWLIPLFPLVSFLLLIIFGKKIREGSSVLSIFFVFLSFILAVLVLIERFSEASVKHKWVWLRAGDVDISFGFEVTALGALMLFIVTLVSLLVHVYSKGYMKGDERLPTFYAYLGLFTFAMLGLVISTNLLQLYIFWELVGLGSFLLIGFYFFKEEAKAAAKKAFIMTRIGDVGLFIGMILIFWYAGSFEYDAIFRAIYTGDLPPYMITITAILIFIGAMGKSGQFPLHTWLPDAMEGPTPVSALIHAATMVAAGVYLVATMFPLFSASTVAMQTVAIVGAFTAIFAASIGLVQTDIKRVLAYSTVSQLGYMMLALGSAGYVAGVFHLTTHAFFKALLFLAAGSVIHAVHTQNINKMGGLQKKMKVTGTLFLIGTLAISGVPLLSGFFSKDEILAATWMNGNYVLFTLAVIAAFLTAFYMFRLYFLVFTGETKTKEDVHESPRVMTYPMIVLGVLAVVAGYINTPWFGTFLGDWLTKDVGFKVEEAHGPVWIMIVATLVSFAGIALAYFIYGKKSISRDWAGGTETSLYNLLKEKYYVDELYNMTVIPITKGIAHVLRLFEVYVVEGIAVLIGSVVKGTSNLGSKLQNGNVQVYGTVTAVSLAVLVIILLYTGGDLR |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_018877_3 | 3.1|3683576|27|NC_018877|CRT | 3683576-3683602 | 27 | NC_018877.1 | 3683423-3683449 | 0 | 1.0 |
NC_018877_3 | 3.1|3683576|27|NC_018877|CRT | 3683576-3683602 | 27 | NC_018877.1 | 3683531-3683557 | 1 | 0.963 |
NC_018877_3 | 3.1|3683576|27|NC_018877|CRT | 3683576-3683602 | 27 | NC_018877.1 | 3683378-3683404 | 2 | 0.926 |
NC_018877_3 | 3.1|3683576|27|NC_018877|CRT | 3683576-3683602 | 27 | NC_018877.1 | 3683459-3683485 | 2 | 0.926 |
NC_018877_3 | 3.2|3683621|18|NC_018877|CRT | 3683621-3683638 | 18 | NC_018877.1 | 3683504-3683521 | 0 | 1.0 |
NC_018877_3 | 3.2|3683621|18|NC_018877|CRT | 3683621-3683638 | 18 | NC_018877.1 | 3683540-3683557 | 0 | 1.0 |
NC_018877_3 | 3.2|3683621|18|NC_018877|CRT | 3683621-3683638 | 18 | NC_018877.1 | 3683387-3683404 | 1 | 0.944 |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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NC_018877_3 | 3.6|3683774|27|NC_018877|CRT | 3683774-3683800 | 27 | KX845404 | Klebsiella phage vB_Kpn_IME260, complete genome | 83090-83116 | 3 | 0.889 |
NC_018877_4 | 4.6|3684197|27|NC_018877|CRT | 3684197-3684223 | 27 | JQ691611 | Cronobacter phage CR9, complete genome | 9702-9728 | 3 | 0.889 |
NC_018877_3 | 3.6|3683774|27|NC_018877|CRT | 3683774-3683800 | 27 | JQ691611 | Cronobacter phage CR9, complete genome | 9693-9719 | 4 | 0.852 |
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NC_018877_4 | 4.2|3684008|27|NC_018877|CRT | 3684008-3684034 | 27 | NZ_CP049906 | Diaphorobacter sp. HDW4B plasmid unnamed1, complete sequence | 380839-380865 | 4 | 0.852 |
NC_018877_4 | 4.2|3684008|27|NC_018877|CRT | 3684008-3684034 | 27 | NZ_CP054613 | Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence | 963441-963467 | 4 | 0.852 |
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NC_018877_4 | 4.9|3684323|27|NC_018877|CRT | 3684323-3684349 | 27 | MN163280 | Klebsiella phage KpGranit, complete genome | 84576-84602 | 4 | 0.852 |
NC_018877_4 | 4.12|3684458|27|NC_018877|CRT | 3684458-3684484 | 27 | JQ691611 | Cronobacter phage CR9, complete genome | 9702-9728 | 4 | 0.852 |
NC_018877_4 | 4.2|3684008|27|NC_018877|CRT | 3684008-3684034 | 27 | AP014476 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C5C-MedDCM-OCT-S42-C91, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***, 2 ordered pieces | 18186-18212 | 5 | 0.815 |
NC_018877_4 | 4.2|3684008|27|NC_018877|CRT | 3684008-3684034 | 27 | AP013564 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGR-C5-MedDCM-OCT-S33-C6, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***, 4 ordered pieces | 8316-8342 | 5 | 0.815 |
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NC_018877_4 | 4.2|3684008|27|NC_018877|CRT | 3684008-3684034 | 27 | AP013942 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C5C-MedDCM-OCT-S39-C99, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 15786-15812 | 5 | 0.815 |
NC_018877_4 | 4.2|3684008|27|NC_018877|CRT | 3684008-3684034 | 27 | AP013945 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C5C-MedDCM-OCT-S43-C137, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 3615-3641 | 5 | 0.815 |
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NC_018877_4 | 4.2|3684008|27|NC_018877|CRT | 3684008-3684034 | 27 | NZ_CP023738 | Methylosinus trichosporium OB3b plasmid pOB3b1, complete sequence | 122815-122841 | 5 | 0.815 |
NC_018877_4 | 4.2|3684008|27|NC_018877|CRT | 3684008-3684034 | 27 | NZ_CP023740 | Methylosinus trichosporium OB3b plasmid pOB3b3, complete sequence | 57293-57319 | 5 | 0.815 |
NC_018877_4 | 4.2|3684008|27|NC_018877|CRT | 3684008-3684034 | 27 | NC_019718 | Enterobacteria phage vB_EcoS_Rogue1, complete genome | 9971-9997 | 5 | 0.815 |
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NC_018877_4 | 4.4|3684107|27|NC_018877|CRT | 3684107-3684133 | 27 | MN163280 | Klebsiella phage KpGranit, complete genome | 84576-84602 | 5 | 0.815 |
NC_018877_4 | 4.4|3684107|27|NC_018877|CRT | 3684107-3684133 | 27 | JQ691611 | Cronobacter phage CR9, complete genome | 9702-9728 | 5 | 0.815 |
NC_018877_4 | 4.4|3684107|27|NC_018877|CRT | 3684107-3684133 | 27 | MN101228 | Klebsiella phage KPN4, complete genome | 27720-27746 | 5 | 0.815 |
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NC_018877_4 | 4.6|3684197|27|NC_018877|CRT | 3684197-3684223 | 27 | MN163280 | Klebsiella phage KpGranit, complete genome | 84576-84602 | 5 | 0.815 |
NC_018877_4 | 4.4|3684107|27|NC_018877|CRT | 3684107-3684133 | 27 | MN163280 | Klebsiella phage KpGranit, complete genome | 81270-81296 | 6 | 0.778 |
NC_018877_4 | 4.4|3684107|27|NC_018877|CRT | 3684107-3684133 | 27 | MN434096 | Klebsiella phage JIPh_Kp127, complete genome | 85222-85248 | 6 | 0.778 |
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NC_018877_4 | 4.4|3684107|27|NC_018877|CRT | 3684107-3684133 | 27 | AP013411 | Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G16, isolate: uvMED-CGR-C108A-MedDCM-OCT-S29-C43 | 29528-29554 | 6 | 0.778 |
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NC_018877_4 | 4.3|3684053|36|NC_018877|CRT | 3684053-3684088 | 36 | MN163280 | Klebsiella phage KpGranit, complete genome | 84567-84602 | 9 | 0.75 |
NC_018877_4 | 4.11|3684404|36|NC_018877|CRT | 3684404-3684439 | 36 | MN434096 | Klebsiella phage JIPh_Kp127, complete genome | 81946-81981 | 9 | 0.75 |
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NC_018877_5 | 5.2|5282010|34|NC_018877|CRISPRCasFinder | 5282010-5282043 | 34 | NZ_HG813246 | Staphylococcus epidermidis PM221 plasmid 1, complete sequence | 47949-47982 | 11 | 0.676 |
NC_018877_5 | 5.2|5282010|34|NC_018877|CRISPRCasFinder | 5282010-5282043 | 34 | NZ_HG813246 | Staphylococcus epidermidis PM221 plasmid 1, complete sequence | 48333-48366 | 11 | 0.676 |
NC_018877_5 | 5.2|5282010|34|NC_018877|CRISPRCasFinder | 5282010-5282043 | 34 | NZ_HG813246 | Staphylococcus epidermidis PM221 plasmid 1, complete sequence | 48717-48750 | 11 | 0.676 |
NC_018877_5 | 5.2|5282010|34|NC_018877|CRISPRCasFinder | 5282010-5282043 | 34 | NZ_HG813246 | Staphylococcus epidermidis PM221 plasmid 1, complete sequence | 49101-49134 | 11 | 0.676 |
NC_018877_5 | 5.2|5282010|34|NC_018877|CRISPRCasFinder | 5282010-5282043 | 34 | NZ_HG813246 | Staphylococcus epidermidis PM221 plasmid 1, complete sequence | 49485-49518 | 11 | 0.676 |
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3. spacer 3.6|3683774|27|NC_018877|CRT matches to KX845404 (Klebsiella phage vB_Kpn_IME260, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.889
cgctactggacctcaaggtaacacggg CRISPR spacer tgctactggtcctcaaggtaacaaggg Protospacer .******** ************* ***
4. spacer 4.6|3684197|27|NC_018877|CRT matches to JQ691611 (Cronobacter phage CR9, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.889
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5. spacer 3.6|3683774|27|NC_018877|CRT matches to JQ691611 (Cronobacter phage CR9, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.852
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7. spacer 4.2|3684008|27|NC_018877|CRT matches to NZ_CP049906 (Diaphorobacter sp. HDW4B plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.852
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9. spacer 4.4|3684107|27|NC_018877|CRT matches to MN434096 (Klebsiella phage JIPh_Kp127, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.852
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11. spacer 4.9|3684323|27|NC_018877|CRT matches to MN163280 (Klebsiella phage KpGranit, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.852
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12. spacer 4.9|3684323|27|NC_018877|CRT matches to MN163280 (Klebsiella phage KpGranit, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.852
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14. spacer 4.2|3684008|27|NC_018877|CRT matches to AP014476 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C5C-MedDCM-OCT-S42-C91, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***, 2 ordered pieces) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
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15. spacer 4.2|3684008|27|NC_018877|CRT matches to AP013564 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGR-C5-MedDCM-OCT-S33-C6, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***, 4 ordered pieces) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
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16. spacer 4.2|3684008|27|NC_018877|CRT matches to AP013944 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C5C-MedDCM-OCT-S41-C114, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
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17. spacer 4.2|3684008|27|NC_018877|CRT matches to AP013943 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C5C-MedDCM-OCT-S40-C165, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
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18. spacer 4.2|3684008|27|NC_018877|CRT matches to AP013942 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C5C-MedDCM-OCT-S39-C99, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
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19. spacer 4.2|3684008|27|NC_018877|CRT matches to AP013945 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C5C-MedDCM-OCT-S43-C137, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
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20. spacer 4.2|3684008|27|NC_018877|CRT matches to NZ_LR594690 (Variovorax sp. WDL1 plasmid 2) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
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21. spacer 4.2|3684008|27|NC_018877|CRT matches to NZ_CP023408 (Streptomyces fungicidicus strain TXX3120 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
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22. spacer 4.2|3684008|27|NC_018877|CRT matches to NZ_CP023738 (Methylosinus trichosporium OB3b plasmid pOB3b1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
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23. spacer 4.2|3684008|27|NC_018877|CRT matches to NZ_CP023740 (Methylosinus trichosporium OB3b plasmid pOB3b3, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
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24. spacer 4.2|3684008|27|NC_018877|CRT matches to NC_019718 (Enterobacteria phage vB_EcoS_Rogue1, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
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25. spacer 4.4|3684107|27|NC_018877|CRT matches to MN163280 (Klebsiella phage KpGranit, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
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26. spacer 4.4|3684107|27|NC_018877|CRT matches to MN163280 (Klebsiella phage KpGranit, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
cgttcaaggtaacacaggtgctactgg CRISPR spacer tccacagggtaacacaggtgctactgg Protospacer . . **.********************
27. spacer 4.4|3684107|27|NC_018877|CRT matches to JQ691611 (Cronobacter phage CR9, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
cgttcaaggtaacacaggtgctactgg CRISPR spacer tcctcaaggtaacacaggtcctaccgg Protospacer . .**************** ****.**
28. spacer 4.4|3684107|27|NC_018877|CRT matches to MN101228 (Klebsiella phage KPN4, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
cgttcaaggtaacacaggtgctactgg CRISPR spacer tcctcagggtaacactggtgctactgg Protospacer . .***.******** ***********
29. spacer 4.6|3684197|27|NC_018877|CRT matches to MN163280 (Klebsiella phage KpGranit, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
tgttcaaggtaacacaggtgctaccgg CRISPR spacer tccacagggtaacacaggtgctactgg Protospacer * . **.*****************.**
30. spacer 4.6|3684197|27|NC_018877|CRT matches to MN163280 (Klebsiella phage KpGranit, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
tgttcaaggtaacacaggtgctaccgg CRISPR spacer tccacagggtaacacaggtgctactgg Protospacer * . **.*****************.**
31. spacer 4.4|3684107|27|NC_018877|CRT matches to MN163280 (Klebsiella phage KpGranit, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgttcaaggtaacacaggtgctactgg CRISPR spacer tccacagggtaacaccggtgctactgg Protospacer . . **.******** ***********
32. spacer 4.4|3684107|27|NC_018877|CRT matches to MN434096 (Klebsiella phage JIPh_Kp127, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgttcaaggtaacacaggtgctactgg CRISPR spacer tccacaaggtaacaaaggtgatactgg Protospacer . . ********** ***** ******
33. spacer 4.4|3684107|27|NC_018877|CRT matches to AP013669 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C108A-MedDCM-OCT-S25-C43, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgttcaaggtaacacaggtgctactgg CRISPR spacer accacaaggtaatacaggagctactgg Protospacer . ********.***** ********
34. spacer 4.4|3684107|27|NC_018877|CRT matches to AP013411 (Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G16, isolate: uvMED-CGR-C108A-MedDCM-OCT-S29-C43) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgttcaaggtaacacaggtgctactgg CRISPR spacer accacaaggtaatacaggagctactgg Protospacer . ********.***** ********
35. spacer 4.4|3684107|27|NC_018877|CRT matches to MT380195 (Klebsiella phage KP_LZD_B01, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgttcaaggtaacacaggtgctactgg CRISPR spacer tccacagggtaacactggtgctactgg Protospacer . . **.******** ***********
36. spacer 4.4|3684107|27|NC_018877|CRT matches to MT380195 (Klebsiella phage KP_LZD_B01, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgttcaaggtaacacaggtgctactgg CRISPR spacer tccacagggtaacactggtgctactgg Protospacer . . **.******** ***********
37. spacer 4.4|3684107|27|NC_018877|CRT matches to MT380195 (Klebsiella phage KP_LZD_B01, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgttcaaggtaacacaggtgctactgg CRISPR spacer tccgcagggtaacactggtgctactgg Protospacer . . **.******** ***********
38. spacer 4.4|3684107|27|NC_018877|CRT matches to KX845404 (Klebsiella phage vB_Kpn_IME260, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgttcaaggtaacacaggtgctactgg CRISPR spacer tccacagggtaacactggtgctactgg Protospacer . . **.******** ***********
39. spacer 4.4|3684107|27|NC_018877|CRT matches to KX845404 (Klebsiella phage vB_Kpn_IME260, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgttcaaggtaacacaggtgctactgg CRISPR spacer tccacagggtaacactggtgctactgg Protospacer . . **.******** ***********
40. spacer 4.4|3684107|27|NC_018877|CRT matches to KX845404 (Klebsiella phage vB_Kpn_IME260, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgttcaaggtaacacaggtgctactgg CRISPR spacer tccgcagggtaacactggtgctactgg Protospacer . . **.******** ***********
41. spacer 4.5|3684152|27|NC_018877|CRT matches to MN163280 (Klebsiella phage KpGranit, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgttcaaggtaacacaggtgctaccgg CRISPR spacer tccacagggtaacacaggtgctactgg Protospacer . . **.*****************.**
42. spacer 4.5|3684152|27|NC_018877|CRT matches to MN163280 (Klebsiella phage KpGranit, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgttcaaggtaacacaggtgctaccgg CRISPR spacer tccacagggtaacacaggtgctactgg Protospacer . . **.*****************.**
43. spacer 4.12|3684458|27|NC_018877|CRT matches to MN163280 (Klebsiella phage KpGranit, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgttcaaggtaacacaggtgctaccgg CRISPR spacer tccacagggtaacacaggtgctactgg Protospacer . . **.*****************.**
44. spacer 4.12|3684458|27|NC_018877|CRT matches to MN163280 (Klebsiella phage KpGranit, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgttcaaggtaacacaggtgctaccgg CRISPR spacer tccacagggtaacacaggtgctactgg Protospacer . . **.*****************.**
45. spacer 4.11|3684404|36|NC_018877|CRT matches to MN163280 (Klebsiella phage KpGranit, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
tgctcaaggtaacacaggtgctactggtgctaccgg CRISPR spacer tccacagggtaacacaggtgctactggtcctcaggg Protospacer * * **.********************* ** **
46. spacer 4.11|3684404|36|NC_018877|CRT matches to MN163280 (Klebsiella phage KpGranit, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
tgctcaaggtaacacaggtgctactggtgctaccgg CRISPR spacer tccacagggtaacacaggtgctactggtcctcaggg Protospacer * * **.********************* ** **
47. spacer 4.11|3684404|36|NC_018877|CRT matches to MN101228 (Klebsiella phage KPN4, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
tgctcaaggtaacacaggtgctactggtgctaccgg CRISPR spacer tcctcagggtaacactggtgctactggttcccaagg Protospacer * ****.******** ************ *. **
48. spacer 5.1|5281956|31|NC_018877|CRISPRCasFinder matches to JX238501 (Bacillus phage phiAGATE, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
ttcttcttttttgtcactagttgaaccgctt CRISPR spacer ctaaccttttttgccactagttaaaccgccc Protospacer .* .********.********.******..
49. spacer 5.2|5282010|34|NC_018877|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014851 (Bacillus thuringiensis strain HD12 plasmid pHD120112, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
cttgtcttctgttttattttctggtttcgtgctc CRISPR spacer tttatcttcttttttattttctggtttattttcc Protospacer .**.****** **************** * ..*
50. spacer 5.2|5282010|34|NC_018877|CRISPRCasFinder matches to MN812210 (Flavobacterium phage vB_FspS_hemulen9-1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
cttgtcttctgttttattttctggtttcgtgctc CRISPR spacer ttcggcttctgttttattttctggttgcgatatt Protospacer .*.* ********************* ** *.
51. spacer 5.2|5282010|34|NC_018877|CRISPRCasFinder matches to MN812215 (Flavobacterium phage vB_FspS_lillamy9-4, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
cttgtcttctgttttattttctggtttcgtgctc CRISPR spacer ttcggcttctgttttattttctggttgcgatatt Protospacer .*.* ********************* ** *.
52. spacer 5.2|5282010|34|NC_018877|CRISPRCasFinder matches to MN812216 (Flavobacterium phage vB_FspS_lillamy9-5, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
cttgtcttctgttttattttctggtttcgtgctc CRISPR spacer ttcggcttctgttttattttctggttgcgatatt Protospacer .*.* ********************* ** *.
53. spacer 5.2|5282010|34|NC_018877|CRISPRCasFinder matches to NC_048835 (Flavobacterium phage vB_FspS_lillamy9-1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
cttgtcttctgttttattttctggtttcgtgctc CRISPR spacer ttcggcttctgttttattttctggttgcgatatt Protospacer .*.* ********************* ** *.
54. spacer 5.2|5282010|34|NC_018877|CRISPRCasFinder matches to MN812213 (Flavobacterium phage vB_FspS_lillamy9-2, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
cttgtcttctgttttattttctggtttcgtgctc CRISPR spacer ttcggcttctgttttattttctggttgcgatatt Protospacer .*.* ********************* ** *.
55. spacer 5.2|5282010|34|NC_018877|CRISPRCasFinder matches to MN812230 (Flavobacterium phage vB_FspS_sniff9-2, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
cttgtcttctgttttattttctggtttcgtgctc CRISPR spacer ttcggcttctgttttattttctggttgcgatatt Protospacer .*.* ********************* ** *.
56. spacer 5.2|5282010|34|NC_018877|CRISPRCasFinder matches to MN812209 (Flavobacterium phage vB_FspS_hemulen6-2, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
cttgtcttctgttttattttctggtttcgtgctc CRISPR spacer ttcggcttctgttttattttctggttgcgatatt Protospacer .*.* ********************* ** *.
57. spacer 5.2|5282010|34|NC_018877|CRISPRCasFinder matches to MN812218 (Flavobacterium phage vB_FspS_lillamy9-7, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
cttgtcttctgttttattttctggtttcgtgctc CRISPR spacer ttcggcttctgttttattttctggttgcgatatt Protospacer .*.* ********************* ** *.
58. spacer 5.2|5282010|34|NC_018877|CRISPRCasFinder matches to MN812233 (Flavobacterium phage vB_FspS_snork9-1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
cttgtcttctgttttattttctggtttcgtgctc CRISPR spacer ttcggcttctgttttattttctggttgcgatatt Protospacer .*.* ********************* ** *.
59. spacer 5.2|5282010|34|NC_018877|CRISPRCasFinder matches to MN812219 (Flavobacterium phage vB_FspS_morran9-1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
cttgtcttctgttttattttctggtttcgtgctc CRISPR spacer ttcggcttctgttttattttctggttgcgatatt Protospacer .*.* ********************* ** *.
60. spacer 5.2|5282010|34|NC_018877|CRISPRCasFinder matches to MN812217 (Flavobacterium phage vB_FspS_lillamy9-6, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
cttgtcttctgttttattttctggtttcgtgctc CRISPR spacer ttcggcttctgttttattttctggttgcgatatt Protospacer .*.* ********************* ** *.
61. spacer 5.2|5282010|34|NC_018877|CRISPRCasFinder matches to NC_048840 (Flavobacterium phage vB_FspS_snork6-1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
cttgtcttctgttttattttctggtttcgtgctc CRISPR spacer ttcggcttctgttttattttctggttgcgatatt Protospacer .*.* ********************* ** *.
62. spacer 5.2|5282010|34|NC_018877|CRISPRCasFinder matches to NC_048839 (Flavobacterium phage vB_FspS_sniff9-1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
cttgtcttctgttttattttctggtttcgtgctc CRISPR spacer ttcggcttctgttttattttctggttgcgatatt Protospacer .*.* ********************* ** *.
63. spacer 5.2|5282010|34|NC_018877|CRISPRCasFinder matches to NC_048842 (Flavobacterium phage vB_FspS_stinky9-1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
cttgtcttctgttttattttctggtttcgtgctc CRISPR spacer ttcggcttctgttttattttctggttgcgatatt Protospacer .*.* ********************* ** *.
64. spacer 5.2|5282010|34|NC_018877|CRISPRCasFinder matches to MN812232 (Flavobacterium phage vB_FspS_snork6-2, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
cttgtcttctgttttattttctggtttcgtgctc CRISPR spacer ttcggcttctgttttattttctggttgcgatatt Protospacer .*.* ********************* ** *.
65. spacer 5.2|5282010|34|NC_018877|CRISPRCasFinder matches to MN812208 (Flavobacterium phage vB_FspS_hemulen6-1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
cttgtcttctgttttattttctggtttcgtgctc CRISPR spacer ttcggcttctgttttattttctggttgcgatatt Protospacer .*.* ********************* ** *.
66. spacer 4.3|3684053|36|NC_018877|CRT matches to MN163280 (Klebsiella phage KpGranit, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
cgttcaaggtaacacaggtgctactggtgctaccgg CRISPR spacer tccacagggtaacacaggtgctactggtcctcaggg Protospacer . . **.********************* ** **
67. spacer 4.3|3684053|36|NC_018877|CRT matches to MN163280 (Klebsiella phage KpGranit, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
cgttcaaggtaacacaggtgctactggtgctaccgg CRISPR spacer tccacagggtaacacaggtgctactggtcctcaggg Protospacer . . **.********************* ** **
68. spacer 4.11|3684404|36|NC_018877|CRT matches to MN434096 (Klebsiella phage JIPh_Kp127, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
tgctcaaggtaacacaggtgctactggtgctaccgg CRISPR spacer ccctcagggtaacactggtgctactggtccacaagg Protospacer . ****.******** ************ * **
69. spacer 5.2|5282010|34|NC_018877|CRISPRCasFinder matches to NZ_HG813246 (Staphylococcus epidermidis PM221 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
cttgtcttctgttttattttctggtttcgtgctc CRISPR spacer tatgtcttctgtttttgtttctggttccccagct Protospacer . ************* *********.* .. ..
70. spacer 5.2|5282010|34|NC_018877|CRISPRCasFinder matches to NZ_HG813246 (Staphylococcus epidermidis PM221 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
cttgtcttctgttttattttctggtttcgtgctc CRISPR spacer tatgtcttctgtttttgtttctggttccccagct Protospacer . ************* *********.* .. ..
71. spacer 5.2|5282010|34|NC_018877|CRISPRCasFinder matches to NZ_HG813246 (Staphylococcus epidermidis PM221 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
cttgtcttctgttttattttctggtttcgtgctc CRISPR spacer tatgtcttctgtttttgtttctggttccccagct Protospacer . ************* *********.* .. ..
72. spacer 5.2|5282010|34|NC_018877|CRISPRCasFinder matches to NZ_HG813246 (Staphylococcus epidermidis PM221 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
cttgtcttctgttttattttctggtttcgtgctc CRISPR spacer tatgtcttctgtttttgtttctggttccccagct Protospacer . ************* *********.* .. ..
73. spacer 5.2|5282010|34|NC_018877|CRISPRCasFinder matches to NZ_HG813246 (Staphylococcus epidermidis PM221 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
cttgtcttctgttttattttctggtttcgtgctc CRISPR spacer tatgtcttctgtttttgtttctggttccccagct Protospacer . ************* *********.* .. ..
74. spacer 5.2|5282010|34|NC_018877|CRISPRCasFinder matches to NZ_HG813246 (Staphylococcus epidermidis PM221 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
cttgtcttctgttttattttctggtttcgtgctc CRISPR spacer tatgtcttctgtttttgtttctggttccccagct Protospacer . ************* *********.* .. ..
75. spacer 5.2|5282010|34|NC_018877|CRISPRCasFinder matches to NZ_HG813246 (Staphylococcus epidermidis PM221 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
cttgtcttctgttttattttctggtttcgtgctc CRISPR spacer tatgtcttctgtttttgtttctggttccccagct Protospacer . ************* *********.* .. ..
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
312731 : 321107
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_018877|312731:321107|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_018877|312731:321107|320519_321107_+|WP_000088590.1|DBSCAN-SWA MSRLAVFASGSGSNFQSLVNAVEEKRLDAEISLLVCDKPEARAVGRANYHHIPCFAFSAKAYESKEAFEKEILKKLEEYEVDYIILAGYMRLIGPTLLEAYGGKIINIHPSLLPSFPGKDAVGQALEAGVKVTGVTIHYVDAGMDTGPIIAQEAVVVSEGDTRESLQKKIQQVEHKLYVNTVNQIVQSVKETTVN >NC_018877|312731:321107|315757_317977_+|WP_000055559.1|DBSCAN-SWA MSLMLEPNPTQIKEERIYAEMGLTDEEFAMVEKILGRLPNYTETGLFSVMWSEHCSYKNSKPVLRKFPTTGERVLQGPGEGAGIVDIGDNQAVVFKMESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDVFSMGARPVALLNSLRFGELQSPRVKYLFEEVVAGIAGYGNCIGIPTVGGEVQFDPCYEGNPLVNAMCVGLINHEDIKKGQAHGAGNTVMYVGASTGRDGIHGATFASEELSESSEAKRPAVQVGDPFMEKLLIEACLELIQSDALVGIQDMGAAGLTSSSAEMASKAGMGIEMYLDDVPQRETGMTPYEMMLSESQERMLIVVKKGREQEIVDLFEKYGLAAVTMGKVTEDKMLRLFHKGEKVAEVPADALAEEAPIYHKPSKEAAYFAEFQAMKMETPKVENYKEALFALLQQPTIASKEWVYDQYDYQVRTSTVVTPGSDAAVVRVRGTEKGLAMTTDCNSRYIYLDPEMGGKIAVAEAARNIVCSGGEPLAITDCLNFGNPEKPEIFWQIEKSVDGMSEACRTLQTPVIGGNVSMYNERSGEAVYPTPTVGMVGLVHDLKHITTQEFKQAGDLVYIIGETKAEFGGSELQKMIHGKIFGQSPSIDLDVELKRQKQVLEAIQAGLVQSAHDVAEGGLAVAISESAIGANGLGATVKLDGEATAALFAESQSRFVITVKRENKEAFEKTVEAIQVGEVTSTNEVTIHNEENEVLLTANVDEMRKAWKGAIPCLLK >NC_018877|312731:321107|314127_314847_+|WP_001170549.1|DBSCAN-SWA MQKLELLYEGKAKRIYRTESADMVWVEYKDSATAFNGEKKETITGKGRLNNEITTLLFRKLQEVGIKTHFVEKLSETEQLVKKVSIIPLEVVTRNVIAGSLSKRLGMEEGTVLAEPIVEFYFKDDNLGDPLVTEDHIRVLNVASPEQVSVLRDMALQINQVLIDHFASCRVRLVDFKLEFGVTEEGEIILADEISPDTCRLWDETSNEKFDKDVFRRDLGNLTDAYEEILKRLGGISHV >NC_018877|312731:321107|317961_319377_+|WP_000879026.1|DBSCAN-SWA MLAEIKGLNEECGVFGIWGHENAAQVSYYGLHSLQHRGQEGAGIVVNNGEKIVGHKGLGLISEVFSRGELEGLNGKSAIGHVRYATAGGSEVANVQPLLFRFSDHSMALAHNGNLINAKMLRRELEAEGSIFQTSSDTEVLLHLIKRSTKDSLIESVKEALNKVKGAFAYLLLTGNEMIVALDPNGFRPLSIGKMGDAYVVASETCAFDVVGATYIRDVEPGELLIINDEGIHVDRFTNDVEHAICSMEYIYFARPDSNIAGVNVHAARKNMGKRLAAEAPIEADVVTGVPDSSISAAIGYAEATGIPYELGLIKNRYVGRTFIQPSQELREQGVKMKLSAVRGVVEGKRVVMIDDSIVRGTTSKRIVRMLREAGATEVHVRIASPPLKYPCFYGIDIQTRKELIAANNTVEEIREMIGADSLTFLSEDGLVDAIGRPYEGKYGGLCMAYFNGDYPTALYDYEQELLESMK >NC_018877|312731:321107|315090_315774_+|WP_000666785.1|DBSCAN-SWA MKFAVIVFPGSNCDVDMFHAIKDELGEEVDYVWHDTENLDEYDAILLPGGFSYGDYLRCGAISRFANAMKAVQKAAEQGKPILGVCNGFQILVESGLLPGALMRNENLKFMCRTVQLRVENNETMFTSQYEKNEVINIPIAHGEGNYYCDEETLKRLEENNQIAFRYVENPNGSVSDIAGIVNEKGNVLGMMPHPERAVDELLGGAEGLKVFQSILKQWRETYVVNA >NC_018877|312731:321107|319482_320523_+|WP_001262441.1|DBSCAN-SWA MANAYKQAGVDIEAGYEAVSRMKKHVQTTMRKEVLGGLGGFGGMFDLSKFALEEPVLVSGTDGVGTKLMLAFMADKHDTIGIDAVAMCVNDIVVQGAEPLFFLDYIACGKAEPSKIENIVKGISEGCRQAGCALIGGETAEMPGMYSTEEYDLAGFTVGIVDKKKIVTGEKIEAGHVLIGLASSGIHSNGYSLVRKVLLEDGELSLERIYGRLELPLGEELLKPTKIYVKPILELLKKHEVYGMAHITGGGFIENIPRMLPEGIGAEIELGSWKIQPIFHLLQEVGKLEEKEMFNIFNMGIGMVVAVKEEDAKDVVRLLEEQGETARIIGRTIQGAGVTFNGGTAL >NC_018877|312731:321107|312731_314039_+|WP_000625682.1|DBSCAN-SWA MISRYTRPEMGAIWTEENKFKAWLEVEILACEAWAELGDIPKEDVKKIREHASFDIDRIYEIEKETRHDVVAFTRAVSETPALGEERKWVHYGLTSTDVVDTALSYILKQANEIILKDLENFVSILANKAKEHKYTIMMGRTHGVHAEPTTFGLKLGLWYEEMKRNVERFKQAADTVRVGKLSGAVGTYANIDPFVEKYVCENLGLEAAPISTQTLQRDRHAHYMSTLALIATSIEKMAVEIRGLQKSETREVEEAFAKGQKGSSAMPHKRNPIGSENMTGLARVIRGYMMTAYENVPLWHERDISHSSAERVILPDATIALNYMLNRFGNIVKNLTVYPENMKRNMTRTYGLIYSQRVMLTLIDKGMVREEAYDIVQPKAMEAWETQVQFKELVEADERITSKLTQEEINECFNYEHHMQHVDTIFERLGLNEA >NC_018877|312731:321107|314839_315094_+|WP_000278823.1|DBSCAN-SWA MYKVKVYVTLRESVLDPQGTAVKGALHSLSFTEVQDVRIGKYMELTIDKSVSDLDSKVKEMCEKLLANVVMEDFRYEVEEVVAQ |
8 | Synechococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
661189 : 669349
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_018877|661189:669349|DBSCAN-SWA 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GCTGGGGCACCTTTTTCACATATGGGTAAACACGCACCTGTTGTCTTGTTAGAAGAAGGGAAAGCTTCACAACCAGTGTATGACTTCCTTGCTACTATTCAGCCGAAGTTTAAAGATGATCCAACACTTGGACCATATAATCATGGCTTCTTATTAGGAAGTACGAGTGATATTTCATTTGAAACACAAGGAATACTAGATGAGAGGTTAGAAATTGTTCAGGAAAGTGGTCAAGGACACGGTGGACATTAATGAAATGAGAAAAGACGCTACTGATATAGCGTCTTTTTTTATTTTTCTCGACAAAATATGACAAAAAAGTTGTAACTGTTTCTGTTATGATAGTTTCGGAAATCTTACATTTTACATAATCGGAGGAAAAAGAATGTATAAAAAATTGGGTACTATTGCTTTAACAGGTGCACTTGCTTTTAGTTTAGCTGCTTGTGGTGAAACTGAAGTTAAAGAAGTGAGTAAAAACGATGCTCCTAAACAGGCTGAAAAGAAAGATAAAAAGGAAAAAGCTGAAAGCAAGATTTATAAAATTGGAGATACGGTAGAAGTTAATGGTCTACAGCTTACTTTCAGTTCAGCTAAATTCGTTGAGCCTAACGAATACATAAAAGCTGAAAAAGGGAAAGTACTAGAAATCGCTTTTAACGCTAAAAATAATGGCAAAAAAGATATATATTTTGGAACTTCTGAGTTGAAAATTGCTGATACTAACGGCAACCAATTCAAAGAGTACTTTGGTGGGGACAATACGTTTATAAACGAAAATATTGCGCCAGGTAACCAAATTACAAACAAAATGTTATTTGATGTACCAGAAGGCGATAAGTTTGTTGGTACATTTAAACCTACATTTACATTTGACGAGAAATCAGTGAAATTTGAATTTGAAGTTGCTAAATAAGGAGAGATTGAAATGAAAAGAACAGCTGAATTTGTATTAGGTCTTATTGGAGGTATTTTTGGTATTATTTGTGCATTTGTTGCTTTATTGATCGGCGGTATGGGAGCTGCTTTTGAAGCTGATGGAGCAAATACTGTTATTGGTTTAGGTTGGGGAGCTGTGGCTCTATCAATCTTAGGAATTGTTGGATCTGTTATGGTAAGAAGTAAAGCGAAGGTTGGCGGTATTATGATGACTGTGGCTGCTATCGGTGGATTTATTTGTATTTCTATAATTTACTTATTACCAGGCGTATTATTATTAATCGGTGGGTTAATGGGTATATTCCGTAAGGATAAAGCAACTGTATCTGCATAAAATGAGCACTCGAAAGAGTGCTCTTACTATTTTCATTAAATTAGCATAAACTCCTCTAATCCTAAACTATCCAAACTAAACCTCATATATGAAGTGGAAATATCTATAGAACTTTAAATGAATTCCCTTGGTAGCTAATATCTTGATCCTTGGATTATTCAATTAAATGAACTAAATTACATGTGCATTTTTCATCCATCCAAACAAAGTTCTCTTCATTTGACATACTGTAGAATCCGAAATCATTGTACGTTAAATCAACAATAGGTGATAGTATATTTAAAGTTTCCTAAAAAAGAAGCTACGAAGGTAACATCTTTTTAGGAAACTTTTACATAGTAAAAAATCTTCTACTCGTTATATAATAGCTTTCGTGCAGTCGGCTAGATTTTCTTATGGAGAAAATCAAATTATAAAGGAGTAGAGGAGTGGTATTTTGTTTCAAACGATAAAAAATGATTGGTTTTCTAATGTGAGAGGGGACGTGTTATCAGGAATTGTCGTTGCTTTAGCGTTAATCCCTGAAGCGATAGCTTTCTCTGTTATTGCAGGCGTGGATCCGACAGTTGGACTATATGCAGCCTTTTGTATTGCAGTTACCATTTCATTTGTTGGCGGAAGAACTGGGATGATTTCAGCTGCAACAGGTGCAATGGCATTATTAATGGTAACGCTCGTTAAAGATCATGGTTTGCAATATTTATTTGCTACAACAATATTAACAGGTATTGTCCAAATTATTTTTGGCGTGTTCAAACTGAGCTCATTTATGAAGTTTGTTCCGAAATCTGTTATGAGTGGTTTTTTAAATTCACTTGGAATTTTAGTTTTTACAGCGCAATTACCGCATTTTAAAAATGCAACTTGGCAAATGTATGCACTCGTTGTATTAGGACTTGCAATTATATATTTATTTCCACGTATTACAACGGTTGTACCTTCTACGCTTATTTCAATTATTATTGTGACGAGTATTGCACTTATGAGCGGATTACAGTTGAAAACAGTAGGGGATATGGGAAGCCTACCGAAAGAATTACCGTTCTTTAGTATTCCTGATGTGCCATTTACATTAGAAACATTAGGGATTATTTTACCTTATGCAGTTATGCTTGCAATTATTGGTTTACTAGAGTCTTTATTAACAGCTTCAGTTTTAGATGATATGACGCATACAGAAAGTAATAAGCATAAAGAGGCACGCGGACAAGGGATCGCAAACATCGTCGCTGGTTTCTTCGGAGGAATGGCAGGATGTGCAATGATCGGTCAATCTGTTATTAATATTAAATCAGGTGGACGAGGTCGCCTATCAACATTTGTAGCGGGCGGATTTTTAATCGTATTACTATTCGTTTTAGGAGATTATGTCGTTCATATTCCGATGGCAGCTTTAGTTGCGGTTATGATTATGGTTTCAATCGGAACGTTTGATTGGAACTCTGTAACAACGATTCATAAAGTACCAAAAGGAAACGCATTTGTTATGATCGTAACAGTTGTGATTGTCCTAATTACACATAACTTAGCAGTAGGTGTAATTATCGGAACAGTAATTAGTGCGGTGTTATTTGCATTCAATATGGCAAAGATTCACGTGAAACATTTATATATTGAAAATAAGAAAATATACGAAATTCACGGTCAACTTTTCTTTGCATCCACAGCCGATTTCATAAATAATTTTTCATTTAATGAAGATGTAAAAGAAATTGAAATGAATTTTACTCATGCGCACGTATGGGATGATTCAGCGGTGGCATCAATTGATAAAGTTATCATAAAGTATGAGCAAAGTGGTGTGAAAGTAAGTATAACAGGATTAAATGAACGTAGCTCAAAACTTGTTGCAAATTTAGCTACTTATAATAAAAGAATTGCTAGTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_018877|661189:669349|664339_665017_-|WP_000565468.1|DBSCAN-SWA MIDILLVDDEPRMLELLTLYLTPIGYNCVCANSGEEAILHIENQNFKFVLLDIMMPKMDGWETCKKIRSFSNIPIIMVTARDQTVDVVQGLKLGADDYVTKPFHEEELFARIEAVLRRTNEHKQIQYHGIVWDETKHFVSVHNEELLLTPIEFSLLGLFLRHVNYVLNRDQLIERIWGLNTNTEDRTVDSHIRNLRDKLRKAHFPIDHHLKTVYGVGYRWVDTLD >NC_018877|661189:669349|662936_664328_-|WP_000822580.1|DBSCAN-SWA MKRISIQLGFYFLIVTLLIESVLFVSLYYSLVNNRVNEEMTALLKRGNSHRDVLEKYFDKQTISHVALMESEAETTVVITNANKEVLAKSNEINTTIKKHIEKMQTRTDHDGAIIENHWKTSNYICTVSPIVVAGKTEGYVYMFLGTESIEEMVNGLTRQFIIAGVITFLLTAITIFLLSRLLTKPLLHMKHATEKMSKGDLSVSLTTTRNDEIGELASSIQTLANDLHYMKTERSEFLASVAHELRTPLTYVRGYADIALKESTSPEQRLRYLSIIKDESDYITNLVQDLFSLAQMEQHNFSIQVKEVHLHTFLTRIAEKVNAMYKERYIKVSFSCSPTLLVNLDEQRFEQVIVNILNNAYRHSKEHSHINISITEEHKRISITIEDEGEGIPPEDLPHIFDRFYRVDKARTRATGGTGLGLSIVKEIVELHGGTITVTSEVDHGSCFIISLPSIKKHDYHQ >NC_018877|661189:669349|667897_669349_+|WP_000487919.1|DBSCAN-SWA MFQTIKNDWFSNVRGDVLSGIVVALALIPEAIAFSVIAGVDPTVGLYAAFCIAVTISFVGGRTGMISAATGAMALLMVTLVKDHGLQYLFATTILTGIVQIIFGVFKLSSFMKFVPKSVMSGFLNSLGILVFTAQLPHFKNATWQMYALVVLGLAIIYLFPRITTVVPSTLISIIIVTSIALMSGLQLKTVGDMGSLPKELPFFSIPDVPFTLETLGIILPYAVMLAIIGLLESLLTASVLDDMTHTESNKHKEARGQGIANIVAGFFGGMAGCAMIGQSVINIKSGGRGRLSTFVAGGFLIVLLFVLGDYVVHIPMAALVAVMIMVSIGTFDWNSVTTIHKVPKGNAFVMIVTVVIVLITHNLAVGVIIGTVISAVLFAFNMAKIHVKHLYIENKKIYEIHGQLFFASTADFINNFSFNEDVKEIEMNFTHAHVWDDSAVASIDKVIIKYEQSGVKVSITGLNERSSKLVANLATYNKRIAS >NC_018877|661189:669349|666573_667104_+|WP_000277054.1|DBSCAN-SWA MYKKLGTIALTGALAFSLAACGETEVKEVSKNDAPKQAEKKDKKEKAESKIYKIGDTVEVNGLQLTFSSAKFVEPNEYIKAEKGKVLEIAFNAKNNGKKDIYFGTSELKIADTNGNQFKEYFGGDNTFINENIAPGNQITNKMLFDVPEGDKFVGTFKPTFTFDEKSVKFEFEVAK >NC_018877|661189:669349|667116_667461_+|WP_000831286.1|DBSCAN-SWA MKRTAEFVLGLIGGIFGIICAFVALLIGGMGAAFEADGANTVIGLGWGAVALSILGIVGSVMVRSKAKVGGIMMTVAAIGGFICISIIYLLPGVLLLIGGLMGIFRKDKATVSA >NC_018877|661189:669349|661189_662143_-|WP_000030268.1|DBSCAN-SWA MSKAKRLLDILIFASAKKTFTAQEIADEFNISVRTVHRYILDLSDMGLPIYAEQGRNGGYKVLTTRVIPPILFTEEETVSIFFAFQSLSYYRDLPFNTEINSVTHKLYSSLQHEAKAKVDKIRSYISFWNPKRTIETPLLNKVLTAAIENKNLHFQYESKSGIKTKHVHPIGVYAHDGLWYLPSYDFGRKKVLLYRVDRILSILSMEENTDTFMNLEEWFASNSNVVHNPTQLHVLLTTEGVRQCKSVPYLEEFVVVNEDGTGYIHSTIDKSEINFITPLFYRLGKDAKVLEPKELIDGLRIRAKEVLHMYEDEKSC >NC_018877|661189:669349|662330_662771_+|WP_003273797.1|DBSCAN-SWA METEGEGDNGYTEMYETIDTIIMGKRTYDYVVEHTETFPYLDKKCYVFSNSEKGTNGHVEFVNEDVVEFTKRLKAQEGSKIWMVGGGSLLREFFKNNLIDEYIVTITPHILGSGVPLFQDKNPEINLTLTDTKRFGQFVNLYYKVK >NC_018877|661189:669349|665192_666440_+|WP_000738870.1|DBSCAN-SWA MKKMTRIFGITIITAVGLAACGQTNTDHKNHESTKEKKTEQKEMKMNQEVTAPKEMNEGASNDLLTTSLKNVTRLNTNDPLQMAVLTSQTIWPATHKENQPGAVILVPVSEWQLGIASADLIHHPNNGPILFIEKEKIPEMTLKEIKRLNPIGTKDGTQIMVMGDVGTSALEQLKGYKIKQIKETNPAIFAKDVDKEYADITGSYPNSVIIGSSAEEGRLYTTPAVNWISHMPEPLLYTEKNKVPEATIEALKMRKDKANIYVLGPEKIVSKEVEKELSKYGKVTRISGETPTENSIAFAKFKDEKTKFGWGFTKPGHGLSFVSSKTPDLAVAGAPFSHMGKHAPVVLLEEGKASQPVYDFLATIQPKFKDDPTLGPYNHGFLLGSTSDISFETQGILDERLEIVQESGQGHGGH |
8 | Bacillus_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
691215 : 721271
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_018877|691215:721271|DBSCAN-SWA AATGAAAGCACTACTTTGGCATAATCAACGTGATGTACGAGTAGAAGAAGTACCAGAACCAACAGTAAAACCAGGAACAGTGAAAATCAAAGTTAAATGGTGTGGTATTTGTGGGACAGACTTGCATGAATATTTAGCAGGGCCTATTTTTATTCCAACAGAAGAACATCCATTAACACATGTGAAAGCACCTGTTATTTTAGGTCATGAGTTTAGTGGTGAGGTAATAGAGATTGGTGAAGGAGTTACATCTCATAAAGTGGGAGACCGCGTTGTTGTAGAGCCAATTTATTCTTGTGGTAAATGTGAAGCTTGTAAACATGGACATTACAATGTTTGTGAACAACTTGTTTTCCACGGTCTTGGCGGAGAAGGCGGCGGTTTCTCTGAATATACAGTAGTACCAGAAGATATGGTTCATCACATTCCAGATGAAATGACGTATGAACAAGGTGCGCTTGTAGAACCAGCAGCAGTAGCAGTTCATGCAGTACGTCAAAGTAAATTAAAAGAAGGGGAAGCTGTAGCTGTATTTGGTTGCGGTCCAATTGGACTTCTTGTTATCCAAGCAGCTAAAGCAGCAGGAGCAACTCCTGTTATTGCAGTTGAACTTTCTAAAGAACGTCAAGAGTTAGCGAAATTAGCAGGTGCGGATTATGTATTAAATCCAGCAACTCAAGATGTGTTAGCTGAAATTCGTAACTTAACAAATGGTTTAGGTGTAAATGTTAGCTTTGAAGTAACAGGTGTTGAAGTTGTACTACGCCAAGCGATTGAAAGTACAAGCTTCGAAGGACAAACTGTAATTGTTAGTGTATGGGAAAAAGACGCAACAATTACTCCAAATAACTTAGTATTAAAAGAAAAAGAAGTTATTGGTATTTTAGGATACCGTCACATCTTCCCAGCTGTTATTAAATTGATTAGCTCTGGTCAAATTCAAGCAGAGAAATTAATTACGAAAAAAATTACAGTGGATCAAGTTGTTGAAGAAGGATTTGAAGCACTTGTAAAAGATAAAACACAAGTGAAAATTCTTGTTTCACCTAAATAAGATAGAATCGAAAAGAGTAGCCCTTTTCTAGAAATAGAAGAGGGCTACTTTTTTTCTGTACAGAAAGGTGATAGACTTTCCTGTAACTAAAGGTATTTTGTTTGGAAGGGGAAGTCTAATGCTTTCATTTATGTTGACATTGAAACGGATGCTAAAAGCTTGTTTGCGAGCATGGAAAGATAAAGAATTTCAAGTGTTATTCGTATTAACAATTTTGACATTAATATCTGGTACAATCTTTTATAGTACAGTGGAGGGGTTACGTCCTCTGGATGCTTTATATTTTAGCGTTATGACGCTGACTACTGTCGGTGATGGACAATTTAGTCCCAAAACTGACTTCGGAAAGATATTTACGATATTATACATATTTATAGGGATCGGATTAGTGTTTGGATTTATACATAAGTTGGCAGTTAATGTACAATTGCCAAGTATATTATCGAATAGAAAAAAAGAGTAAAGCATGTGTATGCTTTACTCTTTTTTTACATTAGTTTAGACAAGCCTTAATAATAGTTTATTAAAATGAAAGTGTATTCATTCATTATATTCACTGTGTATAAAGTTATAATGATATGAACATTTGCATATTTTAATTTAGTGATAGAAATTTCGTGAAAGGTGGGATATTCTAGTCATAGGTTAACCGGACGACATCATAGGATCCTAACAAAATGTTTACAATAATTCAATTATAAAATGGAGGATTTTATATGAAAAAGAAAGTACTTGCTTTAGCGGCAGCTATTACATTAGTTGCTCCATTACAAAGTGTTGCATTTGCTCATGAAAATGATGGGGGACAGAGATTTGGAGTTATTCCGCGCTGGTCTGCTGAAGATAAACATAAAGAAGGCGTGAATTCTCATTTATGGATTGTAAACCGTGCAATTGATATTATGTCTCGTAATACAACACTTGTAAAACAAGATCGAGTTGCACTATTAAATGAATGGCGTACTGAGTTAGAGAACGGTATTTATGCTGCTGACTATGAAAATCCTTATTATGATAATAGCACATTTGCTTCACATTTCTATGACCCTGACAATGGGAAAACTTATATTCCGTATGCAAAGCAGGCAAAGGAAACTGGAGCTAAATATTTTAAATTAGCTGGTGAGTCTTACAAAAATAAAGATATGAAACAAGCATTCTTCTATTTAGGATTATCTCTTCATTATTTAGGGGATGTAAACCAACCGATGCATGCGGCAAACTTTACGAACCTTTCGTATCCACAAGGATTCCATTCTAAATATGAAAACTTTGTAGATACGATAAAAGATAATTATAAAGTAACGGATGGAAATGGATATTGGAACTGGAAAGGTACAAATCCAGAAGATTGGATTCATGGAGCGGCAGTAGTTGCGAAACAAGATTACGCTGGCATTGTAAATGATAATACGAAAGATTGGTTCGTAAGAGCAGCTGTATCACAAGAATATGCAGATAAATGGCGCGCTGAAGTTACACCAATGACAGGTAAGCGTTTAATGGATGCACAACGTGTTACTGCTGGATACATTCAGCTTTGGTTTGATACGTACGGAAATCGTTAAGTATTTGAAAAAGGTCAAATCTCAGAATAGAGTATTTGGCCTTTTTATGACTATACAATACATGGAGGTATGAAACGTGAAAGGTAAATTGCTAAAAGGTGTACTTAGCTTAGGGGTTGGTTTAGGAGCTTTATATAGCGGAACTTCAGCTCAAGCAGAAGCATCTACAAATCAAAATGATACATTAAAAGTGATGACGCATAATGTATATATGCTATCAACAAACTTATATCCAAACTGGGGACAAACTGAGCGTGCTGATTTAATCGGGGCGGCAGATTATATAAAGAATCAAGATGTTGTTATATTAAATGAAGTGTTTGATAATAGTGCCTCAGATCGTTTATTAGGCAATTTGAAGAAAGAATATCCAAATCAAACAGCAGTATTAGGTCGTAGTAGTGGAAGCGAATGGGATAAAACGTTAGGGAACTATTCATCTTCAACTCCTGAAGATGGTGGCGTTGCGATTGTGAGCAAATGGCCAATCGCTGAAAAGATTCAATATGTATTTGCAAAAGGATGCGGGCCAGATAATTTATCGAATAAAGGATTTGTATACACGAAAATTAAGAAAAATGATCGTTTCGTTCACGTGATTGGGACGCATTTGCAGGCTGAAGATAGTATGTGCGGAAAAACTTCACCAGCATCTGTACGTACGAACCAATTAAAAGAAATTCAAGATTTTATTAAAAATAAAAATATACCAAATAATGAGTATGTGTTAATTGGTGGTGATATGAACGTAAATAAGATAAATGCAGAGAACAATAATGATTCAGAGTATGCATCTATGTTTAAAACATTGAACGCTTCTGTACCATCTTATACTGGACATACAGCGACTTGGGATGCAACGACAAACAGTATTGCAAAATATAATTTCCCTGATAGTCCTGCCGAATATTTAGATTATATTATTGCAAGCAAAGACCATGCGAACCCATCGTATATAGAGAATAAGGTGTTACAGCCGAAATCTCCACAATGGACTGTTACATCGTGGTTCCAAAAATATACGTATAATGATTACTCTGATCATTGCGAATTGCATAATATCAACCTTTTAAAGGGCGTAGGTCACGAATTGGTAACGAAAATGATAAATCTTGTTCCATAAACGCAACTACTTCCGCTTGTTTTGACGGATATAAATGACTATATGTATTTAACGTTGTTGACACATCCGAATGTCCTAGTCTCTGGGCTACCACAAGTGGACTAACACCTCTATTTATTAAATAAGATGCATGGGAATGTCTAAATTCATGAAGTAGAATTTTAGGTATTTCAGAAGAAGCAACATATTTGGCAAAACGTTTATGAAGGGTGGCTGTCGCTATACTTGTGTAAAATTCACCAAATACAATATAATCATTTTTTATCGGTGCCCCTAATGTAGCATGTTCTTTTAATGTTTTCAATAAGTCTATGACAAGAGATGGTAGCATAATAATACGATTTGAGGCTTTGGTTTTTGGTTTTGTAATTTGTCTGTTATAGTTGGTTTTATTAATATTAATCGATTTTTCTTCAAAATTAATATCTGCCCATGTTAATGCTAGCAATTCGCCAGTTCTTGCACCGCTATAATAAAGAGTCGTAAAAAAGGCTTGATATAGTAAATCATCTACTACATGAATGAATTGTTTAAACTCATCAAATTCCCAAAAGTTTAATCGTTTATTCGATTCTTTTTCAAAGTTGCCAGCAATTCTCGCAGGATTACTTGTGAGACCATAAAATTTTATTGCGAAATTAAAAATTGAGGACAGTACGGTATGAATCTTTTTCAAATAAACAGCTGAATACTTATGAATAATTTCGTTTTGGTAGATCATGATATGCTTAGCAGTTATATTGTTGATTTTTGATTTTCCGAACTTTTCTAGTAAATGATTTTCAAGGATGGCTTTAATGGTGTTAATTGAAGATTGTTTTCTCCTTTGGCAATACCAATCAAAATAACTATCCGCGACTTGAGCGAATGTAAAATTTGAATTTGTTTCTTTTTCAATTAACATTTTTGCTTCAGCTTCACGTGCTTCTTTTTTCGTTTTAAACCCACGACGTTTTACTTGTTTTTGGGTACCATCAAACTGACGGACTCTGACCACAAAAAAATATGTTCCTCGTTCTTTATCTTTGTAGACCACCATAAGAACCCCTCCTGTATATATAAAGATTGATAATTAAATTTATTGGGTAGATTATAACTTGTTTGTTACCAAAAGAAAAGACTCTCAAAATAAATTGAGAGCCTTTCTTTGACTTTAACCACTTTAATTTTAATAACATATTACCTACATGAAAATAAAATTGCCGTTTAAAACAGTATAACATATTTAGATTTGAAATTACTCAAGAAATAAACA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42 | Bacillus_phage(61.54%) | terminase,integrase,capsid | attL 690461:690476|attR 714316:714331 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
725678 : 735936
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_018877|725678:735936|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_018877|725678:735936|735054_735936_-|WP_000730126.1|DBSCAN-SWA MKKKQAITILASIETYENLVSFQTLKELNDTVRAYKRQFADQLNKNQLAVLNKLHNYSSKFLGVSFRTKKHIAEDLDISRRTVIRACHHLESLGIIKQLEMKRKSDMRQTSNIIIIQPIITKEQLVTEAPTKTVEICHTKKTTTKTLKQKIKDINKRKEEVSQSFQHDLDFIDYRVPQSMRMELQTAFSPNVINESFKNARNIAKKAAKQFNLLADTDVFHNLLANASSVLYFKTHKYEHNGKSMKNPIGYFTRTFKRIVYNYIDSFREIHNLASRKANKYTGLAFFKEFIDG >NC_018877|725678:735936|732803_732935_+|WP_127057661.1|DBSCAN-SWA MNIKMALSEETCEYCKCLLSDWLFWRWNGKKYCSESCAEYDKK >NC_018877|725678:735936|729998_730229_+|WP_000392441.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA MEEQIFNSMIQQGAFAALFVWMLFTTQKKNEQREEQYQKVIEKNQDVITKQAEAFGDLSKDVSEIKQKILGSGDVQ >NC_018877|725678:735936|730228_730933_+|WP_003269494.1|DBSCAN-SWA MEIRKNLVDPSKYGTKCPYTMNPEFITVHNTYNDAPAENEIAYMIRNNNEVSFHIAVDDKEAVQGILLERNAWHCGDGGGNGNRKSIGVEICYSLSGGDRYYKAENNAAIIVAQLMRQYNIPISKVRTHQSWSGKYCPHRMLAEGRWNSFIERVQKTYDGGGNTTPSTQPANNGVGVVTITADVLRVRTGPGTNYDIVKKVYRGERYQSWGIQNGWYNVGGDQWVSGEYVRFEG >NC_018877|725678:735936|732954_733275_+|WP_000495115.1|DBSCAN-SWA MFTRKQVIPFRDFMDGSYKMKEQKIQRYHSLSPLAFVHMSDSILNTYLALGIMGTALIGAVMLERYLVRNDYVSAAKLLSNGIHYGVKIGGVGFITYVFVRIVIMF >NC_018877|725678:735936|725678_729947_+|WP_001137510.1|DBSCAN-SWA MPRKKKSDIEREQASSMVKDWEKDNGGLDDNQRATLQRMIELNSNTAQQDVRRVDYYSGNQDKYERSTQPIQVRNENTGSLVKKKKEIFALKNGEEDEPVENVYQNLEFDKNNEDHRKPPERNPFLDQIKAANSISQSISTDWMKQQEEASRTNRMMGTIDRIAKQSPPQEGGFFGDLKFAAQKFGEMIKPPEGKTRQQVWDEYMKDGGKSEATKEVNRFANRTMDSTLLNAPSAAMKKVRGQDAVDWQDHREGVGENVADFVSTGIGYVLPGAGAANVAGKLGMAAKVGENTSKLGKIGQFAKEGAVTGALIAGAETPAKAYVNPEQTVEDHLKRIGVETAAGAAITPLAHGLMNAVQNLRKTKGHTSNVSDDVIQQERHQRELTNQAVEEQALQNTRIKNEPESLPIQSELESATSLEQAIESVAKQKKKASSNGELPDDVQAMRNAPPVIQSAMAPDGRTITQKKLMDSFRDNVGITLRTGRMGVGDDAVSGIYKNSPEVIRTRDYGDLETLAHETGHHLDKKFGLNDPKFDDELMKLGSHTSGQNYTPEQIRQEGMAEFMRRYLLNPAMAEQEAPAFMKHFQNTIPEDVQKGLKKVQEDAQIWANQGDEARFRGKINVNEKPKGLERVKQVLQKLPKTKEEFYTDVMDRLYPISKAEKEILGGELADASVSPYKKARLAAGTPKKAQMKVEEFRNIFGDSKVDMADIRDYVTATHARDLEKQGIKTGFTPDEIEKTIAKFDNPEIQAAHQKIKAYNDSLLDMLVEGQMLSKDAVTAMREKHPNYMPFNRYFDEEGIGEGFGGGKGFVDLTNPVKRIEGSSRNVIDPFESIVKNTFKSMQAIERNKVGLALADLAENEGAGKWIEKLAGDGKESVAKENIVTVFRNGEKQQYQLAPELYRAVKAMDKEVTNKFVLAAGKPSDWLRAGATLTPEFALRNPIRDQFASYVVSDTGYNPFDFVKGLKEVGKKKFGKGSEVYDDWVNQGGAYGGYLSADRDLLKEQLSGLEKQESGLPKAIKAITAPVNPKNWLKVLQNISEVSEEATKVGAYNKGLKKGLTPEEAAYQARDLMDFNRMGNSMQSANRIFTFLNANVQGKDKLIRAMKEHPVRTSARIAGSTLPPSALAIASYASANDKQKEMMDNMPQQEKDTYWSYAIPGTDKVGRIPKPFDISLLANTVERANKYREGDQYAFDGFDKTVNDAVKVPWIPTTLQPIVENMANYSFFRDGPIVPKRDEKNSPKEQYGPNTSLTAREMASALDKIGIEASPYKIDNLYKGYTAGLGQFPLKGLDSAISLISNKDVPTPIAQEWNESTPGAKAFFVNGQGGGQVMEDYYNIMDEQQAIQADSKKNEEDASNAEEMKAFNRIDREMAKLRKEYYVVKSDTEMNPEVKRSELDRLDEEMRTLAREGITIFRPDYK >NC_018877|725678:735936|734441_735050_+|WP_000842170.1|DBSCAN-SWA MKSRDKAIIKDLCRFRCLSRDDIIDLHFQGLKKAVTSCNTVMKRLRRDGSVDVNLLQKPYIYFPQPSPIRKTSQKIPHFLAIVNVYKQLLQYEKPKLFKVEPKYGKAYMEPDIFTIWRQSPFFIEVQNSVYSKKVMQEKLNRYEFYFHSLEWQQELWQPKKSKYFPSLLVITDSQYDISSSNFRIFQAKSIHDFMNQMVVKT >NC_018877|725678:735936|732255_732480_-|WP_000264500.1|DBSCAN-SWA MWGLGKKRTKLGKFLDKHEIEQEWLIRKSDLGRNTIGELANNPNRYPTQKTMKKILKVLREFDPKIRADDFWDM >NC_018877|725678:735936|731059_731458_-|WP_000494384.1|DBSCAN-SWA MFTKKLVTVATTLALGCGFSFSITPAFADSNEVSTTNTPISSIQNQEQLSFTGYVISVDSHYLVVANTSTKEEALSYQNNWWELASQNKILRVPISSGDNYALGEKLNVFAKAWTYSIPPIAIMPTIEKVVE >NC_018877|725678:735936|733285_734452_+|WP_000511372.1|DBSCAN-SWA MGIIKEWLHKRSLKHQIIEVFQKAGLYTEHQTRGGKIPIYPKVHAVFSSNESVKYVFTIPNGLDPKTIEKKWFCFQQIFGRNVAIEGDIKKFVLNVFHSDGGLKQYNYSYKQWQPFIKECRLPVIVGRDQFGNMLVYDMVNPNTPHLLIAGETGSGKSSMVRVVLSTLIQYMPPDKLYLYLGDLKNSEFHFLRRVKHVKEVCMEEIEMKVMLHKVWNEIRERRKLMEEYEVDHIDEYNKLNPDKQKPYILLAIDEVAMLQDEKECMTTIEKISAVGRALGVFLMLSMQRPDAKVLDGKLKLNMTVRMGFKCDNTINSNIMGTPGSEQLEQSGQMILKLNGLKKVQAPYLELNKAKQIVEPYRLLKEDITLQNSLQQELPLFGVLEHEE |
10 | Bacillus_phage(100.0%) | bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1844479 : 1901904
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_018877|1844479:1901904|DBSCAN-SWA 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72 | Bacillus_phage(68.57%) | integrase,terminase,transposase,portal,holin,tail | attL 1840005:1840023|attR 1906791:1906809 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1938783 : 1948082
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_018877|1938783:1948082|DBSCAN-SWA TATGAAAAAAGTAATTGCAGGTTTAGCAGCAGCTTCTGTAGCTGGCGTTGCAGTTCCAGGAATGGATTCTGCTCATGCACAAGTTTCAAATGAAGCGCTAAAAGAAATTAATGGACAAACTCAAACTCAAACGACTGTAACTGAAACAAAAACTGTAGAAACAACTTCTGAATTAAAATACACAGTAACTGCTGATGTATTAAATGTTCGTTCAGGTGCTGGTACAGGACATAACGTTATTTCTAAAGTGAAATCAGGTCAAGTGCTACAAGTAGTTGGACAAGAAAACGGTTGGTTCAAAGTAAACGTAAATGGTCAAACAGGTTATGTAAGTGGTGACTTCGTAACGACTGGTGGCAAAACAGGAACGACTGTTCAACAAGGAACAGGTACTTATACAGTAAACGTTTCTTCACTTAACGTACGTACAGGCCCAAGTACATCTCATACAGTTTTAGGTTCTGTAAACAAAGGTAAAACAGTACAAGTTGTAGGTGAAGTACAAGATTGGTTTAAAATCAACTTCAATGGTGGAACTGGATACGTAAGCAAAGACTTCGTAACAAAAGGTGGTTCTGCTGTATCTAACGAAACACAACAACCAACTACAAACAACAATACTACAACAGTTCAAACTGGTGGTTCTTATGTTGTTAACACTGGTGCTTTAAAAGTACGTACAGGCCCAGCTACATACAACGCTGTAATCGGTGGAGTAACAAATGGTAAAGTACTAAACGTTACTGGCGCTGAAAATGGTTGGTACAAAATTAACCATAACGGCCGCACGGGTTACGTAAGTGCAGACTTCGTTAAGTTTGTAAAAGGCGGAGTAAACAACGTTACAAATAACAATAACAATAACAATAACGTTACAAATAACGTTCAACAACCAGGTAAAGACGTACAAAAACCAACAACAGGTGGAGATACATCTTCAATCGCTGGATTCGCTAGATCTTTAAATGGTTCACCATACAGAAATGCTGGTACAACACCTGCTGGTTTTGACTGCAGTGGATTCATTCACTACGTATTAAATCAAACTGGTCATAAAGGCGCTCGTCAAACAGTTGCTGGATACTGGAGCTCTAAAACAAAAACTAGCAATCCACAACCAGGTGATTTAGTATACTTCCAAAATACTTATAAATCAGGTCCTTCTCACATGGGTGTTTACTTAGGAAACGGTCAGTTCATTAGTGCAGAAACAGATGCAACTGGTGTACGTATTAGTTCTGTAAGTAACTCTTACTGGAGCAAGCACCTATTAGGTTACACAAAAGCATACTAAGAAAAAGTAGTTTTATATACTTTTCGTATAGAGAAAAGGCTTTCCAAGGAAACTTGGGAAGCCTTTTTATAATTGTATAAATTGGAAGTTTAATAGTTTTTATTTTAAATTTCCATTTAAAAATCGATCATATAAGTCATGGAAATAGTTAGGACGAAATAAGTTCGCTGCATGTCCTGCTAAAGGTATTTCCTTATATAGAACGTTAGGTAAAATAGATTTCAAATCAAATAGACAAGATTTATAGAGATGATCATGCTCTCCCATTACCCATAGTATAGGGTGAGGAAGTGATTTTAATTTAGACTTTAAATCGAATTCTAACCGATGTCGTAATGACTGGGCAATAATGGATGAATGTAATTGTAATCCGAAACGGTAGTAAATATTTCTTGAAATGACTGCAAACGGATTTGCTTTTAGTATACCACTTGGAAAAATAGTATTTGCGTATTGAGAGAGCCATTTAGAGTATTCATCCCCTCGCTTCTCCCAAAAATTTTGGAATACGCTATATAAGCGAGAAGGGTTATTGTAATGTCCTCCAATATGACAAATACTTAATACTTTTTCTGGATGCATTTGTGCAAAAATTGTAGAGATGTAACAGCCGTAACTTAGCGCACAAATATGAGCTTTTTTAATACCTTCTTGTTCATATAAGTTTAATAATTGATCTACGAGACGCTGTAATGAAAAGTCGATTGCTTCTCCTTTATCATCACCGTGACCTAATAAGTCATAAGTTATAATGTTGTAGGAGGCAGAAAATCGTTTTTGCTCCTTTTTGAAGGCGCGACGATTGCCAACTAATCCATGAATAAAAATAATTGTTTCCTTTTCAGAATGTATATTTGTTTACAAAAAGGATACTCCTTTCACTAACTGGAGATTTATATCGTGTTTTAAATTATTTATCTATAATTCACATAGAATAATATTAAGTACCAGGTAATAATATCAGATGTTTATATCTGTTGTAAAGATGAGTTTTTATGTATATTTTGTAAAAATAGAAAAAGTGTGTTTACATTCAGTTTACATTTGTATCGTATTCTAATTTTAGAAAGAATAGTTTGGTTTAACATGAGGAGATGAACAGGAATGGAAGTTAGAAATGAAATGAAGAAAAAAGGGAGCTGGAGGCAGTTTTTACGCCTTATTCAAGATACAAATCCTCCGAAAGGAATTTTAATTTTTGCGTTATTAATGAGTTTGCTTTCTACGGGAGCGAGTTTATTTATTCCTATGCTAACAAAAGGATTAGTAGATAATTTTTCGCTTTCTTCAATTAGTGCAGGACAAATTGTTGGGTTAGTTGCTTTCTTTGTAATGCAAACTATTGCGGCAGGGTTGTCTATATATTTACTAAATTATATTGGGCAGAAGATTGTAGCGGGACTAAGAGAACGTTTGTGGAAAAAGGTACTTATCTTGCCGGTATCTTATTACGATCAAAATAGAACAGGTGATACCATTAGCCGTATGACGAATGATACAGGTGTTGTGAAAACGTTAATTTCTGAGCATTTGTCAAACTTATTAACAGGTGGTATTTCAATTGTTGGATCGTTAATTGTATTATTTGTGTTAGATTGGAAAATGACTGCGTTACTTTTAACGGTTATTCCGTTGTCTGTATTAATTTTAGTTCCACTTGGACGAAAAATGTATAAGATTTCAAAAGCACTTCAAGATGAAACGGCATCTTTTACAAGTGTGTTAACGCAAGTGTTATCAGAAATTCGTTTAGTGAAATCTTCAAATACAGAAAAAAGAGAATATGAAACGGGTAATACAGGCATACAAAAGTTATTACAATTTGGTTTGAAAGAAGGAAAAGTGCAAGCATTAATTTCGCCAGTTATGTCGTTTGTTTTAATGGCACTACTTGTTATTATCGTAGGATATGGCGGGATGAGAGTTTCTAGCGGTGCATTAACAACTGGTGAACTTGTAGCGTTTATTTTGTATTTAGTTCAAATTGTAATGCCGATGAGTCAATTATCTATGTTCTTTACACAATTCCAAAAGGCAATTGGTGCAACGGAAAGAATTAGTACGATTTTAGAATATAAAGTAGAAGATCATGAAACTGGTGTGAAAGTGACAAATGCTAAGCAACCGATCGTTCTTGAAAATGTACATTTTGAGTATAACGAAGAAGAGCAAGTTTTGAGAAATATTGATTTCACAATTGAATCTGGAAAAGTGACAGCGATTGTAGGACCAAGTGGTAGTGGGAAAACAACGTTATTCTCATTACTGGAACGTTTTTATGAGCCAACTAGTGGTGCCATTAAATTAGGAAAAGAATCAATTACGAGTTATTCATTACAGTCATGGCGACGTCAAATCGGTTACGTATCACAAGATAGTCCGTTAATCGATGGAACGATTCGTGATAATATTTGTTACGGCGTTGAAGGCGAAGTAACGGATGAAGAAATTGAAAAAGTAGCAGCAATGGCATATGTTGATGCATTTATTCATGACTTACCAAACGGTTATGCAACAGAAGTTGGAGAACGCGGTGTGAAGCTTTCTGGTGGACAAAGACAGCGAATTGCCATTGCCCGAGCGTTACTTCGAAATCCGCAAATTCTTATGCTCGATGAGGCAACTTCAAGCTTAGATAGTAAATCTGAGTCTGTCGTTCAAAAAGCGTTAAATAACTTAATGAAAGGCAGAACAACGTTAGTGATTGCGCATAGACTTTCTACTGTTGTAGATGCAGATAAAATTATCTTTATTGAAAAAGGGAATCTTACAGGTAGTGGTACGCATGATGAATTATTACAGACGCATGATATGTATCGTGAGTTTGCAACGCAACAATTGAAAATTAAAGAGGGTGCATTTTAAAAAAATATATTAGATGCTAAGTAGAAAGGAAATGGTTCCTTTGATACCTAAAATTTTAATAGTAGACGACGATCCACACATTAGGGAACTCGTTTCTGTATTTTTAGAACGAGAAGGTTTTCAAACATATGAGGCAATTGATGGAGTAGATGCACTTCGGAAAATGGATGACGTAAAAGTCGATATGGTTATTCTTGATATCATGATGCCAAATATGGATGGATTTGATGTATGTTTTGAATTAAGAAAATACTATGATATCCCGGTTCTGATGCTAACTGCCAAAGGGGAAACATCACAAAAAGTAAAAGGATTTCACCTTGGGACAGATGATTATCTTGTAAAGCCATTTGACCCTATAGAACTAGTAGTGAGAGTAAAGGCATTATTGAAACGTTACCAAATTACAGTTTCACAATCGATTCAAGTTGGAAATGTATTATTAAATCGTAAAACATTCGAAGTTACATCTGGAGAACAAACGGTTATGTTACCGTTAAAAGAATTTGAGCTGCTTTTTACTTTAGGGTCTAAATCGGGAAGAACTTGTTCGAGAGAGCAATTAATTGAAGAAATATGGGGATATGATTTTGAAGGGAATGAACGTACACTAGACGTTCATATTAATCGGTTACGTGAGAAGTTTCAAGAAGAGCAGTCGAAATTTAGTATTAAAACAATAAGAGGATTAGGGTATCGCTTAGAGGTAAGTAAATGAGAAAAAGAAAACGAATGAGTAAGTTGAAGATGCTGAAAGTATTTGGAGCGGTATTAGCGCTCTTTTCTTTTCTTACTATCATTTGGTCTATCGCATTTTATGTAGCAACTAGTATATTGAATG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_018877|1938783:1948082|1943655_1944729_+|WP_001231619.1|DBSCAN-SWA MRKRKRMSKLKMLKVFGAVLALFSFLTIIWSIAFYVATSILNAFDVNVSPFVAFLISDMVGFVFIILIWTLIGILMRPKREAMIWTIIEPIQKIAKGDFSVKIRNEEKYDGEIGVLVKSINDMTDELNTMEKMRQEFVSNVSHEIQSPLTSIKGFARALQDDNLSEEKRKHYLTIIETETTRLSKLSQNLLKLTLLESEEYIPERVSYRLDQQLKQIVLNSEPLWAEKEIELELDLEKVHVIADQESMSQVWINLIHNSIKFTPSGGTITIQLKEHETVVEVRIRDSGIGISEEQKQHIFERFYKADSSRNRAYGGSGLGLAIVKKVLDLHQGEIKVESEEGNGTEFIVCILNYEEK >NC_018877|1938783:1948082|1947209_1948082_+|WP_001258527.1|DBSCAN-SWA MRTEKEMLDLIINTAKEDGRIRAVIMNGSRVNPNVKRDCFQDYDIMYVVNDIQSFTSNHNWVHRFGEIMIVQMPEEMSLVQPDEDGKFPYLMQFMDGNRIDLTLVPVELIKKFVGQDSLSKLLLDKDNCMEGFPPASDKDYLIKKPTEKEFLDCCNEFWWCSTNVAKGLWREELSYAKGMLEGPVRDMFIVMLEWYIGMKTDFTVNAGKFGKHFEQYIEKDMWVQFKRTFSNAEYENIWESFFVMGDLFREVANEIANKYEYQYPQDDDDKVTNYLKHVKALPKDSTSIY >NC_018877|1938783:1948082|1945537_1946257_+|WP_000818985.1|DBSCAN-SWA MAELLQGKNALITGAGRGIGRAVAIALAKEGVNVGLLARSEENLKAVAKEVEAEGVKAVIATADVSSYEEVTTAIETLKNGLGSIDILINNAGISKFGKFLELDVADWEKIIQVNLMGVYYATRAALPSMIEQQSGDIINISSTAGQKGAPVTSAYSASKFGVLGLTESLAMEVRKHNIRVTALTPSTVATDMAVDLGLTDGNPDKVMQAEDIAEFIVAQLKLNKRTFIKSAGLWSTNP >NC_018877|1938783:1948082|1942981_1943659_+|WP_015055113.1|DBSCAN-SWA MIPKILIVDDDPHIRELVSVFLEREGFQTYEAIDGVDALRKMDDVKVDMVILDIMMPNMDGFDVCFELRKYYDIPVLMLTAKGETSQKVKGFHLGTDDYLVKPFDPIELVVRVKALLKRYQITVSQSIQVGNVLLNRKTFEVTSGEQTVMLPLKEFELLFTLGSKSGRTCSREQLIEEIWGYDFEGNERTLDVHINRLREKFQEEQSKFSIKTIRGLGYRLEVSK >NC_018877|1938783:1948082|1941180_1942941_+|WP_000453879.1|DBSCAN-SWA MEVRNEMKKKGSWRQFLRLIQDTNPPKGILIFALLMSLLSTGASLFIPMLTKGLVDNFSLSSISAGQIVGLVAFFVMQTIAAGLSIYLLNYIGQKIVAGLRERLWKKVLILPVSYYDQNRTGDTISRMTNDTGVVKTLISEHLSNLLTGGISIVGSLIVLFVLDWKMTALLLTVIPLSVLILVPLGRKMYKISKALQDETASFTSVLTQVLSEIRLVKSSNTEKREYETGNTGIQKLLQFGLKEGKVQALISPVMSFVLMALLVIIVGYGGMRVSSGALTTGELVAFILYLVQIVMPMSQLSMFFTQFQKAIGATERISTILEYKVEDHETGVKVTNAKQPIVLENVHFEYNEEEQVLRNIDFTIESGKVTAIVGPSGSGKTTLFSLLERFYEPTSGAIKLGKESITSYSLQSWRRQIGYVSQDSPLIDGTIRDNICYGVEGEVTDEEIEKVAAMAYVDAFIHDLPNGYATEVGERGVKLSGGQRQRIAIARALLRNPQILMLDEATSSLDSKSESVVQKALNNLMKGRTTLVIAHRLSTVVDADKIIFIEKGNLTGSGTHDELLQTHDMYREFATQQLKIKEGAF >NC_018877|1938783:1948082|1944753_1945347_-|WP_003270270.1|DBSCAN-SWA MCMKRKKWVLLLTAVGLFIILFALYFIFGNPLNYKVIEKDTSNYLHIKKGYKQEEIQDITGKYTPIYNIGYYATVVYKDEPYFTYSYTYDDNKKIIQDNGILGRHTESFEHLNLNWSLFDQLVDGIHTNLQGRGLREKKDYSIRNVQFIDIDDDKNGAEAYVDFKNDKESDYSYRMNSEGKAYQYNCSNGKCIFKEK >NC_018877|1938783:1948082|1938783_1940076_+|WP_000755523.1|DBSCAN-SWA MKKVIAGLAAASVAGVAVPGMDSAHAQVSNEALKEINGQTQTQTTVTETKTVETTSELKYTVTADVLNVRSGAGTGHNVISKVKSGQVLQVVGQENGWFKVNVNGQTGYVSGDFVTTGGKTGTTVQQGTGTYTVNVSSLNVRTGPSTSHTVLGSVNKGKTVQVVGEVQDWFKINFNGGTGYVSKDFVTKGGSAVSNETQQPTTNNNTTTVQTGGSYVVNTGALKVRTGPATYNAVIGGVTNGKVLNVTGAENGWYKINHNGRTGYVSADFVKFVKGGVNNVTNNNNNNNNVTNNVQQPGKDVQKPTTGGDTSSIAGFARSLNGSPYRNAGTTPAGFDCSGFIHYVLNQTGHKGARQTVAGYWSSKTKTSNPQPGDLVYFQNTYKSGPSHMGVYLGNGQFISAETDATGVRISSVSNSYWSKHLLGYTKAY >NC_018877|1938783:1948082|1946404_1947076_+|WP_000014165.1|DBSCAN-SWA MSGIEKWTAVDQYMSDVLIPKDSTLEGVLQTNAAANLPAHDVSPTQGKFLQLLVQIQGARNVLEIGTLGGYSTIWLARALPSGGRVVTLEASEKHAEIARSNIERANLTDKIEIRTGLALDSLQQIENEKYEPFDFIFIDADKQNNPAYFEWALKLSRPGTVIIGDNVVREGEVIDNTSTDPRVQGIRRFYELIAAEPRVSATALQTVGSKGYDGFVMAIVKE |
8 | Bacillus_phage(71.43%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2368858 : 2375939
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_018877|2368858:2375939|DBSCAN-SWA GATGATGCAACCTCTAACGATACAAGAGATTAATAAACTATATGAGCAAGATAAGATTATCAAGTTCTATAAGCATTCTTATTGGAGAAGGAACATTAGGATTAAGGCGTTAGAGAGAGGCAACAGTGAGTGTCAGGAGTGCAAGCGCAAAGGTAAGTACAGCAAAGGTAGGAATGTCCATCACATCAAAGAGTTACGTGACAGACCAGATTTAGCGTACGTATTAAGCAACCTAGAAACGCTATGCATTCGCTGCCATAACAAAGAACATGGCAAAGAGAAAAACATAGTGAAGAAGCGTTGCACGATAGTAGATGAAGAGAGGTGGTAAGTGTGGACAGCCTAATGATACAAGGTAACATATATGACTTGCAATTCATCAAGACATTAATGAAAGACGGAACAGATGATGAACGTGCTTTAGATATATTTAAACAGTTTCAGCGTGACATCTACACAACATACAAACTGATACGTCACATATGTAATCCAAGAGCATGTGAGAAGATTACACTTGAAACTGTAAAGAAAAGTCTACGTGAACATTGGTTAGAACATTATCTAAATATGACTTTAACAGAAGCTCATATTATTATTGAATATGCTGAGCTATTCTTTGGTTTAGCTATTAAATGATTAACTTACTTATAAACATTCTTCTAATAGCTTTAATGATTTGCAATGTAAATATCATTGTTATCGATAAGATAAATAAGAAGTTAGATAAAGAATTAAATTAAAATAAATTTCCTAAGACACCCCCCGGGTAAAATATAGAAACAATTTTGCTGGGGGACCGAGCAACGCGAGGGGGGATTTCTCTTTTTATTTTCGCGTTACGCGCGTGGGAATAGAAAAAAAGGCAAAAAAAATACCATCCCTTCTCTGGGATGATTAAAATTTTCGATATGTATTTGTAATCAGTGGACCGTCGCCACTGTTTCCTTCTAAGTAAAACTATACATGATTATTCTCGTCTTTACAAGTGTCATTTTTAAAATTAATCTTCGAAAAAATCCAATGAAAAAGCGGGGTGGTGATATTGTGAGCGGAAAACAAAGTAAATATAAATTAGCGTTCAAAGATTTCTTAGAAGGTGTTAAATACAAGGATATCGCGGATAAATATGGCGTATCTGTTAGCACTGTCAAATCATGGCGCAGCCGTTATTGGGAAGACATGATAAATGAAAAAGGTCTAAAAAATGTTTCGGAAAAGGTTGCAAAACTTCAAAAAAACAGAGAAAAAACGCTTAGAAATAAAATAAGAGATGATTTATATGAACAACTCGGCACGAACGGTATCATACACGCTCATTTTATGGATTTAGTAGAAGATTATATGTCATTTTGGGATATAAAAAACAGATTGATAGCTGATGTAAAAGATCGCGGTGTATCTGTACTAGGCGCTAATGGATTTATGAAAAAAAACGATAGCATTAACGAGTTGAATAAAACTAACACGCAAATGTTAAAGATTCTTAATGAGTTAGGACTTAAGGCGGTATGTGAGGATGATGACGATGATGCAGAAGTCTAATCTTCCTTATAAATATCATCCTTTCATTAGTGAGTACATGCATGCTGTGGAAAGCGGATCTATCCGTTCTTGTAATGAACAAAAACAATTAATGACCTTAGTTCGAAAAACTTTAGATGATCCAAATGTTTATGTTGATGTTCAAGCTATTGAGGATAGTGTTAATATCCCAGCTAAATATTTTCCATTCGAATTATTCGCATGGCAACGTTTTGTTAACGCTTGTGTGTTCGGCGTTCGTTATAAGGACACCAATCGTCTTGTTTGGAATCAAATATTAATACTGATGGGACGTGGCGGTGGTAAAAACGGATATGCCGGATATTTAAACTTCTATATGCTATCTAAACAGTTTGGTATAGATAGATATCACATTGAATGGATCGCGACATCTGAAGAACAAGCAAAAACTACATTCGATGACGTGAAGGAAGTAATAGAAAATCCTGCAAATAAGGTTTTAAAGAAATCGTTTAGTGCTACAAAGGTACTAATTAAACATAAAACAAACAAATCTCACATGAAATTCAATACTTCTAATGCTAGAACGAAAGATGGACGACGTCCTGGATCAGTTTGGTTCGATGAAATTCATGAATATGAAGATTATAAGTCGATTAAAGTATTCCGTTCAGCCTTGGGTAAAGTTAAAGATGGACGAACTTTCTATTTAACAACGGATGGATATGTCCGAGGTGGTATGTAATGTTTGAAATTACTGTAATGATTGGAATTGTGGTTGGTCTTTCGCAGATCGTAAAAATAATTGGATTACAAACAAAATATGTTCCGTTATTGAATTTAACGCTTGGCATTGTGCTAGGCGTTTTATTTTTGGGCGGAGATATCAAAACAAATGTATTTCAAGGAATCATCATTGGACTGTCAGCAAGTGGATTATTTGACCACACAAAAATTATAAAAAAGGATGTTGATGCTAAATGAAAAAGACAATGAAACATATTACCTCGTTCCTTATGATTCTAGTACTTGCTGTTTCTTTTGCTGATAGAACGCTTATTATTCCTGATTTACCGAAACAACCATACCGTTATGGTGTAGGTGCTTATGAGGGCGTTGTAGCACATTCTACAGCGACTCCAGAAGCTCCAGCTATTAACATTCAAAAATATGAGTCTCGAACATGGAGAAATGCATTTGTTCACTATGCAGTCGATTGGGACGAAACAATCCAAATTGCTGATACAAAATACATTGCTTATGGCGGCGGTCCTGCTGCTAACAAACGATTTGTACATGTTGAGTTATGCGAAACAGCGGACTATACAAAATTCAAGCGTTCTTATGAAAAGTATGTAAAACTTTTAGCAAAAATTTTAAAAGATAACAAGATATCTGTAGAAAAAGGATTATGGACGCATAGCGATGTAACACATTACCTTGGTGGTACAGATCATGAAGATCCAATTGATTACTTAAAGTCTCATGGCGTTTCAGAAGCTCAATTTAGAGCAGATGTACAACGAGTATACAATAATTCTAGTGTGGATGTTTCTGTTCCTGATAAGCCATCTAAACCAGCGGAAGTACCAACATCCGTAACAGATGGGATTGCTTATATTGAAGGTTATAACGTTAATTTACGTAAAGGACCTGGCACAAGCTATTCTAAGATTCGTCAGTTGAACAAACCAGAATCTTATATTGTGTGGGCTGAAAAAGACGGGTGGTTAAATCTTGGTGGAAATCAGTGGATTAAGAACGATCCATCTTATGTGAAGTTTAATAAGAAAAGTACAGTAGATTCTTCTATTGTTGGAAAGCGTGTTGTCTCAAAAGTTAACAATCTACGTTTCTATGATGCTCCATCTTGGCAGGATAAAGATGTGGCTGGTTCTGTAGATGCAGGATTAGGATTTATAATTGATGCGAAGATAAGTGTAAATGATTCGTATCAATATAAAGTGCATAATAGTCATGGGCAAGTTTTCTATATTACGGCTATTGATACGTATGTGAATGTGCGTTAATTTAACGAAAAGGGCCCCTTATTATAGGCGGCCTTTTTCGTGCTGTATGTAACATCATTTAATTGTTATTTTTTTCGGTTTTCAATTTTGTGTATTCATTTAACCAAATATCTATTAGATTTCTTAATGTAATAGTTTCTATTTCAAGAGGGATTTCGATTTCATCTTCATCATACTTATTAAATATAACAGTTTTATCTCTTCGAACATCTGCCCCAAAAATATTCGCACTTATTTTTTCATAATCACTTTTTTCATTTAAAACTTTATCTACAGTTTCTGCTATCCAATCACCGAATTCAGATACCTCTACATTTAAAAAAGCTTCTAAAATATCGAATTCCTTTGGTAGTCTAATAACTAAACTTCCTGTACTAAGTAACTCAAATTTGTAATCCATATTATTTTCTCCCTTAAAAATTAAATTATCGACCTTGTCTTGGAAATGCAGAAATAATTTTACCATTACCATCTAAAAACAAACGAATAGGTAGGCCGTCTATCCCTACTCCATCATAGATATTAGTATTACCACCCATGTGAATTTTATTGCTGTATGCCTCGTTTATATTGTCTACGATTTGTTGTGGATGCCAATCTTTAGGGAAAAAAGTAGAATAGCCACCATTCACCGCCTTAGGAATCCCATCCACTTCCACTTGGGCTTTGTATGCCCCATAATCATTAATGTTACGATCTGTGCCAGGAATTATTCTTCCGTGAGTATTCTCTAAAAACTCTGAGTGGTATCCGGTTGCTTCGCCTCTCCGGTTTATCTCTCCTTCAAGGATATGTTTGAGTGAGTTTGACCGGAAATTCTCAGTTTCTTGTAAACTAGATATAATTTCGCTAGTAGAGAGTGATGAAGTATGACTTTCATTAACAGGATTATTTCCGCTAGAACCAGCCTCGTCTTTAGCAAACTGATGAGTCGATAGTTTTTCTTCAGCTTTTCTAAAATCAGGTGTATCAAATGCAGAGCGTATATTATTTCCGCCAGCTAAAGCAAACTCATTGTGATTACGATTGAATAAGGACGCAGCGTCTTGCAAGCTTTGATTAGCAGTTCGTGAAATCTCAGCTAATTTTGTGCCAGGGTTCAACATTGCAATTTTATCCACGCCTTTTGTTCCTACGAATAGTTGTCCAACAGCCAATATAGTATGACCAGCTGCGCTTCCATACCATTCTGCACCACTATACGAGTCACCATTGGTAACATCACGATTCCAAGAATCAGAAATTGTTTGTTTTATCGTATTGAACGTCTCGACTGGGTGAGAAACGGCTTCAATCGTGTTATTAAATGTGTCAATTGGATGGATAGCTGCATCTGCAAGTCCTAATAATTCATCACCTATAGCGTCGCTCATTCCCTTTTTTAAGTAATAGGGGACACCTAATCCAGATTTTTCAAAAGCAGATGCGATTTCATCATCTATAGTGTCTTTTATTTTATTCACATCTTTATACGCTGCATCGATACCATGTTTAAATTTATCATATAAAGACTCATCGGAATTTTGTATTTTACTAAGATCCTCATAAGTTTCCTTGAGACCATGCCAAACCTTGTCACGTAAAGATCCATCATTTTTCTCACTATTTAACTTACCACACATTGCTCCTTCTTCAAGATTTCCATCATATGAAGCATCTGCGGTACGGAATTTTTCGGCAATTCGTTTCAAATCCTCTTCCACTTTTATAATCGAATTGATAGATGTAAAAGCTTTTGGTCTTGCATCATTGAACATTTGAATGAACTGTTGGTTAGAGGCACCAATCCATTGAAAACACAAATGATCTATTTCATTACATAAATTATTATGTATAGATTCTAATGCGATCCTGGTATTACTTGCACGATTTGCAACATCTTCTAGCATTTCAGGTGTCACTTTGATTTGAACCATTTTTTTCCTTCCTCTCCCAATTAAAATTATAAGATAAATAGAAGAAAAGTAAATATATAAAATTTAGATTATATTAAGGGGGATTTATTTATAGAAGAAATATAAAAAAGTGCTAACAAGTTTGCAAACGAACTTGCTAACACCTATAAGAAATAGACATAAATTATCGCCGATATATCGTCTTTGAAAATAGCTTTAATCAGTTACATCATACATATACGAAATGCTCATGAAAACAGTCTTAATATACGTGGTATTGTAATAATCTCAAGCGCAATTTGCGTTGAATATAGGAGTATTGGAGTTAAATCTAAAGCGAGTGTTAAAAGTATTATGAAGCTTGTAAGAATTACAAAACTACCCCAAAAGAAACTTTTTGAAGTGTTGCGGAAATCTTTTATTAAGGAAAAGAAAGAAAAAGATGCGGTAACAATAAGAATGAAAATTTTATACTTATCAGACATTATAACCCTCCCAAAGAACAGTGACTTATATTATACCGTATTTTTCAATATTATTATAAAAAGATTTTAAAGTGAATAATAAGAAAAAAATAAAACCATAACTTAAAACATTAGTTTAGGTTCTATTGTTTGAATTCTTTGTTTTAGAAGGTATATAATTTGAAATTTAAAATTTTCCAAATGAATTACCATTTTTTATTTCTGATCCAACATCAGGTGCTCAATGAAATGGTATGAAAGATTATAGGCTAGTGATACGAGATTAAATAAGAGGAATCTGCGTGCAGCAAGAGTCCTAGCTCAGATTTCTACTAGAGAAAAGTATTTAGTTGGAGTTGGTATGTTAATAAAAAAAGGATGGATGTGGAAACTAAATATTCAAGACATTAAGGATAAAGGTCAGGAAATATAATTTGGTATTCTGGGAATAACCGGAGGTCCGTAGTTAAAGTTGCATAGAATTTGTATTTTGTTTCTAATTTTTCAATTGTTGTTAAGTGATGAGAACCTAGTCCACGCTGTACACTATGTTGAGAAAGAGTCGGCCCAATTTGTAATTTTCGTTTTTTCATTGCATCGTTCCATGGACTATAAAAAAATTTAAAAATAAAAGCAGGTTCTATGTAAATGTTATAAGGATAATGCGAACCATGTCTCCCGACTCTATAGTTCCCGTGCGAATTATTGTGAATTAATCTACCGTTAAGATATAGTTGATTTGGATTAGGTTGAATTATTATGCCATGGTAACGTTGTTTAACAAGCGGAGAACCATATCTTGGATTAGTGTAGCCATAAGTCGGATCATCAATCATCATAATCATTCTTATTGAAAACATATTGCCGCCCATAGTGTTAAGTGATTTGAAAAATTGTTCTTTATTATAACAGCATAGGAATTCTGTCGTATTTAATACCATTTTCCATCCTGTAAGTTCTCTTTCAATTTCCATAACTTCTTGATCAACTAAATAAGCATCAAATTCGAGTGATTTTGAGTTTCGTATTTCCCAATTAGGAGCGAATATTTTACAGATTTCAACTGACCGATCAGTGGATCCACGGTTAATAAGAATGCCGTGATCAAATAGCTTTGTATGGTGCATTAACCACCATGGAAGTAAATATTCTTCATTGTAAAAATGAGAAATTAAAGTAGTCTTAATCAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_018877|2368858:2375939|2375156_2375939_-|WP_000598277.1|DBSCAN-SWA MIKTTLISHFYNEEYLLPWWLMHHTKLFDHGILINRGSTDRSVEICKIFAPNWEIRNSKSLEFDAYLVDQEVMEIERELTGWKMVLNTTEFLCCYNKEQFFKSLNTMGGNMFSIRMIMMIDDPTYGYTNPRYGSPLVKQRYHGIIIQPNPNQLYLNGRLIHNNSHGNYRVGRHGSHYPYNIYIEPAFIFKFFYSPWNDAMKKRKLQIGPTLSQHSVQRGLGSHHLTTIEKLETKYKFYATLTTDLRLFPEYQIIFPDLYP >NC_018877|2368858:2375939|2372448_2372790_-|WP_000384715.1|DBSCAN-SWA MDYKFELLSTGSLVIRLPKEFDILEAFLNVEVSEFGDWIAETVDKVLNEKSDYEKISANIFGADVRRDKTVIFNKYDEDEIEIPLEIETITLRNLIDIWLNEYTKLKTEKNNN >NC_018877|2368858:2375939|2374533_2374770_-|WP_001281134.1|DBSCAN-SWA MSDKYKIFILIVTASFSFFSLIKDFRNTSKSFFWGSFVILTSFIILLTLALDLTPILLYSTQIALEIITIPRILRLFS >NC_018877|2368858:2375939|2368858_2369188_+|WP_015055127.1|DBSCAN-SWA MMQPLTIQEINKLYEQDKIIKFYKHSYWRRNIRIKALERGNSECQECKRKGKYSKGRNVHHIKELRDRPDLAYVLSNLETLCIRCHNKEHGKEKNIVKKRCTIVDEERW >NC_018877|2368858:2375939|2369901_2370399_+|WP_000015466.1|DBSCAN-SWA MSGKQSKYKLAFKDFLEGVKYKDIADKYGVSVSTVKSWRSRYWEDMINEKGLKNVSEKVAKLQKNREKTLRNKIRDDLYEQLGTNGIIHAHFMDLVEDYMSFWDIKNRLIADVKDRGVSVLGANGFMKKNDSINELNKTNTQMLKILNELGLKAVCEDDDDDAEV >NC_018877|2368858:2375939|2372815_2374306_-|WP_000249917.1|DBSCAN-SWA MVQIKVTPEMLEDVANRASNTRIALESIHNNLCNEIDHLCFQWIGASNQQFIQMFNDARPKAFTSINSIIKVEEDLKRIAEKFRTADASYDGNLEEGAMCGKLNSEKNDGSLRDKVWHGLKETYEDLSKIQNSDESLYDKFKHGIDAAYKDVNKIKDTIDDEIASAFEKSGLGVPYYLKKGMSDAIGDELLGLADAAIHPIDTFNNTIEAVSHPVETFNTIKQTISDSWNRDVTNGDSYSGAEWYGSAAGHTILAVGQLFVGTKGVDKIAMLNPGTKLAEISRTANQSLQDAASLFNRNHNEFALAGGNNIRSAFDTPDFRKAEEKLSTHQFAKDEAGSSGNNPVNESHTSSLSTSEIISSLQETENFRSNSLKHILEGEINRRGEATGYHSEFLENTHGRIIPGTDRNINDYGAYKAQVEVDGIPKAVNGGYSTFFPKDWHPQQIVDNINEAYSNKIHMGGNTNIYDGVGIDGLPIRLFLDGNGKIISAFPRQGR >NC_018877|2368858:2375939|2371340_2372390_+|WP_000753400.1|DBSCAN-SWA MKKTMKHITSFLMILVLAVSFADRTLIIPDLPKQPYRYGVGAYEGVVAHSTATPEAPAINIQKYESRTWRNAFVHYAVDWDETIQIADTKYIAYGGGPAANKRFVHVELCETADYTKFKRSYEKYVKLLAKILKDNKISVEKGLWTHSDVTHYLGGTDHEDPIDYLKSHGVSEAQFRADVQRVYNNSSVDVSVPDKPSKPAEVPTSVTDGIAYIEGYNVNLRKGPGTSYSKIRQLNKPESYIVWAEKDGWLNLGGNQWIKNDPSYVKFNKKSTVDSSIVGKRVVSKVNNLRFYDAPSWQDKDVAGSVDAGLGFIIDAKISVNDSYQYKVHNSHGQVFYITAIDTYVNVR >NC_018877|2368858:2375939|2369247_2369493_+|WP_003269337.1|DBSCAN-SWA MKDGTDDERALDIFKQFQRDIYTTYKLIRHICNPRACEKITLETVKKSLREHWLEHYLNMTLTEAHIIIEYAELFFGLAIK >NC_018877|2368858:2375939|2371104_2371344_+|WP_000461733.1|DBSCAN-SWA MFEITVMIGIVVGLSQIVKIIGLQTKYVPLLNLTLGIVLGVLFLGGDIKTNVFQGIIIGLSASGLFDHTKIIKKDVDAK |
9 | Bacillus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2582925 : 2649913
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_018877|2582925:2649913|DBSCAN-SWA TATGCATTGGGCGTATGAAGTAGCACATGAATTAATTAGGAAACATCCAAATAAAGAAACGTTTGTTTGTGCATCTGGAATTAGTCCGTCAGGTTCTGTTCATATTGGGAACTTTCGTGAAATCGTAACGACTTATTTCGTAGTAAGAGCACTTCAAGATTTAGGGAAAAAGACTCGTTTTATATTTTCGTGGGATGATTATGATAGGTTTAGAAAAGTTCCAAAAAATATTGATCCATCTTTTGCAAAGTATATGGGTATGCCATACTGTGATATTCCAGATCCGTATGGATGTCATAACTCGTATGCGGAGCATTTTGAAAAAGAGTTTGAAAAATCGCTTCAAGCATTTGGAATTGAAGTAGAATTTATTTATCAACATGATGAATATAGAAGTGGAAGGTATAATGAAAATATTTTAGAGGCTTTGTATAAACGAAAAGAAATATATGATATTTTAATGGATTTTAAAACTGGAGAGTGTAGTGAAAAAGAGCGAGAGAGCTTTTATCCAGCTACATTATATTGTGAGAGGTGCGGAAAAGATACAACAACTATTACACATTTTAATGAAGTATTAAAAATAGTCCGGTATGAATGTGAATGCGGAAATGAAAAAGAGTTATCCGTATTAAATACAAATAAAATGAAATTGAATTGGAAAATCGATTGGCCGATGAGATGGATGATAGAGGATGTTGTTTTTGAACCGGGCGGTAGAGATCATTCATCAGAAACGGGTAGTTATAATGTATCAAAAGAAATTGCAAGGAAAATATTCAATTGTGAAGCGCCTCATTACGTTGCTTACGATTTCATTGGTATTAAAGGGAATCATGAAAAAATGTCTAGTTCTTCAGGGAATAGTATTACACCAAGCGATTTATTGAAAGTGTATATACCAGAAGTAATTCTCTTTATGTTTGCAAAATACAAACCAGGCGCTGCTTTTCATATTGGGTTGTATGAAGATGTGATTCGCAATTATACAGAATATGAACGATTGAAAGATAGTTATGAAAATAAAATGCTCAAAAATGAAGATTTATTTGATGCAATTAAACTATCTATAGTTGATAGCGTGTTTAAAGAATATCCGAGGTTTAATCAAGTGGCAGGAACGTTACCATTATTAAATTTTGATTCAACTATTTTACAGGGGATATTAAAGAAAATAGATAGGAGTTATGCATTAGATGAAATGAGAGTGATAAGTAATCGCGCAGAGTATTGGATAAGAAACTTTCAATCTGAAAAATTAATCGCGGTAAATCAGGAGAAAAATGCTGAGTTTTACTACACATTAGATGAAAGGCAGAAAGAATGGCTAGTAGAAGTTTGTAAAATACTTCGTTCTATTAAAGATTACTCTAACTTAATGGAGCAATTATATACGATTTGTCATCATGAAAATAAAAAAATAATGAAAGAAAATCAAAAACAATTATTCACTATTATATATAAGCTCATTATGAATCAATCAAATGGTCCTCGTATACCATTATTAATACATGTAGTAGGCATAGAAAAATTCATCACACTATTAGATTTCTAAAACACAGTTAAAAGCAACGTAAGTACCAAAATTTCTAAGTACTTGCGTTGCAAATTTTACTATCGTGAATACATTTTCGGACATTCATCACCACTTGGTTCATAAAAACAATGGCTTTTAAACTGTCCTACAAATGGCTGATTATACCATTCAGGTGGACAAGCTCCAACTGGACGGAAATACCAAAGAGCCCATCGTGCAGGCCAGCGCCATTGACCTTGTAAAACTTTTCGTGCGATTTCTTTTTCTGATTCACGAGCGCGTTGATAAAAATATCCATATTGTACTGCTTCAAATCCGCCGGGGCTTTGATATACAGCGTCTCGTACGGTACGGAGTTGTTTAAAATCTAAGCAATCACAAAATACACGGTTTACTACAACGCATCCAACTAACTCCTCACCTTGGCGACCTTCGCCTTCAGCTTCAGCACGAATTAATCGAGCTAGTAAATCAACATCACTTTCGTTGTATGGAATAAGGGGCATAGTGATACCACCTTTCTGTTATAGTAAAGAGTGTATGTTATAAAACAATCTGCGTGCTTTTTTACTTAAAAATAACATTTAATTTTAAGAGGAGCTTGTATAAAAAAAGCTAATTAGTATTAGTAGATAAATATAAAAGGGAGAGGTATTATGTATCGAATTCATAAAGACCATATCATTTACTCAATGTCACCAGAAAATAAGCCGTGTATGGAAGTAGAAATTGGGAGCAGTCTTGTATTTGAAACATATGATTGCTTTGAAAATCAAATCGATTCTGAAGATGTTGTGTTTCAAGAATTAGATTGGAACCGAATTAATCCAGCCACTGGACCTGTATATGTTAAAGGAGCAGAACCTGGCGATATATTAGCCGTAACGATTGAAAAGATTAAAATTGCAGAGCAGGGCGTTTTAACTACAGGTGCAAACCTTGGTGTAATAGGGGATGAGTTAAATGAAAATACAGTGAAAATTGTCCCAATACATAATGAACATGTTTTGTTTTCAAGTGAACTACAAATCCCGATTAATCCAATGATTGGGGTAATTGGTACTGCACCGAAAGAAGAGAGCATTTCATGTGGCACACCGCATGATCACGGCGGGAATATGGACTATAAAGAGATTAAAGAAGGAACAACATTACTACTACCAGTTAATGTCCCAGGAGCACTATTAGCGTTAGGTGATTTACACGCAGCGATGGGTGATGGTGAAATTGGTGTTAGTGGTGTAGAGGTTGCTGGTGAGGTAACGGTAACAGTTCAAATTATAAAAGGAAAACAATGGCCATTACCAATGGCTATTCAAAAAGAAAAAATGATGACGATTGCTTCAGAGAAATTGTTAGATGATGCAGCAAATCGTGCTGTACGTAATATGGTGACATTTTTACATGAAGAATTAGCAATGTCTAAAGCTGATGCAACGCTTTTATTATCGGCAGCAGGTAATTTAAAAGTTTGCCAAGTTGTGGATCCGCTGAAAACAGCGCGTATGGAACTAGGAATGGATTATGTGGAGAAACTAGGATTTATTTTTAGTAAATTTCATATTAAATAGATAAGGGACGAAAAAGGATACTTTTGTATAAAAGCATCCTTTTTTAATTTACGGATTTTGTGAAAAGAGGTAGTATTTATTCTATATAAGTATATTTGAGATTGCGGATTAAAAAGGAGTTCAATAATGGTCAAAATTATGATTGTAGAAGACGATATGAAAATTGCAGAACTATTATCGACACATGTTGCGAAATATGGTTATCAAGGAGTTATTGTATCGGACTTTCAAAATGTATTAAACATTTTTTTAGAAGAACAACCAGAGTTAGTTTTATTAGATATTAATTTACCGAGTTTTGATGGGTACTTTTGGTGTCGTCAAATTCGCGGAGTTTCAACATGTCCGATACTATTCATTTCGGCCCGTGAAGGCACGATGGATCAAGTTATGGCGTTAGAAAACGGTGGCGATGATTTTATTCCGAAGCCTTTTCATTATGAAGTTGTAGTGGCGAAAATTCGTAGTCATTTAAGACGTGCATATGGAGATTATGCACCGAAACTAGAAGAGCGAATGATTGAGCAACAAGGTCTTTGTTTATATCCTGAAAGACTTGTATTGAAACTTAGAAATGACGAGATTGATATAACGAGAAACGAAGCTATTTTATTAGAGACATTAATGAAAAATTATCCGCGTGTTGTGAGTAGAGAAGTGTTACTTAATAAATTATGGGATAGTGAATCTTATGTTGATGATAATACATTAAGTGTAAATACAACACGTGTGCGTAAAAAGTTACAAACGTTACATATAGAAGGTGCGATTGAAACGATTCGTAGTGTTGGATATAGATTGCATATTACTTGGGATACTGGTATAGAAAAATGATAAGGTTGTTTATACGTGATCATATACCACTTATTTGCTTTACCATAATTCAACTACTAGCTATATTTCTCGTATATTGGTTTGATGGGCATAATCATATTACAACGGCGTTATATGCAATGTTTCTAGGTATTTTCTTTATGGGAAGTTATTTAGTGTTTCGTTATTTTACACATCGTTCTTTTTATGAGCGCCTAGCAAACCCGATGCAATCTTTGGATGAATCTGTTCAAAAATCTGATTTTGCAGCTGTATCGGCTGCTCTTCAAGAACTACTTGAGGTGCAATATAGACATTATCAAAATCAGCTGCAAATGCAAGAGAGAAAAAATAATGACCATTTAACCTTTATGAATCAGTGGATCCATCAAATGAAAACACCTTTATCTGTAATAGAATTAATTACACAGGATGAAGTAGATTCACGTTTTGAAAGTATAAATGAGGAAACTGATCGATTAAAAAAGGGATTAGAAATGGCTCTGTATGTCGCACGTTTAGAAGCGTTTACACAAGACTTTTATGTAGAAAGGGTACAACTACATAAAATAGTGAATGATTCGGTACATGAACATAAACGATTCTTTATCCGGAATTTTGTATATCCAGAGCTTGAAATTGATAAGGACATTACTGTAGAAAGTGATGTGAAATGGTTACAATTTTTAATCGGACAAATACTATCGAATGCGATTAAGTATTCATCAGGTAGTAGAGAAAAGATTAAAGTGAAAGCTTGTAAGGAAGATAATACCGTTATACTTGAAATTGCTGATAATGGCGTAGGTATACCGAAGCAAGATTTACCAAGAGTATTCAAACCTTTCTTTACAGGAGAAAACGGTAGAGATTTTAAAGAATCAACAGGAATGGGGCTATATCTTGTATATGAAATTACAAAACAATTAGGGCATAGTGTAGAGATTCATTCAGAAGTTGGTAAAGGTACCGTTGTACGAATTAAATTTTTTAATGTGTAGATAATTGATCTAGGCTAAAGAACTTTGGAGATAAGTTTTTTAGCCTTATTTTATAGCAATTATATGAAATAGTAAAAG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75 | Bacillus_phage(62.86%) | protease,integrase,terminase,transposase,portal,bacteriocin,tail,tRNA,capsid | attL 2583333:2583349|attR 2648578:2648594 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
3729538 : 3850279
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_018877|3729538:3850279|DBSCAN-SWA 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111 | Bacillus_phage(51.92%) | coat,protease,integrase,head,terminase,transposase,portal,holin,bacteriocin,tail,tRNA,capsid | attL 3805653:3805670|attR 3822000:3822017 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
4535791 : 4543474
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_018877|4535791:4543474|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_018877|4535791:4543474|4536841_4537777_-|WP_000247669.1|DBSCAN-SWA MVNLLIGIIFILLCVIYIQYKMRKNSSKNLRYTYEKLESIVNVQTGEKLLVMTDDRELQKLLVAINQLLDAKQKTNADHAKVEISMRKMLSNISHDLKTPLTVILGYTEMLNKDKTMNKEEQQILLEKVHVKTLEVMELIHKFFDLAKLESGDKAIEMTKVNMNEVCREKILSFYDLVTTKGFQVHIDIPEKNIYALGNVEVLGRVLNNLISNAITYGDDGKILGMTLRDDETNVYIDVWDKGKGIDESHIDKVFERMYTLEDSRNRLYQGSGLGLTITKRLVEAMDGKIHLSSKPYEKTIFTVALKKMQF >NC_018877|4535791:4543474|4542490_4543474_-|WP_001036824.1|DBSCAN-SWA MNKKTWSFLIVTALLIVMTSFSAMKGSLEVGIVELVQGIFTGGNEDVEVIKDLRFPRIIIALFTGAALAVSGVLFQAVMKNPLADAGVIGISSGASFMTLVIITLFPQFFFWTPVFAFLGGAFACYLVYAFSWKSGLSPLRIILVGIAINAMFTGLNESFITICGYFIKSIKQTTTSNITMKTWGDVEIMVMYGTIGLILALFVGAWCNLLSLQDKTAKNLGLHVTRVRLIISAIAVLLAAVSTAIAGVIAFVGLLVPHISRQLVGSDHKVLIPFSALAGALLILTADTIGRLIVPPNEIPAATIMAVIGGPFLIFLLRKSDKVHGN >NC_018877|4535791:4543474|4535791_4536715_-|WP_000221100.1|DBSCAN-SWA MTYILKTNQLTKVFKGKEVISSVNMHVKKGEIYGFLGPNGAGKTTIMKMITNLIKPTSGEIEILGEKLTDTSYEVLKRMGTIIEYPIFYDKLTAKENLELHCEYMGYYDKNAIDHALHLVKLQGIDNKKVKDFSLGMKQRLGIARAIVTKPELLILDEPINGLDPIGIKELRDLFKMLCKEYGITLLVSSHILGEMELMADTIGVIQNGKLIKEVSMKSINGKQTEYIEITVPDVKRAAYILEDKLGIKNYKIMSGNMIRVYDTAVSQQAISKALIMNDVEIESINKKHSSLEEYFLNVMDGEGIHA >NC_018877|4535791:4543474|4540934_4541699_-|WP_000095598.1|DBSCAN-SWA MSSKKERKKNSFFQRILTVVFLGTFFYSVYELGDIFMDYYENRKVMAEAQNIYEKSPMEEQSQDGEVRKQFKALQQINQEIVGWVTMDDTQINYPIVQAKDNDYYLFRNYKGEDMRAGSIFMDYRNDVKSQNRNTILYGHRMKDGSMFGSLKKMLDEEFFMSHRKLYYDTLFEGYDLEVFSVYTTTTDFYYIETDFSSDKEYTSFLEKIQEKSLYKTDTKLTASDQIVTLSTCDYALDPEAGRLVVHAKLVKRQ >NC_018877|4535791:4543474|4538813_4539008_+|WP_001014310.1|DBSCAN-SWA MNGQKRSNIAPGLEVDIVLKQDQRTGKLTRGIVKDILTNSPSHPHGIKVRLQDGQVGRVQNIVQ >NC_018877|4535791:4543474|4539048_4540248_-|WP_001255968.1|DBSCAN-SWA MRSEVTVKIKPKFIKEIKSGYPLILKDAIQNLNDVQEEGTIIKVVDEKSQFVGKGYYGKQNKGYGWILTRKESEQINQSFFESKIKSALHKRKQFYKSSDTTAFRVVNGEGDGLGGLIIDYYDGYYVVSWYSEGIYTFRDEIIAALQKVANFKGIYEKKRFDTKGKYIEGDDFVAGERGEFPLIVKENGVNFAVYLNDGAMVGVFLDQRSVRKQIRDKYAKGRTVLNMFSYTGAFSVFAALGGASKTTSVDLANRSLSKTIEQFSVNEIDYEAQDIIVEDVFLYFKYAAKKNMKFDMVVLDPPSFARSKKYTFSAAKDYKNLLKETIAITENNGIIVASTNCSAFDMKKFKGFIDTAFKEMNGKYKILEEHSLPEDFRTIDQFKEGDYLKVVFIEKIKG >NC_018877|4535791:4543474|4540542_4540866_+|WP_000587824.1|DBSCAN-SWA MIIVTNTAKITKGNGHKLIERFNKVGQVETMPGFLGLEVLLTQNTVDYDEVTISTRWNAKEDFQGWTKSSAFKDAHSHQGGMPEYILDNKIAYYNVEVVRMPMAAAQ >NC_018877|4535791:4543474|4537778_4538471_-|WP_000018060.1|DBSCAN-SWA MSHHILLVEDDLSIQEMVEKYLIKEGFQVTIASDGEEGVNTYLKGSFDLIILDIMMPKLDGLEVVRIIREKSAVPILMMSAKDTDVDKAVGLGLGADDYICKPFSMIELAARVKAGIRRSTKYSATETTEKMIQIGDLTIDPINFTVEKNRKPLKLTLKEFEILKLFVKNQNRVFTKAQIYTLVWNEEYYGDDNVINVHMRRLREKIESDPSNPEYIKTLWGIGYKLEVM >NC_018877|4535791:4543474|4541730_4542501_-|WP_000403738.1|DBSCAN-SWA MEIKNVTFSYDNVTDRLKSVSSEIEIGKITTIIGPNGCGKSTLLGVMSRNHDPRSGEVILDGKAISQYKPKEFARKLAVVHQQNEAPADMTVEKLTSFGRMPHKNVFSSQTDEDREAIERALACTNLLSKRDKEIHALSGGERQRVWIAMTLAQKTPMLFLDEPTTYLDIYYQLEILELVKELNEVHGLTIVMVLHDINQAIRYSDHIIVMKDGEIVTKGKPNDVVTESMIKTIYGVDVVVKQDEDTGLYMVPMGI |
9 | Staphylococcus_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
4737287 : 4744331
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NC_018877|4737287:4744331|DBSCAN-SWA 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GTGGAAGGTGTAAATAAATTACGTAAGCACGGCATTCGAGTTTGTTCTCATATTATTAACGGCCTTCCACTTGAAGATTACGACATGATGATGGAAACAGCTCGTGAAGTAGCGAAGCTTGACGTACAAGGAATTAAAATCCACTTACTTCACTTATTAAAAGGAACGCCAATGGTGAAGCAATATGAAAAAGGACAACTCGAGTTCCTTTCTCTTGAGGATTACGTAAGTCTCGTTGTTGACCAACTTGAAATTATTCCAGAAGACGTAATTGTGCACCGTATCACAGGTGACGGTCCACCTGATTTAATGATTGGCCCAATGTGGAGCTTAAATAAATGGGAAGTATTAAATTCCATCGATGCAGAATTTGTACGCCGCGGAAGCTGGCAAGGAAAATATGCAAATGAGGAGAAACAAAAATGAAATTAGAACGTGTATTACCGTTTGCTCGCACTCTCTTGCAAACAGCAGTAAAAGAAGGCGATTACGCTGTAGATGCAACACTCGGCAATGGGCATGACACTTGCTTCCTAGCTGAAATCGTTGGAGATAACGGAAAAGTATTTGGATTTGATATTCAAAAAGAGGCAATTGAAAGCTCAACAACTCGTCTAAAAGAAAAAGAACTTTTCGAACGTACTGTTTTAGTTCACGATAGTCACGATACACTTCTATCCGTATTACCAGAAGATGCAAAAGGAAAAGTAACAGGCGCAATTTTCAACTTAGGTTACCTTCCAGGCGGAGACAAGCATATCGTTACAAAACCGAACTCAACAATCTCAGCGATCGAACAATTATTAGAAGTAATGGCACCTGAAGGTATCATCGTCCTTGTTATTTACCACGGACACCCAGAAGGACAAGTAGAACGCGACGCTGTACTTACATTTGCCGAAGAACTAGACCAAAAACAAGCACACGTACTGCGATACGGCTTCATTAATCAACAAAATAACCCGCCATTTATTGTGGCGATTGAGAAGCGATAATATATCAACGATTTTTCAATTATATCTATCGTAACTCGGGATATATCAACGATTTTTTCGATATATCTATCATAACTTACAATATATCAACGATTTCTCGGATATATCGATTGTTCGACAAAACATAACAAAAAAAGACGTGCATTCACTGCACGTCTTTTTTTATTCTCCTATATAATGGATATATACACTATTTAAAGAAAGAAGGATAGAACTTTGCTAGTAGAACTACGGGGAATTCAAAAGAAGTACGACAAATCACTTATACTAGACAACATTGATTTATCCATTTCAGAAGGAGAAGCACTCGCCATTGTTGGCGGAAACGGGACTGGAAAAAGTACTCTACTCAAAATAATTGCAGGATTTGTTTCACCTACGGCAGGAGCACTTCAAAGAAAAGAACATATACAAATTGGCTATGTACCTGAATATTTTCCTGAAGGGATTCGTTTTACATTAGAGGATTATTTATATCATCTCGGCCACATTCACGGTTTATCAACAAAATATTTAAAAGATAAAATCCCGATGCTTCTTGAATCTTTTCATTTACAGCATGCAAGACATTCTGTTGTACGAAACTTTTCAAAAGGTATGAAACAAAAAACTGGTATTATGCAAGCATTACTTACAGACGTCCATTTATTAGTTTTAGACGAACCGCTTTCTGGACTCGATCCTCACTTTCAGCAAGAATTAGAACATATTTTACTCTCATTAAAACAACACGGCATATCCATACTCTTCACATGTCATGAAAAACAACTATTAGAAAACTTCGCCGATAGAATTGTGACGTTAGCAAATCATACAATCACAGAAGATATTTTTGTACAAAAAGGAGCAGAACAAGTCTATATTGAAGCAATCGTTCACGAAACATTTTCAGCGATAGAACTAAAAAAGCAATCCGGTTTTATACACGTTGCACACAATGCAAATCAAAACCTTATTCAATTACAAATCGAAAAAGAATATACAAACGAAATGCTTCAGTTTTTATTACATAAAAAAGCATCTATCACACTGCTACAACCTAACTTTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >NC_018877|4737287:4744331|4741212_4741362_-|WP_001129340.1|DBSCAN-SWA MAKRSDQNNPEQKTQNGHNAEFSNELDPIVQVKQRNSKKGQPQKSKQSE >NC_018877|4737287:4744331|4740647_4740998_-|WP_004412121.1|transposase|DBSCAN-SWA MSFANTRGIIVDEVIKDIGSGLNYKRKQWNKLIDSCMERNISTIIIAHKDRFVRFGYDWFEKFLHKMEVEIMIVNNEKLSPQEELVQDLISIIHVFSCRIYGLRKYKKKMSEDGDL >NC_018877|4737287:4744331|4739493_4740651_-|WP_000817275.1|transposase|DBSCAN-SWA MKRAYLIEIKPTTEQISKIRQTIGVCRYVYNLYISKNKEAYESEGKFLSGYDFSKWLNNIHTKECDQWIKEVSSKAVKQAIMNGDKAFKRFFKGLSKFPQYKKKKKQDVKCYFPKNNKTDWTVERHRVKVPTIGWVRLKEYGYIPKNATVKSGTVYQRAGRYFVSVLCELEEMATKLALNKIGLGIDLGVKDFATRSDGIVHENINKTIKVKKIEKRLKREQRSLARKFENLKKRGEKSVTNKRVNIDKNVLRVQKLHARLANIRIEYVKSIVTNVVKTKPTFITVEDLNVKGMMKNKHLSKTIAKQSFFAFKTWLLTKCEEYGIELRQVDRFYPSSKLCSCCSQKKADLKLSDRVYTCECGNVMDRDLNAAINLLQAKEYIILT >NC_018877|4737287:4744331|4742708_4743281_+|WP_000764492.1|DBSCAN-SWA MKLERVLPFARTLLQTAVKEGDYAVDATLGNGHDTCFLAEIVGDNGKVFGFDIQKEAIESSTTRLKEKELFERTVLVHDSHDTLLSVLPEDAKGKVTGAIFNLGYLPGGDKHIVTKPNSTISAIEQLLEVMAPEGIIVLVIYHGHPEGQVERDAVLTFAEELDQKQAHVLRYGFINQQNNPPFIVAIEKR >NC_018877|4737287:4744331|4738314_4739337_-|WP_000527699.1|DBSCAN-SWA MGNNITNKRIDELDYIRGFALLGIILVNILALLHIKIPDPNTVDASYQRFLYLFVEGRFFSIFSFLFGVGFYIFITRAIAKGKNGYVLFLRRLVALFIFGLIHQMFQPGEALALYAICGLIVLPFYKAKKEVNLVLGLILTIAFSVMGVKELLPLGLILLGLAAGQYRVFENLAQNIKKVAVFTGIMFVLSVIAVWYQYGHVPAEPFINMILENEDGTMNAASQFLKIGVTVGPIISAFYVGALILLLQLKSVQTLLAPLKYYGRMALTNYIGQTAMILIAGSVFNFAENLTYMQTLYVCIAIYVIQIVCSVIWMKIFKMGPLEWIWRVITYWTVTPLKK >NC_018877|4737287:4744331|4741377_4741641_-|WP_000840869.1|DBSCAN-SWA MAERQSLESYITQAEQAVEYAKEQLDQGMRQEHYNTMEYSDAQLQLEQAYNDLQTMQQHANDEQREQLNRARMAIRQLQHQMIITPH >NC_018877|4737287:4744331|4743497_4744331_+|WP_000959717.1|DBSCAN-SWA MLVELRGIQKKYDKSLILDNIDLSISEGEALAIVGGNGTGKSTLLKIIAGFVSPTAGALQRKEHIQIGYVPEYFPEGIRFTLEDYLYHLGHIHGLSTKYLKDKIPMLLESFHLQHARHSVVRNFSKGMKQKTGIMQALLTDVHLLVLDEPLSGLDPHFQQELEHILLSLKQHGISILFTCHEKQLLENFADRIVTLANHTITEDIFVQKGAEQVYIEAIVHETFSAIELKKQSGFIHVAHNANQNLIQLQIEKEYTNEMLQFLLHKKASITLLQPNF >NC_018877|4737287:4744331|4741752_4742712_+|WP_000868033.1|DBSCAN-SWA MKVQNPFPYTNDNKRYHTWNYHLRNEFGEKIFKVSLDAGFDCPNRDGTVAYGGCTFCSAAGSGDFAGDRRDDVITQYHEMKEKMRSKWKDGKCIAYFQAYTNTHAPLEVLKEKFEPLLAEKDVVGLSIATRPDCLPDDVVEYLADLNKRTYLWVELGLQTVHERTANLINRAHDYPSYVEGVNKLRKHGIRVCSHIINGLPLEDYDMMMETAREVAKLDVQGIKIHLLHLLKGTPMVKQYEKGQLEFLSLEDYVSLVVDQLEIIPEDVIVHRITGDGPPDLMIGPMWSLNKWEVLNSIDAEFVRRGSWQGKYANEEKQK >NC_018877|4737287:4744331|4737287_4738049_-|WP_000165837.1|DBSCAN-SWA MTKPVVDVKNVQKVYGKKGENQSHALKGVSFSIQEGEFVGIMGPSGSGKTTLLNVISTLDKATGGVVEIAGTDITKMKQGELSDFRSQKLGFIFQDFNLLENLSIYENIALPLSLQGVASRNIGPKVEKVADMLGITEILQKYPSEVSGGQKQRSAAARALVHEPAIILGDEPTGALDSKNATSLLDAMTNLNKDQGVSIMMVTHDPYSASYCQRILFIQDGELYKEIHRGGTREEFYKEILDVLADLGTQKA |
9 | Staphylococcus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
4891799 : 4980343
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NC_018877|4891799:4980343|DBSCAN-SWA 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95 | Bacillus_phage(67.86%) | coat,protease,integrase,head,tRNA,terminase,plate,transposase,portal,holin,tail,capsid | attL 4886359:4886382|attR 4982357:4982380 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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