Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_018645 | Desulfobacula toluolica Tol2, complete genome | 4 crisprs | RT,c2c9_V-U4,cas5,cas3,cas8b6,cas7,cas6,cas4,cas1,cas2,DEDDh,csa3,cas8b1,Cas9_archaeal,PD-DExK | 0 | 4 | 8 | 0 |
1. NC_018645
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_018645_1 | 1120959-1125463 | Unclear |
I-A,II-B,III-A
Consensus repeat of NC_018645_1
|
68 spacers
spacers of NC_018645_1
>1.1|1120989|35|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGGTTATCAGAAGTGTTATGGACGGGGGGACCGT >1.2|1121054|35|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGTGTATGACGAGTACTTATATGCTATTGTACCG >1.3|1121119|36|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTTCAATAACTCCTTAATTTTACGTTCATTATTT >1.4|1121185|37|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGTGTCAGCTGACACAGAACGAGAAGGATGGACAGA >1.5|1121252|37|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATTGAATCTAATAAACTGGCCTTAGATATTGTAAGC >1.6|1121319|36|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACTGCCACGCCTCATTATCAAACTCATACTCTGAT >1.7|1121385|37|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCTGTGCTGTTGATTGGTGTGTTTATGATATCCATT >1.8|1121452|36|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACTCCTGCTTAAGCGCCTTTGACTTTGCAAATTCT >1.9|1121518|36|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAGCACATTCACCCCAAACAACATCACCAGTTGTC >1.10|1121584|36|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTGGAAAACCCAGGCGGCGACCGGATACAAATAACT >1.11|1121650|35|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAACTCATTGAGTTTATTCCTGAAGCAGCCACGG >1.12|1121715|37|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCCCTTGTAAAGGATGGACAGAAACTCGAAGCAAAAG >1.13|1121782|36|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGTAACCTGACTCATATCAATTGCCGTCTGGGGCG >1.14|1121848|36|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGATTCTCAGAGATGGTACGCTTGTCAATCTTGGTT >1.15|1121914|37|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGCGTTGGGAGGATGAGGCCGCGCTCGTTATTCAGGG >1.16|1121981|35|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATAGTTCTGGGTATTTTTCCCGCGTCCGGCGTAG >1.17|1122046|35|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCCGACATGGCGGTATCAGCTAACCTGCAACCAT >1.18|1122111|36|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTGTTTGTTCTTCGTCACCTCCAGAATCTTGAGAC >1.19|1122177|36|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCAAAAAACCACTGGTCACTTTATAATCTCTCGGA >1.20|1122243|37|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGATATGCAAAATAATCAAGTACTTCTTTAGATCCCT >1.21|1122310|36|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTATGATTTCAAAATCCTTGTAATTGCTCGAAATAA >1.22|1122376|38|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTGCATCTCTTTTTCTTGCTCATGACTTTTTATCTC >1.23|1122444|36|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCATTTCTCTGTTGAAAACTAAAAACTTTCCTTCAT >1.24|1122510|36|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATTTTATCGCCATAGTGACGATGGGTATCAAAATA >1.25|1122576|36|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CATAATTATTCCTTTGGTACAAGCATTGTCATATCA >1.26|1122642|37|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTATGTGAAAATTACTTTTAACGGAAAAGAGCCTA >1.27|1122709|36|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCCATAGTGGAGAAACGCATCATAGGGCAACTATA >1.28|1122775|35|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTGAAGGGCAAGCCAATCCAGCAATTGACATGCC >1.29|1122840|34|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAAAAGGGCCAGTAGCAAAATCAGGAACGGGCA >1.30|1122904|35|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGCTGATACCCACCCTGCTGGTTCTGCTGGCCCTG >1.31|1122969|35|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAATTAACTTTTGAATTGGAAAAAAAATATGACAT >1.32|1123034|34|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAATAACCCATTTTCTTAGTGACCCACCAAGAAG >1.33|1123098|35|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATACTCTGCGCTTTGACATTTATCTTCGCTAAATT >1.34|1123163|36|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAAATCAGTATAATCAGTAATGGCAGGTTCGATAA >1.35|1123229|36|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGAAGAAACTCAAACCATATTGAATTTGTCAACAAA >1.36|1123295|36|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACGGTTGATAGATTCCCTGTTCCTGGCTTTGCTACT >1.37|1123361|38|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGGTACATTAAGATATTTAATCATTTCTACCTCTCTT >1.38|1123429|37|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGGCTTGTATTGACTGTATCAATTGCAAGAGATCCTT >1.39|1123496|37|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCCATTATATTCAATTCAGCAGCGGTTGCCGTAACCT >1.40|1123563|35|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGACGTAGTGACTAATTTCCCGACCTTGTTGACTT >1.41|1123628|37|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTTATAGTATTACAACATGGGTTTATTATTTTATTA >1.42|1123695|36|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGAGACAATGAAACTTTAATGTCTTGGATCTGCATA >1.43|1123761|36|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTATTAATCTTTAGTTTTTGAATGGCTCCGAGAAAA >1.44|1123827|35|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCGGGAAAAAGAAATTCATGGCAGGTGGCGAAGT >1.45|1123892|35|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACATCGCAAAGCGGCCTTACTTCAGCCATATCAAA >1.46|1123957|37|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGGGAACATTGCTTTTTTACCACCAACAATAAAATA >1.47|1124024|35|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGTCCTGTAAGCCAGTCCCGATATTTTGAACATT >1.48|1124089|36|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACGGTGAAGTGGTAGAAAAAAAGATAAAAAAGCAC >1.49|1124155|35|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTTGTACCAATATTTTTCGTGTCAATCAGCTCGT >1.50|1124220|35|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTGGTGAGATGCTCTTGTTTACAAGATATTGATG >1.51|1124285|37|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCAATACCCCGGTTGATCGCATCGAGATAATCACCAA >1.52|1124352|38|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCGCTGTTTTCAGTCCACCACTGTTGGAATAACACGT >1.53|1124420|36|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGGTTTGCGCGACGTGGAAAATTTACCGTGACATAT >1.54|1124486|37|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTGGAGGGCAAACAGGAGACTCAAGGAAAAGCTGTT >1.55|1124553|36|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGAAACAGACGTGTGGGCGCTAATCGAAAAAATCAA >1.56|1124619|36|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGTAAGATTGAAAAACCTGTTTCAGAGTTTTACAA >1.57|1124685|36|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAATATCCTATTTTTTTGGTGATCCACCAAGAAGTT >1.58|1124751|38|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATACTAAAATACAAACGAATAAATATCCACATTGCCAT >1.59|1124819|36|NC_018645|CRISPRCasFinder,CRT TAATATCCTATTTTTTTGGTGATCCACCAAGAAGTT >1.60|1124885|25|NC_018645|CRISPRCasFinder,CRT ATACTAAAATACAAATGCTTTTCTG >1.61|1124940|35|NC_018645|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACGGAATAACCAGAGATATTTCTCAAAACGCAATA >1.62|1125005|37|NC_018645|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGGATAAGCGGATTGCATTCAAGCAGTATGGACCAAA >1.63|1125072|36|NC_018645|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTATCCACGGCGTATGGGTCAGATAATGCTTTTCTG >1.64|1125138|35|NC_018645|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACGGAATAACCAGAGATATTTCTCAAAACGCAATA >1.65|1125203|35|NC_018645|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATGGTTCCAATAAGCTTTAGAACGGCCTCTTTCAA >1.66|1125268|34|NC_018645|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAGGGATGTTCCGACCATTGAACAATTAGAATGG >1.67|1125332|36|NC_018645|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCAGAAACCAAATAGCCGATGAATCAGACACGTTTG >1.68|1125398|36|NC_018645|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGTTATAGAGTATATGATCCATGTTTTTTATACCAG |
cas2,cas1,cas4,cas6,cas7,cas8b6,cas3,cas5 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018645_1
The CRISPR arrays of NC_018645_1 >merge|NC_018645|1|1120959-1125463|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACCTGGTTATCAGAAGTGTTATGGACGGGGGGACCGTCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACTAGTGTATGACGAGTACTTATATGCTATTGTACCGCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACTTTTTCAATAACTCCTTAATTTTACGTTCATTATTTCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACATGTGTCAGCTGACACAGAACGAGAAGGATGGACAGACTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACGATTGAATCTAATAAACTGGCCTTAGATATTGTAAGCCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACAACTGCCACGCCTCATTATCAAACTCATACTCTGATCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACTTCTGTGCTGTTGATTGGTGTGTTTATGATATCCATTCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACAACTCCTGCTTAAGCGCCTTTGACTTTGCAAATTCTCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACTAAGCACATTCACCCCAAACAACATCACCAGTTGTCCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACGTGGAAAACCCAGGCGGCGACCGGATACAAATAACTCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACATAACTCATTGAGTTTATTCCTGAAGCAGCCACGGCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACCCCCTTGTAAAGGATGGACAGAAACTCGAAGCAAAAGCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACCTGTAACCTGACTCATATCAATTGCCGTCTGGGGCGCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACAGATTCTCAGAGATGGTACGCTTGTCAATCTTGGTTCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACAGCGTTGGGAGGATGAGGCCGCGCTCGTTATTCAGGGCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACAATAGTTCTGGGTATTTTTCCCGCGTCCGGCGTAGCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACTTCCGACATGGCGGTATCAGCTAACCTGCAACCATCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACAGTGTTTGTTCTTCGTCACCTCCAGAATCTTGAGACCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACATCAAAAAACCACTGGTCACTTTATAATCTCTCGGACTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACTGATATGCAAAATAATCAAGTACTTCTTTAGATCCCTCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACTTATGATTTCAAAATCCTTGTAATTGCTCGAAATAACTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACTTTTGCATCTCTTTTTCTTGCTCATGACTTTTTATCTCCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACGCATTTCTCTGTTGAAAACTAAAAACTTTCCTTCATCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACAATTTTATCGCCATAGTGACGATGGGTATCAAAATACTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACCATAATTATTCCTTTGGTACAAGCATTGTCATATCACTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACTTTTATGTGAAAATTACTTTTAACGGAAAAGAGCCTACTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACATCCATAGTGGAGAAACGCATCATAGGGCAACTATACTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACCTTGAAGGGCAAGCCAATCCAGCAATTGACATGCCCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACTTAAAAGGGCCAGTAGCAAAATCAGGAACGGGCACTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACTGCTGATACCCACCCTGCTGGTTCTGCTGGCCCTGCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACTAATTAACTTTTGAATTGGAAAAAAAATATGACATCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACCAATAACCCATTTTCTTAGTGACCCACCAAGAAGCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACATACTCTGCGCTTTGACATTTATCTTCGCTAAATTCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACTAAAATCAGTATAATCAGTAATGGCAGGTTCGATAACTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACCGAAGAAACTCAAACCATATTGAATTTGTCAACAAACTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACACGGTTGATAGATTCCCTGTTCCTGGCTTTGCTACTCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACTTGGTACATTAAGATATTTAATCATTTCTACCTCTCTTCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACAGGCTTGTATTGACTGTATCAATTGCAAGAGATCCTTCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACTCCATTATATTCAATTCAGCAGCGGTTGCCGTAACCTCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACTGACGTAGTGACTAATTTCCCGACCTTGTTGACTTCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACTGTTATAGTATTACAACATGGGTTTATTATTTTATTACTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACTGAGACAATGAAACTTTAATGTCTTGGATCTGCATACTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACTTATTAATCTTTAGTTTTTGAATGGCTCCGAGAAAACTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACTTCGGGAAAAAGAAATTCATGGCAGGTGGCGAAGTCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACACATCGCAAAGCGGCCTTACTTCAGCCATATCAAACTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACAAGGGAACATTGCTTTTTTACCACCAACAATAAAATACTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACATGTCCTGTAAGCCAGTCCCGATATTTTGAACATTCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACAACGGTGAAGTGGTAGAAAAAAAGATAAAAAAGCACCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACACTTGTACCAATATTTTTCGTGTCAATCAGCTCGTCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACTGTGGTGAGATGCTCTTGTTTACAAGATATTGATGCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACCCAATACCCCGGTTGATCGCATCGAGATAATCACCAACTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACTTCGCTGTTTTCAGTCCACCACTGTTGGAATAACACGTCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACAGGTTTGCGCGACGTGGAAAATTTACCGTGACATATCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACTTTGGAGGGCAAACAGGAGACTCAAGGAAAAGCTGTTCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACCGAAACAGACGTGTGGGCGCTAATCGAAAAAATCAACTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACTTGTAAGATTGAAAAACCTGTTTCAGAGTTTTACAACTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACTAATATCCTATTTTTTTGGTGATCCACCAAGAAGTTCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACATACTAAAATACAAACGAATAAATATCCACATTGCCATCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACTAATATCCTATTTTTTTGGTGATCCACCAAGAAGTTCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACATACTAAAATACAAATGCTTTTCTGCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACACGGAATAACCAGAGATATTTCTCAAAACGCAATACTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACAGGATAAGCGGATTGCATTCAAGCAGTATGGACCAAACTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACGTATCCACGGCGTATGGGTCAGATAATGCTTTTCTGCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACACGGAATAACCAGAGATATTTCTCAAAACGCAATACTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACATGGTTCCAATAAGCTTTAGAACGGCCTCTTTCAACTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACTAGGGATGTTCCGACCATTGAACAATTAGAATGGCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACGCAGAAACCAAATAGCCGATGAATCAGACACGTTTGCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACGGTTATAGAGTATATGATCCATGTTTTTTATACCAGCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC >NC_018645|1|1|1120959-1124818|PILER-CR CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC CTGGTTATCAGAAGTGTTATGGACGGGGGGACCGT CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC TAGTGTATGACGAGTACTTATATGCTATTGTACCG CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC TTTTTCAATAACTCCTTAATTTTACGTTCATTATTT CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC ATGTGTCAGCTGACACAGAACGAGAAGGATGGACAGA CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC GATTGAATCTAATAAACTGGCCTTAGATATTGTAAGC CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC AACTGCCACGCCTCATTATCAAACTCATACTCTGAT CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC TTCTGTGCTGTTGATTGGTGTGTTTATGATATCCATT CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC AACTCCTGCTTAAGCGCCTTTGACTTTGCAAATTCT CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC TAAGCACATTCACCCCAAACAACATCACCAGTTGTC CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC GTGGAAAACCCAGGCGGCGACCGGATACAAATAACT CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC ATAACTCATTGAGTTTATTCCTGAAGCAGCCACGG CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC CCCCTTGTAAAGGATGGACAGAAACTCGAAGCAAAAG CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC CTGTAACCTGACTCATATCAATTGCCGTCTGGGGCG CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC AGATTCTCAGAGATGGTACGCTTGTCAATCTTGGTT CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC AGCGTTGGGAGGATGAGGCCGCGCTCGTTATTCAGGG CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC AATAGTTCTGGGTATTTTTCCCGCGTCCGGCGTAG CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC TTCCGACATGGCGGTATCAGCTAACCTGCAACCAT CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC AGTGTTTGTTCTTCGTCACCTCCAGAATCTTGAGAC CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC ATCAAAAAACCACTGGTCACTTTATAATCTCTCGGA CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC TGATATGCAAAATAATCAAGTACTTCTTTAGATCCCT CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC TTATGATTTCAAAATCCTTGTAATTGCTCGAAATAA CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC TTTTGCATCTCTTTTTCTTGCTCATGACTTTTTATCTC CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC GCATTTCTCTGTTGAAAACTAAAAACTTTCCTTCAT CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC AATTTTATCGCCATAGTGACGATGGGTATCAAAATA CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC CATAATTATTCCTTTGGTACAAGCATTGTCATATCA CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC TTTTATGTGAAAATTACTTTTAACGGAAAAGAGCCTA CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC ATCCATAGTGGAGAAACGCATCATAGGGCAACTATA CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC CTTGAAGGGCAAGCCAATCCAGCAATTGACATGCC CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC TTAAAAGGGCCAGTAGCAAAATCAGGAACGGGCA CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC TGCTGATACCCACCCTGCTGGTTCTGCTGGCCCTG CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC TAATTAACTTTTGAATTGGAAAAAAAATATGACAT CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC CAATAACCCATTTTCTTAGTGACCCACCAAGAAG CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC ATACTCTGCGCTTTGACATTTATCTTCGCTAAATT CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC TAAAATCAGTATAATCAGTAATGGCAGGTTCGATAA CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC CGAAGAAACTCAAACCATATTGAATTTGTCAACAAA CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC ACGGTTGATAGATTCCCTGTTCCTGGCTTTGCTACT CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC TTGGTACATTAAGATATTTAATCATTTCTACCTCTCTT CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC AGGCTTGTATTGACTGTATCAATTGCAAGAGATCCTT CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC TCCATTATATTCAATTCAGCAGCGGTTGCCGTAACCT CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC TGACGTAGTGACTAATTTCCCGACCTTGTTGACTT CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC TGTTATAGTATTACAACATGGGTTTATTATTTTATTA CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC TGAGACAATGAAACTTTAATGTCTTGGATCTGCATA CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC TTATTAATCTTTAGTTTTTGAATGGCTCCGAGAAAA 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MRIKITAITNQPAFFPYNYQYAVHSALYSLIQESSANYSSFLHDKGYVKDGINKLFKLFTFSKLNFSPKNNGNGGFYKVSKIQFVFSTIMEKSMRHLILGIFSNQKMMLNLSGQRHFFDIVNVDIQEDCQFTNTEKFICLSPITVSSIMIKEKGKRVQHFLNYMVPAERDHFVENLKKNLINKYETINNIPYENMKFPFQFHFENNYIVKRNGRISKLIEFKNNIKVKAMEAPFYIEADPELIKIGYDCGWGEKNSAGFGCVEKAAK >NC_018645.1|WP_014956477.1|1117003_1118071_+|hypothetical-protein MNTIYIRTLKRAEHTVFCVADGQKTYYDPQFNRYIPYSSGQQIKRSLIDTLARQLNQLPAPTTFIFDVTKKKEITEGEVFGTCDPSHFDQLLGGWMKASKGGKEKTIKRRSPLSISAMRALHPLLAGIDRENITFDRSDRPNNTVIVRDPNGKELCEDDIITLLQDKDRSLIRKWIPDNKRATGLFVQDIAIDLRRLFCVTQSVFEPEITKETEDRLKESGWLESNNIFGNCLVAPPETRNKLIPAIAKAIINWRITSNQSRTFSLMETLAVSISTNANKIAGSIRAKLSEEDEKKAIPVIEEDLEGVETFVTLSAGGYFLTKSETAEALEEAEKNLIDRMMAFDYEDQIIKIND >NC_018645.1|WP_014956476.1|1115564_1116965_+|hypothetical-protein 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MDVCDHIKAKGAPEFTTLYAHLCQVKSAIKVFAGYLNFDVETAKLGAVFHDIGKASPIFQERLVSKYKTGQSTFRHEIASCFFLSLVEKTYHPQLIEMIIAHHKSIENDKGLKGILDLEENEDDIFEFHIEHWDVWKLDALKILAGFGINSRDIGYDEAKENYFKVLEYCENTIMNNGYSEWRGLLMSADHFASALSSAAPDYLPHTFKKPILEFYNRTSQLYPLSLKKASSNRPHTMVVACTGAGKTDYLFRRCRGRVFYTLPFQASINAMFKRVKTDLIKLNPNLDIRVLHSSSKISSGAESHEDMLLQRLVGSSVKVLTPYQLASIIFATRGFESMIEDLKGCDVILDEIHTYDNVSKSIVLKIVEVLNHIGCRIHIGTATMSSSLYNEIIDLLGRDFVSEISLDSIELEKFDRHILHKIGSWDDAHAVIKEAIKKNNKILLVCNRVDSAQEMFEIVKEAFSDIPLLLIHSRFKRGDRRDKEASLLGLDSQGNTTFEFNTSSNACIVVSTQVVEVSLDISFDLMITETAPIDSLIQRFGRINRKRTPATIGTYKPVYVIAPPEDEKAARPYELEILRKSYAVLDHDQVLHESDYQEKINCVYPDLSYTSIENHTAYKGNGRWNVPMLTHRDRSILLELLEVDSVNCIVDSDCQAYEQAGFEDQMMLEIPVRYYAVKNYFQLNFGSNPFVIPDSGYSRETGLDLAKANDRKADLNFL >NC_018645.1|WP_014956474.1|1112810_1113389_+|hypothetical-protein MYFVNYTGPFGFIKPWTAVRDSETFSQQFLTPSIVAGMERKLFPDLLSETYGLYKIKRHRLSYKQISHQQEQIQPRGWNKKNNNFFRKYSIIVRGVLIEPVLYLGFDNEQDAVHAAKQHICLCRNEDILFPGRKILEVPEKEFDTQEDFFNGFELVFEQTDQSFLVGYNRFDNNAPMYGWLKVVGNPVKHIC >NC_018645.1|WP_014956473.1|1111745_1112537_+|hypothetical-protein MIQKLSSIKFAFYNLVCLVCFMGAGVYLSRWYKNDFKVMNETLIFEWLKSAWSQTPVLVVWFALLCLSAGLLFVNTLCCSFTKQIQVARKSGKFEKWLFFVLHCLFIVVLACHGLILVVGHKQGNITLFSNSKMLFQNQYLIEVSDIVFKDDINILKAGKQEQRIMMTRDNIHRKQNFAIVSLYQASTLMETKKVMMLSPLRHGSIQVALTDFIVKKADNQERVGVKLTITDNPLNIFFFTIYALMILSLGGYIITISWGGRD >NC_018645.1|WP_014956472.1|1111016_1111733_+|hypothetical-protein MIQIFPTLVYWIMFLLFAGELVLLLLKKDTIAKWFRHLEILTCLAGVLFIVFVTGRPPLFGPFEACVYIIFVVVLLARGCTGNVFLVNSIVVLLILALVLGKPMAVNDDYYMYDNIWVMLFFDLRLVAAAFFVHVMVLHLTCFFEGFREKAVLLKQARHKILVGALIYLCGEWSGSVWCLNWFGDSWQWSNGFFKASLLFVLVMIVCHMPPAFGNNRLIRTLSGSLPGIFALWMIFYH >NC_018645.1|WP_014956144.1|1125500_1127033_-|IS66-family-transposase MTKGKVKGNRNLDEVKKIACDLIDENQILKEQVKSLQNMIFGRKSEKTPKDDGQMSLFDMPEPELPILEKEEEDVTIGEHTRKKRGRKPLPADLPRIDVIHELSEDERQCNCGCLKERIGQEESEQLDYIPAKVRVLRNIRYKYACKNCEGVEDDGPTVSIARMPEQIIPKSIATPGLLAHILTAKFADALPFYRQEKQFTRIGIELGRSTMCTWAMKVADACDILIDMMQKDILASPMIGADETPLLVLKGPRKSKSYMWIFRGGPPDMPIIQFQYHPTRSGDVAASFLNGYKGIVQTDGYKGYDFLDKITDIIHVACWTHARRGFKNVTKAAGNKKSSSGNAGTALKYISLLYKIEKEARVQELTPDQLYARRQKEAVPILEEFKKWLDARVEKVPPKSLLGKAIHYTLNQWHRLIQYTTDGIIRPDNNLVENAIRPFVVGRKNWLFSDTVKGARASALIYSLIETAKSNGLEPYWYLKYLFEHLPEAMTEDDFKALLPYNVDKKQLA >NC_018645.1|WP_014956143.1|1127077_1127425_-|IS66-family-insertion-sequence-element-accessory-protein-TnpB MMNFPSDTKVYLFLGATDMRKAINGLSVIVSEQMQLDIFSSNLFVFCNRTQTILKILYWDKNGFCMWQKRLEKDRFKWPKTSDDVMNITSRELSWLVDGLNINQAHKPLKYSMIY >NC_018645.1|WP_014956142.1|1127421_1127742_-|IS66-family-insertion-sequence-hypothetical-protein MSKSWKKINEEKAIFWKTHIDQWTESRLSQIEYCRQNGLRPNRFTYWKIKFGKPNQPTGLVQVPVPTHFCQAGLKLNIGRELQVEIPDGFKKETLEQVLSVLKAVQ >NC_018645.1|WP_041279292.1|1128390_1128909_-|MmgE/PrpD-family-protein MNLLEEIRTQENIDIENVDRIDLEIGPVASTAATIKAPKIGVEGKFSVWFLAALALAEGNVTLAKFTDEKVNSPRLVTLCKKIHTSLDPRIGFGARVKILMKDGTKYARFLAKPKGDPDNPLTFEQLAEKYRNAAIMAISKEKTENLIKKIKSLEQINNMNEIVALTIHPNA >NC_018645.1|WP_041279294.1|1128927_1129731_-|MmgE/PrpD-family-protein MELTRRLAQFVCATRFEDLPEPVVNKAKECFLDWQGVALAGTTDPGSKVMMHYVMAVGGKPEASVIGSSLKTDIANAALANGMIGHALDFDDYHDETVIHASAACVPAILALAEKFNTSGREFITAMVLGVDVCIRIGLALGDYHYQRGWHTTATAGTFGATAGAAKLMGLNADQLVTAFGICGTQASGLRQVFGTMCKPFHAGKVSMEGIMSASLASMGFTASQNMLEGELGLLDVLTETPDQAIMLDQLGQKFHINRLSIKPYPT >NC_018645.1|WP_041279295.1|1129754_1131425_-|methyl-accepting-chemotaxis-protein MNLSILKKKTRLRTIRSKILTLIIGLMVFTSMVFTFITTKNYQRELTAHYHKLSKETLSSTIRIIDSEYNDLLSYEINSIKTQRSLMENTGKNLLLMINSFYDLHKTGFLTELTAKELCLKNIEEYRYKKNNYFFVYDLNLTGLSHPSKEMVGKNWSGFEDLKKRDALQLVRENLKTEKKNFTVFMWPRLEDMKPVKQIGFFMYYPQWKWIIGTALEMGYIEKISCAKEKLILSKLNKILGQVSLSNVGGIIIFNSHGKVILHTSNLKDIDLKLSGMTLNPSIQNYLKKSTGNFSQPVEYPYPNKNQKQMTQSAFVDYFKSMDWYVAAFVDNQTLKKPGSAIAARHSAIILMFSMIGIAFAVFISKKIASPLADLTQYAKNLANSNFKLHDDPLLKSIRANDRNDEIKQLADAFAFMEFELKKNLLDLKNYQQNLEHLIEIRTKALSDTNKDLTKEIQERKRLEEKHNKLIKELQKALDNVKMLSGLLPICSNCNKIRNDKGDWNELEDYIESHSDVLFTHGLCQTCADKLYGHNAWYIKSKNKKLRNQNPPHQTP >NC_018645.1|WP_041279296.1|1131452_1132622_-|hypothetical-protein MNRVITLTVIGLYFVLTVFLIDAWAQMPFETTPITNKGKKWRIGYLEGGPYANYQSILKSITKTLMDAGWIQHSSIPECRDEIETKTLWKFLSTQIQSNYLEFVSDAYWSAEWCDAKRKSLKHDIIKRLNESKDINLMLAFGTWAGQDLANNQHNTPTMVLSASNAIRSGIIKSVENSGFDHIHAWIDPNKSERQLRLFHKITGFKKLGIAYENDLDGRSYSAVEDVQNLSRELGFQIIECHLPGQASGTSHEEAELVKCYEQLAQKIDSMYITDYAGLTKKNLNKLLMPLFENKVATFAQTRYDLVKYGILMGAGRSDFKADARFYTEILAGILNGKKPGDLPQEFKSPLKIVVNLESSKQIGFRIPLDILAGAFEIHETIHHPENKE >NC_018645.1|WP_014956485.1|1132945_1135351_-|endopeptidase-La MTYENRPIVPKTVENRDENKKGQLIKQETKPDMLYLLPITGRPHMPGQVQPLMVNKKLWEETLNKVSSQAKSLLGLAYLKKIKSKDVYKEDFPKVGCVVRIENIVKVQESVQFIAQGLERFRIKKFLSDKPPFAVQVEYFEKIEENEIELKAYAISIINSIKQLLALSPLYSEQVRLFLSMFSPDKPAPLTDFATGITMASGDELQEILELPLVMDRMKKAMMMLQKEIEIAKLQNKIKKDLNHQMEDNKRTFFLKEQMRAIQKELGLLKDDKTSDVDKFKKRFAALFPTDQVVKRFDDEIKKLSVLEIGSAEYGVTRNYLDWVTSFPWGIHSKDNIDIDLAQKVLDRDHAGLSDVKDRIIEFFAAGIYRKDIAGSIILFVGPPGVGKTSIGKSIAQALGRKFYRFSLGGMRDEAEIKGHRRTYVGALPGRLVQALKDTEVSNPVIMLDEVDKIGVSYQGDPASALLEVLDPEQNVEFMDHYMDLRMDLSKVLFICTANQLDTIPRPLLDRMDKIKLSGYITEEKIQIARKHLWPKLLRRNNMTSKVITITNPTIRYLIEGFAREAGVRDLEKLLNKIIRKSIVTILKEKKKKIRINIESLDKLLGSPTFKHEKQMSGVGVVTGLAWTQMGGATLSIEAVRIHEKKPGFKLTGKLGEVMQESAAIAYSHVRANMGLFNINKKYFDKAFIHIHVPEGATPKDGPSAGITIATALVSLATGKAINRPLAMTGEITLTGKVLPVGGIREKIIAAKRSGINEIIIPEGSMTQIKKLPAHIKEGIEFHFADKYKDVFKIAFKNQLE >NC_018645.1|WP_014956486.1|1135850_1138799_+|PAS-domain-containing-protein MPTKKKKVLIAKEKFLETVDQEKKIKKSDRFFIVGIGASAGGLETLNVFFSIMPPDSGMAFVIIQHLSPQHKSIMASLLEKQTRMAVKQIEDGTKVLPNHVYLNPPGKNVAMFNRSLHLIEPMKTGVINMPVDFFFRSLSEDQKGKAIGIILSGTASDGTLGIKAIKSEGGMAMVQQPDTAKYDGMPRSAVETGLIDFVLPVEKMPEALTRYTQHPYLGLPDKIKITDSPNKNYIQKIFALIRSKTGHDFSHYKPNTISRRIERRLAVHQITRLSDYIQFIQKNPVEIDTLFKNLVIGVTSFFRDPEVFEVIEKEVIPNMLKDKPPDSTIRFWVTGCSTGEEAYSLAIIVSEIMDNIKKYFNVRIFATDIDPSAIDIARRGIYPENICADISPERLYQFFTKTHDGFHVKKQIRDMIVFSIQNVIKDPPFSRLDLVSCRNLLIYMDSTLQKKNIPLFHYTLNPGGILLLGTSESIGEHTDLFEPFNSKLKIFIRSKSFVGKGIDFSGKIYHDAQPGIKADEDVHLSAKTDIQAVIERTILDVYAPAGVLINDKYEILYFAGITAKYLSPPTGKPSFNVLDMACGDLKNKLTIALHKAAQKKTATVCKDVKISRNGTFCSIDILIRPITDQGLPKGSMLIMFDDKIPADASGEKTMGAVKTRKKSMALQSLEQELQSTREYLQATIEELETSNEELKSANEELQSFNEEIQSSNEELETSKEELQSTNEELATVNAELQTKVEEYSKTRNDMNNLLAATEIATLFIDTNLCIKNYTPAADNLINLIRTDIGRPLDDLKTCFGDVNLVGLARNVLKDLNTIEIEILSLDDIWYTLKMIPYRTVENLIDGVVMTFINVNKIKQADKFRRLATVLEDSNDAITVLGLNGDIRAWNKGAQAMYGWTESEALKMNISEFLPKDKQGELNSIIEKLKRHEPIPPFKSRRKTSTGKNLEVWLTITALMDETGQPIEIATTERNLAWLIEK >NC_018645.1|WP_014956487.1|1138810_1140973_+|PAS-domain-S-box-protein MGNKKEIPDNSELRQRAEKALKVSSVNNDCPVEFSPDEMKTLIHDLEVHQIELEMQNDELRRFQAELYTERARYFDLYNMAPVGFFSINEQKLIFECNLTAAKMLGTTRSTIVKQPVTRFILKEDQDIYYLHNKQLFETDVPQECDLRMLKNNGSAIWVRLATTVVQNSEGITSRRMVMSDITERKKVENILKERETFLKTLINAIPIPVFYKDKKGRYLEFNEAFEVFFGKKREDLIGKSVFDISPRHLAEKYTAQDNELFAIGGKQQYESQVKNTNGKLRDVIFSTSVVPGNKGSFIGLIGAILDITDRKRDEEDISNLRNYLSNIIDSMPSVIIGVDKDGRVNQWNHKAQIITGISKESAKGQLFEKAFPLLSSESERLKQAISMRKICSNPRQFRKEEDQVIFENITIYPLTANGRAGAVVRVDDVTEQVKLEEMMVQSEKMLSLGGFSAAMAHEINNPLAGVIQNTNVLSNRLTMKDMPANIKAAESSGTTMEAIHEFMHARKVPRMLEAITESGLRIADIVRNILSFSRKSDSFFSTHNPKVLMEKILALASSGYDLKKKFDFKSIVIEKKYEKDLPVIVCRGSEIQQVLLNVFNNGAYAMFEKQFSEKDYQPKFCLKLSEEREFNMLRIEVKDNGPGIDKETCKRIFEPFFTTKPIGSGTGLGLSVSYFIITKNHNGTMEVESELGKGTNFIIRLPMGACSIKDKHLFGLGEF |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_018645_2 | 1127805-1128164 | Unclear |
I-A,II-B,III-A
Consensus repeat of NC_018645_2
|
5 spacers
spacers of NC_018645_2
>2.1|1127835|37|NC_018645|CRT ATTTTTTCACTACGTTGGTATGTGTTTGGCTCTAAGG >2.2|1127902|35|NC_018645|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATTTTCTGGGGGCACAACGGTAGAAATGGGAAAAG >2.3|1127967|36|NC_018645|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TACATTAATAGTTCTGAATTGCAGCAAAAATTTGAA >2.4|1128033|36|NC_018645|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGACCACGGATTATGGATCATCATAAATGCATTTTC >2.5|1128099|36|NC_018645|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATGTAAAAGCAAAATTAAACGAACGAGGTAAAGCCT |
cas2,cas1,cas4,cas6,cas7,cas8b6,cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018645_2
The CRISPR arrays of NC_018645_2 >merge|NC_018645|2|1127805-1128164|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TAATTACCGCTTACAGTGTGGAATTGAAACATTTTTTCACTACGTTGGTATGTGTTTGGCTCTAAGGCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACATTTTCTGGGGGCACAACGGTAGAAATGGGAAAAGCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACTACATTAATAGTTCTGAATTGCAGCAAAAATTTGAACTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACTGACCACGGATTATGGATCATCATAAATGCATTTTCCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAACATGTAAAAGCAAAATTAAACGAACGAGGTAAAGCCTCTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC >NC_018645|2|2|1127805-1128164|CRT TAATTACCGCTTACAGTGTGGAATTGAAAC ATTTTTTCACTACGTTGGTATGTGTTTGGCTCTAAGG CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC ATTTTCTGGGGGCACAACGGTAGAAATGGGAAAAG CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC TACATTAATAGTTCTGAATTGCAGCAAAAATTTGAA CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC TGACCACGGATTATGGATCATCATAAATGCATTTTC CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC ATGTAAAAGCAAAATTAAACGAACGAGGTAAAGCCT CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC >NC_018645|2|3|1127872-1128164|PILER-CR CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC ATTTTCTGGGGGCACAACGGTAGAAATGGGAAAAG CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC TACATTAATAGTTCTGAATTGCAGCAAAAATTTGAA CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC TGACCACGGATTATGGATCATCATAAATGCATTTTC CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC ATGTAAAAGCAAAATTAAACGAACGAGGTAAAGCCT CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC >NC_018645|2|2|1127872-1128164|CRISPRCasFinder CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC ATTTTCTGGGGGCACAACGGTAGAAATGGGAAAAG CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC TACATTAATAGTTCTGAATTGCAGCAAAAATTTGAA CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC TGACCACGGATTATGGATCATCATAAATGCATTTTC CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC ATGTAAAAGCAAAATTAAACGAACGAGGTAAAGCCT CTTTTAATCAGACCAGTGTGGAATTGAAAC
>NC_018645.1|WP_014956142.1|1127421_1127742_-|IS66-family-insertion-sequence-hypothetical-protein MSKSWKKINEEKAIFWKTHIDQWTESRLSQIEYCRQNGLRPNRFTYWKIKFGKPNQPTGLVQVPVPTHFCQAGLKLNIGRELQVEIPDGFKKETLEQVLSVLKAVQ >NC_018645.1|WP_014956143.1|1127077_1127425_-|IS66-family-insertion-sequence-element-accessory-protein-TnpB MMNFPSDTKVYLFLGATDMRKAINGLSVIVSEQMQLDIFSSNLFVFCNRTQTILKILYWDKNGFCMWQKRLEKDRFKWPKTSDDVMNITSRELSWLVDGLNINQAHKPLKYSMIY >NC_018645.1|WP_014956144.1|1125500_1127033_-|IS66-family-transposase MTKGKVKGNRNLDEVKKIACDLIDENQILKEQVKSLQNMIFGRKSEKTPKDDGQMSLFDMPEPELPILEKEEEDVTIGEHTRKKRGRKPLPADLPRIDVIHELSEDERQCNCGCLKERIGQEESEQLDYIPAKVRVLRNIRYKYACKNCEGVEDDGPTVSIARMPEQIIPKSIATPGLLAHILTAKFADALPFYRQEKQFTRIGIELGRSTMCTWAMKVADACDILIDMMQKDILASPMIGADETPLLVLKGPRKSKSYMWIFRGGPPDMPIIQFQYHPTRSGDVAASFLNGYKGIVQTDGYKGYDFLDKITDIIHVACWTHARRGFKNVTKAAGNKKSSSGNAGTALKYISLLYKIEKEARVQELTPDQLYARRQKEAVPILEEFKKWLDARVEKVPPKSLLGKAIHYTLNQWHRLIQYTTDGIIRPDNNLVENAIRPFVVGRKNWLFSDTVKGARASALIYSLIETAKSNGLEPYWYLKYLFEHLPEAMTEDDFKALLPYNVDKKQLA >NC_018645.1|WP_014956481.1|1120548_1120830_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MYIIAMYDINTETKAGRKRLRHMFKLLKKYLIRIQNSVFEGELTKAKFEKMKYEVNDIIDSSKDSVIFFKSRDIKWMDKDICGFEKDDTDNFL >NC_018645.1|WP_014956480.1|1119556_1120546_+|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKQSLYLFSNSTIKRKDNSLMFEIDGEKKYRPVESICDLFLFNEHTLNTKLLNFLGQQKIPVHIFNYYGFYSGSFVPREQYLSGHVTISQAKHYLDDKKRMVLAYELLNAAASNIITNLTYYKNRERDIGEKILKIKELKKSLKNADSISYLMGIEGNIRDLYYSAFNEIVQNKVEFKKRIKRPPDNFINSLISFGNSLVYTTVLSEIYRTQLDPTVSFLHEPGYRRYSLALDISEIFKPILLDRMIFTMINKKELTEKDTDKDLNYCYLKDQGRMKFLRKYDERLKKTIKHKKLNRNVSYKRLIRLECYKIVKHILGEEKYTGFKMWW >NC_018645.1|WP_041279291.1|1118964_1119459_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MDNINFTGTQINYYFVCKRKLWLFTRAIRFEDENEYVQLGKLIDESTYKRNKKQIEIGNIKIDFIDNTGVIHEIKKSNKIEKAHIYQLKYYIYFLNKMGVKNIIGEIDYPKLKQRQKVILDAEDEMEFKTIFSDIHEILDRKKPPAIINKPYCKKCAYYEFCFV >NC_018645.1|WP_148278198.1|1118125_1118929_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRIKITAITNQPAFFPYNYQYAVHSALYSLIQESSANYSSFLHDKGYVKDGINKLFKLFTFSKLNFSPKNNGNGGFYKVSKIQFVFSTIMEKSMRHLILGIFSNQKMMLNLSGQRHFFDIVNVDIQEDCQFTNTEKFICLSPITVSSIMIKEKGKRVQHFLNYMVPAERDHFVENLKKNLINKYETINNIPYENMKFPFQFHFENNYIVKRNGRISKLIEFKNNIKVKAMEAPFYIEADPELIKIGYDCGWGEKNSAGFGCVEKAAK >NC_018645.1|WP_014956477.1|1117003_1118071_+|hypothetical-protein MNTIYIRTLKRAEHTVFCVADGQKTYYDPQFNRYIPYSSGQQIKRSLIDTLARQLNQLPAPTTFIFDVTKKKEITEGEVFGTCDPSHFDQLLGGWMKASKGGKEKTIKRRSPLSISAMRALHPLLAGIDRENITFDRSDRPNNTVIVRDPNGKELCEDDIITLLQDKDRSLIRKWIPDNKRATGLFVQDIAIDLRRLFCVTQSVFEPEITKETEDRLKESGWLESNNIFGNCLVAPPETRNKLIPAIAKAIINWRITSNQSRTFSLMETLAVSISTNANKIAGSIRAKLSEEDEKKAIPVIEEDLEGVETFVTLSAGGYFLTKSETAEALEEAEKNLIDRMMAFDYEDQIIKIND >NC_018645.1|WP_014956476.1|1115564_1116965_+|hypothetical-protein MISMTIGRTFLTAFNKKYNKSYTSKQFFETVFFELFFNHPKYMLWQTNSPFVQMKKGQKPHLLREEDRIEKLNNLAEKITTGDRDASIAIGFPASEANEFATTSGLVSDIDIPADEFGIYDSWIGAGLGIGVSGGYCIFFNDPEILLTLYDGWQVYRGFLNENSIDKLAPNKINTWNGQWLNYYHGKKFRKGFDFGVLDNMKMFSHDKQGNILINTVKWSQLFFNLSSKFPDQTLMGYLYSLGQTNKTIGFIPFHFQQARRIKDFYKILFGKNNAIKDSRAYEEMFGIHIKRACELGAIGLHALQPKDLKKYFKQGKTPNFKKTAIPVLKKGESAEDFQTRKQKASNKEYEKVILFRTYKTWLVAMLTKNKEDMLDYTEKIARALHEYREDGRKTDRKNLIEKELLIAASRKKFIDALAVVIKDVQSEYLEIIRELKKRVHLMTSEDFAYFVVLLRFDYAYEERNI >NC_018645.1|WP_014956475.1|1113391_1115551_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MDVCDHIKAKGAPEFTTLYAHLCQVKSAIKVFAGYLNFDVETAKLGAVFHDIGKASPIFQERLVSKYKTGQSTFRHEIASCFFLSLVEKTYHPQLIEMIIAHHKSIENDKGLKGILDLEENEDDIFEFHIEHWDVWKLDALKILAGFGINSRDIGYDEAKENYFKVLEYCENTIMNNGYSEWRGLLMSADHFASALSSAAPDYLPHTFKKPILEFYNRTSQLYPLSLKKASSNRPHTMVVACTGAGKTDYLFRRCRGRVFYTLPFQASINAMFKRVKTDLIKLNPNLDIRVLHSSSKISSGAESHEDMLLQRLVGSSVKVLTPYQLASIIFATRGFESMIEDLKGCDVILDEIHTYDNVSKSIVLKIVEVLNHIGCRIHIGTATMSSSLYNEIIDLLGRDFVSEISLDSIELEKFDRHILHKIGSWDDAHAVIKEAIKKNNKILLVCNRVDSAQEMFEIVKEAFSDIPLLLIHSRFKRGDRRDKEASLLGLDSQGNTTFEFNTSSNACIVVSTQVVEVSLDISFDLMITETAPIDSLIQRFGRINRKRTPATIGTYKPVYVIAPPEDEKAARPYELEILRKSYAVLDHDQVLHESDYQEKINCVYPDLSYTSIENHTAYKGNGRWNVPMLTHRDRSILLELLEVDSVNCIVDSDCQAYEQAGFEDQMMLEIPVRYYAVKNYFQLNFGSNPFVIPDSGYSRETGLDLAKANDRKADLNFL >NC_018645.1|WP_041279292.1|1128390_1128909_-|MmgE/PrpD-family-protein MNLLEEIRTQENIDIENVDRIDLEIGPVASTAATIKAPKIGVEGKFSVWFLAALALAEGNVTLAKFTDEKVNSPRLVTLCKKIHTSLDPRIGFGARVKILMKDGTKYARFLAKPKGDPDNPLTFEQLAEKYRNAAIMAISKEKTENLIKKIKSLEQINNMNEIVALTIHPNA >NC_018645.1|WP_041279294.1|1128927_1129731_-|MmgE/PrpD-family-protein MELTRRLAQFVCATRFEDLPEPVVNKAKECFLDWQGVALAGTTDPGSKVMMHYVMAVGGKPEASVIGSSLKTDIANAALANGMIGHALDFDDYHDETVIHASAACVPAILALAEKFNTSGREFITAMVLGVDVCIRIGLALGDYHYQRGWHTTATAGTFGATAGAAKLMGLNADQLVTAFGICGTQASGLRQVFGTMCKPFHAGKVSMEGIMSASLASMGFTASQNMLEGELGLLDVLTETPDQAIMLDQLGQKFHINRLSIKPYPT >NC_018645.1|WP_041279295.1|1129754_1131425_-|methyl-accepting-chemotaxis-protein MNLSILKKKTRLRTIRSKILTLIIGLMVFTSMVFTFITTKNYQRELTAHYHKLSKETLSSTIRIIDSEYNDLLSYEINSIKTQRSLMENTGKNLLLMINSFYDLHKTGFLTELTAKELCLKNIEEYRYKKNNYFFVYDLNLTGLSHPSKEMVGKNWSGFEDLKKRDALQLVRENLKTEKKNFTVFMWPRLEDMKPVKQIGFFMYYPQWKWIIGTALEMGYIEKISCAKEKLILSKLNKILGQVSLSNVGGIIIFNSHGKVILHTSNLKDIDLKLSGMTLNPSIQNYLKKSTGNFSQPVEYPYPNKNQKQMTQSAFVDYFKSMDWYVAAFVDNQTLKKPGSAIAARHSAIILMFSMIGIAFAVFISKKIASPLADLTQYAKNLANSNFKLHDDPLLKSIRANDRNDEIKQLADAFAFMEFELKKNLLDLKNYQQNLEHLIEIRTKALSDTNKDLTKEIQERKRLEEKHNKLIKELQKALDNVKMLSGLLPICSNCNKIRNDKGDWNELEDYIESHSDVLFTHGLCQTCADKLYGHNAWYIKSKNKKLRNQNPPHQTP >NC_018645.1|WP_041279296.1|1131452_1132622_-|hypothetical-protein MNRVITLTVIGLYFVLTVFLIDAWAQMPFETTPITNKGKKWRIGYLEGGPYANYQSILKSITKTLMDAGWIQHSSIPECRDEIETKTLWKFLSTQIQSNYLEFVSDAYWSAEWCDAKRKSLKHDIIKRLNESKDINLMLAFGTWAGQDLANNQHNTPTMVLSASNAIRSGIIKSVENSGFDHIHAWIDPNKSERQLRLFHKITGFKKLGIAYENDLDGRSYSAVEDVQNLSRELGFQIIECHLPGQASGTSHEEAELVKCYEQLAQKIDSMYITDYAGLTKKNLNKLLMPLFENKVATFAQTRYDLVKYGILMGAGRSDFKADARFYTEILAGILNGKKPGDLPQEFKSPLKIVVNLESSKQIGFRIPLDILAGAFEIHETIHHPENKE >NC_018645.1|WP_014956485.1|1132945_1135351_-|endopeptidase-La MTYENRPIVPKTVENRDENKKGQLIKQETKPDMLYLLPITGRPHMPGQVQPLMVNKKLWEETLNKVSSQAKSLLGLAYLKKIKSKDVYKEDFPKVGCVVRIENIVKVQESVQFIAQGLERFRIKKFLSDKPPFAVQVEYFEKIEENEIELKAYAISIINSIKQLLALSPLYSEQVRLFLSMFSPDKPAPLTDFATGITMASGDELQEILELPLVMDRMKKAMMMLQKEIEIAKLQNKIKKDLNHQMEDNKRTFFLKEQMRAIQKELGLLKDDKTSDVDKFKKRFAALFPTDQVVKRFDDEIKKLSVLEIGSAEYGVTRNYLDWVTSFPWGIHSKDNIDIDLAQKVLDRDHAGLSDVKDRIIEFFAAGIYRKDIAGSIILFVGPPGVGKTSIGKSIAQALGRKFYRFSLGGMRDEAEIKGHRRTYVGALPGRLVQALKDTEVSNPVIMLDEVDKIGVSYQGDPASALLEVLDPEQNVEFMDHYMDLRMDLSKVLFICTANQLDTIPRPLLDRMDKIKLSGYITEEKIQIARKHLWPKLLRRNNMTSKVITITNPTIRYLIEGFAREAGVRDLEKLLNKIIRKSIVTILKEKKKKIRINIESLDKLLGSPTFKHEKQMSGVGVVTGLAWTQMGGATLSIEAVRIHEKKPGFKLTGKLGEVMQESAAIAYSHVRANMGLFNINKKYFDKAFIHIHVPEGATPKDGPSAGITIATALVSLATGKAINRPLAMTGEITLTGKVLPVGGIREKIIAAKRSGINEIIIPEGSMTQIKKLPAHIKEGIEFHFADKYKDVFKIAFKNQLE >NC_018645.1|WP_014956486.1|1135850_1138799_+|PAS-domain-containing-protein MPTKKKKVLIAKEKFLETVDQEKKIKKSDRFFIVGIGASAGGLETLNVFFSIMPPDSGMAFVIIQHLSPQHKSIMASLLEKQTRMAVKQIEDGTKVLPNHVYLNPPGKNVAMFNRSLHLIEPMKTGVINMPVDFFFRSLSEDQKGKAIGIILSGTASDGTLGIKAIKSEGGMAMVQQPDTAKYDGMPRSAVETGLIDFVLPVEKMPEALTRYTQHPYLGLPDKIKITDSPNKNYIQKIFALIRSKTGHDFSHYKPNTISRRIERRLAVHQITRLSDYIQFIQKNPVEIDTLFKNLVIGVTSFFRDPEVFEVIEKEVIPNMLKDKPPDSTIRFWVTGCSTGEEAYSLAIIVSEIMDNIKKYFNVRIFATDIDPSAIDIARRGIYPENICADISPERLYQFFTKTHDGFHVKKQIRDMIVFSIQNVIKDPPFSRLDLVSCRNLLIYMDSTLQKKNIPLFHYTLNPGGILLLGTSESIGEHTDLFEPFNSKLKIFIRSKSFVGKGIDFSGKIYHDAQPGIKADEDVHLSAKTDIQAVIERTILDVYAPAGVLINDKYEILYFAGITAKYLSPPTGKPSFNVLDMACGDLKNKLTIALHKAAQKKTATVCKDVKISRNGTFCSIDILIRPITDQGLPKGSMLIMFDDKIPADASGEKTMGAVKTRKKSMALQSLEQELQSTREYLQATIEELETSNEELKSANEELQSFNEEIQSSNEELETSKEELQSTNEELATVNAELQTKVEEYSKTRNDMNNLLAATEIATLFIDTNLCIKNYTPAADNLINLIRTDIGRPLDDLKTCFGDVNLVGLARNVLKDLNTIEIEILSLDDIWYTLKMIPYRTVENLIDGVVMTFINVNKIKQADKFRRLATVLEDSNDAITVLGLNGDIRAWNKGAQAMYGWTESEALKMNISEFLPKDKQGELNSIIEKLKRHEPIPPFKSRRKTSTGKNLEVWLTITALMDETGQPIEIATTERNLAWLIEK >NC_018645.1|WP_014956487.1|1138810_1140973_+|PAS-domain-S-box-protein MGNKKEIPDNSELRQRAEKALKVSSVNNDCPVEFSPDEMKTLIHDLEVHQIELEMQNDELRRFQAELYTERARYFDLYNMAPVGFFSINEQKLIFECNLTAAKMLGTTRSTIVKQPVTRFILKEDQDIYYLHNKQLFETDVPQECDLRMLKNNGSAIWVRLATTVVQNSEGITSRRMVMSDITERKKVENILKERETFLKTLINAIPIPVFYKDKKGRYLEFNEAFEVFFGKKREDLIGKSVFDISPRHLAEKYTAQDNELFAIGGKQQYESQVKNTNGKLRDVIFSTSVVPGNKGSFIGLIGAILDITDRKRDEEDISNLRNYLSNIIDSMPSVIIGVDKDGRVNQWNHKAQIITGISKESAKGQLFEKAFPLLSSESERLKQAISMRKICSNPRQFRKEEDQVIFENITIYPLTANGRAGAVVRVDDVTEQVKLEEMMVQSEKMLSLGGFSAAMAHEINNPLAGVIQNTNVLSNRLTMKDMPANIKAAESSGTTMEAIHEFMHARKVPRMLEAITESGLRIADIVRNILSFSRKSDSFFSTHNPKVLMEKILALASSGYDLKKKFDFKSIVIEKKYEKDLPVIVCRGSEIQQVLLNVFNNGAYAMFEKQFSEKDYQPKFCLKLSEEREFNMLRIEVKDNGPGIDKETCKRIFEPFFTTKPIGSGTGLGLSVSYFIITKNHNGTMEVESELGKGTNFIIRLPMGACSIKDKHLFGLGEF >NC_018645.1|WP_041279297.1|1141000_1141192_-|hypothetical-protein MDLMQFVITLAIIGALLWVVNAYIPMDRKIKQILNIVMVVAVALWVCNLFGVFDFFQGFHIGK >NC_018645.1|WP_014956488.1|1141365_1142592_-|OmpA-family-protein MKVFSMKIIPLLLGTLFLFGCYARQQVHSIPDFTATQFDSNEYASAVDNFLIIMDASSSMDDDYMGNKKFIIALEIINRLNLTLPELLQNGGLRSFGHDKAVSEKNTVLFYGMEPYSTKALKEKLNLIKTSGGTSPMHSALTEAGQDLNGVSGKTAMVIISDGQEAYGMGHSITLAAAQALKNQLGPGLCYYPVIIGDNNKGTDLMEKISGMGECGFATNADTLLTGDGMARFVKDVFLTQKTIRPMAPKDSDNDGVTDNMDKCPGTPHGTMVNADGCPPVTQKPAPAITETLNAQGAWVIDEAYFDFDKAVVKPSAFEFLDNIAEFLKNNPEVFININGHTDNIGTKAYNDVLSLRRAEAVKTYLTNKGIEKNRLACQGFAFSKPVASNKTDKGRALNRRVEIYPVK >NC_018645.1|WP_173391134.1|1142790_1142925_-|hypothetical-protein MPKIKIVCTISDTPGMIRKLIAVGMRIARLNFSHGTHGEHEKKI |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_018645_3 | 1808150-1808247 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_018645_3
|
1 spacers
spacers of NC_018645_3
>3.1|1808176|46|NC_018645|CRISPRCasFinder CCGAGGTGGGCCTCCACAGGGGCGTCACTCCATGATACCATGGGTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018645_3
The CRISPR arrays of NC_018645_3 >merge|NC_018645|3|1808150-1808247|CRISPRCasFinder CGCTACTGGCAGGCCGTCGCCCGATGCCGAGGTGGGCCTCCACAGGGGCGTCACTCCATGATACCATGGGTTCGCTACTGGCAGGCCGTCGCCCAATG >NC_018645|3|3|1808150-1808247|CRISPRCasFinder CGCTACTGGCAGGCCGTCGCCCGATG CCGAGGTGGGCCTCCACAGGGGCGTCACTCCATGATACCATGGGTT CGCTACTGGCAGGCCGTCGCCCAATG
>NC_018645.1|WP_014957039.1|1803846_1805469_+|IS66-family-transposase MKKIQLTQEEVDALLERVKANNLTNGDYDIIKSMADAVTILSQALNKKATSIKRLLTMLFGAKTEKKDKVLKNTTTTNNNNTTANNNDKSKKGTAPKPGSNQKKAGHGRIPACDYTGADRVSISHDKLKHKDPCPLCPNGKLYKIKDPGVAIRINGQAPLNATVYELEKLRCNLCGEVFTAAAPDNTTGKQYDETAKAMIALLKYSCGFPWYRLAGLQKSLGIPVPASILWENAESSADHIYPAFDELMRQAAQGNVFHNDDTTMKILDLIKENQFLDKKERTGIFTSGIISVLDDDKRIALFFTGRCHAGENIASLYDLRNKEKPPPLQMCDTLSRNMSSEFKIILIHCMVHARRNFVDVVTAFPDECRHVIEILAKVYETDAIAKTERMSPEERLTYHQTHSGPKMKALRTWLDKQINEKLVEPNSGIGNAIAYMRKHWTELTQFLRVPGAPLDNNICEQALKRSILNRKNALFYKTQHGAYIGDMFMSLIHTCSLMKVNPFNYLVALQKYSARVFKNPSQWMPWNYETAATLAAQSA >NC_018645.1|WP_014957038.1|1803174_1803573_+|hypothetical-protein MKPATSSTTDSALEEVRQQFSEWRRTKIGRGRIPEFLWQSAIGLFNTGGYSLHKISKTLRLNHTDFKKHVNKNLAVPQEKTPAFIELEPPVSDSECVIEMENISGSKMSMCFRGKPDPNLIELGKSFWRKPA >NC_018645.1|WP_014957037.1|1802159_1803080_+|UbiA-family-prenyltransferase MSGNKTDLVVQAGGSGSVQAITHYLELFKLHLCLYIGLSAVFGHVMACQSFSFESLLVGILVLVLACGSAVLNNIQDRVYDGFFFRTRHRSLPQKKVPVFHAAVIAIVMIWCGLFGLLLFTGLFCFFWGGMALIAYNGLYTPLKKQSLLAIVPGTLCGMLPLLIGWAAAGKPLSDPHILMIMVVMGLWQIPHFFIILLKTKPSPSGMAGYNRFPCFTKIFSPNEIKLQILIWTSLYSLAILLFLLNGSIKNPLLSNLSGLNAVMIPFLVSIMVIKSGKWNLPFAFVSINLSVLFFMGAGIFDNCLL >NC_018645.1|WP_014957036.1|1801558_1802170_+|cytochrome-c-oxidase-subunit-II MNDIVNPVALVDRSFYFIIGFSFVFLFAITLVMIWFVIRYRRSKHPSPSDIRGNLLLETVWIVLPTIIALSMFVSGWRSYTGLRNVPEGALEIEVIGQSFSWLFYYPNDKETESEIVVPVNTPVKLNITSADVIHSIFIPAFRVKVDAVKGLYTYAWFLPEKTGEYFFQCTEFCGTGHSDMTGVVRVVSQEEYEKWVNQEDEW >NC_018645.1|WP_014957035.1|1801263_1801551_+|cytochrome-C-oxidase-subunit-IV-family-protein MENKPLQHFFEYKTLFNVLLVLLMFTGITVAVSFMDLGKLNVWITLLIASVKASFVLLFFMHMKFEGRVLLLSFLGTIFFLGIMISFTFWDVAFR >NC_018645.1|WP_014957034.1|1800542_1801139_+|cytochrome-c-oxidase-subunit-3 MSSSLDESGKKMGMWLFLYTEIILFGGLFVLYAVYFARYTSDFVDGGKELNRLFGVVNTVILLVSSFAVAASITAIQKKEKKWVMAGILTALLCGLVFLVNKYFEWSHKIEYGIFPNSEKLVDGPPGQNMFFGLYYVITGLHGVHIVIGMSLLLISLVLVMREKITHDRFAMLENSGLYWHLVDLIWIFIFPLFYLVI >NC_018645.1|WP_014957033.1|1798873_1800502_+|cbb3-type-cytochrome-c-oxidase-subunit-I MEGATSFFETPSPARYKGVWSWLITTDHKRIGLMYMFSILFWFLLAVLLGGLLRLELMFPGETVIGSEIYNSMFTLHGVIMIFLFIIPGIPAIFGNFFLPMQIGTDDVFFPKLNLLSWYLYMSGGAIAIISLFSDGFADTGWTFYVPFSISTNTNVSTAVFAAFVLGMASMLTGLNFITTVHKMKRKDMGWMQIPLFTWTLYATSWVQLLATPVVSITLLLVIIERYVGVGLFDPSRGGDPILYQHLFWMYSHPAVYIMILPGMGVISEIIPVFSRKSIFGYKAIVASSMAIAIAGSLVWAHHMYTSGMSDTAIFVFSLLTFVVAIPSAIKVFSWVSTLYKGSIQMAPPLFLALCFIYLFSVGGLTGLVLGAAGTDIHVHDTHFVVAHFHFTMFGGTGFAFFAALHYWWPKMFGRMYDFKRAYIGAILVTGGFVLHYVPMFILGLQGMPRRYFDYLPQYATGNFFAGFGAFFMIIGIFLMMTNLMLSFRKQRDAVSDPWGGTTLEWQTPSPPPLHNFITEPEVLAYPYDFTGVVERYASQKK >NC_018645.1|WP_158406170.1|1797992_1798856_+|SCO-family-protein MHPDHGTATPRQDVMVGEGEPDQSIHDHTQMVMETEKQEPALTQQIKVEEQLGKYAALDTRFKDDNGNPIKLETIFDKPVVLLPVYFMCPSVCDFLQADLANALNFVDQIPGKEFNVVTLGFADDEDHTHANIAKTNYSNLIKRDFPLENWFYLTGDNENIHKLTDSLGYYFIKTKPHFYVHPSVLVVLAKDGKIIRYLYGPNFLPFDLGMAISEADRGEPGISIKRGVLSFCFDYDPQKKTYVFKMFRIVGTAILILVLGFIIFLLYPSKRDKSKKDKTVFKNENS >NC_018645.1|WP_014957031.1|1797351_1797897_+|DOMON-domain-containing-protein MTKNYFIISIAATVFFLSLLPLYAMDYQHTLEVKDMQFSWTIEGEQIHVQMSAKTTGWVAVGFDPEKAMQGANIIIGAVKEGKFKVEDHYGNRKRGHKSDEEMGGKNDVLNPAGSEADGITTISFSLPLDTGDAYDKPIKQEGTTKVMLAYGAGKDSFRNRHPFRTIYEINFSTGENKKIK >NC_018645.1|WP_014957030.1|1796910_1797336_+|hypothetical-protein MTEIIFEFLNKIGFTHPLHPALTHIPMGMVMGAVIFRLASFLPKLRFLAKTGYHCVVLGLLGVFPTAFTGYLDWQHTYMGQWEFLIVLKMILAVILTVVLAIIVITDDPENPKFDKKTLFYIVIVFLAVGLGFSGGELQYG >NC_018645.1|WP_014957041.1|1814734_1816066_-|hypothetical-protein MNCSSNFDWFIDKLHNTFDRLPDYRSFSPALTYEVKNAVLGAFSMFFSQSASFLSYQNSMKQAKGKSNAESLFKIEKIPSDNQIRNILDGVSPDNFYSVFSDCYSKIEESGHLGGYRFFQDCLLVAIDGTEYFRSSKIHCKNCTVTHHKNGKVSYSHKVLTPVITQPSSTTVIPLEPEFVIPQDGSKKQDCELNAAKRWIERNAHMADEKSIILGDDLFSREPFCKQLLLKGFHFILVCKPDSHKTLYEYLDGFIKSNDVSSISSRRWNGKYHEKIILRYFNNLPVKDGENVLHVNWADITITNTKTQETCYYNSFITDFIIDDSNVEQIIQAGRARWKVENENNNVLKTKGYHLEHNYGHGKKFLSSTLLTLNLLAFLSHIFLEFMDKTYFSVRKALSVRKIFFHDFKALTKYLYFDNWKHLINFMAEQLELNITDIKMNSG >NC_018645.1|WP_014957042.1|1816302_1816653_+|type-II-toxin-antitoxin-system-RelE/ParE-family-toxin MKEINFYRSESGKSPVEEFLDNLTAKQAKKVVWVLNMIEEHINVPSKYFKKMVNTDNLWEVRVNLGSNIFRILCFFDGSEIIILTHAIQKKTQKTPRQAIKIAEKRMKDYFKRKKL >NC_018645.1|WP_014957043.1|1816649_1816925_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MSDLQKYIKKRKKKDPEFAKDFDSGYEHFKIGVMLKQAREESGLTQEELASRLNTKKSAISRIENHAEDIKLSTLEKFANALGKRLRLEVA >NC_018645.1|WP_014957044.1|1817216_1818569_+|transposase MAKYKDYSYDQGVFLPVFFDKQILPGTFEYSLNHLIDNEVDLTIFDNRYNNDKTGAKAYDPRILLKIILFAYSRGITSSRKMFAVDGCKLPSNASKEWSGTKTDFKNKALKLEKAIERIIQKHREIDHIEEKNNIIDTDTQYIATPAKADKKIRNWTKDNDDKIGASGKPVKSNITDNDSAKMKTSNGVIQGYNGLAMVDNKHQVIVGAEAFGKGPEQDLLKPLINNTKENLGDDVFENTRLTADSGFHTNKNMDMLAEENIDAYVADNLFRKRDPRFDNAGRYKELFRKQKNTKLFSKKDFYFDPEFKFSMCPARKRLYRTGNGIDKKGNFVTRFEGPKSACGPCKLRSKCLRKPDKTLQRQVAYFHVSRKTPETATEKMKLKIDSPSGRQTYSKRLGTVEPVFGHIRHTMKLNWFSMRWKIKVNSQWLLFCTLHNLKKIHRYGSVEVT >NC_018645.1|WP_014957045.1|1818813_1819722_+|alpha/beta-hydrolase MKTDITVMKKYIASIKNNKTIAIYLITAILCLLFSACAINNPATQNKKLTAQSADDSRIAYGTRGQGETTLLFVHGWLCDHKVWQPQIDYFSNHYKVAWLDLAGHGDSETNRQKFTMSAFAQDVKSVSDKVGGEKIILIGHSMGGPIVIETAKLLGEKVVGIVGVDAFYTPLASFPEAMKLVFLEKLKNNYPVALEETVKSMFAKSANPDLINLYYKNMLAADHKMGISSLYECIKWNSQQEPLELKKFSSKLYNINGAPTGKEKVLHESVVLISGVGHFVAQIKPDEFNAAFEKIIENLKD >NC_018645.1|WP_014957046.1|1819835_1821404_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MGKLQSKITTRRWRHEDIPEIIECSRATYHDYSEEFIYSERHYEMQFAAFPQGQFVAVCNKKIVGYATSIIVSIDDDFWYDVDELTGAGTFSTHNPDGDTLYGADIAVHPDYQRRGIAMLLYSRRKSILKRYNLKQMIAYGRLSGYRNYAGKMTAEQYVEKVKKGELKDQALSTHLKVGYQVKKVQLDITIDHSSLNYSTFLVMPNPDYNLAKKRISSAVFPKIQARRVRVCAAQYHMRPIRSFEDLERSVEFFVDTADSYHCHFLLFPEYFTYQLLSFQEKKMSMRDAALKLAGYTDQYIDMFKRFARKYNIYIIGGSTPVLREGKFYNTAHLFTPAGNVHTQDKLHITPAERNEGGIEPGTSVRIFNTPLARIAIQVCYDIEFPEVSRLLTLAGAEIIFVPYYTEEKKAYYRVRHCAQARAVENFIYVVMTGSVGNMQTRSGSFLNYSQAAILTPSDFSFPEKGIEGEADPNVEAVVISELALSSLSQQRHVATVRPLHDMRLDLYDLMSKDKIKILRVE >NC_018645.1|WP_014957047.1|1821534_1822485_+|radical-SAM-protein MNSKTVFGPVPSRRLGKSVGINNIPPKICTYSCVYCQLGKTQKMIVYRCVFHDPDRLVEETKTKLINAQSNNESIDYLTIVSDGEPTLDAKLGLLIDRLRPLGIKIAVITNSSLLHRIDVRHDLCKADWVSVKIDTLDEKTWRKIDRPHNGIKFDVMLDGISSFAKKFTGRLVTETMLIKGLNDDRQNIEKTADFILGIDCATAYLSIPTRPPAQKWVKPPGEQALNQAYHVFDDRGINTEYLIGYEGNQFAFTGNIEDDILSITSVHPMRKDAVAGYLKKAGSDFSVIEKLLEENKLKVSEYQNEQFYIRKLPVI >NC_018645.1|WP_041279371.1|1822481_1822667_-|hypothetical-protein MENIIKRDKFDFEIGYLTKSPCLTCDKKSSLPKCHDGCLILDEIQTKLARGISSQRSSYES >NC_018645.1|WP_041279901.1|1822945_1823920_+|MoxR-family-ATPase MEEIKESIEKSHLLISSIRNEISKQLVGQEKLVDSLLTGLLTGGHVLIEGVPGLAKTSAVKALASVVQAQFKRIQFTPDLLPADLTGTEIYRPKTADFVTRKGPLFNNIILADEINRAPSKVQSALLEAMEEKQVTIGDQTFVLPSPFLVLATQNPIEQEGTYPLPEAQVDRFMLKVCIDYPDKAQELEILKKNSFQKTDTVNPVISCDQLAAMGELIDHIYVDEKLKEYIVDLVFATRQPEKYGMDMAEYIEFGASPRATIFLAKAARVNAFLSGRAYVTPQDIKLVGPDVLRHRIILSFEAEAEDISCEDIIQTLFDSVEVP >NC_018645.1|WP_014957049.1|1823938_1824817_+|DUF58-domain-containing-protein MIPAHIIKKIKRIHIKSSRTVNSIMAGQYKSVFRGSGIEFEEVREYCPGDDVKTIDWKVSARLGKPFVKLYKEERESIVMLLIDMSASLKFGTFFGPKLERAAEVASVLAFNAVKNNDKVGVIFFTDRVEKYIPPKKGSGHIWRVIKEIFTFSPQGKGTDISEALDFLAKISKKRSFVFVLSDFLDDGYLKSLRTVRQRHEVIGVMIYDQGAFELPFKGIVTLSDFETDGEMVFDAFDTHTRKKFFTAKQANHKKTLTLFSKAQSDVIELETAASVSDTLSRYFRLRERRLL |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_018645_4 | 3489798-3490420 | TypeI-B |
I-B
Consensus repeat of NC_018645_4
|
8 spacers
spacers of NC_018645_4
>4.1|3489835|37|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAGCAAGCTTAAGGGGCGAGGCATTAAAATAGTTGTT >4.2|3489909|37|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAGCCAACTATCTGGGTATGAATATTGCCGAAATGTT >4.3|3489983|36|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCAAGTCGCCTTTATCAACGGTGATCGTCGGCTCTG >4.4|3490056|35|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGTCGGTGAGGGCCTGATTTTCGAGACTCGTGTG >4.5|3490128|36|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCGGAAGGCCGCCACCCTCAGCGGTTGTTGAGTTCG >4.6|3490201|37|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACCTGGGGCGGCTTGTATAGCGCCCAAACCCATAAG >4.7|3490275|36|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGAGTTGATAAAAAACCGCACTGTAATTTTCAGCAA >4.8|3490348|36|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CATGCTGTAATCTGTTCCGGTGTTGTCCAATTCACA |
cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b1,cas6,cas2,cas1 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018645_4
The CRISPR arrays of NC_018645_4 >merge|NC_018645|4|3489798-3490420|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTCTGAACGGCATATCCAGAAGAACAAGGATTGAAACCAGCAAGCTTAAGGGGCGAGGCATTAAAATAGTTGTTGTCTGAACGGCATATCCAGAAGAACAAGGATTGAAACCAGCCAACTATCTGGGTATGAATATTGCCGAAATGTTGTCTGAACGGCATATCCAGAAGAACAAGGATTGAAACCCAAGTCGCCTTTATCAACGGTGATCGTCGGCTCTGGTCTGAACGGCATATCCAGAAGAACAAGGATTGAAACATGTCGGTGAGGGCCTGATTTTCGAGACTCGTGTGGTCTGAACGGCATATCCAGAAGAACAAGGATTGAAACCCGGAAGGCCGCCACCCTCAGCGGTTGTTGAGTTCGGTCTGAACGGCATATCCAGAAGAACAAGGATTGAAACAACCTGGGGCGGCTTGTATAGCGCCCAAACCCATAAGGTCTGAACGGCATATCCAGAAGAACAAGGATTGAAACTGAGTTGATAAAAAACCGCACTGTAATTTTCAGCAAGTCTGAACGGCATATCCAGAAGAACAAGGATTGAAACCATGCTGTAATCTGTTCCGGTGTTGTCCAATTCACAGTCTGAACGGCATATCCAGAAGAACAAGGATTGAAAC >NC_018645|4|4|3489798-3490420|PILER-CR GTCTGAACGGCATATCCAGAAGAACAAGGATTGAAAC CAGCAAGCTTAAGGGGCGAGGCATTAAAATAGTTGTT GTCTGAACGGCATATCCAGAAGAACAAGGATTGAAAC CAGCCAACTATCTGGGTATGAATATTGCCGAAATGTT GTCTGAACGGCATATCCAGAAGAACAAGGATTGAAAC CCAAGTCGCCTTTATCAACGGTGATCGTCGGCTCTG GTCTGAACGGCATATCCAGAAGAACAAGGATTGAAAC ATGTCGGTGAGGGCCTGATTTTCGAGACTCGTGTG GTCTGAACGGCATATCCAGAAGAACAAGGATTGAAAC CCGGAAGGCCGCCACCCTCAGCGGTTGTTGAGTTCG GTCTGAACGGCATATCCAGAAGAACAAGGATTGAAAC AACCTGGGGCGGCTTGTATAGCGCCCAAACCCATAAG GTCTGAACGGCATATCCAGAAGAACAAGGATTGAAAC TGAGTTGATAAAAAACCGCACTGTAATTTTCAGCAA GTCTGAACGGCATATCCAGAAGAACAAGGATTGAAAC CATGCTGTAATCTGTTCCGGTGTTGTCCAATTCACA GTCTGAACGGCATATCCAGAAGAACAAGGATTGAAAC >NC_018645|4|4|3489798-3490420|CRISPRCasFinder GTCTGAACGGCATATCCAGAAGAACAAGGATTGAAAC CAGCAAGCTTAAGGGGCGAGGCATTAAAATAGTTGTT GTCTGAACGGCATATCCAGAAGAACAAGGATTGAAAC CAGCCAACTATCTGGGTATGAATATTGCCGAAATGTT GTCTGAACGGCATATCCAGAAGAACAAGGATTGAAAC CCAAGTCGCCTTTATCAACGGTGATCGTCGGCTCTG GTCTGAACGGCATATCCAGAAGAACAAGGATTGAAAC ATGTCGGTGAGGGCCTGATTTTCGAGACTCGTGTG GTCTGAACGGCATATCCAGAAGAACAAGGATTGAAAC CCGGAAGGCCGCCACCCTCAGCGGTTGTTGAGTTCG GTCTGAACGGCATATCCAGAAGAACAAGGATTGAAAC AACCTGGGGCGGCTTGTATAGCGCCCAAACCCATAAG GTCTGAACGGCATATCCAGAAGAACAAGGATTGAAAC TGAGTTGATAAAAAACCGCACTGTAATTTTCAGCAA GTCTGAACGGCATATCCAGAAGAACAAGGATTGAAAC CATGCTGTAATCTGTTCCGGTGTTGTCCAATTCACA GTCTGAACGGCATATCCAGAAGAACAAGGATTGAAAC >NC_018645|4|3|3489798-3490420|CRT GTCTGAACGGCATATCCAGAAGAACAAGGATTGAAAC CAGCAAGCTTAAGGGGCGAGGCATTAAAATAGTTGTT GTCTGAACGGCATATCCAGAAGAACAAGGATTGAAAC CAGCCAACTATCTGGGTATGAATATTGCCGAAATGTT GTCTGAACGGCATATCCAGAAGAACAAGGATTGAAAC CCAAGTCGCCTTTATCAACGGTGATCGTCGGCTCTG GTCTGAACGGCATATCCAGAAGAACAAGGATTGAAAC ATGTCGGTGAGGGCCTGATTTTCGAGACTCGTGTG GTCTGAACGGCATATCCAGAAGAACAAGGATTGAAAC CCGGAAGGCCGCCACCCTCAGCGGTTGTTGAGTTCG GTCTGAACGGCATATCCAGAAGAACAAGGATTGAAAC AACCTGGGGCGGCTTGTATAGCGCCCAAACCCATAAG GTCTGAACGGCATATCCAGAAGAACAAGGATTGAAAC TGAGTTGATAAAAAACCGCACTGTAATTTTCAGCAA GTCTGAACGGCATATCCAGAAGAACAAGGATTGAAAC CATGCTGTAATCTGTTCCGGTGTTGTCCAATTCACA GTCTGAACGGCATATCCAGAAGAACAAGGATTGAAAC
>NC_018645.1|WP_041279564.1|3489036_3489639_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MSFFCHGGNCILTATHILQYLFCPRFIYFENVLDIPENQGSRFKVAKGREIHKKIRKTNPEYLRTKLGVIKKESDVYLDSDSGICGIVDEILFMADGCAVPLDYKYAEFKDRIFETYHFQLVFYGKLIKENYGVPVNDGYIVYTRSKNKLVRVDLKKKDFEKLNDTIEEIDVIIKNGKYPKPTKYKKRCIDCCYKNICES >NC_018645.1|WP_014958325.1|3486633_3489036_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MFSSKLYSHPDISLIDHLQNVADMCEEKFLSHQTGLDDFFEKKSWQKLIWIMGFCHDFGKATCFFQAYLAEKDEKIKAGMRGKKETNHALISAVLSHFILCSIVKKSKNRNDLWEIMPFLIFMAIKRHHGNVNNAVRMNNAKEDENELDIKYEYIDRQFDNIDTDEFEHLLALLEKKSGINLNRSDFPESLSKYFKQNILRGEKKRIKAVDKKIEYYFIFQYLFSLLIQSDKEEAIFNRRFEFKRKDIQGDIVKNYIKDNFESPKTEMNIIRDNIFNDADKTVSCIDLTSDKIFSLNVPTGTGKTFTSLSVALQLRTRLENEKKQFPRIIYSLPFTSIIDQNYKVFEKIFTKPDSDILIKHHHLADVFFKSENHEFDTNESKFLIESWESEIVVTTMFQLFHSVLTNRNRMLVKFEKFVNSIVLCDEIQSLPYKYWKLAKAIMTCLSKTFNIYFILITATQPKIFNENEIVELVPNKSTYFSKLDRVDITFEKQPVTLEDYKLLCKTAINSNEESFLFVMNTVNSALELFESLSASGCDAEFFFLATNIVPADRLIAIQEIQDSKKRKIIISTQMIEAGVDIDIDNVWRDMGPLESINQVCGRCNRNFKQEKGKVRIFQVLNEAHNNTPFEKYIYGKNPLSIHQTREIIAGKETVSETDFLNNMDQYYEQIQARLRDDDSVDIINFMKNLQFLSVFKNFKLIDEENYERKDIFIELNEVAEEAWRRYIEIREIQDKIERKLKFLKIKKVFYDYIISVPANFVSEKEYGDTNFVYINKEMLPVCYDKKTGWMRKTEDVYTF >NC_018645.1|WP_014958324.1|3485936_3486647_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MTKVLVFKLWGDYGHFKKFYTTTSPLTFEFPPPVTVLGIVSAIIGLDKDSYLENFIDPTRCHLAIGLERPVKKVRWTQNLIDTKRNFWKIHNRTQIRTEFLKDPGFKFFFSHKNPEIYDQLKENLMAHKSYYTISLGLSELLADFEFCGEQTITPSTTDEWQSIQSVVPCSALQDDQSIDFEEGKEIFKISYPVEMIPNRVVTRREDVIFERRGLPVTCRVKEVFKTEEGEKIVFF >NC_018645.1|WP_014958323.1|3484944_3485937_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csh2 MSEFKNRTELLFLYDIENANPNGDPNDENKPRIDEETGKNIVTDVRLKRTIRDYLFEKGNDIFVQEKIYDDDGHIQDAKLRAADYLPDDPEELSQMSAEQQKKEISNNILKDCIDVRLFGATIPLDLKVKKGKKTDNVSGSLTYTGPVQFRVGKSLHSVKLQFFKGTGAFASKKDVTKKTFREEYMLPYSLIGFYGIANENAGKHTNLTEDDIMLLKKAMWNGTKGLISRSKFGQMPRLLLSIRYNEPDFFIGELDNLVHLKSEVFDTKIRRPEDYIIDISELVGKIEKVKDKIHSISFIVDEKMQFSLKGEKVKLSDLGNFTDEATEVL >NC_018645.1|WP_014958322.1|3483090_3484941_+|TIGR02556-family-CRISPR-associated-protein MIKAIAELGRYAKENNPEMTAFDIWLEDSYDNGKYDIVFFVVLKKDNEQSDWRYKKIDISENGKHLKNKLIYKRGSPRGTDKTPTAKVAKSIASTFRQKIKAWFESKKEASFLKDSEKEFLNQVFELLSTDEERIIKDLEAQYELIDAKGVVLSLQFVENSDLKYIGDFDFFSGFIVQESKAAYKFSKTFKKHSFSNDKVCSVCNNLKQEVFGYFTSLGFYTVDKPGMVTGGFRQDLSWKNYPVCLDCALDIENGIKFKEEFFDFRFYGFRYYLIPTIINDKGKFEIIDAITDYNPDQKINSKSKEAVLNPDEEVFDLLKDYQNHVHFNLLFYDKPNKGVFRILENIEEVLPSRIRLLYETKEYVDGLFIFKNPEKDGKRIFRYSFGILRDFFPRDKIRGNHDKDFLQIVRKIFSGLPVQYDFLVTHIMRAIRNRFVNNNNYWFQALSGFMMLNYFYKLGLLNCFKGADNMTPDFYKSFEIRKTDDYEEKVDGFFDQFNDFFKTNEKRGIFLLGVLTQLLLNIQEKERGSTPFRSQLKGLKMDSSDITGLLPKLVEKLEQYKKNYYMKLEKLISKYFISSGDHKSWNLTIDEMNYVFVLGMNLSKYFKIIKEQKEN >NC_018645.1|WP_014958321.1|3482428_3483094_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas6 MKKAILYFNNIKLNSSQIHKLRGYVGNVFAEHDLIHNHDSVTGKSIYRYPLIQFKIIDHDPCIIALTEKAVQVFTEIFMTLDEIVIDGKVIPIFEKDLKVESVEFGFSSETFMYEFVSPWASLNQKNFKIFITLKTETEKTELLKRILIGNILSMSKYLGVHLEKEQQIQTNLQLKPAKVILKGKQMMGFKGLFKTNFRIPDHLGLGKSVSRGFGTIRRLI >NC_018645.1|WP_014958320.1|3482115_3482406_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MLAWIMYDIASNKTRGRVAKQCKKYGLTRFQKSIFLGKLDINRFDELAQMCQDEIDEETDSVYLFPFCQDDFRRIQVLGQGFDKKLVNDEILSKFF >NC_018645.1|WP_041279563.1|3481091_3482105_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MQVVINSPGTMIKQKDEIFRFQNKENRLDLSPMKVESIIISNKAMISTQAISLALENNIDLIFLDHYGFPIGRVWFSKMGSTAMIRRQQLEAANNDQGLRLVMDLVKQKLNNQISFLKKLKYARPEKKELFQAPVHTIQGSLDALEQDLPNLEDSRSLIMGLEGAAGRAYFSCLSKVMPEKYRFKGRSKRPALNPFNAVLNYCYGVLYSRVEKACIIAGLDPFVGFMHTDNYNKKSMVFDLIEPFRIFADQVAVYFFTGKKAKDDYFDMQSHSCSLNTKGKPMVIDALNRHLEEKVRYRKRNVKRKHLISHEAHKLANILLEDEGLEHPDWLDIKEF >NC_018645.1|WP_014958318.1|3480447_3480816_-|cupin-domain-containing-protein MTDKDTRLIKNIPFSTPVDLVDLVDYEEGRVVSRTLSSKPHINITLFAFDKDEEISAHTSPGDAMIQVLDGDALINIDGSKIKASKGQSVVMPANVPHSVSACSRFKMLLTVVKQPVGIDGL >NC_018645.1|WP_014958317.1|3480200_3480398_+|YwbE-family-protein MSTGTKRADIIAGLKVSIVLKQDQRTGKLTQGIVRDILTKSATHPHGIKVRLENGQVGRVKTIHT >NC_018645.1|WP_041279565.1|3490820_3491372_+|hypothetical-protein MDPNKFRESRQEINRLCENINVLIEQNALEASKEGYQEVTTQLDTLKPQAEGEIQKRSVKNLSVKIGALATYIDKLKPEKKRAAGKKGTKTAIIWDEERVGQLSTAFLKKLFANMGNDSDAKVCFGTTGKGIRPSYQIEFSDQNIIAFSGSGHSPQEKTLSSAAKKLSQPFPHELIASILREK >NC_018645.1|WP_014958329.1|3491558_3494249_+|DEAD/DEAH-box-helicase-family-protein MHQFITGQRWISQAEPELGLGTLIKVNDRTISIRFDSSDCTRQYSLQSAPLKRVVFKPGDEIQLKDNKKLIVQTLSESEGLIYYSGKETIVCEKDLCDTISFSMPQDRLFAGITDSSKLFDLRYRLLKAKADYDASMVKGFLGGQVELIPHQFFIADKVTTRYIPRVLLSDETGLGKTIEACLILHKLLITHRAQRVLIVVPESLVHQWFIELYRKFNLSFMIFDADWCESLEQESSRTNPFLNRQMGIVSINFLKNKKRQTQIIKAGWDMVVIDEAHHITDDKKTYEFIQTLARTTFGLMLLTATPEQMGIKNHFLHLQLLDPERYFDFNTYLDETSQYKKTIHTVTQLIKKEKNTDHILDSYGPGRVIFRNKRDVIKDFPKRVAHLKPLAATISQIKAANREFFDTNETKAHVFSDDPRISCLVELIKQKKKLLVICSSKEKVNAIAKAVANHIFVDVAKFDETMSLLQRDRNAAWFSRKDGARILICSEIGSEGRNFQFVHHLFLFDLPHNPELLEQRIGRVDRIGQKSDIQIHVPYILGSVYEILARWYMDGLNLFAGNINGSHLIYEKFKPNLFDLFSRSAESAAVKAFVLEKLIEETKAYCIKVDKKLAHGKNILLEMNSFKPESAKKIIDHITRTEKNNAFDDLLTMVLDHYGIEIDFIDKTIFKLNSTTMTDEKFPALTSLSNAMTFNRKTAIARDDIDFFSWDHPFVQQTFEYFITNDTGSCATALLNRQQGPGILLETIFILECIAPGNLNMERYLMPHPIRIIVDHEGRDTSLDNKFTSLSSKLKKDQSTWFMDMEPVKQVLIPSMIEKSVSIAENHCEKMIKKGQNRIKDILGKEITRLMQLQKINPDIRTAEIKLARNRMESLLKYLDTSRLRMDAVRLIRVQ >NC_018645.1|WP_148278129.1|3494275_3495124_-|2-oxoacid:ferredoxin-oxidoreductase-subunit-beta MEQIRSAYLDEKLDMVRKVDFLQYRSPDLPTWCPGCGYFGIVDALYRACRELALKQEDIVTVSGIGCSGRTPIFINSYGFHTLHGRSIPVATGLKLAREDLTVFAVAGDGDALGIGGGHLPHVARKNINITFLLFDNSIYGLTKGQSSSTTPYEMRTSSHPVGNPDTPLNPIKLALAYGASFVARGYAGNPQGLKEIIKEGILHQGFSFIQILTPCVTFDKENRTWKNLKENVCDLNIRIEEKNMETAMRAAENEPYGCGIFFQDKQRPHYQEILRHLNRDD >NC_018645.1|WP_014958331.1|3495123_3496884_-|2-oxoacid:acceptor-oxidoreductase-subunit-alpha MKDINIVIEICGSAGEGTISAGEILSRFMSGQGFEIMSFDSYPAEIRGFGKCVAHTRISSDPIYSPGKFADVLISLNDKHSISQLPSLKQTGVLIFDSQPPRPHEEDTSVVGWAKPGIVSYGIPLNMLANKAAGNARGMNMVALGALAALFCVDKDRFTDSIKTRYGKKKQVVIDSNVNSFLEGYDWTKENIKKIDSYSFEDVRLPEQQEKLIINGNQLVAQAALDANLCFYAGYPITPATKIMEILSKELPKHGGVLLQTEDEICAIGAVIGAGFGGKRAMTGTSGPGFALMTEFTGLSVMAEVPAVIIDSQRAGPSTGMPTKTEQSDFNIAVSGGTGDCPRIVLAPTDTKSCYDATVLALYFAEKYQTLVVVLLDFFLSNSIKNIDRPQKPPQKYLDANIAPDKEALKDYKRYKITENGISPRAIPGTPGGIFFSTGLEHNEYGRPDYSQAGHLKMTQKRFEKFNAVLSEAPEPQMSLNGKDEFDIGVISWGSSAGAAHEAVMSAQKEGINAAAFSSMMLSPFPEKLLLEFSGKCKKILIPELNFSGQFAGFATQIIKRPVERLNFITGRPMASEDILQKMREM >NC_018645.1|WP_014958332.1|3496914_3497946_-|FAD-dependent-oxidoreductase MPFKDHYVIIGNGPAGNHAAAILRENNKDARITIISDECIAFYYKPKLTRFIAGEINKEELMVTSLESYRKKNIRLRCGQAVERIDPDSKTLFLQHMEKISYSRLIIASGSRARVLPSMSRYSDHLKFVTSYADVIEYKEKIQKAKDFFVFGGDLVGFKFLRMLTDMGKTVTVLIYPNAFWPYNLTDAMLKQIVGSLSKYTSDIIVKDDISTIDAQNGSYRVKTQKGIEKNVDMVFSFNGLSPNIDFAKGSGIDTDHGILVDEYLRTNIDGIYACGSCAQIYNRDIQSYTVSIGWPNAVAQGETVALNLLGDHKVVESTGRKYFDLEGVKIKTTWWEDIDDEL >NC_018645.1|WP_051012571.1|3497975_3499673_-|FAD-dependent-oxidoreductase MVYSTDVRDFGQVAKSIPCQDACPAQTNIPGYIRCIYEKRYGRAYEINRSANILPGVLGRICSRPCESACRHGEPDNGQSVGICHLKRSCADLKPASHRIIEALYAPTDKKVVIIGSGPAGLAAAHDLAGLGHKVVIFESMEKPGGMLMYGIPEFRLPRDLLMLEIKNILRLGVELKTNTAVGTDISLDQLKKDFDAVVVTTGCVSPRKLDIPGEELENVHNGLEFMKAVNEGQTPFVGDKVVVIGAGFTAVDCARSALRLGSTDVSINIRKTIEYMRIDETEKHEAQFEGIKTYSLVQPSKIIGIDNKVTAVEFVRTRMETSDTPPYRVSVPIENSRFLIPADCVIAALGQTPDGNMVSRDLGGLDKKGHNTSIDGVFAAGDFVTGSSDVISAIAGGRKCARAVDQYLIGEQRKQTVVRLENHETTDRPRSYDFIGKVGMNTLDMQERFSQSTNEVETGYKDDQAREEAKRCYLCNLKYEIDPLVCIYCSLCIDVAPKDCIKMIKDVPINADGTYGTYLETKDWNKVVSIAIDNDKCIRCGNCVAVCPMDCISVTKTELIEIDT >NC_018645.1|WP_014958334.1|3499995_3500544_-|hypothetical-protein MNNNECSIYSGGLKGAEETFGKCAEKYGINEINFSFEGHRPSRDKNITLLSEEELKKGNISMEIVSARMGRRYSRADKIRKVFQVIFHMVNKGYQVVAVGWIQSDKTVKGGTGWGVELAKFFNRPVSVFDQGKNGWYTWKGDEWVADEPVISHKTFCGTGTRNLSKEGEKAIEDLFSRSFTA >NC_018645.1|WP_014958335.1|3500959_3501817_+|YitT-family-protein MKLQNLTYLIPWNLFLITLGSIIFGIGLKAVVIPNQMITGGFSGAGILLFYYTNFLTPGTWYLILNIPVFILGWLFISRRFLLYSLYGTIVLTLVIDLIQIEFPIKDLVLAVLAGGTLTGAGSGIIFRSLGSAGGNDIISVILNQKYAVRIGTYNFVFNFVLFLFSFGKMDTNLILYSMAMSYISSQVIEYFMTLFNQRKMIFIVSNNPRQISHEIMNKLKRGVTFIKGEGAHSGLEKDIILTVVNTFQIKRIEEIAFAIDPDAFLITENTFNVLGKGFSKRKVY >NC_018645.1|WP_014958336.1|3502452_3503742_+|PEP-CTERM-sorting-domain-containing-protein MKKFLLILLVTLLLPSILMAATEAEKRTAIDNGLAYLATTQNANGSFDGGGLDYLISQTGSALLAFLEEKDNWGTNAAAYQTVVDKGLSYLLENANVVGITPQTHGNPDGDGNGVGVKFYPGVINSRDTYVTGLVLPAIASSGTPDALVTTGPLAGRTDGTGAGGAWTYKDVVQNTIDYFSFGQTENAGTMDGGWRYYANYGNSDQSTTQWPVISSLYASKMGVSTPGFVGTELDKWINNIQYPDGGAGYYPTDYGTRYGEMNETGALLIEQAFRGLGVGNANVDAALAYINSGWLWSLGSGGSYDGNFGHPYAMWAIYKGLDLTIGRDDMTTITNLHGDPGDVDNPSHGWNWWEDYCESLVSSQAANGSWAGYSSWGTGLATPWFINILAGTTIPDGNGENIIPEPATMLLFGLGLLGIAGISRRKKN >NC_018645.1|WP_014958337.1|3503902_3505996_+|tetratricopeptide-repeat-protein MFLIRKKTFFILIVLIFYSVPCSGVQIVNDSIVQPDSFSTDDFSTLEPHIDSNTLAITIAVERLRQGRLKQAFEYAQATLSQNPENISGHGIAGVVLALKGQKEQARKKLKFFKNHKQEIFFPELINAIINAQEGNLKKAEKHLAASLKKQPEHPVALYYKGSLFLTKKQYKSAITIFEKVIRFQPEFVPALEGLGRAFLMLKDVEQAIVYYEKAVTLEPENLLYRRQLLTIYQKTDKKELANKQIREMLYYTPGVKQGYLKKGRQLLVMGAYEETATLMDKILNIYKDVPLAFYIKAAAHSNLNQTEKAVNNINNFLDAQQNSAMTHHYAGMCYMVLKQYKKAEDQFIKAISINPNMGKSFVPMIIIEQLNGNFIRALEGLSLAEKGGEPANLIDFLSAHIFLQRKNDPAFFQKMETGVKLIPGLRQSNTLSLPNNKNRDFFAENRNLMVLFFYNGWYGKTLKTSQALLEKNPQDRFALYYKALCETAQNTNMDGISSFNALLKLEKNLYSAHMGLGQLYLKTFDLKNAENAFKKVIDINPSYGPAYAALGDTFQMDDNNEKAIENYQKAIEINPQILSVYPKLIILLSEKKETISQAARYSEKLKTFSPKDPYSIDAIGWISLNLKKTKKGFELIQKAHKLLPNDPIILYHLGIAYYQSKNLKAAEKYLQASIERSNNFPGYNLAMNVLKKIKSD |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_018645_1 | 1.28|1122775|35|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1122775-1122809 | 35 | MK448818 | Streptococcus phage Javan597, complete genome | 36037-36071 | 8 | 0.771 |
| NC_018645_1 | 1.39|1123496|37|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1123496-1123532 | 37 | MN694775 | Marine virus AFVG_250M170, complete genome | 41795-41831 | 8 | 0.784 |
| NC_018645_1 | 1.39|1123496|37|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1123496-1123532 | 37 | MN694117 | Marine virus AFVG_250M169, complete genome | 12017-12053 | 8 | 0.784 |
| NC_018645_1 | 1.39|1123496|37|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1123496-1123532 | 37 | MN693887 | Marine virus AFVG_250M171, complete genome | 12019-12055 | 8 | 0.784 |
| NC_018645_1 | 1.32|1123034|34|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1123034-1123067 | 34 | NZ_CP016024 | Ralstonia insidiosa strain ATCC 49129 plasmid pRI-1, complete sequence | 177496-177529 | 10 | 0.706 |
| NC_018645_1 | 1.29|1122840|34|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1122840-1122873 | 34 | NZ_CP021021 | Xanthomonas citri pv. phaseoli var. fuscans strain CFBP6167 plasmid pE, complete sequence | 10565-10598 | 11 | 0.676 |
| NC_018645_1 | 1.29|1122840|34|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1122840-1122873 | 34 | NZ_CP021021 | Xanthomonas citri pv. phaseoli var. fuscans strain CFBP6167 plasmid pE, complete sequence | 42898-42931 | 11 | 0.676 |
| NC_018645_1 | 1.29|1122840|34|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1122840-1122873 | 34 | NZ_CP021004 | Xanthomonas citri pv. phaseoli var. fuscans strain CFBP6166 plasmid pE, complete sequence | 23786-23819 | 11 | 0.676 |
1. spacer 1.28|1122775|35|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448818 (Streptococcus phage Javan597, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
cttgaagggcaagccaatccag------caattgacatgcc CRISPR spacer cttgaatggaaagccaatccagcaacatcaattga------ Protospacer ****** ** ************ *******
2. spacer 1.39|1123496|37|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694775 (Marine virus AFVG_250M170, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
tccattatattcaattcagcagcggttgccgtaacct CRISPR spacer tccattatattcaattcagcagccgtagctgctattg Protospacer *********************** ** **.*. *..
3. spacer 1.39|1123496|37|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694117 (Marine virus AFVG_250M169, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
tccattatattcaattcagcagcggttgccgtaacct CRISPR spacer tccattatattcaattcagcagccgtagctgctattg Protospacer *********************** ** **.*. *..
4. spacer 1.39|1123496|37|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693887 (Marine virus AFVG_250M171, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
tccattatattcaattcagcagcggttgccgtaacct CRISPR spacer tccattatattcaattcagcagccgtagctgctattg Protospacer *********************** ** **.*. *..
5. spacer 1.32|1123034|34|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP016024 (Ralstonia insidiosa strain ATCC 49129 plasmid pRI-1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
caataacccattttcttagtgacccaccaagaag CRISPR spacer cagcggtccattttcttagcgaccgaccaagtct Protospacer **.....************.**** ******
6. spacer 1.29|1122840|34|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021021 (Xanthomonas citri pv. phaseoli var. fuscans strain CFBP6167 plasmid pE, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
ttaaaagggccagtagcaaaatcaggaacgggca CRISPR spacer cgggcagggccagcaggaaaatcaggaactcaaa Protospacer . .. ********.** ************ . *
7. spacer 1.29|1122840|34|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021021 (Xanthomonas citri pv. phaseoli var. fuscans strain CFBP6167 plasmid pE, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
ttaaaagggccagtagcaaaatcaggaacgggca CRISPR spacer cgggcagggccagcaggaaaatcaggaactcaaa Protospacer . .. ********.** ************ . *
8. spacer 1.29|1122840|34|NC_018645|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021004 (Xanthomonas citri pv. phaseoli var. fuscans strain CFBP6166 plasmid pE, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
ttaaaagggccagtagcaaaatcaggaacgggca CRISPR spacer cgggcagggccagcaggaaaatcaggaactcaaa Protospacer . .. ********.** ************ . *
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
234811 : 253850
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_018645|234811:253850|DBSCAN-SWA AATGGTCTGGAAGGGATTGGAGAAGGCGCTGACGCTTGCCATGGCAGAAATGTATGTTCAGGGGGTATCAACTCGAAAAGTAACCTCAGTCCTTAAAAAATTATGCGGACTTGGAATCAGCAGCACCCAGGTCAGCAATGCCTCAAAGCTTTTGGATGAAGAATTAGAAAAATGGAGAAACCGACCAATAGGTCGGATCAATTATCTCCAACTGGATGCCAGATATGAAAAGGTCCGTCAGGATGGAATGGTTCTCTCCTGTGCGGTTTTGGTCGCCACCGGTGTTTATGGAAGATGGAAAGAGAACGGTACTTGGGACCAGTGTGTCTTTGAGTGAAGCTGAGGTCCACTGGCGTAGTTTTTTGTTGGATCTGAAAAAAAGGGGGCTTCATGGGCTAAAACTGATTACCAGTGATGATCATAGTGGATTAAAAGCTGCATTAGAGTCAGTTTTCCCAAGTGTGCCCTGGCAGCGTTGTCAGGTCCATTTACAAAGAAATGCTGTTCCATATGTTCCGAAAATGGACATGCGCAAAGGAGTAGCCAATGATATTCGAATGTTAAAAAATGAGGGATTGTTTTTTCAATTTTTGGATAGGGAAAGTCTGAAGCCGTATTTGTATCCACCCACCCGTTGAGTTTTAAGAAATGAAAGAACTGTCTCAAGCTCCAGATACGTGCTTTTTTGATATGAATGGAAGGGTTGTGATACTGGGTAATGAATACTTTTAAATGCCTGTAAGAGATACCTTTTACTGAGTCAACAGACGTTTTTTTAATAAACCGATTGAATTCATTGAGCCTTACTCTTAAGGATTGAATGGACCTGGTTGCAAAATTTGATACTTTACAATAATCGAGAAAATGTTCTATCTTGATTTCCAGCATAGAGGATCTCCTTTCTTTTTGGGAGAAAAGTTAAAAATTACTGTTTGGGAGGTTCTCTATGCTTCTACTACAATTTTAATACCTTACAAATTCCTTTTTTTGCTAACCGCGGGGTTTGGGGGTTAATTTAGAGGATTGTTTATGAATAAAAAGGTCGTTGATTATTACACGGAAATATTTAGTGAAAATGAACGTCATGAAGATGGTTTTGGTCAAATTCAACGACAGCGTACACTTAATATTTTTAAACAATACCTTCAGGGTAACCCTCTCAAAATAATTGATATTGGTGGAGCAACTGGTGCCTATTCGTTTGATTTAGCAAGAGCTGGTCATAATGTACATCTATTAGACATAGTGCCCGCTCATATAGAAAAGGCTGAAAGAATCGGTTTGGATAAAGGAATTCTCCTTGATGGTTACCATGTTGGTGACGCTAAGGATTTAGAATTTGAAGATAACTCATTTGACGCTGTGATCTTGCATGGTCCGCTATATCACATCACAGGCTTAGTTGAGAGAAAGAAAGTCCTCAATGAAGCTCTTCGGATTTTAAAACCCAATGGGGTTCTGTTTGGTTTTGCAATTAATCGCTATGCGGGTGTTTTCTACGGTATTCATAGTGAGCTTATTCTGGATGACACCTATTTTGAAATGGTTAAAACAGAAGTAGAAACAGGTTTTAGAACTCGTAATCCAACTTGGCATTTTCATTTGCCTGAAGAATTAGAAGCAGAAATAACGTCGTCAGGTTTCAAAATAGAGGCAACGAAAGGCGTAGTTAGCCCTGTTTGGATGCTTCCTGATATTGAGTCGAAAATAGCTGATGCTGAAATGCATGAAAAAATACTTAGGGTTTGCGAGCTTCTTGAGAATGAGCCTAAGATTGGACAGGACTTTGTGTGCATCGGCCGAAAACAATAGTCAGCTCCCATAACAATAAAATTCAGCAGACGCAAAAAAGCCGCGCCGCTGATTTAAGCGAACCGCGCGGCGGTAGATGTCAAGCAAGATGTCGCCTTTTTATAAAACACTTTGTTAATATTCCCGCAAAATCCCCTCATGACCTCCGACGGATAATTTGAGTATCCATTCTCGCCCATGAGGGATTTTTGCTAATGCTATACCCATTTCTGACATCTATGCAGCCCTCTTTGCCGTATCAGTATATAGGTAAAAGAACCTGCCCCTTACTGTTGACGGCAAATACGTTATGTCCCAGCTCCACAACTGGTTCGGGCCATTTGCAATCAATGGATCAGGACTGTGCCTTTTTGCGGGAAGACTGGATTGACGGTGTTTATTCATTTTTAAGTCCCTAAGAATTCTGTACATGGTTGATTCAGAACCCAGATAAATTCCCTGGTCAGCAAGTCTTGGTACGATCTGATTTGGATTGGACTCAGCAAATTCAGGCACTCTAATACATTGGCTATCCGGGTCTTTTCATCATCAGACAATTTGTTACCAGGGTAGGCTCGGGAGCCTATTCGGCTGTCCAGTCTTTGGGGCGTTTTTCTTTTGATTTCAATTTTATGCTTCCGTTTTGTTTGTATTCTCTTAATCATTTACCGATTGTAGACCGGCCAACACCTAATTCTTTTGCAATTTCATGGTGGGGTTTGTTTCCCTGTAACACCTTTTTTAACACAGCTTCTTTTAATTGAATAGAATATCCCATATTTATCACCTCAATGCCCCAAATTTAATTTTTAATTGAGGCGACATCTATCCTGACACAGGGGGATTTCAAGGCCACTAAAACCCACTGGATTATTACGTGGCGCCTTGAGGAGTCGGAAAACTATGATCGTTTTGGAATGGAAGATGGCCGAGGCTGGATGGCGTGCCTGGCTCCGTTGAGAGATGAATTGTTGCGGGGAGATATCCGAAGCCTTTACATCGGTTGGCTGGCATCTGTGACCGGGGAAATGATAGACAATCATAAAAAGGAACCTTTATCCGTCAGTGGATTGGGAATTTTGACATCATCCCAGCAGGCATTGGCTGATTTTTTGGAGGTGGACCCTGATTTATTGAAAGGTGCGGGTATTAACAGCCCCGCAGACCAAACCGACGAAATATCTGAAAGTGAGGTGGAAGATTGGATCGATGGTTTACCGAAAAGTGAAGTGAATACTTTTATAAAACAGCTCCTACAGGGCAAAGGCCATCAAGCCGAAAGGAAATTGAAGAACTGGTTCGCGACATGGCGGATAAACTTGCAAGGAGATAAACCCCAAACGCCTCGACGGACATTGGGAGAACTGCTGAAAAATGCAAAGAAAGCTGAAAAAATACGCCTTGACTTGGAAAGCCTTGAGCAGATGCAGCAAGAAATCAAACGCCGCAAAGAGAGAGAGGTATATCTGAAGAACATATCCAAGGATTTTCCAAAGATTTGGAAGTCGGTTCAGCAAATCGTGAAAAGAGGATCGGGACTGGCCTACGATGAAGCCTGCCGTTCCATTTTGGATATTTCTGAAGCATACTCACTCATAGGGAATAGTAGATCTTTCAGACAGGAATTAAATAAATTCATGACCAGTCATATGCGACGTAGGGCATTGATCCAACGTCTTGCAAAAGTCGGTATCTGGGAGGAAAAATAAAGAAAATTACAGTTAGAACCCCGTTTTTAAAAAAATTAAAAATCGATAAATCTAATGCATAAAATCAAACCTCCATTATATATGATCGGTAAGAAAGTTCACTGCTGGCGGTGCGATACAAAGATGCCGGTAATCGCACTTTTGGCCCCTCATATCGAAAATGGTTATGATGAAGTCTATACCATATCCGGTATAGAGAAAATGCCTGTTAACATCAGATCATTTATCCAAAGCAAAGTCCCGACATTCGTTTTCAGATATTCAAAAACAGTGGGGAAAAAATATTTTGCAAACACCTGTCCGCACTGCAATGTTATTTATGGTGACTTTTTTTTGCATGATGAACCTGGGGCCCCTTTCTTCCCCGCTGATGAGGAAGACGCCAAGTTGTTATATATCAAAGAGATTCCTATAAACGGACCCGTTGAAATCGAAGGTGGGGCAGTATCCGGAATGGGAGAAATAATTCTGGAACATGCAATAAGAGTTTGACTACACCATACATTTAAAACCTCACAATTATAATTTGCTCTGAACAATCAATTTCATAAACATTGACAAAAAAGCATGTCTTATGTAATTCATTTCAGATGAACCTTTATACGCCACAAAATACAAAAGTATTCTAATGACATCAAATAATTCTCAGAATAGTTTTAATATCCTTCTTGAAAAATTTGAAATGATATCTGAAGGATACAAGTCTCCAAGTCTATTGTTACCCAATGACCTTCATTTGTCAGATGGTGACAAAATTATTTTAGAACAGGCGGGAAAATATAATGTTGATGCGGTGTATGTAAGGCAATTCAATGACGGACGAAACCCTATCCCACAAATATACATATATGATTTTATCAAAAACCCCAGGAAAGATAATGAGATAACAGAACTGTATCGGAAAATTTGGAACTCCGGTCATGTTCCTCTTATTTTTTTATTTTTTAGAACAGAAATTCAAATATTAACCTGTTTAAAACAACCGGATTTCGATCCAAAAACCGGGAATCTTTCATATAGCCTGTTTGAAAAAATCCATTTGGCATCAAAAGCAAAAAAAGAGTTGGATAAATTCAAACAGTTATCTGCTAGGCGGTTTGATAATGGCTCATTTTGGACTGACTCAAAATATAAAAGCAAATTTTCATTAAAAGAGACTGCCTATATAAAGCTTTTAACTGAACTCAAAACAGCCAAACGAGATATCATTAAAAAAGAGATTCTGGATGAGAATCTTACAAAAAAGCTTCTTGTGATGTCGATTCTTGTCAAATACCTTGAAGAGAGAGAGGATAAAGACGGCAATAAAGTTTTTCCCAAAAGGTTTTTTGTCAAATTTTCAAATGGGGAGGATAAATTTTTAGATGTCCTTCGTAAAAAAGGAGGATGCCTTCAATTATTTGATGAACTGAGCAGCAAGAATAGCTTTAATGGAGAAATTTTCGCCTGGAACGGCAAAAAAGAAAGAGATCAGTTAGCCGAAGCAGACTTGAACTCTTT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22 | Staphylococcus_phage(16.67%) | transposase,integrase | attL 234710:234723|attR 253938:253951 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
732751 : 776848
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_018645|732751:776848|DBSCAN-SWA 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43 | Leptospira_phage(57.14%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
922925 : 961088
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_018645|922925:961088|DBSCAN-SWA 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41 | Catovirus(25.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
2347841 : 2437272
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_018645|2347841:2437272|DBSCAN-SWA 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95 | Brevibacillus_phage(28.57%) | tRNA,transposase,integrase | attL 2389097:2389156|attR 2437273:2437405 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
3000400 : 3109745
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_018645|3000400:3109745|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_018645|3000400:3109745|3051825_3052428_+|WP_014958059.1|DBSCAN-SWA MYEKIIKFIKPFYKKNTLSHDYSHAISVYENVKRICKKESLEGEVAKISALFHDIIQLKDKSGEDVVASAAIAKDFLIRQGVDKETYDQVHTSIIESSWDFFDKSKKLSSMQSYLLRDADFLESIGTHGLVRVFSYSGENRIVFGFPPFIEKENTAYNHINNKLLKMKDYFHFKTALAEAERRHKYMRQFLDQYSKETKW >NC_018645|3000400:3109745|3035675_3037004_-|WP_014958047.1|integrase|DBSCAN-SWA MKKISQQLLKQFDAQLITNRIPAENHNFFRKWLRYYIDFCSKYDHRPKNTESLIHFINKLREKRQSKQQQKQAYDAILIFYKMFGIHPKWPEKPSSENRFEKEDLSIREQTVSYNKNEVVFDNNWKYVYTGLSDEIKVRHYSPKTFKAYSIWVSKFQNFVQSKSLEELSTDDVKAFLTFLAVEQHISASSQNQAFNALLFFFRNILKKEFGRIDGVVRAKRKPYIPVVLSRQEIDLIIGKLRYPYDLIVKLLYGCGLRLSECMNIRMNNFNFDTGILTIHDGKGKKDRTLPLPETILSDLTYQVDVVKKLHRHDLKEDYSGVFMFDAIERKYKNAGKEFNWQWFFPAKELTYVPETNEYRRSHLHNRHVQKAIKSAVNRVQLTKRATAHTFRHSFASHLLQANYDIRTIQELLGHSDVRTTMIYTHTVKSRTLKESKSPLDL >NC_018645|3000400:3109745|3092505_3094065_+|WP_014958088.1|DBSCAN-SWA 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97 | Bacillus_phage(18.75%) | transposase,protease,integrase | attL 3068911:3068965|attR 3083039:3083093 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
3129968 : 3192036
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_018645|3129968:3192036|DBSCAN-SWA AATGCTCACACGTTTTTTCACAAAAGTACCATGCACCGACAACAGACAAACAAAAATCATAATCATGGCAAAAAACAAACTTCACAGATACGAACGAGTCAAACATCTGCCCAACGTTACTTTTTCCGTATTCGGCGATTCAAGATTGCCTTGCACATACCCTTGGTATGATGAGCGTTACAAAGGTATGGAAAGGATTCTCGAACTGGGTTGCGGCAAAGGAGAGCATAGTCTTGCATTCGCCGCTGCCAATCCTTTCAAACTTTGTGTGGGAATCGACAGTAAGAGTCATCGCATATGTGTCGGCGCAGAAAAAGCAGTTGCAGAGTGCCTTGAAAATGTCCTCTTCCTTCGTGTTCGTATTGAGCGTATCAAGGAATTCTTTGCTGAAAACTCGATACACGAAATATGGCTCACCTTTCCTGACCCGCACCTGAAGAATCGGGCAATCAAATCCAGGTTGTCCGCCCCTCTGTTTTTAGACCTGTATGCACATTTGCTCGTGCCCGGAGGTATCGTGCATTTAAAGACTGACAGTGACGTGTTCTACGACTACACCGGAAAATCTGTTGAACAATTTGGCGGGCGGGTGGTTGCAGCGTCAGATAATATTCATGCAACAGATTGCAACCTGCCTGGTGCCCGTGACATCGTTTCCGCTTTCGAAAATACTGCCCTGTCAAAGGGATTGAACATCAAATACATGGCATTCACACTAAACTGACAAAGTGCCAATAAAAACTTATACCGAGTATAAAAATTACCCATTAATTGTCAAACCAGAAGACAGTGCGTTTGCAAAAACCCACCAGCATCAACATGACCGGAACTTCGATCAAAACCCCCACGACTGTTGCAAGTGCCGCACCGGATGAAAGACCGAACAGCATAACAGAAGTGGCAATGGCCACTTCAAAATGGTTGGATGCTCCGATCATAGCAGCAGGAGCAGCATCTTCATATTTTAACTTTAATAGTTTGGCAGCACCATAACCAAGGGCAAAAATGAAAATGGTCTGGATAAAAAGAGGAATGGCGATCCAAATGATTGTTAAAGGATTGGATGTAATAACCTCCCCTTTAAAGCTGAACAATAATAACAGAGTTAAAAGCAAGGCGATTATGGTGACGGGAGTTAATACCTGTAAAAATCTTTCTTTAAACCATGTTTCACCTTTGGCACCAATAATCCATTTCCTGGAAAAAAAACCTGCAACAAGGGGAAGAGCAACATAAATGCCCACAGATAAAAGCAATGCCTGCCATGGAATCGGAAGCTTCCCTACGCCAAGCAGAAAACCGCCTAAAACACCGTATAAGACCAGCATGGCAAGAGAGTTGATGGCAACCATGACCAGAGTCAGGCCGTCATTCCCGCGAGAAAGGTATCCCCAGACCAGAACCATGGCAGTACACGGTGCGATTCCCAAGAGAATACATCCGGCAAAGTAACTTCGCCATAATGGAATCTGCAGCATTTTTATGCCTTCCTGCAAAACAACTACCCCGGCACCATGATGGGCGCCAACAGGAAGATCAAGGCCGAAAGGCAATCTGACCAGATCAACCGCATCCGATCCTATAAATGATTTGAATAAAAATCCGAGAAAAAATATTGAAATGGCATACATTGTAAACGGTTTGATGCACCAGTTGATAAAAAGTGTTAAAAAGACAGGTTTCCCGCTTTTACCCGCCTTGATGACCGAGGCAAAATCAATTTTTACCATTATTGGATACATCATAAAAAAAAGGCACACCGCTATGGGTATGGAAACAACCGGAGCGCCCTTAACATTAATCGACATTCCATCCAGTGTTTTGGCCAAACCAGGAGCAAACTTGCCCAACAATATGCCGCCAACTATACACAAGGCGACCCAGACTGTCAGATACCGTTCAAACATACTGGTCATTTTGCGATCATTCTCTGCAATATTTTCTTTGCCCATTTTTTATTTCTCCTTTTGTTTTCAAAAACTATCCGGAAAATCTTCAATAACGGCCTTAGGCAGACATGCTACTTCACCGTGGTTTTCCCACAACAAAACATGAAAATCTTTGTTGTGATTTTTTGAAGACTTTCATATAAAAAATATTTTGGATAAAATATTACATGCCCATTGCGAATCTAATGTGAATTATGCGGATCAAGCGCGTACCCACCTCCTGCCCACAACCATATAGACAACAACAGAACCCAGGATCAGATATCCGAACATCTGGGTATTTTTTGTTTTTAAAATAAAAGAAAGCGTAACAATAACTGTTGCACTGATCATAAAAAACAAGGGTTTAGGAATCTTCTTAAGGATAACCCGGCCAAAATGGGCAAAACGAATATGACTCACCATCAAGCCGATAGAGACACAGGTAATGCCCCACAATATGCCCGGAGTTGACACAAGAGAAGCGCCAAGAACAATCAATGCTCCCGCAGGACTGGGAAGTCCGTTGAATATACCCTCGGGCAGATCGCTCCGGTTTTTATCCGTCCGAACAAACCGTATGAGACGAAATGCAACCCCGACAACAAAAAAACCACCGACAAACCATGCTAATGAACCGCCTGTTTTTACGACCACAAAGGCCGGGGCCAGCCCAAAACTTACAAAATCGGCAATGTCATCCATTAAAGGGCCATATTTGGTTCCACCATGTTTTAGAGCCATACGCCCATCGAACAAGTCAAACAATTGTCCGACAATGATGATACAAATTGCCCAGGCAAAATAATGATGGTGGGTCAGGATAAGGCTGGTGACACCACAACAGAAATTAAGTGAAGAAAGAAGATCTGCATAGAGCCAGTTGGGAATAAATTTAAAGACCACGGAAGCGGATGAAAGGATAAGACAGGCCATGAGAACCCCATCGCCAATGTTTATGATATCAGGATTTTTATCCATCAATGCACATAAAATAACAAGACCAAAACAGATGATGGCTTTTATTTTACCAAAATTATTGGCTGCCCCTGAGAATTTGATCCAAGTCAAAATCCGCCTGGCAAGAAACTGGCCCACAAATTCAATGGCCACAAGTATCCATACCAATTCTATTGATATGATTCCTGCATAGGCAAATCCAATCAATGGCGGCAAATAAGTCAATTTGTCACACATGGGATCCAGCCATTCCCCCCAGCTGGATCCAAGATTGCATCCCCTTGCCACTACACCGTCAGCACCATCAAGGATTGCCGCAAAGGTAAATATAAAGATGGCAACAGATTGATAAGAGGTGAAAAAGTAGAGGGCAAATCCAATGACAGCCATGGCAGTCCGCCAGTAGCAAATTGAGTTTGGATGCAACAGCCACTGGTGTGCCAGTATATATTCCTGCATGGATTGTTTTTTAACAGCCTGAGAAAACCATAAGAAAAACGCTGTCCCAAAAGCTGCAGAAAAAACAATAACTAAAAATCTTTCCATTTTATCGTCTCAATCATTAAATTACTTTTTTGATGCTGAAACTATTTTTCAGCAACAGCATCTGTTTCTTAAATTTCAGTCTACTTATCATTTTAGCCGTCAATAATCCATCCAAAAAAGCCCCGAAGGCATGATCTTCACCAATCTTATGACACTCTTTGTGCTTTATAAGCACAATAACATCAAGAAAATCTGAACGATCCTTGAAATATAAATTTAACACATTGGCGGTTATTTAATTTCATGAACCCAATCGTTACTCGGCATTTGTCAAAAGCTTGACCGGCTTTGAGTTCATGACCTTGCGGGAGGCTGCAAAGCCCGCACCCATGCAGATGCAGGTGGTCAACACCAAAATCAAAAAGGAAAGGATCAGGTTGACCTTCCAGAGACTGTCAAAAAAATACCAGGAAACAGCCCATGAAAAAACATAACTCAACAGGATGGCAAATAAGGCTGCGGTAAATCCAATAAAACCGAATTCCAGCAGGGTGATGGCCTGGATGGCCTTAAAATCAGATCCCAGCACTTTTAACAGATTGATTTGATTTTCATTTTTCCGGGCCTGGTGGCGGGCAATGGAAAAAATAGAAACCAGGCCCGCAGCAATGGCCAGCCAGGCCATAAACCGGATGGACAAAGAGAGCTTGTCCGTTATATCCAGCAGGGTCGTGGCCATTTGTGTCACATCAATGACGGAAACATTGGGGAAGACATCGACAATTTTATTTTTCAGGTCTTGTCTTTTTGCCGGCGGCACTTGAGAGACAGCTGCCAGAAAAGTTTTGGGGGCAGCGTTCAAAACTCCGTCCTGGAAGAGCAGGAAAAAATTGGGCAAAAAACTGTTCCATCGAACCTTTCTTAAGTTTTTAACGCGTCCTTGAAGGGGAATTCCCTGGATTTCAAAACCCAGCAGATCCCCTATTTCAATATCATATCGCCGGGCAAAAGAGTTTTCAACAGAGACTTCAAACGGGGTTTGCGATTCAAACTCCCAGGGGATTTTTGACAAAGGAAGTCCCTGGACAATGGTTTCCGACACATCCAGATCCGGACGATAGGAGAAATTAAACTCCAGTCTCCGGCCACGCCCCCGGTATCCGGAACCCGACGGCCTGGTTTCACCATAAAAGGACTCCTGGTTTTTTGTCAGAATTCGTCCACGGACCATGGGGGATAAATTGACAAGTTTGGCATCCTGGTTCCTGATAAATTCCATAAAAGGCATTTTTTGTTCATCCTGAATATCCACCAGGAAAAAAACCGGAATTTTCAAGCCTTCCGGCCTGACAATTTCGTTTTGCAGTCCTTTTTGAACCTGGGGGATAAGGGATATTAAAAAAGCGCCCATGGCAATGGTGACAAAACAGGACAAAGAGGCCCACTTGTTTCGAAAAAGGTTCCGAAAGGCGATTTTTACCATAGGATAACGGGTGTTGGAAAGATGTTTGCAGCCTGAAAACAAAAGCCTTCCCAAGGCGGATAAAAATGCCAGGGCCAGGACAAACCCAACCACAAAAATGCTACCGTTTTTAACGGAACCGGCTGCAAAAACAGAGATCAGTA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48 | Catovirus(33.33%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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| DBSCAN-SWA_7 |
3210584 : 3287415
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_018645|3210584:3287415|DBSCAN-SWA 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56 | Bacillus_phage(30.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
3946100 : 3956250
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_018645|3946100:3956250|DBSCAN-SWA 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ACCGGAAACAAGTTTATACCCTCTTTTCAGTATAACACTTGCCAGGGCAGCCGTATTTTTGATTACCTGTTTCTGATAATCCGCAAAAGAGTCTTCCAAAGCTTCTTTAAAGGCAACTGCTTTGGCTGCAATCACATGCATCAAAGGTCCGCCCTGAATCCCCGGGAATATCTGGCTGCCGATGGCCTTGGCAAATTTTTCTGAAGACAGAATCAAACCGCCTCGAGGCCCTCTCAGGGTTTTGTGGGTGGTTGAGGTGATCACATCTGCAAATCCCACCGGACTTGGATGAACACCGGCTGCCACAAGCCCTGCAATGTGAGCCATATCCACCATAAAAAGAGCCCCCACTGACTTGGCAATATCGGAAAACCCTTTAAAGTCTATAATCCTGGGGTACGCACTGGCACCCGCTACAATCAACTTGGGCTGATGTTTTTTTGCAAGATCTTCAACCTTATTCAGATCAATCATCTGAGTTTTCGGCGACAATCCGTAATGGGCAAAATCATATAACCTGCCAGAAAAACTGACAGCAGCCCCATGGGTCAGGTGACCACCATGTGAAAGATCCATGGCAAGAATCCGGTCCCCCGGGTTCAGCAATGCAAAATAAACAGCCATATTGGCCTGGGAGCCTGAATGAGGCTGAACATTTGCATATTCGACATTGAACAGCTTTTTAGCCCGTTCAATGGCCAGATCCTCTGCCTGATCCACAAACTCACAACCGCCATAATACCGCCTGGAAGGATATCCTTCTGCATACTTATTGGTCAATATAGACCCCTGTGCTTCCATTACTGAAGGACTAACCGTATTTTCAGAAGCAATCAGATTTAATTCATATTCCTGGCGGTCTGCTTCCAGTTCAATAATCTTTGCAATTTCAAAATCCGTCTGCTTGATATATCCCATTTTACCTGCCCCTTCCGGTATTGCTAATTGTCAATTGCTTGAATCCGTTCAAGATGGCGTCCGCCTTCAAAGCCGGTATCCAGCCAGGTTTGAACAAGTTCAAATGCCAGAACATCTCCCACGATACGGCCACCGATAACCAGGATATTGGAATCATTATGAACCCGGCTCATCTTTGCTGAAAAAATATCAGAACAAAGAGCCGCTCTTACATTTGCAAACCGGTTAGCAACCATGGACATGCCAAGCCCGGTGCCGCAAAGCAAAATCCCTTTTAAATATTGACCGTTTGAGACCGCTTTGGCAACCTTTTTCCCATAGGTCACATAATTTACAGATGCCTCACTTTGAGTCCCTGCATCTGCAACCAAATAACCTTTATCAATGAGATACGCCTTGATTTTTTCTTTCAATTCATAGGCTGCATGATCACTTCCAATGATAATGGACTTGTATTTATCCATTTTATTTACCCTTATTTAAGATTTTGCTTTGATAAAATCAATGGCATCCTGAACCGTGAGCAGTTTTTCAGCGTCATCATCATCAATTTCAATTTCAAAAATTTCTTCCATTGACATGACCAATTCAACGATTGTCAGGGAATCAGCGCCTAAATCTTCGATCAAAGAGGCTTCCGGGACAACATCCTCAATATCAATATCAGGTATCTTTTCTGCGATCACTTTTTTAACTTTTGTTTCAACGGTCATATTTAGACTGCCTCCTTGATCTATCCTTCGTCCTTGCCCTATTCGTTGTCGTCAGCCTGAGCATTTATATTTCTGCCTTTATACGCACCACATTCCGGGCAGGCTGCATGGGGAAGCTTGGGTTCCTGGCATTCCGGACATACGCTCACTGTGGGAGCGCTTACCTTGTAATGTGTGCGTCTTTTTCTGCCTCTTGCCTTGGAACTCTTTTGTTTTGGAACTGCCATTGATCTCTCCTAACTATATTAATTTATTTGAATTTATTTTACTATAAGCCAACATAATAAACACACATTTTTACATCAATTTATGAAAAGTGTCAAGAATTTAAAAAGAACTTAAAAAACAATCGCTTTTGACAATTTATAAACAATTTCACTCAAATATAAATTTAATATTCTTTTCAGAAAAATTCTATTCCACGAAATAATCGTCTGTTAAATTAAACTGAGAAAGCAAAAATTAAGTAAAAAATAAAAACACAAAGAAGCGAAATGATCTTCCCAAACACCTTCCATCAAAGCCTTAGAGGCAATCATACTAAAAAACGACACTTCTACTATTGACATACCATAGTCGAGTATGTAAAGGTCTAATAATCTCAATTTCAAAAGACAACTATCGTTATCCAAGTCGCAACATTAATATTATTTTAAATAAATTACTGAGGCTTATAGGTAATACAATTTTTACTTGAGCATATTAAAACAAATCACATTTAGGAGGAAACAATGAAAAAACCAGGCATGATGATTGTTATTTGGATGGTCTTTTTAATGGAATCTTCAGTATTGTGGGCAGGAGGTGCGGACAACAAAACCAATTGGAGCGCTGAATATATCGGCATTCTGAACCGGAATGCTGCAACTGACAGTGCAGATATTGTCATGTATAATCCTGCCGGAATCATGAAAATGGAAAACGGATTTTATGGAAACGTATCCGCCCATTATGTTGCAAAAAACTACAACAATAAAATCAATGGACATGATTTTGATCAGGATAAATCCTCAATTGTCCCCGGCATTTTTACGATATATAAAAAAGATAAATGGGCAGGTTTTTTTGGAGTCTCCAATGTTGTGGGCGGCGGGAAAGTTAACTTTGAAAACGGAAATGCAACTACCAATTTTGTCAGAATGGTCTTAAGCGGGGGCCTGGCCCCTTACATAGATGAGAATCTAAAGGCCGAGGCTATAGGGCTTGGCTATACTATAGGCGGTGCATACTCATTCAATGATATGTGGTCTGTCTCCCTTGGAGTACGATATGTAAAAAGCGACCGAAAAATGAAAGGCCTCGTAACCCTTCCCGGACCTTTTCCCATTGATTTATCGTTTGAGGAAGAGGCGGATGGCTTTGGTGGCATCATCGGGATCAACTTTTCTCCTTTTGATGCCCTGAATTTGGGCCTTCACTATGACACAAAAGTTGACCTGGATTATGAAGCTGACGTAAAAAGGGATTTCATTACCCCGGCAGGACCACTTCTTTCCAGCTTTGGCGTTGTAGATGGCCAGAAAAGAAGCAGGAATCTTCCAGCTGTATTGGCAGCAGGCGTGTCATATAAGATCAGTCCGAAGATAAGAGCTGAAAGCAACCTGACCTTATATCTAAACAACGACGCTGGCTTCAAAGATATTGCCGGAACCTCAAGAGATGAGAGCGCTGTGGATAATGGGTATGATATTGGTATCGGTTTTGAATATGCCTGCACAGACACTTTAAAAGTCACCCTTGGATACCTTTACACAAACACGGGTGTGGATGCCAAAGATATGACCCCGGAATTACCTGAACTTGATGCCCATACCCTTGGCAGCAGCCTGGGATATCAGATGAACGAAAACTTAAACCTGATTTTCAGTTTAGGTCATGTTTTTTATAAAGACGCATCCTTTATAAATCGTTTTGATCAACCCATAACTTATGAAAAAGAGATTACTTTCCTTGCGTTTGGCATCCAGTATAAGTTTTTTTAAACCCTGTTTTATGTGATGCCAAAAATATCTGTCAAGGGGGGGGGATGTTTTTTTCTTGCTCACACTTGAATGAAAATACGTCTTATGGTACTTAAAGTCTCGATTTTACACAATATTTATTTTATGGAGAACCAATGGATACAATCATCACACGATTTCCCCCCTCCCCAACCGGATACCTTCACATTGGCGGGGCAAGGACAGCTCTGTTTAACTGGCTGTATGCACGAAAAAAAAAGGGAAAATTTGTTTTAAGAATCGAAGATACTGATGCGGCAAGATCCACAGAAGAGTCAGTGGATGCAATACTCGAATCCCTGGAATGGCTCGGCATTGACTGGGACGAAGGCCCCTATTTTCAAACCCAAAGATATGACATCTATAATGAATACATAGAAAAATTGATCAAATCAGGGGCAGCCTACTATTGTTCGTGTACGCCTGAAGAGATTGATGCCATGAGGGAAGAGGCAAAGGCCAACGGACAAAAACCCATGTACAACGGCAAGTGCAGAAACAGAAATCTCGAAAAAGCGGACAATACCGTTGTTCGACTTAAAACCCCTGATTCCGGCGTAACCATTGTCCAGGACGTTGTAAAAGGTGCGACATCTTTTCAAAATTCGGAAATAGACGACTTTATTATCAGAAGAAGCGACGGATCTGCCATGTACAACCTGGCCGTGGTGATTGATGACCTGACAATGGGGATCAACACCATTATCCGGGGGGACGACCATTTAATCAACACCCCGAAACAGATGCTGATATACCAGGCCCTTGGCGCAGAAATGCCGGTTTTCGGACATGTTCCCATGGTTCTGGGAGCCGACAAATCACGCCTGAGCAAGCGGCATGGTGCCATGTCCGTTGGAGAATACAAAAAAATGGGATTTTTGCCTGATGCCATGATCAATTACCTGGTCCGCCTGGGATGGTCTCATGGTGACCAGGAATTTTTCACAAGAGACGACCTCATTGAAAAGTTTAACCTGGAACACCTGGGCAGATCCGCATCAATGTTTGACACGGACAAACTAACAGCTCTGAACGCCAAGCATATTCAAAGTAAAAGCCCGGCTGAACTGGCAGACCATCTCTTGTTTCATCTCAAAGAGTTGGGGATTGATGCACAAAACAATGCCTTTACCCAGGGGGTTATTGAAACCCTTCAACCCAGAAGTAAAACCCTTGTTGAAATGGCACAGGGCGCTGTTTTTTATTACCTGGATGAGGTTCAGTTTGATGAAAAAGCAGCTAAAAAATTTCTAAAACCTGACGTACTGGATATGCTGCAAAAATCAGCCGGTTATATCAAAGGCCTTGAAGCGTATACCCAGGAAGCACTTGAAAACGTGTTCAAACAGATCATGGAAGAAACCGACCTCAAATTCGGAAAAATTGCCCAGCCGTTAAGGGTTGCCATCACCGGAACAACAGTGAGCCCGGGCATTTTTGAAATGCTTCTGGCCCTTGGCAAAGAAAAAACCGTTCAAAGGATTGAAGCAGCTATACGGCTTATTCAGGACAACTCATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_018645|3946100:3956250|3946100_3946577_-|WP_014958713.1|DBSCAN-SWA MPKIIEAGLQAQGKKFGIIASRFNDFITGRLVEGALDALIRSGAEDKDITLLKVPGAFEIPLAAKKMLNHGSYDAIICIGAVIRGATTHYDYVCAEVSKGIASVSLEADIPVMFGILTTETIEQAIERAGTKAGNKGFDVALGAVEMANLSDSLKKAE >NC_018645|3946100:3956250|3946657_3947860_-|WP_014958714.1|DBSCAN-SWA MPHLTIEQAIEDIKNGKMVILVDDEDRENEGDLTMAAQAVTPEAINFMATYGRGLICLSLDSTIADRLDLPMMVDNNTSQYGTGFTVSIEAKKGVTTGISAADRATTVLTAVADDTTPNDIARPGHIFPLRARDGGVMVRIGQTEGSVDLARLAGLKPAGVICEIMDDDGTMARMPSLEKFAKKHGIGICTVADLVKYRLRTESFVKRAAQTVIPTKVGGEFKIIAYENDMDSLTHIALVKGDIDSEKEILVRVHSECMTGDIFSSLRCDCQDQLHKAMAMMEEEGCGVLLYLRQEGRGIGLVNKLKAYEYQRQGLDTVEANEKLGFDADMRDYGVGAQMLVDLGVKKMRLLTNNPKKMIGLEGYGLSVVEQVPIEVAPNCHNKGYLKCKQAKMGHLLHM >NC_018645|3946100:3956250|3952040_3952481_-|WP_041279610.1|DBSCAN-SWA MDKYKSIIIGSDHAAYELKEKIKAYLIDKGYLVADAGTQSEASVNYVTYGKKVAKAVSNGQYLKGILLCGTGLGMSMVANRFANVRAALCSDIFSAKMSRVHNDSNILVIGGRIVGDVLAFELVQTWLDTGFEGGRHLERIQAIDN >NC_018645|3946100:3956250|3952496_3952730_-|WP_014958721.1|DBSCAN-SWA MTVETKVKKVIAEKIPDIDIEDVVPEASLIEDLGADSLTIVELVMSMEEIFEIEIDDDDAEKLLTVQDAIDFIKAKS >NC_018645|3946100:3956250|3954846_3956250_+|WP_014958724.1|tRNA|DBSCAN-SWA MDTIITRFPPSPTGYLHIGGARTALFNWLYARKKKGKFVLRIEDTDAARSTEESVDAILESLEWLGIDWDEGPYFQTQRYDIYNEYIEKLIKSGAAYYCSCTPEEIDAMREEAKANGQKPMYNGKCRNRNLEKADNTVVRLKTPDSGVTIVQDVVKGATSFQNSEIDDFIIRRSDGSAMYNLAVVIDDLTMGINTIIRGDDHLINTPKQMLIYQALGAEMPVFGHVPMVLGADKSRLSKRHGAMSVGEYKKMGFLPDAMINYLVRLGWSHGDQEFFTRDDLIEKFNLEHLGRSASMFDTDKLTALNAKHIQSKSPAELADHLLFHLKELGIDAQNNAFTQGVIETLQPRSKTLVEMAQGAVFYYLDEVQFDEKAAKKFLKPDVLDMLQKSAGYIKGLEAYTQEALENVFKQIMEETDLKFGKIAQPLRVAITGTTVSPGIFEMLLALGKEKTVQRIEAAIRLIQDNS >NC_018645|3946100:3956250|3947968_3948634_-|WP_014958715.1|DBSCAN-SWA MFTGIIESFGTIKRIESSGEGKVLHIGCDLDLSESKIGDSIAVNGACLTAVSLEKHAFKVDMAPETVERTTFKSLTTGSRVNIERALKLSDRIDGHLVSGHIDGTGIISSMVRKSNAVIIKIDVPSTLGSDMIEKGSVAIEGISLTINKCSDKDFQVSIIPHTADITTIGLKRVGDEVNIETDMIGKYVKKILRGSVSKNDALPKGEKDISMELLARNGFL >NC_018645|3946100:3956250|3952768_3952957_-|WP_014958722.1|DBSCAN-SWA MAVPKQKSSKARGRKRRTHYKVSAPTVSVCPECQEPKLPHAACPECGAYKGRNINAQADDNE >NC_018645|3946100:3956250|3953461_3954712_+|WP_014958723.1|DBSCAN-SWA MKKPGMMIVIWMVFLMESSVLWAGGADNKTNWSAEYIGILNRNAATDSADIVMYNPAGIMKMENGFYGNVSAHYVAKNYNNKINGHDFDQDKSSIVPGIFTIYKKDKWAGFFGVSNVVGGGKVNFENGNATTNFVRMVLSGGLAPYIDENLKAEAIGLGYTIGGAYSFNDMWSVSLGVRYVKSDRKMKGLVTLPGPFPIDLSFEEEADGFGGIIGINFSPFDALNLGLHYDTKVDLDYEADVKRDFITPAGPLLSSFGVVDGQKRSRNLPAVLAAGVSYKISPKIRAESNLTLYLNNDAGFKDIAGTSRDESAVDNGYDIGIGFEYACTDTLKVTLGYLYTNTGVDAKDMTPELPELDAHTLGSSLGYQMNENLNLIFSLGHVFYKDASFINRFDQPITYEKEITFLAFGIQYKFF >NC_018645|3946100:3956250|3948709_3949807_-|WP_014958716.1|DBSCAN-SWA MTDNDYMSLAISLAGKGKGFTSPNPCVGAVVVKDGRVVGKGFHRAAGLAHAEVEAIDDAGYMAKGATIYVTLEPCNHFGKTPPCTHKIINAGIKKVVVGCKDPNPNVCGGGIAYLRDNGIEVVTGVLQKEAQALIEEFIWYVQNNKTPFVILKCASTLDGRIATATGDSKWITNEKSRVFVHKIRHQVDAILVGSGTLHADNPSLTSRIEGVQTKDPVRIILDTHLTIKEDANVLTQKSNAKTIIVTGTGASKEKRALIESKGAQILEVSLKQEKLDLNELMIKLGKMSILSLLIEGGSVVAGSALKAGIVNKVLFFLAPKFLGSDDGIPVFQGKGPKLIKDAFELKKSTVTLFDTDMLVQGYLN >NC_018645|3946100:3956250|3950318_3950780_-|WP_041279609.1|DBSCAN-SWA MTDSLSDRPSWHEYFMGICDLVSGRSTCIRRKVGAVLVKEKRILCSGYNGAPAGVPHCSETGCLREQLKVPSGEKHELCRGVHAEQNAIIQAAYHGVQVKGAVLYCTNQPCSICAKMIVNAGIKTVYYKDGYDDPLTLDMFDKAKVKLILLDT >NC_018645|3946100:3956250|3949796_3950300_-|WP_014958717.1|DBSCAN-SWA MKCPFCGNLNTRVVDSRPGKIDLEVRRRRECPECSQRFTTYERVEQIPIMIVKKDNRREEFNREKVLTGIKKACEKRAISINQIEDIVDDIERNLREINDREISSKFVGEKVIEALKQIDDVAYVRFASVYRDFKDVADFIQELKGMISKECLPLEFNAISDKPDDR >NC_018645|3946100:3956250|3950772_3952017_-|WP_014958719.1|DBSCAN-SWA MGYIKQTDFEIAKIIELEADRQEYELNLIASENTVSPSVMEAQGSILTNKYAEGYPSRRYYGGCEFVDQAEDLAIERAKKLFNVEYANVQPHSGSQANMAVYFALLNPGDRILAMDLSHGGHLTHGAAVSFSGRLYDFAHYGLSPKTQMIDLNKVEDLAKKHQPKLIVAGASAYPRIIDFKGFSDIAKSVGALFMVDMAHIAGLVAAGVHPSPVGFADVITSTTHKTLRGPRGGLILSSEKFAKAIGSQIFPGIQGGPLMHVIAAKAVAFKEALEDSFADYQKQVIKNTAALASVILKRGYKLVSGGTDNHMVLVDFSQRDISGKDAEERLGRAGITVNKNTVPNEKRGPFVTSGIRIGLPLVTSRGMDEAAGKKIATFICDVLDDEKNIEAVARNVRALCIEYPLYVGKSTHD |
12 | Staphylococcus_phage(57.14%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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