Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_018642 | Listeria monocytogenes L312, complete genome | 2 crisprs | DinG,cas3,WYL,casR,DEDDh,RT,csa3 | 0 | 0 | 4 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_018642_1 | 501262-501690 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_018642_1
|
5 spacers
spacers of NC_018642_1
>1.1|501285|55|NC_018642|CRISPRCasFinder TGCGGTAACTACTATGTGGGATATGTTTAACAGCTGTAGGGCACTTGAGGAACTG >1.2|501363|55|NC_018642|CRISPRCasFinder TTCAGTAACTGATATGTATAGAGTGTTTAATGGCTGTGAAAAACTGAAGAAACTA >1.3|501441|55|NC_018642|CRISPRCasFinder TTCCGCTACTGCAATGGTTCAAATGTTTAGAAATTGTAGCGCCCTTGAGAAGTTG >1.4|501519|55|NC_018642|CRISPRCasFinder CTTAGTAACTGATATGCGTGCCATGTTTGCTGGTTGTACTAGTCTTGAAGCGTTA >1.5|501597|55|NC_018642|CRISPRCasFinder TTCAGTAACTAATATGGCTGCCATGTTTTCTGATAATGAAAAACTGGAGAAGCTT >1.6|501301|39|NC_018642|CRT TGGGATATGTTTAACAGCTGTAGGGCACTTGAGGAACTG >1.7|501379|39|NC_018642|CRT TATAGAGTGTTTAATGGCTGTGAAAAACTGAAGAAACTA >1.8|501457|39|NC_018642|CRT GTTCAAATGTTTAGAAATTGTAGCGCCCTTGAGAAGTTG >1.9|501535|39|NC_018642|CRT CGTGCCATGTTTGCTGGTTGTACTAGTCTTGAAGCGTTA >1.10|501613|39|NC_018642|CRT GCTGCCATGTTTTCTGATAATGAAAAACTGGAGAAGCTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018642_1
The CRISPR arrays of NC_018642_1 >merge|NC_018642|1|501262-501690|CRISPRCasFinder,CRT GATTTGAGTGGTCTTGATACTAGTGCGGTAACTACTATGTGGGATATGTTTAACAGCTGTAGGGCACTTGAGGAACTGGATGTAAGTCATTTTGATACGAGTTCAGTAACTGATATGTATAGAGTGTTTAATGGCTGTGAAAAACTGAAGAAACTAGATGTAAGTAATTTCGATACCAGTTCCGCTACTGCAATGGTTCAAATGTTTAGAAATTGTAGCGCCCTTGAGAAGTTGGATGTAAGTAATTTTAATACGAGCTTAGTAACTGATATGCGTGCCATGTTTGCTGGTTGTACTAGTCTTGAAGCGTTAGATGTAAGTAATTTTGATACGAGTTCAGTAACTAATATGGCTGCCATGTTTTCTGATAATGAAAAACTGGAGAAGCTTGATTTAAGTACCTTTGATACCAGTTCAGTGACTAACATG >NC_018642|1|1|501262-501674|CRISPRCasFinder GATTTGAGTGGTCTTGATACTAG TGCGGTAACTACTATGTGGGATATGTTTAACAGCTGTAGGGCACTTGAGGAACTG GATGTAAGTCATTTTGATACGAG TTCAGTAACTGATATGTATAGAGTGTTTAATGGCTGTGAAAAACTGAAGAAACTA GATGTAAGTAATTTCGATACCAG TTCCGCTACTGCAATGGTTCAAATGTTTAGAAATTGTAGCGCCCTTGAGAAGTTG GATGTAAGTAATTTTAATACGAG CTTAGTAACTGATATGCGTGCCATGTTTGCTGGTTGTACTAGTCTTGAAGCGTTA GATGTAAGTAATTTTGATACGAG TTCAGTAACTAATATGGCTGCCATGTTTTCTGATAATGAAAAACTGGAGAAGCTT GATTTAAGTACCTTTGATACCAG >NC_018642|1|1|501262-501690|CRT GATTTGAGTGGTCTTGATACTAGTGCGGTAACTACTATG TGGGATATGTTTAACAGCTGTAGGGCACTTGAGGAACTG GATGTAAGTCATTTTGATACGAGTTCAGTAACTGATATG TATAGAGTGTTTAATGGCTGTGAAAAACTGAAGAAACTA GATGTAAGTAATTTCGATACCAGTTCCGCTACTGCAATG GTTCAAATGTTTAGAAATTGTAGCGCCCTTGAGAAGTTG GATGTAAGTAATTTTAATACGAGCTTAGTAACTGATATG CGTGCCATGTTTGCTGGTTGTACTAGTCTTGAAGCGTTA GATGTAAGTAATTTTGATACGAGTTCAGTAACTAATATG GCTGCCATGTTTTCTGATAATGAAAAACTGGAGAAGCTT GATTTAAGTACCTTTGATACCAGTTCAGTGACTAACATG
>NC_018642.1|WP_014952534.1|498387_500469_+|BspA-family-leucine-rich-repeat-surface-protein MKKFSMRVVLIISVLFIALGNANVSIAQERDTTNKLPEEELGSLDTSNLIAEEVAQEKPAEVENLEEIPTTDELMQNPDVREQSVADSDDPDLTAVSSGDYWTIYYNSANDEYSLRMFGNVPSSKPSAWNSYLKYIKHIEIEEATLTGDFSSYFRSNVFTVLESVRIERSNLSGVTSFARAFEGDSESESPLEKVIIRDNYYPETPSLTNISRMFTLCRKLSELDVSGLNTSSVTKMDTIFSNANSLKELDVSHFDTSSVTDMSSMFAACNSLEELDVSNFDTSSVTNMKYMLSGLHLKKLDVSNFDTSSVTNMYGMFAYCYNLEELDVSNFDTSSVNNMLHMFYVCNNLEELDLSNFDTSSVTNMFAMFAYCTSLKEIDVSNFDTSSVTTMSAMFFECSSLEALDLSNFDTSSVTTMASMFENSTALKSLYLDNFTDAASMTDMFKGTTSLTYLFVSHNLSTFNRLENTSWYDEKNWVQFSNLSQLQTYHRKQSEPTGYRKGAFLSLTMDAMGGEFEDAEEQKVQNKVSGEYWEEIVPVKEDYYFDGWYLDQNFTNKFDFSLPAAVSTTIYAKWVENYTVIIPASISLNEATELKVEGINRGSKALSVGLNRLATSVSESNELTLANTADTTVQCSAPLSWDGSENNPEKAILTLAPGSEITEGDAVMAIEAPENIQAGKYTGNLVFSINYE >NC_018642.1|WP_003728090.1|496586_498125_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MREYLDSKSQKKVALLEKIFYAENHTSTQEELLNDLNITYPTLISTIKTINFDIERFGYKAFSIVHSAPNLSYTLKISDNCSIQLIINAYIRESPKFQILETLLLASFPNLQALAKKVHVSYSGIKKEIKELNEELSERNLYISTGNQVEITGDEFSLRIFYAFLFLVAYSGDRWPFSFVRYDEITDLLESCPKEIYRANSIDKAMMIHYYVAMHLLRDRMNCQIDTTRQFKVALYKACTEESKKSESAFIKKVAKQLPNRNYKEMTYTTQIILSTIVAFGSYSSIEKMPSFFYMDEQLEEMGFMKLVDFASERVNDNLSIPFSEKEMELLRYSFASINYRYFLLDNLINKFNNIVPGYTDLDRNIRKIHKVNHLEPLISQLVNLKEMDPLKPFEERLTSDYLIILDKRIDFSIHTLPIKVTILSTISNETAVFDFMRYFSSYYNLEIINQVDPVVDLYISDFSVSPEVLTSLRINQPIIYVNTRWLESDYVKINDNLAKIARKKFIANKKD >NC_018642.1|WP_003728092.1|494400_495951_+|hydantoinase/oxoprolinase-family-protein MYKIGIDVGGTNTDAVILDENQQLIHSVKMPTSEDIETGITESLHRVLSETGIDRSKVTHAMLGTTQCTNAIVERKKLAKVGVLRLGYPATASVLPYTAWPEDMVGFLSGKYKLTGGGYEYDGQVLSEINEAEIRETLASWKGEVESVAVVGVFSSLKNDQELAVQKIIEEELGADIPVSISSSVGSVGLIERENATILNAALFKVIAATSDGFEKALEQEGIAHAEIYLCQNDGTLMSLNYARQFPILTIACGPTNSIRGASYLAGLKDAMVLDVGGTTSDIGVLTDGFPRESSLAVDVGGVRTNFRMPDIISIGLGGGSIVREKDGDITIGPDSVGYRISEEALVFGGKTMTTTDIAVRLGRAEIGNPELVAHIPTDFAEKAYKKIAEMTEDAIDKMKTSSGSVSLVLVGGGSVIIPDEISGVAQIFRDKNGPVANAIGASISQISGQYEQIYIYSQIEREEALQDAEQKAREQATLAGAVTDSIEVVEVEEIPLAYHPGNATRLRVKVVGNLV >NC_018642.1|WP_003728093.1|493307_494408_+|DUF917-domain-containing-protein MRYLDEQAIENIAIGAAFLGTGGGGDPYIGKMMALTAIKKHGPIKLLSPEEIADDDYFIPAAMMGAPSVLIEKFPKGDEFVRVFEKLGRYVGKEVKGTFPMEAGGVNSMIPIVVAAQLGLPMVDCDGMGRAFPELQMVTFHLDGISATPMAITDEKGNIGIMETIDNKWTERLARVTTVEMGASSLVSLYPCNGAQIKQSSIKNIVTLSEEIGKVIRETSMDEAEKLQKLLDVTHGYHLFEGKITDVVRETRAGFNFGRVKIDGLNKDTGSEVIVHFQNENLVAEKNGEPIAITPDLICMVDLETLMPVTTEALKYGKRVRVMALPADDAWRTDKGIETVGPRYFGYDVDFEPLEELVKKEERRHV >NC_018642.1|WP_003728992.1|492023_493307_+|cytosine-permease MTEKKSVEQTQSWQSLAFVWTGAMICVPSLLVGGTLISGMPLWEAILIALLGYGVIVLFMIYQGMQSSDLGIPAVSVASQVFGEQGSKKIISILLAIACLGWFGIQANVCGAAFSQFLGIYGINLPVPVSSLIWGVIMLLSAIYGIRILSILNYIAVPVLLFVCIYGLVVSLNDGGLAIVENYKPAGSMSFMTGLAITIGSFALGAVIAGDYSQYTKSRKDVVKAAIVGILPSGVLMITVGAVLALTAGTADISVVFTNLGLPVLGIIGLILAAWTTNAVNAFSGGIAIINVFNISEKYHKVAVAVAGGLGTILAVIGILNHFVPIMSVLSAMVPPVAGVMIASYWIVQKGDKSKWAPVSGVNWLGVSSWLVGAVIAGIPVILTFFPELPQLPNQPLIGIILSLAVYLIGAKVLSGKTNNVENLEGK >NC_018642.1|WP_003740428.1|490294_491890_+|PucR-family-transcriptional-regulator MSVKLADLMKLPSLKEAKVVSGKSGLSKLVSSISVLEYTEVALLEDDLFDNDEFYGSEIVVSAFVNIRDDVEAQCRTIERLHKVGEVALILYYVGIFVPKMDQKLIDFANELDFTIIVMPENEMSLRYSEVIYEVVEAIVKQEMTDTNFVTESLEQISSVRPPQRNIDTTLKILSDRTHTSLVLTDNSFQVINSITWPRTRHWDFERIIEASKQIGEHELVQLTLDERDFYTARKPIFQDGMQAMHLFMMKEKGVLTADVVMQITEVVQVFMNLWGRNYVEISTAELMKAILNDESVKMRRLGKILNVDVSSIKWMWLVKTEEIRDNEQVLAELKSFVASHFQVSLIDLFEDNIVVLLDNSVAQRDRTHTANEFAMMMKEHGIDLKITVCQGMEQTSDVQSAYSLVNEYKNAANAIYANKSIYSLQEIDFAAKCVEIVDRGELAIAEQMRPLKPLEDNDELIETLSVFLLEGESNYNQAAELLFLHKNTIKYRIQRINELLQYPATKIPESYNLYLAVAIRRILGGNNNNK >NC_018642.1|WP_003721242.1|489191_490139_-|MoxR-family-ATPase MSIEPSIKIEEIINEVEKVIVGKRHVVKLSLTALLAGGHVLLEDVPGVGKTMMVRTLSKTIGVSFKRIQFTPDLLPADVTGVSIFNPETRDFEFRPGPVMGNIVLADEINRTAPRTQAALLEGMAENSVTVDGITRKLANPFFVMATQNPIEYEGTYALPEAQLDRFLLKINIGYPTVEEEMQLLTLKQYQDPLDQTQQVVTLSELLDLKNKAKQVFIDDVLKNYIIRLVDATRKHPSVALGISPRGSLAFMQAAQAFALIEGRDYVIPDDIQYLAPYIFTHRLILKSEAYYNEETAESIIASILKNTSVPVEKR >NC_018642.1|WP_003734634.1|488038_489187_-|DUF58-domain-containing-protein 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MKRYLTLVMLFILSVLLISEWIYPFAELTELSTANWIILFITLSLGSFFLRLKYYWTIPLHIVMIIFVSGIYYAKGGILAGNWFVSFFQITFNGFRDMVQFRSSDISMDFILIVFLIALWLLSYITTYSILRKQRVMSVLVLTVAYLAVINTFTDYNSNWAIVRTVLEGFLLLHLALASRIAAPNRISADSLKRNGLFYHIFVILLLAVFVFSSLMLPKKAPIFPDPVPTIKNALGINTTRTVGYSEDDTTLGGALKKDNATVFTARAEKGHYWRVESKTVYTGTGWANANSADVISFSSGDNFPIQLTEQTTGATNTAEISFASSNDYMPYPYGTQTVNGAVDSFSANLTIERVGPVDTIKNYTVQLKTPVYNIEKMQNADFSTLSNAFVSQYTQTPKDLPDRVTKLANKVTKDADSIYDKTKAIERYLSASGTFTYSTEDAKETPRGADYVDQFLFETQIGYCDNFSTSMVVMLRSLGIPARWAKGYTPGEGEKKENDAKTTYTITNNNAHSWPEVFFPGTGWVPFEPTATFSNPENFQEPTTETANKPETPNDSTSTPETPNTADKTPEQDNGSSSTGETPKKEEPKTETAASNFEIPSWVWWIPAGLVVTLLALAIIFRRRIRRYLLLRSLRNSPEFGKTYHRLMKLLASYGYVRESSETLRHFSTRVDAELTTTEFSRLTKMYEAQIYSNNLTEKVITAEETQLVQQVIARLTK >NC_018642.1|WP_003734632.1|485010_485766_-|DUF4866-family-protein MTTIFPKEQNVAPLFEQILANPTACRRFKDVFLDNLESYQETRGFEKDDTLFAKIILSAYRQSDVSALLLGVCGRTLFELLRQAFLIPKKLTVDNPFFLTDKEGNFIAKKDDISNREQEKFQEIYQSDLHHSETTIFLVDDDDIIHSYEPDFSISTKRINKKRGILVLYSLPDTLKLGMTESEVYAFIWKTFLHIQEIIPSSRIFYGQETSENADELGVFLPIHHFEKKMLQNIEQVNELVDALREQMVNK >NC_018642.1|WP_012681107.1|502652_504413_+|BspA-family-leucine-rich-repeat-surface-protein MKKFSMRVVLIISVLFIAFGSANVSIAQERDTTNKLPEEELGSLDTSNIIAEEVAQEKPAEVEQLEEIPTTDELMQNPDVLEKSVADSDDPDLTVVSSGDFWTIYRNTVNNEYNLRMFGNVPSSRPTAWNSYLKSIKHIEIEEATLTGSFASYFRGTDFPVLESVRIEQCNLSGVTSFEMAFYNSGIEKVIIRDNDYPKAPSLLTATQYMFSLCRNLSELDLSGLDTSAVTNMYAMFQNCTSLEELDLSNFDTSSATNMYSMFSGCRSLEKLDVSNFDTSSVAHMQFMFEKCSILEELDLSNFDTSSVTNMSYMFQLCPALKSLYLDNFTDAAIMTGMFAGTTSLTYLFVSHNLSTFNNLENTSWYDEKNWVQFSNLSQLQTYHRQQSEPIGYRKGAFLSLTMDAMGGEFEDAEEQKVQNKISGEYWEEVIPVKEGHYFDGWYLDQNFTNKFDFSLPAAVSTTIYAKWVENYTVIIPASISLNEASELKVQGINRGSKTLSVGLNYEETTISESNKLTLSNTADTTVRCLAPMSWDGSETNPEKAILTLAPGSEITEGDAVMEIKSPENIQAGKYTGNVVFSIKYE >NC_018642.1|WP_003728455.1|504478_504952_+|hypothetical-protein 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>NC_018642.1|WP_003734773.1|507792_508140_+|hypothetical-protein MQKDTYSGIRLSVIQLIDSKKENLKENNIKLTIIKDEKDGYVVELDNDKCMAEIVVEEPTYAPYRYISFEVVSLMDGKVKIIYSWYDDETSQWSDIEKELNKGIQFLNNFKTMEQ >NC_018642.1|WP_003734774.1|508543_508786_+|hypothetical-protein MKRIILTSTLIVWTIVCIYMSISMVSNNTGIAFPIWLHIILLICFLATGIVNVKKKEYLWSTMLFEGVLVVLLSLIIVLV >NC_018642.1|WP_012681109.1|508868_509846_-|HD-domain-containing-protein MKITDPLYGTFEIEPVLAELIQSPLVSRLAYVHQGGSSYLVNPLWDLSRLDHSIGVMLFIRKFGGSLEEQIAGLLHDVSHTAFSHVVDYALDFEEEDYHEQIFEDFVKTSTIPAILEKYGYSFEGIFDDISKWKILEQEAPELCADRIDYTLQDLYRHGKISLAEVEEFLQALVMVDGRLYLANIALAEWFVAQYYSEVIDYFYDPLNVYSYEILAEAMRIAFQQETITTADLRLTDTELLAKLNANSDAREKIQLLASAHLEENEADFTYHHKKKMRLINPSILVDGRLIPADELSENVREMNDWASERSKHGIYIKATKKSKQ >NC_018642.1|WP_012681110.1|510607_511435_+|hypothetical-protein MKKRLIGIITALLLVSGILLSPQMAQAETKVDYDALYQQGVSEGIINKADVSLETWIKENESEYNQVYQDGLKDGVYDASLSYEEWIKLNNYGQPPVVDENWEEVPQKPMLKGVYKGYNIKKGDILITNGTSSSGLLGHAAIANGNEYILDIPGAGKTTRQVPTSKWMSDYDPEGWVKVYRLKDSSVANAAANWADKNYYSTKGTSKQNIFPKYGMTGSRYSKNPTYCSKIVLQAYYFGTGNKPVVQVFPSLVTVYDLPNYFSKAYKPQQVKYFK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_018642_2 | 2104310-2104597 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_018642_2
|
3 spacers
spacers of NC_018642_2
>2.1|2104364|24|NC_018642|PILER-CR CTCTACAGGAACTAAACAAGGCTG >2.2|2104442|33|NC_018642|PILER-CR CTTTAAGACTGGTACTATTAACAAACATGCCTC >2.3|2104529|24|NC_018642|PILER-CR CTTTACAATCCCTAAACATATGAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018642_2
The CRISPR arrays of NC_018642_2 >merge|NC_018642|2|2104310-2104597|PILER-CR ACATAGTAGTAACGGAACTCGTATCAAAATTGCTTACATCCAATTTCTCAAGTGCTCTACAGGAACTAAACAAGGCTGACATATTAGTAACGGAACTCGTATCAAAATTACTTACATCTAATTCTTTAAGACTGGTACTATTAACAAACATGCCTCCCATATTAGTAACGGAACTCGTATCAAAATTACTTACATCCAATTTTTCAAGTGCTTTACAATCCCTAAACATATGATACATATCATTCACAGAACTCGTATCAAAATTACTTACATTCAATTTCTCAAGTG >NC_018642|2|1|2104310-2104597|PILER-CR ACATAGTAGTAACGGAACTCGTATCAAAATTGCTTACATCCAATTTCTCAAGTG CTCTACAGGAACTAAACAAGGCTG ACATATTAGTAACGGAACTCGTATCAAAATTACTTACATCTAATTCTTTAAGAC TGGTACTATTAACAAACATGCCTCCCATATTAG TAACGGAACTCGTATCAAAATTACTTACATCCAATTTTTCAAGTGCTTTACAAT CCCTAAACATATGATACATATCAT TCACAGAACTCGTATCAAAATTACTTACATTCAATTTCTCAAGTG
>NC_018642.1|WP_014952579.1|2100962_2103113_-|BspA-family-leucine-rich-repeat-surface-protein MKKFSMRVVLIISVLFITFGSANVSTAQERDTANKLPEVELGSLDTSNIIAEEVTQEKPAEVEQLEEIPTTDELMQNPNVLEKSVADSDDPDLTVVSSGAYWTIYYNSANGEYSLRMFGNVPSSKPTAWNSYLSNIKHIEIEEATLTGSFEAYFRDNVFTVLESVRIEQCNLSGVTSFRSAFEGQLALEKVIIRDNYYPTTPTLRTTENMFLGCYNLREFDVSGLDTRAVTNMRAMFQNCTSLEELDVSNFDTSSVTTMQNMFQNCTSLEELDVSNFDTSSVTTMQNMFQNCTSLEELDVSNFDTRSVTSMAYMFYRSAGLKELDVSNFNTSSVTAIQGMFYDCSSLEELDVSNFDTRSVTSMTFMFLNCANLEELDVSNFNTRSVTSMTYMFGGCTSLKELDLSNFNTSSVTAMYNMFQNSTSLEELDLSNFNTSSVTNMSYMFQNCTALKSLYLDNFTTPKTMTDMFIGTTSLTYLFVSHNFKDFNGVENTNWFDEKNGVQFSNLSQLQTYHQQQREPTGYRKGVFLSLTMDAMGGQFEDAEEQKVQNKVSGEYWEEVVPVKEGHYFDGWYLDRNFTNKFDFSLPVAVSTTIYAKWVENYTVVIPASISLNEATELKVEGINRGSKTLSVGLNYEETTISESNKLTLANTADTTVQCLAPLSWDGSETNPEKVILTLAPGSEITEGDAVMAIEAPENIQAGTYTGNLVFSINYE >NC_018642.1|WP_014952578.1|2098989_2100828_-|BspA-family-leucine-rich-repeat-surface-protein 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MKKFSMRVVLIISVLFIAFGSANVSIAQEMDTTNKLPEEELGSLYTSNLITEEVAQDKPAEVEQLEEIPTTDELMQNPDVLEQPVADSDDPDLTVVSSGAYWTIYRNTVNGEYSLHMFGNVPSSRPTAWNSYLKSIKHIEIEEATLTGNFASYFDNSAFPALESVRIEQCNLSGVTSFASAFYSSGIEKVIIRDNDYPTAPSLLTTQSMFGYANKLTELDVSGLDTSAVTNMQNMFQYCRALEELDVSHFDTSSVTTMRGMFQYCELLDKLDVSNWDTSSVTTMMSAFAECNSLEILDVSNFDTSSVTDMTAMFQNCYALEKLNISNFDTSSVTKMYAMFSGLYEVGKLDASNFDTSLVTTMNRMFQNCKSLKELDIGNFNTSLVTDMDRMFINCAALKSLYLDNFTTAKTMTDMFTGTTSLTYLFVSHNLSTFTGLENTSWYDEKNWVQFSNLSQLQTYHRKQSEPTGYRKGEFLSLTMDAMGGEFEDAEEQKVQSKISGEYWEEVIPVKEGHYFDGWYLDQNFTNKFDFSLPAAVSTTIYAKWIENYTVIIPASISLNETSELKVEGINRGDKNLSVGLNRTATSISESNKLTLSNTADATVQCLVPLSWDGSENNPENAILTLAPGSEITEGDAVMEIKSPENIQAGKYTGNVVFSIKYD >NC_018642.1|WP_003725196.1|2096323_2096797_-|hypothetical-protein MKKKRVVIISLLLLLVSVIGISSYFLFKDKINLLDVDHSAVDWNGKKQKDTSGEENTIAIPGFEKVTLYANETTQAVNFHNPEINDCYFKISLIHPDGSVLWISDLIEPGKGMYSIELEKTLAVGEYENAVLKYECFSLNDQSPLNGSEINLKLVVV >NC_018642.1|WP_003721253.1|2095818_2096304_-|hypothetical-protein 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>NC_018642.1|WP_003725773.1|2092878_2093724_+|carboxylating-nicotinate-nucleotide-diphosphorylase MNSILMNQAIQAFLLEDIGQHDLSAETVFPRDTMGEGVFLAKETGILCGISIPPKVYELLGGNIQFEAYKKDGDWIQKGDIIAAVTAPVRTLLSGERVILNLMQRMSGIASQTNFAVKQLDDSAIRICDTRKTAPGLRAFDKYAVQTGGGFNHRNGLYDGVMLKDNHIAFSGGITSAVSTVREKLGHMVKIEVETETAEQVKEAVQAGADIIMFDNRTPEEIKQLVKLVPPHITTEISGNVTLENIHRYKGSGANYLSLGSLTHSVRAFDISFNSKGGIKA >NC_018642.1|WP_003730798.1|2091427_2092882_+|L-aspartate-oxidase MTKERVIIIGSGIAGCTAAFRLMHDYDVTIITKGLKEESNSMLAQGGVAAAVSKNDTPKKHFSDTFQAGCFHNKVLAVNQLVTNGPIVIQKLIAEGMTFDEQNGELSLGLEGAHQLPRILHTGGDQTGKFLTTFLQEKLTNIHWQEQKMAIEIIKQNDSAIGVHCLDKENRLHTYYGEHIILASGGLGQLFPVTTNAATISGDGLALAYRAGAKLTDMEFIQFHPTLLFLNGRCHGLISEAVRGEGAKLIRADGSAVMTDVHPRADLAPRDIVAATLFAEIQDGNEVFLDITPIPNFEERFPGITANLDAYHVPFRETKRIPVHPGAHFLMGGIRTDLQGKTNIPGLYAIGEVANAGVHGANRLASNSLLETLVFGEKVAEYILTQKTNLIDHPEIPLSNQTQTPHLPDKQLLQEKIWETLGITRKPEKITEFLHWLTDFDYANHTRETAEISHMLITAKLIAESALKRTESLGAHRILKGVIK 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
123377 : 129904
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_018642|123377:129904|DBSCAN-SWA TTCAAAACTTCTTGTAAACATCAATGGAATTGCCAAAATTAATGAAATATCCACCATAATCATACATCGGACCATATTTTTCTGCGTAATGAGTAACTGTATGGCGCAAAAATTCTTCTGTTACCTCTAAAAACTCCGCTACTTCAAAATATTCTCGTAAGCCTAGATAAAAACAAGCAATGATGTCATCAAGCGGTATTAGTTCCTCATAACCTTTACGACGAGCAAAAATTTCTTGTTTTTTATCCATAATTGTTTCCTGTTTAGTGATGTTACCTACAGTGTATTTGTAATGCATCAATTCTTCTACTAAAACACAGCCTTTTTCAATGGAAGATTGATCCTTACTAATAAAAATCGTCCCATTTAAATAAAGACCTGGCAATTTGTAAGGCATTTTTTCTTCTCTGATTGTTACCTCATCTTGGTATTTATTTACCAATTTTTCGTACAATAAAATCACATCCCGCGATGGAGTTTTTTCTTCATCTCTATATAAGCTAAAATATCCCGCATTTCTTCCTCGGTTACGTCATCATCAATATGGGCTGCAATTGTTACCAAGCGTTCATCAACAGGTGGTAAATTTCTTTCAGGAAAAAAGTCATCTAATCGTTTGTTGAAAATTTTTGCAAGTTCAAATAAAACGTCTTGATTTGCTTTTCGATCACCATTTTCATAACGGCTAATAGTTTGGCGAGTTGTATGAAGCTTTTCTGCTAATGCTTCTTGATTTAAGCCTCGTTCCTCGCGATATTGTTTTATTTTATTTCCTACAAATTTATTTAACTCCATAATAATTGCCCTCCACATGTTTATGGCTTCAGTATAGCACTTTTAGCACCAAAACGGAACTTTTTCGAACATATTTGTCGGATAAAGTTTACCAGTAACCAAAATGGTGCTATAATATTTATAGAGCTAGAAAATAAATGCGGCTGATTTTGCGCCAATAGCACCGAATTGGTGACAATGTTACTATATTAATTTATGAGATGGAAGTGGGAATGGATGGATAGAAAACTTTTAAAAGAAAAGCAAATCCAACTAATTTTTCAACTAGAACAAGAAGAAAATCGATTTATTCGAAAGCGTTTAATAGAAGAGTTGGAGTTTTTTGAAGCGCTTGGGGACAGAGAAAAAGGACTGTTAACGGCGGAGCAAAAGTTGCTTATTTTAACACCAAGTGAGTACCGAGAATATAAACGAACTAAATCAGATGTGCAAATTAGTAGGTTAATTGGAGTATCGAGATCGTCTCTTGCGGAATGGAAGCGAAAAAAAGGTTTAAATAGAAAAAAGCCGCAACCGGTTCAGCAGGAAATGATTGATGTATTAGCTTTTCATTTAGATAAAACAAAAGACGAAATTGGCGCTTTACCTGCTTCGGCGATTGAATGTCAGTATGAGGCTTTTGTGATTAATGAAGCGCACAATTAAGGAGTGATAACATGCAGGTTTTAGTTTTACCAGAAAATAAGGATATCAATTATATAAAAACGGTCCAAGAAGTAAAACGATTTTTTGCTGATTTTGAGCGGTTTCGGATGATTACGGGGTTATCAAAAAAGCCACAGTTACTTAGAAATGGTTTTCTGGAAGAGCCGCAGTTTGCGCCGGTAGCATTTTCTGCTAGACATAATAAAGAGGTCATTTTGGAAGCGCGATGGTTGGTAGAGAAATATACTGAAATGTTAAATCAGATGGATGATTTATATCGCACTATTTTGATGGAATGTTACGTGGAACGAAAACAAGATGTGGCGGTAATGATGGATTTACCGTACGAAATTGCCCAGTTTAAACGGATAAAAAAACGAGCAGTATTAGAAATCGCAACGCTAATGGGAATTTTAGTAAGGAAATGATGATACTTTCGTGATATTTTGAAACGTCATTTTACGATTAATATAGAAGTAAGCTAATTGTCTAGTAAGCGGATGACGATAAAACCTGCATCAGAATGAAGGTGCACCGATTTTCTGATAATACAAGAGGTTGTACAAGAAATTTGTTTTTATGATTATATTTTTCATCCGTTGACATAAACAAATATTCTATTTTGGAAAGTAAAGTTCGGAGGAATAAATTATCAAATGTGGTCTCGACCGAATTTTACTTTCTGTTTTTAAAGGAGTGAACGCTTGGTGAAGAGTTTAAGCTTCATGAGAGTTTTGGAAGCAGTGAGAACAATGCTCCAGGAAAAAGGCGGACTAGATGTTTCTATTGTAATGCGTGACCAAGTGGAAATGCCTACAACGATGATCGAGATGATTGATCAAGAGGAAGAAGAAAGCCAAACTGCCTGGAAAGAAAAATACCGTTTTGCAATCCATCATTATACAAATGAAACGGACTTAGCGGGAGTCGAAATGATAGATACGCTTATCCAAACAGGGTTCACTTTGCCTGAAGGATACAAATTAATCGCTGTTCGACATTACGGAAAACAAAATTTAGTCAAAGAAAATACGTTAATTCACGCAAAAACCAGTTTTGAAGTAAGTATTTGTCGTGAATTAAAAGTAAAAATTTAGGGGGAAATATTAATGGCATTTGAAGAGAATTTATATTGTGATTATACACCGGGAGCTGCTAAAGCGGTCGCGGGGAAAGATGTAATTTTAGCAGTTTTTAACGCAGCGGGGGATAAGCTATTAGCGGTTGCGGGGCAACAAGGTCTAACTGTAAACCGTTCTAAAGATAGCATTGAAATTACATCTAAAGATACAGTTGGCGGATGGAAATCCAAAATTGGCGGTATGAAAGAATGGTCAATTGAAAATGACGGATTATATGTCGCTGATGCAGAGTCTCACAAAGAATTGGCGAAATATTTCGAAAGTGATAGCCCGGTTTGCGTGAAAATCATTAATCAAGCATCTAAAAAAGGTCTTTTCGGTGGTTTGGCAATTGTAGCTGACTATAGTTTTGAAGCACCTTTTGATGAAGCGATGACTTACTCTGTAAAACTAGACGGAATGGGTGCGCTTGTTGATTTAACGATTACTGAGGGCGGAGATCAAATGCCCGGCGAAACACCTGTAGCACCAGCAGAATAAAATAGAGAGCCACTGAAATAAGTGGCTTTCCCTTAGGAGGAAAATAAATGTTTGAAGTGAATGATACAACTTATATTTTACGATTTAATAAACAAAAAGTTAAAACGGTGGAATTAACATCAGGGATTAGTTTAGTTGCAGCTTTGACTGCGAATAAAGGGATTTTGAGCTACCAAGTGATTGAAACGCTATTTGTTTCAGGACTTGTGGAAGAAAAAGGCTTAGTACCTGTAAAACAAAAAGAAGCTTTGGAGATTTTCGACAAATTAGTAGAAGAACAAGGCTTAATTTCGCTTAATGTAGCTGTTATTGAGAAATTGCAAGAGGATATGGGTTTTTTGTTCCGTTAAAACAGATTGAATTTGAGTATTTTGGTGCTGAGGACGAAGAAGTGGATAGTGAAATGAACCATGATTTTGATTTGGAAAAACAATTCGCTTTTTTTGTAGTTAATTTTCAGATGTCCAAGCATGATTTTGAAGAACTTACTGAAGTGGAGAAAAATTTCATCATGAAAGAATGGGAAAACAAGGTGATTTTTGAATCTACTATGCTTCGAAATGCAGTTTTAAATGCGGAACAAAATCTCAATCGAAAACGAAATTCACGTTTTATCGACTTGCATAAAAAACGTCAGAAGAAAGCCGATGTTAATTATACAGTAAATGCACTTCAAGCAATTTCCGATAATGAAGCGAAGGAAGGTAAAGCGTGGATTGATCGGATTTATGGTGCAAATGGGTTACGAAGACCTAAGAATAAAGAAGAAAGGGGGAAAGTGAATGGCGGATTCTAAAAGTTTTACATTTGAACTGAACGAGAGCGTTTTAACAGCGCAAGTTGGCAGGCTAGATGAGATGGCGATGGTTGTAGAGCGGCGGTTTTCAGAGCTCAAAATGACTATTGAAGATGTTGGAAATGCTGATCCAGGTTCGAAAATTTCCGAATCTTTAGGTGGGCTGCAGTCTGGGCTTGGCACGATTAGTTCGGCGTTTGGACAACTGGGTTCTAGTAGTGAGGCGATTACATCCGGATTCGGTACTGCGGTTGGTTCTGTTGGTGGAATCACGGATGCGTTTAAAAATCTAGGTTCAAGTGTGCAAAATGGTACGTTATTTTCAAGCTTGGCAACCGGGATTGGTGGCATGAGTACAATGCTTGGTGGAGTATCTGGCGGCGTTCAAGGAATTACAAATCTAGCTAGTGGATTTATGGAATTGAAGAAGCATCTAGGCGGTTTGATGTCATCTATTGGTGGCGTTGGTGGAATTATGGGTAAACTGACCTCTCCAATGGGGTTAGTAATTATCGGGATTGTAGCGTTAGTAGCTGCATTTGCGTATTTGATGACGACGAATGAATCATTCCGAAATACGGTGATGTCAGTTGTAACACAGGTTGCGCAACTGTTCGGTCAACTTGTCGCCAGTTTAATGCCGATTATCATGCAAATTGTTACTGCGGTTATGCAAATTGGTGCCGCGTTAATGCCGATGGTTATGCAATTTATTAGCTTTTTTGCGCAATTGTTAGCCCAATTAATGCCGTTTATTAATATGCTGATTTCCATGCTTATGCCTGTTATTATGCAGATTGTTCAAGTTGTTATGTCACTTGTTTCGGCACTATTACCGAGCATCATGACAGTGATTCAAGGCATTATGAGCGTTATTCAATTTTTAATTCCGATAATCATGCAAATTGCGACGGTGGTTGTACAAATTGTTGTAACGATTATTTCTTATATAAGTAAAATTATGCCGATTGTTATGACGATTATTGGCGTTATTGTTTCGATTATCACAACGATTATTAGTTACGTCGTTATTATTGCGACGACGATTGCTAGTGTTATTGGGAAAATTATTAGCTTTATTGCGAGTGTTATTACGGCGGTTATCGGGATTGTGCAACCAATTATTGGCTTTATTACTAATA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_018642|123377:129904|124827_125244_+|WP_003724947.1|DBSCAN-SWA MQVLVLPENKDINYIKTVQEVKRFFADFERFRMITGLSKKPQLLRNGFLEEPQFAPVAFSARHNKEVILEARWLVEKYTEMLNQMDDLYRTILMECYVERKQDVAVMMDLPYEIAQFKRIKKRAVLEIATLMGILVRK >NC_018642|123377:129904|125925_126438_+|WP_003721744.1|tail|DBSCAN-SWA MAFEENLYCDYTPGAAKAVAGKDVILAVFNAAGDKLLAVAGQQGLTVNRSKDSIEITSKDTVGGWKSKIGGMKEWSIENDGLYVADAESHKELAKYFESDSPVCVKIINQASKKGLFGGLAIVADYSFEAPFDEAMTYSVKLDGMGALVDLTITEGGDQMPGETPVAPAE >NC_018642|123377:129904|129085_129904_+|WP_003724951.1|tail|DBSCAN-SWA MSDLFLELNGKVHSLSETFPGLSVQEVSRQSPQLSMETAEIAGTDGVIPGMTQFKPFIFSAKCNLQALDIPDYHLAVREIYEFLFQRDSYYIWSDQMPGIRYEVHPKPVDFSRESDRVGLLTIEFDVFKGYAESRGTSLDPMTFEVDLWQMGMNLSNRDDLFYIFKENTFRVYNAGSDRVNPLMRHELDIAMTANGTPTIHNLTTGESFEYRKALQKTDVLLLNNIYPLVNNRRVGKDTNHGIITLEKGWNDFEIKGVTDVTIAFNFPFIYR >NC_018642|123377:129904|126485_126788_+|WP_003721745.1|DBSCAN-SWA MFEVNDTTYILRFNKQKVKTVELTSGISLVAALTANKGILSYQVIETLFVSGLVEEKGLVPVKQKEALEIFDKLVEEQGLISLNVAVIEKLQEDMGFLFR >NC_018642|123377:129904|127220_129089_+|WP_003731178.1|DBSCAN-SWA MADSKSFTFELNESVLTAQVGRLDEMAMVVERRFSELKMTIEDVGNADPGSKISESLGGLQSGLGTISSAFGQLGSSSEAITSGFGTAVGSVGGITDAFKNLGSSVQNGTLFSSLATGIGGMSTMLGGVSGGVQGITNLASGFMELKKHLGGLMSSIGGVGGIMGKLTSPMGLVIIGIVALVAAFAYLMTTNESFRNTVMSVVTQVAQLFGQLVASLMPIIMQIVTAVMQIGAALMPMVMQFISFFAQLLAQLMPFINMLISMLMPVIMQIVQVVMSLVSALLPSIMTVIQGIMSVIQFLIPIIMQIATVVVQIVVTIISYISKIMPIVMTIIGVIVSIITTIISYVVIIATTIASVIGKIISFIASVITAVIGIVQPIIGFITNIFTTIVTIIGAAFQMVFTVASKIWNAIMTTISGIIEGIKAVITGISTTVSSVFNGVKRIITGVFDGIKSAWGGLTDFVGNIFDGVSSAIQTVVDNVKGFVNVVIRGINGAIGLINKIPGVEIGKIPQLISGTTNFQGGFARMNEGGRGEMVVLPSGSQVIPHDATMKYARESARGNKSMLYTSQGADLARVENLLERLLQKNPVIKMDDKVVAEVVSRNQANSFDQYNYTMGGAAYS >NC_018642|123377:129904|124387_124816_+|WP_003724946.1|DBSCAN-SWA MDRKLLKEKQIQLIFQLEQEENRFIRKRLIEELEFFEALGDREKGLLTAEQKLLILTPSEYREYKRTKSDVQISRLIGVSRSSLAEWKRKKGLNRKKPQPVQQEMIDVLAFHLDKTKDEIGALPASAIECQYEAFVINEAHN >NC_018642|123377:129904|123377_123830_-|WP_003728215.1|DBSCAN-SWA MYEKLVNKYQDEVTIREEKMPYKLPGLYLNGTIFISKDQSSIEKGCVLVEELMHYKYTVGNITKQETIMDKKQEIFARRKGYEELIPLDDIIACFYLGLREYFEVAEFLEVTEEFLRHTVTHYAEKYGPMYDYGGYFINFGNSIDVYKKF >NC_018642|123377:129904|125523_125913_+|WP_003728212.1|DBSCAN-SWA MKSLSFMRVLEAVRTMLQEKGGLDVSIVMRDQVEMPTTMIEMIDQEEEESQTAWKEKYRFAIHHYTNETDLAGVEMIDTLIQTGFTLPEGYKLIAVRHYGKQNLVKENTLIHAKTSFEVSICRELKVKI >NC_018642|123377:129904|126829_127234_+|WP_003740367.1|DBSCAN-SWA MDSEMNHDFDLEKQFAFFVVNFQMSKHDFEELTEVEKNFIMKEWENKVIFESTMLRNAVLNAEQNLNRKRNSRFIDLHKKRQKKADVNYTVNALQAISDNEAKEGKAWIDRIYGANGLRRPKNKEERGKVNGGF >NC_018642|123377:129904|123835_124171_-|WP_003721740.1|DBSCAN-SWA MELNKFVGNKIKQYREERGLNQEALAEKLHTTRQTISRYENGDRKANQDVLFELAKIFNKRLDDFFPERNLPPVDERLVTIAAHIDDDVTEEEMRDILAYIEMKKKLHRGM |
10 | Listeria_phage(33.33%) | tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1271743 : 1328595
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_018642|1271743:1328595|DBSCAN-SWA 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56 | Bacillus_virus(16.67%) | protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1824302 : 1832588
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_018642|1824302:1832588|DBSCAN-SWA ATTAATCGTTCCCTCCATTTTGAATTAATCCTCGAATCACTTTTGGATAAAAAATATGTTCTACTTGATGAATTTTTCCAGCTAAAGTATCTACAGTTTCCGCATGTTCAATCGGTACTTTCACTTGATCAATAATTGGTCCAGTATCCATTCCCGCATCCACAAAGTGCGCCGTGACACCAGTTTCTGAAACATTGGCTTGAATCGCTTGACCAATTGCATCTTTTCCTTTGAATTCAGGTAACAACGATGGGTGCAGGTTGACAATTTGCTCGGGAAATTCTGCTAATAAAGTCGGCCCAATCAAACGCATATATCCTGCTAGCACTAACAAATCAATTTCCAACCCGCGAAGTTCTAGTAAAATTTCTGTCTCAAAAGCTTCTTTATCCGGATAATTTTTCGCTTCAAAAAGGAACACCGGAATCTGATATGTGTTTGCGCGTTCTAAAACATAAGCATTTGGTTTATCACATACCAGTAGTTTCACATGAGGCTTAATAAACGCATCATCCACTAAAGCTTGAAAATTCGAACCGTTACCCGAAGCAAAAATGGCTATATTCATCCTTTTGTGCCTCCTGTGAAAATAACCGCATCATTTTCACGTGTCGTAACTTCTCCAATAACATAAGCCGCTTCCCCGTTTTGAACGAGTACTTCTAATGTTCTTTCCACATCCGCTTTCGCCACTGCCAACACCATACCAATGCCCATATTGAAAATTTCATACATTTCAAGTTCGCTCAATTGGCCGTATTTCTTCATAACGTCAAAAATCGGCAACACCGGCCACGAACCAAGCTCCACTTTGACAGCTAAATCATTTGTTAACATCCGCGGTAAATTCTCTACAAATCCGCCACCAGTCACATGCGTAATTCCGTGCACATCTACCTCTTTCAATACTTCTAAAACTGGCTTCACATAAATCCGTGTCGGTTTAAGTAGCTCTTCCACAAGCGGTACATCTAGTTCACTGATTTCCGCATCGAGTGTCAATTCGTTATCTTTAAAGAAAATTTTACGCACAAGGGAGTAACCATTACTATGAATTCCGCTTGATGGAATACCAATGAGTGTATCTCCTTCTTTGACTGCGCCTTCTGTAATTAGCTTCTGTTTCTCTACAGCCCCAACAGTAAAACCAGCTAAATCATAATCTTCCGCGCCGTACATATCAGGCATTTCAGCAGTTTCGCCGCCAATTAAAGCCGCACCAGCTTGTTCACAGCCGTCAGCCACGCCTTTAACAATTTGTTCCATTTTCACTGGATCTGTTTTTCCAGTAGCGATATAATCTAAGAAAAATAATGGCTCGGCGCCTTGAGCTAAAATGTCATTCACACACATTGCCACGCAGTCAATCCCGATGGTATCATGCTTATCTGCTTCAATTGCCAAAAGTAATTTTGTCCCAACACCATCCGTACCAGAAACAAGGACAGGTTCTTTTAAATGCAAACTACTTAAGTCAAACATTCCACCAAATGAACCAAGTGCCCCCATCGCGCCTAATCGCTCTGTTCTAGCCACATGTTTTTTGATACGTTCTACAACTTGATAGCCAGCTTCTACGTCCACGCCTGCTTTACTATATGCATTTTCTGCCATTCGATTTGTCACTCCTCATTATTTTTCTGCTTCTAAGCTCGCTAAATATTCCGCTTCATAATCATATAAAGGGGTTGGGTAATCGCCGTTGAAATAAGCCATACAAAGTCCCCCGTAAGGTTCGTTCGGATAAGGTCTGCCAATGGAATCTACTAAACCTTCTTCACTCAAATACTCTAAAGAATCAGCCCCAATAATCCGACAAATTTCATCAACAGAATAATTAGAAGCGATTAATTCATTTCGTGTTTGGATATCAATTCCATAAAAACAAGGATAAGCAAGTGGTGGAGAAGCGATTCTTACATGAACTTCCGCCGCTCCTGCTTCACGTAAAAGCTGGACAATGCGTTTACTTGTCGTCCCGCGAACAATCGAATCATCAATCATGACAACGCGTTTTCCTTCCACAACCCCGCGCACGGCAGAAAGTTTCATTCTAACGCCTTGTTCCCTAAGTTCTTGTGATGGCTGGATAAAAGTTCTTGCCACATATCTATTTTTGATGAGACCAAGTTCGTAAGGAAGACCAGCTTCCTCCGCATAACCAATCGCTGCAGAAATACTGGAATCTGGTACACCTGTAACCACATCTGCATCAATAAAAGCCTCTTTTGCTAATCTTTTCCCAGAACGTTTTCTTGCCGAGTGGACATTAACTCCAGCAATATTAGAGTCAGGTCGCGCAAAATAAATGTATTCCATACTGCAAATCGAATGCGTCACATTTTCCGTGAATTTTTCAATTCGAAGCCCGTCATCATTAATAATAATTAGTTCACCTGGCTCCACATCGCGAACAAACTCAGCGCCAACCGTTTCAAAGGCACATGTTTCCGAAGCAACTACGTAAGAATCACCAATGCGACCTATCGAAAGCGGTCTAAAACCATTCGGGTCAAGCGCCGCATACATCGTGTCTTCCGTCAGAAGCATGTACGCAAAGCCACCCTTAACCTTGTTCAAAGCAACTTTTAAATCTTCCACAAAATCACCTGTATGGCTACGTTTAATTAAATGCGCTAACACTTCTGTATCCGAACTCGTTTGAAAAATAGCGCCTTCTTCTTCTAGTTCACGGCGTAAACTTTTCGCATTAACCAAATTTCCATTATGCGCAAGTGCTAAAGAAGAACTATGAAAGTGAAATAAAAATGGTTGTACGTTTCCTAAGTTTTTTTGACCGGCTGTCGCATATCGAACGTGGCCAATGGCTGCTTTACCTTTTAAATCGTCTAGTTCACCATGTTTAAATACGTCTGCTAAAAGGCCGAGATTTCGGTGACCTTTTAGTGTTTCACCGTCTGTCGAAACAATTCCGGCACCTTCTTGACCGCGATGTTGTAAACTATGCAACCCATAATAGGTGATTTCCGCTGCATTAGGATGATCCCAAATACCAAAAATACCACATTCTTCGTTAAGTCCTTTTACTTCAGCAAGCATGGAATAGCCCCTTCCCAAATGGATCGTAATTCCGTTGTTTTCGCTGTAACTTGATCTTCCTTATGTTTCACACGAATCGTATCATCCTCGGTTACTACACCAAGGCGGTATACTTTTTCCAGTTCCATTAATTGCGCAAAAGCTGCTTCGTTTTCCGGTTTTACCGATACTAAGAAACGTGATTGCGATTCACTGAATAGTTGATTCAACTCAAACGGTACTTCTACATCCGCACCAAGCCCTGCTTTAAAAGTCGCTTCCGCAAGGGCAACACCAAATCCACCTTCTGCCAAATCGTGACTAGAAGCAACTAGACCTTCCTGAATCGCCGTTAGAAGTAATTGTTGGTATTTTTTCTCTGTCGTTAAATCTAATTCCGGCGCACGTCCGCTAATTTTCCCTTGTTGCAATTTTTGCAATTCCGAACCACTATATTCAGCTTTTGTTTCACCAATTAAGAAAATCACATCGCCACTATTTTTAAAATCTTGTGTCGTAATATGTGCCAAATCTTCTACTAAACCAACCATTCCAATGACTGGCGTTGGATAAATTCCGGTACCATCTGTTTCATTATAAAGCGATACATTACCAGAGATAACAGGCGTATCAAGTTCTAAACAAGCCGCACTAATACCATCAGCCGCTTTTTCAATTTCCCAAAAAATTTCTGGTTTTTCAGGATTTCCAAAGTTCAGTCCATCTGTAATCGCTAGTGGTTTCCCGCCAGAACAAACGATATTGCGCGCCGCTTCCGCAACCGCTATCGCTCCGCCTACTTCTGGATCAAGATACAAATAGCGTGAGTTACAATCAGTTGTCATGGCAATTGCCTTCTCGGTCCCACGCACACGAACAATCGCCGCATCTGAACCAGGTACAACAGCTGTATCCGTCCGAACTTGATAATCATATTGCTCATAAATATGGCGCTTACTAGCAATCGTTGGCTGAGCAAGCAGTTCCTTCCAAACACCGACCACATCTTCCATAACTGGCACAAACGATTCCTCTTCTTGGAAAGCTTGATAACGAGCTGGCTCTTTGGAAGGTTTATGATAAACTGGCGCATCTTCTGCAAGCGCATCTACAGGAACATTCGCAACTACTTCACCATGATGAATAATTTTGTACATTTTATCATCTGTTACTTGACCAATCACAACAGCCTCTAAACCATAACGTTCAAATAACGCTTGGATTTCTTCCACATGCCCTTTTTTCACACATAGAAGCATCCGTTCTTGCGATTCAGAAAGCAACATTTCATAAGGCGTCATATTTAGTTCTCGTTGCGGCACATCATCCATAATTAATTCTAGCCCAGCGCCCGCTTTTGAGGCCATTTCAGAACTTGAACTAACGAGACCTGCAGCCCCCATATCTTGAATTCCCACTAAAATATCCGAATGATCACGAATCACATCTAAACAAGCTTCAAGCAACAATTTCTCCATAAAAGGATCGCCAACCTGTACAGCAGAGCGTTGTTGTTCGCCTTCTTCACTAAACTCTACAGAAGCAAAAGTAGCACCATGAATCCCGTCACGACCAGTTTTAGCGCCAACATACATCACCGGATTACCAATTCCTTTTGCTTGCCCTTTTTGAATATCTTTCGCCTCGATTAAACCAACACACATTGCATTAACTAGCGGATTTTTTGTATAACAAGGATCAAATTGGATTTCGCCACCAACCGTTGGAATCCCAATGGAGTTACCGTATCCTGCGATTCCCGCAACGACTTCACTAACTAAGTATTTCGCATGGGGTGTATCTAACTCACCAAAACGAAGCGAGTTAAGCATTGCAATCGGTCTAGCTCCCATCGAGAACACATCACGGATAATCCCGCCGACCCCAGTCGCAGCCCCTTGATACGGCTCCACGTAGGATGGATGATTATGACTCTCCACTTTAAAAGCAACACCTAAACC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_018642|1824302:1832588|1827345_1829565_-|WP_003731570.1|DBSCAN-SWA MPNMEPTTKEIKEQKIYQEMGLTDSEYELVCSILGREPNYTETGLFSVMWSEHCSYKNSKPVLRKFPTEGKQVLQGPGEGAGIVDIGDGLGVAFKVESHNHPSYVEPYQGAATGVGGIIRDVFSMGARPIAMLNSLRFGELDTPHAKYLVSEVVAGIAGYGNSIGIPTVGGEIQFDPCYTKNPLVNAMCVGLIEAKDIQKGQAKGIGNPVMYVGAKTGRDGIHGATFASVEFSEEGEQQRSAVQVGDPFMEKLLLEACLDVIRDHSDILVGIQDMGAAGLVSSSSEMASKAGAGLELIMDDVPQRELNMTPYEMLLSESQERMLLCVKKGHVEEIQALFERYGLEAVVIGQVTDDKMYKIIHHGEVVANVPVDALAEDAPVYHKPSKEPARYQAFQEEESFVPVMEDVVGVWKELLAQPTIASKRHIYEQYDYQVRTDTAVVPGSDAAIVRVRGTEKAIAMTTDCNSRYLYLDPEVGGAIAVAEAARNIVCSGGKPLAITDGLNFGNPEKPEIFWEIEKAADGISAACLELDTPVISGNVSLYNETDGTGIYPTPVIGMVGLVEDLAHITTQDFKNSGDVIFLIGETKAEYSGSELQKLQQGKISGRAPELDLTTEKKYQQLLLTAIQEGLVASSHDLAEGGFGVALAEATFKAGLGADVEVPFELNQLFSESQSRFLVSVKPENEAAFAQLMELEKVYRLGVVTEDDTIRVKHKEDQVTAKTTELRSIWEGAIPCLLK >NC_018642|1824302:1832588|1831295_1832588_-|WP_003729814.1|DBSCAN-SWA MLERYTRKEMGNIWTEQNRYQAWLEVEILACEAWAELGDIPKEDVAKIRANAKFDVDRIHEIELETRHDVVAFTRSVSESLGAERKWVHYGLTSTDVVDTANSYLLKQANEILRKDLENFIAIIGEKAKEHKYTVTMGRTHGVHAEPTTFGLKLALWYEEMKRNLERFNFAADGVEFGKISGAVGTYANIDPFVEAYVCEKLGTTPAPISTQTLQRDRHAEYLATLALIATSVEKFAVEVRALQKSEVREVEEFFAKGQKGSSAMPHKRNPIGSENVTGLARVIRGHMVTAYENVPLWHERDISHSSAERIILPDSTILLDYILNRFGNIVKNLTVFPENMKRNMDRTLGLIYSQRVLLALIDKGLAREAAYDVVQPRAMEAWEKQVPFRELVEQDATITENLSAEEIADCFDYNYHLKNVDLIFDRLGL >NC_018642|1824302:1832588|1824302_1824869_-|WP_003731569.1|DBSCAN-SWA MNIAIFASGNGSNFQALVDDAFIKPHVKLLVCDKPNAYVLERANTYQIPVFLFEAKNYPDKEAFETEILLELRGLEIDLLVLAGYMRLIGPTLLAEFPEQIVNLHPSLLPEFKGKDAIGQAIQANVSETGVTAHFVDAGMDTGPIIDQVKVPIEHAETVDTLAGKIHQVEHIFYPKVIRGLIQNGGND >NC_018642|1824302:1832588|1829557_1830241_-|WP_003726212.1|DBSCAN-SWA MKFAVIQFPGSNCDLDMLHAIRDSLGEEAEYVWHAETSLAGFDAVLLPGGFSYGDYLRTGAIAKFSSIMPEVLRFAEMGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALIRNNNLHFICKTVPLRVANASTMFTGLYKEGEIIQVPVAHGEGNYYCDDETLLKLKDNNQIVFTYDSVNPNGSRADIAGIVNERGNVLGMMPHPERAVEEIIGGTDGLRLFESVVKAWKEEQVNA >NC_018642|1824302:1832588|1824865_1825915_-|WP_003726210.1|DBSCAN-SWA MAENAYSKAGVDVEAGYQVVERIKKHVARTERLGAMGALGSFGGMFDLSSLHLKEPVLVSGTDGVGTKLLLAIEADKHDTIGIDCVAMCVNDILAQGAEPLFFLDYIATGKTDPVKMEQIVKGVADGCEQAGAALIGGETAEMPDMYGAEDYDLAGFTVGAVEKQKLITEGAVKEGDTLIGIPSSGIHSNGYSLVRKIFFKDNELTLDAEISELDVPLVEELLKPTRIYVKPVLEVLKEVDVHGITHVTGGGFVENLPRMLTNDLAVKVELGSWPVLPIFDVMKKYGQLSELEMYEIFNMGIGMVLAVAKADVERTLEVLVQNGEAAYVIGEVTTRENDAVIFTGGTKG >NC_018642|1824302:1832588|1825933_1827361_-|WP_012681342.1|DBSCAN-SWA MLAEVKGLNEECGIFGIWDHPNAAEITYYGLHSLQHRGQEGAGIVSTDGETLKGHRNLGLLADVFKHGELDDLKGKAAIGHVRYATAGQKNLGNVQPFLFHFHSSSLALAHNGNLVNAKSLRRELEEEGAIFQTSSDTEVLAHLIKRSHTGDFVEDLKVALNKVKGGFAYMLLTEDTMYAALDPNGFRPLSIGRIGDSYVVASETCAFETVGAEFVRDVEPGELIIINDDGLRIEKFTENVTHSICSMEYIYFARPDSNIAGVNVHSARKRSGKRLAKEAFIDADVVTGVPDSSISAAIGYAEEAGLPYELGLIKNRYVARTFIQPSQELREQGVRMKLSAVRGVVEGKRVVMIDDSIVRGTTSKRIVQLLREAGAAEVHVRIASPPLAYPCFYGIDIQTRNELIASNYSVDEICRIIGADSLEYLSEEGLVDSIGRPYPNEPYGGLCMAYFNGDYPTPLYDYEAEYLASLEAEK >NC_018642|1824302:1832588|1830244_1830490_-|WP_003722248.1|DBSCAN-SWA MYNVKVYVTLKKSVLDPQGVAVKDAAKSMGYEEVEDVRIGKFMELKVAKSDRDIHEVLNEMCDKLLTNPVMEDYRYEIEEA >NC_018642|1824302:1832588|1830501_1831215_-|WP_003726214.1|DBSCAN-SWA MTNELVYEGKAKRLFKTEEAGVLRVAYKDDATALNGVRKESFAGKGELNNQITSLIFSHLAGAGIESHFIRAISETEQLVKEVSIIPLEVVVRNVMAGSLAKRLGKEEGELIPNAIVEFYYKDDALDDPFINDDHVLYLELATTSEMDIIRQAARSINKVLQELFNQMNITLIDFKLEFGRDATGNILLADEISPDTCRLWDKETNQKLDKDVFRRNIGNLTDVYTEVLNRLKQVQN |
8 | Prochlorococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2519416 : 2527261
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_018642|2519416:2527261|DBSCAN-SWA 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TGATCCAGCCCCGCACCAACTAATTTTACTTGCTGGTCCTGACTTTGTGTAATCTCCGCTACTTCACGACCTGCACGCAAATCAAAGATAGTATTTTCCGCTAACCGCTTTTCCCCAATTGGGAGAAACTCTTCATCAATTGGTAGGAAGCTGTCACTATTAACCCAAAGCTGATGTTGTAAAACCGTTGAACCAGCTTCTCCGCTTAGATTAAAATAAATATGATTGCTCGGGTTATATATAGTCGGCTGATCGCTTTTCGCTTCATAATCAAGCAGCCATTCATTTTTATTATTTAACGTATATGTCATTTTTGCATCAATATTTCCTGGATAGCCATTTTCTCCATCCGCCCAGCAGTATTCAAAAGTCATCACAATTTGATCAAGACTTTTTTCTACTGAAACATCCCAAAGCTTCTTACTAAAATTGAATTTCCCACCGTGACGATGGTTAGCTCCTTCATTTTGAATCAGTTGAAATTGTTTACCGTCCAAACTAAATTGCCCATTTGTAATGCGTCCAGCAACAGGGCCAAGTGTCGCGCCGAAGTATGGGGAGTGTGCCAAATAATCATCTAAATTTGTAAAACCAAGACTAATATTCGCAAAATCACCAAATTTATCTTTTGTTTCAAGGGAAGTAACAATCGCTCCGTAATTTAAAACACTCATGCGCATACCATGATCATTTACCATCGTCCACTTCCAAACAGTTTCTCCCTCAAACTCCCCAAATCGCTCCTTCATTACTTCGATAAAAATCACATTCCTTCATAAGTTATTAATAGCCATTTGGATGAGATACGTGCCATTTCCAAGCAGTGGCGATAATATCTTTTACGTCTGTATAAGTTGGCTCCCAACCAAGAATTTCACGCGCTTTATCACTTGAAGCAATTAACGTTCCTGGATCTCCTGCACGGCGTGGTACAACTTCAGCTGGAATTTCTTTACCTGTTACAGTACGAGCTGCTTCAAGCATTTCTTTCACTGAAAAACCGTTACTGCTACCAAGGTTGAAAATATTACTTTCCCCGCCATTTTTCAAGTATTCTAGCGCTTTAATATGCGCGTCAATTAAATCTTCTACTTGTACATAATCACGAATACAAGTACCATCAGGCGTATTGTAGTCGTCACCGTAAATCGCTAATTTTTCTCGTTGACCAAGCGCAACTTGTAAAATAATTGGGACTAAGTGTGATTCTGGTTTGTGATCTTCCCCAATTGAACCATCCGCTTTGGCGCCAGCAACATTAAAATACCGGAGTGCAACATATTTCATATCATACGCTTTATCGCACCATTTCATCATTTTTTCCATGATTAGCTTCGTTTCGCCGTAAGTACTTTCCGGATTTGTTGGCATATCTTCCGTAATCGGTACTCGTTCTGGCTCACCATATGTTGCAGCGCTAGAAGAAAAGACAATATGCTTCACACCAAATTGCTCCATCACTTCTAAGACAATTTGCGTACCATAAACATTATTATTTAAATAAACAAGCGGTACTTCCATCGATTCTCCTACAAGTGAACTAGCAGCAAAGTGAATCACACCATCTACCTTTTCTTTTTCAAAAACTGAACTTAAAAATGCCTTATCTCGAATATCTCCTTCATAAAATTTTGCCTTTGTATGAATGGATTCCTTGTGCCCTGTTCTTAAATTATCAATAACTACTACTTCATATCCGCGAGTAATTAACTCATCTACTGCATGTGAACCGATATAGCCAGCGCCACCAAGTACAACAATACTCATTATTATCTCTCTCCTAACAATAGTCTTTGTCTTCCATTTTACACTACTCAAGTCTATATAGTCACGCAAAAATGGGTCTAAGATAAATAATCTCAGACCCATTCGAGTTTTCTTTACTGTTATTTAGCTGCCTCTGCTTCTAGCGACTCTTTTAATTCTTCTACATATTTTTGAGCGTTTTGTCCAGCAAGTCCGCCATCGCCTGTTGCTGTTACAATTTGGCGTAAGCTTTTCGCACGAACATCACCAGCTGCAAAAATACCAGGAAGGTTTGTACGCATTTCCTCGTCCGTTACGATGTATCCTTCATCATCTGTAATACCTAAATTTAAGAATGCTTTCGTAAGTGGAACAAGTCCAACATAGATGAAAACACCATCCACTGGCATAATAGATTCGGAACCATCCACTGTGGAAACAAGTTTTGCTCCAGTTACTTTTTTGCCATCGCCAACAATTTCTTCTACTGTACTATTCCAAATGAAATCAACTTTTTCATCTTTGAAAGCACGATCTTGTAAAATTTGTTGTGCGCGCAATTTATCACGACGGTGTACTATCGTTACTTTATCTGCATAACGAGTCAAATAAGTTCCTTCTTCCACTGCAGAGTCTCCGCCGCCAACCACGATTAATTCGCGATTTTTGAAGAACGCTCCATCACAAACAGCACAATAAGAAACGCCGCGTCCACTAAGCTCTTCTTCGCCAGCTGCACCAAGTTTCCGGTGTTCAGCACCAGTCGCAATAATAATCGCCCGAGCTTTATAGGTTTTCGATCCAGCCGTTACAGTTTTAAATTCTTTGCCATCAACGACTTCTTTAATGTCCCCATAAGCATACTCAGCGCCAAATTGTTTCGCACCGCTAAGCATCTTATCGGATAAATCGGGTCCTAAAATACTATCAAATCCAGGGTAATTTTCAACCTCAGCTGTGTTAACCATTTGTCCACCAGGTACACCGCGTTCAATCATTAACGTATCTAAATCTGCACGGGAAGTATATAAAGCAGCTGTCATTCCAGCTGGTCCCGCTCCAATAATAATCACATCATAAATTTTTTCTTCACTAGCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_018642|2519416:2527261|2522348_2524079_-|WP_003725409.1|DBSCAN-SWA MNWQEEYQKWVANDKLDSTLRKQLTNMEANEKELEDSFYRNMEFGTAGMRGVLGAGTNRMNIYTIRKASLGLAQFVAENGDEAKKRGIVIAYDPRHMSREFAFESAAVLGHHGVKSYVFDALRPTPELSFAVRHLNAFGGIVITASHNPPEYNGYKIYGEDGGQMPPTGASAVIEYINAVEDIFSVEVANQELLIENGLLEVISEKVDRPYLEKLKEVIVNKELVQERGEDLKIVFTPLHGTGGILGVPALESVGFTNIVKVDEQFVNDPDFGTVKSPNPENREAFLLAIEYGKKFGGDILVGTDPDADRLGVAVRNLDGEYEVLSGNQIGAIILHYLLKQKKAQNELPANAAVLKSIVTSNLGTEIAKHYGAEMIEVLTGFKFIAEQIKHFEETGKHTFEFGYEESNGYMVKPFTRDKDAIQAVLAIAEVALVSKVEGGSLLEDLEQIYAEFGYYKEDLVSLTLSGKDGSRRIKEITSNFREQLPTSMGGFPVERAEDYLRSETTWIATGKTEAIHLPTADVIKCYFEDGSWFCLRPSGTEPKIKFYFSIRGESKEESATKLEKVKADLMQHIEA >NC_018642|2519416:2527261|2526301_2527261_-|WP_003722610.1|DBSCAN-SWA MASEEKIYDVIIIGAGPAGMTAALYTSRADLDTLMIERGVPGGQMVNTAEVENYPGFDSILGPDLSDKMLSGAKQFGAEYAYGDIKEVVDGKEFKTVTAGSKTYKARAIIIATGAEHRKLGAAGEEELSGRGVSYCAVCDGAFFKNRELIVVGGGDSAVEEGTYLTRYADKVTIVHRRDKLRAQQILQDRAFKDEKVDFIWNSTVEEIVGDGKKVTGAKLVSTVDGSESIMPVDGVFIYVGLVPLTKAFLNLGITDDEGYIVTDEEMRTNLPGIFAAGDVRAKSLRQIVTATGDGGLAGQNAQKYVEELKESLEAEAAK >NC_018642|2519416:2527261|2519416_2520388_-|WP_003725407.1|DBSCAN-SWA MSFASETKKELTHMDVSDSDAKVELAAFIRMNGAISFSNQLVIMDVQTENAAIARRMYQLLKDLYEVPIELLVRRKMKLKKNNVYIVRLKSGTRGILEDLRILEPPMTFTKSIDRGFVKKRSAKRAYLRGAFLASGSVNNPETSSYHLEIFSVYEEHNEAICALMNQFDLNARTLERKNGFITYLKEAEKITEFLSIIGATSALLHFEDVRIMRDMRNSVNRLVNCETANLNKTINAAVRQIDNIKYIQSTVGLEALPERLREIAALRIANEDVTLKELGEMLTTGQVSKSGINHRLRKLDQIAERLRSGETPAQVGLKISNS >NC_018642|2519416:2527261|2524120_2525182_-|WP_003741152.1|DBSCAN-SWA MIFIEVMKERFGEFEGETVWKWTMVNDHGMRMSVLNYGAIVTSLETKDKFGDFANISLGFTNLDDYLAHSPYFGATLGPVAGRITNGQFSLDGKQFQLIQNEGANHRHGGKFNFSKKLWDVSVEKSLDQIVMTFEYCWADGENGYPGNIDAKMTYTLNNKNEWLLDYEAKSDQPTIYNPSNHIYFNLSGEAGSTVLQHQLWVNSDSFLPIDEEFLPIGEKRLAENTIFDLRAGREVAEITQSQDQQVKLVGAGLDHAFILKHENSRPDAVLFDPKSGRRLEMETKADSVLIYTANSLDGSFEIGERTVPKYAGITMETQGLVDAINHDGFGDIVLRPEKPFTSRTAFRFTVES >NC_018642|2519416:2527261|2521365_2522241_-|WP_003722606.1|DBSCAN-SWA MASKQLKLVIITGMSGAGKTVAMQSLEDLGYFCVDNLPPSLLPKFWELMKESDKMDKIALVMDLRGREFFDSIEPALDELDNTNFITTKILFLEADDKVLVSRYKETRRHHPLEPNGSVLDGINAERELLSDLKGRSQLVINTSNMAPRELRERINNEFQTEDKDIFNVQLMSFGFKYGIPIDADLVFDVRFLPNPHYIDKMRPLTGLDEDVYEYVMKWPETQTFLDKLVDLLMFTLPFYKREGKTQLVIAIGCTGGQHRSVALTEFVGKAIQQKYETTISHRDMKRRKGR >NC_018642|2519416:2527261|2520395_2521364_-|WP_003734495.1|DBSCAN-SWA MKKEMKPKVVVIGGGTGLPVILKGLKKKDIHLTAIVTVADDGGSSGKIREQMDVLPPGDIRNVMLALSNVDPRVVDLFQYRFAVDGDLSGHVIGNLILTALSQLNDSYVDAINVLATVLKIRGKVIPATDQPLILNAEMEDGSIVHGESLIPLQGKHINRVYIEPENVKPYPTAVEAVKEADLIVIGPGSLYTSILPNLLLTELADEIIASKAPKVYITNILTQIGETDFFSDADHIKVIHEHVGKSFIDKTLINTTTVPKELLFPEDVAQVEHNAKGMEELGVEAIYQDFLSTEDGLVRHAAEKVADALLAMLPNQTIEKE >NC_018642|2519416:2527261|2525198_2526182_-|WP_003725411.1|DBSCAN-SWA MSIVVLGGAGYIGSHAVDELITRGYEVVVIDNLRTGHKESIHTKAKFYEGDIRDKAFLSSVFEKEKVDGVIHFAASSLVGESMEVPLVYLNNNVYGTQIVLEVMEQFGVKHIVFSSSAATYGEPERVPITEDMPTNPESTYGETKLIMEKMMKWCDKAYDMKYVALRYFNVAGAKADGSIGEDHKPESHLVPIILQVALGQREKLAIYGDDYNTPDGTCIRDYVQVEDLIDAHIKALEYLKNGGESNIFNLGSSNGFSVKEMLEAARTVTGKEIPAEVVPRRAGDPGTLIASSDKAREILGWEPTYTDVKDIIATAWKWHVSHPNGY |
7 | Streptococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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